Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: NW_018397451.1 Herrania umbratica cultivar Fairchild unplaced genomic scaffold, ASM216827v2 scaffold_1216.0, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
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ACGTcount: A:0.35, C:0.13, G:0.13, T:0.37
Warning! 485 characters in sequence are not A, C, G, or T
Found at i:292 original size:171 final size:169
Alignment explanation
Indices: 1--695 Score: 607
Period size: 171 Copynumber: 4.1 Consensus size: 169
** * *
1 TAATAAGGCTTTCGAAGGCTTGGGTTG-CTATAAATGGACTTTTCTTGCAAATGAATAGCTTTTT
1 TAATAAGGCTTTTAAAGGCATGGG-TGACTATAAATGGACTTTTCTTGCTAATG-ATAGCTTTTT
* * * *********
65 CTTCATATTTCTCAA-GCTAGACATTCAATTATAATCTGTTNNNNNNNNNNATGTAAAATA-ATT
64 CTTCATCTTTCTTAAGGC-AGACATTCAATTATAATCTATT-TTATCAAAAATGTAAAA-ACATT
*
128 CAACCTAAATTCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAG
126 CAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAG
* * * *
172 TACTTAGGCTTTTAAAGGCATGGGTGACTACAAATGGACTTTTCTTGCTAATGATAGTCTTTTGC
1 TAATAAGGCTTTTAAAGGCATGGGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCTAATGATAG-CTTTTTC
* *
237 TTCATGTTTCTTAAGGCAAACATTCAATTATAATCTATTTTCATCAAAAATGTAAAAACATTCAA
65 TTCATCTTTCTTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTATTTT-ATCAAAAATGTAAAAACATTCAA
* *****************
302 CTTAAAATCAATTATGAGATTATANNNNNNNNNNNNNNNNN
129 CCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAG
*** * *
343 NNNTAAGGCTTTTAAAGGCTTGGGCTG-CTATATATGGACTTTTCTTG-TCAATGAATAGCTTTT
1 TAATAAGGCTTTTAAAGGCATGGG-TGACTATAAATGGACTTTTCTTGCT-AATG-ATAGCTTTT
* * * * * *
406 TCTTCACCTTTTTTGAGGCAGACATTCAATTATAATTTGTTTTAACTAAAAATGT-AAAACAATT
63 TCTTCATCTTTCTTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTATTTTATC-AAAAATGTAAAAAC-ATT
*
470 CAACCTAAAATCAA-TATGAGATTATAAAACCATTTAAAACGAG
126 CAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAG
* * * * *
513 TAATTAGGCTTTTAATGGCATGGGTGACTATAAATGGACTTTTTTTGCTAATAAATGGCTTTTTC
1 TAATAAGGCTTTTAAAGGCATGGGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCTAAT-GATAGCTTTTTC
* * * *
578 TTCA-CTTT-TTCCAAGGTAGGCATTCAATTGTAATCTATTTTAATAAAAAATGTAAAAACATTC
65 TTCATCTTTCTT--AAGGCAGACATTCAATTATAATCTATTTT-ATCAAAAATGTAAAAACATTC
* *
641 TATCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAG
127 AACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAG
684 TAATAAGGCTTT
1 TAATAAGGCTTT
696 NNNNNNNNNN
Statistics
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0.76 0.18 0.07
Matches are distributed among these distances:
168 2 0.00
169 6 0.01
170 126 0.31
171 268 0.65
172 8 0.02
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Consensus pattern (169 bp):
TAATAAGGCTTTTAAAGGCATGGGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCTAATGATAGCTTTTTCT
TCATCTTTCTTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTATTTTATCAAAAATGTAAAAACATTCAACC
TAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAG
Found at i:693 original size:341 final size:342
Alignment explanation
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Period size: 341 Copynumber: 2.0 Consensus size: 342
* *
1 TAATAAGGCTTTCGAAGGCTTGGGTTGCTATAAATGGACTTTTCTTGCAAATGAATAGCTTTTTC
1 TAATAAGGCTTTCAAAGGCTTGGGCTGCTATAAATGGACTTTTCTTGCAAATGAATAGCTTTTTC
********** *
66 TTCATATTTCTCAAGCTAGACATTCAATTATAATCTGTTNNNNNNNNNNATGTAAAATAATTCAA
66 TTCATATTTCTCAAGCTAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACTAAAAATGTAAAACAATTCAA
* * *
131 CCTAAATTCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTACTTAGGCTTTTAAAGGCATGGG
131 CCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAACGAGTAATTAGGCTTTTAAAGGCATGGG
* * *
196 TGACTACAAATGGACTTTTCTTGCTAATGATAGTCTTTTGCTTCATGTTTCTTAAGGCAAACATT
196 TGACTACAAATGGACTTTTCTTGCTAATAATAGGCTTTTGCTTCATGTTTCTCAAGGCAAACATT
* *
261 CAATTATAATCTATTTTCATCAAAAATGTAAAAACATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATA
261 CAATTATAATCTATTTTAATAAAAAATGTAAAAACATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATA
*****************
326 NNNNNNNNNNNNNNNNN
326 AAACCATTTAAAGCGAG
*** * *
343 NNNTAAGGCTTTTAAAGGCTTGGGCTGCTATATATGGACTTTTCTTGTC-AATGAATAGCTTTTT
1 TAATAAGGCTTTCAAAGGCTTGGGCTGCTATAAATGGACTTTTCTTG-CAAATGAATAGCTTTTT
* * * *
407 CTTCACCT-TTTTTGAGGC-AGACATTCAATTATAATTTGTTTTAACTAAAAATGTAAAACAATT
65 CTTCA--TATTTCTCAAGCTAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACTAAAAATGTAAAACAATT
*
470 CAACCTAAAATCAA-TATGAGATTATAAAACCATTTAAAACGAGTAATTAGGCTTTTAATGGCAT
128 CAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAACGAGTAATTAGGCTTTTAAAGGCAT
* * * * * *
534 GGGTGACTATAAATGGACTTTTTTTGCTAATAA-ATGGCTTTTTCTTCACTTTTTC-CAAGGTAG
193 GGGTGACTACAAATGGACTTTTCTTGCTAATAATA-GGCTTTTGCTTCA-TGTTTCTCAAGGCAA
* * *
597 GCATTCAATTGTAATCTATTTTAATAAAAAATGTAAAAACATTCTA-TCTAAAATCAATTATGAG
256 ACATTCAATTATAATCTATTTTAATAAAAAATGTAAAAACATTCAACT-TAAAATCAATTATGAG
661 ATTATAAAACCATTTAAAGCGAG
320 ATTATAAAACCATTTAAAGCGAG
684 TAATAAGGCTTT
1 TAATAAGGCTTT
696 NNNNNNNNNN
Statistics
Matches: 287, Mismatches: 60, Indels: 13
0.80 0.17 0.04
Matches are distributed among these distances:
340 2 0.01
341 165 0.57
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343 8 0.03
344 1 0.00
ACGTcount: A:0.34, C:0.13, G:0.13, T:0.36
Consensus pattern (342 bp):
TAATAAGGCTTTCAAAGGCTTGGGCTGCTATAAATGGACTTTTCTTGCAAATGAATAGCTTTTTC
TTCATATTTCTCAAGCTAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACTAAAAATGTAAAACAATTCAA
CCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAACGAGTAATTAGGCTTTTAAAGGCATGGG
TGACTACAAATGGACTTTTCTTGCTAATAATAGGCTTTTGCTTCATGTTTCTCAAGGCAAACATT
CAATTATAATCTATTTTAATAAAAAATGTAAAAACATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATA
AAACCATTTAAAGCGAG
Found at i:1466 original size:171 final size:171
Alignment explanation
Indices: 1155--16874 Score: 9763
Period size: 171 Copynumber: 91.6 Consensus size: 171
1145 NNTGATTTTA
* * * * * * * * *
1155 TGAATTTTTTTGCATCTTTGATTAACACAGATTAGAATTGAATGTTTGCCTCGAGAAA-AGTAAA
1 TGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAACA-TGAA
* * * * * *
1219 TAAGAAGGC-TATCATTGGCAAGAAGAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTATT
65 GAAAAAGCCAT-TCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATACCTTTGAAAGCCTTATT
* * *
1283 ACTCACTTTAAATGGTTTTATAATTTGATAATTGATTTTAAGT
129 ACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
** * * * * *
1326 ACAATTTTTTTACATTTTTTATTCAAATAGATTATAATTGAATGTTTACCTTTAGAAACATTAAG
1 TGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAACATGAAG
* * * * * * * *
1391 AAAAAGGCATTCATTAGCAAGAAAAGTCCATTTATAGCCACCCATATCGTTAAAAACCTTGTTAC
66 AAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATACCTTTGAAAGCCTTATTAC
* * *
1456 TTGATTTAAATGGTTTTATAATCTGATAATTGATTTTAAGT
131 TCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
* ** *
1497 TGAA-TTTTTTATATTTTTTATTAAAATGGATTATAATTGAATGTCTACCTTCG-GAAACGTGAA
1 TGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTT-GAGAAACATGAA
* * * * * * *
1560 TAAAAAACCATTTATTGGCAACAAAAGTCCATTTATAGTCACCAACACTTTTGAAAGCCTTATTA
65 GAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATACCTTTGAAAGCCTTATTA
*
1625 CTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTT-AGAT
130 CTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAG-T
* * * * * * *
1667 AGAATGTGTTTACATTTTTTATTAAAATAAATTATAATTGCATGTCTACCTTG-GAAAAAGTGAA
1 TGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAACA-TGAA
* * * * * * * * *
1731 GAAAAAGCCATTTATTAGCAAGAAAAATCCATTTATAGTTACTCATGCCCTTAAAAGCCTAATTA
65 GAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATACCTTTGAAAGCCTTATTA
* *
1796 CTCGCTTTAAATGGCTTTATAATCTCAT-ATTGATTTTAGGT
130 CTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
* * * ** * **
1837 TGAATTGTTTTACA-TTTTTAGTTAAAATAGATTATAATTGAATGTTTACCTCAAAAAAGGTGAA
1 TGAATTTTTTTACATTTTTTA-TTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAACATGAA
* * * *
1901 GAAAAAGCCATTCATTGACAAAAAAAGTCCATATATAG-CAACCCA-AGCCTTTAAAAGCCTTAT
65 GAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTC-ACCCATA-CCTTTGAAAGCCTTAT
* *
1964 AACGCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
128 TACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
* * * *
2008 TGAATGTTTTTACA-TTTTTAGTGAAAATAGATTATAATTGAATGTCTGCCTT-AGGAAACATGA
1 TGAATTTTTTTACATTTTTTA-TTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGA-GAAACATGA
* * * *
2071 AGAAAAAGAC-TATCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTTAAAAGCCTAAT
64 AGAAAAAGCCAT-TCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATACCTTTGAAAGCCTTAT
* *
2135 TACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAGGT
128 TACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
* * * * *
2179 TGAGTTATTTTACA-TTTTTAGTTAAAACAAATTATAATTGAATGTCTACCTTGAAAAATATGAA
1 TGAATTTTTTTACATTTTTTA-TTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAACATGAA
* * * * ** * *
2243 GAAAAAGTCATTCATTTGTAAGAAAAGTCTATTTATAG-CAACCCA-AGCCTTCAAAAGACATAT
65 GAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTC-ACCCATA-CCTTTGAAAGCCTTAT
** * ** *
2306 TAAGCACTTTAAATATTTTTATAATCTTATAATTGATTTT-A--
128 TACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
* * * * * * * *
2347 TGAATTTTTTTGCATCTTTGATTAACACAGATTAGAATTGAATGT-TCACCTCGGGAAA-AGTAA
1 TGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCT-ACCTTGAGAAACA-TGA
** * * * *
2410 AGAAAAATGTTA-TCATTGGTAAGAAGAGTCAATTTATAGTCACCCATGCCTTTGAAAGCCTTAT
64 AGAAAAA-GCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATACCTTTGAAAGCCTTAT
*
2474 TACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTGATAATTGATTTTAAGT
128 TACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
* * * * * * *
2518 TGAATTTTTTTATATTTTCTATTCAAATAGACTATAATTGAATGTTTACCTTTAGAAACATGAAG
1 TGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAACATGAAG
* * * * * * *
2583 AAAAAGGCATTCATTGGCTAGAAAAGTCCATTTATAGCCACCTATACCTTCGGAAGCCTTGTTAC
66 AAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATACCTTTGAAAGCCTTATTAC
* * *
2648 TCGATTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTTAGT
131 TCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
* * * *
2689 TGAATATTTTTACATTTTCTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCATGAGAAACGTGAAG
1 TGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAACATGAAG
** * * * * *
2754 AAAAAGGTATTCGTTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTAGAAGGTCTTATTAC
66 AAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATACCTTTGAAAGCCTTATTAC
*
2819 TCGCTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
131 TCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
* * * * * * * * * * * *
2860 TTAATATTTTT-CTTTTTTTGTTAAAATAAATTATAATTAAATATCTACCCTGGGAAACCTAAAG
1 TGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAACATGAAG
* * * * * ** *
2924 AAAAAGCCATTCATTGGTAAGTAAAGTGCATTTATAGTTACCCATGCCTTCAAAAGCACAT-TTA
66 AAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATACCTTTGAAAGC-CTTATTA
* * *
2988 CTCGCTTTAAATGGTTTTATTATCTTATAATTGATTTTAGGT
130 CTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
* * * * ** * * * *
3030 TCAATGTTTGTGCATTTTTGGTTAAAACAGATTAAAATTGAATATTTACCTTG-GAAAACGTGAA
1 TGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGAG-AAACATGAA
* * * * *
3094 -AGAAAAGCCATTGATTGGCAAGTAAAGTCAATTTCTAGTCACACA-AGCCTTTGAAAGCCTTAT
65 GA-AAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATA-CCTTTGAAAGCCTTAT
* * *
3157 TACTCGCTTTGAATAGTTTTATAATCTCATAATT-ATTTTTAAGC
128 TACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGA-TTTTAAGT
* * * * * * *
3201 TGAATGTTTTTAAATTTTTGATGAAAACAGATTATAATTGAATGTTTGCCTAGAGAAACAT-AGA
1 TGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAACATGA-A
* * *
3265 GAAAAAAG-AATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTTCAAAGCCTTATT
65 G-AAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATACCTTTGAAAGCCTTATT
*
3329 ACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTGATAATTGATTTTAAGT
129 ACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
* * * ** **
3372 TTAATTTTTTTACATTTTTTGTTAAAACAGATTATAATTAAATGTCTACCTAAAGAAATGTGAAT
1 TGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAACATGAA-
* * * *
3437 G-AAAAGCCATTCATGGGTAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTTGAAAGTCTTATTA
65 GAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATACCTTTGAAAGCCTTATTA
* *
3501 CTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAGGT
130 CTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
* * * * * *
3543 TAAATTTTTTTATATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTTTGCCTCGAGAAACGTGAAG
1 TGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAACATGAAG
** * ** * *
3608 AAAAAGGTATTTATTAACAATAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATACCTTTGTAAGCCTTATTAC
66 AAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATACCTTTGAAAGCCTTATTAC
* * * * *
3673 GCACTTTAAAT-G-ATTA-AA----A-CA--GATTATAA-T
131 TCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
* ** *** * ** * ** * * *
3703 TCAATGTCTTCCT-CGGGAAACTTGAGGAAAA-AGCCATTCA-ATGTTAGAAAATTTACATTTAT
1 TGAAT-T-TTTTTAC---ATTTTTTATTAAAACAG--ATT-ATA-ATT-GAATGTCTAC-CTT-G
** ***** * * * *
3765 AGTTACGCATGCCTTTGAAAG-C-TTAATTACCCGGTTTAA-AAAA-T---TTTATAAT--CTCA
54 AG--AAACATG-AAGAAAAAGCCATTCATT----GG--CAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCA
* ** * ** * **
3821 TA--ATTG--A-TTTTAGGTTGAGT-TTTTGTACAT--TTTTAGTTAA-AACA-AATT-A---TA
110 TACCTTTGAAAGCCTTA--TT-ACTCGCTT-TAAATGGTTTTA--TAATCTCATAATTGATTTTA
3872 A-T
169 AGT
* * *** ** * * * * * *
3874 TGAATGTTTGCCTTAGGAAACGTAAAGTAAAAGCCATTCATTGGTAA--GAAAAGTCTA-TTTAT
1 TGAAT-TTT--TTTA--CATTTTTTATTAAAA--CA--GATT-ATAATTG-AATGTCTACCTT-G
** *** ** * * *** * * * **
3936 AGTTACCCAAACTTTCAAAAGCCTAATT-ACTCGCTTTAAATGGT---TTTATAATCTCATAATT
54 AGAAACATGAA---GAAAAAGCC--ATTCATTGGCAAGAAA-AGTCCATTTATAGTCAC-CCA-T
* ** * ** * ***** * * *
3997 GA-TTTTAGGTAGAA-TTTTTTTACATTTTTCATTAAAACAAATTATAAT-TGA-ATGTCTGCCT
111 -ACCTTT--G-A-AAGCCTTATTAC---TCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATA-AT-TG-AT
**
4058 TAGGAAACG-
165 T--TTAA-GT
* * * *
4067 TGAATTTTTTTACATTTTTCATTAAAACAAATTATAATTGAATGTCTGCCTT-AGGAAACGTGAA
1 TGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGA-GAAACATGAA
*** * ** * * * * *
4131 GAAAAAATGATTTATTGGCAAGAAAAGTTTATTTATATTGACCCA-AGTCTTCGAAAGCCTTTTT
65 GAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATA-CCTTTGAAAGCCTTATT
* ** ** *
4195 ACTTGCCGTAGTTGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAGGT
129 ACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
* * * * *
4238 TGAATTGTTTTACATTTTTTGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTAGC-TCATGAAACGTGAA
1 TGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGA-GAAACATGAA
* ** * * * * *
4302 GAAAAAGCCATTCATTAGTGAGAAAGGTCCATTTATAGTCTCCAATGCCTTTAAAAGCCTTATTA
65 GAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATACCTTTGAAAGCCTTATTA
*
4367 CTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAGGT
130 CTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
* * ** * * * *
4409 TGAATGTTTTTATATTTTTGGTTAAAATAGATTATAATTGGATGTCCACCTTGAGAAACCT-AAC
1 TGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAACATGAA-
* * * * ** ** * **
4473 G-AAAAGTCCATTCAATGGTAAGAAAAGTCTATTTATAGTTACGTATGTCATCAAAAG-CTTAAT
65 GAAAAAG-CCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATACCTTTGAAAGCCTT-AT
** * * * *
4536 TTTTTGGTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTAATTTTAGGT
128 TACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
* ** * * * * * *
4580 TGAA-TTTTGTACATTTTTGGTTAAAACAGATTATAGTTGAATATTTACC-TCAGGAAACGTAAA
1 TGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGA-GAAACATGAA
* * ** * * * ** *
4643 GTAAAAGCCATTTATTGATACA-AAAAGTCTATTTATACTTACCCACGCCTTT-AGAAGCCTAAT
65 GAAAAAGCCATTCATTGGCA-AGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATACCTTTGA-AAGCCTTAT
* *
4706 TACTAGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTAATTTTAAGT
128 TACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
* * ** ** *
4750 TGAATTTGTTTACATTTTTTTATTAAAACAGATTATAATT-AATTGTCTGCCTCAAGAAATGTAA
1 TGAATTTTTTTACA-TTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAA-TGTCTACCTTGAGAAACAT-G
* ** * * * *
4814 AAAAAAAAATCATTCATTAGCAAGAAAAGTACATTTATA-TGAACCCA-A-GTGTTCGAAAGCCT
63 AAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGT-CACCCATACCT-TT-GAAAGCCT
* *
4876 AATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAATTGATTTT-AGAT
125 TATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAG-T
* ** * * * ** * *
4923 TGAAGTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAAAATATAATTGAATGTCTATCTCAAGAAACGTAAAG
1 TGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAACATGAAG
* ** * * ** *
4988 AAAAAGTCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATCCTTACCCATGCCTTCAAAAGCCTAATTAC
66 AAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATACCTTTGAAAGCCTTATTAC
* ** * *
5053 TCACTTTAAATAATTTTATACTGC-CATAATTGATTTTAGGT
131 TCGCTTTAAATGGTTTTATAAT-CTCATAATTGATTTTAAGT
* * * * * *
5094 TGAATTTTTTTACATTTCTCACTAAAATAGATTATAATTGAATGTCTGCCATG-GAAAACATGAA
1 TGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGAG-AAACATGAA
* * * * ** *
5158 -ATAAAAGCCATTCATTGGTAAGAAATGTCCATTTATAATCACCTATGGCTTTGAAAGCCTAATT
65 GA-AAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATACCTTTGAAAGCCTTATT
** * * *
5222 ACTTACTTTAAGTGGTTTTATAATC-CAATAATTGATTTCAGGT
129 ACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTC-ATAATTGATTTTAAGT
* * * * ** *
5265 TGAATTGTTTTACATTTTTTGTTAAAACAGATTATACTTGAATGTCTACGTCAAGAAACATGAAA
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* * * **
5330 AAAAACCCACTCATT-GAAGAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCC-TAACCTTCAAAAGCCTTATT
66 AAAAAGCCATTCATTGGCA-AGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCAT-ACCTTTGAAAGCCTTATT
** * * *
5393 ACTCGAATTAAATAGTTTTATAAGCTCATAATTGGTTTT-AGCT
129 ACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAG-T
* * * * *
5436 TGAGTTTCTTT--ATCTTTTTATTAAAAAAGATTATAATTGAATGTCTACTTTGAGAAACGTGAA
1 TGAATTTTTTTACAT-TTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAACATGAA
* * * * *
5499 GAAAAAGTCAGTCATTGGTAAAAAAAGTCCATTTATAGTCACCTATACCTTTGAAAGCCTTA-TA
65 GAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATACCTTTGAAAGCCTTATTA
** * *
5563 CTCGCTTTAAATATTTTTATAATCTCCTAATTGATTTTATGT
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* * * * * *
5605 TGAATTTTTTTTACATTTTTGAGTAAAATAGATTGTAATTGAATCTCTA-CTATGGGAAACATGA
1 TGAA-TTTTTTTACATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCT-TGAGAAACATGA
* ** * * * *
5669 AGAGAAA-CTTGTTCATTGACAAAAAAAAG--CATTTATAGTCACCCATGCCTTTGAAAGCCTAA
64 AGAAAAAGC-CATTCATTGGC-AAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATACCTTTGAAAGCCTTA
* * *
5731 TTGCTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAGGT
127 TTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
**
5776 TGAA-TTTTTTACA-TTTTTAGTTAAAAC-GCATTATAATTGAATGGT-TACCTTG-GTAAATGT
1 TGAATTTTTTTACATTTTTTA-TTAAAACAG-ATTATAATTGAAT-GTCTACCTTGAG-AAACAT
* * ** **
5836 GAAGAAAAAGTCATTCA-T-G-AGAGAAAAAGTTCATTTATAGTCACTGA-AGCCTTCAAAAGCC
62 GAAGAAAAAGCCATTCATTGGCA-AG-AAAAGTCCATTTATAGTCACCCATA-CCTTTGAAAGCC
* *
5897 TTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCCTAATTGATTTTAAGT
124 TTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
* * ** * * *
5945 TGAATATTTCTACATTTTTGGTGAAAACAGATTCTAATTGAATAT-T-CGCATTG-GTAAACATG
1 TGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTAC-C-TTGAG-AAACATG
* * * * * * * * *
6007 AAGAAAAAGGC-TAACACTAGCAAGAAAACTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTTGACAGCCTTA
63 AAGAAAAAGCCAT-TCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATACCTTTGAAAGCCTTA
* * * *
6071 TTACTCGCTTT-AATGATTTTTTAATCTCATAATTAATTTTAAAT
127 TTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
* * * * * * * * *
6115 TAAATATTTTTACA-TTTTTAGTAAAACAGAATATAATTAAATGTCCACC-TCAGGAAACCTAAA
1 TGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGA-GAAACATGAA
* * * * ** *
6178 GAAAAAGCCATTCATTGGCAACTAAAA-TCCATTTATTGTTACTCATACCTTCAAAAGCCTAATT
65 GAAAAAGCCATTCATTGGCAA-GAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATACCTTTGAAAGCCTTATT
* * *
6242 ACTCACTTTAAATGGTTTTATAACCTCATAATTGATTTTAGGT
129 ACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
* * * * * * ** *
6285 TTAATTTTTTTATATTTTTGATTAAAATAGATTATAATTGAATGTCTGCC-TCATGAAATGTGAG
1 TGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGA-GAAACATGAA
* * * * * * *
6349 GAAAAA-CTATTCATTGGTAAAAAAAATCCATTTCTAGTCACCCA-AGCTTTTGAAAGCCATATT
65 GAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATA-CCTTTGAAAGCCTTATT
* * *
6412 ACTCTCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAA-TCAATTTAAGGT
129 ACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAA-GT
* * ** * * * *
6455 TAAATGTTTTTACATTTTTGGTTAAGACA-ATTTATAATTGAATATATACCTTGAGAAACGTGAA
1 TGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAAACAGA-TTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAACATGAA
* * *** * * * *
6519 AAAAAAGCTATTCATTGATGAGAAAAGTCCATTTATGGCCACCCAAACCTTCGAAAGCCTTATTA
65 GAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATACCTTTGAAAGCCTTATTA
* * * * *
6584 TTCACTTTAAATAGTTTTATAATCTTATAATTGATTTTAGGT
130 CTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
* * * * * * *
6626 TGAGTTTTCTCACATTTTTTGTTAAAGCAGATTATAATTGAATATTTACCTTGAGAAACATGAAG
1 TGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAACATGAAG
* * * *
6691 AAAAAGCCATTCATTCTG-AAGAAAAGTTCATTTATAGCCA-CCAAAGCCTTTGAAAGCCTTATT
66 AAAAAGCCATTCATT-GGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATA-CCTTTGAAAGCCTTATT
* * *
6754 GCTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCTTATAATTGATTTT-AGAT
129 ACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAG-T
* * * * * ** *
6797 TG-AGTTTTTCACATTTTTTATTAAAACATATTATAATTGTATCTCTGTCTTGGGAAACATGAAG
1 TGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAACATGAAG
* * * * *
6861 AGAAAGCCTTTCAATGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTC-GCC-TACGGCTTTGGAAG-CTTGAT
66 AAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATAC--CTTTGAAAGCCTT-AT
* * *
6923 TACTCGCTTTAAACGGTTTTAAAATCTCATAATTGATTTAAAGT
128 TACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
* * * * * **
6967 TGATTTTTTTTACATTTTTAATGAAAACAGATTATAATTGAATGTCTGCATT-AGGAAATGTGAA
1 TGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGA-GAAACATGAA
* * *
7031 GAAAAAGGC-TATCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTTGAAAGTCTTATT
65 GAAAAAGCCAT-TCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATACCTTTGAAAGCCTTATT
* * * *
7095 ACTCACTTTAAATGGTTTCATAATCTCATAATTGGTTTTCAGT
129 ACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
* * * *
7138 TGAATTTATTTACCA-TTTTTGTTAAAACAAATTATAATTGAATGTCTACCTCT-AGAAACTTGA
1 TGAATTTTTTTA-CATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCT-TGAGAAACATGA
* * ** * * * *
7201 AGAAAAAGTCATTCATTGGCAAGTAAAGTCCATTTATAGTTGCCCATGCCTTTAAAAACCTAATT
64 AGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATACCTTTGAAAGCCTTATT
* * *
7266 ACTCACTTTAAATGGTTTTCTAATCTCATAATTGATTTTACGT
129 ACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
* * * *
7309 TGAATATTTTTACA-TTTTTAGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTGTGCCTTGAGAAACATCAA
1 TGAATTTTTTTACATTTTTTA-TTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAACATGAA
* * * * * * *
7373 GAAAGGAG--ATTCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTTACCAACACCTTTGAAAGCCTTATC
65 GAAA-AAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATACCTTTGAAAGCCTTATT
* * * * *
7436 GCTCGCTTTAAATAGTTTTGTAAGCTCATTATTGATTTT-AGTT
129 ACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAG-T
** * * * * * *
7479 TGAATAGTTTTACATGTTTTGTTAAAATAGATTATAATTGAATGTCTACC-TCACAAAAAGGTGA
1 TGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAACA--TGA
* * * * * * *
7543 AGAAAAAGCCATTTATTAGTAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACCCA-AGCTTTTAAAAGCCTAAT
64 AGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATA-CCTTTGAAAGCCTTAT
* *
7607 TACTCGCTTTAAATGATTTTATAATCTCATAATTGATTTTAGGT
128 TACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
* * * * * * **
7651 TGAA-TTTTTTAAAATTTTTAGTTAAAACAAATTATAACTGAATTTCTACCTTGAAAAATGTGAA
1 TGAATTTTTTTACATTTTTTA-TTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAACATGAA
* * *
7715 -AAAAAGCCATTCATTGACAAGAAAAGTCCATATATAG-CAACCCA-AGCCTTCGAAAGCCTTAT
65 GAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTC-ACCCATA-CCTTTGAAAGCCTTAT
** * * * *
7777 TAGACGATTTAAATGGTTATAGAATCTCATAATTGATTTTAGGT
128 TACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
* ** * * * *
7821 TGAATTGTTTTTATATTTTTGGTGAAAATAAATTATAATTGAATGTCTACCTTGTGAAACATGAA
1 TGAATT-TTTTTACATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAACATGAA
* **
7886 GAAAAAGGC-TATCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATGTCTTTGAAAGCCTTATT
65 GAAAAAGCCAT-TCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATACCTTTGAAAGCCTTATT
* * * * *
7950 ACTTGCTTTAACTGGCTTCATAATCTCATAATTGATTTTAATT
129 ACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
* ** * * * * *
7993 TGAATTTTTATACCA-TTTTGGTTAAAAAAGATTATAATTAAATGTCTA-CATCAGGAAATAT-A
1 TGAATTTTTTTA-CATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGA-GAAACATGA
* * ** * ** * * *
8055 AGTAAAAGCCATTTATTGATTAA-AAAAGTCCATTTATACTTTCCCATACCTCTAAAAGCCTAAT
64 AGAAAAAGCCATTCATTG-GCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATACCTTTGAAAGCCTTAT
* * *
8119 TATTCACCTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
128 TACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
* * * * * ** * *
8163 TGAATTTGTTTACA-TTTTTGTTAAAACAGTTTATAATTAAATGTATACCTCAAGAAACCTAAAG
1 TGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAACATGAAG
* * * * ** *
8227 AAAAAGCCATTCATTAGCAAGTAAAGTCTATTTATAGTTACCCATACCTTCAAAAGCCTAATTAC
66 AAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATACCTTTGAAAGCCTTATTAC
* **
8292 TCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTGGGT
131 TCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
* * ** * ** **
8333 AGAATTTTTTTAAATTTTTGGTTAAAACAAATTATAATTGAATGTCTACCTCAAGAAATGTGAAG
1 TGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAACATGAAG
* * ** *
8398 AAAAAGCCATTCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCAACGCCTTTGAAAGACTTATTAC
66 AAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATACCTTTGAAAGCCTTATTAC
* * * *
8463 ACGATTTAAATGGTTTTATAATCTCATAACTGATTTTAGGT
131 TCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
* * * * * * * **
8504 TTAATGTTTTTGCATTTTTCATTAAAACAAATTATAATTGAATCTCTACCTCGAGAAATGTGAAG
1 TGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAACATGAAG
*** * * * *
8569 AAAAAGCCATTCATTAATAAGCAAAGTCCATTTATTGTCACCCATGCCTTT-AATAGCCTAATTA
66 AAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATACCTTTGAA-AGCCTTATTA
* *
8633 CTCGCTTTAAATGGTTTTATAATGTCATAATTGATTTTAGGT
130 CTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
* * * * * * * *
8675 TGAATTTTTTAAAATGTTTTGTTAAAACAAATTATAATTGAAAGTCTACATTGAGAAATATGAAG
1 TGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAACATGAAG
*
8740 -AAAAGCCATTCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAG-CAACCCA-AGCCTTCT-AAAGCCTTAT
66 AAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTC-ACCCATA-CCTT-TGAAAGCCTTAT
* *
8801 TA-TACGCTTTAAATGGTTTTATAATGTCATAATTGATTTTAAGC
128 TACT-CGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
** * ** * *
8845 TGAATTATTTTTACATTTTTGGTGAAAACAGATTATAATTGAATGTCTATATCGGGAAACATGAA
1 TGAATT-TTTTTACATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAACATGAA
** * * **
8910 GAAAAATAC-TATCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAATCACCCATACCTTTAAAAGTTTTATT
65 GAAAAAGCCAT-TCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATACCTTTGAAAGCCTTATT
* * *
8974 ACTCTCTTTAAATGGTTTTAAAATCTCATAATTGTTTTTAAGT
129 ACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
* * * * *
9017 TGATTTTTTTTTGCATTTTTTTGATTAAAACAGATTATAATTGAATGCCTACC-TCAGAAAACTT
1 TGA-ATTTTTTTACA-TTTTTT-ATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGAG-AAACAT
* * * * * * * *
9081 GAGGAAAAAGCCATTCAATGGTAAGAAAAGTCCGTTTATAGTTACGCATACCATCGAAAG-CTTA
62 GAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATACCTTTGAAAGCCTT-
* * **
9145 ATTACTCGATTTAAATGGTTTTACAAT-TCCATAATTGATTTTGGGT
126 ATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCT-CATAATTGATTTTAAGT
* * * * * *
9191 TGAATTTTTGTACATTTTTTTATTAAAATAGATCATAATTAAATATCTACCTT-AGGAAACATAA
1 TGAATTTTTTTACA-TTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGA-GAAACATGA
* * ** ** * * ***
9255 AGTAAAAGCCATTTATTGGTGAGAAAAGTCCATTTATTAGCTTTCTCAATGCCTCCACAAAAGCC
64 AGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTA-TAG-TCAC-CCATACCT--TTGAAAGCC
* *
9320 TAAATTACTCCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAAT
124 T-TATTACT-CGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
* * * * *
9370 TGAATTTGTTTACATTGTTTATTAAAACAGATTATAATTAAATGTCTACCATGGGAAAC-TGGAA
1 TGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAACAT-GAA
* * * * ** **
9434 AAAAAAGCCATTCATTGGCAAGTAAAGTCCATTTATAGTTACCTATACCTTCAAAAGCCAAATTA
65 GAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATACCTTTGAAAGCCTTATTA
* * * **
9499 CTCGCTCTAAATGATTTTATAATCTTATAATTGATTTTGGGT
130 CTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
* * * * * * **
9541 AGAATTTTTTTAAAATTTTTGATTAAAACAGCTTATAATTGAATGTCTGCCTTAAGAAATGTGAA
1 TGAATTTTTTT-ACATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAACATGAA
* **
9606 GAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCAACGCCTTTGAAAGCCTTATTA
65 GAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATACCTTTGAAAGCCTTATTA
* * *
9671 CTCGATTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAGGT
130 CTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
* * * * * * ** **
9713 TTAATTGTTTTATATTTTTCATGAAAATAGATTATAATTGAATGTCTACCTCAAGAAATGTGAA-
1 TGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAACATGAAG
* * * * * * *
9777 AAAAAGCCATTGATTAGTAAGAAAAGTCCATTTATAGTCGCTCATGCCTTT-AATAGCCTAATTA
66 AAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATACCTTTGAA-AGCCTTATTA
* * *
9841 CTCGCTTTAAATGGGTTTATAATCTCATAATTGATTTTAGGC
130 CTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
* * * * * * *
9883 TGAATTTTTTAAAATTTTTTATTAAAACAAATTATAATTGAATGTCTATCTTGGGAAATATAAAG
1 TGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAACATGAAG
** * * * * *
9948 -AAAAGCCATTCATTGATAAGAAAGGAT-CATTTCTAG-CAACCCAAACCTTTGAAAGCGTTCTT
66 AAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAG-TCCATTTATAGTC-ACCCATACCTTTGAAAGCCTTATT
* *
10010 A-TACGCTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAACT
129 ACT-CGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
** * *
10053 TGAATTGTTTTTACATTTTTGGTGAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCATGAGAAACATGAA
1 TGAATT-TTTTTACATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAACATGAA
* ** * * * *
10118 GAAAGAG-GTTATCATTGGCAAGAACAGTCCATTTATAGTTACTCATATCTTTGAAAGCCTTATT
65 GAAAAAGCCAT-TCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATACCTTTGAAAGCCTTATT
** * *
10182 ACTTTCCTTAAATGGCTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
129 ACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
** * * * * *
10225 TGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAAATTATAATTGAATGTCTACCTCGGGAAACCTAAAG
1 TGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAACATGAAG
* * * * * ** *
10290 AAAAAGTCATTCATTGGCAAGTAAAGTCTATTTATAGTTATCCATACCTTCAAAAGCCTAATTAC
66 AAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATACCTTTGAAAGCCTTATTAC
* **
10355 TCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTAATTTTGGGT
131 TCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
* * * * ** * * ** ** *
10396 GGAATTCTTTTAAAGTTTTGGTTAAAACAGTTTATAATTGAATATCTA-CTCAAGAAATGTGAAA
1 TGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAACATGAAG
* * * * * * *
10460 AAAAACCCATTTATTGGTAAAAAAAG-CCTATTTATAGTTACCAACACCTTTGAAAGCCTTATTA
66 AAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCC-ATTTATAGTCACCCATACCTTTGAAAGCCTTATTA
* *
10524 CTCGATTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAGGT
130 CTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
* * * * * * *
10566 TTAATTTTTTTCCATTGTTCATTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAATATGAAA
1 TGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAACATGAAG
* * * * ** *
10631 AAAAAGCCATTCATTAGTAAGAAAAGTCCATTTATAGTCGCCCATGCCTTT-AATAATCTAATTA
66 AAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATACCTTTGAA-AGCCTTATTA
* *
10695 CTCGCTTTAAATGGGTTTATAATCTCATAATTGATTTTAGGT
130 CTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
** * * **
10737 TGAATTTTTAAAAATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACC-TCAGGAAATGTGAA
1 TGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGA-GAAACATGAA
* * * * * * *
10801 GACAAA-CTATTTATTGACAAGAAAAGACTATTTATAG-CAACCCAAACCTTTGAAAGCCTTATT
65 GAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTC-ACCCATACCTTTGAAAGCCTTATT
**
10864 A-TACGCTTTAAATTTTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
129 ACT-CGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
* * ** * * **
10907 TGGATTATTTTTATATTTTTGGTGAAAACAGATTATAATTGAATGT-TCACC-TCAGAAAACGGG
1 TGAATT-TTTTTACATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCT-ACCTTGAG-AAACATG
* * * * * * **
10970 AAGAAAGAGGC-TATCATTGGCAAAAAAAATCTATTTATAGTTACCTTTACCTTTGAAAGCCTTA
63 AAGAAAAAGCCAT-TCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATACCTTTGAAAGCCTTA
** * *
11034 TTACTATCTTTAAATGGCTTTATAATCACATAATTGATTTTAAGT
127 TTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
** * * * * * * **
11079 TGAATTTTTTTGTATTTTTGATTAAAATATATGATAATTGAATGTCTACCTAGAAAAATTTGAAG
1 TGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAACATGAAG
* * * ** * *
11144 AAAAAGCCATTCATTGGCAAGTAAAGTTCATTTATAGTTACCCATACCTTCAAAAACCTAATTAC
66 AAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATACCTTTGAAAGCCTTATTAC
* **
11209 TCGCTTGAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTGGGT
131 TCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
* * * ** * **
11250 AGAATTCTTTTA-AATTTTTAGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTCAATAAATGTGAA
1 TGAATTTTTTTACATTTTTTA-TTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAACATGAA
* * *
11314 GAAAAAGCCATTCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCA-CCACCACCTTTGAAAGCCTTATT
65 GAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCA-TACCTTTGAAAGCCTTATT
* * *
11378 ACTTGATTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAGGT
129 ACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
* * * * **
11421 TTAA-TTGTTTAGCATTTTTCATTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAATGTGAA
1 TGAATTTTTTTA-CATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAACATGAA
* * ** * *
11485 GAAAAAGCCATTCATTAGTAAGAAAAGTCCATTTATAGTCGTCCATGCCTTT-AATAGCCTAATT
65 GAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATACCTTTGAA-AGCCTTATT
** *
11549 ACTCGCTTTAAATTTTTTTATAACCTCATAATTGATTTTAAGT
129 ACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
* * * * * **
11592 TGAATTTTTTAAAATTTTTTGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTAAAAAATGTGAAG
1 TGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAACATGAAG
** * * *
11657 -AAAAGCCATTCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATA-ACAACACA-AGCCTTCGAAAGCCTTATT
66 AAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTC-ACCCATA-CCTTTGAAAGCCTTATT
11719 A-TACGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
129 ACT-CGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
** * * *
11762 TGAATTGTTTTTACATTTTTGGTGAAAATAGATTATAATTGAATGTCTACCTCGAGAAACATGAA
1 TGAATT-TTTTTACATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAACATGAA
* * * *
11827 GAAAAAGAC-TACCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCGCTCATACCTTTGAAAGCCTTATT
65 GAAAAAGCCAT-TCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATACCTTTGAAAGCCTTATT
*
11891 ACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
129 ACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
* ** * * * * * *
11934 TGAAATTTTTTACATTTTTGGTTAAAACTGATTATAATTGAATGTGTACTTTGAAAAACTTGACG
1 TGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAACATGAAG
* * * * * **
11999 AAAAAGTCATTCAATGGTAAGAAAAGTCCATTTATAATTATGCATACCTTTGAAAG-CTTAATTA
66 AAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATACCTTTGAAAGCCTT-ATTA
* *
12063 CTCGATTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATT-AGTTTT-AGAT
130 CTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGA-TTTTAAG-T
* * * * * ** *
12105 TGAATTTTTTTACATTTTTTATTAACATAAAGTATAATTGAATGTTTGTCTT-AGGAAACGTGAA
1 TGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGA-GAAACATGAA
* ** ** * * * *
12169 GAAAAAGGC-TATCATTTACAAGAAATTTCCATTTATTGTCACCTATATCTTTGATAGCCTTATT
65 GAAAAAGCCAT-TCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATACCTTTGAAAGCCTTATT
* *
12233 ACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATTTGATAATTGATTTTAAG-
129 ACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
* * * * * * *
12275 TCAACTTTTTTTACATTTTCTGTGAAAACAGATTATAGTTGAATGT-TGACCTTGAGAAACGTAA
1 TGAA-TTTTTTTACATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCT-ACCTTGAGAAACATGA
* * * * * *
12339 AGAAAAAGCCATTCATTAGCAAGAAAAGTCTATTTATAGTAATCTATGCCTTTGAAAGCCTTATT
64 AGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATACCTTTGAAAGCCTTATT
* *
12404 ACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTGATAATTGATTTTAACT
129 ACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
* * * * * * * *
12447 TTAATTTTTTT-CCTGTTTTGTTAAAACAGTTTATAATTGAAAGTCTACCTT-AGAAAACCTAAA
1 TGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGAG-AAACATGAA
** * * * ** * *
12510 GAAAAAGCCATTCATTAACATGTAAAGTCCATTTATAGGT-ACCCATGCCTTCAAAAGCGTAATT
65 GAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATA-GTCACCCATACCTTTGAAAGCCTTATT
12574 ACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
129 ACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
* * *
12617 TTAATATTTTTT--ATTTTTTATTAAAACAGATTAAAATTGAATGTCTGCCTTG-GAAAACATGA
1 TGAAT-TTTTTTACATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGAG-AAACATGA
* * * * * * * *
12679 AAAAAAAGTCATTGA-TGGACAAGAGAAGTCTATTTATAG-CAACCCA-AGACTTCGAAAGCCAT
64 AGAAAAAGCCATTCATTGG-CAAGAAAAGTCCATTTATAGTC-ACCCATA-CCTTTGAAAGCCTT
* **
12741 ATTACGCTTTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
126 ATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
* * * ************************************************
12787 TAAATTTTTTTATACTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
1 TGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAACATGAAG
*****************************************************************
12852 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
66 AAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATACCTTTGAAAGCCTTATTAC
*****************************************
12917 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
131 TCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
*****************************************************************
12958 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
1 TGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAACATGAAG
******************** ** * * * * ** *
13023 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGATTA-T-AATTGA-ATGTTTA-CCTTGGAAAATGTGAAGAAAAA
66 AAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATA-G-TCACCCAT---ACCT-T--TG--AAA
* * ** * * **
13084 GCCATTCATTGA-TAAG---AAAAGTCCATTTATAGTAA-CCCA-AGCCTTCGAAAACCTT-A-T
121 GCC-TT-ATT-ACT-CGCTTTAAA-T-GGTTT-TA-TAATCTCATA--ATT-G---ATTTTAAGT
** * * * * * * * *
13141 T-ACA-TGCTTTAAATGGTTTGATAATCTCATAACTGATTTTAGGTTGAATTTCTTTACATT-AT
1 TGA-ATTTTTTTACAT--TTT--TTAT-T-AAAACAGATTATA-ATTGAATGTC--TACCTTGA-
** * * * * * * * *
13203 TGATTAACACAAATTATAATTGAATGTC-TGCCTTGGAAAACCTAAAGAAAAAGGCTA-TCATTG
55 -GA--AACATGAA-GA-AA---AA-GCCATTCATTGG-----C--AAG-AAAAGTCCATTTATAG
*** * * * * * * * * * *
13266 -CAAGAAAAGTCTATTTATAG--TCACCTA-T-GCATTTGAAA-GCCTTATTGCTCAATTTAAAT
103 TCACCCATA-CCT-TTGAAAGCCTTA-TTACTCGC-TTT-AAATG-GTT-TT-AT-AATCT-CAT
* * *
13325 AGCTTTATAATCTTATAAT
158 A-ATTGAT--T-TTA-AGT
* * * * * *
13344 TGATTTTAAGTTGAATTGTTTTACATTTTTAATGAAAACGGATAATAATTGAATGTCTATCTT-A
1 TGA--AT--------TT-TTTTACATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGA
* ** * * * * *
13408 GCATATGTGAAGAAAGAGGC-TATCATTAGCAAGAAAAGTTCATTTATAGTCA-CCATGCCTTTG
55 G-AAACATGAAGAAAAAGCCAT-TCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATACCTTTG
* * * *
13471 AAAGCATTATTACTTGCTTTAAATGATTTTATAATCTGATAATTGATTTTAAGT
118 AAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
* * * *
13525 TGAATTTTTTTACATTTTTTGTTAAAACGGATTATAATTGAATGTCTACCTTGGGAAACCTGAAG
1 TGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAACATGAAG
* * * * * * *
13590 AAAAA-CTAATTCATTAGCAAGGAAAGTCCATTTATAGTTACCCATGCCTTCGAAAGCCTAATTA
66 AAAAAGC-CATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATACCTTTGAAAGCCTTATTA
* * * *
13654 CTCGCTTTTAATGGATTTATCATCTCATAATTGATTTCAAGT
130 CTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
** * * **
13696 TGAA-TTTTTTA-ATATTTTTAGCGAAAACATG-TTATAATTGAATGTTTAACTTGAGAAATGTG
1 TGAATTTTTTTACAT-TTTTTA-TTAAAACA-GATTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAACATG
* * * *
13758 ATGAAAAAGTCATTCATTGGCAAGAAAAATCCATTTCTAGTCACCCA-AGCCTTTTG-AAGCCTT
63 AAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATA-CC-TTTGAAAGCCTT
** *
13821 ATTACTCATTTTAAATGGTTTTATAATTTCATAATTGATTTT-AGAT
126 ATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAG-T
* * * * * * *
13867 TGAATTTGTTTACATTTTTTTTTGAAAACAAATTATAATTGATTGT-GAGCC-TCAGGAAACGTG
1 TGAATTTTTTTACATTTTTTATT-AAAACAGATTATAATTGAATGTCTA-CCTTGA-GAAACATG
* * * * * **
13930 AAGAAAAAGACATTCATTAGTAAGAAAAGTCTATTTTTAGTCACCCACGCCTTTGAAAGCCTTAT
63 AAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATACCTTTGAAAGCCTTAT
* *
13995 TAC-CTGCTCTAAATGGTTTTATAATCTGATAATTGATTTTAAGT
128 TACTC-GCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
* * * * * *
14039 TAAATTTTTTTACATTTTTTGTCAAAATAGATTAGAATTGAATGTCTACCTT-AGGAAACGTGAA
1 TGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGA-GAAACATGAA
* ** * * *
14103 TAAAAAGCCATTCATTGATAAGAAAAGTCTATTTATAGTCA-CCA-ACGCTTTTAAAAGCTTTAT
65 GAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATAC-C-TTTGAAAGCCTTAT
* **
14166 TACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATATGGTAATTGATTTTAAGT
128 TACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
* ** * * * *
14210 TGAAGTTTCATACATTTTTTATTAAAA-ATTATTATAATTGTATGTCTACCTCGAGAAACGTGAA
1 TGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAAACA-GATTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAACATGAA
* * * ** * ** * * ** *
14274 GAAAAAACCATTCATTGGTAAGTAAAGTTTACTTACGGTTACCCACACCTTCAAAAGCCTAATTA
65 GAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATACCTTTGAAAGCCTTATTA
*
14339 CTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTT-AGAT
130 CTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAG-T
* * ** * * * * *
14381 TGAGTTTTTTTATATTTTTGGTGAAAACACATTATTATTGAATGTCTGA-CTCGAGAAACGTGAA
1 TGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCT-ACCTTGAGAAACATGAA
* * * * *
14445 GAAAAAACCATTCATTGACAAGAAAAGTCTATTTCTAGTTA-CCA-AGCCTTTGAAAGCCTTATT
65 GAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATA-CCTTTGAAAGCCTTATT
* * *
14508 ACTCGCTTTAAATAGCTTTATAATCTCATAATTGATTTTAGGT
129 ACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
* * * * * * * * *
14551 TAAATGTTTTTATATTTTTTATAAAAATAAATTATAATTGATTGTCTGCCTCGAGAAACATGAAG
1 TGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAACATGAAG
* * * * * * *
14616 AAAAAGGCATTCATTGGTAAAAAAAATCCATTTATAGTCATCCATGCCTTTAAAAGCCTTATTAC
66 AAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATACCTTTGAAAGCCTTATTAC
* * *
14681 -CTGCTCTAAATAGTTTTATAATCTGATAATTGATTTTAAGT
131 TC-GCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
* * * * * * ** * **
14722 T-AGATTTTTTTACTTTTTTTGTTAAAATAAATTATAATTGAATGCCTACATCAAGAAACGTGGG
1 TGA-ATTTTTTTACATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAACATGAA
* * * * * * * *
14786 GAACAAGCTATTCATTGGTAAGAAAAGTCCATTCATTGTCA-CCA-ACGCTTTTAAAAGCATAAT
65 GAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATAC-C-TTTGAAAGCCTTAT
** *
14849 TACTCTTTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAGGT
128 TACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
* ** * * * **
14893 AGAATGCTTTTACATTTTTTATTAAAACAAATTATAATTGAATGTCTACCTTAAAAAATGTGAAG
1 TGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAACATGAAG
** * * * * * * * * *
14958 AAAAAGAAATTTATTAGTAAGAAAAGTCCATTTAGAGTCACCCGTGCCCTT-AAAGCATAATTAC
66 AAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATACCTTTGAAAGCCTTATTAC
* * *
15022 TCGCTTTAAATAGTTTTATAAACTCATAATTGATTTTAGGT
131 TCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
* * * * * * **
15063 TGAATTGTTTTATA-TTTTTAGTTAAAACAAATTATAATTAAATGTCTGCCTTGAAAAAGGTGAA
1 TGAATTTTTTTACATTTTTTA-TTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAACATGAA
* * * *
15127 -AAAAAGCCATTCATTAGTAAGAAAAGTTCATTTATAG-CAACCCA-AGCTTTCGAAAGCCTTAT
65 GAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTC-ACCCATACCTTT-GAAAGCCTTAT
* * *
15189 TACGT-GCATTAAATGGTTTGACAATCTCATAATTGATTTTAAGT
128 TAC-TCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
* ** ** * *
15233 TGAATGTTTTTACATTTTTGGTGCAAACAGATTATAATTGAATGTCTACC-TCAGGAAACGTGAA
1 TGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGA-GAAACATGAA
* * * * * * * * *
15297 GAACAAGGC-TATCACTGACAAGAAAATTCTATTTATAGTCACCCATGCCTTTAAAAGCCTAATT
65 GAAAAAGCCAT-TCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATACCTTTGAAAGCCTTATT
** *
15361 ACTTACTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTAATTTT-AGAT
129 ACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAG-T
* ** * * *
15404 TGAATTGTTTTACATTTTTGGTT-AAATAGATTATAATTGAATATCTACCTTG-GAAAATATGAA
1 TGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGAG-AAACATGAA
* * * **
15467 GAAAAAGCCATTCATTTGCAACAAAAGTCCATTTATAG-CAACCTCA-GCCTTCAAAAG-CTTAA
65 GAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTC-ACC-CATACCTTTGAAAGCCTT-A
* * * * * *
15529 TT-TTGCACTTTAAATAGTTTTATAGTCTTATAATTGATTTTAGGT
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* * * * *** *
15574 TGAATTTTTTTACATTTCTTATTAACACATATTAGAATTGAATGTCCGGCTT-AGGAGAA-GTGA
1 TGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGA-GA-AACATGA
* * * *
15637 AGAAAAAGGC-TATCATTTGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCGATGCCTTTGAAAGCCTTAT
64 AGAAAAAGCCAT-TCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATACCTTTGAAAGCCTTAT
* ** * * *
15701 TACTTGCAATAAATGGTTTTATAATTTGATAATTGATCTTCAA-T
128 TACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGAT-TTTAAGT
** * * * * *
15745 TGAATTTTTTTATGTTTTCTATTAAAATAGATTATAATTGAATGTCTACC-TCAG-GAGATGAGA
1 TGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAACATGA-A
* ** * * * * *
15808 GGAAAAAGCCATTCATTAGCAAGAAAAGTTTATTTATAGCCGCCCATGCCTTCGAAAGCTTTATT
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** *
15873 AAACGCTTTAAATGGTTTTATAAGCTCATAATTGATTTT-AGT
129 ACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
* * * * ** * *
15915 TGAATTTTTTTACATTTTCTGTTAAAACATATTATAATTGAATATCTACCTCAAGAGACGTGAAG
1 TGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAACATGAAG
* * * * * *
15980 AAAAAGGCATTCGTTGGCAAGAAAAGTCTATTTATATTCACCCATGCCTTTGAAGGCCTTATTAC
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* * **
16045 TCGCTTTAAATGATTTTATAATCTCTTAATCAATTTTAAGT
131 TCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
* * * * * * * *
16086 TTAATATTTTTT-CTTTTTTTGTTAAAACAAATTATAATTGAATGTCTGCTTTGGGAAACCTGAA
1 TGAAT-TTTTTTACATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAACATGAA
* * ** ** * * * * **
16150 GAAAAAGTCATTTATTATCAAGTGAAGTCCATTTATACTTATCCATGCCTTCAAAAGCC-TATTT
65 GAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATACCTTTGAAAGCCTTA-TT
* * **
16214 ACTCACTTTAAATGGTTTTATTATCTCATAATTGATTTTACCT
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* * * * * *
16257 TGAATGTTTGTACAATTTTTATTAAAACAGATTAAAATTCAATGTCTACCTTG-GAAAACGTGAA
1 TGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGAG-AAACATGAA
* * * * * *
16321 AAAAAAGCCATTGATTGGCAAG-TAAGTCCATTTCTAGTTACCCA-AGCC-TTGAAAGCCTTTTT
65 GAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATA-CCTTTGAAAGCCTTATT
* * * * *
16383 ACTCGTTTTGAATAGTTTTATAATCTCGTAATTGATTTTAGGT
129 ACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
* * ** * * *
16426 TGAATGTTTTTAAATTTTTGGTAAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTAGAGAAACATGGAG
1 TGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAACATGAAG
** * * *
16491 AAAAAGAGATTCATTGGTAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACGCATACCTTTGAAAGCCTTATTAC
66 AAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATACCTTTGAAAGCCTTATTAC
* *
16556 TCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTGATAATTGACTTTAAGT
131 TCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
* * * * * * * *
16597 TCAATTTTTTTACATATTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATATTTACCTAGAAAAACGTGAAT
1 TGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAACATGAAG
* * * * * * *
16662 AAAAAGTCATTCATTGACAAAAAAAGTCAATTTATAGTCATCCATACCATTAAAAGCCTTATTAC
66 AAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATACCTTTGAAAGCCTTATTAC
*
16727 TCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAGGT
131 TCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
* * * *
16768 TGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAAACAGATTAGAATTGAATGTTTGCCTCGAGAAACAT-AAG
1 TGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAACATGAA-
* * * *
16832 GAAAAAGGCATTCATTGACAAGAAAAGTCTATCTATAGTCACC
65 GAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACC
16875 AAGCCTTTGA
Statistics
Matches: 12176, Mismatches: 2786, Indels: 1174
0.75 0.17 0.07
Matches are distributed among these distances:
160 5 0.00
161 7 0.00
162 3 0.00
163 3 0.00
164 12 0.00
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167 25 0.00
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181 12 0.00
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185 11 0.00
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200 5 0.00
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ACGTcount: A:0.35, C:0.13, G:0.13, T:0.37
Consensus pattern (171 bp):
TGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAACATGAAG
AAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATACCTTTGAAAGCCTTATTAC
TCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT
Found at i:2213 original size:512 final size:510
Alignment explanation
Indices: 1230--16885 Score: 9241
Period size: 512 Copynumber: 30.4 Consensus size: 510
1220 AAGAAGGCTA
* * *
1230 TCATTGGCAAGAAGAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCACTTTAAA
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* * ** * *
1295 TGGTTTTATAATTTGATAATTGATTTTAAGTACAATTTTTTTACATTTTTTA-TTCAAATAGATT
66 TGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACA-TTTTTAGTTAAAACAGATT
* * * * * * *
1359 ATAATTGAATGTTTACCTTTAGAAACATTAAGAAAAAGGCATTCATTAGCAAGAAAAGTCCATTT
130 ATAATTGAATGTCTACCTTAAGAAACGTGAAGAAAAAGCCATTCATTGGTAAGAAAAGTCCATTT
* * * * * * * *
1424 ATAGCCACCCATA-TCGTTAAAAACCTTGTTACTTGATTTAAATGGTTTTATAATCTGATAATTG
195 ATAG-CACCCA-AGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTG
* ** *
1488 ATTTTAAGTTGAATTTTTTATATTTTTTA-TTAAAATGGATTATAATTGAATGTCTACCTTCGGA
258 ATTTTAAGTTGAATTTTTTACA-TTTTTAGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGA
* * * * * * ** *
1552 AACGTGAATAAAAAACCATTTATTGGCAACAAAAGTCCATTTATAGTCACCAACACTTTTGAAAG
322 AACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTTGAAAG
* * * *
1617 CCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAGATAGAATGTGTTTACAT
387 CCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAGGTTGAAT-TTTTTACA-
* * *
1682 TTTTTA-TTAAAATAAATTATAATTGCATGTCTACCTTGGAAAAAGTGAAGAAAAAGCCAT
450 TTTTTAGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGGAAAAAGTGAAGAAAAAGCCAT
* * * * * * * *
1742 TTATTAGCAAGAAAAATCCATTTATAGTTACTCATGCCCTTAAAAGCCTAATTACTCGCTTTAAA
1 TCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAA
* * * *
1807 TGGCTTTATAATCTCAT-ATTGATTTTAGGTTGAATTGTTTTACATTTTTAGTTAAAATAGATTA
66 TGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTAGTTAAAACAGATTA
* * * * ** * *
1871 TAATTGAATGTTTACCTCAAAAAAGGTGAAGAAAAAGCCATTCATTGACAAAAAAAGTCCATATA
131 TAATTGAATGTCTACCTTAAGAAACGTGAAGAAAAAGCCATTCATTGGTAAGAAAAGTCCATTTA
* * *
1936 TAGCAACCCAAGCCTTTAAAAGCCTTATAACGCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGAT
196 TAGC-ACCCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGAT
* * *
2001 TTTAAGTTGAATGTTTTTACATTTTTAGTGAAAATAGATTATAATTGAATGTCTGCCTTAGGAAA
260 TTTAAGTTGAAT-TTTTTACATTTTTAGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAA
* *
2066 CATGAAGAAAAAGAC-TATCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTTAAAAGC
324 CATGAAGAAAAAGCCAT-TCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTTGAAAGC
* * *
2130 CTAATTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAGGTTGAGTTATTTTACATT
388 CTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAGGTTGAATT-TTTTACATT
* * *
2195 TTTAGTTAAAACAAATTATAATTGAATGTCTACCTT-GAAAAATATGAAGAAAAAGTCAT
452 TTTAGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGGAAAAA-GTGAAGAAAAAGCCAT
* * * * ** * * ** *
2254 TCATTTGTAAGAAAAGTCTATTTATAG-CAACCCAAGCCTTCAAAAGACATATTAAGCACTTTAA
1 TCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTC-ACCCATGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAA
** * * * *
2318 ATATTTTTATAATCTTATAATTGATTTT-A--TGAATTTTTTTGCATCTTT-GATTAACACAGAT
65 ATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTAG-TTAAAACAGAT
* *** * * ** * *
2379 TAGAATTGAATGT-TCACCTCGGGAAAAGTAAAGAAAAATGTTA-TCATTGGTAAGAAGAGTCAA
129 TATAATTGAATGTCT-ACCTTAAGAAACGTGAAGAAAAA-GCCATTCATTGGTAAGAAAAGTCCA
* *
2442 TTTATAGTCACCCATGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTGATAAT
192 TTTATAG-CACCCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAAT
* * * * *
2507 TGATTTTAAGTTGAATTTTTTTATATTTTCTA-TTCAAATAGACTATAATTGAATGTTTACCTTT
256 TGATTTTAAGTTGAA-TTTTTTACATTTT-TAGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACC-TT
* * * * * *
2571 A-GAAACATGAAGAAAAAGGCATTCATTGGCTAGAAAAGTCCATTTATAGCCACCTATACCTTCG
318 AGGAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTTG
* * * *
2635 GAAGCCTTGTTACTCGATTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTTA-GTTGAATATTTT
383 AAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGA-TTTTAGGTTGAAT-TTTT
* * **
2699 TACATTTTCTA-TTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCAT-GAGAAACGTGAAGAAAAAGGT
446 TACATTTT-TAGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGGA-AAAAGTGAAGAAAAAGCC
2762 AT
509 AT
* * * *
2764 TCGTTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTAGAAGGTCTTATTACTCGCTTTAAA
1 TCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAA
* * * * * * *
2829 TAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTTAATATTTTT-CTTTTTTTGTTAAAATAAATTA
66 TGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTAGTTAAAACAGATTA
* * * ** * * * *
2893 TAATTAAATATCTACCCTGGGAAACCTAAAGAAAAAGCCATTCATTGGTAAGTAAAGTGCATTTA
131 TAATTGAATGTCTACCTTAAGAAACGTGAAGAAAAAGCCATTCATTGGTAAGAAAAGTCCATTTA
* * ** * * *
2958 TAGTTACCCATGCCTTCAAAAGCACAT-TTACTCGCTTTAAATGGTTTTATTATCTTATAATTGA
196 TAG-CACCCAAGCCTTTGAAAGC-CTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGA
* * * * * * * *
3022 TTTTAGGTTCAATGTTTGTGCATTTTTGGTTAAAACAGATTAAAATTGAATATTTACCTT-GGAA
259 TTTTAAGTTGAAT-TTTTTACATTTTTAGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTAGG-A
* * * * * * *
3086 AACGTGAA-AGAAAAGCCATTGATTGGCAAGTAAAGTCAATTTCTAGTCACACAAGCCTTTGAAA
322 AACATGAAGA-AAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTTGAAA
* * * * *
3150 GCCTTATTACTCGCTTTGAATAGTTTTATAATCTCATAATT-ATTTTTAAGCTGAATGTTTTTAA
386 GCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGA-TTTTAGGTTGAAT-TTTTTAC
* * * * * *
3214 ATTTTT-GATGAAAACAGATTATAATTGAATGTTTGCCTAGAGAAACA-T-AGAGAAAAAAG-AA
449 ATTTTTAG-TTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTG-GAAAAAGTGA-AG-AAAAAGCCA
3275 T
510 T
*
3276 TCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTTCAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAA
1 TCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAA
* * *
3341 TGGTTTTATAATCTGATAATTGATTTTAAGTTTAATTTTTTTACATTTTTTGTTAAAACAGATTA
66 TGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTAGTTAAAACAGATTA
* * * *
3406 TAATTAAATGTCTACCTAAAGAAATGTGAATG-AAAAGCCATTCATGGGTAAGAAAAGTCCATTT
131 TAATTGAATGTCTACCTTAAGAAACGTGAA-GAAAAAGCCATTCATTGGTAAGAAAAGTCCATTT
* * *
3470 ATAGTCACCCATGCCTTTGAAAGTCTTATTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGA
195 ATAG-CACCCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGA
* * * * * *
3535 TTTTAGGTTAAATTTTTTTATATTTTTTA-TTAAAACAGATTATAATTGAATGTTTGCC-TCGAG
259 TTTTAAGTTGAA-TTTTTTACA-TTTTTAGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTAG-G
* ** * ** * * *
3598 AAACGTGAAGAAAAAGGTATTTATTAACAATAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATACCTTTGTAA
321 AAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTTGAAA
* * * * * * * *
3663 GCCTTATTACGCACTTTAAAT-G-ATTA-AA----A-CA--GATTATA-ATTCAA---TGT-C-T
386 GCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAGGTTGAATTTTTTACAT
** * ** * ** ** * * ** * * * *** * ** *
3712 TCCTCG-GGAAACTTGAGGA-AAAAGCCAT-TCAATGTTAG-AAAATTTACATTTATAGTTAC
451 TTTTAGTTAAAAC-AGATTATAATTG-AATGTCTACCTTGGAAAAAGTGA-AGAAAAAGCCAT
* * ** * * *** * * * *
3771 GCA-TGCCTTTG-AAAG--C--TTA-A-TTACCC--G-GTTT-AAAAAATTTTATAATCTC-ATA
1 TCATTGGC-AAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTTGAAAGCCTTAT-TACTCGCTTTA
* * ** * ** * * * * *
3823 ATTGATTTTA-GGT-TGAGTTTTTGTACATTTTTAGTTAAAACAAATTATAATTGA-ATGTTT-G
64 AATGGTTTTATAATCTCA-TAATTG---ATTTTAAGTT-----GAATT-T-TTTTACATTTTTAG
* * * * * * *
3884 CCTTAGGAAAC-G--TA-AAGTAAAAGCCATTCATT--G----GT-AAG-AAAAGTC--T-ATT-
118 --TTA--AAACAGATTATAATTGAATGTC-TACCTTAAGAAACGTGAAGAAAAAGCCATTCATTG
* * * *
3933 -T------A-T--A-GT-T---ACCCAA-ACTTTCAAAAGCCTAATTACTCGCTTTAAATGGTTT
178 GTAAGAAAAGTCCATTTATAGCACCCAAGCCTTT-GAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTT
* * *
3982 TATAATCTCATAATTGATTTTAGGTAGAATTTTTTTACATTTTTCA-TTAAAACAAATTATAATT
242 TATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAA-TTTTTTACATTTTT-AGTTAAAACAGATTATAATT
* * ******** * * ** *
4046 GAATGTCTGCCTTAGGAAACGTGAATTTTTTTACATTTTTCATT---AAAACAAATTATAATTGA
305 GAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGAAAAAGCCA---TTCATTGGCAAGA-AAAGT-CCATTTA
* * * * ** *** * * * *** * * *
4108 -ATGTCTGCCTTAGGAAACGTGAAGAAAAAATGATTTATTGGCAAGAAAAGTTTATTTATATTGA
365 TA-GTC-ACC-CATG---CCT-TTGAAAGCCTTA-TTACTCGCTTTAAATG-GT-TTTATAAT--
* * ** *
4172 CCCA-AGTCTTCGAAAGCCTTTTTACTTGCCGTAGTTGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAG
418 CTCATA--ATT-G--A----TTTTA------G--GTTGAATTT-T--T-T-A-CA-T--TTTTA-
* ** * *** **
4236 GTT-GAATTG-TTTTACATTTTTTGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTAGCTCATGAAACGT
456 GTTAAAACAGATTATA-ATTGAATG-T----C----TA-CCTTG---G---A----A--AAA-GT
4299 GAAGAAAAAGCCAT
497 GAAGAAAAAGCCAT
* ** * * * *
4313 TCATTAGTGAGAAAGGTCCATTTATAGTCTCCAATGCCTTTAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAA
1 TCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAA
* * * * *
4378 TGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAGGTTGAATGTTTTTATATTTTTGGTTAAAATAGATTA
66 TGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTAGTTAAAACAGATTA
* * * * * *
4443 TAATTGGATGTCCACCTTGAGAAACCT-AACG-AAAAGTCCATTCAATGGTAAGAAAAGTCTATT
131 TAATTGAATGTCTACCTTAAGAAACGTGAA-GAAAAAG-CCATTCATTGGTAAGAAAAGTCCATT
* ** * * * ** ** * *
4506 TATAGTTACGTATGTCATCAAAAG-CTTAATTTTTTGGTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATT
194 TATAG-CACCCAAGCCTTTGAAAGCCTT-ATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATT
* * * * * * * *
4570 AATTTTAGGTTGAATTTTGTACATTTTTGGTTAAAACAGATTATAGTTGAATATTTACCTCAGGA
257 GATTTTAAGTTGAATTTTTTACATTTTTAGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGA
* * * * ** * * * *
4635 AACGTAAAGTAAAAGCCATTTATTGATACA-AAAAGTCTATTTATACTTACCCACGCCTTT-AGA
322 AACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCA-AGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTTGA-A
* * * *
4698 AGCCTAATTACTAGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTAATTTTAAGTTGAATTTGTTTAC
385 AGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAGGTTGAATTT-TTTAC
* * * * **
4763 ATTTTTTTA-TTAAAACAGATTATAATT-AATTGTCTGCC-T-CAAGAAATGTAAAAAAAAAAAT
449 A--TTTTTAGTTAAAACAGATTATAATTGAA-TGTCTACCTTGGAA-AAA-GT-GAAGAAAAAGC
4824 CAT
508 CAT
* * * * ** * *
4827 TCATTAGCAAGAAAAGTACATTTATA-TGAACCCAAGTGTTCGAAAGCCTAATTACTCGCTTTAA
1 TCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGT-CACCCATGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAA
* * * * *
4891 ATGGTTTTATAATCTTATAATTGATTTT-AGATTGAAGTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAAAA
65 ATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAG-TTGAATTTTTTTACATTTTTAGTTAAAACAGAT
* * * * *
4955 TATAATTGAATGTCTATCTCAAGAAACGTAAAGAAAAAGTCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATT
129 TATAATTGAATGTCTACCTTAAGAAACGTGAAGAAAAAGCCATTCATTGGTAAGAAAAGTCCATT
* * ** * * ** *
5020 TAT-CCTTACCCATGCCTTCAAAAGCCTAATTACTCACTTTAAATAATTTTATACTGC-CATAAT
194 TATAGC--ACCCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAAT-CTCATAAT
* * * * * *
5083 TGATTTTAGGTTGAATTTTTTTACATTTCTCA-CTAAAATAGATTATAATTGAATGTCTGCCAT-
256 TGATTTTAAGTTGAA-TTTTTTACATTT-TTAGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTA
* * * * *
5146 GGAAAACATGAA-ATAAAAGCCATTCATTGGTAAGAAATGTCCATTTATAATCACCTATGGCTTT
319 GG-AAACATGAAGA-AAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTT
* ** * *
5210 GAAAGCCTAATTACTTACTTTAAGTGGTTTTATAATC-CAATAATTGATTTCAGGTTGAATTGTT
382 GAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTC-ATAATTGATTTTAGGTTGAATT-TT
* * * ** * * *
5274 TTACATTTTTTGTTAAAACAGATTATACTTGAATGTCTACGTCAAGAAACA-TGAAAAAAAACCC
445 TTACATTTTTAGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCT-TGGAAAAAGTGAAGAAAAAGCC
*
5338 AC
509 AT
* * ** **
5340 TCATT-GAAGAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCC-TAACCTTCAAAAGCCTTATTACTCGAATTA
1 TCATTGGCA-AGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCAT-GCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTA
* * * * * *
5403 AATAGTTTTATAAGCTCATAATTGGTTTT-AGCTTGAGTTTCTTTATC-TTTTTA-TTAAAAAAG
64 AATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAG-TTGAATTTTTTTA-CATTTTTAGTTAAAACAG
* * * * *
5465 ATTATAATTGAATGTCTACTTTGAGAAACGTGAAGAAAAAGTCAGTCATTGGTAAAAAAAGTCCA
127 ATTATAATTGAATGTCTACCTTAAGAAACGTGAAGAAAAAGCCATTCATTGGTAAGAAAAGTCCA
* ** *
5530 TTTATAGTCACCTATA-CCTTTGAAAGCCTTA-TACTCGCTTTAAATATTTTTATAATCTCCTAA
192 TTTATAG-CACCCA-AGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAA
* * * *
5593 TTGATTTTATGTTGAATTTTTTTTACATTTTTGAG-TAAAATAGATTGTAATTGAATCTCTA-CT
255 TTGATTTTAAGTTGAA--TTTTTTACATTTTT-AGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCT
* * ** * *
5656 ATGGGAAACATGAAGAGAAA-CTTGTTCATTGACAAAAAAAAG--CATTTATAGTCACCCATGCC
317 -TAGGAAACATGAAGAAAAAGC-CATTCATTGGC-AAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATGCC
* * *
5718 TTTGAAAGCCTAATTGCTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAGGTTGAATTT
379 TTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAGGTTGAATTT
* *
5783 TTTACATTTTTAGTTAAAAC-GCATTATAATTGAATGGT-TACCTTGGTAAATGTGAAGAAAAAG
444 TTTACATTTTTAGTTAAAACAG-ATTATAATTGAAT-GTCTACCTTGGAAAAAGTGAAGAAAAAG
*
5846 TCAT
507 CCAT
* ** * ** *
5850 TCA-T-G-AGAGAAAAAGTTCATTTATAGTCACTGAAGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCACTTTA
1 TCATTGGCA-AG-AAAAGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTA
* * * * *
5912 AATGGTTTTATAATCTCCTAATTGATTTTAAGTTGAATATTTCTACATTTTTGGTGAAAACAGAT
64 AATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTAGTTAAAACAGAT
* * * * * * * * * *
5977 TCTAATTGAATAT-T-CGCATT-GGTAAACATGAAGAAAAAGGC-TAACACTAGCAAGAAAACTC
129 TATAATTGAATGTCTAC-C-TTAAG-AAACGTGAAGAAAAAGCCAT-TCATTGGTAAGAAAAGTC
* * * * * *
6038 TATTTATAGTCACTCATGCCTTTGACAGCCTTATTACTCGCTTT-AATGATTTTTTAATCTCATA
190 CATTTATAG-CACCCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATA
* * * * * * *
6102 ATTAATTTTAAATTAAATATTTTTACATTTTTAG-TAAAACAGAATATAATTAAATGTCCACCTC
254 ATTGATTTTAAGTTGAAT-TTTTTACATTTTTAGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTT
* * * * * * * *
6166 AGGAAACCTAAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAACTAAAA-TCCATTTATTGTTACTCATACCTTC
318 AGGAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAA-GAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTT
* * * * *
6230 AAAAGCCTAATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAACCTCATAATTGATTTTAGGTTTAATTTTTT
382 GAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAGGTTGAA-TTTTT
* * * * *
6295 TATATTTTT-GATTAAAATAGATTATAATTGAATGTCTGCCTCAT-G-AAATGTGAGGAAAAA-C
446 TACATTTTTAG-TTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCT--TGGAAAAAGTGAAGAAAAAGC
*
6356 TAT
508 CAT
* * * * * * * *
6359 TCATTGGTAAAAAAAATCCATTTCTAGTCACCCAAGCTTTTGAAAGCCATATTACTCTCTTTAAA
1 TCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAA
* * * * * *
6424 TGGTTTTATAATCTCATAA-TCAATTTAAGGTTAAATGTTTTTACATTTTTGGTTAAGACA-ATT
66 TGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAA-GTTGAATTTTTTTACATTTTTAGTTAAAACAGA-T
* * * * * * *
6487 TATAATTGAATATATACCTTGAGAAACGTGAAAAAAAAGCTATTCATTGATGAGAAAAGTCCATT
129 TATAATTGAATGTCTACCTTAAGAAACGTGAAGAAAAAGCCATTCATTGGTAAGAAAAGTCCATT
* * * * * * *
6552 TATGGCCACCCAAACCTTCGAAAGCCTTATTATTCACTTTAAATAGTTTTATAATCTTATAATTG
194 TATAG-CACCCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTG
* * * * * * *
6617 ATTTTAGGTTGAGTTTTCTCACATTTTTTGTTAAAGCAGATTATAATTGAATATTTACCTT-GAG
258 ATTTTAAGTTGAATTTT-TTACATTTTTAGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTAG-G
* * * * *
6681 AAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTCTG-AAGAAAAGTTCATTTATAGCCACCAAAGCCTTTGAA
321 AAACATGAAGAAAAAGCCATTCATT-GGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTTGAA
* * * * * *
6745 AGCCTTATTGCTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCTTATAATTGATTTTAGATTGAGTTTTTCACA
385 AGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAGGTTGAATTTTTTACA
* * * ** * * *
6810 TTTTTTA-TTAAAACATATTATAATTGTATCTCTGTCTTGGGAAACA-TGAAGAGAAAGCCTT
450 -TTTTTAGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTT-GGAAAAAGTGAAGAAAAAGCCAT
* * * * * *
6871 TCAATGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCGCCTACGGCTTTGGAAG-CTTGATTACTCGCTTTAA
1 TCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTTGAAAGCCTT-ATTACTCGCTTTAA
* * * * * *
6935 ACGGTTTTAAAATCTCATAATTGATTTAAAGTTGATTTTTTTTACATTTTTAATGAAAACAGATT
65 ATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTAGTTAAAACAGATT
* * * * * *
7000 ATAATTGAATGTCTGCATTAGGAAATGTGAAGAAAAAGGC-TATCATTGGCAAGAAAAGTCCATT
130 ATAATTGAATGTCTACCTTAAGAAACGTGAAGAAAAAGCCAT-TCATTGGTAAGAAAAGTCCATT
* * * *
7064 TATAGTCACCCATGCCTTTGAAAGTCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTCATAATCTCATAATTG
194 TATAG-CACCCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTG
* * *
7129 GTTTTCAGTTGAATTTATTTACCATTTTT-GTTAAAACAAATTATAATTGAATGTCTACCTCTA-
258 ATTTTAAGTTGAATTT-TTTA-CATTTTTAGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCT-TAG
* * * ** *
7192 GAAACTTGAAGAAAAAGTCATTCATTGGCAAGTAAAGTCCATTTATAGTTGCCCATGCCTTTAAA
320 GAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTTGAA
* * * * *
7257 AACCTAATTACTCACTTTAAATGGTTTTCTAATCTCATAATTGATTTTACGTTGAATATTTTTAC
385 AGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAGGTTGAAT-TTTTTAC
* * * * *
7322 ATTTTTAGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTGTGCCTTGAGAAACA-TCAAGAAAGGAG--AT
449 ATTTTTAGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTG-GAAAAAGTGAAGAAA-AAGCCAT
* * * * ** **
7383 TCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTTACCAACACCTTTGAAAGCCTTATCGCTCGCTTTAAA
1 TCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAA
* * * * ** *
7448 TAGTTTTGTAAGCTCATTATTGATTTT-AGTTTGAATAGTTTTACATGTTTT-GTTAAAATAGAT
66 TGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAG-TTGAATTTTTTTACAT-TTTTAGTTAAAACAGAT
* * * * * *
7511 TATAATTGAATGTCTACCTCACAAAAAGGTGAAGAAAAAGCCATTTATTAGTAAGAAAAGTCTAT
129 TATAATTGAATGTCTACCTTA-AGAAACGTGAAGAAAAAGCCATTCATTGGTAAGAAAAGTCCAT
* * * *
7576 TTATAGTCACCCAAGCTTTTAAAAGCCTAATTACTCGCTTTAAATGATTTTATAATCTCATAATT
193 TTATAG-CACCCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATT
* * * * *
7641 GATTTTAGGTTGAATTTTTTAAAATTTTTAGTTAAAACAAATTATAACTGAATTTCTACCTT--G
257 GATTTTAAGTTGAATTTTTT-ACATTTTTAGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTAGG
* * * * *
7704 AAAAATGTGAA-AAAAAGCCATTCATTGACAAGAAAAGTCCATATATAG-CAACCCAAGCCTTCG
321 AAACA--TGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTC-ACCCATGCCTTTG
** * * *
7767 AAAGCCTTATTAGACGATTTAAATGGTTATAGAATCTCATAATTGATTTTAGGTTGAATTGTTTT
383 AAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAGGTTGAA-T-TTTT
* * * * * * *
7832 TATATTTTTGGTGAAAATAAATTATAATTGAATGTCTACCTTGTGAAACA-TGAAGAAAAAGGC-
446 TACATTTTTAGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTG-GAAAAAGTGAAGAAAAAGCCA
7895 T
510 T
* *
7896 ATCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATGTCTTTGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAA
1 -TCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAA
* * * * * * *
7961 CTGGCTTCATAATCTCATAATTGATTTTAATTTGAATTTTTATACCA-TTTTGGTTAAAAAAGAT
65 ATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTA-CATTTTTAGTTAAAACAGAT
* * * * ** * * *
8025 TATAATTAAATGTCTACATCAGGAAATAT-AAGTAAAAGCCATTTATTGATTAA-AAAAGTCCAT
129 TATAATTGAATGTCTACCTTAAGAAACGTGAAGAAAAAGCCATTCATTG-GTAAGAAAAGTCCAT
* * * * * * *
8088 TTATA-CTTTCCCATA-CCTCTAAAAGCCTAATTATTCACCTTAAATGGTTTTATAATCTCATAA
193 TTATAGC--ACCCA-AGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAA
* * * *
8151 TTGATTTTAAGTTGAATTTGTTTACATTTTT-GTTAAAACAGTTTATAATTAAATGTATACCTCA
255 TTGATTTTAAGTTGAATTT-TTTACATTTTTAGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTA
* * * * * * * * **
8215 AGAAACCTAAAGAAAAAGCCATTCATTAGCAAGTAAAGTCTATTTATAGTTACCCATACCTTCAA
319 GGAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTTGA
* * * *
8280 AAGCCTAATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTGGGTAGAATTTTTTTA
384 AAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAGGTTGAA-TTTTTTA
* * * *
8345 AATTTTTGGTTAAAACAAATTATAATTGAATGTCTACC-T-CAAGAAATGTGAAGAAAAAGCCAT
448 CATTTTTAGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGGAA-AAA-GTGAAGAAAAAGCCAT
* * * * * *
8408 TCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCAACGCCTTTGAAAGACTTATTACACGATTTAAA
1 TCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAA
* * * * * *
8473 TGGTTTTATAATCTCATAACTGATTTTAGGTTTAATGTTTTTGCATTTTTCA-TTAAAACAAATT
66 TGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTT-AGTTAAAACAGATT
* ** * ** *
8537 ATAATTGAATCTCTACCTCGAGAAATGTGAAGAAAAAGCCATTCATTAATAAGCAAAGTCCATTT
130 ATAATTGAATGTCTACCTTAAGAAACGTGAAGAAAAAGCCATTCATTGGTAAGAAAAGTCCATTT
* * * *
8602 ATTGTCACCCATGCCTTT-AATAGCCTAATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATGTCATAATTG
195 ATAG-CACCCAAGCCTTTGAA-AGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTG
* * * * *
8666 ATTTTAGGTTGAATTTTTTAAAATGTTTT-GTTAAAACAAATTATAATTGAAAGTCTACATT-GA
258 ATTTTAAGTTGAATTTTTT-ACAT-TTTTAGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTAG-
* * *
8729 GAAATATGAAG-AAAAGCCATTCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAG-CAACCCAAGCCTTCT-
320 GAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTC-ACCCATGCCTT-TG
* * *
8791 AAAGCCTTATTA-TACGCTTTAAATGGTTTTATAATGTCATAATTGATTTTAAGCTGAATTATTT
383 AAAGCCTTATTACT-CGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAGGTTGAA-T-TTT
* * ** * * **
8855 TTACATTTTTGGTGAAAACAGATTATAATTGAATGTCTATATCGGGAAACA-TGAAGAAAAATAC
445 TTACATTTTTAGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCT-TGGAAAAAGTGAAGAAAAAGCC
8919 -T
509 AT
* * * ** *
8920 ATCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAATCACCCATACCTTTAAAAGTTTTATTACTCTCTTTAA
1 -TCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAA
* * * * *
8985 ATGGTTTTAAAATCTCATAATTGTTTTTAAGTTGATTTTTTTTTGCATTTTTTTGATTAAAACAG
65 ATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGA-ATTTTTTTACA-TTTTTAG-TTAAAACAG
* * * * *
9050 ATTATAATTGAATGCCTACC-TCAGAAAACTTGAGGAAAAAGCCATTCAATGGTAAGAAAAGTCC
127 ATTATAATTGAATGTCTACCTTAAG-AAACGTGAAGAAAAAGCCATTCATTGGTAAGAAAAGTCC
* * * * * * *
9114 GTTTATAGTTACGCATA-CCATCGAAAG-CTTAATTACTCGATTTAAATGGTTTTACAAT-TCCA
191 ATTTATAG-CACCCA-AGCCTTTGAAAGCCTT-ATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCT-CA
** * * * *
9176 TAATTGATTTTGGGTTGAATTTTTGTACATTTTTTTA-TTAAAATAGATCATAATTAAATATCTA
252 TAATTGATTTTAAGTTGAATTTTT-TACA--TTTTTAGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTA
* * * ** ** *
9240 CCTTAGGAAACATAAAGTAAAAGCCATTTATTGGTGAGAAAAGTCCATTTATTAGCTTTCTCAAT
314 CCTTAGGAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTA-TAG-TCAC-CCAT
*** * **
9305 GCCTCCACAAAAGCCTAAATTACTCCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAAT
376 GCCT--TTGAAAGCCT-TATTACT-CGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAGGT
* * * *
9370 TGAATTTGTTTACATTGTTTA-TTAAAACAGATTATAATTAAATGTCTACCATGG-GAAACTGGA
437 TGAATTT-TTTACATT-TTTAGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGGAAAAAGT-GA
*
9433 AAAAAAAGCCAT
499 AGAAAAAGCCAT
* * * * ** ** *
9445 TCATTGGCAAGTAAAGTCCATTTATAGTTACCTATACCTTCAAAAGCCAAATTACTCGCTCTAAA
1 TCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAA
* * ** * * *
9510 TGATTTTATAATCTTATAATTGATTTTGGGTAGAATTTTTTTAAAATTTTT-GATTAAAACAGCT
66 TGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTT-ACATTTTTAG-TTAAAACAGAT
* * *
9574 TATAATTGAATGTCTGCCTTAAGAAATGTGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATT
129 TATAATTGAATGTCTACCTTAAGAAACGTGAAGAAAAAGCCATTCATTGGTAAGAAAAGTCCATT
* *
9639 TATAGTCA-CCAACGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGATTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATT
194 TATAG-CACCCAA-GCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATT
* * * * * * *
9703 GATTTTAGGTTTAATTGTTTTATATTTTTCA-TGAAAATAGATTATAATTGAATGTCTACCTCAA
257 GATTTTAAGTTGAATT-TTTTACATTTTT-AGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTAG
** * * * * *
9767 GAAATGTGAA-AAAAAGCCATTGATTAGTAAGAAAAGTCCATTTATAGTCGCTCATGCCTTT-AA
320 GAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTTGAA
* * *
9830 TAGCCTAATTACTCGCTTTAAATGGGTTTATAATCTCATAATTGATTTTAGGCTGAATTTTTTAA
385 -AGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAGGTTGAATTTTTT-A
* * * * *
9895 AATTTTTTA-TTAAAACAAATTATAATTGAATGTCTATCTTGGGAAATA-TAAAG-AAAAGCCAT
448 CA-TTTTTAGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTT-GGAAAAAGTGAAGAAAAAGCCAT
** * * ** * *
9957 TCATTGATAAGAAAGGAT-CATTTCTAG-CAACCCAAACCTTTGAAAGCGTTCTTA-TACGCTTT
1 TCATTGGCAAGAAAAG-TCCATTTATAGTC-ACCCATGCCTTTGAAAGCCTTATTACT-CGCTTT
* * * *
10019 AAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAACTTGAATTGTTTTTACATTTTTGGTGAAAACAG
63 AAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATT-TTTTTACATTTTTAGTTAAAACAG
* * * * ** * *
10084 ATTATAATTGAATGTCTACCATGAGAAACATGAAGAAAGAG-GTTATCATTGGCAAGAACAGTCC
127 ATTATAATTGAATGTCTACCTTAAGAAACGTGAAGAAAAAGCCAT-TCATTGGTAAGAAAAGTCC
* * * ** * *
10148 ATTTATAGTTACTCATA-TCTTTGAAAGCCTTATTACTTTCCTTAAATGGCTTTATAATCTCATA
191 ATTTATAG-CACCCA-AGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATA
* * *
10212 ATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAAATTATAATTGAATGTCTACCTC
254 ATTGATTTTAAGTTGAA-TTTTTTACATTTTTAGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTT
* * * * * * * * * **
10277 GGGAAACCTAAAGAAAAAGTCATTCATTGGCAAGTAAAGTCTATTTATAGTTATCCATACCTTCA
318 AGGAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTTG
* * * *
10342 AAAGCCTAATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTAATTTTGGGTGGAATTCTTTT
383 AAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAGGTTGAATT-TTTT
* * * * * * * *
10407 AAAGTTTTGGTTAAAACAGTTTATAATTGAATATCTA-C-T-CAAGAAATGTGAAAAAAAACCCA
447 ACATTTTTAGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGGAA-AAA-GTGAAGAAAAAGCCA
10469 T
510 T
* * * * * ** *
10470 TTATTGGTAAAAAAAG-CCTATTTATAGTTACCAACACCTTTGAAAGCCTTATTACTCGATTTAA
1 TCATTGGCAAGAAAAGTCC-ATTTATAGTCACCCATGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAA
* * * * *
10534 ATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAGGTTTAATTTTTTTCCATTGTTCA-TTAAAACATAT
65 ATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATT-TTTAGTTAAAACAGAT
* ** * *
10598 TATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAATATGAAAAAAAAGCCATTCATTAGTAAGAAAAGTCCATT
129 TATAATTGAATGTCTACCTTAAGAAACGTGAAGAAAAAGCCATTCATTGGTAAGAAAAGTCCATT
* * ** * *
10663 TATAGTCGCCCATGCCTTT-AATAATCTAATTACTCGCTTTAAATGGGTTTATAATCTCATAATT
194 TATAG-CACCCAAGCCTTTGAA-AGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATT
* * * *
10727 GATTTTAGGTTGAATTTTTAAAAATTTTTTA-TTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTCAG
257 GATTTTAAGTTGAATTTTT-TACA-TTTTTAGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTAG
** * * * * * * **
10791 GAAATGTGAAGACAAA-CTATTTATTGACAAGAAAAGACTATTTATAG-CAACCCAAACCTTTGA
320 GAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTC-ACCCATGCCTTTGA
** * *
10854 AAGCCTTATTA-TACGCTTTAAATTTTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGGATTATTTT
384 AAGCCTTATTACT-CGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAGGTT-GAAT-TTTT
* * * ** * * * *
10918 TATATTTTTGGTGAAAACAGATTATAATTGAATGT-TCACCTCAGAAAACGGGAAGAAAGAGGC-
446 TACATTTTTAGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCT-ACCTTGGAAAAAGTGAAGAAAAAGCCA
10981 T
510 T
* * * * ** * **
10982 ATCATTGGCAAAAAAAATCTATTTATAGTTACCTTTACCTTTGAAAGCCTTATTACTATCTTTAA
1 -TCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAA
* * ** * *
11047 ATGGCTTTATAATCACATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTGTATTTTT-GATTAAAATATAT
65 ATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTAG-TTAAAACAGAT
* * ** * * *
11111 GATAATTGAATGTCTACC-TAGAAAAATTTGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGTAAAGTTCAT
129 TATAATTGAATGTCTACCTTA-AGAAACGTGAAGAAAAAGCCATTCATTGGTAAGAAAAGTCCAT
* ** * * *
11175 TTATAGTTACCCATA-CCTTCAAAAACCTAATTACTCGCTTGAAATGGTTTTATAATCTCATAAT
193 TTATAG-CACCCA-AGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAAT
** * * * *
11239 TGATTTTGGGTAGAATTCTTTTAAATTTTTAGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTCAA
256 TGATTTTAAGTTGAATT-TTTTACATTTTTAGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTAG
* ** * *
11304 TAAATGTGAAGAAAAAGCCATTCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACCACCA--CCTTTG
320 GAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCA-C-CCATGCCTTTG
* * * *
11367 AAAGCCTTATTACTTGATTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAGGTTTAATTGTTTA
383 AAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAGGTTGAATTTTTTA
* *
11432 GCATTTTTCA-TTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACCTT-GAGAAATGTGAAGAAAAAGCCA
448 -CATTTTT-AGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGGA-AAAAGTGAAGAAAAAGCCA
11495 T
510 T
* * ** *
11496 TCATTAGTAAGAAAAGTCCATTTATAGTCGTCCATGCCTTT-AATAGCCTAATTACTCGCTTTAA
1 TCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTTGAA-AGCCTTATTACTCGCTTTAA
** * * * *
11560 ATTTTTTTATAACCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTAAAATTTTTTGTTAAAACAGATT
65 ATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTAGTTAAAACAGATT
* * *
11625 ATAATTGAATGTCTACCTTAAAAAATGTGAAG-AAAAGCCATTCATTGATAAGAAAAGTCCATTT
130 ATAATTGAATGTCTACCTTAAGAAACGTGAAGAAAAAGCCATTCATTGGTAAGAAAAGTCCATTT
* * *
11689 ATAACAACACAAGCCTTCGAAAGCCTTATTA-TACGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTG
195 ATAGC-ACCCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACT-CGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTG
* * * *
11753 ATTTTAAGTTGAATTGTTTTTACATTTTTGGTGAAAATAGATTATAATTGAATGTCTACC-TCGA
258 ATTTTAAGTTGAA-T-TTTTTACATTTTTAGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTAG-
* * * * *
11817 GAAACATGAAGAAAAAGAC-TACCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCGCTCATACCTTTGA
320 GAAACATGAAGAAAAAGCCAT-TCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTTGA
* *
11881 AAGCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAAATTTTTTA
384 AAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAGGTTG-AATTTTTTA
* * * * * * *
11946 CATTTTTGGTTAAAACTGATTATAATTGAATGTGTA-CTTTGAAAAACTTGACGAAAAAGTCAT
448 CATTTTTAGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGGAAAAA-GTGAAGAAAAAGCCAT
* * * * ** * *
12009 TCAATGGTAAGAAAAGTCCATTTATAATTATGCATACCTTTGAAAG-CTTAATTACTCGATTTAA
1 TCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTTGAAAGCCTT-ATTACTCGCTTTAA
* * * *
12073 ATAGTTTTATAATCTCATAATT-AGTTTT-AGATTGAATTTTTTTACATTTTTTA-TTAACATAA
65 ATGGTTTTATAATCTCATAATTGA-TTTTAAG-TTGAATTTTTTTACA-TTTTTAGTTAAAACAG
* * ** * * *** **
12135 AGTATAATTGAATGTTTGTCTTAGGAAACGTGAAGAAAAAGGC-TATCATTTACAAGAAATTTCC
127 ATTATAATTGAATGTCTACCTTAAGAAACGTGAAGAAAAAGCCAT-TCATTGGTAAGAAAAGTCC
* * * * * *
12199 ATTTATTGTCACCTATA-TCTTTGATAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATTTGATA
191 ATTTATAG-CACCCA-AGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATA
* * *
12263 ATTGATTTTAAG-TCAACTTTTTTTACATTTTCT-GTGAAAACAGATTATAGTTGAATGT-TGAC
254 ATTGATTTTAAGTTGAA--TTTTTTACATTTT-TAGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCT-AC
* * * * * * *
12325 CTT-GAGAAACGTAAAGAAAAAGCCATTCATTAGCAAGAAAAGTCTATTTATAGTAATCTATGCC
315 CTTAG-GAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATGCC
* ** *
12389 TTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTGATAATTGATTTTAACTTTAATTT
379 TTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAGGTTGAATTT
* * * * * ** *
12454 TTTTCCTGTTTT-GTTAAAACAGTTTATAATTGAAAGTCTACCTTAGAAAACCTAAAGAAAAAGC
444 TTTACAT-TTTTAGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGGAAAAAGTGAAGAAAAAGC
12518 CAT
508 CAT
** * * ** * *
12521 TCATTAACATGTAAAGTCCATTTATAGGT-ACCCATGCCTTCAAAAGCGTAATTACTCGCTTTAA
1 TCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATA-GTCACCCATGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAA
* *
12585 ATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTTAATATTTTTTA-TTTTTTA-TTAAAACAGAT
65 ATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAAT-TTTTTTACATTTTTAGTTAAAACAGAT
* * * * * * * * * *
12648 TAAAATTGAATGTCTGCCTT-GGAAAACATGAAAAAAAAGTCATTGA-TGGACAAGAGAAGTCTA
129 TATAATTGAATGTCTACCTTAAG-AAACGTGAAGAAAAAGCCATTCATTGG-TAAGAAAAGTCCA
* * * * **
12711 TTTATAGCAACCCAAGACTTCGAAAGCCATATTACGCTTTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAAT
192 TTTATAGC-ACCCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAAT
* * *************
12776 TGATTTTAAGTTAAATTTTTTTATACTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
256 TGATTTTAAGTTGAA-TTTTTTACA-TT------------------------TTTAGTTAAAACA
*****************************************************************
12841 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
295 GATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCC
*****************************************************************
12906 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
360 ATTTATAGTCACCCATGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAA
*****************************************************************
12971 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
425 TTGATTTTAGGTTGAATTTTTTACATTTTTAGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGG
******* * * *
13036 NNNNNNNGATTATAATTGAATG--TT
490 AAAAAGTGA--AGAA---AAAGCCAT
* * ** *** * * ** * ** * *
13060 TACCTTGG--A-AAATGTGAAGAAAAAGCCATTCATTG-ATAAGAAAAGTCCAT-TTA-TAG---
1 T-CATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCA-TGCCTTTG-AAAG-CCTTATTACTCGCTT
* * ** * * * * * ** * ** *
13116 TAACCCAAGCCTTCGAAAACCTTATTACA-TGCTTTAAATGGTTTG-A-TAATCT-CATAACTGA
62 TAA---ATG-GTTTTATAATCTCA-TA-ATTGATTTTAA--G-TTGAATTTTTTTACAT-TTTTA
* * **** * * *
13177 TTTTAGGTTGAATTTCTTTACATT-ATTGAT-TAACACAAATTATAATTGAATGTCTGCCTTGGA
117 GTTAAAACAG-A--T-TATA-ATTGAATG-TCT-AC-C----T-TAA--GAA--AC-G---T-G-
* * * * * *
13240 AAACCTAAAGAAAAAGGC-TATCATT-GCAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACCTATGCATTTGAA
159 -------AAGAAAAAGCCAT-TCATTGGTAAGAAAAGTCCATTTATAG-CACCCAAGCCTTTGAA
* ** * * *
13303 AGCCTTATTGCTCAATTTAAATAGCTTTATAATCTTATAATTGATTTTAAGTTGAATTGTTTTAC
215 AGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATT-TTTTAC
* * * * * * * ** * *
13368 ATTTTTAATGAAAACGGATAATAATTGAATGTCTATCTTAGCATATGTGAAGAAAGAGGC-TATC
279 ATTTTTAGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGAAAAAGCCAT-TC
* * * *
13432 ATTAGCAAGAAAAGTTCATTTATAGTCA-CCATGCCTTTGAAAGCATTATTACTTGCTTTAAATG
343 ATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATG
* * * * *
13496 ATTTTATAATCTGATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTGTTAAAACGGATTATA
408 GTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAGGTTGAA-TTTTTTACATTTTTAGTTAAAACAGATTATA
* ** *
13561 ATTGAATGTCTACCTTGGGAAACCTGAAGAAAAA-CTAAT
472 ATTGAATGTCTACCTTGGAAAAAGTGAAGAAAAAGC-CAT
* * * * * *
13600 TCATTAGCAAGGAAAGTCCATTTATAGTTACCCATGCCTTCGAAAGCCTAATTACTCGCTTTTAA
1 TCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAA
* * * * * **
13665 TGGATTTATCATCTCATAATTGATTTCAAGTTGAATTTTTTAATATTTTTAGCGAAAACATG-TT
66 TGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTAGTTAAAACA-GATT
* * * * * * * *
13729 ATAATTGAATGTTTAACTTGAGAAATGTGATGAAAAAGTCATTCATTGGCAAGAAAAATCCATTT
130 ATAATTGAATGTCTACCTTAAGAAACGTGAAGAAAAAGCCATTCATTGGTAAGAAAAGTCCATTT
* ** *
13794 CTAGTCACCCAAGCCTTTTG-AAGCCTTATTACTCATTTTAAATGGTTTTATAATTTCATAATTG
195 ATAG-CACCCAAGCC-TTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTG
** * * * *
13858 ATTTT-AGATTGAATTTGTTTACATTTTTTTTTGAAAACAAATTATAATTGATTGT-GAGCCTCA
258 ATTTTAAG-TTGAATTT-TTTACATTTTTAGTT-AAAACAGATTATAATTGAATGTCTA-CCTTA
* * * * * * *
13921 GGAAACGTGAAGAAAAAGACATTCATTAGTAAGAAAAGTCTATTTTTAGTCACCCACGCCTTTGA
319 GGAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTTGA
* * * *
13986 AAGCCTTATTAC-CTGCTCTAAATGGTTTTATAATCTGATAATTGATTTTAAGTTAAATTTTTTT
384 AAGCCTTATTACTC-GCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAGGTTGAA-TTTTTT
* * * * * *
14050 ACATTTTTTGTCAAAATAGATTAGAATTGAATGTCTACCTTAGG-AAACGTGAATAAAAAGCCAT
447 ACATTTTTAGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTT-GGAAAAAGTGAAGAAAAAGCCAT
** * * * * * *
14114 TCATTGATAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACCAACGCTTTTAAAAGCTTTATTACTCGCTTTAAA
1 TCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAA
* ** * ** *
14179 TGGTTTTATAATATGGTAATTGATTTTAAGTTGAAGTTTCATACATTTTTTA-TTAAAA-ATTAT
66 TGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACA-TTTTTAGTTAAAACA-GAT
* ** * * ** *
14242 TATAATTGTATGTCTACCTCGAGAAACGTGAAGAAAAAACCATTCATTGGTAAGTAAAGTTTACT
129 TATAATTGAATGTCTACCTTAAGAAACGTGAAGAAAAAGCCATTCATTGGTAAGAAAAGTCCATT
** * ** * *
14307 TACGGTTACCCACA-CCTTCAAAAGCCTAATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATT
194 TATAG-CACCCA-AGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATT
* * * * * * *
14371 GATTTT-AGATTGAGTTTTTTTATATTTTTGGTGAAAACACATTATTATTGAATGTCTGA-C-TC
257 GATTTTAAG-TTGA-ATTTTTTACATTTTTAGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCT-ACCTTA
* * * * * * *
14433 GAGAAACGTGAAGAAAAAACCATTCATTGACAAGAAAAGTCTATTTCTAGTTA-CCAAGCCTTTG
319 G-GAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTTG
* * *
14497 AAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATAGCTTTATAATCTCATAATTGATTTTAGGTTAAATGTTTTT
383 AAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAGGTTGAAT-TTTTT
* * * * * * * * *
14562 ATATTTTTTA-TAAAAATAAATTATAATTGATTGTCTGCCTCGAGAAACA-TGAAGAAAAAGGCA
447 ACA-TTTTTAGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTG-GAAAAAGTGAAGAAAAAGCCA
14625 T
510 T
* * * * * *
14626 TCATTGGTAAAAAAAATCCATTTATAGTCATCCATGCCTTTAAAAGCCTTATTAC-CTGCTCTAA
1 TCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTTGAAAGCCTTATTACTC-GCTTTAA
* * * * * *
14690 ATAGTTTTATAATCTGATAATTGATTTTAAGTT-AGATTTTTTTACTTTTTTTGTTAAAATAAAT
65 ATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGA-ATTTTTTTACATTTTTAGTTAAAACAGAT
* * * ** * *
14754 TATAATTGAATGCCTACATCAAGAAACGTGGGGAACAAGCTATTCATTGGTAAGAAAAGTCCATT
129 TATAATTGAATGTCTACCTTAAGAAACGTGAAGAAAAAGCCATTCATTGGTAAGAAAAGTCCATT
* * * * * * **
14819 CATTGTCA-CCAACGCTTTTAAAAGCATAATTACTCTTTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATT
194 TATAG-CACCCAA-GCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATT
* * * * *
14883 GATTTTAGGTAGAATGCTTTTACATTTTTTA-TTAAAACAAATTATAATTGAATGTCTACCTTAA
257 GATTTTAAGTTGAAT-TTTTTACA-TTTTTAGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTAG
* ** ** * * * * * *
14947 AAAATGTGAAGAAAAAGAAATTTATTAGTAAGAAAAGTCCATTTAGAGTCACCCGTGCCCTT-AA
320 GAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTTGAA
* * * * *
15011 AGCATAATTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAAACTCATAATTGATTTTAGGTTGAATTGTTTTAT
385 AGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAGGTTGAATT-TTTTAC
* * *
15076 ATTTTTAGTTAAAACAAATTATAATTAAATGTCTGCCTT-GAAAAAGGTGAA-AAAAAGCCAT
449 ATTTTTAGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGGAAAAA-GTGAAGAAAAAGCCAT
* * * * *
15137 TCATTAGTAAGAAAAGTTCATTTATAG-CAACCCAAG-CTTTCGAAAGCCTTATTACGT-GCATT
1 TCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTC-ACCCATGCCTTT-GAAAGCCTTATTAC-TCGCTTT
* * * * **
15199 AAATGGTTTGACAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATGTTTTTACATTTTTGGTGCAAACAGA
63 AAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTAGTTAAAACAGA
* * * * * ** * *
15264 TTATAATTGAATGTCTACCTCAGGAAACGTGAAGAACAAGGC-TATCACTGACAAGAAAATTCTA
128 TTATAATTGAATGTCTACCTTAAGAAACGTGAAGAAAAAGCCAT-TCATTGGTAAGAAAAGTCCA
* * * **
15328 TTTATAGTCACCCATGCCTTTAAAAGCCTAATTACTTACTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAAT
192 TTTATAG-CACCCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAAT
* * * *
15393 TAATTTT-AGATTGAATTGTTTTACATTTTTGGTT-AAATAGATTATAATTGAATATCTACCTT-
256 TGATTTTAAG-TTGAATT-TTTTACATTTTTAGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTA
* * *
15455 GGAAAATATGAAGAAAAAGCCATTCATTTGCAACAAAAGTCCATTTATAG-CAACCTCA-GCCTT
319 GG-AAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTC-ACC-CATGCCTT
** * * * * *
15518 CAAAAG-CTTAATT-TTGCACTTTAAATAGTTTTATAGTCTTATAATTGATTTTAGGTTGAATTT
381 TGAAAGCCTT-ATTACT-CGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAGGTTGAA-TT
* * * *** *
15581 TTTTACATTTCTTA-TTAACACATATTAGAATTGAATGTCCGGCTTAGG-AGAAGTGAAGAAAAA
443 TTTTACATTT-TTAGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTT-GGAAAAAGTGAAGAAAAA
*
15644 GGC-T
506 GCCAT
* * * **
15648 ATCATTTGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCGATGCCTTTGAAAGCCTTATTACTTGCAATAA
1 -TCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAA
* * * ** *
15713 ATGGTTTTATAATTTGATAATTGATCTTCAA-TTGAATTTTTTTATGTTTTCTA-TTAAAATAGA
65 ATGGTTTTATAATCTCATAATTGAT-TTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTT-TAGTTAAAACAGA
* * * * * * * * **
15776 TTATAATTGAATGTCTACCTCAGGAGATGAGAGGAAAAAGCCATTCATTAGCAAGAAAAGTTTAT
128 TTATAATTGAATGTCTACCTTAAGAAACGTGAAGAAAAAGCCATTCATTGGTAAGAAAAGTCCAT
* * * * ** *
15841 TTATAGCCGCCCATGCCTTCGAAAGCTTTATTAAACGCTTTAAATGGTTTTATAAGCTCATAATT
193 TTATAG-CACCCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATT
* * * *
15906 GATTTT-AGTTGAATTTTTTTACATTTTCT-GTTAAAACATATTATAATTGAATATCTACCTCAA
257 GATTTTAAGTTGAA-TTTTTTACATTTT-TAGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTAG
* * * * * *
15969 GAGACGTGAAGAAAAAGGCATTCGTTGGCAAGAAAAGTCTATTTATATTCACCCATGCCTTTGAA
320 GAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTTGAA
* * * ** * * *
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385 AGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAGGTTGAAT-TTTTTAC
* * * * * * ** *
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449 ATTTTTAGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGGAAAAAGTGAAGAAAAAGCCAT
* ** ** * * * ** *
16161 TTATTATCAAGTGAAGTCCATTTATACTTATCCATGCCTTCAAAAGCC-TATTTACTCACTTTAA
1 TCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTTGAAAGCCTTA-TTACTCGCTTTAA
* ** * *
16225 ATGGTTTTATTATCTCATAATTGATTTTACCTTGAATGTTTGTACAATTTTTA-TTAAAACAGAT
65 ATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTAC-ATTTTTAGTTAAAACAGAT
* * * * * * *
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129 TATAATTGAATGTCTACCTTAAG-AAACGTGAAGAAAAAGCCATTCATTGGTAAGAAAAGTCCAT
* * * * * * *
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193 TTATAG-CACCCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATT
* * * *
16416 GATTTTAGGTTGAATGTTTTTAAATTTTTGGTAAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACC-TAGA
257 GATTTTAAGTTGAAT-TTTTTACATTTTTAGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTAG-
* ** * * * *
16480 GAAACATGGAGAAAAAGAGATTCATTGGTAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACGCATACCTTTGAA
320 GAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTTGAA
* * * *
16545 AGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTGATAATTGACTTTAAGTTCAATTTTTTTAC
385 AGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAGGTTGAA-TTTTTTAC
* * * * *
16610 ATATTTTA-TTAAAACAGATTATAATTGAATATTTACC-TAGAAAAACGTGAATAAAAAGTCAT
449 AT-TTTTAGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGGAAAAA-GTGAAGAAAAAGCCAT
* * * * * * *
16672 TCATTGACAAAAAAAGTCAATTTATAGTCATCCATACCATTAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAA
1 TCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAA
*
16737 TGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAGGTTGAATTTTTTTACATTTTTTA-TTAAAACAGATT
66 TGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACA-TTTTTAGTTAAAACAGATT
* * * ** * * ** * *
16801 AGAATTGAATGTTTGCCTCGAGAAACAT-AAGGAAAAAGGCATTCATTGACAAGAAAAGTCTATC
130 ATAATTGAATGTCTACCTTAAGAAACGTGAA-GAAAAAGCCATTCATTGGTAAGAAAAGTCCATT
16865 TATAGTCA-CCAAGCCTTTGAA
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16886 TGTTGGCTCC
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TGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTAGTTAAAACAGATTA
TAATTGAATGTCTACCTTAAGAAACGTGAAGAAAAAGCCATTCATTGGTAAGAAAAGTCCATTTA
TAGCACCCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATT
TTAAGTTGAATTTTTTACATTTTTAGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACA
TGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATGCCTTTGAAAGCCTT
ATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAGGTTGAATTTTTTACATTTTTA
GTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGGAAAAAGTGAAGAAAAAGCCAT
Found at i:4079 original size:60 final size:60
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Period size: 60 Copynumber: 2.0 Consensus size: 60
3998 ATTTTAGGTA
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4128 GAA
1 GAA
4131 GAAAAAATGA
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Matches are distributed among these distances:
60 63 1.00
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Consensus pattern (60 bp):
GAATTTTTTTACATTTTTCATTAAAACAAATTATAATTGAATGTCTGCCTTAGGAAACGT
Found at i:4251 original size:231 final size:231
Alignment explanation
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Period size: 231 Copynumber: 2.0 Consensus size: 231
3830 TTAGGTTGAG
* *
3840 TTTTTGTACATTTTTAGTTAAAACAAATTATAATTGAATGTTTGCCTTAGGAAACGTAAAGTAAA
1 TTTTTGTACATTTTTAGTTAAAACAAATTATAATTGAATGTCTGCCTTAGGAAACGTAAAGAAAA
* *
3905 AGCCATTCATTGGTAAGAAAAGTCTATTTATAGTTACCCAAACTTTCAAAAGCCTAATTACTCGC
66 AACCATTCATTGGCAAGAAAAGTCTATTTATAGTTACCCAAACTTTCAAAAGCCTAATTACTCGC
** *
3970 TTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAGGTAGAATTTTTTTACATTTTTCATTAAAAC
131 CGTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAGGTAGAATTGTTTTACATTTTTCATTAAAAC
*
4035 AAATTATAATTGAATGTCT-GCCTTAGGAAACGTGAA
196 AAATTATAATTGAATGTCTAG-CTCAGGAAACGTGAA
* *
4071 TTTTTTTACATTTTTCA-TTAAAACAAATTATAATTGAATGTCTGCCTTAGGAAACGTGAAGAAA
1 TTTTTGTACATTTTT-AGTTAAAACAAATTATAATTGAATGTCTGCCTTAGGAAACGTAAAGAAA
** * * * * **
4135 AAATGATTTATTGGCAAGAAAAGTTTATTTATA-TTGACCC-AAGTCTTCGAAAGCCTTTTTACT
65 AAACCATTCATTGGCAAGAAAAGTCTATTTATAGTT-ACCCAAACT-TTCAAAAGCCTAATTACT
* ** * **
4198 TGCCGTAGTTGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAGGTTGAATTGTTTTACATTTTTTGTTAA
128 CGCCGTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAGGTAGAATTGTTTTACATTTTTCATTAA
* *
4263 AACAGATTATAATTGAATGTCTAGCTCATGAAACGTGAA
193 AACAAATTATAATTGAATGTCTAGCTCAGGAAACGTGAA
4302 GAAAAAGCCA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (231 bp):
TTTTTGTACATTTTTAGTTAAAACAAATTATAATTGAATGTCTGCCTTAGGAAACGTAAAGAAAA
AACCATTCATTGGCAAGAAAAGTCTATTTATAGTTACCCAAACTTTCAAAAGCCTAATTACTCGC
CGTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAGGTAGAATTGTTTTACATTTTTCATTAAAAC
AAATTATAATTGAATGTCTAGCTCAGGAAACGTGAA
Found at i:17301 original size:32 final size:32
Alignment explanation
Indices: 17263--17350 Score: 106
Period size: 32 Copynumber: 2.8 Consensus size: 32
17253 AAGCTACTAT
*
17263 CAGAAACTGAGTTCAGAGACAGAGCCTGTTAC
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* * * *
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*
17327 CAGAAA-TTAGGTTCAGAGACAGAG
1 CAGAAACTGA-GTTCAGAGACAGAG
17351 ACGACTT
Statistics
Matches: 45, Mismatches: 10, Indels: 2
0.79 0.18 0.04
Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (32 bp):
CAGAAACTGAGTTCAGAGACAGAGCCTGCTAC
Done.