Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: NW_018403240.1 Herrania umbratica cultivar Fairchild unplaced genomic scaffold, ASM216827v2 scaffold_910.0, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Pmatch=0.80,Pindel=0.10
tuple sizes 0,4,5,7
tuple distances 0, 29, 159, 1000
Length: 8547
ACGTcount: A:0.26, C:0.09, G:0.08, T:0.28
Warning! 2497 characters in sequence are not A, C, G, or T
Found at i:996 original size:16 final size:17
Alignment explanation
Indices: 975--1025 Score: 50
Period size: 17 Copynumber: 2.9 Consensus size: 17
965 ACTCGGTTTA
975 AATAATTTTATAATTT-
1 AATAATTTTATAATTTG
*
991 AATAATTGGTTTTAATTTG
1 AATAATT--TTATAATTTG
**
1010 AATTTTTTTATAATTT
1 AATAATTTTATAATTT
1026 TGATTAAAAC
Statistics
Matches: 28, Mismatches: 4, Indels: 5
0.76 0.11 0.14
Matches are distributed among these distances:
16 7 0.25
17 8 0.29
18 8 0.29
19 5 0.18
ACGTcount: A:0.35, C:0.00, G:0.06, T:0.59
Consensus pattern (17 bp):
AATAATTTTATAATTTG
Found at i:1066 original size:169 final size:169
Alignment explanation
Indices: 860--1563 Score: 481
Period size: 171 Copynumber: 4.1 Consensus size: 169
850 NNNNNNTTGG
* * * *
860 TTAAAACAGACTATAATTGAATGTCTACCTCGAGAAATATAAAGAAAAAAGCATTCAATGGTAAG
1 TTAAAACAGACTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAATGTGAAGAAAAAAGCATTCAATGGGAAG
** *
925 AAAAGTCTATTTATATTCTCTTATTCTTT-AAAGCCTTAGTACTCGGTTTAAATAATTTTATAAT
66 AAAAGTCTATTTATATTCTCCCATTCTTTCAAAGCCTTAGTACTCGCTTTAAATAATTTTATAAT
** * * * *
989 TTAATAATTGGTTTTAATTTGAATTTTTTTATA-ATTTT
131 CCAATAATTGATTTTAAGTTAAATTTTTATATATATTTT
* ** *********
1027 GATTAAAACAGACTATAATTGAATATCTGGCTTGAGAAATGTGAAGAAAAAAGCATNNNNNNNNN
1 --TTAAAACAGACTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAATGTGAAGAAAAAAGCATTCAATGGGA
* * **
1092 NGAAAAGTCTATTTATAGTCTCCCATTCTTTCGAAAGCCTTAGTACTCGCTTTAAATGGTTTTAT
64 AGAAAAGTCTATTTATATTCTCCCATTCTTTC-AAAGCCTTAGTACTCGCTTTAAATAATTTTAT
*
1157 AATCCCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTTTATATATATTTT
128 AATCCAATAATTGATTTTAAGTTAAATTTTTATATATATTTT
** * * * *
1199 TTAAAATTGA-TAATAATTGAATGTCTATCTTGAGAAATGTGTAGAAAAACA-AATTCATTGGGA
1 TTAAAACAGACT-ATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAATGTGAAGAAAAA-AGCATTCAATGGGA
* * * * * **********
1262 ACAAAAGTCTATTTATATCCTCACATTCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTNNNNNNNNNNTAT
64 AGAAAAGTCTATTTATATTCTCCCATTCTTTC-AAAGCCTTAGTACTCGCTTTAAATAATTTTAT
* * * * *
1327 AATCTC-ATCATTGATTTTAAGCTGAATTGTTT-TACATTTTTT
128 AATC-CAATAATTGATTTTAAGTTAAATT-TTTATATATATTTT
* * ********** * *
1369 CTTAAAACAGATTATAATTGAATGTCTACCTCT-AGAAACGTGAAGAANNNNNNNNNNATTGGTA
1 -TTAAAACAGACTATAATTGAATGTCTACCT-TGAGAAATGTGAAGAAAAAAGCATTCAATGGGA
* *** ** ** *
1433 AGAAAAGTCTATTTATAGTCTCCCATTCAACCAAAAGCCTTTTTACTCATTTTAAATAGTTTTAT
64 AGAAAAGTCTATTTATATTCTCCCATTCTTTC-AAAGCCTTAGTACTCGCTTTAAATAATTTTAT
* * *
1498 TATCTC-ATAATT-AGTTTTAAGTTAAATTTTTTTATATTTTTT
128 AATC-CAATAATTGA-TTTTAAGTTAAATTTTTATATATATTTT
1540 ATTAAAACAGACTATAATTGAATG
1 -TTAAAACAGACTATAATTGAATG
1564 NNNNNNNNNN
Statistics
Matches: 412, Mismatches: 110, Indels: 24
0.75 0.20 0.04
Matches are distributed among these distances:
169 76 0.18
170 125 0.30
171 204 0.50
172 7 0.02
ACGTcount: A:0.35, C:0.12, G:0.11, T:0.38
Consensus pattern (169 bp):
TTAAAACAGACTATAATTGAATGTCTACCTTGAGAAATGTGAAGAAAAAAGCATTCAATGGGAAG
AAAAGTCTATTTATATTCTCCCATTCTTTCAAAGCCTTAGTACTCGCTTTAAATAATTTTATAAT
CCAATAATTGATTTTAAGTTAAATTTTTATATATATTTT
Found at i:3535 original size:170 final size:173
Alignment explanation
Indices: 3177--3535 Score: 381
Period size: 170 Copynumber: 2.1 Consensus size: 173
3167 NNNNNNNNNN
* * *
3177 TTTAAATGATTTTATAATCCCGTAATTGATTTTAAGTTGAATTGTTTTATATTTTTTTTATCAAA
1 TTTAAATGATTTTATAATCCCATAATTGATTTTAAGTTGAATTGTTTTACATTTTTTGTATCAAA
* * *
3242 ACAGATAATAATTGAATGTCTATCTTGAGAAACATGTAAAAAAACACATTCATTAATAACAAAAG
66 ACAGATAATAAGTGAATGTCTATCTTGAGAAACATGTAAAAAAACAAATTCATTAACAACAAAAG
* *
3307 TATATTTATAGTCACCCATTCCTTCAAAAGCCTTATTACTTGN
131 TATATTTATAGTCACCCATTCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGC
********* *
3350 NNNNNNNNNTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGATATT-TTTTACATTTTTTGT-T-AA
1 TTTAAATGATTTTATAATCCCATAATTGATTTTAAGTTGA-ATTGTTTTACATTTTTTGTATCAA
* * ** *
3412 AACAGACT-ATAAGTGAATGTTTA-CATTGAGAAACATG-AAGAAAACAAATTCATTGGCAAGAA
65 AACAGA-TAATAAGTGAATGTCTATC-TTGAGAAACATGTAAAAAAACAAATTCATTAACAACAA
* * * *
3474 AAGTCTATTTATAG-CGTCGCATTCGTTCAAAAGCCTTATTACTCGC
128 AAGTATATTTATAGTC-ACCCATTCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGC
*
3520 TTTAAATGGTTTTATA
1 TTTAAATGATTTTATA
3536 NNNNNNNNNN
Statistics
Matches: 146, Mismatches: 36, Indels: 11
0.76 0.19 0.06
Matches are distributed among these distances:
169 1 0.01
170 65 0.45
171 33 0.23
172 2 0.01
173 42 0.29
174 3 0.02
ACGTcount: A:0.35, C:0.12, G:0.11, T:0.39
Consensus pattern (173 bp):
TTTAAATGATTTTATAATCCCATAATTGATTTTAAGTTGAATTGTTTTACATTTTTTGTATCAAA
ACAGATAATAAGTGAATGTCTATCTTGAGAAACATGTAAAAAAACAAATTCATTAACAACAAAAG
TATATTTATAGTCACCCATTCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGC
Found at i:7238 original size:170 final size:170
Alignment explanation
Indices: 6898--8402 Score: 1288
Period size: 170 Copynumber: 8.8 Consensus size: 170
6888 NNNNNNNNNN
* * *
6898 TTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTATATTTTTTGTT-AAATCAGACTATAA
1 TTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTT-AAATTTTTTACATTTTTTATTAAAAT-AGACTATAA
* ** * ** * * *
6962 TTAAATACCTGCCT-ATAGAAATGTGTAG-AAAAAGCCATTCATTGAGAAAAAAAAGTCCATTTA
64 TTGAATGTCTACCTCA-AGAAACATGAAGAAAAAAG-CATTCATTG-GTAAGAAAAGTCCATTTA
***
7025 TAGTCACCCATTCCTTCAAAAATTTTATTACTCGCTTTAAATGGT
126 TAGTCACCCATTCCTTCAAAAGCATTATTACTCGCTTTAAATGGT
* * * *
7070 TTTATAATCCCGTCATTGATTTTAAGTTAAATTTTTTACATTTTTTATTAAAATGGA-TAATAAT
1 TTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTTTTACATTTTTTATTAAAATAGACT-ATAAT
* ** * * *
7134 TGAATGTCTATCTGGAGAAACATGAAGAAAAATGCATTCATTGGTAAGAATAGTCCATTTACAGT
65 TGAATGTCTACCTCAAGAAACATGAAGAAAAAAGCATTCATTGGTAAGAAAAGTCCATTTATAGT
* * ** *
7199 CACCCATTTCTTTAATAATTATT-TTACTCACTTTAAATGGT
130 CACCCATTCCTTCAA-AAGCATTATTACTCGCTTTAAATGGT
* * * *
7240 TTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATATTTTAGATTTTTTGTTAAAATAGACTATAATT
1 TTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTTTTACATTTTTTATTAAAATAGACTATAATT
* * * ** * * * *
7305 -AAGTGTTTGCCT-AAGAAAACATGTAGAAAAACTCATTTATTTGAAAGAAAAGTCCATTCATAG
66 GAA-TGTCTACCTCAAG-AAACATGAAGAAAAAAGCATTCATTGGTAAGAAAAGTCCATTTATAG
* * * * *
7368 T-ATCCCATTCCCTCAAAAGCCA-TGTTACACTCTTTAAATGGA
129 TCA-CCCATTCCTTCAAAAG-CATTATTACTCGCTTTAAATGGT
** * * * *
7410 TTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTGTTTTTTATTTTTGATCAAAACAGACAATAAT
1 TTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATT-TTTTACATTTTTTATTAAAATAGACTATAAT
* * * * * *
7475 TGACTGTCTATC-CAAGAAACATGTAA-AAAAACA-CATTGATAGGCAAGAAAAGTCTATTTATA
65 TGAATGTCTACCTCAAGAAACATG-AAGAAAAA-AGCATTCATTGGTAAGAAAAGTCCATTTATA
* * * * *
7537 GCCTCCCATTCCATCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATAGT
128 GTCACCCATTCCTTCAAAAGCATTATTACTCGCTTTAAATGGT
* * * *
7580 TTTATAATCTCATCATTGATTTTAAGTTGAATTTATTTATATTTTTCATTAAAATAGACTATAAT
1 TTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTT-TTTACATTTTTTATTAAAATAGACTATAAT
* * ** *
7645 TGAATGTCTACCTCAAGAAATATGAAGAAAAAAGCATTAATCCGTAAGAAAAGTCTATTTATAGT
65 TGAATGTCTACCTCAAGAAACATGAAGAAAAAAGCATTCATTGGTAAGAAAAGTCCATTTATAGT
* ** * * * * * *
7710 CTCCCATTCCACCAAAAGTATTTTTGCTCGTTTTCAATAGT
130 CACCCATTCCTTCAAAAGCATTATTACTCGCTTTAAATGGT
* * * * *
7751 TTTATTATCTCATAATTAATTTTAAGTTGAATTTTTTTATATTTTTT-TATAAAACAGACTATAA
1 TTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTT-AAATTTTTTACATTTTTTAT-TAAAATAGACTATAA
* * * * *** *
7815 TTGAATGTTTACCTTAAAAAACGTGAAGAAAAAAGCATTCATTGACGAGAAAAGTCTATTTATAG
64 TTGAATGTCTACCTCAAGAAACATGAAGAAAAAAGCATTCATTGGTAAGAAAAGTCCATTTATAG
* ** * *
7880 CCTTCCATTCATTCAAAAGCCTTATTACTCG-TTGTAAATGGT
129 TCACCCATTCCTTCAAAAGCATTATTACTCGCTT-TAAATGGT
* * * * * * *
7922 TTTATAATCTCATAAATAATTTTAAGTTGAATTTTTTACATTTTTGAATAAAATAGACAACAATT
1 TTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTTTTACATTTTTTATTAAAATAGACTATAATT
* ** ** *
7987 GAATGTCTATCTTGAGAAATGTGAAGAAAAAAGCATTCATTGGTAAGAAAAGTCTATTTATAGTC
66 GAATGTCTACCTCAAGAAACATGAAGAAAAAAGCATTCATTGGTAAGAAAAGTCCATTTATAGTC
* * * *
8052 ACCCATTCCTTTAAAAGCATTATTAGTCGTTTTAAATGAT
131 ACCCATTCCTTCAAAAGCATTATTACTCGCTTTAAATGGT
* ** *
8092 TTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATATTTTTACA-TTTTT-TTAAACCAAACTATAAT
1 TTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAAT-TTTTTACATTTTTTATTAAAATAGACTATAAT
* * * * *********
8155 TGAATGTTTACCTCGAGAAACGTGTAG-AAAAAGCCATTCATTGAG-AA-AAANNNNNNNNNNAT
65 TGAATGTCTACCTCAAGAAACATGAAGAAAAAAG-CATTCATTG-GTAAGAAA-AGTCCATTTAT
* * **
8217 AGTCACCCATTCCTTCAAAAGCCTTATTTCTCATTTTAAATGGT
127 AGTCACCCATTCCTTCAAAAGCATTATTACTCGCTTTAAATGGT
* * *
8261 TTTATAAT-TCCATCATTGATTTTAACTTAAACTTTTTTACATTTTTTATTAAAATGGA-TAATA
1 TTTATAATCT-CATAATTGATTTTAAGTTAAA-TTTTTTACATTTTTTATTAAAATAGACT-ATA
* * * * * * *
8324 ATTAAATGTGTATCTCGAGAAATATAAAAAAAAAATGCATTCATTGGTAAGAAAAGTCCATTTAT
63 ATTGAATGTCTACCTCAAGAAACATGAAGAAAAAA-GCATTCATTGGTAAGAAAAGTCCATTTAT
8389 AGTCACCCATTCCT
127 AGTCACCCATTCCT
8403 NNNNNNNNNN
Statistics
Matches: 1078, Mismatches: 215, Indels: 80
0.79 0.16 0.06
Matches are distributed among these distances:
168 10 0.01
169 128 0.12
170 500 0.46
171 365 0.34
172 71 0.07
173 4 0.00
ACGTcount: A:0.37, C:0.13, G:0.11, T:0.39
Consensus pattern (170 bp):
TTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTAAATTTTTTACATTTTTTATTAAAATAGACTATAATT
GAATGTCTACCTCAAGAAACATGAAGAAAAAAGCATTCATTGGTAAGAAAAGTCCATTTATAGTC
ACCCATTCCTTCAAAAGCATTATTACTCGCTTTAAATGGT
Found at i:7764 original size:341 final size:335
Alignment explanation
Indices: 6898--8402 Score: 1264
Period size: 341 Copynumber: 4.4 Consensus size: 335
6888 NNNNNNNNNN
*
6898 TTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTATATTTTTTGTT-AAATCAGACTATAA
1 TTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAA-TTTTTTATATTTTTTATTAAAAT-AGACTATAA
* ** * * * * *
6962 TTAAATACCTGCCTATAGAAATGTGTAG-AAAAAGCCATTCATTGAGAAAAAAAAGTCCATTTAT
64 TTGAATGTCTACCTA-AGAAATATGAAGAAAAAAG-CATTAATT-AGAAAGAAAAGTCCATTTAT
* * * * *
7026 AGTCACCCATTCCTTCAAAA--ATTTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCCCGTCATTGA
126 AGTCACCCATTCCTCCAAAAGCA-TTT-TTACTCGTTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGA
** ** * **
7089 TTTTAAGTTAAATTTTTTACATTTTTTATTAAAATGGATAATAATTGAATGTCTATCTGGAGAAA
189 TTTTAAGTTAAATTTTTTTTATTTTTTA-TAAAACAGACAATAATTGAATGTCTATC-CAAGAAA
* * * * * * * * * **
7154 CATGAAGAAAAATGCATTCATTGGTAAGAATAGTCCATTTACAGTCACCCATTTCTTTAATAATT
252 CATGAAGAAAAA-ACATTCATTGGCAAGAAAAGTCTATTTATAGCCTCCCA-TTCATCAA-AAGC
* *
7219 ATT-TTACTCACTTTAAATGGT
314 CTTATTACTCGCTTTAAATGGT
* * *
7240 TTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATATTTTAGATTTTTTGTTAAAATAGACTATAATT
1 TTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTATATTTTTTATTAAAATAGACTATAATT
* * * * ** * * *
7305 -AAGTGTTTGCCTAAGAAAACATGTAGAAAAACTCATTTATTTGAAAGAAAAGTCCATTCATAGT
66 GAA-TGTCTACCTAAG-AAATATGAAGAAAAAAGCATTAATTAGAAAGAAAAGTCCATTTATAGT
* * *
7369 -ATCCCATTCC-CTCAAAAGCCA-TGTTACAC-TCTTTAAATGGATTTATAATCTCATAATTGAT
129 CA-CCCATTCCTC-CAAAAG-CATTTTTACTCGT-TTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGAT
* *
7430 TTTAAGTTAAATTGTTTTTTATTTTTGATCAAAACAGACAATAATTGACTGTCTATCCAAGAAAC
190 TTTAAGTTAAATT-TTTTTTATTTTTTAT-AAAACAGACAATAATTGAATGTCTATCCAAGAAAC
* *
7495 ATGTAA-AAAAACACATTGATAGGCAAGAAAAGTCTATTTATAGCCTCCCATTCCATCAAAAGCC
253 ATG-AAGAAAAA-ACATTCATTGGCAAGAAAAGTCTATTTATAGCCTCCCATT-CATCAAAAGCC
*
7559 TTATTACTCGCTTTAAATAGT
315 TTATTACTCGCTTTAAATGGT
* *
7580 TTTATAATCTCATCATTGATTTTAAGTTGAATTTATTTATATTTTTCATTAAAATAGACTATAAT
1 TTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTT-TTTATATTTTTTATTAAAATAGACTATAAT
** * *
7645 TGAATGTCTACCTCAAGAAATATGAAGAAAAAAGCATTAATCCGTAAGAAAAGTCTATTTATAGT
65 TGAATGTCTACCT-AAGAAATATGAAGAAAAAAGCATTAATTAGAAAGAAAAGTCCATTTATAGT
* * * * * * * *
7710 CTCCCATTCCACCAAAAGTATTTTTGCTCGTTTTCAATAGTTTTATTATCTCATAATTAATTTTA
129 CACCCATTCCTCCAAAAGCATTTTTACTCGTTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTA
* * * * *
7775 AGTTGAATTTTTTTATATTTTTTTATAAAACAGACTATAATTGAATGTTTA-CCTTAAAAAACGT
194 AGTTAAATTTTTTT-TA-TTTTTTATAAAACAGACAATAATTGAATGTCTATCC--AAGAAACAT
* * *
7839 GAAGAAAAAAGCATTCATTGACGAGAAAAGTCTATTTATAGCCTTCCATTCATTCAAAAGCCTTA
255 GAAGAAAAAA-CATTCATTGGCAAGAAAAGTCTATTTATAGCCTCCCATTCA-TCAAAAGCCTTA
7904 TTACTCG-TTGTAAATGGT
318 TTACTCGCTT-TAAATGGT
* * * * * * *
7922 TTTATAATCTCATAAATAATTTTAAGTTGAATTTTTTACATTTTTGAATAAAATAGACAACAATT
1 TTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTATATTTTTTATTAAAATAGACTATAATT
* * * * * * *
7987 GAATGTCTATCTTGAGAAATGTGAAGAAAAAAGCATTCATTGGTAAGAAAAGTCTATTTATAGTC
66 GAATGTCTA-CCTAAGAAATATGAAGAAAAAAGCATTAATTAGAAAGAAAAGTCCATTTATAGTC
** * * *
8052 ACCCATTCCTTTAAAAGCATTATTAGTCGTTTTAAATGATTTTATAATCTCATAATTGATTTTAA
130 ACCCATTCCTCCAAAAGCATTTTTACTCGTTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAA
* ** * * * * * * * *
8117 GTTGAATATTTTTACATTTTTT-TAAACCAAACTATAATTGAATGTTTACCTCGAGAAACGTGTA
195 GTTAAAT-TTTTTTTATTTTTTATAAAACAGACAATAATTGAATGTCTATC-CAAGAAACATGAA
* ********* * * *
8181 GAAAAAGCCATTCATTGAG-AA-AAANNNNNNNNNNATAGTCACCCATTCCTTCAAAAGCCTTAT
258 GAAAAA-ACATTCATTG-GCAAGAAA-AGTCTATTTATAGCCTCCCATT-CATCAAAAGCCTTAT
* **
8244 TTCTCATTTTAAATGGT
319 TACTCGCTTTAAATGGT
* * * * *
8261 TTTATAAT-TCCATCATTGATTTTAACTTAAACTTTTTTACATTTTTTATTAAAATGGA-TAATA
1 TTTATAATCT-CATAATTGATTTTAAGTTGAA-TTTTTTATATTTTTTATTAAAATAGACT-ATA
* * * * * * * * *
8324 ATTAAATGTGTATCTCGAGAAATATAAAAAAAAAATGCATTCATTGGTAAGAAAAGTCCATTTAT
63 ATTGAATGTCTACCT-AAGAAATATGAAGAAAAAA-GCATTAATTAGAAAGAAAAGTCCATTTAT
8389 AGTCACCCATTCCT
126 AGTCACCCATTCCT
8403 NNNNNNNNNN
Statistics
Matches: 962, Mismatches: 157, Indels: 89
0.80 0.13 0.07
Matches are distributed among these distances:
338 4 0.00
339 116 0.12
340 246 0.26
341 431 0.45
342 164 0.17
343 1 0.00
ACGTcount: A:0.37, C:0.13, G:0.11, T:0.39
Consensus pattern (335 bp):
TTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTATATTTTTTATTAAAATAGACTATAATT
GAATGTCTACCTAAGAAATATGAAGAAAAAAGCATTAATTAGAAAGAAAAGTCCATTTATAGTCA
CCCATTCCTCCAAAAGCATTTTTACTCGTTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAG
TTAAATTTTTTTTATTTTTTATAAAACAGACAATAATTGAATGTCTATCCAAGAAACATGAAGAA
AAAACATTCATTGGCAAGAAAAGTCTATTTATAGCCTCCCATTCATCAAAAGCCTTATTACTCGC
TTTAAATGGT
Done.