Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: NW_018397482.1 Herrania umbratica cultivar Fairchild unplaced genomic scaffold, ASM216827v2 scaffold_232.0, whole genome shotgun sequence
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Warning! 781 characters in sequence are not A, C, G, or T
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* * * ***
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1 TTCATTGGCAAGAAAAGTCC-ATTTATAGTCACCTATA-CCTTAGAAAGCCTTATTACTTGCTTT
* * * * * ** *
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64 AAATGGTTTTATAATCTCATAATTGA-TTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAAACAAA
* * * * *
129 TAATAATTGAATGTCTATCTCAAGAGACATGAAGGAAAAGCTA
128 T-ATAATTGAATGTCTACCTCGAGAAACATGAAGAAAAAGATA
* * * * *
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* * * * * **
233 TTAAATGGTTATATAATCTCATAATTGATTGAAAGTTAAATTTTTTTATATTTTTTACTAAANNN
62 TTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATT-TAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAA-AC
******* *
298 NNNNNNNATTGAATGTTTACCTCGAGAAACATGAAGAAAAAGATA
125 AAATATAATTGAATGTCTACCTCGAGAAACATGAAGAAAAAGATA
* * * * ** *
343 TTAATGGGTAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATACCTTAGAAAATCTTATTACTTGTTTTAA
1 TTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCTATACCTTAGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAA
* * *
408 ATGGTTTTATCATCTCATAATTG-TTTCAAAGTTGAATTTTTTTATATTTTTTATTAAAACAGGA
66 ATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTT--AAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAAACA-AA
* *
472 TATAATTGAATGTCTAGCTTGAGAAACGA-GAAGAAAAAGATA
128 TATAATTGAATGTCTACCTCGAGAAAC-ATGAAGAAAAAGATA
* * * * * * *
514 TTTATTAGCAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACCTATGGCTTTA-AAAGCCTTATTACCTACTTTA
1 TTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCTAT-ACCTTAGAAAGCCTTATTACTTGCTTTA
* * * * * *** * *
578 AATGATTTTCTAATCTAATAAGTGACTTTAAGTAGAATTGTTTTT-CATTTTTGGCTAAAATATA
65 AATGGTTTTATAATCTCATAATTGA-TTTAAGTTGAATT-TTTTTACATTTTTTATTAAAACAAA
** * * *
642 T-TACAGTTGGCTGTCTGCCT-AAGGAAACAT-AA-AAAAAAATCCA
128 TATA-A-TTGAATGTCTACCTCGA-GAAACATGAAGAAAAAGAT--A
* * *
685 ATCATTGGCAAGAAAAG-CCTATTTATAGTCACCTA-AGCCGTCA-AAAGCCTTATTACTCT-CC
1 TTCATTGGCAAGAAAAGTCC-ATTTATAGTCACCTATA-CC-TTAGAAAGCCTTATTACT-TGCT
* * * * * *
746 TTAAATGGTTTTAGAATCTTACAATTGATTTGAAGTTGATTTTTTTTACACTTTTTATTAAAAAA
62 TTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTT-AAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAAACA
* *
811 AACTATAATTGAATGTCTACCTCGAGAAACATGAAGGAAAATATA
126 AA-TATAATTGAATGTCTACCTCGAGAAACATGAAGAAAAAGATA
* * *
856 TTCATTAGCAAGAAAAGTCTATTTATTGTCACCTATACCTT-GAAAAGCCTTATTACTTGCTTTA
1 TTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCTATACCTTAG-AAAGCCTTATTACTTGCTTTA
* * * * *
920 AATGGTTTCATAATCTCATAATTGGCTTTGAGTTAAATTTTTTTTCATTTTTTATTAAAACAAAT
65 AATGGTTTTATAATCTCATAATT-GATTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAAACAAA-
985 TATAATTGAATGT
128 TATAATTGAATGT
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Statistics
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ATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAAACAAATAT
AATTGAATGTCTACCTCGAGAAACATGAAGAAAAAGATA
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943 GGCTTTGAGT
953 TAAATTTTTTTTCATTTTTTATTAAAACAAATTATAATTGAATGTTTAC
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1051 T
1 T
1052 TTAAAAAACA
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TAAATTTTTTTTCATTTTTTATTAAAACAAATTATAATTGAATGTTTAC
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1678 NNNNNNNNNN
* * *
1688 TTTATAGTCACCCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCTCTTTAAATAGTTTTATAATCTCATCAA
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* * * * * **
1753 -TGATATTAAGCTGAATTTTTTTACATTTTTTGATAAAACAGAATACAATTGAATGTTTGTCTAA
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* *
1817 GAAAACTTGAAGAAAAAGCCATTCATTGGTAAGAAAAGCCTA
128 GAAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGCC-A
* * * *
1859 TTTATAGTCACTCAAGCCTTCGAAAGCCTCATTACTCACTTTAAATGGTTTTACAATCTCATAGA
1 TTTATAGTCAC-CAAGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATA-A
* * * *
1924 -TAATTTGAAGATGAATTTTTTATACA-TTTTTCTTAAAATAGATTATAATTGAATGT-TGACCT
64 TTGATTT-AAGTTGAATTTTTT-TACATTTTTTGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCT-ACCT
* ** * *
1986 -AGAGAAACATGAAGAACAAGATATTCATTGACAAGAAAAGTCTA
126 AAGA-AAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAG-CCA
* * ** * *
2030 TTTATAGTCACTTATA-CCTTTAAAAGCCTTATTACTTTCTTTAAATGGCTTTATAATTTCATAA
1 TTTATAGTCAC-CA-AGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAA
* * * *
2094 TTAACTTAAAGTTGAATTTTTTT-CA-TTTTTGATTAAAATAGACTATAA-TGAAATGTCTACCT
64 TTGA-TTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTG-TTAAAACAGATTATAATTG-AATGTCTACCT
* ** * *
2156 CAAG-AAACGTGAAGAAAAAGTGATTCATTGACAAGAAAAGTTCA
126 -AAGAAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAG-CCA
*
2200 TTTATAGTCACCAATGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTCATAATCTCATAAT
1 TTTATAGTCACCAA-GCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAAT
* * * * * * * *
2265 CGACTTTAAGTTGAATTTTTTTATATTTTTGGTTAAAATATATTATAGTTGAATGTCTATCTAGG
65 TGA-TTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTAAG
* * * *
2330 GAAACATAAAGAAAACGCCATTCATTGGCAACAAAAGCCTA
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* * * ** *
2371 TTTATAGTTACCCAAGCCTTCGAAAGACTTATTACTCGCTTTAAATAATTTTATAATCTGATAAT
1 TTTATAGTCA-CCAAGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAAT
* * * * * * * **
2436 TAATTTGAAGTTGAATTTTTTTAGATTTTTT-TAAAAATAGATTTTAATTGAATGTTTACATTTG
65 TGATTT-AAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTAAG
* * **
2500 GAAACGTGAAG-AAAAGAATATTCATTGGCAAGAAAAGTCCA
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* * * * * *
2541 TTTGTAGTCATCTATA-CCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTGACTAGTTTTATAACCTCATAA
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* * * * * * * * *
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64 TTG-ATTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTA-CCTA
* * * **
2670 AG-AAACATGAAGAAAAAACCATTCATTTGCATGAAAAATTCA
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* * * *
2712 TTTATAGTCACCCATGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGATTTCATAATCTTATAAT
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* * * * *
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*
2842 AAAACATAAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGCCTA
129 AAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGCC-A
* * * *
2883 TTTATAGTCACCCAAGCTTTCAAAAGCCTTTTTACTCACTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAAT
1 TTTATAGTCA-CCAAGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAAT
* * * * * * *
2948 TGATTTGAAGTTGAATTTGTTTAAATTTTTTATTAAAACAGATTTTAATTGAATGTTTTCCTCAG
65 TGATTT-AAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTAAG
* ** * * **
3013 GAAACATGAAGAAAAAGGTACTCATTGGCAAAAAAAATCA
129 AAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGCCA
* * * *
3053 TTTATAGTCACCTATGCCTTTAAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGGTTTATAATCTCATAAT
1 TTTATAGTCACC-AAGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAAT
* * * **
3118 TGATTCTAAGTTGAA-TTTTTTATATTTTTAGTTAAAACAGATAATAATTGAATGTCTACCTTGG
65 TGATT-TAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTAAG
* * ** * ** *
3182 GAAACGTGAAGAAAAAATCATTAATTGATAAGAAAAGTCAA
129 AAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAG-CCA
* * * * *
3223 CTTATAGACACCTAAGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCTCTTTAAATGGCTTTATAATCTCGTAAT
1 TTTATAGTCACC-AAGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAAT
* *** * * * * * * *
3288 TGACTTTAAGTTGAATTGTTTCGTATTTCTCGTTAAAACAAATAATAATTGAATATCTACATTAG
65 TGA-TTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTAAG
* * * * * *
3353 GAAATATGAAGAAAAAGTCATTCATTAGTAAGAAAAGTTCA
129 AAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAG-CCA
* * * *
3394 TTTATAATCACCCATA-ACTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATATCATAG
1 TTTATAGTCA-CCA-AGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAA
* * * * * *
3458 TTGATTTTAAGTTGAGTTTTTTTATATTTTTTGTTAAAATAGATTATAATTAAATGTTTACCT-T
64 TTGA-TTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTAA
* ** *
3522 GAGAAACATGAGGAAAAAGATATTCATTGGTAAGAAAAGTCCA
128 GA-AAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAG-CCA
* * *
3565 TTTATTGTCACTCATA-CCTTCAAAAACCTTATTACTCGTTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAA
1 TTTATAGTCAC-CA-AGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAA
* *
3629 TTGATTTCAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTGTTAAAGCAGATTATAATTGAATG-CATGCCTC
64 TTGATTT-AAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTC-TACCT-
* * * *
3693 AAG-AAACGTGAAGAGAAAA-TCATTCATTGGTAGGAAAAGTCCA
126 AAGAAAACATGAAGA-AAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAG-CCA
** ** * * * *
3736 CCTATAGTCACCCTGGCTTCAAAAGCCCTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAAAT
1 TTTATAGTCACCAAGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATT
* ** * *
3801 GACTTTAAGTTGAATTGTTTTT-CA-TTTTTGATTAAGACAGATTATAATAAAATGTCTACGT-T
66 GA-TTTAAGTTGAATT-TTTTTACATTTTTTG-TTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTAA
* *
3863 GAGAAACATGAAGAAAAAGCTATTCATTGGTAAGAAAAGTCCA
128 GA-AAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAG-CCA
* * * ** * * *
3906 -TTATAGTAACCCATA-CCTTCTAAAGTCTTATTGTTCACTTTACATGGTTTTATAATCTCATAG
1 TTTATAGTCA-CCA-AGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAA
* * * *
3969 TTGATTTTAAGTTGAATTTTTTT-CAATTTTTTGTCAAAACAGTTTATAACTGAATGT-TATCT-
64 TTGA-TTTAAGTTGAATTTTTTTAC-ATTTTTTGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTA
* ** *
4031 TGAGAAACATGAAG-AAAAGATACTCATTGGCAAGAAAAGTCCA
127 AGA-AAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAG-CCA
* * * * * ** * *
4074 TTTACAGTCAACCATA-TCTTCGAAAGCCTTATTA-TGTGTTTTAAACAGCTTTATAATCCCATA
1 TTTATAGTC-ACCA-AGCCTTCAAAAGCCTTATTACT-CGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATA
* * * *
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63 ATTGA-TTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTG-TTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCT
* ** *
4201 CAGAAAATC-TGAAGAAAACTCCATTCATTGGTAAGAAAAGTCCA
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********* * *
4245 TTTATAGTCACCNNNNNNNNNNAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATATCATAAT
1 TTTATAGTCACC-AAGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAAT
* * *** * * *
4310 TAACTTTAAGTTGAATTTTTTTATATTTTTAACTAAAACATATTACAGTTGAATGTCTACCTAA-
65 TGA-TTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTAAG
* * * * *
4374 AGAAACATAAAGAAAAAGCCATTCATTAGTAAAAAAAACCTA
129 A-AAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGCC-A
* * * * * * *
4416 TTTAAAGTTACCCAAGCCCTCAAAAGCCTTATTATTGGCTTAAAAT-GTTTTATAATCTCATACT
1 TTTATAGTCA-CCAAGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAAT
* * * * * * * * *
4480 GGATTCGAAGTTGAATTGTTTTGCATTTTTTATTAAAACAAATTTTAATAGAATGTCTACCTCAG
65 TGATT-TAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTAAG
* * ** * * * * **
4545 -GAA-ATGAGCAGGAAAAGATATTCGTTAGTAAGAGGATAGTTTA
129 AAAACATGA--AGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGA--AAAG-CCA
* * ** * *
4588 TTTATTGGGCATTATG-CTTCAAAAGCTCTTATTACTCGCTTTTAAAATGG--TT-TACTCT-AT
1 TTTA-TAGTCACCAAGCCTTCAAAAGC-CTTATTACTCGC-TTT-AAATGGTTTTATAATCTCAT
* * * * * * *
4648 AATTTGAGCTTTAAGTTGAAATTTTTTTTGCATTTTTGGTTAAAATAGACTATAACTAAAT-ACT
62 AA-TTGA--TTTAAGTTG-AA-TTTTTTTACATTTTTTGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCT
* * * **
4712 ACATCAAG--AACGTGAAGAAAAATG--ATTCATTGGCTAAAAAAAGTTTA
122 ACCT-AAGAAAACATGAAGAAAAA-GCCATTCATTGGC-AAGAAAAG-CCA
* * *
4759 TTTATAGTCATACATGCCTTCGAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAAGGGTTTTATAATCTCA-AT
1 TTTATAGTCA-CCAAGCCTTC-AAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATA-
* * * * * * *
4823 TTTGGGACTTTAAGTTGAATTTTTTTATATTTTTAGTTAAAACAGATTACAGTTGAATATCTGCC
63 ATT--GA-TTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACC
* * * *
4888 TAGGGAAACA--AAAAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAATCCTA
125 TAAGAAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGCC-A
* ** * * * *
4931 CTTATAGTCAGTAAAGCATTCAAAAGTCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCAAAAT
1 TTTATAGTCA-CCAAGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAAT
********** * * * *
4996 TGNNNNNNNNNNAAATTTTTTTATATTTTTTATTAAAATAGATTATAATTGAATGTCTACCT-TG
65 TG-ATTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTAAG
* * ** * **
5060 TGAAACGA-GAAGTAAAAGATATTTATTGATAAGAAAAGTCCA
129 -AAAAC-ATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAG-CCA
* * * * *
5102 TTTATAGTCATCTATGCCGTCAAAAGCCTTATTACCCGCTTTAAATGGTTTTATAATGTCATAAT
1 TTTATAGTCA-CCAAGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAAT
* * * * * * *
5167 TGACTTTAAGTTTAATTTTTTTTCATTTTTGGTT-AAACAGATTACAGTTGAATATCTGCCTAAG
65 TGA-TTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTAAG
* * *
5231 GAAACATGAAGAAAAAG-CATTCATTTGCAAGAAAACCCTA
129 AAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGCC-A
* * * * **********
5271 TTTATAGTCACTTAAACTTTCGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAANNNNNNNNNNATCTCATAAT
1 TTTATAGTCAC-CAAGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAAT
* * * * * * *
5336 TGATTTGAAATTGAATTTTTCTTATATTGTTTATTAAAATAGATTATAATTGAATGTCTATCTTA
65 TGATTT-AAGTTGAATTTTT-TTACATTTTTTGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTAA
* * * * * * *
5401 GGAAACACGAGGAAAAA-CATATTCATTGGTAAAAAAATTCCA
128 GAAAACATGAAGAAAAAGC-CATTCATTGGCAAGAAAA-GCCA
* * * * ** *
5443 TTTGTAGTCACCTATGACTTCAAAAACCTTATTACTTTCTTTAAATGATTTTATAATCTCATAAT
1 TTTATAGTCACC-AAGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAAT
* * * * * *
5508 TGACTTAAAATTGAATTTTTTT-CATTTTTGGCTAAAACAGACTATAATTAAATGTCTACCTCAA
65 TGA-TTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCT-AA
* * * * * **
5572 G-AAACGTAAAGAAAAAGCAACTCATTGGTAAGAAAAGTTTA
128 GAAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAG-CCA
* * ********** *
5613 TTTATAGTCACCCATGCCTTCGAANNNNNNNNNNCTCGCTTTAAATGGTTTTATAGTCTCATAAT
1 TTTATAGTCA-CCAAGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAAT
* * * * * * *
5678 TGACTTTAAGTTGAATTTTTTCAC-TTTTATCGTTAAAACAGATAATAATTTAATGTATACATTA
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* ** * ** * * *
5742 GGAAATGTGAAGAAAAAGTCATTCATCAGTAGGAAAGATCCA
128 GAAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAA-AGCCA
* * * * * *
5784 TTTATAGTCACCTATA-CCTTTAAAAGCCTTATTACTCTCTTTAAATGATTTTATAGTATTATAA
1 TTTATAGTCACC-A-AGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAA
* * * * * *
5848 TTGACTTCT-AGTTGAATTTTTTT-CATTTTTGGTTAAAACAGCTTACAGTTGAATATCTGCCTA
64 TTGA-TT-TAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTA
* *
5911 AGGAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCTAGAAAAGCCTA
127 AGAAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGCC-A
** * * **********
5954 TTTATAGTTGGCCAAGCTTTCGAAAA-CCTTATTACTCACTTTAAATGGTNNNNNNNNNNCATAA
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* ** **
6018 TTGATTTGAAGTTGAATTCTTTTACATTTTTAATTAAAACA-AGTTATAAATT-AATGTCTTTCT
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* * * * ** * *
6081 CAGGAAACATAAAGAACAAGATATTCATTGGCAAAAAAAGGTCA
126 AAGAAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAA-GCCA
* * * * * * * * *
6125 TTTGTAGTCACTTATA-CCTTCAAGAGTCGTATTACTCACTTTAATTAGTTTTATGATCTCATAA
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* * * * * * **
6189 TTGATTGTAAGTTAAATTTTTTTACATTTTTGGTTGAAACAGATAATAATTGAATGCCTGCCTTG
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* *
6254 GAAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTAGTAAGAAAAGTCCA
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********* ** *
6296 TTTATAGTNNNNNNNNNNTTCAAAAGCCTTATTACTTACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAT
1 TTTATAGT-CACCAAGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAAT
* * * * * * *
6361 TGACTTTAAGTAGAATTGTTTTACATTTTTTGTTGAAATAG-TGTACAGTTGAATGTCTGCCTAA
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* * *
6425 G-GAACATGAAGAAAAAGCCATGCATTAGCAAGAAAAGCCTA
128 GAAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGCC-A
* ** * * *
6466 TTTATAGTCACCCAACCCTTTGAAAGTCTTATTACTTGCTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAAT
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* * **********
6531 TGATTTAAAG-TGAAATTTTTTTATATTTTTTATTAAAACAGATTA-NNNNNNNNNNCTTACCT-
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* *** * * *
6593 CGAGAAACATGAAGAAAAATATATTGATTAG-TAGAAAAGTCCA
127 AGA-AAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAG-CCA
* * * * * * * *
6636 TTTAAAGTCACCCATGCCTTCGAAAGCTTTATTACTTGCTTTAAAAGTTTTTATAGTCTCATAAT
1 TTTATAGTCA-CCAAGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAAT
* * * * * * * *
6701 TAAATTTAAGTTGAATGTTTTTATACTTTTGGTTAAAACATATAATACTTGAATGTCTACCTCAA
65 T-GATTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCT-AA
* * * * *
6766 G-AAACATGAGGAGAAAGCTATTGATTGGCAAGAAAGGTCCA
128 GAAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAG-CCA
* * * ** **********
6807 TTTATAGTAACCCATGCCTTCAAATGCCTTATTACTCATTTTAAATGGTTNNNNNNNNNNATAAT
1 TTTATAGTCA-CCAAGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAAT
* * *
6872 TGATTTTAAGTTGAATTTTTTGACATTTTGTTGTTAAAATAGATTATAGTTGAATGTCTACCTAA
65 TGA-TTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTT-TTGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTAA
* * *
6937 GGAAACATGAAGAAAAAGTCACTCATTGGCAAGAAAAGCCTA
128 GAAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGCC-A
* * * * * * *
6979 TTTATGGTCACACAAACCTTCGAAAGCCTTATTACTCTCTTTAAATGCTTATATAATATCATAAT
1 TTTATAGTCAC-CAAGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAAT
* * * * * **
7044 TTATTTGAAGTTGAATTTTCTTACATTTTTTATGAAAACAAATTATAATTGAATGTCTA-CTTTG
65 TGATTT-AAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTAAG
* ** *
7108 AGAA-ATGTAAAGAAAAAGGTATTCATTGGTAAGAAAAGTCCA
129 AAAACATG--AAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAG-CCA
* ********** * *
7150 TTTATAGTCACCTATGCNNNNNNNNNNCTTATTACTCGCTTTAAATGATTTTATAATATCATAAT
1 TTTATAGTCACC-AAGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAAT
* ** * * * *
7215 TGACTTTAACTCAAATTGTTTTT-TATTTTTAGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTATACCT-T
65 TGA-TTTAAGTTGAATT-TTTTTACATTTTTTGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTAA
**
7278 GAGAAATGTGAAGAAAAAGCCATTCATT-GCTAAGAAAAGTCCA
128 GA-AAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGC-AAGAAAAG-CCA
* ** * *
7321 TTTCTAGTCACCTAAGCCTTTGAAAGCCTTATTATTCGCTTTAAATGGTTTTATAATTTCATAAT
1 TTTATAGTCACC-AAGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAAT
* ** * * *
7386 TGATTTGAAATTGAATTCTTTTT-CA-TTTTTGTTAATGCAAACTATGATTGAATGTCTACCTCA
65 TGATTT-AAGTTGAATT-TTTTTACATTTTTTGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCT-A
* * * *
7449 AG-AAACGTAAAG-AAAAGCCACTCATTGGCAAAAAAAGTCCA
127 AGAAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAG-CCA
* * * ** *
7490 CTTATAGTCACCTATGCCTTCAAAAGCCTTATTATTCGCTTTAAACAGTTTTATAATCTCATAGT
1 TTTATAGTCACC-AAGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAAT
* *** * * * *
7555 TGATCTAAGTTGAATTTTTTTATGCTTTTTGTTAAAA-AAATTATAATTGAATATTTTCCTTAAG
65 TGATTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACC-TAAG
* ** ** **
7619 -GAATGTGAAGAAAAAGATATTCATTGATAAGAAAAGTCCA
129 AAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAG-CCA
* * ** * * ** * *
7659 CTCATAGTTGCTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCATTTTAAATAGTTTTATAATCACATAAT
1 TTTATAGTCAC-CAAGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAAT
* * * * * * *
7724 TGATTTTAAATTGAATTTTTTTACACTTTTGGTTAAAATAGATAATAGTTGAATGTCGACCTCAA
65 TGA-TTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCT-AA
* * ** * *
7789 G-AAGCAAGAAGAAAAAGATATTCATTGACAATAAAAGTCCA
128 GAAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAG-CCA
* * *
7830 TTTATAGTCACCTATGCCTTCAAGAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAAT
1 TTTATAGTCACC-AAGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAAT
* * * * * **
7895 TGATTGTAAGTTAAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAATAGATAATAATTGAATGTTTACCTTGG
65 TGATT-TAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTAAG
* * * *
7960 GAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTAGTAAGAAAAGTCTA
129 AAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAG-CCA
* * *
8001 TTTATAGTCACCTATA-CCTTCAAAAGCCTTATTACCCACTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAA
1 TTTATAGTCACC-A-AGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAA
* * * * * * * *
8065 GTGACTTTAAGTTGAAATGTTTTTT--GTTTTTTGTTAAAATATATCATAGTTGAATGTCTGCAT
64 TTGA-TTTAAGTTG-AAT-TTTTTTACATTTTTTGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCT
* *
8128 AAGAAAATAT-AGAGAAAAAGCCATTCATTAGCAAGAAAAGCCTA
126 AAGAAAACATGA-AGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGCC-A
* ** *
8172 TTTAGAGTCACCCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGGTTTATAATCTCATAAT
1 TTTATAGTCA-CCAAGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAAT
********** * * * *
8237 TGATTTGAAGTTNNNNNNNNNNATATTTTTTATTAAAATAGATTATAATTGAATGT-TAACCT-C
65 TGATTT-AAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCT-ACCTAA
* * ** *
8300 GAGAAACGTGACGAAAAAGATATTTATTGGCAA-AATAAGTCCA
128 GA-AAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAA-AAG-CCA
* * * * *
8343 TTTATAGTCATCCATGCCTTTAAAAGTCTTATTACTCGCTTTAAATGATTTTATAATCTCGTAAT
1 TTTATAGTCA-CCAAGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAAT
* * * * * * * *
8408 TCACTTTAAGTTGAATTTCTTTT-CATTTTTGGTTCAAAGAGTTTATAATTAAATAT-TCATCTC
65 TGA-TTTAAGTTGAATTT-TTTTACATTTTTTGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCT-ACCT-
* *
8471 AAG-AAGCATGAAGAAAAAGTCATTTC-TTGGCAAGAAAAGTCCA
126 AAGAAAACATGAAGAAAAAGCCA-TTCATTGGCAAGAAAAG-CCA
* * * * *
8514 TTTATAGTCACCCAAGCTTTCGAAAGCCTTATTACTCCCTTTAAATGGTTTTATAATATAATAAT
1 TTTATAGTCA-CCAAGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAAT
* * * * * *
8579 CGATTTGAAGTTGAATTTTTTTACA-TTTTTATTAAAAAAGATTA-AGATTGAAAGTCTGCC-AT
65 TGATTT-AAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTGTTAAAACAGATTATA-ATTGAATGTCTACCTAA
* * * * *
8641 GAGAAACGTGAAAAAAAAGTCATTCGTTGGCAA-AACAATTCCA
128 GA-AAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAA-AA-GCCA
* * * * * ** *
8684 TTTATAGTCACCCATGCCTTCACAAGTCTTATTATTAGCTTTAAATTCTTTTCTAATCTCATAAT
1 TTTATAGTCA-CCAAGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAAT
* * * * * * * * ** *
8749 TGTTTTTAAGTT-AATTTTTTCACA-TTTTAGCTAAAATAGATTACAGTTGAATATCTGTCTTAG
65 TG-ATTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTAAG
* * * *
8812 -GAA-ATGCAAAGAAAAAGTCATTCATTAGCATGAAAAGCCGA
129 AAAACATG--AAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGCC-A
** * * **********
8853 TTTATAGTCACCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATAGNNNNNNNNNNTCATAATT
1 TTTATAGTCACCAAGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATT
* ** * * *
8918 CATTTGAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTCATTAAAACAGATTATAATTAAATGTCAACCT-CGA
66 GATTT-AAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTAAGA
**
8982 GAAACATGAAGAAAAAGATATTCATTGGCAAGAAAAGTCCA
130 -AAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAG-CCA
* * * * * * *
9023 TTTATAATAACGCATA-CCTTCGAAAGCCTTATTACTGGTTTTAAATGATTTTATAATCTCATNN
1 TTTATAGTCAC-CA-AGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCAT-A
******** ** * * * * **
9087 NNNNNNNNAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTCATTATAACAGATTATTATTGAATGTCAATCTTG
63 ATTGATTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTAA
* * ** *
9152 GGAAACCTGAAGAAAAAGAAATTCATTGGTAAGAAAAGTCCA
128 GAAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAG-CCA
** * * * * *
9194 TTTGCAATCACCCATA-CCTTCGAAAGCCTTATTACTTGATTTAAATGGTTCTATAATCTCATAA
1 TTTATAGTCA-CCA-AGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAA
* ** * * * *
9258 TTAATTTCAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTCATTGAAACAGATTATAATTAAACGTCTACCT-T
64 TTGATTT-AAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTAA
* * * * ** *
9322 GAGAAACATAAAGAGAAAGTCATTTATTAACAAGAAAAGTCTA
128 GA-AAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAG-CCA
* ********** * *
9365 TTTATAGTCACCTATGCCTTCANNNNNNNNNNTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCGTAAT
1 TTTATAGTCACC-AAGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAAT
* * * * * *
9430 TGACTTTAAGTTG-ATTTTTTCTTCATTTTTGGTTAAAATAGATTATAATTAAATGTTTACC-AT
65 TGA-TTTAAGTTGAATTTTTT-TACATTTTTTGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTAA
* ** * * * *
9493 GAGAAACGTGAAGAAAAAGGTATTCACTAGCAACAAAAGTCTA
128 GA-AAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAG-CCA
* **********
9536 TTTATAGTCACCCAAGCCTTTAAAAGCCTTATTACTCGNNNNNNNNNNTTTTATAATCTCATAAT
1 TTTATAGTCA-CCAAGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAAT
* * * * *
9601 TGATTTGAAGTTGAA-TTTTTTACACTTTTAG-TAAAACAGATTATGATTAAATGTCTACCT-TG
65 TGATTT-AAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTAAG
* * *
9663 AAAAACTTGAAG-AAAAGCCTATTCATTGCCAAGAAAAGTTCA
129 -AAAACATGAAGAAAAAGCC-ATTCATTGGCAAGAAAAG-CCA
* * * * * *
9705 TTTATAGTTATCTATGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAGT
1 TTTATAGTCA-CCAAGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAAT
* * *
9770 CGATTTAAGTTGAATTTTTTT-TATTTTTTGTTAAAACAGATTATAATTGAACGGT-TACCTCAA
65 TGATTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTGTTAAAACAGATTATAATTGAA-TGTCTACCT-AA
* * ** *
9833 G-AAATATAAAGAAAAAGATATTCATTGACAAGAAAAGTCCA
128 GAAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAG-CCA
** * ** * * *
9874 TTTATAGTTGCGCATGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCTCTTTAAATGATTGTTATAATCACATAA
1 TTTATAGTCAC-CAAGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTT-TTATAATCTCATAA
* ** * * * * *
9939 TTGATTTCAAGTTGAATTTTTTTATATTTTTAATTAAAACAGGTTACAGTTGAATGTTTGCCTAA
64 TTGATTT-AAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTAA
* **************************
10004 GAAAATATGAAGAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
128 GAAAACATGAAGAAA----AAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGCCA
*****************************************************************
10049 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
1 TTTATAGTCACCAAGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATT
**************************************** ** * * * * *
10114 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTA-AA-TGGTTTTATAATCTCATA
66 GATTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCT-ACCTAAGA
* ** *** *** *** ** ***
10177 ATTGATTTGAAG-TTGAGTTTTTTTACACTTTTTATTAAAATAGA
130 A--AACATGAAGAAAAAG--CCATT-CA-TTGGCAAGAAAAGCCA
**** *** * * *** * *
10221 TTATAATTGAATGTCTACTTC-AGGAAACGAAAAGAAAAAGATATTCATTGGCAAGAAAAGTCTA
1 TT-T-A-T--A-GTC-AC--CAAGCCTTC-AAAAG----CCTTATT-ACTCGCTTTAAATG-GT-
* * ** * * * * * *
10285 TTTATAGTCAC-CCATGGCTTTAAAAGCCTT--ATTACCCGTTTTAAATGGTTTTCAAATCTCAT
49 TTTATAATCTCATAATTGATTT--AAG--TTGAATT----TTTTTACAT--TTTT----TGTTA-
* * * ** * * ***
10347 AAGC-GACTT-TAAGTAGAATTTCTTTTCATTTTTAGCTAAAACAGGTTACAGTTGAATGTTTGC
99 AAACAGA-TTATAA-TTGAATGTC---T-A-CCTAAG--AAAACA--TGA-A---GAA--AAAGC
***
10410 CTAAGAAAATAT-G-AAGAAAAAGCCA
147 C--A-TTCAT-TGGCAAG-AAAAGCCA
* * * * * *
10435 TTCATTG-GA--AAG-----AAAAGCCTATTTATAGTCACCCAAGCCTTCGAAA-GCTCTATTAC
1 TTTATAGTCACCAAGCCTTCAAAAGCC---TTAT--T-ACTC--G-CTT-TAAATGGT-T-TTA-
* * * * * * * * ** *** ** *
10491 TCA-CT-TTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTGA-AGTTGAATTGTTTTTAC-TTTTTT
53 TAATCTCAT-AATTGATTTA-AGT-T--GAATT-TTTTTACA-TT-TTTTGTTAAAACAGATTAT
* * * ** * * * ** *
10552 TATTAAAATAGATTATAATTGAATGTTTACCTCAAGAAACGGAAAGAAAAAGATATTTATTGGCA
110 AATT-GAAT-G--TCTACCT-AA-G---A---AAACA---TG-AAGAAAAAGCCATTCATTGGCA
10617 AGAAAAGTCCA
159 AGAAAAG-CCA
* * *********** * **
10628 TTTATTGTCACTTATNNNNNNNNNNGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTGTAAGATCATAAT
1 TTTATAGTCAC-CAAGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAAT
* * * * * * * * *
10693 TGACTGTAACTCGAATTTTTTT-TATTTATGGTTAAAACAGATTATAATTGAATATATACCT-TG
65 TGA-TTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTAAG
* *
10756 AGAAACGTGAAGAAAAAGCCATTCATTGCCAAGAAAAGTCCA
129 A-AAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAG-CCA
* * **********
10798 TTTATAGTCACCCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTGCTCGCTTNNNNNNNNNNTATAATCTCATAAT
1 TTTATAGTCA-CCAAGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAAT
* * *** * * *
10863 CGATTTGAAGTTGAATTTTTTTACA-TTTTTATTAAGGTAGATTATCATTGAATATCTACCT-CG
65 TGATTT-AAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTAAG
** *** *
10926 AGAAACATGAAG-AAAAGTAATTCATTGATGAGAAAACTCCA
129 A-AAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAA-GCCA
10967 TTTATAGTCACCTATA-CCTTCAAAA-CCATTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATA
1 TTTATAGTCACC-A-AGCCTTCAAAAGCC-TTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATA
* * * *
11030 GTTGATTTAAGTTGAATTTTTTT-TATTTTTT-TTAAAACAGATTATAATTGAATGTTTTCCTCA
63 ATTGATTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCT-A
* * ** * *
11093 AG-GAACGT-ACAGAAAAAGATATTCATTGACAAGAAAAGTCTA
127 AGAAAACATGA-AGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAG-CCA
* ** * * *
11135 TTTATAATTGCTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCACATAAT
1 TTTATAGTCAC-CAAGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAAT
* * * * * * * * * * * **
11200 TAATTTCAAATTGAATTTTTTTATATCTTTGGATAAAACAGATAATATTTCAATGTTTGCCTCGG
65 TGATTT-AAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTAAG
* * **
11265 GAAACATGAAGAAAAAGCCATTTATCAAG-AAGAAAAGTCCA
129 AAAACATGAAGAAAAAGCCATTCAT-TGGCAAGAAAAG-CCA
* * * ** * * *
11306 TTTAAAGTCACCCATGCTTTTGAAAGCCTTATTACTCCCTTTAAA-AGTTGTTATAGTCTCATAA
1 TTTATAGTCA-CCAAGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTT-TTATAATCTCATAA
* * * * * * * **
11370 TTGATTTTAAGTTGAATATATTTACACTTTTAGTTAAAACAAATAATAGTTGAATACCTACCTCA
64 TTGA-TTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCT-A
* ** *
11435 AGAAGCACA--AAGAAAAAGATATTCATTGGCAAAAAAAGTCCA
127 AGAA-AACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAG-CCA
* * * * *
11477 TTTGTAGTAACCTATGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAAT
1 TTTATAGTCACC-AAGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAAT
* * * * * * * * *
11542 TCATTAGAAGTTGAATTTTTTTACACTTTTGGTTAAAACATATAATAATTGGATGTCTGCCTTAG
65 TGATT-TAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTAAG
* * * * *
11607 GAAACATGATGAAAAAGCCATTCATTAGTAAGAAAAGTCTA
129 AAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAG-CCA
* * * * * *
11648 TTTATAGTCACCTATGCCTTCAAAAGCCTTATTACCCACTCTAAATGATTTTATAATCTCATAAG
1 TTTATAGTCACC-AAGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAAT
* * * **
11713 TGACTTTAAATTGAATTGTTTTT-CA-TTTTTGTTTAAAACATATTATAGTTGAATGTCGGCCTA
65 TGA-TTTAAGTTGAATT-TTTTTACATTTTTTG-TTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTA
* * * *
11776 AGGAAACAT-AGAGAAAAAGCCATTCATTAGTAAGAAGAGCCCA
127 AGAAAACATGA-AGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAG-CCA
* * * * * **
11819 TTTAGAGTCATCTAAGCCTTCGAAAGCCGTATTACTCACTTTAAATAATTTTATAATCTCATAAT
1 TTTATAGTCA-CCAAGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAAT
* * ** * * * * **
11884 TGATTTGAAGTTGAATTTATTTACATTCTTCATTAAAATAAATTATAATTGAATGCCAACCTTGG
65 TGATTT-AAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTAAG
* * ** * * *
11949 GAAACATGAAGAAAAGGATATTCATTGACAAAAAAAGTGCA
129 AAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAG-CCA
* * * *
11990 TTTATATTCACCTATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGG---T-T--T-T-ATAAT
1 TTTATAGTCACC-AAGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAAT
* * * * * * * *
12047 TGACTTTAATTTGAATTTCTTTT-CATTTTTAGTTTAAATAGCTTATAATTAAATGTTTACCT-C
65 TGA-TTTAAGTTGAATTT-TTTTACATTTTTTGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTAA
*
12110 GAGAAACATGAAGAAAAAGTCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCA
128 GA-AAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAG-CCA
* * * * *
12153 TTTGTAGTCATCCAAGCCTTCAAAAACCTTATTACTCCCTTTAAATGGTTTTATAATCTAAAAAT
1 TTTATAGTCA-CCAAGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAAT
* * * * ** *
12218 CGATTTGAAGTTGAATTTTTTTATA-TTTTTATTAAAAAAGATTAGGATTGAATGTTTACCTTAA
65 TGATTT-AAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACC-TAA
* * * *
12282 -AAAACGTGAA-AAAAAGTCATTCATTTG-TAGAAAAAGTCCA
128 GAAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAG-AAAAG-CCA
* *
12322 TTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTCA-AATCTCATAA
1 TTTATAGTCAC-CAAGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTT-ATAATCTCATAA
* * * * * * * *
12386 GTGACTTTAACTAGAATTTTTTTACATTTTTGGTTCAAATAGATTATAGTTGAATGTCTGCCTAA
64 TTGA-TTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTAA
* * * * * *
12451 GGATACAAGAAGAGAAAGCCATTCATTAGTAAGAAAAGCCTA
128 GAAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGCC-A
* * * * *
12493 TTTATAGTCACCCAAGACTTCAAAATCCCTATTACTCGCTTTAAAAGCTTTTATAATCTCATAAT
1 TTTATAGTCA-CCAAGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAAT
* * * * *
12558 TAATTTGAAGTTGAATTGTTTTTATATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAAAGTCTACCTTA
65 TGATTT-AAGTTGAATT-TTTTTACATTTTTTGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTAA
* **
12623 GAACACATGAAGAAAAAGATATTCATTGGCAAGAAAAGTCCA
128 GAAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAG-CCA
* * ** *
12665 TTTATTGTCACCTATA-CCTTCAAAAGCTTTATTACTCGCTTTAAATTATTTTATAATATCATAA
1 TTTATAGTCACC-A-AGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAA
* * * * *
12729 TTGACTTTAACTCGAATTTTTTTTC--TTTTGGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCT-T
64 TTGA-TTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTAA
* * * * **
12791 GAGAAACGTAAAGTAAAAGCCATTCATTAGCAAGAAAAGTGTA
128 GA-AAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAG-CCA
*
12834 TTTATAGTCACACAAGCCTTCGAAAG-CTTCATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAA
1 TTTATAGTCAC-CAAGCCTTCAAAAGCCTT-ATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAA
** * ** * *
12898 TCAATTTGAAGTTGAATTTTTTTACA-TTTTTATTAAGGCAAATTATGATTGAATGTCTACCTAA
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* * * ** *
12962 GGAAACATAAAGAAAAAGTCATTCATTGGTTAGAAAAGTTCA
128 GAAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAG-CCA
* *
13004 TTTATAGTCACCTATGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTCAAATGGTTTTA-AGATCTCATAG
1 TTTATAGTCACC-AAGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATA-ATCTCATA-
** * *
13068 A-TGATTTAAGTTGAATTTTTTTATGTTTTTTGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTTTTCCTCA
63 ATTGATTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCT-A
* **
13132 AG-GAACATGAAGAAAAAGATATTCATTGGCAAGAAAAGCCCA
127 AGAAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAG-CCA
* * ** * * * * *
13174 TTTATAGTCGTCCATGCCTTTGAAAGCCTTATGACTTGCTTTAAATTGTTTTATAATCACATAGT
1 TTTATAGTC-ACCAAGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAAT
* * ** * * * * **
13239 TGATTTCAAATTAAATTTTTTTGTATTTTTGGATAAAACAGATAATAATTCAATGTCTACCTTGG
65 TGATTT-AAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTAAG
* *
13304 GAAACATGAAGAAAAAGTCATTCATTAGG-AAGAAAAGTCCA
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* * * * *
13345 TTTATAGTCACCTATGCCTTCGAAAGCTTTATTACTCGCTTTCAATGGCTTTATAATCTCATAAT
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* * * * * * *
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* * * * *
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* ** * *
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* *
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* *
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* * * * * *
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* * * * * * **
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* * * * * *
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* * *
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* *
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* * * *
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* *
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* * * * *
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* * * * * * *
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*
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* * * **
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* * * **
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* * * * **
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* * ** * * * * * *
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* * * *
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* * * * * * *
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* * *
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* * * * * *
3651 TACATTTTTTGTTAAAGCAGATTATAATTGAATG-CATGCCTCAAGAAACGTGAAGAGAAAATCA
257 TACATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTC-TACCTTAAGAAACATGAAGA-AAAAGCA
* * *
3715 TTCATTGGTAGGAAAAGTCCA
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** * * * * *
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* * ** * *
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66 TGA-TTTAAGTTGAATT-TTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTAA
* * *
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* * ** * * * *
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*
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* * * * * *
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** * * *
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* * * * * * * *
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* * *
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* * * * * * * *
4416 TTTAAAGTTACCCAAGCCCTCAAAAGCCTTATTATTGGCTTAAAATG-TTTTATAATCTCATACT
1 TTTATAGTCACCCATGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGATTTTATAATCTCATAAT
* * * * ** * * * *
4480 GGATTCGAAGTTGAATTGTTTTGCATTTTTTATTAAAACAAATTTTAATAGAATGTCTACCTCAG
66 TGATT-TAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTAAG
* * ** * * * * ** * * ** *
4545 -GAA-ATGAGCAGGAAAAGATATTCGTTAGTAAGAGGATAGTTTATTTATTGGGCA-TTATG-CT
130 AAAACATGA--AGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGA--AAAGCCTATTTA-TAGTCACCCAAGCCT
*
4606 TCAAAAGCTCTTATTACTCGCTTTTAAAATGG--TT-TACTCT-ATAATTTGAGCTTT-AAGTTG
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* ** * * * * * * * *
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249 -AA-TTTTTTTACATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTAAGAAACATGAAG
**
4729 AAAAATG-ATTCATTGGCTAA-AAAAAGTTTA
312 AAAAA-GCATTCATTGGC-AAGAAAAA-TCCA
** * *
4759 TTTATAGTCATACATGCCTTCGAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAAGGGTTTTATAATCTCA-AT
1 TTTATAGTCACCCATGCCTTC-AAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGATTTTATAATCTCATA-
* * * * * * *
4823 TTTGGGACTTTAAGTTGAATTTTTTTATATTTTTAGTTAAAACAGATTACAGTTGAATATCTGCC
64 ATT--GA-TTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACC
* * * * * *** *
4888 TAGGGAAACA--AAAAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAATCCTACTTATAGTCAGTAAAGCATT
126 TAAGAAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGCCTATTTATAGTCACCCAAGCCTT
* * * ***********
4951 CAAAAGTCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCAAAATTGNNNNNNNNNNAAATTTTT
191 CAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTGAAGTTGAATTTTT
* * ** * *
5016 TTATATTTTTTATTAAAATAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGTGAAACGA-GAAGTAAAAGAT
256 TTACATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTAAGAAAC-ATGAAGAAAAAG-C
* ** *
5080 ATTTATTGATAAGAAAAGTCCA
319 ATTCATTGGCAAGAAAAATCCA
* * * * * *
5102 TTTATAGTCATCTATGCCGTCAAAAGCCTTATTACCCGCTTTAAATGGTTTTATAATGTCATAAT
1 TTTATAGTCACCCATGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGATTTTATAATCTCATAAT
* * * * * *
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* * * ** * * *
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********** *
5295 AGCCTTATTACTCGCTTTAAANNNNNNNNNNATCTCATAATTGATTTGAAATTGAATTTTTCTTA
195 AGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTGAAGTTGAATTTTT-TTA
* * * * * * *
5360 TATTGTTTATTAAAATAGATTATAATTGAATGTCTATCTTAGGAAACACGAGGAAAAA-CATATT
259 CATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTAAGAAACATGAAGAAAAAGC--ATT
*
5424 CATTGGTAA-AAAAATTCCA
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* * * * **
5443 TTTGTAGTCACCTATGACTTCAAAAACCTTATTACTTTCTTTAAATGATTTTATAATCTCATAAT
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* * * * *
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* * * * * ** * *
5572 G-AAACGTAAAGAAAAAGCAACTCATTGGTAAGAAAAGTTTATTTATAGTCACCCATGCCTTCGA
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** * * * * * **
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** * * *
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* * * * * * *
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* * * * *
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* * *** *
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** * * *
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* * * * * * *
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* * *
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** ** * *
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* * * * * * * *
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* **
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129 GAAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGCCTATTTATAGTCACCCAAGCCTTCAA
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7002 AAGCCTTATTACTCTCTTTAAATGCTTATATAATATCATAATTTATTTGAAGTTGAATTTTCTTA
194 AAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTGAAGTTGAATTTTTTTA
* * * * ** * *
7067 CATTTTTTATGAAAACAAATTATAATTGAATGTCTACTTTGAGAAATGTAAAGAAAAAGGTATTC
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* *
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* ********** *
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* ** * * * *
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* * * * *
7554 TTGATCTAAGTTGAATTTTTTTATGC-TTTTT-GTTAAAA-AAATTATAATTGAATATTTTCCTT
65 TTGATTTAAGTTGAATTTTTTTA--CATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACC-T
* ** ** ** * * ** * *
7616 AAG-GAATGTGAAGAAAAAGATATTCATTGATAAGAAAAGTCC-ACTCATAGTTGCTCATGCCTT
127 AAGAAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAG-CCTATTTATAGTCACCCAAGCCTT
* ** * * * *
7679 CGAAAGCCTTATTACTCATTTTAAATAGTTTTATAATCACATAATTGATTTTAAATTGAATTTTT
191 CAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTGAAGTTGAATTTTT
* ** * * * * * * * *
7744 TTACACTTTTGGTTAAAATAGATAATAGTTGAATGTCGACCTCAAGAAGCAAGAAGAAAAAGATA
256 TTACATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTAAGAAACATGAAGAAAAAG-CA
* * *
7809 TTCATTGACAATAAAAGTCCA
320 TTCATTGGCAAGAAAAATCCA
* * * *
7830 TTTATAGTCACCTATGCCTTCAAGAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAAT
1 TTTATAGTCACCCATGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGATTTTATAATCTCATAAT
* * * * **
7895 TGATTGTAAGTTAAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAATAGATAATAATTGAATGTTTACCTTGG
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* * * * *
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130 AAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGCCTATTTATAGTCACCCA-AGCCTTCAA
* * * *
8024 AAGCCTTATTACCCACTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAAGTGACTTT-AAGTTGAAATGTTTT
194 AAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGA-TTTGAAGTTG-AAT-TTTT
* * * * * * * * *
8088 TT--GTTTTTTGTTAAAATATATCATAGTTGAATGTCT-GCATAAGAAA-ATATAGAGAAAAAGC
256 TTACATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTAAGAAACAT-GA-AGAAAAAG-
* *
8149 CATTCATTAGCAAG-AAAAGCCTA
318 CATTCATTGGCAAGAAAAATCC-A
* * ** **
8172 TTTAGAGTCACCCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGGTTTATAATCTCATAAT
1 TTTATAGTCACCCATGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGATTTTATAATCTCATAAT
********** * ** * *
8237 TGATTTGAAGTTNNNNNNNNNNATATTTTTTATTAAAATAGATTATAATTGAATGT-TAACCT-C
66 TGATTT-AAGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCT-ACCTAA
* * ** * * *
8300 GAGAAACGTGACGAAAAAGATATTTATTGGCAA-AATAAGTCC-ATTTATAGTCATCCATGCCTT
129 GA-AAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAA-AAG-CCTATTTATAGTCACCCAAGCCTT
* * * * *
8363 TAAAAGTCTTATTACTCGCTTTAAATGATTTTATAATCTCGTAATTCACTTT-AAGTTGAATTTC
191 CAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGA-TTTGAAGTTGAATTT-
** * * * * * * * *
8427 TTTT-CATTTTTGGTTCAAAGAGTTTATAATTAAATAT-TCATCTCAAGAAGCATGAAGAAAAAG
254 TTTTACATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCT-ACCTTAAGAAACATGAAGAAAAAG
*
8490 TCATTTC-TTGGCAAGAAAAGTCCA
318 -CA-TTCATTGGCAAGAAAAATCCA
* * * * * * *
8514 TTTATAGTCACCCAAGCTTTCGAAAGCCTTATTACTCCCTTTAAATGGTTTTATAATATAATAAT
1 TTTATAGTCACCCATGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGATTTTATAATCTCATAAT
* * * * * *
8579 CGATTTGAAGTTGAATTTTTTTACATTTTT-ATTAAAAAAGATTA-AGATTGAAAGTCTGCC-AT
66 TGATTT-AAGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATTATA-ATTGAATGTCTACCTAA
* * * * * *
8641 GAGAAACGTGAAAAAAAAGTCATTCGTTGGCAA-AACAATTCC-ATTTATAGTCACCCATGCCTT
129 GA-AAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAA-AA-GCCTATTTATAGTCACCCAAGCCTT
* * * * ** * * *
8704 CACAAGTCTTATTATTAGCTTTAAATTCTTTTCTAATCTCATAATTGTTTTTAAGTT-AATTTTT
191 CAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTGAAGTTGAATTTTT
* * * * * * ** *
8768 TCACA--TTTTAGCTAAAATAGATTACAGTTGAATATCTGTCTT-AGGAA-ATGCAAAGAAAAAG
256 TTACATTTTTTA-TTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTAAGAAACATG--AAGAAAAAG
* * *
8829 TCATTCATTAGCATG-AAAAGCCGA
318 -CATTCATTGGCAAGAAAAATCC-A
* ** * **********
8853 TTTATAGTCA-CCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCACTTTAAAT-AGNNNNNNNNNNTCATAA
1 TTTATAGTCACCCATGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGA-TTTTATAATCTCATAA
* ** * * *
8916 TTCATTTGAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTCATTAAAACAGATTATAATTAAATGTCAACCT-C
65 TTGATTT-AAGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTAA
** * * *
8980 GAGAAACATGAAGAAAAAGATATTCATTGGCAAGAAAAGTCC-ATTTATAATAACGCATA-CCTT
129 GA-AAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAG-CCTATTTATAGTCACCCA-AGCCTT
* * * * **********
9043 CGAAAGCCTTATTACTGGTTTTAAATGATTTTATAATCTCATNNNNNNNNNNAAGTTGAATTTTT
191 CAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTGAAGTTGAATTTTT
* * * * * ** * *
9108 TTACATTTTTCATTATAACAGATTATTATTGAATGTCAATCTTGGGAAACCTGAAGAAAAAGAAA
256 TTACATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTAAGAAACATGAAGAAAAAG-CA
* *
9173 TTCATTGGTAAGAAAAGTCCA
320 TTCATTGGCAAGAAAAATCCA
** * * * * * * *
9194 TTTGCAATCACCCATACCTTCGAAAGCCTTATTACTTGATTTAAATGGTTCTATAATCTCATAAT
1 TTTATAGTCACCCATGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGATTTTATAATCTCATAAT
* ** * * * *
9259 TAATTTCAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTCATTGAAACAGATTATAATTAAACGTCTACCT-TG
66 TGATTT-AAGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTAAG
* * * * ** * * * *
9323 AGAAACATAAAGAGAAAGTCATTTATTAACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACCTATGCCTTCAN
130 A-AAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGCCTATTTATAGTCACCCAAGCCTTCAA
********* * *
9388 NNNNNNNNNTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCGTAATTGACTTT-AAGTTG-ATTTTTTC
194 AAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGA-TTTGAAGTTGAATTTTTT-
* ** * * * * * * *
9451 TTCATTTTTGGTTAAAATAGATTATAATTAAATGTTTACCATGAGAAACGTGAAGAAAAAGGTAT
257 TACATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTAAGAAACATGAAGAAAAA-GCAT
* * * * *
9516 TCACTAGCAACAAAAGTCTA
321 TCATTGGCAAGAAAAATCCA
* * **********
9536 TTTATAGTCACCCAAGCCTTTAAAAGCCTTATTACTCGNNNNNNNNNNTTTTATAATCTCATAAT
1 TTTATAGTCACCCATGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGATTTTATAATCTCATAAT
* * * * *
9601 TGATTTGAAGTTGAA-TTTTTTACACTTTTAG-TAAAACAGATTATGATTAAATGTCTACCT-TG
66 TGATTT-AAGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTAAG
* * * * * * *
9663 AAAAACTTGAAG-AAAAGCCTATTCATTGCCAAGAAAAG-TTCATTTATAGTTATCTATGCCTTC
130 -AAAACATGAAGAAAAAGCC-ATTCATTGGCAAGAAAAGCCT-ATTTATAGTCACCCAAGCCTTC
* * * *
9726 AAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAGTCGATTT-AAGTTGAATTTTTT
192 AAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTGAAGTTGAATTTTTT
* * * * * * *
9790 T-TATTTTTTGTTAAAACAGATTATAATTGAACGGT-TACCTCAAGAAATATAAAGAAAAAGATA
257 TACATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAA-TGTCTACCTTAAGAAACATGAAGAAAAAG-CA
* *
9853 TTCATTGACAAGAAAAGTCCA
320 TTCATTGGCAAGAAAAATCCA
** * ** * *
9874 TTTATAGTTGCGCATGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCTCTTTAAATGATTGTTATAATCACATAA
1 TTTATAGTCACCCATGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGATT-TTATAATCTCATAA
* ** * * * * *
9939 TTGATTTCAAGTTGAATTTTTTTATATTTTTAATTAAAACAGGTTACAGTTGAATGTTTGCCTAA
65 TTGATTT-AAGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTAA
* ***************************
10004 GAAAATATGAAGAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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*****************************************************************
10069 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
171 TTTATAGTCACCCAAGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAAT
******************** * * ** *
10134 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTAAATGGTTTTA-TAATCTCATAATTGAT--TTGAA-GT-TGAG
236 TGATTTGAAGTTGAATTTTTTTACAT-TTTTTATTAA-AACA-GATT-ATAATTGAATGTCT-A-
** *** * * * ** * *
10194 TTTTTTTACACTTTTTATTAAAATAG-ATTATAATTGAATGTCTACTTCAGGAAACGAA--AA
295 CCTTAAGAAAC--ATGAAGAAAA-AGCA-T-TCATTG---G-C-A----A-GAAA--AATCCA
*** * ** * *** * * *
10254 GAAAAAGAT-ATTCATTGGCAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACCCATGGCTTTAAAAGCCTTATT
1 TTTATAG-TCACCCA-TGCCTTCAAAAG-C--CTTAT--T-A--C-TCGCTTT--AA-----ATG
** * *
10318 ACCCGTTTTAAATGGTTTTCAAATCTCATAAGCGACTTTAAGTAGAATTTCTTTT-CATTTTTAG
48 A----TTTT--A------T--AATCTCATAATTGA-TTTAAGTTGAATTT-TTTTACATTTTTGG
* * * * * * * *
10382 CTAAAACAGGTTACAGTTGAATGTTTGCCTAAGAAAATATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGAAAG
97 TTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTAAGAAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAG
* *
10447 AAAAGCCTATTTATAGTCACCCAAGCCTTCGAAAG-CTCTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATA
162 AAAAGCCTATTTATAGTCACCCAAGCCTTCAAAAGCCT-TATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATA
* *
10511 ATCTCATAATTGATTTGAAGTTGAATTGTTTTTACTTTTTTTATTAAAATAGATTATAATTGAAT
226 ATCTCATAATTGATTTGAAGTTGAATT-TTTTTACATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAAT
* * * * * *
10576 GTTTACCTCAAGAAAC-GGAAAGAAAAAGATATTTATTGGCAAGAAAAGTCCA
290 GTCTACCTTAAGAAACATG-AAGAAAAAG-CATTCATTGGCAAGAAAAATCCA
* ** ********** * * **
10628 TTTATTGTCACTTATNNNNNNNNNNGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTGTAAGATCATAAT
1 TTTATAGTCACCCATGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGATTTTATAATCTCATAAT
* * * * * * * *
10693 TGACTGTAACTCGAATTTTTTT-TATTTATGGTTAAAACAGATTATAATTGAATATATACCT-TG
66 TGA-TTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTAAG
* * *
10756 AGAAACGTGAAGAAAAAGCCATTCATTGCCAAGAAAAGTCC-ATTTATAGTCACCCAAGCCTTCG
130 A-AAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAG-CCTATTTATAGTCACCCAAGCCTTCA
* ********** *
10820 AAAGCCTTATTGCTCGCTTNNNNNNNNNNTATAATCTCATAATCGATTTGAAGTTGAATTTTTTT
193 AAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTGAAGTTGAATTTTTTT
*** * * ** *
10885 ACA-TTTTTATTAAGGTAGATTATCATTGAATATCTACCTCGAGAAACATGAAG-AAAAGTAATT
258 ACATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTAAGAAACATGAAGAAAAAG-CATT
*** *
10948 CATTGATGAGAAAACTCCA
322 CATTGGCAAGAAAAATCCA
* * * *
10967 TTTATAGTCACCTATACCTTCAAAA-CCATTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAG
1 TTTATAGTCACCCATGCCTTCAAAAGCC-TTATTACTCGCTTTAAATGATTTTATAATCTCATAA
* * * *
11031 TTGATTTAAGTTGAATTTTTTT-TATTTTT-TTTAAAACAGATTATAATTGAATGTTTTCCTCAA
65 TTGATTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCT-AA
* * ** * * * ** * * *
11094 G-GAACGT-ACAGAAAAAGATATTCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAATTGCTCATGCCTTCG
129 GAAAACATGA-AGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGCCTATTTATAGTCACCCAAGCCTTCA
* * * *
11157 AAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCACATAATTAATTTCAAATTGAATTTTTTT
193 AAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTGAAGTTGAATTTTTTT
* ** * * * * * ***
11222 ATATCTTTGGA-TAAAACAGATAATATTTCAATGTTTGCCTCGGGAAACATGAAGAAAAAGCCAT
258 ACAT-TTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTAAGAAACATGAAGAAAAAG-CAT
* ** *
11286 TTATCAAG-AAGAAAAGTCCA
321 TCAT-TGGCAAGAAAAATCCA
* * ** * * *
11306 TTTAAAGTCACCCATGCTTTTGAAAGCCTTATTACTCCCTTTAAAAG-TTGTTATAGTCTCATAA
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* * * * * * * **
11370 TTGATTTTAAGTTGAATATATTTACACTTTTAGTTAAAACAAATAATAGTTGAATACCTACCTCA
65 TTGA-TTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCT-A
* ** * * * * *
11435 AGAAGCACA--AAGAAAAAGATATTCATTGGCAAAAAAAGTCC-ATTTGTAGTAACCTATGCCTT
128 AGAA-AACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAG-CCTATTTATAGTCACCCAAGCCTT
* * * *
11497 CAAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTCATTAGAAGTTGAATTTTT
191 CAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTGAAGTTGAATTTTT
* ** * * * * * *
11562 TTACACTTTTGGTTAAAACATATAATAATTGGATGTCTGCCTTAGGAAACATGATGAAAAAGCCA
256 TTACATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTAAGAAACATGAAGAAAAAG-CA
* * * *
11627 TTCATTAGTAAGAAAAGTCTA
320 TTCATTGGCAAGAAAAATCCA
* * * * *
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1 TTTATAGTCACCCATGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGATTTTATAATCTCATAAT
* * * * **
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* * * * * * * * *
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* * ** *
11841 AAAGCCGTATTACTCACTTTAAATAATTTTATAATCTCATAATTGATTTGAAGTTGAATTTATTT
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* * * * * * ** * *
11906 ACATTCTTCATTAAAATAAATTATAATTGAATGCCAACCTTGGGAAACATGAAGAAAAGGATATT
258 ACATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTAAGAAACATGAAGAAAAAG-CATT
* *
11971 CATTGACAA-AAAAAGTGCA
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* * * * *
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1 TTTATAGTCACCCATGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGATTTTATAATCTCATAAT
* * * * * * * *
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* * *
12110 GAGAAACATGAAGAAAAAGTCATTCATTGGCAAGAAAAGTCC-ATTTGTAGTCATCCAAGCCTTC
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* * * * *
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* * ** * * *
12239 TATA-TTTTTATTAAAAAAGATTAGGATTGAATGTTTACCTTAAAAAACGTGAA-AAAAAGTCAT
257 TACATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTAAGAAACATGAAGAAAAAG-CAT
* *
12302 TCATTTG-TAGAAAAAGTCCA
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* * *
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* * * * * * *
12451 GGATACAAGAAGAGAAAGCCATTCATTAGTAAGAAAAGCCTATTTATAGTCACCCAAGACTTCAA
129 GAAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGCCTATTTATAGTCACCCAAGCCTTCAA
* * * * *
12516 AATCCCTATTACTCGCTTTAAAAGCTTTTATAATCTCATAATTAATTTGAAGTTGAATTGTTTTT
194 AAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTGAAGTTGAATT-TTTTT
* * *
12581 ATATTTTTTATTAAAACAGATTATAATTGAAAGTCTACCTT-AGAACACATGAAGAAAAAGATAT
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*
12645 TCATTGGCAAGAAAAGTCCA
321 TCATTGGCAAGAAAAATCCA
* * * * * *
12665 TTTATTGTCACCTATACCTTCAAAAGCTTTATTACTCGCTTTAAATTATTTTATAATATCATAAT
1 TTTATAGTCACCCATGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGATTTTATAATCTCATAAT
* * * *
12730 TGACTTTAACTCGAATTTTTTTTC--TTTTGGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCT-TG
66 TGA-TTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTAAG
* * * * ** * *
12792 AGAAACGTAAAGTAAAAGCCATTCATTAGCAAGAAAAGTGTATTTATAGTCACACAAGCCTTCGA
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**
12857 AAG-CTTCATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATCAATTTGAAGTTGAATTTTTTT
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** * * *
12921 ACA-TTTTTATTAAGGCAAATTATGATTGAATGTCTACC-TAAGGAAACATAAAGAAAAAGTCAT
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** * *
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* * *
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** * * *
13068 A-TGATTTAAGTTGAATTTTTTTATGTTTTTTGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTTTTCCTCA
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* ** * ** * **
13132 AG-GAACATGAAGAAAAAGATATTCATTGGCAAGAAAAGCCCATTTATAGTCGTCCATGCCTTTG
128 AGAAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGCCTATTTATAGTCACCCAAGCCTTCA
* * * * * * * *
13196 AAAGCCTTATGACTTGCTTTAAATTGTTTTATAATCACATAGTTGATTTCAAATTAAATTTTTTT
193 AAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTGAAGTTGAATTTTTTT
** * * * **
13261 GTATTTTTGGA-TAAAACAGATAATAATTCAATGTCTACCTTGGGAAACATGAAGAAAAAGTCAT
258 ACATTTTT-TATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTAAGAAACATGAAGAAAAAG-CAT
*
13325 TCATTAGG-AAGAAAAGTCCA
321 TCATT-GGCAAGAAAAATCCA
* * * * **
13345 TTTATAGTCACCTATGCCTTCGAAAGCTTTATTACTCGCTTTCAATGGCTTTATAATCTCATAAT
1 TTTATAGTCACCCATGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGATTTTATAATCTCATAAT
* * * * * *
13410 TGATTTGGAGTTG-ATTTCTTTTACATTTTTGGTTAAAACATAATACAGTTGAATGTCTGCCTAA
66 TGATTT-AAGTTGAATTT-TTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTAA
*
13474 GGAAAC
129 GAAAAC
13480 TT
Statistics
Matches: 8717, Mismatches: 2313, Indels: 840
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (340 bp):
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TGATTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTAAGA
AAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGCCTATTTATAGTCACCCAAGCCTTCAAAA
GCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTGAAGTTGAATTTTTTTACA
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Done.