Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: NW_018397256.1 Herrania umbratica cultivar Fairchild unplaced genomic scaffold, ASM216827v2 scaffold_56.0, whole genome shotgun sequence
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Warning! 99179 characters in sequence are not A, C, G, or T
File 2 of 29
Found at i:150068 original size:171 final size:169
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Indices: 149814--150122 Score: 410
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149804 CTTTATAAAT
* * * *
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* *
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* *
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*
150113 GCCTTTTTAC
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Statistics
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170 12 0.10
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Consensus pattern (169 bp):
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AAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATAAAAAAGAAAAGTCTATTTCTACTCACTATACCTTGAAAGC
CTTATTACCTACTTTAAGTAGATTTATAAGGTGTTCATC
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* * * * * * *
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* * ** * * *
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* * * * *
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* * *
154861 AACATGAACCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCTAGTTATAGTCACTCATGCCTTTAAAAG
64 AACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAG
* * ** *
154926 CGTTGTTACTCTCTTTAAGCAGATTTATAA-CTTTATAAATGA
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* * * **
154968 TTTTAAATTGAATTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACAAATCATAATTTGTTGTTTGCACCAGGAAA
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* * * * * *
155033 CGTGAAGCGAAAGCCAAT-TATTAACAAGAAAAGTCCATTTAT-GCACACTCATGGCTCTT--AA
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* * ** * * *
155094 AGTCTTGCTACT-TGTATTAAAT-GGTTTATAATATTATAAATAA
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** * * * * * * * *
155137 TTTTAAATCAAAGTTCTATACATATATAGTTAAAACATATCATACTTTGATGTTTGCATTAGGAA
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* * ** ** ** *
155202 ACTTGAAACAAAAGTAATTTATTGACAAGAAAAGT-TCAACTATAGTCACTCAAGCCTTCAAAAG
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* * * * * *
155266 CATTTTTACTCTCTTTAAGTAGATTTGTAA-CTTTATAAATGA
129 CCTTGTTACTCACTTTAAATAGTTTTATAATC-TTATAAATGA
* * * * *
155308 TTTTAAATTGAATTTGACTTTTGATTTTTAGTTAAAACATATCATAATCT-ATTGTTTGCATCGA
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*** * * * * * **
155372 GG-GGTAT-ATAGCAAAAGCCATCCATTGACAATAACAGTCCATTTAAAGTCACTCATGGCTTTG
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** * * * * *
155435 AAAGCCTCATAACTCACTTTAAGTGGATTTATAAAT-TTTTAAATGA
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* * * * * *
155481 TGTTCAATTGAATTTGTTTTACATTTTTGTTTAAACCATG-TCCTAATTTAATGTTTGCATT-GG
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* * ** * ** * ** * * ** *
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* **
155608 AAGCCTTGTTATTTGCTTTAAAT-GATTTTATAATCTTATAAATGA
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* * * * * * * *
155653 TTTTGAATTGGATTTTGTTTCATTTTTTGTTTAAATAGATCATAATTTGTTATTTGCATT-GAAA
1 TTTTAAATTGAATTTT-TTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGGAA
* * * * * * * * * *
155717 ACGTAAAGCAAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAATCCATTTATAGTTACTTATGCTTTCGAATGC
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* * *
155782 CTTAG-TACTTA-TTATAAATAGTTCTATAATATTATAAATGA
130 CTT-GTTACTCACTT-TAAATAGTTTTATAATCTTATAAATGA
* * * * * * *
155823 TTTCAAAATTAAATTTTTTTTATTTATGGTTAAAACATATCATAATTTTATGTTTGCATTAGAAA
1 TTT-TAAATTGAATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGGAA
* ** * * * *
155888 ACATGAAGCAAAAGCCATTCGCTAATAAGAAAAGTCTA-TTATAGTCACTTATACCTTCAAAAGC
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* * * * * * *
155952 CTAGTTTCTCGCTTTAAATGGTTTTATAACCATATAAATGG
130 CTTGTTACTCACTTTAAATAGTTTTATAATCTTATAAATGA
* ** * * * * *
155993 CTTTAAATCAAAATTATTTTT-ATTTATGGTT-AAA-ATA-CAAAATTAGAGGTTTGCA-TAGAG
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* * ** * * **
156053 AAATAGGAAGTGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAAT-TAATTTATAGTCAGC-CATACCTTTGA
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* * * * *
156116 AAGCATTGTTACTTACTTTAAATGGTTTTATATTCTTATAAATTA
126 AAGCCTTGTTACTCACTTTAAATAGTTTTATAATCTTATAAATGA
* * * * * * *
156161 TTTGAAAGTGAAATTTTTTTAATTTTTGGTCAAAACAAATCATAATTGGATGTTTGCATTGGGAA
1 TTTTAAATTG-AATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGGAA
** ** * * * *
156226 ACACAAAGTGAAAGCCACCCATTGA-AAGGAAAAGT-TCATTTAAAGTCACTTATGCCTTCGAAA
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*** ** * *
156289 GCCTAACTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCATATAAATGA
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* * * * * * * ** *
156332 GTTTAAATTGATTTTTTTTTATTTTTTGTTCAAACAGATTATAATTCGATGTCAGCA-T-CGAAA
1 TTTTAAATTGAATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGGAAA
* * * * * * * * * *
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* * * *
156459 CCTTGTTACTCACTTCAAAT-GTTTCTATAGTCTTATAACTTA
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** * * * * * * **
156501 TTTTAAATCAAAATTGTTTCCATATTTT-GTTAAAACAGATTATAACTTGATATTTGTAGCAGGA
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* *** ** * * * * *
156565 AACGTGAAGCAAAAATTATCTGTTGATAAAAAAAGTCCATTCATAGTCCCTCATGCCTTCAAAAG
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* ** * *
156630 CCTTATTACTTGCTTTAAATAGTTTTATAATCTCA-ATAATGG
129 CCTTGTTACTCACTTTAAATAGTTTTATAATCTTATA-AATGA
* * * * * * * * *
156672 TTTTAAGTTGAA-GTTTTTCATTTTTGGTTAGATCAAATCATAACTTCATATTTGCATCAGGAAA
1 TTTTAAATTGAATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGGAAA
* * * * *
156736 CATAAAGCAAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTTTATGTATAGTCACTGATGCCTTCGAAAA-C
66 CATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTC-AAAAGC
* * * * *
156800 CTAT-TTAATGGA-TTCAAATGGTTTTATATTCTTATAAATGA
130 CT-TGTTACT-CACTTTAAATAGTTTTATAATCTTATAAATGA
* * * *
156841 TTTCAAATTGAATTTTTTTTTCATTTTGGGTTAAAATAGATCATAATTTGTTGTTTGCATTAGGA
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** * ** * * * *
156906 AATGTTAAGCAAAAATCATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTAATACCTACGAAAG
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* * ** * *
156971 CCTAGTTAGTTGCTTCAAATAGTTTTATAATATTATAAATGA
129 CCTTGTTACTCACTTTAAATAGTTTTATAATCTTATAAATGA
* * *
157013 TTTTAAAATTAAATATTTCTT-ATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTTGATGTTTGCATT-GGA
1 TTTT-AAATTGAAT-TTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGG-
** *** * * * *
157076 AAACACAAATG-AAAAGCCATCTGCTGATAAGAAAAGTC-ATTTATATTCACTTATACCTTCGAA
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* * * * * *
157139 AAGTCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTACAA-CATTATAAATGA
126 AAGCCTTGTTACTCACTTTAAATAGTTTTATAATC-TTATAAATGA
* * * * * * * * * **
157184 TTTTTAGTTGAATTTTTTTACATCTGTGGTTGAAATAGATCATAATTTCATGTTTTCATCAAAAA
1 TTTTAAATTGAATTTTTTT-CATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGGAA
* * * * * * * *
157249 ATATGATGTAAAAGCCATCCTTTGATAAGAAAAGTCTATTTATAGCCACTCATACCTTTAAAAGC
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* * * * * *
157314 CTAGTTACTAACTTTAAATGGTTTTTTAATGTTAAAAATGA
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* * * * * * * **
157355 GTTTAAATT-AATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACATATTATACTTTAATGCTTGCAGCAGGAA
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** * * * **
157419 ACATGAAGTGAAATCCATCCATTGACATGAAAAGT-TCACTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAG
65 ACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCT-ATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAG
* * * * *
157483 CCTAGTTACATGA-TTTAAATGGTTTTGTAACCTTATAAATGA
129 CCTTGTTAC-TCACTTTAAATAGTTTTATAATCTTATAAATGA
* ** * * * * * * **
157525 TTTGAAATCAAAATTGTTTTCATTTGTGGTGAAAACAGATCATAATTGGATGGTTGCATCAACAA
1 TTTTAAAT-TGAATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGGAA
* * * * * ** **
157590 ACATGAAGCAAAACCCATCCATTGA-AAAAAAAATCAATTTATAGTCACCCATGCAATCGGAAGC
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* * *
157654 CTTGTTACTCACTTTAAAT-GATTTTATATTCTTACAAATTA
130 CTTGTTACTCACTTTAAATAG-TTTTATAATCTTATAAATGA
* * * *
157695 TTTTAAATTGAATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTCGATGTTTACATTAGAAA
1 TTTTAAATTGAA-TTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGGAA
* * * * * *
157760 ACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTTACTAATGTCTTTAAAAGG
65 ACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGC
* * * * *
157825 CTAGTTACACACTTTAAGTGGTTTTATAA-CTTTATAAATAA
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* * * * **
157866 TTTTAAATTGAGTTTTTTTTTCATTTCTAGTT-AAACAGATCATTATTTGATGTTTGCATTAAAA
1 TTTTAAATTGA--ATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGGA
** * * * **
157930 AACATGAAAGCAAAAGTTGA-CCATTGATAAGAAAAGT-TCATTCATAGTCACTCATACCTTCGG
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* *** *
157993 AAGTCTTGTTACTGGTTTTAAATAGTTTTATAATCATATAAATGA
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* * ** * * * *
158038 TTTTAAGTTGAATTTTTTTAATTTTAAGTCAAAGCAAATCATAATTTG-TAGCTTT---TGTCGA
1 TTTTAAATTGAATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGAT-G-TTTGCAT-TAG-
* * * * * * * * * * *
158099 GAAACATGAAG-AGCAAGCTATTCATTGATAAAAAAAGTCCATCTATAGTCATTAATGTCGTTGA
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* * *
158163 AAA--CTAGGTTACTCATTTTAAATAGCTTTATAATCTTATAAATGA
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* ** * * * * * *
158208 TTTTGAATTGAATTTTTTTTCATTTTTACTTCAAACAAATTATAGTTTGTTGTTTGCA-TCGGAA
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* *** * * * * ** *
158272 ACATAAAATGAAAGCCATCCATTAACAAGAAAAGT-TGATTTATAGTTACTTATACCTTTGAATG
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* * ** *
158336 CCTTGTTACTCATTTTAAATTGTTCAAAAATCTTATAAATGA
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* * * * * * *
158378 TTTTAAAATTGAATTTTTTTTTCATTTCTGGTTTAAAACATATCATAGTTTAATATTTTACATTG
1 TTTT-AAATTGAA--TTTTTTTCATTTTTGG-TTAAAACAGATCATAATTTGAT-GTTTGCATTA
* * * * * * * * *
158443 GGAAATATGAAGCGAAAGCCATCTATTGATAAAAAAAATTTTATTTATGGTCACTTATGCCTTCA
61 GGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGA-CAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCA
* * * * *
158508 AAAGCCTAGTTACTCACTTTAAA-CGATTTTGTAACCTTGTAAATGA
125 AAAGCCTTGTTACTCACTTTAAATAG-TTTTATAATCTTATAAATGA
* * * * *
158554 TTTTAAATCGAAATTGTTTTCATTTATGGTTAAAACAGTTCATAATTCGATGTTTGCATTAGGAA
1 TTTTAAATTG-AATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGGAA
* * * * * * * * ** **
158619 ACTTGAAACGAAAA-CCATCTATTCATAAAAAAAATTCAATTTATAGTCAC-CTATAACTTCGGA
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* * * *
158682 AGTCTTGTTACTCACTTTAAA-CGATTTTATATTCTTATAAATTA
127 AGCCTTGTTACTCACTTTAAATAG-TTTTATAATCTTATAAATGA
* * * * * * **
158726 TTATAAATTGAATTTCTTTTCATTTTTAGTT-AAACATATCACACTTGGATGTTTGTGTT-GGAA
1 TTTTAAATTGAATTT-TTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGG-A
* * *
158789 AACATGAAG-AGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAG-CTCATTTGTAGTCACTCTTGCCTTCGAA
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* * * *
158852 AGCCTTATTACTCGCTTTAAGT-GATTTTATAA-CTTTATAAATAA
127 AGCCTTGTTACTCACTTTAAATAG-TTTTATAATC-TTATAAATGA
* * * ** * * *
158896 TTTTAGATTCAATTTGTTTTCATTTTTGGTTAAAATAGATCATAATTTTTTGTTTGTATCATGAA
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* * * * * *
158961 AAATGTGAAGCAAAGGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTCTAGTCTCTCATGCCTTCGAAA
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* *
159026 GCCTTGTTACTCACTTTCAGTAGTTTTATAA-CTTTATAAATGA
128 GCCTTGTTACTCACTTTAAATAGTTTTATAATC-TTATAAATGA
* * * * ** *
159069 TTCTAAATTGAATTTTTTTTCACTTTTGGTTAAGACAAATCAGGATTT-ATTGTTTGCA-TCGAG
1 TTTTAAATTGAA-TTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGA-TGTTTGCATTAG-G
** ** * * *
159132 AAA-AGTGAAGCAAAAGCTGTCCATTGGTAGGAAAAGTCTGTTTATAGTCACTCATGCCTTCGAA
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* * * *
159196 ACCCTTGTTACTCGCTTTAAATGGTTTTGTAATCTTA-AAATGA
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* * * * * * * *
159239 ATTTAGATTGAATTTTTTTTTATTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTTTATGCTTACATAAGGAA
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* ** * *
159304 ATATGAAGTGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGT-TCATTTATAGTCACTCATGCCTTTAACAG
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** * * * * * *
159368 CCTAATCACTCACTTT-AATGGTTCTGTAATCTTATAAGTAA
129 CCTTGTTACTCACTTTAAATAGTTTTATAATCTTATAAATGA
**** * * * * * * *
159409 TTTTAGAGCAAAATTTTTATC-TTTCCTAGTTAAAACATATCATAATTGGATGTTTTCACTAGGA
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* * * * * *
159473 AACATGAAGCAAAAGCAATCTATTGAAAAGAAAAGT-TCATCTAAAGTCACTCATACCTTCAACA
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** *
159537 A-CCTAATTACTCACTTTAAATAGTTTTATAATCATATAAACT-A
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* * * * * * *
159580 GTTTAAATTGAGTTTTCTTTCATTTTTAGTTAAAACATATCATAATTTGATGTTTACATCAGAAA
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* * * * * * * *
159645 ACGTGAAGCAAAAGTCATCCATTGAGAAGAAAAGTCTATTGATAGTTACTTATTCCTTTAAAAGC
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* * * * *
159710 CTAGTTACTCGCTTTGAATGGTTCTATAATCTTATAAATGA
130 CTTGTTACTCACTTTAAATAGTTTTATAATCTTATAAATGA
** * ** * * *
159751 TTTTAAATCAAAATTGTTTTCCGTTCTAGTTAAAATAGATCATACA-TTGATGTTTGCATT-GAG
1 TTTTAAAT-TGAATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATA-ATTTGATGTTTGCATTAG-G
* ** * * * * * *
159814 AGATGTGAAGCAAAAACTATCCGTTGACAAGAAAAGTCCATTCATAGTCACTCATACCTTCAAAA
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159879 GCTTTGTTACTTGCTTTAAATAGTTTTAAAATATTATAAATGG
128 GCCTTGTTACTCACTTTAAATAGTTTTATAATCTTATAAATGA
* * ** * * * *
159922 TTTTAAGTTGAACCTTTTTTT-GTTTTTTATTAAAACAAATTATAATTTGTTGTTTGCA-TCGAG
1 TTTTAAATTGAA--TTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAG-G
* * * ** * * * * * *
159985 AAACATGAAATGC--AAGTCATCCATTAATGAA-AAAAGTCCGTCTATACTTACTTATACCTTCG
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* * * * * *
160047 AAAGCCTTGTTACTCAATTTATATGGTTTTATGATTTTATAAATGG
125 AAAGCCTTGTTACTCACTTTAAATAGTTTTATAATCTTATAAATGA
* * * * * * * * *
160093 TTTTGAATTGGATTTTTTTTCATTTTTGGTTCAAACAAATCATAATTTGTTATTTACA-TCGAAA
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* * * * * ** *
160157 ACGTAAAGCAAAAGCCATCCATTTAGAAGAAAAGTCTATTTATAGTTACTTTTGCCTTCAAATGC
65 ACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGC
* *
160222 CTTGTTACTCACTTTAAATGGTTCTATAATCTTATAAATGA
130 CTTGTTACTCACTTTAAATAGTTTTATAATCTTATAAATGA
* * * *
160263 TTTTAAAATTGAATTTTTTTCATATATT-GTTAAAACATATCATAATTTCATGTTTGCATCAGGA
1 TTTT-AAATTGAATTTTTTTCAT-TTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGGA
* * * * *
160327 AACATGAAGCAAAAGCTATCCATTGATAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTTATACTTTCAAAAG
64 AACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAG
* * * * *
160392 CATAGTTACTCACCTTAAATAGTTTTATGACCTTATAAATGA
129 CCTTGTTACTCACTTTAAATAGTTTTATAATCTTATAAATGA
** * * *
160434 TTTTAAATTGAAATTATTTTT-ATTTAGGGTTAAAAC--A-CATAATTGGATGTTTGCATAAGAA
1 TTTTAAATTG-AATT-TTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGGA
** * * * * * *
160495 AACATGAAGTGAAAGCCATCCATTAACAAGAAAAATCAATTTATAGTCACCCATACCTTCGAAAG
64 AACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAG
* ** * * *
160560 TCTTGTTACTTGCTTTAAATGGTTTTATATTCTTATAAATTA
129 CCTTGTTACTCACTTTAAATAGTTTTATAATCTTATAAATGA
* * * * * * * *
160602 TTTTAAAGTGAAATATTTTTCATTTCTAGTTAAAACAAATCACAATTAGATGTTT-CATTGGGAA
1 TTTTAAATTG-AATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGGAA
* * * ***
160666 ACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGCAAAGT-TCATTTAAAGTCACTCATACCTTTGGAAG
65 ACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCT-ATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAG
* * * * * * *
160730 CCTAGTTACTCACTATAAATGGTTTTGTAGTCATATAACTGA
129 CCTTGTTACTCACTTTAAATAGTTTTATAATCTTATAAATGA
* * * * *
160772 GTTTAAATTGAATTTATTTTTATTTTTGGTTAAAACATATCATAATTTGATGTTTACATTGGGAA
1 TTTTAAATTGAATTT-TTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGGAA
** * * * * * * *
160837 ATGTGAAGCAAAAACCATCCATTGATAAGAAAAATCTATTGATAGTGACTTATGCCTTCGAAAGC
65 ACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGC
* * *
160902 CTAGTTACTCACTTTAAAT-GTTTCTATAGTCTTAAAAATGA
130 CTTGTTACTCACTTTAAATAGTTT-TATAATCTTATAAATGA
** * ** * * * *
160943 TTTTAAATCAAACTTGTTTTT-ATTTCTAATTAAAATAGATCATAACTTGATATTTGCATCTA-A
1 TTTTAAATTGAA-TT-TTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCAT-TAGG
** * * * *
161006 AAACATGAATTAAAAGCTATCCATTGACAAGAAAAGTCGATTCATAGTCACTCATGCCTTTAAAA
63 AAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAA
* *
161071 GCCTTGTTACGCGCTTTAAATAGTTTTATAATCTTATAAAT-A
128 GCCTTGTTACTCACTTTAAATAGTTTTATAATCTTATAAATGA
* * * * * * * *
161113 GTTTTAAGTTTAATTTTTTTTATTTTTGGTTAAACCAGAGCATAATTTGTTTTTTGGATT-GAGA
1 -TTTTAAATTGAATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAG-GA
* * * * * ** * * *
161177 AACACGAAACACAAGTCATCCATTGACAAGAAAAGTCTGTCAATAGTCAC-AATACCTTTAAAAG
64 AACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAG
* * * * * *
161241 CCTTATTACTCGCTTTAAAT-GATTTTGAATTGATTTTTTTTAAT--
129 CCTTGTTACTCACTTTAAATAG-TTTT--A-T-AATCTTATAAATGA
* * * *** * * ** * ** **
161285 TTTT-CATTTAA-ATAGATCATAATTT-GCTATTTAC--ATCA-GA--T-ATGTAAAGCAAAAGC
1 TTTTAAATTGAATTTTTTTCAT-TTTTGGTTA-AAACAGATCATAATTTGATGT-TTGCATTAG-
* ** * * * * * ** *
161341 TATCCATTTAGAAGAAAAAG---TCTA-TGTAC------CGT-TACTTAT-GCCTTTGAATGCCT
62 GAAACA--T-GAAGCAAAAGCCATCCATTG-ACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACT-CATGCCT
** * * * ** * * *
161394 T-ATTA--CTTGTT-TTAAATAGTTCCATAATCTTATAAATGAATT-TAAA--A
122 TCAAAAGCCTTGTTACTCACT--TTAAATAGTTTTAT-AAT--CTTATAAATGA
* ** * * * * *
161441 --TTGAATTTT-TTTTTTGC--TTATGGTTTAAAACATATCATAATTTCATGTATGCATTAGGAA
1 TTTTAAATTGAATTTTTTTCATTTTTGG-TTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGGAA
* * * * * *
161501 ACATGAAGTAAAAGCTATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTTTAGT-ACTTATTCCTTCAAAAGG
65 ACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGC
** * *
161565 CTAATTACTCTCTTTAAAT-GATTTTATAACCTTATAAATGA
130 CTTGTTACTCACTTTAAATAG-TTTTATAATCTTATAAATGA
* * * * * *
161606 TTTTAGA-TCAATTTTTTTTCATTTAATGGTTAAAAC--A-CATAATTGGATGTTTGCATCAAGA
1 TTTTAAATTGAA-TTTTTTTCATTT-TTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGGA
* * * * * * * *
161667 AACATAAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCAATTTATAGTCACCCATACCTTTAGAAG
64 AACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAG
* * * * *
161732 CCTTGTTACTCGCTTTAAAAAGTTTTATATTCTTACAAATTA
129 CCTTGTTACTCACTTTAAATAGTTTTATAATCTTATAAATGA
* * ** * * * *
161774 TCTTAAATT--ATTTTTTTTATTTTTTTATTAAAACAAATCATAATTGGATATTTGCATTGGGAA
1 TTTTAAATTGAATTTTTTTCA-TTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGGAA
* * * * *
161837 ACATGAAGCAAGAGCCATCCATTGACAAGAAATGTCCATTTATAAT--CTCAAGCC-TCTAAAAG
65 ACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTC-AAAAG
*
161899 CCTTGTTACTCACTTTAAATGGTTTTATAA-CTTTATAAATGA
129 CCTTGTTACTCACTTTAAATAGTTTTATAATC-TTATAAATGA
* * * * * * * *
161941 TCTTAAATGGATTTTTTTTTCATTTTTGGCTAGAACAGATCATAATTT-ATTTTTTGAATCATGG
1 TTTTAAATTGA-ATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGA-TGTTTGCATTA-GG
* * * * * *
162005 AAAACATGAAGTAAAAGGCATCCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCTCTCATGTCTTCAAA
63 -AAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAA
* ** *
162070 AGCCTTGTTACTCATTTTAGGTGGTTTTATAA-CTTTATAAATGA
127 AGCCTTGTTACTCACTTTAAATAGTTTTATAATC-TTATAAATGA
* * * * **
162114 TTTTAAATTGAATTTTTTTTATTTTTTGTTAAAAAACAAATCATGATTTCCTGTTTGCATT-GGA
1 TTTTAAATTGAATTTTTTTCATTTTTGGTT--AAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGGA
* ** * * * * * **
162178 AAAAGTGGTGGAAAAGCTATCCATTAACAAGAGAAA-TCCATTTATAGTCACTTATGCCTTTGAA
64 AACA-TGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGA-AAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAA
* *
162242 AGCCTAGTTACTCGCTTTAAAT-GCTTTTATAATCTTA-AAAGTGA
127 AGCCTTGTTACTCACTTTAAATAG-TTTTATAATCTTATAAA-TGA
* * * * * * * * * *
162286 GTTTAAATTG-TTTCTTTCTTCATTTATGATTAAAATAGATCA-CAGTTAATGCTTGCATAAGGA
1 TTTTAAATTGAATT-TTT-TTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGGA
** * * * *
162349 AACATGAAGTGAAAGCTATCCATTTATAAGAAAAGT-TCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAA
64 AACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCT-ATTTATAGTCACTCATGCC-TTCAAA
** ** *
162413 A-CCTAATTACTCGTTTTAAATAGTTTTATAATCTTATAAATAA
127 AGCCTTGTTACTCACTTTAAATAGTTTTATAATCTTATAAATGA
* * ** * * * * * *
162456 GTTTAAGGTAAAATTTTTGTCATTTTTGGTTAAACCAAATCATAATTGGATGTTTGCACTAAGAA
1 TTTTAA-ATTGAATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGGAA
** * * * *
162521 ATGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGA-AATAAAAAGT-TCATTTAAAGTCACTCATACCTTCAATA
65 ACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAA-GAAAAGTCT-ATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAA
* ** * * *
162584 GCCTAGTTACTTGCTTTAAATGGTTTTGTAATCATATAAATGA
128 GCCTTGTTACTCACTTTAAATAGTTTTATAATCTTATAAATGA
* * * * * *
162627 GTTTAAATTTAATATTTTTTCATTTTTAGTTGAAACAGGTCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAA
1 TTTTAAATTGAAT-TTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGGAA
* * * * ** * * *
162692 ACTTGAAGTAAAAACCATCCATTGATAAGAAAAGTCTATGGACAGTCACTTATGTCTTCAAAAGC
65 ACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGC
* * ** *
162757 CTAGTTAGTTTCTTTAAAT-GTTTTTATAGTCTTATAAATGA
130 CTTGTTACTCACTTTAAATAG-TTTTATAATCTTATAAATGA
* * * * * *
162798 TTTTAAAATGAAATTATTTTCATTTCTGGTTAAAGA-AAATCATACTTGGA-GATTTGCA-TATG
1 TTTTAAATTG-AATTTTTTTCATTTTTGGTTAAA-ACAGATCATAATTTGATG-TTTGCATTA-G
* * ** * * *
162860 AAAACATGAAGCAAAAGCTATCTGTTGACAAGAAAAGTCCATTCACAGTCACTCATGCCTTCAAA
62 GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAA
* ** * *
162925 AACCTTGTTACTCGTTTTAAATAATTTTATAACCTTATAAATGA
127 AGCCTTGTTACTCACTTTAAATAGTTTTATAATCTTATAAATGA
* * * * * * *
162969 TTTTAAATTAAAATTGTTTTT-ATTTATGGTGAAAACA-ATTTATAATTAGATGTTTGCAATAAG
1 TTTTAAATT-GAATT-TTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGA-TCATAATTTGATGTTTGCATTAGG
* ** * * * * * *
163032 AAACAAGAAGCAAAAGCCATCCATTGTTAAGAAAAATCAATTTATAGTGAGTCGTGCCTTTAAAA
63 AAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAA
* ** * * * *
163097 ACCTTGTTACTTGCTTTAAATAGTTTTATATTTTTAGAAATTA
128 GCCTTGTTACTCACTTTAAATAGTTTTATAATCTTATAAATGA
* * * * *
163140 TTTTAAATTAAAATTTCTTTT-ATTTCTAGTTAAAACAAATCATAATTTAATGTTTGCATTAGGA
1 TTTTAAATT-GAATTT-TTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGGA
* * * *
163204 AATATGAAGCAAAAGCCATCCATGGATAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTGATGCCTTCAAAAT
64 AACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAA-
* * * * * *
163269 G-ATAGTTAAAT-GCTTTAAGT-GATTTTATAA-CGTTATAAATAA
128 GCCTTGTT-ACTCACTTTAAATAG-TTTTATAATC-TTATAAATGA
* * * * * *
163311 TTTTAGATTGAGTTTTTTTTAATTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTTAATATTTTGCATTAGGA
1 TTTTAAATTGA-ATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGAT-GTTTGCATTAGGA
* * * * * * *
163376 AACGTGAATGTAAAAGGTC-TCTATTGACAAAAAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTT-TA
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* * * *
163439 GAGCCTTGTTACTCA-TGTTAAATGGGTTTATAAT-TATATAACTGA
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* * * * * * * *
163484 CTTTAAGTTAAATTGTTTTAATTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTTGTTGTTT--ATGTTGAGA
1 TTTTAAATTGAATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCAT-TAG-GA
* * * * * *** *
163547 AACATGAAGCGCATA-CCATCCGTTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTAATGTAATCGAAA
64 AACATGAAGC-AAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAA
* *
163611 G-CTTGGTTGCTCACTTTAAATA-TTTTGATAATCTTAGAAATGA
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* * * * *
163654 TTTCAAATTGAATTTTTTTTCATTTTTTGGTTCAAACAGATCATAATTTGTTGTTTGCATCA-AA
1 TTTTAAATTGAA-TTTTTTTCA-TTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGGA
* * * * ** ** *
163718 AACATAAAGCGAAAGCCATTCATTGACAAGAAAAGTCGATTTATAGTTGCTCATGCCTTTGAATG
64 AACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAG
* * * ** *
163783 CCTTGTTACTCATTTTAAATGGATCAATAATCTTATAAATAA
129 CCTTGTTACTCACTTTAAATAGTTTTATAATCTTATAAATGA
* * * * * * * *
163825 TTTTAAAATTAAATTTTTTTTATTTCTAGTTAGAACATATCATAATTTAATGTTTTCATTAGGAA
1 TTTT-AAATTGAATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGGAA
** * * * * *
163890 ACATGAAGTGAAAGCCATCCATTGACAAG-AAAGTTTCATTTATAGTTACTTATACCTTTAAAAG
65 ACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCT-ATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAG
* ** * ** *
163954 CTTTGTTACTTGCTTTAAATAGTTTTTTAATGATAAAAATGA
129 CCTTGTTACTCACTTTAAATAGTTTTATAATCTTATAAATGA
** ** * * *
163996 TTTTAAATCAAAATAGTTTTCATTTATGGTTAAAATA-ATTCATAATTGGATGTTTGCATTAGGA
1 TTTTAAAT-TGAATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGA-TCATAATTTGATGTTTGCATTAGGA
* ** * * * *
164060 AAC-TTATAGTGAAAGCCATCTATTTG-CAAGAAAAAT-TAATTTATAGTCACCCATACCTTCAA
64 AACATGA-AGCAAAAGCCATCCA-TTGACAAGAAAAGTCT-ATTTATAGTCACTCATGCCTTCAA
* * * ** *
164122 AAG-CTTCATAACTCACTTTAAAT-GATATTATTTTCTTATAAATTA
126 AAGCCTT-GTTACTCACTTTAAATAG-TTTTATAATCTTATAAATGA
** * * * * * *
164167 TTGAAAATTGAAATTCTTTTCATTTCTAGTTAAAACATATCACAATTTGATGTTTGCATCAGGAA
1 TTTTAAATTG-AATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGGAA
* * *
164232 ACATGAAGCGATAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGT
65 ACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGC
* * *
164297 CTTGTTACTCATTTTAAGTGGTTTTATAA-CTTTATAAATGA
130 CTTGTTACTCACTTTAAATAGTTTTATAATC-TTATAAATGA
* * * * * * * * *
164338 TTTCAAGTTGAATTTTTCTCA-CTTTAGTTAAAACA-AGTCATGATTT-ATTATTTGCATCACGA
1 TTTTAAATTGAATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGA-TCATAATTTGA-TGTTTGCATTAGGA
* * ** * * *
164400 AA-AGTGATGCAAAAGTCATCCATTGGTAAGAAAAATCTATTTATAGTCACTTATACCTTCGAAA
64 AACA-TGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTC-AAA
*
164464 ATCCTTG
127 AGCCTTG
164471 AAAATTTCAC
Statistics
Matches: 7447, Mismatches: 1840, Indels: 770
0.74 0.18 0.08
Matches are distributed among these distances:
152 2 0.00
153 3 0.00
154 13 0.00
155 14 0.00
156 7 0.00
157 15 0.00
158 18 0.00
159 9 0.00
160 9 0.00
162 2 0.00
163 12 0.00
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165 19 0.00
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176 65 0.01
177 1 0.00
ACGTcount: A:0.36, C:0.13, G:0.13, T:0.38
Consensus pattern (170 bp):
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CATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCC
TTGTTACTCACTTTAAATAGTTTTATAATCTTATAAATGA
Found at i:158929 original size:342 final size:340
Alignment explanation
Indices: 154777--180389 Score: 5080
Period size: 341 Copynumber: 75.3 Consensus size: 340
154767 TTTATGTAGA
* * * * * *
154777 TTTATAACTTTTTAAATAATTTGAAATTCAATTTTGTTTACTTTTTTGGTTGAAACAGATCATAA
1 TTTATAACTTTATAAATGATTT-TAATTCAA-TTTGTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAA
** * * * * * *
154842 TTTGATGTTTGCATTGGGAAACATG-AACCAAAAGCCATCCATTGA-CAAGAAAAGTCTAGTTAT
64 TTTGATGTTTGCATTAAGAAACATGAAACGAAAA-CCATCCATTGATAAAAAAAATTCAATTTAT
** *** * *
154905 AGTCA-CTCATGCCTTTAAAAGCGTTGTTACTCTCTTTAAGCA-GA-TTTATAA-CTTTATAAAT
128 AGTCACCT-ATAACTTCGGAAGCCTTGTTACTCACTTTAA--ATGATTTTATAATC-TTATAAAT
* * **
154966 GATTTTAAATTGAA-TTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACAAATCATAATTTGTTG-TTTGCACCAG
189 GATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACATATCATAATTTGATGTTTTG---TTG
* * * * * *
155029 G-AAACGTGAAGCGAAAGCCAAT-TATTAACAAGAAAAGTCCATTTAT-GCACACTCATGGCTCT
251 GAAAACATGAAGAGAAAGCC-ATCCATTGACAAGAAAAGT-CATTTATAG-TCACTAAT-GC-CT
* * * ** *
155091 T--AAAGTCTTGCTACT-TGTATTAAATG-G
311 TCGAAAGCCTAGTTACTCACT-TTAAATGAT
* * * * * * * * * * *
155118 TTTATAA-TATTATAAATAATTTTAAATCAAAGTTCTATACATATATAGTTAAAACATATCATAC
1 TTTATAACT-TTATAAATGATTTTAATTC-AATTTGTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAA
* * ** ** * * * *
155182 TTTGATGTTTGCATTAGGAAACTTGAAAC-AAAAGTAATTTATTGACAAGAAAAGTTCAA-CTAT
64 TTTGATGTTTGCATTAAGAAACATGAAACGAAAA-CCATCCATTGATAAAAAAAATTCAATTTAT
* ** * * * * *
155245 AGTCA-CTCA-AGCCTTCAAAAGCATTTTTACTCTCTTTAAGTAGA-TTTGTAA-CTTTATAAAT
128 AGTCACCT-ATA-ACTTCGGAAGCCTTGTTACTCACTTTAAAT-GATTTTATAATC-TTATAAAT
* * * *
155306 GATTTTAAATTGAATTTGACTTTTGATTTTTAGTTAAAACATATCATAATCT-AT-TGTTTGCAT
189 GATTTTAAATTGAATTT--TTTTTCATTTTTAGTTAAAACATATCATAATTTGATGT-TTTG-TT
* **** * * * * *
155369 CGAGGGGTAT-ATAGCA-AAAGCCATCCATTGACAATAACAGTCCATTTAAAGTCACTCATGGCT
250 GGA-AAACATGA-AG-AGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGT-CATTTATAGTCACTAATGCCT
* * *
155432 TTGAAAGCCTCA-TAACTCACTTTAAGTGGA-
311 TCGAAAGCCT-AGTTACTCACTTTAAAT-GAT
* * * * * * *
155462 TTTATAAATTTTTAAATGATGTTCAATTGAATTTGTTTTACATTTTTGTTTAAACCATG-TCCTA
1 TTTATAACTTTATAAATGAT-TTTAATTCAATTTGTTTT-CATTTTTGGTTAAAACA-GATCATA
* * * * ** * * * ** ** *
155526 ATTTAATGTTTGCATT-GGGAA-ATGTAAGA-TAAAAGTAATTCATTGGT-AAGAAAAGCCCGTC
63 ATTTGATGTTTGCATTAAGAAACATG-AA-ACGAAAA-CCATCCATTGATAAAAAAAATTCAATT
* * **
155587 TATAGTCA-CTA-ACACCTTCGAAAGCCTTGTTATTTGCTTTAAATGATTTTATAATCTTATAAA
125 TATAGTCACCTATA-A-CTTCGGAAGCCTTGTTACTCACTTTAAATGATTTTATAATCTTATAAA
* * * * * * *
155650 TGATTTTGAATTGGATTTTGTTTCATTTTTTGTTTAAATAGATCATAATTTG-T-TATTTGCATT
188 TGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACATATCATAATTTGATGT-TTTG--TT
* * * * * * *
155713 -GAAAACGTAAAGCA-AAAGCCATCCATTGATAAGAAAAATCCATTTATAGTTACTTATGCTTTC
250 GGAAAACATGAAG-AGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGT-CATTTATAGTCACTAATGCCTTC
* *
155776 GAATGCCTTAG-TACTTA-TTATAAAT-AGT
313 GAAAGCC-TAGTTACTCACTT-TAAATGA-T
* * * * * *
155804 TCTATAA-TATTATAAATGATTTCAAAATTAAATTT-TTTTTATTTATGGTTAAAACATATCATA
1 TTTATAACT-TTATAAATGATTT--TAATTCAATTTGTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATA
* * * ** * * * *
155867 ATTTTATGTTTGCATT-AGAAAACATGAAGC-AAAAGCCATTCGCTAAT-AAGAAAAGTCTA-TT
63 ATTTGATGTTTGCATTAAG-AAACATGAAACGAAAA-CCATCCATTGATAAAAAAAATTCAATTT
* * ** * * * * * * *
155928 ATAGTCACTTATACCTTCAAAAGCCTAGTTTCTCGCTTTAAATGGTTTTATAACCATATAAATGG
126 ATAGTCACCTATAACTTCGGAAGCCTTGTTACTCACTTTAAATGATTTTATAATCTTATAAATGA
* ** * * * * * * * *
155993 CTTTAAATCAAAATTATTTTT-ATTTATGGTT-AAA-ATA-CAAAATTAGA-GGTTTGCATAGAG
191 TTTTAAAT-TGAATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACATATCATAATTTGATGTTTTG-TTGGA-
* * * * * * * *
156053 AAATAGGAAGTGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATTAATTTATAGTCAGC-CATACCTTTGAA
253 AAACATGAAGAGAAAGCCATCCATTGACAAG-AAAAGTCATTTATAGTCA-CTAATGCCTTCGAA
* * * *
156117 AGCATTGTTACTTACTTTAAATGGT
316 AGCCTAGTTACTCACTTTAAATGAT
* * * ** * * *
156142 TTTAT-ATTCTTATAAATTATTTGAAAGTGAAATTT-TTTTAATTTTTGGTCAAAACAAATCATA
1 TTTATAACT-TTATAAATGATTT-TAA-TTCAATTTGTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATA
* ** * * * * * *
156205 ATTGGATGTTTGCATTGGGAAACA-CAAAGTGAAAGCCACCCATTGA-AAGGAAAAGTTC-ATTT
63 ATTTGATGTTTGCATTAAGAAACATGAAA-CGAAAACCATCCATTGATAA-AAAAAATTCAATTT
* * ** * *** ** * *
156267 AAAGTCACTTATGCCTTCGAAAGCCTAACTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCATATAAATGA
126 ATAGTCACCTATAACTTCGGAAGCCTTGTTACTCACTTTAAATGATTTTATAATCTTATAAATGA
* * * * * * * ** * *
156332 GTTTAAATTG-ATTTTTTTTTATTTTTTGTTCAAACAGATTATAATTCGATG-TCAGCATCGAAA
191 TTTTAAATTGAATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACATATCATAATTTGATGTTTTG-TTGGAAA
* * * * * * * * *
156395 A-ATGTGAA-ACAAAATCTATCCATTAAGAAAAAAAGTCTATTGATAGTGACTTATGCCTTC-AA
255 ACA--TGAAGA-GAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTC-ATTTATAGTCACTAATGCCTTCGAA
* *
156457 AGCCTTGTTACTCACTTCAAATG-T
316 AGCCTAGTTACTCACTTTAAATGAT
* * * * * * *
156481 TTCTAT-AGTCTTATAACTTATTTTAAATCAAAATTGTTTCCATATTTT-GTTAAAACAGATTAT
1 TT-TATAACT-TTATAAATGATTTTAATTC-AATTTGTTTTCAT-TTTTGGTTAAAACAGATCAT
* * * ** * * * * ** ** * * *
156544 AACTTGATATTTGTAGCAGGAAACGTGAAGCAAAAATTATCTGTTGAT-AAAAAAAGTCCATTCA
62 AATTTGATGTTTGCATTAAGAAACATGAAACGAAAACCATCCATTGATAAAAAAAATTCAATTTA
** ** * ** *
156608 TAGTC-CCTCATGCCTTCAAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAAT-AGTTTTATAATCTCA-ATAAT
127 TAGTCACCT-ATAACTTCGGAAGCCTTGTTACTCACTTTAAATGA-TTTTATAATCTTATA-AAT
* * * * * * * * * * *
156670 GGTTTTAAGTTGAA--GTTTTTCATTTTTGGTTAGATCAAATCATAACTTCAT-ATTTGCATCAG
189 GATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACATATCATAATTTGATGTTTTG--T-TG
* * * * *
156732 G-AAACATAAAGCA-AAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTTTATGTATAGTCACTGATGCCTTCG
251 GAAAACATGAAG-AGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAG-TCATTTATAGTCACTAATGCCTTCG
* * * * * *
156795 AAAACCTATTTAATGGA-TTCAAATGGT
314 AAAGCCTAGTTACT-CACTTTAAATGAT
* * * * * *
156822 TTTAT-ATTCTTATAAATGATTTCAAATTGAATTTTTTTTTCATTTTGGGTTAAAATAGATCATA
1 TTTATAACT-TTATAAATGATTT-TAATTCAA-TTTGTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATA
* * ** * * * * * * * *
156886 ATTTGTTGTTTGCATTAGGAAATGTTAAGCAAAAATCATCCATTGA-CAAGAAAAGTCTATTTAT
63 ATTTGATGTTTGCATTAAGAAACATGAAACGAAAACCATCCATTGATAAAAAAAATTCAATTTAT
* * * * * ** * *
156950 AGTCA-CTAATACCTACGAAAGCCTAGTTAGTTGCTTCAAAT-AGTTTTATAATATTATAAATGA
128 AGTCACCT-ATAACTTCGGAAGCCTTGTTACTCACTTTAAATGA-TTTTATAATCTTATAAATGA
* * * * * *
157013 TTTTAAAATTAAATATTTCTT-ATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTTGATG-TTTGCATTGGA
191 TTTT-AAATTGAATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACATATCATAATTTGATGTTTTG--TTGGA
** *** * * * *
157076 AAACACAAATGA-AAAGCCATCTGCTGATAAGAAAAGTCATTTATATTCACTTATACCTTCGAAA
253 AAACATGAA-GAGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCATTTATAGTCACTAATGCCTTCG-AA
* * * *
157140 AGTCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGA-
316 AGCCTAGTTACTCACTTTAAAT-GAT
* * * * * * * *
157165 TTTACAACATTATAAATGATTTTTAGTTGAATTT-TTTTACATCTGTGGTTGAAATAGATCATAA
1 TTTATAACTTTATAAATGA-TTTTAATTCAATTTGTTTT-CATTTTTGGTTAAAACAGATCATAA
* * * * * * * * * *
157229 TTTCATGTTTTCATCAAAAAATATG--ATGTAAAAGCCATCCTTTGAT-AAGAAAAGTCTATTTA
64 TTTGATGTTTGCATTAAGAAACATGAAACG-AAAA-CCATCCATTGATAAAAAAAATTCAATTTA
* * *** * * * * * *
157291 TAGCCA-CTCATACCTTTAAAAGCCTAGTTACTAACTTTAAATGGTTTTTTAATGTTAAAAATGA
127 TAGTCACCT-ATAACTTCGGAAGCCTTGTTACTCACTTTAAATGATTTTATAATCTTATAAATGA
* * * * * ** *
157355 GTTTAAATT-AATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACATATTATACTTTAATG-CTTGCAGCAGGA
191 TTTTAAATTGAATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACATATCATAATTTGATGTTTTGTTG--GAA
* * * * * *
157418 AACATGAAGTGAAATCCATCCATTGACATGAAAAGTTCACTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAG
254 AACATGAAGAGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAG-TCATTTATAGTCACTAATGCCTTCGAAAG
* *
157483 CCTAGTTACATGA-TTTAAATGGT
318 CCTAGTTAC-TCACTTTAAATGAT
* * * * * * *
157506 TTTGTAACCTTATAAATGATTTGAAATCAAAATTGTTTTCATTTGTGGTGAAAACAGATCATAAT
1 TTTATAACTTTATAAATGATTTTAATTC-AATTTGTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAAT
* * * * *
157571 TGGATGGTTGCATCAACAAACATGAAGC-AAAACCCATCCATTGA-AAAAAAAA-TCAATTTATA
65 TTGATGTTTGCATTAAGAAACATGAAACGAAAA-CCATCCATTGATAAAAAAAATTCAATTTATA
* * * *
157633 GTCACCCATGCAA--TCGGAAGCCTTGTTACTCACTTTAAATGATTTTATATTCTTACAAATTAT
129 GTCACCTAT--AACTTCGGAAGCCTTGTTACTCACTTTAAATGATTTTATAATCTTATAAATGAT
* * ** *
157696 TTTAAATTGAATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTCGATGTTTACATTAGAAAA
192 TTTAAATTGAATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACATATCATAATTTGATGTTT-TGTTGGAAAA
* * ** *
157761 CATGAAGCA-AAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTTACTAATGTCTTTAAAAGG
256 CATGAAG-AGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGT-CATTTATAGTCACTAATGCCTTCGAAAGC
* * *
157825 CTAGTTACACACTTTAAGTGGT
319 CTAGTTACTCACTTTAAATGAT
* * * * * * *
157847 TTTATAACTTTATAAATAATTTTAAATTGAGTTTTTTTTTCATTTCTAGTT-AAACAGATCATTA
1 TTTATAACTTTATAAATGATTTT-AATTCA-ATTTGTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAA
* ** * * *
157911 TTTGATGTTTGCATTAAAAAACATGAAA-GCAAAA-GTTGACCATTGATAAGAAAAGTTC-ATTC
64 TTTGATGTTTGCATTAAGAAACATGAAACG-AAAACCAT--CCATTGATAAAAAAAATTCAATTT
* * *** *
157973 ATAGTCA-CTCATACCTTCGGAAGTCTTGTTACTGGTTTTAAAT-AGTTTTATAATCATATAAAT
126 ATAGTCACCT-ATAACTTCGGAAGCCTTGTTACTCACTTTAAATGA-TTTTATAATCTTATAAAT
* * * * * * *
158036 GATTTTAAGTTGAA-TTTTTTTAATTTTAAGTCAAAGCAAATCATAATTTG-TAGCTTTTG-TCG
189 GATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACATATCATAATTTGAT-G-TTTTGTTGG
* * * * * * * *
158098 AGAAACATGAAGAGCAAGCTATTCATTGATAAAAAAAGTCCATCTATAGTCATTAATGTCGTT-G
252 A-AAACATGAAGAGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGT-CATTTATAGTCACTAATG-CCTTCG
* * *
158162 AAA-ACTAGGTTACTCATTTTAAAT-AGC
314 AAAGCCTA-GTTACTCACTTTAAATGA-T
* * ** * * * *
158189 TTTATAA-TCTTATAAATGATTTTGAATTGAATTTTTTTTCATTTTTACTTCAAACAAATTATAG
1 TTTATAACT-TTATAAATGATTTT-AATTCAATTTGTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAA
* ** * * * * * * * *
158253 TTTGTTGTTTGCA-TCGGAAACATAAAATGAAAGCCATCCATTAACAAGAAAAGTT-GATTTATA
64 TTTGATGTTTGCATTAAGAAACATGAAACGAAAACCATCCATTGATAAAAAAAATTCAATTTATA
* * * * * ** *
158316 GTTACTTATACCTT-TGAATGCCTTGTTACTCATTTTAAATTG-TTCAAAAATCTTATAAATGAT
129 GTCACCTATAACTTCGGAA-GCCTTGTTACTCACTTTAAA-TGATTTTATAATCTTATAAATGAT
* * * * * *
158379 TTTAAAATTGAATTTTTTTTTCATTTCTGGTTTAAAACATATCATAGTTTAATATTTTACATTGG
192 TTT-AAATTGAA-TTTTTTTTCATTTTTAG-TTAAAACATATCATAATTTGATGTTTT--GTTGG
* * * * * * * * * * *
158444 GAAATATGAAGCGAAAGCCATCTATTGATAAAAAAAATTTTATTTATGGTCACTTATGCCTTCAA
252 AAAACATGAAGAGAAAGCCATCCATTGA-CAAGAAAA-GTCATTTATAGTCACTAATGCCTTCGA
*
158509 AAGCCTAGTTACTCACTTTAAACGAT
315 AAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGAT
* * * * * * *
158535 TTTGTAACCTTGTAAATGATTTTAAATCGAAATTGTTTTCATTTATGGTTAAAACAGTTCATAAT
1 TTTATAACTTTATAAATGATTTTAATTC-AATTTGTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAAT
* * * * *
158600 TCGATGTTTGCATTAGGAAACTTGAAACGAAAACCATCTATTCATAAAAAAAATTCAATTTATAG
65 TTGATGTTTGCATTAAGAAACATGAAACGAAAACCATCCATTGATAAAAAAAATTCAATTTATAG
* * * * *
158665 TCACCTATAACTTCGGAAGTCTTGTTACTCACTTTAAACGATTTTATATTCTTATAAATTATTAT
130 TCACCTATAACTTCGGAAGCCTTGTTACTCACTTTAAATGATTTTATAATCTTATAAATGATTTT
* * * *
158730 AAATTGAATTTCTTTTCATTTTTAGTT-AAACATATCACACTTGGATGTTTGTGTTGGAAAACAT
195 AAATTGAATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACATATCATAATTTGATGTTT-TGTTGGAAAACAT
* **
158794 GAAGAGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGCTCATTTGTAGTCACTCTTGCCTTCGAAAGCCTTA
259 GAAGAGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAG-TCATTTATAGTCACTAATGCCTTCGAAAGCC-TA
* *
158859 -TTACTCGCTTTAAGTGAT
322 GTTACTCACTTTAAATGAT
* *
158877 TTTATAACTTTATAAATAATTTTAGATTCAATTTGTTTTCATTTTTGGTTAAAATAGATCATAAT
1 TTTATAACTTTATAAATGATTTTA-ATTCAATTTGTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAAT
** * * * * * * * * * * *
158942 TTTTTGTTTGTATCATGAAAAATGTGAA-GCAAAGGCCATCCATTGA-CAAGAAAAGTCCATTTC
65 TTGATGTTTGCATTAAGAAACATG-AAACG-AAA-ACCATCCATTGATAAAAAAAATTCAATTTA
* ** * * *
159005 TAGTC-TCTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCACTTTCAGT-AGTTTTATAA-CTTTATAAAT
127 TAGTCACCT-ATAACTTCGGAAGCCTTGTTACTCACTTTAAATGA-TTTTATAATC-TTATAAAT
* * * * * ** *
159067 GATTCTAAATTGAATTTTTTTTCACTTTTGGTTAAGACAAATCAGGATTT-AT-TGTTTGCATCG
189 GATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACATATCATAATTTGATGT-TTTG--TTG
* ** ** * * *
159130 AGAAAA-GTGAAGCA-AAAGCTGTCCATTGGTAGGAAAAGTCTGTTTATAGTCACTCATGCCTTC
251 -GAAAACATGAAG-AGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTC-ATTTATAGTCACTAATGCCTTC
* * * *
159193 GAAACCCTTGTTACTCGCTTTAAATGGT
313 GAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGAT
* * * * * *
159221 TTTGTAA-TCTTA-AAATGAATTTAGATTGAATTTTTTTTTATTTTTAGTTAAAACAGATCATAA
1 TTTATAACT-TTATAAATGATTTTA-ATTCAATTTGTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAA
* * * * ** * * * *
159284 TTTTATGCTTACA-TAAGGAAATATGAAGTGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTTC-ATTTAT
64 TTTGATGTTTGCATTAA-GAAACATGAAACGAAAACCATCCATTGATAAAAAAAATTCAATTTAT
** ** ** * * * * * *
159347 AGTCA-CTCATGCCTT-TAACAGCCTAATCACTCACTTT-AATGGTTCTGTAATCTTATAAGTAA
128 AGTCACCT-ATAACTTCGGA-AGCCTTGTTACTCACTTTAAATGATTTTATAATCTTATAAATGA
* *** * * * * * *
159409 TTTTAGAGCAAAATTTTTATC-TTTCCTAGTTAAAACATATCATAATTGGATGTTTTCACTAGG-
191 TTTTAAATTGAATTTTTTTTCATTT-TTAGTTAAAACATATCATAATTTGATGTTTT--GTTGGA
* * * * * * *
159472 AAACATGAAGCA-AAAGCAATCTATTGAAAAGAAAAGTTCATCTAAAGTCACTCATACCTTC-AA
253 AAACATGAAG-AGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAG-TCATTTATAGTCACTAATGCCTTCGAA
* *
159535 CAACCTAATTACTCACTTTAAAT-AGT
316 -AGCCTAGTTACTCACTTTAAATGA-T
* * * * * *
159561 TTTATAA-TCATATAAACT-AGTTTAAATTGAGTTT-TCTTTCATTTTTAGTTAAAACATATCAT
1 TTTATAACT-TTATAAA-TGA-TTTTAATTCAATTTGT-TTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCAT
* * * * * * * * *
159623 AATTTGATGTTTACA-TCAGAAAACGTGAAGC-AAAAGTCATCCATTGA-GAAGAAAAGTCTATT
62 AATTTGATGTTTGCATTAAG-AAACATGAAACGAAAA-CCATCCATTGATAAAAAAAATTCAATT
* * * ** *** * * * * *
159685 GATAGTTACTTATTCCTTTAAAAGCCTAGTTACTCGCTTTGAATGGTTCTATAATCTTATAAATG
125 TATAGTCACCTATAACTTCGGAAGCCTTGTTACTCACTTTAAATGATTTTATAATCTTATAAATG
** * * ** * * *
159750 ATTTTAAATCAAAATTGTTTTCCGTTCTAGTTAAAATAGATCATACA-TTGATG-TTTGCATT-G
190 ATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACATATCATA-ATTTGATGTTTTG--TTGG
* ** * * * * * * *
159812 AGAGATGTGAAGCA-AAAACTATCCGTTGACAAGAAAAGTCCATTCATAGTCACTCATACCTTCA
252 A-AAACATGAAG-AGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGT-CATTTATAGTCACTAATGCCTTCG
* * **
159876 AAAGCTTTGTTACTTGCTTTAAAT-AGT
314 AAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGA-T
* * * * ** * *
159903 TTTA-AAATATTATAAATGGTTTTAAGTTGAACCTTT-TTTT-GTTTTTTATTAAAACAAATTAT
1 TTTATAACT-TTATAAATGATTTTAA-TTCAA--TTTGTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCAT
* ** * * ** * * * ** *
159965 AATTTGTTGTTTGCATCGAGAAACATGAAATGCAAGTCATCCATTAAT-GAAAAAAGTCCGTCTA
62 AATTTGATGTTTGCATTAAGAAACATGAAACGAAAACCATCCATTGATAAAAAAAATTCAATTTA
* * * * * * * * * * *
160029 TACTTACTTATACCTTCGAAAGCCTTGTTACTCAATTTATATGGTTTTATGATTTTATAAATGGT
127 TAGTCACCTATAACTTCGGAAGCCTTGTTACTCACTTTAAATGATTTTATAATCTTATAAATGAT
* * * * * * * *** *
160094 TTTGAATTGGATTTTTTTTCATTTTTGGTTCAAACAAATCATAATTTGTTATTTACATCGAAAAC
192 TTTAAATTGAATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACATATCATAATTTGATGTTTTGTTGGAAAAC
* * * * * **
160159 GTAAAGCA-AAAGCCATCCATTTAGAAGAAAAGTCTATTTATAGTTACTTTTGCCTTC-AAATGC
257 ATGAAG-AGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTC-ATTTATAGTCACTAATGCCTTCGAAA-GC
* *
160222 CTTGTTACTCACTTTAAATGGT
319 CTAGTTACTCACTTTAAATGAT
* * * *
160244 TCTATAA-TCTTATAAATGATTTTAAAATTGAATTT-TTTTCATATATT-GTTAAAACATATCAT
1 TTTATAACT-TTATAAATGATTTT--AATTCAATTTGTTTTCAT-TTTTGGTTAAAACAGATCAT
* * * * * * * *
160306 AATTTCATGTTTGCATCAGGAAACATGAAGC-AAAAGCTATCCATTGAT-AAGAAAAGTCTATTT
62 AATTTGATGTTTGCATTAAGAAACATGAAACGAAAA-CCATCCATTGATAAAAAAAATTCAATTT
* ** * * * * *
160369 ATAGTCACTTAT-ACTTTCAAAAGCATAGTTACTCACCTTAAAT-AGTTTTATGACCTTATAAAT
126 ATAGTCACCTATAAC-TTCGGAAGCCTTGTTACTCACTTTAAATGA-TTTTATAATCTTATAAAT
* *** * **
160432 GATTTTAAATTGAAATTATTTTT-ATTTAGGGTTAAAAC--A-CATAATTGGATG-TTTGCATAA
189 GATTTTAAATTG-AATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACATATCATAATTTGATGTTTTG--TTG
* * * ** *
160492 GAAAACATGAAGTGAAAGCCATCCATTAACAAGAAAAATCAATTTATAGTCACCCATACCTTCGA
251 GAAAACATGAAGAGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTC-ATTTATAGTCACTAATGCCTTCGA
* * ** *
160557 AAGTCTTGTTACTTGCTTTAAATGGT
315 AAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGAT
* * ** * * * * *
160583 TTTAT-ATTCTTATAAATTATTTTAAAGTGAAATAT-TTTTCATTTCTAGTTAAAACAAATCACA
1 TTTATAACT-TTATAAATGATTTT-AA-TTCAATTTGTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATA
* ** * * ** *
160646 ATTAGATGTTT-CATTGGGAAACATGAAGC-AAAAGCCATCCATTGACAAGCAAAGTTC-ATTTA
63 ATTTGATGTTTGCATTAAGAAACATGAAACGAAAA-CCATCCATTGATAAAAAAAATTCAATTTA
* * * * * * * * * *
160708 AAGTCA-CTCATACCTTTGGAAGCCTAGTTACTCACTATAAATGGTTTTGTAGTCATATAACTGA
127 TAGTCACCT-ATAACTTCGGAAGCCTTGTTACTCACTTTAAATGATTTTATAATCTTATAAATGA
* * ** *
160772 GTTTAAATTGAATTTATTTTT-ATTTTTGGTTAAAACATATCATAATTTGATGTTTACATTGGGA
191 TTTTAAATTGAATTT-TTTTTCATTTTTAGTTAAAACATATCATAATTTGATGTTT-TGTTGGAA
** * * * * * *
160836 AATGTGAAGCA-AAAACCATCCATTGATAAGAAAAATCTATTGATAGTGACTTATGCCTTCGAAA
254 AACATGAAG-AGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTC-ATTTATAGTCACTAATGCCTTCGAAA
160900 GCCTAGTTACTCACTTTAAATG-T
317 GCCTAGTTACTCACTTTAAATGAT
* * * * * * ** *
160923 TTCTAT-AGTCTTAAAAATGATTTTAAATCAAACTTGTTTTTATTTCTAATTAAAATAGATCATA
1 TT-TATAACT-TTATAAATGATTTTAATTC-AATTTGTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATA
* * ** * * * * * *
160987 ACTTGATATTTGCATCTAA-AAACATG-AATTAAAAGCTATCCATTGA-CAAGAAAAGTCGATTC
63 ATTTGATGTTTGCAT-TAAGAAACATGAAACGAAAA-CCATCCATTGATAAAAAAAATTCAATTT
** *** * *
161049 ATAGTCA-CTCATGCCTTTAAAAGCCTTGTTACGCGCTTTAAAT-AGTTTTATAATCTTATAAAT
126 ATAGTCACCT-ATAACTTCGGAAGCCTTGTTACTCACTTTAAATGA-TTTTATAATCTTATAAAT
* * * * * * *
161112 -AGTTTTAAGTTTAATTTTTTTT-ATTTTTGGTTAAACCAGAGCATAATTTG-TTTTTTGGATT-
189 GA-TTTTAAATTGAATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACATATCATAATTTGATGTTTT-G-TTG
* * * * *
161173 GAGAAACACGAA-ACACAAGTCATCCATTGACAAGAAAAGTC-TGTCAATAGTCAC-AATACCTT
251 GA-AAACATGAAGAGA-AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCAT-T-TATAGTCACTAATGCCTT
** *
161235 TAAAAGCCTTA-TTACTCGCTTTAAATGAT
312 CGAAAGCC-TAGTTACTCACTTTAAATGAT
* * *
161264 TTT-GAA-TTGAT---T--TTTT--TT-AA--T-TTTTCA----T--TT-AAATAGATCATAATT
1 TTTATAACTTTATAAATGATTTTAATTCAATTTGTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATT
* * * * * * * * * * * * *
161309 TGCTATTTACA-TCAG--ATATGTAAA-GCAAAAGCTATCCATTTAGAAGAAAAAGTCTATGTAC
66 TGATGTTTGCATTAAGAAACATG-AAACG-AAAA-CCATCCATTGATAAAAAAAATTCAATTTAT
* * * ** * * *** **
161370 CGTTACTTATGCCTT-TGAATGCCTTATTACTTGTTTTAAAT-AGTTCCATAATCTTATAAATGA
128 AGTCACCTATAACTTCGGAA-GCCTTGTTACTCACTTTAAATGA-TTTTATAATCTTATAAATG-
* * * *
161433 ATTTAAAATTGAATTTTTTTT--TTGCTTATGGTTTAAAACATATCATAATTTCATG-TATGCAT
190 ATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATT--TT-TAG-TTAAAACATATCATAATTTGATGTTTTG--T
* * * *
161495 TAGG-AAACATGAAGTA-AAAGCTATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTTTAGT-ACTTATTCCT
249 T-GGAAAACATGAAG-AGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTC-ATTTATAGTCACTAATGCCT
* * * *
161557 TCAAAAGGCTAATTACTCTCTTTAAATGAT
311 TCGAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGAT
* * *
161587 TTTATAACCTTATAAATGATTTTAGA-TCAATTTTTTTTCATTTAATGGTTAAAAC--A-CATAA
1 TTTATAACTTTATAAATGATTTTA-ATTCAATTTGTTTTCATTT-TTGGTTAAAACAGATCATAA
* * * * *
161648 TTGGATGTTTGCATCAAGAAACAT-AAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAA-TCAATTTAT
64 TTTGATGTTTGCATTAAGAAACATGAAA-CGAAAACCATCCATTGATAAAAAAAATTCAATTTAT
* * ** * * * * *
161711 AGTCACCCATACCTTTAGAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAA-AAGTTTTATATTCTTACAAATTAT
128 AGTCACCTATAACTTCGGAAGCCTTGTTACTCACTTTAAATGA-TTTTATAATCTTATAAATGAT
* * * * *
161775 CTTAAATT--ATTTTTTTT-ATTTTTTTA-TTAAAACAAATCATAATTGGAT-ATTTGCATTGGG
192 TTTAAATTGAATTTTTTTTCA--TTTTTAGTTAAAACATATCATAATTTGATGTTTTG--TTGGA
* * * * *
161835 AAACATGAAGCA-AGAGCCATCCATTGACAAGAAATGTCCATTTATAATCTC-AA-GCC-TCTAA
253 AAACATGAAG-AGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGT-CATTTATAGTCACTAATGCCTTC-GA
* *
161896 AAGCCTTGTTACTCACTTTAAATGGT
315 AAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGAT
* ** * * * *
161922 TTTATAACTTTATAAATGATCTTAAATGGATTTTTTTTTCATTTTTGGCTAGAACAGATCATAAT
1 TTTATAACTTTATAAATGAT-TTTAATTCAATTTGTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAAT
* * * * * ** * * *
161987 TT-ATTTTTTGAATCATGGAAAACATG-AA-GTAAAAGGCATCCATTG-GCAAGAAAAGTCCATT
65 TTGA-TGTTTGCATTA-AG-AAACATGAAACG-AAAA-CCATCCATTGATAAAAAAAATTCAATT
* ** ** * ** *
162048 TATAGTC-TCTCATGTCTTCAAAAGCCTTGTTACTCATTTTAGGTGGTTTTATAA-CTTTATAAA
125 TATAGTCACCT-ATAACTTCGGAAGCCTTGTTACTCACTTTAAATGATTTTATAATC-TTATAAA
* * * **
162111 TGATTTTAAATTGAATTTTTTTT-ATTTTTTGTTAAAAAACAAATCATGATTTCCTG-TTTGCAT
188 TGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATTTTTAGTT--AAAACATATCATAATTTGATGTTTTG--T
** * * *
162174 TGGAAAA-AGTGGTG-GAAAAGCTATCCATTAACAAGAGAAA-TCCATTTATAGTCACTTATGCC
249 TGGAAAACA-TGAAGAG-AAAGCCATCCATTGACAAGA-AAAGT-CATTTATAGTCACTAATGCC
* * *
162236 TTTGAAAGCCTAGTTACTCGCTTTAAATGCT
310 TTCGAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGAT
* * * * * *
162267 TTTATAA-TCTTA-AAAGTGAGTTTAAATT--GTTTCTTTCTTCATTTATGATTAAAATAGATCA
1 TTTATAACT-TTATAAA-TGA-TTTTAATTCAATTT-GTT-TTCATTTTTGGTTAAAACAGATCA
* * * * ** * * * * *
162328 -CAGTTAATGCTTGCA-TAAGGAAACATGAAGTGAAAGCTATCCATTTATAAGAAAAGTTC-ATT
61 TAATTTGATGTTTGCATTAA-GAAACATGAAACGAAAACCATCCATTGATAAAAAAAATTCAATT
** * * * ** **
162390 TATAGTCA-CTCATGCCTTTGAAAACCTAATTACTCGTTTTAAAT-AGTTTTATAATCTTATAAA
125 TATAGTCACCT-ATAACTTCGGAAGCCTTGTTACTCACTTTAAATGA-TTTTATAATCTTATAAA
* * ** * * * * * * * *
162453 TAAGTTTAAGGTAAAATTTTTGTCATTTTTGGTTAAACCAAATCATAATTGGATG-TTTGCACT-
188 TGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACATATCATAATTTGATGTTTTG--TTG
* ** * * * *
162516 AAGAAATGTGAAGCA-AAAGCCATCCATTGA-AATAAAAAGTTCATTTAAAGTCACTCATACCTT
251 GA-AAACATGAAG-AGAAAGCCATCCATTGACAA-GAAAAG-TCATTTATAGTCACTAATGCCTT
** *
162579 C-AATAGCCTAGTTACTTGCTTTAAATGGT
312 CGAA-AGCCTAGTTACTCACTTTAAATGAT
* * * * * * *
162608 TTTGTAA-TCATATAAATGAGTTTAAATTTAATATT-TTTTCATTTTTAGTTGAAACAGGTCATA
1 TTTATAACT-TTATAAATGA-TTTTAATTCAAT-TTGTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATA
* * * *** * * * ** *
162671 ATTTGATGTTTGCATCAGGAAACTTGAAGTAAAAACCATCCATTGAT-AAGAAAAGTCTATGGAC
63 ATTTGATGTTTGCATTAAGAAACATGAAACGAAAACCATCCATTGATAAAAAAAATTCAATTTAT
* ** ** * * ** * *
162735 AGTCACTTATGTCTTCAAAAGCCTAGTTAGTTTCTTTAAATGTTTTTATAGTCTTATAAATGATT
128 AGTCACCTATAACTTCGGAAGCCTTGTTACTCACTTTAAATGATTTTATAATCTTATAAATGATT
* * * * * * * * *
162800 TTAAAATGAAATTATTTTCATTTCTGGTTAAAGA-AAATCATACTTGGA-GATTTGCATAT-GAA
193 TTAAATTGAATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAA-ACATATCATAATTTGATGTTTTG--T-TGGAA
* ** * * * *
162862 AACATGAAGCA-AAAGCTATCTGTTGACAAGAAAAGTCCATTCACAGTCACTCATGCCTTCAAAA
254 AACATGAAG-AGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGT-CATTTATAGTCACTAATGCCTTCGAAA
* * ** *
162926 ACCTTGTTACTCGTTTTAAATAAT
317 GCCTAGTTACTCACTTTAAATGAT
* * * * * * *
162950 TTTATAACCTTATAAATGATTTTAAATTAAAATTGTTTTTATTTATGGTGAAAACA-ATTTATAA
1 TTTATAACTTTATAAATGATTTT-AATTCAATTTGTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGA-TCATAA
* * * * * *
163014 TTAGATGTTTGCAATAAGAAACAAGAAGC-AAAAGCCATCCATTGTTAAGAAAAA-TCAATTTAT
64 TTTGATGTTTGCATTAAGAAACATGAAACGAAAA-CCATCCATTGATAAAAAAAATTCAATTTAT
* * * ** *** * ** * * * *
163077 AGTGA-GTCGTGCCTTTAAAAACCTTGTTACTTGCTTTAAAT-AGTTTTATATTTTTAGAAATTA
128 AGTCACCT-ATAACTTCGGAAGCCTTGTTACTCACTTTAAATGA-TTTTATAATCTTATAAATGA
* * * * *
163140 TTTTAAATTAAAATTTCTTTT-ATTTCTAGTTAAAACAAATCATAATTTAATG-TTTGCATTAGG
191 TTTTAAATT-GAATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACATATCATAATTTGATGTTTTG--TT-GG
* * * * *
163203 -AAATATGAAGCA-AAAGCCATCCATGGATAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTGATGCCTTCAA
252 AAAACATGAAG-AGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTC-ATTTATAGTCACTAATGCCTTCGA
* * * *
163266 AATG-ATAGTTAAAT-GCTTTAAGTGAT
315 AA-GCCTAGTT-ACTCACTTTAAATGAT
* * * * * * *
163292 TTTATAACGTTATAAATAATTTTAGATTGAGTTTTTTTTAATTTTTAGTTAAAACAGATCATAAT
1 TTTATAACTTTATAAATGATTTTA-ATTCAATTTGTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAAT
* * * * * * * * * *
163357 TTAATATTTTGCATTAGGAAACGTG-AATGTAAAAGGTC-TCTATTGACAAAAAAAAGTCCATTT
65 TTGAT-GTTTGCATTAAGAAACATGAAACG-AAAA--CCATCCATTGATAAAAAAAATTCAATTT
** ** ** *
163420 ATAGTCA-CTCATGCCTTTAG-AGCCTTGTTACTCA-TGTTAAATGGGTTTATAAT-TATATAAC
126 ATAGTCACCT-ATAACTTCGGAAGCCTTGTTACTCACT-TTAAATGATTTTATAATCT-TATAAA
* * * * * * *
163481 TGACTTTAAGTT-AAATTGTTTTAATTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTTGTTGTTTATGTT-G
188 TGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACATATCATAATTTGATGTTT-TGTTGG
* * * ***
163544 AGAAACATGAAGCGCATA-CCATCCGTTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTAATGTAATCG
252 A-AAACATGAAGAG-AAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGT-CATTTATAGTCACTAATGCCTTCG
* * *
163608 AAAGCTTGGTTGCTCACTTTAAAT-AT
314 AAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGAT
* * * * *
163634 TTTGATAA-TCTTAGAAATGATTTCAAATTGAATTTTTTTTCATTTTTTGGTTCAAACAGATCAT
1 TTT-ATAACT-TTATAAATGATTT-TAATTCAATTTGTTTTCA-TTTTTGGTTAAAACAGATCAT
* * * * * * * *
163698 AATTTGTTGTTTGCATCAA-AAACAT-AAAGCGAAAGCCATTCATTGA-CAAGAAAAGTCGATTT
62 AATTTGATGTTTGCATTAAGAAACATGAAA-CGAAAACCATCCATTGATAAAAAAAATTCAATTT
** ** * * **
163760 ATAGT-TGCTCATGCCTT-TGAATGCCTTGTTACTCATTTTAAATGGA-TCAATAATCTTATAAA
126 ATAGTCACCT-ATAACTTCGGAA-GCCTTGTTACTCACTTTAAAT-GATTTTATAATCTTATAAA
* * * * * *
163822 TAATTTTAAAATTAAATTTTTTTT-ATTTCTAGTTAGAACATATCATAATTTAATGTTTTCATTA
188 TGATTTT-AAATTGAATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACATATCATAATTTGATGTTTT-GTT-
* * * * *
163886 GG-AAACATGAAGTGAAAGCCATCCATTGACAAG-AAAGTTTCATTTATAGTTACTTATACCTTT
250 GGAAAACATGAAGAGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAG--TCATTTATAGTCACTAATGCCTTC
* * * **
163949 AAAAGCTTTGTTACTTGCTTTAAAT-AGT
313 GAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGA-T
* * * * * * * *
163977 TTTTTAA-TGATAAAAATGATTTTAAATCAAAATAGTTTTCATTTATGGTTAAAATA-ATTCATA
1 TTTATAACT-TTATAAATGATTTTAATTC-AATTTGTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGA-TCATA
* * * ** * * * *
164040 ATTGGATGTTTGCATTAGGAAAC-TTATAGTGAAAGCCATCTATTTG-CAAGAAAAATT-AATTT
63 ATTTGATGTTTGCATTAAGAAACATGA-AACGAAAACCATCCA-TTGATAAAAAAAATTCAATTT
* * ** * * * ** *
164102 ATAGTCACCCATACCTTCAAAAG-CTTCATAACTCACTTTAAATGATATTATTTTCTTATAAATT
126 ATAGTCACCTATAACTTCGGAAGCCTT-GTTACTCACTTTAAATGATTTTATAATCTTATAAATG
** * * * * *
164166 ATTGAAAATTGAAATTCTTTTCATTTCTAGTTAAAACATATCACAATTTGATG-TTTGCATCAGG
190 ATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACATATCATAATTTGATGTTTTG--T-TGG
* * * *
164230 -AAACATGAAGCGATAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAA
252 AAAACATGAAGAGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTC-ATTTATAGTCACTAATGCCTTCGAA
* * * * *
164294 AGTCTTGTTACTCATTTTAAGTGGT
316 AGCCTAGTTACTCACTTTAAATGAT
* * * * * *
164319 TTTATAACTTTATAAATGATTTCAAGTTGAATTT-TTCTCA-CTTTAGTTAAAACA-AGTCATGA
1 TTTATAACTTTATAAATGATTTTAA-TTCAATTTGTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGA-TCATAA
* * * ** * * * *
164381 TTT-ATTATTTGCATCACGAAA-AGTGATGC-AAAAGTCATCCATTGGTAAGAAAAA-TCTATTT
64 TTTGA-TGTTTGCATTAAGAAACA-TGAAACGAAAA-CCATCCATTGATAAAAAAAATTCAATTT
* * * * ** * * **
164442 ATAGTCACTTATACCTTCGAAAATCCTTGAAAATTTCACCATTTATAGTGA--TT-T-GGCTTGA
126 ATAGTCACCTATAACTTCG-GAAGCCTTG-TTA-CTCA-C-TTTA-AATGATTTTATAATCTT-A
* ** * * ** *** * ** ** *
164503 AAAATCTTTGGTTGAACAATCAAGGCAGTGGATGCAGGTCCTT-GACAGAACCACTAT-A-AATT
184 TAAATGATT--TT-AA-ATTGAA---TTTTTTTTCA--TTTTTAGTTA-AAACA-TATCATAATT
* * *** * * **** **** * ** * **
164565 TG-TG-TGTATTGTCTATCCTG-CTTCATTTTCATTTCATTTTTTCTTAA-ATCATTTC-TTTAT
238 TGATGTTTTGTTGGAAAACATGAAGAGAAAGCCA-TCCA--TTGAC--AAGA-AAAGTCATTTA-
* * ** * * * * * *
164625 CTTGT-ATTTAA-GTTTTC-ATCATTGATCTTTAATTTGC-CCCTAATTAGAAGTCAAT
296 -TAGTCA-CTAATGCCTTCGA--A---AGC-CT-AGTTACTCACT--TTA-AA-T-GAT
* * * * ** * *** * *
164680 CTAAGTGAGAGC--TA-AAAAG-TGTT-ATTCACCCCTTCTAGCACATTTATTTGG-GACCAACA
1 TTTA-T-A-A-CTTTATAAATGATTTTAATTCA--ATTTGT-TTTCA-TT-TTTGGTTA-AAACA
* * ** * ** * ** * ** **
164739 AAGT-TTAAATTAAAATTTTTTTATTATTG---GTTAAAAC-AAATCATAATTTGATGTTGCATT
56 GA-TCAT-AATT-TGATGTTTGCATTA-AGAAACATGAAACGAAA--ACCA-TCCA--TTG-A-T
** * * ** * * ** * *
164799 GGAAAACA-TAAAGTGAAAAG-CATCC-ATTGA-TAAGAAAAGTCCATT-TATAGTCAC-TT--A
110 AAAAAAAATTCAA-TTTATAGTCA-CCTA-TAACTTCG-GAAG-CC-TTGT-TACTCACTTTAAA
** * * * * * * * * * ** * ** *
164856 TGCCTTCAAAAACCTAGTTACTCACTTGAAA-TGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATCA
168 TGATTTTATAATCTTA-TAAATGATTTTAAATTGAATTT-T--T-TT-T-CAT--TTTTAGTTAA
* * * ** * ** *
164920 AA-AT-T-AT--TTTTAT-TTTAGTT--AAAATAT-ATTATAATTAG--AT-GTTTGTATAAGAA
224 AACATATCATAATTTGATGTTTTGTTGGAAAACATGAAGAGAA--AGCCATCCATTG-ACAAGAA
* *** * * * * * * ** **
164973 AACGTGAAGCAAAAGCCATTTACGAC-AAGAAAAGTCCATTTATAGTTGTTCATGCCTTTGAAA-
286 AA-GT-CATTTATAGTCACTAATGCCTTCG-AAAG-CC-----TAGTTACTCA---CTTT-AAAT
*
165036 GTCT
338 G-AT
* *** * * *
165040 TGTTACTCACTTTAAGTGGTTTTGTAACTTTATAAATGATTTAAAATTGATTTTTTTTTATTTTT
1 T-TTA-TAACTTT-A-T--AAATG--A-TTT-T--A--A-TT--CA---ATTTGTTTTCATTTTT
* * * * ** * ** * * * * *
165105 GGTT--AA-A-A-CA-AA--TCATAATTT-CATGGT-TGCATTAAGAAGTGTGAAGCGAAAGCAA
46 GGTTAAAACAGATCATAATTTGAT-GTTTGCAT--TAAGAAACATGAAACG-AAAAC--CATCCA
* * * ** ** * * *
165160 TTTATTGATAAAAAAAATCCATTTATAGTCA-CTCATCCCTTTAGAAGCCTTATTACTCGCTTCA
105 TTGA-T-A-AAAAAAATTCAATTTATAGTCACCT-ATAACTTCGGAAGCCTTGTTACTCACTTTA
* ** * * * * *
165224 AATGGTTTTATAATCATT-TAAATGATTTTAAATCAAAATTGTTTTCATTTCTGGTTCAAACATA
166 AATGATTTTATAATC-TTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACATA
** *
165288 TCATAATTTGATGTTTACATTAGG-AAATAT-AAG-GCAAAAGCCATCCATTGAGACAA-AAAA-
230 TCATAATTTGATGTTT-TGTT-GGAAAACATGAAGAG--AAAGCCATCCATT--GACAAGAAAAG
* * * * *
165348 TCTATTTGTAGCCACTCATACCTTCGAAAGCCTTA-TTACT-AGCTTTAAGTGAT
289 TC-ATTTATAGTCACTAATGCCTTCGAAAGCC-TAGTTACTCA-CTTTAAATGAT
* * * * * * *
165401 TTTATAACTTTATAAATGACTTTAAATTGAATTTTTTTTTATTTTTGGTTAAAAAAAATTATAAT
1 TTTATAACTTTATAAATGA-TTTTAATTCAATTTGTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAAT
** * ** * * ** * *
165466 TTGATGTTTGCATCT-AGAAATGTGTAGTGAAAGCCTTCCATTGAT-ACGAAAAGTCTATTTATA
65 TTGATGTTTGCAT-TAAGAAACATGAAACGAAAACCATCCATTGATAAAAAAAATTCAATTTATA
* ** ** * ** * * **
165529 GTCACTTATGCCTT-TAAACCCTTGTTACTTGCTTTAAGTGGTTTTATAATCTTATAAATGAGCT
129 GTCACCTATAACTTCGGAAGCCTTGTTACTCACTTTAAATGATTTTATAATCTTATAAATGATTT
* * * * *
165593 TGAATTGAA------TT--TTTTTA-TTAAAACAAATCATAATTTGATG-TTTGCATCGACAAAT
194 TAAATTGAATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACATATCATAATTTGATGTTTTG-TTGGA-AAAC
* * * * *
165648 ATAAAGCGAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTGCATTTATAGTCACTTATGCGTTCGAAAGCCT
257 ATGAAGAGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGT-CATTTATAGTCACTAATGCCTTCGAAAGCCT
** * * *
165713 TTTTACTCGCTTTAAGTGGT
321 AGTTACTCACTTTAAATGAT
* * * * *
165733 TTTATAACTTTCA-GAATGATTTTAAATT-AATTCTTTTTTAATTTTTAGCTAAAACAGATCATA
1 TTTATAACTTT-ATAAATGATTTT-AATTCAATT-TGTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATA
* * * * * * * * * *
165796 ACTTGTTATTTGCATCAAGAAACATGAAGC-AAAAGCCATTCATTGACAAGAAAAGTTC-ATGTA
63 ATTTGATGTTTGCATTAAGAAACATGAAACGAAAA-CCATCCATTGATAAAAAAAATTCAATTTA
* ** ** * * * * * *
165859 TAGT-AACTCATGCCTTTAGACGCGTTGTTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAAATAA
127 TAGTCACCT-ATAACTTCGGAAGCCTTGTTACTCACTTTAAATGATTTTATAATCTTATAAATGA
* * * * *
165923 TTTTAAATTGAATTCTTTTTCA-TTTTAGGTT-CAACAGATCATTATTT-AT-TGTTGGCATT-G
191 TTTTAAATTGAATTTTTTTTCATTTTTA-GTTAAAACATATCATAATTTGATGT-TTTG--TTGG
** * * * * * * * *
165983 AGAAATGTGAAGTGATAGCTAACCATTGATAAGAAAAGTCCATTTACAGTCATTCATGCCTTCGA
252 A-AAACATGAAGAGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGT-CATTTATAGTCACTAATGCCTTCGA
* * * *** * *
166048 CAGGCTTGTTACTTGTTTTAAGTGGT
315 AAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGAT
* * * * * *
166074 TTTAT-AGTTCTATAAGTTATTTT-A---AA-TTGAATTT--TTTTTAGTTAAAATAGATCATAA
1 TTTATAACTT-TATAAATGATTTTAATTCAATTTG-TTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAA
* * * ** * *
166131 TTTGATGTTTACATCAAGAAACAT-AAAGCAAAAATTATCCATTGAT-AAAAAAGTTC-ATTTGT
64 TTTGATGTTTGCATTAAGAAACATGAAA-CGAAAACCATCCATTGATAAAAAAAATTCAATTTAT
* * * * * ** *
166193 AGTCA-CTCGTACCTTAGTAAGCATAT-TTACT-TGTAGTAAAT-AGTTTTATAATCTTATAAAT
128 AGTCACCT-ATAACTTCGGAAGCCT-TGTTACTCACT-TTAAATGA-TTTTATAATCTTATAAAT
* * * ** * * * *
166254 GATTTTAAGTTTAA-TTTTTTTCATTTTTAGTTGAAACGGATCAGATTTTGTTG-TTTGCATT-A
189 GATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACATATCATAATTTGATGTTTTG--TTGG
* * * * * **
166316 AGAAACATGAA-ACACAAGCCATCCATTAACATGTAAAGTCCATCTATAGTCACTAATGTTTTCG
252 A-AAACATGAAGAGA-AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGT-CATTTATAGTCACTAATGCCTTCG
** * * * *
166380 AAAGAATTGTTACTCGCTTTAAGTCAT
314 AAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGAT
* * * *
166407 TTTATAACTTTGTAAGTGATTTTAAATT-GATTT-TTTTAAATTTTTGGTTAAAACCA-ATCATA
1 TTTATAACTTTATAAATGATTTT-AATTCAATTTGTTTT-CATTTTTGGTTAAAA-CAGATCATA
* * * * * * * *
166469 ATTTGTTGTTTG-AATAGGAAA-ACGAGAA-GCAAAAGCCATCTATTGA-CAAAAAAAGTCCATT
63 ATTTGATGTTTGCATTAAGAAACATGA-AACG-AAAA-CCATCCATTGATAAAAAAAATTCAATT
* * * ** * * * *
166530 TGTAGTGACTTAT-ACATTCAAAAGACTAGTTGCTC-CTTTTAAATGATTTTTTAATCTTATAAA
125 TATAGTCACCTATAAC-TTCGGAAGCCTTGTTACTCAC-TTTAAATGATTTTATAATCTTATAAA
* * * * * * *
166593 TGAGTTGAAATTGAATTTTTTTCTTCATTTTTAGTTAAAACAGATCCTAATTAGATG-TTGGCAT
188 TGATTTTAAATTGAA-TTTTTT-TTCATTTTTAGTTAAAACATATCATAATTTGATGTTTTG-TT
* * * * * *
166657 -CAAGAA-ATGTAA-AGCAAAAGCCATCCATTAACAAGGAAAGTATATTTATAGTCAATCATGCC
250 GGAA-AACATG-AAGAG--AAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGT-CATTTATAGTCACTAATGCC
* *
166719 ATCAAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAAT-AGT
310 TTCGAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGA-T
* * ** * *** *
166750 TTTATAA-TCTAATAAATGATTTTAAATCAAAACTATTTTCATACCTGGTTAGAACAGATCATAA
1 TTTATAACT-TTATAAATGATTTTAATTC-AATTTGTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAA
* * * * *
166814 -TTGAAGGTTTGCAGTAAGAAACATGAAGCGAAAACCATCCATTGAT-AAGAAAAGTCAATTTAT
64 TTTG-ATGTTTGCATTAAGAAACATGAAACGAAAACCATCCATTGATAAAAAAAATTCAATTTAT
** * * ** ** * * * * *
166877 TTTCACCCATACCTT-TAAAAACTTAATTGCTCGCTTTAAATTATTTTATAATCTTATAAATGAG
128 AGTCACCTATAACTTCGGAAGCCTT-GTTACTCACTTTAAATGATTTTATAATCTTATAAATGAT
* ** * *
166941 TTTAAATTGAA--TTTTTTCATTTTTAGTTAAAATATATTGTAATTTGATATTTGCGTTGGAAAA
192 TTTAAATTGAATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACATATCATAATTTGATGTTT-TGTTGGAAAA
* * * ** *
167004 CATGAAGCGACAA-CTATCAATTGACAAG-AAAGTCCATTTATAGTCACTTTTG-CTATCAAAAG
256 CATGAAGAGA-AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGT-CATTTATAGTCACTAATGCCT-TCGAAAG
**
167066 CCTAGTTA-TTGCTTTAAATTG-T
318 CCTAGTTACTCACTTTAAA-TGAT
* * * * * * *
167088 TTTATAA-TCTTATAAATTAATTTTGAATTAAAATTGTTTTTATTTATGGTTAAAACAAATTATA
1 TTTATAACT-TTATAAA-TGATTTT-AATTCAATTTGTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATA
* * * * * * * * * *
167152 ATTGGATGTTTTCATTAGGAAACATGAAGC-AAAAGACATCTATTGA-GAAGAAAAGTCCATTTA
63 ATTTGATGTTTGCATTAAGAAACATGAAACGAAAA-CCATCCATTGATAAAAAAAATTCAATTTA
* * * * * * * * * *
167215 CAGTCACTCT-TACCTTTGAAAGTCTTGCTACTCGCTTTAAGTGGTTTTATGAGT-TTATAAATG
127 TAGTCAC-CTATAACTTCGGAAGCCTTGTTACTCACTTTAAATGATTTTAT-AATCTTATAAATG
* ** ** * * * *
167278 ATTTTAGATTG-A-TTTTTTAAATTTTGGGTTAAAACAGATCATAAATTGATG-TTGGTATGGGG
190 ATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACATATCATAATTTGATGTTTTGT-T-GGA
** * * * * * *
167340 AAATGTGAAGTGAAAGCTATTCATAT-ATAAGAAAAATCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAA
253 AAACATGAAGAGAAAGCCATCCAT-TGACAAGAAAAGTC-ATTTATAGTCACTAATGCCTTCGAA
* * *
167404 AGCCTAGTAACT-AGCTTCAAATGGT
316 AGCCTAGTTACTCA-CTTTAAATGAT
* * **** * *
167429 TTTAT-AGTCTTATAAATGATTTTCAATTGAAAACCTTTTCATTTATGATTAAAACAGATCATAA
1 TTTATAACT-TTATAAATGATTTT-AATTCAATTTGTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAA
* * * ** * * ** *
167493 TTGGATGTTTGCATTGACATCCATTAACAAGAAAAGGCCAT--A-TG-T---AATCACTCATATC
64 TTTGATGTTTGCATTAAGAAACATGAA-ACGAAAA--CCATCCATTGATAAAAAAAATTCA-AT-
* *** * ** ** * * * *
167551 TTCAAAAGCTTTGCTACATGTT-TTATGTGCTT-TT-GTAACTTTATAAATGA-TTT-TAA----
124 TT--ATAG-TCACCTATAACTTCGGAAG-CCTTGTTACTCAC-TT-TAAATGATTTTATAATCTT
* * *
167607 AT---TG-------A--G---TTTTTTT-ATTTTTGGTTAAAACATATCATAATTTAAT-ATTTG
183 ATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACATATCATAATTTGATGTTTTG
* * * * * * * * * *
167655 CATCTAG-AAATATGAAGCA-AAAACCATTCATTGATAGGAAAAATCTATTTATAATCACTCATA
248 --T-TGGAAAACATGAAG-AGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTC-ATTTATAGTCACTAATG
* * * * ** * *
167718 CCTTTGGAAG-ATCAGTAACTTTCTTCAAATGGT
308 CCTTCGAAAGCCT-AGTTACTCACTTTAAATGAT
* * * * * * * *
167751 TTTAT-AGTTCTATAACTGATTTTAAATTGAA-ATGTTTTTCATTTCTAGTTAAAAAAGATTATA
1 TTTATAACTT-TATAAATGATTTT-AATTCAATTTG-TTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATA
* * * * * * * * *
167814 ATTAGATGTTTGCATCAAGAAACATGAAACAAAAACCAAACC-TTCA-CAATAAAGTT-TATTTA
63 ATTTGATGTTTGCATTAAGAAACATGAAACGAAAACC-ATCCATTGATAAAAAAAATTCAATTTA
* * * * ** * *
167876 TACTCACTTAT-ACTCTCGAAAGCTTTGTTACTTGCTTTAAGT-TTATTTATAA-CTTTATAAA-
127 TAGTCACCTATAACT-TCGGAAGCCTTGTTACTCACTTTAAATGAT-TTTATAATC-TTATAAAT
* * * *
167937 GAATTTTAAATTTAA-TTTTTTT-ATTTTTAATT-AAACAAGATCATAATTTGTTG-TTTGCATC
189 G-ATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAAC-ATATCATAATTTGATGTTTTG--T-
* ** * * * * * **
167998 AGGAAATGA-GAAGCA-AAAGCCATCCATGGAGAAGAAAAGTCCATATATAGTTACTTATTTC-T
249 TGGAAAACATGAAG-AGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGT-CATTTATAGTCACTAATGCCTT
* * * * *
168060 CTAATAGCATTA-TTACTCGCTTTAAAGGGT
312 CGAA-AGC-CTAGTTACTCACTTTAAATGAT
* * * * * **
168090 TTTA-AAATCTCATAAATGATTTTGAATTAAATTTTTTTTCATTTTAGGTTCCAACAGATCATAA
1 TTTATAACT-TTATAAATGATTTT-AATTCAATTTGTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAA
** * * ** * * * * *
168154 TTT-ATTGTTTGCATTGGGAAGA-ATGAAATGTAAGTCATGCATTAACAAGAAAAATAC-ATTTA
64 TTTGA-TGTTTGCATTAAGAA-ACATGAAACGAAAACCATCCATTGATAAAAAAAATTCAATTTA
* ** *** ** * *
168216 TAGTCA-ATCATGCCTTTAAAAGTGTAGTTATTCACTTTAAAT-AGTTTTATAATCTTATAAATG
127 TAGTCACCT-ATAACTTCGGAAGCCTTGTTACTCACTTTAAATGA-TTTTATAATCTTATAAATG
* * * * * * * * * *** *
168279 ATTTTGAATTGAATTTTTTTTTAATTTTGGTTCAAA-TTGATCATAGTTTGTTGCTTAAAT-AAG
190 ATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACAT-ATCATAATTTGATGTTTTGTTGGA-
* * * * * * * * * *
168342 AAACGTAAAGTGAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAATCAACTTATAGTTACTTATGCTTTCGAAT
253 AAACATGAAGAGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTC-ATTTATAGTCACTAATGCCTTCGAAA
* * * *
168407 GCCTTGTTACTCTCTTTAAGTGGT
317 GCCTAGTTACTCACTTTAAATGAT
* * * * *
168431 TTTATAACTTTGTAATTGATTTTAAATTGAATTT-TTTTCATTTTTTGTTAAAAACATATCATAA
1 TTTATAACTTTATAAATGATTTT-AATTCAATTTGTTTTCATTTTTGGTT-AAAACAGATCATAA
* * * ** * * * * * * * *
168495 -TTGATATTTGCATCAAGAAACGTGAAGTGACAGCTATCAATT-A-ACAAGAAAGTCTATTTATA
64 TTTGATGTTTGCATTAAGAAACATGAAACGAAAACCATCCATTGATAAAAAAAATTCAATTTATA
** *** *** ** * ** * *
168557 GTCA-CTCATGCCTTTAAAATAATAATTATTCTTTTTAAATAGCTTTTATAATTTTATAAATGAT
129 GTCACCT-ATAACTTCGGAAGCCTTGTTACTCACTTTAAAT-GATTTTATAATCTTATAAATGAT
** * * * * * * *
168621 TTTAGGTTGAATTATTTTTCATATTTGGTTAAAACATATAAGAATTTGCT-ATTTGCATTGTG-A
192 TTTAAATTGAATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACATATCATAATTTGATGTTTTG--TTG-GAA
* * * * * * * * *
168684 AGCGTGAAGCGCAAGTCATCCATTAATATGAAAAGTCCATTTATAGTTACTAATGCCTTCGAAAG
254 AACATGAAGAGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGT-CATTTATAGTCACTAATGCCTTCGAAAG
** * * * *
168749 TGTTGTTACTC-GTTTCAATTGGT
318 CCTAGTTACTCACTTT-AAATGAT
** * * * *
168772 TTTATAACCGTATCAATGACTTTAA-TCGAATTTGTTTTCATTTTTAGTTAAAATAGATCATAAT
1 TTTATAACTTTATAAATGATTTTAATTC-AATTTGTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAAT
** * * * * ** *
168836 TTCTTGTTTGCATCAAGAAACATGAAACGAAAGCCATCAATTGACAAAAAAGGTTCAA-GTATAG
65 TTGATGTTTGCATTAAGAAACATGAAACGAAAACCATCCATTGATAAAAAAAATTCAATTTATAG
* ** * * * * *** * * *
168900 TCACTTATGCCTTTGAAATCCTAGTTACTTGTTTTAAGTGGTTTTGTAA-CTTTATAAATGATTT
130 TCACCTATAACTTCGGAAGCCTTGTTACTCACTTTAAATGATTTTATAATC-TTATAAATGATTT
*** **
168964 TAAATTG-ATTTTTTTT-ATTTTT-GATTAAAACATATCATAATTTGATGTTTACATCAAGAAAC
194 TAAATTGAATTTTTTTTCATTTTTAG-TTAAAACATATCATAATTTGATGTTTTGTTGGA-AAAC
* * * * * * * * * * *
169026 GTGAA-AAAAAACTATTCATTGATAAAAAAAATCTATTTATAGTTACTCATGCCTTCAAAAG-CT
257 ATGAAGAGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTC-ATTTATAGTCACTAATGCCTTCGAAAGCCT
* ** *
169089 AAGTAACTCA-TGACAAATGGT
321 -AGTTACTCACT-TTAAATGAT
* * * ** * *
169110 TTTATAA-TCCTGTAAATGATTTTAAATCAAAACAT-TTTTCATTTTTTGTTAAAACAGATCGTA
1 TTTATAACT-TTATAAATGATTTTAATTC--AATTTGTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATA
* * * * * * * * * * *
169173 ATTAGTTGTTTGCATT-GGAAAATATGAAGCGAAAACTAACAATTGAT-AAAAAAAGTCTATATA
63 ATTTGATGTTTGCATTAAG-AAACATGAAACGAAAACCATCCATTGATAAAAAAAATTCAATTTA
* ** * * * ** * *
169236 TAATCA-CTCATGCCTTTGAAAACCTTGCCACTCACTTTAAGTGATTTTGTAA-CTTTATAAATG
127 TAGTCACCT-ATAACTTCGGAAGCCTTGTTACTCACTTTAAATGATTTTATAATC-TTATAAATG
* * ** ***
169299 ATTTTAAATT-AATTTTTTTT-ATTTTT-GATTAAAACAGATCATAATATGATGTTTACATCAAA
190 ATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATTTTTAG-TTAAAACATATCATAATTTGATGTTT-TGTTGGA
* * * * * * *
169361 AAACATGAAGCA-AAAACCATTCATTGGCAAGAAAAAG-CTATTTATACTTACTCATGCCTTCAA
253 AAACATGAAG-AGAAAGCCATCCATTGACAAG-AAAAGTC-ATTTATAGTCACTAATGCCTTCGA
** * * *
169424 AAGATTTA-TAACTCACTTCAAATCAT
315 AAG-CCTAGTTACTCACTTTAAATGAT
* * ** * * * *
169450 TGTAT-AGTCTTCCAAATGATTCTCAA-TCAAATATT-TTTTTATTTCTAGTTAAAACAGATCAT
1 TTTATAACT-TTATAAATGATT-TTAATTC-AAT-TTGTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCAT
* * * * * * * * * * * *
169512 AATTAGATATTTACATCAAAAAACATTAAGCGAAAGCCATCCATTGACACAAAAAA-CCCATTTA
62 AATTTGATGTTTGCATTAAGAAACATGAAACGAAAACCATCCATTGATAAAAAAAATTCAATTTA
* ** ** * *
169576 TAATCA-CTCATGCCTTCAAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTTG-TTTTATAA-CTTTATAAAT
127 TAGTCACCT-ATAACTTCGGAAGCCTTGTTACTCACTTTAA-ATGATTTTATAATC-TTATAAAT
* * * * * * **
169638 GATCTTAAATTGAATTTTTTTTCATTTTTAATTAATATATATCATAATTTGTTG-TTTGCATCAA
189 GATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACATATCATAATTTGATGTTTTG-TTGGA
* * * * * * **
169702 GAAACGTGAAGTGAAAGTCATCCATTGAGAAGAAAAGTTCATCTATAGTCACTCATGCCACCGAA
253 -AAACATGAAGAGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAG-TCATTTATAGTCACTAATGCCTTCGAA
* * *
169767 AGCATTA-TTACACACTTTAAATTG-G
316 AGC-CTAGTTACTCACTTTAAA-TGAT
* * * * * * * * *
169792 TTTAAAACCTGATAAATGATTTTAAATTGAATTT-TTTCCATTTTAGGTTCAAGCTGATCATAAC
1 TTTATAACTTTATAAATGATTTT-AATTCAATTTGTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAA-
* *** * * * *
169856 TTT-TTGTTTGCATCGGGAAATATGAAGC-AAAAGCCTTCCATTGATAAAAAAAGTTC-ATTTAT
64 TTTGATGTTTGCATTAAGAAACATGAAACGAAAA-CCATCCATTGATAAAAAAAATTCAATTTAT
* * ** *** * * ** * *
169918 AGTCA-TTCGTGCCTTTAAAAGGCTTGTTAATTGCTTT-AAGGGTTTTATAA-CTTTATAAATGA
128 AGTCACCT-ATAACTTCGGAAGCCTTGTTACTCACTTTAAATGATTTTATAATC-TTATAAATGA
* * * * * *
169980 TTTTAAATTAAATTTTTCTTT-ATTTTTAATTAAAATAGATCATTATTTGTTG-TTTGCATTAGG
191 TTTTAAATTGAATTTTT-TTTCATTTTTAGTTAAAACATATCATAATTTGATGTTTTG--TT-GG
** * * * ** * *
170043 -AAACATGATCTA-AAA-CTGATCCACTGACAAG-AAAGTCTAGTTATAGTCACTTTTGCTTTTG
252 AAAACATGA-AGAGAAAGC-CATCCATTGACAAGAAAAGTC-ATTTATAGTCACTAATGCCTTCG
* * **
170104 AAAGCGTAGTTACTCGCTTTAAATGGC
314 AAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGAT
* * * * * * * *
170131 TTTACAA-TCTTATAAATGATTTGAAGTTGAATTTCTTTTTATATTTT-GTTAAAATAGATAAAA
1 TTTATAACT-TTATAAATGATTTTAA-TTCAATTTGTTTTCAT-TTTTGGTTAAAACAGATCATA
* * * * ** * * * * * * *
170194 ATTTGTTATTTGCCTTGAG-AA-ATGCTAAGTGCAAGCCATTCAATGAT-AAGAAAAGTCCATTT
63 ATTTGATGTTTGCATTAAGAAACATG--AAACGAAAACCATCCATTGATAAAAAAAATTCAATTT
* * ** * ** * * * *
170256 GTGGTCA-CTAATGCCTTCGAAAGCGATCTTACTCGCTTTAACTGGTTTTATAA-CATTATAAAT
126 ATAGTCACCT-ATAACTTCGGAAGCCTTGTTACTCACTTTAAATGATTTTATAATC-TTATAAAT
* *
170319 GATTTTAAATTGAATTTTTTTT-ATTTTTTGTTAAAACAAATCATAATTTG-T-TCTTTGCATTA
189 GATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACATATCATAATTTGATGT-TTTG--TT-
* * * * * * *
170381 GG-AAACATGAAGCA-AAAGTCATCCATTGACAAAAAAAGTCCATTTATATTGATTGATGTC-TC
250 GGAAAACATGAAG-AGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGT-CATTTATAGTCACTAATGCCTTC
* **
170443 GGAAAGCCTAGTTGCTTGCTTTAAAT-AGT
313 -GAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGA-T
* * * * * *
170472 TTTATAA-TCTTATAAATGATTTTAAATT-AATTTTTTTTTGTGATTTTGGGTTAAAATAAATCC
1 TTTATAACT-TTATAAATGATTTT-AATTCAA--TTTGTTT-TCATTTTTGGTTAAAACAGATCA
*** * * * * * * *
170535 TAATTTGATGTTTGCATCGGGAAATATGAAGCGAAAGCCATTCATTGATAAGAAAAGTTC-CTTT
61 TAATTTGATGTTTGCATTAAGAAACATGAAACGAAAACCATCCATTGATAAAAAAAATTCAATTT
* ** * * * * **
170599 ATTA-TCA-CTCATACCTTCAAAAGCCTTTTTTCTCACTTTGAATGGTTTTATAATCAGATAAAT
126 A-TAGTCACCT-ATAACTTCGGAAGCCTTGTTACTCACTTTAAATGATTTTATAATCTTATAAAT
* * * * ** * *
170662 GATTTTAGATCAGAGTTTTTCTTTTCATTTCTAGTTTGAACAAATCATAA-TTGAATGTTTGTAT
189 GATTTTAAAT-TGA-ATTTT-TTTTCATTTTTAGTTAAAACATATCATAATTTG-ATGTTT-TGT
* ** * * * * * ***
170726 TAGAAAATGTGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAATGTTCATTTATAGCCGCTCATATATTC
249 TGGAAAACATGAAGAGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAG-TCATTTATAGTCACTAATGCCTTC
* * * * *
170791 AAAAGCCTTA-TTACTTACTTCAAGTGGT
313 GAAAGCC-TAGTTACTCACTTTAAATGAT
* * * * * *
170819 TCTATAACTATATAAATGAATTTAATTCAATTT-TTTTCATTTTTAGTTAAAATAGATCAAAATT
1 TTTATAACTTTATAAATGATTTTAATTCAATTTGTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATT
** * * * *
170883 T-ATTGTTTGCATT-AGAAAACATG-AA-GTAAAAGTTATCCATTGAT-AAGAAAAGTCCATCTA
66 TGA-TGTTTGCATTAAG-AAACATGAAACG-AAAA-CCATCCATTGATAAAAAAAATTCAATTTA
** * ** * * ** * * * *
170943 TAGTCA-CTCATTCCTCCATAGGCATCATTACTCACTTTCAATGGTTTTAAAATCTCAT-AA--A
127 TAGTCACCT-ATAACTTCGGAAGCCTTGTTACTCACTTTAAATGATTTTATAATCTTATAAATGA
* ** * * *
171004 ---TAAATTGAATTTCTTTTCA-TTTTAGGTGT-GTACAGATCAAAATTTGTTG-TTTGCATT-G
191 TTTTAAATTGAATTTTTTTTCATTTTTA-GT-TAAAACATATCATAATTTGATGTTTTG--TTGG
** ** ** * * * *
171062 ACAAATGTGAAGCA-AAAATCATCTTTTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGCCATTCATGTCTTC-
252 A-AAACATGAAG-AGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGT-CATTTATAGTCACTAATGCCTTCG
* ** * **
171125 AACTA-ACTTTTTTCTTGCTTTAAATGAT
314 AA--AGCCTAGTTACTCACTTTAAATGAT
* * * * * *
171153 TTTATAACCTTATAAATGATTTTAAATTGAATTCT-TGTTCATTTTTAGTTGAAATAGATCATAA
1 TTTATAACTTTATAAATGATTTT-AATTCAATT-TGTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAA
* ** * * * * * * * **
171217 TTTGATGTTTGCCTTGTG-AACATGAAGCGAAAGCTATGCA-TCA-ACAATAAAGTT-TGTTTAT
64 TTTGATGTTTGCATTAAGAAACATGAAACGAAAACCATCCATTGATA-AAAAAAATTCAATTTAT
** *** * * *
171278 AGTCA-CTCATGCCTTTAAAAGCATAT-TTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTTAAAAATGA
128 AGTCACCT-ATAACTTCGGAAGCCT-TGTTACTCACTTTAAATGATTTTATAATCTTATAAATGA
* * * * *
171341 TTTTAAGTTGAATGTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAAATAAAAATTTG-T-TATTTGCATT-G
191 TTTTAAATTGAAT-TTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACATATCATAATTTGATGT-TTTG--TTGG
* * * * **
171403 AGAAACATTAAGCGCAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTTCATTTATAGTTACTAATGCCTTAAA
252 A-AAACATGAAGAGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAG-TCATTTATAGTCACTAATGCCTTCGA
** * * *
171468 AAGTATTA-TTACTCACCTTAAGTGGT
315 AAG-CCTAGTTACTCACTTTAAATGAT
** * * *
171494 TTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATGGAATTTATTTTCATTTTTTGTTAAAACAGTTCATAAT
1 TTTATAACTTTATAAATGATTTT-AATTCAATTTGTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAAT
* ** ** *** * * *
171559 TTGATGTTTGGATTAAGAAATGTGAAGTGAAAGTTATCCACT-A-ACAAAACAATTCCATTTATA
65 TTGATGTTTGCATTAAGAAACATGAAACGAAAACCATCCATTGATA-AAAAAAATTCAATTTATA
* ** ** * * * * * *
171622 ATCA-CTCATGCCTTCAAAAGTCGTGTTAGTCACTTCAAATGGTTTTATAATCTTGTAAATGATT
129 GTCACCT-ATAACTTCGGAAGCCTTGTTACTCACTTTAAATGATTTTATAATCTTATAAATGATT
* * * * * * * ** *
171686 ATGAATTGAA-TTCTTTTCATTTTTGGTGAAAATAGATCATAATTTGATGTTTACATTAGAAAAC
193 TTAAATTGAATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACATATCATAATTTGATGTTT-TGTTGGAAAAC
* * * * *
171750 ATGAGGCA-AAAGCTATCCATTGACAAG-AAAGTCCATTTATCGTCACTCATGCCTTCAAAAG-C
257 ATGAAG-AGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGT-CATTTATAGTCACTAATGCCTTCGAAAGCC
* * ** **
171812 GAGTTATTCGTTTTAAATGGC
320 TAGTTACTCACTTTAAATGAT
** ** * * * * * *
171833 TTTATAA-TCTTGCAAATGATTTTCGGTTGAAGTT-TTTTCATTTTTGGTAAAAACATATTAGAA
1 TTTATAACT-TTATAAATGATTTT-AATTCAATTTGTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAA
* * * * * * * * * *
171896 TTTGTTATTTGCATTCAA-AGAA-ATGAAGCGCAAGCCATCAATT--TACAAAAAAGTCTATCTA
64 TTTGATGTTTGCATT-AAGA-AACATGAAACGAAAACCATCCATTGATAAAAAAAATTCAATTTA
* ** * * *
171957 TAGTCA-CTAATACCTTC-GAAGGTGTTGTTAATCGCTTCAAAT-AGTTTTATAA-CTTTATAAA
127 TAGTCACCT-ATAACTTCGGAA-GCCTTGTTACTCACTTTAAATGA-TTTTATAATC-TTATAAA
** * * * * ***
172018 TGATTTTGGATTGAATTTTTTTTTATTTTTGGTTAAAACTTACCATAATTT-ATTGTGTACATTA
188 TGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACATATCATAATTTGA-TGT-TTTGTT-
* * * * * * * * * *
172082 GG-AAACGTGAAGCGAATGCTATCTATTGACAAGAAAAGTCCACTTATACTGACTTATGCATTCG
250 GGAAAACATGAAGAGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGT-CATTTATAGTCACTAATGCCTTCG
** *
172146 AAAGTGTAGTTACTCGCTTTAAAT-AGT
314 AAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGA-T
* * * ** * *
172173 TTTATAA-TCTTATAAATGGGTTTGAATTGAAATTT-TTTTCATTTTTCTTTAAAATAGATCCTA
1 TTTATAACT-TTATAAAT-GATTTTAATT-CAATTTGTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATA
** ** ** * * ** * *
172236 ATTTGATGTTTGCATTTGGAAATGTGAAGTGAAAGCCATCCATT-A-ACAAGATTAGTCCATTTA
63 ATTTGATGTTTGCATTAAGAAACATGAAACGAAAACCATCCATTGATA-AAAAAAATTCAATTTA
* ** * * * * **
172299 TTGTCA-CTCATGCCTTTGAAAG-GTTAATTACTTTCTTTAAATTG-TTTTATAATCTTATAAAT
127 TAGTCACCT-ATAACTTCGGAAGCCTT-GTTACTCACTTTAAA-TGATTTTATAATCTTATAAAT
* * * *
172361 GAGTTTAAATTG-ATTTTTTGTTCATTCTTAGTTAAAAC-TGATCATAGTTTAATG-TTTGCATT
189 GATTTTAAATTGAATTTTTT-TTCATTTTTAGTTAAAACAT-ATCATAATTTGATGTTTTG--TT
* * * * * * * * *
172423 GGGAAACTTGAAGCA-AAAACCATCCATTGATGAA-AAAAGTCTATTTACATTGACTTATGCCTA
250 GGAAAACATGAAG-AGAAAGCCATCCATTGA-CAAGAAAAGTC-ATTTATAGTCACTAATGCCTT
* * *
172486 GGAAAGCCTAGTTTCTCACTTGAAAT-AGT
312 CGAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGA-T
* * * * * * * *
172515 TTTATAA-TCATATAAATGATTTGAAATT-AATTTTTTTTAATTCTTGGTTAAAACATATCCTAG
1 TTTATAACT-TTATAAATGATTT-TAATTCAATTTGTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAA
* * * ** * * * *
172578 TTTGATGTTTGCATTAGGAAATATG-AA-GGAAACTTTTCCATTGA-CAAGAAAAGTCTATTTAT
64 TTTGATGTTTGCATTAAGAAACATGAAACGAAAAC-CATCCATTGATAAAAAAAATTCAATTTA-
* * ** * * *
172640 TA-TCA-CTCATATCTT-GGAAAGCCTAGTTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAACTA
127 TAGTCACCT-ATAACTTCGG-AAGCCTTGTTACTCACTTTAAATGATTTTATAATCTTATAAATG
** * * * *
172702 ATTTTAAATCAAAATTTTTCTCATTTCTT-GTTAGAAA-AAATCATAATTGGATGTTTGTGTTGG
190 ATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATTT-TTAGTTA-AAACATATCATAATTTGATGTTT-TGTTGG
* * * *
172765 GAAACAT-AA-AGTATAAGCTATCCATTGACAAGTAAAA-TCCATTTACAGTCACTCATGCCTTC
252 AAAACATGAAGAG-A-AAGCCATCCATTGACAAG-AAAAGT-CATTTATAGTCACTAATGCCTTC
* * * *
172827 GAAAGCCT-GATTACTCGCCTTAAGTGGT
313 GAAAGCCTAG-TTACTCACTTTAAATGAT
* * * **
172855 ATTATAACTTTATAAATGATTTTAATTTAAATTGTTTTTCATTTTTGGTTAAATGA-ATCATAAT
1 TTTATAACTTTATAAATGATTTTAATTCAATTTG-TTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAAT
* * ** * ** * * *
172919 TTGATGTTTGCATCAAAAAATGTGAAGCGAAAGTCATCCATTGACAAGAAAAA-TCTATTTATAG
65 TTGATGTTTGCATTAAGAAACATGAAACGAAAACCATCCATTGATAAAAAAAATTCAATTTATAG
* ** ** ** * * **
172983 TCACATATGCCTTCAAAAGCCTAATTGCT-AGCTTTAAATGATTTTAGAATCACATAAATG-TTT
130 TCACCTATAACTTCGGAAGCCTTGTTACTCA-CTTTAAATGATTTTATAATCTTATAAATGATTT
* * * *
173046 ACAAAATAT-AA-TTTTTCTCATTTTTTGTTAAAACATATCATAATTTGATG-TTTGCATAAGG-
194 --TAAAT-TGAATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACATATCATAATTTGATGTTTTG--T-TGGA
** * * * * * ** * *
173107 AAAGGTAAAGCGAAAGCCATCTATTGATAA-AATAAGTCCATTTATAGTCACTCATATCTACAAA
253 AAACATGAAGAGAAAGCCATCCATTGACAAGAA-AAGT-CATTTATAGTCACTAATGCCTTCGAA
* * *
173171 AGCCTAGTTACACGCTTTAAATGGT
316 AGCCTAGTTACTCACTTTAAATGAT
* * ** * * * *
173196 TTTAT-AGTCTTATTAATGATTTTAAATAAAAATT-TTTTCATTTCTAGTT-AAACAGGTCATAA
1 TTTATAACT-TTATAAATGATTTT-AATTCAATTTGTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAA
* * * * * ** * * * * *
173258 GTGGACT-TTTGCATCATGAAACATTAAGTGAAAA-CTTCCATTGACT--AGAAAAGTCTATTTG
64 TTTGA-TGTTTGCATTAAGAAACATGAAACGAAAACCATCCATTGA-TAAAAAAAATTCAATTTA
* * * ** * * * *
173319 TAGTCA-CTCATAACTTTGAAACCCTTGTTACTTGCTTTAAGTGGTTTTATGA-CATTATAATTG
127 TAGTCACCT-ATAACTTCGGAAGCCTTGTTACTCACTTTAAATGATTTTATAATC-TTATAAATG
* * **
173382 ATTTTAAATTG-A-TTTTTTTCATTTCTT-GTTAAAATAGATCATAATTTGATG-TTTGCATCAG
190 ATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATTT-TTAGTTAAAACATATCATAATTTGATGTTTTG--TTGG
** * ** * ** ** **
173443 AAAAGGTAAAGCA-AAAATCATCCATTGA-ATAAAAAAGTTCATTTATAGTCTGTTTTGTGTTCG
252 AAAACATGAAG-AGAAAGCCATCCATTGACA-AGAAAAG-TCATTTATAGTCACTAATGCCTTCG
** *
173506 AAAGCCTAGTTACTTGCTTTCAATG-T
314 AAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGAT
* * * * * **
173532 TTT-TACAGTATTAT-AATCATTTTTATATTGAAATTT-TCTT-AGTTTTGGTTAAAACAGATTG
1 TTTATA-ACT-TTATAAATGA-TTTTA-ATT-CAATTTGTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCA
* * ** * * * * * *
173593 TAATTTGATGTTTGTATTGAGAAAGGTGAAGCGAAAGCAATCCATTAATAAAAAAAAATCTATTT
61 TAATTTGATGTTTGCATTAAGAAACATGAAACGAAAACCATCCATTGATAAAAAAAATTCAATTT
* *** * * ** * * *
173658 ATAGGCACTCT-GGCCTTC-AATAACCTAATTACTCAAC-TTAAGTGGTTTTATGATCTTATAAA
126 ATAGTCAC-CTATAACTTCGGA-AGCCTTGTTACTC-ACTTTAAATGATTTTATAATCTTATAAA
* * * * * * *
173720 TGATTTTAAAATT-AACTTTTTCTCATTTTTTGTTAAAACAGATCATAATTTAATG-TTTGCATC
188 TGATTTT-AAATTGAATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACATATCATAATTTGATGTTTTG-TTG
* ** * * * * * * * * **
173783 AAGAAATGTGAAGCGAAAGCCATCCAATAATAATAAAAATCCATTTGTAGTTACTCTTGCCTTC-
251 GA-AAACATGAAGAGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGT-CATTTATAGTCACTAATGCCTTCG
* * *
173847 ACAGCCTTA-TTACTCGCTTTAAATGGT
314 AAAGCC-TAGTTACTCACTTTAAATGAT
* * * * * *
173874 TTTATAGCTTTATAAATAATTTTAAATT-AATTT-TTTTTATTTTTTGTTAGAACAGATCATAAC
1 TTTATAACTTTATAAATGATTTT-AATTCAATTTGTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAAT
* *** * * * *** * * * * *
173937 TTCATGTTTGCA-CCGGGAA-ATGCTAAGCGCAAGTTATTCATT-A-ACAAGAAAAGTCCATTTG
65 TTGATGTTTGCATTAAGAAACATG--AAACGAAAACCATCCATTGATA-AAAAAAATTCAATTTA
* * * * ** ** * * * * ** *
173998 TTGTAACTTTTGCCTTCAAAAACCTAGTTTCTCGCTTTAAATGGGTTTATAATCCTATAAATGAT
127 TAGTCACCTATAACTTCGGAAGCCTTGTTACTCACTTTAAATGATTTTATAATCTTATAAATGAT
* * * * * * *
174063 TTAAAATTAAATTTTTTTT-ATTTTTGGTTAAAACAAATCGTAATTTCAT-ATTTGCATTAGG-A
192 TTTAAATTGAATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACATATCATAATTTGATGTTTTG--TT-GGAA
* * * * * * **
174125 AACATGAAGCGAAAGCTATCCATTGACAAGAAAATTCTATTTTATAGTCATTCATACCTTTAAAA
254 AACATGAAGAGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTC-A-TTTATAGTCACTAATGCCTTCGAAA
* * *
174190 ACCTAGTTA--CATGTTTCAAATGGT
317 GCCTAGTTACTCA-CTTT-AAATGAT
* * * * * *** *
174214 TTTAT-AGTCATATAAATAATTTTAAATTGAA-GTGTTTTTCATTTGAAGTTAAAACAAATCATA
1 TTTATAACT-TTATAAATGATTTT-AATTCAATTTG-TTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATA
* * ** * * * * * * * * *
174277 ATTGGATTTTTGTGTCAGGAAACGTGAAGC-AAAACCCTTCCATTGAT-AAGAAAAGTCCATTTG
63 ATTTGATGTTTGCATTAAGAAACATGAAACGAAAA-CCATCCATTGATAAAAAAAATTCAATTTA
** * * * * * *
174340 TAGTCA-CTCATGCCTTTGAAAGCCTTGTTACTCACTTCAAGTGATTTTATAA-CTTCAAAAATA
127 TAGTCACCT-ATAACTTCGGAAGCCTTGTTACTCACTTTAAATGATTTTATAATCTT-ATAAATG
* * *
174403 ATTTTAAATTG-A-TTTTTTTCA-TTTCAGTTAAAATAGATCATAATTTGATG-TTTGCATTGGA
190 ATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACATATCATAATTTGATGTTTTG--TTGGA
* * * * **
174464 AAACGTAAAGCA-AAAGCCAT-CATTAACTAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCGTG--TTCGAA
253 AAACATGAAG-AGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGT-CATTTATAGTCACTAATGCCTTCGAA
* *
174525 AGCCTAATTATTTC-CTTTAAAT-AT
316 AGCCTAGTTA-CTCACTTTAAATGAT
* * * * * **
174549 TTT-TACAATCTTATAAATGATTTTTACATTGAAATTT-TCTT-ATTTTTGGTTAAAATAAATTG
1 TTTATA-ACT-TTATAAATGA-TTTTA-ATT-CAATTTGTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCA
* * * * *** * *
174611 TAATTTGATGTGTGCATCAAGAAACGTGAAGCGAAAGTGATCCATTGATAAGAAAAGTT-AATTT
61 TAATTTGATGTTTGCATTAAGAAACATGAAACGAAAACCATCCATTGATAAAAAAAATTCAATTT
* ** * ** * *
174675 GTAG-CTA-CTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTTGCTTCAAGTGATTTTATAA-CTTTATAAA
126 ATAGTC-ACCT-ATAACTTCGGAAGCCTTGTTACTCACTTTAAATGATTTTATAATC-TTATAAA
* * *
174737 TGA-TTTAAA-T---TTTTTTTTCACTTTTTA-TTAAAGCATATCAAAATTTGATG-TTTGCATC
188 TGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCA-TTTTTAGTTAAAACATATCATAATTTGATGTTTTG--TT
* * * * ** * *
174795 AGAAAACGTAAAGTGAAAGCCATCCATTGAGTAGAAAA-TCCATTTATAGTCACTTATACC-TCT
250 GGAAAACATGAAGAGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGT-CATTTATAGTCACTAATGCCTTC-
*
174858 GAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAGTGAT
313 GAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGAT
* * * ** * *
174886 TTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTTAATTT-TTATCAATTTCAGTTAAAATAGATCATTAT
1 TTTATAACTTTATAAATGATTTT-AATTCAATTTGTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAAT
* * * * ** * * *
174950 TGGATGTTTGAATT-GGAAA-ATCTGAAGCGAAAATGATCTATTGA-CAAAAAAGTTC-ATTTAT
65 TTGATGTTTGCATTAAGAAACA--TGAAACGAAAACCATCCATTGATAAAAAAAATTCAATTTAT
* * * * ** * * * *
175011 AGTCA-CTCA-AGTCTTTGAAAACCTAATTACTCGCTTTAAATGGTTTTGTGATCTTATAAATGA
128 AGTCACCT-ATA-ACTTCGGAAGCCTTGTTACTCACTTTAAATGATTTTATAATCTTATAAATGA
* * * * *
175074 TTTTAAAATTGAA-TATTTCTCATTTTTTGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGTGTTGGGA
191 TTTT-AAATTGAATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACATATCATAATTTGATGTTT-TGTTGGAA
** * * * * * * * *
175138 AATGTGAATCA-AAAGCCATCAATTGACAAGAAAAATCCATTTATATTCATTCATGACTTTGAAA
254 AACATGAA-GAGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGT-CATTTATAGTCACTAATGCCTTCGAAA
* *
175202 GCCTTA-TTACTCACTTTAAGTGGT
317 GCC-TAGTTACTCACTTTAAATGAT
* * * * *
175226 TTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTT-TTTTTATTTTTAGTTAGAACAGATCATAGT
1 TTTATAACTTTATAAATGATTTT-AATTCAATTTGTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAAT
* * ** * ** * * *
175290 TTGATGTTTGCATCAAGGAATGTGAAGC-AAAAGTTATCCAGTGAT-AAGAAAAGTCAA-TTATA
65 TTGATGTTTGCATTAAGAAACATGAAACGAAAA-CCATCCATTGATAAAAAAAATTCAATTTATA
* ** * * * * * * *
175352 GTC-GCTCATGCCTTCGAAAACCTAT-CTACCCACTTTAAATGGTTGTATAACCTTATAAATGAT
129 GTCACCT-ATAACTTCGGAAGCCT-TGTTACTCACTTTAAATGATTTTATAATCTTATAAATGAT
* * * * * ** *
175415 TTTAAAATTGAA---TTTCTCATTTTTGGTT-AAACAAAAT-ATAATTTGTTATTTACATTGGGA
192 TTT-AAATTGAATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAAC-ATATCATAATTTGATGTTT-TGTTGGAA
* * * * *
175475 AACATGAAGCA-AAAGCCATCCATTGACAAGCAAGGTCAATTTACAGTCACTCATGCCTTCAAAA
254 AACATGAAG-AGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTC-ATTTATAGTCACTAATGCCTTCGAAA
* * * * *
175539 ACCTAATTAC-AAGCTTCAAATGGT
317 GCCTAGTTACTCA-CTTTAAATGAT
* * * * * * * * * *
175563 TTT-TTAGTCTTACAAATGATTTTAAATAAATTTTTTTTTATTTTTGGATAAAAAAAATCATAAT
1 TTTATAACT-TTATAAATGATTTTAATTCAATTTGTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAAT
* * * * * * **
175627 TAGAT-TTATGTATTAGGAAAC-TTAAA-GCAAAACCTTTCCATTGATAAGAAAAGCTC-ATTTA
65 TTGATGTT-TGCATTAAGAAACATGAAACG-AAAACC-ATCCATTGATAAAAAAAATTCAATTTA
* * * * * * * * *
175688 TAGTCA-CTCAT-ACTTTTGAAAACCTTATTACT-AGCTTCAAGTGGTTTGATGA-CTTTATAAA
127 TAGTCACCT-ATAAC-TTCGGAAGCCTTGTTACTCA-CTTTAAATGATTTTATAATC-TTATAAA
* * * *
175749 TAACTTT--A---AA----TTTT--TTTTT-GTTAAAACAAATCATAATTTGATG-TTTGCATCA
188 TGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACATATCATAATTTGATGTTTTG--T-T
* * * * **
175801 GG-AAACGTAAAGCA-AAAGCCATCCGTTGACTAA-AAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGTGTT
250 GGAAAACATGAAG-AGAAAGCCATCCATTGAC-AAGAAAAGTC-ATTTATAGTCACTAATGCCTT
* * * *
175863 CGAAAGCTTAGTTACTCGCGTTAAATGTT
312 CGAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGAT
* * * * * * *
175892 TTTACAA-TCTTATAAGTGAATTTTATGTTGACTTT-TTTCTCATTTTTGGTTAAAACATATCGT
1 TTTATAACT-TTATAAATG-ATTTTA-ATTCAATTTGTTT-TCATTTTTGGTTAAAACAGATCAT
* * * * * * * *
175955 AATTTGTTGCTCGCATTGAGAAATATGGAAC-AAAAGCTATCCATTGATAAGAAAAAA--CCATT
62 AATTTGATGTTTGCATTAAGAAACATGAAACGAAAA-CCATCCATTGATAA-AAAAAATTCAATT
* * ** ** * * * * * * * **
176017 TATAGTCA-CTTTTACTTTCAAAAATCTAGTTACACGCTTGAAAAGGTTTTGTAGCCTTATAAAT
125 TATAGTCACCTATAAC-TTCGGAAGCCTTGTTACTCACTTTAAATGATTTTATAATCTTATAAAT
* * * * * * * *
176081 GATTTTAAATTGAAATGTGTTTCATTTCTAGTTACAATAGT-TCA-AAATTGAATGTTTGTATTG
189 GATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACA-TATCATAATTTG-ATGTTT-TGTTG
* * * * * * * * ** *
176144 G-AAAGATTAAAACCAAAACCATCCATTGACAAGAAAAATCCATGTATAGCCACTCTTGCCTTTG
251 GAAAACATGAAGA-GAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGT-CATTTATAGTCACTAATGCCTTCG
* * * * * *
176208 AAAACTTTGTTACTTACTTTAAGTGGT
314 AAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGAT
* * * ** *
176235 TTTATAACTTTATAAATAATTTTAAATTGAA--TGTTTTCCATATTTAATT-AAACTAGATTA-A
1 TTTATAACTTTATAAATGATTTT-AATTCAATTTGTTTT-CATTTTTGGTTAAAAC-AGATCATA
* ** * * * * * *
176296 TATTTAATGTTTGCATTGGGAAACGTGAACCGAAAGCCATCCCTTGATAAGAAAAA-TCTATTTA
63 -ATTTGATGTTTGCATTAAGAAACATGAAACGAAAACCATCCATTGATAAAAAAAATTCAATTTA
* ** * * ** * * *
176360 TAATCA-CTCATGTCTTCGAAAGCCTTATTACTGGCTTTAAGTGGTTTTACAA-CTTATAAATGA
127 TAGTCACCT-ATAACTTCGGAAGCCTTGTTACTCACTTTAAATGATTTTATAATCTTATAAATGA
* ** * * * *
176423 TTTTAAATTGATTTTTTTTTCATTTTTAGTTTGAATAGATCATAATTTGAT-ATTTGCATCTTG-
191 TTTTAAATTGAATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACATATCATAATTTGATGTTTTG--T-TGGA
** * * *
176486 AAACATGAAGCA-AAAGTTATCCATTCACAAG-AAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGTA
253 AAACATGAAG-AGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGT-CATTTATAGTCACTAATGCCTTCGAA
** **
176549 AGCCTAGTTGTTTGCTTTAAATGAT
316 AGCCTAGTTACTCACTTTAAATGAT
* * * * * * * *
176574 TTTATAA-TCATATAAATAATTTTCAAATT-GATTTTTTTTTATTTTTAGTAAAAACATATCATA
1 TTTATAACT-TTATAAATGATTTT--AATTCAATTTGTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATA
* * * * ** ** * *
176637 ATTTGATGCTTGCATT-AGAAA-ATGTGAATC-AAAAGCTATTCATT-AGCACCAAAAGTCTATT
63 ATTTGATGTTTGCATTAAGAAACA--TGAAACGAAAA-CCATCCATTGATAAAAAAAATTCAATT
* * * ** * * * *
176698 TATAGTCACTTATACCTTCGGAAGCCTAGGCACACACTTCAAATGGTTTTATAGTCTTATAAATG
125 TATAGTCACCTATAACTTCGGAAGCCTTGTTACTCACTTTAAATGATTTTATAATCTTATAAATG
* * * * * *
176763 ATTGTAAATTAAAATTTTTTTTCATTTCTAGTTAAAACATATCATAGTTAGAT-TTTTCTTCAGG
190 ATTTTAAATT-GAATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACATATCATAATTTGATGTTTTGTT--GG
* * * * * *
176827 -AAACATGAAGCGAAA-CTCTTTCATTGATAA-AGAA---A---A-AGT---TCAT--C-T----
252 AAAACATGAAGAGAAAGC-CATCCATTGACAAGAAAAGTCATTTATAGTCACTAATGCCTTCGAA
* * *
176872 -G--TAATCACTCA-TTTCAAGTGAT
316 AGCCTAGTTACTCACTTT-AAATGAT
* * *
176894 TTTATAACTTTACAAATGATTTTAAATT-GATTT-TTTTCATTTTTGGTTAAAACAGAT-AGCAA
1 TTTATAACTTTATAAATGATTTT-AATTCAATTTGTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCA-TAA
* * * * ** *
176956 TTTGATGTTTGCATTAAAAAACAT-AAAGTGAAAGCCATCCATTTACT-AGCAACATTC-ATTTA
64 TTTGATGTTTGCATTAAGAAACATGAAA-CGAAAACCATCCATTGA-TAAAAAAAATTCAATTTA
* * * * * * *
177018 TAGTCA-CTATTACCTTCGAAAGCCTAGTTGCCCACTTTTAAATGATTTTATACTCTTATAAATT
127 TAGTCACCTA-TAACTTCGGAAGCCTTGTTACTCAC-TTTAAATGATTTTATAATCTTATAAATG
* * * * *
177082 ATTTTAAA-TCAA--TTTTTT-ATTTTTAGTTAAAAAAAATCATAAATTGATGTTTT-TATTGAG
190 ATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACATATCATAATTTGATGTTTTGT-TGGA-
* * * * * * * *
177142 AAACGTGAAGCA-AAAGCTATCCATTAACAAGAAAAGTCTATCTATAGCCATTCATGCCTTTGAA
253 AAACATGAAG-AGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTC-ATTTATAGTCACTAATGCCTTCGAA
** * * * *
177206 AGGTTTGTTACTCACTTCAAGTGGT
316 AGCCTAGTTACTCACTTTAAATGAT
* * * *
177231 TTTATAACTTTATAAATGATGTTAAATTGAATTAT-TTTT-ATTTTTAGTTAAAAC-GTATCATT
1 TTTATAACTTTATAAATGAT-TTTAATTCAATT-TGTTTTCATTTTTGGTTAAAACAG-ATCATA
** * * * ** * * * * *
177293 ATTAAATATTTGCATCAAGAAACGTGAAGTGAAAGA-TATCCATTGAT-AAGAAAAGTCTAGTTA
63 ATTTGATGTTTGCATTAAGAAACATGAAACGAAA-ACCATCCATTGATAAAAAAAATTCAATTTA
* ** ** * * *
177356 TAGTCACTTATGCCTTCAAAAACTTTTTTACTCACTTTAAATGATTTTATAATCTTATAAATGAT
127 TAGTCACCTATAACTTCGGAAGCCTTGTTACTCACTTTAAATGATTTTATAATCTTATAAATGAT
* * * * * *
177421 TTTAAATTGAA--TTTTTTCATTTTCAGTTAAAACATATTATTATTAGAT-ATTTGCATTGGCAA
192 TTTAAATTGAATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACATATCATAATTTGATGTTTTG--TTGGAAA
* * * * * * *
177483 TCATAAAGTGAAAGCCATCCATTGACAAGGAAAGTTCATCTATAGTCACTCATACCTTCG-AAGC
255 ACATGAAGAGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAG-TCATTTATAGTCACTAATGCCTTCGAAAGC
* * ** *
177547 TTAGTAACTTGCTTCAAAT--T
319 CTAGTTACTCACTTTAAATGAT
* * * * ** *
177567 GTTTAT-AGTCTTATAAATGATTTT-TTATCAAAATT-TTTTCATTTTTGGTTAAAATAGAAAAA
1 -TTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAT-TC-AATTTGTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCAT
* * * ** * * * * *
177629 AAATGGACGTTTGCATTGGGAAACATGATACTG-AAACCATCCATTGA-CAAGAAAAGTCTATTT
62 AATTTGATGTTTGCATTAAGAAACATGAAAC-GAAAACCATCCATTGATAAAAAAAATTCAATTT
* * ** *** ** * *
177692 ATAGGCACTTATGTCTTTAAAAATCTTGTTACCCACTTTAAGA-GATTTAATAA-CTTTATAAAT
126 ATAGTCACCTATAACTTCGGAAGCCTTGTTACTCACTTTAA-ATGATTTTATAATC-TTATAAAT
* * * * * * * *
177755 GATTTTAAATT-TATTTTTTTT-ATTTTTGGTTCAAACAGATGATTAGTTGACG-TTTGCATT-G
189 GATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACATATCATAATTTGATGTTTTG--TTGG
** * * * * * * *
177816 AGAAACATGAAGCA-AAAGTGATCCATTGATAAGAAAAGTCCGTTCATAGTAACTCATGTCTTCA
252 A-AAACATGAAG-AGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGT-CATTTATAGTCACTAATGCCTTCG
**
177880 AAAGCCTAGTTACTCACTTTAAAATGGC
314 AAAGCCTAGTTACTCACTTT-AAATGAT
* * * * **
177908 TTTATGA-TCTTATAAATGATTTTAAAATTGAATTT-TTCTCATTTTTGATTAAAACAGATTGTA
1 TTTATAACT-TTATAAATGATTTT--AATTCAATTTGTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATA
* * * * *
177971 ATTTGATGTTTGTATCTAA-AAACAAG-AA-GTAAAAGCCATCCATTGA-CAAGAAAA-TCTATT
63 ATTTGATGTTTGCAT-TAAGAAACATGAAACG-AAAA-CCATCCATTGATAAAAAAAATTCAATT
** * * * * *
178031 TATAGTCA-CTCATGTCTTCGAAAGCCTTATTATTCACTTCAAGTGATTTTATAA-CTTTATAAA
125 TATAGTCACCT-ATAACTTCGGAAGCCTTGTTACTCACTTTAAATGATTTTATAATC-TTATAAA
* * * * *
178094 TGATTTTAAATTGAA-TTTTTTTCATTTCTTA-TTAAAATAGATAATAACTTAATG-TTTGCATT
188 TGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATTT-TTAGTTAAAACATATCATAATTTGATGTTTTG--TT
** * * * *
178156 AAAAAACATGAAGTA-AAAGCGATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATTGTTACTAATACCTTC
250 GGAAAACATGAAG-AGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTC-ATTTATAGTCACTAATGCCTTC
* * * * *
178220 GAAAACTTAATTATTCATTTTAAAT-AGT
313 GAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGA-T
** * *
178248 TTTATAA-TCTTAT-AATGATTTTTAAATGGAATTT-TTCTCATTTTTGGTTAAAATAGATCATA
1 TTTATAACT-TTATAAATGA-TTTT-AATTCAATTTGTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATA
** * * ** ** * *
178310 ATTTGATGTTCACATCATGAAACATGAAGTGAAAATTATCCATTAATAAGAAAAA-TCAATTTAT
63 ATTTGATGTTTGCATTAAGAAACATGAAACGAAAACCATCCATTGATAAAAAAAATTCAATTTAT
* * * *** ** * * * * *
178374 AGTTACTTAT-GCATTAAAAAGCCTTACTACCCGCTCTAAGT-AGTTTTATAA-CATTATAAATT
128 AGTCACCTATAAC-TTCGGAAGCCTTGTTACTCACTTTAAATGA-TTTTATAATC-TTATAAATG
* * * * *
178436 ATTTTAAATTGAATTTTTTTTTCATTTTTGGTTAGAACAAATCGTAATTTGATG-TCTGTATCAG
190 ATTTTAAATTGAA-TTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACATATCATAATTTGATGTTTTGT-T--G
* * * * * *
178500 G-AAATATGAAGTA-AAAACCATCC-GTGAACAAGAAAAGTTCATTTATAAT-ATCTCATACCTT
251 GAAAACATGAAG-AGAAAGCCATCCATTG-ACAAGAAAAG-TCATTTATAGTCA-CTAATGCCTT
* *** *
178561 CGAAAGCCGAGTTACTTGGTTTAAATGTT
312 CGAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGAT
* * * * * * **
178590 TTTATAA-TCCTATAAATTATTTTAAAT-AATTTTTTTTAATTTTTTGTTAAAACAGATCATGGT
1 TTTATAACT-TTATAAATGATTTTAATTCAATTTGTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAAT
* * * * * * * *
178653 TT-ATTATTTGCATTAGGAAACATGAAAC-AAAAGCCATCTATCGAT-AAGAAAAGTCCATCT-T
65 TTGA-TGTTTGCATTAAGAAACATGAAACGAAAA-CCATCCATTGATAAAAAAAATTCAATTTAT
* ** * ** * *
178714 AGTCA-CTCAT-GCTTCCTAAAGCCATGTTACTTGCTTTAAATCATTTTATAATCTAATAAATGA
128 AGTCACCT-ATAACTT-CGGAAGCCTTGTTACTCACTTTAAATGATTTTATAATCTTATAAATGA
* * * * * * * *
178777 TTTTGAATTAAATTATTTTTTTATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTTGATTTTTTTAATTGAA
191 TTTTAAATTGAATT-TTTTTTCATTTTTAGTTAAAACATATCATAATTTGA-TGTTTT-GTTGGA
* * **
178842 AAACATGAAGCA-AAAGCCATCCATTAACAAGAAAACTCCATTTATAGTCACTTTTGCCTTCGAA
253 AAACATGAAG-AGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGT-CATTTATAGTCACTAATGCCTTCGAA
*
178906 AACCTAGTTACTCACTTTAAAT-AGT
316 AGCCTAGTTACTCACTTTAAATGA-T
*** **
178931 TTTATAATCTTT-TAAATGATTTTTAAAAGAA-TTGATTTT-ATTTTTCATTAAAACAGATCATA
1 TTTATAA-CTTTATAAATGA-TTTTAATTCAATTTG-TTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATA
* * * ** * * *** **
178993 ATTTGATTTTTTTCA-T-CGAAA-ATTGTAAA-GCAAAAGCCATTGATGGTTTCGAAAGCTT--A
63 ATTTGA-TGTTTGCATTAAGAAACA-TG-AAACG-AAAA-CCATCCATTGATAAAAAAAATTCAA
* * ** * * ** * **
179052 CTTAT-GTGA-CTCATGCCTTCGAAAGCCTAGTTACTTTCTTTAAATGGTTTTATAGCCTTATAA
123 TTTATAGTCACCT-ATAACTTCGGAAGCCTTGTTACTCACTTTAAATGATTTTATAATCTTATAA
* ***** * * * * * * **
179115 ATGATTTTAAA-TCAAAAGCCTTTCATTTCTAGTTAAAATAGAACATAATTGGATCTTTACATTA
187 ATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACATATCATAATTTGATGTTT-TGTT-
* * * * * * * *
179179 GG-AAACGTG-AGATGAAAGTCATCCATTCATAAGAAAAGTCCATTTACAGTGACGAATACCTTC
250 GGAAAACATGAAGA-GAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGT-CATTTATAGTCACTAATGCCTTC
* * * **
179242 GAAAGGCTAATTGCTTGCTTTAAAT-AGT
313 GAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGA-T
* * ** * * *
179270 TTTATAA-TCTTATAAACGATTTTAAATT-GATTT-TTTTCGCTTTCGGTTAAAAGAGATTATAA
1 TTTATAACT-TTATAAATGATTTT-AATTCAATTTGTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAA
* ** * ** * * ** ** *
179332 TTTGATGTTTGTATTGGGAAACTTGAAGTGAAAGCCATCCGTTGAT-ATGAAAAGGCTATTTATA
64 TTTGATGTTTGCATTAAGAAACATGAAACGAAAACCATCCATTGATAAAAAAAATTCAATTTATA
* * * * * * * * *
179396 CTCA-CTCATACCTT-TGACAGTCTAGTTGCTTACTTTAAATGGTTTTATAATTTTATAAATGAT
129 GTCACCT-ATAACTTCGGA-AGCCTTGTTACTCACTTTAAATGATTTTATAATCTTATAAATGAT
* * * * * *
179459 TTTAAATTG-A-TTTTTTTCATTTGTCA-TTAAAATAGATCATAATTTGTTG-TTTGCATAGAGA
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* * * * * * *
179520 AACATGAAGCGAAAGCCCTCCATTGACAAGAAAAGTTCATTGATAGTCGCTTATGTCTTCTAAAG
254 AACATGAAGAGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAG-TCATTTATAGTCACTAATGCCTTCGAAAG
* ** *
179585 CCTAGTTGCTTGCTTTAAATGGT
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* * * * * * *
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1 TTTATAACT-TTATAAATGATTTT-AATTCAATTTGTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAA
* * ** * * * *
179671 TTTGTTATTTGCATCGAGAAACGTGAAAC-AAAACCTATCCATTGA-CAAGAAAAGTCAATTTAT
64 TTTGATGTTTGCATTAAGAAACATGAAACGAAAACC-ATCCATTGATAAAAAAAATTCAATTTAT
* ** ** * *
179734 AGTCA-CTCATACCTTCAAAAGTATAGTTACTCACTTTAAAT-AGTTTTATAATCTTATAAATTA
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* * *
179797 TTTTAAA-T-AATTTTTTTTTTCATTTTTGGTTAAATAGATA--ATAATTTGCA----TTG--AG
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* * * *
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* * * ** *
179915 AAGTCAAGTTGCTTGCTTTAAATG-G
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* * * * * * * *
179940 TTTATTA-TCTTATAAATGATTGTAAATCAATTTTTTTTTCATTTCTAGTTAAAATAGACCATAA
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* ** * * * *
180004 -TTGTATGTTTACATT-AGAAAACATGAAGTGAAAGCCATCCATTGCT-AAAAAAAGTCAACTTA
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* ** ** ** * *
180066 TAGTCA-CTCATACCTTCAAAAGCCTAATTGTTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATAA
127 TAGTCACCT-ATAACTTCGGAAGCCTTGTTACTCACTTTAAATGATTTTATAATCTTATAAATGA
* * * * * * * *
180130 TTTGAAGTTGAATTTTATTTTTTATTTTTGGTTACAA-AGATCATAATTTGAT-ATTTGAATT-A
191 TTTTAAATTGAA-TTT-TTTTTCATTTTTAGTTAAAACATATCATAATTTGATGTTTTG--TTGG
* * * *** * * * * *
180192 AGAAATATTAAGTGAAAATAATCTATTGACTAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTTATACATTCGA
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* * *
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* * * * *
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* * * * * * *
180346 TTGGATGTTTGC-GTAGGAAACGTGGAGCGAAAGCCATCCATTGA
64 TTTGATGTTTGCATTAAGAAACATGAAACGAAAACCATCCATTGA
180390 CAAGAAAGGC
Statistics
Matches: 18854, Mismatches: 4825, Indels: 3186
0.70 0.18 0.12
Matches are distributed among these distances:
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* * ** ** * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * * * *
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189 ACTCACTTTAAAT-ATTTTATAATCTTAGAAATGATTTTAAATTGAAATTCTTTTCATTT-CTAG
* * * *
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252 TTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAG
* * * * * * * * **
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317 AAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTACTCATCTTTAAATGGTTTTATA
* * * * * * **
161760 ATTCTTACAAATTATCTT-AAATT--ATTTTTTTTATTTTTTTA-TTAAAACAAATCATAATTGG
382 ACTCTTATAAATAATTTTAAAATTAAATTTTTTTTA--TTTCTAGTTAGAAC-AATCATAATTTA
* * * * * *
161821 ATATTTGCATTGGGAAACATGAAGCAAGAGCCATCCATTGACAAGAAATGTCCATTTATAAT--C
444 ATGTTTGCATTAGGAAACATGAAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCAC
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509 TC
* * * * * *
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1 ATGCCTTTAAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATC-ATATAAATGATTTTAAAT-
* ** * * * * * * * * * *
161950 GATTTTTTTTTCATTTTTGGCTAGAACAGA-TCATAATT-TATTTTTTGAATCATGGAAAACATG
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* * * * * * ** *
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* ** * * * * * *
162078 TACTCATTTTAGGTGGTTTTATAA-CTTTATAAATGATTTTAAATTG-AATTTTTTTTATTTTTT
188 TACTCACTTTAAAT-ATTTTATAATC-TTAGAAATGATTTTAAATTGAAATTCTTTTCATTTCTA
* * ** * * ** * * *
162141 GTTAAAAAACAAATCATGATTTCCTGTTTGCAT-TGGAAAAAGTGGTGGAAAAGCTATCCATTAA
251 GTT--AAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACA-TGAAGCAAAAGCCATCCATTGA
* * ** * *
162205 CAAGAGAAA-TCCATTTATAGTCACTTATGCCTTTGAAAGCCTAGTTACTC-GCTTTAAATGCTT
313 CAAGA-AAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTACTCATCTTTAAATGGTT
* * * * * *
162268 TTATAA-TCTTA-AAAGTGAGTTT-AAATT--GTTTCTTTCTTCATTTAT-GATTAAAATAGATC
377 TTATAACTCTTATAAA-TAATTTTAAAATTAAATTT-TTT-TT-ATTTCTAG-TTAGAACA-ATC
* * * * * * * * *
162327 A-CAGTTAATGCTTGCATAAGGAAACATGAAGTGAAAGCTATCCATTTATAAGAAAAGTTCATTT
436 ATAATTTAATGTTTGCATTAGGAAACATGAAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTT
162391 ATAGTCACTC
501 ATAGTCACTC
** * * * * *
162401 ATGCCTTTGAAAA-CCTAATTACTCGTTTTAAATAGTTTTATAATCTTATAAATAAGTTTAAGGT
1 ATGCCTTT-AAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCATATAAATGATTTTAA-AT
* * * *
162465 AAAATT-TTTGTCATTTTTGGTTAAACCAAATCATAATTGGATGTTTGCACTAAGAAA-TGTGAA
64 AAAATTGTTT-TCATTTATGGTTAAAACAATTCATAATTGGATGTTTGCATTAAGAAACT-T-AA
* * * *
162528 GCAAAAGCCATCCATTGA-AATAAAAAGTTC-ATTTAAAGTCACTCATACCTTCAATAGCCTAGT
126 GCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAA--TCAATTTATAGTCACTCATACCTTCAAAAGCTTA-T
** * * * * * * *
162591 TACTTGCTTTAAATGGTTTTGTAATCATATAAATGAGTTTAAATTTAATATT-TTTTCATTTTTA
188 TACTCACTTTAAAT-ATTTTATAATCTTAGAAATGATTTTAAATTGAA-ATTCTTTTCATTTCTA
* * * * * *
162655 GTTGAAACAGGTCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACTTGAAGTAAAAACCATCCATTGATAA
251 GTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAA
** * * * * * *
162720 GAAAAGTCTATGGACAGTCACTTATGTCTTCAAAAGCCTAGTTAGT-TTCTTTAAATGTTTTTAT
316 GAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTACTCATCTTTAAATGGTTTTAT
* * * * * * * **
162784 -AGTCTTATAAATGATTTTAAAATGAAATTATTTTCATTTCTGGTTAAAGAA-AATCATACTTGG
381 AACTCTTATAAATAATTTTAAAATTAAATTTTTTTTATTTCTAGTT--AGAACAATCATAATTTA
* * * ** * *
162847 A-GATTTGCA-TATGAAAACATGAAGCAAAAGCTATCTGTTGACAAGAAAAGTCCATTCACAGTC
444 ATG-TTTGCATTA-GGAAACATGAAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTC
162910 ACTC
507 ACTC
* * * * * *
162914 ATGCCTTCAAAAACCTTGTTACTCGTTTTAAATAATTTTATAACCTTATAAATGATTTTAAATTA
1 ATGCCTTTAAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCATATAAATGATTTTAAA-TA
* * * * * **
162979 AAATTGTTTTTATTTATGGTGAAAACAATTTATAATTAGATGTTTGCAATAAGAAACAAGAAGCA
65 AAATTGTTTTCATTTATGGTTAAAACAATTCATAATTGGATGTTTGCATTAAGAAAC-TTAAGCA
** * * * * * * * *
163044 AAAGCCATCCATTGTTAAGAAAAATCAATTTATAGTGAGTCGTGCCTTTAAAAACCTTGTTACTT
129 AAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCAATTTATAGTCACTCATACC-TTCAAAAGCTTATTACTC
* * * * *
163109 GCTTTAAATAGTTTTATATTTTTAGAAATTATTTTAAATTAAAATTTCTTTT-ATTTCTAGTTAA
193 ACTTTAAATA-TTTTATAATCTTAGAAATGATTTTAAATTGAAA-TTCTTTTCATTTCTAGTTAA
* * * * * *
163173 AACAAATCATAATTTAATGTTTGCATTAGGAAATATGAAGCAAAAGCCATCCATGGATAAGAAAA
256 AACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAA
* * * * *
163238 GTCTATTTATAGTCACTGATGCCTTCAAAATG-ATAGTTA--AATGCTTTAAGTGATTTTATAAC
321 GTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAA-GCCTAGTTACTCAT-CTTTAAATGGTTTTATAAC
* * * * * *
163300 -GTTATAAATAATTTT-AGATTGAGTTTTTTTTAATTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTTAATA
384 TCTTATAAATAATTTTAAAATTAAATTTTTTTT-ATTTCTAGTTAGAACA-ATCATAATTTAAT-
* * * * *
163363 TTTTGCATTAGGAAACGTGAATGTAAAAGGTC-TCTATTGACAAAAAAAAGTCCATTTATAGTCA
446 GTTTGCATTAGGAAACATGAA-GTAAAA-GCCATCCATTGAC-AAGAAAAGTCCATTTATAGTCA
163427 CTC
508 CTC
* * * * * * * * *
163430 ATGCCTTT-AGAGCCTTGTTACTC-ATGTTAAATGGGTTTATAATTATATAACTGACTTTAAGTT
1 ATGCCTTTAAAAGCCTTGTTACTCGCT-TTAAATAGTTTTATAATCATATAAATGATTTTAAATA
* * * * * *** * *
163493 AAATTGTTTTAATTTTTAGTTAAAACAGA-TCATAATTTGTTGTTTATGTTGAGAAACATGAAGC
65 AAATTGTTTTCATTTATGGTTAAAACA-ATTCATAATTGGATGTTTGCATTAAGAAAC-TTAAGC
* * * * * * **** * * *
163557 GCATA-CCATCCGTTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTAATGTAATCGAAAGCTTGGTTGC
128 -AAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCAATTTATAGTCACTCATACCTTCAAAAGCTT-ATTAC
* * * * *
163621 TCACTTTAAATATTTTGATAATCTTAGAAATGATTTCAAATTGAATTTTTTTTCATTTTTTGGTT
191 TCACTTTAAATATTTT-ATAATCTTAGAAATGATTTTAAATTGAAATTCTTTTCA-TTTCTAGTT
* * * * * *
163686 CAAACAGATCATAATTTGTTGTTTGCATCA-AAAACATAAAGCGAAAGCCATTCATTGACAAGAA
254 AAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAA
* ** ** * * * **
163750 AAGTCGATTTATAGTTGCTCATGCCTTTGAATGCCTTGTTACTCAT-TTTAAATGGATCAATAA-
319 AAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTACTCATCTTTAAATGGTTTTATAAC
163813 TCTTATAAATAATTTTAAAATTAAATTTTTTTTATTTCTAGTTAGAACATATCATAATTTAATGT
384 TCTTATAAATAATTTTAAAATTAAATTTTTTTTATTTCTAGTTAGAACA-ATCATAATTTAATGT
* * * * *
163878 TTTCATTAGGAAACATGAAGTGAAAGCCATCCATTGACAAG-AAAGTTTCATTTATAGTTACTT
448 TTGCATTAGGAAACATGAAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAG-TCCATTTATAGTCACTC
* * * * * *
163941 ATACCTTTAAAAGCTTTGTTACTTGCTTTAAATAGTTTTTTAATGATAAAAATGATTTTAAATCA
1 ATGCCTTTAAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCATATAAATGATTTTAAAT-A
* * * **
164006 AAATAGTTTTCATTTATGGTTAAAATAATTCATAATTGGATGTTTGCATTAGGAAACTTATAGTG
65 AAATTGTTTTCATTTATGGTTAAAACAATTCATAATTGGATGTTTGCATTAAGAAACTTA-AGCA
* * * *
164071 AAAGCCATCTATTTG-CAAGAAAAATTAATTTATAGTCACCCATACCTTCAAAAGCTTCATAACT
129 AAAGCCATCCA-TTGACAAGAAAAATCAATTTATAGTCACTCATACCTTCAAAAGCTT-ATTACT
* ** * * **
164135 CACTTTAAATGATATTATTTTCTTATAAATTATTGAAAATTGAAATTCTTTTCATTTCTAGTTAA
192 CACTTTAAAT-ATTTTATAATCTTAGAAATGATTTTAAATTGAAATTCTTTTCATTTCTAGTTAA
* * * *
164200 AACATATCACAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACATGAAGCGATAGCCATCCATTGACAAGAAAA
256 AACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAA
* * *
164265 GTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGTCTTGTTACTCAT-TTTAAGTGGTTTTATAACT-
321 GTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTACTCATCTTTAAATGGTTTTATAACTC
* * * * * * * * * * *
164328 TTATAAATGA-TTTCAAGTTGAATTTTTCTCACTT-TAGTTAAAACAAGTCATGATTTATTATTT
386 TTATAAATAATTTTAAAATTAAATTTTTTTTATTTCTAGTTAGAACAA-TCATAATTTAATGTTT
* * * * * ** * * *
164391 GCATCACGAAA-AGTGATGCAAAAGTCATCCATTGGTAAGAAAAATCTATTTATAGTCACTT
450 GCATTAGGAAACA-TGAAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTC
* * * * * * ** * * **
164452 ATACCTTCGAAAATCCTTGAAAATTTCAC-CATTT--ATAGTGATT-T-GGCTTGAAAAATCTTT
1 ATGCCTT-TAAAAGCCTTG----TTACTCGC-TTTAAATAGT-TTTATAATCAT-ATAAATGATT
* * ** * * ** * ** * * *
164512 GGTTGAACAATCAAGGCAGTGGATGCAGGTCCTTGACAGAACCACT-ATAAATTTGTG-TGTATT
58 --TT--A-AAT-AA--AATTGTTTTCA-TTTATGGTTAAAACAATTCAT-AA-TTG-GATGT-TT
*** **** * ******* * * * *
164575 GTCTATCCTG---CTT---C-ATTTTCATTTCATT-TTTTCTTAAATCATTTCTTTA-TC-TTGT
110 G-C-ATTAAGAAACTTAAGCAAAAGCCA-TCCATTGACAAGAAAAATCAATT-TATAGTCACT-C
** * * * * * * *
164630 ATTTAAGTTTTCATCATTGATCTTTAATTTGC-CCCTAATTAGAAGTCAATCTAAGTGAGAGC-T
170 A--T-A-CCTTCA--A--AAGC-TT-A-TTACTCACT--TTA-AA-T--ATTTTA-T-A-ATCTT
* * * ** *** * * ** * * * **
164693 A-AAAAG-TGTT--ATTCACCCCTTCTAGCACATTTATTTGGGACCAACAAAGT-TTAAATTAAA
215 AGAAATGATTTTAAATTGA--AATTCT-TTTCATTT-CTAGTTA-AAACAGA-TCAT-AATT-TG
* ** * * * *** *
164753 ATTTTTTTATTATTGGTTAAAACA--AATCATAATTTGATGTTGCATTGGAAAACATAAAGTGAA
272 ATGTTTGCATCA--GG---AAACATGAAGCA-AA--AG-CCATCCATT-G---AC---AA--GAA
* *
164816 AAGCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTTATGCCTTCAAAAACCTAGTTACTCA-
319 AAG--T-C--------------T--ATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTACTCAT
* * * * *
164880 CTTGAAATGGTTTTATAA-TCTTATAAATGATTTT-AAATCAAAATTATTTTTATTT-TAGTTAA
365 CTTTAAATGGTTTTATAACTCTTATAAATAATTTTAAAAT-TAAATTTTTTTTATTTCTAGTTAG
* * * * * * * ** *
164942 AATATATTATAA-TTAGATGTTTGTATAAGAAAACGTGAAGCAAAAGCCATTTA-CGACAAGAAA
429 AACA-ATCATAATTTA-ATGTTTGCATTAGGAAACATGAAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAA
***
165005 AGTCCATTTATAGTTGTTC
492 AGTCCATTTATAGTCACTC
* * * * * * * * *
165024 ATGCCTTTGAAAGTCTTGTTACTCACTTTAAGTGGTTTTGTAA-CTTTATAAATGATTTAAAATT
1 ATGCCTTTAAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATC-ATATAAATGATTTTAAATA
* * * * * * ** * *
165088 GATTTTTTTTTATTTTTGGTTAAAACAAATCATAATTTCATGGTTGCATTAAG-AAGTGTGAAGC
65 AAATTGTTTTCATTTATGGTTAAAACAATTCATAATTGGATGTTTGCATTAAGAAACT-T-AAGC
* * ** * * * * * *
165152 GAAAGCAATTTATTGATAAAAAAAATCCATTTATAGTCACTCATCCCTTTAGAAGCCTTATTACT
128 AAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCAATTTATAGTCACTCATACCTTCAAAAG-CTTATTACT
* * * * ** * * *
165217 CGCTTCAAATGGTTTTATAATCATT-TAAATGATTTTAAATCAAAATTGTTTTCATTTCTGGTTC
192 CACTTTAAAT-ATTTTATAATC-TTAGAAATGATTTTAAATTGAAATTCTTTTCATTTCTAGTTA
* * * *
165281 AAACATATCATAATTTGATGTTTACATTAGGAAATAT-AAGGCAAAAGCCATCCATTGAGACAA-
255 AAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACATGAA-GCAAAAGCCATCCATT--GACAAG
* * * * * * *
165344 AAAA-TCTATTTGTAGCCACTCATACCTTCGAAAGCCTTA-TTACT-AGCTTTAAGTGATTTTAT
317 AAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCC-TAGTTACTCATCTTTAAATGGTTTTAT
* * * * * * * * *
165406 AACT-TTATAAATGACTTT-AAATTGAATTTTTTTTTATTTTTGGTTAAAAAAAATTATAATTTG
381 AACTCTTATAAATAATTTTAAAATT-AAATTTTTTTTATTTCTAGTT-AGAACAATCATAATTTA
** * * * * * *
165469 ATGTTTGCATCTA-GAAATGTGTAGTGAAAGCCTTCCATTGATACGAAAAGTCTATTTATAGTCA
444 ATGTTTGCAT-TAGGAAACATGAAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCA
*
165533 CTT
508 CTC
* * * * * ** * **
165536 ATGCCTTT-AAACCCTTGTTACTTGCTTTAAGTGGTTTTATAATCTTATAAATGAGCTTGAATTG
1 ATGCCTTTAAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCATATAAATGATTTTAAATAA
* * ** * *
165600 AA---TTTT--TTTA---TTAAAACAAATCATAATTTGATGTTTGCATCGACAAA-TATAAAGCG
66 AATTGTTTTCATTTATGGTTAAAACAATTCATAATTGGATGTTTGCATTAAGAAACT-T-AAGCA
* * * * * * *
165656 AAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTGC-ATTTATAGTCACTTATGCGTTCGAAAGCCTTTTTACT
129 AAAGCCATCCATTGACAAGAAAAAT-CAATTTATAGTCACTCATACCTTCAAAAG-CTTATTACT
* * * * *
165720 CGCTTTAAGTGGTTTTATAA-CTTTCAG-AATGATTTTAAATT--AATTCTTTTTTAATTTTTAG
192 CACTTTAAAT-ATTTTATAATC-TT-AGAAATGATTTTAAATTGAAATTC--TTTTCATTTCTAG
* * * * * *
165781 CTAAAACAGATCATAACTTGTTATTTGCATCAAGAAACATGAAGCAAAAGCCATTCATTGACAAG
252 TTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAG
* * * * * * * *
165846 AAAAGT-TCATGTATAGTAACTCATGCCTTTAGACGCGTTGTTACTC-GCTTTAAATGGTTTTAT
317 AAAAGTCT-ATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTACTCATCTTTAAATGGTTTTAT
* * * * *
165909 AA-TCTCATAAATAATTTT-AAATTGAATTCTTTTTCATTT-TAGGTT-CAACAGATCATTATTT
381 AACTCTTATAAATAATTTTAAAATTAAATT-TTTTTTATTTCTA-GTTAGAACA-ATCATAATTT
* * ** * * * * * *
165970 ATTGTTGGCATT-GAGAAATGTGAAGTGATAGCTAACCATTGATAAGAAAAGTCCATTTACAGTC
443 AATGTTTGCATTAG-GAAACATGAAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTC
*
166034 ATTC
507 ACTC
** * * * * * * * * * *
166038 ATGCCTTCGACAGGCTTGTTACTTGTTTTAAGTGGTTTTATAGTTC-TATAAGTTATTTTAAATT
1 ATGCCTTTAAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAATAGTTTTATA-ATCATATAAATGATTTTAAATA
* * * * * *
166102 GAA-T-TTTT--TTTA--GTTAAAATAGA-TCATAATTTGATGTTTACATCAAGAAACATAAAGC
65 AAATTGTTTTCATTTATGGTTAAAACA-ATTCATAATTGGATGTTTGCATTAAGAAAC-TTAAGC
*** * * * * * *
166160 AAAAATTATCCATTGATAA-AAAAGTTC-ATTTGTAGTCACTCGTACCTT-AGTAAGCATATTTA
128 AAAAGCCATCCATTGACAAGAAAA-ATCAATTTATAGTCACTCATACCTTCA-AAAGCTTA-TTA
** * * * * * *
166222 CT-TGTAGTAAATAGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAGTT-TAATTTTTTTCATTTTTAGT
190 CTCACT-TTAAATA-TTTTATAATCTTAGAAATGATTTTAAATTGAAATTCTTTTCATTTCTAGT
* * * * * * * * * * * *
166285 TGAAACGGATCAGATTTTGTTGTTTGCATTAAGAAACATGAAACACAAGCCATCCATTAACATGT
253 TAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGA
* * * ** * ** * * * **
166350 AAAGTCCATCTATAGTCACTAATGTTTTCGAAAGAATTGTTACTC-GCTTTAAGTCATTTTATAA
318 AAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTACTCATCTTTAAATGGTTTTATAA
* * * * * * * * **
166414 CT-TTGTAAGTGATTTT-AAATT-GATTTTTTTAAATTTTTGGTTAAAACCAATCATAATTTGTT
383 CTCTTATAAATAATTTTAAAATTAAATTTTTTT-TATTTCTAGTTAGAA-CAATCATAATTTAAT
* * * * * *
166476 GTTTG-AATAGGAAAACGA-GAAGCAAAAGCCATCTATTGACAAAAAAAGTCCATTTGTAGTGAC
446 GTTTGCATTAGG-AAAC-ATGAAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCAC
*
166539 TT
509 TC
* * * * * * * * * *
166541 ATACATTCAAAAGACTAGTTGCTC-CTTTTAAAT-GATTTTTTAATCTTATAAATGAGTTGAAAT
1 ATGCCTTTAAAAGCCTTGTTACTCGC-TTTAAATAG-TTTTATAATCATATAAATGATTTTAAA-
** * * * * * * *
166604 TGAATTTTTTTCTTCATTTTTAGTTAAAACAGA-TCCTAATTAGATGTTGGCATCAAGAAA-TGT
63 T-AAAATTGTT-TTCATTTATGGTTAAAACA-ATTCATAATTGGATGTTTGCATTAAGAAACT-T
* * * * * * *
166667 AAAGCAAAAGCCATCCATTAACAAGGAAAGT-ATATTTATAGTCAATCATGCCATCAAAAGCCTA
124 -AAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCA-ATTTATAGTCACTCATACCTTCAAAAGCTTA
* * ** * * **
166731 GTTACTCACTTTAAATAGTTTTATAATCTAATAAATGATTTTAAATCAAAACTATTTTCATACCT
187 -TTACTCACTTTAAATA-TTTTATAATCTTAGAAATGATTTTAAATTGAAATTCTTTTCATTTCT
* * * *
166796 GGTTAGAACAGATCATAA-TTGAAGGTTTGCAGT-AAGAAACATGAAGCGAAAA-CCATCCATTG
250 AGTTAAAACAGATCATAATTTG-ATGTTTGCA-TCAGGAAACATGAAGC-AAAAGCCATCCATTG
* * ** * * * * * * * * **
166858 ATAAGAAAAGTCAATTTATTTTCACCCATACCTTTAAAAACTTAATTGCTC-GCTTTAAATTATT
312 ACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTACTCATCTTTAAATGGTT
* * * * * * * **
166922 TTATAA-TCTTATAAATGAGTTT-AAATTGAA-TTTTTTCATTTTTAGTTAAAATATATTGTAAT
377 TTATAACTCTTATAAATAATTTTAAAATTAAATTTTTTTTATTTCTAGTTAGAACA-ATCATAAT
* * * * * * *
166984 TTGATATTTGCGTT-GGAAAACATGAAGCGACAA-CTATCAATTGACAAG-AAAGTCCATTTATA
441 TTAATGTTTGCATTAGG-AAACATGAAG-TAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATA
*
167046 GTCACTT
504 GTCACTC
* * * * * * * *
167053 TTG-CTATCAAAAGCCTAGTTA-TTGCTTTAAATTGTTTTATAATCTTATAAATTAATTTTGAAT
1 ATGCCT-TTAAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCATATAAA-TGATTTT-AAA
* * * *
167116 TAAAATTGTTTTTATTTATGGTTAAAACAAATT-ATAATTGGATGTTTTCATTAGGAAACATGAA
63 TAAAATTGTTTTCATTTATGGTTAAAAC-AATTCATAATTGGATGTTTGCATTAAGAAAC-TTAA
* * * * * * * ** **
167180 GCAAAAGACATCTATTGAGAAGAAAAGTCCATTTACAGTCACTCTTACCTTTGAAAGTCTTGCTA
126 GCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCAATTTATAGTCACTCATACCTTCAAAAG-CTTATTA
* * * * * * * *
167245 CTCGCTTTAAGTGGTTTTATGAGT-TTATAAATGATTTTAGATTG--ATT-TTTTAAATTT-TGG
190 CTCACTTTAAAT-ATTTTAT-AATCTTAGAAATGATTTTAAATTGAAATTCTTTT-CATTTCT-A
* * * ** ** ** * * *
167305 GTTAAAACAGATCATAAATTGATGTTGGTATGGGGAAATGTGAAGTGAAAGCTATTCATAT-ATA
251 GTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCAT-TGACA
* * * * *
167369 AGAAAAATCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTAGTAACT-AGCTTCAAATGGTTTTA
315 AGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTACTCATCTTTAAATGGTTTTA
* * * *** * * *
167433 T-AGTCTTATAAATGATTTT-CAATTGAAAACCTTTTCATTTAT-GATTAAAACAGATCATAATT
380 TAACTCTTATAAATAATTTTAAAATT-AAATTTTTTTTATTTCTAG-TTAGAACA-ATCATAATT
** * * * * *
167495 GGATGTTTGCA-T--------T---G----A--CATCCATTAACAAGAAAAGGCCATATGTAATC
442 TAATGTTTGCATTAGGAAACATGAAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTC
167542 ACTC
507 ACTC
** * * * * ** * *
167546 ATATCTTCAAAAGCTTTGCTACAT-GTTTTATGT-GCTTTTGTAA-CTTTATAAATGATTTTAAA
1 ATGCCTTTAAAAGCCTTGTTAC-TCGCTTTAAATAG-TTTTATAATC-ATATAAATGATTTTAAA
** * * * ** *
167608 TTGAGTT-TTTTTATTTTTGGTTAAAAC-ATATCATAATTTAATATTTGCATCT-AGAAA-TATG
63 TAAAATTGTTTTCATTTATGGTTAAAACAAT-TCATAATTGGATGTTTGCAT-TAAGAAACT-T-
* * * * * * *** * *
167669 AAGCAAAAACCATTCATTGATAGGAAAAATCTATTTATAATCACTCATACCTTTGGAAGATCAGT
124 AAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCAATTTATAGTCACTCATACCTTCAAAAGCTTA-T
* ** * * * * *
167734 AACTTTCTTCAAATGGTTTTATAGT-TCTATAACTGATTTTAAATTGAAATGT-TTTTCATTTCT
188 TACTCACTTTAAAT-ATTTTATAATCT-TAGAAATGATTTTAAATTGAAAT-TCTTTTCATTTCT
* * * * * * * *
167797 AGTTAAAAAAGATTATAATTAGATGTTTGCATCAAGAAACATGAAACAAAAACCAAACC-TTCAC
250 AGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACATGAAGCAAAAGCC-ATCCATTGAC
* * * * * * * * * *
167861 AA-TAAAGTTTATTTATACTCACTTAT-ACTCTCGAAAGCTTTGTTACT--TGCTTTAAGT-TTA
314 AAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCT-TCAAAAGCCTAGTTACTCAT-CTTTAAATGGT-
* * * *
167921 TTTATAACT-TTATAAAGAATTTT-AAATTTAA-TTTTTTTATTTTTAATTA-AACAAGATCATA
376 TTTATAACTCTTATAAATAATTTTAAAATTAAATTTTTTTTATTTCTAGTTAGAAC-A-ATCATA
** * * * * * *
167982 ATTTGTTGTTTGCATCAGGAAATGA-GAAGCAAAAGCCATCCATGGAGAAGAAAAGTCCATATAT
439 ATTTAATGTTTGCATTAGGAAA-CATGAAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTAT
* *
168046 AGTTACTT
503 AGTCACTC
** * * * * ** * *
168054 ATTTCTCTAATAGCATTATTACTCGCTTTAAAGGGTTTTAAAATC-TCATAAATGATTTTGAATT
1 ATGCCTTTAAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCAT-ATAAATGATTTT-AAAT
* * ** * ** * *
168118 AAATTTTTTTTCATTT-TAGGTTCCAACAGA-TCATAATT-TATTGTTTGCATTGGGAAGAATGA
64 AAAATTGTTTTCATTTAT-GGTTAAAACA-ATTCATAATTGGA-TGTTTGCATTAAGAA-ACTTA
**** * * * * * *
168180 AATGTAAGTCATGCATTAACAAGAAAAAT-ACATTTATAGTCAATCATGCCTTTAAAAG-TGTAG
125 AGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCA-ATTTATAGTCACTCATACCTTCAAAAGCT-TA-
* * * * * *
168243 TTATTCACTTTAAATAGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTGAATTGAATTTTTTTTTAATTT-T
187 TTACTCACTTTAAATA-TTTTATAATCTTAGAAATGATTTTAAATTGAA-ATTCTTTTCATTTCT
* * ** * * * ** * * * ** *
168307 GGTTCAAATTGATCATAGTTTGTTGCTTAAAT-AAGAAACGTAAAGTGAAAGCCATCCATTGATA
250 AGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACA
* * * * * * * * * *
168371 AGAAAAATCAACTTATAGTTACTTATGCTTTCGAATGCCTTGTTACTC-TCTTTAAGTGGTTTTA
315 AGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTACTCATCTTTAAATGGTTTTA
* * * * * * * *
168435 TAACT-TTGTAATTGATTTT-AAATTGAATTTTTTTCATTTTTTGTTAAAAACATATCATAA-TT
380 TAACTCTTATAAATAATTTTAAAATTAAATTTTTTTTATTTCTAGTT-AGAACA-ATCATAATTT
* * * * * * * * * * *
168497 GATATTTGCATCAAGAAACGTGAAGTGACAGCTATCAATTAACAAG-AAAGTCTATTTATAGTCA
443 AATGTTTGCATTAGGAAACATGAAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCA
168561 CTC
508 CTC
*** ** * ** ** ** *
168564 ATGCCTTTAAAATAATAATTATTCTTTTTAAATAGCTTTTATAATTTTATAAATGATTTTAGGTT
1 ATGCCTTTAAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAATAG-TTTTATAATCATATAAATGATTTTAAATA
* * * * * * * ** * *
168629 GAATTATTTTTCATATT-TGGTTAAAAC-ATATAAGAATTTGCTATTTGCATTGTGAAGCGTGAA
65 AAATT-GTTTTCAT-TTATGGTTAAAACAAT-TCATAATTGGATGTTTGCATTAAGAAAC-TTAA
** * * * * * * * * * * * *
168692 GCGCAAGTCATCCATTAATATGAAAAGTCCATTTATAGTTACTAATGCCTTCGAAAGTGTTGTTA
126 GCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCAATTTATAGTCACTCATACCTTCAAAAG-CTTATTA
* * * * * ** * * * * *
168757 CTC-GTTTCAATTGGTTTTATAACCGTATCAATGACTTT-AATCGAATTTGTTTTCATTTTTAGT
190 CTCACTTT-AAAT-ATTTTATAATCTTAGAAATGATTTTAAATTGAAATTCTTTTCATTTCTAGT
* ** * * * *
168820 TAAAATAGATCATAATTTCTTGTTTGCATCAAGAAACATGAAACGAAAGCCATCAATTGACAA-A
253 TAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGA
** * ** * ** * *
168884 AAAGGT-TCAAGTATAGTCACTTATGCCTTTGAAATCCTAGTTACTTGT-TTTAAGTGGTTTTGT
318 AAA-GTCT-ATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTACTCATCTTTAAATGGTTTTAT
* * * * *
168947 AACT-TTATAAATGATTTT-AAATT-GATTTTTTTTATTT-TTGATTAAAACATATCATAATTTG
381 AACTCTTATAAATAATTTTAAAATTAAATTTTTTTTATTTCTAG-TTAGAACA-ATCATAATTTA
* * * * * * * * * * * * *
169008 ATGTTTACATCAAGAAACGTGAA-AAAAAACTATTCATTGATAAAAAAAATCTATTTATAGTTAC
444 ATGTTTGCATTAGGAAACATGAAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCAC
169072 TC
509 TC
* * * * ** * * *
169074 ATGCCTTCAAAAG-CTAAGTAACTC-ATGACAAATGGTTTTATAATCCTGTAAATGATTTTAAAT
1 ATGCCTTTAAAAGCCT-TGTTACTCGCT-TTAAATAGTTTTATAATCATATAAATGATTTTAAAT
* * * * * * * *
169137 CAAAACAT-TTTTCATTTTTTGTTAAAACAGA-TCGTAATTAGTTGTTTGCATT-GGAAAATATG
64 -AAAA-TTGTTTTCATTTATGGTTAAAACA-ATTCATAATTGGATGTTTGCATTAAGAAACT-T-
* * * * * * * * * *
169199 AAGCGAAAA-CTAACAATTGATAA-AAAAAGTCTATATATAATCACTCATGCCTTTGAAAACCTT
124 AAGC-AAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAA-TCAATTTATAGTCACTCATACC-TTCAAAAGCTT
*** * * * * *
169262 GCCACTCACTTTAAGTGATTTTGTAA-CTTTATAAATGATTTTAAATT--AATTTTTTTTATTT-
186 ATTACTCACTTTAAAT-ATTTTATAATC-TTAGAAATGATTTTAAATTGAAATTCTTTTCATTTC
* * * ** * * *
169323 TTGATTAAAACAGATCATAATATGATGTTTACATCAAAAAACATGAAGCAAAAACCATTCATTGG
249 TAG-TTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGA
* * ** * * **
169388 CAAGAAAAAG-CTATTTATACTTACTCATGCCTTCAAAAGATTTA-TAACTCA-CTTCAAATCAT
313 CAAG-AAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAG-CCTAGTTACTCATCTTTAAATGGT
* * ** * * * * *
169450 TGTAT-AGTCTTCCAAATGATTCT-CAATCAAATATTTTTTTATTTCTAGTTAAAACAGATCATA
376 TTTATAACTCTTATAAATAATTTTAAAATTAAAT-TTTTTTTATTTCTAGTTAGAACA-ATCATA
* * * ** * ** **
169513 A-TTAGATATTTACATCAAAAAACATTAAGCGAAAGCCATCCATTGACACA-AAAAACCCATTTA
439 ATTTA-ATGTTTGCATTAGGAAACATGAAGTAAAAGCCATCCATTGACA-AGAAAAGTCCATTTA
*
169576 TAATCACTC
502 TAGTCACTC
* * * * *
169585 ATGCCTTCAAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTTGTTTTATAA-CTTTATAAATGATCTTAAATT
1 ATGCCTTTAAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATC-ATATAAATGATTTTAAA-T
* * * * ** * * * * * *
169649 GAATTTTTTTTCATTTTTAATTAATA-TATATCATAATTTGTTGTTTGCATCAAGAAACGTGAAG
64 AAAATTGTTTTCATTTATGGTTAAAACAAT-TCATAATTGGATGTTTGCATTAAGAAAC-TTAAG
** * * * * * ** *
169713 TGAAAGTCATCCATTGAGAAGAAAAGTTC-ATCTATAGTCACTCATGCCACCGAAAGCATTATTA
127 CAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAA-ATCAATTTATAGTCACTCATACCTTCAAAAGC-TTATTA
* * * * *
169777 CACACTTTAAAT-TGGTTTAAAACCTGATAAATGATTTTAAATTG-AATT-TTTTCCATTT-TAG
190 CTCACTTTAAATAT--TTTATAATCTTAGAAATGATTTTAAATTGAAATTCTTTT-CATTTCTA-
* * * * * * * *
169838 GTTCAAGCTGATCATAACTTT-TTGTTTGCATCGGGAAATATGAAGCAAAAGCCTTCCATTGATA
251 GTTAAAACAGATCATAA-TTTGATGTTTGCATCAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACA
* * * * * * * *
169902 AAAAAAGT-TCATTTATAGTCATTCGTGCCTTTAAAAGGCTTGTTAAT--TGCTTT-AAGGGTTT
315 AGAAAAGTCT-ATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTACTCAT-CTTTAAATGGTTT
* * * * * *
169963 TATAACT-TTATAAATGATTTT-AAATTAAATTTTTCTTTATTTTTAATTAAAATAGATCATTAT
378 TATAACTCTTATAAATAATTTTAAAATTAAATTTTT-TTTATTTCTAGTTAGAACA-ATCATAAT
** ** * * * *
170026 TTGTTGTTTGCATTAGGAAACATGATCTAAAA-CTGATCCACTGACAAG-AAAGTCTAGTTATAG
441 TTAATGTTTGCATTAGGAAACATGAAGTAAAAGC-CATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAG
*
170089 TCACTT
505 TCACTC
* * * * * * * * * * * *
170095 TTGCTTTTGAAAGCGTAGTTACTCGCTTTAAATGGCTTTACAATCTTATAAATGATTTGAAGTTG
1 ATGCCTTTAAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCATATAAATGATTTTAA-ATA
* * * * * * * * * * * *
170160 AATTTCTTTTTATATT-TTGTTAAAATAGA-TAAAAATTTGTTATTTGCCTTGAGAAA-TGCTAA
65 AAATTGTTTTCAT-TTATGGTTAAAACA-ATTCATAATTGGATGTTTGCATTAAGAAACT--TAA
*** * * * * * * * * * * * *
170222 GTGCAAGCCATTCAATGATAAGAAAAGTCCATTTGTGGTCACTAATGCCTTCGAAAGCGATCTTA
126 GCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCAATTTATAGTCACTCATACCTTCAAAAGC-TTATTA
* * * * * * * *
170287 CTCGCTTTAACTGGTTTTATAA-CATTATAAATGATTTTAAATTG-AATTTTTTTTATTTTTTGT
190 CTCACTTTAAAT-ATTTTATAATC-TTAGAAATGATTTTAAATTGAAATTCTTTTCATTTCTAGT
* * * * * *
170350 TAAAACAAATCATAATTTGTTCTTTGCATTAGGAAACATGAAGCAAAAGTCATCCATTGACAAAA
253 TAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGA
* * * * * * * * *
170415 AAAGTCCATTTATATTGATTGATGTC-TCGGAAAGCCTAGTTGCT--TGCTTTAAATAGTTTTAT
318 AAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTC-AAAAGCCTAGTTACTCAT-CTTTAAATGGTTTTAT
* * * * * *
170477 AA-TCTTATAAATGATTTT-AAATTAATTTTTTTTTGTGATTT-TGGGTTAAAATAAATCCTAAT
381 AACTCTTATAAATAATTTTAAAATTAA-ATTTTTTT-T-ATTTCT-AGTTAGAA-CAATCATAAT
* ** * ** * *
170539 TTGATGTTTGCATCGGGAAATATGAAGCGAAAGCCATTCATTGATAAGAAAAGTTCC-TTTATTA
441 TTAATGTTTGCATTAGGAAACATGAAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAG-TCCATTTA-TA
170603 -TCACTC
504 GTCACTC
* * * * * * * * *
170609 ATACCTTCAAAAGCCTTTTTTCTCACTTTGAATGGTTTTATAATCAGATAAATGATTTTAGATCA
1 ATGCCTTTAAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCATATAAATGATTTTAAAT-A
** * * * ** * * * *
170674 GAGTTTTTCTTTTCATTTCTAGTTTGAACAAATCATAATTGAATGTTTGTATT-AGAAAATGTGA
65 -A--AATTGTTTTCATTTATGGTTAAAACAATTCATAATTGGATGTTTGCATTAAGAAACT-T-A
* ** * * **
170738 AGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAATGTTC-ATTTATAGCCGCTCATATATTCAAAAGCCTTAT
125 AGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAA-AATCAATTTATAGTCACTCATACCTTCAAAAG-CTTAT
* * * * * * * * * *
170802 TACTTACTTCAAGTGGTTCTATAA-CTATATAAATGAATTT-AATT-CAATTTTTTTCATTTTTA
188 TACTCACTTTAAAT-ATTTTATAATCT-TAGAAATGATTTTAAATTGAAATTCTTTTCATTTCTA
* * * * * ** *
170864 GTTAAAATAGATCAAAATTT-ATTGTTTGCATTAGAAAACATGAAGTAAAAGTTATCCATTGATA
251 GTTAAAACAGATCATAATTTGA-TGTTTGCATCAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACA
* * * * * * * *
170928 AGAAAAGTCCATCTATAGTCACTCATTCCTCCATAGGCATCA-TTACTCA-CTTTCAATGGTTTT
315 AGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCT-AGTTACTCATCTTTAAATGGTTTT
* * * * * *
170991 A-AAATCTCAT--A-AA---T-AAATTGAATTTCTTTTCATTT-TAGGTGT-GTACAGATCAAAA
379 ATAACTCTTATAAATAATTTTAAAATTAAATTT-TTTTTATTTCTA-GT-TAGAACA-ATCATAA
** * ** * ** **
171046 TTTGTTGTTTGCATT-GACAAATGTGAAGCAAAAATCATCTTTTGACAAGAAAAGTCCATTTATA
440 TTTAATGTTTGCATTAG-GAAACATGAAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATA
* *
171110 GCCATTC
504 GTCACTC
* * * * * * *
171117 ATGTCTTCAACTAA--CTTTTTTCTTGCTTTAAAT-GATTTTATAACCTTATAAATGATTTTAAA
1 ATGCCTTTAA--AAGCCTTGTTACTCGCTTTAAATAG-TTTTATAATCATATAAATGATTTTAAA
** * * * * * * * ** *
171179 TTGAATTCTTGTTCATTTTTAGTTGAAATAGA-TCATAATTTGATGTTTGCCTTGTG-AACATGA
63 TAAAATTGTT-TTCATTTATGGTTAAAACA-ATTCATAATTGGATGTTTGCATTAAGAAAC-TTA
* * * ** * * *** * * *
171242 AGCGAAAGCTATGCATCAACAA-TAAAGTTTGTTTATAGTCACTCATGCCTTTAAAAGCATATTT
125 AGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCAATTTATAGTCACTCATACCTTCAAAAGCTTA-TT
* * * * * * *
171306 ACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTTAAAAATGATTTTAAGTTGAATGTTTTTTTCATTTTTGG
189 ACTCACTTTAAAT-ATTTTATAATCTTAGAAATGATTTTAAATTGAA-ATTCTTTTCATTTCTAG
* * * * * * * **
171371 TTAAAACAAATAAAAATTTGTTATTTGCAT-TGAGAAACATTAAGCGCAAGCCATCCATTGACAA
252 TTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAG-GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAA
* * * ** * *
171435 GAAAAGT-TCATTTATAGTTACTAATGCCTTAAAAAGTATTA-TTACTCA-CCTTAAGTGGTTTT
316 GAAAAGTCT-ATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAG-CCTAGTTACTCATCTTTAAATGGTTTT
* ** * * * * *
171497 ATAACT-TTATAAATGATTTT-AAATGGAATTTATTTTCATTTTTTGTTAAAACAGTTCATAATT
379 ATAACTCTTATAAATAATTTTAAAATTAAATTT-TTTTTATTTCTAGTTAGAACA-ATCATAATT
* * * ** * ** * * * *
171560 TGATGTTTGGATTAAGAAATGTGAAGTGAAAGTTATCCACTAACAA-AACAATTCCATTTATAAT
442 TAATGTTTGCATTAGGAAACATGAAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAA-AAGTCCATTTATAGT
171624 CACTC
506 CACTC
* * * * * * * * * * * **
171629 ATGCCTTCAAAAGTCGTGTTAGTCACTTCAAATGGTTTTATAATCTTGTAAATGATTATGAATTG
1 ATGCCTTTAAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCATATAAATGATTTTAAATAA
* * * * * * * *
171694 AATTCTTTTCATTTTTGGTGAAAATAGA-TCATAATTTGATGTTTACATT-AGAAAACATGAGGC
66 AATTGTTTTCATTTATGGTTAAAACA-ATTCATAATTGGATGTTTGCATTAAG-AAAC-TTAAGC
* * * * * * *
171757 AAAAGCTATCCATTGACAAG-AAAGTCCATTTATCGTCACTCATGCCTTCAAAAGC-GAGTTATT
128 AAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCAATTTATAGTCACTCATACCTTCAAAAGCTTA-TTACT
** ** *** * * * *
171820 CGTTTTAAATGGCTTTATAATCTT-GCAAATGATTTTCGGTTGAAGTT-TTTTCATTTTTGGTAA
192 CACTTTAAAT-ATTTTATAATCTTAG-AAATGATTTTAAATTGAAATTCTTTTCATTTCTAGTTA
* * * * * * ** * *
171883 AAACATATTAGAATTTGTTATTTGCATTCA--AAGAAATGAAGCGCAAGCCATCAATTTACAA-A
255 AAACAGATCATAATTTGATGTTTGCA-TCAGGAA-ACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGA
* * * * * ** * * * * *
171945 AAAGTCTATCTATAGTCACTAATACCTTCGAAGGTGTTGTTAATC-GCTTCAAATAGTTTTATAA
318 AAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTACTCATCTTTAAATGGTTTTATAA
* ** * * * * * * *
172009 CT-TTATAAATGATTTT-GGATTGAATTTTTTTTTATTTTTGGTTAAAACTTACCATAATTTATT
383 CTCTTATAAATAATTTTAAAATT-AAATTTTTTTTATTTCTAGTTAGAAC-AATCATAATTTAAT
* * * ** * * * * * * *
172072 GTGTACATTAGGAAACGTGAAGCGAATGCTATCTATTGACAAGAAAAGTCCACTTATACTGACTT
446 GTTTGCATTAGGAAACATGAAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTC
* ** ** * * * * * *
172137 ATGCATTCGAAAGTGTAGTTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCTTATAAATGGGTTTGAATTG
1 ATGCCTTTAAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCATATAAAT-GATTTTAAATA
* * ** * * * **
172202 AAATTTTTTTCATTTTTCTTTAAAATAGA-TCCTAATTTGATGTTTGCATTTGGAAA-TGTGAAG
65 AAATTGTTTTCATTTATGGTTAAAACA-ATTCATAATTGGATGTTTGCATTAAGAAACT-T-AAG
** * ** * * * * ** *
172265 TGAAAGCCATCCATTAACAAGATTAGTCCATTTATTGTCACTCATGCCTTTGAAAGGTTAATTAC
127 CAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCAATTTATAGTCACTCATACCTTCAAAAGCTT-ATTAC
** * * * * *
172330 TTTCTTTAAATTGTTTTATAATCTTATAAATGAGTTTAAATTG-ATTTTTTGTTCA-TTCTTAGT
191 TCACTTTAAA-TATTTTATAATCTTAGAAATGATTTTAAATTGAAATTCTT-TTCATTTC-TAGT
* * * ** * * *
172393 TAAAACTGATCATAGTTTAATGTTTGCATTGGGAAACTTGAAGCAAAAACCATCCATTGATGAA-
253 TAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGA-CAAG
* * * * *** * * *
172457 AAAAGTCTATTTACATTGACTTATGCCTAGGAAAGCCTAGTTTCTCA-CTTGAAATAGTTTTATA
317 AAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTACTCATCTTTAAATGGTTTTATA
* * * * * * * * *
172521 A-TCATATAAATGA-TTTGAAATT-AATTTTTTTTAATTCTTGGTTAAAACATATCCTAGTTTGA
382 ACTCTTATAAATAATTTTAAAATTAAATTTTTTTTATTTC-TAGTTAGAACA-ATCATAATTTAA
* * ** *
172583 TGTTTGCATTAGGAAATATGAAG-GAAA-CTTTTCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATTA-TCA
445 TGTTTGCATTAGGAAACATGAAGTAAAAGC-CATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTA-TAGTCA
172645 CTC
508 CTC
** ** * * * * * *
172648 ATATCTTGGAAAGCCTAGTTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAACTAATTTTAAATCA
1 ATGCCTTTAAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCATATAAATGATTTTAAAT-A
* * * ** ** *
172713 AAATT-TTTCTCATTTCTTGTTAGAAA-AAATCATAATTGGATGTTTGTGTTGGGAAACATAAAG
65 AAATTGTTT-TCATTTATGGTTA-AAACAATTCATAATTGGATGTTTGCATTAAGAAAC-TTAAG
* * * * * * * * *
172776 TATAAGCTATCCATTGACAAGTAAAATCCATTTACAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTGATTAC
127 CAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCAATTTATAGTCACTCATACCTTCAAAAG-CTTATTAC
* * * * * * * * * *
172841 TCGCCTTAAGTGGTATTATAA-CTTTATAAATGATTTT-AATTTAAATTGTTTTTCATTTTTGGT
191 TCACTTTAAAT-ATTTTATAATC-TTAGAAATGATTTTAAATTGAAATT-CTTTTCATTTCTAGT
** ** ** * *
172904 TAAATGA-ATCATAATTTGATGTTTGCATCAAAAAATGTGAAGCGAAAGTCATCCATTGACAAGA
253 TAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGA
* * * * * *
172968 AAAATCTATTTATAGTCACAT-ATGCCTTCAAAAGCCTAATTGCT-AGCTTTAAATGATTTTAGA
318 AAAGTCTATTTATAGTCAC-TCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTACTCATCTTTAAATGGTTTTATA
** * * * * * * * *
173031 A-TCACATAAAT--GTTTACAAAATATAATTTTTCTCATTTTTTGTTAAAACATATCATAATTTG
382 ACTCTTATAAATAATTTTA-AAATTA-AATTTTTTTTATTTCTAGTTAGAACA-ATCATAATTTA
* ** * ** * *
173093 ATGTTTGCATAAGGAAAGGTAAAGCGAAAGCCATCTATTGATAA-AATAAGTCCATTTATAGTCA
444 ATGTTTGCATTAGGAAACATGAAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAA-AAGTCCATTTATAGTCA
173157 CTC
508 CTC
** ** * * * * * *
173160 ATATCTACAAAAGCCTAGTTACACGCTTTAAATGGTTTTATAGTCTTATTAATGATTTTAAATAA
1 ATGCCTTTAAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCATATAAATGATTTTAAAT-A
* * ** * * *
173225 AAATT-TTTTCATTTCTAGTT-AAACAGGTCATAAGTGGACT-TTTGCATCATGAAACATTAAGT
65 AAATTGTTTTCATTTATGGTTAAAACAATTCATAATTGGA-TGTTTGCATTAAGAAAC-TTAAG-
* * * * * * * * ** *
173287 GAAAA--CTTCCATTGACTAGAAAAGTCTATTTGTAGTCACTCATAACTTTGAAACCCTTGTTAC
127 CAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCAATTTATAGTCACTCAT-ACCTTCAAAAGCTTATTAC
** * * * * * * *
173350 TTGCTTTAAGTGGTTTTATGA-CATTATAATTGATTTTAAATTG--ATTTTTTTCATTTCTTGTT
191 TCACTTTAAAT-ATTTTATAATC-TTAGAAATGATTTTAAATTGAAATTCTTTTCATTTCTAGTT
* * ** * ** *
173412 AAAATAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGAAAAGGTAAAGCAAAAATCATCCATTGA-ATAAA
254 AAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACA-AGA
** ** ** * *
173476 AAAGT-TCATTTATAGTCTGTTTTGTGTTCGAAAGCCTAGTTACT--TGCTTTCAAT-GTTTT-T
318 AAAGTCT-ATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTACTCAT-CTTTAAATGGTTTTAT
* * * * * * * * **
173536 ACAGTATTAT-AATCATTTTTATATTGAAA-TTTTCTTAGTTT-TGGTTAAAACAGATTGTAATT
381 A-ACTCTTATAAATAATTTTAAAATT-AAATTTTTTTTA-TTTCTAGTTAGAACA-ATCATAATT
* * ** ** * * * * * *
173598 TGATGTTTGTATT-GAGAAAGGTGAAGCGAAAGCAATCCATTAATAAAAAAAAATCTATTTATAG
442 TAATGTTTGCATTAG-GAAACATGAAGTAAAAGCCATCCATTGA-CAAGAAAAGTCCATTTATAG
*
173662 GCACTC
505 TCACTC
* ** * * * * *
173668 -TGGCCTTCAATAA-CCTAATTACTCAAC-TTAAGTGGTTTTATGATCTTATAAATGATTTTAAA
1 AT-GCCTTTAA-AAGCCTTGTTACTC-GCTTTAAATAGTTTTATAATCATATAAATGATTTT-AA
* * * * ** *
173730 ATTAACTT-TTTCTCATTTTTTGTTAAAACAGA-TCATAATTTAATGTTTGCATCAAGAAA-TGT
62 ATAAAATTGTTT-TCATTTATGGTTAAAACA-ATTCATAATTGGATGTTTGCATTAAGAAACT-T
* * * * * * * * * * *
173792 GAAGCGAAAGCCATCCAATAATAATAAAAATCCATTTGTAGTTACTCTTGCCTTC-ACAGCCTTA
124 -AAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCAATTTATAGTCACTCATACCTTCAAAAG-CTTA
* * * * * * * *
173856 TTACTCGCTTTAAATGGTTTTAT-AGCTTTATAAATAATTTTAAATT--AATTTTTTTTATTTTT
187 TTACTCACTTTAAAT-ATTTTATAATC-TTAGAAATGATTTTAAATTGAAATTCTTTTCATTTCT
* * * * * * ** ** * *
173918 TGTTAGAACAGATCATAACTTCATGTTTGCA-CCGGGAA-ATGCTAAGCGCAAGTTATTCATTAA
250 AGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACATG--AAGCAAAAGCCATCCATTGA
* * * * ** * * * *
173981 CAAGAAAAGTCCATTTGTTGTAACTTTTGCCTTCAAAAACCTAGTTTCTC-GCTTTAAATGGGTT
313 CAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTACTCATCTTTAAATGGTTT
* * * * * *
174045 TATAA-TCCTATAAATGA-TTTAAAATTAAATTTTTTTTATTTTTGGTTAAAACAAATCGTAATT
378 TATAACTCTTATAAATAATTTTAAAATTAAATTTTTTTTATTTCTAGTTAGAAC-AATCATAATT
* * ** * * *
174108 TCATATTTGCATTAGGAAACATGAAGCGAAAGCTATCCATTGACAAGAAAATTCTATTTTATAGT
442 TAATGTTTGCATTAGGAAACATGAAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCA-TTTATAGT
*
174173 CATTC
506 CACTC
* * * * * *
174178 ATACCTTTAAAAACCTAGTTACAT-G-TTTCAAATGGTTTTATAGTCATATAAATAATTTTAAAT
1 ATGCCTTTAAAAGCCTTGTTAC-TCGCTTT-AAATAGTTTTATAATCATATAAATGATTTTAAAT
** * * * * ** * * *
174241 TGAAGTGTTTTTCATTTGA-AGTTAAAACAAATCATAATTGGATTTTTGTGTCAGGAAACGTGAA
64 AAAATTG-TTTTCATTT-ATGGTTAAAACAATTCATAATTGGATGTTTGCATTAAGAAAC-TTAA
* * * * * * * ** *
174305 GCAAAACCCTTCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTGTAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTGTTA
126 GCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCAATTTATAGTCACTCATACCTTCAAAAG-CTTATTA
* * * * *
174370 CTCACTTCAAGTGATTTTATAA-CTTCAAAAATAATTTTAAATTG--ATTTTTTTCATTTC-AGT
190 CTCACTTTAAAT-ATTTTATAATCTT-AGAAATGATTTTAAATTGAAATTCTTTTCATTTCTAGT
* * * * * *
174431 TAAAATAGATCATAATTTGATGTTTGCAT-TGGAAAACGTAAAGCAAAAGCCAT-CATTAACTAG
253 TAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGG-AAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAG
* * * * * ** *
174494 AAAAGTCCATTTATAGTCACTCGTG--TTCGAAAGCCTAATTA-T-TTCCTTTAAATATTTTTAC
317 AAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTACTCAT-CTTTAAATGGTTTTAT
* * * * * * * * ** *
174555 AA-TCTTATAAATGATTTTTACATTGAAA-TTTTCTTATTTTTGGTTAAAATAAATTGTAATTTG
381 AACTCTTATAAATAATTTTAAAATT-AAATTTTTTTTATTTCTAGTTAGAA-CAATCATAATTTA
* * * * ** ** * ** *
174618 ATGTGTGCATCAAGAAACGTGAAGCGAAAGTGATCCATTGATAAGAAAAGTTAATTTGTAG-CTA
444 ATGTTTGCATTAGGAAACATGAAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTC-A
174682 CTC
508 CTC
** * * * *
174685 ATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTTGCTTCAAGT-GATTTTATAA-CTTTATAAATGA-TTTAAAT
1 ATGCCTTTAAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAATAG-TTTTATAATC-ATATAAATGATTTTAAAT
* * ** * * * * *
174747 ---TTTTTTTTCACTTT-TTATTAAAGC-ATATCAAAATTTGATGTTTGCA-TCAGAAAACGTAA
64 AAAATTGTTTTCA-TTTATGGTTAAAACAAT-TCATAATTGGATGTTTGCATTAAG-AAAC-TTA
** ** * * * *
174806 AGTGAAAGCCATCCATTGAGTAG-AAAATCCATTTATAGTCACTTATACC-TCTGAAAGCCTAGT
125 AGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCAATTTATAGTCACTCATACCTTC-AAAAGCTTA-T
* * *
174869 TACTCACTTTAAGTGATTTTATAA-CTTTATAAATGATTTTAAATT-TAATT-TTTATCAATTTC
188 TACTCACTTTAAAT-ATTTTATAATC-TTAGAAATGATTTTAAATTGAAATTCTTT-TC-ATTTC
* * * * * *
174931 -AGTTAAAATAGATCATTATTGGATGTTTGAAT-TGGAAA-ATCTGAAGCGAAAATG--ATCTAT
249 TAGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACA--TGAAGC-AAAA-GCCATCCAT
* * * * *
174991 TGACAA-AAAAGT-TCATTTATAGTCACTCAAGTCTTTGAAAA-CCTAATTACTC-GCTTTAAAT
310 TGACAAGAAAAGTCT-ATTTATAGTCACTCATG-CCTTCAAAAGCCTAGTTACTCATCTTTAAAT
* * * * * * * * * *
175052 GGTTTTGTGA-TCTTATAAATGATTTTAAAATTGAATATTTCTCATTTTTTGTTAAAACAGATCA
373 GGTTTTATAACTCTTATAAATAATTTTAAAATTAAATTTTTTTTATTTCTAGTTAGAACA-ATCA
* ** * ** * *
175116 TAATTTGATGTTTGTGTTGGGAAATGTGAA-TCAAAAGCCATCAATTGACAAGAAAAATCCATTT
437 TAATTTAATGTTTGCATTAGGAAACATGAAGT-AAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTT
* *
175180 ATATTCATTC
501 ATAGTCACTC
* * * * * * * *
175190 ATGACTTTGAAAGCCTTATTACTCACTTTAAGTGGTTTTATAA-CTTTATAAATGATTTTAAATT
1 ATGCCTTTAAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATC-ATATAAATGATTTTAAATA
* * * * * * * * * *
175254 GAATTTTTTTTATTTTTAGTTAGAACAGA-TCATAGTTTGATGTTTGCATCAAGGAA-TGTGAAG
65 AAATTGTTTTCATTTATGGTTAAAACA-ATTCATAATTGGATGTTTGCATTAAGAAACT-T-AAG
** * * * * * *
175317 CAAAAGTTATCCAGTGATAAGAAAAGTCAA-TTATAGTCGCTCATGCCTTCGAAAA-CCTATCTA
127 CAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCAATTTATAGTCACTCATACCTTC-AAAAGCTTAT-TA
* * * * * * * *
175380 CCCACTTTAAATGGTTGTATAACCTTATAAATGATTTTAAAATTG-AA-T-TTCTCATTTTTGGT
190 CTCACTTTAAAT-ATTTTATAATCTTAGAAATGATTTT-AAATTGAAATTCTTTTCATTTCTAGT
* * * * **
175442 T-AAACAAAAT-ATAATTTGTTATTTACATTGGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAG
253 TAAAAC-AGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAG
* * * * * * * * * *
175505 CAAGGTCAATTTACAGTCACTCATGCCTTCAAAAACCTAATTAC-AAGCTTCAAATGGTTTT-TT
317 AAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTACTCATCTTTAAATGGTTTTATA
* * * * * * * *
175568 AGTCTTACAAATGATTTT-AAA-TAAATTTTTTTTTATTTTTGGATAAAAAAAATCATAA-TTAG
382 ACTCTTATAAATAATTTTAAAATTAAA-TTTTTTTTATTTCTAG-TTAGAACAATCATAATTTA-
* * * * * *
175630 AT-TTATGTATTAGGAAACTTAAAGCAAAA-CCTTTCCATTGATAAGAAAAG-CTCATTTATAGT
444 ATGTT-TGCATTAGGAAACATGAAGTAAAAGCC-ATCCATTGACAAGAAAAGTC-CATTTATAGT
175692 CACTC
506 CACTC
* * * * * * * * * * **
175697 ATACTTTTGAAAA-CCTTATTACTAGCTTCAAGTGGTTTGATGA-CTTTATAAAT-AACTT---T
1 ATGCCTTT-AAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATC-ATATAAATGATTTTAAAT
* * * * *
175756 -AAA-T-TTTT--TTT-T-GTTAAAACAAATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACGTAAAGC
64 AAAATTGTTTTCATTTATGGTTAAAACAATTCATAATTGGATGTTTGCATTAAGAAAC-TTAAGC
* * * *** *
175814 AAAAGCCATCCGTTGACTAA-AAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGTGTTCGAAAGCTTAGTTAC
128 AAAAGCCATCCATTGAC-AAGAAAAATCAATTTATAGTCACTCATACCTTCAAAAGCTTA-TTAC
* * * * * * ** * * * *
175878 TCGCGTTAAATGTTTTTACAATCTTATAAGTGAATTTTATGTTG-ACTTTTTTCTCATTTTTGGT
191 TCACTTTAAAT-ATTTTATAATCTTAGAAATG-ATTTTAAATTGAAATTCTTT-TCATTTCTAGT
* * * * * * * * *
175942 TAAAACATATCGTAATTTGTTGCTCGCAT-TGAGAAATATGGAA-CAAAAGCTATCCATTGATAA
253 TAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAG-GAAACAT-GAAGCAAAAGCCATCCATTGACAA
** * ** * * ** * * * * *
176005 GAAAAAACCATTTATAGTCACTTTTACTTTCAAAAATCTAGTTACAC-GCTTGAAAAGGTTTTGT
316 GAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTACTCATCTTTAAATGGTTTTAT
* * * * * * * * * *
176069 AGC-CTTATAAATGATTTT-AAATTGAAATGTGTTTCATTTCTAGTTACAATAGTTCAAAATTGA
381 AACTCTTATAAATAATTTTAAAATT-AAATTTTTTTTATTTCTAGTTAGAACA-ATCATAATTTA
* * * * * * * *
176132 ATGTTTGTATT-GGAAAGATTAA-AACCAAAACCATCCATTGACAAGAAAAATCCATGTATAGCC
444 ATGTTTGCATTAGGAAACATGAAGTA--AAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTC
176195 ACTC
507 ACTC
* * ** * * * *
176199 TTGCCTTTGAAAA-CTTTGTTACTTACTTTAAGTGGTTTTATAA-CTTTATAAATAATTTTAAAT
1 ATGCCTTT-AAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATC-ATATAAATGATTTTAAAT
** ** * ** ** *
176262 TGAA-TGTTTTCCATATT-TAATT-AAACTAGATTAAT-ATTTAATGTTTGCATTGGGAAACGTG
64 AAAATTGTTTT-CAT-TTATGGTTAAAAC-A-ATTCATAATTGGATGTTTGCATTAAGAAAC-TT
* * * * * * ** *
176323 AACCGAAAGCCATCCCTTGATAAGAAAAATCTATTTATAATCACTCATGTCTTCGAAAGCCTTAT
124 AAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCAATTTATAGTCACTCATACCTTCAAAAG-CTTAT
** * * * * ** * *
176388 TACTGGCTTTAAGTGGTTTTACAA-CTTATAAATGATTTTAAATTGATTTTTTTTTCATTTTTAG
188 TACTCACTTTAAAT-ATTTTATAATCTTAGAAATGATTTTAAATTGAAATTCTTTTCATTTCTAG
** * * ** ** *
176452 TTTGAATAGATCATAATTTGATATTTGCATCTTGAAACATGAAGCAAAAGTTATCCATTCACAAG
252 TTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAG
* ** * * *
176517 -AAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGTAAGCCTAGTT-GT-TTGCTTTAAATGATTTTAT
317 AAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTACTCAT-CTTTAAATGGTTTTAT
* * * * * * * *
176579 AA-TCATATAAATAATTTTCAAATTGATTTTTTTTTATTTTTAGTAAAAACATATCATAATTTGA
381 AACTCTTATAAATAATTTTAAAATTAAATTTTTTTTATTTCTAGTTAGAACA-ATCATAATTTAA
* * ** * * ** *
176643 TGCTTGCATTAGAAAATGTGAA-TCAAAAGCTATTCATT-AGCACCAAAAGTCTATTTATAGTCA
445 TGTTTGCATTAGGAAACATGAAGT-AAAAGCCATCCATTGA-CAAGAAAAGTCCATTTATAGTCA
*
176706 CTT
508 CTC
* *** * ** * * * * * * *
176709 ATACCTTCGGAAGCCTAGGCACACACTTCAAATGGTTTTATAGTCTTATAAATGATTGTAAATTA
1 ATGCCTTTAAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCATATAAATGATTTTAAA-TA
* * * * * * * *
176774 AAATTTTTTTTCATTTCTAGTTAAAAC-ATATCATAGTTAGAT-TTTTC-TTCAGGAAACATGAA
65 AAA-TTGTTTTCATTTATGGTTAAAACAAT-TCATAATTGGATGTTTGCATT-AAGAAAC-TTAA
* * * * * * *
176836 GCGAAA-CTCTTTCATTG---ATAAAGA--AA---A-AGT---TCAT--C-T-----G-TAATCA
126 GCAAAAGC-CATCCATTGACAAGAAAAATCAATTTATAGTCACTCATACCTTCAAAAGCTTATTA
* * * * *
176879 CTCA-TTTCAAGTGATTTTATAA-CTTTACAAATGATTTTAAATTG--ATTTTTTTCATTTTTGG
190 CTCACTTT-AAAT-ATTTTATAATC-TTAGAAATGATTTTAAATTGAAATTCTTTTCATTTCTAG
* * ** * ** * *
176940 TTAAAACAGAT-AGCAATTTGATGTTTGCATTAAAAAACATAAAGTGAAAGCCATCCATTTACTA
252 TTAAAACAGATCA-TAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAA
* * * * * * *
177004 GCAACATTC-ATTTATAGTCACT-ATTACCTTCGAAAGCCTAGTTGCCCA-CTTTTAAATGATTT
316 G-AAAAGTCTATTTATAGTCACTCA-TGCCTTCAAAAGCCTAGTTACTCATC-TTTAAATGGTTT
* * * * * *
177066 TAT-ACTCTTATAAATTATTTT-AAA-TCAA--TTTTTTATTTTTAGTTAAAAAAAATCATAAAT
378 TATAACTCTTATAAATAATTTTAAAATTAAATTTTTTTTATTTCTAGTT-AGAACAATCATAATT
* ** * * * * * * *
177126 TGATGTTTTTATT-GAGAAACGTGAAGCAAAAGCTATCCATTAACAAGAAAAGTCTATCTATAGC
442 TAATGTTTGCATTAG-GAAACATGAAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGT
*
177190 CATTC
506 CACTC
* ** * * * * * * *
177195 ATGCCTTTGAAAGGTTTGTTACTCACTTCAAGTGGTTTTATAA-CTTTATAAATGATGTTAAATT
1 ATGCCTTTAAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATC-ATATAAATGATTTTAAATA
* * * * * * * ** * * * *
177259 GAATTATTTTTATTTTTAGTTAAAAC-GTATCATTATTAAATATTTGCATCAAGAAACGTGAAGT
65 AAATTGTTTTCATTTATGGTTAAAACAAT-TCATAATTGGATGTTTGCATTAAGAAAC-TTAAGC
* ** * * * * * * * *
177323 GAAAGATATCCATTGATAAGAAAAGTCTAGTTATAGTCACTTATGCCTTCAAAAACTTTTTTACT
128 AAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCAATTTATAGTCACTCATACCTTCAAAAGC-TTATTACT
*
177388 CACTTTAAATGATTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATTG-AATT-TTTTCATTT-TCAGTTA
192 CACTTTAAAT-ATTTTATAATCTTAGAAATGATTTTAAATTGAAATTCTTTTCATTTCT-AGTTA
* * * * * * * * ** *
177450 AAACATATTATTATTAGATATTTGCAT-TGGCAATCATAAAGTGAAAGCCATCCATTGACAAGGA
255 AAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGG-AAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAA
* * * * * * *
177514 AAGT-TCATCTATAGTCACTCATACCTTC-GAAGCTTAGTAACT--TGCTTCAAATTG-TTTAT-
319 AAGTCT-ATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTACTCAT-CTTTAAATGGTTTTATA
* * ** * * * * * * * ** * * ** *
177573 AGTCTTATAAATGATTTT-TTATCAAAATTTTTTCATTTTTGGTTAAAATAGAAAAAAAATGGAC
382 ACTCTTATAAATAATTTTAAAATTAAATTTTTTTTATTTCTAGTTAGAACA-ATCATAATTTAAT
* * * * *
177637 GTTTGCATTGGGAAACATGATACTGAAA-CCATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGGCACT
446 GTTTGCATTAGGAAACATGA-AGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACT
*
177701 T
510 C
* ** * * * * *
177702 ATGTCTTTAAAAATCTTGTTACCCACTTT-AAGAGATTTAATAA-CTTTATAAATGATTTTAAAT
1 ATGCCTTTAAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAATAG-TTTTATAATC-ATATAAATGATTTTAAAT
** * * * * * * * * *
177765 -TTATTTTTTTTATTTTTGGTTCAAACAGA-TGATTAGTT-GACGTTTGCATTGAGAAACATGAA
64 AAAATTGTTTTCATTTATGGTTAAAACA-ATTCA-TAATTGGATGTTTGCATTAAGAAAC-TTAA
** * * ** * * ** *
177827 GCAAAAGTGATCCATTGATAAGAAAAGTCCGTTCATAGTAACTCATGTCTTCAAAAGCCTAGTTA
126 GCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCAATTTATAGTCACTCATACCTTCAAAAGCTTA-TTA
* *
177892 CTCACTTTAAA-ATGGCTTTATGATCTTATAAATGATTTTAAAATTG-AATT-TTTCTCATTT-T
190 CTCACTTTAAATAT---TTTATAATCTTAGAAATGATTTT-AAATTGAAATTCTTT-TCATTTCT
* ** * * * *
177953 TGATTAAAACAGATTGTAATTTGATGTTTGTATCTA-AAAACAAGAAGTAAAAGCCATCCATTGA
250 AG-TTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATC-AGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGA
* * * * * *
178017 CAAGAAAA-TCTATTTATAGTCACTCATGTCTTCGAAAGCCTTA-TTATTCA-CTTCAAGTGATT
313 CAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCC-TAGTTACTCATCTTTAAATGGTT
* * * * * *
178079 TTATAACT-TTATAAATGATTTT-AAATTGAATTTTTTTCATTTCTTA-TTAAAATAGATAATAA
377 TTATAACTCTTATAAATAATTTTAAAATTAAATTTTTTTTATTTC-TAGTTAGAACA-ATCATAA
* ** * * *
178141 CTTAATGTTTGCATTAAAAAACATGAAGTAAAAGCGATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATTG
440 TTTAATGTTTGCATTAGGAAACATGAAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAG
* *
178206 TTACTA
505 TCACTC
* * * * ** *
178212 ATACCTTCGAAAA--CTTAATTATTCATTTTAAATAGTTTTATAATCTTAT-AATGATTTTTAAA
1 ATGCCTT-TAAAAGCCTT-GTTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCATATAAATGA-TTTTAAA
** * * * ** * * *
178274 TGGAATT-TTTCTCATTTTTGGTTAAAATAGA-TCATAATTTGATGTTCACATCATGAAACATGA
63 TAAAATTGTTT-TCATTTATGGTTAAAACA-ATTCATAATTGGATGTTTGCATTAAGAAAC-TTA
* ** * * * * * * * *
178337 AGTGAAAA-TTATCCATTAATAAGAAAAATCAATTTATAGTTACTTATGCATTAAAAAGCCTTAC
125 AG-CAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCAATTTATAGTCACTCATACCTTCAAAAG-CTTAT
* * * * * * * * *
178401 TACCCGCTCTAAGTAGTTTTATAA-CATTATAAATTATTTTAAATTGAATTTTTTTTTCATTTTT
188 TACTCACTTTAAATA-TTTTATAATC-TTAGAAATGATTTTAAATTGAA-ATTCTTTTCATTTCT
* * * * * * * * * *
178465 GGTTAGAACAAATCGTAATTTGATGTCTGTATCAGGAAATATGAAGTAAAAACCATCC-GTGAAC
250 AGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTG-AC
* * * * * *
178529 AAGAAAAGT-TCATTTATAAT-ATCTCATACCTTCGAAAGCCGAGTTACT--TGGTTTAAATGTT
314 AAGAAAAGTCT-ATTTATAGTCA-CTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTACTCAT-CTTTAAATGGT
* * * * * *
178590 TTTATAA-TCCTATAAATTATTTT-AAA-T-AATTTTTTTTAATTTTTTGTTAAAACAGATCATG
376 TTTATAACTCTTATAAATAATTTTAAAATTAAATTTTTTTT-ATTTCTAGTTAGAACA-ATCATA
* * * ** * * * *
178651 GTTTATTATTTGCATTAGGAAACATGAAACAAAAGCCATCTATCGATAAGAAAAGTCCATCT-TA
439 ATTTAATGTTTGCATTAGGAAACATGAAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATA
178715 GTCACTC
504 GTCACTC
* *
178722 ATG-CTTCCT-AAAGCCATGTTACTTGCTTTAAATCA-TTTTATAATC-TAATAAATGATTTTGA
1 ATGCCTT--TAAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAAT-AGTTTTATAATCAT-ATAAATGATTTT-A
* * * * * **
178783 ATTAAATTATT-TTTTTATTTTTGGTTAAAACATATT-ATAATTTGATTTTTTTAATTGAA-AAA
61 AATAAA--ATTGTTTTCATTTATGGTTAAAACA-ATTCATAATTGGA-TGTTTGCATT-AAGAAA
* * * * ** *
178845 CATGAAGCAAAAGCCATCCATTAACAAGAAAACTCCATTTATAGTCACTTTTGCCTTCGAAAA-C
121 C-TTAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCAATTTATAGTCACTCATACCTTC-AAAAGC
* ** * *
178909 CTAGTTACTCACTTTAAATAGTTTTATAATCTTTTAAATGATTTTTAAA-AG-AATTGATTTT-A
184 TTA-TTACTCACTTTAAATA-TTTTATAATCTTAGAAATGA-TTTTAAATTGAAATT-CTTTTCA
* * *
178971 TTTTTCA-TTAAAACAGATCATAATTTGATTTTTTTCATC--GAAA-ATTGTAAAGCAAAAGCCA
245 TTTCT-AGTTAAAACAGATCATAATTTGA-TGTTTGCATCAGGAAACA-TG--AAGCAAAAGCCA
** * **** * * * *
179032 TTGATGGTTTCG-AAAG-CTTACTTAT-GTGACTCATGCCTTCGAAAGCCTAGTTACT-TTCTTT
305 TCCATTGACAAGAAAAGTC-TATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTACTCATCTTT
* * * **** * * *
179093 AAATGGTTTTATAGC-CTTATAAATGATTTT-AAATCAAAAGCCTTTCATTTCTAGTTAAAATAG
369 AAATGGTTTTATAACTCTTATAAATAATTTTAAAATTAAATTTTTTTTATTTCTAGTTAGAACA-
* ** * * * * * * *
179156 AACATAATTGGATCTTTACATTAGGAAACGTG-AGATGAAAGTCATCCATTCATAAGAAAAGTCC
433 ATCATAATTTAATGTTTGCATTAGGAAACATGAAG-TAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCC
* * **
179220 ATTTACAGTGACGA
497 ATTTATAGTCACTC
* ** * ** * * * * *
179234 ATACCTTCGAAAGGCTAATTGCTTGCTTTAAATAGTTTTATAATCTTATAAACGATTTTAAAT-T
1 ATGCCTTTAAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCATATAAATGATTTTAAATAA
* * * * * * * ** *
179298 GATTTTTTTCGCTTT-CGGTTAAAAGAGATT-ATAATTTGATGTTTGTATTGGGAAACTTGAAGT
66 AATTGTTTTC-ATTTATGGTTAAAACA-ATTCATAATTGGATGTTTGCATTAAGAAACTT-AAGC
* * * * ** * * ** * *
179361 GAAAGCCATCCGTTGATATGAAAAGGCTATTTATACTCACTCATACCTTTGACAG-TCTAGTTGC
128 AAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCAATTTATAGTCACTCATACCTTCAAAAGCT-TA-TTAC
* * * * * *
179425 TTACTTTAAATGGTTTTATAATTTTATAAATGATTTTAAATTG--ATTTTTTTCATTTGTCA-TT
191 TCACTTTAAAT-ATTTTATAATCTTAGAAATGATTTTAAATTGAAATTCTTTTCATTTCT-AGTT
* * * *
179487 AAAATAGATCATAATTTGTTGTTTGCAT-AGAGAAACATGAAGCGAAAGCCCTCCATTGACAAGA
254 AAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAG-GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGA
* * * * * *
179551 AAAGT-TCATTGATAGTCGCTTATGTCTTCTAAAGCCTAGTTGCT--TGCTTTAAATGGTTTTAT
318 AAAGTCT-ATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTACTCAT-CTTTAAATGGTTTTAT
* * * *
179613 GA-TCTTGTAAATGATTTT-AAATT-GATTTTTTTTCACTTT-TAGTTCA-AACAGATCATAATT
381 AACTCTTATAAATAATTTTAAAATTAAATTTTTTTT-A-TTTCTAGTT-AGAACA-ATCATAATT
** * * * ** *
179673 TGTTATTTGCA-TCGAGAAACGTGAAACAAAA-CCTATCCATTGACAAGAAAAGTCAATTTATAG
442 TAATGTTTGCATTAG-GAAACATGAAGTAAAAGCC-ATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAG
179736 TCACTC
505 TCACTC
* * ** * * * *
179742 ATACCTTCAAAAGTATAGTTACTCACTTTAAATAGTTTTATAATCTTATAAATTATTTTAAATAA
1 ATGCCTTTAAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCATATAAATGATTTTAAATAA
** * * ** * * *
179807 TTTTTTTTTTCATTTTTGGTT---A-AATAGATAA-T--A-ATTTGCATTGAGAAACATGAAGCA
66 -AATTGTTTTCATTTATGGTTAAAACAATTCATAATTGGATGTTTGCATTAAGAAAC-TTAAGCA
* * * ** * *
179864 AAAGCCATTCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATACCTTTGAAAG-TCAAGTTGCT
129 AAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCAATTTATAGTCACTCATACCTTCAAAAGCT-TA-TTACT
** ** * * * * * *
179928 TGCTTTAAATGGTTTATTATCTTATAAATGATTGTAAA-TCAATTTTTTTTTCATTTCTAGTTAA
192 CACTTTAAATATTTTATAATCTTAGAAATGATTTTAAATTGAA-ATTCTTTTCATTTCTAGTTAA
* * * * * ** *
179992 AATAGACCATAA-TTGTATGTTTACATTAGAAAACATGAAGTGAAAGCCATCCATTG-CTAAAAA
256 AACAGATCATAATTTG-ATGTTTGCATCAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGAC-AAGAA
* * * * **
180055 AAGTCAACTTATAGTCACTCATACCTTCAAAAGCCTAATTGTTCA-CTTTAAATGGTTTTATAA-
319 AAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTACTCATCTTTAAATGGTTTTATAAC
* * * * * * *
180118 TCTTATAAATAA-TTTGAAGTTGAATTTTATTTTTTATTTTTGGTTACAA-AGATCATAATTTGA
384 TCTTATAAATAATTTTAAAATT-AA-ATT-TTTTTTATTTCTAGTTAGAACA-ATCATAATTTAA
* * * * * ** * * *
180181 TATTTGAATTAAGAAATATTAAGTGAAAA-TAATCTATTGACTAGAAAAGTCTATTTATAGTCAC
445 TGTTTGCATTAGGAAACATGAAGT-AAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCAC
*
180245 TT
509 TC
* * ** * * * * * * * **
180247 ATACATTCGAAATCCTAGTTGCTAGCTTTAAACAGTTTTATAATCTTCTAAATGATTTTAAATTG
1 ATGCCTTTAAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCATATAAATGATTTTAAATAA
* * * * * **
180312 AATT-TGCTTCATTTTTGGTTGAAAC-ATATCATAATTGGATGTTTGC-GTAGGAAACGTGGAGC
66 AATTGT-TTTCATTTATGGTTAAAACAAT-TCATAATTGGATGTTTGCATTAAGAAAC-TTAAGC
* ** * **
180374 GAAAGCCATCCATTGACAAG-AAAGGC--TTGT-T--T--CTC-T--CTT--TAAG-TGGTT--T
128 AAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCAATT-TATAGTCACTCATACCTTCAAAAGCTTATTACT
* ** * * *
180423 CA--TT--A-A--TT-T-A---TA-AAA-GATTTTGAATTGATTTTTTTTTCATTTTTGGTTAAA
192 CACTTTAAATATTTTATAATCTTAGAAATGATTTTAAATTGAAATTCTTTTCATTTCTAGTTAAA
** * ** ** * * * *
180474 A-AGATCCCAATTTAATGTTTTTATCAAAAAACATGAAGCGACAGCAATCCAGTGACAAGAAAAG
257 ACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAG
* * * * * * * *
180538 TCCATTTATCA-TTACTCATGCATTCAAAAGCTTAGCTGCTCAT-TTTAAATAG-TTTGTAA-TC
322 TCTATTTAT-AGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTACTCATCTTTAAATGGTTTTATAACTC
* * * ** *
180599 TTATAAATAATTTT-AAATTGAA------CT-TGTC---TT-------TCATAATTTGCTGTTTA
386 TTATAAATAATTTTAAAATTAAATTTTTTTTATTTCTAGTTAGAACAATCATAATTTAATGTTTG
* * ** * * * * * *
180646 CAATGGGAAATGTGAAGCAAAAGCCATCAATTGTCAAGAAAAGTTCATTTATAGTCATTT
451 CATTAGGAAACATGAAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTC
* ** * * * * *
180706 ATGCCTTTAAAA-ACTAACTTATTTGCTTTAAATGGTTTTATAGTC-TCATAAATAATTTTAAAT
1 ATGCCTTTAAAAGCCT-TGTTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCAT-ATAAATGATTTTAAAT
* * * ** *
180769 CAAAATTTTTTTAATTCTA--GTTCAAACAGA-TCATAATTGGATGTTTG-ATTTGGAAACATGA
64 -AAAATTGTTTTCATT-TATGGTTAAAACA-ATTCATAATTGGATGTTTGCATTAAGAAAC-TTA
* * * * * * * *
180830 AGTAAAATG-CATCTATTGACAAGAAAAGTCAATTTATAGGCACACATGCCTTCGAAAGCCTTGT
125 AGCAAAA-GCCATCCATTGACAAGAAAAATCAATTTATAGTCACTCATACCTTCAAAAG-CTTAT
* * * * * * *
180894 TACTTATTTTAAGTAGATTTATAA-CTTTGTAAATCATTTTAAATT-AAATTTTTTTCAATTT-T
188 TACTCACTTTAAATA-TTTTATAATCTTAG-AAATGATTTTAAATTGAAATTCTTTTC-ATTTCT
* * * * * *
180956 GGTTAAAAC-GATCATAATTTGATGTTTGTAT-AGGGAAACGTGAGGTAAAA-ACATTCCATTGA
250 AGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCA-GGAAACATGAAGCAAAAGCCA-TCCATTGA
* * * *
181018 CAAGAAAAGT-TCATTTACACG-CACTCATGCCTTCGAAAGCTTAGTT--GC-TC--------G-
313 CAAGAAAAGTCT-ATTTATA-GTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTACTCATCTTTAAATGGT
* * ** * *
181069 -------CT-TTATAAATGATTTT-GAATTATTTTTTTTTTCATTT-TTGCTTAAAACAAATCAT
376 TTTATAACTCTTATAAATAATTTTAAAATTAAATTTTTTTT-ATTTCTAG-TTAGAAC-AATCAT
* ** *
181124 -ATTTCAATGTTTGCATTGGGAAACATGAAGCGAAAGCCATCCATTAACAAGAAAAGTCCATTTA
438 AATTT-AATGTTTGCATTAGGAAACATGAAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTA
*
181188 TAGTCACTT
502 TAGTCACTC
* * * * * * *
181197 ATACCTTTGAAAGCCTTATTTCTCGCTTTAAGT-GATTTTATAA-CTTTATAAATGATTTTAGAT
1 ATGCCTTTAAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAATAG-TTTTATAATC-ATATAAATGATTTTAAAT
* * * * * * * * * *
181260 CGAAATTGCTTTCATTGCA-GATTAAAACAAATCATAATTGAATGTTTGCAATAGGAGACATGAA
64 -AAAATTGTTTTCATT-TATGGTTAAAACAATTCATAATTGGATGTTTGCATTAAGAAAC-TTAA
* * * * * * * *
181324 GCGATAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTGTAG-CTAC-CTATGCCTTCGAAAGCCTTGT
126 GCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCAATTTATAGTC-ACTC-ATACCTTCAAAAG-CTTAT
* * * * * * * * *
181387 TACTCGCTTTAAGTGGTTTTATAATGTTATAAATTATTTGAAATTGAATTTCCTTTTTAGTTT-T
188 TACTCACTTTAAAT-ATTTTATAATCTTAGAAATGATTTTAAATTGAAATT-CTTTTCA-TTTCT
* * * * * **
181451 -GATTGAAA-AGATCATAATTTAATGTTTTCATCATGAAACGTGAAGCAAAAGTAATCCATTGAC
250 AG-TTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGAC
* ** * *** * * *
181514 AAAAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTT-TGATGTCC-ACCAACTC-GCATTAAATGGATT
314 AAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAG-CCTAGTTACTCATCTTTAAATGGTTT
* * * * * * * * * *
181576 TATAA-TTTTATAAATGATTGT-GAATTGAATTGTTTTTCATTTTTGGCTAAAACATATCATAAT
378 TATAACTCTTATAAATAATTTTAAAATTAAATT-TTTTTTATTTCTAGTTAGAACA-ATCATAAT
** * * ** * * * *
181639 TTGTTGTTTGCATCA--AGA-A-GAAGCGAAACCCATCCA-TCACAA-AAAGGTCCATTCATAGT
441 TTAATGTTTGCATTAGGAAACATGAAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGT
*
181698 CTTA-TAA
506 C--ACT-C
** *** * * * * * * *** *** *
181705 AT-TATTTCCAATCAATTTTTTTTATTTCTGGTTAAAACA-TATTATAATTGGATGTTTGCATCA
1 ATGCCTTT--AA--AAGCCTTGTTA-CTC-GCTTTAAATAGTTTTATAATCATATAAATG-AT-T
** ** * * ** * *
181768 AGAAACGTAAAGCAAGAGCTATCCA--TACAG--AAAAAAAGTCCAT--TT--ATAG--T-CATT
58 TTAAA--T-AA--AATTG-TTTTCATTTATGGTTAAAACAA-TTCATAATTGGAT-GTTTGCATT
* * * * * ** * * ** * * * *
181822 TA-TACCTT-TG--AAAGCCTTGTTACTCACTTG--AAGT-GATTT-TA-TAACT-TTA---T-A
115 AAGAAACTTAAGCAAAAGCCAT-CCATTGACAAGAAAAATCAATTTATAGTCACTCATACCTTCA
* * * * * * ** * ** *
181873 AATGATT-TTA---AATTGAATTTGTTTTTCATTTTTGCTTAAAAAT-ATCAT-AATT-TAATGT
179 AAAGCTTATTACTCACTTTAA-AT-ATTTT-A-TAAT-CTTAGAAATGATTTTAAATTGAAAT-T
* *** * * * * ** * * * ** *** *
181931 -TTGT-ATTGAGAAATGTGAAGCA-AACGA-AA-TCCA---TT--AACAAGAAA-GTCCATTTAT
238 CTTTTCATT-TCTAGT-TAAAACAGATC-ATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACATGAAGCAAA
* * * *** * * * ** * * * * * *
181985 AGTCA-CCAATGCCTTCAAAAGACTAATTTCT--T-ACTTTAAATGGTTTTATAATCTTA-TAAA
300 AGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCT-ATTTATAGTCAC--T-CATGCCTTCAAAAGCCTAGTTAC
* * * * * * * * * ** * *
182045 TGATTTTGGATTGAAAT--TTTTTTCAGTTTTGTACA-AA----CAAAGCACAA-TTTATGTATG
361 TCA-TCT---TT-AAATGGTTTTATAACTCTTATAAATAATTTTAAAATTA-AATTTTTTTTAT-
*** * ** * * **
182102 TT-T--TTAG-A-AA-CATGAAGCGAAAG--T-CATCT--GTTA-AT-AA-AAAAAGTTCATTTA
419 TTCTAGTTAGAACAATCAT-AATTTAATGTTTGCAT-TAGGAAACATGAAGTAAAAG-CCATCCA
* * * *** * **
182153 TAGTCGCCTA-TACCTTCAATAATT-TAGTTGCTC
481 T--T-GACAAGAAAAGTCCAT--TTATAGTCACTC
* * * ***
182186 --GGC-TTAAATG-ATT-TTACAATCTTATAAAT-G--TT-T--T-ATAT---TGA---T---T-
1 ATGCCTTTAAAAGCCTTGTTACTCGCTT-TAAATAGTTTTATAATCATATAAATGATTTTAAATA
* * * * * * *
182229 ---TT-TTTT-ATTT-TGGTTAAAACAAATCATTATTTGTTGTTTGCATTGAGAAACATAAAGCC
65 AAATTGTTTTCATTTATGGTTAAAACAATTCATAATTGGATGTTTGCATTAAGAAAC-TTAAGCA
* * * * * * *
182288 AAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTTC-ATTTATAATTACCCATACCTTCGTAAAGCCTAGTTA-
129 AAAGCCATCCATTGACAAGAAAA-ATCAATTTATAGTCACTCATACCTTC-AAAAGCTTA-TTAC
* * * ** * * * *
182351 TTAGCTTTATATAGTTTTATAGTCTTATCAATGATTGTAAATTGAAA-ACATTGTCATTTGT-GA
191 TCA-CTTTAAATA-TTTTATAATCTTAGAAATGATTTTAAATTGAAATTC-TTTTCATTTCTAG-
* * * * * * *
182414 TTAAAACAAATCATAATTTGTTGTTTGCATTAGGAAACATGAAACGAAAGCCATCCATTTATAAG
252 TTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAG
* * * * * * * *
182479 AAAAGTCCAATTATAGTCATTTATGCCTTCAAAAGCCTTGTTACTC-GCTTTAAGTGGTTTTGTA
317 AAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTACTCATCTTTAAATGGTTTTATA
* * * * * * * *
182543 ACT-TTATAAATGATTTT-CAATTGATTTTTTTTTCATTTTTAGTTCA-AA-GATCGTAATTTGA
382 ACTCTTATAAATAATTTTAAAATTAAATTTTTTTT-ATTTCTAGTT-AGAACAATCATAATTTAA
* * * ** * *
182604 TGTTTGTA-TA-AAAAAATGTAAAGCGAAAGCAATCCATTGTCAAGAAAAGTCCATTTATCA-TC
445 TGTTTGCATTAGGAAACATG--AAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTAT-AGTC
182666 AACT-
507 -ACTC
* * * * * * * *
182670 ATGCCTTCAAAAGCCTAGTTGCTCACTTTAAATGGTTTTATGATCTTATAAATGATTTTAAAT-G
1 ATGCCTTTAAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCATATAAATGATTTTAAATAA
* * * * * ** *
182734 AATTGTTTTTTTAATTTTTGGCTAAAATAGA-TCATAATT-TATTGTTTGCTATGGA-AAACATG
66 AATTG---TTTTCATTTATGGTTAAAACA-ATTCATAATTGGA-TGTTTGC-ATTAAGAAAC-TT
* * * * * * * * * * **
182796 AAGCGAAAGTCATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTTATTTATGCCATCGAAA-CCAACT
124 AAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCAATTTATAGTCACTCATACCTTCAAAAGCTTA-T
** * * * * * * * *
182860 TACTTGCTTTAAATGGTTTTATAGTCTCATAAATAATTTTAAATCGAACTT-TTTTCAATTCTAG
188 TACTCACTTTAAAT-ATTTTATAATCTTAGAAATGATTTTAAATTGAAATTCTTTTCATTTCTAG
* * * * * * * * *
182924 CT-AAACAAATCATAATTAGATGTTTGCATTAGGCAACA-CAATTCGAAAGTCATCCATTGACAA
252 TTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACATGAA-GCAAAAGCCATCCATTGACAA
* * * * *
182987 GAACAG-CTAATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCA-CTTTAAATAGATTTA
316 GAAAAGTCT-ATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTACTCATCTTTAAATGGTTTTA
* * *
183050 TAACT-TTATAAATGATTTT-AAATTGAATTGTTTTTTCATTTTTAGTTA-AA-AAGCTCATAAT
380 TAACTCTTATAAATAATTTTAAAATTAAATT-TTTTTT-ATTTCTAGTTAGAACAA--TCATAAT
* * * * * ** * * * * *
183111 TTGATGTTTGTATTAAGAAA-AGTAAAGCAAAAGGAATCTACTGAAAAGAAAAATCTATTTATAG
441 TTAATGTTTGCATTAGGAAACA-TGAAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAG
*
183175 TCACTA
505 TCACTC
* * * * * ** * *
183181 ATGACTTTGAAAGCCGTATTGCTCAATTTAAATATTTTTATAATC-TCATAAATAATTTTAAAGT
1 ATGCCTTTAAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCAT-ATAAATGATTTTAAA-T
* * * * * * *
183245 GAATTATT-CTTTCATTTGTGGTTAAAACAGA-TCCTAATTTGATGTTTGCA-TCAGAAAACATG
64 -AA-AATTGTTTTCATTTATGGTTAAAACA-ATTCATAATTGGATGTTTGCATTAAG-AAAC-TT
* * * * * * * * *
183307 ACGCGAAAGCTATCCATTGATAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATAGCTTCGAAAGCCTAGT
124 AAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCAATTTATAGTCACTCATACCTTCAAAAGCTTA-T
* * * * **
183372 TGCTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATT-AAATT-TTTTTATTT-TCC
188 TACTCACTTTAAAT-ATTTTATAATCTTAGAAATGATTTTAAATTGAAATTCTTTTCATTTCTAG
* * * ** ** * * *
183434 TTAAAAATAGATCATAATTGGATGTTTACATTGGGAAATGTGAAACCAAAGTCC-TCCATTTACA
252 TT-AAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACATGAAGCAAAAG-CCATCCATTGACA
* * * * * ** **
183498 AGAAAAGTGC-ACTTATAGTCACTCATACCTTCGAAAGCTTTGTTACT--TGCTTTAAGCGGACT
315 AGAAAAGT-CTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTACTCAT-CTTTAAATGGTTT
* * * * * * * *
183560 TATAACT-TTATAAATGATTTT-GAATTGAATTATTTTTCATTT-TTGATTA-AAAAGATGACAA
378 TATAACTCTTATAAATAATTTTAAAATTAAATT-TTTTTTATTTCTAG-TTAGAACA-ATCATAA
* * * * * *
183621 TTTAATATTTG-TTTCAGGAAACATG-ATTCAAAAGTCATCCATTAACAAGAAAAGTCAATTTAT
440 TTTAATGTTTGCATT-AGGAAACATGAAGT-AAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTAT
*
183684 AGTTACTC
503 AGTCACTC
* * * * * * *
183692 ATGCCTTTGAAAGCCTTGTTGCTCGCTTTAAGTCGATTTATAA-CTTTATAAATGATTTTCAATT
1 ATGCCTTTAAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATC-ATATAAATGATTTT-AAAT
** * * * ** * * * *
183756 GAATTTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAA-AGCTCATAATTTGATGTTTGTATTAAGAAAAGTAAAG
64 -AAAATTGTTTTCATTTATGGTTAAAACAATTCATAATTGGATGTTTGCATTAAG-AAACTTAAG
** ** * * * * * * * * * * **
183820 TGAAAGGGATCTATTAAAAAGAAAAGTCCATTTACAATCACTTATAACTTCGAAAGCTTTATGGC
127 CAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCAATTTATAGTCACTCATACCTTCAAAAGC-TTATTAC
* * * * * *
183885 TCACATTAAATAATTTTATAATCTCATAAATGGTTTTAAATTG-AATTTTTTTTATTT-TAAGTT
191 TCACTTTAAAT-ATTTTATAATCTTAGAAATGATTTTAAATTGAAATTCTTTTCATTTCT-AGTT
* * * ** *
183948 AAAACATATCCTAATTTGATGTTTGCATCTA-AAAACAT-AATGTGAAAGCCATCCTTTGACAA-
254 AAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATC-AGGAAACATGAA-GCAAAAGCCATCCATTGACAAG
* * * * *
184010 AAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTCGAAAGCCTAGTTGA-TCGT-TTTAAATGATTTTAT
317 AAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTT-ACTCATCTTTAAATGGTTTTAT
* * * * * * * * *
184073 AA-TCTTATAAATCATTTT-AAATTGAATTCCTTTTTATTT-TCACTGAAAATAGATCACAATTG
381 AACTCTTATAAATAATTTTAAAATTAAATT-TTTTTTATTTCT-AGTTAGAACA-ATCATAATTT
* * ** * * ** * * * * * * *
184135 GATATTTATATCGAGCAAATGTGAAGCAAAGGTCATCCATTGACAAGAAAATTGCACTTATAGCC
443 AATGTTTGCAT-TAGGAAACATGAAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTC
*
184200 ACTT
507 ACTC
* * ** * * ** * * *
184204 ATGCCTTCGAAAA-CTTTGTTACTTACTTTAAGTGGACTTATAA-CTTTATAAATGATTTTGAGT
1 ATGCCTT-TAAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATC-ATATAAATGATTTTAAAT
** * * * *** ** * **
184267 TGAATTGTTTTTGATTTTTGATTAAAA-TGCTCATAATTTAATATTT-CTATCGAGAAA-TATAA
64 AAAATTG-TTTTCATTTATGGTTAAAACAATTCATAATTGGATGTTTGC-ATTAAGAAACT-T-A
* * * * * * *
184329 AGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTTATACTTTCGAAAGCTTTGTT
125 AGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCAATTTATAGTCACTCATACCTTCAAAAGC-TTATT
* * * * * * *
184394 ACT-AGCTTTAAGTAGTTTTATAA-CTTTATAAATGATTTTAAGTTGAATTTTTTTTCATTTTTG
189 ACTCA-CTTTAAATA-TTTTATAATC-TTAGAAATGATTTTAAATTGAAATTCTTTTCATTTCTA
* ** * * *
184457 GTTAAAA-AGATCATAGTTTGATGTTT--AT-ATTAAACAATGTGAGGTAAAAGCAATCCATTGA
251 GTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAAC-A--TGAAGCAAAAGCCATCCATTGA
* * * * * * * *
184518 TAGGAAGAGTAC-A-TTATTCA-TCACTTATGCCTTCAAAAGCCTTGTTACTC-GCTTTAAGTGA
313 CAAGAAAAGT-CTATTTA-T-AGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTACTCATCTTTAAATGG
* * * * * *
184579 TTTTATAA-TCTTATAAATGATTTT-AAGTAAAAGTTCTTTTTATTTTTTGTTA-AACCAGATCA
375 TTTTATAACTCTTATAAATAATTTTAAAATTAAA-TTTTTTTTATTTCTAGTTAGAA-CA-ATCA
* ** * * * * * * * *
184641 CAATTTCTTGTTGGCATTGGGAAATATGAAGCGAAAA-TCATCTATTAACAAGAAAAGTCTATTT
437 TAATTTAATGTTTGCATTAGGAAACATGAAG-TAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTT
184705 -TAGTCACTC
501 ATAGTCACTC
* * * * * * * *
184714 ATGCCTTTTACAG--TTGAATTACTCTCTTTAAATAGTTTTAGAGTCTTATAAATAACTTTAAAT
1 ATGCCTTTAAAAGCCTTG--TTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCATATAAATGATTTTAAAT
* * * * * *
184777 CAAAATT-TTTTCATTTCTAGTTAAAATAAATCATAATTGAATGTTTGCATTGAGAAA-TATAAA
64 -AAAATTGTTTTCATTTATGGTTAAAACAATTCATAATTGGATGTTTGCATTAAGAAACT-T-AA
* * * * * * *
184840 GCAAAAGCTATCCATTGATAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCGGAAA-CCTAGTT
126 GCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCAATTTATAGTCACTCATACCTTC-AAAAGCTTA-TT
* * * *** * * * * *
184904 AATCACTTTGAGTGATTTTATAATCTTTTTAATGATTTGAAATAG-AATTTTATTTCATTTTTGG
189 ACTCACTTTAAAT-ATTTTATAATCTTAGAAATGATTTTAAATTGAAATTCT-TTTCATTTCTAG
* * * ** * ** **
184968 TTAAAACAAATCATAATTTGATTTTTGCAT-TGAGAAATGTAAAGCAAAAGTGATCCATTGGTAA
252 TTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAG-GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAA
* * * * * * * *
185032 GAAAAGT-TCATTTATAATCACTTATACCTTTAAAAGCATTGTTATTCA-CTTTAAATGATTTTA
316 GAAAAGTCT-ATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTACTCATCTTTAAATGGTTTTA
* * * * * ** * * * *
185095 T-AGTATTATAAATAATTTT-GAATTGAACTCTTTTCCATCTT-AAGTTAAAATAGATAATAATT
380 TAACTCTTATAAATAATTTTAAAATT-AAATTTTTTTTAT-TTCTAGTTAGAACA-ATCATAATT
** * * * * * * * **
185157 GGATGTTTGCATCAAG-AATA-GAATTTGAAAGTCATCCATTGACAATAAAAGTTAATTTATAGT
442 TAATGTTTGCATTAGGAAACATGAA-GTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGT
*
185220 TACTC
506 CACTC
* * * ** * * * *
185225 AAGCCTTTGAAAA-CCTTATTACTCACTTTAAGCAGATGTATAA-CTTTATAAATAATTTTAAAT
1 ATGCCTTT-AAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATC-ATATAAATGATTTTAAA-
* * * * ** * * *
185288 TAAATTTTTTTTCATTCT-TAGTTAAGA-AGCTCATAATTTGATG-TT-CATATCAAGAAAAGTA
63 TAAAATTGTTTTCATT-TATGGTTAAAACAATTCATAATTGGATGTTTGCAT-T-AAG-AAACTT
* ** * * * * *
185349 AAACAAAAGGAATCTATTCAAAAGAAAAGTTC-ATTTATAGTCACTCATAACTT-AGAAAGCTTT
124 AAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAA-ATCAATTTATAGTCACTCATACCTTCA-AAAGC-TT
* * * * * * * *
185412 GTTGCTCACTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAAATGTTTTTAAATTGAATTGTTTTTTCATTTT
186 ATTACTCACTTTAAATA-TTTTATAATCTTAGAAATGATTTTAAATTGAAAT-TCTTTTCATTTC
* * * * * * **
185477 TAGTTAAAACTGATCCTACTTTGATGTTTGCATCAAGAAACATGACGCGAAAGTTATCCATTGAC
249 TAGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGAC
* * * ** * * ** *
185542 AA-AAAA-TCTCCATTAATAGTCATTGATGCCTTTGAAAG-CTGTGTTA-TAAGATTTAAGTGGT
314 AAGAAAAGTCT--ATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCT-AGTTACTCATCTTTAAATGGT
* * * *
185603 TTTATAA-TCTTATAAATAATTTT-AAATT-TATTTTTTTTAATTTTTAGTTAAAACAAATCATG
376 TTTATAACTCTTATAAATAATTTTAAAATTAAATTTTTTTT-ATTTCTAGTTAGAAC-AATCATA
* * * * * ***
185665 ATTTATTTTTTACATT-GAAAAACGTGAAACGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTT-T
439 ATTTAATGTTTGCATTAG-GAAACATGAAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTAT
185728 AGTCACTC
503 AGTCACTC
* * * * * *
185736 ATACCTTCT-AAAGCCTTATTGA-TTGCTTTACAT-GATTTTATAAACAAATAAATGATTTTGAA
1 ATGCCTT-TAAAAGCCTTGTT-ACTCGCTTTAAATAG-TTTTATAATCATATAAATGATTTT-AA
* * * * * * * * **** * *
185798 TTGAATTCTTTTTTCATTTCTTGTTAAAACAAATCATAATTAGATGTTTGCACCGGGAGACATGA
62 ATAAAAT-TGTTTTCATTTATGGTTAAAACAATTCATAATTGGATGTTTGCATTAAGAAAC-TTA
** * * * * * * *
185863 AGTGAAAGCCATCCATTGATAAGTACAATGC-ATTTATAATTACTTATACCTTCGAAAG------
125 AGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAAT-CAATTTATAGTCACTCATACCTTCAAAAGCTTATT
* ** * * * * *
185921 ----AC--T-AGT-TGCT-T--GCTT-TAAATGATTTTAAATT-AAAAT-TTTTCATTTTTTGTT
189 ACTCACTTTAAATATTTTATAATCTTAGAAATGATTTTAAATTGAAATTCTTTTCATTTCTAGTT
* * * * * * * *
185972 AAAA-AGAACATAACTTGATGTTTGTATCAAGAAACGTGTAGCAAAAGCAATCCATTAACAAGAA
254 AAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAA
* * ** * * *
186036 AAGTCTATTTATATTCATTCATGCCTTTGAAAGCCTAGCTGCTTA-CTTTAAATGGTTTTATAA-
319 AAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTACTCATCTTTAAATGGTTTTATAAC
* * * * * * *
186099 TCTTATCAATGATTTT-AGATTGAA----TTTT-TTT-TAGTTAAAACAGATCAAAATTTATTGT
384 TCTTATAAATAATTTTAAAATTAAATTTTTTTTATTTCTAGTTAGAACA-ATCATAATTTAATGT
* ** * * * * * * *
186157 TTGCATCAAAAAACATAAAGCAAAAGCCATCCGTTAATAAGAAAAGTCTATTTATAGTCATTC
448 TTGCATTAGGAAACATGAAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTC
* * * * * *
186220 ATACCTTCAAAAGTCGTGTTACTTGCTTTAAGT-GTTTTTATAACTC-TATAAATGATTTTAAAT
1 ATGCCTTTAAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAATAG-TTTTATAA-TCATATAAATGATTTTAAAT
* * * * * * * * *
186283 -GATTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAA-AGA-ACATAATTTGATATTTGTATTGAGAAACATTAAG
64 AAAATTGTTTTCATTTATGGTTAAAACA-ATTCATAATTGGATGTTTGCATTAAGAAAC-TTAAG
* * ** * * * * * *
186345 CGAAAGCAATTGATTGACAAGTAAAATCCATTTATTGTAACTCTTGCCTT-ATAAAGAC-TAGTT
127 CAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCAATTTATAGTCACTCATACCTTCA-AAAG-CTTA-TT
* * * * * * *
186408 GCTTGA-TTTAAATAGTTCTATATTCTTATAAATGATTTTAAATT-AAATT-TTATTTATTTTTT
189 AC-TCACTTTAAATA-TTTTATAATCTTAGAAATGATTTTAAATTGAAATTCTT-TTCA-TTTCT
* * * * * ** *
186470 A-TTAAAATAGATCATAATTTGATGTTTACAGTGA-GAAACGTGAAGCAAGA-CCAATATAGTGA
250 AGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCA-TCAGGAAACATGAAGCAAAAGCC-ATCCATTGA
* * * * * * * *
186532 TAATAAAAGTCCT-TTTATAGTTACTCATACCTTTGAAAA-CCAACTTAGT--TGCTTTAAATGG
313 CAAGAAAAGT-CTATTTATAGTCACTCATGCC-TTCAAAAGCCTAGTTACTCAT-CTTTAAATGG
* * * * * * * * * *
186593 TTTTATAA-TCCTACAAATGATTTT-AAGTTGAATTGTTTTAATTT-TACTTAAAATACATCATA
375 TTTTATAACTCTTATAAATAATTTTAAAATTAAATTTTTTTTATTTCTAGTTAGAACA-ATCATA
** * * ** * * * * *
186655 ATTTGTTGTTTTCA-TCGAGAAATGTGAAGCGAAAA-CCATTCATT-AGTAACAAAAGTCCATCT
439 ATTTAATGTTTGCATTAG-GAAACATGAAG-TAAAAGCCATCCATTGA-CAAGAAAAGTCCATTT
* *
186717 AAAGTCATTC
501 ATAGTCACTC
** * * * * *
186727 ATGCCTTCT-AAAGCCTCATTACAT-GCTTTATATGGGTTTATAATC-TAATAAATAATTCTAAA
1 ATGCCTT-TAAAAGCCTTGTTAC-TCGCTTTAAATAGTTTTATAATCAT-ATAAATGATTTTAAA
** * * * * * * **
186789 TTGAATTGATTTT-ATTTTTGATTCAAACAAATCCTAATT-TATTGTTTGCATTATTAAA-TGTG
63 TAAAATTG-TTTTCATTTATGGTTAAAACAATTCATAATTGGA-TGTTTGCATTAAGAAACT-T-
* * * * * *
186851 AAG-AGAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATATCGTCAAAAGTCTAA
124 AAGCA-AAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCAATTTATAGTCACTCATACCTTCAAAAG-CTTA
* * * * *
186915 TTGCTTACTTTAAATA--GTAT--TCTT-GTAAATAATTTTAAATTG-AATTTTATTTCATTT-T
187 TTACTCACTTTAAATATTTTATAATCTTAG-AAATGATTTTAAATTGAAATTCT-TTTCATTTCT
* * * * * ** *
186973 GGGATAAAAGAGATCATAATTTGATATTTTCA-CTAAAAAACATGAAACAAAAGCCATCCATTGA
250 -AGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATC-AGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGA
* * * * * *
187037 CAAGAAAAGTCTATTTATAGTTATTCACAG-CTGCGAAAGCCTAATTACTCA-CTTTAAATGGTT
313 CAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCA-TGCCTTCAAAAGCCTAGTTACTCATCTTTAAATGGTT
* * * * * * **
187100 TTAT-AGTCTTATAAGAGAA-TTT-GAATTAAAATTTTTTTCAATTT-TGGTTAAAACAGATTTT
377 TTATAACTCTTATAA-ATAATTTTAAAATT-AAATTTTTTT-TATTTCTAGTTAGAACA-ATCAT
* * * * * * * *
187161 AATTGAATGTTTGCATTAGGAAACATAAAGCAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTGCACTCAT
438 AATTTAATGTTTGCATTAGGAAACATGAAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTAT
*
187226 AGTTACTC
503 AGTCACTC
* ** * *
187234 ATGCATTCGAAAGCCTT-TTACTCGCTTTAACT-GATTTTATAA-CTTTATAAATGATTTTAAAT
1 ATGCCTTTAAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAATAG-TTTTATAATC-ATATAAATGATTTTAAAT
* * ** * ** * *
187296 TAAATTGTTTTCATTTTTTATTAAAA-AATATCATCATTTTATGTTTGCATCTTA-AAACGTGAA
64 AAAATTGTTTTCATTTATGGTTAAAACAAT-TCATAATTGGATGTTTGCAT-TAAGAAAC-TTAA
*** * * * * * *
187359 GCAAAAAAAAATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATATTCACTCATGCCTTTGAAAA-CTTGGT
126 GC-AAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCAATTTATAGTCACTCATACC-TTCAAAAGCTT-AT
** * * * * ** *
187423 TACTCGGTTTAAATTGTTTTATAGTCTTATAAATGATTTTGAATCAAAATTTTTTTCATTTCT-G
188 TACTCACTTTAAA-TATTTTATAATCTTAGAAATGATTTTAAATTGAAATTCTTTTCATTTCTAG
* * ** *
187487 ATTAAAATCA-ATCATAA-TTGAATGTTTGTATCAAG-AACTAT-ATAGTGAAAGCTATCCATTG
252 -TTAAAA-CAGATCATAATTTG-ATGTTTGCATCAGGAAAC-ATGA-AGCAAAAGCCATCCATTG
* * * ** * * * *
187548 ATAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATACTTTTGAAAGCCTAGCTGCTTA-CTTTAAATGATT
312 ACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTACTCATCTTTAAATGGTT
* ** * * * * *
187612 TTATAA-TCTTATAAATGATTTT-AAATTTTATTGTTTTCATTTTTAGTTAAAATAAATCATAAT
377 TTATAACTCTTATAAATAATTTTAAAATTAAATTTTTTTTATTTCTAGTTAGAA-CAATCATAAT
* * * * * * * *
187675 TTACTGTTTGCATCATGAAACATGAAGCT-AAAGCTA-CTCGTTGATAAGAAAAGTCTATATATA
441 TTAATGTTTGCATTAGGAAACATGAAG-TAAAAGCCATC-CATTGACAAGAAAAGTCCATTTATA
* *
187738 ATTACTC
504 GTCACTC
* * *
187745 ATGCCTTAAAAAGCCTTGTTACTCACTTTAAGTA-TCTTTATAATTC-TATAAATGATTTTAGAA
1 ATGCCTTTAAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAATAGT-TTTATAA-TCATATAAATGATTTTA-AA
* * * * * * * *
187808 TGAATTTCTCTTTCATTTTTGGTTAAAA-AGA-TCATAATTTGATGTTTGTATTAGGAAACATGA
63 TAAAATTGT-TTTCATTTATGGTTAAAACA-ATTCATAATTGGATGTTTGCATTAAGAAAC-TTA
* *** * * * * * ** **
187871 AGTAAAAATAATCTATTGACAAGTAAAATCCATTTATAGTAACTCATGCCTTTGAAAGAATAGTT
125 AGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCAATTTATAGTCACTCATACCTTCAAAAGCTTA-TT
* ** * * ** * * *
187936 GCTTGCTCTAAATGGTTTTATAATCTTATCAATGATTTTAAATTG--ATTTTTTTTATTT-TGGT
189 ACTCACTTTAAAT-ATTTTATAATCTTAGAAATGATTTTAAATTGAAATTCTTTTCATTTCTAGT
* * * * * *
187998 TAAAATAGATCATAATTT-ATTTTTTGCAT-TGAGAAACATGAAGCCAAAGCCATTCATTGAGAA
253 TAAAACAGATCATAATTTGA-TGTTTGCATCAG-GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAA
* * * * * *
188061 GAAATGTCAATTTATAGTTACTCATGCCTTTGAAAAGCCTA-TTAACT--TGCTTTATATTGTTT
316 GAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCC-TTCAAAAGCCTAGTT-ACTCAT-CTTTAAATGGTTT
* * * * ** * * * *
188123 TGT-AGTCTTCTAAATGATTTTAAGCTAAAATTGTTTTCATTTCTAGTTAAAACAGATCATAA-T
378 TATAACTCTTATAAATAATTTTAAAATTAAATTTTTTTTATTTCTAGTTAGAACA-ATCATAATT
** ** * * * * * * *
188186 TAGATGTTTGCATTAAAAAAGGTAAAGCAAAAGCCATCTACTGACAAGAAAAGTTCAATTGTAGT
442 TA-ATGTTTGCATTAGGAAACATGAAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGT
* *
188251 CATTT
506 CACTC
** * * * * * * * *
188256 ATGCCTTCGAAAG--ATGTT--T-GCATCAAAGAAG--GTA-AAGCA-A-AAGTCATCTATTAAC
1 ATGCCTTTAAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAA-TAGTTTTATAATCATATAAATGAT-T-TT-A-
* * * ** * * *
188311 AAGAAAAGTCCAAT-TTTAGTCATTTATGCATTCGAAAGCCTTGTTACTAGTTTTAAGTGATTTT
61 AATAAAA-T----TGTTT--TCATTTATG-GTT--AAAACAAT-TCA-TA--ATT--G-GATGTT
* * * **** * * * *
188375 ATAACTTTATA-AATTATTTAA--AATTGAATTTTTTTTCCATTTTTGATACGTAAAGT-AA---
109 -T-GCATTA-AGAA--ACTTAAGCAA---AA---GCCATCCA---TTGACAAGAAAAATCAATTT
* *** * * * * * *
188433 A-AG---C-CAT-CCATTCACAAGAAAAAT-CT-A-TCT--ATA-TTCACTCATTCCTAATAAAT
160 ATAGTCACTCATACC-TTCAAAAGCTTATTACTCACTTTAAATATTTTA-T-AAT-CTTAGAAAT
* * * * * * * * * * *
188486 TATTTTAAATTTAATTTATTTTTATTTTTGGCTCAAAACAAATTATAATTTGTTGTTTGCAT-AG
221 GATTTTAAATTGAAATTCTTTTCATTTCTAG-TTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAG
* * * * ** **
188550 TGAAACATGAAGCGAAAGCCATCTATTGACAAGAAAAATCTATTTATAGTCATTCATGTGTTTGA
285 -GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAA
* * * * * * *
188615 AAGCCTAGTT-GTCCA-CTTTAAATAGCTTTATAA-TCTTAGAATTGATTTT-AAATTGAATTTT
349 AAGCCTAGTTACT-CATCTTTAAATGGTTTTATAACTCTTATAAATAATTTTAAAATTAAATTTT
* * * * * * * * ** ***
188676 ATTTCATTTTTGGTTAAAACATATCATAACTTGATTTTTACATT-GAGAAACGCGAAACGAAAGC
413 -TTTTATTTCTAGTTAGAACA-ATCATAATTTAATGTTTGCATTAG-GAAACATGAAGTAAAAGC
** * * **
188740 CATTTATTGACAAGAAAAGTTCATTTA-AATCA-AA
475 CATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTC
* ** *** ** * * ** *
188774 AT--TTTTTCATTTC-TGATTAAAAC-ATATCAAAATTGGATGTTTTCATTGGCAAACTTGGTGT
1 ATGCCTTTAAAAGCCTTG-TT-ACTCGCT-T-TAAA-T--A-GTTTT-A-T----AA--TCATAT
* * * * * * *
188835 GAAA-GCCATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATTGTCACTCATGCCTTTAAATGCTTATTTAC
50 -AAATG--AT---TTTA-AATAAAA---T-TGT-TT-TCATTTATG--GTTAAA-AC--A---A-
** * * * * * *** *
188899 TCGTTTTAAAT-GATTTTATAGTC-TTATA-AATGATTTTAAATC-AAA--CTTGTTTTTGTTTC
93 T--TCATAATTGGATGTT-T-G-CATTA-AGAA--A-CTT-AAGCAAAAGCCAT-CCATTG--AC
* * * * * *
188958 TAGTTAAAACAGATC-ATGTTGCAT-GTTTTCA-TCGAGAAACGTGAAGCAAAAGC-TATCCATT
145 AAG---AAA-A-ATCAAT-TT--ATAG---TCACTC---ATACCT---TCAAAAGCTTAT-TACT
* ** * * * * * * **
189019 GACATGAAAAGTCCACTTATAGTCACTCATGCCTTTA-AAAAGCCTTGTTACTCACTTTAAGTGG
192 CAC-TTTAAA-T--A-TT-T--T-A-TAAT--C-TTAGAAATG-ATT-TTA---AATTGAAATTC
* * ** ** ** ** * * * * * *
189083 TTTACTAATTTTATAAATGATTTTAATTGAATTGTTTTTTTAT-TTTTCATTA-AAAATATTATA
239 TTT--TCA-TTTCT--A-G-TTAAAACAG-ATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACA-T-GA
**** * ** * ** * * * *
189146 ATTTGATGTTTGTATCGACGAATGTGAAGCACAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCGACTTATA
294 AGCAAAAG---CCATC--C-ATTGACAAG-AAAAG---TCTATT--T----ATAGTC-ACTCAT-
* * *
189211 G---TCAATCATGCCTTTAAAAGCCTAGTTACTCA-CTTTAAATAGTTTTATAACT-TCATAAAT
341 GCCTTCAA--AAGCC----------TAGTTACTCATCTTTAAATGGTTTTATAACTCTTATAAAT
* * * * * *
189271 GATTTT--AATTGAATTGTTTTTTTATTTCTTGTTA-AAAAGATCATAATTTGAA-GCTTGTATT
394 AATTTTAAAATT-AAAT-TTTTTTTATTTCTAGTTAGAACA-ATCATAATTT-AATGTTTGCATT
* * * * * * *
189332 AGGAAACTTGATGTGAAAGCAATCCATTAACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCAGTC
455 AGGAAACATGAAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTC
* * * * * * * * * *
189388 ATGCCTTTGAAAGCCTAGCTGCTTGCTTTAAAT-GCTTTTATATTCTTATAAATGACTGTAAATT
1 ATGCCTTTAAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAATAG-TTTTATAATCATATAAATGATTTTAAATA
* * * ** * * * * * *
189452 GAATTATTTTTCATTTTTGGTTAAAGTAGA-CCATAATT-TATTATTTACATTAGGAAACATGAA
65 AAATT-GTTTTCATTTATGGTTAAAACA-ATTCATAATTGGA-TGTTTGCATTAAGAAAC-TTAA
* * * * * * * * *
189515 GTAAAAGCCAACCATTGACAAG-AAAGTCAATTTAAAGTCACTTATGCTTTCAAAATCCTTGTTA
126 GCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCAATTTATAGTCACTCATACCTTCAAAA-GCTTATTA
* *** * * * * * *
189579 CTCGCTTTAAGCGGTTTTA-AAACTTTATAACTGA-TTTCAATTG-AATT-TTTTCCATTTTTGG
190 CTCACTTTAA-ATATTTTATAATC-TTAGAAATGATTTTAAATTGAAATTCTTTT-CATTTCTAG
* * ** ** *
189640 TTAAAA-AGATCATAATTTGATGTTTGTATTAGGAAATGTGAAGTGAAAGCTATCCATTGACAAA
252 TTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGAC-AA
* * * * ** * ** * * ** * *
189704 AAAAAATCCACTTATAGTCGTTCATGCCTTTGAAAA-CCTTTTTACTTA-GTTTAGGTAGTTTTT
316 GAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCC-TTCAAAAGCCTAGTTACTCATCTTTAAATGGTTTTA
* * * *
189767 TAACT-TTATAAATGATTTT-AAGTTAAATTATTTTTTTATTTTTAGTTA-AAAAGATCATAATT
380 TAACTCTTATAAATAATTTTAAAATTAAA-T-TTTTTTTATTTCTAGTTAGAACA-ATCATAATT
* * * ** * * *
189829 TCAA-GTTTGTATTAGAAAACTTG-AGTCAAAAGTAATCTATTGACAAGAAAAGTCTATCTATAG
442 T-AATGTTTGCATTAGGAAACATGAAGT-AAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAG
* *
189892 TCATTT
505 TCACTC
* * * * *
189898 ATGCCTTTGAAAGCCTAACTGTT--T-GTTTTAAATAGTTTTATATTCTTATAAATAATTTTAAA
1 ATGCCTTTAAAAGCCT---TGTTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCATATAAATGATTTTAAA
** * * * * * * * *
189960 TTGAATTGTTTTTCAGTTT-TTGTTAAAACAGATT-AGAATTTGTTGTTTGTATTAGGAAGCATG
63 TAAAATTG-TTTTCA-TTTATGGTTAAAACA-ATTCATAATTGGATGTTTGCATTAAGAAAC-TT
* * * * *
190023 AAGCAAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTTC-ATTTGTAGTCACTCATATCTTCGAAAA-CTGA
124 AAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAA-ATCAATTTATAGTCACTCATACCTTC-AAAAGCTTA
* * * * * ** ** *
190086 GCTACTCATTTTAAATAGTTTTATAGTCTTATAAAT-ATTTTCAATCAAAAATT-TTTTTGTTTT
187 -TTACTCACTTTAAATA-TTTTATAATCTTAGAAATGATTTTAAAT-TGAAATTCTTTTCATTTC
* * * ** * * *
190149 TAGTTAAAACTGAACATAATTGGATGCTTT-CATTGGGAAACGTGAAGCAAACGCCATCTATTGA
249 TAGTTAAAACAGATCATAATTTGATG-TTTGCATCAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGA
* * * * * * * * **
190213 TAAGAAAAGTCTTTTTATAGTCATTCATGTCTTCGAAAGCCTAATTACTC-GCTTCAAATAATTT
313 CAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTACTCATCTTTAAATGGTTT
* * * ** ** * * *
190277 TAT-AGTCTTATAAATGA-TTTCAAATCGAATTCATTTTATTTTTGGTTA-AACCATATCAAAAT
378 TATAACTCTTATAAATAATTTTAAAATTAAATTTTTTTTATTTCTAGTTAGAA-CA-ATCATAAT
** *** * * * ** *
190339 TGGATGTTTTTGTCAAGAAATATGAAGCGAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATTA-
441 TTAATGTTTGCATTAGGAAACATGAAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTA-TAG
* *
190403 TTACTT
505 TCACTC
* * ** * **
190409 ATGCCTTGAAAAACCTTGACACTAG-TTTAAGCAGTTTTACT--T--TATAAATGATTTTAAAT-
1 ATGCCTTTAAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAATAGTTTTA-TAATCATATAAATGATTTTAAATA
* * * * * * * * * * *
190468 TATTTTTTTTTATTTTTGGTTAAAACAGA-TCATAATT-TATTTATTACTTTAGGAAACATGAAG
65 AAATTGTTTTCATTTATGGTTAAAACA-ATTCATAATTGGATGT-TTGCATTAAGAAAC-TTAAG
* * * * ** * ** * * *
190531 CAGAAGTCATCTATTGATAAGAAACGTCTATTTATAGTCACTCATGTCATGAAAATCCTTATTAC
127 CAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCAATTTATAGTCACTCATACCTTCAAAA-GCTTATTAC
* * * * * * * *
190596 TTACTTTAAGTAGTTTTATAA-CTTTATAAATGATGTTAAATAGAATTTTTTTTCATTTTTAGTT
191 TCACTTTAAATA-TTTTATAATC-TTAGAAATGATTTTAAATTGAAATTCTTTTCATTTCTAGTT
* ** ** **
190660 AAAA-AGATCATAATTTGTTGTTTATATC-GAGAAACATGAAGTGAAAGTAATCCATTGACAAGA
254 AAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAG-GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGA
** * ** * * *
190723 AAAGTCTATTTATAGTCTTTCATGTCTTTGAAAGCCTAGTT-GT-TTGCTTTAAATAGTTTTAT-
318 AAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTACTCAT-CTTTAAATGGTTTTATA
* * * * * **
190785 ATTCTTATAAATAATTTT-AAATTGAATTTTTTTTCTTTTTTGTTAAGTAA-AA-CATAATTGGA
382 ACTCTTATAAATAATTTTAAAATTAAATTTTTTTTATTTCTAGTT-AG-AACAATCATAATTTAA
* * ** * * * *
190847 TGTTTGCATAAGGAAATATGAAGCGAAAGCCCTCCATTAACAAGAAAAGTCAATTTCA-AGTCAT
445 TGTTTGCATTAGGAAACATGAAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTT-ATAGTCAC
190911 TC
509 TC
** * * * * * * * * *
190913 ATGCCTTCGAAAGTCTTATTTCCTCACTCTAAGTGGTTTTATAA-CTTTATAACTGATTTTAAAT
1 ATGCCTTTAAAAGCCTT-GTTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATC-ATATAAATGATTTTAAAT
** * * * * * * * *
190977 -TGATTTTTTTTATTTTTTGTTAAAA-AGA-TCATAATTTGATGTTTGTA-TAGGAAAACGTGAA
64 AAAATTGTTTTCATTTATGGTTAAAACA-ATTCATAATTGGATGTTTGCATTAAG-AAAC-TTAA
** * * * * * *
191038 GTGAAAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGAT-ACCCAT-GCTATCAAAAGCCTAGT
126 GCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCAATTTATAG-TCACTCATACCT-TCAAAAGCTTA-T
* ** * * * * * * * * *
191101 TGCTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAAT-AGTTTATATTG-ATTTTTTTTAATTTTTGG
188 TACTCACTTTAAAT-ATTTTATAATCTTAGAAATGATTTTAAATTGAAATTCTTTTCATTTCTAG
* * * * * * ** * *
191164 TTAAAA-AGATCATACTTTGATGTTTGTAT-AGAGAAACGTAAAACGAAAGGAATCTATTGATAA
252 TTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAG-GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAA
* * * * * *
191227 GAAAAGT-TCATTTATAGTCATTCATACCTTCGAAAGCCTTGTTA-T-TTGCTTTAAGTGGTTTT
316 GAAAAGTCT-ATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTACTCAT-CTTTAAATGGTTTT
* ** * *
191289 ATAACT-TTATAAATTATTTT-AAATTGTATTTTTTTCCATTT-T-GCTTTA-AA-ATATCACAA
379 ATAACTCTTATAAATAATTTTAAAATTAAATTTTTTT-TATTTCTAG--TTAGAACA-ATCATAA
* * * * * *
191348 TTTAATGTTTGTATAAAGAAACATGAAGTAAAAG-TAGTTCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATA
440 TTTAATGTTTGCATTAGGAAACATGAAGTAAAAGCCA-TCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATA
191412 GTCA-TGC
504 GTCACT-C
* ** * * ** * * ** * *
191419 ATGCCTTTTAAAGCCTAATTGCTCACTTCGAGTGGGTTTGCT-ATCTTATAAATGATTTTAAATT
1 ATGCCTTTAAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAAT-AGTTTTATAATCATATAAATGATTTTAAATA
* * * * * * *
191483 GAATTATGTTTCATTTTTGGTTAAAATAGA-T-ATAATTTGTTG-TTGCATTGAGAAA-TGTACA
65 AAATTGT-TTTCATTTATGGTTAAAACA-ATTCATAATTGGATGTTTGCATTAAGAAACT-TA-A
* * ** ** *
191544 GCGAAAA-CTATCCATTGACAAGAAAAGTTTATTTATAGTCACTCATACCTTTGAAAGCCTAATT
126 GC-AAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCAATTTATAGTCACTCATACCTTCAAAAG-CTTATT
* * **
191608 ACTCACTTTAATTGATTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATCAAAATGT-TTTTCCATTTCTA
189 ACTCACTTTAAAT-ATTTTATAATCTTAGAAATGATTTTAAATTGAAAT-TCTTTT-CATTTCTA
* * * ** *
191672 GTTAAAACAAATCATAATTGGATGTTTGCATCAAGAAATGTGAAGCAAAAGCCATCTATTGACAA
251 GTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAA
* * * * * * * * * *
191737 GTAAAGT-TCATTTATACTTACTTATACCTTCGAAAATCTTA-TTAGTC-GCTTTAAGTGG-TTT
316 GAAAAGTCT-ATTTATAGTCACTCATGCCTTC-AAAAGCCTAGTTACTCATCTTTAAATGGTTTT
* * * *
191798 ATAACT-TTATAAATGACTTT-AAATTGAATTTCTTTTTTCAGTTT-TGGTTA-AA-AAGGTCAT
379 ATAACTCTTATAAATAATTTTAAAATT-AAATT-TTTTTT-A-TTTCTAGTTAGAACAA--TCAT
* * * ** *
191858 AATTTGATGTTTGTATTAGGAAACATGAAGTGAAAGTAATCCATTGACAA-AAACA-TTCATGGT
438 AATTTAATGTTTGCATTAGGAAACATGAAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAA-AGTCCAT--T
* *
191921 TAAAACAGATCA-TG
500 T---ATAG-TCACTC
** * * * ** * * *
191935 AGTGGATATTGGCATCAGAAAACATGAAAAGAAAGCTCTCCATCGATAAGAAAAGTCCGTTTATA
1 A-T-G-CCTT----T-A-AAAGCCT----TGTTA-CTC-GC-T---TTA-AATAGT---TTTATA
* * * * * ** * *** * * *
192000 GTCA-CT-CATGCCTCTTAAAGCCAAGTTACATGC-TTTAAATGGTTTAATAGCCCTATAT-ATA
43 ATCATATAAATG-ATTTTAAA-TAAAATTGTTTTCATTT--ATGG-TTAA-A--ACAAT-TCATA
* * ** * * * * *
192061 ATTTGAAATCAAATTTTTTTTTATTTCTAATTAAAAC-AAATCATAATTTGATGTTTGCAT-TAT
99 A-TTG------GA--TGTTTGCA--T-TAA--GAAACTTAAGCA-AA----A-G---CCATCCAT
** * * ** *
192124 AAACGTGAAGTGAAAGCCATTCATTGGCAAGATAAGTCTATCTATATTAACTCATGTCTTCTAAA
141 TGAC---AA--GAAA---A---AT---C-----AA---T-T-TATAGTCACTCATACCTTCAAAA
* * ** ** * * *
192189 GCTAAATTACACACTTTAAATGATTTTATAGCCTTATAAATGATTTTAAA-TCAAATTTTTTTTC
182 GCT-TATTACTCACTTTAAATATTT-TATAATCTTAGAAATGATTTTAAATTGAAA-TTCTTTTC
* ** ** * ** *
192253 ATTTCTGGTTAAAGTAGATCATAA-TTGTATGTTTGTGTC-GAGAAACTTGAAGTGAAAGCTAGT
244 ATTTCTAGTTAAAACAGATCATAATTTG-ATGTTTGCATCAG-GAAACATGAAGCAAAAGCCA-T
* * * ** * * ** *
192316 -TATTGGCAAAAAAAGGTCCGTCTATAGTCACTCATGTCTTTTAAAGCCTTA-TTGCTCA-CTTT
306 CCATTGACAAGAAAA-GTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCC-TAGTTACTCATCTTT
* * * * * *
192378 AAATAGTTTTCTAA-ACTAATAAATAATTTT-AAATTGATTTTTTTTTAGTTT-TAGTTCA-AAC
369 AAATGGTTTTATAACTCTTATAAATAATTTTAAAATTAAATTTTTTTTA-TTTCTAGTT-AGAAC
** * * * * * *
192439 AGATCATAATTTGTTGTTTACATCAAGAAACATAAAGCAAAAGCCA-CCATT-AGTAAGAAAAGT
432 A-ATCATAATTTAATGTTTGCATTAGGAAACATGAAGTAAAAGCCATCCATTGA-CAAGAAAAGT
192502 CCATTTATAGTCACAT-
495 CCATTTATAGTCAC-TC
* * ** * * * *
192518 ATG-CTTTCGAAAGCCTTTTTACTTACTTTAAGT-GATTTTATTATTATATAAATGATTTTGAAT
1 ATGCCTTT-AAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAATAG-TTTTATAATCATATAAATGATTTT-AAA
*** * * ** * * ** *
192581 TGATTTTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAGTAGA-TCATAATTTGATATTCACATTAAGAAACATGA
63 T-AAAATTGTTTTCATTTATGGTTAAAACA-ATTCATAATTGGATGTTTGCATTAAGAAAC-TTA
*** ** * * * * * * *
192645 AGTTCAAGCCATTGATTGGA-AGGAAAAGTCAATTTATAGTCACTAATGCCTTTAAAAACCTTGT
125 AGCAAAAGCCATCCATT-GACAAGAAAAATCAATTTATAGTCACTCATACC-TTCAAAAGCTTAT
** * * * * * * *
192709 TACTCGTTTTAAGTGGTTTGATAA-CTTTATAAATGATTTTAAATTG-AATTGTTTTTATTTTTA
188 TACTCACTTTAAAT-ATTTTATAATC-TTAGAAATGATTTTAAATTGAAATTCTTTTCATTTCTA
* * * ***** * * * * *
192772 GTTAAAGCAG---ATAATTT-AT-ATGGC--CA--CCTTTTG-GGC-CAATCACATTTC-GTG-C
251 GTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACATGAAGCAAAAGC-CA-TCCATTGAC
* **** * * * * * ** * *
192824 ACATATTTTTCCTTTGTTTTCATTTGGCCACCCTCATAAACCAATCAAAATAC-ATGCATT-TTT
314 A-AGAAAAGT-C--T-ATTT-A--TAGTCA--CTCAT--GCC-TTCAAAAGCCTA-G--TTACTC
* ** * * * ** * * * ** *
192887 ATTCCTTT-TATTTTATTTGTCCAC-CTTGCCATCCAATGGTGCTT--CATGCACCAATTTCCTC
363 A-T-CTTTAAATGGT-TTTAT-AACTCTT---AT-AAATAAT-TTTAAAAT-TA--AATTTTTTT
* * * * * * * **** *** **
192948 TCTTGTCCATCGGTCTA-ATATCTATCCTCTATTT-A--TTT-CAATCACCGCCTTAT-TCCTCC
416 TATT-T-C-T-AGT-TAGA-A-CAATCAT-AATTTAATGTTTGC-ATTA-GGAAACATGAAGTAA
* * ** **
193007 AA-TCA-CCTTTGATGCACA-AATTTTATTTTATATTTTATTAAGTCATTCTTC
471 AAGCCATCCATTGA--CA-AGAA----A-AGTCCA-TTTA-T-AGTCA--C-TC
** * * * * * *** ** *
193058 AAACCATTCAAGACA-CATGTATCTATGTCCCCTTTTCCTCA-TCTGGCCACTTAATGCA-CT-A
1 ATGCC-TTTAA-A-AGCCT-TGT-TA-CT-CGCTTTAAAT-AGT-T--TTA--TAAT-CATATAA
** * * * ** *** * * *
193119 ATCCCTTTT-CATGCAAACA-AGTTTAAGCCTATCTT-TCCTT--TTTATTTCACATGATGGGGG
52 AT-GATTTTAAAT--AAA-ATTGTTT---TC-AT-TTATGGTTAAAACAATT--CATAAT--TGG
* * **** ** *** * * * * * *
193179 CCCCACATGTTCTCCACTAACTTCCTCTTTGTTGCATGCCA-CCATTTACATGTAATAGTGAATT
104 ------ATGTT-TGCATTAAGAAACT-TAAG-CAAAAGCCATCCATTGACAAG-AAAAATCAATT
* * * * ** * * *
193243 T-TACATGCACATCTTATTATC-TCACATAATC-TA--ACTTC-GTTTAGTTAGTTAATGCCCA-
159 TATA-GT-CAC-TC--A-TACCTTCA-A-AAGCTTATTAC-TCACTTTAAATATTTTAT---AAT
** * ***
193301 CTTAGCTTCAAAT-A-TTGCAATTGCACATAGGTCCTCAACTTTTCCTTATTTACCA-TT-TGTC
212 CTTAG----AAATGATTTTAAATTG-A-A-A--T--T---CTTTT-C--ATTT-CTAGTTAAAAC
** * * ** ** * * * ** ** * ****
193362 CCACCA-AACTTTTCAT-TCTTGCAATTTGG-TCCTTCAATC---A--TTTCTTTTAACTTCCAA
259 AGATCATAA--TTTGATGT-TTGC-ATCAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAA
** * ** * * * ** ** * * ** * * **
193419 TTTC-CTTT-TA-TCTTTC-TTCCATT-ACATGTGTA-AAAATAAAATATCAA---TTTT-GCAC
320 AGTCTATTTATAGTCACTCATGCC-TTCAAAAGCCTAGTTACTCATCTTTAAATGGTTTTATAAC
* ** * **** ** * ** * *
193474 T-TCACCAA-AATGTCGTCA-TAATATTTAAATATATATT-TACCT-G--C--TCTTACTTT-A-
384 TCTTATAAATAATTTTAAAATTAA-ATTT-TTTTTAT-TTCTAGTTAGAACAATCATAATTTAAT
** * * * * * * ** *** *
193528 --TTAAATAAAGACACATGGACCCCACT-TATGCCAT---TTTTCTTTAAAA-TTCATTCT-TAT
446 GTTTGCATTAGGAAACAT-GA----AGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATT-TATA-
* *
193585 TTCTTCTC
504 GTC-ACTC
** * * * * * * * *
193593 -CCCCACTTAGATTAG--TTATATACTC-CTCCTTCATGACTAATTTCAATCA-CAGATAAA--A
1 ATGCC-TTTA-A-AAGCCTTGT-TACTCGCT--TT-A--AATAGTTT-TATAATCATATAAATGA
* ** * * * * * ** **
193651 TATT-AAT-ATTTTAATATT-ATTTTAT--TT--CACAATCCTC-CACTT-GACTCCTTGGGTTA
56 TTTTAAATAAAATT-GTTTTCA-TTTATGGTTAAAACAAT--TCATAATTGGA-TGTTTGCATTA
** *** ** * ***** * * * *
193707 CA-AAA-TGT-CTCACTTGTCC--CGGTTCACTTTCGAATTGC-TTTTATCATGCCAATTCAT-C
116 -AGAAACT-TAAGCAAAAG-CCATCCATTGACAAGAAAAAT-CAATTTAT-A-GTC-ACTCATAC
* * * * * * *
193765 C-TCGATAAA--ATATTA-TTA-TTTAATTATCTTGTCCTCA-CATACGAAAT-ATTTT--ATTC
174 CTTC-A-AAAGCTTATTACTCACTTTAAATAT-TT-T-ATAATCTTA-GAAATGATTTTAAATTG
** * * ** * * *
193821 AAA-AATATTC--TT-T--TT---GCCTATCACT-ACTT--T-TTTGCACTTA--AATTTACATC
233 AAATTCTTTTCATTTCTAGTTAAAACAGATCA-TAATTTGATGTTTGCA-TCAGGAA---ACATG
* * ** ** * * * * ***** *
193871 CATC-AACCCTCTATCTCATTGATTAG---A-TC-A--TATTGGCACTTATTCGAGGGTAAAG-G
293 AAGCAAAAGC-C-ATC-CATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGC-CTTCAAAAGCC
* * * *** *
193927 T-GTTACAATCTAT-TGATAATAAATGTTTATTTATAGTCACTTATGCCTTCGAACGCCTAGTTA
354 TAGTTAC--TC-ATCT--T--TAAATG-GT-TTTATA-ACTCTTAT-AAAT--AA----T-TTTA
*** ** * ** * * **
193990 CTTTCTTGAAATAGTTTATAATGTTATTAATGATTTTAGAACTAA--ATTTTTCTCATTTTTGGT
401 --AAATT-AAAT--TTT-T--T-TTATTTCT-A-GTTAGAAC-AATCATAATT-TAATGTTTGCA
* * * ** * * *** * *
194053 TTA-AATAGATTTTTATTTGATGTTGGAATCAAAAAATATGA-ATCGAAAGCCATCCATTGATAA
453 TTAGGA-A-A----CA--TGAAG-TAAAAGCCATCCAT-TGACA-AGAAA---AG----------
*
194116 GAAAGGTCCATTTATAGTCACTT
494 ------TCCATTTATAGTCACTC
* ** ** * * *
194139 ATGCTTTTGAAAA-CCTAATTACTTACTTTAAATGGTTTTA-AAGACATACAAATGATTTTAAAT
1 ATGCCTTT-AAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAA-TCATATAAATGATTTTAAAT
* * * * * * * * * * ** *
194202 CAATTCTTTTTTCATTTCTAGTCAAAA-TATACTATAATTAGATGCTTGCATCGAGAAACATGAA
64 AAAAT-TGTTTTCATTTATGGTTAAAACAATTC-ATAATTGGATGTTTGCATTAAGAAAC-TTAA
* * * ** * * *
194266 GCAAAAGCAATCCATTAATAA-AAAAAGTTC-ATTTATAGTTTCTCATGCCTTCGAAAGCCTATT
126 GCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAA--TCAATTTATAGTCACTCATACCTTCAAAAGCTTA-T
* * * * * * * * *
194329 TGCTCATTTTAAATAGTTTTCTAAT-TCTATAAGTAATTTTAAATTGAACTTTTTTTCATTTTTA
188 TACTCACTTTAAATA-TTTTATAATCT-TAGAAATGATTTTAAATTGAAATTCTTTTCATTTCTA
* * * * * ** *
194393 GTTAAAACAGATCAT-AGTTGTTATTTGCATTAGGAAACATGAAGCAAAAGCTATTTATTCACAA
251 GTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAA
* * ** ** * * * **
194457 AAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATATCTTTGAAAGCCCAATTACTC-GCTTTAAATTATTTTAT
316 GAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTACTCATCTTTAAATGGTTTTAT
* * * * * * * * * * * *
194521 AA-TATTATAAATGATTTTCACATTGAATTTTTCTCATTTTTGGTTAAAACAGATCGTAATTTGA
381 AACTCTTATAAATAATTTTAAAATTAAATTTTTTTTATTTCTAGTTAGAACA-ATCATAATTTAA
* * ** ** * * * * * *
194585 TGTTTGCATAAGAAAACATGAAGCGAAAGTGATCCAATGATAAAAAAAGTTCATCTATAATCACT
445 TGTTTGCATTAGGAAACATGAAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACT
*
194650 T
510 C
* * * * ** * **
194651 ATGGCTTCAAAAG-CTTAATTACTAGCAGTAAATGGTTTTATAGGC-TATAAATGATTTTAAATC
1 ATGCCTTTAAAAGCCTT-GTTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCATATAAATGATTTTAAAT-
* * * * *** * * *
194714 AAAATGGTTGTTTCATTTTTGGTGAAAATAGA-TCATAATTTTCTATTTG-TTTTAGAAAACTTG
64 AAAATTG-T-TTTCATTTATGGTTAAAACA-ATTCATAATTGGATGTTTGCATTAAG-AAACTT-
** * * * * * * * * *
194777 AAGTGAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCTATTTATACTCACTCATGCTTTCGAAAGCCTAAT
124 AAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCAATTTATAGTCACTCATACCTTCAAAAG-CTTAT
* * * * *
194842 TACTCATTTTAACTAGTTTTATAATCTTATAAATG-TGTTTAAAATTG-AATTATTCTCATTT-T
188 TACTCACTTTAAATA-TTTTATAATCTTAGAAATGAT-TTT-AAATTGAAATTCTTTTCATTTCT
* * * ** * * * ** *
194904 TGATTAAAATAGATCATAATTTGATGTCTATAT-TGAAAAACAAGAAGTGAAAGCCATCCATTAA
250 AG-TTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAG-GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGA
* * * * * * * *
194968 CAAGAAACA-TCTTTTTATAGCCACTCATTCCATT-GAGAGCCTAATTACTC-GCTTTAAATAGT
313 CAAGAAA-AGTCTATTTATAGTCACTCATGCC-TTCAAAAGCCTAGTTACTCATCTTTAAATGGT
* * * * * *
195030 TTCGA-AAGTC-----CAT--TGTT---ACT--A--------A-----A---AGCA-AATCATAA
376 TT-TATAACTCTTATAAATAATTTTAAAATTAAATTTTTTTTATTTCTAGTTAGAACAATCATAA
** * * * * *
195065 TTGGATGGTTGCATT-GAAAAACATGAAGTAAAAG-CAGTCTATTAACAAGAGAAGTCCATTTAT
440 TTTAATGTTTGCATTAG-GAAACATGAAGTAAAAGCCA-TCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTAT
*
195128 AGTCATTC
503 AGTCACTC
* * * * * * * *
195136 ATGCCTTCT-AAAGCCTAGTTGCTCAC-TGAAAT-GATTTTATAGTCTTAAAAATGATTTTAAGT
1 ATGCCTT-TAAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAATAG-TTTTATAATCATATAAATGATTTTAA-A
** * * * ** * ***
195198 TAATCTTTTTTTCACTTT-TGGTTAAAATAGA-TCATAGGTT-TTTATTTGCATCGGGAAA-TGT
63 TAAAATTGTTTTCA-TTTATGGTTAAAACA-ATTCATA-ATTGGATGTTTGCATTAAGAAACT-T
* * * * * * ** *
195259 GAAGCAAAAGCCA-CCTATTGATAAGAAAAGTCCATTTAGAGCCACTCATACTTTTGAAAGCCTA
124 -AAGCAAAAGCCATCC-ATTGACAAGAAAAATCAATTTATAGTCACTCATACCTTCAAAAG-CTT
* * * * * * * * *
195323 AGTACTCACCTTAAATGGTTTTATAATCCTATAATTAAGTTTAAAATT-TAATT-TTTCTCATTT
186 ATTACTCACTTTAAAT-ATTTTATAATCTTAGAAATGA-TTTTAAATTGAAATTCTTT-TCATTT
* * * * * ** *
195386 -TTGATTAAAACATATAATAATTGGATGTTTGCATTAGGAAACATGAAGTGAAAGCCATCTATTG
248 CTAG-TTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTG
* * * ** ** *
195450 ATAAGAAAAGTTTATTTATAGTCACTCATGCTTTTGAAAGCCTAGTTACT--TGCTTTAGCTAGT
312 ACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTACTCAT-CTTTAAATGGT
** * * * * ** * *
195513 TTTAT-TGTCTTTTAAATGATTTT-GAATCAAAATGTTTTTCAATTT-TGGTTAGTACAGATCAT
376 TTTATAACTCTTATAAATAATTTTAAAAT-TAAAT-TTTTTTTATTTCTAGTTAGAACA-ATCAT
** * * *
195575 AATTGGATGTTTACGTT--G-----T---G---AA---A--CA-T-----G--AAGTCTATTTAT
438 AATTTAATGTTTGCATTAGGAAACATGAAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTAT
195614 AGTCACTC
503 AGTCACTC
** * ** * * * * * * *
195622 ATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCATTTTAAGTAGCTTCACAA-CTTTTTCAATGATTTTAAAT-
1 ATGCCTTTAAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATC-ATATAAATGATTTTAAATA
* * ** * * * * *
195685 CAATT-TTTTTATTT-TGGTTAAAA-AGA-TCATGGTTTGATGTTTGTATTAGGAAACATGAAGT
65 AAATTGTTTTCATTTATGGTTAAAACA-ATTCATAATTGGATGTTTGCATTAAGAAAC-TTAAGC
* * * * * * * * *
195746 AGAAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTAAAAGCCTATATGCC
128 AAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCAATTTATAGTCACTCATACCTTCAAAAGCTTAT-TACT
* * * * *
195811 CACTTTAAATGGTTTTATAATCTT-GTAAATGATTTTGAATTG-AACT-TTTTCATTTTTGGTTA
192 CACTTTAAAT-ATTTTATAATCTTAG-AAATGATTTTAAATTGAAATTCTTTTCATTTCTAGTTA
* * * ** * *
195873 AAACAGATCACAA-TTGTTGTTTGCATCAGCAAACGCGAAGCGAAAGTCATCCATTGACAAGAAA
255 AAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAA
* * * * * * * *
195937 AAT-TCAATTATTGTCACTCATGTCTCCGAAAA-CTTAGTTACT--TGCTTTAAATAGTTTTATG
320 AGTCT-ATTTATAGTCACTCATGCCTTC-AAAAGCCTAGTTACTCAT-CTTTAAATGGTTTTATA
* * * * * * **
195998 A-TATTATAAATCATTTT-AAATT-GATTTTTTTTAATTTTTGGTTAAAACATATCATAATTGGA
382 ACTCTTATAAATAATTTTAAAATTAAATTTTTTTT-ATTTCTAGTTAGAACA-ATCATAATTTAA
* * * * * ** * * * *
196060 TGTCTGCATCAAGAAACGTAAAGCGAAAGCAATTCATTTACAAGAAAAGTCCATTTATAGTTACT
445 TGTTTGCATTAGGAAACATGAAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACT
196125 C
510 C
* * * * * * * * * **
196126 ATACCTTCAAAAGCCTAGTTGCTCAC-TTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATATTAAGTTG
1 ATGCCTTTAAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCATATAAATGATTTTAAATAA
* * * * * *** * *
196190 ATTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAATAGA-CCATAATTTTCTATTTGCA-TAGGGAAA-TGTGAAG
66 AATTGTTTTCATTTATGGTTAAAACA-ATTCATAATTGGATGTTTGCATTA-AGAAACT-T-AAG
* * * * * * * * * *
196252 CGAAGGCCATTCATTGACAAG-----TCCATTTAGAGTCGCTCATGCCTTTGAAAACCTAATTAC
127 CAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCAATTTATAGTCACTCATACC-TTCAAAAGCTTATTAC
* * * * * * * * * *
196312 TCGCATTAAATAGTTTTATAATCTTATAATTGAATTTAAAATTTAAGTT-TTCTCATTTTTTGTT
191 TCACTTTAAATA-TTTTATAATCTTAGAAATG-ATTTTAAATTGAAATTCTTTTCATTTCTAGTT
* * * * * *
196376 AAAACATATCATAATTTGATGTCTGCATTAGAAAACATGAAACAAAAGCCATCCGTTGACAAGAA
254 AAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAA
* * * * ** * *
196441 AAATGC-ATTTATAGTCACTCATACATTCGAAAGTTTAGTTACTCGT-TTTAAATAGTTTTAT-A
319 AAGT-CTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTACTCATCTTTAAATGGTTTTATAA
* * * * * * * * *
196503 GTCTTATAAATCACTAT-AAATT-AATTTTTTTAAATTT-TTGATTAAAACATATCATAGTTGAA
383 CTCTTATAAATAATTTTAAAATTAAATTTTTTT-TATTTCTAG-TTAGAACA-ATCATAATTTAA
* * * * * *
196565 TGTTTGCATCATGAAACATGATGCAAAAGCCATCCATTAACAAGAAAAGTCCATTTATAATCACT
445 TGTTTGCATTAGGAAACATGAAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACT
196630 C
510 C
* * * * ** * * * * * *
196631 TTACCATCAAAAGTGTAGTTATTCGCTTTAAATGGTTTTATAGA-CTTATAAATTATTTT-AATT
1 ATGCCTTTAAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAATAGTTTTATA-ATCATATAAATGATTTTAAATA
* * * * ** * * ** *
196694 CAGTTTTCTTTCATTTCTAATTAAAA-AGGA-TCATGATTGGGTGTTTGCATTGGGAAACATGAA
65 AAATTGT-TTTCATTTATGGTTAAAACA--ATTCATAATTGGATGTTTGCATTAAGAAAC-TTAA
* * * * * * * ** *
196757 GCGAAGGCTATCTATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATACTTTGGAAAGCCTAGTTA
126 GCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCAATTTATAGTCACTCATACCTTCAAAAGCTTA-TTA
** * * * * * * *
196822 CTTGCTTGAAATAGTTTTGTAATGTTATAAATTATTTTAAATTTG-AATT-TTTCTCATTTTTGG
190 CTCACTTTAAATA-TTTTATAATCTTAGAAATGATTTTAAA-TTGAAATTCTTT-TCATTTCTAG
* ** * * * * * * *
196885 CTT-AAACAAATTGTTATTTCAT-TTGGCAT-TGGAAAACATGAA-TAGAAAGCCATCTATTGTC
252 -TTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGG-AAACATGAAGCA-AAAGCCATCCATTGAC
* * * ** *
196946 AAGAAAGGCCCT-TTTATAGTTACTCATGCCTTTGAAAGCCTTGTTACTCA-C-TTAAATGGTTT
314 AAGAAAAG-TCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTACTCATCTTTAAATGGTTT
* * * * * * * *
197008 TA-GAGTCGTATAAATGATTTT-AAA-TCATTTTTTTTTCATTTCTA-TTCAAAACATATTATAA
378 TATAACTCTTATAAATAATTTTAAAATTAAATTTTTTTT-ATTTCTAGTT-AGAACA-ATCATAA
* * * * ** **
197069 TTTAAATGTTTACCTCTA-GAAACATGAAATGAAAGTAATTTATTGACAAGAAAAGTCCATTTAT
440 TTT-AATGTTTGCAT-TAGGAAACATGAAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTAT
197133 AGTCACTC
503 AGTCACTC
** * * * * * * * * *
197141 ATGCCTTCGAAAGCTTTGTTACTCGCCTCAAGTGGTTTTATGA-CTTTTTAACTGATTTTAAAT-
1 ATGCCTTTAAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATC-ATATAAATGATTTTAAATA
* * ** ** * * *
197204 TAATTTTTTTCATTT-TCAATTAAAACAGA-TCATAATTTTATGTTTACATCACA-AAACATAAA
65 AAATTGTTTTCATTTAT-GGTTAAAACA-ATTCATAATTGGATGTTTGCATTA-AGAAAC-TTAA
* * * * * * * * * * *
197266 GCGAAAGCGATCTATTTAGAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTTATACGTTGAAAAGCCTAGTTA
126 GCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCAATTTATAGTCACTCATACCTTCAAAAGCTTA-TTA
* * * * *
197331 CTCACTTTATATGTTTTATAGTTTTATAGT-TTATAAATTATTTTAAATTAAAATT-TTTT-TTT
190 CTCACTTTA-A------ATA-TTTTATAATCTTAGAAATGATTTTAAATTGAAATTCTTTTCATT
*** * * *
197393 TC-ATGTATGGTTACAGATCAT-A-TTGCA---TTG----A-GAATCGTGAAG-AGAAAGCCATT
247 TCTA-GT-T-AAAACAGATCATAATTTG-ATGTTTGCATCAGGAAACATGAAGCA-AAAGCCATC
* * * * * * *
197446 CATTGATAAGAAATGCCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAG-CTAGTTGCTC-GCTTTAAA
307 CATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTACTCATCTTTAAA
* * * * * * * * *
197509 TGGTTTTATAA-ACTTATAAATTATTTT-GAATTGAATTTTTTTAATTTTTAATTAAAACAAATT
372 TGGTTTTATAACTCTTATAAATAATTTTAAAATTAAATTTTTTTTATTTCTAGTTAGAAC-AATC
* * * * * * **
197572 AGACATTGT--T-TTCTACATTGGGAAATATGAAGTAAAAGCTATCCATTGACAAGAAATGTGTA
436 ATA-ATT-TAATGTT-TGCATTAGGAAACATGAAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCA
197634 TTTATAGTCACTC
498 TTTATAGTCACTC
* *** * * * * * *
197647 ATACCTTCGGAAG-CTTAGTTACTTGCTCTAAATAATTTTATAATCTTATCAAGGA-TTTAAAGT
1 ATGCCTTTAAAAGCCTT-GTTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCATATAAATGATTTTAAA-T
** * * * * * * * * * * *
197710 TGAATTTTTTTGAATTTTTGATTAAAACATATT-AGAATTTGTTGTTTACATCAATAAAATGTGA
64 AAAATTGTTTT-CATTTATGGTTAAAACA-ATTCATAATTGGATGTTTGCATTAAGAAACT-T-A
** * * * * * *
197774 AGTGAAAGTCATCCACTGATAA-AAAAAGTTC-ATTTATAGTCACTTAT-CCTTTGAAAAGCTTT
125 AGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAA--TCAATTTATAGTCACTCATACC-TTCAAAAGCTTA
* * * * * *
197836 TATACTCACTTTAAGTGATTCTATAA-CTTTATAAATAATTTTAAATTGAAGTT-TTTATGATTT
187 T-TACTCACTTTAAAT-ATTTTATAATC-TTAGAAATGATTTTAAATTGAAATTCTTT-TCATTT
* * * * * ** * * ** * **
197899 TTGGTTAAAA-ATATTAAAATTTGACCTTTGTATTAGGAAATGTGAAGCGAAAGTAATCCATTGA
248 CTAGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGA
* * * * ** * *
197963 TAAGAAAAGT-TCATTTGTAGTCACTGATACCTT-TGAAGCCTAGTTGCTCA-CTTTAAATGATT
313 CAAGAAAAGTCT-ATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTACTCATCTTTAAATGGTT
* * * * * *
198025 TTATAA-TCTTATAATTGAGTTTT-AAATTGAATTTTTCTTATTTTTAGTTAAAACATATCA-AA
377 TTATAACTCTTATAAAT-AATTTTAAAATTAAATTTTTTTTATTTCTAGTTAGAACA-ATCATAA
* * * * * *
198087 TTTATTTTTTGCATCAGGAAGCATGAAGTAAAAGCCATCTATTGACAAGAAAAGTCCATTTATGG
440 TTTAATGTTTGCATTAGGAAACATGAAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAG
* *
198152 TTACAC
505 TCACTC
* * * * ** *
198158 ATACCTTTAAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATAGTTTTATAGTGTTATAAATGATTTGAAATCA
1 ATGCCTTTAAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCATATAAATGATTTTAAAT-A
* * * * *
198223 AAATTGTTTTCATTT-TGGGTTAAAAC-ATACCATAATTCGATGTTTCCACT-AGAAAATGTGAA
65 AAATTGTTTTCATTTAT-GGTTAAAACAAT-TCATAATTGGATGTTTGCATTAAGAAACT-T-AA
** * * * ** *
198285 GCGGAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTTATA-CTTGTTAAAGCCTAGTT
126 GCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCAATTTATAGTCACTCATACCTT-CAAAAGCTTA-TT
* ** * ** * ** *
198349 GCTCGTTTTAAATGATTTTGTGGTCTTATAAATGATTTTAAATCAAAATAT-TTTTCATTTCAAG
189 ACTCACTTTAAAT-ATTTTATAATCTTAGAAATGATTTTAAATTGAAAT-TCTTTTCATTTCTAG
* * ** * * * * *
198413 CTCAATGAGATCACAATTGGATGTGTGCATCTGGAAATATGAAGC--AA---A---A--GACAAG
252 TTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAG
* * ** * * * *
198468 AAAAGTCTATTTATAGCCAATCATGCCTTTGAAAGCCTTGTTATTTA-CTTTAAGTGGTTTTATA
317 AAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTACTCATCTTTAAATGGTTTTATA
* * * * * * * * * **
198532 ACT-TTATAAATGATATT-GAATTGAATTTTTTTCATTT-TTGATTAAAATAGATTATAATTGGA
382 ACTCTTATAAATAATTTTAAAATTAAATTTTTTTTATTTCTAG-TTAGAACA-ATCATAATTTAA
* * * ** * * * ** * *
198594 TGTTTTCATTAGAAAACATAAAGCGATAGCCATCTATTGACAAAAAAAGTTTATTTGTAGTTACT
445 TGTTTGCATTAGGAAACATGAAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACT
198659 C
510 C
** * * * * * *
198660 ATATCTTTGAAAGCCTTGTTACTCG-TATTTAGTAGTTTTATAA-CTTCATAAATGATATTGAAT
1 ATGCCTTTAAAAGCCTTGTTACTCGCT-TTAAATAGTTTTATAATCAT-ATAAATGATTTTAAAT
** * * * * * ** *
198723 TGAGTTTTATTTCTTTTTTGGTTCAAAACAGACTT--GAATTTAAT-TTATGCATTGAGAAA-TA
64 AAAATTGT-TTTCATTTATGGTT-AAAACA-A-TTCATAATTGGATGTT-TGCATTAAGAAACT-
* ** * * * * * * * * *
198784 TGAAGCCAAAGTTATTCATTGACAAGAAAAGTCTATTTACAGTCATTCATGAACTT-AGAATCCT
123 T-AAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCAATTTATAGTCACTCAT-ACCTTCAAAAGCTT
* * * * * *
198848 AGTTACTGACTTTAAATAGTTTTACAATCTAATAAATGATTTTAAATT--AATTTTTTTTATTTT
186 A-TTACTCACTTTAAATA-TTTTATAATCTTAGAAATGATTTTAAATTGAAATTCTTTTCA-TTT
* * * * * * *
198911 TTA-TTAAAACAGATCATAATTTGATGTCTACATCAGAAAACATGAAGCGAAGGCCATCCGTTGA
248 CTAGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGA
** *** * * * * **
198975 CAAGAAAAGTCCGTTTATAGTCACTCATATTTTCAAAAGCCTAATTATTTA-CATTAAATAATTT
313 CAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTACTCATCTTTAAATGGTTT
* * * * * ** * * * * * *
199039 TAT-AGTCTTGTAAATGATGTT-GAATCGAATTTTTATTCATGTCTGGTTAAAAAAGATCATAGT
378 TATAACTCTTATAAATAATTTTAAAATTAAATTTTT-TTTATTTCTAGTTAGAACA-ATCATAAT
** * * * * * * ** *
199102 TGGATGTTTGTATCAAGAAACATGAAGTAAAAGCTATCGATTGA-GAGAAAAGTTGATTTATAAT
441 TTAATGTTTGCATTAGGAAACATGAAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGT
*
199166 CACCC
506 CACTC
* * ** * * * ** * * * * * * *
199171 TTGTCTTCGAAGGCTTTTTTACTCTTTTTAAGTGGTTTTGTAA-CTTTCTTAATGATTTAAAAT-
1 ATGCCTTTAAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATC-ATATAAATGATTTTAAATA
* * * * * * * * *
199234 TAATTTTTTTTATTTTTAGTTAAAACAAATCATAATTTGATGTTTGCATT-GGAAAACATGAAGC
65 AAATTGTTTTCATTTATGGTTAAAACAATTCATAATTGGATGTTTGCATTAAG-AAAC-TTAAGC
* * * * *
199298 GAAAGCCATCCATTGACAAGAAATATCCATTTATAGTCACTCCTGCCTT-AGAAAGCTTAGTTAC
128 AAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCAATTTATAGTCACTCATACCTTCA-AAAGCTTA-TTAC
** * * * * * *
199362 T-TGTTGAAATGGTTTTATAATCTTATAAATAATTTTAAAATT-AAATTTTTCTTACA-TT-TGG
191 TCACTTTAAAT-ATTTTATAATCTTAGAAATGATTTT-AAATTGAAATTCTT-TT-CATTTCTAG
* * * * ** *
199423 TTAAACCAGATAATTATTGGATGTTTGCATTGGGAAACATGAAGCAAAAGCTATCCATTGACAAG
252 TTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAG
* * ** *
199488 AAAAGTCCATTTGTAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTAGTTACT--TGCCTTAAATGGTTTTA-
317 AAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTACTCAT-CTTTAAATGGTTTTAT
* * * * * ** * * *
199550 GAGTCATACAAATAATTTT-AAATCAAATTTTTTCAATTT-TCAATT-GAAACATATCTTAATTG
381 AACTCTTATAAATAATTTTAAAATTAAATTTTTTTTATTTCT-AGTTAG-AACA-ATCATAATTT
* * * * * * * *
199612 GATGTCTGCATT-GAGAAACTTAAAGCAAAAGCCTTCTATTGACAAGAAAAGTCCATTTGTAGTC
443 AATGTTTGCATTAG-GAAACATGAAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTC
199676 AC-C
507 ACTC
* ** * * * * *
199679 TACGCCTTCGAAAGCCTTGTTACAT-GCATTAAGTGGTTTTATAA-CTTTATAAATGATTTTGAA
1 -ATGCCTTTAAAAGCCTTGTTAC-TCGCTTTAAATAGTTTTATAATC-ATATAAATGATTTTAAA
* * * * * * * * * *
199742 TCAATTTTTATTTCATTTTTGGTTAAAAATAAATCATAATTTGATTTTTTCATCAAGAAA-TGTG
63 TAAAATTGT-TTTCATTTATGGTT-AAAACAATTCATAATTGGATGTTTGCATTAAGAAACT-T-
** * * * * ** *
199806 AAGTGATAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCTATTTATAGTCGCCCATACCTTTGAAAGCCTAGT
124 AAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCAATTTATAGTCACTCATACCTTCAAAAGCTTA-T
* * * ** * * * * * * * *
199871 TGCTTACCTTAAATGGGTTTAGAGTCATACAAATGATTTTGAA-TCAAATTTTTTTTCATTT-TT
188 TACTCACTTTAAAT-ATTTTATAATCTTAGAAATGATTTTAAATTGAAA-TTCTTTTCATTTCTA
* * * * * * *
199934 GCTTAAAATAGATCTTAATTTGATGTTTACAT-TGAGAAACTTGAAGCGAAAGCCATCCATTTAC
251 G-TTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAG-GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGAC
* * ** * * * *
199998 AAGAAAAGTCTATTTTTAGTAACTCATGCCTTTGAAAGCCTTGTTACTC-GCATTAAGTGGTTTT
314 AAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTACTCATCTTTAAATGGTTTT
** * * * * * * * *
200062 ATAACT-TTATAAATAATTTT-GCATTGAGTTTTGGTTCATTTTTTTGTTAAAAATATATCATAA
379 ATAACTCTTATAAATAATTTTAAAATTAAATTTT-TTTTA-TTTCTAGTT-AGAACA-ATCATAA
* * * * * * * * * *
200125 TTCGATTTTTTTCATCAAGAAATAGGAAGCAAAAGTCATCCATTCGTA-AA-AAAAG-CCTATTT
440 TT-TAATGTTTGCATTAGGAAACATGAAGTAAAAGCCATCCATT-G-ACAAGAAAAGTCC-ATTT
200187 ATAGTCA-TCC
501 ATAGTCACT-C
* * * * * * * * *
200197 ATGTCATCAAAAGCCTAGTTACTAGCTTCAAAT-GGTTAATAATC-TGATAAATGATTTTAAATT
1 ATGCCTTTAAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCAT-ATAAATGATTTTAAATA
* * * * * * * * *
200260 AAA-TGTTTCTCATTTTTGGTCAAAATAAATCATAATTTGATGTCTGCATCAAAAAACATGAAGC
65 AAATTGTTT-TCATTTATGGTTAAAACAATTCATAATTGGATGTTTGCATTAAGAAAC-TTAAGC
* * * * ** ** *
200324 AAAAGTCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATTGTCA-TCATGTCTTCAAAATTATTGTTACT
128 AAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCAATTTATAGTCACTCATACCTTCAAAA-GCTTATTACT
* * * ** * * * * * * *
200388 CACTTTGAATGGTTTTATAGTCTTCTAAATGATTTTGAATTTAATTTTTTTTTACTTCTGGTTAA
192 CACTTTAAAT-ATTTTATAATCTTAGAAATGATTTTAAATTGAAATTCTTTTCATTTCTAGTTAA
* * * * * ** * ** * *
200453 AACAGATCCTAGTTGGATGTTTGTATCAAGAAATGTGGAGTGAAAGCCCTCGATTGACAAGAAAA
256 AACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAA
* * * * * * *
200518 GTCTATTTATAGTGATTCATACCTTCGAAAGCCTTGTTACTC-TTTTTAAGTGGTTTTATAACT-
321 GTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTACTCATCTTTAAATGGTTTTATAACTC
* * * * * * * *
200581 TTATAAATGA-TTTAAAATTGAATTTCTTTTCATTTTTGGTTAAAACATATCTTAATTTGATGTT
386 TTATAAATAATTTTAAAATTAAATTT-TTTTTATTTCTAGTTAGAACA-ATCATAATTTAATGTT
* * * * ** * * * *
200645 TACGTTAGAAAACACGAAGTAAAAATCATCCGTTCACAAGAAATGTCCATTTATAGTCACTG
449 TGCATTAGGAAACATGAAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTC
* * * * *
200707 TTGCC-TTAGAAAGCCTAGTTACTC-ATTAAAAT-GATTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAAA
1 ATGCCTTTA-AAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAATAG-TTTTATAATCATATAAATGATTTT-AAA
* * * * * * * *
200769 TTATATT-TTTCTCATTT-TCGTTAAAACAAATCATTATTTGATGTTTGCATT-GGAAAACATGA
63 TAAAATTGTTT-TCATTTATGGTTAAAACAATTCATAATTGGATGTTTGCATTAAG-AAAC-TTA
** * * * * * * * ** *
200831 AGTGAAAGCCATCCATTAACCAGAAACATCCATTTATATTCAATCAT-GCTTTGAAAGCCTAGTT
125 AGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCAATTTATAGTCACTCATACCTTCAAAAGCTTA-TT
* * * *
200895 ACTC-GTCTTAAATAGTTTTAGAGT-TGTACAAATGATTTTAAATTGAAATGT-TTTTCATTTCC
189 ACTCACT-TTAAATA-TTTTATAATCT-TAGAAATGATTTTAAATTGAAAT-TCTTTTCATTT-C
* * * * ** * * *** *
200957 TA-TTAAAACGGATCTTAATTAGATGTTTGAATTGGGAAATATAAAATGAAAGCTATCCATTGAC
249 TAGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGAC
* * * * * *
201021 AAGAAAAATCCATTTACAGT-TCTCTTGCCTTCGAAAA-TCTAGTTACT--TGCTTTAAATGGTT
314 AAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTC-AAAAGCCTAGTTACTCAT-CTTTAAATGGTT
* * * * *
201082 TTATAA-GCTTATAAATTATTTT-AAGTTAAATTTTTTTTACTTT-TGGTTA-AAGCATATCGTA
377 TTATAACTCTTATAAATAATTTTAAAATTAAATTTTTTTTA-TTTCTAGTTAGAA-CA-ATCATA
* * ** * * * *
201143 ATTTAGT-TTTCACCATTAGGAAATGTGAAGCAAAAGCCAACCATTGACTAGGAAAGTCCATTTA
439 ATTTAATGTTT--GCATTAGGAAACATGAAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTA
*
201207 TAGTCACTA
502 TAGTCACTC
** * * * * * * * *
201216 ATGCCTTCGAAATCCTAGTTACTCGCTTGAAATTGTTTTATAGTCTTATAATTAATTTTAAAT--
1 ATGCCTTTAAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCATATAAATGATTTTAAATAA
* * ** * * * * * * *
201279 AATTTTTTTCATTT-TCAGTTAAAGGAAATCATAATTGGATGTTTGTATTGAGAAAAATGAAACT
66 AATTGTTTTCATTTAT-GGTTAAAACAATTCATAATTGGATGTTTGCATTAAG-AAACTTAAGCA
** * * * * *
201343 AAAGCCATCCATTGACAAGAAATGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAATCTTGTTATTC
129 AAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCAATTTATAGTCACTCATACCTTC-AAAAGCTTATTACTC
* * * *
201408 ACTTTAAGTGATTTTATAATGTTATAAATGATTTTAAATTG-AATAT-TTTTCATTT-TTGATTA
193 ACTTTAAAT-ATTTTATAATCTTAGAAATGATTTTAAATTGAAAT-TCTTTTCATTTCTAG-TTA
* * * * ** *
201470 AAACATACCATAATTTGATATTTGCAT-TGGAAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGTTATGAA
255 AAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGG-AAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAA
*
201534 AAGT-TCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTAGTTACTCA-CTTTAAATGGTTTTAT-A
319 AAGTCT-ATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTACTCATCTTTAAATGGTTTTATAA
* * * * * * **
201596 GTCTTATAAATGATTTT-AAATCAAAATTCTTTTCATTTCTAGTTA-ACATAGATCATAATTCGA
383 CTCTTATAAATAATTTTAAAAT-TAAATTTTTTTTATTTCTAGTTAGA-ACA-ATCATAATTTAA
* * * * * * * * * * * *
201659 TGTTTTCATTGGGAAACCTAAAGCAAAAGCTATCCATGGATAAGAAAAATCTATTCATAATCACT
445 TGTTTGCATTAGGAAACATGAAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACT
*
201724 T
510 C
* * ** * * * * * *
201725 ATGCCTTCAAAAGCCTAGTTGTTCACTTTAAATGGTTTTGTAA-CTTTATAAATGATTTCAAATT
1 ATGCCTTTAAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATC-ATATAAATGATTTTAAATA
* * * * * * ** *
201789 GAATTGTTTTTCAGTTATGGTTAAAA-AGA-TCATGATTTGATGATTGTATTGTGAAATCTGAAG
65 AAATTG-TTTTCATTTATGGTTAAAACA-ATTCATAATTGGATGTTTGCATTAAGAAA-CTTAAG
** * * * * * * * * * *
201852 TGAAAGCAATCTATTGAGAAGAAAAGTCCATTTATCGTCACTCATGCCTTAAAAAGCCTAGTTGC
127 CAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCAATTTATAGTCACTCATACCTTCAAAAGCTTA-TTAC
* * * * * * *
201917 TCACTTTAAACAGTTTTATAATCTTATAAACGGTTTTAAATTG-AATTGTTTTTCATTTTTGGTT
191 TCACTTTAAATA-TTTTATAATCTTAGAAATGATTTTAAATTGAAATT-CTTTTCATTTCTAGTT
* * * * * *** * *
201981 AATACAGATCATAA-TTGTTGTTCGCATCAGGAAACGTGAAGCGAAATAAATCGATTGACAAGGA
254 AAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAA
* * * ** * * * ** * *
202045 AAGCCTATTAATAGTCACTTATATCTTCGAAAGCCTAATT-GTTTTCTTTAAATAGTTTTAT-AT
319 AAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTACTCATCTTTAAATGGTTTTATAAC
* * * *
202108 TCATATAAATAATTTT-AAATTGAATTTTCTTTTATTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTGT--T
384 TCTTATAAATAATTTTAAAATTAAATTTT-TTTTATTTCTAGTTAGAACA-ATCATAATT-TAAT
* * * * *
202170 GTTTGCATCT-TGATACATGAATTGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCCATTTATAGTCACT
446 GTTTGCAT-TAGGAAACATGAAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACT
202234 C
510 C
* * ** * * * *
202235 ATGCCTTGT-AAACCCTAGTTACTCGCTCGAAATGGTCTTGTAATCTTATAAATGATTTTAAA-A
1 ATGCCTT-TAAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCATATAAATGATTTTAAATA
** * * * * * * *
202298 TTGATTTTTTCTCATTGT-TAGTTAAAACATATT-GTTATTGGATGTTT-CTATCAAAAAAATGT
65 -AAATTGTTT-TCATT-TATGGTTAAAACA-ATTCATAATTGGATGTTTGC-ATTAAGAAACT-T
* * * * * * ** * *
202360 GTAGTAAAAGCCATCCATTGACAAG-----TCCATTTTTTGTCGCTCATGGCTTCAAAAACCTTG
124 -AAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCAATTTATAGTCACTCATACCTTC-AAAAGCTTA
** ** * * * * *
202420 TTACT-TGTCCAAAGTGATTTTGTAA-CTTCATAAATGATTTTAAATTG-AATTTTTCTTAAATT
187 TTACTCACTTTAAA-T-ATTTTATAATCTT-AGAAATGATTTTAAATTGAAATTCTT-TTCATTT
* * * * ** *
202482 -TGGTTTAAATAGATCATAATTTGATGTTTGCA-CTGGAAAACATGAAGTGAAAGCCATCCATTC
248 CTAGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGG-AAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTG
* **
202545 ACAAGAAATGTGC-ATTTATAGGT-ACTCATGCCTTTGAAAGCCTAGTTACT--TGCTTTAAATG
312 ACAAGAAAAGT-CTATTTATA-GTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTACTCAT-CTTTAAATG
* * * * * * * * * *
202606 GTTTTATAA-TCTGATCAATGATTTT-AAGTTTAATTTTTTTAAATTTTTGGTTAAAATAGATCA
374 GTTTTATAACTCTTATAAATAATTTTAAAATTAAATTTTTTT-TATTTCTAGTTAGAACA-ATCA
* * ** * ** * *
202669 AAATTTATTGTTTGCATT-GAGAAATGTAAAGTGAAAA-TAATGCATTGACACA-AAAAGTCTAT
437 TAATTTAATGTTTGCATTAG-GAAACATGAAGT-AAAAGCCATCCATTGACA-AGAAAAGTCCAT
*
202731 TTACAGTCACTC
499 TTATAGTCACTC
* * ** * * * * * * * * * *
202743 ATGTCTTTGAAATACTAGTTACTTGATTTAAATAGATGTGTAGTCTTGTAAGTGATTTTAAATCA
1 ATGCCTTTAAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCATATAAATGATTTTAAAT-A
* * * * * * * ** *
202808 AACTTTTTTTCATTTCTAGTTAAAAGAGA-TCATAATTGTATGTTTACATTGGGAAACATGAAGC
65 AAATTGTTTTCATTTATGGTTAAAACA-ATTCATAATTGGATGTTTGCATTAAGAAAC-TTAAGC
* ** * * * *
202872 -AAAGCCACCCATTGACAAGCGAAGTCCATTTATAGTCACTCA-AGCCTTCGAAAGCTTAGTTGC
128 AAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCAATTTATAGTCACTCATA-CCTTCAAAAGCTTA-TTAC
* * * * * * * * *
202935 TCGCTTTAAATGGTTTTATAATCGTATAAATAATTTTAAACTG-AATTGCTTCTT--TTTTTGGA
191 TCACTTTAAAT-ATTTTATAATCTTAGAAATGATTTTAAATTGAAATT-CTT-TTCATTTCTAGT
* * * ** * * * **
202997 TAAAACAGATCATAATTTGTTATTTCCATTGGGAAACGTGAAGCAAAAGCTACCCAAAGACAAG-
253 TAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGA
* * * * * * * * *
203061 GAAGTCCATTAATAGTCACTC-CGTTCTTCAAAAGCCTGGTTACTTA-CTTTAAATAGTTTTATT
318 AAAGTCTATTTATAGTCACTCATG-CCTTCAAAAGCCTAGTTACTCATCTTTAAATGGTTTTATA
* * * * * **
203124 ACT-TTATAAATGATTTT-AAATTAAAATATTTTTCATTTCTAGTTAAAACTAATCATAAGTGGA
382 ACTCTTATAAATAATTTTAAAATT-AAATTTTTTTTATTTCTAGTTAGAAC-AATCATAATTTAA
* * * * ** *
203187 TGTTTGCATTAGGAAACACGAGGCAAAAGCCACCCATTGACAAGAAAAGTATATTTATACTCACT
445 TGTTTGCATTAGGAAACATGAAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACT
203252 C
510 C
* * * * ** * *
203253 ATGCCTTCAAAAGCCTAGTTACTTGCTTTGAATAGTTTTATGCTCTTATAAATAATTTTAAATCA
1 ATGCCTTTAAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCATATAAATGATTTTAAAT-A
* * * * * * * *
203318 AAA-TGTTTTTCATTTCTGGCTAAAATAGA-TAACAATTGGATGTTTGTATTAGGAAACATAAAG
65 AAATTG-TTTTCATTTATGGTTAAAACA-ATTCATAATTGGATGTTTGCATTAAGAAAC-TTAAG
* * * * * * ** * *
203381 CGAAAGCTATCAATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATACCTTTGAGAGCATTGTTAC
127 CAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCAATTTATAGTCACTCATACCTTCAAAAGC-TTATTAC
* * ** * * * * *
203446 TTACTTTAAGTGCTTTATAA-CTTTATAAATGATATTAAATTGAAA-TGTTTTCATTTTTGGTTA
191 TCACTTTAAATATTTTATAATC-TTAGAAATGATTTTAAATTGAAATTCTTTTCATTTCTAGTTA
* * ** * ** * *
203509 AAACAGATCATAACTAGATGTTTGCATCAAAAAACATGAGGTGAAAGCCTTCTATTGACAAGAAA
255 AAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAA
* * * * * * *
203574 AGTCCATTTGTAGTCACTTGA-GCCTTCAAAAGCCTTA-TCACT--TGTATTAAGTGGTTTTAGA
320 AGTCTATTTATAGTCAC-TCATGCCTTCAAAAGCC-TAGTTACTCATCT-TTAAATGGTTTTATA
* ** * * * * * * *
203635 ACT-TTATAAATAATTTTGAAA-TGGATTTAATTTCATTTTTTGTTAAAAATATATCATAA-TTG
382 ACTCTTATAAATAATTTTAAAATTAAATTT-TTTTTATTTCTAGTT-AGAACA-ATCATAATTTA
* * ** ** * *
203697 ATTTTTCCATTCA-GAAATC-TGAAGCCAAATTCATCTATTGACAAGAAAAGTTCATTTATAGTC
444 ATGTTTGCATT-AGGAAA-CATGAAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTC
*
203760 GCTC
507 ACTC
** ** * * * * * *
203764 ATGCCCATGGAAGCCTAGTTATTGGCTTTAAATGGTTTTATAATC-TGATAAATGATTTTGAATT
1 ATGCCTTTAAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCAT-ATAAATGATTTTAAATA
* * * * * *
203828 GAATTTTTTTCATTTCAT-GTTAAAACAAATCATAATTTGATGTCTGCATTAA-AAAATATGAAG
65 AAATTGTTTTCATTT-ATGGTTAAAACAATTCATAATTGGATGTTTGCATTAAGAAACT-T-AAG
* * * *** * **
203891 CAAATGCCATCCATTGAGAAGAAAAGTCTGCTTATAGTCATTCATGTCTTCAAAAGCTTAGTTAC
127 CAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCAATTTATAGTCACTCATACCTTCAAAAGCTTA-TTAC
* * * *
203956 TCACTTTAAATAGTTTTATAGTCTTATAAATGATTTTCAATTGAAAGTT-TTTTAATTTCTAGTT
191 TCACTTTAAATA-TTTTATAATCTTAGAAATGATTTTAAATTGAAA-TTCTTTTCATTTCTAGTT
* * * * ** * * ** ** *
204020 AAAACAAATCATAGTTGGACGTTTGTGTCAAGAAACATAAAGTGAAAGCCATTGATTGATAAGAA
254 AAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAA
* * *** * * * *
204085 AAATCCATTTATAGTCACTCATATTTTTAAAAGCCTTGTTGCTCAT-TTTAGATGGTTTTATAAC
319 AAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTACTCATCTTTAAATGGTTTTATAAC
* * * * * *
204149 T-TTATAATTGATTTT-AAATTGAATTTTTTTTATTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTTCATGT
384 TCTTATAAATAATTTTAAAATTAAATTTTTTTTATTTCTAGTTAGAACA-ATCATAATTTAATGT
* * * * ** * *
204212 TTGCATCAAGAAACATGAAGTGAAAGTCATCTGTTGGCAAGAAATGTCCATTTATAGTCACTC
448 TTGCATTAGGAAACATGAAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTC
* * * * * * * *
204275 AT-ACTTTGGAAAGCATAGTTACTC-ATTGAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAAAT
1 ATGCCTTT-AAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCATATAAATGATTTT-AAAT
** * * * * * ** * * * *
204338 TGAA-TGTTTCTAATTTTTGGATAAAATAGATT-GTTTTTTGATGTTTGCATCAAGAAGAATAAA
64 AAAATTGTTT-TCATTTATGGTTAAAACA-ATTCATAATTGGATGTTTGCATTAAGAA-ACTTAA
* * * * * * *
204401 GCAAAAGCCATCCATTAAGAAGAAAAGTCCATTTATAATCACT-ATTACCTTCGAAAGCCTTGTT
126 GCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCAATTTATAGTCACTCA-TACCTTCAAAAG-CTTATT
* ** * * ** * * * * * *
204465 ATTGGCTTTATACA-ATTTGAGAGGCATAAAAATAATTTTAAATT-CAATTTTTTTCATTTCTGG
189 ACTCACTTTA-A-ATATTTTATAATCTTAGAAATGATTTTAAATTGAAATTCTTTTCATTTCTAG
** * * * * * * * *
204528 TTAAAATGGATCATAACTAGGTGTTTGCATTAGAAAACATGAAGCGAAAGTCATCCATTGATAAG
252 TTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAG
* * * * * * * *
204593 AAAAGACTGTTGATAGTCACTCATACCTTAAAAAGCATAGTTACTCGT-TTTAAATGGTTGTATA
317 AAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTACTCATCTTTAAATGGTTTTATA
* * * * * * * * * * **
204657 A-TCTTGTAAATGATTTT-GAATCAAAATGTTTTTCATTTTTAGTTAAAACATGTCATAGTTGGA
382 ACTCTTATAAATAATTTTAAAAT-TAAATTTTTTTTATTTCTAGTTAGAACA-ATCATAATTTAA
* * ** * * *
204720 TGTTT-CTATT-GGAAAACGTGATGTAAAAGTGATCCATTGACAAGAAAATTCTATTTATAGTCG
445 TGTTTGC-ATTAGG-AAACATGAAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCA
*
204783 TTC
508 CTC
* * * * * * * ** * **
204786 ATACCTTTTAAAGCCTTGTTACTCGTTTTAAGTGGTTTTACATTGTTATAAATTATTTTAAATTG
1 ATGCCTTTAAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCATATAAATGATTTTAAATAA
* * ** * * * * * **
204851 AATTCTTTTCATTTTTTATTAAAACAAATCATAGTTTGATGTTTGCATTAGGAAACATGAAATAA
66 AATTGTTTTCATTTATGGTTAAAACAATTCATAATTGGATGTTTGCATTAAGAAAC-TTAAGCAA
* * * * ** * *
204916 AAGCCATCAATTGAAAAGAAAAGTTC-ATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTAGTTACTT
130 AAGCCATCCATTGACAAGAAAA-ATCAATTTATAGTCACTCATACCTTCAAAAGCTTA-TTACTC
* * ** * *
204980 GCTTTAAATGATTTTA-AAGTC-TACTAAATGATTTTAAATCAAAATAT-TTTTCATTTCTGGCT
193 ACTTTAAAT-ATTTTATAA-TCTTA-GAAATGATTTTAAATTGAAAT-TCTTTTCATTTCTAGTT
*
205042 AAAATAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGG-AA-ATGTAA--AATGAAGCCATCCATTGA-AT
254 AAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACATG-AAGCAA--AAGCCATCCATTGACA-
* * * ** * * * * *
205102 ATAAAAGTCCATATATAGTCACTTTTACCTTCAAAAGCTTTGTTACT--TGCTTTAAGTGGTTTC
315 AGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTACTCAT-CTTTAAATGGTTTT
* * * * * * * * *
205165 AT-AGTTTTGTAAATGATTTT-AAATTTAA-CTTTTCTAGTTT-TGGTTA-AAAAGATCATAATT
379 ATAACTCTTATAAATAATTTTAAAATTAAATTTTTTTTA-TTTCTAGTTAGAACA-ATCATAATT
* * * ** * *
205225 TGATGTTTGTA-TAGGGAAACATGAA-TCGAAAGTAATCAATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAG
442 TAATGTTTGCATTA-GGAAACATGAAGT-AAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAG
205288 TCACTC
505 TCACTC
** ** * * * * *
205294 ATAACTTCGAAAGCCTAGTTGCTCGCTTTAAATAGTTTTATAGTCTTATAAATGATTTTATATCC
1 ATGCCTTTAAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCATATAAATGATTTTAAAT--
* * * * * ** *
205359 AAAA--ATTTTCATTT-TCAGTTAAAACAGA-TCATGATTTGATGTATGCATCGAGAAACATGAA
64 AAAATTGTTTTCATTTAT-GGTTAAAACA-ATTCATAATTGGATGTTTGCATTAAGAAAC-TTAA
* * * * **
205420 GCAAAAGCTATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCAAGTTA
126 GCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCAATTTATAGTCACTCATACCTTCAAAAGCTTA-TTA
* * * * * * * * *
205485 CACTCTTTAAATGGTATAATAATCTTATAAATGATTTTAAGTT-AAATT-TTTT-ATTTTTTTGG
190 CTCACTTTAAAT-ATTTTATAATCTTAGAAATGATTTTAAATTGAAATTCTTTTCA--TTTCTAG
* * ** * *
205547 TTAAAACATATTATAATTTGATGTTTGC--CTTGAGAA-ATGCAAAGCGAAAGGCATCCATTGAC
252 TTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGA-AACATG--AAGCAAAAGCCATCCATTGAC
* * * * * * * * *
205609 AA-AAAAATTTCATTTATATTTAATCATGCCTTCGAAAGCTTAGTTATTC-TCTTTAAATAGTTT
314 AAGAAAAGTCT-ATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTACTCATCTTTAAATGGTTT
* * * * *
205672 TAT-ATTCTTCTAAATGATTTT-AAA-TAGAATTTTTTTTATTTCTTA-TTAAAACAGATCATCA
378 TATAACTCTTATAAATAATTTTAAAATTA-AATTTTTTTTATTTC-TAGTTAGAACA-ATCATAA
** * * * * * * *
205733 TTGGATGTGTGCATTAGGAAACATGAAATGAAAGTCATCCATTGACAAGAAAATTCTATTTGTAG
440 TTTAATGTTTGCATTAGGAAACATGAAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAG
205798 TCA-TCC
505 TCACT-C
* * * * * *
205804 ATACCTTTTAAAGCCTTGTTACTCGCTTCAAAGAGTTTTATAAAC-TAATAAATGATTTTAAATT
1 ATGCCTTTAAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCAT-ATAAATGATTTTAAATA
* * * ** * * * * * *
205868 GAATTATTTTTCAGTTT-TAGTTGGAACACA-TCAAAATTTGTTGTTTACATTGAGAAA-TAAAA
65 AAATT-GTTTTCA-TTTATGGTTAAAACA-ATTCATAATTGGATGTTTGCATTAAGAAACT--TA
*** * * * * * *
205930 AGTGGAAGTCATCCATTG---AGAAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATATCTTTAAAAGCCTAGC
125 AGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAA-TCAATTTATAGTCACTCATACCTTCAAAAGCTTA-T
* * * * * *
205992 TACTCACTTTTAATGAATTTATAATATTATAAATGAATTTAAAATT-AAATT-TTTCTCATTTTT
188 TACTCACTTTAAAT-ATTTTATAATCTTAGAAATG-ATTTTAAATTGAAATTCTTT-TCATTTCT
* * * * * * ** *
206055 GGTTAAAACATATCATAATTTAATGTTTGCAT-TGGTAGACATGCAGTGAAAGCCATCCATTGAT
250 AGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGG-AAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGAC
* * ** * *
206119 AAGAAAAGTCTATTCATAATCACTCATATCTTTAAAAGCCTAGTTACACA-CTTTAAATGGTTTT
314 AAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTACTCATCTTTAAATGGTTTT
* *** * * * * * *
206183 GT-TGGCTTATAAATGATTTT-AAGTCAAATTTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAAATCATAA-
379 ATAACTCTTATAAATAATTTTAAAATTAAA-TTTTTTTT-ATTTCTAGTTAGAAC-AATCATAAT
* * * * ** * * *
206245 TTAGATTTTTACGTTAAGAAATGTTAAGTGAAAGCTATCCATTGACAAGAGAAA-TCCATTTATA
441 TTA-ATGTTTGCATTAGGAAACATGAAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGA-AAAGTCCATTTATA
* *
206309 ATCACTT
504 GTCACTC
* * * * * * *
206316 ATGCCTTTGAAAGCCTTGTTACTCACTTTAAGTGGTTTTATAA-CGTTATAAATGATTTTGAATT
1 ATGCCTTTAAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATC-ATATAAATGATTTTAAATA
* * * * * * * * *
206380 GAATTATTTTTATTTTTGGTTAAAAC-TTATCAAAATTTGATGTTTG-ATTGAGAAACATGAAGC
65 AAATTGTTTTCATTTATGGTTAAAACAAT-TCATAATTGGATGTTTGCATTAAGAAAC-TTAAGC
* * * * * * * * ** *
206443 GAAACCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTACAGTTACTCATGCCTTTGAAAGCATAGTTACA
128 AAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCAATTTATAGTCACTCATACCTTCAAAAGCTTA-TTAC-
* * ** * * *
206508 T-GCTTTAAATGGTTTTATAGCCTTATAAATGATTTTAAA-TCAAATT-TTTT-ATTTC-GGTTA
191 TCACTTTAAAT-ATTTTATAATCTTAGAAATGATTTTAAATTGAAATTCTTTTCATTTCTAGTTA
* * * * * * * * *
206568 AACCATATCGTAATTTGTTGTTTACAT-TGAGAAACATGAAGTAAAAGCCATCCAATGATAAGAA
255 AAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAG-GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAA
* ** * * * *
206632 AAGTCTATTTATAGTCACTAATGCCTTTGAAAGCCTATTTACTTA-CTTTAAATAGTTTTAT-AG
319 AAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTACTCATCTTTAAATGGTTTTATAAC
* * * * * * * *
206695 TCTCATACATGATTTT-AAATCGAGATTGTTTTCATTT-TAAGTTA-AAGCAAATCATAA-TTGA
384 TCTTATAAATAATTTTAAAAT-TAAATTTTTTTTATTTCT-AGTTAGAA-C-AATCATAATTTAA
** * * * *
206756 TGTTTGCATT-GAGAAATGTGAAGCAAAATCCATCCATTTACATA-AAAAGTTCATTTATAGTCA
445 TGTTTGCATTAG-GAAACATGAAGTAAAAGCCATCCATTGACA-AGAAAAGTCCATTTATAGTCA
206819 CTC
508 CTC
* * ** * *
206822 ATGCCTTTGAAAG-CTAT-TTACTTGC-TTAAAGTTCTTTTATAAAT-TTATCAATGATTTTAAA
1 ATGCCTTTAAAAGCCT-TGTTACTCGCTTTAAA-TAGTTTTAT-AATCATATAAATGATTTTAAA
** * * * * * * *
206883 TTAATTTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAA-AGA-TCATAATTTGATGTTTGTAGTAGGGAA-TGTG
63 -TAAAATTGTTTTCATTTATGGTTAAAACA-ATTCATAATTGGATGTTTGCATTAAGAAACT-T-
* * ** * * * * * ** *
206945 AAGCGAAAGCAATTGATGGACAAGAAAAGTCATTTTATTGTCACTCATTCCTTTGAATGCTTAGT
124 AAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCAATTTATAGTCACTCATACCTTCAAAAGCTTA-T
* * * * * * *
207010 TGCTCATTTTAAATGGTTTTATAAACTTATAAATGATTTTCAATTG-AATAT-TGTTCATCTT-T
188 TACTCACTTTAAAT-ATTTTATAATCTTAGAAATGATTTTAAATTGAAAT-TCTTTTCAT-TTCT
* * * * * * * *** *
207072 GGTTGAAACAGATCTTACTTTGTTGTTTTCATCAAGAAACATGAAATGAAAGCCATCCATTGATA
250 AGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACA
* * * * * ** * *
207137 A-AGAAAGTCTATTTATTGTCACTAATACCTTCAAAAGCCTTGTTACAC-GGTATAAATTGTTTT
315 AGA-AAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTACTCATCTTTAAATGGTTTT
* * * *
207200 A-CAGTCTTATAAATAATTTT-AAATTGAATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAGAA-AATCAT-AT
379 ATAACTCTTATAAATAATTTTAAAATTAAATTTTTTTT-ATTTCTAGTT--AGAACAATCATAAT
* * * ** *
207261 TTGGATGTTTTCATTGGGAAACATGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCAATTTATAG
441 TT-AATGTTTGCATTAGGAAACATGAAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAG
*
207326 TCATTC
505 TCACTC
* * * * *
207332 ATGCCTTTGAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTAGTTTTATACCTC-TATAAAAGATTTTAAATT
1 ATGCCTTTAAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAATAGTTTTATA-ATCATATAAATGATTTTAAATA
* * * * ** * * *
207396 GAATTTTTATTCATTTTTGGTTAAAA-AAATCATAATTTAATGTTCGCATTAGGAAACGTGAAGC
65 AAATTGTT-TTCATTTATGGTTAAAACAATTCATAATTGGATGTTTGCATTAAGAAAC-TTAAGC
* ** * * * * * * *
207460 GAAAGTAATCCATTGGCAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATACGTTGAAAACCTTAGTTGCT
128 AAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCAATTTATAGTCACTCATACCTTCAAAAGCTTA-TTACT
* * * * * * * * *
207525 CACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTATATATTGAATTTTTTTTCTTTTTTGGTTAA
192 CACTTTAAAT-ATTTTATAATCTTAGAAATGATTTTAAATTGAAATTCTTTTCATTTCTAGTTAA
* * * ** ** * *
207590 AACAAATCATAA-TT-ATTTTTTGCAT-TGGCAAA-ATGTGAAGTGAAAGAAATCTATGGACAAG
256 AACAGATCATAATTTGA-TGTTTGCATCAGG-AAACA--TGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAG
* * * * * * *
207651 AAAACTCCATTTATAGTCACTCATACCTTTAAACGCGTA-ATACCTCA-CTTTAAATGGTTTTAT
317 AAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTA-CTCATCTTTAAATGGTTTTAT
* * * * * * *
207714 AA-TCTTATAAATGATTTTCAAATTAAGTTTCTCTCATTGTTT-TTGTTAAAACAGATCATAATT
381 AACTCTTATAAATAATTTTAAAATTAAATTT-T-T-TTTATTTCTAGTTAGAACA-ATCATAATT
* * ** * *
207777 TAATGTTTGCATTAGAAAACATAAAGCGAAGGCCATCCATTGACAAGAAATGTCCATTTATAGTC
442 TAATGTTTGCATTAGGAAACATGAAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTC
207842 ACTC
507 ACTC
* * * * * * * *
207846 ATGCCTTCGAAAA--CTAAGTTACTAGCTTTAAATGGTATTGTAGT-ATTATAAATTATTTTAAA
1 ATGCCTT-TAAAAGCCT-TGTTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCA-TATAAATGATTTTAAA
* * * * * * *
207908 TTAAATTATT-TTTTCATTTCTGATTATAACAGA-CCATAATTGAATGTTTACA-TCAGTAAA-T
63 -TAAA--ATTGTTTTCATTTATGGTTAAAACA-ATTCATAATTGGATGTTTGCATTAAG-AAACT
* * * * ** * *
207969 ATGAAGCGAAAGCCATCCATTAACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCAC-CAATGTCTTCGAAAGCG
123 -T-AAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCAATTTATAGTCACTC-ATACCTTCAAAAGCT
* * * *
208033 TAGTTACTCAATTTAAATAGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTCAATTG-AA-TCTTTTAAATT
185 TA-TTACTCACTTTAAATA-TTTTATAATCTTAGAAATGATTTTAAATTGAAATTCTTTT-CATT
* * * * * ** *
208096 TTTAGTTAAAATATATCATAA-TTGTTGTTTGCATCA-GAAAAAGTGAAGCAAAAGTAATCTATT
247 TCTAGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACA-TGAAGCAAAAGCCATCCATT
* * * * * *
208159 GACAAGAAAACTCTATTTATAGGCACTCATACTTTTAAAAGCCTAGTTACT-AGCTTTAAATGGT
311 GACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTACTCATCTTTAAATGGT
* * * * * * * * * * *
208223 TTTATAA-TCTTATAAATAATTCTCAATTTGAATGTTTCTCATTTTTGGAT-GAAATAAATCATA
376 TTTATAACTCTTATAAATAATTTTAAAATTAAATTTTTTTTATTTCTAGTTAG-AA-CAATCATA
* * * * * * **
208286 ATTTGATGTCTACATTAGGAAACATGAA-TCGAAAGCTATCCATTGACAAGAGAAGTTTATTTAT
439 ATTTAATGTTTGCATTAGGAAACATGAAGT-AAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTAT
208350 AGTCACTC
503 AGTCACTC
*** * * ** * *
208358 ATGCCTTCGTATGCGTTGTTACTAACTTTAAGTAGTTTTATAA-CTTTATAAATGATTTTAAAGT
1 ATGCCTTTAAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATC-ATATAAATGATTTTAAA-T
** * * * ** * * * * ** * * *
208422 AATTTTTTTTTCATTTTTAG-TAAAATGA-TCATCATTTGATGTTCGTATTGGGAAAAGTGAAGT
64 AAAATTGTTTTCATTTATGGTTAAAACAATTCATAATTGGATGTTTGCATTAAG-AAACTTAAGC
* ** * * * * *
208485 GAAAGTAATCTATTGACAAGAAAAATTC-ATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAACCTAGTTGC
128 AAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAA-TCAATTTATAGTCACTCATACCTTCAAAAGCTTA-TTAC
* ** * * *
208549 TCACTTTAAATAGTTTTACAATCTT-GTAAATGATTTTACGTTGAATTTGTTTTTCACTTT-TGG
191 TCACTTTAAATA-TTTTATAATCTTAG-AAATGATTTTAAATTGAAATT-CTTTTCA-TTTCTAG
* * * * ** * * * *
208612 TTAAAACATATAATAATTT-ACTATTTGCATTAGGAAATGTGAGGCGAAA-CCATCCATTAATAA
252 TTAAAACAGATCATAATTTGA-TGTTTGCATCAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAA
* * * ** *
208675 GGAAAGTCCATTTATTA-TCATTCATGCCTTTGAAAGTCTAGTTACT--TGCTTTAAATGG-TTT
316 GAAAAGTCTATTTA-TAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTACTCAT-CTTTAAATGGTTTT
* * * * ** * * * * * *
208736 AT-AGTCTTATAAATGAGTTTAAAATTGAATTTTACTCATTTTTGGTTAAAATAAATTATAATTT
379 ATAACTCTTATAAATAATTTTAAAATTAAATTTTTTTTATTTCTAGTTAGAA-CAATCATAATTT
* * * ** ** * * * *
208800 GATGTTGGTAATGT-GG-AATGTGAAGCCAAAGCAATCCACTGACAAGAAAAGTCGACTTATAGT
443 AATGTTTG-CAT-TAGGAAACATGAAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGT
*
208863 CACTT
506 CACTC
** * * * * * * * * **
208868 ATGTTTTTAATAGCCTAGTTGCTCG-TTTAAATAATTTTGTAAACTTATAAATGATTTTCAATTG
1 ATGCCTTTAAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCATATAAATGATTTTAAATAA
* * * * * * * *
208932 AATT-TCTTTCATTTTTAGTTAAAATAGATT-ATAATTTGTTCTTTGCATCAGGAAA-TGTGAAA
66 AATTGT-TTTCATTTATGGTTAAAACA-ATTCATAATTGGATGTTTGCATTAAGAAACT-T--AA
* * * * * * ** * *
208994 TG-ACAA-CCATCCACTGACAA-AAAAAGTCCATCTATAGTCACTTATACTTTTGAAAGCCTAAG
126 -GCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAA-TCAATTTATAGTCACTCATACCTTCAAAAG-CTTAT
* * * * ** *
209056 TACTCACTGTAAATAGTTTTATAGTCTTATAAATGATTTTATATCAAAATTGTTTTTCATTT-TC
188 TACTCACTTTAAATA-TTTTATAATCTTAGAAATGATTTTAAATTGAAATT-CTTTTCATTTCT-
* * * * ** * *
209120 ACTTCAAATAGATCATAA-TTGAGTGTTGGCATTGGGAAACGTGAAGCAAAAACCATCCATTGAC
250 AGTTAAAACAGATCATAATTTGA-TGTTTGCATCAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGAC
* * * * * **
209184 ATGAAAAGTCAATTTATAGTCACTCATTCCTTCAAAAG--T-CTTACTACTTGCTTTAGGTGGTT
314 AAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTACT-CAT-CTTTAAATGGTT
* * * * * * *
209246 TTATACCT-TTATAAA-AGATTTT-AAATTGAATTCTTATTCATTTTTGGTT-GAAAAAGATCAT
377 TTATAACTCTTATAAATA-ATTTTAAAATTAAATT-TTTTTTATTTCTAGTTAG-AACA-ATCAT
* * * * ** * * *
209307 AATTTGATGTTTGTA-TGGGAAAACGA-GAAGCAAAAGTGATCCATTCATAA-AAAAGGTGCATT
438 AATTTAATGTTTGCATTAGG-AAAC-ATGAAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAA-GTCCATT
* *
209369 TGTAGTCATTC
500 TATAGTCACTC
* * * * * * * * *
209380 ATGCCTTCAAAAGCCTAGTTAATGGCTTTAAATAGTTCTAAAATTATATAAATGATTTTGAATTG
1 ATGCCTTTAAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCATATAAATGATTTT-AAATA
** * * ** * *
209445 ATTTTGTTTTCAATTT-TGGTTAAAA-TATATCATAATT-GTTGTTTGCATCGAGAAACGTGAAA
65 AAATTGTTTTC-ATTTATGGTTAAAACAAT-TCATAATTGGATGTTTGCATTAAGAAAC-TTAAG
** * * * * * *
209507 TGAAAGCTATCCATTGACAACAAAAATCTATTGATAGTCACTCATACCTTCGAAAG-TATAGTTG
127 CAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCAATTTATAGTCACTCATACCTTCAAAAGCT-TA-TTA
* * * * * * ** *
209571 CTCACTTTCAGTGGTTTTATAACCTTATAAATGATTTCAAATTG-AA-TC-TCCCATTTTTTA-T
190 CTCACTTTAAAT-ATTTTATAATCTTAGAAATGATTTTAAATTGAAATTCTTTTCA-TTTCTAGT
* * * * **
209632 TAAAACATATTATAATTTGATGTTTGCATCAGAAAACATAAAGCAAAAGCCATCTGTTGACAAGA
253 TAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGA
* * * * *
209697 AAAGTTTATTTATAGTTACTTATGCCTTAAAAAGCCTAGTTACTCACTTCAAATAGATCATAATT
318 AAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTACTCA--TC---T---T--TAAAT
* ** * * * * * * * **** * ***
209762 GGATGTTGGCATTGGAAAACGTGAAGCAAAAACCATCCATTGACATGAAAGAAATCTTATAAATG
373 GG-T-TT--TA-T--AACTC-T-TA-TAAATA--AT--TTTAAAATTAAATTTTTTTTATTTCT-
* * ** * * ** * ** * ** **
209827 AGTTA-AA-ATTGAATTTTTCTTACT-TTTG-GTTAAAATAGATCAT-AATTTGATG-TTTGTAT
423 AGTTAGAACAAT-CA-TAAT-TTAATGTTTGCATTAGGA-A-A-CATGAAGTAAAAGCCATCCAT
** ** *** *
209886 TGTGGAATCTAAAG--CAAAAATAAT--C-C
482 TG-ACAA-GAAAAGTCCATTTATAGTCACTC
** *** *
209912 ATTAACAAGAAAAGTCCATT-TATAGTCATTTATGCCTTCGATAGCCTAATTGCTCATTTTAATT
1 A-TGCCTTTAAAAG-CC-TTGT-TA--C---TC-----------G-C---TT--T-A----AA-T
* * * * ** * * *
209976 AGTTTTATAAGCTTATAAATGATTTTCAATTGATTTTTTTTTCATGTT-TTG-TAAAACAAATCA
34 AGTTTTATAATCATATAAATGATTTT-AAATAAAATTGTTTTCAT-TTATGGTTAAAACAATTCA
* * * * ** * * * * * *
210039 TAATTTGTTATTTGCA-TAAGGAAACATGAAGTGAAAGCTATCCATTGATAAGGAAAGTCTATTA
97 TAATTGGATGTTTGCATTAA-GAAAC-TTAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCAATTT
* * * * * * * * *
210103 ATAGTCATTTATACTTTCAAAAGCTTAGTTACT-AGTTTTAAGTGGTCTTATACCTTTTA-AAA-
160 ATAGTCACTCATACCTTCAAAAGCTTA-TTACTCA-CTTTAAAT-ATTTTATA-ATCTTAGAAAT
* * * * * * * * *
210165 GATTTTAAATTGAATTTTTTTTACATTTTTGGTCAAAAAAGATCATAACTTGATGTTTGTATTAG
221 GATTTTAAATTGAAATTCTTTT-CATTTCTAGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAG
* * * * * * *
210230 GAAA-AGAGAAGCAAAAGCGATCTATTGATAA-AAAAATCTATGTATAGTCACTCATGCCTTTAA
285 GAAACA-TGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAA
* * * * ** * * *
210293 AAGCTTAGTTGC-CCTCTTTAAATGGTTTCA-AAAGCTTATAAATGATTTT-CAATTGAATTTTT
349 AAGCCTAGTTACTCATCTTTAAATGGTTTTATAACTCTTATAAATAATTTTAAAATTAAATTTTT
* * * * * * * *
210355 TTCATTTTTAGTTAAAATAGATTAAAATTGT--TGTTTGCATTAGGAAACATGAAGCAAAAGCTA
414 TTTATTTCTAGTTAGAACA-ATCATAATT-TAATGTTTGCATTAGGAAACATGAAGTAAAAGCCA
**** * *
210418 TCCATTGACAAGAAAAAAATATTTATAGACACTA
477 TCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTC
* * * * * *
210452 ATACCTTT--GAGCACATGGTTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAAAGATTTTCAAA
1 ATGCCTTTAAAAGC-C-TTGTTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCATATAAATGATTTT-AAA
* * * * * * *
210515 TTAAATAT-CTCTCATATT-TAGTTAAAAC-ATATCATAATTTGATGTTTACA-TCAGAAAACAT
63 TAAAAT-TGTTTTCAT-TTATGGTTAAAACAAT-TCATAATTGGATGTTTGCATTAAG-AAAC-T
* * * * * * * **
210576 GAAGCAAAAACCATCTATTGATAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCATT-AAAA-CCGA
123 TAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCAATTTATAGTCACTCATACC-TTCAAAAGCTTA
* ** * * * * * * * *
210639 GTTGCTTGCTTTAAATAGTTTTATAATCTTATAAATAATTTTGAGTTGGATTTTTTTTCCATTTT
187 -TTACTCACTTTAAATA-TTTTATAATCTTAGAAATGATTTTAAATTGAAATTCTTTT-CATTTC
* * * * * *
210704 TGGTTAACATAGATCATAA-TTGTTGTTTGCATTAGGAAA-AGTGAAGCAAAAGCAATCCATTGA
249 TAGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACA-TGAAGCAAAAGCCATCCATTGA
* * * * * * ** **
210767 CACG-AAAGTCCATTTATAGGCACTTATACTTTTGAAAGCCTAGTTACT--TGCTTTAAATGGGC
313 CAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTACTCAT-CTTTAAATGGTT
* * * * * * * *
210829 TTATAA-TCTTATAAATGATTTTCAAGTTGAATGTTTCTTATTTTTTGTT-GAAACAAATCATAA
377 TTATAACTCTTATAAATAATTTTAAAATTAAATTTTTTTTATTTCTAGTTAG-AAC-AATCATAA
* * * * * * * * * *
210892 TTTGATGTTAGAATCA-AAATACGTGAAGCAAAATCTATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATA
440 TTTAATGTTTGCATTAGGAA-ACATGAAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATA
*
210956 GTC-CTTT
504 GTCAC-TC
* ** * * * * * * *
210963 ATGCGTTCGAAAGCCTAGTTACTCGCTTTCAATGGTTTTATAGT-ATTATAAATTATTTTCAATC
1 ATGCCTTTAAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCA-TATAAATGATTTTAAATA
* * * * * * * * * * * * *
211027 CATTTCTTTTTATCTCTAGTTAAAACAGA-TCATAATTGAATG-TTGCATTAGGAAAGGTGATGT
65 AAATTGTTTTCATTTATGGTTAAAACA-ATTCATAATTGGATGTTTGCATTAAGAAA-CTTAAGC
* * * * ** *
211090 GAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCA-TT-TA-T-ACTCATGCCTT-AGAAAGCCAAGTTGC
128 AAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCAATTTATAGTCACTCATACCTTCA-AAAGCTTA-TTAC
* * * * *
211150 TCACTTTAAATAGTTTTATAATCTTATAAATTATTTTGAATT-AAATTTTTTCTCATTTTTAGTT
191 TCACTTTAAATA-TTTTATAATCTTAGAAATGATTTTAAATTGAAATTCTTT-TCATTTCTAGTT
* * * *
211214 AAAACATATCATAA-TTGTTGTTTGCATCAGG-AA-ATGGTTAG-AGAAAGCCATCCATTGATAA
254 AAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACAT-G-AAGCA-AAAGCCATCCATTGACAA
* * * * ** * *
211275 GAAAAGTCCATTGATAGCCACT-AAGACCTTTGAAAGCCTAATAACTCA-CTTTAAATGGTTTTA
316 GAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATG-CCTTCAAAAGCCTAGTTACTCATCTTTAAATGGTTTTA
* * * * * * * * *
211338 TCA-TCTTATAAATGATCTTAAAATTGAATTTTTCTCATTTTTAGTTAAAACATATCATAATTGA
380 TAACTCTTATAAATAATTTTAAAATTAAATTTTTTTTATTTCTAGTTAGAACA-ATCATAATTTA
* * * ** * * * *
211402 ATGCTTGCATCAGAAAACATGAAGCGAAAGCCATCTATTGATAAAAAAAAGTCTATTTATAGTCA
444 ATGTTTGCATTAGGAAACATGAAGTAAAAGCCATCCATTGA-CAAGAAAAGTCCATTTATAGTCA
*
211467 CTG
508 CTC
* * * * * * * *
211470 ATACCTTCAAAAGCCTAGTTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATATATGA-TTTGAATCA
1 ATGCCTTTAAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCATATAAATGATTTTAAAT-A
* * * * * * ** **
211534 AAATTTATTTTCATTTCTTGTTAAAACAAATCATACTTGAATGTTTGCATTGGGAAACGAGAAGC
65 AAA-TTGTTTTCATTTATGGTTAAAACAATTCATAATTGGATGTTTGCATTAAGAAAC-TTAAGC
* * * * *
211599 AAAAGCCATCCTTTGACAA-AAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATACATTCGAAAACCTTGTTAC
128 AAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAA-TCAATTTATAGTCACTCATACCTTC-AAAAGCTTATTAC
** * * ** * * *
211663 TTGCTTGAAATGATTTTATTA-CTTTCTAAATGATTTTATATTGAATTTTATTTTCATTT-TATG
191 TCACTTTAAAT-ATTTTATAATC-TTAGAAATGATTTTAAATTGAA-ATTCTTTTCATTTCTA-G
* * * * * ** **
211726 TTAAAA-ATACCATAACTTGATGTTTGTATC-GTGGAACATGAAGTGAAAGTAATCCATTGACAA
252 TTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAG-GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAA
* * * * ***
211789 GAAAAATCCATTTATAGTCACTCATACCTTCAAAAGCATAGTTACT--TGCTTTAAGCAGTTTTA
316 GAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTACTCAT-CTTTAAATGGTTTTA
* * * * * * **
211852 TAA-TCTCCAT-AATGATTTTCAAATTGAATTTTTCTTTCAGTTT-TGGTTA-AAAAGATCATGG
380 TAACTCT-TATAAATAATTTTAAAATTAAATTTTT-TTT-A-TTTCTAGTTAGAACA-ATCATAA
* * * * * * * * * *
211913 TTTGATGTTTGTATCA-AAAACCATGAAATGAAAGCAATCGATTGACAAAAAAAGTCTATTTATA
440 TTTAATGTTTGCATTAGGAAA-CATGAAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATA
*
211977 GTTACTC
504 GTCACTC
* ** ** * * * * ** *
211984 ATACCTTCGAAAG-CTTAGTTGTTCACTTTAAATAATTTTACAATCTTATAAATGATTTGCAATT
1 ATGCCTTTAAAAGCCTT-GTTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCATATAAATGATTTTAAATA
* * * * * ** * ** *
212048 GAGTTCTTTTTCATTTTTTGTTAAAA-TTTATCATAATT-GTTGTTTGCATTGGGAAACATGAAG
65 AAATT-GTTTTCATTTATGGTTAAAACAAT-TCATAATTGGATGTTTGCATTAAGAAAC-TTAAG
** * * * * * * * ** * *
212111 TGAATGACATCCATTGACAGGAAAAGTCTATTGATAGTCACTCAT-GCTTGTGAAGGCCTAGTTA
127 CAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCAATTTATAGTCACTCATACCTT-CAAAAGCTTA-TTA
* * * *
212175 CTCACTTTGAATGGTTTCATAAT-TGTACAAATG-------ATT----TT-TTTT-AGTTT-TAG
190 CTCACTTTAAAT-ATTTTATAATCT-TAGAAATGATTTTAAATTGAAATTCTTTTCA-TTTCTAG
* * * * * * *
212225 TTAAAA-ATATCATAATTTGATGTTTGCATTAGAAAATAGGAAGCAAAAGCCATCCATTGAAAAA
252 TTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAG
* * * * * * * *
212289 AAAAATCCATTTATAGTCACTAATGCCTGCAAAGGCCTAGTTACTCA-CTTTGAATAGTTTTCTA
317 AAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTACTCATCTTTAAATGGTTTTATA
* * * * * * * * *
212353 A-TCTTATAAATTATTTTAAAATTGAATTTTTTCTCATTTTTGGTTA-AATATGTCATGATTTGA
382 ACTCTTATAAATAATTTTAAAATTAAATTTTTT-TTATTTCTAGTTAGAACA-ATCATAATTTAA
* * *
212416 TGTTTGCATTAGGAAACATAAAGTGAAAGCCATCCATTGACAACAAAAGTCCATTTATAGTCACT
445 TGTTTGCATTAGGAAACATGAAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACT
212481 C
510 C
* * * * * * * * *
212482 ATG-CTTGCAAAAGCCTAGATACTCACATTGAATAGTTTTCTAATCTTATAAATTATTTTAAAAT
1 ATGCCTT-TAAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCATATAAATGATTTT-AAAT
** * * * ** ** *
212546 TGAATT-TTTCTCATTTTTAGTTAAAA-TATGTCATAATTTTATGTTTGCATTGGGAAACATAAA
64 AAAATTGTTT-TCATTTATGGTTAAAACAAT-TCATAATTGGATGTTTGCATTAAGAAAC-TTAA
** * ** *
212609 GTGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCCATTTATAGTCACTCACGCCTTTAAAAGCTTAGTTA
126 GCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCAATTTATAGTCACTCATACCTTCAAAAGCTTA-TTA
* * * * * * * ** *
212674 CTTACTTTGAATAGTTTTCTAGTCTCAAAAATAATTTTAAATCAAAATT-TTTATCATTTCTAAT
190 CTCACTTTAAATA-TTTTATAATCTTAGAAATGATTTTAAATTGAAATTCTTT-TCATTTCTAGT
* * * * ** * * * *
212738 CAAAGCAAATCATAATTAGATGTTTGCATTGGGAAACGTGAAGCGAAAGCCATCCACTGCCAA-A
253 TAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGA
* * *
212802 ACAA-TTTCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAATCCTTGTTACTCAT-TTTAAATGGTTTTAT
318 A-AAGTCT-ATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTACTCATCTTTAAATGGTTTTAT
* * * * *
212865 AACT-TTATAAATGATTTT-GAATTGAATTTTTTTTTCATTTTTAATTTA-AACAAATCATAATT
381 AACTCTTATAAATAATTTTAAAATT-AAATTTTTTTT-ATTTCT-AGTTAGAAC-AATCATAATT
* ** * * * * ***
212927 TGACCTTTGCATGAGGAAAACA--AA-TCATAATTGCCATCTATTGACAATAGTTGTCCATTTAT
442 TAATGTTTGCATTAGG-AAACATGAAGT-A-AA-AGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTAT
* *
212989 AGTCCCTA
503 AGTCACTC
* * * *
212997 ATG-CTTTGAAAAGCCTAT-TTACTC-ATTGAAATAGTTTTACAATCTTATAAATGATTTTAAA-
1 ATGCCTTT-AAAAGCCT-TGTTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCATATAAATGATTTTAAAT
** * * * * ** * ** * *
213058 ACTTTATT-TTTTGTATTTTTGATTAAAACAAAATGTTAATT-GATGTTTGCTTTGGGGAACGTG
64 A--AAATTGTTTT-CATTTATGGTTAAAAC-AATTCATAATTGGATGTTTGCATTAAGAAAC-TT
* * * * * * * * * *
213121 AAACGAAAGCTATCCATTGATAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTGATGCCTTCAAAATCCTAAT
124 AAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCAATTTATAGTCACTCATACCTTCAAAA-GCTTAT
** * * * * ** *
213186 TACTTGCTTTAAATAGTTTTAGAGT-TGTACAAATGATCTTAAATCAAAAGGT-TTTTCATCTT-
188 TACTCACTTTAAATA-TTTTATAATCT-TAGAAATGATTTTAAATTGAAA-TTCTTTTCAT-TTC
* * * ** * * *
213248 TAGTTAGAACAGATCATAATTGGATGTTTACATCA-GAAGATGTGAATCGAAAGCCATTCATTGA
249 TAGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAA-ACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGA
* * * * * *
213312 CAAGAAAAGTCCATTTATAGTCAGTTATGCCTTCGAATGCCTAGTTACTCA-CTTCAAATGGTTT
313 CAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTACTCATCTTTAAATGGTTT
* * * * * * * **
213376 TACAA-TCTTATAAATGATTTT-AAGTT-GA-CTTTTTTAGTTT-TTGCTTAAAACATATTTTAA
378 TATAACTCTTATAAATAATTTTAAAATTAAATTTTTTTTA-TTTCTAG-TTAGAACA-ATCATAA
* * ** * *
213436 TTT-GTTTTTGCATCGGGAAACATGAAGCAAAAGCCATTCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAG
440 TTTAATGTTTGCATTAGGAAACATGAAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAG
213500 TCACTC
505 TCACTC
* * * * * * * * * * * *
213506 ATGCCTTCAAAGGGCTAGTTACTCACATAAAATGGTTTTATAGTCATATAGATGATTTTGAATGG
1 ATGCCTTTAAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCATATAAATGATTTTAAAT-A
* * * * * * *
213571 AAA-TGTTTTTCATTTCTAGTTATAGCAAATCATAACTAGATGTTTGCATT
65 AAATTG-TTTTCATTTATGGTTAAAACAATTCATAATTGGATGTTTGCATT
213621 TATAGTTCCT
Statistics
Matches: 38112, Mismatches: 10088, Indels: 7068
0.69 0.18 0.13
Matches are distributed among these distances:
443 1 0.00
444 3 0.00
445 4 0.00
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447 2 0.00
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Consensus pattern (510 bp):
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AATTGTTTTCATTTATGGTTAAAACAATTCATAATTGGATGTTTGCATTAAGAAACTTAAGCAAA
AGCCATCCATTGACAAGAAAAATCAATTTATAGTCACTCATACCTTCAAAAGCTTATTACTCACT
TTAAATATTTTATAATCTTAGAAATGATTTTAAATTGAAATTCTTTTCATTTCTAGTTAAAACAG
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TTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTACTCATCTTTAAATGGTTTTATAACTCTTATA
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* *
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* * * * * *
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127 GCTTTAAGTGGTTTTATAATCT-TATAAATGATTTTAAATTGATT
* * * * * * **
170850 TTTTTTCATTTTTAGTTAAAATAGATCAAAATTT-ATTGTTTGCATT-AGAAAACATGAAGTAAA
1 TTTTTTTATTTTTGGTTAAAACAAATCATAATTTGA-TGTTTGCATTAAG-AAATATGAAGCGAA
** * * ** * * * * *
170913 AGTTATCCATTGATAAGAAAAGTCCATCTATAGTCACTCATTCCTCCATAGGCATCATTACTCAC
64 AGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTAGAAGCCTTATTACTCGC
* *
170978 TTTCAA-TGGTTTTAAAATCTCAT-AA--A---TAAATTGAATT
129 TTT-AAGTGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATTG-ATT
* * * ** * * * * * * *
171015 TCTTTTCATTTTAGGTGT-GTACAGATCAAAATTTGTTGTTTGCATTGACAAATGTGAAGCAAAA
1 TTTTTTTATTTTTGGT-TAAAACAAATCATAATTTGATGTTTGCATTAAGAAATATGAAGCGAAA
** ** * * * * * * * * *
171079 ATCATCTTTTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGCCATTCATGTCTTCA-ACTA-ACTTTTTTCTTG
65 GCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTAGA--AGCCTTATTACTCG
* * *
171142 CTTTAAATGATTTTATAACCTTATAAATGATTTTAAATTGAATT
128 CTTTAAGTGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATTG-ATT
* * * * * * * * ** *
171186 CTTGTTCATTTTTAGTTGAAATAGATCATAATTTGATGTTTGCCTTGTG-AACATGAAGCGAAAG
1 TTTTTTTATTTTTGGTTAAAACAAATCATAATTTGATGTTTGCATTAAGAAATATGAAGCGAAAG
* * ** * * *** * * *
171250 CTATGCATCAACAA-TAAAGTTTGTTTATAGTCACTCATGCCTTTAAAAG-CATATTTACTCACT
66 CCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTAGAAGCCTTA-TTACTCGCT
* * *
171313 TTAAATGGTTTTATAATCTTAAAAATGATTTTAAGTTGAATGT
130 TTAAGTGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATTG-AT-T
* * * * * * * * *
171356 TTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAAATAAAAATTTGTTATTTGCATTGAGAAACATTAAGCGCAAG
1 TTTTTTTATTTTTGGTTAAAACAAATCATAATTTGATGTTTGCATTAAGAAATATGAAGCGAAAG
* * * * * * ** * *
171421 CCATCCATTGACAAGAAAAGTTCATTTATAGTTACTAATGCCTTAAAAAGTATTATTACTCACCT
66 CCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTAGAAGCCTTATTACTCGCTT
*
171486 TAAGTGGTTTTATAA-CTTTATAAATGATTTTAAATGGAATT
131 TAAGTGGTTTTATAATC-TTATAAATGATTTTAAATTG-ATT
* * * ** * * *
171527 TATTTTCATTTTTTGTTAAAACAGTTCATAATTTGATGTTTGGATTAAGAAATGTGAAGTGAAAG
1 TTTTTTTATTTTTGGTTAAAACAAATCATAATTTGATGTTTGCATTAAGAAATATGAAGCGAAAG
** * * * * * * * * * * * *
171592 TTATCCACTAACAA-AACAATTCCATTTATAATCACTCATGCCTTCAAAAGTCGTGTTAGTCACT
66 CCATCCATTGATAAGAA-AAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTAGAAGCCTTATTACTCGCT
* * * * * *
171656 TCAAATGGTTTTATAATCTTGTAAATGATTATGAATTGAAT
130 TTAAGTGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATTGATT
* * * * * * * * *
171697 TCTTTTCATTTTTGGTGAAAATAGATCATAATTTGATGTTTACATT-AGAAAACATGAGGCAAAA
1 TTTTTTTATTTTTGGTTAAAACAAATCATAATTTGATGTTTGCATTAAG-AAATATGAAGCGAAA
* * * * * * * *
171761 GCTATCCATTGACAAG-AAAGTCCATTTATCGTCACTCATGCCTTCAAAAG-C-GAGTTATTCGT
65 GCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTAGAAGCCTTA-TTACTCGC
* * ** *** **
171823 TTTAAATGGCTTTATAATCTTGCAAATGATTTTCGGTTGAAG
129 TTTAAGTGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATTGATT
* * * * * * * *
171865 TTTTTTCATTTTTGGTAAAAACATATTAGAATTTGTTATTTGCATTCAA-AGAA-ATGAAGCGCA
1 TTTTTTTATTTTTGGTTAAAACAAATCATAATTTGATGTTTGCATT-AAGA-AATATGAAGCGAA
* * * * * * * * ** * *
171928 AGCCATCAATTTACAA-AAAAGTCTATCTATAGTCACTAATACC-TTCGAAGGTGTTGTTAATCG
64 AGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTAGAA-GCCTTATTACTCG
* * * **
171991 CTTCAAATAGTTTTATAA-CTTTATAAATGATTTTGGATTGAATT
128 CTTTAAGTGGTTTTATAATC-TTATAAATGATTTTAAATTG-ATT
** * * * * ** *
172035 TTTTTTTATTTTTGGTTAAAACTTACCATAATTT-ATTGTGTACATTAGGAAACGTGAAGCGAAT
1 TTTTTTTATTTTTGGTTAAAACAAATCATAATTTGA-TGTTTGCATTAAGAAATATGAAGCGAAA
* * * * * * * * *
172099 GCTATCTATTGACAAGAAAAGTCCACTTATACTGACTTATG-CATTCGAAAG--TGTAGTTACTC
65 GCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTAG-AAGCCT-TA-TTACTC
* * ** * *
172161 GCTTTAAATAGTTTTATAATCTTATAAATGGGTTTGAATTGAAAT
127 GCTTTAAGTGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATTG-ATT
* ** * * * ** * *
172206 TTTTTTCATTTTTCTTTAAAATAGATCCTAATTTGATGTTTGCATTTGGAAATGTGAAGTGAAAG
1 TTTTTTTATTTTTGGTTAAAACAAATCATAATTTGATGTTTGCATTAAGAAATATGAAGCGAAAG
* * ** * * **
172271 CCATCCATTAACAAGATTAGTCCATTTATTGTCACTCATGCCTTT-GAAAG-GTTAATTACTTTC
66 CCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTAG-AAGCCTT-ATTACTCGC
* * *
172334 TTTAAATTGTTTTATAATCTTATAAATGAGTTTAAATTGATT
129 TTTAAGTGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATTGATT
* * * ** * * ** *
172376 TTTTGTTCATTCTTAGTTAAAACTGATCATAGTTTAATGTTTGCATTGGGAAACT-TGAAGCAAA
1 TTTT-TTTATTTTTGGTTAAAACAAATCATAATTTGATGTTTGCATTAAGAAA-TATGAAGCGAA
* * * * * * *
172440 AACCATCCATTGATGAA-AAAAGTCTATTTACATTGACTTATGCC--TAGGAAAGCC-TAGTTTC
64 AGCCATCCATTGAT-AAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTA-G-AAGCCTTA-TTAC
* * * * * * *
172501 TCACTTGAAATAGTTTTATAATCATATAAATGATTTGAAATTAATT
125 TCGCTTTAAGTGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATTGATT
* * * * * *
172547 TTTTTTAATTCTTGGTTAAAACATATCCTAGTTTGATGTTTGCATTAGGAAATATGAAG-GAAA-
1 TTTTTTTATTTTTGGTTAAAACAAATCATAATTTGATGTTTGCATTAAGAAATATGAAGCGAAAG
** * * ** * *
172610 CTTTTCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATTA-TCACTCATATC-TTGGAAAGCC-TAGTTACTT
66 C-CATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTA-TAGTCACTCATGCCTTTAG-AAGCCTTA-TTACTC
* * * ** *
172672 GCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAACTAATTTTAAATCAAAAT
127 GCTTTAAGTGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAAT-TGATT
* * * ** ** * * *
172717 TTTTCTCATTTCTT-GTTAGAAA-AAATCATAATTGGATGTTTGTGTTGGGAAACATAAAG-TAT
1 TTTTTTTATTT-TTGGTTA-AAACAAATCATAATTTGATGTTTGCATTAAGAAATATGAAGCGA-
* * * * *
172779 AAGCTATCCATTGACAAGTAAAA-TCCATTTACAGTCACTCATGCC-TTCGAAAGCCTGATTACT
63 AAGCCATCCATTGATAAG-AAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTAG-AAGCCTTATTACT
* * * *
172842 CGCCTTAAGTGGTATTATAA-CTTTATAAATGATTTTAATTTAAATT
126 CGCTTTAAGTGGTTTTATAATC-TTATAAATGATTTTAAATT-GATT
* * ** * * *
172888 GTTTTTCATTTTTGGTT-AAATGAATCATAATTTGATGTTTGCATCAAAAAATGTGAAGCGAAAG
1 TTTTTTTATTTTTGGTTAAAACAAATCATAATTTGATGTTTGCATTAAGAAATATGAAGCGAAAG
* * * * * * * * *
172952 TCATCCATTGACAAGAAAAATCTATTTATAGTCACAT-ATGCCTTCAAAAGCCTAATTGCTAGCT
66 CCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCAC-TCATGCCTTTAGAAGCCTTATTACTCGCT
* * * ** * *
173016 TTAAATGATTTTAGAATCACATAAATG-TTTACAAAATAT-AAT
130 TTAAGTGGTTTTATAATCTTATAAATGATTT--TAAAT-TGATT
* * * * ** *
173058 TTTTCTCATTTTTTGTTAAAACATATCATAATTTGATGTTTGCA-TAAGGAAAGGTAAAGCGAAA
1 TTTTTTTATTTTTGGTTAAAACAAATCATAATTTGATGTTTGCATTAA-GAAATATGAAGCGAAA
* ** ** * *
173122 GCCATCTATTGATAA-AATAAGTCCATTTATAGTCACTCATATCTACAAAAGCC-TAGTTACACG
65 GCCATCCATTGATAAGAA-AAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTAGAAGCCTTA-TTACTCG
* * * ** **
173185 CTTTAAATGGTTTTATAGTCTTATTAATGATTTTAAATAAAAA
128 CTTTAAGTGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATTGATT
* * * ** * * * * * * *
173228 TTTTTTCATTTCTAGTT-AAACAGGTCATAAGTGGACT-TTTGCATCATGAAACATTAAGTGAAA
1 TTTTTTTATTTTTGGTTAAAACAAATCATAATTTGA-TGTTTGCATTAAGAAATATGAAGCGAAA
* * * * ** * * *
173291 -ACTTCCATTGACT-AGAAAAGTCTATTTGTAGTCACTCATAACTTT-GAAACCCTTGTTACTTG
65 GCCATCCATTGA-TAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTAG-AAGCCTTATTACTCG
* *
173353 CTTTAAGTGGTTTTATGA-CATTATAATTGATTTTAAATTGA-T
128 CTTTAAGTGGTTTTATAATC-TTATAAATGATTTTAAATTGATT
* * * * * *
173395 TTTTTTCATTTCTT-GTTAAAATAGATCATAATTTGATGTTTGCA-TCAGAAA-AGGTAAAGCAA
1 TTTTTTTATTT-TTGGTTAAAACAAATCATAATTTGATGTTTGCATTAAGAAATA--TGAAGCGA
** * ** ** *
173457 AAATCATCCATTGAATAA-AAAAGTTCATTTATAGTCTGTTTTG--TGTTCGAAAGCC-TAGTTA
63 AAGCCATCCATTG-ATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCT-TTAG-AAGCCTTA-TTA
* * * * * * * **
173518 CTTGCTTTCAA-TGTTTTTACAGTATTAT-AATCATTTTTATATTGAAA
124 CTCGCTTT-AAGTGGTTTTATAATCTTATAAATGA-TTTTAAATTGATT
* * * ** * * **
173565 TTTTCTTAGTTTTGGTTAAAACAGATTGTAATTTGATGTTTGTATTGAGAAAGGTGAAGCGAAAG
1 TTTTTTTATTTTTGGTTAAAACAAATCATAATTTGATGTTTGCATTAAGAAATATGAAGCGAAAG
* * * * * * * * *
173630 CAATCCATTAATAAAAAAAAATCTATTTATAGGCACTC-TGGCCTTCA-ATAACCTAATTACTCA
66 CCATCCATTGAT-AAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAT-GCCTTTAGA-AGCCTTATTACTC-
* * * *
173693 AC-TTAAGTGGTTTTATGATCTTATAAATGATTTTAAAATTAACT
127 GCTTTAAGTGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTT-AAATTGATT
* * * * * * *
173737 TTTTCTCATTTTTTGTTAAAACAGATCATAATTTAATGTTTGCATCAAGAAATGTGAAGCGAAAG
1 TTTTTTTATTTTTGGTTAAAACAAATCATAATTTGATGTTTGCATTAAGAAATATGAAGCGAAAG
* * * * * * * * *
173802 CCATCCAATAATAATAAAAATCCATTTGTAGTTACTCTTGCCTTCA-CAGCCTTATTACTCGCTT
66 CCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTAGAAGCCTTATTACTCGCTT
* * * *
173866 TAAATGGTTTTAT-AGCTTTATAAATAATTTTAAATT-AAT
131 TAAGTGGTTTTATAATC-TTATAAATGATTTTAAATTGATT
* * * * * **** * *
173905 TTTTTTTATTTTTTGTTAGAACAGATCATAACTTCATGTTTGCACCGGGAAATGCT-AAGCGCAA
1 TTTTTTTATTTTTGGTTAAAACAAATCATAATTTGATGTTTGCATTAAGAAAT-ATGAAGCGAAA
** * * * * * * ** * * * *
173969 GTTATTCATTAACAAGAAAAGTCCATTTGTTGTAACTTTTGCCTTCAAAAACC-TAGTTTCTCGC
65 GCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTAGAAGCCTTA-TTACTCGC
* * * * * *
174033 TTTAAATGGGTTTATAATCCTATAAATGATTTAAAATTAAAT
129 TTTAAGTGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATTGATT
* * * * *
174075 TTTTTTTATTTTTGGTTAAAACAAATCGTAATTTCATATTTGCATTAGGAAACATGAAGCGAAAG
1 TTTTTTTATTTTTGGTTAAAACAAATCATAATTTGATGTTTGCATTAAGAAATATGAAGCGAAAG
* * * * * * * *
174140 CTATCCATTGACAAGAAAATTCTATTTTATAGTCATTCATACCTTTAAAAACC-TAGTTACAT-G
66 CCATCCATTGATAAGAAAAGTCCA-TTTATAGTCACTCATGCCTTTAGAAGCCTTA-TTAC-TCG
* * * * *
174203 -TTTCAAATGGTTTTATAGTCATATAAATAATTTTAAATTGAAGT
128 CTTT-AAGTGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATTG-ATT
* * *** * * ** * * ** * *
174247 GTTTTTCATTTGAAGTTAAAACAAATCATAATTGGATTTTTGTGTCAGGAAACGTGAAGCAAAAC
1 TTTTTTTATTTTTGGTTAAAACAAATCATAATTTGATGTTTGCATTAAGAAATATGAAGCGAAAG
* * * *
174312 CCTTCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTGTAGTCACTCATGCCTTT-GAAAGCCTTGTTACTCACT
66 CCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTAG-AAGCCTTATTACTCGCT
* * * *
174376 TCAAGTGATTTTATAA-CTTCAAAAATAATTTTAAATTGA-T
130 TTAAGTGGTTTTATAATCTT-ATAAATGATTTTAAATTGATT
* ** * * * * *
174416 TTTTTTCA-TTTCAGTTAAAATAGATCATAATTTGATGTTTGCATT-GGAAA-ACGTAAAGCAAA
1 TTTTTTTATTTTTGGTTAAAACAAATCATAATTTGATGTTTGCATTAAGAAATA--TGAAGCGAA
* * * * *
174478 AGCCAT-CATTAACT-AGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCGTG---TTCGAAAGCCTAATTATTT
64 AGCCATCCATTGA-TAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTAG-AAGCCTTATTA-CT
* ** * * **
174538 C-CTTTAAATATTTTTACAATCTTATAAATGATTTTTACATTGAAA
126 CGCTTTAAGTGGTTTTATAATCTTATAAATGA-TTTTAAATTGATT
* * ** * * **
174583 TTTTCTTATTTTTGGTTAAAATAAATTGTAATTTGATGTGTGCATCAAGAAACGTGAAGCGAAAG
1 TTTTTTTATTTTTGGTTAAAACAAATCATAATTTGATGTTTGCATTAAGAAATATGAAGCGAAAG
** ** * * * *
174648 TGATCCATTGATAAGAAAAGTTAATTTGTAG-CTACTCATGCC-TTCGAAAGCCTTGTTACTTGC
66 CCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTC-ACTCATGCCTTTAG-AAGCCTTATTACTCGC
* *
174711 TTCAAGTGATTTTATAA-CTTTATAAATGA-TTTAAA-T--TT
129 TTTAAGTGGTTTTATAATC-TTATAAATGATTTTAAATTGATT
* * * * * * * *
174749 TTTTTTCACTTTTT-ATTAAAGCATATCAAAATTTGATGTTTGCA-TCAGAAA-ACGTAAAGTGA
1 TTTTTTTA-TTTTTGGTTAAAACAAATCATAATTTGATGTTTGCATTAAGAAATA--TGAAGCGA
* * *
174811 AAGCCATCCATTGAGT-AGAAAA-TCCATTTATAGTCACTTATACCTCT-GAAAGCC-TAGTTAC
63 AAGCCATCCATTGA-TAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTAG-AAGCCTTA-TTAC
* * * *
174872 TCACTTTAAGTGATTTTATAA-CTTTATAAATGATTTTAAATTTAAT
125 TCGCTTTAAGTGGTTTTATAATC-TTATAAATGATTTTAAATTGATT
* * * ** * * * * * * *
174918 TTTTATCAATTTCAGTTAAAATAGATCATTATTGGATGTTTGAATT-GGAAAATCTGAAGCGAAA
1 TTTTTTTATTTTTGGTTAAAACAAATCATAATTTGATGTTTGCATTAAG-AAATATGAAGCGAAA
*** * * * * * * *
174982 ATGATCTATTGACAA-AAAAGTTCATTTATAGTCACTCAAGTCTTT-GAAAACCTAATTACTCGC
65 GCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTAG-AAGCCTTATTACTCGC
* * * *
175045 TTTAAATGGTTTTGTGATCTTATAAATGATTTTAAAATTGAAT
129 TTTAAGTGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTT-AAATTGATT
* * * * * ** ** * * *
175088 ATTTCTCATTTTTTGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGTGTTGGGAAATGTGAATCAAAAG
1 TTTTTTTATTTTTGGTTAAAACAAATCATAATTTGATGTTTGCATTAAGAAATATGAAGCGAAAG
* * * * * * *
175153 CCATCAATTGACAAGAAAAATCCATTTATATTCATTCATGACTTT-GAAAGCCTTATTACTCACT
66 CCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTAG-AAGCCTTATTACTCGCT
*
175217 TTAAGTGGTTTTATAA-CTTTATAAATGATTTTAAATTGAAT
130 TTAAGTGGTTTTATAATC-TTATAAATGATTTTAAATTGATT
* * * * * * * *
175258 TTTTTTTATTTTTAGTTAGAACAGATCATAGTTTGATGTTTGCATCAAGGAATGTGAAGCAAAAG
1 TTTTTTTATTTTTGGTTAAAACAAATCATAATTTGATGTTTGCATTAAGAAATATGAAGCGAAAG
** * * * * * * *
175323 TTATCCAGTGATAAGAAAAGT-CAATTATAGTCGCTCATGCC-TTCGAAAACC-TATCTACCCAC
66 CCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTAG-AAGCCTTAT-TACTCGC
* * *
175385 TTTAAATGGTTGTATAACCTTATAAATGATTTTAAAATTGA--
129 TTTAAGTGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTT-AAATTGATT
* * * * * * ** * *
175426 ATTTCTCATTTTTGGTT-AAACAAAAT-ATAATTTGTTATTTACATTGGGAAACATGAAGCAAAA
1 TTTTTTTATTTTTGGTTAAAAC-AAATCATAATTTGATGTTTGCATTAAGAAATATGAAGCGAAA
* * * * * * * * * **
175489 GCCATCCATTGACAAGCAAGGTCAATTTACAGTCACTCATGCCTTCAAAAACCTAATTACAAGCT
65 GCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTAGAAGCCTTATTACTCGCT
* * * * * **
175554 TCAAATGGTTTTTTAGTCTTACAAATGATTTTAAATAAATT
130 TTAAGTGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATTGATT
* * * * * *
175595 TTTTTTTATTTTTGGATAAAAAAAATCATAATTAGAT-TTATGTATTAGGAAACT-TAAAGC-AA
1 TTTTTTTATTTTTGGTTAAAACAAATCATAATTTGATGTT-TGCATTAAGAAA-TATGAAGCGAA
* * * * *
175657 AACCTTTCCATTGATAAGAAAAG-CTCATTTATAGTCACTCAT-ACTTTTGAAAACCTTATTACT
64 AGCC-ATCCATTGATAAGAAAAGTC-CATTTATAGTCACTCATGCCTTTAG-AAGCCTTATTACT
* * * * * *
175720 AGCTTCAAGTGGTTTGATGA-CTTTATAAATAACTTT-AA---A--
126 CGCTTTAAGTGGTTTTATAATC-TTATAAATGATTTTAAATTGATT
* * ** * *
175759 ---TTTT-TTTTT-GTTAAAACAAATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACGTAAAGCAAAAG
1 TTTTTTTATTTTTGGTTAAAACAAATCATAATTTGATGTTTGCATTAAGAAATATGAAGCGAAAG
* * *
175819 CCATCCGTTGACTAA-AAAAGTCTATTTATAGTCACTCATG--TGTTCGAAAG-CTTAGTTACTC
66 CCATCCATTGA-TAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCT-TTAG-AAGCCTTA-TTACTC
* * * * * **
175880 GCGTTAAATGTTTTTACAATCTTATAAGTGAATTTTATGTTGACTT
127 GCTTTAAGTGGTTTTATAATCTTATAAATG-ATTTTAAATTGA-TT
* * * * * * * * *
175926 TTTTCTCATTTTTGGTTAAAACATATCGTAATTTGTTGCTCGCATTGAGAAATATGGAA-CAAAA
1 TTTTTTTATTTTTGGTTAAAACAAATCATAATTTGATGTTTGCATTAAGAAATAT-GAAGCGAAA
* ** * ** * ** *
175990 GCTATCCATTGATAAGAAAAAACCATTTATAGTCACT-TTTACTTTCAAAAATC-TAGTTACACG
65 GCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTT-AGAAGCCTTA-TTACTCG
* ** * ** *
176053 CTTGAAAAGGTTTTGTAGCCTTATAAATGATTTTAAATTGAAAT
128 CTTTAAGTGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATTG-ATT
* * * * * * * ** * * * * * * *
176097 GTGTTTCATTTCTAGTTACAATAGTTCA-AAATTGAATGTTTGTATT-GGAAAGATTAAAACCAA
1 TTTTTTTATTTTTGGTTAAAACAAATCATAATTTG-ATGTTTGCATTAAGAAATA-TGAAGCGAA
* * * * * * * * * **
176160 AACCATCCATTGACAAGAAAAATCCATGTATAGCCACTCTTGCCTTT-GAAAACTTTGTTACTTA
64 AGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTAG-AAGCCTTATTACTCG
* *
176224 CTTTAAGTGGTTTTATAA-CTTTATAAATAATTTTAAATTGAAT
128 CTTTAAGTGGTTTTATAATC-TTATAAATGATTTTAAATTGATT
* ** * ** * * * ** ** *
176267 GTTTTCCATATTTAATT-AAACTAGATTA-ATATTTAATGTTTGCATTGGGAAACGTGAACCGAA
1 TTTTTTTATTTTTGGTTAAAAC-AAATCATA-ATTTGATGTTTGCATTAAGAAATATGAAGCGAA
* * * * * * *
176330 AGCCATCCCTTGATAAGAAAAATCTATTTATAATCACTCATGTC-TTCGAAAGCCTTATTACTGG
64 AGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTAG-AAGCCTTATTACTCG
*
176394 CTTTAAGTGGTTTTACAA-CTTATAAATGATTTTAAATTGATT
128 CTTTAAGTGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATTGATT
* ** * * * * * *
176436 TTTTTTTCATTTTTAGTTTGAATAGATCATAATTTGATATTTGCATCT-TGAAACATGAAGCAAA
1 TTTTTTT-ATTTTTGGTTAAAACAAATCATAATTTGATGTTTGCAT-TAAGAAATATGAAGCGAA
** * * * ** *
176500 AGTTATCCATTCACAAG-AAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCC-TTCGTAAGCC-TAGTTGTTT
64 AGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTAG-AAGCCTTA-TTACTC
* * * *
176562 GCTTTAAATGATTTTATAATCATATAAATAATTTTCAAATTGATT
127 GCTTTAAGTGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTT-AAATTGATT
* * * * * * *
176607 TTTTTTTATTTTTAGTAAAAACATATCATAATTTGATGCTTGCATT-AGAAAATGTGAATCAAAA
1 TTTTTTTATTTTTGGTTAAAACAAATCATAATTTGATGTTTGCATTAAG-AAATATGAAGCGAAA
* * * ** * * * ** ** * *
176671 GCTATTCATT-AGCACCAAAAGTCTATTTATAGTCACTTATACCTTCGGAAGCC-TAGGCACACA
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* * * * *
176734 CTTCAAATGGTTTTATAGTCTTATAAATGATTGTAAATTAAAATT
128 CTTTAAGTGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATT--GATT
* * * *
176779 TTTTTTCATTTCTAGTTAAAACATATCATA
1 TTTTTTTATTTTTGGTTAAAACAAATCATA
176809 GTTAGATTTT
Statistics
Matches: 8922, Mismatches: 2426, Indels: 1072
0.72 0.20 0.09
Matches are distributed among these distances:
152 3 0.00
153 1 0.00
154 1 0.00
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173 259 0.03
174 138 0.02
175 3 0.00
ACGTcount: A:0.35, C:0.13, G:0.13, T:0.39
Consensus pattern (170 bp):
TTTTTTTATTTTTGGTTAAAACAAATCATAATTTGATGTTTGCATTAAGAAATATGAAGCGAAAG
CCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTAGAAGCCTTATTACTCGCTT
TAAGTGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATTGATT
Found at i:165796 original size:503 final size:504
Alignment explanation
Indices: 164999--166200 Score: 1139
Period size: 503 Copynumber: 2.4 Consensus size: 504
164989 CATTTACGAC
* ** * ** ** *
164999 AAGAAAAGTCCATTTATAGTTGTTCATGCCTTTGAAAGTCTTGTTACTCACTTTAAGTGGTTTTG
1 AAGAAAAGTCCATTTACAGTCATTCATGCCTTCGAAACCCTTGTTACTTGCTTTAAGTGGTTTTA
* * *
165064 TAACTT-TATAAATGA-TTTAAAATTGATTTTTTTTTATTTTTGGTTAAAACAAATCATAATTTC
66 TAA-TTCTATAAATGAGCTT-AAATTGAATTTTTTTTA------GTTAAAACAAATCATAATTTG
* * * * * ** *
165127 ATGGTTGCATTAAGAAGTGTGAAGCGAAAGCAATTTATTGATAAAAAAAATCCATTTATAGTCAC
123 ATGTTTGCATCAAGAAATATAAAGCGAAAGCAATCCATTGAT-AAAAAAGTCCATTTATAGTCAC
*
165192 TCATCCCTTTAGAAGCCTTATTACTCGCTTCAAATGGTTTTATAATCATTTAAATGATTTTAAAT
187 TCATCCCTTGAGAAGCCTTATTACTCGCTTCAAATGGTTTTATAATCATTTAAATGATTTTAAAT
* * * * * * * * * *
165257 CAAAATTGTTTTCATTTCTGGTTCAAACATATCATAATTTGATGTTTACATTAGGAAATAT-AAG
252 CAAAATTGTTTTAATTTCTAGCTAAAACAGATCATAACTTGATATTTACATCAAGAAACATGAA-
* * *
165321 GCAAAAGCCATCCATTGAGACAA-AAAA--TCTATTTGTAGCCACTCATACCTTCGA-AAGCCTT
316 GCAAAAGCCATCCATT--GACAAGAAAAGTTC-ATGTATAGCAACTCATACCTT-GAGAAGCCTT
* * * * *
165382 ATTACTAGCTTTAAGTGATTTTATAA-CTTTATAAATGACTTTAAATTGAATTTTTTTTTATTTT
377 ATTACTAGCTTTAAATGATTTTATAATC-TCATAAATAACTTTAAATTGAATTCTTTTTCATTTT
* * * * *
165446 TGGTTAAAAAAAATTATAATTTGA-TGTTTGCATCT-AGAAATGTGTAGTGAAAGCCT-TCCATT
441 AGGTT-AAAAAAATCATAATTT-ATTGTTGGCAT-TGAGAAATGTGAAGTGAAAG-CTAACCATT
165508 GAT
502 GAT
* * * *
165511 ACGAAAAGTCTATTTATAGTCACTT-ATGCCTT-TAAACCCTTGTTACTTGCTTTAAGTGGTTTT
1 AAGAAAAGTCCATTTACAGTCA-TTCATGCCTTCGAAACCCTTGTTACTTGCTTTAAGTGGTTTT
*
165574 ATAA-TCTTATAAATGAGCTTGAATTGAA-TTTTTTTA-TTAAAACAAATCATAATTTGATGTTT
65 ATAATTC-TATAAATGAGCTTAAATTGAATTTTTTTTAGTTAAAACAAATCATAATTTGATGTTT
* * * * * *
165636 GCATCGACAAATATAAAGCGAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTGCATTTATAGTCACTTATGC
129 GCATCAAGAAATATAAAGCGAAAGCAATCCATTGATAA-AAAAGTCCATTTATAGTCACTCATCC
* * * * *
165701 GTTCGA-AAGCCTTTTTACTCGCTTTAAGTGGTTTTATAA-C-TTTCAGAATGATTTTAAAT-TA
193 CTT-GAGAAGCCTTATTACTCGCTTCAAATGGTTTTATAATCATTT-A-AATGATTTTAAATCAA
* * * * *
165762 ATTCTTTTTTAATTTTTAGCTAAAACAGATCATAACTTGTTATTTGCATCAAGAAACATGAAGCA
255 AAT-TGTTTTAATTTCTAGCTAAAACAGATCATAACTTGATATTTACATCAAGAAACATGAAGCA
* * * * * * * *
165827 AAAGCCATTCATTGACAAGAAAAGTTCATGTATAGTAACTCATGCCTTTAGACGCGTTGTTACTC
319 AAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTTCATGTATAGCAACTCATACCTTGAGAAGCCTTATTACTA
* * *
165892 GCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAAATAATTTTAAATTGAATTCTTTTTCATTTTAGGTTCAA
384 GCTTTAAATGATTTTATAATCTCATAAATAACTTTAAATTGAATTCTTTTTCATTTTAGGTTAAA
* * * *
165957 CAGATCATTATTTATTGTTGGCATTGAGAAATGTGAAGTGATAGCTAACCATTGAT
449 AAAATCATAATTTATTGTTGGCATTGAGAAATGTGAAGTGAAAGCTAACCATTGAT
* ** *
166013 AAGAAAAGTCCATTTACAGTCATTCATGCCTTCGACAGGCTTGTTACTTGTTTTAAGTGGTTTTA
1 AAGAAAAGTCCATTTACAGTCATTCATGCCTTCGAAACCCTTGTTACTTGCTTTAAGTGGTTTTA
* * * ** * * *
166078 TAGTTCTATAAGTTATTTTAAATTGAATTTTTTTTAGTTAAAATAGATCATAATTTGATGTTTAC
66 TAATTCTATAAATGAGCTTAAATTGAATTTTTTTTAGTTAAAACAAATCATAATTTGATGTTTGC
* * *** * *
166143 ATCAAGAAACATAAAGCAAAAATTATCCATTGATAAAAAAGTTCATTTGTAGTCACTC
131 ATCAAGAAATATAAAGCGAAAGCAATCCATTGATAAAAAAGTCCATTTATAGTCACTC
166201 GTACCTTAGT
Statistics
Matches: 563, Mismatches: 104, Indels: 54
0.78 0.14 0.07
Matches are distributed among these distances:
501 14 0.02
502 81 0.14
503 297 0.53
504 35 0.06
505 54 0.10
509 1 0.00
510 8 0.01
511 44 0.08
512 27 0.05
513 2 0.00
ACGTcount: A:0.34, C:0.13, G:0.14, T:0.40
Consensus pattern (504 bp):
AAGAAAAGTCCATTTACAGTCATTCATGCCTTCGAAACCCTTGTTACTTGCTTTAAGTGGTTTTA
TAATTCTATAAATGAGCTTAAATTGAATTTTTTTTAGTTAAAACAAATCATAATTTGATGTTTGC
ATCAAGAAATATAAAGCGAAAGCAATCCATTGATAAAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATCCCTT
GAGAAGCCTTATTACTCGCTTCAAATGGTTTTATAATCATTTAAATGATTTTAAATCAAAATTGT
TTTAATTTCTAGCTAAAACAGATCATAACTTGATATTTACATCAAGAAACATGAAGCAAAAGCCA
TCCATTGACAAGAAAAGTTCATGTATAGCAACTCATACCTTGAGAAGCCTTATTACTAGCTTTAA
ATGATTTTATAATCTCATAAATAACTTTAAATTGAATTCTTTTTCATTTTAGGTTAAAAAAATCA
TAATTTATTGTTGGCATTGAGAAATGTGAAGTGAAAGCTAACCATTGAT
Found at i:166525 original size:503 final size:500
Alignment explanation
Indices: 165383--166614 Score: 1144
Period size: 503 Copynumber: 2.4 Consensus size: 500
165373 GAAAGCCTTA
* * *
165383 TTACTAGCTTTAAGTGATTTTATAACTTTATAAATGACTTTAAATTGAATTTTTTTTTATTTTTG
1 TTACTCGCTTTAAGTGATTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAA-TTTTTTTAATTTTTG
* * * * * *
165448 GTTAAAAAAAATTATAATTTGATGTTTGCATCTAG-AAATGTGTAGTGAAAGCCTTCCATTGATA
65 GTT-AAAACAATCATAATTTGTTGTTTG-A-ATAGAAAATGTGAAGTGAAAGCCATCCATTGATA
* * * *
165512 CGAAAAGTCTATTTATAGTCACTTATGCCTTTAAACCCTTGTTACTTGCTTTAAGTGGTTTTATA
127 AGAAAAGTCCATTTACAGTCACTTATGCCTTGAAACCCTTGTTACTTGCTTTAAGTGGTTTTATA
* * *
165577 ATCTTATAAATGAGCTTGAATTGAATTTTTTTATTAAAACAAATCATAATTTGATGTTTGCATCG
192 ATCTTATAAATGAGCTTAAATTGAATTTTTTTATTAAAACAAATCATAATTTGATGTTTACATCA
* * * * * * *
165642 ACAAATATAAAGCGAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTGCATTTATAGTCACTTATGCGTTCGA
257 ACAAACATAAAGCAAAAACCATCCATTGATAAGAAAAGTGCATTTATAGTCACTCATACCTTAGA
* * * * *
165707 AAGCCTTTTTACTCGCTTTAAGTGGTTTTATAACTTTCAGAATGATTTTAAATTAATTCTTTTTT
322 AAGCATATTTACTCGCTGTAAATAGTTTTATAACTTTCAGAATGATTTTAAATTAATTCTTTTTT
* * *
165772 AATTTTTAGCTAAAACAGATCATAACTTGTTATTTGCATCAAGAAACATGAAGCAAAAGCCATTC
387 AATTTTTAGCTAAAACAGATCAGAACTTGTTATTTGCATCAAGAAACATGAAACAAAAGCCATCC
* * * * * **
165837 ATTGACAAGAAAAGTTCATGTATAGTAACTCATGCCTTTAGACGCGTTG
452 ATTAACAAGAAAAGTCCATCTATAGTAACTAATGCCTTTAGAAGAATTG
* * * * * *
165886 TTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAA-TCTCATAAATAATTTTAAATTGAATTCTTTTTCATTTTA
1 TTACTCGCTTTAAGTGATTTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAATTGAATT-TTTTTAATTTTT
* * * * * * * * *
165950 GGTT-CAACAGATCATTATTTATTGTTGGCATTGAGAAATGTGAAGTGATAGCTAACCATTGATA
64 GGTTAAAACA-ATCATAATTTGTTGTTTGAATAGA-AAATGTGAAGTGAAAGCCATCCATTGATA
* ** *
166014 AGAAAAGTCCATTTACAGTCA-TTCATGCCTTCGACAGGCTTGTTACTTGTTTTAAGTGGTTTTA
127 AGAAAAGTCCATTTACAGTCACTT-ATGCCTT-GAAACCCTTGTTACTTGCTTTAAGTGGTTTTA
* * * ** * *
166078 TAGT-TCTATAAGTTATTTTAAATTGAATTTTTTTTAGTTAAAATAGATCATAATTTGATGTTTA
190 TAATCT-TATAAATGAGCTTAAATTGAA-TTTTTTTA-TTAAAACAAATCATAATTTGATGTTTA
* ** * * *
166142 CATCAAGAAACATAAAGCAAAAATTATCCATTGATAA-AAAAGTTCATTTGTAGTCACTCGTACC
252 CATCAACAAACATAAAGCAAAAACCATCCATTGATAAGAAAAGTGCATTTATAGTCACTCATACC
* * *
166206 TTAGTAAGCATATTTACTTG-TAGTAAATAGTTTTATAATCTTAT-A-AATGATTTTAAGTTTAA
317 TTAGAAAGCATATTTACTCGCT-GTAAATAGTTTTATAA-CTT-TCAGAATGATTTTAA-ATTAA
* * * * ** * * *
166268 -T-TTTTTTCATTTTTAGTTGAAACGGATCAGATTTTGTTGTTTGCATTAAGAAACATGAAACAC
378 TTCTTTTTTAATTTTTAGCTAAAACAGATCAGAACTTGTTATTTGCATCAAGAAACATGAAACAA
* * * * *
166331 AAGCCATCCATTAACATGTAAAGTCCATCTATAGTCACTAATG-TTTTCGAAAGAATTG
443 AAGCCATCCATTAACAAGAAAAGTCCATCTATAGTAACTAATGCCTTTAG-AAGAATTG
* * *
166389 TTACTCGCTTTAAGTCATTTTATAACTTTGTAAGTGATTTTAAATTG-ATTTTTTTAAATTTTTG
1 TTACTCGCTTTAAGTGATTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTT-AATTTTTG
* * ** * *
166453 GTTAAAACCAATCATAATTTGTTGTTTGAATAGGAAAACGAGAAGCAAAAGCCATCTATTGACAA
65 GTTAAAA-CAATCATAATTTGTTGTTTGAATA-GAAAATGTGAAGTGAAAGCCATCCATTGATAA
* ** * * * * ** * * * * * *
166518 AAAAAGTCCATTTGTAGTGACTTATACATTCAAAAGACTAGTTGC-TCCTTTTAAATGATTTTTT
128 GAAAAGTCCATTTACAGTCACTTATGCCTT-GAAACCCTTGTTACTTGC-TTTAAGTGGTTTTAT
166582 AATCTTATAAATGAG-TTGAAATTGAATTTTTTT
191 AATCTTATAAATGAGCTT-AAATTGAATTTTTTT
166615 CTTCATTTTT
Statistics
Matches: 575, Mismatches: 130, Indels: 49
0.76 0.17 0.06
Matches are distributed among these distances:
500 2 0.00
501 10 0.02
502 92 0.16
503 331 0.58
504 77 0.13
505 62 0.11
506 1 0.00
ACGTcount: A:0.34, C:0.12, G:0.14, T:0.40
Consensus pattern (500 bp):
TTACTCGCTTTAAGTGATTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTAATTTTTGG
TTAAAACAATCATAATTTGTTGTTTGAATAGAAAATGTGAAGTGAAAGCCATCCATTGATAAGAA
AAGTCCATTTACAGTCACTTATGCCTTGAAACCCTTGTTACTTGCTTTAAGTGGTTTTATAATCT
TATAAATGAGCTTAAATTGAATTTTTTTATTAAAACAAATCATAATTTGATGTTTACATCAACAA
ACATAAAGCAAAAACCATCCATTGATAAGAAAAGTGCATTTATAGTCACTCATACCTTAGAAAGC
ATATTTACTCGCTGTAAATAGTTTTATAACTTTCAGAATGATTTTAAATTAATTCTTTTTTAATT
TTTAGCTAAAACAGATCAGAACTTGTTATTTGCATCAAGAAACATGAAACAAAAGCCATCCATTA
ACAAGAAAAGTCCATCTATAGTAACTAATGCCTTTAGAAGAATTG
Found at i:167231 original size:339 final size:341
Alignment explanation
Indices: 166446--167502 Score: 776
Period size: 339 Copynumber: 3.1 Consensus size: 341
166436 ATTTTTTTAA
* * * * *
166446 ATTTTTGGTTAAAACCAATCATAATTTGTTG-TTTGAATAGGAAAACGA-GAAGCAAAAGCCATC
1 ATTTATGGTTAAAACAAATCATAATTGGATGTTTTCAATAGG-AAAC-ATGAAGCAAAAGCCATC
* * * * * *
166509 TATTGACAAAAAAAGTCCATTTGTAGTGACT-TATACATTCAAAAGACTAGTTGCTCCTTTTAAA
64 TATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCT-TACCTTTAAAAGACTAATTGCTCCTTTTAAA
*
166573 TGATTTTTTAATCTTATAAATGAGTTGAAATTGAATTTTTTTCTTCATTTTTAGTTAAAACAGAT
128 TGATTTTATAATCTTATAAATGAGTTGAAATTGAA--TTTTTCTTCATTTTTAGTTAAAACAGAT
* * *
166638 CCTAATTAGATGTTGGCATCAAGAAATGTAAAGCAAAAGCCATCCATTAACAAGGAAAGTATATT
191 CCTAATTAGATATTGGCATCAAGAAATG-AAAGCAAAAGCCATCAATTAACAAGGAAAGTACATT
*
166703 TATAGTCAATCATGCCATCAAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATAGTTTTATAATCTAATAAATG
255 TATAGTCAATCATGCCATCAAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATAGTTTTATAATCTAATAAATA
166768 ATTTTAAATCAAAACTATTTTC
320 ATTTTAAATCAAAACTATTTTC
*** * * * * * * * *
166790 ATACCTGGTTAGAACAGATCATAATTGAAGGTTTGCAGTAAGAAACATGAAGCGAAAA-CCATCC
1 ATTTATGGTTAAAACAAATCATAATTGGATGTTTTCAATAGGAAACATGAAGC-AAAAGCCATCT
* * ** * *
166854 ATTGATAAGAAAAGTCAATTTATTTTCACCCATACCTTTAAAA-ACTTAATTGCTCGC-TTTAAA
65 ATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCTTACCTTTAAAAGAC-TAATTGCTC-CTTTTAAA
* * * * **
166917 TTATTTTATAATCTTATAAATGAGTTTAAATTGAA-TTTT-TTCATTTTTAGTTAAAATATATTG
128 TGATTTTATAATCTTATAAATGAGTTGAAATTGAATTTTTCTTCATTTTTAGTTAAAACAGATCC
* * * * * * * *
166980 TAATTTGATATTTGCGTTGGAA-AACATG-AAGCGACAA-CTATCAATTGACAA-GAAAGTCCAT
193 TAATTAGATATTGGC-AT-CAAGAA-ATGAAAGC-AAAAGCCATCAATTAACAAGGAAAGTACAT
* ** * ** * *
167041 TTATAGTCACTTTTGCTATCAAAAGCCTAGTTA-TTGCTTTAAATTGTTTTATAATCTTATAAAT
254 TTATAGTCAATCATGCCATCAAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATAGTTTTATAATCTAATAAA-
* * * * *
167105 TAATTTTGAATTAAAATTGTTTTT
318 TAATTTTAAATCAAAACTATTTTC
* * *
167129 ATTTATGGTTAAAACAAATTATAATTGGATGTTTTCATTAGGAAACATGAAGCAAAAGACATCTA
1 ATTTATGGTTAAAACAAATCATAATTGGATGTTTTCAATAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCTA
* * * * *** * *
167194 TTGAGAAGAAAAGTCCATTTACAGTCACTCTTACCTTTGAAAGTCTTGCTACTCGC-TTTAAGTG
66 TTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCTTACCTTTAAAAGACTAATTGCTC-CTTTTAAATG
* * * * * ** ** *
167258 GTTTTATGAGT-TTATAAATGATTTTAGATTG-ATTTTT-TAAATTTTGGGTTAAAACAGATCAT
130 ATTTTAT-AATCTTATAAATGAGTTGAAATTGAATTTTTCTTCATTTTTAGTTAAAACAGATCCT
* * *** * ** * *
167320 AAATT-GATGTTGGTATGGGGAAATGTGAAGTGAAAGCTATTCATATATAAGAA--AAA-T-CTA
194 -AATTAGATATTGGCATCAAGAAATG-AAAGCAAAAGCCA-TCA-AT-TAACAAGGAAAGTAC-A
* * * * * * * *
167380 TTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTAGTAACT-AGCTTCAAATGGTTTTATAGTCTTATAA
253 TTTATAGTCAATCATGCCATCAAAAGCCTAGTTACTCA-CTTTAAATAGTTTTATAATCTAATAA
* * * *
167444 ATGATTTTCAATTGAAAAC-CTTTTC
317 ATAATTTT-AAATCAAAACTATTTTC
* *
167469 ATTTATGATTAAAACAGATCATAATTGGATGTTT
1 ATTTATGGTTAAAACAAATCATAATTGGATGTTT
167503 GCATTGACAT
Statistics
Matches: 556, Mismatches: 130, Indels: 58
0.75 0.17 0.08
Matches are distributed among these distances:
337 4 0.01
338 36 0.06
339 207 0.37
340 128 0.23
341 46 0.08
342 9 0.02
343 3 0.01
344 112 0.20
345 11 0.02
ACGTcount: A:0.37, C:0.12, G:0.14, T:0.37
Consensus pattern (341 bp):
ATTTATGGTTAAAACAAATCATAATTGGATGTTTTCAATAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCTA
TTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCTTACCTTTAAAAGACTAATTGCTCCTTTTAAATGA
TTTTATAATCTTATAAATGAGTTGAAATTGAATTTTTCTTCATTTTTAGTTAAAACAGATCCTAA
TTAGATATTGGCATCAAGAAATGAAAGCAAAAGCCATCAATTAACAAGGAAAGTACATTTATAGT
CAATCATGCCATCAAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATAGTTTTATAATCTAATAAATAATTTTA
AATCAAAACTATTTTC
Found at i:170466 original size:341 final size:339
Alignment explanation
Indices: 167591--180396 Score: 5468
Period size: 340 Copynumber: 37.8 Consensus size: 339
167581 TTTTGTAACT
* * ** *
167591 TTATAAATGATTTTAAATTG-AGTTTTTTTATTTTTGGTTAAAACATATCATAATTTAATATTTG
1 TTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGTTGTTTG
* * * * * * * * * *
167655 CATCTA-GAAATATGAAGCAAAAACCATTCATTGATAGGAAAAA-TCTATTTATAATCACTCATA
66 CAT-TAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACA-AAAAAAGTCCATTTATAGTGA-TTATG
* * * * ** * * *
167718 CCTTTGGAAG-ATCAGTAACTTTCTTCAAATGGTTTTATAGT-TCTATAACTGATTTTAAATTGA
128 CCTTCGAAAGCCT-AGTTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCT-TATAAATGATTTTAAATTG-
* * * * * * ** ** ***
167781 AATGTTTTTCATTTCTAGTTAAAAAAGATTATAATTAGATGTTTGCATCAAGAAACATGAAACAA
190 AATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAATAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGAGAAATGTGAAGTGA
* * * * * * ** * * * * ** *
167846 AAACCAAACC-TTCACAA-TAAAGTTTATTTATACTCACTTAT-ACTCTCGAAAGCTTTGTTACT
255 AAGCC-ATCCAATGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCT-TCAAAAGCGATCTTACT
** * *
167908 TGCTTTAAGT-TTATTTATAA-C
318 CACTTTAAATGGT-TTTATAATC
* **
167929 TTTATAAA-GAATTTTAAATTTAA-TTTTTTTATTTTTAATT-AAACAAGATCATAATTTGTTGT
1 -TTATAAATG-ATTTTAAATTGAATTTTTTTTATTTTTGGTTAAAAC-AGATCATAATTTGTTGT
* * * * * * *
167991 TTGCATCAGGAAATGA-GAAGCAAAAGCCATCCATGGAGAAGAAAAGTCCATATATAGTTACTTA
63 TTGCATTAGGAAA-CATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAAAAAAGTCCATTTATAGTGA-TTA
** * * * * * *
168055 TTTC-TCTAATAGCATTA-TTACTCGCTTTAAAGGGTTTTAAAATCTCATAAATGATTTTGAATT
126 TGCCTTCGAA-AGC-CTAGTTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATT
* * ** * * *
168118 AAATTTTTTTTCATTTTAGGTTCCAACAGATCATAATTT-ATTGTTTGCATTGGGAAGA-ATGAA
189 GAA-TTTTTTTCATTTTTGGTTAAAATAGATCATAATTTGA-TGTTTGCATTGAGAA-ATGTGAA
* * * * * * * * * * * * *
168181 ATGTAAGTCATGCATTAACAAGAAAAATACATTTATAGTCAATCATGCCTTTAAAAGTG-TAGTT
251 GTGAAAGCCATCCAATGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCGAT-CTT
* *
168245 ATTCACTTTAAATAGTTTTATAATC
315 ACTCACTTTAAATGGTTTTATAATC
* * * ** * *
168270 TTATAAATGATTTTGAATTGAATTTTTTTTTAATTTTGGTTCAAATTGATCATAGTTTGTTGCTT
1 TTATAAATGATTTTAAATTGAA-TTTTTTTTATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGTTGTTT
* * * * * ** * * * *
168335 -AAATAAGAAACGTAAAGTGAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAA-TCAACTTATAGTTACTTATG
65 GCATTAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAA-AAAAAGTCCATTTATAGTGA-TTATG
* * * * * * *
168398 CTTTCGAATGCCTTGTTACTCTCTTTAAGTGGTTTTATAA-CTTTGTAATTGATTTTAAATTGAA
128 CCTTCGAAAGCCTAGTTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATC-TTATAAATGATTTTAAATTGAA
* * * * ** * *
168462 TTTTTTTCATTTTTTGTTAAAAACATATCATAA-TTGATATTTGCATCAAGAAACGTGAAGTGAC
192 TTTTTTTCATTTTTGGTT-AAAATAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGAGAAATGTGAAGTGAA
* * * * * ** * *
168526 AGCTAT-CAATTAACAAG-AAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTTAAAA-TAATAATTATTC
256 AGCCATCCAA-TGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCGAT-CTTACTC
** * *
168588 TTTTTAAATAGCTTTTATAATT
319 ACTTTAAAT-GGTTTTATAATC
** * * * * * * *
168610 TTATAAATGATTTTAGGTTGAATTATTTTTCATATTTGGTTAAAACATATAAGAATTTGCTATTT
1 TTATAAATGATTTTAAATTGAATT-TTTTTTATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGTTGTTT
* * ** * * * ** * *
168675 GCATT-GTGAAGCGTGAAGCGCAAGTCATCCATTAATATGAAAAGTCCATTTATAGTTACTAATG
65 GCATTAG-GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAAAAAAGTCCATTTATAGTGA-TTATG
** * * * * * * *
168739 CCTTCGAAAGTGTTGTTACTCG-TTTCAATTGGTTTTATAACCGTATCAATGACTTT-AATCGAA
128 CCTTCGAAAGCCTAGTTACTCGCTTT-AAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATTGAA
* ** ** ** **
168802 TTTGTTTTCATTTTTAGTTAAAATAGATCATAATTTCTTGTTTGCATCAAGAAACATGAAACGAA
192 TTT-TTTTCATTTTTGGTTAAAATAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGAGAAATGTGAAGTGAA
* * ** * ** * * *
168867 AGCCAT-CAATTGACAA-AAAAGGTTCAAGTATAGTCACTTATGCCTTTGAAATC-CTAGTTACT
256 AGCCATCCAA-TGATAAGAAAA-GTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCGAT-CTTACT
*** * *
168929 TGTTTTAAGTGGTTTTGTAA-C
318 CACTTTAAATGGTTTTATAATC
* * *
168950 TTTATAAATGATTTTAAATTG-ATTTTTTTTATTTTTGATTAAAACATATCATAATTTGATGTTT
1 -TTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGTTGTTT
* * * * * * * * * * * * *
169014 ACATCAAGAAACGTGAA-AAAAAACTATTCATTGATAAAAAAAATCTATTTATAGTTACTCATGC
65 GCATTAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAAAAAAGTCCATTTATAGTGA-TTATGC
* * * ** * * **
169078 CTTCAAAAG-CTAAGTAACTC-ATGACAAATGGTTTTATAATCCTGTAAATGATTTTAAATCAAA
129 CTTCGAAAGCCT-AGTTACTCGCT-TTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAAT-TGA
** * * * * * * *
169141 ACATTTTTCATTTTTTGTTAAAACAGATCGTAATTAGTTGTTTGCATTG-GAAAATATGAAGCGA
191 ATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAATAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGAG-AAATGTGAAGTGA
* * * * * * * * ** *
169205 AAACTA-ACAATTGATAAAAAAAGTCTATATATAATCACTCATGCCTTTGAAAA-CCTTGC-CAC
255 AAGCCATCCAA-TGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCC-TTCAAAAGCGAT-CTTAC
* * *
169267 TCACTTTAAGTGATTTTGTAA-C
317 TCACTTTAAATGGTTTTATAATC
* * *
169289 TTTATAAATGATTTTAAATT-AATTTTTTTTATTTTTGATTAAAACAGATCATAATATGATGTTT
1 -TTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGTTGTTT
* * ** * * * * * * *
169353 ACATCAAAAAACATGAAGCAAAAACCATTCATTGGCAAGAAAAAG-CTATTTATACTTACTCATG
65 GCATTAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAA-AAAAAGTCCATTTATAGTGA-TTATG
* ** * * * ** * * ** * * **
169417 CCTTCAAAAGATTTA-TAACTCACTTCAAATCATTGTATAGTCTTCCAAATGATTCTCAATCAAA
128 CCTTCGAAAG-CCTAGTTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATTGAA
* * * * * * * ** * ** * *
169481 TATTTTTTTATTTCTAGTTAAAACAGATCATAATTAGATATTTACATCAAAAAACATTAAGCGAA
192 T-TTTTTTCATTTTTGGTTAAAATAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGAGAAATGTGAAGTGAA
* * ** * ** * *
169546 AGCCATCCATTGACACA-AAAAACCCATTTATAATCACTCATGCCTTCAAAAGCCTTGTTACTCG
256 AGCCATCCAATGATA-AGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCGATCTTACTCA
* *
169610 CTTTAAGTTGTTTTATAA-C
320 CTTTAAATGGTTTTATAATC
* ** * * *
169629 TTTATAAATGATCTTAAATTGAATTTTTTTTCATTTTTAATTAATATATATCATAATTTGTTGTT
1 -TTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTT-ATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGTTGTT
* * * ** * * * * * * *
169694 TGCATCAAGAAACGTGAAGTGAAAGTCATCCATTGAGAAGAAAAGTTCATCTATAGTCACTCATG
64 TGCATTAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAAAAAAGTCCATTTATAGTGA-TTATG
** * * * * * *
169759 CCACCGAAAGCATTA-TTACACACTTTAAATTGG-TTTAAAACCTGATAAATGATTTTAAATTGA
128 CCTTCGAAAGC-CTAGTTACTCGCTTTAAA-TGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATTGA
* * ** * * * * **
169822 ATTTTTTCCATTTTAGGTTCAAGCT-GATCATAACTTT-TTGTTTGCATCGGGAAATATGAAGCA
191 ATTTTTTTCATTTTTGGTT-AAAATAGATCATAA-TTTGATGTTTGCATTGAGAAATGTGAAGTG
* * * * * * * * * *
169885 AAAGCCTTCCATTGATAAAAAAAGTTCATTTATAGTCATTCGTGCCTTTAAAAG-GCTTGTTAAT
254 AAAGCCATCCAATGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCG-ATCTTACT
** *
169949 TGCTTT-AAGGGTTTTATAA-C
318 CACTTTAAATGGTTTTATAATC
* ** * *
169969 TTTATAAATGATTTTAAATTAAATTTTTCTTTATTTTTAATTAAAATAGATCATTATTTGTTGTT
1 -TTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTT-TTTATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGTTGTT
* * * * * * * *
170034 TGCATTAGGAAACATG-ATCTAAAA-CTGATCCACTGAC-AAGAAAGTCTAGTTATAGTCACTTT
64 TGCATTAGGAAACATGAAGC-AAAAGC-CATCCATTGACAAAAAAAGTCCATTTATAGTGA-TTA
* * * * * * *
170096 TGCTTTTGAAAGCGTAGTTACTCGCTTTAAATGGCTTTACAATCTTATAAATGATTTGAAGTTGA
126 TGCCTTCGAAAGCCTAGTTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATTGA
* * * * * *
170161 ATTTCTTTTTATATTTT-GTTAAAATAGATAAAAATTTGTTATTTGCCTTGAGAAATGCT-AAGT
191 ATTT-TTTTCAT-TTTTGGTTAAAATAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGAGAAATG-TGAAGT
* * * * * *
170224 GCAAGCCATTCAATGATAAGAAAAGTCCATTTGTGGTCACTAATGCCTTCGAAAGCGATCTTACT
253 GAAAGCCATCCAATGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCGATCTTACT
* *
170289 CGCTTTAACTGGTTTTATAA-C
318 CACTTTAAATGGTTTTATAATC
* * *
170310 ATTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTATTTTTTGTTAAAACAAATCATAATTTGTTCTTT
1 -TTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGTTGTTT
* * *
170375 GCATTAGGAAACATGAAGCAAAAGTCATCCATTGACAAAAAAAGTCCATTTATATTGATTGATGT
65 GCATTAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAAAAAAGTCCATTTATAGTGATT-ATGC
* * *
170440 C-TCGGAAAGCCTAGTTGCTTGCTTTAAATAGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATT-AAT
129 CTTC-GAAAGCCTAGTTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATTGAA-
* * * * * * * *
170503 TTTTTTTTGTGATTTTGGGTTAAAATAAATCCTAATTTGATGTTTGCATCGGGAAATATGAAGCG
192 --TTTTTT-TCATTTTTGGTTAAAATAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGAGAAATGTGAAGTG
* * * ** * *
170568 AAAGCCATTCATTGATAAGAAAAGTTCC-TTTATTA-TCACTCATACCTTCAAAAGCCTTTTTTC
254 AAAGCCATCCAATGATAAGAAAAG-TCCATTTA-TAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCGATCTTAC
*
170631 TCACTTTGAATGGTTTTATAATC
317 TCACTTTAAATGGTTTTATAATC
** * * * * * ** * *
170654 AGATAAATGATTTTAGATCAGAGTTTTTCTTTTCATTTCTAGTTTGAACAAATCATAA-TTGAAT
1 TTATAAATGATTTTAAAT-TGA-ATTTT-TTTT-ATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTG-TT
* * ** * * * * * * *
170718 GTTTGTATTAGAAAATGTGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAATGTTCATTTATAGCCGCTC
61 GTTTGCATTAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAAAAAAGTCCATTTATAG-TGATT
*** * ** * * * *
170783 ATATATTCAAAAGCCTTA-TTACTTACTTCAAGTGGTTCTATAA-CTATATAAATGAATTT-AAT
125 ATGCCTTCGAAAGCC-TAGTTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCT-TATAAATGATTTTAAAT
* * * **
170845 TCAATTTTTTTCATTTTTAGTTAAAATAGATCAAAATTT-ATTGTTTGCATT-AGAAAACATGAA
188 TGAATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAATAGATCATAATTTGA-TGTTTGCATTGAG-AAATGTGAA
* ** * * * * * *
170908 GTAAAAGTTATCCATTGATAAGAAAAGTCCATCTATAGTCACTCATTCCTCCATAGGC-ATCATT
251 GTGAAAGCCATCCAATGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCGATC-TT
* *
170972 ACTCACTTTCAATGGTTTTAAAATC
315 ACTCACTTTAAATGGTTTTATAATC
* * * ** *
170997 TCAT-AA--A---TAAATTGAATTTCTTTTCATTTTAGGTGT-GTACAGATCAAAATTTGTTGTT
1 TTATAAATGATTTTAAATTGAATTT-TTTTTATTTTTGGT-TAAAACAGATCATAATTTGTTGTT
* ** ** ** * **
171055 TGCATT-GACAAATGTGAAGCAAAAATCATCTTTTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGCCATTCAT
64 TGCATTAG-GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAAAAAAGTCCATTTATAGTGATT-AT
* * ** * * * *
171119 GTCTTC-AACTA-ACTTTTTTCTTGCTTTAAATGATTTTATAACCTTATAAATGATTTTAAATTG
127 GCCTTCGAA--AGCCTAGTTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATTG
* * * * * *
171182 AATTCTTGTTCATTTTTAGTTGAAATAGATCATAATTTGATGTTTGCCTTGTGAACA--TGAAGC
190 AATT-TTTTTCATTTTTGGTTAAAATAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGAGAA-ATGTGAAGT
* * * *** * *
171245 GAAAGCTATGC-ATCA-ACA-ATAAAGTTTGTTTATAGTCACTCATGCCTTTAAAAGC-ATATTT
253 GAAAGCCATCCAATGATA-AGA-AAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCGAT-CTT
171306 ACTCACTTTAAATGGTTTTATAATC
315 ACTCACTTTAAATGGTTTTATAATC
* * * * * *
171331 TTAAAAATGATTTTAAGTTGAATGTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAAATAAAAATTTGTTATT
1 TTATAAATGATTTTAAATTGAAT-TTTTTTT-ATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGTTGTT
* ** * * * *
171396 TGCATT-GAGAAACATTAAGCGCAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTTCATTTATAGTTACTAAT
64 TGCATTAG-GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAAAAAAGTCCATTTATAGTGA-TTAT
** ** * * * *
171460 GCCTTAAAAAGTATTA-TTACTCACCTTAAGTGGTTTTATAA-CTTTATAAATGATTTTAAATGG
127 GCCTTCGAAAG-CCTAGTTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATC-TTATAAATGATTTTAAATTG
* * * * *
171523 AATTTATTTTCATTTTTTGTTAAAACAGTTCATAATTTGATGTTTGGATTAAGAAATGTGAAGTG
190 AATTT-TTTTCATTTTTGGTTAAAATAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGAGAAATGTGAAGTG
** * * * * * * *
171588 AAAGTTATCCACTAACAA-AACAATTCCATTTATAATCACTCATGCCTTCAAAAGTCG-TGTTAG
254 AAAGCCATCCAATGATAAGAA-AAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAG-CGATCTTAC
*
171651 TCACTTCAAATGGTTTTATAATC
317 TCACTTTAAATGGTTTTATAATC
* * * * * * * * *
171674 TTGTAAATGATTATGAATTGAATTCTTTTCATTTTTGGTGAAAATAGATCATAATTTGATGTTTA
1 TTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGTTGTTTG
* * * * * * *
171739 CATTAGAAAACATGAGGCAAAAGCTATCCATTGAC-AAGAAAGTCCATTTATCGTCACTCATGCC
66 CATTAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAAAAAAGTCCATTTATAGTGA-TTATGCC
* * * * * ** *** *
171803 TTCAAAAG-CGAGTTATTCGTTTTAAATGGCTTTATAATCTTGCAAATGATTTTCGGTTGAAGTT
130 TTCGAAAGCCTAGTTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATTGAATTT
* * * * * * * * * *
171867 TTTTCATTTTTGGTAAAAACATATTAGAATTTGTTATTTGCATTCAAAGAAA--TGAAGCGCAAG
195 TTTTCATTTTTGGTTAAAATAGATCATAATTTGATGTTTGCATT--GAGAAATGTGAAGTGAAAG
* * * * * * * * * * * * *
171930 CCAT-CAAT-TTACAAAAAAGTCTATCTATAGTCACTAATACCTTCGAAGGTGTTGTTAATCGCT
258 CCATCCAATGATA-AGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCGATCTTACTCACT
* *
171993 TCAAATAGTTTTATAA-C
322 TTAAATGGTTTTATAATC
** ** * * *
172010 TTTATAAATGATTTTGGATTGAATTTTTTTTTATTTTTGGTTAAAACTTACCATAATTTATTGTG
1 -TTATAAATGATTTTAAATTGAA-TTTTTTTTATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGTTGTT
* * * * * * * * *
172075 TACATTAGGAAACGTGAAGCGAATGCTATCTATTGACAAGAAAAGTCCACTTATACTGACTTATG
64 TGCATTAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAAAAAAGTCCATTTATAGTGA-TTATG
* ** * ** *
172140 CATTCGAAAGTGTAGTTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCTTATAAATGGGTTTGAATTGAAA
128 CCTTCGAAAGCCTAGTTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATTG-AA
** *
172205 TTTTTTTCATTTTTCTTTAAAATAGATCCTAATTTGATGTTTGCATTTG-GAAATGTGAAGTGAA
192 TTTTTTTCATTTTTGGTTAAAATAGATCATAATTTGATGTTTGCA-TTGAGAAATGTGAAGTGAA
* * * ** * ** * * **
172269 AGCCATCCATTAACAAGATTAGTCCATTTATTGTCACTCATGCCTTTGAAAG-GTTAATTACTTT
256 AGCCATCCAATGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCGAT-CTTACTCA
*
172333 CTTTAAATTGTTTTATAATC
320 CTTTAAATGGTTTTATAATC
* * * * * **
172353 TTATAAATGAGTTTAAATTG-ATTTTTTGTTCATTCTTAGTTAAAACTGATCATAGTTTAATGTT
1 TTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTT-TT-ATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGTTGTT
* * * ** * * *
172417 TGCATTGGGAAACTTGAAGCAAAAACCATCCATTGATGAAAAAAGTCTATTTACATTGACTTATG
64 TGCATTAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAAAAAAGTCCATTTATAGTGA-TTATG
** * * * * * *
172482 CCTAGGAAAGCCTAGTTTCTCACTTGAAATAGTTTTATAATCATATAAATGATTTGAAATT-AAT
128 CCTTCGAAAGCCTAGTTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATTGAA-
* * * * * * *
172546 TTTTTTTAATTCTTGGTTAAAACATATCCTAGTTTGATGTTTGCATT-AGGAAATATGAAG-GAA
192 TTTTTTTCATTTTTGGTTAAAATAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGA-GAAATGTGAAGTGAA
** * * * ** ** * *
172609 A-CTTTTCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATTA-TCACTCATATCTTGGAAAGC-CTAGTTACT
256 AGC-CATCCAATGATAAGAAAAGTCCATTTA-TAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCGAT-CTTACT
**
172671 TGCTTTAAATGGTTTTATAATC
318 CACTTTAAATGGTTTTATAATC
* * ** * * * * *
172693 TTATAACTAATTTTAAATCAAAATTTTTCTCATTTCTT-GTTAGAAA-AAATCATAATTGGATGT
1 TTATAAATGATTTTAAAT-TGAATTTTTTTTATTT-TTGGTTA-AAACAGATCATAATTTGTTGT
** * * * * * * * * *
172756 TTGTGTTGGGAAACATAAAGTATAAGCTATCCATTGACAAGTAAAA-TCCATTTACAGTCACTCA
63 TTGCATTAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAA-AAAAAGTCCATTTATAGTGA-TTA
* * * *
172820 TGCCTTCGAAAGCCT-GATTACTCGCCTTAAGTGGTATTATAA-CTTTATAAATGATTTTAATTT
126 TGCCTTCGAAAGCCTAG-TTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATC-TTATAAATGATTTTAAATT
* ** *
172883 AAATTGTTTTTCATTTTTGGTT-AAAT-GAATCATAATTTGATGTTTGCATCAAAAAATGTGAAG
189 GAATT-TTTTTCATTTTTGGTTAAAATAG-ATCATAATTTGATGTTTGCATTGAGAAATGTGAAG
* * * * * * * *
172946 CGAAAGTCATCCATTGACAAGAAAAATCTATTTATAGTCACAT-ATGCCTTCAAAAGC-CTAATT
252 TGAAAGCCATCCAATGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCAC-TCATGCCTTCAAAAGCGAT-CTT
* * *
173009 GCT-AGCTTTAAATGATTTTAGAATC
315 ACTCA-CTTTAAATGGTTTTATAATC
** * * * * * *
173034 ACATAAATG-TTTACAAAATAT-AATTTTTCTCATTTTTTGTTAAAACATATCATAATTTGATGT
1 TTATAAATGATTT--TAAAT-TGAATTTTTTTTATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGTTGT
* ** * * * * * * *
173097 TTGCATAAGGAAAGGTAAAGCGAAAGCCATCTATTGATAAAATAAGTCCATTTATAGTCACTCAT
63 TTGCATTAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAAAAAAGTCCATTTATAGTGA-TTAT
** * * * * * **
173162 ATCTACAAAAGCCTAGTTACACGCTTTAAATGGTTTTATAGTCTTATTAATGATTTTAAATAAAA
127 GCCTTCGAAAGCCTAGTTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATTGAA
* * * * * * *
173227 ATTTTTTCATTTCTAGTT-AAACAGGTCATAAGTGGACT-TTTGCATCATGA-AACAT-T-AAGT
192 TTTTTTTCATTTTTGGTTAAAATAGATCATAATTTGA-TGTTTGCAT--TGAGAA-ATGTGAAGT
* * * * * ** ** * ** *
173287 GAAA-ACTTCCATTGACT-AGAAAAGTCTATTTGTAGTCACTCATAACTTTGAAACCCTTGTTAC
253 GAAAGCCATCCAATGA-TAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCGATCTTAC
** * *
173350 TTGCTTTAAGTGGTTTTATGA-C
317 TCACTTTAAATGGTTTTATAATC
* * * *
173372 ATTATAATTGATTTTAAATTG-ATTTTTTTCATTTCTT-GTTAAAATAGATCATAATTTGATGTT
1 -TTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTATTT-TTGGTTAAAACAGATCATAATTTGTTGTT
* * ** * ** * *
173435 TGCATCAGAAAAGGTAAAGCAAAAATCATCCATTGA-ATAAAAAAGTTCATTTATAGTCTG-TTT
64 TGCATTAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACA-AAAAAAGTCCATTTATAG--TGATTA
** * * * * * * * *
173498 TGTGTTCGAAAGCCTAGTTACTTGCTTTCAATGTTTTTACAGTATTAT-AATCATTTTTATATTG
126 TGCCTTCGAAAGCCTAGTTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGA-TTTTAAATTG
* * * ** * * *
173562 AAATTTTCTT-AGTTTTGGTTAAAACAGATTGTAATTTGATGTTTGTATTGAGAAAGGTGAAGCG
190 -AATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAATAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGAGAAATGTGAAGTG
* * * * * * * * * *
173626 AAAGCAATCCATTAATAAAAAAAAATCTATTTATAGGCACTC-TGGCCTTCAATAACCTA-ATTA
254 AAAGCCATCCAATGAT-AAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAT-GCCTTCAA-AAGCGATCTTA
* *
173689 CTCAAC-TTAAGTGGTTTTATGATC
316 CTC-ACTTTAAATGGTTTTATAATC
* * * **
173713 TTATAAATGATTTTAAAATT-AACTTTTTCTCATTTTTTGTTAAAACAGATCATAATTTAATGTT
1 TTATAAATGATTTT-AAATTGAA-TTTTTTTTATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGTTGTT
* * ** * * * * * *
173777 TGCATCAAGAAATGTGAAGCGAAAGCCATCCAATAATAATAAAAA-TCCATTTGTAGTTACTCT-
64 TGCATTAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAA-AAAAAGTCCATTTATAGTGA-T-TA
* * *
173840 TGCCTTC-ACAGCCTTA-TTACTCGCTTTAAATGGTTTTAT-AGCTTTATAAATAATTTTAAATT
126 TGCCTTCGAAAGCC-TAGTTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATC-TTATAAATGATTTTAAATT
* * * * * * ** * *
173902 -AATTTTTTTTATTTTTTGTTAGAACAGATCATAACTTCATGTTTGCACCGGGAAATGCT-AAGC
189 GAATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAATAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGAGAAATG-TGAAGT
* ** * * * * * * * ** * *
173965 GCAAGTTATTCATTAACAAGAAAAGTCCATTTGTTGTAACTTTTGCCTTCAAAAACCTAGT-TT-
253 GAAAGCCATCCAATGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTC-AAAAGCGA-TCTTA
* *
174028 CTCGCTTTAAATGGGTTTATAATC
316 CTCACTTTAAATGGTTTTATAATC
* * * * * ** *
174052 CTATAAATGATTTAAAATTAAATTTTTTTTATTTTTGGTTAAAACAAATCGTAATTTCATATTTG
1 TTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGTTGTTTG
* * * * * * *
174117 CATTAGGAAACATGAAGCGAAAGCTATCCATTGACAAGAAAATTCTATTTTATAGTCATTCATAC
66 CATTAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAAAAAAGTCCA-TTTATAGTGATT-ATGC
** * * * *
174182 CTTTAAAAACCTAGTTACAT-G-TTTCAAATGGTTTTATAGTCATATAAATAATTTTAAATTGAA
129 CTTCGAAAGCCTAGTTAC-TCGCTTT-AAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATTGAA
* *** * * * * * * **
174245 GTGTTTTTCATTTGAAGTTAAAACAAATCATAATTGGATTTTTG--TGTCAGGAAACGTGAAGCA
192 -TTTTTTTCATTTTTGGTTAAAATAGATCATAATTTGATGTTTGCAT-TGA-GAAATGTGAAGTG
* * * * ** ** *
174308 AAACCCTTCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTGTAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTGTTACTC
254 AAAGCCATCCAATGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCGATCTTACTC
* * *
174373 ACTTCAAGTGATTTTATAA-C
319 ACTTTAAATGGTTTTATAATC
* * * ** * *
174393 TTCAAAAATAATTTTAAATTG-ATTTTTTTCA-TTTCAGTTAAAATAGATCATAATTTGATGTTT
1 TT-ATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGTTGTTT
* * * * * * **
174456 GCATT-GGAAAACGTAAAGCAAAAGCCAT-CATTAACTAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCGTG
65 GCATTAGG-AAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAAAAAAGTCCATTTATAGTGA-TTATG
* * ** * *
174519 --TTCGAAAGCCTAATTATTTC-CTTTAAATATTTTTACAATCTTATAAATGATTTTTACATTGA
128 CCTTCGAAAGCCTAGTTA-CTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGA-TTTTAAATTG-
* * ** * ** * *
174581 AATTTTCTT-ATTTTTGGTTAAAATAAATTGTAATTTGATGTGTGCATCAAGAAACGTGAAGCGA
190 AATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAATAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGAGAAATGTGAAGTGA
** * ** * * ** * *
174645 AAGTGATCCATTGATAAGAAAAGTTAATTTGTAG-CTACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTT
255 AAGCCATCCAATGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTC-ACTCATGCCTTCAAAAGCGATCTTACTC
* * * *
174709 GCTTCAAGTGATTTTATAA-C
319 ACTTTAAATGGTTTTATAATC
* * * * * *
174729 TTTATAAATGA-TTTAAATT---TTTTTTTCACTTTTT-ATTAAAGCATATCAAAATTTGATGTT
1 -TTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTA-TTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGTTGTT
* * * * ** ** * * *
174789 TGCATCAGAAAACGTAAAGTGAAAGCCATCCATTGAGTAGAAAA-TCCATTTATAGTCACTTATA
64 TGCATTAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAAAAAAGTCCATTTATAGTGA-TTATG
* * * *
174853 CC-TCTGAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAGTGATTTTATAA-CTTTATAAATGATTTTAAATTTA
128 CCTTC-GAAAGCCTAGTTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATC-TTATAAATGATTTTAAATTGA
* * ** * * * * *
174916 ATTTTTATCAATTTCAGTTAAAATAGATCATTATTGGATGTTTGAATTG-GAAAATCTGAAGCGA
191 ATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAATAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGAG-AAATGTGAAGTGA
*** * * * * * * * * * *
174980 AAATGATCTATTGACAA-AAAAGTTCATTTATAGTCACTCAAGTCTTTGAAAACCTA-ATTACTC
255 AAGCCATCCAATGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATG-CCTTCAAAAGCGATCTTACTC
* * *
175043 GCTTTAAATGGTTTTGTGATC
319 ACTTTAAATGGTTTTATAATC
* * * * *
175064 TTATAAATGATTTTAAAATTGAATATTTCTCATTTTTTGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTT
1 TTATAAATGATTTT-AAATTGAATTTTTTTTATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGTTGTTT
** * ** * * * *
175129 GTGTTGGGAAATGTGAATCAAAAGCCATCAATTGACAAGAAAAA-TCCATTTATATTCATTCATG
65 GCATTAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAA-AAAAAGTCCATTTATAGTGATT-ATG
* * * *
175193 ACTTTGAAAGCCTTA-TTACTCACTTTAAGTGGTTTTATAA-CTTTATAAATGATTTTAAATTGA
128 CCTTCGAAAGCC-TAGTTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATC-TTATAAATGATTTTAAATTGA
* * * * * ** * **
175256 ATTTTTTTTATTTTTAGTTAGAACAGATCATAGTTTGATGTTTGCATCAAGGAATGTGAAGCAAA
191 ATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAATAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGAGAAATGTGAAGTGAA
** * * * * * *
175321 AGTTATCCAGTGATAAGAAAAGT-CAATTATAGTCGCTCATGCCTTCGAAAACCTATC-TACCCA
256 AGCCATCCAATGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTC-AAAAGCGATCTTACTCA
* *
175384 CTTTAAATGGTTGTATAACC
320 CTTTAAATGGTTTTATAATC
* * * *
175404 TTATAAATGATTTTAAAATTGAA--TTTCTCATTTTTGGTT-AAACAAAAT-ATAATTTGTTATT
1 TTATAAATGATTTT-AAATTGAATTTTTTTTATTTTTGGTTAAAAC-AGATCATAATTTGTTGTT
* * ** * * * * *
175465 TACATTGGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGCAAGGTCAATTTACAGTCACTCATG
64 TGCATTAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAAAAAAGTCCATTTATAGTGA-TTATG
* * * ** * * * * *
175530 CCTTCAAAAACCTAATTACAAGCTTCAAATGGTTTTTTAGTCTTACAAATGATTTTAAA-TAAAT
128 CCTTCGAAAGCCTAGTTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATTGAA-
* * * * * * * *
175594 TTTTTTTTATTTTTGGATAAAAAAAATCATAATTAGAT-TTATGTATT-AGGAAACT-TAAAG-C
192 TTTTTTTCATTTTTGGTTAAAATAGATCATAATTTGATGTT-TGCATTGA-GAAA-TGTGAAGTG
* * * * * * ** *
175655 AAAACCTTTCCATTGATAAGAAAAG-CTCATTTATAGTCACTCATACTTTTGAAAA-CCTTATTA
254 AAAGCC-ATCCAATGATAAGAAAAGTC-CATTTATAGTCACTCATGC-CTTCAAAAGCGATCTTA
* * * *
175718 CT-AGCTTCAAGTGGTTTGATGA-C
316 CTCA-CTTTAAATGGTTTTATAATC
* * * *
175741 TTTATAAATAACTTT--A---AA----TTTT-TTTTT-GTTAAAACAAATCATAATTTGATGTTT
1 -TTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGTTGTTT
* * * * * * * * *
175795 GCATCAGGAAACGTAAAGCAAAAGCCATCCGTTGACTAAAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGT
65 GCATTAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAAAAAAGTCCATTTATAGTGA-TTATGC
* * * * * * ** *
175860 GTTCGAAAGCTTAGTTACTCGCGTTAAATGTTTTTACAATCTTATAAGTGAATTTTATGTTGACT
129 CTTCGAAAGCCTAGTTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATG-ATTTTAAATTGAAT
* * * * * * * **
175925 TTTTTCTCATTTTTGGTTAAAACATATCGTAATTTGTTGCTCGCATTGAGAAATATGGAA-CAAA
193 TTTTT-TCATTTTTGGTTAAAATAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGAGAAATGT-GAAGTGAA
* * ** ** * * * * * * *
175989 AGCTATCCATTGATAAGAAAAAACCATTTATAGTCACTTTTACTTTCAAAAATCTA-GTTACACG
256 AGCCATCCAATGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTC-AAAAGCGATCTTACTCA
* * * **
176053 CTTGAAAAGGTTTTGTAGCC
320 CTTTAAATGGTTTTATAATC
* * * * * * * * * *
176073 TTATAAATGATTTTAAATTGAAATGTGTTTCATTTCTAGTTACAATAGTTCA-AAATTGAATGTT
1 TTATAAATGATTTTAAATTG-AATTTTTTTTATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTG-TTGTT
* * * * * **
176137 TGTATT-GGAAAGATTAAAACCAAAA-CCATCCATTGACAAGAAAAA-TCCATGTATAGCCACTC
64 TGCATTAGGAAACA-T-GAAGCAAAAGCCATCCATTGACAA-AAAAAGTCCATTTATAGTGA-T-
* * * * ** * *
176199 T-TGCCTTTGAAAACTTTGTTACTTACTTTAAGTGGTTTTATAA-CTTTATAAATAATTTTAAAT
124 TATGCCTTCGAAAGCCTAGTTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATC-TTATAAATGATTTTAAAT
* * * ** * * * * * *
176262 TGAATGTTTTCCATATTTAATTAAACTAGATTA-ATATTTAATGTTTGCATTGGGAAACGTGAAC
188 TGAATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAATAGATCATA-ATTTGATGTTTGCATTGAGAAATGTGAAG
* ** * * * * * ** *
176326 CGAAAGCCATCCCTTGATAAGAAAAATCTATTTATAATCACTCATGTCTTCGAAAGCCTTATTAC
252 TGAAAGCCATCCAATGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCGATCTTAC
** * *
176391 TGGCTTTAAGTGGTTTTACAA-C
317 TCACTTTAAATGGTTTTATAATC
* * ** * * *
176413 TTATAAATGATTTTAAATTGATTTTTTTTTCATTTTTAGTTTGAATAGATCATAATTTGATATTT
1 TTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTT-ATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGTTGTTT
* ** * * * *
176478 GCATCT-TGAAACATGAAGCAAAAGTTATCCATTCAC-AAGAAAGTCCATTTATAGTCACTCATG
65 GCAT-TAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAAAAAAGTCCATTTATAGTGA-TTATG
* ** * * * * *
176541 CCTTCGTAAGCCTAGTTGTTTGCTTTAAATGATTTTATAATCATATAAATAATTTTCAAATTGAT
128 CCTTCGAAAGCCTAGTTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTT-AAATTGAA
* * * * * * *
176606 TTTTTTTTATTTTTAGTAAAAACATATCATAATTTGATGCTTGCATT-AGAAAATGTGAA-TCAA
192 TTTTTTTCATTTTTGGTTAAAATAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGAG-AAATGTGAAGT-GA
* * * * ** * * * ** * *
176669 AAGCTATTC-ATTAGCACCAAAAGTCTATTTATAGTCACTTATACCTTCGGAAGCCTAGGC--AC
255 AAGCCATCCAATGA-TAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAG-CGA-TCTTAC
* * *
176731 ACACTTCAAATGGTTTTATAGTC
317 TCACTTTAAATGGTTTTATAATC
* * * * * * *
176754 TTATAAATGATTGTAAATTAAAATTTTTTTTCATTTCTAGTTAAAACATATCATAGTTAGATT-T
1 TTATAAATGATTTTAAATT-GAATTTTTTTT-ATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTG-TTGT
* * * * * *
176818 TT-C-TTCAGGAAACATGAAGCGAAA-CTCTTTCATTGA-TAAAGAA----A---A-AGT--TCA
63 TTGCATT-AGGAAACATGAAGCAAAAGC-CATCCATTGACAAAAAAAGTCCATTTATAGTGATTA
* * * * * *
176869 T--C-T-----G--TAATCACTC-ATTTCAAGTGATTTTATAA-CTTTACAAATGATTTTAAATT
126 TGCCTTCGAAAGCCTAGTTACTCGCTTT-AAATGGTTTTATAATC-TTATAAATGATTTTAAATT
* * * * ** *
176922 G-ATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGAT-AGCAATTTGATGTTTGCATTAAAAAACATAAAGT
189 GAATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAATAGATCA-TAATTTGATGTTTGCATTGAGAAATGTGAAGT
* * * * * * * *
176985 GAAAGCCATCCATTTACT-AGCAACA-TTCATTTATAGTCACT-ATTACCTTCGAAAGC-CTAGT
253 GAAAGCCATCCAATGA-TAAG-AAAAGTCCATTTATAGTCACTCA-TGCCTTCAAAAGCGAT-CT
* * * *
177046 TGCCCACTTTTAAATGATTTTATACTC
314 TACTCAC-TTTAAATGGTTTTATAATC
* * * * * * * *
177073 TTATAAATTATTTTAAA-TCAA--TTTTTTATTTTTAGTTAAAAAAAATCATAAATTGATGTTTT
1 TTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGTTGTTTG
* * * * * * * **
177135 TATT-GAGAAACGTGAAGCAAAAGCTATCCATTAACAAGAAAAGTCTATCTATAGCCATTCATGC
66 CATTAG-GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAAAAAAGTCCATTTATAGTGATT-ATGC
* ** * * * * *
177199 CTTTGAAAGGTTTGTTACTCACTTCAAGTGGTTTTATAA-CTTTATAAATGATGTTAAATTGAAT
129 CTTCGAAAGCCTAGTTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATC-TTATAAATGATTTTAAATTGAAT
* * * ** * ** *
177263 TATTTTT-ATTTTTAGTTAAAA-CGTATCATTATTAAATATTTGCATCAAGAAACGTGAAGTGAA
193 T-TTTTTCATTTTTGGTTAAAATAG-ATCATAATTTGATGTTTGCATTGAGAAATGTGAAGTGAA
** * * * * * ** *
177326 AGATATCCATTGATAAGAAAAGTCTAGTTATAGTCACTTATGCCTTCAAAAACTTTTTTACTCAC
256 AGCCATCCAATGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCGATCTTACTCAC
*
177391 TTTAAATGATTTTATAATC
321 TTTAAATGGTTTTATAATC
* ** * * * * * *
177410 TTATAAATGATTTTAAATTGAA-TTTTTTCATTTTCAGTTAAAACATATTATTATTAGATATTTG
1 TTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGTTGTTTG
* * ** ** * * * * *
177474 CATT-GGCAATCATAAAGTGAAAGCCATCCATTGACAAGGAAAGTTCATCTATAGTCACTCATAC
66 CATTAGG-AAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAAAAAAGTCCATTTATAGTGA-TTATGC
* * * * * * ** ** *
177538 CTTCG-AAGCTTAGTAACTTGCTTCAAATTG-TTTATAGTCTTATAAATGATTTTTTATCAAAAT
129 CTTCGAAAGCCTAGTTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATTGAATT
** * * * * * ** *
177601 TTTTTCATTTTTGGTTAAAATAGAAAAAAAATGGACGTTTGCATTGGGAAACATGATACTGAAA-
194 TTTTTCATTTTTGGTTAAAATAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGAGAAATGTGA-AGTGAAAG
* * * * * * * * * * *
177665 CCATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGGCACTTATGTCTTTAAAAATC-TTGTTACCCACT
258 CCATCCAATGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATG-CCTTCAAAAGCGATCTTACTCACT
* *
177729 TTAAGA-GATTTAATAA-C
322 TTAA-ATGGTTTTATAATC
* * * * * **
177746 TTTATAAATGATTTTAAATT-TATTTTTTTTATTTTTGGTTCAAACAGATGATTAGTTGACGTTT
1 -TTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGTTGTTT
** * * * * * *
177810 GCATT-GAGAAACATGAAGCAAAAGTGATCCATTGATAAGAAAAGTCCGTTCATAGTAACTCATG
65 GCATTAG-GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAAAAAAGTCCATTTATAGTGA-TTATG
* * * * *
177874 TCTTCAAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAAATGGCTTTATGATCTTATAAATGATTTTAAAATTGA
128 CCTTCGAAAGCCTAGTTACTCGCTTT-AAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTT-AAATTGA
* * * ** * * *** *
177939 ATTTTTCTCATTTTTGATTAAAACAGATTGTAATTTGATGTTTGTATCT-AAAAACAAGAAGTAA
191 ATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAATAGATCATAATTTGATGTTTGCAT-TGAGAAATGTGAAGTGA
* * * * * ** * *
178003 AAGCCATCCATTGACAAGAAAA-TCTATTTATAGTCACTCATGTCTTCGAAAGCCTTATTATTCA
255 AAGCCATCCAATGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCGATCTTACTCA
* * *
178067 CTTCAAGTGATTTTATAA-C
320 CTTTAAATGGTTTTATAATC
* * * * * **
178086 TTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTCATTTCTT-ATTAAAATAGATAATAACTTAATGTT
1 -TTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTATTT-TTGGTTAAAACAGATCATAATTTGTTGTT
** * * * * * * * *
178150 TGCATTAAAAAACATGAAGTAAAAGCGATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATTGTTACTAATA
64 TGCATTAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAAAAAAGTCCATTTATAGTGA-TTATG
* * * * ** * *
178215 CCTTCGAAAACTTAATTATTCATTTTAAATAGTTTTATAATCTTAT-AATGATTTTTAAATGGAA
128 CCTTCGAAAGCCTAGTTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGA-TTTTAAATTGAA
* ** * **
178279 TTTTTCTCATTTTTGGTTAAAATAGATCATAATTTGATGTTCACA-TCATGAAACATGAAGTGAA
192 TTTTTTTCATTTTTGGTTAAAATAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGA-GAAATGTGAAGTGAA
*** * * * * * * * * ** * *
178343 AATTATCCATTAATAAGAAAAATCAATTTATAGTTACTTATGCATTAAAAAGCCTTAC-TACCCG
256 AGCCATCCAATGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCGAT-CTTACTCA
* * *
178407 CTCTAAGTAGTTTTATAA-C
320 CTTTAAATGGTTTTATAATC
* * * * *
178426 ATTATAAATTATTTTAAATTGAATTTTTTTTTCATTTTTGGTTAGAACAAATCGTAATTTGATGT
1 -TTATAAATGATTTTAAATTGAA-TTTTTTTT-ATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGTTGT
* * * * * * * * * *
178491 CTGTATCAGGAAATATGAAGTAAAAACCATCC-GTGAACAAGAAAAGTTCATTTATAAT-ATCTC
63 TTGCATTAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTG-ACAAAAAAAGTCCATTTATAGTGAT-T-
* * * * * * *
178554 ATACCTTCGAAAGCCGAGTTACTTGGTTTAAATGTTTTTATAATCCTATAAATTATTTTAAA-T-
125 ATGCCTTCGAAAGCCTAGTTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATTG
* * * ** * ** *
178617 AATTTTTTTTAATTTTTTGTTAAAACAGATCATGGTTT-ATTATTTGCATT-AGGAAACATGAAA
190 AA-TTTTTTTCATTTTTGGTTAAAATAGATCATAATTTGA-TGTTTGCATTGA-GAAATGTGAAG
** * * * * *
178680 CAAAAGCCAT-CTATCGATAAGAAAAGTCCATCT-TAGTCACTCATG-CTTCCTAAAGCCATGTT
252 TGAAAGCCATCCAAT-GATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTT-CAAAAGCGATCTT
** **
178742 ACTTGCTTTAAATCATTTTATAATC
315 ACTCACTTTAAATGGTTTTATAATC
* * * * * *
178767 TAATAAATGATTTTGAATTAAATTATTTTTTTATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTTGATTTT
1 TTATAAATGATTTTAAATTGAA-T-TTTTTTTATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTG-TTGT
** * * * * * *
178832 TTTAATT-GAAAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTAACAAGAAAACTCCATTTATAGTCACTTT
63 TTGCATTAG-GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAAAAAAGTCCATTTATAGTGA-TTA
* * * * *
178896 TGCCTTCGAAAACCTAGTTACTCACTTTAAATAGTTTTATAATCTTTTAAATGATTTTTAAA-AG
126 TGCCTTCGAAAGCCTAGTTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGA-TTTTAAATTG
* ** * * * * *
178960 AATTGATTTT-ATTTTTCATTAAAACAGATCATAATTTGATTTTTTTCATCGA-AAATTGTAAAG
190 AATT-TTTTTCATTTTTGGTTAAAATAGATCATAATTTGA-TGTTTGCATTGAGAAA-TGTGAAG
** ** * ** * * * * * *
179023 CAAAAGCCAT-TGATGGTTTCG-AAAG-CTTACTTAT-GTGACTCATGCCTTCGAAAGC-CTAGT
252 TGAAAGCCATCCAAT-GATAAGAAAAGTC-CATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCGAT-CT
** **
179083 TACTTTCTTTAAATGGTTTTATAGCC
314 TACTCACTTTAAATGGTTTTATAATC
** **** * * * * * * * * *
179109 TTATAAATGATTTTAAATCAAAAGCCTTTCATTTCTAGTTAAAATAGAACATAATTGGATCTTTA
1 TTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGTTGTTTG
* * * * * * ** *
179174 CATTAGGAAACGTG-AG-ATGAAAGTCATCCATTCATAAGAAAAGTCCATTTACAGTGACGAATA
66 CATTAGGAAACATGAAGCA--AAAGCCATCCATTGACAAAAAAAGTCCATTTATAGTGA-TTATG
* * * * * *
179237 CCTTCGAAAGGCTAATTGCTTGCTTTAAATAGTTTTATAATCTTATAAACGATTTTAAATTG-AT
128 CCTTCGAAAGCCTAGTTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATTGAAT
** * * * * *
179301 TTTTTTCGCTTTCGGTTAAAAGAGATTATAATTTGATGTTTGTATTGGGAAACT-TGAAGTGAAA
193 TTTTTTCATTTTTGGTTAAAATAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGAGAAA-TGTGAAGTGAAA
** * * * * * ** * * * * *
179365 GCCATCCGTTGATATGAAAAGGCTATTTATACTCACTCATACCTTTGACAGTCTA-GTTGCTTAC
257 GCCATCCAATGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAG-CGATCTTACTCAC
*
179429 TTTAAATGGTTTTATAATT
321 TTTAAATGGTTTTATAATC
* * ** *
179448 TTATAAATGATTTTAAATTG-ATTTTTTTCATTTGTCATTAAAATAGATCATAATTTGTTGTTTG
1 TTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGTTGTTTG
* * * * * * *
179512 CA-TAGAGAAACATGAAGCGAAAGCCCTCCATTGACAAGAAAAGTTCATTGATAGTCGCTTATGT
66 CATTAG-GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAAAAAAGTCCATTTATAGT-GATTATGC
* * * * * *
179576 CTTCTAAAGCCTAGTTGCTTGCTTTAAATGGTTTTATGATCTTGTAAATGATTTTAAATTGATTT
129 CTTCGAAAGCCTAGTTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATTGAATT
* * * * * * * * ** *
179641 TTTTTCACTTTTAGTTCAAACAGATCATAATTTGTTATTTGCATCGAGAAACGTGAA-ACAAAAC
194 TTTTTCATTTTTGGTTAAAATAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGAGAAATGTGAAGTGAAAGC
* * * * * *
179705 CTATCCATTGACAAGAAAAGTCAATTTATAGTCACTCATACCTTCAAAAG-TATAGTTACTCACT
259 C-ATCCAATGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCGAT-CTTACTCACT
*
179769 TTAAATAGTTTTATAATC
322 TTAAATGGTTTTATAATC
* * *
179787 TTATAAATTATTTTAAA-T-AATTTTTTTTTTCATTTTTGGTT-AAATAGATAATAA-------T
1 TTATAAATGATTTTAAATTGAA--TTTTTTTT-ATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGTTGT
* * * *
179842 TTGCATT-GAGAAACATGAAGCAAAAGCCATTCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCA
63 TTGCATTAG-GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAAAAAAGTCCATTTATAGTGA-TTA
* * * * * * * * *
179906 TACCTTTGAAAGTCAAGTTGCTTGCTTTAAATGG-TTTATTATCTTATAAATGATTGTAAA-TCA
126 TGCCTTCGAAAGCCTAGTTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATTGA
* * * * **
179969 ATTTTTTTTTCATTTCTAGTTAAAATAGACCATAA-TTGTATGTTTACATT-AGAAAACATGAAG
191 A--TTTTTTTCATTTTTGGTTAAAATAGATCATAATTTG-ATGTTTGCATTGAG-AAATGTGAAG
* * * * * * * * *
180032 TGAAAGCCATCCATTGCTAAAAAAAGTCAACTTATAGTCACTCATACCTTCAAAAGC-CTAATTG
252 TGAAAGCCATCCAATGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCGAT-CTTA
*
180096 TTCACTTTAAATGGTTTTATAATC
316 CTCACTTTAAATGGTTTTATAATC
* * * * * *
180120 TTATAAATAATTTGAAGTTGAATTTTATTTTTTATTTTTGGTTACAA-AGATCATAATTTGATAT
1 TTATAAATGATTTTAAATTGAA--TT-TTTTTTATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGTTGT
* * * * * ** * * * * *
180184 TTGAATTAAGAAATATTAAGTGAAAA-TAATCTATTGACTAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTTA
63 TTGCATTAGGAAACATGAAG-CAAAAGCCATCCATTGACAAAAAAAGTCCATTTATAGTGA-TTA
* * * * * ** *
180248 TACATTCGAAATCCTAGTTGCTAGCTTTAAACAGTTTTATAATCTTCTAAATGATTTTAAATTGA
126 TGCCTTCGAAAGCCTAGTTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATTGA
** * * * * * * * * *
180313 ATTTGCTTCATTTTTGGTTGAAACATATCATAATTGGATGTTTGCGTAG-GAAACGTGGAGCGAA
191 ATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAATAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGAGAAATGTGAAGTGAA
* *
180377 AGCCATCCATTGACAAGAAA
256 AGCCATCCAATGATAAGAAA
180397 GGCTTGTTTC
Statistics
Matches: 9548, Mismatches: 2374, Indels: 1088
0.73 0.18 0.08
Matches are distributed among these distances:
313 1 0.00
314 26 0.00
315 26 0.00
316 7 0.00
317 5 0.00
318 83 0.01
319 49 0.01
320 29 0.00
322 1 0.00
323 1 0.00
324 2 0.00
326 1 0.00
327 3 0.00
328 8 0.00
329 109 0.01
330 23 0.00
331 102 0.01
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333 229 0.02
334 287 0.03
335 165 0.02
336 276 0.03
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338 742 0.08
339 1379 0.14
340 1906 0.20
341 1650 0.17
342 1020 0.11
343 468 0.05
344 33 0.00
345 4 0.00
346 13 0.00
347 111 0.01
348 6 0.00
ACGTcount: A:0.35, C:0.13, G:0.13, T:0.39
Consensus pattern (339 bp):
TTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGTTGTTTG
CATTAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAAAAAAGTCCATTTATAGTGATTATGCCT
TCGAAAGCCTAGTTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTT
TTTCATTTTTGGTTAAAATAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGAGAAATGTGAAGTGAAAGCCA
TCCAATGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCGATCTTACTCACTTTAA
ATGGTTTTATAATC
Found at i:174896 original size:165 final size:167
Alignment explanation
Indices: 167581--180076 Score: 2882
Period size: 170 Copynumber: 73.8 Consensus size: 167
167571 TTTTATGTGC
* * * *
167581 TTTTGTAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAGTTTTTTT-ATTTTTGGTTAAAACATATCATAAT
1 TTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATT-A-TTTTTTTCATTTTT-ATTAAAATAAATCATAAT
* * * * * * * * *
167645 TTAATATTTGCATCTAGAAATA--TGAAGCAAAAACCATTCATTGATAGGAAAAATCTATTTATA
63 TTGATGTTTGCATC-AGAAA-ACGTAAAGCGAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATA
* * * * * * ** * *
167708 ATCACTCATACCTTTGGAAG-ATCAGTAACTTTCTTCAAATGG
126 GTCACTCATGCCTCTGAAAGCCT-AGTTACTCACTTCAAGTGA
* * * * *
167750 TTTTAT-AGTTCTATAACTGATTTTAAATTGAAATGTTTTTCATTTCTAGTTAAAA-AAGATTAT
1 TTTTATAACTT-TATAAATGATTTTAAATT---ATTTTTTTCATTTTTA-TTAAAATAA-ATCAT
* * * * * * * * **
167813 AATTAGATGTTTGCATCA-AGAAACATGAAA-CAAAAACCAAACC-TTCACAA-TAAAGTTTATT
60 AATTTGATGTTTGCATCAGA-AAACGT-AAAGCGAAAGCC-ATCCATTGATAAGAAAAGTCCATT
* * * * * ** * *
167874 TATACTCACTTAT-ACTCTCGAAAGCTTTGTTACTTGCTTTAAGT-T
122 TATAGTCACTCATGCCTCT-GAAAGCCTAGTTACTCACTTCAAGTGA
*
167919 TATTTATAACTTTATAAA-GAATTTTAAATTTAATTTTTTT-ATTTTTAATTAAACA-AGATCAT
1 T-TTTATAACTTTATAAATG-ATTTTAAA-TT-ATTTTTTTCATTTTT-ATTAAA-ATAAATCAT
* * * * * * *
167981 AATTTGTTGTTTGCATCAGGAAATG-AGAAGCAAAAGCCATCCATGGAGAAGAAAAGTCCATATA
60 AATTTGATGTTTGCATCAGAAAACGTA-AAGCGAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTA
* * ** * * * *
168045 TAGTTACTTATTTCTCT-AATAGCATTA-TTACTCGCTTTAAAG-GG
124 TAGTCACTCATGCCTCTGAA-AGC-CTAGTTACTCAC-TTCAAGTGA
* * * ** * *
168089 TTTTA-AAATCTCATAAATGATTTTGAATTAAATTTTTTTTCA-TTTTAGGTTCCAACAGATCAT
1 TTTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAATT--A-TTTTTTTCATTTTTA--TTAAAATAAATCAT
** * * * * * * * * *
168152 AATTT-ATTGTTTGCATTGGGAAGAATG-AAA-TGTAAGTCATGCATTAACAAGAAAAATACATT
60 AATTTGA-TGTTTGCA-TCAGAA-AACGTAAAGCGAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATT
* * * ** * * *
168214 TATAGTCAATCATGCCTTTAAAAGTGTAGTTATTCACTTTAAAT-A
122 TATAGTCACTCATGCCTCTGAAAGCCTAGTTACTCACTTCAAGTGA
* * ** * **
168259 GTTTTATAA-TCTTATAAATGATTTTGAATTGAATTTTTTTTTAATTTTGGTTCAAATTGATCAT
1 -TTTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAATT--A--TTTTTTTCATTTTTATTAAAATAAATCAT
* * * ** * * * * *
168323 AGTTTGTTGCTTAAATAAG-AAACGTAAAGTGAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAATCAACTTAT
60 AATTTGATGTTTGCATCAGAAAACGTAAAGCGAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTAT
* * * * * * * *
168387 AGTTACTTATG-CTTTCGAATGCCTTGTTACTCTCTTTAAGTGG
125 AGTCACTCATGCCTCT-GAAAGCCTAGTTACTCACTTCAAGTGA
* * *
168430 TTTTATAACTTTGTAATTGATTTTAAATTGAATTTTTTTCATTTTTTGTTAAAA-ACATATCATA
1 TTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATT--ATTTTTTTCA-TTTTTATTAAAATA-A-ATCATA
* * * * * * * * *
168494 A-TTGATATTTGCATCA-AGAAACGTGAAGTGACAGCTATCAATTAACAAG-AAAGTCTATTTAT
61 ATTTGATGTTTGCATCAGA-AAACGTAAAGCGAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTAT
* * *** * * ** * * *
168556 AGTCACTCATGCCTTTAAAATAATAATTATTCTTTTTAAATAGC
125 AGTCACTCATGCCTCTGAAAGCCTAGTTACTCACTTCAAGT-GA
* ** ** * * * *
168600 TTTTATAATTTTATAAATGATTTTAGGTTGAATTATTTTTCATATTTGGTTAAAACATATAAGAA
1 TTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATT--ATT-TTTTTCAT-TTTTATTAAAATAAATCATAA
* * * * * * * * * *
168665 TTTGCTATTTGCAT-TGTGAAGCGTGAAGCGCAAGTCATCCATTAATATGAAAAGTCCATTTATA
62 TTTGATGTTTGCATCAG-AAAACGTAAAGCGAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATA
* * ** * ** * *
168729 GTTACTAATGCCT-TCGAAAGTGTTGTTACTCGTTTCAATTGG
126 GTCACTCATGCCTCT-GAAAGCCTAGTTACTCACTTCAAGTGA
** * * * *
168771 TTTTATAACCGTATCAATGACTTT-AATCGAATTTGTTTTCATTTTTAGTTAAAATAGATCATAA
1 TTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAAT--TATTT-TTTTCATTTTTA-TTAAAATAAATCATAA
** * * * * **
168835 TTTCTTGTTTGCATCA-AGAAACATGAAA-CGAAAGCCATCAATTGACAA-AAAAGGTTCAAGTA
62 TTTGATGTTTGCATCAGA-AAACGT-AAAGCGAAAGCCATCCATTGATAAGAAAA-GTCCATTTA
* * * *** * *
168897 TAGTCACTTATGCCTTTGAAATCCTAGTTACTTGTTTTAAGTGG
124 TAGTCACTCATGCCTCTGAAAGCCTAGTTACTCACTTCAAGTGA
* * * *
168941 TTTTGTAACTTTATAAATGATTTTAAATTGATTTTTTTTATTTTTGATTAAAACATATCATAATT
1 TTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATT-ATTTTTTTCATTTTT-ATTAAAATAAATCATAATT
* * * * * * * *
169006 TGATGTTTACATCA-AGAAACGTGAAA--AAAAACTATTCATTGATAAAAAAAATCTATTTATAG
64 TGATGTTTGCATCAGA-AAACGT-AAAGCGAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAG
* * * * * *
169068 TTACTCATGCCT-TCAAAAG-CTAAGTAACTCA-TGACAAATGG
127 TCACTCATGCCTCT-GAAAGCCT-AGTTACTCACT-TCAAGTGA
* * * ** * * * *
169109 TTTTATAA-TCCTGTAAATGATTTTAAATCAAAACATTTTTCATTTTTTGTTAAAACAGATCGTA
1 TTTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAAT---TATTTTTTTCA-TTTTTATTAAAATAAATCATA
* * ** ** * * * * * * * *
169173 ATTAGTTGTTTGCATTGGAAAATATGAAGCGAAAACTAACAATTGATAAAAAAAGTCTATATATA
61 ATTTGATGTTTGCATCAGAAAACGTAAAGCGAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATA
* * * * ** *
169238 ATCACTCATGCCTTTGAAAACCTTGCCACTCACTTTAAGTGA
126 GTCACTCATGCCTCTGAAAGCCTAGTTACTCACTTCAAGTGA
* * * * *
169280 TTTTGTAACTTTATAAATGATTTTAAATTAATTTTTTTTATTTTTGATTAAAACAGATCATAATA
1 TTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATT-ATTTTTTTCATTTTT-ATTAAAATAAATCATAATT
* * * * * * * ** * *
169345 TGATGTTTACATCAAAAAACATGAAGCAAAAACCATTCATTGGCAAGAAAAAG-CTATTTATACT
64 TGATGTTTGCATCAGAAAACGTAAAGCGAAAGCCATCCATTGATAAG-AAAAGTCCATTTATAGT
* * ** * * *
169409 TACTCATGCCT-TCAAAAGATTTA-TAACTCACTTCAAATCA
128 CACTCATGCCTCT-GAAAG-CCTAGTTACTCACTTCAAGTGA
* * ** * * *
169449 TTGTAT-AGTCTTCCAAATGATTCTCAATCAAA-TATTTTTTT-ATTTCTAGTTAAAACAGATCA
1 TTTTATAACT-TTATAAATGATT-T---T-AAATTATTTTTTTCATTTTTA-TTAAAATAAATCA
* * * * * * * **
169511 TAATTAGATATTTACATCAAAAAACATTAAGCGAAAGCCATCCATTGACACA-AAAAACCCATTT
59 TAATTTGATGTTTGCATCAGAAAACGTAAAGCGAAAGCCATCCATTGATA-AGAAAAGTCCATTT
* * * * *
169575 ATAATCACTCATGCCT-TCAAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTTG-
123 ATAGTCACTCATGCCTCT-GAAAGCCTAGTTACTCACTTCAAG-TGA
* * *
169620 TTTTATAACTTTATAAATGATCTTAAATTGAATTTTTTTTCATTTTTAATTAATATATATCATAA
1 TTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATT--A-TTTTTTTCATTTTT-ATTAAAATAAATCATAA
* * * * * * *
169685 TTTGTTGTTTGCATCA-AGAAACGTGAAGTGAAAGTCATCCATTGAGAAGAAAAGTTCATCTATA
62 TTTGATGTTTGCATCAGA-AAACGTAAAGCGAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATA
* * * * * *
169749 GTCACTCATGCCACCGAAAGCATTA-TTACACACTTTAAATTG-
126 GTCACTCATGCCTCTGAAAGC-CTAGTTACTCAC-TTCAAGTGA
* * * * * ** *
169791 GTTTAAAACCTGATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTCCA-TTTTAGGTTCAAGCT-GATCATA
1 TTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATT--ATTTTTTTCATTTTTA--TT-AAAATAAATCATA
* * * ** * * * * *
169854 ACTTT-TTGTTTGCATCGGGAAATATGAAGCAAAAGCCTTCCATTGATAAAAAAAGTTCATTTAT
61 A-TTTGATGTTTGCATCAGAAAACGTAAAGCGAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTAT
* * * * * * * ** * *
169918 AGTCATTCGTGCCTTTAAAAGGCTTGTTAATTGCTTTAAG-GG
125 AGTCACTCATGCCTCTGAAAGCCTAGTTACTCACTTCAAGTGA
* * *
169960 TTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTAAATTTTTCTTTATTTTTAATTAAAATAGATCATTA
1 TTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATT--ATTTTT-TTCATTTTT-ATTAAAATAAATCATAA
* * * * * * * * * * * * *
170025 TTTGTTGTTTGCATTAGGAAACAT-GATCTAAAACTGATCCACTGACAAG-AAAGTCTAGTTATA
62 TTTGATGTTTGCATCAGAAAACGTAAAGCGAAAGC-CATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATA
** * * * * * * *
170088 GTCACTTTTGCTTTTGAAAGCGTAGTTACTCGCTTTAAATGG
126 GTCACTCATGCCTCTGAAAGCCTAGTTACTCACTTCAAGTGA
* * * * * * * * *
170130 CTTTACAA-TCTTATAAATGATTTGAAGTTGAATTTCTTTTTATATTTTGTTAAAATAGATAAAA
1 TTTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAATT--ATTT-TTTTCAT-TTTTATTAAAATAAATCATA
* * * * * * * * * *
170194 ATTTGTTATTTGCCT-TGAGAAATGCT-AAGTGCAAGCCATTCAATGATAAGAAAAGTCCATTTG
61 ATTTGATGTTTGCATCAGA-AAACG-TAAAGCGAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTA
* * * * * * * *
170257 TGGTCACTAATGCCT-TCGAAAG-CGATCTTACTCGCTTTAACTGG
124 TAGTCACTCATGCCTCT-GAAAGCCTA-GTTACTCACTTCAAGTGA
* * * *
170301 TTTTATAACATTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTATTTTTTGTTAAAACAAATCATAAT
1 TTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATT--ATTTTTTTCA-TTTTTATTAAAATAAATCATAAT
* * * * * * * * * * *
170366 TTGTTCTTTGCATTAGGAAACATGAAGCAAAAGTCATCCATTGACAAAAAAAGTCCATTTATATT
63 TTGATGTTTGCATCAGAAAACGTAAAGCGAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGT
* * * * * * ** * *
170431 GATTGATGTCTCGGAAAGCCTAGTTGCTTGCTTTAAAT-A
128 CACTCATGCCTCTGAAAGCCTAGTTACTCACTTCAAGTGA
* **
170470 GTTTTATAA-TCTTATAAATGATTTTAAATTAATTTTTTTTTGTGATTTTGGGTTAAAATAAATC
1 -TTTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAATT-A---TTTTTT-TCATTTT-TATTAAAATAAATC
* * * ** * *
170534 CTAATTTGATGTTTGCATCGGGAAATATGAAGCGAAAGCCATTCATTGATAAGAAAAGTTCC-TT
58 ATAATTTGATGTTTGCATCAGAAAACGTAAAGCGAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAG-TCCATT
* * ** * * *
170598 TATTA-TCACTCATACCT-TCAAAAGCCTTTTTTCTCACTTTGAA-TGG
122 TA-TAGTCACTCATGCCTCT-GAAAGCCTAGTTACTCAC-TTCAAGTGA
** * ** *
170644 TTTTATAA-TCAGATAAATGATTTTAGATCAGAGTT-TTTCTTTTCATTTCTAGTTTGAACAAAT
1 TTTTATAACT-TTATAAATGATTTT--A--A-A-TTATTT-TTTTCATTTTTA-TTAAAATAAAT
* * * * * * *
170707 CATAA-TTGAATGTTTGTATTAGAAAATGTGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAATGTTCAT
57 CATAATTTG-ATGTTTGCATCAGAAAACGTAAAGCGAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCAT
* * *** * * *
170771 TTATAGCCGCTCATATAT-TCAAAAGCCTTA-TTACTTACTTCAAGTGG
121 TTATAGTCACTCATGCCTCT-GAAAGCC-TAGTTACTCACTTCAAGTGA
* * * * *
170818 TTCTATAACTATATAAATGAATTT-AATTCAATTTTTTTCATTTTTAGTTAAAATAGATCAAAAT
1 TTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATT--ATTTTTTTCATTTTTA-TTAAAATAAATCATAAT
* * * ** ** *
170882 TT-ATTGTTTGCATTAGAAAACATGAAGTAAAAGTTATCCATTGATAAGAAAAGTCCATCTATAG
63 TTGA-TGTTTGCATCAGAAAACGTAAAGCGAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAG
* * * * *
170946 TCACTCATTCCTC-CATAGGCATCA-TTACTCACTTTCAA-TGG
127 TCACTCATGCCTCTGA-AAGCCT-AGTTACTCAC-TTCAAGTGA
* * ** * * ** * * *
170987 TTTTA-AAATCTCATAAAT-AAATTGAA-T-TTCTTTTCA-TTTTAGGTGT-GTACAGATCAAAA
1 TTTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAATTATTTTTTTCATTTTTA--T-TAAAATAAATCATAA
* * * * * ** ** *
171046 TTTGTTGTTTGCAT-TGACAAATGTGAAGCAAAAATCATCTTTTGACAAGAAAAGTCCATTTATA
62 TTTGATGTTTGCATCAGA-AAACGTAAAGCGAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATA
* * * * * ** * ** * *
171110 GCCATTCATGTCT-TCAACTA-ACTTTTTTCTTGCTTTAAATGA
126 GTCACTCATGCCTCTGAA--AGCCTAGTTACTCACTTCAAGTGA
* * * *
171152 TTTTATAACCTTATAAATGATTTTAAATTGAATTCTTGTTCATTTTTAGTTGAAATAGATCATAA
1 TTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATT--ATT-TTTTTCATTTTTA-TTAAAATAAATCATAA
* * ** * * * * ** * * ***
171217 TTTGATGTTTGCCT-TGTGAACATGAAGCGAAAGCTATGCATCAACAA-TAAAGTTTGTTTATAG
62 TTTGATGTTTGCATCAGAAAACGTAAAGCGAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAG
* * * * * * *
171280 TCACTCATGCCTTTAAAAGCATATTTACTCACTTTAAATGG
127 TCACTCATGCCTCTGAAAGCCTAGTTACTCACTTCAAGTGA
* * * * * *
171321 TTTTATAA-TCTTAAAAATGATTTTAAGTTGAATGTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAAATAAA
1 TTTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAATT--A--TTTTTTTCATTTTT-ATTAAAATAAATCAT
* * * * * * * *
171385 AATTTGTTATTTGCAT-TGAGAAACATTAAGCGCAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTTCATTTA
60 AATTTGATGTTTGCATCAGA-AAACGTAAAGCGAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTA
* * * ** *
171449 TAGTTACTAATGCCT-TAAAAAGTATTA-TTACTCACCTT-AAGTGG
124 TAGTCACTCATGCCTCT-GAAAG-CCTAGTTACTCA-CTTCAAGTGA
* * * **
171493 TTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATGGAATTTATTTTCATTTTTTGTTAAAACAGTTCATAA
1 TTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAAT--TATTT-TTTTCA-TTTTTATTAAAATAAATCATAA
* * * * * ** * * * *
171558 TTTGATGTTTGGATTA-AGAAATGTGAAGTGAAAGTTATCCACTAACAA-AACAATTCCATTTAT
62 TTTGATGTTTGCATCAGA-AAACGTAAAGCGAAAGCCATCCATTGATAAGAA-AAGTCCATTTAT
* * * * * *
171621 AATCACTCATGCCT-TCAAAAGTCGT-GTTAGTCACTTCAAATGG
125 AGTCACTCATGCCTCT-GAAAG-CCTAGTTACTCACTTCAAGTGA
* * * * * * *
171664 TTTTATAA-TCTTGTAAATGATTATGAATTGAATTCTTTTCATTTTTGGTGAAAATAGATCATAA
1 TTTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAATT--ATTTTTTTCATTTTT-ATTAAAATAAATCATAA
* * * * * * * * *
171728 TTTGATGTTTACATTAGAAAACATGAGGCAAAAGCTATCCATTGACAAG-AAAGTCCATTTATCG
62 TTTGATGTTTGCATCAGAAAACGTAAAGCGAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAG
* * * ** * * *
171792 TCACTCATGCCT-TCAAAAG-CGAGTTATTCGTTTTAAATGG
127 TCACTCATGCCTCT-GAAAGCCTAGTTACTCACTTCAAGTGA
* ** *** * ** * *
171832 CTTTATAA-TCTTGCAAATGATTTTCGGTTGAAGTTTTTTCATTTTTGGTAAAA-ACATATTAGA
1 TTTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAATT--ATTTTTTTCATTTTTATTAAAATA-A-ATCATA
* * * * * * * * * *
171895 ATTTGTTATTTGCATTCA-AAGAA-ATGAAGCGCAAGCCATCAATTTACAA-AAAAGTCTATCTA
61 ATTTGATGTTTGCA-TCAGAA-AACGTAAAGCGAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTA
* * * ** * * * *
171957 TAGTCACTAATACCT-TCGAAGGTGTTGTTAATCGCTTCAAAT-A
124 TAGTCACTCATGCCTCT-GAAAGCCTAGTTACTCACTTCAAGTGA
** * * * *
172000 GTTTTATAACTTTATAAATGATTTTGGATTGAATTTTTTTTTATTTTTGGTTAAAACT-TACCAT
1 -TTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATT--A-TTTTTTTCATTTTT-ATTAAAA-TAAATCAT
* * * * * * * * * *
172064 AATTT-ATTGTGTACATTAGGAAACGTGAAGCGAATGCTATCTATTGACAAGAAAAGTCCACTTA
60 AATTTGA-TGTTTGCATCAGAAAACGTAAAGCGAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTA
* * * * ** * * *
172128 TACTGACTTATGCAT-TCGAAAGTGTAGTTACTCGCTTTAAAT-A
124 TAGTCACTCATGCCTCT-GAAAGCCTAGTTACTCACTTCAAGTGA
** * * * *
172171 GTTTTATAA-TCTTATAAATGGGTTTGAATTGAAATTTTTTTCATTTTTCTTTAAAATAGATCCT
1 -TTTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAATT---ATTTTTTTCATTTTT-ATTAAAATAAATCAT
** * * * * * * **
172235 AATTTGATGTTTGCATTTGGAAATGTGAAGTGAAAGCCATCCATTAACAAGATTAGTCCATTTAT
60 AATTTGATGTTTGCATCAGAAAACGTAAAGCGAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTAT
* * ** * ** * *
172300 TGTCACTCATGCCTTTGAAAGGTTAATTACTTTCTTTAAATTG-
125 AGTCACTCATGCCTCTGAAAGCCTAGTTACTCAC-TTCAAGTGA
* * *
172343 TTTTATAA-TCTTATAAATGAGTTTAAATTGATTTTTTGTTCATTCTTAGTTAAAACT-GATCAT
1 TTTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAATT-A-TTTTT-TTCATTTTTA-TTAAAA-TAAATCAT
* * ** * * * * * *
172406 AGTTTAATGTTTGCATTGGGAAACTTGAAGCAAAAACCATCCATTGATGAA-AAAAGTCTATTTA
60 AATTTGATGTTTGCATCAGAAAACGTAAAGCGAAAGCCATCCATTGAT-AAGAAAAGTCCATTTA
* * * * ** * * *
172470 CATTGACTTATGCCTAGGAAAGCCTAGTTTCTCACTTGAAAT-A
124 TAGTCACTCATGCCTCTGAAAGCCTAGTTACTCACTTCAAGTGA
* * * ** * * *
172513 GTTTTATAA-TCATATAAATGATTTGAAATTAATTTTTTTTAATTCTTGGTTAAAACATATCCTA
1 -TTTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAATT-A-TTTTTTTCATT-TTTATTAAAATAAATCATA
* * * ** * ** * *
172577 GTTTGATGTTTGCATTAGGAAATATGAAG-GAAA-CTTTTCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTAT
61 ATTTGATGTTTGCATCAGAAAACGTAAAGCGAAAGC-CATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTA-
** ** * * *
172640 TA-TCACTCATATCT-TGGAAAGCCTAGTTACTTGCTTTAAATGG
124 TAGTCACTCATGCCTCT-GAAAGCCTAGTTACTCACTTCAAGTGA
* * * * *
172683 TTTTATAA-TCTTATAACTAATTTTAAATCAAAATTTTTCTCATTTCTTGTTAGAAA-AAATCAT
1 TTTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAAT---TATTTTTTTCATTT-TTATTA-AAATAAATCAT
* ** ** * * * * *
172746 AATTGGATGTTTGTGTTGGGAAACATAAAG-TATAAGCTATCCATTGACAAGTAAAA-TCCATTT
60 AATTTGATGTTTGCATCAGAAAACGTAAAGCGA-AAGCCATCCATTGATAAG-AAAAGTCCATTT
* * *
172809 ACAGTCACTCATGCCT-TCGAAAGCCT-GATTACTCGCCTT-AAGTGG
123 ATAGTCACTCATGCCTCT-GAAAGCCTAG-TTACTC-ACTTCAAGTGA
* * * *
172854 TATTATAACTTTATAAATGATTTTAATTTAAATTGTTTTTCATTTTTGGTT-AAATGAATCATAA
1 TTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATT--ATT-TTTTTCATTTTT-ATTAAAATAAATCATAA
* * * * * * *
172918 TTTGATGTTTGCATCAAAAAATGTGAAGCGAAAGTCATCCATTGACAAGAAAAATCTATTTATAG
62 TTTGATGTTTGCATCAGAAAACGTAAAGCGAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAG
* * * * *
172983 TCACAT-ATGCCT-TCAAAAGCCTAATTGCT-AGCTTTAAATGA
127 TCAC-TCATGCCTCT-GAAAGCCTAGTTACTCA-CTTCAAGTGA
* ** * * * * *
173024 TTTTAGAA-TCACATAAATG-TTTACAAAATATAATTTTTCTCATTTTTTGTTAAAACATATCAT
1 TTTTATAACT-TTATAAATGATTT--TAAAT-T-ATTTTTTTCA-TTTTTATTAAAATAAATCAT
* * * *
173087 AATTTGATGTTTGCATAAGGAAAGGTAAAGCGAAAGCCATCTATTGATAA-AATAAGTCCATTTA
60 AATTTGATGTTTGCATCAGAAAACGTAAAGCGAAAGCCATCCATTGATAAGAA-AAGTCCATTTA
** * * * * * *
173151 TAGTCACTCATATCTAC-AAAAGCCTAGTTACACGCTTTAAATGG
124 TAGTCACTCATGCCT-CTGAAAGCCTAGTTACTCACTTCAAGTGA
* * * * * * **
173195 TTTTAT-AGTCTTATTAATGATTTTAAATAAAAATTTTTTCATTTCTAGTT-AAACAGGTCATAA
1 TTTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAAT--TATTTTTTTCATTTTTA-TTAAAATAAATCATAA
* * * * * * * * *
173258 GTGGACT-TTTGCATCATG-AAACATTAAGTGAAA-ACTTCCATTGACT-AGAAAAGTCTATTTG
62 TTTGA-TGTTTGCATCA-GAAAACGTAAAGCGAAAGCCATCCATTGA-TAAGAAAAGTCCATTTA
** * * * ** * *
173319 TAGTCACTCATAACTTTGAAACCCTTGTTACTTGCTTTAAGTGG
124 TAGTCACTCATGCCTCTGAAAGCCTAGTTACTCACTTCAAGTGA
* * * * *
173363 TTTTATGACATTATAATTGATTTTAAATTGATTTTTTTCATTTCTTGTTAAAATAGATCATAATT
1 TTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATT-ATTTTTTTCATTT-TTATTAAAATAAATCATAATT
* * ** *
173428 TGATGTTTGCATCAGAAAAGGTAAAGCAAAAATCATCCATTGAATAA-AAAAGTTCATTTATAGT
64 TGATGTTTGCATCAGAAAACGTAAAGCGAAAGCCATCCATTG-ATAAGAAAAGTCCATTTATAGT
** ** ** **
173492 CTGTTTTGTGT-TCGAAAGCCTAGTTACTTGCTTTCAA-TG-
128 CACTCATGCCTCT-GAAAGCCTAGTTACTCAC-TTCAAGTGA
* * * * ** * * **
173531 TTTT-TACAGTATTAT-AATCATTTTTATATTGAAATTTTCTT-AGTTTTGGTTAAAACAGATTG
1 TTTTATA-ACT-TTATAAATGA-TTTTAAATT---ATTTTTTTCA-TTTTTATTAAAATAAATCA
* * * * * * * * *
173593 TAATTTGATGTTTGTAT-TGAGAAAGGTGAAGCGAAAGCAATCCATTAATAAAAAAAAATCTATT
59 TAATTTGATGTTTGCATCAGA-AAACGTAAAGCGAAAGCCATCCATTGAT-AAGAAAAGTCCATT
* * * * *
173657 TATAGGCACTC-TGGCCT-TCAATAACCTAATTACTCAACTT-AAGTGG
122 TATAGTCACTCAT-GCCTCTGAA-AGCCTAGTTACTC-ACTTCAAGTGA
* * * * *
173703 TTTTATGA-TCTTATAAATGATTTTAAAATTAACTTTTTCTCATTTTTTGTTAAAACAGATCATA
1 TTTTATAACT-TTATAAATGATTTT-AAATT-A-TTTTTTTCA-TTTTTATTAAAATAAATCATA
* * * * * * * *
173767 ATTTAATGTTTGCATCA-AGAAATGTGAAGCGAAAGCCATCCAATAATAATAAAAATCCATTTGT
61 ATTTGATGTTTGCATCAGA-AAACGTAAAGCGAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTAT
* * * * * * * *
173831 AGTTACTCTTGCCT-TCACAGCCTTA-TTACTCGCTTTAAATGG
125 AGTCACTCATGCCTCTGAAAGCC-TAGTTACTCACTTCAAGTGA
* * * * * * * *
173873 TTTTATAGCTTTATAAATAATTTTAAATTAATTTTTTTTATTTTTTGTTAGAACAGATCATAACT
1 TTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATT-ATTTTTTTCA-TTTTTATTAAAATAAATCATAATT
* * * * * * ** * * * * *
173938 TCATGTTTGCACCGGGAAATGCT-AAGCGCAAGTTATTCATTAACAAGAAAAGTCCATTTGTTGT
64 TGATGTTTGCATCAGAAAACG-TAAAGCGAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGT
* ** * * * * * * *
174002 AACTTTTGCCT-TCAAAAACCTAGTTTCTCGCTTTAAATGG
128 CACTCATGCCTCT-GAAAGCCTAGTTACTCACTTCAAGTGA
* * * * * * *
174042 GTTTATAA-TCCTATAAATGATTTAAAATTAAATTTTTTTTATTTTTGGTTAAAACAAATCGTAA
1 TTTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAATT--ATTTTTTTCATTTTT-ATTAAAATAAATCATAA
* * * * * * * * * *
174106 TTTCATATTTGCATTAGGAAACATGAAGCGAAAGCTATCCATTGACAAGAAAATTCTATTTTATA
62 TTTGATGTTTGCATCAGAAAACGTAAAGCGAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCA-TTTATA
* * * * * ** * *
174171 GTCATTCATACCTTTAAAAACCTAGTTACAT-GTTTCAAATGG
126 GTCACTCATGCCTCTGAAAGCCTAGTTAC-TCACTTCAAGTGA
* * * * ** *
174213 TTTTAT-AGTCATATAAATAATTTTAAATTGAAGTGTTTTTCATTTGAAGTTAAAACAAATCATA
1 TTTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAATT--A-TTTTTTTCATTTTTA-TTAAAATAAATCATA
* * ** * * * * * *
174277 ATTGGATTTTTGTGTCAGGAAACGTGAAGCAAAACCCTTCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTGTA
61 ATTTGATGTTTGCATCAGAAAACGTAAAGCGAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATA
* *
174342 GTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTGTTACTCACTTCAAGTGA
126 GTCACTCATGCCTCTGAAAGCCTAGTTACTCACTTCAAGTGA
* * * * *
174384 TTTTATAACTTCAAAAATAATTTTAAATTGATTTTTTTCA-TTTCAGTTAAAATAGATCATAATT
1 TTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATT-ATTTTTTTCATTTTTA-TTAAAATAAATCATAATT
** * *
174448 TGATGTTTGCATTGGAAAACGTAAAGCAAAAGCCAT-CATTAACT-AGAAAAGTCCATTTATAGT
64 TGATGTTTGCATCAGAAAACGTAAAGCGAAAGCCATCCATTGA-TAAGAAAAGTCCATTTATAGT
* * * * * *
174511 CACTCGTG-TTC-GAAAGCCTAATTATTTC-CTTTAAAT-A
128 CACTCATGCCTCTGAAAGCCTAGTTA-CTCACTTCAAGTGA
* * * * **
174548 TTTT-TACAATCTTATAAATGATTTTTACATTGAAATTTTCTT-ATTTTTGGTTAAAATAAATTG
1 TTTTATA-ACT-TTATAAATGA-TTTTAAATT---ATTTTTTTCATTTTT-ATTAAAATAAATCA
* * ** **
174611 TAATTTGATGTGTGCATCA-AGAAACGTGAAGCGAAAGTGATCCATTGATAAGAAAAGTTAATTT
59 TAATTTGATGTTTGCATCAGA-AAACGTAAAGCGAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTT
* * **
174675 GTAG-CTACTCATGCCT-TCGAAAGCCTTGTTACTTGCTTCAAGTGA
123 ATAGTC-ACTCATGCCTCT-GAAAGCCTAGTTACTCACTTCAAGTGA
** * *
174720 TTTTATAACTTTATAAATGA-TTTAAATT-TTTTTTTCACTTTTTATTAAAGCATATCAAAATTT
1 TTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTATTTTTTTCA-TTTTTATTAAAATAAATCATAATTT
*
174783 GATGTTTGCATCAGAAAACGTAAAGTGAAAGCCATCCATTGAGT-AGAAAA-TCCATTTATAGTC
65 GATGTTTGCATCAGAAAACGTAAAGCGAAAGCCATCCATTGA-TAAGAAAAGTCCATTTATAGTC
* * *
174846 ACTTATACCTCTGAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAGTGA
129 ACTCATGCCTCTGAAAGCCTAGTTACTCACTTCAAGTGA
* * * * *
174885 TTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTTAATTTTTATCAATTTCAGTTAAAATAGATCATTAT
1 TTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAA-TT-ATTTTTTTCATTTTTA-TTAAAATAAATCATAAT
* * ** * *** * * *
174950 TGGATGTTTGAATTGGAAAATC-TGAAGCGAAAATGATCTATTGACAA-AAAAGTTCATTTATAG
63 TTGATGTTTGCATCAGAAAA-CGTAAAGCGAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAG
* * * * * * * * *
175013 TCACTCAAGTCTTTGAAAACCTAATTACTCGCTTTAAATGG
127 TCACTCATGCCTCTGAAAGCCTAGTTACTCACTTCAAGTGA
* * * * * * *
175054 TTTTGTGA-TCTTATAAATGATTTTAAAATTGAATATTTCTCATTTTTTGTTAAAACAGATCATA
1 TTTTATAACT-TTATAAATGATTTT-AAATT--ATTTTTTTCA-TTTTTATTAAAATAAATCATA
** ** * * * * * * * *
175118 ATTTGATGTTTGTGTTGGGAAATGTGAATCAAAAGCCATCAATTGACAAGAAAAATCCATTTATA
61 ATTTGATGTTTGCATCAGAAAACGTAAAGCGAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATA
* * * * * *
175183 TTCATTCATGACTTTGAAAGCCTTA-TTACTCACTTTAAGTGG
126 GTCACTCATGCCTCTGAAAGCC-TAGTTACTCACTTCAAGTGA
* * * * *
175225 TTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTATTTTTAGTTAGAACAGATCATAGT
1 TTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATT--ATTTTTTTCATTTTTA-TTAAAATAAATCATAAT
* * * * ** * *
175290 TTGATGTTTGCATCA-AGGAATGTGAAGCAAAAGTTATCCAGTGATAAGAAAAGT-CAATTATAG
63 TTGATGTTTGCATCAGA-AAACGTAAAGCGAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAG
* * * * * *
175353 TCGCTCATGCCT-TCGAAAACCTA-TCTACCCACTTTAAATGG
127 TCACTCATGCCTCT-GAAAGCCTAGT-TACTCACTTCAAGTGA
* * * * *
175394 TTGTATAACCTTATAAATGATTTTAAAATTGA-ATTTCTCATTTTTGGTTAAACA-AAAT-ATAA
1 TTTTATAACTTTATAAATGATTTT-AAATT-ATTTTTTTCATTTTT-ATTAAA-ATAAATCATAA
* * * ** * * * * * * * * *
175456 TTTGTTATTTACATTGGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGCAAGGTCAATTTACAG
62 TTTGATGTTTGCATCAGAAAACGTAAAGCGAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAG
* * * * * *
175521 TCACTCATGCCT-TCAAAAACCTAATTAC-AAGCTTCAAATGG
127 TCACTCATGCCTCT-GAAAGCCTAGTTACTCA-CTTCAAGTGA
* * * * * *
175562 TTTT-TTAGTCTTACAAATGATTTTAAATAAATTTTTTTTTATTTTTGGA-TAAAAAAAATCATA
1 TTTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAAT-TA-TTTTTTTCATTTTT--ATTAAAATAAATCATA
* * * * * * *
175625 ATTAGAT-TTATGTATTAGGAAACTTAAAGC-AAAACCTTTCCATTGATAAGAAAAG-CTCATTT
61 ATTTGATGTT-TGCATCAGAAAACGTAAAGCGAAAGCC-ATCCATTGATAAGAAAAGTC-CATTT
* * * * *
175687 ATAGTCACTCATACTTTTGAAAACCTTA-TTACT-AGCTTCAAGTGG
123 ATAGTCACTCATGCCTCTGAAAGCC-TAGTTACTCA-CTTCAAGTGA
* * * * * *
175732 TTTGATGACTTTATAAATAACTTT-AA--A---TTTT--TTTTTGTTAAAACAAATCATAATTTG
1 TTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTATTTTTTTCATTTTTATTAAAATAAATCATAATTTG
* * * *
175789 ATGTTTGCATCAGGAAACGTAAAGCAAAAGCCATCCGTTGACTAA-AAAAGTCTATTTATAGTCA
66 ATGTTTGCATCAGAAAACGTAAAGCGAAAGCCATCCATTGA-TAAGAAAAGTCCATTTATAGTCA
** * * * *
175853 CTCATGTGT-TCGAAAGCTTAGTTACTCGCGTT-AAATGT
130 CTCATGCCTCT-GAAAGCCTAGTTACTCAC-TTCAAGTGA
* * ** * * * *
175891 TTTTACAA-TCTTATAAGTGAATTTTATGTTGACTTTTTTCTCATTTTTGGTTAAAACATATCGT
1 TTTTATAACT-TTATAAATG-ATTTTAAATT-A-TTTTTT-TCATTTTT-ATTAAAATAAATCAT
* * * * * * * * **
175955 AATTTGTTGCTCGCATTGAGAAATATG-GAA-CAAAAGCTATCCATTGATAAGAAAAAACCATTT
60 AATTTGATGTTTGCA-TCAGAAA-ACGTAAAGCGAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTT
* ** * * ** * * * ** *
176018 ATAGTCACT-TTTACTTTCAAAAATCTAGTTACACGCTTGAAAAGG
123 ATAGTCACTCATGCCTCT-GAAAGCCTAGTTACTCACTTCAAGTGA
* * * * * * * **
176063 TTTTGTAGCCTTATAAATGATTTTAAATTGAAATGTGTTTCATTTCTAGTTACAATAGTTCA-AA
1 TTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATT---ATTTTTTTCATTTTTA-TTAAAATAAATCATAA
* * ** * * * * * * *
176127 ATTGAATGTTTGTATTGGAAAGA-TTAAAACCAAAACCATCCATTGACAAGAAAAATCCATGTAT
62 TTTG-ATGTTTGCATCAGAAA-ACGTAAAGCGAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTAT
* * * * * * * * *
176191 AGCCACTCTTGCCTTTGAAAACTTTGTTACTTACTTTAAGTGG
125 AGTCACTCATGCCTCTGAAAGCCTAGTTACTCACTTCAAGTGA
* * * * * * *
176234 TTTTATAACTTTATAAATAATTTTAAATTGAATGTTTTCCATATTTAATTAAACTAGATTA-ATA
1 TTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATT--ATTTTTTTCAT-TTTTATTAAAATAAATCATA-A
* ** * * * * * * *
176298 TTTAATGTTTGCATTGGGAAACGTGAACCGAAAGCCATCCCTTGATAAGAAAAATCTATTTATAA
62 TTTGATGTTTGCATCAGAAAACGTAAAGCGAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAG
* ** * *
176363 TCACTCATGTCT-TCGAAAGCCTTA-TTACTGGCTTTAAGTGG
127 TCACTCATGCCTCT-GAAAGCC-TAGTTACTCACTTCAAGTGA
* ** *
176404 TTTTACAAC-TTATAAATGATTTTAAATTGATTTTTTTTTCATTTTTAGTTTGAATAGATCATAA
1 TTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATT-A--TTTTTTTCATTTTTA-TTAAAATAAATCATAA
* * * * * ** * *
176468 TTTGATATTTGCATCTTG-AAACATGAAGCAAAAGTTATCCATTCACAAG-AAAGTCCATTTATA
62 TTTGATGTTTGCATC-AGAAAACGTAAAGCGAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATA
* ** ** * *
176531 GTCACTCATGCCT-TCGTAAGCCTAGTTGTTTGCTTTAAATGA
126 GTCACTCATGCCTCT-GAAAGCCTAGTTACTCACTTCAAGTGA
* * * *
176573 TTTTATAA-TCATATAAATAATTTTCAAATTGATTTTTTTTTATTTTTAGTAAAA-ACATATCAT
1 TTTTATAACT-TTATAAATGATTTT-AAATT-A-TTTTTTTCATTTTTATTAAAATA-A-ATCAT
* * * * * * * * * ** *
176636 AATTTGATGCTTGCATTAGAAAATGTGAATCAAAAGCTATTCATT-AGCACCAAAAGTCTATTTA
60 AATTTGATGTTTGCATCAGAAAACGTAAAGCGAAAGCCATCCATTGA-TAAGAAAAGTCCATTTA
* * * ** * * *
176700 TAGTCACTTATACCT-TCGGAAGCCTAGGCACACACTTCAAATGG
124 TAGTCACTCATGCCTCT-GAAAGCCTAGTTACTCACTTCAAGTGA
* * * * *
176744 TTTTAT-AGTCTTATAAATGATTGTAAATTAAAATTTTTTTTCATTTCTAGTTAAAACATATCAT
1 TTTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAATT---A-TTTTTTTCATTTTTA-TTAAAATAAATCAT
* * * * * * * * * * *
176808 AGTTAGAT-TTTTCTTCAGGAAACATGAAGCGAAA-CTCTTTCATTGATAAAGAAAAAGTTCATC
60 AATTTGATGTTTGCATCAGAAAACGTAAAGCGAAAGC-CATCCATTGAT-AAG-AAAAGTCCATT
* * * * * *
176871 TGTAATCACTCAT---T-T-CAAG--TGATTTTA-TAACTTTACAAATGA
122 TATAGTCACTCATGCCTCTGAAAGCCT-A-GTTACTCAC-TT-CAAGTGA
** ** * * *
176913 -TTT-TAA----AT---TGATTTT---TT-TCATTTT--TGGTTA--AAACAGATAGC--AATTT
1 TTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTATTTTTTTCATTTTTATTAAA-ATAAATCATAATTT
* * * * * * *
176959 GATGTTTGCATTAAAAAACATAAAGTGAAAGCCATCCATTTACT-AGCAACA-TTCATTTATAGT
65 GATGTTTGCATCAGAAAACGTAAAGCGAAAGCCATCCATTGA-TAAG-AAAAGTCCATTTATAGT
* * * * *
177022 CACT-ATTACCT-TCGAAAGCCTAGTTGCCCACTTTTAAATGA
128 CACTCA-TGCCTCT-GAAAGCCTAGTTACTCAC-TTCAAGTGA
* * * * *
177063 TTTTAT-ACTCTTATAAATTATTTTAAATCAATTTTTT-ATTTTTAGTTAAAAAAAATCATAAAT
1 TTTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAATTATTTTTTTCATTTTTA-TTAAAATAAATCATAATT
** * * * * * * * * *
177126 TGATGTTTTTAT-TGAGAAACGTGAAGCAAAAGCTATCCATTAACAAGAAAAGTCTATCTATAGC
64 TGATGTTTGCATCAGA-AAACGTAAAGCGAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGT
* * ** * *
177190 CATTCATGCCTTTGAAAGGTTTGTTACTCACTTCAAGTGG
128 CACTCATGCCTCTGAAAGCCTAGTTACTCACTTCAAGTGA
* *** *
177230 TTTTATAACTTTATAAATGATGTTAAATTGAATTATTTTT-ATTTTTAGTTAAAACGTATCATTA
1 TTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATT--ATT-TTTTTCATTTTTA-TTAAAATAAATCATAA
** * * * ** * *
177294 TTAAATATTTGCATCA-AGAAACGTGAAGTGAAAGATATCCATTGATAAGAAAAGTCTAGTTATA
62 TTTGATGTTTGCATCAGA-AAACGTAAAGCGAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATA
* * * * ** * *
177358 GTCACTTATGCCT-TCAAAAACTTTTTTACTCACTTTAAATGA
126 GTCACTCATGCCTCT-GAAAGCCTAGTTACTCACTTCAAGTGA
* * * * * *
177400 TTTTATAA-TCTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTCATTTTCAGTTAAAACATATTATTAT
1 TTTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAATT-ATTTTTTTCATTTTTA-TTAAAATAAATCATAAT
* * ** * * * * * * * *
177464 TAGATATTTGCATTGGCAATCATAAAGTGAAAGCCATCCATTGACAAGGAAAGTTCATCTATAGT
63 TTGATGTTTGCATCAGAAAACGTAAAGCGAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGT
* * * ** *
177529 CACTCATACCT-TCG-AAGCTTAGTAACTTGCTTCAAAT--
128 CACTCATGCCTCT-GAAAGCCTAGTTACTCACTTCAAGTGA
* ** * * * * *
177566 TGTTTAT-AGTCTTATAAATGATTTTTTATCAAAATTTTTTCATTTTTGGTTAAAATAGAA-AAA
1 T-TTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAAT--TATTTTTTTCATTTTT-ATTAAAATA-AATCAT
* * * ** * * * * *
177629 AAATGGACGTTTGCATTGGGAAACATGATA-CTGAAA-CCATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTT
60 AATTTGATGTTTGCATCAGAAAACGT-AAAGC-GAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTT
* * * * * ** * * * *
177692 ATAGGCACTTATGTCTTTAAAAATCTTGTTACCCACTTTAAGAGA
123 ATAGTCACTCATGCCTCTGAAAGCCTAGTTACTCACTTCAAGTGA
* * * * * * * * *
177737 TTTAATAACTTTATAAATGATTTTAAATTTATTTTTTTTATTTTTGGTTCAAACAGATGATTAGT
1 TTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAA-TTATTTTTTTCATTTTT-ATTAAAATAAATCATAATT
* * * * * ** * *
177802 TGACGTTTGCAT-TGAGAAACATGAAGCAAAAGTGATCCATTGATAAGAAAAGTCCGTTCATAGT
64 TGATGTTTGCATCAGA-AAACGTAAAGCGAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGT
* * * * * *
177866 AACTCATGTCT-TCAAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAAATGG
128 CACTCATGCCTCT-GAAAGCCTAGTTACTCAC-TTCAAGTGA
* * * * * **
177907 CTTTATGA-TCTTATAAATGATTTTAAAATTGAATTTTTCTCATTTTTGATTAAAACAGATTGTA
1 TTTTATAACT-TTATAAATGATTTT-AAATT--ATTTTTTTCATTTTT-ATTAAAATAAATCATA
* * ** * *
177971 ATTTGATGTTTGTATCTA-AAAAC-AAGAAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAA-TCTATTTA
61 ATTTGATGTTTGCATC-AGAAAACGTA-AAGCGAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTA
* *
178033 TAGTCACTCATGTCT-TCGAAAGCCTTA-TTATTCACTTCAAGTGA
124 TAGTCACTCATGCCTCT-GAAAGCC-TAGTTACTCACTTCAAGTGA
* * *
178077 TTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTCATTTCTTATTAAAATAGATAATAAC
1 TTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATT--ATTTTTTTCATTT-TTATTAAAATAAATCATAAT
* * * * * ** * * * *
178142 TTAATGTTTGCATTAAAAAACATGAAGTAAAAGCGATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATTGT
63 TTGATGTTTGCATCAGAAAACGTAAAGCGAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGT
* * * * * * * * * *
178207 TACTAATACCT-TCGAAAACTTAATTATTCATTTTAAAT-A
128 CACTCATGCCTCT-GAAAGCCTAGTTACTCACTTCAAGTGA
* * * *
178246 GTTTTATAA-TCTTAT-AATGATTTTTAAATGGAATTTTTCTCATTTTTGGTTAAAATAGATCAT
1 -TTTTATAACT-TTATAAATGA-TTTTAAAT--TATTTTTTTCATTTTT-ATTAAAATAAATCAT
** * * * *** * * *
178309 AATTTGATGTTCACATCATG-AAACATGAAGTGAAAATTATCCATTAATAAGAAAAATCAATTTA
60 AATTTGATGTTTGCATCA-GAAAACGTAAAGCGAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTA
* * * * * * *
178373 TAGTTACTTATGCAT-TAAAAAGCCTTA-CTACCCGC-TCTAAGT-A
124 TAGTCACTCATGCCTCT-GAAAGCC-TAGTTACTCACTTC-AAGTGA
* * * * * *
178416 GTTTTATAACATTATAAATTATTTTAAATTGAATTTTTTTTTCATTTTTGGTTAGAACAAATCGT
1 -TTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATT--A--TTTTTTTCATTTTT-ATTAAAATAAATCAT
* * * ** * ** * * * *
178481 AATTTGATGTCTGTATCAGGAAATATGAAGTAAAAACCATCC-GTGAACAAGAAAAGTTCATTTA
60 AATTTGATGTTTGCATCAGAAAACGTAAAGCGAAAGCCATCCATTG-ATAAGAAAAGTCCATTTA
* * * *** * * *
178545 TAAT-ATCTCATACCT-TCGAAAGCCGAGTTACTTGGTTTAAATGT
124 TAGTCA-CTCATGCCTCT-GAAAGCCTAGTTACTCACTTCAAGTGA
* * * * * * * **
178589 TTTTATAA-TCCTATAAATTATTTTAAATAATTTTTTTTAATTTTTTGTTAAAACAGATCATGGT
1 TTTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAATTA-TTTTTTTCA-TTTTTATTAAAATAAATCATAAT
* * * * * * * *
178653 TT-ATTATTTGCATTAGGAAACATGAAA-CAAAAGCCATCTATCGATAAGAAAAGTCCATCT-TA
63 TTGA-TGTTTGCATCAGAAAACGT-AAAGCGAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATA
* ** * * *
178715 GTCACTCATGCTTCCT-AAAGCC-ATGTTACTTGCTTTAAATCA
126 GTCACTCATGCCT-CTGAAAGCCTA-GTTACTCACTTCAAGTGA
* * * * *
178757 TTTTATAA-TCTAATAAATGATTTTGAATTAAATTATTTTTTT-ATTTTTGGTTAAAACATATTA
1 TTTTATAACT-TTATAAATGA--TT---TTAAATTATTTTTTTCATTTTT-ATTAAAATAAATCA
* ** * * * * * * *
178820 TAATTTGATTTTTTTAAT-TGAAAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTAACAAGAAAACTCCATT
59 TAATTTGA-TGTTTGCATCAG-AAAACGTAAAGCGAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATT
** * * *
178884 TATAGTCACTTTTGCCT-TCGAAAACCTAGTTACTCACTTTAAAT-A
122 TATAGTCACTCATGCCTCT-GAAAGCCTAGTTACTCACTTCAAGTGA
** * * *
178929 GTTTTATAATCTTT-TAAATGATTTTTAAAAGAATTGATTTT-ATTTTTCATTAAAACAGATCAT
1 -TTTTATAA-CTTTATAAATGA-TTTT-AAATTATT-TTTTTCATTTTT-ATTAAAATAAATCAT
* * * * ** * * ** * *
178992 AATTTGATTTTTTTCATC-GAAAATTGTAAAGCAAAAGCCATTGATGGTTTCG-AAAG-CTTACT
60 AATTTGA-TGTTTGCATCAGAAAA-CGTAAAGCGAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTC-CATT
* ** * * *
179054 TAT-GTGACTCATGCCT-TCGAAAGCCTAGTTACTTTCTTTAAATGG
122 TATAGTCACTCATGCCTCT-GAAAGCCTAGTTACTCACTTCAAGTGA
* * * **** *
179099 TTTTATAGCCTTATAAATGATTTTAAATCAAAAGCCTTTCATTTCTAGTTAAAATAGAA-CATAA
1 TTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAAT--TATTTTTTTCATTTTTA-TTAAAATA-AATCATAA
* * * * * * * * * *
179163 TTGGATCTTTACATTAGGAAACGT-GAGATGAAAGTCATCCATTCATAAGAAAAGTCCATTTACA
62 TTTGATGTTTGCATCAGAAAACGTAAAG-CGAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATA
* ** * * * * ** * *
179227 GTGACGAATACCT-TCGAAAGGCTAATTGCTTGCTTTAAAT-A
126 GTCACTCATGCCTCT-GAAAGCCTAGTTACTCACTTCAAGTGA
* * *** * * *
179268 GTTTTATAA-TCTTATAAACGATTTTAAATTGATTTTTTTCGCTTTCGGTTAAAAGAGATTATAA
1 -TTTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAATT-ATTTTTTTC-ATTTTTATTAAAATAAATCATAA
* ** * * * * * * * * *
179332 TTTGATGTTTGTATTGGGAAACTTGAAGTGAAAGCCATCCGTTGATATGAAAAGGCTATTTATAC
62 TTTGATGTTTGCATCAGAAAACGTAAAGCGAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAG
* * * * * * * * *
179397 TCACTCATACCTTTGACAGTCTAGTTGCTTACTTTAAATGG
127 TCACTCATGCCTCTGAAAGCCTAGTTACTCACTTCAAGTGA
* * *
179438 TTTTATAATTTTATAAATGATTTTAAATTGATTTTTTTCATTTGTCATTAAAATAGATCATAATT
1 TTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATT-ATTTTTTTCATTT-TTATTAAAATAAATCATAATT
* * * * * * *
179503 TGTTGTTTGCAT-AGAGAAACATGAAGCGAAAGCCCTCCATTGACAAGAAAAGTTCATTGATAGT
64 TGATGTTTGCATCAGA-AAACGTAAAGCGAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGT
* * * * ** * * *
179567 CGCTTATGTCTTCT-AAAGCCTAGTTGCTTGCTTTAAATGG
128 CACTCATG-CCTCTGAAAGCCTAGTTACTCACTTCAAGTGA
* * * * * *
179607 TTTTATGA-TCTTGTAAATGATTTTAAATTGATTTTTTTTCACTTTTAGTTCAAACAGATCATAA
1 TTTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAATT-A-TTTTTTTCATTTTTA-TTAAAATAAATCATAA
* * * * *
179671 TTTGTTATTTGCATC-GAGAAACGTGAAA-C-AAAACCTATCCATTGACAAGAAAAGTCAATTTA
62 TTTGATGTTTGCATCAGA-AAACGT-AAAGCGAAAGCC-ATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTA
* * ** * *
179733 TAGTCACTCATACCT-TCAAAAGTATAGTTACTCACTTTAAAT-A
124 TAGTCACTCATGCCTCT-GAAAGCCTAGTTACTCACTTCAAGTGA
* * * * *
179776 GTTTTATAA-TCTTATAAATTATTTTAAATAATTTTTTTTTTCATTTTTGGTT-AAATAGATAAT
1 -TTTTATAACT-TTATAAATGATTTT--A-AATTATTTTTTTCATTTTT-ATTAAAATAAATCAT
* * * * *
179839 AATTTGCA---TTG----AG-AAACATGAAGCAAAAGCCATTCATTGACAAGAAAAGTCCATTTA
60 AATTTG-ATGTTTGCATCAGAAAACGTAAAGCGAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTA
* * * * * ** * *
179896 TAGTCACTCATACCTTTGAAAGTCAAGTTGCTTGCTTTAAATG-
124 TAGTCACTCATGCCTCTGAAAGCCTAGTTACTCACTTCAAGTGA
* * * * * * *
179939 GTTTATTA-TCTTATAAATGATTGTAAATCAATTTTTTTTTCATTTCTAGTTAAAATAGACCATA
1 TTTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAAT---TATTTTTTTCATTTTTA-TTAAAATAAATCATA
* * * * * * * * *
180003 A-TTGTATGTTTACATTAGAAAACATGAAGTGAAAGCCATCCATTGCTAAAAAAAGTCAACTTAT
61 ATTTG-ATGTTTGCATCAGAAAACGTAAAGCGAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTAT
180067 AGTCACTCAT
125 AGTCACTCAT
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Statistics
Matches: 9324, Mismatches: 2315, Indels: 1375
0.72 0.18 0.11
Matches are distributed among these distances:
144 1 0.00
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ACGTcount: A:0.35, C:0.13, G:0.13, T:0.39
Consensus pattern (167 bp):
TTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTATTTTTTTCATTTTTATTAAAATAAATCATAATTTG
ATGTTTGCATCAGAAAACGTAAAGCGAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCAC
TCATGCCTCTGAAAGCCTAGTTACTCACTTCAAGTGA
Found at i:177529 original size:169 final size:168
Alignment explanation
Indices: 176890--180396 Score: 1732
Period size: 169 Copynumber: 20.7 Consensus size: 168
176880 TCATTTCAAG
* * *
176890 TGATTTTATAA-CTTTACAAATGATTTTAAATTGATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGA-TAG
1 TGATTTTATAATC-TTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTCATTTTTAGTTAAAACAGATTA-
* * ** * * * * *
176953 CAATTTGATGTTTGCATTAAAAAACATAAAGTGAAAGCCATCCATTTACTAGCAACATTC-ATTT
64 TAATTAGATGTTTGCATT-GGAAACATAAAGTAAAAGCCATCCATTGACAAG-AAAAGTCTATTT
* * * *
177017 ATAGTCAC-TATTACCTTCGAAAGCCTAGTTGCCCACTTTTAAA
127 ATAGTCACTTA-TGCCTTCGAAAGCTTAGTTACTCAC-TTTAAA
* * * * * *
177060 TGATTTTATACTCTTATAAATTATTTTAAA-TCAATTTTTT-ATTTTTAGTTAAAAAAAATCATA
1 TGATTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTCATTTTTAGTTAAAACAGATTAT-
** * * * * * *
177123 AATT-GATGTTTTTATTGAGAAACGTGAAGCAAAAGCTATCCATTAACAAGAAAAGTCTATCTAT
65 AATTAGATGTTTGCATTG-GAAACATAAAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTAT
* * * * * *
177187 AGCCA-TTCATGCCTTTGAAAGGTTTGTTACTCACTTCAAG
129 AGTCACTT-ATGCCTTCGAAAGCTTAGTTACTCACTTTAAA
* * * *
177227 TGGTTTTATAA-CTTTATAAATGATGTTAAATTGAATTATTTTTATTTTTAGTTAAAAC-GTATC
1 TGATTTTATAATC-TTATAAATGATTTTAAATTGAATT-TTTTCATTTTTAGTTAAAACAG-ATT
* * * ** * * * ** * *
177290 ATTATTAAATATTTGCATCAAGAAACGTGAAGTGAAAGATATCCATTGATAAGAAAAGTCTAGTT
63 ATAATTAGATGTTTGCAT-TGGAAACATAAAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTT
* * **
177355 ATAGTCACTTATGCCTTCAAAAACTTTTTTACTCACTTTAAA
127 ATAGTCACTTATGCCTTCGAAAGCTTAGTTACTCACTTTAAA
* * *
177397 TGATTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTCATTTTCAGTTAAAACATATTATT
1 TGATTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTCATTTTTAGTTAAAACAGATTATA
* * * * *
177462 ATTAGATATTTGCATTGGCAATCATAAAGTGAAAGCCATCCATTGACAAGGAAAGT-TCATCTAT
66 ATTAGATGTTTGCATTGG-AAACATAAAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCT-ATTTAT
* * * ** *
177526 AGTCACTCATACCTTCG-AAGCTTAGTAACTTGCTTCAAA
129 AGTCACTTATGCCTTCGAAAGCTTAGTTACTCACTTTAAA
* ** ** * * **
177565 T--TGTTTATAGTCTTATAAATGATTTTTTATCAAAATTTTTTCATTTTTGGTTAAAATAGAAAA
1 TGAT-TTTATAATCTTATAAATGATTTTAAAT-TGAATTTTTTCATTTTTAGTTAAAACAGATTA
* * * * * * *
177628 AAAATGGACGTTTGCATTGGGAAACATGATACTGAAA-CCATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTT
64 TAATTAGATGTTTGCATT-GGAAACAT-AAAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTT
* * ** * *
177692 ATAGGCACTTATGTCTTTAAAAATCTT-GTTACCCACTTTAAGA
127 ATAGTCACTTATG-CCTTCGAAAGCTTAGTTACTCACTTTAA-A
* * * * * * *
177735 -GATTTAATAA-CTTTATAAATGATTTTAAATTTATTTTTTTTATTTTTGGTTCAAACAGATGAT
1 TGATTTTATAATC-TTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTCATTTTTAGTTAAAACAGATTA-
* * * * ** * ** *
177798 TAGTT-GACGTTTGCATTGAGAAACATGAAGCAAAAGTGATCCATTGATAAGAAAAGTCCGTTCA
64 TAATTAGATGTTTGCATTG-GAAACATAAAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTA
* * * * *
177862 TAGTAACTCATGTCTTCAAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAAA
128 TAGTCACTTATGCCTTCGAAAGCTTAGTTACTCACTTT-AAA
** *
177904 TGGCTTTATGATCTTATAAATGATTTTAAAATTGAATTTTTCTCATTTTT-GATTAAAACAGATT
1 TGATTTTATAATCTTATAAATGATTTT-AAATTGAATTTTT-TCATTTTTAG-TTAAAACAGATT
* * * **
177968 GTAATTTGATGTTTGTATCTAAAAACA-AGAAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAA-TCTATT
63 ATAATTAGATGTTTGCAT-TGGAAACATA-AAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCTATT
* * * * *
178031 TATAGTCACTCATGTCTTCGAAAGCCTTA-TTATTCACTTCAAG
126 TATAGTCACTTATGCCTTCGAAAG-CTTAGTTACTCACTTTAAA
* *
178074 TGATTTTATAA-CTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTCATTTCTTA-TTAAAATAGATA
1 TGATTTTATAATC-TTATAAATGATTTTAAATTGAA-TTTTTTCATTT-TTAGTTAAAACAGATT
** * *
178137 ATAACTTA-ATGTTTGCATTAAAAAACATGAAGTAAAAGCGATCCATTGACAAGAAAAGTCTATT
63 ATAA-TTAGATGTTTGCATT-GGAAACATAAAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCTATT
* * * * * * * *
178201 TATTGTTACTAATACCTTCGAAAACTTAATTATTCATTTTAAA
126 TATAGTCACTTATGCCTTCGAAAGCTTAGTTACTCACTTTAAA
* * * *
178244 T-AGTTTTATAATCTTAT-AATGATTTTTAAATGGAATTTTTCTCATTTTTGGTTAAAATAGATC
1 TGA-TTTTATAATCTTATAAATGA-TTTTAAATTGAATTTTT-TCATTTTTAGTTAAAACAGATT
* ** * ** * * * *
178307 ATAATTTGATGTTCACATCAT-GAAACATGAAGTGAAAA-TTATCCATTAATAAGAAAAATCAAT
63 ATAATTAGATGTTTGCAT--TGGAAACATAAAGT-AAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCTAT
* * ** * * * * *
178370 TTATAGTTACTTATGCATTAAAAAGCCTTA-CTACCCGCTCTAAG
125 TTATAGTCACTTATGCCTTCGAAAG-CTTAGTTACTCACTTTAAA
* * * *
178414 T-AGTTTTATAA-CATTATAAATTATTTTAAATTGAATTTTTTTTTCATTTTTGGTTAGAACAAA
1 TGA-TTTTATAATC-TTATAAATGATTTTAAATTGAA---TTTTTTCATTTTTAGTTAAAACAGA
** * * * * * * * *
178477 TCGTAATTTGATGTCTGTATCAGGAAATATGAAGTAAAAACCATCC-GTGAACAAGAAAAGT-TC
61 TTATAATTAGATGTTTGCAT-TGGAAACATAAAGTAAAAGCCATCCATTG-ACAAGAAAAGTCT-
* * * ** ***
178540 ATTTATAAT-ATCTCATACCTTCGAAAGCCGAGTTACTTGGTTTAAA
123 ATTTATAGTCA-CTTATGCCTTCGAAAGCTTAGTTACTCACTTTAAA
* * * * * *
178586 TGTTTTTATAATCCTATAAATTATTTTAAA-T-AATTTTTTTTAATTTTTTGTTAAAACAGATCA
1 TGATTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATTGAA--TTTTTTCATTTTTAGTTAAAACAGATTA
** * * * * * * * *
178649 TGGTTTA-TTATTTGCATTAGGAAACATGAAA-CAAAAGCCATCTATCGATAAGAAAAGTCCATC
64 T-AATTAGATGTTTGCATT-GGAAACAT-AAAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCTATT
* * * **
178712 T-TAGTCACTCATG-CTTCCTAAAGC-CATGTTACTTGCTTTAAA
126 TATAGTCACTTATGCCTT-CGAAAGCTTA-GTTACTCACTTTAAA
* * * * * * *
178754 TCATTTTATAATCTAATAAATGATTTTGAATTAAATTATTTTTTTATTTTTGGTTAAAACATATT
1 TGATTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATT-GA--ATTTTTTCATTTTTAGTTAAAACAGATT
* * ** * * * * * *
178819 ATAATTTGATTTTTTTAATTGAAAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTAACAAGAAAACTCCATT
63 ATAATTAGA-TGTTTGCATTG-GAAACATAAAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCTATT
* * *
178884 TATAGTCACTTTTGCCTTCGAAAACCTAGTTACTCACTTTAAA
126 TATAGTCACTTATGCCTTCGAAAGCTTAGTTACTCACTTTAAA
* *
178927 T-AGTTTTATAATCTTTTAAATGATTTTTAAA-AGAATTGATTTT-ATTTTTCA-TTAAAACAGA
1 TGA-TTTTATAATCTTATAAATGA-TTTTAAATTGAATT--TTTTCATTTTT-AGTTAAAACAGA
* * * * * * ** * ** * ****
178988 TCATAATTTGATTTTTTTCATCGAAAATTGTAAAGCAAAAGCCATTGATGGTTTCG-AAAG-CTT
61 TTATAATTAGA-TGTTTGCATTGGAAA-CATAAAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTC-T
* * * * **
179051 ACTTAT-GTGACTCATGCCTTCGAAAGCCTAGTTACTTTCTTTAAA
123 ATTTATAGTCACTTATGCCTTCGAAAGCTTAGTTACTCACTTTAAA
* ** ** *** * * **
179096 TGGTTTTATAGCCTTATAAATGATTTTAAATCAAAAGCCTTTCATTTCTAGTTAAAATAGAACAT
1 TGATTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAAT-TGAATTTTTTCATTTTTAGTTAAAACAGATTAT
* * * * * * * * * *
179161 AATTGGATCTTTACATTAGGAAACGT-GAGATGAAAGTCATCCATTCATAAGAAAAGTCCATTTA
65 AATTAGATGTTTGCATT-GGAAACATAAAG-TAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTA
* * ** * * * **
179225 CAGTGACGAATACCTTCGAAAGGC-TAATTGCTTGCTTTAAA
128 TAGTCACTTATGCCTTCGAAA-GCTTAGTTACTCACTTTAAA
* * ** ** *
179266 T-AGTTTTATAATCTTATAAACGATTTTAAATTGATTTTTTTCGCTTTCGGTTAAAAGAGATTAT
1 TGA-TTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTCATTTTTAGTTAAAACAGATTAT
* * * * * * * * *
179330 AATTTGATGTTTGTATTGGGAAACTTGAAGTGAAAGCCATCCGTTGATATGAAAAGGCTATTTAT
65 AATTAGATGTTTGCATT-GGAAACATAAAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTAT
* * * * * * *
179395 ACTCACTCATACCTTTGACAG-TCTAGTTGCTTACTTTAAA
129 AGTCACTTATGCCTTCGAAAGCT-TAGTTACTCACTTTAAA
* * * * * *
179435 TGGTTTTATAATTTTATAAATGATTTTAAATTGATTTTTTTCATTTGTCA-TTAAAATAGATCAT
1 TGATTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTCATTT-TTAGTTAAAACAGATTAT
* * * * ** * *
179499 AATTTGTTGTTTGCATAGAGAAACATGAAGCGAAAGCCCTCCATTGACAAGAAAAGT-TCATTGA
65 AATTAGATGTTTGCATTG-GAAACATAAAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCT-ATTTA
* * * * * **
179563 TAGTCGCTTATGTCTTCTAAAGCCTAGTTGCTTGCTTTAAA
128 TAGTCACTTATGCCTTCGAAAGCTTAGTTACTCACTTTAAA
* * * * * * *
179604 TGGTTTTATGATCTTGTAAATGATTTTAAATTGATTTTTTTTCACTTTTAGTTCAAACAGATCAT
1 TGATTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATTGA-ATTTTTTCATTTTTAGTTAAAACAGATTAT
* * * * * * *
179669 AATTTGTTATTTGCATCGAGAAACGTGAAA-CAAAA-CCTATCCATTGACAAGAAAAGTCAATTT
65 AATTAGATGTTTGCATTG-GAAACAT-AAAGTAAAAGCC-ATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTT
* * *
179732 ATAGTCACTCATACCTTCAAAAG-TATAGTTACTCACTTTAAA
127 ATAGTCACTTATGCCTTCGAAAGCT-TAGTTACTCACTTTAAA
* *** * *
179774 T-AGTTTTATAATCTTATAAATTATTTTAAATAATTTTTTTTTTCATTTTTGGTT-AAATAG---
1 TGA-TTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAAT--TGAATTTTTTCATTTTTAGTTAAAACAGATT
* * * *
179834 ATAA-TA-A--TTTGCATTGAGAAACATGAAGCAAAAGCCATTCATTGACAAGAAAAGTCCATTT
63 ATAATTAGATGTTTGCATTG-GAAACATAAAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTT
* * * * * **
179895 ATAGTCACTCATACCTTTGAAAG-TCAAGTTGCTTGCTTTAAA
127 ATAGTCACTTATGCCTTCGAAAGCT-TAGTTACTCACTTTAAA
* * * * * * **
179937 TG-GTTTATTATCTTATAAATGATTGTAAA-TCAATTTTTTTTTCATTTCTAGTTAAAATAGACC
1 TGATTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATTGAA---TTTTTTCATTTTTAGTTAAAACAGATT
* * * * * * *
180000 ATAATT-GTATGTTTACATTAGAAAACATGAAGTGAAAGCCATCCATTG-CTAAAAAAAGTCAAC
63 ATAATTAG-ATGTTTGCATT-GGAAACATAAAGTAAAAGCCATCCATTGAC-AAGAAAAGTCTAT
* * * * * **
180063 TTATAGTCACTCATACCTTCAAAAGCCTAATTGTTCACTTTAAA
125 TTATAGTCACTTATGCCTTCGAAAGCTTAGTTACTCACTTTAAA
* * * * * * *
180107 TGGTTTTATAATCTTATAAATAATTTGAAGTTGAATTTTATTTTTTATTTTTGGTTACAA-AGAT
1 TGATTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATTGAA---T-TTTTTCATTTTTAGTTAAAACAGAT
* * * * * * * ** * *
180171 CATAATTTGATATTTGAATTAAGAAATATTAAGTGAAAA-TAATCTATTGACTAGAAAAGTCTAT
62 TATAATTAGATGTTTGCATT-GGAAACATAAAGT-AAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCTAT
* * * * *
180235 TTATAGTCACTTATACATTCGAAATCCTAGTTGCT-AGCTTTAAA
125 TTATAGTCACTTATGCCTTCGAAAGCTTAGTTACTCA-CTTTAAA
* * * * * * *
180279 -CAGTTTTATAATCTTCTAAATGATTTTAAATTGAATTTGCTTCATTTTTGGTTGAAACATATCA
1 TGA-TTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATTGAATTT-TTTCATTTTTAGTTAAAACAGATTA
* * * * ** **
180343 TAATTGGATGTTTGCGTAGGAAACGTGGAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAA
64 TAATTAGATGTTTGCATTGGAAACATAAAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAA
180397 GGCTTGTTTC
Statistics
Matches: 2577, Mismatches: 599, Indels: 323
0.74 0.17 0.09
Matches are distributed among these distances:
159 1 0.00
162 40 0.02
163 85 0.03
164 2 0.00
166 7 0.00
167 68 0.03
168 280 0.11
169 755 0.29
170 722 0.28
171 202 0.08
172 329 0.13
173 76 0.03
174 10 0.00
ACGTcount: A:0.36, C:0.13, G:0.12, T:0.39
Consensus pattern (168 bp):
TGATTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTCATTTTTAGTTAAAACAGATTATA
ATTAGATGTTTGCATTGGAAACATAAAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAG
TCACTTATGCCTTCGAAAGCTTAGTTACTCACTTTAAA
Found at i:179772 original size:339 final size:338
Alignment explanation
Indices: 176893--180396 Score: 2108
Period size: 339 Copynumber: 10.3 Consensus size: 338
176883 TTTCAAGTGA
* * *
176893 TTTTATAA-CTTTACAAATGATTTTAAATTGA-TTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGAT-AGCA
1 TTTTATAATC-TTATAAATGATTTTAAATTGATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACAGATCA-TA
** * * * * * * *
176955 ATTTGATGTTTGCATTAAAAAACAT-AAAGTGAAAGCCATCCATTTACTAGCAACATTC-ATTTA
64 ATTTGATGTTTGCATCGAGAAACATGAAA--CAAAACCATCCATTGACAAG-AAAAGTCTATTTA
* * * * * * * *
177018 TAGTCACT-ATTACCTTCGAAAGCCTAGTTGCCCACTTTTAAATGATTTTATACTCTTATAAATT
126 TAGTCACTCA-TGCCTTCAAAAGTCTAGTTACTCAC-TTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATG
* * * * * * ** *
177082 ATTTTAAA-TCAATTTTTT-ATTTTTAGTTAAAAAAAATCATAAATTGATGTTTTTATTGAGAAA
189 ATTTTAAATTGATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATAGAGAAA
* * * * * * * * * *
177145 CGTGAAGCAAAAGCTATCCATTAACAAGAAAAG-TCTATCTATAGCCATTCATGCCTTTGAAAGG
254 CATGAAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTTC-ATTTATAGTCACTCATACCTTCGAAAGC
* * ** * * *
177209 TTTGTTACTCACTTCAAGTGG
318 CTAGTTACTTGCTTTAAATAG
* *
177230 TTTTATAA-CTTTATAAATGATGTTAAATTGAATTATTTTT-ATTTTTAGTTAAAAC-GTATCAT
1 TTTTATAATC-TTATAAATGATTTTAAATTG-ATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACAG-ATCAT
* ** * * * ** * * *
177292 TATTAAATATTTGCATCAAGAAACGTGAAGTGAAAGA-TATCCATTGATAAGAAAAGTCTAGTTA
63 AATTTGATGTTTGCATCGAGAAACATGAA-ACAAA-ACCATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTA
* * ** *
177356 TAGTCACTTATGCCTTCAAAA-ACTTTTTTACTCACTTTAAATGATTTTATAATCTTATAAATGA
126 TAGTCACTCATGCCTTCAAAAGTC-TAGTTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGA
* ** * * * * * * *
177420 TTTTAAATTGAATTTTTTCATTTTCAGTTAAAACATATTATTATTAGATATTTGCATTG-GCAAT
190 TTTTAAATTGATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATAGAG-AAA
* * * * *
177484 CATAAAGTGAAAGCCATCCATTGACAAGGAAAGTTCATCTATAGTCACTCATACCTTCG-AAGCT
254 CATGAAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTTCATTTATAGTCACTCATACCTTCGAAAGCC
* * *
177548 TAGTAACTTGCTTCAAATTG
319 TAGTTACTTGCTTTAAATAG
* ** ** ** * * ** * *
177568 -TTTATAGTCTTATAAATGATTTTTTATCAAAATTTTTTCATTTTTGGTTAAAATAGAAAAAAAA
1 TTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATTGATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACAGATCATAAT
* * * * * * *
177632 TGGACGTTTGCATTGGGAAACATGATACTGAAACCATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGG
66 TTGATGTTTGCATCGAGAAACATGAAAC-AAAACCATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGT
* * * * * * * *
177697 CACTTATGTCTTTAAAAATCTTGTTACCCACTTTAAGA-GATTTAATAA-CTTTATAAATGATTT
130 CACTCATGCCTTCAAAAGTCTAGTTACTCACTTTAA-ATGGTTTTATAATC-TTATAAATGATTT
* * * * * * * *
177760 TAAATTTATTTTTTTTATTTTTGGTTCAAACAGATGATTAGTTGACGTTTGCATTGAGAAACATG
193 TAAATTGATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATAGAGAAACATG
* ** * * * * * ** *
177825 AAGCAAAAGTGATCCATTGATAAGAAAAGTCCGTTCATAGTAACTCATGTCTTCAAAAGCCTAGT
258 AAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTTCATTTATAGTCACTCATACCTTCGAAAGCCTAGT
** *
177890 TACTCACTTTAAAATGG
323 TACTTGCTTT-AAATAG
* * * * **
177907 CTTTATGATCTTATAAATGATTTTAAAATTGAATTTTTCTCATTTTT-GATTAAAACAGATTGTA
1 TTTTATAATCTTATAAATGATTTT-AAATTGATTTTTTTTCATTTTTAG-TTAAAACAGATCATA
* * * * **
177971 ATTTGATGTTTGTATCTAAAAACAAGAAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAA-TCTATTTATA
64 ATTTGATGTTTGCATCGAGAAACATGAAACAAAA-CCATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATA
* * * * * * *
178035 GTCACTCATGTCTTCGAAAGCCTTA-TTATTCACTTCAAGTGATTTTATAA-CTTTATAAATGAT
128 GTCACTCATGCCTTCAAAAGTC-TAGTTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATC-TTATAAATGAT
* * * * * *
178098 TTTAAATTGAATTTTTTTCATTTCTT-ATTAAAATAGATAATAACTTAATGTTTGCATTA-AAAA
191 TTTAAATTG-ATTTTTTTCATTT-TTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCA-TAGAGAA
* * * * *
178161 ACATGAAGTAAAAGCGATCCATTGACAAGAAAAG-TCTATTTATTGTTACTAATACCTTCGAAAA
253 ACATGAAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTTC-ATTTATAGTCACTCATACCTTCGAAAG
* *
178225 CTTAATTA-TT-CATTTTAAATAG
317 CCTAGTTACTTGC--TTTAAATAG
* * * * *
178247 TTTTATAATCTTAT-AATGATTTTTAAATGGAATTTTTCTCATTTTTGGTTAAAATAGATCATAA
1 TTTTATAATCTTATAAATGA-TTTTAAATTGATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACAGATCATAA
** ** ** * * * *
178311 TTTGATGTTCACATC-ATGAAACATGAAGTGAAAATTATCCATTAATAAGAAAAATCAATTTATA
65 TTTGATGTTTGCATCGA-GAAACATGAA-ACAAAACCATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATA
* * * * * * * * * * * *
178375 GTTACTTATGCATTAAAAAGCCTTA-CTACCCGCTCTAAGTAGTTTTATAA-CATTATAAATTAT
128 GTCACTCATGCCTTCAAAAGTC-TAGTTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATC-TTATAAATGAT
* * * * *
178438 TTTAAATTGAATTTTTTTTTCATTTTTGGTTAGAACAAATCGTAATTTGATGTCTGTATCAG-GA
191 TTTAAATTG-A--TTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCAT-AGAGA
* * * *
178502 AATATGAAGTAAAAACCATCC-GTGAACAAGAAAAGTTCATTTATAAT-ATCTCATACCTTCGAA
252 AACATGAAGTAAAAGCCATCCATTG-ACAAGAAAAGTTCATTTATAGTCA-CTCATACCTTCGAA
* *
178565 AGCCGAGTTACTTGGTTTAAAT-G
315 AGCCTAGTTACTTGCTTTAAATAG
* * * * * **
178588 TTTTTATAATCCTATAAATTATTTTAAA-TAATTTTTTTTAATTTTTTGTTAAAACAGATCATGG
1 -TTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATTGATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACAGATCATAA
* * * * * * *
178652 TTT-ATTATTTGCAT-TAGGAAACATGAAACAAAAGCCATCTATCGATAAGAAAAGTCCATCT-T
65 TTTGA-TGTTTGCATCGA-GAAACATGAAACAAAA-CCATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTAT
* * ** ** *
178714 AGTCACTCATG-CTTCCTAAAG-CCATGTTACTTGCTTTAAATCATTTTATAATCTAATAAATGA
127 AGTCACTCATGCCTT-CAAAAGTCTA-GTTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGA
* * * * * * ** * *
178777 TTTTGAATTAAATTATTTTTTTATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTTGATTTTTTTAATTGAA
190 TTTTAAATT-GA-T-TTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGA-TGTTTGCATAGAG
* * * * ** *
178842 AAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTAACAAGAAAACTCCATTTATAGTCACTTTTGCCTTCGAAA
251 AAACATGAAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTTCATTTATAGTCACTCATACCTTCGAAA
* **
178907 ACCTAGTTACTCACTTTAAATAG
316 GCCTAGTTACTTGCTTTAAATAG
* * **
178930 TTTTATAATCTTTTAAATGATTTTTAAA-AGAATTGATTTT-ATTTTTCA-TTAAAACAGATCAT
1 TTTTATAATCTTATAAATGA-TTTTAAATTG-ATTTTTTTTCATTTTT-AGTTAAAACAGATCAT
* * * ** * **** *
178992 AATTTGATTTTTTTCATCGA-AAA-TTGTAAAGCAAAAGCCATTGATGGTTTCG-AAAG-CTTAC
63 AATTTGA-TGTTTGCATCGAGAAACATG-AAA-CAAAA-CCATCCATTGACAAGAAAAGTC-TAT
* * * ** **
179053 TTAT-GTGACTCATGCCTTCGAAAGCCTAGTTACTTTCTTTAAATGGTTTTATAGCCTTATAAAT
123 TTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGTCTAGTTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAAT
** **** * * * * * * *
179117 GATTTTAAATCAAAAGCCTTTCATTTCTAGTTAAAATAGAACATAATTGGATCTTTACATTAG-G
188 GATTTTAAAT-TGATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCA-TAGAG
* * * * * * * * **
179181 AAACGTG-AGATGAAAGTCATCCATTCATAAGAAAAGTCCATTTACAGTGACGAATACCTTCGAA
251 AAACATGAAG-TAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTTCATTTATAGTCACTCATACCTTCGAA
* * *
179245 AGGCTAATTGCTTGCTTTAAATAG
315 AGCCTAGTTACTTGCTTTAAATAG
* ** ** * *
179269 TTTTATAATCTTATAAACGATTTTAAATTGA-TTTTTTTCGCTTTCGGTTAAAAGAGATTATAAT
1 TTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATTGATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACAGATCATAAT
* * * * ** * * * * * *
179333 TTGATGTTTGTATTGGGAAACTTGAAGTGAAAGCCATCCGTTGATATGAAAAGGCTATTTATACT
66 TTGATGTTTGCATCGAGAAACATGAA-ACAAAACCATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGT
* ** * * * *
179398 CACTCATACCTTTGACAGTCTAGTTGCTTACTTTAAATGGTTTTATAATTTTATAAATGATTTTA
130 CACTCATGCCTTCAAAAGTCTAGTTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTA
* ** * *
179463 AATTGATTTTTTTCATTTGTCATTAAAATAGATCATAATTTGTTGTTTGCATAGAGAAACATGAA
195 AATTGATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATAGAGAAACATGAA
** * * * * ** * *
179528 GCGAAAGCCCTCCATTGACAAGAAAAGTTCATTGATAGTCGCTTATGTCTTCTAAAGCCTAGTTG
260 GTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTTCATTTATAGTCACTCATACCTTCGAAAGCCTAGTTA
*
179593 CTTGCTTTAAATGG
325 CTTGCTTTAAATAG
* * * *
179607 TTTTATGATCTTGTAAATGATTTTAAATTGATTTTTTTTCACTTTTAGTTCAAACAGATCATAAT
1 TTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATTGATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACAGATCATAAT
* * * *
179672 TTGTTATTTGCATCGAGAAACGTGAAACAAAACCTATCCATTGACAAGAAAAGTCAATTTATAGT
66 TTGATGTTTGCATCGAGAAACATGAAACAAAACC-ATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGT
* * * *
179737 CACTCATACCTTCAAAAGTATAGTTACTCACTTTAAATAGTTTTATAATCTTATAAATTATTTTA
130 CACTCATGCCTTCAAAAGTCTAGTTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTA
** * * *
179802 AATAATTTTTTTTTTCATTTTTGGTT-AAATAG---ATAA--T-A-ATTTGCATTGAGAAACATG
195 AAT--TGATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATAGAGAAACATG
* * * * * *
179859 AAGCAAAAGCCATTCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATACCTTTGAAAGTCAAGT
258 AAGTAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTTCATTTATAGTCACTCATACCTTCGAAAGCCTAGT
*
179924 TGCTTGCTTTAAAT-G
323 TACTTGCTTTAAATAG
* * * ** * * *
179939 GTTTATTATCTTATAAATGATTGTAAATCAATTTTTTTTTCATTTCTAGTTAAAATAGACCATAA
1 TTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATTGA-TTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACAGATCATAA
* * ** * * * *
180004 -TTGTATGTTTACAT-TAGAAAACATGAAGTGAAAGCCATCCATTG-CTAAAAAAAGTCAACTTA
65 TTTG-ATGTTTGCATCGAG-AAACATGAA-ACAAAACCATCCATTGAC-AAGAAAAGTCTATTTA
* * * ** *
180066 TAGTCACTCATACCTTCAAAAGCCTAATTGTTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATAAT
126 TAGTCACTCATGCCTTCAAAAGTCTAGTTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGAT
* * * * * *
180131 TTGAAGTTGAATTTTATTTTTTATTTTTGGTTACAA-AGATCATAATTTGATATTTGAATTA-AG
191 TTTAAATTG-A--TT-TTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCA-TAGAG
* * ** * * * *
180194 AAATATTAAGTGAAAA-TAATCTATTGACTAGAAAAG-TCTATTTATAGTCACTTATACATTCGA
251 AAACATGAAGT-AAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTTC-ATTTATAGTCACTCATACCTTCGA
* * * *
180257 AATCCTAGTTGCTAGCTTTAAACAG
314 AAGCCTAGTTACTTGCTTTAAATAG
* * ** * * *
180282 TTTTATAATCTTCTAAATGATTTTAAATTGAATTTGCTTCATTTTTGGTTGAAACATATCATAAT
1 TTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATTGATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACAGATCATAAT
* * * * * * *
180347 TGGATGTTTGCGTAG-GAAACGTGGAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAA
66 TTGATGTTTGCATCGAGAAACATGAAAC-AAAACCATCCATTGACAAGAAA
180397 GGCTTGTTTC
Statistics
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TTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATTGATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACAGATCATAAT
TTGATGTTTGCATCGAGAAACATGAAACAAAACCATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTC
ACTCATGCCTTCAAAAGTCTAGTTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAA
ATTGATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATAGAGAAACATGAAG
TAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTTCATTTATAGTCACTCATACCTTCGAAAGCCTAGTTAC
TTGCTTTAAATAG
Found at i:181174 original size:153 final size:152
Alignment explanation
Indices: 180942--181226 Score: 337
Period size: 153 Copynumber: 1.9 Consensus size: 152
180932 TTAAATTAAA
* * * * *
180942 TTTTTTTCAATTTTGGTTAAAACGATCATAATTTGATGTTTGTATAGGGAAACGTGAGGTAAAAA
1 TTTTTTTCAATTTTGCTTAAAACAATCATAATTTAATGTTTGCATAGGGAAACATGAGGTAAAAA
* * *
181007 CATTCCATTGACAAGAAAAGTTCATTTACACG-CACTCATGCCTTCGAAAG-CTTAGTTGCTCGC
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181070 TTTATAAATGATTTTGAATTATTT
129 TTTATAAATGATTTTGAATTATTT
* *
181094 TTTTTTTCATTTTTGCTTAAAACAAATCAT-ATTTCAATGTTTGCATTGGGAAACATGAAGCG-A
1 TTTTTTTCAATTTTGCTTAAAAC-AATCATAATTT-AATGTTTGCATAGGGAAACATG-AG-GTA
** * * * *
181157 AAGCCA-TCCATTAACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTTATACCTTTGAAAGCCTTATTTCTC
62 AAAACATTCCATTAACAAGAAAAGTCCATTTACAGTCACTCATACCTTCGAAAGCCTTATTGCTC
181221 GCTTTA
127 GCTTTA
181227 AGTGATTTTA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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CATTCCATTAACAAGAAAAGTCCATTTACAGTCACTCATACCTTCGAAAGCCTTATTGCTCGCTT
TATAAATGATTTTGAATTATTT
Found at i:181545 original size:171 final size:171
Alignment explanation
Indices: 181110--181545 Score: 470
Period size: 171 Copynumber: 2.5 Consensus size: 171
181100 TCATTTTTGC
* * * * *
181110 TTAAAACAAATCATATTTCAATGTTTGCATTGGGAAACATGAAGCGAAAGCCATCCATTAACAAG
1 TTAAAACAAATCATAATTGAATGTTTGCAATAGGAAACATGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAG
* * * * *
181175 AAAAGTCCATTTATAGTCACTTATACCTTTGAAAGCCTTATTTCTCGCTTTAAGTGATTTTATAA
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* * *
181240 CTTTATAAATGATTTTAGATCGAAATTGCTTTCATTGCAGA
131 CTTTATAAATGATTTGAAATCGAAATTCCTTTCATTGCAGA
* *
181281 TTAAAACAAATCATAATTGAATGTTTGCAATAGGAGACATGAAGCGATAGCCATCCATTGACAAG
1 TTAAAACAAATCATAATTGAATGTTTGCAATAGGAAACATGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAG
* * *
181346 AAAAGTCTATTTGTAG-CTAC-CTATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGTTTTAT
66 AAAAGTCTATTTATAGTC-ACTC-ATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAGTGATTTTAT
* * * * **
181409 AA-TGTTATAAATTATTTGAAATTGAATTTCCTTTTTAGTT-TTGA
129 AACT-TTATAAATGATTTGAAATCGAAATTCC-TTTCA-TTGCAGA
* * * * * * * **
181453 TTGAAA-AGATCATAATTTAATGTTTTC-ATCATGAAACGTGAAGCAAAAGTAATCCATTGACAA
1 TTAAAACAAATCATAATTGAATGTTTGCAAT-AGGAAACATGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAA
*
181516 AAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTT
65 GAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTT
181546 TGATGTCCAC
Statistics
Matches: 220, Mismatches: 37, Indels: 16
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (171 bp):
TTAAAACAAATCATAATTGAATGTTTGCAATAGGAAACATGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAG
AAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAGTGATTTTATAA
CTTTATAAATGATTTGAAATCGAAATTCCTTTCATTGCAGA
Found at i:182772 original size:341 final size:340
Alignment explanation
Indices: 181697--188268 Score: 3170
Period size: 341 Copynumber: 19.4 Consensus size: 340
181687 CCATTCATAG
* ** * * * * * * *
181697 TCTTATAAATTATTTCCAATCAATTTTTTTT-ATTTCTGGTTAAAACATATTATAATTGGATGTT
1 TCTTATAAATGATTTTAAATGAATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAATAGATCATAATTTGATGTT
* * * * ** * * *
181761 TGCATCAAGAAACGT-AAA-GCAAGAGCTATCCATACAGAAAAAAAGTCCATTTATAGTCATTTA
66 TGCATTAGGAAACATGAAACG-AA-AGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTTA
* * * * *
181824 TACCTTTGAAAGCCTTGTTACTCACTTGAAGTGATTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGA
129 TGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGTTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGA
* * * *
181889 ATTTGTTTTTCATTTTT-GCTTAAAA-ATATCATAATTTAATGTTTGTATTGAGAAATGTGAAGC
194 ATTT-TTTTTCATTTTTAG-TTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGTATTGAAAAATGTAAAGC
* * * * * *
181952 -AAACGAAATCCATTAACAAG-AAAGTCCATTTATAGTCAC-CAATGCCTTCAAAAGACTAATTT
257 GAAA-GCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTC-ATGCCTTCGAAAGCCTAGTTG
*
182014 CTTACTTTAAATGGTTTTATAA
320 CTCACTTTAAATGGTTTTAT-A
* * * * * * * *
182036 TCTTATAAATGATTTTGGATTGAAATTTTTTTCAGTTTT-G-TACAAACAAAGCACAATTT-ATG
1 TCTTATAAATGATTTT-AAATGAATTTTTTTTCATTTTTAGTTA-AAATAGATCATAATTTGATG
* ** * * ** * * * * *
182098 TATGTTTTTA-GAAACATGAAGCGAAAGTCATCTGTTAATAAAAAAAGTTCATTTATAGTCGCCT
64 TTTG-CATTAGGAAACATGAAACGAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTT
* ** * * * * *
182162 ATACCTTC-AATA-ATTTAGTTGCTCGGC-TTAAATGATTTTACAA-TCTTATAAATG-TTTTAT
128 ATGCCTTCGAA-AGCCTT-GTTACTC-GCTTTAAGTGGTTTTATAACT-TTATAAATGATTTTAA
* * * * * * **
182222 ATTG-ATTTTTTTT-A-TTTTGGTTAAAACAAATCATTATTTGTTGTTTGCATTGAGAAACATAA
189 ATTGAATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGTATTGAAAAATGTAA
* * * * * * * *
182284 AGCCAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTTCATTTATAATTACCCATACCTTCGTAAAGCCTAGT
254 AGCGAAAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCG-AAAGCCTAGT
* * * *
182349 T-ATTAGCTTTATATAGTTTTATA
318 TGCTCA-CTTTAAATGGTTTTATA
* * **** * * * * *
182372 GTCTTATCAATGATTGTAAATTGAAAACATTGTCATTTGT-GATTAAAACAAATCATAATTTGTT
1 -TCTTATAAATGATTTTAAA-TGAATTTTTTTTCATTTTTAG-TTAAAATAGATCATAATTTGAT
* * *
182436 GTTTGCATTAGGAAACATGAAACGAAAGCCATCCATTTATAAGAAAAGTCCAATTATAGTCATTT
63 GTTTGCATTAGGAAACATGAAACGAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTT
* * *
182501 ATGCCTTCAAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGTTTTGTAACTTTATAAATGATTTTCAATTG
128 ATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGTTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTG
* * * **
182566 ATTTTTTTTTCATTTTTAGTT-CAA-AGATCGTAATTTGATGTTTGTATAAAAAAATGTAAAGCG
193 AATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGTATTGAAAAATGTAAAGCG
* *
182629 AAAGCAATCCATTGTCAAGAAAAGTCCATTTATCA-TCAACT-ATGCCTTCAAAAGCCTAGTTGC
258 AAAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTAT-AGTC-ACTCATGCCTTCGAAAGCCTAGTTGC
182692 TCACTTTAAATGGTTTTATGA
321 TCACTTTAAATGGTTTTAT-A
* * *
182713 TCTTATAAATGATTTTAAATGAATTGTTTTTTTAATTTTTGGCTAAAATAGATCATAATTT-ATT
1 TCTTATAAATGATTTTAAATGAA-T-TTTTTTTCATTTTTAGTTAAAATAGATCATAATTTGA-T
* * * * * *
182777 GTTTGC--TATGGAAAACATGAAGCGAAAGTCATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTTAT
63 GTTTGCATTA-GG-AAACATGAAACGAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCAC
* *** * * * * *
182840 TTATGCCATCGAAA-CCAACTTACTTGCTTTAAATGGTTTTAT-AGTCTCATAAATAATTTTAAA
126 TTATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGTTTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAA
* * * * * * * * * * *
182903 TCGAA-CTTTTTTCAATTCTAGCT-AAACAAATCATAATTAGATGTTTGCATTAGGCAACA--CA
190 TTGAATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGTATT--GAAAAATGTA
** * * *
182964 ATTCGAAAGTC-ATCCATTGACAAGAACAG-CTAATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTT
253 AAGCGAAAG-CAATCCATTGACAAGAAAAGTC-CATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTA
* * *
183027 GTTACTCACTTTAAATAGATTTATA
316 GTTGCTCACTTTAAATGGTTTTATA
* *
183052 ACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTGTTTTTTCATTTTTAGTTAAAA-AGCTCATAATTTGAT
1 TC-TTATAAATGATTTTAAA-TGAATT-TTTTTTCATTTTTAGTTAAAATAGATCATAATTTGAT
* * * ** * * * * *
183116 GTTTGTATTAAGAAA-A-GTAAAGCAAAAGGAATCTACTGAAAAGAAAAATCTATTTATAGTCAC
63 GTTTGCATTAGGAAACATG-AAA-CGAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCAC
* * * * * * ** * ** * *
183179 TAATGACTTTGAAAGCCGTATTGCTCAATTTAAATATTTTTATAA-TCTCATAAATAATTTTAAA
126 TTATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGTTTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAA
* * * * * * *
183243 GTGAATTATTCTTTCATTTGTGGTTAAAACAGATCCTAATTTGATGTTTGCATCAGAAAACATG-
190 TTGAATT-TTTTTTCATTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGTAT-TGAAAA-ATGT
* * * *
183307 -ACGCGAAAGCTATCCATTGATAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATAG-CTTCGAAAGCCTA
252 AAAGCGAAAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAT-GCCTTCGAAAGCCTA
183370 GTTGCTCACTTTAAATGGTTTTATAA
316 GTTGCTCACTTTAAATGGTTTTAT-A
* * ** *
183396 TCTTATAAATGATTTTAAATTAAATTTTTTT-A-TTTTCCTTAAAAATAGATCATAATTGGATGT
1 TCTTATAAATGATTTTAAATGAATTTTTTTTCATTTTTAGTT-AAAATAGATCATAATTTGATGT
* * ** * * * * * *
183459 TTACATTGGGAAATGTGAAACCAAAGTCC-TCCATTTACAAGAAAAGTGCACTTATAGTCACTCA
65 TTGCATTAGGAAACATGAAACGAAAG-CCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTTA
* * * * ** *
183523 TACCTTCGAAAGCTTTGTTACTTGCTTTAAGCGGACTTATAACTTTATAAATGATTTTGAATTGA
129 TGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGTTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGA
* * * * * * *
183588 ATTATTTTTCATTTTT-GATTAAAA-AGATGACAATTTAATATTTGT-TTCAGGAAACATG--AT
194 ATTTTTTTTCATTTTTAG-TTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGTATT---GAAAAATGTAAA
* * * * * * *
183648 TCAAAAGTC-ATCCATTAACAAGAAAAGTCAATTTATAGTTACTCATGCCTTTGAAAGCCTTGTT
255 GCGAAAG-CAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTAGTT
* * * *
183712 GCTCGCTTTAAGTCGATTTATA
319 GCTCACTTTAAATGGTTTTATA
* * *
183734 ACTTTATAAATGATTTTCAATTGAATTTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAA-AGCTCATAATTTGAT
1 TC-TTATAAATGATTTT-AAATGAA-TTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAATAGATCATAATTTGAT
* * * ** * * * * *
183798 GTTTGTATTAAGAAA-A-GTAAAGTGAAAGGGATCTATTAAAAAGAAAAGTCCATTTACAATCAC
63 GTTTGCATTAGGAAACATG-AAA-CGAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCAC
** * * ** * * * ** * *
183861 TTATAACTTCGAAAGCTTTATGGCTCACATTAAATAATTTTATAA-TCTCATAAATGGTTTTAAA
126 TTATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGTTTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAA
* * * * **
183925 TTGAATTTTTTTT-ATTTTAAGTTAAAACATATCCTAATTTGATGTTTGCATCT-AAAAACATAA
190 TTGAATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGTAT-TGAAAAATGTAA
* * * * *
183988 TGTGAAAGCCATCCTTTGACAA-AAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTCGAAAGCCTAGTT
254 AGCGAAAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTAGTT
* ** *
184052 GATCGTTTTAAATGATTTTATAA
319 GCTCACTTTAAATGGTTTTAT-A
* * * * * * * *
184075 TCTTATAAATCATTTTAAATTGAATTCCTTTTT-ATTTTCACTGAAAATAGATCACAATTGGATA
1 TCTTATAAATGATTTTAAA-TGAATT-TTTTTTCATTTTTAGTTAAAATAGATCATAATTTGATG
** * * ** * * * * * * *
184139 TTTATATCGAGCAAATGTGAAGC-AAAGGTCATCCATTGACAAGAAAATTGCACTTATAGCCACT
64 TTTGCAT-TAGGAAACATGAAACGAAA-GCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACT
* * ** ** * *
184203 TATGCCTTCGAAAACTTTGTTACTTACTTTAAGTGGACTTATAACTTTATAAATGATTTTGAGTT
127 TATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGTTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATT
* * * * * * * * * *
184268 GAATTGTTTTTGATTTTT-GATTAAAA-TGCTCATAATTTAATATTTCTATCGAGAAATATAAAG
192 GAATTTTTTTTCATTTTTAG-TTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGTATTGAAAAATGTAAAG
* * * * * * *
184331 CGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTTATACTTTCGAAAGCTTTGTTAC
256 CGAAAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTAGTTGC
* *
184396 T-AGCTTTAAGTAGTTTTATA
321 TCA-CTTTAAATGGTTTTATA
* * * *
184416 ACTTTATAAATGATTTTAAGTTGAATTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAA-AGATCATAGTTTGATG
1 TC-TTATAAATGATTTTAA-ATGAATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAATAGATCATAATTTGATG
** ** * * * * *
184480 TTT--A-TATTAAACAATGTGAGGTAAAAGCAATCCATTGATAGGAAGAGTACA-TTATTCA-TC
64 TTTGCATTAGGAAAC-ATGAAACG--AAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTA-T-AGTC
* *
184540 ACTTATGCCTTCAAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGATTTTATAA-TCTTATAAATGATTTTA
124 ACTTATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGTTTTATAACT-TTATAAATGATTTTA
* ** * * * * ** * * ** *
184604 AGTAAAAGTTCTTTTT-ATTTTTTGTTAAACCAGATCACAATTTCTTGTTGGCATTGGGAAATAT
188 AATTGAA-TTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGTATTGAAAAATGT
* * * * * ** * *
184668 GAAGCGAAAATC-ATCTATTAACAAGAAAAGTCTATTT-TAGTCACTCATGCCTTTTACAG-TTG
252 AAAGCG-AAAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCT-
* * * * *
184730 AATTACTCTCTTTAAATAGTTTTAGA
315 AGTTGCTCACTTTAAATGGTTTTATA
* * * ** * *
184756 GTCTTATAAATAACTTTAAATCAAAATTTTTTCATTTCTAGTTAAAATAAATCATAA-TTGAATG
1 -TCTTATAAATGATTTTAAATGAATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAATAGATCATAATTTG-ATG
* * * *
184820 TTTGCATT-GAGAAATAT-AAAGCAAAAGCTATCCATTGATAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACT
64 TTTGCATTAG-GAAACATGAAA-CGAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACT
* * * * * * * *
184883 CATGCCTTCGGAAA-CCTAGTTAATCACTTTGAGTGATTTTATAATCTTT-TTAATGATTTGAAA
127 TATGCCTTC-GAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGTTTTATAA-CTTTATAAATGATTTTAAA
* * * * * * *
184946 TAGAATTTTATTTCATTTTTGGTTAAAACAAATCATAATTTGATTTTTGCATTGAGAAATGTAAA
190 TTGAATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGTATTGAAAAATGTAAA
* ** ** * * * * ** * * *
185011 GCAAAAGTGATCCATTGGTAAGAAAAGTTCATTTATAATCACTTATACCTTTAAAAGCATTGTTA
255 GCGAAAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTAGTTG
* *
185076 TTCACTTTAAATGATTTTATA
320 CTCACTTTAAATGGTTTTATA
* * * * * * * * * *
185097 GTATTATAAATAATTTTGAATTGAACTCTTTTCCATCTTAAGTTAAAATAGATAATAATTGGATG
1 -TCTTATAAATGATTTT-AAATGAATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAATAGATCATAATTTGATG
* * * ** * * * ** * *
185162 TTTGCATCAAG-AATA-GAATTTGAAAGTCATCCATTGACAATAAAAGTTAATTTATAGTTACTC
64 TTTGCATTAGGAAACATGAA-ACGAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTT
* * * * * ** * * * *
185225 AAGCCTTTGAAAACCTTATTACTCACTTTAAGCAGATGTATAACTTTATAAATAATTTTAAATTA
128 ATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGTTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTG
* * * ** * * *
185290 AATTTTTTTTCATTCTTAGTTAAGA-AGCTCATAATTTGATGTTCATA-TCAAGAAAAGTAAAAC
193 AATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGTATTGAA-AAATGTAAAGC
* * * * * * ** * * *
185353 AAAAGGAATCTATTCAAAAGAAAAGTTCATTTATAGTCACTCATAACTTAGAAAGCTTTGTTGCT
257 GAAAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTAGTTGCT
*
185418 CACTTTAAATAGTTTTATAA
322 CACTTTAAATGGTTTTAT-A
* * * *
185438 TCTCATAAATGTTTTTAAATTGAATTGTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACT-GATCCTACTTTGAT
1 TCTTATAAATGATTTTAAA-TGAATT-TTTTTTCATTTTTAGTTAAAA-TAGATCATAATTTGAT
* * ** ** * * *
185502 GTTTGCATCAAGAAACATGACGCGAAAGTTATCCATTGACAA-AAAATCTCCATTAATAGTCA-T
63 GTTTGCATTAGGAAACATGAAACGAAAGCCATCCATTGATAAGAAAA-GTCCATTTATAGTCACT
* * * *
185565 TGATGCCTTTGAAAG-CTGTGTTA-TAAGATTTAAGTGGTTTTATAA-TCTTATAAATAATTTTA
127 T-ATGCCTTCGAAAGCCT-TGTTACT-CGCTTTAAGTGGTTTTATAACT-TTATAAATGATTTTA
* * * * * *
185627 AATT-TATTTTTTTTAATTTTTAGTTAAAACAAATCATGATTT-AT-TTTTTACATTGAAAAACG
188 AATTGAATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGT--ATTGAAAAATG
* * *
185689 TGAAA-CGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTT-TAGTCACTCATACCTTCTAAAGCCT
251 T-AAAGCGAAAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCC-
* ** * *
185752 TA-TTGATTGCTTTACATGATTTTATAA
314 TAGTTGCTCACTTTAAATGGTTTTAT-A
* ** * * * *
185779 ACAAATAAATGATTTTGAATTGAATTCTTTTTTCATTTCTT-GTTAAAACAAATCATAATTAGAT
1 TCTTATAAATGATTTT-AAATGAATT-TTTTTTCATTT-TTAGTTAAAATAGATCATAATTTGAT
*** * ** * * * *
185843 GTTTGCACCGGGAGACATGAAGTGAAAGCCATCCATTGATAAGTACAA-TGCATTTATAATTACT
63 GTTTGCATTAGGAAACATGAAACGAAAGCCATCCATTGATAAG-AAAAGTCCATTTATAGTCACT
* * *
185907 TATACCTTCGAAAGACTAG-T--T-GC--T---T-G--------C-TT-TAAATGATTTTAAATT
127 TATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGTTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATT
** * * * * * **
185952 -AA-AATTTTTCATTTTTTGTTAAAA-AGAACATAACTTGATGTTTGTA-TCAAGAAACGTGTAG
192 GAATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGTATTGAA-AAATGTAAAG
* * * * * * *
186013 CAAAAGCAATCCATTAACAAGAAAAGTCTATTTATATTCATTCATGCCTTTGAAAGCCTAGCTGC
256 CGAAAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTAGTTGC
*
186078 TTACTTTAAATGGTTTTATAA
321 TCACTTTAAATGGTTTTAT-A
* * * *
186099 TCTTATCAATGATTTTAGATTGAA-----TTT--TTTTTAGTTAAAACAGATCAAAATTT-ATTG
1 TCTTATAAATGATTTTA-AATGAATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAATAGATCATAATTTGA-TG
* ** * * * *
186156 TTTGCATCAAAAAACAT-AAAGCAAAAGCCATCCGTTAATAAGAAAAGTCTATTTATAGTCA-TT
64 TTTGCATTAGGAAACATGAAA-CGAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTT
* * * * * * *
186219 CATACCTTCAAAAGTCGTGTTACTTGCTTTAAGTGTTTTTATAACTCTATAAATGATTTTAAA-T
128 -ATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGTTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATT
* * *
186283 G-ATTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAA-AGAACATAATTTGATATTTGTATTGAGAAACAT-T-AA
192 GAATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGTATTGA-AAA-ATGTAAA
** * * * ** *
186344 GCGAAAGCAATTGATTGACAAGTAAAA-TCCATTTATTGTAACTCTTGCCTTATAAAGACTAGTT
255 GCGAAAGCAATCCATTGACAAG-AAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTAGTT
* * *
186408 GCTTGA-TTTAAATAGTTCTATA
319 GC-TCACTTTAAATGGTTTTATA
* *
186430 TTCTTATAAATGATTTTAAATTAAATTTTATTT-ATTTTTTA-TTAAAATAGATCATAATTTGAT
1 -TCTTATAAATGATTTTAAA-TGAATTTTTTTTCA-TTTTTAGTTAAAATAGATCATAATTTGAT
* * * * ** * * * *
186493 GTTTACAGT-GAGAAACGTG-AA-GCAAGACCAATATAGTGATAATAAAAGTCCTTTTATAGTTA
63 GTTTGCATTAG-GAAACATGAAACGAAAG-CC-ATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCA
* * * * *** * * * * *
186555 CTCATACCTTTGAAAACCAACTTAGTTGCTTTAAATGGTTTTATAA-TCCTACAAATGATTTTAA
125 CTTATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGTTTTATAACT-TTATAAATGATTTTAA
* * * * * * * * * *
186619 GTTGAA-TTGTTTT-AATTTTACTTAAAATACATCATAATTTGTTGTTT-TCATCGAGAAATGTG
189 ATTGAATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGT-ATTGAAAAATGTA
* * * * * * * * *
186681 AAGCGAAAACCATTCATT-AGTAACAAAAGTCCATCTAAAGTCATTCATGCCTTCTAAAGCCTCA
253 AAGCGAAAGCAATCCATTGA-CAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCT-A
* * * *
186745 -TTACAT-GCTTTATATGGGTTTATAA
316 GTTGC-TCACTTTAAATGGTTTTAT-A
* * * ** * * * *
186770 TCTAATAAATAATTCTAAATTGAATTGATTTT-ATTTTT-GATTCAAACAAATCCTAATTT-ATT
1 TCTTATAAATGATTTTAAA-TGAATTTTTTTTCATTTTTAG-TTAAAATAGATCATAATTTGA-T
** ** *
186832 GTTTGCATTATTAAATGTGAAGA-GAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACT
63 GTTTGCATTAGGAAACATGAA-ACGAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACT
* ** * * * ** * ** * * * * *
186896 CATATCGTCAAAAGTCTAATTGCTTACTTTAAATAG---TAT-TC-TTGTAAATAATTTTAAATT
127 TATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGTTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATT
* ** * * * **
186956 GAATTTTATTTCATTTTGGGATAAAAGAGATCATAATTTGATATTT-TCACTAAAAAACATG-AA
192 GAATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGT-A-TTGAAAA-ATGTAA
* * * * * * * *
187019 A-CAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTTATTCACAG-CTGCGAAAGCCTAAT
254 AGCGAAAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCA-TGCCTTCGAAAGCCTAGT
*
187082 TACTCACTTTAAATGGTTTTATA
318 TGCTCACTTTAAATGGTTTTATA
* * * * * * * **
187105 GTCTTATAAGA-GAATTTGAATTAAAATTTTTTTCAATTTTGGTTAAAACAGATTTTAA-TTGAA
1 -TCTTATAA-ATG-ATTTTAAATGAATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAATAGATCATAATTTG-A
* * ** * * * *
187168 TGTTTGCATTAGGAAACAT-AAAGCAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTGCACTCATAGTTAC
62 TGTTTGCATTAGGAAACATGAAA-CGAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCAC
* * * *
187232 TCATGCATTCGAAAGCCTT-TTACTCGCTTTAACTGATTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAAT
126 TTATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGTTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAAT
* * * * * * * * * *
187296 T-AAATTGTTTTCATTTTTTA-TTAAAAAATATCATCATTTTATGTTTGCATCT-TAAAACGTGA
191 TGAATTTTTTTTCA-TTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGTAT-TGAAAAATGTAA
* ** * * * * * *
187358 AGCAAAAAAAAATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATATTCACTCATGCCTTTGAAAACTTGGT
254 AGC-GAAAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTAGT
* ** *
187423 TACTCGGTTTAAATTGTTTTATA
318 TGCTCACTTTAAATGGTTTTATA
* * * *
187446 GTCTTATAAATGATTTTGAATCAAAATTTTTTTCATTTCT-GATTAAAATCA-ATCATAA-TTGA
1 -TCTTATAAATGATTTTAAAT-GAATTTTTTTTCATTTTTAG-TTAAAAT-AGATCATAATTTG-
* * * ** * *
187508 ATGTTTGTATCAAG-AACTAT-ATAGTGAAAGCTATCCATTGATAAGAAAAGTCTATTTATAGTC
61 ATGTTTGCATTAGGAAAC-ATGA-AACGAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTC
* * * * * * * ** * *
187571 ACTCATACTTTTGAAAGCCTAGCTGCTTACTTTAAATGATTTTATAA-TCTTATAAATGATTTTA
124 ACTTATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGTTTTATAACT-TTATAAATGATTTTA
** * * * * *
187635 AATTTTA-TTGTTTTCATTTTTAGTTAAAATAAATCATAATTT-ACTGTTTGCATCATGAAACAT
188 AATTGAATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTTGA-TGTTTGTAT--TGAAAAAT
* * * * * * * * **
187698 G--AAGCTAAAGCTA-CTCGTTGATAAGAAAAGTCTATATATAATTACTCATGCCTTAAAAAGCC
250 GTAAAGCGAAAGCAATC-CATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCC
* * * *
187760 TTGTTACTCACTTTAAGT-ATCTTTATAA
314 TAGTTGCTCACTTTAAATGGT-TTTAT-A
* *
187788 T-TCTATAAATGATTTTAGAATGAATTTCTCTTTCATTTTTGGTTAAAA-AGATCATAATTTGAT
1 TCT-TATAAATGATTTTA-AATGAATTT-TTTTTCATTTTTAGTTAAAATAGATCATAATTTGAT
* *** *** * * *
187851 GTTTGTATTAGGAAACATGAAGTAAAAATAATCTATTGACAAGTAAAA-TCCATTTATAGTAACT
63 GTTTGCATTAGGAAACATGAAACGAAAGCCATCCATTGATAAG-AAAAGTCCATTTATAGTCACT
* * ** * * * * * *
187915 CATGCCTTTGAAAGAATAGTTGCTTGCTCTAAATGGTTTTATAA-TCTTATCAATGATTTTAAAT
127 TATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGTTTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAAT
* * * *
187979 TG-ATTTTTTTT-A-TTTTGGTTAAAATAGATCATAATTT-ATTTTTTGCATTGAGAAACATG--
191 TGAATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTTGA-TGTTTGTATTGA-AAA-ATGTA
* * * * * * * *
188038 AAGCCAAAGCCATTCATTGAGAAGAAATGTCAATTTATAGTTACTCATGCCTTTGAAAAGCCTA-
253 AAGCGAAAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCG-AAAGCCTAG
* ** * * *
188102 TTAACTTGCTTTATATTGTTTTGTA
317 TT-GCTCACTTTAAATGGTTTTATA
* * * * * * * *
188127 GTCTTCTAAATGATTTTAAGCTAAAATTGTTTTCATTTCTAGTTAAAACAGATCATAATTAGATG
1 -TCTTATAAATGATTTTAA-ATGAATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAATAGATCATAATTTGATG
* * * * * * * * * *
188192 TTTGCATTA--AAAAAGGTAAAGCAAAAGCCATCTACTGACAAGAAAAGTTCAATTGTAGTCATT
64 TTTGCATTAGGAAACATG-AAA-CGAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACT
188255 TATGCCTTCGAAAG
127 TATGCCTTCGAAAG
188269 ATGTTTGCAT
Statistics
Matches: 4740, Mismatches: 1174, Indels: 637
0.72 0.18 0.10
Matches are distributed among these distances:
311 10 0.00
312 75 0.02
313 1 0.00
314 3 0.00
315 1 0.00
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ACGTcount: A:0.36, C:0.13, G:0.12, T:0.39
Consensus pattern (340 bp):
TCTTATAAATGATTTTAAATGAATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAATAGATCATAATTTGATGTT
TGCATTAGGAAACATGAAACGAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTTATG
CCTTCGAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGTTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAAT
TTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGTATTGAAAAATGTAAAGCGAAA
GCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTAGTTGCTCACT
TTAAATGGTTTTATA
Found at i:184515 original size:170 final size:170
Alignment explanation
Indices: 181718--185849 Score: 2289
Period size: 170 Copynumber: 24.3 Consensus size: 170
181708 ATTTCCAATC
* * * * * * *
181718 AATTTTTTTT-ATTTCTGGTTAAAACATATTATAATTGGATGTTTGCATCAAGAAACGTAAAGC-
1 AATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAA-AAATGTAAAGCG
** * * * * *
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* *
181846 CACTTGAAGT-GATTTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAATTG
128 CACTTTAAATAG-TTTTATAACTCTTATAAATGATTTTAAATTG
* * * * *
181888 AATTTGTTTTTCATTTTT-GCTTAAAA-ATATCATAATTTAATGTTTGTATTGAGAAATGTGAAG
1 AATTT-TTTTTCATTTTTAG-TTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATT-AAAAATGTAAAG
* * * * * **
181951 C-AAACGAAATCCATTAACAAG-AAAGTCCATTTATAGTCAC-CAATGCCTTCAAAAGACTAATT
63 CGAAA-G-CATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTC-ATACCTTCGAAAGCCTTGTT
* * * **
182013 TCTTACTTTAAATGGTTTTATAA-TCTTATAAATGATTTTGGATTG
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* * * * * * **
182058 AAATTTTTTTCAGTTTT-G-TACAAACAAAGCACAATTT-ATGTATGTTTTTAGAAACATG--AA
1 AATTTTTTTTCATTTTTAGTTA-AAACAGATCATAATTTGATGTTTG-CATTA-AAA-ATGTAAA
** * * * * * **
182118 GCGAAAGTCATCTGTTAATAAAAAAAGTTCATTTATAGTCGC-CTATACCTTC-AATA-ATTTAG
62 GCGAAAG-CATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTC-ATACCTTCGAA-AGCCTT-G
* * * *
182180 TTGCTCGGC-TTAAAT-GATTTTACAA-TCTTATAAATG-TTTTATATTG
123 TTACTC-ACTTTAAATAG-TTTTATAACTCTTATAAATGATTTTAAATTG
* * * * * ** *
182226 -ATTTTTTTT-A-TTTTGGTTAAAACAAATCATTATTTGTTGTTTGCATTGAGAAACATAAAGCC
1 AATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATT-AAAAATGTAAAGCG
* * * * * *
182288 AAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTTCATTTATAATTACCCATACCTTCGTAAAGCCTAGTTA-T
65 AAAG-CATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATACCTTCG-AAAGCCTTGTTACT
* * * * *
182352 TAGCTTTATATAGTTTTAT-AGTCTTATCAATGATTGTAAATTG
128 CA-CTTTAAATAGTTTTATAACTCTTATAAATGATTTTAAATTG
**** * * * *
182395 AAAACATTGTCATTTGT-GATTAAAACAAATCATAATTTGTTGTTTGCATTAGGAAACATG-AAA
1 AATTTTTTTTCATTTTTAG-TTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTA--AAA-ATGTAAA
* * * * * * *
182458 -CGAAAGCCATCCATTTATAAGAAAAGTCCAATTATAGTCATTTATGCCTTCAAAAGCCTTGTTA
62 GCGAAAG-CATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATACCTTCGAAAGCCTTGTTA
* * * * *
182522 CTCGCTTTAAGTGGTTTTGTAACT-TTATAAATGATTTTCAATTG
126 CTCACTTTAAATAGTTTTATAACTCTTATAAATGATTTTAAATTG
* * * * *
182566 ATTTTTTTTTCATTTTTAGTT-CAA-AGATCGTAATTTGATGTTTGTATAAAAAAATGTAAAGCG
1 AATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCAT-TAAAAATGTAAAGCG
* * * * *
182629 AAAGCAATCCATTGTCAAGAAAAGTCCATTTATCA-TCAACT-ATGCCTTCAAAAGCCTAGTTGC
65 AAAGC-ATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTAT-AGTC-ACTCATACCTTCGAAAGCCTTGTTAC
* *
182692 TCACTTTAAATGGTTTTATGA-TCTTATAAATGATTTTAAA-TG
127 TCACTTTAAATAGTTTTATAACTCTTATAAATGATTTTAAATTG
* * * * *
182734 AATTGTTTTTTTAATTTTTGGCTAAAATAGATCATAATTT-ATTGTTTGCTATGGAAAACATG--
1 AA-T-TTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTTGA-TGTTTGC-AT-TAAAA-ATGTA
* * * * * * ***
182796 AAGCGAAAGTCATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTTATTTATGCCATCGAAA-CCAACT
60 AAGCGAAAG-CATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATACCTTCGAAAGCCTTGT
** * * * * *
182860 TACTTGCTTTAAATGGTTTTAT-AGTCTCATAAATAATTTTAAATCG
124 TACTCACTTTAAATAGTTTTATAACTCTTATAAATGATTTTAAATTG
* * * * * * ** *** **
182906 AA-CTTTTTTCAATTCTAGCT-AAACAAATCATAATTAGATGTTTGCATTAGGCAACACAATTCG
1 AATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTA-AAAATGTAAAGCG
* * *
182969 AAAGTCATCCATTGACAAGAACAG-CTAATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACT
65 AAAG-CATCCATTGACAAGAAAAGTC-CATTTATAGTCACTCATACCTTCGAAAGCCTTGTTACT
*
183033 CACTTTAAATAGATTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAATTG
128 CACTTTAAATAGTTTTATAACTCTTATAAATGATTTTAAATTG
* * *
183075 AATTGTTTTTTCATTTTTAGTTAAAA-AGCTCATAATTTGATGTTTGTATTAAGAAAAGTAAAGC
1 AATT-TTTTTTCATTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAA-AAATGTAAAGC
* * * * * * * * * * * *
183139 AAAAGGAATCTACTGAAAAGAAAAATCTATTTATAGTCACTAATGA-CTTTGAAAGCCGTATTGC
64 GAAA-GCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAT-ACCTTCGAAAGCCTTGTTAC
* * * * *
183203 TCAATTTAAATATTTTTATAA-TCTCATAAATAATTTTAAAGTG
127 TCACTTTAAATAGTTTTATAACTCTTATAAATGATTTTAAATTG
* * * * * ** * *
183246 AATTATTCTTTCATTTGTGGTTAAAACAGATCCTAATTTGATGTTTGCATCAGAAAACATGACGC
1 AATT-TTTTTTCATTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTA-AAAATGTAAAGC
* * * * *
183311 GAAAGCTATCCATTGATAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATAGCTTCGAAAGCCTAGTTGCT
64 GAAAGC-ATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATACCTTCGAAAGCCTTGTTACT
*
183376 CACTTTAAATGGTTTTATAA-TCTTATAAATGATTTTAAATT-
128 CACTTTAAATAGTTTTATAACTCTTATAAATGATTTTAAATTG
* ** * * * **
183417 AAATTTTTTT-A-TTTTCCTTAAAAATAGATCATAATTGGATGTTTACATTGGGAAATGTGAAA-
1 AATTTTTTTTCATTTTTAGTT-AAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATT-AAAAATGT-AAAG
* * * * * *
183479 CCAAAGTCCTCCATTTACAAGAAAAGTGCACTTATAGTCACTCATACCTTCGAAAGCTTTGTTAC
63 CGAAAG-CATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATACCTTCGAAAGCCTTGTTAC
** *** ** *
183544 TTGCTTTAAGCGGACTTATAACT-TTATAAATGATTTTGAATTG
127 TCACTTTAAATAGTTTTATAACTCTTATAAATGATTTTAAATTG
* * * * * *
183587 AATTATTTTTCATTTTT-GATTAAAA-AGATGACAATTTAATATTTG-TTTCAGGAAACATG--A
1 AATTTTTTTTCATTTTTAG-TTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATT-A--AAA-ATGTAA
** * * * * * *
183647 TTCAAAAGTCATCCATTAACAAGAAAAGTCAATTTATAGTTACTCATGCCTTTGAAAGCCTTGTT
61 AGCGAAAG-CATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATACCTTCGAAAGCCTTGTT
* * * * * *
183712 GCTCGCTTTAAGTCGATTTATAACT-TTATAAATGATTTTCAATTG
125 ACTCACTTTAAATAGTTTTATAACTCTTATAAATGATTTTAAATTG
* * * *
183757 AATTTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAA-AGCTCATAATTTGATGTTTGTATTAAGAAAAGTAAAGT
1 AA-TTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAA-AAATGTAAAGC
* * * * * * * * * * **
183821 GAAAGGGATCTATTAAAAAGAAAAGTCCATTTACAATCACTTATAACTTCGAAAGCTTTATGGCT
64 GAAA-GCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATACCTTCGAAAGCCTTGTTACT
* * * *
183886 CACATTAAATAATTTTATAA-TCTCATAAATGGTTTTAAATTG
128 CACTTTAAATAGTTTTATAACTCTTATAAATGATTTTAAATTG
* * * ** * *
183928 AATTTTTTTT-ATTTTAAGTTAAAACATATCCTAATTTGATGTTTGCATCTAAAAACATAATGTG
1 AATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCAT-TAAAAATGTAAAGCG
* *
183992 AAAGCCATCCTTTGACAA-AAAAGTCCATTTATAGTCACTCA-AGCCTTCGAAAGCCTAGTTGA-
65 AAAG-CATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATA-CCTTCGAAAGCCTTGTT-AC
** *
184054 TCGTTTTAAAT-GATTTTATAA-TCTTATAAATCATTTTAAATTG
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* * * * * * * * ** * * *
184097 AATTCCTTTTT-ATTTTCACTGAAAATAGATCACAATTGGATATTTATATCGAGCAAATGTGAAG
1 AATT-TTTTTTCATTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCAT-TA-AAAATGTAAAG
* * * * * * * *
184161 C-AAAGGTCATCCATTGACAAGAAAATTGCACTTATAGCCACTTATGCCTTCGAAAACTTTGTTA
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* * * ** * *
184225 CTTACTTTAAGTGGACTTATAACT-TTATAAATGATTTTGAGTTG
126 CTCACTTTAAATAGTTTTATAACTCTTATAAATGATTTTAAATTG
* * * * * * * * *
184269 AATTGTTTTTGATTTTT-GATTAAAA-TGCTCATAATTTAATATTT-CTATCGAGAAATATAAAG
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* * *
184331 CGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTTATACTTTCGAAAGCTTTGTTAC
63 CGAAAG-CATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATACCTTCGAAAGCCTTGTTAC
* *
184396 T-AGCTTTAAGTAGTTTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAGTTG
127 TCA-CTTTAAATAGTTTTATAACTCTTATAAATGATTTTAAATTG
* * ** * * **
184439 AATTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAA-AGATCATAGTTTGATGTTTATATTAAACAATGTGAGGTA
1 AATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAAA-AATGTAAAGCG
* * * * * * *
184503 AAAGCAATCCATTGATAGGAAGAGTACA-TTATTCA-TCACTTATGCCTTCAAAAGCCTTGTTAC
65 AAAGC-ATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTA-T-AGTCACTCATACCTTCGAAAGCCTTGTTAC
* * * **
184566 TCGCTTTAAGT-GATTTTATAA-TCTTATAAATGATTTTAAGTAA
127 TCACTTTAAATAG-TTTTATAACTCTTATAAATGATTTTAAATTG
* * * * ** * ** * *
184609 AAGTTCTTTTT-ATTTTTTGTTAAACCAGATCACAATTTCTTGTTGGCATTGGGAAATATGAAGC
1 AA-TTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATT-AAAAATGTAAAGC
* * * * * ** *
184673 GAAAATCATCTATTAACAAGAAAAGTCTATTT-TAGTCACTCATGCCTTTTACAG--TTGAATTA
64 G-AAAGCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATACCTTCGAAAGCCTTG--TTA
* * * * * *
184735 CTCTCTTTAAATAGTTTTA-GAGTCTTATAAATAACTTTAAA-TC
126 CTCACTTTAAATAGTTTTATAACTCTTATAAATGATTTTAAATTG
** * * * * *
184778 AAAATTTTTTCATTTCTAGTTAAAATAAATCATAA-TTGAATGTTTGCATTGAGAAATATAAAGC
1 AATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTTG-ATGTTTGCATT-AAAAATGTAAAGC
* * * * * *
184842 AAAAGCTATCCATTGATAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCGGAAA-CCTAGTTAA
64 GAAAGC-ATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATACCTTC-GAAAGCCTTGTTAC
* * * * * *
184906 TCACTTTGAGT-GATTTTATAA-TCTTTTTAATGATTTGAAATAG
127 TCACTTTAAATAG-TTTTATAACTCTTATAAATGATTTTAAATTG
* * * * * *
184949 AATTTTATTTCATTTTTGGTTAAAACAAATCATAATTTGATTTTTGCATTGAGAAATGTAAAGCA
1 AATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATT-AAAAATGTAAAGCG
* ** * * * ** * *
185014 AAAGTGATCCATTGGTAAGAAAAGTTCATTTATAATCACTTATACCTTTAAAAGCATTGTTATTC
65 AAAG-CATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATACCTTCGAAAGCCTTGTTACTC
* * * *
185079 ACTTTAAAT-GATTTTAT-AGTATTATAAATAATTTTGAATTG
129 ACTTTAAATAG-TTTTATAACTCTTATAAATGATTTTAAATTG
* * * * * * * * * * ***
185120 AACTCTTTTCCATCTTAAGTTAAAATAGATAATAATTGGATGTTTGCATCAAGAATAG-AATTTG
1 AATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAAAAAT-GTAAAGCG
* ** * * * *
185184 AAAGTCATCCATTGACAATAAAAGTTAATTTATAGTTACTCA-AGCCTTTGAAAACCTTATTACT
65 AAAG-CATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATA-CCTTCGAAAGCCTTGTTACT
** * * * *
185248 CACTTTAAGCAGATGTATAACT-TTATAAATAATTTTAAATTA
128 CACTTTAAATAGTTTTATAACTCTTATAAATGATTTTAAATTG
* * * * *
185290 AATTTTTTTTCATTCTTAGTTAAGA-AGCTCATAATTTGATG-TT-CATATCAAGAAAAGTAAAA
1 AATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCAT-T-AA-AAATGTAAAG
* * * * * * * * * *
185352 CAAAAGGAATCTATTCAAAAGAAAAGTTCATTTATAGTCACTCATAACTTAGAAAGCTTTGTTGC
63 CGAAA-GCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATACCTTCGAAAGCCTTGTTAC
* *
185417 TCACTTTAAATAGTTTTATAA-TCTCATAAATGTTTTTAAATTG
127 TCACTTTAAATAGTTTTATAACTCTTATAAATGATTTTAAATTG
* * * * ** * *
185460 AATTGTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACTGATCCTACTTTGATGTTTGCATCAAGAAACATGACGC
1 AATT-TTTTTTCATTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAA-AAATGTAAAGC
* * * * * * *
185525 GAAAGTTATCCATTGACAA-AAAATCTCCATTAATAGTCATTGATGCCTTTGAAAG-CTGTGTTA
64 GAAAG-CATCCATTGACAAGAAAA-GTCCATTTATAGTCACTCATACCTTCGAAAGCCT-TGTTA
* * * * *
185588 -TAAGATTTAAGTGGTTTTATAA-TCTTATAAATAATTTTAAATT-
126 CTCA-CTTTAAATAGTTTTATAACTCTTATAAATGATTTTAAATTG
* * * * * * *
185631 TATTTTTTTTAATTTTTAGTTAAAACAAATCATGATTT-ATTTTTTACATTGAAAAACGTGAAA-
1 AATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTTGA-TGTTTGCATT-AAAAATGT-AAAG
* *
185694 CGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTT-TAGTCACTCATACCTTCTAAAGCCTTATTGA
63 CGAAAG-CATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATACCTTCGAAAGCCTTGTT-A
** * * ** *
185758 -TTGCTTTACAT-GATTTTATAA-ACAAATAAATGATTTTGAATTG
126 CTCACTTTAAATAG-TTTTATAACTCTTATAAATGATTTTAAATTG
* *
185801 AATTCTTTTTTCATTTCTT-GTTAAAACAAATCATAATTAGATGTTTGCA
1 AATT-TTTTTTCATTT-TTAGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCA
185850 CCGGGAGACA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (170 bp):
AATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAAAAATGTAAAGCGA
AAGCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATACCTTCGAAAGCCTTGTTACTCAC
TTTAAATAGTTTTATAACTCTTATAAATGATTTTAAATTG
Found at i:187406 original size:170 final size:170
Alignment explanation
Indices: 185936--188198 Score: 863
Period size: 170 Copynumber: 13.4 Consensus size: 170
185926 TTGCTTGCTT
* * * *
185936 TAAATGATTTTAAATTAAAAT-TTTTCATTTTTTG-TTAAAA-AGAA-CATAACTTGATGTTTGT
1 TAAATGATTTTAAATTAAATTGTTTTCA-TTTTTGATTAAAATA-AATCATAATTTTATGTTTGC
* * * * ** * * *
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* * * * *
186061 TTTGAAAGCCTAGCTGCTTACTTTAAATGGTTTTATAATCTTA
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* * * * * * *
186104 TCAATGATTTTAGATTGAA---TTTT--TTTTAG-TTAAAACAGATCA-AAATTTATTGTTTGCA
1 TAAATGATTTTAAATTAAATTGTTTTCATTTTTGATTAAAATAAATCATAATTTTA-TGTTTGCA
** * * *** * * * * *
186162 TCAAAAAACATAAAGCAAAAGCCATCCGTTAATAAGAAAAGTCTATTTATAGTCATTCATACCTT
65 TCTTAAAACATGAAGTAAAAATAATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTT
** * * ** * *
186227 CAAAAGTCGTGTTACTTGCTTTAAGTGTTTTTATAA-CTCTA
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* * * * * * *
186268 TAAATGATTTTAAA-TGATTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAA-AGAA-CATAATTTGATATTTGTA
1 TAAATGATTTTAAATTAAATTGTTTTCATTTTTGATTAAAATA-AATCATAATTTTATGTTTGCA
* * ** ** ** * * * *
186330 T-TGAGAAACATTAAGCGAAAGCAATTGATTGACAAGTAAAA-TCCATTTATTGTAACTCTTGCC
65 TCTTA-AAACATGAAGTAAAAATAATCCATTGACAAG-AAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCC
* * * * * *
186393 TTAT-AAAGACTAGTTGCTTGA-TTTAAAT-AGTTCTATATTCTTA
128 TT-TGAAAGCCTTGTTAC-TCACTTTAAATGA-TTTTATAATCTTA
* * * * *
186436 TAAATGATTTTAAATTAAATT-TTATTTATTTTTTATTAAAATAGATCATAATTTGATGTTTACA
1 TAAATGATTTTAAATTAAATTGTT-TTCATTTTTGATTAAAATAAATCATAATTTTATGTTTGCA
* * * * * ** ** * * * * *
186500 -GTGAGAAACGTGAAGCAAGACCAATATAGTGATAATAAAAGTCCT-TTTATAGTTACTCATACC
65 TCTTA-AAACATGAAGTAAAAATAATCCATTGACAAGAAAAGT-CTATTTATAGTCACTCATGCC
* *** * ** * *
186563 TTTGAAAACCAACTTAGTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCCTA
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* * * * * *
186606 CAAATGATTTTAAGTTGAATTGTTTT-AATTTT-ACTTAAAATACATCATAATTTGT-TGTTTTC
1 TAAATGATTTTAAATTAAATTGTTTTCATTTTTGA-TTAAAATAAATCATAATTT-TATGTTTGC
* ** ** ** * * * * * * *
186668 ATC-GAGAAATGTGAAGCGAAAACCATTCATT-AGTAACAAAAGTCCATCTAAAGTCATTCATGC
64 ATCTTA-AAACATGAAGTAAAAATAATCCATTGA-CAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGC
** * * ** *
186731 CTTCT-AAAGCCTCATTACAT-GCTTTATATGGGTTTATAATCTAA
127 CTT-TGAAAGCCTTGTTAC-TCACTTTAAATGATTTTATAATCTTA
* * * * * *
186775 TAAATAATTCTAAATTGAATTGATTTT-ATTTTTGATTCAAACAAATCCTAA-TTTATTGTTTGC
1 TAAATGATTTTAAATTAAATTG-TTTTCATTTTTGATTAAAATAAATCATAATTTTA-TGTTTGC
* ** *** * **
186838 AT-TATTAAATGTGAAG-AGAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATAT
64 ATCT-TAAAACATGAAGTA-AAAATAATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGC
* ** * ** * * * *
186901 CGTCAAAAGTCTAATTGCTTACTTTAAAT-A--GTAT--TCTTG
127 CTTTGAAAGCCTTGTTACTCACTTTAAATGATTTTATAATCTTA
* * * * * * * * *
186940 TAAATAATTTTAAATTGAATTTTATTTCATTTTGGGA-TAAAAGAGATCATAATTTGATATTTTC
1 TAAATGATTTTAAATTAAATTGT-TTTCATTTT-TGATTAAAATAAATCATAATTTTATGTTTGC
* ** *** * * *
187004 A-CTAAAAAACATGAAACAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTTATTCACAG-
64 ATCT-TAAAACATGAAGTAAAAATAATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCA-TGC
** ** * *
187067 CTGCGAAAGCCTAATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAGTCTTA
127 CTTTGAAAGCCTTGTTACTCACTTTAAATGATTTTATAATCTTA
* * * * * * * ** **
187111 TAAGA-GAATTTGAATTAAAATTTTTTTCAATTTTGGTTAAAACAGATTTTAATTGAATGTTTGC
1 TAA-ATGATTTTAAATT-AAATTGTTTTCATTTTTGATTAAAATAAATCATAATTTTATGTTTGC
* * *** * * * * *
187175 A--TTAGGAAACATAAAGCAAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTGC-ACTCATAGTTACTCATG
64 ATCTTA--AAACATGAAGTAAAAATAATCCATTGACAAGAAAAGT-CTATTTATAGTCACTCATG
* * * *
187237 CATTCGAAAGCCTT-TTACTCGCTTTAACTGATTTTATAA-CTTTA
126 CCTTTGAAAGCCTTGTTACTCACTTTAAATGATTTTATAATC-TTA
* *
187281 TAAATGATTTTAAATTAAATTGTTTTCATTTTTTATTAAAA-AATATCATCATTTTATGTTTGCA
1 TAAATGATTTTAAATTAAATTGTTTTCATTTTTGATTAAAATAA-ATCATAATTTTATGTTTGCA
* * * *
187345 TCTTAAAACGTGAAGCAAAAAAAAATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATATTCACTCATGCCT
65 TCTTAAAACATGAAG-TAAAAATAATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCT
* ** *
187410 TTGAAA-ACTTGGTTACTCGGTTTAAATTG-TTTTATAGTCTTA
129 TTGAAAGCCTT-GTTACTCACTTTAAA-TGATTTTATAATCTTA
* * * * * ** *
187452 TAAATGATTTTGAATCAAAATTTTTTTCATTTCTGATTAAAATCAATCATAATTGAATGTTTGTA
1 TAAATGATTTTAAAT-TAAATTGTTTTCATTTTTGATTAAAATAAATCATAATTTTATGTTTGCA
** * *
187517 TC--AAGAACTAT-ATAGTGAAAGCT-ATCCATTGATAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATA
65 TCTTAA-AAC-ATGA-AGT-AAAAATAATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATG
* * * * *
187578 CTTTTGAAAGCCTAGCTGCTTACTTTAAATGATTTTATAATCTTA
126 CCTTTGAAAGCCTTGTTACTCACTTTAAATGATTTTATAATCTTA
**
187623 TAAATGATTTTAAATTTTATTGTTTTCATTTTT-AGTTAAAATAAATCATAA-TTTACTGTTTGC
1 TAAATGATTTTAAATTAAATTGTTTTCATTTTTGA-TTAAAATAAATCATAATTTTA-TGTTTGC
* * ** * * * * * *
187686 ATCATGAAACATGAAGCTAAAGCTACT-CGTTGATAAGAAAAGTCTATATATAATTACTCATGCC
64 ATCTTAAAACATGAAG-TAAAAATAATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCC
** *
187750 TTAAAAAGCCTTGTTACTCACTTTAAGT-ATCTTTATAAT-TCTA
128 TTTGAAAGCCTTGTTACTCACTTTAAATGAT-TTTATAATCT-TA
* * * * * *
187793 TAAATGATTTTAGAATGAATTTCTCTTTCATTTTTGGTTAAAA-AGATCATAATTTGATGTTTG-
1 TAAATGATTTTA-AATTAAATTGT-TTTCATTTTTGATTAAAATAAATCATAATTTTATGTTTGC
* * * *
187856 -TATTAGGAAACATGAAGTAAAAATAATCTATTGACAAGTAAAA-TCCATTTATAGTAACTCATG
64 ATCTTA--AAACATGAAGTAAAAATAATCCATTGACAAG-AAAAGTCTATTTATAGTCACTCATG
** * * ** * *
187919 CCTTTGAAAGAATAGTTGCTTGCTCTAAATGGTTTTATAATCTTA
126 CCTTTGAAAGCCTTGTTACTCACTTTAAATGATTTTATAATCTTA
* * * * * * *
187964 TCAATGATTTTAAATT-GATTTTTTTTA-TTTTGGTTAAAATAGATCATAA-TTTATTTTTTGCA
1 TAAATGATTTTAAATTAAATTGTTTTCATTTTTGATTAAAATAAATCATAATTTTA-TGTTTGCA
* ** *** * * * * *
188026 T-TGAGAAACATGAAGCCAAAGCCATTCATTGAGAAGAAATGTCAATTTATAGTTACTCATGCCT
65 TCTTA-AAACATGAAGTAAAAATAATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCT
* ** * * * *
188090 TTGAAAAGCCTAT-TAACTTGCTTTATATTG-TTTTGTAGTCTTC
129 TTG-AAAGCCT-TGTTACTCACTTTA-AATGATTTTATAATCTTA
* * * * * **
188133 TAAATGATTTTAAGCTAAAATTGTTTTCATTTCT-AGTTAAAACAGATCATAATTAGATGTTTGC
1 TAAATGATTTTAA-ATTAAATTGTTTTCATTTTTGA-TTAAAATAAATCATAATTTTATGTTTGC
188197 AT
64 AT
188199 TAAAAAAGGT
Statistics
Matches: 1600, Mismatches: 378, Indels: 230
0.72 0.17 0.10
Matches are distributed among these distances:
163 22 0.01
164 105 0.07
165 28 0.02
166 101 0.06
167 28 0.02
168 182 0.11
169 270 0.17
170 416 0.26
171 334 0.21
172 111 0.07
173 3 0.00
ACGTcount: A:0.36, C:0.12, G:0.12, T:0.40
Consensus pattern (170 bp):
TAAATGATTTTAAATTAAATTGTTTTCATTTTTGATTAAAATAAATCATAATTTTATGTTTGCAT
CTTAAAACATGAAGTAAAAATAATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTT
GAAAGCCTTGTTACTCACTTTAAATGATTTTATAATCTTA
Found at i:188325 original size:80 final size:80
Alignment explanation
Indices: 188187--188348 Score: 252
Period size: 80 Copynumber: 2.0 Consensus size: 80
188177 GATCATAATT
* * *
188187 AGATGTTTGCATTAAAAAAGGTAAAGCAAAAGCCATCTACTGACAAGAAAAGTTCAATTGTAGTC
1 AGATGTTTGCATCAAAAAAGGTAAAGCAAAAGCCATCTACTAACAAGAAAAGTCCAATTGTAGTC
*
188252 ATTTATGCCTTCGAA
66 ATTTATGCATTCGAA
* * * *
188267 AGATGTTTGCATCAAAGAAGGTAAAGCAAAAGTCATCTATTAACAAGAAAAGTCCAATTTTAGTC
1 AGATGTTTGCATCAAAAAAGGTAAAGCAAAAGCCATCTACTAACAAGAAAAGTCCAATTGTAGTC
188332 ATTTATGCATTCGAA
66 ATTTATGCATTCGAA
188347 AG
1 AG
188349 CCTTGTTACT
Statistics
Matches: 74, Mismatches: 8, Indels: 0
0.90 0.10 0.00
Matches are distributed among these distances:
80 74 1.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.14, G:0.17, T:0.28
Consensus pattern (80 bp):
AGATGTTTGCATCAAAAAAGGTAAAGCAAAAGCCATCTACTAACAAGAAAAGTCCAATTGTAGTC
ATTTATGCATTCGAA
Found at i:190999 original size:169 final size:167
Alignment explanation
Indices: 188833--191907 Score: 1436
Period size: 170 Copynumber: 18.1 Consensus size: 167
188823 CAAACTTGGT
* * * * * *
188833 GTGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATTGTCACTCATGCCTT-TAAATGCTTATTT
1 GTGAAAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCATTCATGCCTTCGAAA-GCCTAGTT
* ** * * * ** * * * *
188897 ACTCGTTTTAAAT-GATTTTAT-AGTCTTATAAATGATTTTAAATCAAACTTGTTTTTGTTTCTA
65 CCTCACTCTAAGTAG-TTTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAATTGAA-TTTTTTTTATTTTTT
* * * *
188960 GTTAAAACAGATCAT--GTTGCATGTTTTCAT-CGAGAAACGTGAA
127 GTTAAAA-AGATCATAATTTG-ATG-TTTGATAAG-GAAA-ATGAA
** * * * * * ** *
189003 GCAAAAGCTATCCATTGACATGAAAAGTCCACTTATAGTCACTCATGCCTTTAAAAAGCCTTGTT
1 GTGAAAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCATTCATGCC-TTCGAAAGCCTAGTT
* * * * *
189068 ACTCACTTTAAGT-GGTTTACTAATTTTATAAATGATTTT-AATTGAATTGTTTTTTTATTTTTC
65 CCTCACTCTAAGTAGTTTTA-TAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAA-T-TTTTTTTATTTTTT
* * * * * **
189131 ATTAAAAATATTATAATTTGATGTTTGTATCGACGAATGTGAA
127 GTTAAAAAGATCATAATTTGATGTTTG-AT-AAGGAAAATGAA
* * * * * * **
189174 G-CACAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCGACTTATAGTCAATCATGCCTTTAAAAGCCTAGTT
1 GTGA-AAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCATTCATGCCTTCGAAAGCCTAGTT
* * * * *
189238 ACTCACTTTAAATAGTTTTATAACTTCATAAATGATTTT-AATTGAATTGTTTTTTTATTTCTTG
65 CCTCACTCTAAGTAGTTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAA-T-TTTTTTTATTTTTTG
* * * * *
189302 TTAAAAAGATCATAATTTGAAGCTTGTATTAGGAAACTTGAT
128 TTAAAAAGATCATAATTTGATGTTTG-ATAAGGAAA-ATGAA
* * * * *
189344 GTGAAAGCAATCCATTAACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCAGTCATGCCTTTGAAAGCCTAGCTG
1 GTGAAAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCATTCATGCCTTCGAAAGCCTAGTTC
** * * * * * * *
189409 CTTGCTTTAAAT-GCTTTTAT-ATTCTTATAAATGACTGTAAATTGAATTATTTTTCATTTTTGG
66 CTCACTCTAAGTAG-TTTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAATTGAATT-TTTTTTATTTTTTG
* * * * *
189472 TTAAAGTAGACCATAATTT-ATTATTTACATTAGGAAACATGAA
128 TTAAA-AAGATCATAATTTGA-TGTTT-GATAAGGAAA-ATGAA
* * * * * * *
189515 GTAAAAGCCAA-CCATTGACAAG-AAAGTCAATTTAAAGTCACTT-ATGCTTTCAAAATCCTTGT
1 GTGAAAG-CAATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCA-TTCATGCCTTCGAAAGCCTAGT
* * * ** * * * ** *
189577 TACTCGCTTTAAGCGGTTTTAAAACTTTATAACTGA-TTTCAATTGAATTTTTTCCATTTTTGGT
64 TCCTCACTCTAAGTAGTTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTATTTTTTGT
* *
189641 TAAAAAGATCATAATTTGATGTTTGTATTAGGAAATGTGAA
129 TAAAAAGATCATAATTTGATGTTTG-ATAAGGAAA-ATGAA
* * * * * * * * **
189682 GTGAAAGCTATCCATTGACAAAAAAAAATCCACTTATAGTCGTTCATGCCTTTGAAAACCTTTTT
1 GTGAAAGCAATCCATTGAC-AAGAAAAGTCTATTTATAGTCATTCATGCCTTCGAAAGCCTAGTT
* * * * * * * * *
189747 ACTTAGTTTAGGTAGTTTTTTAACTTTATAAATGATTTTAAGTTAAATTATTTTTTTATTTTTAG
65 CCTCACTCTAAGTAGTTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAA-T-TTTTTTTATTTTTTG
* * *
189812 TTAAAAAGATCATAATTTCAAGTTTGTATTA-GAAAACTTG-A
128 TTAAAAAGATCATAATTTGATGTTTG-ATAAGGAAAA--TGAA
* * * * * * **
189853 GTCAAAAGTAATCTATTGACAAGAAAAGTCTATCTATAGTCATTTATGCCTTTGAAAGCCTAACT
1 GT-GAAAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCATTCATGCCTTCGAAAGCCTAGTT
** *** * * * * * *
189918 GTTTGTTTTAAATAGTTTTAT-ATTCTTATAAATAATTTTAAATTGAATTGTTTTTCAGTTTTTG
65 CCTCACTCTAAGTAGTTTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAATTGAATT-TTTTTTATTTTTTG
* * * * *
189982 TTAAAACAGATTAGAATTTGTTGTTTGTATTAGGAAGCATGAA
128 TTAAAA-AGATCATAATTTGATGTTTG-ATAAGGAA-AATGAA
** * * * * ** * *
190025 GCAAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGT-TCATTTGTAGTCACTCATATCTTCGAAA-ACTGAGC
1 GTGAAAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCT-ATTTATAGTCATTCATGCCTTCGAAAGCCT-AGT
* * * * * * ** * * *
190088 TACTCATTTTAAATAGTTTTAT-AGTCTTATAAAT-ATTTTCAATCAAAAATTTTTTTGTTTTTA
64 TCCTCACTCTAAGTAGTTTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAAT-TGAATTTTTTTTATTTTTT
* * * * ** *
190151 GTTAAAACTGAACATAATTGGATGCTTTCATTGGGAAACGTGAA
127 GTTAAAA-AGATCATAATTTGATG-TTTGATAAGGAAA-ATGAA
* * * * * * *
190195 G-CAAACGCCATCTATTGATAAGAAAAGTCTTTTTATAGTCATTCATGTCTTCGAAAGCCTAATT
1 GTGAAA-GCAATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCATTCATGCCTTCGAAAGCCTAGTT
* * * * * * * ** *
190259 ACTCGCT-TCAAATAATTTTAT-AGTCTTATAAATGATTTCAAATCGAATTCATTTTATTTTTGG
65 CCTCACTCT-AAGTAGTTTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTATTTTTTG
* * * *
190322 TTAAACCATATCAAAATTGGATGTTTTTG-TCAA-GAAATATGAA
128 TTAAA-AAGATCATAATTTGATG--TTTGAT-AAGGAAA-ATGAA
* * * * * * *
190365 GCGAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATTA-TTACTT-ATGCCTT-GAAAAACCTTG
1 GTGAAAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTA-TAGTCA-TTCATGCCTTCG-AAAGCCTAG
* * * * * *
190427 -ACACT-AGTTTAAGCAG-TTT-T-ACTTTATAAATGATTTTAAATT-ATTTTTTTTTATTTTTG
63 TTC-CTCACTCTAAGTAGTTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTATTTTTT
* *
190486 GTTAAAACAGATCATAATTT-AT-TTATTACTTTAGGAAACATGAA
127 GTTAAAA-AGATCATAATTTGATGTT-TGA--TAAGGAAA-ATGAA
* * * * * * * *
190530 G-CAGAAGTC-ATCTATTGATAAGAAACGTCTATTTATAGTCACTCATGTCAT-GAAAATCCTTA
1 GTGA-AAG-CAATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCATTCATGCCTTCG-AAAGCC-TA
* * * * *
190592 -TTACTTACTTTAAGTAGTTTTATAACTTTATAAATGATGTTAAATAGAATTTTTTTTCATTTTT
62 GTTCCTCACTCTAAGTAGTTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTT-ATTTTT
* * *
190656 AGTTAAAAAGATCATAATTTGTTGTTT-ATATCGAGAAACATGAA
126 TGTTAAAAAGATCATAATTTGATGTTTGATA-AG-GAAA-ATGAA
* * * * *
190700 GTGAAAGTAATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCTTTCATGTCTTTGAAAGCCTAGTTG
1 GTGAAAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCATTCATGCCTTCGAAAGCCTAGTTC
* ** * * * * *
190765 TTTGCTTTAAATAGTTTTAT-ATTCTTATAAATAATTTTAAATTGAATTTTTTTTCTTTTTTGTT
66 CTCACTCTAAGTAGTTTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTATTTTTTGTT
*
190829 AAGTAAA-A-CATAATTGGATGTTTGCATAAGGAAATATGAA
130 AA--AAAGATCATAATTTGATGTTTG-ATAAGGAAA-ATGAA
* ** * * * *
190869 GCGAAAGCCCTCCATTAACAAGAAAAGTCAATTTCA-AGTCATTCATGCCTTCGAAAGTCTTATT
1 GTGAAAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTT-ATAGTCATTCATGCCTTCGAAAG-CCTAGT
* *
190933 TCCTCACTCTAAGTGGTTTTATAACTTTATAACTGATTTTAAATTG-ATTTTTTTTATTTTTTGT
64 TCCTCACTCTAAGTAGTTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTATTTTTTGT
190997 TAAAAAGATCATAATTTGATGTTTG-TATAGGAAAACGTGAA
129 TAAAAAGATCATAATTTGATGTTTGATA-AGGAAAA--TGAA
** *
191038 GTGAAAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGAT-ACCCATG-CTATCAAAAGCCTAGT
1 GTGAAAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAG-TCATTCATGCCT-TCGAAAGCCTAGT
* ** * * * * * *
191101 TGCTTGCTTTAAATGGTTTTATAA-TCTTATAAAT-AGTTTATATTG-ATTTTTTTTAATTTTTG
64 TCCTCACTCTAAGTAGTTTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTT-ATTTTTT
* * *
191163 GTTAAAAAGATCATACTTTGATGTTTG-TATAGAGAAACGTAAA
127 GTTAAAAAGATCATAATTTGATGTTTGATA-AG-GAAA-ATGAA
** * * * * *
191206 ACGAAAGGAATCTATTGATAAGAAAAGT-TCATTTATAGTCATTCATACCTTCGAAAGCCTTGTT
1 GTGAAAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCT-ATTTATAGTCATTCATGCCTTCGAAAGCCTAGTT
** ** * * * * *
191270 ATTTGCTTTAAGTGGTTTTATAACTTTATAAATTATTTTAAATTGTATTTTTTTCCA--TTTTGC
65 CCTCACTCTAAGTAGTTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTT-TATTTTTTG-
* * * * *
191333 TTTAAAATATCACAATTTAATGTTTGTATAAAGAAACATGAA
128 TTAAAAAGATCATAATTTGATGTTTG-ATAAGGAAA-ATGAA
* * * * * ** * *
191375 GTAAAAGTAGTTCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCATGCATGCCTTTTAAAGCCTAATTG
1 GTGAAAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCATTCATGCCTTCGAAAGCCTAGTTC
* * ** * * * *
191440 CTCACT-TCGAGTGGGTTTGCTATC-TTATAAATGATTTTAAATTGAATTATGTTTCATTTTTGG
66 CTCACTCT-AAGT-AGTTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATT-TTTTTTATTTTTTG
* *
191503 TTAAAATAGAT-ATAATTTGTTG-TTGCAT--TGAGAAATGTACA
128 TTAAAA-AGATCATAATTTGATGTTTG-ATAAGGA-AAATG-A-A
* * * * * * * * *
191544 GCGAAAACTATCCATTGACAAGAAAAGTTTATTTATAGTCACTCATACCTTTGAAAGCCTAATTA
1 GTGAAAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCATTCATGCCTTCGAAAGCCTAGTTC
* * ** ** * *
191609 CTCACTTTAA-TTGATTTTATAA-TCTTATAAATGATTTTAAATCAAAATGTTTTTCCATTTCTA
66 CTCACTCTAAGTAG-TTTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAAT-TGAAT-TTTTTTTATTTTTT
* * *
191672 GTTAAAACAAATCATAATTGGATGTTTGCATCAA-GAAATGTGAA
127 GTTAAAA-AGATCATAATTTGATGTTTG-AT-AAGGAAA-ATGAA
** * * * * * * * *
191716 GCAAAAGCCATCTATTGACAAGTAAAGT-TCATTTATACTTACTT-ATACCTTCGAAAATCTTA-
1 GTGAAAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCT-ATTTATAGTCA-TTCATGCCTTCG-AAAGCCTAG
** * * * * *
191778 TTAGTCGCTTTAAGT-GGTTTATAACTTTATAAATGACTTTAAATTGAATTTCTTTTTTCAGTTT
63 TTCCTCACTCTAAGTAGTTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAA-TT-TTTTTT-ATTTT
* * *
191842 TGGTTAAAAAGGTCATAATTTGATGTTTGTATTAGGAAACATGAA
125 TTGTTAAAAAGATCATAATTTGATGTTTG-ATAAGGAAA-ATGAA
*
191887 GTGAAAGTAATCCATTGACAA
1 GTGAAAGCAATCCATTGACAA
191908 AAACATTCAT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
161 2 0.00
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174 4 0.00
ACGTcount: A:0.34, C:0.12, G:0.13, T:0.40
Consensus pattern (167 bp):
GTGAAAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCATTCATGCCTTCGAAAGCCTAGTTC
CTCACTCTAAGTAGTTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTATTTTTTGTTA
AAAAGATCATAATTTGATGTTTGATAAGGAAAATGAA
Found at i:192722 original size:172 final size:169
Alignment explanation
Indices: 192396--192783 Score: 417
Period size: 172 Copynumber: 2.3 Consensus size: 169
192386 TTCTAAACTA
* * * * *
192396 ATAAATAATTTTAAATTGATTTTTTTTTAGTTTTAGTTCAAA-CAGATCATAATTTGTTGTTTAC
1 ATAAATGATTTTAAATTGATTTTTTTTTATTTTTAGTT-AAAGCAGATCATAATTTGATATTCAC
* *
192460 ATCAAGAAACATAAAGCAAAAGCCACCATTAGTAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACATATGCTTT
65 ATCAAGAAACATAAAGCAAAAGCCACCATTAGGAAGAAAAGTCAATTTATAGTCACATATGCTTT
* * * * * *
192525 CGAAAGCCTTTTTACTTACTTTAAGTGATTTTATTA-TTAT
130 CAAAAACCTTGTTACTCACTTTAAGTGATTTGATAACTT-T
* * *
192565 ATAAATGATTTTGAATTGATTTTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAGTAGATCATAATTTGATATTCA
1 ATAAATGATTTTAAATTGA-TTTTTTTTT-ATTTTTAGTTAAAGCAGATCATAATTTGATATTCA
* * *** **
192630 CATTAAGAAACATGAAGTTCAAGCCATTGATT-GGAAGGAAAAGTCAATTTATAGTCAC-TAATG
64 CATCAAGAAACATAAAGCAAAAGCCA-CCATTAGGAA-GAAAAGTCAATTTATAGTCACAT-ATG
** *
192693 CCTTT-AAAAACCTTGTTACTCGTTTTAAGTGGTTTGATAACTTT
126 -CTTTCAAAAACCTTGTTACTCACTTTAAGTGATTTGATAACTTT
* *
192737 ATAAATGATTTTAAATTGAATTGTTTTTATTTTTAGTTAAAGCAGAT
1 ATAAATGATTTTAAATTGATTTTTTTTTATTTTTAGTTAAAGCAGAT
192784 AATTTATATG
Statistics
Matches: 180, Mismatches: 31, Indels: 15
0.80 0.14 0.07
Matches are distributed among these distances:
169 17 0.09
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ACGTcount: A:0.35, C:0.10, G:0.13, T:0.42
Consensus pattern (169 bp):
ATAAATGATTTTAAATTGATTTTTTTTTATTTTTAGTTAAAGCAGATCATAATTTGATATTCACA
TCAAGAAACATAAAGCAAAAGCCACCATTAGGAAGAAAAGTCAATTTATAGTCACATATGCTTTC
AAAAACCTTGTTACTCACTTTAAGTGATTTGATAACTTT
Found at i:194471 original size:170 final size:171
Alignment explanation
Indices: 194256--194928 Score: 414
Period size: 170 Copynumber: 3.9 Consensus size: 171
194246 CTTGCATCGA
* * ** *
194256 GAAACATGAAGCAAAAGCAATCCATTAATAAAAAAAGTTCATTTATAGTTTCTCATGCCTTCGAA
1 GAAACATGAAGCAAAAGCAATCCATTAACAAAAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATACCTTCGAA
* * * * * *
194321 AGCCTATTTGCTCATTTTAAA-TAGTTTTCTAAT-TCTATAAGTAATTTT-AAATTGAACTTTTT
66 AGCCCAATTACTCACTTTAAATTA-TTTTATAATAT-TATAAATAATTTTCAAATTGAA-TTTTT
* * *
194383 TTCATTTTTAGTTAAAACAGATCAT-AGTTGTTATTTGCATTAG
128 CTCATTTTTAGTTAAAACAGATCATAAGTTGATATTTGCATAAG
* ** * * *
194426 GAAACATGAAGCAAAAGCTATTTATTCACAAAAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATATCTTTGAA
1 GAAACATGAAGCAAAAGCAATCCATTAACAAAAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATACCTTCGAA
* * *
194491 AGCCCAATTACTCGCTTTAAATTATTTTATAATATTATAAATGATTTTCACATTGAATTTTTCTC
66 AGCCCAATTACTCACTTTAAATTATTTTATAATATTATAAATAATTTTCAAATTGAATTTTTCTC
* * * *
194556 ATTTTTGGTTAAAACAGATCGTAATTTGATGTTTGCATAAG
131 ATTTTTAGTTAAAACAGATCATAAGTTGATATTTGCATAAG
* * ** * * * * * * * ** *
194597 AAAACATGAAGCGAAAGTGATCCAATGATAAAAAAAGTTCATCTATAATCACTTATGGCTTCAAA
1 GAAACATGAAGCAAAAGCAATCCATTAACAAAAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATACCTTCGAA
** ** ** *** * **
194662 AGCTTAATTACT-AGCAGTAAATGGTTTTAT-AGGCTATAAATGATTTT-AAATCAAAATGGTTG
66 AGCCCAATTACTCA-CTTTAAATTATTTTATAATATTATAAATAATTTTCAAAT-TGAAT--TT-
* * * * ** ** *
194724 TT-TCATTTTTGGTGAAAATAGATCATAATTTTCTATTTGTTTTAG
126 TTCTCATTTTTAGTTAAAACAGATCATAAGTTGATATTTGCATAAG
* * ** * * ** * * * * *
194769 AAAACTTGAAGTGAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCTATTTATACTCACTCATGCTTTCGAA
1 GAAACATGAAGCAAAAGCAATCCATTAACAAAAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATACCTTCGAA
* * * * * * *
194834 AGCCTAATTACTCA-TTTTAACTAGTTTTATAATCTTATAAAT-GTGTTTAAAATTGAATTATTC
66 AGCCCAATTACTCACTTTAAATTA-TTTTATAATATTATAAATAAT-TTTCAAATTGAATTTTTC
* *
194897 TCATTTTT-GATTAAAATAGATCATAATTTGAT
129 TCATTTTTAG-TTAAAACAGATCATAAGTTGAT
194929 GTCTATATTG
Statistics
Matches: 387, Mismatches: 100, Indels: 31
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Matches are distributed among these distances:
169 3 0.01
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171 125 0.32
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173 17 0.04
174 4 0.01
ACGTcount: A:0.36, C:0.13, G:0.12, T:0.39
Consensus pattern (171 bp):
GAAACATGAAGCAAAAGCAATCCATTAACAAAAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATACCTTCGAA
AGCCCAATTACTCACTTTAAATTATTTTATAATATTATAAATAATTTTCAAATTGAATTTTTCTC
ATTTTTAGTTAAAACAGATCATAAGTTGATATTTGCATAAG
Found at i:194673 original size:171 final size:169
Alignment explanation
Indices: 193955--194921 Score: 480
Period size: 171 Copynumber: 5.7 Consensus size: 169
193945 ATAAATGTTT
* * * ** * *
193955 ATTTATAGTCACTTATGCCTTCGAACGCCTAGTTACTTTCTTGAAATAG-TTTATAATGT-TATT
1 ATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTAATTACTCACTTTAAATAGTTTTATAAT-TCTATA
* * * * * * ** * * * *
194018 AATGATTTTAGAACT-AAATTTTTCTCATTTTTGGTTTAAATAGATTTTTATTTGATGTTGGAAT
65 AATAATTTTA-AATTGAACTTTTTCTCATTTTTAGTTAAAACAGA-TCATAGTTGATATTTGCAT
* * * * * * * *
194082 CAA-AAAATATGAATCGAAAGCCATCCATTGATAAGAAAGGTCC
128 -AAGAAAACATGAAGCAAAAG-TATCCATTAATAAAAAAAGTTC
* * * * * * ** *
194125 ATTTATAGTCACTTATGCTTTTGAAAACCTAATTACTTACTTTAAATGGTTTTA-AAGACATACA
1 ATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTAATTACTCACTTTAAATAGTTTTATAATTC-TATA
* * * * * * * **
194189 AATGATTTTAAA-TCAATTCTTTTT-TCATTTCTAGTCAAAATATA-CTATAATTAGATGCTTGC
65 AATAATTTTAAATTGAA--CTTTTTCTCATTTTTAGTTAAAACAGATC-ATAGTT-GATATTTGC
* *
194251 AT-CGAGAAACATGAAGCAAAAGCAATCCATTAATAAAAAAAGTTC
126 ATAAGA-AAACATGAAGCAAAAG-TATCCATTAATAAAAAAAGTTC
** * * * *
194296 ATTTATAGTTTCTCATGCCTTCGAAAGCCTATTTGCTCATTTTAAATAGTTTTCTAATTCTATAA
1 ATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTAATTACTCACTTTAAATAGTTTTATAATTCTATAA
* * * *
194361 GTAATTTTAAATTGAACTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACAGATCATAGTTGTTATTTGCATTAG
66 ATAATTTTAAATTGAACTTTTTCTCATTTTTAGTTAAAACAGATCATAGTTGATATTTGCATAAG
* ** * * *
194426 GAAACATGAAGCAAAAGCTATTTATTCACAAAAAAAGTCC
131 AAAACATGAAGCAAAAG-TATCCATTAATAAAAAAAGTTC
** * * *
194466 ATTTATAGTCACTCATATCTTTGAAAGCCCAATTACTCGCTTTAAATTA-TTTTATAATAT-TAT
1 ATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTAATTACTCACTTTAAA-TAGTTTTATAAT-TCTAT
* * * * * *
194529 AAATGATTTTCACATTGAA-TTTTTCTCATTTTTGGTTAAAACAGATCGTAATTTGATGTTTGCA
64 AAATAATTTT-AAATTGAACTTTTTCTCATTTTTAGTTAAAACAGATCAT-AGTTGATATTTGCA
* * *
194593 TAAGAAAACATGAAGCGAAAGTGATCCAATGATAAAAAAAGTTC
127 TAAGAAAACATGAAGCAAAAGT-ATCCATTAATAAAAAAAGTTC
* * * * * * ** * **
194637 ATCTATAATCACTTATGGCTTCAAAAGCTTAATTACT-AGCAGTAAATGGTTTTAT-AGGCTATA
1 ATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTAATTACTCA-CTTTAAATAGTTTTATAATTCTATA
* ** * * * * * ** *
194700 AATGATTTTAAATCAAAATGGTTGTT-TCATTTTTGGTGAAAATAGATCATAATTTTCTATTTGT
65 AATAATTTTAAATTGAACT--TT-TTCTCATTTTTAGTTAAAACAGATCAT-AGTTGATATTTGC
* * * ** * * *** *
194764 TTTAGAAAACTTGAAGTGAAAGCCATTCATTGGCAAGAAAAG-TC
126 ATAAGAAAACATGAAGCAAAAG-TATCCATTAATAAAAAAAGTTC
* * * *
194808 TATTTATACTCACTCATGCTTTCGAAAGCCTAATTACTCATTTTAACTAGTTTTATAA-TCTTAT
1 -ATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTAATTACTCACTTTAAATAGTTTTATAATTC-TAT
* * *
194872 AAAT-GTGTTTAAAATTGAA-TTATTCTCATTTTT-GATTAAAATAGATCATA
64 AAATAAT-TTT-AAATTGAACTTTTTCTCATTTTTAG-TTAAAACAGATCATA
194922 ATTTGATGTC
Statistics
Matches: 612, Mismatches: 149, Indels: 72
0.73 0.18 0.09
Matches are distributed among these distances:
169 6 0.01
170 202 0.33
171 264 0.43
172 119 0.19
173 15 0.02
174 6 0.01
ACGTcount: A:0.36, C:0.13, G:0.12, T:0.39
Consensus pattern (169 bp):
ATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTAATTACTCACTTTAAATAGTTTTATAATTCTATAA
ATAATTTTAAATTGAACTTTTTCTCATTTTTAGTTAAAACAGATCATAGTTGATATTTGCATAAG
AAAACATGAAGCAAAAGTATCCATTAATAAAAAAAGTTC
Found at i:195956 original size:168 final size:169
Alignment explanation
Indices: 195748--209750 Score: 4200
Period size: 170 Copynumber: 82.4 Consensus size: 169
195738 CATGAAGTAG
* *
195748 AAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTAAAAGCCTA-TATGCCC
1 AAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGT-TGCTC
* **
195812 ACTTTAAATGGTTTTATAATCTTGTAAATGATTTTGAATTGA-ACTTTTTCATTTTTGGTTAAAA
65 ACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTT-AATTGATTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAA
* * *
195876 CAGATCACAATT-GTTGTTTGCATC-AGCAAACGCGAAGCGA
129 CAGATCACAATTGGATGTCTGCATCAAG-AAACGCAAAGCGA
* * * * * * * *
195916 AAGTC-ATCCATTGACAAGAAAAATTCAATTATTGTCACTCATGTCTCCGAAAA-CTTAGTTACT
1 AAG-CAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTC-AAAAGCCTAGTTGCT
** * * * * *
195979 TGCTTTAAATAGTTTTATGATATTATAAATCATTTTAAATTGATTTTTTTTAATTTTTGGTTAAA
64 CACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTT-AATTGATTTTTTTTCATTTTTGGTTAAA
* * *
196044 ACATATCATAATTGGATGTCTGCATCAAGAAACGTAAAGCGA
128 ACAGATCACAATTGGATGTCTGCATCAAGAAACGCAAAGCGA
* * * *
196086 AAGCAATTCATTTACAAGAAAAGTCCATTTATAGTTACTCATACCTTCAAAAGCCTAGTTGCTCA
1 AAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTGCTCA
* *
196151 C-TTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATATTAAGTTGATTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAAT
66 CTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAA-TTGATTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAAC
* * *** * * * * **
196215 AGACCATAATTTTCTATTTGCAT-AGGGAAATGTGAAGCGA
130 AGATCACAATTGGATGTCTGCATCA-AGAAACGCAAAGCGA
* * * * * * * *
196255 AGGCCATTCATTGAC-----AAGTCCATTTAGAGTCGCTCATGCCTTTGAAAA-CCTAATTACTC
1 AAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCC-TTCAAAAGCCTAGTTGCTC
* * * * * * ** * *
196314 GCATTAAATAGTTTTATAATCTTATAATTGAATTTAAAATTTAAGTTTTCTCATTTTTTGTTAAA
65 ACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATG-ATTT-TAATTGATTTTTTTTCATTTTTGGTTAAA
* * * * *
196379 ACATATCATAATTTGATGTCTGCAT-TAGAAAACATG-AAA-CAA
128 ACAGATCACAATTGGATGTCTGCATCAAG-AAAC--GCAAAGCGA
* * * * * * * ** * *
196421 AAGCCATCCGTTGACAAGAAAAATGCATTTATAGTCACTCATACATTCGAAAGTTTAGTTACTCG
1 AAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTGCTCA
* * * * * * * ** *
196486 TTTTAAATAGTTTTATAGTCTTATAAATCACTATAAATTAATTTTTTTAAATTTTTGATTAAAAC
66 CTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGA-TTTTAATTGATTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAAC
* * * * * * *** * *
196551 ATATCATAGTTGAATGTTTGCATCATGAAACATGATGCAA
130 AGATCACAATTGGATGTCTGCATCAAGAAACGCAAAGCGA
* * * * * * ** ** *
196591 AAGCCATCCATTAACAAGAAAAGTCCATTTATAATCACTCTTACCATCAAAAGTGTAGTTATTCG
1 AAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTGCTCA
* * * * **
196656 CTTTAAATGGTTTTATAGA-CTTATAAATTATTTTAATTCAGTTTTCTTTCATTTCTAATTAAAA
66 CTTTAAATGGTTTTATA-ATCTTATAAATGATTTTAATTGA-TTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAA
** * * *** ***
196720 -AGGATCATGATTGGGTGTTTGCATTGGGAAACATGAAGCGA
129 CA-GATCACAATTGGATGTCTGCATCAAGAAACGCAAAGCGA
* * * * * * ** * **
196761 AGGCTATCTATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATACTTTGGAAAGCCTAGTTACTTG
1 AAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTGCTCA
* * * * * * *
196826 CTTGAAATAGTTTTGTAATGTTATAAATTATTTTAAATTTGAATTTTTCTCATTTTTGGCTT-AA
66 CTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTT-AA-TTGATTTTTTTTCATTTTTGG-TTAAA
* **** ** ** * **
196890 ACAAATTGTTATTTCAT-T-TGGCAT-TGGAAA-ACATGAATAGA
128 ACAGATCACAATTGGATGTCT-GCATCAAGAAACGCA--AAGCGA
* * * * * * * ** * *
196931 AAGCCATCTATTGTCAAGAAAGGCCCTTTTATAGTTACTCATGCCTTTGAAAGCCTTGTTACTCA
1 AAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTGCTCA
* * * * * * *
196996 C-TTAAATGGTTTTAGAGTCGTATAAATGATTTTAAATCATTTTTTTTTCATTTCT-ATTCAAAA
66 CTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAATTGA-TTTTTTTTCATTTTTGGTT-AAAA
* * * ** * * * * *
197059 CATATTATAATTTAAATGTTTACCTCTAGAAACATG-AAA-TGA
129 CAGATCACAA-TTGGATGTCTGCATCAAGAAAC--GCAAAGCGA
* ** * * * * *
197101 AAGTAATTTATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCTTTGTTACTCG
1 AAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTGCTCA
* * * * * * * ***
197166 CCTCAAGTGGTTTTATGA-CTTTTTAACTGATTTTAAATT-AATTTTTTTCATTTTCAATTAAAA
66 CTTTAAATGGTTTTATAATC-TTATAAATGATTTT-AATTGATTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAA
* ** * * **
197229 CAGATCATAATTTTATGTTTACATCACA-AAACATAAAGCGA
129 CAGATCACAATTGGATGTCTGCATCA-AGAAACGCAAAGCGA
* * * * * * * * *
197270 AAGCGATCTATTTAGAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTTATACGTTGAAAAGCCTAGTTACTCA
1 AAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTGCTCA
* * * * *
197335 CTTTATAT-GTTTTATAGTTTTATAGTTTATAAATTATTTTAAATTAAAATTTTTTTTTTCATGT
66 CTTTAAATGGTTTTATA-----AT--CTTATAAATGATTTT-AATT--GA--TTTTTTTTCATTT
* ** * ** *
197399 ATGGTT---ACAGAT--C-A-T--A--T-TGCATTGAGAATCGTGAAGAGA
119 TTGGTTAAAACAGATCACAATTGGATGTCTGCATCAAGAAACGCAAAGCGA
* * * * * * *
197438 AAGCCATTCATTGATAAGAAATGCCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAG-CTAGTTGCTCG
1 AAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTGCTCA
* * * * **
197502 CTTTAAATGGTTTTATAAACTTATAAATTATTTTGAATTGAATTTTTTTAATTTTTAATTAAAAC
66 CTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTT-AATTGATTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAAC
* * * * * * *** **** **
197567 AAATTAGACATT-GTTTTCTACATTGGGAAATATGAAGTAA
130 AGATCACA-ATTGGATGTCTGCATCAAGAAACGCAAAGCGA
* * ** * ** * * **
197607 AAGCTATCCATTGACAAGAAATGTGTATTTATAGTCACTCATACCTTCGGAAGCTTAGTTACTTG
1 AAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTGCTCA
* ** * * * ** *
197672 CTCTAAATAATTTTATAATCTTATCAAGGATTTAAAGTTGAATTTTTTTGAATTTTTGATTAAAA
66 CTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAA-TTG-ATTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAA
* * * * * * * * * ** *
197737 CATATTAGAATTTGTTGTTTACATCAATAAAATGTGAAGTGA
129 CAGATCACAATTGGATGTCTGCATCAA-GAAACGCAAAGCGA
* * * * * * ** *
197779 AAGTC-ATCCACTGATAAAAAAAGTTCATTTATAGTCACTTAT-CCTTTGAAAAG-CTTTTATAC
1 AAG-CAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCC-TTCAAAAGCCTAGT-TGC
* * * * * * *
197841 TCACTTTAAGTGATTCTATAA-CTTTATAAATAATTTTAAATTGAAGTTTTTATGATTTTTGGTT
63 TCACTTTAAATGGTTTTATAATC-TTATAAATGATTTT-AATTG-ATTTTTTTTCATTTTTGGTT
* * * * ** * * * * * **
197905 AAAA-ATATTAAAATTTGACCTTTGTATTAGGAAATGTGAAGCGA
125 AAAACAGATCACAATTGGATGTCTGCATCAAGAAACGCAAAGCGA
* * * * * * **
197949 AAGTAATCCATTGATAAGAAAAGTTCATTTGTAGTCACTGATACCTT-TGAAGCCTAGTTGCTCA
1 AAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTGCTCA
* * * *
198013 CTTTAAATGATTTTATAATCTTATAATTGAGTTTTAAATTGAATTTTTCTT-ATTTTTAGTTAAA
66 CTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGA-TTTT-AATTG-ATTTTTTTTCATTTTTGGTTAAA
* * * * * **
198077 ACATATCA-AATT-TATTTTTTGCATC-AGGAA-GCATGAAGTAA
128 ACAGATCACAATTGGA-TGTCTGCATCAAGAAACGCA--AAGCGA
* * * * * * * *
198118 AAGCCATCTATTGACAAGAAAAGTCCATTTATGGTTACACATACCTTTAAAAGCCTAGTTACTCA
1 AAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTGCTCA
* * * * ** * * *
198183 CTTTAAATAGTTTTATAGTGTTATAAATGATTTGAAATCAAAATTGTTTTCATTTTGGGTTAAAA
66 CTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTT-TAAT-TGATTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAA
* * * * * * * * ** *
198248 CATACCATAATTCGATGTTTCCA-CTAGAAAATGTGAAGCGG
129 CAGATCACAATTGGATGTCTGCATCAAG-AAACGCAAAGCGA
* * * **
198289 AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTTAT-ACTTGTTAAAGCCTAGTTGCTC
1 AAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTT-CAAAAGCCTAGTTGCTC
** * * ** ** * * *** * *
198353 GTTTTAAATGATTTTGTGGTCTTATAAATGATTTTAAATCAAAATATTTTTCATTTCAAGCTCAA
65 ACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTT-AAT-TGATTTTTTTTCATTTTTGGTTAAA
** * * * * *
198418 TGAGATCACAATTGGATGTGTGCATC-TGGAA---ATA-TG-
128 ACAGATCACAATTGGATGTCTGCATCAAGAAACGCAAAGCGA
* * * * ** * ** *
198454 AAGCAA---A-AGACAAGAAAAGTCTATTTATAGCCAATCATGCCTTTGAAAGCCTTGTTATTTA
1 AAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTGCTCA
* * * *
198515 CTTTAAGTGGTTTTATAA-CTTTATAAATGATATTGAATTGAATTTTTTTCATTTTTGATTAAAA
66 CTTTAAATGGTTTTATAATC-TTATAAATGAT-TTTAATTGATTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAA
* * * * * * **
198579 TAGATTATAATTGGATGTTTTCAT-TAGAAAACATAAAGCGA
129 CAGATCACAATTGGATGTCTGCATCAAG-AAACGCAAAGCGA
* * * * ** * * ** ** * *
198620 TAGCCATCTATTGACAAAAAAAGTTTATTTGTAGTTACTCATATCTTTGAAAGCCTTGTTACTCG
1 AAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTGCTC-
* * * * *
198685 TA-TTT-AGTAGTTTTATAA-CTTCATAAATGATATTGAATTGAGTTTTATTTCTTTTTTGGTTC
65 -ACTTTAAATGGTTTTATAATCTT-ATAAATGAT-TTTAATTGA-TTTTTTTTCATTTTTGGTT-
** ** * * ** **** *
198747 AAAACAGA-CTTGAATTTAATTTATGCATTGAGAAATATGAAGCCA
125 AAAACAGATC-ACAATTGGATGTCTGCATCAAGAAACGCAAAGCGA
** * * * * * * * * *
198792 AAGTTATTCATTGACAAGAAAAGTCTATTTACAGTCATTCATGAACTT-AGAATCCTAGTTACTG
1 AAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATG-CCTTCAAAAGCCTAGTTGCTC
* * * * **
198856 ACTTTAAATAGTTTTACAATCTAATAAATGATTTTAAATTAATTTTTTTT-ATTTTTTATTAAAA
65 ACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTT-AATTGATTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAA
* * * *
198920 CAGATCATAATTTGATGTCTACATC-AGAAA-ACATGAAGCGA
129 CAGATCACAATTGGATGTCTGCATCAAGAAACGCA--AAGCGA
* * * * *** * ** *
198961 AGGCCATCCGTTGACAAGAAAAGTCCGTTTATAGTCACTCATATTTTCAAAAGCCTAATTATTTA
1 AAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTGCTCA
* ** * * * * * * *
199026 CATTAAATAATTTTATAGTCTTGTAAATGATGTTGAATCGAATTTTTATTCATGTCTGGTTAAAA
66 CTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGAT-TTTAATTG-ATTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAA
* * * * * *** **
199091 AAGATCATAGTTGGATGTTTGTATCAAGAAACATGAAGTAA
129 CAGATCACAATTGGATGTCTGCATCAAGAAACGCAAAGCGA
* * * ** * * * * * * * ** * *
199132 AAGCTATCGATTGA-GAGAAAAGTTGATTTATAATCACCCTTGTCTTCGAAGGCTTTTTTACTCT
1 AAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTGCTCA
* * * * * * * *
199196 TTTTAAGTGGTTTTGTAA-CTTTCTTAATGATTTAAAATTAATTTTTTTT-ATTTTTAGTTAAAA
66 CTTTAAATGGTTTTATAATC-TTATAAATGATTT-TAATTGATTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAA
* * * * ** *
199259 CAAATCATAATTTGATGTTTGCAT-TGGAAA-ACATGAAGCGA
129 CAGATCACAATTGGATGTCTGCATCAAGAAACGCA--AAGCGA
* * * *
199300 AAGCCATCCATTGACAAGAAATA-TCCATTTATAGTCACTCCTGCCTT-AGAAAGCTTAGTTACT
1 AAGCAATCCATTGACAAGAAA-AGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCA-AAAGCCTAGTTGCT
** * * * *
199363 -TGTTGAAATGGTTTTATAATCTTATAAATAATTTTAAAATTAAATTTTTCTTACA--TTTGGTT
64 CACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTT--AATT-GATTTTT-TTTCATTTTTGGTT
* * ** * *** *** *
199425 AAACCAGATAATTATTGGATGTTTGCATTGGGAAACATGAAGCAA
125 AAAACAGATCACAATTGGATGTCTGCATCAAGAAACGCAAAGCGA
* * ** * **
199470 AAGCTATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTGTAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTAGTTACTTG
1 AAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTGCTCA
* * * * * * * * ** *** *
199535 CCTTAAATGGTTTTAGAGTCATACAAATAATTTTAAATCAAATTTTTTCAATTTTCAATTGAAAC
66 CTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAATTGATTTTTTTTC-ATTTTTGGTTAAAAC
* ** ** ** *
199600 ATATCTTAATTGGATGTCTGCATTGAGAAACTTAAAGCAA
130 AGATCACAATTGGATGTCTGCATCAAGAAACGCAAAGCGA
** * * * * * *
199640 AAGCCTTCTATTGACAAGAAAAGTCCATTTGTAGTCAC-CTACGCCTTCGAAAGCCTTGTTACAT
1 AAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTC-ATGCCTTCAAAAGCCTAGTTGC-T
* **
199704 GCA--TTAAGTGGTTTTATAA-CTTTATAAATGATTTTGAATCAATTTTTATTTCATTTTTGGTT
64 -CACTTTAAATGGTTTTATAATC-TTATAAATGATTTT-AATTGATTTTT-TTTCATTTTTGGTT
* * * * * * * * ** *
199766 AAAAATAAATCATAATTTGATTTTTTCATCAAGAAATGTGAAGTGA
125 -AAAACAGATCACAATTGGATGTCTGCATCAAGAAACGCAAAGCGA
* * * * * * * ** *
199812 TAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCTATTTATAGTCGCCCATACCTTTGAAAGCCTAGTTGCTTA
1 AAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTGCTCA
* * * * * * ** *
199877 CCTTAAATGGGTTTAGAGTCATACAAATGATTTTGAATCAAATTTTTTTTCATTTTTGCTTAAAA
66 CTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTT-AAT-TGATTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAA
* ** * * * ** ***
199942 TAGATCTTAATTTGATGTTTACATTGAGAAACTTGAAGCGA
129 CAGATCACAATTGGATGTCTGCATCAAGAAACGCAAAGCGA
* * * * * ** * * *
199983 AAGCCATCCATTTACAAGAAAAGTCTATTTTTAGTAACTCATGCCTTTGAAAGCCTTGTTACTCG
1 AAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTGCTCA
* * * * ** *
200048 CATTAAGTGGTTTTATAA-CTTTATAAATAATTTTGCATTGAGTTTTGGTTCATTTTTTTGTTAA
66 CTTTAAATGGTTTTATAATC-TTATAAATGATTTT-AATTGA-TTTTTTTTCA-TTTTTGGTT-A
* * * * * * * * * *
200112 AAATATATCATAATTCGATTTTTTTCATCAAGAAATAG-GAAGCAA
126 AAACAGATCACAATTGGA-TGTCTGCATCAAGAAA-CGCAAAGCGA
* *
200157 AAGTC-ATCCATTCGTA-AA-AAAAG-CCTATTTATAGTCA-TCCATGTCATCAAAAGCCTAGTT
1 AAG-CAATCCATT-G-ACAAGAAAAGTCC-ATTTATAGTCACT-CATGCCTTCAAAAGCCTAGTT
* * * * * * * *
200217 ACT-AGCTTCAAATGG-TTAATAATCTGATAAATGATTTTAAATTAAATGTTTCTCATTTTTGGT
61 GCTCA-CTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTT-AATTGATTTTTTTTCATTTTTGGT
* * * * * * *** *
200280 CAAAATAAATCATAATTTGATGTCTGCATCAAAAAACATGAAGCAA
124 TAAAACAGATCACAATTGGATGTCTGCATCAAGAAACGCAAAGCGA
* * *** * *
200326 AAGTC-ATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATTGTCA-TCATGTCTTCAAAATTATTGTTACTC
1 AAG-CAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTGCTC
* * * * * * *
200389 ACTTTGAATGGTTTTATAGTCTTCTAAATGATTTTGAATTTAATTTTTTTTTACTTCTGGTTAAA
65 ACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTT-AA-TTGATTTTTTTTCATTTTTGGTTAAA
* * * * *** *
200454 ACAGATC-CTAGTTGGATGTTTGTATCAAGAAATGTGGAGTGA
128 ACAGATCAC-AATTGGATGTCTGCATCAAGAAACGCAAAGCGA
** * * * * * * * * *
200496 AAGCCCTCGATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTGATTCATACCTTCGAAAGCCTTGTTACTCT
1 AAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTGCTCA
* * * *
200561 TTTTAAGTGGTTTTATAA-CTTTATAAATGATTTAAAATTGAATTTCTTTTCATTTTTGGTTAAA
66 CTTTAAATGGTTTTATAATC-TTATAAATGATTT-TAATTG-ATTTTTTTTCATTTTTGGTTAAA
* ** * * * * * * * **
200625 ACATATCTTAATTTGATGTTTACGT-TAGAAAACACGAAGTAAA
128 ACAGATCACAATTGGATGTCTGCATCAAG-AAACGCAAAG-CGA
* * * * ** *
200668 AATC-ATCCGTTCACAAGAAATGTCCATTTATAGTCACTGTTGCCTT-AGAAAGCCTAGTTACTC
1 AAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCA-AAAGCCTAGTTGCTC
* * * *
200731 A-TTAAAATGATTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAAATT-ATATTTTTCTCA-TTTTCGTTAA
65 ACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTT--AATTGAT-TTTTTTTCATTTTTGGTTAA
* ** * * ** * *
200793 AACAAATCATTATTTGATGTTTGCAT-TGGAAA-ACATGAAGTGA
127 AACAGATCACAATTGGATGTCTGCATCAAGAAACGCA--AAGCGA
* * * * * ** *
200836 AAGCCATCCATTAACCAGAAACA-TCCATTTATATTCAATCATG-CTTTGAAAGCCTAGTTACTC
1 AAGCAATCCATTGACAAGAAA-AGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTGCTC
* * * * * * * * *
200899 -GTCTTAAATAGTTTTAGAGT-TGTACAAATGATTTTAAATTGAAATGTTTTTCATTTCCT-ATT
65 ACT-TTAAATGGTTTTATAATCT-TATAAATGATTTT-AATTG-ATTTTTTTTCATTT-TTGGTT
* ** * * * *** *** **
200961 AAAACGGATCTTAATTAGATGTTTGAATTGGGAAATATAAAATGA
125 AAAACAGATCACAATTGGATGTCTGCATCAAGAAACGCAAAGCGA
* * * * * * * *
201006 AAGCTATCCATTGACAAGAAAAATCCATTTACAGT-TCTCTTGCCTTCGAAAA-TCTAGTTACTT
1 AAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTC-AAAAGCCTAGTTGCTC
* * * * *
201069 GCTTTAAATGGTTTTATAAGCTTATAAATTATTTTAAGTTAAATTTTTTTT-ACTTTTGGTTAAA
65 ACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAA-TT-GATTTTTTTTCATTTTTGGTTAAA
* * ** * * * ** * * * ** *
201133 GCATATCGTAATTTAGTTTTCACCATTAGGAAATGTGAAGCAA
128 ACAGATCACAA-TTGGATGTCTGCATCAAGAAACGCAAAGCGA
* * * * * *
201176 AAGCCAA-CCATTGACTAGGAAAGTCCATTTATAGTCACTAATGCCTTCGAAATCCTAGTTACTC
1 AAG-CAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTGCTC
* * * * * * * * ** **
201240 GCTTGAAATTGTTTTATAGTCTTATAATTAATTTTAAAT-AATTTTTTTCATTTTCAGTTAAAGG
65 ACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAATTGATTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAAC
* * * * * * * *
201304 AAATCATAATTGGATGTTTGTATTGAGAAAAATG-AAA-CTA
130 AGATCACAATTGGATGTCTGCA-TCA-AGAAACGCAAAGCGA
* * * * **
201344 AAGCCATCCATTGACAAGAAATGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAA-TCTTGTTATTC
1 AAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTC-AAAAGCCTAGTTGCTC
* * * * * *
201408 ACTTTAAGTGATTTTATAATGTTATAAATGATTTTAAATTGAATATTTTTCATTTTTGATTAAAA
65 ACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTT-AATTGATTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAA
* * * * * * ** * *
201473 CATACCATAATTTGATATTTGCAT-TGGAAA-ACATGAAGCAA
129 CAGATCACAATTGGATGTCTGCATCAAGAAACGCA--AAGCGA
* ** * * * *
201514 AAGCCATCCATTGTTATGAAAAGTTCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTAGTTACTCA
1 AAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTGCTCA
* ** * * * * *
201579 CTTTAAATGGTTTTATAGTCTTATAAATGATTTTAAATCAAAATTCTTTTCATTTCTAGTTAACA
66 CTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTT-AAT-TGATTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAA
* * * * * *** *
201644 TAGATCATAATTCGATGTTTTCATTGGGAAAC-CTAAAGCAA
129 CAGATCACAATTGGATGTCTGCATCAAGAAACGC-AAAGCGA
* * * * * * * * *
201685 AAGCTATCCATGGATAAGAAAAATCTATTCATAATCACTTATGCCTTCAAAAGCCTAGTTGTTCA
1 AAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTGCTCA
* * * * *
201750 CTTTAAATGGTTTTGTAA-CTTTATAAATGATTTCAAATTGAATTGTTTTTCAGTTATGGTTAAA
66 CTTTAAATGGTTTTATAATC-TTATAAATGATTT-TAATTG-ATTTTTTTTCATTTTTGGTTAAA
** * * *** *
201814 A-AGATCATGATTTGATGAT-TGTATTGTGAAATCTG--AAGTGA
128 ACAGATCACAATTGGATG-TCTGCATCAAGAAA-C-GCAAAGCGA
* * * *
201855 AAGCAATCTATTGAGAAGAAAAGTCCATTTATCGTCACTCATGCCTTAAAAAGCCTAGTTGCTCA
1 AAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTGCTCA
** * * * *
201920 CTTTAAACAGTTTTATAATCTTATAAACGGTTTTAAATTGAATTGTTTTTCATTTTTGGTTAATA
66 CTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTT-AATTG-ATTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAA
* * * **
201985 CAGATCATAATT-GTTGT-TCGCATCAGGAAACGTGAAGCGA
129 CAGATCACAATTGGATGTCT-GCATCAAGAAACGCAAAGCGA
** * * * * ** * * * *
202025 AATAAATCGATTGACAAGGAAAG-CCTATTAATAGTCACTTATATCTTCGAAAGCCTAATTGTTT
1 AAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCC-ATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTGCTC
* * * * * *
202089 TCTTTAAATAGTTTTATATTCATATAAATAATTTTAAATTGAATTTTCTTTT-ATTTTTAGTTAA
65 ACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTT-AATTG-ATTTT-TTTTCATTTTTGGTTAA
* * * ** * *** **
202153 AACAGATCATAATT-GTTGTTTGCATCTTGATACATGAATTGA
127 AACAGATCACAATTGGATGTCTGCATCAAGAAACGCAAAGCGA
* * ** * * *
202195 AAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCCATTTATAGTCACTCATGCCTTGTAAACCCTAGTTACTCG
1 AAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTGCTCA
** * * * * *
202260 CTCGAAATGGTCTTGTAATCTTATAAATGATTTTAAAATTGATTTTTTCTCATTGTTAGTTAAAA
66 CTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTT--AATTGATTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAA
* **** * * * *** **
202325 CATATTGTTATTGGATGT-TTCTATCAAAAAAATGTGTAGTAA
129 CAGATCACAATTGGATGTCTGC-ATC-AAGAAACGCAAAGCGA
* * * * * * * * *
202367 AAGCCATCCATTGAC-----AAGTCCATTTTTTGTCGCTCATGGCTTCAAAAACCTTGTTACT-T
1 AAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTGCTCA
* ** * * * ** *
202426 GTCCAAAGTGATTTTGTAA-CTTCATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTCTT-AAATTTGGTTTA
66 CTTTAAA-TGGTTTTATAATCTT-ATAAATGATTTT-AATTG-ATTTTTTTTCATTTTTGGTTAA
* * * * ** * *
202489 AATAGATCATAATTTGATGTTTGCA-CTGGAAA-ACATGAAGTGA
127 AACAGATCACAATTGGATGTCTGCATCAAGAAACGCA--AAGCGA
* * * * ** * *
202532 AAGCCATCCATTCACAAGAAATGTGCATTTATAGGT-ACTCATGCCTTTGAAAGCCTAGTTACTT
1 AAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATA-GTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTGCTC
* * * * **
202596 GCTTTAAATGGTTTTATAATCTGATCAATGATTTTAAGTTTAATTTTTTTAAATTTTTGGTTAAA
65 ACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAA--TTGATTTTTTTTCATTTTTGGTTAAA
* * * * ** * * *
202661 ATAGATCAAAATT-TATTGTTTGCATTGAGAAATGTAAAGTGA
128 ACAGATCACAATTGGA-TGTCTGCATCAAGAAACGCAAAGCGA
** * * * * ** ** *
202703 AAATAATGCATTGACACA-AAAAGTCTATTTACAGTCACTCATGTCTTTGAAATACTAGTTACTT
1 AAGCAATCCATTGACA-AGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTGC-T
* * * * * * * * ** * * *
202767 GA-TTTAAATAGATGTGTAGTCTTGTAAGTGATTTTAAATCAAACTTTTTTTCATTTCTAGTTAA
64 CACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTT-AAT-TGATTTTTTTTCATTTTTGGTTAA
* * * * * *** ***
202831 AAGAGATCATAATTGTATGTTTACATTGGGAAACATGAAGC-A
127 AACAGATCACAATTGGATGTCTGCATCAAGAAACGCAAAGCGA
* * ** * * * *
202873 AAGCCACCCATTGACAAGCGAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTCGAAAGCTTAGTTGCTCG
1 AAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTGCTCA
* * * * * *
202938 CTTTAAATGGTTTTATAATCGTATAAATAATTTTAAACTGAATTGCTTCTT--TTTTTGGATAAA
66 CTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTT-AATTG-ATT-TTTTTTCATTTTTGGTTAAA
* * * * * * *** ** *
203001 ACAGATCATAATTTGTTATTTCCATTGGGAAACGTGAAGCAA
128 ACAGATCACAATTGGATGTCTGCATCAAGAAACGCAAAGCGA
* * ** * * * * * * *
203043 AAGCTACCCAAAGACAAG-GAAGTCCATTAATAGTCACTC-CGTTCTTCAAAAGCCTGGTTACTT
1 AAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATG-CCTTCAAAAGCCTAGTTGCTC
* * * * * * *
203106 ACTTTAAATAGTTTTATTA-CTTTATAAATGATTTTAAATTAAAATATTTTTCATTTCTAGTTAA
65 ACTTTAAATGGTTTTATAATC-TTATAAATGATTTT-AATT-GATTTTTTTTCATTTTTGGTTAA
* * * * * * * * *
203170 AACTA-ATCATAAGTGGATGTTTGCATTAGGAAACACGAGGCAA
127 AAC-AGATCACAATTGGATGTCTGCATCAAGAAACGCAAAGCGA
* * ** * * **
203213 AAGCCACCCATTGACAAGAAAAGTATATTTATACTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTACTTG
1 AAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTGCTCA
* * ** * ** * * * *
203278 CTTTGAATAGTTTTATGCTCTTATAAATAATTTTAAATCAAAATGTTTTTCATTTCTGGCTAAAA
66 CTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTT-AAT-TGATTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAA
* * * * * * **
203343 TAGATAACAATTGGATGTTTGTATTAGGAAACATAAAGCGA
129 CAGATCACAATTGGATGTCTGCATCAAGAAACGCAAAGCGA
* * * * ** * * * * *
203384 AAGCTATCAATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATACCTTTGAGAGCATTGTTACTTA
1 AAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTGCTCA
* * * ** *
203449 CTTTAAGT-GCTTTATAA-CTTTATAAATGATATTAAATTGAAATGTTTTCATTTTTGGTTAAAA
66 CTTTAAATGGTTTTATAATC-TTATAAATGAT-TTTAATTGATTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAA
* * * * * *** * *
203512 CAGATCATAACTAGATGTTTGCATCAAAAAACATGAGGTGA
129 CAGATCACAATTGGATGTCTGCATCAAGAAACGCAAAGCGA
** * * * *
203553 AAGCCTTCTATTGACAAGAAAAGTCCATTTGTAGTCACTTGA-GCCTTCAAAAGCC---TT-ATC
1 AAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCAC-TCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTGCTC
* * * ** *
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65 ACTT-TA--AA-TGGTTTTATAATC-TTATAAATGATTTT--AATTGATTTTTTTTCATTTTTGG
* * * * * * *
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123 TT-AAAACAGATCACAATTGGATGTCTGCA-TCAAGAAA-C-GCAAAGCGA
* * * * * **
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1 AA-GCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCA--AAAGCCTAGTTGC
** * * *
203786 TGGCTTTAAATGGTTTTATAATCTGATAAATGATTTTGAATTGAATTTTTTTCATTTCAT-GTTA
63 TCACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTT-AATTGATTTTTTTTCATTT-TTGGTTA
* * * * * ****
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126 AAACAGATCACAATTGGATGTCTGCATCAAGAAACGCAAAGCGA
* * *** * * * *
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1 AA-GCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTGCTC
* * ** * * *
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65 ACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTT-AATTG-ATTTTTTTTCATTTTTGGTTAAA
* * * * * ** ** *
204023 ACAAATCATAGTTGGACGTTTGTGTCAAGAAACATAAAGTGA
128 ACAGATCACAATTGGATGTCTGCATCAAGAAACGCAAAGCGA
* ** * * *** * *
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1 AAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTGCTCA
* * * *
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66 CTTTAAATGGTTTTATAATC-TTATAAATGATTTT-AATTG-ATTTTTTTTCATTTTTGGTTAAA
* ** * *** *
204193 ACAGATCATAATTTCATGTTTGCATCAAGAAACATGAAGTGA
128 ACAGATCACAATTGGATGTCTGCATCAAGAAACGCAAAGCGA
** * * * * ** * *
204235 AAGTC-ATCTGTTGGCAAGAAATGTCCATTTATAGTCACTCATACTTTGGAAAGCATAGTTACTC
1 AAG-CAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTGCTC
* * * * * *
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65 ACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTT--AATTGATTTTTTTTCATTTTTGGTTAAA
* ***** * * ** *
204363 ATAGATTGTTTTTTGATGTTTGCATCAAGAAGA-ATAAAGCAA
128 ACAGATCACAATTGGATGTCTGCATCAAGAA-ACGCAAAGCGA
* * * * * * * ** *
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1 AAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCA-TGCCTTCAAAAGCCTAGTTGCTC
* * *** * * ** * * * * * *
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** * * * * *
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129 CAGATCACAA-TTGGATGTCTGCATCAAGAAACGCA--AAGCGA
* * ** * * * * *
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1 AAG-CAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTGCTC
** * * ** * * *
204639 GTTTTAAATGGTTGTATAATCTTGTAAATGATTTTGAATCAAAATGTTTTTCATTTTTAGTTAAA
65 ACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTT-AAT-TGATTTTTTTTCATTTTTGGTTAAA
* * * ** ** * **
204704 ACATG-TCATAGTTGGATGT-TTCTAT-TGGAAAACGTGATGTAA
128 ACA-GATCACAATTGGATGTCTGC-ATCAAG-AAACGCAAAGCGA
** * * ** * ** * * *
204746 AAGTGATCCATTGACAAGAAAATTCTATTTATAGTCGTTCATACCTTTTAAAGCCTTGTTACTCG
1 AAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTGCTCA
* * * * * * * * **
204811 TTTTAAGTGGTTTTACATTGTTATAAATTATTTTAAATTGAATTCTTTTCATTTTTTATTAAAAC
66 CTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTT-AATTGATTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAAC
* * * * * * * **
204876 AAATCATAGTTTGATGTTTGCATTAGGAAACATG-AAA-TAA
130 AGATCACAATTGGATGTCTGCATCAAGAAAC--GCAAAGCGA
* * * * ** * **
204916 AAGCCATCAATTGAAAAGAAAAGTTCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTAGTTACTTG
1 AAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTGCTCA
* ** * * * *
204981 CTTTAAATGATTTTA-AAGTC-TACTAAATGATTTTAAATCAAAATATTTTTCATTTCTGGCTAA
66 CTTTAAATGGTTTTATAA-TCTTA-TAAATGATTTT-AAT-TGATTTTTTTTCATTTTTGGTTAA
* * * * * * * **
205044 AATAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAATGTAAAATG-
127 AACAGATCACAATTGGATGTCTGCATCAAGAAACGCAAAGCGA
* * * ** * * * * *
205086 AAGCCATCCATTGA-ATATAAAAGTCCATATATAGTCACTTTTACCTTCAAAAGCTTTGTTACTT
1 AAGCAATCCATTGACA-AGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTGCTC
* * * * * * * ** * *
205150 GCTTTAAGTGGTTTCATAGTTTTGTAAATGATTTTAAATTTAACTTTTCT-AGTTTTGGTTAAAA
65 ACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTT-AATTGATTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAA
* * * * * *** *
205214 -AGATCATAATTTGATGTTTGTAT-AGGGAAACATGAATCGA
129 CAGATCACAATTGGATGTCTGCATCA-AGAAACGCAAAGCGA
* * * ** * *
205254 AAGTAATCAATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATAACTTCGAAAGCCTAGTTGCTCG
1 AAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTGCTCA
* * ** **** **
205319 CTTTAAATAGTTTTATAGTCTTATAAATGATTTTATATCCAAAAATTTTCATTTTCAGTTAAAAC
66 CTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTA-ATTGATTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAAC
** * * * *** *
205384 AGATCATGATTTGATGTATGCATCGAGAAACATGAAGCAA
130 AGATCACAATTGGATGTCTGCATCAAGAAACGCAAAGCGA
* * * * * *
205424 AAGCTATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCAAGTTACACT
1 AAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTGCTCA
* * *
205489 CTTTAAATGGTATAATAATCTTATAAATGATTTTAAGTTAAATTTTTTATT--TTTTTGGTTAAA
66 CTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAA-TT-GATTTTTT-TTCATTTTTGGTTAAA
* * * * * * ** *
205552 ACATATTATAATTTGATGTTTGCCTTGAGAAATGCAAAGCGA
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* * * * * * * * **
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1 AA-GCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTGCTC
* * * * * *
205658 TCTTTAAATAGTTTTATATTCTTCTAAATGATTTTAAATAGAATTTTTTTT-ATTTCTT-ATTAA
65 ACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTT-AATTG-ATTTTTTTTCATTT-TTGGTTAA
* * * *
205721 AACAGATCATC-ATTGGATGTGTGCATTAGGAAACATG-AAA-TGA
127 AACAGATCA-CAATTGGATGTCTGCATCAAGAAAC--GCAAAGCGA
* * * * ** * *
205764 AAGTC-ATCCATTGACAAGAAAATTCTATTTGTAGTCA-TCCATACCTTTTAAAGCCTTGTTACT
1 AAG-CAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACT-CATGCCTTCAAAAGCCTAGTTGCT
* * * * * * * *
205827 CGCTTCAAA-GAGTTTTATAAACTAATAAATGATTTTAAATTGAATTATTTTTCAGTTTTAGTTG
64 CACTTTAAATG-GTTTTATAATCTTATAAATGATTTT-AATTG-ATTTTTTTTCATTTTTGGTTA
* * * * * * * ** *** * *
205891 GAACACATCAAAATTTGTTGTTTACATTGAGAAATAAAAAGTGG
126 AAACAGATCACAATTGGATGTCTGCATCAAGAAACGCAAAGCGA
* * ** * * *
205935 AAGTC-ATCCATTGA-GA-AAAAGTCTATTTATAGTCACTCATATCTTTAAAAGCCTAGCTACTC
1 AAG-CAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTGCTC
* ** * * * * *
205997 ACTTTTAATGAATTTATAATATTATAAATGAATTTAAAATTAAATTTTTCTCATTTTTGGTTAAA
65 ACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATG-ATTT-TAATTGATTTTTTTTCATTTTTGGTTAAA
* * ** * ** * * *
206062 ACATATCATAATTTAATGTTTGCATTGGTAGACATGC--AGTGA
128 ACAGATCACAATTGGATGTCTGCA-T-CAAGAAACGCAAAGCGA
* * * * * ** * * *
206104 AAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCTATTCATAATCACTCATATCTTTAAAAGCCTAGTTACACA
1 AAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTGCTCA
* *** **
206169 CTTTAAATGGTTTTGTTGGCTTATAAATGATTTTAAGTCAAATTTTTTTTTCATTTTTGGTTAAA
66 CTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAA-T-TGA-TTTTTTTTCATTTTTGGTTAAA
* * * * * * * * * ** *
206234 ACAAATCATAATTAGATTTTTACGTTAAGAAATGTTAAGTGA
128 ACAGATCACAATTGGATGTCTGCATCAAGAAACGCAAAGCGA
* * * ** * *
206276 AAGCTATCCATTGACAAGAGAAA-TCCATTTATAATCACTTATGCCTTTGAAAGCCTTGTTACTC
1 AAGCAATCCATTGACAAGA-AAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTGCTC
* *
206340 ACTTTAAGTGGTTTTATAA-CGTTATAAATGATTTTGAATTGAATTATTTTT-ATTTTTGGTTAA
65 ACTTTAAATGGTTTTATAATC-TTATAAATGATTTT-AATTG-ATTTTTTTTCATTTTTGGTTAA
** * * * ** ***
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* * * * * ** * *
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1 AAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTGC-TC
* ** * * ** * *
206509 GCTTTAAATGGTTTTATAGCCTTATAAATGATTTTAAATCAAATTTTTT-A-TTTCGGTTAAACC
65 ACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAATTGATTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAAC
* ** * * * * ** *** **
206572 ATATCGTAATTTGTTGTTTACATTGAGAAACATGAAGTAA
130 AGATCACAATTGGATGTCTGCATCAAGAAACGCAAAGCGA
* * * * * ** * * *
206612 AAGCCATCCAATGATAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTAATGCCTTTGAAAGCCTATTTACTTA
1 AAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTGCTCA
* * * * * * * ** *
206677 CTTTAAATAGTTTTATAGTCTCATACATGATTTTAAATCGAGATTGTTTTCATTTTAAGTTAAAG
66 CTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTT-AATTGA-TTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAA
* * * ** * ** *
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129 CAGATCACAATTGGATGTCTGCATCAAGAAACGCAAAGCGA
* * * * ** * * *
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1 AAGCAATCCATTGACA-AGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTGCTC
* ** * *
206845 GC-TTAAAGTTCTTTTATAAAT-TTATCAATGATTTTAAATTAATTTTTTTTTCATTTTTGGTTA
65 ACTTTAAA-TGGTTTTAT-AATCTTATAAATGATTTT-AATTGA-TTTTTTTTCATTTTTGGTTA
* * * * * * * **
206908 AAA-AGATCATAATTTGATGTTTGTAGT-AGGGAATGTGAAGCGA
126 AAACAGATCACAATTGGATGTCTGCA-TCAAGAAACGCAAAGCGA
** * * * ** * *
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1 AAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCA-TTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTGCTC
* * * * * * *
207015 ATTTTAAATGGTTTTATAAACTTATAAATGATTTTCAATTGAATATTGTTCATCTTTGGTTGAAA
65 ACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTT-AATTGATTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAA
** * * * * * *
207080 CAGATCTTACTTTGTTGTTTTCATCAAGAAACATG-AAA-TGA
129 CAGATCACAATTGGATGTCTGCATCAAGAAAC--GCAAAGCGA
* * * * * * * * *
207121 AAGCCATCCATTGATAA-AGAAAGTCTATTTATTGTCACTAATACCTTCAAAAGCCTTGTTACAC
1 AAGCAATCCATTGACAAGA-AAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTGCTC
** * * * * * *
207185 GGTATAAATTGTTTTACAGTCTTATAAATAATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAA
65 ACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTT-AATTG-ATTTTTTTTCATTTTTGGTTAAA
* * * * * *** ***
207250 GA-AAATCATATTTGGATGTTTTCATTGGGAAACATGAAGCGA
128 -ACAGATCACAATTGGATGTCTGCATCAAGAAACGCAAAGCGA
* * * ** * * *
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1 AAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTGCTCA
* * * * *
207357 CTTTAAGTAGTTTTAT-ACCTCTATAAAAGATTTTAAATTGAATTTTTATTCATTTTTGGTTAAA
66 CTTTAAATGGTTTTATAATCT-TATAAATGATTTT-AATTG-ATTTTTTTTCATTTTTGGTTAAA
* * ** * * **
207421 A-AAATCATAATTTAATGT-TCGCATTAGGAAACGTGAAGCGA
128 ACAGATCACAATTGGATGTCT-GCATCAAGAAACGCAAAGCGA
* * * * * *
207462 AAGTAATCCATTGGCAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATACGTTGAAAA-CCTTAGTTGCTC
1 AAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCC-TAGTTGCTC
* *
207526 ACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTATATATTGAATTTTTTTTCTTTTTTGGTTAAA
65 ACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTA-ATTG-ATTTTTTTTCATTTTTGGTTAAA
* * * * * ** *
207591 ACAAATCATAATT--ATTTTTTGCATTGGC-A-AAATGTGAAGTGA
128 ACAGATCACAATTGGA-TGTCTGCA-T--CAAGAAACGCAAAGCGA
* * * * * * * * * **
207633 AAGAAATCTATGGACAAGAAAACTCCATTTATAGTCACTCATACCTTTAAACGCGTAATACCTCA
1 AAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTGCTCA
* * * * *
207698 CTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTCAAATTAAGTTTCTCTCATTGTTTTTGTTAA
66 CTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTT--AATTGATTTTTTTTCA-T-TTTTGGTTAA
* ** * * **
207763 AACAGATCATAATTTAATGTTTGCAT-TAGAAAACATAAAGCGA
127 AACAGATCACAATTGGATGTCTGCATCAAG-AAACGCAAAGCGA
* * * *
207806 AGGCCATCCATTGACAAGAAATGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAA--CTAAGTTACT
1 AAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTC-AAAAGCCT-AGTTGCT
* * * * * * * *
207869 -AGCTTTAAATGGTATTGTAGTATTATAAATTATTTTAAATTAAATTATTTTTTCATTTCTGATT
64 CA-CTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTT-AATT-GATT-TTTTTTCATTTTTGGTT
* * * * * * ****
207933 ATAACAGACCATAATTGAATGTTTACATC-AGTAAATATGAAGCGA
125 AAAACAGATCACAATTGGATGTCTGCATCAAG-AAACGCAAAGCGA
* * * * * *
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1 AAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTC-ATGCCTTCAAAAGCCTAGTTGCTC
* * * * ** *
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65 ACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTT-AATTGATTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAA
* * * * * * ** *
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129 CAGATCACAATTGGATGTCTGCATCAAG-AAACGCAAAGCGA
* * * * * * * * *
208147 AAGTAATCTATTGACAAGAAAACTCTATTTATAGGCACTCATACTTTTAAAAGCCTAGTTACT-A
1 AAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTGCTCA
* * * * * * *
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66 -CTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATT-TTAA-TTGATTTTTTTTCATTTTTGGTTAAA
* * * * * * * *** *
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128 ACAGATCACAATTGGATGTCTGCATCAAGAAACGCAAAGCGA
* * ** ** * * * * *
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1 AAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTGCTCA
* * * * *
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* * * *** * ** *
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* * * * *
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1 AAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTGCTCA
* * * * *
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66 CTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTA-ATTG-ATTT-TTTTTCATTTTTGGTTAAA
* * * * * * * * * ** *
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* * * * * ** * * *
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1 AAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTA-TAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTGCTC
* * * * **
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* * * * * * * * ** *
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* * * * ** * *
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1 AAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTGCTCA
* ** * * * * * *
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* * * * * * * * * *
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* * * * * * * ** *
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* * * ** * *** *
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64 CACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTA-AT--TGATTTTTTTTCATTTTTGGTTA
* * *** ** *
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126 AAACAGATCACAATTGGA-TGTCT-GCATCAAGAAACGCAAAGCGA
* * * * * * * * *
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1 AAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAG-CCTAGTTGCTC
* ** * * * *
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* * * * ** *
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** * * * * * ** *
209340 AAGTGATCCATTCATAA-AAAAGGTGCATTTGTAGTCATTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTAATG
1 AAGCAATCCATTGACAAGAAAA-GTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTGCTC
* * * * *
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65 ACTTTAAATGGTTTTATAATCT-TATAAATGATTTT-AATTGATTTT-TTTTCATTTTTGGTTAA
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127 AACAGATCACAATTGGATGTCTGCATCAAGAAACG-CAAAGCGA
* * * * * * * **
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1 AAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTGCTCA
* * * * * * ** **
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* ** ** * * * *
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*
209743 CTTCAAAT
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Statistics
Matches: 10515, Mismatches: 2755, Indels: 1130
0.73 0.19 0.08
Matches are distributed among these distances:
157 13 0.00
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165 63 0.01
166 136 0.01
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176 1 0.00
177 6 0.00
178 1 0.00
180 13 0.00
ACGTcount: A:0.35, C:0.13, G:0.14, T:0.39
Consensus pattern (169 bp):
AAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTGCTCA
CTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAATTGATTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACA
GATCACAATTGGATGTCTGCATCAAGAAACGCAAAGCGA
Found at i:196463 original size:335 final size:333
Alignment explanation
Indices: 195696--196551 Score: 844
Period size: 338 Copynumber: 2.5 Consensus size: 333
195686 AATTTTTTTA
* ** * * * ** *
195696 TTTTGGTTAAAA-AGATCATGGTTTGATGTTTGTATTAGGAAACATGAAGTAGAAGCAATCCATT
1 TTTTGGTTAAAACATATCATAATTTGATGTCTGCATTAGAAAACATGAAACAAAAGCAATCCATT
* * *
195760 GACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTAAAAGCCTA-TATGCCCACTTTAAATGGT
66 GACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATACCTTCAAAAGCCTAGT-TGCTCAC-TTAAATGGT
* * ** *
195824 TTTATAATCTTGTAAATGATTTTGAATTGA-ACTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCACAATT
129 TTTATAATCTTATAAATGATATT-AATTGATTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGACCACAATT
* * * **
195888 GTTGTTTGCATCAGCAAACGCGAAGCGAAAGTCATCCATTGACAAGAAAAATTCAATTATTGTCA
193 GTTATTTGCATCAGCAAACGCGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAG----ATCCAATTAGAGTCA
* * * * * * * *
195953 CTCATGTCTCCGAAAACTTAGTTACTTGCTTTAAATAGTTTTATGATATTATAAATCATTTTAAA
254 CTCATGCCTCCGAAAACCTAATTACTCGCATTAAATAGTTTTATAATATTATAAATAATTTAAAA
** *
196018 TTGATTTTTTTTAAT
319 TTGAAGTTTTCTAAT
* * * * *
196033 TTTTGGTTAAAACATATCATAATTGGATGTCTGCATCA-AGAAACGT-AAAGCGAAAGCAATTCA
1 TTTTGGTTAAAACATATCATAATTTGATGTCTGCATTAGA-AAACATGAAA-CAAAAGCAATCCA
* *
196096 TTTACAAGAAAAGTCCATTTATAGTTACTCATACCTTCAAAAGCCTAGTTGCTCACTTAAATGGT
64 TTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATACCTTCAAAAGCCTAGTTGCTCACTTAAATGGT
* *
196161 TTTATAATCTTATAAATGATATTAAGTTGATTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAATAGACCATAATT
129 TTTATAATCTTATAAATGATATTAA-TTGATTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGACCACAATT
* * * * * * * *
196226 TTCTATTTGCAT-AGGGAAATGTGAAGCGAAGGCCATTCATTGACAAG-TCCATTTAGAGTCGCT
193 GT-TATTTGCATCA-GCAAACGCGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGATCCAATTAGAGTCACT
** * *
196289 CATGCCTTTGAAAACCTAATTACTCGCATTAAATAGTTTTATAATCTTATAATTGAATTTAAAAT
256 CATGCCTCCGAAAACCTAATTACTCGCATTAAATAGTTTTATAATATTATAAAT-AATTTAAAAT
* *
196354 TTAAGTTTTCTCAT
320 TGAAGTTTTCTAAT
* * *
196368 TTTTTGTTAAAACATATCATAATTTGATGTCTGCATTAGAAAACATGAAACAAAAGCCATCCGTT
1 TTTTGGTTAAAACATATCATAATTTGATGTCTGCATTAGAAAACATGAAACAAAAGCAATCCATT
* * * * ** * ** *
196433 GACAAGAAAAATGCATTTATAGTCACTCATACATTCGAAAGTTTAGTTACTCGTTTTAAATAGTT
66 GACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATACCTTCAAAAGCCTAGTTGCTC-ACTTAAATGGTT
* * * * ** *
196498 TTATAGTCTTATAAATCACTATAAATTAATTTTTTTAAATTTTTGATTAAAACA
130 TTATAATCTTATAAATGA-TATTAATTGATTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACA
196552 TATCATAGTT
Statistics
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0.79 0.16 0.05
Matches are distributed among these distances:
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336 55 0.13
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339 36 0.09
ACGTcount: A:0.35, C:0.14, G:0.13, T:0.38
Consensus pattern (333 bp):
TTTTGGTTAAAACATATCATAATTTGATGTCTGCATTAGAAAACATGAAACAAAAGCAATCCATT
GACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATACCTTCAAAAGCCTAGTTGCTCACTTAAATGGTTT
TATAATCTTATAAATGATATTAATTGATTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGACCACAATTGTT
ATTTGCATCAGCAAACGCGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGATCCAATTAGAGTCACTCATGC
CTCCGAAAACCTAATTACTCGCATTAAATAGTTTTATAATATTATAAATAATTTAAAATTGAAGT
TTTCTAAT
Found at i:196557 original size:505 final size:503
Alignment explanation
Indices: 195768--196709 Score: 1169
Period size: 505 Copynumber: 1.9 Consensus size: 503
195758 TTGACAAGAA
* * * *
195768 AAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTAAAAGCCTATATGCCCACTTTAAATGGTTTTATAATC
1 AAGTCCATTTAGAGTCACTCATGCCTTTAAAAGCCTATATACCCACATTAAATAGTTTTATAATC
* ** * *
195833 TTGTAAATGATTTTGAATTGAACTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCACAATTGTTGTTTGCA
66 TTATAAATGATTTAAAATTGAACTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCACAATTGATGTCTGCA
* * * * * * * *
195898 TCAGCAAACGCGAAGCGAAAGTCATCCATTGACAAGAAAAATTCAATTATTGTCACTCATGTCTC
131 TCAGAAAACACGAAACAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATGCAATTATAGTCACTCATGACTC
* * * *
195963 CGAAAACTTAGTTACTTGCTTTAAATAGTTTTATGATATTATAAATCATTTTAAATTGATTTTTT
196 CGAAAACTTAGTTACTCGCTTTAAATAGTTTTATGATATTATAAATCACTATAAATTAATTTTTT
* * * * *
196028 TTAATTTTTGGTTAAAACATATCATAATTGGATGTCTGCATCAAGAAACGTAAAGCGAAAGCAAT
261 TAAATTTTTGATTAAAACATATCATAATTGAATGTCTGCATCAAGAAACATAAAGCAAAAGCAAT
* * * * * *
196093 TCATTTACAAGAAAAGTCCATTTATAGTTACTCATACCTTCAAAAGCCTAGTTGCTCAC-TTAAA
326 CCATTAACAAGAAAAGTCCATTTATAATCACTCATACCATCAAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAA
* *
196157 TGGTTTTATA-ATCTTATAAATGATATTAAGTTGA-TTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAATAGACC
391 TGGTTTTATAGA-CTTATAAATGATATTAA-TTCAGTTTTCTTTCATTTTTGGTTAAAATAGACC
196220 ATAATTTTCTATTTGCATAGGGAAATGTGAAGCGAAGGCCATTCATTGAC
454 ATAATTTTCTATTTGCATAGGGAAATGTGAAGCGAAGGCCATTCATTGAC
* * *
196270 AAGTCCATTTAGAGTCGCTCATGCCTTTGAAAA-CCTA-ATTACTCGCATTAAATAGTTTTATAA
1 AAGTCCATTTAGAGTCACTCATGCCTTT-AAAAGCCTATA-TACCCACATTAAATAGTTTTATAA
* * * * * *
196333 TCTTATAATTGAATTTAAAATTTAAGTTTTCTCATTTTTTGTTAAAACATATCATAATTTGATGT
64 TCTTATAAATG-ATTTAAAATTGAACTTTT-TCATTTTTGGTTAAAACAGATCACAA-TTGATGT
* * * *
196398 CTGCATTAGAAAACATGAAACAAAAGCCATCCGTTGACAAGAAAAATGCATTTATAGTCACTCAT
126 CTGCATCAGAAAACACGAAACAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATGCAATTATAGTCACTCAT
* ** * *
196463 -ACATTCGAAAGTTTAGTTACTCGTTTTAAATAGTTTTAT-AGTCTTATAAATCACTATAAATTA
191 GAC-TCCGAAAACTTAGTTACTCGCTTTAAATAGTTTTATGA-TATTATAAATCACTATAAATTA
* * * * *
196526 ATTTTTTTAAATTTTTGATTAAAACATATCATAGTTGAATGTTTGCATCATGAAACATGATGCAA
254 ATTTTTTTAAATTTTTGATTAAAACATATCATAATTGAATGTCTGCATCAAGAAACATAAAGCAA
* * ** * *
196591 AAGCCATCCATTAACAAGAAAAGTCCATTTATAATCACTCTTACCATCAAAAGTGTAGTTATTCG
319 AAGCAATCCATTAACAAGAAAAGTCCATTTATAATCACTCATACCATCAAAAGCCTAGTTACTCA
* *
196656 CTTTAAATGGTTTTATAGACTTATAAATTATTTTAATTCAGTTTTCTTTCATTT
384 CTTTAAATGGTTTTATAGACTTATAAATGATATTAATTCAGTTTTCTTTCATTT
196710 CTAATTAAAA
Statistics
Matches: 365, Mismatches: 65, Indels: 16
0.82 0.15 0.04
Matches are distributed among these distances:
501 1 0.00
502 58 0.16
503 18 0.05
504 25 0.07
505 220 0.60
506 42 0.12
507 1 0.00
ACGTcount: A:0.35, C:0.14, G:0.12, T:0.39
Consensus pattern (503 bp):
AAGTCCATTTAGAGTCACTCATGCCTTTAAAAGCCTATATACCCACATTAAATAGTTTTATAATC
TTATAAATGATTTAAAATTGAACTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCACAATTGATGTCTGCA
TCAGAAAACACGAAACAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATGCAATTATAGTCACTCATGACTC
CGAAAACTTAGTTACTCGCTTTAAATAGTTTTATGATATTATAAATCACTATAAATTAATTTTTT
TAAATTTTTGATTAAAACATATCATAATTGAATGTCTGCATCAAGAAACATAAAGCAAAAGCAAT
CCATTAACAAGAAAAGTCCATTTATAATCACTCATACCATCAAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAA
TGGTTTTATAGACTTATAAATGATATTAATTCAGTTTTCTTTCATTTTTGGTTAAAATAGACCAT
AATTTTCTATTTGCATAGGGAAATGTGAAGCGAAGGCCATTCATTGAC
Found at i:198350 original size:341 final size:337
Alignment explanation
Indices: 195672--213620 Score: 8112
Period size: 341 Copynumber: 52.7 Consensus size: 337
195662 CAACTTTTTC
* ** * *
195672 AATGATTTTAAA-TCAATTTTTTTA-TTTTGGTTAAAA-AGATCATGGTTTGATGTTTGTATTAG
1 AATGATTTTAAATTGAATTTTTTTATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTT-ATGTTTGCATCAG
* *
195734 GAAACATGAAGT-AGAAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTAA
65 GAAACATGAAGTGA-AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGA
* * * * ** *
195798 AAGCCTA-TATGCCCACTTTAAATGGTTTTATAATCTTGTAAATGATTTTGAATTGAACT-TTTT
129 AAGCCTAGT-TACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATAAAATTGTTTT
* * * * * *
195861 CATTTTTGGTTAAAACAGATCACAA-TTGTTGTTTGCATCAGCAAACGCGAAGCGAAAGTCATCC
193 CATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGAAAACGTGAAGCGAAAGCCATCC
* * * * * ** * **
195925 ATTGACAAGAAAAATTCAATTATTGTCACTCATGTCTCCGAAAA-CTTAGTTACTTGCTTTAAAT
258 ATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAT-ACT-TTAAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAAT
* * *
195989 AGTTTTATGATATTATA
321 GGTTTTATAATCTTATA
* * * * *
196006 AATCATTTTAAATTGATTTTTTTTAATTTTTGGTTAAAACATATCATAATTGGATGTCTGCATCA
1 AATGATTTTAAATTGAATTTTTTT-ATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATT-TATGTTTGCATCA
* * * * * * * * * **
196071 AGAAACGTAAAGCGAAAGCAATTCATTTACAAGAAAAGTCCATTTATAGTTACTCATACCTTCAA
64 GGAAACATGAAGTGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGA
* * * ** * *
196136 AAGCCTAGTTGCTCAC-TTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATATTAAGTTGATTTTTTTTC
129 AAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATAAAATTGTTTTC
* * ** * * * * *
196200 ATTTTTGGTTAAAATAGACCATAATTTTCTATTTGCA-TAGGGAAATGTGAAGCGAAGGCCATTC
194 ATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTA-GAAAACGTGAAGCGAAAGCCATCC
* * * * * *
196264 ATTGAC-----AAGTCCATTTAGAGTCGCTCATGCCTTTGAAAA-CCTAATTACTCGCATTAAAT
258 ATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAT-ACTTT-AAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAAT
*
196323 AGTTTTATAATCTTATA
321 GGTTTTATAATCTTATA
* * * * * * * * *
196340 ATTGAATTTAAAATTTAAGTTTTCTCATTTTTTGTTAAAACATATCATAATTTGATGTCTGCATT
1 AATG-ATTTTAAATTGAA-TTTTTTTATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTT-ATGTTTGCATC
* *** * * * * * *
196405 AGAAAACATGAAACAAAAGCCATCCGTTGACAAGAAAAATGCATTTATAGTCACTCATACATTCG
63 AGGAAACATGAAGTGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTG
** ** * * * * * * *
196470 AAAGTTTAGTTACTCGTTTTAAATAGTTTTATAGTCTTATAAATCACTATAAAT-TAATTTTTTT
128 AAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATAAAATTGTTTT
* * * * * * * *
196534 AAATTTTTGATTAAAACATATCAT-AGTTGAATGTTTGCATCATG-AAACATGATGCAAAAGCCA
193 -CATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTG-ATGTTTGCATTA-GAAAACGTGAAGCGAAAGCCA
* * * * * ** * *
196597 TCCATTAACAAGAAAAGTCCATTTATAATCACTCTTACCATCAAAAGTGTAGTTATTCGCTTTAA
255 TCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATA-CTTTAAAAGCCTAGTTACTCACTTTAA
196662 ATGGTTTTATAGA-CTTATA
319 ATGGTTTTATA-ATCTTATA
* * * * ** * **
196681 AATTATTTT-AATTCAGTTTTCTTTCATTTCTAATTAAAA-AGGATCATGATTGGGTGTTTGCAT
1 AATGATTTTAAATTGAATTTT-TTT-ATTTTTGGTTAAAACA-GATCATAATT-TATGTTTGCAT
** * * * * * *
196744 TGGGAAACATGAAGCGAAGGCTATCTATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCAT-ACTTT
62 CAGGAAACATGAAGTGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTT
** * * * * * **
196808 GGAAAGCCTAGTTACTTGCTTGAAATAGTTTTGTAATGTTATAAATTATTTTAAATTTGAATT-T
127 -GAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAA-TAAAATTGT
* ** * * * * * **
196872 TTCTCATTTTTGGCTT-AAACAAATTGTTATTTCAT-TTGGCATTGGAAAACATGAATAGAAAGC
190 TT-TCATTTTTGG-TTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGAAAACGTGAAGCGAAAGC
* * * * * * * * *
196935 CATCTATTGTCAAGAAAGGCCCTTTTATAGTTACTCATGCCTTTGAAAGCCTTGTTACTCAC-TT
253 CATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAT-ACTTTAAAAGCCTAGTTACTCACTTT
* * *
196999 AAATGGTTTTAGAGTCGTATA
317 AAATGGTTTTATAATCTTATA
* * * * * * * *
197020 AATGATTTTAAA-TCATTTTTTTTTCATTTCT-ATTCAAAACATATTATAATTTAAATGTTTACC
1 AATGATTTTAAATTGA-ATTTTTTT-ATTTTTGGTT-AAAACAGATCATAATTT--ATGTTTGCA
* ** **
197083 TCTA-GAAACATGAAATGAAAGTAATTTATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCT
61 TC-AGGAAACATGAAGTGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCT
* * * * * * * * * * * *
197147 TCGAAAGCTTTGTTACTCGCCTCAAGTGGTTTTATGA-CTTTTTAACTGATTTTAAAT-TAATTT
125 TTGAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATC-TTATAAATGATTTTAAATAAAATTG
*** * * * * * * *
197210 TTTTCATTTTCAATTAAAACAGATCATAATTTTATGTTTACATCACAAAACATAAAGCGAAAGCG
189 TTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGAAAACGTGAAGCGAAAGCC
* * * * *
197275 ATCTATTTAGAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTTATACGTTGAAAAGCCTAGTTACTCACTTTA
254 ATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATAC-TTTAAAAGCCTAGTTACTCACTTTA
* *
197340 TAT-GTTTTATAGTTTTATAGTTTATA
318 AATGGTTTTATA-----AT--CTTATA
* * *
197366 AATTATTTTAAATTAAAATTTTTTTTTTCATGTATGGTT---ACAGATC---A--TA---TTGCA
1 AATGATTTTAAATT-GAATTTTTTTATT--T-T-TGGTTAAAACAGATCATAATTTATGTTTGCA
* * * * * * * *
197420 T-TGAGAATCGTGAAGAGAAAGCCATTCATTGATAAGAAATGCCCATTTATAGTCACTCATGCCT
61 TCAG-GAAACATGAAGTGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCT
* * * * * * ** *
197484 TCGAAAG-CTAGTTGCTCGCTTTAAATGGTTTTATAAACTTATAAATTATTTTGAATTGAATTTT
125 TTGAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATAAAATTGT
* ** * * * * * * * ** **
197548 TTTAATTTTTAATTAAAACAAATTAGACA-TTG-TTTTCTACATTGGGAAATATGAAGTAAAAGC
190 TTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATA-ATTTGATGTT-TGCATTAGAAAACGTGAAGCGAAAGC
* * ** *** * ** *
197611 TATCCATTGACAAGAAATGTGTATTTATAGTCACTCATACCTTCGGAAGCTTAGTTACTTGCTCT
253 CATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATA-CTTTAAAAGCCTAGTTACTCACTTT
** *
197676 AAATAATTTTATAATCTTATC
317 AAATGGTTTTATAATCTTATA
* * * * * * *
197697 AAGGA-TTTAAAGTTGAATTTTTTTGAATTTTTGATTAAAACATATTAGAATTTGTTGTTTACAT
1 AATGATTTTAAA-TTGAATTTTTTT--ATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTT-ATGTTTGCAT
** * * * * * *
197761 CAATAAA-ATGTGAAGTGAAAGTCATCCACTGATAAAAAAAGTTCATTTATAGTCACTTAT-CCT
62 CAGGAAACA--TGAAGTGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCT
** * * * * * *
197824 TTGAAAAG-CTTTTATACTCACTTTAAGTGATTCTATAA-CTTTATAAATAATTTTAAATTGAAG
125 TTG-AAAGCCTAGT-TACTCACTTTAAATGGTTTTATAATC-TTATAAATGATTTTAAA-TAAAA
* * * * ** * * *
197887 TT-TTTATGATTTTTGGTTAAAA-ATATTAAAATTTGACCTTTGTATTAGGAAATGTGAAGCGAA
186 TTGTTT-TCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGAAAACGTGAAGCGAA
** * * * * * *
197950 AGTAATCCATTGATAAGAAAAGTTCATTTGTAGTCACTGATACCTTT-GAAGCCTAGTTGCTCAC
250 AGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATA-CTTTAAAAGCCTAGTTACTCAC
*
198014 TTTAAATGATTTTATAATCTTATA
314 TTTAAATGGTTTTATAATCTTATA
* * * *
198038 ATTGAGTTTTAAATTGAATTTTTCTTATTTTTAGTTAAAACATATCA-AATTTATTTTTTGCATC
1 AATGA-TTTTAAATTGAATTTTT-TTATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTA-TGTTTGCATC
* * * * * * * *
198102 AGGAAGCATGAAGTAAAAGCCATCTATTGACAAGAAAAGTCCATTTATGGTTACACATACCTTTA
63 AGGAAACATGAAGTGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTG
* * * *
198167 AAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATAGTTTTATAGTGTTATAAATGATTTGAAATCAAAATTGTTT
128 AAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAAT-AAAATTGTTT
* * * * * * * *
198232 TCATTTTGGGTTAAAACATACCATAATTCGATGTTTCCACTAGAAAATGTGAAGCGGAAGCCATC
192 TCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGAAAACGTGAAGCGAAAGCCATC
* * * **
198297 CATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTTATACTTGTTAAAGCCTAGTTGCTCGTTTTAAAT
257 CATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATACTT-TAAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAAT
* * **
198362 GATTTTGTGGTCTTATA
321 GGTTTTATAATCTTATA
** * *** * * ** * * *
198379 AATGATTTTAAATCAAAATATTTTTCATTTCAAGCTCAATGAGATCACAATTGGATGTGTGCATC
1 AATGATTTTAAAT-TGAAT-TTTTTTATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATT-TATGTTTGCATC
* ** * * *
198444 TGG-AA-AT--A-TG-AAG-CA---AAAGACAAGAAAAGTCTATTTATAGCCAATCATGCCTTTG
63 AGGAAACATGAAGTGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTG
* * * * * * ** *
198499 AAAGCCTTGTTATTTACTTTAAGTGGTTTTATAA-CTTTATAAATGATATTGAATTGAATTTTTT
128 AAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATC-TTATAAATGATTTTAAATAAAATTGTTT
* * * * * * * *
198563 TCATTTTTGATTAAAATAGATTATAATTGGATGTTTTCATTAGAAAACATAAAGCGATAGCCATC
192 TCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGAAAACGTGAAGCGAAAGCCATC
* * ** * * * *
198628 TATTGACAAAAAAAGTTTATTTGTAGTTACTCATATCTTTGAAAGCCTTGTTACTCGTA-TTT-A
257 CATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATA-CTTTAAAAGCCTAGTTACTC--ACTTTAA
* *
198691 GTAGTTTTATAA-CTTCATA
319 ATGGTTTTATAATCTT-ATA
* * * * *
198710 AATGATATTGAATTGAGTTTTATTTCTTTTTTGGTTCAAAACAGA-CTTGAATTTAAT-TTATGC
1 AATGATTTTAAATTGAATTTT-TTT-ATTTTTGGTT-AAAACAGATCAT-AATTT-ATGTT-TGC
* * ** ** * * * * *
198773 AT-TGAGAAATATGAAGCCAAAGTTATTCATTGACAAGAAAAGTCTATTTACAGTCATTCATGAA
60 ATCAG-GAAACATGAAGTGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATG-C
* * * * * * *
198837 CTTAG-AATCCTAGTTACTGACTTTAAATAGTTTTACAATCTAATAAATGATTTTAAAT-TAATT
123 CTTTGAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATAAAATT
* * ** * * * * *
198900 TTTTTTATTTTTTATTAAAACAGATCATAATTTGATGTCTACATCAGAAAACATGAAGCGAAGGC
188 GTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGAAAACGTGAAGCGAAAGC
* * * * * * *
198965 CATCCGTTGACAAGAAAAGTCCGTTTATAGTCACTCATATTTTCAAAAGCCTAATTATTTACATT
253 CATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATACTTT-AAAAGCCTAGTTACTCACTTT
** * *
199030 AAATAATTTTATAGTCTTGTA
317 AAATGGTTTTATAATCTTATA
* * * * * * * * *
199051 AATGATGTTGAATCGAATTTTTATTCATGTCTGGTTAAAAAAGATCATAGTTGGATGTTTGTATC
1 AATGATTTTAAATTGAATTTTT-TT-ATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATT-TATGTTTGCATC
* * * * * ** * * * * *
199116 AAGAAACATGAAGTAAAAGCTATCGATTGA-GAGAAAAGTTGATTTATAATCACCCTTGTCTTCG
63 AGGAAACATGAAGTGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTG
* * ** ** * * * * * * *
199180 AAGGCTTTTTTACTCTTTTTAAGTGGTTTTGTAA-CTTTCTTAATGATTTAAAAT-TAATTTTTT
128 AAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATC-TTATAAATGATTTTAAATAAAATTGTTT
* * * * *
199243 TTATTTTTAGTTAAAACAAATCATAATTTGATGTTTGCATTGGAAAACATGAAGCGAAAGCCATC
192 TCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGAAAACGTGAAGCGAAAGCCATC
* * * * ** *
199308 CATTGACAAGAAATA-TCCATTTATAGTCACTCCTGCCTTAGAAAGCTTAGTTACT-TGTTGAAA
257 CATTGACAAGAAA-AGTCCATTTATAGTCACTCATACTTTA-AAAGCCTAGTTACTCACTTTAAA
199371 TGGTTTTATAATCTTATA
320 TGGTTTTATAATCTTATA
* * ** * * * * *
199389 AATAATTTTAAAATTAAATTTTTCTTACATTTGGTTAAACCAGATAATTATTGGATGTTTGCATT
1 AATGATTTT-AAATTGAATTTTT-TTATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATT-TATGTTTGCATC
* ** * *
199454 GGGAAACATGAAGCAAAAGCTATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTGTAGTCACTCATGCCTTTG
63 AGGAAACATGAAGTGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTG
** * * * * * * *
199519 AAAGCCTAGTTACTTGCCTTAAATGGTTTTAGAGTCATACAAATAATTTTAAATCAAATT-TTTT
128 AAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATAAAATTGTTTT
*** * * * * * * * * *
199583 CAATTTTCAATTGAAACATATCTTAATTGGATGTCTGCATT-GAGAAACTTAAAGCAAAAGCCTT
193 C-ATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGA-AAACGTGAAGCGAAAGCCAT
* * ** *
199647 CTATTGACAAGAAAAGTCCATTTGTAGTCAC-C-TACGCCTTCGAAAGCCTTGTTACATGCA--T
256 CCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATA---CTTTAAAAGCCTAGTTAC-T-CACTT
*
199708 TAAGTGGTTTTATAA-CTTTATA
316 TAAATGGTTTTATAATC-TTATA
* * * * * *
199730 AATGATTTTGAA-TCAATTTTTATTTCATTTTTGGTTAAAAATAAATCATAATTTGATTTTTTCA
1 AATGATTTTAAATTGAA-TTTT-TTT-ATTTTTGGTT-AAAACAGATCATAATTT-ATGTTTGCA
* ** * * * * * *
199794 TCAAGAAATGTGAAGTGATAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCTATTTATAGTCGCCCATACCTT
61 TCAGGAAACATGAAGTGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTT
* * * * * * * * * * *
199859 TGAAAGCCTAGTTGCTTACCTTAAATGGGTTTAGAGTCATACAAATGATTTTGAATCAAATTTTT
126 TGAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAAT-AAAATTGT
* * * * *
199924 TTTCATTTTTGCTTAAAATAGATCTTAATTTGATGTTTACATT-GAGAAACTTGAAGCGAAAGCC
190 TTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGA-AAACGTGAAGCGAAAGCC
* * * * * * * * *
199988 ATCCATTTACAAGAAAAGTCTATTTTTAGTAACTCATGCCTTTGAAAGCCTTGTTACTCGCATTA
254 ATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAT-ACTTTAAAAGCCTAGTTACTCACTTTA
*
200053 AGTGGTTTTATAA-CTTTATA
318 AATGGTTTTATAATC-TTATA
* ** * * * * * * * *
200073 AATAATTTTGCATTGAGTTTTGGTTCATTTTTTTGTTAAAAATATATCATAATTCGATTTTTTTC
1 AATGATTTTAAATTGAATTTT--TTTA-TTTTTGGTT-AAAACAGATCATAATT-TA-TGTTTGC
* * * ** *
200138 ATCAAGAAATAGGAAGCAAAAGTCATCCATTCGTA-AA-AAAAG-CCTATTTATAGTCA-TCCAT
60 ATCAGGAAACATGAAGTGAAAGCCATCCATT-G-ACAAGAAAAGTCC-ATTTATAGTCACT-CAT
* * ** * * * *
200199 GTCATCAAAAGCCTAGTTACT-AGCTTCAAATGG-TTAATAATCTGATAAATGATTTTAAATTAA
121 GCCTTTGAAAGCCTAGTTACTCA-CTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATAAA
* * * * * * * *
200262 A-TGTTTCTCATTTTTGGTCAAAATAAATCATAATTTGATGTCTGCATCAAAAAACATGAAGCAA
185 ATTGTTT-TCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGAAAACGTGAAGCGA
* * * * *** *
200326 AAGTCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATTGTCA-TCATGTCTTCAAAATTATTGTTACTCA
249 AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAT-ACTTTAAAAGCCTAGTTACTCA
* * *
200390 CTTTGAATGGTTTTATAGTCTTCTA
313 CTTTAAATGGTTTTATAATCTTATA
* * * * * *
200415 AATGATTTTGAATTTAATTTTTTT-TTACTTCTGGTTAAAACAGATCCTAGTTGGATGTTTGTAT
1 AATGATTTTAAATTGAATTTTTTTATT--TT-TGGTTAAAACAGATCATAATT-TATGTTTGCAT
* ** * * * * * * * *
200479 CAAGAAATGTGGAGTGAAAGCCCTCGATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTGATTCATACCTTC
62 CAGGAAACATGAAGTGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTT
* ** * * * * *
200544 GAAAGCCTTGTTACTCTTTTTAAGTGGTTTTATAA-CTTTATAAATGATTTAAAATTGAATTTCT
127 GAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATC-TTATAAATGATTTTAAA-TAAAATTGT
* * * * ** ** **
200608 TTTCATTTTTGGTTAAAACATATCTTAATTTGATGTTTACGTTAGAAAACACGAAGTAAAAATCA
190 TTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGAAAACGTGAAGCGAAAGCCA
* * * ** * * *
200673 TCCGTTCACAAGAAATGTCCATTTATAGTCACTGTTGCCTTAGAAAGCCTAGTTACTCA-TTAAA
255 TCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATACTTTA-AAAGCCTAGTTACTCACTTTAA
*
200737 ATGATTTTATAATCTTATA
319 ATGGTTTTATAATCTTATA
* * * *
200756 AATGATTTTAAAATT-ATATTTTTCTCA-TTTTCGTTAAAACAAATCATTATTTGATGTTTGCAT
1 AATGATTTT-AAATTGA-ATTTTT-TTATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTT-ATGTTTGCAT
* * * * *
200819 -TGGAAAACATGAAGTGAAAGCCATCCATTAACCAGAAACA-TCCATTTATATTCAATCATG-CT
62 CAGG-AAACATGAAGTGAAAGCCATCCATTGACAAGAAA-AGTCCATTTATAGTCACTCATGCCT
* * * * * *
200881 TTGAAAGCCTAGTTACTC-GTCTTAAATAGTTTTAGAGT-TGTACAAATGATTTTAAATTGAAA-
125 TTGAAAGCCTAGTTACTCACT-TTAAATGGTTTTATAATCT-TATAAATGATTTTAAA-TAAAAT
* * * * * * * * ** * **
200943 TGTTTTTCATTTCCT-ATTAAAACGGATCTTAATTAGATGTTTGAATTGGGAAATATAAAATGAA
187 TG-TTTTCATTT-TTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGAAAACGTGAAGCGAA
* * * * * * * * **
201007 AGCTATCCATTGACAAGAAAAATCCATTTACAGT-TCTCTTGCCTTCGAAAA-TCTAGTTACTTG
250 AGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAT-ACTT-TAAAAGCCTAGTTACTCA
*
201070 CTTTAAATGGTTTTATAAGCTTATA
313 CTTTAAATGGTTTTATAATCTTATA
* * * * * * * *
201095 AATTATTTTAAGTTAAATTTTTTTTACTTTTGGTTAAAGCATATCGTAATTTA-GTTTTCACCAT
1 AATGATTTTAAATTGAA-TTTTTTTATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTATG-TTT--GCAT
* ** ** * * * * *
201159 TAGGAAATGTGAAGCAAAAGCCAACCATTGACTAGGAAAGTCCATTTATAGTCACTAATGCCTTC
62 CAGGAAACATGAAGTGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTT
* * * * * * * *
201224 GAAATCCTAGTTACTCGCTTGAAATTGTTTTATAGTCTTATAATTAATTTTAAAT--AATTTTTT
127 GAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATAAAATTGTTT
** ** * * * * * *
201287 TCATTTTCAGTTAAAGGAAATCATAATTGGATGTTTGTATTGAGAAAA-ATGAAACTAAAGCCAT
192 TCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATT-AGAAAACGTGAAGCGAAAGCCAT
* * * * * *
201351 CCATTGACAAGAAATGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAA-TCTTGTTATTCACTTTAA
256 CCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAT-ACTT-TAAAAGCCTAGTTACTCACTTTAA
* * *
201415 GTGATTTTATAATGTTATA
319 ATGGTTTTATAATCTTATA
* * * * * *
201434 AATGATTTTAAATTGAATATTTTTCATTTTTGATTAAAACATACCATAATTTGATATTTGCAT-T
1 AATGATTTTAAATTGAAT-TTTTTTATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTT-ATGTTTGCATCA
** ** * * *
201498 GGAAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGTTATGAAAAGTTCATTTATAGTCACTCATGCCTTCG
64 GG-AAACATGAAGTGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTG
* *
201563 AAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGGTTTTATAGTCTTATAAATGATTTTAAATCAAAATTCTTT
128 AAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAAT-AAAATTGTTT
* * * * * * * * * * * *
201628 TCATTTCTAGTTAACATAGATCATAATTCGATGTTTTCATTGGGAAACCTAAAGCAAAAGCTATC
192 TCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGAAAACGTGAAGCGAAAGCCATC
* * * * * * * * * **
201693 CATGGATAAGAAAAATCTATTCATAATCACTTATGCCTTCAAAAGCCTAGTTGTTCACTTTAAAT
257 CATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAT-ACTTTAAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAAT
*
201758 GGTTTTGTAA-CTTTATA
321 GGTTTTATAATC-TTATA
* * * * * *
201775 AATGATTTCAAATTGAATTGTTTTTCAGTTATGGTTAAAA-AGATCATGATTTGATGATTGTAT-
1 AATGATTTTAAATTGAATT-TTTTT-ATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTT-ATGTTTGCATC
* * * * *
201838 TGTGAAATC-TGAAGTGAAAGCAATCTATTGAGAAGAAAAGTCCATTTATCGTCACTCATGCCTT
63 AG-GAAA-CATGAAGTGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTT
** * ** * * **
201902 AAAAAGCCTAGTTGCTCACTTTAAACAGTTTTATAATCTTATAAACGGTTTTAAATTGAATTGTT
126 TGAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATAAAATTG-T
* * * * * ***
201967 TTTCATTTTTGGTTAATACAGATCATAA-TTGTTGTTCGCATCAGGAAACGTGAAGCGAAATAAA
190 TTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGAAAACGTGAAGCGAAAGCCA
* * * * ** * ** **
202031 TCGATTGACAAGGAAAG-CCTATTAATAGTCACTTATATCTTCGAAAGCCTAATTGTTTTCTTTA
255 TCCATTGACAAGAAAAGTCC-ATTTATAGTCACTCATA-CTTTAAAAGCCTAGTTACTCACTTTA
* * *
202095 AATAGTTTTATATTCATATA
318 AATGGTTTTATAATCTTATA
* *
202115 AATAATTTTAAATTGAATTTTCTTTTATTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTGT-TGTTTGCATC
1 AATGATTTTAAATTGAA-TTT-TTTTATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATT-TATGTTTGCATC
** * * *
202179 TTGATACATGAATTGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCCATTTATAGTCACTCATGCC-TTG
63 AGGAAACATGAAGTGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTG
* * ** * * ** *
202243 TAAACCCTAGTTACTCGCTCGAAATGGTCTTGTAATCTTATAAATGATTTTAAA-ATTGATTTTT
128 -AAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATA-AAATTGTT
* * * ** * * * * * * **
202307 TCTCATTGTTAGTTAAAACATATTGTTATTGGATGTTT-CTATCAAAAAAATGTGTAGTAAAAGC
191 T-TCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGC-AT-TAGAAAACGTGAAGCGAAAGC
* * * * * * * ** **
202371 CATCCATTGAC-----AAGTCCATTTTTTGTCGCTCATGGCTTCAAAAACCTTGTTACT-TGTCC
253 CATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAT-ACTTTAAAAGCCTAGTTACTCACTTT
* *
202430 AAAGTGATTTTGTAA-CTTCATA
317 AAA-TGGTTTTATAATCTT-ATA
** * * *
202452 AATGATTTTAAATTGAATTTTTCTTAAATTTGGTTTAAATAGATCATAATTTGATGTTTGCA-CT
1 AATGATTTTAAATTGAATTTTT-TTATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTT-ATGTTTGCATCA
* * *
202516 GGAAAACATGAAGTGAAAGCCATCCATTCACAAGAAATGTGCATTTATAGGT-ACTCATGCCTTT
64 GG-AAACATGAAGTGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATA-GTCACTCATGCCTTT
** * * * ** *
202580 GAAAGCCTAGTTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTGATCAATGATTTTAAGTTTAATTTTTT
127 GAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATAAAATTGTTT
* * * * * * ***
202645 TAAATTTTTGGTTAAAATAGATCAAAATTT-ATTGTTTGCATT-GAGAAATGTAAAGTGAAAATA
192 T-CATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGA-TGTTTGCATTAGA-AAACGTGAAGCGAAAGCC
* * * * * ** *
202708 ATGCATTGACACA-AAAAGTCTATTTACAGTCACTCATGTCTTTGAAATACTAGTTACTTGA-TT
254 ATCCATTGACA-AGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAT-ACTTTAAAAGCCTAGTTAC-TCACTT
* * * * * *
202771 TAAATAGATGTGTAGTCTTGTA
316 TAAATGGTTTTATAATCTTATA
* ** * * * * *
202793 AGTGATTTTAAATCAAACTTTTTTTCATTTCTAGTTAAAAGAGATCATAATTGTATGTTTACATT
1 AATGATTTTAAATTGAA-TTTTTTT-ATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATT-TATGTTTGCATC
* * * ** * *
202858 GGGAAACATGAAG-CAAAGCCACCCATTGACAAGCGAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTCG
63 AGGAAACATGAAGTGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTG
* * * * * *
202922 AAAGCTTAGTTGCTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCGTATAAATAATTTTAAACT-GAATTGCTT
128 AAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAA-TAAAATTG-TT
* * * * * * * *
202986 CTT--TTTTTGGATAAAACAGATCATAATTTGTTATTTCCATTGGGAAACGTGAAGCAAAAGCTA
191 -TTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGAAAACGTGAAGCGAAAGCCA
* ** * * * * * * *
203049 CCCAAAGACAAG-GAAGTCCATTAATAGTCACTCCGTTCTTCAAAAGCCTGGTTACTTACTTTAA
255 TCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACT-CATACTTTAAAAGCCTAGTTACTCACTTTAA
* *
203113 ATAGTTTTATTA-CTTTATA
319 ATGGTTTTATAATC-TTATA
* * * * **
203132 AATGATTTTAAATTAAAATATTTTTCATTTCTAGTTAAAACTA-ATCATAAGTGGATGTTTGCAT
1 AATGATTTTAAATT-GAAT-TTTTTTATTTTTGGTTAAAAC-AGATCATAA-TTTATGTTTGCAT
* * * ** * ** * *
203196 TAGGAAACACGAGGCAAAAGCCACCCATTGACAAGAAAAGTATATTTATACTCACTCATGCCTTC
62 CAGGAAACATGAAGTGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTT
* ** * * ** *
203261 AAAAGCCTAGTTACTTGCTTTGAATAGTTTTATGCTCTTATAAATAATTTTAAATCAAAA-TGTT
127 GAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAAT-AAAATTG-T
* * * * * * * * * * *
203325 TTTCATTTCTGGCTAAAATAGATAACAATTGGATGTTTGTATTAGGAAACATAAAGCGAAAGCTA
190 TTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGAAAACGTGAAGCGAAAGCCA
* * * * * * *
203390 TCAATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATACCTTTGAGAGCATTGTTACTTACTTTAA
255 TCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATA-CTTTAAAAGCCTAGTTACTCACTTTAA
* *
203455 GT-GCTTTATAA-CTTTATA
319 ATGGTTTTATAATC-TTATA
* * * **
203473 AATGATATTAAATTGAAATGTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAACTAGATGTTTGCATCA
1 AATGATTTTAAATTG-AATTTTTTTATTTTTGGTTAAAACAGATCATAA-TTTATGTTTGCATCA
** * * * * * **
203538 AAAAACATGAGGTGAAAGCCTTCTATTGACAAGAAAAGTCCATTTGTAGTCACTTGA-GCCTTCA
64 GGAAACATGAAGTGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCAC-TCATGCCTTTG
* * ** *
203602 AAAGCC---TTA-TCACTTGTATTAAGTGGTTTTAGAA-CTTTATAAATAATTTTGAAATGGATT
128 AAAGCCTAGTTACTCACTT-TA--AA-TGGTTTTATAATC-TTATAAATGATTTT-AAATAAAAT
** * * * * * * *
203662 TAATTTCATTTTTTGTTAAAAATATATCATAA-TTGATTTTTCCATTCAGAAATC-TGAAGCCAA
187 TGTTTTCATTTTTGGTT-AAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATT-AGAAAACGTGAAGCGAA
** * * * * ** ** * **
203725 ATTCATCTATTGACAAGAAAAGTTCATTTATAGTCGCTCATGCCCATGGAAGCCTAGTTATTGGC
250 AGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAT-ACTTTAAAAGCCTAGTTACTCAC
*
203790 TTTAAATGGTTTTATAATCTGATA
314 TTTAAATGGTTTTATAATCTTATA
* * * * *
203814 AATGATTTTGAATTGAATTTTTTTCATTTCAT-GTTAAAACAAATCATAATTTGATGTCTGCATT
1 AATGATTTTAAATTGAATTTTTTT-ATTT-TTGGTTAAAACAGATCATAATTT-ATGTTTGCATC
** * * * *** * * *
203878 AAAAAATATGAAG-CAAATGCCATCCATTGAGAAGAAAAGTCTGCTTATAGTCATTCATGTCTTC
63 AGGAAACATGAAGTGAAA-GCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTT
* * * * * *
203942 AAAAGCTTAGTTACTCACTTTAAATAGTTTTATAGTCTTATAAATGATTTTCAATTGAAAGTT-T
127 GAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTT-AAAT-AAAATTGT
* * * * * * * ** * * * *
204006 TTTAATTTCTAGTTAAAACAAATCATAGTTGGACGTTTGTGTCA-AGAAACATAAAGTGAAAGCC
190 TTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGA-AAACGTGAAGCGAAAGCC
** * * * * * *
204070 ATTGATTGATAAGAAAAATCCATTTATAGTCACTCATATTTTTAAAAGCCTTGTTGCTCATTTTA
254 ATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATA-CTTTAAAAGCCTAGTTACTCACTTTA
*
204135 GATGGTTTTATAA-CTTTATA
318 AATGGTTTTATAATC-TTATA
* *
204155 ATTGATTTTAAATTGAATTTTTTTTATTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTTCATGTTTGCATCA
1 AATGATTTTAAATTGAA-TTTTTTTATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTT-ATGTTTGCATCA
* * ** * * *
204220 AGAAACATGAAGTGAAAGTCATCTGTTGGCAAGAAATGTCCATTTATAGTCACTCAT-ACTTTGG
64 GGAAACATGAAGTGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTT-G
* * **
204284 AAAGCATAGTTACTCA-TTGAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAAATTGAA-TGTTT
128 AAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTT-AAATAAAATTGTTT
* * * ** ** * * *
204347 CTAATTTTTGGATAAAATAGATTGTTTTTTGATGTTTGCATCAAGAAGAA--TAAAGCAAAAGCC
192 -TCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCAT-TAGAA-AACGTGAAGCGAAAGCC
* * * ** * * **
204410 ATCCATTAAGAAGAAAAGTCCATTTATAATCACT-ATTACCTTCGAAAGCCTTGTTATTGGCTTT
254 ATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCA-TA-CTTTAAAAGCCTAGTTACTCACTTT
* *** * * ** * *
204474 ATACAATTTGAGAGGCATAAA
317 AAATGGTTTTATAATCTTATA
* * * ** * *
204495 AATAATTTTAAATTCAATTTTTTTCATTTCTGGTTAAAATGGATCATAA-CTAGGTGTTTGCATT
1 AATGATTTTAAATTGAATTTTTTT-ATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTA--TGTTTGCATC
* * * * * ** * * **
204559 AGAAAACATGAAGCGAAAGTCATCCATTGATAAGAAAAGACTGTTGATAGTCACTCATACCTTAA
63 AGGAAACATGAAGTGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTG
* ** * * *
204624 AAAGCATAGTTACTCGTTTTAAATGGTTGTATAATCTTGTAAATGATTTTGAATCAAAA-TGTTT
128 AAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAAT-AAAATTG-TT
* * * * * ** **
204688 TTCATTTTTAGTTAAAACATG-TCATAGTTGGATGTTT-CTATTGGAAAACGTGATGTAAAAGTG
191 TTCATTTTTGGTTAAAACA-GATCATAATTTGATGTTTGC-ATTAGAAAACGTGAAGCGAAAGCC
* * ** * * **
204751 ATCCATTGACAAGAAAATTCTATTTATAGTCGTTCATACCTTTTAAAGCCTTGTTACTCGTTTTA
254 ATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATA-CTTTAAAAGCCTAGTTACTCACTTTA
* * * *
204816 AGTGGTTTTACATTGTTATA
318 AATGGTTTTATAATCTTATA
* * ** * * *
204836 AATTATTTTAAATTGAATTCTTTTCATTTTTTATTAAAACAAATCATAGTTTGATGTTTGCATTA
1 AATGATTTTAAATTGAATT-TTTTTATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTT-ATGTTTGCATCA
* * * * *
204901 GGAAACATGAAATAAAAGCCATCAATTGAAAAGAAAAGTTCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGA
64 GGAAACATGAAGTGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGA
** *
204966 AAGCCTAGTTACTTGCTTTAAATGATTTTA-AAGTC-TACTAAATGATTTTAAATCAAAATAT-T
129 AAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGGTTTTATAA-TCTTA-TAAATGATTTTAAAT-AAAAT-TGT
* * * * * * * **
205028 TTTCATTTCTGGCTAAAATAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAATGTAAAATG-AAGCCA
190 TTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGAAAACGTGAAGCGAAAGCCA
* * ** * * * **
205092 TCCATTGA-ATATAAAAGTCCATATATAGTCACTTTTACCTTCAAAAGCTTTGTTACTTGCTTTA
255 TCCATTGACA-AGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATA-CTTTAAAAGCCTAGTTACTCACTTTA
* * * * *
205156 AGTGGTTTCATAGTTTTGTA
318 AATGGTTTTATAATCTTATA
* * * * *
205176 AATGATTTTAAATTTAACTTTTCTAGTTTTGGTTAAAA-AGATCATAATTTGATGTTTGTAT-AG
1 AATGATTTTAAATTGAATTTTTTTATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTT-ATGTTTGCATCA-
** * * ** *
205239 GGAAACATGAA-TCGAAAGTAATCAATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATAACTTCG
64 GGAAACATGAAGT-GAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTG
* * * * * *
205303 AAAGCCTAGTTGCTCGCTTTAAATAGTTTTATAGTCTTATAAATGATTTTATATCCAAAA--ATT
128 AAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAAT--AAAATTGTT
** * * * * * *
205366 TTCATTTTCAGTTAAAACAGATCATGATTTGATGTATGCA-TCGAGAAACATGAAGCAAAAGCTA
191 TTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGA-AAACGTGAAGCGAAAGCCA
* * * * * *
205430 TCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCAAGTTACACTCTTTAA
255 TCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAT-ACTTTAAAAGCCTAGTTACTCACTTTAA
* *
205495 ATGGTATAATAATCTTATA
319 ATGGTTTTATAATCTTATA
* * * * * *
205514 AATGATTTTAAGTTAAATTTTTTATTTTTTTGGTTAAAACATATTATAATTTGATGTTTGC--CT
1 AATGATTTTAAATTGAATTTTTT-TATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTT-ATGTTTGCATCA
* * * * * * * * *
205577 TGAGAA-ATGCAAAGCGAAAGGCATCCATTGACAAAAAAATTTCATTTATATTTAATCATGCCTT
64 GGA-AACATG--AAGTGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTT
* * * * * * * * *
205641 CGAAAGCTTAGTTATTCTCTTTAAATAGTTTTATATTCTTCTAAATGATTTTAAATAGAATTTTT
126 TGAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATAAAATTGTT
* * * * * * * ** *
205706 TTTATTTCTT-ATTAAAACAGATCATCATTGGATGTGTGCATTAGGAAACATGAAATGAAAGTCA
191 TTCATTT-TTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGAAAACGTGAAGCGAAAGCCA
* * * * * * *
205770 TCCATTGACAAGAAAATTCTATTTGTAGTCA-TCCATACCTTTTAAAGCCTTGTTACTCGCTTCA
255 TCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACT-CATA-CTTTAAAAGCCTAGTTACTCACTTTA
* *
205834 AA-GAGTTTTATAAACTAATA
318 AATG-GTTTTATAATCTTATA
* * ** * * * *
205854 AATGATTTTAAATTGAATTATTTTTCAGTTTTAGTTGGAACACATCAAAATTTGTTGTTTACAT-
1 AATGATTTTAAATTGAATT-TTTTT-ATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTT-ATGTTTGCATC
* * ** * * * * **
205918 TGAGAAATAAAAAGTGGAAGTCATCCATTGA-GA-AAAAGTCTATTTATAGTCACTCATATCTTT
63 AG-GAAACATGAAGTGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTT
* * * ** * * *
205981 AAAAGCCTAGCTACTCACTTTTAATGAATTTATAATATTATAAATGAATTTAAAATTAAATT-TT
127 GAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATG-ATTTTAAATAAAATTGTT
* * * * * * * *
206045 TCTCATTTTTGGTTAAAACATATCATAATTTAATGTTTGCATTGGTAGACATGCAGTGAAAGCCA
191 T-TCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGAAAACGTGAAGCGAAAGCCA
* * * * *
206110 TCCATTGATAAGAAAAGTCTATTCATAATCACTCATATCTTTAAAAGCCTAGTTACACACTTTAA
255 TCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATA-CTTTAAAAGCCTAGTTACTCACTTTAA
* ***
206175 ATGGTTTTGTTGGCTTATA
319 ATGGTTTTATAATCTTATA
* ** * * * * *
206194 AATGATTTTAAGTCAAATTTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAAATCATAATTAGATTTTTACGT
1 AATGATTTTAAATTGAA--TTTTTTT-ATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATT-TATGTTTGCAT
* * ** * * * *
206259 TAAGAAATGTTAAGTGAAAGCTATCCATTGACAAGAGAAA-TCCATTTATAATCACTTATGCCTT
62 CAGGAAACATGAAGTGAAAGCCATCCATTGACAAGA-AAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTT
* * * ** *
206323 TGAAAGCCTTGTTACTCACTTTAAGTGGTTTTATAA-CGTTATAAATGATTTTGAATTGAATTAT
126 TGAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATC-TTATAAATGATTTTAAATAAAATTGT
* ** * * *
206387 TTTTATTTTTGGTTAAAACTTATCAAAATTTGATGTTTG-ATT-GAGAAACATGAAGCGAAACCC
190 TTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGA-AAACGTGAAGCGAAAGCC
* * * * * * *
206450 ATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTACAGTTACTCATGCCTTTGAAAGCATAGTTACAT-GCTTT
254 ATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAT-ACTTTAAAAGCCTAGTTAC-TCACTTT
**
206514 AAATGGTTTTATAGCCTTATA
317 AAATGGTTTTATAATCTTATA
* * * * * * * * *
206535 AATGATTTTAAA-TCAAATTTTTTA-TTTCGGTTAAACCATATCGTAATTTGTTGTTTACAT-TG
1 AATGATTTTAAATTGAATTTTTTTATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTT-ATGTTTGCATCAG
* * * * *
206597 AGAAACATGAAGTAAAAGCCATCCAATGATAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTAATGCCTTTGA
65 -GAAACATGAAGTGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGA
* * * * * * * *
206662 AAGCCTATTTACTTACTTTAAATAGTTTTATAGTCTCATACATGATTTTAAATCGAGATTGTTTT
129 AAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAAT-AAAATTGTTTT
** * * * * *
206727 CATTTTAAGTTAAAGCAAATCATAA-TTGATGTTTGCATT-GAGAAATGTGAAGCAAAATCCATC
193 CATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGA-AAACGTGAAGCGAAAGCCATC
* * * * * **
206790 CATTTACATA-AAAAGTTCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAG-CTATTTACTTGC-TTAAA
257 CATTGACA-AGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAT-ACTTTAAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAA
** *
206852 GTTCTTTTATAAAT-TTATC
320 -TGGTTTTAT-AATCTTATA
*
206871 AATGATTTTAAATT-AATTTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAA-AGATCATAATTTGATGTTTGTAG
1 AATGATTTTAAATTGAA--TTTTTTT-ATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTT-ATGTTTGCA-
* ** * * ** * * *
206934 T-AGGGAATGTGAAGCGAAAGCAATTGATGGACAAGAAAAGT-CATTTTATTGTCACTCATTCCT
61 TCAGGAAACATGAAGTGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCA-TTTATAGTCACTCATGCCT
* * * * * * *
206997 TTGAATGCTTAGTTGCTCATTTTAAATGGTTTTATAAACTTATAAATGATTTTCAATTGAATATT
125 TTGAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTT-AAAT-AAAATT
* * * * * * * * **
207062 G--TTCATCTTTGGTTGAAACAGATCTTACTTTGTTGTTTTCATCA-AGAAACATGAAATGAAAG
188 GTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGA-AAACGTGAAGCGAAAG
* * * * * * * **
207124 CCATCCATTGATAA-AGAAAGTCTATTTATTGTCACTAATACCTTCAAAAGCCTTGTTACACGGT
252 CCATCCATTGACAAGA-AAAGTCCATTTATAGTCACTCATA-CTTTAAAAGCCTAGTTACTCACT
* * * *
207188 ATAAATTGTTTTACAGTCTTATA
315 TTAAATGGTTTTATAATCTTATA
* * * *
207211 AATAATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAGA-AAATCAT-ATTTGGATGTTTTCA
1 AATGATTTTAAATTGAA-TTTTTTT-ATTTTTGGTTAAA-ACAGATCATAATTT--ATGTTTGCA
** * * *
207274 TTGGGAAACATGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCAATTTATAGTCATTCATGCCTT
61 TCAGGAAACATGAAGTGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTT
* * * * * * ** *
207339 TGAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTAGTTTTAT-ACCTCTATAAAAGATTTTAAATTGAATTTT
126 TGAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCT-TATAAATGATTTTAAATAAAATTGT
* * * * **
207403 TATTCATTTTTGGTTAAAA-AAATCATAATTTAATGTTCGCATTAGGAAACGTGAAGCGAAAGTA
190 T-TTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGAAAACGTGAAGCGAAAGCC
* * * *
207467 ATCCATTGGCAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATACGTTGAAAA-CCTTAGTTGCTCACTTT
254 ATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATAC-TTTAAAAGCC-TAGTTACTCACTTT
207531 AAATGGTTTTATAATCTTATA
317 AAATGGTTTTATAATCTTATA
* * * * *
207552 AATGATTATATATTGAATTTTTTTTCTTTTTTGGTTAAAACAAATCATAA-TTATTTTTTGCAT-
1 AATGATTTTAAATTGAA-TTTTTTT-ATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTA-TGTTTGCATC
* ** * * * *
207615 TGGCAAA-ATGTGAAGTGAAAGAAATCTATGGACAAGAAAACTCCATTTATAGTCACTCATACCT
63 AGG-AAACA--TGAAGTGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCT
* * * *
207679 TT-AAACGCGTA-ATACCTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTCAAATTAAGT
125 TTGAAA-GCCTAGTTA-CTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTT-AAATAAAAT
* * * * *
207742 T-TCTCTCATTGTTTTTGTTAAAACAGATCATAATTTAATGTTTGCATTAGAAAACATAAAGCGA
187 TGT-TTTCA-T-TTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGAAAACGTGAAGCGA
* * * *
207806 AGGCCATCCATTGACAAGAAATGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAA--CTAAGTTACT
249 AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAT-ACTT-TAAAAGCCT-AGTTACT
* * * *
207869 -AGCTTTAAATGGTATTGTAGTATTATA
311 CA-CTTTAAATGGTTTTATAATCTTATA
* * * * * * * *
207896 AATTATTTTAAATTAAATTATTTTTTCATTTCTGATTATAACAGACCATAATTGAATGTTTACAT
1 AATGATTTTAAATTGAA-T-TTTTTT-ATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATT-TATGTTTGCAT
* * * * *
207961 CAGTAAATATGAAGCGAAAGCCATCCATTAACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCAC-CAATGTCTT
62 CAGGAAACATGAAGTGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTC-ATGCCTT
* * * * * **
208025 CGAAAGCGTAGTTACTCAATTTAAATAGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTCAATTGAATCT-T
126 TGAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATAAAAT-TGT
** * * * * * * * **
208089 TTAAATTTTTAGTTAAAATATATCATAA-TTGTTGTTTGCATCAGAAAAAGTGAAGCAAAAGTAA
190 TTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGAAAACGTGAAGCGAAAGCCA
* * * *
208153 TCTATTGACAAGAAAACTCTATTTATAGGCACTCATACTTTTAAAAGCCTAGTTACT-AGCTTTA
255 TCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATAC-TTTAAAAGCCTAGTTACTCA-CTTTA
208217 AATGGTTTTATAATCTTATA
318 AATGGTTTTATAATCTTATA
* * * * * * * * * * * *
208237 AATAATTCTCAATTTGAATGTTTCTCATTTTTGGATGAAATAAATCATAATTTGATGTCTACATT
1 AATGATT-TTAAATTGAAT-TTTTTTATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTT-ATGTTTGCATC
* * ** *
208302 AGGAAACATGAA-TCGAAAGCTATCCATTGACAAGAGAAGTTTATTTATAGTCACTCATGCCTTC
63 AGGAAACATGAAGT-GAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTT
* * * * * * * ** *
208366 GTATGCGTTGTTACTAACTTTAAGTAGTTTTATAA-CTTTATAAATGATTTTAAAGTAATTTTTT
127 GAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATC-TTATAAATGATTTTAAA-TAAAATTGT
* * * * * * * **
208430 TTTCATTTTTAG-TAAAA-TGATCATCATTTGATGTTCGTATTGGGAAAA-GTGAAGTGAAAGTA
190 TTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATT-AGAAAACGTGAAGCGAAAGCC
* * * * * * *
208492 ATCTATTGACAAGAAAAATTCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAACCTAGTTGCTCACTTTA
254 ATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAT-ACTTTAAAAGCCTAGTTACTCACTTTA
* * *
208557 AATAGTTTTACAATCTTGTA
318 AATGGTTTTATAATCTTATA
** * * * *
208577 AATGATTTTACGTTGAATTTGTTTTTCACTTTTGGTTAAAACATATAATAATTTACTATTTGCAT
1 AATGATTTTAAATTGAA-TT-TTTTT-ATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTA-TGTTTGCAT
* ** * * * * * *
208642 TAGGAAATGTGAGGCGAAA-CCATCCATTAATAAGGAAAGTCCATTTATTA-TCATTCATGCCTT
62 CAGGAAACATGAAGTGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTA-TAGTCACTCATGCCTT
* ** * * **
208705 TGAAAGTCTAGTTACTTGCTTTAAATGG-TTTATAGTCTTATAAATGAGTTTAAAATTGAATT-T
126 TGAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGA-TTTTAAATAAAATTGT
* * * * * * * * *
208768 TACTCATTTTTGGTTAAAATAAATTATAATTTGATGTTGGTAATGT-G-GAATGTGAAGCCAAAG
190 T-TTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTG-CAT-TAGAAAACGTGAAGCGAAAG
* * * * * ** * * *
208831 CAATCCACTGACAAGAAAAGTCGACTTATAGTCACTTATGTTTTTAATAGCCTAGTTGCTC-GTT
252 CCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAT-ACTTTAAAAGCCTAGTTACTCACTT
** * *
208895 TAAATAATTTTGTAAACTTATA
316 TAAATGGTTTTATAATCTTATA
* * * * * * *
208917 AATGATTTTCAATTGAATTTCTTTCATTTTTAGTTAAAATAGATTATAATTTGTTCTTTGCATCA
1 AATGATTTTAAATTGAATTT-TTTTATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTT-ATGTTTGCATCA
** * * * * * * *
208982 GGAAATGTGAAATGACAA-CCATCCACTGACAAAAAAAGTCCATCTATAGTCACTTATACTTTTG
64 GGAAACATGAAGTGA-AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTG
* * * *
209046 AAAGCCTAAG-TACTCACTGTAAATAGTTTTATAGTCTTATAAATGATTTTATATCAAAATTGTT
128 AAAGCCT-AGTTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAAT-AAAATTG-T
*** * * * * * * *
209110 TTTCATTTTCACTTCAAATAGATCATAA-TTGAGTGTTGGCATTGGGAAACGTGAAGCAAAAACC
190 TTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGA-TGTTTGCATTAGAAAACGTGAAGCGAAAGCC
* * * * * * **
209174 ATCCATTGACATGAAAAGTCAATTTATAGTCACTCATTCCTTCAAAAGTCTTA-CTACTTGCTTT
254 ATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCA-TACTTTAAAAG-CCTAGTTACTCACTTT
** *
209238 AGGTGGTTTTAT-ACCTTTATA
317 AAATGGTTTTATAATC-TTATA
* * *
209259 AAAGATTTTAAATTGAATTCTTATTCATTTTTGGTTGAAAA-AGATCATAATTTGATGTTTGTAT
1 AATGATTTTAAATTGAATT-TT-TTTATTTTTGGTT-AAAACAGATCATAATTT-ATGTTTGCAT
* ** ** * * * * *
209323 -GGGAAAACGA-GAAGCAAAAGTGATCCATTCATAA-AAAAGGTGCATTTGTAGTCATTCATGCC
62 CAGG-AAAC-ATGAAGTGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAA-GTCCATTTATAGTCACTCATGCC
** * ** * * * * * **
209385 TTCAAAAGCCTAGTTAATGGCTTTAAATAGTTCTAAAAT-TATATAAATGATTTTGAATTGATTT
124 TTTGAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCT-TATAAATGATTTT-AAATAAAAT
* * * * * **
209449 TGTTTTCAATTTTGGTTAAAATATATCATAA-TTGTTGTTTGCA-TCGAGAAACGTGAAATGAAA
187 TGTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGA-AAACGTGAAGCGAAA
* * * * * ** ** *
209512 GCTATCCATTGACAACAAAAATCTATTGATAGTCACTCATACCTTCGAAAGTATAGTTGCTCACT
251 GCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATA-CTTTAAAAGCCTAGTTACTCACT
* * *
209577 TTCAGTGGTTTTATAACCTTATA
315 TTAAATGGTTTTATAATCTTATA
* * *** ** * *
209600 AATGATTTCAAATTGAA-TCTCCCATTTTTTATTAAAACATATTATAATTTGATGTTTGCATCAG
1 AATGATTTTAAATTGAATTTTTTTATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTT-ATGTTTGCATCAG
* * ** ** ** * * **
209664 AAAACATAAAGCAAAAGCCATCTGTTGACAAGAAAAGTTTATTTATAGTTACTTATGCCTTAAAA
65 GAAACATGAAGTGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAA
* * ** ***
209729 AGCCTAGTTACTCACTTCAAATAGATCATAATTGGATGTTGGCATTGGA-AAACGTGA-AGCAAA
130 AGCCTAGTTACTCACTTTAAAT-GGT--T--TT--ATAAT--C-TT--ATAAA--TGATTTTAAA
* ** ** **** * * * * * ***
209792 -AACCATCCATTGACATGAAAGAAATCTTATAAA-TGAGTTA-AAATTGAAT-TTTTC-TTACTT
181 TAA-AAT-TGTTTTCATTTTTG----GTTA-AAACAGA-TCATAATTTG-ATGTTTGCATTAGAA
*** * * * *** * ** ** * * * * *
209852 TTGGTTAA---AATAGATCAT-AATTTGATGTTTGTATTGTGGAATCTAAAG-CAAAAATAATCC
237 AACGTGAAGCGAA-AG-CCATCCA-TTGA--CAAGAAAAGT-CCATTTATAGTC---ACTCATAC
* *** * **
209912 ATTAACAAGAAAAG-T-C-CA-TTT--ATAGTCATTTAT-GCCTTCGATA
293 TTTAA-AAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGGT--TTTATAATCTT--ATA
** * * * * * * ** * * ** * * ***
209955 GCCTAATTGCTCATTTTAATTAGTTTTA--TAAGCTTATAAA-TGATTTTCAATTGATTTTTTTT
1 -AATGATT-TTAAATTGAATT-TTTTTATTTTTGGTTA-AAACAGATCAT-AATTTATGTTTGCA
* **** * * ** * * *
210017 TCATGTTTTGTAAAACA--AA-TCATAATTTGT-TATTTGCATAAGGAAACA-TGAAGTGAAAG-
61 TCA-G----G--AAACATGAAGTGA-AAGCCATCCA-TTG-ACAA-GAAA-AGTCCATTTATAGT
* ** * * * ** * * * * *
210076 CTA-TCCATTG-ATAAGGAAAGTCTATTAATAGTCA-TTT--ATACTTTCAAAAGCTTAGTTACT
114 C-ACT-CA-TGCCT-TTGAAAGCCTAGT--TACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTTA-TAAAT
* * * * ** ** * * *
210136 -AGTTT---T-AAGTGGTCTT-ATACCTT--TT-AAA-AGATTTTAAATTGAATTTTTTTTACAT
172 GATTTTAAATAAAATTGTTTTCAT-TTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTG-A---TGTTTGCA-
* * * * * ** ** * * *
210191 TTTTGGTCAAAAAAGATCATAACTTG-ATG-TTTGTATTAGGAAAAGAGAAG--CA---AAAG-C
231 --TTAG---AAAACG-TGA-AGC--GAAAGCCATCCATT--GACAAGAAAAGTCCATTTATAGTC
**
210248 GA-TC-TA-TTGATAAAAAAATCTATGTATAGTCACTCATGCCTTTAAAAGCTTAGTTGCCCTCT
285 -ACTCATACTT--T--AAAAGCCTA-G--T--T-ACTCA---CTTT-AAA---T-G--G---T-T
*
210310 TTA-AATGGTT-TCA
325 TTATAAT-CTTAT-A
* * * * * * *
210323 AAAGCTTATAAATGATTTTCAATTGAATTTTTTTCATTTTTAGTTAAAATAGATTAAAATTGT-T
1 AATGATT-TTAA--A---T----TGAATTTTTTT-ATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATT-TAT
* ** * **** * *
210387 GTTTGCATTAGGAAACATGAAGCAAAAGCTATCCATTGACAAGAAAAAAATATTTATAGACACTA
54 GTTTGCATCAGGAAACATGAAGTGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTC
* * * *
210452 ATACCTTTG--AGCACATGGTTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAAAGATTTTCAAA
119 ATGCCTTTGAAAGC-C-TAGTTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTT-AAA
* * * * * * * * *
210515 TTAAATAT-CTCTCATATTTAGTTAAAACATATCATAATTTGATGTTTACATCAGAAAACATGAA
181 TAAAAT-TGTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGAAAACGTGAA
* * * * * * * * *
210579 GCAAAAACCATCTATTGATAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCATTAAAA-CCGAGTTG
245 GCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAT-ACTTTAAAAGCCTAGTTA
** *
210643 CTTGCTTTAAATAGTTTTATAATCTTATA
309 CTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATA
* * * * * *
210672 AATAATTTTGAGTTGGATTTTTTTTCCATTTTTGGTTAACATAGATCATAATTGT-TGTTTGCAT
1 AATGATTTTAAATT-GAATTTTTTT--ATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATT-TATGTTTGCAT
* ** * * * * * *
210736 TAGGAAA-AGTGAAGCAAAAGCAATCCATTGACACG-AAAGTCCATTTATAGGCACTTATACTTT
62 CAGGAAACA-TGAAGTGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTT
** ** * **
210799 TGAAAGCCTAGTTACTTGCTTTAAATGGGCTTATAATCTTATAAATGATTTTCAAGTTGAA-TGT
126 TGAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTT-AAATAAAATTGT
* * * * * * * * *
210863 TTCTTATTTTTTGTTGAAACAAATCATAATTTGATGTTAGAATCA-AAATACGTGAAGCAAAATC
190 TT-TCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGAAA-ACGTGAAGCGAAAGC
* * * * ** *
210927 TATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTC-CTTTATGCGTTCGAAAGCCTAGTTACTCGCTT
253 CATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCAC-TCATAC-TTTAAAAGCCTAGTTACTCACTT
* * *
210991 TCAATGGTTTTATAGTATTATA
316 TAAATGGTTTTATAATCTTATA
* * ** * * * * * *
211013 AATTATTTTCAATCCATTTCTTTTTATCTCTAGTTAAAACAGATCATAATTGAATG-TTGCATTA
1 AATGATTTTAAATTGAATT-TTTTTATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATT-TATGTTTGCATCA
** * *
211077 GGAAAGGTGATGTGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCA-TT-TA-T-ACTCATGCCTTAGA
64 GGAAACATGAAGTGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGA
* * * * * * *
211138 AAGCCAAGTTGCTCACTTTAAATAGTTTTATAATCTTATAAATTATTTTGAATTAAATTTTTTCT
129 AAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATAAAATTGTTT-T
* * * * * * * *
211203 CATTTTTAGTTAAAACATATCATAA-TTGTTGTTTGCATCAGGAAATG-GTTAGAGAAAGCCATC
193 CATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGAAAACGTG-AAGCGAAAGCCATC
* * * * * * * *
211266 CATTGATAAGAAAAGTCCATTGATAGCCACTAAGACCTTTGAAAGCCTAATAACTCACTTTAAAT
257 CATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATA-CTTTAAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAAT
*
211331 GGTTTTATCATCTTATA
321 GGTTTTATAATCTTATA
* * * * * *
211348 AATGATCTTAAAATTGAATTTTTCTCATTTTTAGTTAAAACATATCATAATTGAATGCTTGCATC
1 AATGAT-TTTAAATTGAATTTTT-TTATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATT-TATGTTTGCATC
* * * * * * * * *
211413 AGAAAACATGAAGCGAAAGCCATCTATTGATAAAAAAAAGTCTATTTATAGTCACTGATACCTTC
63 AGGAAACATGAAGTGAAAGCCATCCATTGA-CAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTT
* ** * * *
211478 AAAAGCCTAGTTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATATATGA-TTTGAATCAAAATTTAT
127 GAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAAT-AAAA-TTGT
* * * * * *
211542 TTTCATTTCTT-GTTAAAACAAATCAT-ACTTGAATGTTTGCATTGGGAAACGAGAAGCAAAAGC
190 TTTCATTT-TTGGTTAAAACAGATCATAATTTG-ATGTTTGCATTAGAAAACGTGAAGCGAAAGC
* * * * **
211605 CATCCTTTGACAAAAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATACATTCGAAAA-CCTTGTTACTTGCTT
253 CATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATAC-TT-TAAAAGCCTAGTTACTCACTT
* * * *
211669 GAAATGATTTTATTA-CTTTCTA
316 TAAATGGTTTTATAATC-TTATA
* * * * *
211691 AATGATTTTATATTGAATTTTATTTTCATTTTAT-GTTAAAA-ATACCATAACTTGATGTTTGTA
1 AATGATTTTAAATTGAA-TTT-TTTT-ATTTT-TGGTTAAAACAGATCATAA-TTTATGTTTGCA
* ** * *
211754 TC-GTGGAACATGAAGTGAAAGTAATCCATTGACAAGAAAAATCCATTTATAGTCACTCATACCT
61 TCAG-GAAACATGAAGTGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCT
** * ** *** * * *
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125 TTGAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCT-TATAAATGATTTT-AAA-TAAAAT
* * ** * * * **
211882 TTTCTTTCAGTTTTGGTTAAAA-AGATCATGGTTTGATGTTTGTATCA-AAAACCATGAAATGAA
187 TGT-TTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGAAAA-CGTGAAGCGAA
* * * * * ** * **
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250 AGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATA-CTTTAAAAGCCTAGTTACTCAC
** *
212010 TTTAAATAATTTTACAATCTTATA
314 TTTAAATGGTTTTATAATCTTATA
** * * *** *
212034 AATGATTTGCAATTGAGTTCTTTTTCATTTTTTGTTAAAATTTATCATAATTGT-TGTTTGCATT
1 AATGATTTTAAATTGAATT-TTTTT-ATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATT-TATGTTTGCATC
* * * * * *
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63 AGGAAACATGAAGTGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTT-T
* * * *
212162 GAAGGCCTAGTTACTCACTTTGAATGGTTTCATAAT-TGTACAAATGA---T---T----TT-TT
127 GAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCT-TATAAATGATTTTAAATAAAATTGTT
* * * * *
212215 TT-AGTTTTAGTTAAAA-ATATCATAATTTGATGTTTGCATTAGAAAATAG-GAAGCAAAAGCCA
191 TTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGAAAA-CGTGAAGCGAAAGCCA
* * * * * ** * *
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255 TCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAT-ACTTTAAAAGCCTAGTTACTCACTTTAA
* *
212342 ATAGTTTTCTAATCTTATA
319 ATGGTTTTATAATCTTATA
* * *
212361 AATTATTTTAAAATTGAATTTTTTCTCATTTTTGGTTAAATA-TG-TCATGATTTGATGTTTGCA
1 AATGATTTT-AAATTGAATTTTTT-T-ATTTTTGGTTAAA-ACAGATCATAATTT-ATGTTTGCA
* * *
212424 TTAGGAAACATAAAGTGAAAGCCATCCATTGACAACAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATG-C-T
61 TCAGGAAACATGAAGTGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTT
* * * * * * **
212487 TGCAAAAGCCTAGATACTCACATTGAATAGTTTTCTAATCTTATAAATTATTTTAAAATTGAATT
126 TG--AAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTT-AAATAAAATT
* * * * * * * *
212552 -TTTCTCATTTTTAGTTAAAATATG-TCATAATTTTATGTTTGCATTGGGAAACATAAAGTGAAA
188 GTTT-TCATTTTTGGTTAAAACA-GATCATAATTTGATGTTTGCATTAGAAAACGTGAAGCGAAA
* ** * *
212615 GCCATCCATTGACAAGAAAAATCCATTTATAGTCACTCACGCCTTTAAAAGCTTAGTTACTTACT
251 GCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCA-TACTTTAAAAGCCTAGTTACTCACT
* * * * * *
212680 TTGAATAGTTTTCTAGTCTCAAA
315 TTAAATGGTTTTATAATCTTATA
* ** * * ** * * * * *
212703 AATAATTTTAAATCAAAATTTTTATCATTTCTAATCAAAGCAAATCATAATTAGATGTTTGCATT
1 AATGATTTTAAAT-TGAATTTTT-TTATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATT-TATGTTTGCATC
* * * * * * * *
212768 GGGAAACGTGAAGCGAAAGCCATCCACTGCCAA-AACAATTTCATTTATAGTCACTCATGCCTTC
63 AGGAAACATGAAGTGAAAGCCATCCATTGACAAGAA-AAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTT
* * * * * ** *
212832 AAAATCCTTGTTACTCATTTTAAATGGTTTTATAA-CTTTATAAATGATTTTGAATTGAATTTTT
127 GAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATC-TTATAAATGATTTT-AAAT-AAAATTG
** * * ** * * *
212896 TTTTCATTTTTAATTTAAACAAATCATAATTTGACCTTTGCATGAGGAAAAC--AAATC-ATAAT
189 TTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTA-GAAAACGTGAAGCGA-AA-
* * *** * * * *
212958 TGCCATCTATTGACAATAGTTGTCCATTTATAGTCCCTAATGCTTTGAAAAGCCTATTTACTCA-
251 -GCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATACTTT-AAAAGCCTAGTTACTCAC
* * *
213022 TTGAAATAGTTTTACAATCTTATA
314 TTTAAATGGTTTTATAATCTTATA
* * * ** * *
213046 AATGATTTTAAAACTT-TATTTTTTGTATTTTTGATTAAAACAAAATGTTAATTGATGTTTGCTT
1 AATGATTTT-AAA-TTGAATTTTTT-TATTTTTGGTTAAAAC-AGATCATAATTTATGTTTGCAT
** * * ** * * * * *
213110 TGGGGAACGTGAAACGAAAGCTATCCATTGATAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTGATGCCTTC
62 CAGGAAACATGAAGTGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTT
* * * ** * * * * * *
213175 AAAATCCTAATTACTTGCTTTAAATAGTTTTAGAGT-TGTACAAATGATCTTAAATCAAAA-GGT
127 GAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCT-TATAAATGATTTTAAAT-AAAATTG-
* * * * * * * * *
213238 TTTTCATCTTTAGTTAGAACAGATCATAATTGGATGTTTACATCAGAAGATGTGAATCGAAAGCC
189 TTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGAAAACGTGAAGCGAAAGCC
* * * * ** * *
213303 ATTCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCAGTTATGCCTTCGAATGCCTAGTTACTCACTTCA
254 ATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAT-ACTTTAAAAGCCTAGTTACTCACTTTA
*
213368 AATGGTTTTACAATCTTATA
318 AATGGTTTTATAATCTTATA
* * * * ** * * *
213388 AATGATTTTAAGTTG-ACTTTTTTAGTTTTTGCTTAAAACATATTTTAATTTGTTTTTGCATCGG
1 AATGATTTTAAATTGAATTTTTTTA-TTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTATGTTTGCATCAG
** * *
213452 GAAACATGAAGCAAAAGCCATTCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCC-TTCAA
65 GAAACATGAAGTGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAA
* * * * * * * *
213516 AGGGCTAGTTACTCACATAAAATGGTTTTATAGTCATATAGATGATTTTGAATGGAAA-TGTTTT
130 A-GCCTAGTTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAAT-AAAATTG-TTT
* * * * * * *
213580 TCATTTCTAGTTATAGCAAATCATAACTAGATGTTTGCATT
192 TCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATT
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Statistics
Matches: 13326, Mismatches: 3438, Indels: 1697
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GCCTAGTTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATAAAATTGTTTTCAT
TTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGAAAACGTGAAGCGAAAGCCATCCATT
GACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATACTTTAAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGGTTT
TATAATCTTATA
Found at i:198406 original size:171 final size:168
Alignment explanation
Indices: 195748--213585 Score: 2495
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195738 CATGAAGTAG
* * * *
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* * * * ** *
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* * * * * *
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* * ** ** *
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* * * * *
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* * * * **
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* * * * ** **
196151 C-TTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATATTAAGTTGATTTTTTTTCATTTTTG-GTTAAAA
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* * * * * *
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* * * * * * * * * *
196255 AGGCCATTCATTGAC-----AAGTCCATTTAGAGTCGCTCATGCCTTTGAAAACCTAATTACTCG
1 AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAT-ACTTTTAAAGCCTAGTTGCTCA
* * * * ** * * **
196315 CATTAAAT-AGTTTTATAATCTTATAATTGAATTTAAAATTTAAGTTTTCTCATTTTTTGTTAAA
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* * * * ** * *
196379 ACATATCATAATTTGA-TGTCTGCATTAGAAAACATGAAACAA
128 ACATACCA-AA-TTGATTGTTTCCATCAGAAAATGTGAAGCGA
* * * ** ** * *
196421 AAGCCATCCGTTGACAAGAAAAATGCATTTATAGTCACTCATACATTCGAAAGTTTAGTTACTCG
1 AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATAC-TTTTAAAGCCTAGTTGCTCA
* * * * * * *
196486 TTTTAAAT-AGTTTTATAGTCTTATAAATCACTATAAAT-TAATTTTTTTAAATTTTTGA-TTAA
65 CTTTAAATGA-TTTTATAGTCTTATAAATGATTTTAAATCAAAATTTTTT-CA-TTTTGAGTTAA
* * * * * *
196548 AACATATCATAGTTGAATGTTTGCATCATGAAACA--TGATGCAA
127 AACATACCA-AATTGATTGTTTCCATCA-GAAA-ATGTGAAGCGA
* * * * ** ** ** *
196591 AAGCCATCCATTAACAAGAAAAGTCCATTTATAATCACTCTTACCATCAAAAGTGTAGTTATTCG
1 AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATA-CTTTTAAAGCCTAGTTGCTCA
* * * * ** *
196656 CTTTAAATGGTTTTATAGACTTATAAATTATTTTAATTC-AGTTTTCTTTCATTTCT-AATTAAA
65 CTTTAAATGATTTTATAGTCTTATAAATGATTTTAAATCAAAATTT-TTTCATTT-TGAGTTAAA
* * * ** * ** * **
196719 A-AGGATCATGATTGGGTGTTTGCATTGGGAAACATGAAGCGA
128 ACA-TACCA-AATTGATTGTTTCCATCAGAAAATGTGAAGCGA
* * * * * * **
196761 AGGCTATCTATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATACTTTGGAAAGCCTAGTTACTTG
1 AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATACTTT-TAAAGCCTAGTTGCTCA
* * * * * ***
196826 CTTGAAAT-AGTTTTGTAATGTTATAAATTATTTTAAATTTGAATTTTTCTCATTTTTG-GCTTA
65 CTTTAAATGA-TTTTATAGTCTTATAAATGATTTTAAATCAAAATTTTT-TCA-TTTTGAG-TTA
* **** * * ** ** ** **
196889 AACAAATTGTTATTTCA-T-TTGGCATTGGAAAACATGAATAGA
126 AA-ACATACCAAATTGATTGTTTCCATCAGAAAATGTGAAGCGA
* * * * * * * * * *
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1 AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAT-ACTTTTAAAGCCTAGTTGCTCA
* * * ***
196996 C-TTAAATGGTTTTAGAGTCGTATAAATGATTTTAAATCATTTTTTTTTCATTTCT-A-TTCAAA
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** * * **
197058 ACATATTATAATTTAAATGTTTACC-TCTAGAAACA--TGAAATGA
128 ACATACCA-AA-TTGATTGTTT-CCATC-AGAAA-ATGTGAAGCGA
** ** * ** * * * *
197101 AAGTAATTTATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCTTTGTTACTCG
1 AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAT-ACTTTTAAAGCCTAGTTGCTCA
* * * * * * * * * * *
197166 CCTCAAGTGGTTTTAT-GACTTTTTAACTGATTTTAAAT-TAATTTTTTTCATTTTCAATTAAAA
65 CTTTAAATGATTTTATAGTC-TTATAAATGATTTTAAATCAAAATTTTTTCATTTTGAGTTAAAA
* * * * * ** *
197229 CAGATCATAATT-TTATGTTTACATCACAAAACATAAAGCGA
129 CATACCA-AATTGAT-TGTTTCCATCAGAAAATGTGAAGCGA
* * * * * ** *
197270 AAGCGATCTATTTAGAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTTATACGTTGAAAAGCCTAGTTACTCA
1 AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATAC-TTTTAAAGCCTAGTTGCTCA
* * * *
197335 CTTTATATGTTTTATAGTTTTATAGT-TTATAAATTATTTTAAATTAAAATTTTTT--TTTTCA-
65 CTTTAAATG------A-TTTTATAGTCTTATAAATGATTTTAAATCAAAATTTTTTCATTTTGAG
**** * * * * * * *
197396 TGT-ATGGTTA-CAGA-TCA-T-ATTGCAT-TGAGAATCGTGAAGAGA
123 T-TAAAACATACCAAATTGATTGTTTCCATCAGAAAAT-GTGAAGCGA
* * * * * ** *
197438 AAGCCATTCATTGATAAGAAATGCCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAG-CTAGTTGCTCG
1 AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAT-ACTTTTAAAGCCTAGTTGCTCA
* ** * * ** * * * *
197502 CTTTAAATGGTTTTATAAACTTATAAATTATTTTGAATTGAATTTTTTTAATTTTTAATTAAAAC
65 CTTTAAATGATTTTATAGTCTTATAAATGATTTTAAATCAAAATTTTTTCATTTTGAGTTAAAAC
* ** * ** * * **
197567 AAATTAGACATTG-TT-TTCTACATTGGGAAATATGAAGTAA
130 ATACCA-A-ATTGATTGTT-TCCATCAGAAAATGTGAAGCGA
* * ** *** * * **
197607 AAGCTATCCATTGACAAGAAATGTGTATTTATAGTCACTCATACCTTCGGAAGCTTAGTTACTTG
1 AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATA-CTTTTAAAGCCTAGTTGCTCA
* * * * * ** * *
197672 CTCTAAATAATTTTATAATCTTATCAAGGA-TTTAAAGTTGAATTTTTTTGAATTTTTGA-TTAA
65 CTTTAAATGATTTTATAGTCTTATAAATGATTTTAAA-TCAAAATTTTTT-CA-TTTTGAGTTAA
** * * *
197735 AACATATTAGAATTTG-TTGTTTACATCAATAAAATGTGAAGTGA
127 AACATACCA-AA-TTGATTGTTTCCATC-AGAAAATGTGAAGCGA
* * * * * * * * ** *
197779 AAGTCATCCACTGATAAAAAAAGTTCATTTATAGTCACTTATCCTTTGAAAAG-CTTTTATACTC
1 AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATACTTT-TAAAGCCTAGT-TGCTC
* * * * ** * *
197843 ACTTTAAGTGATTCTATA-ACTTTATAAATAATTTTAAATTGAAGTTTTTATGATTTTTG-GTTA
64 ACTTTAAATGATTTTATAGTC-TTATAAATGATTTTAAATCAAAATTTTT-TCA-TTTTGAGTTA
** ** ** * *
197906 AAA-ATATTAAAATTTGA-CCTTTGTATTAGGAAATGTGAAGCGA
126 AAACATA-CCAAA-TTGATTGTTTCCATCAGAAAATGTGAAGCGA
** * * * * * *
197949 AAGTAATCCATTGATAAGAAAAGTTCATTTGTAGTCACTGATACCTTTGAAGCCTAGTTGCTCAC
1 AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATACTTTTAAAGCCTAGTTGCTCAC
* * ** * *
198014 TTTAAATGATTTTATAATCTTATAATTGAGTTTTAAAT-TGAATTTTTCTTATTTTTAGTTAAAA
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* * * * * *** **
198078 CATATCAAATTTATTTTTTGCATCAGGAAGCATGAAGTAA
129 CATACCAAATTGATTGTTTCCATCAGAAAATGTGAAGCGA
* * * * * *
198118 AAGCCATCTATTGACAAGAAAAGTCCATTTATGGTTACACATACCTTTAAAAGCCTAGTTACTCA
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* * *
198183 CTTTAAAT-AGTTTTATAGTGTTATAAATGATTTGAAATCAAAATTGTTTTCATTTTGGGTTAAA
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*
198247 ACATACCATAATTCGA-TGTTTCCA-CTAGAAAATGTGAAGCGG
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* *
198289 AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTTATACTTGTTAAAGCCTAGTTGCTCG
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* * * ** * * *
198354 TTTTAAATGATTTTGTGGTCTTATAAATGATTTTAAATCAAAATATTTTTCATTTCAAGCTCAAT
65 CTTTAAATGATTTTATAGTCTTATAAATGATTTTAAATCAAAAT-TTTTTCATTTTGAGTTAAAA
* * * * * * * *
198419 GAGATCACAATTGGA-TGTGTGCATCTGGAAATATGAAGC--
129 CATACCA-AATT-GATTGTTTCCATCAGAAAATGTGAAGCGA
* * * * * * ** *
198458 AA---A---A--GACAAGAAAAGTCTATTTATAGCCAATCATGCCTTTGAAAGCCTTGTTATTTA
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* * * * * ** *
198515 CTTTAAGTGGTTTTATA-ACTTTATAAATGATATTGAATTGAATTTTTTTCATTTTTGA-TTAAA
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* * ** * * ** *
198578 ATAGATTATAATTGGA-TGTTTTCATTAGAAAACATAAAGCGA
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* * * ** * * * * *
198620 TAGCCATCTATTGACAAAAAAAGTTTATTTGTAGTTACTCATATCTTTGAAAGCCTTGTTACTCG
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* * * * ** ** *
198685 TA-TTT-AGT-AGTTTTATA-ACTTCATAAATGATATTGAATTGAGTTTTATTTCTTTTTTG-GT
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* * * * * * * * *
198745 TCAAAACAGACTTGAATTTAATT-TATGCAT-TGAGAAATATGAAGCCA
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** * * * * * *
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* * * * * * * *
198855 GACTTTAAAT-AGTTTTACAATCTAATAAATGATTTTAAAT-TAATTTTTTTTATTTTTTA-TTA
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198917 AAACAGATCATAATTTGA-TGTCTACATCAGAAAACATGAAGCGA
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198961 AGGCCATCCGTTGACAAGAAAAGTCCGTTTATAGTCACTCATA-TTTTCAAAAGCCTAATTATTT
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199025 ACATTAAATAATTTTATAGTCTTGTAAATGATGTTGAATCGAATTTTTATTCATGTCTG-GTTAA
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* * * ** * * * * ** * * ** * *
199132 AAGCTATCGATTGA-GAGAAAAGTTGATTTATAATCACCCTTGTCTTCGAAGGCTTTTTTACTCT
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199196 TTTTAAGTGGTTTTGTA-ACTTTCTTAATGATTTAAAAT-TAATTTTTTTTATTTTTAGTTAAAA
65 CTTTAAATGATTTTATAGTC-TTATAAATGATTTTAAATCAAAATTTTTTCATTTTGAGTTAAAA
* * * ** **
199259 CAAATCATAATTTGA-TGTTTGCATTGGAAAACATGAAGCGA
129 CATACCA-AA-TTGATTGTTTCCATCAGAAAATGTGAAGCGA
* * ** * *
199300 AAGCCATCCATTGACAAGAAATA-TCCATTTATAGTCACTCCTGCCTTAGAAAGCTTAGTTACT-
1 AAGCCATCCATTGACAAGAAA-AGTCCATTTATAGTCACTCAT-ACTTTTAAAGCCTAGTTGCTC
** * * * * * *
199363 TGTTGAAATGGTTTTATAATCTTATAAATAATTTTAAAATTAAATTTTTCTTACA-TTTG-GTTA
64 ACTTTAAATGATTTTATAGTCTTATAAATGATTTT-AAATCAAAATTTT-TT-CATTTTGAGTTA
* * * * ** * ** *
199426 AACCAGA-TAATTATTGGA-TGTTTGCATTGGGAAACATGAAGCAA
126 AAACATACCAA--ATT-GATTGTTTCCATCAGAAAATGTGAAGCGA
* * * * * **
199470 AAGCTATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTGTAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTAGTTACTTG
1 AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAT-ACTTTTAAAGCCTAGTTGCTCA
* * * * * * * * *
199535 CCTTAAATGGTTTTAGAGTCATACAAATAATTTTAAATC-AAATTTTTTCAATTTTCAATTGAAA
65 CTTTAAATGATTTTATAGTCTTATAAATGATTTTAAATCAAAATTTTTTC-ATTTTGAGTTAAAA
** * * * * * *
199599 CATATCTTAATTGGA-TGTCTGCATTGAGAAACT-TAAAGCAA
129 CATA-CCAAATT-GATTGTTTCCA-TCAGAAAATGTGAAGCGA
* * * ** * *
199640 AAGCCTTCTATTGACAAGAAAAGTCCATTTGTAGTCAC-C-TACGCCTTCGAAAGCCTTGTTACA
1 AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATA---CTTTTAAAGCCTAGTTGC-
* * * * **
199703 TGCA--TTAAGTGGTTTTATA-ACTTTATAAATGATTTTGAATCAATTTTTATTTCATTTTTG-G
62 T-CACTTTAAATGATTTTATAGTC-TTATAAATGATTTTAAATCAAAATTT-TTTCA-TTTTGAG
* * *
199764 TTAAAA-ATAAATCATAATTTGATT-TTTTCATCA-AGAAATGTGAAGTGA
123 TTAAAACAT--ACCA-AA-TTGATTGTTTCCATCAGA-AAATGTGAAGCGA
* * * * * * *
199812 TAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCTATTTATAGTCGCCCATACCTTTGAAAGCCTAGTTGCTTA
1 AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATA-CTTTTAAAGCCTAGTTGCTCA
* ** * * * * * *
199877 CCTTAAATGGGTTTAGAGTCATACAAATGATTTTGAATCAAATTTTTTTTCATTTTTG-CTTAAA
65 CTTTAAATGATTTTATAGTCTTATAAATGATTTTAAATCAAA-ATTTTTTCA-TTTTGAGTTAAA
* * * * * * *
199941 ATAGATCTTAATTTGA-TGTTTACATTGAGAAACT-TGAAGCGA
128 ACATA-C-CAAATTGATTGTTTCCA-TCAGAAAATGTGAAGCGA
* * * * * * * * *
199983 AAGCCATCCATTTACAAGAAAAGTCTATTTTTAGTAACTCATGCCTTTGAAAGCCTTGTTACTCG
1 AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAT-ACTTTTAAAGCCTAGTTGCTCA
* * * * * ** ** * **
200048 CATTAAGTGGTTTTATA-ACTTTATAAATAATTTTGCAT-TGAGTTTTGGTTCATTTTTTTGTTA
65 CTTTAAATGATTTTATAGTC-TTATAAATGATTTTAAATCAAAATTTT--TTCA-TTTTGAGTT-
* * * * *
200111 AAAATATATCATAATTCGATTTTTTTCATCA-AGAAATAG-GAAGCAA
125 AAAACATACCA-AATT-GATTGTTTCCATCAGA-AAAT-GTGAAGCGA
* * * ** *
200157 AAGTCATCCATTCGTA-AA-AAAAG-CCTATTTATAGTCA-TCCATGTCATCAAAAGCCTAGTTA
1 AAGCCATCCATT-G-ACAAGAAAAGTCC-ATTTATAGTCACT-CAT-ACTTTTAAAGCCTAGTTG
* * * * * * *
200218 CT-AGCTTCAAATG-GTTAATAATCTGATAAATGATTTTAAAT-TAAATGTTTCTCATTTTTG-G
61 CTCA-CTTTAAATGATTTTATAGTCTTATAAATGATTTTAAATCAAAAT-TTTTTCA-TTTTGAG
* * * * * * * ** *
200279 TCAAAATAAATCATAATTTGA-TGTCTGCATCAAAAAACATGAAGCAA
123 TTAAAACATACCA-AA-TTGATTGTTTCCATCAGAAAATGTGAAGCGA
* * * ** *** * *
200326 AAGTCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATTGTCA-TCATGTCTTCAAAATTATTGTTACTCA
1 AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAT-ACTTTTAAAGCCTAGTTGCTCA
* * * * * ** * *
200390 CTTTGAATGGTTTTATAGTCTTCTAAATGATTTTGAATTTAATTTTTTTTTACTTCTG-GTTAAA
65 CTTTAAATGATTTTATAGTCTTATAAATGATTTT-AAATCAAAATTTTTTCA-TTTTGAGTTAAA
* * * ** * *
200454 ACAGATCCTAGTTGGA-TGTTTGTATCA-AGAAATGTGGAGTGA
128 ACATA-CCAAATT-GATTGTTTCCATCAGA-AAATGTGAAGCGA
* * * * * ** * * *
200496 AAGCCCTCGATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTGATTCATACCTTCGAAAGCCTTGTTACTCT
1 AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATA-CTTTTAAAGCCTAGTTGCTCA
* * * * * ** *
200561 TTTTAAGTGGTTTTATA-ACTTTATAAATGATTTAAAATTGAATTTCTTTTCATTTTTG-GTTAA
65 CTTTAAATGATTTTATAGTC-TTATAAATGATTTTAAATCAAAATT-TTTTCA-TTTTGAGTTAA
* * * * * *** **
200624 AACATATCTTAATTTGA-TGTTTACGTTAGAAAACACGAAGTAA
127 AACATA-C-CAAATTGATTGTTTCCATCAGAAAATGTGAAGCGA
** * * * ** * ** *
200667 AAATCATCCGTTCACAAGAAATGTCCATTTATAGTCACTGTTGCCTTAGAAAGCCTAGTTACTCA
1 AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAT-ACTTTTAAAGCCTAGTTGCTCA
* * * * *
200732 -TTAAAATGATTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAAAT-TATATTTTTCTCATTTT-CGTTAAA
65 CTTTAAATGATTTTATAGTCTTATAAATGATTTT-AAATCAAAATTTTT-TCATTTTGAGTTAAA
* * * * ** ** *
200794 ACAAATCATTATTTGA-TGTTTGCATTGGAAAACATGAAGTGA
128 ACATACCA--AATTGATTGTTTCCATCAGAAAATGTGAAGCGA
* * * * * * *
200836 AAGCCATCCATTAACCAGAAACA-TCCATTTATATTCAATCATGCTTTGAAAGCCTAGTTACTC-
1 AAGCCATCCATTGACAAGAAA-AGTCCATTTATAGTCACTCATACTTTTAAAGCCTAGTTGCTCA
* * * **
200899 GTCTTAAAT-AGTTTTAGAGT-TGTACAAATGATTTTAAATTGAAATGTTTTTCATTTCCT-A-T
65 CT-TTAAATGA-TTTTATAGTCT-TATAAATGATTTTAAATCAAAAT-TTTTTCATTT--TGAGT
** ** ** * * * **
200960 TAAAACGGAT-CTTAATTAGA-TGTTTGAATTGGGAAATATAAAATGA
124 TAAAAC--ATACCAAATT-GATTGTTTCCATCAGAAAATGTGAAGCGA
* * * * * * ** ** * **
201006 AAGCTATCCATTGACAAGAAAAATCCATTTACAGT-TCTCTTGCCTTCGAAAATCTAGTTACTTG
1 AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAT-ACTTTTAAAGCCTAGTTGCTCA
* * * * * *
201070 CTTTAAATGGTTTTATAAG-CTTATAAATTATTTTAAGTTAAATTTTTTTTACTTTTG-GTTAAA
65 CTTTAAATGATTTTAT-AGTCTTATAAATGATTTTAAATCAAAATTTTTTCA-TTTTGAGTTAAA
* ** * * * * *
201133 GCATATCGTAATTTAGTT-TTCACCATTAGGAAATGTGAAGCAA
128 ACATA-CCAAATTGA-TTGTT-TCCATCAGAAAATGTGAAGCGA
* * * * * ** * * *
201176 AAGCCAACCATTGACTAGGAAAGTCCATTTATAGTCACTAATGCCTTCGAAATCCTAGTTACTCG
1 AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAT-ACTTTTAAAGCCTAGTTGCTCA
* * * * * *
201241 CTTGAAATTG-TTTTATAGTCTTATAATTAATTTTAAAT--AATTTTTTTCATTTTCAGTTAAAG
65 CTTTAAA-TGATTTTATAGTCTTATAAATGATTTTAAATCAAAATTTTTTCATTTTGAGTTAAAA
* * * ** * * * *
201303 GAAATCATAATTGGA-TGTTTGTATTGAGAAAA-ATGAAACTA
129 CATACCA-AATT-GATTGTTTCCA-TCAGAAAATGTGAAGCGA
* * ** ** * **
201344 AAGCCATCCATTGACAAGAAATGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAATCTTGTTATTCA
1 AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAT-ACTTTTAAAGCCTAGTTGCTCA
* * * **
201409 CTTTAAGTGATTTTATAATGTTATAAATGATTTTAAAT-TGAATATTTTTCATTTTTGA-TTAAA
65 CTTTAAATGATTTTATAGTCTTATAAATGATTTTAAATCAAAAT-TTTTTCA-TTTTGAGTTAAA
* * ** ** *
201472 ACATACCATAATTTGA-TATTTGCATTGGAAAACATGAAGCAA
128 ACATACCA-AA-TTGATTGTTTCCATCAGAAAATGTGAAGCGA
** * * * ** *
201514 AAGCCATCCATTGTTATGAAAAGTTCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTAGTTACTCA
1 AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAT-ACTTTTAAAGCCTAGTTGCTCA
* *
201579 CTTTAAATGGTTTTATAGTCTTATAAATGATTTTAAATCAAAATTCTTTTCATTTCT-AGTTAAC
65 CTTTAAATGATTTTATAGTCTTATAAATGATTTTAAATCAAAATT-TTTTCATTT-TGAGTTAAA
* * * * ** * ** * *
201643 ATAGATCATAATTCGA-TGTTTTCATTGGGAAACCTAAAGCAA
128 ACATACCA-AATT-GATTGTTTCCATCAGAAAATGTGAAGCGA
* * * * * * * * * ** *
201685 AAGCTATCCATGGATAAGAAAAATCTATTCATAATCACTTATGCCTTCAAAAGCCTAGTTGTTCA
1 AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAT-ACTTTTAAAGCCTAGTTGCTCA
* * * * ** * *
201750 CTTTAAATGGTTTTGTA-ACTTTATAAATGATTTCAAATTGAATTGTTTTTCAGTTATG-GTTAA
65 CTTTAAATGATTTTATAGTC-TTATAAATGATTTTAAATCAAAAT-TTTTTCA-TTTTGAGTTAA
* * * * ** * * * *
201813 AA-AGATCATGATTTGA-TGATTGTAT-TGTGAAATCTGAAGTGA
127 AACATACCA--AATTGATTGTTTCCATCAG-AAAATGTGAAGCGA
* * * * * **
201855 AAGCAATCTATTGAGAAGAAAAGTCCATTTATCGTCACTCATGCCTTAAAAAGCCTAGTTGCTCA
1 AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAT-ACTTTTAAAGCCTAGTTGCTCA
* * * * ** *
201920 CTTTAAA-CAGTTTTATAATCTTATAAACGGTTTTAAATTGAATTGTTTTTCATTTTTG-GTTAA
65 CTTTAAATGA-TTTTATAGTCTTATAAATGATTTTAAATCAAAAT-TTTTTCA-TTTTGAGTTAA
* * * * *
201983 TACAGATCATAATTG-TTG-TTCGCATCAGGAAACGTGAAGCGA
127 AACATACCA-AATTGATTGTTTC-CATCAGAAAATGTGAAGCGA
*** * * * * ** * * *
202025 AATAAATCGATTGACAAGGAAAG-CCTATTAATAGTCACTTATATCTTCGAAAGCCTAATTGTTT
1 AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCC-ATTTATAGTCACTCATA-CTTTTAAAGCCTAGTTGCTC
* * * * ** * * *
202089 TCTTTAAAT-AGTTTTATATTCATATAAATAATTTTAAATTGAATTTTCTTTTATTTTTAGTTAA
64 ACTTTAAATGA-TTTTATAGTCTTATAAATGATTTTAAATCAAAATTT-TTTCATTTTGAGTTAA
* * * * * **
202153 AACAGATCATAATTG-TTGTTTGCATCTTGATACA--TGAATTGA
127 AACATACCA-AATTGATTGTTTCCATC-AGA-AAATGTGAAGCGA
* * * * * *
202195 AAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCCATTTATAGTCACTCATGCCTTGTAAACCCTAGTTACTCG
1 AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAT-ACTTTTAAAGCCTAGTTGCTCA
** * * * * ** *
202260 CTCGAAATGGTCTTGTAATCTTATAAATGATTTTAAAAT-TGATTTTTTCTCATTGTT-AGTTAA
65 CTTTAAATGATTTTATAGTCTTATAAATGATTTT-AAATCAAAATTTTT-TCATT-TTGAGTTAA
**** * * * **
202323 AACATATTGTTATTGGA-TGTTTCTATCAAAAAAATGTGTAGTAA
127 AACATA-CCAAATT-GATTGTTTCCATC-AGAAAATGTGAAGCGA
* * * * ** * * * *
202367 AAGCCATCCATTGAC-----AAGTCCATTTTTTGTCGCTCATGGCTTCAAAAACCTTGTTACT-T
1 AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAT-ACTTTTAAAGCCTAGTTGCTCA
* ** * * ** * * * *
202426 GTCCAAAGTGATTTTGTA-ACTTCATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTCTTAAATTTG-GTTTA
65 CTTTAAA-TGATTTTATAGTCTT-ATAAATGATTTTAAATCAAAATTTT-TTCATTTTGAGTTAA
* * * * * ** *
202489 AATAGATCATAATTTGA-TGTTTGCA-CTGGAAAACATGAAGTGA
127 AACATACCA-AA-TTGATTGTTTCCATC-AGAAAATGTGAAGCGA
* * * * * * *
202532 AAGCCATCCATTCACAAGAAATGTGCATTTATAGGT-ACTCATGCCTTTGAAAGCCTAGTTACTT
1 AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATA-GTCACTCAT-ACTTTTAAAGCCTAGTTGCTC
* * * * * * ** * *
202596 GCTTTAAATGGTTTTATAATCTGATCAATGATTTTAAGTTTAATTTTTTTAAATTTTTG-GTTAA
64 ACTTTAAATGATTTTATAGTCTTATAAATGATTTTAAATCAAAATTTTTT-CA-TTTTGAGTTAA
* * * * * * * *
202660 AATAGATCAAAATTTATTGTTTGCAT-TGAGAAATGTAAAGTGA
127 AACATA-CCAAATTGATTGTTTCCATCAGA-AAATGTGAAGCGA
*** * * * * * ** *
202703 AAATAATGCATTGACACA-AAAAGTCTATTTACAGTCACTCATGTCTTTGAAATACTAGTTACTT
1 AAGCCATCCATTGACA-AGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAT-ACTTTTAAAGCCTAGTTGC-T
* * * * * *
202767 GA-TTTAAATAGA-TGTGTAGTCTTGTAAGTGATTTTAAATCAAACTTTTTTTCATTTCT-AGTT
63 CACTTTAAAT-GATTTTATAGTCTTATAAATGATTTTAAATCAAA-ATTTTTTCATTT-TGAGTT
* * * * ** * **
202829 AAAAGAGATCATAATTG-TATGTTTACATTGGGAAACATGAAGC-A
125 AAAACATACCA-AATTGAT-TGTTTCCATCAGAAAATGTGAAGCGA
* ** ** *
202873 AAGCCACCCATTGACAAGCGAAGTCCATTTATAGTCACTCA-AGCCTTCGAAAGCTTAGTTGCTC
1 AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATA--CTTTTAAAGCCTAGTTGCTC
* * * * * ** * *
202937 GCTTTAAATGGTTTTATAATCGTATAAATAATTTTAAA-CTGAATTGCTTCTT-TTTTTG-GATA
64 ACTTTAAATGATTTTATAGTCTTATAAATGATTTTAAATCAAAATT--TT-TTCATTTTGAGTTA
* * * ** * * *
202999 AAACAGATCATAATTTG-TTATTTCCATTGGGAAACGTGAAGCAA
126 AAACATACCA-AA-TTGATTGTTTCCATCAGAAAATGTGAAGCGA
* * ** * * * * ** * * *
203043 AAGCTACCCAAAGACAAG-GAAGTCCATTAATAGTCACTCCGTTCTTCAAAAGCCTGGTTACTTA
1 AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACT-CATACTTTTAAAGCCTAGTTGCTCA
* *
203107 CTTTAAAT-AGTTTTATTACT-TTATAAATGATTTTAAATTAAAATATTTTTCATTTCT-AGTTA
65 CTTTAAATGA-TTTTA-TAGTCTTATAAATGATTTTAAATCAAAAT-TTTTTCATTT-TGAGTTA
* * * * * *** * *
203169 AAAC-TAATCATAAGTGGA-TGTTTGCATTAGGAAACACGAGGCAA
126 AAACAT-ACCA-AA-TTGATTGTTTCCATCAGAAAATGTGAAGCGA
* ** * * ** * **
203213 AAGCCACCCATTGACAAGAAAAGTATATTTATACTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTACTTG
1 AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAT-ACTTTTAAAGCCTAGTTGCTCA
* * *
203278 CTTTGAAT-AGTTTTAT-GCTCTTATAAATAATTTTAAATCAAAATGTTTTTCATTTCTG-GCTA
65 CTTTAAATGA-TTTTATAG-TCTTATAAATGATTTTAAATCAAAAT-TTTTTCATTT-TGAG-TT
* * ** * * ** *
203340 AAATAGATAAC-AATTGGA-TGTTTGTATTAGGAAACATAAAGCGA
125 AAA-ACATACCAAATT-GATTGTTTCCATCAGAAAATGTGAAGCGA
* * * * * * * * *
203384 AAGCTATCAATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATACCTTTGAGAGCATTGTTACTTA
1 AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATA-CTTTTAAAGCCTAGTTGCTCA
* * * * ** *
203449 CTTTAAGTG-CTTTATA-ACTTTATAAATGATATTAAATTGAAATGTTTTCATTTTTG-GTTAAA
65 CTTTAAATGATTTTATAGTC-TTATAAATGATTTTAAATCAAAATTTTTTCA-TTTTGAGTTAAA
* * * * * ** * *
203511 ACAGATCATAACTAGA-TGTTTGCATCAAAAAACATGAGGTGA
128 ACATACCA-AA-TTGATTGTTTCCATCAGAAAATGTGAAGCGA
* * * * ** ** *
203553 AAGCCTTCTATTGACAAGAAAAGTCCATTTGTAGTCACTTGAGCCTTCAAAAGCC---TT-ATCA
1 AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCAC-TCATACTTTTAAAGCCTAGTTGCTCA
* * * * ** **
203614 CTTGTATTAAGTGGTTTTAGA-ACTTTATAAATAATTTTGAAAT--GGATTTAATTTCATTTTTT
65 CTT-TA--AA-TGATTTTATAGTC-TTATAAATGATTTT-AAATCAAAATTT--TTTCATTTTGA
* * * *
203676 GTTAAAAATATATCATAATTGATT-TTTCCATTCAG-AAATCTGAAGCCA
122 GTT-AAAACATACCA-AATTGATTGTTTCCA-TCAGAAAATGTGAAGCGA
** * * * * ** ** ** **
203724 AATTCATCTATTGACAAGAAAAGTTCATTTATAGTCGCTCATGCCCATGGAAGCCTAGTTATTGG
1 AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAT-ACTTTTAAAGCCTAGTTGCTCA
* * * * ** * *
203789 CTTTAAATGGTTTTATAATCTGATAAATGATTTTGAATTGAATTTTTTTCA-TTTCATGTTAAAA
65 CTTTAAATGATTTTATAGTCTTATAAATGATTTTAAATCAAAATTTTTTCATTTTGA-GTTAAAA
* * * * * * *
203853 CAAATCATAATTTGA-TGTCTGCATTAAAAAATATGAAGC-A
129 CATACCA-AA-TTGATTGTTTCCATCAGAAAATGTGAAGCGA
* *** * * ** * *
203893 AATGCCATCCATTGAGAAGAAAAGTCTGCTTATAGTCATTCATGTCTTCAAAAGCTTAGTTACTC
1 AA-GCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAT-ACTTTTAAAGCCTAGTTGCTC
* * * *
203958 ACTTTAAAT-AGTTTTATAGTCTTATAAATGATTTTCAATTGAAAGTTTTTTAATTTCT-AGTTA
64 ACTTTAAATGA-TTTTATAGTCTTATAAATGATTTT-AAATCAAAATTTTTTCATTT-TGAGTTA
* * * * *** * *
204021 AAACAAATCATAGTTGGA-CGTTTGTGTCAAGAAACA--TAAAGTGA
126 AAACATACCA-AATT-GATTGTTTCCATC-AGAAA-ATGTGAAGCGA
** * * * *
204065 AAGCCATTGATTGATAAGAAAAATCCATTTATAGTCACTCATATTTTTAAAAGCCTTGTTGCTCA
1 AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATACTTTT-AAAGCCTAGTTGCTCA
* * * * * ** * * *
204130 TTTTAGATGGTTTTATA-ACTTTATAATTGATTTTAAATTGAATTTTTTTTATTTTTAGTTAAAA
65 CTTTAAATGATTTTATAGTC-TTATAAATGATTTTAAATCAAAATTTTTTCATTTTGAGTTAAAA
* * * * *
204194 CAGATCATAATTTCA-TGTTTGCATCAAGAAACA--TGAAGTGA
129 CATACCA-AA-TTGATTGTTTCCATC-AGAAA-ATGTGAAGCGA
* ** * * * * *
204235 AAGTCATCTGTTGGCAAGAAATGTCCATTTATAGTCACTCATACTTTGGAAAGCATAGTTACTCA
1 AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATACTTT-TAAAGCCTAGTTGCTCA
* * * ** * * *
204300 -TTGAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAAAT-TGAATGTTTCTAATTTTTG-GATAA
65 CTTTAAATGATTTTATAGTCTTATAAATGATTTT-AAATCAAAAT-TTTTTCA-TTTTGAG-TTA
* ****** * * *
204362 AATAGATTGTTTTTTGA-TGTTTGCATCAAGAAGAA--TAAAGCAA
126 AA-ACATACCAAATTGATTGTTTCCATC-AGAA-AATGTGAAGCGA
* * * ** * ** *
204405 AAGCCATCCATTAAGAAGAAAAGTCCATTTATAATCACT-ATTACCTTCGAAAGCCTTGTTATTG
1 AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCA-TA-CTTTTAAAGCCTAGTTGCTC
* * ** * * * * * * *
204469 GCTTTATACAATTTGAGAGGCATAAAAATAATTTTAAATTC-AATTTTTTTCATTTCTG-GTTAA
64 ACTTTAAATGATTTTATAGTCTTATAAATGATTTTAAA-TCAAAATTTTTTCATTT-TGAGTTAA
*** * * * * * **
204532 AATGGATCATAACT-AGGTGTTTGCATTAGAAAACATGAAGCGA
127 AACATACCA-AATTGA-TTGTTTCCATCAGAAAATGTGAAGCGA
* * * ** * ** * * *
204575 AAGTCATCCATTGATAAGAAAAGACTGTTGATAGTCACTCATACCTTAAAAAGCATAGTTACTCG
1 AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATA-CTTTTAAAGCCTAGTTGCTCA
* * * * * * *
204640 TTTTAAATGGTTGTATAATCTTGTAAATGATTTTGAATCAAAATGTTTTTCATTTTTAGTTAAAA
65 CTTTAAATGATTTTATAGTCTTATAAATGATTTTAAATCAAAAT-TTTTTCATTTTGAGTTAAAA
** * * ** * * **
204705 CATGTCATAGTTGGA-TGTTTCTATTGGAAAACGTGATGTAA
129 CATACCA-AATT-GATTGTTTCCATCAGAAAATGTGAAGCGA
** * * ** * * *
204746 AAGTGATCCATTGACAAGAAAATTCTATTTATAGTCGTTCATACCTTTTAAAGCCTTGTTACTCG
1 AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATA-CTTTTAAAGCCTAGTTGCTCA
* * * * * * * ** *
204811 TTTTAAGTGGTTTTACATTGTTATAAATTATTTTAAAT-TGAATTCTTTTCATTTTTTA-TTAAA
65 CTTTAAATGATTTTATAGTCTTATAAATGATTTTAAATCAAAATT-TTTTCA-TTTTGAGTTAAA
* * * * * * ** ***
204874 ACAAATCATAGTTTGA-TGTTTGCATTAGGAAACATGAAATAA
128 ACATACCA-A-ATTGATTGTTTCCATCAGAAAATGTGAAGCGA
* * * * * * **
204916 AAGCCATCAATTGAAAAGAAAAGTTCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTAGTTACTTG
1 AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAT-ACTTTTAAAGCCTAGTTGCTCA
* *
204981 CTTTAAATGATTTTAAAGTC-TACTAAATGATTTTAAATCAAAATATTTTTCATTTCTG-GCTAA
65 CTTTAAATGATTTTATAGTCTTA-TAAATGATTTTAAATCAAAAT-TTTTTCATTT-TGAGTTAA
* * * * * * **
205044 AATAGATCATAATTTGA-TGTTTGCATCAGGAAATGTAAAATG-
127 AACATACCA-AA-TTGATTGTTTCCATCAGAAAATGTGAAGCGA
* * ** ** * * * *
205086 AAGCCATCCATTGA-ATATAAAAGTCCATATATAGTCACTTTTACCTTCAAAAGCTTTGTTACTT
1 AAGCCATCCATTGACA-AGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATA-CTTTTAAAGCCTAGTTGCTC
* * * * * * ** * *
205150 GCTTTAAGTGGTTTCATAGTTTTGTAAATGATTTTAAATTTAACTTTTCT-AGTTTTG-GTTAAA
64 ACTTTAAATGATTTTATAGTCTTATAAATGATTTTAAATCAAAATTTTTTCA-TTTTGAGTTAAA
* * ** * ** *
205213 A-AGATCATAATTTGA-TGTTTGTAT-AGGGAAACATGAATCGA
128 ACATACCA-AA-TTGATTGTTTCCATCA-GAAAATGTGAAGCGA
** * * ** *
205254 AAGTAATCAATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATAACTTCGAAAGCCTAGTTGCTCG
1 AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAT-ACTTTTAAAGCCTAGTTGCTCA
* * *
205319 CTTTAAAT-AGTTTTATAGTCTTATAAATGATTTTATATCCAAAA-ATTTTCATTTTCAGTTAAA
65 CTTTAAATGA-TTTTATAGTCTTATAAATGATTTTAAAT-CAAAATTTTTTCATTTTGAGTTAAA
* * * * * *
205382 ACAGATCATGATTTGA-TGTATGCATCGAGAAACA--TGAAGCAA
128 ACATACCA--AATTGATTGTTTCCATC-AGAAA-ATGTGAAGCGA
* * * ** * * * *
205424 AAGCTATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCAAGTTACACT
1 AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAT-ACTTTTAAAGCCTAGTTGCTCA
* * * * * * * **
205489 CTTTAAATGGTATAATAATCTTATAAATGATTTTAAGTTAAATTTTTTATTTTTTTG-GTTAAAA
65 CTTTAAATGATTTTATAGTCTTATAAATGATTTTAAATCAAAATTTTT-TCATTTTGAGTTAAAA
** * * **
205553 CATATTATAATTTGA-TGTTTGCCTTGAG-AAATGCAAAGCGA
129 CATACCA-AA-TTGATTGTTT-CCATCAGAAAATGTGAAGCGA
* * * * * * * * ** * ** *
205594 AAGGCATCCATTGACAAAAAAATTTCATTTATATTTAATCATGCCTTCGAAAGCTTAGTTATTCT
1 AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAT-ACTTTTAAAGCCTAGTTGCTCA
* * * * *
205659 CTTTAAAT-AGTTTTATATTCTTCTAAATGATTTTAAAT-AGAATTTTTTTTATTTCTTA-TTAA
65 CTTTAAATGA-TTTTATAGTCTTATAAATGATTTTAAATCA-AAATTTTTTCATTT-TGAGTTAA
* * * * * * * ** **
205721 AACAGATCATCATTGGA-TGTGTGCATTAGGAAACATGAAATGA
127 AACATACCA-AATT-GATTGTTTCCATCAGAAAATGTGAAGCGA
* * * * * *
205764 AAGTCATCCATTGACAAGAAAATTCTATTTGTAGTCA-TCCATACCTTTTAAAGCCTTGTTACTC
1 AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACT-CATA-CTTTTAAAGCCTAGTTGCTC
* * ** * ** *
205828 GCTTCAAA-GAGTTTTATAAACTAATAAATGATTTTAAATTGAATTATTTTTCAGTTTT-AGTTG
64 ACTTTAAATGA-TTTTATAGTCTTATAAATGATTTTAAATCAAAAT-TTTTTCA-TTTTGAGTT-
* * * * *** * *
205891 GAACACAT-CAAAATTTG-TTGTTTACAT-TGAGAAATAAAAAGTGG
125 -AAAACATACCAAA-TTGATTGTTTCCATCAGA-AAATGTGAAGCGA
* * * * * *
205935 AAGTCATCCATTGA-GA-AAAAGTCTATTTATAGTCACTCATATCTTTAAAAGCCTAGCTACTCA
1 AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATA-CTTTTAAAGCCTAGTTGCTCA
* * * * * *
205998 CTTTTAATGAATTTATAATATTATAAATGAATTTAAAAT-TAAATTTTTCTCATTTTTG-GTTAA
65 CTTTAAATGATTTTATAGTCTTATAAATG-ATTTTAAATCAAAATTTTT-TCA-TTTTGAGTTAA
* * * * ** * * ** * *
206061 AACATATCATAATTTAATGTTTGCATTGGTAGACATGCAGTGA
127 AACATACCA-AATTGATTGTTTCCATCAGAAAATGTGAAGCGA
* * * * * * *
206104 AAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCTATTCATAATCACTCATATCTTTAAAAGCCTAGTTACACA
1 AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATA-CTTTTAAAGCCTAGTTGCTCA
* * * * * *
206169 CTTTAAATGGTTTTGTTGGCTTATAAATGATTTTAAGTCAAATTTTTTTTTCATTTTTG-GTTAA
65 CTTTAAATGATTTTATAGTCTTATAAATGATTTTAAATCAAA--ATTTTTTCA-TTTTGAGTTAA
* * * * * * *
206233 AACAAATCATAATTAGATT-TTTACGTTA-AGAAATGTTAAGTGA
127 AACATACCA-AATT-GATTGTTTCCATCAGA-AAATGTGAAGCGA
* * * * * * *
206276 AAGCTATCCATTGACAAGAGAAA-TCCATTTATAATCACTTATGCCTTTGAAAGCCTTGTTACTC
1 AAGCCATCCATTGACAAGA-AAAGTCCATTTATAGTCACTCAT-ACTTTTAAAGCCTAGTTGCTC
* * * * ** *
206340 ACTTTAAGTGGTTTTATA-ACGTTATAAATGATTTTGAAT-TGAATTATTTTTATTTTTG-GTTA
64 ACTTTAAATGATTTTATAGTC-TTATAAATGATTTTAAATCAAAATT-TTTTCA-TTTTGAGTTA
* * * *
206402 AAACTTATCAAAATTTGA-TGTTT-GATTGAGAAACA--TGAAGCGA
126 AAACATA-CCAAA-TTGATTGTTTCCA-TCAGAAA-ATGTGAAGCGA
* * * * * * * *
206445 AACCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTACAGTTACTCATGCCTTTGAAAGCATAGTTACAT-
1 AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAT-ACTTTTAAAGCCTAGTTGC-TC
* * * * *
206509 GCTTTAAATGGTTTTATAGCCTTATAAATGATTTTAAATC-AAATTTTTT-ATTTCG-GTTAAAC
64 ACTTTAAATGATTTTATAGTCTTATAAATGATTTTAAATCAAAATTTTTTCATTTTGAGTTAAAA
* * * * **
206571 CATATCGTAATTTG-TTGTTTACATTGAGAAACA--TGAAGTAA
129 CATA-C-CAAATTGATTGTTTCCA-TCAGAAA-ATGTGAAGCGA
* * * * * * * * *
206612 AAGCCATCCAATGATAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTAATGCCTTTGAAAGCCTATTTACTTA
1 AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAT-ACTTTTAAAGCCTAGTTGCTCA
* * * * *
206677 CTTTAAAT-AGTTTTATAGTCTCATACATGATTTTAAATCGAGATTGTTTTCATTTTAAGTTAAA
65 CTTTAAATGA-TTTTATAGTCTTATAAATGATTTTAAATCAAAATT-TTTTCATTTTGAGTTAAA
* * * * * *
206741 GCAAATCATAATTGA-TGTTTGCAT-TGAGAAATGTGAAGCAA
128 ACATACCA-AATTGATTGTTTCCATCAGA-AAATGTGAAGCGA
* * * * * * * *
206782 AATCCATCCATTTACATA-AAAAGTTCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAG-CTATTTACTT
1 AAGCCATCCATTGACA-AGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAT-ACTTTTAAAGCCTAGTTGCTC
* ** * * * **
206845 GC-TTAAAGTTCTTTTATAAAT-TTATCAATGATTTTAAATTAATTTTTTTTTCATTTTTG-GTT
64 ACTTTAAA-TGATTTTAT-AGTCTTATAAATGATTTTAAATCAA-AATTTTTTCA-TTTTGAGTT
* * ** **
206907 AAAA-AGATCATAATTTGA-TGTTTGTAGT-AGGGAATGTGAAGCGA
125 AAAACATACCA-AA-TTGATTGTTTCCA-TCAGAAAATGTGAAGCGA
* ** * * * * * *
206951 AAGCAATTGATGGACAAGAAAAGT-CATTTTATTGTCACTCATTCCTTTGAATGCTTAGTTGCTC
1 AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCA-TTTATAGTCACTCA-TACTTTTAAAGCCTAGTTGCTC
* * ** * ** * *
207015 ATTTTAAATGGTTTTATAAACTTATAAATGATTTTCAAT-TGAATATTGTTCATCTTTG-GTTGA
64 ACTTTAAATGATTTTATAGTCTTATAAATGATTTTAAATCAAAAT-TTTTTCAT-TTTGAGTTAA
* * ** * **
207078 AACAGATCTTACTTTG-TTGTTTTCATCAAGAAACA--TGAAATGA
127 AACATA-C-CAAATTGATTGTTTCCATC-AGAAA-ATGTGAAGCGA
* * * * ** * * *
207121 AAGCCATCCATTGATAA-AGAAAGTCTATTTATTGTCACTAATACCTTCAAAAGCCTTGTTACAC
1 AAGCCATCCATTGACAAGA-AAAGTCCATTTATAGTCACTCATA-CTTTTAAAGCCTAGTTGCTC
** * * * * ** *
207185 GGTATAAATTG-TTTTACAGTCTTATAAATAATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATTTTTAGTTAA
64 ACTTTAAA-TGATTTTATAGTCTTATAAATGATTTTAAA-TCAAAATTTTTTCATTTTGAGTTAA
* * * * ** * **
207249 AGA-AAATCATATTTGGA-TGTTTTCATTGGGAAACATGAAGCGA
127 A-ACATACCA-AATT-GATTGTTTCCATCAGAAAATGTGAAGCGA
* * * * * * *
207292 AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCAATTTATAGTCATTCATGCCTTTGAAAGCCTTGTTACTCG
1 AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAT-ACTTTTAAAGCCTAGTTGCTCA
* * * ** *
207357 CTTTAAGT-AGTTTTATA-CCTCTATAAAAGATTTTAAATTGAATTTTTATTCATTTTTG-GTTA
65 CTTTAAATGA-TTTTATAGTCT-TATAAATGATTTTAAATCAAAATTTT-TTCA-TTTTGAGTTA
* * * * * * *
207419 AAA-AAATCATAATTTAATG-TTCGCATTAGGAAACGTGAAGCGA
126 AAACATACCA-AATTGATTGTTTC-CATCAGAAAATGTGAAGCGA
** * * * * *
207462 AAGTAATCCATTGGCAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATACGTTGAAAACCTTAGTTGCTCA
1 AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATACTTTTAAAGCC-TAGTTGCTCA
* * * * * ** *
207527 CTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTATATATTGAATTTTTTTTCTTTTTTG-GTTAAA
65 CTTTAAATGATTTTATAGTCTTATAAATGATTTTA-AATCAAAATTTTTTC-ATTTTGAGTTAAA
* * * * ** *
207591 ACAAATCATAATT-ATTTTTTGCATTGGCAAAATGTGAAGTGA
128 ACATACCA-AATTGATTGTTTCCATCAG-AAAATGTGAAGCGA
** * * * * * * **
207633 AAGAAATCTATGGACAAGAAAACTCCATTTATAGTCACTCATACCTTTAAACGCGTAATACCTCA
1 AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATACTTTTAAA-GCCTAGTTGCTCA
* * * * * **
207698 CTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTCAAAT-TAAGTTTCTCTCATTGTTTTTGTTA
65 CTTTAAATGATTTTATAGTCTTATAAATGATTTT-AAATCAAAATTT-TTTCA-T-TTTGAGTTA
* * * * * * ** *
207762 AAACAGATCATAATTTAATGTTTGCATTAGAAAACATAAAGCGA
126 AAACATACCA-AATTGATTGTTTCCATCAGAAAATGTGAAGCGA
* * * ** * *
207806 AGGCCATCCATTGACAAGAAATGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAA-ACTAAGTTACT-
1 AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAT-ACTTTTAAAGCCT-AGTTGCTC
* * * * * *
207869 AGCTTTAAATGGTATTGTAGTATTATAAATTATTTTAAATTAAATTATTTTTTCATTTCTGA-TT
64 A-CTTTAAATGATTTTATAGTCTTATAAATGATTTTAAATCAAA--ATTTTTTCATTT-TGAGTT
* * * * * *
207933 ATAACAGACCATAATTGAATGTTTACATCAGTAAATATGAAGCGA
125 AAAACATACCA-AATTGATTGTTTCCATCAGAAAATGTGAAGCGA
* * ** * *
207978 AAGCCATCCATTAACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCAC-CAATGTCTTCGAAAGCGTAGTTACTC
1 AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTC-AT-ACTTTTAAAGCCTAGTTGCTC
* * * ** ** *
208042 AATTTAAAT-AGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTCAAT-TGAATCTTTTAAATTTTTAGTTAA
64 ACTTTAAATGA-TTTTATAGTCTTATAAATGATTTTAAATCAAAAT-TTTTTCATTTTGAGTTAA
* * * * *
208105 AATATATCATAATTG-TTGTTTGCATCAGAAAAAGTGAAGCAA
127 AACATACCA-AATTGATTGTTTCCATCAGAAAATGTGAAGCGA
** * * * * *
208147 AAGTAATCTATTGACAAGAAAACTCTATTTATAGGCACTCATACTTTTAAAAGCCTAGTTACT-A
1 AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATACTTTT-AAAGCCTAGTTGCTCA
* * * * * *** * * *
208211 GCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATAATTCTCAATTTGAATGTTTCTCATTTTTG-GATGA
65 -CTTTAAATGATTTTATAGTCTTATAAATGATTTTAAATCAAAAT-TTTTTCA-TTTTGAGTTAA
* * * * * * * ** *
208275 AATAAATCATAATTTGA-TGTCTACATTAGGAAACATGAATCGA
127 AACATACCA-AA-TTGATTGTTTCCATCAGAAAATGTGAAGCGA
* * ** * * * * * * *
208318 AAGCTATCCATTGACAAGAGAAGTTTATTTATAGTCACTCATGCCTTCGT-ATGCGTTGTTACTA
1 AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAT-ACTT-TTAAAGCCTAGTTGCTC
* * ** *
208382 ACTTTAAGT-AGTTTTATA-ACTTTATAAATGATTTTAAAGT-AATTTTTTTTTCATTTTTAG-T
64 ACTTTAAATGA-TTTTATAGTC-TTATAAATGATTTTAAA-TCAA-AATTTTTTCATTTTGAGTT
* * * * ** *
208443 AAAATGATCATC-ATTTGA-TG-TTCGTATTGGGAAAA-GTGAAGTGA
125 AAAA-CAT-ACCAAATTGATTGTTTC-CA-TCAGAAAATGTGAAGCGA
** * * * * ** *
208487 AAGTAATCTATTGACAAGAAAAATTCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAACCTAGTTGCTCA
1 AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAT-ACTTTTAAAGCCTAGTTGCTCA
* * * ** * **
208552 CTTTAAAT-AGTTTTACAATCTTGTAAATGATTTTACGTTGAATTTGTTTTTCACTTTTG-GTTA
65 CTTTAAATGA-TTTTATAGTCTTATAAATGATTTTA-AATCAAAAT-TTTTTCA-TTTTGAGTTA
** * * * * * * *
208615 AAACATATAATAATTTACTATTTGCATTAGGAAATGTGAGGCGA
126 AAACATACCA-AATTGATTGTTTCCATCAGAAAATGTGAAGCGA
* * * * * * * * *
208659 AA-CCATCCATTAATAAGGAAAGTCCATTTATTA-TCATTCATGCCTTTGAAAGTCTAGTTACTT
1 AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTA-TAGTCACTCAT-ACTTTTAAAGCCTAGTTGCTC
* * * ** *
208722 GCTTTAAATG-GTTTATAGTCTTATAAATGAGTTTAAAAT-TGAATTTTACTCATTTTTG-GTTA
64 ACTTTAAATGATTTTATAGTCTTATAAATGA-TTTTAAATCAAAATTTT-TTCA-TTTTGAGTTA
* * ** * ** * *
208784 AAATAAATTATAATTTGA-TGTTGGT-AATGTG-GAATGTGAAGCCA
126 AAACATACCA-AA-TTGATTGTT--TCCATCAGAAAATGTGAAGCGA
* * * * * **
208828 AAGCAATCCACTGACAAGAAAAGTCGACTTATAGTCACTTATGTTTTTAATAGCCTAGTTGCTC-
1 AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATACTTTTAA-AGCCTAGTTGCTCA
* * * ** * ** *
208892 GTTTAAATAATTTTGTAAACTTATAAATGATTTTCAAT-TGAATTTCTTTCATTTTTAGTTAAAA
65 CTTTAAATGATTTTATAGTCTTATAAATGATTTTAAATCAAAATTT-TTTCATTTTGAGTTAAAA
* * ** * * * **
208956 TAGATTATAATTTG-TTCTTTGCATCAGGAAATGTGAAATGA
129 CATACCA-AA-TTGATTGTTTCCATCAGAAAATGTGAAGCGA
* * * * *
208997 CAA-CCATCCACTGACAAAAAAAGTCCATCTATAGTCACTTATACTTTTGAAAGCCTAAG-TACT
1 -AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATACTTTT-AAAGCCT-AGTTGCT
* * * *
209060 CACTGTAAAT-AGTTTTATAGTCTTATAAATGATTTTATATCAAAATTGTTTTTCATTTTCACTT
63 CACTTTAAATGA-TTTTATAGTCTTATAAATGATTTTAAATCAAAA-T-TTTTTCATTTTGAGTT
* * * * * ** ** * * *
209124 CAAATAGATCATAATTGAGTGTTGGCATTGGGAAACGTGAAGCAA
125 AAAACATACCA-AATTGATTGTTTCCATCAGAAAATGTGAAGCGA
* * * * ** * * * *
209169 AAACCATCCATTGACATGAAAAGTCAATTTATAGTCACTCATTCCTTCAAAAGTCTTA-CTACTT
1 AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCA-TACTTTTAAAG-CCTAGTTGCTC
* ** * * * **
209233 GCTTTAGGTGGTTTTATA-CCTTTATAAAAGATTTTAAAT-TGAATTCTTATTCATTTTTG-GTT
64 ACTTTAAATGATTTTATAGTC-TTATAAATGATTTTAAATCAAAATT-TT-TTCA-TTTTGAGTT
* * ** ** * * *
209295 GAAAA-AGATCATAATTTGA-TGTTTGTATGGGAAAACGAGAAGCAA
125 -AAAACATACCA-AA-TTGATTGTTTCCATCAGAAAATGTGAAGCGA
** * * * * * * ** ** *
209340 AAGTGATCCATTCATAA-AAAAGGTGCATTTGTAGTCATTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTAATG
1 AAGCCATCCATTGACAAGAAAA-GTCCATTTATAGTCACTCAT-ACTTTTAAAGCCTAGTTGCTC
* * * * * ** **
209404 GCTTTAAAT-AGTTCTAAAAT-TATATAAATGATTTTGAATTGATTTTGTTTTCAATTTTG-GTT
64 ACTTTAAATGA-TTTTATAGTCT-TATAAATGATTTTAAATCAAAATT-TTTTC-ATTTTGAGTT
* * * * **
209466 AAAATATATCATAATTG-TTGTTTGCATC-GAGAAACGTGAAATGA
125 AAAACATACCA-AATTGATTGTTTCCATCAGA-AAATGTGAAGCGA
* * * * * ** **
209510 AAGCTATCCATTGACAACAAAAATCTATTGATAGTCACTCATACCTTCGAAAGTATAGTTGCTCA
1 AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATA-CTTTTAAAGCCTAGTTGCTCA
* * * ** * ** * ** *
209575 CTTTCAGTGGTTTTATAACCTTATAAATGATTTCAAAT-TGAA-TCTCCCATTTTTTA-TTAAAA
65 CTTTAAATGATTTTATAGTCTTATAAATGATTTTAAATCAAAATTTTTTCA-TTTTGAGTTAAAA
** * ** * *
209637 CATATTATAATTTGA-TGTTTGCATCAGAAAACATAAAGCAA
129 CATACCA-AA-TTGATTGTTTCCATCAGAAAATGTGAAGCGA
** ** * * * ** *
209678 AAGCCATCTGTTGACAAGAAAAGTTTATTTATAGTTACTTATGCCTTAAAAAGCCTAGTTACTCA
1 AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAT-ACTTTTAAAGCCTAGTTGCTCA
* * * * * *** * *** * * **** * *
209743 CTTCAAATAGATCATAATTGGATGTTGGCATTGGAAAACGTGAAGCAAAAACCATCCATTGACAT
65 CTTTAAAT-GAT-TTTA-TAG-TCTTATAAAT-G--ATTTTAAATCAAAATTTTTTCATT---TT
* * ** *
209808 GAAAGAAATCTTATAAATGAGTTA--AAATTGAATT-TTTCTTACTTTTGGTTAAAATAGATCAT
120 G--AG-----TTA-AAA-CA--TACCAAATTG-ATTGTTTC---C-ATCAG--AAAAT-G-T--G
**
209870 AATTTG-
163 AA-GCGA
* ** ** * * * * *
209876 ATG-TTTGTATTGTGGAATCTAAAGCAAAAATAATCCATTAACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCA
1 AAGCCATCCA-T-T-G-A-C--AAG---AAA-AGTCCATT------TATAGT-CACTCATA--C-
* * * *
209940 TTTATGCCTTCGATAGCCTAATTGCTCA-TTTTAATTAGTTTTATAAG-CTTATAAATGATTTTC
45 --T-T---TT--AAAGCCTAGTTGCTCACTTTAAATGA-TTTTAT-AGTCTTATAAATGATTTT-
* * *** * * * * * * * **
210003 AATTGATTTTTTTTTCATGTTT-TG-TAAAACAAATCATAATTTG-TTATTTGCATAAGGAAACA
99 AAATCAAAATTTTTTCAT-TTTGAGTTAAAACATACCA-AA-TTGATTGTTTCCATCAGAAAATG
*
210065 TGAAGTGA
161 TGAAGCGA
* * * * * * * * * *
210073 AAGCTATCCATTGATAAGGAAAGTCTATTAATAGTCATTTATACTTTCAAAAGCTTAGTTACT-A
1 AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATACTTT-TAAAGCCTAGTTGCTCA
* * * * * * * * ** *
210137 GTTTTAAGTGGTCTTATA-CCTTTTAAAAGATTTTAAATTGAATTTTTTTTACATTTTTG-GTCA
65 -CTTTAAATGATTTTATAGTCTTATAAATGATTTTAAA-TCAAAATTTTTT-CA-TTTTGAGTTA
* * * ** * * *
210200 AAAAAGATCATAACTTGA-TGTTTGTATTAGGAAAA-GAGAAGCAA
126 AAACATACCA-AA-TTGATTGTTTCCATCA-GAAAATGTGAAGCGA
* * * * * * * * * * *
210244 AAGCGATCTATTGATAA-AAAAATCTATGTATAGTCACTCATGCCTTTAAAAGCTTAGTTGCCCT
1 AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAT-ACTTTTAAAGCCTAGTTGCTCA
* * * * ** * *
210308 CTTTAAATGGTTTCAAAAG-CTTATAAATGATTTTCAATTGAATTTTTTTCATTTTTAGTTAAAA
65 CTTTAAATGATTT-TATAGTCTTATAAATGATTTTAAATCAAAATTTTTTCATTTTGAGTTAAAA
* * ** * * * ** *
210372 TAGATTAAAATTG-TTGTTTGCATTAGGAAACATGAAGCAA
129 CATA-CCAAATTGATTGTTTCCATCAGAAAATGTGAAGCGA
* **** * * * * * *
210412 AAGCTATCCATTGACAAGAAAAAAATATTTATAGACACTAATACCTTT-GAGCACATGGTTACTC
1 AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATACTTTTAAAGC-C-TAGTTGCTC
* * * * * * *
210476 GCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAAAGATTTTCAAAT-TAAATATCTCTCATATTT-AGTTA
64 ACTTTAAATGATTTTATAGTCTTATAAATGATTTT-AAATCAAAAT-TTTTTCAT-TTTGAGTTA
* * ** *
210539 AAACATATCATAATTTGA-TGTTTACATCAGAAAACATGAAGCAA
126 AAACATACCA-AA-TTGATTGTTTCCATCAGAAAATGTGAAGCGA
* * * * * ** * * **
210583 AAACCATCTATTGATAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCATTAAAACCGAGTTGCTTGC
1 AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATACTTTTAAAGCCTAGTTGCTCAC
* * ** ** **
210648 TTTAAAT-AGTTTTATAATCTTATAAATAATTTTGAGTTGGATTTTTTTTCCATTTTTG-GTTAA
66 TTTAAATGA-TTTTATAGTCTTATAAATGATTTT-AAATCAAAATTTTTT-CA-TTTTGAGTTAA
* * * * * * *
210711 CATAGATCATAATTG-TTGTTTGCATTAGGAAAA-GTGAAGCAA
127 AACATACCA-AATTGATTGTTTCCATCA-GAAAATGTGAAGCGA
* * * * * **
210753 AAGCAATCCATTGACACG-AAAGTCCATTTATAGGCACTTATACTTTTGAAAGCCTAGTTACTTG
1 AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATACTTTT-AAAGCCTAGTTGCTCA
*** * * ** ** *
210817 CTTTAAATGGGCTTATAATCTTATAAATGATTTTCAAGT-TGAATGTTTCTT-ATTTTTTGTTGA
65 CTTTAAATGATTTTATAGTCTTATAAATGATTTT-AAATCAAAAT-TTT-TTCATTTTGAGTTAA
* * *** * *
210880 AACAAATCATAATTTGA-TGTTAGAATCA-AAATACGTGAAGCAA
127 AACATACCA-AA-TTGATTGTTTCCATCAGAAA-ATGTGAAGCGA
* * * * * ** *
210923 AATCTATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTC-CTTTATGCGTTCGAAAGCCTAGTTACTC
1 AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCAC-TCATAC-TTTTAAAGCCTAGTTGCTC
* * * * * * * * * *
210987 GCTTTCAATGGTTTTATAGTATTATAAATTATTTTCAATC-CATTTCTTTTTATCTCT-AGTTAA
64 ACTTTAAATGATTTTATAGTCTTATAAATGATTTTAAATCAAAATT-TTTTCAT-TTTGAGTTAA
* * * * * * * * *
211050 AACAGATCATAATTGAATG-TTGCATTAGGAAAGGTGATGTGA
127 AACATACCA-AATTGATTGTTTCCATCAGAAAATGTGAAGCGA
* ** *
211092 AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCA-TT-TA-T-ACTCATGCCTTAGAAAGCCAAGTTGCTCA
1 AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAT-ACTTTTAAAGCCTAGTTGCTCA
* * * * * *
211153 CTTTAAAT-AGTTTTATAATCTTATAAATTATTTTGAATTAAATTTTTTCTCATTTTTAGTTAAA
65 CTTTAAATGA-TTTTATAGTCTTATAAATGATTTTAAATCAAAATTTTT-TCATTTTGAGTTAAA
* * * * *
211217 ACATATCATAATTG-TTGTTTGCATCAGGAAATG-GTTAGAGA
128 ACATACCA-AATTGATTGTTTCCATCAGAAAATGTG-AAGCGA
* * * * * * * **
211258 AAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTGATAGCCACTAAGACCTTTGAAAGCCTAATAACTCA
1 AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATA-CTTTTAAAGCCTAGTTGCTCA
* * ** *
211323 CTTTAAATGGTTTTATCA-TCTTATAAATGATCTTAAAAT-TGAATTTTTCTCATTTTTAGTTAA
65 CTTTAAATGATTTTAT-AGTCTTATAAATGAT-TTTAAATCAAAATTTTT-TCATTTTGAGTTAA
* * * * **
211386 AACATATCATAATTGAATGCTTGCATCAGAAAACATGAAGCGA
127 AACATACCA-AATTGATTGTTTCCATCAGAAAATGTGAAGCGA
* * * * * ** * *
211429 AAGCCATCTATTGATAAAAAAAAGTCTATTTATAGTCACTGATACCTTCAAAAGCCTAGTTACTT
1 AAGCCATCCATTGA-CAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATA-CTTTTAAAGCCTAGTTGCTC
* * * * * *
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* * ** * * * **
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** * * *
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* * ** ** ** **
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** * * ** * ** *
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* * * * * * * * *
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* * * * *
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* *** * * ** ** * *
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* * * * * *
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* * * *** * *
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* ** * *
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* * * * * *
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* * * *
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* * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * **
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* * * * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * ** * * * *
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* * ** * ** *
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* * * * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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* * * *
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* * * * *
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* * ** * * *
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** * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * *
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* ** ** ** * *
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* * * * ***
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* *** * * * *
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* * * * *** *
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** * ** * * * *
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** * * *
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* * *
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* * * * *
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* * * *
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** * * ** * *
212587 TGTTTGCATTGGGAAACATAAAGTGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCCATTTATAGTCACT
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* * ** * * *
212652 CACGCCTTT-AAAAGCTTAGTTACTTACTTTGAATAGTTTTCT
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* * * * ** * * * * * *
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* * * * * **
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213165 TGATGCC-TTCAAAATCCTAATTACTTGCTTTAAATAGTTTTAG
128 TCATGCCTTTGAAAA-CCTAGTTACTCGCTTTAAATGGTTTTAT
* * * ** * * *
213208 AGT-TGTACAAATGATCTT-AAATCAAAAGGTTTT-TCATCTTTAGTTAGAACAGATCATAATTG
1 AATCT-TATAAATGATTTTCAAAT-TGAA-TTTTTCTCATTTTTAGTTAAAACAGATCATAATT-
* * ** * * * *
213270 GATGTTTACATCAGAAGATGTGAATCGAAAGCCATTCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCA
62 GATGTTTGCATCAGAAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCA
* * * ** * * *
213335 GTTATGCCTTCGAATGCCTAGTTACTCACTTCAAATGGTTTTAC
127 CTCATGCCTTTGAAAACCTAGTTACTCGCTTTAAATGGTTTTAT
* * * **
213379 AATCTTATAAATGATTTT-AAGTTGACTTTTT-T-AGTTTTT-GCTTAAAACATATTTTAATTTG
1 AATCTTATAAATGATTTTCAAATTGAATTTTTCTCA-TTTTTAG-TTAAAACAGATCATAA-TTG
* * * * *
213440 -TTTTTGCATCGGGAAACATGAAGCAAAAGCCATTCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCAC
63 ATGTTTGCATCAGAAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCAC
* ** * * *
213504 TCATGCC-TTCAAAGGGCTAGTTACTCACATAAAATGGTTTTAT
128 TCATGCCTTTGAAA-ACCTAGTTACTCGCTTTAAATGGTTTTAT
* * * * * * * * * *
213547 AGTCATATAGATGATTTT-GAATGGAAATGTTTT-TCATTTCTAGTTATAGCAAATCATAACTAG
1 AATCTTATAAATGATTTTCAAATTG-AAT-TTTTCTCATTTTTAGTTAAAACAGATCATAA-TTG
213610 ATGTTTGCAT
63 ATGTTTGCAT
213620 TTATAGTTCC
Statistics
Matches: 2836, Mismatches: 647, Indels: 305
0.75 0.17 0.08
Matches are distributed among these distances:
155 2 0.00
156 10 0.00
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158 3 0.00
159 3 0.00
160 2 0.00
163 3 0.00
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174 5 0.00
ACGTcount: A:0.35, C:0.13, G:0.13, T:0.38
Consensus pattern (170 bp):
AATCTTATAAATGATTTTCAAATTGAATTTTTCTCATTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTGATG
TTTGCATCAGAAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCA
TGCCTTTGAAAACCTAGTTACTCGCTTTAAATGGTTTTAT
Found at i:211329 original size:506 final size:506
Alignment explanation
Indices: 210327--211633 Score: 1295
Period size: 506 Copynumber: 2.6 Consensus size: 506
210317 GTTTCAAAAG
** * * * * * * * *
210327 CTTATAAATGAT-TTTCAATTGAATTTTTTTCATTTTTAGTTAAAATAGATTAAAATTG-TTGTT
1 CTTATAAATGATCTTAAAATTGAATGTTTCTCATTTTTAGTTAAAACAAATCATAATTGAATGCT
* * * * * * * *
210390 TGCATTAGGAAACATGAAGCAAAAGCTATCCATTGACAAGAAAAAA--ATATTTATAGACACTAA
66 TGAATCAGAAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGATAA-AAAAAAGTCTATTTATAGTCACTGA
** * * *
210453 TACCTT--TGAGCACATGGTTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAAAGATTTTCAAAT
130 TACCTTCAAAAGC-C-TAGTTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATATTATAAATGA-TTTC-AAT
* * * * * * * *
210516 TAAA--TATCTCTCATATTTAGTTAAAACATATCATAATTTG-ATGTTTACATCAGAAAAC-ATG
191 CAAATTTAT-TTTCATCTCTAGTTAAAACAAATCATAA-TTGAATGTTTGCATTAGGAAACGA-G
* * * * *
210577 AAGCAAAAACCATCTATTGATAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCATTAAAACCGAGTT
253 AAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCA-TT-TA-T-ACTCATGCCATTAAAACCAAGTT
** * ** * *
210642 GCTTGCTTTAAATAGTTTTATAATCTTATAAATAATTTTGAGTTGGATTTTTTTTCCATTTTTGG
314 GCTCACTTTAAATAGTTTTATAATCTTATAAATAATTTTGAATTAAATTTTTTCTCCATTTTTAG
* * * *
210707 TTAACATAGATCATAATTGTTGTTTGCATTAGGAAAAGTGAAGCAAAAGCAATCCATTGACACGA
379 TTAAAACAGATCATAATTGTTGTTTGCATCAGGAAAAGTGAAG-AAAAGCAATCCATTGACAAGA
* * * * * * * **
210772 AAGTCCATTTATAGGCACTTATACTTTTGAAAGCCTAGTTACTTGCTTTAAATGGGCTTATAAT
443 AAGTCCATTGATAGCCACTAAGACCTTTGAAAGCCTAATAACTCACTTTAAATGGGCTTATAAT
* * * * * *
210836 CTTATAAATGATTTTCAAGTTGAATGTTTCTTATTTTTTGTTGAAACAAATCATAATTTG-ATG-
1 CTTATAAATGATCTTAAAATTGAATGTTTCTCATTTTTAGTTAAAACAAATCATAA-TTGAATGC
* * * * *
210899 TTAGAATCA-AAATACGTGAAGCAAAATCTATCCATTGA-CAAGAAAAGTCTATTTATAGTC-CT
65 TT-GAATCAGAAA-ACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGATAAAAAAAAGTCTATTTATAGTCAC-
* * * * * * *
210961 TTATGCGTTCGAAAGCCTAGTTACTCGCTTTCAATGGTTTTATAGTATTATAAATTATTTTCAAT
127 TGATACCTTCAAAAGCCTAGTTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATATTATAAATGA-TTTCAAT
* * * * * * *
211026 C-CATTTCTTTTTATCTCTAGTTAAAACAGATCATAATTGAATG-TTGCATTAGGAAAGGTGATG
191 CAAATTTATTTTCATCTCTAGTTAAAACAAATCATAATTGAATGTTTGCATTAGGAAACGAGAAG
**
211089 TGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATACTCATGCC-TTAGAAAGCCAAGTTGCTCA
256 CAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATACTCATGCCATTA-AAA-CCAAGTTGCTCA
*
211153 CTTTAAATAGTTTTATAATCTTATAAATTATTTTGAATTAAATTTTTTCT-CATTTTTAGTTAAA
319 CTTTAAATAGTTTTATAATCTTATAAATAATTTTGAATTAAATTTTTTCTCCATTTTTAGTTAAA
* * * * *
211217 ACATATCATAATTGTTGTTTGCATCAGGAAATG-GTTAGAGAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAG
384 ACAGATCATAATTGTTGTTTGCATCAGGAAAAGTG-AAGA-AAAGCAATCCATTGACAAG-AAAG
** *
211281 TCCATTGATAGCCACTAAGACCTTTGAAAGCCTAATAACTCACTTTAAATGGTTTTATCAT
446 TCCATTGATAGCCACTAAGACCTTTGAAAGCCTAATAACTCACTTTAAATGGGCTTATAAT
* *
211342 CTTATAAATGATCTTAAAATTGAATTTTTCTCATTTTTAGTTAAAACATATCATAATTGAATGCT
1 CTTATAAATGATCTTAAAATTGAATGTTTCTCATTTTTAGTTAAAACAAATCATAATTGAATGCT
* * *
211407 TGCATCAGAAAACATGAAGCGAAAGCCATCTATTGATAAAAAAAAGTCTATTTATAGTCACTGAT
66 TGAATCAGAAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGATAAAAAAAAGTCTATTTATAGTCACTGAT
* * * *
211472 ACCTTCAAAAGCCTAGTTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATATATGATTTGAATCAAAA
131 ACCTTCAAAAGCCTAGTTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATATTATAAATGATTTCAATC-AAA
* * * *
211537 TTTATTTTCATTTCTTGTTAAAACAAATCATACTTGAATGTTTGCATTGGGAAACGAGAAGCAAA
195 TTTATTTTCATCTCTAGTTAAAACAAATCATAATTGAATGTTTGCATTAGGAAACGAGAAGCAAA
* *
211602 AGCCATCCTTTGACAAAAAAAGTCCATTTATA
260 AGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATA
211634 GTCACTCATA
Statistics
Matches: 647, Mismatches: 125, Indels: 52
0.79 0.15 0.06
Matches are distributed among these distances:
504 5 0.01
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512 1 0.00
513 3 0.00
ACGTcount: A:0.36, C:0.14, G:0.13, T:0.37
Consensus pattern (506 bp):
CTTATAAATGATCTTAAAATTGAATGTTTCTCATTTTTAGTTAAAACAAATCATAATTGAATGCT
TGAATCAGAAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGATAAAAAAAAGTCTATTTATAGTCACTGAT
ACCTTCAAAAGCCTAGTTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATATTATAAATGATTTCAATCAAAT
TTATTTTCATCTCTAGTTAAAACAAATCATAATTGAATGTTTGCATTAGGAAACGAGAAGCAAAA
GCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATACTCATGCCATTAAAACCAAGTTGCTCACTTTAAA
TAGTTTTATAATCTTATAAATAATTTTGAATTAAATTTTTTCTCCATTTTTAGTTAAAACAGATC
ATAATTGTTGTTTGCATCAGGAAAAGTGAAGAAAAGCAATCCATTGACAAGAAAGTCCATTGATA
GCCACTAAGACCTTTGAAAGCCTAATAACTCACTTTAAATGGGCTTATAAT
Found at i:211684 original size:22 final size:20
Alignment explanation
Indices: 211659--211701 Score: 59
Period size: 20 Copynumber: 2.0 Consensus size: 20
211649 GAAAACCTTG
211659 TTACTTGCTTGAAATGATTTTA
1 TTACTTGC-T-AAATGATTTTA
*
211681 TTACTTTCTAAATGATTTTA
1 TTACTTGCTAAATGATTTTA
211701 T
1 T
211702 ATTGAATTTT
Statistics
Matches: 20, Mismatches: 1, Indels: 2
0.87 0.04 0.09
Matches are distributed among these distances:
20 12 0.60
21 1 0.05
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ACGTcount: A:0.28, C:0.09, G:0.09, T:0.53
Consensus pattern (20 bp):
TTACTTGCTAAATGATTTTA
Found at i:213389 original size:514 final size:506
Alignment explanation
Indices: 210206--213509 Score: 1328
Period size: 514 Copynumber: 6.5 Consensus size: 506
210196 GTCAAAAAAG
* * * * * * * * *
210206 ATCATAACTT-GATGTTTGTATTAGGAAAAGAGAAGCAAAAGCGATCTATTGATAAAAAAATCTA
1 ATCATAA-TTAGATGTTTGCATCA-GAAATGTGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAAAAAATCCA
* * * * * * * * * * *
210270 TGTATAGTCACTCATGCCTTTAAAAGCTTAGTTGCCCTCTTTAAATGGTTTCAAAAGCTTATAAA
64 TTTATAGTCACTAATGCCTTCAAATGCCTAGTTACTCACTTTAAATGGTTTTACAATCTTATAAA
* * *** *
210335 TGATTTTCAATTGAA-TTTTTT-TCATTTTTAGTTAAA-ATAGATTA-AAATTGTTGTTTGCATT
129 TGATTTT-AATTGAATTTTTTTCTCATTTTTAGTTAAACA-A-ATCATAATTTGACCTTTGCATG
** * * **** * *
210396 AGGAAACATGAAG-CAAAAGCTATCCATTGACAAGAAAAAAATATTTATAGACACTAATACCTTT
191 AGGAAACACAAAGTC-AAAGCCATCCATTGACAACAAAAGTCCATTTATAGTCACTAAT-GC-TT
** * * * * * * * * * * * *
210460 G-AGCA-CATGGTTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAAAGATTTTCAAATTAAATAT
253 GCAAAAGCCTAGATACT-ACATTGAATAGTTTTCTAATCTTATAAATGATTTTAAAATTGAATTT
* * * * * ** * * * *
210523 CTCTCATATTTAGTTAAAACATATCATAATTTGATGTTTACATCAGAAAACATGAAGCAAAAACC
317 TTCTCATTTTTAGTTAAAAAATGT-ATAATTTGATGTTTGCATTGGGAAACATAAAGCGAAAGCC
* * * * * * * * *
210588 ATCTATTGATAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCATT-AAAA-CCGAGTTGCTTGCTTT
381 ATCCATTGACAAGAAAAATCCATTTATAGTCACTCACGCC-TTCAAAAGCCTAATTACTTACTTT
* * * * * * * *** ** * *
210651 AAATAGTTTTATAATCTTATAAATAATTTTGAGTTGGATTTTTTTTCCATTTTTGGTT-AACATA
445 AAATAGTTTTAGAGTCTCAAAAATAATCTTAAATCAAAAGTTTTAT-CA-TTTTAGTTAAACA-A
* * * * * ** *
210715 GATCATAATT-GTTGTTTGCATTAGGAAAAGTGAAGCAAAAGCAATCCATTGACACGAAAGTCCA
1 -ATCATAATTAGATGTTTGCATCA-GAAATGTGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAAAAAATCCA
* * * * * ** ** *
210779 TTTATAGGCACTTATACTTTTGAAA-GCCTAGTTACTTGCTTTAAATGGGCTTATAATCTTATAA
64 TTTATAGTCACTAATGC-CTTCAAATGCCTAGTTACTCACTTTAAATGGTTTTACAATCTTATAA
* * * ** * *
210843 ATGATTTTCAAGTTGAA--TGTTTCTTATTTTTTGTTGAAACAAATCATAATTTGATGTTAGAAT
128 ATGATTTT-AA-TTGAATTTTTTTCTCATTTTTAGTT-AAACAAATCATAATTTGACCTTTGCAT
* * * * * * * *
210906 CA--AAATACGTGAAG-CAAAATCTATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTC-CTTTATGC
190 GAGGAAACAC--AAAGTC-AAAGCCATCCATTGACAACAAAAGTCCATTTATAGTCAC-TAATGC
* * * * * * * * * * * **
210967 GTT-CGAAAGCCTAGTTACTCGCTTTCAATGGTTTTATAGTATTATAAATTATTTT-CAA-TCCA
251 -TTGCAAAAGCCTAGATACT-ACATTGAATAGTTTTCTAATCTTATAAATGATTTTAAAATTGAA
* * * * * * ** * * *
211029 TTTCTTTTTATCTCTAGTTAAAACAGAT-CATAA-TTGAATG-TTGCATTAGGAAAGGTGATGTG
314 TTT-TTCTCATTTTTAGTTAAAA-A-ATGTATAATTTG-ATGTTTGCATTGGGAAACATAAAGCG
* * *
211091 AAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCA-TT-TA-T-ACTCATGCCTT-AGAAAGCC-AAGTTGC
375 AAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCCATTTATAGTCACTCACGCCTTCA-AAAGCCTAA-TTAC
* * * * * * * * * ** *
211150 TCACTTTAAATAGTTTTATAATCTTATAAATTATTTTGAATTAAATTTTTTCTCATTTTTAGTTA
438 TTACTTTAAATAGTTTTAGAGTCTCAAAAATAATCTTAAATCAAAAGTTTTATCA-TTTTAGTT-
*
211215 AAACAT
501 AAACAA
* * * * *
211221 ATCATAATT-GTTGTTTGCATCAGGAAATG-GTTAGAGAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCC
1 ATCATAATTAGATGTTTGCATCA-GAAATGTG-AAGCGAAAGCCATCCATTGACAA-AAAAATCC
* * * * *
211284 ATTGATAGCCACTAA-GACCTTTGAAA-GCCTAATAACTCACTTTAAATGGTTTTATC-ATCTTA
63 ATTTATAGTCACTAATG-CC-TTCAAATGCCTAGTTACTCACTTTAAATGGTTTTA-CAATCTTA
* * *
211346 TAAATGATCTTAAAATTGAA--TTTTTCTCATTTTTAGTTAAAACATATCATAA-TTGA-ATGCT
125 TAAATGAT-TT-TAATTGAATTTTTTTCTCATTTTTAGTT-AAACAAATCATAATTTGACCT--T
* * ** * * * * *
211407 TGCATCAGAAAACATGAAG-CGAAAGCCATCTATTGATAAAAAAAAGTCTATTTATAGTCACTGA
185 TGCATGAGGAAACACAAAGTC-AAAGCCATCCATTGA-CAACAAAAGTCCATTTATAGTCACTAA
* * * * * * * * *
211471 TACCTT-CAAAAGCCTAGTTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATATATGATTTGAATCAA
248 T-GCTTGCAAAAGCCTAGATAC-TACATTGAATAGTTTTCTAATCTTATAAATGATTTTAA--AA
* * *
211535 ---AATTTATTTTCATTTCTT-GTTAAAACAAAT-CAT-ACTTGAATGTTTGCATTGGGAAACGA
309 TTGAATTT-TTCTCATTT-TTAGTT-AAA-AAATGTATAATTTG-ATGTTTGCATTGGGAAAC-A
* * * ** *
211594 -GAAGCAAAAGCCATCCTTTGACAA-AAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATACATTCGAAAA-CC
368 TAAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAA-TCCATTTATAGTCACTCACGCCTTC-AAAAGCC
** * * * * * * * * * ** ** *
211656 TTGTTACTTGCTTGAAAT-GATTTTATTACTTTC-TAAATGATTTTATATTGAATTTTATTTTCA
431 TAATTACTTACTTTAAATAG-TTTTA-GAGTCTCAAAAATAATCTTAAATCAAAAGTT-TTATCA
211719 TTTTATGTTAAA-AA
493 TTTTA-GTTAAACAA
* * * * ** * **
211733 TACCATAACTT-GATGTTTGTATCGTGGAACATGAAGTGAAAGTAATCCATTGACAAGAAAAATC
1 -ATCATAA-TTAGATGTTTGCATC-AGAAATGTGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAA-AAAAATC
* * * * ** *** * *
211797 CATTTATAGTCACTCATACCTTCAAAAGCATAGTTACTTGCTTTAAGCAGTTTTATAATCTCCAT
62 CATTTATAGTCACTAATGCCTTCAAATGCCTAGTTACTCACTTTAAATGGTTTTACAATCT-TAT
* * ** **
211862 -AATGATTTTCAAATTGAATTTTTCTT-TCAGTTTTGGTTAAA-AAGATCATGGTTTGATGTTTG
126 AAATGATTTT--AATTGAATTTTT-TTCTCATTTTTAGTTAAACAA-ATCATAATTTGACCTTTG
* * * * * * * * * * *
211924 TATCA-AAAAC-CATGAAATGAAAGCAATCGATTGACAAAAAAAGTCTATTTATAGTTACTCATA
187 CATGAGGAAACACA--AAGTCAAAGCCATCCATTGACAACAAAAGTCCATTTATAGTCACTAAT-
* * * * ** * * * **
211987 CCTT-CGAAAGCTTAGTTGTTCACTTTAAATAATTTTAC-AATCTTATAAATGA-TTTGCAATTG
249 GCTTGCAAAAGCCTAGATACT-ACATTGAATAGTTTT-CTAATCTTATAAATGATTTTAAAATTG
* * * ** * * * *
212049 AGTTCTTTTTCATTTTTTGTTAAAATTTATCATAA-TTGTTGTTTGCATTGGGAAACATGAAGTG
312 AATT-TTTCTCATTTTTAGTTAAAAAATGT-ATAATTTGATGTTTGCATTGGGAAACATAAAGCG
* * * * * * * ** * *
212113 AATGACATCCATTGACAGGAAAAGTCTATTGATAGTCACTCATG-CTTGTGAAGGCCTAGTTACT
375 AAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCCATTTATAGTCACTCACGCCTT-CAAAAGCCTAATTACT
* * * * * * * *
212177 CACTTTGAATGGTTTCATA-ATTGT-ACAAATGAT-TT---T------TTTTA--GTTTTAGTTA
439 TACTTTAAATAGTTT--TAGAGTCTCAAAAATAATCTTAAATCAAAAGTTTTATCATTTTAGTTA
212228 AA-AA
502 AACAA
* * * *
212232 TATCATAATTTGATGTTTGCATTAGAAAATAG-GAAGCAAAAGCCATCCATTGAAAAAAAAAATC
1 -ATCATAATTAGATGTTTGCATCAG-AAAT-GTGAAGCGAAAGCCATCCATTG-ACAAAAAAATC
* * * *
212296 CATTTATAGTCACTAATGCCTGCAAAGGCCTAGTTACTCACTTTGAATAGTTTT-CTAATCTTAT
62 CATTTATAGTCACTAATGCCTTCAAATGCCTAGTTACTCACTTTAAATGGTTTTAC-AATCTTAT
* * * ** * **
212360 AAATTATTTTAAAATTGAA-TTTTTTCTCATTTTTGGTTAAATATGTCATGATTTGATGTTTGCA
126 AAATGATTTT--AATTGAATTTTTTTCTCATTTTTAGTTAAACAAATCATAATTTGACCTTTGCA
* * * *
212424 TTAGGAAACATAAAGTGAAAGCCATCCATTGACAACAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCTTG
189 TGAGGAAACACAAAGTCAAAGCCATCCATTGACAACAAAAGTCCATTTATAGTCACTAATGCTTG
*
212489 CAAAAGCCTAGATACTCACATTGAATAGTTTTCTAATCTTATAAATTATTTTAAAATTGAATTTT
254 CAAAAGCCTAGATACT-ACATTGAATAGTTTTCTAATCTTATAAATGATTTTAAAATTGAATTTT
* * *
212554 TCTCATTTTTAGTTAAAATATGTCATAATTTTATGTTTGCATTGGGAAACATAAAGTGAAAGCCA
318 TCTCATTTTTAGTTAAAAAATGT-ATAATTTGATGTTTGCATTGGGAAACATAAAGCGAAAGCCA
* * * *
212619 TCCATTGACAAGAAAAATCCATTTATAGTCACTCACGCCTTTAAAAGCTTAGTTACTTACTTTGA
382 TCCATTGACAAGAAAAATCCATTTATAGTCACTCACGCCTTCAAAAGCCTAATTACTTACTTTAA
** * * * *
212684 ATAGTTTTCTAGTCTCAAAAATAATTTTAAATCAAAATTTTTATCATTTCTAATCAAAGCAA
447 ATAGTTTTAGAGTCTCAAAAATAATCTTAAATCAAAAGTTTTATCATTT-TAGTTAAA-CAA
** * * * * *
212746 ATCATAATTAGATGTTTGCATTGGGAAACGTGAAGCGAAAGCCATCCACTGCCAAAACAATTTCA
1 ATCATAATTAGATGTTTGCA-TCAGAAATGTGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAAA-AAATCCA
* * * *
212811 TTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAT-CCTTGTTACTCATTTTAAATGGTTTTATAA-CTTTATA
64 TTTATAGTCACTAATGCCTTC-AAATGCCTAGTTACTCACTTTAAATGGTTTTACAATC-TTATA
* *
212874 AATGATTTTGAATTGAATTTTTTTTTCATTTTTAATTTAAACAAATCATAATTTGACCTTTGCAT
127 AATGATTTT-AATTGAATTTTTTTCTCATTTTT-AGTTAAACAAATCATAATTTGACCTTTGCAT
* * *** *
212939 GAGGAAA-ACAAA-TCATAATTGCCATCTATTGACAATAGTTGTCCATTTATAGTCCCTAATGCT
190 GAGGAAACACAAAGTCA-AA--GCCATCCATTGACAACAAAAGTCCATTTATAGTCACTAATGC-
** *
213002 TTG-AAAAGCCTATTTACT-CATTGAAATAGTTTTAC-AATCTTATAAATGATTTTAAAACTTTA
251 TTGCAAAAGCCTAGATACTACATTG-AATAGTTTT-CTAATCTTATAAATGATTTTAAAA-TTGA
* * * * *
213064 TTTTTTGT-ATTTTT-GATTAAAACAAAATGT-TAA-TTGATGTTTGCTTTGGGGAACGTGAAA-
313 ATTTTTCTCATTTTTAG-TT--AA-AAAATGTATAATTTGATGTTTGCATTGGGAAACAT-AAAG
* * * * * * *
213124 CGAAAGCTATCCATTGATAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTGATGCCTTCAAAATCCTAATTAC
373 CGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCCATTTATAGTCACTCACGCCTTCAAAAGCCTAATTAC
* * * *
213189 TTGCTTTAAATAGTTTTAGAGT-TGTACAAATGATCTTAAATCAAAAGGTTTT-TCATCTTTAGT
438 TTACTTTAAATAGTTTTAGAGTCT-CAAAAATAATCTTAAATCAAAA-GTTTTATCAT-TTTAGT
*
213252 TAGAACAG
500 TA-AACAA
* * * * *
213260 ATCATAATTGGATGTTTACATCAGAAGATGTGAATCGAAAGCCATTCATTGACAAGAAAAGTCCA
1 ATCATAATTAGATGTTTGCATCAGAA-ATGTGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAA-AAAAATCCA
* * * *
213325 TTTATAGTCAGTTATGCCTTCGAATGCCTAGTTACTCACTTCAAATGGTTTTACAATCTTATAAA
64 TTTATAGTCACTAATGCCTTCAAATGCCTAGTTACTCACTTTAAATGGTTTTACAATCTTATAAA
* * ** **
213390 TGATTTTAAGTTG-A-CTTTTT-T-AGTTTTT-GCTTAAAACATATTTTAATTTG-TTTTTGCAT
129 TGATTTTAA-TTGAATTTTTTTCTCA-TTTTTAG-TT-AAACAAATCATAATTTGACCTTTGCAT
** * * *
213449 CG-GGAAACATGAAG-CAAAAGCCATTCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGC
190 -GAGGAAACACAAAGTC-AAAGCCATCCATTGACAACAAAAGTCCATTTATAGTCACTAATGC
213510 CTTCAAAGGG
Statistics
Matches: 2193, Mismatches: 440, Indels: 323
0.74 0.15 0.11
Matches are distributed among these distances:
497 7 0.00
498 150 0.07
499 227 0.10
500 14 0.01
502 2 0.00
503 3 0.00
504 5 0.00
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514 505 0.23
515 113 0.05
516 22 0.01
517 9 0.00
ACGTcount: A:0.35, C:0.14, G:0.13, T:0.38
Consensus pattern (506 bp):
ATCATAATTAGATGTTTGCATCAGAAATGTGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAAAAAATCCATT
TATAGTCACTAATGCCTTCAAATGCCTAGTTACTCACTTTAAATGGTTTTACAATCTTATAAATG
ATTTTAATTGAATTTTTTTCTCATTTTTAGTTAAACAAATCATAATTTGACCTTTGCATGAGGAA
ACACAAAGTCAAAGCCATCCATTGACAACAAAAGTCCATTTATAGTCACTAATGCTTGCAAAAGC
CTAGATACTACATTGAATAGTTTTCTAATCTTATAAATGATTTTAAAATTGAATTTTTCTCATTT
TTAGTTAAAAAATGTATAATTTGATGTTTGCATTGGGAAACATAAAGCGAAAGCCATCCATTGAC
AAGAAAAATCCATTTATAGTCACTCACGCCTTCAAAAGCCTAATTACTTACTTTAAATAGTTTTA
GAGTCTCAAAAATAATCTTAAATCAAAAGTTTTATCATTTTAGTTAAACAA
Found at i:215264 original size:171 final size:167
Alignment explanation
Indices: 214720--217727 Score: 599
Period size: 169 Copynumber: 17.8 Consensus size: 167
214710 TGGGAAATGT
* * * ** * ** * *
214720 GAAGCGAAAGCCATCCATTAATAAGAAAAATGAATTTATAGTCAATCACT-CCTTAGAAAGCCTT
1 GAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCTATTTATAGTCACTCA-TGCCTGCGAAAACCTA
* * * * * * ** *
214784 ATTACTCACTTTAAGTTGTTTTAT-ACCTTTATAAAAGATTTTAAATTGAATGCTTTTCATTTTT
65 ATCACTGACTTTAAATGGTTTTATAATC-TTATAAATGATTTTAAATTG-ATTTTTTTTATTTTT
* * * * * ** *
214848 TGTGAAAAAAGATCATAATTTGATGTTTGTATGGAGAAAGAA
128 GGTTAAAACAGATCATAATTT--TATTTGCATTCAGAAACAA
* ** * * * * * *
214890 GAATCAAAA-CTGTTCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATACCTTC-AAAAGCTA
1 GAAGCAAAAGC-CATCCATTGACAAGAAAAATCTATTTATAGTCACTCATGCCTGCGAAAACCTA
** * * * *
214953 ATTGCTTG-CTGTT-AACGGTTTTAAAATTTTATAAATGATTTT-AATTAAATTTTTTTTCATTT
65 ATCAC-TGACT-TTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATT-GATTTTTTTT-ATTT
* * * *
215015 TTGATTAAAATAGCTCATAATTTTGTTTGCATTCAGAAACAA
126 TTGGTTAAAACAGATCATAATTTTATTTGCATTCAGAAACAA
** * * * *
215057 GAAGTGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTTATGTCTGCGAAAACCTAC
1 GAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCTATTTATAGTCACTCATGCCTGCGAAAACCTAA
* * *
215122 TCATTGATTTTGAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAAATTGATTTTTTTTATTTTTTG
66 TCACTGACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTT-AAATTGATTTTTTTTA-TTTTTG
* *
215187 GTTAAAACATATCATAATTTGATATTTGCA-TCGGGAAACATA
129 GTTAAAACAGATCATAATTT--TATTTGCATTC-AGAAACA-A
* ** **
215229 G-AGCAAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAATCTATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGTCTAA
1 GAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCTATTTATAGTCACTCATGCCTGCGAAAACCTAA
* * * * * * *
215293 TTACTGGCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATATAGGATTTTAAGTTGAATTTTTTAATTTTTGGT
66 TCACTGACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATTGATTTTTTTTATTTTTGGT
* ** * * ***
215358 TACAGTAGATCGTAATTTGACTTTTGCATT-AGGAAATGT
131 TAAAACAGATCATAATTTTA--TTTGCATTCA-GAAACAA
* * * * * * **
215397 GAAGTAAAAGCCATTCACTGACAAAAAAAATCCATTTATAGTCACTCATTCCT-TTAAAAGCCTA
1 GAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCTATTTATAGTCACTCATGCCTGCGAAAA-CCTA
* * * * ** * * * * *
215461 GTTACTCA-TATGAAATATTTTTATAGTCCTAAAAATGATTTTAAATCAAAGTTTTTTTTTCATT
65 ATCACTGACT-TTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAAT---TGATTTTTTTT-ATT
* * * * ** * * * *
215525 TCTAGCTAAAACAAATCATAACTGGATGTTTGCACT-GGAAAACAT
125 TTTGGTTAAAACAGATCATAA-T-TTTATTTGCATTCAG-AAACAA
* * * * * * * * * * *
215570 TAAACAAAAGGC-TCTATTGGCAAGCAAAGTCCATTTATAGT---T-ATACTTTTC-AAAGACCT
1 GAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCTATTTATAGTCACTCATGC-CTGCGAAA-ACCT
* * * * * * * * * * *
215629 -GTTACTCATTTTTAGTGGTTTTCTTA-CTTCATAAATGATTTTGAATTAATTTTTTTAATTTTT
64 AATCACTGACTTTAAATGGTTTTATAATCTT-ATAAATGATTTTAAATTGATTTTTTTTATTTTT
* * * **
215692 GGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGTA-TCAATAAACGT
128 GGTTAAAACAGATCATAATTT--TATTTGCATTC-AGAAACAA
** ** * * * *** *
215734 GAAGTGAAAGCTGTCTC-TTTATAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATATATTCGAAAACC-A
1 GAAGCAAAAGCCATC-CATTGACAAGAAAAATCTATTTATAGTCACTCATGCCTGCGAAAACCTA
* * * * * *
215797 AGTTTCGCT--CTTTAAATTGTTCTATAATCTTATAAATGAGTTTAAATTGAATTGTTTTAATTT
65 A---TCACTGACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATTG-ATTTTTTTTATTT
** * * * **
215860 TTCATTAAAATAGATCATAATTATTTTTTTACA-TCGAGAAACGT
126 TTGGTTAAAACAGATCATAA-T-TTTATTTGCATTC-AGAAACAA
* * * * * * * * *
215904 GAAGCAAAAGCCATCCATTAACAA-AAGAAGTCTATCTATAGTTACTCTTGCCTTCTAAAGCCTT
1 GAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAA-AAATCTATTTATAGTCACTCATGCCTGCGAAAACCTA
* * * * *
215968 GTTACTCG-CTTTAAATGGTTTTATAAACTTACAAATGATTTTCAATTGAATTTTTTTTCATTTT
65 ATCACT-GACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATTG-ATTTTTTTT-ATTTT
* * * * *
216032 TGATTAAAACATG-TCTTAATTTGTTGTTTGCATT-GGAAA-ATGT
127 TGGTTAAAACA-GATCATAA-TT-TTATTTGCATTCAGAAACA--A
** * * * * * ** *
216075 GAAGTGAAAGTCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAAT-AGCTCATGCCTTTGAAAGCCTA
1 GAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCTATTTATAGTCA-CTCATGCCTGCGAAAACCTA
* * * * * *
216139 GTTACT-AGCTTTAAATGATTTTATATAT-TT-T---T-AATTCAAA---ATTTTTTTTCATTTC
65 ATCACTGA-CTTTAAATGGTTTTATA-ATCTTATAAATGATTTTAAATTGATTTTTTTT-ATTTT
* * * * * * * * **
216194 TAGTTCAAGCAAATTATAATTGGATGTTTGCA-TCGAGCAACGT
127 TGGTTAAAACAGATCATAATT--TTATTTGCATTC-AGAAACAA
* * * * ** * * **
216237 GAAGTGAAGTAG--ATCCACTAACAAGAAAAGGCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAATTCT
1 GAAG-CAA-AAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCTATTTATAGTCACTCATGCCTGCGAAAACCT
** * * * * * *
216300 TGTTACTCG-TTTTAAGTGATTTTATAA-CTTTATAAATAATTTTAAATTAATTTTTTTTATTTT
64 AATCACT-GACTTTAAATGGTTTTATAATC-TTATAAATGATTTTAAATTGATTTTTTTTATTTT
* * * ***
216363 TTGTTAAAATAGATCATAATTTGATGTTTGCA-TCGAGAAATGT
127 TGGTTAAAACAGATCATAATTT--TATTTGCATTC-AGAAACAA
*** * * ** * ** * * ** *
216406 GAAGTGTAAGTCATCTATCAACAATAATTATCCATTAATAGTCACTCATGCCTTAGAAAACCTAG
1 GAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCTATTTATAGTCACTCATGCCTGCGAAAACCTAA
* * * * * *
216471 TTACT--CGTTGAAATTGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAAATTGAATATTTCTCATTTTT
66 TCACTGAC-TTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTT-AAATTG-ATTTTTTTTATTTTT
* * * * * * * *
216534 TGTTAAAACAAAGT-GTTACTTGATGTTACATT-AGGAAACGTA
128 GGTTAAAACAGA-TCATAATTTTAT-TTGCATTCA-GAAAC-AA
* * * ** ** * *
216576 -AAGCGAAA-CTCATCGATTGATAAGAAAGGTAC-ATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCTT
1 GAAGCAAAAGC-CATCCATTGACAAGAAAAAT-CTATTTATAGTCACTCATGCCTGCGAAAACCT
* * * * * * * *
216638 AATTACTCATTTTAAATAGTTTTA-AAGTCATAAAAATGATTTTAAATTGAGATTTTTCTCATTT
64 AATCACTGACTTTAAATGGTTTTATAA-TCTTATAAATGATTTTAAATT--GATTTTTTTTATTT
* * * ** * ***
216702 TTGATGAAAACAAATCATAATTGGATTTTGTATT-ATGAAATGT
126 TTGGTTAAAACAGATCATAATTTTA-TTTGCATTCA-GAAACAA
* * * * * * **
216745 GAAGCAAAAACCATCTATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCTTTTC-AAAGTCTA
1 GAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCTATTTATAGTCACTCATGC-CTGCGAAAACCTA
* * * ** * *
216809 GT---T-ACTTTAAATGATTTTATAAT-TTGATAAATGATTTTAAGTCAATTTTTTTAACTTTTG
65 ATCACTGACTTTAAATGGTTTTATAATCTT-ATAAATGATTTTAAATTGATTTTTTTTATTTTTG
* * * * *
216869 TCTTAAAATAGAT-AGTAGTTTGGCT-TTTACATTGAG-AACATA
129 -GTTAAAACAGATCA-TAATTT---TATTTGCATTCAGAAACA-A
* ** * * * * ** * *
216911 G-AGCAAAAGTCATTTATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTTACTCATACCTTTGAAAGCCTAG
1 GAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCTATTTATAGTCACTCATGCCTGCGAAAACCTAA
* * * * * * * ** * * *
216975 TTAGTCA-TATGAAATAGTTTTATAGTCATATAAATGATTTTAAATCAAAATGTTTTTCATTTCT
66 TCACTGACT-TTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAAT--TGATTTTTTTTATTTTT
** * ** * **
217039 ATTTAAAACAAATCATAACTAGATGTTTGCA-TCAAGAAACGT
128 GGTTAAAACAGATCATAA-T-TTTATTTGCATTC-AGAAACAA
* * * * * * *
217081 TAGGCGAAAGCTATCCATTGACAAGAAAAGT-TCATTTATAGTTACTCATGCCTTC-AAAAGCCT
1 GAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCT-ATTTATAGTCACTCATGCCTGCGAAAA-CCT
* * * * * * * **
217144 TATTACTCACTTTAAGTAGTTTTATTA-CTTCATAAATAATTTTTTATTGAATTTTTTATTCATT
64 AATCACTGACTTTAAATGGTTTTATAATCTT-ATAAATGATTTTAAATTG-ATTTTTT-TT-ATT
* * * * * *
217208 TTTTGTT-AAAGAGATCGTAAGTTGATGTTTGCA-TCAGGAAACGTA
125 TTTGGTTAAAACAGATCATAA-TT-TTATTTGCATTCA-GAAAC-AA
* * * * * * * ** *
217253 -AAGCGAAAGCTATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTAAAGTCACTTATGCCTTTGAAAGCC-AA
1 GAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCTATTTATAGTCACTCATGCCTGCGAAAACCTAA
* * * * *
217316 GTTACACT--CTTTAAATTGTTTTATAATCTTATACATGATTTTAAGTTGGATTATTTTAAGTTT
66 --T-CACTGACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATT-GATTTTTTTTA-TTT
* * * * * ***
217379 TT-ATTAAAATAGACCATAATTATTTTTTGCATTGAGAAATGT
126 TTGGTTAAAACAGATCATAATT-TTATTTGCATTCAGAAACAA
* * * * * * * * * * * *
217421 GAAGTGAAAA-CCATTCATAGACAAGAGAAGTCCATCTATAGTCATTCATACCTTCTAAAGCCCT
1 GAAG-CAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCTATTTATAGTCACTCATGCCTGCGAAA-ACCT
* * * * * * * *
217485 -ATTATTTG-CTTTAAATGG-TTTATAAACTCATAATTCATTTTAGATTGGTTTTTTTTTTCATT
64 AATCA-CTGACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATT-G-ATTTTTTTT-ATT
* * * * *
217547 TTTAGTTCAAATAGATCATAATTTGTTATTTGCA-TCGGAAAACAT
125 TTTGGTTAAAACAGATCATAA-TT-TTATTTGCATTCAG-AAACAA
* * * *
217592 GAAACAAAAGCCATCCATTGACAAAAAAAATTTATTTATAGTCACTCATGCCTTC-AAAAGCCTA
1 GAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCTATTTATAGTCACTCATGCCTGCGAAAA-CCTA
* * * * * * ** *
217656 GTTACTCATTTTAACTAGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAGCTTGAATTTTTTTAATTTTTG
65 ATCACTGACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATTG-ATTTTTTTTATTTTTG
217721 GTTAAAA
129 GTTAAAA
217728 AAAATTGTAA
Statistics
Matches: 2092, Mismatches: 567, Indels: 358
0.69 0.19 0.12
Matches are distributed among these distances:
161 4 0.00
162 103 0.05
163 8 0.00
164 56 0.03
165 97 0.05
166 42 0.02
167 78 0.04
168 151 0.07
169 505 0.24
170 449 0.21
171 482 0.23
172 78 0.04
173 38 0.02
174 1 0.00
ACGTcount: A:0.35, C:0.13, G:0.13, T:0.39
Consensus pattern (167 bp):
GAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCTATTTATAGTCACTCATGCCTGCGAAAACCTAA
TCACTGACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATTGATTTTTTTTATTTTTGGT
TAAAACAGATCATAATTTTATTTGCATTCAGAAACAA
Found at i:215436 original size:169 final size:171
Alignment explanation
Indices: 214503--217727 Score: 655
Period size: 171 Copynumber: 19.1 Consensus size: 171
214493 TAGTTGCTCA
* * ** * * * ** *
214503 TTTTGGTTAAAATAGTTCATAATTTCTTGTTTGCTTTAGGAAACAT-GAAGTGAAAGCCATCCAT
1 TTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATATTTGCATCAGGAAACATAG-AGCAAAAGCCATCCAC
* * * * * * * * * **
214567 TAATAAAGAAAGTCTATTTATAGTCATTCATG-CTTTAGAAAGCCTAGTTGCTTGCTTTAAATAA
65 TGACAAAAAAAATCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTA-AAAGCCTAATTACTGGCTTTAAATGG
** * * * *
214631 TTTTATAGCCTTATAAATGATTTT--AATTCAAAATGTTTTTCAT
129 TTTTATAATCTTATAAAGGATTTTAAAATT-GATAT-TTTTTAAT
* * * * * * * ** ** * *
214674 TTTCGATTAAAACAAACCATAATTGGATGTTTACATTGGGAAATGT-GAAGCGAAAGCCATCCAT
1 TTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATATTTGCATCAGGAAACATAG-AGCAAAAGCCATCCAC
* * * ** * * ** * *
214738 TAATAAGAAAAATGAATTTATAGTCAATCACT-CC-TTAGAAAGCCTTATTACTCACTTTAAGTT
65 TGACAAAAAAAATCCATTTATAGTCACTCA-TGCCTTTA-AAAGCCTAATTACTGGCTTTAAATG
* * * *
214801 GTTTTAT-ACCTTTATAAAAGATTTT-AAATTGA-ATGCTTTTCAT
128 GTTTTATAATC-TTATAAAGGATTTTAAAATTGATAT-TTTTTAAT
* * * * * * * * **
214844 TTTTTGTGAAAAAAGATCATAATTTGATGTTTGTAT-GGAGAAAGA-AGAATCAAAA-CTGTTCC
1 TTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATATTTGCATCAG-GAAACATAG-AGCAAAAGC-CATCC
* * * * * * * * *
214906 ATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATACCTTCAAAAG-CTAATTGCTTGCTGTT-AAC
63 ACTGACAAAAAAAATCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTAAAAGCCTAATTACTGGCT-TTAAAT
* * * * * *
214969 GGTTTTAAAATTTTATAAATGATTTT--AATTAAATTTTTTTTCAT
127 GGTTTTATAATCTTATAAAGGATTTTAAAATT-GATATTTTTTAAT
* * * * **
215013 TTTTGATTAAAATAGCTCATAATTT--TGTTTGCATTCA-GAAACA-AGAAGTGAAAGCCATCCA
1 TTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATATTTGCA-TCAGGAAACATAG-AGCAAAAGCCATCCA
* * * * * * ** * * * ** *
215074 TTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTTATGTCTGCGAAAA-CCTACTCATTGATTTTGAATG
64 CTGACAAAAAAAATCCATTTATAGTCACTCATGCCT-TTAAAAGCCTAATTACTGGCTTTAAATG
* * *
215138 GTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAAATTGATTTTTTTTATT
128 GTTTTATAATCTTATAAAGGATTTTAAAATTGATATTTTTTAAT
* * *
215182 TTTTGGTTAAAACATATCATAATTTGATATTTGCATCGGGAAACATAGAGCAAAAGCCATCCATT
1 TTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATATTTGCATCAGGAAACATAGAGCAAAAGCCATCCACT
* * * * *
215247 GATAAGAAAAATCTATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGTCTAATTACTGGCTTTAAATGGTT
66 GACAAAAAAAATCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTAAAAGCCTAATTACTGGCTTTAAATGGTT
* *
215312 TTATAATCTTATATAGGATTTT-AAGTTGA-ATTTTTTAAT
131 TTATAATCTTATAAAGGATTTTAAAATTGATATTTTTTAAT
* ** * * ** * *
215351 TTTTGGTTACAGTAGATCGTAATTTGACT-TTTGCATTAGGAAATGT-GAAGTAAAAGCCATTCA
1 TTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGA-TATTTGCATCAGGAAACATAG-AGCAAAAGCCATCCA
* * *
215414 CTGACAAAAAAAATCCATTTATAGTCACTCATTCCTTTAAAAGCCTAGTTACT--CATATGAAAT
64 CTGACAAAAAAAATCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTAAAAGCCTAATTACTGGC-T-TTAAAT
** * * * * ** * * *
215477 ATTTTTATAGTCCTAAAAATGATTTTAAATCAAAGTTTTTTTTTCAT
127 GGTTTTATAATCTTATAAAGGATTTTAAA--ATTGATATTTTTTAAT
* * * * * * * * * * *
215524 TTCTAGCTAAAACAAATCATAACTGGATGTTTGCA-CTGGAAAACATTA-AACAAAAGGC-TCTA
1 TTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATATTTGCATCAGG-AAACA-TAGAGCAAAAGCCATCCA
* * ** * * * * * *** * *
215586 TTGGCAAGCAAAGTCCATTTATAGT---T-ATACTTTTCAAAGACCT-GTTACTCATTTTTAGTG
64 CTGACAAAAAAAATCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTAAAAG-CCTAATTACTGGCTTTAAATG
* * * * *
215646 GTTTTCTTA-CTTCATAAATGATTTT-GAATTAAT-TTTTTTAAT
128 GTTTTATAATCTT-ATAAAGGATTTTAAAATTGATATTTTTTAAT
* * ** * ** **
215688 TTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGTATCAATAAACGT-GAAGTGAAAGCTGTCTC-
1 TTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATATTTGCATCAGGAAACATAG-AGCAAAAGCCATC-CA
* * * * * * *** * * *
215751 TTTATAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATATATTCGAAAA-CC-AAGTTTC-GCTCTTTAAA
64 CTGACAAAAAAAATCCATTTATAGTCACTCATGCCTT-TAAAAGCCTAA-TTACTG-GCTTTAAA
* * * *
215813 TTGTTCTATAATCTTATAAATGAGTTT-AAATTGA-ATTGTTTTAAT
126 TGGTTTTATAATCTTATAAAGGATTTTAAAATTGATATT-TTTTAAT
** * * * * *
215858 TTTTCATTAAAATAGATCATAATTAT-TTTTTTACATC-GAGAAACGT-GAAGCAAAAGCCATCC
1 TTTTGGTTAAAACAGATCATAATT-TGATATTTGCATCAG-GAAACATAG-AGCAAAAGCCATCC
* * * * * * * * ** *
215920 ATTAACAAAAGAAGTCTATCTATAGTTACTCTTGCCTTCT-AAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAAT
63 ACTGACAAAAAAAATCCATTTATAGTCACTCATGCCTT-TAAAAGCCTAATTACTGGCTTTAAAT
* * * * * *
215984 GGTTTTATAAACTTACAAATGATTTT-CAATTGAATTTTTTTTCAT
127 GGTTTTATAATCTTATAAAGGATTTTAAAATTG-ATATTTTTTAAT
* * * * * * ** *
216029 TTTTGATTAAAACATG-TCTTAATTTGTTGTTTGCAT-TGGAAA-ATGTGAAGTGAAAGTCATCC
1 TTTTGGTTAAAACA-GATCATAATTTGATATTTGCATCAGGAAACAT-AG-AGCAAAAGCCATCC
* * * * * * * *
216091 ATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAAT-AGCTCATGCCTTTGAAAGCCTAGTTACTAGCTTTAAAT
63 ACTGACAAAAAAAATCCATTTATAGTCA-CTCATGCCTTTAAAAGCCTAATTACTGGCTTTAAAT
* * * *
216155 GATTTTATATAT-TT-T-TA--A-TTCAAAA-T--T-TTTTTTCAT
127 GGTTTTATA-ATCTTATAAAGGATTTTAAAATTGATATTTTTTAAT
* * * * * * * * * * * *
216191 TTCTAGTTCAAGCAAATTATAATTGGATGTTTGCATC-GAGCAACGT-GAAGTGAAGTAG--ATC
1 TTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATATTTGCATCAG-GAAACATAG-AG-CAA-AAGCCATC
* * ** ** ** ** * * *
216252 CACTAACAAGAAAAGGCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAATTCTTGTTACTCGTTTTAAGT
62 CACTGACAAAAAAAATCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTAAAAGCCTAATTACTGGCTTTAAAT
* ** * *
216317 GATTTTATAA-CTTTATAAATAATTTT-AAATTAAT-TTTTTTTAT
127 GGTTTTATAATC-TTATAAAGGATTTTAAAATTGATATTTTTTAAT
* * * ** *** * *
216360 TTTTTGTTAAAATAGATCATAATTTGATGTTTGCATC-GAGAAATGT-GAAGTGTAAGTCATCTA
1 TTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATATTTGCATCAG-GAAACATAG-AGCAAAAGCCATCCA
* * ** * * * * *
216423 -TCAACAATAATTATCCATTAATAGTCACTCATGCC-TTAGAAAACCTAGTTACTCG-TTGAAAT
64 CT-GACAAAAAAAATCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTA-AAAGCCTAATTACTGGCTTTAAAT
* * * *
216485 TGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAAATTGA-ATATTTCTCAT
127 GGTTTTATAATCTTATAAAGGATTTTAAAATTGATAT-TTTTTAAT
* * * * * * * * * * * *
216530 TTTTTGTTAAAACAAAGT-GTTACTTGAT-GTTACATTAGGAAACGTAAAGCGAAA-CTCATCGA
1 TTTTGGTTAAAACAGA-TCATAATTTGATATTTGCATCAGGAAACATAGAGCAAAAGC-CATCCA
* * * ** * * * *** *
216592 TTGATAAGAAAGGTACATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCTTAATTACTCATTTTAAATAG
64 CTGACAAAAAAAATCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTAAAAGCCTAATTACTGGCTTTAAATGG
* * * * *
216657 TTTTA-AAGTCATAAAAATGATTTT-AAATTGAGATTTTTCTCAT
129 TTTTATAA-TCTTATAAAGGATTTTAAAATTGATATTTTT-TAAT
* * * * * * * ** * * *
216700 TTTTGATGAAAACAAATCATAATTGGAT-TTTGTATTATGAAATGT-GAAGCAAAAACCATCTAT
1 TTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATATTTGCATCAGGAAACATAG-AGCAAAAGCCATCCAC
* * * * * * *
216763 TGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCTTTTCAAAGTCTAGTTA----CTTTAAATGAT
65 TGACAAAAAAAATCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTAAAAGCCTAATTACTGGCTTTAAATGGT
* * ** *
216824 TTTATAAT-TTGATAAATGATTTT-AAGTCAAT-TTTTTTAAC
130 TTTATAATCTT-ATAAAGGATTTTAAAATTGATATTTTTTAAT
* * * * * * * *
216864 TTTTGTCTTAAAATAGAT-AGTAGTTTGGCT-TTTACAT--TGAGAACATAGAGCAAAAGTCATT
1 TTTTG-GTTAAAACAGATCA-TAATTT-GATATTTGCATCAGGA-AACATAGAGCAAAAGCCATC
* * * * * * * * * *
216925 TATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTTACTCATACCTTTGAAAGCCTAGTTA--GTCATATGAA
62 CACTGACAAAAAAAATCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTAAAAGCCTAATTACTGGC-T-TTAA
* * * * ** * *
216988 ATAGTTTTATAGTCATATAAATGATTTT-AAATCAAAATGTTTTTCAT
125 ATGGTTTTATAATCTTATAAAGGATTTTAAAATTGATAT-TTTTTAAT
* ** * * * * * * * * *
217035 TTCTATTTAAAACAAATCATAACTAGATGTTTGCATCAAGAAACGTTAG-GCGAAAGCTATCCAT
1 TTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATATTTGCATCAGGAAAC-ATAGAGCAAAAGCCATCCAC
* * * * * * ** * *
217099 TGACAAGAAAAGTTCATTTATAGTTACTCATGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCACTTTAAGTAGT
65 TGACAAAAAAAATCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTAAAAGCCTAATTACTGGCTTTAAATGGT
* ** **
217164 TTTATTA-CTTCATAAATAATTTT-TTATTGA-ATTTTTTATTCAT
130 TTTATAATCTT-ATAAAGGATTTTAAAATTGATATTTTTTA---AT
* * * * * * * * * *
217207 TTTTTGTT-AAAGAGATCGTAAGTTGATGTTTGCATCAGGAAACGTAAAGCGAAAGCTATCCATT
1 TTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATATTTGCATCAGGAAACATAGAGCAAAAGCCATCCACT
* * * * * * *** *
217271 GATAAGAAAAGTCCATTTAAAGTCACTTATGCCTTTGAAAGCC-AAGTTACACTCTTTAAATTGT
66 GACAAAAAAAATCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTAAAAGCCTAA-TTACTGGCTTTAAATGGT
* * * *
217335 TTTATAATCTTATACATGATTTT-AAGTTGGAT-TATTTTAAGT
130 TTTATAATCTTATAAAGGATTTTAAAATT-GATATTTTTTAA-T
* * * * * ** * *
217377 TTTT-ATTAAAATAGACCATAA-TT-ATTTTTTGCAT-TGAGAAATGT-GAAGTGAAAA-CCATT
1 TTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGA-TATTTGCATCAG-GAAACATAG-AG-CAAAAGCCATC
* * * * * * * *
217436 CA-TAGACAAGAGAAGTCCATCTATAGTCATTCATACCTTCT-AAAGCCCT-ATTATTTGCTTTA
62 CACT-GACAAAAAAAATCCATTTATAGTCACTCATGCCTT-TAAAAG-CCTAATTACTGGCTTTA
* * *** * * * *
217498 AATGG-TTTATAAACTCATAATTCATTTT-AGATTGGTTTTTTTTTTCAT
124 AATGGTTTTATAATCTTATAAAGGATTTTAAAATT-G-ATATTTTTTAAT
* * * * *
217546 TTTTAGTTCAAATAGATCATAATTTGTTATTTGCATC-GGAAAACAT-GAAACAAAAGCCATCCA
1 TTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATATTTGCATCAGG-AAACATAG-AGCAAAAGCCATCCA
* ** * * *** * *
217609 TTGACAAAAAAAATTTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTACTCATTTTAACTAG
64 CTGACAAAAAAAATCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTAAAAGCCTAATTACTGGCTTTAAATGG
* **
217674 TTTTATAATCTTATAAATGATTTT-AGCTTGA-ATTTTTTTAAT
129 TTTTATAATCTTATAAAGGATTTTAAAATTGATA-TTTTTTAAT
217716 TTTTGGTTAAAA
1 TTTTGGTTAAAA
217728 AAAATTGTAA
Statistics
Matches: 2286, Mismatches: 602, Indels: 333
0.71 0.19 0.10
Matches are distributed among these distances:
161 1 0.00
162 104 0.05
163 8 0.00
164 60 0.03
165 104 0.05
166 43 0.02
167 71 0.03
168 137 0.06
169 551 0.24
170 482 0.21
171 596 0.26
172 86 0.04
173 42 0.02
174 1 0.00
ACGTcount: A:0.35, C:0.13, G:0.13, T:0.40
Consensus pattern (171 bp):
TTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATATTTGCATCAGGAAACATAGAGCAAAAGCCATCCACT
GACAAAAAAAATCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTAAAAGCCTAATTACTGGCTTTAAATGGTT
TTATAATCTTATAAAGGATTTTAAAATTGATATTTTTTAAT
Found at i:216698 original size:170 final size:169
Alignment explanation
Indices: 216257--217801 Score: 687
Period size: 170 Copynumber: 9.1 Consensus size: 169
216247 AGATCCACTA
* * * * *
216257 ACAAGAAAAGGCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAATTCTT-GTTACTCGTTTTAAGT-GAT
1 ACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAA-GCTTAGTTACTCATTTTAAATAG-T
* * * * * * * * *
216320 TTTATAA-CTTTATAAATAATTTTAAATT-AATTTTTTTTATTTTTTGTTAAAATAGATCATAAT
64 TTTATAATC-ATATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTCTCATTTTTTGTTAAAACAAATCGTTAC
* * * * * * * **
216383 TTGATGTTTGCA-TCGAGAAATGTGAAGTGTAAGTCATCTATCA
128 TTGATG-TTGCATTAG-GAAACGTAAAGCGAAACTCATCCATTG
* * * * * * * * *
216426 ACAATAATTA-TCCATTAATAGTCACTCATGCCTTAGAAAACCTAGTTACTC-GTTGAAATTGTT
1 ACAAGAA-AAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCTTAGTTACTCATTTTAAATAGTT
* *
216489 TTATAATCTTATAAATGATTTTAAAATTGAATATTTCTCATTTTTTGTTAAAACAAAGT-GTTAC
65 TTATAATCATATAAATGATTTT-AAATTGAATTTTTCTCATTTTTTGTTAAAACAAA-TCGTTAC
* *
216553 TTGATGTTACATTAGGAAACGTAAAGCGAAACTCATCGATTG
128 TTGATGTTGCATTAGGAAACGTAAAGCGAAACTCATCCATTG
* * * *
216595 ATAAGAAAGGTACATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCTTAATTACTCATTTTAAATAGTTT
1 ACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCTTAGTTACTCATTTTAAATAGTTT
* * * *
216660 TA-AAGTCATAAAAATGATTTTAAATTGAGATTTTTCTCA-TTTTTGATGAAAACAAATC-ATAA
66 TATAA-TCATATAAATGATTTTAAATTGA-ATTTTTCTCATTTTTTG-TTAAAACAAATCGTTAC
* * * * * * *
216722 TTGGATTTTGTATTATGAAATGTGAAGCAAAAAC-CATCTATTG
128 TT-GATGTTGCATTAGGAAACGTAAAGC-GAAACTCATCCATTG
* *
216765 ACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCTTTTCAAAG-TCTAGTTA--C--TTTAAAT-GAT
1 ACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCT-TAGTTACTCATTTTAAATAG-T
* * * * * * * * * *
216824 TTTATAAT-TTGATAAATGATTTT-AAGTCAATTTTTTTAACTTTTGTCTTAAAATAGATAG-TA
64 TTTATAATCAT-ATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTCTCA-TTTTTTGTTAAAACAAATCGTTA
* * * * * * * * **
216886 GTTTGGCTTTTACATT--GAGAACATAGAGCAAAAGTCATTTATTG
127 -CTT-GATGTTGCATTAGGA-AACGTAAAGCGAAACTCATCCATTG
* * * * * *
216930 ACAAGAAAAGTCCATTTATAGTTACTCATACCTTTGAAAGCCTAGTTAGTCATATGAAATAGTTT
1 ACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCTTAGTTACTCATTTTAAATAGTTT
* ** * * *
216995 TATAGTCATATAAATGATTTTAAATCAAAATGTTTT-TCATTTCTAT-TTAAAACAAATCATAAC
66 TATAATCATATAAATGATTTTAAAT-TGAAT-TTTTCTCATTT-TTTGTTAAAACAAATCGTTAC
* * * * *
217058 TAGATGTTTGCATCAAGAAACGTTAGGCGAAAGCT-ATCCATTG
128 TTGATG-TTGCATTAGGAAACGTAAAGCGAAA-CTCATCCATTG
* * ** * *
217101 ACAAGAAAAGTTCATTTATAGTTACTCATGCCTTCAAAAGCCTTA-TTACTCACTTTAAGTAGTT
1 ACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAG-CTTAGTTACTCATTTTAAATAGTT
* * * ** * * * *
217165 TTATTA-CTTCATAAATAATTTTTTATTGAATTTTTTATTCATTTTTTGTT-AAAGAGATCGTAA
65 TTATAATCAT-ATAAATGATTTTAAATTGAA-TTTTT-CTCATTTTTTGTTAAAACAAATCGTTA
* *
217228 GTTGATGTTTGCATCAGGAAACGTAAAGCGAAAGCT-ATCCATTG
127 CTTGATG-TTGCATTAGGAAACGTAAAGCGAAA-CTCATCCATTG
* * * ** * *
217272 ATAAGAAAAGTCCATTTAAAGTCACTTATGCCTTTGAAAGCCAAGTTACAC-TCTTTAAATTGTT
1 ACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCTTAGTTACTCAT-TTTAAATAGTT
* * * * * * * * **
217336 TTATAATCTTATACATGATTTTAAGTTGGATTATTT-TAAGTTTTTATTAAAATAGACCATAATT
65 TTATAATCATATAAATGATTTTAAATTGAATT-TTTCTCATTTTTTGTTAAAACA-A--ATCGTT
* * * * * *
217400 A-TT--TTTTGCATT-GAGAAATGTGAAGTGAAAAC-CATTCATAG
126 ACTTGATGTTGCATTAG-GAAACGTAAAGCG-AAACTCATCCATTG
* * * * * * *** *
217441 ACAAGAGAAGTCCATCTATAGTCATTCATACCTTCT-AAAGCCCTA-TTATTTGCTTTAAAT-GG
1 ACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTT-TGAAAG-CTTAGTTACTCATTTTAAATAGT
* * * * ** * * * * * * *
217503 TTTATAAAC-TCATAATTCATTTTAGATTGGTTTTTTTTTTCATTTTTAGTTCAAATAGATCATA
64 TTTATAATCAT-ATAAATGATTTTAAATT-G-AATTTTTCTCATTTTTTGTTAAAACAAATCGTT
* * * *
217567 ATTTGTTAT-TTGCA-TCGGAAAACATGAAA-CAAAAGC-CATCCATTG
126 ACTTG--ATGTTGCATTAGG-AAACGT-AAAGCGAAA-CTCATCCATTG
* * ** ** * *
217612 ACAAAAAAAATTTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTACTCATTTTAACTAGTTT
1 ACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCTTAGTTACTCATTTTAAATAGTTT
* ** * * * * * * *
217677 TATAATCTTATAAATGATTTTAGCTTGAATTTTTTTAATTTTTGGTTAAAAAAAATTGTAATTTG
66 TATAATCATATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTCTCATTTTTTGTTAAAACAAATCGTTACTTG
* ** * **
217742 TTGTTTGCATCGGGAAATGTAAAGCGAAAGACATCCATTG
131 ATG-TTGCATTAGGAAACGTAAAGCGAAACTCATCCATTG
* *
217782 ATAAGAAAAGTCTATTTATA
1 ACAAGAAAAGTCCATTTATA
217802 ATAGATCATA
Statistics
Matches: 1038, Mismatches: 254, Indels: 167
0.71 0.17 0.11
Matches are distributed among these distances:
164 14 0.01
165 72 0.07
166 39 0.04
167 9 0.01
168 54 0.05
169 237 0.23
170 282 0.27
171 277 0.27
172 49 0.05
173 5 0.00
ACGTcount: A:0.35, C:0.12, G:0.13, T:0.39
Consensus pattern (169 bp):
ACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCTTAGTTACTCATTTTAAATAGTTT
TATAATCATATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTCTCATTTTTTGTTAAAACAAATCGTTACTTG
ATGTTGCATTAGGAAACGTAAAGCGAAACTCATCCATTG
Found at i:219440 original size:170 final size:169
Alignment explanation
Indices: 219189--219618 Score: 449
Period size: 170 Copynumber: 2.5 Consensus size: 169
219179 GCATCCAGCG
* * * * *
219189 ACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTGATGCCTTCGAAA-GCTTAGCTGCTTGCTTTAAAAGGTT
1 ACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCA-TGATG-CTTTGAAAGGCTT-GTTACTCGCTTTAAATGGTT
* * * **
219253 TTATAATCTTATAAATGATTTGAAA-CTAAAATCTTTTTTGTTTCGAGTTAAAACTTATCATGAT
63 TTATAAACTTATAAATGATTTGAAATC-AAAATCTTTTTTATTTCGAGTTAAAACATATCACAAT
* * * * *
219317 T-AGATGTTAGCATTC-A-AAAAGTGAAGCGAAAGCTATCCATTT
127 TCA-ATATTAGCA-TCGAGAAAAGTAAAGCGAAAGCCACCCATTA
* * *
219359 ACAAGAAAAGTCCATTTGTAGTCATTGATGCATTTGAAAGGCTTGTTACTCGTTTTAAGTGGTTT
1 ACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCA-TGATGC-TTTGAAAGGCTTGTTACTCGCTTTAAATGGTTT
* * **
219424 TATAAACTTGTAAATGATTTTAAATCAAAATCTTTTTTATTTTTAGTTAAAACATATCACAATTC
64 TATAAACTTATAAATGATTTGAAATCAAAATCTTTTTTATTTCGAGTTAAAACATATCACAATTC
** *
219489 AATATTTTCATCGAGAAATGTAAAGCGAAAGCCACCCATTA
129 AATATTAGCATCGAGAAAAGTAAAGCGAAAGCCACCCATTA
* * * * *
219530 ATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACGCATGCTTTCGAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGGTTT
1 ACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCATG-ATGCTTT-GAAAGGCTTGTTACTCGCTTTAAATGGTTT
219595 TATAATA-TTATAAATGATTTGAAA
64 TATAA-ACTTATAAATGATTTGAAA
219619 AAAGAATATT
Statistics
Matches: 215, Mismatches: 36, Indels: 17
0.80 0.13 0.06
Matches are distributed among these distances:
169 3 0.01
170 113 0.53
171 98 0.46
172 1 0.00
ACGTcount: A:0.36, C:0.14, G:0.14, T:0.37
Consensus pattern (169 bp):
ACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCATGATGCTTTGAAAGGCTTGTTACTCGCTTTAAATGGTTTTA
TAAACTTATAAATGATTTGAAATCAAAATCTTTTTTATTTCGAGTTAAAACATATCACAATTCAA
TATTAGCATCGAGAAAAGTAAAGCGAAAGCCACCCATTA
Found at i:219597 original size:171 final size:167
Alignment explanation
Indices: 218785--220173 Score: 621
Period size: 171 Copynumber: 8.2 Consensus size: 167
218775 TTGAAACCTC
* * ** * * * *
218785 TTTCTTTTTTAGTTAAAACATATCATAATTGGATGTTTGCATTGGAAAACATGAAGTGAAAGCAA
1 TTTCATTTTTAGTTAAAACATATCATAATT-AATGTTTGCATCAGAAAA-GTAAAGCGAAAGCTA
* * * * **
218850 TCCATTGATAAAAAAAGTCCATTTATAGTTA-GTCATGCCTTTTAAAGCCTTA-TTACTCGCTTT
64 TCCATTAACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACG--ATGCCTTCGAAAGCC-TAGTTACTCGCTTT
* *
218913 AAATGATTTTA-AAGTCTTATAAATGATTTGAAATCAAAATCA-T
126 AAATGGTTTTATAA-ACTTATAAATGATTTGAAA-CAAAAT-ATT
* * * * ** * * *
218956 TTTCATTTTTGGTTATAATCA-ATCATACTTAGATGTTAGCATTGGGAAATGTGAAA-CGGATGC
1 TTTCATTTTTAGTTA-AAACATATCATAATTA-ATGTTTGCA-TCAGAAAAGT-AAAGCGAAAGC
* ** * * * ** * **
219019 CATCCATGGACAAGAAAA-T---TTTATAGTCACTCATGCCATGGAAAGTTTTA-TAACTTACTT
62 TATCCATTAACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCAC-GATGCCTTCGAAAG-CCTAGTTACTCGCTT
* * *
219079 TAAATGGTTTTATAATCTTATAAAAGATTTTAAATC-AAA-A-T
125 TAAATGGTTTTATAAACTTATAAATGATTTGAAA-CAAAATATT
* * * * * * **
219120 CTT--TTTTTA-TTAAAACATATTATAATTGGATGTTTGCATTAAGAAATA-TGAAGTGTCTAGC
1 TTTCATTTTTAGTTAAAACATATCATAATT-AATGTTTGCA-TCAGAAA-AGTAAAGCG-AAAGC
*** * * * *
219181 -ATCCAGCGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTGATGCCTTCGAAAGCTTAGCTGCTTGCTTT
62 TATCCATTAACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCAC-GATGCCTTCGAAAGCCTAGTTACTCGCTTT
* * *
219245 AAAAGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTGAAACTAAAATCTT
126 AAATGGTTTTATAAACTTATAAATGATTTGAAAC-AAAATATT
** ** * * * *
219288 TTTTGTTTCGAGTTAAAACTTATCATGATTAGATGTTAGCATTCA-AAAAGTGAAGCGAAAGCTA
1 TTTCATTTTTAGTTAAAACATATCATAATTA-ATGTTTGCA-TCAGAAAAGTAAAGCGAAAGCTA
* * * * * * * *
219352 TCCATTTACAAGAAAAGTCCATTTGTAGTCATTGATGCATTTGAAAGGCTTGTTACTCGTTTTAA
64 TCCATTAACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCA-CGATGCCTTCGAAAGCCTAGTTACTCGCTTTAA
* * * *
219417 GTGGTTTTATAAACTTGTAAATGATTTTAAATCAAAATCTT
128 ATGGTTTTATAAACTTATAAATGATTTGAAA-CAAAATATT
* * * * * *
219458 TTTTATTTTTAGTTAAAACATATCACAATTCAATATTTTCATCGAGAAATGTAAAGCGAAAGCCA
1 TTTCATTTTTAGTTAAAACATATCATAATT-AATGTTTGCATC-AGAAAAGTAAAGCGAAAGCTA
* * * *
219523 CCCATTAATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACGCATGCTTTCGAAAGCCTAGTTACTCACTTTAA
64 TCCATTAACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACG-ATGCCTTCGAAAGCCTAGTTACTCGCTTTAA
*
219588 ATGGTTTTATAATA-TTATAAATGATTTGAAAAAAGAATATT
128 ATGGTTTTATAA-ACTTATAAATGATTTGAAACAA-AATATT
* ** * * *
219629 TTTCATTTTTCAG-CAAAGTAGATCATAATTTAATGTTTGCATCAAGAAACGTGAAAG-AAAAGC
1 TTTCATTTTT-AGTTAAAACATATCATAA-TTAATGTTTGCATC-AGAAAAGT-AAAGCGAAAGC
* * * * * *
219692 TATCCATTAACAAGAAAAGTCCATTTATAATCACTAATACCTTCGAAAGCCTTGTTATTTGCTTT
62 TATCCATTAACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCAC-GATGCCTTCGAAAGCCTAGTTACTCGCTTT
* * * * * * *
219757 CAATGGTTCTATATATCTTAAAAATAGATTTTAAATCGAACTATT
126 AAATGGTTTTATA-AACTTATAAAT-GATTTGAAA-CAAAATATT
* * * * * * ** * * * *
219802 TTTCATTTTTGGGTAAAATAGATCGTAGTTAGATGTTTGCATTGGGAAACGTGAAGCTAAAGTTA
1 TTTCATTTTTAGTTAAAACATATCATAATTA-ATGTTTGCA-TCAGAAAAGTAAAGCGAAAGCTA
* * * * * ** * **
219867 TCCATTGACAAGAAAAGTACATTTATAATCACTTATCCCTTTAAAAGCCTTGCCACTC-CTATTA
64 TCCATTAACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCAC-GATGCCTTCGAAAGCCTAGTTACTCGCT-TTA
* * * * * *
219931 AATGATTTTATAATCTTATAAATAATTTTAAATTGAAAA-CTT
127 AATGGTTTTATAAACTTATAAATGATTTGAAA--CAAAATATT
* * * *
219973 TTTCATTTTTCA-TTAAAATCGAT-TACAT--TTAGATGCTTGCATTAAGAAACA-TGAAGCAAA
1 TTTCATTTTT-AGTTAAAA-C-ATAT-CATAATTA-ATGTTTGCA-TCAGAAA-AGTAAAGCGAA
* * * * ** * * * *
220033 AG-TCATTCGTTAACAAGAAAAGTGCATTTATAGTCACTTAAACTTTTGAAAGCCTTGTTACTCA
59 AGCT-ATCCATTAACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCAC-GATGCCTTCGAAAGCCTAGTTACTCG
* * * * * *
220097 TTTTAAATGGTATTATAATCTTATAAACGATTTTAAATTAAAATTATT
122 CTTTAAATGGTTTTATAAACTTATAAATGATTTGAAA-CAAAA-TATT
* * *
220145 GTT-GTTTTTGGTTAAAATCA-ATCATAATT
1 TTTCATTTTTAGTTAAAA-CATATCATAATT
220174 GATACATTGA
Statistics
Matches: 947, Mismatches: 208, Indels: 126
0.74 0.16 0.10
Matches are distributed among these distances:
160 6 0.01
161 41 0.04
162 8 0.01
164 8 0.01
165 60 0.06
166 6 0.01
167 58 0.06
168 5 0.01
169 9 0.01
170 141 0.15
171 427 0.45
172 57 0.06
173 119 0.13
174 2 0.00
ACGTcount: A:0.36, C:0.13, G:0.13, T:0.37
Consensus pattern (167 bp):
TTTCATTTTTAGTTAAAACATATCATAATTAATGTTTGCATCAGAAAAGTAAAGCGAAAGCTATC
CATTAACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACGATGCCTTCGAAAGCCTAGTTACTCGCTTTAAATG
GTTTTATAAACTTATAAATGATTTGAAACAAAATATT
Found at i:219872 original size:173 final size:170
Alignment explanation
Indices: 219073--220134 Score: 637
Period size: 171 Copynumber: 6.2 Consensus size: 170
219063 GTTTTATAAC
* *
219073 TTACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAA-AGATTTTAAATCA-AA-A-TCTT--TTTTT-ATT
1 TTACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATAGATTTTAAAT-AGAATATTTTTCATTTTTCAGT
* * * * * ** **** * ***
219131 AAAACATATTATAATTGGATGTTTGCATTAAGAAATATGAAGTGTCTAG-CATCCAGCGACAAGA
65 AAAATAGATCATATTTAGATGTTTGCATTAAGAAACGTGAAG-CAAAAGTTATCCATTAACAAGA
* * * **
219195 AAAGTCCATTTATAGTCACTGATGCCTTCGAAAG-CTTAGCTGC
129 AAAGTCCATTTATAATCACTAATACCTTCGAAAGCCTT-G-TTA
* * * * * *
219238 TTGCTTTAAAAGGTTTTATAATCTTATAAAT-GATTTGAAACTAAAATCTTTTT--TGTTTCGAG
1 TTACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATAGATTTTAAA-TAGAATATTTTTCATTTTTC-AG
* * * * *
219300 TTAAAACT-TATCATGA-TTAGATGTTAGCATTCAA-AAA-GTGAAGCGAAAGCTATCCATTTAC
64 -TAAAA-TAGATCAT-ATTTAGATGTTTGCATT-AAGAAACGTGAAGCAAAAGTTATCCATTAAC
* * * * * * * *
219361 AAGAAAAGTCCATTTGTAGTCATTGATGCATTTGAAAGGCTTGTTA
125 AAGAAAAGTCCATTTATAATCACTAATACCTTCGAAAGCCTTGTTA
* * * * * * *
219407 CT-CGTTTTAAGTGGTTTTATAAACTTGTAAAT-GATTTTAAATCAAAATCTTTTTTATTTTT-A
1 TTAC--TTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATAGATTTTAAAT-AGAATATTTTTCATTTTTCA
* * * * * * ** * * * ** * *
219469 GTTAAAACATATCACAATTCA-ATATTTTCATCGAGAAATGTAAAGCGAAAGCCACCCATTAATA
63 G-TAAAATAGATCA-TATTTAGATGTTTGCATTAAGAAACGTGAAGCAAAAGTTATCCATTAACA
* ** * * *
219533 AGAAAAGTCCATTTATAGTCACGCATGCTTTCGAAAGCCTAGTTA
126 AGAAAAGTCCATTTATAATCACTAATACCTTCGAAAGCCTTGTTA
* * * *
219578 CTCACTTTAAATGGTTTTATAATATTATAAAT-GATTTGAAAAAAGAATATTTTTCATTTTTCAG
1 -TTACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATAGATTT-TAAATAGAATATTTTTCATTTTTCAG
* * * *
219642 CAAAGTAGATCATAATTTA-ATGTTTGCATCAAGAAACGTGAAAG-AAAAGCTATCCATTAACAA
64 TAAAATAGATCAT-ATTTAGATGTTTGCATTAAGAAACGTG-AAGCAAAAGTTATCCATTAACAA
219705 GAAAAGTCCATTTATAATCACTAATACCTTCGAAAGCCTTGTTA
127 GAAAAGTCCATTTATAATCACTAATACCTTCGAAAGCCTTGTTA
* * * * * **
219749 TTTGCTTTCAATGGTTCTATATATCTTAAAAATAGATTTTAAATCGAACTATTTTTCATTTTTGG
1 -TTACTTTAAATGGTTTTATA-ATCTTATAAATAGATTTTAAATAGAA-TATTTTTCATTTTTCA
* * ** * *
219814 GTAAAATAGATCGTAGTTAGATGTTTGCATTGGGAAACGTGAAGCTAAAGTTATCCATTGACAAG
63 GTAAAATAGATCATATTTAGATGTTTGCATTAAGAAACGTGAAGCAAAAGTTATCCATTAACAAG
* * * ** **
219879 AAAAGTACATTTATAATCACTTATCCCTTTAAAAGCCTTGCCA
128 AAAAGTCCATTTATAATCACTAATACCTTCGAAAGCCTTGTTA
* * * * * *
219922 CTCCTATTAAATGATTTTATAATCTTATAAATA-ATTTTAAATTGAAAACTTTTTCATTTTTCAT
1 TTACT-TTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATAGATTTTAAATAGAATA-TTTTTCATTTTTCAG
* * * * * * * *
219986 TAAAATCGATTACATTTAGATGCTTGCATTAAGAAACATGAAGCAAAAGTCATTCGTTAACAAGA
64 TAAAATAGATCATATTTAGATGTTTGCATTAAGAAACGTGAAGCAAAAGTTATCCATTAACAAGA
* * * *
220051 AAAGTGCATTTATAGTCACTTAA-ACTTTTGAAAGCCTTGTTA
129 AAAGTCCATTTATAATCAC-TAATACCTTCGAAAGCCTTGTTA
* * * *
220093 CTCATTTTAAATGGTATTATAATCTTATAAA-CGATTTTAAAT
1 -TTACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATAGATTTTAAAT
220135 TAAAATTATT
Statistics
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0.76 0.17 0.08
Matches are distributed among these distances:
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166 3 0.00
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ACGTcount: A:0.37, C:0.13, G:0.13, T:0.37
Consensus pattern (170 bp):
TTACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATAGATTTTAAATAGAATATTTTTCATTTTTCAGTA
AAATAGATCATATTTAGATGTTTGCATTAAGAAACGTGAAGCAAAAGTTATCCATTAACAAGAAA
AGTCCATTTATAATCACTAATACCTTCGAAAGCCTTGTTA
Found at i:220312 original size:138 final size:138
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Period size: 138 Copynumber: 1.8 Consensus size: 138
220037 ATTCGTTAAC
** * *
220047 AAGAAAAGTGCATTTATAGTCACTTAAACTTTTGAAAGCCTTGTTACTCATTTTAAATGGTATTA
1 AAGAAAAGTGCATTTATAGTCACTTAAACCATTGAAAGCCTTGTTACTCACTTTAAATAGTATTA
* *
220112 TAATCTTATAAACGATTTTAAATTAAAATTATTGTTGTTTTTGGTTAAAATCAATCATAATTGAT
66 AAATCTTATAAACGATTTTAAATCAAAATTATTGTTGTTTTTGGTTAAAATCAATCATAATTGAT
220177 ACATTGAT
131 ACATTGAT
* * ** * *
220185 AAGAAAATTTCATTTATAGTCACTTATGCCATTGAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAATAGTTTTA
1 AAGAAAAGTGCATTTATAGTCACTTAAACCATTGAAAGCCTTGTTACTCACTTTAAATAGTATTA
**
220250 AAATCTTATAAATTATTTTAAATCAAAACCTT-TT-TTGTTTTTGGTTAAAAT
66 AAATCTTATAAACGATTTTAAATCAAAA--TTATTGTTGTTTTTGGTTAAAAT
220301 TGATTGTAAT
Statistics
Matches: 100, Mismatches: 14, Indels: 4
0.85 0.12 0.03
Matches are distributed among these distances:
138 96 0.96
139 2 0.02
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ACGTcount: A:0.36, C:0.11, G:0.11, T:0.43
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AAGAAAAGTGCATTTATAGTCACTTAAACCATTGAAAGCCTTGTTACTCACTTTAAATAGTATTA
AAATCTTATAAACGATTTTAAATCAAAATTATTGTTGTTTTTGGTTAAAATCAATCATAATTGAT
ACATTGAT
Found at i:220441 original size:309 final size:308
Alignment explanation
Indices: 219869--220442 Score: 681
Period size: 309 Copynumber: 1.9 Consensus size: 308
219859 TAAAGTTATC
*
219869 CATTGACAAGAAAAGTACATTTATAATCACTTATCCCTTTAAAAGCCTTGCCACTCCTATTAAAT
1 CATTGACAAGAAAAGTACATTTATAATCACTTATCCCATTAAAAGCCTTGCCACTCCTATTAAAT
* *
219934 GATTTTATAATCTTATAAATAATTTTAAATTGAAAACTTTTTCATTTTTCATTAAAATCGATTAC
66 GATTTTAAAATCTTATAAATAATTTTAAATTCAAAACTTTTTCATTTTTCATTAAAATCGATTAC
* * * *
219999 ATTTAGATGCTTGCATTAAGAAACATGAAGCAAAAGTCATTCGTTAACAAGAAAAGTGCATTTAT
131 AATTAGATGCTTGCATTAAGAAACATGAACCAAAAGTCATCCATTAACAAGAAAAGTGCATTTAT
* *
220064 AGTCACTTAAACTTTTGAAAGCCTTGTTACTCATTTTAAATGGTATTATAATCTTATAAACGATT
196 AGTCACTTAAACTTTCGAAAGCCTTGTTACTCA-TTTAAATGGTATTATAATCTTATAAACAATT
220129 TTAAATTAAAATTATTGTTGTTTTTGGTTAAAATCAATCATAATTGATA
260 TTAAATTAAAATTATTGTTGTTTTTGGTTAAAATCAATCATAATTGATA
* * * * * * **
220178 CATTGATAAGAAAATTTCATTTATAGTCACTTATGCCATTGAAAGCCTTGTTACTCGCT-TTAAA
1 CATTGACAAGAAAAGTACATTTATAATCACTTATCCCATTAAAAGCCTTGCCACTC-CTATTAAA
* ** ** *
220242 T-AGTTTTAAAATCTTATAAATTATTTTAAA-TCAAAACCTTTTTTGTTTTTGGTTAAAATTGAT
65 TGA-TTTTAAAATCTTATAAATAATTTTAAATTCAAAA-CTTTTTCATTTTTCATTAAAATCGAT
** * * * * * * ** *
220305 TGTAATTGGATGTTTGCATT-GGAAAACATGAACCGAATGTGATCCATTAAGTAGAAAAGTTCAT
128 TACAATTAGATGCTTGCATTAAG-AAACATGAACCAAAAGTCATCCATTAACAAGAAAAGTGCAT
** * * * *
220369 TTATAGTCACTTATGCTTTCGGAGGCCTTGTTACTTGCA-TTAAGTGGTTTTATAATCTTATAAA
192 TTATAGTCACTTAAACTTTCGAAAGCCTTGTTAC-T-CATTTAAATGGTATTATAATCTTATAAA
*
220433 TAATTTTAAA
255 CAATTTTAAA
220443 CTGAAATCTT
Statistics
Matches: 218, Mismatches: 41, Indels: 12
0.80 0.15 0.04
Matches are distributed among these distances:
308 7 0.03
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ACGTcount: A:0.36, C:0.12, G:0.12, T:0.40
Consensus pattern (308 bp):
CATTGACAAGAAAAGTACATTTATAATCACTTATCCCATTAAAAGCCTTGCCACTCCTATTAAAT
GATTTTAAAATCTTATAAATAATTTTAAATTCAAAACTTTTTCATTTTTCATTAAAATCGATTAC
AATTAGATGCTTGCATTAAGAAACATGAACCAAAAGTCATCCATTAACAAGAAAAGTGCATTTAT
AGTCACTTAAACTTTCGAAAGCCTTGTTACTCATTTAAATGGTATTATAATCTTATAAACAATTT
TAAATTAAAATTATTGTTGTTTTTGGTTAAAATCAATCATAATTGATA
Found at i:222624 original size:171 final size:170
Alignment explanation
Indices: 222255--222643 Score: 399
Period size: 171 Copynumber: 2.3 Consensus size: 170
222245 GTTATCAGTC
* ** * ** * *
222255 AGCGAAAGCCATCCATTCATAAGAAAAGTTTATTATAATCACTCATATCTTCGAAAGCTTAGTTA
1 AGCGAAAGCCATACATTCATAAGAAAAGTCCATTATAGTCACTCATGCCATCGAAAGCCTAGTTA
* * * * * * *
222320 CTCACAATAAATGGTGCTATAATCTTATAAATGATTTTACATCGAACTTATTTTCATTTTTGGTT
66 CTCACAATAAATAGTGCTAAAATCTTATAAATGATTATAAATCAAAATTATTTTCATGTTTGGTT
* * * *
222385 AAAACATATCATAATTGGATGTTTGCATTGGGAAATATAG
131 AAAACAAATCATAACTGGATGTTTGCATAGAGAAATATAG
* ** * * *
222425 AGCGGAAGTAATACAATGATATGAAAAGTCCACTTATAGTCACTCATGCCATCGAAAGCCTAGTT
1 AGCGAAAGCCATACATTCATAAGAAAAGTCCA-TTATAGTCACTCATGCCATCGAAAGCCTAGTT
** ** *
222490 ACTCACTTTAAATAGTTTTAAAATCTTTTAAATGATTATAAATCAAAATCT-TTTTCATGTTTGG
65 ACTCACAATAAATAGTGCTAAAATCTTATAAATGATTATAAATCAAAAT-TATTTTCATGTTTGG
*
222554 TTTAAACAAATCATAACTGGATGTTTGCAATAGAAGAAATGA-AG
129 TTAAAACAAATCATAACTGGATGTTTGC-ATAG-AGAAAT-ATAG
* *
222598 -G-GAAAGCCATTCATTCATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCAATCATG
1 AGCGAAAGCCATACATTCATAAGAAAAGTCCA-TTATAGTCACTCATG
222644 TCTTTGAAAA
Statistics
Matches: 174, Mismatches: 40, Indels: 9
0.78 0.18 0.04
Matches are distributed among these distances:
170 23 0.13
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174 1 0.01
ACGTcount: A:0.38, C:0.14, G:0.14, T:0.34
Consensus pattern (170 bp):
AGCGAAAGCCATACATTCATAAGAAAAGTCCATTATAGTCACTCATGCCATCGAAAGCCTAGTTA
CTCACAATAAATAGTGCTAAAATCTTATAAATGATTATAAATCAAAATTATTTTCATGTTTGGTT
AAAACAAATCATAACTGGATGTTTGCATAGAGAAATATAG
Found at i:223808 original size:170 final size:171
Alignment explanation
Indices: 223561--224207 Score: 605
Period size: 170 Copynumber: 3.8 Consensus size: 171
223551 AAGTCGTCCT
* * ** * * * *
223561 TTGACAATAAAAGTCCATTTATAGTCACTTTTGCCTTTAAAAGTCTTGTCG-CTCCCTTTAAATG
1 TTGACAAGAAAAATCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGT-GACTCACTTTAAATG
*
223625 GTTTTATAATCTTATAAATGATTTTGAATCAAAATATTTTTTATTTTTGGTTAAAATCA-ATCAT
65 GTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATCAAAATATTTTTTATTTTTGGTTAAAATCAGATCAT
* * *
223689 AATTGGATGTTTGTATTGGGAAACATGAAACTGATGCCACTTA
130 AATTGGATGTTTGCATTGGGAAACATGAAACGGA-GCCACTCA
* * *
223732 TTGACAAGAAAAATCCATTTATAGTCA-TCATGCCATCAAAAGTCTAGAGACTCACTTTAAATGG
1 TTGACAAGAAAAATCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTGACTCACTTTAAATGG
* * * * * * *
223796 TTTTAAAATCTTATAATTGATTTTAAATTAAAATCTTTTTAAGTTTTAGTTAAAAT-AGATCATA
66 TTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATCAAAATATTTTTTATTTTTGGTTAAAATCAGATCATA
** * *
223860 ATTGGACATTTGCA-TGGAGAAACAT-AAAGCGGAGGCACCCA
131 ATTGGATGTTTGCATTGG-GAAACATGAAA-CGGAGCCACTCA
* * * * ** * *
223901 TTAACAAG-AAAATAACATTTATAGTCATTCAAGCCTTCGGAAGCCCTA-TTACTCACTGTAAAT
1 TTGACAAGAAAAAT-CCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAG-CCTAGTGACTCACTTTAAAT
* * * * * *
223964 GATTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATCGAAATCTTTTTCATTTTTGGGTAAAA-CATATCA
64 GGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATCAAAATATTTTTTATTTTTGGTTAAAATCAGATCA
* * **
224028 TAATTGAATGTTTACATCAGGAAACATGAAACGGCAGCCA-TCCA
129 TAATTGGATGTTTGCATTGGGAAACATGAAACGG-AGCCACT-CA
* * * ** * * * * *
224072 TTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTTACTCATACCTTTGAAAGCCTTGTCATTCAATTTAAGTGG
1 TTGACAAGAAAAATCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTGACTCACTTTAAATGG
* * * * * *
224137 TTTTATAATATAATAAATTATTTTAAATCAAAATATTTTTTGTTTTTGATTAAAAT-TGATCATA
66 TTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATCAAAATATTTTTTATTTTTGGTTAAAATCAGATCATA
224201 ATTGGAT
131 ATTGGAT
224208 ATTAACATCG
Statistics
Matches: 381, Mismatches: 80, Indels: 30
0.78 0.16 0.06
Matches are distributed among these distances:
168 5 0.01
169 32 0.08
170 204 0.54
171 136 0.36
172 4 0.01
ACGTcount: A:0.36, C:0.13, G:0.13, T:0.38
Consensus pattern (171 bp):
TTGACAAGAAAAATCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTGACTCACTTTAAATGG
TTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATCAAAATATTTTTTATTTTTGGTTAAAATCAGATCATA
ATTGGATGTTTGCATTGGGAAACATGAAACGGAGCCACTCA
Found at i:224031 original size:340 final size:339
Alignment explanation
Indices: 223564--225631 Score: 1461
Period size: 340 Copynumber: 6.1 Consensus size: 339
223554 TCGTCCTTTG
* ** ** * * * * * * *
223564 ACAATAAAAGTCCATTTATAGTCACTTTTGCCTTTAAAAGTCTTGTCGCTCCCTTTAAATGGTTT
1 ACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCCTATCACTCACTGTAAATGATTT
* * *
223629 TATAATCTTATAAATGATTTTGAATCAAAATATTTTTTATTTTTGGTTAAAATCA-ATCATAATT
66 TATAATCTTATAAATGATTTTAAATCGAAATATTTTTCATTTTTGGTTAAAA-CAGATCATAATT
* * * *
223693 GGATGTTTGTATTGGGAAACATGAAACTGATGCCA-CTTATTGACAAGAAAAATCCATTTATAGT
130 GGATGTTTGCATTAGGAAACATGAAACTGATGCCATC-CATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGT
* ** *
223757 CA-TCATGCCATCAAAAGTCTAGAGACTCACTTTAAATGGTTTTAAAATCTTATAATTGATTTTA
194 CACTCATGCCATCAAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGGTTTTAAAATCTTATAATTCATTTTA
* * **
223821 AATTAAAATCTTTTTAAGTTTTAGTTAAAATAGATCATAATTGGACATTTGCATGGAGAAACATA
259 AATCAAAATCTTTTT-AGTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTGGATGTTTGCATGGAGAAACATA
* *
223886 AAGCGGAGGCACCCATTA
323 AAG-GGAGCCATCCATTA
* * * * *
223904 ACAAGAAAA-TAACATTTATAGTCATTCAAGCCTTCGGAAGCCCTATTACTCACTGTAAATGATT
1 ACAAGAAAAGT-CCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCCTATCACTCACTGTAAATGATT
* * *
223968 TTATAATCTTATAAATGATTTTAAATCGAAATCTTTTTCATTTTTGGGTAAAACATATCATAATT
65 TTATAATCTTATAAATGATTTTAAATCGAAATATTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATT
* * * *
224033 GAATGTTTACATCAGGAAACATGAAACGGCA-GCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGT
130 GGATGTTTGCATTAGGAAACATGAAACTG-ATGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGT
* * * ** * * * * * * * *
224097 TACTCATACCTTTGAAAGCCTTGTCATTCAATTTAAGTGGTTTTATAATATAATAAATT-ATTTT
194 CACTCATGCCATCAAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGGTTTTAAAATCTTAT-AATTCATTTT
* * * ** * **
224161 AAATCAAAATATTTTTTGTTTTTGATTAAAATTGATCATAATTGGATATTAACATCGG-GAAA-A
258 AAATCAAAATCTTTTTAGTTTTAG-TTAAAACAGATCATAATTGGATGTTTGCAT-GGAGAAACA
* * ** *
224224 GTGAAGTGGATGCTATTGATTG
321 -TAAAG-GGA-GCCATCCATTA
* * * *
224246 ATAAGAAAATTCCATCTATAATCACTCATG-CTATCGAAAG------CA-T-A--GT---T-A--
1 ACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCT-TCGAAAGCCCTATCACTCACTGTAAATGATT
* * * * ** * * ** *
224294 CT-T-GT-TT-TAAATGATTTTAAATGGAAATCTTTTTTGTTTTAGTTTAAAATTGATCATAGTT
65 TTATAATCTTATAAATGATTTTAAATCGAAATATTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATT
* * * *
224355 GGATGTTTGCA-TCGAGAAACTTGAAACGGAAGCCATCCATTGACAAG--AAGTCCATTTATAGT
130 GGATGTTTGCATTAG-GAAACATGAAACTGATGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGT
* * * ** * ** * *
224417 CACTAATGGCTTTGAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGCTTTT-ATTTCTTATAAATGATTTTA
194 CACTCATGCCATCAAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGGTTTTAAAATCTTATAATTCATTTTA
* * * * * *
224481 AACCGAAATAGTTTTT-GTTCTTCA-TTAAAACAGATTATAATTGGATGTTTGCATTGAAAAACA
259 AATCAAAAT-CTTTTTAGTT-TT-AGTTAAAACAGATCATAATTGGATGTTTGCATGGAGAAACA
* * *
224544 TGAAGGGAAAACCATCCATTG
321 TAAAGGG--AGCCATCCATTA
* * * * * * * * *
224565 ACAAGAAAAGTTCATTTATAGCCACTTAAGCCTTCCAAAG-CCTAGTTATTAACTTTAAAT-ACT
1 ACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCCTA-TCACTCACTGTAAATGA-T
* * * * *
224628 TTTATAATCTTATAAATGGTTTTAAA-CTAAA-ATATTTTCACTTTT-CTCTAAAATAGATCATA
64 TTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATCGAAATAT-TTTTCATTTTTGGT-TAAAACAGATCATA
* * * *
224690 ATTAGATGTTTGCATTA-GAAA-ATGTTAAGCTGATGCCATCCATTAACAAGAAAAGTCTATTTA
127 ATTGGATGTTTGCATTAGGAAACATG--AAACTGATGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTA
* * * ** *
224753 TAGTCATTCATATTATACCATCAAAAGCCTAGTGACTTGCTTTAAATAGTTTTAAAATCTTATAA
190 TAGTCA--C---TCATGCCATCAAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGGTTTTAAAATCTTATAA
* * * * *
224818 TTCATTTTAAATCAAAATCTTTTTCATTTTTAGTTAAAATAGGTCATAATTTGATGTTTTGCATT
250 TTCATTTTAAATCAAAATCTTTTT-AGTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTGGATG-TTTGCATG
** * *
224883 GAGAAATGTGAATGGAAGCCATCCATTGA
313 GAGAAACAT-AAAGGGAGCCATCCATT-A
* * * * ** * *
224912 A-AGGAAAAGTCCATTTATTGTGACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATCACTCTTTTTAAATGGTTT
1 ACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCCTATCACTCACTGTAAATGATTT
* * *
224976 TGTAATCTTATAAATGGTTTTAAATCGAAATATTTTTCATTTTTAGTTAAAATC-GATCATAATT
66 TATAATCTTATAAATGATTTTAAATCGAAATATTTTTCATTTTTGGTTAAAA-CAGATCATAATT
* ** * * *
225040 GGATGTTTGCATTAGGAAACTTGAAGTTGATGCCATCCATTGACAAGTAAAGTCTAGTTATAGTC
130 GGATGTTTGCATTAGGAAACATGAAACTGATGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTC
* ** * **
225105 ACCCATGCCATCAAAAGCCTAGTTAC-CTGTTTTAAATAGTTTTAACCTCTTATAATTCATTTTA
195 ACTCATGCCATCAAAAGCCTAGTTACTC-ACTTTAAATGGTTTTAAAATCTTATAATTCATTTTA
* * * ** *
225169 AATAAAAATCTTTTTAGTTTT-TTGTGAAACAGATCATAATTGGATGTTTGCATCAAGAAACGTA
259 AATCAAAATCTTTTTAGTTTTAGT-TAAAACAGATCATAATTGGATGTTTGCATGGAGAAACATA
**
225233 AATTGAAAGCCATCCATTA
323 AA--GGGAGCCATCCATTA
* * * * ** ** * * *
225252 ACAAGAAAAGT-TATTTATATTCACTCATGCCTTTGAAAACATTGCCATTTACT-TCAAATAATT
1 ACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCCTATCACTCACTGT-AAATGATT
* ** * *
225315 TTATAATCTTATAAATGATTTTAAATTGAAATATTTTTTGTTTTTGGTTAAAACACATAATAATT
65 TTATAATCTTATAAATGATTTTAAATCGAAATATTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATT
* * * * * * *
225380 GGATGTTTCCATTAGGAAACAAGAAGCAGAAGACATCCATTGACAAGAAATA-TCCTTTTATAGT
130 GGATGTTTGCATTAGGAAACATGAAACTGATGCCATCCATTGACAAGAAA-AGTCCATTTATAGT
* * * *
225444 CACTCATGCCATCAAAAGCCTAATTACT-ACTTTAAATGGTTTTAAAATCTTATAAATAATTTTG
194 CACTCATGCCATCAAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGGTTTTAAAATCTTATAATTCATTTTA
* * * * *
225508 GAT-ACAAATCTTTTTCGTGTTTAGTTAAAACATATTATAATTGGATGTTTGCAT-AAGGAAACA
259 AATCA-AAATCTTTTTAGT-TTTAGTTAAAACAGATCATAATTGGATGTTTGCATGGA-GAAACA
** *
225571 TTGAGAA-AAAGCCATCCATTC
321 -T-A-AAGGGAGCCATCCATTA
* * * * *
225592 ATAAAAAAAGTTCATTTATAGTCAGTCTTGCCTTCGAAAG
1 ACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAG
225632 TCTTATTACT
Statistics
Matches: 1353, Mismatches: 288, Indels: 173
0.75 0.16 0.10
Matches are distributed among these distances:
318 6 0.00
319 87 0.06
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ACGTcount: A:0.36, C:0.14, G:0.13, T:0.37
Consensus pattern (339 bp):
ACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCCTATCACTCACTGTAAATGATTT
TATAATCTTATAAATGATTTTAAATCGAAATATTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTG
GATGTTTGCATTAGGAAACATGAAACTGATGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCA
CTCATGCCATCAAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGGTTTTAAAATCTTATAATTCATTTTAAA
TCAAAATCTTTTTAGTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTGGATGTTTGCATGGAGAAACATAAAG
GGAGCCATCCATTA
Found at i:224856 original size:22 final size:24
Alignment explanation
Indices: 224804--224857 Score: 58
Period size: 22 Copynumber: 2.3 Consensus size: 24
224794 TTAAATAGTT
224804 TTAAAATCTTATAATTCATTTTAAA
1 TTAAAATCTTAT-ATTCATTTTAAA
* * *
224829 TCAAAATCTT-T-TTCATTTTTAG
1 TTAAAATCTTATATTCATTTTAAA
224851 TTAAAAT
1 TTAAAAT
224858 AGGTCATAAT
Statistics
Matches: 25, Mismatches: 4, Indels: 3
0.78 0.12 0.09
Matches are distributed among these distances:
22 15 0.60
24 1 0.04
25 9 0.36
ACGTcount: A:0.39, C:0.09, G:0.02, T:0.50
Consensus pattern (24 bp):
TTAAAATCTTATATTCATTTTAAA
Found at i:225015 original size:171 final size:169
Alignment explanation
Indices: 224301--225652 Score: 872
Period size: 170 Copynumber: 7.9 Consensus size: 169
224291 TTACTTGTTT
* * * *
224301 TAAATGATTTTAAATGGAAATCTTTTT--TGTTTTAGTTTAAAATTGATCATAGTTGGATGTTTG
1 TAAATGATTTTAAATCGAAATATTTTTCAT-TTTTAG-TTAAAATAGATCATAATTGGATGTTTG
* * * *
224364 CATCGAGAAACTTGAAACGGAAGCCATCCATTGACAAG--AAGTCCATTTATAGTCACTAATGGC
64 CATTGAGAAA-TTG-AATGGAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTTATGCC
* * *
224427 TTTGAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGCTTTTAT-TTCTTA
127 TTCGAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATACTTTTATAATCTTA
* * * * *
224469 TAAATGATTTTAAACCGAAATAGTTTTT-GTTCTTCA-TTAAAACAGATTATAATTGGATGTTTG
1 TAAATGATTTTAAATCGAAATA-TTTTTCATT-TTTAGTTAAAATAGATCATAATTGGATGTTTG
* * * * * * *
224532 CATTGAAAAACATGAAGGGAAAACCATCCATTGACAAGAAAAGTTCATTTATAGCCACTTAAGCC
64 CATTGAGAAA-TTGAATGG-AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTTATGCC
* * *
224597 TTCCAAAGCCTAGTTATTAACTTTAAATACTTTTATAATCTTA
127 TTCGAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATACTTTTATAATCTTA
* * * * *
224640 TAAATGGTTTTAAA-CTAAA-ATATTTTCACTTTT-CTCTAAAATAGATCATAATTAGATGTTTG
1 TAAATGATTTTAAATCGAAATAT-TTTTCATTTTTAGT-TAAAATAGATCATAATTGGATGTTTG
* * * *
224702 CATT-AGAAAATGTTAA-GCTGATGCCATCCATTAACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCATTCATA
64 CATTGAG-AAAT-TGAATG--GAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCA--C---
* * * * ** * *
224765 TTATACCATCAAAAGCCTAGTGACTTGCTTTAAATAGTTTTAAAATCTTA
120 TTATGCCTTCGAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATACTTTTATAATCTTA
* * * * * *
224815 TAATTCATTTTAAATCAAAATCTTTTTCATTTTTAGTTAAAATAGGTCATAATTTGATGTTTTGC
1 TAAATGATTTTAAATCGAAATATTTTTCATTTTTAGTTAAAATAGATCATAATTGGATG-TTTGC
* * *
224880 ATTGAGAAATGTGAATGGAAGCCATCCATTGA-AAGGAAAAGTCCATTTATTGTGACTCATGCCT
65 ATTGAGAAAT-TGAATGGAAGCCATCCATTGACAA-GAAAAGTCCATTTATAGTCACTTATGCCT
* ** ** *
224944 TCGAAAGCCTTA-TCACTCTTTTTAAATGGTTTTGTAATCTTA
128 TCGAAAGCC-TAGTTACTCACTTTAAATACTTTTATAATCTTA
* *
224986 TAAATGGTTTTAAATCGAAATATTTTTCATTTTTAGTTAAAATCGATCATAATTGGATGTTTGCA
1 TAAATGATTTTAAATCGAAATATTTTTCATTTTTAGTTAAAATAGATCATAATTGGATGTTTGCA
* * * * * ** *
225051 TT-AGGAAACTTGAAGTTGATGCCATCCATTGACAAGTAAAGTCTAGTTATAGTCACCCATGCCA
66 TTGA-GAAA-TTGAA-TGGAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTTATGCCT
* ** * *
225115 TCAAAAGCCTAGTTAC-CTGTTTTAAATAGTTTTA-ACCTCTTA
128 TCGAAAGCCTAGTTACTC-ACTTTAAATACTTTTATA-ATCTTA
* * ** * * * *
225157 TAATTCATTTTAAATAAAAATCTTTTT-AGTTTTTTG-TGAAACAGATCATAATTGGATGTTTGC
1 TAAATGATTTTAAATCGAAATATTTTTCA-TTTTTAGTTAAAATAGATCATAATTGGATGTTTGC
** * * * * * * *
225220 ATCAAGAAACGTAAATTGAAAGCCATCCATTAACAAGAAAAGT-TATTTATATTCACTCATGCCT
65 ATTGAGAAA-TTGAA-TGGAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTTATGCCT
* * * * ** * * * *
225284 TTGAAAACATTGCCATTTACTTCAAATAATTTTATAATCTTA
128 TCGAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATACTTTTATAATCTTA
* ** * * * * *
225326 TAAATGATTTTAAATTGAAATATTTTTTGTTTTTGGTTAAAACACATAATAATTGGATGTTTCCA
1 TAAATGATTTTAAATCGAAATATTTTTCATTTTTAGTTAAAATAGATCATAATTGGATGTTTGCA
** * * *
225391 TT-AGGAAACAAGAA-GCAGAAGACATCCATTGACAAGAAATA-TCCTTTTATAGTCACTCATGC
66 TTGA-GAAA-TTGAATG--GAAGCCATCCATTGACAAGAAA-AGTCCATTTATAGTCACTTATGC
* * * ** *
225453 CATCAAAAGCCTAATTACT-ACTTTAAATGGTTTTAAAATCTTA
126 CTTCGAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATACTTTTATAATCTTA
* ** * * * * * *
225496 TAAATAATTTTGGATAC-AAATCTTTTTCGTGTTTAGTTAAAACATATTATAATTGGATGTTTGC
1 TAAATGATTTTAAAT-CGAAATATTTTTCATTTTTAGTTAAAATAGATCATAATTGGATGTTTGC
* ** * * * * *
225560 A-TAAGGAAACATTGAGA-AAAAGCCATCCATTCATAAAAAAAGTTCATTTATAGTCAGTCT-TG
65 ATTGA-G-AA-ATTGA-ATGGAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACT-TATG
* *
225622 CCTTCGAAAGTCTTA-TTACTCATTTTAAATA
125 CCTTCGAAAG-CCTAGTTACTCACTTTAAATA
225653 AATCATAACT
Statistics
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0.75 0.16 0.09
Matches are distributed among these distances:
167 4 0.00
168 72 0.08
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ACGTcount: A:0.36, C:0.14, G:0.13, T:0.38
Consensus pattern (169 bp):
TAAATGATTTTAAATCGAAATATTTTTCATTTTTAGTTAAAATAGATCATAATTGGATGTTTGCA
TTGAGAAATTGAATGGAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTTATGCCTTCG
AAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATACTTTTATAATCTTA
Found at i:225927 original size:284 final size:283
Alignment explanation
Indices: 225395--225934 Score: 603
Period size: 284 Copynumber: 1.9 Consensus size: 283
225385 TTTCCATTAG
* *
225395 GAAACAAGAAGCAGAAGACATCCATTGACAAGAAATATCCTTTTATAGTCACTCATGCCATCAAA
1 GAAACAAGAAGCAGAAGACATCCATTGACAAAAAAAATCCTTTTATAGTCACTCATGCCATCAAA
* * * *
225460 AGCCTAATTACTACTTTAAATGGTTTTAAAATCTTATAAATAATTTTGGATACAAATCTTTTTCG
66 AACCTAATTACTACTTTAAATAGTTTTAAAATCTTATAAATAATTTTGAATACAAATCTTTTTCA
* *
225525 TGTTTAGTTAAAACATATTATAATTGGATGTTTGCATAAGGAAACATTGAGAAAAAGCCATCCAT
131 TGTTTAGTTAAAACAGATCATAATTGGATGTTTGCATAAGGAAACATTGAGAAAAAGCCATCCAT
* * * ** * *
225590 TCATAAAAAAAGTTCATTTATAGTCAGTCTTGCCTTCGAAAGTCTTATTACTCATTTTAAATAAA
196 TCATAAAAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAACCTCATTACTCACTTTAAATAAA
225655 TCATAACTAGTTGTTTGCATCGA
261 TCATAACTAGTTGTTTGCATCGA
* * * * * *
225678 GAAACATGAAGCA-AATGCCATCCATTGACAAAAAAAAT-TTATTTATAGTTAGTCATGCCTTCA
1 GAAACAAGAAGCAGAA-GACATCCATTGACAAAAAAAATCCT-TTTATAGTCACTCATGCCATCA
* * * * *
225741 AAAACGTAATTACTCATTTTAAATAGTTTTAAAATTTTATAAATGATTTT-AATTCAAAATC-TT
64 AAAACCTAATTACT-ACTTTAAATAGTTTTAAAATCTTATAAATAATTTTGAATAC-AAATCTTT
* *
225804 TTCTATTTTTCA-TTAAAACAGATCATAATTGGATGTTTGCAT-CGTGAAACA-TGA-AATGAAA
127 TTC-ATGTTT-AGTTAAAACAGATCATAATTGGATGTTTGCATAAG-GAAACATTGAGAA--AAA
* ** * * * * *
225865 GTCA-CTTGTTGATAAGAAAAGTCCATTTATATTTACTCATGCCTTCGAAAACCTCGTTACTCAC
187 GCCATC-CATTCATAAAAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAACCTCATTACTCAC
225929 TTTAAA
251 TTTAAA
225935 CGGTTTTATA
Statistics
Matches: 211, Mismatches: 36, Indels: 19
0.79 0.14 0.07
Matches are distributed among these distances:
282 5 0.02
283 75 0.36
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285 1 0.00
ACGTcount: A:0.38, C:0.15, G:0.12, T:0.35
Consensus pattern (283 bp):
GAAACAAGAAGCAGAAGACATCCATTGACAAAAAAAATCCTTTTATAGTCACTCATGCCATCAAA
AACCTAATTACTACTTTAAATAGTTTTAAAATCTTATAAATAATTTTGAATACAAATCTTTTTCA
TGTTTAGTTAAAACAGATCATAATTGGATGTTTGCATAAGGAAACATTGAGAAAAAGCCATCCAT
TCATAAAAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAACCTCATTACTCACTTTAAATAAA
TCATAACTAGTTGTTTGCATCGA
Found at i:226055 original size:171 final size:170
Alignment explanation
Indices: 225678--228107 Score: 1121
Period size: 171 Copynumber: 14.3 Consensus size: 170
225668 TTTGCATCGA
* * ** * * *
225678 GAAACATGAAGCAA-ATGCCATCCATTGACAAAAAAAATTTATTTATAGTTAGTCATGCCTTCAA
1 GAAACATGAA--AAGATGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGA
* * * * *
225742 AAACGTAATTACTCATTTTAAATAGTTTTAAAATTTTATAAATGATTTTAATTCAAAATC-TTTT
64 AAACCTAATTACTCACTTTAAATGGTTTTAAAATCTTATAAATAATTTTAATTCAAAATCTTTTT
* *
225806 CTATTTTTCATTAAAACAGATCATAATTGGATGTTTGCA-TCG
129 C-ATTTTTAATTAAAACAGATCATAATTGGATGTTTGCATTAG
* * * ** * * *
225848 TGAAACATGAAATGAAAGTCA-CTTGTTGATAAGAAAAGTCCATTTATATTTACTCATGCCTTCG
1 -GAAACATGAAAAG-ATGCCATC-CATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCG
** * * *
225912 AAAACCTCGTTACTCACTTTAAACGGTTTTATAATCTTATAAATAATTTTAGTTCAAAATCTTTT
63 AAAACCTAATTACTCACTTTAAATGGTTTTAAAATCTTATAAATAATTTTAATTCAAAATCTTTT
* * *
225977 TCATTTTTAATTAAAGTC-GATAATAATTGGATGATTGCATTAG
128 TCATTTTTAATTAAA-ACAGATCATAATTGGATGTTTGCATTAG
* * * * * * * *
226020 GAAACTTGAAACAGATGCCATCTATTGACAAGAAAATTTCATTTACAATCAGTCATGCCATC-AA
1 GAAACATGAAA-AGATGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAA
* * * * * *
226084 AGCCTAATGACTCATTTTAAATGGTTTTAAAATCCTATAAATGATTTTAAATCAAAATCCTTTTT
65 AACCTAATTACTCACTTTAAATGGTTTTAAAATCTTATAAATAATTTTAATTCAAAAT-CTTTTT
* * ** *
226149 --GTTTTAAGTTAAAACAAATCATGGTTGGATGTTTGTATTAG
129 CATTTTTAA-TTAAAACAGATCATAATTGGATGTTTGCATTAG
* * *
226190 GAAACATG--AAG-TAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATACCTTTGAA
1 GAAACATGAAAAGAT-GCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAA
*** * * * * *
226252 AGGTTTATCACTC-CTTTTAAATGGTTTTATAATTTTATAAATAATTTTAAACTC-AAATCTTTT
65 AACCTAATTACTCAC-TTTAAATGGTTTTAAAATCTTATAAATAATTTT-AATTCAAAATCTTTT
* * * * * ** * * *
226315 TCATTTCTATTTTAAATCA-ATTATATTTCAATGTTTTCATCAA
128 TCATTTTTA-ATTAAAACAGATCATAATTGGATGTTTGCATTAG
* * * ** * * *
226358 GAAACAT-AAAGTGAAAGCCA-CTCATTGATAAGAAAAGTTAATTTATAGTCAGTAATACCTTCG
1 GAAACATGAAA-AG-ATGCCATC-CATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCG
* ** ** ** * * * * *
226421 AAAGCCTTTTTACT-TGTTATAAAAAGTTTTATAATCATATAAATTAA-ATAAAATCAAAATCTT
63 AAAACCTAATTACTCACTT-TAAATGGTTTTAAAATCTTATAAA-TAATTTTAATTCAAAATCTT
* * * * * * *
226484 TTTTATTTTTGATTAAAATTA-ATCATAAATGGATGTTTACTTTGG
126 TTTCATTTTTAATTAAAA-CAGATCATAATTGGATGTTTGCATTAG
* ** * * * *** * * *
226529 GAAACATGAAACAAATTTCATACATTGAGAGGAAGCCTTCATTTATAGTCACTTATGCCTTTGAA
1 GAAACATGAAA-AGATGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAA
* * * * * * ** *
226594 AGCCTTATTACTCCCTTTAAGTGTTTTTAAAATCTTATAAATGAA-TTTAAATCAATTTTTTTTT
65 AACCTAATTACTCACTTTAAATGGTTTTAAAATCTTATAAAT-AATTTTAATTCAAAATCTTTTT
* ** * ** *
226658 CATGTTTAGCTAAAACAAAAT-ATAATTCAATGTTTTCATT-G
129 CATTTTTAATTAAAAC-AGATCATAATTGGATGTTTGCATTAG
* * * * * * * *
226699 GAAA-ATGTGAATCAA-AAGCTATCCATTGATAAAAAAAGTCTATTTACAGTCACTTATACCTTC
1 GAAACA--TGAA--AAGATGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTC
* * *** * * * *
226762 -AAAAGCCTAGTTACTCGCTTTAAATACCTTTATAATCTTATAAATGATTTTAA-ACAAAAAT-A
62 GAAAA-CCTAATTACTCACTTTAAATGGTTTTAAAATCTTATAAATAATTTTAATTC-AAAATCT
* * * *
226824 TTTT--TTTTT-GTTAAAACAGATCATAATTGGATATTTGCATCAA
125 TTTTCATTTTTAATTAAAACAGATCATAATTGGATGTTTGCATTAG
** * *
226867 GAAACATGAAGGGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATACCTTCGAA
1 GAAACATGAAAAG-ATGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAA
* ** * ** * * * * *
226932 AGCCTTGTTAATCA-TGAAAAATGGCTTTATAATCTTTTAAATAATTTTAAATCAAAATATTTTT
65 AACCTAATTACTCACT-TTAAATGGTTTTAAAATCTTATAAATAATTTTAATTCAAAATCTTTTT
* * * * * *
226996 AACTTTTAGTTAAATC-TATCATAATTGGATGTTTTCATT-G
129 CATTTTTAATTAAAACAGATCATAATTGGATGTTTGCATTAG
* * * ** * * * * * *
227036 GGAA-ATGTAAATATGATGCCATTCATTGATAAGAAAACACTATTTCTA-TACGCTTATGTCATC
1 GAAACATG-AAA-A-GATGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGT-CACTCATGCCTTC
* * * * *
227099 GAAAGCCTAATAACTCGCTTTAAATGGTTTTAAAATCTTATGACTAATTTTCAATT-AAAATCTT
62 GAAAACCTAATTACTCACTTTAAATGGTTTTAAAATCTTATAAATAATTTT-AATTCAAAATCTT
*** * * * * * *
227163 TTTTGCTTTTAGTTAAAATAGTTCAAAATTGGATGTTTACACCT-G
126 TTTCATTTTTAATTAAAACAGATCATAATTGGATGTTTGCA-TTAG
** ** * * ** * * * * *
227208 G-AATGTGAAGTGAAAGCCATCTATTGGTAAGAAAAGT-C-TTTTTTGTGACTCATACCTTTGAA
1 GAAACATGAAAAG-ATGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAA
* ** * * * * **
227270 AGCCTTGTCACTCCCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAACAATTTTAAACCAAAATACTTTTT
65 AACCTAATTACTCACTTTAAATGGTTTTAAAATCTTATAAATAATTTTAATTCAAAAT-CTTTTT
* **
227335 -ATTTTTAGTTAAAATTGATCATAATTGGATGTTTGCATT-G
129 CATTTTTAATTAAAACAGATCATAATTGGATGTTTGCATTAG
** * *** * * * *
227375 GCAAACATGAAGCTGGTTTAATCCATTGACAAGGAAAGTCTATTTATGGTCACTCATG-CTATGG
1 G-AAACATGAA-AAGATGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCT-TCG
* * * * * * *
227439 AAAGCCTACTGACTCGCTTTAAATGGTTCTAAAATCTTATAATTAATTTTAAATC-AAATCTTTT
63 AAAACCTAATTACTCACTTTAAATGGTTTTAAAATCTTATAAATAATTTTAATTCAAAATCTTTT
* * * * *
227503 T-AGTTTTTAGTTAAAACGGATTATAATTGGATATTTGCACTA-
128 TCA-TTTTTAATTAAAACAGATCATAATTGGATGTTTGCATTAG
* ** * * * * * * *
227545 AAAATGTGAAGTAGAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCCATTTATAGTGACCCATACCTT-TAA
1 GAAACATGAA-AAGATGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAA
* * * * * * * *
227609 AAGCCTTATCACTCCCTTTAAATGGTGTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATCAAAATATTTTT
65 AA-CCTAATTACTCACTTTAAATGGTTTTAAAATCTTATAAATAATTTTAATTCAAAATCTTTTT
** * *
227674 CATTTTTTGTTAAAATCA-ATCATAATTGGATATTTGCATTGG
129 CATTTTTAATTAAAA-CAGATCATAATTGGATGTTTGCATTAG
* * * * * ** *
227716 GAAACAT-AAAACCGATGCCATCCATTTATAAAAAAAAAT-TATTTATAGTCACTCATATCATC-
1 GAAACATGAAAA--GATGCCATCCATTGA-CAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCG
* * * *
227778 AAAAGCCTAA-TGCATCACTTTCAAA-GGTTTTAAAATCTTATAATTGATTTTAAAT-AGAAATC
63 AAAA-CCTAATTAC-TCACTTT-AAATGGTTTTAAAATCTTATAAATAATTTTAATTCA-AAATC
* * *
227840 TTTTTCATTTTTGGA-T-AAACAAATAATAATTGGATGTTTGCATT-G
124 TTTTTCATTTTT-AATTAAAACAGATCATAATTGGATGTTTGCATTAG
* * * * * * * *
227885 GGAA-ATGCAAAGCGAAAGCCACCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATATTCACTAATGCTTTC-
1 GAAACATG-AAA-AG-ATGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCG
** * * * * * * * *
227948 AAAAGCCTTGTCACT-AGCTTTGAGTAGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATCAAACTCTT
63 AAAA-CCTAATTACTCA-CTTTAAATGGTTTTAAAATCTTATAAATAATTTTAATTCAAAATCTT
** * * * * * *
228012 TTTTGTTTTTAGTTAAAATAGTTAATAATTGGATGTTTACGTT-G
126 TTTCATTTTTAATTAAAACAGATCATAATTGGATGTTTGCATTAG
* * * * *
228056 AGAAACATGAAACAGAAGCCATCTAGTAACAAGAAAAGTCCTTTTATAGTCA
1 -GAAACATGAAA-AGATGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCA
228108 TTCACGGCTT
Statistics
Matches: 1710, Mismatches: 446, Indels: 206
0.72 0.19 0.09
Matches are distributed among these distances:
166 5 0.00
167 158 0.09
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169 168 0.10
170 440 0.26
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172 44 0.03
173 4 0.00
ACGTcount: A:0.37, C:0.14, G:0.12, T:0.38
Consensus pattern (170 bp):
GAAACATGAAAAGATGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAA
ACCTAATTACTCACTTTAAATGGTTTTAAAATCTTATAAATAATTTTAATTCAAAATCTTTTTCA
TTTTTAATTAAAACAGATCATAATTGGATGTTTGCATTAG
Found at i:227348 original size:509 final size:502
Alignment explanation
Indices: 225758--228077 Score: 1393
Period size: 509 Copynumber: 4.6 Consensus size: 502
225748 AATTACTCAT
* * * **
225758 TTTAAATAGTTTTAAAATTTTATAAATGATTTTAATTCAAAATCTTTTCTATTTTTCA-TTAAAA
1 TTTAAATAGTTTTATAATCTTATAAATAATTTTAAACCAAAATCTTTT-TATTTTT-AGTTAAAA
** * * **
225822 CAGATCATAATTGGATGTTTGCATCGTGAAACATGAAATGAAAGTCACTTGTTGATAAGAAAAGT
64 CAGATCATAATTGGATGTTTGCATCAAGAAACATGAAGTGAAAGCCACTCATTGATAAGAAAAGT
* * * * * * *
225887 CCATTTATATTTACTCATGCCTTCGAAAACCTCGTTACTCACTTTAAACGGTTTTATAATCTTAT
129 CCATTTATAGTCACTCATACCTTCGAAAGCCTTGTTACTCA--TAAAAAGGTTTTATAATCTTAT
** * * * * * *
225952 AAATAATTTTAGTTCAAAATCTTTTTCATTTTTAATTAAAGTCGATAATAATTGGATGATTGCAT
192 AAATAATTTTAAATCAAAATCTTTTT-AATTTTAGTTAAA-TCTATCATAATTGGATGTTTACAT
* ** * *
226017 TAGGAAACT-TGAAACAGATGCCA-TCTATTGACAAGAAAATTTCATTTACAATCAG-TCATGCC
255 TGGGAAA-TGT-AAACAGATGCCATTC-ATTGA-AAGAAAACCTCATTT-CTATC-GCTTATGCC
* * * * *
226079 ATC-AAAGCCTAATGACTCATTTTAAATGGTTTTAAAATCCTATAAATGATTTTAAATCAAAATC
314 ATCGAAAGCCTAATAACTCACTTTAAATGGTTTTAAAATCTTATAAATAATTTT-AATTAAAATC
* * ** ** **
226143 CTTTTTG-TTTTAAGTTAAAACAAATCATGGTTGGATGTTTGTATTAGGAAACATGAAGT--AGC
378 TTTTTTGCTTTT-AGTTAAAAAAAATCATAATTGGATGTTTACATT-GGAAATGTGAAGTAAAGC
* ** * *
226205 CATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATACCTTTGAAAGGTTTATCACTCCT
441 CATCCATTGATAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATACCTTTGAAAGCCTTGTCACTCCC
* * * *
226267 TTTAAATGGTTTTATAATTTTATAAATAATTTTAAACTC-AAATCTTTTTCATTTCTATTTTAAA
1 TTTAAATAGTTTTATAATCTTATAAATAATTTTAAAC-CAAAATCTTTTT-ATTTTTA-GTTAAA
* * * ** * *
226331 TCA-ATTATATTTCAATGTTTTCATCAAGAAACATAAAGTGAAAGCCACTCATTGATAAGAAAAG
63 ACAGATCATAATTGGATGTTTGCATCAAGAAACATGAAGTGAAAGCCACTCATTGATAAGAAAAG
** * * * * *
226395 TTAATTTATAGTCAGTAATACCTTCGAAAGCCTTTTTACTTGTTATAAAAA-GTTTTATAATCAT
128 TCCATTTATAGTCACTCATACCTTCGAAAGCCTTGTTAC---TCATAAAAAGGTTTTATAATCTT
* * * * *
226459 ATAAATTAA-ATAAAATCAAAATCTTTTTTATTTTTGATTAAAAT-TAATCATAAATGGATGTTT
190 ATAAA-TAATTTTAAATCAAAATCTTTTTAATTTTAG-TT-AAATCT-ATCATAATTGGATGTTT
* * ** * * * * * *
226522 ACTTTGGGAAACATG-AAACAAATTTCATACATTGAGAGGAAGCCTTCATTTATAGTCACTTATG
251 ACATTGGG-AA-ATGTAAACAGATGCCATTCATTGAAAGAAAACC-TCATTTCTA-TCGCTTATG
* * * * * * * * *
226586 CCTTTGAAAGCCTTATTACTCCCTTTAAGTGTTTTTAAAATCTTATAAATGAA-TTTAAAT-CAA
312 CCATCGAAAGCCTAATAACTCACTTTAAATGGTTTTAAAATCTTATAAAT-AATTTTAATTAAAA
* * * ** *
226649 TTTTTTTTTCATGTTTAGCTAAAACAAAAT-ATAATTCAATGTTTTCATTGGAAAATGTGAA-TC
376 TCTTTTTTGC-T-TTTAGTTAAAA-AAAATCATAATTGGATGTTTACATTGG-AAATGTGAAGT-
* * * * ** * *
226712 AAAAGCTATCCATTGATAAAAAAAGTCTATTTACAGTCACTTATACCTTCAAAAGCCTAGTTACT
436 -AAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATACCTTTGAAAGCCTTGTCACT
*
226777 CGC
500 CCC
** * * *
226780 TTTAAATACCTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAACAAAAAT-ATTTT-TTTTT-GTTAAAACA
1 TTTAAATAGTTTTATAATCTTATAAATAATTTTAAACCAAAATCTTTTTATTTTTAGTTAAAACA
* * *
226842 GATCATAATTGGATATTTGCATCAAGAAACATGAAGGGAAAGCCA-TCCATTGACAAGAAAAGTC
66 GATCATAATTGGATGTTTGCATCAAGAAACATGAAGTGAAAGCCACT-CATTGATAAGAAAAGTC
* * *
226906 CATTTATAGTCACTCATACCTTCGAAAGCCTTGTTAATCATGAAAAATGGCTTTATAATCTTTTA
130 CATTTATAGTCACTCATACCTTCGAAAGCCTTGTTACTCAT-AAAAA-GGTTTTATAATCTTATA
* *
226971 AATAATTTTAAATCAAAATATTTTTAACTTTTAGTTAAATCTATCATAATTGGATGTTTTCATTG
193 AATAATTTTAAATCAAAATCTTTTTAA-TTTTAGTTAAATCTATCATAATTGGATGTTTACATTG
* *
227036 GGAAATGTAAATATGATGCCATTCATTGATAAGAAAACACT-ATTTCTATACGCTTATGTCATCG
257 GGAAATGTAAACA-GATGCCATTCATTGA-AAGAAAAC-CTCATTTCTAT-CGCTTATGCCATCG
* * *
227100 AAAGCCTAATAACTCGCTTTAAATGGTTTTAAAATCTTATGACTAATTTTCAATTAAAATCTTTT
318 AAAGCCTAATAACTCACTTTAAATGGTTTTAAAATCTTATAAATAATTTT-AATTAAAATCTTTT
* ** * *
227165 TTGCTTTTAGTTAAAATAGTTCAAAATTGGATGTTTACACCTGG-AATGTGAAGTGAAAGCCATC
382 TTGCTTTTAGTTAAAAAAAATCATAATTGGATGTTTACA-TTGGAAATGTGAAGT-AAAGCCATC
* * * *
227229 TATTGGTAAGAAAAGTCT-TTT-TTGTGACTCATACCTTTGAAAGCCTTGTCACTCCC
445 CATTGATAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATACCTTTGAAAGCCTTGTCACTCCC
* * *
227285 TTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAACAATTTTAAACCAAAATACTTTTTATTTTTAGTTAAAAT
1 TTTAAATAGTTTTATAATCTTATAAATAATTTTAAACCAAAAT-CTTTTTATTTTTAGTTAAAAC
* ** ** * * *
227350 TGATCATAATTGGATGTTTGCAT-TGGCAAACATGAAGCTG---GTTTAATCCATTGACAAGGAA
65 AGATCATAATTGGATGTTTGCATCAAG-AAACATGAAG-TGAAAG-CCACT-CATTGATAAGAAA
* * * * ** * * * * * *
227411 AGTCTATTTATGGTCACTCAT-GCTATGGAAAGCCTACTGACTCGCTTTAAATGGTTCTAAAATC
126 AGTCCATTTATAGTCACTCATACCT-TCGAAAGCCTTGTTACT--CATAAAAAGGTTTTATAATC
* * * * * *
227475 TTATAATTAATTTTAAATC-AAATCTTTTTAGTTTTTAGTTAAAACGGATTATAATTGGATATTT
188 TTATAAATAATTTTAAATCAAAATCTTTTTA-ATTTTAGTTAAATC-TATCATAATTGGATGTTT
* * ** ** * * * * **
227539 GCACT-AAAAATGTGAAGTAGAAGCCATCCATTGACAAGAAAA-ATCCATTTATAGT-GACCCAT
251 ACATTGGGAAATGT-AAACAGATGCCATTCATTGA-AAGAAAACCT-CATTTCTA-TCG-CTTAT
* * ** * * * * * * *
227601 ACCTTTAAAAGCCTTATCACTCCCTTTAAATGGTGTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATCAAA
311 GCCATCGAAAGCCTAATAACTCACTTTAAATGGTTTTAAAATCTTATAAATAATTTT-AATTAAA
* *** * ** * * ** * ***
227666 ATATTTTTCATTTTTTGTTAAAATCAATCATAATTGGATATTTGCATTGGGAAACATAAAACCGA
375 ATCTTTTTTGCTTTTAGTTAAAAAAAATCATAATTGGATGTTTACATT-GGAAATGT-GAAGTAA
* * * * * * **
227731 TGCCATCCATTTATAAAAAAAAAT-TATTTATAGTCACTCATATCATCAAAAGCCTAATG-CA-T
438 AGCCATCCATTGAT-AAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATACCTTTGAAAGCCT--TGTCACT
*
227793 CAC
500 CCC
* * * * * * *
227796 TTTCAAA-GGTTTTAAAATCTTATAATTGATTTTAAA-TAGAAATCTTTTTCATTTTTGGAT-AA
1 TTT-AAATAGTTTTATAATCTTATAAATAATTTTAAACCA-AAATCTTTTT-ATTTTTAGTTAAA
* * ** * * * *
227858 ACAAATAATAATTGGATGTTTGCAT-TGGGAA-ATGCAAAGCGAAAGCCACCCATTGACAAGAAA
63 ACAGATCATAATTGGATGTTTGCATCAAGAAACATG--AAGTGAAAGCCACTCATTGATAAGAAA
* * * * * * * * * **
227921 AGTCTATTTATATTCACTAATGCTTTCAAAAGCCTTGTCACTAGCTTTGAGTA-GTTTTATAATC
126 AGTCCATTTATAGTCACTCATACCTTCGAAAGCCTTGTTACT--C-ATAAAAAGGTTTTATAATC
* * ** * *
227985 TTATAAATGATTTTAAATCAAACTCTTTTTTGTTTTTAGTTAAA-ATAGTTAATAATTGGATGTT
188 TTATAAATAATTTTAAATCAAAATC-TTTTTAATTTTAGTTAAATCTA--TCATAATTGGATGTT
* * *
228049 TACGTTGAGAAACATG-AAACAGAAGCCAT
250 TACATTG-GGAA-ATGTAAACAGATGCCAT
228078 CTAGTAACAA
Statistics
Matches: 1389, Mismatches: 330, Indels: 181
0.73 0.17 0.10
Matches are distributed among these distances:
505 63 0.05
506 10 0.01
507 54 0.04
508 303 0.22
509 494 0.36
510 232 0.17
511 110 0.08
512 28 0.02
513 92 0.07
514 3 0.00
ACGTcount: A:0.37, C:0.14, G:0.12, T:0.38
Consensus pattern (502 bp):
TTTAAATAGTTTTATAATCTTATAAATAATTTTAAACCAAAATCTTTTTATTTTTAGTTAAAACA
GATCATAATTGGATGTTTGCATCAAGAAACATGAAGTGAAAGCCACTCATTGATAAGAAAAGTCC
ATTTATAGTCACTCATACCTTCGAAAGCCTTGTTACTCATAAAAAGGTTTTATAATCTTATAAAT
AATTTTAAATCAAAATCTTTTTAATTTTAGTTAAATCTATCATAATTGGATGTTTACATTGGGAA
ATGTAAACAGATGCCATTCATTGAAAGAAAACCTCATTTCTATCGCTTATGCCATCGAAAGCCTA
ATAACTCACTTTAAATGGTTTTAAAATCTTATAAATAATTTTAATTAAAATCTTTTTTGCTTTTA
GTTAAAAAAAATCATAATTGGATGTTTACATTGGAAATGTGAAGTAAAGCCATCCATTGATAAGA
AAAGTCTATTTATAGTCACTCATACCTTTGAAAGCCTTGTCACTCCC
Found at i:227688 original size:340 final size:337
Alignment explanation
Indices: 225692--228078 Score: 1321
Period size: 338 Copynumber: 7.0 Consensus size: 337
225682 CATGAAGCAA
* * * * * * * * *
225692 ATGCCATCCATTGACAAA-AAAAATTTATTTATAGTTAGTCATGCCTTCAAAAACGTAATTACTC
1 ATGCCATCCATTGA-AAAGAAAAATCTATTTAT-GTCACTCATGTCATCGAAAGCCTAATGACTC
** * * * * *
225756 ATTTTAAATAGTTTTAAAATTTTATAAATGATTTTAATTCAAAATCTTTTCTATTTTTCA-TTAA
64 GCTTTAAATGGTTTTAAAATCTTATAATTAATTTTAAATC-AAATCTTTT-TATTTTT-AGTTAA
* * * * * * * ** *
225820 AACAGATCATAATTGGATGTTTGCATCGTGAAACATG-AAATGAAAGTCA-CTTGTTGATAAGAA
126 AACAGATTATAATTGGATATTTGCA-C-TCAAAAATGTGAAGGAAAGCCATC-CATTGACAAGAA
* * * * * * * *
225883 AAGTCCATTTATATTTACTCATGCCTTCGAAAA-CCTCGTTACTCACTTTAAACGGTTTTATAAT
188 AAGTCCATTTATAGTCACTCATACCTT-TAAAAGCCTTGTCACTCCCTTTAAATGGTTTTATAAT
** * * * * * *
225947 CTTATAAATAATTTTAGTTCAAAATCTTTTTCATTTTTAATTAAAGTCGATAATAATTGGATGAT
252 CTTATAAATAATTTTAAATCAAAATATTTTT-ATTTTTAGTTAAAATTGATCATAATTGGATGTT
* * * *
226012 TGCATTAGGAAACTTGAAACAG
316 TGCATTGGGAAACATAAAACTG
* * * ** * *
226034 ATGCCATCTATTGACAAG-AAAATTTCATTTACAATCAGTCATGCCATC-AAAGCCTAATGACTC
1 ATGCCATCCATTGAAAAGAAAAATCT-ATTTA-TGTCACTCATGTCATCGAAAGCCTAATGACTC
** * * * * *
226097 ATTTTAAATGGTTTTAAAATCCTATAAATGATTTTAAATCAAAATCCTTTTTGTTTTAAGTTAAA
64 GCTTTAAATGGTTTTAAAATCTTATAATTAATTTTAAATC-AAAT-CTTTTTATTTTTAGTTAAA
* * ** * * * * ** *
226162 ACAAATCATGGTTGGATGTTTGTA-TTAGGAAACATGAA-G-TAGCCATCCATTGACAAGAAAAG
127 ACAGATTATAATTGGATATTTGCACTCA-AAAATGTGAAGGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAG
* * ** * * *
226224 TCTATTTATAGTCACTCATACCTTTGAAAGGTTTATCACTCCTTTTAAATGGTTTTATAATTTTA
191 TCCATTTATAGTCACTCATACCTTTAAAAGCCTTGTCACTCCCTTTAAATGGTTTTATAATCTTA
* * * * ** * * ** *
226289 TAAATAATTTTAAACTC-AAATCTTTTTCATTTCTATTTTAAATCAATTATATTTCAATGTTTTC
256 TAAATAATTTTAAA-TCAAAATATTTTT-ATTTTTAGTTAAAATTGATCATAATTGGATGTTTGC
*** *
226353 ATCAAGAAACAT-AAAGTG
319 ATTGGGAAACATAAAACTG
* * * * * ** * ** *
226371 AAAGCCA-CTCATTGATAAGAAAAGT-TAATTTATAGTCAGTAATACCTTCGAAAGCCTTTTTAC
1 -ATGCCATC-CATTGAAAAGAAAAATCT-ATTTAT-GTCACTCATGTCATCGAAAGCCTAATGAC
* ** * * * *
226434 TTG-TTATAAAAAGTTTTATAATCATATAAATTAA-ATAAAATCAAAATCTTTTTTATTTTT-GA
62 TCGCTT-TAAATGGTTTTAAAATCTTAT-AATTAATTTTAAATC-AAATC-TTTTTATTTTTAG-
* * * * * ** *** ** ** ** * * *
226496 TTAAAATTA-ATCATAAATGGATGTTTACTTTGGGAAACATGAAACAAATTTCATACATTGAGAG
122 TTAAAA-CAGATTATAATTGGATATTTGCACTCAAAAATGTGAAGGAAA-GCCATCCATTGACAA
*** * * * * * * * * *
226560 GAAGCCTTCATTTATAGTCACTTATGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCCCTTTAAGTGTTTTTAAA
185 GAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATACCTTTAAAAGCCTTGTCACTCCCTTTAAATGGTTTTATA
** * * * *** **
226625 ATCTTATAAATGAA-TTTAAATCAATTTTTTTTTCATGTTTAGCTAAAACAAAAT-ATAATTCAA
250 ATCTTATAAAT-AATTTTAAATCAAAATATTTTT-ATTTTTAGTTAAAA-TTGATCATAATTGGA
* * ** * * **
226688 TGTTTTCATTGGAAAATGTGAATCAA
312 TGTTTGCATTGGGAAACATAAAACTG
* * * * * ** * * * *
226714 AAGCTATCCATTGATAAA-AAAAGTCTATTTACAGTCACTTATACCTTCAAAAGCCTAGTTACTC
1 ATGCCATCCATTGA-AAAGAAAAATCTATTTA-TGTCACTCATGTCATCGAAAGCCTAATGACTC
*** * * * **
226778 GCTTTAAATACCTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAA-CAAAAATATTTT-TTTTT-GTTAAAA
64 GCTTTAAATGGTTTTAAAATCTTATAATTAATTTTAAATCAAATCT-TTTTATTTTTAGTTAAAA
* **
226840 CAGATCATAATTGGATATTTGCA-TCAAGAAACATGAAGGGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAG
128 CAGATTATAATTGGATATTTGCACTCAA-AAATGTGAA-GGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAG
** * * * ** *
226904 TCCATTTATAGTCACTCATACCTTCGAAAGCCTTGTTAAT-CATGAAAAATGGCTTTATAATCTT
191 TCCATTTATAGTCACTCATACCTTTAAAAGCCTTGTCACTCCCT-TTAAATGGTTTTATAATCTT
* * *
226968 TTAAATAATTTTAAATCAAAATATTTTTAACTTTTAGTT-AAATCT-ATCATAATTGGATGTTTT
255 ATAAATAATTTTAAATCAAAATATTTTT-ATTTTTAGTTAAAAT-TGATCATAATTGGATGTTTG
**
227031 CATTGGGAAATGTAAATA-TG
318 CATTGGGAAACATAAA-ACTG
* * * * * * *
227051 ATGCCATTCATTGATAAGAAAACA-CTATTTCTATACGCTTATGTCATCGAAAGCCTAATAACTC
1 ATGCCATCCATTGAAAAGAAAA-ATCTATTTATGT-CACTCATGTCATCGAAAGCCTAATGACTC
* * * *
227115 GCTTTAAATGGTTTTAAAATCTTATGACTAATTTTCAATTAAAATCTTTTT-TGCTTTTAGTTAA
64 GCTTTAAATGGTTTTAAAATCTTATAATTAATTTT-AAATCAAATCTTTTTAT--TTTTAGTTAA
* * * * *** * **
227179 AATAG-TTCAAAATTGGATGTTTACAC-CTGGAATGTGAAGTGAAAGCCATCTATTGGTAAGAAA
126 AACAGATT-ATAATTGGATATTTGCACTCAAAAATGTGAAG-GAAAGCCATCCATTGACAAGAAA
* * * *
227242 AGT-C-TTTTTTGTGACTCATACCTTTGAAAGCCTTGTCACTCCCTTTAAATGGTTTTATAATCT
189 AGTCCATTTATAGTCACTCATACCTTTAAAAGCCTTGTCACTCCCTTTAAATGGTTTTATAATCT
* *
227305 TATAAACAATTTTAAACCAAAATACTTTTTATTTTTAGTTAAAATTGATCATAATTGGATGTTTG
254 TATAAATAATTTTAAATCAAAATA-TTTTTATTTTTAGTTAAAATTGATCATAATTGGATGTTTG
* * *
227370 CATTGGCAAACATGAAGCTG
318 CATTGGGAAACATAAAACTG
* *** * * * * *
227390 GTTTAATCCATTGACAAGGAAAGTCTATTTATGGTCACTCATG-CTATGGAAAGCCTACTGACTC
1 ATGCCATCCATTGAAAAGAAAAATCTATTTAT-GTCACTCATGTC-ATCGAAAGCCTAATGACTC
*
227454 GCTTTAAATGGTTCTAAAATCTTATAATTAATTTTAAATCAAATCTTTTTAGTTTTTAGTTAAAA
64 GCTTTAAATGGTTTTAAAATCTTATAATTAATTTTAAATCAAATCTTTTTA-TTTTTAGTTAAAA
* * *
227519 CGGATTATAATTGGATATTTGCACT-AAAAATGTGAAGTAGAAGCCATCCATTGACAAGAAAAAT
128 CAGATTATAATTGGATATTTGCACTCAAAAATGTGAAGGA-AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGT
* * * *
227583 CCATTTATAGTGACCCATACCTTTAAAAGCCTTATCACTCCCTTTAAATGGTGTTATAATCTTAT
192 CCATTTATAGTCACTCATACCTTTAAAAGCCTTGTCACTCCCTTTAAATGGTTTTATAATCTTAT
* * ** *
227648 AAATGATTTTAAATCAAAATATTTTTCATTTTTTGTTAAAATCAATCATAATTGGATATTTGCAT
257 AAATAATTTTAAATCAAAATATTTTT-ATTTTTAGTTAAAATTGATCATAATTGGATGTTTGCAT
*
227713 TGGGAAACATAAAACCG
321 TGGGAAACATAAAACTG
* * * *
227730 ATGCCATCCATTTATAAAAAAAAAT-TATTTATAGTCACTCATATCATCAAAAGCCTAATG-CAT
1 ATGCCATCCATTGA-AAAGAAAAATCTATTTAT-GTCACTCATGTCATCGAAAGCCTAATGAC-T
* * * * *
227793 CACTTTCAAA-GGTTTTAAAATCTTATAATTGATTTTAAATAGAAATCTTTTTCATTTTTGGAT-
63 CGCTTT-AAATGGTTTTAAAATCTTATAATTAATTTTAAAT-CAAATCTTTTT-ATTTTTAGTTA
* * * * *** ** *
227856 AAACAAATAATAATTGGATGTTTGCATTGGGAAATGCAAAGCGAAAGCCACCCATTGACAAGAAA
125 AAACAGATTATAATTGGATATTTGCACTCAAAAATGTGAAG-GAAAGCCATCCATTGACAAGAAA
* * * * ** * * *
227921 AGTCTATTTATATTCACTAAT-GCTTTCAAAAGCCTTGTCACTAGCTTTGAGTAGTTTTATAATC
189 AGTCCATTTATAGTCACTCATACCTTT-AAAAGCCTTGTCACTCCCTTTAAATGGTTTTATAATC
* * * * * * *
227985 TTATAAATGATTTTAAATCAAACTCTTTTTTGTTTTTAGTTAAAATAGTTAATAATTGGATGTTT
253 TTATAAATAATTTTAAATCAAAAT-ATTTTTATTTTTAGTTAAAATTGATCATAATTGGATGTTT
* * * * *
228050 ACGTTGAGAAACATGAAACAG
317 GCATTGGGAAACATAAAACTG
*
228071 AAGCCATC
1 ATGCCATC
228079 TAGTAACAAG
Statistics
Matches: 1589, Mismatches: 376, Indels: 161
0.75 0.18 0.08
Matches are distributed among these distances:
336 5 0.00
337 116 0.07
338 430 0.27
339 231 0.15
340 271 0.17
341 297 0.19
342 226 0.14
343 13 0.01
ACGTcount: A:0.37, C:0.14, G:0.12, T:0.38
Consensus pattern (337 bp):
ATGCCATCCATTGAAAAGAAAAATCTATTTATGTCACTCATGTCATCGAAAGCCTAATGACTCGC
TTTAAATGGTTTTAAAATCTTATAATTAATTTTAAATCAAATCTTTTTATTTTTAGTTAAAACAG
ATTATAATTGGATATTTGCACTCAAAAATGTGAAGGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCAT
TTATAGTCACTCATACCTTTAAAAGCCTTGTCACTCCCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAAT
AATTTTAAATCAAAATATTTTTATTTTTAGTTAAAATTGATCATAATTGGATGTTTGCATTGGGA
AACATAAAACTG
Found at i:229058 original size:220 final size:220
Alignment explanation
Indices: 228474--229953 Score: 896
Period size: 220 Copynumber: 6.6 Consensus size: 220
228464 TTTGATATAG
* * * * * * *
228474 TTTTTATTTTTAATGATTTAAAAGATTCTAAATGAATTATATATCATAACATTGATGATAAAGTG
1 TTTTAATTTATAATAATTTATAAGATTATAAATGAATCATATATCATAAC-TTGATGATAAAATG
* * * *** * * *
228539 TTATTAAAATTATAATTATTCATAGAGCTATCATTTTAATCATTTGAATGCATTATAAACTTAAA
65 TTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCATTTGAATGCATAATAAACTTAAA
* * * *
228604 ATACTTTTTCCTT-TCACTGG-CTAG-CTCCA-TTTCATGTTTCCCAATGCAAACATCTAATTGT
130 ATACTCTTTCCTTGTCAATGGAC-AGCCTCCACTTT-ATGTTTCCCAATGCAAACATCAAATTAT
**
228665 GATAGGTTTTAACTAAGAACGACAAAGC
193 GATAAATTTTAACTAAGAACGACAAAGC
* * * * * *
228693 TTTTTATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATC--GTCTCATAATATTGATAATAAAATG
1 TTTTAATTTATAATAATTTATAAGATTATAAATGAATCATATATCATAA-CTTGATGATAAAATG
* ** * *
228756 TTATCAAAATGATAATTATTCATTGTTACGTCATTTCAAGCATTTGAAAGCATAATAAACTTGAA
65 TTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCATTTGAATGCATAATAAACTTAAA
* * * *
228821 ATGCTCTTTCCTTGTCAATGGACAGCCTTCACTTTATGTTACCCAATGTAAACATC-AATTATGA
130 ATACTCTTTCCTTGTCAATGGACAGCCTCCACTTTATGTTTCCCAATGCAAACATCAAATTATGA
228885 TAAATTTTAACTAAGAAC-AGCAAAG-
195 TAAATTTTAACTAAGAACGA-CAAAGC
* **
228910 TTTTCAATTTATAATAATTTATAAGATTATAAATGAATCATATATCATAACTTGGATGATGATTT
1 TTTT-AATTTATAATAATTTATAAGATTATAAATGAATCATATATCATAACTT-GATGATAAAAT
* *
228975 GTTATCCAAATGATAATTATTTATTGATAAATCATTTCAAGC-TTTCGAATGCATAATAAA-TCT
64 GTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCATTT-GAATGCATAATAAACT-T
* * * * ** *
229038 AAAATACTCTTTCTTTGTCAATCGAAAGCATCCACTACATGTTTCCGAATGCAAACATCAAATTA
127 AAAATACTCTTTCCTTGTCAATGGACAGCCTCCACTTTATGTTTCCCAATGCAAACATCAAATTA
** * * *
229103 TGAT-AGGTTTAGACCAAGAACAAAAAATGTTTC
192 TGATAAATTTTA-ACTAAGAACGACAAA-G---C
* * * *
229136 AATTTATTTTCGATATATAACCTTTTATAAGGTTATAAATGAAAT-ATATATCATAATATTGATG
1 -TTTTAATTT--ATA-ATAA---TTTATAAGATTATAAATG-AATCATATATCATAA-CTTGATG
* * * * * * * *
229200 TTAAAATGTTATCAAAGTGATGATTGTTCATTGATAAATCATTTCAAG--TTCTCAAAGGAATGA
57 ATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCATT-T-GAATGCATAA
* * * * * ** *
229263 TAAGCTTAAAATA-TACATTT-CTTGTCAATGGATAGCATCTACTTCATGTTTCAAAATTCAAAC
120 TAAACTTAAAATACT-C-TTTCCTTGTCAATGGACAGCCTCCACTTTATGTTTCCCAATGCAAAC
* * ** * * ** *
229326 ATCCAATTACGATAGGTTTTAA-TCAATAACAATGAAGA
183 ATCAAATTATGATAAATTTTAACT-AAGAACGACAAAGC
*** * * * *
229364 TTTTAATTTATAAGCTTTTATAAGATTATAAATGAAGT-ATATATCATAATATTTATGTTACAAT
1 TTTTAATTTATAATAATTTATAAGATTATAAATGAA-TCATATATCATAA-CTTGATGATAAAAT
* * * * * * *
229428 GTTATTAAAATGATAATTGTTCATTGATAAATCATTTTAAGC-TTCTG-ACGACATGACAAAATT
64 GTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCATT-TGAATG-CATAATAAACTT
* * * ** * * * * **
229491 AAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCATCTC-CTACACGTTTCCTAGTGAAAACATCTGATT
127 AAAATACTCTTTCCTTGTCAATGGACAGCCTC-CACTTTATGTTTCCCAATGCAAACATCAAATT
** * **
229555 ATGA-ATGGTTTTAAAC-AAGAACAACAAATAA
191 ATGATA-AATTTT-AACTAAGAACGACAAA-GC
** * * * * * * *
229586 TTCGATTTTATAATCATTGATAAGATTATAAATGAATTATATTATAAT-AC-GGCTGATAAAATG
1 TTTTAATTTATAATAATTTATAAGATTATAAATGAATCATA-TATCATAACTTGATGATAAAATG
* * * *
229649 TTATCAAAATAATAGTTATTCATTGATAAATCATTTCAAGC-TTTAAAAGGCA-AGATAAACTTA
65 TTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCATTT-GAATGCATA-ATAAACTTA
* * * * * ** * * * *
229712 AAATGCTCTTTCATTGTCCATGGATAGCATCCACTACACGTTTTCAAATGCAAACATCCAATTAT
128 AAATACTCTTTCCTTGTCAATGGACAGCCTCCACTTTATGTTTCCCAATGCAAACATCAAATTAT
** * *
229777 GATAGGTTTTAACTAAGAACAAGAAA-C
193 GATAAATTTTAACTAAGAACGACAAAGC
* * * *
229804 TTTCAATTTATTTTGAATATATAATTGTTTATAAGATTATAAATGAATAATATATAATAATATTG
1 --T---TTTAATTT--ATA-ATAA---TTTATAAGATTATAAATGAATCATATATCATAA-CTTG
* * * * * * *
229869 ATG-TAAAAATGTTGTCAAAATGATAATCATTCATAGATAAATAATTTCAAACTTTTGAAGGCAT
54 ATGAT-AAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCATTTGAATGCAT
* *
229933 GATAAACTTAAAATGCTCTTT
118 AATAAACTTAAAATACTCTTT
229954 TTTTGTAAAT
Statistics
Matches: 1009, Mismatches: 182, Indels: 128
0.76 0.14 0.10
Matches are distributed among these distances:
217 87 0.09
218 68 0.07
219 68 0.07
220 258 0.26
221 175 0.17
222 44 0.04
223 11 0.01
224 1 0.00
225 6 0.01
226 7 0.01
227 10 0.01
228 9 0.01
229 28 0.03
230 1 0.00
231 73 0.07
232 149 0.15
233 14 0.01
ACGTcount: A:0.39, C:0.12, G:0.11, T:0.38
Consensus pattern (220 bp):
TTTTAATTTATAATAATTTATAAGATTATAAATGAATCATATATCATAACTTGATGATAAAATGT
TATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCATTTGAATGCATAATAAACTTAAAA
TACTCTTTCCTTGTCAATGGACAGCCTCCACTTTATGTTTCCCAATGCAAACATCAAATTATGAT
AAATTTTAACTAAGAACGACAAAGC
Found at i:229275 original size:232 final size:225
Alignment explanation
Indices: 228124--229975 Score: 1531
Period size: 232 Copynumber: 8.2 Consensus size: 225
228114 GCTTTCGAAT
* * * *
228124 GCATCATAAAGTTAAAATGCTCTATCCTTGTCAATGGATAGCATCCACTATATGTTTCCAAATGC
1 GCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCATCCACTACATGTTTCCAAATGC
** * *
228189 AAACATAAAAGTATGATAGGTTTTAACTAAGAACAACAAAGCTTTTGATTTATTTTCAATATATA
66 AAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACTAAGAACAACAAAG--TTTAATTTATTTT--ATATATA
* *
228254 ATCTTTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCGTAATATTGATGTTAAAATGTTATCAAAATGA
127 A-CTTTTATAAGATTATAAATGAA-TATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGA
228319 TAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTAGAAG
190 TAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTA-AAG
* * ** * * **
228356 GCATGATAAACTTAAAATGGTTTTTCCTTGTCAACAGATGGAATCCACTTTATGTTTTCC-AATG
1 GCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCATCCACTACATG-TTTCCAAATG
* * * * * * * * * * * *
228420 TAAACATCCGATTATGATAGGCTTTGAGTGAGAGCAATAAAGCTTTTGATATAGTTTTTATTTTT
65 CAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACTAAGAACAACAAAG--TTTAATTTA--TTTTATATAT
* * * * *
228485 AA-TGATTTAAAAGATTCTAAATGAATTATATATCATAACATTGATGATAAAGTGTTATTAAAAT
126 AACT--TTTATAAGATTATAAATGAA-TATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAAT
* * *** * * * *
228549 TATAATTATTCATAGAGCTATCATTTTAATCATTTGAAT
188 GATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGC-TTTAAAG
* * * * * * * *
228588 GCATTATAAACTTAAAATACTTTTTCCTT-TCACTGGCTAGC-TCCATTTCATGTTTCCCAATGC
1 GCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCATCCACTACATGTTTCCAAATGC
* * * * *
228651 AAACATCTAATTGTGATAGGTTTTAACTAAGAACGACAAAGCTT--TTTA-TTTATA-AT--CAT
66 AAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACTAAGAACAACAAAGTTTAATTTATTTTATATATAACTT
** * *
228710 TTATAAGATTATAAATGAAT-CGTCTCATAATATTGATAATAAAATGTTATCAAAATGATAATTA
131 TTATAAGATTATAAATGAATATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTA
* **
228774 TTCATTGTTACGTCATTTCAAGCATTTGAAA-
196 TTCATTGATAAATCATTTCAAGC-TTT-AAAG
* * * * * ** * * *
228805 GCATAATAAACTTGAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGACAGCCTTCACTTTATGTTACCCAATGT
1 GCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCATCCACTACATGTTTCCAAATGC
** * * *
228870 AAACAT-CAATTATGATAAATTTTAACTAAGAACAGCAAAG-TT--TTCAATTTATA-ATAA--T
66 AAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACTAAGAACAACAAAGTTTAATTTATTTTATATATAACTT
* * ** *
228928 TTATAAGATTATAAATGAATCATATATCATAACT-TGGATGATGATTTGTTATCCAAATGATAAT
131 TTATAAGATTATAAATGAAT-ATATATCATAA-TATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAAT
* * *
228992 TATTTATTGATAAATCATTTCAAGCTTTCGAAT
194 TATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTT-AAAG
* * * * * *
229025 GCATAATAAA-TCTAAAATACTCTTTCTTTGTCAATCGAAAGCATCCACTACATGTTTCCGAATG
1 GCATGATAAACT-TAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCATCCACTACATGTTTCCAAATG
* * *
229089 CAAACATCAAATTATGATAGG-TTTAGACCAAGAACAAAAAATGTTTCAATTTATTTTCGATATA
65 CAAACATCCAATTATGATAGGTTTTA-ACTAAGAACAACAAA-GTTT-AATTTATTTT--ATATA
* * *
229153 TAACCTTTTATAAGGTTATAAATGAAATATATATCATAATATTGATGTTAAAATGTTATCAAAGT
125 TAA-CTTTTATAAGATTATAAATG-AATATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAAT
* *
229218 GATGATTGTTCATTGATAAATCATTTCAAG-TTCTCAAAG
188 GATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTT-T-AAAG
* * * * * *
229257 GAATGATAAGCTTAAAAT-ATACATTT-CTTGTCAATGGATAGCATCTACTTCATGTTTCAAAAT
1 GCATGATAAACTTAAAATGCT-C-TTTCCTTGTCAATGGATAGCATCCACTACATGTTTCCAAAT
* * * ** * * *
229320 TCAAACATCCAATTACGATAGGTTTTAA-TCAATAACAATGAAG---ATTTTA-ATT-TATA-AG
64 GCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACT-AAGAACAACAAAGTTTAATTTATTTTATATATAA
* * * *
229378 CTTTTATAAGATTATAAATGAAGTATATATCATAATATTTATGTTACAATGTTATTAAAATGATA
128 CTTTTATAAGATTATAAATGAA-TATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATA
* * * *
229443 ATTGTTCATTGATAAATCATTTTAAGCTTCTGACG
192 ATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTT-TAAAG
* * * * * *
229478 ACATGACAAAATTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCATCTC-CTACACGTTTCCTAGTG
1 GCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCATC-CACTACATGTTTCCAAATG
* ** *
229542 AAAACATCTGATTATGA-ATGGTTTTAAAC-AAGAACAACAAA---TAATTCGATTTTATA-AT-
65 CAAACATCCAATTATGATA-GGTTTT-AACTAAGAACAACAAAGTTTAATT-TATTTTATATATA
* * * ** * *
229600 -CATTGATAAGATTATAAATGAAT-TATATTATAATACGGCTGATAAAATGTTATCAAAATAATA
127 ACTTTTATAAGATTATAAATGAATATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATA
*
229663 GTTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTAAAAG
192 ATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTT-AAAG
* * * * *
229698 GCAAGATAAACTTAAAATGCTCTTTCATTGTCCATGGATAGCATCCACTACACGTTTTCAAATGC
1 GCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCATCCACTACATGTTTCCAAATGC
* *
229763 AAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACTAAGAACAAGAAACTTTCAATTTATTTTGAATATATAA
66 AAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACTAAGAACAACAAAGTTT-AATTTATTTT--ATATATAA
* * *
229828 TTGTTTATAAGATTATAAATGAATAATATATAATAATATTGATG-TAAAAATGTTGTCAAAATGA
128 CT-TTTATAAGATTATAAATGAAT-ATATATCATAATATTGATGAT-AAAATGTTATCAAAATGA
* * * * *
229892 TAATCATTCATAGATAAATAATTTCAAACTTTTGAAG
190 TAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGC-TTTAAAG
** * *
229929 GCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTTTTTGTAAATAGATAGCATCCA
1 GCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCATCCA
229976 TGTCAAGTTT
Statistics
Matches: 1292, Mismatches: 257, Indels: 143
0.76 0.15 0.08
Matches are distributed among these distances:
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228 5 0.00
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234 4 0.00
ACGTcount: A:0.39, C:0.12, G:0.12, T:0.37
Consensus pattern (225 bp):
GCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCATCCACTACATGTTTCCAAATGC
AAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACTAAGAACAACAAAGTTTAATTTATTTTATATATAACTT
TTATAAGATTATAAATGAATATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTA
TTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTAAAG
Found at i:229688 original size:673 final size:669
Alignment explanation
Indices: 228135--229918 Score: 1561
Period size: 673 Copynumber: 2.6 Consensus size: 669
228125 CATCATAAAG
* * * * * * * * * *
228135 TTAAAATGCTCTATCCTTGTCAATGGATAGCATCCACTATATGTTTCCAAATGCAAACATAAAAG
1 TTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGACAGCATTCACTACACGTTACCCAATGAAAACAT-CAAT
** * * *
228200 TATGATAGGTTTTAACTAAGAACAACAAAGCTTTTGATTTATTTTCAATATATAATCTTTTATAA
65 TATGATAAATTTTAACTAAGAACAACAAAG----T-ATTCAATTT--ATA-ATAA---TTGATAA
* ** * *
228265 GATTATAAATGAATTATATATCGTAA-TATTGATGTTAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCA
119 GATTATAAATGAA-TATATATCATAACT-CGGATGATAAAATGTTATCAAAATAATAATTATTCA
* * ** * *
228329 TTGATAAATCATTTCAAGCTTTAGAAGGCATGATAAACTTAAAATGGTTTTTCCTTGTCAA-CAG
182 TTGATAAATCATTTCAAGCTTTAAAAGGCAAGATAAACTTAAAATACTCTTTCATTGTCAATC-G
** * ** * * ** * * *** *
228393 ATGGAATCCACTTTATGTTTTCC-AATGTAAACATCCGATTATGATAGGCTTTGAGTGAGAGCAA
246 AAAGCATCCACTACACG-TTTCCAAATGCAAACATCAAATTATGATAGGTTTTAACCAAGAACAA
* ** * * * * * * * *
228457 TAAAGCTTTTGATATAGTTTT-TATTTTTAA-TGATTTAAAAGATTCTAAATGAATTATATATCA
310 -AAAACTTTCAATTTA-TTTTGAATATATAACTG-TTTATAAGATTATAAATGAATAATATATAA
* * * * * *** * *
228520 TAACATTGATG-ATAAAGTGTTATTAAAATTATAATTATTCATAGAGCTATCATTTTAA--TCAT
372 TAATATTGATGTA-AAAATGTTATCAAAATGATAATCATTCATAGATAAATAATTTCAAGTTC--
** * * * * * * * * *
228582 TTGAATGCATTATAAACTT-AAA-ATACTTTTTCCTT-TCACTGGCTAGC-TCCATTTCATGTTT
434 TCAAAGGAATGATAAGCTTAAAATATAC-ATTT-CTTGTCAATGGATAGCATCTACTTCATGTTT
** * ** * * * *
228643 CCCAATGCAAACATCTAATTGTGATAGGTTTTAACTAAGAACGACAAAGCTTTTTATTTATAATC
497 CAAAATGCAAACATCCAATTACGATAGGTTTTAACTAAGAACAACAAAGATTTTAATTTATAAGC
* *
228708 ATTTATAAGATTATAAATGAATCGTCTCATAATATTGATAATAAAATGTTATCAAAATGATAATT
562 ATTTATAAGATTATAAATGAATCATATCATAATATTGATAATAAAATGTTATCAAAATGATAATT
* ** * *
228773 ATTCATTGTTACGTCATTTCAAGCATTTGAAAGCATAATAAAC
627 ATTCATTGATAAATCATTTCAAGCATTTGAAAGCATAACAAAA
* * ** * *
228816 TTGAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGACAGCCTTCACTTTATGTTACCCAATGTAAACATCAATT
1 TTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGACAGCATTCACTACACGTTACCCAATGAAAACATCAATT
* * *
228881 ATGATAAATTTTAACTAAGAACAGCAAAGTTTTCAATTTATAATAATTTATAAGATTATAAATGA
66 ATGATAAATTTTAACTAAGAACAACAAAGTATTCAATTTATAATAATTGATAAGATTATAAATGA
* * ** * * *
228946 ATCATATATCATAACTTGGATGATGATTTGTTATCCAAATGATAATTATTTATTGATAAATCATT
131 AT-ATATATCATAACTCGGATGATAAAATGTTATCAAAATAATAATTATTCATTGATAAATCATT
** * *
229011 TCAAGCTTTCGAATGCATA-ATAAA-TCTAAAATACTCTTTCTTTGTCAATCGAAAGCATCCACT
195 TCAAGCTTTAAAAGGCA-AGATAAACT-TAAAATACTCTTTCATTGTCAATCGAAAGCATCCACT
* * *
229074 ACATGTTTCCGAATGCAAACATCAAATTATGATAGG-TTTAGACCAAGAACAAAAAATGTTTCAA
258 ACACGTTTCCAAATGCAAACATCAAATTATGATAGGTTTTA-ACCAAGAACAAAAAA-CTTTCAA
* *
229138 TTTATTTTCG-ATATATAACCT-TTTATAAGGTTATAAATGAA-ATATATATCATAATATTGATG
321 TTTATTTT-GAATATATAA-CTGTTTATAAGATTATAAATGAATA-ATATATAATAATATTGATG
* * * ** * *
229200 TTAAAATGTTATCAAAGTGATGATTGTTCATTGATAAATCATTTCAAGTTCTCAAAGGAATGATA
383 TAAAAATGTTATCAAAATGATAATCATTCATAGATAAATAATTTCAAGTTCTCAAAGGAATGATA
*
229265 AGCTTAAAATATACATTTCTTGTCAATGGATAGCATCTACTTCATGTTTCAAAATTCAAACATCC
448 AGCTTAAAATATACATTTCTTGTCAATGGATAGCATCTACTTCATGTTTCAAAATGCAAACATCC
* ** *
229330 AATTACGATAGGTTTTAA-TCAATAACAATGAAGATTTTAATTTATAAGCTTTTATAAGATTATA
513 AATTACGATAGGTTTTAACT-AAGAACAACAAAGATTTTAATTTATAAGCATTTATAAGATTATA
* * ** * * *
229394 AATGAAGTATATATCATAATATTTATGTTACAATGTTATTAAAATGATAATTGTTCATTGATAAA
577 AATGAA-T-CATATCATAATATTGATAATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAA
* * *
229459 TCATTTTAAGC-TTCTG-ACGACATGACAAAA
640 TCATTTCAAGCATT-TGAAAG-CATAACAAAA
* * * * *
229489 TTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCATCTC-CTACACGTTTCCTAGTGAAAACATCTGA
1 TTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGACAGCAT-TCACTACACGTTACCCAATGAAAACATC-AA
** * *
229553 TTATGA-ATGGTTTTAAAC-AAGAACAACAAA-TAATTCGATTTTATAATCATTGATAAGATTAT
64 TTATGATA-AATTTT-AACTAAGAACAACAAAGT-ATTC-AATTTATAATAATTGATAAGATTAT
* * *
229615 AAATGAAT-TATATTATAA-TACGGCTGATAAAATGTTATCAAAATAATAGTTATTCATTGATAA
125 AAATGAATATATATCATAACT-CGGATGATAAAATGTTATCAAAATAATAATTATTCATTGATAA
* * * *
229678 ATCATTTCAAGCTTTAAAAGGCAAGATAAACTTAAAATGCTCTTTCATTGTCCATGGATAGCATC
189 ATCATTTCAAGCTTTAAAAGGCAAGATAAACTTAAAATACTCTTTCATTGTCAATCGAAAGCATC
* * * *
229743 CACTACACGTTTTCAAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACTAAGAACAAGAAACTTTC
254 CACTACACGTTTCCAAATGCAAACATCAAATTATGATAGGTTTTAACCAAGAACAAAAAACTTTC
*
229808 AATTTATTTTGAATATATAATTGTTTATAAGATTATAAATGAATAATATATAATAATATTGATGT
319 AATTTATTTTGAATATATAACTGTTTATAAGATTATAAATGAATAATATATAATAATATTGATGT
*
229873 AAAAATGTTGTCAAAATGATAATCATTCATAGATAAATAATTTCAA
384 AAAAATGTTATCAAAATGATAATCATTCATAGATAAATAATTTCAA
229919 ACTTTTGAAG
Statistics
Matches: 900, Mismatches: 165, Indels: 85
0.78 0.14 0.07
Matches are distributed among these distances:
668 17 0.02
669 250 0.28
670 19 0.02
671 91 0.10
672 109 0.12
673 262 0.29
674 32 0.04
675 39 0.04
676 1 0.00
680 29 0.03
681 51 0.06
ACGTcount: A:0.39, C:0.12, G:0.12, T:0.37
Consensus pattern (669 bp):
TTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGACAGCATTCACTACACGTTACCCAATGAAAACATCAATT
ATGATAAATTTTAACTAAGAACAACAAAGTATTCAATTTATAATAATTGATAAGATTATAAATGA
ATATATATCATAACTCGGATGATAAAATGTTATCAAAATAATAATTATTCATTGATAAATCATTT
CAAGCTTTAAAAGGCAAGATAAACTTAAAATACTCTTTCATTGTCAATCGAAAGCATCCACTACA
CGTTTCCAAATGCAAACATCAAATTATGATAGGTTTTAACCAAGAACAAAAAACTTTCAATTTAT
TTTGAATATATAACTGTTTATAAGATTATAAATGAATAATATATAATAATATTGATGTAAAAATG
TTATCAAAATGATAATCATTCATAGATAAATAATTTCAAGTTCTCAAAGGAATGATAAGCTTAAA
ATATACATTTCTTGTCAATGGATAGCATCTACTTCATGTTTCAAAATGCAAACATCCAATTACGA
TAGGTTTTAACTAAGAACAACAAAGATTTTAATTTATAAGCATTTATAAGATTATAAATGAATCA
TATCATAATATTGATAATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGC
ATTTGAAAGCATAACAAAA
Found at i:232781 original size:25 final size:24
Alignment explanation
Indices: 232738--232797 Score: 66
Period size: 25 Copynumber: 2.5 Consensus size: 24
232728 GCCATGGTTT
* * **
232738 GTGATATACGTGGCAAGGCCACGG
1 GTGATATATGTGACAAGGCCACAA
*
232762 GTTGATATATGTGACTAGGCCACAA
1 G-TGATATATGTGACAAGGCCACAA
232787 GTGATATATGT
1 GTGATATATGT
232798 AGTTACGACC
Statistics
Matches: 30, Mismatches: 5, Indels: 2
0.81 0.14 0.05
Matches are distributed among these distances:
24 11 0.37
25 19 0.63
ACGTcount: A:0.28, C:0.15, G:0.30, T:0.27
Consensus pattern (24 bp):
GTGATATATGTGACAAGGCCACAA
Found at i:234526 original size:229 final size:228
Alignment explanation
Indices: 234220--235318 Score: 966
Period size: 229 Copynumber: 4.8 Consensus size: 228
234210 GATTCTTTTT
* * ** *
234220 TATAATCATTGATAAGATTATAAATGAATTGTATCATTATATTGATGACAAAATGTTATCAAAAT
1 TATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTATATCAGAATATTGATGA-TAAATGTTATCAAAAT
** * *
234285 GATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTCGTAGGTATGATAAATTTAAAATGCTCTTTT
65 GATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTCAAAGGTATCATAAACTTAAAATGCTCTTTT
* * * * * *
234350 ATTAGCAATGGATAGCATCCACTTCATGTTGCCCAATGCAAACATTCAATTATGATAAATTTTAA
130 CTT-GCAATGGATAGCATCCACTTCATATTTCCCAATGTAAACATCCAATTATGATAAGTTTTAA
* * * *
234415 CCAAGAACAATATAGCTTTCAAATTATTTTCGACT-
194 CCAAGAACAACAAAGCTTTCAATTTATTTTTGA-TA
** * * *
234450 TGGAACCATTTATAAGATTATAAATGAATTATATCAGAATATGGATGATAAATGTTATTAAAATG
1 TATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTATATCAGAATATTGATGATAAATGTTATCAAAATG
* * * * *
234515 ATAATTATTCATTAATAAATCATTTCAAGCTGTTC-AATGTATCATAAACTTTAAATGCTCCTTC
66 ATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCT-TTCAAAGGTATCATAAACTTAAAATGCTCTTTT
* * * * *****
234579 CTTTTCAATGGATAGCATCCACTACATATTT-TCATATGTAAACATCCAATTATGATAGGNNNNN
130 C-TTGCAATGGATAGCATCCACTTCATATTTCCCA-ATGTAAACATCCAATTATGATAAGTTTTA
***** * *
234643 NNNNNGAATAACAAAGCTTTCGATTTATTTTTGATA
193 ACCAAGAACAACAAAGCTTTCAATTTATTTTTGATA
** * * * *
234679 TATAATTTTTTATAAGATTATAAATGAATTATGTACTGTAATATTGATGTTAAAATGTTATCGAA
1 TATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTATAT-CAG-AATATTGATGAT-AAATGTTATCAAA
* * * ** * *
234744 ATGATAATTGTTCATTGATAAATAATTTCAATCTTTCATTGGTATAATAAGCTTAAAATGCT-TT
63 ATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTCAAAGGTATCATAAACTTAAAATGCTCTT
* ** * * * * *
234808 TTCCTTCTCAATGGATAAAATCAACCTCACATTTCCCAA--T--ACAT-CTATTATGACAAGTTT
128 TT-CTT-GCAATGGATAGCATCCACTTCATATTTCCCAATGTAAACATCCAATTATGATAAGTTT
* * *
234868 TAACCAA-AGACAACAAAGCTTTGAATTTATTTTTTATT
191 TAACCAAGA-ACAACAAAGCTTTCAATTTATTTTTGATA
* * * * * *
234906 TATAATCATTTGTAAGAGTAAAAATGAATTTTATACCATAATATCGATGATAAAATGTTATCAAA
1 TATAATCATTTATAAGATTATAAATGAA--TTATATCAGAATATTGATGAT-AAATGTTATCAAA
* * *
234971 ATGATAATTATCCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTCAAATGCATCATAAACTTAAAATGCTCTT
63 ATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTCAAAGGTATCATAAACTTAAAATGCTCTT
* * * * * *
235036 TGCTTGTCAATGGATAGCATACACTACATATTTTCAAATGTAAATATCCAATTATGA-AAGGTTT
128 TTCTTG-CAATGGATAGCATCCACTTCATATTTCCCAATGTAAACATCCAATTATGATAA-GTTT
* * * * *
235100 TAACCAAAAACAACAAAGTTTTGATTTTGTTTTTGATA
191 TAACCAAGAACAACAAAGCTTTCAATTTATTTTTGATA
** * *
235138 TATAATTTTTTATAAGATTATAAAT-AATTATAT-ATCGTCATATTGATGTAAAAATGTTATCAA
1 TATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTATATCA--G-AATATTGATG-ATAAATGTTATCAA
* * ** * * *
235201 AATGATAATTGTTCATTGATAAATTATTTCAAGCTTT-TGAGGAATGATAAACTTAAAATGTTCT
62 AATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTCAAAGGTATCATAAACTTAAAATGCTCT
* * * *
235265 TTTCATGTCAATGGATAGCAACCACTTCATGTTTCCTAATGTAAACATCCAATT
127 TTTCTTG-CAATGGATAGCATCCACTTCATATTTCCCAATGTAAACATCCAATT
235319 NNNNNNNNNN
Statistics
Matches: 682, Mismatches: 160, Indels: 54
0.76 0.18 0.06
Matches are distributed among these distances:
226 1 0.00
227 157 0.23
228 12 0.02
229 171 0.25
230 114 0.17
231 78 0.11
232 146 0.21
233 3 0.00
ACGTcount: A:0.38, C:0.12, G:0.11, T:0.38
Consensus pattern (228 bp):
TATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTATATCAGAATATTGATGATAAATGTTATCAAAATG
ATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTCAAAGGTATCATAAACTTAAAATGCTCTTTTC
TTGCAATGGATAGCATCCACTTCATATTTCCCAATGTAAACATCCAATTATGATAAGTTTTAACC
AAGAACAACAAAGCTTTCAATTTATTTTTGATA
Found at i:234962 original size:227 final size:229
Alignment explanation
Indices: 234231--235281 Score: 770
Period size: 227 Copynumber: 4.6 Consensus size: 229
234221 ATAATCATTG
* * * * *
234231 ATAAGATTATAAATGAATTGTAT--CATTATATTGATGACAAAATGTTATCAAAATGATAATTAT
1 ATAAGATTATAAATGAATTATATACCGTAATATTGATG-TAAAATGTTATCAAAATGATAATTGT
* ** * * * * ** **
234294 TCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTCGTAGGTATGATAAATTTAAAATGCTCTTTTATTAGCAAT
65 TCATTGATAAATAATTTCAAGCTTTCAAATGCATAATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTCTCAAT
** * * ** * * * * * *
234359 GGATAGCATCCACTTCATGTTGCCCAATGCAAACATTCAATTATGATAA-ATTTTAACCAAGAAC
130 GGATAAAATACACTACACATT-TCCAAAG-TAACATCCAATTATGA-AAGGTTTTAACCAAAAAC
* * * * * ** ***
234423 AATATAGCTTTCAAATTATTTTCGACT-TGGAACCATTT
192 AACAAAGCTTTGAATTTATTTTTGA-TATATAATTTTTT
* * * *
234461 ATAAGATTATAAATGAATTATAT-CAG-AATATGGATG-ATAAATGTTATTAAAATGATAATTAT
1 ATAAGATTATAAATGAATTATATACCGTAATATTGATGTA-AAATGTTATCAAAATGATAATTGT
* * * * * * *
234523 TCATTAATAAATCATTTCAAGCTGTTC-AATGTATCATAAACTTTAAATGCTCCTTCCTTTTCAA
65 TCATTGATAAATAATTTCAAGCT-TTCAAATGCATAATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTCTCAA
** * * * * * *********** *
234587 TGGATAGCATCCACTACATATTTTCATATGTAAACATCCAATTATGATAGGNNNNNNNNNNGAAT
129 TGGATAAAATACACTACACATTTCCA-AAGT-AACATCCAATTATGAAAGGTTTTAACCAAAAAC
234652 AACAAAGCTTTCG-ATTTATTTTTGATATATAATTTTTT
192 AACAAAGCTTT-GAATTTATTTTTGATATATAATTTTTT
* * *
234690 ATAAGATTATAAATGAATTATGTACTGTAATATTGATGTTAAAATGTTATCGAAATGATAATTGT
1 ATAAGATTATAAATGAATTATATACCGTAATATTGATG-TAAAATGTTATCAAAATGATAATTGT
* * * * *
234755 TCATTGATAAATAATTTCAATCTTTC-ATTGGTATAATAAGCTTAAAATGCTTTTTCCTTCTCAA
65 TCATTGATAAATAATTTCAAGCTTTCAAAT-GCATAATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTCTCAA
* * *
234819 TGGATAAAAT-CAACCT-CACATTTCCCAA-T-ACAT-CTATTATGACAA-GTTTTAACCAAAGA
129 TGGATAAAATAC-A-CTACACATTTCCAAAGTAACATCCAATTATGA-AAGGTTTTAACCAAAAA
* * **
234878 CAACAAAGCTTTGAATTTATTTTTTATTTATAATCATTT
191 CAACAAAGCTTTGAATTTATTTTTGATATATAATTTTTT
* * * * * * *
234917 GTAAGAGTAAAAATGAATTTTATACCATAATATCGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTAT
1 ATAAGATTATAAATGAATTATATACCGTAATATTGATG-TAAAATGTTATCAAAATGATAATTGT
* * * * *
234982 CCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTCAAATGCATCATAAACTTAAAATGCTCTTTGCTTGTCAAT
65 TCATTGATAAATAATTTCAAGCTTTCAAATGCATAATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTCTCAAT
** * * *
235047 GGATAGCATACACTACATATTTTCAAATGTAAATATCCAATTATGAAAGGTTTTAACCAAAAACA
130 GGATAAAATACACTACACATTTCCAAA-GT-AACATCCAATTATGAAAGGTTTTAACCAAAAACA
* * *
235112 ACAAAGTTTTGATTTTGTTTTTGATATATAATTTTTT
193 ACAAAGCTTTGAATTTATTTTTGATATATAATTTTTT
* *
235149 ATAAGATTATAAAT-AATTATATATCGTCATATTGATGTAAAAATGTTATCAAAATGATAATTGT
1 ATAAGATTATAAATGAATTATATACCGTAATATTGATGT-AAAATGTTATCAAAATGATAATTGT
* ** * * * * * * *
235213 TCATTGATAAATTATTTCAAGCTTT-TGAGGAATGATAAACTTAAAATGTTCTTTTCATGTCAAT
65 TCATTGATAAATAATTTCAAGCTTTCAAATGCATAATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTCTCAAT
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130 GGATA
235282 GCAACCACTT
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ATAAGATTATAAATGAATTATATACCGTAATATTGATGTAAAATGTTATCAAAATGATAATTGTT
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GATAAAATACACTACACATTTCCAAAGTAACATCCAATTATGAAAGGTTTTAACCAAAAACAACA
AAGCTTTGAATTTATTTTTGATATATAATTTTTT
Found at i:235024 original size:459 final size:457
Alignment explanation
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234221 ATAATCATTG
234231 ATAAGATTATAAATGAA-T-TGTATCAT-TATATTGATG-ACAAAATGTTATCAAAATGATAATT
1 ATAAGATTATAAATGAATTATGTA-C-TGTATATTGATGTA-AAAATGTTATCAAAATGATAATT
* * * * *
234292 ATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTCGTAGGTATGATAAATTTAAAATGCTCTTTTATTAGCA
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** * * ** *
234357 ATGGATAGCATCCACTTCATGTTGCCCAATGCAAACATTCAATTATGATAAATTTTAACCAAGAA
128 ATGGATAAAATCAACCTCACATTGCCCAAT---AACATTCAATTATGACAAATTTTAACCAAGAA
* * * * * *
234422 CAATATAGCTTTCAAATTATTTTCGACTTGGAACCATTTATAAGATTATAAATGAATTATATCAG
190 CAACAAAGCTTTCAAATTATTTTCGACTTAGAACCATTTATAAGAGTAAAAATGAATTATACCAG
* * *
234487 AATATGGATGATAAATGTTATTAAAATGATAATTATTCATTAATAAATCATTTCAAGCTGTTCAA
255 AATATCGATGATAAATGTTATCAAAATGATAATTATCCATTAATAAATCATTTCAAGCTGTTCAA
* * * * *
234552 TGTATCATAAACTTTAAATGCTCCTTCCTTTTCAATGGATAGCATCCACTACATATTTTCATATG
320 TGCATCATAAACTTAAAATGCTCCTTCCTTGTCAATGGATAGCATACACTACATATTTTCAAATG
* *********** *
234617 TAAACATCCAATTATGATAGGNNNNNNNNNNGAATAACAAAGCTTTCGA-TTTATTTTTGATATA
385 TAAACATCCAATTATGAAAGGTTTTAACCAAAAACAACAAAG-TTTCGATTTTATTTTTGATATA
234681 TAATTTTTT
449 TAATTTTTT
* *
234690 ATAAGATTATAAATGAATTATGTACTGTAATATTGATGTTAAAATGTTATCGAAATGATAATTGT
1 ATAAGATTATAAATGAATTATGTACTGT-ATATTGATGTAAAAATGTTATCAAAATGATAATTGT
* * * * **
234755 TCATTGATAAATAATTTCAATCTTTCATTGGTATAATAAGCTTAAAATGCT-TTTTCCTTCTCAA
65 TCATTGATAAATAATTTCAAGCTTTCATAGGTATAATAAACTTAAAATGCTCTTTT-ATTAGCAA
* * *
234819 TGGATAAAATCAACCTCACATTTCCCAAT-ACA-TCTATTATGACAAGTTTTAACCAA-AGACAA
129 TGGATAAAATCAACCTCACATTGCCCAATAACATTCAATTATGACAAATTTTAACCAAGA-ACAA
* * ** * * * * *
234881 CAAAGCTTTGAATTTATTTTTTATTTATAATCATTTGTAAGAGTAAAAATGAATTTTATACCATA
193 CAAAGCTTTCAAATTATTTTCGACTTAGAACCATTTATAAGAGTAAAAATGAA--TTATACCAGA
*
234946 ATATCGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATCCATTGATAAATCATTTCAAGCT-TTCAA
256 ATATCGATGAT-AAATGTTATCAAAATGATAATTATCCATTAATAAATCATTTCAAGCTGTTC-A
* *
235010 ATGCATCATAAACTTAAAATGCTCTTTGCTTGTCAATGGATAGCATACACTACATATTTTCAAAT
319 ATGCATCATAAACTTAAAATGCTCCTTCCTTGTCAATGGATAGCATACACTACATATTTTCAAAT
* * *
235075 GTAAATATCCAATTATGAAAGGTTTTAACCAAAAACAACAAAGTTTTGATTTTGTTTTTGATATA
384 GTAAACATCCAATTATGAAAGGTTTTAACCAAAAACAACAAAGTTTCGATTTTATTTTTGATATA
235140 TAATTTTTT
449 TAATTTTTT
*
235149 ATAAGATTATAAAT-AATTATATA-TCGTCATATTGATGTAAAAATGTTATCAAAATGATAATTG
1 ATAAGATTATAAATGAATTATGTACT-GT-ATATTGATGTAAAAATGTTATCAAAATGATAATTG
* * * *
235212 TTCATTGATAAATTATTTCAAGCTTT--TGAGGAATGATAAACTTAAAATGTTCTTTT
64 TTCATTGATAAATAATTTCAAGCTTTCAT-AGGTATAATAAACTTAAAATGCTCTTTT
235268 CATGTCAATG
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (457 bp):
ATAAGATTATAAATGAATTATGTACTGTATATTGATGTAAAAATGTTATCAAAATGATAATTGTT
CATTGATAAATAATTTCAAGCTTTCATAGGTATAATAAACTTAAAATGCTCTTTTATTAGCAATG
GATAAAATCAACCTCACATTGCCCAATAACATTCAATTATGACAAATTTTAACCAAGAACAACAA
AGCTTTCAAATTATTTTCGACTTAGAACCATTTATAAGAGTAAAAATGAATTATACCAGAATATC
GATGATAAATGTTATCAAAATGATAATTATCCATTAATAAATCATTTCAAGCTGTTCAATGCATC
ATAAACTTAAAATGCTCCTTCCTTGTCAATGGATAGCATACACTACATATTTTCAAATGTAAACA
TCCAATTATGAAAGGTTTTAACCAAAAACAACAAAGTTTCGATTTTATTTTTGATATATAATTTT
TT
Found at i:239364 original size:28 final size:25
Alignment explanation
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Period size: 25 Copynumber: 2.6 Consensus size: 25
239322 AGGCTGTTTG
239332 ACGTGGCTAGGCCATGGTCTGTGATTAT
1 ACGTGGCTAGGCCATGG-CT-TG-TTAT
* * *
239360 ACGTGGCAAGGCCACGGGTTGTTAT
1 ACGTGGCTAGGCCATGGCTTGTTAT
*
239385 ACTTGGCTAGGCCATG
1 ACGTGGCTAGGCCATG
239401 AGTTGATATA
Statistics
Matches: 35, Mismatches: 6, Indels: 3
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTGGCTAGGCCATGGCTTGTTAT
Found at i:239405 original size:25 final size:25
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239346 TGGTCTGTGA
*
239356 TTATACGTGGCAAGGCCACGGGTTG
1 TTATACGTGGCAAGGCCACGAGTTG
* * *
239381 TTATACTTGGCTAGGCCATGAGTTG
1 TTATACGTGGCAAGGCCACGAGTTG
*
239406 ATATAC
1 TTATAC
239412 ATAGTTGCGA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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TTATACGTGGCAAGGCCACGAGTTG
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240527 GATTTTGTTT
* * * * *
240537 TATAATCATTGATAAGATTATAAATGAA-T-TGTATCATAATATTGTTGATAAAATGTTATCCAA
1 TATAATCTTTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAA
* * * *
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* * ** * * **
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* * * * *
240728 TTAACCAGGAATAACACAGCTTTCTATTTATTTTCGACT-
191 TTAACCAAGAATAAGAAAGCTTTCAATTTATTTTTGA-TA
** ** * * *
240767 T-GGA-CTCATATAAGATTGTAAATGAA-T-TATATCAGAATATGGATGATAAAATGTTATCAAA
1 TATAATCTTTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAA
* ** * * **
240828 ATGATAATTATCCATTG-------A-TTCAAGCTTTTCAATGTGTCATAAACTTAAAATAC-TCA
66 ATGATAATTAT-CATTGATAAATAATTTCAAGC-TTTCAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTTTT
* * *
240884 TT-TT-TCAATGGATATCATCCAC--CACATATTTCCAAATGTAAACATCCAATTATGATAGGTT
129 TTCTTGTCAATGGATAGCATCCACTTCACGT-TTT-CAAATGCAAACAT-CAATTATGATAGGTT
* **
240945 TTAACCAAGAATAACAAAGCTTTTGATTTATTTTTGATA
191 TTAACCAAGAATAAGAAAGCTTTCAATTTATTTTTGATA
* * *
240984 TATAATCTTTTATAAGATTATAAATGAATTATATACCATAATATTAATGTTAAAATGTT-TGCAA
1 TATAATCTTTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTAT-CAA
* * ** * *
241048 AATGATAGTTGGTCATTGATAAATAATTTCAAGCTTTCGTTGGCATGATAAACTTACAATGCTCT
65 AATGATAATT-ATCATTGATAAATAATTTCAAGCTTTC-AAGGCATGATAAACTTAAAATGCTTT
* * * *** * * *
241113 TTCCTTGTCGATGGATAGCATCCACCTGTTG-TTTGACA---AAACATCTAATTATGACAGGTTT
128 TTTCTTGTCAATGGATAGCATCCACTTCACGTTTTCAAATGCAAACATC-AATTATGATAGGTTT
* *
241174 TAACCAA-AA-ACAGCAAAGCTTTGAATTTAGTTTTT-ATT
192 TAACCAAGAATA-AG-AAAGCTTTCAATTTA-TTTTTGATA
* * * * * *
241212 TATAATCATTTGTAATG-TTATAAATTAATTATATATCATAATATCGATGAGAAAATGTGATCAA
1 TATAATCTTTTATAA-GATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAA
* * * *
241276 AATGATAATTATCAATTGATAAATTATTTCAAGCTTTCTAGTGCATCATAAACATAAAATGCTTT
65 AATGATAATTATC-ATTGATAAATAATTTCAAGCTTTCAAG-GCATGATAAACTTAAAATGCTTT
* * * *
241341 TTTCTTATCAATGGATAGTATACACTTCACGTTTTCAAATGCAAACACTCGATTATGATAGGTTT
128 TTTCTTGTCAATGGATAGCATCCACTTCACGTTTTCAAATGCAAACA-TCAATTATGATAGGTTT
* *
241406 TAACTAAGAATAAGGAAGCTTTCAATTTATTTTTGATA
192 TAACCAAGAATAAGAAAGCTTTCAATTTATTTTTGATA
* * * *
241444 TGTACTCTTTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCGTAACATTGAT-ATTAAAATGTTATCAA
1 TATAATCTTTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGA-TAAAATGTTATCAA
* * * * *
241508 AATTATAATTATTCATAGATAAATAATTTCAAACTTTCGAAGGCATGATAAACATAAAATGCTCT
65 AATGATAATTA-TCATTGATAAATAATTTCAAGCTTTC-AAGGCATGATAAACTTAAAATGCTTT
* * * * * *
241573 TTCCTTGTCAATGGATAGCATCCACTTCAAGTTTCTGAAA-GTAAACATCCGATTATAAT-GGAT
128 TTTCTTGTCAATGGATAGCATCCACTTCACGTTT-TCAAATGCAAACAT-CAATTATGATAGG-T
* * ** * ** ** * *
241636 TTTAGCCATGAACGACAAATTTTTCAGCTTATATTCT-ATT
190 TTTAACCAAGAATAAGAAAGCTTTCAATTTAT-TTTTGATA
* * * * *
241676 TATAATCATTCATAAGATTATAAATGAATTATATATAATAAT-TTGGATGATATAATGATATCAA
1 TATAATCTTTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATT-GATGATAAAATGTTATCAA
* * * ** * ** * * *
241740 AATTATAATTTTTTATACATAAATCATTTCAAGCATTGGAAGGAATGATAAACTTAAAACGCTCT
65 AATGATAA-TTATCATTGATAAATAATTTCAAGC-TTTCAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTTT
* * ** ** * ** * * * *
241805 TTCCTTGTCAATGGATAACATCTGCTGAAGGTTGCCCAATACAAACATCCAATTATGATAAGTTC
128 TTTCTTGTCAATGGATAGCATCCACTTCACGTTTTCAAATGCAAACAT-CAATTATGATAGGTTT
* * * * *
241870 TAATCAAAAACAACAAAGCTTTCATTTTATTTTTGAT-
192 TAACCAAGAATAAGAAAGCTTTCAATTTATTTTTGATA
* * * * * * *
241907 TGGTAATCATTTATAAGTTTGTAAATGAATTATGTACCATAATATTGATGTTAAAATG--AT--A
1 T-ATAATCTTTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAA
* ** **
241968 ATTG-T--TTAGT-A---ATAAATAATTTCAAGCTTTTGTAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCA
65 AATGATAATTA-TCATTGATAAATAATTTCAAGC-TTTCAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTTT
* * * * * * * **
242026 TTCCTTGTCAATGGCTAACGTCCACTTCATGTTTTC---T-AAAACATCTAATTATGACAAATTT
128 TTTCTTGTCAATGGATAGCATCCACTTCACGTTTTCAAATGCAAACATC-AATTATGATAGGTTT
* * * *
242087 TAACCAAGAA-CAGCAAAGCTTTGAATTTATTTCTTTATT
192 TAACCAAGAATAAG-AAAGCTTTCAATTTATTT-TTGATA
* * * *
242126 TATAATCATTTGTAAGATTATAAATGAATTATATATCCTAATATTGATGATGAAATGTTATCAAA
1 TATAATCTTTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAA
* * * * *
242191 ATGATAATTACTCATTG----ATAA-TTCAAGCATTCGAAGGAACGAGAAACTTAAAATGCTCTT
66 ATGATAATTA-TCATTGATAAATAATTTCAAGCTTTC-AAGGCATGATAAACTTAAAATGCTTTT
* * * * * *
242251 TCCTTTTCAATGGATAGCATCAACTACACGTTTCCGAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTT
129 TTCTTGTCAATGGATAGCATCCACTTCACGTTTTCAAATGCAAACAT-CAATTATGATAGGTTTT
* * *
242316 AACCAAGAACAAGAAAGCTTTCAATTTA-TTTTCAAA
193 AACCAAGAATAAGAAAGCTTTCAATTTATTTTTGATA
* *
242352 TTATAATCTTTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGTTAAAATCTTATCAA
1 -TATAATCTTTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAA
* * * * * * *
242417 AAAGGTAATTGTTCATTGTTAAATAATTTCAAGGTTTTATAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCT
65 AATGATAATT-ATCATTGATAAATAATTTCAAGCTTTCA-AGGCATGATAAACTTAAAATGCTTT
*** * * * * * * * ****
242482 TTTCTTGTCAACAAATAGCTTCAAGTTCACGATTCCCAATGTAAACATCCAATTATGATAAACCT
128 TTTCTTGTCAATGGATAGCATCCACTTCACGTTTTCAAATGCAAACAT-CAATTATGATAGGTTT
* * ** * * *
242547 TAACCGAGAACAATG-AAGCTTTTGACTTATTTTTGGTT
192 TAACCAAGAATAA-GAAAGCTTTCAATTTATTTTTGATA
* * * *
242585 TATAAT-TATTTATAAAATTATAAATGTAA-TATAT-T-ATAATATTGAAGAGAAAATGTTATTA
1 TATAATCT-TTTATAAGATTATAAATG-AATTATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCA
* * ** * * *
242646 AAGTGATAACTATTCATTGATAAATTGTTTTAAGCTTTTGAAGGCATGATAAACTTAAGATGC-T
64 AAATGATAATTA-TCATTGATAAATAATTTCAAGC-TTTCAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTT
* * * * ** ** * * * *
242710 CTTTCTTAGTCATTAGATAGCATCCACATCTTGTTACCCATTGCAAACATCCGATTATGATAGCT
127 TTTTCTT-GTCAATGGATAGCATCCACTTCACGTTTTCAAATGCAAACAT-CAATTATGATAGGT
* * * * *
242775 TTTAACCTAGAACAATAATGCTTTC-A---A---TTGGTA
190 TTTAACCAAGAATAAGAAAGCTTTCAATTTATTTTTGATA
* ** * * * *
242808 -ATCAT-TTACAT-TG-TTATAAATGAA-T-TATATCATAATTTTCATGATGAAATGTTATCAAA
1 TATAATCTTTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAA
* * * * *
242867 ATGATAATTATACATTCATAAATTATTTCAAGCTTTCGAAGGCATGAGAAACTTAAAAT-ATTAT
66 ATGATAATTAT-CATTGATAAATAATTTCAAGCTTTC-AAGGCATGATAAACTTAAAATGCTTTT
* ** * * * *
242931 TTCTTTGTCAATGGATAGCATCCACTTCACGTTTTTC-GATGTTAATATCTAATTACGAAAGGCT
129 TTC-TTGTCAATGGATAGCATCCACTTCACG-TTTTCAAATGCAAACATC-AATTATGATAGGTT
* * * * ** ** *
242995 TTGACCGAGAACAATAAAGCTTTCAACATATTTTCAATT
191 TTAACCAAGAATAAGAAAGCTTTCAATTTATTTTTGATA
** * * * * * *
243034 TATAATGATTTATAAGATTGTAAATGAATTATATATAACAATAATGATGATAAAGTGTTATTAAA
1 TATAATCTTTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAA
* * * ** *
243099 ATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTGAAGCTTACGAAGTAATGATAAACTTAAAAAGC-TTT
66 ATGATAATTA-TCATTGATAAATAATTTCAAGCTTTC-AAGGCATGATAAACTTAAAATGCTTTT
* ** * * * * *
243163 TTCTTTTTCGGTAGATAGCATCCACTTCATGTTTCCCAATGAAAACATCCAATTATGATAGGTTT
129 TTC-TTGTCAATGGATAGCATCCACTTCACGTTTTCAAATGCAAACAT-CAATTATGATAGGTTT
* *
243228 TAACCAAGAACAACG-AAGCTTTCGATTTA----T-A-A
192 TAACCAAGAATAA-GAAAGCTTTCAATTTATTTTTGATA
* * * *
243260 T-T-A---TTGATAAG-TTATAAATGAA-T-CATATCATAATATAGATGATAAAATCTTATCAAA
1 TATAATCTTTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAA
* * * *
243317 ATGATAATTAATCATTGACAAA-ATATTTCAAGCTTTTGGAA-GCATGATAATCTT-AAATGCTC
66 ATGATAATT-ATCATTGATAAATA-ATTTCAAGC-TTT-CAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTT
* * * * * * ** * *
243379 TTTTCTTGTTAAT-AACTAGCATCCACTTCACGATTTCTATTGTAAACATTTGATTATGATAAGC
127 TTTTCTTGTCAATGGA-TAGCATCCACTTCACGTTTTCAAATGCAAACA-TCAATTATGATAGGT
*** * * * * * *
243443 TTTAATTGAGAA-CAGTAAAACTTTCGACTTATTTTTTATT
190 TTTAACCAAGAATAAG-AAAGCTTTCAATTTATTTTTGATA
** * * * * *
243483 TATAATGATTTATAAGATTATAAAAGAATTATATATCATAATATTAAAGATAAAGTGTTATTAAA
1 TATAATCTTTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAA
* * * * *
243548 ATTATAATTATTCATTGATAAATTATTTTAAGCTTTCAAAGGCATGATAAACTTAAAACGC-TGT
66 ATGATAATTA-TCATTGATAAATAATTTCAAGCTTTC-AAGGCATGATAAACTTAAAATGCTTTT
* * * * * * * * * *
243612 TTCTTTTCACTGGATAGCATCCACTTGATGCTTCCCAATGGAAACATCAAATTATGAAAGGTTTC
129 TTCTTGTCAATGGATAGCATCCACTTCACGTTTTCAAATGCAAACATC-AATTATGATAGGTTTT
* * * *
243677 AACTAAGAACAATTAAA-C---C--TTTA------ATT
193 AACCAAGAATAA-GAAAGCTTTCAATTTATTTTTGATA
* ** * *
243703 TATAATCATGGATAAGATTATAAATGAA-TA-ATATTATAATATTGATGATAAAATATTATCAAA
1 TATAATCTTTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAA
* * * ** *
243766 TTGATAATTATTTATTGATAAATCATTTCAAGCTTTTGGAGGCATTATAAACTTAAAATGCTTTT
66 ATGATAATTA-TCATTGATAAATAATTTCAAGC-TTTCAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTTTT
* * * * * * * * * * * *
243831 TCCTTATAAATGGATAGGATCAACTTCAC-CTTTCTAATGAAAACAACCGATTATAATAGG-CTT
129 TTCTTGTCAATGGATAGCATCCACTTCACGTTTTCAAATGCAAAC-ATCAATTATGATAGGTTTT
* * * * * * *
243894 AA-TAGAGAACAATAAAGCGTTTGACTTT-TTTTCGATT
193 AACCA-AGAATAAGAAAGC-TTTCAATTTATTTTTGATA
** * * *
243931 TATAATGATTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAACATTGATGATAAAGTGTTATTAAA
1 TATAATCTTTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAA
* * * * * * ** *
243996 ATTATAATTATTCATTGAGAAATCATTTTAAGCTTTCATCGG-ACTGATAAACTAAAAACACTCT
66 ATGATAATTA-TCATTGATAAATAATTTCAAGCTTTCA-AGGCA-TGATAAACTTAAAATGCTTT
* * ** * * * * ** *
244060 TTTATT-TCACTAAATAGCATCCACTACACATTTCCTAATGCAAACATCTAATTACAATAAGTTT
128 TTTCTTGTCAATGGATAGCATCCACTTCACGTTTTCAAATGCAAACATC-AATTATGATAGGTTT
* ** * *
244124 TAACTAAGAACGACAAAGCTTTC----GA--TTTG---
192 TAACCAAGAATAAGAAAGCTTTCAATTTATTTTTGATA
* * * *
244153 --TAATCATTTATAAGATTATAAATGAA-T-CATACCATAATATT-ACTGATAAAATGTTATCCA
1 TATAATCTTTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGA-TGATAAAATGTTATCAA
* * * * * *
244213 AATGATAATTGTTCATTGTTAAGTCATTTCAAGCTTTTGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCT
65 AATGATAATT-ATCATTGATAAATAATTTCAAGC-TTTCAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTTT
* * * * * * * *** ** * * *
244278 TTCCTTGTCAATGCACAACTTCTACTTCATGTCGCCCGATGCAAATATTCAACTATGATATGTTT
128 TTTCTTGTCAATGGATAGCATCCACTTCACGTTTTCAAATGCAAACA-TCAATTATGATAGGTTT
* * * *
244343 TAACCAAG-ATCAATAGAGCTTTCAATTTATTTTTTATT
192 TAACCAAGAAT-AAGAAAGCTTTCAATTTATTTTTGATA
* * * * * * *
244381 TGTAATCATTGATAAAATTATAAATGAA-T-TATATCAGAATATGGATCATAAAATGTTATCAAA
1 TATAATCTTTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAA
* * * * * * **
244444 ATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTTGAATGCATCATGAACTTTAAATGCTCCT
66 ATGATAATTA-TCATTGATAAATAATTTCAAGC-TTTCAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTTTT
* * * * *
244509 TCCTTTTCAATGGATAGCATCCACTGCACATTTTCAAATGTAAACATCCAATTATGATAGGTTTT
129 TTCTTGTCAATGGATAGCATCCACTTCACGTTTTCAAATGCAAACAT-CAATTATGATAGGTTTT
* **
244574 AACCAAGAATAACAAAGCTTTCAATTTATTTTCAATA
193 AACCAAGAATAAGAAAGCTTTCAATTTATTTTTGATA
* * * * *
244611 TGTAATCTTTTATATGATTATAAACGAATTATACACCATAATATTGAT-ATTAAAATGTTATCAA
1 TATAATCTTTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGA-TAAAATGTTATCAA
* * * * *
244675 AATAACAATTGTTCATTGATAAATAATTTCAGGTTTTCATAGGCATGATAAACTTAAAATG-TTA
65 AATGATAATT-ATCATTGATAAATAATTTCAAGCTTTCA-AGGCATGATAAACTTAAAATGCTT-
* *
244739 TTTCCTTGTCAAAGGATAGCAT
127 TTTTCTTGTCAATGGATAGCAT
244761 TATAATAGGC
Statistics
Matches: 3079, Mismatches: 704, Indels: 420
0.73 0.17 0.10
Matches are distributed among these distances:
215 4 0.00
216 13 0.00
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233 34 0.01
234 1 0.00
ACGTcount: A:0.38, C:0.13, G:0.12, T:0.37
Consensus pattern (229 bp):
TATAATCTTTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAA
ATGATAATTATCATTGATAAATAATTTCAAGCTTTCAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTTTTTT
CTTGTCAATGGATAGCATCCACTTCACGTTTTCAAATGCAAACATCAATTATGATAGGTTTTAAC
CAAGAATAAGAAAGCTTTCAATTTATTTTTGATA
Found at i:243520 original size:681 final size:677
Alignment explanation
Indices: 241242--244478 Score: 1624
Period size: 681 Copynumber: 4.8 Consensus size: 677
241232 TAAATTAATT
* * * * * * *
241242 ATATATCATAATATCGATGAGAAAATGTGATCAAAATGATAA-TTATCAATTGATAAATTATTTC
1 ATATATCATAATATAGAAGAGAAAATCTTATCAAAATGATAACTAATC-ATTGACAAAATATTTC
* * * * * * * *
241306 AAGCTTTCT--AGTGCATCATAAACATAAAATGCTTTTTTCTTA-TCAATGGATAGTATACACTT
65 AAGCTTT-TGAAG-GCATGATAAACTTAAGATGC-TCTTTCTTAGTCAATAGATAGCATCCACAT
** * * * * *
241368 CACGTTTTCAAATGCAAACA-CTCGATTATGATAGGTTTTAA-CTAAGAATAAGGAA-GCTTTCA
127 CACGTTACCCATTGCAAACATC-CGATTATGATAGCTTTTAACCT-AGAACAA-AAATGC-TT--
* * * * *
241430 ATTTATTT-TTGATATGTACTCTTTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCGTAACATTGAT-A
186 ATTT-TTTATT--TA--TAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTAATGA
* * * * * *
241493 TTAAAATGTTATCAAAATTATAATTATTCATAGATAAATAATTTCAAACTTTCGAAGGCATGATA
246 -TGAAATGTTATCAAAATGATAATTA-TCATTGATAAATTATTTCAAGCTTTCGAAGGCATGAGA
* * * * * * *
241558 AACATAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCATCCACTTCAAGTTTCTGAAAGTAAACATCC
309 AACTTAAAATGCTATTT-CTTTTCAATGGATAGCATCCACTTCACGTTTCCGAATGCAAACATCC
* * * * * * * * ** * * * * * *
241623 GATTA-TAATGGATTTTAGCCATGAACGACAAATTTTTCAGCTTATATTCTATTTATAATCATTC
373 AATTACGAAAGG-CTTTAACCAAGAACAAGAAAGCTTTCAACATATTTTCAAATTATAATCATTT
* * * ** ** *
241687 ATAAGATTATAAATGAATTATATATAATAAT-TTGGATGATATAATGATATCAAAATTATAATTT
437 ATAAGATTATAAATGAATTATATATAACAATAAT-GATGATAAAATCTTATCAAAAAGATAATTA
* ** * * * *
241751 TTTATACATAAATCATTTCAAGCATTGGA-AGGAATGATAAACTTAAAACGCTCTTTCCTTGTCA
501 TTCATTGATAAATAATTTCAAGC-TTCGATAGGAATGATAAACTTAAAAAGCTCTTTTCTTGTCA
*** * ** * * * ** *
241815 ATGGATAACATCTGC-TGAAGGTTGCCCAAT-ACAAACATCCAATTATGAT-AAGTTCTAATCAA
565 ACAAATAGCATCAACTTCACGATT-CCCAATGA-AAACATCCAATTATGATAAACCT-TAACCAA
* * * ** * * *
241877 AAACAACAAAGCTTTCA-T--TTTATTTTTGATTGGTAATCATTTATAAGTTTGTA
627 GAACAACGAAGCTTTTACTGATTTATAATT-ATTGATAA--AATTATAA--ATGTA
* * ** * * * ** * * * ** * *
241930 A-ATGA--ATTATGTACCATA-ATATTGATGTTAAAATGATAATTGTTTAGT-A-ATAAATAATT
1 ATAT-ATCATAATATAGAAGAGAAAATCTTATCAAAATGATAACTAATCATTGACA-AAAT-ATT
* * * * * * * *
241989 TCAAGCTTTTGTAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCATTCCTT-GTCAATGGCTAACGTCCACTT
63 TCAAGCTTTTGAAGGCATGATAAACTTAAGATGCTC-TTTCTTAGTCAATAGATAGCATCCACAT
* ** * ** * ** * * *
242053 CATGTT-TTC--T-AAAACATCTAATTATGACAAATTTTAACCAAGAACAGCAAAGCTTTGAATT
127 CACGTTACCCATTGCAAACATCCGATTATGATAGCTTTTAACCTAGAACA--AAA---ATG--CT
* * *
242114 TATTTCTTTATTTATAATCATTTGTAAGATTATAAATGAATTATATATCCTAATATTGATGATGA
185 TATTT-TTTATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTAATGATGA
* * *
242179 AATGTTATCAAAATGATAATTACTCATTGAT--A--A-TTCAAGCATTCGAAGGAACGAGAAACT
249 AATGTTATCAAAATGATAATTA-TCATTGATAAATTATTTCAAGCTTTCGAAGGCATGAGAAACT
* * *
242239 TAAAATGCTCTTTCCTTTTCAATGGATAGCATCAACTACACGTTTCCGAATGCAAACATCCAATT
313 TAAAATGCTATTT-CTTTTCAATGGATAGCATCCACTTCACGTTTCCGAATGCAAACATCCAATT
* * * ** *
242304 ATGATAGGTTTTAACCAAGAACAAGAAAGCTTTCAATTTATTTTCAAATTATAATCTTTTATAAG
377 ACGAAAGGCTTTAACCAAGAACAAGAAAGCTTTCAACATATTTTCAAATTATAATCATTTATAAG
* * * * * *
242369 ATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGTTAAAATCTTATCAAAAAGGTAATTGTTCATT
442 ATTATAAATGAATTATATATAACAATAATGATGATAAAATCTTATCAAAAAGATAATTATTCATT
* * ** * *
242434 GTTAAATAATTTCAAGGTTTTATAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTTCTTGTCAACAAATA
507 GATAAATAATTTCAAGCTTCGATAGGAATGATAAACTTAAAAAGCTCTTTTCTTGTCAACAAATA
* * * * *
242499 GCTTCAAGTTCACGATTCCCAATGTAAACATCCAATTATGATAAACCTTAACCGAGAACAATGAA
572 GCATCAACTTCACGATTCCCAATGAAAACATCCAATTATGATAAACCTTAACCAAGAACAACGAA
* *
242564 GCTTTTGACTTATTTTTGGTTTATAATTATTTATAAAATTATAAATGTA
637 GCTTTT-AC-------TGATTTATAATTATTGATAAAATTATAAATGTA
* * * * * * * * * *
242613 ATATATTATAATATTGAAGAGAAAATGTTATTAAAGTGATAACTATTCATTGATAAATTGTTTTA
1 ATATATCATAATATAGAAGAGAAAATCTTATCAAAATGATAACTAATCATTGACAAAATATTTCA
* **
242678 AGCTTTTGAAGGCATGATAAACTTAAGATGCTCTTTCTTAGTCATTAGATAGCATCCACATCTTG
66 AGCTTTTGAAGGCATGATAAACTTAAGATGCTCTTTCTTAGTCAATAGATAGCATCCACATCACG
* **
242743 TTACCCATTGCAAACATCCGATTATGATAGCTTTTAACCTAGAACAATAATGC----TTTCAATT
131 TTACCCATTGCAAACATCCGATTATGATAGCTTTTAACCTAGAACAAAAATGCTTATTTTTTATT
** * * * *
242804 GGTAATCATTTACATTG-TTATAAATGAA-T-TATATCATAATTTTCATGATGAAATGTTATCAA
196 TATAATCATTTATA-AGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTAATGATGAAATGTTATCAA
* **
242866 AATGATAATTATACATTCATAAATTATTTCAAGCTTTCGAAGGCATGAGAAACTTAAAATATTAT
260 AATGATAATTAT-CATTGATAAATTATTTCAAGCTTTCGAAGGCATGAGAAACTTAAAATGCTAT
* ** * *
242931 TTCTTTGTCAATGGATAGCATCCACTTCACGTTTTTCG-ATGTTAATATCTAATTACGAAAGGCT
324 TTCTTT-TCAATGGATAGCATCCACTTCACG-TTTCCGAATGCAAACATCCAATTACGAAAGGCT
* * * * * *
242995 TTGACCGAGAACAATAAAGCTTTCAACATATTTTCAATTTATAATGATTTATAAGATTGTAAATG
387 TTAACCAAGAACAAGAAAGCTTTCAACATATTTTCAAATTATAATCATTTATAAGATTATAAATG
* * * * *
243060 AATTATATATAACAATAATGATGATAAAGTGTTATTAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCAT
452 AATTATATATAACAATAATGATGATAAAATCTTATCAAAAAGATAATTATTCATTGATAAATAAT
* * * *** * *
243125 TTGAAGCTTACGA-AGTAATGATAAACTTAAAAAGCT-TTTTCTTTTTCGGTAGATAGCATCCAC
517 TTCAAGCTT-CGATAGGAATGATAAACTTAAAAAGCTCTTTTC-TTGTCAACAAATAGCATCAAC
* * ****
243188 TTCATGTTTCCCAATGAAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAAGAACAACGAAGC-TTT-C
580 TTCACGATTCCCAATGAAAACATCCAATTATGATAAACCTTAACCAAGAACAACGAAGCTTTTAC
*
243251 -GATTTATAATTATTGAT-AAGTTATAAATG-A
645 TGATTTATAATTATTGATAAAATTATAAATGTA
* * *
243281 ATCATATCATAATATAGATGATAAAATCTTATCAAAATGATAATTAATCATTGACAAAATATTTC
1 AT-ATATCATAATATAGAAGAGAAAATCTTATCAAAATGATAACTAATCATTGACAAAATATTTC
* * *
243346 AAGCTTTTGGAA-GCATGATAATCTTAA-ATGCTCTTTTCTT-GTTAATA-ACTAGCATCCACTT
65 AAGCTTTT-GAAGGCATGATAAACTTAAGATGCTC-TTTCTTAGTCAATAGA-TAGCATCCACAT
* * * ** *
243407 CACGATT-TCTATTGTAAACATTTGATTATGATAAGC-TTTAA-TTGAGAACAGTAAAACTTTCG
127 CACG-TTACCCATTGCAAACATCCGATTATGAT-AGCTTTTAACCT-AGAACA--AAAA---T-G
* * *
243469 ACTTATTTTTTATTTATAATGATTTATAAGATTATAAAAGAATTATATATCATAATATTAAAGAT
183 -CTTATTTTTTATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTAATGAT
* * * * *
243534 -AAAGTGTTATTAAAATTATAATTATTCATTGATAAATTATTTTAAGCTTTCAAAGGCATGATAA
247 GAAA-TGTTATCAAAATGATAATTA-TCATTGATAAATTATTTCAAGCTTTCGAAGGCATGAGAA
* * * * * * * * *
243598 ACTTAAAACGCTGTTTCTTTTCACTGGATAGCATCCACTTGATGCTTCCCAATGGAAACATCAAA
310 ACTTAAAATGCTATTTCTTTTCAATGGATAGCATCCACTTCACGTTTCCGAATGCAAACATCCAA
* * ** * **
243663 TTATGAAAGG-TTTCAACTAAGAAC----AA---TT-AA-A-CCTTT-AATTTATAATCATGGAT
375 TTACGAAAGGCTTT-AACCAAGAACAAGAAAGCTTTCAACATATTTTCAAATTATAATCATTTAT
* * * * ** *
243716 AAGATTATAAATGAA-TA-ATATTATAATATTGATGATAAAATATTATCAAATTGATAATTATTT
439 AAGATTATAAATGAATTATATATAACAATAATGATGATAAAATCTTATCAAAAAGATAATTATTC
* * * * * * * * *
243779 ATTGATAAATCATTTCAAGCTTTTG-GAGGCATTATAAACTTAAAATGCT-TTTTCCTTATAAAT
504 ATTGATAAATAATTTCAAGC-TTCGATAGGAATGATAAACTTAAAAAGCTCTTTT-CTTGTCAAC
** * * * * * * * ** *
243842 GGATAGGATCAACTTCAC-CTTTCTAATGAAAACAACCGATTATAAT-AGGCTTAA-TAGAGAAC
567 AAATAGCATCAACTTCACGATTCCCAATGAAAACATCCAATTATGATAAACCTTAACCA-AGAAC
** * * * * *
243904 AATAAAGCGTTTGACTTTTTTTCGATTTATAATGATTTATAAGATTATAAATGAATT
631 AACGAAGC-TTTTAC------T-GATTTATAATTATTGATAAAATTATAAATG--TA
* * * * * * * * * * * *
243961 ATATATCATAACATTGATGATAAAGTGTTATTAAAATTATAATTATTCATTGA-GAAATCATTTT
1 ATATATCATAATATAGAAGAGAAAATCTTATCAAAATGATAACTAATCATTGACAAAAT-ATTTC
* * * * ** * * *
244025 AAGC-TTTCATCGG-ACTGATAAACTAAAAACACTC-TT-TTATTTCACTAAATAGCATCCAC-T
65 AAGCTTTTGA-AGGCA-TGATAAACTTAAGATGCTCTTTCTTA-GTCAATAGATAGCATCCACAT
* * * * ** ** *
244085 ACACATTTCCTAATGCAAACATCTAATTACAATAAG-TTTTAA-CTAAGAACGACAAA-GC----
127 -CACGTTACCCATTGCAAACATCCGATTATGAT-AGCTTTTAACCT-AGAAC-AAAAATGCTTAT
** * * * * *
244143 TTTCGATTTGTAATCATTTATAAGATTATAAATGAA-T-CATACCATAATATTACTGATAAAATG
188 TTTTTATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTAATGATGAAATG
* * * * * * *
244206 TTATCCAAATGATAATTGTTCATTGTTAAGTCATTTCAAGCTTTTGAAGGCATGATAAACTTAAA
253 TTATCAAAATGATAATT-ATCATTGATAAATTATTTCAAGCTTTCGAAGGCATGAGAAACTTAAA
* * * * * * * * ** * * * *
244271 ATGCTCTTTCCTTGTCAATGCACAACTTCTACTTCATGTCGCCCG-ATGCAAATATTCAACTATG
317 ATGCTATTT-CTTTTCAATGGATAGCATCCACTTCACGT-TTCCGAATGCAAACATCCAATTACG
* * * * * * ** ** * * * *
244335 ATATGTTTTAACCAAGATCAATAGAGCTTTCAATTTATTTTTTATTTGTAATCATTGATAAAATT
380 AAAGGCTTTAACCAAGAACAAGAAAGCTTTCAACATATTTTCAAATTATAATCATTTATAAGATT
* * * * *
244400 ATAAATGAA-T-TATATCAGAAT-ATGGATCATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGA
445 ATAAATGAATTATATATAACAATAAT-GATGATAAAATCTTATCAAAAAGATAATTATTCATTGA
*
244462 TAAATCATTTCAAGCTT
509 TAAATAATTTCAAGCTT
244479 TTGAATGCAT
Statistics
Matches: 1981, Mismatches: 435, Indels: 277
0.74 0.16 0.10
Matches are distributed among these distances:
664 1 0.00
665 16 0.01
666 101 0.05
667 152 0.08
668 100 0.05
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670 24 0.01
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672 3 0.00
673 4 0.00
674 3 0.00
675 4 0.00
676 67 0.03
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689 1 0.00
690 29 0.01
ACGTcount: A:0.38, C:0.13, G:0.12, T:0.37
Consensus pattern (677 bp):
ATATATCATAATATAGAAGAGAAAATCTTATCAAAATGATAACTAATCATTGACAAAATATTTCA
AGCTTTTGAAGGCATGATAAACTTAAGATGCTCTTTCTTAGTCAATAGATAGCATCCACATCACG
TTACCCATTGCAAACATCCGATTATGATAGCTTTTAACCTAGAACAAAAATGCTTATTTTTTATT
TATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTAATGATGAAATGTTATCAAA
ATGATAATTATCATTGATAAATTATTTCAAGCTTTCGAAGGCATGAGAAACTTAAAATGCTATTT
CTTTTCAATGGATAGCATCCACTTCACGTTTCCGAATGCAAACATCCAATTACGAAAGGCTTTAA
CCAAGAACAAGAAAGCTTTCAACATATTTTCAAATTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATT
ATATATAACAATAATGATGATAAAATCTTATCAAAAAGATAATTATTCATTGATAAATAATTTCA
AGCTTCGATAGGAATGATAAACTTAAAAAGCTCTTTTCTTGTCAACAAATAGCATCAACTTCACG
ATTCCCAATGAAAACATCCAATTATGATAAACCTTAACCAAGAACAACGAAGCTTTTACTGATTT
ATAATTATTGATAAAATTATAAATGTA
Found at i:243998 original size:448 final size:450
Alignment explanation
Indices: 240463--244760 Score: 2702
Period size: 449 Copynumber: 9.5 Consensus size: 450
240453 CAGTGGATTA
* * * * * * *
240463 CATCCACTACACGCTTCCCATTGCAAACATCCAATTATGATTGGTTTTATA-AAAGAGCAACT-A
1 CATCCACTTCATGTTTCCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTA-ACTAAGAACAA-TAA
* * *** * ** *
240526 GGATTTTGTTTTATAATCATTGATAAGATTATAAATGAATTGTATCATAATATTGTTGATAAAAT
64 AGCTTTCAATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATAATATCATAATATTGATGATAAAAT
* * * *
240591 GTTATCCAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTCGAAAGG-ATGATAAATTTA
129 CTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTTG-AAGGCATGATAAACTTA
* * * * * * * * *
240655 AAATACTCTTTCATTGTCAATGGATAGCATGC-ACTTCATG-TTGCCCAATGCAAACATTCAATT
193 AAATGCTTTTTCCTTGTCAATGAATAGCAT-CAACTTCACGATT-TCTAATGTAAACATCCAATT
* * * * * * * ** * *
240718 ATAATAA-CTTTTAACC-AGGAATAACACAGCTTTCTATTTATTTTCGACTTGGACTCA--TATA
256 ATAATAAGC-TTTAACCGA-GAACAATAAAGCTTTCGACTTATTTTTGATTTATAATGATTTATA
* * * * * *
240779 AGATTGTAAATGAA-T-TATATCAGAATATGGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATCCA
319 AGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAGTGTTATTAAAATGATAATTATTCA
* ** * ** * * *
240842 TTGAT---TC-----AAGCTTTTC-AATGTGTCATAAACTTAAAATACTC-AT-TTTTCAATGGA
384 TTGATAAATCATTTTAAGC-TTTCGAAGGAATGATAAACTTAAAACGCTCTTTCTTTTCACTAGA
*
240896 TAT
448 TAG
** * * * * * *
240899 CATCCACCACATATTTCCAAATGTAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAAGAATAACAAAG
1 CATCCACTTCATGTTTCCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACTAAGAACAATAAAG
* * *
240964 CTTTTGATTTATTTTTGATATATAATCTTTTATAAGATTATAAATGAATTATATACCATAATATT
66 C-TTTCA---A----T--T-TATAATCATTTATAAGATTATAAATGAA-TA-ATATCATAATATT
* * * * ** * * **
241029 AATGTTAAAATGTT-TGCAAAATGATAGTTGGTCATTGATAAATAATTTCAAGCTTTCGTTGGCA
118 GATGATAAAATCTTAT-CAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTTGAAGGCA
* * * * * * * * **
241093 TGATAAACTTACAATGCTCTTTCCTTGTCGATGGATAGCATCCAC--C-TG-TTGTTTGA-CAAA
182 TGATAAACTTAAAATGCTTTTTCCTTGTCAATGAATAGCATCAACTTCACGATT-TCTAATGTAA
* * * * * * * ** *
241153 ACATCTAATTATGACAGGTTTTAACCAAAAACAGCAAAGCTTT-GAATTTAGTTTTT-ATTTATA
246 ACATCCAATTATAATAAGCTTTAACCGAGAACAATAAAGCTTTCG-ACTTA-TTTTTGATTTATA
* * * * * * * *
241216 ATCATTTGTAATG-TTATAAATTAATTATATATCATAATATCGATGAGAAAATGTGATCAAAATG
309 ATGATTTATAA-GATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAGTGTTATTAAAATG
* * * * * * * *
241280 ATAATTA-TCAATTGATAAATTATTTCAAGCTTTC-TAGTGCATCATAAACATAAAATGCTTTTT
373 ATAATTATTC-ATTGATAAATCATTTTAAGCTTTCGAAG-GAATGATAAACTTAAAACGC-TCTT
* * *
241343 TCTTATCAATGGATAG
435 TCTTTTCACTAGATAG
* * * * * * * **
241359 TATACACTTCACGTTTTCAAATGCAAACA-CTCGATTATGATAGGTTTTAACTAAGAATAAGGAA
1 CATCCACTTCATGTTTCCCAATGCAAACATC-CAATTATGATAGGTTTTAACTAAGAACAATAAA
* * *
241423 GCTTTCAATTTATTTTTGATATGTACTCTTTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCGTAACAT
65 GCTTTC-A---A--TTT-ATA---A-TCATTTATAAGATTATAAATGAA-TA-ATATCATAATAT
* * * * * *
241488 TGAT-ATTAAAATGTTATCAAAATTATAATTATTCATAGATAAATAATTTCAAACTTTCGAAGGC
117 TGATGA-TAAAATCTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTTGAAGGC
* * * * * *
241552 ATGATAAACATAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCATCCACTTCAAG-TTTCTGAAAGTA
181 ATGATAAACTTAAAATGCTTTTTCCTTGTCAATGAATAGCATCAACTTCACGATTTCT-AATGTA
* * * * * * ** *
241616 AACATCCGATTATAAT-GGATTTTAGCC-ATGAACGACAAATTTTTC-AGCTTATATTCT-ATTT
245 AACATCCAATTATAATAAG-CTTTAACCGA-GAACAATAAAGCTTTCGA-CTTAT-TTTTGATTT
* * * * *
241677 ATAATCATTCATAAGATTATAAATGAATTATATATAATAAT-TTGGATGATATAA-TGATATCAA
306 ATAATGATTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATT-GATGATA-AAGTGTTATTAA
* * * ** * * *
241740 AATTATAATTTTTTATACATAAATCATTTCAAGCATTGGAAGGAATGATAAACTTAAAACGCTCT
369 AATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTTAAGCTTTCGAAGGAATGATAAACTTAAAACGCTCT
* * * *
241805 TTCCTTGTCAATGGATAA
434 TT-CTTTTCACTAGATAG
** ** * * * * * * *
241823 CATCTGCTGAAGGTTGCCCAATACAAACATCCAATTATGATAAGTTCTAA-TCAAAAACAACAAA
1 CATCCACTTCATGTTTCCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACT-AAGAACAATAAA
* * * *
241887 GCTTTCATTTTATTTTTGATTGGTAATCATTTATAAGTTTGTAAATGAATTATGTACCATAATAT
65 GCTTTCA----A--TTT-A----TAATCATTTATAAGATTATAAATGAA-TA-ATATCATAATAT
* * * * * *
241952 TGATG---------T-T-AAAATGATAATTGTTTAGTAATAAATAATTTCAAGCTTTTGTAGGCA
117 TGATGATAAAATCTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTTGAAGGCA
** ** * * * * *
242006 TGATAAACTTAAAATGCTCATTCCTTGTCAATGGCTAACGTCCACTTCATGTTTTCT-A---AAA
182 TGATAAACTTAAAATGCTTTTTCCTTGTCAATGAATAGCATCAACTTCACGATTTCTAATGTAAA
* * * ** * ** * *
242067 CATCTAATTATGACAAATTTTAACCAAGAACAGCAAAGCTTT-GAATTTATTTCTTTATTTATAA
247 CATCCAATTATAATAAGCTTTAACCGAGAACAATAAAGCTTTCG-ACTTATTT-TTGATTTATAA
* * * *
242131 TCATTTGTAAGATTATAAATGAATTATATATCCTAATATTGATGATGAAA-TGTTATCAAAATGA
310 TGATTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGAT-AAAGTGTTATTAAAATGA
* * * * * *
242195 TAATTACTCATTGAT--A--A-TTCAAGCATTCGAAGGAACGAGAAACTTAAAATGCTCTTTCCT
374 TAATTATTCATTGATAAATCATTTTAAGCTTTCGAAGGAATGATAAACTTAAAACGCTCTTT-CT
* *
242255 TTTCAATGGATAG
438 TTTCACTAGATAG
* * * * * *
242268 CATCAACTACACGTTTCCGAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAAGAACAAGAAAG
1 CATCCACTTCATGTTTCCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACTAAGAACAATAAAG
*
242333 CTTTCAATTTATTTTCAAATTATAATCTTTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATT
66 CTTTC-A---A---T----TTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAA-TA-ATATCATAATATT
* * * * * * *
242398 GATGTTAAAATCTTATCAAAAAGGTAATTGTTCATTGTTAAATAATTTCAAGGTTTT-ATAGGCA
118 GATGATAAAATCTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTTGA-AGGCA
** * * * *
242462 TGATAAACTTAAAATGCTCTTTT-CTTGTCAACAAATAGCTTCAAGTTCACGATTCCCAATGTAA
182 TGATAAACTTAAAATGCT-TTTTCCTTGTCAATGAATAGCATCAACTTCACGATTTCTAATGTAA
* * * * * *
242526 ACATCCAATTATGATAAACCTTAACCGAGAACAATGAAGCTTTTGACTTATTTTTGGTTTATAAT
246 ACATCCAATTATAATAAGCTTTAACCGAGAACAATAAAGCTTTCGACTTATTTTTGATTTATAAT
* * * * * *
242591 TATTTATAAAATTATAAATGTAA-TATAT-T-ATAATATTGAAGAGAAAATGTTATTAAAGTGAT
311 GATTTATAAGATTATAAATG-AATTATATATCATAATATTGATGATAAAGTGTTATTAAAATGAT
* ** * * * *
242653 AACTATTCATTGATAAATTGTTTTAAGCTTTTGAAGGCATGATAAACTTAAGATGCTCTTTCTTA
375 AATTATTCATTGATAAATCATTTTAAGCTTTCGAAGGAATGATAAACTTAAAACGCTCTTTCTT-
* *
242718 GTCATTAGATAG
439 TTCACTAGATAG
* * * * * * *
242730 CATCCACATCTTGTTACCCATTGCAAACATCCGATTATGATAGCTTTTAACCT-AGAACAATAAT
1 CATCCACTTCATGTTTCCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAA-CTAAGAACAATAAA
** * * * * * *
242794 GCTTTCAATTGGTAATCATTTACATTG-TTATAAATGAATTATATCATAATTTTCATGATGAAAT
65 GCTTTCAATTTATAATCATTTATA-AGATTATAAATGAATAATATCATAATATTGATGATAAAAT
* * * * * *
242858 GTTATCAAAATGATAATTATACATTCATAAATTATTTCAAGCTTTCGAAGGCATGAGAAACTTAA
129 CTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTTGAAGGCATGATAAACTTAA
* * * * * * * * *
242923 AAT-ATTATTTCTTTGTCAATGGATAGCATCCACTTCACG-TTTTTCGATGTTAATATCTAATTA
194 AATGCTT-TTTCCTTGTCAATGAATAGCATCAACTTCACGATTTCT-AATGTAAACATCCAATTA
* * * * * **
242986 CGAA-AGGCTTTGACCGAGAACAATAAAGCTTTCAACATATTTTCAATTTATAATGATTTATAAG
257 -TAATAAGCTTTAACCGAGAACAATAAAGCTTTCGACTTATTTTTGATTTATAATGATTTATAAG
* * * *
243050 ATTGTAAATGAATTATATATAACAATAATGATGATAAAGTGTTATTAAAATGATAATTATTCATT
321 ATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAGTGTTATTAAAATGATAATTATTCATT
* * * * * **
243115 GATAAATCATTTGAAGCTTACGAAGTAATGATAAACTTAAAAAGCTTTTTCTTTTTCGGTAGATA
386 GATAAATCATTTTAAGCTTTCGAAGGAATGATAAACTTAAAACGCTCTTTC-TTTTCACTAGATA
243180 G
450 G
* * **
243181 CATCCACTTCATGTTTCCCAATGAAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAAGAACAACGAAG
1 CATCCACTTCATGTTTCCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACTAAGAACAATAAAG
* * * * *
243246 CTTTCGATTTATAATTATTGATAAG-TTATAAATGAATCATATCATAATATAGATGATAAAATCT
66 CTTTCAATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATAATATCATAATATTGATGATAAAATCT
* * *
243310 TATCAAAATGATAATTAATCATTGACAAAAT-ATTTCAAGCTTTTGGAA-GCATGATAATCTT-A
131 TATCAAAATGATAATTATTCATTGA-TAAATCATTTCAAGCTTTT-GAAGGCATGATAAACTTAA
* * * ***
243372 AATGCTCTTTT-CTTGTTAAT-AACTAGCATCCACTTCACGATTTCTATTGTAAACATTTGATTA
194 AATGCT-TTTTCCTTGTCAATGAA-TAGCATCAACTTCACGATTTCTAATGTAAACATCCAATTA
* ** * * *
243435 TGATAAGCTTTAATTGAGAACAGTAAAACTTTCGACTTATTTTTTATTTATAATGATTTATAAGA
257 TAATAAGCTTTAACCGAGAACAATAAAGCTTTCGACTTATTTTTGATTTATAATGATTTATAAGA
* * * *
243500 TTATAAAAGAATTATATATCATAATATTAAAGATAAAGTGTTATTAAAATTATAATTATTCATTG
322 TTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAGTGTTATTAAAATGATAATTATTCATTG
* * * * *
243565 ATAAATTATTTTAAGCTTTCAAAGGCATGATAAACTTAAAACGCTGTTTCTTTTCACTGGATAG
387 ATAAATCATTTTAAGCTTTCGAAGGAATGATAAACTTAAAACGCTCTTTCTTTTCACTAGATAG
* * * * * *
243629 CATCCACTTGATGCTTCCCAATGGAAACATCAAATTATGAAAGGTTTCAACTAAGAACAATTAAA
1 CATCCACTTCATGTTTCCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACTAAGAACAA-TAAA
* ** * *
243694 CCTTT-AATTTATAATCATGGATAAGATTATAAATGAATAATATTATAATATTGATGATAAAATA
65 GCTTTCAATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATAATATCATAATATTGATGATAAAATC
* * * *
243758 TTATCAAATTGATAATTATTTATTGATAAATCATTTCAAGCTTTTGGAGGCATTATAAACTTAAA
130 TTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTTGAAGGCATGATAAACTTAAA
* * * * * * * *
243823 ATGCTTTTTCCTTATAAATGGATAGGATCAACTTCAC-CTTTCTAATGAAAACAACCGATTATAA
195 ATGCTTTTTCCTTGTCAATGAATAGCATCAACTTCACGATTTCTAATGTAAACATCCAATTATAA
* **
243887 TAGGC-TTAATAGAGAACAATAAAGCGTTT-GACTT-TTTTTCGATTTATAATGATTTATAAGAT
260 TAAGCTTTAACCGAGAACAATAAAGC-TTTCGACTTATTTTT-GATTTATAATGATTTATAAGAT
* *
243949 TATAAATGAATTATATATCATAACATTGATGATAAAGTGTTATTAAAATTATAATTATTCATTGA
323 TATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAGTGTTATTAAAATGATAATTATTCATTGA
* * * * * *
244014 GAAATCATTTTAAGCTTTC-ATCGGACTGATAAACTAAAAACACTCTTT-TATTTCACTAAATAG
388 TAAATCATTTTAAGCTTTCGA-AGGAATGATAAACTTAAAACGCTCTTTCT-TTTCACTAGATAG
* ** * * ** * * *
244077 CATCCACTACACATTTCCTAATGCAAACATCTAATTACAATAAGTTTTAACTAAGAACGACAAAG
1 CATCCACTTCATGTTTCCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACTAAGAACAATAAAG
* * * * *
244142 CTTTCGATTTGTAATCATTTATAAGATTATAAATGAATCATACCATAATATT-ACTGATAAAATG
66 CTTTCAATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATAATATCATAATATTGA-TGATAAAATC
* * * *
244206 TTATCCAAATGATAATTGTTCATTGTTAAGTCATTTCAAGCTTTTGAAGGCATGATAAACTTAAA
130 TTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTTGAAGGCATGATAAACTTAAA
* * * * * * * ** ** * * * * *
244271 ATGCTCTTTCCTTGTCAATGCACAACTTCTACTTCATG-TCGCCCGATGCAAATATTCAACTATG
195 ATGCTTTTTCCTTGTCAATGAATAGCATCAACTTCACGAT-TTCTAATGTAAACATCCAATTATA
* * * * * * * * * * * *
244335 ATATGTTTTAACCAAGATCAATAGAGCTTTCAATTTATTTTTTATTTGTAATCATTGATAAAATT
259 ATAAGCTTTAACCGAGAACAATAAAGCTTTCGACTTATTTTTGATTTATAATGATTTATAAGATT
* * * * *
244400 ATAAATGAA-T-TATATCAGAATATGGATCATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGAT
324 ATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAGTGTTATTAAAATGATAATTATTCATTGAT
* * * * * * * * * * *
244463 AAATCATTTCAAGCTTTTGAATGCATCATGAACTTTAAATGCTCCTTCCTTTTCAATGGATAG
389 AAATCATTTTAAGCTTTCGAAGGAATGATAAACTTAAAACGCT-CTTTCTTTTCACTAGATAG
* ** * * * * * *
244526 CATCCACTGCACATTTTCAAATGTAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAAGAATAACAAAG
1 CATCCACTTCATGTTTCCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACTAAGAACAATAAAG
* * * * *
244591 CTTTCAATTTATTTTCAATATGTAATCTTTTATATGATTATAAACGAATTATACACCATAATATT
66 CTTTC-A---A--TT---TA--TAATCATTTATAAGATTATAAATGAA-TA-ATATCATAATATT
* * * * * * *
244656 GAT-ATTAAAATGTTATCAAAATAACAATTGTTCATTGATAAATAATTTC-AGGTTTTCATAGGC
118 GATGA-TAAAATCTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTTGA-AGGC
* *
244719 ATGATAAACTTAAAATG-TTATTTCCTTGTCAAAGGATAGCAT
181 ATGATAAACTTAAAATGCTT-TTTCCTTGTCAATGAATAGCAT
244761 TATAATAGGC
Statistics
Matches: 3064, Mismatches: 626, Indels: 318
0.76 0.16 0.08
Matches are distributed among these distances:
435 1 0.00
436 49 0.02
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444 1 0.00
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465 7 0.00
468 2 0.00
ACGTcount: A:0.38, C:0.13, G:0.12, T:0.37
Consensus pattern (450 bp):
CATCCACTTCATGTTTCCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACTAAGAACAATAAAG
CTTTCAATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATAATATCATAATATTGATGATAAAATCT
TATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTTGAAGGCATGATAAACTTAAAA
TGCTTTTTCCTTGTCAATGAATAGCATCAACTTCACGATTTCTAATGTAAACATCCAATTATAAT
AAGCTTTAACCGAGAACAATAAAGCTTTCGACTTATTTTTGATTTATAATGATTTATAAGATTAT
AAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAGTGTTATTAAAATGATAATTATTCATTGATAA
ATCATTTTAAGCTTTCGAAGGAATGATAAACTTAAAACGCTCTTTCTTTTCACTAGATAG
Found at i:245151 original size:430 final size:430
Alignment explanation
Indices: 244378--245190 Score: 1116
Period size: 430 Copynumber: 1.9 Consensus size: 430
244368 TTTATTTTTT
* * *
244378 ATTTGTAATCATTGATAAAATTATAAATGAATTATATCAGAATATGGATCATAAAATGTTATCAA
1 ATTTATAATCATTAATAAAATTATAAATGAATTATATCAGAATATGGATCAGAAAATGTTATCAA
* * * * * * * *
244443 AATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTTGAATGCATCATGAACTTTAAATGCTCC
66 AATGATAATTAATAATTGATAAATCATTTCAAACTTTGGAATGAATCATAAACATAAAATGCTCC
* * *
244508 TTCCTTTTCAATGGATAGCATCCACTGCACATTTTCAAATGTAAACATCCAATTATGATAGGTTT
131 TTCCTTTTCAATGGATAGCATCCACTGCACATTTTCAAATGCAAACATCCAACTATGATAGGTTC
* * *
244573 TAACCAAGAATAACAAAGCTTTCAATTTATTTTCAATATGTAATCTTTTATATGATTATAAACGA
196 TAACCAAGAACAACAAAGCTTTCAATTTATTTTCAATATATAATCTTTTATAAGATTATAAACGA
* *
244638 ATTATACACCATAATATTGATATTAAAATGTTATCAAAATAACAATTGTTCATTGATAAATAATT
261 AATATACACCATAATATTGATATTAAAATGTTATCAAAATAACAATTGTTCATAGATAAATAATT
* *
244703 TCAGGTTTTCATAGGCATGATAAACTTAAAATGTTATTTCCTTGTCAAAGGATAGCATTATAATA
326 TCAGCTTTTCATAGGCATGATAAACATAAAATGTTATTTCCTTGTCAAAGGATAGCATTATAATA
244768 GGCTTTAACCTTGAAAAATAAAGTTTTCAGCTTATTATCG
391 GGCTTTAACCTTGAAAAATAAAGTTTTCAGCTTATTATCG
* * * * * *
244808 ATTTATAATGATTAATAAAATTATAAATGTAA-TATATTATAATATTGATGAGAAAATGTTCTCA
1 ATTTATAATCATTAATAAAATTATAAATG-AATTATATCAGAATATGGATCAGAAAATGTTATCA
* *
244872 AAATGATAATTAATAATTGATAAATTATTTCAAACTTTGGGAA-GAATGATAAACATAAAATGCT
65 AAATGATAATTAATAATTGATAAATCATTTCAAACTTT-GGAATGAATCATAAACATAAAATGCT
* * * * *
244936 -CTTTCTTTGTCATTGGATAGTATCCACAT-CACATTTTCCAATGCAAACATCCAACTATGATAT
129 CCTTCCTTT-TCAATGGATAGCATCCAC-TGCACATTTTCAAATGCAAACATCCAACTATGATAG
* * *
244999 GTTCTAACCAAGGACAACAAAGGTTTCAATTTATTTTCGAA-ATATAATCTTTTATAAGTTTATA
192 GTTCTAACCAAGAACAACAAAGCTTTCAATTTATTTTC-AATATATAATCTTTTATAAGATTATA
* * * * *
245063 AATGAAATATATATCATAATATTGATGTTAAAATGTTATCAAAATGACAATTGTTCATAGATAAA
256 AACGAAATATACACCATAATATTGATATTAAAATGTTATCAAAATAACAATTGTTCATAGATAAA
* * * *
245128 TAATTTCAAGCTTTTGA-AGGCATGATAAACATAAAATGTTGTTTTCTTGTCAATGGATAGCAT
321 TAATTTC-AGCTTTTCATAGGCATGATAAACATAAAATGTTATTTCCTTGTCAAAGGATAGCAT
245191 CTACTTCTAG
Statistics
Matches: 331, Mismatches: 46, Indels: 12
0.85 0.12 0.03
Matches are distributed among these distances:
429 7 0.02
430 309 0.93
431 15 0.05
ACGTcount: A:0.40, C:0.12, G:0.11, T:0.37
Consensus pattern (430 bp):
ATTTATAATCATTAATAAAATTATAAATGAATTATATCAGAATATGGATCAGAAAATGTTATCAA
AATGATAATTAATAATTGATAAATCATTTCAAACTTTGGAATGAATCATAAACATAAAATGCTCC
TTCCTTTTCAATGGATAGCATCCACTGCACATTTTCAAATGCAAACATCCAACTATGATAGGTTC
TAACCAAGAACAACAAAGCTTTCAATTTATTTTCAATATATAATCTTTTATAAGATTATAAACGA
AATATACACCATAATATTGATATTAAAATGTTATCAAAATAACAATTGTTCATAGATAAATAATT
TCAGCTTTTCATAGGCATGATAAACATAAAATGTTATTTCCTTGTCAAAGGATAGCATTATAATA
GGCTTTAACCTTGAAAAATAAAGTTTTCAGCTTATTATCG
Found at i:245252 original size:232 final size:229
Alignment explanation
Indices: 244828--245294 Score: 580
Period size: 232 Copynumber: 2.0 Consensus size: 229
244818 ATTAATAAAA
* * * *
244828 TTATAAATGTAATATATTATAATATTGATGAGAAAATGTTCTCAAAATGATAATTAATAATTGAT
1 TTATAAATGAAATATATTATAATATTGATGAGAAAATGTTATCAAAATGACAATTAATAATAGAT
* * *
244893 AAATTATTTCAAACTTTGGGAAGAATGATAAACATAAAATGCTCTTTCTTTGTCATTGGATAGTA
66 AAATAATTTCAAACTTTGGGAAGAATGATAAACATAAAATGCTCTTTCTTTGTCAATGGATAGCA
* * *
244958 TCCACATCACATTTTCCAATGCAAACATCCAACTATGATATGTTCTAACCAAGGACAACAAAGGT
131 TCCACATCACATTTCCCAAAGCAAACATCCAACTATGATAGGTTCTAACCAAGGACAACAAA-GT
*
245023 TTCAATTTATTTTCGAAATATAATCTTTTATAAGT
195 TTCAATTTATTTTCGAAATATAATCATTTATAAGT
** ** *
245058 TTATAAATGAAATATATATCATAATATTGATGTTAAAATGTTATCAAAATGACAATTGTTCATAG
1 TTATAAATGAAATATAT-T-ATAATATTGATGAGAAAATGTTATCAAAATGACAATTAATAATAG
* * * * *
245123 ATAAATAATTTCAAGCTTT-TGAAGGCATGATAAACATAAAATGTTGTTT-TCTTGTCAATGGAT
64 ATAAATAATTTCAAACTTTGGGAA-GAATGATAAACATAAAATGCTCTTTCT-TTGTCAATGGAT
* * * * * *
245186 AGCATCTACTTCTA-GTTTCCCAAAGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACCATGGACAACA
127 AGCATCCACATC-ACATTTCCCAAAGCAAACATCCAACTATGATAGGTTCTAACCAAGGACAACA
** **
245250 AAGTTTTTATTTATTTTCGACTTATAATCATTTATAAGT
191 AAGTTTCAATTTATTTTCGAAATATAATCATTTATAAGT
245289 TTATAA
1 TTATAA
245295 TTTGTAACCA
Statistics
Matches: 201, Mismatches: 31, Indels: 9
0.83 0.13 0.04
Matches are distributed among these distances:
230 16 0.08
231 43 0.21
232 141 0.70
233 1 0.00
ACGTcount: A:0.39, C:0.12, G:0.12, T:0.37
Consensus pattern (229 bp):
TTATAAATGAAATATATTATAATATTGATGAGAAAATGTTATCAAAATGACAATTAATAATAGAT
AAATAATTTCAAACTTTGGGAAGAATGATAAACATAAAATGCTCTTTCTTTGTCAATGGATAGCA
TCCACATCACATTTCCCAAAGCAAACATCCAACTATGATAGGTTCTAACCAAGGACAACAAAGTT
TCAATTTATTTTCGAAATATAATCATTTATAAGT
Found at i:254142 original size:230 final size:230
Alignment explanation
Indices: 253376--256988 Score: 2377
Period size: 230 Copynumber: 15.9 Consensus size: 230
253366 GGGGTGTAAC
* ** * * * *
253376 ATAAATAAATTGTATATTATAAT-TTGGATGATAAAATATTATCAAAATGATAATCACTCATTGA
1 ATAAATAAATTATATATCGTAATATT-GATGATAAAATGTTATTAAAATGATAATTATTCATTGA
* * * * * *
253440 TAAATCATTTCAAGCTTTCGAAGGCATGATAAATTTAAAATACTCTTTCCTTGTCAATGGATACC
65 TAAATAATTTCAAGCTTTTGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCTTTGTCAATGGATAGC
* * * * * * * * *
253505 ATCCACTTCATGTTGCCCAAA-ACAAGCATCCAGTTATGATAAGTTTTAACTAAAAACAACAAAG
130 ATCCACCTCACGTT-TCCAAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAAGAACAACAAAG
** * * * *
253569 CTTTTGTTTTATTTTTAATTTGTAATCATTTATAAGATT
194 C-TTTCATTT-TTTTCAATATATAATCTTTTATAAGATT
* * * * * * * *
253608 AT-ACTAAATTATGTA-CTATAATATTGATGTTAAAATGTTATCAAAAGGATCATTGTTCATTGA
1 ATAAATAAATTATATATC-GTAATATTGATGATAAAATGTTATTAAAATGATAATTATTCATTGA
* * * *
253671 TAAATAATTTCAAGCTTTT-ATGGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATTGATAA
65 TAAATAATTTCAAGCTTTTGA-AGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCTTTGTCAATGGATAG
* * * * * * * *
253735 CATCCACCTCATGTTTCC-CA---AAACATCTAATTCTGAAAAGTTTTATCTAAGAACAACAAAG
129 CATCCACCTCACGTTTCCAAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAAGAACAACAAAG
* ** * * *
253796 CTTTGAATTTATTTTTTTATTTATAATCATTTGTAAGATT
194 CTTT-CA-TT-TTTTTCAATATATAATCTTTTATAAGATT
* * *
253836 ATAAATGAATTTTATATCGTAATATTGATGATAAAATGTTA-TAAATATTATAATTATTCATTGA
1 ATAAATAAATTATATATCGTAATATTGATGATAAAATGTTATTAAA-ATGATAATTATTCATTGA
* * * ** * *
253900 TAAATCATTTCAAGCTTTTGAATGCATCATAAACTTGTAATACTCTTTCTATGTCAATGGATAGC
65 TAAATAATTTCAAGCTTTTGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCTTTGTCAATGGATAGC
* * * * * * *
253965 CTCTA-TTACACGTTTCCAAATGAAAAAATCCAAGTATGATAGGTTTTAACCAAGAATAACAAAG
130 ATCCACCT-CACGTTTCCAAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAAGAACAACAAAG
* *
254029 CTTTCATTTTTTTCAACATATAATGTTTTATAAGATT
194 CTTTCATTTTTTTCAATATATAATCTTTTATAAGATT
* * * * *
254066 ATAAACAAATCATATATTGTAATATTGATGTTAAAATGTTATTAAAATGATAATTGTTCATTGAT
1 ATAAATAAATTATATATCGTAATATTGATGATAAAATGTTATTAAAATGATAATTATTCATTGAT
* * * * *
254131 AGATAATTTCAAGC-TTTCATAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTATCATTGTCAAAGGATAGC
66 AAATAATTTCAAGCTTTTGA-AGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCTTTGTCAATGGATAGC
* * * * * * *
254195 ATCCACCTCACGTTTCCTAATGCAAACATCCGATTATGATAAGCTTTAACCATGAACAATAAGGC
130 ATCCACCTCACGTTTCCAAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAAGAACAACAAAGC
* * * ** *
254260 TTTGGACTTATTTACAAGT-TATAATGATTTATAAAATT
195 TTT-CA-TTTTTTTCAA-TATATAATCTTTTATAAGATT
* * *
254298 ATAAATGTAA-TATAT-TAC--AATATTGATGAGAAAATGTTA-TCAAATGATAATTATTCATTG
1 ATAAAT-AAATTATATAT-CGTAATATTGATGATAAAATGTTATTAAAATGATAATTATTCATTG
* * * ** ** *
254358 ATTAATTATTTCAAGCTTTTAAAGGCATGATAAACTTAAACGGCTCTTTCTTTGTCTCTAGATAG
64 ATAAATAATTTCAAGCTTTTGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCTTTGTCAATGGATAG
* * * * * * * *
254423 CATTCACATCATGTTTCCGAATGCAAACATCAAACTATGATAGGGTTTAATCAAGAACAACAAAG
129 CATCCACCTCACGTTTCCAAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAAGAACAACAAAG
* * * *
254488 TTTTCTATTTATTTTCGATATTTAATCTTTTATAAGGTT
194 CTTTC-ATTT-TTTTCAATATATAATCTTTTATAAGATT
* * * * * *
254527 ATGAATGAAA-TATATATCATAATATTGAT-ATTAAAATGTTATCAAAATGGTAATTGTTCATTC
1 ATAAAT-AAATTATATATCGTAATATTGATGA-TAAAATGTTATTAAAATGATAATTATTCATTG
* ** *
254590 ATAAACAATTTCAAGCTTTT-AAGGGCATGATATGCTTAAAATGCTCTTTCTTTGTCAAAGGATA
64 ATAAATAATTTCAAGCTTTTGAA-GGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCTTTGTCAATGGATA
* * * * *
254654 GCATCCACTTCAAGTTTCTCAAA-GCAAACATTCAATTATGATAGATTTTAA-CAAAAACAACAA
128 GCATCCACCTCACGTTTC-CAAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAAGAACAACAA
* ** *
254717 AGTTTTCAATTTAATTCGATATATAATCTTTTATAAGATT
192 AGCTTTC-ATTTTTTTCAATATATAATCTTTTATAAGATT
* * * * *
254757 ATAAATAAATTATATAGCAGT-ATATTGGTAATAAAATATT-TTCAAAATGATAATTGTTCATTG
1 ATAAATAAATTATATATC-GTAATATTGATGATAAAATGTTATT-AAAATGATAATTATTCATTG
* * * * *
254820 ATAAATAATTTCAAGCTTTTGTAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTGTCCTTGTCTATGGATAA
64 ATAAATAATTTCAAGCTTTTGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCTTTGTCAATGGATAG
* * *
254885 CATCCACCTCATGTTTCC--A---AAACATCTAATTATGATAGGTTTTAA-C--TAACAACAAAG
129 CATCCACCTCACGTTTCCAAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAAGAACAACAAAG
* ** * * *
254942 CTTTGAATTTATTTTTTATTTATAATCCTTTGTAAGATT
194 CTTT-CATTT-TTTTCAATATATAATCTTTTATAAGATT
* * * *
254981 ATAAATTAATTATATATCGTAATATTGATGATAAAATATTATCAAAATGATATTTATTCATTGAT
1 ATAAATAAATTATATATCGTAATATTGATGATAAAATGTTATTAAAATGATAATTATTCATTGAT
* *** ** * * **
255046 AAATCATTTCAAGCTTACAAATACATCATAAACTTGAAATGCTCTTTCCCTGTCAATGGATAGCA
66 AAATAATTTCAAGCTTTTGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCTTTGTCAATGGATAGCA
* * * * *
255111 TCCA-CTACAC-TCTTCCAAATACAGATATCTAATTATGATAAGTTTTAACCAAGAACAACAAA-
131 TCCACCT-CACGT-TTCCAAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAAGAACAACAAAG
**
255173 CGTTTCAATTTATTTTTGATATATAA-CTTTTATAAGATT
194 C-TTTC-ATTT-TTTTCAATATATAATCTTTTATAAGATT
* * * * *
255212 ATAAATGAATTATATATAGTAATAGTGATGTTAAAATGTTATCAAAATGATAATT-TCTCATTGA
1 ATAAATAAATTATATATCGTAATATTGATGATAAAATGTTATTAAAATGATAATTAT-TCATTGA
* * *
255276 TAAATAATTTCAAGCTTTTGTAGGCAAGATAAACTTAAAATGCT-TTTCCTTGTCAATGGATAGC
65 TAAATAATTTCAAGCTTTTGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCTTTGTCAATGGATAGC
* * * * * * ** * * ** * *
255340 ATCAACTTTATGCTTTTC-AATGTAAACATCTGATTATGATAAGCTTTAACTGAGAACAATAAGG
130 ATCCACCTCACG-TTTCCAAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAAGAACAACAAAG
* * **
255404 CTTCTCACTTATTTTCAATTTATAATGATTTATAAGATT
194 CTT-TCA-TTTTTTTCAATATATAATCTTTTATAAGATT
* * * * *
255443 ATAAATATAA-TATAT-T-ATAATATTGATTAGATAATGTTA-TAAAACTGATAATTATTCATGG
1 ATAAATA-AATTATATATCGTAATATTGATGATAAAATGTTATTAAAA-TGATAATTATTCATTG
* * * ** * *
255504 ATACATTATTTCAAGCTTTTGAAGGCCTGATAAACTTAAAATTTTCTTTCTTTGTCACTAGATAG
64 ATAAATAATTTCAAGCTTTTGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCTTTGTCAATGGATAG
* * * * *
255569 CATGCACATCACGTTTCCAAAAAGCAAACATCCAATTATGATAGTTTTTAACCCAGAA-AAC-AA
129 CATCCACCTCACGTTTCC-AAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAAGAACAACAAA
* * * *
255632 ---TGC----TTTT-GAT-TAGTAATCATTTATAATATT
193 GCTTTCATTTTTTTCAATATA-TAATCTTTTATAAGATT
* * * * * *
255662 ATAAATGAA-T-TATATCATAATATTGAAGATAAAATATTATCAAAATGACAATTATAT-ATTGA
1 ATAAATAAATTATATATCGTAATATTGATGATAAAATGTTATTAAAATGATAATTAT-TCATTGA
* * * * * * * *
255724 TAAATCATTTCAAGCTTAAT-AAGGCATGAGAAACTCAAAATGCTCTCTCCTTATCAATGGATAA
65 TAAATAATTTCAAGCTT-TTGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCTTTGTCAATGGATAG
* * *** * * * *
255788 CATCCACTTCACGTTTTCC-AATGAAAACATTTGATTA-GAATAGGCTTTGATCGAGAACAACAA
129 CATCCACCTCACG-TTTCCAAATGCAAACATCCAATTATG-ATAGGTTTTAACCAAGAACAACAA
* * ** *
255851 AGCTTCTAACTTATTTTT-GAT-TGATAATGATTTATAATATT
192 AGCTT-TCA-TT-TTTTTCAATAT-ATAATCTTTTATAAGATT
* * ** * * *
255892 ATAAATGAATTATTTATCAAAATATTGATGATAAAGTGCTATT-AAATGAAAATTATTCATTGAT
1 ATAAATAAATTATATATCGTAATATTGATGATAAAATGTTATTAAAATGATAATTATTCATTGAT
* *** * * * *
255956 AAATCATTTCAAGCTTACAAAAGGCATGATAAACTTAAAAAGCGCCTTCTTTTTCAATGGATAGC
66 AAATAATTTCAAGCTT-TTGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCTTTGTCAATGGATAGC
* ** ** * * ** * **
256021 ATCCACTTCATATTTCCTGATGCAAACTTCCAATTATGAAAGAATTTAACTAAGAACAATGAAGC
130 ATCCACCTCACGTTTCCAAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAAGAACAACAAAGC
* * * *
256086 TTTCGA------T---T-TATAATCATTGATCAGGTT
195 TTTC-ATTTTTTTCAATATATAATCTTTTATAAGATT
* * * * * * *
256113 ATAAATGAA-T-TATATCATAATCTT-AGTGATAAAATGTTATCAAAATAATAATTATTCACTAA
1 ATAAATAAATTATATATCGTAATATTGA-TGATAAAATGTTATTAAAATGATAATTATTCATTGA
* * * ** * * * * *
256175 TAAATCATTTTAAGCTTTCGAAGGCGCGATAAACTTAAAATGCACTTTCCTTATCAACT-AAGAG
65 TAAATAATTTCAAGCTTTTGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCTTTGTCAA-TGGATAG
* * * * * * * * *
256239 CATCCACTTCACATTTCC-TATGGTAAACATTCAATTATGATAAGCTTTAACTAAGAACAAAAAA
129 CATCCACCTCACGTTTCCAAAT-GCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAAGAACAACAAA
* * **
256303 GCTTTCAACTTATTTTT-GATTTATAATGATTTATAAGATT
193 GCTTTC-A-TT-TTTTTCAATATATAATCTTTTATAAGATT
* * * * *
256343 ATAAATGAATTGTATATCATAATATTGATGAT-AAATGTTATTAAAATTATAATTATTCATGGGA
1 ATAAATAAATTATATATCGTAATATTGATGATAAAATGTTATTAAAATGATAATTATTCAT-TGA
* * * * * * * * * * * *
256407 -AAGTCATTTTAAGCCTTCGAAGGCCTGATAAACTTAACACGC-CTTTTCCTT-TCACTGAATAT
65 TAAATAATTTCAAGCTTTTGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTC-TTTCTTTGTCAATGGATAG
* * * * * * ** **
256469 CATCCACTTCACATTT-CACAGTGCAAATATCTAATTATGAAAGGTTTTAACTGAGAACAATGAA
129 CATCCACCTCACGTTTCCA-AATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAAGAACAACAAA
* * * *
256533 G----C----TTTT-GATTTATAATCATTGATAAGATT
193 GCTTTCATTTTTTTCAATATATAATCTTTTATAAGATT
* ** * * * *
256562 ATAAGTGGA-T-TATATCATAATATTAATGATAAAATGATATTAAAATGATAGTTATTCATTGAT
1 ATAAATAAATTATATATCGTAATATTGATGATAAAATGTTATTAAAATGATAATTATTCATTGAT
* * * * * *
256625 AAATCATTCCAAGCTTTCGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTATTTCTTTGTCAATAGATAGGA
66 AAATAATTTCAAGCTTTTGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCTTTGTCAATGGATAGCA
* * * * * ** * * * *
256690 TTCACTTCACGTTTTCTATTGCAAACATCTTATTATGATACGCTTTAACTAAGAACAATAAAGCT
131 TCCACCTCACGTTTCCAAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAAGAACAACAAAGC-
* * * * *
256755 TTTGA-GTTATTCACGATTTATAATGTTTTATAAGATT
195 TTTCATTTTTTTCA--ATATATAATCTTTTATAAGATT
* * * * * *
256792 ACAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAGTGTTATTAAAATTATAATTATTCATTGAG
1 ATAAATAAATTATATATCGTAATATTGATGATAAAATGTTATTAAAATGATAATTATTCATTGAT
** * * * * * *
256857 AAATCAGGTTC-AGCTTTCGAAGGCATGATAAACTTAAAAGGCTTTTTCCTT-TCATTGGATGGC
66 AAAT-AATTTCAAGCTTTTGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCTTTGTCAATGGATAGC
* * * * * * *
256920 ATCCACTTCACGTTTTTC-AATGTAAACATTCAATTATGAAAGATTTTAACCAAGAACAACGAAG
130 ATCCACCTCACG-TTTCCAAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAAGAACAACAAAG
*
256984 GTTTC
194 CTTTC
256989 GATAATTATT
Statistics
Matches: 2686, Mismatches: 555, Indels: 282
0.76 0.16 0.08
Matches are distributed among these distances:
217 25 0.01
218 102 0.04
219 319 0.12
220 52 0.02
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ACGTcount: A:0.38, C:0.13, G:0.11, T:0.37
Consensus pattern (230 bp):
ATAAATAAATTATATATCGTAATATTGATGATAAAATGTTATTAAAATGATAATTATTCATTGAT
AAATAATTTCAAGCTTTTGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCTTTGTCAATGGATAGCA
TCCACCTCACGTTTCCAAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAAGAACAACAAAGCT
TTCATTTTTTTCAATATATAATCTTTTATAAGATT
Found at i:255794 original size:679 final size:674
Alignment explanation
Indices: 253388--262516 Score: 5057
Period size: 680 Copynumber: 13.4 Consensus size: 674
253378 AAATAAATTG
* * * * *
253388 TATATTATAAT-TTGGATGATAAAATATTATCAAAATGATAATCACTCATTGATAAATCATTTCA
1 TATATCATAATATT-GATGAGAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCA
* * * * * *
253452 AGCTTTCGAAGGCATGATAAATTTAAAATACTCTTTCCTTGTCAATGGATACCATCCACTTCATG
65 AGCTTTTGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCACTGGATAGCATCCACTTCACG
* * ** * * ** * *
253517 TTGCCCAAAACAAGCATCCAGTTATGATAAGTTTTAACTAAAAACAA-CAAAGCTTTTGTTTTAT
130 TTTCCTAATGCAAACATCCAATTATGAT-AGTTTTAACCCAGAACAATCAATGCTTTTG----A-
* * * *
253581 TTTTAATTTGTAATCATTTATAAGATTAT-ACTAAATTATGTACTATAATATTGATGTTAAAATG
189 -TTT-A----TAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTATAT-C-ATAATATTGATGATAAAATG
* * * * *
253645 TTATCAAAAGGATCATTGTTCATTGATAAATAATTTCAAGCTTTT-ATGGGCATGATAAACTTAA
246 TTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTTGA-AGGCATGATAAACTTAA
* * * *
253709 AATGCTCTTTCCTTGTCAATTGATAACATCCACCT-CATGTTTCC---CA-AAACATCTAATTCT
310 AATGCTCTTTCCTT-TCAATGGATAGCATCCA-CTACA--TTTCCAAATACAAACATCTAATTAT
* * * * * * * *
253769 GAAAAGTTTTATCTAAGAACAACAAAGCTTTGAATTTATTTTTTTATTTATAATCATTTGTAAGA
371 GATAAGTTTTAACCAAGAACAACAAAGCTTTCAATTTA-TTTTTGATATATAA-CTTTTATAAGA
* * * *
253834 TTATAAATGAATTTTATATCGTAATATTGATGATAAAATGTTAT-AAATATTATAATTATTCATT
434 TTATAAATGAATTATATAT-ATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAA-ATGATAATTGTTCATT
* * * * ** *
253898 GATAAATCATTTCAAGCTTTTGAATGCATCATAAACTTGTAATACTCTTT-CTATGTCAATGGAT
497 GATAAATAATTTCAAGCTTTCGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCT-TGTCAATGGAT
* * * * * * * * * * * *
253962 AGCCTCTA-TTACACGTTTCCAAATGAAAAAATCCAAGTATGATAGGTTTTAACCAAGAATAACA
561 AGCATCCACTT-CATGTTTCC-AATGCAAACATCTAATTATGATAAGCTTTAACTAAGAACAATA
* ** ** **
254026 AAGCTTTCA-TTTTTTTCAACATATAATGTTTTATAAGATTATAAACAAATCA
624 AAGCTTTCACTTATTTTCAATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAA--A
** ** * * * *
254078 TATATTGTAATATTGATGTTAAAATGTTATTAAAATGATAATTGTTCATTGATAGATAATTTCAA
1 TATATCATAATATTGATGAGAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAA
* * * ** *
254143 GC-TTTCATAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTATCATTGTCAAAGGATAGCATCCACCTCACG
66 GCTTTTGA-AGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCACTGGATAGCATCCACTTCACG
* *
254207 TTTCCTAATGCAAACATCCGATTATGATAAGCTTTAA-CCATGAACAAT-AAGGCTTTGGACTTA
130 TTTCCTAATGCAAACATCCAATTATGAT-AGTTTTAACCCA-GAACAATCAA-----T-G-C-T-
* * * * * * *
254270 TTTACAAGTTATAATGATTTATAAAATTATAAATGTAA-TATATTACAATATTGATGAGAAAATG
184 TTT--GATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATG-AATTATATCATAATATTGATGATAAAATG
* * *
254334 TTATC-AAATGATAATTATTCATTGATTAATTATTTCAAGCTTTTAAAGGCATGATAAACTTAAA
246 TTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTTGAAGGCATGATAAACTTAAA
** * ** * * * * * *
254398 CGGCTCTTTCTTTGTCTCTAGATAGCATTCAC-ATCATGTTTCCGAATGCAAACATCAAACTATG
311 ATGCTCTTTCCTT-TCAATGGATAGCATCCACTA-CA--TTTCCAAATACAAACATCTAATTATG
* * * * * * * *
254462 ATAGGGTTTAATCAAGAACAACAAAGTTTTCTATTTATTTTCGATATTTAATCTTTTATAAGGTT
372 ATAAGTTTTAACCAAGAACAACAAAGCTTTCAATTTATTTTTGATATATAA-CTTTTATAAGATT
* * * *
254527 ATGAATGAAATATATATCATAATATTGAT-ATTAAAATGTTATCAAAATGGTAATTGTTCATTCA
436 ATAAATGAATTATATAT-ATAATATTGATGA-TAAAATGTTATCAAAATGATAATTGTTCATTGA
* * ** * *
254591 TAAACAATTTCAAGCTTT-TAAGGGCATGATATGCTTAAAATGCTCTTTCTTTGTCAAAGGATAG
499 TAAATAATTTCAAGCTTTCGAA-GGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAG
* * * * *
254655 CATCCACTTCAAGTTTCTCAAAGCAAACAT-TCAATTATGAT-AGATTTTAAC-AAAAACAACAA
563 CATCCACTTCATGTTTC-CAATGCAAACATCT-AATTATGATAAG-CTTTAACTAAGAACAATAA
* * * * * *
254717 AGTTTTCAATT-TAATTCGATATATAATCTTTTATAAGATTATAAAT-AAA
625 AGCTTTCACTTAT-TTTCAATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAAA
* * * * * * *
254766 TTATATAGCAGT-ATATTGGTAATAAAATATTTTCAAAATGATAATTGTTCATTGATAAATAATT
1 -TATAT--CA-TAATATTGATGAGAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATT
* * * *
254830 TCAAGCTTTTGTAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTGTCCTTGTCTA-TGGATAACATCCACCT
62 TCAAGCTTTTGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTC-ACTGGATAGCATCCACTT
* * ** * * **
254894 CATGTTTCC--A---AAACATCTAATTATGATAGGTTTTAACTAACAACAAAGCTTTGAATTTAT
126 CACGTTTCCTAATGCAAACATCCAATTATGATA-GTTTTAACCCAGAAC-AA----TCAA--TGC
* * * * * *
254954 TTTTTATTTATAATCCTTTGTAAGATTATAAATTAATTATATATCGTAATATTGATGATAAAATA
183 TTTTGATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAA-T-TATATCATAATATTGATGATAAAATG
* *** ** * *
255019 TTATCAAAATGATATTTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTACAAATACATCATAAACTTGAA
246 TTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTTGAAGGCATGATAAACTTAAA
* * *
255084 ATGCTCTTTCCCTGTCAATGGATAGCATCCACTACACTCTTCCAAATACAGATATCTAATTATGA
311 ATGCTCTTT-CCTTTCAATGGATAGCATCCACTACA-T-TTCCAAATACAAACATCTAATTATGA
255149 TAAGTTTTAACCAAGAACAACAAA-CGTTTCAATTTATTTTTGATATATAACTTTTATAAGATTA
373 TAAGTTTTAACCAAGAACAACAAAGC-TTTCAATTTATTTTTGATATATAACTTTTATAAGATTA
* *
255213 TAAATGAATTATATATAGTAATAGTGATGTTAAAATGTTATCAAAATGATAATT-TCTCATTGAT
437 TAAATGAATTATATATA-TAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTGT-TCATTGAT
* * *
255277 AAATAATTTCAAGCTTTTGTAGGCAAGATAAACTTAAAATGCT-TTTCCTTGTCAATGGATAGCA
500 AAATAATTTCAAGCTTTCGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCA
* * * * * * *
255341 TCAACTTTATGCTTTTCAATGTAAACATCTGATTATGATAAGCTTTAACTGAGAACAATAAGGCT
565 TCCACTTCATG-TTTCCAATGCAAACATCTAATTATGATAAGCTTTAACTAAGAACAATAAAGCT
*
255406 TCTCACTTATTTTCAATTTATAATGATTTATAAGATTATAAAT-ATAA
629 T-TCACTTATTTTCAATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGA-AA
* * * * * *
255453 TATATTATAATATTGATTAGATAATGTTAT-AAAACTGATAATTATTCATGGATACATTATTTCA
1 TATATCATAATATTGATGAGAAAATGTTATCAAAA-TGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCA
* ** * * * *
255517 AGCTTTTGAAGGCCTGATAAACTTAAAATTTTCTTTCTTTGTCACTAGATAGCATGCACATCACG
65 AGCTTTTGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCACTGGATAGCATCCACTTCACG
* *
255582 TTTCCAAAAAGCAAACATCCAATTATGATAGTTTTTAACCCAGAA-AA-CAATGCTTTTGA-TTA
130 TTTCC-TAATGCAAACATCCAATTATGATAG-TTTTAACCCAGAACAATCAATGCTTTTGATTTA
* * *
255644 GTAATCATTTATAATATTATAAATGAATTATATCATAATATTGAAGATAAAATATTATCAAAATG
193 -TAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATG
* * * * *
255709 ACAATTATAT-ATTGATAAATCATTTCAAGCTTAAT-AAGGCATGAGAAACTCAAAATGCTCTCT
257 ATAATTAT-TCATTGATAAATCATTTCAAGCTT-TTGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTT
* * * * * *
255772 CCTTATCAATGGATAACATCCACTTCACGTTTTCC-AATGA-AAACATTTGATTA-GAATAGGCT
320 CCTT-TCAATGGATAGCATCCAC-T-AC-ATTTCCAAAT-ACAAACATCTAATTATG-ATAAGTT
* * * * *
255834 TTGATCGAGAACAACAAAGC-TTCTAACTTATTTTTGAT-TGATAA-TGATTTATAATATTATAA
379 TTAACCAAGAACAACAAAGCTTTC-AATTTATTTTTGATAT-ATAACT--TTTATAAGATTATAA
* * * * * * *
255896 ATGAATTATTTATCAAAATATTGATGATAAAGTGCTAT-TAAATGAAAATTATTCATTGATAAAT
440 ATGAATTATATAT-ATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTGTTCATTGATAAAT
* * * * * * * *
255960 CATTTCAAGCTTACAAAAGGCATGATAAACTTAAAAAGCGCCTTCTTTTTCAATGGATAGCATCC
504 AATTTCAAGCTTTC-GAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCATCC
* * * * * *
256025 ACTTCATATTTCCTGATGCAAACTTCCAATTATGA-AAGAATTTAACTAAGAACAATGAAG----
568 ACTTCATGTTTCC-AATGCAAACATCTAATTATGATAAG-CTTTAACTAAGAACAATAAAGCTTT
* * * * *
256085 --C----TTTCGATTTATAATCATTGATCAGGTTATAAATGAAT
631 CACTTATTTTCAATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAAA
* * * * * *
256123 TATATCATAATCTT-AGTGATAAAATGTTATCAAAATAATAATTATTCACTAATAAATCATTTTA
1 TATATCATAATATTGA-TGAGAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCA
* ** * * * *
256187 AGCTTTCGAAGGCGCGATAAACTTAAAATGCACTTTCCTTATCAACT-AAGAGCATCCACTTCAC
65 AGCTTTTGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTC-ACTGGATAGCATCCACTTCAC
* * * * ** *
256251 ATTTCCT-ATGGTAAACATTCAATTATGATAAGCTTTAACTAAGAACAAAAAAGCTTTCAACTTA
129 GTTTCCTAAT-GCAAACATCCAATTATGAT-AGTTTTAACCCAGAAC----AA----TCAA--TG
* *
256315 TTTTTGATTTATAATGATTTATAAGATTATAAATGAATTGTATATCATAATATTGATGAT-AAAT
182 CTTTTGATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAA-T-TATATCATAATATTGATGATAAAAT
* * * * * * * *
256379 GTTATTAAAATTATAATTATTCATGGGA-AAGTCATTTTAAGCCTTCGAAGGCCTGATAAACTTA
245 GTTATCAAAATGATAATTATTCAT-TGATAAATCATTTCAAGCTTTTGAAGGCATGATAAACTTA
* * * * * * * *
256443 ACACGC-CTTTTCCTTTCACTGAATATCATCCACTTCACATTT-CACAGTGCAAATATCTAATTA
309 AAATGCTC-TTTCCTTTCAATGGATAGCATCCAC-T-ACATTTCCA-AATACAAACATCTAATTA
** ** * * *
256506 TGA-AAGGTTTTAACTGAGAACAATGAAGC-TT---TTGA--TTT-ATA-AT--CATTGATAAGA
370 TGATAA-GTTTTAACCAAGAACAACAAAGCTTTCAATTTATTTTTGATATATAACTTTTATAAGA
* * * * * * * *
256560 TTATAAGTGGATTATAT-CATAATATTAATGATAAAATGATATTAAAATGATAGTTATTCATTGA
434 TTATAAATGAATTATATATATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTGTTCATTGA
* * * * * *
256624 TAAATCATTCCAAGCTTTCGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTATTTCTTTGTCAATAGATAGG
499 TAAATAATTTCAAGCTTTCGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGC
* * * * * *
256689 ATTCACTTCACGTTTTCTATTGCAAACATCTTATTATGATACGCTTTAACTAAGAACAATAAAGC
564 ATCCACTTCATG-TTTCCAATGCAAACATCTAATTATGATAAGCTTTAACTAAGAACAATAAAGC
* * ** * ** *
256754 TTTTGAGTTATTCACGATTTATAATGTTTTATAAGATTACAAATGAATTA
628 -TTTCACTTATTTTCAATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAA--A
* * * * * *
256804 TATATCATAATATTGATGATAAAGTGTTATTAAAATTATAATTATTCATTGAGAAATCAGGTTC-
1 TATATCATAATATTGATGAGAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCA-TTTCA
* * * * *
256868 AGCTTTCGAAGGCATGATAAACTTAAAAGGCTTTTTCCTT-TCATTGGATGGCATCCACTTCACG
65 AGCTTTTGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCACTGGATAGCATCCACTTCACG
* * * * * * *
256932 TTT-TTCAATGTAAACATTCAATTATGAAAGATTTTAACCAAGAACAA-CGAA-GGTTTCG----
130 TTTCCT-AATGCAAACATCCAATTATGATAG-TTTTAACCCAGAACAATC-AATGCTTTTGATTT
* * * *
256990 ATAATTATTTATAATATTATAAATGAATTGTATCATAATATTGATAATAAAATGTTATCAAAATG
192 ATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATG
* * * * * *
257055 ATAATTAATCATTGATAAATCATTTCAATCTTTTTGGAA-GTATGATAAATTTAAAATACTCATT
257 ATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGC-TTTT-GAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTT
* ** * ** * * *
257119 CCTTGTCAACGGATAGCATCCACTTTATGTTTCTC-ACTGTAAACAT-TCGATTATAATAAGCTT
320 CCTT-TCAATGGATAGCATCCAC--TACATTTC-CAAATACAAACATCT-AATTATGATAAGTTT
* ** * * * * *
257182 TAACCAATAATTATAAAGCTTTCAACTTT-TTTTTCAATTTATAATTATTTATAAGCTTATAAAT
380 TAACCAAGAACAACAAAGCTTTCAA-TTTATTTTT-GATATATAACT-TTTATAAGATTATAAAT
* * * * * * *
257246 GAATTATATATCATAATATTGAAGATAAAGTGTTATTAAAATTATAATTATTCATTGAGAAATCA
442 GAATTATATAT-ATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTGTTCATTGATAAATAA
* * ** * *
257311 TTTTAAGCTTTCGAAGGCATGATAAACTTTAAACACTCTTT-CTT-TACATTAGATAGCATCCAC
506 TTTCAAGCTTTCGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGT-CAATGGATAGCATCCAC
* * *
257374 TTCATGTTTCCCAATGCAAACATCTAATTATGA-AAGGTTTGAACCAAGAACAATGAAG------
570 TTCATGTTT-CCAATGCAAACATCTAATTATGATAAGCTTT-AACTAAGAACAATAAAGCTTTCA
* * *
257432 C---TTTT-AATTTATAATCATTGATAAAATTATAAATGAAT
633 CTTATTTTCAATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAAA
* * * ** **
257470 TATATCAGAATATTGATGATAAAATATTATCAAGTTGATAATTATTTGTTGATAAATCATTTCAA
1 TATATCATAATATTGATGAGAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAA
* * * * * *
257535 GCTTTTAAAGGCAAGATAAACTTAAAACGCTCTTTCCTTGTAAATGGATAGAATCCACTTCACGT
66 GCTTTTGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCACTGGATAGCATCCACTTCACGT
** * * * **
257600 TTTTTAATG-AAAGCATCTGAA-TATAATAGGTTTTAACCAAGAACAATGAAGCTTTTAATTTAA
131 TTCCTAATGCAAA-CATC-CAATTATGATA-GTTTTAACCCAGAACAAT----C----AA--TGC
* * *
257663 TTTTTATTTATAATGATTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAATTG
183 TTTTGATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAA-T-TATATCATAATATTGATGATAAAATG
* * * * * ** *
257728 TTACCAAAATTATAATTATTCATTGAGAAATCATTTTAAACTTTCAAAGGAATGATAAACTTAAA
246 TTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTTGAAGGCATGATAAACTTAAA
* * * * * ** * *
257793 ATACTCTTTCCTTTCACTAGATAGCATCTACTTCACGTTTCTC-AATGTAAACATCCAATTACGA
311 ATGCTCTTTCCTTTCAATGGATAGCATCCAC-T-ACATTTC-CAAATACAAACATCTAATTATGA
** * * * *
257857 T-AGATTTTAATTAAAAACAACAAAGC-TT---TTGA--TTT-ACA-AT--CATTTATAAGATTA
373 TAAG-TTTTAACCAAGAACAACAAAGCTTTCAATTTATTTTTGATATATAACTTTTATAAGATTA
* ** * * *
257911 TAAATGAATCATA-CCATAATATAGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTGTTCACTGTTAA
437 TAAATGAATTATATATATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTGTTCATTGATAA
* * * * * * * * * * * *
257975 GTCATTTCAACCTTTCGAAGGCATGATAAATTTAAAAGGTTATTTCCTAGTCAATGGACAACCTT
502 ATAATTTCAAGCTTTCGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCATC
* ** * * * * * * *
258040 CACTTCGTGTGGCTTAATGGAAACAT-TCAACTATAATATGTTTTACCTAAGAACAATAAAGCTT
567 CACTTCATGTTTC-CAATGCAAACATCT-AATTATGATAAGCTTTAACTAAGAACAATAAAGCTT
* * * *
258104 TCGATTTATTTTCAATTTGTAATCATTTATAAAATTATAAATGAAT
630 TC-ACTTATTTTCAATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAAA
* * * * *
258150 TATATCAGAATATGGATGATAAAATATTATCAAAATGATAATTATTCACTGATAAATCATTTCAA
1 TATATCATAATATTGATGAGAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAA
* * * ** * *
258215 GCTTTTGATGGCATGATAAACATAAAATGC-CATTTTCTTGTCAAC-AAATAGGATTCACTTCAC
66 GCTTTTGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTC-TTTCCTTGTC-ACTGGATAGCATCCACTTCAC
* * * * * * *
258278 GTTTTCC-AAT-AACAACAACCGATTATAATAAGCTTTAACCGAGAACAATAAAGCTTTCGACTT
129 G-TTTCCTAATGCA-AACATCCAATTATGAT-AGTTTTAACCCAGAACAATCAA----T-G-C--
* * * * *
258341 ATTTTCGATTTATAATGATTTAGAAGATTATAAATGTATTAGATATCATAATATTGATGATCAAT
183 -TTTT-GATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATT--ATATCATAATATTGATGATAAAA
* * * * * * * **
258406 TATTATTAAAATTACAATTATTCATTGAGAAATCATTTTAGGCTTTTGAAGAAATGATAAACTTA
244 TGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTTGAAGGCATGATAAACTTA
** * * * * * * * *
258471 AAACACTTTTTCCTTTCACTAGATAGCATCCACTTTATATTTTCTAATGCAAACATCCAATTATG
309 AAATGCTCTTTCCTTTCAATGGATAGCATCCAC--TACATTTCCAAATACAAACATCTAATTATG
* * * * * * *
258536 ATAGGTTTTAACCAAGAATAAAAAAG----C--TTT-GTTTTG-GA-ATAA--TGTATAAGATAA
372 ATAAGTTTTAACCAAGAACAACAAAGCTTTCAATTTATTTTTGATATATAACTTTTATAAGATTA
* * * * * *
258590 TAAATGAATCATAT-CATAATATTGATGTTAAAATATTATCAAAATAATAATTGTTCATTGTTAA
437 TAAATGAATTATATATATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTGTTCATTGATAA
* * ** * * * * *
258654 GTAGTTTCAAGCTTTC-AAACCAATGATAAACTTAAAGTGCTCTATCCTTGACAAAGGATAGTAT
502 ATAATTTCAAGCTTTCGAAGGC-ATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCAT
* * * * * *
258718 TCACTTCTCAT-TTCCCAATGCAAACATCTGATTATGATAGGCTTTAACCAAGAACAGTAAAGCT
566 CCAC-T-TCATGTTTCCAATGCAAACATCTAATTATGATAAGCTTTAACTAAGAACAATAAAGC-
* ** * * *
258782 TTTGACTTATTTTTTATTTATAATGATTTATAAAATTATAAATGTAA
628 TTTCACTTATTTTCAATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAAA
*** * *
258829 TATATTGCAAGATTGATGAGAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATTATTTCAA
1 TATATCATAATATTGATGAGAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAA
* * * * * *
258894 GCTTTTGGAGGTATGATTAACTTAAAATGCTCTTTCTTTGTCACTGGATAGCATCCACATCACCT
66 GCTTTTGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCACTGGATAGCATCCACTTCACGT
* * * * ** **
258959 TTCCCAGTGTAAACATCCAACTATGATAAGTTTTAACTAAGAACAA-CAATGCTTTCAAATTTTT
131 TTCCTAATGCAAACATCCAATTATGAT-AGTTTTAACCCAGAACAATCAATGC--T----TTTGA
* * * *
259023 TTATATAATCTTTTATAAGATTATAAATGAAATATACATCGTAATATTGA-CATTAAAATGTTAT
189 TT-TATAATCATTTATAAGATTATAAATG-AAT-TATATCATAATATTGATGA-TAAAATGTTAT
* * *
259087 CAAAATAATAATTATTCATTGATAAATAATTTCAAGCTTTTGAAGGCATGATAAATTTAAAATGC
250 CAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTTGAAGGCATGATAAACTTAAAATGC
* * * * *
259152 TCTTTCTCTCTGAAAGGATAGCATCCACTTGA-AGTTTCCCAAA-GCAAACATCTAATTATGATG
315 TCTTTC-CTTTCAATGGATAGCATCCAC-T-ACA-TTT-CCAAATACAAACATCTAATTATGATA
* * * **
259215 GGTTTTAACCAAAAACAATAAAGCTTTCAATTTATTTTCAATATATAATCTTTTATAAGATTATA
375 AGTTTTAACCAAGAACAACAAAGCTTTCAATTTATTTTTGATATATAA-CTTTTATAAGATTATA
* * * *
259280 AATGAATTATATATCATAATATTGGTAATAAAATGTAATCAAAATGCTAATTGTTCATTGATAAA
439 AATGAATTATATAT-ATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTGTTCATTGATAAA
* * * * * *
259345 TAATTTCAAACTTTCGTAGGCATGATAAACTGAAAATGCTTTTTCCTTATCAATTGATAGCATCC
503 TAATTTCAAGCTTTCGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCATCC
* * * * * * * **
259410 A-TTACACGATTCCCAATGCAAACATCCAATTATGAT-TG-ATT--CT----ATATTAAAGC-AA
568 ACTT-CATG-TTTCCAATGCAAACATCTAATTATGATAAGCTTTAACTAAGAACAATAAAGCTTT
* * * *
259465 CA-TGGATTTT-GATTTATAATCATTGATAAGATTATAAATGAAT
631 CACT-TATTTTCAATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAAA
* * * *
259508 TGTATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCCAAATGATAATTATTTATTGATAAATCATTTCAA
1 TATATCATAATATTGATGAGAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAA
** * ** * *
259573 GCTTGCGAAGGCAAGATAAACTTAAAATGCTCTTTTATTGTCAATGGATAGCATCCACTTCATGT
66 GCTTTTGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCACTGGATAGCATCCACTTCACGT
** * * * ** *
259638 GGCCCAATGCAAACATTCAAATATGATAGGTTTTAACTAAGAACAACAAAAATTTCAATGTATTT
131 TTCCTAATGCAAACATCCAATTATGATA-GTTTTAACCCAG---AAC---AA--TCAATG-CTTT
* * * * * *
259703 TCTATTTGTAATCATCTATAGGATTATAAATGAATTATATCAGAATATGGATGATAAAATGTTAT
186 T-GATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTATATCATAATATTGATGATAAAATGTTAT
* * * * * *
259768 CAAAATGATAATTATTCAATGATAAATTATTTCCAGCATTTGAATGCATCATAAACTTAAAATGC
250 CAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTTGAAGGCATGATAAACTTAAAATGC
** * * * * * * *
259833 TCCATCCTCTTGAATGGATAACATCCACTATGCATTTTCGAATGCAAACATCCAATTATGATAAA
315 TCTTTCCT-TTCAATGGATAGCATCCACTA--CATTTCCAAATACAAACATCTAATTATGATAAG
* ** * * * *
259898 TTTTAACCAAAAATGACAAAGCTTTTAATTTTTTTTTCAATATATAATCTTTTATAAGTTTATAA
377 TTTTAACCAAGAACAACAAAGCTTTCAATTTATTTTT-GATATATAA-CTTTTATAAGATTATAA
* * * * *
259963 ATCAATCATATATCGTAATATTGATGTTAAAATGTTATCAAGATGATAATTGTTCATTGA-AATA
440 ATGAATTATATAT-ATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTGTTCATTGATAA-A
* * * * * *
260027 TAATTTCAAGCTCTC-ATAGCCATGATAAA-TTAAAAATGCTCTTTCCTTTTCAACGGATAACAC
503 TAATTTCAAGCTTTCGA-AGGCATGATAAACTT-AAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCAT
* * * * * * * * * *** *
260090 CCACTACGTTTTTTTCGAAAGCAAAAAGGC-AATTATGATATGCTTT-A-TCA-ATTTAT-AATC
566 CCACTTC--ATGTTTCCAATGCAAACA-TCTAATTATGATAAGCTTTAACTAAGAACAATAAAGC
* * * * * **
260150 ATTGAT-AC-AATTAT-AATTCACAAT-ATTGAT--GA-TA-AAATGCTA
628 -TT--TCACTTATTTTCAATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAAA
* * * * * ** ** **
260192 TCGAAATAATAATTATTCACTGA-CAAATAATT-TCAAGCTTTCG-TAGGGAGGATAAATTGA-A
1 T--ATATCATAA-TATTGA-TGAGAAAAT-GTTATCAA--AAT-GATA---ATTATTCATTGATA
* * * * ** * * *
260253 CACTCTCTTTCCATGC----CAACGG-ATAGCATCCACTT--CATG----TTCC----CAATGCA
55 -AATC-ATTT-CAAGCTTTTGAA-GGCAT-G-ATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCACTGGA
* * * * * * *
260303 -AACATCCAATT-ATGATAAGTT-CTAA-CCAAGA-A--CAA-CA-AAT-CTTTT------G---
114 TAGCATCCACTTCACG-T---TTCCTAATGCAA-ACATCCAATTATGATAGTTTTAACCCAGAAC
* * * * * *
260349 -AT---TTCTTTTCAATTTCTAATTATTTGTAAGATTATAAATGAATTATATACCATAATATAGA
174 AATCAATGCTTTT-GATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTATAT--CATAATATTGA
* * * * *
260410 TGTTAAAATGTTATTAAAATGATAATTATTCATTGATTAATAATTTCAAGCTTTTGCAGGCATGA
236 TGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTTGAAGGCATGA
* * * * * *
260475 TTAACTTAAAATGCTTTTTCCTTGTTAATGGATAACATCCGCCT-CATGTTTTCC----A-AAAT
301 TAAACTTAAAATGCTCTTTCCTT-TCAATGGATAGCATCC-ACTACA---TTTCCAAATACAAAC
** * * * * * *
260534 ATCTAATTATGGCAGGTCTTAACAAAGAACAACAAAGCTTTGAATTTAGTTTTT-CTTTATAATC
361 ATCTAATTATGATAAGTTTTAACCAAGAACAACAAAGCTTTCAATTTA-TTTTTGATATATAA-C
* * * * *
260598 ATTTGTAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATGTTGATGATAAAATGTTATTAAAATAATAA
424 TTTTATAAGATTATAAATGAATTATATAT-ATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAA
** * * * * * * * *
260663 TTACTCATTGATAAGTCATTTCAAACTTTTGAATGCATCATAAACTTCAAATGCTTTTTCCTTGT
488 TTGTTCATTGATAAATAATTTCAAGCTTTCGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGT
* ** ** * * * * * * *
260728 CCATGGATAGTGTATACTAGACAT-TTTCGAATGCAAACATCCAATTATGAGAGGTTTTAACCAA
553 CAATGGATAGCATCCACT--TCATGTTTCCAATGCAAACATCTAATTATGATAAGCTTTAACTAA
* * **
260792 GAACAATGAAA-CTTTCAATTTATTTTCAATATATAATGTTTTATAAGATTATAAATGAATTA
616 GAACAAT-AAAGCTTTC-ACTTATTTTCAATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAA--A
** * * * * *
260854 TATATTGTAATATTGA-CATTAAAATGTTATCAAAATGATAATAATTCATTGATAAATAATTTGA
1 TATATCATAATATTGATGA-GAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCA
* * * *
260918 AGCTTTTGTAAGTACA--ATAAACTTAAATTGCTCTTTCCTTGACAAC-AGATAGCATCCACTTC
65 AGCTTTTG-AAG-GCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTC-ACTGGATAGCATCCACTTC
* * * * * * ** *
260980 ATGTTTTCC-AATGTAAACGT-TAGATTATAATAAGCTTTAACTGAAAACAAT-AATCCTTTTGA
127 ACG-TTTCCTAATGCAAACATCCA-ATTATGAT-AGTTTTAACCCAGAACAATCAA------TG-
* * * * * * *
261042 CTTATTTTTTATTTATAATGATTTATAAAATTATAAATGTAGTATATTATAATATTGATGAGAAA
182 C----TTTTGATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTATATCATAATATTGATGATAAA
* *
261107 ATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATTATTTCAAGCTTTTGAAGGCATGATAAAATT
243 ATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTTGAAGGCATGATAAACTT
* * * * * * * *
261172 AAAATGCTCTTTCTTTGTCATTGGATAGCATCCACATCACCTTTCCCAATGCGAGCATCCAATTA
308 AAAATGCTCTTTCCTT-TCAATGGATAGCATCCAC-T-ACATTTCCAAATACAAACATCTAATTA
* * *
261237 TGAT-AGTTTTAACTAAGAACAACAATGCTTTC-A---A---TTGGTA-ATAA--TTTATAATG-
370 TGATAAGTTTTAACCAAGAACAACAAAGCTTTCAATTTATTTTTGATATATAACTTTTATAA-GA
* * *
261290 TCATAAATGAATTATAT-CATAATATTAATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTG-TCTATTG
434 TTATAAATGAATTATATATATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTGTTC-ATTG
** * * * * **
261353 ATAAATCGTTTCAAGCTTTCAAAGGCATGAAAAACTTAAAATGCTCTTTCTTTGTCAGTAAATAG
498 ATAAATAATTTCAAGCTTTCGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAG
* ** * * * * * * *
261418 CATCTC-CTTCATGTTTTTCAATGCAAACATCCGATTATCATAGGCGTTGA-TCGAGATCAACAA
563 CATC-CACTTCATG-TTTCCAATGCAAACATCTAATTATGATAAGCTTTAACT-AAGAACAATAA
** * * *
261481 AGCTCCCAACTT-TTTTCTGATTTGTAATAATTTATAAGATTATAAATGAATTA
625 AGCTTTC-ACTTATTTTC-AATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAA--A
* * * *
261534 TATATCATAATCTTGATGATAAAGTGTTATTAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAA
1 TATATCATAATATTGATGAGAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAA
*** * * * * * * * *
261599 GCTTACAAAGGAATGATCAACTTTAAAA-GCTCTTTCCTTTTTAATGGACATCATCCACTTCATG
66 GCTTTTGAAGGCATGATAAAC-TTAAAATGCTCTTTCCTTGTCACTGGATAGCATCCACTTCACG
* * * * * * ** *
261663 TTTCCCAATGCAAGCTTCCAATTATGATTGGTTTTAACCAAAAATGAT-AAAGCTTTCT-ATTTA
130 TTTCCTAATGCAAACATCCAATTATGA-TAGTTTTAACCCAGAACAATCAATGCTTT-TGATTTA
* * *
261726 CAATCATTGATAAGATTATGAAA--AATT-TATCATAATATTAATGATAAAATGTTATCAAAATG
193 TAATCATTTATAAGATTAT-AAATGAATTATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATG
* * *
261788 ATAATTATTCATTGATAAATCATTCCAAGCTTTCT-AAGACATGAGAAACTTAAAATGCTCTTTC
257 ATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTT-TGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTC
* * * * * *
261852 CTTATCAATGGATATCATCCACTTCACATTTTTC-AATGCCAACAT-TCAATTATGATAGGCTTT
321 CTT-TCAATGGATAGCATCCAC-T-ACA-TTTCCAAATACAAACATCT-AATTATGATAAGTTTT
* * * * * * **
261915 GACCAAGATCAACATAGC-TTCTAACTTATTTTCGATTTATAAGGATTTATAAGATTATAAATGA
381 AACCAAGAACAACAAAGCTTTC-AATTTATTTTTGATATATAA-CTTTTATAAGATTATAAATGA
* * * * * *
261979 ATCATATATCATAATCTTGATGATAAAGTGTTATTAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATT
444 ATTATATAT-ATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTGTTCATTGATAAATAATT
* * ** * * *
262044 TCAAGCTTTCAAAGGCATGAGAAACTTTACAAA--CTCTTTATTTTTCAATGGACAACATCCACT
508 TCAAGCTTTCGAAGGCATGATAAAC-TTA-AAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCATCCACT
* * ** * * ** *
262107 TCACGTTTTCCAATGCAAACATCCAATTATGATTGGTTTTAACCAAGAATGACAAAGCTTT--C-
571 TCATG-TTTCCAATGCAAACATCTAATTATGATAAGCTTTAACTAAGAACAATAAAGCTTTCACT
* * *
262169 TA--TTC-----ATAATTATTGATAAGATTATAAATGAAT
635 TATTTTCAATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAAA
* * * *
262202 TATATCATAATATTAATGATAAAATGTAATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAACCATTTCAA
1 TATATCATAATATTGATGAGAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAA
* * * *
262267 GCTTTTGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCTTTGTCAAC-AGATTGCATCCATTTCACG
66 GCTTTTGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTC-ACTGGATAGCATCCACTTCACG
* * ** * * * *
262331 TTTCC-ATTGTAAACATCTGATTATGATAAGCTTTAACCAAAAACAATAAAGCTTTGGACTTATT
130 TTTCCTAATGCAAACATCCAATTATGAT-AGTTTTAACCCAGAACAATCAA----T-G-C----T
* * * *
262395 TTTTATTTATAATAATTTAGAAGATTATAAATGAATTATGTATCATAATATTGATGATAAAGTGT
184 TTTGATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTA--TATCATAATATTGATGATAAAATGT
** * * * * *
262460 TATTGAAATTATAATTATTCATTGAGAAATCATTTTAAGCTTTCGTAGGCATGATAA
247 TATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTTGAAGGCATGATAA
262517 TCTTGAAACA
Statistics
Matches: 6540, Mismatches: 1388, Indels: 1030
0.73 0.15 0.11
Matches are distributed among these distances:
649 1 0.00
650 26 0.00
651 119 0.02
652 48 0.01
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656 105 0.02
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659 15 0.00
660 16 0.00
662 2 0.00
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664 42 0.01
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670 211 0.03
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672 10 0.00
673 7 0.00
674 17 0.00
675 118 0.02
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678 90 0.01
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680 874 0.13
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688 133 0.02
689 60 0.01
690 430 0.07
691 302 0.05
692 106 0.02
693 30 0.00
694 16 0.00
695 2 0.00
696 1 0.00
697 2 0.00
698 1 0.00
699 3 0.00
ACGTcount: A:0.38, C:0.13, G:0.11, T:0.37
Consensus pattern (674 bp):
TATATCATAATATTGATGAGAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAA
GCTTTTGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCACTGGATAGCATCCACTTCACGT
TTCCTAATGCAAACATCCAATTATGATAGTTTTAACCCAGAACAATCAATGCTTTTGATTTATAA
TCATTTATAAGATTATAAATGAATTATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAA
TTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTTGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTTC
AATGGATAGCATCCACTACATTTCCAAATACAAACATCTAATTATGATAAGTTTTAACCAAGAAC
AACAAAGCTTTCAATTTATTTTTGATATATAACTTTTATAAGATTATAAATGAATTATATATATA
ATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTGTTCATTGATAAATAATTTCAAGCTTTCGAA
GGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCATCCACTTCATGTTTCCAATGC
AAACATCTAATTATGATAAGCTTTAACTAAGAACAATAAAGCTTTCACTTATTTTCAATTTATAA
TCATTTATAAGATTATAAATGAAA
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Alignment explanation
Indices: 253388--260075 Score: 4135
Period size: 449 Copynumber: 14.8 Consensus size: 448
253378 AAATAAATTG
* * * *
253388 TATATTATAAT-TTGGATGATAAAATATTATCAAAATGATAATCACTCATTGATAAATCATTTCA
1 TATATCATAATATT-GATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCA
* * * * *
253452 AGC-TTTCGAAGGCATGATAAATTTAAAATACTCTTTCCTTGTCAATGGATACCATCCACTTCAT
65 AGCTTTTTGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCATCCACTTCAC
** *** * ** * * * ***
253516 GTTGCCCAAAACAAGCA-TCCAGTTATGATAAGTTTTAACTAAAAACAACAAAGCTTTTGTTTTA
130 GTTTTCCAATGTAAACATTTGA-TTATGATAAGCTTTAACTAAGAACAATAAAGC-TTTAACTTA
* * * * * * *
253580 TTTTTAATTTGTAATCATTTATAAGATTAT-ACTAAATTATGTA-CTATAATATTGATGTTAAAA
193 TTTTTGATTTATAATGATTTATAAGATTATAAAT-AATTATATATC-ATAATATTGATGATAAAG
* ** * * * * * *
253643 TGTTATCAAAAGGATCATTGTTCATTGATAAATAATTTCAAGCTTT-TATGGGCATGATAAACTT
256 TGTTATTAAAATTATAATTATTCATTGAGAAATCATTTCAAGCTTTCGA-AGGCATGATAAACTT
* * * * * * * * *
253707 AAAATGCTCTTTCCTTGTCAATTGATAACATCCACCTCATGTTTCCCA---AAACATCTAATTCT
320 AAAATACTCTTTCCTT-TCACTAGATAGCATCCACTTCACGTTTCCAATGCAAACATCCAATTAT
* * * *
253769 GAAA-AGTTTTATCTAAGAACAA-CAAAGCTTTGAATTTATTTTTTTATTTATAATCATTTGTAA
384 GAAAGA-TTTTAACCAAGAACAATC-AAGC------------TTTTGATTTATAATCATTTATAA
253832 GATTATAAATGAATTT
435 GATTATAAATGAA--T
* *
253848 TATATCGTAATATTGATGATAAAATGTTAT-AAATATTATAATTATTCATTGATAAATCATTTCA
1 TATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAA-ATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCA
* * ** * * *
253912 AGC-TTTTGAATGCATCATAAACTTGTAATACTCTTT-CTATGTCAATGGATAGCCTCTA-TTAC
65 AGCTTTTTGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCT-TGTCAATGGATAGCATCCACTT-C
* * *** * * * * * * *
253974 ACG-TTTCCAAATGAAAAAATCCAAGTATGATAGGTTTTAACCAAGAATAACAAAGCTTTCA-TT
128 ACGTTTTCC-AATGTAAACATTTGATTATGATAAGCTTTAACTAAGAACAATAAAGCTTTAACTT
* ** * * * ** *
254037 -TTTTTCAACATATAATGTTTTATAAGATTATAAACAAATCATATATTGTAATATTGATGTTAAA
192 ATTTTT-GATTTATAATGATTTATAAGATTATAAA-TAATTATATATCATAATATTGATGATAAA
* * * * * *
254101 ATGTTATTAAAATGATAATTGTTCATTGATAGATAATTTCAAGCTTTC-ATAGGCATGATAAACT
255 GTGTTATTAAAATTATAATTATTCATTGAGAAATCATTTCAAGCTTTCGA-AGGCATGATAAACT
* * * * * *
254165 TAAAATGCTCTATCATTGTCA-AAGGATAGCATCCACCTCACGTTTCCTAATGCAAACATCCGAT
319 TAAAATACTCTTTCCTT-TCACTA-GATAGCATCCACTTCACGTTTCC-AATGCAAACATCCAAT
* * * *
254229 TATGATAAG-CTTTAACCATGAACAAT-AAGGCTTTGGACTTATTTACAAGTTATAATGATTTAT
381 TATGA-AAGATTTTAACCAAGAACAATCAA-GCTTT----TGA--T-----TTATAATCATTTAT
*
254292 AAAATTATAAATGTAA-
433 AAGATTATAAATG-AAT
* * * * *
254308 TATATTACAATATTGATGAGAAAATGTTATC-AAATGATAATTATTCATTGATTAATTATTTCAA
1 TATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAA
* ** * ** * * * *
254372 GC-TTTTAAAGGCATGATAAACTTAAACGGCTCTTTCTTTGTCTCTAGATAGCATTCACATCATG
66 GCTTTTTGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCATCCACTTCACG
* *** * * * * * * *
254436 -TTTCCGAATGCAAACATCAAACTATGATAGGGTTTAA-TCAAGAACAACAAAGTTTTCTATTTA
131 TTTTCC-AATGTAAACATTTGATTATGATAAGCTTTAACT-AAGAACAATAAAGCTTT-AACTTA
* ** * * *
254499 TTTTCGATATT-TAATCTTTTATAAGGTTATGAATGAAATATATATCATAATATTGAT-ATTAAA
193 TTTTTGAT-TTATAATGATTTATAAGATTATAAAT-AATTATATATCATAATATTGATGA-TAAA
* * ** * * * * **
254562 ATGTTATCAAAATGGTAATTGTTCATTCATAAA-CAATTTCAAGCTTT-TAAGGGCATGATATGC
255 GTGTTATTAAAATTATAATTATTCATTGAGAAATC-ATTTCAAGCTTTCGAA-GGCATGATAAAC
* * * * * *
254625 TTAAAATGCTCTTTCTTTGTCA-AAGGATAGCATCCACTTCAAGTTTCTCAAAGCAAACATTCAA
318 TTAAAATACTCTTTCCTT-TCACTA-GATAGCATCCACTTCACGTTTC-CAATGCAAACATCCAA
* * * *
254689 TTATGATAGATTTTAA-CAAAAACAA-CAAAGTTTTCAATTTAATTCGATATATAATCTTTTATA
380 TTATGAAAGATTTTAACCAAGAACAATC-AAG----C---TT--TT-GATTTATAATCATTTATA
*
254752 AGATTATAAATAAAT
434 AGATTATAAATGAAT
* * * * * *
254767 TATATAGCAGT-ATATTGGTAATAAAATATTTTCAAAATGATAATTGTTCATTGATAAATAATTT
1 TATAT--CA-TAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTT
* * * * *
254831 CAAGC-TTTTGTAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTGTCCTTGTCTATGGATAACATCCACCTC
63 CAAGCTTTTTGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCATCCACTTC
* * * * * * *
254895 ATG-TTTCC-A---AAACATCTAATTATGATAGGTTTTAACT---AACAACAAAGCTTTGAATTT
128 ACGTTTTCCAATGTAAACATTTGATTATGATAAGCTTTAACTAAGAACAATAAAGCTTT-AACTT
* ** * * *
254952 ATTTTTTATTTATAATCCTTTGTAAGATTATAAATTAATTATATATCGTAATATTGATGATAAAA
192 ATTTTTGATTTATAATGATTTATAAGATTATAAA-TAATTATATATCATAATATTGATGATAAAG
* * * * * * * ** * *
255017 TATTATCAAAATGATATTTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTACAAATACATCATAAACTTG
256 TGTTATTAAAATTATAATTATTCATTGAGAAATCATTTCAAGCTTTCGAAGGCATGATAAACTTA
* * * * * * * * *
255082 AAATGCTCTTTCCCTGTCAATGGATAGCATCCACTACAC-TCTTCCAAATACAGATATCTAATTA
321 AAATACTCTTT-CCTTTCACTAGATAGCATCCACTTCACGT-TTCC-AATGCAAACATCCAATTA
* * *
255146 TGATAAG-TTTTAACCAAGAACAA-CAAACGTTTCAATTTATTTTTGATATATAACTTTTATAAG
383 TGA-AAGATTTTAACCAAGAACAATC-AA-GCTT---TTGA--TTT-ATA-AT--CATTTATAAG
255209 ATTATAAATGAAT
436 ATTATAAATGAAT
* * * *
255222 TATATATAGTAATAGTGATGTTAAAATGTTATCAAAATGATAATT-TCTCATTGATAAATAATTT
1 TATAT-CA-TAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTAT-TCATTGATAAATCATTT
* * * *
255286 CAAGC-TTTTGTAGGCAAGATAAACTTAAAATGCT-TTTCCTTGTCAATGGATAGCATCAACTTT
63 CAAGCTTTTTGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCATCCACTTC
* * * * *
255349 ATGCTTTT-CAATGTAAACATCTGATTATGATAAGCTTTAACTGAGAACAATAAGGCTTCTCACT
128 ACG-TTTTCCAATGTAAACATTTGATTATGATAAGCTTTAACTAAGAACAATAAAGCTT-TAACT
** * *
255413 TATTTTCAATTTATAATGATTTATAAGATTATAAAT-ATAATATATTATAATATTGATTAGAT-A
191 TATTTTTGATTTATAATGATTTATAAGATTATAAATAATTATATATCATAATATTGA-T-GATAA
* * * * * * *
255476 A-TGTTA-TAAAACTGATAATTATTCATGGATACATTATTTCAAGCTTTTGAAGGCCTGATAAAC
254 AGTGTTATTAAAA-TTATAATTATTCATTGAGAAATCATTTCAAGCTTTCGAAGGCATGATAAAC
** * * * *
255539 TTAAAATTTTCTTTCTTTGTCACTAGATAGCATGCACATCACGTTTCCAAAAAGCAAACATCCAA
318 TTAAAATACTCTTTCCTT-TCACTAGATAGCATCCACTTCACGTTTCC--AATGCAAACATCCAA
* * * *
255604 TTATGATAGTTTTTAACCCAGAA-AA-CAATGCTTTTGA-TTAGTAATCATTTATAATATTATAA
380 TTATGAAAGATTTTAACCAAGAACAATCAA-GCTTTTGATTTA-TAATCATTTATAAGATTATAA
255666 ATGAAT
443 ATGAAT
* * *
255672 TATATCATAATATTGAAGATAAAATATTATCAAAATGACAATTATAT-ATTGATAAATCATTTCA
1 TATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTAT-TCATTGATAAATCATTTCA
** * * * * *
255736 AGCTTAAT-AAGGCATGAGAAACTCAAAATGCTCTCTCCTTATCAATGGATAACATCCACTTCAC
65 AGCTTTTTGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCATCCACTTCAC
* * * * *
255800 GTTTTCCAATGAAAACATTTGATTA-GAATAGGCTTTGA-TCGAGAACAACAAAGCTTCTAACTT
130 GTTTTCCAATGTAAACATTTGATTATG-ATAAGCTTTAACT-AAGAACAATAAAGCTT-TAACTT
* * * *
255863 ATTTTTGATTGATAATGATTTATAATATTATAAATGAATTATTTATCAAAATATTGATGATAAAG
192 ATTTTTGATTTATAATGATTTATAAGATTATAAAT-AATTATATATCATAATATTGATGATAAAG
* * * * * *
255928 TGCTATT-AAATGAAAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTACAAAAGGCATGATAAACTT
256 TGTTATTAAAATTATAATTATTCATTGAGAAATCATTTCAAGCTTTC-GAAGGCATGATAAACTT
* * * * * ** * *
255992 AAAA-AGCGCCTTCTTTTTCAATGGATAGCATCCACTTCATATTTCCTGATGCAAACTTCCAATT
320 AAAATA-CTCTTTC-CTTTCACTAGATAGCATCCACTTCACGTTTCC-AATGCAAACATCCAATT
* * * * * * *
256056 ATGAAAGAATTTAACTAAGAACAATGAAGCTTTCGATTTATAATCATTGATCAGGTTATAAATGA
382 ATGAAAGATTTTAACCAAGAACAATCAAGCTTTTGATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGA
256121 AT
447 AT
* * * * *
256123 TATATCATAATCTT-AGTGATAAAATGTTATCAAAATAATAATTATTCACTAATAAATCATTTTA
1 TATATCATAATATTGA-TGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCA
* ** * * * *
256187 AGC-TTTCGAAGGCGCGATAAACTTAAAATGCACTTTCCTTATCAACT-AAGAGCATCCACTTCA
65 AGCTTTTTGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAA-TGGATAGCATCCACTTCA
* * ** *
256250 C-ATTTCCTATGGTAAACATTCAATTATGATAAGCTTTAACTAAGAACAAAAAAGCTTTCAACTT
129 CGTTTTCCAAT-GTAAACATTTGATTATGATAAGCTTTAACTAAGAACAATAAAGCTTT-AACTT
*
256314 ATTTTTGATTTATAATGATTTATAAGATTATAAATGAATTGTATATCATAATATTGATGATAAA-
192 ATTTTTGATTTATAATGATTTATAAGATTATAAAT-AATTATATATCATAATATTGATGATAAAG
* * * *
256378 TGTTATTAAAATTATAATTATTCA-TGGGAAAGTCATTTTAAGCCTTCGAAGGCCTGATAAACTT
256 TGTTATTAAAATTATAATTATTCATTGAGAAA-TCATTTCAAGCTTTCGAAGGCATGATAAACTT
* ** * * * * *
256442 AACACGC-CTTTTCCTTTCACT-GAATATCATCCACTTCACATTTCACAGTGCAAATATCTAATT
320 AAAATACTC-TTTCCTTTCACTAG-ATAGCATCCACTTCACGTTTC-CAATGCAAACATCCAATT
* ** * * * *
256505 ATGAAAGGTTTTAACTGAGAACAATGAAGCTTTTGATTTATAATCATTGATAAGATTATAAGTGG
382 ATGAAAGATTTTAACCAAGAACAATCAAGCTTTTGATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGA
256570 AT
447 AT
* * * * *
256572 TATATCATAATATTAATGATAAAATGATATTAAAATGATAGTTATTCATTGATAAATCATTCCAA
1 TATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAA
* * * * * *
256637 GC-TTTCGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTATTTCTTTGTCAATAGATAGGATTCACTTCACG
66 GCTTTTTGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCATCCACTTCACG
* * * * * *
256701 TTTTCTATTGCAAACATCTT-ATTATGATACGCTTTAACTAAGAACAATAAAGCTTTTGAGTTAT
131 TTTTCCAATGTAAACAT-TTGATTATGATAAGCTTTAACTAAGAACAATAAAGC-TTTAACTTAT
*** * *
256765 TCACGATTTATAATGTTTTATAAGATTACAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAGTG
194 TTTTGATTTATAATGATTTATAAGATTATAAAT-AATTATATATCATAATATTGATGATAAAGTG
*
256830 TTATTAAAATTATAATTATTCATTGAGAAATCAGGTTC-AGCTTTCGAAGGCATGATAAACTTAA
258 TTATTAAAATTATAATTATTCATTGAGAAATCA-TTTCAAGCTTTCGAAGGCATGATAAACTTAA
** * * * * * * *
256894 AAGGCTTTTTCCTTTCATTGGATGGCATCCACTTCACGTTTTTCAATGTAAACATTCAATTATGA
322 AATACTCTTTCCTTTCACTAGATAGCATCCACTTCACG-TTTCCAATGCAAACATCCAATTATGA
* * * *
256959 AAGATTTTAACCAAGAACAA-CGAAGGTTTCG----ATAATTATTTATAATATTATAAATGAAT
386 AAGATTTTAACCAAGAACAATC-AAGCTTTTGATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAAT
* * *
257018 TGTATCATAATATTGATAATAAAATGTTATCAAAATGATAATTAATCATTGATAAATCATTTCAA
1 TATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAA
* * * * * * * *
257083 TCTTTTTGGAA-GTATGATAAATTTAAAATACTCATTCCTTGTCAACGGATAGCATCCACTTTAT
66 GCTTTTT-GAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCATCCACTTCAC
* * * * * ** *
257147 G-TTTCTCACTGTAAACATTCGATTATAATAAGCTTTAACCAATAATTATAAAGCTTTCAACTTT
130 GTTTTC-CAATGTAAACATTTGATTATGATAAGCTTTAACTAAGAACAATAAAGCTTT-AACTTA
* * * *
257211 TTTTTCAATTTATAATTATTTATAAGCTTATAAATGAATTATATATCATAATATTGAAGATAAAG
193 TTTTT-GATTTATAATGATTTATAAGATTATAAAT-AATTATATATCATAATATTGATGATAAAG
* *
257276 TGTTATTAAAATTATAATTATTCATTGAGAAATCATTTTAAGCTTTCGAAGGCATGATAAACTTT
256 TGTTATTAAAATTATAATTATTCATTGAGAAATCATTTCAAGCTTTCGAAGGCATGATAAACTTA
* * * *
257341 AAACACTCTTT-CTTTACATTAGATAGCATCCACTTCATGTTTCCCAATGCAAACATCTAATTAT
321 AAATACTCTTTCCTTT-CACTAGATAGCATCCACTTCACGTTT-CCAATGCAAACATCCAATTAT
* * * * * *
257405 GAAAGGTTTGAACCAAGAACAATGAAGCTTTTAATTTATAATCATTGATAAAATTATAAATGAAT
384 GAAAGATTTTAACCAAGAACAATCAAGCTTTTGATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAAT
* * ** **
257470 TATATCAGAATATTGATGATAAAATATTATCAAGTTGATAATTATTTGTTGATAAATCATTTCAA
1 TATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAA
* * * * *
257535 GC-TTTTAAAGGCAAGATAAACTTAAAACGCTCTTTCCTTGTAAATGGATAGAATCCACTTCACG
66 GCTTTTTGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCATCCACTTCACG
** * * * * * * * *
257599 TTTTTTAATG-AAAGCATCTGAATATAATAGGTTTTAACCAAGAACAATGAAGCTTTTAATTTAA
131 TTTTCCAATGTAAA-CATTTGATTATGATAAGCTTTAACTAAGAACAATAAAGC-TTTAACTT-A
*
257663 TTTTT-ATTTATAATGATTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAATT
193 TTTTTGATTTATAATGATTTATAAGATTATAAAT-AATTATATATCATAATATTGATGATAAAGT
** * * * *
257727 GTTACCAAAATTATAATTATTCATTGAGAAATCATTTTAAACTTTCAAAGGAATGATAAACTTAA
257 GTTATTAAAATTATAATTATTCATTGAGAAATCATTTCAAGCTTTCGAAGGCATGATAAACTTAA
* * *
257792 AATACTCTTTCCTTTCACTAGATAGCATCTACTTCACGTTTCTCAATGTAAACATCCAATTACGA
322 AATACTCTTTCCTTTCACTAGATAGCATCCACTTCACGTTTC-CAATGCAAACATCCAATTATGA
* ** * *
257857 TAGATTTTAATTAAAAACAA-CAAAGCTTTTGATTTACAATCATTTATAAGATTATAAATGAAT
386 AAGATTTTAACCAAGAACAATC-AAGCTTTTGATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAAT
* * * * * * *
257920 CATACCATAATATAGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTGTTCACTGTTAAGTCATTTCAA
1 TATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAA
* * * * * * * * * * *
257985 -CCTTTCGAAGGCATGATAAATTTAAAAGGTTATTTCCTAGTCAATGGACAACCTTCACTT--CG
66 GCTTTTTGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCATCCACTTCACG
** * * ** * * * * * * *
258047 TGTGGCTTAATGGAAACATTCAACTATAATATGTTTTACCTAAGAACAATAAAGCTTTCGATTTA
131 T-TTTC-CAATGTAAACATTTGATTATGATAAGCTTTAACTAAGAACAATAAAGCTTT-AACTTA
** * * * * * *
258112 TTTTCAATTTGTAATCATTTATAAAATTATAAATGAA-T-TATATCAGAATATGGATGATAAAAT
193 TTTTTGATTTATAATGATTTATAAGATTATAAAT-AATTATATATCATAATATTGATGATAAAGT
* * * * * * * *
258175 ATTATCAAAATGATAATTATTCACTGATAAATCATTTCAAGCTTTTGATGGCATGATAAACATAA
257 GTTATTAAAATTATAATTATTCATTGAGAAATCATTTCAAGCTTTCGAAGGCATGATAAACTTAA
* * * * * * * *
258240 AATGC-CATTTTCTTGTCAAC-AAATAGGATTCACTTCACGTTTTCCAAT-AACAACAACCGATT
322 AATACTC-TTTCCTT-TC-ACTAGATAGCATCCACTTCACG-TTTCCAATGCA-AACATCCAATT
* * * * * *
258302 ATAATAAG-CTTTAACCGAGAACAATAAAGCTTTCGACTTATTTTCGATTTATAATGATTTAGAA
382 ATGA-AAGATTTTAACCAAGAACAATCAA------G-C---TTTT-GATTTATAATCATTTATAA
*
258366 GATTATAAATGTAT
435 GATTATAAATGAAT
* * * * * * * *
258380 TAGATATCATAATATTGATGATCAATTATTATTAAAATTACAATTATTCATTGAGAAATCATTTT
1 T--ATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTC
* ** ** * * * *
258445 AGGC-TTTTGAAGAAATGATAAACTTAAAACACTTTTTCCTT-TCACTAGATAGCATCCACTTTA
64 AAGCTTTTTGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCATCCACTTCA
** * * *** * * * * * *
258508 TATTTTCTAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAAGAATAAAAAAGC--T---TTGT
129 CGTTTTCCAATGTAAACATTTGATTATGATAAGCTTTAACTAAGAACAATAAAGCTTTAACTTAT
* * * * * *
258568 TTTGGA---ATAATG---TATAAGATAATAAATGAA-T-CATATCATAATATTGATGTTAAAATA
194 TTTTGATTTATAATGATTTATAAGATTATAAAT-AATTATATATCATAATATTGATGATAAAGTG
* * * ** * **
258625 TTATCAAAATAATAATTGTTCATTGTTAAGT-AGTTTCAAGCTTTC-AAACCAATGATAAACTTA
258 TTATTAAAATTATAATTATTCATTGAGAAATCA-TTTCAAGCTTTCGAAGGC-ATGATAAACTTA
* * * * * * * * * **
258688 AAGTGCTCTATCC-TTGACAAAGGATAGTATTCACTTCTCATTTCCCAATGCAAACATCTGATTA
321 AAATACTCTTTCCTTTCAC-TA-GATAGCATCCACTTCACGTTT-CCAATGCAAACATCCAATTA
* ** * * * *
258752 TGATAGGCTTTAACCAAGAACAGTAAAGCTTTTGACTTATTTTTTATTTATAATGATTTATAAAA
383 TGAAAGATTTTAACCAAGAACAATCAAGCTTTTG-----------ATTTATAATCATTTATAAGA
258817 TTATAAATGTAA-
437 TTATAAATG-AAT
*** * * *
258829 TATATTGCAAGATTGATGAGAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATTATTTCAA
1 TATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAA
* * * * * * *
258894 GC-TTTTGGAGGTATGATTAACTTAAAATGCTCTTTCTTTGTCACTGGATAGCATCCACATCACC
66 GCTTTTTGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCATCCACTTCACG
* * *** * * * * *
258958 TTTCCCAGTGTAAACATCCAACTATGATAAGTTTTAACTAAGAACAACAATGCTTTCAAATT-TT
131 TTTTCCAATGTAAACATTTGATTATGATAAGCTTTAACTAAGAACAATAAAGCTTT-AACTTATT
** * * * * *
259022 TTT-A--TATAATCTTTTATAAGATTATAAATGAAATATACATCGTAATATTGA-CATTAAAATG
195 TTTGATTTATAATGATTTATAAGATTATAAAT-AATTATATATCATAATATTGATGA-TAAAGTG
* * * * * *
259083 TTATCAAAATAATAATTATTCATTGATAAATAATTTCAAGCTTTTGAAGGCATGATAAATTTAAA
258 TTATTAAAATTATAATTATTCATTGAGAAATCATTTCAAGCTTTCGAAGGCATGATAAACTTAAA
* * * * * * * *
259148 ATGCTCTTTCTCTCTGA-AAGGATAGCATCCACTTGAAGTTTCCCAAAGCAAACATCTAATTATG
323 ATACTCTTTC-CTTTCACTA-GATAGCATCCACTTCACGTTT-CCAATGCAAACATCCAATTATG
** * * * * *
259212 ATGGGTTTTAACCAAAAACAATAAAGCTTTCAATTTATTTTCAATATATAATCTTTTATAAGATT
385 AAAGATTTTAACCAAGAACAATCAAGC-TT---TTGA---T---T-TATAATCATTTATAAGATT
259277 ATAAATGAATT
439 ATAAATGAA-T
* * * * * *
259288 ATATATCATAATATTGGTAATAAAATGTAATCAAAATGCTAATTGTTCATTGATAAATAATTTCA
1 -TATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCA
* * * * * * *
259353 AAC-TTTCGTAGGCATGATAAACTGAAAATGCTTTTTCCTTATCAATTGATAGCATCCA-TTACA
65 AGCTTTTTGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCATCCACTT-CA
* * * *** * * * * *
259416 CGATTCCCAATGCAAACATCCAATTATGAT-TG-ATT--CT----ATATTAAAGC---AACATGG
129 CGTTTTCCAATGTAAACATTTGATTATGATAAGCTTTAACTAAGAACAATAAAGCTTTAAC-T-T
* * * *
259470 A-TTTTGATTTATAATCATTGATAAGATTATAAATGAA-T-TGTATCATAATATTGATGATAAAA
192 ATTTTTGATTTATAATGATTTATAAGATTATAAAT-AATTATATATCATAATATTGATGATAAAG
** * * * * *
259532 TGTTATCCAAATGATAATTATTTATTGATAAATCATTTCAAGCTTGCGAAGGCAAGATAAACTTA
256 TGTTATTAAAATTATAATTATTCATTGAGAAATCATTTCAAGCTTTCGAAGGCATGATAAACTTA
* ** * * * ** * *
259597 AAATGCTCTTTTATTGTCAATGGATAGCATCCACTTCATGTGGCCCAATGCAAACATTCAAATAT
321 AAATACTCTTTCCTT-TCACTAGATAGCATCCACTTCACGT-TTCCAATGCAAACATCCAATTAT
* * * * * * * *
259662 GATAGGTTTTAACTAAGAACAACAAAAATTTCAATGTATTTTCTATTTGTAATCATCTATAGGAT
384 GAAAGATTTTAACCAAG---AAC---AA--TCAA-G-CTTTT-GATTTATAATCATTTATAAGAT
259727 TATAAATGAAT
438 TATAAATGAAT
* * * * *
259738 TATATCAGAATATGGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCAATGATAAATTATTTCCA
1 TATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAA
* * * ** * *
259803 GC-ATTTGAATGCATCATAAACTTAAAATGCTCCATCCTCT-TGAATGGATAACATCCACTATGC
66 GCTTTTTGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCT-TGTCAATGGATAGCATCCACT-T-C
* * *** ** * * ** * *
259866 A--TTTTCGAATGCAAACATCCAATTATGATAAATTTTAACCAAAAATGACAAAGCTTTTAATTT
128 ACGTTTTCCAATGTAAACATTTGATTATGATAAGCTTTAACTAAGAACAATAAAGC-TTTAACTT
* * * ** * * * *
259929 TTTTTTCAATATATAATCTTTTATAAGTTTATAAATCAATCATATATCGTAATATTGATGTTAAA
192 ATTTTT-GATTTATAATGATTTATAAGATTATAAAT-AATTATATATCATAATATTGATGATAAA
* * * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * *
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* * * *
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* *** * * * * * *
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* ** * ** * ** * *
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* * * * *
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* * * * * *
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434 ATTATAAATG-AAT
* * * * * * *
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* ** * ** * * * *
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* *** * * * * * * *
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* ** * * * *
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* ** * * * * **
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* * ** *
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* * * *
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*
254754 ATTATAAATAAAT
434 ATTATAAATGAAT
* * * *
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* * * * *
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* * * * * * * *
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* ** * * * *
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* * * * * * * ** *
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** ** * * * * * * *
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* * *
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* * * * * *
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* * * *
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* * * * * *
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** * *
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* * * * * * * *
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** * * * * * * *
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* * * *
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*
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* * * * * *
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* * * *
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* * * * * *
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* * * * **
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* * * * * * *
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* * * * * * *
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1 TATATCATAATATTGA-AGATAAAATATTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCA
* ** * * * *
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* * * ** *
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*
256315 TTTTTGATTTATAATGATTTATAAGATTATAAATGAATTGTATATCATAATATTGATGATAAA-T
191 TTTTTGATTTATAATGATTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAGT
* * * *
256379 GTTATTAAAATTATAATTATTCA-TGGGAAAGTCATTTTAAGCCTTCGAAGGCCTGATAAACTT-
256 GTTATT-AAATTATAATTATTCATTGAGAAA-TCATTTCAAGCTTTCGAAGGCATGATAAACTTA
* * * * * ** * *
256442 AACACGCCTTT-TCCTTTCACTGAATATCATCCACTTCACATTT-CACAGTGCAAA-TATCTAAT
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* ** * * *
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380 TATGAAAGATTTTAACCAAGAACAA-CAAGCTTTTGATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATG
*
256569 GAT
444 AAT
* * *
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1 TATATCATAATATTGAA-GATAAAAT-ATTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTC
* * * * * *
256635 AAGCTTTCGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTATTTCTTTGTCAATAGATAGGATTCACTTCAC
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* * * * * *
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*** * *
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*
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* * * * * * * *
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* * * *
256955 ATGAAAGATTTTAACCAAGAACAACGAAGGTTTCG----ATAATTATTTATAATATTATAAATGA
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445 AT
* * *
257018 TGTATCATAATATTGATA-ATAAAATGTTATCAAAATGATAATTAATCATTGATAAATCATTTCA
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* * * * * * *
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* * * * * * **
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* * * * *
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*
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* * * * * * *
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* * * * * *
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* * ** **
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* * * * *
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** * * * * * * * *
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*
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** * * * *
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* * * * * * *
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* ** * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * * * * * * *
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** * * ** * * * * * * *
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** * * * * * * *
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* * * * * * *
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* * ** * * * * ** *
258241 ATGC-CATTT-TCTTGTCAAC-AAATAGGATTCACTTCACGTTTTCC-AAT-AACAACAACCGAT
321 A-ACTC-TTTCT-TTTTC-ACTGGATAGCATCCACTTCATG-TTTCCAAATGCA-AACTTCCAAT
* * * * * *
258301 TATAATAAG-CTTTAACCGAGAACAATAAAGCTTTCGACTTATTTTCGATTTATAATGATTTAGA
380 TATGA-AAGATTTTAACCAAGAACAA-CAA------G-C---TTTT-GATTTATAATCATTTATA
*
258365 AGATTATAAATGTAT
432 AGATTATAAATGAAT
* * * * * * * *
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1 T--ATATCATAATATTGAAGATAAAATATTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTC
* ** ** * * * * *
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* * * *** * * * * *
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* * * * * *
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* * * ** * **
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** * * ** ** * * * * * **
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* ** * *
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*** * * * * *
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* * * * * * *
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* * * *** * * * * *
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131 TTTCCAATGAAAACATTTGATTATGATAAGCTTTAAC-AAGAACAATAAAGCTTT-AACTTATTT
** * * * * *
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* * * * ** * * * *
259149 TGCTCTTTCTCTCTGAAAGGATAGCATCCACTTGAAGTTTCCCAAA-GCAAACATCTAATTATGA
322 -ACTCTTTCTTTTTCACTGGATAGCATCCACTTCATGTTT-CCAAATGCAAACTTCCAATTATGA
** * * * * *
259213 TGGGTTTTAACCAAAAACAATAAAGCTTTCAATTTATTTTCAATATATAATCTTTTATAAGATTA
385 AAGATTTTAACCAAGAACAA-CAAGC-TT---TTGA---T---T-TATAATCATTTATAAGATTA
259278 TAAATGAATT
438 TAAATGAA-T
* * * * * *
259288 ATATATCATAATATTGGTA-ATAAAATGTAATCAAAATGCTAATTGTTCATTGATAAATAATTTC
1 -TATATCATAATATT-GAAGATAAAATATTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTC
* * * * * * *
259352 AAACTTTCGTAGGCATGATAAACTGAAAATGCTTTTTCCTTATCAATTGATAGCATCCA-TTACA
64 AAGCTTTTGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCATCCACTT-CA
* * * *** * * * * * *
259416 CGATTCCCAATGCAAACATCCAATTATGAT-TG-ATT--C---TATATTAAAGC---AACATGGA
128 CGTTTTCCAATGAAAACATTTGATTATGATAAGCTTTAACAAGAACAATAAAGCTTTAAC-T-TA
* * * *
259471 -TTTTGATTTATAATCATTGATAAGATTATAAATGAA-T-TGTATCATAATATTGATGATAAAAT
191 TTTTTGATTTATAATGATTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAGT
* * * * * *
259533 GTTATCCAAATGATAATTATTTATTGATAAATCATTTCAAGCTTGCGAAGGCAAGATAAACTTAA
256 GTTAT-TAAATTATAATTATTCATTGAGAAATCATTTCAAGCTTTCGAAGGCATGATAAACTTAA
* * * ** * *
259598 AATGCTCTTT-TATTGTCAATGGATAGCATCCACTTCATGTGGCCCAATGCAAACATT-CAAATA
320 AA-ACTCTTTCT-TTTTCACTGGATAGCATCCACTTCATGTTTCCAAATGCAAAC-TTCCAATTA
* * * ** * *
259661 TGATAGGTTTTAACTAAGAACAACAAAAATTTCAATGTATTTTCTATTTGTAATCATCTATAGGA
382 TGAAAGATTTTAACCAAGAACAAC-AAGCTTT---TG-A--TT-TA----TAATCATTTATAAGA
259726 TTATAAATGAAT
435 TTATAAATGAAT
* * * * * * *
259738 TATATCAGAATATGGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCAATGATAAATTATTTCCA
1 TATATCATAATATTGAAGATAAAATATTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAA
* * * ** * *
259803 GCATTTGAATGCATCATAAACTTAAAATGCTCCATCCTCT-TGAATGGATAACATCCACTATGCA
66 GCTTTTGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCT-TGTCAATGGATAGCATCCACT-T-CA
* * *** ** * ** * * *
259867 --TTTTCGAATGCAAACATCCAATTATGATAAATTTTAACCAAAAATGACAAAGCTTTTAATTTT
128 CGTTTTCCAATGAAAACATTTGATTATGATAAGCTTTAA-CAAGAACAATAAAGC-TTTAACTTA
* * ** * * * * * *
259930 TTTTTCAATATATAATCTTTTATAAGTTTATAAATCAATCATATATCGTAATATTGATGTTAAAA
191 TTTTT-GATTTATAATGATTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAG
* * * * * *
259995 TGTTATCAAGATGATAATTGTTCATTGA-AATATAATTTCAAGCTCTC-ATAGCCATGATAAA-T
255 TGTTATTAA-ATTATAATTATTCATTGAGAA-ATCATTTCAAGCTTTCGA-AGGCATGATAAACT
* * * * * * * ****
260057 TAAAAATGCTCTTTCCTTTTCAAC-GGATAACACCCACTACGTTTTTTTCGAAA-GCAAAAAGGC
317 TAAAAA--CTCTTTCTTTTTC-ACTGGATAGCATCCACTTC--ATGTTTCCAAATGCAAACTTCC
* * * *** * * * * *
260120 AATTATGATATG-CTTT-ATC-A-ATTTATAA-----TCATTGAT-A-CAATTAT-A-ATTCACA
377 AATTATGA-AAGATTTTAACCAAGAACAACAAGCTTTTGATTTATAATCATTTATAAGATT-ATA
260172 ATATTG-AT
440 A-A-TGAAT
* ** ** * * * * * ** *
260180 GATAAAATGCTATCGAA-ATAATA-ATTATTC--ACTGACAA--A-TAATT-TCAAG-C-TTTC-
1 TATATCATAATATTGAAGATAAAATATTA-TCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCA
** * * * * * * *
260234 -G--TAGGGAGG-ATAAATTGAAC----ACT-CTCTTTCCATGCCAACGGATAGCATCCACTTCA
65 AGCTTTTGAAGGCAT-GA-TAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCATCCACTTCA
* * * *** * * * *
260290 TG-TTCCCAATGCAAACATCCAATTATGATAAG-TTCTAACCAAGAACAACAAATCTTTTGATTT
128 CGTTTTCCAATGAAAACATTTGATTATGATAAGCTT-TAA-CAAGAACAATAAAGC-TTTAACTT
* ** * * * * * * *
260353 CTTTTCAATTTCTAATTATTTGTAAGATTATAAATGAATTATATACCATAATATAGATGTTAAAA
190 ATTTTTGATTTATAATGATTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAG
* ** * * * *
260418 TGTTATTAAAATGATAATTATTCATTGATTAATAATTTCAAGCTTTTGCAGGCATGATTAACTTA
255 TGTTATT-AAATTATAATTATTCATTGAGAAATCATTTCAAGCTTTCGAAGGCATGATAAACTTA
* * * * * * * * *
260483 AAATGCTTTTTCCTTGTT-AATGGATAACATCCGCCTCATGTTTTCCAAA---ATA--TCTAATT
319 AAA-ACTCTTT-CTTTTTCACTGGATAGCATCCACTTCATG-TTTCCAAATGCAAACTTCCAATT
** * * * * *
260542 ATGGCAGGTCTTAACAAAGAACAACAAAGCTTTGAATTTAGTTTTTCTTTATAATCATTTGTAAG
381 ATGAAAGATTTTAACCAAGAACAAC-AAGC--T---TTT-G-----ATTTATAATCATTTATAAG
260607 ATTATAAATGAATT
434 ATTATAAATGAA-T
* * * * * * *
260621 ATATATCATAATGTTGATGATAAAATGTTATTAAAATAATAATTACTCATTGATAAGTCATTTCA
1 -TATATCATAATATTGAAGATAAAATATTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCA
* * * * * * ** ** ** *
260686 AACTTTTGAATGCATCATAAACTTCAAATGCTTTTTCCTTGTCCATGGATAGTGTATACTAGACA
65 AGCTTTTGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCATCCACTTCACG
* * *** * * * *
260751 TTTTCGAATGCAAACATCCAATTATGAGAGGTTTTAACCAAGAACAATGAAA-CTTTCAATTTAT
130 TTTTCCAATGAAAACATTTGATTATGATAAGCTTTAA-CAAGAACAAT-AAAGCTTT-AACTTAT
** * * ** * *
260815 TTTCAATATATAATGTTTTATAAGATTATAAATGAATTATATATTGTAATATTGA-CATTAAAAT
192 TTTTGATTTATAATGATTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGA-TAAAGT
* * * * * * * *
260879 GTTATCAAAATGATAATAATTCATTGATAAATAATTTGAAGCTTTTGTAAGTACA--ATAAACTT
256 GTTAT-TAAATTATAATTATTCATTGAGAAATCATTTCAAGCTTTCG-AAG-GCATGATAAACTT
** * ** * *
260942 AAATTGCTCTTTCCTTGACAAC-AGATAGCATCCACTTCATGTTTTCC-AATGTAAACGTT--AG
318 AAA-AACTCTTTCTTTTTC-ACTGGATAGCATCCACTTCATG-TTTCCAAATGCAAAC-TTCCA-
* * * * * *
261003 ATTATAATAAG-CTTTAACTGAA-AACAATAATCCTTTTGACTTATTTTTTATTTATAATGATTT
378 ATTATGA-AAGATTTTAAC-CAAGAACAACAA-------G-C----TTTTGATTTATAATCATTT
* * *
261066 ATAAAATTATAAATGTAG
429 ATAAGATTATAAATGAAT
* * * * *
261084 TATATTATAATATTGATGAGAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATTATTTCAA
1 TATATCATAATATTGAAGATAAAATATTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAA
* * * * *
261149 GCTTTTGAAGGCATGATAAAATTAAAATGCTCTTTCTTTGTCATTGGATAGCATCCACATCACCT
66 GCTTTTGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCATCCACTTCACGT
* ** * *** * * *
261214 TTCCCAATGCGAGCATCCAATTATGAT-AGTTTTAACTAAGAACAACAATGCTTT--C--A----
131 TTTCCAATGAAAACATTTGATTATGATAAGCTTTAAC-AAGAACAATAAAGCTTTAACTTATTTT
** * * * *
261270 --ATTGGTAATAATTTATAATG-TCATAAATGAA-T-TATATCATAATATTAATGATAAAATGTT
195 TGATTTATAATGATTTATAA-GATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAGTGTT
* * * * * * *
261330 ATCAAAATGATAATT-GTCTATTGATAAATCGTTTCAAGCTTTCAAAGGCATGAAAAACTTAAAA
259 AT-TAAATTATAATTATTC-ATTGAGAAATCATTTCAAGCTTTCGAAGGCATGATAAACTTAAAA
* * * ** * * * *
261394 TGCTCTTTCTTTGTCAGTAAATAGCATCTC-CTTCATGTTTTTC-AATGCAAACATCCGATTATC
322 -ACTCTTTCTTTTTCACTGGATAGCATC-CACTTCATG-TTTCCAAATGCAAACTTCCAATTATG
* *** * * * * * *
261457 ATAGGCGTTGATCGAGATCAACAAAGCTCCCAACTTTTTTCTGATTTGTAATAATTTATAAGATT
384 AAAGATTTTAACCAAGAACAAC-AAG-------C---TTT-TGATTTATAATCATTTATAAGATT
261522 ATAAATGAATT
437 ATAAATGAA-T
* * * * *
261533 ATATATCATAATCTTGATGATAAAGTGTTATTAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCA
1 -TATATCATAATATTGAAGATAAAATATTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCA
*** * * * * * * *
261598 AGCTTACAAAGGAATGATCAACTTTAAAA-GCTCTTTCCTTTTTAATGGACATCATCCACTTCAT
65 AGCTTTTGAAGGCATGATAAAC-TTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCATCCACTTCAC
* * * ** ** * * **
261662 GTTTCCCAATGCAAGC-TTCCAATTATGATTGGTTTTAACCAAAAATGATAAAGCTTT--C----
129 GTTTTCCAATGAAAACATT-TGATTATGATAAGCTTTAA-CAAGAACAATAAAGCTTTAACTTAT
* * * * *
261720 ---T-ATTTACAATCATTGATAAGATTATGAAA--AA-T-T-TATCATAATATTAATGATAAAAT
192 TTTTGATTTATAATGATTTATAAGATTAT-AAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAGT
* * * * * * *
261776 GTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTCCAAGCTTTCTAAGACATGAGAAACTTAA
256 GTTAT-TAAATTATAATTATTCATTGAGAAATCATTTCAAGCTTTCGAAGGCATGATAAACTTAA
* * * * * * *
261841 AATGCTCTTTCCTTATCAATGGATATCATCCACTTCACAT-TTTTC-AATGCCAACATT-CAATT
320 AA-ACTCTTTCTTTTTCACTGGATAGCATCCACTT--CATGTTTCCAAATGCAAAC-TTCCAATT
* ** * * **
261903 ATGATAGGCTTTGACCAAGATCAACATAGCTTCTAACTTATTTTCGATTTATAAGGATTTATAAG
381 ATGAAAGATTTTAACCAAGAACAACA-AG-------C---TTTT-GATTTATAATCATTTATAAG
261968 ATTATAAATGAAT
434 ATTATAAATGAAT
* * * * *
261981 CATATATCATAATCTTGATGATAAAGTGTTATTAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTC
1 --TATATCATAATATTGAAGATAAAATATTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTC
** * ** * * *
262046 AAGCTTTCAAAGGCATGAGAAACTTTACAAA--CTCTTTATTTTTCAATGGACAACATCCACTTC
64 AAGCTTTTGAAGGCATGATAAAC-TTA-AAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCATCCACTTC
* *** ** * ** *
262109 ACGTTTTCCAATGCAAACATCCAATTATGATTGGTTTTAACCAAGAATGACAAAGCTTT--C---
127 ACGTTTTCCAATGAAAACATTTGATTATGATAAGCTTTAA-CAAGAACAATAAAGCTTTAACTTA
* * * * *
262169 ----T-ATTCATAATTATTGATAAGATTATAAATGAA-T-TATATCATAATATTAATGATAAAAT
191 TTTTTGATTTATAATGATTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAGT
* * * * * *
262227 GTAATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAACCATTTCAAGCTTTTGAAGGCATGATAAACTTAA
256 GTTAT-TAAATTATAATTATTCATTGAGAAATCATTTCAAGCTTTCGAAGGCATGATAAACTTAA
* * * * * * * * * **
262292 AATGCTCTTTCTTTGTCAAC-AGATTGCATCCATTTCACGTTTCC-ATTGTAAACATCTGATTAT
320 AA-ACTCTTTCTTTTTC-ACTGGATAGCATCCACTTCATGTTTCCAAATGCAAACTTCCAATTAT
* * * * * *
262355 GATAAG-CTTTAACCAAAAACAATAAAGCTTTGGACTTATTTTTTATTTATAATAATTTAGAAGA
383 GA-AAGATTTTAACCAAGAACAA-CAA------G-C----TTTTGATTTATAATCATTTATAAGA
262419 TTATAAATGAAT
435 TTATAAATGAAT
* * * ** * * *
262431 TATGTATCATAATATTGATGATAAAGTGTTATTGAAATTATAATTATTCATTGAGAAATCATTTT
1 TA--TATCATAATATTGAAGATAAAATATTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTC
* *
262496 AAGCTTTCGTAGGCATGATAA
64 AAGCTTTTGAAGGCATGATAA
262517 TCTTGAAACA
Statistics
Matches: 6816, Mismatches: 1377, Indels: 962
0.74 0.15 0.11
Matches are distributed among these distances:
417 1 0.00
418 9 0.00
419 1 0.00
420 3 0.00
421 3 0.00
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469 1 0.00
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471 1 0.00
473 2 0.00
ACGTcount: A:0.38, C:0.13, G:0.11, T:0.37
Consensus pattern (446 bp):
TATATCATAATATTGAAGATAAAATATTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAA
GCTTTTGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCATCCACTTCACGT
TTTCCAATGAAAACATTTGATTATGATAAGCTTTAACAAGAACAATAAAGCTTTAACTTATTTTT
GATTTATAATGATTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAGTGTTAT
TAAATTATAATTATTCATTGAGAAATCATTTCAAGCTTTCGAAGGCATGATAAACTTAAAAACTC
TTTCTTTTTCACTGGATAGCATCCACTTCATGTTTCCAAATGCAAACTTCCAATTATGAAAGATT
TTAACCAAGAACAACAAGCTTTTGATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAAT
Found at i:258307 original size:230 final size:229
Alignment explanation
Indices: 256990--260094 Score: 2099
Period size: 230 Copynumber: 13.7 Consensus size: 229
256980 GAAGGTTTCG
* * * *
256990 ATAATTATTTATAATATTATAAATGAATTGTATCATAATATTGATAATAAAATGTTATCAAAATG
1 ATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATG
* * * * * *
257055 ATAATTAATCATTGATAAATCATTTCAATCTTTTTGGAA-GTATGATAAATTTAAAATACTCATT
66 ATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGC-TTTT-GAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTT
* * * * * * ** * * * * *
257119 CCTTGTCAACGGATAGCATCCACTTTATGTTTCTCACTGTAAACATTCGATTATAATAAGCTTTA
129 TCTTGTCAACAGATAGCATCCACTTCACGTTTCCCAATACAAACATCCAATTATGAT-AGGTTTT
* ** *
257184 ACCAATAATTATAAAGCTTTCAACTTTTTTTTCAATTT
193 ACCAAGAACAATAAAGCTTTCAA-TTTATTTTCAATTT
* * * * *
257222 ATAATTATTTATAAGCTTATAAATGAATTATATATCATAATATTGAAGATAAAGTGTTATTAAAA
1 ATAATCATTTATAAGATTATAAATGAA-T-TATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAA
* * * * * **
257287 TTATAATTATTCATTGAGAAATCATTTTAAGCTTTCGAAGGCATGATAAACTTTAAACACTC-TT
64 TGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTTGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTT
** * * * *
257351 TCTT-TACATTAGATAGCATCCACTTCATGTTTCCCAATGCAAACATCTAATTATGAAAGGTTTG
129 TCTTGT-CAACAGATAGCATCCACTTCACGTTTCCCAATACAAACATCCAATTATGATAGGTTT-
* *
257415 AACCAAGAACAATGAAG----C------TTTT-AATTT
192 TACCAAGAACAATAAAGCTTTCAATTTATTTTCAATTT
* * * * **
257442 ATAATCATTGATAAAATTATAAATGAATTATATCAGAATATTGATGATAAAATATTATCAAGTTG
1 ATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATG
** * * * *
257507 ATAATTATTTGTTGATAAATCATTTCAAGCTTTTAAAGGCAAGATAAACTTAAAACGCTCTTTCC
66 ATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTTGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTTC
* ** * *** * * *
257572 TTGTAAATGGATAGAATCCACTTCACGTTTTTTAATGA-AAGCATCTGAA-TATAATAGGTTTTA
131 TTGTCAACAGATAGCATCCACTTCACGTTTCCCAAT-ACAAACATC-CAATTATGATAGGTTTT-
* * *
257635 ACCAAGAACAATGAAGCTTTTAATTTAATTTT-TATTT
193 ACCAAGAACAATAAAGCTTTCAATTT-ATTTTCAATTT
* * *
257672 ATAATGATTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAATTGTTACCAAAA
1 ATAATCATTTATAAGATTATAAATGAA-T-TATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAA
* * * * ** * *
257737 TTATAATTATTCATTGAGAAATCATTTTAAACTTTCAAAGGAATGATAAACTTAAAATACTCTTT
64 TGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTTGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTT
* * * ** * *
257802 CCTT-TC-ACTAGATAGCATCTACTTCACGTTTCTCAATGTAAACATCCAATTACGATAGATTTT
129 TCTTGTCAAC-AGATAGCATCCACTTCACGTTTCCCAATACAAACATCCAATTATGATAGGTTTT
** * * *
257865 AATTAAAAACAACAAAG----C------TTTT-GATTT
193 -ACCAAGAACAATAAAGCTTTCAATTTATTTTCAATTT
* * * *
257892 ACAATCATTTATAAGATTATAAATGAATCATACCATAATATAGATGATAAAATGTTATCAAAATG
1 ATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATG
* * * * * * * * * * *
257957 ATAATTGTTCACTGTTAAGTCATTTCAACCTTTCGAAGGCATGATAAATTTAAAAGGTTATTTCC
66 ATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTTGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTTC
* ** * * * * ** ** ** ** * * * *
258022 TAGTCAATGGACAACCTTCACTTCGTGTGGCTTAATGGAAACATTCAACTATAATATGTTTTACC
131 TTGTCAACAGATAGCATCCACTTCACGTTTCCCAATACAAACATCCAATTATGATAGGTTTTACC
*
258087 TAAGAACAATAAAGCTTTCGATTTATTTTCAATTT
196 -AAGAACAATAAAGCTTTCAATTTATTTTCAATTT
* * * * *
258122 GTAATCATTTATAAAATTATAAATGAATTATATCAGAATATGGATGATAAAATATTATCAAAATG
1 ATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATG
* * *
258187 ATAATTATTCACTGATAAATCATTTCAAGCTTTTGATGGCATGATAAACATAAAATGC-CATTTT
66 ATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTTGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTC-TTTT
* * * * * * * * *
258251 CTTGTCAACAAATAGGATTCACTTCACGTTTTCCAATA-ACAACAACCGATTATAATAAGCTTTA
130 CTTGTCAACAGATAGCATCCACTTCACGTTTCCCAATACA-AACATCCAATTATGAT-AGGTTTT
* * * *
258315 ACCGAGAACAATAAAGCTTTCGACTTATTTTCGATTT
193 ACCAAGAACAATAAAGCTTTCAATTTATTTTCAATTT
* * * * * * *
258352 ATAATGATTTAGAAGATTATAAATGTATTAGATATCATAATATTGATGATCAATTATTATTAAAA
1 ATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATT--ATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAA
* * * * * ** **
258417 TTACAATTATTCATTGAGAAATCATTTTAGGCTTTTGAAGAAATGATAAACTTAAAACACT-TTT
64 TGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTTGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTT
* ** * * *
258481 TCCTT-TC-ACTAGATAGCATCCACTTTATATTTTCTAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTT
129 T-CTTGTCAAC-AGATAGCATCCACTTCACGTTTCCCAATACAAACATCCAATTATGATAGGTTT
* * * **
258544 TAACCAAGAATAAAAAAG----C--TTTGTTTTGGA---
192 T-ACCAAGAACAATAAAGCTTTCAATTTATTTTCAATTT
* * * * * *
258574 AT-A--ATGTATAAGATAATAAATGAATCATATCATAATATTGATGTTAAAATATTATCAAAATA
1 ATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATG
* * * * ** * *
258636 ATAATTGTTCATTGTTAAGT-AGTTTCAAGC-TTTCAAACCAATGATAAACTTAAAGTGCTCTAT
66 ATAATTATTCATTGATAAATCA-TTTCAAGCTTTTGAAGGC-ATGATAAACTTAAAATGCTCTTT
* * * * * * * **
258699 CCTTGACAA-AGGATAGTATTCACTTCTCATTTCCCAATGCAAACATCTGATTATGATAGGCTTT
129 TCTTGTCAACA-GATAGCATCCACTTCACGTTTCCCAATACAAACATCCAATTATGATAGG-TTT
* * ** * **
258763 AACCAAGAACAGTAAAGCTTTTGACTTATTTTTTATTT
192 TACCAAGAACAATAAAGCTTTCAATTTATTTTCAATTT
* * *** * *
258801 ATAATGATTTATAAAATTATAAATGTAA-TATATTGCAAGATTGATGAGAAAATGTTATCAAAAT
1 ATAATCATTTATAAGATTATAAATG-AATTATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAAT
* * * *
258865 GATAATTATTCATTGATAAATTATTTCAAGCTTTTGGAGGTATGATTAACTTAAAATGCTC-TTT
65 GATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTTGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTT
* * * * ** * *
258929 CTTTGTC-ACTGGATAGCATCCACATCACCTTTCCCAGTGTAAACATCCAACTATGATAAGTTTT
130 C-TTGTCAAC-AGATAGCATCCACTTCACGTTTCCCAATACAAACATCCAATTATGATAGGTTTT
* * *
258993 AACTAAGAACAACAATGCTTTCAAATTT-TTTT--A--T
193 -ACCAAGAACAATAAAGCTTTC-AATTTATTTTCAATTT
* * * *
259027 ATAATCTTTTATAAGATTATAAATGAAATATACATCGTAATATTGA-CATTAAAATGTTATCAAA
1 ATAATCATTTATAAGATTATAAATG-AAT-TATATCATAATATTGATGA-TAAAATGTTATCAAA
* * *
259091 ATAATAATTATTCATTGATAAATAATTTCAAGCTTTTGAAGGCATGATAAATTTAAAATGCTCTT
63 ATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTTGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTT
* * * *
259156 TCTCTCTG--AA-AGGATAGCATCCACTTGAAGTTTCCCAA-AGCAAACATCTAATTATGATGGG
128 T-TCT-TGTCAACA-GATAGCATCCACTTCACGTTTCCCAATA-CAAACATCCAATTATGATAGG
* *
259217 TTTTAACCAAAAACAATAAAGCTTTCAATTTATTTTCAATAT
189 TTTT-ACCAAGAACAATAAAGCTTTCAATTTATTTTCAATTT
* * * *
259259 ATAATCTTTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGGTAATAAAATGTAATCAAAA
1 ATAATCATTTATAAGATTATAAATGAA-T-TATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAA
* * * * * * *
259324 TGCTAATTGTTCATTGATAAATAATTTCAAACTTTCGTAGGCATGATAAACTGAAAATGCT-TTT
64 TGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTTGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTT
* ** * * * *
259388 TCCTTATCAATTGATAGCATCCA-TTACACGATTCCCAATGCAAACATCCAATTATGAT-TG-AT
129 T-CTTGTCAACAGATAGCATCCACTT-CACGTTTCCCAATACAAACATCCAATTATGATAGGTTT
* * * ** ** *
259450 T--C---TATATTAAAGC-AAC-ATGGATTTT-GATTT
192 TACCAAGAACAATAAAGCTTTCAATTTATTTTCAATTT
* * *
259480 ATAATCATTGATAAGATTATAAATGAATTGTATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCCAAATG
1 ATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATG
* ** * *
259545 ATAATTATTTATTGATAAATCATTTCAAGCTTGCGAAGGCAAGATAAACTTAAAATGCTCTTTTA
66 ATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTTGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTTC
** * ** * * *
259610 TTGTCAATGGATAGCATCCACTTCATGTGGCCCAATGCAAACATTCAAATATGATAGGTTTTAAC
131 TTGTCAACAGATAGCATCCACTTCACGTTTCCCAATACAAACATCCAATTATGATAGGTTTT-AC
* * ** * *
259675 TAAGAACAACAAAAATTTCAATGTATTTTCTATTT
195 CAAGAACAATAAAGCTTTCAATTTATTTTCAATTT
* * * * *
259710 GTAATCATCTATAGGATTATAAATGAATTATATCAGAATATGGATGATAAAATGTTATCAAAATG
1 ATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATG
* * * * * * **
259775 ATAATTATTCAATGATAAATTATTTCCAGCATTTGAATGCATCATAAACTTAAAATGCTCCATCC
66 ATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTTGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCT-C-TTT
** * * * * **
259840 TCTTG--AATGGATAACATCCACTATGCA--TTTTCGAATGCAAACATCCAATTATGATAAATTT
129 TCTTGTCAACAGATAGCATCCACT-T-CACGTTTCCCAATACAAACATCCAATTATGATAGGTTT
* ** * * * *
259901 TAACCAAAAATGACAAAGCTTTTAATTTTTTTTTCAATAT
192 T-ACCAAGAACAATAAAGCTTTCAA-TTTATTTTCAATTT
* * * * * *
259941 ATAATCTTTTATAAGTTTATAAATCAATCATATATCGTAATATTGATGTTAAAATGTTATCAAGA
1 ATAATCATTTATAAGATTATAAATGAAT--TATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAA
* * * * *
260006 TGATAATTGTTCATTGA-AATATAATTTCAAGC-TCTCATAGCCATGATAAA-TTAAAAATGCTC
64 TGATAATTATTCATTGATAA-ATCATTTCAAGCTTTTGA-AGGCATGATAAACTT-AAAATGCTC
* * * * *
260068 TTTCCTTTTCAACGGATAACACCCACT
126 TTTTCTTGTCAACAGATAGCATCCACT
260095 ACGTTTTTTT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.39, C:0.13, G:0.11, T:0.37
Consensus pattern (229 bp):
ATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATG
ATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTTGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTTC
TTGTCAACAGATAGCATCCACTTCACGTTTCCCAATACAAACATCCAATTATGATAGGTTTTACC
AAGAACAATAAAGCTTTCAATTTATTTTCAATTT
Found at i:260905 original size:232 final size:227
Alignment explanation
Indices: 260297--262484 Score: 897
Period size: 232 Copynumber: 9.7 Consensus size: 227
260287 TCATGTTCCC
* * * * ** *
260297 AATGCAAACATCCAATTATGATAAGTTCTAACCAAGAACAACAAATCTTTTGATTTCTTTTCAAT
1 AATGCAAACATCCAATTATGAGAGGTTTTAACCAAGAACAACAAAGCTTTCAATTTATTTTCAAT
* * * **
260362 TTCTAATTATTTGTAAGATTATAAATGAATTATATACCATAATATAGATGTTAAAATGTTATTAA
66 TTATAATT-TTTGTAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGACATTAAAATGTTATTAA
* * * *
260427 AATGATAATTATTCATTGATTAATAATTTCAAGCTTTTGCAGGCATGATTAACTTAAAATGCTTT
130 AATGATAATTATTCATTGA-TAATAATTTCAAACTTTTGAAGGCATCATAAACTTAAAATGCTTT
* * * *
260492 TTCCTTGTTAATGGATAACATCCGCCTCATGTTT
194 TTCCTTGTCAATGGATAACATACGACACATGTTT
* * * * * *
260526 --TCCAAAATATCTAATTATG-GCAGGTCTTAACAAAGAACAACAAAGCTTTGAATTTAGTTTTT
1 AATGC-AAACATCCAATTATGAG-AGGTTTTAACCAAGAACAACAAAGCTTTCAATTTA--TTTT
* * *
260588 C--TTTATAATCATTTGTAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATGTTGATGA-TAAAATGTT
62 CAATTTATAAT-TTTTGTAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGA-CATTAAAATGTT
* * * * *
260650 ATTAAAATAATAATTACTCATTGATAAGTCATTTCAAACTTTTGAATGCATCATAAACTTCAAAT
125 ATTAAAATGATAATTATTCATTGATAA-TAATTTCAAACTTTTGAAGGCATCATAAACTTAAAAT
* ** * *
260715 GCTTTTTCCTTGTCCATGGATAGTGTATACTAGACAT-TTT
189 GCTTTTTCCTTGTCAATGGATA--ACATACGACACATGTTT
*
260755 CGAATGCAAACATCCAATTATGAGAGGTTTTAACCAAGAACAATGAAA-CTTTCAATTTATTTTC
1 --AATGCAAACATCCAATTATGAGAGGTTTTAACCAAGAACAA-CAAAGCTTTCAATTTATTTTC
* * **
260819 AATATATAATGTTTTATAAGATTATAAATGAATTATATATTGTAATATTGACATTAAAATGTTAT
63 AATTTATAAT-TTTTGTAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGACATTAAAATGTTAT
* * * * * *
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127 TAAAATGATAATTATTCATTGAT-AATAATTTCAAACTTTTG-AAGGCATC-ATAAACTTAAAAT
* * ** * * *
260947 GCTCTTTCCTTGACAACAGATAGCAT-CCACTTCATGTTTT
189 GCTTTTTCCTTGTCAATGGATAACATACGAC-ACATG-TTT
* * * * * * * * * ** ** *
260987 CCAATGTAAACGT-TAGATTATAATAAGCTTTAACTGAA-AACAATAATCCTTTTGACTTATTTT
1 --AATGCAAACATCCA-ATTATGAGAGGTTTTAAC-CAAGAACAACAAAGCTTTCAATTTATTTT
** * * * * * * *
261050 TTATTTATAATGATTTATAAAATTATAAATGTAGTATAT-T-ATAATATTGATGA-GAAAATGTT
62 CAATTTATAAT-TTTTGTAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGA-CATTAAAATGTT
* * * * *
261112 ATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATTATTTCAAGCTTTTGAAGGCATGATAAAATTAAAAT
125 ATTAAAATGATAATTATTCATTGAT-AATAATTTCAAACTTTTGAAGGCATCATAAACTTAAAAT
* * * * * **
261177 GCTCTTTCTTTGTCATTGGATAGCAT-CCACATCACCTTT
189 GCTTTTTCCTTGTCAATGGATAACATACGACA-CATGTTT
* * * * * ** **
261216 CCCAATGCGAGCATCCAATTATGATA-GTTTTAACTAAGAACAACAATGCTTTCAATTGGTAAT-
1 ---AATGCAAACATCCAATTATGAGAGGTTTTAACCAAGAACAACAAAGCTTTCAATTTATTTTC
*
261279 AATTTATAA------T--G-TCATAAATGAA-T-TATATCATAATATT-A-ATGATAAAATGTTA
63 AATTTATAATTTTTGTAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGACAT--TAAAATGTTA
* * ** * ** * *
261331 TCAAAATGATAATT-GTCTATTGATAAATCGTTTCAAGCTTTCAAAGGCATGAAAAACTTAAAAT
126 TTAAAATGATAATTATTC-ATTGAT-AATAATTTCAAACTTTTGAAGGCATCATAAACTTAAAAT
* * * ** * ** *
261395 GCTCTTTCTTTGTCAGTAAATAGCAT-CTCCTTCATGTTTTT
189 GCTTTTTCCTTGTCAATGGATAACATACGAC-ACATG--TTT
* * * ** * * * * ** * *
261436 CAATGCAAACATCCGATTATCATAGGCGTTGATCGAGATCAACAAAGCTCCCAACTT-TTTTCTG
1 -AATGCAAACATCCAATTATGAGAGGTTTTAACCAAGAACAACAAAGCTTTCAATTTATTTTC-A
* * * * * *
261500 ATTTGTAATAATTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATCTTGATGA-TAAAGTGTTAT
64 ATTTATAAT-TTTTGTAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGA-CATTAAAATGTTAT
* * *** * * *
261564 TAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTACAAAGGAATGATCAACTTTAAAA-G
127 TAAAATGATAATTATTCATTGAT-AATAATTTCAAACTTTTGAAGGCATCATAAAC-TTAAAATG
* * * * * * *
261628 CTCTTTCCTTTTTAATGGACATCAT-CCACTTCATGTTT
190 CTTTTTCCTTGTCAATGGATAACATACGAC-ACATGTTT
* * ** * ** * *
261666 CCCAATGCAAGCTTCCAATTATGATTGGTTTTAACCAAAAATGATAAAGCTTTC----TATTTAC
1 ---AATGCAAACATCCAATTATGAGAGGTTTTAACCAAGAACAACAAAGCTTTCAATTTATTTTC
*
261727 -A---ATCA---TTGATAAGATTATGAAA--AA-T-T-TATCATAATATT-A-ATGATAAAATGT
63 AATTTATAATTTTTG-TAAGATTAT-AAATGAATTATATATCATAATATTGACAT--TAAAATGT
* * * * * * *
261778 TATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTCCAAGCTTTCT-AAGACATGAGAAACTTAAA
124 TATTAAAATGATAATTATTCATTGAT-AATAATTTCAAACTTT-TGAAGGCATCATAAACTTAAA
* * * ** *
261842 ATGCTCTTTCCTTATCAATGGATATCATCCACTTCACATTTTT
187 ATGCTTTTTCCTTGTCAATGGATAACAT--ACGACACATGTTT
* * * * * * * * *
261885 CAATGCCAACATTCAATTATGATAGGCTTTGACCAAGATCAACATAGC-TTCTAACTTATTTTCG
1 -AATGCAAACATCCAATTATGAGAGGTTTTAACCAAGAACAACAAAGCTTTC-AATTTATTTTCA
** * * * * *
261949 ATTTATAAGGATTTATAAGATTATAAATGAATCATATATCATAATCTTGATGA-TAAAGTGTTAT
64 ATTTATAA-TTTTTGTAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGA-CATTAAAATGTTAT
* * ** * *
262013 TAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTCAAAGGCATGAGAAACTTTACAAAC
127 TAAAATGATAATTATTCATTGAT-AATAATTTCAAACTTTTGAAGGCATCATAAAC-TTA-AAA-
* * * *
262078 T-CTTTATT--TT-TCAATGGACAACAT-CCACTTCACGTTTT
188 TGCTTT-TTCCTTGTCAATGGATAACATACGAC-ACATG-TTT
** **
262116 CCAATGCAAACATCCAATTATGATTGGTTTTAACCAAGAATGACAAAGCTTTC----TA--TTC-
1 --AATGCAAACATCCAATTATGAGAGGTTTTAACCAAGAACAACAAAGCTTTCAATTTATTTTCA
* *
262174 ----ATAATTATTGATAAGATTATAAATGAA-T-TATATCATAATATT-A-ATGATAAAATGTAA
64 ATTTATAATTTTTG-TAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGACAT--TAAAATGTTA
* * *
262231 TCAAAATGATAATTATTCATTGATAA-ACCATTTCAAGCTTTTGAAGGCATGATAAACTTAAAAT
126 TTAAAATGATAATTATTCATTGATAATA--ATTTCAAACTTTTGAAGGCATCATAAACTTAAAAT
* * ** ** * ** *
262295 GCTCTTTCTTTGTCAACAGATTGCAT-CCATTTCACGTTT
189 GCTTTTTCCTTGTCAATGGATAACATACGA-CACATGTTT
* * ** * * * * * ** * **
262334 CCATTGTAAACATCTGATTATGATAAGCTTTAACCAAAAACAATAAAGCTTTGGACTTATTTTTT
1 --AATGCAAACATCCAATTATGAGAGGTTTTAACCAAGAACAACAAAGCTTTCAATTTATTTTCA
* * * *
262399 ATTTATAATAATTTAG-AAGATTATAAATGAATTATGTATCATAATATTGATGA-TAAAGTGTTA
64 ATTTATAAT--TTTTGTAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGA-CATTAAAATGTTA
* *
262462 TTGAAATTATAATTATTCATTGA
126 TTAAAATGATAATTATTCATTGA
262485 GAAATCATTT
Statistics
Matches: 1518, Mismatches: 306, Indels: 268
0.73 0.15 0.13
Matches are distributed among these distances:
214 1 0.00
215 1 0.00
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235 5 0.00
ACGTcount: A:0.38, C:0.13, G:0.11, T:0.38
Consensus pattern (227 bp):
AATGCAAACATCCAATTATGAGAGGTTTTAACCAAGAACAACAAAGCTTTCAATTTATTTTCAAT
TTATAATTTTTGTAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGACATTAAAATGTTATTAAA
ATGATAATTATTCATTGATAATAATTTCAAACTTTTGAAGGCATCATAAACTTAAAATGCTTTTT
CCTTGTCAATGGATAACATACGACACATGTTT
Found at i:261765 original size:22 final size:25
Alignment explanation
Indices: 261735--261782 Score: 66
Period size: 22 Copynumber: 2.0 Consensus size: 25
261725 ACAATCATTG
261735 ATAAGATT-ATGA-AAAAT-TTATC
1 ATAAGATTAATGATAAAATGTTATC
*
261757 ATAATATTAATGATAAAATGTTATC
1 ATAAGATTAATGATAAAATGTTATC
261782 A
1 A
261783 AAATGATAAT
Statistics
Matches: 22, Mismatches: 1, Indels: 3
0.85 0.04 0.12
Matches are distributed among these distances:
22 7 0.32
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ACGTcount: A:0.50, C:0.04, G:0.08, T:0.38
Consensus pattern (25 bp):
ATAAGATTAATGATAAAATGTTATC
Found at i:263607 original size:232 final size:230
Alignment explanation
Indices: 263173--266204 Score: 1798
Period size: 232 Copynumber: 13.4 Consensus size: 230
263163 ACAATGAAGC
* * ** *
263173 TTTCGATTTGTAATCATTGATAAGATTATAAATG-A-GCTATATCATAATATTGATGATAAAATA
1 TTTCGATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAATG
* ** * *
263236 TTATCAAAATGATAACTATTCATTGATAAATCATTACAAGCTATCGAAGGCGTGATAAACTTAAA
66 TTATC-AAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTTAAGCTTTCGAAGGCATGATAAACTTAAA
* * * * **
263301 ATGCTCTTTTCTTGTCAA-TGAATAGCATCCA-TTC-CATGTTTCCCATTATAAACATCTGATTA
130 ATGCTCTTTCCTTGTCAATTG-ATAGCATACACTTCACA--TTTCCCAATGTAAACATCCAATTA
* *
263363 TGACAAGCTTTAACCAAGAACAATAGAGCTTTTGACTTAT
192 TGATAAGCTTTAACCAAGAACAATAAAGCTTTTGAC-TAT
* * *
263403 TTTCGATTTATAATGATTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTAATGATAAAGTG
1 TTTCGATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAATG
* * * ** * *
263468 TTATTAGAATTATAATTATTCATTGAGAAATCATTTTAAGCTTTCGAAGGTGTAATAAACTTAGA
66 TTATCA-AATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTTAAGCTTTCGAAGGCATGATAAACTTAAA
* * * * * *
263533 ATGCTCTTTCCTTGTCAATTGATTA-CATGCATTTCACATTTCTCAATGTAAATATCCAATTCTA
130 ATGCTCTTTCCTTGTCAATTGA-TAGCATACACTTCACATTTCCCAATGTAAACATCCAATTATG
* * *
263597 ATAGGCTTTAACCAAGAACAATAAAGGTTTCGACTA-
194 ATAAGCTTTAACCAAGAACAATAAAGCTTTTGACTAT
* * * *
263633 -----ATTT-T--TTATTTATAAGATTATAAATGTATTATATATCATCATATTGATGATAAAGTG
1 TTTCGATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAATG
* * ** * * *
263690 TTATTAAATTTATAATTATTCATTGAGCAATCATGTTAAGCTTTCAAAGGCATGATAAGCTTAAA
66 TTATCAAA-TGATAATTATTCATTGATAAATCATTTTAAGCTTTCGAAGGCATGATAAACTTAAA
* * ** * * *
263755 ATGATCTTTCCTT-TCACTACATAGCATTCACTTCACATTTCCCAAT-TCGAACATCCAACTATG
130 ATGCTCTTTCCTTGTCAATTGATAGCATACACTTCACATTTCCCAATGT-AAACATCCAATTATG
* * * * *
263818 ATAGGTTTTAACTAAG---AAT-GA-C----GA--AGC
194 ATAAGCTTTAACCAAGAACAATAAAGCTTTTGACTA-T
* * * *
263845 TTTCGATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATCAA-T-CATATCATAAAATTGGTGATAAAATG
1 TTTCGATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAATG
* ** * * *
263908 TTATCAAAATGATAATTACTCATTTTTAAGTCATTTCAAGCTTTCGAAGCCATGATAAACTTAAA
66 TTATC-AAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTTAAGCTTTCGAAGGCATGATAAACTTAAA
* * * * * ** * *
263973 ATACTTTTTCCTTGTCAATGGACAGCGTACACTTCATGTTGCCCAATGTAAACATCCAGTTATGA
130 ATGCTCTTTCCTTGTCAATTGATAGCATACACTTCACATTTCCCAATGTAAACATCCAATTATGA
** ** * * * *
264038 TAAATTTTAACCAAGAATGACAAAGTTTTTCATTTAT
195 TAAGCTTTAACCAAGAACAATAAAGCTTTTGA-CTAT
* * * *
264075 TTTTGACTTATAATAATTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAAT-TTGGATGATAAATT
1 TTTCGATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATT-GATGATAAAAT
* * * *
264139 GTTATCCAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTTCAGCTTTCAAATGCATGATAAATTTAA
65 GTTAT-CAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTTAAGCTTTCGAAGGCATGATAAACTTAA
* * * * * * ** * * * * *
264204 TATGTTCATTCCTTGTCAAATGATAGCATCCACTGCATGTTTACGAATGCAAGCATCAAATTATG
129 AATGCTCTTTCCTTGTCAATTGATAGCATACACTTCACATTTCCCAATGTAAACATCCAATTATG
* * * * ** *
264269 ATAGGTTTTAACCAAGAACGACAAAGCTTTCAATTTAT
194 ATAAGCTTTAACCAAGAACAATAAAGCTTTTGA-CTAT
* * * * * * *
264307 TTTTGATATAGAATCTTTTATAAGGTTATAAATGAAATATATATCATAATATTGACG-TCAAAAT
1 TTTCGATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGAT-AAAAT
* * * * * *
264371 TTTATAAAATGACAATTTTTCATTGGTAAATCATTTCAAGCTTTCGAAGGCATGATAAACTTAAA
65 GTTATCAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTTAAGCTTTCGAAGGCATGATAAACTTAAA
* * ** * ** * * *
264436 ATACTCTTTCATAT-T-TTTTAGATAGCAT-CTATTTCATGTTGCCCAATGCAAACATTCAATTA
130 ATGCTCTTTCCT-TGTCAATT-GATAGCATAC-ACTTCACATTTCCCAATGTAAACATCCAATTA
* * * * *
264498 TGATAAGTTTTGAGCAAGAACAACAAAGCTTTTGATTTAT
192 TGATAAGCTTTAACCAAGAACAATAAAGCTTTTGA-CTAT
* * * * * *
264538 TTTCAATTTGTAATCATTTATAAGATAATAAATTAA-T-TATATCAGAATATGGATGATAAAATG
1 TTTCGATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAATG
* * * * * * * * * *
264601 TTATCAAAATGCTAATTATTTACTAAT-AA--ATTTCAACCTTTTGAATGCGTAATAAAC-TAAA
66 TTATC-AAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTTAAGCTTTCGAAGGCATGATAAACTTAAA
* * * *** * * *
264662 ATTGCTCTTTTCTTGTCAA-TGA-AGGCCATCCA-TTGCATATTTTTGAATGCAGACATTCAATT
130 A-TGCTCTTTCCTTGTCAATTGATA-G-CATACACTT-CACATTTCCCAATGTAAACATCCAATT
** * * * * *
264724 ATGATTGGTTTTAACTAAGAATAA-AACATCTTTTGATTTAT
191 ATGATAAGCTTTAACCAAGAACAATAA-AGCTTTTGA-CTAT
* * ** *
264765 TTTTGATATATAATC-TCTTATAAGATTATAAATGAATTATATATTGTAATATTGATGTTAAAAA
1 TTTCGATTTATAATCAT-TTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGAT-AAAA
* * * * * *
264829 TGCTATCAAACTGATAATTGTTC-TTCGAAAAATAATTTCAAGCTTTC-ATAAGCATGATAAA-T
64 TGTTATCAAA-TGATAATTATTCATT-GATAAATCATTTTAAGCTTTCGA-AGGCATGATAAACT
* * * * * * * * * * * *
264891 ATAAAATACTTTTTCCTTATCAA-GGATAACATACACTACACATTTACCAATGCAAGCATGCTAC
126 -TAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATTGATAGCATACACTTCACATTTCCCAATGTAAACATCCAAT
* * **
264955 TATGATAGGTTTTATGCAA-AAGCAATAAA------G---A-
190 TATGATAAGCTTTAACCAAGAA-CAATAAAGCTTTTGACTAT
* *
264986 TTTCAATTTATAATCATTGATAA-A-T-T---T--A-TA-AT-TCATAATATTGATGATAAAATG
1 TTTCGATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAATG
* * *
265040 TTATCAAAATGATAATTACTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTCGAAGACATGATAAACTTAAA
66 TTATC-AAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTTAAGCTTTCGAAGGCATGATAAACTTAAA
* * * * * * ** * * * *
265105 ACGCTCTTTCCTTATAAATAGATAGTATCCACTTCATGTTACCTAATGCAAACATCCAATAATGA
130 ATGCTCTTTCCTTGTCAATTGATAGCATACACTTCACATTTCCCAATGTAAACATCCAATTATGA
** * * *
265170 TAAATTTTAACTAAGAACAACAAAGCTTTTGATTTAT
195 TAAGCTTTAACCAAGAACAATAAAGCTTTTGA-CTAT
* * ** *
265207 TTTCAATTTGTAATCATTTATAAGA-TATAAATGAATTATATA-CGATAATATTGATTTTAAAAA
1 TTTCGATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTATATATC-ATAATATTGATGATAAAAT
* * * *
265270 GTTATCAAAATGATAA-TGTTCATTGATAAATAATTTCAAG-ATTC-ATA-GCTATGATAAACTT
65 GTTATC-AAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTTAAGCTTTCGA-AGGC-ATGATAAACTT
* * *** * * ** * * *
265331 AAAATGCTCTTTCTTTATCAACAAATAGCATACAATACATGTTTTCAAATGTAAGCATCCAATTA
127 AAAATGCTCTTTCCTTGTCAATTGATAGCATACACTTCACATTTCCCAATGTAAACATCCAATTA
* * * * * ** * *
265396 TGTTAGGTTTTAAACAAGAACAACAAAGCTTTCAATTTGT
192 TGATAAGCTTTAACCAAGAACAATAAAGCTTTTGA-CTAT
* * * * * * *
265436 TTTTGATATATAATCTTTTACAAGATTATAAACGAATTATATATCGT-A-ATTGATGTTAAAATG
1 TTTCGATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAATG
* * * *
265499 TTATCAAAATGATAATTATTCATAGATAAATAATTTTAAGGTTTTGAAGGCATGATAAACTTAAA
66 TTATC-AAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTTAAGCTTTCGAAGGCATGATAAACTTAAA
* * * * * * *
265564 ATGCTCTTT-CTGTGGCAATAGATAGCATCCACTCCA-AGTTTTCCAAAGCAAACATCCAATTAT
130 ATGCTCTTTCCT-TGTCAATTGATAGCATACACTTCACA-TTTCCCAATGTAAACATCCAATTAT
* * * * ** *
265627 GATAGGTTTTAACTATGAACAATAAATTTTTTGATTTAT
193 GATAAGCTTTAACCAAGAACAATAAAGCTTTTGA-CTAT
* * * * * *
265666 TTTTGATTTATAACCAGTTATAAAATTATAAAAGAATTATATATCATAAT-TTGGATAATAAAAT
1 TTTCGATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATT-GATGATAAAAT
* * * * ** *
265730 GTTATTAAAATGATAAGTATTAATTGATAAATCATTTCAAGCTTTTAAAGGCATGATTAACTTAA
65 GTTA-TCAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTTAAGCTTTCGAAGGCATGATAAACTTAA
* * * * * ** * *
265795 AATGCTCTTCCCTTATCAATGGATAGGAT---C--CA-ATGTTGCCTAATACAAAGATCTAATTA
129 AATGCTCTTTCCTTGTCAATTGATAGCATACACTTCACAT-TT-CCCAATGTAAACATCCAATTA
* * *
265854 TGATAAG-TTCTAACCAAGAACAACAAACCTTCATT--TTAT
192 TGATAAGCTT-TAACCAAGAACAATAAAGCTT--TTGACTAT
* * * * * * * *
265893 TTTTGATTTATAGTCATTTATAAGATTACAAATGAATTATATACCATTATACTGAT-TTGAAATG
1 TTTCGATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAATG
* * * * * *
265957 TTATCAAAATGATAATTGTTCATTGAT-AATGACTTAAAGCTTTCGTAGGCATGGTAAACTTAAA
66 TTATC-AAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTTAAGCTTTCGAAGGCATGATAAACTTAAA
** * * * * * *
266021 ATGCTCTTTTTTTGTTAATGGATAACATCCACCTCACATTTCCC-A---AAACATCTAATTATGA
130 ATGCTCTTTCCTTGTCAATTGATAGCATACACTTCACATTTCCCAATGTAAACATCCAATTATGA
* * * * *
266082 CAGGTTTTAACCAATAACAATAAAGC-TTTGAATTTATT
195 TAAGCTTTAACCAAGAACAATAAAGCTTTTG-A-CTA-T
** * * *** * *
266120 TTTTTATTTATAATCATTTGTAAGATTATAAATCAATTATATATTGCAACATTCATGATAAAATG
1 TTTCGATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAATG
266185 TTATCAGAATGATAATTATT
66 TTATCA-AATGATAATTATT
266205 GATAACTCTA
Statistics
Matches: 2190, Mismatches: 477, Indels: 272
0.75 0.16 0.09
Matches are distributed among these distances:
209 67 0.03
210 67 0.03
211 4 0.00
212 4 0.00
213 1 0.00
215 1 0.00
216 1 0.00
217 5 0.00
218 84 0.04
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220 26 0.01
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224 2 0.00
225 89 0.04
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229 189 0.09
230 280 0.13
231 206 0.09
232 476 0.22
233 51 0.02
234 8 0.00
ACGTcount: A:0.38, C:0.13, G:0.11, T:0.38
Consensus pattern (230 bp):
TTTCGATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAATG
TTATCAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTTAAGCTTTCGAAGGCATGATAAACTTAAAA
TGCTCTTTCCTTGTCAATTGATAGCATACACTTCACATTTCCCAATGTAAACATCCAATTATGAT
AAGCTTTAACCAAGAACAATAAAGCTTTTGACTAT
Found at i:265591 original size:230 final size:230
Alignment explanation
Indices: 265023--266204 Score: 1042
Period size: 230 Copynumber: 5.2 Consensus size: 230
265013 ATAATTCATA
* * * *
265023 ATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTACTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTCGAA
1 ATATTGATGTTAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATAATTTCAAGCTTTTGAA
* * * * * * *
265088 GACATGATAAACTTAAAACGCTCTTTCCTTATAAATAGATAGTATCCACTTCATGTTACCTAATG
66 GGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTT-CTTATCAATAGATAGCATCCACTACATGTTTCCAAATG
* * ** ** *
265153 CAAACATCCAATAATGATAAATTTTAACTAAGAACAACAAAGCTTTTGATTTATTTTCAATTTGT
130 CAAACATCCAATTATGATAAGTTTTAACTAAGAACAACAAAGCTTTCAATTTATTTTTGATTTAT
265218 AATCATTTATAAGA-TATAAATGAATTATATA-CGAT
195 AATCATTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCG-T
* * * * *
265253 AATATTGATTTTAAAAAGTTATCAAAATGATAA-TGTTCATTGATAAATAATTTCAAG--ATTCA
1 -ATATTGATGTTAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATAATTTCAAGCTTTTGA
* * * * *
265315 TA-GCTATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCTTTATCAACAAATAGCATACAATACATGTTTTCAA
65 -AGGC-ATGATAAACTTAAAATGCTCTTTC-TTATCAATAGATAGCATCCACTACATGTTTCCAA
* * * * *
265379 ATGTAAGCATCCAATTATGTTAGGTTTTAAAC-AAGAACAACAAAGCTTTCAATTTGTTTTTGAT
127 ATGCAAACATCCAATTATGATAAGTTTT-AACTAAGAACAACAAAGCTTTCAATTTATTTTTGAT
* * * *
265443 ATATAATCTTTTACAAGATTATAAACGAATTATATATCGT
191 TTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCGT
* * *
265483 A-ATTGATGTTAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATAGATAAATAATTTTAAGGTTTTGAA
1 ATATTGATGTTAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATAATTTCAAGCTTTTGAA
** * *
265547 GGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCTGTGGCAATAGATAGCATCCACTCCAAGTTTTCCAAA-
66 GGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCT-TATCAATAGATAGCATCCACTACATG-TTTCCAAAT
* * * ** **
265611 GCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACTATGAACAATAAATTTTTTGATTTATTTTTGATTTA
129 GCAAACATCCAATTATGATAAGTTTTAACTAAGAACAACAAAGCTTTCAATTTATTTTTGATTTA
* * * * *
265676 TAACCAGTTATAAAATTATAAAAGAATTATATATCAT
194 TAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCGT
** * * * * *
265713 A-ATTTGGATAATAAAATGTTATTAAAATGATAAGTATTAATTGATAAATCATTTCAAGCTTTTA
1 ATA-TT-GATGTTAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATAATTTCAAGCTTTTG
* * * * * *
265777 AAGGCATGATTAACTTAAAATGCTCTTCCCTTATCAATGGATAGGAT-C-C-A-ATGTTGCCTAA
64 AAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTT-TCTTATCAATAGATAGCATCCACTACATGTTTCCAAA
* * * * * * *
265838 TACAAAGATCTAATTATGATAAGTTCTAACCAAGAACAACAAA-CCTTCATTTTATTTTTGATTT
128 TGCAAACATCCAATTATGATAAGTTTTAACTAAGAACAACAAAGCTTTCAATTTATTTTTGATTT
* * * *
265902 ATAGTCATTTATAAGATTACAAATGAATTATATACCATT
193 ATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTATATATC-GT
* * * * * * * *
265941 ATACTGAT-TTGAAATGTTATCAAAATGATAATTGTTCATTGAT-AATGACTTAAAGCTTTCGTA
1 ATATTGATGTTAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATAATTTCAAGCTTTTGAA
* * * * * * *
266004 GGCATGGTAAACTTAAAATGCTCTTTTTTTGTTAATGGATAACATCCACCTCACA--TTTCC-CA
66 GGCATGATAAACTTAAAATGCTC-TTTCTTATCAATAGATAGCATCCA-CT-ACATGTTTCCAAA
* * * * * * * *
266066 ---AAACATCTAATTATGACAGGTTTTAACCAATAACAATAAAGCTTTGAATTTATTTTTTTATT
128 TGCAAACATCCAATTATGATAAGTTTTAACTAAGAACAACAAAGCTTTCAATTTA-TTTTTGATT
* * * *
266128 TATAATCATTTGTAAGATTATAAATCAATTATATATTGCA
192 TATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCG-T
* * * *
266168 ACATTCATGATAAAATGTTATCAGAATGATAATTATT
1 ATATTGATGTTAAAATGTTATCAAAATGATAATTATT
266205 GATAACTCTA
Statistics
Matches: 761, Mismatches: 160, Indels: 63
0.77 0.16 0.06
Matches are distributed among these distances:
225 82 0.11
226 40 0.05
227 98 0.13
228 97 0.13
229 141 0.19
230 168 0.22
231 47 0.06
232 86 0.11
233 2 0.00
ACGTcount: A:0.39, C:0.12, G:0.11, T:0.38
Consensus pattern (230 bp):
ATATTGATGTTAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATAATTTCAAGCTTTTGAA
GGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCTTATCAATAGATAGCATCCACTACATGTTTCCAAATGC
AAACATCCAATTATGATAAGTTTTAACTAAGAACAACAAAGCTTTCAATTTATTTTTGATTTATA
ATCATTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCGT
Found at i:265630 original size:669 final size:673
Alignment explanation
Indices: 264344--266030 Score: 1588
Period size: 669 Copynumber: 2.5 Consensus size: 673
264334 ATAAATGAAA
* * * * *
264344 TATATATCATAATATTGACG-TCAAAATTTTATAAAATGACAATTTTTCATTGGTAAATCATTTC
1 TATATATCATAATATTGATGAT-AAAATGTTATAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTC
* * *** *
264408 AAGCTTTCGAAGGCATGATAAACTTAAAATACTCTTT-CATATTTTTTAGATAGCATCTATTTCA
65 AAGCTTTCGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTA-TAAATAGATAGCATCCA-TTCA
* * *
264472 TGTTGCCCAATGCAAACATTCAATTATGATAAGTTTTGAGCAAGAACAACAAAGCTTTTGATTTA
128 TGTTGCCTAATGCAAACATCCAATTATGATAAGTTTT-AACAAGAACAACAAAGCTTTTGATTTA
* * * **
264537 TTTTCAATTTGTAATCATTTATAAGATAATAAATTAATTATAT-CAGAATATGGATGATAAAATG
192 TTTTCAATTTGTAATCATTTATAAGAT-ATAAATGAATTATATACATAATATTGATTTTAAAATG
* * ** * *
264601 TTATCAAAATGCTAA--TT-ATTTACTAATAAATTTCAACCTT-TTGAATGCGTA--ATAAAC-T
256 TTATCAAAATGATAATGTTCATTGA-TAAT-AATTTCAAGATTCAT--AGGC-TATGATAAACTT
* ** * * * * ** * *
264659 AAAATTGCTCTTTTCTTGTCAATGAAGGCCATCCATTGCATATTTTTGAATGCAGACATTCAATT
316 AAAA-TGCTCTTTTCTTATCAACAAAAGCCATACAATACATATTTTCAAATGAAGACATCCAATT
* * ** *
264724 ATGATTGGTTTTAACTAAGAATAAAACATCTTTTGATTTATTTTTGATATATAATCTCTTATAAG
380 ATGATTGGTTTTAACTAAGAACAAAACAGCTTTCAATTTATTTTTGATATATAATCTCTTACAAG
* * * * *
264789 ATTATAAATGAATTATATATTGTAATATTGATGTTAAAAATGCTATCAAACTGATAATTGTTCTT
445 ATTATAAACGAATTATATATCGTAATATTGATGTTAAAAATGCTATCAAAATGATAATTATTCAT
* * * *
264854 CGAAAAATAATTTCAAGCTTTCATAAGCATGATAAATATAAAATACTTTTTCCTTATCAAGGATA
510 AGAAAAATAATTTCAAGCTTT-ATAAGCATGATAAATATAAAATACTCTTTCCTTAGCAAAGATA
* * * * *
264919 ACATACACTACACATTTACCAATGCAAGCATGCTACTATGATAGGTTTTATGC-A-AAAGCAATA
574 ACATACACTACACATTTACCAAAGCAAACATCCAACTATGATAGGTTTTA-ACTATAAA-CAATA
*
264982 AA-GATTTCA-ATTTATAATCA-TTGAT-AAATT-T-A-
637 AATGATTT-ATATTTATAACCAGTT-ATAAAATTATAAT
*
265014 TA-AT-TCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTACTCATTGATAAATCATTTC
1 TATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTAT-AAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTC
* * *
265077 AAGCTTTCGAAGACATGATAAACTTAAAACGCTCTTTCCTTATAAATAGATAGTATCCACTTCAT
65 AAGCTTTCGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTATAAATAGATAGCATCCA-TTCAT
* * *
265142 GTTACCTAATGCAAACATCCAATAATGATAAATTTTAACTAAGAACAACAAAGCTTTTGATTTAT
129 GTTGCCTAATGCAAACATCCAATTATGATAAGTTTTAAC-AAGAACAACAAAGCTTTTGATTTAT
*
265207 TTTCAATTTGTAATCATTTATAAGATATAAATGAATTATATACGATAATATTGATTTTAAAAAGT
193 TTTCAATTTGTAATCATTTATAAGATATAAATGAATTATATAC-ATAATATTGATTTTAAAATGT
265272 TATCAAAATGATAATGTTCATTGATAAATAATTTCAAGATTCATA-GCTATGATAAACTTAAAAT
257 TATCAAAATGATAATGTTCATTGAT-AATAATTTCAAGATTCATAGGCTATGATAAACTTAAAAT
*
265336 GCTC-TTTCTTTATCAACAAATAG-CATACAATACATGTTTTCAAATGTAAG-CATCCAATTATG
321 GCTCTTTTC-TTATCAACAAA-AGCCATACAATACATATTTTCAAATG-AAGACATCCAATTATG
* *
265398 -TTAGGTTTTAAAC-AAGAACAACAA-AGCTTTCAATTTGTTTTTGATATATAATCTTTTACAAG
383 ATT-GGTTTT-AACTAAGAACAA-AACAGCTTTCAATTTATTTTTGATATATAATCTCTTACAAG
*
265460 ATTATAAACGAATTATATATCGT-A-ATTGATGTT-AAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCAT
445 ATTATAAACGAATTATATATCGTAATATTGATGTTAAAAATGCTATCAAAATGATAATTATTCAT
* * * * *
265522 AGATAAATAATTTTAAGGTTT-TGAAGGCATGATAAACT-TAAAATGCTCTTT-CTGTGGCAATA
510 AGAAAAATAATTTCAAGCTTTAT-AA-GCATGATAAA-TATAAAATACTCTTTCCT-TAGCAA-A
* * * * * *
265584 GATAGCATCCACTCCA-AGTTTTCCAAAGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACTATGAACA
570 GATAACATACACTACACA-TTTACCAAAGCAAACATCCAACTATGATAGGTTTTAACTATAAACA
265648 ATAAATTTTTTGATTTATTTTTGATTTATAACCAGTTATAAAATTATAAAAGAAT
634 ATAAA-----TGATTTA----T-ATTTATAACCAGTTATAAAATTAT-----AAT
* * *
265703 TATATATCATAAT-TTGGATAATAAAATGTTATTAAAATGATAAGTATTAATTGATAAATCATTT
1 TATATATCATAATATT-GATGATAAAATGTTA-TAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTT
** * * * * *
265767 CAAGCTTTTAAAGGCATGATTAACTTAAAATGCTCTTCCCTTATCAATGGATAGGATCCA---AT
64 CAAGCTTTCGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTATAAATAGATAGCATCCATTCAT
* * * * * *
265829 GTTGCCTAATACAAAGATCTAATTATGATAAGTTCTAACCAAGAACAACAAA-C-CTTCATTTTA
129 GTTGCCTAATGCAAACATCCAATTATGATAAGTTTTAA-CAAGAACAACAAAGCTTTTGA-TTTA
** * * * * * *
265892 TTTTTGATTTATAGTCATTTATAAGATTACAAATGAATTATATACCATTATACTGA-TTTGAAAT
192 TTTTCAATTTGTAATCATTTATAAGA-TATAAATGAATTATATA-CATAATATTGATTTTAAAAT
* * * * * *
265956 GTTATCAAAATGATAATTGTTCATTGATAATGACTTAAAGCTTTCGTAGGC-ATGGTAAACTTAA
255 GTTATCAAAATGATAA-TGTTCATTGATAATAATTTCAAG-ATTCATAGGCTATGATAAACTTAA
266020 AATGCTCTTTT
318 AATGCTCTTTT
266031 TTTGTTAATG
Statistics
Matches: 839, Mismatches: 116, Indels: 106
0.79 0.11 0.10
Matches are distributed among these distances:
666 1 0.00
667 4 0.00
668 107 0.13
669 228 0.27
670 45 0.05
671 114 0.14
672 26 0.03
673 8 0.01
674 1 0.00
675 5 0.01
680 12 0.01
681 7 0.01
682 1 0.00
685 3 0.00
686 58 0.07
687 104 0.12
688 8 0.01
689 2 0.00
690 4 0.00
691 100 0.12
692 1 0.00
ACGTcount: A:0.39, C:0.12, G:0.11, T:0.38
Consensus pattern (673 bp):
TATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCA
AGCTTTCGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTATAAATAGATAGCATCCATTCATGT
TGCCTAATGCAAACATCCAATTATGATAAGTTTTAACAAGAACAACAAAGCTTTTGATTTATTTT
CAATTTGTAATCATTTATAAGATATAAATGAATTATATACATAATATTGATTTTAAAATGTTATC
AAAATGATAATGTTCATTGATAATAATTTCAAGATTCATAGGCTATGATAAACTTAAAATGCTCT
TTTCTTATCAACAAAAGCCATACAATACATATTTTCAAATGAAGACATCCAATTATGATTGGTTT
TAACTAAGAACAAAACAGCTTTCAATTTATTTTTGATATATAATCTCTTACAAGATTATAAACGA
ATTATATATCGTAATATTGATGTTAAAAATGCTATCAAAATGATAATTATTCATAGAAAAATAAT
TTCAAGCTTTATAAGCATGATAAATATAAAATACTCTTTCCTTAGCAAAGATAACATACACTACA
CATTTACCAAAGCAAACATCCAACTATGATAGGTTTTAACTATAAACAATAAATGATTTATATTT
ATAACCAGTTATAAAATTATAAT
Found at i:266368 original size:21 final size:22
Alignment explanation
Indices: 266339--266382 Score: 63
Period size: 21 Copynumber: 2.0 Consensus size: 22
266329 AAGTGATTAA
266339 TTTAAGTTATTTTA-GTTAAAT
1 TTTAAGTTATTTTATGTTAAAT
* *
266360 TTTAGGTTATTTTATTTTAAAT
1 TTTAAGTTATTTTATGTTAAAT
266382 T
1 T
266383 ACTTTAAGAG
Statistics
Matches: 20, Mismatches: 2, Indels: 1
0.87 0.09 0.04
Matches are distributed among these distances:
21 13 0.65
22 7 0.35
ACGTcount: A:0.30, C:0.00, G:0.09, T:0.61
Consensus pattern (22 bp):
TTTAAGTTATTTTATGTTAAAT
Found at i:269173 original size:219 final size:222
Alignment explanation
Indices: 267931--271574 Score: 1715
Period size: 231 Copynumber: 16.0 Consensus size: 222
267921 TTTAACTGAC
* * * * * * *
267931 AATTATTCATTGATAAATCATTTGAAGTTTTCGAATGCATCATAAATTTAAAATGCTC-TTTCCT
1 AATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTCAAAGGCATGATAAACTTAAAATACTCTTTTCCT
* * *** * * * * * * * * *
267995 TGTCAATGGACAACATTGGCTACATGTTTTCGAATGCAAAAAGCTAATTATGATAG-GTTTTAAC
66 T-TC-ATGGATAGCATCCACTTCACGTTTCCCAATGTAAACATCCAATTATGATAGAGCTTTAAC
* * * * * *
268059 CAAGAACAATAAAGCTTTCAATTTATTTTTGATATATGATCTTTACAATACTATAAATGAATTAT
129 CAAGAACAACAAAGCTTTC-A--TA-TTTT--TA-CT--TCTTGATAAGATTATAAATGAATTAT
* * * * *
268124 ATATCGTAATATTTATGTTAAAATGTCATCAAGATGAT
185 ATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGAT
** * ** * * *
268162 AATCGTTCATTGATAAATAATTTCAAGCTTTCGTAGGCATGATAAACTTAAAATGCCCTTTCCCT
1 AATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTCAAAGGCATGATAAACTTAAAATACTCTTTTCCT
* * * ** * *
268227 GTCAATGGATAGCATGCACTTCACATTTTTCAATGTAAACATCTAATTATGATA-AGCTTTAATC
66 TTC-ATGGATAGCATCCACTTCACGTTTCCCAATGTAAACATCCAATTATGATAGAGCTTTAACC
* * * * * *
268291 GAGAACAAAAAAGGTTTTGACTTATTTTTGATTTATAATGATTTATAAGATTATAAATGTAA-TA
130 AAGAACAACAAA-GCTTT--CATATTTTT-ACTTCT--TG----ATAAGATTATAAATG-AATTA
* *
268355 TAT-T-ATAATATTGATGAGAAAATGTTATCAAAGTGAT
184 TATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGAT
* * * ** * * ** *
268392 AATTAATT-TTTGATTAATTATTTCAAGCTTT-TGAGGCACGATAAACTTAAAATGCAGTTCTTT
1 AATT-ATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTCAAAGGCATGATAAACTTAAAATACTCTT-TTC
* * * * * * * **
268455 GTCTC-TGGATAACATCCACATCATGTTTCCTAATGTAAATATCCAATTATGATAG-TTTTTAAC
64 CTTTCATGGATAGCATCCACTTCACGTTTCCCAATGTAAACATCCAATTATGATAGAGCTTTAA-
* * ** * *
268518 CCAA-AATAACAATGCTTT--TGATTGGTAAACAT-TT-ATAATG-TTATAAATGAA-T-CATAT
128 CCAAGAACAACAAAGCTTTCAT-ATT--TTTACTTCTTGATAA-GATTATAAATGAATTATATAT
* *
268575 CATAATATTCATGACAAAATGTTATCAAAATGAT
189 CATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGAT
* * * * **
268609 AGTTATACATTGATAAATCATTTCAAGCTTTCTAAGGCA-GAAGAAACTTAAAATGTTC-TTTCC
1 AATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTCAAAGGCATG-ATAAACTTAAAATACTCTTTTCC
* * * ** * * *
268672 TTCTCAATGGATAGCATCCACTTCACGCTTTCCTAA-GCAAGCATCTGACTGTGATAG-GCTTTG
65 TT-TC-ATGGATAGCATCCACTTCACG-TTTCCCAATGTAAACATCCAATTATGATAGAGCTTTA
* * * *
268735 ACCAAGAACAACAAAGCTTTTAACTTATTTTCAATTTGTAATGATTTATTAGATTATAAATGAAT
127 ACCAAGAACAACAAAGC-TTT--CATATTTT-TACTTCT--TGA--TA--AGATTATAAATGAAT
* ** * *
268800 TATATATTATAATATTGATGATAAGGTGTAATTAAAATGAT
182 TATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGAT
* * **
268841 AATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTACAAAGACAAAATAAACTTAAAA-AC-CTCTTTCC
1 AATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTCAAAGGCATGATAAACTTAAAATACTCT-TTTCC
* * * * * * *
268904 TTTTCAATGGATAACATCAACTTTACATTTTCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGAG-TTAAA
65 -TTTC-ATGGATAGCATCCACTTCACGTTTCCCAATGTAAACATCCAATTATGATAGAGCTTTAA
*
268968 CCAAGAA-AAGCAAAGCTTTCA-ATTTATACTTCTTGATAAGATTATAAATGAA-TA-ATATCAT
128 CCAAGAACAA-CAAAGCTTTCATATTTTTACTTCTTGATAAGATTATAAATGAATTATATATCAT
* * *
269029 AATATTGATGACAAAATGTTGTCAAAACGAT
192 AATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGAT
* *
269060 AATTATTAATTGATAAATCATTTCAAGCTTTTC-AAGGCATGATAAACTTAAAATACTCTTTTCG
1 AATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGC-TTTCAAAGGCATGATAAACTTAAAATACTCTTTTCC
* * * * * *
269124 TGTCATCAGATAGTATCCACTTCACGTTTCCCATTGTAAGCACCCAATTATGATA-AGCTTTAAC
65 TTTCAT-GGATAGCATCCACTTCACGTTTCCCAATGTAAACATCCAATTATGATAGAGCTTTAAC
* * *
269188 CAAGAACAATAAAGCTTTCGACTTATTTTTGAGTTATAATGATTTATAAGATTATAAATGAATTA
129 CAAGAACAACAAAGCTTTC-A--TATTTTT-ACTTCT--TG----ATAAGATTATAAATGAATTA
* * * **
269253 TATATCATAATATCGATGATAAAATATTATTAAAATTTT
184 TATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGAT
*** * *
269292 AATTATTCATTGAGGGATCACTTTTAA-CTTTCAAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTC-TTTCC
1 AATTATTCATTGATAAATCA-TTTCAAGCTTTCAAAGGCATGATAAACTTAAAATACTCTTTTCC
* * * * *
269355 TTTCATTGGATAGCATCCACCTCAAGTTTCCCAAAGTAAACATCCAATTATGATAG-GTTTTAAT
65 TTTCA-TGGATAGCATCCACTTCACGTTTCCCAATGTAAACATCCAATTATGATAGAGCTTTAAC
* * * * * *
269419 CATGAATAACAAAGTTTTTTATTTATTTTTTATTTATAACCATTTATAAGATTATAAATGAATTA
129 CAAGAACAACAAAG-CTTTCA--TA-TTTTTA-CT-T---C-TTGATAAGATTATAAATGAATTA
*
269484 TATATCATAAT-TTGGACGATAAAATGTTATCAAAATGAT
184 TATATCATAATATT-GATGATAAAATGTTATCAAAATGAT
* * * ** *
269523 AATCATTCATTGATAAATCATTTCTAGGTTTTTAAGGCATGAAAAACTTAAACA-A-TC-TTTCC
1 AATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTCAAAGGCATGATAAACTTAAA-ATACTCTTTTCC
* * ** *
269585 TTATCAATGGATAGCCTCCACTTCATGTTGT-CCAATACAAACATCCAATTATGATA-A-ATTCT
65 TT-TC-ATGGATAGCATCCACTTCACGTT-TCCCAATGTAAACATCCAATTATGATAGAGCTT-T
* ** * * *
269647 AATCAAGAACAA-AGAAGCTTTTGTTTTATGTTCGATATGTAATCATTTATAAGATTATAAATGA
126 AACCAAGAACAACA-AAGC--TT-TCATAT-TT--TTA-CT--TC-TTGATAAGATTATAAATGA
* * *
269711 ATTATATACCATAATATTGCTGTTAAAATGTTATCAAAATGAT
180 ATTATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGAT
* * * * * * * * *
269754 AATTCTTTATTGACAAATAACTTCAAG-TACTCATAGGCATGATAAACTTAAAATGCTC-TTTCT
1 AATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCT-TTCAAAGGCATGATAAACTTAAAATACTCTTTTCC
* * * * * *
269817 TTGTCAATGGGTAACATCCACCTCAC--ATCCC-A---AAACAT-CTATTATGATAG-GTTTTAA
65 TT-TC-ATGGATAGCATCCACTTCACGTTTCCCAATGTAAACATCCAATTATGATAGAGCTTTAA
* *
269874 CCAATAACAACAAAGCTTTGAATTTTTTATATATATATA-TAATCATTTG-TAAGATTATAAATG
128 CCAAGAACAACAAAGCTTT-CA-----TAT-T-T-T-TACT--TC--TTGATAAGATTATAAATG
** ** *
269937 AATTATATATTGTAGGATTGATGATAAAATGTTATTAAAATGAT
179 AATTATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGAT
* * * * * *
269981 AATTATTCATTGATAAATCACTTCAAGCTTTCGAATGCATCATAAATTTAAAATGCTCTTTT-CT
1 AATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTCAAAGGCATGATAAACTTAAAATACTCTTTTCCT
* * * *
270045 TGTCAATGGATAGCATCCA-TTACACGTTTTCGAATGCAAACATCCAATTATGATA-AGTTTTAA
66 T-TC-ATGGATAGCATCCACTT-CACGTTTCCCAATGTAAACATCCAATTATGATAGAGCTTTAA
* * * * *
270108 CTAA-AAGCAACAAAACTTTCAATTTATTTTTGATATATATTCTT-TTCCAAGATTGTAAATGAA
128 CCAAGAA-CAACAAAGCTTTC-A--TA--TTT--T-TA-CTTCTTGAT--AAGATTATAAATGAA
* * *
270171 TTATATATCATAGTATTAATGTTAAAATGTTATCAAAATGAT
181 TTATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGAT
* * * * *
270213 AATTGTTCATTGATAAATAATTTCAAGC-TTCTATAGGCGA-GATAAACTTAAAAT-GTTTTTTC
1 AATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTC-AAAGGC-ATGATAAACTTAAAATACTCTTTTC
* ** * * **
270275 CTTATCAATGGATAGAATCCACTTCACGTTTCATAATGTAAACATCCGATTATGATTG-GCCATA
64 CTT-TC-ATGGATAGCATCCACTTCACGTTTCCCAATGTAAACATCCAATTATGATAGAGCTTTA
*** ** * *
270339 ATTGAGAACAGTAAAGCTTTCGACTTATTTTTGATTTATAATGATTTATAAGATTATAAATGTAA
127 ACCAAGAACAACAAAGCTTTC-A--TATTTTT-ACTTCT--TG----ATAAGATTATAAATG-AA
* * *
270404 -TATAT-T-ATAACATTGATGAGAAAAGGTTATCAAAATGAT
181 TTATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGAT
* * * * * * * **
270443 AATTATTCTTTGACAAATTATTTCAAGCTTTTAAAGGAAAGATAAACTTAAAATGCTCTTTTTTT
1 AATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTCAAAGGCATGATAAACTTAAAATACTCTTTTCCT
* * * * * * **
270508 TTCATTGGATAGCA-CTCATTTCATGTTTTCGAAAGCAAACATCCAATTATGATAG-TTTTTAAC
66 TTCA-TGGATAGCATC-CACTTCACGTTTCCCAATGTAAACATCCAATTATGATAGAGCTTTAAC
* * ** * ** * *
270571 CTAGAACAATAGTGATTT--TGATTGGTAAACAT-TT-ATAATG-TTGTAAATGAA-T-TATATC
129 CAAGAACAACAAAGCTTTCAT-ATT--TTTACTTCTTGATAA-GATTATAAATGAATTATATATC
* *
270629 ATACTATTGATAATAAAATGTTATCAAAATGAT
190 ATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGAT
* * * * * *
270662 AATTATACATTGATATATCA-TTCAAGCTTTCAAAGGCATCAGAAACTTTAAATGCTC-TTTCCT
1 AATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTCAAAGGCATGATAAACTTAAAATACTCTTTTCCT
* * * * *** *
270725 TGTCAATGAATAGCATCCA-TCTCATGTTT-CCAATGCAAGCATCGGCTTATGATAG-GCTTTGA
66 T-TC-ATGGATAGCATCCACT-TCACGTTTCCCAATGTAAACATCCAATTATGATAGAGCTTTAA
*** * * * *
270787 TTGAGAACAAGAAAGCTTCCA-ACTTATTGT-CGATTATAATGATTTATTAGATTGTAAATGAAT
128 CCAAGAACAACAAAGCTTTCATA-TT-TT-TAC--TTCT--TGA--TA--AGATTATAAATGAAT
* * *
270850 TATATATCATAGTATTAATGA-AAAAGTGTTAGT-AAAATAAT
182 TATATATCATAATATTGATGATAAAA-TGTTA-TCAAAATGAT
* * * *
270891 AATTTTTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTACAAAGACATGATAAACTCAAAA-AGC-CTTTTCC
1 AATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTCAAAGGCATGATAAACTTAAAATA-CTCTTTTCC
* * * * *
270954 TTCCAATGGATAGCA-CCGACTTCACATTTCCCAATGCAAACATCAAATTATGATA-CG-TTTAA
65 TTTC-ATGGATAGCATCC-ACTTCACGTTTCCCAATGTAAACATCCAATTATGATAGAGCTTT-A
* * *
271016 ACCAAGAGCAACAAAGCTTTCA-ATTTATA-ATCTTTGATAAGATTATAAATGAATTATAT-T-A
127 ACCAAGAACAACAAAGCTTTCATATTTTTACTTC-TTGATAAGATTATAAATGAATTATATATCA
271077 TAATATTGATGATAAAATGTTATCAAACA--AT
191 TAATATTGATGATAAAATGTTATCAAA-ATGAT
* *
271108 AATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTGT-GAAGGCATGATAAACTTAAAATTCT-TTTTCC
1 AATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTT-TCAAAGGCATGATAAACTTAAAATACTCTTTTCC
* *** * * * **
271171 TTGCCAACAAATAGCATCCACTTCACATTTTCCATTGTAAACATCTTATTATGATA-AGCTTTAA
65 TT-TC-ATGGATAGCATCCACTTCACGTTTCCCAATGTAAACATCCAATTATGATAGAGCTTTAA
* * * * * * * * *
271235 CTACGAACAATAAAGTGTTTGACTTATTTTCTATTTCCAATGATTTATAAGATTATAATTCAATT
128 CCAAGAACAACAAAG-CTTT--CATATTTT-TACTT-C-----TTGATAAGATTATAAATGAATT
* * * *
271300 ATATATCATAATATTGATGATAAAGTCTTATTAAAATTAT
183 ATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGAT
* * * * *
271340 AATTATTCATTTG-GAAATCATTTTTAA-CTTTGAAAGGTATGATAAACTT-AAA-ACGCTTGTT
1 AATTATTCA-TTGATAAATCA-TTTCAAGCTTTCAAAGGCATGATAAACTTAAAATACTCTT-TT
* * * * * * * * * * *
271401 TCTATCACTAGATAGCATCCACTTCAAGTTTCCCAAAGCAAACAT-TAGTTATAATTG-GTTTTA
63 CCTTTCA-TGGATAGCATCCACTTCACGTTTCCCAATGTAAACATCCAATTATGATAGAGCTTTA
* * *
271464 ACCATGAACAACAAAGTTTTCAATTTATTTTCAATTTA-TAGTCATTTG-TAAGATTAGAAATGA
127 ACCAAGAACAACAAAGCTTTC-A--TA--TT---TTTACT--TC--TTGATAAGATTATAAATGA
271527 ATTATATATCATAAT-TTGGATGATAAAATGTTATCAAAATGAT
180 ATTATATATCATAATATT-GATGATAAAATGTTATCAAAATGAT
271570 AATTA
1 AATTA
271575 CTAACATTTA
Statistics
Matches: 2637, Mismatches: 535, Indels: 483
0.72 0.15 0.13
Matches are distributed among these distances:
215 2 0.00
216 9 0.00
217 176 0.07
218 160 0.06
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220 46 0.02
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Consensus pattern (222 bp):
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AGAACAACAAAGCTTTCATATTTTTACTTCTTGATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATA
TTGATGATAAAATGTTATCAAAATGAT
Found at i:269467 original size:231 final size:232
Alignment explanation
Indices: 267931--274682 Score: 4295
Period size: 232 Copynumber: 29.3 Consensus size: 232
267921 TTTAACTGAC
* * * * * *
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* * *** * * * * * * *
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* * * * * *
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131 AGAACAACAAAGCTTTCAATTTATTTTTGATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTATA
* * * * *
268125 TATCGTAATATTTATGTTAAAATGTCATCAAGATGAT
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** * ** * *
268162 AATCGTTCATTGATAAATAATTTCAAGCTTTCGTAGGCATGATAAACTTAAAATGCCCTTTCCCT
1 AATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTCAAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTT
* ** * * * * *
268227 GTCAATGGATAGCATGCACTTCACA-TTTTTCAATGTAAACATCTAATTATGATAAGCTTTAATC
66 GTCAATGGATAGCATCCACTTCA-AGTTTCCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACC
* * * ** * *
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130 AAGAACAACAAAGCTTTCAATTTATTTTTGATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATG-AATTA
* *
268355 TAT-T-ATAATATTGATGAGAAAATGTTATCAAAGTGAT
194 TATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGAT
* * * ** * ** *
268392 AATTAATT-TTTGATTAATTATTTCAAGCTTT-TGAGGCACGATAAACTTAAAATGC-AGTTCTT
1 AATT-ATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTCAAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCT
** * * * * * * *
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* * * *
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* * *
268570 -CATATCATAATATTCATGACAAAATGTTATCAAAATGAT
193 ATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGAT
* * * * *
268609 AGTTATACATTGATAAATCATTTCAAGCTTTCTAAGGCA-GAAGAAACTTAAAATGTTCTTTCCT
1 AATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTCAAAGGCATG-ATAAACTTAAAATGCTCTTTCCT
* * * * ** * * * *
268673 TCTCAATGGATAGCATCCACTTCACGCTTTCCTAA-GCAAGCATCTGACTGTGATAGGCTTTGAC
65 TGTCAATGGATAGCATCCACTTCAAG-TTTCCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAAC
* * ** * * *
268737 CAAGAACAACAAAGCTTTTAACTTATTTTCAATTTGTAATGATTTATTAGATTATAAATGAATTA
129 CAAGAACAACAAAGCTTTCAATTTATTTTTGATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTA
* ** * *
268802 TATATTATAATATTGATGATAAGGTGTAATTAAAATGAT
194 TATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGAT
* * ** **
268841 AATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTACAAAGACAAAATAAACTTAAAAACCTCTTTCCTT
1 AATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTCAAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTT
* * * * * *
268906 TTCAATGGATAACATCAACTTTACA-TTTTCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGAG-TTAAAC
66 GTCAATGGATAGCATCCACTTCA-AGTTTCCCAATGCAAACATCCAATTATGATAG-GTTTTAAC
* *
268969 CAAGAA-AAGCAAAGCTTTCAATTTA----T-A---CT--TC-TTGATAAGATTATAAATGAA-T
129 CAAGAACAA-CAAAGCTTTCAATTTATTTTTGATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATT
* * *
269021 A-ATATCATAATATTGATGACAAAATGTTGTCAAAACGAT
193 ATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGAT
* * * *
269060 AATTATTAATTGATAAATCATTTCAAGCTTTTC-AAGGCATGATAAACTTAAAATACTCTTTTCG
1 AATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGC-TTTCAAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCT
* * * * * * * * *
269124 TGTC-ATCAGATAGTATCCACTTCACGTTTCCCATTGTAAGCACCCAATTATGATAAGCTTTAAC
65 TGTCAAT-GGATAGCATCCACTTCAAGTTTCCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAAC
* * * * *
269188 CAAGAACAATAAAGCTTTCGACTTATTTTTGAGTTATAATGATTTATAAGATTATAAATGAATTA
129 CAAGAACAACAAAGCTTTCAATTTATTTTTGATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTA
* * * **
269253 TATATCATAATATCGATGATAAAATATTATTAAAATTTT
194 TATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGAT
*** *
269292 AATTATTCATTGAGGGATCACTTTTAA-CTTTCAAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCT
1 AATTATTCATTGATAAATCA-TTTCAAGCTTTCAAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCT
* * * * *
269356 T-TCATTGGATAGCATCCACCTCAAGTTTCCCAAAGTAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAATC
65 TGTCAATGGATAGCATCCACTTCAAGTTTCCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACC
* * * ** * *
269420 ATGAATAACAAAGTTTTTTATTTATTTTTTATTTATAACCATTTATAAGATTATAAATGAATTAT
130 AAGAACAACAAAGCTTTCAATTTATTTTTGATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTAT
*
269485 ATATCATAAT-TTGGACGATAAAATGTTATCAAAATGAT
195 ATATCATAATATT-GATGATAAAATGTTATCAAAATGAT
* * * ** * *
269523 AATCATTCATTGATAAATCATTTCTAGGTTTTTAAGGCATGAAAAACTTAAACA--ATCTTTCCT
1 AATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTCAAAGGCATGATAAACTTAAA-ATGCTCTTTCCT
* * * * ** * *
269586 TATCAATGGATAGCCTCCACTTCATGTTGT-CCAATACAAACATCCAATTATGATAAATTCTAAT
65 TGTCAATGGATAGCATCCACTTCAAGTT-TCCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAAC
*** * * * *
269650 CAAGAACAA-AGAAGCTTTTGTTTTATGTTCGATATGTAATCATTTATAAGATTATAAATGAATT
129 CAAGAACAACA-AAGCTTTCAATTTATTTTTGATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATT
* * *
269714 ATATACCATAATATTGCTGTTAAAATGTTATCAAAATGAT
193 ATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGAT
* * * * * * * *
269754 AATTCTTTATTGACAAATAACTTCAAG-TACTCATAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCTT
1 AATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCT-TTCAAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCT
* * * *
269818 TGTCAATGGGTAACATCCACCTCACA---TCCC-A---AAACAT-CTATTATGATAGGTTTTAAC
65 TGTCAATGGATAGCATCCACTTCA-AGTTTCCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAAC
* * *
269875 CAATAACAACAAAGCTTTGAATTT-TTTATAT-ATATATATAATCATTTGTAAGATTATAAATGA
129 CAAGAACAACAAAGCTTTCAATTTATTT-T-TGAT-T-TATAATCATTTATAAGATTATAAATGA
** ** *
269938 ATTATATATTGTAGGATTGATGATAAAATGTTATTAAAATGAT
190 ATTATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGAT
* * * * * *
269981 AATTATTCATTGATAAATCACTTCAAGCTTTCGAATGCATCATAAATTTAAAATGCTCTTTTCTT
1 AATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTCAAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTT
* * * * *
270046 GTCAATGGATAGCATCCA-TTACACGTTTTCGAATGCAAACATCCAATTATGATAAGTTTTAACT
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* * * * ** *
270110 AA-AAGCAACAAAACTTTCAATTTATTTTTGATATATATTCTTTTCCAAGATTGTAAATGAATTA
130 AAGAA-CAACAAAGCTTTCAATTTATTTTTGATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTA
* * *
270174 TATATCATAGTATTAATGTTAAAATGTTATCAAAATGAT
194 TATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGAT
* * * * *
270213 AATTGTTCATTGATAAATAATTTCAAGC-TTCTATAGGCGA-GATAAACTTAAAATGTTTTTTCC
1 AATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTC-AAAGGC-ATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCC
* * * ** * * * *** *
270276 TTATCAATGGATAGAATCCACTTCACGTTTCATAATGTAAACATCCGATTATGATTGGCCATAAT
64 TTGTCAATGGATAGCATCCACTTCAAGTTTCCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAAC
** ** * * *
270341 TGAGAACAGTAAAGCTTTCGACTTATTTTTGATTTATAATGATTTATAAGATTATAAATGTAA-T
129 CAAGAACAACAAAGCTTTCAATTTATTTTTGATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATG-AATT
* * *
270405 ATAT-T-ATAACATTGATGAGAAAAGGTTATCAAAATGAT
193 ATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGAT
* * * * * * **
270443 AATTATTCTTTGACAAATTATTTCAAGCTTTTAAAGGAAAGATAAACTTAAAATGCTCTTTTTTT
1 AATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTCAAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTT
* * * * * * * *
270508 TTCATTGGATAGCA-CTCATTTCATGTTTTCGAAAGCAAACATCCAATTATGATAGTTTTTAACC
66 GTCAATGGATAGCATC-CACTTCAAGTTTCCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACC
* * * ** * *
270572 TAG---AAC-AA----T--AGTGA-TTTTGATTGGTAAACATTTATAATG-TTGTAAATGAA-T-
130 AAGAACAACAAAGCTTTCAATTTATTTTTGATTTATAATCATTTATAA-GATTATAAATGAATTA
* *
270623 TATATCATACTATTGATAATAAAATGTTATCAAAATGAT
194 TATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGAT
* * * * *
270662 AATTATACATTGATATATCA-TTCAAGCTTTCAAAGGCATCAGAAACTTTAAATGCTCTTTCCTT
1 AATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTCAAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTT
* * * *** * * **
270726 GTCAATGAATAGCATCCA-TCTCATGTTT-CCAATGCAAGCATCGGCTTATGATAGGCTTTGATT
66 GTCAATGGATAGCATCCACT-TCAAGTTTCCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACC
* * * * * * * * *
270789 GAGAACAAGAAAGCTTCCAACTTATTGTCGA-TTATAATGATTTATTAGATTGTAAATGAATTAT
130 AAGAACAACAAAGCTTTCAATTTATTTTTGATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTAT
* * *
270853 ATATCATAGTATTAATGA-AAAAGTGTTAGT-AAAATAAT
195 ATATCATAATATTGATGATAAAA-TGTTA-TCAAAATGAT
* * * * *
270891 AATTTTTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTACAAAGACATGATAAACTCAAAAAGC-CTTTTCCT
1 AATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTCAAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTC-TTTCCT
* * * *
270955 T-CCAATGGATAGCA-CCGACTTCACA-TTTCCCAATGCAAACATCAAATTATGATACGTTTAAA
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*
271017 CCAAGAGCAACAAAGCTTTC-----A------ATTTATAATC-TTTGATAAGATTATAAATGAAT
128 CCAAGAACAACAAAGCTTTCAATTTATTTTTGATTTATAATCATTT-ATAAGATTATAAATGAAT
271070 TATAT-T-ATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAACA--AT
192 TATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAA-ATGAT
* * *
271108 AATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTGT-GAAGGCATGATAAACTTAAAATTCTTTTTCCT
1 AATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTT-TCAAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCT
* *** * * * ** * *
271172 TGCCAACAAATAGCATCCACTTCACA-TTTTCCATTGTAAACATCTTATTATGATAAGCTTTAAC
65 TGTCAATGGATAGCATCCACTTCA-AGTTTCCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAAC
* * * ** * ** * * *
271236 TACGAACAATAAAG-TGTTTGACTTATTTTCT-ATTTCCAATGATTTATAAGATTATAATTCAAT
129 CAAGAACAACAAAGCT-TTCAATTTATTTT-TGATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAAT
* * * *
271299 TATATATCATAATATTGATGATAAAGTCTTATTAAAATTAT
192 TATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGAT
* * * * * *
271340 AATTATTCATTTG-GAAATCATTTTTAA-CTTTGAAAGGTATGATAAACTTAAAACGCT-TGTTT
1 AATTATTCA-TTGATAAATCA-TTTCAAGCTTTCAAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCT-TTC
* * * * * * * *
271402 C-TATCACTAGATAGCATCCACTTCAAGTTTCCCAAAGCAAACAT-TAGTTATAATTGGTTTTAA
63 CTTGTCAATGGATAGCATCCACTTCAAGTTTCCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAA
* * ** * * *
271465 CCATGAACAACAAAGTTTTCAATTTATTTTCAATTTATAGTCATTTGTAAGATTAGAAATGAATT
128 CCAAGAACAACAAAGCTTTCAATTTATTTTTGATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATT
271530 ATATATCATAAT-TTGGATGATAAAATGTTATCAAAATGAT
193 ATATATCATAATATT-GATGATAAAATGTTATCAAAATGAT
* * * * * * *
271570 AATTACTAACATTTATAAGATTATAACTGAA-TTATATCAAAAGTTTG-ATGATAAAATATTATC
1 AATTA-T-TCATTGATAA-ATCAT--TTCAAGCT-T-TC-AAAG---GCATGAT--AA-ACT-T-
* ** * ** * * * ** * ** * *
271633 AAAATGATAATT--AT-TC-ATTAATA-AATCC-TTTCGAGCTTT-GAAAAGC-ATGATACACTT
50 AAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCATCCACTTCAAG-TTTCCCAATGCAAACATCCAATT
** ** * * * * ** * ** * ** ** *
271690 AAAAT-GCCCTTT--CCATG-TCAATAGATGGAGTCCGCTTCATGTTTCCCATCGCAAACATCCA
114 ATGATAG-GTTTTAACCAAGAACAACA-A-AGCTTTCAATTTAT-TTT-TGAT-TTATA-AT-C-
* * * * * ** * *
271751 ATTGTGATGA-ATTTTAACCAAGAACAACTTAACTTTTGAT-TTGTTTTTGATTTATAATAAT-T
170 ATT-T-ATAAGATTATAA--ATG---AA-TT-A--TAT-ATCATAATATTGA-TGATAA-AATGT
* *
271813 TAT-AAGATTAT
221 TATCAAAATGAT
* * * ** *
271824 AAATGAATTATATATCATAATATCAATGACAAAATG-TTATCCAAATGATAATTGTTCGGTGATA
1 -AAT-TATT-CAT-TGATAA-ATC-ATTTC--AA-GCTT-T-CAAA-G------G--C-ATGATA
** * * ** ** * * * * * *
271888 AATCATTCCAA-G--CTTTCCTAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTC---CTTGCCAGTTGG
45 AA-C-TTAAAATGCTCTTTCCTTGTCA--ATGGA--TAGCATCCAC-TTCAAGTTTCCCA-ATGC
* * * * * *** * *
271947 TAGCATCCACTTCA-CAT--CTCCCAACACAA-ACACCCAATTATGATAGGTTTTAACTAAAAAC
102 AAACATCCAATT-ATGATAGGTTTTAAC-CAAGA-A--CAA-CA--A-A-GCTTT--C-----A-
** * ** * * * * *
272008 CATAAAGCTTTCAATTTAAAATCTTTTATAAGATTATAAATAAATTATATATCATGATATTAATG
149 -ATTTA-TTTTTGATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATG
* * *
272073 TTAAAATGTTATGAAAATCAT
212 ATAAAATGTTATCAAAATGAT
* * **
272094 AATTGTTCATTGATAAAACATTTCAAGCTTTCGGAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTT
1 AATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTCAAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTT
* * * * *
272159 ATCAATTGATAGCATCCGCTT-AATGTTTTCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTCAACC
66 GTCAATGGATAGCATCCACTTCAA-GTTTCCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACC
* ** * * * *
272223 AAGAACAACAAAGCTTTCAATTTAGTTGAGATTTAAAATCTTTTATAAAATTATAAATAAATTAT
130 AAGAACAACAAAGCTTTCAATTTATTTTTGATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTAT
* *
272288 ATATCATAATATTGTTGTTAAAATGTTATCAAAATGAT
195 ATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGAT
* * **** * * *
272326 AATTGTTCATTGATAAAACATTTCAAGCTTTTGGTGACATAATAAACTTATAATGCTCTTTCCTT
1 AATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTCAAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTT
* * * * *
272391 GTCAATTGAGAGCATCCACTTCACACTTT-CTAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAATC
66 GTCAATGGATAGCATCCACTTCA-AGTTTCCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACC
* * * ** *
272455 ACGAACGACAAAGCTTTCTATTTATTTTCAATTTATAATCTTTTATAAGATTATAAA-GAAGTTA
130 AAGAACAACAAAGCTTTCAATTTATTTTTGATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAA-TTA
* *
272519 TATATCATAATATTGATGTTAAAAGGTTATCAAAATGAT
194 TATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGAT
* * * * *
272558 AATTCTTCATTGATTAAAT-GTTTCAAGCTTTCAGAGGCGTGATAAACGTAAAATGCTCTTTCCT
1 AATTATTCATTGA-TAAATCATTTCAAGCTTTCAAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCT
** ** * **
272622 TGTCAATTAATAGCATCCACTTCAAGTTTTTCAATGCAAACATTCAATTATGATAGGTTTTAATT
65 TGTCAATGGATAGCATCCACTTCAAGTTTCCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACC
** * * * * * *
272687 TGGAACAATAAAGCTTTTACTTTATTTTCT-ACTTATAATAATTTATGAGATTATAAATGAATTA
130 AAGAACAACAAAGCTTTCAATTTATTTT-TGATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTA
* *
272751 TATATAATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAGTGAT
194 TATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGAT
* * * *
272790 AATTATTCATTGATAAATCATTTCGAGCTTTTCAACA--CATGATAAACATAAAATGTTCTTTCT
1 AATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGC-TTTCAA-AGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCC
* * * ** ** * * * * * *
272853 TTATCGATAGACGGCATTGACTTCACG-CTCTCAATGCGAACATCAAATTATGATGGGTTTTAAC
64 TTGTCAATGGATAGCATCCACTTCAAGTTTCCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAAC
* * * * * *
272917 AAAGAACAACAAAGCTTTCGATTTGTTTATGATTGATAATCATTTATAAGATTTTAAATGAA-TA
129 CAAGAACAACAAAGCTTTCAATTTATTTTTGATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTA
* * * * *
272981 TATATCATTATATTGATGACAAATTGTTATCAAAGTTAT
194 TATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGAT
* * *
273020 AATTATTCATTGATATATTATTTCAAGCTTTCGAAA-GCATGATAAACTTAAAATGTTCTTTCCT
1 AATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTC-AAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCT
* * * * ** * ** *
273084 TGTCAATAGATTGTATCCACTTCATGTTTCTTAATGTAGTCATCCAATTACGATAGGTTTTAACC
65 TGTCAATGGATAGCATCCACTTCAAGTTTCCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACC
* * * * * *
273149 AAGAACAATAAAGCTTGT-AATTTATTTTTTATTTGTAATTATTTATAATAATATAAATGAATTA
130 AAGAACAACAAAGCTT-TCAATTTATTTTTGATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTA
*
273213 TATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATTAAAATGAT
194 TATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGAT
* * * * *
273252 AATTATTCATTGATAAATCTTTTCAAGTTTTCGAAGGCATGAAAAACTTAAAATAAC-CTTTCCT
1 AATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTCAAAGGCATGATAAACTTAAAAT-GCTCTTTCCT
* * * * * * *
273316 TGTCAATGGATAGCATCCA-TTGCATGTTTCCCTATGCAAACATCAAACTGTGATAAGTTTTAAT
65 TGTCAATGGATAGCATCCACTT-CAAGTTTCCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAAC
* ** ** ** * *
273380 GAAGAACAACAAAGCTTTCAACGTATAGTCAATCTATAATCATTTATAAGATTATAGATGAATTA
129 CAAGAACAACAAAGCTTTCAATTTATTTTTGATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTA
* *
273445 TAGATCATAATATTGATGATAAAAT-TTGATCAAATTGAT
194 TATATCATAATATTGATGATAAAATGTT-ATCAAAATGAT
* * * * * * * **
273484 AATTATTCATTGATGAGTCATTTGAATCTTTCAAAAAGAATGATACACTTAAAATGC-CATTTTT
1 AATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTC-AAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTC-TTTCC
** ** * * *
273548 TTGTCAATGGATAGCATCCACTAGATTTTTCACAATGCAAACATCTAATTATGATAGGTTTTCAC
64 TTGTCAATGGATAGCATCCACTTCAAGTTTCCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAAC
* *
273613 CAAAAACAATC-AAGCTTTTC-A---A--TTTG-----TAA-CATTTATAAGATCATAAATGAA-
129 CAAGAACAA-CAAAGC-TTTCAATTTATTTTTGATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAAT
*
273664 T-TATATCATAACT-TTGATGAGAAAATGTTAT-AAAATGAT
192 TATATATCATAA-TATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGAT
* * * *
273703 AATCATTCATTGATAAATCCTTTCAAGCTTTCAAAAGCATGATAAACTTAAAATGGC-CTTTCCA
1 AATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTCAAAGGCATGATAAACTTAAAAT-GCTCTTTCCT
* * * * *
273767 TGTCAATGGATAGAATCCACTTTATGTTTCCC-ATCTCAAACATCCAATTATAATAGGTTTTAAC
65 TGTCAATGGATAGCATCCACTTCAAGTTTCCCAAT-GCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAAC
* **
273831 CAGGAACAACTTAGCTTTCAATTTA----T-A---AT--T-ATTTATAAGATTATAAATGAATTA
129 CAAGAACAACAAAGCTTTCAATTTATTTTTGATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTA
* *
273885 TATATCATAATATTGATGATTACATGTTATCAAAATGAT
194 TATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGAT
** * * * * * * * *
273924 AATTATTTGTTGATAAATCATTCCAAGCTTTCAGAGACATGATAAATTTAAAATACTTTTTTCAT
1 AATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTCAAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTT
* * * *
273989 GTCAATGAATAGCATCCATTTCACGTTTCCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACTA
66 GTCAATGGATAGCATCCACTTCAAGTTTCCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACCA
** * *
274054 AGAACAACAAAGCTTTTGATTTATTGTTGATTTATAATC-TTTGATAAAATTATAAATGAATTAT
131 AGAACAACAAAGCTTTCAATTTATTTTTGATTTATAATCATTT-ATAAGATTATAAATGAATTAT
* * * * * * *
274118 ACATCATCATATCGATGGTAAAATGTGATTAAGATGAT
195 ATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGAT
* * *
274156 AATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGTTTTCGAAA-GAATGATAAACTTAAAATACTCTTTCCT
1 AATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTC-AAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCT
* ** * * * * *
274220 TGTCAATGGATAGCATCCACTACATCTTTCCCAATGCAAACTTCCAATAATGAAAAGTTCTAACC
65 TGTCAATGGATAGCATCCACTTCAAGTTTCCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACC
* * * ** * *
274285 AAGAATAACAAAGCTTTCGATTTATTTTCT--TTTAAAATC-TTTAGGAGATTTTAAATAAATTA
130 AAGAACAACAAAGCTTTCAATTTATTTT-TGATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTA
* * *
274347 TATATAACAATATTGATG-TGAAAATGTTATCAAAATGAA
194 TATATCATAATATTGATGAT-AAAATGTTATCAAAATGAT
* * * * *
274386 AATTGTTCACTGATAAAACATTTCAA-CATTTCAAAAGTATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCT
1 AATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGC-TTTCAAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCT
* * * * * *
274450 TATTAATTGATCA-CATCCACTTCACGTTGT-CCAATGCAAATATCCAATTGTGATAGGTTTTAA
65 TGTCAATGGAT-AGCATCCACTTCAAGTT-TCCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAA
* * * ** *
274513 CCAAGAACAATAAAGC-TTCTGATTTATTTTTG-GTTATAACTTTTTTATAAGATTATAAATAAA
128 CCAAGAACAACAAAGCTTTC-AATTTATTTTTGATTTATAA-TCATTTATAAGATTATAAATGAA
* *
274576 TTATATATCATAATATTGATGTTAAAATGTTATCAAAATAAT
191 TTATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGAT
* * * *
274618 AATTGTTTATTGATTAAA-AATTTCAAGCTTTCAGAA-GAATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCC
1 AATTATTCATTGA-TAAATCATTTCAAGCTTTCA-AAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCC
274681 TT
64 TT
274683 CATGTTTCTC
Statistics
Matches: 5073, Mismatches: 1107, Indels: 681
0.74 0.16 0.10
Matches are distributed among these distances:
215 2 0.00
216 6 0.00
217 167 0.03
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257 10 0.00
258 3 0.00
259 3 0.00
260 2 0.00
261 6 0.00
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269 24 0.00
270 20 0.00
272 1 0.00
273 5 0.00
274 4 0.00
275 3 0.00
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279 7 0.00
280 2 0.00
281 1 0.00
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283 3 0.00
284 3 0.00
285 5 0.00
ACGTcount: A:0.38, C:0.14, G:0.11, T:0.37
Consensus pattern (232 bp):
AATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTCAAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTT
GTCAATGGATAGCATCCACTTCAAGTTTCCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACCA
AGAACAACAAAGCTTTCAATTTATTTTTGATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTATA
TATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGAT
Found at i:270579 original size:921 final size:904
Alignment explanation
Indices: 268041--275894 Score: 3279
Period size: 926 Copynumber: 8.5 Consensus size: 904
268031 CAAAAAGCTA
* * * * * * * *
268041 ATTATGATAGGTTTTAACCAAGAACAATAAAGCTTTCAATTTATTTTTGATATATGATC-TTTAC
1 ATTATGATAGGCTTTAACCAAGAACAACAAAGCTTCCAACTTATTATAGAT-TATAATCATTTAT
* * * * * * * * * **
268105 AATACTATAAATGAATTATATATCGTAATATTTATGTTAAAATGTCATCAAGATGATAATCGTTC
65 AAGATTATAAATGAATTATATATCATAGTATTGATG-AAAAATGTTATTAAAATGATAATTATTC
* * * * * *
268170 ATTGATAAATAATTTCAAGCTTTCGTAGGCATGATAAACTTAAAATGCCCTTTCCCTGTCAATGG
129 ATTGATAAATCATTTCAAGCTTTC-AAAGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTTCTTGTCAATGG
* * ** * * * * *
268235 ATAGCATGCACTTCACATTTTTCAATGTAAACATCTAATTATGATAAGCTTTAATCGAGAA-CAA
193 ATAGCATCCACTTCACGTTTCCCAATGCAAACATCCAATTATGATAAGTTTTAA-CCAAAAGCAA
* * * * **
268299 AAAAGGTTTTGACTTATTTTTGATTTATAATGATTTATAAGATTATAAATGTAA-TATAT-T-AT
257 CAAA-GCTTTCA-TTATTTTTGATATAT-ATCTTTTATAAGATTATAAATG-AATTATATATCAT
* * * * * **
268361 AATATTGATGAGAAAATGTTATCAAAGTGATAATTAATT-TTTGATTAATTATTTCAAGCTTTTG
318 AATATTGATGATAAAATGTTATCAAAAT-ATAATT-ATTCATTGATAAATAATTTCAAGCTTTCA
* *** * ** * * * *
268425 AGGCACGATAAACTTAAAATG-CAGTTCTTTGTCTCTGGATAACATCCACATCATGTTTCCTAAT
381 AGGCATGATAAACTTAAAATGTTTTTTCCTT-TCAATGGATAGCATCCACTTCACGTTTCATAAT
* ** * * * * **
268489 GTAAATATCCAATTATGATAGTTTTTAA-CCCAA-AATAACA---ATG-C---TTTTGATTGGTA
445 GTAAACATCCAATTATGATAGGCTTTAATACGAACAATAA-AGTTTTGACTTATTTTTATTTATA
** * * *
268545 AACATTTATAATG-TTATAAATG-AA-T-CATATCATAATATTCATGACAAAATGTTATCAAAAT
509 ATGATTTATAA-GATTATAAATGTAATTATATATCATAA-ATTGATGA-AAAAGGTTATCAAAAT
* * * * * * *
268606 GATAGTTATACATTGATAAATCATTTCAAGCTTTCT-AAGGCA-GAAGAAACTTAAAATGTTCTT
571 GATAATTATTCTTTGACAAATCATTTCAAGCTTT-TAAAGGAATG-ATAAACTTAAAA-GCTCTT
** * * * * * ** * * **
268669 TCCTTCTCAATGGATAGCA-TCCACTTCACGCTTTCCTAAGCAAGCATCTGACTGTGATAGGCTT
633 TTTTTATCAATGGATAGCACTCCACTTCATGTTTTCCAAAGCAAACATCCAATTATGATAGATTT
* ** * * *
268733 TGACCAAGAACAACAAAGCTTTTAACTTATTTTCAATTTGTAATGATTTATTAGATTATAAATGA
698 TAACC-AGAACAA-AAAG-TTTT-GTTTA-TTTCGA-TTGTAATCATTTATAAGATTATAAATGA
* ** * * * * *
268798 ATTATATATTATAATATTGATGATAAGGTGTAATTAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATT
757 ATTATATA-CATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATACATTGACAAAT-AAT
* ** * ** * * * *
268863 TCAAGCT-TACAAAGACAAAATAAACTTAAAAACCTCTTTCCTTTTCAATGGATAACATCAACTT
820 TCAAGCTCT-CAAAGGCATCAGAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGAATAACATCCAC-C
* * * **
268927 TACAT-TTTCCAATGCAAACATCCA
883 T-CATCATCCCAA--CAAGCATCGG
* * * *
268951 ATTATGATAGAG-TTAAACCAAGAA-AAGCAAAGCTTTCAA--T-TTAT--A--CT--TC-TTGA
1 ATTATGATAG-GCTTTAACCAAGAACAA-CAAAGCTTCCAACTTATTATAGATTATAATCATTTA
* * * *
269004 TAAGATTATAAATGAA-TA-ATATCATAATATTGATGACAAAATGTTGTCAAAACGATAATTATT
64 TAAGATTATAAATGAATTATATATCATAGTATTGATGA-AAAATGTTATTAAAATGATAATTATT
* * * *
269067 AATTGATAAATCATTTCAAGCTTTTCAAGGCATGATAAACTTAAAATACTCTTTTCGTGTC-ATC
128 CATTGATAAATCATTTCAAGC-TTTCAAAGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTTCTTGTCAAT-
* * * * * * *
269131 AGATAGTATCCACTTCACGTTTCCCATTGTAAGCACCCAATTATGATAAGCTTTAACCAAGAA-C
191 GGATAGCATCCACTTCACGTTTCCCAATGCAAACATCCAATTATGATAAGTTTTAACCAA-AAGC
* **
269195 AATAAAGCTTTCGACTTATTTTTGAGT-TATAATGATTTATAAGATTATAAATGAATTATATATC
255 AACAAAGCTTTC-A-TTATTTTTGA-TATAT-ATCTTTTATAAGATTATAAATGAATTATATATC
* * * * *** * *
269259 ATAATATCGATGATAAAATATTATTAAAATTTTAATTATTCATTGAGGGATCACTTTTAA-CTTT
316 ATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAA-TATAATTATTCATTGATAAAT-AATTTCAAGCTTT
* * * * * **
269323 CAAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTTCATTGGATAGCATCCACCTCAAGTTTCCCA
379 C-AAGGCATGATAAACTTAAAATGTTTTTTCCTTTCAATGGATAGCATCCACTTCACGTTTCATA
* * * * * * *
269388 AAGTAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAATCATGAATAACAAAGTTTTTTATTTATTTTTTATT
443 ATGTAAACATCCAATTATGATAGGCTTTAAT-ACGAACAATAAAG-TTTTGACTTA-TTTTTATT
** * * *
269453 TATAACCATTTATAAGATTATAAATG-AATTATATATCATAATTTGGACGATAAAATGTTATCAA
505 TATAATGATTTATAAGATTATAAATGTAATTATATATCATAAATT-GATGA-AAAAGGTTATCAA
* * * * * * * * *
269517 AATGATAATCATTCATTGATAAATCATTTCTAGGTTTTTAAGGCATGAAAAACTTAAACA-ATCT
568 AATGATAATTATTCTTTGACAAATCATTTCAAGCTTTTAAAGGAATGATAAACTTAAA-AGCTCT
** * *
269581 TTCCTTATCAATGGATAGC-CTCCACTTCATGTTGTCCAATA-CAAACATCCAATTATGATAAAT
632 TTTTTTATCAATGGATAGCACTCCACTTCATGTTTTCCAA-AGCAAACATCCAATTATGATAGAT
* *
269644 TCTAATCAAGAACAAAGAAGCTTTTGTTTTATGTTCGATATGTAATCATTTATAAGATTATAAAT
696 TTTAA-CCAGAACAAA-AAG-TTTTG-TTTAT-TTCGAT-TGTAATCATTTATAAGATTATAAAT
* * * **
269709 GAATTATATACCATAATATTGCTGTTAAAATGTTATCAAAATGATAATTCTTTATTGACAAATAA
755 GAATTATATA-CATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATACATTGACAAATAA
* * * * **
269774 CTTCAAG-TACTCATAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCTTTGTCAATGGGTAACATCCAC
819 -TTCAAGCT-CTCAAAGGCATCAGAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGAATAACATCCAC
*
269838 CTCA-CATCCCAA-AA-CATC-T
882 CTCATCATCCCAACAAGCATCGG
* * ** * * *
269857 ATTATGATAGGTTTTAACCAATAACAACAAAGCTTTGAATTTTTTATATATATATATAATCATTT
1 ATTATGATAGGCTTTAACCAAGAACAACAAAGCTTCCAA-CTTAT-TATAGAT-TATAATCATTT
* ** *
269922 GTAAGATTATAAATGAATTATATATTGTAGGATTGATGATAAAATGTTATTAAAATGATAATTAT
63 ATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAGTATTGATGA-AAAATGTTATTAAAATGATAATTAT
* * * *
269987 TCATTGATAAATCACTTCAAGCTTTCGAATGCATCATAAATTTAAAATGCTCTTTTCTTGTCAAT
127 TCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTC-AAAGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTTCTTGTCAAT
* * *
270052 GGATAGCATCCA-TTACACGTTTTCGAATGCAAACATCCAATTATGATAAGTTTTAACTAAAAGC
191 GGATAGCATCCACTT-CACGTTTCCCAATGCAAACATCCAATTATGATAAGTTTTAACCAAAAGC
* ** *
270116 AACAAAACTTTCAATTTATTTTTGATATATATTCTTTTCCAAGATTGTAAATGAATTATATATCA
255 AACAAAGCTTTC-A-TTATTTTTGATATATA-TCTTTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCA
* * * *
270181 TAGTATTAATGTTAAAATGTTATCAAAATGATAATTGTTCATTGATAAATAATTTCAAGC-TTCT
317 TAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAAT-ATAATTATTCATTGATAAATAATTTCAAGCTTTC-
*
270245 ATAGGCGA-GATAAACTTAAAATGTTTTTTCCTTATCAATGGATAGAATCCACTTCACGTTTCAT
380 A-AGGC-ATGATAAACTTAAAATGTTTTTTCCTT-TCAATGGATAGCATCCACTTCACGTTTCAT
* * ** * *
270309 AATGTAAACATCCGATTATGATTGGCCATAATTGA-GAACAGTAAAGCTTTCGACTTATTTTTGA
442 AATGTAAACATCCAATTATGATAGGCTTTAA-T-ACGAACAATAAAG-TTTTGACTTATTTTT-A
270373 TTTATAATGATTTATAAGATTATAAATGTAA-TATAT-T-ATAACATTGATGAGAAAAGGTTATC
503 TTTATAATGATTTATAAGATTATAAATGTAATTATATATCATAA-ATTGATGA-AAAAGGTTATC
* *
270435 AAAATGATAATTATTCTTTGACAAATTATTTCAAGCTTTTAAAGGAAAGATAAACTTAAAATGCT
566 AAAATGATAATTATTCTTTGACAAATCATTTCAAGCTTTTAAAGGAATGATAAACTTAAAA-GCT
* * * * *
270500 CTTTTTTTTTCATTGGATAGCACT-CATTTCATGTTTTCGAAAGCAAACATCCAATTATGATAGT
630 CTTTTTTTATCAATGGATAGCACTCCACTTCATGTTTTCCAAAGCAAACATCCAATTATGATAGA
* * * *
270564 TTTTAACCTAGAAC-AATAG---TG---ATTTTGATTGGTAAACATTTATAATG-TTGTAAATGA
695 TTTTAACC-AGAACAAAAAGTTTTGTTTATTTCGATT-GTAATCATTTATAA-GATTATAAATGA
* * * * *
270621 ATTATAT-CATACTATTGATAATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATACATTGATATATCATTC
757 ATTATATACATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATACATTGACAAATAATTC
* * * *
270685 AAGCTTTCAAAGGCATCAGAAACTTTAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGAATAGCATCCATCTCAT
822 AAGCTCTCAAAGGCATCAGAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGAATAACATCCACCTCAT
** *
270750 GTTTCCAATGCAAGCATCGG
887 CATCCCAA--CAAGCATCGG
* * *** * * * * *
270770 CTTATGATAGGCTTTGATTGAGAACAAGAAAGCTTCCAACTTATTGTCGATTATAATGATTTATT
1 ATTATGATAGGCTTTAACCAAGAACAACAAAGCTTCCAACTTATTATAGATTATAATCATTTATA
* * * * *
270835 AGATTGTAAATGAATTATATATCATAGTATTAATGAAAAAGTGTTAGTAAAATAATAATTTTTCA
66 AGATTATAAATGAATTATATATCATAGTATTGATGAAAAA-TGTTATTAAAATGATAATTATTCA
* * * *
270900 TTGATAAATCATTTCAAGCTTACAAAGACATGATAAACTCAAAAAGC-CTTTTCCTT-CCAATGG
130 TTGATAAATCATTTCAAGCTTTCAAAG-CATGATAAACTTAAAATGCTCTTTT-CTTGTCAATGG
* * * * *
270963 ATAGCA-CCGACTTCACATTTCCCAATGCAAACATCAAATTATGATACGTTTAAACCAAGAGCAA
193 ATAGCATCC-ACTTCACGTTTCCCAATGCAAACATCCAATTATGATAAGTTTTAACCAAAAGCAA
*
271027 CAAAGCTTTCA--A---TT--TATA-ATCTTTGATAAGATTATAAATGAATTATAT-T-ATAATA
257 CAAAGCTTTCATTATTTTTGATATATATCTTTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATA
* *
271082 TTGATGATAAAATGTTATCAAACA-ATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTGTGAAGGC
322 TTGATGATAAAATGTTATCAAA-ATATAATTATTCATTGATAAATAATTTCAAGCTT-TCAAGGC
* *** *
271146 ATGATAAACTTAAAAT-TCTTTTTCCTTGCCAACAAATAGCATCCACTTCACATTTTCCAT--TG
385 ATGATAAACTTAAAATGT-TTTTTCCTT-TCAATGGATAGCATCCACTTCAC-GTTT-CATAATG
** * **
271208 TAAACATCTTATTATGATAAGCTTTAACTACGAACAATAAAGTGTTTGACTTATTTTCTATTTCC
446 TAAACATCCAATTATGATAGGCTTTAA-TACGAACAATAAAGT-TTTGACTTATTTT-TATTTAT
* * *
271273 AATGATTTATAAGATTAT-AAT-TCAATTATATATCATAATATTGATGATAAAGTCTTATTAAAA
508 AATGATTTATAAGATTATAAATGT-AATTATATATCATAA-ATTGATGAAAAAG-GTTATCAAAA
* * * * *
271336 TTATAATTATTCATTTG-GAAATCATTTTTAA-CTTTGAAAGGTATGATAAACTTAAAACGCT-T
570 TGATAATTATTC-TTTGACAAATCA-TTTCAAGCTTTTAAAGGAATGATAAACTTAAAA-GCTCT
* * * * * * * * * * *
271398 GTTTCTATCACTAGATAGCA-TCCACTTCAAGTTTCCCAAAGCAAACAT-TAGTTATAATTGGTT
632 TTTTTTATCAATGGATAGCACTCCACTTCATGTTTTCCAAAGCAAACATCCAATTATGATAGATT
* * * *
271461 TTAACCATGAACAACAAAGTTTTCAATTTATTTTCAATT-TATAGTCATTTGTAAGATTAGAAAT
697 TTAACCA-GAACAA-AAAGTTTT--GTTTA-TTTCGATTGTA-A-TCATTTATAAGATTATAAAT
* *
271525 GAATTATATATCATAAT-TTGGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTACTAACATTTATAAG
755 GAATTATATA-CATAATATT-GATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTA-T-ACATTGA-CA-
* * ** * * * * * ** *
271589 ATTATAACTGAATTATATCAAAAGTTTG-ATGATAAAATATTATCAAAATGATAATT--AT-TC-
814 A--ATAATTCAA-GCTCTC-AAAG---GCAT--CAGAA-ACT-T-AAAATGCTCTTTCCTTGTCA
* ** * ***
271649 ATTAATAA-ATCC-TTTCGAGC-TTTGAA-AAGCAT--G
867 ATGAATAACATCCACCTC-ATCATCCCAACAAGCATCGG
* * * * * * * * ** * * ** *
271682 ATACACTTAAAATGCCCTTT--CCATG-TCAATAGATGGAGTCC-GCTTCATGTTTCCCATCGCA
1 AT-TA--TGATA-G-GCTTTAACCAAGAACAACA-A-AGCTTCCAACTT-AT-TAT-AGAT--TA
* * * * * * * * *
271743 AACATCCAATTGTGATGA-ATTTTAACCAAGAACAACTTA-ACTTTTGATTTGTTTTTGATTTAT
54 TA-AT-C-ATT-T-ATAAGATTATAA--ATG---AA-TTATA--TATCA-TAG-TATTGA-TGA-
* * * * *
271806 AATAATTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATCAATGACAAAAT-GTTATCCAA-A
102 AA-AATGT-T---ATTA-AAATG----ATA-AT--T-AT-TCATTGA-TAAATCATT-T-CAAGC
* * * *
271869 TGAT-AATTGTTCGGTGATAAATCATTCCAAGCTTTCCTAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTT
149 T-TTCAA-AG--C-ATGATAAA-C-TT--AA--------A---ATGCT---CTT----T--TCTT
** * * * * * * ** * *
271933 -TCCTTGCCAGTTGGTAGCATCCACTTCACATCTCCCAACACAAACACCCAATTATGATAGGTTT
185 GTCAATG---GATAGCATC--C-ACTTCACGTTTCCCAATGCAAACATCCAATTATGATAAGTTT
* * * * *
271997 TAACTAAAAACCATAAAGCTTTCA--A--TTT-A-A-A-ATCTTTTATAAGATTATAAATAAATT
244 TAACCAAAAGCAACAAAGCTTTCATTATTTTTGATATATATCTTTTATAAGATTATAAATGAATT
* * * * *
272054 ATATATCATGATATTAATGTTAAAATGTTATGAAAATCATAATTGTTCATTGATAAA-ACATTTC
309 ATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAAT-ATAATTATTCATTGATAAATA-ATTTC
* * * * * * *
272118 AAGCTTTCGGAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTATCAATTGATAGCATCCGCTTAAT
372 AAGCTTTC-AAGGCATGATAAACTTAAAATGTTTTTTCCTT-TCAATGGATAGCATCCACTTCAC
* * * * * ** *
272183 GTTTTC-CAATGCAAACATCCAATTATGATAGG-TTTCAACCAAGAACAACAAAGCTTTCAATTT
435 G-TTTCATAATGTAAACATCCAATTATGATAGGCTTT-AA-TACGAACAATAAAG-TTTTGACTT
*** * ** * * * *
272246 AGTTGAGATTTAAAATCTTTTATAAAATTATAAAT-AAATTATATATCATAATATTGTTGTTAAA
496 A-TTTTTATTTATAATGATTTATAAGATTATAAATGTAATTATATATCATAA-ATTGATG-AAAA
* * * * * * *
272310 ATGTTATCAAAATGATAATTGTTCATTGATAAAACATTTCAAGCTTTT--GGTGACATAATAAAC
558 AGGTTATCAAAATGATAATTATTCTTTGACAAATCATTTCAAGCTTTTAAAG-GA-ATGATAAAC
* ** * * * *** * *
272373 TTATAATGCTCTTTCCTTGTCAATTGAGAGCA-TCCACTTCACACTTTCTAATGCAAACATCCAA
621 TTA-AAAGCTCTTTTTTTATCAATGGATAGCACTCCACTTCATGTTTTCCAAAGCAAACATCCAA
* * * * * * *
272437 TTATGATAGGTTTTAATCACGAACGACAAAGCTTTCTATTTATTTTCAATTTATAATCTTTTATA
685 TTATGATAGATTTTAACCA-GAAC-AAAAAG-TTT-TGTTTA-TTTCGA-TTGTAATCATTTATA
* * * *
272502 AGATTATAAA-GAAGTTATATATCATAATATTGATGTTAAAAGGTTATCAAAATGATAATTCTTC
744 AGATTATAAATGAA-TTATATA-CATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATAC
* ** * * * * * * *
272566 ATTGATTAAATGTTTCAAGCTTTCAGAGGCGTGATAAACGTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATTA
807 ATTGA-CAAATAATTCAAGCTCTCAAAGGCATCAGAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGA
* * * ** * *
272631 ATAGCATCCACTTCAAGT-TTTTCAATGCAAACATTC-A
871 ATAACATCCACCTC-A-TCATCCCAA--CAAGCA-TCGG
* **** * ** * ** *
272668 ATTATGATAGGTTTTAATTTGGAACAATAAAGCTT-TTACTTTATTTTCTACTTATAATAATTTA
1 ATTATGATAGGCTTTAACCAAGAACAACAAAGCTTCCAAC-TTATTATAGA-TTATAATCATTTA
* * * * *
272732 TGAGATTATAAATGAATTATATATAATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAGTGATAATTATT
64 TAAGATTATAAATGAATTATATATCATAGTATTGATGA-AAAATGTTATTAAAATGATAATTATT
* * * * *
272797 CATTGATAAATCATTTCGAGCTTTTCAACA-CATGATAAACATAAAATGTTC-TTTCTTTATCGA
128 CATTGATAAATCATTTCAAGC-TTTCAA-AGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTTC-TTGTCAA
* ** ** * * * * ** *
272860 TAGACGGCATTGACTTCACG-CTCTCAATGCGAACATCAAATTATGATGGGTTTTAA-CAAAGAA
190 TGGATAGCATCCACTTCACGTTTCCCAATGCAAACATCCAATTATGATAAGTTTTAACCAAA-AG
* *
272923 CAACAAAGCTTTCGATT-TGTTTATGAT-TGATAATCATTTATAAGATTTTAAATGAA-TATATA
254 CAACAAAGCTTTC-ATTAT-TTT-TGATAT-AT-ATCTTTTATAAGATTATAAATGAATTATATA
* * * * * *
272985 TCATTATATTGATGACAAATTGTTATCAAAGTTATAATTATTCATTGATATATTATTTCAAGCTT
314 TCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAA-ATATAATTATTCATTGATAAATAATTTCAAGCTT
* * * * * * *
273050 TCGAAAGCATGATAAACTTAAAATGTTCTTTCCTTGTCAATAGATTGTATCCACTTCATGTTTCT
378 TC-AAGGCATGATAAACTTAAAATGTTTTTTCCTT-TCAATGGATAGCATCCACTTCACGTTTCA
** * * * * * * *
273115 TAATGTAGTCATCCAATTACGATAGGTTTTAACCAAGAACAATAAAGCTTGTAATTTATTTTTTA
441 TAATGTAAACATCCAATTATGATAGGCTTTAA-TACGAACAATAAAG-TTTTGACTTA-TTTTTA
* * * * * *
273180 TTTGTAATTATTTATAATAATATAAATG-AATTATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATT
503 TTTATAATGATTTATAAGATTATAAATGTAATTATATATCATAA-ATTGATGA-AAAAGGTTATC
* * * * * * *
273244 AAAATGATAATTATTCATTGATAAATCTTTTCAAG-TTTTCGAAGGCATGAAAAACTTAAAATAA
566 AAAATGATAATTATTCTTTGACAAATCATTTCAAGCTTTT-AAAGGAATGATAAACTT-AAA-AG
** * * * * * * *
273308 C-CTTTCCTTGTCAATGGATAGCA-TCCA-TTGCATGTTTCCCTATGCAAACATCAAACTGTGAT
628 CTCTTTTTTTATCAATGGATAGCACTCCACTT-CATGTTTTCCAAAGCAAACATCCAATTATGAT
** * * * * *
273370 A-AGTTTTAATGAAGAACAACAAAGCTTTCAACGTATA-GTCAATCTATAATCATTTATAAGATT
692 AGA-TTTTAA-CCAGAACAA-AAAG-TTT---TGTTTATTTCGAT-TGTAATCATTTATAAGATT
* * * *
273433 ATAGATGAATTATAGATCATAATATTGATGATAAAAT-TTGATCAAATTGATAATTATTCATTGA
749 ATAAATGAATTATATA-CATAATATTGATGATAAAATGTT-ATCAAAATGATAATTATACATTGA
** * * * * * * * * * * ** *
273497 TGAGTCATTTGAATCTTTCAAAAAGAATGATACACTTAAAATGC-CATTTTTTTGTCAATGGATA
812 CAAAT-AATTCAAGCTCTC-AAAGGCATCAGAAACTTAAAATGCTC-TTTCCTTGTCAATGAATA
* * ** * * **
273561 GCATCCA-CTAGATTTTTCACAATGCAAACATCTA
874 ACATCCACCT-CA-TCATCCCAA--CAAGCATCGG
* * * *
273595 ATTATGATAGGTTTTCACC-A-AA-AAC-AA---T-CAAGCTT-TTCA-A-TTTGTAA-CATTTA
1 ATTATGATAGGCTTTAACCAAGAACAACAAAGCTTCCAA-CTTATT-ATAGATTATAATCATTTA
* * *
273648 TAAGATCATAAATGAA-T-TATATCATAACT-TTGATGAGAAAATGTTA-TAAAATGATAATCAT
64 TAAGATTATAAATGAATTATATATCAT-AGTATTGATGA-AAAATGTTATTAAAATGATAATTAT
* * *
273709 TCATTGATAAATCCTTTCAAGCTTTCAAAAGCATGATAAACTTAAAATGGC-CTTTCCATGTCAA
127 TCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTC-AAAGCATGATAAACTTAAAAT-GCTCTTTTCTTGTCAA
* * * * * * *
273773 TGGATAGAATCCACTTTATGTTTCCC-ATCTCAAACATCCAATTATAATAGGTTTTAACCAGGAA
190 TGGATAGCATCCACTTCACGTTTCCCAAT-GCAAACATCCAATTATGATAAGTTTTAACCA-AAA
** *
273837 -CAACTTAGCTTTCA--A--TTT-ATA-AT-T-ATTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCAT
253 GCAACAAAGCTTTCATTATTTTTGATATATATCTTTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCAT
* * ** * *
273893 AATATTGATGATTACATGTTATCAAAATGATAATTATTTGTTGATAAATCATTCCAAGCTTTCAG
318 AATATTGATGATAAAATGTTATCAAAAT-ATAATTATTCATTGATAAATAATTTCAAGCTTTCA-
* * * * * * * **
273958 AGACATGATAAATTTAAAATACTTTTTTCATGTCAATGAATAGCATCCATTTCACGTTTCCCAAT
381 AGGCATGATAAACTTAAAAT-GTTTTTTCCTTTCAATGGATAGCATCCACTTCACGTTTCATAAT
* * * * * *
274023 GCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACTAAGAACAACAAAGCTTTTGATTTATTGTTGATTTA
445 GTAAACATCCAATTATGATAGGCTTTAA-TACGAACAATAAAG-TTTTGACTTATT-TTTATTTA
* * * * * * * * * *
274088 TAAT-CTTTGATAAAATTATAAATG-AATTATACATCATCATATCGATGGTAAAATGTGATTAAG
507 TAATGATTT-ATAAGATTATAAATGTAATTATATATCAT-AAATTGAT-GAAAAAGGTTATCAAA
* * *
274151 ATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAG-TTTTCGAAA-GAATGATAAACTTAAAATACTC
569 ATGATAATTATTCTTTGACAAATCATTTCAAGCTTTT--AAAGGAATGATAAACTTAAAA-GCTC
** * * * * * * * *
274214 TTTCCTTGTCAATGGATAGCA-TCCACTACATCTTTCCCAATGCAAACTTCCAATAATGA-AAAG
631 TTTTTTTATCAATGGATAGCACTCCACTTCATGTTTTCCAAAGCAAACATCCAATTATGATAGA-
* * * ** ** ** *
274277 TTCTAACCAAGAATAACAAAGCTTTCGATTTATTTTCTTTTAAAATC-TTTAGGAGATTTTAAAT
695 TTTTAACC-AGAACAA-AAAG-TTTTG-TTTA-TTTCGATTGTAATCATTTATAAGATTATAAAT
* * * * * * * *
274341 AAATTATATATAACAATATTGATG-TGAAAATGTTATCAAAATGAAAATTGTTCACTGATAAA-A
755 GAATTATATA-CATAATATTGATGAT-AAAATGTTATCAAAATGATAATTATACATTGACAAATA
* * * * * * * *
274404 CATTTCAA-CATTTCAAAAGTATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTATTAATTG-ATCACATC
818 -A-TTCAAGC-TCTCAAAGGCATCAGAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAA-TGAATAACATC
* * * ** **
274467 CACTTCA-CGTTGTCCAATGCAAATATCCA
879 CACCTCATC-AT-CCCAA--CAAGCATCGG
* * * ** * * * * **
274496 ATTGTGATAGGTTTTAACCAAGAACAATAAAGCTTCTGATTTATTTTTGGTTATAACTTTTTTAT
1 ATTATGATAGGCTTTAACCAAGAACAACAAAGCTTCCAACTTATTATAGATTATAA-TCATTTAT
* * * * * * *
274561 AAGATTATAAATAAATTATATATCATAATATTGATGTTAAAATGTTATCAAAATAATAATTGTTT
65 AAGATTATAAATGAATTATATATCATAGTATTGATG-AAAAATGTTATTAAAATGATAATTATTC
* *
274626 ATTGATTAAA-AATTTCAAGCTTTCAGAAGAATGATAAACTTAAAATGCTC-TTTC----C----
129 ATTGA-TAAATCATTTCAAGCTTTCA-AAGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTTCTTGTCAATG
* * * *
274681 --T----T-CA--T---GTTTCTCAATGCAAACATCTAATTATGATAAGGTTTAACCAGGAA-CA
192 GATAGCATCCACTTCACGTTTCCCAATGCAAACATCCAATTATGATAAGTTTTAACCA-AAAGCA
* * * * * * * **
274733 AGAAAGCTTTCCCTTTATTTTCGATTTATAATCATTTATGAGACTATAAACAAATTATATATCAT
256 ACAAAGCTTT--CATTATTTTTGATATAT-ATCTTTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCAT
* * *
274798 AATATCGATGATAAAATGTTATCAAAGTAATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTCAA
318 AATATTGATGATAAAATGTTATCAAAAT-ATAATTATTCATTGATAAATAATTTCAAGCTTTC-A
* * * * * * **
274863 AAGCATGATAAACGTAAAATGTTCTTTT-CTTGTTAATGGACAGCATCAACTTCATGTTTCCCAA
381 AGGCATGATAAACTTAAAATGTT-TTTTCCTT-TCAATGGATAGCATCCACTTCACGTTTCATAA
* * * * * *
274927 TGTGAACAACAAATTATGATAGTG-TTTAATCAAGAACAATAAAGCTTTCGATTTATTTTTGATT
444 TGTAAACATCCAATTATGATAG-GCTTTAAT-ACGAACAATAAAG-TTTTGACTTATTTTT-ATT
* * * **
274991 TATAA-GCATTTATAACATTCTAACTG-AATTATATATCATAATATTGATGATAAATTGTTATCA
505 TATAATG-ATTTATAAGATTATAAATGTAATTATATATCATAA-ATTGATGA-AAAAGGTTATCA
* * * * **
275054 AAATTATAATTATT-TATTGATATATCATTTCAAGCCTTCGAA-GACATGATAAACTTAAAATGC
567 AAATGATAATTATTCT-TTGACAAATCATTTCAAGCTTTTAAAGGA-ATGATAAACTTAAAA-GC
** * * * * * * * *
275117 TCTTTCCTTGTCATTGGATTGCA-TCCACTTCATGTTTACTAATGCAATCATCCAATTATGGTA-
629 TCTTTTTTTATCAATGGATAGCACTCCACTTCATGTTTTCCAAAGCAAACATCCAATTATGATAG
* * *** * * *
275180 AGTTTTGACCAAGAATAATAAAGCTTTCAAATTATTTTTGATTTGTAATTATTTATAAGATTTTA
694 A-TTTTAACC-AGAACAA-AAAG-TTT-TGTTTA-TTTCGA-TTGTAATCATTTATAAGATTATA
** * * * **
275245 AATGAATTATATATCATAATATCAATGATAAAATGTTATCAAAGTTATAATTATTCATTGGTAAA
752 AATGAATTATATA-CATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATACATTGACAAA
* * * * * * * * * ** *
275310 TCATTTCAAGCTTTCGAAGGCATGA-AAACCTTAACATGCCCTTTTCTTGTTAGTGGTTACCATC
816 T-AATTCAAGCTCTCAAAGGCATCAGAAA-CTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGAATAACATC
* * * * *
275374 CACTTCA-CATTTTCTAATGCAAACATCTG
879 CACCTCATCA--TCCCAA--CAAGCATCGG
* * * * * * * * *
275403 ATTATCACAGGTTTTAACAAAGAACAACAACGCCTT-CGATTTATTGTCGATTTATAATCATTTA
1 ATTATGATAGGCTTTAACCAAGAACAACAAAG-CTTCCAACTTATTATAGA-TTATAATCATTTA
* * * ** ** *
275467 TAAGATTATAAATGAATTATACATCATCA-TATTAATGATAAAATATGGTCCAACTGATAATTAT
64 TAAGATTATAAATGAATTATATATCAT-AGTATTGATGA-AAAATGTTATTAAAATGATAATTAT
* * * ** *
275531 TCATTGATAAATGATTTGAAGGTTTCGAGGGCATGATAAACTT-AAATGCTCTTTTCTTGTCGAT
127 TCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTC-AAAGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTTCTTGTCAAT
* * ***
275595 GGATAGCATCCA-TTGCACATTTCCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAGGGAAGAA-
191 GGATAGCATCCACTT-CACGTTTCCCAATGCAAACATCCAATTATGATAAGTTTTAACCAA-AAG
* * * * * *
275658 CAA-AAATGCTTTCGATTTATTTTTTATTTATAATCATTTATAAGGGTCATAAATGAATTATACA
254 CAACAAA-GCTTTC-A-TTATTTTTGATATAT-ATCTTTTATAA-GATTATAAATGAATTATATA
* * * *
275722 TCATAATATTGATGATAAAGT-TTGATCAAAATGACAATTATTCTTTGATAAATCATTTCAAGCT
314 TCATAATATTGATGATAAAATGTT-ATCAAAAT-ATAATTATTCATTGATAAATAATTTCAAGCT
* * * * * * *
275786 TTCGAAGTCATGATAAACATAAAATGTTCATTTT-TTTGGTTAATCGATAGCATCCACTGCATGT
377 TTC-AAGGCATGATAAACTTAAAATGTT--TTTTCCTT--TCAATGGATAGCATCCACTTCACGT
* * * *
275850 TTGC--AATGCAAATATCCAATTATGATAGGTTTTAACTAAGAACAA
437 TT-CATAATGTAAACATCCAATTATGATAGGCTTTAA-TACGAACAA
275895 CAAAACTTTT
Statistics
Matches: 5385, Mismatches: 1092, Indels: 915
0.73 0.15 0.12
Matches are distributed among these distances:
893 1 0.00
894 55 0.01
895 169 0.03
896 76 0.01
897 82 0.02
898 216 0.04
899 14 0.00
900 68 0.01
901 153 0.03
902 87 0.02
903 46 0.01
904 344 0.06
905 370 0.07
906 92 0.02
907 318 0.06
908 108 0.02
909 88 0.02
910 183 0.03
911 23 0.00
912 68 0.01
913 307 0.06
914 185 0.03
915 73 0.01
916 78 0.01
917 27 0.01
918 12 0.00
919 30 0.01
920 110 0.02
921 331 0.06
922 107 0.02
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924 9 0.00
925 24 0.00
926 414 0.08
927 171 0.03
928 99 0.02
929 41 0.01
930 28 0.01
931 8 0.00
932 2 0.00
933 4 0.00
934 3 0.00
935 4 0.00
936 3 0.00
939 3 0.00
940 4 0.00
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TGATAAAATGTTATCAAAATATAATTATTCATTGATAAATAATTTCAAGCTTTCAAGGCATGATA
AACTTAAAATGTTTTTTCCTTTCAATGGATAGCATCCACTTCACGTTTCATAATGTAAACATCCA
ATTATGATAGGCTTTAATACGAACAATAAAGTTTTGACTTATTTTTATTTATAATGATTTATAAG
ATTATAAATGTAATTATATATCATAAATTGATGAAAAAGGTTATCAAAATGATAATTATTCTTTG
ACAAATCATTTCAAGCTTTTAAAGGAATGATAAACTTAAAAGCTCTTTTTTTATCAATGGATAGC
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TTGTTTATTTCGATTGTAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTATATACATAATATTGATGATA
AAATGTTATCAAAATGATAATTATACATTGACAAATAATTCAAGCTCTCAAAGGCATCAGAAACT
TAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGAATAACATCCACCTCATCATCCCAACAAGCATCGG
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* * *
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* *
271579 CATTTATAAGATTATAACTGAA-T-TATATCAAAAGTTT-GATGATAAAATATTATCAAAATGAT
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* * * * * *
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* * *** * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * ** *
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* * * * * * * *
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* * * * * * * * * * *
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** * *
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*
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* * * * * ** *
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** * * * * * *
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* ** ** *
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* * * * *
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* * * * *
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* * ** * * * * ** *
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321 CACTTTCC-AATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAAGAACAACAAAGCTTTCGATTT
* * * * **
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* *
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449 TGTTATCAAAATGAT
* * * ** ** *
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1 AATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTCAGAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTTCTT
* * * * *
268906 TTCAATGGATAACATCAACTTTACA-TTTTCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGAG-TTAAAC
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* * *
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* * * *
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193 ATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCA
* * * * * * * *
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258 AGCTTTTGAAGACATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAAT-GGAGAGCATCCACTTCAC
* * * * * * * * *
269149 -GTTTCCCATTGTAAGCACCCAATTATGATAAGCTTTAACCAAGAACAATAAAGCTTTCGACTTA
322 ACTTT-CCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAAGAACAACAAAGCTTTCGATTTA
** * * *
269213 TTTTTGAGTTATAATGATTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATCGATGATAAAAT
386 TTTTCAATTTATAATCATTTATAAGATTATAAA-GAATTATATATCATAATATTGATGATAAAAT
* * **
269278 ATTATTAAAATTTT
450 GTTATCAAAATGAT
*** * * *
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1 AATTATTCATTGATAAATCA-TTTCAAGCTTTCAGAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTTCT
* * * * * *
269356 T-TCATTGGATAGCATCCACCTCAAGTTTCCCAAAGTAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAATC
65 TGTCAATGGATAGCATCCACTTCAAGTTTTCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACC
* * * * ** * *
269420 ATGAATAACAAAGTTTTTTATTTATTTTTTATTTATAACCATTTATAAGATTATAAATGAATTAT
130 AAGAACAATAAAGCTTTCAATTTATTTTTGATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTAT
* * *
269485 ATATCATAAT-TTGGACGATAAAATGTTATCAAAATGATAATCATTCATTGATAAATCATTTCTA
195 ATATCATAATATT-GATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAA
* * * * * * * * *
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259 GCTTTTGAAGACATGATAAACTTAAA-ATGCTCTTTCCTTGTCAATGGAGAGCATCCACTTCACA
* * ** * * * *
269611 GTTGTCCAATACAAACATCCAATTATGATAAATTCTAATCAAGAACAA-AGAAGCTTTTGTTTTA
323 CTT-TCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAAGAACAACA-AAGCTTTCGATTTA
* * * * * * *
269675 TGTTCGATATGTAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTATATACCATAATATTGCTGTTAAAAT
386 TTTTCAATTTATAATCATTTATAAGATTATAAA-GAATTATATATCATAATATTGATGATAAAAT
269740 GTTATCAAAATGAT
450 GTTATCAAAATGAT
* * * * * * *
269754 AATTCTTTATTGACAAATAACTTCAAG-TACTCATAGGCATGATAAACTTAAAATGCTC-TTTCT
1 AATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCT-TTCAGAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTTC-
* * * * *
269817 TTGTCAATGGGTAACATCCACCTCACA----TCCCA---AAACAT-CTATTATGATAGGTTTTAA
64 TTGTCAATGGATAGCATCCACTTCA-AGTTTTCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAA
* * * *
269874 CCAATAACAACAAAGCTTTGAATTT-TTTATAT-ATATATATAATCATTTGTAAGATTATAAATG
128 CCAAGAACAATAAAGCTTTCAATTTATTT-T-TGAT-T-TATAATCATTTATAAGATTATAAATG
** ** * *
269937 AATTATATATTGTAGGATTGATGATAAAATGTTATTAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCAC
189 AATTATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCAT
* * * * *
270002 TTCAAGCTTTCGAATG-CATCATAAATTTAAAATGCTCTTTTCTTGTCAATGGATAGCATCCA-T
254 TTCAAGCTTTTGAA-GACATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGAGAGCATCCACT
* * * *
270065 T-ACACGTTTTCGAATGCAAACATCCAATTATGATAAGTTTTAACTAA-AAGCAACAAAACTTTC
318 TCACAC--TTTCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAAGAA-CAACAAAGCTTTC
* ** * * * ** * * * *
270128 AATTTATTTTTGATATATATTCTTTTCCAAGATTGTAAATGAATTATATATCATAGTATTAATGT
380 GATTTATTTTCAATTTATAATCATTTATAAGATTATAAA-GAATTATATATCATAATATTGATGA
270193 TAAAATGTTATCAAAATGAT
444 TAAAATGTTATCAAAATGAT
* * * *
270213 AATTGTTCATTGATAAATAATTTCAAGC-TTCTATAGGCGA-GATAAACTTAAAATG-TTTTTTC
1 AATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTC-AGAGGC-ATGATAAACTTAAAATGCTCTTTT-
* * * * * * * ***
270275 CTTATCAATGGATAGAATCCACTTCACG-TTTCATAATGTAAACATCCGATTATGATTGGCCATA
63 CTTGTCAATGGATAGCATCCACTTCAAGTTTTC-CAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTA
*** * * * *
270339 ATTGAGAACAGTAAAGCTTTCGACTTATTTTTGATTTATAATGATTTATAAGATTATAAATGTAA
127 ACCAAGAACAATAAAGCTTTCAATTTATTTTTGATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATG-AA
* * * * * *
270404 -TATAT-T-ATAACATTGATGAGAAAAGGTTATCAAAATGATAATTATTCTTTGACAAATTATTT
191 TTATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTT
* * ** * * * *
270466 CAAGCTTTTAAAGGA-AAGATAAACTTAAAATGCTCTTTTTTTTTCATTGGATAGCA-CTCATTT
256 CAAGCTTTTGAA-GACATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGAGAGCATC-CACTT
*** * * * * *
270529 CATGTTTTCGAAAGCAAACATCCAATTATGATAGTTTTTAACCTAGAAC-A-ATAG---T-G---
319 CACACTTTCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAAGAACAACAAAGCTTTCGATT
* ** * * * *
270585 -ATTTT-GATTGGTAAACATTTATAATG-TTGTAAATGAA-T-TATATCATACTATTGATAATAA
384 TATTTTCAATTTATAATCATTTATAA-GATTATAAA-GAATTATATATCATAATATTGATGATAA
270645 AATGTTATCAAAATGAT
447 AATGTTATCAAAATGAT
* * * * * * *
270662 AATTATACATTGATATATCA-TTCAAGCTTTCAAAGGCATCAGAAACTTTAAATGCTCTTTCCTT
1 AATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTCAGAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTTCTT
* * * *** * * **
270726 GTCAATGAATAGCATCCA-TCTCATG-TTTCCAATGCAAGCATCGGCTTATGATAGGCTTTGATT
66 GTCAATGGATAGCATCCACT-TCAAGTTTTCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACC
* * * * * * * * *
270789 GAGAACAAGAAAGCTTCCAACTTATTGTCGA-TTATAATGATTTATTAGATTGTAAATGAATTAT
130 AAGAACAATAAAGCTTTCAATTTATTTTTGATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTAT
* * * *
270853 ATATCATAGTATTAATGA-AAAAGTGTTAGT-AAAATAATAATTTTTCATTGATAAATCATTTCA
195 ATATCATAATATTGATGATAAAA-TGTTA-TCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCA
*** * * * *
270916 AGCTTACAAAGACATGATAAACTCAAAAAGC-CTTTTCCTT-CCAATGGATAGCA-CCGACTTCA
258 AGCTTTTGAAGACATGATAAACTTAAAATGCTC-TTTCCTTGTCAATGGAGAGCATCC-ACTTCA
* * * *
270978 CA-TTTCCCAATGCAAACATCAAATTATGATACGTTTAAACCAAGAGCAACAAAG----C-----
321 CACTTT-CCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAAGAACAACAAAGCTTTCGATTT
271033 --TTTCAATTTATAATC-TTTGATAAGATTATAAATGAATTATAT-T-ATAATATTGATGATAAA
385 ATTTTCAATTTATAATCATTT-ATAAGATTATAAA-GAATTATATATCATAATATTGATGATAAA
271093 ATGTTATCAAACA--AT
448 ATGTTATCAAA-ATGAT
* *
271108 AATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTGTGA-AGGCATGATAAACTTAAAATTCT-TTTTCC
1 AATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTT-TCAGAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTT-C
* *** * * ** * *
271171 TTGCCAACAAATAGCATCCACTTCACA-TTTTCCATTGTAAACATCTTATTATGATAAGCTTTAA
64 TTGTCAATGGATAGCATCCACTTCA-AGTTTTCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAA
* * ** * ** * * *
271235 CTACGAACAATAAAG-TGTTTGACTTATTTTCT-ATTTCCAATGATTTATAAGATTATAATTCAA
128 CCAAGAACAATAAAGCT-TTCAATTTATTTT-TGATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAA
* * * * *
271298 TTATATATCATAATATTGATGATAAAGTCTTATTAAAATTATAATTATTCATTTG-GAAATCATT
191 TTATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCA-TTGATAAATCA-T
* ** * * * * * *
271362 TTTAA-C-TTTGAAAGGTATGATAAACTTAAAACGCT-TGTTTC-TATCACTAGATAGCATCCAC
254 TTCAAGCTTTTG-AAGACATGATAAACTTAAAATGCTCT-TTCCTTGTCAATGGAGAGCATCCAC
* * * * * * * * *
271423 TTCA-AGTTTCCCAAAGCAAACAT-TAGTTATAATTGGTTTTAACCATGAACAACAAAGTTTTCA
317 TTCACACTTT-CCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAAGAACAACAAAGCTTTCG
* * *
271486 ATTTATTTTCAATTTATAGTCATTTGTAAGATTAGAAATGAATTATATATCATAAT-TTGGATGA
381 ATTTATTTTCAATTTATAATCATTTATAAGATTATAAA-GAATTATATATCATAATATT-GATGA
271550 TAAAATGTTATCAAAATGAT
444 TAAAATGTTATCAAAATGAT
* * * * * * * *
271570 AATTACTAACATTTATAAGATTATAACTGAA-TTATATCAAAAGTTTG-ATGATAAAATATTATC
1 AATTA-T-TCATTGATAA-ATCAT--TTCAAGCT-T-TC-AGAG---GCATGAT--AA-ACT-T-
* * * * * * ** * ** * *
271633 AAAATGATAATTATTCAT-T-AAT--A-A--ATCC-TTTCGAGCTTTGAAAAGC-ATGATACACT
50 AAAATGCT-CTT-TTCTTGTCAATGGATAGCATCCACTTCAAGTTTTCCAATGCAAACATCCAAT
** ** * * * ** * ** * ** ** *
271689 TAAAAT-GCCCTTT--CCATG-TCAATAGATGGAGTCCGCTTCATGTTTCCCATCGCAAACATCC
113 TATGATAG-GTTTTAACCAAGAACAATA-A-AGCTTTCAATTTAT-TTT-TGAT-TTATA-AT-C
* * * * * ** * *
271750 AATTGTGATGA-ATTTTAACCAAGAACAACTTAACTTTTGAT-TTGTTTTTGATTTATAATAAT-
170 -ATT-T-ATAAGATTATAA--ATG---AA-TT-A--TAT-ATCATAATATTGA-TGATAA-AATG
* * * * * ** ** **
271812 TTAT-AAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATCAATGACAAAATGTTATCCA-A-ATGATA
220 TTATCAAAATGAT-AAT-TATT-CAT-TGATAA-ATC-ATTTCAAGCT-TT-TGAAGACATGATA
* * * * ** *
271874 ATTGTTCGGTGATAAATCATTCCAAGCTTTCCTAGGCATGATAAACTTAAAATGC-TCTTTC-CT
277 A----AC--T--TAAA--A-TGC--TCTTTCCT-----TG-TCAA-TGGAGA-GCATC---CACT
* * *
271937 TGC-CAGTTGGTAGCATCCACTTCACATCTCCCAACACAAACACCCAATTATGATAGGTTTTAAC
318 T-CACA-CT--T----T---C--CA-A--T------GCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAAC
* * * * * *
272001 TAAAAACCATAAAGCTTTC-A---A-TTT--A---A-AATCTTTTATAAGATTATAAATAAATTA
361 CAAGAACAACAAAGCTTTCGATTTATTTTCAATTTATAATCATTTATAAGATTATAAA-GAATTA
* * * * *
272055 TATATCATGATATTAATGTTAAAATGTTATGAAAATCAT
425 TATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGAT
* * * *
272094 AATTGTTCATTGATAAAACATTTCAAGCTTTCGGAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTT
1 AATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTCAGAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTTCTT
* * * *
272159 ATCAATTGATAGCATCCGCTT-AATGTTTTCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTCAACC
66 GTCAATGGATAGCATCCACTTCAA-GTTTTCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACC
* * ** * * * *
272223 AAGAACAACAAAGCTTTCAATTTAGTTGAGATTTAAAATCTTTTATAAAATTATAAATAAATTAT
130 AAGAACAATAAAGCTTTCAATTTATTTTTGATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTAT
* * * *
272288 ATATCATAATATTGTTGTTAAAATGTTATCAAAATGATAATTGTTCATTGATAAAACATTTCAAG
195 ATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAG
** * * *
272353 CTTTTGGTGACATAATAAACTTATAATGCTCTTTCCTTGTCAATTGAGAGCATCCACTTCACACT
260 CTTTTGAAGACATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGAGAGCATCCACTTCACACT
* * * * *
272418 TTCTAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAATCACGAACGACAAAGCTTTCTATTTATTTT
325 TTCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAAGAACAACAAAGCTTTCGATTTATTTT
* * *
272483 CAATTTATAATCTTTTATAAGATTATAAAGAAGTTATATATCATAATATTGATGTTAAAAGGTTA
390 CAATTTATAATCATTTATAAGATTATAAAGAA-TTATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTA
272548 TCAAAATGAT
454 TCAAAATGAT
* * * * *
272558 AATTCTTCATTGATTAAAT-GTTTCAAGCTTTCAGAGGCGTGATAAACGTAAAATGCTCTTTCCT
1 AATTATTCATTGA-TAAATCATTTCAAGCTTTCAGAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTTCT
** * * **
272622 TGTCAATTAATAGCATCCACTTCAAGTTTTTCAATGCAAACATTCAATTATGATAGGTTTTAATT
65 TGTCAATGGATAGCATCCACTTCAAGTTTTCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACC
** * * * * *
272687 TGGAACAATAAAGCTTTTACTTTATTTTCT-ACTTATAATAATTTATGAGATTATAAATGAATTA
130 AAGAACAATAAAGCTTTCAATTTATTTT-TGATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTA
* * *
272751 TATATAATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAGTGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCGA
194 TATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAA
* * * * * * * * ** *
272816 GCTTTTCAACACATGATAAACATAAAATGTTCTTTCTTTATCGATAGACG-GCATTGACTTCACG
259 GCTTTTGAAGACATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGA-GAGCATCCACTTCACA
* * * * * *
272880 CTCT-CAATGCGAACATCAAATTATGATGGGTTTTAACAAAGAACAACAAAGCTTTCGATTTGTT
323 CTTTCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAAGAACAACAAAGCTTTCGATTTATT
* * * * * *
272944 TAT-GATTGATAATCATTTATAAGATTTTAAATGAA-TATATATCATTATATTGATGACAAATTG
388 T-TCAATTTATAATCATTTATAAGATTATAAA-GAATTATATATCATAATATTGATGATAAAATG
* *
273007 TTATCAAAGTTAT
451 TTATCAAAATGAT
* * * * *
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1 AATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTCAG-AGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTTCT
* * * * * * ** *
273084 TGTCAATAGATTGTATCCACTTCATG-TTTCTTAATGTAGTCATCCAATTACGATAGGTTTTAAC
65 TGTCAATGGATAGCATCCACTTCAAGTTTTC-CAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAAC
* * * * *
273148 CAAGAACAATAAAGCTTGT-AATTTATTTTTTATTTGTAATTATTTATAATAATATAAATGAATT
129 CAAGAACAATAAAGCTT-TCAATTTATTTTTGATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATT
* *
273212 ATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATTAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCTTTTCA
193 ATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCA
* * * *
273277 AG-TTTTCGAAGGCATGAAAAACTTAAAATAAC-CTTTCCTTGTCAATGGATAGCATCCA-TTGC
258 AGCTTTT-GAAGACATGATAAACTTAAAAT-GCTCTTTCCTTGTCAATGGAGAGCATCCACTT-C
** * * * * * ** * **
273339 A-TGTTTCCCTATGCAAACATCAAACTGTGATAAGTTTTAATGAAGAACAACAAAGCTTTCAACG
320 ACACTTT-CCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAAGAACAACAAAGCTTTCGATT
** * * *
273403 TATAGTCAATCTATAATCATTTATAAGATTATAGATGAATTATAGATCATAATATTGATGATAAA
384 TATTTTCAATTTATAATCATTTATAAGATTATA-AAGAATTATATATCATAATATTGATGATAAA
*
273468 AT-TTGATCAAATTGAT
448 ATGTT-ATCAAAATGAT
* * * * * * * * *
273484 AATTATTCATTGATGAGTCATTTGAATCTTTCAAAAAGAATGATACACTTAAAATGC-CATTTTT
1 AATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTC-AGAGGCATGATAAACTTAAAATGCTC-TTTTC
* * *
273548 TTGTCAATGGATAGCATCCAC-T-AGATTTTTCACAATGCAAACATCTAATTATGATAGGTTTTC
64 TTGTCAATGGATAGCATCCACTTCA-AGTTTTC-CAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTA
* * *
273611 ACCAAAAACAATCAAGCTTTTC-A---A--TTTG-----TAA-CATTTATAAGATCATAAATGAA
127 ACCAAGAACAATAAAGC-TTTCAATTTATTTTTGATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAA
* * *
273664 -T-TATATCATAACT-TTGATGAGAAAATGTTAT-AAAATGATAATCATTCATTGATAAATCCTT
191 TTATATATCATAA-TATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATT
* * * * *
273725 TCAAGC-TTTCAAAAGCATGATAAACTTAAAATGGC-CTTTCCATGTCAATGGATAGAATCCACT
255 TCAAGCTTTTGAAGA-CATGATAAACTTAAAAT-GCTCTTTCCTTGTCAATGGAGAGCATCCACT
* ** * * * *
273788 TTA-TGTTTCCCATCTCAAACATCCAATTATAATAGGTTTTAACC-AG--GAAC-AA-C-TT--A
318 TCACACTTTCCAAT-GCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAAGAACAACAAAGCTTTCGA
** * *
273844 ---GCTTTCAATTTATAATTATTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATT
382 TTTATTTTCAATTTATAATCATTTATAAGATTATAAA-GAATTATATATCATAATATTGATGATA
*
273906 ACATGTTATCAAAATGAT
446 AAATGTTATCAAAATGAT
** * * * * * *
273924 AATTATTTGTTGATAAATCATTCCAAGCTTTCAGAGACATGATAAATTTAAAATACTTTTTTCAT
1 AATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTCAGAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTTCTT
* * * * *
273989 GTCAATGAATAGCATCCATTTCACGTTTCCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACTA
66 GTCAATGGATAGCATCCACTTCAAGTTTTCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACCA
* ** * *
274054 AGAACAACAAAGCTTTTGATTTATTGTTGATTTATAATC-TTTGATAAAATTATAAATGAATTAT
131 AGAACAATAAAGCTTTCAATTTATTTTTGATTTATAATCATTT-ATAAGATTATAAATGAATTAT
* * * * * * *
274118 ACATCATCATATCGATGGTAAAATGTGATTAAGATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAG
195 ATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAG
* *
274183 -TTTTCGAAAGA-ATGATAAACTTAAAATACTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCATCCAC-T-ACA
260 CTTTT-G-AAGACATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGAGAGCATCCACTTCACA
* * * * * *
274244 TCTTTCCCAATGCAAACTTCCAATAATGAAAAGTTCTAACCAAGAATAACAAAGCTTTCGATTTA
323 -CTTT-CCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAAGAACAACAAAGCTTTCGATTTA
* * ** * * * *
274309 TTTTC-TTTTAAAATC-TTTAGGAGATTTTAAATAAATTATATATAACAATATTGATG-TGAAAA
386 TTTTCAATTTATAATCATTTATAAGATTATAAA-GAATTATATATCATAATATTGATGAT-AAAA
*
274371 TGTTATCAAAATGAA
449 TGTTATCAAAATGAT
* * * * * * *
274386 AATTGTTCACTGATAAAACATTTCAA-CATTTCAAAAGTATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCT
1 AATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGC-TTTCAGAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTTCT
* * * * * * *
274450 TATTAATTGATCA-CATCCACTTCACGTTGTCCAATGCAAATATCCAATTGTGATAGGTTTTAAC
65 TGTCAATGGAT-AGCATCCACTTCAAGTTTTCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAAC
* * ** *
274514 CAAGAACAATAAAGC-TTCTGATTTATTTTTG-GTTATAACTTTTTTATAAGATTATAAATAAAT
129 CAAGAACAATAAAGCTTTC-AATTTATTTTTGATTTATAA-TCATTTATAAGATTATAAATGAAT
* * * * *
274577 TATATATCATAATATTGATGTTAAAATGTTATCAAAATAATAATTGTTTATTGATTAAA-AATTT
192 TATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGA-TAAATCATTT
*
274641 CAAGCTTTCAGAAGA-ATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCC-T-TC-AT-----G--T----TT-
256 CAAGCTTT-TGAAGACATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGAGAGCATCCACTTC
* * * **
274690 ---C--T-CAATGCAAACATCTAATTATGATAAGG-TTTAACCAGGAACAAGAAAGCTTTCCCTT
320 ACACTTTCCAATGCAAACATCCAATTATGAT-AGGTTTTAACCAAGAACAACAAAGCTTTCGATT
* * * * *
274748 TATTTTCGATTTATAATCATTTATGAGACTATAAACAAATTATATATCATAATATCGATGATAAA
384 TATTTTCAATTTATAATCATTTATAAGATTATAAA-GAATTATATATCATAATATTGATGATAAA
* *
274813 ATGTTATCAAAGTAAT
448 ATGTTATCAAAATGAT
* * * *
274829 AATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTCAAAAGCATGATAAACGTAAAATGTTCTTTTCTT
1 AATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTCAGAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTTCTT
* * * * * ** * * *
274894 GTTAATGGACAGCATCAACTTCATGTTTCCCAATGTGAACAACAAATTATGATA-GTGTTTAATC
66 GTCAATGGATAGCATCCACTTCAAGTTTTCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGT-TTTAACC
* * * * *
274958 AAGAACAATAAAGCTTTCGATTTATTTTTGATTTATAAGCATTTATAACATTCTAACTGAATTAT
130 AAGAACAATAAAGCTTTCAATTTATTTTTGATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTAT
* * * *
275023 ATATCATAATATTGATGATAAATTGTTATCAAAATTATAATTATTTATTGATATATCATTTCAAG
195 ATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAG
* * * ** **
275088 CCTTCGAAGACATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCATTGGATTGCATCCACTTCA-TGT
260 CTTTTGAAGACATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGAGAGCATCCACTTCACACT
* * * * * * * * *
275152 TTACTAATGCAATCATCCAATTATGGTAAGTTTTGACCAAGAATAATAAAGCTTTCAAATTATTT
325 TT-CCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAAGAACAACAAAGCTTTCGATTTATTT
** * * * **
275217 TTGATTTGTAATTATTTATAAGATTTTAAATGAATTATATATCATAATATCAATGATAAAATGTT
389 TCAATTTATAATCATTTATAAGATTATAAA-GAATTATATATCATAATATTGATGATAAAATGTT
* *
275282 ATCAAAGTTAT
453 ATCAAAATGAT
* * *
275293 AATTATTCATTGGTAAATCATTTCAAGCTTTC-GAAGGCATGA-AAACCTTAACATGCCCTTTTC
1 AATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTCAG-AGGCATGATAAA-CTTAAAATGCTCTTTTC
* * * * * ** * *
275356 TTGTTAGTGGTTACCATCCACTTCACA-TTTTCTAATGCAAACATCTGATTATCACAGGTTTTAA
64 TTGTCAATGGATAGCATCCACTTCA-AGTTTTCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAA
* * * * * * *
275420 CAAAGAACAACAACGCCTTCGATTTATTGTCGATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATT
128 CCAAGAACAATAAAGCTTTCAATTTATTTTTGATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATT
* * * * ** * * * *
275485 ATACATCATCATATTAATGATAAAATATGGTCCAACTGATAATTATTCATTGATAAATGATTTGA
193 ATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCA
* * * * * * *
275550 AGGTTTCGAGGGCATGATAAACTT-AAATGCTCTTTTCTTGTCGATGGATAGCATCCA-TTGCAC
258 AGCTTTTGAAGACATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGAGAGCATCCACTT-CAC
***
275613 A-TTTCCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAGGGAAGAACAA-AAATGCTTTCGATTT
322 ACTTT-CCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAAGAACAACAAA-GCTTTCGATTT
** * * *
275676 ATTTTTTATTTATAATCATTTATAAGGGTCATAAATGAATTATACATCATAATATTGATGATAAA
385 ATTTTCAATTTATAATCATTTATAA-GATTATAAA-GAATTATATATCATAATATTGATGATAAA
* *
275741 GT-TTGATCAAAATGAC
448 ATGTT-ATCAAAATGAT
* * * * *
275757 AATTATTCTTTGATAAATCATTTCAAGCTTTC-GAAGTCATGATAAACATAAAATGTTCATTTTT
1 AATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTCAG-AGGCATGATAAACTTAAAATGCTC-TTTTC
* * * * * *
275821 TTGGTTAATCGATAGCATCCACTGCATG-TTTGCAATGCAAATATCCAATTATGATAGGTTTTAA
64 TT-GTCAATGGATAGCATCCACTTCAAGTTTTCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAA
* * *
275885 CTAAGAACAACAAAACTTT
128 CCAAGAACAATAAAGCTTT
275904 TGATTTATAA
Statistics
Matches: 5859, Mismatches: 1226, Indels: 850
0.74 0.15 0.11
Matches are distributed among these distances:
438 3 0.00
439 83 0.01
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479 2 0.00
480 2 0.00
481 2 0.00
482 1 0.00
483 7 0.00
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Consensus pattern (463 bp):
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GTCAATGGATAGCATCCACTTCAAGTTTTCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACCA
AGAACAATAAAGCTTTCAATTTATTTTTGATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTATA
TATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGC
TTTTGAAGACATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGAGAGCATCCACTTCACACTT
TCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAAGAACAACAAAGCTTTCGATTTATTTTC
AATTTATAATCATTTATAAGATTATAAAGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATC
AAAATGAT
Found at i:273196 original size:694 final size:694
Alignment explanation
Indices: 267931--275903 Score: 4852
Period size: 694 Copynumber: 11.5 Consensus size: 694
267921 TTTAACTGAC
* * * * *
267931 AATTATTCATTGATAAATCATTTGAAG-TTTTCG-AATGCATCATAAATTTAAAATGCTCTTTCC
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* * *** * * * * * * *
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* * * * * * * * *
268059 CAAGAACAATAAAGCTTTCAATTTATTTTTGATATATGATC-TTTACAATACTATAAATGAATTA
130 AAAGAACAACAAAGCTTTCGATTTATTTATGATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTA
* * * * * ** *
268123 TATATCGTAATATTTATGTTAAAATGTCATCAAGATGATAATCGTTCATTGATAAATAATTTCAA
195 TATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAA
* * * * * *
268188 GCTTTCGTAGGCATGATAAACTTAAAATGCCCTTTCCCTGTCAATGGATAGCATGCACTTCACAT
260 GCTTTCGAAAGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATAGATAGCATCCACTT--CAT
* * * * * * * * * * * *
268253 -TTTTCAATGTAAACATCTAATTATGATAAGCTTTAATCGAGAACAAAAAAGGTTTTGACTTATT
323 GTTTCCAATGCAATCATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAAGAACAATAAA-GCTTTAATTTATT
* * *
268317 TTTGATTTATAATGATTTATAAGATTATAAATGTAA-TATAT-T-ATAATATTGATGAGAAAATG
387 TTTTATTTATAATTATTTATAAGATTATAAATG-AATTATATATCATAATATTGATGATAAAATG
* * * * * *
268379 TTATCAAAGTGATAATTAATT-TTTGATTAATTATTTCAAGCTTT-TGAGGCACGATAAACTTAA
451 TTATCAAAATGATAATT-ATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTCAGAGGCATGATAAACTTAA
** * ** * * * * * * *
268442 AATGC-AGTTCTTTGTCTCTGGATAACATCCACATCATGTTTCCTAATGTAAATATCCAATTATG
515 AATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCATCCACTTCA-ATTTCCCAATGCAAACATCTAATTATG
* * * * * *
268506 ATAGTTTTTAACCCAA-AATAACAATGC--TT--TTGA--TT-G--GTA-AA-CATTTATAATG-
579 ATAGGTTTTAA-CTAAGAACAACAAAGCTTTTACTTTATTTTCGATTTATAATCATTTATAA-GA
* * * *
268558 TTATAAATGAA-T-CATATCATAATATTCATGACAAAATGTTATCAAAATGAT
642 TTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAGTGAT
* * * * * *
268609 AGTTATACATTGATAAATCATTTCAAGC-TTTC-TAAGGCA-GAAGAAACTTAAAATGTTCTTTC
1 AATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTTCGAAAAGCATG-ATAAACTTAAAATGCTCTTTC
* * * * ** * * * *
268671 CTTCTCAATGGATAGCATCCACTTCACGCTTTCCTAA-GCAAGCATCTGACTGTGATAGGCTTTG
65 TTTGTCAATGGATAGCATCCACTTCACG--TTCCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTA
* ** * * * * *
268735 ACCAAGAACAACAAAGCTTTTAACTTATTT-TCAATTTGTAATGATTTATTAGATTATAAATGAA
128 ACAAAGAACAACAAAGCTTTCGATTTATTTAT-GATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAA
* ** * *
268799 TTATATATTATAATATTGATGATAAGGTGTAATTAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTT
192 TTATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTT
* ** ** * * * *
268864 CAAGCTTAC-AAAGACAAAATAAACTTAAAAACCTCTTTCCTTTTCAATGGATAACATCAACTTT
257 CAAGCTTTCGAAAG-CATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATAGATAGCATCCAC-TT
* * *
268928 ACAT-TTTCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGAG-TTAAACCAAGAA-AAGCAAAGC--T--T
320 -CATGTTTCCAATGCAATCATCCAATTATGATAG-GTTTTAACCAAGAACAA-TAAAGCTTTAAT
* * * * *
268986 TCA------ATTTATACTTCTTGATAAGATTATAAATGAA-TA-ATATCATAATATTGATGACAA
382 TTATTTTTTATTTATAATTATTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAA
* * *
269043 AATGTTGTCAAAACGATAATTATTAATTGATAAATCATTTCAAGCTTTTCA-AGGCATGATAAAC
447 AATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGC-TTTCAGAGGCATGATAAAC
* * * * * * * * * * *
269107 TTAAAATACTCTTTTCGTGTC-ATCAGATAGTATCCACTTCACGTTTCCCATTGTAAGCACCCAA
511 TTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAAT-GGATAGCATCCACTTCA-ATTTCCCAATGCAAACATCTAA
* * * * * * * *
269171 TTATGATAAGCTTTAACCAAGAACAATAAAGCTTTCGAC-TTATTTTTGAGTTATAATGATTTAT
574 TTATGATAGGTTTTAACTAAGAACAACAAAGCTTT-TACTTTATTTTCGATTTATAATCATTTAT
* * * * **
269235 AAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATCGATGATAAAATATTATTAAAATTTT
638 AAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAGTGAT
*** * *
269292 AATTATTCATTGAGGGATCACTTTTAA-C-TTTC-AAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTC
1 AATTATTCATTGATAAATCA-TTTCAAGCTTTTCGAAAAGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTC
* * * * * *
269354 CTT-TCATTGGATAGCATCCACCTCAAGTTTCCCAAAGTAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAA
65 TTTGTCAATGGATAGCATCCACTTCACG-TTCCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAA
* * * ** * * *
269418 TC-ATGAATAACAAAGTTTTTTATTTATTTTTTATTTATAACCATTTATAAGATTATAAATGAAT
129 -CAAAGAACAACAAAGCTTTCGATTTATTTATGATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAAT
* *
269482 TATATATCATAAT-TTGGACGATAAAATGTTATCAAAATGATAATCATTCATTGATAAATCATTT
193 TATATATCATAATATT-GATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTT
* * ** * * * * * *
269546 CTAGGTTTTTAAGGCATGAAAAACTTAAACA--ATCTTTCCTTATCAATGGATAGCCTCCACTTC
257 CAAGCTTTCGAAAGCATGATAAACTTAAA-ATGCTCTTTCCTTGTCAATAGATAGCATCCACTTC
* * ** * * **
269609 ATGTTGTCCAATACAAACATCCAATTATGATAAATTCTAATCAAGAACAA-AGAAGCTTTTGTTT
321 ATGTT-TCCAATGCAATCATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAAGAACAATA-AAGC-TTTAATT
* ** * * * * * *
269673 TATGTTCGATATGTAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTATATACCATAATATTGCTGTTAAA
383 TATTTTTTATTTATAATTATTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAA
* * * * * * *
269738 ATGTTATCAAAATGATAATTCTTTATTGACAAATAACTTCAAG-TACTCATAGGCATGATAAACT
448 ATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCT-TTCAGAGGCATGATAAACT
* * * *
269802 TAAAATGCTCTTTCTTTGTCAATGGGTAACATCCACCTCACA--TCCC-A---AAACATCT-ATT
512 TAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCATCCACTTCA-ATTTCCCAATGCAAACATCTAATT
* * * * ** *
269860 ATGATAGGTTTTAACCAATAACAACAAAGCTTTGAATTT-TTTATATATATATATAATCATTTGT
576 ATGATAGGTTTTAACTAAGAACAACAAAGCTTTTACTTTATTT-TCGAT-T-TATAATCATTTAT
** ** * *
269924 AAGATTATAAATGAATTATATATTGTAGGATTGATGATAAAATGTTATTAAAATGAT
638 AAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAGTGAT
* * * *
269981 AATTATTCATTGATAAATCACTTCAAGC-TTTCG-AATGCATCATAAATTTAAAATGCTCTTT-T
1 AATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTTCGAAAAGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCT
* * *
270043 CTTGTCAATGGATAGCATCCA-TTACACGTTTTCGAATGCAAACATCCAATTATGATAAGTTTTA
66 -TTGTCAATGGATAGCATCCACTT-CACG-TTCCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTA
* * * * * * * ** *
270107 ACTAAA-AGCAACAAAACTTTCAATTTATTTTTGATATATATTCTTTTCCAAGATTGTAAATGAA
128 AC-AAAGAACAACAAAGCTTTCGATTTATTTATGATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAA
* * * * *
270171 TTATATATCATAGTATTAATGTTAAAATGTTATCAAAATGATAATTGTTCATTGATAAATAATTT
192 TTATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTT
* * * * * * *
270236 CAAGC-TTCTATAGGCGA-GATAAACTTAAAATGTTTTTTCCTTATCAATGGATAGAATCCACTT
257 CAAGCTTTCGA-AAGC-ATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATAGATAGCATCCACTT
* * * * * * *** *** * * *
270299 CACGTTTCATAATGTAAACATCCGATTATGATTGGCCATAATTGAGAACAGTAAAGCTTTCGACT
320 CATGTTTC-CAATGCAATCATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAAGAACAATAAAGCTTT-AATT
* * * *
270364 TATTTTTGATTTATAATGATTTATAAGATTATAAATGTAA-TATAT-T-ATAACATTGATGAGAA
383 TATTTTTTATTTATAATTATTTATAAGATTATAAATG-AATTATATATCATAATATTGATGATAA
* * * * * * * *
270426 AAGGTTATCAAAATGATAATTATTCTTTGACAAATTATTTCAAGCTTTTAAAGGAAAGATAAACT
447 AATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTCAGAGGCATGATAAACT
** * * * * * * * *
270491 TAAAATGCTCTTTTTTTTTCATTGGATAGCA-CTCATTTCATGTTTTCGAAAGCAAACATCCAAT
512 TAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCATC-CACTTCA-ATTTCCCAATGCAAACATCTAAT
* * * ** *
270555 TATGATAGTTTTTAACCT-AG---AAC-AA-----TA-GTGATTTT-GATTGGTAAACATTTATA
575 TATGATAGGTTTTAA-CTAAGAACAACAAAGCTTTTACTTTATTTTCGATTTATAATCATTTATA
* * * *
270608 ATG-TTGTAAATGAA-T-TATATCATACTATTGATAATAAAATGTTATCAAAATGAT
639 A-GATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAGTGAT
* * * * * * *
270662 AATTATACATTGATATATCA-TTCAAGC-TTTC-AAAGGCATCAGAAACTTTAAATGCTCTTTCC
1 AATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTTCGAAAAGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCT
* * * * *** * * *
270724 TTGTCAATGAATAGCATCCA-TCTCATGTTTCCAATGCAAGCATCGGCTTATGATAGGCTTTGAT
66 TTGTCAATGGATAGCATCCACT-TCACGTTCCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAAC
** * * * * * * * *
270788 TGAGAACAAGAAAGCTTCCAACTTATTGT-CGA-TTATAATGATTTATTAGATTGTAAATGAATT
130 AAAGAACAACAAAGCTTTCGATTTATT-TATGATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATT
* * * *
270851 ATATATCATAGTATTAATGA-AAAAGTGTTAGT-AAAATAATAATTTTTCATTGATAAATCATTT
194 ATATATCATAATATTGATGATAAAA-TGTTA-TCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTT
* * * * *
270914 CAAGCTTAC-AAAGACATGATAAACTCAAAAAGC-CTTTTCCTT-CCAATGGATAGCA-CCGACT
257 CAAGCTTTCGAAAG-CATGATAAACTTAAAATGCTC-TTTCCTTGTCAATAGATAGCATCC-ACT
** * * * * * *
270975 TCACATTTCCCAATGCAAACATCAAATTATGATACGTTTAAACCAAGAGCAACAAAGCTTTCAAT
319 TCATGTTT-CCAATGCAATCATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAAGAACAATAAAGCTTT-AAT
* *
271040 TTA-----TA---AT--CT-TTGATAAGATTATAAATGAATTATAT-T-ATAATATTGATGATAA
382 TTATTTTTTATTTATAATTATTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAA
*
271092 AATGTTATCAAACA--ATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTGTGA-AGGCATGATAAA
447 AATGTTATCAAA-ATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTT-TCAGAGGCATGATAAA
* * * *** * * * *
271154 CTTAAAATTCTTTTTCCTTGCCAACAAATAGCATCCACTTCACATTTTCCATTGTAAACATCTTA
510 CTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCATCCACTTCA-ATTTCCCAATGCAAACATCTAA
* * * * * ** *
271219 TTATGATAAGCTTTAACTACGAACAATAAAG-TGTTTGAC-TTATTTTCTATTTCCAATGATTTA
574 TTATGATAGGTTTTAACTAAGAACAACAAAGCT-TTT-ACTTTATTTTCGATTTATAATCATTTA
* * * * * * *
271282 TAAGATTATAATTCAATTATATATCATAATATTGATGATAAAGTCTTATTAAAATTAT
637 TAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAGTGAT
* * * * *
271340 AATTATTCATTTG-GAAATCATTTTTAA-C-TTT-GAAAGGTATGATAAACTTAAAACGCT-TGT
1 AATTATTCA-TTGATAAATCA-TTTCAAGCTTTTCGAAAAGCATGATAAACTTAAAATGCTCT-T
* * * * * * * * * *
271400 T-TCTATCACTAGATAGCATCCACTTCAAGTTTCCCAAAGCAAACAT-TAGTTATAATTGGTTTT
63 TCTTTGTCAATGGATAGCATCCACTTCACG-TTCCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTT
* * * * * * * *
271463 AACCATGAACAACAAAGTTTTCAATTTATTT-TCAATTTATAGTCATTTGTAAGATTAGAAATGA
127 AACAAAGAACAACAAAGCTTTCGATTTATTTAT-GATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGA
* *
271527 ATTATATATCATAAT-TTGGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTACTAACATTTATAAGAT
191 ATTATATATCATAATATT-GATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTA-T-TCATTGATAA-AT
* * * * * * * * ** * *
271591 TATAACTGAA-TTATATCAAAAGTTTGATGATAAAATATTATCAAAATGATAATT--AT-TCATT
252 CAT--TTCAAGCT-T-TCGAAAG---CATGAT--AA-ACT-T-AAAATGCTCTTTCCTTGTCAAT
* * ** * * * * ** ** * *
271652 A-ATA-AATCC-TTTCGA-GCTTTGAAAAGC-ATGATACACTTAAAAT-GCCCTTT--CCATG-T
305 AGATAGCATCCACTTC-ATG-TTTCCAATGCAATCATCCAATTATGATAG-GTTTTAACCAAGAA
**** * ** ** * * * *
271708 CAATAGATGGAG-TCCGCTTCATGTTTCCCATCGCAAACATCCAATTGTGATGA-ATTTTAACCA
367 CAATA-A---AGCTTTAATTTAT-TTT-TTAT-TTATA-AT--TATT-T-ATAAGATTATAA--A
* * * ** * * * * *
271771 AGAACAACTTAACTTTTGAT-TTGTTTTTGATTTATAATAAT-TTAT-AAGATTATAAATGAATT
418 TG---AA-TT-A--TAT-ATCATAATATTGA-TGATAA-AATGTTATCAAAATGAT-AAT-TATT
* * ** * * **
271833 ATATATCATAATATCAATGACAAAATG-TTATCCAAATGATAATTGTTCGGTGATAAATCATTCC
471 -CAT-TGATAA-ATC-ATTTC--AA-GCTT-T-C--A-G---A--G-GC-ATGATAAA-C-TTAA
** ** * *
271897 AA-G--CTTTCCTAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGCCAGTTGGTAGCATCCACTT
515 AATGCTCTTTCCT-----TG-T---C----AATG--GATAGCAT-CCA-CT--T--CA---A--T
** * * * * *
271959 CACATCTCCCAACACAAACACCCAATTATGATAGGTTTTAACTAAAAACCATAAAGC-TTT-C--
554 ----T-TCCCAATGCAAACATCTAATTATGATAGGTTTTAACTAAGAACAACAAAGCTTTTACTT
* * * * * *
272020 -A------ATTTAAAATCTTTTATAAGATTATAAATAAATTATATATCATGATATTAATGTTAAA
614 TATTTTCGATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAA
* * *
272078 ATGTTATGAAAATCAT
679 ATGTTATCAAAGTGAT
* * * * *
272094 AATTGTTCATTGATAAAACATTTCAAGC-TTTCG-GAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCC
1 AATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTTCGAAAAGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCT
* * * * * * *
272157 TTATCAATTGATAGCATCCGCTTAATGTTTTCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTCAAC
66 TTGTCAATGGATAGCATCCACTTCACG-TTCCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAAC
* * * * * * *
272222 CAAGAACAACAAAGCTTTCAATTTAGTTGA-GATTTAAAATCTTTTATAAAATTATAAATAAATT
130 AAAGAACAACAAAGCTTTCGATTTA-TTTATGATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATT
* * * *
272286 ATATATCATAATATTGTTGTTAAAATGTTATCAAAATGATAATTGTTCATTGATAAAACATTTCA
194 ATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCA
* ** * * * *
272351 AGCTTTTG-GTGACATAATAAACTTATAATGCTCTTTCCTTGTCAATTGAGAGCATCCACTTCAC
259 AGCTTTCGAAAG-CATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATAGATAGCATCCACTTCA-
** * * * * * * *
272415 ACTTTCTAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAATCACGAACGACAAAGCTTTCTATTTAT
322 TGTTTCCAATGCAATCATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAAGAACAATAAAGCTTT-AATTTAT
** *
272480 TTTCAATTTATAATCT-TTTATAAGATTATAAA-GAAGTTATATATCATAATATTGATGTTAAAA
386 TTTTTATTTATAAT-TATTTATAAGATTATAAATGAA-TTATATATCATAATATTGATGATAAAA
* * * * *
272543 GGTTATCAAAATGATAATTCTTCATTGATTAAAT-GTTTCAAGCTTTCAGAGGCGTGATAAACGT
449 TGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGA-TAAATCATTTCAAGCTTTCAGAGGCATGATAAACTT
** **
272607 AAAATGCTCTTTCCTTGTCAATTAATAGCATCCACTTCAAGTTTTTCAATGCAAACAT-TCAATT
513 AAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCATCCACTTCAA-TTTCCCAATGCAAACATCT-AATT
* ** * * * * *
272671 ATGATAGGTTTTAATTTGGAACAATAAAGCTTTTACTTTATTTTCTACTTATAATAATTTATGAG
576 ATGATAGGTTTTAACTAAGAACAACAAAGCTTTTACTTTATTTTCGATTTATAATCATTTATAAG
*
272736 ATTATAAATGAATTATATATAATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAGTGAT
641 ATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAGTGAT
* * * *
272790 AATTATTCATTGATAAATCATTTCGAGCTTTTC-AACA-CATGATAAACATAAAATGTTCTTTCT
1 AATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTTCGAAAAGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCT
* * * ** ** * * * * *
272853 TTATCGATAGACGGCATTGACTTCACGCTCTCAATGCGAACATCAAATTATGATGGGTTTTAACA
66 TTGTCAATGGATAGCATCCACTTCACGTTCCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACA
* * *
272918 AAGAACAACAAAGCTTTCGATTTGTTTATGATTGATAATCATTTATAAGATTTTAAATGAA-TAT
131 AAGAACAACAAAGCTTTCGATTTATTTATGATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTAT
* * * * * * *
272982 ATATCATTATATTGATGACAAATTGTTATCAAAGTTATAATTATTCATTGATATATTATTTCAAG
196 ATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAG
* * *
273047 CTTTCGAAAGCATGATAAACTTAAAATGTTCTTTCCTTGTCAATAGATTGTATCCACTTCATGTT
261 CTTTCGAAAGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATAGATAGCATCCACTTCATGTT
* * * *
273112 TCTTAATGTAGTCATCCAATTACGATAGGTTTTAACCAAGAACAATAAAGCTTGTAATTTATTTT
326 TC-CAATGCAATCATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAAGAACAATAAAGCTT-TAATTTATTTT
* * *
273177 TTATTTGTAATTATTTATAATAATATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTA
389 TTATTTATAATTATTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTA
* * * *
273242 TTAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCTTTTCAAGTTTTC-GAAGGCATGAAAAACTTAAAAT
454 TCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTCAG-AGGCATGATAAACTTAAAAT
* * * * * *
273306 AAC-CTTTCCTTGTCAATGGATAGCATCCA-TTGCATGTTTCCCTATGCAAACATCAAACTGTGA
518 -GCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCATCCACTT-CA-ATTTCCCAATGCAAACATCTAATTATGA
* * * ** * *
273369 TAAGTTTTAA-TGAAGAACAACAAAGCTTTCAAC-GTATAGTCAATCTATAATCATTTATAAGAT
580 TAGGTTTTAACT-AAGAACAACAAAGCTTT-TACTTTATTTTCGATTTATAATCATTTATAAGAT
* * *
273432 TATAGATGAATTATAGATCATAATATTGATGATAAAAT-TTGATCAAATTGAT
643 TATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAATGTT-ATCAAAGTGAT
* * * * * * * *
273484 AATTATTCATTGATGAGTCATTTGAATC-TTTCAAAAAGAATGATACACTTAAAATGC-CATTTT
1 AATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTTCGAAAAGCATGATAAACTTAAAATGCTC-TTTC
** ** * *
273547 TTTGTCAATGGATAGCATCCACTAGATTTTTCACAATGCAAACATCTAATTATGATAGGTTTTCA
65 TTTGTCAATGGATAGCATCCACTTCA-CGTTCCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTT-A
* *
273612 CCAAA-AACAATC-AAGCTTTTC-A---A-TT-TG-----TAA-CATTTATAAGATCATAAATGA
128 ACAAAGAACAA-CAAAGC-TTTCGATTTATTTATGATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGA
* * *
273663 A-T-TATATCATAACT-TTGATGAGAAAATGTTAT-AAAATGATAATCATTCATTGATAAATCCT
191 ATTATATATCATAA-TATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCAT
* * * *
273724 TTCAAGCTTTCAAAAGCATGATAAACTTAAAATGGC-CTTTCCATGTCAATGGATAGAATCCACT
255 TTCAAGCTTTCGAAAGCATGATAAACTTAAAAT-GCTCTTTCCTTGTCAATAGATAGCATCCACT
* * * * * * *
273788 TTATGTTTCCCATCTCAAACATCCAATTATAATAGGTTTTAACCAGGAACAACT-TAGC--T--T
319 TCATGTTTCCAAT-GCAATCATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAAGAACAA-TAAAGCTTTAAT
* *
273848 TCA------ATTTATAATTATTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATTA
382 TTATTTTTTATTTATAATTATTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAA
* ** * * *
273907 CATGTTATCAAAATGATAATTATTTGTTGATAAATCATTCCAAGCTTTCAGAGACATGATAAATT
447 AATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTCAGAGGCATGATAAACT
* * * * * * * *
273972 TAAAATACTTTTTTCATGTCAATGAATAGCATCCATTTCACGTTTCCCAATGCAAACATCCAATT
512 TAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCATCCACTTCA-ATTTCCCAATGCAAACATCTAATT
274037 ATGATAGGTTTTAACTAAGAACAACAAAGCTTTTGA-TTTATTGTT-GATTTATAATC-TTTGAT
576 ATGATAGGTTTTAACTAAGAACAACAAAGCTTTT-ACTTTATT-TTCGATTTATAATCATTT-AT
* * * * * * *
274099 AAAATTATAAATGAATTATACATCATCATATCGATGGTAAAATGTGAT-TAAGATGAT
638 AAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAG-TGAT
* * *
274156 AATTATTCATTGATAAATCATTTCAAG-TTTTCG-AAAGAATGATAAACTTAAAATACTCTTTCC
1 AATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTTCGAAAAGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCT
* * * * * * *
274219 TTGTCAATGGATAGCATCCACTACATCTTTCCCAATGCAAACTTCCAATAATGAAAAGTTCTAAC
66 TTGTCAATGGATAGCATCCACTTCA-CGTTCCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAAC
* * ** * ** * *
274284 CAAGAATAACAAAGCTTTCGATTTATTT-TCTTTTAAAATC-TTTAGGAGATTTTAAATAAATTA
130 AAAGAACAACAAAGCTTTCGATTTATTTATGATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTA
* * * * * *
274347 TATATAACAATATTGATG-TGAAAATGTTATCAAAATGAAAATTGTTCACTGATAAAACATTTCA
195 TATATCATAATATTGATGAT-AAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCA
* * * * *
274411 A-CATTTCAAAAGTATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTATTAATTGATCA-CATCCACTTCA
259 AGC-TTTCGAAAGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATAGAT-AGCATCCACTTCA
* * *
274474 CGTTGTCCAATGCAAAT-ATCCAATTGTGATAGGTTTTAACCAAGAACAATAAAGCTTCTGATTT
322 TGTT-TCCAATGC-AATCATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAAGAACAATAAAGCTT-TAATTT
** * * *
274538 A-TTTTTGGTTATAACTTTTTTATAAGATTATAAATAAATTATATATCATAATATTGATGTTAAA
384 ATTTTTTATTTATAA-TTATTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAA
* * * * * *
274602 ATGTTATCAAAATAATAATTGTTTATTGATTAAA-AATTTCAAGCTTTCAGAAGAATGATAAACT
448 ATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGA-TAAATCATTTCAAGCTTTCAGAGGCATGATAAACT
274666 TAAAATGCTCTTTCC-T-TC-----AT-G--T----TTC----T--CAATGCAAACATCTAATTA
512 TAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCATCCACTTCAATTTCCCAATGCAAACATCTAATTA
* * * ** *
274711 TGATAAGG-TTTAACCAGGAACAAGAAAGCTTTCCCTTTATTTTCGATTTATAATCATTTATGAG
577 TGAT-AGGTTTTAACTAAGAACAACAAAGCTTTTACTTTATTTTCGATTTATAATCATTTATAAG
* ** * *
274775 ACTATAAACAAATTATATATCATAATATCGATGATAAAATGTTATCAAAGTAAT
641 ATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAGTGAT
* *
274829 AATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGC-TTTC-AAAAGCATGATAAACGTAAAATGTTCTTT-T
1 AATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTTCGAAAAGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCT
* * * * ** * *
274891 CTTGTTAATGGACAGCATCAACTTCATGTTTCCCAATGTGAACAACAAATTATGATA-GTGTTTA
66 -TTGTCAATGGATAGCATCCACTTCACG-TTCCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGT-TTTA
* * * * * *
274955 ATC-AAGAACAATAAAGCTTTCGATTTATTTTTGATTTATAAGCATTTATAACATTCTAACTGAA
128 A-CAAAGAACAACAAAGCTTTCGATTTATTTATGATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAA
* * * *
275019 TTATATATCATAATATTGATGATAAATTGTTATCAAAATTATAATTATTTATTGATATATCATTT
192 TTATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTT
* * * *
275084 CAAGCCTTCG-AAGACATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCATTGGATTGCATCCACTTC
257 CAAGCTTTCGAAAG-CATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATAGATAGCATCCACTTC
* * * * * *
275148 ATGTTTACTAATGCAATCATCCAATTATGGTAAGTTTTGACCAAGAATAATAAAGCTTTCAAATT
321 ATGTTT-CCAATGCAATCATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAAGAACAATAAAGCTTT-AATTT
* * * **
275213 ATTTTTGATTTGTAATTATTTATAAGATTTTAAATGAATTATATATCATAATATCAATGATAAAA
384 ATTTTTTATTTATAATTATTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAA
* * *
275278 TGTTATCAAAGTTATAATTATTCATTGGTAAATCATTTCAAGCTTTC-GAAGGCATGA-AAACCT
449 TGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTCAG-AGGCATGATAAA-CT
* * * * * * * * * *
275341 TAACATGCCCTTTTCTTGTTAGTGGTTACCATCCACTTCACATTTTCTAATGCAAACATCTGATT
512 TAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCATCCACTTCA-ATTTCCCAATGCAAACATCTAATT
* * * * ** *
275406 ATCACAGGTTTTAACAAAGAACAACAACGCCTTCGA-TTTATTGTCGATTTATAATCATTTATAA
576 ATGATAGGTTTTAACTAAGAACAACAAAG-CTTTTACTTTATTTTCGATTTATAATCATTTATAA
* * * * ** * *
275470 GATTATAAATGAATTATACATCATCATATTAATGATAAAATATGGTCCAACTGAT
640 GATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAGTGAT
* * * **
275525 AATTATTCATTGATAAATGATTTGAAG-GTTTCG-AGGGCATGATAAACTT-AAATGCTCTTT-T
1 AATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTTCGAAAAGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCT
* *
275586 CTTGTCGATGGATAGCATCCA-TTGCACATTTCCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTA
66 -TTGTCAATGGATAGCATCCACTT-CAC-GTTCCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTA
*** * * * *
275650 GGGAAGAACAA-AAATGCTTTCGATTTATTTTTTATTTATAATCATTTATAAGGGTCATAAATGA
128 ACAAAGAACAACAAA-GCTTTCGATTTATTTATGATTTATAATCATTTATAA-GATTATAAATGA
* * * *
275714 ATTATACATCATAATATTGATGATAAAGT-TTGATCAAAATGACAATTATTCTTTGATAAATCAT
191 ATTATATATCATAATATTGATGATAAAATGTT-ATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCAT
* * ** * *
275778 TTCAAGCTTTCG-AAGTCATGATAAACATAAAATGTTCATTTTTTTGGTTAATCGATAGCATCCA
255 TTCAAGCTTTCGAAAG-CATGATAAACTTAAAATGCTC-TTTCCTT-GTCAATAGATAGCATCCA
* * * * *
275842 CTGCATGTTTGCAATGCAAAT-ATCCAATTATGATAGGTTTTAACTAAGAACAACAAAACTTT
317 CTTCATGTTTCCAATGC-AATCATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAAGAACAATAAAGCTTT
275904 TGATTTATAA
Statistics
Matches: 5652, Mismatches: 1211, Indels: 845
0.73 0.16 0.11
Matches are distributed among these distances:
664 2 0.00
665 99 0.02
666 53 0.01
667 9 0.00
668 77 0.01
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670 66 0.01
671 93 0.02
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ACGTcount: A:0.38, C:0.14, G:0.11, T:0.37
Consensus pattern (694 bp):
AATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTTCGAAAAGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCT
TTGTCAATGGATAGCATCCACTTCACGTTCCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACA
AAGAACAACAAAGCTTTCGATTTATTTATGATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTAT
ATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAG
CTTTCGAAAGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATAGATAGCATCCACTTCATGTT
TCCAATGCAATCATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAAGAACAATAAAGCTTTAATTTATTTTTT
ATTTATAATTATTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATC
AAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTCAGAGGCATGATAAACTTAAAATGCT
CTTTCCTTGTCAATGGATAGCATCCACTTCAATTTCCCAATGCAAACATCTAATTATGATAGGTT
TTAACTAAGAACAACAAAGCTTTTACTTTATTTTCGATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATG
AATTATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAGTGAT
Found at i:274854 original size:211 final size:211
Alignment explanation
Indices: 274481--274889 Score: 538
Period size: 211 Copynumber: 1.9 Consensus size: 211
274471 TCACGTTGTC
* * * * *
274481 CAATGCAAATATCCAATTGTGATAGGTTTTAACCAAGAACAATAAAGCTTCTGATTTATTTTTGG
1 CAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAAGAACAAGAAAGCTTCTCATTTATTTTCGG
** * * * *
274546 TTATAACTTTTTTATAAGATTATAAATAAATTATATATCATAATATTGATGTTAAAATGTTATCA
66 TTATAACTCATTTATAAGACTATAAACAAATTATATATCATAATATCGATGATAAAATGTTATCA
* * * *
274611 AAATAATAATTGTTTATTGATTAAAAATTTCAAGCTTTCAGAAGAATGATAAACTTAAAATGCTC
131 AAATAATAATTATTCATTGATTAAAAATTTCAAGCTTTCAAAAGAATGATAAACGTAAAATGCTC
274676 TTTCCTTCATGTTTCT
196 TTTCCTTCATGTTTCT
* * *
274692 CAATGCAAACATCTAATTATGATAAGG-TTTAACCAGGAACAAGAAAGCTT-TCCCTTTATTTTC
1 CAATGCAAACATCCAATTATGAT-AGGTTTTAACCAAGAACAAGAAAGCTTCT-CATTTATTTTC
* *
274755 GATTTATAA-TCATTTATGAGACTATAAACAAATTATATATCATAATATCGATGATAAAATGTTA
64 G-GTTATAACTCATTTATAAGACTATAAACAAATTATATATCATAATATCGATGATAAAATGTTA
* * *
274819 TCAAAGTAATAATTATTCATTGA-TAAATCATTTCAAGCTTTCAAAAGCATGATAAACGTAAAAT
128 TCAAAATAATAATTATTCATTGATTAAA-AATTTCAAGCTTTCAAAAGAATGATAAACGTAAAAT
*
274883 GTTCTTT
192 GCTCTTT
274890 TCTTGTTAAT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.40, C:0.12, G:0.11, T:0.38
Consensus pattern (211 bp):
CAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAAGAACAAGAAAGCTTCTCATTTATTTTCGG
TTATAACTCATTTATAAGACTATAAACAAATTATATATCATAATATCGATGATAAAATGTTATCA
AAATAATAATTATTCATTGATTAAAAATTTCAAGCTTTCAAAAGAATGATAAACGTAAAATGCTC
TTTCCTTCATGTTTCT
Found at i:275104 original size:232 final size:231
Alignment explanation
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Period size: 232 Copynumber: 5.3 Consensus size: 231
274670 ATGCTCTTTC
* * * *
274680 CTTCATGTTTCTCAATGCAAACATCTAATTATGATAAGG-TTTAACCAGGAACAAGAAAGCTTTC
1 CTTCATGTTTCCCAATGCAAACATCCAATTATGAT-AGGTTTTAA-CAAGAACAACAAAGCTTTC
** * * * ** *
274744 CCTTTATTTTCGATTTATAATCATTTATGAGACTATAAACAAATTATATATCATAATATCGATGA
64 GATTTATTTTTGATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGA
* * *
274809 TAAAATGTTATCAAAGTAATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTC-AAAAGCATGATA
129 TAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTCGAAGA-CATGATA
* * * *
274873 AACGTAAAATGTTCTTTTCTTGTTAATGGACAGCATCAA
193 AACTTAAAATGCTCTTTTCTTGTTAATGGATAGCATCCA
** * * *
274912 CTTCATGTTTCCCAATGTGAACAACAAATTATGATA-GTGTTTAATCAAGAACAATAAAGCTTTC
1 CTTCATGTTTCCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGT-TTTAA-CAAGAACAACAAAGCTTTC
* * * *
274976 GATTTATTTTTGATTTATAAGCATTTATAACATTCTAACTGAATTATATATCATAATATTGATGA
64 GATTTATTTTTGATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGA
* * * * *
275041 TAAATTGTTATCAAAATTATAATTATTTATTGATATATCATTTCAAGCCTTCGAAGACATGATAA
129 TAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTCGAAGACATGATAA
* * * *
275106 ACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCATTGGATTGCATCCA
194 ACTTAAAATGCTCTTTTCTTGTTAATGGATAGCATCCA
* * * * * * * * *
275144 CTTCATGTTTACTAATGCAATCATCCAATTATGGTAAGTTTTGACCAAGAATAATAAAGCTTTCA
1 CTTCATGTTTCCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTT-AACAAGAACAACAAAGCTTTCG
* * * * **
275209 AATTATTTTTGATTTGTAATTATTTATAAGATTTTAAATGAATTATATATCATAATATCAATGAT
65 ATTTATTTTTGATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGAT
* * * *
275274 AAAATGTTATCAAAGTTATAATTATTCATTGGTAAATCATTTCAAGCTTTCGAAGGCATGA-AAA
130 AAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTCGAAGACATGATAAA
* * * * *
275338 CCTTAACATGCCCTTTTCTTGTTAGTGGTTACCATCCA
195 -CTTAAAATGCTCTTTTCTTGTTAATGGATAGCATCCA
** * * ** * * * *
275376 CTTCACATTTTCTAATGCAAACATCTGATTATCACAGGTTTTAACAAAGAACAACAACGCCTTCG
1 CTTCATGTTTCCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAAC-AAGAACAACAAAGCTTTCG
* * * * *
275441 ATTTATTGTCGATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTATACATCATCATATTAATGAT
65 ATTTATTTTTGATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGAT
* ** * * * * * * *
275506 AAAATATGGTCCAACTGATAATTATTCATTGATAAATGATTTGAAGGTTTCGAGGGCATGATAAA
130 AAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTCGAAGACATGATAAA
**
275571 CTT-AAATGCTCTTTTCTTGTCGATGGATAGCATCCA
195 CTTAAAATGCTCTTTTCTTGTTAATGGATAGCATCCA
** **
275607 -TTGCACATTTCCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAGGGAAGAACAA-AAATGCTTT
1 CTT-CATGTTTCCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTA-ACAAGAACAACAAA-GCTTT
* * * *
275670 CGATTTATTTTTTATTTATAATCATTTATAAGGGTCATAAATGAATTATACATCATAATATTGAT
63 CGATTTATTTTTGATTTATAATCATTTATAA-GATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGAT
* * * *
275735 GATAAAGT-TTGATCAAAATGACAATTATTCTTTGATAAATCATTTCAAGCTTTCGAAGTCATGA
127 GATAAAATGTT-ATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTCGAAGACATGA
* * * *
275799 TAAACATAAAATGTTCATTTTTTTGGTTAATCGATAGCATCCA
191 TAAACTTAAAATGCTC-TTTTCTT-GTTAATGGATAGCATCCA
* * * * *
275842 CTGCATGTTT-GCAATGCAAATATCCAATTATGATAGGTTTTAACTAAGAACAACAAAACTTTTG
1 CTTCATGTTTCCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAAC-AAGAACAACAAAGCTTTCG
275906 ATTTAT
65 ATTTAT
275912 AACATTTATA
Statistics
Matches: 824, Mismatches: 157, Indels: 36
0.81 0.15 0.04
Matches are distributed among these distances:
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236 1 0.00
ACGTcount: A:0.36, C:0.14, G:0.12, T:0.38
Consensus pattern (231 bp):
CTTCATGTTTCCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACAAGAACAACAAAGCTTTCGA
TTTATTTTTGATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATA
AAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTCGAAGACATGATAAAC
TTAAAATGCTCTTTTCTTGTTAATGGATAGCATCCA
Found at i:277758 original size:80 final size:80
Alignment explanation
Indices: 277578--277770 Score: 242
Period size: 80 Copynumber: 2.4 Consensus size: 80
277568 AGTTCCATTT
* * * *
277578 ATGAGGTTATAAAATGCATGCCATAAGATGTATGTGTTAAGTATATCATGTACACTATGGGCCAA
1 ATGAGGTTATGAAATGTATGCCATAAGATGCATATGTTAAGTATATCATGTACACTATGGGCCAA
** * *
277643 ATGTGTAAGTGATTT
66 ACATGCAAGTGATTC
* ** * * * *
277658 ATGAGGTTATGACACATATGCAATGAGATGCATATGTTAAGTATATCATGTATACTATGGGCTAA
1 ATGAGGTTATGAAATGTATGCCATAAGATGCATATGTTAAGTATATCATGTACACTATGGGCCAA
*
277723 GCATGCAAGTGATTC
66 ACATGCAAGTGATTC
277738 ATGAGGTTATGAAATGTATGCCATAAGATGCAT
1 ATGAGGTTATGAAATGTATGCCATAAGATGCAT
277771 GTATTGAAAT
Statistics
Matches: 92, Mismatches: 21, Indels: 0
0.81 0.19 0.00
Matches are distributed among these distances:
80 92 1.00
ACGTcount: A:0.34, C:0.11, G:0.23, T:0.32
Consensus pattern (80 bp):
ATGAGGTTATGAAATGTATGCCATAAGATGCATATGTTAAGTATATCATGTACACTATGGGCCAA
ACATGCAAGTGATTC
Found at i:277816 original size:80 final size:79
Alignment explanation
Indices: 277574--277821 Score: 241
Period size: 80 Copynumber: 3.1 Consensus size: 79
277564 CATGAGTTCC
* * *
277574 ATTTATGAGGTTATAAAATGCATGCCATAAGATGTATGTGTTAAGTATATCATGTACACTATGGG
1 ATTTATGAGGTTATGAAATGTATGCCATAAGATGCATGTGTTAAG-ATATCATGTACACTATGGG
* * * *
277639 CCAAATGTGTAAG-TG
65 CTAAGTATG-ACGATG
* ** * * * *
277654 ATTTATGAGGTTATGACACATATGCAATGAGATGCATATGTTAAGTATATCATGTATACTATGGG
1 ATTTATGAGGTTATGAAATGTATGCCATAAGATGCATGTGTTAAG-ATATCATGTACACTATGGG
* *
277719 CTAAGCATG-CAAGTG
65 CTAAGTATGACGA-TG
* * * *
277734 ATTCATGAGGTTATGAAATGTATGCCATAAGATGCATGTATTGAA-ATAGTCATATACACTATGA
1 ATTTATGAGGTTATGAAATGTATGCCATAAGATGCATGTGTT-AAGATA-TCATGTACACTATGG
277798 GCTAAGTATGACGATG
64 GCTAAGTATGACGATG
277814 ATTTATGA
1 ATTTATGA
277822 AAATATCATA
Statistics
Matches: 133, Mismatches: 30, Indels: 10
0.77 0.17 0.06
Matches are distributed among these distances:
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ATTTATGAGGTTATGAAATGTATGCCATAAGATGCATGTGTTAAGATATCATGTACACTATGGGC
TAAGTATGACGATG
Found at i:280233 original size:452 final size:450
Alignment explanation
Indices: 279338--290820 Score: 8127
Period size: 452 Copynumber: 25.4 Consensus size: 450
279328 AGATGTAACA
* * *
279338 ATAAATGAA--ATATATCATAATTTTAATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCAATGAT
1 ATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGAT
* * * * * * * *
279401 AAAACCTTTCAAACTTTCAAAAGCATGATAAACTTAAAATTCCCTTT-CTATGTTAATGGATAGC
66 AAATCATTTCAAGCTTTCGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCT-TGTCAATGGATAGC
* * *
279465 ATCCACTTCACGTTTCCCAATGCAAACATCTAATTAAT-ATAGGTTTTAACCAAGAACAA-ATAG
130 ATCCACTTCACATTTTCCAATGCAAACATC-AATT-ATGATAGGTTTTAACCAAGAACAACAAAG
* * *
279528 CTTTCAATTTGTTTTCGATTTATAACTATTTATAGGATTATAAATGAATTATATATCACAATATT
193 CTTTCAA-----TTT--A--TA-ATC-ATTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATT
* ** * * ** *
279593 GATGACAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTTGTTGATAAACCATTCCAAGCTTTCCTAGGAAT
247 GATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTCGAAGGCAT
* * * * *
279658 GATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATTGATAGCATCTACTTTATGTTTCCCAATGCAAAC
312 GATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCATCCACTTCACGTTTCTCAATGCAAAC
* * ** * *
279723 ATCCAATTATGATAGGATTTAACTAAGGGCAACAAAGCTTTTCAATTT-TTTTGATTTATAATCT
377 ATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAA-AACAACAAAGC-TTTCAATTTATTTCGATTTATAATCA
279787 TTTATAAGATT
440 TTTATAAGATT
* * * * *
279798 ATAAAAGAATTATGTATCATAATATTGATGTTTAAATGTTATCAAAATGATAATTGTTCATTGAT
1 ATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGAT
* * * * * * * *
279863 AAAACATTTCAAGCTTCCGAAGGCCTAATAAACTTAAAATACTCTTTCTTTGTCAATTGCTAGCA
66 AAATCATTTCAAGCTTTCGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCA
* * *
279928 TCCATTTCACATTTTCCAATGCAAACATCAAATTATGATAGGTTTTAACTAAGAACAATAAAGCT
131 TCCACTTCACATTTTCCAATGCAAACATC-AATTATGATAGGTTTTAACCAAGAACAACAAAGCT
* * *
279993 TTCACTTTATAATCATTTATGAGATTATAAATGAATTATATATCATAGTATTGATGATAAAATGT
195 TTCAATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAATGT
* * * * * *
280058 TAGT-GAAGTGATAATTATTCATTCATAAATCGTTTTAAGCTTTCGAAGGCATGA-AAAATGTAA
260 TA-TCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTCGAAGGCATGATAAACT-TAA
* * ** * * * ** *
280121 AATGTTCTTTCCTTGTCAATGGACAGTGTCGACTTCACGCTTCTCAATGCAAACTTGAAATTGTG
323 AATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCATCCACTTCACGTTTCTCAATGCAAACATCCAATTATG
* *
280186 ATAGGTTTTGACCAAAACAACAAAGCTTTCAAGTTATTTCCGATTTATAATCATTTATAAGATT
388 ATAGGTTTTAACCAAAACAACAAAGCTTTCAATTTATTT-CGATTTATAATCATTTATAAGATT
* * * *
280250 CTCAAA-GAATTATATATCATAATATTGATGATAAATTGTTATCAAAATTAAAATTATTCATTGA
1 AT-AAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGA
* * * * * *
280314 TATATCATTTCAAGCCTTT-GAAGGCATGATAAACTTAGAATGCACTTTCCTTATAAATGGATTG
65 TAAATCATTTCAAG-CTTTCGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAG
** ** * *
280378 CAT--TTTTTTCATGTTTCCTAATGCAATCATCTAATTATGATAGGTTTTAGCCAAGAACAACAA
129 CATCCACTTCACAT-TTTCC-AATGCAAACATC-AATTATGATAGGTTTTAACCAAGAACAACAA
* * * *
280441 AGATTCCAATTTATTTTTGATTTGTAATTATTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATG
191 AGCTTTC-A---A--TTT-A----TAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATA
* * ** * *
280506 TTGACGATAAACTGTTATCAAAATGATAATTATTCATTCTTAAATCATTTCAAGCTTTCAAAAGC
245 TTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTCGAAGGC
* * * * * *
280571 ATTGA-AAACTTAAAATCCCCTTCCCTTGTCAATGGATGGCATCCATTTCATGTTTCTCAATGCA
310 A-TGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCATCCACTTCACGTTTCTCAATGCA
* * ** * *
280635 AACATCCAATTATGATAGCTTTTAACCATGAACAGTAAAGCTTT-GATTTATTGTC-ATTTTATT
374 AACATCCAATTATGATAGGTTTTAACCA-AAACAACAAAGCTTTCAATTTATT-TCGA-TTTATA
*
280698 ATCATTTATAGGATT
436 ATCATTTATAAGATT
* * * * * *
280713 GTCAATGAATTATACATCATCATATTGATGATAAAATGTGATCAAAATGATAATTATTCGTTGAT
1 ATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGAT
* * * *
280778 AAATCATTTCAAGCTTTTGAAGGCATGGTAAACTTAAAATGCTCCTTCCTTGTCAACGGATAGCA
66 AAATCATTTCAAGCTTTCGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCA
* * * * *
280843 TCCA-TTGCACATATTCCAATGCAAATATCTAATTATAATAGGTTTTAACCTAGAACAA-AAACA
131 TCCACTT-CACATTTTCCAATGCAAACATC-AATTATGATAGGTTTTAACCAAGAACAACAAA-G
* * * *
280906 CTTTCAATTTATTGTCGATTACAATAGTTTATAA-AGTTATAAATGAAGTGTGTATCATAATATT
193 CTTTCAATTTA---T--AAT-C---A-TTTATAAGA-TTATAAATGAATTATATATCATAATATT
* * * * * * *
280970 GATGATAAAAT-TTGATCAAGATCATAGTTATTCATTCATAAATTATTTCAAGTTTTCGAAGGTA
247 GATGATAAAATGTT-ATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTCGAAGGCA
* * * * * * * *
281034 TGACAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTTTCAATGGATAGCATTCAGTGCATGTTTTTCAATGTAAA
311 TGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCATCCACTTCACGTTTCTCAATGCAAA
* * * *
281099 CATCCAATTGTGATGGGTTTTAACCAACAACAACGAAG----C----T-TTT-GATTTAT-AGCA
376 CATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAA-AACAACAAAGCTTTCAATTTATTTCGATTTATAATCA
*
281153 TTTACAAGATT
440 TTTATAAGATT
* * *
281164 ATAAATG-AGT-TATATCATAATTTTGATGAGAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGAT
1 ATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGAT
* * * * * * * *
281227 AAATCTTTTCGAGCTTTCGAAAGCATGATAAACTTAAAATAC-CTGTTTCATGTCAGTGGATAGG
66 AAATCATTTCAAGCTTTCGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCT-TTCCTTGTCAATGGATAGC
** * ** * *
281291 ATGTACTTTATGTCTTCCAATGAAAACATCAAATTATGATAGGTTTTAACCAAGAACAACATAAC
130 ATCCACTTCACATTTTCCAATGCAAACATC-AATTATGATAGGTTTTAACCAAGAACAAC--AA-
* * * **
281356 TTTTGATTTGATTTCGATTTATAATTATTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATCCTATTG
191 -----A---GCTTTCAATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTG
* ** * * **
281421 ATGATAAAATGTTATCAAAGTGATAATTATTTGTTGATAAATCATTCCAAGCTTTTGGGGGCATG
248 ATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTCGAAGGCATG
*** * * * * * * * * *
281486 ATAAACTTAAAACATTATTTCCATGTTAACGGATGGCATCTATTTCAC-ATTCTTAATGCAAACA
313 ATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCATCCACTTCACGTTTCTCAATGCAAACA
* * * * * *
281550 TCTAA-TATGATAGGTTTTAATCAAGAACAATAAAGTTTTCGATTTATTTTCAATTTATAATCAT
378 TCCAATTATGATAGGTTTTAACCAA-AACAACAAAGCTTTCAATTTA-TTTCGATTTATAATCAT
*
281614 TTATAAAATT
441 TTATAAGATT
* * * * *
281624 ATAAATGAACTATACATCATCATATTGATGATAAAATGTGATCAAAATGATAATTATTCTTTGAT
1 ATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGAT
* * * * *
281689 AAATCATTTCAAGCTTTCAAAAGAATGATAAACTTAAAATACTTTTTCCTTGTCAATGGATGGAT
66 AAATCATTTCAAGCTTTCGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTC-A---ATGGAT
* * *
281754 AGCATCCAC-T-ACATCTTTCCCAATGCAAACATCCAATAATGAAAAGTTTTAACCAAGAACAAC
127 AGCATCCACTTCACAT-TTT-CCAATGCAAACAT-CAATTATGATAGGTTTTAACCAAGAACAAC
* * * * *
281817 AAAGTTTTCAAATTTATAA-CAGTTATAAGATTATAAATGAATTATAT-T-TTAATTTTGATCAT
189 AAAGCTTTC-AATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGAT
* * * * * * * *
281879 AAAATTTTATCAAAATAATAACTATTCATTGATAAATGC-TTCCGAGATTTCAAAAGCATGATAA
253 AAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAAT-CATTTCAAGCTTTCGAAGGCATGATAA
* * * * * **
281943 ACTTAAAATGCCCTTTCCATGTCAATGGCTAGCATCCACTTCACATTTTTCAATGCAAACATGTA
317 ACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCATCCACTTCACGTTTCTCAATGCAAACATCCA
** * * ** * *
282008 ATTATGATCA-GTTTTAATGAAGAATAACAAAGTTTTTGATTTATTTTCGATTGATAATCACTTA
382 ATTATGAT-AGGTTTTAACCAA-AACAACAAAGCTTTCAATTTA-TTTCGATTTATAATCATTTA
* *
282072 GATGATT
444 TAAGATT
* * * * * *
282079 ATAAATGAATTATATATCATAATACTGATGATAAAATGTTAGCAAAATAAGAATTCTTCATTTAT
1 ATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGAT
** * * * * * * * * * **
282144 AAATCATTTTTATCTTTCAAAGGAATGATAAACCTAAGATGCTATTTTCTTGTTAATGGACAATA
66 AAATCATTTCAAGCTTTCGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCA
* * * * * * * * *
282209 TCCACTTTA-TTTTTCCCAATGCAAATATCTATTTATGATA-GATTTAACCGAGAACGACAATGG
131 TCCACTTCACATTTT-CCAATGCAAACATC-AATTATGATAGGTTTTAACCAAGAACAACAAAGC
** * * * * *
282272 TTTGGATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATG-AGT-GATATCACAATATTGAGGGTAAAATG
194 TTTCAATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAATG
* * * * *
282335 TTATCTAAATGATAATTATTCAATGATATATTC-TTTCAAGCTTTTC-AAGGTATGATAAAATTA
259 TTATCAAAATGATAATTATTCATTGATA-AATCATTTCAAGC-TTTCGAAGGCATGATAAACTTA
* * * * * * * * * * * **
282398 AAATGTTCTTTGCTTGTTAATAGATAACACCCATTTCATGTTGCCCAATGCAAACGTTTAATTAT
322 AAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCATCCACTTCACGTTTCTCAATGCAAACATCCAATTAT
* * ** *
282463 GATAGGTTTTAACC--AAGAA-AAA--TAT--AGCT-TTT-GATTTATAATCTTTTATAAGATT
387 GATAGGTTTTAACCAAAACAACAAAGCTTTCAATTTATTTCGATTTATAATCATTTATAAGATT
* * * * * *
282518 ATAAATGGATTGA-ATATCATAATATTGATGATTAAAATGCTATCAAAAGGATAGTCATTAATTG
1 ATAAATGAATT-ATATATCATAATATTGATGA-TAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTG
* * * * * * **
282582 ATAAATCCTTTGAAGCATTCAAAAGCATAATAAACATT-AAATGC-CTTTTCCTTGTCAGCGGAT
64 ATAAATCATTTCAAGCTTTCGAAGGCATGATAAAC-TTAAAATGCTC-TTTCCTTGTCAATGGAT
* * ** * * **
282645 AGTATCCGCTTCATGTTTCCCAATGCAAACATACAATTATCATAGGTTTTAAAAAAGAACAACAA
127 AGCATCCACTTCACATTTTCCAATGCAAACAT-CAATTATGATAGGTTTTAACCAAGAACAACAA
* * * *
282710 CGCTTTCAATTTATTTCAATTTATGATTATTTATACAATTATAAATGAATTAGATATCATAATAT
191 AGCTTTCAATTTA--T-AA-TCAT--TTA--TA-A-GATTATAAATGAATTATATATCATAATAT
** * * * * ** * *
282775 CAATGAT-AAATATAAGCAAAATGATAATAATTCATCAATAAATCATTTTAAGCTTT-TATAGGC
246 TGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTCGA-AGGC
* * * * **
282838 ATGACAAACTTAAAATGGTCTTTCTTTATCAATGGATAGCATCCACTTCACGTTTCTTGATGCAA
310 ATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCATCCACTTCACGTTTCTCAATGCAA
* *
282903 GCATCCAATTATGATAGGTTTTAACTAGAAACAACAAAG----C------TTTCGATTTATAATC
375 ACATCCAATTATGATAGGTTTTAACCA-AAACAACAAAGCTTTCAATTTATTTCGATTTATAATC
* * *
282958 ATTTAGAAAACT
439 ATTTATAAGATT
* * * * * *
282970 GTAAATGAATTATATATCATAATATTGACGAGAAAATGTTATCAAAATAATAATTCTTCATTCAT
1 ATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGAT
* * * * * * * *
283035 GAATCATTTCAAGCTTTCAAAGGCATGATAAACTTCAAATGCTTTTTCGTTGTCAACGGATGGAA
66 AAATCATTTCAAGCTTTCGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCA
** * * * * * * *
283100 TCCACTTCATTTTTTCAAACGCAAACATTCAATTAAGATAGATTTTAGCCAAAAATAACAAAATG
131 TCCACTTCACATTTTCCAATGCAAACA-TCAATTATGATAGGTTTTAACC---AAGAACAACA--
* * * * * *
283165 TTTAAGTTATTTTCGATTTATAATCATTTATTACATTATAAATGAGTT-TATATCATAGTATTGA
190 ---AAG---CTTTCAATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGA
* * * *
283229 TGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATGGATAAATCTTTTAAAGCTTTTGAAGGCATGA
249 TGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTCGAAGGCATGA
* * * *
283294 TAAACTTAAAATACTCTTTCCATG-CAAATGGATAGCATCCACTTCATGTTGCTCAATGCAAACA
314 TAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTC-AATGGATAGCATCCACTTCACGTTTCTCAATGCAAACA
* * * * * *
283358 TCCAATAATGATAGGTTTTATCCAAGAACAACCAAGCTTTCAAATTATTATCAACTTATAATCAT
378 TCCAATTATGATAGGTTTTAACCAA-AACAACAAAGCTTTCAATTTATT-TCGATTTATAATCAT
283423 TTATAAGATT
441 TTATAAGATT
* * * *
283433 ATAAATGAATTAGACATCATAATATTTATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGGT
1 ATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGAT
** * * * *
283498 AAATTGTTTCAAGCTTTCAAAGGCATGATAAACATACAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGGTAGCA
66 AAATCATTTCAAGCTTTCGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCA
* ** * *
283563 TCCAATTCATGTTTTGCCAA-GCAAACATTCAATTATGAT-TGTTTTAACCAAGAACAACAAAAC
131 TCCACTTCACATTTT-CCAATGCAAACA-TCAATTATGATAGGTTTTAACCAAGAACAACAAAGC
* * ** * *
283626 TTTTAATTTATTTTTTTATAATGATTTATTTGATTGTAAATGAATTATATATCATAATATTGTTG
194 -TTTCA---A----TTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATG
* * * *
283691 ATAAATTGTTATCAAAATGATAGTTATTTATTGATAAATTC-TTTCAAGCTTTTGAAGGCATG--
251 ATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAA-TCATTTCAAGCTTTCGAAGGCATGAT
* * * * * ** * *
283753 ------AAAAT-CTCTTTCCGTGTTAATGGATAGCATCTATTTCACATTTCTCAATATAAATAGC
315 AAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCATCCACTTCACGTTTCTCAATGCAAACATC
* * * * * * * * *
283811 TAATTATGATAGCTTTTAACCTTAAATAACAACA-CATTCTATTTATTGCCAATTATAATCATTT
380 CAATTATGATAGGTTTTAACC-AAAACAACAA-AGCTTTCAATTTATTTCGATTTATAATCATTT
*
283875 ATGAGATT
443 ATAAGATT
* * *
283883 ATAAATGAATTATATGTCATAATATTGATGATAAAATGTGATCAAAATGATAATTGTTCATTGAT
1 ATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGAT
* * * *
283948 -AA--A-TT---G-TTTC-AA-GCATGATAAATTTCAAATACTCTTTCCTTGTCAATGGATTGCA
66 AAATCATTTCAAGCTTTCGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCA
* * *
284003 TCCACTT--C-TTGTTCCCTAATGCAAATATTCAATTATTG-TAGGTTTTATTCAAAAACAAAAA
131 TCCACTTCACATT-TT-CC-AATGCAAACA-TCAATTA-TGATAGG--TT-TT---AACCAAGAA
* * * * * * *
284064 AAACTTCCAATTTGTTTTCAATTTATAATTATTTATAAGGTCATAAATGAATTATAAATC-TGAA
185 CAA----CAA--AGCTTTCAATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCAT-AA
* * * * * *
284128 TGTTGATGATAGAATGTTATCAAAATGATAATTCTTCATTGACAAATCATTTCAAGTTTTTGAAG
243 TATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTCGAAG
* * * * * * *
284193 TCATTG-TAAACTTAAACTGCTTTTTTCTTGTTAATGGATAACATCCACTTCATCTTTTC-CAAT
308 GCA-TGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCATCCACTTCA-CGTTTCTCAAT
* *
284256 GCAAACATTCAATTATGATAGGTTTTATCCAAGAACAAC-AA----TC-----A----G-----T
371 GCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAA-AACAACAAAGCTTTCAATTTATTTCGATTTAT
284302 --T-A--TA-AA-ATT
435 AATCATTTATAAGATT
* * * *
284311 ATAAATGAATTATACT-TCATAATATTGATGATAAAATTTGATCAAAATGATAATTTTTCATTAA
1 ATAAATGAATTATA-TATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGA
* * ** *
284375 TAAATGATTTCAAGCTTTCGAAGGTATGATAAACTTAAAATGCTCTTT-CTTAACAATGGATATC
65 TAAATCATTTCAAGCTTTCGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGC
* * * *
284439 ATCCAC-TC-CATGTTTCCTAGTGCAAA-ATTCAATTACGAGAGGTTATAACCAAGAACAACAAA
130 ATCCACTTCACAT-TTTCC-AATGCAAACA-TCAATTATGATAGGTTTTAACCAAGAACAACAAA
* * *
284501 GCTTTCAATTTATAA-CATTTATAAGATTATAAAAGAA-T-TATATCATAATTTTGATCACT-AA
192 GCTTTCAATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGA-TAAA
** * * * *
284562 ATGTTATCAAAATGATAACCATTAATTGATAAATGC-TTTCAAGCTTTCAAAAGCATGAGAAACT
256 ATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAAT-CATTTCAAGCTTTCGAAGGCATGATAAACT
* * * * * * *
284626 TAAAAAGCCCTTTCCATATCAATGGATAGCATCCATTTCACGTTTCACAATGCAAACATCCAACT
320 TAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCATCCACTTCACGTTTCTCAATGCAAACATCCAATT
* * * * * *
284691 ATGATAGGTTTCAAACGAAGAATAACAAAGTTTTCAATTTATTTTTGATTTATAATCACTTA-AA
385 ATGATAGGTTT-TAACCAA-AACAACAAAGCTTTCAATTTA-TTTCGATTTATAATCATTTATAA
284755 TGATT
447 -GATT
* * * * * *
284760 ATAAATTACTTATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTAGCAAAATGAGAATTCTTCATTCAT
1 ATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGAT
* * * * *
284825 AAATCATTTCAAGCTTTCAAAGGTATGATAAACTTAAAATGTTATTTCCTTGTCAATGGATAACA
66 AAATCATTTCAAGCTTTCGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCA
* * * * * * * *
284890 TCTACTTCA-TTTTTCTTAATGCAAACATCCAATTATGATAGATTTTAACTAAAAACAACAATGG
131 TCCACTTCACATTTTC-CAATGCAAACAT-CAATTATGATAGGTTTTAACCAAGAACAACAAAGC
* * * * * *
284954 TTTCAATTTATAATCATTTATACGATTATAAATGAA-T-GATATCACAATATTGAGGGTACAATG
194 TTTCAATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAATG
* * * *
285017 TTATCAAAATGATAATTATTTATTGATAAATCCTTTCAAGCTTTTGAAGGCATGATAAAATTAAA
259 TTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTCGAAGGCATGATAAACTTAAA
* * * * * * * * ** * *
285082 ATGTTGTTTGCTTGTCATTGGATAACACCCATTTCATGTTATC-CCGTGCAAACCTCTAATTATG
324 ATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCATCCACTTCACGTT-TCTCAATGCAAACATCCAATTATG
* *
285146 ATAGGTTTTAACC-AAGCATA-ATAGAC---C------TTTCGATTTATAAT-ATTTTATAAGAT
388 ATAGGTTTTAACCAAAACA-ACAAAG-CTTTCAATTTATTTCGATTTATAATCA-TTTATAAGAT
285199 T
450 T
** *
285200 ATAAATGAATTGCATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATAATAATTATTCATTGAT
1 ATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGAT
* * * * * * * * *
285265 AAATCTTTTCAAACTTTCAAAAGCATGATAAACATCAAATGCCCTTT-CTTGGTCAATGAATAGA
66 AAATCATTTCAAGCTTTCGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTT-GTCAATGGATAGC
* * ** * *
285329 ATCCACCTCACACTTTCCACCGCAAATATACAATTATGATA-GTTTTAACAAAGAACAACAAAGC
130 ATCCACTTCACATTTTCCAATGCAAACAT-CAATTATGATAGGTTTTAACCAAGAACAACAAAGC
* **
285393 TTTCAATTTATTTCGATTTACAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTAGATATCATAATATCAA
194 TTTC-A---ATTT--A--T--AATCATTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGA
* * * * *
285458 TGATAAAATGTGATCAAAATGATAATAATTCATTGATAAATCATTTTAAGCTTTCGTAGCCATGA
249 TGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTCGAAGGCATGA
* * * * * * *
285523 TAAACTTAAAATGATCTTTCCTTATCAATGGATAGCATTCATTTCACGTTTC-CTGATGTAAGCA
314 TAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCATCCACTTCACGTTTCTC-AATGCAAACA
** ** *
285587 TTGAATTATGATAAATTTTAACCAGGAACAACAAAGCTTTC-----A-----ATTTATAATCATT
378 TCCAATTATGATAGGTTTTAACCA-AAACAACAAAGCTTTCAATTTATTTCGATTTATAATCATT
285642 TATAAGATT
442 TATAAGATT
* * * *
285651 GTAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATAATACTTCTTCATTGAT
1 ATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGAT
* * * * **
285716 GAATCATTTCAAGCTTTCGACGACATGGTAAACTTAAAATGCTCTTT-CTTGTCAATGGATAAAA
66 AAATCATTTCAAGCTTTCGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCA
* * * * * * *
285780 CCCACTTCA-TTTTTCCCAATGCAAACATTTAACTAAGATAAGTTTTAACCAAGAACAACAAAAC
131 TCCACTTCACATTTT-CCAATGCAAACA-TCAATTATGATAGGTTTTAACCAAGAACAACAAAGC
* * * *
285844 TTTTGAGTGATCTTTTATTTATAATCATTTATTACATTATAAATGAATT-TGTATCATAATATTG
194 ---T---T--TC---AATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTG
* * * * * * *
285908 ATGGTAAAATGTTATCACAATAATAATTATTCATTGATAAAGCCTTTGAAGCTTTTGAAGGCATG
248 ATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTCGAAGGCATG
* ** * * * * *
285973 ATAAATTTAAAATGCTCTTTTTTTGCCAATGGATAGCATCCACATCACATTTTTCTATGCAAACA
313 ATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCATCCACTTCACGTTTCTCAATGCAAACA
* * ** *
286038 TCCAATAATGATAGGTTTTAACTAAGAACAACAAAGCTTTTGATTTAGTATCGATTTATAATCAT
378 TCCAATTATGATAGGTTTTAACCAA-AACAACAAAGCTTTCAATTTA-TTTCGATTTATAATCAT
286103 TTATAAGATT
441 TTATAAGATT
* * * * *
286113 ATAAAT-ACTTTATACATCAAAATATTGATGATAAAATGTGATCAAAATGATAATTATTCATTAA
1 ATAAATGA-ATTATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGA
* * * * * *
286177 TAAAGCGTTTTAGGCTTTCAAAAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTGT-CTT-TCCATGGAT
65 TAAATCATTTCAAGCTTTC--GAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTT-TCCTTGTCAATGGAT
* * * * *
286240 AGCATCCAATTCACATTTCACCAAT-CAAATAGTCAATTATGATATGTTTTAACAAAGAACAACA
127 AGCATCCACTTCACATTT-TCCAATGCAAACA-TCAATTATGATAGGTTTTAACCAAGAACAACA
* * *
286304 AAGCTTTTGATTTATTTTTTTATAATGATTTATTAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATT
190 AAGC-TTTCA---A----TTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATT
* * * * * * *
286369 GTTGATAAAATATTATCAAAATGATAATTATTTATTGATAGACCCTTTCAAGTTTTCGAAGGCAT
247 GATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTCGAAGGCAT
* * * * * * *
286434 GATAAA-TTTAAGTTCTCTTTTCTTGTCAATGGATAGCATCTATTTCACATTTCTCAATGCAAAC
312 GATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCATCCACTTCACGTTTCTCAATGCAAAC
*** * * * * * *
286498 ATCTTGTTATGATAAGTTTTAGCCATAAATAACAAAGCGTTT-GATTTATTATCAATTTATAATT
377 ATCCAATTATGATAGGTTTTAACCA-AAACAACAAAGC-TTTCAATTTATT-TCGATTTATAATC
*
286562 ATTTATGAGATT
439 ATTTATAAGATT
* * * * **
286574 ATAAATGAATCATACATCATAATATTGATGAAAAAATGTGATCAAAATGATAATTGCTCATTG--
1 ATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGAT
* * * * * *
286637 --ATCA-ATC-A--TTTC-AA-GCATGATAAATTTAAAGTACTCTTTTCTTGTCAATGGATTGCA
66 AAATCATTTCAAGCTTTCGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCA
* *** *
286694 TCCACTT--CATGTTCCCTAATGCAAACATCAAATTATTG-TAGGTTTTATTGAAGAACAAAAAA
131 TCCACTTCACAT-TTTCC-AATGCAAACATC-AATTA-TGATAGGTTTTAACCAAGAACAACAAA
* * * *
286756 GTTTCCAATTTATTTTCAATTTATAATCATTTATAAGGTCATAAA-CAGATTATATATCCTAATA
192 G----C-------TTTCAATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGA-ATTATATATCATAATA
* * * * *
286820 TTAATGATAAAATATTATCAAAATGATAATTCTTCATTGATGAATCATTTCAAGCTTTCGAA-GT
245 TTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTCGAAGGC
* * * * * ** * *
286884 ATTGATAAACTTAAATTGCTTTTTCCTTATTAATGGATAGCATCCACTACATTTTTCCCAATACA
310 A-TGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCATCCACTTCACGTTTCTCAATGCA
** ** * ** * *
286949 AACATTTAATTACAATAGGTTTTAACTAAGAGTAGCAAAGCTTTCGATTTATTGTCGATTTATAA
374 AACATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAA-AACAACAAAGCTTTCAATTTATT-TCGATTTATAA
**
287014 TCATTTATAATTTT
437 TCATTTATAAGATT
* * * * *
287028 ATAAATGAATTATACACCATAATATTAATGATAAAAT-TTGATCAAAATGATAATTTTTCATTAA
1 ATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAATGTT-ATCAAAATGATAATTATTCATTGA
* *
287092 TAAATCATTTCAAGCTTTCGAAGGTATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGT
65 TAAATCATTTCAAGCTTTCGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGC
* * * **
287157 ATTCAC-T-ACATGTTTCCAGTGCAAACATCCAATTATGAGAGGTTTTAATGAAGAACAACAAAG
130 ATCCACTTCACAT-TTTCCAATGCAAACAT-CAATTATGATAGGTTTTAACCAAGAACAACAAAG
* ** * * * * *
287220 GTTTTGATTTATAA-CATCTATAAGATTATAAGTGAATTA-A-ATTATAATTTTGATAATAAAAT
193 CTTTCAATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAAT
* * * *
287282 GTTATCAAAATGATAGCTT-TTCATTGATAAATGC-TTTCGAGCTTTCAAAAGC-TGATAAACTT
258 GTTATCAAAATGATA-ATTATTCATTGATAAAT-CATTTCAAGCTTTCGAAGGCATGATAAACTT
* * * * * * * *
287344 AAAATGCCCTTTCCATGTCAACT-AATAGCATCAATTTCATGCTTCTCAATGCAATCATCCAATT
321 AAAATGCTCTTTCCTTGTCAA-TGGATAGCATCCACTTCACGTTTCTCAATGCAAACATCCAATT
** ** * * * * *
287408 ATGATACATTTTAATGAATAATAACAATG-TTTCCAATTTATTTTCGATTTATAATCACTTAGAT
385 ATGATAGGTTTTAACCAA-AACAACAAAGCTTT-CAATTTA-TTTCGATTTATAATCATTTATAA
287472 GATT
447 GATT
* ** * * * *
287476 ATAAATAAATTATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCCGAATGAGAATTCTTTATTAAT
1 ATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGAT
* * * * * * ** **
287541 AAATCATTTCAAGCTTTCAAAGGTATAATAAACTGAAAATTCTATTTCCTTGTTGATGGATAATA
66 AAATCATTTCAAGCTTTCGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCA
* * ** * *
287606 TCCACTT--CATTTTCCTAGTACAAACATCTAATTATGATATATTTTAACCAAGAACAACAATGG
131 TCCACTTCACATTTTCC-AATGCAAACATC-AATTATGATAGGTTTTAACCAAGAACAACAAAGC
* * * * * *
287669 TTTCCATTTATAATCATTTATAGGATTATAATTGAA-T-GATATCACAATATGGATG-TAAAAT-
194 TTTCAATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAATG
* * * *
287730 TATATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCCTTTCAAGCTTTTC-ACGACATGATAAAATTA
259 T-TATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGC-TTTCGAAGGCATGATAAACTTA
* *** * * * * * * *
287794 AACTGCTCTTTGAATGTCAATGGATAACA-CCTATTTCATGTTGCTTAATGCAAACATCTAATTT
322 AAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCATCC-ACTTCACGTTTCTCAATGCAAACATCCAATTA
* * * * *
287858 TGATAGGTTTTAACCAATAACAATAGAG------A--T-TTT-GATTAATAACCTTTTATAAGAT
386 TGATAGGTTTTAACCAA-AACAACAAAGCTTTCAATTTATTTCGATTTATAATCATTTATAAGAT
287913 T
450 T
* * *
287914 ATAAATGAATTACATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATC-AAGTGACAATTATTCATT-AT
1 ATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGA-
* * *
287977 TAAATCCTTTTAAGCTTTCGAAAGCATGATAAACATT-AAATGC-CTTTTCCTTGTCAAT-GATA
65 TAAATCATTTCAAGCTTTCGAAGGCATGATAAAC-TTAAAATGCTC-TTTCCTTGTCAATGGATA
* *
288039 GCATCCACTTCAC-GTTTCTCAATGAAAACATACAATTATGATAGGTTTTAA-CATAGAACAACA
128 GCATCCACTTCACATTTTC-CAATGCAAACAT-CAATTATGATAGGTTTTAACCA-AGAACAACA
* * * *
288102 AAGTTTTCAATTTATTTCTATTTATAATCATTTATAATATTATAAATGAATTAGATATCTTAATA
190 AAG----C------TTTCAATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATA
* * * * * * * * * *
288167 TCGATGATAAAATGTGATCAAAGTGATAATAATTCGTTGGTCAATCATTTTAAGCTTTTGTAGGC
245 TTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTCGAAGGC
* * * * * ** * * *
288232 ATGATAAACTTAAAGTGATCTTTTCTTATAAATGGATAATATCTACTTCACGTTTC-CTGATGTA
310 ATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCATCCACTTCACGTTTCTC-AATGCA
* *
288296 AGCATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAGGAACAACAAAG----C----T-TTT-GATTTATAAT
374 AACATCCAATTATGATAGGTTTTAACCA-AAACAACAAAGCTTTCAATTTATTTCGATTTATAAT
288351 CATTTATAAGATT
438 CATTTATAAGATT
* * * *
288364 GTAAATTAATTATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATAATAATTCTTCATTGAT
1 ATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGAT
* * * *
288429 GAATCATTTCAAGCTTTCGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCATTCCTTATCAACGGATAGCA
66 AAATCATTTCAAGCTTTCGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCA
* ** * *
288494 TCCACTTCA-TTTTTCCCAACACCAACATTCAATTAAT-ATAGGCTTTAACCAAGAACAACAAAA
131 TCCACTTCACATTTT-CCAATGCAAACA-TCAATT-ATGATAGGTTTTAACCAAGAACAAC--AA
* * * * * *
288557 CGTTTGAGTTATTTTCGATTTATAAACATTTATTACATTATAAATGAATT-TATATCATAGTATT
191 ------AG---CTTTCAATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATT
* * * * * *
288621 GATGATTAAATGTTATCAAAATGATCAA-TATTCATTGATAAATCCTTTGAAGCTTTTGTAGGTA
247 GATGATAAAATGTTATCAAAATGAT-AATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTCGAAGGCA
* * * * * *
288685 TGATAGACTTAAAATGCTCTTTCCTTGCCAATAGATAGCATCCACTTTATGTTTCTTAATGCAAA
311 TGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCATCCACTTCACGTTTCTCAATGCAAA
* * * * * *
288750 CATCTAATAATGATAGTTTTTAATCAAGAA-AACCAAAGCTTTCGATTTATTATCAATTTATAAT
376 CATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAA-AACAA-CAAAGCTTTCAATTTATT-TCGATTTATAAT
*
288814 CATTTATAGGATT
438 CATTTATAAGATT
* * *** * *
288827 ATAAATGAATTATATACATCATAATATTTATTATAAAATACGATCAAAATAATAATTATTTATTG
1 ATAAATGAATTATAT--ATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTG
** * * * *
288892 ATAAATTGTTTCAAGCTTTCAAAGGCATAATAAACTTAAAATGCTCCTTCCTTATCAATGGATAG
64 ATAAATCATTTCAAGCTTTCGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAG
* * * * * * *
288957 CATCTTA-TTCAC-GTTT-CACTGAGCAAACATGCAGTTATGATACGTTTTAACTAAGAATAACA
129 CATC-CACTTCACATTTTCCAAT--GCAAACAT-CAATTATGATAGGTTTTAACCAAGAACAACA
* * * *
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190 AAGC-TTTCA---A----TTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATT
* * * * *
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* ** * * * * * *
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* * ** * *
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375 ACATCCAATTATGATAGGTTTTAACC-AAAACAACAAAGCTTTCAATTTATT-TCGATTTATAAT
*
289277 CATTTATGAGATT
438 CATTTATAAGATT
* * ** * *
289290 ATAAATGAATTATACATCATAATATTGATAATAAAATGAGATCAAAATTATAATTGTTCATTGAT
1 ATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGAT
* * * * * * * *
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* * * * ** *
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131 TCCACTTCACA-TTTTCCAATGCAAACAT-CAATTA-TGATAGGTTTTAACCAAGAA-C--AA--
* * *
289483 TTTCAATTTGTTTTCAATTTATAATCATTTATAA-AGTCATAAATGAATTAT-TATCATAATATT
188 ---CAA--AGCTTTCAATTTATAATCATTTATAAGA-TTATAAATGAATTATATATCATAATATT
* * * * **
289546 GATGATAAAATGTTATCAAAATCAT-A--ATTC-TT--TATATCATTTCAACCTTTTGAAGGTGT
247 GATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTCGAAGGCAT
*
289605 GATAAACTTAAAATTCTCTTTCCTTGTC-A---AT---A---A----A------T--A-G----C
312 GATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCATCCACTTCACGTTTCTCAATGCAAAC
** **
289643 ATCCAATTATGATAGACTTTAACCAAGAACATA-AAAGCTTTCAATTTATTTTTAATTTATAATC
377 ATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAA-AACA-ACAAAGCTTTCAATTTA-TTTCGATTTATAATC
*
289707 ATTTATGAGATT
439 ATTTATAAGATT
* *
289719 ATAAATGAATTATATATGATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTTTTCATTGAT
1 ATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGAT
* * * * * *
289784 TAATCTTTTCAAGTTTTCGAAAGCATGAT-AACTTAAAATGCCCTTTCCTTGTTAATGG-TAGCA
66 AAATCATTTCAAGCTTTCGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCA
* ** * ** * ** * * *
289847 TCCACTTTATGTTTGCCAACACAAATATCTAATTATGGCAGATTTTAACAAAAAACAACAAAGTT
131 TCCACTTCACATTTTCCAATGCAAACATC-AATTATGATAGGTTTTAACCAAGAACAACAAAG--
* * * * *
289912 CTCTATTTATTTTCAATTTATAATCATTTATAAGATTAGAAACGAATCACATATCATAATATTAA
193 --C-------TTTCAATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGA
* * *
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* * * * * *
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* ** *
290105 ATCTAATTA-GAGTACATTTT-----AAACAACAAAG---------T-TTTCCATTTATAATCAT
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*
290154 TTGTAAGATT
441 TTATAAGATT
*
290164 ATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTCTTCATTGAT
1 ATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGAT
* * * * * * * * * **
290229 GAATCAATCCAATCATTCTAAGGCATTATAAACTTAAAATGCCCTTTACTTGTCAATAAATAGCA
66 AAATCATTTCAAGCTTTCGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCA
* * * * * *
290294 TCCCCTTCACA-TTTCTCAGTACTAACATTCAATTATGATAGGTTTTAACTAAGAACAATAAAAT
131 TCCACTTCACATTTTC-CAATGCAAACA-TCAATTATGATAGGTTTTAACCAAGAAC-A-ACAA-
* ** ** * * *
290358 TTTTGAGTTATTTTTTATTTATAATTTTTTATAACACTATAAATGAATTATATATGATAATATTG
191 -----AG---CTTTCAATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTG
* * * *
290423 ATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTTATTGATAAATCATTTCAAGCTTTTGAAGCCACG
248 ATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTCGAAGGCATG
* * * *
290488 AT-AACTTGAAATACTCTATCCTTATCAATGGAT-GCATCCACTTCACGTTT-TCCAATGCAAAC
313 ATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCATCCACTTCACGTTTCT-CAATGCAAAC
* * * * * *
290550 ATCCAATTATGAGAGGTTTTAACTAAGAACAACAAAGCTCTT-GATTCATTTTCAATTTATGAT-
377 ATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAA-AACAACAAAGCT-TTCAATTTA-TTTCGATTTATAATC
*
290613 TTTTATAAGATT
439 ATTTATAAGATT
* * * * **
290625 ATAAATGAATTATTTACCATAATATTGATGATAAAAGGTTATCAAAATGAAAATGGTTCATTGAT
1 ATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGAT
** * *
290690 AAATCATTTCAAATTTTCGAAGGGATGATAAACTTAAAATGTTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCA
66 AAATCATTTCAAGCTTTCGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCA
* * *
290755 TCCACTTCACA-TTTCTCAAAGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTAAACCAAGAACAATAAAGC
131 TCCACTTCACATTTTC-CAATGCAAACAT-CAATTATGATAGGTTTTAACCAAGAACAACAAAGC
290819 TT
194 TT
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Statistics
Matches: 8724, Mismatches: 1720, Indels: 1168
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ATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAAGCTTTCGAAGGCATGATAAACTTAAAAT
GCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCATCCACTTCACGTTTCTCAATGCAAACATCCAATTATGATA
GGTTTTAACCAAAACAACAAAGCTTTCAATTTATTTCGATTTATAATCATTTATAAGATT
Found at i:281338 original size:218 final size:219
Alignment explanation
Indices: 279338--290820 Score: 4312
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279328 AGATGTAACA
* * *
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* * * * * * * * *
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* * * * *
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* *
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* * * **
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1 ATAAATGAA-T-TATATCATAATTTTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGAT
* * ** * * * * * *
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* * * * ***
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*
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* * * * *
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1 ATAAATGAATTA--TATCATAATTTTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGAT
* * * * * ** * * *
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64 AAATCATTTCAAGCTTTCGAAAGCATGATAAACTTAAAATACT-TTTCCATGTCAATGGAT-GGA
* * ** * * * * *
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127 TGTCACTTCATGTCTTCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAACAACAACAAAGC
* *
279992 -TTTCACTTTATAATCATTTATGAGATT
192 TTTTCAATTTATAATCATTTATAAGATT
* * * * *
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1 ATAAATGAA-T-TATATCATAATTTTGATGATAAAATGTTA-TCAAAATGATAATTATTCATTGA
* * * * ** * **
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* * ** * *
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126 ATGTC-ACTTCATGTCTTC-CAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAACAACAACAA
*
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* * * * *
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1 AT-AAATGAA-T-TATATCATAATTTTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGA
* * * * * *
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* *** * * * *
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124 GGATGTCACTTCATGTCTTCC-AATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAACAACAACA
** * *
280440 AAGATTCCAATTTATTTTTGATTTGTAATTATTTATAAGATT
188 AAG----C------TTTTCAATTTATAATCATTTATAAGATT
* * * **
280482 ATAAATGAATTATATATCATAATGTTGACGATAAACTGTTATCAAAATGATAATTATTCATTCTT
1 ATAAATGAA-T-TATATCATAATTTTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGAT
* * * * *
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64 AAATCATTTCAAGCTTTCGAAAGCA-TGATAAACTTAAAAT-ACTTTTCCATGTCAATGGATGG-
* * * ** **
280611 AT-CCATTTCATGT-TTCTCAATGCAAACATCCAATTATGATAGCTTTTAACCATGAACAGTAAA
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* * *
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* * * * * *
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1 ATAAATGAATTAT--ATCATAATTTTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGAT
* * * * * * * *
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64 AAATCATTTCAAGCTTTCGAAAGCATGATAAACTTAAAATACT-TTTCCATGTCAATGGAT-GGA
* ** * * * * * *
280843 T-CCA-TTGCACATATTCCAATGCAAATATCTAATTATAATAGGTTTTAACCTAGAACAA-AAA-
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* *
280904 CACTTTCAATTTATTGTCGATTACAATAGTTTATAA-AGTT
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* * * * * *
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1 ATAAATGAA-T-TATATCATAATTTTGATGATAAAATGTT-ATCAAAATGATAATTATTCATTGA
* * * * * * * * *
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63 TAAATCATTTCAAGCTTTCGAAAGCATGATAAACTTAAAATACT-TTTCCATGTCAATGGAT-GG
* * * * * * * *
281073 AT-TCAGTGCATGTTTTTCAATGTAAACATCCAATTGTGATGGGTTTTAACCAACAACAACGAAG
126 ATGTCACTTCATGTCTTCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAACAACAACAAAG
* * *
281137 CTTTT-GATTTAT-AGCATTTACAAGATT
191 CTTTTCAATTTATAATCATTTATAAGATT
* *
281164 ATAAATGAGTTATATCATAATTTTGATGAGAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAA
1 ATAAATGAATTATATCATAATTTTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAA
* * *
281229 ATCTTTTCGAGCTTTCGAAAGCATGATAAACTTAAAATACCTGTTT-CATGTCAGTGGATAGGAT
66 ATCATTTCAAGCTTTCGAAAGCATGATAAACTTAAAATA-CT-TTTCCATGTCAATGGAT-GGAT
* * * *
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128 GTCACTTCATGTCTTCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAACAACAACA-AA--
* * *
281357 TTTGATTTGATTTCGATTTATAATTATTTATAAGATT
190 ---G--CT--TTTCAATTTATAATCATTTATAAGATT
* * **
281394 ATAAATGAATTATAT-ATCATCCTATTGATGATAAAATGTTATCAAAGTGATAATTATTTGTTGA
1 ATAAATGAATTATATCATAAT--T-TTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGA
* * *** * * * *
281458 TAAATCATTCCAAGCTTTTGGGGGCATGATAAACTTAAAACATTATTTCCATGTTAACGGATGGC
63 TAAATCATTTCAAGCTTTCGAAAGCATGATAAACTTAAAATACT-TTTCCATGTCAATGGATGG-
* * * * * *
281523 ATCT-ATTTCACAT-TCTT--AATGCAAACATCTAA-TATGATAGGTTTTAATCAAGAACAATAA
126 ATGTCACTT--CATGTCTTCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAACAACAACAA
*
281583 AGTTTTCGATTTATTTTCAATTTATAATCATTTATAAAATT
189 AG----C------TTTTCAATTTATAATCATTTATAAGATT
* * * * *
281624 ATAAATGAACTATACATCATCATATTGATGATAAAATGTGATCAAAATGATAATTATTCTTTGAT
1 ATAAATGAA-T-TATATCATAATTTTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGAT
* * *
281689 AAATCATTTCAAGCTTTCAAAAGAATGATAAACTTAAAATACTTTTTCCTTGTCAATGGATGGAT
64 AAATCATTTCAAGCTTTCGAAAGCATGATAAACTTAAAATAC-TTTTCCATGTCAATGGATGGAT
* * * * * *
281754 AGCATCCACTACATCT-TTCCCAATGCAAACATCCAATAATGAAAAGTTTTAACCAAGAACAACA
128 -G--T-CACTTCATGTCTT-CCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAACAACAACA
*
281818 AAG-TTTTCAAATTTATAA-CAGTTATAAGATT
188 AAGCTTTTC-AATTTATAATCATTTATAAGATT
** * * * *
281849 ATAAATGAATTATATTTTAATTTTGATCATAAAATTTTATCAAAATAATAACTATTCATTGATAA
1 ATAAATGAATTATATCATAATTTTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAA
* * * * * * * *
281914 ATGC-TTCCGAGATTTCAAAAGCATGATAAACTTAAAATGCCCTTTCCATGTCAATGGCTAGCAT
66 AT-CATTTCAAGCTTTCGAAAGCATGATAAACTTAAAAT-ACTTTTCCATGTCAATGGAT-GGAT
* ** * * ** ** * * *
281978 -CCACTTCACATTTTTCAATGCAAACATGTAATTATGATCA-GTTTTAATGAAGAATAACAAAGT
128 GTCACTTCATGTCTTCCAATGCAAACATCCAATTATGAT-AGGTTTTAACCAACAACAACAAAGC
* * * *
282041 TTTTGATTTATTTTCGATTGATAATCACTTAGATGATT
192 TTTTCA---A---T---TT-ATAATCATTTATAAGATT
** * * * * *
282079 ATAAATGAATTATATATCATAATACTGATGATAAAATGTTAGCAAAATAAGAATTCTTCATTTAT
1 ATAAATGAA-T-TATATCATAATTTTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGAT
** * * * * * * * * **
282144 AAATCATTTTTATCTTTC-AAAGGAATGATAAACCTAAGATGCTATTTTCTTGTTAATGGA-CAA
64 AAATCATTTCAAGCTTTCGAAA-GCATGATAAACTTAAAATACT-TTTCCATGTCAATGGATGGA
* * * * * * * * * * *
282207 TATCCACTTTAT-TTTTCCCAATGCAAATATCTATTTATGATA-GATTTAACCGAGAACGACAAT
127 TGT-CACTTCATGTCTT-CCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAACAACAACAAA
* **
282270 G-GTTTGGATTTATAATCATTTATAAGATT
190 GCTTTTCAATTTATAATCATTTATAAGATT
* * * * * * * *
282299 ATAAATGAGTGATATCACAATATTGAGGGTAAAATGTTATCTAAATGATAATTATTCAATGATAT
1 ATAAATGAATTATATCATAATTTTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATA-
* * * * ** * * * * *
282364 ATTC-TTTCAAGCTTTTC-AAGGTATGATAAAATTAAAATGTTCTTTGCTTGTTAATAGAT-AAC
65 AATCATTTCAAGC-TTTCGAAAGCATGATAAACTTAAAATACT-TTTCCATGTCAATGGATGGA-
*** * * * ** * * * *
282426 ACCCATTTCATGT-TGCCCAATGCAAACGTTTAATTATGATAGGTTTTAACCAAGAAAAATATAG
127 TGTCACTTCATGTCT-TCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAACAACAACAAAG
* *
282490 CTTTT-GATTTATAATCTTTTATAAGATT
191 CTTTTCAATTTATAATCATTTATAAGATT
* * * * * * *
282518 ATAAATGGATTGAATATCATAATATTGATGATTAAAATGCTATCAAAAGGATAGTCATTAATTGA
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* * * * * * * **
282583 TAAATCCTTTGAAGCATTCAAAAGCATAATAAACATT-AAATGCCTTTTCCTTGTCAGCGGATAG
63 TAAATCATTTCAAGCTTTCGAAAGCATGATAAAC-TTAAAAT-ACTTTTCCATGTCAATGGAT-G
* * * * * ** *
282647 TAT-CCGCTTCATGT-TTCCCAATGCAAACATACAATTATCATAGGTTTTAAAAAAGAACAACAA
125 GATGTCACTTCATGTCTT-CCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAACAACAACAA
* * *
282710 CGC-TTTCAATTTATTTCAATTTATGATTATTTATACAATT
189 AGCTTTTCAATTTA--T-AA-TCAT--TTA--TA-A-GATT
* ** * * * * **
282750 ATAAATGAATTAGATATCATAATATCAATGAT-AAATATAAGCAAAATGATAATAATTCATCAAT
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* * * * ** ** * *
282814 AAATCATTTTAAGCTTT-TATAGGCATGACAAACTTAAAATGGTCTTTCTTTATCAATGGATAGC
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* * ** * *
282878 AT-CCACTTCACGT-TTCTTGATGCAAGCATCCAATTATGATAGGTTTTAACTAGA-AACAACAA
126 ATGTCACTTCATGTCTTC-CAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACCA-ACAACAACAA
* * * *
282940 AGC-TTTCGATTTATAATCATTTAGAAAACT
189 AGCTTTTCAATTTATAATCATTTATAAGATT
* * * * * * *
282970 GTAAATGAATTATATATCATAATATTGACGAGAAAATGTTATCAAAATAATAATTCTTCATTCAT
1 ATAAATGAA-T-TATATCATAATTTTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGAT
* * * ** *
283035 GAATCATTTCAAGCTTTC-AAAGGCATGATAAACTTCAAATGCTTTTTCGTTGTCAACGGATGGA
64 AAATCATTTCAAGCTTTCGAAA-GCATGATAAACTTAAAATAC-TTTTCCATGTCAATGGATGG-
* * * * * * * * * * *
283099 AT-CCACTTCATTTTTTCAAACGCAAACATTCAATTAAGATAGATTTTAGCCAAAAATAACAAAA
126 ATGTCACTTCATGTCTTCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACC---AACAACAACA
* * * *
283163 TGTTTAAGTTATTTTCGATTTATAATCATTTATTACATT
188 -----AAG--CTTTTCAATTTATAATCATTTATAAGATT
* * * *
283202 ATAAATGAGTTTATATCATAGTATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATGGATA
1 ATAAATGA-ATTATATCATAATTTTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATA
* * * * *
283267 AATCTTTTAAAGCTTTTGAAGGCATGATAAACTTAAAATACTCTTTCCATG-CAAATGGATAGCA
65 AATCATTTCAAGCTTTCGAAAGCATGATAAACTTAAAATACT-TTTCCATGTC-AATGGAT-GGA
* * * * * *
283331 T-CCACTTCATGT-TGCTCAATGCAAACATCCAATAATGATAGGTTTTATCCAAGAACAACCAAG
127 TGTCACTTCATGTCTTC-CAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAACAACAACAAAG
*
283394 CTTTCAAATTATTATCAACTTATAATCATTTATAAGATT
191 ----C----T-TT-TCAATTTATAATCATTTATAAGATT
* *
283433 ATAAATGAATTAGACATCATAATATTT-ATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGG
1 ATAAATGAATT--ATATCATAAT-TTTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGA
** * * * * *
283497 TAAATTGTTTCAAGCTTTC-AAAGGCATGATAAACATACAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGGTAG
63 TAAATCATTTCAAGCTTTCGAAA-GCATGATAAACTTAAAATACT-TTTCCATGTCAATGGAT-G
* * * * * * *
283561 CAT-CCAATTCATGTTTTGCCAA-GCAAACATTCAATTATGAT-TGTTTTAACCAAGAACAACAA
125 GATGTCACTTCATGTCTT-CCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAACAACAACAA
* * * **
283623 AACTTTTAATTTATTTTTTTATAATGATTTATTTGATT
189 AGCTTTTCA---A----TTTATAATCATTTATAAGATT
* * * * * *
283661 GTAAATGAATTATATATCATAATATTGTTGATAAATTGTTATCAAAATGATAGTTATTTATTGAT
1 ATAAATGAA-T-TATATCATAATTTTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGAT
* * * * * *
283726 AAATTC-TTTCAAGCTTTTGAAGGCATGA-AAA--T---CT-C-TTTCCGTGTTAATGGATAGCA
64 AAA-TCATTTCAAGCTTTCGAAAGCATGATAAACTTAAAATACTTTTCCATGTCAATGGAT-GGA
* * ** ** * * * * *
283782 TCT-ATTTCACAT-TTCTCAATATAAATAGCTAATTATGATAGCTTTTAACCTTAAATAACAACA
127 TGTCACTTCATGTCTTC-CAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACC---AACAACAACA
** *
283845 CATTCTATTTATTGCCAA-TTATAATCATTTATGAGATT
188 -AAGC---TT-TT--CAATTTATAATCATTTATAAGATT
* * *
283883 ATAAATGAATTATATGTCATAATATTGATGATAAAATGTGATCAAAATGATAATTGTTCATTGAT
1 ATAAATGAATTATA--TCATAATTTTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGAT
* * * *
283948 -AA--A-TT---G-TTTC--AAGCATGATAAATTTCAAATACTCTTTCCTTGTCAATGGATTGCA
64 AAATCATTTCAAGCTTTCGAAAGCATGATAAACTTAAAATACT-TTTCCATGTCAATGGA-TGGA
* * * * * ** * *
284003 T-CCACTTCTTGT-TCCCTAATGCAAATATTCAATTATTG-TAGGTTTTATTCAAAAACAAAAAA
127 TGTCACTTCATGTCTTCC-AATGCAAACATCCAATTA-TGATAGGTTTTAACCAACAAC--AACA
* * * *
284065 AACTTCCAATTTGTTTTCAATTTATAATTATTTATAAGGTC
188 AA---GC------TTTTCAATTTATAATCATTTATAAGATT
* * *
284106 ATAAATGAATTATAAATC-TGAATGTTGATGATAGAATGTTATCAAAATGATAATTCTTCATTGA
1 ATAAATGAATTAT--ATCAT-AATTTTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGA
* * * * * * * *
284170 CAAATCATTTCAAGTTTTTG-AAGTCATTG-TAAACTTAAACTGCTTTTTTCTTGTTAATGGATA
63 TAAATCATTTCAAGCTTTCGAAAG-CA-TGATAAACTTAAAATAC-TTTTCCATGTCAATGGAT-
** * * * * * *
284233 ACAT-CCACTTCATCTTTTCCAATGCAAACATTCAATTATGATAGGTTTTATCCAAGAACAAC-A
124 GGATGTCACTTCATGTCTTCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAACAACAACAA
*
284296 A-----TC-A---GT--T-A--TA-AA-ATT
189 AGCTTTTCAATTTATAATCATTTATAAGATT
* * *
284311 ATAAATGAATTATACTTCATAATATTGATGATAAAAT-TTGATCAAAATGATAATTTTTCATTAA
1 ATAAATGAATTATA--TCATAATTTTGATGATAAAATGTT-ATCAAAATGATAATTATTCATTGA
* * * * * **
284375 TAAATGATTTCAAGCTTTCGAAGGTATGATAAACTTAAAATGCTCTTT-CTTAACAATGGAT--A
63 TAAATCATTTCAAGCTTTCGAAAGCATGATAAACTTAAAATACT-TTTCCATGTCAATGGATGGA
* * * * * * * *
284437 TCATCCACTCCATGT-TTCCTAGTGCAAA-ATTCAATTACGAGAGGTTATAACCAAGAACAACAA
127 T-GT-CACTTCATGTCTTCC-AATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAACAACAACAA
284500 AGC-TTTCAATTTATAA-CATTTATAAGATT
189 AGCTTTTCAATTTATAATCATTTATAAGATT
* * ** *
284529 ATAAAAGAATTATATCATAATTTTGATCACT-AAATGTTATCAAAATGATAACCATTAATTGATA
1 ATAAATGAATTATATCATAATTTTGATGA-TAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATA
* * * * *
284593 AATGC-TTTCAAGCTTTCAAAAGCATGAGAAACTTAAAA-AGCCCTTTCCATATCAATGGATAGC
65 AAT-CATTTCAAGCTTTCGAAAGCATGATAAACTTAAAATA--CTTTTCCATGTCAATGGAT-GG
* * * * * * * *
284656 AT-CCATTTCACGT-TTCACAATGCAAACATCCAACTATGATAGGTTTCAAACGAAGAATAACAA
126 ATGTCACTTCATGTCTTC-CAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTT-TAACCAACAACAACAA
*
284719 AG-TTTTCAATTTATTTTTGATTTATAATCACTTA-AATGATT
189 AGCTTTTC-----A------ATTTATAATCATTTATAA-GATT
* * * * * * *
284760 ATAAATTACTTATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTAGCAAAATGAGAATTCTTCATTCAT
1 ATAAATGA-AT-TATATCATAATTTTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGAT
* ** * *
284825 AAATCATTTCAAGCTTTC-AAAGGTATGATAAACTTAAAATGTTATTTCCTTGTCAATGGAT-AA
64 AAATCATTTCAAGCTTTCGAAA-GCATGATAAACTTAAAATACT-TTTCCATGTCAATGGATGGA
** * * * * * *
284888 CATCTACTTCAT-TTTTCTTAATGCAAACATCCAATTATGATAGATTTTAACTAAAAACAACAAT
127 TGTC-ACTTCATGTCTTC-CAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAACAACAACAAA
* *
284952 G-GTTTCAATTTATAATCATTTATACGATT
190 GCTTTTCAATTTATAATCATTTATAAGATT
* * * * * * *
284981 ATAAATGAATGATATCACAATATTGAGGGTACAATGTTATCAAAATGATAATTATTTATTGATAA
1 ATAAATGAATTATATCATAATTTTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAA
* * * * ** * * * * **
285046 ATCCTTTCAAGCTTTTGAAGGCATGATAAAATTAAAATGTTGTTTGCTTGTCATTGGAT-AACAC
66 ATCATTTCAAGCTTTCGAAAGCATGATAAACTTAAAATACT-TTTCCATGTCAATGGATGGA-TG
* * ** * * * * *
285110 CCATTTCATGT-TATCCCGTGCAAACCTCTAATTATGATAGGTTTTAACCAAGC-ATAATAGA-C
129 TCACTTCATGTCT-TCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAA-CAACAACAAAGC
* *
285172 CTTTCGATTTATAAT-ATTTTATAAGATT
192 TTTTCAATTTATAATCA-TTTATAAGATT
* *
285200 ATAAATGAATTGCATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATAATAATTATTCATTGAT
1 ATAAATGAATT--ATATCATAATTTTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGAT
* * * * * * * * * *
285265 AAATCTTTTCAAACTTTCAAAAGCATGATAAACATCAAATGCCCTTT-CTTGGTCAATGAATAGA
64 AAATCATTTCAAGCTTTCGAAAGCATGATAAACTTAAAAT-ACTTTTCCAT-GTCAATGGAT-GG
* * ** ** * * * *
285329 AT-CCACCTCA-CACTTTCCACCGCAAATATACAATTATGATA-GTTTTAACAAAGAACAACAAA
126 ATGTCACTTCATGTC-TTCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAACAACAACAAA
285391 GC-TTTCAATTTATTTCGATTTACAATCATTTATAAGATT
190 GCTTTTC-A---ATTT--A--T--AATCATTTATAAGATT
* ** * *
285430 ATAAATGAATTAGATATCATAATATCAATGATAAAATGTGATCAAAATGATAATAATTCATTGAT
1 ATAAATGAATT--ATATCATAATTTTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGAT
* * * *
285495 AAATCATTTTAAGCTTTCG-TAGCCATGATAAACTTAAAATGA-TCTTTCCTTATCAATGGATAG
64 AAATCATTTCAAGCTTTCGAAAG-CATGATAAACTTAAAAT-ACT-TTTCCATGTCAATGGAT-G
* * * * * * ** ** **
285558 CAT-TCATTTCACGT-TTCCTGATGTAAGCATTGAATTATGATAAATTTTAACCAGGAACAACAA
125 GATGTCACTTCATGTCTTCC-AATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAACAACAACAA
285621 AGC-TTTCAATTTATAATCATTTATAAGATT
189 AGCTTTTCAATTTATAATCATTTATAAGATT
* * * * *
285651 GTAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATAATACTTCTTCATTGAT
1 ATAAATGAA-T-TATATCATAATTTTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGAT
* * * * * **
285716 GAATCATTTCAAGCTTTCG-ACGACATGGTAAACTTAAAATGCTCTTT-CTTGTCAATGGATAAA
64 AAATCATTTCAAGCTTTCGAAAG-CATGATAAACTTAAAATACT-TTTCCATGTCAATGGATGGA
*** * ** * * * * *
285779 ACCCACTTCAT-TTTTCCCAATGCAAACATTTAACTAAGATAAGTTTTAACCAAGAACAACAAAA
127 TGTCACTTCATGTCTT-CCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAACAACAACAAAG
* * *
285843 CTTTTGAGTGATCTTTTATTTATAATCATTTATTACATT
191 C--TT---T--TC---AATTTATAATCATTTATAAGATT
* * * * *
285882 ATAAATGAATTTGTATCATAATATTGATGGTAAAATGTTATCACAATAATAATTATTCATTGATA
1 ATAAATGAA-TTATATCATAATTTTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATA
* * * * * * * *** * *
285947 AAGCCTTTGAAGCTTTTGAAGGCATGATAAATTTAAAATGCTCTTTTTTTGCCAATGGATAGCAT
65 AATCATTTCAAGCTTTCGAAAGCATGATAAACTTAAAATACT-TTTCCATGTCAATGGAT-GGAT
* * ** * * * * * *
286012 -CCACATCACATTTTTCTATGCAAACATCCAATAATGATAGGTTTTAACTAAGAACAACAAAGCT
128 GTCACTTCATGTCTTCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAACAACAACAAAGC-
*
286076 TTTGATTTAGTATCGATTTATAATCATTTATAAGATT
192 ------TT--T-TCAATTTATAATCATTTATAAGATT
* * * * *
286113 ATAAAT-ACTTTATACATCAAAATATTGATGATAAAATGTGATCAAAATGATAATTATTCATTAA
1 ATAAATGA-ATTAT--ATCATAATTTTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGA
* * * * * * * *
286177 TAAAGCGTTTTAGGCTTTCAAAAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTGT-C-TTTCCATGGAT
63 TAAATCATTTCAAGCTTTC-GAAA-GCATGATAAACTTAAAATACT-TT-TCCATGTCAATGGAT
* * * * * * * * *
286240 AGCAT-CCAATTCACATTTC-ACCAAT-CAAATAGT-CAATTATGATATGTTTTAACAAAGAACA
124 -GGATGTCACTT--CATGTCTTCCAATGCAAACA-TCCAATTATGATAGGTTTTAACCAACAACA
* * *
286301 ACAAAGCTTTTGATTTATTTTTTTATAATGATTTATTAGATT
185 ACAAAGCTTTTCA---A----TTTATAATCATTTATAAGATT
* * * *
286343 ATAAATGAATTATATATCATAATATTGTTGATAAAATATTATCAAAATGATAATTATTTATTGAT
1 ATAAATGAA-T-TATATCATAATTTTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGAT
* * * * * * * * * * *
286408 AGACCCTTTCAAGTTTTCGAAGGCATGATAAA-TTTAAGTTCTCTTTTCTTGTCAATGGATAGCA
64 AAATCATTTCAAGCTTTCGAAAGCATGATAAACTTAAAATACT-TTTCCATGTCAATGGAT-GGA
* * ** *** * * *
286472 TCT-ATTTCACAT-TTCTCAATGCAAACATCTTGTTATGATAAGTTTTAGCCATA-AATAACAAA
127 TGTCACTTCATGTCTTC-CAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACCA-ACAACAACAAA
* *
286534 GCGTTTGATTTATTATCAATTTATAATTATTTATGAGATT
190 GC--------T-TT-TCAATTTATAATCATTTATAAGATT
* * * * **
286574 ATAAATGAATCATACATCATAATATTGATGAAAAAATGTGATCAAAATGATAATTGCTCATTG--
1 ATAAATGAAT--TATATCATAATTTTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGAT
* * * * * *
286637 --ATCA-ATC-A--TTTC--AAGCATGATAAATTTAAAGTACTCTTTTCTTGTCAATGGATTGCA
64 AAATCATTTCAAGCTTTCGAAAGCATGATAAACTTAAAATACT-TTTCCATGTCAATGGA-TGGA
* * * *** * *
286694 T-CCACTTCATGT-TCCCTAATGCAAACATCAAATTATTG-TAGGTTTTATTGAAGAACAAAAAA
127 TGTCACTTCATGTCTTCC-AATGCAAACATCCAATTA-TGATAGGTTTTAACCAACAACAACAAA
* *
286756 GTTTCCAATTTATTTTCAATTTATAATCATTTATAAGGTC
190 G----C------TTTTCAATTTATAATCATTTATAAGATT
* * * * * * *
286796 ATAAACAGATTATATATCCTAATATTAATGATAAAATATTATCAAAATGATAATTCTTCATTGAT
1 ATAAA-TGAAT-TATATCATAATTTTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGAT
* * * * * * * *
286861 GAATCATTTCAAGCTTTCG-AAGTATTGATAAACTTAAATTGCTTTTTCCTTATTAATGGATAGC
64 AAATCATTTCAAGCTTTCGAAAGCA-TGATAAACTTAAAATAC-TTTTCCATGTCAATGGAT-GG
* * * * ** ** * * ** *
286925 AT-CCACTACAT-TTTTCCCAATACAAACATTTAATTACAATAGGTTTTAACTAAGAGTAGCAAA
126 ATGTCACTTCATGTCTT-CCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAACAACAACAAA
* **
286988 GCTTTCGATTTATTGTCGATTTATAATCATTTATAATTTT
190 G----C----T-TT-TCAATTTATAATCATTTATAAGATT
* * * * *
287028 ATAAATGAATTATACACCATAATATTAATGATAAAAT-TTGATCAAAATGATAATTTTTCATTAA
1 ATAAATGAATTAT--ATCATAATTTTGATGATAAAATGTT-ATCAAAATGATAATTATTCATTGA
* * * * *
287092 TAAATCATTTCAAGCTTTCGAAGGTATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGT
63 TAAATCATTTCAAGCTTTCGAAAGCATGATAAACTTAAAATACT-TTTCCATGTCAATGGAT-GG
* * * ** *
287157 AT-TCACTACATGT-TTCCAGTGCAAACATCCAATTATGAGAGGTTTTAATGAAGAACAACAAAG
126 ATGTCACTTCATGTCTTCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAACAACAACAAAG
* * *
287220 GTTTT-GATTTATAA-CATCTATAAGATT
191 CTTTTCAATTTATAATCATTTATAAGATT
* * * * *
287247 ATAAGTGAATTAAATTATAATTTTGATAATAAAATGTTATCAAAATGATAGCTT-TTCATTGATA
1 ATAAATGAATTATATCATAATTTTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATA-ATTATTCATTGATA
* * * * * *
287311 AATGC-TTTCGAGCTTTCAAAAGC-TGATAAACTTAAAATGCCCTTTCCATGTCAACT-AATAGC
65 AAT-CATTTCAAGCTTTCGAAAGCATGATAAACTTAAAAT-ACTTTTCCATGTCAA-TGGAT-GG
* * ** ** * *
287373 A--TCAATTTCATG-CTTCTCAATGCAATCATCCAATTATGATACATTTTAATGAATAATAACAA
126 ATGTC-ACTTCATGTCTTC-CAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAACAACAACAA
* * * * *
287435 TGTTTCCAATTTATTTTCGATTTATAATCACTTAGATGATT
189 AG----C------TTTTCAATTTATAATCATTTATAAGATT
* * ** * * * *
287476 ATAAATAAATTATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCCGAATGAGAATTCTTTATTAAT
1 ATAAATGAA-T-TATATCATAATTTTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGAT
* * * * * ** *
287541 AAATCATTTCAAGCTTTC-AAAGGTATAATAAACTGAAAATTCTATTTCCTTGTTGATGGAT-AA
64 AAATCATTTCAAGCTTTCGAAA-GCATGATAAACTTAAAATACT-TTTCCATGTCAATGGATGGA
* * * * ** * *
287604 TATCCACTTCAT-T-TTCCTAGTACAAACATCTAATTATGATATATTTTAACCAAGAACAACAAT
127 TGT-CACTTCATGTCTTCC-AATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAACAACAACAAA
* * *
287667 G-GTTTCCATTTATAATCATTTATAGGATT
190 GCTTTTCAATTTATAATCATTTATAAGATT
* * * * *
287696 ATAATTGAATGATATCACAATATGGATG-TAAAAT-TATATCAAAATGATAATTATTCATTGATA
1 ATAAATGAATTATATCATAATTTTGATGATAAAATGT-TATCAAAATGATAATTATTCATTGATA
* * * * * ** *
287759 AATCCTTTCAAGCTTTTC--ACGACATGATAAAATTAAACTGCTCTTTGAATGTCAATGGAT-AA
65 AATCATTTCAAGC-TTTCGAAAG-CATGATAAACTTAAAATACT-TTTCCATGTCAATGGATGGA
*** * * * * * *
287821 CACCTATTTCATGTTGCTT--AATGCAAACATCTAATTTTGATAGGTTTTAACCAATAACAATAG
127 TGTC-ACTTCATG-T-CTTCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAACAACAACAA
* * * * *
287884 AGATTTT-GATTAATAACCTTTTATAAGATT
189 AGCTTTTCAATTTATAATCATTTATAAGATT
* * *
287914 ATAAATGAATTACATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATC-AAGTGACAATTATTCATT-AT
1 ATAAATGAATT--ATATCATAATTTTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGA-
* * * *
287977 TAAATCCTTTTAAGCTTTCGAAAGCATGATAAACATT-AAATGCCTTTTCCTTGTCAAT-GATAG
63 TAAATCATTTCAAGCTTTCGAAAGCATGATAAAC-TTAAAAT-ACTTTTCCATGTCAATGGAT-G
* * * * * *
288040 CAT-CCACTTCACGT-TTCTCAATGAAAACATACAATTATGATAGGTTTTAA-CATAGAACAACA
125 GATGTCACTTCATGTCTTC-CAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACCA-ACAACAACA
* *
288102 AAGTTTTCAATTTATTTCTATTTATAATCATTTATAATATT
188 AAG----C----T-TTTCAATTTATAATCATTTATAAGATT
* * * * * * * *
288143 ATAAATGAATTAGATATCTTAATATCGATGATAAAATGTGATCAAAGTGATAATAATTCGTTGGT
1 ATAAATGAATT--ATATCATAATTTTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGAT
* * * * * * * * * *
288208 CAATCATTTTAAGCTTTTGTAGGCATGATAAACTTAAAGTGATCTTTT-CTTATAAATGGAT-AA
64 AAATCATTTCAAGCTTTCGAAAGCATGATAAACTTAAAAT-A-CTTTTCCATGTCAATGGATGGA
* * * * * **
288271 TATCTACTTCACGT-TTCCTGATGTAAGCATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAGGAACAACAAA
127 TGTC-ACTTCATGTCTTCC-AATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAACAACAACAAA
*
288335 GCTTTT-GATTTATAATCATTTATAAGATT
190 GCTTTTCAATTTATAATCATTTATAAGATT
* * * * *
288364 GTAAATTAATTATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATAATAATTCTTCATTGAT
1 ATAAATGAA-T-TATATCATAATTTTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGAT
* * * * * * * *
288429 GAATCATTTCAAGCTTTCGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCATTCCTTATCAACGGATAGCA
64 AAATCATTTCAAGCTTTCGAAAGCATGATAAACTTAAAATACT-TTTCCATGTCAATGGAT-GGA
* * ** * * * *
288494 T-CCACTTCAT-TTTTCCCAACACCAACATTCAATTAAT-ATAGGCTTTAACCAAGAACAACAAA
127 TGTCACTTCATGTCTT-CCAATGCAAACATCCAATT-ATGATAGGTTTTAACCAACAACAAC--A
* * * * *
288556 ACGTTTGAGTTATTTTCGATTTATAAACATTTATTACATT
188 A------AG--CTTTTCAATTTATAATCATTTATAAGATT
* * *
288596 ATAAATGAATTTATATCATAGTATTGATGATTAAATGTTATCAAAATGATCAA-TATTCATTGAT
1 ATAAATGAA-TTATATCATAATTTTGATGATAAAATGTTATCAAAATGAT-AATTATTCATTGAT
* * * * * * * * * * * *
288660 AAATCCTTTGAAGCTTTTGTAGGTATGATAGACTTAAAATGCTCTTTCCTTGCCAATAGATAGCA
64 AAATCATTTCAAGCTTTCGAAAGCATGATAAACTTAAAATACT-TTTCCATGTCAATGGAT-GGA
* * * * * * * *
288725 T-CCACTTTATGT-TTCTTAATGCAAACATCTAATAATGATAGTTTTTAATCAAGAA-AACCAAA
127 TGTCACTTCATGTCTTC-CAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAACAACAA-CAAA
*
288787 GCTTTCGATTTATTATCAATTTATAATCATTTATAGGATT
190 G----C----T-TT-TCAATTTATAATCATTTATAAGATT
* *** * *
288827 ATAAATGAATTATATACATCATAATATTT-ATTATAAAATACGATCAAAATAATAATTATTTATT
1 ATAAATGAA-T-TAT--ATCATAAT-TTTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATT
** * * * * *
288891 GATAAATTGTTTCAAGCTTTC-AAAGGCATAATAAACTTAAAATGCTCCTTCCTTATCAATGGAT
61 GATAAATCATTTCAAGCTTTCGAAA-GCATGATAAACTTAAAATACT-TTTCCATGTCAATGGAT
* * * * * * * * * * *
288955 AGCATCTTA-TTCACGT-TT-CACTGAGCAAACATGCAGTTATGATACGTTTTAACTAAGAATAA
124 -GGATGTCACTTCATGTCTTCCAAT--GCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAACAACAA
* * * *
289017 CAAAACTTTTGATTTATTTTTTTATAATGATTTATTAGATT
186 CAAAGCTTTTCA---A----TTTATAATCATTTATAAGATT
* * *
289058 ATAAATGAATTATATATCATAATATTGTTGATAAAATATTATCAAAATGATAATTACTT-ATTGA
1 ATAAATGAA-T-TATATCATAATTTTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTA-TTCATTGA
* * * * * * ** * * *
289122 TAAATCCTTTCAAGCTTTTGAAGGCGTGATAAATTTAAATTTTTTTTACCTTGTCAGTGGATAGC
63 TAAATCATTTCAAGCTTTCGAAAGCATGATAAACTTAAAATACTTTT-CCATGTCAATGGAT-GG
* * * * * *
289187 AT-CCATTTCACATGTC-T-CAATGCTAATATCTAATTATGATAGGTTTTAACCTTGAACAGCAA
126 ATGTCACTT--CATGTCTTCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACC---AACAAC-A
* ** *
289249 AGCTTTCAATTTATTGTCAATTTATAATCATTTATGAGATT
185 A-C---AAAGCT-TT-TCAATTTATAATCATTTATAAGATT
* * ** * *
289290 ATAAATGAATTATACATCATAATATTGATAATAAAATGAGATCAAAATTATAATTGTTCATTGAT
1 ATAAATGAATTAT--ATCATAATTTTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGAT
* * * * * * * *
289355 AAATCGTTTCAAGCTTTTGAATGCATAATAAATTTAAAATTCTTTTTCCTTGTCAATGGATTGCA
64 AAATCATTTCAAGCTTTCGAAAGCATGATAAACTTAAAATAC-TTTTCCATGTCAATGGA-TGGA
* * * * * ** * *
289420 T-CCATTTTAAGT-TTCCCAATGCAAATATCCAATTATTG-TAGGTTTTATTCAAAAACCA-AAA
127 TGTCACTTCATGTCTT-CCAATGCAAACATCCAATTA-TGATAGGTTTTAACCAACAACAACAAA
*
289481 GCTTTCAATTTGTTTTCAATTTATAATCATTTATAA-AGTC
190 G----C------TTTTCAATTTATAATCATTTATAAGA-TT
* *
289521 ATAAATGAATTATTATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATCAT-A--ATTC-TT--TA
1 ATAAATGAATTA-TATCATAATTTTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATA
* * * * ** * * ** *
289580 TATCATTTCAACCTTTTGAAGGTGTGATAAACTTAAAATTCTCTTTCCTTGTCAATAAATAGCAT
65 AATCATTTCAAGCTTTCGAAAGCATGATAAACTTAAAATACT-TTTCCATGTCAATGGAT-GGAT
* * * * * * **
289645 -CCAATT-ATGATAGACTT-TAA-CCAAGA-A--C-A-TA--A-AAGCTTT---------CAATT
128 GTCACTTCATG-T---CTTCCAATGCAA-ACATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAACAACAACA
* * *
289689 TA--TTTTTAATTTATAATCATTTATGAGATT
188 AAGCTTTTCAATTTATAATCATTTATAAGATT
* * *
289719 ATAAATGAATTATATATGATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTTTTCATTGAT
1 ATAAATGAA-T-TATATCATAATTTTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGAT
* * * * * * * *
289784 TAATCTTTTCAAGTTTTCGAAAGCATGAT-AACTTAAAATGCCCTTTCCTTGTTAATGG-TAGCA
64 AAATCATTTCAAGCTTTCGAAAGCATGATAAACTTAAAAT-ACTTTTCCATGTCAATGGAT-GGA
* * ** * * ** * * *
289847 T-CCACTTTATGT-TTGCCAACACAAATATCTAATTATGGCAGATTTTAACAAAAAACAACAAAG
127 TGTCACTTCATGTCTT-CCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAACAACAACAAAG
289910 TTCTCTATTTATTTTCAATTTATAATCATTTATAAGATT
191 ----C------TTTTCAATTTATAATCATTTATAAGATT
* * * * * *
289949 AGAAACGAATCACATATCATAATATTAATGATAAAATGTTACTGC--AATGATAATTATTCATTA
1 ATAAATGAAT--TATATCATAATTTTGATGATAAAATGTTA-T-CAAAATGATAATTATTCATTG
* * * * * *
290012 ATAAATCATTTTAAGCTTTAGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTGCCTTGTCAATGGATGG
62 ATAAATCATTTCAAGCTTTCGAAAGCATGATAAACTTAAAATACT-TTTCCATGTCAATGGATGG
* * * * * **
290077 CT-TCCACGTCATGTTTTTCAATGCAAACATCTAATTA-GAGTACATTTT-----A-AACAACAA
126 ATGT-CACTTCATGTCTTCCAATGCAAACATCCAATTATGA-TAGGTTTTAACCAACAACAACAA
* *
290134 AG-TTTTCCATTTATAATCATTTGTAAGATT
189 AGCTTTTCAATTTATAATCATTTATAAGATT
* *
290164 ATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTCTTCATTGAT
1 ATAAATGAA-T-TATATCATAATTTTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGAT
* * * * * * * * * * * * ** *
290229 GAATCAATCCAATCATTCTAAGGCATTATAAACTTAAAATGCCCTTTACTTGTCAATAAATAGCA
64 AAATCATTTCAAGCTTTCGAAAGCATGATAAACTTAAAAT-ACTTTTCCATGTCAATGGAT-GGA
* * ** * * * * * * *
290294 T-CCCCTTCACAT-TTCTCAGTACTAACATTCAATTATGATAGGTTTTAACTAAGAACAATAAAA
127 TGTCACTTCATGTCTTC-CAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAACAAC-A-ACAA
* ** ** * *
290357 TTTTTGAGTTATTTTTTATTTATAATTTTTTATAACACT
189 ------AG--CTTTTCAATTTATAATCATTTATAAGATT
* * *
290396 ATAAATGAATTATATATGATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTTATTGAT
1 ATAAATGAA-T-TATATCATAATTTTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGAT
* * * * * * *
290461 AAATCATTTCAAGCTTTTG-AAGCCACGAT-AACTTGAAATACTCTATCCTTATCAATGGATGCA
64 AAATCATTTCAAGCTTTCGAAAG-CATGATAAACTTAAAATACT-TTTCCATGTCAATGGATGGA
* * * * * *
290524 T-CCACTTCACGTTTTCCAATGCAAACATCCAATTATGAGAGGTTTTAACTAAGAACAACAAAGC
127 TGTCACTTCATGTCTTCCAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAACAACAACAAAG-
* * *
290588 TCTTGATTCATTTTCAATTTATGATTTTTATAAGATT
191 -CTT--TTCAATTT--A-TAATCA--TTTATAAGATT
* * * * **
290625 ATAAATGAATTATTTACCATAATATTGATGATAAAAGGTTATCAAAATGAAAATGGTTCATTGAT
1 ATAAATGAATTA--TATCATAATTTTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGAT
** * * ** * *
290690 AAATCATTTCAAATTTTCGAAGGGATGATAAACTTAAAATGTTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCA
64 AAATCATTTCAAGCTTTCGAAAGCATGATAAACTTAAAATACT-TTTCCATGTCAATGGAT-GGA
* ** * * * *
290755 T-CCACTTCACAT-TTCTCAAAGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTAAACCAAGAACAATAAAG
127 TGTCACTTCATGTCTTC-CAATGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAACAACAACAAAG
290818 CTT
191 CTT
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Statistics
Matches: 8732, Mismatches: 1760, Indels: 1524
0.73 0.15 0.13
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Consensus pattern (219 bp):
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CAATTTATAATCATTTATAAGATT
Found at i:287478 original size:902 final size:889
Alignment explanation
Indices: 284295--290830 Score: 4014
Period size: 902 Copynumber: 7.2 Consensus size: 889
284285 CAAGAACAAC
* * *
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1 AATCATTTATAAGATTATAAATGAATTATACATCATAATATTGATGATAAAATTTGATCAAAATG
* * * *
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66 ATAATTATTCATTAATAAATCATTTCAAGCTTTCAAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCT
** * *
284425 TAACAATGGATA-TCATCCACTC-CATGTTTCCTAGTGCAAA-ATTCAATTACGAGAGGTTATAA
131 TGTCAATGGATAGT-ATCCACTCACATGTTTCC-AGTGCAAATA-TCAATTATGAGAGGTTTTAA
* ** *
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* * * *
284549 TTTTGATCACT-AAATGTTATCAAAATGATAACCATTAATTGATAAATGCTTTCAAGCTTTCAAA
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* * *
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* * * * *
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385 CAAACATCCAATTATGATA-ATTT-TAACGAAGAATAACAAAG-TTTCAATTTATTATCGATTTA
* * * *
284743 TAATCACTTAAATGATTATAAATTACTTATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTAGCAAAAT
447 TAATCACTTAGA-GATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAAT
* * * *
284808 GAGAATTCTTCATTCATAAATCATTTCAAGCTTTCAAAGGTATGATAAACTTAAAATGTTATTTC
511 GAGAATTCTTCATTGATAAATCATTTCAAG---TC------ATGATAAACTTAAAATGCTCTTTT
* * * * *
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567 CTTGTCAATGGATAACATCCACTTCATTTTCCCTAATGCAAACATCAAATTATGATAGGTTTTAA
** * ** *
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* * *
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696 C-CTAATATTGATGGTAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCCTTTCAAGCTT
* * * * * *
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760 TTGAAGGCATGATAAAATTAAAATGCTT-TTT-CTTGTCAATGGATAGCATCCACTACAT-TTTT
* * * * * *
285124 CCCGTGCAAACCTCTAATTATGATAGGTTTTAACCAAGCATAATAGACCTTTCGATTTA-T--A-
822 CCCATGCAAACATCTAATTATGATAGGTTTTAACTAAG-ATAACAAAGCTTTCGATTTATTCGAT
285185 --AT
886 TTAT
** *
285187 -AT--TTTATAAGATTATAAATGAATTGCATATCATAATATTGATGATAAAATGTT-ATCAAAAT
1 AATCATTTATAAGATTATAAATGAATTATACATCATAATATTGATGATAAAAT-TTGATCAAAAT
* * * * * * * *
285248 AATAATTATTCATTGATAAATCTTTTCAAACTTTCAAAAGCATGATAAACATCAAATGCCCTTTC
65 GATAATTATTCATTAATAAATCATTTCAAGCTTTCAAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTC
* * * ** *
285313 TTGGTCAATGAATAGAATCCACCTCACA-CTTTCCACCGCAAATATACAATTATGATA-GTTTTA
130 TT-GTCAATGGATAGTATCCA-CTCACATGTTTCCAGTGCAAATAT-CAATTATGAGAGGTTTTA
*
285376 ACAAAGAACAACAAAGCTTTCAATTTATTTCGATTTACAATCATTTATAAGATTATAAATGAATT
192 ACAAAGAACAACAAAG----C----T-TTT-GATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATT
** * * *
285441 AGATATCATAATATCAATGATAAAATGTGATCAAAATGATAATAATTCATTGATAAAT-CATTTT
247 AGATATCATAATATTGATAATAAAATGTTATCAAAATGATAAT-ATTCATTGATAAATGC-TTTC
** ** *
285505 AAGCTTTC-GTAGCCATGATAAACTTAAAATGATCTTTCCTTATCAATGGATAGCATTCATTTCA
310 AAGCTTTCAAAAG-CATGATAAACTTAAAATGCCCTTTCCATATCAATGGATAGCA-TCATTTCA
* * * ** * * *
285569 CGTTTC-CTGATGTAAGCATTGAATTATGATAAATTTTAACCAGGAACAACAAAGCTTTCAATTT
373 CGTTTCTC-AATGCAAACATCCAATTATGAT-AATTTTAACGAAGAATAACAAAG-TTTCAATTT
* *
285633 ATAATC-A--T-T--T-A--TA-AGATTGTAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAAT
435 ATTATCGATTTATAATCACTTAGAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAAT
* * * * *
285688 GTTATCAAAATAATACTTCTTCATTGATGAATCATTTCAAGCTTTCGACGACATGGTAAACTTAA
500 GTTATCAAAATGAGAATTCTTCATTGATAAATCATTTCAAG---T------CATGATAAACTTAA
* * ** * *
285753 AATGCTC-TTTCTTGTCAATGGATAAAACCCACTTCATTTTTCCC-AATGCAAACATTTAACTAA
556 AATGCTCTTTTCTTGTCAATGGATAACATCCACTTCA-TTTTCCCTAATGCAAACATCAAATTAT
* * * * * * *
285816 GATAAGTTTTAACCAAGAACAACAAAACTTTTGAGTGATCTTT-TATTTATAATCATTTATTACA
620 GATAGGTTTT-A--AAGAACAA-AAAA--TTTCAATTAT-TTTCAATTTATAATCATTTATAAGA
* * * *
285880 TTATAAATGAATT-TGTATCATAATATTGATGGTAAAATGTTATCACAATAATAATTATTCATTG
678 TTATAAATG-ATTATATATCCTAATATTGATGGTAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTG
* * * * *
285944 ATAAAGCCTTTGAAGCTTTTGAAGGCATGATAAATTTAAAATGCTCTTTTTTTGCCAATGGATAG
742 ATAAATCCTTTCAAGCTTTTGAAGGCATGATAAAATTAAAATGCT-TTTTCTTGTCAATGGATAG
* * * *
286009 CATCCACATCACATTTTT-CTATGCAAACATCCAATAATGATAGGTTTTAACTAAGAACAACAAA
806 CATCCAC-T-ACATTTTTCCCATGCAAACATCTAATTATGATAGGTTTTAACTAAG-ATAACAAA
*
286073 GCTTTTGATTTAGTATCGATTTAT
868 GCTTTCGATTTA-T-TCGATTTAT
* * *
286097 AATCATTTATAAGATTATAAAT-ACTTTATACATCAAAATATTGATGATAAAATGTGATCAAAAT
1 AATCATTTATAAGATTATAAATGA-ATTATACATCATAATATTGATGATAAAATTTGATCAAAAT
* * * *
286161 GATAATTATTCATTAATAAAGCGTTTTAGGCTTTCAAAAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTT
65 GATAATTATTCATTAATAAATCATTTCAAGCTTTC--AAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTT
* * * * * * *
286226 GTCTT-TCCATGGATAGCATCCAATTCACAT-TTCACCAAT-CAAATAGTCAATTATGATATGTT
128 -TCTTGTCAATGGATAGTATCC-ACTCACATGTT-TCCAGTGCAAATA-TCAATTATGAGAGGTT
* *
286288 TTAACAAAGAACAACAAAGCTTTTGATTTATTTTTTTATAATGATTTATTAGATTATAAATGAAT
189 TTAACAAAGAACAACAAAGCTTTTG----A----TTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAAT
* * * * * * **
286353 TATATATCATAATATTGTTGATAAAATATTATCAAAATGATAATTATTTATTGATAGACCCTTTC
246 TAGATATCATAATATTGATAATAAAATGTTATCAAAATGATAA-TATTCATTGATAAATGCTTTC
* * * * * * * * * *
286418 AAGTTTTCGAAGGCATGATAAA-TTTAAGTTCTCTTTTCTTGTCAATGGATAGCATCTATTTCAC
310 AAGCTTTCAAAAGCATGATAAACTTAAAATGCCCTTTCCATATCAATGGATAGCATC-ATTTCAC
* *** * * *
286482 ATTTCTCAATGCAAACATCTTGTTATGATAAGTTTTAGCCATA-AATAACAAAGCGTTT-GATTT
374 GTTTCTCAATGCAAACATCCAATTATGATAA-TTTTAACGA-AGAATAACAAA--GTTTCAATTT
* * * * * *
286545 ATTATCAATTTATAATTATTTATGAGATTATAAATGAATCATACATCATAATATTGATGAAAAAA
435 ATTATCGATTTATAATCACTTA-GAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAA
* * * * * *
286610 TGTGATCAAAATGATAATTGC-TCATTGATCAATCATTTCAAG-CATGATAAATTTAAAGTACTC
499 TGTTATCAAAATGAGAATT-CTTCATTGATAAATCATTTCAAGTCATGATAAACTTAAAATGCTC
** *
286673 TTTTCTTGTCAATGGATTGCATCCACTTCATGTTCCCTAATGCAAACATCAAATTATTG-TAGGT
563 TTTTCTTGTCAATGGATAACATCCACTTCATTTTCCCTAATGCAAACATCAAATTA-TGATAGGT
* *
286737 TTTATTGAAGAACAAAAAAGTTTCCAATTTATTTTCAATTTATAATCATTTATAAGGTCATAAAC
627 TTTA---AAGAACAAAAAA-TTT-CAA-TTATTTTCAATTTATAATCATTTATAAGATTATAAA-
* * * * * * *
286802 AGATTATATATCCTAATATTAATGATAAAATATTATCAAAATGATAATTCTTCATTGATGAATCA
685 TGATTATATATCCTAATATTGATGGTAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCC
* * * * * *
286867 TTTCAAGCTTTCGAA-GTATTGATAAACTTAAATTGCTTTTTCCTTATTAATGGATAGCATCCAC
750 TTTCAAGCTTTTGAAGGCA-TGATAAAATTAAAATGCTTTTT-CTTGTCAATGGATAGCATCCAC
* * ** *
286931 TACATTTTTCCCAATACAAACATTTAATTACAATAGGTTTTAACTAAGAGTAGCAAAGCTTTCGA
813 TACATTTTTCCC-ATGCAAACATCTAATTATGATAGGTTTTAACTAAGA-TAACAAAGCTTTCGA
286996 TTTATTGTCGATTTAT
876 TTTA-T-TCGATTTAT
** * *
287012 AATCATTTATAATTTTATAAATGAATTATACACCATAATATTAATGATAAAATTTGATCAAAATG
1 AATCATTTATAAGATTATAAATGAATTATACATCATAATATTGATGATAAAATTTGATCAAAATG
* * *
287077 ATAATTTTTCATTAATAAATCATTTCAAGCTTTCGAAGGTATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCC
66 ATAATTATTCATTAATAAATCATTTCAAGCTTTCAAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTT-C
* * *
287142 TTGTCAATGGATAGTATTCACT-ACATGTTTCCAGTGCAAACATCCAATTATGAGAGGTTTTAAT
130 TTGTCAATGGATAGTATCCACTCACATGTTTCCAGTGCAAATAT-CAATTATGAGAGGTTTTAAC
* * * * *
287206 GAAGAACAACAAAGGTTTTGATTTATAA-CATCTATAAGATTATAAGTGAATTA-A-ATTATAAT
194 AAAGAACAACAAAGCTTTTGATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTAGATATCATAAT
* * * *
287268 TTTGATAATAAAATGTTATCAAAATGATAGCTTTTCATTGATAAATGCTTTCGAGCTTTCAAAAG
259 ATTGATAATAAAATGTTATCAAAATGATA-ATATTCATTGATAAATGCTTTCAAGCTTTCAAAAG
* * * *
287333 C-TGATAAACTTAAAATGCCCTTTCCATGTCAACT-AATAGCATCAATTTCATGCTTCTCAATGC
323 CATGATAAACTTAAAATGCCCTTTCCATATCAA-TGGATAGCATC-ATTTCACGTTTCTCAATGC
* * * * *
287396 AATCATCCAATTATGATACATTTTAATGAATAATAACAATGTTTCCAATTTATTTTCGATTTATA
386 AAACATCCAATTATGATA-ATTTTAACGAAGAATAACAAAGTTT-CAATTTATTATCGATTTATA
* **
287461 ATCACTTAGATGATTATAAATAAATTATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCCGAATGA
449 ATCACTTAGA-GATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGA
* * * * * * *
287526 GAATTCTTTATTAATAAATCATTTCAAGCTTTCAAAGGTATAATAAACTGAAAATTCTATTTCCT
513 GAATTCTTCATTGATAAATCATTTCAAG---TC------ATGATAAACTTAAAATGCTCTTTTCT
** * * * * ** **
287591 TGTTGATGGATAATATCCACTTCATTTT-CCTAGTACAAACATCTAATTATGATATATTTTAACC
569 TGTCAATGGATAACATCCACTTCATTTTCCCTAATGCAAACATCAAATTATGATAGGTTTTAAAG
* * ** * * *
287655 AA-GAACAA---CAA-TGGTTTCCATTTATAATCATTTATAGGATTATAATTGA--ATGATATCA
634 AACAAAAAATTTCAATTATTTTCAATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGATTAT-ATATC-
*
287713 C-AATATGGAT-GTAAAAT-TATATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCCTTTCAAGCTTT
697 CTAATATTGATGGTAAAATGT-TATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCCTTTCAAGCTTT
* * * * *** * * * * *
287775 TCACGACATGATAAAATTAAACTGCTCTTTGAATGTCAATGGATAACA-CCTATTTCATGTTGCT
761 TGAAGGCATGATAAAATTAAAATGCT-TTTTCTTGTCAATGGATAGCATCC-ACTACATTTTTC-
** * * *
287839 TAATGCAAACATCTAATTTTGATAGGTTTTAAC-CA-ATAACAATAG----AGA-TT-TT-GATT
823 CCATGCAAACATCTAATTATGATAGGTTTTAACTAAGATAACAA-AGCTTTCGATTTATTCGATT
*
287895 AAT
887 TAT
* * * * *
287898 AACCTTTTATAAGATTATAAATGAATTACATATCATAATATTGATGATAAAATGTT-ATC-AAGT
1 AATCATTTATAAGATTATAAATGAATTATACATCATAATATTGATGATAAAAT-TTGATCAAAAT
* * * *
287961 GACAATTATTCATTATTAAATCCTTTTAAGCTTTCGAAA-GCATGATAAACATT-AAATGC-CTT
65 GATAATTATTCATTAATAAATCATTTCAAGCTTTC-AAAGGCATGATAAAC-TTAAAATGCTC-T
* * * * *
288023 TTCCTTGTCAAT-GATAGCATCCACTTCAC--GTTTCTCAATGAAAACATACAATTATGATAGGT
127 TT-CTTGTCAATGGATAGTATCCAC-TCACATGTTTC-CAGTGCAAATAT-CAATTATGAGAGGT
* * *
288085 TTTAACATAGAACAACAAAGTTTTCAATTTATTTCTATTTATAATCATTTATAATATTATAAATG
188 TTTAACAAAGAACAACAAAG----C----T-TTT-GATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATG
* * * * * * * *
288150 AATTAGATATCTTAATATCGATGATAAAATGTGATCAAAGTGATAATAATTCGTTGGTCAAT-CA
243 AATTAGATATCATAATATTGATAATAAAATGTTATCAAAATGATAAT-ATTCATTGATAAATGC-
* *** * * ** * * * ** *
288214 TTTTAAGCTTTTGTAGGCATGATAAACTTAAAGTGATCTTTTCTTATAAATGGATAATATCTACT
306 TTTCAAGCTTTCAAAAGCATGATAAACTTAAAATGCCCTTTCCATATCAATGGATAGCATC-ATT
* * * * * * *
288279 TCACGTTTC-CTGATGTAAGCATCCAATTATGATAGGTTTTAACCAGGAACAACAAAG---C---
370 TCACGTTTCTC-AATGCAAACATCCAATTATGATA-ATTTTAACGAAGAATAACAAAGTTTCAAT
* * * *
288337 -T-TT-T-GATTTATAATCATTTATAAGATTGTAAATTAATTATATATCATAATATTGATGATAA
433 TTATTATCGATTTATAATCACTTA-GAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAA
* * *
288398 AATGTTATCAAAATAATAATTCTTCATTGATGAATCATTTCAAGCTTTCGAAGGCATGATAAACT
497 AATGTTATCAAAATGAGAATTCTTCATTGAT-AA--A--TC-A--TTTC-AAGTCATGATAAACT
* * * * * ** *
288463 TAAAATGCTCATTCCTTATCAACGGATAGCATCCACTTCATTTTTCCC-AACACCAACATTC-AA
553 TAAAATGCTCTTTTCTTGTCAATGGATAACATCCACTTCA-TTTTCCCTAATGCAAACA-TCAAA
* * * * *
288526 TTAAT-ATAGGCTTTAACCAAGAACAACAAAACGTTTGAGTTATTTTCGATTTATAAACATTTAT
616 TT-ATGATAGG-TTTTA--AAGAACAA-AAAA--TTTCAATTATTTTCAATTTATAATCATTTAT
* * * * * *
288590 TACATTATAAATGAATT-TATATCATAGTATTGATGATTAAATGTTATCAAAATGATCAA-TATT
674 AAGATTATAAATG-ATTATATATCCTAATATTGATGGTAAAATGTTATCAAAATGAT-AATTATT
* * * * * * * *
288653 CATTGATAAATCCTTTGAAGCTTTTGTAGGTATGATAGACTTAAAATGCTCTTTCCTTGCCAATA
737 CATTGATAAATCCTTTCAAGCTTTTGAAGGCATGATAAAATTAAAATGCT-TTTTCTTGTCAATG
** * ** * * *
288718 GATAGCATCCACTTTATGTTTCTTAATGCAAACATCTAATAATGATAGTTTTTAA-TCAAGAAAA
801 GATAGCATCCACTACATTTTTC-CCATGCAAACATCTAATTATGATAGGTTTTAACT-AAGATAA
*
288782 CCAAAGCTTTCGATTTATTATCAATTTAT
864 -CAAAGCTTTCGATTTA-T-TCGATTTAT
* * * **
288811 AATCATTTATAGGATTATAAATGAATTATATACATCATAATATTTATTATAAAATACGATCAAAA
1 AATCATTTATAAGATTATAAATGAA-T-TATACATCATAATATTGATGATAAAATTTGATCAAAA
* * * ** *
288876 TAATAATTATTTATTGATAAATTGTTTCAAGCTTTCAAAGGCATAATAAACTTAAAATGCTCCTT
64 TGATAATTATTCATTAATAAATCATTTCAAGCTTTCAAAGGCATGATAAACTTAAAATGCT-CTT
* * * * * * * * * * *
288941 CCTTATCAATGGATAGCATCTTATTCAC--GTTTCACTGAGCAAACATGCAGTTATGATACGTTT
128 TCTTGTCAATGGATAGTATC-CACTCACATGTTTC-CAGTGCAAATAT-CAATTATGAGAGGTTT
* * * * *
289004 TAACTAAGAATAACAAAACTTTTGATTTATTTTTTTATAATGATTTATTAGATTATAAATGAATT
190 TAACAAAGAACAACAAAGCTTTTG----A----TTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATT
* * * * *
289069 ATATATCATAATATTGTTGATAAAATATTATCAAAATGATAATTACTT-ATTGATAAATCCTTTC
247 AGATATCATAATATTGATAATAAAATGTTATCAAAATGATAA-TA-TTCATTGATAAATGCTTTC
** * * * **** * * *
289133 AAGCTTTTGAAGGCGTGATAAA-TTTAAATTTTTTTTACCTTGTCAGTGGATAGCATCCATTTCA
310 AAGCTTTCAAAAGCATGATAAACTTAAAATGCCCTTT-CCATATCAATGGATAGCAT-CATTTCA
* * * * * * *** * *
289197 CATGTCTCAATGCTAATATCTAATTATGATAGGTTTTAACCTTGAACAGCAAAGCTTTCAATTTA
373 CGTTTCTCAATGCAAACATCCAATTATGATA-ATTTTAACGAAGAATAACAAAG-TTTCAATTTA
* * * * *
289262 TTGTCAATTTATAATCATTTATGAGATTATAAATGAATTATACATCATAATATTGATAATAAAAT
436 TTATCGATTTATAATCACTTA-GAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAAT
** * * * * * *
289327 GAGATCAAAATTATAATTGTTCATTGATAAATCGTTTCAAGCTTTTGAATGCATAATAAATTTAA
500 GTTATCAAAATGAGAATTCTTCATTGATAAATCATTTCAA------G--T-CATGATAAACTTAA
* ** * * * * *
289392 AATTCT-TTTTCCTTGTCAATGGATTGCATCCATTTTAAGTTTCCC-AATGCAAATATCCAATTA
556 AATGCTCTTTT-CTTGTCAATGGATAACATCCA-CTTCATTTTCCCTAATGCAAACATCAAATTA
* ** *
289455 TTG-TAGGTTTTATTCAAAAACCAAAAGCTTTCAATTTGTTTTCAATTTATAATCATTTATAA-A
619 -TGATAGGTTTTA---AAGAA-CAAAAAATTTCAA-TTATTTTCAATTTATAATCATTTATAAGA
* * * *
289518 GTCATAAATGAATTAT-TATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATCAT-A--ATTC-TT
678 -TTATAAATG-ATTATATATCCTAATATTGATGGTAAAATGTTATCAAAATGATAATTATTCATT
* * * ** * * * **
289578 --TATATCATTTCAACCTTTTGAAGGTGTGATAAACTTAAAATTCTCTTTCCTTGTCAATAAATA
741 GATAAATCCTTTCAAGCTTTTGAAGGCATGATAAAATTAAAATGCT-TTTTCTTGTCAATGGATA
* * * *
289641 GCAT-C-C-A-A---TT---ATG-ATAGA-CT--TTA--ACCAAG----AAC----AT-A-AAAG
805 GCATCCACTACATTTTTCCCATGCAAACATCTAATTATGA-TAGGTTTTAACTAAGATAACAAAG
* **
289680 CTTTCAATTTATTTTTAATTTAT
869 CTTTCGATTTA--TTCGATTTAT
* * *
289703 AATCATTTATGAGATTATAAATGAATTATATATGATAATATTGATGATAAAATGTT-ATCAAAAT
1 AATCATTTATAAGATTATAAATGAATTATACATCATAATATTGATGATAAAAT-TTGATCAAAAT
* * * * * *
289767 GATAATTTTTCATTGATTAATCTTTTCAAGTTTTCGAAA-GCATGAT-AACTTAAAATGCCCTTT
65 GATAATTATTCATTAATAAATCATTTCAAGCTTTC-AAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTT
* * ** *** *
289830 CCTTGTTAATGG-TAGCATCCACT-TTATGTTTGCCAACACAAATATCTAATTATG-GCAGATTT
129 -CTTGTCAATGGATAGTATCCACTCACATGTTT-CCAGTGCAAATATC-AATTATGAG-AGGTTT
* * * *
289892 TAACAAAAAACAACAAAGTTCTCTATTTATTTTCAATTTATAATCATTTATAAGATTAGAAACGA
190 TAACAAAGAACAACAAAG----C------TTTT-GATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGA
* * * * *
289957 ATCACATATCATAATATTAATGATAAAATGTTACTGC--AATGATAATTATTCATTAATAAAT-C
244 ATTAGATATCATAATATTGATAATAAAATGTTA-T-CAAAATGATAA-TATTCATTGATAAATGC
* * * * * * * *
290019 ATTTTAAGCTTT-AGAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTGCCTTGTCAATGGATGGCTTCCA
306 -TTTCAAGCTTTCA-AAAGCATGATAAACTTAAAATGCCCTTTCCATATCAATGGATAGCAT-CA
** * * * *
290083 CGTCATGTTTTTCAATGCAAACATCTAATTA-GAGTACATTTT-----A-AACAACAAAGTTTTC
368 TTTCACGTTTCTCAATGCAAACATCCAATTATGA-TA-ATTTTAACGAAGAATAACAAAG-TTTC
* * *
290141 CATTTATAATC-A--T-T--T---GTA-AGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGAT
430 AATTTATTATCGATTTATAATCACTTAGAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGAT
* * *
290196 AAAATGTTATCAAAATGATAATTCTTCATTGATGAATCAATCCAATCATTCTAAGGCATTATAAA
495 AAAATGTTATCAAAATGAGAATTCTTCATTGAT--A--AAT-C-AT--TTC-AAGTCATGATAAA
* * ** * * * * * * *
290261 CTTAAAATGCCCTTTACTTGTCAATAAATAGCATCCCCTTCACATTTCTC-AGTACTAACATTC-
551 CTTAAAATGCTCTTTTCTTGTCAATGGATAACATCCACTTCA-TTTTCCCTAATGCAAACA-TCA
* * ** **
290324 AATTATGATAGGTTTTAACTAAGAACAATAAAATTTTTGAGTTATTTTTTATTTATAATTTTTTA
614 AATTATGATAGGTTTT-A--AAGAACAA-AAAA--TTTCAATTATTTTCAATTTATAATCATTTA
* * ** *
290389 TAACACTATAAATGAATTATATATGATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGATAATTATT
673 TAAGATTATAAATG-ATTATATATCCTAATATTGATGGTAAAATGTTATCAAAATGATAATTATT
* * * * * * * * * *
290454 TATTGATAAATCATTTCAAGCTTTTGAAGCCACGAT-AACTTGAAATACTCTATCCTTATCAATG
737 CATTGATAAATCCTTTCAAGCTTTTGAAGGCATGATAAAATTAAAATGCT-TTTTCTTGTCAATG
* * * * * *
290518 GAT-GCATCCACTTCACGTTTTCCAATGCAAACATCCAATTATGAGAGGTTTTAACTAAGAACAA
801 GATAGCATCCACTACA-TTTTTCCCATGCAAACATCTAATTATGATAGGTTTTAACTAAG-ATAA
* *
290582 CAAAGCTCTT-GATTCATTTTCAATTTAT
864 CAAAGCT-TTCGATT--TATTCGATTTAT
* * ** * *
290610 GAT-TTTTATAAGATTATAAATGAATTATTTACCATAATATTGATGATAAAAGGTT-ATCAAAAT
1 AATCATTTATAAGATTATAAATGAATTATACATCATAATATTGATGATAAAA-TTTGATCAAAAT
* ** * ** * * *
290673 GAAAATGGTTCATTGATAAATCATTTCAAATTTTCGAAGGGATGATAAACTTAAAATGTTCTTTC
65 GATAATTATTCATTAATAAATCATTTCAAGCTTTCAAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTT-
* ** * * *
290738 CTTGTCAATGGATAGCATCCACTTCACA--TTTCTCAAAGCAAACATCCAATTATGATAGGTTTA
129 CTTGTCAATGGATAGTATCCAC-TCACATGTTTC-CAGTGCAAATAT-CAATTATGAGAGGTTTT
* * *
290801 AACCAAGAACAATAAAGCTTCTGATTTATA
191 AACAAAGAACAACAAAGCTTTTGATTTATA
290831 TTTGATTTAT
Statistics
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Consensus pattern (889 bp):
AATCATTTATAAGATTATAAATGAATTATACATCATAATATTGATGATAAAATTTGATCAAAATG
ATAATTATTCATTAATAAATCATTTCAAGCTTTCAAAGGCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTCT
TGTCAATGGATAGTATCCACTCACATGTTTCCAGTGCAAATATCAATTATGAGAGGTTTTAACAA
AGAACAACAAAGCTTTTGATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGAATTAGATATCATAATAT
TGATAATAAAATGTTATCAAAATGATAATATTCATTGATAAATGCTTTCAAGCTTTCAAAAGCAT
GATAAACTTAAAATGCCCTTTCCATATCAATGGATAGCATCATTTCACGTTTCTCAATGCAAACA
TCCAATTATGATAATTTTAACGAAGAATAACAAAGTTTCAATTTATTATCGATTTATAATCACTT
AGAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAATGTTATCAAAATGAGAATTCTT
CATTGATAAATCATTTCAAGTCATGATAAACTTAAAATGCTCTTTTCTTGTCAATGGATAACATC
CACTTCATTTTCCCTAATGCAAACATCAAATTATGATAGGTTTTAAAGAACAAAAAATTTCAATT
ATTTTCAATTTATAATCATTTATAAGATTATAAATGATTATATATCCTAATATTGATGGTAAAAT
GTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCCTTTCAAGCTTTTGAAGGCATGATAAAATTAA
AATGCTTTTTCTTGTCAATGGATAGCATCCACTACATTTTTCCCATGCAAACATCTAATTATGAT
AGGTTTTAACTAAGATAACAAAGCTTTCGATTTATTCGATTTAT
Found at i:290656 original size:229 final size:231
Alignment explanation
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290126 AACAACAAAG
* ** *
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* * * * * *
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* * ** * * * * *
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129 AAATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCATCCACTTCACATTTCTCAATGCAAACATCCAATTAT
** *
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** * * *
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1 TTTTCAATTTATAATTTTTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAAT
* * * *
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66 GTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAA-CTTTTGAAGGCATGATAAACTTAA
* * * *
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* *
290560 GAGAGGTTTTAACTAAGAACAACAAAGCTCTTGA-TTCA
194 GATAGGTTTTAACTAAGAACAATAAAGCTCTTGAGTT-A
* * * *
290598 TTTTCAATTTATGA-TTTTTATAAGATTATAAATGAATTATTTACCATAATATTGATGATAAAAG
1 TTTTCAATTTATAATTTTTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAAT
* ** * *
290662 GTTATCAAAATGAAAATGGTTCATTGATAAATCATTTCAAATTTTCGAAGGGATGATAAACTTAA
66 GTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAACTTTT-GAAGGCATGATAAACTTAA
* *
290727 AATGTTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCATCCACTTCACATTTCTCAAAGCAAACATCCAATTATG
130 AATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCATCCACTTCACATTTCTCAATGCAAACATCCAATTATG
* * *
290792 ATAGGTTTAAACCAAGAACAATAAAGCT-TCTGATTTA
195 ATAGGTTTTAACTAAGAACAATAAAGCTCT-TGAGTTA
* * *
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290858 AGTATGTGGA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.38, C:0.13, G:0.11, T:0.38
Consensus pattern (231 bp):
TTTTCAATTTATAATTTTTTATAAGATTATAAATGAATTATATATCATAATATTGATGATAAAAT
GTTATCAAAATGATAATTATTCATTGATAAATCATTTCAACTTTTGAAGGCATGATAAACTTAAA
ATGCTCTTTCCTTGTCAATGGATAGCATCCACTTCACATTTCTCAATGCAAACATCCAATTATGA
TAGGTTTTAACTAAGAACAATAAAGCTCTTGAGTTA
Found at i:290987 original size:68 final size:69
Alignment explanation
Indices: 290891--291220 Score: 239
Period size: 68 Copynumber: 4.9 Consensus size: 69
290881 ACATGCTTAC
* ** * *
290891 TCATCTCATAAGGTATAT-GAAAAATACATCATATACATAATCACATGGCAATCATCATGCT-TT
1 TCATCTCATAGGGTATATCGAATTATACATCATATACATAATCACATAGCAATCATCATG-TATA
*
290954 CTCAA
65 CTAAA
* * *
290959 TCATCTCAT-GGAGTATAT-GGATTATACATCATATACATAATCTCATAGCATTCATCATGTATA
1 TCATCTCATAGG-GTATATCGAATTATACATCATATACATAATCACATAGCAATCATCATGTATA
291022 CTAAA
65 CTAAA
* * ** * *
291027 TCATCTCATATGGTATATCGAATT-TACATCATATACACAATCTTATAGTATAT-ATCATGCATA
1 TCATCTCATAGGGTATATCGAATTATACATCATATACATAATCACATAGCA-ATCATCATGTATA
**
291090 CTTGA
65 CTAAA
* * * * ** * ** * *
291095 TCACCTCATATGGTCTATGGAATT-TACATTGTATACACAATCTTATAGTATAT-ATCATGCATA
1 TCATCTCATAGGGTATATCGAATTATACATCATATACATAATCACATAGCA-ATCATCATGTATA
*
291158 CTTAA
65 CTAAA
* * ** *
291163 TCATCTCATATGGTATAT-GAAATT-TACATCATATACCTAATCTTATAGCATTCATCAT
1 TCATCTCATAGGGTATATCG-AATTATACATCATATACATAATCACATAGCAATCATCAT
291221 ACCAAAGATG
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (69 bp):
TCATCTCATAGGGTATATCGAATTATACATCATATACATAATCACATAGCAATCATCATGTATAC
TAAA
Found at i:291220 original size:136 final size:136
Alignment explanation
Indices: 290886--291220 Score: 358
Period size: 136 Copynumber: 2.5 Consensus size: 136
290876 CACATACATG
* * ** * ** * *
290886 CTTACTCATCTCATAAGGTATATGAAAAATACATCATATACATAATCACATGGCAATCATCATGC
1 CTTAATCATCTCATATGGTATATGAAATTTACATCATATACCTAATCTTATAGCATTCATCATGC
* * * *
290951 TTTCTCAATCATCTCATGGAGTATATGGATTATACATCATATACATAATCTCATAGCATTCATCA
66 ATACTCAATCACCTCATGGAGTATATGGATTATACATCATATACACAATCTCATAGCATTCATCA
*
291016 TGTATA
131 TGCATA
* *
291022 CTAAATCATCTCATATGGTATATCG-AATTTACATCATATACAC-AATCTTATAGTATAT-ATCA
1 CTTAATCATCTCATATGGTATAT-GAAATTTACATCATATAC-CTAATCTTATAGCAT-TCATCA
** * * ** * *
291084 TGCATACTTGATCACCTCATATG-GTCTATGGAATT-TACATTGTATACACAATCTTATAGTATA
63 TGCATACTCAATCACCTCAT-GGAGTATATGG-ATTATACATCATATACACAATCTCATAGCAT-
291147 T-ATCATGCATA
125 TCATCATGCATA
291158 CTTAATCATCTCATATGGTATATGAAATTTACATCATATACCTAATCTTATAGCATTCATCAT
1 CTTAATCATCTCATATGGTATATGAAATTTACATCATATACCTAATCTTATAGCATTCATCAT
291221 ACCAAAGATG
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.36, C:0.19, G:0.09, T:0.36
Consensus pattern (136 bp):
CTTAATCATCTCATATGGTATATGAAATTTACATCATATACCTAATCTTATAGCATTCATCATGC
ATACTCAATCACCTCATGGAGTATATGGATTATACATCATATACACAATCTCATAGCATTCATCA
TGCATA
Found at i:292440 original size:16 final size:16
Alignment explanation
Indices: 292421--292455 Score: 52
Period size: 16 Copynumber: 2.2 Consensus size: 16
292411 TCAAAATATC
292421 AAAAAAATAAAAATCT
1 AAAAAAATAAAAATCT
* *
292437 AAAAGAATTAAAATCT
1 AAAAAAATAAAAATCT
292453 AAA
1 AAA
292456 TTTTGCTTTT
Statistics
Matches: 17, Mismatches: 2, Indels: 0
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Matches are distributed among these distances:
16 17 1.00
ACGTcount: A:0.71, C:0.06, G:0.03, T:0.20
Consensus pattern (16 bp):
AAAAAAATAAAAATCT
Found at i:295380 original size:78 final size:78
Alignment explanation
Indices: 295245--295407 Score: 263
Period size: 78 Copynumber: 2.1 Consensus size: 78
295235 TTCTCATCAT
* * *
295245 AATCATAGTGCATTATTTTTACCGTATGACATTATCCGGAACCATCCATAGACAGTTTGCATTTA
1 AATCA-AGTGCATCATTTTTACCATATGACATTATCCGGAACCATCCACAGACAGTTTGCATTTA
295310 TCATTCATAATCTC
65 TCATTCATAATCTC
* * *
295324 AATCAAGTGCATCATTTTTACCATATGACATTATCTGGAACCATCCACGGATAGTTTGCATTTAT
1 AATCAAGTGCATCATTTTTACCATATGACATTATCCGGAACCATCCACAGACAGTTTGCATTTAT
295389 CATTCATAATCTC
66 CATTCATAATCTC
295402 AATCAA
1 AATCAA
295408 TCATACTTAA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (78 bp):
AATCAAGTGCATCATTTTTACCATATGACATTATCCGGAACCATCCACAGACAGTTTGCATTTAT
CATTCATAATCTC
Found at i:296638 original size:30 final size:31
Alignment explanation
Indices: 296585--296643 Score: 102
Period size: 30 Copynumber: 1.9 Consensus size: 31
296575 TCGATCCTGG
*
296585 TGCTATTATTTAGCCCTTAAATTTTTACTCA
1 TGCTATTATTTAGCCCCTAAATTTTTACTCA
296616 TGCTATTATTTA-CCCCTAAATTTTTACT
1 TGCTATTATTTAGCCCCTAAATTTTTACT
296644 TCACAAGATC
Statistics
Matches: 27, Mismatches: 1, Indels: 1
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Matches are distributed among these distances:
30 15 0.56
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Consensus pattern (31 bp):
TGCTATTATTTAGCCCCTAAATTTTTACTCA
Found at i:297543 original size:19 final size:18
Alignment explanation
Indices: 297504--297543 Score: 53
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297494 ATTTATTGTC
*
297504 AATTTATAATCATTTAAA
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*
297522 AATTTATAAATCAGTTATA
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297541 AAT
1 AAT
297544 CATAATATTG
Statistics
Matches: 19, Mismatches: 2, Indels: 1
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Matches are distributed among these distances:
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* * * * * *
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* ** * * ** * *
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* * * * **
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* * * *
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* * *
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* * * * *
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* *
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* * *
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* * * * * * *
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* * * * * * *
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* * *
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* *
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* * *
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* * *
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*
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*
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* * * *
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* * *
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* *
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* * *
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*
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1 A
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** * *
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* *
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* *
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* *
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* * *
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* * * * * *
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* * *
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* *
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*** * *
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* * * *
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* *
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* ****
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* * *
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* * *
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* ********** *
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* * * *
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* * *
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*
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Statistics
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* *
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*
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*** * * *
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* * * ** *
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* * * * ** *
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1 -AAATTATTTAATTAAGTTATTGGGCCTAATTAATT
* * *
370760 AAATTGTTTAATTAAGTTGTTGGGCCTAATTCATT
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1 AAATTA
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*
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*
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Statistics
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1 T
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*
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* **** * * * * *
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* * **
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*
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Statistics
Matches: 113, Mismatches: 30, Indels: 13
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Matches are distributed among these distances:
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GCCTAA
Done.