Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: NW_018397324.1 Herrania umbratica cultivar Fairchild unplaced genomic scaffold, ASM216827v2 scaffold_1266.0, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Pmatch=0.80,Pindel=0.10
tuple sizes 0,4,5,7
tuple distances 0, 29, 159, 1000
Length: 64571
ACGTcount: A:0.32, C:0.12, G:0.13, T:0.28
Warning! 9551 characters in sequence are not A, C, G, or T
Found at i:439 original size:171 final size:171
Alignment explanation
Indices: 132--4384 Score: 3600
Period size: 171 Copynumber: 25.0 Consensus size: 171
122 AAGTAATTAG
* * * ** *
132 GCATGGATAACTATAAATGGACCTTTCTTGCCAATGAATGACTTTCTCTTCACATTTCTTGAGGC
1 GCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATGACTTTTTCTTCATGTTTCTTAAGGC
* * * * *
197 AG-TATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTCAAACAATTCAACCTAAAATGATTTATGA
66 AGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGA
* * * *
261 CATTATAAAATCATTTAACGCGTGTAATTAGGCTTTTGAAA
131 GATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTGAAA
* * * *
302 GTATGGGTAACTATAAATGGACCTTTGTTGCCAATGAATGACTTTTTCTTCATGTTTCTTAAGGT
1 GCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATGACTTTTTCTTCATGTTTCTTAAGGC
* *
367 AGACATTCAATTATAATATGTTTTAACTAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGA
66 AGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGA
** *
432 GATTATAAAATTATTTAAAGCAAGTAATTAGGCTTTTGAAA
131 GATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTGAAA
* * * * **
473 CCATAGGTAACTATAAATGGGCTTTTCTTGCCAATGAATGACTTTTT-TCTCAAGTTTCCCGAA-
1 GCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATGACTTTTTCT-TCATGTTT-CTTAAG
* * * * * **
536 ACAAACATTCAATTATAGTCTATTTTAACAAAAAATGTAAAAAAATTCAAAATAAAATCAATTAT
64 GCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTAT
* *
601 GAGATTATAAAACC-TTTAGAAGCGAGTAATAAGGC-TTTCAAA
129 GAGATTATAAAACCATTTA-AAGCGAGTAATTAGGCTTTTGAAA
* * * * * *
643 GGAATGGGTTACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAAT-AATAGCCTTTTTCTTCATGTTCCTTGAG
1 -GCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAAT-GACTTTTTCTTCATGTTTCTTAAG
* * * * *
707 GCAGACATTCAATTATAATCTACTTTCAA--AAAAATGTAAAAGAATTCAACTTAAAATTAATTA
64 GCAGACATTCAATTATAATCT-GTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTA
* * ** * * *
770 TGACATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAAGAAGACTTTCGAAT
128 TGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTGAAA
* * ** * * ** * * *
814 GCTTGAGTGGCTATAAATGAACTTTTCTTACTGATG-GTAGCCTTTTTCTTCATATTTCCTT-AG
1 GCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAAT-GACTTTTTCTTCATGTTT-CTTAAG
* * * ** *
877 GCAAATATTCAATTATAATCTTTTTTAAGTAAAAATATAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTAT
64 GCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTAT
* * * *
942 GATATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAATTAGGCTTTCG-GA
129 GAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTGAAA
* * ** * * *
984 GACATGGGTAACTGTAAATGGGCTTTTCTTGCCAATGAATGGTTTTTTCCTCATGTTTCTCAAGA
1 G-CATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATGACTTTTTCTTCATGTTTCTTAAGG
* * ** ** * **
1049 CAAACATTCCATTATAGGCTGTTTTAATAAAAAATGTAAAGAAATTCAAAATAAAATCAATTATG
65 CAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATG
* * * * * *
1114 GGATTATAAAACTATTGAAAGCGAGTAATAAGGATTTCGAAA
130 AGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTGAAA
* * * * * *
1156 GAATGGGTTACTAGAAATGGACTTTTCTTGCTAATGACA-G-CTTTTTTCTTCACGTTTCTTGAG
1 GCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGA-ATGAC-TTTTTCTTCATGTTTCTTAAG
* * * *
1219 GCAAACATTCAATTATAATCTGCTTTCACC-AAAATGTAAAATAATTCAA-CTCAAAATCAATTA
64 GCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCT-AAAATCAATTA
* * *
1282 TGACATTATAAAACCATTTAAAACGAGTAA-TACGGCTTTCG-AA
128 TGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTA-GGCTTTTGAAA
* * * * * * * *
1325 GCCTTAGGTGACTATAAATGGATTTTTTTTTGCCAATGACA--ACCTTTTTCTTCACGTTTCATG
1 G-CATGGGTAACTATAAATGGA-CTTTTCTTGCCAATGA-ATGA-CTTTTTCTTCATGTTTCTTA
** * * * * * *
1388 AGATAGATATTCAATTATAATCTTTTTTAACTAAAAATTTTAAAAAATTCAACATAAAATCAATT
62 AGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATT
** * ** * * * *
1453 GCGAGATTATAAAACTATTTAAAATGAGTAATAATGATTTTGAAG
127 ATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTGAAA
* ** * * *
1498 GCATTGGTTTCTATAAATGGACTTTTCTTGTCAATGAATGGCTTTTTGTTCATGTTT-TTCAAGG
1 GCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATGACTTTTTCTTCATGTTTCTT-AAGG
* *
1562 CAGATATTCAATTATAATCAGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATG
65 CAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATG
* *
1627 AGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAACTAGGCTTTTGAAA
130 AGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTGAAA
* * * * * * * *
1669 GCGTGAGTAACTATAAATGGACTTTTTTTGCAAATGAATGGCTTTTTCCTCAGGTTT-TTAGAGT
1 GCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATGACTTTTTCTTCATGTTTCTTA-AGG
* * * * * *
1733 CAAACATTCAATTATAGTTTGTTTTAA-TAAAAATGTAAAAAGATTCAACATAAAATCAATTATG
65 CAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATG
* * * *
1797 GGATTACAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGC-TTTCAAA
130 AGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTGAAA
* * * *
1838 GGAATGGGTGAA-TATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGATAGTG--TTTTTCATCA-CTTTCTTG
1 -GCATGGGT-AACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGA-A-TGACTTTTTCTTCATGTTTCTTA
* * * * *
1899 AGGCAGACATTCAATTATAATCTGCTTTCACAAAAAATATAAAAAAATTCAA-CTCAAAATCAGT
62 AGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCT-AAAATCAAT
** * * *
1963 TATGAGATTATAAGTCCATTTAAAGTGAGTAATTAGGC-CTTCAAA
126 TATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTGAAA
* * * * * ** * * *
2008 GGCATGAGTGATTATAATTGGACTTTTCTTACCAATGAATGGTTTTTTCTTCACGTTT-TCCATG
1 -GCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATGACTTTTTCTTCATGTTTCT-TAAG
* * * * * * *
2072 CCAAACATTCAATTATAATATGTTTTATCCAATAATGTAAAAACAATTCAACCCATAATCAATTA
64 GCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAA-AATTCAACCTAAAATCAATTA
* * * * * * *
2137 TGAGATTACAAAGCCATTCAAAGC-ACGTAAGTAGGATTTTTAAG
128 TGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGA-GTAATTAGGCTTTTGAAA
* * * * * **
2181 GTATGGTTAACTATAAATGGACTTTT-TTAGCCAAAGAATGATTTTTTCTTCATGTCTCCCAAGG
1 GCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTT-GCCAATGAATGACTTTTTCTTCATGTTTCTTAAGG
* * * * * *
2245 CAGACATTCAATAATAATATATTTTAACCAAAAATGTAGAGAAATTCATCCTAAAATCAATTATG
65 CAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATG
* * * * ** *
2310 ACATTATAAAACTATTTAAAGCAAGTAATGACTCTTTTGAAG
130 AGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTGAAA
* * * * *
2352 GCATGGGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCTAATG-ATAGCCTTTTTCTTTACGTTTCTTGAA-
1 GCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAAT-GACTTTTTCTTCATGTTTCTT-AAG
** * * * *
2415 GCATTCATTCAATTATAATCTTTTTTAACCAAAAATATAAAACAATTTAACCTAAAATCAATTAT
64 GCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTAT
* ** *
2480 GATATTATAAAATTATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTGAAG
129 GAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTGAAA
* * * * * * * *
2523 GCATGGATAACTATAAATGGACCTTTCTTGCCAATGAAAGCCTTTTTCATCATGTCTCCTAAGGT
1 GCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATGACTTTTTCTTCATGTTTCTTAAGGC
* * *
2588 AGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAA--TATAAAAACTCAACCTAAAATCAATTACGA
66 AGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGA
* * * * *
2651 GGTTATAAAACTATTTAAAGTGAGTAATTATGATTTT-AAA
131 GATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTGAAA
* * * *
2691 GGCATGGGTAACTATAAATGGATTTTTCTTACCAATGAAT-AGCTTTTTCTTTATGTTTCCTAAG
1 -GCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATGA-CTTTTTCTTCATGTTTCTTAAG
* ** * * *
2755 ACAGACATTCAATTATAATCAATTTTAACCAAAAATGCAAAACAATTCAACCTAAAATCAATAAT
64 GCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTAT
* * *
2820 GAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAATTAGGCTTTTGGAG
129 GAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTGAAA
* * * * *
2863 GCATGGGTAACTATAAATGG-CTTTTCTTACCAATGAATGGCTTTTTTCGT-AGGTTT-TTCGAG
1 GCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATGAC-TTTTTCTTCATGTTTCTT-AAG
* * * * * * ** *
2925 ACAGAGATTCAATTATATTCTATTTTAACAAAAAAT-AAAAAAAATTCAAAATAAAATCAATTAC
64 GCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTAT
* * * * *
2989 GGGATTATAAAACCATTGAAAGCAAGTAATAAGGCTTTTAAAA
129 GAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTGAAA
** ** * * * * *
3032 AAATGAATGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGGCA-GCCTTTTTCTTCAGGTTTCTTGAGG
1 GCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAAT-GAATGACTTTTTCTTCATGTTTCTTAAGG
* * * * * * *
3096 CAGATATTCAATTATAATATGGTTTCACCAAACATATAAAAAAATTCGACCTAAAATCAATTATG
65 CAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATG
* * *
3161 ACATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTTGAAG
130 AGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTGAAA
* * * * *
3203 GCTTGAGTGACTATAAATGGACCTTTT-TTGCCAATGACA--ATCTTTTTCTTCATATTT-TCCA
1 GCATGGGTAACTATAAATGGA-CTTTTCTTGCCAATGA-ATGA-CTTTTTCTTCATGTTTCT-TA
* ** * * *
3264 AGGTAGATGTTCAATTATAATCTATTTTAAGCAAAAATTTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATT
62 AGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATT
*
3329 ACGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTT-AAA
127 ATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTGAAA
* * * * * * * * * *
3373 GGCTTGAGTGACTAGAAATAGAATTTCCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCTTTATATTTCTTAAGG
1 -GCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATGACTTTTTCTTCATGTTTCTTAAGG
* * * * * * *
3438 TAAATATTCAAATATAATCTATTTT-ACCAAAAATGT-AAAAAATTCAACTTAAAATTAATTATG
65 CAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATG
* * * * * *
3501 AGATTATAAAACCATTTAAAGTGCGTAATAAGG-ATTTCAACG
130 AGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTGAA-A
* * * * * *
3543 GAATTGGTGACTATAGAA-GGACTTTGCTTGCCAATGAATG-C-CTTT-TTCA----TCCTAAGG
1 GCATGGGTAACTATA-AATGGACTTTTCTTGCCAATGAATGACTTTTTCTTCATGTTTCTTAAGG
* * * * ** * *
3600 AAAACAATCAATTATAATCTATTTTAACCAAAAACATAAAAAACTTCAAGCTAAAATCAATTATG
65 CAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATG
* * * *** * *
3665 AGATTATAAAACTATTTAAAGTGAATAATTATAATTTTTAAG
130 AGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTGAAA
* * * * * * * *** *
3707 GCATGGGTAACTATGAATGGGCTTTTCTTACTAATGAATGGCTTTTTCCTCAAG-TTCCGGAGAC
1 GCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATGACTTTTTCTTCATGTTTCTTAAGGC
* * * **
3771 AGACATTCAATTATAGTCTGTTTTAACAAAAAAAGTAAAAAAATTCAAAAATAAAATCAATTATG
66 AGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTC-AACCTAAAATCAATTATG
* * * * * *
3836 AAATTATAAAACCATTGAAAGTGAATAATAAGGC-TTTCAAA
130 AGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTGAAA
* * * * * *
3877 GGAATGGTTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATTACA-GCCTTTTTCTTCCTGTTTCTTAAG
1 -GCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGA-ATGACTTTTTCTTCATGTTTCTTAAG
* * * * * * *
3941 GCAGGCATTCAATTATAATCTGCTTTCACCAAACATGTAACAAAATTTAACCCTAAAATTAATTA
64 GCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAA-CCTAAAATCAATTA
* * * * *
4006 TGACATTATAAAACTATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCGAAG
128 TGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTGAAA
* * * ** *
4050 GCTTGGGTGATTATAAATGGACTTTTCTTGCTGATGACA--ACCTTTTTCTTCATGTTTCCTAAG
1 GCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGA-ATGA-CTTTTTCTTCATGTTTCTTAAG
* * * * *
4113 GCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAAGCAGAAATGTAACAACATTCAATCTAAAATCAATTAT
64 GCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTAT
* * * *
4178 GAAAATT-TAAAACCGTTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCGAAG
129 G-AGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTGAAA
* * * * * * * * * * *
4221 GCTTGAGTGACTACAAATGAAATTTTCTTACCAATGAATGGC-TTTTCTTCACGTTTCTTGATGC
1 GCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATGACTTTTTCTTCATGTTTCTTAAGGC
* * * * * * * * ** * *
4285 AAAAATTCAATCACAATCTGTTATAGCTAAAAATATAAAAACCTT-AACATAAAATCAATTATAA
66 AGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGA
* *
4349 GATTATAAAACCATTTAAAGCGACTAATAAGGCTTT
131 GATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTT
4385 CAATTATAAT
Statistics
Matches: 3303, Mismatches: 675, Indels: 211
0.79 0.16 0.05
Matches are distributed among these distances:
162 28 0.01
163 11 0.00
164 80 0.02
165 6 0.00
166 6 0.00
167 6 0.00
168 12 0.00
169 396 0.12
170 716 0.22
171 1619 0.49
172 410 0.12
173 13 0.00
ACGTcount: A:0.38, C:0.14, G:0.13, T:0.35
Consensus pattern (171 bp):
GCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATGACTTTTTCTTCATGTTTCTTAAGGC
AGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGA
GATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTGAAA
Found at i:2200 original size:683 final size:678
Alignment explanation
Indices: 74--28009 Score: 9459
Period size: 682 Copynumber: 40.8 Consensus size: 678
64 AATATGTTTT
** * *
74 AAAATTCAACCTAAAATCAATTATGTCATTGTAAAATCATTT-AA--AAGTAAGTA--A--TT--
1 AAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAA-TAGGATTTTGA
* * * ** *
130 AGGCATGGATAACTATAAATGGACCTTTCTTGCCAATGAATGACTTTCTCTTCACATTTCTTGAG
65 AGGCATGG-TAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCTTCATGTTT-TTAAG
* * * * *
195 GCAG-TATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTCAAACAATTCAACCTAAAATGATTTAT
128 GCAGATATTCAATTATAATC-ATTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTAT
* * * ** *
259 GACATTATAAAATCATTTAACGCGTGTAATTAGGCTTTTGAAAGTATGGGTAACTATAAATGGAC
192 GAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAATTAGGCTTTTGAAAGCATGGGTAACTATAAATGGAC
* * * * * ** *
324 CTTTGTTGCCAATGAATGACTTTTTCTTCATGTTTCTTA-AGGTAGACATTCAATTATAATATGT
257 TTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCCTCAGGTTTCTTAGAGACAGACATTCAATTATAATTTGT
* **
388 TTTAACTAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAATTATTTAAAGC
322 TTTAACTAAAAATGTAAAAAAATTCAACATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGC
* * * ** * * *
453 AAGTAATTAGGCTTTTGAAA-CCATAGGT-AACTATAAATGGGCTTTTCTTGCCAATGA-ATGAC
387 GAGTAATAAGGC-TTTCAAAGGAATGGGTGAA-TATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGACA-GTC
* ** * * * **
515 TTTTT-TCTCAAGTTTCCCGAA-ACAAACATTCAATTATAGTCTATTTTAACAAAAAATGTAAAA
449 TTTTTCT-TC-ACTTT-CTTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGCTTTAAC-AAAAATGTAAAA
** *
578 AAATTCAA-AATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACC-TTTAGAAGCGAGTAATAAGGCTTTCA
510 AAATTCAACTCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTA-AAGCGAGTAATTAGGCTTTCA
* * * * * * *
641 AAGGAATGGGTTACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAAT-AATAGCCTTTTTCTTCA-TGTTCCTT
574 AAGGCATGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAAT-GGCTTTTTCTTCAGTTTTCCAT
* *
704 GAGGCAGACATTCAATTATAATCTACTTTCAA--AAAAATGTAA
638 GA--CAAACATTCAATTATAATCTA-TTTTAACCAAAAATGTAA
* * * * * *
746 AAGAATTCAACTTAAAATTAATTATGACATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAAGAAGACTTTCG
1 AA-AATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAATAGGA-TTTTG
* * ** * * ** * * *
811 AATGCTTGAGTGGCTATAAATGAACTTTTCTTACTGATG-GTAGCCTTTTTCTTCATATTTCCTT
64 AAGGCATG-GTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAAT-GGCTTTTTCTTCATGTTT--TT
* * ** *
875 -AGGCAAATATTCAATTATAATCTTTTTTAAGTAAAAATATAAAAAAATTCAACCTAAAATCAAT
125 AAGGCAGATATTCAATTATAATC-ATTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAAT
* * * *
939 TATGATATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAATTAGGCTTTCG-GAGACATGGGTAACTGTAAAT
189 TATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAATTAGGCTTTTGAAAG-CATGGGTAACTATAAAT
* * * * * * **
1003 GGGCTTTTCTTGCCAATGAATGGTTTTTTCCTCATGTTTCTCA-AGACAAACATTCCATTATAGG
253 GGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCCTCAGGTTTCTTAGAGACAGACATTCAATTATAAT
* * * * * *
1067 CTGTTTTAA-TAAAAAATGTAAAGAAATTCAAAATAAAATCAATTATGGGATTATAAAACTATTG
318 TTGTTTTAACT-AAAAATGTAAAAAAATTCAACATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTT
* * * * *
1131 AAAGCGAGTAATAAGGATTTCGAAA-GAATGGGTTACTAGAAATGGACTTTTCTTGCTAATGACA
382 AAAGCGAGTAATAAGGCTTTC-AAAGGAATGGGTGAATATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGACA
* * * *
1195 G-CTTTTTTCTTCACGTTTCTTGAGGCAAACATTCAATTATAATCTGCTTTCACCAAAATGTAAA
446 GTC-TTTTTCTTCAC-TTTCTTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGCTTTAACAAAAATGTAAA
* * *
1259 ATAATTCAACTC-AAAATCAATTATGACATTATAAAACCATTTAAAACGAGTAA-TACGGCTTTC
509 AAAATTCAACTCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTA-GGCTTTC
* * * * * **
1322 GAA-GCCTTAGGTGACTATAAATGGATTTTTTTTTGCCAATGACA-ACCTTTTTCTTCACG-TTT
573 AAAGGCATGA-GTGACTATAAATGGA-CTTTTCTTGCCAATGA-ATGGCTTTTTCTTCA-GTTTT
* * * * *
1384 -CATGAGATAGATATTCAATTATAATCTTTTTTAACTAAAAATTTTAA
634 CCATGACA-A-ACATTCAATTATAATCTATTTTAACCAAAAA-TGTAA
* ** * *** *
1431 AAAATTCAACATAAAATCAATTGCGAGATTATAAAACTATTTAAAATGAGTAATAATGATTTTGA
1 AAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAAT-AGGATTTTGA
** * *
1496 AGGCATTGGTTTCTATAAATGGACTTTTCTTGTCAATGAATGGCTTTTTGTTCATGTTTTTCAAG
65 AGGCA-TGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCTTCATGTTTTT-AAG
1561 GCAGATATTCAATTATAATCAGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTAT
128 GCAGATATTCAATTATAATCA-TTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTAT
* * *
1626 GAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAACTAGGCTTTTGAAAGCGTGAGTAACTATAAATGGAC
192 GAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAATTAGGCTTTTGAAAGCATGGGTAACTATAAATGGAC
* * * * *
1691 TTTTTTTGCAAATGAATGGCTTTTTCCTCAGGTTT-TTAGAGTCAAACATTCAATTATAGTTTGT
257 TTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCCTCAGGTTTCTTAGAGACAGACATTCAATTATAATTTGT
* * *
1755 TTTAA-TAAAAATGTAAAAAGATTCAACATAAAATCAATTATGGGATTACAAAACCATTTAAAGC
322 TTTAACTAAAAATGTAAAAAAATTCAACATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGC
* *
1819 GAGTAATAAGGCTTTCAAAGGAATGGGTGAATATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGATAGTGTTT
387 GAGTAATAAGGCTTTCAAAGGAATGGGTGAATATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGACAGTCTTT
* * * *
1884 TTCATCACTTTCTTGAGGCAGACATTCAATTATAATCTGCTTTCACAAAAAATATAAAAAAATTC
452 TTCTTCACTTTCTTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGCTTTAAC-AAAAATGTAAAAAAATTC
* ** * *
1949 AACTC-AAAATCAGTTATGAGATTATAAGTCCATTTAAAGTGAGTAATTAGGCCTTCAAAGGCAT
516 AACTCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCAAAGGCAT
* * * * *
2013 GAGTGATTATAATTGGACTTTTCTTACCAATGAATGGTTTTTTCTTCACGTTTTCCATGCCAAAC
581 GAGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCTTCA-GTTTTCCATGACAAAC
* * * *
2078 ATTCAATTATAATATGTTTTATCCAATAATGTAAA
645 ATTCAATTATAATCTATTTTAACCAAAAATGT-AA
* * * * * * *
2113 AACAATTCAACCCATAATCAATTATGAGATTACAAAGCCATTCAAAGCACGTAAGTAGGATTTTT
1 AA-AATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAA-TAGGATTTTG
* * ** ***
2178 AAGGTATGGTTAACTATAAATGGACTTTT-TTAGCCAAAGAATGATTTTTTCTTCATGTCTCCCA
64 AAGGCATGG-TAACTATAAATGGACTTTTCTT-GCCAATGAATGGCTTTTTCTTCATGT-TTTTA
* * * * * *
2242 AGGCAGACATTCAATAATAATATATTTTAACCAAAAATGTAGAGAAATTCATCCTAAAATCAATT
126 AGGCAGATATTCAATTATAAT-CATTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATT
* * * ** * *
2307 ATGACATTATAAAACTATTTAAAGCAAGTAATGACTCTTTTGAAGGCATGGGTGACTATAAATGG
190 ATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAATTAGGCTTTTGAAAGCATGGGTAACTATAAATGG
* * * * * **
2372 ACTTTTCTTGCTAATG-ATAGCCTTTTTCTTTACGTTTCTT-GA-AGCATTCATTCAATTATAAT
255 ACTTTTCTTGCCAATGAAT-GGCTTTTTCCTCAGGTTTCTTAGAGA-CAGACATTCAATTATAAT
* * * * * * **
2434 CTT-TTTTAACCAAAAATATAAAACAATTTAACCTAAAATCAATTATGATATTATAAAATTATTT
318 -TTGTTTTAACTAAAAATGTAAAAAAATTCAACATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTT
* ** * * * *
2498 AAAGCGAGTAATTAGGCTTTTGAAGGCATGGAT-AACTATAAATGGACCTTTCTTGCCAATGAAA
382 AAAGCGAGTAATAAGGCTTTCAAAGGAATGGGTGAA-TATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGACA
* * * * * *
2562 GCCTTTTTCATCA-TGTCTCCTAAGGTAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAA--TAT
446 GTCTTTTTCTTCACT-T-TCTTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGCTTTAA-CAAAAATGTAA
* * * * * * * *
2624 AAAAACTCAAC-CTAAAATCAATTACGAGGTTATAAAACTATTTAAAGTGAGTAATTATGATTTT
508 AAAAATTCAACTCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTC
* * * * * *
2688 AAAGGCATGGGTAACTATAAATGGATTTTTCTTACCAATGAATAGCTTTTTCTTTA-TGTTTCCT
573 AAAGGCATGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCTTCAGT-TTTCC-
* * * *
2752 AAGACAGACATTCAATTATAATCAATTTTAACCAAAAATGCAA
636 ATGACAAACATTCAATTATAATCTATTTTAACCAAAAATGTAA
* *
2795 AACAATTCAACCTAAAATCAATAATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAATTAGGCTTTTG
1 AA-AATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAA-TAGGATTTTG
* * * * *
2860 GAGGCATGGGTAACTATAAATGG-CTTTTCTTACCAATGAATGGCTTTTTTCGT-AGGTTTTTCG
64 AAGGCAT-GGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATGGC-TTTTTCTTCATGTTTTT-A
* * * * * **
2923 AGACAGAGATTCAATTATATTCTATTTTAACAAAAAAT-AAAAAAAATTCAAAATAAAATCAATT
126 AGGCAGATATTCAATTATAATC-ATTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATT
* * * * * ** ** *
2987 ACGGGATTATAAAACCATTGAAAGCAAGTAATAAGGCTTTTAAAAAAATGAATGACTATAAATGG
190 ATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAATTAGGCTTTTGAAAGCATGGGTAACTATAAATGG
* * * * * *
3052 ACTTTTCTTGCCAATGGCA-GCCTTTTTCTTCAGGTTTCTT-GAGGCAGATATTCAATTATAATA
255 ACTTTTCTTGCCAAT-GAATGGCTTTTTCCTCAGGTTTCTTAGAGACAGACATTCAATTATAATT
* * * * * * * *
3115 TGGTTTCACCAAACATATAAAAAAATTCGACCTAAAATCAATTATGACATTATAAAACCATTTAA
319 TGTTTTAACTAAAAATGTAAAAAAATTCAACATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAA
** ** * * *
3180 AGCGAGTAATAAGGCTTTTGAAGGCTTGAGTGACTATAAATGGACCTTTT-TTGCCAATGACAAT
384 AGCGAGTAATAAGGCTTTCAAAGGAATGGGTGAATATAAATGGA-CTTTTCTTGCCAATGACAGT
* ** ** *
3244 CTTTTTCTTCA-TATT-TTCCAAGGTAGATGTTCAATTATAATCTATTTTAAGCAAAAATTTAAA
448 CTTTTTCTTCACT-TTCTT--AAGGCAGACATTCAATTATAATCTGCTTTAA-CAAAAATGTAAA
* *
3307 AAAATTCAAC-CTAAAATCAATTACGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTA
509 AAAATTCAACTCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCA
* * * * * * *
3371 AAGGCTTGAGTGACTAGAAATAGAATTTCCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCTTTA-TATTTCTTA
574 AAGGCATGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCTTCAGT-TTTC-CA
* ** * *
3435 AGGTAAATATTCAAATATAATCTATTTT-ACCAAAAATGTAA
637 TGACAAACATTCAATTATAATCTATTTTAACCAAAAATGTAA
* * *** *
3476 AAAATTCAACTTAAAATTAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGTGCGTAATAAGGA-TTTCA
1 AAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAAT-AGGATTTTGA
* * * * **
3540 ACGGAATTGGTGACTATAGAA-GGACTTTGCTTGCCAATGAAT-GC-CTTT-TTCA---TCCTAA
65 A-GGCA-TGGTAACTATA-AATGGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCTTCATGTTTTTAA
* * * * ** * *
3598 GGAAAACAATCAATTATAATCTATTTTAACCAAAAACATAAAAAACTTCAAGCTAAAATCAATTA
127 GGCAGATATTCAATTATAATC-ATTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTA
* * *** * * *
3663 TGAGATTATAAAACTATTTAAAGTGAA-TAATTATAATTTTTAAGGCATGGGTAACTATGAATGG
191 TGAGATTATAAAACCATTTAAAG-CAAGTAATTAGGCTTTTGAAAGCATGGGTAACTATAAATGG
* * * * ** * *
3727 GCTTTTCTTACTAATGAATGGCTTTTTCCTCAAG-TTC-CGGAGACAGACATTCAATTATAGTCT
255 ACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCCTCAGGTTTCTTAGAGACAGACATTCAATTATAATTT
* * * * *
3790 GTTTTAACAAAAAAAGTAAAAAAATTCAAAAATAAAATCAATTATGAAATTATAAAACCATTGAA
320 GTTTTAACTAAAAATGTAAAAAAATTC-AACATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAA
* * * * * *
3855 AGTGAATAATAAGGCTTTCAAAGGAATGGTTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATTACAGCC
384 AGCGAGTAATAAGGCTTTCAAAGGAATGGGTGAATATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGACAGTC
* * * *
3920 TTTTTCTTC-CTGTTTCTTAAGGCAGGCATTCAATTATAATCTGCTTTCACCAAACATGTAACAA
449 TTTTTCTTCAC--TTTCTTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGCTTT-AACAAAAATGTAAAAA
* * * * * * *
3984 AATTTAACCCTAAAATTAATTATGACATTATAAAACTATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCGAA
511 AATTCAACTCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCAAA
* * * ** ** *
4049 GGCTTGGGTGATTATAAATGGACTTTTCTTGCTGATGACA-ACCTTTTTCTTCA-TGTTTCCTAA
576 GGCATGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGA-ATGGCTTTTTCTTCAGT-TTTCC-AT
* * * * *
4112 GGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAAGCAGAAATGTAA
638 GACAAACATTCAATTATAATCTATTTTAACCAAAAATGTAA
* * * * * * *
4153 CAACATTCAATCTAAAATCAATTATGAAAATT-TAAAACCGTTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTC
1 -AAAATTCAACCTAAAATCAATTATG-AGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAA-TAGGATTTT
* * * * * * * *
4217 GAAGGCTTGAGTGACTACAAATGAAATTTTCTTACCAATGAATGGC-TTTTCTTCACGTTTCTTG
63 GAAGGCATG-GTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCTTCATGTTT-TTA
* * * * * * * * ** *
4281 ATGCAAAAATTCAATCACAATC-TGTTATAGCTAAAAATATAAAAACCTT-AACATAAAATCAAT
126 AGGCAGATATTCAATTATAATCAT-TT-TAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAAT
* * * * * * ** * *
4344 TATAAGATTATAAAACCATTTAAAGCGACTAATAAGGCTTTCAATTATAATCAAT-TTTAACCAA
189 TATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAATTAGGCTTT---TGA-AAGC-ATGGGTAACTAT
* * ** ** * * * * *
4408 AAATGTAAAAAAATTCAACTT-AAAATCAATTATGATATTATAAAACCATTTAAAGCTAGTAATT
249 AAATG-----GACTT-TTCTTGCCAATGAA-T-GGCT-TT-T---TCC---T-CAG---GT--TT
* ** * * * * ** * ** ***
4472 AGGCTTTTAGAGGCATG--GGT-AACTATAAATGGTCTTT-TCTTACCAATG--AATAGCTTTTT
292 ---C--TTAGAGACA-GACATTCAATTATAATTTGT-TTTAAC-TAAAAATGTAAAAAAATTCAA
* * ** *** * ** * *** ***
4531 CCTTAGGTTTTTTGAGATAGACATTCAATTATAGTCTATTTTCATAAAAAATGTAA-AAAAATTC
349 CATAAAATCAATT---AT-GAGATT--A-TA-AAACCA-TTT-A-AAGCGA-GTAATAAGGCTT-
* ** * * * * * * *
4595 AACATAAAACCAATTATGGGATTATAAAACTATTGAAAGTGAGTAATAATGCTTTCAAAGGA-AT
401 ----TCAAA-GGA--ATGGG----T-GAA-TA-T-AAA-TG-G-ACT-TTTCTTGCCAATGACA-
* * *** ** * * * * ** * *
4659 GGGTAATAATAAATAGACATTTCTTGCCAATGACAGCCTTTC-TTTATGTTTCTTGATGTAGACA
446 --GT-CT-TTTTCTTCAC-TTTCTT---AA-GGCAGACATTCAATTAT-AATC-TGCTTTA-ACA
** **** * * ** * ****
4723 TTCAAT-TATAATTTGTTTTC-AC-CAAAAATGTAAAAAATTCA-ACTTA-AANNNNNNNNNNAG
499 -AAAATGTA-AA--AAAATTCAACTCTAAAA--TCAATTA-TGAGA-TTATAA------AACCA-
* * ** * * * * * * **
4783 ATTATAA--AACCATTTCAAGCGAGTAATTAGGCCTTCGAAGGCATGGGTGATTATAATTAAACT
549 TTTA-AAGCGAGTAATT--A-----------GGCTTTCAAAGGCATGAGTGACTATAAATGGACT
* * * * *
4846 TTTCTTGCTAATGAATGGCTTTCTT-TTCATGTTTCCCAAGACAGATATTCAATTATAATCTATT
600 TTTCTTGCCAATGAATGGCTTT-TTCTTCA-GTTTTCCATGACAAACATTCAATTATAATCTATT
**
4910 TTAAGTAAAAATGTAAA
663 TTAACCAAAAATGT-AA
* * * *
4927 AAAATTAAATCC-AAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAGCGAGTAATTAAGATTTTG
1 AAAATTCAA-CCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAA-TAGGATTTTG
* * * * ** * **
4991 AAAGTATGGGTAATTATAAATAGACTTTTCTAACCAATGAATGGCTTTTTCTTCGTGTTTCCCAA
64 AAGGCAT-GGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCTTCATGTTT-TTAA
* * ** * * *
5056 GGCAGACATTCAATAATAAATTGTTTTAATCGAAAATGTAGAAAAATTCAACCTAAAATCAATTA
127 GGCAGATATTCAATTAT-AATCATTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTA
* * * * * * * *
5121 TGACATTATTAAACTATTTAAAGCGAGTAATAAGGC-TTTCAAAGGCATAGGTGACTATAAATGG
191 TGAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAATTAGGCTTTTGAAA-GCATGGGTAACTATAAATGG
* * ** * * * *
5185 ACTTTTCTTGCCAATGACA--GCATTTTTCTTTACATTTGTT-GAGGCGGTCATTCAATTATAAT
255 ACTTTTCTTGCCAATGA-ATGGC-TTTTTCCTCAGGTTTCTTAGAGACAGACATTCAATTATAAT
* * ********** * * *
5247 CTGTTTTAACCAAAAATNNNNNNNNNNTCAACCTAAAATCAATTATGACATTATAAAATCATTTA
318 TTGTTTTAACTAAAAATGTAAAAAAATTCAACATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTA
* * * * * *
5312 AAGTGAGTAATAAAGCTTTCAAAGGCATGGGTGACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATGATAG-
383 AAGCGAGTAATAAGGCTTTCAAAGGAATGGGTGAATATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGACAGT
* * * *
5376 CATTTTTCTTTACGTTTCTTGAGGCAGTCATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGT-AAA
448 C-TTTTTCTTCAC-TTTCTTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGCTTTAA-CAAAAATGTAAAA
********** * * *
5440 NNNNNNNNNNCTAAAATCAATTATGATATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGTTTTTAA
510 AAATTCAACTCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCAA
* * * * **
5505 AGACATGGGTAACTATAAATAGACCGTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCTTCA-TGTTTCC-TG
575 AGGCATGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCTTCAGT-TTTCCATG
* * * * *
5568 AGGTAGACATTCAATTATAATATGTTTTAACAAAAAATGTAAA
639 A--CAAACATTCAATTATAATCTATTTTAACCAAAAATGT-AA
* * * * * *
5611 AAAAATCAACGTAAAATCAATTACGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTATGATTTTAA
1 AAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAA-TAGGATTTTGA
* * * * * * *
5676 AGGCATGGGTAACTATAAATGAATTTTTCTTGTCAATAAATGGCTTTCTCTTCACGTTTTCCAAG
65 AGGCAT-GGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCTTCATGTTTT-TAAG
* * * * *
5741 GTAGATATTAAATTATAATTAGTTTTAACCAAAAATATAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATAAT
128 GCAGATATTCAATTATAATCA-TTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTAT
* * * * *
5806 GAGATTATAAAACCATTTAAAACAAGTAATTAGGCTTTTGGAGGCATAGGTAACTATAAATGGGC
192 GAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAATTAGGCTTTTGAAAGCATGGGTAACTATAAATGGAC
* * * * * * *
5871 TTTTCTTGCCAATGAATGACTTTGTCCTCAAGTTTCCT-GAGACAAACATTCAATTATAGTCTGT
257 TTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCCTCAGGTTTCTTAGAGACAGACATTCAATTATAATTTGT
* * * * * * * *
5935 TTTAACAAAAAATATAAAAAAACTCAAAATAAAATTAATTATGGGATTATAAAACTATTAAAAGC
322 TTTAACTAAAAATGTAAAAAAATTCAACATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGC
* * * * *** * * *
6000 GAGTAAGAAGGCTTTCAAAAGAATGGGTCAGTATAAATATCCTTTTTTTTGCCAATGATAGCCTT
387 GAGTAATAAGGCTTTCAAAGGAATGGGTGAATATAAATGGAC-TTTTCTTGCCAATGACAGTCTT
* * * * * * *
6065 TTTCTTCATGTTTATTGAGGTAGGCATTCAATTATAATCTGCTTTCACCAAAAATGTAAAACAAT
451 TTTCTTCA-CTTTCTTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGCTTT-AACAAAAATGTAAAAAAAT
* * ** **
6130 TAAACT-TAAAATCAATTATGATG-TTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAAACTTTTGAAGG
514 TCAACTCTAAAATCAATTATGA-GATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCAAAGG
* * * * ** * * *
6193 CTTGGGTAACTATAAATGGACTTTTTTTATCAATG-ATAGCCTTTTTCTTCACG-TTTCCTAAGG
578 CATGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAAT-GGCTTTTTCTTCA-GTTTTCC-ATGA
* * * * ** *
6256 TAGACATTCAATTATAATATGTTTTAAGTAGAAATGTAA
640 CAAACATTCAATTATAATCTATTTTAACCAAAAATGTAA
* * * * * * **
6295 AAAAGCTCAACCTAAATTCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAGCGAGTGATTAGGCTTTCA
1 AAAA-TTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGT-AATAGGATTTTG
* * * * * *
6360 AAGGCTTGAGTGACTAGAAATGGAATTTTCTTGCTAATAAATGGC-TTTTCTTCATGTTTCTTAA
64 AAGGCATG-GTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCTTCATGTTT-TTAA
* * * *** *
6424 GACAGGTATTCAATCATAATC-TGTTTAGGTAAAAATATAAAAAAATT-AACCTAAAATCAATTA
127 GGCAGATATTCAATTATAATCAT-TTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTA
* * * * * * * * * *
6487 CGAGATTAT-AAACTCATTTAAATCGAGTAATTAGGCTTTCGAAGGCTTGAGTGACTAGAAATAG
191 TGAGATTATAAAAC-CATTTAAAGCAAGTAATTAGGCTTTTGAAAGCATGGGTAACTATAAATGG
* * * * ** * * *
6551 ACTTTTCTTGCCAATGAATAGC-TTTTCTTAACGTTTCTT-GAGGTAGATATTCAATCATAATCT
255 ACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCCTCAGGTTTCTTAGAGACAGACATTCAATTATAATTT
* * * * *
6614 GTTTTAGCCAAAAATG--AAAAAATTCAACATAATATCAATTATAAAATTATAAAACCATTTAAA
320 GTTTTAACTAAAAATGTAAAAAAATTCAACATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAA
* *** * * * * * *
6677 GCGAGTAATAAGGCTTTTAAAGGAATCACTGACTATAAATGGACATTTCTTGCTAATAATAGCCT
385 GCGAGTAATAAGGCTTTCAAAGGAATGGGTGAATATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGACAGTCT
* * * ** *
6742 TTTTCTTCATATTTCTTAAGGTAGATATTCAATTATAATCTATTTTCACCAAAAATGTAAAAAAA
450 TTTTCTTCA-CTTTCTTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGCTTT-AACAAAAATGTAAAAAAA
* * * * * * * *
6807 TTCAACT-TAAACTCAGTTATTAAATTATAAAACTATTTAAAGCGAGTAACTAGGCCTTCGAAGG
513 TTCAACTCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCAAAGG
* * * * * * * * *
6871 CATGGGTGATTATAATTAGACTTTTCTTGCTAATGAATGGCTTTTACTACATGTTTCCCAAT-AT
578 CATGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCTTCA-GTTTTCC-ATGAC
* * * *
6935 AGACATTCAATTATAATCTGTTTTAA-TAAAAATATAA
641 AAACATTCAATTATAATCTATTTTAACCAAAAATGTAA
* * * * * * *
6972 ACCAGTTCAACCCAAAATCAATTATGAGATTCTAAAACTATTTAAAGCGAGTGATTAGGATTTTG
1 A-AAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGT-AATAGGATTTTG
** * * *
7037 AAGAAATGGGTAACGATAAATGGACTTTTCTAGCCAATGAATGGCTTTTTCTTCATGTTTCCTAA
64 AAGGCAT-GGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCTTCATGTTT-TTAA
* * ** ** * *
7102 GACAGACATTCAAGAATAATTTGTTTTAACCAAAAATGTAGAAAAATTTAACCTAAAATCAATTA
127 GGCAGATATTCAATTATAA-TCATTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTA
* * ** * * * * **
7167 TGACATTATAAAACCA-TAAAAGGTGAGTAATAAGGC-TTTCAAAGGTATAGGTGGCTATAAATG
191 TGAGATTATAAAACCATTTAAA-GCAAGTAATTAGGCTTTTGAAA-GCATGGGTAACTATAAATG
* * * * *
7230 GGCTTTTCTTGCTAAT-AATAGACTTTTTCTTCATGTTTCTTATG-G-CAGACATTCAATTATAA
254 GACTTTTCTTGCCAATGAAT-GGCTTTTTCCTCAGGTTTCTTA-GAGACAGACATTCAATTATAA
* * * * *
7292 TTTATTTTCAC-AATAAAT-AAAAAAAATTCACCATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCAGT
317 TTTGTTTTAACTAA-AAATGTAAAAAAATTCAACATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATT
* * * * **
7355 TAAAGCGAGTAATAAAGCTTTTAAAGGCATGGGTGACTATAAATACACTTTTCTTGCCAATGACA
381 TAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCAAAGGAATGGGTGAATATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGACA
* * * * **
7420 GAC-TTTTCTTCATATTTCTTGAGGCAGTCATTCAATTATAATCTATTTTAACAAAAAATGTAAA
446 GTCTTTTTCTTCA-CTTTCTTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGCTTTAAC-AAAAATGTAAA
* * * * *
7484 AACAA-TCAACT-TAAAATTAATTACGACATTATAAAACTATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTT
509 AA-AATTCAACTCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTC
* * * ** *
7547 AAAGGCATGAGTAACTACAAATGGA-TATTTCTTACCAATGAATGGCTTTTTCTTCACATTTCTT
573 AAAGGCATGAGTGACTATAAATGGACT-TTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCTTCAGTTTTC-C
* * ** * * *
7611 AAGGCAGTCACTCAATTATAATCTTTTTTAACTAAAAATGTAGA
636 ATGACAAACATTCAATTATAATCTATTTTAACCAAAAATGTA-A
* * * *
7655 AAAATTCAACCTAAAA-CGAATTATGACATTATAAAACTATTT-AAGCCCAGTAATTAGGCTTTT
1 AAAATTCAACCTAAAATC-AATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAG-CAAGTAA-TAGGATTTT
* * * * * * *
7718 GAAGGCATAGGTAACTGTAAATGGGCCTTTCTTACTAATGAATGGCTTTTTCTTCATGTTTCCTG
63 GAAGGCAT-GGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCTTCATGTTT-TTA
** * *
7783 AGATAGACATTCAATTATAATCTATTTTAACTAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATT
126 AGGCAGATATTCAATTATAATC-ATTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATT
*** * * * * * *
7848 ATGAGATTATAAAACCATTTAAAGTGTGTAATAAGGCTTTCGAAGGTACGGGTGACTATAAATGG
190 ATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAATTAGGCTTTTGAAAGCATGGGTAACTATAAATGG
* * ** ** * *
7913 ACTTTTCTTGCCAATGAAT--CATTGTTTCTTCATGTTTCCCA-AGGTAGACATTCAACTATAAC
255 ACTTTTCTTGCCAATGAATGGC-TT-TTTCCTCAGGTTTCTTAGAGACAGACATTCAATTATAAT
* * * * * * * * * *
7975 CTATTTTAACCAAAAATATAAAAGAATACAACATAAGATCACTTA-CAGGATTATAAAACTATTT
318 TTGTTTTAACTAAAAATGTAAAAAAATTCAACATAAAATCAATTATGA-GATTATAAAACCATTT
* * * * * * * * ** *
8039 AAAGTGAGTAATTATG-ATGCTGAAGGCATGGGT-AACTATAAATAGACTTTTCTTATCAAT-AA
382 AAAGCGAGTAATAAGGCTTTC-AAAGGAATGGGTGAA-TATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAC
* ** * * * *
8101 ATGGCTTTTTCTTCA-TGCCTGCTAAGGCAGACATTCAATTATATTCAGTTTTAACCAAAAATAT
445 A-GTCTTTTTCTTCACTTTCT--TAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGCTTTAA-CAAAAATGT
* * *
8165 AAAAAAATTC-AGTCAAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAATTAGG-TG
506 AAAAAAATTCAACTCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCT-
** * * * * *
8228 TTTGAAGACATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGTCAATGAATGACTTTTT-TCTCAAGTTT
570 TTCAAAGGCATGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCT-TC-AGTTT
* ** * * * * * *
8292 CTCGA-GGTAGACATTCAATTGTAGTATGTTTTAA--AAAGATGTAAA
633 -TCCATGACAAACATTCAATTATAATCTATTTTAACCAAAAATGT-AA
* ********** * * * *
8337 AAAATTCAACATAAAATCAATTANNNNNNNNNNAAATCATTTAAAGCGAGTAATAAGG-CTTTCA
1 AAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAAT-AGGATTTTGA
* * * ******** * *
8401 AAGCAATGGGTGATTATAAATGGACTTTT-TTNNNNNNNNNNA-GCCTTTTTCTTTATG--TTT-
65 AGGC-AT-GGTAACTATAAATGGACTTTTCTT--GCCAATGAATGGCTTTTTCTTCATGTTTTTA
* * * * *
8461 ---C---T-TTC--------T-GTTTTCACTAAAAATGTAAACAAATTAAACCTAAAATCAATTA
126 AGGCAGATATTCAATTATAATCATTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTA
********** * * * * * * ** * *
8510 TGAGATTANNNNNNNNNNTAAATCGAGTAATTAGGCTTTCGAAGGCTTGAGTGGCTAGAAATGAA
191 TGAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAATTAGGCTTTTGAAAGCATGGGTAACTATAAATGGA
* * ********** *
8575 CTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCTTCATGTTT-NNNNNNNNNNATATTCAATTATAATTTG
256 CTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCCTCAGGTTTCTTAGAGACAGACATTCAATTATAATTTG
* * * * * * *
8639 TTTTAGCCAAAAATG-CAAAAAATTCAACTTAAAATTAATTATGAGATTATAAAACTATTTAATG
321 TTTTAACTAAAAATGTAAAAAAATTCAACATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAG
* * * * * * *
8703 CGTGTAATAAGGCTTTCAAAGGCATGAGT-AACTATAAATGGACTTTACTTGTCAAT-AAATGTT
386 CGAGTAATAAGGCTTTCAAAGGAATGGGTGAA-TATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGACA-GTC
** * * * **
8766 TTTTTCTTCACGTTTCCCAAGGTAAACATTCAATTATAATCTGCTTTCACCAAAAGCGTAAAAAA
449 TTTTTCTTCAC-TTTCTTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGCTTT-AACAAAAATGTAAAAAA
* * * * * **
8831 GTTTAAC-CCAAAATCAATTATAAGATTATAAAACCATTTAAAGTGAGTAATTATAAATATACTT
512 ATTCAACTCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGT-A--AT---TAGGC--
* * *
8895 TTCTAGCCGATAAGTGACTTTTTCTTTGGGTTTCAAAAGTATGGGTAATTATAAATGGACCTTTC
569 TT-T---C-A-AAG-G-------C-AT--G-------AG--T--G--ACTATAAATGGACTTTTC
* * * * * *
8960 TTGCTAATGAATGGCTTTTTCTTCAAGTTTTCTAAG-CTAGACATGCAATTATAATTTATTTTAA
604 TTGCCAATGAATGGCTTTTTCTTC-AGTTTTCCATGAC-AAACATTCAATTATAATCTATTTTAA
9024 CCAAAAATGTAA
667 CCAAAAATGTAA
* ** * * **
9036 AACAATTTAATATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCA
1 AA-AATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAAT-AGGATTTTG
* * * * * * *
9101 AATGCATGGGTGACTATAAATGTACTTTTCTTGCCAATGACA-GTCTTTTCCTTCACGTTTCTTG
64 AAGGCAT-GGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGA-ATGGCTTTTTCTTCATGTTT-TTA
* *
9165 AGGCAG-TCATTCAATTATAATCTATTTTAACCAAAAATATGAAAAAATTCAACCTAAAATCAAT
126 AGGCAGAT-ATTCAATTATAATC-ATTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAAT
* * * ** * * *
9229 TATGACATTATAAAACCATTTTAAGCGAGTAATTAGGCTTCCGAAGGCATGGGTAACTATGAATA
189 TATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAATTAGGCTTTTGAAAGCATGGGTAACTATAAATG
* * * ** ** * * **
9294 GACTTTTCTAGTCAATGAATAGCTTTTT-CTTTGTGTTTCCCA-AGACAGATATTTAACAATAAT
254 GACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCCTCAG-GTTTCTTAGAGACAGACATTCAATTATAAT
* * * * * * * *
9357 TTATTTTAACGAAAAATATAGAAAAATTTAACTTAAAATTAATTATGAGATTACAAAACCATTTA
318 TTGTTTTAACTAAAAATGTAAAAAAATTCAACATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTA
* ** * * * *
9422 AAGCGCGTAATAAGGCTTTCAAAGGCTTAGGTGACTATGAAA-GGACTTTTCTTGCCGATGATAG
383 AAGCGAGTAATAAGGCTTTCAAAGGAATGGGTGAATAT-AAATGGACTTTTCTTGCCAATGACAG
* * * * * * * * *
9486 TCTTTTTTTTTACGTTTCTCT-AGGCAAAAAATGAATTATAATCTGTTTTCACCAAAAACGTAAA
447 TCTTTTTCTTCAC-TTTCT-TAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGCTTT-AACAAAAATGTAAA
* * ** * * * * *
9550 ACAATTCAAC-CTAAAATCAGTTACAACATTATAAAACCATTTGAAA-CCAGTAATTACGATTTT
509 AAAATTCAACTCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTT-AAAGCGAGTAATTAGGCTTTC
* * * * * *
9613 GAAGGCATGGGTAACTATAAACGGACTTTTGTATAG--AATGAATGACTTTTTCTTCA-TGTTTC
573 AAAGGCATGAGTGACTATAAATGGACTTTTCT-T-GCCAATGAATGGCTTTTTCTTCAGT-TTTC
* * * * * *
9675 TCAAGGCAGACATTCAATTATATTATATTTTTAA--AAAAAAGTAA
635 -CATGACAAACATTCAATTATAATCTA-TTTTAACCAAAAATGTAA
* * ** *
9719 AAACATTTAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGTGAGTAATTA-GACCTTT
1 AAA-ATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAA-TAGGA-TTTT
* * * * ** * *
9783 GAAGGCTTGAGTGAGTAGAAATTAACTTTTCTTGCCAATGAATGGATTTTTCTTCACGTTTTTTA
63 GAAGGCATG-GTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCTTCATG-TTTTTA
* ** * * *
9848 AGACAGATATTCAATTATAAT-ATGTTTTAGTCAAAAATAT-AAAAAATT-AACTTAAAATTAAT
126 AGGCAGATATTCAATTATAATCA--TTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAAT
** *** * * *
9910 TAT-AGGATTATAAAATTATTTAAAGTGCGTAATAAGGATTTT-AAAGGCATGGGTGACTATAAA
189 TATGA-GATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAATTAGGCTTTTGAAA-GCATGGGTAACTATAAA
* * * * **
9973 TAGACTTTTCTTGCCAACGAAT-GCTTTTTTCTTCATGTTTCCCATG-G-CAGACATTCAATTAT
252 TGGACTTTTCTTGCCAATGAATGGC-TTTTTCCTCAGGTTTCTTA-GAGACAGACATTCAATTAT
* * * ** * * * *
10035 AATCTATTTTCACTAAAAACATAAAAAAATTTAACATAAAATTAATTACGAGATTATAAGACCAT
315 AATTTGTTTTAACTAAAAATGTAAAAAAATTCAACATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCAT
* * * * * ** *
10100 TTAAAGTGAGCAATTACGATTTTGAAGGAATGGGT-AACTATAAATGGATTTTTCTT--C-AT--
380 TTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCAAAGGAATGGGTGAA-TATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGA
* * *
10159 --G------T-TT--C---C-TAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAAAGTAG
444 CAGTCTTTTTCTTCACTTTCTTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGCTTTAA-CAAAAATGTAA
* *
10209 AAAAATTCAAC-CTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGTGAGTAATTAGGCTTTT
508 AAAAATTCAACTCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTC
* * * * * * ** *
10273 GAAGGCTTGAGTGACTAGAAATAGAATTTTTCTT-TCAATGAATTACTTTTTCTTCACGTTTCCC
573 AAAGGCATGAGTGACTATAAAT-GGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCTTCA-GTTTTCC
* ** *
10337 AATG-CAAACATTCAATTATAATCTGTTTTAACTTAAAACGTAA
636 -ATGACAAACATTCAATTATAATCTATTTTAACCAAAAATGTAA
* * *
10380 AAAAGTTTAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAGAGCGAGTAATTAGGATTTTG
1 AAAA-TTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAA-TAGGATTTTG
* * * * * ***
10445 AAGGCATCGGTAACTACAAATGCACTTTTCTAGCCAATGAATAGCTTTTTCTTCTTGTTCCCCAA
64 AAGGCAT-GGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCTTCATGTT-TTTAA
* * * ** * *
10510 GGCAGACATTCTATAATAATTTGTTTTAACCAAAAATATAAAAACATTCAACCTAAAATCAATTA
127 GGCAGATATTCAATTATAA-TCATTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTA
* * * * * * * * * *
10575 TTACATTATAAAACTAATTAAAACGAGTAATTAGGCATTTGAAGGCTTTGGTAACTATAAATGGA
191 TGAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAATTAGGCTTTTGAAAGCATGGGTAACTATAAATGGA
* * * * * * ** *
10640 CCTTCCTTACCAATGAATGGCTTTTTCTTTAGGTTTCCTA-AGGTAGACATTCAATTATAATATG
256 CTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCCTCAGGTTTCTTAGAGACAGACATTCAATTATAATTTG
* * * * * * *
10704 TATTAACCAAAAATGTAAAACAATTCAATATACAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAN
321 TTTTAACTAAAAATGTAAAAAAATTCAACATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAG
********* * * * *
10769 NNNNNNNNNAGGCTTTCAAAGGCATGGGTGACTATAAATGTA-TATTTCTTGCCAATGACAGCCT
386 CGAGTAATAAGGCTTTCAAAGGAATGGGTGAATATAAATGGACT-TTTCTTGCCAATGACAGTCT
* * * * * * *
10833 TTTCCTTCACATTTCTTGATGCAGTCATTCAATTATAATTTGTTTTAACAAAAAATGTAAAACAA
450 TTTTCTTCAC-TTTCTTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGCTTTAAC-AAAAATGTAAAAAAA
* * * **
10898 TTCAAC-CTAAAATCAATTATGACATTATAAAACTATTTTAAA-TGAGTAATTAGGCTTTTGAAG
513 TTCAACTCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCA-TTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCAAAG
** * * * * * **
10961 ATATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTAGCCAATGAATGGCTTTTTCTTCAAGTTTCCCAAGGT
577 GCATGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCTTC-AGTTTTCCATGAC
* * * *
11026 AAACATTCAATAATAATTTGTTTTAA-CAAAAATATAGA
641 AAACATTCAATTATAATCTATTTTAACCAAAAATGTA-A
* * ** *
11064 AAAATTCAACCAAAAATCAATTATAAGATTATAAAAATATTTAAAGCGAGTAATTA-GACTTTTG
1 AAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAA-TAGGA-TTTTG
* * *
11128 AAGGCTTGAGTGACTAGAAATGGACTTTTCCTT--C-----AT-G--TTTTC--C--------AA
64 AAGGCATG-GTAACTATAAATGGACTTTT-CTTGCCAATGAATGGCTTTTTCTTCATGTTTTTAA
* * * ** * * * * * *
11173 GGAAGACATTCAATAATAATTTGTTTTAACCCAAAATATAGAAAAATTCAATCAAAAATTAATTA
127 GGCAGATATTCAATTATAA-TCATTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTA
********** * * * *
11238 TGAGATTATAAANNNNNNNNNNGCGAGTAATTAGGCTTTTGAAGGCGTGGGTAACTAGAAATGGA
191 TGAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAATTAGGCTTTTGAAAGCATGGGTAACTATAAATGGA
* * * * * * *
11303 CCTTTCTTACTAATGAATGGCTTTTTCTTCATGTTTCTT-GA-AGTAGACATTCAATTATAGTTT
256 CTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCCTCAGGTTTCTTAGAGA-CAGACATTCAATTATAATTT
* ************ * * *
11366 GTTTTAACCAAANNNNNNNNNNNNTTCAACCTAAAATCAATTATGACATTATAAAACCATTTTAA
320 GTTTTAACTAAAAATGTAAAAAAATTCAACATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAA
* * * * * * * *
11431 GCGAGTAATTAGGTTTTTAAAGGCACGGAT-AACTATAAATGGACCTATCTTGCCAATGA-ATGG
385 GCGAGTAATAAGGCTTTCAAAGGAATGGGTGAA-TATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGACA--G
* * ** * * * *
11494 T-TTTTTCTTCATGTTTCCTAAGATAAACATTCAATTGTAATCCGTTTTAACAAAAAATGT-AAA
447 TCTTTTTCTTCA-CTTTCTTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGCTTTAAC-AAAAATGTAAAA
* * * * *
11557 AAATTTAAC-CTAAAATCAATTATTAGATTATAAAACCATTTAAAGCGATTAATAAGGCTTTCGA
510 AAATTCAACTCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCAA
* * * * * **
11621 AGGTATGGGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGTCAATG-ATAGCCTTGTTCTTCATGTTTCTTAA
575 AGGCATGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAAT-GGCTTTTTCTTCA-GTTT-TCCA
* * * * *
11685 GGA-AACCATTCAATTGTAA--TATGTTTAATCTAAAAATATAA
637 TGACAAACATTCAATTATAATCTAT-TTTAA-CCAAAAATGTAA
* * * * * *
11726 AAAATTC-ACCTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAATCATTTAAAGCGATTAATAAGTTTTTCA
1 AAAATTCAACC-TAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAATAGGATTTTGA
* * * * * *
11790 AGGACAAGGGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGTCAATG-ATAGCTTTTTTCTTCACGTTTTTTG
65 AGG-C-ATGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATGGC-TTTTTCTTCATG-TTTTTA
* * ** * * ****** **
11854 AGGTAGACATTCAA-T-GGA-C-TTTTCTAGCAAATGAATG-ACTTTTTCTTCTTGTTTTCCTAG
126 AGGCAGATATTCAATTATAATCATTTT-AACCAAA--AATGTA-AAAAAATTC-----AACCTA-
* * * *
11914 GCAGATATTCAATAATAATTTGTTTTAACTAGAAATATGAAAA-CA-TTCAACCTAAAATCAATT
181 --A-A-A-TCAAT--T-A--TG--------AG-ATTAT-AAAACCATTTAAAGC--AAGT-AATT
* * * * * * * *** * ** ** **
11977 ATGACATTGTAAAACCAAT---TAAAGTGAGTAATTAGG-CATTTAAAGGC-ATGGGTAAC-AAT
223 A-GGC-TTTTGAAAGC-ATGGGT-AACT-A-TAAAT-GGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTT
*** * ** * * * * * ** *** *
12036 GAATGGACCTTCCTTACCA-A-TGA-A-T-AGGTTTTTCTTTAGGTTTCTTGGGGTAAACAT-TC
281 TCCT-CAGGTTTCTTA-GAGACAGACATTCA-ATTATAATTT--G-TT-TT-AACTAAAAATGT-
** ** *
12095 AATTATAATCTGTTTTA-ATGAAAA--ATATAAAAAAATTCAACACAAAATCAATTATGAGATTA
337 AA--A-AA--AATTCAACAT-AAAATCA-AT-TA-----------------------TGAGATTA
* * ** * * * * *
12157 GAAAACCATTTGAAGTTAGTAATAAGGCTTTCAAATGCATGGGTGACTGTAAATAGACTTTTCTT
371 TAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCAAAGGAATGGGTGAATATAAATGGACTTTTCTT
* * * * * * * * * **
12222 GTCAATGACAGCCTTTTGCTTCATATTTTTTGAGGTAGTCATTCAATTATAAACTATTTTAACAA
436 GCCAATGACAGTCTTTTTCTTCA-CTTTCTTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGCTTTAACAA
* * * * ** * * * *
12287 AAA-ATACAAAAAGTTTAAC-CTAAAATTAATTATGTCATTATTAAACCATTTTAAGCAAGTAAC
500 AAATGTA-AAAAAATTCAACTCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAAT
* * * * *
12350 TAGGCTTTTC-AGGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTAGCCAATGAATGGTTTTTTCTTC
564 TAGGC-TTTCAAAGGCATGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCTTC
* * * * * *
12414 ATGTTTCCCA-AAGCAGACATTCAATAATAATTTATTTTAACCAAAAATATAA
628 A-GTTTTCCATGA-CAAACATTCAATTATAATCTATTTTAACCAAAAATGTAA
* * * * * * * *
12466 GAAAATCCAATCAAAAATCAATGATGTGATTATAAATA-TATTTAAAG--TG-AGTA--A--TT-
1 -AAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAA-ACCATTTAAAGCAAGTAATAGGATTTTG
* ** * * * *
12522 -AGGC-T--T---T-TAAA-AG-CTTGAC-TGACTA-GAAATGGACTTTTTCTTCGTGTTTTCCA
64 AAGGCATGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATG-AATGG-CTTTTTCTTCATGTTTT-TA
* * ** ** * * * * *
12575 AGGCAGACATTCAATAATAATGTGTTTTAATAAAAAAAT-TAGAGAAATTCAATCAAAAATTAAT
126 AGGCAGATATTCAATTATAAT-CATTTTAA-CCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAAT
* *** * *
12639 TATGAGATTATAAAACTATTTAAAGTGCGTAATTAGGCTTTTGAAGGTGA-GGGTAACTATAAAT
189 TATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAATTAGGCTTTTGAAAG-CATGGGTAACTATAAAT
* * ** * * * *
12703 GGACCTTCCTTGCCAATGAATTACTTTTTCTTCATGTTT-TCTAAAG-TAGACATTCAATTATAA
253 GGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCCTCAGGTTTCT-TAGAGACAGACATTCAATTATAA
* * * * * *
12766 TCTGTTTTAACTAAAAATCTAAAAAACATTTAGCCTAAAACCAATTATGAGATTATAAAACCATT
317 TTTGTTTTAACTAAAAATGTAAAAAA-ATTCAACATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATT
* ** * ** * * * * * *
12831 TAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTGAATGCTTGAGTGACTAGAAATGGA-TTTTTTTACCAAT-AAA
381 TAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCAAAGGAATGGGTGAATATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGACA
* * * * * ** * *
12894 TGGCTTTTTCTTCAAATTTCTTGAGGCAGATATTCAATTATAACCTATTTTAATTATAAATGT-A
446 -GTCTTTTTCTTC-ACTTTCTTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGCTTTAA-CAAAAATGTAA
* * * * *
12958 AAAAATTCAACT-TAAAATTAATTATGAGATTATAAAAACATTTAAAACGCGTAATAAGGCTTTC
508 AAAAATTCAACTCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTC
** * * ** *
13022 AAAGATATGGGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAACGAATACCTTTTTCTTCAAG-TTT-CT
573 AAAGGCATGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCTTC-AGTTTTCCA
* ** * **
13085 TGAGGAAGACATTCAATTATAATCTGCTTTCACCAAAAACATAAA
637 TGA-CAA-ACATTCAATTATAATCTATTTTAACCAAAAATGT-AA
* * * **
13130 AAAATTTAACATAAAATCAATTAT-AGGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAAAATTTTG
1 AAAATTCAACCTAAAATCAATTATGA-GATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAA-TAGGATTTTG
* * * * *
13194 AAGGCATGGATAACTATAAATGGATTTTTCTTACCAATGAATAGATTTTTCTTCATGTTTCCTAA
64 AAGGCATGG-TAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCTTCATGTTT-TTAA
* * * ** * *
13259 GGCAGACATTCAATTATAATCTATTTTAACCAAAAAAGT-AAAAGATTCAATGTAAATTAAATTA
127 GGCAGATATTCAATTATAATC-ATTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTA
* * * * * * * **
13323 TGAGATTATAAAGCTATTTAAAGCGACTAATTAGGATTTTGAAGGCAAGGGTAACTATAAACAGA
191 TGAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAATTAGGCTTTTGAAAGCATGGGTAACTATAAATGGA
* * * ** ** * * *
13388 CGTTTT-TAGTCAATGAATGGCTTTTTCTTCATATTTCCCA-AGTCAGACATTCAATAATAATTG
256 C-TTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCCTCAGGTTTCTTAGAGACAGACATTCAATTATAATTT
* * * *
13451 GTTTTAACAAAAAAAGTAGAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAA
320 GTTTTAACTAAAAATGTAAAAAAATTCAACATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAA
* * ** * * * * * * * *
13516 GCGAGTAATTAGGCTTT-AGAATGCTTGGGTGACTAGAAATAGATTTTTCTTACTAATGAAAGGC
385 GCGAGTAATAAGGCTTTCA-AAGGAATGGGTGAATATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGACAGTC
* ** * *
13580 TTTTTCTTCACATTTCTTGAA-GCAGATATTCAATTATAATCTATTTTAGCCAAAAACGTAAAAA
449 TTTTTCTTCAC-TTTCTT-AAGGCAGACATTCAATTATAATCTGCTTTA-ACAAAAATGTAAAAA
* * * * * * * * * *
13644 ACTT-AA-TTTAAAATTAATTATGAGATGATAAAAACACTTAAAGTGCA-TAATAAAGCTTTCAG
511 AATTCAACTCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCG-AGTAATTAGGCTTTCAA
** * * * *** ** * * *
13706 ACACATGGGTGACTATAAATGAACTTTTCTTGCTAGCAAATACCTTTTTTTTCACGTTTCTCAAG
575 AGGCATGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCTTCA-GTTT-TCCAT
* * * * *
13771 GA-AGATATTCAATAATAATCTATTTTCACCAAAAACGT-A
638 GACAAACATTCAATTATAATCTATTTTAACCAAAAATGTAA
* * * * * *
13810 AAAATATCTAACATAAAATTAATTACGAGATTATAAAACCATTTAAAACGAGTAATTACGATTTT
1 AAAAT-TC-AACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAA-TAGGATTTT
* * ** * **
13875 GAAGACATGGGTAACTATACATGGTGTTTTCTTGCCAATGAATGGATTTTTCTTCATGTTTCCCA
63 GAAGGCAT-GGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCTTCATGTTT-TTA
* * * * *
13940 AGGCAGACATTAAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAATATTCAACCTAAAATAAATT
126 AGGCAGATATTCAATTATAATC-ATTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATT
* * * * *
14005 ATGAGATTATAAAGCCATTTAAA--ATGGCTAATTAGGATTTTG-AAGCCGTGGCTAACTATAAA
190 ATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCA-AG-TAATTAGGCTTTTGAAAG-CATGGGTAACTATAAA
* * * *** * * *
14067 TAGACTTTT-TCAGCCAACGAATTATTTTTTCTTC-GTGTTT-TT-GAAGGCAGACATTCAATAA
252 TGGACTTTTCT-TGCCAATGAATGGCTTTTTCCTCAG-GTTTCTTAG-AGACAGACATTCAATTA
* * * *
14128 TAA--TGATTTTAACAAAAAATGTAGAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAATC
314 TAATTTG-TTTTAACTAAAAATGTAAAAAAATTCAACATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACC
* * * * * *
14191 ATTTAAAGCAAGTAATAAGGCTTTCGATA-GTATGGGTGACTATAAATAGACTTTTCTTACCAAT
378 ATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTC-AAAGGAATGGGTGAATATAAATGGACTTTTCTTGCCAAT
* * * * * * * * *
14255 GATAGCCTTTTTCTTCACATTTCTTCAGGTAGTCATCCGATTATAATTTGTTTTAACCAAAAATG
442 GACAGTCTTTTTCTTCAC-TTTCTTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGCTTTAA-CAAAAATG
*
14320 TAAAAAAATTCAAC-CTAAAATCAATTATGACATTATAAAACTATTTTTTTGAAAGACCATTATA
505 TAAAAAAATTCAACTCTAAAATCAATTATG--A-GAT-----TA------T-AAA-ACCATT-TA
* * ** * * * *
14384 AAACTATTTAAAGTAAGTAATTACGCTTTTGAAGGCATGGGTAACTTTAAATGGACATTTCTTGC
553 AAGC--------G--AGTAATTAGGCTTTCAAAGGCATGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGC
** * ** *
14449 CAATGAATGATTTTTTCTTCACG-TTT-CTTGAAGCAGTCATTCAATTATAATATATTTT-ACCA
608 CAATGAATGGCTTTTTCTTCA-GTTTTCCATG-A-CAAACATTCAATTATAATCTATTTTAACCA
*
14511 AAAATATAAA
670 AAAATGT-AA
* * * *
14521 AAAATTCAACCTAAAATCAATTATAACATTATAAAACTATTTTAAAG-GAGTAATTA-GACTTTT
1 AAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCA-TTTAAAGCAAGTAA-TAGGA-TTTT
* * * *
14584 GAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACCTTTCTTGCAAATGAATGGC-TTTTCTTCATATTTCCTA
63 GAAGGCAT-GGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCTTCATGTTT--TT
* * * * *
14648 AAGTC-GACATTCAATTATAATCCGTTTTAACTAAATATGTAAAAAAATTCAACCTAAAAAT-AA
125 AAGGCAGATATTCAATTATAAT-CATTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCT-AAAATCAA
* * * * * * *
14711 TTATGAGATTATAATACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCGAATGCTTGGGTGACTAGAAAT
188 TTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAATTAGGCTTTTGAAAGCATGGGTAACTATAAAT
* * * * * * * * *
14776 GAACTTTTTTTTTACAAATGAATGGCTTTTTCTTTATGTTTCTTA-AGGCAGATATTCAATTATA
253 GGAC--TTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCCTCAGGTTTCTTAGAGACAGACATTCAATTATA
* * * * ** * *
14840 ATCTGTTTTAGCAAAAAATGT--AAAAATTCAACTTAAAATTGATTATGAAATTATAAAAACATT
316 ATTTGTTTTAACTAAAAATGTAAAAAAATTCAACATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATT
* * * * * * * *
14903 TAAAGCGTGTAATAAGGCCTTCAAAGGCATGGGTGACTATAAGTGAACTTTTCCTG-CAAAGA-A
381 TAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCAAAGGAATGGGTGAATATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGACA
* * * ** * *
14966 ATGCTTTTTTCTTCA-TATTTTCTAAGGAAGACATTCAATTATAATCTATTTTCACCAAAAACGT
446 GT-C-TTTTTCTTCACT-TTCT-TAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGCTTT-AACAAAAATGT
* * * * * * * * *
15030 AAATAAA-TCTAAC-ATAAAATTAGTTATGAGATTATAAAACCTTTTATAGCGAGTAACTACGAT
506 AAAAAAATTC-AACTCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCT
** * * * * * *
15093 TTTGAAGGC-TTAGGTAACTATAAATGGATTTTTCTTGCCAATGAATAGATTTTTCCTCATGTTT
570 TTCAAAGGCATGA-GTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCTTCA-GTTT
* * * * * * * *
15157 CCCAAGGCAGACATTCAATTATAATTTGTTTTAAGCAAAAGTGTAA
633 TCCATGACAAACATTCAATTATAATCTATTTTAACCAAAAATGTAA
* * * * *
15203 AAAGATTTAACGTAAAATAAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGACTAATTAGGATTTTG
1 AAA-ATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAA-TAGGATTTTG
* * * ** * * *
15268 AAGGCATGGGTAACTATAAATAGTCTTTTCTAGCCAATGAACAGCTTTTTCTTTAAGTTTTCCAA
64 AAGGCAT-GGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCTTCATGTTTT-TAA
* * * * ** * * *
15333 GTCAGACAATCAATAATAATTGGTTTTAACAAAAAATGTAAAAATATTCAATCTAAAATCAATTA
127 GGCAGATATTCAATTATAA-TCATTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTA
* * * * * * **
15398 TGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAGTAAGGCTTTCGAAGGCATGGGTGACTATAAATAAA
191 TGAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAATTAGGCTTTTGAAAGCATGGGTAACTATAAATGGA
* * ** ** *
15463 CTTTTCTTGCCAATGACA-GCCTTTTTCTTCACATTTCTTTAG-G-CATTCATTCGATTATAATT
256 CTTTTCTTGCCAATGA-ATGGCTTTTTCCTCAGGTTTC-TTAGAGACAGACATTCAATTATAATT
* * * *
15525 TGTTTTAA-TCAAAAAAGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGACATTATAAAACTATTTA
319 TGTTTTAACT-AAAAATGTAAAAAAATTCAACATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTA
* * * * * * * * *
15589 AAGCAAGTAATTAA-GCTTTTAAAGGCATGGGT-AGCTTTGAATGGACCTTTATTGCTAATGA-A
383 AAGCGAGTAA-TAAGGCTTTCAAAGGAATGGGTGA-ATATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGACA
* * * * * * * * **
15651 TGGCTTTTTCTTCATATTTCCTGAGGTAAATATTCAATTATAATCTGTTTTAAGCAAAAA-AAAA
446 -GTCTTTTTCTTCA-CTTTCTTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGCTTTAA-CAAAAATGTAA
* *
15715 AAACAATTCAAC-CTAAAATCGATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTACGCTTT
508 AAA-AATTCAACTCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTT
* * * * * * *
15779 CGAATGCTTGGGTGACTAGAAATGGACTTTTCTTGCCAACGAAAGGCTTTTTCTTCACG-TTT-C
572 CAAAGGCATGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCTTCA-GTTTTCC
* * * * *
15842 TTGAGGTAGATATTCAATTATAATCTATTTTAGCCAAAAATGTAA
636 ATGA--CAAACATTCAATTATAATCTATTTTAACCAAAAATGTAA
* * * * ** * **
15887 AACATTCAACTTAAAATTAATTATGAGATTATAAAAACATTTAAAGCGCGTAGA-AGGCTTTCAA
1 AAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTA-ATAGGATTTTGA
* * * * ** ** * * *
15951 AAGCATGAGTGACTATAAATTGACTTTTCTTACCACCGAATAACTTTTTATTCACGTTTCTCAAG
65 AGGCATG-GTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCTTCATGTTT-TTAAG
* * * * ** * * *
16016 G-TGCACATTCAATTATAATCTATTTTCACCCAAAACATAAAAAAATTTAACATAAAATTAATTA
128 GCAG-ATATTCAATTATAATC-ATTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTA
* * * * * *
16080 CGAGATTATAAAACTATTTAAAACGAGTAATTACGATTTT-AAACGCATGGGTAACTATAAATGG
191 TGAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAATTAGGCTTTTGAAA-GCATGGGTAACTATAAATGG
* * * * * ** * * *
16144 ACTTTTCTTGCCAATGAATAGATTTCTCTTCATGTTTCCCA-ATATAGACATTCAATTATAATAT
255 ACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCCTCAGGTTTCTTAGAGACAGACATTCAATTATAATTT
* * ** *
16208 GTTTTAA-TCAAAAGTGT-AAAAAATTTAATTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAGCCATTTAA
320 GTTTTAACT-AAAAATGTAAAAAAATTCAACATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAA
* * * * ** * * ** *
16271 AGTGACTAATTAGGATTTTGAAGGCATGGGT-AACTACAAATATACTTTTCTAGCCAATGA-ATG
384 AGCGAGTAATAAGGCTTTCAAAGGAATGGGTGAA-TATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGACA-G
** * * * * *
16334 TCTTTTTCTTCTTGTTTCTCAAGGCAGACATTCAATAATAAT-TGGTTTTCACTAAAAATAT-AA
447 TCTTTTTCTTC-ACTTTCTTAAGGCAGACATTCAATTATAATCT-GCTTTAAC-AAAAATGTAAA
* *
16397 AAAATTCAACATC--AAATCAATTATAAGATTATAAAACCATTTAAAGTGAGTAATTAGGCTTTC
509 AAAATTCAAC-TCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTC
* * * * *
16460 GAATGCTTGAGTGACTATAAATGGACTTTT-TCTG-CATATGAGTGGCTTTTTCTTCACGTTTTT
573 AAAGGCATGAGTGACTATAAATGGACTTTTCT-TGCCA-ATGAATGGCTTTTTCTTCA-GTTTTC
* * * * * *
16523 TAT-AGTAGATATTCAATTATAATCTGTTTTAGCCAAAAATGTAA
635 CATGA-CAAACATTCAATTATAATCTATTTTAACCAAAAATGTAA
* ** * * * **
16567 AAAATTCAACTTAAAATTGATTATGAGATTATAAAAACATTTAAAGCGCA-TAATAAGGCTTTCA
1 AAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGC-AAGTAAT-AGGATTTTG
* * * * * ** **
16631 AAGGCATGGGTGACTATAAATGGACTTTT-TTACCAACGAATGCCTTTTTCTTTACCTTTCTCGA
64 AAGGCAT-GGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCTTCATGTTT-TTAA
* * * * *** * *
16695 GGAAGACATTCAATTATAATCTATTTTCACAAAAAACAAAAAAAAATTTAACATAAAATCAATTA
127 GGCAGATATTCAATTATAATC-ATTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTA
* * * * * *
16760 CGGGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTACGATTTT-AAACGCATGGGTAACTATAGATGG
191 TGAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAATTAGGCTTTTGAAA-GCATGGGTAACTATAAATGG
* * * * * * ** * * * * *
16824 ACTTTTCTTGTCAATGAATAGATTTCTCTTCATGTTTCCCAAAAGTGTAAAAAAATTCAACCTA-
255 ACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCCTCAGGTTT--C-TTAGAG-ACAGACATTCAA-TTAT
* *** * * * * ** * * * * * ***
16888 AA-ATCAATT-A-TGAGATTATAAAGCAATTTAA-AGT-GACT-AATTA-G-GATTTTGAAGGTA
315 AATTTGTTTTAACTAAAAATGTAAAAAAATTCAACA-TAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCA
* * * * * * * ** * *** *** * * *
16945 TGGGT-AA-CTA-CAA-ATGCACTTCTC-TAGCCAATGAATG--TCTTTTTCTTCGTAT-TTCCC
379 T--TTAAAGCGAGTAATAAG-GCTT-TCAAAG-GAATGGGTGAATATAAATGGACTTTTCTTGCC
* * ** *** * ** * * * * *
17002 AA-GGCAGACATTCAATAATAATTGGTTTTCAATAAAAATGTAAAAAATTCAACATAAAATC--A
439 AATGACAGTC-TT---T--TTCTTCACTTTC--T--TAA-GGCAGACATTCAA-TTATAATCTGC
* ** * * * * * *** * * * ** ****
17064 ATT-ATGAGATTATAAAACCATTTCAA---GGGAGT-AATTA-G-GCTT-TCGAATGC-TTGGGT
492 TTTAACAAAAATGTAAAA-AAATTCAACTCTAAAATCAATTATGAGATTAT-AAAACCATTTAAA
* * * * * *
17120 GACTAG-AAAT-GGACTTTTC-----C-TGCA---A--ATGAGTGG-CTTTT-TT-TC-ACG--T
555 G-CGAGTAATTAGG-C-TTTCAAAGGCATG-AGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAAT
** ** * * * * *
17166 TTCTTGCT-GT-AG------ATG-------TTCAATTATAATTTGTTTTAGCCAAAAATTTAA
616 GGCTTTTTCTTCAGTTTTCCATGACAAACATTCAATTATAATCTATTTTAACCAAAAATGTAA
* * ** * *** * *
17214 AAAATTCAACTTGAAATTGATTATGAGATTATAAAAACATTTAAAGTGCGTAATAAGGCTTTCGA
1 AAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAAT-AGGATTTTGA
* ** * * * *
17279 AGGCATGGTTGACTATAAATATACTTTTCTTGTCAATAAAT-GCATTTTTCTTTAAGTTTTTCAA
65 AGGCATGG-TAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATGGC-TTTTTCTTCATGTTTTT-AA
* * * * ** * *
17343 GGAAGACATTCAATTATAATCTGTTTTCACCAAAAACATAAAACAATT-TACCATAAAATCAATT
127 GGCAGATATTCAATTATAATC-ATTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACC-TAAAATCAATT
* * * *
17407 ATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTACGATTTT-AAAGGTATGGGTAACTATAAATG
190 ATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAATTAGGCTTTTGAAA-GCATGGGTAACTATAAATG
* *** * * * * * * * *
17471 GGCTTTTCTTGCCAATGAATAAATTTCTCTTCATGTTTCCTA-ATATAGACATTCAACTATAATC
254 GACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCCTCAGGTTTCTTAGAGACAGACATTCAATTATAATT
* *
17535 TGTTTTAACCAAAAGTGT-AAAAAATTCAATC-TAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTA
319 TGTTTTAACTAAAAATGTAAAAAAATTCAA-CATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTA
* * * * * * * * * **
17598 AAGCGAGTAATTAGGCTTTCGAA-TATTTGGGTGACTAGAAATAGACTTTTCCTGCAAATGAGTG
383 AAGCGAGTAATAAGGCTTTCAAAGGA-ATGGGTGAATATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGA-CA
* * ** * * * *
17662 GT-TTTTTCTTCATGTTTCTTGTA-GCAGATTTTCAATTATAATTTGTTTTAGCCAAAAA-ATAA
446 GTCTTTTTCTTCA-CTTTCTT-AAGGCAGACATTCAATTATAATCTGCTTTA-ACAAAAATGTAA
* ** * * * *
17724 AAAAATTCAACT-TGAAATTGATTATGAGATTATAAAAACATTTAAAGCGCGTAATAAGGATTTC
508 AAAAATTCAACTCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTC
* * * * ** *
17788 GAAGGTATG-GCTGACTATAAATAGACTTTTCTTACCACCGAAT-GCATTTTTCTTCACTTTTCT
573 AAAGGCATGAG-TGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATGGC-TTTTTCTTCAGTTTTC-
* * * ** * **
17851 CAAGGA-AGACATTTAATTATAATCTGCTTTCACCAAAAACATAAA
635 C-ATGACAAACATTCAATTATAATCTATTTTAACCAAAAATGT-AA
* * * ** *
17896 AAAATTTAACATAAAATCAATTACGAGATTATAAAACCATTTAAAGTGAGTAATTATGATTTTGA
1 AAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAA-TAGGATTTTGA
* * * * * ** *
17961 AGGTATGGGTAACTATAAATGGGCTTTTCTTGCCAATGAATAGATTTCTCTTCATGTTCCCTAAT
65 AGGCAT-GGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCTTCATGTT-TTTAAG
** ** * * *
18026 ATAGACT-TTCAATTATAATTTGTTTTAACCAAAAGTGTAAAAATATTCAATCTAAAATCAATTA
128 GCAGA-TATTCAATTATAA-TCATTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTA
**************************
18090 TGAGATTATAAAACCATTTAAAGC----------G----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
191 TGAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAATTAGGCTTTTGAAAGCATGGGTAACTATAAATGGA
*****************************************************************
18141 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
256 CTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCCTCAGGTTTCTTAGAGACAGACATTCAATTATAATTTG
*****************************************************************
18206 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
321 TTTTAACTAAAAATGTAAAAAAATTCAACATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAG
****************************************************************
18271 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNT
386 CGAGTAATAAGGCTTTCAAAGGAATGGGTGAATATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGACAGTCTT
* * *
18336 TTTCTTCACTTTTCTTAAGGAAGACATTCAATTATAATCTGCTTTCACCAAAAACGTAAAAAAAT
451 TTTCTTCAC-TTTCTTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGCTTT-AACAAAAATGTAAAAAAAT
* * * **
18401 TTAAC-ATAAAATCAATTACGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTACGAATTT-AAAGG
514 TCAACTCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTA-GGCTTTCAAAGG
* * * * * * * * * *
18464 CATGGGTAACTAGAAATGGACTTTTCGTACCAATGAATAGATTTCTCTTCATGTTTCCCAAT-AT
578 CATGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCTTCA-GTTTTCC-ATGAC
* * *
18528 AGACATTCAATTATAATAC-GTTTTAACCAAAAGTGTAAA
641 AAACATTCAATTATAAT-CTATTTTAACCAAAAATGT-AA
** * * * *
18567 AAAATTCAACCTAAAAGT-AATTACAAGATTATAAAACCATTTAAAGCGATTAATTAGGCTTTCG
1 AAAATTCAACCTAAAA-TCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAA-TAGGATTTTG
* * * * * * ** *
18631 AAAGCTTGGGTAACTAGAAATGGACTTTTCTTACAAATGAGTGGCTTTTTCTTCACATTTCTTGA
64 AAGGCAT-GGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCTTCATGTTT-TTAA
* * ** *
18696 GGTAAATATTCAATTATAATCTATTTTAGA-CAAAAATGT-AAAAAATTCAATTTAAAATTAATT
127 GGCAGATATTCAATTATAATC-ATTTTA-ACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATT
** ** * * *
18759 ATGAGATTATAAAAATATTTAAAGCGTGTAATAAGGC-TTTCAAAGGCATGGGTGACTATAAATG
190 ATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAATTAGGCTTTTGAAA-GCATGGGTAACTATAAATG
* *** ** * * * **
18823 GACTTTTCTTGCTACCAAATATCTTTTTCTTCACGTTTC-TCGAGGTAGACATTCAATTATAATT
254 GACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCCTCAGGTTTCTTAGAGACAGACATTCAATTATAATT
* * ** * * *
18887 TATTTTCACTAAAAGCGTAAAACCAGTT-AACATAAAATCAATTACGAGATTAT------A---A
319 TGTTTTAACTAAAAATGTAAAA-AAATTCAACATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTA
* * *
18942 AA-C---T-AT-----TTT-AAAGGCATGGGT-AACTATAAGTGGACTTTTCTTGCTAATGA-A-
383 AAGCGAGTAATAAGGCTTTCAAAGGAATGGGTGAA-TATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGACAG
* * *********************** *
18993 TCGATTTCTCTTCATGTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATCTGTTTTAACCAAAAATGTAA
447 TC--TTTTTCTTCA-CTTTCTTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGCTTTAA-CAAAAATGTAA
* * * * * * * *
19058 AAAAATTCAA-TTTAAAATTAATTATGAGATTTTAAAGCCATTTAAAGTGACTAATTAGGATTTT
508 AAAAATTCAACTCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTC
* * * ** * ** *
19122 GAAGGCATGGGTAACTACGAATGGACTTTTCTAGGGAATGAATGCCTTTTTCTTC-GTGTTTCCT
573 AAAGGCATGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCTTCAGT-TTTCC-
* * * * * * *
19186 AAGGCAAACATTCAATAATAAT-TGGTTTTCACTAATAATGTAA
636 ATGACAAACATTCAATTATAATCT-ATTTTAACCAAAAATGTAA
* * **
19229 AAAATTCAACATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTA-GACTTTCA
1 AAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAA-TAGGA-TTTTG
* * * * * *
19293 AATGCTTGGGTGACTAGAAATGGACTTTTCTTGCTAATGAATGGCTTTTT-TTCATGTTTCTTGA
64 AAGGCAT-GGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCTTCATGTTT-TTAA
* * ** * * * *
19357 GGCAGATATTGAATTATAATCTGTTTTCGCTAAAAATGT-AAAAAATTTAACTTAAAATCGATTA
127 GGCAGATATTCAATTATAATC-ATTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTA
** ** * * * *
19421 TGAGATTATAAAAATATTTAAAGCGCGTAATAAGGCTTTT-AAAGGCATGAGCT-ACAATAAATA
191 TGAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAATTAGGCTTTTGAAA-GCATG-GGTAACTATAAATG
* * * * * * * *
19484 GACTTTTCTTGCTAATGAATGCCTTTTTCTTTACGTTTCTT-GAGAAAGACATTCAATTAGAATC
254 GACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCCTCAGGTTTCTTAGAGACAGACATTCAATTATAATT
* * * ** * * * *
19548 TATTTTCACCAAAAACATAAAAAAATTTAACATAAAATCAGTTACGAGATTATAAAACCTTTTAA
319 TGTTTTAACTAAAAATGTAAAAAAATTCAACATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAA
* *** ** * * * * *
19613 AGCGAGTAATTACTATTTTGAAGGCATAGGT-AACTATAAATGGATTTTTCTTACCAATGAATAG
384 AGCGAGTAATAAGGCTTTCAAAGGAATGGGTGAA-TATAAATGGACTTTTCTTGCCAATG-ACAG
* * * *
19677 -ATTTTTCTTCA-TGTT-TTCCAAGGCAAACATTAAATTATAATCTGTTTTAACTAAAAATGTAA
447 TCTTTTTCTTCACT-TTCTT--AAGGCAGACATTCAATTATAATCTGCTTTAAC-AAAAATGTAA
* * * * * * * * *
19739 ACAAATTCAAC-CTAAAGTAAATTATGAGATTATAAAGCTATTTAAAAACTA-TAATTTGGATTT
508 AAAAATTCAACTCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTT-AAAGCGAGTAATTAGGCTTT
** * ** * * * * * * *
19802 TGAAGGTATGCCTAACTATAAACGAACTTTTCTAGTCAATGAATGGCTTCTTCTTCATGTTTTCT
572 CAAAGGCATGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCTTCA-GTTTTCC
* ** * ** * * *
19867 AAGGTAGACATTCAACAATAAT-TGGTTTTAACAAAAAATGCTGA
636 ATGACAAACATTCAATTATAATCT-ATTTTAACCAAAAATG-TAA
* ********** ** * *
19911 AAAATTCAACCTAAAATCAATTATGGGANNNNNNNNNNATTTAAAGTGAGTAATAAGGCTTTCGA
1 AAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAAT-AGGATTTTGA
* *** ** * *
19976 TA-GCATGGGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAAT-AACAACCTTTTTCTTTGTATTTCTTT
65 -AGGCAT-GGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAA-TGGCTTTTTCTTCATGTTT-TTA
** ** * *
20039 AGGCA-ATCATTTGATTATAATTTGTTTTAACTAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATTAAT
126 AGGCAGAT-ATTCAATTATAA-TCATTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAAT
* ** ** * * * * *
20103 TATGACATTATAAAACTGTTTAAAGTGAGTAATTACGTTTTTGAAGGCATGGGCAACTTTAAATG
189 TATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAATTAGGCTTTTGAAAGCATGGGTAACTATAAATG
* * ** * * * * *
20168 GACCTTTCTTGTCAATGAATGATTTTTTCTTCATGTTTCTTA-AGGCAGTCATTCAATTATAATC
254 GACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCCTCAGGTTTCTTAGAGACAGACATTCAATTATAATT
* * * *
20232 TATTTTAACTAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAACTATGACATTAT------A---AA
319 TGTTTTAACTAAAAATGTAAAAAAATTCAACATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAA
* * * *
20288 A-C---T-AT-----TTT-AAAGGCATGAGT-AACTATAAATGAAAC-TTTCTTACCAATGA-AT
384 AGCGAGTAATAAGGCTTTCAAAGGAATGGGTGAA-TATAAATG-GACTTTTCTTGCCAATGACA-
* * * * * *
20339 GGCTTTTTCTTCACGTTTCTTGAA-GTAGACCTTCAATTGTAATATGTTTTAACTAAAAATGTAA
446 GTCTTTTTCTTCAC-TTTCTT-AAGGCAGACATTCAATTATAATCTGCTTTAAC-AAAAATGTAA
* * * *
20403 AAAAATTCAAC-CTAAAATCAATTATGAGGTTATAAGACCATTTAAAGCAAGTAGTTAGGCTTTC
508 AAAAATTCAACTCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTC
* * * * * * * * * * * **
20467 GAATGCTTGGGTAACTAGAAATGGACTTTTCCTACAAATGAATAGTTTTTTCTTCACATTT-CAT
573 AAAGGCATGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCTTCAGTTTTCCAT
* * * * *
20531 GAGGCAGATATTCAATTATAATCTGTTTTAGCAAAAAATGT-A
638 GA--CAAACATTCAATTATAATCTATTTTAACCAAAAATGTAA
** ** * ** * * **
20573 AAAATTCAAGTTAAAATTGATTATGAGATTATAAAAACATTTAAAGCGTGCAATAAGACTTTCAA
1 AAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAATAGGA-TTTTGA
* * * * * * * ** **
20638 AGGTATGGGTGACTATAAATGAACTTTTGC-TACAAACGAAT-ACTTTTTTCTTCACCTTTCCCA
65 AGGCAT-GGTAACTATAAATGGACTTTT-CTTGCCAATGAATGGC-TTTTTCTTCATGTTT-TTA
* * ** * * * *
20701 AGGAAGACATTCAATTATAATTTGTTTTCACCAAAAACGTAAAAAAA-TCTAACATAAAATCAGT
126 AGGCAGATATTCAATTATAA-TCATTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTC-AACCTAAAATCAAT
* * * * *
20765 TATGAGATTATAAAACCTTTTAAAGCGAGTAATTACGATTTTGAAGGCATGGG------TAAATG
189 TATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAATTAGGCTTTTGAAAGCATGGGTAACTATAAATG
* * * * * * * * * * *
20824 GATTTTTCTTGCTAATAAATAGATTTTTCTTCATGTTTCCTA-AGGCAGACATTCAATTTTAATC
254 GACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCCTCAGGTTTCTTAGAGACAGACATTCAATTATAATT
* * * * ** ** *
20888 TGTTTTAACCAAAAGTGTAAAGAGATTCAATGTAAAAAAAATTATGAGATTATAAAACTATTTAA
319 TGTTTTAACTAAAAATGTAAAAAAATTCAACATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAA
* ** * * *
20953 AGCGACTAATTAAGATTTTCAAA-GCATGGGT-AACTATAAATAGACTTTTCTAGCCAATGA-AT
384 AGCGAGTAA-TAAGGCTTTCAAAGGAATGGGTGAA-TATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGACA-
* * ** * * * * *
21015 GGCTTTTTCTTCATGTTTCCCAAGTCAGACAATCAATAATAATTTGTTTTAACTAAAAATGTAAA
446 GTCTTTTTCTTCA-CTTTCTTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGCTTTAAC-AAAAATGTAAA
* *********** * *
21080 AATATTCAAC-CTAAAATTNNNNNNNNNNTTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGACTTTCA
509 AAAATTCAACTCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCA
** * * * ** **
21144 AAGTAATGGGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATG-ATAGCCTCTTTCTTCACATTTCTTT
574 AAGGCATGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAAT-GGCTTTTTCTTCAGTTTTCCAT
* ** * * * *
21208 AGGCAGTCATTCGATTAGAATTTGTTTTAA-CAAAAGATGTAAA
638 -GACAAACATTCAATTATAATCTATTTTAACCAAAA-ATGT-AA
* * * * *
21251 AAAATTCAACTTAAAATCAATTATGACATTATAAAACTATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTGA
1 AAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAA-TAGGATTTTGA
* * ** ** ** *
21316 AGGCATGGGTGACTATAAATGGACTTTTCTTACCACCGAATACCTTTTTCTTCACATTTTCCAAG
65 AGGCAT-GGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCTTCATGTTTT-TAAG
* * * * * *
21381 GTAGACAATCAATTATAATCAGTTTTAACCAAAAGTGTAAAAAAATTCAATCTAAAATAAATTAT
128 GCAGATATTCAATTATAATCA-TTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTAT
* ** * * *
21446 GAGATTATAAAGCCATTTAAAGTGACTAATTAGGATTTTG-AAGCATTGGGTAACTACAAATGGA
192 GAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAATTAGGCTTTTGAAAGCA-TGGGTAACTATAAATGGA
* * ** * * ** * *
21510 CTTTTCTAGCCAATTAAT-GCTTTTTTTTTTATGTTTCCCA-AGGCAGACATTCAATAATAATTT
256 CTTTTCTTGCCAATGAATGGC-TTTTTCCTCAGGTTTCTTAGAGACAGACATTCAATTATAATTT
* * *
21573 GTTTTCACTAAAAATGT-AAAAAATTCAATATAAAATTAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAA
320 GTTTTAACTAAAAATGTAAAAAAATTCAACATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAA
* * * * ** * * * * * * **
21637 GCAAGTAATTAGGCTTTCGAATGCTTGGGTGACTAGAAATGGGCTTTTCCTGCAAATGAAAGGGT
385 GCGAGTAATAAGGCTTTCAAAGGAATGGGTGAATATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGACAGTCT
* * * * ** * * **
21702 TTTTCTTCACTTTTCTTGAGGTAGATATACAATTATAATCTATTTTAGCCAAAATTGT-AAAACC
450 TTTTCTTCAC-TTTCTTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGCTTTA-ACAAAAATGTAAAAAAA
* * * * * *
21766 TTCAAC-GTAAAATGAATTATGAGATTATAAAAACATTTAAAGCGCGTAATAAGGCTTTCAAAGA
513 TTCAACTCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCAAAGG
* * * ** * *
21830 CATGGGTGACTATAAATAGA-ATTTCTTGCC-ATCGAATACCTTTTTCTTCACGTTTCTCGA-GG
578 CATGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAAT-GAATGGCTTTTTCTTCA-GTTT-TCCATGA
* * * *
21892 CAAACATTCAATTATAATTTGTTTTCACCAAAAATGAAAA
640 CAAACATTCAATTATAATCTATTTTAACCAAAAATG-TAA
* * * * * * *
21932 AAAATTTAACATAAAATGAATTACGAGATAATAAAACCATTTAAAACAAGTAATTACGATTTTGA
1 AAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAA-TAGGATTTTGA
* * * * * **
21997 ACGCATGGGTAACTATAAATGAACTTTTCTTGCCAATGAATAGATTTCTCTTCATGTTTCCCAAG
65 AGGCAT-GGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCTTCATGTTT-TTAAG
* ** * * * ***
22062 GCAGACATTCAATTATAATTTGTTTTAAACAAAAGTGTAAAAAAATTTAGTATAAAATCAATTAT
128 GCAGATATTCAATTATAA-TCATTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTAT
* * * * * *
22127 GAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGCAATAAGGC-TTTCAAATGTATGGGTGACTAGAAATGGA
192 GAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAATTAGGCTTTTGAAA-GCATGGGTAACTATAAATGGA
* * * * * * *
22191 CTTTTATTGCCAATG-ATAGCCTTTTTCTTCATGTTTCTTA-AGGCACACATTCAATTATAATCT
256 CTTTTCTTGCCAATGAAT-GGCTTTTTCCTCAGGTTTCTTAGAGACAGACATTCAATTATAATTT
* * * * * * * *
22254 ATTTTAACCAAAAATGTAAAAAACTTCAACCTAAAATCTATTATGACATCATAAAACCATTTTAA
320 GTTTTAACTAAAAATGTAAAAAAATTCAACATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAA
* ** * * * * *
22319 GCGAGTAATTAGGCTTTTGAAGGTATGAGT-AACTATAAATGGACTTTTCTCGTCAATGA-ATGG
385 GCGAGTAATAAGGCTTTCAAAGGAATGGGTGAA-TATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGACA-GT
* * * * * * * *
22382 CTTCTTCTTTAGGTTT-TCCAAGACAGACTTTCAATTATAGTCTGTTTTAACAAAAAATGTAAAA
448 CTTTTTCTTCA-CTTTCT-TAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGCTTTAAC-AAAAATGTAAAA
** ** * * * *
22446 AGGTTTTAC-ATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTAAAAGTGAGTAATAAGGCTTTCAA
510 AAATTCAACTCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCAA
* * * * * * * * * *
22510 AGACATGGGTTATTATAAATGGACTTTTCTCGCTAATGAATGTCTTCTTCCTT-ATGTTTACCAA
575 AGGCATGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTT-TTTCTTCA-GTTTTCCAT
* * * *
22574 GGCAAACATTCAATTATAGTCTGTTTTAACAAAAAATGTAA
638 GACAAACATTCAATTATAATCTATTTTAACCAAAAATGTAA
* * * ** *
22615 AACAATTTAACCTAAAATTAATTATGAGATTATAAAACCATTAAAAGTGATTAATAAGG-TTTTC
1 AA-AATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAAT-AGGATTTT-
* * * * * * * * *
22679 AAAGGCACGAGTTACTATAAATGTACTTTTGTTGCCAATG-ATAGCCTTTTTTTTCACGTTTTTT
63 GAAGGCATG-GTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAAT-GGCTTTTTCTTCATGTTTTTA
* * * * * ** * *
22743 AGGTAAAAATTCAATTATAATTGATTTTCACCAAAAA-AAATAAAAAATTCAACTTAAAA--AAG
126 AGGCAGATATTCAATTATAA-TCATTTTAACCAAAAATGTA-AAAAAATTCAACCTAAAATCAAT
** * ** * * * *
22805 TATGAGATTATAAAACCATTTAAAGTGAGTAATAAGGCTTCCGAAGGCTTGGGTGATTATAAATG
189 TATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAATTAGGCTTTTGAAAGCATGGGTAACTATAAATG
* * * ** * *
22870 GACCTTTCTTGACAATGAATGG-TTGTTTCTTCACATTT-TCCAAAGTA-A-ACATTCAATTATA
254 GACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTT-TTTCCTCAGGTTTCT-TAGAG-ACAGACATTCAATTATA
* * * ** * **
22931 ATCTG-TTTAACCAAAAATATAAAAACTTTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAATTATT
316 ATTTGTTTTAACTAAAAATGTAAAAAAATTCAACATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATT
* ** * * * * *
22995 TAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTGAAGGCATGGGT-AACTACAAACGGACTTTTCTAGCTAATGA-
381 TAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCAAAGGAATGGGTGAA-TATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAC
* ** * * * * * * *
23058 ATGTTTTTTTCTT-TGTGTTCCTAAGGTAGACATTTAATAATAATTTGTTTTAATAAAAAATGTA
445 A-GTCTTTTTCTTCACT-TTCTTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGCTTTAA-CAAAAATGTA
* * * * * * *
23122 GAAAAACTCAAC-CCAAAATCAATTACGACATTATAAAATCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTT
507 AAAAAATTCAACTCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTT
* * * *
23186 CAAAAGCATGAGTAACTATAAATGGACTTTTATTGCCAATG-ATAGCCTTTTTCTTCACGATTTT
572 CAAAGGCATGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAAT-GGCTTTTTCTTCA-G-TTTT
** ** * * * *
23250 TGA-GGTAGACATTCAATTATAATCTGTTTTCACAAAAAATGTAA
634 CCATGACAAACATTCAATTATAATCTATTTTAACCAAAAATGTAA
* * * * * ** * * **
23294 AACATTTAACTTAAAATCAATTATAAGATTATAAAACCATGTAAAGCGCGTAGTAAGACTTTCAA
1 AAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAATAGGA-TTTTGA
* ** * * **
23359 AGGTATGGGGGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATAGCTATTTCTTCATGTTTCCCAAG
65 AGGCAT-GGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCTTCATGTTT-TTAAG
** * * * * * * *
23424 GTGGACATTCAATTATAATCTTTTTTAACTAAAAATGTAAAAATATTTAACATAAAATCAATTAC
128 GCAGATATTCAATTATAATC-ATTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTAT
* * ** * * * ** **
23489 GAGATTATAAAATCACTTAAAGTGAGTAATTACGATTTTGAAGGCATAAGTAACT-TAAATAAAC
192 GAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAATTAGGCTTTTGAAAGCATGGGTAACTATAAATGGAC
* * * * * ** * *
23553 TTTTGTTGCCAATGAATAGCCTTTTCTTCATGTTTCCCA-AGACAGATATTCAATTATAATTTAT
257 TTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCCTCAGGTTTCTTAGAGACAGACATTCAATTATAATTTGT
*
23617 TTTAAC-AAAAATTTTAAAAAAACTT-AATC-TAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAA
322 TTTAACTAAAAA-TGTAAAAAAA-TTCAA-CATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAA
* * * * * * * * * *
23679 AGCAAGAAATGAGGCTTTCAAAGG-CTCGAGTGACTAGAAATGGACTTTTCTTGCTAATAAATAG
384 AGCGAGTAATAAGGCTTTCAAAGGAAT-GGGTGAATATAAATGGACTTTTCTTGCCAAT-GACAG
* ** * * * ** **
23743 -CTTTTTCTTCATGTTTCCCAATGAAGGCATTCAATTATAATCTATTTTAACTAAAAACAT-AAA
447 TCTTTTTCTTCA-CTTTCTTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGCTTTAAC-AAAAATGTAAAA
* * * * *
23806 AATTTCAAC-CTAAAATCAATTATGGGATTATAAAACTATTTAAAGCGAGTAATTAGGATTTTGA
510 AAATTCAACTCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGG-CTTTCA
* * * * *
23870 AA-GAATGGGTAACTATAAATGAACTTTTC-TGACCAATGAATGGCTTTTTCTTC-TTGTTTCCT
574 AAGGCATGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTTG-CCAATGAATGGCTTTTTCTTCAGT-TTTCC-
* * * * * * * *
23932 AAGGCAGACATTCAATAATAATTTGTTTTAGCCAAACATGTAAA
636 ATGACAAACATTCAATTATAATCTATTTTAACCAAAAATGT-AA
* * ** * * *
23976 AAAATTTAACCTAAAATCAATTATGATATTATAAAATTATTTTAAGCGAGTAATTAGGCTTTTGA
1 AAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAA-TAGGATTTTGA
* * * * *
24041 AGGCATGTGTAACTATAAATGGACCTTTCTTGCCGATGAATAGCTTTTTCTTCATGTTTCCTGAG
65 AGGCATG-GTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCTTCATGTTT-TTAAG
* * * * * *
24106 GTAAAGATTTAATTATAATCCGTTTTAACCTAAAATGT--AAAAATTCAACCTAAAATCAATTAT
128 GCAGATATTCAATTATAAT-CATTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTAT
* * * * * * *
24169 GAGATTTTAAAATCATTTAAAGCGAGTAATTAGG-TTTTCGAACGCATTGGTGA-TCAGAAATGG
192 GAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAATTAGGCTTTT-GAAAGCATGGGTAACT-ATAAATGG
* * * * * ********** * * *
24232 ACTTTTCTTACCCATGAAAGGCTTTTTCTTCATGTTTNNNNNNNNNNG-TATTGAATTATAATCT
255 ACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCCTCAGGTTTCTTAGAGACAGACATTCAATTATAATTT
* * * * ** * **
24296 ATTTTAGCCAAAAATGT-AAAAAATTTAATTTAAAATTAATTATGAGATTATAAAAATATTTAAA
320 GTTTTAACTAAAAATGTAAAAAAATTCAACATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAA
* * * * * * * **
24360 TCGCGTGATAAGGCTTTCAAAGGCATGGGTGACTATAAACGGACTTTTCTTACCACCGA-A-TAC
385 GCGAGTAATAAGGCTTTCAAAGGAATGGGTGAATATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGACAGT-C
* * * * *
24423 TTTTTTTTTCATGTTTCCTAAGGTAGACATTCAAAGTATAGGTAATTATAAATGGACTTTTCTTG
449 -TTTTTCTTCA-CTTTCTTAAGGCAGACATTC-----------AATTAT-AAT---C--TGCTT-
* * *** *** ** * * *
24488 TCAATGAAGAGATTTGTTTTCATGTTTCCCAAGGC-AGACATTCAATTATAATATGTTTTAACCA
494 T-AA-CAA-A-A-ATG-TAAAAAAATT--CAACTCTA-A-AATCAATTAT--GA-G-ATT----A
* * * * * * * * *
24552 AAAATACAAAAATATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAACGAGTAATT
541 TAAA-AC---CAT-TTAAAGC--GAGT-AATTA-G-G----------C-TTTCAAA-G-G-CATG
* * ** *
24617 AGCCTTTTGAATACTTGGGTGACTAGAAATGGA-TATTTCTTTCCAATGACTCAC-TTTTCTCCA
582 AG----T-G---AC-----T-A-T--AAATGGACT-TTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCTTCA
* * * * * * * * *
24680 CATTGCTT-GATG-CAGATATTGAATGATAATCTGTTTTAGCCAAAAATGTAG
629 -GTT--TTCCATGACAAACATTCAATTATAATCTATTTTAACCAAAAATGTAA
** *** * ** * **
24731 AAAATTCAAATTAAAATTGGTTATGAGATTATAAAAACATTTAAAGCGCGTAATAAGACTTTCAA
1 AAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAATAGGA-TTTTGA
* * * ** ** ** * * * *
24796 AGGCATAGGTGATTGTAAATGGACTTTTCTTATCAACAAATTCCTTTTTCCTCACGTTTCATGAG
65 AGGCAT-GGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCTTCATGTTT-TTAAG
* * * * ** * * * * *
24861 GAAGACATTCAATTATAATCTGTTTTCACCAAAAACATAAAAAAAATTTAACATAAAATCGAGTG
128 GCAGATATTCAATTATAATC-ATTTTAACCAAAAATGT-AAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTA
* * * * * * * * *
24926 CGATATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAGTTACGATTTTGAAGGCATGAGTAACTATAAATAGA
191 TGAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAATTAGGCTTTTGAAAGCATGGGTAACTATAAATGGA
* * * * ** ** * * *
24991 TTTTTCTTGCCAATGAATAGATTTTTCTTCCTGTTTCCCA-AGGCAGACATTTAATTATAATCTG
256 CTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCCTCAGGTTTCTTAGAGACAGACATTCAATTATAATTTG
* * *
25055 TTTTAACCAAAAGTGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAGA-CATTTAAA
321 TTTTAACTAAAAATGTAAAAAAATTCAACATAAAATCAATTATGAGATTATAAA-ACCATTTAAA
* * ** ** ** * * *
25119 GTC-ACTAATTAGAATTTTGAAGGCGTGGGT-AACTACAAATAGACTTTTCTAGCCAATGA-A-T
385 G-CGAGTAATAAGGCTTTCAAAGGAATGGGTGAA-TATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGACAGT
** ** * * * *
25180 GCTTTTTTCTTCGTGTTTC-CCAGGACAGACATTTAATAATAAT-TAGTTTTCACTAAAAATGT-
448 -C-TTTTTCTTC-ACTTTCTTAAGG-CAGACATTCAATTATAATCT-GCTTTAAC-AAAAATGTA
* *
25242 AAAAAATTCAAC-ATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGTGAGTAATTAGGCTTT
507 AAAAAATTCAACTCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTT
* * * * * * * * * *
25306 CGAATGCTTGGGTGACTAGAAATAGACTTTTCCTACAAATGAATGGCTTTTTTTTCACG-TTT-C
572 CAAAGGCATGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCTTCA-GTTTTCC
* * * * * * * * **
25369 TTGAGGTAGATATTCAATTATAATCTGTATTAGCTAAAAATACAA
636 ATGA--CAAACATTCAATTATAATCTATTTTAACCAAAAATGTAA
* * ** * ** * **
25414 AAAATTCAACTTAAAGTTGATTATGAGATTATAAAAACATTTAAAGCGCGTAATAAGGCTTCCGA
1 AAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAAT-AGGATTTTGA
* * * * * *
25479 AGGCATGGGTGACTATAAATGGAGTTTTCTTGCCAACGAATGCCTTTCTCTTCATGTTTCTCAAG
65 AGGCAT-GGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCTTCATGTTT-TTAAG
** * * * * * * *
25544 AAAAACATTCAATTATAATC-TGCTTTCAA-TAAAAACGTTAAAAAATTTAACATAAAATCAATT
128 GCAGATATTCAATTATAATCAT--TTT-AACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATT
** ** * * * * **
25607 ACAAGATTATAAAACCATTTAAAGTGAGCAATTACGATTTTGAAGGCATGGGTAACTACGAATGG
190 ATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAATTAGGCTTTTGAAAGCATGGGTAACTATAAATGG
* * * * * ** ** ** *
25672 ATTTTTCTTACCAATGAATAGATTTTTCTTCATTTTTCCCA-AGGTAGACATTCAATTATAATCT
255 ACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCCTCAGGTTTCTTAGAGACAGACATTCAATTATAATTT
* * * * *
25736 GTTTTAATTAAAAATGT-AAAATATTCAACATAAAATAAATTATGAGATTATAAAGCTATTTAAA
320 GTTTTAACTAAAAATGTAAAAAAATTCAACATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAA
* * * *** ** * * * *
25800 GTGACTAATTACAATTTTGAAGGCATGGGT-AACTATGAATAGACTTTT-TTAGCCTATGA-ATG
385 GCGAGTAATAAGGCTTTCAAAGGAATGGGTGAA-TATAAATGGACTTTTCTT-GCCAATGACA-G
* * * * * * **
25862 ACCTTTTCTTCA-TAT-TTACTAGGTCAGACATTCAATAATAAT-TAGTTTTCACTAATTATGT-
447 TCTTTTTCTTCACTTTCTTA--AGG-CAGACATTCAATTATAATCT-GCTTTAAC-AAAAATGTA
** *
25923 AAAAAATTCAA-GATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGTGAGTAATTAGGCTTT
507 AAAAAATTCAACTCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTT
* * * * * * * * * * * *
25987 CGAATGC-TTAGGTTACTAGAAATGTACTTTCCCTACAAATGAATGGTTTTTTCTTC-GCGTTTC
572 CAAAGGCATGA-GTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCTTCAG-TTTTC
* * ** * * * *
26050 TTAAGGTAGATATTCAATTATAATATGTTTTAACCAAAAATGTAA
635 -CATGACAAACATTCAATTATAATCTATTTTAACCAAAAATGTAA
* ** ** ** ** **
26095 AAAATTCAACTTAAAATTGATTATGAGATTATAAAAATATTTAAAGCGCGTAATAAGCCTTTCAA
1 AAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAAT-AGGATTTTGA
* * * * * **
26160 AGGCATGGGTGACTAGAAATAGACTTTTCTTGCCAACGAATGCCTTTTTCTTC-TAGTTTCAAAA
65 AGGCAT-GGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCTTCAT-GTTT-TTAA
** * * ** ** * * * *
26224 GTAAGACATTCAATTATAATCTAATTTCTCCAAAAACATAGAAAAATTTAACATCAAATCAATTA
127 GGCAGATATTCAATTATAATC-ATTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTA
* * * * ** * * *
26289 -CAGGATTATAAAATCATTTAAAGCGAGTAATTACGAATATGAAGGCATGGGTAACTATAAATAG
191 TGA-GATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAATTAGGCTTTTGAAAGCATGGGTAACTATAAATGG
* * * * * * ** * * *
26353 ATTTTTCTTAG-TAATGAATAGATTTTTCTTCATGTTTCCCA-AGGCAGACTTTCAATTATAATA
255 ACTTTTCTT-GCCAATGAATGGCTTTTTCCTCAGGTTTCTTAGAGACAGACATTCAATTATAATT
* * * * * * * * *
26416 TGTTTTCACCAAAAAAGT-AAAAGATTCAACGA-AAAATAAATTATTAGATTATGAAGCTATTTA
319 TGTTTTAACTAAAAATGTAAAAAAATTCAAC-ATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTA
* * * * * * * * * *
26479 AAGTGACTAATTAGGATTTTGAAA-GCATGGAT-AACTATGAATAGACTTTTTTTAGCCAATGA-
383 AAGCGAGTAATAAGG-CTTTCAAAGGAATGGGTGAA-TATAAATGGACTTTTCTT-GCCAATGAC
* * ** * * *
26541 ATGATC-TTTTCTTCATATTTAC-CAAGTTAGACATTCAATAATAATTTGTTTTAACCAAAAATG
445 A-G-TCTTTTTCTTCA-CTTT-CTTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGCTTTAA-CAAAAATG
* *
26604 TAAAACAATTCAAC-CTAAAATCAATTATGAGATTTTAAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGC
505 TAAAAAAATTCAACTCTAAAATCAATTATGAGATTAT-AAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGC
* * * * * * * *
26668 TTTAAAATGCTTGGGTGACTAGAAATCGACTTTTCTTACCAATGAAAGGCTTTTTCTTCA-TGTT
569 TTTCAAAGGCATGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCTTCAGT-TT
* * * * **
26732 T-CTTGAGGCAGATATTCAATGATAATCTATTTTAGTCAAAAATGTAA
633 TCCATGA--CAAACATTCAATTATAATCTATTTTAACCAAAAATGTAA
* * * * * ** *
26779 AAAATTCAACTTAAAATTAATTACGAGATTATAAAAACGTTTAAAGCGCGTAATAAGG-TTTTCA
1 AAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAAT-AGGATTTTGA
** * * ** * **
26843 GAGGCATGGGTGGCTATAAATGGACTTTTCTTGCTACT-AATACCTTTTTCTTTATGTTTCTCGA
65 -AGGCAT-GGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCTTCATGTTT-TTAA
* * * * * * *
26907 GGTAGACATTCAATTATAAT-ATGTTTTCATCAAAAACGTAAAACAAGTT-AACATAAAATCAAT
127 GGCAGATATTCAATTATAATCA--TTTTAACCAAAAATGTAAAA-AAATTCAACCTAAAATCAAT
** * * * ** **
26970 TACAAGATTACAAAGCTATTTAAAGGGAGTAATTAGAATTTT-AAAGGCATGGGTAACTATAAAT
189 TATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAATTAGGCTTTTGAAA-GCATGGGTAACTATAAAT
** * * * * * ** * *
27034 AAACTTTTCTTGCCAATGAATCGATTTCTCATCATGTTTCCCA-AGGCAGACATTCAATTATTAT
253 GGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCCTCAGGTTTCTTAGAGACAGACATTCAATTATAAT
* * * *
27098 TTGTTTTAACCAAAAATGTAAACAAATTCAACGTAAAATCAATTATGAGATTATAAAGCCATTTA
318 TTGTTTTAACTAAAAATGTAAAAAAATTCAACATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTA
*** * * * * * * * * *
27163 AAATAACTAATTAGGATTTTGACA-GCATGGGT-AACCACAAATGGACTTTTCTAGCCAATGA-A
383 AAGCGAGTAATAAGG-CTTTCAAAGGAATGGGTGAA-TATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGACA
* * * ** * * * *
27225 TGCCTTTTTTTTTCATGTTTCCCAAGGCAGGCATTCAATAATAAT-TGGTTTTCACTAAAAATGT
446 -GTC-TTTTTCTTCA-CTTTCTTAAGGCAGACATTCAATTATAATCT-GCTTTAAC-AAAAATGT
* * * * *
27289 -AAAAAATTAAAC-ATAAAATCAATTATAAGATTATAAAATCATTTAAAGTGAGTAATTAGGCTT
506 AAAAAAATTCAACTCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTT
* * * * * * *
27352 T-AGAGTGCTTGGGTGACTAGAAATGTACTTTT-TCTGCAAATGAATGACTTTTTCTTCA-TGTT
571 TCAAAG-GCATGAGTGACTATAAATGGACTTTTCT-TGCCAATGAATGGCTTTTTCTTCAGT-TT
* * * * * *
27414 TCTTAAGGCAGATATTCAATTATAATCTGTTTTAA-CAAACAATGTAA
633 TC-CATGACAAACATTCAATTATAATCTATTTTAACCAAA-AATGTAA
* ********** * ** * *
27461 AAAATTCAACTTAAAANNNNNNNNNNGATTATAAAAACATTTAAAGCGCGTAATAAGGCTTTCGA
1 AAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAAT-AGGATTTTGA
* *
27526 ACGCATGGGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAACGAATGCCTTTTCTTGCCAATGAATGGCT
65 AGGCAT-GGTAACTAT-AA---A-------TG-----G-A---CTTTTCTTGCCAATGAATGGCT
* * * * * * *********
27591 TTTTCTTTATGTTTCCTAAGGTATACATTCGATTATAATCTATTTTAACCAAAAATNNNNNNNNN
109 TTTTCTTCATGTTT-TTAAGGCAGATATTCAATTATAATC-ATTTTAACCAAAAATGTAAAAAAA
* * * * * *
27656 NTCAACCTAAAATCAGTTATGAGATTATAAAACCATGTAAAGCGAGTAATTAGGGTTTTGAAGGC
172 TTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAATTAGGCTTTTGAAAGC
* * * * * * **
27721 ATAGGTAACTATAAATAGACTTTTCTTCCCAATGAATGGTTTTTTCCTCAAGTTTCTCA-AGGTA
237 ATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCCTCAGGTTTCTTAGAGACA
* * * * *
27785 GACATTCAATTATAATCTGCTTTAACAAAAAATGTAAACAAATTAAACATAAAATCAATTATGAG
302 GACATTCAATTATAATTTGTTTTAACTAAAAATGTAAAAAAATTCAACATAAAATCAATTATGAG
* * * * * * * * **
27850 ATTATAAATCCATTTAAAGTGAGTAATAGGGATTTCGAAGGTATAGGT-AACAATAAATAAACTT
367 ATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCAAAGGAATGGGTGAA-TATAAATGGACTT
* * * * * * *
27914 TTCTTGCCAATGATAGCCTTTCTT-TTCATGTTTCTTAAAGCAGATATTCAATTATAATATGTTT
431 TTCTTGCCAATGACAGTCTTT-TTCTTCA-CTTTCTTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGCTT
*
27978 TAACAAAAAATATAAAAAAATTCAAC-CTAAAA
494 TAAC-AAAAATGTAAAAAAATTCAACTCTAAAA
28010 NNNNNNNNNN
Statistics
Matches: 20725, Mismatches: 5091, Indels: 2865
0.72 0.18 0.10
Matches are distributed among these distances:
642 8 0.00
643 18 0.00
644 11 0.00
645 18 0.00
646 15 0.00
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653 1 0.00
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668 9 0.00
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680 1190 0.06
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684 2358 0.11
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* * *
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* * ** * ** *
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********** *
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* * * *
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* * * *
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129 TGCCAATGAATAGC-TTTTTCTTCATGTTTCTTGAGGTAGACA
********** *
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1 TTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTA
* * * * * * **
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* *
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* * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * ** *
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* * *
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* * * * ** *
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* * * * ** * *
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* *
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* * * * *
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* ** ** * *
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** * * *
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* ** * ** *
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* * * * * * *
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* * * * ** **
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* * * * * * * *
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* * *
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129 TGCCAATGAATAGCTTTTTCTTCATGTTTCTTGAGGTAGACA
* * * * * *
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* * * *** * *
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* * * *
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* * * * * * *
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* * * * *
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* * * ** ** * *
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* * * **
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** * * * *
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* * * * * ** *
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* *
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* * * *
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1 TTCAATTATAATCTGTTTTAACCAA-AAATGTAAAAAAATTCAACC-TAAAATCAATTATGAGAT
* * * * * **
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* * * *
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* * * * * *
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* * * *
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* * ** * * *
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128 TTGCCAATGAATAGCTTTTTCTTCATGTTTCTTGAGGTAGACA
* * * * *
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1 TTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATC-AATTATGAGATT
* * ** * * * *
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* * * * *
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* *
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1 TTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTA
* * * * * * *
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66 TAAAACTATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCAAAGGCATGGGT-AATATAAATGGACTTTTCTT
***
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130 GCCAATGAATAGC-TT-TTTCTTCATGTTTCTTGAGGTAGACA
* * * * * * * * * *
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* * * * * * *
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** * * * * * *
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128 TTGCCAATGAATAGCTTTTTCTTCATG-TTTCTTGAGGTAGACA
* * * ** *
8134 TTCAATTATATTCAGTTTTAACCAAAAATATAAAAAAATTCAGTCAAAAATCAATTATGAGATTA
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* * * ** *
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* * *
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* * * * * ********
8305 TTCAATTGTAGTATGTTTTAA--AAAGATGTAAAAAAATTCAACATAAAATCAATTANNNNNNNN
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** *
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8430 TTNNNNNNNN
Statistics
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Found at i:5287 original size:342 final size:340
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* * * * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * **********
4723 TTCAATTATAATTTGTTTTCACCAAAAATGT-AAAAAATTCAACTTAAANNNNNNNNNNAGATTA
1 TTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTA
* * * * * **
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66 TAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCGAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTT
* * ** * * * **
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*
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* * **
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* *
5044 CGTGTTTCCCAAGGCAGACA
321 CATGTTTCCTAAGGCAGACA
* * * * *
5064 TTCAATAATAAAT-TGTTTTAATCGAAAATGTAGAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGACATT
1 TTCAATTAT-AATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATT
* * * * * *
5128 ATTAAACTATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCAAAGGCATAGGTGACTATAAATGGACTTTTCT
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* * * * * *
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130 TGCCAATGA-AGC-TTTTTCTTCACGTTTCTTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACC
********* * *
5258 AAAAATNNNNNNNNNNTCAACCTAAAATCAATTATGACATTATAAAA-TCATTTAAAGTGAGTAA
193 AAAAAT-TAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACT-ATTTAAAGCGAGTAA
* * * * *
5322 TAAAG-CTTTCAAAGGCATGGGTGACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATG-ATAGCATTTTTCT
256 TTAAGATTTTGAAAGGCATGGGTAACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATGAATGGC-TTTTTCT
* * * * *
5385 TTACGTTTCTTGAGGCAGTCA
320 TCATGTTTCCTAAGGCAGACA
********** *
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* ** * * **
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66 TAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCGAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTT
* * * * * *
5536 GCCAATGAATGGCTTTTTCTTCATGTTTCCTGAGGTAGACATTCAATTATAATATGTTTTAACAA
131 GCCAATGAA--GCTTTTTCTTCACGTTTCTTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCA
* * * *
5601 AAAATGTAAAAAAAATCAACGTAAAATCAATTACGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATT
194 AAAAT-TAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAGCGAGTAATT
* * * * *
5666 ATGATTTT-AAAGGCATGGGTAACTATAAAT-GAATTTTTCTTGTCAATAAATGGCTTTCTCTTC
258 AAGATTTTGAAAGGCATGGGTAACTATAAATAG-ACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCTTC
* * *
5729 ACGTTTTCC-AAGGTAGATA
322 ATG-TTTCCTAAGGCAGACA
* * *
5748 TTAAATTATAAT-TAGTTTTAACCAAAAATATAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATAATGAGATT
1 TTCAATTATAATCT-GTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATT
* * * * * *
5812 ATAAAACCATTTAAAACAAGTAATTAGGCTTTTGGAGGCATAGGTAACTATAAATGGGCTTTTCT
65 ATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCGAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCT
* * * * * * * * *
5877 TGCCAATGAATGACTTTGTCCTCAAGTTTCCTGAGACAAACATTCAATTATAGTCTGTTTTAACA
130 TGCCAATGAA-G-CTTTTTCTTCACGTTTCTTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACC
* ** * * *
5942 AAAAATATAAAAAAACTCAAAATAAAATTAATTATGGGATTATAAAACTATTAAAAGCGAGTAA-
193 AAAAAT-TAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAGCGAGTAAT
* ** * * * * * ** * *
6006 GAAGGCTTTCAAAAGAATGGGTCAGTATAAATATCCTTTTTTTTGCCAATG-ATAGCCTTTTTCT
257 TAAGATTTTGAAAGGCATGGGTAACTATAAATAGAC-TTTTCTTGCCAATGAAT-GGCTTTTTCT
** * * *
6070 TCATGTTTATTGAGGTAGGCA
320 TCATGTTTCCTAAGGCAGACA
* * * * *
6091 TTCAATTATAATCTGCTTTCACCAAAAATGTAAAACAATTAAACTTAAAATCAATTATGATG-TT
1 TTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGA-GATT
* ** * * *
6155 ATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAAACTTTTGAAGGCTTGGGTAACTATAAATGGACTTTTTT
65 ATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCGAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCT
** * * * **
6220 TATCAATGATAGCCTTTTTCTTCACGTTTCCTAAGGTAGACATTCAATTATAATATGTTTTAAGT
130 TGCCAATGA-AG-CTTTTTCTTCACGTTTCTTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACC
* ** * *
6285 AGAAATGTAAAAAAGCTCAACCTAAATTCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAGCGAGTGAT
193 AAAAAT-TAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAGCGAGTAAT
** * * * * * * * * *
6350 T-AGGCTTTCAAAGGCTTGAGTGACTAGAAATGGAATTTTCTTGCTAATAAATGGC-TTTTCTTC
257 TAAGATTTTGAAAGGCATGGGTAACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCTTC
* * **
6413 ATGTTTCTTAAGACAGGTA
322 ATGTTTCCTAAGGCAGACA
* *** * *
6432 TTCAATCATAATCTG-TTTAGGTAAAAATATAAAAAAATT-AACCTAAAATCAATTACGAGATTA
1 TTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTA
* * * * * *
6495 T-AAACTCATTTAAATCGAGTAATTAGGCTTTCGAAGGCTTGAGTGACTAGAAATAGACTTTTCT
66 TAAAAC-CATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCGAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCT
* * * * * *
6559 TGCCAATGAATAGC-TTTTCTTAACGTTTCTTGAGGTAGATATTCAATCATAATCTGTTTTAGCC
130 TGCCAATG-A-AGCTTTTTCTTCACGTTTCTTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACC
* * * * * *
6623 AAAAA-TGAAAAAATTCAACATAATATCAATTATAAAATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAA-T
193 AAAAATTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAGCGAGTAATT
* * *** * * * * *
6686 AAGGCTTTT-AAAGGAATCACTGACTATAAATGGACATTTCTTGCTAAT-AATAGCCTTTTTCTT
258 AA-GATTTTGAAAGGCATGGGTAACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATGAAT-GGCTTTTTCTT
* * * *
6749 CATATTTCTTAAGGTAGATA
321 CATGTTTCCTAAGGCAGACA
* * * * * * *
6769 TTCAATTATAATCTATTTTCACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACTTAAACTCAGTTATTAAATTA
1 TTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTA
* * * * * * *
6834 TAAAACTATTTAAAGCGAGTAACTAGGCCTTCGAAGGCATGGGTGATTATAATTAGACTTTTCTT
66 TAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCGAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTT
* * * * ** *** *
6899 GCTAATGAATGGCTTTTACTACATGTTTCCCAATATAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAA-TA
131 GCCAATGAA--GCTTTTTCTTCACGTTTCTTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCA
** * * * *
6963 AAAATATAAACCAGTTCAACCCAAAATCAATTATGAGATTCTAAAACTATTTAAAGCGAGTGATT
194 AAAAT-TAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAGCGAGTAATT
* ** * * *
7028 AGGATTTTG-AAGAAATGGGTAACGATAAATGGACTTTTCTAGCCAATGAATGGCTTTTTCTTCA
258 AAGATTTTGAAAGGCATGGGTAACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCTTCA
*
7092 TGTTTCCTAAGACAGACA
323 TGTTTCCTAAGGCAGACA
** * * * *
7110 TTCAAGAATAATTTGTTTTAACCAAAAATGTAGAAAAATTTAACCTAAAATCAATTATGACATTA
1 TTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTA
* * * * * * ** *
7175 TAAAACCA-TAAAAGGTGAGTAATAAGGCTTTCAAAGGTATAGGTGGCTATAAATGGGCTTTTCT
66 TAAAACCATTTAAA-GCGAGTAATTAGGCTTTCGAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCT
* * * * * * *
7239 TGCTAATAATAGACTTTTTCTTCATGTTTCTTATGGCAGACATTCAATTATAATTTATTTTCA-C
130 TGCCAATGA-AG-CTTTTTCTTCACGTTTCTTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACC
* * *
7303 AATAAATAAAAAAAATTC-ACCATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCAGTTAAAGCGAGTAA
193 AA-AAATTAAAAAAATTCAACC-TAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAGCGAGTAA
* * * * *
7367 TAAAGCTTTT-AAAGGCATGGGTGACTATAAATACACTTTTCTTGCCAATGACA-GAC-TTTTCT
256 TTAAGATTTTGAAAGGCATGGGTAACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATGA-ATGGCTTTTTCT
* * * *
7429 TCATATTTCTTGAGGCAGTCA
320 TCATGTTTCCTAAGGCAGACA
* * * * * *
7450 TTCAATTATAATCTATTTTAACAAAAAATGTAAAAACAA-TCAACTTAAAATTAATTACGACATT
1 TTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAA-AATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATT
* ** * *
7514 ATAAAACTATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTAAAGGCATGAGTAACTACAAATGGA-TATTTC
65 ATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCGAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACT-TTTC
* * * * *
7578 TTACCAATGAATGGCTTTTTCTTCACATTTCTTAAGGCAGTCACTCAATTATAATCTTTTTTAAC
129 TTGCCAATGAA--GCTTTTTCTTCACGTTTCTTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAAC
* * * *
7643 TAAAAATGTAGAAAAATTCAACCTAAAA-CGAATTATGACATTATAAAACTATTT-AAGCCCAGT
192 CAAAAAT-TAAAAAAATTCAACCTAAAATC-AATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAG-CGAGT
* * * * * * * * *
7706 AATTAGGCTTTTG-AAGGCATAGGTAACTGTAAATGGGCCTTTCTTACTAATGAATGGCTTTTTC
254 AATTAAGATTTTGAAAGGCATGGGTAACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTC
* **
7770 TTCATGTTTCCTGAGATAGACA
319 TTCATGTTTCCTAAGGCAGACA
* *
7792 TTCAATTATAATCTATTTTAACTAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTA
1 TTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTA
* * * * * *
7857 TAAAACCATTTAAAGTGTGTAATAAGGCTTTCGAAGGTACGGGTGACTATAAATGGACTTTTCTT
66 TAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCGAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTT
* * ** * * * *
7922 GCCAATGAATCATTGTTTCTTCATGTTTCCCAAGGTAGACATTCAACTATAACCTATTTTAACCA
131 GCCAATGAAGC-TT-TTTCTTCACGTTTCTTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCA
* * * * * * *
7987 AAAATATAAAAGAATACAACATAAGATCACTTA-CAGGATTATAAAACTATTTAAAGTGAGTAAT
194 AAAAT-TAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGA-GATTATAAAACTATTTAAAGCGAGTAAT
* ** ** *
8051 TATGATGCTG-AAGGCATGGGTAACTATAAATAGACTTTTCTTATCAATAAATGGCTTTTTCTTC
257 TAAGATTTTGAAAGGCATGGGTAACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCTTC
** *
8115 ATGCCTGCTAAGGCAGACA
322 ATGTTTCCTAAGGCAGACA
* * * ** *
8134 TTCAATTATATTCAGTTTTAACCAAAAATATAAAAAAATTCAGTCAAAAATCAATTATGAGATTA
1 TTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTA
* * *
8199 TAAAACCATTTAAAGCAAGTAATTAGG-TGTTTGAAGACATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCT
66 TAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCT-TTCGAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCT
* * ** * * * *
8263 TGTCAATGAATGACTTTTT-TCTCAAGTTTCTCGAGGTAGACATTCAATTGTAGTATGTTTTAA-
130 TGCCAATGAA-G-CTTTTTCT-TCACGTTTCTTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAAC
* * **********
8326 -AAAGATGTAAAAAAATTCAACATAAAATCAATTANNNNNNNNNNAAA-TCATTTAAAGCGAGTA
192 CAAAAAT-TAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACT-ATTTAAAGCGAGTA
** * * * * ******** *
8389 A-TAAGGCTTTCAAA-GCAATGGGTGATTATAAATGGACTTTT-TTNNNNNNNNNNA-GCCTTTT
255 ATTAAGATTTTGAAAGGC-ATGGGTAACTATAAATAGACTTTTCTT--GCCAATGAATGGCTTTT
*
8450 TCTTTATG-----T----------
317 TCTTCATGTTTCCTAAGGCAGACA
* * * *
8459 TTC---T-T--TCTGTTTTCACTAAAAATGTAAACAAATTAAACCTAAAATCAATTATGAGATTA
1 TTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTA
********** * * * ** * *
8518 NNNNNNNNNNTAAATCGAGTAATTAGGCTTTCGAAGGCTTGAGTGGCTAGAAATGAACTTTTCTT
66 TAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCGAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTT
* ********** * * *
8583 GCCAATGAATGGCTTTTTCTTCATGTTTNNNNNNNNNNATATTCAATTATAATTTGTTTTAGCCA
131 GCCAATGAA--GCTTTTTCTTCACGTTTCTTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCA
** * * * *
8648 AAAATGCAAAAAATTCAACTTAAAATTAATTATGAGATTATAAAACTATTTAATGCGTGTAA-TA
194 AAAATTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAGCGAGTAATTA
** * * * * * * ** *
8712 AGGCTTTCAAAGGCATGAGTAACTATAAATGGACTTTACTTGTCAATAAATGTTTTTTTCTTCAC
259 AGATTTTGAAAGGCATGGGTAACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCTTCAT
* * *
8777 GTTTCCCAAGGTAAACA
324 GTTTCCTAAGGCAGACA
* * ** * * * *
8794 TTCAATTATAATCTGCTTTCACCAAAAGCGTAAAAAAGTTTAACCCAAAATCAATTATAAGATTA
1 TTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTA
* ** ** * *** * * *
8859 TAAAACCATTTAAAGTGAGTAATTA-----TAAATATACTTTTCTAGCCGATAAGT-GACTTTTT
66 TAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCGA-AGGCATGGGTA-ACTATAAATGGAC-TTTT
* * * * ** ** * * * * *
8918 CTTTGGGTTTCAAAAGTATGGGTAATTATAAATGGACCTTTCTTGCTAATGAATGGCTTTTTCTT
128 C-TT--G---CCAATG-A-AGCT--TT-T-TCTTCACGTTTC-T--TAAGGCA-GAC-----ATT
* * ** ** * * **
8983 CAAGTTTTCTAAGCTAGACATGCAATTATAATTTATTTTAACCAAAAATGTAAAACAATTTAATA
172 CAA---TTATAA--T---C-TG---TTTTAA-CCA----AAAA-----T-TAAAAAAATTCAACC
* ** * *
9048 TAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAA-TAAGGCTTTCAAATGCATGGGT
214 TAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAGCGAGTAATTAAGATTTTGAAAGGCATGGGT
* * * * * * *
9112 GACTATAAAT-GTACTTTTCTTGCCAATGACA-GTCTTTTCCTTCACGTTTCTTGAGGCAGTCA
279 AACTATAAATAG-ACTTTTCTTGCCAATGA-ATGGCTTTTTCTTCATGTTTCCTAAGGCAGACA
* * * *
9174 TTCAATTATAATCTATTTTAACCAAAAATATGAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGACATTA
1 TTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTA
* * * * *
9239 TAAAACCATTTTAAGCGAGTAATTAGGCTTCCGAAGGCATGGGTAACTATGAATAGACTTTTCTA
66 TAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCGAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTT
* *** ** * * * ** * * *
9304 GTCAATGAATAGCTTTTTCTTTGTGTTTCCCAAGACAGATATTTAACAATAATTTATTTTAACGA
131 GCCAATG-A-AGCTTTTTCTTCACGTTTCTTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCA
* * * * * * *
9369 AAAATATAGAAAAATTTAACTTAAAATTAATTATGAGATTACAAAACCATTTAAAGCGCGTAA-T
194 AAAAT-TAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAGCGAGTAATT
** * * * * * * * *
9433 AAGGCTTTCAAAGGCTTAGGTGACTATGAAA-GGACTTTTCTTGCCGATG-ATAGTCTTTTTTTT
258 AAGATTTTGAAAGGCATGGGTAACTAT-AAATAGACTTTTCTTGCCAATGAAT-GGCTTTTTCTT
* * * *
9496 TACGTTTCTCT-AGGCAAAAA
321 CATGTTTC-CTAAGGCAGACA
* * * * * * ** *
9516 ATGAATTATAATCTGTTTTCACCAAAAACGTAAAACAATTCAACCTAAAATCAGTTACAACATTA
1 TTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTA
* * * * * *
9581 TAAAACCATTTGAAA-CCAGTAATTACGATTTTGAAGGCATGGGTAACTATAAACGGACTTTTGT
66 TAAAACCATTT-AAAGCGAGTAATTAGGCTTTCGAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCT
* * *
9645 ATAG--AATGAATGACTTTTTCTTCATGTTTCTCAAGGCAGACATTCAATTATATTATAT-TTTT
130 -T-GCCAATGAA-G-CTTTTTCTTCACGTTTCTTAAGGCAGACATTCAATTATA--ATCTGTTTT
* * * * * * *
9707 AA-AAAAAAGTAAAAACATTTAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGTGAGT
189 AACCAAAAATTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAGCGAGT
* * * * * * *
9771 AATT-AGACCTTTG-AAGGCTTGAGTGAGTAGAAATTA-ACTTTTCTTGCCAATGAATGGATTTT
254 AATTAAGA-TTTTGAAAGGCATGGGTAACTATAAA-TAGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTT
* ** * *
9833 TCTTCACGTTTTTTAAGACAGATA
317 TCTTCATGTTTCCTAAGGCAGACA
* ** * * *
9857 TTCAATTATAATATGTTTTAGTCAAAAATAT-AAAAAATT-AACTTAAAATTAATTAT-AGGATT
1 TTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGA-GATT
** * * * * ** * *
9919 ATAAAATTATTTAAAGTGCGTAATAAGGATTTTAAAGGCATGGGTGACTATAAATAGACTTTTCT
65 ATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCGAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCT
* * ** * * * *
9984 TGCCAACGAATGCTTTTTTCTTCATGTTTCCCATGGCAGACATTCAATTATAATCTATTTTCACT
130 TGCCAATGAA-GC-TTTTTCTTCACGTTTCTTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACC
* * * * * * * * *
10049 AAAAACATAAAAAAATTTAACATAAAATTAATTACGAGATTATAAGACCATTTAAAGTGAGCAAT
193 AAAAA-TTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAGCGAGTAAT
* *
10114 TACGATTTTG-AAGGAATGGGTAACTAT--A-A-A-------TG-----G-A----TTTTTCTTC
257 TAAGATTTTGAAAGGCATGGGTAACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCTTC
10157 ATGTTTCCTAAGGCAGACA
322 ATGTTTCCTAAGGCAGACA
* *
10176 TTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAAAGTAGAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTA
1 TTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTA
* * * * * * * *
10241 TAAAACCATTTAAAGTGAGTAATTAGGCTTTTGAAGGCTTGAGTGACTAGAAATAGAATTTTTCT
66 TAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCGAAGGCATGGGTAACTATAAAT-GGACTTTTCT
* * ** * *
10306 T-TCAATGAATTACTTTTTCTTCACGTTTCCCAATGCAAACATTCAATTATAATCTGTTTTAACT
130 TGCCAATGAA--GCTTTTTCTTCACGTTTCTTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAAC-
* ** * * * *
10370 TAAAACGTAAAAAAGTTTAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAGAGCGAGTAAT
192 CAAAAATTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAGCGAGTAAT
* * * * *
10435 TAGGATTTTG-AAGGCATCGGTAACTACAAAT-GCACTTTTCTAGCCAATGAATAGCTTTTTCTT
257 TAAGATTTTGAAAGGCATGGGTAACTATAAATAG-ACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCTT
* * *
10498 CTTGTTCCCCAAGGCAGACA
321 CATGTTTCCTAAGGCAGACA
* * * * * * *
10518 TTCTATAATAATTTGTTTTAACCAAAAATATAAAAACATTCAACCTAAAATCAATTATTACATTA
1 TTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTA
* * * * * * *
10583 TAAAACTAATTAAAACGAGTAATTAGGCATTT-GAAGGCTTTGGTAACTATAAATGGACCTTCCT
66 TAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGC-TTTCGAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCT
* * * * * * *
10647 TACCAATGAATGGCTTTTTCTTTAGGTTTCCTAAGGTAGACATTCAATTATAATATGTATTAACC
130 TGCCAATGAA--GCTTTTTCTTCACGTTTCTTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACC
* ** * ********
10712 AAAAATGTAAAACAATTCAATATACAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAA-NNNNNNNN
193 AAAAAT-TAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAGCGAGTAAT
** ** * * * *
10776 NNAGGCTTTCAAAGGCATGGGTGACTATAAAT-GTA-TATTTCTTGCCAATGACA-GCCTTTTCC
257 TAAGATTTTGAAAGGCATGGGTAACTATAAATAG-ACT-TTTCTTGCCAATGA-ATGGCTTTTTC
** * * * *
10838 TTCACATTTCTTGATGCAGTCA
319 TTCATGTTTCCTAAGGCAGACA
* * * *
10860 TTCAATTATAATTTGTTTTAACAAAAAATGTAAAACAATTCAACCTAAAATCAATTATGACATTA
1 TTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTA
* * * **
10925 TAAAACTATTTTAAA-TGAGTAATTAGGCTTTTGAAGATATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCT
66 TAAAACCA-TTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCGAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCT
* * ** * * * *
10989 AGCCAATGAATGGCTTTTTCTTCAAGTTTCCCAAGGTAAACATTCAATAATAATTTGTTTTAA-C
130 TGCCAATGAA--GCTTTTTCTTCACGTTTCTTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACC
* * * *
11053 AAAAATATAGAAAAATTCAACCAAAAATCAATTATAAGATTATAAAAATATTTAAAGCGAGTAAT
193 AAAAAT-TAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAGCGAGTAAT
* * * * *
11118 T-AGACTTTTG-AAGGCTTGAGTGAC------TAGA-----------AATG---GACTTTTCCTT
257 TAAGA-TTTTGAAAGGCATGGGTAACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCTT
*
11161 CATGTTTTCC-AAGGAAGACA
321 CATG-TTTCCTAAGGCAGACA
* * * * * * * *
11181 TTCAATAATAATTTGTTTTAACCCAAAATATAGAAAAATTCAATCAAAAATTAATTATGAGATTA
1 TTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTA
********** * * * *
11246 TAAANNNNNNNNNNGCGAGTAATTAGGCTTTTGAAGGCGTGGGTAACTAGAAATGGACCTTTCTT
66 TAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCGAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTT
* * * * * *
11311 ACTAATGAATGGCTTTTTCTTCATGTTTCTTGAA-GTAGACATTCAATTATAGTTTGTTTTAACC
131 GCCAATGAA--GCTTTTTCTTCACGTTTCTT-AAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACC
*********** * * *
11375 AAANNNNNNNNNNNNTTCAACCTAAAATCAATTATGACATTATAAAACCATTTTAAGCGAGTAAT
193 AAA-AATTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAGCGAGTAAT
* * * * * * * *
11440 T-AGGTTTTTAAAGGCACGGATAACTATAAATGGACCTATCTTGCCAATGAATGGTTTTTTCTTC
257 TAAGATTTTGAAAGGCATGGGTAACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCTTC
** *
11504 ATGTTTCCTAAGATAAACA
322 ATGTTTCCTAAGGCAGACA
* * * * *
11523 TTCAATTGTAATCCGTTTTAACAAAAAATGT-AAAAAATTTAACCTAAAATCAATTATTAGATTA
1 TTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTA
* * * *
11587 TAAAACCATTTAAAGCGATTAATAAGGCTTTCGAAGGTATGGGTGACTATAAATGGACTTTTCTT
66 TAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCGAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTT
* * * * * *
11652 GTCAATGATAGCCTTGTTCTTCATGTTTCTTAAGG-AAACCATTCAATTGTAATATG-TTTAATC
131 GCCAATGA-AG-CTTTTTCTTCACGTTTCTTAAGGCAGA-CATTCAATTATAATCTGTTTTAA-C
* *
11715 TAAAAA-TATAAAAAATTC-ACCTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAA-TCATTTAAAGCGATT
192 CAAAAATTA-AAAAAATTCAACC-TAAAATCAATTATGAGATTATAAAACT-ATTTAAAGCGAGT
** * * * * *
11777 AA-TAAG-TTTTTCAAGGACAAGGGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGTCAATG-ATAGCTTTTT
254 AATTAAGATTTTGAAAGG-CATGGGTAACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATGAATGGC-TTTT
* ** * *
11839 TCTTCACGTTTTTTGAGGTAGACA
317 TCTTCATGTTTCCTAAGGCAGACA
** * **** ** * **** * *
11863 TTCAA-T-GGA-CT-TTTCT-AGC--AAATG-AATGACTTTTTCTTCTTGTTTTC--CTAGGCAG
1 TTCAATTATAATCTGTTT-TAACCAAAAATGTAA--AAAAATTCAACCTAAAATCAATTATG-AG
*** * * * ** * * *** *
11918 ATATTCAATAATAATTTGTTTTAA-CTAGAAATATGAAAACATTC-AA--CCTAAAATCAATTAT
62 --ATT--ATAA-AA-CCATTTAAAGCGAGTAAT-T--AGGCTTTCGAAGGCAT-GGGT-AACTAT
* * **** ** * * ***** * ** *
11979 GACATTGTAAAACCAATTAAAGTGAGTAATTAGGCATTTAAAGGCATGGGTAACAATGAATGGAC
116 -A-AATG---GA-C--TTTTCTTG-CCAATGAAGC-TTTTTCTTCA--CGTTTC--TTAA-GG-C
*** * * * * * ****** ** * * *
12044 CTTCCTTACCAATGAATAGGT-TTTTCTTTA-GGTTTCTTGGGGTAAACATTCAA-TTATAATCT
165 AGACATT--CAAT-TATA-ATCTGTT-TTAACCAAAAATT---AAAAAAATTCAACCTAAAATC-
** * * ** * * * * **
12106 GTTTTAATGAAAAATATAAAAAAATTCAACA-CAAAATCAATTATGAGA-TTAGAAAACCATTTG
221 -AATT-ATG-AGATTATAAAACTATTTAA-AGC-GAGT-AATTA--AGATTTTGAAAGGCA--TG
* * *
12169 AAGTTAGTAATAAGGCTTTCAAATGCATGGGTGACTGTAAATAGACTTTTCTTGTCAATGACA-G
276 --G---G---TAA--CTAT-AAAT--A-----GACT-T---T--TC-TT----GCCAATGA-ATG
* * * ** * * *
12233 CCTTTTGCTTCATATTTTTTGAGGTAGTCA
311 GCTTTTTCTTCATGTTTCCTAAGGCAGACA
* * * * * * **
12263 TTCAATTATAAACTATTTTAA-CAAAAA-ATACAAAAAGTTTAACCTAAAATTAATTATGTCATT
1 TTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTA-AAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATT
* * * * *
12326 ATTAAACCATTTTAAGCAAGTAACTAGGCTTTTC-AGGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTC
65 ATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGC-TTTCGAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTC
* * * ** * * * *
12390 TAGCCAATGAATGGTTTTTTCTTCATGTTTCCCAAAGCAGACATTCAATAATAATTTATTTTAAC
129 TTGCCAATGAA--GCTTTTTCTTCACGTTTCTTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAAC
* * * * * * *
12455 CAAAAATATAAGAAAATCCAATCAAAAATCAATGATGTGATTATAAATA-TATTTAAAGTGAGTA
192 CAAAAAT-TAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAA-ACTATTTAAAGCGAGTA
* * * * ** * * *
12519 ATTAGGCTTTT-AAAAGCTTGACTGACTAGAAATGGACTTTTTCTT--C---G--T-G--TTTTC
255 ATTAAGATTTTGAAAGGCATGGGTAACTATAAATAGAC-TTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTC
* * * **
12573 --CAAG---GC--AGACATTCA
319 TTCATGTTTCCTAAGGCAGACA
* * * * * ** ** ** ** * *
12588 AT-AATAAT-GTGTTTTAATAAAAAAATTAGA-G-AAATTCAA-TCAAAAATTAATTATGAGATT
1 TTCAATTATAAT-CTGTTTTAACCAAA--A-ATGTAAA-AAAATTC--AACCTAA-AATCA-ATT
* * * * ***** * * * ***
12648 ATAAAACTATTTAAAGTGCGTAATTAG-G-CT-TTTGAAGG---T-G-AGG-GT-AAC---TATA
57 ATGAGATTA-TAAAACCATTTAA--AGCGAGTAATT--AGGCTTTCGAAGGCATGGGTAACTATA
* * * * * *
12700 AATGGACCTTCCTTGCCAATGAATTACTTTTTCTTCATGTTT-TCTAAAGTAGACATTCAATTAT
117 AATGGACTTTTCTTGCCAATGAA--GCTTTTTCTTCACGTTTCT-TAAGGCAGACATTCAATTAT
* * * * *
12764 AATCTGTTTTAACTAAAAATCTAAAAAACATTTAGCCTAAAACCAATTATGAGATTATAAAACCA
179 AATCTGTTTTAACCAAAAAT-TAAAAAA-ATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTA
* * * * * * * * * * *
12829 TTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTG-AATGCTTGAGTGACTAGAAATGGA-TTTTTTTACCAATA
242 TTTAAAGCGAGTAATTAAGATTTTGAAAGGCATGGGTAACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATG
** * * *
12892 AATGGCTTTTTCTTCAAATTTCTTGAGGCAGATA
307 AATGGCTTTTTCTTCATGTTTCCTAAGGCAGACA
* * ** * * *
12926 TTCAATTATAACCTATTTTAATTATAAATGT-AAAAAATTCAACTTAAAATTAATTATGAGATTA
1 TTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTA
* * * * * ** *
12990 TAAAAACATTTAAAACGCGTAATAAGGCTTTCAAAGATATGGGTGACTATAAATGGACTTTTCTT
66 TAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCGAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTT
* * * * * * *
13055 GCCAACGAATACCTTTTTCTTCAAGTTTCTTGAGGAAGACATTCAATTATAATCTGCTTTCACCA
131 GCCAATG-A-AGCTTTTTCTTCACGTTTCTTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCA
* * * *
13120 AAAACATAAAAAAATTTAACATAAAATCAATTAT-AGGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAAT
194 AAAA-TTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGA-GATTATAAAACTATTTAAAGCGAGTAAT
* * * * * * *
13184 TAAAATTTTG-AAGGCATGGATAACTATAAATGGATTTTTCTTACCAATGAATAGATTTTTCTTC
257 TAAGATTTTGAAAGGCATGGGTAACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCTTC
13248 ATGTTTCCTAAGGCAGACA
322 ATGTTTCCTAAGGCAGACA
* * * ** * *
13267 TTCAATTATAATCTATTTTAACCAAAAAAGT-AAAAGATTCAATGTAAATTAAATTATGAGATTA
1 TTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTA
* * * * * * **
13331 TAAAGCTATTTAAAGCGACTAATTAGGATTTTGAAGGCAAGGGTAACTATAAACAGACGTTTT-T
66 TAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCGAAGGCATGGGTAACTATAAATGGAC-TTTTCT
* * ** ** * *
13395 AGTCAATGAATGGCTTTTTCTTCATATTTCCCAAGTCAGACATTCAATAATAAT-TGGTTTTAAC
130 TGCCAATGAA--GCTTTTTCTTCACGTTTCTTAAGGCAGACATTCAATTATAATCT-GTTTTAAC
* * * *
13459 AAAAAAAGTAGAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAA
192 -CAAAAATTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAGCGAGTAA
* * * * * * * * * * *
13524 TTAGGCTTTAG-AATGCTTGGGTGACTAGAAATAGATTTTTCTTACTAATGAAAGGCTTTTTCTT
256 TTAAGATTTTGAAAGGCATGGGTAACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCTT
** * *
13588 CACATTTCTTGAA-GCAGATA
321 CATGTTTCCT-AAGGCAGACA
* * * * ** * *
13608 TTCAATTATAATCTATTTTAGCCAAAAACGTAAAAAACTT-AATTTAAAATTAATTATGAGATGA
1 TTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTA
* * * * * * *
13672 TAAAAACACTTAAAGTGCA-TAATAAAGCTTTCAGACA--CATGGGTGACTATAAATGAACTTTT
66 TAAAACCATTTAAAGCG-AGTAATTAGGCTTTC-GA-AGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTT
* * * * * * *
13734 CTTGCTAGCAA--ATACCTTTTTTTTCACGTTTCTCAAGGAAGATATTCAATAATAATCTATTTT
128 CTTGC---CAATGA-AGCTTTTTCTTCACGTTTCTTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTT
* * * * * * * *
13797 CACCAAAAACGTAAAAATA-TCTAACATAAAATTAATTACGAGATTATAAAACCATTTAAAACGA
189 AACCAAAAA-TTAAAAAAATTC-AACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAGCGA
* * * * ** *
13861 GTAATTACGATTTTG-AAGACATGGGTAACTATACATGGTGTTTTCTTGCCAATGAATGGATTTT
252 GTAATTAAGATTTTGAAAGGCATGGGTAACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTT
*
13925 TCTTCATGTTTCCCAAGGCAGACA
317 TCTTCATGTTTCCTAAGGCAGACA
* * *
13949 TTAAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAATATTCAACCTAAAATAAATTATGAGATTA
1 TTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTA
* ** * * * * * *
14014 TAAAGCCATTTAAAATG-GCTAATTAGGATTTTGAAGCCGTGGCTAACTATAAATAGACTTTT-T
66 TAAAACCATTTAAAGCGAG-TAATTAGGCTTTCGAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCT
* * ** ** *
14077 CAGCCAACGAATTATTTTTTCTTCGTGTTT-TTGAAGGCAGACATTCAATAATAA--TGATTTTA
130 -TGCCAATGAA--GCTTTTTCTTCACGTTTCTT-AAGGCAGACATTCAATTATAATCTG-TTTTA
* * * *
14139 ACAAAAAATGTAGAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAA-TCATTTAAAGCAAG
190 ACCAAAAAT-TAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACT-ATTTAAAGCGAG
* * * * * * *
14203 TAA-TAAGGCTTTCGATA-GTATGGGTGACTATAAATAGACTTTTCTTACCAATG-ATAGCCTTT
253 TAATTAA-GATTTTGAAAGGCATGGGTAACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATGAAT-GGCTTT
** * * * *
14265 TTCTTCACATTTCTTCAGGTAGTCA
316 TTCTTCATGTTTCCTAAGGCAGACA
* * * *
14290 TCCGATTATAATTTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGACATTA
1 TTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTA
* * * * ** * *
14355 TAAAACTATTTTTTTGAAAGACCA-TTATAAAACTATTTAAAGTAAGTAATTACGCTTTTGAAGG
66 TAAAACCA----TTT-AAAG-CGAGTAATTAGGC--TTT--CG-AAG-------GC--ATG--GG
*** * *
14419 CATGGGTAACTTTAAATGGACATTTCTTGCCAATGAATGATTTTTTCTTCACGTTTCTTGAA-GC
109 --TAACT-A--T-AAATGGACTTTTCTTGCCAATGAA-G-CTTTTTCTTCACGTTTCTT-AAGGC
* * * *
14483 AGTCATTCAATTATAATATATTTT-ACCAAAAATATAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATAA
165 AGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAAT-TAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGA
* *
14547 CATTATAAAACTATTTTAAAG-GAGTAATT-AGACTTTTG-AAGGCATGGGTAACTATAAATGGA
229 GATTATAAAACTA-TTTAAAGCGAGTAATTAAGA-TTTTGAAAGGCATGGGTAACTATAAATAGA
* * * *
14609 CCTTTCTTGCAAATGAATGGC-TTTTCTTCATATTTCCTAAAGTC-GACA
292 CTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCTTCATGTTTCCT-AAGGCAGACA
* * *
14657 TTCAATTATAATCCGTTTTAACTAAATATGTAAAAAAATTCAACCTAAAAAT-AATTATGAGATT
1 TTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCT-AAAATCAATTATGAGATT
* * * * * *
14721 ATAATACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCGAATGCTTGGGTGACTAGAAATGAACTTTTTT
65 ATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCGAAGGCATGGGTAACTATAAATGGAC--TTTT
* * * * * * *
14786 TTTACAAATGAATGGCTTTTTCTTTATGTTTCTTAAGGCAGATATTCAATTATAATCTGTTTTAG
128 CTTGCCAATGAA--GCTTTTTCTTCACGTTTCTTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAA
* * ** * *
14851 CAAAAAATGT--AAAAATTCAACTTAAAATTGATTATGAAATTATAAAAAC-ATTTAAAGCGTGT
191 CCAAAAAT-TAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTAT-AAAACTATTTAAAGCGAGT
*** * * * * *
14913 AA-TAAGGCCTTCAAAGGCATGGGTGACTATAAGT-GAACTTTTCCTG-CAAAGAAAT-GCTTTT
254 AATTAAGATTTTGAAAGGCATGGGTAACTATAAATAG-ACTTTTCTTGCCAATG-AATGGC-TTT
* * *
14974 TTCTTCATATTTTCTAAGGAAGACA
316 TTCTTCATGTTTCCTAAGGCAGACA
* * * * * * *
14999 TTCAATTATAATCTATTTTCACCAAAAACGTAAATAAA-TCTAACATAAAATTAGTTATGAGATT
1 TTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTC-AACCTAAAATCAATTATGAGATT
* * * * * * * * *
15063 ATAAAACCTTTTATAGCGAGTAACTACGATTTTGAAGGCTTAGGTAACTATAAATGGATTTTTCT
65 ATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCGAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCT
* * * ** * *
15128 TGCCAATGAATAGATTTTTCCTCATGTTTCCCAAGGCAGACATTCAATTATAATTTGTTTTAAGC
130 TGCCAATG-A-AGCTTTTTCTTCACGTTTCTTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACC
* * * * * * *
15193 AAAAGTGTAAAAAGATTTAACGTAAAATAAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGACTAAT
193 AAAAAT-TAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAGCGAGTAAT
* * * ** *
15258 TAGGATTTTG-AAGGCATGGGTAACTATAAATAGTCTTTTCTAGCCAATGAACAGCTTTTTCTTT
257 TAAGATTTTGAAAGGCATGGGTAACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCTTC
* *
15322 AAGTTTTCC-AAGTCAGACA
322 ATG-TTTCCTAAGGCAGACA
* * * * *
15341 ATCAATAATAAT-TGGTTTTAACAAAAAATGTAAAAATATTCAATCTAAAATCAATTATGAGATT
1 TTCAATTATAATCT-GTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATT
* * * **
15405 ATAAAACCATTTAAAGCGAGTAGTAAGGCTTTCGAAGGCATGGGTGACTATAAATAAACTTTTCT
65 ATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCGAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCT
* * ** * *
15470 TGCCAATGACAGCCTTTTTCTTCACATTTCTTTAGGCATTCATTCGATTATAATTTGTTTTAATC
130 TGCCAATGA-AG-CTTTTTCTTCACGTTTCTTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAA-C
* * * *
15535 AAAAAAGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGACATTATAAAACTATTTAAAGCAAGTAAT
192 CAAAAATTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAGCGAGTAAT
* * * * * * * *
15600 TAAGCTTTT-AAAGGCATGGGTAGCTTTGAATGGACCTTTATTGCTAATGAATGGCTTTTTCTTC
257 TAAGATTTTGAAAGGCATGGGTAACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCTTC
* * * * *
15664 ATATTTCCTGAGGTAAATA
322 ATGTTTCCTAAGGCAGACA
* ** *
15683 TTCAATTATAATCTGTTTTAAGCAAAAA-AAAAAAACAATTCAACCTAAAATCGATTATGAGATT
1 TTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAA-AATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATT
* * * * *
15747 ATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTACGCTTTCGAATGCTTGGGTGACTAGAAATGGACTTTTCT
65 ATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCGAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCT
* * * * * *
15812 TGCCAACGAAAGGCTTTTTCTTCACGTTTCTTGAGGTAGATATTCAATTATAATCTATTTTAGCC
130 TGCCAATG-AA-GCTTTTTCTTCACGTTTCTTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACC
* * * *
15877 AAAAATGT-AAAACATTCAACTTAAAATTAATTATGAGATTATAAAAAC-ATTTAAAGCGCGT-A
193 AAAAAT-TAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTAT-AAAACTATTTAAAGCGAGTAA
* ** * * * * * * ** ** *
15939 -GAAGGCTTTCAAAAGCATGAGTGACTATAAATTGACTTTTCTTACCACCGAATAACTTTTTATT
256 TTAAGATTTTGAAAGGCATGGGTAACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCTT
* *
16003 CACGTTT-CTCAAGG-TGCACA
321 CATGTTTCCT-AAGGCAG-ACA
* * * ** * * * *
16023 TTCAATTATAATCTATTTTCACCCAAAACATAAAAAAATTTAACATAAAATTAATTACGAGATTA
1 TTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTA
* * * * ** *
16088 TAAAACTATTTAAAACGAGTAATTACGATTTTAAACGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTT
66 TAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCGAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTT
* * * ** *** * *
16153 GCCAATGAATAGATTTCTCTTCATGTTTCCCAATATAGACATTCAATTATAATATGTTTTAATCA
131 GCCAATG-A-AGCTTTTTCTTCACGTTTCTTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCA
* * ** * * * *
16218 AAAGTGT-AAAAAATTTAATTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAGCCATTTAAAGTGACTAATT
194 AAAAT-TAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAGCGAGTAATT
* * * * * *
16282 AGGATTTTG-AAGGCATGGGTAACTACAAATATACTTTTCTAGCCAATGAATGTCTTTTTCTTCT
258 AAGATTTTGAAAGGCATGGGTAACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCTTCA
16346 TGTTT-CTCAAGGCAGACA
323 TGTTTCCT-AAGGCAGACA
* * * * * * *
16364 TTCAATAATAAT-TGGTTTTCACTAAAAATAT-AAAAAATTCAACATCAAATCAATTATAAGATT
1 TTCAATTATAATCT-GTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATT
* * * * *
16427 ATAAAACCATTTAAAGTGAGTAATTAGGCTTTCGAATGCTTGAGTGACTATAAATGGACTTTT-T
65 ATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCGAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCT
* * * *
16491 CTG-CATATGAGTGGCTTTTTCTTCACGTTTTTTATA-GTAGATATTCAATTATAATCTGTTTTA
130 -TGCCA-ATGA--AGCTTTTTCTTCACGTTTCTTA-AGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTA
* * **
16554 GCCAAAAATGT-AAAAAATTCAACTTAAAATTGATTATGAGATTATAAAAAC-ATTTAAAGCGCA
190 ACCAAAAAT-TAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTAT-AAAACTATTTAAAGCG-A
** * * * * * *
16617 -TAA-TAAGGCTTTCAAAGGCATGGGTGACTATAAATGGACTTTT-TTACCAACGAATGCCTTTT
252 GTAATTAAGATTTTGAAAGGCATGGGTAACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTT
* ** * *
16679 TCTTTACCTTT-CTCGAGGAAGACA
317 TCTTCATGTTTCCT-AAGGCAGACA
* * * *** * * * *
16703 TTCAATTATAATCTATTTTCACAAAAAACAAAAAAAAATTTAACATAAAATCAATTACGGGATTA
1 TTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTA
* * ** * *
16768 TAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTACGATTTTAAACGCATGGGTAACTATAGATGGACTTTTCTT
66 TAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCGAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTT
*
16833 GTCAATGAA
131 GCCAATGAA
16842 TAGATTTCTC
Statistics
Matches: 9173, Mismatches: 2345, Indels: 1204
0.72 0.18 0.09
Matches are distributed among these distances:
319 178 0.02
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ACGTcount: A:0.38, C:0.13, G:0.13, T:0.35
Consensus pattern (340 bp):
TTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTA
TAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCGAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTT
GCCAATGAAGCTTTTTCTTCACGTTTCTTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAA
AATTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAGCGAGTAATTAAG
ATTTTGAAAGGCATGGGTAACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCTTCATGT
TTCCTAAGGCAGACA
Found at i:5516 original size:513 final size:511
Alignment explanation
Indices: 4383--31081 Score: 7772
Period size: 513 Copynumber: 51.8 Consensus size: 511
4373 TAATAAGGCT
** * * ** *
4383 TTCAATTATAATCAATTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGATATTA
1 TTCAATTATAATCTGTTTTAACTAAAAATATAAAAAAATAAAAC-TAAAATCAATTATGAGATTA
* * * * *
4448 TAAAACCATTTAAAGCTAGTAATTAGGCTTTTAGAGGCATGGGTAACTATAAATGGTCTTTTCTT
65 TAAAACTATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTAAAGGCATGGGTAACTATAAATAGACTTTTCTT
* * ** * ** * * * **
4513 ACCAATGAATAGCTTTTTCCTT-AGGTTTTTTGAGATAGACATTCAATTATAGTCTATTTTCATA
130 ACCAATGAATGGCTTTTT-CTTCATGTTTCCTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACC
* * ** * * *
4577 AAAAATGTAAAAAAATTCAACATAAAACCAATTATGGGATTATAAAACTATTGAAAGTGAGTAAT
194 AAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGACATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAAT
* * * * * * * * *
4642 AATGCTTTCAAAGGAATGGGTAA-TAATAAATAGACATTTCTTGCCAATGACAGC-CTTTCTTTA
259 AAGGCTTTTAAAGGCATAGGTAACT-ATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGATAGCTTTTTCTTCA
* * * * *
4705 TGTTTCTTGATGTAGACATTCAATTATAATTTGTTTTCACCAAAAATGT-AAAAAATTCAACTTA
323 TGTTTCTTAAGGTAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTA
********** * * * *
4769 AANNNNNNNNNNAGATTATAAAACCATTTCAAGCGAGTAATTAGGCCTTCGAAGGCATGGGTGAT
388 AAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCGAAGGCATGGGTGAC
* * * * *
4834 TATAATTAAACTTTTCTTGCTAATGAATGGC-TTTCTT-TTCATGTTTCCCAAGACAGAT-A
453 TATAAATAGACTTTTCTTGCCAATG-ATAGCATTT-TTCTTCATGTTTCCTAAGACAG-TCA
* * * * *
4893 TTCAATTATAATCTATTTTAAGTAAAAATGTAAAAAAATTAAATCCAAAATCAATTATGAGATTA
1 TTCAATTATAATCTGTTTTAACTAAAAATATAAAAAAA-TAAAACTAAAATCAATTATGAGATTA
* * * *
4958 TAAAACTATTTAAAGCGAGTAATTAAGATTTTGAAA-GTATGGGTAATTATAAATAGACTTTTCT
65 TAAAACTATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTT-AAAGGCATGGGTAACTATAAATAGACTTTTCT
* * * * *
5022 AACCAATGAATGGCTTTTTCTTCGTGTTTCCCAAGGCAGACATTCAATAATAAAT-TGTTTTAAT
129 TACCAATGAATGGCTTTTTCTTCATGTTTCCTAAGGCAGACATTCAATTAT-AATCTGTTTTAAC
* * * *
5086 CGAAAATGTAGAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGACATTATTAAACTATTTAAAGCGAGTAA
193 CAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGACATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAA
* * * *
5151 TAAGGCTTTCAAAGGCATAGGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGACAGCATTTTTCTTT
258 TAAGGCTTTTAAAGGCATAGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGATAGC-TTTTTCTTC
** * * ** * **********
5216 ACATTTGTTGAGGCGGTCATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATNNNNNNNNNNTCAACCT
322 ATGTTTCTTAAGGTAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCT
* * * * *
5281 AAAATCAATTATGACATTATAAAATCATTTAAAGTGAGTAATAAAGCTTTCAAAGGCATGGGTGA
387 AAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCGAAGGCATGGGTGA
* * * * *
5346 CTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATGATAGCATTTTTCTTTACGTTTCTTGAGGCAGTCA
452 CTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATGATAGCATTTTTCTTCATGTTTCCTAAGACAGTCA
* * ********* *
5406 TTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAANNNNNNNNNNCTAAAATCAATTATGATATTA
1 TTCAATTATAATCTGTTTTAACTAAAAATATAAA-AAAATAAAACTAAAATCAATTATGAGATTA
* * * **
5471 TAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGTTTTTAAAGACATGGGTAACTATAAATAGACCGTTCTT
65 TAAAACTATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTAAAGGCATGGGTAACTATAAATAGACTTTTCTT
* * * * *
5536 GCCAATGAATGGCTTTTTCTTCATGTTTCCTGAGGTAGACATTCAATTATAATATGTTTTAACAA
130 ACCAATGAATGGCTTTTTCTTCATGTTTCCTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCA
* * * * *
5601 AAAATGTAAAAAAAATCAACGTAAAATCAATTACGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATT
195 AAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGACATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATA
* * * * * * * * * *
5666 ATGATTTTAAAGGCATGGGTAACTATAAATGAATTTTTCTTGTCAATAAATGGCTTTCTCTTCAC
260 AGGCTTTTAAAGGCATAGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAAT-GATAGCTTTTTCTTCAT
* * * *
5731 GTTT-TCCAAGGTAGATATTAAATTATAAT-TAGTTTTAACCAAAAATATAAAAAAATTCAACCT
324 GTTTCT-TAAGGTAGACATTCAATTATAATCT-GTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCT
* * * * * * * *
5794 AAAATCAATAATGAGATTATAAAACCATTTAAAACAAGTAATTAGGCTTTTGGAGGCATAGGTAA
387 AAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCGAAGGCATGGGTGA
* * * * * * **
5859 CTATAAATGGGCTTTTCTTGCCAATGA-ATG-ACTTTGTCCTCAAGTTTCCTGAGACAAACA
452 CTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATGATA-GCA-TTTTTCTTCATGTTTCCTAAGACAGTCA
* * * *
5919 TTCAATTATAGTCTGTTTTAACAAAAAATATAAAAAAACTCAAAA-TAAAATTAATTATGGGATT
1 TTCAATTATAATCTGTTTTAACTAAAAATATAAAAAAA-T-AAAACTAAAATCAATTATGAGATT
* ** * * * * * ** *
5983 ATAAAACTATTAAAAGCGAGTAAGAAGGCTTTCAAAAGAATGGGTCAGTATAAATATCCTTTTTT
64 ATAAAACTATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTAAAGGCATGGGTAACTATAAATAGAC-TTTTC
* * ** * * * * *
6048 TTGCCAATG-ATAGCCTTTTTCTTCATGTTTATTGAGGTAGGCATTCAATTATAATCTGCTTTCA
128 TTACCAATGAAT-GGCTTTTTCTTCATGTTTCCTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAA
* * * **
6112 CCAAAAATGTAAAACAATTAAACTTAAAATCAATTATGATGTTATAAAACCATTTAAAGCGAGTA
192 CCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGACATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTA
** * * * * **
6177 ATAAAACTTTTGAAGGCTTGGGTAACTATAAATGGACTTTTTTTATCAATGATAGCCTTTTTCTT
257 ATAAGGCTTTTAAAGGCATAGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGATAG-CTTTTTCTT
* * * ** * **
6242 CACGTTTCCTAAGGTAGACATTCAATTATAATATGTTTTAAGTAGAAATGTAAAAAAGCTCAACC
321 CATGTTTCTTAAGGTAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACC
* * * * * * *
6307 TAAATTCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAGCGAGTGATTAGGCTTTCAAAGGCTTGAGTG
386 TAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCGAAGGCATGGGTG
* * * * * * *
6372 ACTAGAAATGGAATTTTCTTGCTAATAAATGGC--TTTTCTTCATGTTTCTTAAGACAGGT-A
451 ACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAAT-GATAGCATTTTTCTTCATGTTTCCTAAGACA-GTCA
* ** * * *
6432 TTCAATCATAATCTG-TTTAGGTAAAAATATAAAAAAATTAACCTAAAATCAATTACGAGATTAT
1 TTCAATTATAATCTGTTTTAACTAAAAATATAAAAAAATAAAACTAAAATCAATTATGAGATTAT
* ** * * * *
6496 -AAACTCATTTAAATCGAGTAATTAGGCTTTCGAAGGCTTGAGTGACTAGAAATAGACTTTTCTT
66 AAAACT-ATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTAAAGGCATGGGTAACTATAAATAGACTTTTCTT
* * * * * * * * * *
6560 GCCAATGAATAGC-TTTTCTTAACGTTTCTTGAGGTAGATATTCAATCATAATCTGTTTTAGCCA
130 ACCAATGAATGGCTTTTTCTTCATGTTTCCTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCA
* * * *
6624 AAAATG--AAAAAATTCAACATAATATCAATTATAAAATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATA
195 AAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGACATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATA
* * * * * *
6687 AGGCTTTTAAAGGAATCA-CTGACTATAAATGGACATTTCTTGCTAATAATAGCCTTTTTCTTCA
260 AGGCTTTTAAAGGCAT-AGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGATAG-CTTTTTCTTCA
* * * * *
6751 TATTTCTTAAGGTAGATATTCAATTATAATCTATTTTCACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACTTA
323 TGTTTCTTAAGGTAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTA
* * * * * *
6816 AACTCAGTTATTAAATTATAAAACTATTTAAAGCGAGTAACT-AGGCCTTCGAAGGCATGGGTGA
388 AAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAA-TAAGGCTTTCGAAGGCATGGGTGA
* * * * * * * * * *
6880 TTATAATTAGACTTTTCTTGCTAATGAATGGC-TTTTACTACATGTTTCCCAATATAGACA
452 CTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATG-ATAGCATTTTTCTTCATGTTTCCTAAGACAGTCA
* ** * * * *
6940 TTCAATTATAATCTGTTTTAA-TAAAAATATAAACCAGTTCAACCCAAAATCAATTATGAGATTC
1 TTCAATTATAATCTGTTTTAACTAAAAATATAAA-AAAATAAAACTAAAATCAATTATGAGATTA
* * * ** * *
7004 TAAAACTATTTAAAGCGAGTGATTAGGATTTTGAAGAAATGGGTAACGATAAATGGACTTTTC-T
65 TAAAACTATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTAAAGGCATGGGTAACTATAAATAGACTTTTCTT
* ** *
7068 AGCCAATGAATGGCTTTTTCTTCATGTTTCCTAAGACAGACATTCAAGAATAATTTGTTTTAACC
130 A-CCAATGAATGGCTTTTTCTTCATGTTTCCTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACC
* * * *
7133 AAAAATGTAGAAAAATTTAACCTAAAATCAATTATGACATTATAAAACCA-TAAAAGGTGAGTAA
194 AAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGACATTATAAAACCATTTAAA-GCGAGTAA
* * ** * * *
7197 TAAGGCTTTCAAAGGTATAGGTGGCTATAAATGGGCTTTTCTTGCTAATAATAGACTTTTTCTTC
258 TAAGGCTTTTAAAGGCATAGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGATAG-CTTTTTCTTC
* * * * * *
7262 ATGTTTCTTATGGCAGACATTCAATTATAATTTATTTTCA-CAATAAAT-AAAAAAAATTC-ACC
322 ATGTTTCTTAAGGTAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAA-AAATGTAAAAAAATTCAACC
* * **
7324 ATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCAGTTAAAGCGAGTAATAAAGCTTTTAAAGGCATGGGT
386 -TAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCGAAGGCATGGGT
* * * * * * *
7389 GACTATAAATACACTTTTCTTGCCAATGACAG-ACTTTTCTTCATATTTCTTGAGGCAGTCA
450 GACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATGATAGCATTTTTCTTCATGTTTCCTAAGACAGTCA
* * * * * * *
7450 TTCAATTATAATCTATTTTAACAAAAAATGTAAAAACAAT-CAACTTAAAATTAATTACGACATT
1 TTCAATTATAATCTGTTTTAACTAAAAATATAAAAA-AATAAAAC-TAAAATCAATTATGAGATT
* * *
7514 ATAAAACTATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTAAAGGCATGAGTAACTACAAATGGA-TATTTC
64 ATAAAACTATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTAAAGGCATGGGTAACTATAAATAGACT-TTTC
** * * * *
7578 TTACCAATGAATGGCTTTTTCTTCACATTTCTTAAGGCAGTCACTCAATTATAATCTTTTTTAAC
128 TTACCAATGAATGGCTTTTTCTTCATGTTTCCTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAAC
* * * *
7643 TAAAAATGTAGAAAAATTCAACCTAAAA-CGAATTATGACATTATAAAACTATTT-AAGCCCAGT
193 CAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATC-AATTATGACATTATAAAACCATTTAAAG-CGAGT
* * * * * * * *
7706 AATTAGGCTTTTGAAGGCATAGGTAACTGTAAATGGGCCTTTCTTACTAATGAATGGCTTTTTCT
256 AATAAGGCTTTTAAAGGCATAGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATG-ATAGCTTTTTCT
* * * * *
7771 TCATGTTTCCTGAGATAGACATTCAATTATAATCTATTTTAACTAAAAATGTAAAAAAATTCAAC
320 TCATGTTTCTTAAGGTAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAAC
* * * *
7836 CTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGTGTGTAATAAGGCTTTCGAAGGTACGGGT
385 CTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCGAAGGCATGGGT
* * * ** *
7901 GACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGA-ATCATTGTTTCTTCATGTTTCCCAAGGTAGACA
450 GACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATGATAGCATT-TTTCTTCATGTTTCCTAAGACAGTCA
* * * * * * * * *
7963 TTCAACTATAACCTATTTTAACCAAAAATATAAAAGAATACAACATAAGATCACTTA-CAGGATT
1 TTCAATTATAATCTGTTTTAACTAAAAATATAAAAAAATAAAAC-TAAAATCAATTATGA-GATT
* * * ** *
8027 ATAAAACTATTTAAAGTGAGTAATTATGATGCTGAAGGCATGGGTAACTATAAATAGACTTTTCT
64 ATAAAACTATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTAAAGGCATGGGTAACTATAAATAGACTTTTCT
* * ** * * *
8092 TATCAATAAATGGCTTTTTCTTCATGCCTGCTAAGGCAGACATTCAATTATATTCAGTTTTAACC
129 TACCAATGAATGGCTTTTTCTTCATGTTTCCTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACC
* ** * * *
8157 AAAAATATAAAAAAATTCAGTCAAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAAT
194 AAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGACATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAAT
* * * * *
8222 TAGG-TGTTTGAAGACATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGTCAATGA-ATGACTTTTT-TC
259 AAGGCT-TTTAAAGGCATAGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGATA-G-CTTTTTCT-
* ** * * * *
8284 TCAAGTTTCTCGAGGTAGACATTCAATTGTAGTATGTTTTAA--AAAGATGTAAAAAAATTCAAC
320 TCATGTTTCTTAAGGTAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAAC
* ********** * *
8347 ATAAAATCAATTANNNNNNNNNNAAATCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTC-AAAGCAATGGG
385 CTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCGAAGGC-ATGGG
* * ********* * *
8411 TGATTATAAATGGACTTTT-TTNNNNNNNNNNAGC--CTTT-TTC----TT--T---A-TGT--
449 TGACTATAAATAGACTTTTCTT-GCCAATGATAGCATTTTTCTTCATGTTTCCTAAGACAGTCA
* * * *
8459 TTC---T-T--TCTGTTTTCACTAAAAATGTAAACAAATTAAACCTAAAATCAATTATGAGATTA
1 TTCAATTATAATCTGTTTTAACTAAAAATATAAA-AAAATAAAACTAAAATCAATTATGAGATTA
********** * ** * * ** *
8518 NNNNNNNNNNTAAATCGAGTAATTAGGCTTTCGAAGGCTTGAGTGGCTAGAAAT-GAACTTTTCT
65 TAAAACTATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTAAAGGCATGGGTAACTATAAATAG-ACTTTTCT
* ********** * * *
8582 TGCCAATGAATGGCTTTTTCTTCATGTTTNNNNNNNNNNATATTCAATTATAATTTGTTTTAGCC
129 TACCAATGAATGGCTTTTTCTTCATGTTTCCTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACC
* * * * * * *
8647 AAAAATG-CAAAAAATTCAACTTAAAATTAATTATGAGATTATAAAACTATTTAATGCGTGTAAT
194 AAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGACATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAAT
* * * * *
8711 AAGGCTTTCAAAGGCAT-GAGTAACTATAAATGGACTTTACTTGTCAAT-AAATGTTTTTTTCTT
259 AAGGCTTTTAAAGGCATAG-GTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGATA-G-CTTTTTCTT
* ** * * * ** * *
8774 CACGTTTCCCAAGGTAAACATTCAATTATAATCTGCTTTCACCAAAAGCGTAAAAAAGTTTAACC
321 CATGTTTCTTAAGGTAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACC
* * *
8839 CAAAATCAATTATAAGATTATAAAACCATTTAAAGTGAGTAATTATAAATATACTTTTCTAGCCG
386 TAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAG--------------------TA----
* * * * * * *
8904 ATAAGTGACTTTTTCTTTGGGTTTCAAAAGTATGGGTAATTATAAATGGACCTTTCTTGCTAATG
427 ATAAG-G-C--TTTC-----G-----AAGGCATGGGTGACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATG
* * * *
8969 AATGGC-TTTTTCTTCAAGTTTTCTAAG-CTAGACA
478 -ATAGCATTTTTCTTCATGTTTCCTAAGAC-AGTCA
* * * * * * *
9003 TGCAATTATAATTTATTTTAACCAAAAATGTAAAACAATTTAATA-TAAAATCAATTATGAGATT
1 TTCAATTATAATCTGTTTTAACTAAAAATATAAAA-AA-ATAAAACTAAAATCAATTATGAGATT
* * * * *
9067 ATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCAAATGCATGGGTGACTATAAAT-GTACTTTTC
64 ATAAAACTATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTAAAGGCATGGGTAACTATAAATAG-ACTTTTC
* * * * * * * *
9131 TTGCCAATGACA-GTCTTTTCCTTCACGTTTCTTGAGGCAGTCATTCAATTATAATCTATTTTAA
128 TTACCAATGA-ATGGCTTTTTCTTCATGTTTCCTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAA
* * *
9195 CCAAAAATATGAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGACATTATAAAACCATTTTAAGCGAGTA
192 CCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGACATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTA
* *** * * * * *
9260 ATTAGGCTTCCGAAGGCATGGGTAACTATGAATAGACTTTTCTAGTCAATGAATAGCTTTTTCTT
257 ATAAGGCTTTTAAAGGCATAGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATG-ATAGCTTTTTCTT
** ** ** * * ** * * * * * * *
9325 TGTGTTTCCCAAGACAGATATTTAACAATAATTTATTTTAACGAAAAATATAGAAAAATTTAACT
321 CATGTTTCTTAAGGTAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACC
* * * * * *
9390 TAAAATTAATTATGAGATTACAAAACCATTTAAAGCGCGTAATAAGGCTTTCAAAGGCTTAGGTG
386 TAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCGAAGGCATGGGTG
* * * * * * ***
9455 ACTATGAAA-GGACTTTTCTTGCCGATGATAGTC-TTTTTTTTTACGTTTCTCT-AGGCAAAAA
451 ACTAT-AAATAGACTTTTCTTGCCAATGATAG-CATTTTTCTTCATGTTTC-CTAAGACAGTCA
* * * * ** * * * * ** *
9516 ATGAATTATAATCTGTTTTCACCAAAAACGTAAAACAATTCAACCTAAAATCAGTTACAACATTA
1 TTCAATTATAATCTGTTTTAACTAAAAATATAAAA-AAATAAAACTAAAATCAATTATGAGATTA
* * * * * ** *
9581 TAAAACCATTTGAAA-CCAGTAATTACGATTTTGAAGGCATGGGTAACTATAAACGGACTTTTGT
65 TAAAACTATTT-AAAGCGAGTAATTAGGCTTTTAAAGGCATGGGTAACTATAAATAGACTTTTCT
* * *
9645 ATA-GAATGAATGACTTTTTCTTCATGTTT-CTCAAGGCAGACATTCAATTATATTATAT-TTTT
129 -TACCAATGAATGGCTTTTTCTTCATGTTTCCT-AAGGCAGACATTCAATTATA--ATCTGTTTT
* * * * * *
9707 AA--AAAAAAGTAAAAACATTTAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGTGAG
190 AACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGACATTATAAAACCATTTAAAGCGAG
* * * * * * * * ** * *
9770 TAATTAGACCTTTGAAGGC-TTGAGTGAGTAGAAATTAACTTTTCTTGCCAATGAATGGATTTTT
255 TAATAAGGCTTTTAAAGGCATAG-GTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATG-ATAGCTTTTT
* * ** * * ** *
9834 CTTCACGTTTTTTAAGACAGATATTCAATTATAATATGTTTTAGTCAAAAATAT-AAAAAATT-A
318 CTTCATGTTTCTTAAGGTAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCA
* * ** * * * **
9897 ACTTAAAATTAATTAT-AGGATTATAAAATTATTTAAAGTGCGTAATAAGGATTTTAAAGGCATG
383 ACCTAAAATCAATTATGA-GATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCGAAGGCATG
* * * * * *
9961 GGTGACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAACGA-ATGCTTTTTTCTTCATGTTTCCCATGGCAGAC
447 GGTGACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATGATA-GCATTTTTCTTCATGTTTCCTAAGACAGTC
10025 A
511 A
* * * ** * *
10026 TTCAATTATAATCTATTTTCACTAAAAACATAAAAAAATTTAACATAAAATTAATTACGAGATTA
1 TTCAATTATAATCTGTTTTAACTAAAAATATAAAAAAATAAAAC-TAAAATCAATTATGAGATTA
* * * * * * * *
10091 TAAGACCATTTAAAGTGAGCAATTACGATTTTGAAGGAATGGGTAACTATAAAT-G---------
65 TAAAACTATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTAAAGGCATGGGTAACTATAAATAGACTTTTCTT
10146 ------G-A----TTTTTCTTCATGTTTCCTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCA
130 ACCAATGAATGGCTTTTTCTTCATGTTTCCTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCA
* * * * *
10200 AAAAAGTAGAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGTGAGTAATT
195 AAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGACATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATA
* * * * * * *
10265 AGGCTTTTGAAGGC-TTGAGTGACTAGAAATAGAATTTTTCTT-TCAATGAATTA-CTTTTTCTT
260 AGGCTTTTAAAGGCATAG-GTAACTATAAAT-GGACTTTTCTTGCCAATG-A-TAGCTTTTTCTT
* ** * * * ** * * *
10327 CACGTTTCCCAATGCAAACATTCAATTATAATCTGTTTTAACTTAAAACGTAAAAAAGTTTAACC
321 CATGTTTCTTAAGGTAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACC
* * * * * *
10392 TAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAGAGCGAGTAATTAGGATTTTGAAGGCATCGGTA
386 TAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCGAAGGCATGGGTG
* * * * * * *
10457 ACTACAAAT-GCACTTTTCTAGCCAATGAATAGC-TTTTTCTTCTTGTTCCCCAAGGCAGACA
451 ACTATAAATAG-ACTTTTCTTGCCAATG-ATAGCATTTTTCTTCATGTTTCCTAAGACAGTCA
* * * * * * * * *
10518 TTCTATAATAATTTGTTTTAACCAAAAATATAAAAACATTCAACCTAAAATCAATTATTACATTA
1 TTCAATTATAATCTGTTTTAACTAAAAATATAAAAA-AATAAAACTAAAATCAATTATGAGATTA
* * * * * * * * *
10583 TAAAACTAATTAAAACGAGTAATTAGGCATTTGAAGGCTTTGGTAACTATAAATGGACCTTCCTT
65 TAAAACTATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTAAAGGCATGGGTAACTATAAATAGACTTTTCTT
* * * * *
10648 ACCAATGAATGGCTTTTTCTTTAGGTTTCCTAAGGTAGACATTCAATTATAATATGTATTAACCA
130 ACCAATGAATGGCTTTTTCTTCATGTTTCCTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCA
* ** * * * **********
10713 AAAATGTAAAACAATTCAATATACAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAANNNNNNNNNN
195 AAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGACATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATA
* * * * * *
10778 AGGCTTTCAAAGGCATGGGTGACTATAAATGTA-TATTTCTTGCCAATGACAGCCTTTTCCTTCA
260 AGGCTTTTAAAGGCATAGGTAACTATAAATGGACT-TTTCTTGCCAATGATAG-CTTTTTCTTCA
** * * * * * * *
10842 CATTTCTTGATGCAGTCATTCAATTATAATTTGTTTTAACAAAAAATGTAAAACAATTCAACCTA
323 TGTTTCTTAAGGTAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTA
* * * * * ** *
10907 AAATCAATTATGACATTATAAAACTATTTTAAA-TGAGTAATTAGGCTTTTGAAGATATGGGTAA
388 AAATCAATTATGAGATTATAAAACCA-TTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCGAAGGCATGGGTGA
* * * * * ** **
10971 CTATAAATGGACTTTTCTAGCCAATGAATGGC-TTTTTCTTCAAGTTTCCCAAGGTAAACA
452 CTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATG-ATAGCATTTTTCTTCATGTTTCCTAAGACAGTCA
* * * * * * *
11031 TTCAATAATAATTTGTTTTAAC-AAAAATATAGAAAAATTCAACCAAAAATCAATTATAAGATTA
1 TTCAATTATAATCTGTTTTAACTAAAAATATA-AAAAAATAAAACTAAAATCAATTATGAGATTA
* * * * * *
11095 TAAAAATATTTAAAGCGAGTAATTAGACTTTTGAAGGCTTGAGTGAC------TAG---------
65 TAAAACTATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTAAAGGCATGGGTAACTATAAATAGACTTTTCTT
* * * * *
11145 A--AATG---GACTTTTCCTTCATGTTTTCC-AAGGAAGACATTCAATAATAATTTGTTTTAACC
130 ACCAATGAATGGCTTTTTCTTCATG-TTTCCTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACC
* * * * * * * **********
11204 CAAAATATAGAAAAATTCAATCAAAAATTAATTATGAGATTATAAANNNNNNNNNNGCGAGTAAT
194 AAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGACATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAAT
* * * * * * * * *
11269 TAGGCTTTTGAAGGCGTGGGTAACTAGAAATGGACCTTTCTTACTAATGAATGGCTTTTTCTTCA
259 AAGGCTTTTAAAGGCATAGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATG-ATAGCTTTTTCTTCA
* * ************
11334 TGTTTCTTGAA-GTAGACATTCAATTATAGTTTGTTTTAACCAAANNNNNNNNNNNNTTCAACCT
323 TGTTTCTT-AAGGTAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCT
* * * * ** * * *
11398 AAAATCAATTATGACATTATAAAACCATTTTAAGCGAGTAATTAGGTTTTTAAAGGCACGGATAA
387 AAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCGAAGGCATGGGTGA
* * * ** * **
11463 CTATAAATGGACCTATCTTGCCAATGA-ATGGTTTTTTCTTCATGTTTCCTAAGATAAACA
452 CTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATGATA-GCATTTTTCTTCATGTTTCCTAAGACAGTCA
* * * * * * * *
11523 TTCAATTGTAATCCGTTTTAACAAAAAATGTAAAAAATTTAACCTAAAATCAATTATTAGATTAT
1 TTCAATTATAATCTGTTTTAACTAAAAATATAAAAAAATAAAACTAAAATCAATTATGAGATTAT
* * * ** * * * *
11588 AAAACCATTTAAAGCGATTAATAAGGCTTTCGAAGGTATGGGTGACTATAAATGGACTTTTCTTG
66 AAAACTATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTAAAGGCATGGGTAACTATAAATAGACTTTTCTTA
* * * * * * *
11653 TCAATG-ATAGCCTTGTTCTTCATGTTTCTTAAGG-AAACCATTCAATTGTAATATG-TTTAATC
131 CCAATGAAT-GGCTTTTTCTTCATGTTTCCTAAGGCAGA-CATTCAATTATAATCTGTTTTAA-C
* * * * *
11715 TAAAAATAT-AAAAAATTC-ACCTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAATCATTTAAAGCGATTA
193 CAAAAATGTAAAAAAATTCAACC-TAAAATCAATTATGACATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTA
* * * *
11778 ATAA-GTTTTTCAAGGACA-AGGGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGTCAATGATAGCTTTTTTC
257 ATAAGGCTTTTAAAGG-CATA-GGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGATAGC-TTTTTC
* * * ** * ******
11841 TTCACGTTTTTTGAGGTAGACATTCAA-T-GGA-CT-TTTCT-AGCAAATGAATG-ACTTTTTCT
319 TTCATGTTTCTTAAGGTAGACATTCAATTATAATCTGTTT-TAACCAAA--AATGTA-AAAAAAT
** * *
11900 TCTTGTTTTCCTAGGCAGATATTCAATAATAATTTGTTTTAACTAGAAATATGAAAA-CA-TTCA
380 TC-----AACCTA---A-A-A-TCAAT--T-A--TG--------AG-ATTAT-AAAACCATTTAA
* * * * * * ** ** * * * * *** *
11963 ACCTAAAATCAATTATGACATTGT-AAAACCAATTAAAGTGA--GTAATTAGGCATTTAAAGGC-
419 AGC--GAGT-AA-TAAGGC-TT-TCGAAGGC-A-T-GGGTGACTATAAATAGACTTTTCTTGCCA
* * *** * * * **
12024 ATGGGTAACAATGAATGGACCTTC--CTTACC-AATGAATAGGTTT
475 AT-GATAGC-AT---T-TTTCTTCATGTTTCCTAA-G-ACA-GTCA
* * ** * *
12067 TTC-TTTAGGT-TTCTTGGGGTAAACATTCAATTATAATCTGTTTTAATGAAAAATATAAA--AA
1 TTCAATTA--TAATC-T-GTTTTAAC--T-AA--A-AA-----TATAA--AAAAATA-AAACTAA
** * * * * ** * * * **
12128 AATTCAACACAAAATCA-ATTATGAGATTA-GAAAACCATTTGAAGTTAGTAATAAGGCTTTCAA
48 AA-T---CA-ATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAGC----G-AG-TA--ATTAGGCTTTT-AA
* * * ** * * * ** *
12191 ATGCATGGGTGACTGTAAATAGACTTTTCTTGTCAATGACA-GCCTTTTGCTTCATATTTTTTGA
99 AGGCATGGGTAACTATAAATAGACTTTTCTTACCAATGA-ATGGCTTTTTCTTCATGTTTCCTAA
* * * * * * * *
12255 GGTAGTCATTCAATTATAAACTATTTTAA-CAAAAA-ATACAAAAAGTTTAACCTAAAATTAATT
163 GGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTA-AAAAAATTCAACCTAAAATCAATT
* * * * * * *
12318 ATGTCATTATTAAACCATTTTAAGCAAGTAACT-AGGCTTTTCAGGGCATGGGTAACTATAAATG
227 ATGACATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAA-TAAGGCTTTTAAAGGCATAGGTAACTATAAATG
* * * ** * * * *
12382 GACTTTTCTAGCCAATGAATGGTTTTTTCTTCATGTTTCCCAAAGCAGACATTCAATAATAATTT
291 GACTTTTCTTGCCAATG-ATAGCTTTTTCTTCATGTTTCTTAAGGTAGACATTCAATTATAATCT
* * * * * * * * *
12447 ATTTTAACCAAAAATATAAGAAAATCCAATCAAAAATCAATGATGTGATTATAAATA-TATTTAA
355 GTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAA-ACCATTTAA
* * ** * * * *
12511 AGTGAGTAATTAGGCTTTTAAAAGC-T---TGAC------T-GA-----CTAG-AAATG-GA-C-
419 AGCGAGTAATAAGGCTTTCGAAGGCATGGGTGACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATGATAGCA
* * *
12556 TTTTTCTTCGTGTTTTCC-AAGGCAGACA
484 TTTTTCTTCATG-TTTCCTAAGACAGTCA
* * * * * * * * *
12584 TTCAATAATAATGTGTTTTAA-TAAAAAAATTAGAGAAATTCAATCAAAAATTAATTATGAGATT
1 TTCAATTATAATCTGTTTTAACTAAAAATA-TA-AAAAAATAAAACTAAAATCAATTATGAGATT
* * * * * * *
12648 ATAAAACTATTTAAAGTGCGTAATTAGGCTTTTGAAGGTGA-GGGTAACTATAAATGGACCTTCC
64 ATAAAACTATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTAAAGG-CATGGGTAACTATAAATAGACTTTTC
* ** * * *
12712 TTGCCAATGAATTACTTTTTCTTCATGTTTTCTAAAGTAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAAC
128 TTACCAATGAATGGCTTTTTCTTCATGTTTCCTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAAC
* * * * * *
12777 TAAAAATCTAAAAAACATTTAGCCTAAAACCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTA
193 CAAAAATGTAAAAAA-ATTCAACCTAAAATCAATTATGACATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTA
* * * * * * * * * *
12842 ATTAGGCTTTTGAATGC-TTGAGTGACTAGAAATGGA-TTTTTTTACCAATAAATGGCTTTTTCT
257 ATAAGGCTTTTAAAGGCATAG-GTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAAT-GATAGCTTTTTCT
** * * * * * ** *
12905 TCAAATTTCTTGAGGCAGATATTCAATTATAACCTATTTTAATTATAAATGT-AAAAAATTCAAC
320 TCATGTTTCTTAAGGTAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAAC
* * * * * * **
12969 TTAAAATTAATTATGAGATTATAAAAACATTTAAAACGCGTAATAAGGCTTTCAAAGATATGGGT
385 CTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCGAAGGCATGGGT
* * * * * * *
13034 GACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAACGAATA-CCTTTTTCTTCAAGTTTCTTGAGGA-AGACA
450 GACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATG-ATAGCATTTTTCTTCATGTTTCCT-AAGACAGTCA
* * * * **
13096 TTCAATTATAATCTGCTTTCACCAAAAACATAAAAAAATTTAACATAAAATCAATTAT-AGGATT
1 TTCAATTATAATCTGTTTTAACTAAAAATATAAAAAAATAAAAC-TAAAATCAATTATGA-GATT
* *** * * * *
13160 ATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAAAATTTTGAAGGCATGGATAACTATAAATGGATTTTTCT
64 ATAAAACTATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTAAAGGCATGGGTAACTATAAATAGACTTTTCT
* * *
13225 TACCAATGAATAGATTTTTCTTCATGTTTCCTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTATTTTAACC
129 TACCAATGAATGGCTTTTTCTTCATGTTTCCTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACC
* * ** * * * * * *
13290 AAAAAAGT-AAAAGATTCAATGTAAATTAAATTATGAGATTATAAAGCTATTTAAAGCGACTAAT
194 AAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGACATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAAT
* * * ** * * *
13354 TAGGATTTTGAAGGCA-AGGGTAACTATAAACAGACGTTTT-TAGTCAATGAATGGCTTTTTCTT
259 AAGGCTTTTAAAGGCATA-GGTAACTATAAATGGAC-TTTTCTTGCCAATG-ATAGCTTTTTCTT
* ** * * * *
13417 CATATTTCCCAA-GTCAGACATTCAATAATAAT-TGGTTTTAACAAAAAAAGTAGAAAAATTCAA
321 CATGTTTCTTAAGGT-AGACATTCAATTATAATCT-GTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAA
* * * *
13480 CCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTAGAATGCTTGGG
384 CCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCGAAGGCATGGG
* * * * * ** *
13545 TGACTAGAAATAGATTTTTCTTACTAATGAAAGGC-TTTTTCTTCACATTTCTTGAAG-CAGAT-
449 TGACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATGATA-GCATTTTTCTTCATGTTTCCT-AAGACAG-TC
13607 A
511 A
* * * ** * * ** * *
13608 TTCAATTATAATCTATTTTAGCCAAAAACGTAAAAAACTTAATTTAAAATTAATTATGAGATGAT
1 TTCAATTATAATCTGTTTTAACTAAAAATATAAAAAAATAAAACTAAAATCAATTATGAGATTAT
* * * * * * ** *
13673 AAAAAC-ACTTAAAGTGCA-TAATAAAGCTTTCAGACACATGGGTGACTATAAAT-GAACTTTTC
66 -AAAACTATTTAAAGCG-AGTAATTAGGCTTTTAAAGGCATGGGTAACTATAAATAG-ACTTTTC
* * *** ** * * * * * * *
13735 TTGCTAGCAAATACCTTTTTTTTCACGTTT-CTCAAGGAAGATATTCAATAATAATCTATTTTCA
128 TTACCAATGAATGGCTTTTTCTTCATGTTTCCT-AAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAA
* * * * * * *
13799 CCAAAAACGTAAAAATA-TCTAACATAAAATTAATTACGAGATTATAAAACCATTTAAAACGAGT
192 CCAAAAATGTAAAAAAATTC-AACCTAAAATCAATTATGACATTATAAAACCATTTAAAGCGAGT
* * * * * * * ** * *
13863 AATTACGATTTTGAAGACATGGGTAACTATACATGGTGTTTTCTTGCCAATGAATGGATTTTTCT
256 AATAAGGCTTTTAAAGGCATAGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATG-ATAGCTTTTTCT
** * * *
13928 TCATGTTTCCCAAGGCAGACATTAAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAATATTCAAC
320 TCATGTTTCTTAAGGTAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAAC
* * ** * * * * * *
13993 CTAAAATAAATTATGAGATTATAAAGCCATTTAAAATG-GCTAATTAGGATTTTGAAGCCGTGGC
385 CTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAG-TAATAAGGCTTTCGAAGGCATGGG
* * * ** * * * *
14057 TAACTATAAATAGACTTTT-TCAGCCAACGA-ATTATTTTTTCTTCGTGTTT-TTGAAGGCAGAC
449 TGACTATAAATAGACTTTTCT-TGCCAATGATAGCA-TTTTTCTTCATGTTTCCT-AAGACAGTC
14119 A
511 A
* * * * **
14120 TTCAATAATAA--TGATTTTAACAAAAAATGTAGAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATT
1 TTCAATTATAATCTG-TTTTAACTAAAAATATAAAAAAATAAAAC-TAAAATCAATTATGAGATT
* * * * * *
14183 ATAAAA-TCATTTAAAGCAAGTAATAAGGCTTTCGATA-GTATGGGTGACTATAAATAGACTTTT
64 ATAAAACT-ATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTT-TAAAGGCATGGGTAACTATAAATAGACTTTT
* ** * * * * * * *
14246 CTTACCAATG-ATAGCCTTTTTCTTCACATTTCTTCAGGTAGTCATCCGATTATAATTTGTTTTA
127 CTTACCAATGAAT-GGCTTTTTCTTCATGTTTCCTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTA
14310 ACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGACATTATAAAACTATTTTTTTGAAAG
191 ACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAC---AT-----TA------T-AAA-
* * * * * *
14375 ACCATTATAAAACTATTTAAAGTAAGTAATTACGCTTTTGAAGGCATGGGTAACTTTAAATGGAC
240 ACCATT-TAAAGC--------G--AGTAATAAGGCTTTTAAAGGCATAGGTAACTATAAATGGAC
* * * * * * *
14440 ATTTCTTGCCAATGA-ATGATTTTTTCTTCACGTTTCTTGAA-GCAGTCATTCAATTATAATATA
294 TTTTCTTGCCAATGATA-G-CTTTTTCTTCATGTTTCTT-AAGGTAGACATTCAATTATAATCTG
* * * *
14503 TTTT-ACCAAAAATATAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATAACATTATAAAACTATTTTAAA
356 TTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCA-TTTAAA
* * * * * * * *
14567 G-GAGTAATTAGACTTTTGAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACCTTTCTTGCAAATGAATGGC-
420 GCGAGTAATAAGGCTTTCGAAGGCATGGGTGACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATG-ATAGCA
* * *
14630 -TTTTCTTCATATTTCCTAAAGTC-GACA
484 TTTTTCTTCATGTTTCCT-AAGACAGTCA
* * * * *
14657 TTCAATTATAATCCGTTTTAACTAAATATGTAAAAAAATTCAACCTAAAAAT-AATTATGAGATT
1 TTCAATTATAATCTGTTTTAACTAAAAATATAAAAAAA-TAAAACT-AAAATCAATTATGAGATT
* * ** * * * *
14721 ATAATACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCGAATGCTTGGGTGACTAGAAAT-GAACTTTTT
64 ATAAAACTATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTAAAGGCATGGGTAACTATAAATAG-AC--TTT
* * * * *
14785 TTTTACAAATGAATGGCTTTTTCTTTATGTTTCTTAAGGCAGATATTCAATTATAATCTGTTTTA
126 TCTTACCAATGAATGGCTTTTTCTTCATGTTTCCTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTA
* * * ** * * *
14850 GCAAAAAATGT--AAAAATTCAACTTAAAATTGATTATGAAATTATAAAAACATTTAAAGCGTGT
191 ACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGACATTATAAAACCATTTAAAGCGAGT
* * * * * * * * *
14913 AATAAGGCCTTCAAAGGCATGGGTGACTATAAGTGAACTTTTCCTG-CAAAGAAATGCTTTTTTC
256 AATAAGGCTTTTAAAGGCATAGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGATA-GC-TTTTTC
* * * * * *
14977 TTCATATTT-TCTAAGGAAGACATTCAATTATAATCTATTTTCACCAAAAACGTAAATAAA-TCT
319 TTCATGTTTCT-TAAGGTAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTC-
* * * * * * * * *
15040 AACATAAAATTAGTTATGAGATTATAAAACCTTTTATAGCGAGTAACT-ACGATTTTGAAGGCTT
382 AACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAA-TAAGGCTTTCGAAGGCAT
* * * * * * * *
15104 AGGTAACTATAAATGGATTTTTCTTGCCAATGAATAG-ATTTTTCCTCATGTTTCCCAAGGCAGA
446 GGGTGACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATG-ATAGCATTTTTCTTCATGTTTCCTAAGACAGT
15168 CA
510 CA
* * * * ** *
15170 TTCAATTATAATTTGTTTTAAGC-AAAAGTGTAAAAAGATTTAACGTAAAATAAATTATGAGATT
1 TTCAATTATAATCTGTTTTAA-CTAAAAATATAAAAAAATAAAAC-TAAAATCAATTATGAGATT
* * * * *
15234 ATAAAACCATTTAAAGCGACTAATTAGGATTTTGAAGGCATGGGTAACTATAAATAGTCTTTTC-
64 ATAAAACTATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTAAAGGCATGGGTAACTATAAATAGACTTTTCT
** * * * * *
15298 TAGCCAATGAACAGCTTTTTCTTTAAGTTTTCC-AAGTCAGACAATCAATAATAAT-TGGTTTTA
129 TA-CCAATGAATGGCTTTTTCTTCATG-TTTCCTAAGGCAGACATTCAATTATAATCT-GTTTTA
* * * *
15361 ACAAAAAATGTAAAAATATTCAATCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGT
191 ACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGACATTATAAAACCATTTAAAGCGAGT
* ** * * ** *
15426 AGTAAGGCTTTCGAAGGCATGGGTGACTATAAATAAACTTTTCTTGCCAATGACAGCCTTTTTCT
256 AATAAGGCTTTTAAAGGCATAGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGATAG-CTTTTTCT
** * * ** * * * *
15491 TCACATTTCTTTAGGCATTCATTCGATTATAATTTGTTTTAATCAAAAAAGTAAAAAAATTCAAC
320 TCATGTTTCTTAAGGTAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAAC
* * * **
15556 CTAAAATCAATTATGACATTATAAAACTATTTAAAGCAAGTAATTAA-GCTTTTAAAGGCATGGG
385 CTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAA-TAAGGCTTTCGAAGGCATGGG
* * * * * * * * * *
15620 T-AGCTTTGAATGGACCTTTATTGCTAATGAATGGC-TTTTTCTTCATATTTCCTGAGGTA-AAT
449 TGA-CTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATG-ATAGCATTTTTCTTCATGTTTCCT-AAG-ACAGT
15682 -A
510 CA
* * * *
15683 TTCAATTATAATCTGTTTTAAGC-AAAAA-AAAAAAACAATTCAACCTAAAATCGATTATGAGAT
1 TTCAATTATAATCTGTTTTAA-CTAAAAATATAAAAA-AA-TAAAACTAAAATCAATTATGAGAT
* * ** * * * * *
15746 TATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTACGCTTTCGAATGCTTGGGTGACTAGAAATGGACTTTTC
63 TATAAAACTATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTAAAGGCATGGGTAACTATAAATAGACTTTTC
* * * * * * * * * *
15811 TTGCCAACGAAAGGCTTTTTCTTCACGTTTCTTGAGGTAGATATTCAATTATAATCTATTTTAGC
128 TTACCAATGAATGGCTTTTTCTTCATGTTTCCTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAAC
* * * * * *
15876 CAAAAATGT-AAAACATTCAACTTAAAATTAATTATGAGATTATAAAAACATTTAAAGCGCGT-A
193 CAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGACATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAA
* * * * * * ** * *
15939 GAAGGCTTTCAAAAGCAT-GAGTGACTATAAATTGACTTTTCTTACCACCGAATAACTTTTTATT
258 TAAGGCTTTTAAAGGCATAG-GTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATG-ATAGCTTTTTCTT
* * * * * ** *
16003 CACGTTTCTCAAGGT-GCACATTCAATTATAATCTATTTTCACCCAAAACATAAAAAAATTTAAC
321 CATGTTTCTTAAGGTAG-ACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAAC
* * * * * * * * ** *
16067 ATAAAATTAATTACGAGATTATAAAACTATTTAAAACGAGTAATTACGATTTTAAACGCATGGGT
385 CTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCGAAGGCATGGGT
* * * * * * *
16132 AACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATAG-ATTTCTCTTCATGTTTCCCAATATAGACA
450 GACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATG-ATAGCATTTTTCTTCATGTTTCCTAAGACAGTCA
* * * * * **
16194 TTCAATTATAATATGTTTTAA-TCAAAAGTGTAAAAAATTTAATTTAAAATCAATTATGAGATTA
1 TTCAATTATAATCTGTTTTAACT-AAAAATATAAAAAAATAAAACTAAAATCAATTATGAGATTA
* * * * * * * *
16258 TAAAGCCATTTAAAGTGACTAATTAGGATTTTGAAGGCATGGGTAACTACAAATATACTTTTC-T
65 TAAAACTATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTAAAGGCATGGGTAACTATAAATAGACTTTTCTT
* * * *
16322 AGCCAATGAATGTCTTTTTCTTCTTGTTT-CTCAAGGCAGACATTCAATAATAAT-TGGTTTTCA
130 A-CCAATGAATGGCTTTTTCTTCATGTTTCCT-AAGGCAGACATTCAATTATAATCT-GTTTTAA
* * * * * * *
16385 CTAAAAATAT-AAAAAATTCAACATCAAATCAATTATAAGATTATAAAACCATTTAAAGTGAGTA
192 CCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGACATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTA
* ** * * * *
16449 ATTAGGCTTTCGAATGC-TTGAGTGACTATAAATGGACTTTT-TCTG-CATATGAGTGGCTTTTT
257 ATAAGGCTTTTAAAGGCATAG-GTAACTATAAATGGACTTTTCT-TGCCA-ATGA-TAGCTTTTT
* * * *
16511 CTTCACGTTTTTTATA-GTAGATATTCAATTATAATCTGTTTTAGCCAAAAATGT-AAAAAATTC
318 CTTCATGTTTCTTA-AGGTAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTC
* ** * *
16574 AACTTAAAATTGATTATGAGATTATAAAAACATTTAAAGCGCA-TAATAAGGCTTTCAAAGGCAT
382 AACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCG-AGTAATAAGGCTTTCGAAGGCAT
* * * * * ** * *
16638 GGGTGACTATAAATGGACTTTT-TTACCAACGA-ATGCCTTTTTCTTTACCTTTCTCGAGGA-AG
446 GGGTGACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATGATA-GCATTTTTCTTCATGTTTC-CTAAGACAG
*
16700 ACA
509 TCA
* * * * * ** * *
16703 TTCAATTATAATCTATTTTCACAAAAAACAAAAAAAAATTTAACATAAAATCAATTACGGGATTA
1 TTCAATTATAATCTGTTTTAACTAAAAATATAAAAAAATAAAAC-TAAAATCAATTATGAGATTA
* * * * * *
16768 TAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTACGATTTTAAACGCATGGGTAACTATAGATGGACTTTTCTT
65 TAAAACTATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTAAAGGCATGGGTAACTATAAATAGACTTTTCTT
** * * * * * * * * * **
16833 GTCAATGAATAGATTTCTCTTCATGTTTCCCAAAAGTGTAAAAAAATTCAACCTAAAATC--AAT
130 ACCAATGAATGGCTTTTTCTTCATGTTT-CC-TAAG-G--CAGACATTCAA-TTATAATCTGTTT
** * * * ** * ** * * * * * *** *
16896 T-A-TGAGATTATAAAGCAATTTAAAGT-GACT-AATTA-G-GATTTTGAAGGTATGGGT-AA-C
189 TAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGACATTATAAAACCAT--TTAAAGC
* * * * * ** * * * ** *** * **
16953 TA-CAA-ATGCACTTCTCTAGCCA-ATG-AA-TGT-CTTTTTCTTCGTAT-TTCCCAA-GGCAGA
252 GAGTAATAAG-GCTTTTAAAGGCATAGGTAACTATAAATGGACTT--T-TCTTGCCAATGATAG-
** ** * * * * * * * ** *
17010 CATTCAATAATAATTGGTTTTCAATAAAAATGTAAAAAATTCAACATAAAATCAATTATGAGATT
312 C-TT-TTTCTTCA-T-G-TTTC--T--TAAGGT-AGACATTCAA-TTATAATCTGTT-TTA-A--
** * ** * * ** ** * * * *
17075 ATAAAACCATTTCAAGGGAGTAATT-AGGCTTTCGAATGC--TTGGGTGACTAGAAATGGA-CTT
362 CCAAAA--ATGT-AA---AAAAATTCA-AC-CTAAAAT-CAATTATGAGATTATAAA---ACCAT
*** * **** * ** *** *
17136 TTCCTGC-A--AATGAGTGGCTTT--TTTTCA--CGTTTCT-TGCTGTAGA----TGTT--CAAT
415 TTAAAGCGAGTAAT-A-AGGCTTTCGAAGGCATGGGTGACTAT-AAATAGACTTTTCTTGCCAAT
* *** *
17187 TATA--ATTTGTT-TTAGCCAAAAATT--TAA-A-A--AA
477 GATAGCATTT-TTCTT---C-ATGTTTCCTAAGACAGTCA
* * * * * *
17218 TTCAACTTGA-AAT-TG-ATT-A-TGAGATTATAAAAACATTTAAAGTGCGTAATAAGGCTTTCG
1 TTCAA-TT-ATAATCTGTTTTAACTAAAAATATAAAAA-A-ATAAA--AC-TAA-AA-----TC-
** * * *** * * *** * *
17278 AAGGCATGGTTGACTATAAATA-TACTTTTCTTGTC-AATAAATGCATTTTTCTTTAAGTTTTTC
52 AA-TTAT-G-AGATTATAAA-ACTA--TTTAAAG-CGAGT-AAT-TAGGCTT-TTAAAG----GC
* * * ** **
17341 A-AGGAAGAC-ATTCAATTATA-ATCTGTTT-TCACCAAAAACATAAAACAATTTACCATAAAAT
103 ATGGGTA-ACTA-T-AA--ATAGA-CT-TTTCTTACCAATGA-AT--GGC--TTT----T----T
* * * * ** *
17402 CAATT-ATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTA-ATTACGATTTTAAAGGTATG-GGTAACT
148 C--TTCAT--G-TT-T----CC---TAAGGC-AG-ACATT-CAATTAT-AA--TCTGTTTTAACC
* ******** *** ** * * * * *
17464 ATAAATGGGCTTTTCTTGCCAATGAATAAATTTCTCTTCATGTTTCCTAATATAGA-CA-TTCAA
194 AAAAATGTAAAAAAATT--CAACCTA-AAA--TCAATT-ATG--ACATTATA-AAACCATTTAAA
* ** * * ** *
17527 -CTA-TAAT-CTG-TTTTAACCAAAAGTGTAAAAAATTCAATCTAAAATCAATTATGAGA-TTAT
250 GCGAGTAATAAGGCTTTT-----AAAG-G--CATAGGT-AA-CT---AT-AA--ATG-GACTTTT
**** * * * ** * * ** * *
17587 AAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCGAATATTTGGGTGACTAGAAATAGACTTTTC-CT
298 CTTGCCAATGATAGC---T--TT-TTC-TTC--ATGTTT--CT---TA-AGGTAGAC-ATTCAAT
* * ** **** * * ** * * *** *
17651 GCA-AATGAGTGGTTTTTTCTTCATGTTTCTTGTAGCAGATTTTCAA-TTATAATTTGTTTTAGC
347 -TATAAT--CT-GTTTTAAC--CA---AAAATGTA-AAAAAATTCAACCTAAAATCAATTAT-G-
* * * * * * * ** *
17714 CAAAAAATAAAAAAATTCAACTTGAAATTGATTATGAGATTATAAAAACATTT-AAAGCGCGTAA
400 ----AGATTATAAAA--CCA-TTTAAA--G----CGAG-TAAT-AAGGC-TTTCGAAG-GC---A
* * *** * ** *
17778 TAAGGATTTCGAAGGTATGGCT-GACTATAAATAGACTTTTCTTACCACCGA-ATGCATTTTTCT
445 T--GG--GT-G-A-CTATAAATAGACT-T---T--TCTTGCC--A--A-TGATA-GCATTTTTCT
*
17841 TCACT-TTT-CTCAAGGA-AGACA
491 TCA-TGTTTCCT-AA-GACAGTCA
* * * * * ** *
17862 TTTAATTATAATCTGCTTTCACCAAAAACATAAAAAAATTTAACATAAAATCAATTACGAGATTA
1 TTCAATTATAATCTGTTTTAACTAAAAATATAAAAAAATAAAAC-TAAAATCAATTATGAGATTA
* * * * * * * *
17927 TAAAACCATTTAAAGTGAGTAATTATGATTTTGAAGGTATGGGTAACTATAAATGGGCTTTTCTT
65 TAAAACTATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTAAAGGCATGGGTAACTATAAATAGACTTTTCTT
* * * * * *** * *
17992 GCCAATGAATAGATTTCTCTTCATGTTCCCTAATATAGACTTTCAATTATAATTTGTTTTAACCA
130 ACCAATGAATGGCTTTTTCTTCATGTTTCCTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCA
* * * *
18057 AAAGTGTAAAAATATTCAATCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGC--------
195 AAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGACATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATA
************************************************************
18114 --G--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
260 AGGCTTTTAAAGGCATAGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGATAGCTTTTTCTTCATG
*****************************************************************
18175 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
325 TTTCTTAAGGTAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAA
*****************************************************************
18240 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
390 ATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCGAAGGCATGGGTGACTA
****************************** * *
18305 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTCTTCACT-TTTCTTAAGGA-AGACA
455 TAAATAGACTTTTCTTGCCAATGATAGCATTTTTCTTCA-TGTTTCCTAA-GACAGTCA
* * * ** ** *
18362 TTCAATTATAATCTGCTTTCACCAAAAACGTAAAAAAATTTAACATAAAATCAATTACGAGATTA
1 TTCAATTATAATCTGTTTTAACTAAAAATATAAAAAAATAAAAC-TAAAATCAATTATGAGATTA
* * ** * * *
18427 TAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTACGAATTTAAAGGCATGGGTAACTAGAAATGGACTTTTCGT
65 TAAAACTATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTAAAGGCATGGGTAACTATAAATAGACTTTTCTT
* * * * ***
18492 ACCAATGAATAGATTTCTCTTCATGTTTCCCAATATAGACATTCAATTATAATAC-GTTTTAACC
130 ACCAATGAATGGCTTTTTCTTCATGTTTCCTAAGGCAGACATTCAATTATAAT-CTGTTTTAACC
* ** * *
18556 AAAAGTGTAAAAAAATTCAACCTAAAAGT-AATTACAAGATTATAAAACCATTTAAAGCGATTAA
194 AAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAA-TCAATTATGACATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAA
* * * * * * * *
18620 TTAGGCTTTCGAAA-GCTTGGGTAACTAGAAATGGACTTTTCTTACAAATGAGTGGCTTTTTCTT
258 TAAGGCTTT-TAAAGGCATAGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGA-TAGCTTTTTCTT
** * * * * *
18684 CACATTTCTTGAGGTAAATATTCAATTATAATCTATTTTAGA-CAAAAATGT-AAAAAATTCAAT
321 CATGTTTCTTAAGGTAGACATTCAATTATAATCTGTTTTA-ACCAAAAATGTAAAAAAATTCAAC
* * ** * *
18747 TTAAAATTAATTATGAGATTATAAAAATATTTAAAGCGTGTAATAAGGCTTTCAAAGGCATGGGT
385 CTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCGAAGGCATGGGT
* * * * ** *
18812 GACTATAAATGGACTTTTCTTGCTACCAA--ATATC-TTTTTCTTCACGTTT-CTCGAGGTAGAC
450 GACTATAAATAGACTTTTCTTG---CCAATGATAGCATTTTTCTTCATGTTTCCT-AAGACAGTC
18873 A
511 A
* * * *** * * * *
18874 TTCAATTATAATTTATTTTCACTAAAAGCGTAAAACCAGT-TAACATAAAATCAATTACGAGA-T
1 TTCAATTATAATCTGTTTTAACTAAAAATATAAAA-AAATAAAAC-TAAAATCAATTATGAGATT
* *
18937 -T---A-TA---AAA-C-------TA---TTTTAAAGGCATGGGTAACTATAAGTGGACTTTTCT
64 ATAAAACTATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTAAAGGCATGGGTAACTATAAATAGACTTTTCT
* * * * * ***********************
18983 TGCTAATGAATCGATTTCTCTTCATGTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATCTGTTTTAACC
129 TACCAATGAATGGCTTTTTCTTCATGTTTCCTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACC
** * * * * * *
19048 AAAAATGTAAAAAAATTCAATTTAAAATTAATTATGAGATTTTAAAGCCATTTAAAGTGACTAAT
194 AAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGACATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAAT
* * * * ** * **
19113 TAGGATTTTGAAGGCATGGGTAACTACGAATGGACTTTTCTAGGGAATGA-ATGCCTTTTTCTTC
259 AAGGCTTTTAAAGGCATAGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGATA-G-CTTTTTCTTC
* * * * * * * * *
19177 GTGTTTCCTAAGGCAAACATTCAATAATAAT-TGGTTTTCACTAATAATGT-AAAAAATTCAACA
322 ATGTTTCTTAAGGTAGACATTCAATTATAATCT-GTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACC
* * * * *
19240 TAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGACTTTCAAATGCTTGGGTG
386 TAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCGAAGGCATGGGTG
* * * * * * *
19305 ACTAGAAATGGACTTTTCTTGCTAATGAATGGC-TTTTT-TTCATGTTTCTTGAGGCAGAT-A
451 ACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATG-ATAGCATTTTTCTTCATGTTTCCTAAGACAG-TCA
* ** * ** *
19365 TTGAATTATAATCTGTTTTCGCTAAAAATGT-AAAAAATTTAACTTAAAATCGATTATGAGATTA
1 TTCAATTATAATCTGTTTTAACTAAAAATATAAAAAAATAAAAC-TAAAATCAATTATGAGATTA
* * * * *
19429 TAAAAATATTTAAAGCGCGTAATAAGGCTTTTAAAGGCATGAGCT-ACAATAAATAGACTTTTCT
65 TAAAACTATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTAAAGGCATG-GGTAACTATAAATAGACTTTTCT
* * * * * * * ** * * *
19493 TGCTAATGAATGCCTTTTTCTTTACGTTTCTTGAGAAAGACATTCAATTAGAATCTATTTTCACC
129 TACCAATGAATGGCTTTTTCTTCATGTTTCCTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACC
** * * * * * *
19558 AAAAACATAAAAAAATTTAACATAAAATCAGTTACGAGATTATAAAACCTTTTAAAGCGAGTAAT
194 AAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGACATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAAT
* *** * * * *
19623 TACTATTTTGAAGGCATAGGTAACTATAAATGGATTTTTCTTACCAATGAATAGATTTTTCTTCA
259 AAGGCTTTTAAAGGCATAGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATG-ATAGCTTTTTCTTCA
* * * * * *
19688 TGTTT-TCCAAGGCAAACATTAAATTATAATCTGTTTTAACTAAAAATGTAAACAAATTCAACCT
323 TGTTTCT-TAAGGTAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCT
* * * * * * ** * * * ** *
19752 AAAGTAAATTATGAGATTATAAAGCTATTTAAAAACTA-TAATTTGGATTTTGAAGGTATGCCTA
387 AAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTT-AAAGCGAGTAATAAGGCTTTCGAAGGCATGGGTG
* * * * * * ** *
19816 ACTATAAA-CGAACTTTTCTAGTCAATGAATGGC-TTCTTCTTCATGTTTTCTAAGGTAGACA
451 ACTATAAATAG-ACTTTTCTTGCCAATG-ATAGCATTTTTCTTCATGTTTCCTAAGACAGTCA
** * * * * * * * **
19877 TTCAACAATAAT-TGGTTTTAACAAAAAATGCTGAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGGGANN
1 TTCAATTATAATCT-GTTTTAACTAAAAAT-ATAAAAAAATAAAACTAAAATCAATTATGAGATT
******** * * * * * *
19941 NNNNNNNNATTTAAAGTGAGTAATAAGGCTTTCGATA-GCATGGGTGACTATAAATGGACTTTTC
64 ATAAAACTATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTT-TAAAGGCATGGGTAACTATAAATAGACTTTTC
* *** ** * * * ** *
20005 TTGCCAAT-AACAACCTTTTTCTTTGTATTTCTTTAGGCA-ATCATTTGATTATAATTTGTTTTA
128 TTACCAATGAA-TGGCTTTTTCTTCATGTTTCCTAAGGCAGA-CATTCAATTATAATCTGTTTTA
* * ** *
20068 ACTAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATTAATTATGACATTATAAAACTGTTTAAAGTGAGT
191 ACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGACATTATAAAACCATTTAAAGCGAGT
* * * * * * * * * *
20133 AATTACGTTTTTGAAGGCATGGGCAACTTTAAATGGACCTTTCTTGTCAATGA-ATGATTTTTTC
256 AATAAGGCTTTTAAAGGCATAGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGATA-G-CTTTTTC
* * * *
20197 TTCATGTTTCTTAAGGCAGTCATTCAATTATAATCTATTTTAACTAAAAATGTAAAAAAATTCAA
319 TTCATGTTTCTTAAGGTAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAA
* * * *
20262 CCTAAAATCAACTATGACATTAT------A---AAA-C---T-AT-----TTT-AAAGGCATGAG
384 CCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCGAAGGCATGGG
* * * * * * * *
20307 TAACTATAAATGAAAC-TTTCTTACCAATGAATGGC-TTTTTCTTCACGTTTCTTGAAG-TAGAC
449 TGACTATAAAT-AGACTTTTCTTGCCAATG-ATAGCATTTTTCTTCATGTTTCCT-AAGACAGTC
*
20369 C
511 A
* * * * * *
20370 TTCAATTGTAATATGTTTTAACTAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGGTTA
1 TTCAATTATAATCTGTTTTAACTAAAAATATAAAAAAA-TAAAACTAAAATCAATTATGAGATTA
* * * * ** * * * * *
20435 TAAGACCATTTAAAGCAAGTAGTTAGGCTTTCGAATGCTTGGGTAACTAGAAATGGACTTTTCCT
65 TAAAACTATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTAAAGGCATGGGTAACTATAAATAGACTTTTCTT
* * * ** * * * * *
20500 ACAAATGAATAGTTTTTTCTTCACATTTCATGAGGCAGATATTCAATTATAATCTGTTTTAGCAA
130 ACCAATGAATGGCTTTTTCTTCATGTTTCCTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCA
** ** * * * *
20565 AAAATGT--AAAAATTCAAGTTAAAATTGATTATGAGATTATAAAAACATTTAAAGCGTGCAATA
195 AAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGACATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATA
* * * * * * * * *
20628 AGACTTTCAAAGGTATGGGTGACTATAAATGAACTTTTGC-TACAAACGAATA-CTTTTTTCTTC
260 AGGCTTTTAAAGGCATAGGTAACTATAAATGGACTTTT-CTTGCCAATG-ATAGC-TTTTTCTTC
** ** * * * * *
20691 ACCTTTCCCAAGGAAGACATTCAATTATAATTTGTTTTCACCAAAAACGTAAAAAAA-TCTAACA
322 ATGTTTCTTAAGGTAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTC-AACC
* * * * * *
20755 TAAAATCAGTTATGAGATTATAAAACCTTTTAAAGCGAGTAATTACGATTTTGAAGGCAT-GG-G
386 TAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCGAAGGCATGGGTG
* * * * * *
20818 ----TAAATGGATTTTTCTTGCTAATAAATAG-ATTTTTCTTCATGTTTCCTAAGGCAGACA
451 ACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAAT-GATAGCATTTTTCTTCATGTTTCCTAAGACAGTCA
* * * * * * * ** **
20875 TTCAATTTTAATCTGTTTTAACCAAAAGTGTAAAGAGATTCAATGTAAAAAAAATTATGAGATTA
1 TTCAATTATAATCTGTTTTAACTAAAAATATAAA-AAAATAAAACTAAAATCAATTATGAGATTA
* * *
20940 TAAAACTATTTAAAGCGACTAATTAAGATTTTCAAA-GCATGGGTAACTATAAATAGACTTTTC-
65 TAAAACTATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTT-AAAGGCATGGGTAACTATAAATAGACTTTTCT
* * * * *
21003 TAGCCAATGAATGGCTTTTTCTTCATGTTTCCCAAGTCAGACAATCAATAATAATTTGTTTTAAC
129 TA-CCAATGAATGGCTTTTTCTTCATGTTTCCTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAAC
* * ***********
21068 TAAAAATGTAAAAATATTCAACCTAAAATTNNNNNNNNNNTTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAA
193 CAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGACATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAA
* * ** * * *
21133 TAAGACTTTCAAAGTAATGGGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGATAGCCTCTTTCTTC
258 TAAGGCTTTTAAAGGCATAGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGATAG-CTTTTTCTTC
** * * * * * * *
21198 ACATTTCTTTAGGCAGTCATTCGATTAGAATTTGTTTTAA-CAAAAGATGTAAAAAAATTCAACT
322 ATGTTTCTTAAGGTAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAA-ATGTAAAAAAATTCAACC
* * * *
21262 TAAAATCAATTATGACATTATAAAACTATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTGAAGGCATGGGTG
386 TAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCGAAGGCATGGGTG
* * ** * ** *
21327 ACTATAAATGGACTTTTCTTACCACCGAATA-CCTTTTTCTTCACAT-TTTCC-AAGGTAGACA
451 ACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATG-ATAGCATTTTTCTT--CATGTTTCCTAAGACAGTCA
* * * * * * * *
21388 ATCAATTATAATCAGTTTTAACCAAAAGTGTAAAAAAATTCAATCTAAAATAAATTATGAGATTA
1 TTCAATTATAATCTGTTTTAACTAAAAATATAAAAAAA-TAAAACTAAAATCAATTATGAGATTA
* * * * * * * *
21453 TAAAGCCATTTAAAGTGACTAATTAGGATTTTGAA-GCATTGGGTAACTACAAATGGACTTTTC-
65 TAAAACTATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTAAAGGCA-TGGGTAACTATAAATAGACTTTTCT
* * * * * * *
21516 TAGCCAATTAAT-GCTTTTTTTTTTATGTTTCCCAAGGCAGACATTCAATAATAATTTGTTTTCA
129 TA-CCAATGAATGGC-TTTTTCTTCATGTTTCCTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAA
* ** * * *
21580 CTAAAAATGT-AAAAAATTCAATATAAAATTAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTA
192 CCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGACATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTA
* ** * * * * * * * * * *
21644 ATTAGGCTTTCGAATGCTTGGGTGACTAGAAATGGGCTTTTCCTGCAAATGAAAGGGTTTTTCTT
257 ATAAGGCTTTTAAAGGCATAGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGATA-GCTTTTTCTT
* * * * * * **
21709 CACT-TTTCTTGAGGTAGATATACAATTATAATCTATTTTAGCCAAAATTGT-AAAACCTTCAAC
321 CA-TGTTTCTTAAGGTAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAAC
* * * * * *
21772 GTAAAATGAATTATGAGATTATAAAAACATTTAAAGCGCGTAATAAGGCTTTCAAAGACATGGGT
385 CTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCGAAGGCATGGGT
* * * * * **
21837 GACTATAAATAGA-ATTTCTTGCC-ATCGAATA-CCTTTTTCTTCACGTTT-CTCGAGGCAAACA
450 GACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAAT-G-ATAGCATTTTTCTTCATGTTTCCT-AAGACAGTCA
* * * ** * * *
21898 TTCAATTATAATTTGTTTTCACCAAAAATGA-AAAAAAATTTAACATAAAATGAATTACGAGATA
1 TTCAATTATAATCTGTTTTAACTAAAAAT-ATAAAAAAATAAAAC-TAAAATCAATTATGAGATT
* * * * * * *
21962 ATAAAACCATTTAAAACAAGTAATTACGATTTTGAACGCATGGGTAACTATAAAT-GAACTTTTC
64 ATAAAACTATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTAAAGGCATGGGTAACTATAAATAG-ACTTTTC
* * * * * * *
22026 TTGCCAATGAATAGATTTCTCTTCATGTTTCCCAAGGCAGACATTCAATTATAATTTGTTTTAAA
128 TTACCAATGAATGGCTTTTTCTTCATGTTTCCTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAAC
* * *** * * *
22091 CAAAAGTGTAAAAAAATTTAGTATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGCAA
193 CAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGACATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAA
* * * * * * *
22156 TAAGGCTTTCAAATGTATGGGTGACTAGAAATGGACTTTTATTGCCAATGATAGCCTTTTTCTTC
258 TAAGGCTTTTAAAGGCATAGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGATAG-CTTTTTCTTC
* * * *
22221 ATGTTTCTTAAGGCACACATTCAATTATAATCTATTTTAACCAAAAATGTAAAAAACTTCAACCT
322 ATGTTTCTTAAGGTAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCT
* * * * * * * * *
22286 AAAATCTATTATGACATCATAAAACCATTTTAAGCGAGTAATTAGGCTTTTGAAGGTATGAGTAA
387 AAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCGAAGGCATGGGTGA
* * * * * * * * *
22351 CTATAAATGGACTTTTCTCGTCAATGAATGGC-TTCTTCTTTAGGTTTTCC-AAGACAGACT
452 CTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATG-ATAGCATTTTTCTTCATG-TTTCCTAAGACAGTCA
* * * ** ***
22411 TTCAATTATAGTCTGTTTTAACAAAAAATGTAAAAAGGTTTTACATAAAATCAATTATGAGATTA
1 TTCAATTATAATCTGTTTTAACTAAAAATATAAAAAAATAAAAC-TAAAATCAATTATGAGATTA
* * * * * * * * * *
22476 TAAAACCATTAAAAGTGAGTAATAAGGCTTTCAAAGACATGGGTTATTATAAATGGACTTTTCTC
65 TAAAACTATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTAAAGGCATGGGTAACTATAAATAGACTTTTCTT
* * * * * *
22541 GCTAATGAATGTCTTCTTCCTT-ATGTTTACC-AAGGCAAACATTCAATTATAGTCTGTTTTAAC
130 ACCAATGAATGGCTT-TTTCTTCATGTTT-CCTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAAC
* * * * * * * *
22604 AAAAAATGTAAAACAATTTAACCTAAAATTAATTATGAGATTATAAAACCATTAAAAGTGATTAA
193 CAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGACATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAA
* * * * *
22669 TAAGG-TTTTCAAAGGCA-CGAGTTACTATAAATGTACTTTTGTTGCCAATGATAGCCTTTTTTT
258 TAAGGCTTTT-AAAGGCATAG-GTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGATAG-CTTTTTCT
* * * * * **
22732 TCACGTTT-TTTAGGTAAAAATTCAATTATAAT-TGATTTTCACCAAAAA-AAATAAAAAATTCA
320 TCATGTTTCTTAAGGTAGACATTCAATTATAATCTG-TTTTAACCAAAAATGTA-AAAAAATTCA
* * * * *
22794 ACTTAAAA--AAGTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGTGAGTAATAAGGCTTCCGAAGGCTTGG
383 ACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCGAAGGCATGG
* * * * * *
22857 GTGATTATAAATGGACCTTTCTTGACAATGA-ATG-GTTGTTTCTTCACAT-TTTCCAAAGTA-A
448 GTGACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATGATA-GCATT-TTTCTT--CATGTTTCCTAAG-ACA
*
22918 -ACA
508 GTCA
* ** * *
22921 TTCAATTATAATCTG-TTTAACCAAAAATATAAAAACTTTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTA
1 TTCAATTATAATCTGTTTTAACTAAAAATATAAAAA-AATAAAACTAAAATCAATTATGAGATTA
* * * **
22985 TAAAATTATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTGAAGGCATGGGTAACTACAAACGGACTTTTC-T
65 TAAAACTATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTAAAGGCATGGGTAACTATAAATAGACTTTTCTT
* ** * * * * *
23049 AGCTAATGAATGTTTTTTTCTT--TGTGTTCCTAAGGTAGACATTTAATAATAATTTGTTTTAAT
130 A-CCAATGAATGGCTTTTTCTTCATGT-TTCCTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAAC
* * * * * *
23112 AAAAAATGTAGAAAAACTCAACCCAAAATCAATTACGACATTATAAAATCATTTAAAGCGAGTAA
193 CAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGACATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAA
* * *
23177 TAAGGCTTTCAAAAGCAT-GAGTAACTATAAATGGACTTTTATTGCCAATGATAGCCTTTTTCTT
258 TAAGGCTTTTAAAGGCATAG-GTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGATAG-CTTTTTCTT
* * * * * *
23241 CACGATTT-TTGAGGTAGACATTCAATTATAATCTGTTTTCACAAAAAATGT-AAAACATTTAAC
321 CATG-TTTCTTAAGGTAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAAC
* * * * * * * * *
23304 TTAAAATCAATTATAAGATTATAAAACCATGTAAAGCGCGTAGTAAGACTTTCAAAGGTATGGGG
385 CTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCGAAGGCATGGGT
* * * *** *
23369 GACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATAGC-TATTTCTTCATGTTTCCCAAGGTGGACA
450 GACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATG-ATAGCATTTTTCTTCATGTTTCCTAAGACAGTCA
* * * ** *
23431 TTCAATTATAATCTTTTTTAACTAAAAATGTAAAAATATTTAACATAAAATCAATTACGAGATTA
1 TTCAATTATAATCTGTTTTAACTAAAAATATAAAAAAATAAAAC-TAAAATCAATTATGAGATTA
* * * * * ** * *
23496 TAAAA-TCACTTAAAGTGAGTAATTACGATTTTGAAGGCATAAGTAACT-TAAATAAACTTTTGT
65 TAAAACT-ATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTAAAGGCATGGGTAACTATAAATAGACTTTTCT
* * * * * * * *
23559 TGCCAATGAATAGCCTTTTCTTCATGTTTCCCAAGACAGATATTCAATTATAATTTATTTTAA-C
129 TACCAATGAATGGCTTTTTCTTCATGTTTCCTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACC
* * * * *
23623 AAAAATTTTAAAAAAACTT-AATCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGAA
194 AAAAA-TGTAAAAAAA-TTCAACCTAAAATCAATTATGACATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTA
* * * * * * *
23687 ATGAGGCTTTCAAAGGC-TCGAGTGACTAGAAATGGACTTTTCTTGCTAATAAATAGCTTTTTCT
257 ATAAGGCTTTTAAAGGCATAG-GTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAAT-GATAGCTTTTTCT
** * * * * * ** *
23751 TCATGTTTCCCAATGAAGGCATTCAATTATAATCTATTTTAACTAAAAACAT-AAAAATTTCAAC
320 TCATGTTTCTTAAGGTAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAAC
* * * * * * *
23815 CTAAAATCAATTATGGGATTATAAAACTATTTAAAGCGAGTAATTAGGATTTTGAAAGAATGGGT
385 CTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCGAAGGCATGGGT
* * * * *
23880 AACTATAAAT-GAACTTTTC-TGACCAATGAATGGC-TTTTTCTTCTTGTTTCCTAAGGCAGACA
450 GACTATAAATAG-ACTTTTCTTG-CCAATG-ATAGCATTTTTCTTCATGTTTCCTAAGACAGTCA
* * * * * * * * *
23942 TTCAATAATAATTTGTTTTAGCCAAACATGTAAAAAAATTTAACCTAAAATCAATTATGATATTA
1 TTCAATTATAATCTGTTTTAACTAAAAATATAAAAAAA-TAAAACTAAAATCAATTATGAGATTA
* * * * * *
24007 TAAAATTATTTTAAGCGAGTAATTAGGCTTTTGAAGGCATGTGTAACTATAAATGGACCTTTCTT
65 TAAAACTATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTAAAGGCATGGGTAACTATAAATAGACTTTTCTT
* * * * * * * * * *
24072 GCCGATGAATAGCTTTTTCTTCATGTTTCCTGAGGTAAAGATTTAATTATAATCCGTTTTAACCT
130 ACCAATGAATGGCTTTTTCTTCATGTTTCCTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCA
* * * *
24137 AAAATGT--AAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTTTAAAATCATTTAAAGCGAGTAATT
195 AAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGACATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATA
* * * * * * * *
24200 AGG-TTTTCGAACGCATTGGTGA-TCAGAAATGGACTTTTCTTACCCATGAAAGGCTTTTTCTTC
260 AGGCTTTT-AAAGGCATAGGTAACT-ATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGATA-GCTTTTTCTTC
********* * * * * * **
24263 ATGTTTNNNNNNNNNNG-TATTGAATTATAATCTATTTTAGCCAAAAATGT-AAAAAATTTAATT
322 ATGTTT-CTTAAGGTAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACC
* ** * * * *
24326 TAAAATTAATTATGAGATTATAAAAATATTTAAATCGCGTGATAAGGCTTTCAAAGGCATGGGTG
386 TAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCGAAGGCATGGGTG
** * ** * * *
24391 ACTATAAACGGACTTTTCTTACCACCGAATA-CTTTTTTTTTCATGTTTCCTAAGGTAGACATTC
451 ACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATG-ATAGCATTTTTCTTCATGTTTCCT-A---AGACAGTC
24455 AAA
511 --A
* * * * ****** **** ** **
24458 GTATAGGTAATTATAAATGGACTTTTCTTGTCAA-TGAAGAGATTTGTTTTCATGTTTCCCAAGG
1 -T-T---CAATTAT-AAT---C-TGT-TT-T-AACT-AA-AAATATAAAAAAATAAAACTAAAAT
* * * * * * ** * *** **
24522 CAGA-CATTCA-ATTATAATA-TGTTTTAA-CCAAAAATACAAAAATATTCAACCTAAAATCAAT
51 CA-ATTA-TGAGATTATAAAACTATTTAAAGCGAGTAAT--TAGGCT-TT-----TAAAGGC-AT
** * * * *** * * * ** ** ***
24583 -TATGAGATTATAAA-A-CCATTTAAAACGAGT-AATTAGCCTTTTGAATACTTGGGTGACTAGA
105 GGGT-A-ACTATAAATAGACTTTTCTTACCAATGAA-T-GGCTTTT---T-CTT-CATGTTTCCT
* * ** * **
24644 AATGG-ATATTTCTTTCCAATGACTCACTTTTCTCCACATTGCTTGATGCAGATATTGAATGATA
161 AA-GGCAGA---CATT-CAAT---T-A-TAATCT----GTT--TT-AACCA-A-A---AATG-TA
***** * * * * * *
24708 ATCTGTTTTAGCCAAAAATGTAGAAAATTCAAATTAAAATTGGTTATGAGATTATAAAAACATTT
203 AAAAAATTCAACCTAAAA--T---CAA----------------TTATGACATTATAAAACCATTT
* * * * * * ** ** *
24773 AAAGCGCGTAATAAGACTTTCAAAGGCATAGGTGATTGTAAATGGACTTTTCTTATCAACAAATT
247 AAAGCGAGTAATAAGGCTTTTAAAGGCATAGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAA-TGATA
* * * * * * * **
24838 CCTTTTTCCTCACGTTTCATGAGGAAGACATTCAATTATAATCTGTTTTCACCAAAAACATAAAA
311 GCTTTTTCTTCATGTTTCTTAAGGTAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGT-AAA
* * * * ** * * * * * *
24903 AAAATTTAACATAAAATCGAGTGCGATATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAGTTACGATTTTGA
375 AAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCGA
* * * * *
24968 AGGCATGAGTAACTATAAATAGATTTTTCTTGCCAATGAATAG-ATTTTTCTTCCTGTTTCCCAA
440 AGGCATGGGTGACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATG-ATAGCATTTTTCTTCATGTTTCCTAA
* *
25032 GGCAGACA
504 GACAGTCA
* * * * * *
25040 TTTAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAGTGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTA
1 TTCAATTATAATCTGTTTTAACTAAAAATATAAAAAAA-TAAAACTAAAATCAATTATGAGATTA
* ** * * *
25105 TAAAGAC-ATTTAAAGTC-ACTAATTAGAATTTTGAAGGCGTGGGTAACTACAAATAGACTTTTC
65 TAAA-ACTATTTAAAG-CGAGTAATTAGGCTTTTAAAGGCATGGGTAACTATAAATAGACTTTTC
* * * *
25168 -TAGCCAATGAAT-GCTTTTTTCTTCGTGTTTCC-CAGGACAGACATTTAATAATAAT-TAGTTT
128 TTA-CCAATGAATGGC-TTTTTCTTCATGTTTCCTAAGG-CAGACATTCAATTATAATCT-GTTT
* * * * *
25229 TCACTAAAAATGT-AAAAAATTCAACATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGTGA
189 TAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGACATTATAAAACCATTTAAAGCGA
* ** * * * * * * * * * *
25293 GTAATTAGGCTTTCGAATGCTTGGGTGACTAGAAATAGACTTTTCCTACAAATGAATGGCTTTTT
254 GTAATAAGGCTTTTAAAGGCATAGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATG-ATAGCTTTTT
* * * * * * *
25358 TTTCACGTTTCTTGAGGTAGATATTCAATTATAATCTGTATTAGCTAAAAA--TACAAAAAATTC
318 CTTCATGTTTCTTAAGGTAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTA-AAAAAATTC
* * ** * * *
25421 AACTTAAAGTTGATTATGAGATTATAAAAACATTTAAAGCGCGTAATAAGGCTTCCGAAGGCATG
382 AACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCGAAGGCATG
* * * * * * **
25486 GGTGACTATAAATGGAGTTTTCTTGCCAACGA-ATGCCTTTCTCTTCATGTTT-CTCAAGAAAAA
447 GGTGACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATGATA-GCATTTTTCTTCATGTTTCCT-AAGACAGT
25549 CA
510 CA
* ** * ** **
25551 TTCAATTATAATCTGCTTTCAA-TAAAAACGTTAAAAAATTTAACATAAAATCAATTACAAGATT
1 TTCAATTATAATCTG-TTTTAACTAAAAATATAAAAAAATAAAAC-TAAAATCAATTATGAGATT
* * * * * * ** * *
25615 ATAAAACCATTTAAAGTGAGCAATTACGATTTTGAAGGCATGGGTAACTACGAATGGATTTTTCT
64 ATAAAACTATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTAAAGGCATGGGTAACTATAAATAGACTTTTCT
* * * * * **
25680 TACCAATGAATAGATTTTTCTTCATTTTTCCCAAGGTAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAATT
129 TACCAATGAATGGCTTTTTCTTCATGTTTCCTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACC
* * * * * * * *
25745 AAAAATGT-AAAATATTCAACATAAAATAAATTATGAGATTATAAAGCTATTTAAAGTGACTAAT
194 AAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGACATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAAT
* *** * * * * * *
25809 TACAATTTTGAAGGCATGGGTAACTATGAATAGACTTTT-TTAGCCTATGA-ATGACCTTTTCTT
259 AAGGCTTTTAAAGGCATAGGTAACTATAAATGGACTTTTCTT-GCCAATGATA-G-CTTTTTCTT
* * * * **
25872 CATATTTAC-T-AGGTCAGACATTCAATAATAAT-TAGTTTTCACTAATTATGT-AAAAAATTCA
321 CATGTTT-CTTAAGGT-AGACATTCAATTATAATCT-GTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCA
** * * * * *
25933 AGATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGTGAGTAATTAGGCTTTCGAATGCTTAG
383 ACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCGAAGGCATGG
* * * * * * ** ** * **
25998 GTTACTAGAAAT-GTACTTTCCCTACAAATGA-ATGGTTTTTTCTTCGCGTTTCTTAAGGTAGAT
448 GTGACTATAAATAG-ACTTTTCTTGCCAATGATA-GCATTTTTCTTCATGTTTCCTAAGACAG-T
26061 -A
510 CA
* * * ** **
26062 TTCAATTATAATATGTTTTAACCAAAAATGT-AAAAAATTCAACTTAAAATTGATTATGAGATTA
1 TTCAATTATAATCTGTTTTAACTAAAAATATAAAAAAATAAAAC-TAAAATCAATTATGAGATTA
* * * * * * *
26126 TAAAAATATTTAAAGCGCGTAATAAGCCTTTCAAAGGCATGGGTGACTAGAAATAGACTTTTCTT
65 TAAAACTATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTAAAGGCATGGGTAACTATAAATAGACTTTTCTT
* * * ** ** ** **
26191 GCCAACGAATGCCTTTTTCTTC-TAGTTTCAAAAGTAAGACATTCAATTATAATCTAATTTCTCC
130 ACCAATGAATGGCTTTTTCTTCAT-GTTTCCTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACC
** * * * * * * *
26255 AAAAACATAGAAAAATTTAACATCAAATCAATTA-CAGGATTATAAAATCATTTAAAGCGAGTAA
194 AAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGA-CATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAA
* * ** * * * * * * *
26319 TTACGAATATGAAGGCATGGGTAACTATAAATAGATTTTTCTTAG-TAATGAATAGATTTTTCTT
258 TAAGGCTTTTAAAGGCATAGGTAACTATAAATGGACTTTTCTT-GCCAATG-ATAGCTTTTTCTT
** * * * * * * *
26383 CATGTTTCCCAAGGCAGACTTTCAATTATAATATGTTTTCACCAAAAAAGT-AAAAGATTCAACG
321 CATGTTTCTTAAGGTAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACC
* * * * * * * * * * * * * *
26447 AAAAATAAATTATTAGATTATGAAGCTATTTAAAGTGACTAATTAGGATTTTGAAAGCATGGATA
386 TAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCGAAGGCATGGGTG
* * * ** *
26512 ACTATGAATAGACTTTTTTTAGCCAATGA-ATG-ATCTTTTCTTCATATTTACC-AAGTTAGACA
451 ACTATAAATAGACTTTTCTT-GCCAATGATA-GCAT-TTTTCTTCATGTTT-CCTAAGACAGTCA
* * * * * * * *
26574 TTCAATAATAATTTGTTTTAACCAAAAATGTAAAACAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTT
1 TTCAATTATAATCTGTTTTAACTAAAAATATAAAA-AAATAAAACTAAAATCAATTATGAGATTA
* * * * * * *
26639 TAAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTAAAATGCTTGGGTGACTAGAAATCGACTTTTCT
65 T-AAAACTATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTAAAGGCATGGGTAACTATAAATAGACTTTTCT
* * * * * * **
26704 TACCAATGAAAGGCTTTTTCTTCATGTTTCTTGAGGCAGATATTCAATGATAATCTATTTTAGTC
129 TACCAATGAATGGCTTTTTCTTCATGTTTCCTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACC
* * * * * * *
26769 AAAAATGT-AAAAAATTCAACTTAAAATTAATTACGAGATTATAAAAACGTTTAAAGCGCGTAAT
194 AAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGACATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAAT
* * ** * * * * *
26833 AAGG-TTTTCAGAGGCATGGGTGGCTATAAATGGACTTTTCTTGCTACTAATACCTTTTTCTTTA
259 AAGGCTTTT-AAAGGCATAGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGATAGCTTTTTCTTCA
** * * * * * *
26897 TGTTTCTCGAGGTAGACATTCAATTATAATATGTTTTCATCAAAAACGTAAAACAAGTT-AACAT
323 TGTTTCTTAAGGTAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAA-AAATTCAACCT
** * * * * * ** ** *
26961 AAAATCAATTACAAGATTACAAAGCTATTTAAAGGGAGTAATTAGAATTTTAAAGGCATGGGTAA
387 AAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCGAAGGCATGGGTGA
* * * * * * *
27026 CTATAAATAAACTTTTCTTGCCAATGA-ATCGATTTCTCATCATGTTTCCCAAGGCAGACA
452 CTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATGATAGC-ATTTTTCTTCATGTTTCCTAAGACAGTCA
* * * * * **
27086 TTCAATTATTATTTGTTTTAACCAAAAATGTAAACAAATTCAACGTAAAATCAATTATGAGATTA
1 TTCAATTATAATCTGTTTTAACTAAAAATATAAAAAAATAAAAC-TAAAATCAATTATGAGATTA
* * *** * * * * * *
27151 TAAAGCCATTTAAAATAACTAATTAGGATTTTGACA-GCATGGGTAACCACAAATGGACTTTTC-
65 TAAAACTATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTT-AAAGGCATGGGTAACTATAAATAGACTTTTCT
* * * * * *
27214 TAGCCAATGAATGCCTTTTTTTTTCATGTTTCCCAAGGCAGGCATTCAATAATAAT-TGGTTTTC
129 TA-CCAATGAATGGC-TTTTTCTTCATGTTTCCTAAGGCAGACATTCAATTATAATCT-GTTTTA
* * * * * * *
27278 ACTAAAAATGT-AAAAAATTAAACATAAAATCAATTATAAGATTATAAAATCATTTAAAGTGAGT
191 ACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGACATTATAAAACCATTTAAAGCGAGT
* * * * * * * *
27342 AATTAGGC-TTTAGAGTGCTTGGGTGACTAGAAATGTACTTTT-TCTGCAAATGA-ATGACTTTT
256 AATAAGGCTTTTAAAG-GCATAGGTAACTATAAATGGACTTTTCT-TGCCAATGATA-G-CTTTT
* *
27404 TCTTCATGTTTCTTAAGGCAGATATTCAATTATAATCTGTTTTAA-CAAACAATGT-AAAAAATT
317 TCTTCATGTTTCTTAAGGTAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAA-AATGTAAAAAAATT
* ********** * * *
27467 CAACTTAAAANNNNNNNNNNGATTATAAAAACATTTAAAGCGCGTAATAAGGCTTTCGAACGCAT
381 CAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCGAAGGCAT
*
27532 GGGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAACGAATGCCTTTTCTTGCCAATGAATGGC-TTTTTC
446 GGGTGACTAT-AA---A-------T----A-G-A---CTTTTCTTGCCAATG-ATAGCATTTTTC
* **
27596 TTTATGTTTCCTAAGGTA-TACA
490 TTCATGTTTCCTAAGACAGT-CA
* * * ********* * * *
27618 TTCGATTATAATCTATTTTAACCAAAAATNNNNNNNNNNTCAACCTAAAATCAGTTATGAGATTA
1 TTCAATTATAATCTGTTTTAACTAAAAAT-ATAAAAAAATAAAACTAAAATCAATTATGAGATTA
* * * * *
27683 TAAAACCATGTAAAGCGAGTAATTAGGGTTTTGAAGGCATAGGTAACTATAAATAGACTTTTCTT
65 TAAAACTATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTAAAGGCATGGGTAACTATAAATAGACTTTTCTT
* * * * * * *
27748 CCCAATGAATGGTTTTTTCCTCAAGTTT-CTCAAGGTAGACATTCAATTATAATCTGCTTTAACA
130 ACCAATGAATGGCTTTTTCTTCATGTTTCCT-AAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACC
* * * * * *
27812 AAAAATGTAAACAAATTAAACATAAAATCAATTATGAGATTATAAATCCATTTAAAGTGAGTAAT
194 AAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGACATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAAT
* * ** * * **
27877 AGGGATTTCGAAGGTATAGGTAACAATAAATAAACTTTTCTTGCCAATGATAGCCTTTCTT-TTC
259 AAGGCTTTTAAAGGCATAGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGATAG-CTTT-TTCTTC
* * * * * *
27941 ATGTTTCTTAAAGCAGATATTCAATTATAATATGTTTTAACAAAAAATATAAAAAAATTCAACCT
322 ATGTTTCTTAAGGTAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCT
************************************************************
28006 AAAA-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
387 AAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCGAAGGCATGGGTGA
************************************************************
28070 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
452 CTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATGATAGCATTTTTCTTCATGTTTCCTAAGACAGTCA
******************** * ** *
28130 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA--AAAAATATAAAAACATTTAACATAAAATCAATTATGAGAGTA
1 TTCAATTATAATCTGTTTTAACTAAAAATATAAAAAAATAAAAC-TAAAATCAATTATGAGATTA
* * * * * *
28193 TAAAACCATTAAAAGTGAGTAATAAGGCTTTCAAA-GCTATGGGTTACTATAAAT-GTACTTTTC
65 TAAAACTATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTAAAGGC-ATGGGTAACTATAAATAG-ACTTTTC
* * * * * * * * * **
28256 TTGCCAATG-ATAGCATTTTTCTTCACGTTT-TTTAGGTAAAAATTCAATTATAAGCCATTTNNN
128 TTACCAATGAATGGC-TTTTTCTTCATGTTTCCTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTT---
********************************************************
28319 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
189 ---------TAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGACATTATAAAACCAT
*************************************************************
28384 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGA-
245 TTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTTAAAGGCATAGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAT
* * * * * ** *
28448 ATGGTTTTTTTTC-TCATTTCCTAAAGTAGATGTTGAATTATAATCTG-TTTAACCAAAAATGTA
310 A-GCTTTTTCTTCAT-GTTTCTTAAGGTAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTA
* * * * * * **
28511 AAAGATTTCAACCTAAAATCAATTTTGAGATTTTAAAACCATTTAAAGCTAGTAATTACACTTTC
373 AAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTC
* * * * * * * **
28576 GATGGCATAGGTAACTACAAATAGACTTTTCTAGCTAATGAATGGC-TTTTTCTTTGTGTTT-CT
438 GAAGGCATGGGTGACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATG-ATAGCATTTTTCTTCATGTTTCCT
* **
28639 CAAGATAAAACA
502 -AAGA-CAGTCA
* * * * * * * * * *
28651 TTCAATAATAATTTATTTTAA-TAAAAAATGTAGAAAAACTCAACCCAAAATTAATTATGACATT
1 TTCAATTATAATCTGTTTTAACT-AAAAATATA-AAAAAATAAAACTAAAATCAATTATGAGATT
* * * * * * * *
28715 ATAAAACCATTTAAAGCAAGTAATAAGGCTTTCAAAGGTATGGGCAACTATAAATTGACTTTTAT
64 ATAAAACTATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTAAAGGCATGGGTAACTATAAATAGACTTTTCT
* * * * * * * *
28780 TGCTAATG-ATAGCCTTTTTCTTCACGTTTCTTGAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTCAT
129 TACCAATGAAT-GGCTTTTTCTTCATGTTTCCTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAAC
* * * * *
28844 TAAAAATGT-AAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTAGAAAACCATTTAAAGCGCGTAA
193 CAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGACATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAA
* * * * * * * *
28908 TAAAGCTTTCAAAGGTATGGGTGACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTATTTCTTC
258 TAAGGCTTTTAAAGGCATAGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATG-ATAGCTTTTTCTTC
* * * * * * * ** *
28973 ACGTTTCCTAAGGTAAACATTTAAGTATAATCTGTTTTAACCAAAAATATAAAAATATTTTACAT
322 ATGTTTCTTAAGGTAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCT
* * * * * * * * *
29038 AAAATCAATTACGAGATTATAAAACTATTTAAAGTGAGTAATTATGATTTTGAAGGTATGGGTAA
387 AAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCGAAGGCATGGGTGA
* * * * * * **
29103 CTATAAATGGACTTTTGTTGTCAATGAATAGC-CTTTTCTTTATGTTTCCCAAGGTAGAT-A
452 CTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATG-ATAGCATTTTTCTTCATGTTTCCTAAGACAG-TCA
* * * *
29163 TTCAATTATAATTTGTTTGAAC-AAAAAT-TAAAAAAAATTTAACCTAAAATCAATTATGAGATT
1 TTCAATTATAATCTGTTTTAACTAAAAATAT-AAAAAAA-TAAAACTAAAATCAATTATGAGATT
* * * * * * * *
29226 ATAAAACCATTAAAAGCGAGTAATGAGGCTTTTGAAGGCTTGAGTGACTAGAAAT-GAACTTTTC
64 ATAAAACTATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTAAAGGCATGGGTAACTATAAATAG-ACTTTTC
* * * * *
29290 TTGCCAATGAATGGCTTTTTCTTCTTAT-TTTTC-AAGGTAGACATTCAATAATAATTTGTTTTA
128 TTACCAATGAATGGCTTTTTCTTC--ATGTTTCCTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTA
* * * *
29353 ACCAAAAAATGTAAAAAAATTCAATCTAAAATCAATTATGACATTATAAAATCATTTTAAGTGAG
191 ACC-AAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGACATTATAAAACCATTTAAAGCGAG
* * * * * *
29418 CAATCAGGCTTTTGAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACCTTTT-TTGCCAATGAATGGTTTTTT
255 TAATAAGGCTTTTAAAGGCATAGGTAACTATAAATGGA-CTTTTCTTGCCAATG-ATAGCTTTTT
* * **
29482 CTTCATGTTT-TCTAAGGTAGACATTTAATTGTAAT-TCGTTTTAACCAAAAATGTAGGAAAATT
318 CTTCATGTTTCT-TAAGGTAGACATTCAATTATAATCT-GTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATT
** * * *
29545 CAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGTTAGTAATTAGACTTTCGAATGCAT
381 CAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCGAAGGCAT
* * ** * * * * * * * *
29610 GGGTGACCAGAAAGGGACTTTTCTTGCTAATAAATGGC-TTTTTCTTCACGTTTCTTGAGGCAAA
446 GGGTGACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAAT-GATAGCATTTTTCTTCATGTTTCCTAAGAC-AG
29674 T-A
509 TCA
* * * * ** * * *
29676 TTCAATTATAATCTATTGTAA-TAAAAATGTTAAAAGTTCAACCTAAAATCTATTATGAGATTAT
1 TTCAATTATAATCTGTTTTAACTAAAAATATAAAAAAATAAAACTAAAATCAATTATGAGATTAT
* * * * * *
29740 AAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGG-TTTTCCAATGCATGGGTGACCAAAAATAGACTTTTCTT
66 AAAACTATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTT-AAAGGCATGGGTAACTATAAATAGACTTTTCTT
* * ** * * * * *
29804 ACCAATTAATGGCTTTTTCTTTACATTT-CTTAGGCAAATATTCAATTATAATGTGTTTTAATCA
130 ACCAATGAATGGCTTTTTCTTCATGTTTCCTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCA
* * * * *
29868 AAAATAT-AAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGATATTATAATACCATTTAAAGCGCGTAATA
195 AAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGACATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATA
* * * * * * *
29932 AAGCTTTCAAAGGTATGGGTGACTATAAATGGACTTTTCTTACCAATGAATAG-TTGTTTCTTTA
260 AGGCTTTTAAAGGCATAGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATG-ATAGCTT-TTTCTTCA
* * * * * *
29996 CGTTTCTTAAGGTAAACATTCAATTATAATC-GATTTTAATCAAAAATGTAAAACAATTTAACAT
323 TGTTTCTTAAGGTAGACATTCAATTATAATCTG-TTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCT
* * * * * * * **
30060 AAAATCAATTACGAGATTATAAAACCATTTAAAGCTAGTAATTACGATTTTGAAGGCATTGGCAA
387 AAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCGAAGGCATGGGTGA
* * * * * * * * **
30125 CTAAAAATGGACTTTTGTTGCTAGTGAATGGC-CTTTTCTTCATGTTTCCTAAGGCAAACA
452 CTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATG-ATAGCATTTTTCTTCATGTTTCCTAAGACAGTCA
* * * *
30185 TTCAATTATAATCTGTTTTAA-TGAAAAT-TAAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATTAGATT
1 TTCAATTATAATCTGTTTTAACTAAAAATAT-AAAAAAA-TAAAACTAAAATCAATTATGAGATT
* * * * *
30248 ATAAAACTATTTAAAGCGAGTAATTAAGCTTTTGAAA-GTATGGGTAACTATTAATGGACTTTGC
64 ATAAAACTATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTT-AAAGGCATGGGTAACTATAAATAGACTTTTC
* * * * * * * * *
30312 TTACTAATGAATGACCTTTTTC-TCAAGTTTCTTGAGACAGGCTTTCAATTATAATATGTTTTAA
128 TTACCAATGAATG-GCTTTTTCTTCATGTTTCCTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAA
* * * *
30376 -CAAAACATAT-AAAAAATTCAACATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGTGAGT
192 CCAAAA-ATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGACATTATAAAACCATTTAAAGCGAGT
* * *
30439 AATAAAGCTTTTAAAGGTAT-GAG-AGACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATGATAGCCTTTTT
256 AATAAGGCTTTTAAAGGCATAG-GTA-ACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGATAG-CTTTTT
* * *
30502 -TGTCATGTTTCTTGAGGTAGACATTCAATTATAATCTGTTTTCACCAAAAATATAAAAAAA-TC
318 CT-TCATGTTTCTTAAGGTAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTC
* * * *
30565 AACATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAGCGAAG-AATAAAGCTTTCGGAGGCAT
382 AACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCG-AGTAATAAGGCTTTCGAAGGCAT
* * * * ** * * **
30629 AGGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGATAGCCTTTTTCTTCACGTTTTTTGAGGCAAAC
446 GGGTGACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATGATAGCATTTTTCTTCATGTTTCCTAAGACAGTC
30694 A
511 A
* * * ** * *
30695 TTCAATTATAATATGTTTTCA-TCAAAAATGT-AAAAAATTCAACATAAAAGCAATTATGACATT
1 TTCAATTATAATCTGTTTTAACT-AAAAATATAAAAAAATAAAAC-TAAAATCAATTATGAGATT
* * * * *
30758 ATAAAACCT-TTTAAAACGAGTAATAAGG-TTGTCAAAGGCATGGGTGACTATAAATGGACTTTT
64 ATAAAA-CTATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTT-TTAAAGGCATGGGTAACTATAAATAGACTTTT
* * * * * * * *
30821 CTTGCCAATG-ATAGCTTTTTTCTTCATGTTTCTTGAGGCAGATATTCATTTATAATTTGTTTTC
127 CTTACCAATGAATGGC-TTTTTCTTCATGTTTCCTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTA
* * * * *
30885 ACCAAAAATGT-AAAAAATTCAACATAAAATCAATTATAAGATTATAAAACCATTTAGAGTGAGT
191 ACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGACATTATAAAACCATTTAAAGCGAGT
* * * * *
30949 AATAAGGC-TTTCAAGGACAT-GGATAACTATAAATAGACTTTT-TGTACCAATGACAACTTTTT
256 AATAAGGCTTTTAAAGG-CATAGG-TAACTATAAATGGACTTTTCT-TGCCAATGATAGC-TTTT
* * * * * *
31011 TCTTCACGTTTCTTGAGGCAGTCATTCAATTATAATTTGTTTTAAACAAAAATGTAAAAAAATTC
317 TCTTCATGTTTCTTAAGGTAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTC
31076 AACCTA
382 AACCTA
31082 NNNNNNNNNN
Statistics
Matches: 19245, Mismatches: 5597, Indels: 2693
0.70 0.20 0.10
Matches are distributed among these distances:
487 3 0.00
488 8 0.00
489 168 0.01
490 293 0.02
491 276 0.01
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493 301 0.02
494 81 0.00
495 9 0.00
496 10 0.00
497 2 0.00
498 3 0.00
499 9 0.00
500 269 0.01
501 6 0.00
502 5 0.00
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504 20 0.00
505 200 0.01
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AAAACTATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTAAAGGCATGGGTAACTATAAATAGACTTTTCTTA
CCAATGAATGGCTTTTTCTTCATGTTTCCTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAA
AAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGACATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAA
GGCTTTTAAAGGCATAGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGATAGCTTTTTCTTCATGT
TTCTTAAGGTAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAA
TCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCGAAGGCATGGGTGACTAT
AAATAGACTTTTCTTGCCAATGATAGCATTTTTCTTCATGTTTCCTAAGACAGTCA
Found at i:9225 original size:171 final size:168
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8915 TTTCTTTGGG
* * * * * * * *
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* * *
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* *
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** * * *
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* * *
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* * * * * * ***
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1 TTTCAAAGGCATGGGTGACTATAAAT-GACTTTTCTTGCCAATGAAGT--CTTTTTCTTCACGTT
* * * * ** * *
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* * *
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* * * * * *
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1 TTTCAAAGGCATGGGTGACTAT-AAATGACTTTTCTTGCCAATGA-AGTCTTTTTCTTCACGTTT
* * * * * * * ** * *
9503 CTCTAGGCAAAAAATGAATTATAATCTGTTTTCACCAAAAACGTAAAACAATTCAACCTAAAATC
64 CTCAAGGCAGACATTCAATTATAATCTATTTTAACCAAAAATATAAAA-AATTTAACTTAAAATC
* ** * * * * *
9568 AGTTACAACATTATAAAACCATTTGAAA-CCAGTAATTACGA
128 AATTATGAGATTATAAAACCATTT-AAAGCGAGTAATAAGGC
** * * * * *
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1 TTTCAAAGGCATGGGTGACTATAAA-TGACTTTTCT-T-GCCAATGAA-GTCTTTTTCTTCACGT
* *
9672 TTCTCAAGGCAGACATTCAATTATATTATATTTTTAA--AAAAA-AGTAAAAACATTTAACTTAA
62 TTCTCAAGGCAGACATTCAATTATAATCTA-TTTTAACCAAAAATA-TAAAAA-ATTTAACTTAA
* * *
9734 AATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGTGAGTAATTAGACC
124 AATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAG-GC
* * * * * * **
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1 TTTCAAAGGCATGGGTGACTATAAA-TGACTTTTCTTGCCAATGAA-GTCTTTTTCTTCACGTTT
* * * * * * ** *
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64 CTCAAGGCAGACATTCAATTATAATCTATTTTAACCAAAAATATAAAAAATTTAACTTAAAATCA
** * * *
9908 ATTAT-AGGATTATAAAATTATTTAAAGTGCGTAATAAGGA
129 ATTATGA-GATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGC
* * *
9948 TTTTAAAGGCATGGGTGACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAACGAA-TGCTTTTTTCTTCATGTT
1 TTTCAAAGGCATGGGTGACTATAAAT-GACTTTTCTTGCCAATGAAGT-C-TTTTTCTTCACGTT
* * * * * *
10012 TCCCATGGCAGACATTCAATTATAATCTATTTTCACTAAAAACATAAAAAAATTTAACATAAAAT
63 TCTCAAGGCAGACATTCAATTATAATCTATTTTAACCAAAAATAT-AAAAAATTTAACTTAAAAT
* * * * * * * *
10077 TAATTACGAGATTATAAGACCATTTAAAGTGAGCAATTACGA
127 CAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGC
** * * *
10119 TTTTGAAGGAATGGGTAACTATAAATGGATTTTTCTT
1 TTTCAAAGGCATGGGTGACTATAAAT-GACTTTTCTT
10156 CATGTTTCCT
Statistics
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0.76 0.17 0.07
Matches are distributed among these distances:
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173 2 0.00
ACGTcount: A:0.38, C:0.13, G:0.13, T:0.35
Consensus pattern (168 bp):
TTTCAAAGGCATGGGTGACTATAAATGACTTTTCTTGCCAATGAAGTCTTTTTCTTCACGTTTCT
CAAGGCAGACATTCAATTATAATCTATTTTAACCAAAAATATAAAAAATTTAACTTAAAATCAAT
TATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGC
Found at i:10213 original size:150 final size:150
Alignment explanation
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Period size: 150 Copynumber: 1.9 Consensus size: 150
9988 AACGAATGCT
* * *
9998 TTTTTCTTCATGTTTCCCATGGCAGACATTCAATTATAATCTATTTTCACTAAAAACATAAAAAA
1 TTTTTCTTCATGTTTCCCAAGGCAGACATTCAATTATAATCTATTTTAACCAAAAACATAAAAAA
* * *
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66 ATTCAACATAAAATCAATTACGAGATTATAAAACCATTTAAAGTGAGCAATTACGATTTTGAAGG
10128 AATGGGTAACTATAAATGGA
131 AATGGGTAACTATAAATGGA
* * *
10148 TTTTTCTTCATGTTTCCTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAA-AGTAGAAA
1 TTTTTCTTCATGTTTCCCAAGGCAGACATTCAATTATAATCTATTTTAACCAAAAACA-TAAAAA
* * * * *
10212 AATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGTGAGTAATTAGGCTTTTGAAG
65 AATTCAACATAAAATCAATTACGAGATTATAAAACCATTTAAAGTGAGCAATTACGATTTTGAAG
10277 G
130 G
10278 CTTGAGTGAC
Statistics
Matches: 115, Mismatches: 14, Indels: 2
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.40, C:0.13, G:0.13, T:0.34
Consensus pattern (150 bp):
TTTTTCTTCATGTTTCCCAAGGCAGACATTCAATTATAATCTATTTTAACCAAAAACATAAAAAA
ATTCAACATAAAATCAATTACGAGATTATAAAACCATTTAAAGTGAGCAATTACGATTTTGAAGG
AATGGGTAACTATAAATGGA
Found at i:10434 original size:171 final size:168
Alignment explanation
Indices: 10148--11157 Score: 979
Period size: 171 Copynumber: 5.9 Consensus size: 168
10138 TATAAATGGA
* * * *
10148 TTTTTCTTCATGTTTCCTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAAAGTAGAAAA
1 TTTTTCTTCACGTTTCCCAAGGCAGACATTCAATTATAATTTGTTTTAACCAAAAATGTA-AAAA
* *
10213 ATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGTGAGTAATTAGGCTTTTGAAGG
65 ATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTGAAGG
* * * * * *
10278 CTTGAGTGACTAGAAATAGAATTTTTCTTTCAATGAATTAC
130 CTTG-GTAACTATAAAT-GGACTTTTCTTCCAATGAATGAC
* * * ** *
10319 TTTTTCTTCACGTTTCCCAATGCAAACATTCAATTATAATCTGTTTTAACTTAAAACGTAAAAAA
1 TTTTTCTTCACGTTTCCCAAGGCAGACATTCAATTATAATTTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAA
* * * *
10384 GTTTAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAGAGCGAGTAATTAGGATTTTGAAGG
66 -TTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTGAAGG
* * * *
10449 CATCGGTAACTACAAATGCACTTTTCTAGCCAATGAAT-AGC
130 C-TTGGTAACTATAAATGGACTTTTCT-TCCAATGAATGA-C
** * * * *
10490 TTTTTCTTCTTGTTCCCCAAGGCAGACATTCTATAATAATTTGTTTTAACCAAAAATATAAAAAC
1 TTTTTCTTCACGTTTCCCAAGGCAGACATTCAATTATAATTTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAA-
* * * * *
10555 ATTCAACCTAAAATCAATTATTACATTATAAAACTAATTAAAACGAGTAATTAGGCATTTGAAGG
65 ATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTGAAGG
* * *
10620 CTTTGGTAACTATAAATGGACCTTCCTTACCAATGAATGGC
130 C-TTGGTAACTATAAATGGACTTTTCTT-CCAATGAATGAC
* * * * * *
10661 TTTTTCTTTAGGTTTCCTAAGGTAGACATTCAATTATAATATGTATTAACCAAAAATGTAAAACA
1 TTTTTCTTCACGTTTCCCAAGGCAGACATTCAATTATAATTTGTTTTAACCAAAAATGTAAAA-A
** * ********** **
10726 ATTCAATATACAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAANNNNNNNNNNAGGCTTTCAAAGG
65 ATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTGAAGG
* * * *
10791 CATGGGTGACTATAAATGTA-TATTTCTTGCCAATGACA-GCC
130 C-TTGGTAACTATAAATGGACT-TTTCTT-CCAATGA-ATGAC
* * *** * * *
10832 TTTTCCTTCACATTTCTTGATGCAGTCATTCAATTATAATTTGTTTTAACAAAAAATGTAAAACA
1 TTTTTCTTCACGTTTCCCAAGGCAGACATTCAATTATAATTTGTTTTAACCAAAAATGTAAAA-A
* *
10897 ATTCAACCTAAAATCAATTATGACATTATAAAACTATTTTAAA-TGAGTAATTAGGCTTTTGAA-
65 ATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTA-TTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTGAAG
* * *
10960 GATATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTAGCCAATGAATGGC
129 GCT-T-GGTAACTATAAATGGACTTTTCT-TCCAATGAATGAC
* * * * *
11003 TTTTTCTTCAAGTTTCCCAAGGTAAACATTCAATAATAATTTGTTTTAA-CAAAAATATAGAAAA
1 TTTTTCTTCACGTTTCCCAAGGCAGACATTCAATTATAATTTGTTTTAACCAAAAATGTA-AAAA
* * * *
11067 ATTCAACCAAAAATCAATTATAAGATTATAAAAATATTTAAAGCGAGTAATTAGACTTTTGAAGG
65 ATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTGAAGG
* *
11132 CTTGAGTGACTAGAAATGGACTTTTC
130 CTTG-GTAACTATAAATGGACTTTTC
11158 CTTCATGTTT
Statistics
Matches: 679, Mismatches: 140, Indels: 41
0.79 0.16 0.05
Matches are distributed among these distances:
169 8 0.01
170 95 0.14
171 564 0.83
172 12 0.02
ACGTcount: A:0.38, C:0.14, G:0.12, T:0.34
Consensus pattern (168 bp):
TTTTTCTTCACGTTTCCCAAGGCAGACATTCAATTATAATTTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAA
TTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTGAAGGC
TTGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTCCAATGAATGAC
Found at i:11295 original size:151 final size:150
Alignment explanation
Indices: 10997--11308 Score: 394
Period size: 151 Copynumber: 2.1 Consensus size: 150
10987 CTAGCCAATG
*
10997 AATGG-CTTTTTCTTCAAGTTTCCCAAGGTAAACATTCAATAATAATTTGTTTTAACAAAAATAT
1 AATGGACTTTTCCTTCAAGTTTCCCAAGGTAAACATTCAATAATAATTTGTTTTAACAAAAATAT
11061 AGAAAAATTCAACCAAAAATCAATTATAAGATTATAAAAATATTTAAAGCGAGTAATTAGACTTT
66 AGAAAAATTCAACCAAAAATCAATTATAAGATTATAAAAATATTTAAAGCGAGTAATTAGACTTT
* *
11126 TGAAGGCTTGAGTGACTAGA
131 TGAAGGCGTGAGTAACTAGA
* * *
11146 AATGGACTTTTCCTTCATGTTTTCCAAGG-AAGACATTCAATAATAATTTGTTTTAACCCAAAAT
1 AATGGACTTTTCCTTCAAGTTTCCCAAGGTAA-ACATTCAATAATAATTTGTTTTAA-CAAAAAT
* * * ********** *
11210 ATAGAAAAATTCAATCAAAAATTAATTATGAGATTATAAANNNNNNNNNNGCGAGTAATTAGGCT
64 ATAGAAAAATTCAACCAAAAATCAATTATAAGATTATAAAAATATTTAAAGCGAGTAATTAGACT
*
11275 TTTGAAGGCGTGGGTAACTAGA
129 TTTGAAGGCGTGAGTAACTAGA
*
11297 AATGGACCTTTC
1 AATGGACTTTTC
11309 TTACTAATGA
Statistics
Matches: 138, Mismatches: 22, Indels: 4
0.84 0.13 0.02
Matches are distributed among these distances:
149 7 0.05
150 44 0.32
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ACGTcount: A:0.39, C:0.12, G:0.14, T:0.32
Consensus pattern (150 bp):
AATGGACTTTTCCTTCAAGTTTCCCAAGGTAAACATTCAATAATAATTTGTTTTAACAAAAATAT
AGAAAAATTCAACCAAAAATCAATTATAAGATTATAAAAATATTTAAAGCGAGTAATTAGACTTT
TGAAGGCGTGAGTAACTAGA
Found at i:11867 original size:170 final size:169
Alignment explanation
Indices: 11393--11868 Score: 582
Period size: 170 Copynumber: 2.8 Consensus size: 169
11383 NNNNNNNTTC
* * * * * *
11393 AACCTAAAATCAATTATGACATTATAAAACCATTTTAAGCGAGTAATTAGGTTTTTAAAGGCACG
1 AACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGATTAA-TAAGTTTTTCAAGGCAAG
* * * * * * * *
11458 GATAACTATAAATGGACCTATCTTGCCAATGA-ATGGTTTTTTCTTCATGTTTCCTAAGATAAAC
65 GGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGTCAATGATA-GCTTTTTTCTTCATGTTTCTTAAGGTAAAC
* *
11522 ATTCAATTGTAATCCGTTTTAACAAAAAATGTAAAAAATTT
129 ATTCAATTGTAATACGTTTTAACAAAAAATATAAAAAATTT
* ** * *
11563 AACCTAAAATCAATTATTAGATTATAAAACCATTTAAAGCGATTAATAAGGCTTTCGAAGGTATG
1 AACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGATTAATAAGTTTTTC-AAGGCAAG
* *
11628 GGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGTCAATGATAGCCTTGTTCTTCATGTTTCTTAAGG-AAACC
65 GGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGTCAATGATAGCTTTTTTCTTCATGTTTCTTAAGGTAAA-C
* *
11692 ATTCAATTGTAATATG-TTTAATCTAAAAATATAAAAAA-TT
129 ATTCAATTGTAATACGTTTTAA-CAAAAAATATAAAAAATTT
* *
11732 CACCTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAATCATTTAAAGCGATTAATAAGTTTTTCAAGGACAA
1 AACC-TAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGATTAATAAGTTTTTCAAGG-CAA
* * * *
11797 GGGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGTCAATGATAGCTTTTTTCTTCACGTTTTTTGAGGTAGAC
64 GGGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGTCAATGATAGCTTTTTTCTTCATGTTTCTTAAGGTAAAC
11862 ATTCAAT
129 ATTCAAT
11869 GGACTTTTCT
Statistics
Matches: 262, Mismatches: 37, Indels: 14
0.84 0.12 0.04
Matches are distributed among these distances:
169 23 0.09
170 236 0.90
171 3 0.01
ACGTcount: A:0.37, C:0.13, G:0.14, T:0.36
Consensus pattern (169 bp):
AACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGATTAATAAGTTTTTCAAGGCAAGG
GTGACTATAAATGGACTTTTCTTGTCAATGATAGCTTTTTTCTTCATGTTTCTTAAGGTAAACAT
TCAATTGTAATACGTTTTAACAAAAAATATAAAAAATTT
Found at i:12253 original size:400 final size:398
Alignment explanation
Indices: 11537--12268 Score: 909
Period size: 400 Copynumber: 1.8 Consensus size: 398
11527 ATTGTAATCC
* * * *
11537 GTTTTAACAAAAAATGTAAAAAATTTAACCTAAAATCAATTATTAGATTATAAAACCATTTAAAG
1 GTTTTAACAAAAAATGTAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGACATTATAAAACCAATTAAAG
* * * * * * * **
11602 CGATTAATAAGGCTTTCGAAGGTATGGGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGTCAATGATAGCCTT
66 CGAGTAATAAGGCTTTCAAAGGCATGGGTAACAATAAATGGACCTTCCTTACCAATGATAGCCTT
* * *
11667 GTTCTTCATGTTTCTTAAGGAAACCATTCAATTGTAATATGTTTAATCTAAAAATATAAAAAATT
131 GTTCTTCAGGTTTCTTAAGGAAACCATTCAATTATAATATGTTTAATCGAAAAATATAAAAAATT
* ** * * * **
11732 CACCTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAATCATTTAAAGCGATTAATAAGTTTTTCAAGGACAA
196 CAACACAAAATCAATTATGAGATTAGAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCAAGGACAA
* * * * *
11797 GGGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGTCAATGATAGCTTTTTTCTTCACGTTTTTTGAGGTAGAC
261 GGGTGACTATAAATAGACTTTTCTTGTCAATGACAGCCTTTTGCTTCACATTTTTTGAGGTAGAC
11862 ATTCAATGGACTTTTCTAGCAAATGAATGACTTTTTCTTCTTGTTTTCCTAGGCAGATATTCAAT
326 ATTCAATGGACTTTTCTAGCAAATGAATGACTTTTTCTTCTTGTTTTCCTAGGCAGATATTCAAT
11927 AATAATTT
391 AATAATTT
* * *
11935 GTTTTAACTAGAAATATG-AAAACATTCAACCTAAAATCAATTATGACATTGTAAAACCAATTAA
1 GTTTTAAC-A-AAAAATGTAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGACATTATAAAACCAATTAA
* * *
11999 AGTGAGTAATTAGGCATTT-AAAGGCATGGGTAACAATGAATGGACCTTCCTTACCAATGAATAG
64 AGCGAGTAATAAGGC-TTTCAAAGGCATGGGTAACAATAAATGGACCTTCCTTACCAATG-ATAG
* * * ** *
12063 -GTTTTTCTTTAGGTTTCTTGGGGTAAA-CATTCAATTATAATCTGTTTTAAT-GAAAAATATAA
127 CCTTGTTCTTCAGGTTTCTTAAGG-AAACCATTCAATTATAATATG-TTTAATCGAAAAATAT-A
* **
12125 AAAAATTCAACACAAAATCAATTATGAGATTAGAAAACCATTTGAAGTTAGTAATAAGGCTTTCA
189 AAAAATTCAACACAAAATCAATTATGAGATTAGAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTC-
* * * *
12190 AATG-CATGGGTGACTGTAAATAGACTTTTCTTGTCAATGACAGCCTTTTGCTTCATATTTTTTG
253 AAGGACAAGGGTGACTATAAATAGACTTTTCTTGTCAATGACAGCCTTTTGCTTCACATTTTTTG
*
12254 AGGTAGTCATTCAAT
318 AGGTAGACATTCAAT
12269 TATAAACTAT
Statistics
Matches: 277, Mismatches: 49, Indels: 14
0.81 0.14 0.04
Matches are distributed among these distances:
398 8 0.03
399 124 0.45
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ACGTcount: A:0.36, C:0.13, G:0.15, T:0.36
Consensus pattern (398 bp):
GTTTTAACAAAAAATGTAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGACATTATAAAACCAATTAAAG
CGAGTAATAAGGCTTTCAAAGGCATGGGTAACAATAAATGGACCTTCCTTACCAATGATAGCCTT
GTTCTTCAGGTTTCTTAAGGAAACCATTCAATTATAATATGTTTAATCGAAAAATATAAAAAATT
CAACACAAAATCAATTATGAGATTAGAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCAAGGACAA
GGGTGACTATAAATAGACTTTTCTTGTCAATGACAGCCTTTTGCTTCACATTTTTTGAGGTAGAC
ATTCAATGGACTTTTCTAGCAAATGAATGACTTTTTCTTCTTGTTTTCCTAGGCAGATATTCAAT
AATAATTT
Found at i:12594 original size:151 final size:151
Alignment explanation
Indices: 12405--12680 Score: 403
Period size: 151 Copynumber: 1.8 Consensus size: 151
12395 AATGAATGGT
* *
12405 TTTTTCTTCATGTTTCCCAAAGCAGACATTCAATAATAATTTATTTTAACCAAAAATATAAGA-A
1 TTTTTCTTCATGTTTCCCAAAGCAGACATTCAATAATAATGTATTTTAA-CAAAAAAATAAGAGA
*
12469 AATCCAATCAAAAATCAATGATGTGATTATAAATA-TATTTAAAGTGAGTAATTAGGCTTTTAAA
65 AATCCAATCAAAAATCAATGATGAGATTATAAA-ACTATTTAAAGTGAGTAATTAGGCTTTTAAA
12533 AGCTTGACTGACTAGAAATGGAC
129 AGCTTGACTGACTAGAAATGGAC
* * * * * *
12556 TTTTTCTTCGTGTTTTCCAAGGCAGACATTCAATAATAATGTGTTTTAATAAAAAAATTAGAGAA
1 TTTTTCTTCATGTTTCCCAAAGCAGACATTCAATAATAATGTATTTTAACAAAAAAATAAGAGAA
* * * *
12621 ATTCAATCAAAAATTAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAGTGCGTAATTAGGCTTTT
66 ATCCAATCAAAAATCAATGATGAGATTATAAAACTATTTAAAGTGAGTAATTAGGCTTTT
12681 GAAGGTGAGG
Statistics
Matches: 110, Mismatches: 13, Indels: 4
0.87 0.10 0.03
Matches are distributed among these distances:
150 11 0.10
151 99 0.90
ACGTcount: A:0.41, C:0.11, G:0.12, T:0.36
Consensus pattern (151 bp):
TTTTTCTTCATGTTTCCCAAAGCAGACATTCAATAATAATGTATTTTAACAAAAAAATAAGAGAA
ATCCAATCAAAAATCAATGATGAGATTATAAAACTATTTAAAGTGAGTAATTAGGCTTTTAAAAG
CTTGACTGACTAGAAATGGAC
Found at i:13046 original size:492 final size:492
Alignment explanation
Indices: 12089--13566 Score: 1067
Period size: 512 Copynumber: 3.0 Consensus size: 492
12079 CTTGGGGTAA
* *
12089 ACATTCAATTATAATCTGTTTTAATGAAAAATATAAAAAAATTCAACACAAAATCAATTATGAGA
1 ACATTCAATAATAATCTGTTTTAATAAAAAATATAAAAAAATTCAACACAAAATCAATTATGAGA
* * * * * *
12154 TTAGAAAACCATTTGAAGTTAGTAATAAGGCTTTCAAATGCATGGGTGACTGTAAATAGACTTTT
66 TTAGAAAACCATTTAAAGTGAGTAATAAGGCTTTCAAATGCATGGGTAACTATAAATAGACCTTC
* * * * * *
12219 CTTGTCAATGACAGCCTTTTGCTTCATATTTTTTGAGGTAGTCATTCAATTATAAACTATTTTAA
131 CTTGCCAATGACAGACTTTTGCTTCATATTTTCTAAAGTAGACATTCAATTATAAACTATTTTAA
* ** * * *
12284 CAAAAAATACAAAAAGTTTAACCTAAAATTAATTATGTCATTATTAAACCATTTTAAGCAAGTAA
196 CAAAAAATACAAAAAATTTAACCTAAAACCAATTATGACATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAA
* * * * *
12349 CTAGGCTTTTCAGGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTAGCCAATGAATGGTTTTTTCTTC
261 CTAGGCTTTTCAAGGCATGAGTAACTAGAAATGGACTTTTCTAGCCAATAAATGGCTTTTTCTTC
** **
12414 ATGTTTCCCAAAGCAGACATTCAATAATAATTTATTTTAACCAAAAATATAAGAAAATCCAATCA
326 AAATTTCCCAAAGCAGACATTCAATAATAACCTATTTTAACCAAAAATATAAGAAAATCCAATCA
* * * ** * *
12479 AAAATCAATGATGTGATTATAAATATATTTAAAGTGAGTAATTAGGCTTTTAAAAGCTTGACTGA
391 AAAATCAATGATGAGATTATAAAAACATTTAAAACGAGTAATAAGGCTTTTAAAAGATTGACTGA
12544 CTAGAAATGGACTTTTTCTTCGTGTTTTCCAAGGCAG
456 CTAGAAATGGACTTTTTCTTCGTGTTTTCCAAGGCAG
* * * *
12581 ACATTCAATAATAATGTGTTTTAATAAAAAA-ATTAGAGAAATTCAATCA-AAAATTAATTATGA
1 ACATTCAATAATAATCTGTTTTAATAAAAAATA-TAAAAAAATTCAA-CACAAAATCAATTATGA
* * * * * * *
12644 GATTATAAAACTATTTAAAGTGCGTAATTAGGCTTTTGAAGGTG-A-GGGTAACTATAAATGGAC
64 GATTAGAAAACCATTTAAAGTGAGTAATAAGGC-TTTCAA-ATGCATGGGTAACTATAAATAGAC
* * * * *
12707 CTTCCTTGCCAATGA-ATTACTTTTTCTTCATGTTTTCTAAAGTAGACATTCAATTATAATCTGT
127 CTTCCTTGCCAATGACA-GACTTTTGCTTCATATTTTCTAAAGTAGACATTCAATTATAAACTAT
* * *
12771 TTTAACTAAAAAT-CTAAAAAACATTTAGCCTAAAACCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAA
191 TTTAACAAAAAATAC--AAAAA-ATTTAACCTAAAACCAATTATGACATTATAAAACCATTTAAA
* * * * * * * *
12835 GCGAGTAATTAGGCTTTTGAATGCTTGAGTGACTAGAAATGGATTTTTTTA-CCAATAAATGGCT
253 GCAAGTAACTAGGCTTTTCAAGGCATGAGTAACTAGAAATGGACTTTTCTAGCCAATAAATGGCT
*** * * * ** * *
12899 TTTTCTTCAAATTTCTTGAGGCAGATATTCAATTATAACCTATTTTAATTATAAATGTAA-AAAA
318 TTTTCTTCAAATTTCCCAAAGCAGACATTCAATAATAACCTATTTTAACCAAAAATATAAGAAAA
* * * * * *
12963 TTCAA-CTTAAAATTAATTATGAGATTATAAAAACATTTAAAACGCGTAATAAGGC-TTTCAAAG
383 TCCAATC-AAAAATCAATGATGAGATTATAAAAACATTTAAAACGAGTAATAAGGCTTTTAAAAG
** * *
13026 ATATGGGTGACTATAAATGGAC-TTTTCTTGCCAACGAATACCTTTTTCTTCAAGTTTCTTGAGG
447 AT-TGACTGACTAGAAATGGACTTTTTCTT-----CG--T---GTTTTC--C-A--------AGG
*
13090 AAG
490 CAG
* * * ** * * *
13093 ACATTCAATTATAATCTGCTTTCACCAAAAACATAAAAAAATTTAACATAAAATCAATTAT-AGG
1 ACATTCAATAATAATCTGTTTTAATAAAAAATATAAAAAAATTCAACACAAAATCAATTATGA-G
* * ** ** * * * **
13157 ATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAA-AATTTTGAAGGCATGGATAACTATAAATGGATTT
65 ATTAGAAAACCATTTAAAGTGAGTAA-TAAGGCTTTCAAATGCATGGGTAACTATAAATAGACCT
* * * * * * * * *
13221 TTCTTACCAATGAATAGA-TTTTTCTTCATGTTTCCTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTATTT
129 TCCTTGCCAATG-ACAGACTTTTGCTTCATATTTTCTAAAGTAGACATTCAATTATAAACTATTT
* * ** *** * * * *
13285 TAACCAAAAAAGT--AAAAGATTCAATGTAAATTAAATTATGAGATTATAAAGCTATTTAAAGCG
193 TAA-CAAAAAA-TACAAAAAATTTAACCTAAAACCAATTATGACATTATAAAACCATTTAAAGCA
* * * * * * * ** * *
13348 ACTAATTAGGATTTTGAAGGCAAGGGTAACTATAAACAGACGTTTT-TAGTCAATGAATGGCTTT
256 AGTAACTAGGCTTTTCAAGGCATGAGTAACTAGAAATGGAC-TTTTCTAGCCAATAAATGGCTTT
* * * *
13412 TTCTTCATATTTCCC-AAGTCAGACATTCAATAATAA-TTGGTTTTAA-CAAAAAAAGT-AGAAA
320 TTCTTCAAATTTCCCAAAG-CAGACATTCAATAATAACCT-ATTTTAACCAAAAATA-TAAG-AA
* * * * * * *
13473 AATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGC-TTTAGAA
381 AATCCAATCAAAAATCAATGATGAGATTATAAAAACATTTAAAACGAGTAATAAGGCTTTTA-AA
* * ** *
13537 TGCTTGGGTGACTAGAAATAGA-TTTTTCTT
445 AGATTGACTGACTAGAAATGGACTTTTTCTT
13567 ACTAATGAAA
Statistics
Matches: 775, Mismatches: 160, Indels: 82
0.76 0.16 0.08
Matches are distributed among these distances:
491 19 0.02
492 217 0.28
493 70 0.09
494 76 0.10
496 2 0.00
498 1 0.00
501 5 0.01
503 1 0.00
504 1 0.00
510 77 0.10
511 63 0.08
512 225 0.29
513 16 0.02
514 2 0.00
ACGTcount: A:0.39, C:0.13, G:0.13, T:0.35
Consensus pattern (492 bp):
ACATTCAATAATAATCTGTTTTAATAAAAAATATAAAAAAATTCAACACAAAATCAATTATGAGA
TTAGAAAACCATTTAAAGTGAGTAATAAGGCTTTCAAATGCATGGGTAACTATAAATAGACCTTC
CTTGCCAATGACAGACTTTTGCTTCATATTTTCTAAAGTAGACATTCAATTATAAACTATTTTAA
CAAAAAATACAAAAAATTTAACCTAAAACCAATTATGACATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAA
CTAGGCTTTTCAAGGCATGAGTAACTAGAAATGGACTTTTCTAGCCAATAAATGGCTTTTTCTTC
AAATTTCCCAAAGCAGACATTCAATAATAACCTATTTTAACCAAAAATATAAGAAAATCCAATCA
AAAATCAATGATGAGATTATAAAAACATTTAAAACGAGTAATAAGGCTTTTAAAAGATTGACTGA
CTAGAAATGGACTTTTTCTTCGTGTTTTCCAAGGCAG
Found at i:13225 original size:171 final size:171
Alignment explanation
Indices: 12574--16861 Score: 3051
Period size: 171 Copynumber: 25.0 Consensus size: 171
12564 CGTGTTTTCC
* * * * * * *
12574 AAGGCAGACATTCAATAATAATGTGTTTTAA-TAAAAAAATTAGAGAAATTCAATCA-AAAATTA
1 AAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAACA-TAAAAAAATTCAA-CATAAAATCA
* * * * *
12637 ATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAGTGCGTAATTAGGCTTTTGAAGGTGA-GGGTAACTATAA
64 ATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAAGCTTTTGAAGG-CATGGGTAACTATAA
* * *
12701 ATGGACCTTCCTTGCCAATGAATTA-CTTTTTCTTCATGTTT-TCT
128 ATGGACTTTTCTTGCCAATGAA-TAGCTTTTTCTTCAAGTTTCT-T
* * * * * * *
12745 AAAGTAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACTAAAAATC-TAAAAAACATTTAGCCTAAAACCA
1 AAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAA-CATAAAAAA-ATTCAACATAAAATCA
* * * * * *
12809 ATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTGAATGCTTGAGTGACTAGAAA
64 ATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAAGCTTTTGAAGGCATGGGTAACTATAAA
* * * * *
12874 TGGA-TTTTTTTACCAATAAATGGCTTTTTCTTCAAATTTCTT
129 TGGACTTTTCTTGCCAATGAATAGCTTTTTCTTCAAGTTTCTT
* * * * ** * ** * *
12916 GAGGCAGATATTCAATTATAACCTATTTTAATTATAAATGT-AAAAAATTCAACTTAAAATTAAT
1 AAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAACATAAAAAAATTCAACATAAAATCAAT
* * * ** ** *
12980 TATGAGATTATAAAAACATTTAAAACGCGTAA-TAAGGCTTTCAAAGATATGGGTGACTATAAAT
66 TATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAA-GCTTTTGAAGGCATGGGTAACTATAAAT
* *
13044 GGACTTTTCTTGCCAACGAATACCTTTTTCTTCAAGTTTCTT
130 GGACTTTTCTTGCCAATGAATAGCTTTTTCTTCAAGTTTCTT
* * * * *
13086 GAGGAAGACATTCAATTATAATCTGCTTTCACCAAAAACATAAAAAAATTTAACATAAAATCAAT
1 AAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAACATAAAAAAATTCAACATAAAATCAAT
** *
13151 TAT-AGGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAAAATTTTGAAGGCATGGATAACTATAAAT
66 TATGA-GATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAAGCTTTTGAAGGCATGGGTAACTATAAAT
* * * * *
13215 GGATTTTTCTTACCAATGAATAGATTTTTCTTCATGTTTCCT
130 GGACTTTTCTTGCCAATGAATAGCTTTTTCTTCAAGTTTCTT
* * ** * *
13257 AAGGCAGACATTCAATTATAATCTATTTTAACCAAAAA-AGT-AAAAGATTCAATGTAAATTAAA
1 AAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAACA-TAAAAAAATTCAACATAAAATCAA
* * * * * * *
13320 TTATGAGATTATAAAGCTATTTAAAGCGACTAATTAGGATTTTGAAGGCAAGGGTAACTATAAAC
65 TTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAAGCTTTTGAAGGCATGGGTAACTATAAAT
* * * * **
13385 AGACGTTTT-TAGTCAATGAATGGCTTTTTCTTCATA-TTTCCC
130 GGAC-TTTTCTTGCCAATGAATAGCTTTTTCTTCA-AGTTTCTT
* * * * *
13427 AAGTCAGACATTCAATAATAAT-TGGTTTTAA-CAAAAAAAGTAGAAAAATTCAACCTAAAATCA
1 AAGGCAGACATTCAATTATAATCT-GTTTTAACCAAAAACA-TAAAAAAATTCAACATAAAATCA
* * * * * *
13490 ATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTAGAATGCTTGGGTGACTAGAAA
64 ATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAAGCTTTTGAAGGCATGGGTAACTATAAA
* * * *
13555 TAGATTTTTCTTACTAATGAA-AGGCTTTTTCTTCACA-TTTCTT
129 TGGACTTTTCTTGCCAATGAATA-GCTTTTTCTTCA-AGTTTCTT
* * * * * ** *
13598 GAA-GCAGATATTCAATTATAATCTATTTTAGCCAAAAACGTAAAAAACTT-AATTTAAAATTAA
1 -AAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAACATAAAAAAATTCAACATAAAATCAA
* * * * * * *
13661 TTATGAGATGATAAAAACACTTAAAGTGCA-TAATAAAGCTTTCAGACA--CATGGGTGACTATA
65 TTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCG-AGTAATTAAGCTTT-TGA-AGGCATGGGTAACTATA
* * *** * * * *
13723 AATGAACTTTTCTTGCTAGCAAATACCTTTTTTTTCACGTTTCTC
127 AATGGACTTTTCTTGCCAATGAATAGCTTTTTCTTCAAGTTTCTT
* * * * * * * *
13768 AAGGAAGATATTCAATAATAATCTATTTTCACCAAAAACGTAAAAATA-TCTAACATAAAATTAA
1 AAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAACATAAAAAAATTC-AACATAAAATCAA
* * * * * *
13832 TTACGAGATTATAAAACCATTTAAAACGAGTAATTACGATTTTGAAGACATGGGTAACTATACAT
65 TTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAAGCTTTTGAAGGCATGGGTAACTATAAAT
** * * * **
13897 GGTGTTTTCTTGCCAATGAATGGATTTTTCTTCATGTTTCCC
130 GGACTTTTCTTGCCAATGAATAGCTTTTTCTTCAAGTTTCTT
* ** * * *
13939 AAGGCAGACATTAAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAATATTCAACCTAAAATAAAT
1 AAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAACATAAAAAAATTCAACATAAAATCAAT
* ** * * * * *
14004 TATGAGATTATAAAGCCATTTAAAATG-GCTAATTAGGATTTTGAAGCCGTGGCTAACTATAAAT
66 TATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAG-TAATTAAGCTTTTGAAGGCATGGGTAACTATAAAT
* * * * **
14068 AGACTTTT-TCAGCCAACGAATTA-TTTTTTCTTCGTGTTT-TT
130 GGACTTTTCT-TGCCAATGAA-TAGCTTTTTCTTCAAGTTTCTT
* * ** * *
14109 GAAGGCAGACATTCAATAATAA--TGATTTTAACAAAAAATGTAGAAAAATTCAACTTAAAATCA
1 -AAGGCAGACATTCAATTATAATCTG-TTTTAACCAAAAACATAAAAAAATTCAACATAAAATCA
* * * * *
14172 ATTATGAGATTATAAAATCATTTAAAGCAAGTAA-TAAGGCTTTCGATA-GTATGGGTGACTATA
64 ATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAA-GCTTTTGA-AGGCATGGGTAACTATA
* *
14235 AATAGACTTTTCTTACCAATG-ATAGCCTTTTTCTTCACA-TTTCTT
127 AATGGACTTTTCTTGCCAATGAATAG-CTTTTTCTTCA-AGTTTCTT
* * * * * * ** *
14280 CAGGTAGTCATCCGATTATAATTTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAAT
1 AAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAACATAAAAAAATTCAACATAAAATCAAT
* * * * * * * ** *** *
14345 TATGACATTATAAAACTATTTTTTTGAAAGACCA-TTATAAAACTATTTAAAGTAAGTAATTACG
66 TATGAGATTATAAAACCA----TTT-AAAG-CGAGTAATTAAGCT-TTTGAAGGCA-TGGGTA-A
* * *
14409 CTTTTGAAGGCATGGGTAACTTTAAATGGACATTTCTTGCCAATGAAT-GATTTTTTCTTCACGT
122 C-TAT-AA---AT-GG--AC------T-----TTTCTTGCCAATGAATAG-CTTTTTCTTCAAGT
14473 TTCTT
167 TTCTT
* * * * *
14478 GAA-GCAGTCATTCAATTATAATATATTTT-ACCAAAAATATAAAAAAATTCAACCTAAAATCAA
1 -AAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAACATAAAAAAATTCAACATAAAATCAA
* * *
14541 TTATAACATTATAAAACTATTTTAAAG-GAGTAATT-AGACTTTTGAAGGCATGGGTAACTATAA
65 TTATGAGATTATAAAACCA-TTTAAAGCGAGTAATTAAG-CTTTTGAAGGCATGGGTAACTATAA
* * * *
14604 ATGGACCTTTCTTGCAAATGAATGGC-TTTTCTTCATA-TTTCCTA
128 ATGGACTTTTCTTGCCAATGAATAGCTTTTTCTTCA-AGTTT-CTT
* * * * ** *
14648 AAGTC-GACATTCAATTATAATCCGTTTTAACTAAATATGTAAAAAAATTCAACCTAAAAAT-AA
1 AAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAACATAAAAAAATTCAACAT-AAAATCAA
* * * * * * *
14711 TTATGAGATTATAATACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCGAATGCTTGGGTGACTAGAAAT
65 TTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAAGCTTTTGAAGGCATGGGTAACTATAAAT
* * * * * * *
14776 GAACTTTTTTTTTACAAATGAATGGCTTTTTCTTTATGTTTCTT
130 GGAC--TTTTCTTGCCAATGAATAGCTTTTTCTTCAAGTTTCTT
* * ** * **
14820 AAGGCAGATATTCAATTATAATCTGTTTT-AGCAAAAA-ATGTAAAAATTCAACTTAAAATTGAT
1 AAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAACATAAAAAAATTCAACATAAAATCAAT
* * * * ** * *
14883 TATGAAATTATAAAAACATTTAAAGCGTGTAA-TAAGGCCTTCAAAGGCATGGGTGACTATAAGT
66 TATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAA-GCTTTTGAAGGCATGGGTAACTATAAAT
* * * *
14947 GAACTTTTCCTG-CAAAGAA-ATGCTTTTTTCTTCATATTTTC-T
130 GGACTTTTCTTGCCAATGAATA-GC-TTTTTCTTCA-AGTTTCTT
* * * * * * *
14989 AAGGAAGACATTCAATTATAATCTATTTTCACCAAAAACGTAAATAAA-TCTAACATAAAATTAG
1 AAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAACATAAAAAAATTC-AACATAAAATCAA
* * * * * * *
15053 TTATGAGATTATAAAACCTTTTATAGCGAGTAACTACGATTTTGAAGGCTTAGGTAACTATAAAT
65 TTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAAGCTTTTGAAGGCATGGGTAACTATAAAT
* * * * **
15118 GGATTTTTCTTGCCAATGAATAGATTTTTCCTCATGTTTCCC
130 GGACTTTTCTTGCCAATGAATAGCTTTTTCTTCAAGTTTCTT
* * *** * * * *
15160 AAGGCAGACATTCAATTATAATTTGTTTTAAGCAAAAGTGTAAAAAGATTTAACGTAAAATAAAT
1 AAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAACATAAAAAAATTCAACATAAAATCAAT
* * * *
15225 TATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGACTAATTAGGATTTTGAAGGCATGGGTAACTATAAATA
66 TATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAAGCTTTTGAAGGCATGGGTAACTATAAATG
* * * * *
15290 GTCTTTTCTAGCCAATGAACAGCTTTTTCTTTAAGTTT-TCC
131 GACTTTTCTTGCCAATGAATAGCTTTTTCTTCAAGTTTCT-T
* * * * ** *
15331 AAGTCAGACAATCAATAATAAT-TGGTTTTAACAAAAAATGTAAAAATATTCAATC-TAAAATCA
1 AAGGCAGACATTCAATTATAATCT-GTTTTAACCAAAAACATAAAAAAATTCAA-CATAAAATCA
* * *
15394 ATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGT-AGTAAGGCTTTCGAAGGCATGGGTGACTATAA
64 ATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAA-GCTTTTGAAGGCATGGGTAACTATAA
** *
15458 ATAAACTTTTCTTGCCAATG-ACAGCCTTTTTCTTCACA-TTTCTT
128 ATGGACTTTTCTTGCCAATGAATAG-CTTTTTCTTCA-AGTTTCTT
* ** * * * *
15502 TAGGCATTCATTCGATTATAATTTGTTTTAATCAAAAA-AGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAA
1 AAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAACA-TAAAAAAATTCAACATAAAATCAA
* * * * * * *
15566 TTATGACATTATAAAACTATTTAAAGCAAGTAATTAAGCTTTTAAAGGCATGGGTAGCTTTGAAT
65 TTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAAGCTTTTGAAGGCATGGGTAACTATAAAT
* * * * *
15631 GGACCTTTATTGCTAATGAATGGCTTTTTCTTCATA-TTTCCT
130 GGACTTTTCTTGCCAATGAATAGCTTTTTCTTCA-AGTTTCTT
* * * * * * * *
15673 GAGGTAAATATTCAATTATAATCTGTTTTAAGCAAAAA-AAAAAAACAATTCAACCTAAAATCGA
1 AAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAACATAAAAA-AATTCAACATAAAATCAA
* * * * * *
15737 TTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTACGCTTTCGAATGCTTGGGTGACTAGAAAT
65 TTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAAGCTTTTGAAGGCATGGGTAACTATAAAT
* *
15802 GGACTTTTCTTGCCAACGAA-AGGCTTTTTCTTCACGTTTCTT
130 GGACTTTTCTTGCCAATGAATA-GCTTTTTCTTCAAGTTTCTT
* * * * * ** * * *
15844 GAGGTAGATATTCAATTATAATCTATTTTAGCCAAAAATGT-AAAACATTCAACTTAAAATTAAT
1 AAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAACATAAAAAAATTCAACATAAAATCAAT
* * * ** * * *
15908 TATGAGATTATAAAAACATTTAAAGCGCGTAGA--AGGCTTTCAAAAGCATGAGTGACTATAAAT
66 TATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTA-ATTAAGCTTTTGAAGGCATGGGTAACTATAAAT
* * ** * * * *
15971 TGACTTTTCTTACCACCGAATAACTTTTTATTCACGTTTCTC
130 GGACTTTTCTTGCCAATGAATAGCTTTTTCTTCAAGTTTCTT
* * * * * *
16013 AAGG-TGCACATTCAATTATAATCTATTTTCACCCAAAACATAAAAAAATTTAACATAAAATTAA
1 AAGGCAG-ACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAACATAAAAAAATTCAACATAAAATCAA
* * * * * * *
16077 TTACGAGATTATAAAACTATTTAAAACGAGTAATTACGATTTTAAACGCATGGGTAACTATAAAT
65 TTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAAGCTTTTGAAGGCATGGGTAACTATAAAT
* * * **
16142 GGACTTTTCTTGCCAATGAATAGATTTCTCTTCATGTTTCCC
130 GGACTTTTCTTGCCAATGAATAGCTTTTTCTTCAAGTTTCTT
*** * * *** * **
16184 AATATAGACATTCAATTATAATATGTTTTAATCAAAAGTGT-AAAAAATTTAATTTAAAATCAAT
1 AAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAACATAAAAAAATTCAACATAAAATCAAT
* * * * * * *
16248 TATGAGATTATAAAGCCATTTAAAGTGACTAATTAGGATTTTGAAGGCATGGGTAACTACAAATA
66 TATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAAGCTTTTGAAGGCATGGGTAACTATAAATG
* * ** *
16313 TACTTTTCTAGCCAATGAAT-GTCTTTTTCTTCTTGTTTCTC
131 GACTTTTCTTGCCAATGAATAG-CTTTTTCTTCAAGTTTCTT
* * * * *
16354 AAGGCAGACATTCAATAATAAT-TGGTTTTCACTAAAAATAT-AAAAAATTCAACATCAAATCAA
1 AAGGCAGACATTCAATTATAATCT-GTTTTAACCAAAAACATAAAAAAATTCAACATAAAATCAA
* * * * * * * *
16417 TTATAAGATTATAAAACCATTTAAAGTGAGTAATTAGGCTTTCGAATGCTTGAGTGACTATAAAT
65 TTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAAGCTTTTGAAGGCATGGGTAACTATAAAT
* * * *
16482 GGACTTTT-TCTG-CATATGAGTGGCTTTTTCTTCACGTTTTTT
130 GGACTTTTCT-TGCCA-ATGAATAGCTTTTTCTTCAAGTTTCTT
* * * ** * **
16524 ATA-GTAGATATTCAATTATAATCTGTTTTAGCCAAAAATGT-AAAAAATTCAACTTAAAATTGA
1 A-AGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAACATAAAAAAATTCAACATAAAATCAA
* ** *
16587 TTATGAGATTATAAAAACATTTAAAGCGCA-TAA-TAAGGCTTTCAAAGGCATGGGTGACTATAA
65 TTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCG-AGTAATTAA-GCTTTTGAAGGCATGGGTAACTATAA
* * * ** *
16650 ATGGACTTTT-TTACCAACGAAT-GCCTTTTTCTTTACCTTTCTC
128 ATGGACTTTTCTTGCCAATGAATAG-CTTTTTCTTCAAGTTTCTT
* * * * * * *
16693 GAGGAAGACATTCAATTATAATCTATTTTCACAAAAAACAAAAAAAAATTTAACATAAAATCAAT
1 AAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAACATAAAAAAATTCAACATAAAATCAAT
* * * * * * *
16758 TACGGGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTACGATTTTAAACGCATGGGTAACTATAGATG
66 TATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAAGCTTTTGAAGGCATGGGTAACTATAAATG
* * * *
16823 GACTTTTCTTGTCAATGAATAGATTTCTCTTCATGTTTC
131 GACTTTTCTTGCCAATGAATAGCTTTTTCTTCAAGTTTC
16862 CCAAAAGTGT
Statistics
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168 14 0.00
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Consensus pattern (171 bp):
AAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAACATAAAAAAATTCAACATAAAATCAAT
TATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAAGCTTTTGAAGGCATGGGTAACTATAAATG
GACTTTTCTTGCCAATGAATAGCTTTTTCTTCAAGTTTCTT
Found at i:13245 original size:341 final size:341
Alignment explanation
Indices: 12574--16861 Score: 3256
Period size: 341 Copynumber: 12.5 Consensus size: 341
12564 CGTGTTTTCC
* * * ** *
12574 AAGGCAGACATTCAATAATAATGTGTTTTAATAAAAAAAT-TAGAGAAATTCAATCA-AAAATTA
1 AAGGCAGACATTCAATTATAATCTATTTTAA-CCAAAAATGTA-AAAAATTCAA-CATAAAATTA
* * * * * **
12637 ATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAGTGCGTAATTAGGCTTTTGAAGGTGA-GGGTAACTATAA
63 ATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGC-TTTCAAAGCCATGGGTAACTATAA
* * * *
12701 ATGGACCTTCCTTGCCAATGAATTA-CTTTTTCTTCATGTTT-TCTAAAGTAGACATTCAATTAT
127 ATGGACTTTTCTTGCCAATGAA-TAGCTTTTTCTTCATGTTTCT-TAAGGCAGACATTCAATTAT
* * * * * * *
12764 AATCTGTTTTAACTAAAAATCTAAAAAACATTTAGCCTAAAACCAATTATGAGATTATAAAACCA
190 AATCTGTTTTTACCAAAAATATAAAAAA-ATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCA
* * * * * * *
12829 TTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTGAATGCTTGAGTGACTAGAAATGGA-TTTTTTTACCAATAA
254 TTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTGAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTACCAATGA
* *
12893 ATGGCTTTTTCTTCAAATTTCTT
319 ATAGCTTTTTCTTCATATTTCTT
* * * ** * *
12916 GAGGCAGATATTCAATTATAACCTATTTTAATTATAAATGTAAAAAATTCAACTTAAAATTAATT
1 AAGGCAGACATTCAATTATAATCTATTTTAACCAAAAATGTAAAAAATTCAACATAAAATTAATT
* * * * ** *
12981 ATGAGATTATAAAAACATTTAAAACGCGTAATAAGGCTTTCAAAGATATGGGTGACTATAAATGG
66 ATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCAAAGCCATGGGTAACTATAAATGG
* * * * *
13046 ACTTTTCTTGCCAACGAATACCTTTTTCTTCAAGTTTCTTGAGGAAGACATTCAATTATAATCTG
131 ACTTTTCTTGCCAATGAATAGCTTTTTCTTCATGTTTCTTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTG
* * * * *
13111 CTTTCACCAAAAACATAAAAAAATTTAACATAAAATCAATTAT-AGGATTATAAAACCATTTAAA
196 TTTTTACCAAAAATATAAAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGA-GATTATAAAACCATTTAAA
*** * * *
13175 GCGAGTAATTAAAATTTTGAAGGCATGGATAACTATAAATGGATTTTTCTTACCAATGAATAGAT
260 GCGAGTAATTAGGCTTTTGAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTACCAATGAATAGCT
* *
13240 TTTTCTTCATGTTTCCT
325 TTTTCTTCATATTTCTT
* * **
13257 AAGGCAGACATTCAATTATAATCTATTTTAACCAAAAAAGTAAAAGATTCAATGT-AAATTAAAT
1 AAGGCAGACATTCAATTATAATCTATTTTAACCAAAAATGTAAAAAATTCAACATAAAATT-AAT
* * * * ** * * **
13321 TATGAGATTATAAAGCTATTTAAAGCGACTAATTAGGATTTTGAAGGCAAGGGTAACTATAAACA
65 TATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCAAAGCCATGGGTAACTATAAATG
* * * * ** * *
13386 GACGTTTT-TAGTCAATGAATGGCTTTTTCTTCATATTTCCCAAGTCAGACATTCAATAATAAT-
130 GAC-TTTTCTTGCCAATGAATAGCTTTTTCTTCATGTTTCTTAAGGCAGACATTCAATTATAATC
* * * * *
13449 TGGTTTTAACAAAAAAAGTAGAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTA
194 TGTTTTTACCAAAAATA-TAAAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTA
* * * * * * * *
13514 AAGCGAGTAATTAGGCTTTAGAATGCTTGGGTGACTAGAAATAGATTTTTCTTACTAATGAA-AG
258 AAGCGAGTAATTAGGCTTTTGAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTACCAATGAATA-
*
13578 GCTTTTTCTTCACATTTCTT
322 GCTTTTTCTTCATATTTCTT
* * * **
13598 GAA-GCAGATATTCAATTATAATCTATTTTAGCCAAAAACGTAAAAAACTT-AATTTAAAATTAA
1 -AAGGCAGACATTCAATTATAATCTATTTTAACCAAAAATGTAAAAAA-TTCAACATAAAATTAA
* * * * * * * *
13661 TTATGAGATGATAAAAACACTTAAAGTGCA-TAATAAAGCTTTCAGA-CACATGGGTGACTATAA
64 TTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCG-AGTAATTAGGCTTTCAAAGC-CATGGGTAACTATAA
* * *** * * * * * * *
13724 ATGAACTTTTCTTGCTAGCAAATACCTTTTTTTTCACGTTTCTCAAGGAAGATATTCAATAATAA
127 ATGGACTTTTCTTGCCAATGAATAGCTTTTTCTTCATGTTTCTTAAGGCAGACATTCAATTATAA
* * ** * * * *
13789 TCTATTTTCACCAAAAACGTAAAAATA-TCTAACATAAAATTAATTACGAGATTATAAAACCATT
192 TCTGTTTTTACCAAAAATATAAAAAAATTC-AACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATT
* * * * * ** *
13853 TAAAACGAGTAATTACGATTTTGAAGACATGGGTAACTATACATGGTGTTTTCTTGCCAATGAAT
256 TAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTGAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTACCAATGAAT
* * * **
13918 GGATTTTTCTTCATGTTTCCC
321 AGCTTTTTCTTCATATTTCTT
* * * *
13939 AAGGCAGACATTAAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAATATTCAACCTAAAATAAAT
1 AAGGCAGACATTCAATTATAATCTATTTTAACCAAAAATGTAAAAA-ATTCAACATAAAATTAAT
* ** * ** * *
14004 TATGAGATTATAAAGCCATTTAAAATG-GCTAATTAGGATTTTGAAGCCGTGGCTAACTATAAAT
65 TATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAG-TAATTAGGCTTTCAAAGCCATGGGTAACTATAAAT
* * * * * *
14068 AGACTTTT-TCAGCCAACGAATTA-TTTTTTCTTCGTGTTT-TTGAAGGCAGACATTCAATAATA
129 GGACTTTTCT-TGCCAATGAA-TAGCTTTTTCTTCATGTTTCTT-AAGGCAGACATTCAATTATA
* * * * *
14130 A--TGATTTTAACAAAAAATGTAGAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAATCAT
191 ATCTG-TTTTTACCAAAAATATAAAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCAT
* * * * * *
14193 TTAAAGCAAGTAATAAGGCTTTCGATA-GTATGGGTGACTATAAATAGACTTTTCTTACCAATG-
255 TTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTGA-AGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTACCAATGA
*
14256 ATAGCCTTTTTCTTCACATTTCTT
319 ATAG-CTTTTTCTTCATATTTCTT
* * * * * * * * *
14280 CAGGTAGTCATCCGATTATAATTTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAAT
1 AAGGCAGACATTCAATTATAATCTATTTTAACCAAAAATGT-AAAAAATTCAACATAAAATTAAT
* * *
14345 TATGACATTATAAAACTATTTTTTTGAAAGACCATTATAAAACTATTTAAAGTAAGTAATTACGC
65 TATG--A-GAT-----TA------T-AAA-ACCATT-TAAAGC--------G--AGTAATTAGGC
** * * * * *
14410 TTTTGAAGGCATGGGTAACTTTAAATGGACATTTCTTGCCAATGAAT-GATTTTTTCTTCACGTT
103 TTTCAAAGCCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATAG-CTTTTTCTTCATGTT
* * * *
14474 TCTTGAA-GCAGTCATTCAATTATAATAT-ATTTTACCAAAAATATAAAAAAATTCAACCTAAAA
167 TCTT-AAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTTACCAAAAATATAAAAAAATTCAACTTAAAA
* * * *
14537 TCAATTATAACATTATAAAACTATTTTAAAG-GAGTAATTAGACTTTTGAAGGCATGGGTAACTA
231 TCAATTATGAGATTATAAAACCA-TTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTGAAGGCATGGGTAACTA
* * * * *
14601 TAAATGGACCTTTCTTGCAAATGAATGGC-TTTTCTTCATATTTCCTA
295 TAAATGGACTTTTCTTACCAATGAATAGCTTTTTCTTCATATTT-CTT
* ** * * * *
14648 AAGTC-GACATTCAATTATAATCCGTTTTAACTAAATATGTAAAAAAATTCAACCTAAAAATAAT
1 AAGGCAGACATTCAATTATAATCTATTTTAACCAAAAATGT-AAAAAATTCAACATAAAATTAAT
* * * * *
14712 TATGAGATTATAATACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCGAATG-CTTGGGTGACTAGAAAT
65 TATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTC-AAAGCCATGGGTAACTATAAAT
* * * * * * *
14776 GAACTTTTTTTTTACAAATGAATGGCTTTTTCTTTATGTTTCTTAAGGCAGATATTCAATTATAA
129 GGAC--TTTTCTTGCCAATGAATAGCTTTTTCTTCATGTTTCTTAAGGCAGACATTCAATTATAA
* ** ** * *
14841 TCTG-TTTTAGCAAAAA-ATGTAAAAATTCAACTTAAAATTGATTATGAAATTATAAAAACATTT
192 TCTGTTTTTACCAAAAATATAAAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTT
* * * ** * * * * * *
14904 AAAGCGTGTAATAAGGCCTTCAAAGGCATGGGTGACTATAAGTGAACTTTTCCT-GCAAAGAA-A
257 AAAGCGAGTAATTAGGCTTTTGAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTACCAATGAATA
14967 TGCTTTTTTCTTCATATTT-TCT
322 -GC-TTTTTCTTCATATTTCT-T
* * * *
14989 AAGGAAGACATTCAATTATAATCTATTTTCACCAAAAACGTAAATAAA-TCTAACATAAAATTAG
1 AAGGCAGACATTCAATTATAATCTATTTTAACCAAAAATGTAAA-AAATTC-AACATAAAATTAA
* * * * * ** * * *
15053 TTATGAGATTATAAAACCTTTTATAGCGAGTAACTACGATTTTGAAGGCTTAGGTAACTATAAAT
64 TTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCAAAGCCATGGGTAACTATAAAT
* * * ** *
15118 GGATTTTTCTTGCCAATGAATAGATTTTTCCTCATGTTTCCCAAGGCAGACATTCAATTATAATT
129 GGACTTTTCTTGCCAATGAATAGCTTTTTCTTCATGTTTCTTAAGGCAGACATTCAATTATAATC
* * * * * * * *
15183 TGTTTTAAGCAAAAGTGTAAAAAGATTTAACGTAAAATAAATTATGAGATTATAAAACCATTTAA
194 TGTTTTTACCAAAAATATAAAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAA
* * * * *
15248 AGCGACTAATTAGGATTTTGAAGGCATGGGTAACTATAAATAGTCTTTTC-TAGCCAATGAACAG
259 AGCGAGTAATTAGGCTTTTGAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTA-CCAATGAATAG
* *
15312 CTTTTTCTTTA-AGTTT-TCC
323 CTTTTTCTTCATA-TTTCT-T
* * * * * *
15331 AAGTCAGACAATCAATAATAAT-TGGTTTTAACAAAAAATGTAAAAATATTCAATC-TAAAATCA
1 AAGGCAGACATTCAATTATAATCT-ATTTTAACCAAAAATGTAAAAA-ATTCAA-CATAAAATTA
* * * * *
15394 ATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAGTAAGGCTTTCGAAGGCATGGGTGACTATAAA
63 ATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCAAAGCCATGGGTAACTATAAA
** * ** * ** *
15459 TAAACTTTTCTTGCCAATG-ACAGCCTTTTTCTTCACATTTCTTTAGGCATTCATTCGATTATAA
128 TGGACTTTTCTTGCCAATGAATAG-CTTTTTCTTCATGTTTCTTAAGGCAGACATTCAATTATAA
* * * * * *
15523 TTTGTTTTAATCAAAAA-AGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGACATTATAAAACTATT
192 TCTGTTTTTACCAAAAATA-TAAAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATT
* * * * * * * * * *
15587 TAAAGCAAGTAATTAAGCTTTTAAAGGCATGGGTAGCTTTGAATGGACCTTTATTGCTAATGAAT
256 TAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTGAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTACCAATGAAT
* *
15652 GGCTTTTTCTTCATATTTCCT
321 AGCTTTTTCTTCATATTTCTT
* * * * * * *** * **
15673 GAGGTAAATATTCAATTATAATCTGTTTTAAGCAAAAAAAAAAAACAATTCAACCTAAAATCGAT
1 AAGGCAGACATTCAATTATAATCTATTTTAACCAAAAATGTAAAA-AATTCAACATAAAATTAAT
* * * * *
15738 TATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTACGCTTTCGAATG-CTTGGGTGACTAGAAAT
65 TATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTC-AAAGCCATGGGTAACTATAAAT
* * * * *
15802 GGACTTTTCTTGCCAACGAA-AGGCTTTTTCTTCACGTTTCTTGAGGTAGATATTCAATTATAAT
129 GGACTTTTCTTGCCAATGAATA-GCTTTTTCTTCATGTTTCTTAAGGCAGACATTCAATTATAAT
* * * * *
15866 CT-ATTTTAGCCAAAAATGT-AAAACATTCAACTTAAAATTAATTATGAGATTATAAAAACATTT
193 CTGTTTTTA-CCAAAAATATAAAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTT
* ** * * * * **
15929 AAAGCGCGTAGA--AGGCTTTCAAAAGCATGAGTGACTATAAATTGACTTTTCTTACCACCGAAT
257 AAAGCGAGTA-ATTAGGCTTTTGAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTACCAATGAAT
* * ** *
15992 AACTTTTTATTCACGTTTCTC
321 AGCTTTTTCTTCATATTTCTT
* * * *
16013 AAGG-TGCACATTCAATTATAATCTATTTTCACCCAAAACAT-AAAAAAATTTAACATAAAATTA
1 AAGGCAG-ACATTCAATTATAATCTATTTT-AACCAAAA-ATGTAAAAAATTCAACATAAAATTA
* * * * * *
16076 ATTACGAGATTATAAAACTATTTAAAACGAGTAATTACGATTTTAAA-CGCATGGGTAACTATAA
63 ATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCAAAGC-CATGGGTAACTATAA
* * ** ***
16140 ATGGACTTTTCTTGCCAATGAATAGATTTCTCTTCATGTTTCCCAATATAGACATTCAATTATAA
127 ATGGACTTTTCTTGCCAATGAATAGCTTTTTCTTCATGTTTCTTAAGGCAGACATTCAATTATAA
* * * * * * * *
16205 TATGTTTTAATCAAAAGTGT-AAAAAATTTAATTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAGCCATTT
192 TCTGTTTTTACCAAAAATATAAAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTT
* * * * **
16269 AAAGTGACTAATTAGGATTTTGAAGGCATGGGTAACTACAAATATACTTTTC-TAGCCAATGAAT
257 AAAGCGAGTAATTAGGCTTTTGAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTA-CCAATGAAT
* * *
16333 -GTCTTTTTCTTCTTGTTTCTC
321 AG-CTTTTTCTTCATATTTCTT
* * * * * * *
16354 AAGGCAGACATTCAATAATAAT-TGGTTTTCACTAAAAATATAAAAAATTCAACATCAAATCAAT
1 AAGGCAGACATTCAATTATAATCT-ATTTTAACCAAAAATGTAAAAAATTCAACATAAAATTAAT
* * * * * *
16418 TATAAGATTATAAAACCATTTAAAGTGAGTAATTAGGCTTTCGAATG-CTTGAGTGACTATAAAT
65 TATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTC-AAAGCCATGGGTAACTATAAAT
* * * * * *
16482 GGACTTTT-TCTG-CATATGAGTGGCTTTTTCTTCACGTTTTTTATA-GTAGATATTCAATTATA
129 GGACTTTTCT-TGCCA-ATGAATAGCTTTTTCTTCATGTTTCTTA-AGGCAGACATTCAATTATA
* ** *
16544 ATCTG-TTTTAGCCAAAAATGT-AAAAAATTCAACTTAAAATTGATTATGAGATTATAAAAACAT
191 ATCTGTTTTTA-CCAAAAATATAAAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCAT
* ** * *
16607 TTAAAGCGCA-TAATAAGGCTTTCAAAGGCATGGGTGACTATAAATGGACTTTT-TTACCAACGA
255 TTAAAGCG-AGTAATTAGGCTTTTGAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTACCAATGA
* ** *
16670 AT-GCCTTTTTCTTTACCTTTCTC
319 ATAG-CTTTTTCTTCATATTTCTT
* * * * *** * *
16693 GAGGAAGACATTCAATTATAATCTATTTTCACAAAAAACAAAAAAAAATTTAACATAAAATCAAT
1 AAGGCAGACATTCAATTATAATCTATTTTAACCAAAAA-TGTAAAAAATTCAACATAAAATTAAT
* * * * * *
16758 TACGGGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTACGATTTTAAA-CGCATGGGTAACTATAGAT
65 TATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCAAAGC-CATGGGTAACTATAAAT
* * *
16822 GGACTTTTCTTGTCAATGAATAGATTTCTCTTCATGTTTC
129 GGACTTTTCTTGCCAATGAATAGCTTTTTCTTCATGTTTC
16862 CCAAAAGTGT
Statistics
Matches: 3114, Mismatches: 692, Indels: 282
0.76 0.17 0.07
Matches are distributed among these distances:
339 70 0.02
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ACGTcount: A:0.39, C:0.13, G:0.13, T:0.35
Consensus pattern (341 bp):
AAGGCAGACATTCAATTATAATCTATTTTAACCAAAAATGTAAAAAATTCAACATAAAATTAATT
ATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCAAAGCCATGGGTAACTATAAATGG
ACTTTTCTTGCCAATGAATAGCTTTTTCTTCATGTTTCTTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTG
TTTTTACCAAAAATATAAAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAG
CGAGTAATTAGGCTTTTGAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTACCAATGAATAGCTT
TTTCTTCATATTTCTT
Found at i:14558 original size:197 final size:198
Alignment explanation
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Period size: 198 Copynumber: 1.9 Consensus size: 198
14170 CAATTATGAG
* * * *
14180 ATTATAAAATCATTTAAAGCAAGTAATAAGGCTTTCGATAGTATGGGTGACTATAAATAGACTTT
1 ATTATAAAATCATTTAAAGCAAGTAATAACGCTTTCGATAGCATGGGTAACTATAAATAGACATT
* * * * * *
14245 TCTTACCAATGATAGCCTTTTTCTTCACATTTCTTCAGGTAGTCATCCGATTATAATTTGTTTTA
66 TCTTACCAATGATAGACTTTTTCTTCACATTTCTTCAAGCAGTCATCCAATTATAATATATTTTA
* *
14310 ACCAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGACATTATAAAACTATTTTTTTGAAAG
131 ACCAAAAATATAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATAACATTATAAAACTATTTTTTTGAAAG
14375 ACC
196 ACC
* * * * *
14378 ATTATAAAA-CTATTTAAAGTAAGTAATTACGCTTTTGA-AGGCATGGGTAACTTTAAATGGACA
1 ATTATAAAATC-ATTTAAAGCAAGTAATAACGCTTTCGATA-GCATGGGTAACTATAAATAGACA
* * * * *
14441 TTTCTTGCCAATGA-ATGATTTTTTCTTCACGTTTCTTGAAGCAGTCATTCAATTATAATATATT
64 TTTCTTACCAATGATA-GACTTTTTCTTCACATTTCTTCAAGCAGTCATCCAATTATAATATATT
14505 TT-ACCAAAAATATAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATAACATTATAAAACTATTTT
128 TTAACCAAAAATATAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATAACATTATAAAACTATTTT
14564 AAAGGAGTAA
Statistics
Matches: 161, Mismatches: 22, Indels: 7
0.85 0.12 0.04
Matches are distributed among these distances:
197 58 0.36
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ACGTcount: A:0.39, C:0.14, G:0.10, T:0.37
Consensus pattern (198 bp):
ATTATAAAATCATTTAAAGCAAGTAATAACGCTTTCGATAGCATGGGTAACTATAAATAGACATT
TCTTACCAATGATAGACTTTTTCTTCACATTTCTTCAAGCAGTCATCCAATTATAATATATTTTA
ACCAAAAATATAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATAACATTATAAAACTATTTTTTTGAAAG
ACC
Found at i:16992 original size:138 final size:138
Alignment explanation
Indices: 16734--17003 Score: 326
Period size: 138 Copynumber: 2.0 Consensus size: 138
16724 CAAAAAACAA
* * * *
16734 AAAAAAATTTAACATAAAATCAATTACGGGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTACGATTT
1 AAAAAAATTCAACATAAAATCAATTACGAGATTATAAAACAATTTAAAGCGACTAATTACGATTT
* * * * * * *
16799 TAAACGCATGGGTAACTATAGATGGACTTTTCTTGTCAATGAATAGATTTCTCTTCATGTTTCCC
66 TAAACGCATGGGTAACTACAAATGCACTTCTCTAGCCAATGAATAGATTTCTCTTCATATTTCCC
16864 AAAAGTGT
131 AAAAGTGT
* * * * *
16872 AAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAGCAATTTAAAGTGACTAATTAGGATTT
1 AAAAAAATTCAACATAAAATCAATTACGAGATTATAAAACAATTTAAAGCGACTAATTACGATTT
* * * * * *
16937 TGAAGGTATGGGTAACTACAAATGCACTTCTCTAGCCAATGAAT-GTCTTTTTCTTCGTATTTCC
66 TAAACGCATGGGTAACTACAAATGCACTTCTCTAGCCAATGAATAG-ATTTCTCTTCATATTTCC
17001 CAA
130 CAA
17004 GGCAGACATT
Statistics
Matches: 109, Mismatches: 22, Indels: 2
0.82 0.17 0.02
Matches are distributed among these distances:
137 1 0.01
138 108 0.99
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Consensus pattern (138 bp):
AAAAAAATTCAACATAAAATCAATTACGAGATTATAAAACAATTTAAAGCGACTAATTACGATTT
TAAACGCATGGGTAACTACAAATGCACTTCTCTAGCCAATGAATAGATTTCTCTTCATATTTCCC
AAAAGTGT
Found at i:17134 original size:308 final size:306
Alignment explanation
Indices: 16555--17138 Score: 685
Period size: 308 Copynumber: 1.9 Consensus size: 306
16545 TCTGTTTTAG
* **
16555 CCAAAAATGTAAAAAATTCAACTTAAAATTGATTATGAGATTATAAAAACATTTAAAGCGCATAA
1 CCAAAAATGTAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAAACATTTAAAGCGCATAA
* * * * * *
16620 TAAGGCTTTCAAAGGCATGGGTGACTATAAATGGACTTTTTTACCAACGAATGCCTTTTTCTTTA
66 TAAGGATTTCAAAGGCATGGGTAACTACAAATGCACTTCTCTACCAACGAATGCCTTTTTCTTTA
* * * *
16685 CCTTTCTCGAGGAAGACATTCAATTATAATCTATTTTCACAAAAAACAAAAAAAAATTTAACATA
131 -CTTTCCCAAGGAAGACATTCAATAATAATCTATTTTCACAAAAAACAAAAAAAAATTCAACATA
* *
16750 AAATCAATTACGGGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTACGATTTTAAACGCATGGGTAAC
195 AAATCAATTACGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTACGATTTCAAACGCATGGGTAAC
* *
16815 TATAGATGGACTTTTCTTGTCAATGAATAGATTTCTCTTCATGTTTC
260 TAGAAATGGACTTTTCTTGTCAATGAATAGATTTCTCTTCATGTTTC
* * *
16862 CCAAAAGTGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTAT-AAAGCAATTTAAAGTG-AC
1 CCAAAAATGT-AAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAAAC-ATTTAAAGCGCA-
* ** * * *
16925 TAATTAGGATTTTGAAGGTATGGGTAACTACAAATGCACTTCTCTAGCCAATGAATGTCTTTTTC
63 TAATAAGGATTTCAAAGGCATGGGTAACTACAAATGCACTTCTCTA-CCAACGAATGCCTTTTTC
* * ***
16990 TTCGTA-TTTCCCAAGGCAGACATTCAATAATAAT-TGGTTTTCA-ATAAAAA-TGTAAAAAATT
127 TT--TACTTTCCCAAGGAAGACATTCAATAATAATCT-ATTTTCACA-AAAAACAAAAAAAAATT
* * * * * * * *
17051 CAACATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTCAAGGGAGTAATTAGGCTTTCGAATGCTT
188 CAACATAAAATCAATTACGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTACGATTTCAAACGCAT
*
17116 GGGTGACTAGAAATGGACTTTTC
253 GGGTAACTAGAAATGGACTTTTC
17139 CTGCAAATGA
Statistics
Matches: 229, Mismatches: 40, Indels: 15
0.81 0.14 0.05
Matches are distributed among these distances:
307 14 0.06
308 160 0.70
309 53 0.23
311 2 0.01
ACGTcount: A:0.39, C:0.14, G:0.14, T:0.32
Consensus pattern (306 bp):
CCAAAAATGTAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAAACATTTAAAGCGCATAA
TAAGGATTTCAAAGGCATGGGTAACTACAAATGCACTTCTCTACCAACGAATGCCTTTTTCTTTA
CTTTCCCAAGGAAGACATTCAATAATAATCTATTTTCACAAAAAACAAAAAAAAATTCAACATAA
AATCAATTACGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTACGATTTCAAACGCATGGGTAACT
AGAAATGGACTTTTCTTGTCAATGAATAGATTTCTCTTCATGTTTC
Found at i:17348 original size:648 final size:647
Alignment explanation
Indices: 16216--17510 Score: 2054
Period size: 648 Copynumber: 2.0 Consensus size: 647
16206 ATGTTTTAAT
* ** *
16216 CAAAAGTGTAAAAAATTTAATTTAAAATCAATTATGAGATTATAAAGCCATTTAAAGTGACTAAT
1 CAAAAGTGTAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAGCAATTTAAAGTGACTAAT
* * *
16281 TAGGATTTTGAAGGCATGGGTAACTACAAATATACTTTTCTAGCCAATGAATGTCTTTTTCTTCT
66 TAGGATTTTGAAGGCATGGGTAACTACAAATACACTTCTCTAGCCAATGAATGTCTTTTTCTTCG
* * * *
16346 TGTTTCTCAAGGCAGACATTCAATAATAATTGGTTTTCACTAAAAATATAAAAAATTCAACATCA
131 TATTTCCCAAGGCAGACATTCAATAATAATTGGTTTTCAATAAAAATATAAAAAATTCAACATAA
*
16411 AATCAATTATAAGATTATAAAACCATTTAAAGTGAGTAATTAGGCTTTCGAATGCTTGAGTGACT
196 AATCAATTATAAGATTATAAAACCATTTAAAGGGAGTAATTAGGCTTTCGAATGCTTGAGTGACT
* * * *
16476 ATAAATGGACTTTTTCTGCATATGAGTGGCTTTTTCTTCACGTTTTTTATAGTAGATATTCAATT
261 AGAAATGGACTTTTCCTGCAAATGAGTGGCTTTTTCTTCACGTTTTTGATAGTAGATATTCAATT
16541 ATAATCTGTTTTAGCCAAAAATGTAAAAAATTCAACTTAAAATTGATTATGAGATTATAAAAACA
326 ATAATCTGTTTTAGCCAAAAATGTAAAAAATTCAACTTAAAATTGATTATGAGATTATAAAAACA
* *
16606 TTTAAAGCGCATAATAAGGCTTTCAAAGGCATGGGTGACTATAAATGGACTTTTTTACCAACGAA
391 TTTAAAGCGCATAATAAGGCTTTCAAAGGCATGGGTGACTATAAATAGACTTTTTTACCAACAAA
* * *
16671 TGCCTTTTTCTTTACCTTTCTCGAGGAAGACATTCAATTATAATCTATTTTCACAAAAAACAAAA
456 TGCATTTTTCTTTAACTTTCTCAAGGAAGACATTCAATTATAATCTATTTTCACAAAAAACAAAA
*
16736 AAAAATTTAACATAAAATCAATTACGGGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTACGATTTTA
521 AAAAATTTAACATAAAATCAATTACGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTACGATTTTA
* * *
16801 AACGCATGGGTAACTATAGATGGACTTTTCTTGTCAATGAATAGATTTCTCTTCATGTTTCC
586 AACGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATAAATTTCTCTTCATGTTTCC
16863 CAAAAGTGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAGCAATTTAAAGTGACTAA
1 CAAAAGTGT-AAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAGCAATTTAAAGTGACTAA
* *
16928 TTAGGATTTTGAAGGTATGGGTAACTACAAATGCACTTCTCTAGCCAATGAATGTCTTTTTCTTC
65 TTAGGATTTTGAAGGCATGGGTAACTACAAATACACTTCTCTAGCCAATGAATGTCTTTTTCTTC
*
16993 GTATTTCCCAAGGCAGACATTCAATAATAATTGGTTTTCAATAAAAATGTAAAAAATTCAACATA
130 GTATTTCCCAAGGCAGACATTCAATAATAATTGGTTTTCAATAAAAATATAAAAAATTCAACATA
* * *
17058 AAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTCAAGGGAGTAATTAGGCTTTCGAATGCTTGGGTGAC
195 AAATCAATTATAAGATTATAAAACCATTTAAAGGGAGTAATTAGGCTTTCGAATGCTTGAGTGAC
* *
17123 TAGAAATGGACTTTTCCTGCAAATGAGTGGCTTTTT-TTCACGTTTCTTGCT-GTAGATGTTCAA
260 TAGAAATGGACTTTTCCTGCAAATGAGTGGCTTTTTCTTCACGTTT-TTGATAGTAGATATTCAA
* * *
17186 TTATAATTTGTTTTAGCCAAAAATTTAAAAAATTCAACTTGAAATTGATTATGAGATTATAAAAA
324 TTATAATCTGTTTTAGCCAAAAATGTAAAAAATTCAACTTAAAATTGATTATGAGATTATAAAAA
* * * * * ** *
17251 CATTTAAAGTGCGTAATAAGGCTTTCGAAGGCATGGTTGACTATAAATATACTTTTCTTGTCAAT
389 CATTTAAAGCGCATAATAAGGCTTTCAAAGGCATGGGTGACTATAAATAGACTTTT-TTACCAAC
* * * *
17316 AAATGCATTTTTCTTTAAGTTTTTCAAGGAAGACATTCAATTATAATCTGTTTTCACCAAAAACA
453 AAATGCATTTTTCTTTAACTTTCTCAAGGAAGACATTCAATTATAATCTATTTTCACAAAAAACA
* * * *
17381 TAAAACAATTTACCATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTACGATT
518 AAAAAAAATTTAACATAAAATCAATTACGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTACGATT
* * *
17446 TTAAAGGTATGGGTAACTATAAATGGGCTTTTCTTGCCAATGAATAAATTTCTCTTCATGTTTCC
583 TTAAACGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATAAATTTCTCTTCATGTTTCC
17511 TAATATAGAC
Statistics
Matches: 590, Mismatches: 55, Indels: 5
0.91 0.08 0.01
Matches are distributed among these distances:
647 141 0.24
648 449 0.76
ACGTcount: A:0.37, C:0.13, G:0.14, T:0.35
Consensus pattern (647 bp):
CAAAAGTGTAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAGCAATTTAAAGTGACTAAT
TAGGATTTTGAAGGCATGGGTAACTACAAATACACTTCTCTAGCCAATGAATGTCTTTTTCTTCG
TATTTCCCAAGGCAGACATTCAATAATAATTGGTTTTCAATAAAAATATAAAAAATTCAACATAA
AATCAATTATAAGATTATAAAACCATTTAAAGGGAGTAATTAGGCTTTCGAATGCTTGAGTGACT
AGAAATGGACTTTTCCTGCAAATGAGTGGCTTTTTCTTCACGTTTTTGATAGTAGATATTCAATT
ATAATCTGTTTTAGCCAAAAATGTAAAAAATTCAACTTAAAATTGATTATGAGATTATAAAAACA
TTTAAAGCGCATAATAAGGCTTTCAAAGGCATGGGTGACTATAAATAGACTTTTTTACCAACAAA
TGCATTTTTCTTTAACTTTCTCAAGGAAGACATTCAATTATAATCTATTTTCACAAAAAACAAAA
AAAAATTTAACATAAAATCAATTACGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTACGATTTTA
AACGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATAAATTTCTCTTCATGTTTCC
Found at i:17674 original size:170 final size:170
Alignment explanation
Indices: 16862--18114 Score: 1130
Period size: 170 Copynumber: 7.4 Consensus size: 170
16852 TTCATGTTTC
* * * * * *
16862 CCAAAAGTGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAGCAATTTAAAGTGACTA
1 CCAAAAATGT-AAAAAATTCAACATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTA
* * * * * **
16927 ATTAGGATTTTGAAGGTATGGGTAACTACAAAT-GCACTTCTCTAGCCAATGAATGTCTTTTTCT
65 ATTAGGATTTCGAAGGTATGGGTGACTATAAATAG-ACTTTTCTTGCCAATGAATGGATTTTTCT
* * * *** *
16991 TCGTATTTCCCAAGGCAGACATTCAATAATAAT-TGGTTTTCAA
129 TCATGTTTCCTAATATAGACATTCAATTATAATCT-GTTTT-AA
* * *
17034 -TAAAAATGTAAAAAATTCAACATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTCAAGGGAGTAA
1 CCAAAAATGTAAAAAATTCAACATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAA
* * * * * * * *
17098 TTAGGCTTTCGAATGCT-TGGGTGACTAGAAATGGACTTTTCCTGCAAATGAGTGGCTTTTT-TT
66 TTAGGATTTCGAA-GGTATGGGTGACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATGAATGGATTTTTCTT
* * ** * ** * *
17161 CACGTTTCTTGCTGTAGATGTTCAATTATAATTTGTTTTAG
130 CATGTTTCCTAATATAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAA
* * * ** * * *
17202 CCAAAAATTTAAAAAATTCAACTTGAAATTGATTATGAGATTATAAAAACATTTAAAGTGCGTAA
1 CCAAAAATGTAAAAAATTCAACATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAA
* * * * * * * * *
17267 TAAGGCTTTCGAAGGCATGGTTGACTATAAATATACTTTTCTTGTCAATAAATGCATTTTTCTTT
66 TTAGGATTTCGAAGGTATGGGTGACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATGAATGGATTTTTCTTC
* * * *
17332 AAGTTT-TTCAAGGA-AGACATTCAATTATAATCTGTTTTCA
131 ATGTTTCCT-AA-TATAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAA
** * *
17372 CCAAAAACATAAAACAATTTACCATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTA
1 CCAAAAATGTAAAA-AATTCAACATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTA
* ** * * * ** *
17437 ATTACGATTTTAAAGGTATGGGTAACTATAAATGGGCTTTTCTTGCCAATGAATAAATTTCTCTT
65 ATTAGGATTTCGAAGGTATGGGTGACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATGAATGGATTTTTCTT
*
17502 CATGTTTCCTAATATAGACATTCAACTATAATCTGTTTTAA
130 CATGTTTCCTAATATAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAA
*
17543 CCAAAAGTGTAAAAAATTCAATC-TAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTA
1 CCAAAAATGTAAAAAATTCAA-CATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTA
* ** * * * * * *
17607 ATTAGGCTTTCGAATATTTGGGTGACTAGAAATAGACTTTTCCTGCAAATGAGTGGTTTTTTCTT
65 ATTAGGATTTCGAAGGTATGGGTGACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATGAATGGATTTTTCTT
** * ** * *
17672 CATGTTT-CTTGTAGCAGATTTTCAATTATAATTTGTTTTAG
130 CATGTTTCCTAATA-TAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAA
* * * ** * *
17713 CCAAAAAAT-AAAAAAATTCAACTTGAAATTGATTATGAGATTATAAAAACATTTAAAGCGCGTA
1 CC-AAAAATGTAAAAAATTCAACATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTA
* * * ** *
17777 ATAAGGATTTCGAAGGTATGGCTGACTATAAATAGACTTTTCTTACCACCGAATGCATTTTTCTT
65 ATTAGGATTTCGAAGGTATGGGTGACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATGAATGGATTTTTCTT
* * * *
17842 CACT-TTT-CTCAAGGA-AGACATTTAATTATAATCTGCTTTCA
130 CA-TGTTTCCT-AA-TATAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAA
** * * *
17883 CCAAAAACATAAAAAAATTTAACATAAAATCAATTACGAGATTATAAAACCATTTAAAGTGAGTA
1 CCAAAAATGT-AAAAAATTCAACATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTA
* * * * * * *
17948 ATTATGATTTTGAAGGTATGGGTAACTATAAATGGGCTTTTCTTGCCAATGAATAGATTTCTCTT
65 ATTAGGATTTCGAAGGTATGGGTGACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATGAATGGATTTTTCTT
* * *
18013 CATGTTCCCTAATATAGACTTTCAATTATAATTTGTTTTAA
130 CATGTTTCCTAATATAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAA
*
18054 CCAAAAGTGTAAAAATATTCAATC-TAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCG
1 CCAAAAATGTAAAAA-ATTCAA-CATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCG
18115 NNNNNNNNNN
Statistics
Matches: 856, Mismatches: 200, Indels: 51
0.77 0.18 0.05
Matches are distributed among these distances:
168 2 0.00
169 138 0.16
170 391 0.46
171 320 0.37
172 5 0.01
ACGTcount: A:0.38, C:0.13, G:0.14, T:0.35
Consensus pattern (170 bp):
CCAAAAATGTAAAAAATTCAACATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAA
TTAGGATTTCGAAGGTATGGGTGACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATGAATGGATTTTTCTTC
ATGTTTCCTAATATAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAA
Found at i:17890 original size:511 final size:508
Alignment explanation
Indices: 16871--27573 Score: 1910
Period size: 511 Copynumber: 20.9 Consensus size: 508
16861 CCCAAAAGTG
* * * * * *
16871 TAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAGCAATTTAAAGTGACTAATTAGGATT
1 TAAAAAAATTTAACATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGTGAGTAATTACGATT
* ** * * *** * * *
16936 TTGAAGGTATGGGTAACTACAAATGCACTTCTCTAGCCAATGAATGTCTTTTTCTTCGTATTTCC
66 TTGAAGGTATGGGTAACTATAAATGGGCTTTTCTTGCCAATGAATAAATTTCTCTTCATGTTTCC
* *** * *
17001 CAAGGCAGACATTCAATAATAATTGGTTTTCAA-TAAAAATGTAAAAAATTCAA-CATAAAATCA
131 TAATATAGACATTCAAT-ATAATT-GTTTT-AACCAAAAGTGTAAAAAATTCAATC-TAAAATCA
* * *
17064 ATTATGAGATTATAAAACCATTTCAAGGGAGTAATTAGGCTTTCGAATGCTTGGGTGACTAGAAA
192 ATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCGAATACTTGGGTGACTAGAAA
* *
17129 TGGACTTTTCCTGCAAATGAGTGGCTTTTTTTCACGTTTCTTGCTGTAGATGTTCAATTATAATT
257 TAGACTTTTCCTGCAAATGAGTGGCTTTTTTTCACGTTTCTTGCTGCAGATGTTCAATTATAATT
* *
17194 TGTTTTAGCCAAAAATTTAAAAAATTCAACTTGAAATTGATTATGAGATTATAAAAACATTTAAA
322 TGTTTTAGCCAAAAAATAAAAAAATTCAACTTGAAATTGATTATGAGATTATAAAAACATTTAAA
* * * * ** *
17259 GTGCGTAATAAGGCTTTCGAAGGCATGGTTGACTATAAATATACTTTTCTTGTCAATAAATGCAT
387 GCGCGTAATAAGGATTTCGAAGGCATGGCTGACTATAAATAGACTTTTCTTACCAACAAATGCAT
* *
17324 TTTTCTTTAAGTTTTTCAAGGAAGACATTCAATTATAATCTGTTTTCACCAAAAACA
452 TTTTCTTTAACTTTTTCAAGGAAGACATTCAATTATAATCTGCTTTCACCAAAAACA
* * *
17381 TAAAACAATTTACCATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTACGATT
1 TAAAAAAATTTAACATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGTGAGTAATTACGATT
*
17446 TTAAAGGTATGGGTAACTATAAATGGGCTTTTCTTGCCAATGAATAAATTTCTCTTCATGTTTCC
66 TTGAAGGTATGGGTAACTATAAATGGGCTTTTCTTGCCAATGAATAAATTTCTCTTCATGTTTCC
17511 TAATATAGACATTCAACTATAATCTGTTTTAACCAAAAGTGTAAAAAATTCAATCTAAAATCAAT
131 TAATATAGACATTCAA-TATAAT-TGTTTTAACCAAAAGTGTAAAAAATTCAATCTAAAATCAAT
*
17576 TATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCGAATATTTGGGTGACTAGAAATA
194 TATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCGAATACTTGGGTGACTAGAAATA
* * *
17641 GACTTTTCCTGCAAATGAGTGGTTTTTTCTTCATGTTTCTTG-TAGCAGATTTTCAATTATAATT
259 GACTTTTCCTGCAAATGAGTGGCTTTTT-TTCACGTTTCTTGCT-GCAGATGTTCAATTATAATT
17705 TGTTTTAGCCAAAAAATAAAAAAATTCAACTTGAAATTGATTATGAGATTATAAAAACATTTAAA
322 TGTTTTAGCCAAAAAATAAAAAAATTCAACTTGAAATTGATTATGAGATTATAAAAACATTTAAA
* * *
17770 GCGCGTAATAAGGATTTCGAAGGTATGGCTGACTATAAATAGACTTTTCTTACCACCGAATGCAT
387 GCGCGTAATAAGGATTTCGAAGGCATGGCTGACTATAAATAGACTTTTCTTACCAACAAATGCAT
* *
17835 TTTTC-TTCACTTTTCTCAAGGAAGACATTTAATTATAATCTGCTTTCACCAAAAACA
452 TTTTCTTTAACTTTT-TCAAGGAAGACATTCAATTATAATCTGCTTTCACCAAAAACA
* *
17892 TAAAAAAATTTAACATAAAATCAATTACGAGATTATAAAACCATTTAAAGTGAGTAATTATGATT
1 TAAAAAAATTTAACATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGTGAGTAATTACGATT
* *
17957 TTGAAGGTATGGGTAACTATAAATGGGCTTTTCTTGCCAATGAATAGATTTCTCTTCATGTTCCC
66 TTGAAGGTATGGGTAACTATAAATGGGCTTTTCTTGCCAATGAATAAATTTCTCTTCATGTTTCC
*
18022 TAATATAGACTTTCAATTATAATTTGTTTTAACCAAAAGTGTAAAAATATTCAATCTAAAATCAA
131 TAATATAGACATTCAA-TATAA-TTGTTTTAACCAAAAGTGTAAAAA-ATTCAATCTAAAATCAA
**************************
18087 TTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGC----------G-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
193 TTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCGAATACTTGGGTGACTAGAAAT
*****************************************************************
18141 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
258 AGACTTTTCCTGCAAATGAGTGGCTTTTTTTCACGTTTCTTGCTGCAGATGTTCAATTATAATTT
*****************************************************************
18206 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
323 GTTTTAGCCAAAAAATAAAAAAATTCAACTTGAAATTGATTATGAGATTATAAAAACATTTAAAG
****************************************************************
18271 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNT
388 CGCGTAATAAGGATTTCGAAGGCATGGCTGACTATAAATAGACTTTTCTTACCAACAAATGCATT
* * *
18336 TTTC-TTCACTTTTCTTAAGGAAGACATTCAATTATAATCTGCTTTCACCAAAAACG
453 TTTCTTTAACTTTT-TCAAGGAAGACATTCAATTATAATCTGCTTTCACCAAAAACA
* * *
18392 TAAAAAAATTTAACATAAAATCAATTACGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTACGAAT
1 TAAAAAAATTTAACATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGTGAGTAATTACGATT
* * * * * * *
18457 TTAAAGGCATGGGTAACTAGAAATGGACTTTTCGTACCAATGAATAGATTTCTCTTCATGTTTCC
66 TTGAAGGTATGGGTAACTATAAATGGGCTTTTCTTGCCAATGAATAAATTTCTCTTCATGTTTCC
* * *
18522 CAATATAGACATTCAATTATAATACGTTTTAACCAAAAGTGTAAAAAAATTCAACCTAAAAGT-A
131 TAATATAGACATTCAA-TATAAT-TGTTTTAACCAAAAGTGT-AAAAAATTCAATCTAAAA-TCA
** * *
18586 ATTACAAGATTATAAAACCATTTAAAGCGATTAATTAGGCTTTCGAA-AGCTTGGGTAACTAGAA
192 ATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCGAATA-CTTGGGTGACTAGAA
* * * * ** * * *
18650 ATGGACTTTTCTTACAAATGAGTGGCTTTTTCTTCACATTTCTTGAGGTAAATATTCAATTATAA
256 ATAGACTTTTCCTGCAAATGAGTGGCTTTTT-TTCACGTTTCTTGCTGCAGATGTTCAATTATAA
* * * * * * * *
18715 TCTATTTTAGAC-AAAAATGTAAAAAATTCAATTTAAAATTAATTATGAGATTATAAAAATATTT
320 TTTGTTTTAGCCAAAAAAT-AAAAAAATTCAACTTGAAATTGATTATGAGATTATAAAAACATTT
* * * * * * * *
18779 AAAGCGTGTAATAAGGCTTTCAAAGGCATGGGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCTACCAAATA
384 AAAGCGCGTAATAAGGATTTCGAAGGCATGGCTGACTATAAATAGACTTTTCTTACCAACAAAT-
* * * * * * ** * * *
18844 TC-TTTTTC-TTCACGTTTCTCGAGGTAGACATTCAATTATAATTTATTTTCACTAAAAGCG
448 GCATTTTTCTTTAAC-TTTTTCAAGGAAGACATTCAATTATAATCTGCTTTCACCAAAAACA
** * *
18904 TAAAACCAGTTAACATAAAATCAATTACGAGATTATAAAA-C---T--A-T---T--TT---A--
1 TAAAAAAATTTAACATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGTGAGTAATTACGATT
* * * * ** *
18952 ---AAGGCATGGGTAACTATAAGTGGACTTTTCTTGCTAATGAATCGATTTCTCTTCATGTTTNN
66 TTGAAGGTATGGGTAACTATAAATGGGCTTTTCTTGCCAATGAATAAATTTCTCTTCATGTTT-C
********************* * * *
19014 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAATTTAAAATTAA
130 CTAATATAGACATTCAATATAAT-TGTTTTAACCAAAAGTGT-AAAAAATTCAATCTAAAATCAA
* * * * * * ** * *
19079 TTATGAGATTTTAAAGCCATTTAAAGTGACTAATTAGGATTTTGAAGGCATGGGTAACTACG-AA
193 TTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCGAATACTTGGGTGACTA-GAAA
* ** * * ** * *** * ** *
19143 TGGACTTTT-CTAGGGAATGAATGCCTTTTTCTTCGTGTTTCCTAAGGCAAACATTCAATAATAA
257 TAGACTTTTCCT-GCAAATGAGTGGCTTTTT-TTCACGTTTCTTGCTGCAGATGTTCAATTATAA
* * * * * * ** *
19207 TTGGTTTT--CACTAATAATGTAAAAAATTCAACATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATT
320 TTTGTTTTAGC-CAAAAAAT-AAAAAAATTCAACTTGAAATTGATTATGAGATTATAAAAACATT
* * * * * * * * * * **
19270 TAAAGCGAGTAATTA-GACTTTCAAATGCTTGGGTGACTAGAAATGGACTTTTCTTGCTAATGAA
383 TAAAGCGCGTAATAAGGA-TTTCGAAGGCATGGCTGACTATAAATAGACTTTTCTTACCAACAAA
* ** * * * * * * * **
19334 TGGC-TTTTT-TTCATGTTTCTT-GAGGCAGATATTGAATTATAATCTGTTTTCGCTAAAAATG
447 T-GCATTTTTCTTTAACTTT-TTCAAGGAAGACATTCAATTATAATCTGCTTTCACCAAAAACA
* * ** * * * * *
19395 T-AAAAAATTTAACTTAAAATCGATTATGAGATTATAAAAATATTTAAAGCGCGTAATAAGGCTT
1 TAAAAAAATTTAACATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGTGAGTAATTACGATT
* * * * * * * *** * * *
19459 TTAAAGGCATGAGCT-ACAATAAATAGACTTTTCTTGCTAATGAATGCCTTTTTCTTTACGTTTC
66 TTGAAGGTATG-GGTAACTATAAATGGGCTTTTCTTGCCAATGAATAAATTTCTCTTCATGTTTC
* * * * * * * *** *
19523 TTGAGAAAGACATTCAATTAGAATCTATTTTCACCAAAAACATAAAAAAATTTAA-CATAAAATC
130 CTAATATAGACATTCAA-TATAAT-TGTTTTAACCAAAAGTGT-AAAAAATTCAATC-TAAAATC
* * * *** * ** * * * *
19587 AGTTACGAGATTATAAAACCTTTTAAAGCGAGTAATTACTATTTTGAAGGCATAGGTAACTATAA
191 AATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCGAATACTTGGGTGACTAGAA
* * * * * * * * * * * * ** *
19652 ATGGATTTTTCTTACCAATGAATAGATTTTTCTTCATG-TT-TTCCAAGGCAAACATTAAATTAT
256 ATAGACTTTTCCTGCAAATGAGTGGCTTTTT-TTCACGTTTCTTGC--TGCAGATGTTCAATTAT
* * * * * * ** *
19715 AATCTGTTTTAACTAAAAATGTAAACAAATTCAACCT-AAAGTAAATTATGAGATTAT-AAAGCT
318 AATTTGTTTTAGCCAAAAA-ATAAAAAAATTCAACTTGAAA-TTGATTATGAGATTATAAAAAC-
* ** ** * * * * * *
19778 ATTTAAAAAC-TATAATTTGGATTTTGAAGGTATGCCTAACTATAAA-CGAACTTTTC-TAGTCA
380 ATTT-AAAGCGCGTAATAAGGATTTCGAAGGCATGGCTGACTATAAATAG-ACTTTTCTTA-CCA
** * * * ** * * *
19840 ATGAATGGC-TTCTTC-TTCA-TGTTTTCTAAGGTAGACATTCAACAATAAT-TGGTTTTAACAA
442 ACAAAT-GCATTTTTCTTTAACT-TTTTC-AAGGAAGACATTCAATTATAATCTGCTTTCACCAA
19901 AAA-A
504 AAACA
** * * * ********** * * *
19905 TGCTGAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGGGANNNNNNNNNNATTTAAAGTGAGTAATAAGGC
1 T--AAAAAAATTTAACATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGTGAGTAATTACGA
* * * * * * * ** *
19970 TTTCGATA-GCATGGGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAAT-AACAACCTTTTTCTTTGTAT
64 TTTTGA-AGGTATGGGTAACTATAAATGGGCTTTTCTTGCCAATGAATAA-ATTTCTCTTCATGT
* * *** * * * * *
20033 TTCTTTAGGCA-ATCATTTGATTATAATTTGTTTTAACTAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAA
127 TTCCTAATATAGA-CA-TTCAATATAA-TTGTTTTAACCAAAAGTGT-AAAAAATTCAATCTAAA
* * ** * * * * ** * ** *
20097 ATTAATTATGACATTATAAAACTGTTTAAAGTGAGTAATTACGTTTTTGAAGGCATGGGCAACTT
188 ATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCGAATACTTGGGTGACTA
* * * * * ** * *** *
20162 TAAATGGACCTTTCTTGTC-AATGAATGATTTTTTCTTCATGTTTCTTAAGGCAG-TCATTCAAT
253 GAAATAGACTTTTCCTG-CAAATGAGTGGCTTTTT-TTCACGTTTCTTGCTGCAGAT-GTTCAAT
* * * * * * * ** * *
20225 TATAATCTATTTTAACTAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAACTATGACATTAT-----
315 TATAATTTGTTTTAGCCAAAAA-ATAAAAAAATTCAACTTGAAATTGATTATGAGATTATAAAAA
* * *
20285 -A---AAA---C-T-AT-----TTT-AAAGGCATGAG-TAACTATAAATGAAAC-TTTCTTACCA
379 CATTTAAAGCGCGTAATAAGGATTTCGAAGGCATG-GCTGACTATAAAT-AGACTTTTCTTACCA
** * * * * * * * * *
20333 ATGAATGGC-TTTTTC-TTCACGTTTCTTGAA-GTAGACCTTCAATTGTAATATGTTTTAACTAA
442 ACAAAT-GCATTTTTCTTTAAC-TTT-TTCAAGGAAGACATTCAATTATAATCTGCTTTCACCAA
**
20395 AAATG
504 AAACA
* * * * ** * * *
20400 TAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGGTTATAAGACCATTTAAAGCAAGTAGTTAGGCTT
1 TAAAAAAATTTAACATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGTGAGTAATTACGATT
* * * * * * * ** * **
20465 TCGAATGCT-TGGGTAACTAGAAATGGACTTTTCCTACAAATGAATAGTTTTTTCTTCACATTTC
66 TTGAA-GGTATGGGTAACTATAAATGGGCTTTTCTTGCCAATGAATAAATTTCTCTTCATGTTTC
* * *** * * * * **
20529 ATGAGGCAGATATTCAATTATAATCTGTTTTAGCAAAAAATGT-AAAAATTCAAGT-TAAAATTG
130 CTAATATAGACATTCAA-TATAAT-TGTTTTAACCAAAAGTGTAAAAAATTCAA-TCTAAAATCA
* * * * * * *
20592 ATTATGAGATTATAAAAACATTTAAAGCGTGCAATAAGACTTTC-AA-AGGTATGGGTGACTATA
192 ATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCGAATA-CT-TGGGTGACTAGA
* * * * * * ***** * **
20655 AAT-GAACTTTTGCTACAAACGAAT-ACTTTTTTCTTCACCTTTCCCAAGGAAGACATTCAATTA
255 AATAG-ACTTTTCCTGCAAATGAGTGGC-TTTTT-TTCACGTTTCTTGCTGCAGATGTTCAATTA
* * * *
20718 TAATTTGTTTTCA-CCAAAAACGTAAAAAAA-TCTAACAT-AAAATCAGTTATGAGATTATAAAA
317 TAATTTGTTTT-AGCCAAAAA-ATAAAAAAATTC-AACTTGAAATTGA-TTATGAGATTATAAAA
* * * * * * * * * *
20780 CCTTTTAAAGCGAGTAATTACGATTTTGAAGGCATGG--G----TAAATGGATTTTTCTTGCTAA
378 ACATTTAAAGCGCGTAATAAGGATTTCGAAGGCATGGCTGACTATAAATAGACTTTTCTTACCAA
* * * * * * *
20839 TAAATAG-ATTTTTC-TTCA-TGTTTCCTAAGGCAGACATTCAATTTTAATCTGTTTTAACCAAA
443 CAAAT-GCATTTTTCTTTAACT-TTTTC-AAGGAAGACATTCAATTATAATCTGCTTTCACCAAA
***
20901 AGTG
505 AACA
* * * ** ** * * * *
20905 TAAAGAGATTCAATGTAAAAAAAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAGCGACTAATTAAGATT
1 TAAAAAAATTTAACATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGTGAGTAATTACGATT
* * * * * * *** *
20970 TTCAAAGCATGGGTAACTATAAATAGACTTTTCTAGCCAATGAATGGCTTTTTCTTCATGTTTCC
66 TTGAAGGTATGGGTAACTATAAATGGGCTTTTCTTGCCAATGAATAAATTTCTCTTCATGTTTCC
* * * * * * **
21035 CAAGT-CAGACAATCAATAATAATTTGTTTTAACTAAAAATGTAAAAATATTCAACCTAAAATTN
131 TAA-TATAGACATTCAAT-ATAA-TTGTTTTAACCAAAAGTGTAAAAA-ATTCAATCTAAAATCA
********* * * * * *
21099 NNNNNNNNNTTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGACTTTCAAAGTA-ATGGGTGACTATAA
192 ATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCGAA-TACTTGGGTGACTAGAA
* * * * * * *** * * *
21163 ATGGACTTTTCTTGCCAATGA-TAGCCTCTTTCTTCACATTTCTTTAGGCAG-TCATTCGATTAG
256 ATAGACTTTTCCTGCAAATGAGT-GGCT-TTTTTTCACGTTTCTTGCTGCAGAT-GTTCAATTAT
* * * ** *
21226 AATTTGTTTTA-ACAAAAGATGTAAAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGACATTAT-AAAACT
318 AATTTGTTTTAGCCAAAA-A-ATAAAAAAATTCAACTTGAAATTGATTATGAGATTATAAAAAC-
* * * * * * * *
21289 ATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTGAAGGCATGGGTGACTATAAATGGACTTTTCTTACCACCG
380 ATTTAAAGCGCGTAATAAGGATTTCGAAGGCATGGCTGACTATAAATAGACTTTTCTTACCAACA
* * * * * * * * * ***
21354 AATACCTTTTTC-TTCACATTTTCCAAGGTAGACAATCAATTATAATCAGTTTTAACCAAAAGTG
445 AATGCATTTTTCTTTAAC-TTTTTCAAGGAAGACATTCAATTATAATCTGCTTTCACCAAAAACA
* * * * *
21418 TAAAAAAATTCAATC-TAAAATAAATTATGAGATTATAAAGCCATTTAAAGTGACTAATTAGGAT
1 TAAAAAAATTTAA-CATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGTGAGTAATTACGAT
* * * * * *** * * *
21482 TTTGAA-GCATTGGGTAACTACAAATGGACTTTTCTAGCCAATTAATGCTTTTTTTTTTATGTTT
65 TTTGAAGGTA-TGGGTAACTATAAATGGGCTTTTCTTGCCAATGAATAAATTTCTCTTCATGTTT
* *** * * * * *
21546 CCCAAGGCAGACATTCAATAATAATTTGTTTTCACTAAAAATGTAAAAAATTCAATATAAAATTA
129 CCTAATATAGACATTCAAT-ATAA-TTGTTTTAACCAAAAGTGTAAAAAATTCAATCTAAAATCA
* *
21611 ATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAATTAGGCTTTCGAATGCTTGGGTGACTAGAAA
192 ATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCGAATACTTGGGTGACTAGAAA
* * ** * * ** * * *
21676 TGGGCTTTTCCTGCAAATGAAAGGGTTTTTCTTCACTTTTCTTGAGGTAGATATACAATTATAAT
257 TAGACTTTTCCTGCAAATGAGTGGCTTTTT-TTCACGTTTCTTGCTGCAGATGTTCAATTATAAT
* * * * ** * *
21741 CTATTTTAGCC-AAAATTGTAAAACCTTCAACGT-AAAATGAATTATGAGATTATAAAAACATTT
321 TTGTTTTAGCCAAAAAAT-AAAAAAATTCAACTTGAAATTG-ATTATGAGATTATAAAAACATTT
* * * * * * * * *
21804 AAAGCGCGTAATAAGGCTTTCAAAGACATGGGTGACTATAAATAGA-ATTTCTTGCCATCGAATA
384 AAAGCGCGTAATAAGGATTTCGAAGGCATGGCTGACTATAAATAGACTTTTCTTACCAACAAATG
* * * * * * *
21868 CCTTTTTC-TTCACGTTTCTCGAGGCAA-ACATTCAATTATAATTTGTTTTCACCAAAAATGA
449 CATTTTTCTTTAAC-TTTTTCAAGG-AAGACATTCAATTATAATCTGCTTTCACCAAAAA-CA
* * * ***
21929 -AAAAAAATTTAACATAAAATGAATTACGAGATAATAAAACCATTTAAAACAAGTAATTACGATT
1 TAAAAAAATTTAACATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGTGAGTAATTACGATT
* * ** *
21993 TTGAACGCATGGGTAACTATAAATGAACTTTTCTTGCCAATGAATAGATTTCTCTTCATGTTTCC
66 TTGAAGGTATGGGTAACTATAAATGGGCTTTTCTTGCCAATGAATAAATTTCTCTTCATGTTTCC
* *** * * * *
22058 CAAGGCAGACATTCAATTATAATTTGTTTTAAACAAAAGTGTAAAAAAATTTAGTATAAAATCAA
131 TAATATAGACATTCAA-TATAA-TTGTTTTAACCAAAAGTGT-AAAAAATTCAATCTAAAATCAA
* * * * *
22123 TTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGCAATAAGGCTTTCAAAT-GTATGGGTGACTAGAAA
193 TTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCGAATACT-TGGGTGACTAGAAA
* ** * * * *** * **
22187 TGGACTTTTATTGCCAATGA-TAGCCTTTTTCTTCATGTTTCTTAAGGCACACATTCAATTATAA
257 TAGACTTTTCCTGCAAATGAGT-GGCTTTTT-TTCACGTTTCTTGCTGCAGATGTTCAATTATAA
* * * * * * * * * *
22251 TCTATTTTAACCAAAAATGTAAAAAACTTCAACCTAAAATCT-ATTATGACATCATAAAACCATT
320 TTTGTTTTAGCCAAAAA-ATAAAAAAATTCAACTTGAAAT-TGATTATGAGATTATAAAAACATT
* * * * * * * * *** **
22315 TTAAGCGAGTAATTAGGCTTTTGAAGGTATGAG-TAACTATAAATGGACTTTTCTCGTCAATGAA
383 TAAAGCGCGTAATAAGGATTTCGAAGGCATG-GCTGACTATAAATAGACTTTTCTTACCAACAAA
* ** * * * * * * **
22379 TGGC-TTCTTCTTTAGGTTTTCCAA-GACAGACTTTCAATTATAGTCTGTTTTAACAAAAAATG
447 T-GCATTTTTCTTTAACTTTTTCAAGGA-AGACATTCAATTATAATCTGCTTTCACCAAAAACA
** * * * * *
22441 TAAAAAGGTTTTACATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTAAAAGTGAGTAATAAGGCTT
1 TAAAAAAATTTAACATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGTGAGTAATTACGATT
** ** * * * * * *
22506 TCAAAGACATGGGTTATTATAAATGGACTTTTCTCGCTAATGAAT--GTCTTCTTCCTT-ATGTT
66 TTGAAGGTATGGGTAACTATAAATGGGCTTTTCTTGCCAATGAATAAAT-TTC-T-CTTCATGTT
*** * * * * * *
22568 TACC-AAGGCAAACATTCAATTATAGTCTGTTTTAACAAAAAATGTAAAACAATTTAACCTAAAA
128 T-CCTAATATAGACATTCAA-TATAAT-TGTTTTAACCAAAAGTGTAAAA-AATTCAATCTAAAA
* * * * * * * ** ** * * *
22632 TTAATTATGAGATTATAAAACCATTAAAAGTGATTAATAAGGTTTTCAAAGGCACGAGTTACTAT
189 TCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCGAATACTTGGGTGACTAG
** * * * * * **
22697 AAAT-GTACTTTTGTTGCCAATGA-TAGCCTTTTTTTTCACGTTTTTTAG--GTAAAAATTCAAT
254 AAATAG-ACTTTTCCTGCAAATGAGT-GGC-TTTTTTTCACGTTTCTT-GCTGCAGATGTTCAAT
* ** *
22758 TATAA-TTGATTTTCA-CCAAAAAAAATAAAAAATTCAACTT-AAA-AAAGTATGAGATTATAAA
315 TATAATTTG-TTTT-AGCCAAAAAATA-AAAAAATTCAACTTGAAATTGATTATGAGATTATAAA
* * * * * * * * * *
22819 ACCATTTAAAGTGAGTAATAAGGCTTCCGAAGGCTTGGGTGATTATAAATGGACCTTTCTTGA-C
377 AACATTTAAAGCGCGTAATAAGGATTTCGAAGGCATGGCTGACTATAAATAGACTTTTCTT-ACC
** * * * * *
22883 AATGAATG-GTTGTTTC-TTCACATTTTCCAAAGTAA-ACATTCAATTATAATCTG-TTTAACCA
441 AACAAATGCATT-TTTCTTTAAC-TTTTTC-AAGGAAGACATTCAATTATAATCTGCTTTCACCA
*
22944 AAAATA
503 AAAACA
* * ** * * *
22950 T-AAAAACTTTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAATTATTTAAAGCGAGTAATTAGGCT
1 TAAAAAAATTT-AACATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGTGAGTAATTACGAT
* * * * * * *** *
23014 TTTGAAGGCATGGGTAACTACAAACGGACTTTTCTAGCTAATGAATGTTTTTTTCTT--TGTGTT
65 TTTGAAGGTATGGGTAACTATAAATGGGCTTTTCTTGCCAATGAATAAATTTCTCTTCATGT-TT
** * ** * * * *
23077 CCTAAGGTAGACATTTAATAATAATTTGTTTTAATAAAAAATGTAGAAAAACTCAACCCAAAATC
129 CCTAATATAGACATTCAAT-ATAA-TTGTTTTAACCAAAAGTGTA-AAAAATTCAATCTAAAATC
* * * * * * * * *
23142 AATTACGACATTATAAAATCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTC-AAAAGCATGAGTAACTATA
191 AATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCGAATA-CTTGGGTGACTAGA
* ** * * ** * **
23206 AATGGACTTTTATTGCCAATGA-TAGCCTTTTTCTTCACGATTT-TTGAGGTAGACATTCAATTA
255 AATAGACTTTTCCTGCAAATGAGT-GGCTTTTT-TTCACG-TTTCTTGCTGCAGATGTTCAATTA
* * * * * ** * *
23269 TAATCTGTTTT--CACAAAAAATGTAAAACATTTAACTTAAAATCAATTATAAGATTATAAAACC
317 TAATTTGTTTTAGC-CAAAAAAT-AAAAAAATTCAACTTGAAATTGATTATGAGATTATAAAAAC
* * * * ** * * *
23332 ATGTAAAGCGCGTAGTAA-GACTTTCAAAGGTATGGGGGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAAT
380 ATTTAAAGCGCGTAATAAGGA-TTTCGAAGGCATGGCTGACTATAAATAGACTTTTCTTACCAAC
* * * ** ** ** ** * * *
23396 GAATAGC-TATTTCTTCATGTTTCCCAAGGTGGACATTCAATTATAATCTTTTTTAACTAAAAAT
444 AAAT-GCATTTTTCTTTAACTTTTTCAAGGAAGACATTCAATTATAATCTGCTTTCACCAAAAAC
*
23460 G
508 A
* * * *
23461 TAAAAATATTTAACATAAAATCAATTACGAGATTATAAAATCACTTAAAGTGAGTAATTACGATT
1 TAAAAAAATTTAACATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGTGAGTAATTACGATT
* ** *** * **
23526 TTGAAGGCATAAGTAACT-TAAATAAACTTTTGTTGCCAATGAATAGCCTTT-TCTTCATGTTTC
66 TTGAAGGTATGGGTAACTATAAATGGGCTTTTCTTGCCAATGAATA-AATTTCTCTTCATGTTTC
* * * * * * * *
23589 CCAAGACAGATATTCAATTATAATTTATTTTAACAAAAATTTTAAAAAAACTT-AATCTAAAATC
130 CTAATATAGACATTCAA-TATAA-TTGTTTTAACCAAAAGTGT-AAAAAA-TTCAATCTAAAATC
* * * * ** * *
23653 AATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGAAATGAGGCTTTCAAAGGCTCGAGTGACTAGAA
191 AATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCGAATACTTGGGTGACTAGAA
* * * * * * * **** * ***
23718 ATGGACTTTTCTTGCTAATAAATAGCTTTTTCTTCATGTTTCCCAATGAAGGCATTCAATTATAA
256 ATAGACTTTTCCTGCAAATGAGTGGCTTTTT-TTCACGTTTCTTGCTGCAGATGTTCAATTATAA
* * * * * * * ** *
23783 TCTATTTTAACTAAAAACAT-AAAAATTTCAACCTAAAATCAATTATGGGATTAT-AAAACTATT
320 TTTGTTTTAGCCAAAAA-ATAAAAAAATTCAACTTGAAATTGATTATGAGATTATAAAAAC-ATT
* * * * * * * * **
23846 TAAAGCGAGTAATTAGGATTTTGAAAGAATGGGTAACTATAAAT-GAACTTTTCTGACCAATGAA
383 TAAAGCGCGTAATAAGGATTTCGAAGGCATGGCTGACTATAAATAG-ACTTTTCTTACCAACAAA
* * * * *
23910 TGGC-TTTTTC-TT--CTTGTTTCCTAAGGCAGACATTCAATAATAATTTG-TTTTAGCCAAACA
447 T-GCATTTTTCTTTAACTT-TTT-C-AAGGAAGACATTCAATTATAATCTGCTTTCA-CCAAAAA
**
23970 TG
507 CA
* * ** * * * *
23972 TAAAAAAATTTAACCTAAAATCAATTATGATATTATAAAATTATTTTAAGCGAGTAATTAGGCTT
1 TAAAAAAATTTAACATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGTGAGTAATTACGATT
* * * * * ** *
24037 TTGAAGGCATGTGTAACTATAAATGGACCTTTCTTGCCGATGAATAGCTTTTTCTTCATGTTTCC
66 TTGAAGGTATGGGTAACTATAAATGGGCTTTTCTTGCCAATGAATAAATTTCTCTTCATGTTTCC
* ** * * * * *
24102 TGAGGTAAAGATTTAATTATAATCCGTTTTAACCTAAAA-TGT-AAAAATTCAACCTAAAATCAA
131 TAATATAGACATTCAA-TATAAT-TGTTTTAACC-AAAAGTGTAAAAAATTCAATCTAAAATCAA
* * * **
24165 TTATGAGATTTTAAAATCATTTAAAGCGAGTAATTAGGTTTTCGAACGCATT-GGTGA-TCAGAA
193 TTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCGAATAC-TTGGGTGACT-AGAA
* * * ** ** * ********* * *
24228 ATGGACTTTTCTTACCCATGAAAGGCTTTTTCTTCATGTTTNNNNNNNNNNG-TATTGAATTATA
256 ATAGACTTTTCCTGCAAATGAGTGGCTTTTT-TTCACGTTT-CTTGCTGCAGATGTTCAATTATA
* * * * * * * *
24292 ATCTATTTTAGCC-AAAAATGTAAAAAATTTAATTTAAAATTAATTATGAGATTATAAAAATATT
319 ATTTGTTTTAGCCAAAAAAT-AAAAAAATTCAACTTGAAATTGATTATGAGATTATAAAAACATT
* * * * * ** * *
24356 TAAATCGCGTGATAAGGCTTTCAAAGGCATGGGTGACTATAAACGGACTTTTCTTACCACCGAAT
383 TAAAGCGCGTAATAAGGATTTCGAAGGCATGGCTGACTATAAATAGACTTTTCTTACCAACAAAT
* * * * * *
24421 AC-TTTTTTTTTCA-TGTTTCCTAAGGTAGACATTCAAAGTATAGGTAATTATAAATGGACTTTT
448 GCATTTTTCTTTAACT-TTTTC-AAGGAAGACATTC-AA-T-TA--T-A--AT--CT-G-C-TTT
** *
24484 CTTGTCAATGAAGAGA
498 C--ACCAA--AA-ACA
**** ** * * * * * * *
24500 TTTGTTTTCATGTTTCCCAAGGCAGACATTCAATTATAATATGTTTTAACCAAAAATACAAAAAT
1 ----TAAAAAAATTT---AA--CATAAAATCAATTAT--GA-G-ATT----ATAAA-AC---CAT
** * * * * * *** **** * * * *
24565 ATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAACGAGTAATTAGCCTTTTGAATA
45 -TT-AAAGT-GAGT-AATTA--CGATTTTGAAGGTATGGGTAACTA-TAAATGGGC-TTT---T-
** * * *
24630 CTTGGGTGACTAGAAATGGATATTTCT-TTCCAATGACTCACTTTTCTCCACATTGCTTGATGCA
98 CTT--GCCAAT-G-AAT--AAATTTCTCTT-C-ATG-------TTTC-CTA-A-----T-AT--A
* * * * * ***
24694 GATATTGAATGATAATCTGTTTTAGCCAAAAATGTAGAAAATTCAAAT-TAAAATTGGTTATGAG
138 GACATTCAAT-ATAAT-TGTTTTAACCAAAAGTGTAAAAAATTC-AATCTAAAATCAATTATGAG
* * * * * ** * * * *
24758 ATTATAAAAACATTTAAAGCGCGTAATAAGACTTTCAAAGGCATAGGTGA-TTGTAAATGGACTT
200 ATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCGAATACTTGGGTGACTAG-AAATAGACTT
* * * ** * * ** * ** *
24822 TTCTTATCAACA--AATTCCTTTTTCCTCACGTTTCATGAGGAAGACATTCAATTATAATCTGTT
264 TTCCT-GCAA-ATGAGTGGCTTTTT-TTCACGTTTCTTGCTGCAGATGTTCAATTATAATTTGTT
* * * * * ** * *
24885 TTCA-CCAAAAACATAAAAAAAATTTAACATAAAATCGAGTGCGATATTATAAAACCATTTAAAG
326 TT-AGCCAAAAA-AT-AAAAAAATTCAACTTGAAATTGATTATGAGATTATAAAAACATTTAAAG
* * * * * * * * **
24949 CGAGTAGTTACGATTTTGAAGGCATGAG-TAACTATAAATAGATTTTTCTTGCCAATGAATAG-A
388 CGCGTAATAAGGATTTCGAAGGCATG-GCTGACTATAAATAGACTTTTCTTACCAACAAAT-GCA
* * * * * * ***
25012 TTTTTC-TT-CCTGTTTCCCAAGGCAGACATTTAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAGTG
451 TTTTTCTTTAACT-TTT-TCAAGGAAGACATTCAATTATAATCTGCTTTCACCAAAAACA
* * * *
25070 TAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAGA-CATTTAAAGTCACTAATTA-GAA
1 TAAAAAAATTTAACATAAAATCAATTATGAGATTATAAA-ACCATTTAAAGTGAGTAATTACG-A
** * * * * *** * *
25133 TTTTGAAGGCGTGGGTAACTACAAATAGACTTTTCTAGCCAATGAATGCTTTTTTCTTCGTGTTT
64 TTTTGAAGGTATGGGTAACTATAAATGGGCTTTTCTTGCCAATGAATAAATTTCTCTTCATGTTT
* ** * * * * *
25198 CCCAGGACAGACATTTAATAATAATTAGTTTTCACTAAAAATGTAAAAAATTCAA-CATAAAATC
129 CCTAATATAGACATTCAAT-ATAATT-GTTTTAACCAAAAGTGTAAAAAATTCAATC-TAAAATC
* *
25262 AATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGTGAGTAATTAGGCTTTCGAATGCTTGGGTGACTAGAA
191 AATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCGAATACTTGGGTGACTAGAA
* * ** * *
25327 ATAGACTTTTCCTACAAATGAATGGCTTTTTTTTCACGTTTCTTGAGGTAGATATTCAATTATAA
256 ATAGACTTTTCCTGCAAATGAGTGGC-TTTTTTTCACGTTTCTTGCTGCAGATGTTCAATTATAA
* * *
25392 TCTGTATTAG-CTAAAAATACAAAAAATTCAACTT-AAAGTTGATTATGAGATTATAAAAACATT
320 TTTGTTTTAGCCAAAAAATA-AAAAAATTCAACTTGAAA-TTGATTATGAGATTATAAAAACATT
* * * * * * *
25455 TAAAGCGCGTAATAAGGCTTCCGAAGGCATGGGTGACTATAAATGGAGTTTTCTTGCCAACGAAT
383 TAAAGCGCGTAATAAGGATTTCGAAGGCATGGCTGACTATAAATAGACTTTTCTTACCAACAAAT
* * * ** * * * ** *
25520 GCCTTTCTCTTCATGTTTCTCAAGAAAAACATTCAATTATAATCTGCTTTCAATAAAAACG
448 GCATTTTTCTTTAACTTTTTCAAGGAAGACATTCAATTATAATCTGCTTTCACCAAAAACA
* ** *
25581 TTAAAAAATTTAACATAAAATCAATTACAAGATTATAAAACCATTTAAAGTGAGCAATTACGATT
1 TAAAAAAATTTAACATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGTGAGTAATTACGATT
* ** ** * * * *
25646 TTGAAGGCATGGGTAACTACGAATGGATTTTTCTTACCAATGAATAGATTTTTCTTCATTTTTCC
66 TTGAAGGTATGGGTAACTATAAATGGGCTTTTCTTGCCAATGAATAAATTTCTCTTCATGTTTCC
* ** ** * * *
25711 CAAGGTAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAATTAAAAATGTAAAATATTCAA-CATAAAATAAA
131 TAATATAGACATTCAA-TATAAT-TGTTTTAACCAAAAGTGTAAAAAATTCAATC-TAAAATCAA
* * * * *** * ** * *
25775 TTATGAGATTATAAAGCTATTTAAAGTGACTAATTACAATTTTGAAGGCATGGGTAACTATG-AA
193 TTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCGAATACTTGGGTGACTA-GAAA
* ** * * * ** * * ** *
25839 TAGACTTTT-TTAGCCTATGAATGACCTTTTCTTCATATTTACTAGGT-CAGACATTCAATAATA
257 TAGACTTTTCCT-GCAAATGAGTG-GCTTTTTTTCACGTTT-CTTGCTGCAGATGTTCAATTATA
* * ** * ** * ** *
25902 ATTAGTTTT--CACTAATTATGTAAAAAATTCAAGATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCAT
319 ATTTGTTTTAGC-CAAAAAAT-AAAAAAATTCAACTTGAAATTGATTATGAGATTATAAAAACAT
* * * * * * * * * * * **
25965 TTAAAGTGAGTAATTAGGCTTTCGAATGCTTAGG-TTACTAGAAAT-GTACTTTCCCTACAAATG
382 TTAAAGCGCGTAATAAGGATTTCGAAGGCAT-GGCTGACTATAAATAG-ACTTTTCTTACCAACA
** ** * * * * * *
26028 AATGGTTTTTTC-TTCGCGTTTCTT-AAGGTAGATATTCAATTATAATATGTTTTAACCAAAAAT
445 AATGCATTTTTCTTTAAC-TTT-TTCAAGGAAGACATTCAATTATAATCTGCTTTCACCAAAAAC
*
26091 G
508 A
* * ** ** * * * *
26092 T-AAAAAATTCAACTTAAAATTGATTATGAGATTATAAAAATATTTAAAGCGCGTAA-TAAGCCT
1 TAAAAAAATTTAACATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGTGAGTAATTACG-AT
** * * * * * * *** *
26155 TTCAAAGGCATGGGTGACTAGAAATAGACTTTTCTTGCCAACGAATGCCTTTTTCTTC-TAGTTT
65 TTTGAAGGTATGGGTAACTATAAATGGGCTTTTCTTGCCAATGAATAAATTTCTCTTCAT-GTTT
** ** ** *** * *
26219 CAAAAGTA-AGACATTCAATTATAATCTAATTTCTCCAAAAACATAGAAAAATTTAA-CATCAAA
129 CCTAA-TATAGACATTCAA-TATAAT-TGTTTTAACCAAAAGTGTA-AAAAATTCAATC-TAAAA
* * ** * ** * *
26282 TCAATTA-CAGGATTATAAAATCATTTAAAGCGAGTAATTACGAATAT-GAAGGCATGGGTAACT
189 TCAATTATGA-GATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTA-GGCTTTCGAATACTTGGGTGACT
* * * * * * * * *****
26345 ATAAATAGATTTTTCTTAG-TAATGAATAGATTTTTCTTCATGTTTCCCAAGGCAGACT-TTCAA
252 AGAAATAGACTTTTCCT-GCAAATGAGTGGCTTTTT-TTCACGTTTCTTGCTGCAGA-TGTTCAA
* * *** ** * *
26408 TTATAATATGTTTTCA-CCAAAAAAGT-AAAAGATTCAACGAAAAATAAATTATTAGATTAT-GA
314 TTATAATTTGTTTT-AGCCAAAAAA-TAAAAAAATTCAACTTGAAATTGATTATGAGATTATAAA
* * * * * * * * *
26470 AGCTATTTAAAGTGAC-TAATTAGGATTTTGAAAGCATGGATAACTATGAATAGACTTTTTTTAG
377 AAC-ATTTAAAGCG-CGTAATAAGGATTTCGAAGGCATGGCTGACTATAAATAGACTTTTCTTA-
** * ** ** * * * *
26534 CCAATGAATG-ATCTTTTCTTCATA-TTTACCAAGTTAGACATTCAATAATAATTTGTTTTAACC
439 CCAACAAATGCAT-TTTTCTTTA-ACTTTTTCAAGGAAGACATTCAATTATAATCTGCTTTCACC
**
26597 AAAAATG
502 AAAAACA
* * * * * * *
26604 TAAAACAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTTTAAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCT
1 TAAAAAAATTTAACATAAAATCAATTATGAGATTAT-AAAACCATTTAAAGTGAGTAATTACGAT
** * * * * * * ** *
26669 TTAAAATGCT-TGGGTGACTAGAAATCGACTTTTCTTACCAATGAA-AGGCTTTTTCTTCATGTT
65 TTTGAA-GGTATGGGTAACTATAAATGGGCTTTTCTTGCCAATGAATA-AATTTCTCTTCATGTT
* * *** * * ** *
26732 TCTTGAGGCAGATATTCAATGATAATCTATTTTAGTCAAAAATGTAAAAAATTCAA-CTTAAAAT
128 TCCTAATATAGACATTCAAT-ATAAT-TGTTTTAACCAAAAGTGTAAAAAATTCAATC-TAAAAT
* * * * * * * ** * * *
26796 TAATTACGAGATTATAAAAACGTTTAAAGCGCGTAATAAGGTTTTC-AGAGGCATGGGTGGCTAT
190 CAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCGA-ATACTTGGGTGACTAG
* * * * * ** * * * ** * **
26860 AAATGGACTTTTCTTGCTACT-AATACCTTTTTCTTTATGTTTCTCGAGGTAGACATTCAATTAT
254 AAATAGACTTTTCCTGCAAATGAGTGGCTTTTT-TTCACGTTTCTTGCTGCAGATGTTCAATTAT
* * * * * * ** ** * *
26924 AATATGTTTTCA-TCAAAAACGTAAAACAAGTT-AACATAAAATCAATTACAAGATTA-CAAAGC
318 AATTTGTTTT-AGCCAAAAA-ATAAAA-AAATTCAACTTGAAATTGATTATGAGATTATAAAAAC
* * * * ** * * * * *
26986 TATTTAAAGGGAGTAATTAGAATTTTAAAGGCATGGGTAACTATAAATAAACTTTTCTTGCCAAT
380 -ATTTAAAGCGCGTAATAAGGATTTCGAAGGCATGGCTGACTATAAATAGACTTTTCTTACCAAC
* * * * ** ** * * * * * *
27051 GAAT-CGATTTCTCATCATGTTTCCCAAGGCAGACATTCAATTATTATTTGTTTTAACCAAAAAT
444 AAATGC-ATTTTTCTTTAACTTTTTCAAGGAAGACATTCAATTATAATCTGCTTTCACCAAAAAC
*
27115 G
508 A
* * * * * * * *
27116 TAAACAAATTCAACGTAAAATCAATTATGAGATTATAAAGCCATTTAAAATAACTAATTAGGATT
1 TAAAAAAATTTAACATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGTGAGTAATTACGATT
* * * * * *** * *
27181 TTGACA-GCATGGGTAACCACAAATGGACTTTTCTAGCCAATGAATGCCTTTTTTTTTCATGTTT
66 TTGA-AGGTATGGGTAACTATAAATGGGCTTTTCTTGCCAATGAAT-AAATTTCTCTTCATGTTT
* *** * * * * *
27245 CCCAAGGCAGGCATTCAATAATAATTGGTTTTCACTAAAAATGTAAAAAATT-AAACATAAAATC
129 CCTAATATAGACATTCAAT-ATAATT-GTTTTAACCAAAAGTGTAAAAAATTCAATC-TAAAATC
* * * * * *
27309 AATTATAAGATTATAAAATCATTTAAAGTGAGTAATTAGGCTTTAGAGTGCTTGGGTGACTAGAA
191 AATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCGAATACTTGGGTGACTAGAA
* * * * *** *
27374 AT-GTACTTTTTCTGCAAATGAATGACTTTTTCTTCATGTTTCTTAAGGCAGATATTCAATTATA
256 ATAG-ACTTTTCCTGCAAATGAGTGGCTTTTT-TTCACGTTTCTTGCTGCAGATGTTCAATTATA
* * * * * **********
27438 ATCTGTTTTA-ACAAACAATGTAAAAAATTCAACTTAAAANNNNNNNNNNGATTATAAAAACATT
319 ATTTGTTTTAGCCAAAAAAT-AAAAAAATTCAACTTGAAATTGATTATGAGATTATAAAAACATT
* * * * * *
27502 TAAAGCGCGTAATAAGGCTTTCGAACGCATGGGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAACGAAT
383 TAAAGCGCGTAATAAGGATTTCGAAGGCATGGCTGACTATAAATAGACTTTTCTTACCAACAAAT
*
27567 GCCTTTT
448 GCATTTT
27574 CTTGCCAATG
Statistics
Matches: 7590, Mismatches: 2135, Indels: 934
0.71 0.20 0.09
Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.37, C:0.13, G:0.13, T:0.34
Consensus pattern (508 bp):
TAAAAAAATTTAACATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGTGAGTAATTACGATT
TTGAAGGTATGGGTAACTATAAATGGGCTTTTCTTGCCAATGAATAAATTTCTCTTCATGTTTCC
TAATATAGACATTCAATATAATTGTTTTAACCAAAAGTGTAAAAAATTCAATCTAAAATCAATTA
TGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCGAATACTTGGGTGACTAGAAATAGA
CTTTTCCTGCAAATGAGTGGCTTTTTTTCACGTTTCTTGCTGCAGATGTTCAATTATAATTTGTT
TTAGCCAAAAAATAAAAAAATTCAACTTGAAATTGATTATGAGATTATAAAAACATTTAAAGCGC
GTAATAAGGATTTCGAAGGCATGGCTGACTATAAATAGACTTTTCTTACCAACAAATGCATTTTT
CTTTAACTTTTTCAAGGAAGACATTCAATTATAATCTGCTTTCACCAAAAACA
Found at i:18824 original size:170 final size:168
Alignment explanation
Indices: 18335--18954 Score: 565
Period size: 171 Copynumber: 3.6 Consensus size: 168
18325 NNNNNNNNNN
* * * * * *
18335 TTTTCTTCACTTTTCTTAAGG-AAGACATTCAATTATAATCTGCTTTCACCAAAAACGTAAAAAA
1 TTTTCTTCACGTTTCTCAAGGTAA-ACATTCAATTATAATCT-ATTTTAACAAAAATGTAAAAAA
* * * * **
18399 ATTTAACATAAAATCAATTACGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTACGAATTT-AAAG
64 ATTCAACATAAAATTAATTACGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGTGTAA-TAAGGCTTTCAAAG
* * *
18463 GCATGGGTAACTAGAAATGGACTTTTCGTACCAATGAATAGAT
128 GCATGGGTAACTAGAAATGGACTTTTCTTACAAATG-AT-GCT
* * * ** * * *
18506 TTCTCTTCATGTTTCCCAATATAGACATTCAATTATAATAC-GTTTTAACCAAAAGTGTAAAAAA
1 TTTTCTTCACGTTTCTCAAGGTAAACATTCAATTATAAT-CTATTTTAA-CAAAAATGTAAAAAA
* * * *
18570 ATTCAACCTAAAAGTAATTACAAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAT-TAATTAGGCTTTCGAAA
64 ATTCAACATAAAATTAATTACGAGATTATAAAACCATTTAAAGCG-TGTAATAAGGCTTTC-AAA
*
18634 -GCTTGGGTAACTAGAAATGGACTTTTCTTACAAATGAGTGGCT
127 GGCATGGGTAACTAGAAATGGACTTTTCTTACAAATGA-T-GCT
* ** *
18677 TTTTCTTCACATTTCTTGAGGTAAATATTCAATTATAATCTATTTTAGACAAAAATGT-AAAAAA
1 TTTTCTTCACGTTTCTCAAGGTAAACATTCAATTATAATCTATTTTA-ACAAAAATGTAAAAAAA
** * **
18741 TTCAATTTAAAATTAATTATGAGATTATAAAAATATTTAAAGCGTGTAATAAGGCTTTCAAAGGC
65 TTCAACATAAAATTAATTACGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGTGTAATAAGGCTTTCAAAGGC
* *
18806 ATGGGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCTACCAAAT-AT-CT
130 ATGGGTAACTAGAAATGGACTTTTC-T--TA-CAAATGATGCT
* * * * ** *
18847 TTTTCTTCACGTTTCTCGAGGTAGACATTCAATTATAATTTATTTTCACTAAAAGCGTAAAACCA
1 TTTTCTTCACGTTTCTCAAGGTAAACATTCAATTATAATCTATTTTAAC-AAAAATGTAAAA-AA
* * *
18912 GTT-AACATAAAATCAATTACGAGATTATAAAACTATTTTAAAG
64 ATTCAACATAAAATTAATTACGAGATTATAAAACCA-TTTAAAG
18955 GCATGGGTAA
Statistics
Matches: 364, Mismatches: 66, Indels: 37
0.78 0.14 0.08
Matches are distributed among these distances:
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174 5 0.01
ACGTcount: A:0.39, C:0.14, G:0.12, T:0.34
Consensus pattern (168 bp):
TTTTCTTCACGTTTCTCAAGGTAAACATTCAATTATAATCTATTTTAACAAAAATGTAAAAAAAT
TCAACATAAAATTAATTACGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGTGTAATAAGGCTTTCAAAGGCA
TGGGTAACTAGAAATGGACTTTTCTTACAAATGATGCT
Found at i:19639 original size:171 final size:169
Alignment explanation
Indices: 19070--19674 Score: 515
Period size: 169 Copynumber: 3.6 Consensus size: 169
19060 AAATTCAATT
* * * * * * * *
19070 TAAAATTAATTATGAGATTTTAAAGCCATTTAAAGTGACTAATTAGGATTTTGAAGGCATG-GGT
1 TAAAATCAGTTATGAGATTATAAAACCTTTTAAAGCGAGTAATTA-GATTTTAAAGGCATGAGGT
** * ** ** * * *
19134 AACTACGAATGGACTTTTCTAGGGAATGAATGCCTTTTTCTTCGTGTTTCCTAAGGCAA-ACATT
65 AACTATAAATGGACTTTTCTTGCTAATGAATGCCTTTTT-TTCACGTTTCTTGA-GAAAGACATT
* * * * * ** *
19198 CAATAATAAT-TGGTTTTCACTAATAATGTAAAAAATTCAACA
128 CAATTAGAATCT-ATTTTCACCAAAAACATAAAAAATTTAACA
* * * * *
19240 TAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGACTTTCAAATGCTTG-GGT
1 TAAAATCAGTTATGAGATTATAAAACCTTTTAAAGCGAGTAATTAGA-TTTTAAAGGCATGAGGT
* * * * ** * *
19304 GACTAGAAATGGACTTTTCTTGCTAATGAATGGCTTTTTTTCATGTTTCTTGAGGCAGATATTGA
65 AACTATAAATGGACTTTTCTTGCTAATGAATGCCTTTTTTTCACGTTTCTTGAGAAAGACATTCA
* * * * ** *
19369 ATTATAATCTGTTTTCGCTAAAAATGTAAAAAATTTAACT
130 ATTAGAATCTATTTTCACCAAAAACATAAAAAATTTAACA
* * * *
19409 TAAAATC-GATTATGAGATTATAAAA-ATATTTAAAGCGCGTAATAAGGCTTTTAAAGGCATGAG
1 TAAAATCAG-TTATGAGATTATAAAACCT-TTTAAAGCGAGTAATTA-GATTTTAAAGGCATGAG
* * * *
19472 CT-ACAATAAATAGACTTTTCTTGCTAATGAATGCCTTTTTCTTTACGTTTCTTGAGAAAGACAT
63 GTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCTAATGAATGCCTTTTT-TTCACGTTTCTTGAGAAAGACAT
19536 TCAATTAGAATCTATTTTCACCAAAAACATAAAAAAATTTAACA
127 TCAATTAGAATCTATTTTCACCAAAAACAT-AAAAAATTTAACA
* * *
19580 TAAAATCAGTTACGAGATTATAAAACCTTTTAAAGCGAGTAATTACTATTTTGAAGGCAT-AGGT
1 TAAAATCAGTTATGAGATTATAAAACCTTTTAAAGCGAGTAATTA-GATTTTAAAGGCATGAGGT
* * *
19644 AACTATAAATGGATTTTTCTTACCAATGAAT
65 AACTATAAATGGACTTTTCTTGCTAATGAAT
19675 AGATTTTTCT
Statistics
Matches: 354, Mismatches: 69, Indels: 23
0.79 0.15 0.05
Matches are distributed among these distances:
168 2 0.01
169 133 0.38
170 132 0.37
171 85 0.24
172 2 0.01
ACGTcount: A:0.37, C:0.12, G:0.15, T:0.36
Consensus pattern (169 bp):
TAAAATCAGTTATGAGATTATAAAACCTTTTAAAGCGAGTAATTAGATTTTAAAGGCATGAGGTA
ACTATAAATGGACTTTTCTTGCTAATGAATGCCTTTTTTTCACGTTTCTTGAGAAAGACATTCAA
TTAGAATCTATTTTCACCAAAAACATAAAAAATTTAACA
Found at i:19684 original size:171 final size:167
Alignment explanation
Indices: 19070--24268 Score: 1288
Period size: 171 Copynumber: 30.7 Consensus size: 167
19060 AAATTCAATT
* * * * * * * * *
19070 TAAAATTAATTATGAGATTTTAAAGCCATTTAAAGTGACTAATTAGGATTTTGAAGGCATGGGTA
1 TAAAATCAGTTATGAGATTATAAAACCTTTTAAAGCGAGTAATTA-GATTTTAAAGGCATAGGT-
** * ** ** * * *
19135 ACTACGAATGGACTTTTCTAGGGAATGAATGCCTTTTTCTTCGTGTTTCCTAAGGCAA-ACATTC
64 ACTATAAATGGACTTTTCTTGCTAATGAATG-CTTTTTCTTCACGTTTCTTGA-GAAAGACATTC
* * * * * ** *
19199 AATAATAAT-TGGTTTTCACTAATAATGTAAAAAATTCAACA
127 AATTAGAATCT-ATTTTCACCAAAAACATAAAAAATTTAACA
* * * * * *
19240 TAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGACTTTCAAATGCTTGGGTG
1 TAAAATCAGTTATGAGATTATAAAACCTTTTAAAGCGAGTAATTAGA-TTTTAAAGGCATAGGT-
* * ** * *
19305 ACTAGAAATGGACTTTTCTTGCTAATGAATGGCTTTTT-TTCATGTTTCTTGAGGCAGATATTGA
64 ACTATAAATGGACTTTTCTTGCTAATGAAT-GCTTTTTCTTCACGTTTCTTGAGAAAGACATTCA
* * * * ** *
19369 ATTATAATCTGTTTTCGCTAAAAATGTAAAAAATTTAACT
128 ATTAGAATCTATTTTCACCAAAAACATAAAAAATTTAACA
* * * *
19409 TAAAATC-GATTATGAGATTATAAAA-ATATTTAAAGCGCGTAATAAGGCTTTTAAAGGCATGAG
1 TAAAATCAG-TTATGAGATTATAAAACCT-TTTAAAGCGAGTAATTA-GATTTTAAAGGCAT-AG
* * * *
19472 CTACAATAAATAGACTTTTCTTGCTAATGAATGCCTTTTTCTTTACGTTTCTTGAGAAAGACATT
62 GTACTATAAATGGACTTTTCTTGCTAATGAATG-CTTTTTCTTCACGTTTCTTGAGAAAGACATT
19537 CAATTAGAATCTATTTTCACCAAAAACATAAAAAAATTTAACA
126 CAATTAGAATCTATTTTCACCAAAAACAT-AAAAAATTTAACA
* * *
19580 TAAAATCAGTTACGAGATTATAAAACCTTTTAAAGCGAGTAATTACTATTTTGAAGGCATAGGTA
1 TAAAATCAGTTATGAGATTATAAAACCTTTTAAAGCGAGTAATTA-GATTTTAAAGGCATAGGT-
* * * * * ** *
19645 ACTATAAATGGATTTTTCTTACCAATGAATAGATTTTTCTTCATGTTT-TCCAAGGCAA-ACATT
64 ACTATAAATGGACTTTTCTTGCTAATGAAT-GCTTTTTCTTCACGTTTCT-TGA-GAAAGACATT
* * * * * ** * *
19708 AAATTATAATCTGTTTTAACTAAAAATGTAAACAAATTCAACC
126 CAATTAGAATCTATTTTCACCAAAAACATAAA-AAATTTAACA
* * * * * * * * *
19751 TAAAGTAAATTATGAGATTAT-AAAGCTATTTAAAAACTA-TAATTTGGATTTTGAAGGTAT-GC
1 TAAAATCAGTTATGAGATTATAAAACCT-TTT-AAAGCGAGTAA-TTAGATTTTAAAGGCATAG-
* * * * * * * **
19813 CTAACTATAAACGAACTTTTCTAG-TCAATGAATGGCTTCTTCTTCATGTTT-TCTAAGGTAGAC
62 GT-ACTATAAATGGACTTTTCTTGCT-AATGAAT-GCTTTTTCTTCACGTTTCT-TGAGAAAGAC
** * * * * * * *
19876 ATTCAACAATAAT-TGGTTTTAACAAAAAATGC-TGAAAAATTCAACC
123 ATTCAATTAGAATCT-ATTTTCACCAAAAA--CATAAAAAATTTAACA
* * *********** * * * * * *
19922 TAAAATCAATTATGGGANNNNNNNNNNATTTAAAGTGAGTAATAAGGCTTTCGATA-GCATGGGT
1 TAAAATCAGTTATGAGATTATAAAACCTTTTAAAGCGAGTAATTA-GATTT-TAAAGGCATAGGT
* * ** **** * * *
19986 GACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATAACAACCTTTTTCTTTGTATTTCTTTAGGCAA-TCATT
64 -ACTATAAATGGACTTTTCTTGCTAATGA-ATGCTTTTTCTTCACGTTTCTTGA-GAAAGACATT
** * * * * * ** * *
20050 TGATTATAATTTGTTTTAACTAAAAATGTAAAAAAATTCAACC
126 CAATTAGAATCTATTTTCACCAAAAACAT-AAAAAATTTAACA
* * * * * * *
20093 TAAAATTAATTATGACATTATAAAA-CTGTTTAAAGTGAGTAATTACGTTTTTGAAGGCATGGGC
1 TAAAATCAGTTATGAGATTATAAAACCT-TTTAAAGCGAGTAATTA-GATTTTAAAGGCATAGG-
* * * * * * ** *
20157 AACTTTAAATGGACCTTTCTTG-TCAATGAATGATTTTTTCTTCATGTTTCTTAAGGCAGTCATT
63 TACTATAAATGGACTTTTCTTGCT-AATGAATG-CTTTTTCTTCACGTTTCTTGAGAAAGACATT
* * * ** * *
20221 CAATTATAATCTATTTTAACTAAAAATGTAAAAAAATTCAACC
126 CAATTAGAATCTATTTTCACCAAAAACAT-AAAAAATTTAACA
** * * * * ** * * **
20264 TAAAATCAACTATGACATTATAAAACTATTTTAAAGGCATGAGTAACTATAAATGAAA--CTTTC
1 TAAAATCAGTTATGAGATTATAAAAC-CTTTTAAA-GC--GAGTAATTAGATTTTAAAGGCATAG
* * * * * * * ****
20327 TTACCAATGAATGG-C-TTT-TT-CT--T-CA--C-GTTTCTTGAAG-----T-AGACCTTCAAT
62 GTA-CTATAAATGGACTTTTCTTGCTAATGAATGCTTTTTCTTCACGTTTCTTGAGAAAGAC-AT
* ** ** * *
20376 TGTAA-TATG--T-T-TTAACTA--AAAATGTA-AAAAAATTCAACC
125 T-CAATTA-GAATCTATTTTC-ACCAAAA-ACATAAAAAATTTAACA
* * * * * * * ** * * *
20415 TAAAATCAATTATGAGGTTATAAGACCATTTAAAGCAAGTAGTTAGGCTTTCGAATGCTTGGGTA
1 TAAAATCAGTTATGAGATTATAAAACCTTTTAAAGCGAGTAATTA-GATTTTAAAGGCATAGGT-
* * * * * * * ** *
20480 ACTAGAAATGGACTTTTCCTACAAATGAATAGTTTTTTCTTCACATTTCATGAGGCAGATATTCA
64 ACTATAAATGGACTTTTCTTGCTAATGAAT-GCTTTTTCTTCACGTTTCTTGAGAAAGACATTCA
* * * * * **
20545 ATTATAATCTGTTTT-AGCAAAAA-ATGTAAAAATTCAAGT
128 ATTAGAATCTATTTTCACCAAAAACAT-AAAAAATTTAACA
* * * * * * * * *
20584 TAAAAT-TGATTATGAGATTATAAAAACATTTAAAGCGTGCAATAAGACTTTCAAAGGTATGGGT
1 TAAAATCAG-TTATGAGATTATAAAACCTTTTAAAGCGAGTAATTAGA-TTTTAAAGGCATAGGT
* * * * * * *** *
20648 GACTATAAATGAACTTTTGC-TACAAACGAATACTTTTTTCTTCACCTTTCCCAAGGAAGACATT
64 -ACTATAAATGGACTTTT-CTTGCTAATGAATGC-TTTTTCTTCACGTTTCTTGAGAAAGACATT
* * * * *
20712 CAATTATAATTTGTTTTCACCAAAAACGTAAAAAAATCTAACA
126 CAATTAGAATCTATTTTCACCAAAAACAT-AAAAAATTTAACA
*
20755 TAAAATCAGTTATGAGATTATAAAACCTTTTAAAGCGAGTAATTACGATTTTGAAGGCAT-GG--
1 TAAAATCAGTTATGAGATTATAAAACCTTTTAAAGCGAGTAATTA-GATTTTAAAGGCATAGGTA
* * * * * * * **
20817 --GTAAATGGATTTTTCTTGCTAATAAATAGATTTTTCTTCATGTTTCCTAAGGCAGACATTCAA
65 CTATAAATGGACTTTTCTTGCTAATGAAT-GCTTTTTCTTCACGTTTCTTGAGAAAGACATTCAA
** * * *** * * **
20880 TTTTAATCTGTTTTAACCAAAAGTGTAAAGAGATTCAATG
129 TTAGAATCTATTTTCACCAAAAACATAAA-AAATTTAACA
** * * *
20920 TAAAAAAAATTATGAGATTATAAAA-CTATTTAAAGCGACTAATTAAGATTTTCAAA-GCATGGG
1 TAAAATCAGTTATGAGATTATAAAACCT-TTTAAAGCGAGTAATT-AGATTTT-AAAGGCATAGG
* * * * *** ** *
20983 TAACTATAAATAGACTTTTCTAGCCAATGAATGGCTTTTTCTTCATGTTTCCCAAGTCAGACAAT
63 T-ACTATAAATGGACTTTTCTTGCTAATGAAT-GCTTTTTCTTCACGTTTCTTGAGAAAGACATT
* * * * * * ** * *
21048 CAATAATAATTTGTTTTAACTAAAAATGTAAAAATATTCAACC
126 CAATTAGAATCTATTTTCACCAAAAACATAAAAA-ATTTAACA
*********** * * * ** *
21091 TAAAATTNNNNNNNNNNTTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGACTTTCAAAGTAATGGGTG
1 TAAAATCAGTTATGAGATTATAAAACCTTTTAAAGCGAGTAATTAGA-TTTTAAAGGCATAGGT-
* * * * ** *
21156 ACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATG-ATAGCCTCTTTCTTCACATTTCTTTAGGCAGTCATTC
64 ACTATAAATGGACTTTTCTTGCTAATGAAT-G-CTTTTTCTTCACGTTTCTTGAGAAAGACATTC
* * * * ** * *
21220 GATTAGAATTTGTTTT-AACAAAAGATGTAAAAAAATTCAACT
127 AATTAGAATCTATTTTCACCAAAA-ACAT-AAAAAATTTAACA
* * * * *
21262 TAAAATCAATTATGACATTATAAAA-CTATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTGAAGGCATGGGT
1 TAAAATCAGTTATGAGATTATAAAACCT-TTTAAAGCGAGTAATTA-GATTTTAAAGGCATAGGT
* * ** * * ** ** *
21326 GACTATAAATGGACTTTTCTTACCACCGAATACCTTTTTCTTCACATTT-TCCAAGGTAGACAAT
64 -ACTATAAATGGACTTTTCTTGCTAATGAAT-GCTTTTTCTTCACGTTTCT-TGAGAAAGACATT
* * *** *
21390 CAATTATAATC-AGTTTTAACCAAAAGTGTAAAAAAATTCAATC-
126 CAATTAGAATCTA-TTTTCACCAAAAACAT-AAAAAATTTAA-CA
* * * * * * * *
21433 TAAAATAAATTATGAGATTATAAAGCCATTTAAAGTGACTAATTAGGATTTTGAA-GCATTGGGT
1 TAAAATCAGTTATGAGATTATAAAACCTTTTAAAGCGAGTAATTA-GATTTTAAAGGCA-TAGGT
* * * * * * * *** **
21497 AACTACAAATGGACTTTTCTAGCCAATTAATGCTTTTTTTTTTATGTTTCCCAAGGCAGACATTC
64 -ACTATAAATGGACTTTTCTTGCTAATGAATGC-TTTTTCTTCACGTTTCTTGAGAAAGACATTC
* * * * * ** * *
21562 AATAATAATTTGTTTTCACTAAAAATGTAAAAAATTCAATA
127 AATTAGAATCTATTTTCACCAAAAACATAAAAAATTTAACA
* * * * * ** * * *
21603 TAAAATTAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAATTAGGCTTTCGAATGCTTGGGTG
1 TAAAATCAGTTATGAGATTATAAAACCTTTTAAAGCGAGTAATTA-GATTTTAAAGGCATAGGT-
* * * * * * * ** * *
21668 ACTAGAAATGGGCTTTTCCTGCAAATGAAAGGGTTTTTCTTCACTTTTCTTGAGGTAGATATACA
64 ACTATAAATGGACTTTTCTTGCTAATG-AATGCTTTTTCTTCACGTTTCTTGAGAAAGACATTCA
* *** ** * *
21733 ATTATAATCTATTTT-AGCCAAAATTGTAAAACCTTCAACG
128 ATTAGAATCTATTTTCA-CCAAAAACATAAAAAATTTAACA
* * * * * * * * * *
21773 TAAAATGAATTATGAGATTATAAAAACATTTAAAGCGCGTAATAAGGCTTTCAAAGACATGGGTG
1 TAAAATCAGTTATGAGATTATAAAACCTTTTAAAGCGAGTAATTA-GATTTTAAAGGCATAGGT-
* * * * * *
21838 ACTATAAATAGA-ATTTCTTGC-CATCGAATACCTTTTTCTTCACGTTTCTCGAGGCAA-ACATT
64 ACTATAAATGGACTTTTCTTGCTAAT-GAAT-GCTTTTTCTTCACGTTTCTTGA-GAAAGACATT
* * * * *
21900 CAATTATAATTTGTTTTCACCAAAAATGAAAAAAAATTTAACA
126 CAATTAGAATCTATTTTCACCAAAAA-CATAAAAAATTTAACA
* * * * * * * * * *
21943 TAAAATGAATTACGAGATAATAAAACCATTTAAAACAAGTAATTACGATTTTGAACGCATGGGTA
1 TAAAATCAGTTATGAGATTATAAAACCTTTTAAAGCGAGTAATTA-GATTTTAAAGGCATAGGT-
* * * * * *** **
22008 ACTATAAATGAACTTTTCTTGCCAATGAATAGATTTCTCTTCATGTTTCCCAAGGCAGACATTCA
64 ACTATAAATGGACTTTTCTTGCTAATGAAT-GCTTTTTCTTCACGTTTCTTGAGAAAGACATTCA
* * * * * *** **
22073 ATTATAATTTGTTTTAAACAAAAGTGTAAAAAAATTTAGTA
128 ATTAGAATCTATTTTCACCAAAAACAT-AAAAAATTTAACA
* * * * * * * * * *
22114 TAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGCAATAAGGCTTTCAAATGTATGGGTG
1 TAAAATCAGTTATGAGATTATAAAACCTTTTAAAGCGAGTAATTA-GATTTTAAAGGCATAGGT-
* * * * * ** *
22179 ACTAGAAATGGACTTTTATTGCCAATG-ATAGCCTTTTTCTTCATGTTTCTTAAGGCACACATTC
64 ACTATAAATGGACTTTTCTTGCTAATGAAT-G-CTTTTTCTTCACGTTTCTTGAGAAAGACATTC
* * ** * *
22243 AATTATAATCTATTTTAACCAAAAATGTAAAAAACTTCAACC
127 AATTAGAATCTATTTTCACCAAAAACATAAAAAA-TTTAACA
* * * * *
22285 TAAAATCTA-TTATGACATCATAAAACCATTTT-AAGCGAGTAATTAGGCTTTTGAAGGTAT-GA
1 TAAAATC-AGTTATGAGATTATAAAACC-TTTTAAAGCGAGTAATTA-GATTTTAAAGGCATAG-
* * * * ** *
22347 GTAACTATAAATGGACTTTTCTCG-TCAATGAATGGCTTCTTCTTTAGGTTT-TCCAAGACAGAC
62 GT-ACTATAAATGGACTTTTCTTGCT-AATGAAT-GCTTTTTCTTCACGTTTCT-TGAGAAAGAC
* * * * * * ** * *
22410 TTTCAATTATAGTCTGTTTTAACAAAAAATGTAAAAAGGTTTTACA
123 ATTCAATTAGAATCTATTTTCACCAAAAACATAAAAA-ATTTAACA
* * * * * * * * *
22456 TAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTAAAAGTGAGTAATAAGGCTTTCAAAGACATGGGTT
1 TAAAATCAGTTATGAGATTATAAAACCTTTTAAAGCGAGTAATTA-GATTTTAAAGGCATAGG-T
* * * * ** *
22521 ATTATAAATGGACTTTTCTCGCTAATGAATGTCTTCTTCCTT-ATGTTTAC-CAAGGCAA-ACAT
64 ACTATAAATGGACTTTTCTTGCTAATGAATG-CTT-TTTCTTCACGTTT-CTTGA-GAAAGACAT
* * * * * ** *
22583 TCAATTATAGTCTGTTTTAACAAAAAATGTAAAACAATTTAACC
125 TCAATTAGAATCTATTTTCACCAAAAACATAAAA-AATTTAACA
* * * * * * * * * *
22627 TAAAATTAATTATGAGATTATAAAACCATTAAAAGTGATTAATAAGGTTTTCAAAGGCACGAGTT
1 TAAAATCAGTTATGAGATTATAAAACCTTTTAAAGCGAGTAATTAGATTTT-AAAGGCA-TAGGT
* * * * *
22692 ACTATAAATGTACTTTTGTTGCCAATG-ATAGCCTTTTTTTTCACGTTT-TTTAGGTAAA-A-AT
64 ACTATAAATGGACTTTTCTTGCTAATGAAT-G-CTTTTTCTTCACGTTTCTTGA-G-AAAGACAT
* * * *
22753 TCAATTATAAT-TGATTTTCACCAAAAAAAATAAAAAATTCAACT
125 TCAATTAGAATCT-ATTTTCACC-AAAAACATAAAAAATTTAACA
* * * * * *** * *
22797 TAAAA-AAG-TATGAGATTATAAAACCATTTAAAGTGAGTAATAAGGCTTCCGAAGGCTTGGGTG
1 TAAAATCAGTTATGAGATTATAAAACCTTTTAAAGCGAGTAATTA-GATTTTAAAGGCATAGGT-
* * * * *** *
22860 ATTATAAATGGACCTTTCTTGAC-AATGAATGGTTGTTTCTTCACATTTTCCAAAGTAA-ACATT
64 ACTATAAATGGACTTTTCTTG-CTAATGAATGCTT-TTTCTTCAC-GTTTCTTGAGAAAGACATT
* * * * * *
22923 CAATTATAATCT-GTTTAACCAAAAATATAAAAACTTTCAACC
126 CAATTAGAATCTATTTTCACCAAAAACATAAAAAATTT-AACA
* * * * *
22965 TAAAATCAATTATGAGATTATAAAA-TTATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTGAAGGCATGGGT
1 TAAAATCAGTTATGAGATTATAAAACCT-TTTAAAGCGAGTAATTA-GATTTTAAAGGCATAGGT
* * * ** * * **
23029 AACTACAAACGGACTTTTCTAGCTAATGAATG-TTTTT-TTCTTTGTGTTCCTAAGGTAGACATT
64 -ACTATAAATGGACTTTTCTTGCTAATGAATGCTTTTTCTTC-ACGT-TTCTTGAGAAAGACATT
* * * * * * ** ** * * *
23092 TAATAATAATTTGTTTTAATAAAAAATGTAGAAAAACTCAACC
126 CAATTAGAATCTATTTTCACCAAAAACATA-AAAAATTTAACA
* * * * * * * * * *
23135 CAAAATCAATTACGACATTATAAAATCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCAAAAGCAT-GAGT
1 TAAAATCAGTTATGAGATTATAAAACCTTTTAAAGCGAGTAATTA-GATTTTAAAGGCATAG-GT
* * **
23199 AACTATAAATGGACTTTTATTGCCAATG-ATAGCCTTTTTCTTCACGATTT-TTGAGGTAGACAT
64 -ACTATAAATGGACTTTTCTTGCTAATGAAT-G-CTTTTTCTTCACG-TTTCTTGAGAAAGACAT
* * * ** * *
23262 TCAATTATAATCTGTTTTCACAAAAAATGTAAAACATTTAACT
125 TCAATTAGAATCTATTTTCACCAAAAACATAAAAAATTTAACA
* * * * * * * * * * *
23305 TAAAATCAATTATAAGATTATAAAACCATGTAAAGCGCGTAGTAAGACTTTCAAAGGTATGGGGG
1 TAAAATCAGTTATGAGATTATAAAACCTTTTAAAGCGAGTAATTAGA-TTTTAAAGGCAT-AGGT
* * * *** ***
23370 ACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATAGCTATTTCTTCATGTTTCCCAAGGTGGACATTCA
64 ACTATAAATGGACTTTTCTTGCTAATGAAT-GCTTTTTCTTCACGTTTCTTGAGAAAGACATTCA
* * * * **
23435 ATTATAATCTTTTTTAACTAAAAATGTAAAAATATTTAACA
128 ATTAGAATCTATTTTCACCAAAAACATAAAAA-ATTTAACA
* * * ** * * *
23476 TAAAATCAATTACGAGATTATAAAATCACTTAAAGTGAGTAATTACGATTTTGAAGGCATAAGTA
1 TAAAATCAGTTATGAGATTATAAAACCTTTTAAAGCGAGTAATTA-GATTTTAAAGGCATAGGT-
** * * * * *** * *
23541 ACT-TAAATAAACTTTTGTTGCCAATGAATAGCCTTTTCTTCATGTTTCCCAAGACAGATATTCA
64 ACTATAAATGGACTTTTCTTGCTAATGAAT-GCTTTTTCTTCACGTTTCTTGAGAAAGACATTCA
* * * ** *
23605 ATTATAATTTATTTT-AACAAAAATTTTAAAAAAACTTAATC-
128 ATTAGAATCTATTTTCACCAAAAA-CAT-AAAAAATTTAA-CA
* * * * * * * *
23646 TAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGAAATGAGGCTTTCAAAGGC-TCGAGT
1 TAAAATCAGTTATGAGATTATAAAACCTTTTAAAGCGAGTAATTA-GATTTTAAAGGCATAG-GT
* * * *** *
23710 GACTAGAAATGGACTTTTCTTGCTAATAAATAGCTTTTTCTTCATGTTTCCCAATG-AAGGCATT
64 -ACTATAAATGGACTTTTCTTGCTAATGAAT-GCTTTTTCTTCACGTTTCTTGA-GAAAGACATT
* * * *
23774 CAATTATAATCTATTTTAACTAAAAACAT-AAAAATTTCAACC
126 CAATTAGAATCTATTTTCACCAAAAACATAAAAAATTT-AACA
* * * *
23816 TAAAATCAATTATGGGATTATAAAA-CTATTTAAAGCGAGTAATTAGGATTTTGAAA-GAATGGG
1 TAAAATCAGTTATGAGATTATAAAACCT-TTTAAAGCGAGTAATTA-GATTTT-AAAGGCATAGG
* * ** * * **
23879 TAACTATAAATGAACTTTTC-TGACCAATGAATGGCTTTTTCTTCTTGTTTCCTAAGGCAGACAT
63 T-ACTATAAATGGACTTTTCTTG-CTAATGAAT-GCTTTTTCTTCACGTTTCTTGAGAAAGACAT
* * * * * ** *
23943 TCAATAATAATTTGTTTT-AGCCAAACATGTAAAAAAATTTAACC
125 TCAATTAGAATCTATTTTCA-CCAAAAACAT-AAAAAATTTAACA
* * * * * *
23987 TAAAATCAATTATGATATTATAAAA-TTATTTTAAGCGAGTAATTAGGCTTTTGAAGGCAT-GTG
1 TAAAATCAGTTATGAGATTATAAAACCT-TTTAAAGCGAGTAATTA-GATTTTAAAGGCATAG-G
* ** * *
24050 TAACTATAAATGGACCTTTCTTGCCGATGAATAGCTTTTTCTTCATGTTTCCTGAGGTAAAG--A
63 T-ACTATAAATGGACTTTTCTTGCTAATGAAT-GCTTTTTCTTCACGTTTCTTGA-G-AAAGACA
* * ** * * ** * *
24113 TTTAATTATAATCCGTTTTAACCTAAAATGT-AAAAATTCAACC
124 TTCAATTAGAATCTATTTTCACCAAAAACATAAAAAATTTAACA
* * * * * * * *
24156 TAAAATCAATTATGAGATTTTAAAATCATTTAAAGCGAGTAATTAGGTTTTCGAACGCATTGGTG
1 TAAAATCAGTTATGAGATTATAAAACCTTTTAAAGCGAGTAATTAGATTTT-AAAGGCATAGGT-
* * ** * *
24221 A-TCAGAAATGGACTTTTCTTACCCATGAAAGGCTTTTTCTTCATGTTT
64 ACT-ATAAATGGACTTTTCTTGCTAATG-AATGCTTTTTCTTCACGTTT
24269 NNNNNNNNNN
Statistics
Matches: 3894, Mismatches: 906, Indels: 459
0.74 0.17 0.09
Matches are distributed among these distances:
147 6 0.00
148 3 0.00
149 2 0.00
150 17 0.00
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155 6 0.00
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157 3 0.00
161 15 0.00
164 6 0.00
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174 3 0.00
175 8 0.00
ACGTcount: A:0.38, C:0.13, G:0.14, T:0.35
Consensus pattern (167 bp):
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TATAAATGGACTTTTCTTGCTAATGAATGCTTTTTCTTCACGTTTCTTGAGAAAGACATTCAATT
AGAATCTATTTTCACCAAAAACATAAAAAATTTAACA
Found at i:19928 original size:342 final size:340
Alignment explanation
Indices: 19035--31081 Score: 4579
Period size: 340 Copynumber: 35.1 Consensus size: 340
19025 NNNNNNNNNN
* ** * * *
19035 ATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATTCAATTTAAAATTAATTATGAGATTTTAAAGCCATT
1 ATCTGTTTTAACTAAAAATGT-AAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATT
* * ** * **
19100 T-AAAGTGACTAATTAGGATTTTGAAGGCATGGGTAACTACGAATGGACTTTTCTAGGGAATGAA
65 TAAAACT-AGTAATTAGGATTTTGAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAA
* * * * * * * *
19164 TGCCTTTTTCTTCGTGTTTCCTAAGGCAAACATTCAATAATAAT-TGGTTTTCACTAATAATGTA
129 TGGCTTTTTCTTCATGTTTTCTAAGGCAGACATTCAATTATAATCT-GTTTTAACAAAAAATGTA
* *
19228 AAAAATTCAACATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTA-GACTTTC
193 AAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGA-TTTT
* * * * * * * *
19292 AAATGCTTGGGTGACTAGAAATGGACTTTTCTTGCTAATGAATGGCTTTTT-TTCATG-TTTCTT
257 GAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATAGCTTTTTCTTCATGTTTTC-C
* * * *
19355 GAGGCAGATATTGAATTATA
321 AAGGTAGACATTCAATTATA
** * * * **
19375 ATCTGTTTTCGCTAAAAATGTAAAAAATTTAACTTAAAATCGATTATGAGATTATAAAAATATTT
1 ATCTGTTTTAACTAAAAATGTAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTT
* ** * * * * * * *
19440 AAAGCGCGTAATAAGGCTTTTAAAGGCATGAGCT-ACAATAAATAGACTTTTCTTGCTAATGAAT
66 AAAACTAGTAATTAGGATTTTGAAGGCATG-GGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAAT
* * * * ** * * * *
19504 GCCTTTTTCTTTACG-TTTCTTGAGAAAGACATTCAATTAGAATCTATTTTCACCAAAAACAT-A
130 GGCTTTTTCTTCATGTTTTC-TAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTT-AACAAAAA-ATGT
* * * * * **
19567 AAAAAATTTAACATAAAATCAGTTACGAGATTATAAAACCTTTTAAAGCGAGTAATTACTATTTT
192 AAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGATTTT
* * * *
19632 GAAGGCATAGGTAACTATAAATGGATTTTTCTTACCAATGAATAGATTTTTCTTCATGTTTTCCA
257 GAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATAGCTTTTTCTTCATGTTTTCCA
* * *
19697 AGGCAAACATTAAATTATA
322 AGGTAGACATTCAATTATA
* * * *
19716 ATCTGTTTTAACTAAAAATGTAAACAAATTCAACCTAAAGTAAATTATGAGATTATAAAGCTATT
1 ATCTGTTTTAACTAAAAATGTAAA-AAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATT
* * ** * * * *
19781 TAAAAACTA-TAATTTGGATTTTGAAGGTATGCCTAACTATAAACGAACTTTTCTAGTCAATGAA
65 T-AAAACTAGTAATTAGGATTTTGAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAA
* * **
19845 TGGCTTCTTCTTCATGTTTTCTAAGGTAGACATTCAACAATAAT-TGGTTTTAACAAAAAATGCT
129 TGGCTTTTTCTTCATGTTTTCTAAGGCAGACATTCAATTATAATCT-GTTTTAACAAAAAATG-T
* * ********** * * * *
19909 GAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGGGANNNNNNNNNNATTTAAAGTGAGTAATAAGGCTTTC
192 AAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGATTTT
* * *
19974 GATA-GCATGGGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAAT-AACAACCTTTTTCTT--TGTATTT
257 GA-AGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAA-TAGCTTTTTCTTCATGT-TTT
** * **
20035 CTTTAGGCA-ATCATTTGATTATA
319 C-CAAGGTAGA-CATTCAATTATA
* * * **
20058 ATTTGTTTTAACTAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATTAATTATGACATTATAAAACTGTT
1 ATCTGTTTTAACTAAAAATGT-AAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATT
* * * * * * *
20123 T-AAAGTGAGTAATTACGTTTTTGAAGGCATGGGCAACTTTAAATGGACCTTTCTTGTCAATGAA
65 TAAAACT-AGTAATTAGGATTTTGAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAA
** * * *
20187 TGATTTTTTCTTCATG-TTTCTTAAGGCAGTCATTCAATTATAATCTATTTTAACTAAAAATGTA
129 TGGCTTTTTCTTCATGTTTTC-TAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACAAAAAATGT-
* *
20251 AAAAAATTCAACCTAAAATCAACTATGACATTAT------A---AAA-C-------T---ATTTT
192 AAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGATTTT
* * * * * * *
20296 AAAGGCATGAGTAACTATAAATGAAAC-TTTCTTACCAATGAATGGCTTTTTCTTCACGTTTCTT
257 GAAGGCATGGGTAACTATAAATG-GACTTTTCTTGCCAATGAATAGCTTTTTCTTCATGTTT-TC
* * *
20360 GAA-GTAGACCTTCAATTGTA
320 CAAGGTAGACATTCAATTATA
* * *
20380 ATATGTTTTAACTAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGGTTATAAGACCATT
1 ATCTGTTTTAACTAAAAATGT-AAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATT
* * * * * * * * * * *
20445 TAAAGCAAGTAGTTAGGCTTTCGAATGCTTGGGTAACTAGAAATGGACTTTTCCTACAAATGAAT
65 TAAAACTAGTAATTAGGATTTTGAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAAT
* * ** * * *
20510 AGTTTTTTCTTCA-CATTTCATGAGGCAGATATTCAATTATAATCTGTTTTAGCAAAAAATGT-A
130 GGCTTTTTCTTCATGTTTTC-TAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACAAAAAATGTAA
** ** * * * * **
20573 AAAATTCAAGTTAAAATTGATTATGAGATTATAAAAACATTTAAAGCGTGCAA-TAAGACTTTCA
194 AAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGA-TTTTG
* * * * * * ** *
20637 AAGGTATGGGTGACTATAAATGAACTTTTGC-TACAAACGAATA-CTTTTTTCTTCACCTTTCCC
258 AAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTT-CTTGCCAATGAATAGC-TTTTTCTTCATGTTTTCC
*
20700 AAGGAAGACATTCAATTATA
321 AAGGTAGACATTCAATTATA
* * * * * * * *
20720 ATTTGTTTTCACCAAAAACGTAAAAAAATCTAACATAAAATCAGTTATGAGATTATAAAACCTTT
1 ATCTGTTTTAACTAAAAATGTAAAAAATTC-AACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATT
* * * * * *
20785 TAAAGCGAGTAATTACGATTTTGAAGGCATGGG------TAAATGGATTTTTCTTGCTAATAAAT
65 TAAAACTAGTAATTAGGATTTTGAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAAT
* * * * * *
20844 AGATTTTTCTTCATGTTTCCTAAGGCAGACATTCAATTTTAATCTGTTTTAACCAAAAGTGTAAA
130 GGCTTTTTCTTCATGTTTTCTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACAAAAAATGTAAA
* ** ** * * * *
20909 GAGATTCAATGTAAAAAAAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAGCGACTAATTAAGATTTTCA
195 -AAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGATTTTGA
* * * * *
20974 AAGCATGGGTAACTATAAATAGACTTTTCTAGCCAATGAATGGCTTTTTCTTCATGTTTCCCAA-
259 AGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATAGCTTTTTCTTCATGTTTTCCAAG
* *
21038 GTCAGACAATCAATAATA
324 GT-AGACATTCAATTATA
* ***********
21056 ATTTGTTTTAACTAAAAATGTAAAAATATTCAACCTAAAATTNNNNNNNNNNTTATAAAACCATT
1 ATCTGTTTTAACTAAAAATGTAAAAA-ATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATT
* * * ** ** *
21121 TAAAGCGAGTAA-TAAGACTTTCAAAGTAATGGGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATG-A
65 TAAAACTAGTAATTAGGA-TTTTGAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAA
* * ** * * * * * *
21184 TAGCCTCTTTCTTCA-CATTTCTTTAGGCAGTCATTCGATTAGAATTTGTTTTAACAAAAGATGT
129 T-GGCTTTTTCTTCATGTTTTC-TAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACAAAAAATGT
* * * *
21248 AAAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGACATTATAAAACTATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTT
192 -AAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGATTT
* * ** * **
21313 TGAAGGCATGGGTGACTATAAATGGACTTTTCTTACCACCGAATACCTTTTTCTTCACATTTTCC
256 TGAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATAGCTTTTTCTTCATGTTTTCC
*
21378 AAGGTAGACAATCAATTATA
321 AAGGTAGACATTCAATTATA
* * * * * *
21398 ATCAGTTTTAACCAAAAGTGTAAAAAAATTCAATCTAAAATAAATTATGAGATTATAAAGCCATT
1 ATCTGTTTTAACTAAAAATGT-AAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATT
* * * * *
21463 T-AAAGTGACTAATTAGGATTTTGAA-GCATTGGGTAACTACAAATGGACTTTTCTAGCCAATTA
65 TAAAACT-AGTAATTAGGATTTTGAAGGCA-TGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGA
* * * * * * * *
21526 AT-GCTTTTTTTTTTATGTTTCCCAAGGCAGACATTCAATAATAATTTGTTTTCACTAAAAATGT
128 ATGGC-TTTTTCTTCATGTTTTCTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACAAAAAATGT
** * * * *
21590 AAAAAATTCAATATAAAATTAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAATTAGGCTTTC
192 AAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGATTTT
* * * * * * * * *
21655 GAATGCTTGGGTGACTAGAAATGGGCTTTTCCTGCAAATGAA-AGGGTTTTTCTTCA-CTTTTCT
257 GAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATA-GCTTTTTCTTCATGTTTTC-
** * *
21718 TGAGGTAGATATACAATTATA
320 CAAGGTAGACATTCAATTATA
* * * * ** * * *
21739 ATCTATTTTAGCCAAAATTGTAAAACCTTCAACGTAAAATGAATTATGAGATTATAAAAACATTT
1 ATCTGTTTTAACTAAAAATGTAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTT
* ** * * ** * * * *
21804 AAAGCGCGTAATAAGGCTTTCAAAGACATGGGTGACTATAAATAGA-ATTTCTTGCC-ATCGAAT
66 AAAACTAGTAATTAGGATTTTGAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAAT-GAAT
** * * * * * * *
21867 ACCTTTTTCTTCACG-TTTCTCGAGGCAAACATTCAATTATAATTTGTTTTCACCAAAAATGAAA
130 GGCTTTTTCTTCATGTTTTCT-AAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACAAAAAATG-TA
* * * * * * * *
21931 AAAAATTTAACATAAAATGAATTACGAGATAATAAAACCATTTAAAACAAGTAATTACGATTTTG
193 AAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGATTTTG
* * * * *
21996 AACGCATGGGTAACTATAAATGAACTTTTCTTGCCAATGAATAGATTTCTCTTCATGTTTCCCAA
258 AAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATAGCTTTTTCTTCATGTTTTCCAA
*
22061 GGCAGACATTCAATTATA
323 GGTAGACATTCAATTATA
* * * ***
22079 ATTTGTTTTAAAC-AAAAGTGTAAAAAAATTTAGTATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCAT
1 ATCTGTTTT-AACTAAAAATGT-AAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCAT
* * * * * ** * * * * *
22143 TTAAAGCAAGCAATAAGGCTTTCAAATGTATGGGTGACTAGAAATGGACTTTTATTGCCAATG-A
64 TTAAAACTAGTAATTAGGATTTTGAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAA
* * * *
22207 TAGCCTTTTTCTTCATG-TTTCTTAAGGCACACATTCAATTATAATCTATTTTAACCAAAAATGT
129 T-GGCTTTTTCTTCATGTTTTC-TAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACAAAAAATGT
* * * * *
22271 AAAAAACTTCAACCTAAAATCTATTATGACATCATAAAACCATTTTAAGCGAGTAATTAGGCTTT
192 AAAAAA-TTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGATTT
* * * * * * * *
22336 TGAAGGTATGAGTAACTATAAATGGACTTTTCTCGTCAATGAATGGCTTCTTCTTTAGGTTTTCC
256 TGAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATAGCTTTTTCTTCATGTTTTCC
** *
22401 AAGACAGACTTTCAATTATA
321 AAGGTAGACATTCAATTATA
* * * ** *
22421 GTCTGTTTTAACAAAAAATGTAAAAAGGTTTTACATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCA-T
1 ATCTGTTTTAACTAAAAATGTAAAAA-ATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATT
* * * ** * * * * *
22485 TAAAAGTGAGTAATAAGGCTTTCAAAGACATGGGTTATTATAAATGGACTTTTCTCGCTAATGAA
65 TAAAACT-AGTAATTAGGATTTTGAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAA
* * * * * *
22550 TGTCTTCTTCCTT-ATGTTTACCAAGGCAAACATTCAATTATAGTCTGTTTTAACAAAAAATGTA
129 TGGCTT-TTTCTTCATGTTTTCTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACAAAAAATGTA
* * * * * *
22614 AAACAATTTAACCTAAAATTAATTATGAGATTATAAAACCATTAAAAGTGATTAATAAGG-TTTT
193 AAA-AATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGATTTT
* * * * * * * *
22678 CAAAGGCACGAGTTACTATAAATGTACTTTTGTTGCCAATG-ATAGCCTTTTTTTTCACGTTTT-
257 -GAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATAG-CTTTTTCTTCATGTTTTC
** * *
22741 TTAGGTAAAAATTCAATTATA
320 CAAGGTAGACATTCAATTATA
* * ** * *
22762 AT-TGATTTTCACCAAAAAAAATAAAAAATTCAACTTAAAA--AAGTATGAGATTATAAAACCAT
1 ATCTG-TTTT-AACTAAAAATGTAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCAT
* * * ** * * * * *
22824 TT-AAAGTGAGTAATAAGGCTTCCGAAGGCTTGGGTGATTATAAATGGACCTTTCTTGACAATGA
64 TTAAAACT-AGTAATTAGGATTTTGAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGA
** * * * * * *
22888 ATGG-TTGTTTCTTCACATTTTCCAAAGTAAACATTCAATTATAATCTG-TTTAACCAAAAATAT
128 ATGGCTT-TTTCTTCATGTTTTCTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACAAAAAATGT
* ** *
22951 AAAAACTTTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAATTATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTT
192 AAAAA-ATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGATTT
* * * * * *
23016 TGAAGGCATGGGTAACTACAAACGGACTTTTCTAGCTAATGAAT-G-TTTTT-TTCTTTGTGTTC
256 TGAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATAGCTTTTTCTTC-ATGTTTTC
* *
23078 CTAAGGTAGACATTTAATAATA
320 C-AAGGTAGACATTCAATTATA
* * * * * *
23100 ATTTGTTTTAA-TAAAAAATGTAGAAAAACTCAACCCAAAATCAATTACGACATTATAAAATCAT
1 ATCTGTTTTAACT-AAAAATGTA-AAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCAT
* * * * ** * * *
23164 TTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCAAAAGCATGAGTAACTATAAATGGACTTTTATTGCCAATG-A
64 TTAAAACTAGTAATTAGGATTTTGAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAA
* * * * *
23228 TAGCCTTTTTCTTCACGATTTT-TGAGGTAGACATTCAATTATAATCTGTTTTCACAAAAAATGT
129 T-GGCTTTTTCTTCATG-TTTTCTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACAAAAAATGT
* * * * * * * *
23292 AAAACATTTAACTTAAAATCAATTATAAGATTATAAAACCATGTAAAGCGCGT-AGTAAGACTTT
192 AAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGA-TTT
** * ** * *
23356 CAAAGGTATGGGGGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATAGCTATTTCTTCATGTTTCCC
256 TGAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATAGCTTTTTCTTCATGTTTTCC
*
23421 AAGGTGGACATTCAATTATA
321 AAGGTAGACATTCAATTATA
* * * * * *
23441 ATCTTTTTTAACTAAAAATGTAAAAATATTTAACATAAAATCAATTACGAGATTATAAAATCACT
1 ATCTGTTTTAACTAAAAATGTAAAAA-ATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATT
* * ** ** *
23506 T-AAAGTGAGTAATTACGATTTTGAAGGCATAAGTAACT-TAAATAAACTTTTGTTGCCAATGAA
65 TAAAACT-AGTAATTAGGATTTTGAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAA
* * * * * * * * * *
23569 TAGCCTTTTCTTCATGTTTCCCAAGACAGATATTCAATTATAATTTATTTTAACAAAAATTTTAA
129 TGGCTTTTTCTTCATGTTTTCTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACAAAAAATGT-A
* * * * * *
23634 AAAAACTT-AATCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGAAATGAGGCTTTC
193 AAAAA-TTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGATTTT
* * * * * * *
23698 AAAGGC-TCGAGTGACTAGAAATGGACTTTTCTTGCTAATAAATAGCTTTTTCTTCATGTTTCCC
257 GAAGGCAT-GGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATAGCTTTTTCTTCATGTTTTCC
* * *
23762 AATGAAGGCATTCAATTATA
321 AAGGTAGACATTCAATTATA
* ** * * *
23782 ATCTATTTTAACTAAAAACATAAAAATTTCAACCTAAAATCAATTATGGGATTATAAAACTATTT
1 ATCTGTTTTAACTAAAAATGTAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTT
* * * * *
23847 AAAGCGAGTAATTAGGATTTTGAAAGAATGGGTAACTATAAATGAACTTTTC-TGACCAATGAAT
66 AAAACTAGTAATTAGGATTTTGAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTG-CCAATGAAT
* * * * * * *
23911 GGCTTTTTCTTCTTGTTTCCTAAGGCAGACATTCAATAATAATTTGTTTTAGCCAAACATGTAAA
130 GGCTTTTTCTTCATGTTTTCTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACAAAAAATGT-AA
* * ** * *
23976 AAAATTTAACCTAAAATCAATTATGATATTATAAAATTATTTTAAGCGAGTAATTAGGCTTTTGA
194 AAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGATTTTGA
* * * *
24041 AGGCATGTGTAACTATAAATGGACCTTTCTTGCCGATGAATAGCTTTTTCTTCATG-TTTCCTGA
259 AGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATAGCTTTTTCTTCATGTTTTCC-AA
* * *
24105 GGTAAAGATTTAATTATA
323 GGTAGACATTCAATTATA
* * *
24123 ATCCGTTTTAACCT-AAAATGT-AAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTTTAAAATCATT
1 ATCTGTTTTAA-CTAAAAATGTAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATT
* * * * * * * *
24186 TAAAGCGAGTAATTAGG-TTTTCGAACGCATTGGTGA-TCAGAAATGGACTTTTCTTACCCATGA
65 TAAAACTAGTAATTAGGATTTT-GAAGGCATGGGTAACT-ATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGA
* ********* * * * * *
24249 AAGGCTTTTTCTTCATGTTTNNNNNNNNNNG-TATTGAATTATAATCTATTTTAGCCAAAAATGT
128 ATGGCTTTTTCTTCATGTTT-TCTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACAAAAAATGT
* ** * ** * * * * * *
24313 AAAAAATTTAATTTAAAATTAATTATGAGATTATAAAAATATTTAAATCGCGTGATAAGGCTTTC
192 AAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGATTTT
* * * * ** *
24378 AAAGGCATGGGTGACTATAAACGGACTTTTCTTACCACCGAATA-CTTTTTTTTTCATG-TTTCC
257 GAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATAGC-TTTTTCTTCATGTTTTCC
24441 TAAGGTAGACATTCAAAGTATAGGTA
321 -AAGGTAGACATTC-AA-T-TA--TA
* * ** ***** ***** *** ** *
24467 AT-TATAAATGGACTTTTCTTGTCAATGAAGAGATTTGTTTTCATGTTTCCCAAGGCA-GACATT
1 ATCTGT--TTTAACTAAAAATGT-AA--AA-A-ATTCAACCT-A-AAAT--CAA-TTATGAGATT
* * ** * ** * ** * * * *** *
24530 CAATTATAA-TATGTTTTAACCAAAAATACAAAAATATTCAA--CCTAAAATCAATTATGAGATT
54 --A-TAAAACCAT-TTAAAACTAGTAAT--TAGGATTTTGAAGGCAT-GGGT-AACTAT-A-A--
** * **** * * * * * * * * ** *
24592 ATAAAACCATTTAAAACGAGT-AATTAGCCTTTTGAATACTTGGGTGACTAGAAATGG-ATATTT
107 AT-GGA-CTTTTCTTGCCAATGAA-TGGCTTTTT--CTTCAT-GTTTTCT---AA-GGCAGA---
* * * * ***** * * * * * ** *
24655 CTTTCCAATGACTCA-CT-TTTCTCCACATTGCTTGATGCAGATATTGAA--TGATAATCTGTTT
159 CATT-CAATTA-TAATCTGTTT-T-AACAAAAAATG-T-AAAAAATTCAACCT-AAAATCAATTA
* * * * ** * * * * ** *
24716 TAGCCAAAAATGTAGAAAATTCAAATTAAAATTG-GTTATGA-GATTATAAAAACAT--TTAAAG
217 T-G----AGAT-TATAAAA--C-CATTTAAAGCGAGTAATTAGGATTTTGAAGGCATGGGT-AA-
** * * * * * ** * ** ** *** * *
24777 CGCGT-AATAAGAC---T-TT-CAAAGGCATAGGTGATTGTAAATGGACTTTTCTTATCAACAAA
271 C-TATAAAT-GGACTTTTCTTGCCAATGAATAGCTTTTTCTTCAT-G--TTTTCCAAGGTAGACA
** * *
24836 TTCCTTTTTC
331 TTCAATTATA
* * ** * * * * * ** ** * **
24846 CTCACG-TTT--C--ATGA-GGAAGACATTCAA-TTATAATCTGTTTTCACCAAAAACATAAAAA
1 ATC-TGTTTTAACTAAAAATGTAAAAAATTCAACCTAAAATC--AATT-A-TGAGATTAT-AAAA
** * * * * ** * * ** *
24904 AAATTTAACA-TA-AAATCGAGTGCGATATTATAAAACCAT--TTAAAGCGAGTAGTTACGA-TT
60 CCATTTAAAACTAGTAAT-TA--G-GAT-TT-TGAAGGCATGGGT-AA-CTA-TAAAT-GGACTT
*** * * ** * *** ** * * ** * * **
24964 TTGAAGGC-ATGAGTAACTATAAATAGAT-TTTTCT-TGCCAATGA-ATAGATTTTTCTTCCTGT
115 TTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCTTCATGTTTTCTAAGGC-A-GACATTCAATTATAAT-CTGT
*
25025 TTCCCAAGGCAGACATTTAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAGTGTAAAAAAATTCAACCTAAAA
177 TT-------TA-ACA---AA--A-AA--TG---T-------A------AAAAATTCAACCTAAAA
* * *
25090 TCAATTATGAGATTATAAAGA-CATTTAAAGTC-ACTAATTAGAATTTTGAAGGCGTGGGTAACT
210 TCAATTATGAGATTATAAA-ACCATTTAAAG-CGAGTAATTAGGATTTTGAAGGCATGGGTAACT
* * * * * * *
25153 ACAAATAGACTTTTCTAGCCAATGAAT-GCTTTTTTCTTCGTG-TTTCCCAGGACAGACATTTAA
273 ATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATAGC-TTTTTCTTCATGTTTTCCAAGG-TAGACATTCAA
*
25216 TAATA
336 TTATA
* *
25221 AT-TAGTTTTCACTAAAAATGTAAAAAATTCAACATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATT
1 ATCT-GTTTTAACTAAAAATGTAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATT
* * * * * * * * * * *
25285 T-AAAGTGAGTAATTAGGCTTTCGAATGCTTGGGTGACTAGAAATAGACTTTTCCTACAAATGAA
65 TAAAACT-AGTAATTAGGATTTTGAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAA
* * * * * * * * **
25349 TGGCTTTTTTTTCACG-TTTCTTGAGGTAGATATTCAATTATAATCTGTATTAGCTAAAAATACA
129 TGGCTTTTTCTTCATGTTTTC-TAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACAAAAAATGTA
* * ** * * * * **
25413 AAAAATTCAACTTAAAGTTGATTATGAGATTATAAAAACATTTAAAGCGCGTAATAAGGCTTCCG
193 AAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGATTTTG
* * * *
25478 AAGGCATGGGTGACTATAAATGGAGTTTTCTTGCCAACGAAT-GCCTTTCTCTTCATG-TTTCTC
258 AAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATAG-CTTTTTCTTCATGTTTTC-C
** *
25541 AAGAAAAACATTCAATTATA
321 AAGGTAGACATTCAATTATA
* * * * **
25561 ATCTGCTTTCAA-TAAAAACGTTAAAAAATTTAACATAAAATCAATTACAAGATTATAAAACCAT
1 ATCTG-TTTTAACTAAAAATG-TAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCAT
* * * ** * *
25625 TT-AAAGTGAGCAATTACGATTTTGAAGGCATGGGTAACTACGAATGGATTTTTCTTACCAATGA
64 TTAAAACT-AGTAATTAGGATTTTGAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGA
* * * * **
25689 ATAGATTTTTCTTCAT-TTTTCCCAAGGTAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAATTAAAAATGT
128 ATGGCTTTTTCTTCATGTTTT-CTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACAAAAAATGT
* * * * * * * **
25753 AAAATATTCAACATAAAATAAATTATGAGATTATAAAGCTATTTAAAGTGACTAATTACAATTTT
192 AAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGATTTT
* * * * * *
25818 GAAGGCATGGGTAACTATGAATAGACTTTT-TTAGCCTATGAAT-GACCTTTTCTTCAT-ATTTA
257 GAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTT-GCCAATGAATAG-CTTTTTCTTCATGTTTTC
* *
25880 CTAGGTCAGACATTCAATAATA
320 CAAGGT-AGACATTCAATTATA
* ** **
25902 AT-TAGTTTTCACTAATTATGTAAAAAATTCAAGATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATT
1 ATCT-GTTTTAACTAAAAATGTAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATT
* * * * * * * * * * * * *
25966 T-AAAGTGAGTAATTAGGCTTTCGAATGCTTAGGTTACTAGAAATGTACTTTCCCTACAAATGAA
65 TAAAACT-AGTAATTAGGATTTTGAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAA
* ** * * * *
26030 TGGTTTTTTCTTCGCG-TTTCTTAAGGTAGATATTCAATTATAATATGTTTTAACCAAAAATGTA
129 TGGCTTTTTCTTCATGTTTTC-TAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACAAAAAATGTA
* ** ** * * ** **
26094 AAAAATTCAACTTAAAATTGATTATGAGATTATAAAAATATTTAAAGCGCGTAATAAGCCTTTCA
193 AAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGATTTTG
* * * * *
26159 AAGGCATGGGTGACTAGAAATAGACTTTTCTTGCCAACGAAT-GCCTTTTTCTTC-TAG-TTTCA
258 AAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATAG-CTTTTTCTTCAT-GTTTTCC
*
26221 AAAGTAAGACATTCAATTATA
321 AAGGT-AGACATTCAATTATA
** ** * ** * * * * *
26242 ATCTAATTTCTCCAAAAACATAGAAAAATTTAACATCAAATCAATTA-CAGGATTATAAAATCAT
1 ATCTGTTTTAACTAAAAATGTA-AAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGA-GATTATAAAACCAT
* * * * * * * *
26306 TTAAAGCGAGTAATTACGAATATGAAGGCATGGGTAACTATAAATAGATTTTTCTTAG-TAATGA
64 TTAAAACTAGTAATTAGGATTTTGAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTT-GCCAATGA
* * * * * * *
26370 ATAGATTTTTCTTCATGTTTCCCAAGGCAGACTTTCAATTATAATATGTTTTCACCAAAAAA-GT
128 ATGGCTTTTTCTTCATGTTTTCTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTT-AACAAAAAATGT
* ** * * * * * * *
26434 AAAAGATTCAACGAAAAATAAATTATTAGATTATGAAGCTATTTAAAGTGACTAATTAGGATTTT
192 AAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGATTTT
* * * * * * * *
26499 GAAAGCATGGATAACTATGAATAGACTTTTTTTAGCCAATGAAT-GATCTTTTCTTCATATTTAC
257 GAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTT-GCCAATGAATAGCT-TTTTCTTCATGTTTTC
* *
26563 CAAGTTAGACATTCAATAATA
320 CAAGGTAGACATTCAATTATA
* * *
26584 ATTTGTTTTAACCAAAAATGTAAAACAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTTTAAAAACCAT
1 ATCTGTTTTAACTAAAAATGTAAAA-AATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTAT-AAAACCAT
* * * ** * * * * * *
26649 TTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTAAAATGCTTGGGTGACTAGAAATCGACTTTTCTTACCAATGAA
64 TTAAAACTAGTAATTAGGATTTTGAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAA
* * * * * *
26714 AGGCTTTTTCTTCATG-TTTCTTGAGGCAGATATTCAATGATAATCTATTTTAGTC-AAAAATGT
129 TGGCTTTTTCTTCATGTTTTC-TAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTA-ACAAAAAATGT
* * * * * * *
26777 AAAAAATTCAACTTAAAATTAATTACGAGATTATAAAAACGTTTAAAGCGCGTAATAAGG-TTTT
192 AAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGATTTT
* ** * * * *
26841 CAGAGGCATGGGTGGCTATAAATGGACTTTTCTTGCTACT-AATACCTTTTTCTTTATG-TTTCT
257 GA-AGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATAGCTTTTTCTTCATGTTTTC-
*
26904 CGAGGTAGACATTCAATTATA
320 CAAGGTAGACATTCAATTATA
* * * * ** * * *
26925 ATATGTTTTCA-TCAAAAACGTAAAACAAGTT-AACATAAAATCAATTACAAGATTACAAAGCTA
1 ATCTGTTTTAACT-AAAAATGTAAAA-AA-TTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCA
*** * * **
26988 TTTAAAGGGAGTAATTAGAATTTTAAAGGCATGGGTAACTATAAATAAACTTTTCTTGCCAATGA
63 TTTAAAACTAGTAATTAGGATTTTGAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGA
* * * * * * * * *
27053 ATCGATTTCTCATCATGTTTCCCAAGGCAGACATTCAATTATTATTTGTTTTAACCAAAAATGTA
128 ATGGCTTTTTCTTCATGTTTTCTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACAAAAAATGTA
* * *** *
27118 AACAAATTCAACGTAAAATCAATTATGAGATTATAAAGCCATTTAAAATAACTAATTAGGATTTT
193 AA-AAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGATTTT
* * * * *
27183 GACA-GCATGGGTAACCACAAATGGACTTTTCTAGCCAATGAAT-GCCTTTTTTTTTCATGTTTC
257 GA-AGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATAG-C-TTTTTCTTCATGTTTT
* * *
27246 CCAAGGCAGGCATTCAATAATA
319 CCAAGGTAGACATTCAATTATA
* * * * *
27268 AT-TGGTTTTCACTAAAAATGTAAAAAATTAAACATAAAATCAATTATAAGATTATAAAATCATT
1 ATCT-GTTTTAACTAAAAATGTAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATT
* * * * * * * *
27332 T-AAAGTGAGTAATTAGGCTTTAG-AGTGCTTGGGTGACTAGAAATGTACTTTT-TCTGCAAATG
65 TAAAACT-AGTAATTAGGATTTTGAAG-GCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCT-TGCCAATG
* * *
27394 AATGACTTTTTCTTCATG-TTTCTTAAGGCAGATATTCAATTATAATCTGTTTTAACAAACAATG
127 AATGGCTTTTTCTTCATGTTTTC-TAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACAAAAAATG
* ********** * * * *
27458 TAAAAAATTCAACTTAAAANNNNNNNNNNGATTATAAAAACATTTAAAGCGCGTAATAAGGCTTT
191 TAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGATTT
* * *
27523 CGAACGCATGGGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAACGAATGCCTTTTCTTGCCAATGAATG
256 TGAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTG-C--C-AA----------TG--AAT--A--
* * *
27588 GCTTTTTCTTTATG-TTTCCTAAGGTATACATTCGATTATA
301 GCTTTTTCTTCATGTTTTCC-AAGGTAGACATTCAATTATA
* * ********* * *
27628 ATCTATTTTAACCAAAAATNNNNNNNNNNTCAACCTAAAATCAGTTATGAGATTATAAAACCATG
1 ATCTGTTTTAACTAAAAAT-GTAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATT
* * * * * *
27693 TAAAGCGAGTAATTAGGGTTTTGAAGGCATAGGTAACTATAAATAGACTTTTCTTCCCAATGAAT
65 TAAAACTAGTAATTAGGATTTTGAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAAT
* * * * *
27758 GGTTTTTTCCTCAAG-TTTCTCAAGGTAGACATTCAATTATAATCTGCTTTAACAAAAAATGTAA
130 GGCTTTTTCTTCATGTTTTCT-AAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACAAAAAATGTAA
* * * * *
27822 ACAAATTAAACATAAAATCAATTATGAGATTATAAATCCATTTAAAGTGAGTAA-TAGGGATTTC
194 A-AAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTA-GGATTTT
* * * **
27886 GAAGGTATAGGTAACAATAAATAAACTTTTCTTGCCAATG-ATAGCCTTTCTT-TTCATG-TTTC
257 GAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATAG-CTTT-TTCTTCATGTTTTC
* * * *
27948 TTAAAGCAGATATTCAATTATA
320 -CAAGGTAGACATTCAATTATA
* * * **********************
27970 ATATGTTTTAACAAAAAATATAAAAAAATTCAACCT-AAA--ANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
1 ATCTGTTTTAACTAAAAATGT-AAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATT
*****************************************************************
28032 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
65 TAAAACTAGTAATTAGGATTTTGAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAAT
***************************************************** *
28097 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAAAATATAAA
130 GGCTTTTTCTTCATGTTTTCTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACAAAAAATGTAAA
* * * * * * * *
28162 AACATTTAACATAAAATCAATTATGAGAGTATAAAACCATTAAAAGTGAGTAATAAGG-CTTTCA
195 AA-ATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGATTTTGA
* * * * **
28226 AAGCTATGGGTTACTATAAATGTACTTTTCTTGCCAATG-ATAGCATTTTTCTTCACGTTTT-TT
259 AGGC-ATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATAGC-TTTTTCTTCATGTTTTCCA
* *
28289 AGGTAAAAATTCAATTATA
322 AGGTAGACATTCAATTATA
* ** ********************************************
28308 AGCCATTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
1 ATCTGTTT-------------TAACTAAAAATGTAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGAT
*****************************************************************
28373 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
53 TATAAAACCATTTAAAACTAGTAATTAGGATTTTGAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTC
******* * * * * * ** *
28438 NNNNNNNTGAATGG-TTTTTTTTC-TCATTTCCTAAAGTAGATGTTGAATTATAATCTG-TTTAA
118 TTGCCAATGAATGGCTTTTTCTTCAT-GTTTTCTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAA
* * * * *
28500 CCAAAAATGTAAAAGATTTCAACCTAAAATCAATTTTGAGATTTTAAAACCATTTAAAGCTAGTA
182 CAAAAAATGTAAAA-AATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTA
* * * * * * * * *
28565 ATTA-CACTTTCGATGGCATAGGTAACTACAAATAGACTTTTCTAGCTAATGAATGGCTTTTTCT
246 ATTAGGA-TTTTGAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATAGCTTTTTCT
* * *
28629 T--TGTGTTTCTCAAGATAAAACATTCAATAATA
310 TCATGT-TTTC-CAAGGT-AGACATTCAATTATA
* * * * * *
28661 ATTTATTTTAA-TAAAAAATGTAGAAAAACTCAACCCAAAATTAATTATGACATTATAAAACCAT
1 ATCTGTTTTAACT-AAAAATGTA-AAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCAT
* * * * ** * * * * *
28725 TTAAAGCAAGTAATAAGGCTTTCAAAGGTATGGGCAACTATAAATTGACTTTTATTGCTAATG-A
64 TTAAAACTAGTAATTAGGATTTTGAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAA
* * * * **
28789 TAGCCTTTTTCTTCACG-TTTCTTGAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTCATTAAAAATGT
129 T-GGCTTTTTCTTCATGTTTTC-TAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACAAAAAATGT
* * * * * * *
28853 AAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTAGAAAACCATTTAAAGCGCGTAATAAAGCTTTC
192 AAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGATTTT
* * * * * * *
28918 AAAGGTATGGGTGACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTATTTCTTCACG-TTTCCT
257 GAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATAGCTTTTTCTTCATGTTTTCC-
* * *
28982 AAGGTAAACATTTAAGTATA
321 AAGGTAGACATTCAATTATA
* * ** * * *
29002 ATCTGTTTTAACCAAAAATATAAAAATATTTTACATAAAATCAATTACGAGATTATAAAACTATT
1 ATCTGTTTTAACTAAAAATGTAAAAA-ATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATT
* * * * *
29067 T-AAAGTGAGTAATTATGATTTTGAAGGTATGGGTAACTATAAATGGACTTTTGTTGTCAATGAA
65 TAAAACT-AGTAATTAGGATTTTGAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAA
* * * * * * * * * * **
29131 TAGCCTTTTCTTTATGTTTCCCAAGGTAGATATTCAATTATAATTTGTTTGAACAAAAATTAAAA
129 TGGCTTTTTCTTCATGTTTTCTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACAAAAAATGTAA
* * * *
29196 AAAATTTAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTAAAAGCGAGTAATGAGGCTTTTGA
194 AAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGATTTTGA
* * * * * * * * *
29261 AGGCTTGAGTGACTAGAAATGAACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCTTCTTATTTTTCAAG
259 AGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATAGCTTTTTCTTCATGTTTTCCAAG
*
29326 GTAGACATTCAATAATA
324 GTAGACATTCAATTATA
* * * * *
29343 ATTTGTTTTAACCAAAAAATGTAAAAAAATTCAATCTAAAATCAATTATGACATTATAAAATCAT
1 ATCTGTTTTAA-CTAAAAATGT-AAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCAT
* * * * *
29408 TT-TAAGTGAGCAATCAGGCTTTTGAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACCTTTT-TTGCCAATG
64 TTAAAACT-AGTAATTAGGATTTTGAAGGCATGGGTAACTATAAATGGA-CTTTTCTTGCCAATG
* * * * *
29471 AATGGTTTTTTCTTCATGTTTTCTAAGGTAGACATTTAATTGTAAT-TCGTTTTAACCAAAAATG
127 AATGGCTTTTTCTTCATGTTTTCTAAGGCAGACATTCAATTATAATCT-GTTTTAACAAAAAATG
* **
29535 TAGGAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGTTAGTAATTA-GACT
191 TA-AAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGA-T
* * * * * * * * * *
29599 TTCGAATGCATGGGTGACCAGAAAGGGACTTTTCTTGCTAATAAATGGCTTTTTCTTCACG-TTT
254 TTTGAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATAGCTTTTTCTTCATGTTTT
** * * *
29663 CTTGAGGCAAATATTCAATTATA
319 C-CAAGGTAGACATTCAATTATA
* * * * *
29686 ATCTATTGTAA-TAAAAATGTTAAAAGTTCAACCTAAAATCTATTATGAGATTATAAAACCATTT
1 ATCTGTTTTAACTAAAAATGTAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTT
* * * * * * * * * *
29750 AAAGCGAGTAATTAGG-TTTTCCAATGCATGGGTGACCAAAAATAGACTTTTCTTACCAATTAAT
66 AAAACTAGTAATTAGGATTTT-GAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAAT
* ** * * * * *
29814 GGCTTTTTCTTTA-CATTTCTTAGGCAAATATTCAATTATAATGTGTTTTAATC-AAAAATATAA
130 GGCTTTTTCTTCATGTTTTCTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAA-CAAAAAATGTAA
* * * * * * * **
29877 AAAATTCAACTTAAAATCAATTATGATATTATAATACCATTTAAAGCGCGTAATAAAGCTTTCAA
194 AAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGATTTTGA
* * * * * *
29942 AGGTATGGGTGACTATAAATGGACTTTTCTTACCAATGAATAG-TTGTTTCTTTACG-TTTCTTA
259 AGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATAGCTT-TTTCTTCATGTTTTC-CA
*
30005 AGGTAAACATTCAATTATA
322 AGGTAGACATTCAATTATA
* * *
30024 ATC-GATTTTAA-TCAAAAATGTAAAACAATTTAACATAAAATCAATTACGAGATTATAAAACCA
1 ATCTG-TTTTAACT-AAAAATGTAAAA-AATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCA
* * * * * * * *
30087 TTTAAAGCTAGTAATTACGATTTTGAAGGCATTGGCAACTAAAAATGGACTTTTGTTGCTAGTGA
63 TTTAAAACTAGTAATTAGGATTTTGAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGA
* * * ** * **
30152 ATGGCCTTTTCTTCATGTTTCCTAAGGCAAACATTCAATTATAATCTGTTTTAATGAAAATTAAA
128 ATGGCTTTTTCTTCATGTTTTCTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACAAAAAATGTA
* * * *
30217 AAAAATTCAACCTAAAATCAATTATTAGATTATAAAACTATTTAAAGCGAGTAATTAAGCTTTTG
193 AAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGATTTTG
* * * * * * * * *
30282 AAAGTATGGGTAACTATTAATGGACTTTGCTTACTAATGAATGACCTTTTTC-TCAAG-TTTCTT
258 AAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAAT-AGCTTTTTCTTCATGTTTTC-C
* ** * *
30345 GAGACAGGCTTTCAATTATA
321 AAGGTAGACATTCAATTATA
* * *
30365 ATATGTTTTAAC-AAAACATATAAAAAATTCAACATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATT
1 ATCTGTTTTAACTAAAA-ATGTAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATT
* * * * * * * *
30429 T-AAAGTGAGTAATAAAGCTTTTAAAGGTATGAG-AGACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATG-
65 TAAAACT-AGTAATTAGGATTTTGAAGGCATGGGTA-ACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGA
* * * * *
30491 ATAGCCTTTTT-TGTCATG-TTTCTTGAGGTAGACATTCAATTATAATCTGTTTTCACCAAAAAT
128 AT-GGCTTTTTCT-TCATGTTTTC-TAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACAAAAAAT
* * * * * * *
30554 ATAAAAAAATCAACATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAGCGAAG-AATAAAGCT
190 GTAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCG-AGTAATTAGGAT
* * * * *
30618 TTCGGAGGCATAGGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATG-ATAGCCTTTTTCTTCACGTTT
254 TTTGAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATAG-CTTTTTCTTCATGTTT
*** * *
30682 TTTGAGGCAAACATTCAATTATA
318 TCCAAGGTAGACATTCAATTATA
* * * * * *
30705 ATATGTTTTCA-TCAAAAATGTAAAAAATTCAACATAAAAGCAATTATGACATTATAAAACCTTT
1 ATCTGTTTTAACT-AAAAATGTAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATT
* * ** *
30769 TAAAACGAGTAATAAGG-TTGTCAAAGGCATGGGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATG-A
65 TAAAACTAGTAATTAGGATT-TTGAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAA
* * * * * * *
30832 TAGCTTTTTTCTTCATG-TTTCTTGAGGCAGATATTCATTTATAATTTGTTTTCACCAAAAATGT
129 TGGC-TTTTTCTTCATGTTTTC-TAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACAAAAAATGT
* * * * * *
30896 AAAAAATTCAACATAAAATCAATTATAAGATTATAAAACCATTTAGAGTGAGTAATAAGG-CTTT
192 AAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGATTTT
* * * * *
30960 CAAGGACATGGATAACTATAAATAGACTTTT-TGTACCAATGACA-A-CTTTTTTCTTCACG-TT
257 GAAGG-CATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCT-TGCCAATGA-ATAGC-TTTTTCTTCATGTTT
** * *
31021 TCTTGAGGCAGTCATTCAATTATA
318 TC-CAAGGTAGACATTCAATTATA
*
31045 ATTTGTTTTAAAC-AAAAATGTAAAAAAATTCAACCTA
1 ATCTGTTTT-AACTAAAAATGT-AAAAAATTCAACCTA
31082 NNNNNNNNNN
Statistics
Matches: 8675, Mismatches: 2521, Indels: 1021
0.71 0.21 0.08
Matches are distributed among these distances:
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387 8 0.00
ACGTcount: A:0.37, C:0.13, G:0.13, T:0.34
Consensus pattern (340 bp):
ATCTGTTTTAACTAAAAATGTAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTT
AAAACTAGTAATTAGGATTTTGAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATG
GCTTTTTCTTCATGTTTTCTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACAAAAAATGTAAAA
AATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGATTTTGAAG
GCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATAGCTTTTTCTTCATGTTTTCCAAGGT
AGACATTCAATTATA
Found at i:20437 original size:151 final size:151
Alignment explanation
Indices: 20141--20429 Score: 400
Period size: 151 Copynumber: 1.9 Consensus size: 151
20131 GTAATTACGT
* * * * * ** * *
20141 TTTTGAAGGCATGGGCAACTTTAAATGGACCTTTCTTGTCAATGAATGATTTTTTCTTCATGTTT
1 TTTTAAAGGCATGAGCAACTATAAATGAAACTTTCTTACCAATGAATGACTTTTTCTTCACGTTT
* *
20206 CTTAAGGCAGTCATTCAATTATAATCTATTTTAACTAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATC
66 CTTAAGGCAGACATTCAATTATAATATATTTTAACTAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATC
20271 AACTATGACATTATAAAACTA
131 AACTATGACATTATAAAACTA
* *
20292 TTTTAAAGGCATGAGTAACTATAAATGAAACTTTCTTACCAATGAATGGCTTTTTCTTCACGTTT
1 TTTTAAAGGCATGAGCAACTATAAATGAAACTTTCTTACCAATGAATGACTTTTTCTTCACGTTT
* * * *
20357 CTTGAA-GTAGACCTTCAATTGTAATATGTTTTAACTAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAAT
66 CTT-AAGGCAGACATTCAATTATAATATATTTTAACTAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAAT
*
20421 CAATTATGA
130 CAACTATGA
20430 GGTTATAAGA
Statistics
Matches: 119, Mismatches: 18, Indels: 2
0.86 0.13 0.01
Matches are distributed among these distances:
151 117 0.98
152 2 0.02
ACGTcount: A:0.38, C:0.14, G:0.11, T:0.37
Consensus pattern (151 bp):
TTTTAAAGGCATGAGCAACTATAAATGAAACTTTCTTACCAATGAATGACTTTTTCTTCACGTTT
CTTAAGGCAGACATTCAATTATAATATATTTTAACTAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATC
AACTATGACATTATAAAACTA
Found at i:21763 original size:170 final size:170
Alignment explanation
Indices: 20300--24456 Score: 3226
Period size: 171 Copynumber: 24.4 Consensus size: 170
20290 TATTTTAAAG
* * * * * * **
20300 GCATGAGTAACTATAAATGAAAC-TTTCTTACCAATGAATGGCTTTTTCTTCACGTTTCTTGAA-
1 GCATGGGTGACTATAAATG-GACTTTTCTTGCCAATGAAAGGCTTTTTCTTCATGTTTC-CCAAG
* * * * *
20363 GTAGACCTTCAATTGTAATATGTTTTAACTAAAAATGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTAT
64 GCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGT-AAAAAATTCAACCTAAAATCAATTAT
* * * * *
20428 GAGGTTATAAGACCATTTAAAGCAAGTAGTTAGGCTTTCGAAT
128 GAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCGAAA
* * * * * * * ** ***
20471 GCTTGGGTAACTAGAAATGGACTTTTCCTACAAATGAATA-GTTTTTTCTTCACATTTCATGAGG
1 GCATGGGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAA-AGGCTTTTTCTTCATGTTTCCCAAGG
* * * ** **
20535 CAGATATTCAATTATAATCTGTTTTAGCAAAAAATGT-AAAAATTCAAGTTAAAATTGATTATGA
65 CAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGA
* * * * *
20599 GATTATAAAAACATTTAAAGCGTGCAATAAGACTTTC-AAA
130 GATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCGAAA
* * * * * **
20639 GGTATGGGTGACTATAAATGAACTTTTGC-TACAAACGAATA--CTTTTTTCTTCACCTTTCCCA
1 -GCATGGGTGACTATAAATGGACTTTT-CTTGCCAATGAA-AGGC-TTTTTCTTCATGTTTCCCA
* * * * * * *
20701 AGGAAGACATTCAATTATAATTTGTTTTCACCAAAAACGTAAAAAAATCTAACATAAAATCAGTT
62 AGGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAATTC-AACCTAAAATCAATT
* * * * *
20766 ATGAGATTATAAAACCTTTTAAAGCGAGTAATTACGATTTTGAAG
126 ATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCGAAA
* * * * *
20811 GCAT-GG-G----TAAATGGATTTTTCTTGCTAAT-AAATAGATTTTTCTTCATGTTTCCTAAGG
1 GCATGGGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAAA-GGCTTTTTCTTCATGTTTCCCAAGG
* * * ** **
20869 CAGACATTCAATTTTAATCTGTTTTAACCAAAAGTGTAAAGAGATTCAATGTAAAAAAAATTATG
65 CAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAA-AAATTCAACCTAAAATCAATTATG
* * **
20934 AGATTATAAAACTATTTAAAGCGACTAATTAAGATTTTC-AAA
129 AGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATT-AGGCTTTCGAAA
* * * * *
20976 GCATGGGTAACTATAAATAGACTTTTCTAGCCAATGAATGGCTTTTTCTTCATGTTTCCCAAGTC
1 GCATGGGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAAAGGCTTTTTCTTCATGTTTCCCAAGGC
* * * * *********
21041 AGACAATCAATAATAATTTGTTTTAACTAAAAATGTAAAAATATTCAACCTAAAATTNNNNNNNN
66 AGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAA-ATTCAACCTAAAATCAATTATGA
** * *
21106 NNTTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGACTTTC-AAA
130 GATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCGAAA
* * * * ** ***
21146 GTAATGGGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGATAGCCTCTTTCTTCACATTTCTTTAGG
1 G-CATGGGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAAAGGCTTTTTCTTCATGTTTCCCAAGG
* * * * *
21211 CAGTCATTCGATTAGAATTTGTTTTAA-CAAAAGATGTAAAAAAATTCAACTTAAAATCAATTAT
65 CAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAA-ATGT-AAAAAATTCAACCTAAAATCAATTAT
* * * *
21275 GACATTATAAAACTATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTGAAG
128 GAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCGAAA
* ** * ** *
21318 GCATGGGTGACTATAAATGGACTTTTCTTACCACCGAATA-CCTTTTTCTTCACATTTTCCAAGG
1 GCATGGGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAA-AGGCTTTTTCTTCATGTTTCCCAAGG
* * * * * *
21382 TAGACAATCAATTATAATCAGTTTTAACCAAAAGTGTAAAAAAATTCAATCTAAAATAAATTATG
65 CAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGT-AAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATG
* * * * *
21447 AGATTATAAAGCCATTTAAAGTGACTAATTAGGATTTTG-AA
129 AGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCGAAA
* * * * * * *
21488 GCATTGGGTAACTACAAATGGACTTTTCTAGCCAAT-TAATGCTTTTTTTTTTATGTTTCCCAAG
1 GCA-TGGGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAAAGGC-TTTTTCTTCATGTTTCCCAAG
* * * * ** *
21552 GCAGACATTCAATAATAATTTGTTTTCACTAAAAATGTAAAAAATTCAATATAAAATTAATTATG
64 GCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATG
* *
21617 AGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAATTAGGCTTTCGAAT
129 AGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCGAAA
* * * * * * ***
21659 GCTTGGGTGACTAGAAATGGGCTTTTCCTGCAAATGAAAGGGTTTTTCTTCACT-TTTCTTGAGG
1 GCATGGGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAAAGGCTTTTTCTTCA-TGTTTCCCAAGG
* * * * * * ** * *
21723 TAGATATACAATTATAATCTATTTTAGCCAAAATTGTAAAACCTTCAACGTAAAATGAATTATGA
65 CAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGA
* * *
21788 GATTATAAAAACATTTAAAGCGCGTAATAAGGCTTTC-AAA
130 GATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCGAAA
* * * * * *
21828 GACATGGGTGACTATAAATAGA-ATTTCTTGCC-ATCGAATA-CCTTTTTCTTCACGTTTCTCGA
1 G-CATGGGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAAT-GAA-AGGCTTTTTCTTCATGTTTCCCAA
* * * * * * *
21890 GGCAAACATTCAATTATAATTTGTTTTCACCAAAAATGAAAAAAAATTTAACATAAAATGAATTA
63 GGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATG-TAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTA
* * * * * * * *
21955 CGAGATAATAAAACCATTTAAAACAAGTAATTACGATTTTGAAC
127 TGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCGAAA
* * * *
21999 GCATGGGTAACTATAAATGAACTTTTCTTGCCAATGAATA-GATTTCTCTTCATGTTTCCCAAGG
1 GCATGGGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAA-AGGCTTTTTCTTCATGTTTCCCAAGG
* * * * ***
22063 CAGACATTCAATTATAATTTGTTTTAAACAAAAGTGTAAAAAAATTTAGTATAAAATCAATTATG
65 CAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGT-AAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATG
* * *
22128 AGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGCAATAAGGCTTTC-AAA
129 AGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCGAAA
* * * * * **
22169 TGTATGGGTGACTAGAAATGGACTTTTATTGCCAATGATAGCCTTTTTCTTCATGTTTCTTAAGG
1 -GCATGGGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAAAGGCTTTTTCTTCATGTTTCCCAAGG
* * *
22234 CACACATTCAATTATAATCTATTTTAACCAAAAATGTAAAAAACTTCAACCTAAAATCTATTATG
65 CAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAA-TTCAACCTAAAATCAATTATG
* * * * *
22299 ACATCATAAAACCATTTTAAGCGAGTAATTAGGCTTTTGAAG
129 AGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCGAAA
* * * * * * * * * * *
22341 GTATGAGTAACTATAAATGGACTTTTCTCGTCAATGAATGGCTTCTTCTTTAGGTTTTCCAAGAC
1 GCATGGGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAAAGGCTTTTTCTTCATGTTTCCCAAGGC
* * * * ** *
22406 AGACTTTCAATTATAGTCTGTTTTAACAAAAAATGTAAAAAGGTTTTACATAAAATCAATTATGA
66 AGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAA-ATTCAACCTAAAATCAATTATGA
* * *
22471 GATTATAAAACCATTAAAAGTGAGTAATAAGGCTTTC-AAA
130 GATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCGAAA
* * * * * * * *
22511 GACATGGGTTATTATAAATGGACTTTTCTCGCTAATGAATGTCTTCTTCCTT-ATGTTTACCAAG
1 G-CATGGGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAAAGGCTT-TTTCTTCATGTTTCCCAAG
* * * * *
22575 GCAAACATTCAATTATAGTCTGTTTTAACAAAAAATGTAAAACAATTTAACCTAAAATTAATTAT
64 GCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAA-AATTCAACCTAAAATCAATTAT
* * * * *
22640 GAGATTATAAAACCATTAAAAGTGATTAATAAGGTTTTC-AAA
128 GAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCGAAA
* * * * * * * * * ***
22682 GGCACGAGTTACTATAAATGTACTTTTGTTGCCAATGATAGCCTTTTTTTTCACGTTT-TTTAGG
1 -GCATGGGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAAAGGCTTTTTCTTCATGTTTCCCAAGG
* * * * ** * *
22746 TAAAAATTCAATTATAAT-TGATTTTCACCAAAAAAAATAAAAAATTCAACTTAAAA--AAGTAT
65 CAGACATTCAATTATAATCTG-TTTTAACC-AAAAATGTAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTAT
* * * *
22808 GAGATTATAAAACCATTTAAAGTGAGTAATAAGGCTTCCGAAG
128 GAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCGAAA
* * * * * ** * *
22851 GCTTGGGTGATTATAAATGGACCTTTCTTGACAATGAATGG-TTGTTTCTTCACATTTTCCAAAG
1 GCATGGGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAAAGGCTT-TTTCTTCATGTTTCCCAAGG
* * * *
22915 TAAACATTCAATTATAATCTG-TTTAACCAAAAATATAAAAACTTTCAACCTAAAATCAATTATG
65 CAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAA-ATTCAACCTAAAATCAATTATG
** * *
22979 AGATTATAAAATTATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTGAAG
129 AGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCGAAA
* * * * * * ** *
23021 GCATGGGTAACTACAAACGGACTTTTCTAGCTAATGAATGTTTTTTTCTT--TGTGTTCCTAAGG
1 GCATGGGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAAAGGCTTTTTCTTCATGT-TTCCCAAGG
* * * * ** * * *
23084 TAGACATTTAATAATAATTTGTTTTAATAAAAAATGTAGAAAAACTCAACCCAAAATCAATTACG
65 CAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTA-AAAAATTCAACCTAAAATCAATTATG
* * * *
23149 ACATTATAAAATCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCAAAA
129 AGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCGAAA
* * * * * * ***
23191 GCATGAGTAACTATAAATGGACTTTTATTGCCAATGATAGCCTTTTTCTTCACGATTT-TTGAGG
1 GCATGGGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAAAGGCTTTTTCTTCATG-TTTCCCAAGG
* * * * * * *
23255 TAGACATTCAATTATAATCTGTTTTCACAAAAAATGTAAAACATTTAACTTAAAATCAATTATAA
65 CAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGA
* * * * *
23320 GATTATAAAACCATGTAAAGCGCGTAGTAAGACTTTC-AAA
130 GATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCGAAA
* * *
23360 GGTATGGGGGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATA-GCTATTTCTTCATGTTTCCCAAG
1 -GCATGGGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAA-AGGCTTTTTCTTCATGTTTCCCAAG
** * * * * *
23424 GTGGACATTCAATTATAATCTTTTTTAACTAAAAATGTAAAAATATTTAACATAAAATCAATTAC
64 GCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAA-ATTCAACCTAAAATCAATTAT
* * * * * * *
23489 GAGATTATAAAATCACTTAAAGTGAGTAATTACGATTTTGAAG
128 GAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCGAAA
** * ** * * *
23532 GCATAAGTAACT-TAAATAAACTTTTGTTGCCAATGAATA-GCCTTTTCTTCATGTTTCCCAAGA
1 GCATGGGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAA-AGGCTTTTTCTTCATGTTTCCCAAGG
* * * * *
23595 CAGATATTCAATTATAATTTATTTTAA-CAAAAATTTTAAAAAAACTT-AATCTAAAATCAATTA
65 CAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAA-TGT-AAAAAA-TTCAACCTAAAATCAATTA
* * *
23658 TGAGATTATAAAACCATTTAAAGCAAGAAATGAGGCTTTC-AAA
127 TGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCGAAA
* * * *
23701 GGC-TCGAGTGACTAGAAATGGACTTTTCTTGCTAAT-AAATAGCTTTTTCTTCATGTTTCCCAA
1 -GCAT-GGGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAAA-GGCTTTTTCTTCATGTTTCCCAA
* * * * * ** *
23764 TGAAGGCATTCAATTATAATCTATTTTAACTAAAAACATAAAAATTTCAACCTAAAATCAATTAT
63 GGCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTAT
* * * *
23829 GGGATTATAAAACTATTTAAAGCGAGTAATTAGGATTTTGAAA
128 GAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCGAAA
* * * * * *
23872 GAATGGGTAACTATAAATGAACTTTTC-TGACCAATGAATGGCTTTTTCTTCTTGTTTCCTAAGG
1 GCATGGGTGACTATAAATGGACTTTTCTTG-CCAATGAAAGGCTTTTTCTTCATGTTTCCCAAGG
* * * * *
23936 CAGACATTCAATAATAATTTGTTTTAGCCAAACATGTAAAAAAATTTAACCTAAAATCAATTATG
65 CAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGT-AAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATG
* ** * * *
24001 ATATTATAAAATTATTTTAAGCGAGTAATTAGGCTTTTGAAG
129 AGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCGAAA
* * * * **
24043 GCATGTGTAACTATAAATGGACCTTTCTTGCCGATGAATA-GCTTTTTCTTCATGTTTCCTGAGG
1 GCATGGGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAA-AGGCTTTTTCTTCATGTTTCCCAAGG
* * * * * *
24107 TAAAGATTTAATTATAATCCGTTTTAACCTAAAATGT-AAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGA
65 CAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGA
* * * *
24171 GATTTTAAAATCATTTAAAGCGAGTAATTAGGTTTTCGAAC
130 GATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCGAAA
* * * * ******
24212 GCATTGGTGA-TCAGAAATGGACTTTTCTTACCCATGAAAGGCTTTTTCTTCATGTTTNNNNNNN
1 GCATGGGTGACT-ATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAAAGGCTTTTTCTTCATGTTT-CCCAAG
*** * * * * * ** *
24276 NNNG-TATTGAATTATAATCTATTTTAGCCAAAAATGTAAAAAATTTAATTTAAAATTAATTATG
64 GCAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATG
** * * * *
24340 AGATTATAAAAATATTTAAATCGCGTGATAAGGCTTTC-AAA
129 AGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCGAAA
* * ** * *
24381 GGCATGGGTGACTATAAACGGACTTTTCTTACCACCGAATA--CTTTTTTTTTCATGTTTCCTAA
1 -GCATGGGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAA-AGGC-TTTTTCTTCATGTTTCCCAA
*
24444 GGTAGACATTCAA
63 GGCAGACATTCAA
24457 AGTATAGGTA
Statistics
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164 3 0.00
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ACGTcount: A:0.38, C:0.13, G:0.13, T:0.35
Consensus pattern (170 bp):
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AGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAG
ATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTCGAAA
Found at i:25153 original size:171 final size:168
Alignment explanation
Indices: 24463--27476 Score: 2172
Period size: 170 Copynumber: 17.7 Consensus size: 168
24453 TCAAAGTATA
* * * *
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* ** *
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* * ** ** *
24592 ATAAAACCATTTAAA-ACGAGTAATTAGCCTTTTGAATACTTG
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* * * * * * * * ** * *** * *
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* * * * ***
24698 TTGAATGATAATCTGTTTTAGCCAAAAATGTAGAAAATTCAA-ATTAAAATTGGTTATGAGATTA
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* * ** *
24762 TAAAAACATTTAAAG-CGCGTAA-TAAGACTTTCAAAGGCATA
129 T-AAAACATTTAAAGTCAC-TAATTAGGA-TTTTGAAGGCATG
* * * * ** ** ** * * *** *
24803 GGTGATTGTAAATGGACTTTTCTTATCAACAAATTCCTTTTTCCTCACGTTTCATGAGGAAGACA
1 GGTAACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATGAA-TGATTTTTCTTCATGTTTCCCAAGGCAGACA
* ** * * * ** *
24868 TTCAATTATAATCTGTTTTCACCAAAAACATAAAAAAAATTTAACATAAAATCGAGTGCGATATT
65 TTCAATTATAATCTGTTTTAACC-AAAA-ATGTAAAAAATTCAACATAAAATCAATTATGAGATT
* * *
24933 ATAAAACCATTTAAAG-CGAGTAGTTACGATTTTGAAGGCATG
128 ATAAAA-CATTTAAAGTC-ACTAATTAGGATTTTGAAGGCATG
* * *
24975 AGTAACTATAAATAGATTTTTCTTGCCAATGAATAGATTTTTCTTCCTGTTTCCCAAGGCAGACA
1 GGTAACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATGAAT-GATTTTTCTTCATGTTTCCCAAGGCAGACA
* * *
25040 TTTAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAGTGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTA
65 TTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGT-AAAAAATTCAACATAAAATCAATTATGAGATTA
* *
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129 TAAA-ACATTTAAAGTCACTAATTAGGATTTTGAAGGCATG
* * * *
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* * * *
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* * * * * *
25274 ATAAAACCATTTAAAGTGAGTAATTAGGCTTTCGAATGCTTG
128 ATAAAA-CATTTAAAGTCACTAATTAGGATTTTGAAGGCATG
* * * * * * * * *** * *
25316 GGTGACTAGAAATAGACTTTTCCTACAAATGAATGGCTTTTTTTTCACGTTTCTTGAGGTAGATA
1 GGTAACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATGAAT-GATTTTTCTTCATGTTTCCCAAGGCAGACA
* * * ** * * **
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65 TTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAATTCAACATAAAATCAATTATGAGATTAT
* * * **
25446 AAAAACATTTAAAG-CGCGTAATAAGGCTTCCGAAGGCATG
130 -AAAACATTTAAAGTCAC-TAATTAGGATTTTGAAGGCATG
* * * * * * * ** *
25486 GGTGACTATAAATGGAGTTTTCTTGCCAACGAATGCCTTTCTCTTCATGTTTCTCAAGAAAAACA
1 GGTAACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATGAATG-ATTTTTCTTCATGTTTCCCAAGGCAGACA
* * * * **
25551 TTCAATTATAATCTGCTTTCAA-TAAAAACGTTAAAAAATTTAACATAAAATCAATTACAAGATT
65 TTCAATTATAATCTG-TTTTAACCAAAAATG-TAAAAAATTCAACATAAAATCAATTATGAGATT
* *
25615 ATAAAACCATTTAAAGTGAGC-AATTACGATTTTGAAGGCATG
128 ATAAAA-CATTTAAAGTCA-CTAATTAGGATTTTGAAGGCATG
** * * * * *
25657 GGTAACTACGAATGGATTTTTCTTACCAATGAATAGATTTTTCTTCATTTTTCCCAAGGTAGACA
1 GGTAACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATGAAT-GATTTTTCTTCATGTTTCCCAAGGCAGACA
** * *
25722 TTCAATTATAATCTGTTTTAATTAAAAATGTAAAATATTCAACATAAAATAAATTATGAGATTAT
65 TTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAATTCAACATAAAATCAATTATGAGATTAT
* * **
25787 AAAGCTATTTAAAGTGACTAATTACAATTTTGAAGGCATG
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* * * * * *
25827 GGTAACTATGAATAGACTTTT-TTAGCCTATGAATGACCTTTTCTTCATATTT-ACTAGGTCAGA
1 GGTAACTATAAATAGACTTTTCTT-GCCAATGAATGA-TTTTTCTTCATGTTTCCCAAGG-CAGA
* * * ** *
25890 CATTCAATAATAAT-TAGTTTTCACTAATTATGTAAAAAATTCAAGATAAAATCAATTATGAGAT
63 CATTCAATTATAATCT-GTTTTAACCAAAAATGTAAAAAATTCAACATAAAATCAATTATGAGAT
* * * * * * *
25954 TATAAAACCATTTAAAGTGAGTAATTAGGCTTTCGAATGCTTA
127 TATAAAA-CATTTAAAGTCACTAATTAGGATTTTGAAGGCATG
* * * * * * * ** ** * *
25997 GGTTACTAGAAAT-GTACTTTCCCTACAAATGAATGGTTTTTTCTTCGCGTTTCTTAAGGTAGAT
1 GGTAACTATAAATAG-ACTTTTCTTGCCAATGAAT-GATTTTTCTTCATGTTTCCCAAGGCAGAC
* * **
26061 ATTCAATTATAATATGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAATTCAACTTAAAATTGATTATGAGATTA
64 ATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAATTCAACATAAAATCAATTATGAGATTA
* * * ** **
26126 TAAAAATATTTAAAG-CGCGTAATAAGCCTTTCAAAGGCATG
129 T-AAAACATTTAAAGTCAC-TAATTAGGATTTTGAAGGCATG
* * * * ** **
26167 GGTGACTAGAAATAGACTTTTCTTGCCAACGAATGCCTTTTTCTTC-TAGTTTCAAAAGTAAGAC
1 GGTAACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATGAATG-ATTTTTCTTCAT-GTTTCCCAAGGCAGAC
** ** ** * * *
26231 ATTCAATTATAATCTAATTTCTCCAAAAACATAGAAAAATTTAACATCAAATCAATTA-CAGGAT
64 ATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTA-AAAAATTCAACATAAAATCAATTATGA-GAT
* * * *
26295 TATAAAATCATTTAAAG-CGAGTAATTACGAATATGAAGGCATG
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* *
26338 GGTAACTATAAATAGATTTTTCTTAG-TAATGAATAGATTTTTCTTCATGTTTCCCAAGGCAGAC
1 GGTAACTATAAATAGACTTTTCTT-GCCAATGAAT-GATTTTTCTTCATGTTTCCCAAGGCAGAC
* * * * * * *
26402 TTTCAATTATAATATGTTTTCACCAAAAAAGTAAAAGATTCAACGA-AAAATAAATTATTAGATT
64 ATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAATTCAAC-ATAAAATCAATTATGAGATT
* * * *
26466 ATGAAGCTATTTAAAGTGACTAATTAGGATTTTGAAAGCATG
128 ATAAAAC-ATTTAAAGTCACTAATTAGGATTTTGAAGGCATG
* * * * * **
26508 GATAACTATGAATAGACTTTTTTTAGCCAATGAATGATCTTTTCTTCATATTTACCAAGTTAGAC
1 GGTAACTATAAATAGACTTTTCTT-GCCAATGAATGAT-TTTTCTTCATGTTTCCCAAGGCAGAC
* * *
26573 ATTCAATAATAATTTGTTTTAACCAAAAATGTAAAACAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATT
64 ATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAA-AATTCAACATAAAATCAATTATGAGATT
* * * ** * *
26638 TTAAAAACCATTTAAAG-CGAGTAATTAGGCTTTAAAATGCTTG
128 AT-AAAA-CATTTAAAGTC-ACTAATTAGGATTTTGAAGGCATG
* * * * * * *** *
26681 GGTGACTAGAAATCGACTTTTCTTACCAATGAAAGGCTTTTTCTTCATGTTTCTTGAGGCAGATA
1 GGTAACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATG-AATGATTTTTCTTCATGTTTCCCAAGGCAGACA
* * ** * * *
26746 TTCAATGATAATCTATTTTAGTCAAAAATGTAAAAAATTCAACTTAAAATTAATTACGAGATTAT
65 TTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAATTCAACATAAAATCAATTATGAGATTAT
* * * *
26811 AAAAACGTTTAAAG-CGCGTAATAAGG-TTTTCAGAGGCATG
130 -AAAACATTTAAAGTCAC-TAATTAGGATTTTGA-AGGCATG
** * * * * * * *
26851 GGTGGCTATAAATGGACTTTTCTTGCTACT-AAT-ACCTTTTTCTTTATGTTTCTCGAGGTAGAC
1 GGTAACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATGAATGA--TTTTTCTTCATGTTTCCCAAGGCAGAC
* * * * **
26914 ATTCAATTATAATATGTTTTCATCAAAAACGTAAAACAAGTT-AACATAAAATCAATTACAAGAT
64 ATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAA-AA-TTCAACATAAAATCAATTATGAGAT
* * ** * * *
26978 TACAAAGCTATTTAAAGGGAGTAATTAGAATTTTAAAGGCATG
127 TATAAAAC-ATTTAAAGTCACTAATTAGGATTTTGAAGGCATG
* * *
27021 GGTAACTATAAATAAACTTTTCTTGCCAATGAATCGATTTCTCATCATGTTTCCCAAGGCAGACA
1 GGTAACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATGAAT-GATTTTTCTTCATGTTTCCCAAGGCAGACA
* * *
27086 TTCAATTATTATTTGTTTTAACCAAAAATGTAAACAAATTCAACGTAAAATCAATTATGAGATTA
65 TTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAA-AAATTCAACATAAAATCAATTATGAGATTA
* * *
27151 TAAAGCCATTTAAAATAACTAATTAGGATTTTGACA-GCATG
129 TAAA-ACATTTAAAGTCACTAATTAGGATTTTGA-AGGCATG
* * * * * * *
27192 GGTAACCACAAATGGACTTTTCTAGCCAATGAATGCCTTTTTTTTTCATGTTTCCCAAGGCAGGC
1 GGTAACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATGAATG--ATTTTTCTTCATGTTTCCCAAGGCAGAC
* * * * *
27257 ATTCAATAATAAT-TGGTTTTCACTAAAAATGTAAAAAATTAAACATAAAATCAATTATAAGATT
64 ATTCAATTATAATCT-GTTTTAACCAAAAATGTAAAAAATTCAACATAAAATCAATTATGAGATT
* * * * *
27321 ATAAAATCATTTAAAGTGAGTAATTAGGCTTTAG-AGTGCTTG
128 ATAAAA-CATTTAAAGTCACTAATTAGGATTTTGAAG-GCATG
* * * **
27363 GGTGACTAGAAAT-GTACTTTT-TCTGCAAATGAATGACTTTTTCTTCATGTTTCTTAAGGCAGA
1 GGTAACTATAAATAG-ACTTTTCT-TGCCAATGAATGA-TTTTTCTTCATGTTTCCCAAGGCAGA
* *
27426 TATTCAATTATAATCTGTTTTAA-CAAACAATGTAAAAAATTCAACTTAAAA
63 CATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAA-AATGTAAAAAATTCAACATAAAA
27477 NNNNNNNNNN
Statistics
Matches: 2230, Mismatches: 514, Indels: 199
0.76 0.17 0.07
Matches are distributed among these distances:
168 4 0.00
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173 57 0.03
174 1 0.00
ACGTcount: A:0.38, C:0.13, G:0.14, T:0.35
Consensus pattern (168 bp):
GGTAACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATGAATGATTTTTCTTCATGTTTCCCAAGGCAGACAT
TCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAATTCAACATAAAATCAATTATGAGATTATA
AAACATTTAAAGTCACTAATTAGGATTTTGAAGGCATG
Found at i:27597 original size:21 final size:20
Alignment explanation
Indices: 27549--27593 Score: 72
Period size: 20 Copynumber: 2.2 Consensus size: 20
27539 TATAAATGGA
27549 CTTTTCTTGCCAACGAATGC
1 CTTTTCTTGCCAACGAATGC
* *
27569 CTTTTCTTGCCAATGAATGG
1 CTTTTCTTGCCAACGAATGC
27589 CTTTT
1 CTTTT
27594 TCTTTATGTT
Statistics
Matches: 23, Mismatches: 2, Indels: 0
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Matches are distributed among these distances:
20 23 1.00
ACGTcount: A:0.18, C:0.24, G:0.16, T:0.42
Consensus pattern (20 bp):
CTTTTCTTGCCAACGAATGC
Found at i:27854 original size:171 final size:171
Alignment explanation
Indices: 27663--28009 Score: 441
Period size: 171 Copynumber: 2.0 Consensus size: 171
27653 NNNNTCAACC
* *
27663 TAAAATCAGTTATGAGATTATAAAACCATGTAAAGCGAGTAATTAGGG-TTTTGAAGGCATAGGT
1 TAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATGTAAAGCGAGTAA-TAGGGATTTCGAAGGCATAGGT
* * * * *
27727 AACTATAAATAGACTTTTCTTCCCAATGA-ATG-GTTT-TTTCCTCAAGTTTCTCAAGGTAGACA
65 AACAATAAATAAACTTTTCTTCCCAATGATA-GCCTTTCTTT--TCAAGTTTCTCAAAGCAGACA
* * *
27789 TTCAATTATAATCTGCTTTAACAAAAAATGTAAACAAATTAAACA
127 TTCAATTATAATATGCTTTAACAAAAAATATAAAAAAATTAAACA
* * * *
27834 TAAAATCAATTATGAGATTATAAATCCATTTAAAGTGAGTAATAGGGATTTCGAAGGTATAGGTA
1 TAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATGTAAAGCGAGTAATAGGGATTTCGAAGGCATAGGTA
* * * *
27899 ACAATAAATAAACTTTTCTTGCCAATGATAGCCTTTCTTTTCATGTTTCTTAAAGCAGATATTCA
66 ACAATAAATAAACTTTTCTTCCCAATGATAGCCTTTCTTTTCAAGTTTCTCAAAGCAGACATTCA
* * *
27964 ATTATAATATGTTTTAACAAAAAATATAAAAAAATTCAACC
131 ATTATAATATGCTTTAACAAAAAATATAAAAAAATTAAACA
28005 TAAAA
1 TAAAA
28010 NNNNNNNNNN
Statistics
Matches: 151, Mismatches: 21, Indels: 8
0.84 0.12 0.04
Matches are distributed among these distances:
170 5 0.03
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ACGTcount: A:0.41, C:0.12, G:0.13, T:0.34
Consensus pattern (171 bp):
TAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATGTAAAGCGAGTAATAGGGATTTCGAAGGCATAGGTA
ACAATAAATAAACTTTTCTTCCCAATGATAGCCTTTCTTTTCAAGTTTCTCAAAGCAGACATTCA
ATTATAATATGCTTTAACAAAAAATATAAAAAAATTAAACA
Found at i:28910 original size:170 final size:170
Alignment explanation
Indices: 28483--31078 Score: 2365
Period size: 170 Copynumber: 15.2 Consensus size: 170
28473 GTAGATGTTG
* * * *
28483 AATTATAATCTG-TTTAACCAAAAATGTAAAAGATTTCAACCTAAAATCAATTTTGAGATTTTAA
1 AATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAA-AATTCAACATAAAATCAATTATGAGATTATAA
* * ** * * * * * *
28547 AACCATTTAAAGCTAGTAATTACACTTTCGATGGCATAGGTAACTACAAATAGACTTTTCTAGCT
65 AACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCGAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCC
* *** * ** *
28612 AATGA-ATGGCTTTTTCTTTGTGTTTCTCAAGATAAAACATTC
130 AATGATA-GCCTTTTTCTTCACGTTTCTTAAG-GCAGACATTC
* * * ** * ** * *
28654 AATAATAATTTATTTTAATAAAAAATGTAGAAAAACTCAACCCAAAATTAATTATGACATTATAA
1 AATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTA-AAAAATTCAACATAAAATCAATTATGAGATTATAA
* * * * * * *
28719 AACCATTTAAAGCAAGTAATAAGGCTTTCAAAGGTATGGGCAACTATAAATTGACTTTTATTGCT
65 AACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCGAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCC
*
28784 AATGATAGCCTTTTTCTTCACGTTTCTTGAGGCAGACATTC
130 AATGATAGCCTTTTTCTTCACGTTTCTTAAGGCAGACATTC
* ** * *
28825 AATTATAATCTGTTTTCATTAAAAATGTAAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTAGAAA
1 AATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAATTCAACATAAAATCAATTATGAGATTATAAA
* * * * * *
28890 ACCATTTAAAGCGCGTAATAAAGCTTTCAAAGGTATGGGTGACTATAAATAGACTTTTCTTGCCA
66 ACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCGAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCA
* * * * * *
28955 ATGA-ATGGCTATTTCTTCACGTTTCCTAAGGTAAACATTT
131 ATGATA-GCCTTTTTCTTCACGTTTCTTAAGGCAGACATTC
* * ** *
28995 AAGTATAATCTGTTTTAACCAAAAATATAAAAATATTTTACATAAAATCAATTACGAGATTATAA
1 AATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAA-ATTCAACATAAAATCAATTATGAGATTATAA
* * * * * * * * *
29060 AACTATTTAAAGTGAGTAATTATGATTTTGAAGGTATGGGTAACTATAAATGGACTTTTGTTGTC
65 AACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCGAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCC
* * ** * *
29125 AATGAATAGCC-TTTTCTTTATGTTTCCCAAGGTAGATATTC
130 AATG-ATAGCCTTTTTCTTCACGTTTCTTAAGGCAGACATTC
* * * *
29166 AATTATAATTTGTTTGAA-CAAAAAT-TAAAAAAAATTTAACCTAAAATCAATTATGAGATTATA
1 AATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGT--AAAAAATTCAACATAAAATCAATTATGAGATTATA
* * * * * * * *
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* *** *
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* * *
29336 AATAATAATTTGTTTTAACCAAAAAATGTAAAAAAATTCAATC-TAAAATCAATTATGACATTAT
1 AATTATAATCTGTTTTAACC-AAAAATGT-AAAAAATTCAA-CATAAAATCAATTATGAGATTAT
* * * * * *
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** * * *
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* * *
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1 AATTATAATCT-GTTTTAACCAAAAATGTA-AAAAATTCAACATAAAATCAATTATGAGATTATA
** * * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * *
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1 AATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAATTCAACATAAAATCAATTATGAGATTATAAA
* * * * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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1 AATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAATTCAACATAAAATCAATTATGAGATTATAAA
* * * * * *
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* * *
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131 ATG-ATAGCCTT-TTTCTTCACGTTTCTTAAGGCAGACATTC
* * *
30017 AATTATAATC-GATTTTAATCAAAAATGTAAAACAATTTAACATAAAATCAATTACGAGATTATA
1 AATTATAATCTG-TTTTAACCAAAAATGTAAAA-AATTCAACATAAAATCAATTATGAGATTATA
* * * * * * * * *
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64 AAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCGAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGC
* * * * * *
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** * ** * *
30188 AATTATAATCTGTTTTAATGAAAATTAAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATTAGATTATAAA
1 AATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAATTCAACATAAAATCAATTATGAGATTATAAA
* * * * * * * *
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66 ACCATTTAAAGCGAGTAA-TAAGGCTTTCGAAGGCATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCTTGCC
* * * * *
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* *
30358 AATTATAATATGTTTTAA-CAAAACATATAAAAAATTCAACATAAAATCAATTATGAGATTATAA
1 AATTATAATCTGTTTTAACCAAAA-ATGTAAAAAATTCAACATAAAATCAATTATGAGATTATAA
* * ** * * *
30422 AACCATTTAAAGTGAGTAATAAAGCTTTTAAAGGTATGAG-AGACTATAAATAGACTTTTCTTGC
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* * *
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* * *
30528 AATTATAATCTGTTTTCACCAAAAATATAAAAAAATCAACATAAAATCAATTATGAGATTATAAA
1 AATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAATTCAACATAAAATCAATTATGAGATTATAAA
* * * * *
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* * *
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130 AATGATAGCCTTTTTCTTCACGTTTCTTAAGGCAGACATTC
* * * * *
30698 AATTATAATATGTTTTCATCAAAAATGTAAAAAATTCAACATAAAAGCAATTATGACATTATAAA
1 AATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAATTCAACATAAAATCAATTATGAGATTATAAA
* * * *
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* * * *
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* * * *
30868 ATTTATAATTTGTTTTCACCAAAAATGTAAAAAATTCAACATAAAATCAATTATAAGATTATAAA
1 AATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAATTCAACATAAAATCAATTATGAGATTATAAA
* * * * *
30933 ACCATTTAGAGTGAGTAATAAGGCTTTC-AAGGACATGGATAACTATAAATAGACTTTT-TGTAC
66 ACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCGAAGG-CATGGGTAACTATAAATGGACTTTTCT-TGC
* * * * *
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* *
31038 AATTATAATTTGTTTTAAACAAAAATGTAAAAAAATTCAAC
1 AATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGT-AAAAAATTCAAC
31079 CTANNNNNNN
Statistics
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Found at i:30701 original size:340 final size:337
Alignment explanation
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Period size: 341 Copynumber: 31.3 Consensus size: 337
20287 AACTATTTTA
* * * *
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* * * * * *
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* * *
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* * * * * * * **
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* * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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* * ** ** *
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* * *
20952 AAGCGACTAATTAAGATTTTC-
317 AAGCGAGTAATAAAG-CTTTCG
* * * * * **
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* * * * * ******
21038 GTCAGACAATCAATAATAATTTGTTTTAACTAAAAATGTAAAAATATTCAACCTAAAATTNNNNN
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***** * * ** **
21103 NNNNNTTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGACTTTCAAAGTAATGGGTGACTATAAATGGA
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* ** * * * * *
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* * *
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* * *
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320 CGAGTAATAAAGCTTTCG
* ** ** * *
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* * * ** * *
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* * * * * * *
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127 TATGAGATTATAAAACCATTTAAAGTGAGTAA-TAAGCTTTTAAAGGCA-TGGGCAACTATAAAT
* * * * ** *
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* * * ** *
21571 TTGTTTTCACTAAAAATGTAAAAAATTCAATATAAAATTAATTATGAGATTATAAAACCATTTAA
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* * *
21636 AGCAAGTAATTAGGCTTTCG
318 AGCGAGTAATAAAGCTTTCG
* * * * * * * * * *
21656 AATGCTTGGGTGACTAGAAATGGGCTTTTCCTGCAAATGAAAGGGTTTTTCTTCACTTTTCTTGA
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* * * * * * * * ** * *
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* * * * * ** *
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130 GAGATTATAAAACCATTTAAAGTGAGTAATAA-GCTTTTAAAGGCATGGGCAACTATAAATGGAC
* * ** * *
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* * * * * * * *
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* * * * *
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320 CGAGTAATAAAGCTTTCG
* * * * * * * **
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* * * **
22061 GGCAGACATTCAATTATAATTTGTTTTAAACAAAAGTGTAAAAAAATTTAGTATAAAATCAATTA
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** * * * * ** *
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* * *
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* * * *
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* * *
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* * * * * * * * *
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1 AAGGCATGGGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCTTCACGTTTCT-TA
* * * * * * **
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* * * ** *
22467 ATGAGATTATAAAACCATTAAAAGTGAGTAATAAGGCTTTCAAAGACATGGGTTATTATAAATGG
128 ATGAGATTATAAAACCATTTAAAGTGAGTAATAA-GCTTTTAAAGGCATGGGCAACTATAAATGG
* * * * * * *
22532 ACTTTTCTCGCTAATGA-ATGTCTTCTTCCTT-ATGTTTAC-CAAGGCAAACATTCAATTATAGT
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* * * *
22594 CTGTTTTAACAAAAAATGTAAAACAATTTAACCTAAAATTAATTATGAGATTATAAAACCATTAA
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* * * * *
22659 AAGTGATTAATAAGGTTTTCA
317 AAGCGAGTAATAAAGCTTTCG
* * * * * * * *
22680 AAGGCACGAGTTACTATAAATGTACTTTTGTTGCCAATG-ATAGCCTTTTTTTTCACGTTT-TTT
1 AAGGCATGGGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAAT-GGCTTTTTCTTCACGTTTCTTA
* * * ** * *
22743 AGGTAAAAATTCAATTATAA-TTGATTTTCACCAAAAAAAATAAAAAATTCAACTTAAAA--AAG
65 AGGCAAACATTCAATTATAATTTG-TTTT-AAC-AAAAATGTAAAAAATTCAACATAAAATCAAT
*** * ** *
22805 TATGAGATTATAAAACCATTTAAAGTGAGTAATAAGGCTTCCGAAGGCTTGGGTGATTATAAATG
127 TATGAGATTATAAAACCATTTAAAGTGAGTAATAA-GCTTTTAAAGGCATGGGCAACTATAAATG
* * * * * * *
22870 GACCTTTCTTGACAATGA-ATG-GTTGTTTCTTCACAT-TTTC-CAAAGTAAACATTCAATTATA
191 GACTTTTCTTGCCAATGATA-GCCTT-TTT-TT--CATGTTTCTTAAGGCAGACATTCAATTATA
* * **
22931 ATCTG-TTTAACCAAAAATATAAAAACTTTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAATTATT
251 ATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAA-ATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATT
* * *
22995 TAAAGCGAGTAATTAGGCTTTTG
315 TAAAGCGAGTAATAAAGCTTTCG
* * * * * ** * *
23018 AAGGCATGGGTAACTACAAACGGACTTTTCTAGCTAATGAATGTTTTTTTCTT--TGTGTTCCTA
1 AAGGCATGGGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCTTCACGT-TTCTTA
* * * * * * **
23081 AGGTAGACATTTAATAATAATTTGTTTTAATAAAAAATGTAGAAAAACTCAACCCAAAATCAATT
65 AGGCAAACATTCAATTATAATTTGTTTTAA-CAAAAATGTA-AAAAATTCAACATAAAATCAATT
* * * * * * * *
23146 ACGACATTATAAAATCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCAAAAGCATGAGTAACTATAAATGG
128 ATGAGATTATAAAACCATTTAAAGTGAGTAATAA-GCTTTTAAAGGCATGGGCAACTATAAATGG
* * * *
23211 ACTTTTATTGCCAATGATAGCCTTTTTCTTCACGATTT-TTGAGGTAGACATTCAATTATAATCT
192 ACTTTTCTTGCCAATGATAGCCTTTTT-TTCATG-TTTCTTAAGGCAGACATTCAATTATAATCT
* * * * * * *
23275 GTTTTCACAAAAAATGTAAAACATTTAACTTAAAATCAATTATAAGATTATAAAACCATGTAAAG
255 GTTTTAACCAAAAATGTAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAG
* * *
23340 CGCGTAGT-AAGACTTTCA
320 CGAGTAATAAAG-CTTTCG
* * * * * **
23358 AAGGTATGGGGGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATAGCTATTTCTTCATGTTTCCCAA
1 AAGGCATGGGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCTTCACGTTTCTTAA
*** *
23423 GGTGGACATTCAATTATAATCTT-TTTTAACTAAAAATGTAAAAATATTTAACATAAAATCAATT
66 GGCAAACATTCAATTATAAT-TTGTTTTAAC-AAAAATGTAAAAA-ATTCAACATAAAATCAATT
* * * * * * ** * **
23487 ACGAGATTATAAAATCACTTAAAGTGAGTAATTACGATTTTGAAGGCATAAGTAACT-TAAATAA
128 ATGAGATTATAAAACCATTTAAAGTGAGTAA-TAAGCTTTTAAAGGCATGGGCAACTATAAATGG
* * ** * * * *
23551 ACTTTTGTTGCCAATGAATAGCCTTTTCTTCATGTTTCCCAAGACAGATATTCAATTATAATTTA
192 ACTTTTCTTGCCAATG-ATAGCCTTTTTTTCATGTTTCTTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTG
* *
23616 TTTTAA-CAAAAATTTTAAAAAAACTT-AATCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAA
256 TTTTAACCAAAAA-TGT-AAAAAA-TTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAA
* * * * *
23679 AGCAAGAAATGAGGCTTTCA
318 AGCGAGTAATAAAGCTTTCG
* * * * * * **
23699 AAGGC-TCGAGTGACTAGAAATGGACTTTTCTTGCTAATAAATAGCTTTTTCTTCATGTTTCCCA
1 AAGGCAT-GGGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCTTCACGTTTCTTA
* * * * ** * *
23763 ATG-AAGGCATTCAATTATAATCTATTTTAACTAAAAACATAAAAATTTCAACCTAAAATCAATT
65 AGGCAA-ACATTCAATTATAATTTGTTTTAAC-AAAAATGTAAAAAATTCAACATAAAATCAATT
* * * * * * *
23827 ATGGGATTATAAAACTATTTAAAGCGAGTAATTAGGATTTTGAAA-GAATGGGTAACTATAAATG
128 ATGAGATTATAAAACCATTTAAAGTGAGTAA-TAAGCTTTT-AAAGGCATGGGCAACTATAAATG
* * * * *
23891 AACTTTTC-TGACCAATGA-ATGGCTTTTTCTTCTTGTTTCCTAAGGCAGACATTCAATAATAAT
191 GACTTTTCTTG-CCAATGATA-GCCTTTTT-TTCATGTTTCTTAAGGCAGACATTCAATTATAAT
* * * * * ** *
23954 TTGTTTTAGCCAAACATGTAAAAAAATTTAACCTAAAATCAATTATGATATTATAAAATTATTTT
253 CTGTTTTAACCAAAAATGT-AAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTA
* * *
24019 AAGCGAGTAATTAGGCTTTTG
317 AAGCGAGTAATAAAGCTTTCG
* * * * * * * *
24040 AAGGCATGTGTAACTATAAATGGACCTTTCTTGCCGATGAATAGCTTTTTCTTCATGTTTCCTGA
1 AAGGCATGGGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCTTCACGTTTCTTAA
* * * ** * *
24105 GGTAAAGATTTAATTATAATCCGTTTTAACCTAAAATGT-AAAAATTCAACCTAAAATCAATTAT
66 GGCAAACATTCAATTATAATTTGTTTTAA-CAAAAATGTAAAAAATTCAACATAAAATCAATTAT
* * * * * * * * *
24169 GAGATTTTAAAATCATTTAAAGCGAGTAATTAGGTTTTCGAACGCATTGGTG-ATC-AGAAATGG
130 GAGATTATAAAACCATTTAAAGTGAGTAATAAGCTTTT-AAAGGCA-TGG-GCAACTATAAATGG
* * * * ********* * *
24232 ACTTTTCTTACCCATGAAAGGCTTTTTCTTCATGTTTNNNNNNNNNNG-TATTGAATTATAATCT
192 ACTTTTCTTGCCAATGATAGCCTTTTT-TTCATGTTT-CTTAAGGCAGACATTCAATTATAATCT
* * * ** * ** *
24296 ATTTTAGCCAAAAATGTAAAAAATTTAATTTAAAATTAATTATGAGATTATAAAAATATTTAAAT
255 GTTTTAACCAAAAATGTAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAG
* * * *
24361 CGCGTGATAAGGCTTTCA
320 CGAGTAATAAAGCTTTCG
* * ** * * * *
24379 AAGGCATGGGTGACTATAAACGGACTTTTCTTACCACCGAAT-ACTTTTTTTTTCATGTTTCCTA
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* * * * *
24443 AGGTAGACATTCAAAGTATAGGTAATTATAAATGGACTTTTCTTGTCAATGAAGAGATTTGTTTT
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* *** * * * * * * * **
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* * * * ** **** * * * *
24573 TAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAACGAGTAATTAGCCTTTTGAATACTTGGGTG
152 T-GAGT-AA-TA--AGCTTTTAAAGGCATGGGCAACTA-TAAATGGAC-TTT---T-C-T---TG
* * ** * * * * *
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202 -C---CAAT-GATA------GCC--T---T---TTTT-T-CATGTTTCTTAAGGCAGACATTCAA
* * * ** *** *
24703 TGATAATCTGTTTTAGCCAAAAATGTAGAAAATTCAAATTAAAATTGGTTATGAGATTATAAAAA
246 TTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAAC
* *
24768 CATTTAAAGCGCGTAAT-AAGACTTTCA
311 CATTTAAAGCGAGTAATAAAG-CTTTCG
* * * ** ** ** * * *
24795 AAGGCATAGGTGATTGTAAATGGACTTTTCTTATCAACAAATTCCTTTTTCCTCACGTTTCATGA
1 AAGGCATGGGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCTTCACGTTTCTTAA
* * ** * * *
24860 GG-AAGACATTCAATTATAATCTGTTTTCACCAAAAACATAAAAAAAATTTAACATAAAATCGAG
66 GGCAA-ACATTCAATTATAATTTGTTTT-AAC-AAAA-ATGTAAAAAATTCAACATAAAATCAAT
** * * * * * * * * *
24924 TGCGATATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAGTTACGATTTTGAAGGCATGAGTAACTATAAATA
127 TATGAGATTATAAAACCATTTAAAGTGAGTA-ATAAGCTTTTAAAGGCATGGGCAACTATAAATG
* * * ** *
24989 GATTTTTCTTGCCAATGAATAG-ATTTTTCTTCCTGTTTCCCAAGGCAGACATTTAATTATAATC
191 GACTTTTCTTGCCAATG-ATAGCCTTTTT-TTCATGTTTCTTAAGGCAGACATTCAATTATAATC
*
25053 TGTTTTAACCAAAAGTGTAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAGA-CATTTA
254 TGTTTTAACCAAAAATGT-AAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAA-ACCATTTA
* *
25117 AAGTC-ACTAATTAGAA--TTTTG
317 AAG-CGAGTAA-TA-AAGCTTTCG
* * * * * ** **
25138 AAGGCGTGGGTAACTACAAATAGACTTTTCTAGCCAATGAAT-GCTTTTTTCTTCGTGTTTC-CC
1 AAGGCATGGGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATGGC-TTTTTCTTCACGTTTCTTA
* * * * *
25201 AGGACAGACATTTAATAATAATTAGTTTTCACTAAAAATGTAAAAAATTCAACATAAAATCAATT
65 AGG-CAAACATTCAATTATAATTTGTTTTAAC-AAAAATGTAAAAAATTCAACATAAAATCAATT
* ** * * ** * *
25266 ATGAGATTATAAAACCATTTAAAGTGAGTAATTAGGCTTTCGAATGCTTGGGTGACTAGAAATAG
128 ATGAGATTATAAAACCATTTAAAGTGAGTAA-TAAGCTTTTAAAGGCATGGGCAACTATAAATGG
* * * * * * * * *
25331 ACTTTTCCTACAAATGAATGGCTTTTTTTTCACGTTTCTTGAGGTAGATATTCAATTATAATCTG
192 ACTTTTCTTGCCAATG-ATAGCCTTTTTTTCATGTTTCTTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTG
* * * ** * * ** *
25396 TATTAGCTAAAAATACAAAAAATTCAACTTAAAGTTGATTATGAGATTATAAAAACATTTAAAGC
256 TTTTAACCAAAAATGTAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGC
* * *
25461 GCGTAATAAGGCTTCCG
321 GAGTAATAAAGCTTTCG
* * * * * *
25478 AAGGCATGGGTGACTATAAATGGAGTTTTCTTGCCAACGAATGCCTTTCTCTTCATGTTTCTCAA
1 AAGGCATGGGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCTTCACGTTTCTTAA
** * * * * *
25543 GAAAAACATTCAATTATAATCTGCTTTCAATAAAAACGTTAAAAAATTTAACATAAAATCAATTA
66 GGCAAACATTCAATTATAATTTG-TTTTAACAAAAATG-TAAAAAATTCAACATAAAATCAATTA
** * * * * * **
25608 CAAGATTATAAAACCATTTAAAGTGAGCAATTACGATTTTGAAGGCATGGGTAACTACGAATGGA
129 TGAGATTATAAAACCATTTAAAGTGAGTAA-TAAGCTTTTAAAGGCATGGGCAACTATAAATGGA
* * * * ** *
25673 TTTTTCTTACCAATGAATAG-ATTTTTCTTCATTTTTCCCAAGGTAGACATTCAATTATAATCTG
193 CTTTTCTTGCCAATG-ATAGCCTTTTT-TTCATGTTTCTTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTG
** * * * * * *
25737 TTTTAATTAAAAATGTAAAATATTCAACATAAAATAAATTATGAGATTATAAAGCTATTTAAAGT
256 TTTTAACCAAAAATGTAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGC
* *
25802 GACTAATTACAA--TTTTG
321 GAGTAA-TA-AAGCTTTCG
* * * * * * **
25819 AAGGCATGGGTAACTATGAATAGACTTTT-TTAGCCTATGAATGACCTTTTCTTCATATTTAC-T
1 AAGGCATGGGTGACTATAAATGGACTTTTCTT-GCCAATGAATGGCTTTTTCTTCACGTTT-CTT
* * * * ** *
25882 -AGGTCAGACATTCAATAATAATTAGTTTTCACTAATTATGTAAAAAATTCAAGATAAAATCAAT
64 AAGG-CAAACATTCAATTATAATTTGTTTTAAC-AAAAATGTAAAAAATTCAACATAAAATCAAT
* ** * * * ** *
25946 TATGAGATTATAAAACCATTTAAAGTGAGTAATTAGGCTTTCGAATGCTTAGGTTACTAGAAATG
127 TATGAGATTATAAAACCATTTAAAGTGAGTAA-TAAGCTTTTAAAGGCATGGGCAACTATAAATG
* * * * * ** ** * * *
26011 TACTTTCCCTACAAATGA-ATGGTTTTTTCTTCGCGTTTCTTAAGGTAGATATTCAATTATAATA
191 GACTTTTCTTGCCAATGATA-GCCTTTTT-TTCATGTTTCTTAAGGCAGACATTCAATTATAATC
* ** **
26075 TGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAATTCAACTTAAAATTGATTATGAGATTATAAAAATATTTAAA
254 TGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAA
* *
26140 GCGCGTAAT-AAGCCTTTCA
319 GCGAGTAATAAAG-CTTTCG
* * * * *
26159 AAGGCATGGGTGACTAGAAATAGACTTTTCTTGCCAACGAATGCCTTTTTCTTCTA-GTTTC-AA
1 AAGGCATGGGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCTTC-ACGTTTCTTA
* * ** * ** * *
26222 AAGTAAGACATTCAATTATAATCTAATTTCT-CCAAAAACATAGAAAAATTTAACATCAAATCAA
65 AGGCAA-ACATTCAATTATAAT-TTGTTT-TAACAAAAATGTA-AAAAATTCAACATAAAATCAA
* * * * ** * * *
26286 TTA-CAGGATTATAAAATCATTTAAAGCGAGTAATTACGAATATGAAGGCATGGGTAACTATAAA
126 TTATGA-GATTATAAAACCATTTAAAGTGAGTAA-TAAGCTTTTAAAGGCATGGGCAACTATAAA
* * * * ** *
26350 TAGATTTTTCTTAG-TAATGAATAG-ATTTTTCTTCATGTTTCCCAAGGCAGACTTTCAATTATA
189 TGGACTTTTCTT-GCCAATG-ATAGCCTTTTT-TTCATGTTTCTTAAGGCAGACATTCAATTATA
* * * * ** * * * * *
26413 ATATGTTTTCACCAAAAAAGTAAAAGATTCAACGAAAAATAAATTATTAGATTATGAAGCTATTT
251 ATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTT
* * * * * *
26478 AAAGTGACTAATTAGGATTTTG
316 AAAGCGAGTAATAAAGCTTTCG
* * * * * * * **
26500 AAAGCATGGATAACTATGAATAGACTTTTTTTAGCCAATGAAT-GATCTTTTCTTCATATTTAC-
1 AAGGCATGGGTGACTATAAATGGACTTTTCTT-GCCAATGAATGGCT-TTTTCTTCACGTTT-CT
* ** * * *
26563 CAAGTTAGACATTCAATAATAATTTGTTTTAACCAAAAATGTAAAACAATTCAACCTAAAATCAA
63 TAAGGCAAACATTCAATTATAATTTGTTTTAA-CAAAAATGTAAAA-AATTCAACATAAAATCAA
* * * * * * ** *
26628 TTATGAGATTTTAAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGCTTTAAAATGCTTGGGTGACTAGAAA
126 TTATGAGATTAT-AAAACCATTTAAAGTGAGTAA-TAAGCTTTTAAAGGCATGGGCAACTATAAA
* * * * * * *
26693 TCGACTTTTCTTACCAATGAAAGGCTTTTTCTTCATGTTTCTTGAGGCAGATATTCAATGATAAT
189 TGGACTTTTCTTGCCAATGATAGCCTTTTT-TTCATGTTTCTTAAGGCAGACATTCAATTATAAT
* ** * * * * *
26758 CTATTTTAGTCAAAAATGTAAAAAATTCAACTTAAAATTAATTACGAGATTATAAAAACGTTTAA
253 CTGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAA
* * *
26823 AGCGCGTAATAAGGTTTTC-
318 AGCGAGTAATAAAGCTTTCG
* * * ** * * **
26842 AGAGGCATGGGTGGCTATAAATGGACTTTTCTTGCTACT-AATACCTTTTTCTTTATGTTTCTCG
1 A-AGGCATGGGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCTTCACGTTTCTTA
* * * * *
26906 AGGTAGACATTCAATTATAATATGTTTTCATCAAAAACGTAAAACAAGTT-AACATAAAATCAAT
65 AGGCAAACATTCAATTATAATTTGTTTT-AACAAAAATGTAAAA-AA-TTCAACATAAAATCAAT
** * * * * * * * *
26970 TACAAGATTACAAAGCTATTTAAAGGGAGTAATTAGAATTTTAAAGGCATGGGTAACTATAAATA
127 TATGAGATTATAAAACCATTTAAAGTGAGTAATAAG-CTTTTAAAGGCATGGGCAACTATAAATG
* * * ** ** * *
27035 AACTTTTCTTGCCAATGA-ATCGATTTCTCATCATGTTTCCCAAGGCAGACATTCAATTATTATT
191 GACTTTTCTTGCCAATGATAGC-CTTT-TTTTCATGTTTCTTAAGGCAGACATTCAATTATAATC
* *
27099 TGTTTTAACCAAAAATGTAAACAAATTCAACGTAAAATCAATTATGAGATTATAAAGCCATTTAA
254 TGTTTTAACCAAAAATGTAAA-AAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAA
*** * * * * *
27164 AATAACTAATTAGGATTTTG
318 AGCGAGTAATAAAGCTTTCG
* * * * * * * **
27184 ACA-GCATGGGTAACCACAAATGGACTTTTCTAGCCAATGAATGCCTTTTTTTTTCATGTTTCCC
1 A-AGGCATGGGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATGGC-TTTTTCTTCACGTTTCTT
** * * * *
27248 AAGGCAGGCATTCAATAATAATTGGTTTTCACTAAAAATGTAAAAAATTAAACATAAAATCAATT
64 AAGGCAAACATTCAATTATAATTTGTTTTAAC-AAAAATGTAAAAAATTCAACATAAAATCAATT
* * * * * ** *
27313 ATAAGATTATAAAATCATTTAAAGTGAGTAATTAGGC-TTTAGAGTGCTTGGGTGACTAGAAATG
128 ATGAGATTATAAAACCATTTAAAGTGAGTAA-TAAGCTTTTAAAG-GCATGGGCAACTATAAATG
* * * *
27377 TACTTTT-TCTGCAAATGA-ATGACTTTTTCTTCATGTTTCTTAAGGCAGATATTCAATTATAAT
191 GACTTTTCT-TGCCAATGATA-GCCTTTTT-TTCATGTTTCTTAAGGCAGACATTCAATTATAAT
* ********** *
27440 CTGTTTTAA-CAAACAATGTAAAAAATTCAACTTAAAANNNNNNNNNNGATTATAAAAACATTTA
253 CTGTTTTAACCAAA-AATGTAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTA
* *
27504 AAGCGCGTAATAAGGCTTTCG
317 AAGCGAGTAATAAAGCTTTCG
*
27525 AACGCATGGGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAACGAATGCCTTTTCTTGCCAATGAATGGC
1 AAGGCATGGGTGACTAT-AA---A-------TG-----G-A---CTTTTCTTGCCAATGAATGGC
* * * * * * * * *******
27590 TTTTTCTTTATGTTTCCTAAGGTATACATTCGATTATAATCTATTTTAACCAAAAATNNNNNNNN
46 TTTTTCTTCACGTTTCTTAAGGCAAACATTCAATTATAATTTGTTTTAA-CAAAAAT-GTAAAAA
** * * * * * * *
27655 NNTCAACCTAAAATCAGTTATGAGATTATAAAACCATGTAAAGCGAGTAATTAGGGTTTTGAAGG
109 ATTCAACATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGTGAGTAA-TAAGCTTTTAAAGG
* * * * * * *
27720 CATAGGTAACTATAAATAGACTTTTCTTCCCAATGA-ATG-GTTTTTTCCTCAAGTTTCTCAAGG
173 CATGGGCAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGATA-GCCTTTTTT--TCATGTTTCTTAAGG
* * * * *
27783 TAGACATTCAATTATAATCTGCTTTAACAAAAAATGTAAACAAATTAAACATAAAATCAATTATG
235 CAGACATTCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAA-AAATTCAACCTAAAATCAATTATG
* * ** *
27848 AGATTATAAATCCATTTAAAGTGAGTAATAGGGATTTCG
299 AGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAAGCTTTCG
* * * * ** * *
27887 AAGGTATAGGTAACAATAAATAAACTTTTCTTGCCAATG-ATAGCCTTTCTT-TTCATGTTTCTT
1 AAGGCATGGGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAAT-GGCTTT-TTCTTCACGTTTCTT
* * * * * * ****
27950 AAAGCAGATATTCAATTATAATATGTTTTAACAAAAAATATAAAAAAATTCAACCTAAAANNNNN
64 AAGGCAAACATTCAATTATAATTTGTTTTAAC-AAAAATGT-AAAAAATTCAACATAAAA-TCAA
*****************************************************************
28015 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
126 TTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGTGAGTAATAAGCTTTTAAAGGCATGGGCAACTATAAATG
*****************************************************************
28080 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
191 GACTTTTCTTGCCAATGATAGCCTTTTTTTCATGTTTCTTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTG
***** * * * * *
28145 NNNNNA--AAAAATATAAAAACATTTAACATAAAATCAATTATGAGAGTATAAAACCATTAAAAG
256 TTTTAACCAAAAATGTAAAAA-ATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAG
* *
28208 TGAGTAATAAGGCTTTC-
320 CGAGTAATAAAGCTTTCG
* * * *
28225 AAAGCTATGGGTTACTATAAATGTACTTTTCTTGCCAATG-ATAGCATTTTTCTTCACGTTT-TT
1 AAGGC-ATGGGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATGGC-TTTTTCTTCACGTTTCTT
* * * **************************
28288 TAGGTAAAAATTCAATTATAAGCCATTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
64 AAGGCAAACATTCAATTAT-A---ATTT-----------GTTTTAACAAAAATGTAAAAAATTCA
*****************************************************************
28353 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
114 ACATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGTGAGTAATAAGCTTTTAAAGGCATGGG
*************************** ** * * * * **
28418 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGA-ATGGTTTTTTTTC-TCATTTCCTAAAGTAGATGT
179 CAACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGATA-GCCTTTTTTTCAT-GTTTCTTAAGGCAGACAT
* * * *
28481 TGAATTATAATCTG-TTTAACCAAAAATGTAAAAGATTTCAACCTAAAATCAATTTTGAGATTTT
242 TCAATTATAATCTGTTTTAACCAAAAATGTAAAA-AATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTAT
* *
28545 AAAACCATTTAAAGCTAGTAATTACA-CTTTCG
306 AAAACCATTTAAAGCGAGTAA-TAAAGCTTTCG
* * * * * * * *** *
28577 ATGGCATAGGTAACTACAAATAGACTTTTCTAGCTAATGAATGGCTTTTTCTTTGTGTTTCTCAA
1 AAGGCATGGGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCTTCACGTTTCTTAA
** * * * * ** *
28642 GATAAAACATTCAATAATAATTTATTTTAATAAAAAATGTAGAAAAACTCAACCCAAAATTAATT
66 G-GCAAACATTCAATTATAATTTGTTTTAA-CAAAAATGTA-AAAAATTCAACATAAAATCAATT
* ** * * *
28707 ATGACATTATAAAACCATTTAAAGCAAGTAATAAGGCTTTCAAAGGTATGGGCAACTATAAATTG
128 ATGAGATTATAAAACCATTTAAAGTGAGTAATAA-GCTTTTAAAGGCATGGGCAACTATAAATGG
* * * *
28772 ACTTTTATTGCTAATGATAGCCTTTTTCTTCACGTTTCTTGAGGCAGACATTCAATTATAATCTG
192 ACTTTTCTTGCCAATGATAGCCTTTTT-TTCATGTTTCTTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTG
* ** * *
28837 TTTTCATTAAAAATGTAAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGAGATTAGAAAACCATTTAAAGC
256 TTTTAACCAAAAATGTAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGC
* *
28902 GCGTAATAAAGCTTTCA
321 GAGTAATAAAGCTTTCG
* * * *
28919 AAGGTATGGGTGACTATAAATAGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTATTTCTTCACGTTTCCTAA
1 AAGGCATGGGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCTTCACGTTTCTTAA
* * * * * **
28984 GGTAAACATTTAAGTATAATCTGTTTTAACCAAAAATATAAAAATATTTTACATAAAATCAATTA
66 GGCAAACATTCAATTATAATTTGTTTTAA-CAAAAATGTAAAAA-ATTCAACATAAAATCAATTA
* * * * * * *
29049 CGAGATTATAAAACTATTTAAAGTGAGTAATTATGATTTTGAAGGTATGGGTAACTATAAATGGA
129 TGAGATTATAAAACCATTTAAAGTGAGTAA-TAAGCTTTTAAAGGCATGGGCAACTATAAATGGA
* * ** * * *
29114 CTTTTGTTGTCAATGAATAGCCTTTTCTTT-ATGTTTCCCAAGGTAGATATTCAATTATAATTTG
193 CTTTTCTTGCCAATG-ATAGCCTTTT-TTTCATGTTTCTTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTG
* * *
29178 TTTGAA-CAAAAAT-TAAAAAAAATTTAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTAAAA
256 TTTTAACCAAAAATGT--AAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAA
* * *
29241 GCGAGTAATGAGGCTTTTG
319 GCGAGTAATAAAGCTTTCG
* * * * ***
29260 AAGGCTTGAGTGACTAGAAATGAACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCTTCTTATTT-TTCA
1 AAGGCATGGGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCTTCACGTTTCTT-A
* * *
29324 AGGTAGACATTCAATAATAATTTGTTTTAACCAAAAAATGTAAAAAAATTCAATC-TAAAATCAA
65 AGGCAAACATTCAATTATAATTTGTTTTAA-C-AAAAATGT-AAAAAATTCAA-CATAAAATCAA
* * * * * * *
29388 TTATGACATTATAAAATCATTTTAAGTGAGCAATCAGGCTTTTGAAGGCATGGGTAACTATAAAT
126 TTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGTGAGTAAT-AAGCTTTTAAAGGCATGGGCAACTATAAAT
** * * *
29453 GGACCTTTT-TTGCCAATGA-ATGGTTTTTTCTTCATGTTT-TCTAAGGTAGACATTTAATTGTA
190 GGA-CTTTTCTTGCCAATGATA-GCCTTTTT-TTCATGTTTCT-TAAGGCAGACATTCAATTATA
*
29515 AT-TCGTTTTAACCAAAAATGTAGGAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCAT
251 ATCT-GTTTTAACCAAAAATGTA-AAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCAT
** *
29579 TTAAAGTTAGTAAT-TAGACTTTCG
314 TTAAAGCGAGTAATAAAG-CTTTCG
* * * * * * *
29603 AATGCATGGGTGACCAGAAAGGGACTTTTCTTGCTAATAAATGGCTTTTTCTTCACGTTTCTTGA
1 AAGGCATGGGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCTTCACGTTTCTTAA
* * * * * * * * *
29668 GGCAAATATTCAATTATAATCTATTGTAATAAAAATGTTAAAAGTTCAACCTAAAATCTATTATG
66 GGCAAACATTCAATTATAATTTGTTTTAACAAAAATGTAAAAAATTCAACATAAAATCAATTATG
* * * * * ** * * *
29733 AGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATTAGGTTTTCCAATGCATGGGTGACCAAAAATAGACT
131 AGATTATAAAACCATTTAAAGTGAGTAATAAGCTTTT-AAAGGCATGGGCAACTATAAATGGACT
* * * * * * *
29798 TTTCTTACCAATTAATGGCTTTTTCTTTACA--TTTCTT-AGGCAAATATTCAATTATAATGTGT
195 TTTCTTGCCAA-TGATAGCCTTTT-TTT-CATGTTTCTTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGT
* * * * *
29860 TTTAATCAAAAATATAAAAAATTCAACTTAAAATCAATTATGATATTATAATACCATTTAAAGCG
257 TTTAACCAAAAATGTAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCG
* *
29925 CGTAATAAAGCTTTCA
322 AGTAATAAAGCTTTCG
* * * *
29941 AAGGTATGGGTGACTATAAATGGACTTTTCTTACCAATGAATAG-TTGTTTCTTTACGTTTCTTA
1 AAGGCATGGGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTT-TTTCTTCACGTTTCTTA
* * *
30005 AGGTAAACATTCAATTATAA-TCGATTTTAATCAAAAATGTAAAACAATTTAACATAAAATCAAT
65 AGGCAAACATTCAATTATAATTTG-TTTTAA-CAAAAATGTAAAA-AATTCAACATAAAATCAAT
* * * * * *
30069 TACGAGATTATAAAACCATTTAAAGCT-AGTAATTACGATTTTGAAGGCATTGGCAACTAAAAAT
127 TATGAGATTATAAAACCATTTAAAG-TGAGTAA-TAAGCTTTTAAAGGCATGGGCAACTATAAAT
* * * * * * *
30133 GGACTTTTGTTGCTAGTGAATGGCCTTTTCTTCATGTTTCCTAAGGCAAACATTCAATTATAATC
190 GGACTTTTCTTGCCAATG-ATAGCCTTTTTTTCATGTTTCTTAAGGCAGACATTCAATTATAATC
** * ** * *
30198 TGTTTTAATGAAAATTAAAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATTAGATTATAAAACTATTTAAA
254 TGTTTTAACCAAAAATGTAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAA
* *
30263 GCGAGTAATTAAGCTTTTG
319 GCGAGTAATAAAGCTTTCG
* * * * * * * * * *
30282 AAAGTATGGGTAACTATTAATGGACTTTGCTTACTAATGAATGACCTTTTTC-TCAAGTTTCTTG
1 AAGGCATGGGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATG-GCTTTTTCTTCACGTTTCTTA
* ** * * *
30346 AGACAGGCTTTCAATTATAATATGTTTTAACAAAACATATAAAAAATTCAACATAAAATCAATTA
65 AGGCAAACATTCAATTATAATTTGTTTTAACAAAA-ATGTAAAAAATTCAACATAAAATCAATTA
* * *
30411 TGAGATTATAAAACCATTTAAAGTGAGTAATAAAGCTTTTAAAGGTATGAG-AGACTATAAATAG
129 TGAGATTATAAAACCATTTAAAGTGAGTAAT-AAGCTTTTAAAGGCATGGGCA-ACTATAAATGG
* *
30475 ACTTTTCTTGCCAATGATAGCCTTTTTTGTCATGTTTCTTGAGGTAGACATTCAATTATAATCTG
192 ACTTTTCTTGCCAATGATAGCCTTTTTT-TCATGTTTCTTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTG
* * * * *
30540 TTTTCACCAAAAATATAAAAAAATCAACATAAAATCAATTATGAGATTATAAAACTATTTAAAGC
256 TTTTAACCAAAAATGTAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGC
30605 GAAG-AATAAAGCTTTCG
321 G-AGTAATAAAGCTTTCG
* * * * *
30622 GAGGCATAGGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATG-ATAGCCTTTTTCTTCACGTTTTTTG
1 AAGGCATGGGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAAT-GGCTTTTTCTTCACGTTTCTTA
* * *
30686 AGGCAAACATTCAATTATAATATGTTTTCATCAAAAATGTAAAAAATTCAACATAAAAGCAATTA
65 AGGCAAACATTCAATTATAATTTGTTTT-AACAAAAATGTAAAAAATTCAACATAAAATCAATTA
* * ** * * **
30751 TGACATTATAAAACCTTTTAAAACGAGTAATAAGGTTGTCAAAGGCATGGGTGACTATAAATGGA
129 TGAGATTATAAAACCATTTAAAGTGAGTAATAAGCTT-TTAAAGGCATGGGCAACTATAAATGGA
* * * * *
30816 CTTTTCTTGCCAATGATAGCTTTTTTCTTCATGTTTCTTGAGGCAGATATTCATTTATAATTTGT
193 CTTTTCTTGCCAATGATAGCCTTTTT-TTCATGTTTCTTAAGGCAGACATTCAATTATAATCTGT
* * * * *
30881 TTTCACCAAAAATGTAAAAAATTCAACATAAAATCAATTATAAGATTATAAAACCATTTAGAGTG
257 TTTAACCAAAAATGTAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCG
*
30946 AGTAATAAGGCTTTC-
322 AGTAATAAAGCTTTCG
* * * * *
30961 AAGGACATGGATAACTATAAATAGACTTTT-TGTACCAATGACA--ACTTTTTTCTTCACGTTTC
1 AAGG-CATGGGTGACTATAAATGGACTTTTCT-TGCCAATGA-ATGGC-TTTTTCTTCACGTTTC
* **
31023 TTGAGGCAGTCATTCAATTATAATTTGTTTTAAACAAAAATGTAAAAAAATTCAAC
62 TTAAGGCAAACATTCAATTATAATTTGTTTT-AACAAAAATGT-AAAAAATTCAAC
31079 CTANNNNNNN
Statistics
Matches: 7901, Mismatches: 2124, Indels: 833
0.73 0.20 0.08
Matches are distributed among these distances:
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335 8 0.00
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AAGGCATGGGTGACTATAAATGGACTTTTCTTGCCAATGAATGGCTTTTTCTTCACGTTTCTTAA
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AGATTATAAAACCATTTAAAGTGAGTAATAAGCTTTTAAAGGCATGGGCAACTATAAATGGACTT
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ACCAAAAATGTAAAAAATTCAACCTAAAATCAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGCGAGTA
ATAAAGCTTTCG
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34303 GAGATTGCTT
* * *
34313 CCAGAAACTGGGTTTAGAGACAGAAACGACTTAATCGAC-AAAGAAGTTTTGTTGGTCGGCTAAG
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*
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1 CCAGAAACT-GGGTTTAGAGACAGAAACGACTTAATCGACTAAAAAGTTTTGATAGTCGACTAAG
34450 AGGCTACTA
65 AGGCTACTA
* * *
34459 CCAGAAACTGGGTTCAGAGACAGAGACGACTTAGTCGACTAA
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34501 GTAATAATGA
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CCAGAAACTGGGTTTAGAGACAGAAACGACTTAATCGACTAAAAAGTTTTGATAGTCGACTAAGA
GGCTACTA
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38807 AT
1 AT
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ATGCAATTTGCTTTTA
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* * * *
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* * * * * * *
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*
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AATGTTAGTCGACTAAGAGACTACTGCCAAAAATCGAGTTCAAAGACAGAAACGACTTAATCAAC
TAAGAAAT
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46889 CTTGAACCTC
46899 TCAATACCTTCTACAGAACCAGTGAA
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* *
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*
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TCAATACCTTCTACAGAACCAGTGAA
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47837 CAGAATCCAA
* * * * *
47847 GTTCAGAGACAGAAATAACTTAATCGACTAAGAAGTTTTGTTAGTAGACTAAGAGGCTATTGCTA
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* * *
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66 GAAA
47989 CTAAGNNNNN
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GTTCAGAGACAAAAATAACTTAATCAACTAAGAAGTTTTGATAGTAGACTAAGAGGCTACTGCCA
GAAATCGG
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51201 TTTCGTTACA
* * * **
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* * * *
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66 AAAAGCCATTCATTAGCAACAAAAGCCCATTTATAGTCACCCATACCTTCAAAAGCCTTATTACT
* * * *
51341 CGCTTTAAATGGTTTTATAATTTCATAATTGATTTTAGCTTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAA
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** * * * * *
51406 AACAAATTGTAATTGAATGTTTACCTCGAGAAACGAAAAGGAAAACCCATTCATTGGCAAGAAAA
196 AACAAATTACAACTGAATGTTTACCTCGAAAAACGAAAAGAAAAACCCATTCATTGACAACAAAA
** * * * *
51471 GCCCATTTATAGTAACTTACGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTTAATGGTTTTATAATATC
261 GCCCATTTATAGTAACCCACGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCGATTTTAATGATTTTATAATATA
* *
51536 ATAGCTGATTTTAAGTT
326 ATAACTAATTTTAAGTT
* * * **
51553 GAATGTTCTTACATTTTTTGTTAAAACAGATTATAATTAAATGTCTACCTTAGGAAACGTGAAG-
1 GAATGTTTTTACATTTTTAGTTAAAACAGATTATAATTAAATATCTACCTTAAAAAACGTGAAGA
* * *
51617 AAAA-CCTATTCATTTGCAAGAAAAGCCCATTTATAGTCACCCA-AGCCTTTAAAAGCCTTATTA
66 AAAAGCC-ATTCATTAGCAACAAAAGCCCATTTATAGTCACCCATA-CCTTCAAAAGCCTTATTA
*
51680 CTCGCTTTGAATGGCTTTATAATCTT-ATAATTAATTTTAGATTGAACTTTTTTACATTTTTGGT
129 CTCGCTTTAAATGGCTTTATAAT-TTCATAATTAATTTTAGATTGAACTTTTTTACATTTTTGGT
* * * * ** **
51744 TAAAACAGATTACAACTGAATGTTTGCCTTGAAAAATGTGAAGAAAAAGTCATTCATTGACAACA
193 TAAAACAAATTACAACTGAATGTTTACCTCGAAAAACGAAAAGAAAAACCCATTCATTGACAACA
* * *
51809 AAAGCCCATTTATAGTCACCCATGCCTTCGAAAGCCTTATTATTCGATTTTAATGATTTTATAAT
258 AAAGCCCATTTATAGTAACCCACGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCGATTTTAATGATTTTATAAT
* *
51874 CTAATAATTAATTTTAAGTT
323 ATAATAACTAATTTTAAGTT
51894 GAATGTTTTTACATTTTTAGTTAAAACAGATTATAA
1 GAATGTTTTTACATTTTTAGTTAAAACAGATTATAA
51930 NNNNNNNNNN
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.35, C:0.14, G:0.13, T:0.38
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GAATGTTTTTACATTTTTAGTTAAAACAGATTATAATTAAATATCTACCTTAAAAAACGTGAAGA
AAAAGCCATTCATTAGCAACAAAAGCCCATTTATAGTCACCCATACCTTCAAAAGCCTTATTACT
CGCTTTAAATGGCTTTATAATTTCATAATTAATTTTAGATTGAACTTTTTTACATTTTTGGTTAA
AACAAATTACAACTGAATGTTTACCTCGAAAAACGAAAAGAAAAACCCATTCATTGACAACAAAA
GCCCATTTATAGTAACCCACGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCGATTTTAATGATTTTATAATATA
ATAACTAATTTTAAGTT
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Period size: 171 Copynumber: 4.2 Consensus size: 171
51201 TTTCGTTACA
* * * * * ** *
51211 GAATATTTTTATATTTTTAGTTAAAACAGATTATAATTGAATATCTGTCTTAAAAAACGTGAAGA
1 GAATGTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTTTACCTTGAAAAACGTGAAGA
* * * * **
51276 AAAAGCCATTCATT-AGCAACAAAAGTCCATTTATGGTCACCTATATCTTCAAAAGCCTTATTAC
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* * * *
51340 TCGCTTTAAATGGTTTTATAATTTCATAATTGATTTTAGCTT
130 TCGCTTTTAATGGTTTTATAATCTCATAATTAATTTTAGATT
* * * * * ** *
51382 GAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAAATTGTAATTGAATGTTTACCTCGAGAAACGAAAAGG
1 GAATGTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTTTACCTTGAAAAACGTGAAGA
* * * ** * **
51447 AAAACCCATTCATTGGCAAGAAAAGCCCATTTATAGTAACTTACGCCTTTGAAAGCCTTATTACT
66 AAAACCCATTCATTGACAACAAAAGCCCATTTATAGTCACCCATGCCTTCAAAAGCCTTATTACT
* ** *
51512 CGCTTTTAATGGTTTTATAATATCATAGCTGATTTTA-AGTT
131 CGCTTTTAATGGTTTTATAATCTCATAATTAATTTTAGA-TT
* * * * *
51553 GAATGTTCTTACATTTTTTGTTAAAACAGATTATAATTAAATGTCTACCTT-AGGAAACGTGAAG
1 GAATGTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTTTACCTTGA-AAAACGTGAAG
* * * *
51617 -AAAACCTATTCATTTG-CAAGAAAAGCCCATTTATAGTCACCCAAGCCTTTAAAAGCCTTATTA
65 AAAAACCCATTCA-TTGACAACAAAAGCCCATTTATAGTCACCCATGCCTTCAAAAGCCTTATTA
* * *
51680 CTCGCTTTGAATGGCTTTATAATCTTATAATTAATTTTAGATT
129 CTCGCTTTTAATGGTTTTATAATCTCATAATTAATTTTAGATT
* * * *
51723 GAACT-TTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATTACAACTGAATGTTTGCCTTGAAAAATGTGAAG
1 GAA-TGTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTTTACCTTGAAAAACGTGAAG
** * *
51787 AAAAAGTCATTCATTGACAACAAAAGCCCATTTATAGTCACCCATGCCTTCGAAAGCCTTATTAT
65 AAAAACCCATTCATTGACAACAAAAGCCCATTTATAGTCACCCATGCCTTCAAAAGCCTTATTAC
* * *
51852 TCGATTTTAATGATTTTATAATCTAATAATTAATTTTA-AGTT
130 TCGCTTTTAATGGTTTTATAATCTCATAATTAATTTTAGA-TT
*
51894 GAATGTTTTTACATTTTTAGTTAAAACAGATTATAA
1 GAATGTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATTATAA
51930 NNNNNNNNNN
Statistics
Matches: 458, Mismatches: 79, Indels: 22
0.82 0.14 0.04
Matches are distributed among these distances:
170 144 0.31
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GAATGTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTTTACCTTGAAAAACGTGAAGA
AAAACCCATTCATTGACAACAAAAGCCCATTTATAGTCACCCATGCCTTCAAAAGCCTTATTACT
CGCTTTTAATGGTTTTATAATCTCATAATTAATTTTAGATT
Found at i:60872 original size:171 final size:171
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60364 NNNNNNNNNN
* * *
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1 TTTAGGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTGACTATCTGCCTTGAGAAA
* * * *
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66 AATGAAGAAAAAGCCATTGATTGATAAGAAAAGCCCATTTATAGTCACCCATACCTTCAAAAGCC
* * * *
60504 TTATTACTCGCTTTAAATAGTTTTGTAATTTCATAAGTAAT
131 TTATTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGAT
** * * * *
60545 TTTACATTAAATGTTTTTACATTTTTGGATAAAACAGATTATAATTGACTACCTGCCTTGA-AAA
1 TTTAGGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTGACTATCTGCCTTGAGAAA
* * * * *
60609 ACTTTAAAAAAAAAAGCCATTGATTGATAAGAAAAGCCCAGTTATAGCCACCCATACCTTCAAAA
66 A--AT-GAAGAAAAAGCCATTGATTGATAAGAAAAGCCCATTTATAGTCACCCATACCTTCAAAA
* * *
60674 GCTTTATTAATTC-CTTCAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGAT
128 GCCTTATT-ACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGAT
* *
60718 TTTAGGTT-AATTTTTTTTTACATTTTTGGGT-AAACAGATTATAATTGACTATCTGCCTTAAGA
1 TTTAGGTTGAA--TTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTGACTATCTGCCTTGAGA
* * * * *
60781 AAAATGAAGGAAAAGCCATTGATCGATAAGAAAAACCCATTTATAGTCACCCATAGCTTCAAAAC
64 AAAATGAAGAAAAAGCCATTGATTGATAAGAAAAGCCCATTTATAGTCACCCATACCTTCAAAAG
* *
60846 CCTTATTACTCGCTTTAAAAAGTTTTATAATCTCATAACTGAT
129 CCTTATTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGAT
* * * * * * * *
60889 TTTAGGTTAAATTTTTTTATATTTTTGGTTAAAATAGATTATAATTAATTGTTTGCCTTGGGAAA
1 TTTAGGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTGACTATCTGCCTTGAGAAA
** * * * * * *
60954 CGTGAAGAAAAACCCATTCATT--T--G-CAAGTCTATTTATAGTCACCCAAACCTTCAAAAGCC
66 AATGAAGAAAAAGCCATTGATTGATAAGAAAAGCCCATTTATAGTCACCCATACCTTCAAAAGCC
* * ** * *
61014 TTATTACTCACCTTAAAGGGTTTTACAACCTCATAATTGAT
131 TTATTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGAT
** **
61055 TTTA-GTATGAATTTTTTTACATTTTTAATTAAAACAGATTATAATTGACTATCTATCTTGAGAA
1 TTTAGGT-TGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTGACTATCTGCCTTGAGAA
* *
61119 ATATGAA-AGAAAAGCCATTGATTGATAAGAAAA-CCCATTTATAGTCACTCATACCTTCAAAAG
65 AAATGAAGA-AAAAGCCATTGATTGATAAGAAAAGCCCATTTATAGTCACCCATACCTTCAAAAG
* *
61182 CCTTATTACTCGCTTTCAATAGTTTTATAATCTCATAACTGAT
129 CCTTATTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGAT
* * * * *
61225 TTTAGGTTGAATTTTTTTATA-TTTTGGTTAAAACAGATTATAATTAACTGTTTTCCTT-AGAAA
1 TTTAGGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTGACTATCTGCCTTGAGAAA
* * * * * * * * *
61288 AAGCGAAGAAAAAGGCTTTCATTGGTAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCAT-TCTCTCAAAAG
66 AA-TGAAGAAAAAGCCATTGATTGATAAGAAAAGCCCATTTATAGTCACCCATACCT-TCAAAAG
* * * * *
61352 CCTTATTACTTGTTTTAAATGGTTTTGTAATCTCAAAATTGAT
129 CCTTATTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGAT
* * * *
61395 TTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACA-AGTTATGATTGATTGTCTGCCTTGAGAA
1 TTTAGGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGA-TTATAATTGACTATCTGCCTTGAGAA
* * * * * *
61459 ACATGAAAAAAAAGCCATTCATTGACAAGAAAAGCCCATTTATAGTCACTCTTACCTTCAAAAGC
65 AAATGAAGAAAAAGCCATTGATTGATAAGAAAAGCCCATTTATAGTCACCCATACCTTCAAAAGC
61524 CTTATTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAA
130 CTTATTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAA
61561 CTGANNNNNN
Statistics
Matches: 842, Mismatches: 148, Indels: 52
0.81 0.14 0.05
Matches are distributed among these distances:
165 3 0.00
166 129 0.15
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ACGTcount: A:0.36, C:0.15, G:0.12, T:0.38
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AATGAAGAAAAAGCCATTGATTGATAAGAAAAGCCCATTTATAGTCACCCATACCTTCAAAAGCC
TTATTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGAT
Found at i:61397 original size:506 final size:511
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Indices: 60374--61560 Score: 1367
Period size: 506 Copynumber: 2.3 Consensus size: 511
60364 NNNNNNNNNN
* * * *
60374 TTTAAGTTGAATGTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAAATTATAATTGACTATCTGCCTTGAGAAA
1 TTTAAGTTAAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAAC-AATTATAATTGATTGTCTGCCTTGAGAAA
* * * *
60439 CATGAAGAAAAAGCCATTGATTGATAAGAGAAGCCCATTTATAGTCACACATACTTTCAAAAGCC
65 CATGAAGAAAAAGCCATTCATT-AT-AGACAAGCCCATTTATAGTCACACAAACCTTCAAAAGCC
* * * ** **
60504 TTATTACTCGCTTTAAATAGTTTTGTAATTTCATAAGTAATTTTACATTAAATGTTTTTACATTT
128 TTATTACTCACCTTAAAGAGTTTTACAACCTCATAAGTAATTTTACATTAAATGTTTTTACATTT
* * *
60569 TTGGATAAAACAGATTATAATTGACTACCTGCCTTGAAAAACTTTAAAAAAAAAAGCCATTGATT
193 TTGAATAAAACAGATTATAATTGACTACCTACCTTGAAAAACTATAAAAAAAAAAGCCATTGATT
* *
60634 GATAAGAAAAGCCCAGTTATAGCCACCCATACCTTCAAAAGCTTTATTAATTCCTTCAAATAGTT
258 GATAAGAAAAGCCCAGTTATAGCCACCCATACCTTCAAAAGCCTTATTAACTCCTTCAAATAGTT
*
60699 TTATAATCTCATAATTGATTTTAGGTTAATTTTTTTTTACATTTTTGGGTAAACAGATTATAATT
323 TTATAATCTCATAACTGATTTTAGGTTAA-TTTTTTTTACATTTTTGGGTAAACAGATTATAATT
* * * *
60764 GACTATCTGCCTTAAGAAAAATGAAGGAAAAGCCATTGATCGATAAGAAAAACCCATTTATAGTC
387 AACTATCTGCCTTAAGAAAAACGAAGAAAAAGCCATTCATCGATAAGAAAAACCCATTTATAGTC
*
60829 ACCCATAGCTTCAAAACCCTTATTACTCGCTTTAAAAAGTTTTATAATCTCATAACTGAT
452 ACCCATAGCTTCAAAACCCTTATTACTCGCTTTAAAAAGTTTTATAATCTCAAAACTGAT
* * * * * *
60889 TTTAGGTTAAATTTTTTTATATTTTTGGTTAAAATAGATTATAATTAATTGTTTGCCTTGGGAAA
1 TTTAAGTTAAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACA-ATTATAATTGATTGTCTGCCTTGAGAAA
* * * * *
60954 CGTGAAGAAAAACCCATTCATT-T-G-CAAGTCTATTTATAGTCACCCAAACCTTCAAAAGCCTT
65 CATGAAGAAAAAGCCATTCATTATAGACAAGCCCATTTATAGTCACACAAACCTTCAAAAGCCTT
* * * * * *
61016 ATTACTCACCTTAAAGGGTTTTACAACCTCATAATTGATTTTA-GTATGAATTTTTTTACATTTT
130 ATTACTCACCTTAAAGAGTTTTACAACCTCATAAGTAATTTTACAT-TAAATGTTTTTACATTTT
* * * * *
61080 T-AATTAAAACAGATTATAATTGACTATCTATCTTGAGAAA-TAT-GAAAGAAAAGCCATTGATT
194 TGAA-TAAAACAGATTATAATTGACTACCTACCTTGAAAAACTATAAAAAAAAAAGCCATTGATT
* * *
61142 GATAAGAAAA-CCCATTTATAGTCACTCATACCTTCAAAAGCCTTATT-ACTCGCTTTC-AATAG
258 GATAAGAAAAGCCCAGTTATAGCCACCCATACCTTCAAAAGCCTTATTAACTC-C-TTCAAATAG
* *
61204 TTTTATAATCTCATAACTGATTTTAGGTTGAA-TTTTTTTATA-TTTTGGTTAAAACAGATTATA
321 TTTTATAATCTCATAACTGATTTTAGGTT-AATTTTTTTTACATTTTTGGGT-AAACAGATTATA
* * * * * * * ** *
61267 ATTAACTGTTTTCCTT-AGAAAAAGCGAAGAAAAAGGCTTTCATTGGTAAGAAAAGTCTATTTAT
384 ATTAACTATCTGCCTTAAGAAAAA-CGAAGAAAAAGCCATTCATCGATAAGAAAAACCCATTTAT
* * * * * ** * *
61331 AGTCACTCAT-TCTCTCAAAAGCCTTATTACTTGTTTTAAATGGTTTTGTAATCTCAAAATTGAT
448 AGTCACCCATAGCT-TCAAAACCCTTATTACTCGCTTTAAAAAGTTTTATAATCTCAAAACTGAT
* *
61395 TTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAAGTTATGATTGATTGTCTGCCTTGAGAAA
1 TTTAAGTTAAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAA-TTATAATTGATTGTCTGCCTTGAGAAA
* * * * **
61460 CATGAAAAAAAAGCCATTCATTGACAAGAAAAGCCCATTTATAGTCACTCTTACCTTCAAAAGCC
65 CATGAAGAAAAAGCCATTCATT-A-TAGACAAGCCCATTTATAGTCACACAAACCTTCAAAAGCC
* * * * *
61525 TTATTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAA
128 TTATTACTCACCTTAAAGAGTTTTACAACCTCATAA
61561 CTGANNNNNN
Statistics
Matches: 561, Mismatches: 96, Indels: 34
0.81 0.14 0.05
Matches are distributed among these distances:
505 17 0.03
506 191 0.34
507 67 0.12
508 32 0.06
509 4 0.01
510 115 0.20
511 61 0.11
513 1 0.00
514 1 0.00
515 72 0.13
ACGTcount: A:0.36, C:0.15, G:0.12, T:0.38
Consensus pattern (511 bp):
TTTAAGTTAAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAATTATAATTGATTGTCTGCCTTGAGAAAC
ATGAAGAAAAAGCCATTCATTATAGACAAGCCCATTTATAGTCACACAAACCTTCAAAAGCCTTA
TTACTCACCTTAAAGAGTTTTACAACCTCATAAGTAATTTTACATTAAATGTTTTTACATTTTTG
AATAAAACAGATTATAATTGACTACCTACCTTGAAAAACTATAAAAAAAAAAGCCATTGATTGAT
AAGAAAAGCCCAGTTATAGCCACCCATACCTTCAAAAGCCTTATTAACTCCTTCAAATAGTTTTA
TAATCTCATAACTGATTTTAGGTTAATTTTTTTTACATTTTTGGGTAAACAGATTATAATTAACT
ATCTGCCTTAAGAAAAACGAAGAAAAAGCCATTCATCGATAAGAAAAACCCATTTATAGTCACCC
ATAGCTTCAAAACCCTTATTACTCGCTTTAAAAAGTTTTATAATCTCAAAACTGAT
Done.