Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: NW_018401692.1 Herrania umbratica cultivar Fairchild unplaced genomic scaffold, ASM216827v2 scaffold_4806.0, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Pmatch=0.80,Pindel=0.10
tuple sizes 0,4,5,7
tuple distances 0, 29, 159, 1000
Length: 3192
ACGTcount: A:0.31, C:0.11, G:0.10, T:0.34
Warning! 453 characters in sequence are not A, C, G, or T
Found at i:630 original size:343 final size:340
Alignment explanation
Indices: 5--1748 Score: 1116
Period size: 341 Copynumber: 5.1 Consensus size: 340
1 CTCA
* * * * *
5 CTTTAAATGATTTTATAATCTCGA-AATT-ATTTTAATTTGAATTCTTTGTAGATTTTTGGTTAA
1 CTTTAAATGATTTTATAATCT-AATAATTGATTTTAAGTTGAATTGTTT-TACATTTTTGATTAA
* * * * * * *
68 AACATATTATAATTGAATGTCTACCTCAAGAAACATG-AATAAAAACACATTCATTG-GCAAGAA
64 AACAAAATATAATTGAATGCCTGCCTCGAGAAACATGTAAGAAAAGCA-ATTCATTGAG-AAGAA
* * * * * * * * * *
131 AAGTCTATTTATAGT-TACCATTCCTTCAAAAGCTTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATTATT
127 AACTCCATTTATAGTCTCCCATTCTTTCAAAAGCCTTATTACTCGCCTTAAATGGCTTTATAATC
* * * * * * ** * * **********
195 TCAAAATTAATTTTATGTTCATTTTTTTTACATTTTTTGTTAAAACATATTANNNNNNNNNNTCT
192 TCATAATTAATTTTAAGTTGAATGTTTTAACATTTTTT-AAAAAACAGACTATAATTGAATGTCT
* * * *
260 ACCTCAAGAAACATAAAGAAGAAGGCATTCATTGGTAAGAAAAGTCTATTTACAGTCTCTCATTC
256 GCTTCAAGAAACATGAAGAAGAAGGCATTCATTGG-AAGAAAAGTCTATTTATAGTCTCTCATTC
**
325 CTTTAAAAGCCTTATTGGTCG
320 CTTTAAAAGCCTTATTACTCG
**********
346 CTTTAAATGATTTTATAATCTAATNNNNNNNNNNAAGTTGAATTGTTTTACATTTTTTG-TTAAA
1 CTTTAAATGATTTTATAATCTAATAATTGATTTTAAGTTGAATTGTTTTACA-TTTTTGATTAAA
* *
410 ACAAAATATAATTGAATGCCTGCCTTTG-GAATCATGTATTA-AAAAGCAATTCATTGAGAA-AG
65 ACAAAATATAATTGAATGCCTGCC-TCGAGAAACATGTA--AGAAAAGCAATTCATTGAGAAGA-
* ** * ** *
472 AAAGTCCATTTATAGTCTTTCATTCTTTTAAAAGCCTTATTACTCGTTTTAAATGGTTTTATAAT
126 AAACTCCATTTATAGTCTCCCATTCTTTCAAAAGCCTTATTACTCGCCTTAAATGGCTTTATAAT
* * *
537 CTCATAATTAATTTTAAGTTGAATGTTTTAATATTTTTTATTAAAAGAGACTATAATTGAATGTC
191 CTCATAATTAATTTTAAGTTGAATGTTTTAACATTTTTTA-AAAAACAGACTATAATTGAATGTC
* * * * *
602 -GACCTT-GAGAAACATGAAGAAAAAGGCATTCATTGGCAAGAAAAGTCTATTTATTGTCACCCA
255 TG--CTTCAAGAAACATGAAGAAGAAGGCATTCATTGG-AAGAAAAGTCTATTTATAGTCTCTCA
*
665 TT-CTTTCAAAAACCTTATTACTCG
317 TTCCTTT-AAAAGCCTTATTACTCG
* * * * *
689 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTATATTTTTGATTAAAT
1 CTTTAAATGATTTTATAATCTAATAATTGATTTTAAGTTGAATTGTTTTACATTTTTGATTAAAA
* * * * * *
754 CAGACTATAGTTGAATGCCTGCCTCGAGAAACTTGTAAGAAAAGCCATTGATTGAGAAGAAAACT
66 CAAAATATAATTGAATGCCTGCCTCGAGAAACATGTAAGAAAAGCAATTCATTGAGAAGAAAACT
* * *
819 CCATTTATAGTCTCCCATTCTTTCAAAAGTCTTATTACTTGCCTTAAATGGCTTTATGATCTCAT
131 CCATTTATAGTCTCCCATTCTTTCAAAAGCCTTATTACTCGCCTTAAATGGCTTTATAATCTCAT
* * *
884 AATTAGTTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTAAAAAACAGACTATAATTGAATGTCTGCTTC
196 AATTAATTTTAAGTTGAATGTTTTAACATTTTTTAAAAAACAGACTATAATTGAATGTCTGCTTC
* * * * * *
949 AAGAAACGTGTAGATGAAGCCATTTATTGAGAAAAAAAGTAC-ATTTATAGTCTCTCATTCC-TT
261 AAGAAACATGAAGAAGAAGGCATTCATTG-GAAGAAAAGT-CTATTTATAGTCTCTCATTCCTTT
* *
1012 CAAAGCCTTTATTACTTG
324 AAAAGCC-TTATTACTCG
* * * * **
1030 CTTTAAACGATTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTTAATTTTTTTACATTTTTCTTTAAAA
1 CTTTAAATGATTTTATAATCTAATAATTGATTTTAAGTTGAATTGTTTTACATTTTTGATTAAAA
* * * * * * *
1095 CAGAGTATAATTGAATGTCTACCTCGAG-AA-ATGTAAAAAAAG-AGGTATTTATT-AGGAAAAA
66 CAAAATATAATTGAATGCCTGCCTCGAGAAACATGTAAGAAAAGCA---ATTCATTGA-GAAGAA
* ** * * * *
1156 AAGTTTATTTATAGTCTCTCATT-TCTTCGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAA----TATATAAT
127 AACTCCATTTATAGTCTCCCATTCT-TTCAAAAGCCTTATTACTCGCCTTAAATGGCTTTATAAT
* * * * * * * * * * *
1216 CTCATAATTGATTTCAAGTTTAATTTTTTTTACATTTTTCATTAAAATAAATTATAATTGAATAT
191 CTCATAATTAATTTTAAGTTGAA-TGTTTTAACATTTTTTA-AAAAACAGACTATAATTGAATGT
* * * ** * * * * *
1281 CTACCTCGAGAAATGTGAAGAA-AATGACATTAATTGATAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACCCA
254 CTGCTTCAAGAAACATGAAGAAGAA-GGCATTCATTG-GAAGAAAAGTCTATTTATAGTCTCTCA
* * * *
1345 TTTCATCAAAAGCCTTA-T-CAC-
317 TTCCTTTAAAAGCCTTATTACTCG
* * **
1366 C-TTAAAT-AGTTTTATAATCTCAA-AATTGATTTTAA-TGTGAATTCTTTGTATATTTTTGACA
1 CTTTAAATGA-TTTTATAATCT-AATAATTGATTTTAAGT-TGAATTGTTT-TACATTTTTGATT
* * ** * * * * *
1427 AAAACAGATTATAATTGAATATCTACCTCAAGAAACGTG-AAGAAAAAG-ACTTTCATT-ACTAA
62 AAAACAAAATATAATTGAATGCCTGCCTCGAGAAACATGTAAG-AAAAGCA-ATTCATTGA-GAA
* * * * * * * * * *
1489 GAAAAGTCCATTTAAAGTCACCAATTCTTTTAAAATCCTTATTACTCGCATTAAATAGTTTTGTA
124 GAAAACTCCATTTATAGTCTCCCATTCTTTCAAAAGCCTTATTACTCGCCTTAAATGGCTTTATA
* * * * * * * * *
1554 CTC-CAATATTTGATTTTAGGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGT-TAAAATAGATTATAATTGAA
189 ATCTC-ATAATTAATTTTAAGTTGAATGTTTTAACATTTTT--TAAAAAACAGACTATAATTGAA
** * * * * **
1617 TGTCTGTCTT-TGGAAACGTGAAGAAAAAGACA-TCATTGGCAAGAAAAGTATATTTATAGTGAC
251 TGTCTG-CTTCAAGAAACATGAAGAAGAAGGCATTCATTGG-AAGAAAAGTCTATTTATAGTCTC
* * * *
1680 CCATTCTTTTGAAAGGCTTATTACTCG
314 TCATTCCTTTAAAAGCCTTATTACTCG
* * * *
1707 CTTTAAATGGTCTTATAATGTCATAATTGATTTTAAGTTGAA
1 CTTTAAATGATTTTATAATCTAATAATTGATTTTAAGTTGAA
1749 GTTTTNNNNN
Statistics
Matches: 1113, Mismatches: 231, Indels: 117
0.76 0.16 0.08
Matches are distributed among these distances:
334 2 0.00
335 36 0.03
336 89 0.08
337 31 0.03
338 68 0.06
339 137 0.12
340 48 0.04
341 272 0.24
342 200 0.18
343 227 0.20
344 3 0.00
ACGTcount: A:0.35, C:0.13, G:0.12, T:0.39
Consensus pattern (340 bp):
CTTTAAATGATTTTATAATCTAATAATTGATTTTAAGTTGAATTGTTTTACATTTTTGATTAAAA
CAAAATATAATTGAATGCCTGCCTCGAGAAACATGTAAGAAAAGCAATTCATTGAGAAGAAAACT
CCATTTATAGTCTCCCATTCTTTCAAAAGCCTTATTACTCGCCTTAAATGGCTTTATAATCTCAT
AATTAATTTTAAGTTGAATGTTTTAACATTTTTTAAAAAACAGACTATAATTGAATGTCTGCTTC
AAGAAACATGAAGAAGAAGGCATTCATTGGAAGAAAAGTCTATTTATAGTCTCTCATTCCTTTAA
AAGCCTTATTACTCG
Found at i:698 original size:171 final size:171
Alignment explanation
Indices: 5--1753 Score: 1340
Period size: 171 Copynumber: 10.3 Consensus size: 171
1 CTCA
* * * * **
5 CTTTAAATGATTTTATAATCTCGA-AATT-ATTTTAATTTGAATTCTTTGTAGATTTTTGGTTAA
1 CTTTAAATGGTTTTATAATCTC-ATAATTGATTTTAAGTTGAATT-TTTTTACATTTTTTATTAA
* * * * *
68 AACATATTATAATTGAATGTCTACCTCAAGAAACATGAATAAAAACACATTCATTGGCAAGAAAA
64 AACAGATTATAATTGAATGTCGACCTCGAGAAACATGAAGAAAAAGACATTCATTGGCAAGAAAA
* * * *
133 GTCTATTTATAGTTA-CCATTCCTTCAAAAGCTTTATTACTCA
129 GTCTATTTATAGTCACCCATTCTTTCAAAAGCCTTATTACTCG
* * * * * * * *
175 CTTTAAATGGTTTTATTATTTCAAAATTAATTTTATGTTCATTTTTTTTACATTTTTTGTTAAAA
1 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAAA
* ********** * * * * * *
240 CATATTANNNNNNNNNNTCTACCTCAAGAAACATAAAGAAGAAGGCATTCATTGGTAAGAAAAGT
66 CAGATTATAATTGAATGTCGACCTCGAGAAACATGAAGAAAAAGACATTCATTGGCAAGAAAAGT
* * * **
305 CTATTTACAGTCTCTCATTCCTTT-AAAAGCCTTATTGGTCG
131 CTATTTATAGTCACCCATT-CTTTCAAAAGCCTTATTACTCG
* * ********** * *
346 CTTTAAATGATTTTATAATCTAATNNNNNNNNNNAAGTTGAATTGTTTTACATTTTTTGTTAAAA
1 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAAA
* * * * * ** *
411 CAAAATATAATTGAATGCCTG-CCTTTG-GAATCATGTATTAAAAAG-CAATTCATTGAGAAAG-
66 CAGATTATAATTGAATGTC-GACC-TCGAGAAACATG-AAGAAAAAGAC-ATTCATTG-GCAAGA
* *** *
472 AAAGTCCATTTATAGTCTTTCATTCTTTTAAAAGCCTTATTACTCG
126 AAAGTCTATTTATAGTCACCCATTCTTTCAAAAGCCTTATTACTCG
* * * * *
518 TTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTAATTTTAAGTTGAATGTTTTAATATTTTTTATTAAAA
1 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAAA
* * * *
583 GAGACTATAATTGAATGTCGACCTTGAGAAACATGAAGAAAAAGGCATTCATTGGCAAGAAAAGT
66 CAGATTATAATTGAATGTCGACCTCGAGAAACATGAAGAAAAAGACATTCATTGGCAAGAAAAGT
* *
648 CTATTTATTGTCACCCATTCTTTCAAAAACCTTATTACTCG
131 CTATTTATAGTCACCCATTCTTTCAAAAGCCTTATTACTCG
* * *
689 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTATATTTTTGATTAAAT
1 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAAA
* * * * * *
754 CAGACTATAGTTGAATGCCTG-CCTCGAGAAACTTGTAAG-AAAAGCCATTGATTGAG-AAGAAA
66 CAGATTATAATTGAATGTC-GACCTCGAGAAACATG-AAGAAAAAGACATTCATTG-GCAAGAAA
* * * * *
816 ACTCCATTTATAGTCTCCCATTCTTTCAAAAGTCTTATTACTTG
128 AGTCTATTTATAGTCACCCATTCTTTCAAAAGCCTTATTACTCG
* * * *
860 CCTTAAATGGCTTTATGATCTCATAATT-AGTTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTA-AAAA
1 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGA-TTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAA
* * * * * ** * * *
923 ACAGACTATAATTGAATGTCTG-CTTCAAGAAACGTGTAGATGAAGCCATTTATTGAG-AAAAAA
65 ACAGATTATAATTGAATGTC-GACCTCGAGAAACATGAAGAAAAAGACATTCATTG-GCAAGAAA
* * * *
986 AGTAC-ATTTATAGTCTCTCATTCCTTC-AAAGCCTTTATTACTTG
128 AGT-CTATTTATAGTCACCCATTCTTTCAAAAGCC-TTATTACTCG
* * *
1030 CTTTAAACGATTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTTAATTTTTTTACATTTTTCT-TTAAA
1 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTT-TATTAAA
* * * * *
1094 ACAGAGTATAATTGAATGTCTACCTCGAG-AA-ATGTAA-AAAAAGAGGTATTTATTAGG-AAAA
65 ACAGATTATAATTGAATGTCGACCTCGAGAAACATG-AAGAAAAAGA--CATTCATT-GGCAAGA
* * * *
1155 AAAGTTTATTTATAGTCTCTCATT-TCTTCGAAAGCCTTATTACTCG
126 AAAGTCTATTTATAGTCACCCATTCT-TTCAAAAGCCTTATTACTCG
* * * *
1201 CTTTAAA----TATATAATCTCATAATTGATTTCAAGTTTAATTTTTTTTACATTTTTCATTAAA
1 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAA-TTTTTTTACATTTTTTATTAAA
* * * * ** * * **
1262 ATAAATTATAATTGAATATCTACCTCGAGAAATGTGAAGAAAATGACATTAATTGATAAGAAAAG
65 ACAGATTATAATTGAATGTCGACCTCGAGAAACATGAAGAAAAAGACATTCATTGGCAAGAAAAG
* *
1327 TCTATTTATAGTCACCCATT-TCATCAAAAGCCTTA-T-CAC-
130 TCTATTTATAGTCACCCATTCT-TTCAAAAGCCTTATTACTCG
* * * * * **
1366 C-TTAAATAGTTTTATAATCTCAAAATTGATTTTAA-TGTGAATTCTTTGTATATTTTTGACAAA
1 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGT-TGAATT-TTTTTACATTTTTTATTAA
* * * * * *
1429 AACAGATTATAATTGAATATCTACCTCAAGAAACGTGAAGAAAAAGACTTTCATT-ACTAAGAAA
64 AACAGATTATAATTGAATGTCGACCTCGAGAAACATGAAGAAAAAGACATTCATTGGC-AAGAAA
* * * * *
1493 AGTCCATTTAAAGTCACCAATTCTTTTAAAATCCTTATTACTCG
128 AGTCTATTTATAGTCACCCATTCTTTCAAAAGCCTTATTACTCG
* * * * * * **
1537 CATTAAATAGTTTTGTACTC-CAATATTTGATTTTAGGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAA
1 CTTTAAATGGTTTTATAATCTC-ATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAA
* * * * *
1601 ATAGATTATAATTGAATGTCTGTCTTTG-GAAACGTGAAGAAAAAGACA-TCATTGGCAAGAAAA
65 ACAGATTATAATTGAATGTC-GACCTCGAGAAACATGAAGAAAAAGACATTCATTGGCAAGAAAA
* * ** *
1664 GTATATTTATAGTGACCCATTCTTTTGAAAGGCTTATTACTCG
129 GTCTATTTATAGTCACCCATTCTTTCAAAAGCCTTATTACTCG
* * *
1707 CTTTAAATGGTCTTATAATGTCATAATTGATTTTAAGTTGAAGTTTT
1 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTT
1754 NNNNNNNNNN
Statistics
Matches: 1270, Mismatches: 254, Indels: 110
0.78 0.16 0.07
Matches are distributed among these distances:
164 5 0.00
165 1 0.00
166 2 0.00
167 35 0.03
168 210 0.17
169 20 0.02
170 334 0.26
171 485 0.38
172 173 0.14
173 5 0.00
ACGTcount: A:0.35, C:0.13, G:0.12, T:0.40
Consensus pattern (171 bp):
CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTATTAAAA
CAGATTATAATTGAATGTCGACCTCGAGAAACATGAAGAAAAAGACATTCATTGGCAAGAAAAGT
CTATTTATAGTCACCCATTCTTTCAAAAGCCTTATTACTCG
Found at i:2339 original size:172 final size:172
Alignment explanation
Indices: 2038--2424 Score: 474
Period size: 172 Copynumber: 2.2 Consensus size: 172
2028 NNNNNNNATG
* * *
2038 AAGAAAAACGCATTCATTGGTAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACCCATTCCTTCAAAAACCTAAT
1 AAGAAAAAGGCATTCATTGGTAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATTCCATCAAAAACCTAAT
* * * * * *
2103 TACTCACTTCAAATAGTTTTATTATCTCAAAATTTATTTTATGTTTAGTTTATTTAATATTTTTA
66 TACTCACTTCAAATAGTTTTATAATCTCAAAATTGATTTAATGTTGAGATTATTTAACATTTTTA
** ** *
2168 ATTAAAACAGATTATAATTAAATGTCTACCTTGAGAAATGTG
131 ATTAAAACAGATTATAATTAAATGTCTACCTCCAGAAACATA
* * * *
2210 AGGAAAAAGGCATTCATTGGTAAGAAAAGTCCATTTAGAGTCACCCATTCCATCAAAAGCCTTAT
1 AAGAAAAAGGCATTCATTGGTAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATTCCATCAAAAACCTAAT
* * *
2275 TACTCACATT-ACATGGTTTTATAATCTCAAAATTGATTTCAAT-TTGA-ATTCTTTATACATTT
66 TACTCAC-TTCAAATAGTTTTATAATCTCAAAATTGATTT-AATGTTGAGATTATTTA-ACATTT
* * * *
2337 TTAGTTAAAATAGGTTATAATTAAATGTCTACCTCCAGATACATA
128 TTAATTAAAACAGATTATAATTAAATGTCTACCTCCAGAAACATA
* * *
2382 AAGAAAAAGGCATTGATCGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCA
1 AAGAAAAAGGCATTCATTGGTAAGAAAAGTCCATTTATAGTCA
2425 NNNNNNNNNN
Statistics
Matches: 182, Mismatches: 30, Indels: 6
0.83 0.14 0.03
Matches are distributed among these distances:
171 6 0.03
172 172 0.95
173 4 0.02
ACGTcount: A:0.38, C:0.15, G:0.12, T:0.36
Consensus pattern (172 bp):
AAGAAAAAGGCATTCATTGGTAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATTCCATCAAAAACCTAAT
TACTCACTTCAAATAGTTTTATAATCTCAAAATTGATTTAATGTTGAGATTATTTAACATTTTTA
ATTAAAACAGATTATAATTAAATGTCTACCTCCAGAAACATA
Found at i:2756 original size:168 final size:170
Alignment explanation
Indices: 2453--2843 Score: 483
Period size: 169 Copynumber: 2.3 Consensus size: 170
2443 NNNNNNCTCG
* * *
2453 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAGGTTAAATATTTTT--ATTTTATTTTAAAA
1 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTT-AATTTTTTTACATTTTATGTTAAAA
* * * * *
2516 CAGACTATAATTGAATGACTGCCTTAGGAAAAGTCCAAAAAAAGACATTGATTTGAAAGAAAAGT
65 CAAACTATAATTGAATGACTGCCTGAGGAAAAGTCAAAAAAAAGACATTCATTAGAAAGAAAAGT
***
2581 CCATTTATAGTCT-CTCATTCCTTCAAAAGTGTTATT-CATA
130 CCATTTATAGTCTAC-CATTCCTTCAAAACCCTTATTACATA
* *
2621 CTTTAAAAGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTTATTGTTTTTACATTTTA-GTTAAAA
1 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAATT-TTTTTACATTTTATGTTAAAA
* * * * *
2685 CAAATTATAATTGAATGTCTAGCCTGA-GAAAGGTGAAAAAAAAGGCATTCATTAGCAAA-AAAA
65 CAAACTATAATTGAATGACT-GCCTGAGGAAAAGTCAAAAAAAAGACATTCATTAG-AAAGAAAA
* *
2748 GT-CATTTATAGTCTACCATTCCTTCAAAACCCTTGTTACTTA
128 GTCCATTTATAGTCTACCATTCCTTCAAAACCCTTATTACATA
*
2790 CCTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTCAATTTTTTTACATT
1 CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTT-AATTTTTTTACATT
2844 NNNNNNNNNN
Statistics
Matches: 192, Mismatches: 23, Indels: 15
0.83 0.10 0.07
Matches are distributed among these distances:
167 2 0.01
168 71 0.37
169 102 0.53
170 17 0.09
ACGTcount: A:0.36, C:0.12, G:0.11, T:0.40
Consensus pattern (170 bp):
CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAATTTTTTTACATTTTATGTTAAAAC
AAACTATAATTGAATGACTGCCTGAGGAAAAGTCAAAAAAAAGACATTCATTAGAAAGAAAAGTC
CATTTATAGTCTACCATTCCTTCAAAACCCTTATTACATA
Done.