Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: NW_018403051.1 Herrania umbratica cultivar Fairchild unplaced genomic scaffold, ASM216827v2 scaffold_716.0, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Pmatch=0.80,Pindel=0.10
tuple sizes 0,4,5,7
tuple distances 0, 29, 159, 1000
Length: 1904
ACGTcount: A:0.39, C:0.12, G:0.13, T:0.34
Warning! 36 characters in sequence are not A, C, G, or T
Found at i:734 original size:171 final size:171
Alignment explanation
Indices: 1--1904 Score: 1008
Period size: 171 Copynumber: 11.2 Consensus size: 171
* * * *
1 ACTTAAAATCAATAATGAGATTATAAAACCATTTAAAGTGAGTAATAAAGCTTTTGAAGGCATAG
1 ACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTGGAAGGCATAG
* * *** *** * *
66 ATGACTAT-AATAGACTTTTCTTGATAATGAATGGGTTTCTCTTCATGTTTC-CTAAGGTAAACA
66 TTGACTATAAATGGACTTTTCTTTCCAATGAATAACTTTTTCTTCATGTTTCTC-AAGGCAAACA
* * * ** *
129 CTCAGTTATAATCTATTTTAACCAAAAAT-GTAAAAAGTTTCA
130 CTCAATTATAATCTGTTTTAACTAAAAATAAAAAAAAATTT-A
* * * * * ** ** * *
171 GCTTAAAATCAATAATGAGATTATAAGACCGTTTAAAACGAGTAATAAAACTTTAAAATGCATGG
1 ACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTGGAAGGCATAG
** * * ** * * * * *
236 GGGACTATAAATGGATTTTTCTTGT-CAATGGATGGCTTTTGCATCATGTCTC-CTAAAGCAGAC
66 TTGACTATAAATGGACTTTTCTT-TCCAATGAATAACTTTTTCTTCATGTTTCTC-AAGGCAAAC
* * * *
299 ATTTAATTATAATATATTTTAA-TCAAAAATATAAAAAAAATTTA
129 ACTCAATTATAATCTGTTTTAACT-AAAAATA-AAAAAAAATTTA
* * * * *
343 ACGTAAAACCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAATGCGAGTAATAAGGCTTTAGAAGGCATGG
1 ACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTGGAAGGCATAG
* * * *
408 TTGACTATAAATGGACTTTTCTTACCAATGAATAATTTTTTCTTCACGTTT-TCTGAGGCAAACA
66 TTGACTATAAATGGACTTTTCTTTCCAATGAATAACTTTTTCTTCATGTTTCTC-AAGGCAAACA
* * * * ** *
472 TTCAAATATTATCTGTTTTAACTAACAAT--ATCAAAATTCA
130 CTCAATTATAATCTGTTTTAACTAAAAATAAAAAAAAATTTA
* * *** *
512 A-TTGAAAATCAATAATAAGATTATAAAACCATTTAAAATAAGTAATAAGGCTTTGGAAGGTATA
1 ACTT-AAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTGGAAGGCAT-
* * * * * * **
576 AG-TGACTATAAATTGACTTGTCTTTCAAATGAGTAACTTTTCCTTCATATTTCTCAAGGTGAAC
64 AGTTGACTATAAATGGACTTTTCTTTCCAATGAATAACTTTTTCTTCATGTTTCTCAAGGCAAAC
640 ACTCAATTATAATCTGTTTTAACTAAAAATAAAAAAAAATTTA
129 ACTCAATTATAATCTGTTTTAACTAAAAATAAAAAAAAATTTA
* * * * ** *
683 ACTTAAAATGAATTATGAGATTATAAAATCATTTAAAGTGACTAATAAGGCTTTCAAAGGCTTGA
1 ACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTGGAAGGCAT-A
** * * * * * * *
748 G-TGACTATAAATGGACCCTTCTTACTAATGCATGACTTTTAC-TCAGGTTTC-CTAAAGCAAAC
65 GTTGACTATAAATGGACTTTTCTTTCCAATGAATAACTTTTTCTTCATGTTTCTC-AAGGCAAAC
* * ** *
810 -CTTCAAGTATAATATACTTTAA-TCAAAAAT-ATAAAAAATTTA
129 AC-TCAATTATAATCTGTTTTAACT-AAAAATAAAAAAAAATTTA
* * * * *
852 ATTTAAAATCAATT-TGGTGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTGGTATGCATG
1 ACTTAAAATCAATTAT-GAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTGGAAGGCATA
* * * * * *
916 GATT-ACTATAAATGTACTTTTCTTTCCAATGGATGACTTTTTCTTTATGTTTC-CTAAAGCATA
65 G-TTGACTATAAATGGACTTTTCTTTCCAATGAATAACTTTTTCTTCATGTTTCTC-AAGGCAAA
* * *
979 CATTCAATTATAATATATTTTAAC-AAAAA-AAGTAAAAAAATTTA
128 CACTCAATTATAATCTGTTTTAACTAAAAATAA--AAAAAAATTTA
* * * * * *
1023 ACTTAAAATTAATTATGATATTATAAAATCATCTAAAGCAAGTAATAAGGCTTTGGAAGGCATGG
1 ACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTGGAAGGCATAG
* * ** * * * *
1088 TTGACTATAAATGGACTTTTCCTAT-CAGTGAATAGGTTTTTCTTCACGTTT-TCTGAGGTAGAC
66 TTGACTATAAATGGACTTTT-CTTTCCAATGAATAACTTTTTCTTCATGTTTCTC-AAGGCAAAC
* * * * * * *
1151 ATTTAAATATAATCCGTTTGAACTAAAAGTGTAAAAAAAAA-TCA
129 ACTCAATTATAATCTGTTTTAACTAAAA--ATAAAAAAAAATTTA
* **
1195 ACTTAAAATCAA-TAGTGAGATTATAAAACCATTTAAAGTGAGTAATAAAACTTTGGAAGGCATG
1 ACTTAAAATCAATTA-TGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTGGAAGGCAT-
* * * * *
1259 AG-TGATTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATGAATGGA-TTTGTT-TTCATGTTTTTCAAGGCAA
64 AGTTGACTATAAATGGACTTTTCTTTCCAATGAAT-AACTTT-TTCTTCATGTTTCTCAAGGCAA
* * ** *
1321 ACACTCAATTATAATCTGTTTTACCAAAAAATGTAAAAAAATTCA
127 ACACTCAATTATAATCTGTTTTAACTAAAAATAAAAAAAAATTTA
********** * * * * ** *
1366 ACTTAAANNNNNNNNNNAGATTATAAAACTATTTAAAGTGAGTAA-CAGGACTTT-CACAATCTT
1 ACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGG-CTTTGGA-AGGCAT
* * * * * ** * ** * * * * * *
1429 GGGTGAGTTTAAATTGACTTTT-TTTACTGATGGATGGC-TTTGCATCACGTTT-TCTAAAGTAG
64 AGTTGACTATAAATGGACTTTTCTTT-CCAATGAATAACTTTTTCTTCATGTTTCTC-AAGGCAA
* * * * **********************
1491 ACATTCAATTACAATATATTTTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
127 ACACTCAATTATAATCTGTTTTAACTAAAAATAAAAAAAAATTTA
**** * *
1536 NNNNAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAACGAGTAATAAGGCTTTGGAAGGCATGA
1 ACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTGGAAGGCAT-A
* * *** ** *
1601 G-TGACTATAAATGGACTTTTATTGCCAATGAATGGGTTTTTCTTCACATTTC-CTGAGGCAAAC
65 GTTGACTATAAATGGACTTTTCTTTCCAATGAATAACTTTTTCTTCATGTTTCTC-AAGGCAAAC
* * * * * ** *
1664 ATTCAAATATAATCTGTTGTATCAAAAAATGTAAAAAAATCTA
129 ACTCAATTATAATCTGTTTTAACTAAAAATAAAAAAAAATTTA
* * * *
1707 ACTTAAAATCAATAATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTTATAAGGCTTTGGAAGGCTTGG
1 ACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTGGAAGGCATAG
* * * * * * * ** *
1772 GTGATTGTAAATGGGC-ATTCATTGCCAATGAATGA-TTTTGTCTTCACATTTCT-AAGGGAAAA
66 TTGACTATAAATGGACTTTTC-TTTCCAATGAATAACTTTT-TCTTCATGTTTCTCAA-GGCAAA
* * * *
1834 CACTCAATTAGAATCTATTTTAAAC-AAAAATATAAAAACATTTA
128 CACTCAATTATAATCTGTTTT-AACTAAAAATAAAAAAAAATTTA
1878 ACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAA
1 ACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAA
Statistics
Matches: 1306, Mismatches: 367, Indels: 121
0.73 0.20 0.07
Matches are distributed among these distances:
168 3 0.00
169 237 0.18
170 251 0.19
171 542 0.42
172 250 0.19
173 21 0.02
175 2 0.00
ACGTcount: A:0.39, C:0.12, G:0.13, T:0.34
Consensus pattern (171 bp):
ACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTGGAAGGCATAG
TTGACTATAAATGGACTTTTCTTTCCAATGAATAACTTTTTCTTCATGTTTCTCAAGGCAAACAC
TCAATTATAATCTGTTTTAACTAAAAATAAAAAAAAATTTA
Found at i:862 original size:340 final size:339
Alignment explanation
Indices: 1--1271 Score: 941
Period size: 340 Copynumber: 3.7 Consensus size: 339
* * * * * *
1 ACTTAAAATCAATAATGAGATTATAAAACCATTTAAAGTGAGTAATAAAGCTTTTGAAGGCATAG
1 ACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAATCATTTAAAGCGAGTAATAAGGC-TTTAAAGGCATGG
* * ** * *** * * *
66 ATGACTAT-AATAGACTTTTCTTGA-TAATGAATGGGTTTCT-CTTCATGTTTCCTAAGGTAAAC
65 TTGACTATAAATGGACCCTTCTT-ACCAATGAATAACTTT-TACTTCACGTTTCCTAAAGCAAAC
* ** * * * * *
128 ACTCAGTTATAATCTATTTTAACCAAAAATGTAAAAAGTTTCAGCTT-AAAATCAATAATG-AGA
128 ATTCAAATATAATATACTTTAACTAAAAATATAAAAA--TTCA-ATTGAAAATCAAT-ATGAAGA
* * * ** ** * * ** * * *
191 TTATAAGACCGTTTAAAACGAGTAATAAAACTTTAAAATGCATGGGGGACTATAAATGGATTTTT
189 TTATAAAACCATTTAAAACAAGTAATAAGGCTTTGGAAGGCATAGATGACTATAAATGTACTTGT
** * * * * * * *
256 CTTGTC-AATGGATGGCTTTTGCATCATGTCTCCTAAAGCAGACATTTAATTATAATATATTTTA
254 CTT-TCAAATGGATAACTTTTCCTTCATATTTCCTAAAGCATACACTCAATTATAATATATTTTA
320 A-TCAAAAATATAAAAAAAATTTA
318 ACT-AAAAATA-AAAAAAAATTTA
* * * *
343 ACGTAAAACCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAATGCGAGTAATAAGGCTTTAGAAGGCATGG
1 ACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAATCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTA-AAGGCATGG
** * * * * *
408 TTGACTATAAATGGACTTTTCTTACCAATGAATAATTTTTTCTTCACGTTTTCTGAGGCAAACAT
65 TTGACTATAAATGGACCCTTCTTACCAATGAATAACTTTTACTTCACGTTTCCTAAAGCAAACAT
* * ** * *
473 TCAAATATTATCTGTTTTAACTAACAATATCAAAATTCAATTGAAAATCAATAAT-AAGATTATA
130 TCAAATATAATATACTTTAACTAAAAATATAAAAATTCAATTGAAAATCAAT-ATGAAGATTATA
* *
537 AAACCATTTAAAATAAGTAATAAGGCTTTGGAAGGTATA-AGTGACTATAAAT-TGACTTGTCTT
194 AAACCATTTAAAACAAGTAATAAGGCTTTGGAAGGCATAGA-TGACTATAAATGT-ACTTGTCTT
* * * *
600 TCAAAT-GAGTAACTTTTCCTTCATATTT-CTCAAG-GTGAACACTCAATTATAATCTGTTTTAA
257 TCAAATGGA-TAACTTTTCCTTCATATTTCCTAAAGCAT--ACACTCAATTATAATATATTTTAA
662 CTAAAAATAAAAAAAAATTTA
319 CTAAAAATAAAAAAAAATTTA
* * * *
683 ACTTAAAATGAATTATGAGATTATAAAATCATTTAAAGTGACTAATAAGGCTTTCAAAGGCTTGA
1 ACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAATCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTT-AAAGGCATG-
* * * * *
748 G-TGACTATAAATGGACCCTTCTTACTAATGCATGACTTTTAC-TCAGGTTTCCTAAAGCAAACC
64 GTTGACTATAAATGGACCCTTCTTACCAATGAATAACTTTTACTTCACGTTTCCTAAAGCAAACA
* * * * **
811 TTCAAGTATAATATACTTTAA-TCAAAAATATAAAAAATTTAATTTAAAATCAATTTGGTGATTA
129 TTCAAATATAATATACTTTAACT-AAAAATAT-AAAAATTCAATTGAAAATCAATATGAAGATTA
* * * * * * *
875 TAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTGGTATGCATGGATTACTATAAATGTACTTTTCTT
192 TAAAACCATTTAAAACAAGTAATAAGGCTTTGGAAGGCATAGATGACTATAAATGTACTTGTCTT
* * * * * *
940 TCCAATGGATGACTTTTTCTTTATGTTTCCTAAAGCATACATTCAATTATAATATATTTTAAC-A
257 TCAAATGGATAACTTTTCCTTCATATTTCCTAAAGCATACACTCAATTATAATATATTTTAACTA
1004 AAAA-AAGTAAAAAAATTTA
322 AAAATAA--AAAAAAATTTA
* * * * *
1023 ACTTAAAATTAATTATGATATTATAAAATCATCTAAAGCAAGTAATAAGGCTTTGGAAGGCATGG
1 ACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAATCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTT-AAAGGCATGG
** * * * ** * * * * * *
1088 TTGACTATAAATGGACTTTTCCTATCAGTGAATAGGTTTTTCTTCACGTTTTCTGAGGTAGACAT
65 TTGACTATAAATGGACCCTTCTTACCAATGAATAACTTTTACTTCACGTTTCCTAAAGCAAACAT
* * * * *
1153 TTAAATAT-A-ATCCGTTTGAACTAAAAGTGTAAAAAAAAATCAACTT-AAAATCAATAGTG-AG
130 TCAAATATAATATAC-TTT-AACTAAAA--AT-ATAAAAATTCAA-TTGAAAATCAATA-TGAAG
*** ** *
1214 ATTATAAAACCATTTAAAGTGAGTAATAAAACTTTGGAAGGCAT-GAGTGATTATAAAT
188 ATTATAAAACCATTTAAAACAAGTAATAAGGCTTTGGAAGGCATAGA-TGACTATAAAT
1272 AGACTTTTCT
Statistics
Matches: 742, Mismatches: 151, Indels: 71
0.77 0.16 0.07
Matches are distributed among these distances:
338 3 0.00
339 49 0.07
340 329 0.44
341 153 0.21
342 67 0.09
343 136 0.18
344 5 0.01
ACGTcount: A:0.40, C:0.12, G:0.13, T:0.35
Consensus pattern (339 bp):
ACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAATCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTAAAGGCATGGT
TGACTATAAATGGACCCTTCTTACCAATGAATAACTTTTACTTCACGTTTCCTAAAGCAAACATT
CAAATATAATATACTTTAACTAAAAATATAAAAATTCAATTGAAAATCAATATGAAGATTATAAA
ACCATTTAAAACAAGTAATAAGGCTTTGGAAGGCATAGATGACTATAAATGTACTTGTCTTTCAA
ATGGATAACTTTTCCTTCATATTTCCTAAAGCATACACTCAATTATAATATATTTTAACTAAAAA
TAAAAAAAAATTTA
Found at i:1164 original size:511 final size:509
Alignment explanation
Indices: 1--1271 Score: 1337
Period size: 511 Copynumber: 2.5 Consensus size: 509
* * *
1 ACTTAAAATCAATAATGAGATTATAAAACCATTTAAAGTGAGTAATAAAGCTTTTGAAGGCATAG
1 ACTTAAAATCAATAATGAGATTATAAAACCATTTAAAGTAAGTAATAAGGCTTTGGAAGGCATAG
* * * * *
66 ATGACTAT-AATAGACTTTTCTTGAT-AATGAATGGGTTTCTCTTCATGTTTCCTAAGGTAAACA
66 -TGACTATAAATAGACTTTTCCT-ATCAATGAATAGGTTTTTCTTCA-GTTTTCTAAGGTAGACA
* * * ** * * *
129 CTCAGTTATAATCTATTTTAACCAAAAAT-GTAAAAAGTTTCAGCTTAAAATCAATAATGAGATT
128 CTCAATTATAATCTGTTTTAACTAAAAATAAAAAAAAATTT-AACTTAAAATCAATTATGAGATT
* * ** * * * ***
193 ATAAGACCGTTTAAAACGAGTAATAAAACTTTAAAATGCATGGGGGACTATAAATGGATTTTTCT
192 ATAAAACCATTTAAAGTGAGTAATAAAACTTTAAAAGGCATGAGTGACTATAAATGGACCCTTCT
* * * * * * * * *
258 TGTCAATGGATGGCTTTTGCATCATGTCTCCTAAAGCAGACATTTAATTATAATATATTTTAATC
257 TCTCAATGCATGACTTTTACATCAGGTCTCCTAAAGCAAACATTCAAGTATAATATACTTTAATC
*
323 AAAAATATAAAAAAAATTTAACGTAAAACCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAATGCGAGTAA
322 AAAAATAT-AAAAAAATTTAACGTAAAACCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAA
*
388 TAAGGCTTTAGAAGGCATGGTTGACTATAAATGGACTTTTCTTACCAATGAATAATTTTTTCTTC
386 TAAGGCTTTAGAAGGCATGGTTGACTATAAATGGACTTTTCTTACCAATGAATAACTTTTTCTTC
* * * * * * * * **
453 ACGTTTTCTGAGGCAAACATTCAAATATTATCTGTTTTAACTAACAATATCAAAATTCA
451 ACGTTTCCTAAAGCAAACATTCAAATATAATATATTTTAACAAAAAATAAAAAAATTCA
* * *
512 A-TTGAAAATCAATAATAAGATTATAAAACCATTTAAAATAAGTAATAAGGCTTTGGAAGGTATA
1 ACTT-AAAATCAATAATGAGATTATAAAACCATTTAAAGTAAGTAATAAGGCTTTGGAAGGCAT-
* * * * ** *
576 AGTGACTATAAATTGACTTGT-CTTTCAAATGAGTAACTTTTCCTTCA-TATTTCTCAAGGT-GA
64 AGTGACTATAAATAGACTTTTCCTATC-AATGAATAGGTTTTTCTTCAGT-TTTCT-AAGGTAG-
*
638 ACACTCAATTATAATCTGTTTTAACTAAAAATAAAAAAAAATTTAACTTAAAATGAATTATGAGA
125 ACACTCAATTATAATCTGTTTTAACTAAAAATAAAAAAAAATTTAACTTAAAATCAATTATGAGA
* * ** * *
703 TTATAAAATCATTTAAAGTGACTAATAAGGCTTTCAAAGGCTTGAGTGACTATAAATGGACCCTT
190 TTATAAAACCATTTAAAGTGAGTAATAAAACTTTAAAAGGCATGAGTGACTATAAATGGACCCTT
* *
768 CTTACT-AATGCATGACTTTTAC-TCAGGTTTCCTAAAGCAAACCTTCAAGTATAATATACTTTA
255 CTT-CTCAATGCATGACTTTTACATCAGGTCTCCTAAAGCAAACATTCAAGTATAATATACTTTA
** * *
831 ATCAAAAATAT-AAAAAATTTAATTTAAAATCAATT-TGGTGATTATAAAACCATTTAAAGCGAG
319 ATCAAAAATATAAAAAAATTTAACGTAAAACCAATTAT-GAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAG
* * * * * * *
894 TAATAAGGCTTTGGTATGCATGGATT-ACTATAAATGTACTTTTCTTTCCAATGGATGACTTTTT
383 TAATAAGGCTTTAGAAGGCATGG-TTGACTATAAATGGACTTTTCTTACCAATGAATAACTTTTT
* * * * *
958 CTTTATGTTTCCTAAAGCATACATTCAATTATAATATATTTTAACAAAAAAAGTAAAAAAATTTA
447 CTTCACGTTTCCTAAAGCAAACATTCAAATATAATATATTTTAAC-AAAAAA-TAAAAAAATTCA
* * * * * * *
1023 ACTTAAAATTAATTATGATATTATAAAATCATCTAAAGCAAGTAATAAGGCTTTGGAAGGCATGG
1 ACTTAAAATCAATAATGAGATTATAAAACCATTTAAAGTAAGTAATAAGGCTTTGGAAGGCATAG
* * * *
1088 TTGACTATAAATGGACTTTTCCTATCAGTGAATAGGTTTTTCTTCACGTTTTCTGAGGTAGACAT
66 -TGACTATAAATAGACTTTTCCTATCAATGAATAGGTTTTTCTTCA-GTTTTCTAAGGTAGACAC
* * * * * *
1153 TTAAATATAATCCGTTTGAACTAAAAGTGTAAAAAAAAA-TCAACTTAAAATCAA-TAGTGAGAT
129 TCAATTATAATCTGTTTTAACTAAAA--ATAAAAAAAAATTTAACTTAAAATCAATTA-TGAGAT
** *
1216 TATAAAACCATTTAAAGTGAGTAATAAAACTTTGGAAGGCATGAGTGATTATAAAT
191 TATAAAACCATTTAAAGTGAGTAATAAAACTTTAAAAGGCATGAGTGACTATAAAT
1272 AGACTTTTCT
Statistics
Matches: 620, Mismatches: 117, Indels: 45
0.79 0.15 0.06
Matches are distributed among these distances:
508 1 0.00
509 133 0.21
510 11 0.02
511 234 0.38
512 221 0.36
513 20 0.03
ACGTcount: A:0.40, C:0.12, G:0.13, T:0.35
Consensus pattern (509 bp):
ACTTAAAATCAATAATGAGATTATAAAACCATTTAAAGTAAGTAATAAGGCTTTGGAAGGCATAG
TGACTATAAATAGACTTTTCCTATCAATGAATAGGTTTTTCTTCAGTTTTCTAAGGTAGACACTC
AATTATAATCTGTTTTAACTAAAAATAAAAAAAAATTTAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAA
AACCATTTAAAGTGAGTAATAAAACTTTAAAAGGCATGAGTGACTATAAATGGACCCTTCTTCTC
AATGCATGACTTTTACATCAGGTCTCCTAAAGCAAACATTCAAGTATAATATACTTTAATCAAAA
ATATAAAAAAATTTAACGTAAAACCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGG
CTTTAGAAGGCATGGTTGACTATAAATGGACTTTTCTTACCAATGAATAACTTTTTCTTCACGTT
TCCTAAAGCAAACATTCAAATATAATATATTTTAACAAAAAATAAAAAAATTCA
Done.