Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: NW_018397625.1 Herrania umbratica cultivar Fairchild unplaced genomic scaffold, ASM216827v2 scaffold_1133.1, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
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Warning! 248 characters in sequence are not A, C, G, or T
Found at i:499 original size:171 final size:171
Alignment explanation
Indices: 1--3398 Score: 2661
Period size: 171 Copynumber: 19.8 Consensus size: 171
* * * * * * *
1 AAAAGCCTTATTACTCTCTTTAAATAGTTTTATAATCTTAAAAATAATTTTAAGTTCAAAATTAT
1 AAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTT--GAATT-T
* * * * * * *
66 TTTTATACTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACCTCGAAAAATATGAAGAAAAAGG
63 TTTTACATTTTTAGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAACATGAAGAAAAAGG
* * * * *
131 TATTCATTGGCAAAAAAAGTCCATTTATCGT-AACTCATT-TCTTC
128 CATTCATTGGCAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACCT-ATTCT-TTC
* * *
175 AAAAGCCCTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCT-ATTAATTAATTTTAAGTTTAATTTTT
1 AAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCA-TAATTGATTTTAAGTTGAATTTTT
* * * *
239 TTACATTTTTCA--TAAAACAAGCA--ATAATTGAATATTTACC-TCAGAAA-ATGTGTAGAAAA
65 TTACATTTTT-AGTTAAAAC-AG-ATTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAACA--TGAAGAAAA
* * *
298 AGCCATTCATTAGG-AAGAAAAGTCTATTTATAGTCTCTTATTCTTTC
125 AGGCATTCATT-GGCAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACCTATTCTTTC
* * * *
345 AAACGCCTTATTACTCGCTTTAAAAGGTTTTATAATCTCATAATT-AGTTTTAAATTAAATTTTT
1 AAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGA-TTTTAAGTTGAATTTTT
* * * * *
409 TTATATTTTTGGCTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAACATGAAGAAAAAGACA
65 TTACATTTTTAGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAACATGAAGAAAAAGGCA
* * *
474 TACATTGACAATAAAAGTCTATTTATAGTCACCTATTCTTTC
130 TTCATTGGCAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACCTATTCTTTC
* * * * * *
516 AAAAGCCTAATTACTCGGTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTGAAGCTGATTTTTTT
1 AAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTT
* *
581 TACATTTTTAGCTT-AAACAGATTATAATTAAATGT-TGACCTTGAGAAACATGAAGAAAAAAGC
66 TACATTTTTAG-TTAAAACAGATTATAATTGAATGTCT-ACCTTGAGAAACATGAAGAAAAAGGC
* * *
644 A-TCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATGGTCTTCC-ATTCCTTT-
129 ATTCATTGGCAAGAAAAGTCTATTTATAGTC-ACCTATT-CTTTC
* * *
686 AAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTTTAATCTCTTAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTT
1 AAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTT
* * * ** * * *
751 TATATTTTTTATTTAAAATAGATTATAATTGAATGTCTACCTCAAGAAACGTAAAGAGAAAGGCA
66 TACA-TTTTTAGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAACATGAAGAAAAAGGCA
* * *
816 TTCATTGGTAAGAAAACTATATTTATAGTCACCTATTCCTTT-
130 TTCATTGGCAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACCTATT-CTTTC
* * * * **
858 AAAAGTCTTATTGCTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCTCATATTTGATTTTAAGTTTTATTTTTT
1 AAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTT
* * * * **
923 AAAAATTTTTTAATTAAAACAGACTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAATGTGAAGAAAAAGGC
66 -TACA-TTTTTAGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAACATGAAGAAAAAGGC
* * *
988 ATTCATTGGCAAGAAAGGTCTACTTATAGTGACCTATTCTTTC
129 ATTCATTGGCAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACCTATTCTTTC
* * *
1031 AAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGATTTTATTATCTCA-AATTGATTTTAAGTTCAATTTTTT
1 AAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAA-TTTTT
* * * * ** * * * *
1095 TTACGTTTTTAGTTAAAATAGATTATAATTCAATGCCTGTC-TCAAAAATCATGTAGAAAAAGCC
65 TTACATTTTTAGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAA-CATGAAGAAAAAGGC
* * * *
1159 ATTCACTT-GAAAGAAAAGTCTGTTTATGGTC-TCTCATT-TCTTC
129 ATTCA-TTGGCAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACCT-ATTCT-TTC
* * * * *
1202 AAAAGCCTTATTACTCGTTTTAAATAGTTTTATAATCTCAAAATT-AGTTTTAAGTTTAATGTTT
1 AAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGA-TTTTAAGTTGAATTTTT
* * ** * * **
1266 TTATATTTTTAGCTAAAATGGAATATAATTGAATGTCTACCTCGAGAAAGGTGAAGAAAAAGGCA
65 TTACATTTTTAGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAACATGAAGAAAAAGGCA
*
1331 TTCATTGGCAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACCTATTCCTTC
130 TTCATTGGCAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACCTATTCTTTC
* * * * *
1373 AAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCAAAATTGACTTTAAGTTAAATTATTT
1 AAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTT
** * * * *
1438 TACATTTTTAGTTAAAA-ATGGCTATAATTGAATGTCTACCTTCA-AGAACTTGAAGCAAAAGCC
66 TACATTTTTAGTTAAAACA-GATTATAATTGAATGTCTACCTTGAGA-AACATGAAGAAAAAGGC
* * * **
1501 A-TCTATTGGCACGAAATGTCCATTTATAGTCA-CTCAAGCTTT-
129 ATTC-ATTGGCAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACCT-ATTCTTTC
** * * * ** *
1543 AGAAAATCTTATTACTTGCTTTGAATGGTTTTATAAACAAATAATTGATTTTAAGTTGAATCTTT
1 A-AAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTT
* * * * *
1608 TTACATTTTCT-GTTAAAATATACTATAATTGAATGTCTGCCTTGAGAAACATGAAGAAAAAGGT
65 TTACATTTT-TAGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAACATGAAGAAAAAGGC
* * * *
1672 ACTCATTGGCAAGCAAAGTGTATTTATAGTCACCTATTCCTTC
129 ATTCATTGGCAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACCTATTCTTTC
* * * *
1715 AAATGCCTTATTACTCTCTTTAAATGGTTTTATAATCTCA-AATTTAATTTTAAGTTAAATTTTC
1 AAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAA-TTGATTTTAAGTTGAATTTT-
** * *
1779 TTTACATTTTTTAGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAATGTGAAAAAAAAAG
64 TTTACA-TTTTTAGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAACATGAAGAAAAAGG
* * * *
1844 AATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATATATAGTCA-CTCATTCCTTC
128 CATTCATTGGCAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACCT-ATTCTTTC
* * ** *
1888 AAAAGCCTTACTACTCACTTTAAATCATTTTATAATCTCATAATTGATTTTAGGTTGAATTTTTT
1 AAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTT
* * * * * * * *
1953 TTCATTTTTGGTTAGAACATATTATAATTGCATGTCCACCTTGGGAAACATGAAGAAAAAGGTAT
66 TACATTTTTAGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAACATGAAGAAAAAGGCAT
* ** * *
2018 TTATTGGCAAGAAAAGTCTATTTACGGTCACCCGA-TCCTTC
131 TCATTGGCAAGAAAAGTCTATTTATAGTCA-CCTATTCTTTC
* ** * * *
2059 AAAAACCTTATTACTAACTTTAAAAGGTTTTATAATCTCAAAATTGATTTTAAGTTAAATTTTTT
1 AAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTT
* * * * * *
2124 TACAATTTTTTA-TTAAAA-ATG-GTATAATTGAATGTCTGCCTTAGGGAACGCA--AAGCAGAA
66 TAC-A-TTTTTAGTTAAAACA-GATTATAATTGAATGTCTACCTT-GAGAA-ACATGAAGAAAAA
* * ** * * *
2184 GCCATCCATTGATACGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATTCTTTC
126 GGCATTCATTGGCAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACCTATTCTTTC
* * *
2230 AAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAGTCTCAAAATTGATTTTAAGTTGAATTCTTT
1 AAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATT-TTT
* * * * ** * *
2295 GTACATTTTTAATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCAATCTCAAGAAATATAAAGAAAAAGGCA
65 TTACATTTTTAGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAACATGAAGAAAAAGGCA
* * * *
2360 TTCATTGGCAACAAAATTGTATTTATAGTCACCCATTCCTTT-
130 TTCATTGGCAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACCTATT-CTTTC
* * * * *
2402 AAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATATTTGATTTGAAATTGAATTTCTT
1 AAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTT
* * ** * * * *
2467 TACATTTTTCA-TTAAAACAGACTATAATTGAATGCCTGTCTCGGGAAACATGTAGAAAAA-ACT
66 TACATTTTT-AGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAACATGAAGAAAAAGGC-
* * * *
2530 ATTCATTAGG-AAGAAAAGTCCA-TTATAGTCCCCCATTCCTTC
129 ATTCATT-GGCAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACCTATTCTTTC
* * * * * **********
2572 AAAAACCTTATTACTTGCTTAAAATAGTTTTATAAACT-ACTAATTGATTTTAANNNNNNNNNNT
1 AAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCA-TAATTGATTTTAAGTTGAATTTTT
* * * * *
2636 CTATATTTTTGGTTAAAACAGACTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAACGA-GAAGAAAAATGC
65 TTACATTTTTAGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAAC-ATGAAGAAAAAGGC
* ** * * * * ****
2700 ATTCATTAGTGAGAGAAGTCCATTTATATTCACCCATTCNNNN
129 ATTCATTGGCAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACCTATTCTTTC
****** * * * *
2743 NNNNNNCTTATTACTCCCTTTAAATGGTTTTCTAATCCCAAAATTGATTTTAAGTTGAATTCTTT
1 AAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATT-TTT
* * ********** ** *
2808 GTACATTTTTTA-TTAAAATAGATTATAANNNNNNNNNNACCTTGAGAAATGTGAAGAAAAATGC
65 TTACA-TTTTTAGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAACATGAAGAAAAAGGC
* * * *
2872 ATACATTGGCAAGAAAAGTCTATTTATAGTCGTCC-ATCCCTTC
129 ATTCATTGGCAAGAAAAGTCTATTTATAGTC-ACCTATTCTTTC
* * ********** * * *
2915 AAAAGTCTTATTACTCACTTTAAATGGNNNNNNNNNNTCAAAATTGATTTGAAGTTAAATTTTTT
1 AAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAA-TTTTT
* ** * * * *
2980 TTACATTTTT-GATTAAAAAAGGCTATAATTGAATGTCTA-TTTTAGGAAACATGAAGCAAAAGC
65 TTACATTTTTAG-TTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGA-GAAACATGAAGAAAAAGG
* * * ** * *
3043 CATTCATTGACACA-AAAAGCCCATTTATAGTCA-CTCAAGCCTTG
128 CATTCATTGGCA-AGAAAAGTCTATTTATAGTCACCT-ATTCTTTC
* ********* ** *
3087 AAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATNNNNNNNNNNA-CAAATAATTGATTTTAAGTTGAATGTTT
1 AAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAAT-GGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTT
* * * * ** *
3151 TCACATTTTTAGTTAAAACAGACTATAATTGAATGTCTGCTTTGAGAAACACAAAGAAAAAGGTA
65 TTACATTTTTAGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAACATGAAGAAAAAGGCA
** * *
3216 TTCATTGAAAAGAAAAGT-TCATTTATAGTCACCCATTCCTTC
130 TTCATTGGCAAGAAAAGTCT-ATTTATAGTCACCTATTCTTTC
********** * * *
3258 ANNNNNNNNNNTACTCTCTTTAAATGGTTTTATAATGTCAAAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTT
1 AAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAA-TTTTT
* * ** *
3323 TTACATTGTTTGGTTAAAATAGATTATAATTGAATGTCTACCTCAAGAAATATGAAGAAAAAGGC
65 TTACATT-TTTAGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAACATGAAGAAAAAGGC
3388 ATTCATTGGCA
129 ATTCATTGGCA
3399 NNNNNNNNNN
Statistics
Matches: 2550, Mismatches: 569, Indels: 211
0.77 0.17 0.06
Matches are distributed among these distances:
168 1 0.00
169 11 0.00
170 374 0.15
171 1239 0.49
172 526 0.21
173 348 0.14
174 51 0.02
ACGTcount: A:0.35, C:0.13, G:0.12, T:0.38
Consensus pattern (171 bp):
AAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTT
TACATTTTTAGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAACATGAAGAAAAAGGCAT
TCATTGGCAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACCTATTCTTTC
Found at i:1466 original size:686 final size:682
Alignment explanation
Indices: 1--3398 Score: 2737
Period size: 686 Copynumber: 5.0 Consensus size: 682
* * * * *
1 AAAAGCCTTATTACTCTCTTTAAATAGTTTTATAATCTTAAAAATAATTTTAAGTTCAAAATTAT
1 AAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCAAAATTGATTTTAAGTT--AAATTA-
* * ** ** * *
66 TTTTATACTTTTGGTTAAAACAT-ATTATAATTGAATGTCTACCTCGAA-AAATATGAAG-AAAA
63 TTTTACATTTTTTATTAAAA-ATGATTATAATTGAATGTCTACCTC-AAGAAACGTAAAGCAGAA
** * * * * *
128 AGGTATTCATTGGCAAAAAAAGTCCATTTATCGT-AACTCATTTCTTCAAAAGCCCTATTACTCG
126 AGCCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCTCA-TTCTTTAAAAGCCTTATTACTCG
* * *
192 CTTTAAATGGTTTTATAATCT-ATTAATTAATTTTAAGTTTAATTTTTTTACATTTTTCA-TAAA
190 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCA-TAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTAATTAAA
* * * * * * *
255 ACA-AGCAATAATTGAATATTTACC-TCAGAAAATGTGTAGAAAAAGCCATTCATTAGG-AAGAA
254 ACAGA-CTATAATTGAATGTCTACCTTGAG-AAATATGAAGAAAAAGGCATTCATT-GGCAAGAA
* * * *
317 AAGTCTATTTATAGTCTCTTATTCTTTCAAACGCCTTATTACTCGCTTTAAAAGGTTTTATAATC
316 AAGTCTATTTATAGTCACCTATTCTTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATC
* * * * *
382 TCATAATT-AGTTTTAAATTAAATTTT-TTTATATTTTTGGCTAAAACATATTATAATTGAATGT
381 TCATAATTGA-TTTTAAATTAAATTTTCTTTA-CTTTTTAGTTAAAACAGATTATAATTGAATGC
* * * *
445 CTACCTTGAGAAACATGAAGAAAAAGACATACATT-GACAATAAAAGTCTATTTATAGTCAC-CT
444 CTACCTTCAGAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTAGA-AAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTC-
* * * * *
508 ATTCTTTCAAAAGCCTAATTACTCGGTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTGAAGCTG
507 ATTCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
* * *
573 ATTTTTTTTACATTTTTAGCTTAAACA-GATTATAATTAAATGT-TGACCTTGAGAAACATGAAG
572 A-ATTTTTTATATTTTTAGC-TAAA-ATGATTATAATTGAATGTCT-ACCTTGAGAAACATGAAG
* * * *
636 AAAAAAGCA-TCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATGGTCTTCCATTCCTTT
633 AAAAAGGCATTCATTGGCAAGAAAAGTCTATTTATGGTC-ACCATTCCTTC
* ** * *
686 AAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTTTAATCTCTTAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTT
1 AAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCAAAATTGATTTTAAGTTAAATTATTT
* * *
751 TATATTTTTTATTTAAAATAGATTATAATTGAATGTCTACCTCAAGAAACGTAAAG-AGAAAGGC
66 TACATTTTTTATTAAAAAT-GATTATAATTGAATGTCTACCTCAAGAAACGTAAAGCAGAAAGCC
* * ** * *
815 ATTCATTGGTAAGAAAACTATATTTATAGTCACCT-ATTCCTTTAAAAGTCTTATTGCTCGCTTT
130 ATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCTCATT-CTTTAAAAGCCTTATTACTCGCTTT
* * ** * *
879 AAATAGTTTTATAATCTCATATTTGATTTTAAGTTTTATTTTTTAAAAATTTTTTAATTAAAACA
194 AAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTT-TACA-TTTTTAATTAAAACA
* *
944 GACTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAATGTGAAGAAAAAGGCATTCATTGGCAAGAAAGGTCT
257 GACTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAATATGAAGAAAAAGGCATTCATTGGCAAGAAAAGTCT
* * * *
1009 ACTTATAGTGACCTATTCTTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGATTTTATTATCTCA-AA
322 ATTTATAGTCACCTATTCTTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAA
* * * * * **
1073 TTGATTTTAAGTTCAATTTTTTTTACGTTTTTAGTTAAAATAGATTATAATTCAATGCCTGTC-T
387 TTGATTTTAAATTAAATTTTCTTTAC-TTTTTAGTTAAAACAGATTATAATTGAATGCCTACCTT
* * * * * *
1137 CAAAAATCATGTAGAAAAAGCCATTCACTT-GAAAGAAAAGTCTGTTTATGGTCTCTCATTTCTT
451 CAGAAA-CATGAAGAAAAAGCCATTCA-TTAGAAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATTCCTT
* * *
1201 CAAAAGCCTTATTACTCGTTTTAAATAGTTTTATAATCTCAAAATT-AGTTTTAAGTTTAATGTT
514 CAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGA-TTTTAAGTTGAAT-TT
* * **
1265 TTTATATTTTTAGCTAAAATGGAATATAATTGAATGTCTACCTCGAGAAAGGTGAAGAAAAAGGC
577 TTTATATTTTTAGCTAAAAT-GATTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAACATGAAGAAAAAGGC
*
1330 ATTCATTGGCAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACCTATTCCTTC
641 ATTCATTGGCAAGAAAAGTCTATTTATGGTCACC-ATTCCTTC
*
1373 AAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCAAAATTGACTTTAAGTTAAATTATTT
1 AAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCAAAATTGATTTTAAGTTAAATTATTT
** * *
1438 TACA-TTTTTAGTTAAAAATGGCTATAATTGAATGTCTACCTTCAAG-AACTTGAAGCA-AAAGC
66 TACATTTTTTA-TTAAAAATGATTATAATTGAATGTCTACC-TCAAGAAACGTAAAGCAGAAAGC
* * ** ** *
1500 CA-TCTATTGGCACGAAATGTCCATTTATAGTCA-CTCAAGCTTTAGAAAATCTTATTACTTGCT
129 CATTC-ATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCTCATTCTTTA-AAAGCCTTATTACTCGCT
* * ** * * *
1563 TTGAATGGTTTTATAAACAAATAATTGATTTTAAGTTGAATCTTTTTACATTTTCT-GTTAAAAT
192 TTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTT-TAATTAAAAC
* * * * * * *
1627 ATACTATAATTGAATGTCTGCCTTGAGAAACATGAAGAAAAAGGTACTCATTGGCAAGCAAAGTG
256 AGACTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAATATGAAGAAAAAGGCATTCATTGGCAAGAAAAGTC
* * *
1692 TATTTATAGTCACCTATTCCTTCAAATGCCTTATTACTCTCTTTAAATGGTTTTATAATCTCA-A
321 TATTTATAGTCACCTATTCTTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATA
* * *
1756 ATTTAATTTTAAGTTAAATTTTCTTTACATTTTTTAGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTAC
386 A-TTGATTTTAAATTAAATTTTCTTTAC--TTTTTAGTTAAAACAGATTATAATTGAATGCCTAC
* ** * * * * * *
1821 CTTGAGAAATGTGAAAAAAAAAG-AATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATATATAGTCACTCATTCC
448 CTTCAGAAACATG-AAGAAAAAGCCATTCATTAGAAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATTCC
* * *
1885 TTCAAAAGCCTTACTACTCACTTTAAATCA-TTTTATAATCTCATAATTGATTTTAGGTTGAATT
512 TTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAAT-AGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATT
* * * * * *
1949 TTTTTTCATTTTTGGTTAGAACAT-ATTATAATTGCATGTCCACCTTGGGAAACATGAAGAAAAA
576 TTTTAT-ATTTTTAGCTA-AA-ATGATTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAACATGAAGAAAAA
* * *
2013 GGTATTTATTGGCAAGAAAAGTCTATTTACGGTCACCCGA-TCCTTC
638 GGCATTCATTGGCAAGAAAAGTCTATTTATGGTCA-CC-ATTCCTTC
* * * *
2059 AAAAACCTTATTACTAACTTTAAAAGGTTTTATAATCTCAAAATTGATTTTAAGTTAAATTTTTT
1 AAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCAAAATTGATTTTAAGTTAAATTATTT
* * * * * *
2124 TACAATTTTTTATTAAAAATG-GTATAATTGAATGTCTGCCTTAGGGAACGCAAAGCAG-AAGCC
66 TAC-ATTTTTTATTAAAAATGATTATAATTGAATGTCTACCTCAAGAAACGTAAAGCAGAAAGCC
* ** * *
2187 ATCCATTGATACGAAAAGTCCATTTATAGTCACC-CATTCTTTCAAAAGCCTTATTACTCACTTT
130 ATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCTCATTCTTT-AAAAGCCTTATTACTCGCTTT
* * *
2251 AAATGGTTTTATAGTCTCAAAATTGATTTTAAGTTGAATTCTTTGTACATTTTTAATTAAAACAG
194 AAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATT-TTTTTACATTTTTAATTAAAACAG
* * * ** * * * *
2316 ATTATAATTGAATGTCAATCTCAAGAAATATAAAGAAAAAGGCATTCATTGGCAACAAAATTGTA
258 ACTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAATATGAAGAAAAAGGCATTCATTGGCAAGAAAAGTCTA
* * *
2381 TTTATAGTCACCCATTCCTTT-AAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAT
323 TTTATAGTCACCTATT-CTTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAA
* * * **
2445 TTGATTTGAAATTGAA-TTTCTTTACATTTTTCA-TTAAAACAGACTATAATTGAATGCCTGTC-
387 TTGATTTTAAATTAAATTTTCTTTAC-TTTTT-AGTTAAAACAGATTATAATTGAATGCCTACCT
* * * * * * * *
2507 TCGGGAAACATGTAGAAAAAACTATTCATTAGGAAGAAAAGTCCA-TTATAGTCCCCCATTCCTT
450 TC-AGAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTAGAAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATTCCTT
* * * * *********
2571 CAAAAACCTTATTACTTGCTTAAAATAGTTTTATAAACT-ACTAATTGATTTTAANNNNNNNNNN
514 CAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCTCA-TAATTGATTTTAA-GTTGAATTT
* * * * * *
2635 TCTATATTTTTGGTTAAAACAGACTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAACGA-GAAGAAAAATG
577 TTTATATTTTTAGCTAAAA-TGATTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAAC-ATGAAGAAAAAGG
* ** * * ** ****
2699 CATTCATTAGTGAGAGAAGTCCATTTATATTCACCCATTCNNNN
640 CATTCATTGGCAAGAAAAGTCTATTTATGGTCA-CCATTCCTTC
****** * * * * *
2743 NNNNNNCTTATTACTCCCTTTAAATGGTTTTCTAATCCCAAAATTGATTTTAAGTTGAATTCTTT
1 AAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCAAAATTGATTTTAAGTTAAATTATTT
********** ** * * *
2808 GTACATTTTTTATT-AAAATAGATTATAANNNNNNNNNNACCTTGAGAAATGTGAAG-AAAAATG
66 -TACATTTTTTATTAAAAAT-GATTATAATTGAATGTCTACCTCAAGAAACGTAAAGCAGAAA-G
* * ** * * * *
2871 -CATACATTGGCAAGAAAAGTCTATTTATAGTCGTC-CATCCCTTCAAAAGTCTTATTACTCACT
128 CCATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCTCAT-TCTTTAAAAGCCTTATTACTCGCT
********** * * * * *
2934 TTAAATGGNNNNNNNNNNTCAAAATTGATTTGAAGTTAAATTTTTTTTACATTTTTGATTAAAAA
192 TTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAA-TTTTTTTACATTTTTAATTAAAAC
* * * * * * *
2999 AGGCTATAATTGAATGTCTA-TTTTAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATTCATTGACACA-AAAAG
256 AGACTATAATTGAATGTCTACCTTGA-GAAATATGAAGAAAAAGGCATTCATTGGCA-AGAAAAG
* * ** * * * ********* *
3062 CCCATTTATAGTCA-CTCAAGCCTTGAAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATNNNNNNNNNNA-CA
319 TCTATTTATAGTCACCT-ATTCTTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAAT-GGTTTTATAATCT
* * * * * * *
3125 AATAATTGATTTTAAGTTGAATGTT-TTCACATTTTTAGTTAAAACAGACTATAATTGAATGTCT
382 CATAATTGATTTTAAATTAAATTTTCTTTAC-TTTTTAGTTAAAACAGATTATAATTGAATGCCT
* * * ** ** *
3189 GCTTTGAGAAACACAAAGAAAAAGGTATTCATT-GAAAAGAAAAGT-TCATTTATAGTCACCCAT
446 ACCTTCAGAAACATGAAGAAAAAGCCATTCATTAG-AAAGAAAAGTCT-ATTTATAGTCACTCAT
********** * * * *
3252 TCCTTCANNNNNNNNNNTACTCTCTTTAAATGGTTTTATAATGTCAAAATTGATTTTAAGTTGAA
509 TCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAA
* * * ** *
3317 TTTTTTTTACATTGTTTGGTTAAAATAGATTATAATTGAATGTCTACCTCAAGAAATATGAAGAA
574 --TTTTTTATATT-TTTAGCTAAAAT-GATTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAACATGAAGAA
3382 AAAGGCATTCATTGGCA
635 AAAGGCATTCATTGGCA
3399 NNNNNNNNNN
Statistics
Matches: 2182, Mismatches: 443, Indels: 173
0.78 0.16 0.06
Matches are distributed among these distances:
681 2 0.00
682 21 0.01
683 133 0.06
684 343 0.16
685 476 0.22
686 846 0.39
687 293 0.13
688 68 0.03
ACGTcount: A:0.35, C:0.13, G:0.12, T:0.38
Consensus pattern (682 bp):
AAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCAAAATTGATTTTAAGTTAAATTATTT
TACATTTTTTATTAAAAATGATTATAATTGAATGTCTACCTCAAGAAACGTAAAGCAGAAAGCCA
TTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCTCATTCTTTAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAA
ATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTAATTAAAACAGACT
ATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAATATGAAGAAAAAGGCATTCATTGGCAAGAAAAGTCTATTT
ATAGTCACCTATTCTTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGA
TTTTAAATTAAATTTTCTTTACTTTTTAGTTAAAACAGATTATAATTGAATGCCTACCTTCAGAA
ACATGAAGAAAAAGCCATTCATTAGAAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATTCCTTCAAAAGC
CTTATTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTATATTT
TTAGCTAAAATGATTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAACATGAAGAAAAAGGCATTCATTGGC
AAGAAAAGTCTATTTATGGTCACCATTCCTTC
Found at i:1680 original size:857 final size:848
Alignment explanation
Indices: 1--2624 Score: 2751
Period size: 857 Copynumber: 3.1 Consensus size: 848
* * * ** *
1 AAAAGCCTTATTACTCTCTTTAAATAGTTTTATAATCTTAAAAATAATTTTAAGTTCAAAATTAT
1 AAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCTCATATTTGATTTTAAGTT--AAATT-T
* * * ** * * * *
66 T-TTTATA-CTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTCTACCTCGAAAAATATGAAGAAAAA
63 TCTTAAAATTTTTTAATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAATGTGAAGAAAAA
* * * *
129 GGTATTCATTGGCAAAAAAAGTCCATTTATCGTAACTCATT-TCTTCAAAAGCCCTATTACTCGC
128 GGAATTCATTGGCAAGAAAAGTCCA-TTATAGT-ACTCATTCT-TTCAAAAGCCTTATTACTCGC
* * *
193 TTTAAATGGTTTTATAATCT-ATTAATTAATTTTAAGTTTAA-TTTTTTTACATTTTTCA--TAA
190 TTTAAATGATTTTATAATCTCA-TAATTGATTTTAAGTTCAATTTTTTTTACATTTTT-AGTTAA
* *** * *
254 AACAAGCA--ATAATTGAATATTTACCTCAGAAAAT-GTGTAGAAAAAGCCATTCATTAGGAAGA
253 AA-AAG-ATTATAATTCAATGCCTACCTCA-AAAATCATGTAGAAAAAGCCATTCATTAGAAAGA
* * *
316 AAAGTCTATTTATAGTCTCTTATTCTTTCAAACGCCTTATTACTCGCTTTAAAAGGTTTTATAAT
315 AAAGTCTATTTATGGTCTCTCATTC-TTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAAAGGTTTTATAAT
* * * ***
381 CTCATAATTAGTTTTAAATTAAATTTTTTTATATTTTTGGCTAAAACATATTATAATTGAATGTC
379 CTCAAAATTAGTTTTAAGTTAAATTTTTTTATATTTTTAGCTAAAATGGA-TATAATTGAATGTC
* *
446 TACCTTGAGAAACATGAAGAAAAAGACATACATTGACAATAAAAGTCTATTTATAGTCACCTATT
443 TACC-TGAGAAACGTGAAGAAAAAGACATACATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACCTATT
* ** * * * *
511 CTTTCAAAAGCCTAATTACTCGGTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTGAAGCTGATT
507 CTTTCAAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCAAAATTGATTT-AAGTTGAAT
* * * * *
576 TTTTTTACATTTTTAGCTTAAACAGATTATAATTAAATGT-TGACCTT-GAGAAACATGAAGAAA
571 TATTTTACATTTTTAG-TTAAAAAGATTATAATTGAATGTCT-ACCTTCAAG-AACTTGAAG-AA
* * * * *
639 AAAGCATC-ATTGGCAAGAAAAGTCCATTTATGGTC-TTCCATTCCTTTAAAAGCCTTATTACTC
632 AAAGCATCTATTGGCACGAAATGTCCATTTATAGTCACT-CATTCCTTTAAAAGCCTTATTACTT
* * * * *
702 ACTTTAAATGGTTTTTTAATCTCTTAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTATATTTTTTATTTAA
696 GCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAA-TTTTTTACA-TTTTTAATTAA
* * * * * * *
767 AATAGATTATAATTGAATGTCTACCTCAAGAAACGTAAAGAGAAAGGCATTCATTGGTAAGAAAA
759 AATAGACTATAATTGAATGTCTGCCTCGAGAAACATGAAGAAAAAGGTATTCATTGG-AAGAAAA
* *
832 CTATATTTATAGTCACCTATTCCTTT
823 GTATATTTATAGTCACCTATTCCTTC
* * **
858 AAAAGTCTTATTGCTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCTCATATTTGATTTTAAGTTTTATTTT-T
1 AAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCTCATATTTGATTTTAAGTTAAATTTTCT
*
922 TAAAAATTTTTTAATTAAAACAGACTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAATGTGAAGAAAAAGG
66 T-AAAATTTTTTAATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAATGTGAAGAAAAAGG
* * *
987 CATTCATTGGCAAGAAAGGTCTACTTATAGTGAC-CTATTCTTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTT
130 AATTCATTGGCAAGAAAAGTCCA-TTATAGT-ACTC-ATTCTTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTT
* * *
1051 TAAATGATTTTATTATCTCA-AATTGATTTTAAGTTCAATTTTTTTTACGTTTTTAGTTAAAATA
192 TAAATGATTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTCAATTTTTTTTACATTTTTAGTTAAAAAA
**
1115 GATTATAATTCAATGCCTGTCTCAAAAATCATGTAGAAAAAGCCATTCACTT-GAAAGAAAAGTC
257 GATTATAATTCAATGCCTACCTCAAAAATCATGTAGAAAAAGCCATTCA-TTAGAAAGAAAAGTC
* *
1179 TGTTTATGGTCTCTCATTTCTTCAAAAGCCTTATTACTCGTTTTAAATA-GTTTTATAATCTCAA
321 TATTTATGGTCTCTCA-TTCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAA-AGGTTTTATAATCTCAA
* *
1243 AATTAGTTTTAAGTTTAATGTTTTTATATTTTTAGCTAAAATGGAATATAATTGAATGTCTACCT
384 AATTAGTTTTAAGTTAAATTTTTTTATATTTTTAGCTAAAATGG-ATATAATTGAATGTCTACCT
* * * * *
1308 CGAGAAAGGTGAAGAAAAAGGCATTCATTGGCAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACCTATTCCTTC
448 -GAGAAACGTGAAGAAAAAGACATACATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACCTATTCTTTC
*
1373 AAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCAAAATTGACTTTAAGTTAAATTATTT
512 AAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCAAAATTGA-TTTAAGTTGAATTATTT
** *
1438 TACATTTTTAGTTAAAAATGGCTATAATTGAATGTCTACCTTCAAGAACTTGAAGCAAAAGCCAT
576 TACATTTTTAGTTAAAAA-GATTATAATTGAATGTCTACCTTCAAGAACTTGAAGAAAAAG-CAT
** ** *
1503 CTATTGGCACGAAATGTCCATTTATAGTCACTCA-AGCTTTAGAAAATCTTATTACTTGCTTTGA
639 CTATTGGCACGAAATGTCCATTTATAGTCACTCATTCCTTTA-AAAGCCTTATTACTTGCTTTAA
* ** * *
1567 ATGGTTTTATAAACAAATAATTGATTTTAAGTTGAATCTTTTTACATTTTCT-GTTAAAATATAC
703 ATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAAT-TTTTTACATTTT-TAATTAAAATAGAC
* * * *
1631 TATAATTGAATGTCTGCCTTGAGAAACATGAAGAAAAAGGTACTCATTGGCAAGCAAAGTGTATT
766 TATAATTGAATGTCTGCCTCGAGAAACATGAAGAAAAAGGTATTCATTGG-AAGAAAAGTATATT
1696 TATAGTCACCTATTCCTTC
830 TATAGTCACCTATTCCTTC
* * * * *
1715 AAATGCCTTATTACTCTCTTTAAATGGTTTTATAATCTCAAATTTAATTTTAAGTTAAATTTTCT
1 AAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCTCATATTTGATTTTAAGTTAAATTTTCT
* * * * *
1780 TTACATTTTTTAGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAATGTGAAAAAAAAAGA
66 TAAAATTTTTTAATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAATGTGAAGAAAAAGGA
* * *
1845 ATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATATATAGTCACTCATTCCTTCAAAAGCCTTACTACTCACTTTA
131 ATTCATTGGCAAGAAAAGTCCAT-TATAGT-ACTCATTCTTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTA
* * * * * * *
1910 AATCATTTTATAATCTCATAATTGATTTTAGGTTGAATTTTTTTT-CATTTTTGGTTAGAACATA
194 AATGATTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTCAATTTTTTTTACATTTTTAGTTAAAAAAGA
*** * ** * * *
1974 TTATAATTGC-ATGTCC-ACCTTGGGAAA-CATGAAGAAAAAGGTATTTATTGGCAAGAAAAGTC
259 TTATAATT-CAATG-CCTACC-TCAAAAATCATGTAGAAAAAGCCATTCATTAGAAAGAAAAGTC
* * * * * **
2036 TATTTACGGTCACCCGATCCTTCAAAAACCTTATTACTAACTTTAAAAGGTTTTATAATCTCAAA
321 TATTTATGGTCTCTC-ATTCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAAAGGTTTTATAATCTCAAA
* * *
2101 ATT-GATTTTAAGTTAAATTTTTTTACAATTTTTTA-TTAAAAATGG-TATAATTGAATGTCTGC
385 ATTAG-TTTTAAGTTAAATTTTTTTA-TA-TTTTTAGCT-AAAATGGATATAATTGAATGTCTAC
* * ** * * * * * * * *
2163 CTTAGGGAACGCAAAGCAGAAGCCATCCATTGATACGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATTCTT
446 CTGA-GAAACGTGAAGAAAAAGACATACATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACCTATTCTT
* *
2228 TCAAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAGTCTCAAAATTGATTTTAAGTTGAATTCT
510 TCAAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCAAAATTGA-TTTAAGTTGAATTAT
* * * * *
2293 TTGTACATTTTTAATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCAATC-TCAAGAAATATAAAGAAAAAG
574 TT-TACATTTTTAGTTAAAA-AGATTATAATTGAATGTCTACCTTCAAGAACT-TGAAGAAAAA-
* *
2357 GCAT-TCATTGGCAACAAAATTGT--ATTTATAGTCACCCATTCCTTTAAAAGCCTTATTACTTG
635 GCATCT-ATTGGC-ACGAAA-TGTCCATTTATAGTCACTCATTCCTTTAAAAGCCTTATTACTTG
* * * *
2419 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATATTTGATTTGAAATTGAATTTCTTTACATTTTTCATTAAAA
697 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTT-TTTACATTTTTAATTAAAA
* * * * * **
2484 CAGACTATAATTGAATGCCTGTCTCGGGAAACATGTAGAAAAAACTATTCATTAGGAAGAAAAGT
761 TAGACTATAATTGAATGTCTGCCTCGAGAAACATGAAGAAAAAGGTATTCATT-GGAAGAAAAGT
** * *
2549 CCA-TTATAGTCCCCCATTCCTTC
825 ATATTTATAGTCACCTATTCCTTC
* * * * *
2572 AAAAACCTTATTACTTGCTTAAAATAGTTTTATAAACT-ACTAATTGATTTTAA
1 AAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCTCA-TATTTGATTTTAA
2625 NNNNNNNNNN
Statistics
Matches: 1482, Mismatches: 232, Indels: 106
0.81 0.13 0.06
Matches are distributed among these distances:
854 4 0.00
855 24 0.02
856 158 0.11
857 951 0.64
858 314 0.21
859 28 0.02
860 3 0.00
ACGTcount: A:0.36, C:0.14, G:0.12, T:0.39
Consensus pattern (848 bp):
AAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCTCATATTTGATTTTAAGTTAAATTTTCT
TAAAATTTTTTAATTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAATGTGAAGAAAAAGGA
ATTCATTGGCAAGAAAAGTCCATTATAGTACTCATTCTTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAA
TGATTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTCAATTTTTTTTACATTTTTAGTTAAAAAAGATT
ATAATTCAATGCCTACCTCAAAAATCATGTAGAAAAAGCCATTCATTAGAAAGAAAAGTCTATTT
ATGGTCTCTCATTCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAAAGGTTTTATAATCTCAAAATTAGT
TTTAAGTTAAATTTTTTTATATTTTTAGCTAAAATGGATATAATTGAATGTCTACCTGAGAAACG
TGAAGAAAAAGACATACATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACCTATTCTTTCAAAAGCCTT
ATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCAAAATTGATTTAAGTTGAATTATTTTACATTTTTA
GTTAAAAAGATTATAATTGAATGTCTACCTTCAAGAACTTGAAGAAAAAGCATCTATTGGCACGA
AATGTCCATTTATAGTCACTCATTCCTTTAAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAAT
CTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTACATTTTTAATTAAAATAGACTATAATTGAATGTCT
GCCTCGAGAAACATGAAGAAAAAGGTATTCATTGGAAGAAAAGTATATTTATAGTCACCTATTCC
TTC
Done.