Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: NW_018402776.1 Herrania umbratica cultivar Fairchild unplaced genomic scaffold, ASM216827v2 scaffold_5835.0, whole genome shotgun sequence
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* * * * * *
173 TTTTTACC-AAAATGTGAAAAAATTTAATTTAAAAAT-AATTATAAGATTATAAAAATATTTAAG
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* * * * *
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* * * *
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65 CGAGTAATAAGGCTTTCGAAGGCTTGAGTGACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATGGATGGCTT
** ** * *
472 TTGCTTCACATTTCCCAAAGCAAACATTCAATTATTATCTG
130 TTGCTTCATGTTTCCTGAAGCAAACATTCAATTATAATATG
* * *
513 TTTTAACTAAAAATGTAAAAGAATTTAACTTAAAATCAATTATTAGATTATAAAACTATTTAAAG
1 TTTTAACCAAAAATGTAAAA-AATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAG
* * * * * * * * *
578 CGAGTAATAAGGCGTTCGATGACATGGGTGAGTATATATAGACTTTTCTTGCTAATGAATGGCTT
65 CGAGTAATAAGGCTTTCGAAGGCTTGAGTGACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATGGATGGCTT
* * * * * * * *
643 TTTCTTCATGTTTCTTGAGGTAAATATTCAATTATTATTTC
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684 TTTTATA--AACAAATGTAGAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAA
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* * * *
747 GGCGAGTAA-ATAGGGTTTCGAAGGCTTGAGTGACAATAAATGGACTTTTTCTT--CATAGTGGA
63 AGCGAGTAATA-AGGCTTTCGAAGGCTTGAGTGACTATAAATAGAC-TTTTCTTGCCA-A-TGGA
* * * *
809 TGGCTTTTGCTTCACGTTTCTTGAAGCATACATTCAATCATAATATG
124 TGGCTTTTGCTTCATGTTTCCTGAAGCAAACATTCAATTATAATATG
** * * *
856 TTTGCACCAAAAATATAAAAAAATTCAA-TTGAAAATCGATTATGAAATTATAAAACTATTTAAA
1 TTTTAACCAAAAATGT-AAAAAATTCAACTT-AAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAA
** * * * * * * *
920 GTAAGTAATAGGGCTTTCG-AGGATTGGGTGACTATAAA-CGAACTTTTCTCT-CCAGTGAATAA
64 GCGAGTAATAAGGCTTTCGAAGGCTTGAGTGACTATAAATAG-ACTTTTCT-TGCCAATGGAT-G
* * * * ** * * *
982 TCTTTT-CATCATGTTTCTTGAGGTGAACAATAAAATATAAT-TG
126 GCTTTTGCTTCATGTTTCCTGAAGCAAACATTCAATTATAATATG
* * * * *
1025 TTTTAACCAAAAATGTGAAGAAATTGAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACGATTTAAGG
1 TTTTAACCAAAAATGT-AAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAG
** * * * ** * * *
1090 CGAACAATAAGGCTTTCGAAGGCAT-AGATGACTATAAAATGGGCTTTTCTTGTTAACGAATGCC
65 CGAGTAATAAGGCTTTCGAAGGCTTGAG-TGACTAT-AAATAGACTTTTCTTGCCAATGGATGGC
* * * * *
1154 TTTTTCTTCATATTT-CTTAAGACAGACATTCAATTATAATATT
128 TTTTGCTTCATGTTTCCTGAAG-CAAACATTCAATTATAATATG
* *
1197 TTTTAACTAAAAATGTAAAAATATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAA
1 TTTTAACCAAAAATGTAAAAA-ATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAG
* * * * * *
1262 CGAGTAATAAGGCTTTTGAAGGCTTGAGTGACCATAGATAGACTTCTCTTGCTAATGGGTGGCTT
65 CGAGTAATAAGGCTTTCGAAGGCTTGAGTGACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATGGATGGCTT
* * * *
1327 TTGATAGACAT-TTT-CTAAAGAAAACATTCAATTATAATATG
130 TTGCT--TCATGTTTCCTGAAGCAAACATTCAATTATAATATG
* * *
1368 TTTTAGCCAAAAATGTAAAAAAATTCAACTTAAAATGAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAG
1 TTTTAACCAAAAATGT-AAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAG
* * ** * ** * * ** *
1433 TGAGTAATAAGACTTTTAAACG-TACAGGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGGCAATAAATGGTT
65 CGAGTAATAAGGCTTTCGAAGGCTTGA-GTGACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATGGATGGCT
* *
1497 TTTCCTTCATGTTTCCT-AAGCAAGACATTCAATTATAATCTG
129 TTTGCTTCATGTTTCCTGAAGCAA-ACATTCAATTATAATATG
* * *
1539 TTTTAACTAAAAATGTAAAATAATTCAGCTTAAAAAT-AATTATGAGATTACAAAACTATTTAAA
1 TTTTAACCAAAAATGTAAAA-AATTCAACTT-AAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAA
* * * ** * *
1603 GCGAGTACTAAGGCTTTCGAAAGCTTGAGTGGCTATACGTGGACTTTTCTTGCCAATGGGTGGCT
64 GCGAGTAATAAGGCTTTCGAAGGCTTGAGTGACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATGGATGGCT
* * * * * *
1668 TTTACTTCATGTTTCCTGAAGCAGACATTCAATTTTTATCTA
129 TTTGCTTCATGTTTCCTGAAGCAAACATTCAATTATAATATG
* * * * * * *
1710 TTTTAACTAAAAATGAAGAAAAATTCATCTCAAAATTAATTATGAGATAATAAAACCATTTAAAG
1 TTTTAACCAAAAATGTA-AAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAG
* * * * *
1775 CGAGTAATAAGGCTTTTCGAAGGC-CGAAGTGAATATAAATAGACTTTTCTTACCAATGGATAGT
65 CGAGTAATAAGGC-TTTCGAAGGCTTG-AGTGACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATGGATGGC
* * * * * *
1839 TTTTACTTCACGTTTCTCATG--GAAAACATTCAGTTATAACATA
128 TTTTGCTTCATGTTTC-C-TGAAGCAAACATTCAATTATAATATG
*
1882 TTTTAACC-AAAATCATAATAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAA
1 TTTTAACCAAAAAT-GTAA-AAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAA
* * * * * ** *
1946 GCGATTAAT-AGGAGTTTTGAAGGCTTGAGTGACTACAAATAAACTTTTCTTATCAATGGGTGGC
64 GCGAGTAATAAGG-CTTTCGAAGGCTTGAGTGACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATGGATGGC
* ** * * *
2010 TTTTGGTTCATGTTTCCCAAAGCAGATATTCAATTATTATATG
128 TTTTGCTTCATGTTTCCTGAAGCAAACATTCAATTATAATATG
*
2053 TTTTAACCAAAAATGTAAAAAAGTTCACCTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAG
1 TTTTAACCAAAAATGTAAAAAA-TTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAG
* * * * * * * * *
2118 CGACTAATAATGCTTTTGAAGGCTTGGGTGAATATAAATACACTTTTCCTGCTAATAGATGGCTT
65 CGAGTAATAAGGCTTTCGAAGGCTTGAGTGACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATGGATGGCTT
* * *** *
2183 TTGCTTCACT-TTT-CTCAAGGCAGACATTTGGTTATAATATA
130 TTGCTTCA-TGTTTCCTGAA-GCAAACATTCAATTATAATATG
* *
2224 TTTTAACC-AAAATCGTAAAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGGTTATAAAACCATTTAAA
1 TTTTAACCAAAAAT-GT-AAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAA
* * * * ** * ** *
2288 GCG-GCTAATAGGGGTTTTGAAGCGGCTAAT-AGGGGTTTTAAAGCGGCTAATAGGGGTTTTGAT
64 GCGAG-TAATAAGGCTTTCGAA--GGCT--TGA-GTG-ACTATA------AATA-GACTTTT-CT
* ** * * * * * * * *
2351 TG-C-ATAGATAACTAAAATGGACTTC---TCTCGCT-AATG-AAAGACTT--TTTTTACCTGTG
114 TGCCAATGGATGGCT---TTTG-CTTCATGTTTC-CTGAA-GCAAACA-TTCAATTATA-ATATG
** ** ** ** * ** * ** * *
2407 TCTCGAGGCAAGCAT-TCAATTATTGTCTGTCTTGAACAA-AAATGTAAAAAAATT-T-TAA--A
1 T-TTTAACCAAAAATGT-AAAAAAT-TC-AACTT-AA-AATCAAT-T-ATGAGATTATAAAACTA
* * * * * * * * * * ***
2466 TTAAAATC-AATTATGAGACTAT--AAGACCCTTTAAAG-GA--AGT-AATAAGGCTTTTGAAGG
58 TTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCGAAG--GC-TT-GAGTGACTA-TAAAT-AGACTTTT-CTTG
* * * *** ** * **** * *** *
2524 CTTAA--G-TGACTATAAATAAACT-TTTCTTGTCAATGGGTGGCTTTTGCTT-TACGT-T-
116 C-CAATGGATGGCTTTTGCTTCA-TGTTTCCTG--AA--GCAAACATTCAATTATA-ATATG
* * * * * ** * ** * ** * *
2579 TTCTGAAGCAGACAT-TCAATTATT-ATCTGTTTTAGTCAA--AAAAG-TAAAAAAACTCAACTT
1 TT-TTAACCAAAAATGTAAAAAATTCAAC--TTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACT--A-TT
* * * ** ** * * * * * **
2639 AAGAAGAATTATGAGGTTATAAAACTTTTTAAAGAGAGTAATAAG-G-CTTTCAA-AGGC-TTGA
60 TA-AAG-----CGA-GTAATAAGGC-TTTCGAAG-G-CT--TGAGTGACTATAAATAGACTTTTC
* * ** ** * *** ** * **
2700 GTG-AATATAAATAGAATTTT-CTTATCAAT-TTATGGCTTTTGCTTCACGTTTCCCGAGGTAT-
113 TTGCCA-ATGGAT-GGCTTTTGC-T-TC-ATGTT-T-CCTGAAGC-AAAC-ATT--C-AATTATA
2761 -TCAT-
166 AT-ATG
* * * ** * *
2765 TTAGTT-A-TAATATATTTTAACTAA---AAATGTATAAA--AATT-T-A-ATT-TAAAA-TCAA
1 TT--TTAACCAA-A-AATGTAAAAAATTCAACT-TA-AAATCAATTATGAGATTATAAAACT-AT
* * * * * * * *
2818 TT-ATGAGACTAA-AA-TCATTT-AAAGCGAGTAATAAG-G-CTTTCAAAGGCTTGAGTGACTAT
59 TTAAAGCGAGTAATAAGGC-TTTCGAAG-G-CT--TGAGTGACTAT-AAA----T-A--GACT-T
* * * * * * ** **
2877 AATTGGGCTTTCCTTAATAG-TGG--ATGGCTT-TTGCTTTGCGTTTCTCAAAGAAAACATTCAA
110 --TT---CTTGCC--AATGGATGGCTTTTGCTTCATG-TTT-C--CT-GAAGC--AAACATTCAA
*
2938 TTATAATATA
161 TTATAATATG
2948 TTTTAACCAAAAATGTAAAACAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAG
1 TTTTAACCAAAAATGTAAAA-AATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAG
* * * ** * * * * *
3013 CAAGCAATAAGGCTTTTGAAGGAATGGGTGGCTATAAAT-GAACTTTTTTTGTCAATGAATGG-T
65 CGAGTAATAAGGCTTTCGAAGGCTTGAGTGACTATAAATAG-ACTTTTCTTGCCAATGGATGGCT
* * * * * *
3076 GTTTTCTTCATGTTTCC-CAAGGTAGACATTCAAATATAATCTG
129 -TTTGCTTCATGTTTCCTGAA-GCAAACATTCAATTATAATATG
* * * * *
3119 TTTTAACTAAAAATATAAAAAAAGTCAACTTAAAATCAATTGTCAGATTATAAAACTATTTAAAG
1 TTTTAACCAAAAATGT-AAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAG
* * ** * * * * * * * *
3184 CGAGTAATAAAGTTTTTAAAAGCTTAAATGAATATAAATGAGATTTTTCTTACGAATGGATGACT
65 CGAGTAATAAGGCTTTCGAAGGCTTGAGTGACTATAAAT-AGACTTTTCTTGCCAATGGATGGCT
* * * * *
3249 TTTGCTTCATGTTTCCTCGGA-TAGACATTCAGTTATAATATA
129 TTTGCTTCATGTTTCCT-GAAGCAAACATTCAATTATAATATG
* * * *
3291 TTTTAACCAAAAATGTAAAAAGACTCAACTTAAAATCAATTATGAGACTATAAGACCATTTAAAG
1 TTTTAACCAAAAATGTAAAAA-ATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAG
* * * * * * * *
3356 CGAGTAATAAGGCTTTCAAAGGCTTGAGTGACTACAGATGGACTTTTCTTGCAAATGGGTAGCAT
65 CGAGTAATAAGGCTTTCGAAGGCTTGAGTGACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATGGATGGCTT
** ** * * * *
3421 TTGCTTCACATTTTATGAAGCAGACAATCAATTATTATCTG
130 TTGCTTCATGTTTCCTGAAGCAAACATTCAATTATAATATG
**
3462 TTTTAACC-AAAATGTGAAAAAATTCAA-TCTAAAAAAAATTATGAGATTATAATAAC-ATTTAA
1 TTTTAACCAAAAATGT-AAAAAATTCAACT-TAAAATCAATTATGAGATTATAA-AACTATTTAA
* * * * * *
3524 AGCAAGTAATAAGGCTTTCAAAGGCTTGAGTGAATATAAATAGAATTTTTTTACCAATGGATGGC
63 AGCGAGTAATAAGGCTTTCGAAGGCTTGAGTGACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATGGATGGC
* * * *
3589 TTTTGTTTTATGTTTTCT-AAGGCAGACATTCAATTATAATATG
128 TTTTGCTTCATGTTTCCTGAA-GCAAACATTCAATTATAATATG
* * * * * *
3632 TTTTCACTAAAAATGTAAAACAAGTCAACTTGGAAA-CAATTATGAGACTATGAAACTATTTAAA
1 TTTTAACCAAAAATGTAAAA-AATTCAACTT-AAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAA
* * * *
3696 GCAAGTAAAAAGGCTTTTGAAGACTTGAGTGACTATAAATAGA-TTCTTCTTGCCAATTGG-TGG
64 GCGAGTAATAAGGCTTTCGAAGGCTTGAGTGACTATAAATAGACTT-TTCTTGCCAA-TGGATGG
* * * * * *
3759 CTTTGGCTTCACGTTTCCTAAAGCAAACATTCAATTATTATCTA
127 CTTTTGCTTCATGTTTCCTGAAGCAAACATTCAATTATAATATG
* * *
3803 TTTTAATCAAAAATGTAAAAGAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAGCCATTTAAAG
1 TTTTAACCAAAAATGTAAAA-AATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAG
** ** * * * * *
3868 TAAGTAATAAGGCTTTCGAAGGAATGGGTGGCTATAAATGGAGTTTTCTTGCCAATGAATGTAG-
65 CGAGTAATAAGGCTTTCGAAGGCTTGAGTGACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATGGATG--GC
* * * *
3932 TTTT-CTTCATGTTTCAT-AATGCAGACATTCAATTATAATCTT
128 TTTTGCTTCATGTTTCCTGAA-GCAAACATTCAATTATAATATG
* * *
3974 TTTTAACTAAAAATGTAAAAATATTCAACTTAAAATCAATTATAAGATTATAAAACCATTTAAAG
1 TTTTAACCAAAAATGTAAAAA-ATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAG
* * * * * *
4039 CGAGTAATAAGGCTTTTGAAGGCTTGAGTGACTATAGATAGACTTTTCTTGCTAATGGGTAGCCT
65 CGAGTAATAAGGCTTTCGAAGGCTTGAGTGACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATGGATGGCTT
* ** ** * *
4104 TTGATAGACATTT-CTCAAAGAAAACATTCAATTATAATATG
130 TTGCTTCATGTTTCCT-GAAGCAAACATTCAATTATAATATG
* *
4145 TTTTAGCCAAAAATGTAAAACAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAAAC-AATTAAA
1 TTTTAACCAAAAATGTAAAA-AATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTAT-AAAACTATTTAAA
* * * * * * * * * *
4209 GTGAGTAATAAGACTATT-AAAGGATTAAGTGACTATAAATGGA-ATTTCTTGGCAATGAATGGT
64 GCGAGTAATAAGGCT-TTCGAAGGCTTGAGTGACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATGGATGGC
* * *
4272 TTTTCCTTCATGTTTCGT-AAGCAAGACATTCAATTATAATCTG
128 TTTTGCTTCATGTTTCCTGAAGCAA-ACATTCAATTATAATATG
* *
4315 TTTTAACCAAAAATATAAAAAAATTCAACTTAAAAAT-AATTATGAGATTATAAAACAATTTAAA
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* * ** * * *
4379 GAGAGTAATAAGGGTTTTAAAGGCTTGAGTGAATATAAATAGAATGTTCTTGCCAATGGATGGCT
64 GCGAGTAATAAGGCTTTCGAAGGCTTGAGTGACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATGGATGGCT
* * * *
4444 TTTGCTTCATGTTTCTTGAGGCAGACATTCAATTATAATATA
129 TTTGCTTCATGTTTCCTGAAGCAAACATTCAATTATAATATG
* * * * *
4486 TTTTAACCAAAAATGTAAAATAATTTAACTTAAAATCAATTATGAGAGTATAAAACCATTCAATG
1 TTTTAACCAAAAATGTAAAA-AATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAG
** * * * * ** * * * *
4551 TTAGTAATAAGG-TGTTC-AATTGCAT-AGATAACTATAAATGGACTTTTGATACTAATGAAAGG
65 CGAGTAATAAGGCT-TTCGAA-GGCTTGAG-TGACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATGGATGG
* * * * * * * ** *
4613 CTTTTTCTTCCTATGT-CTCAAGGCAAGCGTTCAATTATTCTTTG
127 CTTTTGCTTCATGTTTCCTGAA-GCAAACATTCAATTATAATATG
* * * * * *
4657 TTTTAACTAAAAATGTAAAAAAAGTTTAAATTAAAATCAATTATGAGACTGTAAAACCATTTAAA
1 TTTTAACCAAAAATGT-AAAAAA-TTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAA
* * * * *
4722 GCGAGTAATAAGGCTTTTGAAGGCTTAAGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGTCAATGGGTGGCT
64 GCGAGTAATAAGGCTTTCGAAGGCTTGAGTGACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATGGATGGCT
** * * * * *
4787 TTTGCTTCACATTTTCTAAAGTAAACATTCAATTATTATCTG
129 TTTGCTTCATGTTTCCTGAAGCAAACATTCAATTATAATATG
* * * **
4829 TTTTCACTAAAAATGCAAAAACATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTAT-AAACCGTTTAAAG
1 TTTTAACCAAAAATGTAAAAA-ATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAG
* * * * * * *
4893 TGAGTAATATGGC-TTCTAAAGGCTTGAGTGAATAGAAATAGACTTTTCTTACTAATGGATGGCT
65 CGAGTAATAAGGCTTTC-GAAGGCTTGAGTGACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATGGATGGCT
* * * * * * * *
4957 TTTACTTCACGTTTCC-CAAGACATACATTTAGTTATAACATA
129 TTTGCTTCATGTTTCCTGAAG-CAAACATTCAATTATAATATG
* *
4999 TTTTAACC-AAAATAGTAAAAAAATTTAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAATTATTTAAA
1 TTTTAACCAAAAAT-GT-AAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAA
** * * * * *
5063 ATG-GCTAATAGAGG--TTCTGAAGGGTTGAGTGACTATAAATGGACTTGTCTTGTCAATGGGTG
64 GCGAG-TAATA-AGGCTTTC-GAAGGCTTGAGTGACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATGGATG
* ** * * * *
5125 GTTTTTGCTTCATGTTTCCTGAAATAGACATTCAATTATTATCTA
126 GCTTTTGCTTCATGTTTCCTGAAGCAAACATTCAATTATAATATG
* *
5170 TTTTAACCAAAAATGTATAAAAATTCAACTTAAGAA-GAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAA
1 TTTTAACCAAAAATGTA-AAAAATTCAACTTAA-AATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAA
** * * * * *
5234 AAGAGCAATAAGGCTTTCAAAGGCTTGAGTGAATATAAATAGAATTTTCTTGTCAATGGATGGCT
64 GCGAGTAATAAGGCTTTCGAAGGCTTGAGTGACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATGGATGGCT
* * *
5299 TTTGCTTCATGTTTCC-CAAGGCAAACATTCAGTTATAATATA
129 TTTGCTTCATGTTTCCTGAA-GCAAACATTCAATTATAATATG
* * * *
5341 TTTTAA--TAAAATGTATAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGACACTATAAAACCATTTAAAG
1 TTTTAACCAAAAATGTA-AAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAG
* * * * * * * *
5404 CGAATAATAAGTCTTTTGAAGGCTTAAGTGACTATAAATGGACTTTCCTTGCTAGTGGATGGCTT
65 CGAGTAATAAGGCTTTCGAAGGCTTGAGTGACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATGGATGGCTT
* * ** * *
5469 TTGCTTTATGTTTTCAAAAGAAAACATTCAATTATAATATA
130 TTGCTTCATGTTTCCTGAAGCAAACATTCAATTATAATATG
* * *
5510 TTTTAATCAAAAATATAAAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAG
1 TTTTAACCAAAAATGT-AAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAG
* * * * * * **
5575 CAAGTAATAAGGCTTTCGAA-GCAATGGGTGGCTATAAATGGACTTCTCTTGCCAATAAATAGTG
65 CGAGTAATAAGGCTTTCGAAGGC-TTGAGTGACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATGGAT-G-G
* ** * * ** * *
5639 -TTTT-TTTCACATTTCC-CAAGGTAGGCATTCAAATATAATCTG
127 CTTTTGCTTCATGTTTCCTGAA-GCAAACATTCAATTATAATATG
* * *
5681 TTTTAACTAAAAATATAAAAAAAGTT-AACTTAAAATCAATTGA-GACATTATAAAACTATTTAA
1 TTTTAACCAAAAATGT-AAAAAA-TTCAACTTAAAATCAATT-ATGAGATTATAAAACTATTTAA
* * ** * * * * * * *
5744 AGCGAGTAATAAAGTTTTC-AATAACTTAAGTGAATGTAAAAGAGACGTTTCTTACGAATGGATG
63 AGCGAGTAATAAGGCTTTCGAA-GGCTTGAGTGACTAT-AAATAGACTTTTCTTGCCAATGGATG
* * * * * ** *
5808 ACTTTTGCTACATGTTTCTTGAGGCAGACATTCAGGTATAATATA
126 GCTTTTGCTTCATGTTTCCTGAAGCAAACATTCAATTATAATATG
* * * * * *
5853 TTTTAACTAAAAATGTAAAACACTCAA-TTAAAATCAATTATGAGAATATAAAACAATTTAAAGA
1 TTTTAACCAAAAATGTAAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAGC
** * * * * *
5917 GAGTAATAAGGCTTTTAAAGGCTTAAGTAACTACAAAT-GAACTTTTCTTGCAAATGGGTGGCTT
66 GAGTAATAAGGCTTTCGAAGGCTTGAGTGACTATAAATAG-ACTTTTCTTGCCAATGGATGGCTT
* * *
5981 TTGCTTCATGTTTCTTGAAGCAAACATTCAATTATTATCTG
130 TTGCTTCATGTTTCCTGAAGCAAACATTCAATTATAATATG
* * * *
6022 TTTTAACC-AAAATGTGAAAACATTTAATTTAAAAAT-AATTATGAGATTATAAAA-TCATTTTA
1 TTTTAACCAAAAATGT-AAAAAATTCAACTT-AAAATCAATTATGAGATTATAAAACT-ATTTAA
** * * *
6084 AGCGAGTAATAAGGCTTTTAAAGGCTTGAGTGAATATAAATAGACTTTTTTTACCAATGGATGGC
63 AGCGAGTAATAAGGCTTTCGAAGGCTTGAGTGACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATGGATGGC
* * * * * *
6149 GTTTGTTTCATGTTTTCTGAGGCAGACATTCAGTTATAATATG
128 TTTTGCTTCATGTTTCCTGAAGCAAACATTCAATTATAATATG
* * * *
6192 GTTTCACCAACAATGTAAAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGACTATAAAACTATTTAAAG
1 TTTTAACCAAAAATGT-AAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAG
* * * * * * *
6257 CGAGTAAGAATGCTTTCGAAGGGTTGAGTGACTATAAATGGACTTTGCTTGCCAAAGGGTGGCTT
65 CGAGTAATAAGGCTTTCGAAGGCTTGAGTGACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATGGATGGCTT
* * * * *
6322 TTGCTTCACGTTTCC-GAAGCAGACGTTCAATTATTATCTG
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* * *
6426 CGAGTAATAAGGC-TT-G-A-G--TGA---A-TATAAATAGACTTTTTTTACTAATGGATGG-TG
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* * * * * * *
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* * *
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* * * * * * *
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* * * * * *
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* *
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* * * *
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* * * *
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* * * * * * *
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* * * * *
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* * *
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*
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* * *
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*** * * * ** * *
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* * ** * * *
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* * * * * ** * **
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* * *
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* * * * * **
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* * * ** * * * *
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** ** * *
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* *
1224 ACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAACGAGTAATAAGGCTTTTGAAGGCTTGA
189 ACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTTGAAGACTTGA
* * * * * * * * *
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*
1352 ATTCAATTATAATATGTTTTAGCC
317 ATTCAATTATAATATGTTTTA--A
* * *
1376 AAAAATGTAAAAAAATTCAACTTAAAATGAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGTGAGTAAT
1 AAAAATGT-AAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAGCGAGTAAT
* * * ** * ** * *
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* * *
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* * *
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* ** * * * * * * *
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* * * *
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* * * * * *
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* * * * * * * *
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* ** * * * * * *
1845 TTCACGTTTCTCATGGAAAACATTCAGTTATAA-CATATTTTAAC-CAAAATCATAATAAAATTC
126 TTCACGTTTCCCAAAGCAGACATTCAATTATAATC-TGTTTTAACTAAAAAT-GTAA-AAAATTC
* * *
1908 AACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAGCGATTAAT-AGGAGTTTTGAAGGCTT
188 AACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAGCGAGTAATAAGG-CTTTTGAAGACTT
* * * * * *** * *
1972 GAGTGACTACAAATAAACTTTTCTT-ATCAATGGGTGGCTTTTGGTTCATGTTTCCCAAAGCAGA
252 GAGTGACTATAAATAGACTTTTCTTGCT-AATGGATGGCTTTTGCTTCATGTTTCTTGAGGCAAA
* *
2036 TATTCAATTATTATATGTTTTAA
316 CATTCAATTATAATATGTTTTAA
* *
2059 CCAAAAATGTAAAAAAGTTCACCTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAGCGACTA
1 --AAAAATGTAAAAAA-TTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAGCGAGTA
* ** * * ** * * *
2124 ATAATGCTTTTGAAGGCTTGGGTGAATATAAATACACTTTTCCTGCTAATAGATGGCTTTTGCTT
63 ATAAGGCTTTCAAAGGCTTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGGATGGCTTTTGCTT
* * * *** * * *
2189 CACTTTTCTCAAGGCAGACATTTGGTTATAATATATTTTAAC-CAAAATCGTAAAAAAATTCAAC
128 CACGTTTCCCAAAGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACTAAAAAT-GT-AAAAAATTCAAC
* * * * *
2253 TTAAAATCAATTATGAGGTTATAAAACCATTTAAAGCG-GCTAATAGGGGTTTTGAAGCGGCTAA
191 TTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAGCGAG-TAATAAGGCTTTTGAA--GACT--
* ** * ** * * ** * * *
2317 T-AGGGGTTTTAAAGCGGCTAATAGGGGTTTTGATTGC--ATAGATAACTAAAATGGACTTC-TC
251 TGA-GTG-ACTATA------AATA-GACTTTT-CTTGCTAATGGATGGCT---TTTG-CTTCATG
** * * * * * * * ** *
2378 TCGC-TAATG-AAAGACTT--TTTTTACCTGTGTCTCGAGGC
302 TTTCTTGAGGCAAACA-TTCAATTATA-ATATGT-TTTA--A
** ** * ** * ** *
2416 AAGCAT-TCAATTATTGTCTGTCTTGAACAA-AAATGTAAAAAAATTTTAAATTAAAATCAATTA
1 AAAAATGT-AAAAAAT-TC-AACTT-AA-AATCAAT-T-ATGAGA--TT--A-TAAAA-C---TA
* *** ** * **
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* * * * ** *
2544 CTTTTCTTGTCAATGGGTGGCTTTTGCTTTACGTTTTCTGAAGCAGACATTCAATTATTATCTGT
99 CTTTTCTTGCCAATGGATGGCTTTTGCTTCACGTTTCCCAAAGCAGACATTCAATTATAATCTGT
* * * * * *
2609 TTT-AGTCAAAAAAGTAAAAAAACTCAACTTAAGAA-GAATTATGAGGTTATAAAACTTTTTAAA
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* ** * * * * **
2672 GAGAGTAATAAGGCTTTCAAAGGCTTGAGTGAATATAAATAGAATTTTCTT-ATCAATTTATGGC
226 GCGAGTAATAAGGCTTTTGAAGACTTGAGTGACTATAAATAGACTTTTCTTGCT-AATGGATGGC
* ** * ** * * *
2736 TTTTGCTTCACGTTTCCCGAGGTATTCATTTAGTTATAATATATTTTAA
290 TTTTGCTTCATGTTTCTTGAGGCAAACATTCAATTATAATATGTTTTAA
* * * *
2785 CTAAAAATGTATAAAAATTTAATTTAAAATCAATTATGAGACTA-AAATC-ATTTAAAGCGAGTA
1 --AAAAATGTA-AAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAGCGAGTA
* * * *** *
2848 ATAAGGCTTTCAAAGGCTTGAGTGACTATAATTGGGCTTTCCTTAATAGTGGATGGCTTTTGCTT
63 ATAAGGCTTTCAAAGGCTTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGGATGGCTTTTGCTT
** * * * * * *
2913 TGCGTTTCTCAAAGAAAACATTCAATTATAATATATTTTAACCAAAAATGTAAAACAATTCAACT
128 CACGTTTCCCAAAGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACTAAAAATGTAAAA-AATTCAACT
* * * *
2978 TAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAGCAAGCAATAAGGCTTTTGAAGGA-ATGGGT
192 TAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTTGAA-GACTTGAGT
* * * * *** * *
3042 GGCTATAAAT-GAACTTTTTTTG-TCAATGAATGG-TGTTTTCTTCATGTTTCCCAAGGTAGACA
256 GACTATAAATAG-ACTTTTCTTGCT-AATGGATGGCT-TTTGCTTCATGTTTCTTGAGGCAAACA
* *
3104 TTCAAATATAATCTGTTTTAA
318 TTCAATTATAATATGTTTTAA
* * * *
3125 CTAAAAATATAAAAAAAGTCAACTTAAAATCAATTGTCAGATTATAAAACTATTTAAAGCGAGTA
1 --AAAAATGT-AAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAGCGAGTA
* * * * * * * * * * *
3190 ATAAAGTTTTTAAAAGCTTAAATGAATATAAATGAGATTTTTCTTACGAATGGATGACTTTTGCT
63 ATAAGGCTTTCAAAGGCTTGAGTGACTATAAATG-GACTTTTCTTGCCAATGGATGGCTTTTGCT
* ** * * * * * *
3255 TCATGTTTCCTCGGA-TAGACATTCAGTTATAATATATTTTAACCAAAAATGTAAAAAGACTCAA
127 TCACGTTTCC-CAAAGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACTAAAAATGTAAAAA-ATTCAA
* * * ** *
3319 CTTAAAATCAATTATGAGACTATAAGACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCAAAGGCTTGAG
190 CTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTTGAAGACTTGAG
* * * * * * * ** * * *
3384 TGACTACAGATGGACTTTTCTTGCAAATGGGTAGCATTTGCTTCACATTT-TATGAAGCAGACAA
255 TGACTATAAATAGACTTTTCTTGCTAATGGATGGCTTTTGCTTCATGTTTCT-TGAGGCAAACAT
* *
3448 TCAATTATTATCTGTTTTAA
319 TCAATTATAATATGTTTTAA
* ** *
3468 CCAAAATGTGAAAAAATTCAA-TCTAAAAAAAATTATGAGATTATAATAAC-ATTTAAAGCAAGT
1 -AAAAATGT-AAAAAATTCAACT-TAAAATCAATTATGAGATTATAA-AACTATTTAAAGCGAGT
* * * * * *
3531 AATAAGGCTTTCAAAGGCTTGAGTGAATATAAATAGAATTTTTTTACCAATGGATGGCTTTTGTT
62 AATAAGGCTTTCAAAGGCTTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGGATGGCTTTTGCT
* * * * * * * *
3596 TTATGTTTTCTAAGGCAGACATTCAATTATAATATGTTTTCACTAAAAATGTAAAACAAGTCAAC
127 TCACGTTTCCCAAAGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACTAAAAATGTAAAA-AATTCAAC
* * * * *
3661 TTGGAAA-CAATTATGAGACTATGAAACTATTTAAAGCAAGTAAAAAGGCTTTTGAAGACTTGAG
191 TT-AAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTTGAAGACTTGAG
* * * * * *
3725 TGACTATAAATAGA-TTCTTCTTGCCAATTGG-TGGCTTTGGCTTCACGTTTCCTAAAGCAAACA
255 TGACTATAAATAGACTT-TTCTTGCTAA-TGGATGGCTTTTGCTTCATGTTTCTTGAGGCAAACA
* * *
3788 TTCAATTATTATCTATTTTAA
318 TTCAATTATAATATGTTTTAA
* * **
3809 TCAAAAATGTAAAAGAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAGCCATTTAAAGTAAGTA
1 --AAAAATGTAAAA-AATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAGCGAGTA
* ** * * * *
3874 ATAAGGCTTTCGAAGGAATGGGTGGCTATAAATGGAGTTTTCTTGCCAATGAATGTAG-TTTT-C
63 ATAAGGCTTTCAAAGGCTTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGGATG--GCTTTTGC
* ** * *
3937 TTCATGTTTCATAATGCAGACATTCAATTATAATCTTTTTTAACTAAAAATGTAAAAATATTCAA
126 TTCACGTTTCCCAAAGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACTAAAAATGTAAAAA-ATTCAA
* * *
4002 CTTAAAATCAATTATAAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTTGAAGGCTTGAG
190 CTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTTGAAGACTTGAG
* * * * * ** ** ** * *
4067 TGACTATAGATAGACTTTTCTTGCTAATGGGTAGCCTTTGATAGACATTTCTCAAAGAAAACATT
255 TGACTATAAATAGACTTTTCTTGCTAATGGATGGCTTTTGCTTCATGTTTCTTGAGGCAAACATT
*
4132 CAATTATAATATGTTTTAGCC
320 CAATTATAATATGTTTTA--A
* *
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1 AAAAATGTAAAA-AATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTAT-AAAACTATTTAAAGCGAGTAA
* * * * * * * *
4217 TAAGACTATT-AAAGGATTAAGTGACTATAAATGGA-ATTTCTTGGCAATGAATGGTTTTTCCTT
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* ** * *
4280 CATGTTT-CGTAAGCAAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATATAAAAAAATTCAAC
128 CACGTTTCCCAAAGC-AGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACTAAAAATGT-AAAAAATTCAAC
* * * * *
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* * * * *
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*
4473 CAATTATAATATATTTTAA
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* * * * * **
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** * * ** * * * * *
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* * * ** *
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* * * * * *
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* * * * * *
4747 TAAGTGACTATAAATGGACTTTTCTTG-TCAATGGGTGGCTTTTGCTTCACAT-TTTC-TAAAGT
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* * *
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* ** *
4837 AAAAATGCAAAAACATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTAT-AAACCGTTTAAAGTGAGTAAT
1 AAAAATGTAAAAA-ATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAGCGAGTAAT
* * * * * * *
4901 ATGGC-TTCTAAAGGCTTGAGTGAATAGAAATAGACTTTTCTTACTAATGGATGGCTTTTACTTC
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* * * * * *
4965 ACGTTTCCC-AAGACATACATTTAGTTATAA-CATATTTTAAC-CAAAATAGTAAAAAAATTTAA
129 ACGTTTCCCAAAG-CAGACATTCAATTATAATC-TGTTTTAACTAAAAAT-GT-AAAAAATTCAA
* ** * **
5027 CTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAATTATTTAAAATG-GCTAATAGAGG-TTCTGAAGGGTTG
190 CTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAGCGAG-TAATA-AGGCTTTTGAAGACTTG
* * * * * *** *
5090 AGTGACTATAAATGGACTTGTCTTG-TCAATGGGTGGTTTTTGCTTCATGTTTCCTGAAATAGAC
253 AGTGACTATAAATAGACTTTTCTTGCT-AATGGATGGCTTTTGCTTCATGTTTCTTGAGGCAAAC
* * *
5154 ATTCAATTATTATCTATTTTAA
317 ATTCAATTATAATATGTTTTAA
* * ** *
5176 CCAAAAATGTATAAAAATTCAACTTAAGAA-GAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAAAGAGC
1 --AAAAATGTA-AAAAATTCAACTTAA-AATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAGCGAGT
* * * *
5240 AATAAGGCTTTCAAAGGCTTGAGTGAATATAAATAGAATTTTCTTGTCAATGGATGGCTTTTGCT
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* * * * * *
5305 TCATGTTTCCCAAGGCAAACATTCAGTTATAATATATTTTAA-T-AAAATGTATAAAAATTCAAC
127 TCACGTTTCCCAAAGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACTAAAAATGTA-AAAAATTCAAC
* * * * * * *
5368 TTAAAATCAATTATGACACTATAAAACCATTTAAAGCGAATAATAAGTCTTTTGAAGGCTTAAGT
191 TTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTTGAAGACTTGAGT
* * * * ** * *
5433 GACTATAAATGGACTTTCCTTGCTAGTGGATGGCTTTTGCTTTATGTTT-TCAAAAGAAAACATT
256 GACTATAAATAGACTTTTCTTGCTAATGGATGGCTTTTGCTTCATGTTTCT-TGAGGCAAACATT
*
5497 CAATTATAATATATTTTAA
320 CAATTATAATATGTTTTAA
* * *
5516 TCAAAAATATAAAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTA
1 --AAAAATGT-AAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAGCGAGTA
* * * * * **
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* * * * * * *
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125 CTTCACGTTTCCCAAAGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACTAAAAATGT-AAAAAA-TTC
* * * *
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* * * * * * * * * *
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** *
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* * * * *
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* *** * * * * * *
5988 ATGTTTCTTGAAGCAAACATTCAATTATTATCTGTTTTAAC-CAAAATGTGAAAACATTTAATTT
129 ACGTTTCCCAAAGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACTAAAAATGT-AAAAAATTCAACTT
* * *
6052 AAAAAT-AATTATGAGATTATAAAA-TCATTTTAAGCGAGTAATAAGGCTTTTAAAGGCTTGAGT
193 -AAAATCAATTATGAGATTATAAAACT-ATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTTGAAGACTTGAGT
* * * * * * *
6115 GAATATAAATAGACTTTTTTTACCAATGGATGGCGTTTGTTTCATGTTT-TCTGAGGCAGACATT
256 GACTATAAATAGACTTTTCTTGCTAATGGATGGCTTTTGCTTCATGTTTCT-TGAGGCAAACATT
* * *
6179 CAGTTATAATATGGTTTCACC
320 CAATTATAATAT-GTTTTA-A
* * *
6200 AACAATGTAAAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGACTATAAAACTATTTAAAGCGAGTAAG
1 AAAAATGT-AAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAGCGAGTAAT
* * * * * *
6265 AATGCTTTCGAAGGGTTGAGTGACTATAAATGGACTTTGCTTGCCAAAGGGTGGCTTTTGCTTCA
65 AAGGCTTTCAAAGGCTTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGGATGGCTTTTGCTTCA
* * * * * *
6330 CGTTT-CCGAAGCAGACGTTCAATTATTATCTGTTTTAACCAAAATATG-ATAAAATTCAATTTA
130 CGTTTCCCAAAGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACTAAAA-ATGTAAAAAATTCAACTTA
* *
6393 AAAACAATTATGAGATTATAAAATTATTTAAAGCGAGTAATAAGGC--TTG-AG---TGA---A-
194 AAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTTGAAGACTTGAGTGAC
* * * * * * *
6448 TATAAATAGACTTTTTTTACTAATGGATGG-TGTTTGTTTCATATTTCTTGAGGTAGACATTCAG
259 TATAAATAGACTTTTCTTGCTAATGGATGGCT-TTTGCTTCATGTTTCTTGAGGCAAACATTCAA
*
6512 TTATAATATGTTTTTACC
323 TTATAATATG-TTTTA-A
* *
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ATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTTGAAGACTTGAGTGACTA
TAAATAGACTTTTCTTGCTAATGGATGGCTTTTGCTTCATGTTTCTTGAGGCAAACATTCAATTA
TAATATGTTTTAA
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*
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2349 A
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* **
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* * * * * * * * * *
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* * * * ** * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * *
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* * ** * *
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** ** * * * *
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447 CTTTTCTTGCCAATGAATAGG-T-TTTTTTCACATTTCCCAAGGTAGACATTCAATTATAATCTG
* * * *
513 TTTTAACTAAAAATGTAAAAGAATTTAACTTAAAATCAATT-ATTAGATTATAAAACTATTTAAA
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* ** ** * ** * * * * * *
577 GCGAGTAATAAGGCGTTCGATGACATGGGTGAGTATATATAGA-CTTTTCTTGCTAATGAATGGC
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* * * * * * * * *
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* * * * * **
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* * *
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* * * * * * *
832 AAGCATACATTCAATCATAATATGTTTGCACCAAAAATATAAAAAAATTCAA-TTGAAAATCGAT
317 AAGCAAACATTCAATTATAATATATTT-TAACAAAAATGTAAAAAAATTCAACTT-AAAATCAAT
* * * * * *
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380 TATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAATAAGGCTTTCGAAGGCA-TGAGTGACTATAAAT
* * * * *** * * *
959 GAACTTTTCTCT-CCAGTGAATA--ATCTTTTCATCATGTTTCTTGAGGT-GAACAATAAAATAT
444 GGACTTTTCT-TGCCAATGAATAGGTTTTTTTCA-CA--TTTCCCAAGGTAG-ACATTCAATTAT
1020 AAT-TG
504 AATCTG
* * * * * *
1025 TTTTAACCAAAAATGTGAAGAAA-TTGAACCTAAAATCAATT-ATGAGATTATAAAACGATTTAA
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* ** * * ** * * * * *** * *
1088 GGCGAACAATAAGGCTTTCGAAGGCAT-AGATGACTATAAAATGGGCTTTTCTTGTTAACGAATG
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* * * * * *
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126 GCTTTTGCTTCATGTTTCCTAAAG-CAAACATTCAATTATAATATATTTTAACTAAAAATGTAAA
* * *
1216 AATATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAA-ACGAGTAATAAGGCTTTTG
190 AA-ATTCAACTTAAAATCAATTATGAGACTATAAAACCATTTAAAGA-GAGTAATAAGGCTTTTA
* * * * * * * *
1280 AAGGCTTGAGTGACCATAGATAGACTTCTCTTGCTAATGGGTGGCTTTTGATAGACAT-TTTC-T
253 AAGGCTTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCAAATGGATGGCTTTTGCT--TCATGTTTCTT
* * * * *
1343 AAAGAAAACATTCAATTATAATATGTTTTAGCCAAAAATGTAAAAAAATTCAACTTAAAATGAAT
316 GAAGCAAACATTCAATTATAATATATTTTA-ACAAAAATGTAAAAAAATTCAACTTAAAATCAAT
** * ** *
1408 TATGAGATTATAAAACCATTTAAAGTGAGTAATAAGACTTTTAAACGTACA-G-GTGACTATAAA
380 TATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAATAAGGCTTTCGAA-G-GCATGAGTGACTATAAA
* * ** * **
1471 TGGACTTTTCTTGGCAATAAAT-GGTTTTTCCTTCATGTTTCCTAAGCAAGACATTCAATTATAA
443 TGGACTTTTCTTGCCAATGAATAGGTTTTT--TTCACATTTCCCAAGGTAGACATTCAATTATAA
1535 TCTG
506 TCTG
* * * *
1539 TTTTAACTAAAAATGTAAAATAA-TTCAGCTTAAAAAT-AATT-ATGAGATTACAAAACTATTTA
1 TTTTAACTAAAAATGTAAAAAAAGTT-AACTT-AAAATCAATTGA-GACATTATAAAACTATTTA
* * * * * ** *** * * *
1601 AAGCGAGTACTAAGGCTTTCGAAAGCTTGAGTGGCTATACGTG-GACTTTTCTTGCCAATGGGTG
63 AAGCGAGTAATAAAGTTTTC-AAAACTTAAGTGAATATAAAAGAGA-TTTTCTTACGAATGGATG
* * * * * * *
1665 GCTTTTACTTCATGTTTCCTGAAGCAGACATTCAATTTTTATCTATTTTAACTAAAAATGAAGAA
126 GCTTTTGCTTCATGTTTCCTAAAGCAAACATTCAATTATAATATATTTTAACTAAAAATGTA-AA
* * * * *
1730 AAATTCATCTCAAAATTAATTATGAGA-TAATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTTCG
190 AAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGACT-ATAAAACCATTTAAAGAGAGTAATAAGGCTTTT-A
* * * * * * * * *
1794 AAGGC-CGAAGTGAATATAAATAGACTTTTCTTACCAATGGATAGTTTTTACTTCACGTTTCTCA
253 AAGGCTTG-AGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCAAATGGATGGCTTTTGCTTCATGTTTCT--
* * * * * *
1858 TG--GAAAACATTCAGTTATAACATATTTTAACCAAAATCATAATAAAATTCAACTTAAAATCAA
315 TGAAGCAAACATTCAATTATAATATATTTTAACAAAAAT-GTAAAAAAATTCAACTTAAAATCAA
* * * * * * *
1921 TTATGAGATTATAAAACTATTTAAAGCGATTAAT-AGGAGTTTTGAAGGCTTGAGTGACTACAAA
379 TTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAATAAGG-CTTTCGAAGGCATGAGTGACTATAAA
** ** ** * ** * * * *
1985 TAAACTTTTCTTATCAATGGGT-GGCTTTTGGTTCATGTTTCCCAAAGCAGATATTCAATTATTA
443 TGGACTTTTCTTGCCAATGAATAGG-TTTT-TTTCACATTTCCCAAGGTAGACATTCAATTATAA
*
2049 TATG
506 TCTG
* * *
2053 TTTTAACCAAAAATGT-AAAAAAGTTCACCTTAAAATCAATT-ATGAGATTATAAAACTATTTAA
1 TTTTAACTAAAAATGTAAAAAAAGTT-AACTTAAAATCAATTGA-GACATTATAAAACTATTTAA
* * * ** ** * * * * * *
2116 AGCGACTAATAATGCTTTTGAAGGCTTGGGTGAATATAAATACA-CTTTTCCTGCTAATAGATGG
64 AGCGAGTAATAAAG-TTTTCAAAACTTAAGTGAATATAAA-AGAGATTTTCTTACGAATGGATGG
* * *** *
2180 CTTTTGCTTCACT-TTT-CTCAAGGCAGACATTTGGTTATAATATATTTTAAC-CAAAATCGTAA
127 CTTTTGCTTCA-TGTTTCCT-AAAGCAAACATTCAATTATAATATATTTTAACTAAAAAT-GT-A
** * * *
2242 AAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGGTTATAAAACCATTTAAAGCG-GCTAATAGGGGTTTT
188 AAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGACTATAAAACCATTTAAAGAGAG-TAATAAGGCTTTT
* * ** * ** * * ** *
2306 GAAGCGGCTAAT-AGGGGTTTTAAAGCGGCTAATAGGGGTTTTGATTGC--ATAGATAACTAAAA
252 -AA-AGGCT--TGA-GTG-ACTATA------AAT-GGACTTTT-CTTGCAAATGGATGGCT---T
* * ** * * * * * * ** * ** *
2368 TGGACTTC-TCTCGC-T-AATG-AAAGACTT--TTTTTACCTGTGTCTCGAGGCAAGCAT-TCAA
300 TTG-CTTCATGTTTCTTGAA-GCAAACA-TTCAATTATA-ATATAT-TTTA-ACAAAAATGTAAA
** * ** * ** * * * * *
2426 TTATTGTCTGTCTTGAACAA-AAATGTAAAAAAATTTTAAATTAAAATCAATT-ATG-AGACT-A
359 AAAAT-TC-AACTT-AA-AATCAAT-T-ATGAGA--TT--A-TAAAACCATTTAAAGCA-AGTAA
* * ** * * *
2487 TAAGACCCTTTAAAGGAAGTAATAAGGCTTTTGAAGGCT-TAAGT-GACTATAAATAAACTTTTC
412 TAAG--GCTTT---CGAAGGCATGA-G----TG-A--CTATAAATGGACT-T---T----TCTT-
* ** * ** * *
2550 TTGTCAATGGGT-GGCTTTTGCTTT-ACGTTTTCTGAA-GCAGACATTCAATTATTATCTG
455 --GCCAATGAATAGG-TTTT--TTTCAC-ATTTCCCAAGGTAGACATTCAATTATAATCTG
* * * * * ** *
2608 TTTT-AGTCAAAAAAGTAAAAAAACTCAACTTAAGAA-GAATT-ATGAGGTTATAAAACTTTTTA
1 TTTTAACT-AAAAATGTAAAAAAAGTTAACTTAA-AATCAATTGA-GACATTATAAAACTATTTA
* * * * * **
2670 AAGAGAGTAATAAGGCTTTCAAAGGCTTGAGTGAATATAAATAGA-ATTTTCTTATC-AATTTAT
63 AAGCGAGTAATAAAGTTTTCAAA-ACTTAAGTGAATATAAA-AGAGATTTTCTTA-CGAATGGAT
* ** * * ** * *
2733 GGCTTTTGCTTCACGTTTCCCGAGGTATTCATTTAGTTATAATATATTTTAACTAAAAATGTATA
125 GGCTTTTGCTTCATGTTTCCTAAAGCAAACATTCAATTATAATATATTTTAACTAAAAATGTA-A
* * * * *
2798 AAAATTTAATTTAAAATCAATTATGAGAC--TAAAATCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCAA
189 AAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGACTATAAAACCATTTAAAGAGAGTAATAAGGCTTTTAA
* * * *** **
2861 AGGCTTGAGTGACTATAATTGGGCTTTCCTT--AATAGTGGATGGCTTTTGCTTTGCGTTTCTCA
254 AGGCTTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCAA-A-TGGATGGCTTTTGCTTCATGTTTCTTG
* *
2924 AAGAAAACATTCAATTATAATATATTTTAACCAAAAATGTAAAACAATTCAACTTAAAATCAATT
317 AAGCAAACATTCAATTATAATATATTTTAA-CAAAAATGTAAAAAAATTCAACTTAAAATCAATT
* * * * * * *
2989 ATGAGATTATAAAACTATTTAAAGCAAGCAATAAGGCTTTTGAAGGAATGGGTGGCTATAAATGA
381 ATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAATAAGGCTTTCGAAGGCATGAGTGACTATAAATGG
* * ** *
3054 ACTTTTTTTGTCAATGAAT-GGTGTTTTCTTCATGTTTCCCAAGGTAGACATTCAAATATAATCT
446 ACTTTTCTTGCCAATGAATAGGT-TTTT-TTCACATTTCCCAAGGTAGACATTCAATTATAATCT
3118 G
509 G
* * ** *
3119 TTTTAACTAAAAATATAAAAAAAGTCAACTTAAAATCAATTGTCAGATTATAAAACTATTTAAAG
1 TTTTAACTAAAAATGTAAAAAAAGTTAACTTAAAATCAATTGAGACATTATAAAACTATTTAAAG
* * * *
3184 CGAGTAATAAAGTTTTTAAAAGCTTAAATGAATATAAATGAGATTTTTCTTACGAATGGATGACT
66 CGAGTAATAAAGTTTTCAAAA-CTTAAGTGAATATAAAAGAGA-TTTTCTTACGAATGGATGGCT
* * * *
3249 TTTGCTTCATGTTTCCT--CGGATAGACATTCAGTTATAATATATTTTAACCAAAAATGTAAAAA
129 TTTGCTTCATGTTTCCTAAAGCA-A-ACATTCAATTATAATATATTTTAACTAAAAATGTAAAAA
* * * *
3312 GACTCAACTTAAAATCAATTATGAGACTATAAGACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCAAAG
192 -ATTCAACTTAAAATCAATTATGAGACTATAAAACCATTTAAAGAGAGTAATAAGGCTTTTAAAG
* * * * * **
3377 GCTTGAGTGACTACAGATGGACTTTTCTTGCAAATGGGTAGCATTTGCTTCACATTT-TATGAAG
256 GCTTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCAAATGGATGGCTTTTGCTTCATGTTTCT-TGAAG
* * * * * * * **
3441 CAGACAATCAATTATTATCTGTTTTAACCAAAATGTGAAAAAATTCAA-TCTAAAAAAAATTATG
320 CAAACATTCAATTATAATATATTTTAACAAAAATGTAAAAAAATTCAACT-TAAAATCAATTATG
* * * * *
3505 AGATTATAATAA-CATTTAAAGCAAGTAATAAGGCTTTCAAAGGCTTGAGTGAATATAAATAGAA
384 AGATTATAA-AACCATTTAAAGCAAGTAATAAGGCTTTCGAAGGCATGAGTGACTATAAATGGAC
* * * * ** * * * *
3569 TTTTTTTACCAATGGAT-GGCTTTTGTTTTATGTTTTCTAAGGCAGACATTCAATTATAATATG
448 TTTTCTTGCCAATGAATAGG-TTTT-TTTCACATTTCCCAAGGTAGACATTCAATTATAATCTG
* * * * *
3632 TTTTCACTAAAAATGTAAAACAAGTCAACTTGGAAA-CAATTATGAGAC--TATGAAACTATTTA
1 TTTTAACTAAAAATGTAAAAAAAGTTAACTT-AAAATCAA-T-TGAGACATTATAAAACTATTTA
* * * * * * * *
3694 AAGCAAGTAA-AAAGGCTTTTGAAGACTTGAGTGACTAT-AAATAGATTCTTCTTGCCAATTGG-
63 AAGCGAGTAATAAA-G-TTTTCAAAACTTAAGTGAATATAAAAGAGATT-TTCTTACGAA-TGGA
* * * *
3756 TGGCTTTGGCTTCACGTTTCCTAAAGCAAACATTCAATTATTATCTATTTTAA-TCAAAAATGTA
124 TGGCTTTTGCTTCATGTTTCCTAAAGCAAACATTCAATTATAATATATTTTAACT-AAAAATGTA
* *
3820 AAAGAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAGCCATTTAAAGTA-AGTAATAAGGCTTT
188 AAA-AATTCAACTTAAAATCAATTATGAGACTATAAAACCATTTAAAG-AGAGTAATAAGGCTTT
** ** * * * * *
3884 CGAAGGAATGGGTGGCTATAAATGGAGTTTTCTTGCCAATGAATGTAG-TTTT-CTTCATGTTTC
251 TAAAGGCTTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCAAATGGATG--GCTTTTGCTTCATGTTTC
* * * * *
3947 AT-AATGCAGACATTCAATTATAATCTTTTTTAACTAAAAATGTAAAAATATTCAACTTAAAATC
314 TTGAA-GCAAACATTCAATTATAATATATTTTAAC-AAAAATGTAAAAAAATTCAACTTAAAATC
* * * * *
4011 AATTATAAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTTGAAGGCTTGAGTGACTATAG
377 AATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAATAAGGCTTTCGAAGGCATGAGTGACTATAA
* * ** * ** ** * * * *
4076 ATAGACTTTTCTTGCTAATGGGTAGCCTTTGATAGACATTTCTCAAAGAAAACATTCAATTATAA
442 ATGGACTTTTCTTGCCAATGAATAG-GTTTTTTTCACATTTCCCAAGGTAGACATTCAATTATAA
*
4141 TATG
506 TCTG
* * * * *
4145 TTTTAGCCAAAAATGTAAAACAA-TTCAACTTAAAATCAATT-ATGAGATTATAAAAAC-AATTA
1 TTTTAACTAAAAATGTAAAAAAAGTT-AACTTAAAATCAATTGA-GACATTAT-AAAACTATTTA
* * * * * * * *
4207 AAGTGAGTAATAAGACTATT-AAAGGA-TTAAGTGACTATAAATG-GAATTTCTT-GGCAATGAA
63 AAGCGAGTAATAA-AGTTTTCAAA--ACTTAAGTGAATATAAAAGAGATTTTCTTACG-AATGGA
* * * * * * *
4268 TGGTTTTTCCTTCATGTTTCGT-AAGCAAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATATA
124 TGGCTTTTGCTTCATGTTTCCTAAAGCAA-ACATTCAATTATAATATATTTTAACTAAAAATGT-
* * *
4332 AAAAAATTCAACTTAAAAAT-AATTATGAGATTATAAAACAATTTAAAGAGAGTAATAAGGGTTT
187 AAAAAATTCAACTT-AAAATCAATTATGAGACTATAAAACCATTTAAAGAGAGTAATAAGGCTTT
* * * * *
4396 TAAAGGCTTGAGTGAATATAAATAGAATGTTCTTGCCAATGGATGGCTTTTGCTTCATGTTTCTT
251 TAAAGGCTTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCAAATGGATGGCTTTTGCTTCATGTTTCTT
* * * *
4461 GAGGCAGACATTCAATTATAATATATTTTAACCAAAAATGTAAAATAATTTAACTTAAAATCAAT
316 GAAGCAAACATTCAATTATAATATATTTTAA-CAAAAATGTAAAAAAATTCAACTTAAAATCAAT
* * * ** * *
4526 TATGAGAGTATAAAACCATTCAATGTTAGTAATAAGG-TGTTC-AATTGCAT-AGATAACTATAA
380 TATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAATAAGGCT-TTCGAA-GGCATGAG-TGACTATAA
** * * * * * *
4588 ATGGACTTTTGATACTAATGAA-AGGCTTTTTCTTC-CTATGTCTCAAGGCA-AGCGTTCAATTA
442 ATGGACTTTTCTTGCCAATGAATAGG-TTTTT-TTCAC-ATTTCCCAAGGTAGA-CATTCAATTA
** *
4650 TTCTTTG
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* * *
4657 TTTTAACTAAAAATGTAAAAAAAGTTTAAATTAAAATCAATTATGAGAC--TGTAAAACCATTTA
1 TTTTAACTAAAAATGTAAAAAAAG-TTAACTTAAAATCAA-T-TGAGACATTATAAAACTATTTA
* * ** * * * *
4720 AAGCGAGTAATAAGGCTTTTGAAGGCTTAAGTGACTATAAATG-GACTTTTCTTGTC-AATGGGT
63 AAGCGAGTAATAAAG-TTTTCAAAACTTAAGTGAATATAAAAGAGA-TTTTCTT-ACGAATGGAT
** * * * * * * *
4783 GGCTTTTGCTTCACATTTTCTAAAGTAAACATTCAATTATTATCTGTTTTCACTAAAAATGCAAA
125 GGCTTTTGCTTCATGTTTCCTAAAGCAAACATTCAATTATAATATATTTTAACTAAAAATGTAAA
* * * * *
4848 AACATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTAT-AAACCGTTTAAAGTGAGTAATATGGCTTCTAA
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* * * * * * * **
4912 AGGCTTGAGTGAATAGAAATAGACTTTTCTTACTAATGGATGGCTTTTACTTCACGTTTC-CCAA
254 AGGCTTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCAAATGGATGGCTTTTGCTTCATGTTTCTTGAA
* * * * * *
4976 GACATACATTTAGTTATAACATATTTTAACCAAAATAGTAAAAAAATTTAACTTAAAATCAATTA
319 G-CAAACATTCAATTATAATATATTTTAACAAAAAT-GTAAAAAAATTCAACTTAAAATCAATTA
** * **
5041 TGAGATTATAAAATTATTTAAA--ATGGCTAATAGAGG--TTCTGAAGGGTTGAGTGACTATAAA
382 TGAGATTATAAAACCATTTAAAGCA-AG-TAATA-AGGCTTTC-GAAGGCATGAGTGACTATAAA
* * ** ** * * *
5102 TGGACTTGTCTTGTCAATGGGT-GGTTTTTGCTTCATGTTTCCTGAA-ATAGACATTCAATTATT
443 TGGACTTTTCTTGCCAATGAATAGGTTTTT--TTCACATTTCC-CAAGGTAGACATTCAATTATA
*
5165 ATCTA
505 ATCTG
* * * * *
5170 TTTTAACCAAAAATGTATAAAAA-TTCAACTTAAGAA-GAATT-ATGAGATTATAAAACCATTTA
1 TTTTAACTAAAAATGTAAAAAAAGTT-AACTTAA-AATCAATTGA-GACATTATAAAACTATTTA
** * * * * * *
5232 AAAAGAGCAATAAGGCTTTCAAAGGCTTGAGTGAATATAAATAGA-ATTTTCTTGTC-AATGGAT
63 AAGCGAGTAATAAAGTTTTCAAA-ACTTAAGTGAATATAAA-AGAGATTTTCTT-ACGAATGGAT
* * *
5295 GGCTTTTGCTTCATGTTTCCCAAGGCAAACATTCAGTTATAATATATTTTAA-T-AAAATGTATA
125 GGCTTTTGCTTCATGTTTCCTAAAGCAAACATTCAATTATAATATATTTTAACTAAAAATGTA-A
* * * * *
5358 AAAATTCAACTTAAAATCAATTATGACACTATAAAACCATTTAAAGCGAATAATAAGTCTTTTGA
189 AAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGACTATAAAACCATTTAAAGAGAGTAATAAGGCTTTTAA
* * * * * **
5423 AGGCTTAAGTGACTATAAATGGACTTTCCTTGCTAGTGGATGGCTTTTGCTTTATGTTT-TCAAA
254 AGGCTTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCAAATGGATGGCTTTTGCTTCATGTTTCT-TGA
* *
5487 AGAAAACATTCAATTATAATATATTTTAATCAAAAATATAAAAAAATTCAACTTAAAATCAATTA
318 AGCAAACATTCAATTATAATATATTTTAA-CAAAAATGTAAAAAAATTCAACTTAAAATCAATTA
* *
5552 TGAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAATAAGGCTTTCGAA-GCAATGGGTGGCTATAAATGG
382 TGAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAATAAGGCTTTCGAAGGC-ATGAGTGACTATAAATGG
* * * *
5616 ACTTCTCTTGCCAATAAATAGTGTTTTTTTCACATTTCCCAAGGTAGGCATTCAAATATAATCTG
446 ACTTTTCTTGCCAATGAATAG-GTTTTTTTCACATTTCCCAAGGTAGACATTCAATTATAATCTG
*
5681 TTTTAACTAAAAATATAAAAAAAGTTAACTTAAAATCAATTGAGACATTATAAAACTATTTAAAG
1 TTTTAACTAAAAATGTAAAAAAAGTTAACTTAAAATCAATTGAGACATTATAAAACTATTTAAAG
* * *
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66 CGAGTAATAAAGTTTTCAA-AACTTAAGTGAATATAAAAGAGA-TTTTCTTACGAATGGATGGCT
* * * * * ** * *
5811 TTTGCTACATGTTTCTTGAGGCAGACATTCAGGTATAATATATTTTAACTAAAAATGTAAAACAC
129 TTTGCTTCATGTTTCCTAAAGCAAACATTCAATTATAATATATTTTAACTAAAAATGTAAAAAAT
* *
5876 TCAA-TTAAAATCAATTATGAGAATATAAAACAATTTAAAGAGAGTAATAAGGCTTTTAAAGGCT
194 TCAACTTAAAATCAATTATGAGACTATAAAACCATTTAAAGAGAGTAATAAGGCTTTTAAAGGCT
* * * * *
5940 TAAGTAACTACAAATGAACTTTTCTTGCAAATGGGTGGCTTTTGCTTCATGTTTCTTGAAGCAAA
259 TGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCAAATGGATGGCTTTTGCTTCATGTTTCTTGAAGCAAA
* * * * * * * *
6005 CATTCAATTATTATCTGTTTTAACCAAAATGTGAAAACATTTAATTTAAAAAT-AATTATGAGAT
324 CATTCAATTATAATATATTTTAACAAAAATGTAAAAAAATTCAACTT-AAAATCAATTATGAGAT
* * * ** * * * *
6069 TATAAAATCATTTTAAGCGAGTAATAAGGCTTTTAAAGGCTTGAGTGAATATAAATAGACTTTTT
388 TATAAAACCATTTAAAGCAAGTAATAAGGCTTTCGAAGGCATGAGTGACTATAAATGGACTTTTC
* * * * ** * ** * * *
6134 TTACCAATGGATGGCGTTTGTTTCATGTTTTCTGAGGCAGACATTCAGTTATAATATG
453 TTGCCAATGAATAG-GTTTTTTTCACATTTCCCAAGGTAGACATTCAATTATAATCTG
* * * *
6192 GTTTCACCAACAATGTAAAAAAA-TTCAACTTAAAATCAATTATGAGAC--TATAAAACTATTTA
1 TTTTAACTAAAAATGTAAAAAAAGTT-AACTTAAAATCAA-T-TGAGACATTATAAAACTATTTA
* * * *** * * * * * * * *
6254 AAGCGAGTAAGAATGCTTTCGAAGGGTTGAGTGACTATAAATG-GACTTTGCTTGCCAAAGGGTG
63 AAGCGAGTAATAAAGTTTTC-AAAACTTAAGTGAATATAAAAGAGA-TTTTCTTACGAATGGATG
* * * * * * * * *
6318 GCTTTTGCTTCACGTTTCC-GAAGCAGACGTTCAATTATTATCTGTTTTAACCAAAATATG-ATA
126 GCTTTTGCTTCATGTTTCCTAAAGCAAACATTCAATTATAATATATTTTAACTAAAA-ATGTAAA
* * * ** *
6381 AAATTCAATTTAAAAACAATTATGAGATTATAAAATTATTTAAAGCGAG---TAA------T-AA
190 AAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGACTATAAAACCATTTAAAGAGAGTAATAAGGCTTTTAAA
* * * * * * * *
6436 GGCTTGAGTGAATATAAATAGACTTTTTTTACTAATGGATGG-TGTTTGTTTCATATTTCTTGAG
255 GGCTTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCAAATGGATGGCT-TTTGCTTCATGTTTCTTGAA
* * * * * * *
6500 GTAGACATTCAGTTATAATATGTTTTTACCAACAACGTAAAAAAATTCAACTTAAAATCAATTAT
319 GCAAACATTCAATTATAATAT-ATTTTAACAAAAATGTAAAAAAATTCAACTTAAAATCAATTAT
*
6565 GAGATTATAAAACTATTT
383 GAGATTATAAAACCATTT
Statistics
Matches: 4745, Mismatches: 1007, Indels: 646
0.74 0.16 0.10
Matches are distributed among these distances:
499 1 0.00
500 72 0.02
501 45 0.01
507 3 0.00
508 1 0.00
509 41 0.01
510 142 0.03
511 791 0.17
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513 1127 0.24
514 772 0.16
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521 5 0.00
522 3 0.00
523 2 0.00
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525 15 0.00
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549 3 0.00
550 1 0.00
551 4 0.00
552 5 0.00
553 26 0.01
554 8 0.00
555 190 0.04
556 24 0.01
ACGTcount: A:0.38, C:0.12, G:0.15, T:0.35
Consensus pattern (509 bp):
TTTTAACTAAAAATGTAAAAAAAGTTAACTTAAAATCAATTGAGACATTATAAAACTATTTAAAG
CGAGTAATAAAGTTTTCAAAACTTAAGTGAATATAAAAGAGATTTTCTTACGAATGGATGGCTTT
TGCTTCATGTTTCCTAAAGCAAACATTCAATTATAATATATTTTAACTAAAAATGTAAAAAATTC
AACTTAAAATCAATTATGAGACTATAAAACCATTTAAAGAGAGTAATAAGGCTTTTAAAGGCTTG
AGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCAAATGGATGGCTTTTGCTTCATGTTTCTTGAAGCAAACA
TTCAATTATAATATATTTTAACAAAAATGTAAAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTAT
AAAACCATTTAAAGCAAGTAATAAGGCTTTCGAAGGCATGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTTG
CCAATGAATAGGTTTTTTTCACATTTCCCAAGGTAGACATTCAATTATAATCTG
Done.