Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: NW_018402845.1 Herrania umbratica cultivar Fairchild unplaced genomic scaffold, ASM216827v2 scaffold_5899.0, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Pmatch=0.80,Pindel=0.10
tuple sizes 0,4,5,7
tuple distances 0, 29, 159, 971
Length: 1619
ACGTcount: A:0.36, C:0.13, G:0.12, T:0.37
Warning! 20 characters in sequence are not A, C, G, or T
Found at i:477 original size:171 final size:171
Alignment explanation
Indices: 1--1619 Score: 1211
Period size: 171 Copynumber: 9.5 Consensus size: 171
* * * * * ** *
1 ATAATTGAATGTCGAACTCGAGAAATATGAAGAAAAAAG-CATTCATTGGGAAGAAAAGTCTATT
1 ATAATTGAATGTCTACCTCAAGAAACATGTAG-AAAAAGCCATTCATTGAAAAGAAAAGTCCATT
* * * **********
65 TATAGTCT-CTCATTCTTTC-AAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTNNNNNNNNNNAAAATT
65 TATAGT-TACCCATTCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCAAAATT
* * * * *
128 GATTTTAAGTTTAATTTTTTTACTTTTTTTATTAAAAAAGATT
129 GATTTTAAGTTAAATTGTTTTACATTTTTTATTAAAATAGACT
* * * * ** * * *
171 ATAATCGAATGTCTACATTGAA-AAACATGAAGAAAAAGGGATTCATTGACAAGGAAAGTCTATT
1 ATAATTGAATGTCTAC-CTCAAGAAACATGTAGAAAAAGCCATTCATTGAAAAGAAAAGTCCATT
* * * * * * **********
235 TATTGTCACCAATTCCTTCAAAAGCCTTTTTACTTGCTTTAAATAGTTTTANNNNNNNNNNATTG
65 TATAGTTACCCATTCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCAAAATTG
**
300 ATTTTAAGTTAAATTGTTTTACATTTTCCATTAAAATAGACT
130 ATTTTAAGTTAAATTGTTTTACATTTTTTATTAAAATAGACT
* ** * *
342 ATAATTGAATGGT-TGCCTCATCAAAGATGTAGAAAAAGCCATTCATTGAAAAGGAAAGTCCATT
1 ATAATTGAAT-GTCTACCTCAAGAAACATGTAGAAAAAGCCATTCATTGAAAAGAAAAGTCCATT
* * * *
406 AATAGTTACCCATTCCTTCAAATA-CCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAGTCCCATAATT
65 TATAGTTACCCATTCCTTCAAA-AGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCAAAATT
* * **
470 AATTTTAAGTTGAATTGTTTTACATTTTTGGTTAAAATAGA-T
129 GATTTTAAGTTAAATTGTTTTACATTTTTTATTAAAATAGACT
* * * * * * ** *
512 AATAATTAAATGTCTAGCTCGAGAAACGTGAAAAAAAAATACATTCATT-AGCAAGAAAAGTCCA
1 -ATAATTGAATGTCTACCTCAAGAAACATG-TAGAAAAAGCCATTCATTGA-AAAGAAAAGTCCA
* * ** * * * *
576 -TTATAGTCACCTATTTTTTGAAAAGCCTTATTACTCGTTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAGT
63 TTTATAGTTACCCATTCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCAAAAT
*
640 TGATTTTAAGTTAAATAT-TTTTACATTTTTTATTAAAATAGATT
128 TGATTTTAAGTTAAAT-TGTTTTACATTTTTTATTAAAATAGACT
* * *
684 ATAATTGAATG-CTTACCTCAAGAAACATGTAGAAAAATCCATTC-CTCAAGAAGAAAAGTCCAT
1 ATAATTGAATGTC-TACCTCAAGAAACATGTAGAAAAAGCCATTCATTGAA-AAGAAAAGTCCAT
* * * * * **
747 TAATAGTCACTCATTCCTTCAAAAGCCTTAGTACTCGCTTTAAATGATTTTATAATCTTGAAATT
64 TTATAGTTACCCATTCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCAAAATT
* * * *
812 GATTTTAAGTTGAA-CGTTTT-TATATTTTTAGTTAAAACAGACT
129 GATTTTAAGTTAAATTGTTTTACAT-TTTTTA-TTAAAATAGACT
* * * * * *
855 AGAATTGAATGTCTGCCTCGAGAAACGA-GTAGAAAAAGCCATTCAATGAGAAGAAAAGTTCATT
1 ATAATTGAATGTCTACCTCAAGAAAC-ATGTAGAAAAAGCCATTCATTGAAAAGAAAAGTCCATT
* * * * **
919 TATAGTCACCCATTACTTCAAAAGCCTTATTACTCACTTTAAACGGTTTTATAATCTTGAAATTG
65 TATAGTTACCCATTCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCAAAATTG
* *
984 ATTTT-A-TT---TT-TTTTACATTTTTGATTAAAACAGACT
130 ATTTTAAGTTAAATTGTTTTACATTTTTTATTAAAATAGACT
* * ** * * **
1020 ATAATTGAATGTTTACATTGAGAAACGT-TATGAAAAAAG-CATTAATTGGTAAGAAAAGTCCAT
1 ATAATTGAATGTCTACCTCAAGAAACATGTA-G-AAAAAGCCATTCATTGAAAAGAAAAGTCCAT
* ** *
1083 TTATAGTGT--CCATTTCCTTCAAAAGCCTTATCACTTACTTTAAATGGTTTTATTATCTCAAAA
64 TTATAGT-TACCCA-TTCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCAAAA
* * * * * * *
1146 TTGATTTTATGTTCAA-TGTTTTATACATATTTTGTTTAAACAGGCT
127 TTGATTTTAAGTTAAATTG-TTT-TACATTTTTTATTAAAATAGACT
* ** *
1192 ATAATTGAATGTCTACCTCAAGAAACATGAAGAAAAAAG-CATTCATTGGCAA-AAAAGTTCATT
1 ATAATTGAATGTCTACCTCAAGAAACATGTAG-AAAAAGCCATTCATTGAAAAGAAAAGTCCATT
* * * * *
1255 TATAGTCT-CCCATTCTTTAAAAAGTCTTATTACTCGCTTTAAATGGCTTTATCATCTCAAAATT
65 TATAGT-TACCCATTCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCAAAATT
* * * * ** *
1319 GAATTTATGTTCAATTGTTTTTATATTTTTGCTTAAAATAGATT
129 GATTTTAAGTTAAATTG-TTTTACATTTTTTATTAAAATAGACT
* * * * *
1363 ATAATTGAATGTCTACCTTAAGAAACAAGAAGAAAAAGGCACTT-ATT-AGCAAGAAAAGTCCAT
1 ATAATTGAATGTCTACCTCAAGAAACATGTAGAAAAAGCCA-TTCATTGA-AAAGAAAAGTCCAT
* *
1426 TTATAGTTACCCATT-CTTCAAAAGCCTTATTACTCACTATAAATGGTTTTATAATCTCAAAATT
64 TTATAGTTACCCATTCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCAAAATT
* ** ** * *
1490 GATTTTAGGTTCCATT-TTTTATGCATTTTTGGTTAAAACAGATT
129 GATTTTAAGTTAAATTGTTTTA--CATTTTTTATTAAAATAGACT
** * * * ** *
1534 ATAATTGAATGTCTACCTGGAGAAATATGAAG-AAAAGGCATTCATTGGCAAGAAAAGTCTATTT
1 ATAATTGAATGTCTACCTCAAGAAACATGTAGAAAAAGCCATTCATTGAAAAGAAAAGTCCATTT
*
1598 ATAGTCT-TCCATTCCTTCAAAA
66 ATAGT-TACCCATTCCTTCAAAA
Statistics
Matches: 1181, Mismatches: 215, Indels: 105
0.79 0.14 0.07
Matches are distributed among these distances:
164 5 0.00
165 111 0.09
166 15 0.01
167 4 0.00
169 19 0.02
170 141 0.12
171 758 0.64
172 127 0.11
173 1 0.00
ACGTcount: A:0.36, C:0.13, G:0.12, T:0.37
Consensus pattern (171 bp):
ATAATTGAATGTCTACCTCAAGAAACATGTAGAAAAAGCCATTCATTGAAAAGAAAAGTCCATTT
ATAGTTACCCATTCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCAAAATTGA
TTTTAAGTTAAATTGTTTTACATTTTTTATTAAAATAGACT
Found at i:645 original size:342 final size:339
Alignment explanation
Indices: 34--1603 Score: 1344
Period size: 342 Copynumber: 4.6 Consensus size: 339
24 AATATGAAGA
** * * * *
34 AAAAAG-CATTCATTGGGAAGAAAAGTCTATTTATAGTCT-CTCATTCTTTC-AAAGCCTTATTA
1 AAAAAGCCATTCATTGAAAAGAAAAGTCCATTAATAGT-TACCCATTCCTTCAAAAGCCTTATTA
********** * * * **
96 CTCACTTTAAATGGTTNNNNNNNNNNAAAATTGATTTTAAGTTTAATTTTTTTACTTTTTTTATT
65 CTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCAAAATTGATTTTAAGTTCAATGTTTTTACATTTTTGGTT
* * * * * * * *
161 AAAAAAGATTATAATCGAATGTCTACATTGAAAAACATGAAGAAAAAGGGATTCATT-GACAAGG
130 AAAACAGA-TATAATTGAATGTCTACCTCGAGAAACATGAAAAAAAAGGCATTCATTAG-CAAGA
* * * ** * * * * ***
225 AAAGTCTATTTATTGTCACCAATTCCTTCAAAAGCCTTTTTACTTGCTTTAAATAGTTTTANNNN
193 AAAGTCCATTTATAGTCACCCATTATTTAAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTA-TAA
****** *
290 NNNNNNATTGATTTTAAGTTAAATTGTTTTACATTTTCCATTAAAATAGACTATAATTGAATGGT
257 TCTCAAATTGATTTTAAGTTAAATT-TTTTACATTTTTCATTAAAATAGACTATAATTGAATGGT
* ** *
355 TGCCTCATCAAAGATGTAG
321 TACCTCAAGAAACATGTAG
*
374 AAAAAGCCATTCATTGAAAAGGAAAGTCCATTAATAGTTACCCATTCCTTCAAATA-CCTTATTA
1 AAAAAGCCATTCATTGAAAAGAAAAGTCCATTAATAGTTACCCATTCCTTCAAA-AGCCTTATTA
* * * * * *
438 CTCGCTTTAAATGGTTTTATAGTCCCATAATTAATTTTAAGTTGAAT-TGTTTTACATTTTTGGT
65 CTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCAAAATTGATTTTAAGTTCAATGT-TTTTACATTTTTGGT
* * * * **
502 TAAAATAGATAATAATTAAATGTCTAGCTCGAGAAACGTGAAAAAAAAATACATTCATTAGCAAG
129 TAAAACAGAT-ATAATTGAATGTCTACCTCGAGAAACATG-AAAAAAAAGGCATTCATTAGCAAG
* * * *
567 AAAAGTCCA-TTATAGTCACCTATTTTTTGAAAAGCCTTATTACTCGTTTTAAATGGTTTTATAA
192 AAAAGTCCATTTATAGTCACCCATTATTTAAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAA
* * * *
631 TCTCATAGTTGATTTTAAGTTAAATATTTTTACATTTTTTATTAAAATAGATTATAATTGAATGC
257 TCTCA-AATTGATTTTAAGTTAAAT-TTTTTACATTTTTCATTAAAATAGACTATAATTGAATGG
696 TTACCTCAAGAAACATGTAG
320 TTACCTCAAGAAACATGTAG
* * * * * *
716 AAAAATCCATTC-CTCAAGAAGAAAAGTCCATTAATAGTCACTCATTCCTTCAAAAGCCTTAGTA
1 AAAAAGCCATTCATTGAA-AAGAAAAGTCCATTAATAGTTACCCATTCCTTCAAAAGCCTTATTA
* * ** * * * *
780 CTCGCTTTAAATGATTTTATAATCTTGAAATTGATTTTAAGTTGAACGTTTTTATATTTTTAGTT
65 CTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCAAAATTGATTTTAAGTTCAATGTTTTTACATTTTTGGTT
* * * * * *
845 AAAACAGACTAGAATTGAATGTCTGCCTCGAGAAACGA-GTAGAAAAAGCCATTCAATGAG-AAG
130 AAAACAGA-TATAATTGAATGTCTACCTCGAGAAAC-ATGAAAAAAAAGGCATTC-ATTAGCAAG
* * * * *
908 AAAAGTTCATTTATAGTCACCCATTACTTCAAAAGCCTTATTACTCACTTTAAACGGTTTTATAA
192 AAAAGTCCATTTATAGTCACCCATTATTTAAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAA
* * * *
973 TCTTGAAATTGATTTT-A-TT---TTTTTTACATTTTTGATTAAAACAGACTATAATTGAATGTT
257 TC-TCAAATTGATTTTAAGTTAAATTTTTTACATTTTTCATTAAAATAGACTATAATTGAATGGT
* ** *
1033 TACATTGAGAAACGT-TATG
321 TACCTCAAGAAACATGTA-G
* ** *
1052 AAAAAAG-CATTAATTGGTAAGAAAAGTCCATTTATAGTGT--CCATTTCCTTCAAAAGCCTTAT
1 -AAAAAGCCATTCATTGAAAAGAAAAGTCCATTAATAGT-TACCCA-TTCCTTCAAAAGCCTTAT
* * * *
1114 CACTTACTTTAAATGGTTTTATTATCTCAAAATTGATTTTATGTTCAATGTTTTATACATATTTT
63 TACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCAAAATTGATTTTAAGTTCAATGTTTT-TACAT-TTTT
* * * *
1179 -GTTTAAACAGGCTATAATTGAATGTCTACCTCAAGAAACATGAAGAAAAAA-GCATTCATTGGC
126 GGTTAAAACA-GATATAATTGAATGTCTACCTCGAGAAACATGAA-AAAAAAGGCATTCATTAGC
* * * * *
1242 AA-AAAAGTTCATTTATAGTCTCCCATTCTTTAAAAAGTCTTATTACTCGCTTTAAATGGCTTTA
189 AAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCCATTATTTAAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTA
* * * * * *
1306 TCATCTCAAAATTGAATTTATGTTCAATTGTTTTTATATTTTTGC-TTAAAATAGATTATAATTG
254 TAATCTC-AAATTGATTTTAAGTT-AAAT-TTTTTACATTTTT-CATTAAAATAGACTATAATTG
* * *
1370 AAT-GTCTACCTTAAGAAACAAGAAG
315 AATGGT-TACCTCAAGAAACATGTAG
* * *
1395 AAAAAGGCACTT-ATT-AGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTTACCCATT-CTTCAAAAGCCTTATT
1 AAAAAGCCA-TTCATTGA-AAAGAAAAGTCCATTAATAGTTACCCATTCCTTCAAAAGCCTTATT
* * *
1457 ACTCACTATAAATGGTTTTATAATCTCAAAATTGATTTTAGGTTCCAT-TTTTTATGCATTTTTG
64 ACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCAAAATTGATTTTAAGTTCAATGTTTTTA--CATTTTTG
* * * *
1521 GTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTGGAGAAATATG-AAGAAAAGGCATTCATTGGCAA
127 GTTAAAACAGA-TATAATTGAATGTCTACCTCGAGAAACATGAAAAAAAAGGCATTCATTAGCAA
*
1585 GAAAAGTCTATTTATAGTC
191 GAAAAGTCCATTTATAGTC
1604 TTCCATTCCT
Statistics
Matches: 999, Mismatches: 180, Indels: 100
0.78 0.14 0.08
Matches are distributed among these distances:
335 5 0.01
336 204 0.20
337 52 0.05
338 12 0.01
340 16 0.02
341 88 0.09
342 513 0.51
343 102 0.10
344 7 0.01
ACGTcount: A:0.36, C:0.13, G:0.12, T:0.37
Consensus pattern (339 bp):
AAAAAGCCATTCATTGAAAAGAAAAGTCCATTAATAGTTACCCATTCCTTCAAAAGCCTTATTAC
TCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCAAAATTGATTTTAAGTTCAATGTTTTTACATTTTTGGTTA
AAACAGATATAATTGAATGTCTACCTCGAGAAACATGAAAAAAAAGGCATTCATTAGCAAGAAAA
GTCCATTTATAGTCACCCATTATTTAAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTC
AAATTGATTTTAAGTTAAATTTTTTACATTTTTCATTAAAATAGACTATAATTGAATGGTTACCT
CAAGAAACATGTAG
Found at i:1447 original size:678 final size:676
Alignment explanation
Indices: 396--1619 Score: 1535
Period size: 678 Copynumber: 1.8 Consensus size: 676
386 ATTGAAAAGG
* *
396 AAAGTCCATTAATAGTTACCCATTCCTTCAAATACCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAGT
1 AAAGTCCATTAATAGTTA-CCATTCCTTCAAATACCTTATCACTCACTTTAAATGGTTTTATAGT
* *
461 CCCATAATTAATTTTAAGTTGAATTGTTTTACATTTTTGGTTAAAATAGATAATAATTAAATGTC
65 CCCAAAATTAATTTTAAGTTCAATTGTTTTACATTTTTGGTTAAAATAGATAATAATTAAATGTC
* * * *
526 TAGCTCGAGAAACGTGAAAAAAAAATACATTCATTAGCAAGAAAAGTCCATTATAGTCACCTATT
130 TACCTCAAGAAACATGAAAAAAAAATACATTCATTAGCAAGAAAAGTCCATTATAGTCACCCATT
* * * * * * *
591 TTTTGAAAAGCCTTATTACTCGTTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAGTTGATTTTAAGTTAAAT
195 CTTTAAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGCTTTATAATCTCAAAATTGAATTTAAGTTAAAT
* * *
656 ATTTTTACATTTTTTATTAAAATAGATTATAATTGAATGCTTACCTCAAGAAACATGTAGAAAAA
260 ATTTTTACATTTTTGATTAAAATAGATTATAATTGAATGCTTACCTCAAGAAACAAGAAGAAAAA
* * * *
721 TCCATTCCTCAAGAAGAAAAGTCCATTAATAGTCACTCATTCCTTCAAAAGCCTTAGTACTCGCT
325 GCCATTCATCAAGAAGAAAAGTCCATTAATAGTCACCCATTCCTTCAAAAGCCTTAGTACTCACT
* ** *
786 TTAAATGATTTTATAATCTTGAAATTGATTTTAAGTTGAACGTTTTTAT-ATTTTTAGTTAAAAC
390 ATAAATGATTTTATAATCTCAAAATTGATTTTAAGTTCAA-GTTTTTATCATTTTTAGTTAAAAC
* *
850 AGACTAGAATTGAATGTCTGCCTCGAGAAACGA-GTAGAAAAAGCCATTCAATGAG-AAGAAAAG
454 AGACTAGAATTGAATGTCTACCTCGAGAAA-GATGAAG-AAAAGCCATTCAATG-GCAAGAAAAG
913 T-TCATTTATAGTCACCCATTACTTCAAAAGCCTTATTACTCACTTTAAACGGTTTTATAATCTT
516 TCT-ATTTATAGTCACCCATTACTTCAAAAGCCTTATTACTCACTTTAAACGGTTTTATAATCTT
977 GAAATTGATTTTATTTTTTTTACATTTTTGATTAAAACAGACTATAATTGAATGTTTACATTGAG
580 GAAATTGATTTTATTTTTTTTACATTTTTGATTAAAACAGACTATAATTGAATGTTTACATTGAG
1042 AAACGTTATGAAAAAAGCATTAATTGGTAAGA
645 AAACGTTATGAAAAAAGCATTAATTGGTAAGA
* *
1074 AAAGTCCATTTATAGTGT-CCATTTCCTTCAAA-AGCCTTATCACTTACTTTAAATGGTTTTATT
1 AAAGTCCATTAATAGT-TACCA-TTCCTTCAAATA-CCTTATCACTCACTTTAAATGGTTTTA-T
* * * * * *
1137 A-TCTCAAAATTGATTTTATGTTCAA-TGTTTTATACATATTTTGTTTAAACA-GGCT-ATAATT
62 AGTCCCAAAATTAATTTTAAGTTCAATTG-TTT-TACAT-TTTTGGTTAAA-ATAGATAATAATT
* * * * *
1198 GAATGTCTACCTCAAGAAACATGAAGAAAAAA-GCATTCATTGGCAA-AAAAGTTCATTTATAGT
123 AAATGTCTACCTCAAGAAACATGAAAAAAAAATACATTCATTAGCAAGAAAAGTCCA-TTATAGT
* * *
1261 CTCCCATTCTTTAAAAAGTCTTATTACTCGCTTTAAATGGCTTTATCATCTCAAAATTGAATTTA
187 CACCCATTCTTTAAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGCTTTATAATCTCAAAATTGAATTTA
* * * * * *
1326 TGTTCAATTGTTTTTATATTTTTGCTTAAAATAGATTATAATTGAATG-TCTACCTTAAGAAACA
252 AGTT-AAATATTTTTACATTTTTGATTAAAATAGATTATAATTGAATGCT-TACCTCAAGAAACA
* * * *
1390 AGAAGAAAAAGGCACTT-AT-TAGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTTACCCATT-CTTCAAAAGCC
315 AGAAGAAAAAGCCA-TTCATCAAG-AAGAAAAGTCCATTAATAGTCACCCATTCCTTCAAAAGCC
* * * * *
1452 TTATTACTCACTATAAATGGTTTTATAATCTCAAAATTGATTTTAGGTTCCATTTTTTATGCATT
378 TTAGTACTCACTATAAATGATTTTATAATCTCAAAATTGATTTTAAGTTCAAGTTTTTAT-CATT
* * * * * * *
1517 TTTGGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTGGAGAAATATGAAGAAAAGGCATTCATTGG
442 TTTAGTTAAAACAGACTAGAATTGAATGTCTACCTCGAGAAAGATGAAGAAAAGCCATTCAATGG
** *
1582 CAAGAAAAGTCTATTTATAGTCTTCCATTCCTTCAAAA
507 CAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACCCATTACTTCAAAA
Statistics
Matches: 459, Mismatches: 69, Indels: 36
0.81 0.12 0.06
Matches are distributed among these distances:
677 22 0.05
678 250 0.54
679 172 0.37
680 14 0.03
681 1 0.00
ACGTcount: A:0.36, C:0.14, G:0.12, T:0.38
Consensus pattern (676 bp):
AAAGTCCATTAATAGTTACCATTCCTTCAAATACCTTATCACTCACTTTAAATGGTTTTATAGTC
CCAAAATTAATTTTAAGTTCAATTGTTTTACATTTTTGGTTAAAATAGATAATAATTAAATGTCT
ACCTCAAGAAACATGAAAAAAAAATACATTCATTAGCAAGAAAAGTCCATTATAGTCACCCATTC
TTTAAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGCTTTATAATCTCAAAATTGAATTTAAGTTAAATA
TTTTTACATTTTTGATTAAAATAGATTATAATTGAATGCTTACCTCAAGAAACAAGAAGAAAAAG
CCATTCATCAAGAAGAAAAGTCCATTAATAGTCACCCATTCCTTCAAAAGCCTTAGTACTCACTA
TAAATGATTTTATAATCTCAAAATTGATTTTAAGTTCAAGTTTTTATCATTTTTAGTTAAAACAG
ACTAGAATTGAATGTCTACCTCGAGAAAGATGAAGAAAAGCCATTCAATGGCAAGAAAAGTCTAT
TTATAGTCACCCATTACTTCAAAAGCCTTATTACTCACTTTAAACGGTTTTATAATCTTGAAATT
GATTTTATTTTTTTTACATTTTTGATTAAAACAGACTATAATTGAATGTTTACATTGAGAAACGT
TATGAAAAAAGCATTAATTGGTAAGA
Done.