Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: NW_018397328.1 Herrania umbratica cultivar Fairchild unplaced genomic scaffold, ASM216827v2 scaffold_329.0, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
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tuple sizes 0,4,5,7
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Warning! 4830 characters in sequence are not A, C, G, or T
Found at i:706 original size:11 final size:11
Alignment explanation
Indices: 690--716 Score: 54
Period size: 11 Copynumber: 2.5 Consensus size: 11
680 ATGGATAGCT
690 TTTGCTTCATG
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1 TTTGCTTCATG
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Statistics
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1.00 0.00 0.00
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TTTGCTTCATG
Found at i:1715 original size:171 final size:170
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1414 CTAAGACTTC
* *
1424 TTACTTGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTAGATATTTTTACATTTTTG
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* * * *
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* ** *
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* *
1595 TTACTCGCTTTAAATGGTTTTAGATTCACATAATTGATTTTAAGTTGGATTTTTTCACATTTTTG
1 TTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGATTTTTT-ACATTTTTG
* * * * ** *
1660 GTTAAAATTTGTTATAATTGAATATTTTCCTCGAGAAACATGAATTAAAAGCCATCCATTGGCA-
65 GTTAAAATATGTTATAATTGAATGTTTACCTTGAGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTAG-AG
* **
1724 AGAAAAG-CCATTTATAGTCACTCACGCCTTTGAAAGAATTA
129 AGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTA
* * * * *
1765 CTACTCGCTTTAAATGATTTTATATTCTCGTAATTAATTTTAAGTTGGATTTGTTTACATTTTTT
1 TTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGATTT-TTTACATTTTTG
* * * * * * * * *
1830 GTTAAAATATGCTATAATTGAACGTCTGCCTTG-GAGACGTAAAGTAAAAGCCATCAATTAGAGA
65 GTTAAAATATGTTATAATTGAATGTTTACCTTGAGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTAGAGA
*
1894 GAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTA
130 GAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTA
* * * ** * *
1935 TTACTCACTTTAAATAGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTCAATTTAAATTTTTTATATTTTTT
1 TTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTT-AAGTTGGATTTTTTACATTTTTG
** * *
2000 GTT--AA-A----ATAATTGAATGCCTACCTCG-GAAAGCATGAAGC-AAAGCCATCCATTAGTG
65 GTTAAAATATGTTATAATTGAATGTTTACCTTGAGAAA-CATGAAGCAAAAGCCATCCATTAGAG
* * * *
2056 AAAAAAGT-CTTTTCATAGTTACTCAAG-CTTGTGAAAGCTTTA
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* * * * *
2098 TTACTCACTTTAAATGGTTTTGTATTCTCTTAATTGATTTTAAGTTAGATTTTTTTACATTTATG
1 TTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGA-TTTTTTACATTTTTG
* * * *** *
2163 GATAAAATATGCTATAATTGAATATTTACCTT-AGGAAACATGAAATTAAAGCTATCCATT-GAC
65 GTTAAAATATGTTATAATTGAATGTTTACCTTGA-GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTAGA-
* * * *
2226 AAGAAAAG-ACATTTCTAGTCACGT-AAGCCTTCGAAAGCCTTA
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* * * * * *
2268 TTACTCGCTTTAAATAGTTTCATATTCTAATAATTAATTTTAAGTTTGAATTTTTTACATTTTTA
1 TTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAG-TTGGATTTTTTACATTTTTG
* * * * * * * *
2333 GTTAAAATATATTATAATTGAATGTCTATCTCGAGAAACATGAAGTAAATGCCATCCAAT-GACA
65 GTTAAAATATGTTATAATTGAATGTTTACCTTGAGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTAGA-G
* *
2397 AGAAAAGT-CATTTATAGTCACTCAAGCCCTTGAAAGCATTA
129 AGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTA
* * *
2438 TTACTCGCTTTTAAA-GGTTTTATATTCTCATAATTAATTTTAAGTTGGATTTTTCTATATTTTG
1 TTACTCGC-TTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGATTTTT-TACATTTTT
* * ** *** *
2502 GGTTGAAATATGCTATAATTGAATGTCCACCTT-AGGAAACGCAAAGCAAAAGCCATCAATTAGA
64 GGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTTTACCTTGA-GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTAGA
* * *
2566 GAGAAAAGTCTATTTATAGTCGCTC-ACCGCTTTGAAAGCCTTA
128 GAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGC-CTTTGAAAGCCTTA
** * * *
2609 TCGCTTAG-TTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGGTTTTAAGTTGAAGTTTTTTACATTTTT
1 TTAC-TCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGA-TTTTTTACATTTTT
* * * * ** * **
2673 AGTTAAAATATATTATAATTGAATGTTTGCCTTGGGAAATGTGAAGCAAAAGCTATCCATGGGAG
64 GGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTTTACCTTGAGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTAGAG
* * * * * *
2738 AG-AAAGTCGATTTATATTCACTTAAACATTTCAAAGCCTTA
129 AGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTA
* * * **
2779 TTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCACATAATTAATTTTAAGTTGGATTTTTTTACAATTTCA
1 TTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGA-TTTTTTACATTTTTG
* * ** * * *
2844 ATTAAAATATATTATAATTGAATGACTACCTT-AGGAAACATGAAGTAAAATCCATCCATTAGGG
65 GTTAAAATATGTTATAATTGAATGTTTACCTTGA-GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTAGAG
* * *
2908 AGAAAAGCCCATTTACAGTCACTCAAGCCTTTAAAAGCCTTA
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* * * * * * *
2950 TTACTAGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGGTTATAGGCTGAATTGTTTTTACATTTAT
1 TTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGA-T-TTTTTACATTTTT
* ** * * * *
3015 GGTTAAAATATGTTATAATTGAATATCCA-TTTTAGGAA-ATGGAAAGCAAAAGCCATCTATTAG
64 GGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTTTACCTTGAGAAACAT-G-AAGCAAAAGCCATCCATTAG
* * * *
3078 AGAGAAATGTCTATTCATAGTCACTTAAGCCTTTGAAAGCCTTA
127 AGAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTA
* * * *
3122 TTACTCACTTTAAATTGTTTTATATTCACATAATTGATTTTAAGTTAGATTTGTTTACATTTTTG
1 TTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGATTT-TTTACATTTTTG
* * * * * * * * *
3187 GTTTAAATATGTTATAATTCAGTATCTGCCTTGGGAAACATGAAGCAAAAGCTATCCATTCATA-
65 GTTAAAATATGTTATAATTGAATGTTTACCTTGAGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATT-AGAG
* *
3251 AGAAAAGT-CATTTCTAGTCACACAAGCCTTTGAAAGCCTTA
129 AGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTA
* * * * ** * *
3292 TTACTCCCTTTAAATTGTTTCATATTCCCATAATTGATTTTAAGTTCAAAATTTTTACATTTTTT
1 TTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTT-GGATTTTTTACATTTTTG
** * * *
3357 GTTAAAATATGTTATAATTTG-ATGTTTGTC-TCATGAAACATGAAGCAAAAACCATCCATTGGC
65 GTTAAAATATGTTATAA-TTGAATGTTTACCTTGA-GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTAG-
* * * *
3420 A-AGAAAAG-ACATTTATAGTCACTGAAGCCCTTGAAAGCCTTG
127 AGAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTA
* * * * * *
3462 TTACTCGCTTTAAAAGGTTTAATATTCTCATAACTAATTTTAAGTTAGATTTTTTTACAGTTTTG
1 TTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGA-TTTTTTACATTTTTG
* * * ** * ** * *
3527 GTTAAAATATGCTATAGTTGAATGTCTGTCTTGGGAAAGGTGAAGCAAAAGCCATCAATTAGTGA
65 GTTAAAATATGTTATAATTGAATGTTTACCTTGAGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTAGAGA
* * * **
3592 GAAAAGTCTAATTATAGTCACTCAAGCCCTCAAAAGCCTTA
130 GAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTA
* * * *
3633 TTACTCGCTTTAAACGGTTTTATATTCTCATAATGGATTTTAAGTTGGATTTTTTTACAATTATG
1 TTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGA-TTTTTTACATTTTTG
* * * * * *
3698 GTTAAAATATGTTATTACTGATTGTCTACCTTGGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTAGAGA
65 GTTAAAATATGTTATAATTGAATGTTTACCTTGAGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTAGAGA
* * * * *
3763 GAAAACTCTATTTAGAGTCACTCAAGCCCTTGAAAGCCATA
130 GAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTA
* * * **
3804 TTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGAATTTAGGTTAGATTTTTTTATGTTTTTG
1 TTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGA-TTTTTTACATTTTTG
* * * * * **
3869 GTTAAAATGTGTTATAATTGAATGTCTGCCTAGAGAAACATGAAGCAAAAGCCATCTATTTTAGA
65 GTTAAAATATGTTATAATTGAATGTTTACCTTGAGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTAGAGA
* * * *
3934 GAAAAGTCCATTTATAGTAACTTAAGACTTTGAAAGCTTTA
130 GAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTA
* *
3975 TTACTCGCTTTAAAAT-GTTTTAGATT-TACATAATT-AGTTTTAAGTTGAATTTTTCTCACATT
1 TTACTCGCTTT-AAATGGTTTTATATTCT-CATAATTGA-TTTTAAGTTGGATTTTT-T-ACATT
* * * * ** * *
4037 TTTGGTTGAAATTTATTATAATTGAGTGTTTGTCTTGAGAAACATAAAGCAAAAGCCATCCATTG
61 TTTGGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTTTACCTTGAGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTA
* * **
4102 GCA-AGAGAAA--CCATTTATAGTCACTCCTA-CCCTTGAAAGAATTA
126 G-AGAGA-AAAGTCCATTTATAGTCACT-CAAGCCTTTGAAAGCCTTA
* * * * **
4146 TTATTCACTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTAATTTTAAGTTTGATTTTTTTTATTTTTGG
1 TTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGATTTTTTACATTTTTGG
* * * * *
4211 TAAAAATATGCTATAATTGAATGTTT-GCTTAGGGAAACATGAAGCAAAAGCTATCCATTAGAGA
66 TTAAAATATGTTATAATTGAATGTTTACCTT-GAGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTAGAGA
* * *
4275 GAAAAGTCCATTTATAGTCACTTAAACCTTTGAAAACCTTA
130 GAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTA
* *
4316 TTACTCGCTTTAAATGGTATTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGATTCTTTTACATTTTTT
1 TTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGATT-TTTTACATTTTTG
* * * **
4381 GTTAAAATATGTTGTAATTGAATATTTGA--TTGAGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATGGGAG
65 GTTAAAATATGTTATAATTGAATGTTT-ACCTTGAGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTAGAG
**
4444 AGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTAAGAAAGCCTTA
129 AGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTA
*** * * * ** * *
4486 TTACTAAATTTAAATAGTTTTGTATTCCCATAATTGATTTTAAGTAAGATTTTTTTATATTTCTG
1 TTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGA-TTTTTTACATTTTTG
* * *
4551 GTTAAAATATGTTATAATTAAATGTCTGA-CTTG-GAAA-ATAGGAAGCAAAAGCCATTCATTAG
65 GTTAAAATATGTTATAATTGAATGT-TTACCTTGAGAAACAT--GAAGCAAAAGCCATCCATTAG
* *
4613 AGAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTATGAAAGCCTTT
127 AGAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTA
* * * * * *
4657 TTACTCGCTTTAAATGATTTCATATTTTGATAATTGATTTTAAGTTTGATTTCTTTACATTTATG
1 TTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGATTT-TTTACATTTTTG
* * ** * * * **
4722 CTTAAAATATGTTATTATTGAATGCCTAGCTTGGGAAACGA-GAAGCAAAAGCCATCCGTGGGAG
65 GTTAAAATATGTTATAATTGAATGTTTACCTTGAGAAAC-ATGAAGCAAAAGCCATCCATTAGAG
*
4786 AGAAACA-TCCATTTATAG-CAACACAAGCCTTTTG-AAGCCTTA
129 AGAAA-AGTCCATTTATAGTC-ACTCAAGCC-TTTGAAAGCCTTA
* *
4828 TTACTCGCTTTCAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTAGATTTTTTTACATTTTTG
1 TTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGA-TTTTTTACATTTTTG
** * * * * **
4893 GTTAAAATATACTATCATTGAGTGTCTACCTCGAGAAATGTGAAGCAAAAG----CCA-T-----
65 GTTAAAATATGTTATAATTGAATGTTTACCTTGAGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTAGAGA
* *
4948 ------T-CATTTATAGTCGCTAAAGCCTTTGAAAGCCTTA
130 GAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTA
* * * * * *
4982 TTACTTGATTTAAATGGTTTTATATTCTAATAATTGATTTGAACTTAGATTTTTTTACATTTTTG
1 TTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGA-TTTTTTACATTTTTG
* * * * * * * *
5047 GTTAAAATTTGTTGTAATTGATTGTCTGCCTT-AGGAATCGTGATA-C-AAAGCCATCCATTAGG
65 GTTAAAATATGTTATAATTGAATGTTTACCTTGA-GAAACATGA-AGCAAAAGCCATCCATTAGA
* *
5109 GAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGTCTTAGAAAGCCTTA
128 GAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTA
* * * *
5152 TTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAATTGAAATGTTTTATATTTTTG
1 TTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTG-GATTTTTTACATTTTTG
** * * ** * ** *
5217 GTGCAAATATATTATAATTGAATGTCTGTCTTGAGAAACATGAAGTAAAAGAGATTCATTA-ATG
65 GTTAAAATATGTTATAATTGAATGTTTACCTTGAGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTAGA-G
* **
5281 AGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCAAGCCTTCAAAAGCCTTA
129 AGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTA
* * * *
5323 TTACTTGCTTTAAATAGTTTTATATTCTCATAATTGGCTTTT-AGGTGGATTTTTTTACATTTTT
1 TTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATT-GATTTTAAGTTGGA-TTTTTTACATTTTT
* * * * * *
5387 GGTTAAAATATGTTATACTTGAATGTTTGCC-TCAGAAAACATAAAACAAAAGCCATCCATTGGA
64 GGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTTTACCTTGAG-AAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTAGA
* * * * ** *
5451 GAGAAAAGTCAACTTATAATTAAACAAGTCTTTGAAAG-CTGTA
128 GAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCT-TA
* * * *
5494 TTACTCGCTTTAAATGGTTTCATATTTTCATAATTGATTTTAAGTTAGATTTTTTTTACATTTAT
1 TTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGA--TTTTTTACATTTTT
* * * *
5559 GGTTAAAATTTGGTATAATTGATTGTTTACCTTG-GAAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTAGA
64 GGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTTTACCTTGAG-AAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTAGA
* * *
5623 GA-AAAATGTCAATTTATAGTCACTCAAGTCTTTAAAAGCCTTA
128 GAGAAAA-GTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTA
* * * ** * * * *
5666 TTACTTGATTTAAATGGTTTCATATAATCTTAATTGATTTTAAGTTGGATTTGTTTTAAAATTAT
1 TTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGA-TT-TTTTACATTTTT
* * * * * ** *
5731 GATTAAAATATGTTATAATTGAATGTTTGCCTT-AGGAAACGTGAAGTAAAGGTGATCCATTAGC
64 GGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTTTACCTTGA-GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTAGA
* ** *
5795 GAGAAAAGTCCATTGATAGTCACTCAAGCCTTCAAAAGCCTTC
128 GAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTA
* * *
5838 TTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTG-GTTTAAGGTGGATTTTTTTATATTTTTG
1 TTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGA-TTTTTTACATTTTTG
* * * * *
5902 ATTAAAATATGTTATAATTGAAAGTCTACCTTGGGAAACATGAAGC-AAAGCCCATCCGTT-GAT
65 GTTAAAATATGTTATAATTGAATGTTTACCTTGAGAAACATGAAGCAAAAG-CCATCCATTAGA-
* * * * * *
5965 GAGAAAAGTTCACTTGTAGTCACGCAAGCCTTCGAAAGCCCTA
128 GAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTA
* * * *
6008 TTACTC-CTTTTAATGGTTTCATATTCTCATAATTGATTTTAAATTTGAATTTTTTACATTTTTG
1 TTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTT-AAGTTGGATTTTTTACATTTTTG
* * ** * * **
6072 ATTAAAGTATGTTATAATTGAATGTTTGTCTTAAGAAACGTGAAGCAAAAGCCATTTATTAGCA-
65 GTTAAAATATGTTATAATTGAATGTTTACCTTGAGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTAG-AG
* * * *
6136 AGAAAAG-CTATTTATAGTCACTCAAGCCCTAGAAAGCCTTG
129 AGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTA
* * * * * * * *
6177 TTACTTGCTTTAAAAGTTTTTATACTCTCATAATTAATTTTAAGTTTGATTGTTTTACAATTTTA
1 TTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGATT-TTTTACATTTTTG
* * * * *
6242 GCTAAAATATGTTATAATTGAATGTTTACCTTGGGAAACATGAAGTAAAAACCATCCATTGGCA-
65 GTTAAAATATGTTATAATTGAATGTTTACCTTGAGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTAG-AG
* *
6306 AGAAAAGT-CATTTACAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCTTTA
129 AGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTA
* * * * * *
6347 TTTA-TCGCGTTAAATAGTTTTATGTTCTCATAATTAATTTTAAGCTAGATTTTTTTTA-ATTTT
1 -TTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGA--TTTTTTACATTTT
* ** * *
6410 TGGTTAAAATTATGTTATAATTGAATGTCTACCTT-AGGAAATGTGATGCAAAAGCCATTCATTC
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* * ** * **
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125 AGAGAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTA
* * * *
6519 TTACTCGCTTTAAATGGTTTCTAT-TT-ACATCATTAATTTTAAATTGGATTTTTTTTACATTTT
1 TTACTCGCTTTAAATGGTTT-TATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGA--TTTTTTACATTTT
* * * *
6582 TGGTTAAAATTTGTTATAATTGAATGTTTA-CATCAGGAAA-ATGAAGCAAAACCCATCCATTAG
63 TGGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTTTACCTTGA-GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTAG
* * *
6645 AGAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTTATGCCATTGAAAGCCTTA
127 AGAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTA
*
6689 TTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGATTTTTTTGCATTTTTG
1 TTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGA-TTTTTTACATTTTTG
* * * * * * *
6754 GTTAAACTTTATTATAATTGAATATCTACCTT-AGAAACATGAAGCCAAAGTCATCCATTAGAGA
65 GTTAAAATATGTTATAATTGAATGTTTACCTTGAGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTAGAGA
* * * * ** *
6818 GAGAAGGCCATTTACAATCACTCAAGCCTTCAAAAGTCTTA
130 GAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTA
* * * * * * * *
6859 TTACACGCTTTAAATAGTTTTATATTTTTATAATTGATTTTAAGCTGAATTTTTATATATTTTTT
1 TTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGATTTTT-TACATTTTTG
* * * * * * * * *
6924 ATTAAAATATATTGTAATTGAATATCTGCCTCGAGATACATGAAGCAAAAGCCATCTATTAGAGA
65 GTTAAAATATGTTATAATTGAATGTTTACCTTGAGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTAGAGA
* *
6989 GAAAAATCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCCTA
130 GAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTA
* * * *
7030 TTACTCTCTTTAAATAGTTTTATATTCTCATAATT-AGTTTTAAGTTAGATGTTTTTATATTTTT
1 TTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGA-TTTTAAGTTGGAT-TTTTTACATTTTT
** * * * * * * ** * *
7094 TATT-AAATATATTATAATTAAATATCTATCTTTAGAAA-ATTTGAATTAAAAGCCATCTATTGG
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* *
7157 AGAGAAAAGTCCATTTACAGTTACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTA
127 AGAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTA
* * * * *
7201 TTACTTGCTTTAAATGGTATTATATTCTCATAATTGATTTTTAAGTTAGAATTTTTTATAGTTTT
1 TTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGA-TTTTAAGTT-GGATTTTTTACATTTTT
* * * *
7266 GGTTAAAATATGTTACAATTAAATGTTTTCCTT-AGGAAACATGAAGCAAAAGCCAACCATTAGA
64 GGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTTTACCTTGA-GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTAGA
*
7330 GAGAAAAGTCTATTTATAGTCA-TACAAGCCTTTGAAAGCCTTA
128 GAGAAAAGTCCATTTATAGTCACT-CAAGCCTTTGAAAGCCTTA
7373 TTA
1 TTA
7376 NNNNNNNNNN
Statistics
Matches: 4730, Mismatches: 876, Indels: 349
0.79 0.15 0.06
Matches are distributed among these distances:
153 9 0.00
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TTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGATTTTTTACATTTTTGG
TTAAAATATGTTATAATTGAATGTTTACCTTGAGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTAGAGAG
AAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTA
Found at i:2782 original size:341 final size:341
Alignment explanation
Indices: 1424--7375 Score: 5546
Period size: 341 Copynumber: 17.5 Consensus size: 341
1414 CTAAGACTTC
* * *
1424 TTACTTGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTAGATATTTTTACATTTTTG
1 TTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTAATTTTAAGTTAGATTTTTTTACATTTTTG
* * *
1489 GTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTACCTT-GGAAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTATAC
66 GTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTACCTTAGG-AAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTAGAG
* ** * *
1553 AGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCAAAACTTTGAAAGCTTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTAG
130 AGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTAT
* * * *
1618 ATTCACATAATTGATTTTAAGTTGGATTTTTTCACATTTTTGGTTAAAATTTGTTATAATTGAAT
195 ATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAATATGTTATAATTGAAT
* * * * ** *
1683 ATTTTCC-TCGAGAAACATGAATTAAAAGCCATCCATTGGCA-AGAAAAG-CCATTTATAGTCAC
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* **
1745 TCACGCCTTTGAAAGAATTA
322 TCAAGCCTTTGAAAGCCTTA
* * * * * *
1765 CTACTCGCTTTAAATGATTTTATATTCTCGTAATTAATTTTAAGTTGGATTTGTTTACATTTTTT
1 TTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTAATTTTAAGTTAGATTTTTTTACATTTTTG
* * * * * * * *
1830 GTTAAAATATGCTATAATTGAACGTCTGCCTT-GGAGACGTAAAGTAAAAGCCATCAATTAGAGA
66 GTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTAGAGA
* * *
1894 GAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATAGTTTTATA
131 GAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATA
* * * *
1959 TTCTCATAATTGATTTTCAA-TTTAAATTTTTTATATTTTTTGTT--AA-A----ATAATTGAAT
196 TTCTCATAATTGATTTT-AAGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAATATGTTATAATTGAAT
** * * * * * * *
2016 GCCTACC-TCGGAAAGCATGAAGC-AAAGCCATCCATTAGTGA-AAAAAGT-CTTTTCATAGTTA
260 GTTTGCCTTAGGAAA-CGTGAAGCAAAAGCCATCCA-T-GGGAGAGAAAGTCCATTT-ATAGTCA
*
2077 CTCAAG-CTTGTGAAAGCTTTA
321 CTCAAGCCTT-TGAAAGCCTTA
* * * * *
2098 TTACTCACTTTAAATGGTTTTGTATTCTCTTAATTGATTTTAAGTTAGATTTTTTTACATTTATG
1 TTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTAATTTTAAGTTAGATTTTTTTACATTTTTG
* * * * *** * *
2163 GATAAAATATGCTATAATTGAATATTTACCTTAGGAAACATGAAATTAAAGCTATCCATT-GACA
66 GTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTAGA-G
* * * * *
2227 AGAAAAG-ACATTTCTAGTCACGT-AAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATAGTTTCA
130 AGAAAAGTCCATTTATAGTCAC-TCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTA
* * * *
2290 TATTCTAATAATTAATTTTAAGTTTGAA-TTTTTTACATTTTTAGTTAAAATATATTATAATTGA
194 TATTCTCATAATTGATTTTAAG-TTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAATATGTTATAATTGA
* ** * * * * **
2354 ATGTCTATC-TCGAGAAACATGAAGTAAATGCCATCCAATGACA-AGAAAAGT-CATTTATAGTC
258 ATGTTTGCCTTAG-GAAACGTGAAGCAAAAGCCATCC-ATGGGAGAG-AAAGTCCATTTATAGTC
* *
2416 ACTCAAGCCCTTGAAAGCATTA
320 ACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTA
* * * *
2438 TTACTCGCTTTTAAA-GGTTTTATATTCTCATAATTAATTTTAAGTTGGATTTTTCTATATTTTG
1 TTACTCGC-TTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTAATTTTAAGTTAGATTTTTTTACATTTTT
* * * *** *
2502 GGTTGAAATATGCTATAATTGAATGTCCACCTTAGGAAACGCAAAGCAAAAGCCATCAATTAGAG
65 GGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTAGAG
* * * ** *
2567 AGAAAAGTCTATTTATAGTCGCTC-ACCGCTTTGAAAGCCTTATCGCTTAG-TTTAAATGGTTTT
130 AGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGC-CTTTGAAAGCCTTATTAC-TCGCTTTAAATGGTTTT
* * * *
2630 ATATTCTCATAATTGGTTTTAAGTTGAAGTTTTTTACATTTTTAGTTAAAATATATTATAATTGA
193 ATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAATATGTTATAATTGA
* * * * *
2695 ATGTTTGCCTTGGGAAATGTGAAGCAAAAGCTATCCATGGGAGAGAAAGTCGATTTATATTCACT
258 ATGTTTGCCTTAGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATGGGAGAGAAAGTCCATTTATAGTCACT
* * * *
2760 TAAACATTTCAAAGCCTTA
323 CAAGCCTTTGAAAGCCTTA
* * * **
2779 TTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCACATAATTAATTTTAAGTTGGATTTTTTTACAATTTCA
1 TTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTAATTTTAAGTTAGATTTTTTTACATTTTTG
* * * * * *
2844 ATTAAAATATATTATAATTGAATGACTACCTTAGGAAACATGAAGTAAAATCCATCCATTAGGGA
66 GTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTAGAGA
* * * *
2909 GAAAAGCCCATTTACAGTCACTCAAGCCTTTAAAAGCCTTATTACTAGCTTTAAATGGTTTTATA
131 GAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATA
* * * * *
2974 TTCTCATAATTGGTTATAGGCTGAATTGTTTTTACATTTATGGTTAAAATATGTTATAATTGAAT
196 TTCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATT-TTTTTACATTTTTGGTTAAAATATGTTATAATTGAAT
* ***** * * ** * *
3039 ATCCATTTTAGGAAATG-GAAAGCAAAAGCCATCTATTAGAGAGAAATGTCTATTCATAGTCACT
260 GTTTGCCTTAGGAAACGTG-AAGCAAAAGCCATCCATGGGAGAGAAA-GTCCATTTATAGTCACT
*
3103 TAAGCCTTTGAAAGCCTTA
323 CAAGCCTTTGAAAGCCTTA
* * * * *
3122 TTACTCACTTTAAATTGTTTTATATTCACATAATTGATTTTAAGTTAGATTTGTTTACATTTTTG
1 TTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTAATTTTAAGTTAGATTTTTTTACATTTTTG
* * * * * * * *
3187 GTTTAAATATGTTATAATTCAGTATCTGCCTTGGGAAACATGAAGCAAAAGCTATCCATTCATA-
66 GTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATT-AGAG
* * * * *
3251 AGAAAAGT-CATTTCTAGTCACACAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCCCTTTAAATTGTTTCAT
130 AGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTAT
* * ** *
3315 ATTCCCATAATTGATTTTAAGTTCAAAATTTTTACATTTTTTGTTAAAATATGTTATAATTTG-A
195 ATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAATATGTTATAA-TTGAA
* * * * * * *
3379 TGTTTGTCTCATGAAACATGAAGCAAAAACCATCCATTGGCA-AGAAAAG-ACATTTATAGTCAC
259 TGTTTGCCTTAGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCA-TGGGAGAG-AAAGTCCATTTATAGTCAC
* * *
3442 TGAAGCCCTTGAAAGCCTTG
322 TCAAGCCTTTGAAAGCCTTA
* * * *
3462 TTACTCGCTTTAAAAGGTTTAATATTCTCATAACTAATTTTAAGTTAGATTTTTTTACAGTTTTG
1 TTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTAATTTTAAGTTAGATTTTTTTACATTTTTG
* * ** * ** * *
3527 GTTAAAATATGCTATAGTTGAATGTCTGTCTTGGGAAAGGTGAAGCAAAAGCCATCAATTAGTGA
66 GTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTAGAGA
* * * ** *
3592 GAAAAGTCTAATTATAGTCACTCAAGCCCTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAACGGTTTTATA
131 GAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATA
* * * * * * *
3657 TTCTCATAATGGATTTTAAGTTGGATTTTTTTACAATTATGGTTAAAATATGTTATTACTGATTG
196 TTCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAATATGTTATAATTGAATG
* * * ** * * *
3722 TCTACCTTGGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTAGAGAGAAAACTCTATTTAGAGTCACTCA
261 TTTGCCTTAGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATGGGAGAG-AAAGTCCATTTATAGTCACTCA
* *
3787 AGCCCTTGAAAGCCATA
325 AGCCTTTGAAAGCCTTA
* **
3804 TTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGAA-TTTAGGTTAGATTTTTTTATGTTTTT
1 TTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATT-AATTTTAAGTTAGATTTTTTTACATTTTT
* * * **
3868 GGTTAAAATGTGTTATAATTGAATGTCTGCC-TAGAGAAACATGAAGCAAAAGCCATCTATTTTA
65 GGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTACCTTAG-GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTAGA
* * * *
3932 GAGAAAAGTCCATTTATAGTAACTTAAGACTTTGAAAGCTTTATTACTCGCTTTAAAAT-GTTTT
129 GAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTT-AAATGGTTTT
* * * * *
3996 AGATT-TACATAATT-AGTTTTAAGTTGAATTTTTCTCACATTTTTGGTTGAAATTTATTATAAT
193 ATATTCT-CATAATTGA-TTTTAAGTTGAATTTTT-TTACATTTTTGGTTAAAATATGTTATAAT
* * * * *
4059 TGAGTGTTTGTCTT-GAGAAACATAAAGCAAAAGCCATCCATTGGCAAGAGAAA--CCATTTATA
255 TGAATGTTTGCCTTAG-GAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCA-TGG-GAGAGAAAGTCCATTTATA
* * **
4121 GTCACTCCTA-CCCTTGAAAGAATTA
317 GTCACT-CAAGCCTTTGAAAGCCTTA
* * * *
4146 TTATTCACTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTAATTTTAAGTTTGATTTTTTT-TATTTTTG
1 TTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTAATTTTAAGTTAGATTTTTTTACATTTTTG
* * ** *
4210 GTAAAAATATGCTATAATTGAATGT-TTGCTTAGGGAAACATGAAGCAAAAGCTATCCATTAGAG
66 GTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTACCTTA-GGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTAGAG
* * * *
4274 AGAAAAGTCCATTTATAGTCACTTAAACCTTTGAAAACCTTATTACTCGCTTTAAATGGTATTAT
130 AGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTAT
* * * *
4339 ATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGATTCTTTTACATTTTTTGTTAAAATATGTTGTAATTGAAT
195 ATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAATATGTTATAATTGAAT
* *
4404 ATTTG-ATT-GAGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATGGGAGAGAAAAGTCCATTTATAGTCACT
260 GTTTGCCTTAG-GAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATGGGAGAG-AAAGTCCATTTATAGTCACT
**
4467 CAAGCCTAAGAAAGCCTTA
323 CAAGCCTTTGAAAGCCTTA
*** * * * * * * *
4486 TTACTAAATTTAAATAGTTTTGTATTCCCATAATTGATTTTAAGTAAGATTTTTTTATATTTCTG
1 TTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTAATTTTAAGTTAGATTTTTTTACATTTTTG
* *
4551 GTTAAAATATGTTATAATTAAATGTCTGA-CTT-GGAAA-ATAGGAAGCAAAAGCCATTCATTAG
66 GTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCT-ACCTTAGGAAACAT--GAAGCAAAAGCCATCCATTAG
* * * *
4613 AGAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTATGAAAGCCTTTTTACTCGCTTTAAATGATTTC
128 AGAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTT
* * * * * *
4678 ATATTTTGATAATTGATTTTAAGTTTG-ATTTCTTTACATTTATGCTTAAAATATGTTATTATTG
193 ATATTCTCATAATTGATTTTAAG-TTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAATATGTTATAATTG
* * * * * *
4742 AATGCCTAG-CTTGGGAAACGAGAAGCAAAAGCCATCCGTGGGAGAGAAACATCCATTTATAG-C
257 AATG-TTTGCCTTAGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATGGGAGAGAAA-GTCCATTTATAGTC
*
4805 AACACAAGCCTTTTG-AAGCCTTA
320 -ACTCAAGCC-TTTGAAAGCCTTA
* *
4828 TTACTCGCTTTCAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTAGATTTTTTTACATTTTTG
1 TTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTAATTTTAAGTTAGATTTTTTTACATTTTTG
** * * * **
4893 GTTAAAATATACTATCATTGAGTGTCTACC-TCGAGAAATGTGAAGCAAAAG----CCA-T----
66 GTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTACCTTAG-GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTAGAG
* * * *
4948 -------T-CATTTATAGTCGCTAAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTTGATTTAAATGGTTTTAT
130 AGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTAT
* * * * * *
5005 ATTCTAATAATTGATTTGAACTT-AGATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAATTTGTTGTAATTGAT
195 ATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGA-ATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAATATGTTATAATTGAA
* *
5069 TGTCTGCCTTAGGAATCGTGATA-C-AAAGCCATCCATTAGGGAGA-AAAGTCCATTTATAGTCA
259 TGTTTGCCTTAGGAAACGTGA-AGCAAAAGCCATCCA-T-GGGAGAGAAAGTCCATTTATAGTCA
* *
5131 CTCAAGTCTTAGAAAGCCTTA
321 CTCAAGCCTTTGAAAGCCTTA
* * * * *
5152 TTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAATT-GAAATGTTTTATATTTTT
1 TTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTAATTTTAAGTTAG-ATTTTTTTACATTTTT
** * ** * ** *
5216 GGTGCAAATATATTATAATTGAATGTCTGTCTT-GAGAAACATGAAGTAAAAGAGATTCATTA-A
65 GGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTACCTTAG-GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTAGA
* ** * *
5279 TGAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCAAGCCTTCAAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATAGTTTT
129 -GAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTT
* * * *
5344 ATATTCTCATAATTGGCTTTT-AGGTGGATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAATATGTTATACTTG
193 ATATTCTCATAATT-GATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAATATGTTATAATTG
* * * * * * * * * *
5408 AATGTTTGCCTCAGAAAACATAAAACAAAAGCCATCCATTGGAGAGAAAAGTCAACTTATAATTA
257 AATGTTTGCCTTAGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATGGGAGAG-AAAGTCCATTTATAGTCA
** *
5473 AACAAGTCTTTGAAAG-CTGTA
321 CTCAAGCCTTTGAAAGCCT-TA
* * * *
5494 TTACTCGCTTTAAATGGTTTCATATTTTCATAATTGATTTTAAGTTAGATTTTTTTTACATTTAT
1 TTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTAATTTTAAGTTAGA-TTTTTTTACATTTTT
* * * * *
5559 GGTTAAAATTTGGTATAATTGATTGTTTACCTT-GGAAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTAGA
65 GGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTACCTTAGG-AAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTAGA
* * * * * *
5623 GA-AAAATGTCAATTTATAGTCACTCAAGTCTTTAAAAGCCTTATTACTTGATTTAAATGGTTTC
129 GAGAAAA-GTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTT
** * * * * * *
5687 ATATAATCTTAATTGATTTTAAGTTGGATTTGTTTTAAAATTATGATTAAAATATGTTATAATTG
193 ATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTT-TTTTACATTTTTGGTTAAAATATGTTATAATTG
* * ** * *
5752 AATGTTTGCCTTAGGAAACGTGAAGTAAAGGTGATCCATTAGCGAGA-AAAGTCCATTGATAGTC
257 AATGTTTGCCTTAGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCA-T-GGGAGAGAAAGTCCATTTATAGTC
** *
5816 ACTCAAGCCTTCAAAAGCCTTC
320 ACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTA
** * * *
5838 TTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATT-GGTTTAAGGTGGATTTTTTTATATTTTTG
1 TTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTAATTTTAAGTTAGATTTTTTTACATTTTTG
* * * *
5902 ATTAAAATATGTTATAATTGAAAGTCTACCTTGGGAAACATGAAGC-AAAGCCCATCCGTT-GAT
66 GTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGCAAAAG-CCATCCATTAGA-
* * * * * * * *
5965 GAGAAAAGTTCACTTGTAGTCACGCAAGCCTTCGAAAGCCCTATTACTC-CTTTTAATGGTTTCA
129 GAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTA
* * *
6029 TATTCTCATAATTGATTTTAAATTTGAA-TTTTTTACATTTTTGATTAAAGTATGTTATAATTGA
194 TATTCTCATAATTGATTTT-AAGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAATATGTTATAATTGA
* * ** * * *
6093 ATGTTTGTCTTAAGAAACGTGAAGCAAAAGCCATTTATTAGCA-AGAAAAG-CTATTTATAGTCA
258 ATGTTTGCCTTAGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCA-TGGGAGAG-AAAGTCCATTTATAGTCA
* * *
6156 CTCAAGCCCTAGAAAGCCTTG
321 CTCAAGCCTTTGAAAGCCTTA
* * * * * * * *
6177 TTACTTGCTTTAAAAGTTTTTATACTCTCATAATTAATTTTAAGTTTGATTGTTTTACAATTTTA
1 TTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTAATTTTAAGTTAGATTTTTTTACATTTTTG
* * * * * *
6242 GCTAAAATATGTTATAATTGAATGTTTACCTTGGGAAACATGAAGTAAAAACCATCCATTGGCA-
66 GTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTAG-AG
* * * *
6306 AGAAAAGT-CATTTACAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCTTTATTTA-TCGCGTTAAATAGTTTTA
130 AGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTA-TTACTCGCTTTAAATGGTTTTA
* * * *
6369 TGTTCTCATAATTAATTTTAAGCTAGATTTTTTTTA-ATTTTTGGTTAAAATTATGTTATAATTG
194 TATTCTCATAATTGATTTTAAG-TTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAA-TATGTTATAATTG
* * * * * *** * * **
6433 AATGTCTACCTTAGGAAATGTGATGCAAAAGCCATTCATTCAAGATAAAAGTCGATTTATAACCA
257 AATGTTTGCCTTAGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATGGGAGA-GAAAGTCCATTTATAGTCA
* **
6498 ATCAAGCCTTCAAAAGCCTTA
321 CTCAAGCCTTTGAAAGCCTTA
* * * *
6519 TTACTCGCTTTAAATGGTTTCTAT-TT-ACATCATTAATTTTAAATTGGATTTTTTTTACATTTT
1 TTACTCGCTTTAAATGGTTT-TATATTCTCATAATTAATTTTAAGTTAGA-TTTTTTTACATTTT
* * * * *
6582 TGGTTAAAATTTGTTATAATTGAATGTTTACATCAGGAAA-ATGAAGCAAAACCCATCCATTAGA
64 TGGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTAGA
* * *
6646 GAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTTATGCCATTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTA
129 GAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTA
* * * * *
6711 TATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGATTTTTTTGCATTTTTGGTTAAACTTTATTATAATTGAA
194 TATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAATATGTTATAATTGAA
* * * * * * ** * * *
6776 TATCTACCTTA-GAAACATGAAGCCAAAGTCATCCATTAGAGAGAGAAGGCCATTTACAATCACT
259 TGTTTGCCTTAGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATGGGAGAGA-AAGTCCATTTATAGTCACT
** *
6840 CAAGCCTTCAAAAGTCTTA
323 CAAGCCTTTGAAAGCCTTA
* * * * * * * *
6859 TTACACGCTTTAAATAGTTTTATATTTTTATAATTGATTTTAAGCT-GAATTTTTATATATTTTT
1 TTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTAATTTTAAGTTAG-ATTTTTTTACATTTTT
** * * * * * * *
6923 TATTAAAATATATTGTAATTGAATATCTGCC-TCGAGATACATGAAGCAAAAGCCATCTATTAGA
65 GGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTACCTTAG-GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTAGA
* * * *
6987 GAGAAAAATCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCCTATTACTCTCTTTAAATAGTTTTA
129 GAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTA
* * ** * *
7052 TATTCTCATAATT-AGTTTTAAGTT-AGATGTTTTTATATTTTTTATT-AAATATATTATAATTA
194 TATTCTCATAATTGA-TTTTAAGTTGA-ATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAATATGTTATAATTG
* * * ** ** * * *
7114 AATATCTAT-CTTTAGAAAATTTGAATTAAAAGCCATCTATTGGAGAGAAAAGTCCATTTACAGT
257 AATGT-T-TGCCTTAGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATGGGAGAG-AAAGTCCATTTATAGT
*
7178 TACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTA
319 CACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTA
* * * * * *
7201 TTACTTGCTTTAAATGGTATTATATTCTCATAATTGATTTTTAAGTTAGAATTTTTTATAGTTTT
1 TTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATT-AATTTTAAGTTAGATTTTTTTACATTTTT
* * * * *
7266 GGTTAAAATATGTTACAATTAAATGTTTTCCTTAGGAAACATGAAGCAAAAGCCAACCATTAGAG
65 GGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTAGAG
*
7331 AGAAAAGTCTATTTATAGTCA-TACAAGCCTTTGAAAGCCTTATTA
130 AGAAAAGTCCATTTATAGTCACT-CAAGCCTTTGAAAGCCTTATTA
7376 NNNNNNNNNN
Statistics
Matches: 4581, Mismatches: 861, Indels: 336
0.79 0.15 0.06
Matches are distributed among these distances:
323 4 0.00
324 136 0.03
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328 2 0.00
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ACGTcount: A:0.34, C:0.13, G:0.14, T:0.39
Consensus pattern (341 bp):
TTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTAATTTTAAGTTAGATTTTTTTACATTTTTG
GTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTAGAGA
GAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATA
TTCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAATATGTTATAATTGAATG
TTTGCCTTAGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATGGGAGAGAAAGTCCATTTATAGTCACTCAA
GCCTTTGAAAGCCTTA
Found at i:7764 original size:170 final size:169
Alignment explanation
Indices: 7478--17841 Score: 6292
Period size: 171 Copynumber: 60.1 Consensus size: 169
7468 NNNNNNNNCG
* * * * * *
7478 AAGGCTTGTGTGACTAAAAATAG-CTTTTCT-TGACAATGGTTGGCTTTTGCTTCATGTTTTCTG
1 AAGGCTTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTCT--CAATGGATGGCTTTTGCTTCATGTTTCCTA
* *
7541 AGGTAGACATTCAATTATAACATATTTTAAACATAAATGTAAAGAA-ATCCAACTTAAAATCAAT
64 AGGCAGACATTCAATTATAACATATTTT-AACAAAAATGTAAA-AACATCCAACTTAAAATCAAT
* * * *
7605 TATGAAAATATAAAACCCTTTAAAGTGAGTAAAAAGGCTTTCA
127 TATGAGAATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCA
* * * *
7648 AAGGCTTGAGTGACCATAAATGGACTTTTCTCTCAATAGATGTCTGTTT-CTTCATGTTTCCCAA
1 AAGGCTTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTCTCAATGGATGGCT-TTTGCTTCATGTTTCCTAA
* * * * * *
7712 GCCAAAAAATCAATTATAACATATTTTAATCAAAAATGTAAAAACCTCCAACTTAAAATAAATTA
65 GGCAGACATTCAATTATAACATATTTTAA-CAAAAATGTAAAAACATCCAACTTAAAATCAATTA
* *
7777 TGAGAACATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTGA
129 TGAGAATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCA
* ** *
7818 AAGGCTT-AGGTCACTATAAAT-GACTTTTCT-TGCCAAAAGATGGCTTTTGCTTCATGTTTTCT
1 AAGGCTTGA-GTGACTATAAATGGACTTTTCTCT--CAATGGATGGCTTTTGCTTCATGTTTCCT
* * * * * * * ***
7880 AAGGTAAACATTCAATAATAACACATTTTATCTAAAATAT-AAAACAATCCTGTTTAAAATCAAT
63 AAGGCAGACATTCAATTATAACATATTTTAACAAAAATGTAAAAAC-ATCCAACTTAAAATCAAT
* *
7944 TATGAGAATATAAAACCATTTAAAACAAGTAATAAGGCTTTCA
127 TATGAGAATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCA
* * *** * * * ** *
7987 AAAGCTTGAG-GAACAATAAACATACTTTTCTCTTTAATGGATGGCTTTTGCTTAACGTTTATTG
1 AAGGCTTGAGTG-ACTATAAATGGACTTTTCTC-TCAATGGATGGCTTTTGCTTCATGTTTCCTA
* * *
8051 AGACAGACAATCAATTATAACATATTTTAACAAAAAATGTTAAAAA-ATCTAACTTAAAATCAAT
64 AGGCAGACATTCAATTATAACATATTTTAAC-AAAAATG-TAAAAACATCCAACTTAAAATCAAT
* *
8115 TATGTGAATATAAAACCATTTAAAGTGAGTAATAAGGCTTTCA
127 TATGAGAATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCA
* * * * * ** * *
8158 AAGGATTGATTGGCTATAAATAG-CTTTTCTCACCAATGGATGGCTTTCACTTAAGGTTT-CTAG
1 AAGGCTTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTC-TCAATGGATGGCTTTTGCTTCATGTTTCCTA-
* * * *
8221 AGGTAGTCATTCAATTATAACATATTTTAACCAAAACTGTAAAAAACATCTAACTTAAAATCAAT
64 AGGCAGACATTCAATTATAACATATTTTAA-CAAAAATGT-AAAAACATCCAACTTAAAATCAAT
* *
8286 TATGAGAATATAAAACTATTTAATGCGAGTAATAAGGCTTTCA
127 TATGAGAATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCA
* *
8329 AAGGCTTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTCTCAAATGGATGGCTTTTTCTTCATGTTTCCAAA
1 AAGGCTTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTCTC-AATGGATGGCTTTTGCTTCATGTTTCCTAA
* * * *
8394 GGTAGACATTCAATTATAACATATTTCAACAAAAAATGTAAAAAAATCTAACTTAAAATCAATTA
65 GGCAGACATTCAATTATAACATATTTTAAC-AAAAATGTAAAAACATCCAACTTAAAATCAATTA
* *
8459 TGAGAATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAGTAAGGCTTTCG
129 TGAGAATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCA
* * * * * * *
8500 AAGGCTTGTGTGACTAGAAATAGA-TTTTCT-TGACAATGGTTGGC-TTTGCTTCATATTTTCTG
1 AAGGCTTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTCT--CAATGGATGGCTTTTGCTTCATGTTTCCTA
* *
8562 AGGCAGACATTCAATTATAACATATCTTAAACATAAATGTAAAGAA-ATCCAACTTAAAATCAAT
64 AGGCAGACATTCAATTATAACATAT-TTTAACAAAAATGTAAA-AACATCCAACTTAAAATCAAT
8626 TATGAGAATATAAAACTC-TTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCA
127 TATGAGAATATAAAAC-CATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCA
* * * * *
8669 AAGGTTTGA-AGACTATAAATGGACTTTTCTCTTCAATGGATGTCTGTTT-CTTCACGTTTCCCA
1 AAGGCTTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTC-TCAATGGATGGCT-TTTGCTTCATGTTTCCTA
* * * * * *
8732 AGCCAAAAAATCAATTATAACATATTTTAACCAAAAATGTAAAAACCTCCAACTTAAAATAAATT
64 AGGCAGACATTCAATTATAACATATTTTAA-CAAAAATGTAAAAACATCCAACTTAAAATCAATT
* ** * *
8797 TTGAGAGCATAAAACCATTTAAAGTGAGTAATAAGGCTTTGA
128 ATGAGAATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCA
* * *
8839 AAGGCTTAAGTGACTATAAATGG-CTTTTCTTGTCAAAGGATGGCTTTTGCTTCATGTTTCCTAA
1 AAGGCTTGAGTGACTATAAATGGACTTTTC-TCTCAATGGATGGCTTTTGCTTCATGTTTCCTAA
* * * ***
8903 GGTAGACATTCAATAATAACATATTTTAACTAAAATGT-AAAACAATCCTGTTTAAAATCAATTA
65 GGCAGACATTCAATTATAACATATTTTAACAAAAATGTAAAAAC-ATCCAACTTAAAATCAATTA
*
8967 TGAGAATATAAAACCATTTAAAGCAAGTAATAAGGCTTTCA
129 TGAGAATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCA
* * * * * * ** *
9008 AAAGCTTGAG-GAACAATAAACGTACTTTTCTATTTAATGGATGGCTTTTGCTGAATGTTT-ATC
1 AAGGCTTGAGTG-ACTATAAATGGACTTTTCT-CTCAATGGATGGCTTTTGCTTCATGTTTCCT-
* * * * * * *
9071 GAGACAAACAATCAATTATAATATATTTTAACAAAAAATATTAAAAA-ATCTAACTTAAAATCAA
63 AAGGCAGACATTCAATTATAACATATTTTAAC-AAAAAT-GTAAAAACATCCAACTTAAAATCAA
* * * *
9135 TTATGTGAATATAAAACAATTTAAAGTGAGTAACAAGGCTTTCA
126 TTATGAGAATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCA
* * * * * ** *
9179 AACGATTGAATGACTATAAAT-AACTTTTCTCACCAATGGATGGCTTTCACTTCAGGTTT-CTAG
1 AAGGCTTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTC-TCAATGGATGGCTTTTGCTTCATGTTTCCTA-
* * * * *
9242 AGGTAGTCATTCAATTATAACATATTTTAACCAAAACTGTAAAAAAGATCTAACTTAAAATCAAT
64 AGGCAGACATTCAATTATAACATATTTTAA-CAAAAATGT-AAAAACATCCAACTTAAAATCAAT
* * *
9307 TATGAAAATATAAAACTATTTAATGCGAGTAATACA-GCTTTCA
127 TATGAGAATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATA-AGGCTTTCA
* * * * * * *
9350 AAGGCTTAAGTGACTATAAATAGACTTTTCTCTCAAATGGATGGATTTTGTTTAACT-TTTTCGA
1 AAGGCTTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTCTC-AATGGATGGCTTTTGCTTCA-TGTTTCCTA
* * *
9414 AGGCAGACATTCAATTATAACATATTTCAACAAAAAATGCAAAAACATCCAACTTAAAATGAATT
64 AGGCAGACATTCAATTATAACATATTTTAAC-AAAAATGTAAAAACATCCAACTTAAAATCAATT
* * *
9479 ATGAGAATATAAAACTATTTAAAGCGAGTAGTAAGGCTTTCG
128 ATGAGAATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCA
* * * * * * * *
9521 AAGG-TTTATGTGACTAGAAATAG-CTTTTCT-TGACAACGGTTGGTTTTTTCTTCATGTTTTCT
1 AAGGCTTGA-GTGACTATAAATGGACTTTTCTCT--CAATGGATGGCTTTTGCTTCATGTTTCCT
* * * * *
9583 GAGGCAGGCATTCAATTATAATATATTTTAAACATAAATGTAAAGAA-ATCCAACTTAAAATTAA
63 AAGGCAGACATTCAATTATAACATATTTT-AACAAAAATGTAAA-AACATCCAACTTAAAATCAA
* * * *
9647 TTATGAGAATATAAAACCCTTTAAAGCGAGTAATAAAGCTTCCG
126 TTATGAGAATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCA
** * *
9691 AAGGCTTGAGTGACTATAAATAAACTTTTCTCTCCAATGGATGTCTTTTGCTACATGTTTCCCT-
1 AAGGCTTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTCT-CAATGGATGGCTTTTGCTTCATGTTT-CCTA
* * * * * *
9755 AGGTAGACATTCAATTATAACATATTTTAAATAAAAATATAAAAAAATCCAACTTCAAATCATTT
64 AGGCAGACATTCAATTATAACATATTTT-AACAAAAATGTAAAAACATCCAACTTAAAATCAATT
* * ** * **
9820 ATGAGAATATAAAACTATTGAAATTGAGTAACAAGGCTTTTG
128 ATGAGAATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCA
* * *
9862 AAGGCTTGAATGACTATAAATGG-CTTTTCT-TGCCAATGGATGACTTTTGCTTCATATTT-CTG
1 AAGGCTTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTCT--CAATGGATGGCTTTTGCTTCATGTTTCCT-
* * * * * * *
9924 GAGGCAAACAATCAATTATTACTTATTTTAACTAAATATGTAAAAA-ATTTCAACTT-AAATACA
63 AAGGCAGACATTCAATTATAACATATTTTAAC-AAAAATGTAAAAACA-TCCAACTTAAAAT-CA
*
9987 ATTATAAGAATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCA
125 ATTATGAGAATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCA
* * ** *
10032 AGGGCTTGAGTGACTATAAATGG-CTTTTGCT-TC-----A-CG-TTTT-C-GGA-G---GC--A
1 AAGGCTTGAGTGACTATAAATGGACTTTT-CTCTCAATGGATGGCTTTTGCTTCATGTTTCCTAA
* ** * * * *
10080 GACATTCACTT--A-TA-ACATAT-TTTAACCAAAAATGTAAAAAAATCCAACTTAAAATCAATT
65 GGCAGACA-TTCAATTATA-ACATATTTTAACAAAAATGTAAAAACATCCAACTTAAAATCAATT
* *
10140 ATGAGAATATAAAACCATTTAAAGCAAGTAATAAGGCTTTTA
128 ATGAGAATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCA
* ** *
10182 AAGGCTTAAGTGACTATAAACAGACTTTTCTCTCCAATGGATGGCTTTTGCTTCACGTTT-CTCA
1 AAGGCTTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTCT-CAATGGATGGCTTTTGCTTCATGTTTCCT-A
* * * * * *
10246 AGGTAAACTTTCAATTATAATATATTTTAACCAAAAATGTAAAAACAATCCATCTTAAAATCAAG
64 AGGCAGACATTCAATTATAACATATTTTAA-CAAAAATGTAAAAAC-ATCCAACTTAAAATCAAT
*
10311 TATGAGAATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGACCTTT-A
127 TATGAGAATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAG-GCTTTCA
* * * *
10354 AAGGCTTGAGTGACTATAAACGGACTTTTCTCCCTAATGGATGGCTTCTGCTTCACGTTTTCC-A
1 AAGGCTTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTCTC-AATGGATGGCTTTTGCTTCATG-TTTCCTA
* ** * ** * * *
10418 AGGTAGACATTTGATTATAATATATTCCAACCAAAAACGTAAAAAAATTCAACTTAAAATCAATT
64 AGGCAGACATTCAATTATAACATATTTTAA-CAAAAATGTAAAAACATCCAACTTAAAATCAATT
* * * *
10483 ATGAGAATATAAAATCATTTAAAGTGATTAATAAGGATTTCA
128 ATGAGAATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCA
* * * * * * *
10525 AAAGCTTGAGT-AGCTATATAT-GACCTTTTCTGTCTAATGGATGGCTTTTGCTCCAAGTTGCCC
1 AAGGCTTGAGTGA-CTATAAATGGA-CTTTTCTCTC-AATGGATGGCTTTTGCTTCATGTTTCCT
* * * * * * * *
10588 AAGGTAGACATTCAATTATAGCATATTTTAAGAATAATTGCAAAAAAATCCAAGTTAAAATCAAA
63 AAGGCAGACATTCAATTATAACATATTTTAACAA-AAATGTAAAAACATCCAACTTAAAATCAAT
* * * * * * *
10653 TATGAGAACATAAAACTATTGAAAACGCGTAAT-ATGATTT-A
127 TATGAGAATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCA
* ** * * * * ** * ** **** * *
10694 AAGTGAGTAACAATGGATTATAAAATGCGTAATATGAT-TCAAT-TATAACAAAGGCTTGAT-TG
1 AAG-G-CT-TGAGT-GACTAT-AAATG-G-ACTTTTCTCTCAATGGATGGCTTTTGCTTCATGTT
* * *** * ** * * * **** * * *
10756 ACTATAAATGGACTTTTC-TCTCTAATGGATGGCTTTTGTTTTAC-GTTTTCTAAGGCAGACATT
59 TC-CT-AA-GG-C-AGACAT-TC-AAT-TATAACATAT-TTTAACAAAAATGTAA---AAACATC
** * * * * * * * **
10819 CAACTATAACATATTTTAACCAAAAATGTAAAAATATACAA-C-TTAAAATC-AATTATGAGAAT
112 CAACT-TAA-A-A---T---CAATTATG--AGAATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCT
*
10881 AT-A
166 TTCA
** * * ** * * *** ** *
10884 AAACCATTTAAAGTGAGTA-ACAAT-G-CTTTTAAAGGCTTAA--G-TGACTATAAAC-GAACTT
1 AAGGC--TT-GAGTGACTATA-AATGGACTTTT---CTCTCAATGGATGGCT-TTTGCTTCA-TG
* * * * * * *
10942 TTTCCTCCAATGG-ATGGC-TT--TTTCTTCACAT-TTCTCAAGGCAGATAT-TAATTACAACAT
57 TTTCCT--AA-GGCA-GACATTCAATT-ATAACATATT-TTAA--CAAAAATGTAA--A-AACAT
** * * * * * * * * **
11001 --ATTTTAACCAA-AAATGTA-AAAACATCCAACTTAAAATCAATT-ATGAGAAT-ATAAAACCA
111 CCAACTTAA--AATCAAT-TATGAGA-AT---A--TAAAACCATTTAAAGCGAGTAAT-AAGGC-
11060 TTT-A
165 TTTCA
** * * * ** * * * *
11064 AA-GCGAGTAATATAGCTTTCAAA-GCCCTGATTGACTATAAATGCA---CTTTT-CTCTCTAAT
1 AAGGCTTG-AGT-GA-CTAT-AAATGGACT--TT-TCTCTCAATGGATGGCTTTTGCT-TC--AT
* ** *** ** * *
11123 GGATGGCTTTTGCTTCACGTTTC-CTGTGGCA-AACTTTTAATTATAACATATTTTAACCAAAAA
56 -GTTTCCTAAGGC-AGAC-ATTCAAT-T---ATAAC-----A--------TATTTTAA-CAAAAA
* * * * **
11186 T-AAAAAAAATCCAACTTAAAATCAATTATGAGAATATAACACCATTTAAAGTGAGTAATAACAC
100 TGTAAAAACATCCAACTTAAAATCAATTATGAGAATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGC
11250 TTTCA
165 TTTCA
* * * * * * *
11255 AAGGTTTGAGTGACTATAAATGGACTTTCCTCTTTAATGGATGGCTGTTACTTCACGTTTCCCCA
1 AAGGCTTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTC-TCAATGGATGGCTTTTGCTTCATGTTT-CCTA
** * ****
11320 A-ATAGACATTCAATTATACCATATTTTAACAAAAAATGTAAAAACATTTGGCTTAAAATCAATT
64 AGGCAGACATTCAATTATAACATATTTTAAC-AAAAATGTAAAAACATCCAACTTAAAATCAATT
11384 ATGAGAATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAA-GCTTTTCA
128 ATGAGAATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGC-TTTCA
* * * * ** *
11426 AAGGGC-TGATTGTCTATAAATAGACTTTTCTCTCTAATGGATGGCTTTTGCTTAATGTTTTTTG
1 AA-GGCTTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTCTC-AATGGATGGCTTTTGCTTCATGTTTCCTA
* * *
11490 AGGTAGACATTTAATTATAACATATTTTAACCAAAAATGTAAAAAAAATCCAACTTAAAATCAAT
64 AGGCAGACATTCAATTATAACATATTTTAA-CAAAAATGT-AAAAACATCCAACTTAAAATCAAT
** ** *
11555 TATGATTATATAAAATGATTTAAAGAGAGTAATAAGGCTTTCA
127 TATGAGAATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCA
* * *
11598 AAGGCTTGAGTGACTATAAACGGACTTTTCTCTGCAATGG-TGGGCTTTTGCTTCACGTTTCATA
1 AAGGCTTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTCT-CAATGGAT-GGCTTTTGCTTCATGTTTCCTA
* * * * * * *
11662 AGGTAGACTTTCAATTATAACATATTTCAACCAAAGATGTAAAAA-ATACAACTTAAATTCAATC
64 AGGCAGACATTCAATTATAACATATTTTAA-CAAAAATGTAAAAACATCCAACTTAAAATCAATT
* *
11726 ATGAGAATATAAAACCATTTAAAGCGTGTAATAAGGCTTTCG
128 ATGAGAATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCA
* *
11768 AAGGCTTGAGTGACTATAAACGGACTTTTCTCTCCAATGGATGGCTTTTCCTTCATGTTTCCCTA
1 AAGGCTTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTCT-CAATGGATGGCTTTTGCTTCATGTTT-CCTA
* * * * *
11833 A-GCAAACATTCAATTATAACATATTTTAACGAACAATGT-AAAACAATCTAACTAAAAAGCAAT
64 AGGCAGACATTCAATTATAACATATTTTAAC-AAAAATGTAAAAAC-ATCCAACTTAAAATCAAT
*
11896 TATGAGAATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAA-GTTTATCA
127 TATGAGAATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTT-TCA
* * * * * *
11939 AAGGCTTGA-TAAAATTTTAATAGACTTTGCTCTCTAATGGATGGCTTTTGCTGTACA--TTTCC
1 AAGGCTTGAGT-GACTATAAATGGACTTTTCTCTC-AATGGATGGCTTTTGCT-T-CATGTTTCC
* * * * ** ** ** *
12001 TAAATGGGCTTG--AGTGAA-TATAA-ATGGGCTTTCTTCTCCCATGGATAGCTTTTGCTTTACA
62 T-AA--GGC-AGACATTCAATTATAACA-----TAT-TT-TAACA---A-A---AATG-TAAAAA
** ** * * ** * *
12062 TTTCCTGAAGCACACATTCAATTAT-A-ACATATTTTAACCATAAATGTAAAAC-A--AATCCA-
108 CATCC--AA-CTTAAAATCAATTATGAGA-ATA-TAAAACCAT---T-TAAAGCGAGTAAT-AAG
* *
12121 TC-TTAA
163 GCTTTCA
** * * **** * **
12127 AATCAACTATGAG-AAC-ATAAA---ACCATTTAAAGCGAAT-AATAAGGCATTCAAAGGCTTGC
1 AA--GGCT-TGAGTGACTATAAATGGA-CTTTTCTCTC-AATGGAT--GGC-TT---TTGCTT-C
** * ** * * ** ** **** *
12186 ATGGCT-ATAA-ATAGACTTTTCTCACCAATGGATGGC-T-TTTGTTTCACGTTTCCTAAAGCAA
54 ATGTTTCCTAAGGCAGAC--AT-T---CAAT-TATAACATATTT-TAACAAAAAT-GT-AA--AA
* *** * * * * ***
12247 ACACCCAA-TTATAATATTTTTTATCCAAAAATGTAAAAAAATCTAACTTTAAATTAATTATGTG
107 ACATCCAACTTA-AA-ATCAATTAT--GAGAA--T-ATAAAA-C-CA-TTT-AA--AGCGA-GT-
**
12311 AATATAAAATCATTT-A
157 -A-AT-AAGGC-TTTCA
** * * * * * *
12327 AA-GCGAGTAATAATTCTTTCAAA-GG-CTTGAGTGACTATAAATGGCTTTTCTTGCCAATGGAT
1 AAGGCTTG-AGTGA--CTAT-AAATGGACTT---T-TCTCTCAAT-G--------G---AT-G--
* * * * *
12389 AGGTTTTGCTTCATGTTTCTCGAA-ACAAACAATCAATTATAACATATTTTAACAAAAAATGTAA
43 -GCTTTTGCTTCATGTTTC-CTAAGGCAGACATTCAATTATAACATATTTTAAC-AAAAATGTAA
* * * * * * *
12453 AAAAATCTAACATAAAATCAATTATGAGAATGTTATACTATTTAAAGC-ATGTAATAAGGCTTTC
105 AAACATCCAACTTAAAATCAATTATGAGAATATAAAACCATTTAAAGCGA-GTAATAAGGCTTTC
12517 A
169 A
* * *
12518 AAGGGTTGCGTGACTATAAATAG-CTTTTCT-TGCCAATGGATGGCTTTTGCTTCATGTTTCCTA
1 AAGGCTTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTCT--CAATGGATGGCTTTTGCTTCATGTTTCCTA
* * * **
12581 AGGTAGACATTCAATTATAGCATATTTTAGCCATTAATGTAAAAA-ATTCCAACTTAAAATCAAT
64 AGGCAGACATTCAATTATAACATATTTTA-ACAAAAATGTAAAAACA-TCCAACTTAAAATCAAT
* ** *
12645 TATGAGGATATAAAACCACGTAAAGCGGGTAATAAGGCTTTCA
127 TATGAGAATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCA
* * *
12688 AAGGCTTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCCCTCCAACGGATGGCTTTTGCTTCACAT-TTTTC-
1 AAGGCTTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTCT-CAATGGATGGCTTTTGCTT--CATGTTTCCT
* * * * * *
12751 AAGGCAGATAATT-AATTATAATATGTTTTAACCAAAAATTTAAAAA-GTCCAACTTAAAACCAA
63 AAGGCAGA-CATTCAATTATAACATATTTTAA-CAAAAATGTAAAAACATCCAACTTAAAATCAA
* * * * *
12814 TTTTGAGAATATAAAACTATTTAAAGCGAGTAGTAAAGCTTTTA
126 TTATGAGAATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCA
** * * * * *
12858 AA-GCTGTGAGCAACTATAAATGGACTTTTCTCTTTAATAGATGGCTTTTGCTTGACGTTT-TTA
1 AAGGCT-TGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTC-TCAATGGATGGCTTTTGCTTCATGTTTCCTA
* * * * * * ** *
12921 GAGACAGATATTCAATTATACCATATCTT-ACTAAACAA-GTAAAAAAATCTAGTTTAAAATTAA
64 -AGGCAGACATTCAATTATAACATATTTTAAC-AAA-AATGTAAAAACATCCAACTTAAAATCAA
* *
12984 TTATGAGAATATAAAACCTTTTAAAGTGAGTAATAAGGCTTTCA
126 TTATGAGAATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCA
* * * *
13028 AAGGCTTGCA-TGACTATAAATAGACTTTTCTCACTAATGGATGGCTTTTGCTTTATGTTTCCTG
1 AAGGCTTG-AGTGACTATAAATGGACTTTTCTCTC-AATGGATGGCTTTTGCTTCATGTTTCCTA
* * *
13092 AGGCAGACATTCAATTATAACATATTTTAATCATAAATGTAAAAAAATCTAACTTAAAATCAATT
64 AGGCAGACATTCAATTATAACATATTTTAA-CAAAAATGTAAAAACATCCAACTTAAAATCAATT
* * *
13157 ATGAGAATATAAAATCGTTTAGAGCGAGTAATAAGGCTTTCA
128 ATGAGAATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCA
*** * * * * *
13199 AAATATTGAGTGACTATAAATGGACATTTCTCTCTAATGGATGGCTTTTGCTTTACGTTT-GTGG
1 AAGGCTTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTCTC-AATGGATGGCTTTTGCTTCATGTTTCCT-A
* ** * * *
13263 ATGTTGACATTCAATTATAACAAATTTTAACCAAAAGTATGAAAAAAC-T-CAAGTTAAAATCAA
64 AGGCAGACATTCAATTATAACATATTTTAA-CAAAA--ATGTAAAAACATCCAACTTAAAATCAA
** * * *
13326 TTATGTCAATCTAAAACCATTTAAAGCGAATAATAAGACTTTCTA
126 TTATGAGAATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTC-A
* * * * ** *
13371 AA-GCTTGAGTGGCTATAAACGGACTTTTCTCTCCAACGGATGACTTTTATTTCACGTTTCGC-A
1 AAGGCTTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTCT-CAATGGATGGCTTTTGCTTCATGTTTC-CTA
* * * * *
13434 AGGTAGACACTCAATTGTAACATATTTTAGCCAAAAATGTAAAAGA-AT-CATACTTCAAATCAA
64 AGGCAGACATTCAATTATAACATATTTTA-ACAAAAATGTAAAA-ACATCCA-ACTTAAAATCAA
** * ** *
13497 TTATGAGAATATAAAATTATTTGAAGCGAGTAATAATTCTTTCG
126 TTATGAGAATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCA
* * * * * *
13541 AAGGCTTAAGTGACTATAAATAG-CTTTTCT-TGCCAATGGATAGCTTTTGGTTCACGTTTCCCA
1 AAGGCTTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTCT--CAATGGATGGCTTTTGCTTCATGTTTCCTA
* * * *
13604 ACGCAAACAATCAATTATAACATATTTTAATCAAAAATGTAAAAAAATCCAA-TATAAAATCAAT
64 AGGCAGACATTCAATTATAACATATTTTAA-CAAAAATGTAAAAACATCCAACT-TAAAATCAAT
* * * * *
13668 TATGAGAATGTTAAACTATTTAAAGCGTGTAATAAAGCTTTCA
127 TATGAGAATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCA
* * ** * * *
13711 AAGGCTTGTGTGACTATAAATGG-CTTTTCTTATCAATAAATGACTTTTGTTTCATATTTCCTAA
1 AAGGCTTGAGTGACTATAAATGGACTTTTC-TCTCAATGGATGGCTTTTGCTTCATGTTTCCTAA
* * * * *
13775 GGTAGACATTCAATTATAGCATATTTTAACCAATAATGTAAAAA-TTCTAACTTAAAATCAATTA
65 GGCAGACATTCAATTATAACATATTTTAA-CAAAAATGTAAAAACATCCAACTTAAAATCAATTA
* * *
13839 TGAGGATATAAAACCATTTAAAGCGGGTAATAAAGCTTTCA
129 TGAGAATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCA
* * * * **
13880 AAGGCTTAAGTGACTATAAATGGACTTTTCTCTCCAATGGATGACTTTTACTTTACATTT-CTCA
1 AAGGCTTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTCT-CAATGGATGGCTTTTGCTTCATGTTTCCT-A
* * * * *
13944 AGGTAGATAATT-AATTATAATATATTTTAATCAAAAATGTAAAAA-ATCCAATTTAAAACCAAT
64 AGGCAGA-CATTCAATTATAACATATTTTAA-CAAAAATGTAAAAACATCCAACTTAAAATCAAT
* * *
14007 CATGAGAATATAAAACCATTTAAAGTGAGCAATAAGGCTTTCA
127 TATGAGAATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCA
* * * * * * * *
14050 AAGCCGTGAGTAACTATAAATCGACTTTTCTCTCTAATGGATGGTTTTTTCTTGATGTTTTC-AG
1 AAGGCTTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTCTC-AATGGATGGCTTTTGCTTCATGTTTCCTA-
* * * * * * ** *
14114 AGACAGACATTCAATTATAGCATATCTTAACTAAAAAAGTAAAAAAATCTAGTTTAAAATTAATT
64 AGGCAGACATTCAATTATAACATATTTTAAC-AAAAATGTAAAAACATCCAACTTAAAATCAATT
* * * * *
14179 ATGAGAATATAAAATCTTTTAAAGTGAGTAATAAGTCATTCA
128 ATGAGAATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCA
* * * * * * *
14221 AAAGCTTGCA-TGACTATAAATGAACTTTTCTCACTAATGGATAGCTTTTGTTTTATGTTTTCTA
1 AAGGCTTG-AGTGACTATAAATGGACTTTTCTCTC-AATGGATGGCTTTTGCTTCATGTTTCCTA
* * * *
14285 AGGAAGACATTTAATTATAACATATTTTAACCATAAATGTAAAAAAATCCAACTTAAAATCAATT
64 AGGCAGACATTCAATTATAACATATTTTAA-CAAAAATGTAAAAACATCCAACTTAAAATCAATT
* * * *
14350 ATGAGAATATAAAATCGTTTAAAGCGAGTAACAAGACTTTCAA
128 ATGAGAATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTC-A
* * * * * *
14393 AAAG-TTGAGTGACTATAAATGGACATTTCTCTCTAATAGATGGCTTTTGCTTTATGTTT-GTGG
1 AAGGCTTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTCTC-AATGGATGGCTTTTGCTTCATGTTTCCT-A
* * * * *
14456 AGCCAAACATTCAATTATAATAAATTTTAATAAAAAATGTGAAAAA-ATCCAACTTAAAAAT-AA
64 AGGCAGACATTCAATTATAACATATTTTAA-CAAAAATGT-AAAAACATCCAACTT-AAAATCAA
* * ** * * *
14519 TTATGTGAATCTAAAACTGTTTAAAGTGAGTAATTAGGCTTTGA
126 TTATGAGAATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCA
* * * ** *
14563 ATGGCTTAAGTGACTATAAATGGGCTTTTCTCTCTAATGGATCACTTTTGCTTCATGTTT-TTCA
1 AAGGCTTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTCTC-AATGGATGGCTTTTGCTTCATGTTTCCT-A
* * * * * * * *
14627 AGGAAAACATTCAATTACAACAAATTTTAACCAAAATGTAAAAAAATTCAACGTAAAATCAATTA
64 AGGCAGACATTCAATTATAACATATTTTAACAAAAATGTAAAAACATCCAACTTAAAATCAATTA
* *
14692 TGAGAATATGAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTTA
129 TGAGAATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCA
* * * *
14733 AAGGCTTGAGTGACTATAAATTGACATTTCTCTCTAATGGATGGCTTTTGCTTCACGTTTCTTAA
1 AAGGCTTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTCTC-AATGGATGGCTTTTGCTTCATGTTTCCTAA
* * * *
14798 GGCAAACATTCAATTATAACATGTTTTAACTATAATTGTAAACAA-ATTCCAACTTAAAATCAAT
65 GGCAGACATTCAATTATAACATATTTTAAC-AAAAATGTAAA-AACA-TCCAACTTAAAATCAAT
*
14862 TATGAGAATATAAAACCGTTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCA
127 TATGAGAATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCA
* * * * * *
14905 AAGGCTTGAGAGACTATAAATGGACTTTACACCCTAATGGATGGATTTTGCTTCATGTTTCCCAA
1 AAGGCTTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTCTC-AATGGATGGCTTTTGCTTCATGTTTCCTAA
* * * * *
14970 GGTAGACATTCAATTATGACATATTTTAACCAAAAATGTAAAAAAAATCTAACTTAAAATTAATT
65 GGCAGACATTCAATTATAACATATTTTAA-CAAAAATGT-AAAAACATCCAACTTAAAATCAATT
* ** * * *
15035 ATGAGAATATAAAATCATTTAAAATGAGTAGTAAGGTTTTCG
128 ATGAGAATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCA
* * * * * * *
15077 AAGGCTTGTGTGACTAAAAATAG-CTTTTCT-TGACAATGGTTGGCTTTTGCTTTATGTCTCTTA
1 AAGGCTTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTCT--CAATGGATGGCTTTTGCTTCATGTTTCCTA
* *
15140 AGGCAAACATTCAATTATAATATATTTTAA-ATATAAATGTAAAGAA-ATCCAACTTAAAATCAA
64 AGGCAGACATTCAATTATAACATATTTTAACA-A-AAATGTAAA-AACATCCAACTTAAAATCAA
* * * **
15203 TTATAAGAATATAAAACCTTTTAACGCGAGTGGTAAGGCTTTCA
126 TTATGAGAATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCA
* * * * * **
15247 AAGGCTTGAGTAACTATAAGTGGACTTTTCTCTCTAGTGGTTGGCTTTTGCCTT-GTGTTTCCCG
1 AAGGCTTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTCTC-AATGGATGGCTTTTG-CTTCATGTTTCCTA
* * *
15311 A-GCTAAACATTCAATTATAACAAATTTTAACAAAAAATGTGAAAAA-ATCTAACTTAAAATCAA
64 AGGC-AGACATTCAATTATAACATATTTTAAC-AAAAATGT-AAAAACATCCAACTTAAAATCAA
* * * * * * *
15374 TTATGTGAATCTTAAGCTATTTAAAGCCAGTAATAAGGCTTTTA
126 TTATGAGAATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCA
** * * * ** * * * *
15418 TTGGCTTTAGTGACTATAAATGGATTTTTCCCTTTTATGGATGGTTTTTGCATCAAGTTT-CTCG
1 AAGGCTTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTC-TCAATGGATGGCTTTTGCTTCATGTTTCCT-A
* * * * * * * *
15482 AGGAAAAGATTAAATTATAACATATTTTAACCAAAATCGTAAAAAAATCTAACTTAAAATCAGTT
64 AGGCAGACATTCAATTATAACATATTTTAACAAAAAT-GTAAAAACATCCAACTTAAAATCAATT
* * * *
15547 ATGTGAATATAAAATCATTTAAAGTGAATAATAAGGCTTTCA
128 ATGAGAATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCA
* * * ** *
15589 AAGGCTTGAGTGACTATAAACGGACTCTTCTCTCTAATGGATGGCTTTTCCTTCACATTT-CTCG
1 AAGGCTTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTCTC-AATGGATGGCTTTTGCTTCATGTTTCCT-A
* * * * * * * *
15653 ATGCAGACATTCCATTACAACAAAGTTTAACAAAAAATGTAAAAAAATTCAACATAAAATCAATT
64 AGGCAGACATTCAATTATAACATATTTTAAC-AAAAATGTAAAAACATCCAACTTAAAATCAATT
* * * * *
15718 ATGTGAATCTAAAATCATTTAAATCGAATAATAAGGCTTTCA
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* * * ** *
15760 AAGGCTTAAGTGACTATAAATGGACTTCTCTATCTAATTAATGGCTTTTGCTTCATGTTTTC-AG
1 AAGGCTTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTCTC-AATGGATGGCTTTTGCTTCATGTTTCCTA-
** * *
15824 AGTTAGACATTCAATTATGAGAATATAAAAATATCTAATTAACCAAAAA-GATAAAAATATCCAA
64 AGGCAGACATTC-A--AT-----TAT-AACATAT-T--TTAA-CAAAAATG-TAAAAACATCCAA
* * * *
15888 CTTCAAATCAATTATGAGAATATAAAACTATTTAAATCGAGTAATAAGACTTTCA
115 CTTAAAATCAATTATGAGAATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCA
* * * * * * * * * *
15943 AATGTTTGAGCGACTATAAAGGGGCTTTTCTATCCCATGGATAGCTTTTACTTTACAT-TTTTC-
1 AAGGCTTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTCT-CAATGGATGGCTTTTGC-TT-CATGTTTCCT
** * * *
16006 AATCCAGACATTCAATTATAACATATTTTAACCATAAATGTAAAAAAATCTAACTTAAAATCAAT
63 AAGGCAGACATTCAATTATAACATATTTTAA-CAAAAATGTAAAAACATCCAACTTAAAATCAAT
* *
16071 TATGAGAATAT-AAACCATTTAAATCGGGTAATAAGGCTTTCGA
127 TATGAGAATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTC-A
* * * * * * *
16114 AA-GCTTGCA-TGAGTATAAATAGACTTTTCTCATCAATGGATGTCTTTTGTTTCACGTTTCTTG
1 AAGGCTTG-AGTGACTATAAATGGACTTTTCTC-TCAATGGATGGCTTTTGCTTCATGTTTCCTA
* * * * * * * * *
16177 ATGTAAACATTCAATTATAATATATTTTAGCCAAAAATGTAAAAAAATCTAACTTCAAATTAATT
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* ** ** **
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* *
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* * * * * * * *
16346 GAGGCAGACAATCAATTATAACATGTTTTAGCCAAAAATATAAAAAAATCCAACATAGAATCAAT
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* * * * *
16411 TGTGAAAATGTTAAACTATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCA
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* * * * *
16454 AAGGCTTGCGTGACTATAAATGG-CTGTTCT-TACCAATGGATGACTTTTTCTTTATGTTTCCTA
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* * * * * * * * *
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* *
16582 ATGAGAATATAAAACCTTTTAAAGTGAGTAATAAGGCTTTCA
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* * * *
16624 ACGGCTTGCA-TGACTATAAATGGACTTTTCT-TACTAATGGATGGCTTTTGCTTTACGTTT-TT
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* * * * *
16686 CAAGGTAGATATTCAATTATAACATATTTTAACCATAAATGTAAAAAAATACAACTTAAAATCAA
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* * *
16751 TTATGAGAATATAAAATCGTTTAAAGTGAGTAATAAGGCTTTCAA
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* * * **
16796 AAGG-TTGAGTGACTATAAATGGACTTGTCTCTCAAATGAATGGCTTTTACTTCACATTT-CTCA
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* * * * * * * * * *
16859 AGGAAAACATTCAACTATAACAAAGTTTAATAAAAAATGTGAAAAA-ATTCAGCATAAAATCCAT
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* * * *
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* * *
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* * * * *
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* * * *
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* * * * *
17137 ATGGCTTGAGTGACTATAAATAGACTTTTTTCTCTAATGGATGGCTTTAGCTTCACGTTTTCC-A
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* * * * * *
17201 A-GCTAAACATTCAATTACAACAAATATTAACCAAAAATGTAAAAAAAATCTAACTTAAAATCAA
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* * *
17265 TTATGAGAATGTGAAACTATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCA
126 TTATGAGAATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCA
* * * * * * *
17309 AAGGCTTGAGTGATTATAAATAGACTTTTCTCTCTAATGGATAGTTTTTGCTTCACGTTTCTTGA
1 AAGGCTTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTCTC-AATGGATGGCTTTTGCTTCATGTTTCCTAA
* * * * * * *
17374 GGCAAACATTCAATTATAACATATTTTAAGCATAATTGCAAAAA-AACTAAGTTAAAATCAATTA
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** * * *
17438 TGAGAATATAAAATTATTAAAAGCAAGTAATAAGGCTTTTA
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* * * * *
17479 AAGACTTGAGTGCCTATAAATGGACTTTTCTCTCTAATGGATGGCTTTTGCTTTACGTTT-CTCG
1 AAGGCTTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTCTC-AATGGATGGCTTTTGCTTCATGTTTCCT-A
* * * * * *
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* *
17607 TAT-ATGAATATAAAACTATTTAAAGTGAGTAATAAGGCTTTCA
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* * * * *
17650 AAAGTTTGAGTGACTATAAACGGACTTTTCTCTCTAATGGATGGCTTTTGTTTCACGTTTCTCT-
1 AAGGCTTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTCTC-AATGGATGGCTTTTGCTTCATGTTTC-CTA
* * * * * * * * * *
17714 AGACAGATATTCGATTATAACATATTTTAGCCATAATTGTAAAAAAATTCAAGTTAAAATCGATT
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* ** * *
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17842 TGTTGATCCT
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Found at i:10176 original size:150 final size:150
Alignment explanation
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9895 CAATGGATGA
* * * *
9905 CTTTTGCTTCATATTTCTGGAGGCAAACAATCAATTATTACTTATTTTAACTAAATATGTAAAAA
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* * * *
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*
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* * *
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* *
10118 AAAATCCAACTTAAA-ATCAATTATGAGAATATAAAACCATTTAAAGCAAGTAATAAGGCTTTTA
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10182 AAGGCTTAAGTGACTATAAA
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10202 CAGACTTTTC
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CTTTTGCTTCATATTTCTGGAGGCAAACAATCAATTATAACATATTTTAACCAAAAATGTAAAAA
AATCCAACTTAAATACAATTATAAGAATATAAAACCATTTAAAGCAAGTAATAAGGCTTTCAAAG
GCTTAAGTGACTATAAATGG
Found at i:12242 original size:238 final size:237
Alignment explanation
Indices: 11770--12226 Score: 573
Period size: 238 Copynumber: 1.9 Consensus size: 237
11760 GGCTTTCGAA
* * **
11770 GGCTTGAGTGACTATAAACGGACTTTTCTCTCCAATGGATGGCTTTTCCTTCATGTTTCCCTAAG
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* * *
11835 CAAACATTCAATTATAACATATTTTAACGAACAATGTAAAACAATCTAACTAAAAAGCAATTATG
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* * ** * *
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* *
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* * * * *
12007 GGCTTGAGTGAATATAAATGGGC-TTTCTTCTCCCATGGATAGCTTTTGCTTTACATTT-CCTGA
1 GGCTTGAGTGAATATAAACGGACTTTTC-TCTCCAATGGATAGCTTTTCCTTCACATTTCCCT-A
* * * *
12070 AGCACACATTCAATTATAACATATTTTAACCATA-AATGTAAAACAAATCCATCTTAAAATCAAC
64 AGCAAACATTCAATTATAACATATTTTAACCA-ACAATGTAAAAC-AATCCAACTAAAAAGCAAC
***
12134 TATGAGAACATAAAACCATTTAAAGCGAATAATAAGGCAT-TCAAAGGCTTGCAT-GGCTATAAA
127 TATGAGAACATAAAACCATTTAAAGCGAATAATAA-GCATATCAAAGGCTTG-ATAAAATATAAA
*
12197 TAGACTTTTCTCACCAATGGATGGCTTTTG
190 TAGACTTTGCTCACCAATGGATGGCTTTTG
12227 TTTCACGTTT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (237 bp):
GGCTTGAGTGAATATAAACGGACTTTTCTCTCCAATGGATAGCTTTTCCTTCACATTTCCCTAAG
CAAACATTCAATTATAACATATTTTAACCAACAATGTAAAACAATCCAACTAAAAAGCAACTATG
AGAACATAAAACCATTTAAAGCGAATAATAAGCATATCAAAGGCTTGATAAAATATAAATAGACT
TTGCTCACCAATGGATGGCTTTTGCTGTACATTTCCTAAATG
Found at i:15575 original size:21 final size:20
Alignment explanation
Indices: 15536--15576 Score: 55
Period size: 20 Copynumber: 2.0 Consensus size: 20
15526 AAATCTAACT
*
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*
15556 TAAAATCATTTAAAGTGAATA
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Matches are distributed among these distances:
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TAAAATCAGTTAAGTGAATA
Found at i:19369 original size:13 final size:13
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Indices: 19351--19378 Score: 56
Period size: 13 Copynumber: 2.2 Consensus size: 13
19341 AAAGTCAGCT
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19364 TTCCTAAAATACC
1 TTCCTAAAATACC
19377 TT
1 TT
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Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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TTCCTAAAATACC
Found at i:24687 original size:32 final size:32
Alignment explanation
Indices: 24651--24723 Score: 128
Period size: 32 Copynumber: 2.3 Consensus size: 32
24641 AATGGTACAA
24651 AGTGAAGTGCTTAACTCTATTATAAAGATTGG
1 AGTGAAGTGCTTAACTCTATTATAAAGATTGG
*
24683 AGTGAAGTGTTTAACTCTATTATAAAGATTGG
1 AGTGAAGTGCTTAACTCTATTATAAAGATTGG
*
24715 AGTAAAGTG
1 AGTGAAGTG
24724 TAGAAAGTAT
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Consensus pattern (32 bp):
AGTGAAGTGCTTAACTCTATTATAAAGATTGG
Found at i:26000 original size:341 final size:338
Alignment explanation
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25243 TCTGAGACAT
* * *
25253 ACATTCAATTATAACATATTTTAATCATGAATGTAACAAAATCTAACTTAAAGTCAATTATGAGA
1 ACATTCAATTATAACATATTTTAA-CATAAATGTAA-AAAATCCAACTTAAAATCAATTATGAGA
* * * * *
25318 ATATAAAACTATTTAAAGCAAGTAATAATGCTTTCAAAGGTTTCAGTGACTATAAATAAACTTTT
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* * * * ** *
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128 TTCTCTAATGGATGGCTTTTGCTTCATGTTTTTCATGGTAAACATTCAATTATAATATATTTTAA
*
25448 TG-AAAATGTAAAAAAATCCAACTTAAAATCAATTATGAGAATATAAAACCATTTAAAGTGAGTA
193 TGAAAAATGTAAAAAAATCCAACTTAAAATCAATTATGAGAATATAAAACCATTTAAAGCGAGTA
* *
25512 GTAAGACTTTCAAAGGCTTGTGTGACTAGAAAT-AATTTTTTTTCTAATGGTTGGCTTCTACTTC
258 GTAAGACTTTCAAAGGCTTGTGTGACTAGAAATGACTTTTTTTTCTAATGGTTGGCTTTTACTTC
*
25576 ATGTTTCTCGAGATAG
323 ATGTTTCTTGAGATAG
*
25592 ACATTCAATTATAATATATTTTAAACATAAATGTAAAGAAATCCAACTTAAAATCAATTATGAGA
1 ACATTCAATTATAACATATTTT-AACATAAATGTAAA-AAATCCAACTTAAAATCAATTATGAGA
* * * * *
25657 ATATAAAATCGTTTAAAGCGAGTAATAAAGCTTTCCAAGGTTTGAGTGACTATAAATGAAACTTT
64 ATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCAAAGGCTTGAGTGACTATAAAT-AAACTTT
*
25722 TTCTTTAATGGATGGCTTTTGCTTCATGTTTTTCATGGTAAACATTCAATTATAATATATTTTAA
128 TTCTCTAATGGATGGCTTTTGCTTCATGTTTTTCATGGTAAACATTCAATTATAATATATTTTAA
* * * *
25787 TGAAAAATGTAAAAAAATCTAACTTAAAATGAATTATGAGAATATATAACCATTGAAAGCGAGTA
193 TGAAAAATGTAAAAAAATCCAACTTAAAATCAATTATGAGAATATAAAACCATTTAAAGCGAGTA
* *
25852 GTAAGACTTTCAAAGACTTGTGTGACTAGAAATGACTTTTTTTTCTAATGGTTGGCTTTTGCTTC
258 GTAAGACTTTCAAAGGCTTGTGTGACTAGAAATGACTTTTTTTTCTAATGGTTGGCTTTTACTTC
*
25917 ATGTTTCTTAAGATAG
323 ATGTTTCTTGAGATAG
*
25933 ACATTCAATTATAACATATTTTAAGCATAAATGTAATAAAATCCAACTTAAAATCAACTATGAGA
1 ACATTCAATTATAACATATTTTAA-CATAAATGTAA-AAAATCCAACTTAAAATCAATTATGAGA
* * * **
25998 ATAAAAAACCATTTAAAGTGAGTAATAAGGCTTTCGAAGGCTTGAGTGACTATAAAT-GGC-TTT
64 ATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCAAAGGCTTGAGTGACTATAAATAAACTTTT
* * * * * *
26061 TCTTGCCAATGGATGGCTTTTGCTTTATATTTCTTGA-GGTAGACGA-TCAACTATAATATATTT
129 TC-T-CTAATGGATGGCTTTTGCTTCATGTTT-TTCATGGTAAAC-ATTCAATTATAATATATTT
** * * * *
26124 TAACCAAAAATATAAAAAAATCCAACTTAAAATCCATTATGAGAATATAAAACCGTTTAAAGCAA
190 TAATGAAAAATGTAAAAAAATCCAACTTAAAATCAATTATGAGAATATAAAACCATTTAAAGCGA
* * * * * * * * * *
26189 GTAATGAGGCTTTAAAAGGCTTGAGTGTCTATAAATGGACTTTTCTCTCCAATGGATT-GCTTTT
255 GTAGTAAGACTTTCAAAGGCTTGTGTGACTAGAAAT-GACTTTTTTTTCTAATGG-TTGGCTTTT
** *
26253 ACTTTGTGTTTCTTGAGGTAG
318 ACTTCATGTTTCTTGAGATAG
* * * * * * *
26274 ATAGTCAATTATAACAAATTTTAACAAAAAATGTAAAAAAATCCAACTTCAAATTAATTATAAGA
1 ACATTCAATTATAACATATTTTAAC-ATAAATGT-AAAAAATCCAACTTAAAATCAATTATGAGA
* * *
26339 ATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCCTTT-AAAGCCGTGAGTGACTATAAATATACTTT
64 ATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGG-CTTTCAAAGGCTTGAGTGACTATAAATAAACTTT
* *
26403 TCCCTCTAATGGATAGCTTTT
128 T-TCTCTAATGGATGGCTTTT
26424 ACTTTANNNN
Statistics
Matches: 721, Mismatches: 92, Indels: 35
0.85 0.11 0.04
Matches are distributed among these distances:
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343 4 0.01
344 1 0.00
ACGTcount: A:0.39, C:0.13, G:0.13, T:0.35
Consensus pattern (338 bp):
ACATTCAATTATAACATATTTTAACATAAATGTAAAAAATCCAACTTAAAATCAATTATGAGAAT
ATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCAAAGGCTTGAGTGACTATAAATAAACTTTTTC
TCTAATGGATGGCTTTTGCTTCATGTTTTTCATGGTAAACATTCAATTATAATATATTTTAATGA
AAAATGTAAAAAAATCCAACTTAAAATCAATTATGAGAATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAGTA
AGACTTTCAAAGGCTTGTGTGACTAGAAATGACTTTTTTTTCTAATGGTTGGCTTTTACTTCATG
TTTCTTGAGATAG
Found at i:26428 original size:171 final size:170
Alignment explanation
Indices: 25253--26427 Score: 1301
Period size: 170 Copynumber: 6.9 Consensus size: 170
25243 TCTGAGACAT
** * * *
25253 ACATTCAATTATAACATATTTTAATCATGAATGTAACAAAATCTAACTTAAAGTCAATTATGAGA
1 ACATTCAATTATAACATATTTTAA-CAAAAATGTAAAAAAATCCAACTTAAAATCAATTATGAGA
* * * * * *
25318 ATATAAAACTATTTAAAGCAAGTAATAATGCTTTCAAAGGTTTCAGTGACTATAAATAAACTTTT
65 ATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCAAAGGCTTGAGTGACTATAAATAGACTTTT
* * * ** *
25383 TTCTCTAATGAATGGCTTTTACTTCACGTTTC-TCATGCAAA
130 TTCTCTAATGGATGGCTTTTACTTCATGTTTCTTGA-GGTAG
**
25424 ACATTCAATTATAACATATTTTAATGAAAATGTAAAAAAATCCAACTTAAAATCAATTATGAGAA
1 ACATTCAATTATAACATATTTTAACAAAAATGTAAAAAAATCCAACTTAAAATCAATTATGAGAA
* * * * *
25489 TATAAAACCATTTAAAGTGAGTAGTAAGACTTTCAAAGGCTTGTGTGACTAGAAATA-A-TTTTT
66 TATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCAAAGGCTTGAGTGACTATAAATAGACTTTTT
* * * * *
25552 TTTCTAATGGTTGGCTTCTACTTCATGTTTCTCGAGATAG
131 TCTCTAATGGATGGCTTTTACTTCATGTTTCTTGAGGTAG
* * *
25592 ACATTCAATTATAATATATTTTAAACATAAATGTAAAGAAATCCAACTTAAAATCAATTATGAGA
1 ACATTCAATTATAACATATTTT-AACAAAAATGTAAAAAAATCCAACTTAAAATCAATTATGAGA
* * * * * *
25657 ATATAAAATCGTTTAAAGCGAGTAATAAAGCTTTCCAAGGTTTGAGTGACTATAAATGAAAC-TT
65 ATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCAAAGGCTTGAGTGACTATAAAT-AGACTTT
* * * *
25721 TTTCTTTAATGGATGGCTTTTGCTTCATGTTT-TTCATGGTAA
129 TTTCTCTAATGGATGGCTTTTACTTCATGTTTCTTGA-GGTAG
* * * *
25763 ACATTCAATTATAATATATTTTAATGAAAAATGTAAAAAAATCTAACTTAAAATGAATTATGAGA
1 ACATTCAATTATAACATATTTTAA-CAAAAATGTAAAAAAATCCAACTTAAAATCAATTATGAGA
* * * * * * *
25828 ATATATAACCATTGAAAGCGAGTAGTAAGACTTTCAAAGACTTGTGTGACTAGAAAT-GACTTTT
65 ATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCAAAGGCTTGAGTGACTATAAATAGACTTTT
* * * * *
25892 TTTTCTAATGGTTGGCTTTTGCTTCATGTTTCTTAAGATAG
130 TTCTCTAATGGATGGCTTTTACTTCATGTTTCTTGAGGTAG
* * *
25933 ACATTCAATTATAACATATTTTAAGCATAAATGTAATAAAATCCAACTTAAAATCAACTATGAGA
1 ACATTCAATTATAACATATTTTAA-CAAAAATGTAAAAAAATCCAACTTAAAATCAATTATGAGA
* * * *
25998 ATAAAAAACCATTTAAAGTGAGTAATAAGGCTTTCGAAGGCTTGAGTGACTATAAAT-GGCTTTT
65 ATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCAAAGGCTTGAGTGACTATAAATAGACTTTT
* * *
26062 CTTGC-C-AATGGATGGCTTTTGCTTTATATTTCTTGAGGTAG
130 -TT-CTCTAATGGATGGCTTTTACTTCATGTTTCTTGAGGTAG
* * * *
26103 ACGA-TCAACTATAATATATTTTAACCAAAAATATAAAAAAATCCAACTTAAAATCCATTATGAG
1 AC-ATTCAATTATAACATATTTTAA-CAAAAATGTAAAAAAATCCAACTTAAAATCAATTATGAG
* * * * * *
26167 AATATAAAACCGTTTAAAGCAAGTAATGAGGCTTTAAAAGGCTTGAGTGTCTATAAATGGACTTT
64 AATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCAAAGGCTTGAGTGACTATAAATAGACTTT
* * * **
26232 TCTCTCCAATGGATTGCTTTTACTTTGTGTTTCTTGAGGTAG
129 TTTCTCTAATGGATGGCTTTTACTTCATGTTTCTTGAGGTAG
* * * * * *
26274 ATAGTCAATTATAACAAATTTTAACAAAAAATGTAAAAAAATCCAACTTCAAATTAATTATAAGA
1 ACATTCAATTATAACATATTTTAAC-AAAAATGTAAAAAAATCCAACTTAAAATCAATTATGAGA
* * *
26339 ATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCCTTT-AAAGCCGTGAGTGACTATAAATATACTTT
65 ATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGG-CTTTCAAAGGCTTGAGTGACTATAAATAGACTTT
** *
26403 TCCCTCTAATGGATAGCTTTTACTT
129 TTTCTCTAATGGATGGCTTTTACTT
26428 TANNNNNNNN
Statistics
Matches: 844, Mismatches: 142, Indels: 36
0.83 0.14 0.04
Matches are distributed among these distances:
168 54 0.06
169 90 0.11
170 368 0.44
171 328 0.39
172 4 0.00
ACGTcount: A:0.39, C:0.13, G:0.13, T:0.35
Consensus pattern (170 bp):
ACATTCAATTATAACATATTTTAACAAAAATGTAAAAAAATCCAACTTAAAATCAATTATGAGAA
TATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCAAAGGCTTGAGTGACTATAAATAGACTTTTT
TCTCTAATGGATGGCTTTTACTTCATGTTTCTTGAGGTAG
Found at i:28687 original size:171 final size:171
Alignment explanation
Indices: 28380--33883 Score: 3549
Period size: 171 Copynumber: 32.0 Consensus size: 171
28370 TTTCTGGCTC
* * * *
28380 GAGAAATATGAAGCAAAAGCCATCCATTGGTAAGAAAA-TACATTGATAGTCACTCAAGCCTTTG
1 GAGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGGAAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTG
* * *
28444 AAAGACATT-TTACTCGCTTTAAAT-GATTTAGTATTCT-CATAATTGATTTTAAGTTAGATTTT
66 AAAG-CCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTA-TATT-TACATAATTGATTTTAAGTTGGA-TTT
* *
28506 TTTTACATTTTTGATTAAAATATATTATAATTGAATGTCTGTCTT
127 TTTTACATTTTTGGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTGTCTT
* * * *
28551 GAGAAACATAAAGCAAAAAG-CATCCATTAGAAAGAAAAGTCCATTTATTGTCACTCAAGCCTAT
1 GAGAAACATGAAGC-AAAAGCCATCCATTGGAAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTT
* * * * * ** *
28615 GAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATAGTCTTAGATTTACATAATTAATTTTATTTTGGATCTTTT
65 GAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTTACATAATTGATTTTAAGTTGGATTTTTT
* * * **
28680 CACATTTTTGGTTAAAATTTGTTATAATTGAATGTTTACCTT
130 TACATTTTTGGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTGTCTT
** * * * *
28722 GAGAAATGTGAAGTAAAAGCCATCCATTGGAGAGACAAA-TCCGTTTATAGCCACTCAAGCCTTT
1 GAGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGGAAAGA-AAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTT
* * * * * * * *
28786 GAAAGTCTTGTTGCTAGCTTTAAATGGTTTTATATTCACACAATTAATTTTAAGTTGCATTTTTT
65 GAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTTACATAATTGATTTTAAGTTGGATTTTTT
* * *
28851 TACTTTTTTTGTTAAAATATGTTATAATTGAATGT-TTTCCTT
130 TACATTTTTGGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTGT-CTT
* * * * *
28893 G-GGAACGTGAAGCAAAAGGCATCCATTGGCAAGAAAA-TCCATTTATAGTCACTAAAGCCTTTG
1 GAGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGGAAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTG
* * *
28956 AAAGTCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCT-CATAATT-AGTTTTAAGTTAGATTTTT
66 AAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTAT-ATTTACATAATTGA-TTTTAAGTTGGA--TTT
* * * **
29019 TTTTTCATTTTTGATTAAAATATATTATAATTGAATGTC-CACTT
127 TTTTACATTTTTGGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTGTCTT
* * * * * *
29063 TA-AGAACTATAAAGCTAAAAG-TATCCATTGGAGAGCAAAGTCCATTTATAGTCACTTAAGCCT
1 GAGA-AAC-ATGAAGC-AAAAGCCATCCATTGGAAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCT
* * * * *
29126 TTGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATAGTTTTAGATTCACATAATTGATTTTATGTTGGA-TTT
63 TTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTTACATAATTGATTTTAAGTTGGATTTT
* * * * *
29190 TTTACATTTTTGGTTAAAATTTATTGTAATTGAATGTCTGCCTC
128 TTTACATTTTTGGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTGTCTT
* * * * * * * * *
29234 AAGATA-GTGAAGAAAAAGCTATCCATTGGAGAGAAAAGTCCATTTATTGTCAATCAAGCCTTTA
1 GAGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGGAAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTG
* ** * * *
29298 AAAGCTTTATTACAGGCTTTAAACT-GTTTTATATTCT-CATAAATGATTTCAATTTGGATTTTT
66 AAAGCCTTATTACTCGCTTTAAA-TGGTTTTATATT-TACATAATTGATTTTAAGTTGGA-TTTT
* *
29361 TTTACATTTTTGGTTAAAATATGTTATAATTGAATGCCTATC-T
128 TTTACATTTTTGGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTGTCTT
* * ** * *
29404 CAGGAAACATGAAGCCAAAGCCATCCATT-GACAAGAAAAG-CCATTTATAACCATTTAAGCCTT
1 GA-GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGGA-AAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTT
* * *
29467 TGACAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATATTCTTA-A-AATTGATTCTAAGTTGGATTT
64 TGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATA-T-TTACATAATTGATTTTAAGTTGGATTT
* ** * * * * *
29530 TTTTACATATTTCATTAAACATA--TTAAAATTGATTTTCTGGCTC
127 TTTTACATTTTTGGTTAAA-ATATGTTATAATTGAATGTCTGTCTT
* * * * * *
29574 GAGAAATATGAAGCAAAAGTCATCTATTGGTAAGAAAA-TACATTGATAGTCACTCAAGCCTTTG
1 GAGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGGAAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTG
* * * **
29638 AAAGACATT-TTACTCACTTTAAATGGTTTTATATTCACATAATTGATTTTAAGTTACATTTTTT
66 AAAG-CCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTTACATAATTGATTTTAAGTTGGATTTTTT
*
29702 TACATTTTTGGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTATCTT
130 TACATTTTTGGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTGTCTT
* * ** ** * *
29744 GGGATACACAAAGCAAAAAG-CATCCATTAGG--AGAAAAGAACAATTATAGTCACTCAAGTCTT
1 GAGAAACATGAAGC-AAAAGCCATCCATT-GGAAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTT
* * *
29806 TGAAAGCCTTATTACTCAG-TTTAAATAGTTTTATATTCT-CATAATTAATTTTAAGTTAGATTT
64 TGAAAGCCTTATTACTC-GCTTTAAATGGTTTTATATT-TACATAATTGATTTTAAGTTGGATTT
* * *
29869 TTTTACATTTTTGGTTAAAATATGTTATAATTGGATGTTTGTCTC
127 TTTTACATTTTTGGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTGTCTT
* * * * * * ** * *
29914 AAGAAACGTAAAGTAAAAGCTATCCATTAGAGTGAAAAGTCAATTTATAGTCACTCAAGTCTTTG
1 GAGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGGAAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTG
* * * * * *
29979 ATAGCCTTATTACTCGCTTTAAATAGTTTTATATTCACATAATTTATTTTAAGTTTGATTTTTTA
66 AAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTTACATAATTGATTTTAAGTTGGATTTTTTT
*
30044 ACATTTTT-GTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTGCCTT
131 ACATTTTTGGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTGTCTT
* * * * * ** ** *
30084 -AGGAA-ATGTAAAGTAAAAGCCATCCGTTAGAGAGAAAAGTATATTTATAGTCACAAAAGCTTT
1 GAGAAACATG--AAGCAAAAGCCATCCATTGGAAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTT
* * *
30147 TGAAAGCCTTATTACAT-GCTTTAAATGGTTTTATATTCT-CATAATTTATTTTAAGCTGGAGTT
64 TGAAAGCCTTATTAC-TCGCTTTAAATGGTTTTATATT-TACATAATTGATTTTAAGTTGGATTT
* ** * *
30210 TTTTATATTTTTTATTAAGATATGTTATAATTGAATGTCTGCCTCT
127 TTTTACATTTTTGGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTGTCT-T
* * * **
30256 -AGAAATATAAAGCAAAAGCCATCCATTGGCAAGAGAAA-T-TTTTTATAGTCACTCAAGCCTTT
1 GAGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGGAAAGA-AAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTT
* * * **
30318 GAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAA-CGATTTATATTCTA-ATAATTGATTTTAAGTTGGAAGTTT
65 GAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATT-TACATAATTGATTTTAAGTTGGATTTTT
* * * *
30381 TTATATTTTTGGTTAAAATATCTTATAATTGATTGT-TAGACTT
129 TTACATTTTTGGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCT-GTCTT
* * ** * * *
30424 GAGAAACGTGAAGAAAAAATCATCCATTGGCAAGAAAAG-CGATTTATAGTCACACAAGCCTTTG
1 GAGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGGAAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTG
* * * * * *
30488 AAATCCTTATTACTCGATTTAAATGGTTTTATCTTCT-CATAATTGATTTGATGTTAGATATTTT
66 AAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATT-TACATAATTGATTTTAAGTTGGAT-TTTT
* * * **
30552 TTACATTTTTGGTTAAAATATATTATAATTGAATATTTACCTCT
129 TTACATTTTTGGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTGTCT-T
* * * * *
30596 -AGAAACATAAAGGC-CAAGCCATCCATT-AACAAGAAAAG-CCATTTATAATCACTCAAACCTT
1 GAGAAACATGAA-GCAAAAGCCATCCATTGGA-AAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTT
* * ** * **
30657 T-AACAGCCTTATTTCTCACTTTAAATGGTTTTATATTCTTA-A-AATTGGCTCTAAGTTAAATT
64 TGAA-AGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATA-T-TTACATAATTGATTTTAAGTTGGATT
* ** * * ** *
30719 TTTTTACTTTTTTCATT-AAATATATTAAAATT-AATTGTCTACCTC
126 TTTTTACATTTTTGGTTAAAATATGTTATAATTGAA-TGTCTGTCTT
* * * * *
30764 AAGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGGTAAGAAAA-TACATTGATGGTCACTCAAGCCTTTG
1 GAGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGGAAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTG
* * * * *
30828 AAAGACTTTTTACTCGCTTTAAATGATTTTGTAATCT-CATAATTGATTTTAAGTTGGATTTGTT
66 AAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTAT-ATTTACATAATTGATTTTAAGTTGGATTT-TT
* * * * *
30892 TTACTTTTTTAGTTAAAATATGTTATAATTAAATATTTGTC-T
129 TTACATTTTTGGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTGTCTT
* * * * * * *
30934 CAGAAAATATGAAGCAAAAAG-CATCCATTAGAGAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTTAAGCCTA
1 GAG-AAACATGAAGC-AAAAGCCATCCATTGGAAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTT
* * * *
30998 TGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATAGTTTTAGATTCACATAATTGATTTTAAGTTGGATCTTT
64 TGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTTACATAATTGATTTTAAGTTGGATTTTT
* * * * **
31063 TCACA-TTTTGGTTAAAATTTGTTATAATTTAATGTTTACCTCT
129 TTACATTTTTGGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTGTCT-T
* * * * * ** ** *
31106 -AGAAACATGAAGAAAAAGCCCTCCATTGAAAATAAAAATCTGTTTATAGTCACTCAAGTATTCG
1 GAGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGGAAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTG
* * *
31170 AAAGCCTTATTGCTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCACATAATTGATTTTAAGTTGCATTTTTTT
66 AAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTTACATAATTGATTTTAAGTTGGATTTTTTT
* *
31235 ACATTTTTGTTTACAATATGTTATAATTGAATGTCTGTC-T
131 ACATTTTTGGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTGTCTT
* * * * *
31275 CAGAAA-ATGAGAAGCCAAAAG-TATCCATTAGAGAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTTAAGCCT
1 GAGAAACAT--GAAG-CAAAAGCCATCCATTGGAAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCT
* * *
31338 TTGAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATAGTTTTATATTCT-CATAATTGATTTTAAGTTTGATTT
63 TTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATT-TACATAATTGATTTTAAGTTGGATTT
* *
31402 TTTTATATTTTTGGTTAAAATATGTTATAATTGAATG-CT-TGCCT
127 TTTTACATTTTTGGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTGT-CTT
* * * * ***
31446 CAGGAAACATGAAGCCAAAGCCATCCATTAGAGAGAAAAGTTTGTTTATAGTCACTCAAGCCTTN
1 GA-GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGGAAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTT-
********************************************************
31511 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
64 ---------TGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTTACATAATTGATTTTAAGT
********************************** ** * * * *
31576 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAGATT-TTTTTATATTTTT
120 TGGATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAATATGTTATA-ATTGAATGTCT-GTCTT
* * * ** * ** *** * *
31629 G-GTTAAA-AT-ATA-CTATAATTG-AATGC-TTGCCTCAAGAAACGTGAAGCAAAAGCCA-TCC
1 GAG--AAACATGA-AGC-A-AA-AGCCATCCATTG--GAAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACT-C
* * ** * * * *
31687 ATTGGC-AAGAAAAGCCTTTTACAATCACTCAAGCCTTTGAAA-GCCTTATCACTTGCTTTA-A-
57 A-AGCCTTTG-AAAGCC--TT---ATTACTC--G-CTTT-AAATG-GTT-TTA--T-ATTTACAT
* * * * * **
31748 AAGGTTTTATATTCTCATA-ATCGATTTTAAGTTAGATTTTT--TTACATTTTTGGTTAAACTAT
106 AA---TTGAT-TT-T-A-AGTTGGATTTT--TTTACATTTTTGGTTA-A------AAT-----AT
* * *
31810 GCTATAATTGAATGTTTGTCCT
150 GTTATAATTGAATGTCTGTCTT
* * * * * * *
31832 GAGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTAGAGAGAAAAGTTCATTTATATTCACTCAAGCCATTA
1 GAGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGGAAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTG
* * * ** * * *
31897 AAAGTCTTATTACTAGTTTTAAATAATTTTATATTCT-CATAACTAATTTTAAGTCGGATTTTTT
66 AAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATT-TACATAATTGATTTTAAGTTGGATTTTTT
* * * * **
31961 TATATTTTTGGTTAAAGTATGTTATAATTAAATATCTACCTT
130 TACATTTTTGGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTGTCTT
* * * *
32003 -AGGAAACAAGAAGTC-AAACCCATCCATTGGAGAGAAGAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTT
1 GA-GAAACATGAAG-CAAAAGCCATCCATTGGAAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTT
* * *
32066 TGAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATATTCACATAATTGATTTTAAGCTGGATTTTT
64 TGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTTACATAATTGATTTTAAGTTGGATTTTT
* * * **
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129 TTACATTTTTGGTTAAAATAT-GTTATAATTGAATGTCTGTCTT
* * * *
32174 -AGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATGGGAGAGAGAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTT
1 GA-GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGGAAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTT
* * * * *
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65 GAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATT-TACATAATTGATTTTAAGTTGGATTTTT
** * * ** * *
32301 TTAC-TTTTTTATTTAAATATATTATAATTGGTTGTCTGCCTA
129 TTACATTTTTGGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTGTCTT
** * * * * * * *
32343 GAGAAATGTGAAGCAAATGCCATCCATTGGCAAGATAA-TACATTTATGGTCATTGAAGCAC-TT
1 GAGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGGAAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGC-CTTT
* * * * *
32406 GAAAGCATGATTACTCGCTTTAAATGATTTTATATTCACATAATTGATTTTAAGCTGGATTTATT
65 GAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTTACATAATTGATTTTAAGTTGGA-TT-TT
* * * *
32471 TTTACTTTTTTGGTTAAAATATGTTATAACTGAATGTCT-ACCT
128 TTTACATTTTTGGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTGTCTT
* ** * * * * **
32514 CAGGGGACGTGAAGCAAAAGCCATCCATGGGAGAGAAAAATCCATTTATAGTCACTTGAGCCTTT
1 GA-GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGGAAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTT
* *
32579 GAAAGCCTTATTGCTCACTTTAAATGGTTTTATATTCT-CATAATTGATTTTAAGTTGGATTTTT
65 GAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATT-TACATAATTGATTTTAAGTTGGATTTTT
* * * *
32643 TTACATTTTCGATTAAAATATGTTATAATTAAATGTCTGCCTT
129 TTACATTTTTGGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTGTCTT
* * *
32686 G-GCAAACGT-AAGAAAAAAGCCATCCATTGGCAAGAAAAG--CATTTATAGTCACTCAAGCCTT
1 GAG-AAACATGAAG-CAAAAGCCATCCATTGGAAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTT
* ** *
32747 TGAAAGCTTTATTACTCGCTTTAAATAATTTTATATTCTTA-A-AATT-AGTTCTAAGTTGGATT
64 TGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATA-T-TTACATAATTGA-TTTTAAGTTGGATT
* * * * **
32809 TTTTTATATTTTTTGTTAAAATATGTAATAATTGATTGTCTACCTTT
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* * * * * * *
32856 G-GAAACGTGAAGCAAAAGCTATGCATTGGCAACAAAAG-CCATTTATGGTCATTCAAGCCTTTG
1 GAGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGGAAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTG
* ** * * * *
32919 AAAGCCTGATCCCTCGCTTTAAAAGGTTTTATATTCT-CATCATTAAATTTTAAGTTGGAATTTT
66 AAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATT-TACATAATT-GATTTTAAGTTGGATTTTT
* * *
32983 TTACATTTTTGGTTAAATATATGTTATAATTGATTGTCTGCCTC
129 TTACATTTTTGGTTAAA-ATATGTTATAATTGAATGTCTGTCTT
* * * * * *
33027 GAGAAACATGAAGGAAACA-CCATCCATGGGAGAGTACAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCATT
1 GAGAAACATGAAGCAAA-AGCCATCCATTGGAAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTT
* * *
33091 GAAAGCCTTATTGCTCGCTTTAAATGGTTATATATTCT-CATAATTGATTTTAAGTTAGAATTTT
65 GAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATT-TACATAATTGATTTTAAGTT-GGA-TTT
* **
33155 TTTTACATTTTTGATTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTACCTT
127 TTTTACATTTTTGGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTGTCTT
* *
33200 G-GAAA-ATGTGAAGCAAAAGCCATCCA-TGAGAGAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCAAGCCT
1 GAGAAACA--TGAAGCAAAAGCCATCCATTG-GAAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCT
** * * *
33262 TTGAAAGCCTTATTACTCATTTTAAATGGTTTTATATGCT-CATAGTTGATTTTAAGTTAGATTT
63 TTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAT-TTACATAATTGATTTTAAGTTGGATTT
* * ** *
33326 CTTTACATTCTTCATTAAAATAT-TCTATAATTGAATGTTTG-CTT
127 TTTTACATTTTTGGTTAAAATATGT-TATAATTGAATGTCTGTCTT
* * * * * * *
33370 CAAGAAACATGAAGCAAAAGCCATTCA-TGAGAGAGAAAAGTCTATTTATAGTTACTCGAGCTTT
1 -GAGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTG-GAAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTT
* *
33434 TGAAAACCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTAGATTCTA-ATAATTGATTTTAAGTTGGATTTT
64 TGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATT-TACATAATTGATTTTAAGTTGGA----
* * *
33498 TTTTTTTACATTTTTGGTTAAAATATGTTTTGATTGAATGTCTGCCTTT
124 TTTTTTTACATTTTTGGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTGTC-TT
* * * * *
33547 G-GAAACATAAAGCAAAAGCCATCCATTAGAGAGAAAAGTCCGTTTATAGTCACTCAAGCCTTGG
1 GAGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGGAAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTG
* * * * *
33611 AAAGCTTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATATTCT-TATAATTGATTTTAAGTTAGATCTTTT
66 AAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATT-TACATAATTGATTTTAAGTTGGATTTTTT
* * *
33675 TACATTTTTGGTTGAAATATGTTATAATTAAATGTCTGCCTT
130 TACATTTTTGGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTGTCTT
* * * * * * *
33717 G-GAAAACGTAAAGCAAAAGCCATCTATTAGAGAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCAAGCTTTT
1 GAG-AAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGGAAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTT
* *
33781 AAAAGCCTTATTACAT-GCTTTAAATGGTTTTATATTCT-CATAATTGATTTTATGTTGGATTTT
65 GAAAGCCTTATTAC-TCGCTTTAAATGGTTTTATATT-TACATAATTGATTTTAAGTTGGA-TTT
*
33844 TTTTACATTTTTAGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCT
127 TTTTACATTTTTGGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCT
33884 ATCTCGGAAA
Statistics
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168 64 0.02
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ACATTTTTGGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTGTCTT
Found at i:29363 original size:512 final size:511
Alignment explanation
Indices: 28382--33883 Score: 4319
Period size: 512 Copynumber: 10.7 Consensus size: 511
28372 TCTGGCTCGA
* * *
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* *
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** * *
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* * * * *
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* * * * ** * * *
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* * ** * * *
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* * * * * * * *
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* * * * *
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* * * *
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* *
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* * *
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* * *
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190 TCCATTGGAGAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAA
* * * * * *
29151 ATAGTTTTAGATTCACATAATTGATTTTATGTTGGA-TTTTTTACATTTTTGGTTAAAATTTATT
255 ATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAATATGTT
* * * *
29215 GTAATTGAATGTCTGCCTCAAGATA-GTGAAGAAAAAGCTATCCATTGGAGAGAAAAGTCCATTT
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* * * * ** *
29279 ATTGTCAATCAAGCCTTTAAAAGCTTTATTACAGGCTTTAAACT-GTTTTATATTCTCATAAATG
385 ATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAA-TAGTTTTATATTCTCATAATTG
* * * ** **
29343 ATTTCAATTTGGATTTTTTTTACATTTTTGGTTAAAATATGTTATAATTGAATGCCTATCTCAG
449 ATTTTAAGTTGGA-TTTTTTTACTTTTTTGGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTTTGCCTCAG
* * * ** * * *
29407 GAAACATGAAGCCAAAGCCATCCATT-GACAAGAAAAGCCATTTATAACCATTTAAGCCTTTGAC
1 GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGGA-GAGAAAATCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAA
* * * * *
29471 AGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATATTCTTAAAATTGATTCTAAGTTGGATTTTTTTAC
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* * * * * * ** ** * *
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130 ATTTTTGATTAAAATATATTATAATTGAATGTC-CACTTTAAGAACGTA--AAGCAAAAGCCATC
* * * * *
29598 TATTGGTA-AGAAAA-TACATTGATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGACATT-TTACTCACTTTAA
192 CATTGG-AGAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAG-CCTTATTACTCGCTTTAA
* **
29660 ATGGTTTTATATTCACATAATTGATTTTAAGTTACATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAATATGTT
255 ATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAATATGTT
** *** * *** * ** *
29725 ATAATTGAATGTCTATCTTGGGATACACAAAGCAAAAAG-CATCCATTAG-GAGAAAAGAACAAT
320 ATAATTGAATGTCTGCCTCAAGAAACGTGAAGC-AAAAGCCATCCATTGGAGAGAAAAGTCCATT
*
29788 TATAGTCACTCAAGTCTTTGAAAGCCTTATTACTCAG-TTTAAATAGTTTTATATTCTCATAATT
384 TATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTC-GCTTTAAATAGTTTTATATTCTCATAATT
* * * * * *
29852 AATTTTAAGTTAGATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAATATGTTATAATTGGATGTTTGTCTCAA
448 GATTTTAAGTTGGATTTTTTTACTTTTTTGGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTTTGCCTCAG
* * * * * * * * *
29916 GAAACGTAAAGTAAAAGCTATCCATTAGAGTGAAAAGTCAATTTATAGTCACTCAAGTCTTTGAT
1 GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGGAGAGAAAA-TCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAA
* * * * *
29981 AGCCTTATTACTCGCTTTAAATAGTTTTATATTCACATAATTTATTTTAAGTTTGATTTTTTAAC
65 AGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTAGATTTTTTTAC
* ** * * * * *
30046 ATTTTTG-TTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTGCCTTAGGAAATGTAAAGTAAAAGCCATCCG
130 ATTTTTGATTAAAATATATTATAATTGAATGTCCACTTTAAG-AACGTAAAGCAAAAGCCATCCA
* ** ** *
30110 TTAGAGAGAAAAGTATATTTATAGTCACAAAAGCTTTTGAAAGCCTTATTACAT-GCTTTAAATG
194 TTGGAGAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTAC-TCGCTTTAAATG
* * * * ** *
30174 GTTTTATATTCTCATAATTTATTTTAAGCTGGAGTTTTTTATATTTTTTATTAAGATATGTTATA
258 GTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAATATGTTATA
* ** * **
30239 ATTGAATGTCTGCCTCTAGAAATATAAAGCAAAAGCCATCCATTGGCA-AGAGAAA-T-TTTTTA
323 ATTGAATGTCTGCCTCAAGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGG-AGAGA-AAAGTCCATTTA
* * * *
30301 TAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAA-CGATTTATATTCTAATAATTGAT
386 TAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATAGTTTTATATTCTCATAATTGAT
** * * * * *
30365 TTTAAGTTGGAAGTTTTTA-TATTTTTGGTTAAAATATCTTATAATTGATTGTTAGACT-TG
451 TTTAAGTTGGATTTTTTTACT-TTTTTGGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTTTGCCTCAG
* * ** * * *
30425 AGAAACGTGAAGAAAAAATCATCCATTGGCA-AGAAAAGCGATTTATAGTCACACAAGCCTTTGA
1 -GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGG-AGAGAAAATCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGA
* * * * *
30489 AATCCTTATTACTCGATTTAAATGGTTTTATCTTCTCATAATTGATTTGATGTTAGATATTTTTT
64 AAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTAGAT-TTTTTT
* * ** * * *
30554 ACATTTTTGGTTAAAATATATTATAATTGAATATTTACCTCT-AGAAACATAAAGGC-CAAGCCA
128 ACATTTTTGATTAAAATATATTATAATTGAATGTCCA-CTTTAAG-AACGTAAA-GCAAAAGCCA
* * * * * *
30617 TCCATT-AACAAGAAAAG-CCATTTATAATCACTCAAACCTTT-AACAGCCTTATTTCTCACTTT
190 TCCATTGGA-GAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAA-AGCCTTATTACTCGCTTT
* * ** * ** * ** *
30679 AAATGGTTTTATATTCTTAAAATTGGCTCTAAGTTAAATTTTTTTACTTTTTTCATT-AAATATA
253 AAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAATATG
* * * *
30743 TTAAAATT-AATTGTCTACCTCAAGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGGTA-AGAAAA-TAC
318 TTATAATTGAA-TGTCTGCCTCAAGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGG-AGAGAAAAGTCC
* * * * * *
30805 ATTGATGGTCACTCAAGCCTTTGAAAGACTTTTTACTCGCTTTAAAT-GATTTTGTAATCTCATA
381 ATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATAG-TTTTATATTCTCATA
* * * *
30869 ATTGATTTTAAGTTGGATTTGTTTTACTTTTTTAGTTAAAATATGTTATAATTAAATATTTGTCT
445 ATTGATTTTAAGTTGGATTT-TTTTACTTTTTTGGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTTTGCCT
30934 CAG
509 CAG
* * * * * *
30937 AAAATATGAAGCAAAAAG-CATCCATTAGAGAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTTAAGCCTATGA
1 GAAACATGAAGC-AAAAGCCATCCATTGGAGAGAAAA-TCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGA
* * * * * *
31001 AAGCCTTATTACTCGCTTTAAATAGTTTTAGATTCACATAATTGATTTTAAGTTGGATCTTTTCA
64 AAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTAGATTTTTTTA
* * * * ** * * * * *
31066 CA-TTTTGGTTAAAATTTGTTATAATTTAATGTTTACCTCT-AGAAACATGAAGAAAAAGCCCTC
129 CATTTTTGATTAAAATATATTATAATTGAATGTCCA-CTTTAAG-AACGTAAAGCAAAAGCCATC
* * * * ** ** * *
31129 CATTGAAAATAAAAATCTGTTTATAGTCACTCAAGTATTCGAAAGCCTTATTGCTCGCTTTAAAT
192 CATTGGAGAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAAT
* * * *
31194 GGTTTTATATTCACATAATTGATTTTAAGTTGCATTTTTTTACATTTTTGTTTACAATATGTTAT
257 GGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAATATGTTAT
* * * * *
31259 AATTGAATGTCTGTCTC-AGAAAATGAGAAGCCAAAAG-TATCCATTAGAGAGAAAAGTCCATTT
322 AATTGAATGTCTGCCTCAAG-AAACGTGAAG-CAAAAGCCATCCATTGGAGAGAAAAGTCCATTT
* *
31322 ATAGTCACTTAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATAGTTTTATATTCTCATAATTGA
385 ATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATAGTTTTATATTCTCATAATTGA
* *
31387 TTTTAAGTTTGATTTTTTTA-TATTTTTGGTTAAAATATGTTATAATTGAATGCTTGCCTCAG
450 TTTTAAGTTGGATTTTTTTACT-TTTTTGGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTTTGCCTCAG
* * ***
31449 GAAACATGAAGCCAAAGCCATCCATTAGAGAGAAAAGTTTGTTTATAGTCACTCAAGCCTTNNNN
1 GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGGAGAGAAAA-TCCATTTATAGTCACTCAAGCCTT----
*************************************
31514 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
61 ----------------------------TGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATT
******************************** ** * *
31579 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAGATTTTTTTATATTTTTGGTTAAAATATACTA
98 CTCATAATTGATTTTAAGTTAGATTTTTTTACATTTT------------TGATTAAAATATATTA
* * * *
31644 TAATTGAATGCTTGC-C-TCAAGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGGCA-AGAAAAG-CCTT
151 TAATTGAATG--TCCACTTTAAG-AACGTAAAGCAAAAGCCATCCATTGG-AGAGAAAAGTCCAT
* * * * * *
31705 TTACAATCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTATCACTTGCTTTAAAAGGTTTTATATTCTCATAATC
212 TTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATT
* * * * *
31770 GATTTTAAGTTAGATTTTTTTACATTTTTGGTTAAACTATGCTATAATTGAATGTTTGTCCT-GA
277 GATTTTAAGTTGGATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTG-CCTCAA
* * * * *
31834 GAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTAGAGAGAAAAGTTCATTTATATTCACTCAAGCCATTAAA
341 GAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGGAGAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAA
* * * * * * *
31899 AGTCTTATTACTAGTTTTAAATAATTTTATATTCTCATAACTAATTTTAAGTCGGATTTTTTTA-
406 AGCCTTATTACTCGCTTTAAATAGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGATTTTTTTAC
* * * * * *
31963 TATTTTTGGTTAAAGTATGTTATAATTAAATATCTACCTTAG
471 T-TTTTTGGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTTTGCCTCAG
* * *
32005 GAAACAAGAAGTC-AAACCCATCCATTGGAGAGAAGAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGA
1 GAAACATGAAG-CAAAAGCCATCCATTGGAGAGAA-AATCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGA
* * * * *
32069 AAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATATTCACATAATTGATTTTAAGCTGGATTTTTTTG
64 AAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTAGATTTTTTTA
* * ** * * * * *
32134 CATTCTTGGTTAAAATATCGTATAATTGAATATCTACCTTAGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCC
129 CATTTTTGATTAAAATATATTATAATTGAATGTCCACTTTAAG-AACGTAAAGCAAAAGCCATCC
* * * * * *
32199 ATGGGAGAGAGAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTATAAATCACTTTAAAAG
193 ATTGGAGAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATG
* ** * *
32264 G-TTTATATTCTCATAATTGGTTTTAAGTTGGATTTTTTTAC-TTTTTTATTTAAATATATTATA
258 GTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAATATGTTATA
** * * * *
32327 ATTGGTTGTCTGCCT-AGAGAAATGTGAAGCAAATGCCATCCATTGGCA-AGATAA-TACATTTA
323 ATTGAATGTCTGCCTCA-AGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGG-AGAGAAAAGTCCATTTA
* * * * * *
32389 TGGTCATTGAAGCAC-TTGAAAGCATGATTACTCGCTTTAAAT-GATTTTATATTCACATAATTG
386 TAGTCACTCAAGC-CTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATAG-TTTTATATTCTCATAATTG
* * * *
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** * * **
32517 GGGACGTGAAGCAAAAGCCATCCATGGGAGAGAAAAATCCATTTATAGTCACTTGAGCCTTTGAA
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* * *
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* * * ** *
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*
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** * * * * *
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* * * *** * * *
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* * * ** *
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* * * * *
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510 AG
* * * * *
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* *
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* * * * *
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* **
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* * * * * **
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253 AAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAATATG
* * * * *
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* * * * * * *
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* * * *
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446 TTGATTTTAAGTTGGA----TTTTTTTACTTTTTTGGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTTTGC
**
33543 CTTTG
507 CTCAG
* * * *
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* * * *
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* * * * *
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130 ATTTTTGATTAAAATATATTATAATTGAATGTC--CACTT-TAAGAACGTAAAGCAAAAGCCATC
* * * * *
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* *
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Statistics
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GTTGGATTTTTTTACTTTTTTGGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTTTGCCTCAG
Found at i:29534 original size:341 final size:340
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* * * *
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* *
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* * * * * * * *
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* * * * ** * *
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* * *
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* * * * * *
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* * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * *
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* * * * * **
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* * *
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* *
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* ** * * *
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* ** * * * * * ** * *
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* * * * *
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* * **
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* **
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* ** * * * *
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* * *
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* * * * *
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* * * *
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* * * *
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* *
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** * * * * ** ** *
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* * *
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* ** * * ** * * *
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* ** *
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* * * ** * *
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* * *
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* * ** * * *
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* * * * * *
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* * * * * * * *** *
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128 CATTTTTGGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTGCCTCAAGAAACGTGAAGAAAAAGCTATCC
* * * * *
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* * * ** * ** * ** *
30682 TGGTTTTATATTCTTAAAATTGGCTCTAAGTTAAATTTTTTTACTTTTTTCATT-AAATATATTA
256 TAGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAATATGTTA
* *
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* ** * *
30766 GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGGTAAGAAAATACATTGATGGTCACTCAAGCCTTTGAAA
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* * * * *
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* * *
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* * * * *
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* *
31088 AATTTAATGTTTACCTCTA-
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* * * * ** ** *
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* * *
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64 AGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGATTTTTTTAC
* * * * * *
31237 ATTTTTGTTTACAATATGTTATAATTGAATGTCTGTCTC-AGAAAATGAGAAGCCAAAAG-TATC
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* *
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192 CATTAGAGAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAAT
* *
31365 AGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTTGATTTTTTTATATTTTTGGTTAAAATATGTTAT
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*
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* * ***
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1 GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATT-GAAAGAAAAG-CCATTTATAGTCACTCAAGCCTT----
***********************************************
31514 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
60 ------------------TGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTG
******************************* ** * *
31579 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAGATTTTTTTATATTTTTGGTTAAAATATACTA
107 ATTTTAAGTTGGATTTTTTTACATTTTTGGTTA-AAATATGT-TA--------T---A-AT--T-
* * * * *
31644 TAATTGAATGCTTGCCTCAAGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGGCA-AGAAAAG-CCTTTT
155 GAA-TG--T-C-TGCCTCAAGAAACGTGAAGAAAAAGCTATCCATTAG-AGAGAAAAGTCCATTT
* * * * *
31707 ACAATCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTATCACTTGCTTTAAA-AGGTTTTATATTCTCATAATCG
214 ATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATA-GTTTTATATTCTCATAATTG
* * * * * *
31771 ATTTTAAGTTAGATTTTTTTACATTTTTGGTTAAACTATGCTATAATTGAATGTTTGTCCTGA-
278 ATTTTAAGTTGGATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCT-ACCTCAG
* * * * * *
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* * * ** * * * *
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* * * * * * ** ** * *
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* * * *
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* * * *
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* *
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* * * *
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** * * ** * * * *
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* * *
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*
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** * * * * **
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* **
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*
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320 ATAATTGAATGTCTACCTCAG
*
33201 GAAA-ATGTGAAGCAAAAGCCATCCA-TGAGAGAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCAAGCCTTT
1 GAAACA--TGAAGCAAAAGCCATCCATTGA-A-AGAAAAG-CCATTTATAGTCACTCAAGCCTTT
** * * * *
33264 GAAAGCCTTATTACTCATTTTAAATGGTTTTATATGCTCATAGTTGATTTTAAGTTAGATTTCTT
61 GAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGATTTTTT
* ** * * * * *
33329 TACATTCTTCATTAAAATAT-TCTATAATTGAATGTTTGCTTCAAGAAACATGAAGCAAAAGCCA
126 TACATTTTTGGTTAAAATATGT-TATAATTGAATGTCTGCCTCAAGAAACGTGAAGAAAAAGCTA
* * * * * * *
33393 TTCATGAGAGAGAAAAGTCTATTTATAGTTACTCGAGCTTTTGAAAACCTTATTACTCGCTTTAA
190 TCCATTAGAGAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAA
* * *
33458 ATGGTTTTAGATTCTAATAATTGATTTTAAGTTGGATTTTTTTTTTTACATTTTTGGTTAAAATA
255 ATAGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGA----TTTTTTTACATTTTTGGTTAAAATA
* * * **
33523 TGTTTTGATTGAATGTCTGCCTTTG
316 TGTTATAATTGAATGTCTACCTCAG
* * * *
33548 GAAACATAAAGCAAAAGCCATCCATTAGAGAGAAAAGTCCGTTTATAGTCACTCAAGCCTTGGAA
1 GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATT-GAAAGAAAAG-CCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAA
* * * * *
33613 AGCTTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATATTCTTATAATTGATTTTAAGTTAGATCTTTTTAC
64 AGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGATTTTTTTAC
* * ** * * * *
33678 ATTTTTGGTTGAAATATGTTATAATTAAATGTCTGCCT-TGGAAAACGTAAAGCAAAAGCCATCT
129 ATTTTTGGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTGCCTCAAG-AAACGTGAAGAAAAAGCTATCC
* * *
33742 ATTAGAGAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCAAGCTTTTAAAAGCCTTATTACAT-GCTTTAAAT
193 ATTAGAGAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTAC-TCGCTTTAAAT
* * *
33806 GGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTATGTTGGATTTTTTTTACATTTTTAGTTAAAATATGTTA
257 AGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGA-TTTTTTTACATTTTTGGTTAAAATATGTTA
*
33871 TAATTGAATGTCTATCTC-G
321 TAATTGAATGTCTACCTCAG
33890 GAAA
1 GAAA
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CCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGATTTTTTTACAT
TTTTGGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTGCCTCAAGAAACGTGAAGAAAAAGCTATCCATT
AGAGAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATAGTT
TTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAATATGTTATAATT
GAATGTCTACCTCAG
Found at i:34807 original size:73 final size:73
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** * * * *
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* * *
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* * * *
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1 GCTCTTAGTCAACTAACATTAAC-TCTTAGTCGATTAAGTCGTTTCTATCTCTGAACCTAGTTTC
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65 TGGCAGCAA
* * * *
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34829 ATAGTTTGCT
Statistics
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GCTCTTAGTCAACTAACATTAACTCTTAGTCGATTAAGTCGTTTCTATCTCTGAACCTAGTTTCT
GGCAGCAA
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* * * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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** * * *
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* * ** * * *
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* * ** * **
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* * *
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1 TGAAGCAAAAGCCATCCAT-GGAGA-AAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCT
* * * * * *
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* * * * * *
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* * * *
41527 TGAAGCAAAAGCCATCCATCAGAGAAAAAAGTCTATGTATAGTCACTCAGGCCTTTGAAAGCCTT
1 TGAAGCAAAAGCCATCCAT-GGAGAAAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTT
* * * * * *
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* * *
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* * * * *** * *
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1 TGAAGCAAAAGCCATCCA-TGGAGAAAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTT
* * * * *
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65 ATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGATTTTTTTACA-TTTT
* *
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* * *
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1 TGAAGCAAAAGCCATCCA-TGGAGAAAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTT
* * * * *
41934 ATTACTCGCTTTAAATGGTTTTACATTCTTATAATTAATTTTAAATTGGATTTTTTTATATTTTT
65 ATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGATTTTTTTACATTTTT
** * * * *
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130 GGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTGCCTTGAG-AAACA
* * * * * * *
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1 TGAAGCAAAAGCCATCCATGGAG-AA-AAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCT
* * * * *
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64 TATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGATTTTTTTACATTTT
* * *
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129 TGGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTGCCTTGAG-AAACA
* * * * *
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1 TGAAGCAAAAGCCATCCATGGA-GAAAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTT
* ** *
42275 ATTACTCGCTTTAAATCGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTATATTTTTTTACTTTTTT
65 ATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGATTTTTTTACATTTTT
* * ** * * *
42340 TGTTGAAATATGTTATAATTGAATACCTACCTTGGGAAACT
130 GGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTGCCTTGAGAAACA
* ** * * * * *
42381 TAAAATAAAAGTCATCCAT-TAGAAAGAAAAGTTCATTTATAGTCACTCAAGCTTTTAAAAGCCT
1 TGAAGCAAAAGCCATCCATGGAG-AA-AAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCT
* * * * * * * *
42445 TATCACTCACTTTAAAGGGTTTTATATTTTTAGAATTAATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTT
64 TATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGATTTTTTTACATTTT
* * * *
42510 TGATAAAAATATGCTATAATTGAATGTCTGCCTTGGGAAACA
129 TGGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTGCCTTGAGAAACA
* * * **
42552 TGAAGCAAACGCCATCCATGGGAGAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAG-CTATTAAAAGTTT
1 TGAAGCAAAAGCCATCCAT-GGAGAAAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCT-TTGAAAGCCT
* * *
42616 TATTACTTGCTTTAAATGCTTTTATATTCTCATAATTGGTTTTAAGTTGGATTTTTTTACATTTT
64 TATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGATTTTTTTACATTTT
* * * * * * * *
42681 TAGTTAAAATATATTATAATTAAATATTTTCCATAAGAAACA
129 TGGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTGCCTTGAGAAACA
* * * *
42723 TGAAGCAAAAGCCATCCATTGATAAGAAAG-CTATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTA
1 TGAAGCAAAAGCCATCCATGGAGAAAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTA
* * * * * * * * * *
42787 TCACTTGCTTTAAAAGGTTTTATATTTTTATAATTAATTTT-TGACTGGATTCTTTTATATTTTT
66 TTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAG-TTGGATTTTTTTACATTTTT
* * * * *
42851 GATAAAAATATGTTATAATTGAATGTCTACC-TCAGGTAACA
130 GGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTGCCTTGA-GAAACA
* * * * * *
42892 TAAAGCAAACA-CCATCCATAGAAGAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTTAAGCCGTTGAAAGCCT
1 TGAAGCAAA-AGCCATCCAT-GGAGAAAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCT
* * * *
42956 TATTACTCACTTTAAATGCTTTTATATTCTCATAATTGATTTCAAGTTGGATTTTTTAACATTTT
64 TATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGATTTTTTTACATTTT
* *
43021 TGGTTAAAATATGTTATAATTAAATGTTTGCCTCT-AGAAACA
129 TGGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTGCCT-TGAGAAACA
* * * * * *
43063 TGAACCAAAAGCTATCCATTGGCA-AGAAAAG-CTATTTACAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGTCT
1 TGAAGCAAAAGCCATCCA-TGG-AGAAAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCT
* * * * * * * *
43126 TATTACTCGGTTTAAATAGTTTTATACTCTTATAATTGATTTGAAGATGAAATTTTTTACATTTT
64 TATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGATTTTTTTACATTTT
* * * * *
43191 TGGTTAAAATATGTTATAATTGATTGTTTACCTTGGGAAACG
129 TGGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTGCCTTGAGAAACA
* * * * * *
43233 TAAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAG-CCATTTATAGTCACTTAAACCTTTGAAAGCGTT
1 TGAAGCAAAAGCCATCCATGGAGAA-AAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTT
** * * * * * *
43297 ACCACTCGCTTTAAAAGGTTTTATATTCACATAATTCAATTTTAAGCTAGATTTGTTTACATTTT
65 ATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATT-GATTTTAAGTTGGATTTTTTTACATTTT
* * * *
43362 TGGTTATAAA-ATGTTATAATTGAACGTTTGTC-TCAGGAAACA
129 TGGTTA-AAATATGTTATAATTGAATGTCTGCCTTGA-GAAACA
* * *
43404 TGAAGCAAACGCCA-CCATGGGAGAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCTTTTGAAAGCCTT
1 TGAAGCAAAAGCCATCCAT-GGAGAAAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTT
* *
43468 ATTACTCACTTTAAATGGTTTTATATTCCCATAATTGATTTTAAGTTGGATTTTTTTACATTTTT
65 ATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGATTTTTTTACATTTTT
* * * * *
43533 TGTTGAAATATGTTATAATTAAATGACTTCCTT-AGGAAACA
130 GGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTGCCTTGA-GAAACA
* * * * * *
43574 TGAAGCAAAAGCTATCCATTGTAGAGAAAAGTCTATTTAAAGTAACTCAAGCCTTTGAAAGCCTT
1 TGAAGCAAAAGCCATCCA-TGGAGAAAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTT
* *
43639 ATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGATTTTTTAAAATTTTT
65 ATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGATTTTTTTACATTTTT
** * * ** * *
43704 TATTAACATATGTTATAATTCAATGTCTAACTCGA-AAATTA
130 GGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTGCCTTGAGAAA-CA
* * * * *
43745 TGAAGCGAAAGCCATCCATTGGAGAGAAAAGTCCATTTATGGTCACTTAAGCCTTTGAAAGCTTT
1 TGAAGCAAAAGCCATCCA-TGGAGAAAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTT
* * * * * *
43810 ATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATGTTCACATAATTAATTTTAAGTTGGATGTTTTTGCTTTTTT
65 ATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGATTTTTTTACATTTTT
* * **
43875 GGTTAAAATATGCTATAATTGAATGTTTGCCTCCAGAAACA
130 GGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTGCCTTGAGAAACA
* *
43916 TAAAGCAAAAGCCATCCATGGGAGAGAAAAA-CCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCT
1 TGAAGCAAAAGCCATCCAT-GGAGA-AAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCT
* * * * * *
43980 TATTACTCACTTTAAAAGGTTTTACATTCTCATAATTGGTTTTAAGTTGTA-TTTTTTACTTTTT
64 TATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGATTTTTTTAC-ATTT
* * * * *
44044 TTGGTT-AAATATATTATAATTGATTATCTGCCTAGAGAAACG
128 TTGGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTGCCTTGAGAAACA
* * * * ** *
44086 TGATGCAAATGCTATCCATTGG-GAAGAAAA-TACATTTACGGTCACTGAAGCCTTTGAAAG-CT
1 TGAAGCAAAAGCCATCCA-TGGAGAA-AAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCT
* ** ** * * *
44148 TGATTACTCACTTTAAATAATTTTATATTAACATAATTGATTTTAAGCTAGATTGTTTTTATATT
64 T-ATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGATT-TTTTTACATT
* * * * *
44213 TTTGATAAAAATATGTTATAATTGAACGT-T-CATCTCAGGAAACA
127 TTTGGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTGCCT-TGA-GAAACA
* * * * * * *
44257 TAAAGAAAAAGCCATCCATGGGAGAGAAAAGTCTATTTATATTTACTCAAGCCTTTGAAAGCCAT
1 TGAAGCAAAAGCCATCCAT-GGAGAAAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTT
* * * * * * *
44322 ATAATTCACTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGAAATATTTTATATTTTT
65 ATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGATTTTTTTACATTTTT
* * *
44387 TGTTAAAATATGTTATAATTGATTGTCTACCTT-AGAAA-A
130 GGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTGCCTTGAGAAACA
* * * *
44426 TGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAG-CCATTTATAATCACTCAAGCCTTTGAAAGTC
1 --TGAAGCAAAAGCCATCCATGGAGAA-AAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCC
* * * * * *
44490 TTATCACTCACTTTAAAAGGTTTTATATTCTCATAATTAATTTTAAGTTGAATTTTTTTATATTT
63 TTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGATTTTTTTACATTT
* * *
44555 TTGATTAAAATATATTATAATTGAATGTCTGCC-TCAGGAAACA
128 TTGGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTGCCTTGA-GAAACA
* * * * *
44598 TGAAGCAAATGCCATCCATGGGAGAGAAAGGTCCATTTACAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCCT
1 TGAAGCAAAAGCCATCCAT-GGAGAAAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTT
* * *
44663 ATTACTCGCTTTAAATGTTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAATTAGATTTTTTTACATTTTT
65 ATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGATTTTTTTACATTTTT
* * ** **
44728 GGTTGAAATATGTTATAATTGAATGTCCGCCTCAAGAAATG
130 GGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTGCCTTGAGAAACA
* * * * * *
44769 TGATGCAAAGGCTATCCATTGGCATG--AAAAG-CTATTTA-CGGCGACTC-AGACCTTTGAAAG
1 TGAAGCAAAAGCCATCCA-TGG-A-GAAAAAAGTCCATTTATAGTC-ACTCAAG-CCTTTGAAAG
* ** * *
44829 CCTTATTACTCGCTTTAAGTATTTTTATATT-TCCATAATTGATTTTAAGTTAGAATTTTTTAC-
61 CCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCT-CATAATTGATTTTAAGTTGGATTTTTTTACA
* * * * * * **
44892 TTTTTCAGTTAAAATATGTCATAATTGATTATCTGCCTAGAAAAATG
125 TTTTT-GGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTGCCTTGAGAAACA
* * ** * ** *
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1 TGAAGCAAAAGCCATCCATGGAG-AA-AAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCT
** ** ** *
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* * *
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* * * * *
45109 TGAAGCAAAAGCCATCCATGGGAGAGAAAAGTCCATTTATTGTCACTCGAGCCATTAAAAGCCTT
1 TGAAGCAAAAGCCATCCAT-GGAGAAAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTT
* * *
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* * *
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* * * * *
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** *
45343 ATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGGCTTTAAGTTGGATTTTTTTATATTTTT
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** * * * * *
45408 AATTAAAATATATTATAAATGAATGACTACCTT-AGGAAACG
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* * ** *
45449 TGAATCAAAAGCCAACCATGG-GAAAGAAAAGTTTATTCATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCT
1 TGAAGCAAAAGCCATCCATGGAG-AA-AAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCT
* * * * **
45513 TATTACTCGCTTTAAATAGTTATATATTCTCATAACTGATTTTAAATTATATTTTTTTACATTTT
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* * * * * *
45578 TGGTTAAAATATATTATAATTAAATATTTACCTTGAGAAACG
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** ** * *
45620 TGAAGCAAAAGCCATCCATTAAAGGGAAAAGTCTATTTATAGTCAC-CTAGGCCTTTGAAAGCCT
1 TGAAGCAAAAGCCATCCA-TGGAGAAAAAAGTCCATTTATAGTCACTC-AAGCCTTTGAAAGCCT
* * * * *
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64 TATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGATT-TTTTTACATTT
* *
45749 TTGGTTAAAATAGGTTATAATTGAATGTCTGCCTT-AGGAAACG
128 TTGGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTGCCTTGA-GAAACA
* * ***
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1 TGAAGCAAAAGCCATCCA-TGGAGAAAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTT
* * * *
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* * * * * *
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130 GGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTGCCTTGAG-AAACA
* * *
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129 TGGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCT-GCCTTGA-GAAACA
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1 TGAAGCAAAAGCCATCC-ATGGAGAAAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTT
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1 TGAAGCAAAAGCCATCCA-T-GGAGAAAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCT
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49263 TGATTAAAATATGCTATAATTGAAAGTCTACCTTGAG-CA-A
129 TGGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTGCCTTGAGAAACA
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1 TGAAGCAAAAGCCATCCAT-GGAGAAAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTT
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130 GGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTGCCTTGAGAAACA
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49646 TGAAGCAAAAGCCATCCATTAGAGAGAAAAGTTCATTTAAAGTCAGTCAAGCCTTTGAAAGCCTT
1 TGAAGCAAAAGCCATCCA-TGGAGAAAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTT
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49816 TGAAGCAAAAAACATCCGTTAGAGAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGTGTT
1 TGAAGCAAAAGCCATCC-ATGGAGAAAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTT
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128 TTGGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTGCCTTGA-GAAACA
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1 TGAAGCAAAAGCCATCC-ATGGAG-AAAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCT
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1 TGAAGCAAAAGCCATCCATGGAG-AA-AAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCT
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1 TGAAGCAAAAGCCATCCA-TGGA-GAAAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCT
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1 TGAAGCAAAAGCCATCCAT-GGAGAAAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTT
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1 TGAAGCAAAAGCCATCCAT-GGAGAAAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTT
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50800 TAGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTTTGTC-TCAGGAAACG
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1 TGAAGCAAAAGCCATCCAT-GGAGAAAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTT
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1 TGAAGCAAAAGCCATCCA-TGGAGAAAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTT
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1 TGAAGCAAAAGCCATCCAT-GGAGAAAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTT-GAAAGCCT
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51248 GATTACTCGTTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTAGATTTTTTTACATTTT
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51313 TAATTAAAATAT-TCCATAATTGAATGTCTACCTT-AGGAAACG
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1 TGAAGCAAAAGCCATCCA-TGGAGAAAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTT
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65 ATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGATTTTTTTACATTTTT
* * * * * *
51485 GGCTAAAATATGCTATAGTTGAATGTCTGGCTCGAAAAACA
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1 TGAAGCAAAAGCCATCCA-TGGAGA-AAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCT
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51591 TATTACTAGCTCTAAATAGTTTTATATGCACATAGTTGGCTTTAAGTTGGATTTATGTATATTTT
64 TATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGATTTTTTTACATTTT
* * *
51656 TAGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTTTGCCTTTAGAAACA
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* * * * *
51698 TGAAGCAAAAGCCATCCATAAGATAAAAAAGTCCATTTACAGTAACTCAAGCCATTGAAAGCCTT
1 TGAAGCAAAAGCCATCCAT-GGAGAAAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTT
** * ** *
51763 ATTACTCGCTTTAAATACTTTTATGTTCTCATAATTGGCTTTAAGTTAGATTTTTTTTCACATTT
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* * *** * *
51828 TTGGTTAAAATAAGCTATAATTGAATGTCAAAC-TCAGGAAACG
128 TTGGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTGCCTTGA-GAAACA
* * * **
51871 TTAAGCAAAAGCCATCCATGGGAGATAAAAA-TCCATTTATGGTCACTGAAGCCTTCAAAAGCCT
1 TGAAGCAAAAGCCATCCAT-GGAGA-AAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCT
* * * **
51935 TA-T--TCACTTTAAATAGTTTTATACTCTCATAATTG-TCTTTAAGTTATATTTTCTTTACATT
64 TATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGAT-TTTAAGTTGGATTTT-TTTACATT
** * * ** * *
51996 TTTCATTTAAATATGCTATAATTGAATGT-TTTCTTCATGAAACG
127 TTTGGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTGCCTTGA-GAAACA
* ** * * *
52040 TGAAGCAAAAGTCATTTATGGGAGAGAAAAGTCCATTTACAGTCACTCAAGCCTATGAAAGCCTT
1 TGAAGCAAAAGCCATCCAT-GGAGAAAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTT
* * * * * * *
52105 ATTATTCGCTTTCAATGATTTTATATTCTCATAATAGATTTTAAGATGGATGTTTTTACATTTCT
65 ATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGATTTTTTTACATTTTT
** *
52170 GGTTAAAATATACTATAATTGAATGGT-TGCATT-AGGAAATC-
130 GGTTAAAATATGTTATAATTGAAT-GTCTGCCTTGA-GAAA-CA
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52211 TGAAGCAAAAGCCTTCCATTCAAAAGAAAAGTACATTTATAGTTACTCAAGCTTTTGAAAGCCTT
1 TGAAGCAAAAGCCATCCATGGAGAA-AAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTT
* *
52276 ATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAACTAATTTTAAGTTGGATTTTTTCTACATTTT
65 ATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGATTTTTT-TACATTTT
* * * * * *
52341 TGGTTAAAATATGCTATTATTGAAAGTTTTCCTTGGGAAACA
129 TGGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTGCCTTGAGAAACA
* * *
52383 TGAAGCAAAAGCCATCCATTAGAGAGAAAAGTCCATTTAAAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTT
1 TGAAGCAAAAGCCATCCA-TGGAGAAAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTT
* *
52448 ATTACTTC-CTTTAAATGGTTTTATATTCTCATACTTGATTTTAAGTTGGA-TTTTTTACGTTTT
65 ATTAC-TCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGATTTTTTTACATTTT
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52511 TGTTTAAAATATGCTACT-ATTGAATGTCTACCTCAAGAAACA
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* * * * * * *
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* * * * * *
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** ** *
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* * * * * *
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** * * * *
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* * * * * * *
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**
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* * * * * * *
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* * * *
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** * * * * * *
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* * * * *
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* * * *
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** * * * *
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1 TGAAGCAAAAGCCATCCAT-GGAGA-AAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCT
*
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* * * *
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* * * * * *
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* ** *
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* *** * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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* * *
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** * *
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** ** * * ** * * *
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* * * * * * * *
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* * **
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* * *
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* * * * * *
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* * * *
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* * * *
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* * * *
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* * * * * *
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1 TGAAGCAAAAGCCATCCA-TGGGAGAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCT
* * * * * * * *
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65 TATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGATTTTTTTACATTTT
* * * * *
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130 TGGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTACC-TAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGA-
* * * * ** *
43256 AAGAAAAG-CCATTTATAGTCACTTAAACCTTTGAAAGCGTTACCACTCGCTTTAAAAGGTTTTA
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* * * * * *
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* * ** * *
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* *
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* * * *
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* *
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** * * * * * * * *
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* * * *
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* * * * * *
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* * * * **
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* * *
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* * * * * * * *
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* * * * ** *
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* ** ** * * *
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* * * * * * * *
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* *
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* * * ** * *
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* * * *
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382 CACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTA
* * * *
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* ** * ** * * * *
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508 CA
* * * *
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194 AGA-AAAGTCTATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTA
** * * *
45366 TATTCTCATAATTGGCTTTAAGTTGGATTTTTTTATATTTTTAATTAAAATATATTATAAATGAA
258 TATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGA-TTTTTTATATTTTTGATTAAAATATGTTATAATTGAA
* * * * * ** *
45431 TGACTACCTTAGGAAACGTGAATCAAAAGCCAACCATGGGAAAGAAAAGTTTATTCATAGTCACT
322 TGTCTACCTCAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCAT-GGAAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACT
* * * * *
45496 CAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATAGTTATATATTCTCATAACTGATTTTAAATT
386 CAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTT
** * * * * * * *
45561 ATATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAATATATTATAATTAAATATTTACCTTGAGAAACG
451 GGATTTTTTTACATTTTTGATTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTGCCTTGAGAAACA
*** * * *
45620 TGAAGCAAAAGCCATCCATTAAAGGGAAAAGTCTATTTATAGTCAC-CTAGGCCTTTGAAAGCCT
1 TGAAGCAAAAGCCATCCATGGGAGAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTC-AAGCCTTTGAAAGCCT
* * * * *
45684 TATTACTCACTTTAGATGGTTTTGTATTCTCATAATTGATTTTAAGTTAGATTCTTTTTATATTT
65 TATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGATT-TTTTTACATTT
* * *
45749 TTGGTTAAAATAGGTTATAATTGAATGTCTGCCTTAGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTTG
129 TTGGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTACC-TAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCA-TTG
* * * * *
45814 AGAGAAAAGTTTGTTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTTTTACTCGCTTTAAATAGTTTT
192 AAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTT
* * * ** * *
45879 ATATTCTTATAATTGATTTTAAGTTCGATTTTTTTACATTTTTGGCTGAACTATGTTATAATTGA
257 ATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGA-TTTTTTATATTTTTGATTAAAATATGTTATAATTGA
** ** * * *
45944 ATGT-TTGCTTTGGCAAATATGAAGCGAAAGCCATCCATTGAACAGAAAAG-CCATTTATAGTCA
321 ATGTCTACCTCAGG-AAACATGAAGCAAAAGCCATCCATGGAA-AGAAAAGTCCATTTATAGTCA
* * * *
46007 CCCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCACAATGGATTTTAAG
384 CTCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAG
* * * ** * * * *
46072 TTGGATTTTTTTACATTTCTGGTTGAAATATACTATAATTGAAGGTTTG-CTTTAGGAAACG
449 TTGGATTTTTTTACATTTTTGATTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTGCCTTGA-GAAACA
* * ** * *** *
46133 TGCAGCAAAAGCTATCCAACGGAGAGACAAGGATATTTATAGTCACTCAAGCCTTTAAAAGCCTT
1 TGAAGCAAAAGCCATCCATGGGAGAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTT
* * * * * *
46198 ATTACTTGATTTAAATCGTTTTATATTCTCATAATTAATTATAAGTTGGATTTTTTTATATTTTT
66 ATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGATTTTTTTACATTTTT
* * * * **
46263 GGTTAAAATATGCTATAATTGAATGTCAACCTCAAGAAACGA-AAAGCAAAAGCCATCTGTTGGA
131 GGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTACCT-AGGAAAC-ATGAAGCAAAAGCCATCCATT-GA
* * * * *
46327 AAGAAAAGTCCATTTATAATCACTCAAGCCTTTAAAAGTCTTGA-CACTCGCTTTAAATGGTTTT
193 AAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTT-ATTACTCGCTTTAAATGGTTTT
** * *
46391 ATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTTTAATTTTTTACATTTTTGATTAAAATATGCTATAATTGA
257 ATATTCTCATAATTGATTTTAAG-TTGGATTTTTTATATTTTTGATTAAAATATGTTATAATTGA
* * * **********
46456 AAGTCTACCTC-GAGAATCACGAAGCAAAAGCCATCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
321 ATGTCTACCTCAG-GAAACATGAAGCAAAAGCCATCC------------------ATGGAAAGAA
**************************************************** ***** * **
46520 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGAAGGAAAAGCC
367 AAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATATTC
*** ** * * ** * *
46585 ATCCATCGAA--GA-GAAAAG-TCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCTTTATTACTCAC
432 -T-CAT--AATTGATTTTAAGTTGGATTT-T-TTTA--C-A-TTTTTG--A---TTA-AAAT-A-
* * * * * * *
46646 T-TTA-AATTG-TTTTATGTTCTT-ATAATTGGCT
479 TGTTATAATTGAATGTCTG-CCTTGAGAA---ACA
* ** * ** *** * ***** * ** * * *
46677 TTAAG--TTAG-AAT-TTTTTAACATTTTTGGTTCAAATAT-GTTATAATTGAATGCCTACCTTA
1 TGAAGCAAAAGCCATCCATGGGAGA-GAAAAGTCCATTTATAG---TCACTCAA-GCCT---TT-
* * ** *** * ** **** * * * * * *
46737 GGAAA-CGTGAAGCAAAAGCTATCCATAGGAGAGAAATGTCTAATTATAG-TCACTCAAGCCTTT
57 -GAAAGCCT-TATTACTCGCTTTAAAT-GGTTTTATAT-TCTCATAATTGAT--TTTAAG---TT
* ** * * * ** * * **
46800 GAAAGCCTTATTAC-TCCCTTGAAATAGTT-TTATAT-TCTCATAATTG-ATTTCAAGTTGAAGG
113 G-GA-TTTTTTTACAT---TT---TTGGTTAAAATATGT-T-ATAATTGAATGTCTACCT--AGG
** * * * * * * *** * **** * *
46861 TTTTTACATTTTTG-GGTAAAATATACTAT-AATTGAATG-TCTGCCTCCAGAAACGTGA-TGCA
166 ---AAACAT----GAAG-CAAA-A-GCCATCCATTGAAAGAAAAGTCTATTTATA-GTCACT-C-
* **** *
46922 AAAGCTATCCATTGGAGANNNNNNNNNNTTTATAGTTACTCAAGCCTTTGAAA-GCCTTGTTACT
218 -AAG----CC-TTTGA-A--------AGCCT-TA-TTACTC--G-CTTT-AAATG-GTT-TTA-T
* * * * *
46986 CGCTT-TAAATAGTTTTATATTATCGTAATTGACTTCAATTTGGATTTTTTTATATTTTTGGTTA
259 --ATTCT-CATA-ATTG--ATT-T--TAA--G--------TTGGA-TTTTTTATATTTTTGATTA
* * * * * *
47050 AAATATAG-TATAATCGAATGACTGCCT-AGAAAAACATGAAGAAAAAGCCATCCGTGGGAAAGA
304 AAATAT-GTTATAATTGAATGTCTACCTCAG-GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCAT-GGAAAGA
** * * * * * * *
47113 AAAGAGCATTTTTA-TACTCTCTAGTCTTCGAAAG-CTTGATTACTCGCTTTAAATGATTTTATA
366 AAAGTCCATTTATAGT-CACTCAAGCCTTTGAAAGCCTT-ATTACTCACTTTAAATGGTTTTATA
********** * * * *
47176 TTNNNNNNNNNNATTTTAAGTTGGATTTTTTTATATTTTTAATTAAAATATGCTATAATTAAATG
429 TTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGATTTTTTTACATTTTTGATTAAAATATGTTATAATTGAATG
* *
47241 TCTACCTT-AGGAAACG
494 TCTGCCTTGA-GAAACA
* * * * ** * ********
47257 TGAAACAAAAGCCATCCCTTGGAGAGAAAAGTTCATTTATAAACATTCAAGCCTNNNNNNNNNNN
1 TGAAGCAAAAGCCATCCATGGGAGAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCT---TTGAAAGC
*****************************************************************
47322 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
63 CTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGATTTTTTTACATT
*****************************************************************
47387 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
128 TTTGGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTACCTAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGA
*****************************************************************
47452 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
193 AAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTA
*****************************************************************
47517 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
258 TATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGATTTTTTATATTTTTGATTAAAATATGTTATAATTGAAT
***************************************** *
47582 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGATAAAGGTCCATTTACAGTCACT
323 GTCTACCTCAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATGGAAAGA-AAA-GTCCATTTATAGTCACT
* * * * **
47647 CAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGCTTTTATGTTCTCATTATTGGCTTTAAGTT
386 CAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTT
* * * * * ** **
47712 AGATTTTTTCACATTTTTGGTTAAAATAGGCTATAATTGAATGTCTAACTTGAGAAATG
451 GGATTTTTTTACATTTTTGATTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTGCCTTGAGAAACA
* * * * **
47771 TGAAGCAAAAGCCATCCATGGGAGACAAAAATCCATTTATGGTGACTCAAGCCTTCAAAAGCCTT
1 TGAAGCAAAAGCCATCCATGGGAGAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTT
* * *
47836 ATT-CAT---TTTAAATAGTTTTATACTCTCATAATTGATTTTAAGTTAGATTTTCTTTACATTT
66 ATTAC-TCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGATTTT-TTTACATTT
** * * * * * * * **
47897 TTCATTTAAATATGCTATACTTGAATGTTTTCTTTAGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATTTA-TGA
129 TTGGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTAC-CTAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGA
* * * * *
47961 GAGAGAAAAGTCCATTTACAATCACTCGAA-CCTTTGAAAACCTTATTACTCCCTTTAAATGGTT
193 -A-AGAAAAGTCTATTTATAGTCACTC-AAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTT
* * * * * *
48025 TTATATTCTCATAATCGATTTTCAGTTGGATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAATATGCTATACTT
255 TTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGA-TTTTTTATATTTTTGATTAAAATATGTTATAATT
* * * ** **
48090 GAATGGT-TGCGTCAGGAAATC-TAAAGCAAAAGCCATCCATTCAAGAGAAAAGTATATTTATAG
319 GAAT-GTCTACCTCAGGAAA-CATGAAGCAAAAGCCATCCATGGAA-AGAAAAGTCCATTTATAG
* * * *
48153 TTACTCAAGCTTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAACTGATTTT
381 TCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTT
* * * * * * * **
48218 AAGTTAGATTTTTTTATATTTTTGGTTAAAATATGCTATTATTGAAAGTTTGCCTCAAGAAACA
446 AAGTTGGATTTTTTTACATTTTTGATTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTGCCTTGAGAAACA
** * * * * *
48282 TGAAGCAAAAGCCATCCATTAGAGACAAAAGTCCATTTAAAGTCACTCAAACCTTTGAAAACGTT
1 TGAAGCAAAAGCCATCCATGGGAGAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTT
* * * * * * ** *
48347 TTTACTCGATTTAAATAGTTTTATATTCTCATAATTTATTTTTAGGTT-CAAATTTTTATATTTT
66 ATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGA-TTTTAAGTTGGATTTTTTTACATTTT
* * * ** * ***
48411 TTGTCAAAATATGTTATAATTGAATGACTGTCTCAGGAAACATGAAGCGAAAGCCATCCAACAAA
130 TGGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTACCT-AGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGAA
* * **
48476 GAGAAAAGGAC-ATTTATAGTCACTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCAATTTAAATGG-TTT
194 -AGAAAA-GTCTATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTT
* * * * * *
48539 ATATTCTCATAACTGA-TTTAGGTTGGATTTTTTTACATATTT-ACTTAAAATGT-TCTATTATT
257 ATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGA-TTTTTTATATTTTTGA-TTAAAATATGT-TATAATT
* * * * * * * * *
48601 CAATGTTTGCCTTAGGAAACGTGAAGCAACAA-CCATCCATTAGATAGAAAAGTCTATTTAAAGT
319 GAATGTCTACCTCAGGAAACATGAAGCAA-AAGCCATCCA-TGGAAAGAAAAGTCCATTTATAGT
* *
48665 CATTCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTTACTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTA
382 CACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTA
* * * * * *
48730 AGTTGGATTTTTTTTACATTTTGGTTTAAAATATATTATTATTGAATGTCTGTCTTGAGAAACG
447 AGTTGGA-TTTTTTTACATTTTTGATTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTGCCTTGAGAAACA
* ** * * *
48794 TGAAGCAAAAGACATCCATTAGAGAGAAAAGTTCATTTATAGTCTCTCAAGCCTTTGAAAGCATT
1 TGAAGCAAAAGCCATCCATGGGAGAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTT
* ** * * *
48859 ATTACTCGATTTAAATACTTTTATATTCTCATAATTGATTTTTAGGTTGGAATTTTTTACTTTTT
66 ATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGA-TTTTAAGTTGGATTTTTTTACATTTT
* * * * * * ***
48924 TAGTCAAAATGTGTTATAATTGAATGACTAGCTCAGGAAACATGAAGCAAAGGCCATCCAAAAAA
130 TGGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTACCT-AGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGAA
** * * *
48989 GAGAAAAGGATATTTATAGTCACTCAAGCCTTTAAAAGCCTTATTACTCGATTTAAATCGTTTTA
194 -AGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTA
* * * * *
49054 TGTTCTCATAATTGATTTTAAGTTAGAATTTTTTAGATTTTTGA-TAAATTATGCTATAATTGAA
258 TATTCTCATAATTGATTTTAAGTT-GGATTTTTTATATTTTTGATTAAAATATGTTATAATTGAA
* * * * ** *
49118 TGTCTGCCTCAAGAAACATGAAGCAAAAGCTATCCATTAGG-GAGAAAAGTATATTTATAATCAC
322 TGTCTACCTCAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCA-T-GGAAAGAAAAGTCCATTTATAGTCAC
* * * * * *
49182 TCAAGCCCTTAAAAGCCTTATTGCTCACTTTAAATGG--TTGTGTTCTCATCATTGATTTTAAGT
385 TCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGT
* * * * *
49245 TTGATTTTTTTACATTTTTGATTAAAATATGCTATAATTGAAAGTCTACCTTGAG-CA-A
450 TGGATTTTTTTACATTTTTGATTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTGCCTTGAGAAACA
* * * *
49303 TGAAAGGAAAAAGCCATCCATTAGTG-GA-AAAAGTACATTTATAGTCACTCAAGACTTTGAAAG
1 TG-AA-GCAAAAGCCATCCA-T-GGGAGAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAG
* * * * * *
49366 CCTTATCACTCACTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGACTTTAAGTTCGATTTTATCACA-
62 CCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGATTTTTTTACAT
* * * * *
49430 TTTTGGATTAAAATATGCTATAATTGAATGCCTACCTTGGGAAACATAAAGCAAAAGCTATCCAT
127 TTTTGG-TTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTACC-TAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCAT
* * * * * *
49495 GGGAGAGAACAGTCTATTTATGGTCAGTCAAGCCTTTAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGT
190 -TGAAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGT
* * * *
49560 TTTATATTCTCATAACTGATTTTAAGTTAGATTTTTTTACATTTTT-AGTTAAAATATGTT-TTA
254 TTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGA-TTTTTTATATTTTTGA-TTAAAATATGTTATAA
* * ** * * * * *
49623 TTGAAAGTTTACCTTGGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTAGAGAGAAAAGTTCATTTAAAG
317 TTGAATGTCTACCTCAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCA-TGGAAAGAAAAGTCCATTTATAG
* * *
49688 TCAGTCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTTC-CTCTAAATGGTTTTATATTCTTATAATTGATTT
381 TCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTAC-TCACTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTT
* * * * * *
49752 TAAGTTAGA-TTTTTTACATTTTTGGTTAAAATATGCTATTATTGAATGTTTGCC-TCAGGAAAC
445 TAAGTTGGATTTTTTTACATTTTTGATTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTGCCTTGA-GAAAC
49815 A
509 A
** * ** **
49816 TGAAGCAAAAAACATCCGTTAGAGAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGTGTT
1 TGAAGCAAAAGCCATCCATGGGAGAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTT
* * * * * *
49881 CTTACTCGATTTAAATAGG-TTTATATTGTCATAATTGATTTTTAGGTTGGAATTTTTTCCATTT
66 ATTACTCGCTTTAAAT-GGTTTTATATTCTCATAATTGA-TTTTAAGTTGGATTTTTTTACATTT
* * * * * * *
49945 TTAGTCAAAATATATTATAAGTGAATGACTACCTCAGGAAATATGAAGCAAAAGCCATCCAATGG
129 TTGGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTACCT-AGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCC-ATTG
* * * * * *
50010 AGAAAAAAAGAC-ATTTATAGTCACTCAAGCCTTTAAAAGCCCTATTACTCGATTTAAATCGTTT
192 A-AAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTT
* * * * * *
50074 TATATTCTCATAA-TGAAGTTGAGGTTGAATTTTTTTACATTTTTG-GTAAAATAT-TCTATAAT
256 TATATTCTCATAATTG-ATTTTAAGTTGGA-TTTTTTATATTTTTGATTAAAATATGT-TATAAT
** * * ** * * *
50136 TGAATGTCTGGCTCAGAAAACGTGAAATAAAAGCCATCCATTAGAAAGAAAAGTCCCTTTATAAT
318 TGAATGTCTACCTCAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCA-TGGAAAGAAAAGTCCATTTATAGT
* * * *
50201 CCCTCAAGTCTTTGAAAGCCTTATTACGT-GCTTTCAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTT
382 CACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTAC-TCACTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTT
* * * * *
50265 AAGTTTGATTTTTTTACATTTTTGATTAAAATACGTTATAATTGACA-GTCTACCTTAAGAGACA
446 AAGTTGGATTTTTTTACATTTTTGATTAAAATATGTTATAATTGA-ATGTCTGCCTTGAGAAACA
* * * ** * * *
50329 AGAAGCAAAACCCATCTATTAGAGGGAAAAATCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTCAAAGCCTT
1 TGAAGCAAAAGCCATCCATGGGAGAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTT
* * * *
50394 ATTACTCACTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGACTTTAAGTAGGA-TTTTTCACATTTTT
66 ATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGATTTTTTTACATTTTT
* * * * * * *
50458 TGTTAAAATATGCTATAATTGAATGTCTACTTTAGGAAACGTGAAGCAAAACCCATCCATGGGAG
131 GGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTAC-CTAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCAT-TGAA
* * * * * * *
50523 AGAAAACTCCATTTATGGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTATCACTCACTTTAGATGATTTTAT
194 AGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTAT
* * * * *
50588 TTTCTCATAATTGAATTTAAGTTGGATTTTTTCACATTTTTGGTTAAAATATGATATAATTGAAT
259 ATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGATTTTTT-ATATTTTTGATTAAAATATGTTATAATTGAAT
* * * * * * *
50653 GTCTACCTCAAGAAACATGAAGGAAAATCCATCCATGGGAGAGAAAATTCTATTTGTAGTCACTC
323 GTCTACCTCAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCAT-GGAAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTC
* * * * * **
50718 AAGCCTTTGAAAGCCTTATTATTCGCTTTAAATGGTTTTATGTTTTTATAATTGGCTTTAAGTTG
387 AAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTG
* * * * * *
50783 GAATTTTTTA-ATATTTTTAGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTTTGTC-TCAGGAAACG
452 GATTTTTTTACAT-TTTTGA-TTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTGCCTTGA-GAAACA
* * * * *
50842 TAAAGCAAAAGCTATCCATGGGAGAGAAACGTCTATTTGTAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTT
1 TGAAGCAAAAGCCATCCATGGGAGAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTT
* * * *
50907 ATTACCCCCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGAAGTTTTTTACATTTTT
66 ATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGATTTTTTTACATTTTT
** ** * * * *
50972 GGTTAAAATATACTATAATTGAATGTCCGGCTCTA-GAATCGTGATGCAAAAGCTATCCATTGGA
131 GGTTAAAATATGTTATAATTGAATGT-CTAC-CTAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATT-GA
* * * * * *
51036 GAGAAAAGTCTATTTTTAGTTACTCAAGCCTTTAAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATAGTTTTA
193 AAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTA
* * * * ** *
51101 TATTCTCGTAATTGACTTTAAGTTGGATTTTTTTATAATTTTGGTTAAAATATAATATAA-TCAA
258 TATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGA-TTTTTTATATTTTTGATTAAAATATGTTATAATTGAA
* * * * * * * * ** *
51165 CTGAT-TGCCT-TGAGAAATATGAGGAAAAAGACATCCGTGGGAGAGAAAAGAGCATTTATGGTC
322 -TG-TCTACCTCAG-GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCAT-GGAAAGAAAAGTCCATTTATAGTC
* * * **
51228 TCTCAAG-CTTTCAAAAGCCTGATTACTCGTTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTA
383 ACTCAAGCCTTT-GAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTA
* * * * *
51292 AGTTAGATTTTTTTACATTTTTAATTAAAATAT-TCCATAATTGAATGTCTACCTT-AGGAAACG
447 AGTTGGATTTTTTTACATTTTTGATTAAAATATGT-TATAATTGAATGTCTGCCTTGA-GAAACA
* ** *
51355 TGAAGCAAAAGCCATCCATTGGAGAGAAAAGTTTATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGGCTT
1 TGAAGCAAAAGCCATCCATGGGAGAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTT
* ** * * *
51420 ATTACTCACTTTAAATCATTTTATATTCTCATAATTGAATTTAAGTTTGATTTTTTTACAATTTT
66 ATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGATTTTTTTACATTTTT
* * * ** * * * *
51485 GGCTAAAATATGCTATAGTTGAATGTCTGGCTCGAAAAACATGAAGCAAAAGTCATCCATTAAAT
131 GGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTACCTAG-GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGAA-
* * * * * *
51550 AGAAAAAGTCCATTTATAATCACTCAAGCCCTTGAAAGCCTTATTACTAGCTCTAAATAGTTTTA
194 AG-AAAAGTCTATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTA
* * * ** *
51615 TATGCACATAGTTGGCTTTAAGTTGGATTTATGTATATTTTT-AGTTAAAATATGTTATAATTGA
258 TATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGATTT-TTTATATTTTTGA-TTAAAATATGTTATAATTGA
* * * * * *
51679 ATGTTTGCCTTTA-GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATAAGATAA-AAAAGTCCATTTACAGTA
321 ATGTCTACC-TCAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCAT-GGA-AAGAAAAGTCCATTTATAGTC
* * ** * **
51742 ACTCAAGCCATTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATACTTTTATGTTCTCATAATTGGCTTTAA
383 ACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAA
* * * * *** * *
51807 GTTAGATTTTTTTTCACATTTTTGGTTAAAATAAGCTATAATTGAATGTCAAAC-TCAGGAAACG
448 GTTGGA-TTTTTTT-ACATTTTTGATTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTGCCTTGA-GAAACA
* * * * * **
51871 TTAAGCAAAAGCCATCCATGGGAGATAAAAATCCATTTATGGTCACTGAAGCCTTCAAAAGCCTT
1 TGAAGCAAAAGCCATCCATGGGAGAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTT
* * * **
51936 A-T--TCACTTTAAATAGTTTTATACTCTCATAATTG-TCTTTAAGTTATATTTTCTTTACATTT
66 ATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGAT-TTTAAGTTGGATTTT-TTTACATTT
** * * * * * * * * ** *
51997 TTCATTTAAATATGCTATAATTGAATGTTTTCTTCATGAAACGTGAAGCAAAAGTCATTTATGGG
129 TTGGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTACCT-AGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCAT-TG
* * * * * * *
52062 AGAGAAAAGTCCATTTACAGTCACTCAAGCCTATGAAAGCCTTATTATTCGCTTTCAATGATTTT
192 AAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTT
* * * * * **
52127 ATATTCTCATAATAGATTTTAAGATGGATGTTTTTACATTTCTGGTTAAAATATACTATAATTGA
257 ATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGAT-TTTTTATATTTTTGATTAAAATATGTTATAATTGA
* * * * ** * *
52192 ATGGT-TGCATTAGGAAATC-TGAAGCAAAAGCCTTCCATTCAAAAGAAAAGTACATTTATAGTT
321 AT-GTCTACCTCAGGAAA-CATGAAGCAAAAGCCATCCA-TGGAAAGAAAAGTCCATTTATAGTC
* * * *
52255 ACTCAAGCTTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAACTAATTTTAA
383 ACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAA
* * * * * * *
52320 GTTGGATTTTTTCTACATTTTTGGTTAAAATATGCTATTATTGAAAGTTTTCCTTGGGAAACA
448 GTTGGATTTTTT-TACATTTTTGATTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTGCCTTGAGAAACA
** *
52383 TGAAGCAAAAGCCATCCATTAGAGAGAAAAGTCCATTTAAAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTT
1 TGAAGCAAAAGCCATCCATGGGAGAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTT
* *
52448 ATTACTTC-CTTTAAATGGTTTTATATTCTCATACTTGATTTTAAGTTGGA-TTTTTTACGTTTT
66 ATTAC-TCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGATTTTTTTACATTTT
* * * * * *
52511 TGTTTAAAATATGCTACT-ATTGAATGTCTACCTCAAGAAACATGAAGTAAAAGACATCTATTAG
130 TGGTTAAAATATGTTA-TAATTGAATGTCTACCT-AGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATT-G
* * * * * **
52575 AGAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAACGTTTTTACTCAATTTAAATGGTTTT
192 AAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTT
* ** ** * * * *
52640 ATATTCTCATAATTGATTTTTAGGTTCAAAATTTTACATTTTTGATAAAAAAATGTTATAATTTA
257 ATATTCTCATAATTGA-TTTTAAGTTGGATTTTTTATATTTTTGATTAAAATATGTTATAATTGA
* * ** ** * *
52705 ATGACTGCCTCAGGAAACATGAAGTGAAAGCCATCCAACAGAGAGAAAAAG-ACATTTATAGTCA
321 ATGTCTACCTCAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCC-ATGGAAAG-AAAAGTCCATTTATAGTCA
* * * *
52769 CTCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCACTTTAACTGGCTTTCTATTCTCATAACTGATTTTAAG
384 CTCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAG
* * * * *
52834 TTTGATTTTTTTACATTTTT-ACTTAAAATAT-TCTATTATTCAATGTCTACCTT-AGGAAACG
449 TTGGATTTTTTTACATTTTTGA-TTAAAATATGT-TATAATTGAATGTCTGCCTTGA-GAAACA
* * * * * *
52895 TGAAGCAACAGCCATCCACT-AGATAGAAAAGTCCATTTAAAATCACTTAAGCCTTTGAAAGCCT
1 TGAAGCAAAAGCCATCCA-TGGGAGAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCT
**
52959 TATTACTTACTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGATTTTTTTACATTTT
65 TATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGATTTTTTTACATTTT
* * * * * * * *
53024 TGTTTAAAATATGCTATTATTGAATGTTTACCTCGAGAAATATGAAACAAAAGACATCCATTAGA
130 TGGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTACCTAG-GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATT-GA
* * * * * *
53089 GAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCGTTATTACTAGATTTAAATGATTTTA
193 AAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTA
* * * * * *
53154 TATTCTCATAATTGATTTTTAGGTTGGAATTTTTTACATTTTTGGTCAAAATGTGTTATGATTGA
258 TATTCTCATAATTGA-TTTTAAGTTGG-ATTTTTTATATTTTTGATTAAAATATGTTATAATTGA
* * * * **
53219 ATGACTAGCTTAGGAAACATGAAGCAAAGGCCATCCAAT-GAAGAGAAAAGGACATTTATAGTCA
321 ATGTCTACCTCAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCC-ATGGAA-AGAAAAGTCCATTTATAGTCA
* * * * *
53283 CTCAAGCCTTTAAAAGCCTTATTACTCTA-TTTAAATTGTTTTGTGTTCTTATAATTGATTTTAA
384 CTCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTC-ACTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAA
* * * * * **
53347 GTTAGATTTTTTTAGATTTTTGGTTAAAATATGCTATAATTGAATGTCTACCTCAAGAAACA
448 GTTGGATTTTTTTACATTTTTGATTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTGCCTTGAGAAACA
* * *
53409 TGAAGCAAAAGCCATCCATTGGG-GAGAAAAGTCCATTTATAATCACTCAAGCCCTTAAAAGCCT
1 TGAAGCAAAAGCCATCCA-TGGGAGAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCT
* * ** **
53473 TATTAGTCACTTTAAATAATTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTTTATTTTTTTACATTTT
65 TATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGATTTTTTTACATTTT
* * * * *
53538 TGATTAAAATATGCTATAATTGAAAGTCTACCT-CGAGAA-ATGAAAGGAAAAAGCCATCCATTA
130 TGGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTACCTAGGA-AACATG-AA-GCAAAAGCCATCCATT-
** * *
53601 GAGGGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACCCACTTTAAATGGTTT
191 GAAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTT
* * *
53666 TATATTCTCATAATTGACTTTAAGTTGGATTTTTTTCATATTTTTCATTAAAATATGCTATAATT
256 TATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGA-TTTTTT-ATATTTTTGATTAAAATATGTTATAATT
* * * * * * *
53731 G-ATGCCTACCTCTA-GAAACGTAAAGCAAAAGCCATCCATGGGAGAGAAAAATCTATTTATGGT
319 GAATGTCTACCTC-AGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCAT-GGAAAGAAAAGTCCATTTATAGT
* * * *
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382 CACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTA
* * *
53859 AGTTGGATTTTTTTACATTTTTTG-TTAAAATATGCTT-T-ATTGAAAGTTTTCCTTG-GAAA-A
447 AGTTGGATTTTTTTACA-TTTTTGATTAAAATATG-TTATAATTGAATGTCTGCCTTGAGAAACA
* * ** * *
53919 TGTGAAGGAAAAG-CATCAATTAGAGAGAAAAGTCTATTTAAAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCC
1 --TGAAGCAAAAGCCATCCATGGGAGAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCC
* ** *
53983 TTATTACTTC-CTCTAAATAATTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTAGATTTTTTTACATT
64 TTATTAC-TCGCTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGATTTTTTTACATT
* ** * * * * * ** *
54047 TTTGGTTAGAATATACTATTATTGAATATCTGCCTCAGGAAACGTAAAGCAAAAGATATCCGTTA
128 TTTGGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTACCT-AGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATT-
* * * * * *
54112 GAGAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAGGCGTTATTACTCGATTTAAATGATTT
191 GAAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTT
* * * ** * * *
54177 TATATTATCATAATTGATTTTTAGGTTGGAATGTTTTCCATTTTT-AGTCAAAATATATTATAAG
256 TATATTCTCATAATTGA-TTTTAAGTTGG-ATTTTTTATATTTTTGA-TTAAAATATGTTATAAT
* * ** * *
54241 TGAATGACTACCTCAGGAAACATCAAGCAAAAGCCATCCA-ACAAAGAAAAAAAG-ACATTGATA
318 TGAATGTCTACCTCAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATGGAAAG---AAAAGTCCATTTATA
* * *** ** * * *
54304 GTCACTCAAGCCTTTAAAAGCCTTATTACTCAATTTTTTTCCATTTT-TAGT-T-AAAATATG-C
380 GTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCACTTTAAAT-GGTTTTATATTCTCATAAT-TGAT
* *** * * *** * ** * *
54365 TATAA-TT-GA-AAGTCTAC-CTCAAGA--AACA-A-G--A-AA-CAAAAG-CTATCCATTAGAG
443 TTTAAGTTGGATTTTTTTACATTTTTGATTAAAATATGTTATAATTGAATGTCT-GCC-TT-GAG
*
54417 AGAAAA
505 A-AACA
** *** * ** ******
54423 GTCCATTTATAGTTA-CTCA-GGCCTTTCAAAG-CC--TTAT--T-ACTC-A--CTTT-AAATG-
1 -TGAAGCAAAAGCCATC-CATGGGAGAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAA-GC
* ** ** *
54475 GTT-TTA-T-ATTTTCATAAT--TTACTT-TA-AG-----------------TTGGATTTTTTCA
63 CTTATTACTCGCTTT-A-AATGGTT--TTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGATTTTTTTA
* * * * * *
54516 CATTTTTGTTTAAAATATGCTATAATTGAATGTGTACCTTAGGAAACGTGAAACAAAACCCATCC
124 CATTTTTGGTTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTACC-TAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCC
* * * * * * * * *
54581 ATGGGAGAGAAAAGTCCATTTATGGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCGTTATCAATCACTTTAGATG
188 AT-TGAAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATG
* * * * * *
54646 GTTTTATATTCTCATAATTGATTTTACGTTAGATTTTTTTACAGTTTTGGTTAAAATATGCTATA
252 GTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGA-TTTTTTATATTTTTGATTAAAATATGTTATA
* * * * ** * * **
54711 ATTTAAAGTTTACTTTGGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTAGAGAGAAAAGTATATTTGA-
316 ATTGAATGTCTACCTCAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCA-TGGAAAGAAAAGTCCATTT-AT
* * * * * * ** *
54775 AGTCACTTAAGTCTTAGAAAGCCTTATTATTCCCTTGAAATCATTTTATATTCGCATAATTGATT
379 AGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATT
* * * * ** *
54840 TTAAGTTGGCTTTTTTTACATTTTTGTTTAAAATATGTCATTATTGAATGTCTATCTCGAGAAAC
444 TTAAGTTGGATTTTTTTACATTTTTGATTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTGCCTTGAGAAAC
54905 A
509 A
* ** *
54906 TGAAGAAAAAGCCATCCATTAGAGAAAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTT
1 TGAAGCAAAAGCCATCCATGGGAGAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTT
* * * * * *
54971 ATTATTCCCTTGACATCGTTTTATATTCGT-ATAATTGATTTTAAGTTAGATTTTTTTACATTTT
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* * ** * * * * *
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* * * * **
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193 AAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTA
* * * * *
55165 CATTCTCATAATTGATTTTTAA-TATGAAATTTATTACATTTTTTG-TTAAAATATGCTATAATT
258 TATTCTCATAATTGA-TTTTAAGT-TG-GATTTTTTATA-TTTTTGATTAAAATATGTTATAATT
* * * * *
55228 AAATGTCTATCTCAAGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATGGGAGAGTAAAGTCCATTTATAGTC
319 GAATGTCTACCTCAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCAT-GGAAAGAAAAGTCCATTTATAGTC
* * *
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383 ACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTT
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TCTCATAATTGATTTTAAGTTGGATTTTTTATATTTTTGATTAAAATATGTTATAATTGAATGTC
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CTTTGAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGGATT
TTTTTACATTTTTGATTAAAATATGTTATAATTGAATGTCTGCCTTGAGAAACA
Found at i:54447 original size:130 final size:130
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* * * * *
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* * * * *
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* ** * * * * * * *
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Found at i:54640 original size:171 final size:171
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* * * * *
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* * *
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* * *
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* * *
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* * * * * * * *
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** * * * *
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* * ** *
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* * * *
54849 CTTTTTTTACATTTTTGTTTAAAATATG-TCATTATTGAATGTCTATC-TCGAGAAACATGAAGA
1 ATTTTTTTACATTTTTGTTTAAAATATGCT-ATAATTGAATGTCTACCTTAG-GAAACATGAA-A
* *
54912 -AAAAGCCATCCATTAGAGAAAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTAT
63 CAAAAGCCATCCATTAGAGAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTAC
* * * * *
54976 TCCCTTGACATCGTTTTATATTCGT-ATAATTGATTTTAAGTTAG
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* * * * * *
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1 ATTTTTTTACATTTTTGTTTAAAATATGCTATAATTGAATGTCTACCTTAG-GAAACATGAAA-C
* * *
55083 AAAAGCCATCCATTGGAGAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCTTTTGGAAGCCTTATTACT
64 AAAAGCCATCCATTAGAGAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACT
* * *
55148 CAATTTAAATGGTTTTACATTCTCATAATTGATTTTTAA-TATGA
129 CACTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGA-TTTTAAGT-TGG
* * * * * * *
55192 AATTTATTACATTTTT-TGTTAAAATATGCTATAATTAAATGTCTATCTCAAGAAACATGAAGCA
1 ATTTTTTTACATTTTTGT-TTAAAATATGCTATAATTGAATGTCTACCTTAGGAAACATGAAACA
** * * *
55256 AAAGCCATCCATGGGAGAGTAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTCGAAAGCCTTATTCCTC
65 AAAGCCATCCATTAGAGAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTC
*
55321 AATTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTT
130 ACTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTT
55356 TAATATGGTT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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AAGCCATCCATTAGAGAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCA
CTTTAAATGGTTTTATATTCTCATAATTGATTTTAAGTTGG
Found at i:55972 original size:171 final size:170
Alignment explanation
Indices: 55365--62021 Score: 6842
Period size: 171 Copynumber: 39.0 Consensus size: 170
55355 TTAATATGGT
* ** *
55365 TTGAGTGACTATAAACGGACTTTTCTCTCTAATGGATGGCTTTTGCTTCATATTTCCAAAGGCAA
1 TTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTCTCTAATGGATGGCTTTTGCTTCACGTTTCC-AAGGTAA
* * *
55430 ACATTCAATTATAGCATATTTTAACCAAAAA-CTAAAAAAATTCTAACTTAAAATCGATTATGAG
65 ACATTCAATTATAACATATTTTAACCAAAAATGTAAAAAAA-TCTAACTTAAAATCAATTATGAG
** *
55494 AATATAAAACCATTTAAAGTTAGTAATAAGGCTTTCAAAGGT
129 AATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCAAAGGC
* * * *
55536 TTGAGTGACTATAAATGG-CTTTTCT-TGTCAATGGATGGCTTTTGCCTCATGTTTCCTAGGATA
1 TTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTCTCT-AATGGATGGCTTTTGCTTCACGTTTCCAAGG-TA
* ** * *
55599 GACCA-TCAATTATAATGTATTTTAACCAAAAATGTAAAAAATTATAACTTAAAATCAATTATGA
64 -AACATTCAATTATAACATATTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATCTAACTTAAAATCAATTATGA
* * *
55663 GAATATAAAACCATTTAAAGCAAGTAATAAGCCTTTC-AAGAGA
128 GAATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCAAAG-GC
* * * * * * *
55706 TTAAGTAACTAT-AATGTACTTTTCTTTCTAATGGATGGCTTTTGCTTCAGGTTTCCTGAGGCAA
1 TTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTCTCTAATGGATGGCTTTTGCTTCACGTTTCC-AAGGTAA
* * *
55770 ACATTCAATTACAACATATTTTAACCAAAAATGCAAAAAAAAT-TAACTTAAAATTAATTATGAG
65 ACATTCAATTATAACATATTTTAACCAAAAATG-TAAAAAAATCTAACTTAAAATCAATTATGAG
* * * * *
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* * * * *
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1 TTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTCTCTAATGGATGGCTTTTGCTTCACGTTTC-CAAGGTAA
* * *
55941 ACATTCAATCATAACATATGTTAACCAAAAATATAAAAAAATCTAACTTAAAATCAATTATGAGA
65 ACATTCAATTATAACATATTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATCTAACTTAAAATCAATTATGAGA
* *
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* * ** * *
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1 TTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTCTCTAATGGATGGCTTTTGCTTCACGTTTCC-AAGGTA-
* * * *
56112 AA-AATCAATTATAGCATA-TTTAACTAAAAATGTAAAAAAATCTAACTTAAAATCAATTATGAA
64 AACATTCAATTATAACATATTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATCTAACTTAAAATCAATTATGAG
** * *
56175 AATATAAAAGTATTTAAAGTGAGTAATAAGGCTTTCAATGGC
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* * * * * *
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1 TTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTCTCTAATGGATGGCTTTTGCTTCACGTTT-CCAAGGTAA
* * * ** *
56282 AGATTCAATAACAGTATATTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATCTCACTTAAAATCAATTATGAGA
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* * * * *
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* * * ** *
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** * * *
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* * * *
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1 TTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTCTCTAATGGATGGCTTTTGCTTCACGTTTC-CAAGGTA-
* * * *
56623 AA-ATTCAATTAT-AGATATTTTTATCAAAAAT-TAAAAAAATCCAACTTAAAATCAATTATGAG
64 AACATTCAATTATAACATATTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATCTAACTTAAAATCAATTATGAG
* * * *
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* * *
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1 TTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTCTCTAATGGATGGCTTTTGCTTCACGTTT-CCAAGGTAA
* * *
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* * * * * * *
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* * *
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1 TTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTCTCT-AATGGATGGCTTTTGCTTCACGTTTCC-AAGGTA
* *
56963 GACATTCAATTATAACATATTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATCTAACTTAAAATTAATTATGAG
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* * *
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* * ** * * * **
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1 TTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTCTCT-AATGGATGGCTTTTGCTTCACGTTTCC-AAGGTA
* * * ** * * *
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64 -AACATTCAATTATAACATATTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATCTAACTTAAAATCAATTATGA
* *
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128 GAATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCAAAGGC
* * * * * * *
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1 TTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTCTCTAATGGATGGCTTTTGCTTCACG-TTTCCAAGGTAA
* * * * * * *
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**
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* * * * *
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1 TTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTCT-CTAATGGATGGCTTTTGCTTCACGTTTCC-AAGGTA
** * * * * *
57474 GGCATTCAATTATAACATATTTCAACTAAAAATGTAAAAATACCCAACTTAAAATCAATTATGAG
64 AACATTCAATTATAACATATTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATCTAACTTAAAATCAATTATGAG
* * * * *
57539 AATACAAAACTATTTAAAGTGAGTAATAAGGCTTTCAAAAGA
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* * * * *
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1 TTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTCTCTAATGGATGGCTTTTGCTTCACGTTT-CCAAGGTAA
* * * * *
57645 GGCATTCAATTATAACATATTTCAACCAAAAATATAAAAAAATGTAACTTAAAATTAATTATGAG
65 -ACATTCAATTATAACATATTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATCTAACTTAAAATCAATTATGAG
*
57710 AATATAAAACCATTTAAAGTGAGTAATAAGGCTTTCAAAGGC
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** * * * **
57752 TCAAGTGACTATAAATGAACTTTTCTCTCTAATGGATAGCTTTTGCCTT-ATGTTTCCTAAATTA
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* * * **
57816 GACATTCAATTATAACATATTTCAACCAAAAATGTATAGAAAAATCCAACTTAGTATCAATTATG
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* * * ***
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* *
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1 TTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTCT-CTAATGGATGGCTTTTGCTTCACGTTT-CCAAGGTA
** * * * *
57989 GGCATTCAATTATAATATATTTCAACCAAAAATGTAAAAAAATCCAACTTAAAATTAATTATGAG
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* * * *
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* * ** ** *
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* * * * *
58159 AGCATTCAATTATAACATATTTCAATCAAAAATGTAAGAAAATCTAACTTAAAATCAATTATAAG
64 AACATTCAATTATAACATATTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATCTAACTTAAAATCAATTATGAG
* ** *
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* * * * * * ** * *
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* * ** * * * * *
58331 ACGTTGAATTATAGTATATTTTAACTAGAAATGTAAACATATCAAACTTAAAATCAATTATGAGA
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* * * *
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* * * * * * * *
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* * * * *
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* *** * ** * *
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1 TTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTCTCTAATGGATGGCTTTTGCTTCACGTTT-CCAAGGTAA
* * * * *
58672 ATATTCAATTATAACATATTTCAACCAAAAATGTTAAAAAATCTCACTTAAAATTAATTATGAGA
65 ACATTCAATTATAACATATTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATCTAACTTAAAATCAATTATGAGA
*
58737 ATATAAAACCATTTAAAGCAAGTAATAAGGCTTTCAAAGGC
130 ATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCAAAGGC
* * * ** * * *
58778 TTGAGTGACTATATATGGACTTTTCTCTCAAATGCATAACTTATGCTTAACATTTCCTAAGGTAA
1 TTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTCTCTAATGGATGGCTTTTGCTTCACGTTTCC-AAGGTAA
* * * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * *
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*
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* *
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* ** *
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* *
59184 ACATTCAATTAT-AGATATTTTAACCAAAAATCTAAAAAAATAC-AACTTAAAATCAATTATGAG
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*
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* * * * *
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1 TTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTCTCTAATGGATGGCTTTTGCTTCACGTTT-CCAAGGTAA
* *
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* * * * *
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* * * * * *
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1 TTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTCTCT-AATGGATGGCTTTTGCTTCACGTTTCC-AAGGTA
* * * *
59525 GACATTCAATTATAACATATTTTAACTAAAAATATAAAAAAAGT-TAAACTTAAAATTAATTATG
64 AACATTCAATTATAACATATTTTAACCAAAAATGTAAAAAAA-TCT-AACTTAAAATCAATTATG
* * * *
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127 AGAATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCT-TTCAAAGGC
* * * * *
59633 TTAAGTGACTGTAAATGG-CTTTTCATGC-C-AATGGGTGGCTTTTGCTTTAAGTTTCCTAAGAC
1 TTGAGTGACTATAAATGGACTTTTC-T-CTCTAATGGATGGCTTTTGCTTCACGTTTCC-AAG--
* * * * * *
59695 G-CACCA-TCAATTATAACATATTGTAACCAAAAATGT-AAAAATTTTCATCTTAAAATCAATTA
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* * **
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* * *
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1 TTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTCTCTAATGGATGGCTTTTGCTTCAC-GTTTCCAAGGTAA
* * *
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65 ACATTCAATTATAACATATTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATCTAACTTAAAATCAATTATGAGA
* *
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* * ** * *
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1 TTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTCT-CTAATGGATGGCTTTTGCTTCACGTTTCC-AAGGTA
* * *** **
60036 AAAAATCAATTATAACATATTTTAAATGAAAA--TAAAAAAGCCCTAACTTAAAATCAATTATGA
64 AACATTCAATTATAACATATTTTAACCAAAAATGTAAAAAA-ATCTAACTTAAAATCAATTATGA
* * * *
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* * * * * * *
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1 TTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTCTCTA-ATGGATGGCTTTTGCTTCACGTTTC-CAAGGTA
* * *
60205 GACATTCAATTATAATATATTTTAACCAAAAATGTAAAAAAAATCCAAC-TAGAAA-CTAATTAT
64 AACATTCAATTATAACATATTTTAACCAAAAATGT-AAAAAAATCTAACTTA-AAATC-AATTAT
* ** * *
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* * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * *
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* * * * ** *
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1 TTGAGTGACTATAAATGGACTTTTC-TCTCTAATGGATGGCTTTTGCTTCACGTTTC-CAAGGTA
* * **
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64 AACATTCAATTATAACATATTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATCTAACTTAAAATCAATTATGAG
* * *
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* * ** * * *
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* * * * *
60718 ATC-TTCAATTATAACATATTTCAATCAAAAATGTAAAAAAATCCAACTTAAAATCAATTCTGAG
64 AACATTCAATTATAACATATTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATCTAACTTAAAATCAATTATGAG
* ** *
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* * * * * * *
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* * * * * * *
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* * *
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* * * * **
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* * *
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* * * * * *
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* * * * * * *
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*
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* * * *
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65 ACATTCAATTATAACATATTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATCTAACTTAAAATCAATTATGAGA
* * *
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* * * * * *
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1 TTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTCTCT-AATGGATGGCTTTTGCTTCACGTTT-CCAAGGTA
*************** *
61572 AACATTCAATTATAACATATTTTAACCAAAAATGTAANNNNNNNNNNNNNNNAATCAATTATGAT
64 AACATTCAATTATAACATATTTTAACCAAAAATGTAAAAAAATCTAACTTAAAATCAATTATGAG
* * * *
61637 AATATAAAACCATTTAAAGCAAGTAATAAGCCTTTTAAAGGA
129 AATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCAAAGGC
** * * ** * * *
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1 TTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTCTCTAATGGATGGCTTTTGCTTCACGTTTC-CAAGGTA-
* * * * *
61743 AACAATCAATTATAGCATATTTTAACCAAAAATGTAAAAAACTCTAAATTAAAATTAATTATGAG
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* * * * * *
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* ** * * * * * *
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* * * * * * *
61914 AGATTCAATCACAGCATATTTTAACTAAAAATGTAAAAAAAATCCAACTTAAAATCATTTATGAG
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* *
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62021 T
1 T
Statistics
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Indices: 55365--62021 Score: 6890
Period size: 341 Copynumber: 19.5 Consensus size: 341
55355 TTAATATGGT
* * * *
55365 TTGAGTGACTATAAACGGACTTTTCTCTCTAATGGATGGCTTTTGCTTCATATTTCCAAAGGCAA
1 TTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTCTCTAATGGATGGCTTTTGCTTCATGTTTCCTAAGGCAG
* * * *
55430 ACATTCAATTATAGCATATTTTAACCAAAAACT-AAAAAAATTCTAACTTAAAATCGATTATGAG
66 ACATTCAATTATAACATATTTTAACCAAAAA-TGAAAAAAAATCCAACTTAAAATCAATTATGAG
** *
55494 AATATAAAACCATTTAAAGTTAGTAATAAGGCTTTCAAAGGTTTGAGTGACTATAAATGG-CTTT
130 AATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCAAAGGCTTGAGTGACTATAAATGGACTTT
* * * * * **
55558 TCT-TGTCAATGGATGGCTTTTGCCTCATGTTT-CCTAGGATAGACCA-TCAATTATAATGTATT
195 TCTCTCT-AATGGATGGCTTTTGCTTCACGTTTCCCAAGG-TA-AACATTCAATTATAACATA-T
* * *
55620 TTAACCAAAAATGTAAAAAATTATAACTTAAAATCAATTATGAGAATATAAAACCATTTAAAGCA
256 TTAACCAAAAATGTAAAAAAATCTAACTTAAAATCAATTATGAGAATATAAAACCATTTAAAGCG
* *
55685 AGTAATAAGCCTTTC-AAGAGA
321 AGTAATAAGGCTTTCAAAG-GC
* * * * * * *
55706 TTAAGTAACTAT-AATGTACTTTTCTTTCTAATGGATGGCTTTTGCTTCAGGTTTCCTGAGGCAA
1 TTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTCTCTAATGGATGGCTTTTGCTTCATGTTTCCTAAGGCAG
* * *
55770 ACATTCAATTACAACATATTTTAACCAAAAATGCAAAAAAAAT-TAACTTAAAATTAATTATGAG
66 ACATTCAATTATAACATATTTTAACCAAAAATG-AAAAAAAATCCAACTTAAAATCAATTATGAG
* * * * * * *
55834 AATATAAAATCATTCAAAGAGTGTAATAAGGCGTTT-AAAAGCTTGAGTGACTACAAATAGACTT
130 AATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGC-TTTCAAAGGCTTGAGTGACTATAAATGGACTT
* * * * *
55898 TTTTCTCTAACGGATGGCTTTTGCTTTACGTTTCTCAAGGTAAACATTCAATCATAACATATGTT
194 TTCTCTCTAATGGATGGCTTTTGCTTCACGTTTCCCAAGGTAAACATTCAATTATAACATAT-TT
*
55963 AACCAAAAATATAAAAAAATCTAACTTAAAATCAATTATGAGAATATAAAACCATTTAAAGCGAG
258 AACCAAAAATGTAAAAAAATCTAACTTAAAATCAATTATGAGAATATAAAACCATTTAAAGCGAG
* *
56028 TAATAAGTCTTTCAAAGGA
323 TAATAAGGCTTTCAAAGGC
* * ** * * *
56047 TTGAATGACTATAAATAGACTTTTCTCTAAAATGGATGGATTTTGCTTCATGTTTCCAAAGGTAG
1 TTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTCTCTAATGGATGGCTTTTGCTTCATGTTTCCTAAGGCAG
* * * * * * *
56112 AAAATCAATTATAGCATA-TTTAACTAAAAATGTAAAAAAATCTAACTTAAAATCAATTATGAAA
66 ACATTCAATTATAACATATTTTAACCAAAAATGAAAAAAAATCCAACTTAAAATCAATTATGAGA
** * * *
56176 ATATAAAAGTATTTAAAGTGAGTAATAAGGCTTTCAATGGCTTGAGTCACTATAAATGGACTTTT
131 ATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCAAAGGCTTGAGTGACTATAAATGGACTTTT
* * * * * * * * **
56241 CTCTCAAATGGATGCCTTTGGCTTCATGTTTCCCAAGGAAAAGATTCAATAACAGTATATTTTAA
196 CTCTCTAATGGATGGCTTTTGCTTCACGTTTCCCAAGGTAAACATTCAATTATAACATA-TTTAA
* * *
56306 CCAAAAATGTAAAAAAATCTCACTTAAAATCAATTATGAGAATATAAAACCATTTACAGTGAGTA
260 CCAAAAATGTAAAAAAATCTAACTTAAAATCAATTATGAGAATATAAAACCATTTAAAGCGAGTA
* * *
56371 CA-AAGGCTTTTAAAAGA
325 -ATAAGGCTTTCAAAGGC
* * * *
56388 TTGAGTGACTATAAATGG-CTTTTCT-TGCCAATGGATAGCTTTTACTTCATATTTTCC-AAGGC
1 TTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTCT-CTAATGGATGGCTTTTGCTTCAT-GTTTCCTAAGGC
* * * *
56450 AGGCATTCAATTATAGCATATTTCAACCAAAAATGAAAGAAAATCCAACTTAAAATCAATTATGA
64 AGACATTCAATTATAACATATTTTAACCAAAAATGAAAAAAAATCCAACTTAAAATCAATTATGA
56515 GAATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCAAAGGCTTGAGTGACTATAAATGGACTT
129 GAATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCAAAGGCTTGAGTGACTATAAATGGACTT
* * ** * *
56580 TTCTCTCTAATTGATGGCTTTTGCTTCATGTTTCTGAAGGCAGAA-ATTCAATTAT-AGATATTT
194 TTCTCTCTAATGGATGGCTTTTGCTTCACGTTTCCCAAGGTA-AACATTCAATTATAACATA-TT
* * * *
56643 TTATCAAAAAT-TAAAAAAATCCAACTTAAAATCAATTATGAGAATATAAAACTATTTAAAGCGA
257 TAACCAAAAATGTAAAAAAATCTAACTTAAAATCAATTATGAGAATATAAAACCATTTAAAGCGA
* * *
56707 GTAAAAAGACTTTCAAAAGC
322 GTAATAAGGCTTTCAAAGGC
* * * * * *
56727 TTGAGTGACTATTAATGGACTTTTCTCTCTAATGGATGGTTTTTTCTTCACGTTTCCCAAGGAAG
1 TTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTCTCTAATGGATGGCTTTTGCTTCATGTTTCCTAAGGCAG
* * * * *
56792 ACATTCAATTATAGCATATTTTAACTAAAAATGTAAAAACAATCTAACTTAAAACCAATTATGAG
66 ACATTCAATTATAACATATTTTAACCAAAAATG-AAAAAAAATCCAACTTAAAATCAATTATGAG
* * * * * * *
56857 GATACAAAACCATCTAAAGCGTGTAATAAAGCTTTTAAAGTCTTGAGTGACTATAAATGGACTTT
130 AATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCAAAGGCTTGAGTGACTATAAATGGACTTT
* * * * *
56922 TCTCT-TAAATGGATGGCTTTTCCTTCATGTTTCCTAATGTAGACATTCAATTATAACATATTTT
195 TCTCTCT-AATGGATGGCTTTTGCTTCACGTTTCCCAAGGTAAACATTCAATTATAACATA-TTT
* *
56986 AACCAAAAATGTAAAAAAATCTAACTTAAAATTAATTATGAGAATATAAAATCATTTAAAGCGAG
258 AACCAAAAATGTAAAAAAATCTAACTTAAAATCAATTATGAGAATATAAAACCATTTAAAGCGAG
* *
57051 TGATAAGGCTTTCAAAGGT
323 TAATAAGGCTTTCAAAGGC
* * ** * * * *
57070 TTGAGTGACTATAAATGG-CTTTCCT-TATCCGTGAATGGCTTTTCCTTCAGGTTTCCTAAGACA
1 TTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTCTCT-AATGGATGGCTTTTGCTTCATGTTTCCTAAGGCA
* * * * ** * *
57133 CACCA-TCAATTATAACATATTGTAACTAAAAATGTAAAAAGTTCCATCTTAAAATCAATTATTA
65 GA-CATTCAATTATAACATATTTTAACCAAAAATGAAAAAAAATCCAACTTAAAATCAATTATGA
* * * *
57197 GAATATAAAACCATTTAAAGCCAGTAATAATGCTTTCAAAGGCTTGAGTGACTATAAATAGATTT
129 GAATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCAAAGGCTTGAGTGACTATAAATGGACTT
* * * * * * *
57262 TTTTCTCTAATAGATGGCTTTTGCTTCACGTTTTCCAATGCAGACATTCAATTATAGCATACTTT
194 TTCTCTCTAATGGATGGCTTTTGCTTCACGTTTCCCAAGGTAAACATTCAATTATAACATA-TTT
* * * * * **
57327 AACCAAAAATCTAAAGAATTCCAACTTAAAATCAAATATGAGAATATAAAACCATTTAAAGAAAG
258 AACCAAAAATGTAAAAAAATCTAACTTAAAATCAATTATGAGAATATAAAACCATTTAAAGCGAG
57392 TAATAAGGCTTTCAAAGGC
323 TAATAAGGCTTTCAAAGGC
* * * * *
57411 TTAAGTAACTATAAATGG-CTTTTCT-TGCCAATGGATGGTTTTTGCTTCATGTTTCCTAAGGTA
1 TTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTCT-CTAATGGATGGCTTTTGCTTCATGTTTCCTAAGGCA
* * * * * *
57474 GGCATTCAATTATAACATATTTCAACTAAAAATGTAAAAATACCCAACTTAAAATCAATTATGAG
65 GACATTCAATTATAACATATTTTAACCAAAAATGAAAAAAAATCCAACTTAAAATCAATTATGAG
* * * * * * * *
57539 AATACAAAACTATTTAAAGTGAGTAATAAGGCTTTCAAAAGATTTAGTGATTATAAACGGACTTT
130 AATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCAAAGGCTTGAGTGACTATAAATGGACTTT
* * *
57604 TCTCTCAAATGGATGGCTTTGGCTTCACGTTTCCCAAGG-AAGGCATTCAATTATAACATATTTC
195 TCTCTCTAATGGATGGCTTTTGCTTCACGTTTCCCAAGGTAA-ACATTCAATTATAACATATTT-
* * * *
57668 AACCAAAAATATAAAAAAATGTAACTTAAAATTAATTATGAGAATATAAAACCATTTAAAGTGAG
258 AACCAAAAATGTAAAAAAATCTAACTTAAAATCAATTATGAGAATATAAAACCATTTAAAGCGAG
57733 TAATAAGGCTTTCAAAGGC
323 TAATAAGGCTTTCAAAGGC
** * * ***
57752 TCAAGTGACTATAAATGAACTTTTCTCTCTAATGGATAGCTTTTGCCTT-ATGTTTCCTAAATTA
1 TTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTCTCTAATGGATGGCTTTTG-CTTCATGTTTCCTAAGGCA
* * **
57816 GACATTCAATTATAACATATTTCAACCAAAAATGTATAGAAAAATCCAACTTAGTATCAATTATG
65 GACATTCAATTATAACATATTTTAACCAAAAATG-A-AAAAAAATCCAACTTAAAATCAATTATG
* * * *** *
57881 AGTATATCAAATCATTTAAAGTTTGTAATAAGGCTTTCAAAGGCTTGAGTGACTATAAACGGACT
128 AGAATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCAAAGGCTTGAGTGACTATAAATGGACT
* ** *
57946 TTTCT-TGCTAATGGATGGCTTTTGCTTCACGTTTCCCAGGGTAGGCATTCAATTATAATATATT
193 TTTCTCT-CTAATGGATGGCTTTTGCTTCACGTTTCCCAAGGTAAACATTCAATTATAACATATT
* * * *
58010 TCAACCAAAAATGTAAAAAAATCCAACTTAAAATTAATTATGAGATTATAAAACCATTTAAAGTG
257 T-AACCAAAAATGTAAAAAAATCTAACTTAAAATCAATTATGAGAATATAAAACCATTTAAAGCG
* *
58075 AGTAATAAGGCTTTCGAAGGT
321 AGTAATAAGGCTTTCAAAGGC
* * * * *
58096 TTGAGTGACTATAAATGG-CTTTTCT-TGCCAATGGATGGCTTTTGATTCATATTTACTGAGGCA
1 TTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTCT-CTAATGGATGGCTTTTGCTTCATGTTTCCTAAGGCA
* * * * * *
58159 -AGCATTCAATTATAACATATTTCAATCAAAAATGTAAGAAAATCTAACTTAAAATCAATTATAA
65 GA-CATTCAATTATAACATATTTTAACCAAAAATGAAAAAAAATCCAACTTAAAATCAATTATGA
* ** * * * * *
58223 GAATATAAAACTATTTAAAATGAGTAATAAGGCTTTCAAAAGCTTGACTAACTGTAAATAGACTT
129 GAATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCAAAGGCTTGAGTGACTATAAATGGACTT
* * ** ** * * * **
58288 TTCTCTCAAATGCATGGCTTTTGCTTCACACTTCATAAGGTAGACGTTGAATTATAGTATATTTT
194 TTCTCTCTAATGGATGGCTTTTGCTTCACGTTTCCCAAGGTAAACATTCAATTATAACATA-TTT
* * * * * * *
58353 AACTAGAAATGTAAACATATCAAACTTAAAATCAATTATGAGAATATAAAACCCTTTAATGCGAG
258 AACCAAAAATGTAAAAAAATCTAACTTAAAATCAATTATGAGAATATAAAACCATTTAAAGCGAG
* *
58418 TAACAAGGCTTAC-AAGGAC
323 TAATAAGGCTTTCAAAGG-C
* * * * * ** *
58437 TTAAGTTACTATAAATGGACTTTTCTTTCTAATAGATGGC-TTTGGTTCATGTTTCCCGAGGTAG
1 TTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTCTCTAATGGATGGCTTTTGCTTCATGTTTCCTAAGGCAG
* * * * *
58501 ACATTAAATTATAGCATATTTTTACCCAAAATGTAAAAAAATCCAACTTAAAATCAATTATGAGA
66 ACATTCAATTATAACATATTTTAACCAAAAATGAAAAAAAATCCAACTTAAAATCAATTATGAGA
* ***
58566 ATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCAAAGGCTTAAGTGACTATAAACAAACTTTT
131 ATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCAAAGGCTTGAGTGACTATAAATGGACTTTT
* ** * * *
58631 CTCTCCAATAAATGGCTTTTGCTTCACGTTTCCCAATGTAGATATTCAATTATAACATATTTCAA
196 CTCTCTAATGGATGGCTTTTGCTTCACGTTTCCCAAGGTAAACATTCAATTATAACATATTT-AA
* * * *
58696 CCAAAAATGTTAAAAAATCTCACTTAAAATTAATTATGAGAATATAAAACCATTTAAAGCAAGTA
260 CCAAAAATGTAAAAAAATCTAACTTAAAATCAATTATGAGAATATAAAACCATTTAAAGCGAGTA
58761 ATAAGGCTTTCAAAGGC
325 ATAAGGCTTTCAAAGGC
* * * ** * * ** * *
58778 TTGAGTGACTATATATGGACTTTTCTCTCAAATGCATAACTTATGCTTAACATTTCCTAAGGTAA
1 TTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTCTCTAATGGATGGCTTTTGCTTCATGTTTCCTAAGGCAG
* * * * * * * * *
58843 ATATTTACTTATACCATGTCTTAACCAAAAATGTAAAAACATCCAACTTAAAATGAATTATGAGA
66 ACATTCAATTATAACATATTTTAACCAAAAATGAAAAAAAATCCAACTTAAAATCAATTATGAGA
* * * * * *
58908 ATCTAAAACCCTTTAAAGAGAGTAACAAGGC-TTCCAAGGACCTGAGTGACTATAAATGGACTTT
131 ATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCAAAGG-CTTGAGTGACTATAAATGGACTTT
* * * * *
58972 TCTCTCTAATGAATGGCTTTTGGTTCACATTT-TC--GTGTCAAACATTCAATTATAGCATATTT
195 TCTCTCTAATGGATGGCTTTTGCTTCACGTTTCCCAAG-GT-AAACATTCAATTATAACATA-TT
*
59034 TAACCAAAAATGTAAAAAAATCTAACTTAAAATCAATTATGAGAATATAAAACTATTTAAAGCGA
257 TAACCAAAAATGTAAAAAAATCTAACTTAAAATCAATTATGAGAATATAAAACCATTTAAAGCGA
*
59099 GTAATAAGGCTTTCAAATGC
322 GTAATAAGGCTTTCAAAGGC
** *
59119 TTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTCTCTAATGGATGGCTTTTGCTTCACATTT-TTGAAGGCA
1 TTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTCTCTAATGGATGGCTTTTGCTTCATGTTTCCT-AAGGCA
* * ** *
59183 AACATTCAATTAT-AGATATTTTAACCAAAAATCTAAAAAAATACAACTTAAAATCAATTATGAG
65 GACATTCAATTATAACATATTTTAACCAAAAATGAAAAAAAATCCAACTTAAAATCAATTATGAG
*
59247 AATATAAAGCCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCAAAGGCTTGAGTGACTATAAATGGACTTT
130 AATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCAAAGGCTTGAGTGACTATAAATGGACTTT
* * * * * *
59312 TCTCTCTAATGGATGGCTTTTACTTCATGTTTCCCAATGCAGACATTCAATTATAGCATATTTTA
195 TCTCTCTAATGGATGGCTTTTGCTTCACGTTTCCCAAGGTAAACATTCAATTATAACATA-TTTA
* * * *
59377 ACCAAAAATGTAAAAACAATCTAACTTAAAATCAGTTATGAGAATATAAAATCATCTAAAGCGTG
259 ACCAAAAATGTAAAAA-AATCTAACTTAAAATCAATTATGAGAATATAAAACCATTTAAAGCGAG
* *
59442 TAATAAAGCTTTTAAAGGC
323 TAATAAGGCTTTCAAAGGC
* * * * * *
59461 TTGTGTGACTATAAATAGACATTTCTCT-TAAATGGATGGCTTTTCCTTTACGTTTCCTAAGGCA
1 TTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTCTCT-AATGGATGGCTTTTGCTTCATGTTTCCTAAGGCA
* ** *
59525 GACATTCAATTATAACATATTTTAACTAAAAAT-ATAAAAAAAGTTAAACTTAAAATTAATTATG
65 GACATTCAATTATAACATATTTTAACCAAAAATGA-AAAAAAA-TCCAACTTAAAATCAATTATG
* * * * * *
59589 AGAATATAAAATCATTTAAAGCAAGTGATAAGG-TGTTCGAAGGCTTAAGTGACTGTAAATGG-C
128 AGAATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCT-TTCAAAGGCTTGAGTGACTATAAATGGAC
* * * * * *
59652 TTTTCATGC-C-AATGGGTGGCTTTTGCTTTAAGTTTCCTAAGACG-CACCA-TCAATTATAACA
192 TTTTC-T-CTCTAATGGATGGCTTTTGCTTCACGTTTCCCAAG--GTAAACATTCAATTATAACA
* * * * *
59713 TATTGTAACCAAAAATGT-AAAAATTTTCATCTTAAAATCAATTATTAGAATATAAAACTATTTA
253 TATT-TAACCAAAAATGTAAAAAAATCT-AACTTAAAATCAATTATGAGAATATAAAACCATTTA
**
59777 AAGCGAGTAATAAGGCTTTTGAAGGC
316 AAGCGAGTAATAAGGCTTTCAAAGGC
* * * *
59803 TTGAGTGACTATAAATAGACTTTTCTCTCTAATGGATGGCTTTTGCTTCACAGTTTCCT-ATGTA
1 TTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTCTCTAATGGATGGCTTTTGCTTCA-TGTTTCCTAAGGCA
* * * * *
59867 AACATTCAATTATAACATATTTCAACCAAAAATGCAAGAAAATCTAACTTAAAATCAATTATGAG
65 GACATTCAATTATAACATATTTTAACCAAAAATGAAAAAAAATCCAACTTAAAATCAATTATGAG
* * * *
59932 AATATAAAAGCATTTAAATCGAGTAATAAGGCTTTCAAAGGCTTGAGTGACT-TGAATAG-CTTT
130 AATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCAAAGGCTTGAGTGACTATAAATGGACTTT
** * * * * *
59995 TCT-TGCCCATGGATGGCTTTTGCTTCATGTTTCCTAAGGCAAAAAATCAATTATAACATATTTT
195 TCTCT-CTAATGGATGGCTTTTGCTTCACGTTTCCCAAGGTAAACATTCAATTATAACATA-TTT
*** ** * * *
60059 AAATGAAAA--TAAAAAAGCCCTAACTTAAAATCAATTATGAGAATATAAAAGCATTTCAAGTGA
258 AACCAAAAATGTAAAAAA-ATCTAACTTAAAATCAATTATGAGAATATAAAACCATTTAAAGCGA
*
60122 GTAATAAGGCCTTCAAAGGC
322 GTAATAAGGCTTTCAAAGGC
* * * * * * *
60142 TTAAGTGACTATAAACGGAC-TTTCTCT-GATATGGATGGCTTTTCCTTTACT-TTTCTTAAGGT
1 TTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTCTCTA-ATGGATGGCTTTTGCTTCA-TGTTTCCTAAGGC
*
60204 AGACATTCAATTATAATATATTTTAACCAAAAATGTAAAAAAAATCCAAC-TAGAAA-CTAATTA
64 AGACATTCAATTATAACATATTTTAACCAAAAATG-AAAAAAAATCCAACTTA-AAATC-AATTA
* ** * * *
60267 TGAGAATATAAAACTATTTAAAATGAGTGATAAGACTTTCAAAGGCTTGAGTGACTGTAAATGG-
126 TGAGAATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCAAAGGCTTGAGTGACTATAAATGGA
* * ** * * * * *
60331 CTTTTCT-TGCCAATGGATGGCTTTTGCTTCAAGTTTCTTGAGACG-CACCATGC-ATTATAGCA
191 CTTTTCTCT-CTAATGGATGGCTTTTGCTTCACGTTTC-CCA-AGGTAAACATTCAATTATAACA
* * * * * *
60393 TATTGTAACCAAAAATGTAAAAAATTCCATCTTAAAATCAATTATTAGAGTATAAAACTATTTAA
253 TATT-TAACCAAAAATGTAAAAAAATCTAACTTAAAATCAATTATGAGAATATAAAACCATTTAA
* *
60458 AGCGAGTAATAAGGCTTTCAAGGGA
317 AGCGAGTAATAAGGCTTTCAAAGGC
* * * * * *
60483 TTGAGTGACTATAAATAG-CTTTTCAT-GCTAATGGATGGCTTTTGGTTCAGGTTTCTTGAGGCA
1 TTGAGTGACTATAAATGGACTTTTC-TCTCTAATGGATGGCTTTTGCTTCATGTTTCCTAAGGCA
* * ***
60546 -ATCATTCAATTATAACATATTTTAACCAAAAAAGTAAAAAAATCTTGCTTAAAATCAATTATGA
65 GA-CATTCAATTATAACATATTTTAACCAAAAATGAAAAAAAATCCAACTTAAAATCAATTATGA
* * * * *
60610 GAATATAAAACAATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTTAAAAGCTTAATTGACTATAAATGGACTT
129 GAATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCAAAGGCTTGAGTGACTATAAATGGACTT
** * * * * *
60675 TTCTCTCTAACAGATGGCTTTTGCTTTACATTTCCTAAGGTGGATC-TTCAATTATAACATATTT
194 TTCTCTCTAATGGATGGCTTTTGCTTCACGTTTCCCAAGGT-AAACATTCAATTATAACATATTT
* * * *
60739 CAATCAAAAATGTAAAAAAATCCAACTTAAAATCAATTCTGAGAACATAAAACCATTTAAAGCGA
258 -AACCAAAAATGTAAAAAAATCTAACTTAAAATCAATTATGAGAATATAAAACCATTTAAAGCGA
** *
60804 GTAGCAAGGCTTTCCAAGGC
322 GTAATAAGGCTTTCAAAGGC
* * * * * *
60824 TTGAGTGGCTGTAAACGGACTTTTCTCTCTAACGGATGGCTTTTACTTCACGTTTCCTAAGGCAG
1 TTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTCTCTAATGGATGGCTTTTGCTTCATGTTTCCTAAGGCAG
* * * * * * *
60889 GCATTCAAATATAATATATTTCAGCCAAAAATGTAAACAAATCCAACTTAAAATCAATTATGAGA
66 ACATTCAATTATAACATATTTTAACCAAAAATGAAAAAAAATCCAACTTAAAATCAATTATGAGA
* * * * * * *
60954 ATGTAAAACTATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTCCAAAGGCTTGAGTGATTATAAACGAACGTTT
131 ATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCAAAGGCTTGAGTGACTATAAATGGACTTTT
* * * * *
61019 CTCT-TAGATGGATGGCCTTTGCTTAACATTTCCCAAGGCAGACATTCAATTATAACATATTTCA
196 CTCTCTA-ATGGATGGCTTTTGCTTCACGTTTCCCAAGGTAAACATTCAATTATAACATATTT-A
* * ** *
61083 ACCAAAAATGTAAAAAAATCTAAGTTAAAATTAATTATTTGAATATAAAACCATTTAAAACGAGT
259 ACCAAAAATGTAAAAAAATCTAACTTAAAATCAATTATGAGAATATAAAACCATTTAAAGCGAGT
* *
61148 AATAACGCTTTCAAAGAC
324 AATAAGGCTTTCAAAGGC
* * * * *
61166 TTAAGTGACTATAAACGAACTTTTCTCTCTAATGGATAGCTTTTGCTTCACAT-TTTCC-AAGGT
1 TTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTCTCTAATGGATGGCTTTTGCTT--CATGTTTCCTAAGGC
* * * * * *
61229 AGACAATCAATCATAACATATTTCAACAAAAAATGTAAAAAAATCCAACTTAAAATTAATTATGA
64 AGACATTCAATTATAACATATTTTAACCAAAAATGAAAAAAAATCCAACTTAAAATCAATTATGA
* * ** *
61294 GTATATCAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCAAAGGCTTGAGTGACTATAAACAGAGTT
129 GAATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCAAAGGCTTGAGTGACTATAAATGGACTT
* * * *
61359 TTCTCTCCAATGGATGGCTTTCGCTTCATGTTTCCCAAGGTAGACATTCAATTATAACATATTTC
194 TTCTCTCTAATGGATGGCTTTTGCTTCACGTTTCCCAAGGTAAACATTCAATTATAACATATTT-
* * * * * *
61424 AACCCAAAATGTAAACAAATCCAACTTAAAATCAATTATGAGAATATAAAATCATTTAAAGTGAT
258 AACCAAAAATGTAAAAAAATCTAACTTAAAATCAATTATGAGAATATAAAACCATTTAAAGCGAG
61489 TAATAAGGCATTT-AAAGGC
323 TAATAAGGC-TTTCAAAGGC
* * * * *
61508 TTAAGTGAATATAAATGGACTCTTCTCT-TCAATAGATGGCTTTTGCTTCATGTTTCCCAAGGCA
1 TTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTCTCT-AATGGATGGCTTTTGCTTCATGTTTCCTAAGGCA
* * *************** *
61572 AACATTCAATTATAACATATTTTAACCAAAAATGTAANNNNNNNNNNNNNNNAATCAATTATGAT
65 GACATTCAATTATAACATATTTTAACCAAAAATGAAAAAAAATCCAACTTAAAATCAATTATGAG
* * * * ** *
61637 AATATAAAACCATTTAAAGCAAGTAATAAGCCTTTTAAAGGATTGAGTGACTATAAATATATTTT
130 AATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCAAAGGCTTGAGTGACTATAAATGGACTTT
* ** * * * * * *
61702 TTTCTAAAATAGATGGATTTTGCTTCACGTTTCTCAA-GAACAACAATCAATTATAGCATATTTT
195 TCTCTCTAATGGATGGCTTTTGCTTCACGTTTCCCAAGGTA-AACATTCAATTATAACATA-TTT
* * * * *
61766 AACCAAAAATGTAAAAAACTCTAAATTAAAATTAATTATGAGGATAATAAAA-CATTTAAAGTGA
258 AACCAAAAATGTAAAAAAATCTAACTTAAAATCAATTATGAGAAT-ATAAAACCATTTAAAGCGA
* * * *
61830 CTAA-AATGTTTTCAATGGC
322 GTAATAAGGCTTTCAAAGGC
* ** * * *
61849 TTGAGTGACTATAAATAGACTTTTCTCTGAAATAGATGCCTTTGGCTTCATGTTTCCTAAGGCAG
1 TTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTCTCTAATGGATGGCTTTTGCTTCATGTTTCCTAAGGCAG
* * * * * *
61914 AGATTCAATCACAGCATATTTTAACTAAAAATGTAAAAAAAATCCAACTTAAAATCATTTATGAG
66 ACATTCAATTATAACATATTTTAACCAAAAATG-AAAAAAAATCCAACTTAAAATCAATTATGAG
* *
61979 AATATAAAACCATTTAAAGTGAGTAATAAGACTTTCAAAGGCT
130 AATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCAAAGGCT
Statistics
Matches: 5268, Mismatches: 919, Indels: 257
0.82 0.14 0.04
Matches are distributed among these distances:
337 6 0.00
338 66 0.01
339 239 0.05
340 616 0.12
341 2270 0.43
342 1504 0.29
343 260 0.05
344 304 0.06
345 3 0.00
ACGTcount: A:0.39, C:0.14, G:0.13, T:0.33
Consensus pattern (341 bp):
TTGAGTGACTATAAATGGACTTTTCTCTCTAATGGATGGCTTTTGCTTCATGTTTCCTAAGGCAG
ACATTCAATTATAACATATTTTAACCAAAAATGAAAAAAAATCCAACTTAAAATCAATTATGAGA
ATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAATAAGGCTTTCAAAGGCTTGAGTGACTATAAATGGACTTTT
CTCTCTAATGGATGGCTTTTGCTTCACGTTTCCCAAGGTAAACATTCAATTATAACATATTTAAC
CAAAAATGTAAAAAAATCTAACTTAAAATCAATTATGAGAATATAAAACCATTTAAAGCGAGTAA
TAAGGCTTTCAAAGGC
Done.