Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: NW_018401047.1 Herrania umbratica cultivar Fairchild unplaced genomic scaffold, ASM216827v2 scaffold_4206.0, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Pmatch=0.80,Pindel=0.10
tuple sizes 0,4,5,7
tuple distances 0, 29, 159, 1000
Length: 3103
ACGTcount: A:0.37, C:0.12, G:0.12, T:0.33
Warning! 201 characters in sequence are not A, C, G, or T
Found at i:986 original size:171 final size:171
Alignment explanation
Indices: 348--1345 Score: 837
Period size: 171 Copynumber: 5.8 Consensus size: 171
338 NNNNNNNNNN
* * * * * * *
348 TTCAATTATAATATATTTTAATCAAAAATATAAAAACATTCAACTTAAAATCAAGTATGGGATTA
1 TTCAAATATTATATATTTTAATCAAAAATGTAAAAAAATTCAACTTAAAATGAATTATGAGATTA
* * ** * *
413 TAAAACCATTTAAAGCGAGTAAAAAGGCTTTCGAAGGCATGGGT-AGCTATAAATGGACTTTTGT
66 TAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCGAAGACATAAGTGA-CTATAAATGGACATTTCT
* * * * *
477 TGCCAATAAATGGCTTTTTCTTCACATTTCCCT-ATATAGATA
130 TGCCAATGAATGACTTTTTCTTCACATTT-TCTAATGTAGACA
* * * * * *
519 ATCAAATATTATTTGTTTTAATC-AAAATCTAAAAAAATTCAACATAAAATTAATTATGAGATTA
1 TTCAAATATTATATATTTTAATCAAAAATGTAAAAAAATTCAACTTAAAATGAATTATGAGATTA
* ** * ** * *
583 AAAAATTATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCGAAGACTTAAGCAACTATAATTGGACTTTTCTT
66 TAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCGAAGACATAAGTGACTATAAATGGACATTTCTT
* * * * *** * * * *
648 GTCAATGCATGACTTTTGCCTCTTGTTTTCGAAGGCAAACA
131 GCCAATGAATGACTTTTTCTTCACATTTTCTAATGTAGACA
* * * * * * *
689 TTTAATTATAATATATTTTAATAAAAAATATAAAAAAATTCAACTTAACATCAATTATGAGATTA
1 TTCAAATATTATATATTTTAATCAAAAATGTAAAAAAATTCAACTTAAAATGAATTATGAGATTA
* * * * ** *
754 T-AAACAAATTAAAGCGAGTAATAAGACTTTCAAATG-CATGGGTGACTATAGATGGACATTTCT
66 TAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCGAA-GACATAAGTGACTATAAATGGACATTTCT
** *
817 TGCCAATGAATGGTTTTTTCTTCATATTTTCTAATGTAGACA
130 TGCCAATGAATGACTTTTTCTTCACATTTTCTAATGTAGACA
* * * * * * * *
859 TTCAAATATTATCT-TTGTTAACCAAAAATGCAAGAGAATTTAATTTAAAATGAATTTTGAGATT
1 TTCAAATATTATATATT-TTAATCAAAAATGTAAAAAAATTCAACTTAAAATGAATTATGAGATT
* *
923 ATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCGAAGACTTAAGTGATTATAAATGGACATTTCT
65 ATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCGAAGACATAAGTGACTATAAATGGACATTTCT
* * * * * * *
988 TACCAATGGATGACTTTTGCTTCACGTTTCCTAAGGCAGACA
130 TGCCAATGAATGACTTTTTCTTCACATTTTCTAATGTAGACA
* * * * * * * *
1030 TTCAATTATAATATATTTTAATAAAAAATGTAATAAAGTTCAACTTAAAGTTAATTATGAGAATA
1 TTCAAATATTATATATTTTAATCAAAAATGTAAAAAAATTCAACTTAAAATGAATTATGAGATTA
* * * * ** * *
1095 TAAAACTATTTATAGTGAGTAATGAA-GTTTTCGAATGA-ATGGGTGACTATAGATGGACCTTTC
66 TAAAACCATTTAAAGCGAGTAAT-AAGGCTTTCGAA-GACATAAGTGACTATAAATGGACATTTC
* * *
1158 TGGCCAATAAATGCCTTTTTCTTCACATTTT-TCAATGTAGACA
129 TTGCCAATGAATGACTTTTTCTTCACATTTTCT-AATGTAGACA
* * ** * * * **
1201 TTCAAATATTATCTATTTGAGCCAAAAATGTAAGACAATTTAACTCCAAATGAATTATGAGATTA
1 TTCAAATATTATATATTTTAATCAAAAATGTAAAAAAATTCAACTTAAAATGAATTATGAGATTA
* * * * * *
1266 TCAAACCATTTAAAGCGAGTAAAAAGGCTTTAGAAGACTTAAGCGACTACAAATGGAC-TATTCT
66 TAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCGAAGACATAAGTGACTATAAATGGACAT-TTCT
* *
1330 TACCAATGGATGACTT
130 TGCCAATGAATGACTT
1346 AACAAAAAAT
Statistics
Matches: 635, Mismatches: 178, Indels: 28
0.76 0.21 0.03
Matches are distributed among these distances:
169 3 0.00
170 258 0.41
171 368 0.58
172 6 0.01
ACGTcount: A:0.39, C:0.13, G:0.14, T:0.35
Consensus pattern (171 bp):
TTCAAATATTATATATTTTAATCAAAAATGTAAAAAAATTCAACTTAAAATGAATTATGAGATTA
TAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCGAAGACATAAGTGACTATAAATGGACATTTCTT
GCCAATGAATGACTTTTTCTTCACATTTTCTAATGTAGACA
Found at i:1003 original size:341 final size:338
Alignment explanation
Indices: 348--1345 Score: 1198
Period size: 341 Copynumber: 2.9 Consensus size: 338
338 NNNNNNNNNN
* * * *
348 TTCAATTATAATATATTTTAATCAAAAATATAAAAACATTCAACTTAAAATCAAGTATGGGATTA
1 TTCAATTATAATATATTTTAATAAAAAATATAAAAAAATTCAACTT-AAATCAATTATGAGATTA
* * * * * *
413 TAAAACCATTTAAAGCGAGTAAAAAGGCTTTCGAAGGCATGGGT-AGCTATAAATGGACTTTTGT
65 TAAAACAATTTAAAGCGAGTAATAA-GCTTTCGAATGCATGGGTGA-CTATAGATGGACATTTCT
* * * * * *
477 TGCCAATAAATGGCTTTTTCTTCACATTTCCCT-ATATAGATAATCAAATATTATTTGTTTTAAT
128 TGCCAATAAATGGCTTTTTCTTCACATTT-TCTAATGTAGACATTCAAATATTATCT-TTTTAAC
* * * * * **
541 C-AAAAT-CTAAAAAAATTCAACATAAAATTAATTATGAGATTAAAAAATTATTTAAAGCGAGTA
191 CAAAAATGC-AAGAAAATTTAACTTAAAATGAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTA
* * ** *
604 ATAAGGCTTTCGAAGACTTAAGCAACTATAATTGGACTTTTCTTGTCAATGCATGACTTTTGCCT
255 ATAAGGCTTTCGAAGACTTAAGCGACTATAAATGGAC-TTTCTTACCAATGGATGACTTTTGCCT
** *
669 CTTGTTTTCGAAGGCAAACA
319 CACGTTTCCGAAGGCAAACA
*
689 TTTAATTATAATATATTTTAATAAAAAATATAAAAAAATTCAACTTAACATCAATTATGAGATTA
1 TTCAATTATAATATATTTTAATAAAAAATATAAAAAAATTCAACTTAA-ATCAATTATGAGATTA
* *
754 T-AAACAAATTAAAGCGAGTAATAAGACTTTCAAATGCATGGGTGACTATAGATGGACATTTCTT
65 TAAAACAATTTAAAGCGAGTAATAAG-CTTTCGAATGCATGGGTGACTATAGATGGACATTTCTT
* * *
818 GCCAATGAATGGTTTTTTCTTCATATTTTCTAATGTAGACATTCAAATATTATCTTTGTTAACCA
129 GCCAATAAATGGCTTTTTCTTCACATTTTCTAATGTAGACATTCAAATATTATCTTT-TTAACCA
* * *
883 AAAATGCAAGAGAATTTAATTTAAAATGAATTTTGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATA
193 AAAATGCAAGAAAATTTAACTTAAAATGAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATA
* * *
948 AGGCTTTCGAAGACTTAAGTGATTATAAATGGACATTTCTTACCAATGGATGACTTTTGCTTCAC
258 AGGCTTTCGAAGACTTAAGCGACTATAAATGGAC-TTTCTTACCAATGGATGACTTTTGCCTCAC
* *
1013 GTTTCCTAAGGCAGACA
322 GTTTCCGAAGGCAAACA
* * * * *
1030 TTCAATTATAATATATTTTAATAAAAAATGTAATAAAGTTCAACTTAAAGTTAATTATGAGAATA
1 TTCAATTATAATATATTTTAATAAAAAATATAAAAAAATTCAACTTAAA-TCAATTATGAGATTA
* * * * * * *
1095 TAAAACTATTTATAGTGAGTAATGAAGTTTTCGAATGAATGGGTGACTATAGATGGACCTTTCTG
65 TAAAACAATTTAAAGCGAGTAAT-AAGCTTTCGAATGCATGGGTGACTATAGATGGACATTTCTT
* * *
1160 GCCAATAAATGCCTTTTTCTTCACATTTT-TCAATGTAGACATTCAAATATTATCTATTTGAGCC
129 GCCAATAAATGGCTTTTTCTTCACATTTTCT-AATGTAGACATTCAAATATTATCT-TTTTAACC
* * ** * *
1224 AAAAATGTAAGACAATTTAACTCCAAATGAATTATGAGATTATCAAACCATTTAAAGCGAGTAAA
192 AAAAATGCAAGAAAATTTAACTTAAAATGAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAAT
* *
1289 AAGGCTTTAGAAGACTTAAGCGACTACAAATGGACTATTCTTACCAATGGATGACTT
257 AAGGCTTTCGAAGACTTAAGCGACTATAAATGGACT-TTCTTACCAATGGATGACTT
1346 AACAAAAAAT
Statistics
Matches: 565, Mismatches: 79, Indels: 25
0.84 0.12 0.04
Matches are distributed among these distances:
339 5 0.01
340 103 0.18
341 240 0.42
342 212 0.38
343 5 0.01
ACGTcount: A:0.39, C:0.13, G:0.14, T:0.35
Consensus pattern (338 bp):
TTCAATTATAATATATTTTAATAAAAAATATAAAAAAATTCAACTTAAATCAATTATGAGATTAT
AAAACAATTTAAAGCGAGTAATAAGCTTTCGAATGCATGGGTGACTATAGATGGACATTTCTTGC
CAATAAATGGCTTTTTCTTCACATTTTCTAATGTAGACATTCAAATATTATCTTTTTAACCAAAA
ATGCAAGAAAATTTAACTTAAAATGAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGG
CTTTCGAAGACTTAAGCGACTATAAATGGACTTTCTTACCAATGGATGACTTTTGCCTCACGTTT
CCGAAGGCAAACA
Found at i:1592 original size:297 final size:297
Alignment explanation
Indices: 1047--1642 Score: 718
Period size: 297 Copynumber: 2.0 Consensus size: 297
1037 ATAATATATT
* * * * * * **
1047 TTAATAAAAAATGTAATAAAGTTCAACTTAAAGTTAATTATGAGAATATAAAACTATTTATAGTG
1 TTAACAAAAAATGTAAAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGAATATAAAACCATTTATAACG
* * *
1112 AGTAATGAAGTTTTCGAATGAATGGGTGACTATAGATGGACCTTTCTGGCCAATAAATGCCTTTT
66 AGTAATGAAGCTTTCAAATGAATGGGTGACTATAGATGGACCTTTCTGGCCAATAAATGCCTTTC
* * * * * * * *
1177 TCTTCACATTTTTCAATGTAGACATTCAAATATTATCTATTTGAGCCAAAAATGTAAGACAATTT
131 TCTTCACATTTTTCAAGGTACACATTCAAATATTATCTATTTGAACAAAAAATCTAAAAAAATTC
* * * *
1242 AACTCCAAATGAATTATGAGATTATCAAACCATTTAAAGCGAGTAAAAAGGCTTTAGAAGACTTA
196 AACTCAAAATCAATTACGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAAAAAGGCTTTAGAAGACTTA
* *
1307 AGCGACTACAAATGGACTAT-TCTTACCAATGGATGAC
261 AGCGACTACAAATGAACT-TCTCTTACCAATGGATAAC
1344 TTAACAAAAAATGTAAAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGA-AATTATAAAACCATTTGA-AA
1 TTAACAAAAAATGTAAAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGAA-TATAAAACCATTT-ATAA
* * * * * * * *
1407 CGAGTAAT-AAGGCTTTCAAATGGATGGGTGACTATAGATGGGCTTTTCTTGCTACTGAATGGCT
64 CGAGTAATGAA-GCTTTCAAATGAATGGGTGACTATAGATGGACCTTTCTGGCCAATAAATGCCT
* * *
1471 TTCTCTTCCCA-TTTTCTAAGGTACACATTCAAATATTATTTGTATT-AACAAAAAATCTAAAAA
128 TTCTCTTCACATTTTTC-AAGGTACACATTCAAATATTATCTAT-TTGAACAAAAAATCTAAAAA
* * * *
1534 AATTCAACTTAAAATCAATTACGAGATTATAAAACTATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTTGAAG
191 AATTCAACTCAAAATCAATTACGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAAAAAGGCTTTAGAAG
* *
1599 ACTTAAGTGACTATAAATGAACTTCTCTTACCAATGGATAAC
256 ACTTAAGCGACTACAAATGAACTTCTCTTACCAATGGATAAC
1641 TT
1 TT
1643 TTGCTTCACG
Statistics
Matches: 251, Mismatches: 42, Indels: 12
0.82 0.14 0.04
Matches are distributed among these distances:
296 10 0.04
297 238 0.95
298 3 0.01
ACGTcount: A:0.40, C:0.13, G:0.14, T:0.33
Consensus pattern (297 bp):
TTAACAAAAAATGTAAAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGAATATAAAACCATTTATAACG
AGTAATGAAGCTTTCAAATGAATGGGTGACTATAGATGGACCTTTCTGGCCAATAAATGCCTTTC
TCTTCACATTTTTCAAGGTACACATTCAAATATTATCTATTTGAACAAAAAATCTAAAAAAATTC
AACTCAAAATCAATTACGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAAAAAGGCTTTAGAAGACTTA
AGCGACTACAAATGAACTTCTCTTACCAATGGATAAC
Found at i:1716 original size:171 final size:170
Alignment explanation
Indices: 1350--3103 Score: 1027
Period size: 171 Copynumber: 10.3 Consensus size: 170
1340 TGACTTAACA
* *
1350 AAAAATGTAAAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAAATTATAAAACCATTTGAAA-CGAGTAA
1 AAAAATGTAAAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTT-AAAGCGAGTAA
* ** * * * * *
1414 TAAGGCTTTCAAATGGA--TGGGTGACTATAGATGGGCTTTTCTTGCTACTGAATGGCTTTCT-C
65 TAAGGCTTTCGAA--GACTTAAGTGACTATAAATGGACTTTTCTTACTAATGAATGACTTT-TGC
* * * * * * * * *
1476 TTCCCATTT-TCTAAGGTACACATTCAAA-TATTATTTGTATTAACA
127 TTCACGTTTCTC-AAGGTAGAC-TTTAAATTATAATATATTTTAA-T
* *
1521 AAAAATCTAAAAAAATTCAACTTAAAATCAATTACGAGATTATAAAACTATTTAAAGCGAGTAAT
1 AAAAATGTAAAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAGCGAGTAAT
* * * * * *
1586 AAGGCTTTTGAAGACTTAAGTGACTATAAATGAACTTCTCTTACCAATGGATAACTTTTGCTTCA
66 AAGGCTTTCGAAGACTTAAGTGACTATAAATGGACTTTTCTTACTAATGAATGACTTTTGCTTCA
1651 CGTTT-TCCAAGGTAGACTTTAAATTATAATATATTTTAAT
131 CGTTTCT-CAAGGTAGACTTTAAATTATAATATATTTTAAT
* * * ** ** *
1691 GAAAAATGCAAAACAATTTAACTTAAAATTTATTACAAGATTATTAAAGC-ATTTAAAGCGAGTA
1 -AAAAATGTAAAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTA-TAAAACTATTTAAAGCGAGTA
** * * * * * *
1755 ATAAGGCTTAT-GAATG--TATGGGTGACTACAGATGGACTTTTTTTAATAATGAATGGCTTTTT
64 ATAAGGCTT-TCGAA-GACT-TAAGTGACTATAAATGGACTTTTCTTACTAATGAATGACTTTTG
** * * *
1817 CTTCATATTT-TCTAATGTAGACATTCAAA-TAT--TATCAGTTTGAACT
126 CTTCACGTTTCTC-AAGGTAGAC-TTTAAATTATAATAT-A-TTTTAA-T
* * *
1863 AAAAACGTAAAACAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAGCTATTTAAAGCGAGTAAT
1 AAAAATGTAAAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAGCGAGTAAT
* ** * * * * * * *
1928 AAGGCTTTCGAAGAATTAAACGACTAGAAATAGACTTTTTTTGCCAATAAATGACTTTTGTTTCA
66 AAGGCTTTCGAAGACTTAAGTGACTATAAATGGACTTTTCTTACTAATGAATGACTTTTGCTTCA
* ** ** * ** *
1993 TGTTTCTTGAGACAG-GTATTCCATTTTAATATATTTTAAT
131 CGTTTCTCAAGGTAGACT-TTAAATTATAATATATTTTAAT
* * * * ** *
2033 AAAAAATATAAAAAAATTAAATTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAATTATTTAAATTGACTAA
1 -AAAAATGTAAAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAGCGAGTAA
* * * * ** * * *
2098 TATGGCTGTCGAAAGCAC--AGGTGACTATAAATTGACTTTT-TTTGTAAATTAATAACTTTTTC
65 TAAGGCTTTCG-AAG-ACTTAAGTGACTATAAATGGACTTTTCTTACT-AATGAATGACTTTTGC
* ** * * * *
2160 TACACGTTTCTTGATGTAGACATTT-AAGTATTATCTATTTTAACT
127 TTCACGTTTCTCAAGGTAGAC-TTTAAATTATAATATATTTTAA-T
* * * *
2205 AAAGATGCAAAAAAATTCAAGTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAGCGACTAAT
1 AAAAATGTAAAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAGCGAGTAAT
* * * * ** ** * * * *
2270 CAGGCTTTCAAAGGCATGGGTGAAAATAGATAGACTTTTCTT-CTTAATAAAT-AGCTTTT-TTT
66 AAGGCTTTCGAAGACTTAAGTGACTATAAATGGACTTTTCTTAC-TAATGAATGA-CTTTTGCTT
* * ** * * * * *
2332 TACGTTTCCCAATATAGACATTCAAA-TATTATTTGTTTTAACC
129 CACGTTTCTCAAGGTAGAC-TTTAAATTATAATATATTTTAA-T
* * * *
2375 CAAAATGTAAAAAAATTCAAGTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAA-TCATTTGAAGCGAATAA
1 AAAAATGTAAAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACT-ATTTAAAGCGAGTAA
* * * * * * ** *
2439 TAAGGTTTTCGAAAACATAAGCGACTATAAATGGACTTTTCGTACCAATGCTTGACTTTTGCCTC
65 TAAGGCTTTCGAAGACTTAAGTGACTATAAATGGACTTTTCTTACTAATGAATGACTTTTGCTTC
* * * *
2504 TCG-TTC-CATGAGGTAGACATTCAATTATAATATAATTTAAT
130 ACGTTTCTCA--AGGTAGACTTTAAATTATAATATATTTTAAT
** * *
2545 AAAAAAATAAAAAAATTCAACTTAAAATTAATTATGGGATTATAAAA-TCATTTAAAGCGAGTAA
1 AAAAATGTAAAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACT-ATTTAAAGCGAGTAA
* * * * * *
2609 TAAGGCTTTTG-A-ACGTAAGGGTGACAACAGATGGACTTTTCTTGA-TAATGAATGACTTTT-T
65 TAAGGCTTTCGAAGACTTAA--GTGACTATAAATGGACTTTTCTT-ACTAATGAATGACTTTTGC
* * * * * * *
2670 TGTCACATTTCTCAATGTAGACATT-CATATATTATCTATTTTAGCT
127 T-TCACGTTTCTCAAGGTAGACTTTAAAT-TATAATATATTTTA-AT
* * * * * * * *
2716 AAAAATATAAGAAATTTTAACTTAAAATGAATTATGAGATTATAAAAGTATTTAAAGTGAGCAAT
1 AAAAATGTAAAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAGCGAGTAAT
* * *
2781 AAGGCTTTCGAAGACTTAAGCGACTATAAATGGACTATTT-TT-CTTAATGGATGACTTTTGTTT
66 AAGGCTTTCGAAGACTTAAGTGACTATAAATGGACT-TTTCTTAC-TAATGAATGACTTTTGCTT
** * * * * * *
2844 CACGTTTCTCAAGACAAACATTCAACTACAATAGATTTTAGCA-
129 CACGTTTCTCAAGGTAGACTTTAAATTATAATATATTTTA--AT
* * * * *
2887 AAAAATGTAACAAAATTAAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGTGATTAAT
1 AAAAATGTAAAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAGCGAGTAAT
* * ** * * * * * *
2952 AAGGC-TTCCACATG-CATGGGTAACAATAGATGAACTTTTCTT-GTCAATGAATGGCATTTT-C
66 AAGGCTTTCGA-A-GACTTAAGTGACTATAAATGGACTTTTCTTACT-AATGAATGAC-TTTTGC
* * * * **
3013 TTCACGTTGC-CTAATGTAGACATTCAAA-TATTACCTATTTTAAT
127 TTCACGTTTCTC-AAGGTAGAC-TTTAAATTATAATATATTTTAAT
3057 CAAAAAATGTAAAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAA
1 --AAAAATGTAAAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAA
Statistics
Matches: 1228, Mismatches: 283, Indels: 143
0.74 0.17 0.09
Matches are distributed among these distances:
168 5 0.00
169 14 0.01
170 291 0.24
171 821 0.67
172 87 0.07
173 10 0.01
ACGTcount: A:0.40, C:0.12, G:0.13, T:0.35
Consensus pattern (170 bp):
AAAAATGTAAAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAGCGAGTAAT
AAGGCTTTCGAAGACTTAAGTGACTATAAATGGACTTTTCTTACTAATGAATGACTTTTGCTTCA
CGTTTCTCAAGGTAGACTTTAAATTATAATATATTTTAAT
Done.