Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: VEPZ01001664.1 Hibiscus syriacus cultivar Beakdansim tig00003332_pilon, whole genome shotgun sequence
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265 GATGAGTAGG
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* **
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* * *
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384 TGAGAAAGAT
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* * *
317 TCCTTCGGGCCATCG--G--TAAG
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Statistics
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599 AGTAAGCAAT
* *
609 TCCTTCGGGCCAT-CAGTAAGTCTTTGGAGCATGATGATTAAA
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* * * * *
651 TCCTCCGAGTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGA-TAAG
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* *
692 TCCTTCGGGCCATCCATAAGACCTTCGAG
1 TCCTTCGGGCCATCCATAAGTCTTTCGAG
721 AAGGATGTTT
Statistics
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307 GATGCTTAAA
* *
317 TCCTTCGGGCCATCGGTAAGTCTTTCGAGCATGATGCTTAAATCTTTC-GAGTCATCTATAAGTC
1 TCCTTCGGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATGCTTAAATCCTTCAG-GTCATCTATAAGTC
* * * * * * *
381 TTTTGAGAAAGATCATAAGTCCTTCAGACCTTCCGTAAAACCTTCGGGCAGGATGTTTACAAATG
65 TTTCGAGCAAGATAATAAGTCCTTCAGACCATCCATAAAACCTTCGGGCAAGATGTTTTCAAATG
* * * * * *
446 TGTTTTTAGAATCTAAACTTGATTTTTAGGGTTTTTTGATGATTATCTACAAAGAATTTTTAAAG
130 AGTTTTTAGAAACTAAACCTGATTTTCAGGGTTTCTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAG
* * * *
511 GAAACTATGCGTAATTTTTAAGGG-TTCCTTGATGACAACTGAAAACGAAAGATTTTCAGAAACT
195 GAAGCTAAGCCTAATTTTT-AGGGTTTCCTTGATGACAACTGAAAACGAAAGATTTTAAGAAACT
** * * * *
575 AAGCTTGAAATTCAAG-GCTTTCTT-AGTAAGCAATTCCTTCGGGCCATCAGTAAGTCTTTGGAG
259 AAGCTTGATTTTCAAGAG-TTTCTTGA-TGAGTAAGTCCTTCGGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAG
* * * * *
638 CATGATGATTAAATCC-TCCGAGTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTCCTTCGGGC
322 CATGATGCTTAAATCCTTCAG-GTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGGTAAGTCCTTAGGAC
* *
702 CATCCATAAGACCTTC-GAGAAGGATGTTTTCAAATGAGTTTTTTTAGAAACTAAGCCTGATTTT
386 CATCCATAAGACCTTCAG-GCAGGATGTTTTCAAATGAG--TTTTTAGAAACAAAGCCTGATTTT
* *
766 CAAGGTTTTCTTGATGATTATCTCTAAAGAATTTTTAAA-AGAATCTAAGCCTAATTTTTA-GGG
448 CAAGGGTTTCTTGATGATTATCTCTAAAGAATTTTTAAAGA-AAGCTAAGCCTAATTTTTAGGGG
* *
829 TTCCTTGATGAGAACTGAAAATGAAAGATTTTAAGAAACCAAGCTTGATTTTCAAG-GATTTCTT
512 TTCCTTGATGACAACTGAAAATGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTTGATTTTCAAGAG-TTTCTT
*
893 CATGAGTAAG
576 GATGAGTAAG
* * * * * * *
903 TCCATCGAGCCATCAGTAAGTCTTTCAAGCATGGTGCTTAAATCCATCAAGTCATTTATAAGTCT
1 TCCTTCGGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATGCTTAAATCCTTCAGGTCATCTATAAGTCT
* * * * * *
968 TTCGAGCAAGATAAAAATTCATTCGGGA-CATCCATAACACCTTCGGGTAAGATGTTTTCAAATG
66 TTCGAGCAAGATAATAAGTCCTTC-AGACCATCCATAAAACCTTCGGGCAAGATGTTTTCAAATG
* * *
1032 ACTTTTTAGAAACTAAACCT-ATTTTTCAAGGGTTTCTAGATGATTGTCTCCAAAGAATTTTTAA
130 AGTTTTTAGAAACTAAACCTGA-TTTTC-AGGGTTTCTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAA
* * *
1096 AGGAATCTAAGCCTAATTTTTAGGGTTTCCTTGATGACAACTGAAAATGAGAGATTTTAAGAAAC
193 AGGAAGCTAAGCCTAATTTTTAGGGTTTCCTTGATGACAACTGAAAACGAAAGATTTTAAGAAAC
* * * * *
1161 TAAGCTTGATTTTCAAGTGTTTCTTGCA-GACTAAGTCCTTTGGGCCATCAATAAGTTTTTCGAG
258 TAAGCTTGATTTTCAAGAGTTTCTTG-ATGAGTAAGTCCTTCGGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAG
* * * * * *
1225 CATGATGCTTAAATTCTT-TGGTTCAACTACAAGTCTTTCGAGCAAGATGGTAAGTCCTTGGGGC
322 CATGATGCTTAAATCCTTCAGG-TCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGGTAAGTCCTTAGGAC
* * ** * * * * *
1289 CATTCGTAAGATGTTCAGGCGGGATGTTTTCAAATTAGTTTTTAGAAACCAAA-CATGGTTTTTA
386 CATCCATAAGACCTTCAGGCAGGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAA-CAAAGCCTGATTTTCA
* *
1353 AGGGTTTCTTGATGATTATCTCTAAAGAACTTTTAAAGGAAGCTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTC
450 AGGGTTTCTTGATGATTATCTCTAAAGAATTTTTAAAGAAAGCTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTC
* *
1418 CTTGATGACAACTGAAAACGAAAGATTTTAGGAAACTAAGCTTGATTTTCAAGAGTTTCTTGATG
515 CTTGATGACAACTGAAAATGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTTGATTTTCAAGAGTTTCTTGATG
1483 AGTAAG
580 AGTAAG
* * * * * *
1489 ACCTTCGGGCTATCAGTAATTCTTTCGAGCATGATGCTTAAGTCCTTC-GGTTCCTCTATAATTC
1 TCCTTCGGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATGCTTAAATCCTTCAGG-TCATCTATAAGTC
* ** * * **
1553 TTTTGAGCAAGATGGTAATTCCTTCAGACCATCCATAAGACCTTTAGGCAAGATGTTTTCAAATG
65 TTTCGAGCAAGATAATAAGTCCTTCAGACCATCCATAAAACCTTCGGGCAAGATGTTTTCAAATG
* * * * *
1618 AGTTTTTATAAGCTAAGCCTGGTTTTCAGAGGTTTTTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAA
130 AGTTTTTAGAAACTAAACCTGATTTTCAG-GGTTTCTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAA
* * * * * * *
1683 GGAAGCTAACCCTAGTTTTAAGGG-TTCATTGATGACAACTAAAAACCAAAGATTATAAGAAACT
194 GGAAGCTAAGCCTAATTTTTAGGGTTTCCTTGATGACAACTGAAAACGAAAGATTTTAAGAAACT
* **
1747 AA-CTTCATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCATGCCATCAGTAAGTCTTTCGA-CG
259 AAGCTTGATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCGGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGC-
* *
1810 ATGATGCTTAAATCCTTCAGGTCATCTATAAGTCTTTCAAGCAAGATGGTAAGCCCTTAGGACCA
323 ATGATGCTTAAATCCTTCAGGTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGGTAAGTCCTTAGGACCA
** * * * * *
1875 TCCATAAGACCTTCAGTTAGGATATTTTCAAATGAGTATTTAGAAACAAAGCCTAATTTCCAGGG
388 TCCATAAGACCTTCAGGCAGGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACAAAGCCTGATTTTCAAGG
* *
1940 GTTTCTTGATTATTATCTGC-AAAGAATTTTTAAAGAAAGCTAAGCCAAATTTTTAGGGGTTCCT
453 GTTTCTTGATGATTATCT-CTAAAGAATTTTTAAAGAAAGCTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCT
* * * * * * * *
2004 TGATGATAACTGAAAACGAAGGACTTTAAGAAACTATGCTAGACTTTCAAGGGTTTCTTGATGAG
517 TGATGACAACTGAAAATGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTTGATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAG
2069 TAAG
582 TAAG
* * ** * * * *
2073 TTCATCGGGAAATCAATAAGTCTTTCGAGCATGATGATTAAATCCTTCAGGTCTTCTATTAGTCT
1 TCCTTCGGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATGCTTAAATCCTTCAGGTCATCTATAAGTCT
** * * * *
2138 TTCGAGCAAGATGGTAAGTCCTTCAGACCATCCGTAAAACCTTCGGGCAGGATATTTTCAAATGT
66 TTCGAGCAAGATAATAAGTCCTTCAGACCATCCATAAAACCTTCGGGCAAGATGTTTTCAAATGA
* * * * * * * * * *
2203 GTTTTTAGATATTAAACTTAATTTTTAGGGTTTCTTGATGATTATTTCCCAAGTATTTTGAAATG
131 GTTTTTAGAAACTAAACCTGATTTTCAGGGTTTCTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGG
* *
2268 AAGCAAAGCCTAATTTTTAGGG-TTCCTTGAGGACAACT-AAAAC-AAA-A-TTTAAGAAACTAA
196 AAGCTAAGCCTAATTTTTAGGGTTTCCTTGATGACAACTGAAAACGAAAGATTTTAAGAAACTAA
* * *
2328 GC-TGATTTTCAAGGGTTTCTTGAAGAGTAAGTCCTTCGGGTCATCAGTAAGTCTTTCGTAAGTC
261 GCTTGATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCGGGCCATCAGTAAGTCTTTCG--AG-C
* * * * * * ** *
2392 TTTCGA-GTATTATACTTAGTTCTATCAGTTCATCTAT-A-TCTTTCTAGCAACATAATAAGTCA
323 -AT-GATG-CTTA-A---A-TCCT-TCAGGTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGGTAAGTCC
* * * ** * ** * * * **
2454 TTCGGGCCATTCATAACTCCTTCGGGCAATATATTTTCAAATGAATTTTTAGAAACTAAGTATGA
379 TTAGGACCATCCATAAGACCTTCAGGCAGGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACAAAGCCTGA
* * * * *
2519 TTTTTAAGGGTTTCTTGATAATTATCTCTAAAGAATTTTTATATG-AAGTTAAGCCCAATTTTTA
444 TTTTCAAGGGTTTCTTGATGATTATCTCTAAAGAATTTTTA-AAGAAAGCTAAGCCTAATTTTTA
* * *
2583 GGGGTTCCTTGATGGCAACTAAAAATGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTTGATTTTCAAGGGTTT
508 GGGGTTCCTTGATGACAACTGAAAATGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTTGATTTTCAAGAGTTT
*
2648 CTTGATCAGTAAG
573 CTTGATGAGTAAG
* *
2661 TCATTCGGGCCATCAGTAAGTCTTAT-AAGCATGATGCTTAAATCCTTCAGGTCATCTATAAGTC
1 TCCTTCGGGCCATCAGTAAGTCTT-TCGAGCATGATGCTTAAATCCTTCAGGTCATCTATAAGTC
** * * * * *
2725 TTTCGAGCAAGATTGTAAGCCCTT-AGGACCATCCATAAGACCTTCATGG-AGGATGTATTCAAA
65 TTTCGAGCAAGATAATAAGTCCTTCA-GACCATCCATAAAACCTTC-GGGCAAGATGTTTTCAAA
* * **
2788 TGAGTGTTTAGAAACTAAACATGATTTCTTGGGGTTTCTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTA
128 TGAGTTTTTAGAAACTAAACCTGATTT-TCAGGGTTTCTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTA
* * * * *
2853 AAGAAAGCTAAGTCTAATTTTTTGGGGTTT-CTTAATGTCAACTGAAAACGAAAGATTTTAAGAA
192 AAGGAAGCTAAGCCTAA-TTTTTAGGGTTTCCTTGATGACAACTGAAAACGAAAGATTTTAAGAA
* * * *
2917 ACTATGCTAGATTTTCAA-AGGTTTCTT-CTGAGTAAGTCCTTCGGACCATCAGTAAGTCTTTC-
256 ACTAAGCTTGATTTTCAAGA-GTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCGGGCCATCAGTAAGTCTTTCG
* **
2979 ATGCATGATGCTTAAATCTTTCAGGTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGGTAAGTGTTTCA-
320 A-GCATGATGCTTAAATCCTTCAGGTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGGTAAGTCCTT-AG
* * * * * * *
3043 GACCATCCGTAAAACCTTC-GTGCATGATGTTTTCAAATGTGTTTATAGAAACTAAA-CTTCATT
383 GACCATCCATAAGACCTTCAG-GCAGGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAAC-AAAGCCTGATT
* * * * * * *
3106 TTC-AGGGTTTCCTGATGATTACCTCCAAATAATTTTTAAAGTAAGATATGCCTAATTTTTAGGG
446 TTCAAGGGTTTCTTGATGATTATCTCTAAAGAATTTTTAAAGAAAGCTAAGCCTAATTTTTAGGG
* * *
3170 GTTCCTTGATGAGAACTGAAAATGAAATATATTAAGAAACTAAGCTTGATTTTCAAGAGTTTCTT
511 GTTCCTTGATGACAACTGAAAATGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTTGATTTTCAAGAGTTTCTT
*
3235 GGT-ATGTAAG
576 GATGA-GTAAG
* * * * *
3245 TCCTTCGGGCCATCAGAAAGTCCTTCAAGCATGATGCTTAAATCCATCAGG--A--TGTAAGTCT
1 TCCTTCGGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATGCTTAAATCCTTCAGGTCATCTATAAGTCT
* * ** * * ** * * *
3306 TTCGAGCAAGTTAATAAGTCATTTTGGCCATCCACAACTCCTTCGGGTAAGATGTTTGCGAATGA
66 TTCGAGCAAGATAATAAGTCCTTCAGACCATCCATAAAACCTTCGGGCAAGATGTTTTCAAATGA
* * * * *
3371 ATTTTTAGAAAC-AAAGCCTGATTTTTAGGGGTTTCATGATCATTATCTCCAAAGACTTTTTAAA
131 GTTTTTAGAAACTAAA-CCTGATTTTCA-GGGTTTCTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAA
* * * * *
3435 GGAAGCTAAGCCAAATATTTAGGGTTTCCTTGATGAAAAATGAAAATGAAAGATTTTAAGAAACT
194 GGAAGCTAAGCCTAATTTTTAGGGTTTCCTTGATGACAACTGAAAACGAAAGATTTTAAGAAACT
* * * *
3500 AAGCTTGATTTTCAAGTGTTTCTTGATCAGTAAGTCCATT-GGGCCATCATTAAGTCTTTCAAGC
259 AAGCTTGATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCC-TTCGGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGC
* * *
3564 ATGATGCTTAAATCCTTC-GGTTCAACTATAAGTCTTTCGAGCAAGATTGTAAGTCCTTGGGACC
323 ATGATGCTTAAATCCTTCAGG-TCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGGTAAGTCCTTAGGACC
* * * * * * * *
3628 ATCCATAAGACCTTCGGGTAGGATGTTTTCAAATTACTTTTTAGAAACTAAGTCAGATTTTCAAA
387 ATCCATAAGACCTTCAGGCAGGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACAAAGCCTGATTTTCAAG
*
3693 GGTTTCTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAATGAAA-CTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCC
452 GGTTTCTTGATGATTATCTCTAAAGAATTTTTAAA-GAAAGCTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCC
* * * * *
3757 TTGATGACAACTAAAAATGAAAGATTATAAGAAACCAAACTTCATTTTCAAGAGTTTCTTGATGA
516 TTGATGACAACTGAAAATGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTTGATTTTCAAGAGTTTCTTGATGA
3822 GTAAG
581 GTAAG
* * *
3827 TCCTTCGGGGCATCAGTAAGTCTTTCGAGCACGATGCTTAAATCCTTCAAGTCATCTAT
1 TCCTTCGGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATGCTTAAATCCTTCAGGTCATCTAT
3886 GATGTTTTCA
Statistics
Matches: 2475, Mismatches: 426, Indels: 164
0.81 0.14 0.05
Matches are distributed among these distances:
579 79 0.03
580 174 0.07
581 132 0.05
582 168 0.07
583 92 0.04
584 561 0.23
585 185 0.07
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587 222 0.09
588 316 0.13
589 60 0.02
590 32 0.01
591 9 0.00
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ACGTcount: A:0.31, C:0.16, G:0.18, T:0.35
Consensus pattern (585 bp):
TCCTTCGGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATGCTTAAATCCTTCAGGTCATCTATAAGTCT
TTCGAGCAAGATAATAAGTCCTTCAGACCATCCATAAAACCTTCGGGCAAGATGTTTTCAAATGA
GTTTTTAGAAACTAAACCTGATTTTCAGGGTTTCTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGG
AAGCTAAGCCTAATTTTTAGGGTTTCCTTGATGACAACTGAAAACGAAAGATTTTAAGAAACTAA
GCTTGATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCGGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATG
ATGCTTAAATCCTTCAGGTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGGTAAGTCCTTAGGACCATCC
ATAAGACCTTCAGGCAGGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACAAAGCCTGATTTTCAAGGGTT
TCTTGATGATTATCTCTAAAGAATTTTTAAAGAAAGCTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGAT
GACAACTGAAAATGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTTGATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAG
Found at i:3246 original size:292 final size:292
Alignment explanation
Indices: 317--3885 Score: 3796
Period size: 293 Copynumber: 12.2 Consensus size: 292
307 GATGCTTAAA
* *
317 TCCTTCGGGCCATCGGTAAGTCTTTCGAGCATGATGCTTAAATCTTTC-GAGTCATCTATAAGTC
1 TCCTTCGGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATGCTTAAATCCTTCAG-GTCATCTATAAGTC
* * ** * * * *
381 TTTTGAGAAAGATCATAAGTCCTTCAGACCTTCCGTAAAACCTTCGGGCAGGATGTTTACAAATG
65 TTTCGAGCAAGATGGTAAGTCCTTCAGACCATCCATAAGACCTTCGGGCAGGATGTTTTCAAATG
* * * * * *
446 TGTTTTTAGAATCTAAACTTGATTTTTAGGGTTTTTTGATGATTATCTACAAAGAATTTTTAAAG
130 AGTTTTTAGAAACTAAACCTGATTTTCAGGGTTTCTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAG
* * * * * *
511 GAAACTATGCGTAATTTTTAAGGGTTCCTTGATGACAACTGAAAACGAAAGATTTTCAGAAACTA
195 GAAGCTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTGAAAATGAAAGATTTTAAGAAACTA
** * * *
576 AGCTTGAAATTCAAG-GCTTTCTT-AGTAAGCAAT
260 AGCTTGATTTTCAAGAG-TTTCTTGA-TGAGTAAG
* * *
609 TCCTTCGGGCCATCAGTAAGTCTTTGGAGCATGATGATTAAATCC-TCCGAGTCATCTATAAGTC
1 TCCTTCGGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATGCTTAAATCCTTCAG-GTCATCTATAAGTC
* * * * *
673 TTTCGAGCAAGATGATAAGTCCTTCGGGCCATCCATAAGACCTTCGAGAAGGATGTTTTCAAATG
65 TTTCGAGCAAGATGGTAAGTCCTTCAGACCATCCATAAGACCTTCGGGCAGGATGTTTTCAAATG
* * *
738 AGTTTTTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAAGGTTTTCTTGATGATTATCTCTAAAGAATTTTTA
130 AG--TTTTTAGAAACTAAACCTGATTTTC-AGGGTTTCTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTA
* * *
803 AAAGAATCTAAGCCTAATTTTTA-GGGTTCCTTGATGAGAACTGAAAATGAAAGATTTTAAGAAA
192 AAGGAAGCTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTGAAAATGAAAGATTTTAAGAAA
* *
867 CCAAGCTTGATTTTCAAG-GATTTCTTCATGAGTAAG
257 CTAAGCTTGATTTTCAAGAG-TTTCTTGATGAGTAAG
* * * * * * *
903 TCCATCGAGCCATCAGTAAGTCTTTCAAGCATGGTGCTTAAATCCATCAAGTCATTTATAAGTCT
1 TCCTTCGGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATGCTTAAATCCTTCAGGTCATCTATAAGTCT
*** * * * * * *
968 TTCGAGCAAGATAAAAATTCATTCGGGA-CATCCATAACACCTTCGGGTAAGATGTTTTCAAATG
66 TTCGAGCAAGATGGTAAGTCCTTC-AGACCATCCATAAGACCTTCGGGCAGGATGTTTTCAAATG
* * *
1032 ACTTTTTAGAAACTAAACCT-ATTTTTCAAGGGTTTCTAGATGATTGTCTCCAAAGAATTTTTAA
130 AGTTTTTAGAAACTAAACCTGA-TTTTC-AGGGTTTCTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAA
* * *
1096 AGGAATCTAAGCCTAATTTTTAGGGTTTCCTTGATGACAACTGAAAATGAGAGATTTTAAGAAAC
193 AGGAAGCTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTGAAAATGAAAGATTTTAAGAAAC
* *
1161 TAAGCTTGATTTTCAAGTGTTTCTTGCA-GACTAAG
258 TAAGCTTGATTTTCAAGAGTTTCTTG-ATGAGTAAG
* * * * * * *
1196 TCCTTTGGGCCATCAATAAGTTTTTCGAGCATGATGCTTAAATTCTT-TGGTTCAACTACAAGTC
1 TCCTTCGGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATGCTTAAATCCTTCAGG-TCATCTATAAGTC
** * * * ** * * *
1260 TTTCGAGCAAGATGGTAAGTCCTTGGGGCCATTCGTAAGATGTTCAGGCGGGATGTTTTCAAATT
65 TTTCGAGCAAGATGGTAAGTCCTTCAGACCATCCATAAGACCTTCGGGCAGGATGTTTTCAAATG
* * * * * *
1325 AGTTTTTAGAAACCAAACATGGTTTTTAAGGGTTTCTTGATGATTATCTCTAAAGAACTTTTAAA
130 AGTTTTTAGAAACTAAACCT-GATTTTCAGGGTTTCTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAA
* *
1390 GGAAGCTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTGAAAACGAAAGATTTTAGGAAACT
194 GGAAGCTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTGAAAATGAAAGATTTTAAGAAACT
1455 AAGCTTGATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAG
259 AAGCTTGATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAG
* * * * * *
1489 ACCTTCGGGCTATCAGTAATTCTTTCGAGCATGATGCTTAAGTCCTTC-GGTTCCTCTATAATTC
1 TCCTTCGGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATGCTTAAATCCTTCAGG-TCATCTATAAGTC
* * ** *
1553 TTTTGAGCAAGATGGTAATTCCTTCAGACCATCCATAAGACCTTTAGGCAAGATGTTTTCAAATG
65 TTTCGAGCAAGATGGTAAGTCCTTCAGACCATCCATAAGACCTTCGGGCAGGATGTTTTCAAATG
* * * * *
1618 AGTTTTTATAAGCTAAGCCTGGTTTTCAGAGGTTTTTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAA
130 AGTTTTTAGAAACTAAACCTGATTTTCAG-GGTTTCTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAA
* * * * * ** *
1683 GGAAGCTAACCCT-AGTTTTAAGGGTTCATTGATGACAACTAAAAACCAAAGATTATAAGAAACT
194 GGAAGCTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTGAAAATGAAAGATTTTAAGAAACT
*
1747 AA-CTTCATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAG
259 AAGCTTGATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAG
**
1780 TCCTTCATGCCATCAGTAAGTCTTTCGA-CGATGATGCTTAAATCCTTCAGGTCATCTATAAGTC
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* * * ** *
1844 TTTCAAGCAAGATGGTAAGCCCTT-AGGACCATCCATAAGACCTTCAGTTAGGATATTTTCAAAT
65 TTTCGAGCAAGATGGTAAGTCCTTCA-GACCATCCATAAGACCTTCGGGCAGGATGTTTTCAAAT
* * * * *
1908 GAGTATTTAGAAAC-AAAGCCTAATTTCCAGGGGTTTCTTGATTATTATCTGCAAAGAATTTTTA
129 GAGTTTTTAGAAACTAAA-CCTGATTTTCA-GGGTTTCTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTA
* * * * * *
1972 AAGAAAGCTAAGCCAAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGATAACTGAAAACGAAGGACTTTAAGAAA
192 AAGGAAGCTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTGAAAATGAAAGATTTTAAGAAA
* * * *
2037 CTATGCTAGACTTTCAAGGGTTTCTTGATGAGTAAG
257 CTAAGCTTGATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAG
* * ** * * * *
2073 TTCATCGGGAAATCAATAAGTCTTTCGAGCATGATGATTAAATCCTTCAGGTCTTCTATTAGTCT
1 TCCTTCGGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATGCTTAAATCCTTCAGGTCATCTATAAGTCT
* * * *
2138 TTCGAGCAAGATGGTAAGTCCTTCAGACCATCCGTAAAACCTTCGGGCAGGATATTTTCAAATGT
66 TTCGAGCAAGATGGTAAGTCCTTCAGACCATCCATAAGACCTTCGGGCAGGATGTTTTCAAATGA
* * * * * * * * * *
2203 GTTTTTAGATATTAAACTTAATTTTTAGGGTTTCTTGATGATTATTTCCCAAGTATTTTGAAATG
131 GTTTTTAGAAACTAAACCTGATTTTCAGGGTTTCTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGG
* * *
2268 AAGCAAAGCCTAATTTTTA-GGGTTCCTTGAGGACAACT-AAAA-CAAA-A-TTTAAGAAACTAA
196 AAGCTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTGAAAATGAAAGATTTTAAGAAACTAA
* *
2328 GC-TGATTTTCAAGGGTTTCTTGAAGAGTAAG
261 GCTTGATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAG
* * * * *
2359 TCCTTCGGGTCATCAGTAAGTCTTTCGTAAGTCTTTCGA-GTATTATACTTAGTTCTATCAGTTC
1 TCCTTCGGGCCATCAGTAAGTCTTTCG--AG-C-AT-GATG-CTTA-A---A-TCCT-TCAGGTC
* * ** * * * * ** **
2423 ATCTAT-A-TCTTTCTAGCAACATAATAAGTCATTCGGGCCATTCATAACTCCTTCGGGCAATAT
54 ATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGGTAAGTCCTTCAGACCATCCATAAGACCTTCGGGCAGGAT
* * *** * * *
2486 ATTTTCAAATGAATTTTTAGAAACTAAGTATGATTTTTAAGGGTTTCTTGATAATTATCTCTAAA
119 GTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAACCTGA-TTTTCAGGGTTTCTTGATGATTATCTCCAAA
* * * * * *
2551 GAATTTTTATATGAAGTTAAGCCCAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGGCAACTAAAAATGAAAGAT
183 GAATTTTTAAAGGAAGCTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTGAAAATGAAAGAT
* *
2616 TTTAAGAAACTAAGCTTGATTTTCAAGGGTTTCTTGATCAGTAAG
248 TTTAAGAAACTAAGCTTGATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAG
* *
2661 TCATTCGGGCCATCAGTAAGTCTTAT-AAGCATGATGCTTAAATCCTTCAGGTCATCTATAAGTC
1 TCCTTCGGGCCATCAGTAAGTCTT-TCGAGCATGATGCTTAAATCCTTCAGGTCATCTATAAGTC
* * * *
2725 TTTCGAGCAAGATTGTAAGCCCTT-AGGACCATCCATAAGACCTTCATGG-AGGATGTATTCAAA
65 TTTCGAGCAAGATGGTAAGTCCTTCA-GACCATCCATAAGACCTTC-GGGCAGGATGTTTTCAAA
* * **
2788 TGAGTGTTTAGAAACTAAACATGATTTCTTGGGGTTTCTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTA
128 TGAGTTTTTAGAAACTAAACCTGATTT-TCAGGGTTTCTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTA
* * * * * * *
2853 AAGAAAGCTAAGTCTAATTTTTTGGGGTTTCTTAATGTCAACTGAAAACGAAAGATTTTAAGAAA
192 AAGGAAGCTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTGAAAATGAAAGATTTTAAGAAA
* * *
2918 CTATGCTAGATTTTCAA-AGGTTTCTT-CTGAGTAAG
257 CTAAGCTTGATTTTCAAGA-GTTTCTTGATGAGTAAG
* *
2953 TCCTTCGGACCATCAGTAAGTCTTTC-ATGCATGATGCTTAAATCTTTCAGGTCATCTATAAGTC
1 TCCTTCGGGCCATCAGTAAGTCTTTCGA-GCATGATGCTTAAATCCTTCAGGTCATCTATAAGTC
** * * * *
3017 TTTCGAGCAAGATGGTAAGTGTTTCAGACCATCCGTAAAACCTTCGTGCATGATGTTTTCAAATG
65 TTTCGAGCAAGATGGTAAGTCCTTCAGACCATCCATAAGACCTTCGGGCAGGATGTTTTCAAATG
* * * * * * *
3082 TGTTTATAGAAACTAAACTTCATTTTCAGGGTTTCCTGATGATTACCTCCAAATAATTTTTAAAG
130 AGTTTTTAGAAACTAAACCTGATTTTCAGGGTTTCTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAG
* * * * * *
3147 TAAGATATGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGAGAACTGAAAATGAAATATATTAAGAAACTA
195 GAAGCTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTGAAAATGAAAGATTTTAAGAAACTA
*
3212 AGCTTGATTTTCAAGAGTTTCTTGGT-ATGTAAG
260 AGCTTGATTTTCAAGAGTTTCTTGATGA-GTAAG
* * * * *
3245 TCCTTCGGGCCATCAGAAAGTCCTTCAAGCATGATGCTTAAATCCATCAGG--A--TGTAAGTCT
1 TCCTTCGGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATGCTTAAATCCTTCAGGTCATCTATAAGTCT
* ** * ** * * ** * * * *
3306 TTCGAGCAAGTTAATAAGTCATTTTGGCCATCCACAACTCCTTCGGGTAAGATGTTTGCGAATGA
66 TTCGAGCAAGATGGTAAGTCCTTCAGACCATCCATAAGACCTTCGGGCAGGATGTTTTCAAATGA
* * * * *
3371 ATTTTTAGAAAC-AAAGCCTGATTTTTAGGGGTTTCATGATCATTATCTCCAAAGACTTTTTAAA
131 GTTTTTAGAAACTAAA-CCTGATTTTCA-GGGTTTCTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAA
* * * * *
3435 GGAAGCTAAGCCAAATATTTAGGGTTTCCTTGATGAAAAATGAAAATGAAAGATTTTAAGAAACT
194 GGAAGCTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTGAAAATGAAAGATTTTAAGAAACT
* *
3500 AAGCTTGATTTTCAAGTGTTTCTTGATCAGTAAG
259 AAGCTTGATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAG
* * *
3534 TCCATT-GGGCCATCATTAAGTCTTTCAAGCATGATGCTTAAATCCTTC-GGTTCAACTATAAGT
1 TCC-TTCGGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATGCTTAAATCCTTCAGG-TCATCTATAAGT
* ** *
3597 CTTTCGAGCAAGATTGTAAGTCCTTGGGACCATCCATAAGACCTTCGGGTAGGATGTTTTCAAAT
64 CTTTCGAGCAAGATGGTAAGTCCTTCAGACCATCCATAAGACCTTCGGGCAGGATGTTTTCAAAT
* * ** * *
3662 TACTTTTTAGAAACTAAGTCAGATTTTCAAAGGTTTCTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAA
129 GAGTTTTTAGAAACTAAACCTGATTTTC-AGGGTTTCTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAA
* * * *
3727 ATGAAACTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTAAAAATGAAAGATTATAAGAAAC
193 AGGAAGCTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTGAAAATGAAAGATTTTAAGAAAC
* * *
3792 CAAACTTCATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAG
258 TAAGCTTGATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAG
* * *
3827 TCCTTCGGGGCATCAGTAAGTCTTTCGAGCACGATGCTTAAATCCTTCAAGTCATCTAT
1 TCCTTCGGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATGCTTAAATCCTTCAGGTCATCTAT
3886 GATGTTTTCA
Statistics
Matches: 2729, Mismatches: 472, Indels: 151
0.81 0.14 0.05
Matches are distributed among these distances:
286 48 0.02
287 17 0.01
288 78 0.03
289 160 0.06
290 14 0.01
291 345 0.13
292 534 0.20
293 1032 0.38
294 209 0.08
295 124 0.05
296 57 0.02
297 33 0.01
298 6 0.00
299 4 0.00
300 3 0.00
301 15 0.01
302 49 0.02
303 1 0.00
ACGTcount: A:0.31, C:0.16, G:0.18, T:0.35
Consensus pattern (292 bp):
TCCTTCGGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATGCTTAAATCCTTCAGGTCATCTATAAGTCT
TTCGAGCAAGATGGTAAGTCCTTCAGACCATCCATAAGACCTTCGGGCAGGATGTTTTCAAATGA
GTTTTTAGAAACTAAACCTGATTTTCAGGGTTTCTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGG
AAGCTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTGAAAATGAAAGATTTTAAGAAACTAA
GCTTGATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAG
Found at i:4702 original size:819 final size:817
Alignment explanation
Indices: 3066--4704 Score: 2132
Period size: 819 Copynumber: 2.0 Consensus size: 817
3056 ACCTTCGTGC
3066 ATGATGTTTTCAAATGTGTTTATAGAAACTAAACTTCATTTTCAGGGTTTCCTGATGATTACCTC
1 ATGATGTTTTCAAATGTGTTTATAGAAACTAAACTTCATTTTCAGGGTTTCCTGATGATTACCTC
* * * * *
3131 CAAATAATTTTTAAAGTAAGATATGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGAGAACTGAAAATGAA
66 CAAAGAATTTTTAAAGAAAGATAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTGAAAATAAA
* * * *
3196 ATATATTAAGAAACTAAGCTTGATTTTCAAGAGTTTCTTGGTATGTAAGTCCTTCGGGCCATCAG
131 ATATATTAAGAAACTAAGCTAGATTTTCAAGAGTTTCCTGATATGTAAGTCCTTCAGGCCATCAG
*
3261 AAAGTCCTTCAAGCATGATGCTTAAATCCATCAGGATGTAAGTCTTTCGAGCAAGTTAATAAGTC
196 AAAGTCCTTCAAGCATGATGCTTAAATCCATCAGGATATAAGTCTTTCGAGCAAGTTAATAAGTC
* * * *
3326 ATTTTGGCCATCCACAACTCCTTCGGGTAAGATGTTTGCGAATGAATTTTTAGAAACAAAGCCTG
261 A-TTTGGCCATCCACAACACCTTCGGGGAAGATGTTTGCAAATGAATTTTTAGAAACAAAGCCTA
*
3391 ATTTTTAGGGGTTTCATGATCATTATCTCCAAAGACTTTTTAAAGGAAGCTAAGCCAAATATTTA
325 ATTTTTAGGGGTTTCATGATCATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAAGCTAAGCCAAATATTTA
*
3456 GGGTTTCCTTGATGAAAAATGAAAATGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTTGATTTTCAAGTGTTT
390 GGGGTTCCTTGATGAAAAATGAAAATGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTTGATTTTCAAGTGTTT
* * * *
3521 CTTGATCAGTAAGTCCATTGGGCCATCATTAAGTCTTTCAAGCATGATGCTTAAATCCTTCGGTT
455 CTTGAGCAGCAAGTCCATTGGGCCATCAGTAAGTCTTTCAAGCATGATGCTTAAATCCTTCAGTT
** *
3586 CAACTATAAGTCTTTCGAGCAAGATTGTAAGTCCTTGGGACCATCCATAAGACCTTCGGGTAGGA
520 CAACTATAAGTCTTTCGAGCAAGATAATAAGTCCTTGGGACCATCCATAAGACCTTCGAGTAGGA
3651 TGTTTTCAAATTACTTTTTAGAAACTAAGTCAGATTTTCAAAGGTTTCTTGATGATTATCTCCAA
585 TGTTTTCAAATTACTTTTTAGAAACTAAGTCAGATTTTCAAAGGTTTCTTGATGATTATCTCCAA
* * *
3716 AGAATTTTTAAATGAAACTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTAAAAATGAAAGA
650 AGAATTTTTAAAGGAAACTAAGCCTAATTTTTAGGGATTCCTTGATGACAACTAAAAACGAAAGA
* * * *
3781 TTATAAGAAACCAAACTTCATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCGGGGCATCAGTAA
715 TTATAAGAAACCAAACTTCATTTACAAGAGTATCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCCATCAGTAA
*
3846 GTCTTTCGAGCACGATGCTTAAATCCTTCAAGTCATCT
780 GTCTTTCGAGCACGATGCATAAATCCTTCAAGTCATCT
* *
3884 ATGATGTTTTCAAATGAGTGTTTA-A-AAACTAAGCCTT-A-TTTCTAGGGGTTTCTTGATGATT
1 ATGATGTTTTCAAAT--GTGTTTATAGAAACTAA-ACTTCATTTTC-A-GGGTTTCCTGATGATT
* * * *
3945 ATCTTCAAAGAATTTTTAAAGAAATATAAGCCTACTTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTGAAA
61 ACCTCCAAAGAATTTTTAAAGAAAGATAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTGAAA
** *
4010 ATAAAATAT-TTAAAGAAACTATTCTAGATTTTCAAGGGTTTCCTGATGA-GTAAGTCCTTCAGG
126 ATAAAATATATT-AAGAAACTAAGCTAGATTTTCAAGAGTTTCCTGAT-ATGTAAGTCCTTCAGG
* * * * * * *
4073 CCTTCAGAAAGTCTTTCGAGCATGATGCTTAAATCCTTCGGGTCTTCTATAAGTCTTTCTAGCAA
189 CCATCAGAAAGTCCTTCAAGCATGATGCTTAAATCCATCAGG----ATATAAGTCTTTCGAGCAA
* ** * * *
4138 -TATCATAAGTC-TTTGAGACCATCCGTGAA-ACCTT-GGGGATGATGTTTTCAAATGAGTTTTT
250 GT-TAATAAGTCATTTG-G-CCATCC-ACAACACCTTCGGGGAAGATGTTTGCAAATGAATTTTT
* * * *
4199 AGAAACTAAA-CTTAATTTTTA-GGGTTTCTTGATGATTATCTCTAAAGAATTTTTAAAGGAAGC
311 AGAAAC-AAAGCCTAATTTTTAGGGGTTTCATGATCATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAAGC
* * * * *
4262 TATGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTGAAAATGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTT
375 TAAGCCAAATATTTAGGGGTTCCTTGATGAAAAATGAAAATGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTT
* * * *
4327 GATATTT-AAGTGTTTCTTGGGGAGCAAGTCC-TTCGTGCCATCAGTAAGTCTTTTGAA-CATGA
440 GAT-TTTCAAGTGTTTCTTGAGCAGCAAGTCCATT-GGGCCATCAGTAAGTC-TTTCAAGCATGA
* * *
4389 TGCTTAAATCCTTCAAG-TCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGGTAATAAGTGCTTTGGG-CCATC
502 TGCTTAAATCCTTC-AGTTCAACTATAAGTCTTTCGAGCAAGATAATAAGT-CCTTGGGACCATC
* * * **
4452 CATAAGACCTTCGAGTATGATGTTTTCAAATTAGTTTTTA-AAACTAAGTCTGATTTTCAGGGGT
565 CATAAGACCTTCGAGTAGGATGTTTTCAAATTACTTTTTAGAAACTAAGTCAGATTTTCAAAGGT
* *
4516 TTCTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAATCTAAGCCTAATTTTTA-TGATTCCTTGA
630 TTCTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAAACTAAGCCTAATTTTTAGGGATTCCTTGA
* * * * * * *
4580 TGAGAACTTAAAACGAAAGATT-TGAAGACACTAAGCTTGATTTACAAGGGTATCTTGATGAGTA
695 TGACAACTAAAAACGAAAGATTAT-AAGAAACCAAACTTCATTTACAAGAGTATCTTGATGAGTA
* * * *
4644 AGTCCTTCAGGCCATTAGTAAGTCTTTCGAGGATGATGCATAAATCCATT-AGGTCATCT
759 AGTCCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCACGATGCATAAATCC-TTCAAGTCATCT
4703 AT
1 AT
4705 AAGTCATTCG
Statistics
Matches: 711, Mismatches: 87, Indels: 45
0.84 0.10 0.05
Matches are distributed among these distances:
817 4 0.01
818 27 0.04
819 275 0.39
820 84 0.12
821 228 0.32
822 54 0.08
823 37 0.05
824 2 0.00
ACGTcount: A:0.31, C:0.15, G:0.18, T:0.35
Consensus pattern (817 bp):
ATGATGTTTTCAAATGTGTTTATAGAAACTAAACTTCATTTTCAGGGTTTCCTGATGATTACCTC
CAAAGAATTTTTAAAGAAAGATAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTGAAAATAAA
ATATATTAAGAAACTAAGCTAGATTTTCAAGAGTTTCCTGATATGTAAGTCCTTCAGGCCATCAG
AAAGTCCTTCAAGCATGATGCTTAAATCCATCAGGATATAAGTCTTTCGAGCAAGTTAATAAGTC
ATTTGGCCATCCACAACACCTTCGGGGAAGATGTTTGCAAATGAATTTTTAGAAACAAAGCCTAA
TTTTTAGGGGTTTCATGATCATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAAGCTAAGCCAAATATTTAG
GGGTTCCTTGATGAAAAATGAAAATGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTTGATTTTCAAGTGTTTC
TTGAGCAGCAAGTCCATTGGGCCATCAGTAAGTCTTTCAAGCATGATGCTTAAATCCTTCAGTTC
AACTATAAGTCTTTCGAGCAAGATAATAAGTCCTTGGGACCATCCATAAGACCTTCGAGTAGGAT
GTTTTCAAATTACTTTTTAGAAACTAAGTCAGATTTTCAAAGGTTTCTTGATGATTATCTCCAAA
GAATTTTTAAAGGAAACTAAGCCTAATTTTTAGGGATTCCTTGATGACAACTAAAAACGAAAGAT
TATAAGAAACCAAACTTCATTTACAAGAGTATCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCCATCAGTAAG
TCTTTCGAGCACGATGCATAAATCCTTCAAGTCATCT
Found at i:5000 original size:584 final size:584
Alignment explanation
Indices: 3883--6273 Score: 3005
Period size: 584 Copynumber: 4.1 Consensus size: 584
3873 TCAAGTCATC
* *
3883 TATGATGTTTTCAAATGAGTGTTTAAAAACTAAGCCTTA-TTTCTAGGGGTTTCTTGATGATTAT
1 TATGATGTTTTCAAATGAGT-TTTTAAAACTAAGCCTGATTTTC-AGGGGTTTCTTGATGATTAT
* * * * *
3947 CTTCAAAGAATTTTTAAAGAAATATAAGCCTACTTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTGAAAAT
64 CTCCAAAGAATTTTTAAAGAAATCTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTTAAAAC
* * * ** * * * *
4012 AAAATATTTAAAGAAACTATTCTAGATTTTCAAGGGTTTCCTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCC-T
129 GAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTTGATTTACAAGGGTATCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCCAT
* * * * *
4076 TCAGAAAGTCTTTCGAGCATGATGCTTAAATCCTTCGGGTCTTCTATAAGTCTTTCTAGCAATAT
194 T-AGTAAGTCTTTCGAGCATGATGCTTAAATCCTT-AGGTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGAT
* * * * * * * *
4141 CATAAGTC-TTTGAGACCATCCGTGAA-ACCTT-GGGGATGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAA
257 AATAAGTCATTCG-GACCATCCAT-AACACCTTCGAGTAAGATGTTTTCAAATGAATTTTTAAAA
* * * *
4203 ACTAAACTTAATTTTTAG-GGTTTCTTGATGATTATCT-CTAAAGAATTTTTAAAGGAAGCTATG
320 ACTAAGCCTAATTTTCAGAGGTTTCTTGATGATTATCTGC-AAAGAATTTTTAAAGGAAGCTAAG
4266 CCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTGAAAATGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTTGATA
384 CCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTGAAAATGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTTGAT-
* * ** * * *
4331 TTT-AAGTGTTTCTTG-GGGAGCAAGTCCTTCGTGCCATCAGTAAGTCTTTTGAACATGATGCTT
448 TTTCAAGTGTTTCTTGAAGG-GTAAGTCCTTCAAGCCATCAATAAGTCTTTCGAGCATGATGCTT
* * * * *
4394 AAATCCTTCAAGTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGGTAATAAGTGCTTTGGG-CCATCCATAAG
512 AAATCCTTCGAGTCAACTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGT-CCTTGGGACCATCCATAAG
4458 ACCTTCGAG
576 ACCTTCGAG
* *
4467 TATGATGTTTTCAAATTAGTTTTTAAAACTAAGTCTGATTTTCAGGGGTTTCTTGATGATTATCT
1 TATGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAAAACTAAGCCTGATTTTCAGGGGTTTCTTGATGATTATCT
* * * *
4532 CCAAAGAATTTTTAAAGGAATCTAAGCCTAATTTTTA-TGATTCCTTGATGAGAACTTAAAACGA
66 CCAAAGAATTTTTAAAGAAATCTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTTAAAACGA
* *
4596 AAGATTTGAAGACACTAAGCTTGATTTACAAGGGTATCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCCATTA
131 AAGATTTTAAGAAACTAAGCTTGATTTACAAGGGTATCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCCATTA
* * *
4661 GTAAGTCTTTCGAGGATGATGCATAAATCCATTAGGTCATCTATAAGTCATTCGAGCAAGATAAT
196 GTAAGTCTTTCGAGCATGATGCTTAAATCC-TTAGGTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATAAT
* * *
4726 AAGTCATTCGGGCCATCCATAACTCCTTCGAGTAATATGTTTTCAAATGAATTTTTAAAAACTAA
260 AAGTCATTCGGACCATCCATAACACCTTCGAGTAAGATGTTTTCAAATGAATTTTTAAAAACTAA
* * *
4791 GCCTAATTTTCAGAAGTTTCTTGATGATTAACTGCAAACAATTTTTAAAGGAAGCTAAGCCTAAT
325 GCCTAATTTTCAGAGGTTTCTTGATGATTATCTGCAAAGAATTTTTAAAGGAAGCTAAGCCTAAT
* *
4856 TTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTGAAAATGAACGATTTTAAGACACTAAGCTTGATTTTCAAG
390 TTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTGAAAATGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTTGATTTTCAAG
4921 TGTTTCTTGAAGGGTAAGTCCTTCAAGCCATCAATAAGTCTTTCGAGCATGATGCTTAAATCCTT
455 TGTTTCTTGAAGGGTAAGTCCTTCAAGCCATCAATAAGTCTTTCGAGCATGATGCTTAAATCCTT
* * ** *
4986 -GGGTTCAACTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGGTAAGTCCTTGGGACCATCCATAAGGTCTTCGG
520 CGAG-TCAACTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTCCTTGGGACCATCCATAAGACCTTCGA
5050 G
584 G
* * * * * *
5051 CAGGATGTTTTCAAAAGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGGTTTTTAGGGGTTTCTTGATAATTATC
1 TATGATGTTTTCAAATGAGTTTTTA-AAACTAAGCCTGATTTTCAGGGGTTTCTTGATGATTATC
* * * *
5116 TCGAAAGAA--TTTAAAGAAAGT-TAAGCCTAATTTTTAGGTGTTCCTTGATGACAACTAAAAAA
65 TCCAAAGAATTTTTAAAGAAA-TCTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTTAAAAC
* * * * *
5178 GAAAGATTTTAAGAAACTATGCTTGATTTTCAAGAGT-TTTTGATGAGTAAGT-CTTCAAGCCAT
129 GAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTTGATTTACAAGGGTATCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCCAT
* * * * * * * *
5241 CAGTAAGTC-TTCGAGCATGATACTTAAATCCTTCGGTTCCTCTATAATTCTTTTGAG-AAAATG
194 TAGTAAGTCTTTCGAGCATGATGCTTAAATCCTTAGG-TCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATA
* * * * * ** ** *
5304 GTAAGTCCTTCGGACCATCCATAAGACCTTC-AGGAAAGATGTTTTTAAATGCGTTTTTAGGAAG
258 ATAAGTCATTCGGACCATCCATAACACCTTCGA-GTAAGATGTTTTCAAATGAATTTTTAAAAAC
** * * * *
5368 TAAGCCTGGTTTTCAGGGGTTTCTTGATAATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAAGTTAAGCCT
322 TAAGCCTAATTTTCAGAGGTTTCTTGATGATTATCTGCAAAGAATTTTTAAAGGAAGCTAAGCCT
* * * ** * *
5433 AATTTTTAGGGGATCCTTGATGACAACTGAAAACGAAAGATTATAAGAAACTAAAATTAATTTTG
387 AATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTGAAAATGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTTGATTTTC
* * * ** * *
5498 AAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCGGGCCATCAGTAAATCTTTCGAGCATGATGCTTAAATC
452 AAGTGTTTCTTGAAGGGTAAGTCCTTCAAGCCATCAATAAGTCTTTCGAGCATGATGCTTAAATC
* * *
5563 CTTCGAGTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTACTTTGGG-CCATACATAAGACCTT
517 CTTCGAGTCAACTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGT-CCTTGGGACCATCCATAAGACCTT
5627 CGAG
581 CGAG
* * *
5631 TATGATATTTTCAAATGAGTTTTTAAAACTAAGTCTGCTTTTCAGGGGTTTCTTGATGATTATCT
1 TATGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAAAACTAAGCCTGATTTTCAGGGGTTTCTTGATGATTATCT
* * *
5696 CCAAAGAATTTTTAAAGGAATCTAAGCCTAATTTTTA-GGGTTCCTTGACGAGAACTTAAAACGA
66 CCAAAGAATTTTTAAAGAAATCTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTTAAAACGA
* * *
5760 AAGATTTTAAGACACTAAGCTTGATTTACAAGGGTATCTTGTTGAGTAAGTCCTTTAGGCCATTA
131 AAGATTTTAAGAAACTAAGCTTGATTTACAAGGGTATCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCCATTA
* * *
5825 GTATGTCTTTCGAGGATGATGTTTAAATCCATTAGGTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATAAT
196 GTAAGTCTTTCGAGCATGATGCTTAAATCC-TTAGGTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATAAT
* * * *
5890 AAGTCATTCGGGCCATCCATAACTCCTACGGGTAAGATGTTTTCAAATGAATTTTTAAAAACTAA
260 AAGTCATTCGGACCATCCATAACACCTTCGAGTAAGATGTTTTCAAATGAATTTTTAAAAACTAA
*
5955 GCCTAATTTTCA-AGGGTTTCTTGATGATTATCTGCAAAGAATTTTTAAATGAAGCTAAGCCTAA
325 GCCTAATTTTCAGA-GGTTTCTTGATGATTATCTGCAAAGAATTTTTAAAGGAAGCTAAGCCTAA
* * * *
6019 TTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAATTG-AAATGAACGATTTTAAGACACTAAGCTTGTTTTTCAA
389 TTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTGAAAATGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTTGATTTTCAA
6083 GTGTTTCTTGAAGGGTAAGTCCTTCAAGCCATCAATAAGTCTTTCGAGCATGATGCTTAAATCCT
454 GTGTTTCTTGAAGGGTAAGTCCTTCAAGCCATCAATAAGTCTTTCGAGCATGATGCTTAAATCCT
* * * *
6148 T-GGGTTCAACTATAAGTCTTTCGAACAAGATGGTAAGTCCTTGGGACCATCCATAAGGCCTTCG
519 TCGAG-TCAACTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTCCTTGGGACCATCCATAAGACCTTCG
6212 AG
583 AG
* * * * * * *
6214 CAGGATATTTTCAAAAGAGTTTTTAGAAATTAAGCCTGGTTTTTAGGGGTTTCTTGATGA
1 TATGATGTTTTCAAATGAGTTTTTA-AAACTAAGCCTGATTTTCAGGGGTTTCTTGATGA
6274 CAACTGAAAA
Statistics
Matches: 1540, Mismatches: 235, Indels: 64
0.84 0.13 0.03
Matches are distributed among these distances:
579 44 0.03
580 352 0.23
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TATGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAAAACTAAGCCTGATTTTCAGGGGTTTCTTGATGATTATCT
CCAAAGAATTTTTAAAGAAATCTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTTAAAACGA
AAGATTTTAAGAAACTAAGCTTGATTTACAAGGGTATCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCCATTA
GTAAGTCTTTCGAGCATGATGCTTAAATCCTTAGGTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATAATA
AGTCATTCGGACCATCCATAACACCTTCGAGTAAGATGTTTTCAAATGAATTTTTAAAAACTAAG
CCTAATTTTCAGAGGTTTCTTGATGATTATCTGCAAAGAATTTTTAAAGGAAGCTAAGCCTAATT
TTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTGAAAATGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTTGATTTTCAAGT
GTTTCTTGAAGGGTAAGTCCTTCAAGCCATCAATAAGTCTTTCGAGCATGATGCTTAAATCCTTC
GAGTCAACTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTCCTTGGGACCATCCATAAGACCTTCGAG
Found at i:5046 original size:42 final size:42
Alignment explanation
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4938 GTCCTTCAAG
* * *
4948 CCATCAATAAGTCTTTCGAGCATGATGCTTAAATCCTTGGGT
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* * * *
4990 TCAACTATAAGTCTTTCGAGCAAGATG-GTAAGTCCTTGGGA
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*
5031 CCATCCATAAGGTCTT
1 CCATCAATAA-GTCTT
5047 CGGGCAGGAT
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CCATCAATAAGTCTTTCGAGCAAGATGCGTAAATCCTTGGGA
Found at i:5706 original size:292 final size:290
Alignment explanation
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3873 TCAAGTCATC
* *
3883 TATGATGTTTTCAAATGAGTGTTTAAAAACTAAGCCTTA-TTTCTAGGGGTTTCTTGATGATTAT
1 TATGATGTTTTCAAATGAGT-TTTTAAAACTAAGCCTGATTTTC-AGGGGTTTCTTGATGATTAT
* * *
3947 CTTCAAAGAATTTTTAAA-GAAATATAAGCCTACTTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTGAAAA
64 CTCCAAAGAATTTTTAAAGGAAGT-TAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTGAAAA
* * * ** * * *
4011 TAAAATATTTAAAGAAACTATTCTAGATTTTCAAGGGTTTCCTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCCT
128 TGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTTGATTTTCAAGGGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCCA
* * * *
4076 TCAGAAAGTCTTTCGAGCATGATGCTTAAATCCTTCGGGTCTTCTATAAGTCTTTCTAGCAATAT
193 TCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATGCTTAAATCCTTC-GGTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGAT
* * * *
4141 CATAAGTCTTTGAGACCATCCGTGAA-ACCTT-GGG
257 GATAAGTCTTTG-GGCCATCCAT-AAGACCTTCGAG
* * * * *
4175 GATGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAACTTAATTTTTA-GGGTTTCTTGATGATTATC
1 TATGATGTTTTCAAATGAGTTTTTA-AAACTAAGCCTGATTTTCAGGGGTTTCTTGATGATTATC
* * *
4239 TCTAAAGAATTTTTAAAGGAAGCTATGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTGAAAATG
65 TCCAAAGAATTTTTAAAGGAAGTTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTGAAAATG
* ** *
4304 AAAGATTTTAAGAAACTAAGCTTGATATTT-AAGTGTTTCTTGGGGAGCAAGTCCTTC-GTGCCA
130 AAAGATTTTAAGAAACTAAGCTTGAT-TTTCAAGGGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCAG-GCCA
* * * *
4367 TCAGTAAGTCTTTTGAACATGATGCTTAAATCCTTCAAGTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGGT
193 TCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATGCTTAAATCCTTC-GGTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGAT
*
4432 AATAAGTGCTTTGGGCCATCCATAAGACCTTCGAG
257 GATAAGT-CTTTGGGCCATCCATAAGACCTTCGAG
* *
4467 TATGATGTTTTCAAATTAGTTTTTAAAACTAAGTCTGATTTTCAGGGGTTTCTTGATGATTATCT
1 TATGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAAAACTAAGCCTGATTTTCAGGGGTTTCTTGATGATTATCT
* * * * *
4532 CCAAAGAATTTTTAAAGGAA-TCTAAGCCTAATTTTTA-TGATTCCTTGATGAGAACTTAAAACG
66 CCAAAGAATTTTTAAAGGAAGT-TAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTGAAAATG
* * * * *
4595 AAAGATTTGAAGACACTAAGCTTGATTTACAAGGGTATCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCCATT
130 AAAGATTTTAAGAAACTAAGCTTGATTTTCAAGGGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCCATC
* * * * *
4660 AGTAAGTCTTTCGAGGATGATGCATAAATCCATTAGGTCATCTATAAGTCATTCGAGCAAGATAA
195 AGTAAGTCTTTCGAGCATGATGCTTAAATCC-TTCGGTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGA
* **
4725 TAAGTCATTCGGGCCATCCATAACTCCTTCGAG
259 TAAGTC-TTTGGGCCATCCATAAGACCTTCGAG
* * ** *
4758 TAAT-ATGTTTTCAAATGAATTTTTAAAAACTAAGCCTAATTTTCAGAAGTTTCTTGATGATTAA
1 T-ATGATGTTTTCAAATGAGTTTTT-AAAACTAAGCCTGATTTTCAGGGGTTTCTTGATGATTAT
* * *
4822 CTGCAAACAATTTTTAAAGGAAGCTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTGAAAAT
64 CTCCAAAGAATTTTTAAAGGAAGTTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTGAAAAT
* * * * * *
4887 GAACGATTTTAAGACACTAAGCTTGATTTTCAAGTGTTTCTTGAAGGGTAAGTCCTTCAAGCCAT
129 GAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTTGATTTTCAAGGGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCCAT
* * *
4952 CAATAAGTCTTTCGAGCATGATGCTTAAATCCTTGGGTTCAACTATAAGTCTTTCGAGCAAGATG
194 CAGTAAGTCTTTCGAGCATGATGCTTAAATCCTTCGG-TCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATG
* * ** *
5017 GTAAGTCCTTGGGACCATCCATAAGGTCTTCGGG
258 ATAAGTCTTTGGG-CCATCCATAAGACCTTCGAG
* * * * * *
5051 CAGGATGTTTTCAAAAGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGGTTTTTAGGGGTTTCTTGATAATTATC
1 TATGATGTTTTCAAATGAGTTTTTA-AAACTAAGCCTGATTTTCAGGGGTTTCTTGATGATTATC
* * * * *
5116 TCGAAAGAA--TTTAAAGAAAGTTAAGCCTAATTTTTAGGTGTTCCTTGATGACAACTAAAAAAG
65 TCCAAAGAATTTTTAAAGGAAGTTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTGAAAATG
* * *
5179 AAAGATTTTAAGAAACTATGCTTGATTTTCAAGAGTTT-TTGATGAGTAAGT-CTTCAAGCCATC
130 AAAGATTTTAAGAAACTAAGCTTGATTTTCAAGGGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCCATC
* * * * * *
5242 AGTAAGTC-TTCGAGCATGATACTTAAATCCTTCGGTTCCTCTATAATTCTTTTGAG-AAAATGG
195 AGTAAGTCTTTCGAGCATGATGCTTAAATCCTTCGG-TCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGA
* *
5305 TAAGTCCTTCGGACCATCCATAAGACCTTC-AGG
259 TAAGT-CTTTGGGCCATCCATAAGACCTTCGA-G
* * * * * * * *
5338 AAAGATGTTTTTAAATGCGTTTTTAGGAAGTAAGCCTGGTTTTCAGGGGTTTCTTGATAATTATC
1 TATGATGTTTTCAAATGAGTTTTTA-AAACTAAGCCTGATTTTCAGGGGTTTCTTGATGATTATC
* *
5403 TCCAAAGAATTTTTAAAGGAAGTTAAGCCTAATTTTTAGGGGATCCTTGATGACAACTGAAAACG
65 TCCAAAGAATTTTTAAAGGAAGTTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTGAAAATG
* ** * * * *
5468 AAAGATTATAAGAAACTAAAATTAATTTTGAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCGGGCCATC
130 AAAGATTTTAAGAAACTAAGCTTGATTTTCAAGGGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCCATC
*
5533 AGTAAATCTTTCGAGCATGATGCTTAAATCCTTCGAGTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGA
195 AGTAAGTCTTTCGAGCATGATGCTTAAATCCTTCG-GTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGA
*
5598 TAAGTACTTTGGGCCATACATAAGACCTTCGAG
259 TAAGT-CTTTGGGCCATCCATAAGACCTTCGAG
* * *
5631 TATGATATTTTCAAATGAGTTTTTAAAACTAAGTCTGCTTTTCAGGGGTTTCTTGATGATTATCT
1 TATGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAAAACTAAGCCTGATTTTCAGGGGTTTCTTGATGATTATCT
* * * *
5696 CCAAAGAATTTTTAAAGGAA-TCTAAGCCTAATTTTTA-GGGTTCCTTGACGAGAACTTAAAACG
66 CCAAAGAATTTTTAAAGGAAGT-TAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTGAAAATG
* * * * * *
5759 AAAGATTTTAAGACACTAAGCTTGATTTACAAGGGTATCTTGTTGAGTAAGTCCTTTAGGCCATT
130 AAAGATTTTAAGAAACTAAGCTTGATTTTCAAGGGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCCATC
* * * * *
5824 AGTATGTCTTTCGAGGATGATGTTTAAATCCATTAGGTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATAA
195 AGTAAGTCTTTCGAGCATGATGCTTAAATCC-TTCGGTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGA
* ** * *
5889 TAAGTCATTCGGGCCATCCATAACTCCTACGGG
259 TAAGTC-TTTGGGCCATCCATAAGACCTTCGAG
* * * *
5922 TAAGATGTTTTCAAATGAATTTTTAAAAACTAAGCCTAATTTTCAAGGGTTTCTTGATGATTATC
1 TATGATGTTTTCAAATGAGTTTTT-AAAACTAAGCCTGATTTTCAGGGGTTTCTTGATGATTATC
* * * *
5987 TGCAAAGAATTTTTAAATGAAGCTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAATTG-AAATG
65 TCCAAAGAATTTTTAAAGGAAGTTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTGAAAATG
* * * * * * *
6051 AACGATTTTAAGACACTAAGCTTGTTTTTCAAGTGTTTCTTGAAGGGTAAGTCCTTCAAGCCATC
130 AAAGATTTTAAGAAACTAAGCTTGATTTTCAAGGGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCCATC
* * * * *
6116 AATAAGTCTTTCGAGCATGATGCTTAAATCCTTGGGTTCAACTATAAGTCTTTCGAACAAGATGG
195 AGTAAGTCTTTCGAGCATGATGCTTAAATCCTTCGG-TCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGA
* *
6181 TAAGTCCTTGGGACCATCCATAAGGCCTTCGAG
259 TAAGTCTTTGGG-CCATCCATAAGACCTTCGAG
* * * * * * *
6214 CAGGATATTTTCAAAAGAGTTTTTAGAAATTAAGCCTGGTTTTTAGGGGTTTCTTGATGA
1 TATGATGTTTTCAAATGAGTTTTTA-AAACTAAGCCTGATTTTCAGGGGTTTCTTGATGA
6274 CAACTGAAAA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.31, C:0.15, G:0.19, T:0.35
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TATGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAAAACTAAGCCTGATTTTCAGGGGTTTCTTGATGATTATCT
CCAAAGAATTTTTAAAGGAAGTTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTGAAAATGA
AAGATTTTAAGAAACTAAGCTTGATTTTCAAGGGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCCATCA
GTAAGTCTTTCGAGCATGATGCTTAAATCCTTCGGTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATA
AGTCTTTGGGCCATCCATAAGACCTTCGAG
Found at i:6204 original size:41 final size:42
Alignment explanation
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Period size: 42 Copynumber: 2.3 Consensus size: 42
6101 GTCCTTCAAG
* * * *
6111 CCATCAATAAGTCTTTCGAGCATGATGCTTAAATCCTTGGGT
1 CCATCAATAAGTCTTTCGAACAAGATGCGTAAATCCTTGGGA
* * * *
6153 TCAACTATAAGTCTTTCGAACAAGATG-GTAAGTCCTTGGGA
1 CCATCAATAAGTCTTTCGAACAAGATGCGTAAATCCTTGGGA
*
6194 CCATCCATAAG
1 CCATCAATAAG
6205 GCCTTCGAGC
Statistics
Matches: 41, Mismatches: 11, Indels: 1
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Matches are distributed among these distances:
41 19 0.46
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Consensus pattern (42 bp):
CCATCAATAAGTCTTTCGAACAAGATGCGTAAATCCTTGGGA
Found at i:6425 original size:235 final size:234
Alignment explanation
Indices: 6009--6506 Score: 888
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5999 TTAAATGAAG
** * *
6009 CTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAATTGAAATGAACGATTTTAAGACACTAAGCTT
1 CTAAGCCTGGTTTTTAGGGGTTTCTTGATGACAACTGAAATGAACGATTTTAAGACACTAAGCTT
*
6074 GTTTTTCAAGTGTTTCTTGAAGGGTAAGTCCTTCAAGCCATCAATAAGTCTTTCGAGCATGATGC
66 GATTTTCAAGTGTTTCTTGAAGGGTAAGTCCTTCAAGCCATCAATAAGTCTTTCGAGCATGATGC
6139 TTAAATCCTTGGGTTCAACTATAAGTCTTTCGAACAAGATGGTAAGTCCTTGGGACCATCCATAA
131 TTAAATCCTTGGGTTCAACTATAAGTCTTTCGAACAAGATGGTAAGTCCTTGGGACCATCCATAA
6204 GGCCTTCGAGCAGGATATTTTCAAAAGAGTTTTTAGAAA
196 GGCCTTCGAGCAGGATATTTTCAAAAGAGTTTTTAGAAA
*
6243 TTAAGCCTGGTTTTTAGGGGTTTCTTGATGACAACTGAAAATGAACGATTTTAAGACACTAAGCT
1 CTAAGCCTGGTTTTTAGGGGTTTCTTGATGACAACTG-AAATGAACGATTTTAAGACACTAAGCT
6308 TGATTTTCAAGTGTTTCTTGAAGGGTAAGTCCTTCAAGCCATCAATAAGTCTTTCGAGCATGATG
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* *
6373 CTTAAATCCTTGGGTTCAACTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGGTATGTCCTTGGGACCATCCATA
130 CTTAAATCCTTGGGTTCAACTATAAGTCTTTCGAACAAGATGGTAAGTCCTTGGGACCATCCATA
* * *
6438 AGGTCTTCGGGCAGGATGTTTTCAAAAGAGTTTTTAGAAA
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1 CTAAGCCTGGTTTTTAGGGGTTTCTTGAT
6507 AATTATCTCG
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.28, C:0.16, G:0.21, T:0.34
Consensus pattern (234 bp):
CTAAGCCTGGTTTTTAGGGGTTTCTTGATGACAACTGAAATGAACGATTTTAAGACACTAAGCTT
GATTTTCAAGTGTTTCTTGAAGGGTAAGTCCTTCAAGCCATCAATAAGTCTTTCGAGCATGATGC
TTAAATCCTTGGGTTCAACTATAAGTCTTTCGAACAAGATGGTAAGTCCTTGGGACCATCCATAA
GGCCTTCGAGCAGGATATTTTCAAAAGAGTTTTTAGAAA
Found at i:6439 original size:41 final size:42
Alignment explanation
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Period size: 42 Copynumber: 2.4 Consensus size: 42
6336 GTCCTTCAAG
* * *
6346 CCATCAATAAGTCTTTCGAGCATGATGCTTAAATCCTTGGGT
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* * * **
6388 TCAACTATAAGTCTTTCGAGCAAGATG-GTATGTCCTTGGGA
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*
6429 CCATCCATAAGGTCTT
1 CCATCAATAA-GTCTT
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Statistics
Matches: 45, Mismatches: 11, Indels: 2
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (42 bp):
CCATCAATAAGTCTTTCGAGCAAGATGCGTAAATCCTTGGGA
Found at i:7420 original size:584 final size:584
Alignment explanation
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Period size: 584 Copynumber: 22.3 Consensus size: 584
6233 TTTTTAGAAA
** * * *
6243 TTAAGCCTGGTTTTTAGGGGTTTCTTGATGACAACTGAAAATGAACGATTTTAAGACACTAAGCT
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* * * * * *
6308 TGATTTTCAAGTGTTTCTTGAAGGGTAAGTCCTTCAAGCCATCAATAAGTCTTTCGAGCATGATG
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* * * * *
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131 CTTAAATCCTTGAG-TCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTACTTTGGG-CCATCCAT
** * * * *
6437 AAGGTCTTCGGGCAGGATGTTTTCAAAAGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGGTTTTTAGGGGTTTC
194 AAGACCTTCGAGTAGGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGGTTTTCAGGGGTTTC
* * *
6502 TTGATAATTATCTCGAAAGAATATTTAAAGAAAGT-TAAGCCTAATTTTTAGGTGTTCCTTGATG
259 TTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGAAA-TCTAAGCCTAATTTTTAGGTGTTCCTTGATG
* * *
6566 ACAACTAAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTATGCTTGATTTTCAAGAGTTTATTGATGAGTAAGT
323 AGAACTAAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTTGATTTACAAGAGTTTATTGATGAGTAAGT
* * * *
6631 TCTTCAAGCCATCAGTAAGTCGTTCGAGCATGATACTTAAATCCTTCGGTTCCTCTATAATTCTT
388 TCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATACTTAAATCCTTCGG-TCATCTATAAGTCTT
* * * * * **
6696 TTGAGAAAAATGGTAAGTCCTTCGGACCATCCATAAGACCTTCAGGAAAGATGTTTTTAAATGCG
452 TCGAGCAAGATGGTAAGTCCTTCGGACCATCCATAAGACCTTCGGGAAAGATGTTTTCAAATGAA
* * * *
6761 TTTTTAGGAAGTAAGCCTGGTTTTCAAGGGTTTCTTGATAATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGG
517 TTTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAAGGGTTTCTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGG
6826 AAG
582 AAG
* ** * **
6829 TTAAGCCTAATTTTTAGGGGATCCTTGATGACAACTGAAAACAAAAGATTATAAGAAACTAAAAT
1 TTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTGAAAATGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCT
* * *
6894 TAATTTTGAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCGGGCCATCAGTAAATCTTTCGAGCATGATG
66 TAATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCGAGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATG
*
6959 CTTAAATCCTTCGAGTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTACTTTGGGCCATACATA
131 CTTAAATCCTT-GAGTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTACTTTGGGCCATCCATA
* * * *
7024 AGACCTTCGAGTATGATATTTTCAAATGAGTTTTTA-AAACTAAGTCTGCTTTTCAGGGGTTTCT
195 AGACCTTCGAGTAGGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGGTTTTCAGGGGTTTCT
*
7088 TGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAATCTAAGCCTAATTTTTAGG-GTTCCTTGATGAG
260 TGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGAAATCTAAGCCTAATTTTTAGGTGTTCCTTGATGAG
* * * * * * *
7152 AACTTAAAACGAAAGATTTTAAGACACTAAGCTTGATTTACAAGGGTATCTTGTTGAGTAAG-TC
325 AACTAAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTTGATTTACAAGAGTTTATTGATGAGTAAGTTC
* * * ** *
7216 ATGT-AGGCCATTAGTATGTCTTTCGAGGATGATGTTTAAATCCATTAGGTCATCTATAAGTCTT
390 -T-TCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATACTTAAATCC-TTCGGTCATCTATAAGTCTT
** * * ** * *
7280 TCGAGCAAGATAATAAGTCATTCGGGCCATCCATAACTCCTACGGGTAAGATGTTTTCAAATGAA
452 TCGAGCAAGATGGTAAGTCCTTCGGACCATCCATAAGACCTTCGGGAAAGATGTTTTCAAATGAA
* * * *
7345 TTTTTAAAAACTAAGCCTAATTTTCAAGGGTTTCTTGATGATTATCTGCAAAGAATTTTTAAATG
517 TTTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAAGGGTTTCTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGG
7410 AAG
582 AAG
* * * *
7413 CTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAATTG-AAATGAACGATTTTAAGACACTAAGCT
1 TTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTGAAAATGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCT
** * * * * *
7477 TGTTTTTCAAGTGTTTCTTGAAGGGTAAGTCCTTCAAGCCATCAATAAGTCTTTCGAGCATGATG
66 TAATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCGAGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATG
* * * * *
7542 CTTAAATCCTTGGGTTCAACTATAAGTCTTTCGAACAAGATGGTAAGT-CCTTGGGACCATCCAT
131 CTTAAATCCTTGAG-TCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTACTTTGGG-CCATCCAT
* * * * *
7606 AAGGCCTTCGAGCAGGATATTTTCAAAAGAGTTTTTAGAAATTAAGCCTGGTTTT-AGGGGTTTC
194 AAGACCTTCGAGTAGGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGGTTTTCAGGGGTTTC
* * *
7670 TTGATGATTATCTCAAAAGAATATTTAAAGAAAGCTAAGCCTAATTTTTAGGTGTTCCTTGATGA
259 TTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGAAATCTAAGCCTAATTTTTAGGTGTTCCTTGATGA
* * *
7735 AAACTAAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTTGATTTTCAAGAGTTTATTGATGAGTAAGCT
324 GAACTAAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTTGATTTACAAGAGTTTATTGATGAGTAAGTT
* * * *
7800 CTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATACATAAATCCTTCGGTTCCTCCATAATTCTTT
389 CTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATACTTAAATCCTTCGG-TCATCTATAAGTCTTT
* * * * **
7865 TGAG-AATGATGGTAAGTCCTTCGGACCATTCATAAGACCTTCCGGAAAGATGTTTTTAAATGCG
453 CGAGCAA-GATGGTAAGTCCTTCGGACCATCCATAAGACCTTCGGGAAAGATGTTTTCAAATGAA
* * * * * *
7929 TTTTTAGGAAGTAAGTCTGGTTTTCAGGGGTTTCATGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGG
517 TTTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAAGGGTTTCTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGG
7994 AAG
582 AAG
* * * **
7997 TTAAGCCTAATTTTTAGGGGATCCTTGATGACAACTGAAAAAGAAAGATTATAAGAAACTAAAAT
1 TTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTGAAAATGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCT
* *
8062 TAATTTTGAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCGTGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATG
66 TAATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCGAGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATG
*
8127 CTTAAATCCTTCGAGTCATCTATAACTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTACTTTGGGCCATCCATA
131 CTTAAATCCTT-GAGTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTACTTTGGGCCATCCATA
* *
8192 AGACCTTCGAGTAGGATGTTTTCAAATGAGTTTTTA-AAACTAAGTCTGATTTTCAGGGGTTTCT
195 AGACCTTCGAGTAGGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGGTTTTCAGGGGTTTCT
* * *
8256 TGATGATTATATCCAAAGAATTTTTAAAGGAATCTAAGCCTAATTTTTAAG-GTTCCTTGATGAG
260 TGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGAAATCTAAGCCTAATTTTTAGGTGTTCCTTGATGAG
* * * * * *
8320 AACTTAAAATGAAAGATTTTAAGACAA-TAAGCTTGATTTACAAGGGTATCTTGATGAGTAAGTC
325 AACTAAAAAAGAAAGATTTTAAGA-AACTAAGCTTGATTTACAAGAGTTTATTGATGAGTAAGTT
* * * *
8384 CTTCAGGCCATTAGTAAGTCTTTCGAGGATGATGCTTAAATCCATTAGGTCATCTATAAGTCTTT
389 CTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATACTTAAATCC-TTCGGTCATCTATAAGTCTTT
* ** * * ** *
8449 CAAGCAAGATAATAAGTCATTCGGGCCATCCATAACTCCTTCGGGTAAGATGTTTTCAAATGAAT
453 CGAGCAAGATGGTAAGTCCTTCGGACCATCCATAAGACCTTCGGGAAAGATGTTTTCAAATGAAT
* * * * *
8514 TTTTAAAAACTAAGCCTAATTTTCAGGGGTTTCTTGATGATTATCTGCAAAGAATTTTCAAA-GA
518 TTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAAGGGTTTCTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGA
8578 AG
583 AG
* * * *
8580 CTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAATTGAAAATGAACGATTTTAAGACACTAAGCT
1 TTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTGAAAATGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCT
* * * * * *
8645 TGATTTTCAAGTGTTTCTTGAAGGGTAAGTCCTTCAAGCCATCAATAAGTCTTTCGAGCATGATG
66 TAATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCGAGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATG
* * * * *
8710 CTTAAATCCTTGGGTTCAACTATAAGTCTTTCGAACAAGATGGTAAGT-CCTTGGGACCATCCAT
131 CTTAAATCCTTGAG-TCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTACTTTGGG-CCATCCAT
* * * * *
8774 AAGTCCTTCGAGCATGATGTTTTCAAATTAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGGTTTTTAGGGGTTTC
194 AAGACCTTCGAGTAGGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGGTTTTCAGGGGTTTC
* * * *
8839 TTGATGATAATCTCGAAAGAATATTTAAAGAAAACTAAGCCTAATTTTTAGGTGTTCCTTGATGA
259 TTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGAAATCTAAGCCTAATTTTTAGGTGTTCCTTGATGA
*
8904 TAACTAAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTTGATTTTA-AAGAGTTTATTGATGAGTAAGT
324 GAACTAAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTTGA-TTTACAAGAGTTTATTGATGAGTAAGT
* * * *
8968 TCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATACTTAAATCCTTCGATTCCTCCATAATTCTT
388 TCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATACTTAAATCCTTCG-GTCATCTATAAGTCTT
* * * *
9033 TTGAGAAAGATGGTAAGTCCTTCGGACCATCCATAAGACCTTCAGGAAAGATGTTTTTAAAT-AC
452 TCGAGCAAGATGGTAAGTCCTTCGGACCATCCATAAGACCTTCGGGAAAGATGTTTTCAAATGA-
* * * * * * *
9097 GTTTTTAGGAAGTAAGTCTGGTTTTCAGGGGTTTCTTGATGATTATCTCGAAAGAATTTTTAAAG
516 ATTTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAAGGGTTTCTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAG
9162 GAAG
581 GAAG
* * **
9166 TTAAGCCTAATTTTTAGGGGATCCTTGATGACAACTGAAAA-GAAAGATTATAAGAAACTAAAAT
1 TTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTGAAAATGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCT
**
9230 TAATTTTGTAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCG-GCCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGAT
66 TAATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCGAG-CCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGAT
9294 GCTTAAATCCTTCGAGTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTACTTTGGGCCATCCAT
130 GCTTAAATCCTT-GAGTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTACTTTGGGCCATCCAT
* * *
9359 AAGACCTTCGAGTAGGATGTTTTCAAATGAGTTTTTA-AAACTAAGTCTGATTTTCAAGGGTTTC
194 AAGACCTTCGAGTAGGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGGTTTTCAGGGGTTTC
* *
9423 TTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAATCTAAGCCTAATATTTAGG-GTTCCTTGATGA
259 TTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGAAATCTAAGCCTAATTTTTAGGTGTTCCTTGATGA
* * * * * * * *
9487 GAACTTAAAACGAAAGATTTTAAGACACTAAGCTTGATTTACAAGGGTATCTTGTTGAGTAAGTC
324 GAACTAAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTTGATTTACAAGAGTTTATTGATGAGTAAGTT
* * * * *
9552 CTTCAGTCCATTAGTAAGTCTTTCGAGGATGATGCTTAAATCCATTAGGTCATCTATAAGTCTTT
389 CTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATACTTAAATCC-TTCGGTCATCTATAAGTCTTT
** * * * ** * * *
9617 CGAGCAAGATAATAAGTCATTTGGGCCATCCATAACTCCATCGGGTAAGATTTTTTCAAATGAAT
453 CGAGCAAGATGGTAAGTCCTTCGGACCATCCATAAGACCTTCGGGAAAGATGTTTTCAAATGAAT
* * * * ***
9682 TTTTAAAAACTAAGCCTAATTTTC-AGAAGTTTCTTGATGATTATCTGCAAA-AAAAATTAAAGG
518 TTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAAG-GGTTTCTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGG
9745 AAG
582 AAG
* * * * *
9748 CTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGAAAATTGAAAATGAATGATTTTAAGACACTAAGCT
1 TTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTGAAAATGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCT
* * * * * * *
9813 TGATTTTCAAGTGTTTCTTGAAGGGTAAGTCCTTCAAGCCTTCAATAAGTCTTTCGAGCATGATG
66 TAATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCGAGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATG
* * * * *
9878 CTTAAATCCTTGTGTTCAACTATAAGTCTTTCGAGAAAGATGGTAAG-ACCTTGGGACCATCCAT
131 CTTAAATCCTTGAG-TCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTACTTTGGG-CCATCCAT
* * * * *
9942 AAGGCCTTCGGGCAGGATGTTTTCAAAAGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGGTTTTTAGGGGTTTC
194 AAGACCTTCGAGTAGGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGGTTTTCAGGGGTTTC
* * * *
10007 TTGATGATTATCTCGAAAGAATATTTAAAGAAAGT-TAAGGCAAATTTTTAGGTGTTCCTTGATG
259 TTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGAAA-TCTAAGCCTAATTTTTAGGTGTTCCTTGATG
* *
10071 ACAACTAAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTTGATTTTCAAGAGTTTATTGATGAGTAAGT
323 AGAACTAAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTTGATTTACAAGAGTTTATTGATGAGTAAGT
* * * *
10136 TCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATACTTAAATCCTTCGGTTCCTCCATAATTATT
388 TCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATACTTAAATCCTTCGG-TCATCTATAAGTCTT
* * * * * * * **
10201 TTGAGAAAAATGGTAAGCCCTTCTGACCATCCATAAGACCTTCAGGAAAGATGTTTTTAAATGCT
452 TCGAGCAAGATGGTAAGTCCTTCGGACCATCCATAAGACCTTCGGGAAAGATGTTTTCAAATGAA
* * *
10266 TTTTTAGGAAGTAAGCCTGGTTTTCAAGGGTTTCTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGG
517 TTTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAAGGGTTTCTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGG
10331 AAG
582 AAG
* * * **
10334 TTAAGCCTAATTTTTAGGGGATCCTT-ATTGACAACTGAAAAAGAAAGATTATAAGAAACTAAAA
1 TTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGA-TGACAACTGAAAATGAAAGATTTTAAGAAACTAAGC
* *
10398 TTAATTTTGAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCGGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGAT
65 TTAATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCGAGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGAT
* *
10463 GCTTAAATCCTTCGAGTCATCTATAAGTCTTTCGAGTAAGATAATAAGTACTTTGGGCCATCCAT
130 GCTTAAATCCTT-GAGTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTACTTTGGGCCATCCAT
* * **
10528 AAGACCTTCGAGTAGGATGTTTTCAAATGAGTTTTTA-AAACTAAGTCTGATTTTCAGGTATTTC
194 AAGACCTTCGAGTAGGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGGTTTTCAGGGGTTTC
* *
10592 TTGATGATTATCTCCAAA-ACATTTTTAAAGGAATCTAAGCCTAATTTTTAGG-GTTCCTTGATA
259 TTGATGATTATCTCCAAAGA-ATTTTTAAAGAAATCTAAGCCTAATTTTTAGGTGTTCCTTGATG
* * * * * * * * *
10655 AGAACTTAAAACGAAAGATTTTAAGACACTGACCTAGATTTACAAGGGTATCTTGATGAGTAAGT
323 AGAACTAAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTTGATTTACAAGAGTTTATTGATGAGTAAGT
* * * * * * * *
10720 CCTTCAGTCCATTAGTAAGTCATTCGAGGATGATGCTTAAATCTATTAGGTCATCTATAAGTCTT
388 TCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATACTTAAATC-CTTCGGTCATCTATAAGTCTT
** * * ** * * *
10785 TCGAGCAAGATAATAAGTCATTCGGGCCATCCATAACTCCATCGGGTAAGATTTTTTCAAATGAA
452 TCGAGCAAGATGGTAAGTCCTTCGGACCATCCATAAGACCTTCGGGAAAGATGTTTTCAAATGAA
* * * * ***
10850 TTTTTAAAAACTAAGCCTAATTTTC-AGAAGTTTCTTGATGATTATCTGCAAA-AAAAATTAAAG
517 TTTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAAG-GGTTTCTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAG
10913 GAAG
581 GAAG
* * * * *
10917 CTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGAAAATTGAAAATGAATGATTTTAAGACACTAAGCT
1 TTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTGAAAATGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCT
* * * * * * *
10982 TGATTTTCAAGTGTTTCTTGAAGGGTAAGTCCTTCAAGCCTTCAATAAGTCTTTCGAGCATGATG
66 TAATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCGAGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATG
* * * *
11047 CTTAAATCCTTGGGTTCAACTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGGTAAG-ACCTTGGGACCATCCAT
131 CTTAAATCCTTGAG-TCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTACTTTGGG-CCATCCAT
* * * * *
11111 AAGGCCTTCGGGCAGGATGTTTTCAAAAGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGGTTTTTAGGGGTTTC
194 AAGACCTTCGAGTAGGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGGTTTTCAGGGGTTTC
* * * * *
11176 TTGATGATTATCTCGAAAGAATATTTAAAGAAAGCTAAGGCAAATTTTTAGGTGTTCCTTGATGA
259 TTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGAAATCTAAGCCTAATTTTTAGGTGTTCCTTGATGA
* *
11241 CAACTAAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTTGATTTTCAAGAGTTTATTGATGAGTAAGTT
324 GAACTAAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTTGATTTACAAGAGTTTATTGATGAGTAAGTT
* * * *
11306 CTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATACTTAAATCCTTCGGTTCCTCCATAATTATTT
389 CTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATACTTAAATCCTTCGG-TCATCTATAAGTCTTT
* * * * * * * **
11371 TGAGAAAAATGGTAAGCCCTTCTGACCATCCATAAGACCTTCAGGAAAGATGTTTTTAAATGCTT
453 CGAGCAAGATGGTAAGTCCTTCGGACCATCCATAAGACCTTCGGGAAAGATGTTTTCAAATGAAT
* * *
11436 TTTTAGGAAGTAAGCCTGGTTTTCAAGGGTTTCTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGA
518 TTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAAGGGTTTCTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGA
11501 AG
583 AG
* * * * **
11503 TTAAGCCTAATTTTTAGGGGATCATTGATGACAACTGAAAAAGAAAGATTATAAGAAACTAAAAT
1 TTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTGAAAATGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCT
* *
11568 TAATTTTGAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCGGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATG
66 TAATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCGAGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATG
* *
11633 CTTAAATCCTTCTAGTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATAATAAGTACTTTGGGCCATCCATA
131 CTTAAATCCTT-GAGTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTACTTTGGGCCATCCATA
* * **
11698 AGACCTTCGAGTAGGATGTTTTCAAATGAGTTTTTA-AAACTAAGTCTGATTTTCAGGTATTTCT
195 AGACCTTCGAGTAGGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGGTTTTCAGGGGTTTCT
* *
11762 TGATGATTATCTCCAAA-ACATTTTTAAAGGAATCTAAGCCTAATTTTTAGG-GTTCCTTGATAA
260 TGATGATTATCTCCAAAGA-ATTTTTAAAGAAATCTAAGCCTAATTTTTAGGTGTTCCTTGATGA
* ** * * * * * * * *
11825 GAACTTAAATCGAAAGATTTTAAGACACTGACCTAGATTTACAAGGGTATCTTGATGAGTAAGTC
324 GAACTAAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTTGATTTACAAGAGTTTATTGATGAGTAAGTT
* * * *
11890 CTTCAGGCCATTAGTAAGTCTTTCGAGGATGATGCTTAAATCCATTAGGTCATCTATAAGTCTTT
389 CTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATACTTAAATCC-TTCGGTCATCTATAAGTCTTT
** * * ** * *
11955 CGAGCAAGATAATAAGTCATTCGGGCCATCCATAACTCCTTCGGGTAAGTTGTTTTCAAATGAAT
453 CGAGCAAGATGGTAAGTCCTTCGGACCATCCATAAGACCTTCGGGAAAGATGTTTTCAAATGAAT
* * * * * *
12020 TTTTAAAAACTAGGCCTAATTTTCAGGGGTTTCTTGATGATTATCTGCAAAGAATTTTCAAAGGA
518 TTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAAGGGTTTCTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGA
12085 AG
583 AG
* * * * *
12087 CTAAGCCTAATTTTTAGTGGTTCCTTGATGAAAACTGAAAATGAACGATTTTAAGACACTAAGCT
1 TTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTGAAAATGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCT
* * * * * *
12152 TGATTTTCAAGTGTTTCTTGAAGGGTAAGTCCTTCAAGCCATCAATAAGTCTTTCGAGCATGATG
66 TAATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCGAGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATG
* * * * *
12217 CTTAAATCCTTGGGTTCAACAATAAGTCTTTCGAGCAAGATGGTAAGT-CCTTGGGACCATCCAT
131 CTTAAATCCTTGAG-TCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTACTTTGGG-CCATCCAT
* ** * * * *
12281 ATGGTCTTCGGGTAGGATGTTTTCAAAAGAGTTTTTAGAAAGTAAGCCTGGTTTTTAGGGGTTTC
194 AAGACCTTCGAGTAGGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGGTTTTCAGGGGTTTC
* *
12346 TTGATGATTATCTCGAAAGAATATTTAAAGAAAGT-TAAGCCTAATTTTTAGGTGTTCCTTGATG
259 TTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGAAA-TCTAAGCCTAATTTTTAGGTGTTCCTTGATG
* * *
12410 ACAACTAAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTTGATTTTCAAGAGTTTATTGATGAGTAAGC
323 AGAACTAAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTTGATTTACAAGAGTTTATTGATGAGTAAGT
* * * * *
12475 TCTTTAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATACATAAATCCTTCGGTTCCTCCATAATTCTT
388 TCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATACTTAAATCCTTCGG-TCATCTATAAGTCTT
* * * * * *
12540 TTGAG-AATGATGGTAAGTCCTTCGGACCATTCATAAGACCTTCCGAAAAGATGTTTTTAAATGC
452 TCGAGCAA-GATGGTAAGTCCTTCGGACCATCCATAAGACCTTCGGGAAAGATGTTTTCAAATGA
* * * * * * *
12604 GTTTTTAGGAAGTAAGTCTGGTTTTCAGGGGTTTCATGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAG
516 ATTTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAAGGGTTTCTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAG
12669 GAAG
581 GAAG
* * * **
12673 TTAAGCCTAATTTTTAGGGGATCCTTGATGACAACTGAAAACGAAAGATTATAAGAAACTAAAAT
1 TTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTGAAAATGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCT
* *
12738 TAATTTTGAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCGGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATG
66 TAATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCGAGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATG
*
12803 CTTAAATCCTTCGAGTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTACTTTGGGCCATACATA
131 CTTAAATCCTT-GAGTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTACTTTGGGCCATCCATA
* * * *
12868 AGACCTTCGAGTATGATATTTTCAAATGAGTTTTTA-AAACTAAGTCTGATTTTCAGGGGTTTCT
195 AGACCTTCGAGTAGGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGGTTTTCAGGGGTTTCT
* *
12932 TGAGGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAATCTAAGCCTAATTTTTAGG-GTTCCTTGATGAG
260 TGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGAAATCTAAGCCTAATTTTTAGGTGTTCCTTGATGAG
* * * * * * * *
12996 AACTTAAAACGAAAGATTTTAAGACACTAAGCTTGATTTACAAGGGTATCTTGTTGAGTAAGTCC
325 AACTAAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTTGATTTACAAGAGTTTATTGATGAGTAAGTTC
* * * ** *
13061 TTTAGGCCATTAGTAAGTCTTTCGAGGATGATGTTTAAATCCATTAGGTCATCTATAAGTCTTTC
390 TTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATACTTAAATCC-TTCGGTCATCTATAAGTCTTTC
* ** * * ** *
13126 GAGTAAGATAATAAGTCATTCGGGCCATCCATAACTCCTTCGGGTAAGATGTTTTCAAATGAATT
454 GAGCAAGATGGTAAGTCCTTCGGACCATCCATAAGACCTTCGGGAAAGATGTTTTCAAATGAATT
* * * *
13191 TTTAAAAACTAAGCCTAATTTTCAAGGGTTTCTTGATGATTATCTGCAAAGAATTTTTAAATGAA
519 TTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAAGGGTTTCTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAA
13256 G
584 G
* * * *
13257 CTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAATTGAAAATGAACGATTTTAAGACACTAAGCT
1 TTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTGAAAATGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCT
** * * * *
13322 TGTTTTTCAAGTGTTTCTTGATGGGTAAGTCCTTCAAGCCATCAATAAGTCTTTCGAGCATGATG
66 TAATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCGAGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATG
* * * * *
13387 CTTAAATCCTTGGGTTCAACTATAAGTCTTTCGAACAAGATGGTAAGT-CCTTGGGACCATCCAT
131 CTTAAATCCTTGAG-TCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTACTTTGGG-CCATCCAT
* * * * * *
13451 AAGGCCTTCGAGCAGGATATTTTCAAAAGAGTTTTTAGAAATTAAGCCTGGTTTTTAGGGGTTTC
194 AAGACCTTCGAGTAGGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGGTTTTCAGGGGTTTC
* * *
13516 TTGATGATTATCTCAAAAGAATATTTAAAGAAAGCTAAGCCTAATTTTTAGGTGTTCCTTGATGA
259 TTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGAAATCTAAGCCTAATTTTTAGGTGTTCCTTGATGA
* * *
13581 AAACTAAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTTGATTTTCAAGAGTTTATTGATGAGTAAGCT
324 GAACTAAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTTGATTTACAAGAGTTTATTGATGAGTAAGTT
* * * * *
13646 CTTTAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATACATAAATCCTTCGGTTCCTCCATAATTCTTT
389 CTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATACTTAAATCCTTCGG-TCATCTATAAGTCTTT
* * * * * **
13711 TGAG-AATGATGGTAAGTCCTTCGGACCATTCATAAGACCTTCCGAAAAGATGTTTTTAAATGCG
453 CGAGCAA-GATGGTAAGTCCTTCGGACCATCCATAAGACCTTCGGGAAAGATGTTTTCAAATGAA
* * * * * *
13775 TTTTTAGGAAGTAAGTCTGGTTTTCAGGGGTTTCATGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGG
517 TTTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAAGGGTTTCTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGG
13840 AAG
582 AAG
* * * **
13843 TTAAGCCTAATTTTTAGGGGATCCTTGATGACAACTGAAAAAGAAAGATTATAAGAAACTAAAAT
1 TTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTGAAAATGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCT
* *
13908 TAATTTTGAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCGTGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATG
66 TAATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCGAGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATG
*
13973 CTTAAATCCTTCGAGTCATCTATAACTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTACTTTGGGCCATCCATA
131 CTTAAATCCTT-GAGTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTACTTTGGGCCATCCATA
* *
14038 AGACCTTCGAGTAGGATGTTTTCAAATGAGTTTTTA-AAACTAAGTCTGATTTTCAGGGGTTTCT
195 AGACCTTCGAGTAGGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGGTTTTCAGGGGTTTCT
* *
14102 TGAGGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAATCTAAGCCTAATTTTTAGG-GTTCCTTGATGAG
260 TGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGAAATCTAAGCCTAATTTTTAGGTGTTCCTTGATGAG
* * * * * *
14166 AACTTAAAACGAAAGATTTTAAGACAA-TAAGCTTGATTTACAAGGGTATCTTGATGAGTAAGTC
325 AACTAAAAAAGAAAGATTTTAAGA-AACTAAGCTTGATTTACAAGAGTTTATTGATGAGTAAGTT
* * * *
14230 CTTCAGGCCATTAGTAAGTCTTTCGAGGATGATGCTTAAATCCATTAGGTCATCTATAAGTCTTT
389 CTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATACTTAAATCC-TTCGGTCATCTATAAGTCTTT
* ** * * ** ** *
14295 CAAGCAAGATAATAAGTCATTCGGGCCATCCATAACTCCTTCATGTAAGATGTTTTCAAATGAAT
453 CGAGCAAGATGGTAAGTCCTTCGGACCATCCATAAGACCTTCGGGAAAGATGTTTTCAAATGAAT
* * * * *
14360 TTTTAAAAACTAAGCCTAATTTTCAGGGGTTTCTTGATGATTATCTGCAAAGAATTTTCAAAGGA
518 TTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAAGGGTTTCTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGA
14425 AG
583 AG
* * * *
14427 CTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAATTGAAAATGAACGATTTTAAGACACTAAGCT
1 TTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTGAAAATGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCT
* * * * * ** *
14492 TGATTTTCAAGTGTTTCTTAAAGGGTAAGTCCTTTAAGCCATCAATAAGTCTTTCGAGCATGATG
66 TAATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCGAGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATG
* * * * *
14557 CTTAAATCCTTGGGTTCAACTATAAGTCTTTCGAACAAGATGGTAAGT-CCTTGGGACCATCCAT
131 CTTAAATCCTTGAG-TCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTACTTTGGG-CCATCCAT
* * * * * *
14621 AAGTCATTCGAGCATGATGTTTTCAAATGATTTTTTAGAAACTAAGCCTGGTTTTTAGGGGTTTC
194 AAGACCTTCGAGTAGGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGGTTTTCAGGGGTTTC
* * * * *
14686 TTGATGATAATCTCGAAAGAATATTTAACGAAAACTAAGCCTAATTTTTAGGTGTTCCTTGATGA
259 TTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGAAATCTAAGCCTAATTTTTAGGTGTTCCTTGATGA
*
14751 CAACTAAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTTGATTTTA-AAGAGTTTATTGATGAGTAAGT
324 GAACTAAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTTGA-TTTACAAGAGTTTATTGATGAGTAAGT
* * * *
14815 TCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATACTTAAATCCTTCGATTCCTCCATAATTCTT
388 TCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATACTTAAATCCTTCG-GTCATCTATAAGTCTT
* * ** * **
14880 TTGAGAAAGATGGTAAGTCCTTCGGACCATCCATAAGACCTTTAGGAAAGATGTTTTTAAATGCG
452 TCGAGCAAGATGGTAAGTCCTTCGGACCATCCATAAGACCTTCGGGAAAGATGTTTTCAAATGAA
* * * * * *
14945 TTTTTAGGAAGTAAGTCTGGTTTTCAGGGGTTTCTTGATGATTATCTCGAAAGAATTTTTAAAGG
517 TTTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAAGGGTTTCTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGG
15010 AAG
582 AAG
* * **
15013 TTAAGCCTAATTTTTAGGGGATCCTTGATGACAACTGAAAA-GAAAGATTATAAGAAACTAAAAT
1 TTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTGAAAATGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCT
* * * *
15077 TTATTTTGAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCGGGCCATCAGTAAGTCTTTCGATCATGATG
66 TAATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCGAGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATG
15142 CTTAAATCCTTCGAGTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTACTTTGGGCCATCCATA
131 CTTAAATCCTT-GAGTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTACTTTGGGCCATCCATA
* *
15207 AGACCTTCGAGTAGGATGTTTTCAAATGAGTTTTTA-AAACTAAGTCTGATTTTCAGGGGTTTCT
195 AGACCTTCGAGTAGGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGGTTTTCAGGGGTTTCT
* * * *
15271 TGATGATTATCTCCAAAGATTTTTTAAAGGAATCTATGCCTAATATTTAGG-GTTCCTTGATGAG
260 TGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGAAATCTAAGCCTAATTTTTAGGTGTTCCTTGATGAG
* * * * * * * *
15335 AACTTAAAACGAAAGATTTTAAGACACTAAGCTTGATTTACAAGGGTATCTTGTTGAGTAAGTCC
325 AACTAAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTTGATTTACAAGAGTTTATTGATGAGTAAGTTC
* * * * *
15400 TTCAGTCCATTAGTAAGTCTTTCGAGGATGATGCTTAAATCCATTAGGTCATCTATAAGTCTTTC
390 TTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATACTTAAATCC-TTCGGTCATCTATAAGTCTTTC
** * * ** * * *
15465 GAGCAAGATAATAAGTCATTCGGGCCATCCATAACTCCATCGGGTAAGATTTTTTCAAATGAATT
454 GAGCAAGATGGTAAGTCCTTCGGACCATCCATAAGACCTTCGGGAAAGATGTTTTCAAATGAATT
* * * * ***
15530 TTTAAAAACTAAGCCTAATTTTC-AGAAGTTTCTTGATGATTATCTGCAAA-AAAAATTAAAGGA
519 TTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAAG-GGTTTCTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGA
15593 AG
583 AG
* * * * *
15595 CTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGAAAATTGAAAATGAACGATTTTAAGACACTAAGCT
1 TTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTGAAAATGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCT
* * * * * * *
15660 TGATTTTCAAGTGTTTCTTGAAGGGTAAGTCCTTCAAGCCTTCAATAAGTCTTTCGAGCATGATG
66 TAATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCGAGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATG
* * * * *
15725 CTTAAATCCTTGGGTTCAACTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGGTAAGAAC-TTGAGACCATCCAT
131 CTTAAATCCTTGAG-TCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTACTTTG-GGCCATCCAT
* * * * *
15789 AAGGCCTTCGGGCAGGATGTTTTCAAAAGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGGTTTTTAGGGGTTTC
194 AAGACCTTCGAGTAGGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGGTTTTCAGGGGTTTC
* * * * *
15854 TTGATGATTATCTCGAAAGAATATTTAAAGAAAGCTAAGGCAAATTTTTAGGTGTTCCTTGATGA
259 TTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGAAATCTAAGCCTAATTTTTAGGTGTTCCTTGATGA
* *
15919 CAACTAAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTTGATTTTCAAGAGTTTATTGATGAGTAAGTT
324 GAACTAAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTTGATTTACAAGAGTTTATTGATGAGTAAGTT
* * * * * * *
15984 CTTTAGGACATCAGTACGTCTTTCGAGCATGATACTTAAATCCTTCGGTTCCTCCATAATTATTT
389 CTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATACTTAAATCCTTCGG-TCATCTATAAGTCTTT
* * * * * * * **
16049 TGAGAAAAATGGTAAGCCCTTCTGACCATCCATAAGACCTTCAGGAAAGATGTTTTTAAATGCGT
453 CGAGCAAGATGGTAAGTCCTTCGGACCATCCATAAGACCTTCGGGAAAGATGTTTTCAAATGAAT
* * *
16114 TTTTAGGAAGTAAGCCTGGTTTTCAAGGGTTTCTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGA
518 TTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAAGGGTTTCTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGA
16179 AG
583 AG
* * * **
16181 TTAAGCCTAATTTTTAGGGGATCCTTGATGACAACTGAAAAAGAAAGATTATAAGAAACTAAAAT
1 TTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTGAAAATGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCT
* * *
16246 TAATTTTGAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCGGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCAAGATG
66 TAATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCGAGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATG
*
16311 CTTAAATCCTTCGAGTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATAATAAGTACTTTGGGCCATCCATA
131 CTTAAATCCTT-GAGTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTACTTTGGGCCATCCATA
* * **
16376 AGACCTTCGAGTAGGATGTTTTCAAATGAGTTTTTA-AAACTAAGTCTGATTTTCAGGTATTTCT
195 AGACCTTCGAGTAGGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGGTTTTCAGGGGTTTCT
16440 TGATGATTATCTCCAAA-ACATTTTTAAATGAAGA--TAAGCCTAATTTTTAGG-GTTCCTTGAT
260 TGATGATTATCTCCAAAGA-ATTTTTAAA-GAA-ATCTAAGCCTAATTTTTAGGTGTTCCTTGAT
* * * * * * * *
16501 GAGAACTTAAAACGAAAGATTTTAAGACACTAACCTAGATTTACAAGGGTATCTTGATGAGTAAG
322 GAGAACTAAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTTGATTTACAAGAGTTTATTGATGAGTAAG
* * * * * *
16566 TCCTTCAGGCCATTAGTAAGTCTTTCGAGGATGATGCTTAAATCCATTAGGTAATCTATAAGTCT
387 TTCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATACTTAAATCC-TTCGGTCATCTATAAGTCT
** * * ** *
16631 TTCGAGCAAGATAATAAGTCATTCGGGCCATCCATAACTCCTTCGGGTAAGATGTTTTCAAATGA
451 TTCGAGCAAGATGGTAAGTCCTTCGGACCATCCATAAGACCTTCGGGAAAGATGTTTTCAAATGA
* * * * * * * *
16696 ATTTTTAAAAACTAGGCCTAATTTTTATGGGTTTCTTAATGATTATCTGCAAAGAATTTTCAAAG
516 ATTTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAAGGGTTTCTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAG
16761 GAAG
581 GAAG
* * * * *
16765 CTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGAAAACCGAAAATGAACGATTTTAAGACACTAAGCT
1 TTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTGAAAATGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCT
* * * * * *
16830 TGATTTTCAAGTGTTTCTTGAAG-GTTAAGTCCTTCAAGCCATAAATAAGTCTTTCGAGCATGAT
66 TAATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAG-TAAGTCCTTCGAGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGAT
* * * *
16894 GCTTAAATCCTTGGGTTCAACTATAAGTCTTTCGAACAAGAT-AGTAAGT-CCTTGGGACCATCC
130 GCTTAAATCCTTGAG-TCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGA-TAAGTACTTTGGG-CCATCC
* * * * * *
16957 ATAAGGCCTTCGGGCATGATGTTTTCAAAAGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGGTTTTTAGGGGTT
192 ATAAGACCTTCGAGTAGGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGGTTTTCAGGGGTT
*
17022 TCTTGATGATTATCT-CGAA-AA--TTTAAAGAAAGT-TAAGCCTAATTTTTAGGTGTTCCTTGA
257 TCTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGAAA-TCTAAGCCTAATTTTTAGGTGTTCCTTGA
* *
17082 TGACAACTAAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTTGATTTTCAAGAGTTTATTGATGAGTAA
321 TGAGAACTAAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTTGATTTACAAGAGTTTATTGATGAGTAA
* * * *
17147 GTTCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATACTTAAATCCTTCGGTTCCTCCATAATTA
386 GTTCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATACTTAAATCCTTCGG-TCATCTATAAGTC
* * * * * * *
17212 TTTTGAGAAAAATGGTAAGCCCTTCTGACCATCCATAAGACCTTCAGGAAAGATGTTTTTAAATG
450 TTTCGAGCAAGATGGTAAGTCCTTCGGACCATCCATAAGACCTTCGGGAAAGATGTTTTCAAATG
** * * *
17277 CGTTTTTAGGAAGTAAGCCTGGTTTTCAAGGGTTTCTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAA
515 AATTTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAAGGGTTTCTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAA
17342 GGAAG
580 GGAAG
* * * **
17347 TTAAGCCTAATTTTTAGGGGATCCTTGATGACAACTGAAAAAGAAAGATTATAAGAAACTAAAAT
1 TTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTGAAAATGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCT
* * *
17412 TAATTTTGAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCGGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCAAGATG
66 TAATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCGAGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATG
*
17477 CTTAAATCCTTCGAGTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATAATAAGTACTTTGGGCCATCCATA
131 CTTAAATCCTT-GAGTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTACTTTGGGCCATCCATA
* * **
17542 AGACCTTCGAGTAGGATGTTTTCAAATGAGTTTTTA-AAACTAAGTCTGATTTTCAGGTATTTCT
195 AGACCTTCGAGTAGGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGGTTTTCAGGGGTTTCT
17606 TGATGATTATCTCCAAA-ACATTTTTAAATGAAGA--TAAGCCTAATTTTTAGG-GTTCCTTGAT
260 TGATGATTATCTCCAAAGA-ATTTTTAAA-GAA-ATCTAAGCCTAATTTTTAGGTGTTCCTTGAT
* * * * * * * *
17667 GAGAACTTAAAACGAAAGATTTTAAGACACTAACCTAGATTTACAAGGGTATCTTGATGAGTAAG
322 GAGAACTAAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTTGATTTACAAGAGTTTATTGATGAGTAAG
* * * * * * *
17732 TCCTTCAGTCCATTAGTAAGTCTTTCGAGGATGATGCTTAAATCCATTAGGTAATCTATAAGTCT
387 TTCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATACTTAAATCC-TTCGGTCATCTATAAGTCT
** * * ** *
17797 TTCGAGCAAGATAATAAGTCATTCGGGCCATCCATAACTCCTTCGGGTAAGATGTTTTCAAATGA
451 TTCGAGCAAGATGGTAAGTCCTTCGGACCATCCATAAGACCTTCGGGAAAGATGTTTTCAAATGA
* * * * * * * *
17862 ATTTTTAAAAACTAGGCCTAATTTTTATGGGTTTCTTAATGATTATCTGCAAAGAATTTTCAAAG
516 ATTTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAAGGGTTTCTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAG
17927 GAAG
581 GAAG
* * * * *
17931 CTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGAAAACTGAAAATGAACGCTTTTAAGACACTAAGCT
1 TTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTGAAAATGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCT
* * * * * *
17996 TGATTTTCAAGTGTTTCTTGAAG-GTTAAGTCCTTCAAGCCATAAATAAGTCTTTCGAGCATGAT
66 TAATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAG-TAAGTCCTTCGAGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGAT
* * * *
18060 GCTTAAATCCTTGGGTTCAACTATAAGTCTTTCGAACAAGAT-AGTAAGT-CCTTGGGACCATCC
130 GCTTAAATCCTTGAG-TCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGA-TAAGTACTTTGGG-CCATCC
* * * * *
18123 ATAAGGCCTTCGGGCAGGATGTTTTCAAAAGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGGTTTTTAGGGGTT
192 ATAAGACCTTCGAGTAGGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGGTTTTCAGGGGTT
*
18188 TCTTGATGATTATCT-CGAA-AA--TTTAAAGAAAGT-TAAGCCTAATTTTTAGGTGTTCCTTGA
257 TCTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGAAA-TCTAAGCCTAATTTTTAGGTGTTCCTTGA
* *
18248 TGACAACTAAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTTGATTTTCAAGAGTTTATTGATGAGTAA
321 TGAGAACTAAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTTGATTTACAAGAGTTTATTGATGAGTAA
* * * *
18313 GTTCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATACTTAAATCTTTCGGTTCCTCCATAATTC
386 GTTCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATACTTAAATCCTTCGG-TCATCTATAAGTC
* * * * *
18378 TTTTGAGAAAGATGGTAAGTCCTTCGGACCATCCACAAGACCTTCAGGAAAGATGTTTTTAAATG
450 TTTCGAGCAAGATGGTAAGTCCTTCGGACCATCCATAAGACCTTCGGGAAAGATGTTTTCAAATG
** * * * * * *
18443 CGTTTTTAGGAAGTAAGCCTGGTTTTTAGGGGTTTCTTGATGATTATCTCCAAAGAATATTTAAA
515 AATTTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAAGGGTTTCTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAA
*
18508 GGAAA
580 GGAAG
* * **
18513 TTAAGCCTAATTTTTAGGGGATT-CTTGATGACAACTGAAAACGAAAGATTATAAGAAACTAAAA
1 TTAAGCCTAATTTTTAGGGG-TTCCTTGATGACAACTGAAAATGAAAGATTTTAAGAAACTAAGC
* *
18577 TTAATTTTGAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCGGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGAT
65 TTAATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCGAGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGAT
* * * * * ** ** *
18642 GCTTAAATCCTTCATGACATCTATAAGTCTTTCGAGAAAAATGGTAAGCCCTTT-GGAAAACCGA
130 GCTTAAATCCTTGA-GTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTACTTTGGGCCATCC-A
* * * * * *
18706 TAAGACCTTTGGGTAAGATGTTTTCAAAT-ATGTTTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAAGAGTT
193 TAAGACCTTCGAGTAGGATGTTTTCAAATGA-GTTTTTAGAAACTAAGCCTGGTTTTCAGGGGTT
* * *
18770 TCTTGAAT-ATTATCTTCTATGAATTTTTAAATGAAGA--TAAGCCTAATTTTTAGG-GATTCCT
257 TCTTG-ATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAA-GAA-ATCTAAGCCTAATTTTTAGGTG-TTCCT
* * * * * * * * *
18831 TGATGAGAATTGAAAATGAAAGATATTAAGAAACTAAGCTTGATTTTCAAGGGTTTCTTGCTGAA
318 TGATGAGAACTAAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTTGATTTACAAGAGTTTATTGATGAG
* * * * *
18896 AAAGTCCTTC-GAGACATCAGTAAGTCTTTCGAGCAGGATGCTTAAATCCTTCGGGTCATCTATA
383 TAAGTTCTTCAG-GCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATACTTAAATCCTTC-GGTCATCTATA
* * * * * * *
18960 AGTCATTCGAGCAAGGTGGTCAGTCCTTCAGACCATCCATAAGACCTTTGGGCATGATG-TTTCA
446 AGTCTTTCGAGCAAGATGGTAAGTCCTTCGGACCATCCATAAGACCTTCGGGAAAGATGTTTTCA
* *
19024 AATGAGTTTTTAGAAACTAAGTCTGATTTTCAAGGGTTTCTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTT
511 AATGAATTTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAAGGGTTTCTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTT
***
19089 TAATCAAAG
576 TAAAGGAAG
** * *
19098 TTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTGAAAAAAAAATATTTTAAGAAACTACGCT
1 TTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTGAAAATGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCT
* * * *
19163 TAATTTTCAAGGGTTTCTTGATGAGTAAGTCTTTCGGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCAAGATG
66 TAATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCGAGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATG
* ** * * * * * *
19228 TTTAAATTTTTTGGGTCATTTATAAGTCTTTCGTGCAAGATGATAAATCCTTTGAGCCATCCATA
131 CTTAAA-TCCTTGAGTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTACTTTGGGCCATCCATA
*
19293 AAACCTTCG
195 AGACCTTCG
19302 GGATGGGTGT
Statistics
Matches: 10522, Mismatches: 1785, Indels: 333
0.83 0.14 0.03
Matches are distributed among these distances:
579 2 0.00
580 6 0.00
581 93 0.01
582 996 0.09
583 1406 0.13
584 3463 0.33
585 2343 0.22
586 2155 0.20
587 57 0.01
588 1 0.00
ACGTcount: A:0.32, C:0.15, G:0.19, T:0.34
Consensus pattern (584 bp):
TTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTGAAAATGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCT
TAATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCGAGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATG
CTTAAATCCTTGAGTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTACTTTGGGCCATCCATAA
GACCTTCGAGTAGGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGGTTTTCAGGGGTTTCTT
GATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGAAATCTAAGCCTAATTTTTAGGTGTTCCTTGATGAGA
ACTAAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTTGATTTACAAGAGTTTATTGATGAGTAAGTTCT
TCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATACTTAAATCCTTCGGTCATCTATAAGTCTTTCGA
GCAAGATGGTAAGTCCTTCGGACCATCCATAAGACCTTCGGGAAAGATGTTTTCAAATGAATTTT
TAGAAACTAAGCCTGATTTTCAAGGGTTTCTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAAG
Found at i:7475 original size:292 final size:292
Alignment explanation
Indices: 6244--22474 Score: 16971
Period size: 293 Copynumber: 55.3 Consensus size: 292
6234 TTTTAGAAAT
** * * * * *
6244 TAAGCCTGGTTTTTAGGGGTTTCTTGATGACAACTGAAAATGAACGATTTTAAGACACTAAGCTT
1 TAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAATTGAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTT
* * * * *
6309 GATTTTCAAGTGTTTCTTGAAGGGTAAGTCCTTCAAGCCATCAATAAGTCTTTCGAGCATGATGC
66 GATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATGC
* * * *
6374 TTAAATCCTTGGGTTCAACTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGGTATGTCCTT-GGGACCATCCATA
131 TTAAATCCTTCGG-TCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTCCTTCGGG-CCATCCATA
** * * * * *
6438 AGGTCTTCGGGCAGGATGTTTTCAAAAGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGGTTTTTAGGGGTTTCT
194 AGACCTTCGGGTAAGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAGGGGTTTCT
* * * * *
6503 TGATAATTATCTCGAAAGAATATTTAAAGAAAGT
259 TGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAAGC
* * * *
6537 TAAGCCTAATTTTTAGGTGTTCCTTGATGACAACTAAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTATGCTT
1 TAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAATTGAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTT
* * * * *
6602 GATTTTCAAGAGTTTATTGATGAGTAAGTTCTTCAAGCCATCAGTAAGTCGTTCGAGCATGATAC
66 GATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATGC
* * * * * * *
6667 TTAAATCCTTCGGTTCCTCTATAATTCTTTTGAGAAAAATGGTAAGTCCTTCGGACCATCCATAA
131 TTAAATCCTTCGG-TCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTCCTTCGGGCCATCCATAA
* * * * * * * *
6732 GACCTTCAGGAAAGATGTTTTTAAATGCGTTTTTAGGAAGTAAGCCTGGTTTTCAAGGGTTTCTT
195 GACCTTCGGGTAAGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAGGGGTTTCTT
* *
6797 GATAATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAAGT
260 GATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAAGC
* * * **
6830 TAAGCCTAATTTTTAGGGGATCCTTGATGACAACTGAAAACA-AAAGATTATAAGAAACTAAAAT
1 TAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAATTGAAAA-AGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCT
* * * *
6894 TAATTTTGAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCGGGCCATCAGTAAATCTTTCGAGCATGATG
65 TGATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATG
* * *
6959 CTTAAATCCTTCGAGTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTACTTTGGGCCATACATA
130 CTTAAATCCTTCG-GTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTCCTTCGGGCCATCCATA
* * * * *
7024 AGACCTTCGAGTATGATATTTTCAAATGAGTTTTTA-AAACTAAGTCTGCTTTTCAGGGGTTTCT
194 AGACCTTCGGGTAAGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAGGGGTTTCT
*
7088 TGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAATC
259 TGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAAGC
* * *
7122 TAAGCCTAATTTTTA-GGGTTCCTTGATGAGAACTT-AAAACGAAAGATTTTAAGACACTAAGCT
1 TAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAA-TTGAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCT
* * * * * * * *
7185 TGATTTACAAGGGTATCTTGTTGAGTAAGTCATGT-AGGCCATTAGTATGTCTTTCGAGGATGAT
65 TGATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCT-TCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGAT
* * * *
7249 GTTTAAATCCATTAGGTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATAATAAGTCATTCGGGCCATCCAT
129 GCTTAAATCC-TTCGGTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTCCTTCGGGCCATCCAT
** * * * * *
7314 AACTCCTACGGGTAAGATGTTTTCAAATGAATTTTTAAAAACTAAGCCTAATTTTCAAGGGTTTC
193 AAGACCTTCGGGTAAGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAGGGGTTTC
* *
7379 TTGATGATTATCTGCAAAGAATTTTTAAATGAAGC
258 TTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAAGC
* * *
7414 TAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAATTG-AAATGAACGATTTTAAGACACTAAGCTT
1 TAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAATTGAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTT
* * * * * *
7478 GTTTTTCAAGTGTTTCTTGAAGGGTAAGTCCTTCAAGCCATCAATAAGTCTTTCGAGCATGATGC
66 GATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATGC
* * * *
7543 TTAAATCCTTGGGTTCAACTATAAGTCTTTCGAACAAGATGGTAAGTCCTT-GGGACCATCCATA
131 TTAAATCCTTCGG-TCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTCCTTCGGG-CCATCCATA
* * * * * * * *
7607 AGGCCTTCGAGCAGGATATTTTCAAAAGAGTTTTTAGAAATTAAGCCTGGTTTT-AGGGGTTTCT
194 AGACCTTCGGGTAAGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAGGGGTTTCT
* * *
7671 TGATGATTATCTCAAAAGAATATTTAAAGAAAGC
259 TGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAAGC
* * * *
7705 TAAGCCTAATTTTTAGGTGTTCCTTGATGAAAACTAAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTT
1 TAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAATTGAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTT
* *
7770 GATTTTCAAGAGTTTATTGATGAGTAAG-CTCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATA
66 GATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTC-CTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATG
* * * * * * * *
7834 CATAAATCCTTCGGTTCCTCCATAATTCTTTTGAG-AATGATGGTAAGTCCTTCGGACCATTCAT
130 CTTAAATCCTTCGG-TCATCTATAAGTCTTTCGAGCAA-GATGATAAGTCCTTCGGGCCATCCAT
* * * * * * * *
7898 AAGACCTTCCGGAAAGATGTTTTTAAATGCGTTTTTAGGAAGTAAGTCTGGTTTTCAGGGGTTTC
193 AAGACCTTCGGGTAAGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAGGGGTTTC
* *
7963 ATGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAAGT
258 TTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAAGC
* * * **
7998 TAAGCCTAATTTTTAGGGGATCCTTGATGACAACTGAAAAAGAAAGATTATAAGAAACTAAAATT
1 TAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAATTGAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTT
* *
8063 AATTTTGAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTC-GTGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATG
66 GATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCAG-GCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATG
* * *
8127 CTTAAATCCTTCGAGTCATCTATAACTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTACTTTGGGCCATCCATA
130 CTTAAATCCTTCG-GTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTCCTTCGGGCCATCCATA
* * *
8192 AGACCTTCGAGTAGGATGTTTTCAAATGAGTTTTTA-AAACTAAGTCTGATTTTCAGGGGTTTCT
194 AGACCTTCGGGTAAGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAGGGGTTTCT
* *
8256 TGATGATTATATCCAAAGAATTTTTAAAGGAATC
259 TGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAAGC
* * *
8290 TAAGCCTAATTTTTA-AGGTTCCTTGATGAGAACTT-AAAATGAAAGATTTTAAGACAA-TAAGC
1 TAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAA-TTGAAAAAGAAAGATTTTAAGA-AACTAAGC
* * * * *
8352 TTGATTTACAAGGGTATCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCCATTAGTAAGTCTTTCGAGGATGAT
64 TTGATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGAT
* * * *
8417 GCTTAAATCCATTAGGTCATCTATAAGTCTTTCAAGCAAGATAATAAGTCATTCGGGCCATCCAT
129 GCTTAAATCC-TTCGGTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTCCTTCGGGCCATCCAT
** * * *
8482 AACTCCTTCGGGTAAGATGTTTTCAAATGAATTTTTAAAAACTAAGCCTAATTTTCAGGGGTTTC
193 AAGACCTTCGGGTAAGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAGGGGTTTC
* *
8547 TTGATGATTATCTGCAAAGAATTTTCAAA-GAAGC
258 TTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAAGC
* * *
8581 TAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAATTGAAAATGAACGATTTTAAGACACTAAGCTT
1 TAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAATTGAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTT
* * * * *
8646 GATTTTCAAGTGTTTCTTGAAGGGTAAGTCCTTCAAGCCATCAATAAGTCTTTCGAGCATGATGC
66 GATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATGC
* * * *
8711 TTAAATCCTTGGGTTCAACTATAAGTCTTTCGAACAAGATGGTAAGTCCTT-GGGACCATCCATA
131 TTAAATCCTTCGG-TCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTCCTTCGGG-CCATCCATA
* * * * * * *
8775 AGTCCTTCGAGCATGATGTTTTCAAATTAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGGTTTTTAGGGGTTTCT
194 AGACCTTCGGGTAAGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAGGGGTTTCT
* * * * *
8840 TGATGATAATCTCGAAAGAATATTTAAAGAAAAC
259 TGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAAGC
* * * *
8874 TAAGCCTAATTTTTAGGTGTTCCTTGATGATAACTAAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTT
1 TAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAATTGAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTT
* * * *
8939 GATTTTAAAGAGTTTATTGATGAGTAAGTTCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATAC
66 GATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATGC
* * * * * * * *
9004 TTAAATCCTTCGATTCCTCCATAATTCTTTTGAGAAAGATGGTAAGTCCTTCGGACCATCCATAA
131 TTAAATCCTTCG-GTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTCCTTCGGGCCATCCATAA
* * * * * * *
9069 GACCTTCAGGAAAGATGTTTTTAAAT-ACGTTTTTAGGAAGTAAGTCTGGTTTTCAGGGGTTTCT
195 GACCTTCGGGTAAGATGTTTTCAAATGA-GTTTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAGGGGTTTCT
* *
9133 TGATGATTATCTCGAAAGAATTTTTAAAGGAAGT
259 TGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAAGC
* * * **
9167 TAAGCCTAATTTTTAGGGGATCCTTGATGACAACTG-AAAAGAAAGATTATAAGAAACTAAAATT
1 TAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAATTGAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTT
* **
9231 AATTTTGTAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTC-GGCCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATG
66 GATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGG-CCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATG
* *
9295 CTTAAATCCTTCGAGTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTACTTTGGGCCATCCATA
130 CTTAAATCCTTCG-GTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTCCTTCGGGCCATCCATA
* * * *
9360 AGACCTTCGAGTAGGATGTTTTCAAATGAGTTTTTA-AAACTAAGTCTGATTTTCAAGGGTTTCT
194 AGACCTTCGGGTAAGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAGGGGTTTCT
*
9424 TGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAATC
259 TGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAAGC
* * * *
9458 TAAGCCTAATATTTA-GGGTTCCTTGATGAGAACTT-AAAACGAAAGATTTTAAGACACTAAGCT
1 TAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAA-TTGAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCT
* * * * * * *
9521 TGATTTACAAGGGTATCTTGTTGAGTAAGTCCTTCAGTCCATTAGTAAGTCTTTCGAGGATGATG
65 TGATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATG
* * * *
9586 CTTAAATCCATTAGGTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATAATAAGTCATTTGGGCCATCCATA
130 CTTAAATCC-TTCGGTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTCCTTCGGGCCATCCATA
** * * * * * **
9651 ACTCCATCGGGTAAGATTTTTTCAAATGAATTTTTAAAAACTAAGCCTAATTTTCAGAAGTTTCT
194 AGACCTTCGGGTAAGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAGGGGTTTCT
* ***
9716 TGATGATTATCTGCAAA-AAAAATTAAAGGAAGC
259 TGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAAGC
* * * *
9749 TAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGAAAATTGAAAATGAATGATTTTAAGACACTAAGCTT
1 TAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAATTGAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTT
* * * * * *
9814 GATTTTCAAGTGTTTCTTGAAGGGTAAGTCCTTCAAGCCTTCAATAAGTCTTTCGAGCATGATGC
66 GATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATGC
* * * *
9879 TTAAATCCTT-GTGTTCAACTATAAGTCTTTCGAGAAAGATGGTAAGACCTT-GGGACCATCCAT
131 TTAAATCCTTCG-G-TCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTCCTTCGGG-CCATCCAT
* * * * * *
9942 AAGGCCTTCGGGCAGGATGTTTTCAAAAGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGGTTTTTAGGGGTTTC
193 AAGACCTTCGGGTAAGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAGGGGTTTC
* * * *
10007 TTGATGATTATCTCGAAAGAATATTTAAAGAAAGT
258 TTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAAGC
* * * * *
10042 TAAGGCAAATTTTTAGGTGTTCCTTGATGACAACTAAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTT
1 TAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAATTGAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTT
* * *
10107 GATTTTCAAGAGTTTATTGATGAGTAAGTTCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATAC
66 GATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATGC
* * * * * * * * * * *
10172 TTAAATCCTTCGGTTCCTCCATAATTATTTTGAGAAAAATGGTAAGCCCTTCTGACCATCCATAA
131 TTAAATCCTTCGG-TCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTCCTTCGGGCCATCCATAA
* * * ** * * * *
10237 GACCTTCAGGAAAGATGTTTTTAAATGCTTTTTTAGGAAGTAAGCCTGGTTTTCAAGGGTTTCTT
195 GACCTTCGGGTAAGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAGGGGTTTCTT
*
10302 GATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAAGT
260 GATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAAGC
* * * **
10335 TAAGCCTAATTTTTAGGGGATCCTT-ATTGACAACTGAAAAAGAAAGATTATAAGAAACTAAAAT
1 TAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGA-TGACAATTGAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCT
* * *
10399 TAATTTTGAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCGGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATG
65 TGATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATG
* * * *
10464 CTTAAATCCTTCGAGTCATCTATAAGTCTTTCGAGTAAGATAATAAGTACTTTGGGCCATCCATA
130 CTTAAATCCTTCG-GTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTCCTTCGGGCCATCCATA
* * * **
10529 AGACCTTCGAGTAGGATGTTTTCAAATGAGTTTTTA-AAACTAAGTCTGATTTTCAGGTATTTCT
194 AGACCTTCGGGTAAGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAGGGGTTTCT
*
10593 TGATGATTATCTCCAAA-ACATTTTTAAAGGAATC
259 TGATGATTATCTCCAAAGA-ATTTTTAAAGGAAGC
* * * * * *
10627 TAAGCCTAATTTTTA-GGGTTCCTTGATAAGAACTT-AAAACGAAAGATTTTAAGACACTGACCT
1 TAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAA-TTGAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCT
* * * * * * * *
10690 AGATTTACAAGGGTATCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGTCCATTAGTAAGTCATTCGAGGATGATG
65 TGATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATG
* * * *
10755 CTTAAATCTATTAGGTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATAATAAGTCATTCGGGCCATCCATA
130 CTTAAATC-CTTCGGTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTCCTTCGGGCCATCCATA
** * * * * * **
10820 ACTCCATCGGGTAAGATTTTTTCAAATGAATTTTTAAAAACTAAGCCTAATTTTCAGAAGTTTCT
194 AGACCTTCGGGTAAGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAGGGGTTTCT
* ***
10885 TGATGATTATCTGCAAA-AAAAATTAAAGGAAGC
259 TGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAAGC
* * * *
10918 TAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGAAAATTGAAAATGAATGATTTTAAGACACTAAGCTT
1 TAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAATTGAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTT
* * * * * *
10983 GATTTTCAAGTGTTTCTTGAAGGGTAAGTCCTTCAAGCCTTCAATAAGTCTTTCGAGCATGATGC
66 GATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATGC
* * * *
11048 TTAAATCCTTGGGTTCAACTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGGTAAGACCTT-GGGACCATCCATA
131 TTAAATCCTTCGG-TCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTCCTTCGGG-CCATCCATA
* * * * * *
11112 AGGCCTTCGGGCAGGATGTTTTCAAAAGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGGTTTTTAGGGGTTTCT
194 AGACCTTCGGGTAAGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAGGGGTTTCT
* * *
11177 TGATGATTATCTCGAAAGAATATTTAAAGAAAGC
259 TGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAAGC
* * * * *
11211 TAAGGCAAATTTTTAGGTGTTCCTTGATGACAACTAAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTT
1 TAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAATTGAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTT
* * *
11276 GATTTTCAAGAGTTTATTGATGAGTAAGTTCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATAC
66 GATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATGC
* * * * * * * * * * *
11341 TTAAATCCTTCGGTTCCTCCATAATTATTTTGAGAAAAATGGTAAGCCCTTCTGACCATCCATAA
131 TTAAATCCTTCGG-TCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTCCTTCGGGCCATCCATAA
* * * ** * * * *
11406 GACCTTCAGGAAAGATGTTTTTAAATGCTTTTTTAGGAAGTAAGCCTGGTTTTCAAGGGTTTCTT
195 GACCTTCGGGTAAGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAGGGGTTTCTT
*
11471 GATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAAGT
260 GATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAAGC
* * * * **
11504 TAAGCCTAATTTTTAGGGGATCATTGATGACAACTGAAAAAGAAAGATTATAAGAAACTAAAATT
1 TAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAATTGAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTT
* * *
11569 AATTTTGAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCGGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATGC
66 GATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATGC
* * * *
11634 TTAAATCCTTCTAGTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATAATAAGTACTTTGGGCCATCCATAA
131 TTAAATCCTTC-GGTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTCCTTCGGGCCATCCATAA
* * * **
11699 GACCTTCGAGTAGGATGTTTTCAAATGAGTTTTTA-AAACTAAGTCTGATTTTCAGGTATTTCTT
195 GACCTTCGGGTAAGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAGGGGTTTCTT
*
11763 GATGATTATCTCCAAA-ACATTTTTAAAGGAATC
260 GATGATTATCTCCAAAGA-ATTTTTAAAGGAAGC
* * ** * * *
11796 TAAGCCTAATTTTTA-GGGTTCCTTGATAAGAACTT-AAATCGAAAGATTTTAAGACACTGACCT
1 TAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAA-TTGAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCT
* * * * * *
11859 AGATTTACAAGGGTATCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCCATTAGTAAGTCTTTCGAGGATGATG
65 TGATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATG
* * *
11924 CTTAAATCCATTAGGTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATAATAAGTCATTCGGGCCATCCATA
130 CTTAAATCC-TTCGGTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTCCTTCGGGCCATCCATA
** * * * * *
11989 ACTCCTTCGGGTAAGTTGTTTTCAAATGAATTTTTAAAAACTAGGCCTAATTTTCAGGGGTTTCT
194 AGACCTTCGGGTAAGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAGGGGTTTCT
* *
12054 TGATGATTATCTGCAAAGAATTTTCAAAGGAAGC
259 TGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAAGC
* * * * * *
12088 TAAGCCTAATTTTTAGTGGTTCCTTGATGAAAACTGAAAATGAACGATTTTAAGACACTAAGCTT
1 TAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAATTGAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTT
* * * * *
12153 GATTTTCAAGTGTTTCTTGAAGGGTAAGTCCTTCAAGCCATCAATAAGTCTTTCGAGCATGATGC
66 GATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATGC
* * * *
12218 TTAAATCCTTGGGTTCAACAATAAGTCTTTCGAGCAAGATGGTAAGTCCTT-GGGACCATCCATA
131 TTAAATCCTTCGG-TCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTCCTTCGGG-CCATCCATA
* ** * * * * *
12282 TGGTCTTCGGGTAGGATGTTTTCAAAAGAGTTTTTAGAAAGTAAGCCTGGTTTTTAGGGGTTTCT
194 AGACCTTCGGGTAAGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAGGGGTTTCT
* * * *
12347 TGATGATTATCTCGAAAGAATATTTAAAGAAAGT
259 TGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAAGC
* * *
12381 TAAGCCTAATTTTTAGGTGTTCCTTGATGACAACTAAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTT
1 TAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAATTGAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTT
* * *
12446 GATTTTCAAGAGTTTATTGATGAGTAAG-CTCTTTAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATA
66 GATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTC-CTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATG
* * * * * * * *
12510 CATAAATCCTTCGGTTCCTCCATAATTCTTTTGAG-AATGATGGTAAGTCCTTCGGACCATTCAT
130 CTTAAATCCTTCGG-TCATCTATAAGTCTTTCGAGCAA-GATGATAAGTCCTTCGGGCCATCCAT
* ** * * * * * *
12574 AAGACCTTCCGAAAAGATGTTTTTAAATGCGTTTTTAGGAAGTAAGTCTGGTTTTCAGGGGTTTC
193 AAGACCTTCGGGTAAGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAGGGGTTTC
* *
12639 ATGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAAGT
258 TTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAAGC
* * * * **
12674 TAAGCCTAATTTTTAGGGGATCCTTGATGACAACTGAAAACGAAAGATTATAAGAAACTAAAATT
1 TAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAATTGAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTT
* * *
12739 AATTTTGAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCGGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATGC
66 GATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATGC
* * *
12804 TTAAATCCTTCGAGTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTACTTTGGGCCATACATAA
131 TTAAATCCTTCG-GTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTCCTTCGGGCCATCCATAA
* * * *
12869 GACCTTCGAGTATGATATTTTCAAATGAGTTTTTA-AAACTAAGTCTGATTTTCAGGGGTTTCTT
195 GACCTTCGGGTAAGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAGGGGTTTCTT
* *
12933 GAGGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAATC
260 GATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAAGC
* * *
12966 TAAGCCTAATTTTTA-GGGTTCCTTGATGAGAACTT-AAAACGAAAGATTTTAAGACACTAAGCT
1 TAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAA-TTGAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCT
* * * * * * *
13029 TGATTTACAAGGGTATCTTGTTGAGTAAGTCCTTTAGGCCATTAGTAAGTCTTTCGAGGATGATG
65 TGATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATG
* * * * *
13094 TTTAAATCCATTAGGTCATCTATAAGTCTTTCGAGTAAGATAATAAGTCATTCGGGCCATCCATA
130 CTTAAATCC-TTCGGTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTCCTTCGGGCCATCCATA
** * * * *
13159 ACTCCTTCGGGTAAGATGTTTTCAAATGAATTTTTAAAAACTAAGCCTAATTTTCAAGGGTTTCT
194 AGACCTTCGGGTAAGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAGGGGTTTCT
* *
13224 TGATGATTATCTGCAAAGAATTTTTAAATGAAGC
259 TGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAAGC
* * *
13258 TAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAATTGAAAATGAACGATTTTAAGACACTAAGCTT
1 TAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAATTGAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTT
* * * * *
13323 GTTTTTCAAGTGTTTCTTGATGGGTAAGTCCTTCAAGCCATCAATAAGTCTTTCGAGCATGATGC
66 GATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATGC
* * * *
13388 TTAAATCCTTGGGTTCAACTATAAGTCTTTCGAACAAGATGGTAAGTCCTT-GGGACCATCCATA
131 TTAAATCCTTCGG-TCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTCCTTCGGG-CCATCCATA
* * * * * * * * *
13452 AGGCCTTCGAGCAGGATATTTTCAAAAGAGTTTTTAGAAATTAAGCCTGGTTTTTAGGGGTTTCT
194 AGACCTTCGGGTAAGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAGGGGTTTCT
* * *
13517 TGATGATTATCTCAAAAGAATATTTAAAGAAAGC
259 TGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAAGC
* * * *
13551 TAAGCCTAATTTTTAGGTGTTCCTTGATGAAAACTAAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTT
1 TAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAATTGAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTT
* * *
13616 GATTTTCAAGAGTTTATTGATGAGTAAG-CTCTTTAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATA
66 GATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTC-CTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATG
* * * * * * * *
13680 CATAAATCCTTCGGTTCCTCCATAATTCTTTTGAG-AATGATGGTAAGTCCTTCGGACCATTCAT
130 CTTAAATCCTTCGG-TCATCTATAAGTCTTTCGAGCAA-GATGATAAGTCCTTCGGGCCATCCAT
* ** * * * * * *
13744 AAGACCTTCCGAAAAGATGTTTTTAAATGCGTTTTTAGGAAGTAAGTCTGGTTTTCAGGGGTTTC
193 AAGACCTTCGGGTAAGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAGGGGTTTC
* *
13809 ATGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAAGT
258 TTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAAGC
* * * **
13844 TAAGCCTAATTTTTAGGGGATCCTTGATGACAACTGAAAAAGAAAGATTATAAGAAACTAAAATT
1 TAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAATTGAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTT
* *
13909 AATTTTGAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTC-GTGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATG
66 GATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCAG-GCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATG
* * *
13973 CTTAAATCCTTCGAGTCATCTATAACTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTACTTTGGGCCATCCATA
130 CTTAAATCCTTCG-GTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTCCTTCGGGCCATCCATA
* * *
14038 AGACCTTCGAGTAGGATGTTTTCAAATGAGTTTTTA-AAACTAAGTCTGATTTTCAGGGGTTTCT
194 AGACCTTCGGGTAAGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAGGGGTTTCT
* *
14102 TGAGGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAATC
259 TGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAAGC
* *
14136 TAAGCCTAATTTTTA-GGGTTCCTTGATGAGAACTT-AAAACGAAAGATTTTAAGACAA-TAAGC
1 TAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAA-TTGAAAAAGAAAGATTTTAAGA-AACTAAGC
* * * * *
14198 TTGATTTACAAGGGTATCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCCATTAGTAAGTCTTTCGAGGATGAT
64 TTGATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGAT
* * * *
14263 GCTTAAATCCATTAGGTCATCTATAAGTCTTTCAAGCAAGATAATAAGTCATTCGGGCCATCCAT
129 GCTTAAATCC-TTCGGTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTCCTTCGGGCCATCCAT
** ** * * *
14328 AACTCCTTCATGTAAGATGTTTTCAAATGAATTTTTAAAAACTAAGCCTAATTTTCAGGGGTTTC
193 AAGACCTTCGGGTAAGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAGGGGTTTC
* *
14393 TTGATGATTATCTGCAAAGAATTTTCAAAGGAAGC
258 TTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAAGC
* * *
14428 TAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAATTGAAAATGAACGATTTTAAGACACTAAGCTT
1 TAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAATTGAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTT
* * * * * * *
14493 GATTTTCAAGTGTTTCTTAAAGGGTAAGTCCTTTAAGCCATCAATAAGTCTTTCGAGCATGATGC
66 GATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATGC
* * * *
14558 TTAAATCCTTGGGTTCAACTATAAGTCTTTCGAACAAGATGGTAAGTCCTT-GGGACCATCCATA
131 TTAAATCCTTCGG-TCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTCCTTCGGG-CCATCCATA
* * * * * * * *
14622 AGTCATTCGAGCATGATGTTTTCAAATGATTTTTTAGAAACTAAGCCTGGTTTTTAGGGGTTTCT
194 AGACCTTCGGGTAAGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAGGGGTTTCT
* * * * * *
14687 TGATGATAATCTCGAAAGAATATTTAACGAAAAC
259 TGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAAGC
* * *
14721 TAAGCCTAATTTTTAGGTGTTCCTTGATGACAACTAAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTT
1 TAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAATTGAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTT
* * * *
14786 GATTTTAAAGAGTTTATTGATGAGTAAGTTCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATAC
66 GATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATGC
* * * * * * * *
14851 TTAAATCCTTCGATTCCTCCATAATTCTTTTGAGAAAGATGGTAAGTCCTTCGGACCATCCATAA
131 TTAAATCCTTCG-GTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTCCTTCGGGCCATCCATAA
** * * * * * * *
14916 GACCTTTAGGAAAGATGTTTTTAAATGCGTTTTTAGGAAGTAAGTCTGGTTTTCAGGGGTTTCTT
195 GACCTTCGGGTAAGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAGGGGTTTCTT
* *
14981 GATGATTATCTCGAAAGAATTTTTAAAGGAAGT
260 GATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAAGC
* * * **
15014 TAAGCCTAATTTTTAGGGGATCCTTGATGACAACTG-AAAAGAAAGATTATAAGAAACTAAAATT
1 TAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAATTGAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTT
* * * *
15078 TATTTTGAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCGGGCCATCAGTAAGTCTTTCGATCATGATGC
66 GATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATGC
* *
15143 TTAAATCCTTCGAGTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTACTTTGGGCCATCCATAA
131 TTAAATCCTTCG-GTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTCCTTCGGGCCATCCATAA
* * *
15208 GACCTTCGAGTAGGATGTTTTCAAATGAGTTTTTA-AAACTAAGTCTGATTTTCAGGGGTTTCTT
195 GACCTTCGGGTAAGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAGGGGTTTCTT
* *
15272 GATGATTATCTCCAAAGATTTTTTAAAGGAATC
260 GATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAAGC
* * * * *
15305 TATGCCTAATATTTA-GGGTTCCTTGATGAGAACTT-AAAACGAAAGATTTTAAGACACTAAGCT
1 TAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAA-TTGAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCT
* * * * * * *
15368 TGATTTACAAGGGTATCTTGTTGAGTAAGTCCTTCAGTCCATTAGTAAGTCTTTCGAGGATGATG
65 TGATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATG
* * *
15433 CTTAAATCCATTAGGTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATAATAAGTCATTCGGGCCATCCATA
130 CTTAAATCC-TTCGGTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTCCTTCGGGCCATCCATA
** * * * * * **
15498 ACTCCATCGGGTAAGATTTTTTCAAATGAATTTTTAAAAACTAAGCCTAATTTTCAGAAGTTTCT
194 AGACCTTCGGGTAAGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAGGGGTTTCT
* ***
15563 TGATGATTATCTGCAAA-AAAAATTAAAGGAAGC
259 TGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAAGC
* * * *
15596 TAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGAAAATTGAAAATGAACGATTTTAAGACACTAAGCTT
1 TAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAATTGAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTT
* * * * * *
15661 GATTTTCAAGTGTTTCTTGAAGGGTAAGTCCTTCAAGCCTTCAATAAGTCTTTCGAGCATGATGC
66 GATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATGC
* * * ** *
15726 TTAAATCCTTGGGTTCAACTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGGTAAGAACTT-GAGACCATCCATA
131 TTAAATCCTTCGG-TCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTCCTTCG-GGCCATCCATA
* * * * * *
15790 AGGCCTTCGGGCAGGATGTTTTCAAAAGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGGTTTTTAGGGGTTTCT
194 AGACCTTCGGGTAAGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAGGGGTTTCT
* * *
15855 TGATGATTATCTCGAAAGAATATTTAAAGAAAGC
259 TGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAAGC
* * * * *
15889 TAAGGCAAATTTTTAGGTGTTCCTTGATGACAACTAAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTT
1 TAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAATTGAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTT
* * * * * *
15954 GATTTTCAAGAGTTTATTGATGAGTAAGTTCTTTAGGACATCAGTACGTCTTTCGAGCATGATAC
66 GATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATGC
* * * * * * * * * * *
16019 TTAAATCCTTCGGTTCCTCCATAATTATTTTGAGAAAAATGGTAAGCCCTTCTGACCATCCATAA
131 TTAAATCCTTCGG-TCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTCCTTCGGGCCATCCATAA
* * * * * * * *
16084 GACCTTCAGGAAAGATGTTTTTAAATGCGTTTTTAGGAAGTAAGCCTGGTTTTCAAGGGTTTCTT
195 GACCTTCGGGTAAGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAGGGGTTTCTT
*
16149 GATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAAGT
260 GATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAAGC
* * * **
16182 TAAGCCTAATTTTTAGGGGATCCTTGATGACAACTGAAAAAGAAAGATTATAAGAAACTAAAATT
1 TAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAATTGAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTT
* * * *
16247 AATTTTGAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCGGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCAAGATGC
66 GATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATGC
* * *
16312 TTAAATCCTTCGAGTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATAATAAGTACTTTGGGCCATCCATAA
131 TTAAATCCTTCG-GTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTCCTTCGGGCCATCCATAA
* * * **
16377 GACCTTCGAGTAGGATGTTTTCAAATGAGTTTTTA-AAACTAAGTCTGATTTTCAGGTATTTCTT
195 GACCTTCGGGTAAGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAGGGGTTTCTT
* *
16441 GATGATTATCTCCAAA-ACATTTTTAAATGAAGA
260 GATGATTATCTCCAAAGA-ATTTTTAAAGGAAGC
* * * *
16474 TAAGCCTAATTTTTA-GGGTTCCTTGATGAGAACTT-AAAACGAAAGATTTTAAGACACTAACCT
1 TAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAA-TTGAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCT
* * * * * *
16537 AGATTTACAAGGGTATCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCCATTAGTAAGTCTTTCGAGGATGATG
65 TGATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATG
* * * *
16602 CTTAAATCCATTAGGTAATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATAATAAGTCATTCGGGCCATCCATA
130 CTTAAATCC-TTCGGTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTCCTTCGGGCCATCCATA
** * * * * * *
16667 ACTCCTTCGGGTAAGATGTTTTCAAATGAATTTTTAAAAACTAGGCCTAATTTTTATGGGTTTCT
194 AGACCTTCGGGTAAGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAGGGGTTTCT
* * *
16732 TAATGATTATCTGCAAAGAATTTTCAAAGGAAGC
259 TGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAAGC
* ** * * *
16766 TAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGAAAACCGAAAATGAACGATTTTAAGACACTAAGCTT
1 TAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAATTGAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTT
* * * * *
16831 GATTTTCAAGTGTTTCTTGAAG-GTTAAGTCCTTCAAGCCATAAATAAGTCTTTCGAGCATGATG
66 GATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAG-TAAGTCCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATG
* * *
16895 CTTAAATCCTTGGGTTCAACTATAAGTCTTTCGAACAAGAT-AGTAAGTCCTT-GGGACCATCCA
130 CTTAAATCCTTCGG-TCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGA-TAAGTCCTTCGGG-CCATCCA
* * * * * *
16958 TAAGGCCTTCGGGCATGATGTTTTCAAAAGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGGTTTTTAGGGGTTT
192 TAAGACCTTCGGGTAAGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAGGGGTTT
* * *
17023 CTTGATGATTATCT-CGAA-AA--TTTAAAGAAAGT
257 CTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAAGC
* * *
17055 TAAGCCTAATTTTTAGGTGTTCCTTGATGACAACTAAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTT
1 TAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAATTGAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTT
* * *
17120 GATTTTCAAGAGTTTATTGATGAGTAAGTTCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATAC
66 GATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATGC
* * * * * * * * * * *
17185 TTAAATCCTTCGGTTCCTCCATAATTATTTTGAGAAAAATGGTAAGCCCTTCTGACCATCCATAA
131 TTAAATCCTTCGG-TCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTCCTTCGGGCCATCCATAA
* * * * * * * *
17250 GACCTTCAGGAAAGATGTTTTTAAATGCGTTTTTAGGAAGTAAGCCTGGTTTTCAAGGGTTTCTT
195 GACCTTCGGGTAAGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAGGGGTTTCTT
*
17315 GATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAAGT
260 GATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAAGC
* * * **
17348 TAAGCCTAATTTTTAGGGGATCCTTGATGACAACTGAAAAAGAAAGATTATAAGAAACTAAAATT
1 TAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAATTGAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTT
* * * *
17413 AATTTTGAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCGGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCAAGATGC
66 GATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATGC
* * *
17478 TTAAATCCTTCGAGTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATAATAAGTACTTTGGGCCATCCATAA
131 TTAAATCCTTCG-GTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTCCTTCGGGCCATCCATAA
* * * **
17543 GACCTTCGAGTAGGATGTTTTCAAATGAGTTTTTA-AAACTAAGTCTGATTTTCAGGTATTTCTT
195 GACCTTCGGGTAAGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAGGGGTTTCTT
* *
17607 GATGATTATCTCCAAA-ACATTTTTAAATGAAGA
260 GATGATTATCTCCAAAGA-ATTTTTAAAGGAAGC
* * * *
17640 TAAGCCTAATTTTTA-GGGTTCCTTGATGAGAACTT-AAAACGAAAGATTTTAAGACACTAACCT
1 TAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAA-TTGAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCT
* * * * * * *
17703 AGATTTACAAGGGTATCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGTCCATTAGTAAGTCTTTCGAGGATGATG
65 TGATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATG
* * * *
17768 CTTAAATCCATTAGGTAATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATAATAAGTCATTCGGGCCATCCATA
130 CTTAAATCC-TTCGGTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTCCTTCGGGCCATCCATA
** * * * * * *
17833 ACTCCTTCGGGTAAGATGTTTTCAAATGAATTTTTAAAAACTAGGCCTAATTTTTATGGGTTTCT
194 AGACCTTCGGGTAAGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAGGGGTTTCT
* * *
17898 TAATGATTATCTGCAAAGAATTTTCAAAGGAAGC
259 TGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAAGC
* * * * * *
17932 TAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGAAAACTGAAAATGAACGCTTTTAAGACACTAAGCTT
1 TAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAATTGAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTT
* * * * *
17997 GATTTTCAAGTGTTTCTTGAAG-GTTAAGTCCTTCAAGCCATAAATAAGTCTTTCGAGCATGATG
66 GATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAG-TAAGTCCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATG
* * *
18061 CTTAAATCCTTGGGTTCAACTATAAGTCTTTCGAACAAGAT-AGTAAGTCCTT-GGGACCATCCA
130 CTTAAATCCTTCGG-TCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGA-TAAGTCCTTCGGG-CCATCCA
* * * * * *
18124 TAAGGCCTTCGGGCAGGATGTTTTCAAAAGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGGTTTTTAGGGGTTT
192 TAAGACCTTCGGGTAAGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAGGGGTTT
* * *
18189 CTTGATGATTATCT-CGAA-AA--TTTAAAGAAAGT
257 CTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAAGC
* * *
18221 TAAGCCTAATTTTTAGGTGTTCCTTGATGACAACTAAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTT
1 TAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAATTGAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTT
* * *
18286 GATTTTCAAGAGTTTATTGATGAGTAAGTTCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATAC
66 GATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATGC
* * * * * * * * *
18351 TTAAATCTTTCGGTTCCTCCATAATTCTTTTGAGAAAGATGGTAAGTCCTTCGGACCATCCACAA
131 TTAAATCCTTCGG-TCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTCCTTCGGGCCATCCATAA
* * * * * * * *
18416 GACCTTCAGGAAAGATGTTTTTAAATGCGTTTTTAGGAAGTAAGCCTGGTTTTTAGGGGTTTCTT
195 GACCTTCGGGTAAGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAGGGGTTTCTT
* **
18481 GATGATTATCTCCAAAGAATATTTAAAGGAAAT
260 GATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAAGC
* * * **
18514 TAAGCCTAATTTTTAGGGGATT-CTTGATGACAACTGAAAACGAAAGATTATAAGAAACTAAAAT
1 TAAGCCTAATTTTTAGGGG-TTCCTTGATGACAATTGAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCT
* * *
18578 TAATTTTGAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCGGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATG
65 TGATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATG
* * * * * * * ** *
18643 CTTAAATCCTTCATGACATCTATAAGTCTTTCGAGAAAAATGGTAAGCCCTT-TGGAAAACCGAT
130 CTTAAATCCTTC-GGTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTCCTTCGGGCCATCC-AT
* * *
18707 AAGACCTTTGGGTAAGATGTTTTCAAAT-ATGTTTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAAGAGTTT
193 AAGACCTTCGGGTAAGATGTTTTCAAATGA-GTTTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAGGGGTTT
* * * * *
18771 CTTGAAT-ATTATCTTCTATGAATTTTTAAATGAAGA
257 CTTG-ATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAAGC
* * * *
18807 TAAGCCTAATTTTTAGGGATTCCTTGATGAGAATTGAAAATGAAAGATATTAAGAAACTAAGCTT
1 TAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAATTGAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTT
* * ** * *
18872 GATTTTCAAGGGTTTCTTGCTGAAAAAGTCCTTC-GAGACATCAGTAAGTCTTTCGAGCAGGATG
66 GATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCAG-GCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATG
* * * * * *
18936 CTTAAATCCTTCGGGTCATCTATAAGTCATTCGAGCAAGGTGGTCAGTCCTTCAGACCATCCATA
130 CTTAAATCCTTC-GGTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTCCTTCGGGCCATCCATA
* * * * *
19001 AGACCTTTGGGCATGATG-TTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGTCTGATTTTCAAGGGTTTCT
194 AGACCTTCGGGTAAGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAGGGGTTTCT
*** *
19065 TGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAATCAAAGT
259 TGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAAGC
* * * *
19099 TAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTGAAAAAAAAATATTTTAAGAAACTACGCTT
1 TAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAATTGAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTT
* * * * * *
19164 AATTTTCAAGGGTTTCTTGATGAGTAAGTCTTTCGGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCAAGATGT
66 GATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATGC
** * * * * * *
19229 TTAAATTTTTTGGGTCATTTATAAGTCTTTCGTGCAAGATGATAAATCCTTTGAGCCATCCATAA
131 TTAAA-TCCTTCGGTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTCCTTCGGGCCATCCATAA
* * * * * ** * ** *
19294 AACCTTCGGG-ATGGGTGTTTTCAACAT---TTCCTT-CACTCGATTCATAGCATTTCGAATCAG
195 GACCTTCGGGTA-AGATGTTTTCAA-ATGAGTT-TTTAGAAACTAAGCCT-G-ATTT----TCAG
* ** * * ** **
19354 TGACGCCTCACCATTGGGGATAAAATT-TCCTTTTCTCAATTCACGGCA-TTTCGAA-TCAG-
251 -G--G-GT-TTC-TT---GAT--GATTAT-C---TC-CAA---A--GAATTTTTAAAGGAAGC
** * ** * * * * *** * * ** ** *
19413 TAATGCCCCA-CTAGAGGGGTTAACATTTCCTATGGC--TCGATTCACAACA-CTTCGAATCAGC
1 TAA-GCCTAATTTTTAGGGGTT--C-CTT--GATGACAATTGAAAAAGAA-AGATTTTAAGAAAC
*** * * * * *
19474 TTAAGTCCTTCGAGCCATC-AGTAAGTCTTTCGAACATGATGATTAAATCCTT-TGAGTCATCTA
59 -TAAG--CTT-GA-TTTTCAAG--AG--TTT----CTTGATGAGTAAGTCCTTCAG-GCCATC-A
* * * * * * * * * *
19537 -TAAGTCTTTCAAGCAAGATG-GTAAGTCCTTTAGGCCATCCATAAGACCTTT-GGGCAGAAAGT
109 GTAAGTCTTTCGAGCATGATGCTTAAATCC-TTCGGTCATCTATAAG-TCTTTCGAGCA-AGA-T
** ** * * * * *
19599 TTTCAA-TATTTTCGGTACTCGATTCTCA-AA-TCCTTCAGGTAAGATGTTTTCGAATGAATTTT
170 GAT-AAGT-CCTTCGG-GC-C-A-TC-CATAAGACCTTCGGGTAAGATGTTTTCAAATGAGTTTT
* *
19661 TACAAACTAAGCTTGATTTTTCAGGGGTTTCTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAAG
228 TAGAAACTAAGCCTGA-TTTTCAGGGGTTTCTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAAG
19726 C
292 C
* * * *
19727 TAAGCCTAATTTTTAGGGTTTCCTTGATGACAAATGAAAATGAAAGATTTTAAGAAGCTAAGCTT
1 TAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAATTGAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTT
* * * * * *
19792 TATTTTCAAGTGTTTCTTGACGATTAAGTCCTTC-GAGCCATCAATAAGTCTTTCGAGCATCATG
66 GATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCAG-GCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATG
* * * *
19856 CTTAAATTCTTTGGTTCAACTATAAGTCTTTCGAACAAGATGATAAGTCCTT-GGGACCATCCAT
130 CTTAAATCCTTCGG-TCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTCCTTCGGG-CCATCCAT
* * * * * ** * * *
19920 AAGACCTTTGAGCAGGATGTTTTCAAATGCA-ATTTTAGAAACTAAGTTTGGTTTTCATGGATTT
193 AAGACCTTCGGGTAAGATGTTTTCAAATG-AGTTTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAGGGGTTT
* *
19984 CTTGATGATTATCACCAAATAATTTTTAAAGGAAGC
257 CTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAAGC
* * * *
20020 TAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTGAAAACGAAATATTTTAAGAAATTAAGCTT
1 TAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAATTGAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTT
* * ** * *
20085 GATTTTCAAGTGTTT-TTTATGAGTAAGTCCTTTGGGCCATCAGTAAGTCTTACAAGCATGATGC
66 GATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATGC
* * * ** * *
20149 TTAAATCCTTCGGTTCCTCTATAATTCTTTCGAACAAGATGATAAGTCCTTTAGACCATCCATAC
131 TTAAATCCTTCGG-TCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTCCTTCGGGCCATCCATAA
* * * * * *
20214 GACCTTCAGGCAAGATGTTTTCAAATGCGTTTTTAGAAACAAAGCCTGGTTTTCAGGGGTTTCAT
195 GACCTTCGGGTAAGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAGGGGTTTCTT
*
20279 GATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGAAAGC
260 GATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAAGC
* * *
20312 TAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTGAAAACA-AAAGATTCTAAGAAACTACGCT
1 TAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAATTGAAAA-AGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCT
* * * * * *
20376 AGATTTTCAAGGGTTTCTTGATGAATAAGTCATTCGGGCCATCAGTAAGTCTTTCAAGCATGATG
65 TGATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATG
* * * * * * *
20441 TTTAAATCTTTCGAGTCATCTATATGTCTTTCGAGTAAGATGATAAGTACTTTGGGCCATCAATA
130 CTTAAATCCTTCG-GTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTCCTTCGGGCCATCCATA
* * * * *
20506 AGACCTTCGAGTAGGATGTTTTCAAATGAATTTTTAGAAACTAAGTCTAATTTTCAGGGGTTTCT
194 AGACCTTCGGGTAAGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAGGGGTTTCT
* *
20571 TGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGAAAGT
259 TGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAAGC
* * * *
20605 TAAACCTAATTTTTA-GGGTTCCTTGATGAGAACTGGAAACA-AAAGATTTTAAGAAACTAAGCT
1 TAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAA-TTGAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCT
* *
20668 TGATTTTCAAGGGTTTCTTGATGAGTAAGTTCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATG
65 TGATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATG
* * * * *
20733 CTTAAATCCATCAGGTCATCTATAAGTCTTTTGAGCAAGATAATAAGTCATTCGGGTCATCCATA
130 CTTAAATCCTTC-GGTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTCCTTCGGGCCATCCATA
** * * * *
20798 ACTCCTTCGGGTCAGATATTTTCAAATGAATTTTTAGAAACTAAGCTTGATTTTCAGGGGTTTCT
194 AGACCTTCGGGTAAGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAGGGGTTTCT
* *
20863 TGATGATTATCTCTAAATAATTTTTAAAGGAAGC
259 TGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAAGC
* * * * *
20897 TTAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGACGACAACTGAAAACA-AAAGAATTTAAGAAACTACGCT
1 TAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAATTGAAAA-AGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCT
* * * *
20961 TGATTTTCAAGGGTTTCTTGATGAGTAAGTCTTTCGGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCAAGATG
65 TGATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATG
* ** * *
21026 TTTAAATTTTTCGGGTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTCCTTTGAGCCATCCATA
130 CTTAAATCCTTC-GGTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTCCTTCGGGCCATCCATA
* * * * * *
21091 AAACCTTCGGGATGGGTGTTTTCAACAT-TTCCTTCACTCAATTCATAGTATTTCGAATCAGTGA
194 AGACCTTC------GG-G---T-AAGATGTT--TTCA---AA-T--GAGTTTTTAGAA--ACT-A
* * *** ** * * * **
21155 CGCCTCACCGT-AGGGGATAACATT--TCG-TTTTCT-CAATTCACGGCA-TTTTGAA-TCAGC
237 AGCCTGATTTTCAGGGG-TTTC-TTGAT-GATTATCTCCAA---A--GAATTTTTAAAGGAAGC
** * ** * * * * *** * ** * **
21212 -AATGCCCCA-CTAGAGGGGTTAACATTTCCTATGGC--TCGATTCACAACA-ATTCGAATCAGC
1 TAA-GCCTAATTTTTAGGGGTT--C-CTT--GATGACAATTGAAAAAGAA-AGATTTTAA-GAAA
* *** * * *
21272 CTAAATCCTTCGAGCCATC-AGTAAGTCTT-TTGAACATGATGATTAAATCCTT-TGAGTCATCT
58 CT-AA-GCTT-GA-TTTTCAAG--AGT-TTCTTG---ATGA-G--TAAGTCCTTCAG-GCCATC-
* * * * * * * * *
21334 A-TAAGTCTTTCGAGAAAGATG-GTAAGTCCTTTAGGCCATCCATAAGACCTTTGGGCAGCAAG-
108 AGTAAGTCTTTCGAGCATGATGCTTAAATCC-TTCGGTCATCTATAAG-TCTTT-CG-AGCAAGA
** ** * ** * *
21396 TTTTCAA-TATTTTCGGTGCTCGATTC-TCAACTCCTTCGGGTAAGATG-TTTCGAATGAATTTT
169 TGAT-AAGT-CCTTCGG-GC-C-ATCCAT-AAGACCTTCGGGTAAGATGTTTTCAAATGAGTTTT
*
21458 TAGAAACTAAGCTTGATTTTTCAGGGGTTTCTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAAG
228 TAGAAACTAAGCCTGA-TTTTCAGGGGTTTCTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAAG
21523 C
292 C
* * * *
21524 TAAGCCTAATTTTTAGGGTTTCCTTGATGACAAATGAAAATGAAAGATTTTAAGAAGCTAAGCTT
1 TAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAATTGAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTT
* * * * * * *
21589 TATTTTCAAGTGTTTCTTGACGATTAAGTCCTTCAAGCCATCAATAAGTCTTTCGAGCATAATGC
66 GATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATGC
* * * *
21654 TTAAATCCTTCGGTTCAACTCTAAGGCTTTCGAACAAGATGATAAGTCCTT-GGGACCATCCATA
131 TTAAATCCTTCGG-TCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTCCTTCGGG-CCATCCATA
* * * * ** * *
21718 AGTCCTTCGAGCAGGATGTTTTCAAATGCA-TTTTTAGAAACTAAGTTTGGTTTTCATGGGTTTC
194 AGACCTTCGGGTAAGATGTTTTCAAATG-AGTTTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAGGGGTTTC
* * *
21782 TTGATGATTATCACCAAATAAATTTTAAAGGAAGC
258 TTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAAGC
* * * * * *
21817 TAAGCCTAATTTTTAGTGGTTCCTTGATGATAACTGAAAACGAAAGACTTTAAGAAATTAAGCTT
1 TAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAATTGAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTT
* * * ** * *
21882 GATTTT-AAGTGTTTTTTTATGAGTAAGTCCTTTGGGCCATCAGTAAGTCTTACAAGCATGATGC
66 GATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATGC
* * * * ** * *
21946 TTAAATCCTTCGGTTCCTCTATAATTCTTTCGAACAATATGATAAGTCCTTTAGACCATCCATAC
131 TTAAATCCTTCGG-TCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTCCTTCGGGCCATCCATAA
* * * * *
22011 GACCTTCAGGCAAGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGGTTTTCAGTGGTTTCGT
195 GACCTTCGGGTAAGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAGGGGTTTCTT
*
22076 GATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGAAAGC
260 GATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAAGC
* ** * * *
22109 TAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTGAAAACCAAAGATTCTAAGAAACTATGCTA
1 TAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAATTGAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTT
* * * * * *
22174 GATTTTCAAGGGTTTCTTGATGAATAAGTCATTCGGGCCATCAGTAAGTCTTTCAAGCATGATAC
66 GATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATGC
* *
22239 TTAAATCCTTCGAGTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTACTTTGGGCCATCCATAA
131 TTAAATCCTTCG-GTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTCCTTCGGGCCATCCATAA
* * * * * *
22304 GACCTTCGAGTATGATGTTTTCATATGAATTTTTAGAAACTAAGTCTAATTTTCAGGGGTTTCTT
195 GACCTTCGGGTAAGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAGGGGTTTCTT
**
22369 GATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAAAT
260 GATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAAGC
* * *
22402 TAAACCTAATTTTTA-GGGTTCCTTGATGAGAACTGAAAACA-AAAGATTTTAAGAAACTAAGCT
1 TAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAATTGAAAA-AGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCT
22465 TGATTTTCAA
65 TGATTTTCAA
22475 ACTAAGCTTG
Statistics
Matches: 13247, Mismatches: 2331, Indels: 721
0.81 0.14 0.04
Matches are distributed among these distances:
289 473 0.04
290 42 0.00
291 2103 0.16
292 3786 0.29
293 5995 0.45
294 109 0.01
295 6 0.00
296 12 0.00
297 12 0.00
298 43 0.00
299 64 0.00
300 18 0.00
301 4 0.00
302 1 0.00
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* * * * *
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* * * * * *
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** * * * *
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* * *
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* * * * *
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* * *
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* * * * * * * *
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* ** *
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** * * * * *
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*
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* * * * * *
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* * *
7508 CTTCAAGCCATCAATAAGTCTTTCGAGCATGATGCTTAAATCCTTGGGTTCAACTATAAGTCTTT
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* * * * *
7573 CGAACAAGATGGTAAGTCCTTGGGACCATCCATAAGGCCTTCGAGCAGGATATTTTCAAAAGAGT
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* * * *
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517 TTTTAGAAACTAAGCCTGGTTTTCAGGGGTTTCTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGA
* *
7702 AGCTAAGCCTAATTTTTAGGTGTTCCTTGATGAAAACTAAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAG
582 AGCTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTAAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAG
*
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647 CTTGATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTC-CTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATG
* * * * * * * *
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* * * * * *
7895 CATAAGACCTTCCGGAAAGATGTTTTTAAATGCGTTTTTAGGAAGTAAGTCTGGTTTTCAGGGGT
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*
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839 TTCTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAAG
* * * **
7997 TTAAGCCTAATTTTTAGGGGATCCTTGATGACAACTGAAAAAGAAAGATTATAAGAAACTAAAAT
1 TTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTGAAAAAGAAAGATTTTAAGACACTAAGCT
* *
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* * * * *
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130 GCTTAAATCCTTAG-GTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGGTAAGTCCTTCGGGCCATCCAT
* * *
8191 AAGACCTTCGAGTAGGATGTTTTCAAATGAGTTTTTA-AAACTAAGTCTGATTTTCAGGGGTTTC
194 AAGACCTTCGGGTAAGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAGGGGTTTC
* * *
8255 TTGATGATTATATCCAAAGAATTTTTAAAGGAATCTAAGCCTAATTTTTA-AGGTTCCTTGATGA
259 TTGATGATTATCT-CAAAGAATTTTTAAAGGAAGCTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGA
* * * * *
8319 GAACTTAAAATGAAAGATTTTAAGACAA-TAAGCTTGATTTACAAGGGTATCTTGATGAGTAAGT
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* * *
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386 CCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATGCTTAAATCC-TTGGGTTCATCTATAAGTCT
** * ** *
8447 TTC-AAGCAAGATAATAAGTCATTCGGG-CCATCCATAACTCCTTCGGGTAAGATGTTTTCAAAT
450 TTCGAA-CAAGATGGTAAGTCCTT-GGGACCATCCATAAGACCTTCGAGTAAGATGTTTTCAAAT
* * ** * *
8510 GAATTTTTAAAAACTAAGCCTAATTTTCAGGGGTTTCTTGATGATTATCTGCAAAGAATTTTCAA
513 GAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGGTTTTCAGGGGTTTCTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAA
* * * * *
8575 A-GAAGCTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAATTGAAAATGAACGATTTTAAGACAC
578 AGGAAGCTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTAAAAAAGAAAGATTTTAAGAAAC
* * * * *
8639 TAAGCTTGATTTTCAAGTGTTTCTTGAAGGGTAAGTCCTTCAAGCCATCAATAAGTCTTTCGAGC
643 TAAGCTTGATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGC
* * * * *
8704 ATGATGCTTAAATCCTTGGGTTCAACTATAAGTCTTTCGAACAAGATGGTAAGTCCTTGGGACCA
708 ATGATGCTTAAATCCTTCGG-TCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTCCTTCGGACCA
* * * * *
8769 TCCATAAGTCCTT-CGAGCATGATGTTTTCAAATTAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGGTTTTTAGG
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* * * * *
8833 GGTTTCTTGATGATAATCTCGAAAGAATATTTAAAGAAAA
836 GGTTTCTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAAG
* * * * *
8873 CTAAGCCTAATTTTTAGGTGTTCCTTGATGATAACTAAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCT
1 TTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTGAAAAAGAAAGATTTTAAGACACTAAGCT
* * * *
8938 TGATTTTAAAGAGTTTATTGATGAGTAAGTTCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATA
66 TGATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATG
* * * * * * * *
9003 CTTAAATCCTTCGATTCCTCCATAATTCTTTTGAGAAAGATGGTAAGTCCTTCGGACCATCCATA
131 CTTAAATCCTTAG-GTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGGTAAGTCCTTCGGGCCATCCATA
* * * * * * *
9068 AGACCTTCAGGAAAGATGTTTTTAAAT-ACGTTTTTAGGAAGTAAGTCTGGTTTTCAGGGGTTTC
195 AGACCTTCGGGTAAGATGTTTTCAAATGA-GTTTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAGGGGTTTC
* *
9132 TTGATGATTATCTCGAAAGAATTTTTAAAGGAAGTTAAGCCTAATTTTTAGGGGATCCTTGATGA
259 TTGATGATTATCTC-AAAGAATTTTTAAAGGAAGCTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGA
* * * ** * **
9197 CAACTGAAAAGAAAGATTATAAGAAACTAAAATTAATTTTGTAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCC
323 CAATTGAAATGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTTGATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCC
*
9262 TTC-GGCCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATGCTTAAATCCTTCGAG-TCATCTATAAGTCTT
388 TTCAGG-CCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATGCTTAAATCCTT-GGGTTCATCTATAAGTCTT
* * * *
9325 TCGAGCAAGATGATAAGTACTTTGGG-CCATCCATAAGACCTTCGAGTAGGATGTTTTCAAATGA
451 TCGAACAAGATGGTAAGT-CCTTGGGACCATCCATAAGACCTTCGAGTAAGATGTTTTCAAATGA
* * *
9389 GTTTTTA-AAACTAAGTCTGATTTTCAAGGGTTTCTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAG
515 GTTTTTAGAAACTAAGCCTGGTTTTCAGGGGTTTCTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAG
* * * * * *
9453 GAATCTAAGCCTAATATTTA-GGGTTCCTTGATGAGAACTTAAAACGAAAGATTTTAAGACACTA
580 GAAGCTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTAAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTA
* * * * * * *
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645 AGCTTGATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCAT
* * * * *
9582 GATGCTTAAATCCATTAGGTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATAATAAGTCATTTGGGCCATC
710 GATGCTTAAATCC-TTCGGTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTCCTTCGGACCATC
** * * * * * ** **
9647 CATAACTCCATCGGGTAAGATTTTTTCAAATGAATTTTTAAAAACTAAGCCTAATTTTCAGAAGT
774 CATAAGACCTTCCGGTAAGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGGTTTTCAGGGGT
* ***
9712 TTCTTGATGATTATCTGCAAA-AAAAATTAAAGGAAG
839 TTCTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAAG
* * * * *
9748 CTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGAAAATTGAAAATGAATGATTTTAAGACACTAAGCT
1 TTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTGAAAAAGAAAGATTTTAAGACACTAAGCT
* * * * * *
9813 TGATTTTCAAGTGTTTCTTGAAGGGTAAGTCCTTCAAGCCTTCAATAAGTCTTTCGAGCATGATG
66 TGATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATG
* * *
9878 CTTAAATCCTT-GTGTTCAACTATAAGTCTTTCGAGAAAGATGGTAAGACCTT-GGGACCATCCA
131 CTTAAATCCTTAG-G-TCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGGTAAGTCCTTCGGG-CCATCCA
* * * * * *
9941 TAAGGCCTTCGGGCAGGATGTTTTCAAAAGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGGTTTTTAGGGGTTT
193 TAAGACCTTCGGGTAAGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAGGGGTTT
* * * * * *
10006 CTTGATGATTATCTCGAAAGAATATTTAAAGAAAGTTAAGGCAAATTTTTAGGTGTTCCTTGATG
258 CTTGATGATTATCTC-AAAGAATTTTTAAAGGAAGCTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATG
** * *
10071 ACAACTAAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTTGATTTTCAAGAGTTTATTGATGAGTAAGT
322 ACAA-TTGAAATGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTTGATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGT
* * * * * * *
10136 TCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATACTTAAATCCTTCGGTTCCTCCATAATTATT
386 CCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATGCTTAAATCCTTGGGTTCATCTATAAGTCTT
* * * ** * *
10201 TTGAGA-AAAATGGTAAGCCCTTCTGACCATCCATAAGACCTTC-AGGAAAGATGTTTTTAAATG
451 TCGA-ACAAGATGGTAAGTCCTTGGGACCATCCATAAGACCTTCGA-GTAAGATGTTTTCAAATG
** * * *
10264 CTTTTTTAGGAAGTAAGCCTGGTTTTCAAGGGTTTCTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAA
514 AGTTTTTAGAAACTAAGCCTGGTTTTCAGGGGTTTCTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAA
* * * *
10329 GGAAGTTAAGCCTAATTTTTAGGGGATCCTT-ATTGACAACTGAAAAAGAAAGATTATAAGAAAC
579 GGAAGCTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGA-TGACAACTAAAAAAGAAAGATTTTAAGAAAC
** * * *
10393 TAAAATTAATTTTGAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCGGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGC
643 TAAGCTTGATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGC
* * * * *
10458 ATGATGCTTAAATCCTTCGAGTCATCTATAAGTCTTTCGAGTAAGATAATAAGTACTTTGGGCCA
708 ATGATGCTTAAATCCTTCG-GTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTCCTTCGGACCA
* * *
10523 TCCATAAGACCTT-CGAGTAGGATGTTTTCAAATGAGTTTTTA-AAACTAAGTCTGATTTTCAGG
772 TCCATAAGACCTTCCG-GTAAGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGGTTTTCAGG
**
10586 TATTTCTTGATGATTATCTCCAAA-ACATTTTTAAAGGAA-
836 GGTTTCTTGATGATTATCTCCAAAGA-ATTTTTAAAGGAAG
* * * * * *
10625 TCTAAGCCTAATTTTTA-GGGTTCCTTGATAAGAACTTAAAACGAAAGATTTTAAGACACTGACC
1 T-TAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTGAAAAAGAAAGATTTTAAGACACTAAGC
* * * * * * * *
10689 TAGATTTACAAGGGTATCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGTCCATTAGTAAGTCATTCGAGGATGAT
65 TTGATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGAT
* ** *
10754 GCTTAAATCTATTAGGTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATAATAAGTCATTCGGGCCATCCAT
130 GCTTAAATC-CTTAGGTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGGTAAGTCCTTCGGGCCATCCAT
** * * * * * **
10819 AACTCCATCGGGTAAGATTTTTTCAAATGAATTTTTAAAAACTAAGCCTAATTTTCAGAAGTTTC
194 AAGACCTTCGGGTAAGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAGGGGTTTC
***
10884 TTGATGATTATCTGCAAA-AAAAATTAAAGGAAGCTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGA
259 TTGATGATTATCT-CAAAGAATTTTTAAAGGAAGCTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGA
* * * * * *
10948 AAATTGAAAATGAATGATTTTAAGACACTAAGCTTGATTTTCAAGTGTTTCTTGAAGGGTAAGTC
323 CAATTG-AAATGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTTGATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTC
* * * *
11013 CTTCAAGCCTTCAATAAGTCTTTCGAGCATGATGCTTAAATCCTTGGGTTCAACTATAAGTCTTT
387 CTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATGCTTAAATCCTTGGGTTCATCTATAAGTCTTT
* * * * * * *
11078 CGAGCAAGATGGTAAGACCTTGGGACCATCCATAAGGCCTTCGGGCAGGATGTTTTCAAAAGAGT
452 CGAACAAGATGGTAAGTCCTTGGGACCATCCATAAGACCTTCGAGTAAGATGTTTTCAAATGAGT
* * * *
11143 TTTTAGAAACTAAGCCTGGTTTTTAGGGGTTTCTTGATGATTATCTCGAAAGAATATTTAAAGAA
517 TTTTAGAAACTAAGCCTGGTTTTCAGGGGTTTCTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGA
* * *
11208 AGCTAAGGCAAATTTTTAGGTGTTCCTTGATGACAACTAAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAG
582 AGCTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTAAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAG
* *
11273 CTTGATTTTCAAGAGTTTATTGATGAGTAAGTTCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGA
647 CTTGATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGA
* * * * * * * * * * *
11338 TACTTAAATCCTTCGGTTCCTCCATAATTATTTTGAGAAAAATGGTAAGCCCTTCTGACCATCCA
712 TGCTTAAATCCTTCGG-TCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTCCTTCGGACCATCCA
* * * ** * * *
11403 TAAGACCTTCAGGAAAGATGTTTTTAAATGCTTTTTTAGGAAGTAAGCCTGGTTTTCAAGGGTTT
776 TAAGACCTTCCGGTAAGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGGTTTTCAGGGGTTT
11468 CTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAAG
841 CTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAAG
* * * * **
11503 TTAAGCCTAATTTTTAGGGGATCATTGATGACAACTGAAAAAGAAAGATTATAAGAAACTAAAAT
1 TTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTGAAAAAGAAAGATTTTAAGACACTAAGCT
* * *
11568 TAATTTTGAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCGGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATG
66 TGATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATG
** * *
11633 CTTAAATCCTTCTA-GTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATAATAAGTACTTTGGGCCATCCAT
131 CTTAAATCC-T-TAGGTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGGTAAGTCCTTCGGGCCATCCAT
* * * **
11697 AAGACCTTCGAGTAGGATGTTTTCAAATGAGTTTTTA-AAACTAAGTCTGATTTTCAGGTATTTC
194 AAGACCTTCGGGTAAGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAGGGGTTTC
* *
11761 TTGATGATTATCTCCAAA-ACATTTTTAAAGGAATCTAAGCCTAATTTTTA-GGGTTCCTTGATA
259 TTGATGATTATCT-CAAAGA-ATTTTTAAAGGAAGCTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATG
* * * * * * * *
11824 AGAACTT-AAATCGAAAGATTTTAAGACACTGACCTAGATTTACAAGGGTATCTTGATGAGTAAG
322 ACAA-TTGAAAT-GAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTTGATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAG
* * *
11888 TCCTTCAGGCCATTAGTAAGTCTTTCGAGGATGATGCTTAAATCCATTAGG-TCATCTATAAGTC
385 TCCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATGCTTAAATCC-TTGGGTTCATCTATAAGTC
* ** * ** * *
11952 TTTCGAGCAAGATAATAAGTCATTCGGG-CCATCCATAACTCCTTCGGGTAAGTTGTTTTCAAAT
449 TTTCGAACAAGATGGTAAGTCCTT-GGGACCATCCATAAGACCTTCGAGTAAGATGTTTTCAAAT
* * * ** * *
12016 GAATTTTTAAAAACTAGGCCTAATTTTCAGGGGTTTCTTGATGATTATCTGCAAAGAATTTTCAA
513 GAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGGTTTTCAGGGGTTTCTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAA
* * * * * *
12081 AGGAAGCTAAGCCTAATTTTTAGTGGTTCCTTGATGAAAACTGAAAATGAACGATTTTAAGACAC
578 AGGAAGCTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTAAAAAAGAAAGATTTTAAGAAAC
* * * * *
12146 TAAGCTTGATTTTCAAGTGTTTCTTGAAGGGTAAGTCCTTCAAGCCATCAATAAGTCTTTCGAGC
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* * * * *
12211 ATGATGCTTAAATCCTTGGGTTCAACAATAAGTCTTTCGAGCAAGATGGTAAGTCCTTGGGACCA
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* ** * * * * *
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* * *
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* * *
12380 TTAAGCCTAATTTTTAGGTGTTCCTTGATGACAACTAAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCT
1 TTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTGAAAAAGAAAGATTTTAAGACACTAAGCT
* *
12445 TGATTTTCAAGAGTTTATTGATGAGTAAG-CTCTTTAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGAT
66 TGATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTC-CTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGAT
* * * * * * * * *
12509 ACATAAATCCTTCGGTTCCTCCATAATTCTTTTGAG-AATGATGGTAAGTCCTTCGGACCATTCA
130 GCTTAAATCCTTAGG-TCATCTATAAGTCTTTCGAGCAA-GATGGTAAGTCCTTCGGGCCATCCA
* ** * * * * * *
12573 TAAGACCTTCCGAAAAGATGTTTTTAAATGCGTTTTTAGGAAGTAAGTCTGGTTTTCAGGGGTTT
193 TAAGACCTTCGGGTAAGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAGGGGTTT
* * *
12638 CATGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAAGTTAAGCCTAATTTTTAGGGGATCCTTGATG
258 CTTGATGATTATCT-CAAAGAATTTTTAAAGGAAGCTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATG
* * * ** * *
12703 ACAACTGAAAACGAAAGATTATAAGAAACTAAAATTAATTTTGAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGT
322 ACAATTG-AAATGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTTGATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGT
* *
12768 CCTTCGGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATGCTTAAATCCTTCGAG-TCATCTATAAGTCT
386 CCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATGCTTAAATCCTT-GGGTTCATCTATAAGTCT
* * * * * *
12832 TTCGAGCAAGATGATAAGTACTTTGGG-CCATACATAAGACCTTCGAGTATGATATTTTCAAATG
450 TTCGAACAAGATGGTAAGT-CCTTGGGACCATCCATAAGACCTTCGAGTAAGATGTTTTCAAATG
* * *
12896 AGTTTTTA-AAACTAAGTCTGATTTTCAGGGGTTTCTTGAGGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAA
514 AGTTTTTAGAAACTAAGCCTGGTTTTCAGGGGTTTCTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAA
* * * * *
12960 GGAATCTAAGCCTAATTTTTA-GGGTTCCTTGATGAGAACTTAAAACGAAAGATTTTAAGACACT
579 GGAAGCTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTAAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACT
* * * * * * *
13024 AAGCTTGATTTACAAGGGTATCTTGTTGAGTAAGTCCTTTAGGCCATTAGTAAGTCTTTCGAGGA
644 AAGCTTGATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCA
* * * * * *
13089 TGATGTTTAAATCCATTAGGTCATCTATAAGTCTTTCGAGTAAGATAATAAGTCATTCGGGCCAT
709 TGATGCTTAAATCC-TTCGGTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTCCTTCGGACCAT
** * * * ** *
13154 CCATAACTCCTTCGGGTAAGATGTTTTCAAATGAATTTTTAAAAACTAAGCCTAATTTTCAAGGG
773 CCATAAGACCTTCCGGTAAGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGGTTTTCAGGGG
* *
13219 TTTCTTGATGATTATCTGCAAAGAATTTTTAAATGAAG
838 TTTCTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAAG
* * * *
13257 CTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAATTGAAAATGAACGATTTTAAGACACTAAGCT
1 TTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTGAAAAAGAAAGATTTTAAGACACTAAGCT
* * * * *
13322 TGTTTTTCAAGTGTTTCTTGATGGGTAAGTCCTTCAAGCCATCAATAAGTCTTTCGAGCATGATG
66 TGATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATG
* * *
13387 CTTAAATCCTTGGGTTCAACTATAAGTCTTTCGAACAAGATGGTAAGTCCTT-GGGACCATCCAT
131 CTTAAATCCTTAGG-TCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGGTAAGTCCTTCGGG-CCATCCAT
* * * * * * * * *
13451 AAGGCCTTCGAGCAGGATATTTTCAAAAGAGTTTTTAGAAATTAAGCCTGGTTTTTAGGGGTTTC
194 AAGACCTTCGGGTAAGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAGGGGTTTC
* * *
13516 TTGATGATTATCTCAAAAGAATATTTAAAGAAAGCTAAGCCTAATTTTTAGGTGTTCCTTGATGA
259 TTGATGATTATCTC-AAAGAATTTTTAAAGGAAGCTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGA
* ** * *
13581 AAACTAAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTTGATTTTCAAGAGTTTATTGATGAGTAAG-C
323 CAA-TTGAAATGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTTGATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTC
* * * * * * *
13645 TCTTTAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATACATAAATCCTTCGGTTCCTCCATAATTCTT
387 -CTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATGCTTAAATCCTTGGGTTCATCTATAAGTCTT
* * * * * *
13710 TTGAGA-ATGATGGTAAGTCCTTCGGACCATTCATAAGACCTTCCGA-AAAGATGTTTTTAAATG
451 TCGA-ACAAGATGGTAAGTCCTTGGGACCATCCATAAGACCTT-CGAGTAAGATGTTTTCAAATG
* * * * *
13773 CGTTTTTAGGAAGTAAGTCTGGTTTTCAGGGGTTTCATGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAA
514 AGTTTTTAGAAACTAAGCCTGGTTTTCAGGGGTTTCTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAA
* * * *
13838 GGAAGTTAAGCCTAATTTTTAGGGGATCCTTGATGACAACTGAAAAAGAAAGATTATAAGAAACT
579 GGAAGCTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTAAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACT
** * *
13903 AAAATTAATTTTGAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTC-GTGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGC
644 AAGCTTGATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCAG-GCCATCAGTAAGTCTTTCGAGC
* * * *
13967 ATGATGCTTAAATCCTTCGAGTCATCTATAACTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTACTTTGGGCCA
708 ATGATGCTTAAATCCTTCG-GTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTCCTTCGGACCA
* * *
14032 TCCATAAGACCTT-CGAGTAGGATGTTTTCAAATGAGTTTTTA-AAACTAAGTCTGATTTTCAGG
772 TCCATAAGACCTTCCG-GTAAGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGGTTTTCAGG
*
14095 GGTTTCTTGAGGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAA-
836 GGTTTCTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAAG
* * * *
14134 TCTAAGCCTAATTTTTA-GGGTTCCTTGATGAGAACTTAAAACGAAAGATTTTAAGACAATAAGC
1 T-TAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTGAAAAAGAAAGATTTTAAGACACTAAGC
* * * * *
14198 TTGATTTACAAGGGTATCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCCATTAGTAAGTCTTTCGAGGATGAT
65 TTGATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGAT
* ** *
14263 GCTTAAATCCATTAGGTCATCTATAAGTCTTTCAAGCAAGATAATAAGTCATTCGGGCCATCCAT
130 GCTTAAATCC-TTAGGTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGGTAAGTCCTTCGGGCCATCCAT
** ** * * *
14328 AACTCCTTCATGTAAGATGTTTTCAAATGAATTTTTAAAAACTAAGCCTAATTTTCAGGGGTTTC
194 AAGACCTTCGGGTAAGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAGGGGTTTC
*
14393 TTGATGATTATCTGCAAAGAATTTTCAAAGGAAGCTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGA
259 TTGATGATTATCT-CAAAGAATTTTTAAAGGAAGCTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGA
* * * * * *
14458 CAATTGAAAATGAACGATTTTAAGACACTAAGCTTGATTTTCAAGTGTTTCTTAAAGGGTAAGTC
323 CAATTG-AAATGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTTGATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTC
* * * *
14523 CTTTAAGCCATCAATAAGTCTTTCGAGCATGATGCTTAAATCCTTGGGTTCAACTATAAGTCTTT
387 CTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATGCTTAAATCCTTGGGTTCATCTATAAGTCTTT
* * * * *
14588 CGAACAAGATGGTAAGTCCTTGGGACCATCCATAAGTCATTCGAGCATGATGTTTTCAAATGATT
452 CGAACAAGATGGTAAGTCCTTGGGACCATCCATAAGACCTTCGAGTAAGATGTTTTCAAATGAGT
* * * * * *
14653 TTTTAGAAACTAAGCCTGGTTTTTAGGGGTTTCTTGATGATAATCTCGAAAGAATATTTAACGAA
517 TTTTAGAAACTAAGCCTGGTTTTCAGGGGTTTCTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGA
* *
14718 AACTAAGCCTAATTTTTAGGTGTTCCTTGATGACAACTAAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAG
582 AGCTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTAAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAG
* * *
14783 CTTGATTTTAAAGAGTTTATTGATGAGTAAGTTCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGA
647 CTTGATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGA
* * * * * * * *
14848 TACTTAAATCCTTCGATTCCTCCATAATTCTTTTGAGAAAGATGGTAAGTCCTTCGGACCATCCA
712 TGCTTAAATCCTTCG-GTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTCCTTCGGACCATCCA
** * * * * * *
14913 TAAGACCTTTAGGAAAGATGTTTTTAAATGCGTTTTTAGGAAGTAAGTCTGGTTTTCAGGGGTTT
776 TAAGACCTTCCGGTAAGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGGTTTTCAGGGGTTT
*
14978 CTTGATGATTATCTCGAAAGAATTTTTAAAGGAAG
841 CTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAAG
* * * **
15013 TTAAGCCTAATTTTTAGGGGATCCTTGATGACAACTG-AAAAGAAAGATTATAAGAAACTAAAAT
1 TTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTGAAAAAGAAAGATTTTAAGACACTAAGCT
* * * *
15077 TTATTTTGAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCGGGCCATCAGTAAGTCTTTCGATCATGATG
66 TGATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATG
* * * *
15142 CTTAAATCCTTCGAGTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTACTTTGGGCCATCCATA
131 CTTAAATCCTTAG-GTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGGTAAGTCCTTCGGGCCATCCATA
* * *
15207 AGACCTTCGAGTAGGATGTTTTCAAATGAGTTTTTA-AAACTAAGTCTGATTTTCAGGGGTTTCT
195 AGACCTTCGGGTAAGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAGGGGTTTCT
* * * * *
15271 TGATGATTATCTCCAAAGATTTTTTAAAGGAATCTATGCCTAATATTTA-GGGTTCCTTGATGAG
260 TGATGATTATCT-CAAAGAATTTTTAAAGGAAGCTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGAC
* * * * * * *
15335 AACTTAAAACGAAAGATTTTAAGACACTAAGCTTGATTTACAAGGGTATCTTGTTGAGTAAGTCC
324 AA-TTGAAATGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTTGATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCC
* * * *
15400 TTCAGTCCATTAGTAAGTCTTTCGAGGATGATGCTTAAATCCATTAGG-TCATCTATAAGTCTTT
388 TTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATGCTTAAATCC-TTGGGTTCATCTATAAGTCTTT
* ** * ** * * * *
15464 CGAGCAAGATAATAAGTCATTCGGG-CCATCCATAACTCCATCGGGTAAGATTTTTTCAAATGAA
452 CGAACAAGATGGTAAGTCCTT-GGGACCATCCATAAGACCTTCGAGTAAGATGTTTTCAAATGAG
* ** ** * ***
15528 TTTTTAAAAACTAAGCCTAATTTTCAGAAGTTTCTTGATGATTATCTGCAAA-AAAAATTAAAGG
516 TTTTTAGAAACTAAGCCTGGTTTTCAGGGGTTTCTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGG
* * * * * *
15592 AAGCTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGAAAATTGAAAATGAACGATTTTAAGACACTAA
581 AAGCTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTAAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAA
* * * * * *
15657 GCTTGATTTTCAAGTGTTTCTTGAAGGGTAAGTCCTTCAAGCCTTCAATAAGTCTTTCGAGCATG
646 GCTTGATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATG
* * * **
15722 ATGCTTAAATCCTTGGGTTCAACTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGGTAAGAACTT-GAGACCATC
711 ATGCTTAAATCCTTCGG-TCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTCCTTCG-GACCATC
* * * * * *
15786 CATAAGGCCTTCGGGCAGGATGTTTTCAAAAGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGGTTTTTAGGGGT
774 CATAAGACCTTCCGGTAAGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGGTTTTCAGGGGT
* * *
15851 TTCTTGATGATTATCTCGAAAGAATATTTAAAGAAAG
839 TTCTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAAG
* * * * * *
15888 CTAAGGCAAATTTTTAGGTGTTCCTTGATGACAACTAAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCT
1 TTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTGAAAAAGAAAGATTTTAAGACACTAAGCT
* * * * * *
15953 TGATTTTCAAGAGTTTATTGATGAGTAAGTTCTTTAGGACATCAGTACGTCTTTCGAGCATGATA
66 TGATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATG
* * * * * * * * * * *
16018 CTTAAATCCTTCGGTTCCTCCATAATTATTTTGAGAAAAATGGTAAGCCCTTCTGACCATCCATA
131 CTTAAATCCTTAGG-TCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGGTAAGTCCTTCGGGCCATCCATA
* * * * * * * *
16083 AGACCTTCAGGAAAGATGTTTTTAAATGCGTTTTTAGGAAGTAAGCCTGGTTTTCAAGGGTTTCT
195 AGACCTTCGGGTAAGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAGGGGTTTCT
* *
16148 TGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAAGTTAAGCCTAATTTTTAGGGGATCCTTGATGAC
260 TGATGATTATCT-CAAAGAATTTTTAAAGGAAGCTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGAC
* * * ** * *
16213 AACTGAAAAAGAAAGATTATAAGAAACTAAAATTAATTTTGAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCC
324 AATTG-AAATGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTTGATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCC
* * *
16278 TTCGGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCAAGATGCTTAAATCCTTCGAG-TCATCTATAAGTCTTT
388 TTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATGCTTAAATCCTT-GGGTTCATCTATAAGTCTTT
* ** * *
16342 CGAGCAAGATAATAAGTACTTTGGG-CCATCCATAAGACCTTCGAGTAGGATGTTTTCAAATGAG
452 CGAACAAGATGGTAAGT-CCTTGGGACCATCCATAAGACCTTCGAGTAAGATGTTTTCAAATGAG
* * ** *
16406 TTTTTA-AAACTAAGTCTGATTTTCAGGTATTTCTTGATGATTATCTCCAAA-ACATTTTTAAAT
516 TTTTTAGAAACTAAGCCTGGTTTTCAGGGGTTTCTTGATGATTATCTCCAAAGA-ATTTTTAAAG
* * * * *
16469 GAAGATAAGCCTAATTTTTA-GGGTTCCTTGATGAGAACTTAAAACGAAAGATTTTAAGACACTA
580 GAAGCTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTAAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTA
* * * * * * *
16533 ACCTAGATTTACAAGGGTATCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCCATTAGTAAGTCTTTCGAGGAT
645 AGCTTGATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCAT
* * * * *
16598 GATGCTTAAATCCATTAGGTAATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATAATAAGTCATTCGGGCCATC
710 GATGCTTAAATCC-TTCGGTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTCCTTCGGACCATC
** * * * * ** * *
16663 CATAACTCCTTCGGGTAAGATGTTTTCAAATGAATTTTTAAAAACTAGGCCTAATTTTTATGGGT
774 CATAAGACCTTCCGGTAAGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGGTTTTCAGGGGT
* * *
16728 TTCTTAATGATTATCTGCAAAGAATTTTCAAAGGAAG
839 TTCTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAAG
* * * * *
16765 CTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGAAAACCGAAAATGAACGATTTTAAGACACTAAGCT
1 TTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTGAAAAAGAAAGATTTTAAGACACTAAGCT
* * * * *
16830 TGATTTTCAAGTGTTTCTTGAAG-GTTAAGTCCTTCAAGCCATAAATAAGTCTTTCGAGCATGAT
66 TGATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAG-TAAGTCCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGAT
* * * *
16894 GCTTAAATCCTTGGGTTCAACTATAAGTCTTTCGAACAAGATAGTAAGTCCTT-GGGACCATCCA
130 GCTTAAATCCTTAGG-TCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGGTAAGTCCTTCGGG-CCATCCA
* * * * * *
16958 TAAGGCCTTCGGGCATGATGTTTTCAAAAGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGGTTTTTAGGGGTTT
193 TAAGACCTTCGGGTAAGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAGGGGTTT
* * * *
17023 CTTGATGATTATCTCGAA-AA--TTTAAAGAAAGTTAAGCCTAATTTTTAGGTGTTCCTTGATGA
258 CTTGATGATTATCTCAAAGAATTTTTAAAGGAAGCTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGA
** * * *
17085 CAACTAAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTTGATTTTCAAGAGTTTATTGATGAGTAAGTT
323 CAA-TTGAAATGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTTGATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTC
* * * * * *
17150 CTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATACTTAAATCCTTCGGTTCCTCCATAATTATTT
387 CTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATGCTTAAATCCTTGGGTTCATCTATAAGTCTTT
* * * ** * * *
17215 TGAGA-AAAATGGTAAGCCCTTCTGACCATCCATAAGACCTTC-AGGAAAGATGTTTTTAAATGC
452 CGA-ACAAGATGGTAAGTCCTTGGGACCATCCATAAGACCTTCGA-GTAAGATGTTTTCAAATGA
* * *
17278 GTTTTTAGGAAGTAAGCCTGGTTTTCAAGGGTTTCTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAG
515 GTTTTTAGAAACTAAGCCTGGTTTTCAGGGGTTTCTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAG
* * * *
17343 GAAGTTAAGCCTAATTTTTAGGGGATCCTTGATGACAACTGAAAAAGAAAGATTATAAGAAACTA
580 GAAGCTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTAAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTA
** * * * *
17408 AAATTAATTTTGAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCGGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCAA
645 AGCTTGATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCAT
* * * *
17473 GATGCTTAAATCCTTCGAGTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATAATAAGTACTTTGGGCCATC
710 GATGCTTAAATCCTTCG-GTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTCCTTCGGACCATC
* * * **
17538 CATAAGACCTT-CGAGTAGGATGTTTTCAAATGAGTTTTTA-AAACTAAGTCTGATTTTCAGGTA
774 CATAAGACCTTCCG-GTAAGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGGTTTTCAGGGG
*
17601 TTTCTTGATGATTATCTCCAAA-ACATTTTTAAATGAAG
838 TTTCTTGATGATTATCTCCAAAGA-ATTTTTAAAGGAAG
* * * * *
17639 ATAAGCCTAATTTTTA-GGGTTCCTTGATGAGAACTTAAAACGAAAGATTTTAAGACACTAACCT
1 TTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTGAAAAAGAAAGATTTTAAGACACTAAGCT
* * * * * * *
17703 AGATTTACAAGGGTATCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGTCCATTAGTAAGTCTTTCGAGGATGATG
66 TGATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATG
* ** *
17768 CTTAAATCCATTAGGTAATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATAATAAGTCATTCGGGCCATCCATA
131 CTTAAATCC-TTAGGTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGGTAAGTCCTTCGGGCCATCCATA
** * * * * * *
17833 ACTCCTTCGGGTAAGATGTTTTCAAATGAATTTTTAAAAACTAGGCCTAATTTTTATGGGTTTCT
195 AGACCTTCGGGTAAGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAGGGGTTTCT
* * *
17898 TAATGATTATCTGCAAAGAATTTTCAAAGGAAGCTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGAA
260 TGATGATTATCT-CAAAGAATTTTTAAAGGAAGCTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGAC
* * * * * *
17963 AACTGAAAATGAACGCTTTTAAGACACTAAGCTTGATTTTCAAGTGTTTCTTGAAG-GTTAAGTC
324 AATTG-AAATGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTTGATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAG-TAAGTC
* * * *
18027 CTTCAAGCCATAAATAAGTCTTTCGAGCATGATGCTTAAATCCTTGGGTTCAACTATAAGTCTTT
387 CTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATGCTTAAATCCTTGGGTTCATCTATAAGTCTTT
* * * * * *
18092 CGAACAAGATAGTAAGTCCTTGGGACCATCCATAAGGCCTTCGGGCAGGATGTTTTCAAAAGAGT
452 CGAACAAGATGGTAAGTCCTTGGGACCATCCATAAGACCTTCGAGTAAGATGTTTTCAAATGAGT
* * *
18157 TTTTAGAAACTAAGCCTGGTTTTTAGGGGTTTCTTGATGATTATCT-CGAA-AA--TTTAAAGAA
517 TTTTAGAAACTAAGCCTGGTTTTCAGGGGTTTCTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGA
* *
18218 AGTTAAGCCTAATTTTTAGGTGTTCCTTGATGACAACTAAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAG
582 AGCTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTAAAAAAGAAAGATTTTAAGAAACTAAG
* *
18283 CTTGATTTTCAAGAGTTTATTGATGAGTAAGTTCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGA
647 CTTGATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGA
* * * * * * * *
18348 TACTTAAATCTTTCGGTTCCTCCATAATTCTTTTGAGAAAGATGGTAAGTCCTTCGGACCATCCA
712 TGCTTAAATCCTTCGG-TCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTCCTTCGGACCATCCA
* * * * * * * *
18413 CAAGACCTTCAGGAAAGATGTTTTTAAATGCGTTTTTAGGAAGTAAGCCTGGTTTTTAGGGGTTT
776 TAAGACCTTCCGGTAAGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGGTTTTCAGGGGTTT
* *
18478 CTTGATGATTATCTCCAAAGAATATTTAAAGGAAA
841 CTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAAG
* * * **
18513 TTAAGCCTAATTTTTAGGGGATT-CTTGATGACAACTGAAAACGAAAGATTATAAGAAACTAAAA
1 TTAAGCCTAATTTTTAGGGG-TTCCTTGATGACAACTGAAAAAGAAAGATTTTAAGACACTAAGC
* * *
18577 TTAATTTTGAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCGGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGAT
65 TTGATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGAT
* * * * * * ** *
18642 GCTTAAATCCTTCATGACATCTATAAGTCTTTCGAGAAAAATGGTAAGCCCTT-TGGAAAACCGA
130 GCTTAAATCCTT-AGGTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGGTAAGTCCTTCGGGCCATCC-A
* * *
18706 TAAGACCTTTGGGTAAGATGTTTTCAAAT-ATGTTTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAAGAGTT
193 TAAGACCTTCGGGTAAGATGTTTTCAAATGA-GTTTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAGGGGTT
* * * * *
18770 TCTTGAAT-ATTATCTTCTATGAATTTTTAAATGAAGATAAGCCTAATTTTTAGGGATTCCTTGA
257 TCTTG-ATGATTATC-TCAAAGAATTTTTAAAGGAAGCTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGA
* * * * **
18834 TGAGAATTGAAAATGAAAGATATTAAGAAACTAAGCTTGATTTTCAAGGGTTTCTTGCTGAAAAA
320 TGACAATTG-AAATGAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTTGATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAA
* *
18899 GTCCTTC-GAGACATCAGTAAGTCTTTCGAGCAGGATGCTTAAATCCTTCGGG-TCATCTATAAG
384 GTCCTTCAG-GCCATCAGTAAGTCTTTCGAGCATGATGCTTAAATCCTT-GGGTTCATCTATAAG
* * * * ** * * * *
18962 TCATTCGAGCAAGGTGGTCAGTCCTTCAGACCATCCATAAGACCTTTGGGCATGATG-TTTCAAA
447 TCTTTCGAACAAGATGGTAAGTCCTTGGGACCATCCATAAGACCTTCGAGTAAGATGTTTTCAAA
* * *
19026 TGAGTTTTTAGAAACTAAGTCTGATTTTCAAGGGTTTCTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTA
512 TGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGGTTTTCAGGGGTTTCTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTA
*** * *
19091 ATCAAAGTTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTGAAAAAA-AAATATTTTAAGAA
577 AAGGAAGCTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACT-AAAAAAGAAAGATTTTAAGAA
* * * * *
19155 ACTACGCTTAATTTTCAAGGGTTTCTTGATGAGTAAGTCTTTCGGGCCATCAGTAAGTCTTTCGA
641 ACTAAGCTTGATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCCATCAGTAAGTCTTTCGA
* * ** * * * * *
19220 GCAAGATGTTTAAATTTTTTGGGTCATTTATAAGTCTTTCGTGCAAGATGATAAATCCTT-TGAG
706 GCATGATGCTTAAA-TCCTTCGGTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATAAGTCCTTCGGA-
* * * * * * *
19284 CCATCCATAAAACCTT-CGGGATGGGTGTTTTCAACAT---TTCCTT-----C--A--CTCG-AT
769 CCATCCATAAGACCTTCCGGTA-AGATGTTTTCAA-ATGAGTT-TTTAGAAACTAAGCCTGGTTT
* ** * * * ** ** ***
19335 TCATAGCATTTC--GAATCAGTGA-CGCCTCACCATTGGGGATAA--AA-
831 TCA-GGGGTTTCTTG-ATGA-TTATCTCCAAAGAATT-TTTA-AAGGAAG
* * ** * * * *** ** * *** *
19379 TT--TCCT-TTTCTCAATTCACGGCATT--TCGAATCAGTAA-TGCCCCACTAGAGGGGTTAACA
1 TTAAGCCTAATT-T---TT-A-GGGGTTCCTTG-ATGA-CAACTG-AAAAAGAAAGATTTTAAGA
* * ** * * *
19438 TTTC-CTATGGCTCGATTCACAACA-CTTC--GAATCAGCTTAAGTCCTTC-GAGCCATCAGTAA
57 ---CACTA-AGCTTGATTTTCAAGAGTTTCTTG-ATGAG--TAAGTCCTTCAG-GCCATCAGTAA
* * * *
19498 GTCTTTCGAACATGATGATTAAATCCTTTGAGTCATCTATAAGTCTTTCAAGCAAGATGGTAAGT
114 GTCTTTCGAGCATGATGCTTAAATCCTTAG-GTCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGGTAAGT
** * * * * **
19563 CCTTTAGGCCATCCATAAGACCTTTGGG-CAGAAAGTTTTC-AAT-A--TTTTCGGTACT----C
178 CCTTCGGGCCATCCATAAGACCTTCGGGTAAG-ATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCC
* ***** ** * * * * * *
19619 -GATTCTCAAATCCTTCAGGTAAGATGT-TTTCGAATGAATTTTTACA--AA-CTAAGCTTGATT
242 TGATTTTCAGGGGTTTCTTG-ATGAT-TATCTC-AAAGAATTTTTAAAGGAAGCTAAGCCTAATT
* ** * * * * *
19679 TTTCAGGGGTTTCTTGATGATTATCTCCAAA-G-AA-TTTTTAAAGGAAGCTAAGCCTAATTTT-
304 TTT-AGGGGTTCCTTGATGACAAT-T-GAAATGAAAGATTTT-AA-GAAACTAAGCTTGATTTTC
* *
19740 TAGGGTTTCCTTGATGACAAATGAAAATGAAAGATTTTAAGAAGCTAAGCTTTATTTTCAAGTGT
364 AAGAGTTT-CTTGATG----A-G----T--AAG----T------C----C------TTC-AG-G-
* * * * * *
19805 TTCTTGACGATTAAGTCCTTCGAGCCATCAATAAGTCTTTCGAGCATCATGCTTAAATTCTTTGG
394 -CCAT--C-AGTAAGTCTTTCGAG-CAT-GAT--G-C-TT--A--A--AT-C-------CTTGGG
* * * * *
19870 TTCAACTATAAGTCTTTCGAACAAGATGATAAGTCCTTGGGACCATCCATAAGACCTTTGAGCAG
435 TTCATCTATAAGTCTTTCGAACAAGATGGTAAGTCCTTGGGACCATCCATAAGACCTTCGAGTAA
* ** * * *
19935 GATGTTTTCAAATGCA-ATTTTAGAAACTAAGTTTGGTTTTCATGGATTTCTTGATGATTATCAC
500 GATGTTTTCAAATG-AGTTTTTAGAAACTAAGCCTGGTTTTCAGGGGTTTCTTGATGATTATCTC
* * *
19999 CAAATAATTTTTAAAGGAAGCTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTGAAAACGAA
564 CAAAGAATTTTTAAAGGAAGCTAAGCCTAATTTTTAGGGGTTCCTTGATGACAACTAAAAAAGAA
* * * * **
20064 ATATTTTAAGAAATTAAGCTTGATTTTCAAGTGTTT-TTTATGAGTAAGTCCTTTGGGCCATCAG
629 AGATTTTAAGAAACTAAGCTTGATTTTCAAGAGTTTCTTGATGAGTAAGTCCTTCAGGCCATCAG
* * * * *
20128 TAAGTCTTACAAGCATGATGCTTAAATCCTTCGGTTCCTCTATAATTCTTTCGAACAAGATGATA
694 TAAGTCTTTCGAGCATGATGCTTAAATCCTTCGG-TCATCTATAAGTCTTTCGAGCAAGATGATA
** * * * * *
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758 AGTCCTTCGGACCATCCATAAGACCTTCCGGTAAGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAG
* *
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* * * *
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* * * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * *
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194 AAGACCTTCGGGTAAGATGTTTTCAAATGAGTTTTTAGAAACTAAGCCTGATTTTCAGGGGTTTC
* * *
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* * ** * *
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**
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* * ** * * ** * * *
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* * * * *
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* * * *
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* * * *
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* * ** *
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* * * * * * * * *
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** * *** ** ***** ****
21143 TC----GAATC-AG-TGA-CGCCT-CACCGTAGGGGATAACATTTCG
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** * ** * *** ** * *** *
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* * ** * * * *
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* * * * *
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** * * * * *
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* ***** ** * * * * *
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* ** * * * * * *
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* *
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* * * * * *
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* * * * * * *
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** * *
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* * * * * *
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* * * * * **
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* * * * * *
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** * * *
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* * *
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* ** * * *
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* * * * * * *
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* * * *
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* * * * * *
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** * *
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* **
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AACATTTCCTTCACTCAATTCACAGCATTTCGAATCAGTAACGCCCCACCAGAGGGGAT
Found at i:19841 original size:20 final size:19
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*
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Statistics
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TAAGTCCTTCGAGCATCAA
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22491 A
1 A
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Statistics
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AAACTAAGCTTGATTTTC
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22342 ACTAAGTCTA
22352 ATTTTCAGGGGTTTCTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAAATTAAACCTAATTTTTA
1 ATTTTCAGGGGTTTCTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAAATTAAACCTAATTTTTA
* * * *
22417 GGGTTCCTTGATGAGAACTGAAAACAAAAGATTTTAAGAAACTAAGCTTGATTTTCAAACTAAGC
66 GGGTTCCTTGACGACAACTGAAAACAAAAGAATTTAAGAAACTAAGCTTGATTTTCAAACTAACC
22482 TTG
131 TTG
* *
22485 ATTTTCAGGGGTTTCTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAAGCTT-AGCCTAATTTTT
1 ATTTTCAGGGGTTTCTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAA-ATTAAACCTAATTTTT
*
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65 -AGGGTTCCTTGACGACAACTGAAAACAAAAGAATTTAAGAAACTAAGCTTGATTTTCAA
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Statistics
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ATTTTCAGGGGTTTCTTGATGATTATCTCCAAAGAATTTTTAAAGGAAATTAAACCTAATTTTTA
GGGTTCCTTGACGACAACTGAAAACAAAAGAATTTAAGAAACTAAGCTTGATTTTCAAACTAACC
TTG
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*
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* * **
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22686 TAAGTCTTTCGAGCAAGATGA
1 TAAGTCTTTCGAGCAAGATGA
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Statistics
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TAAGTCTTTCGAGCAAGATGA
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22742 GGGTGTTTTC
* ** * *
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** * * * *
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1 AACATTTCCTTCACTCAATTCACAGCATTTCGAATCAGCAACGCCCCACCAGAGGGGAT
** * * *
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Statistics
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*
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Statistics
Matches: 17, Mismatches: 1, Indels: 1
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TAAGTCCTTCGAGCATCAA
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23696 ATCCCTTTAG
23706 CCAAAAATTCAACCCAAAAGCCTAGATCTAGGATTTTACCTACGTACAACTCGGATTCTAC
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* * *
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1 CCAAAAATTCAACCCAAAAGCCTAGATCTAGGATTTTACCTACGTACAACTCGGATTCT
23826 TTCATTGTTT
Statistics
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27239 GAATAACATG
* * *
27249 AGTGGCATCTTTTATGTCGAAATGCACCGTTAGGCATTTAACTTTCATT
1 AGTGGCACCTTTTATGCCGAAATGCACCGTTATGCATTTAACTTTCATT
*
27298 AGTGGCACCTTTTATGCCGAAATGCATCGTTATGCATTTAACTTTCATT
1 AGTGGCACCTTTTATGCCGAAATGCACCGTTATGCATTTAACTTTCATT
* * *
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1 AGTGGCA-CCTTTTATGCCGAAATGCACCGTTATGCATTTAACTTTCATT
* * *
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* *
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1 AGTGGCACCTTTTATGCCGAAATGCACCGTTATGCATTTAACTTTCATT
**
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1 AGTGGCACCTTTTATGCCGAAATGCACCGTTATGCATTTAACTTTCATT
*
27543 TGTGGCACCTTTTTATGCCGAAATGCACCGTTATGCATTTAACTTTCATT
1 AGTGGCACC-TTTTATGCCGAAATGCACCGTTATGCATTTAACTTTCATT
27593 TTGAGCATTT
Statistics
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30097 TTTGAATCAT
30107 GATACATCTTATCCCACCTA
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30127 GATACATCTTATCCCACCTA
1 GATACATCTTATCCCACCTA
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Statistics
Matches: 28, Mismatches: 0, Indels: 0
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Found at i:34378 original size:49 final size:49
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Indices: 34325--34612 Score: 399
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34315 GAATAACATG
* * *
34325 AGTGGCACCTTTTATGCCGAAATACACCGTTATGTATTTAACTTTCATT
1 AGTGGCACCTTTTATGCTGAAATGCACCGTTATGCATTTAACTTTCATT
* * *
34374 AGTGGCACCTTTTATGCTGAAATACACCGTGATGCATTTAACTTCCATT
1 AGTGGCACCTTTTATGCTGAAATGCACCGTTATGCATTTAACTTTCATT
* * * *
34423 TGTGGCACCTTTTATGCCGAAACGCACCGTTATGCATTTATCTTTCATT
1 AGTGGCACCTTTTATGCTGAAATGCACCGTTATGCATTTAACTTTCATT
* *
34472 AGTGGTACCTTTTATGCTGAAATGCACCG-T-T--A--TAATTTTCATT
1 AGTGGCACCTTTTATGCTGAAATGCACCGTTATGCATTTAACTTTCATT
*
34515 AGTGACACCTTTTATGCTGAAATGCACCGTTATGCATTTAACTTTCATT
1 AGTGGCACCTTTTATGCTGAAATGCACCGTTATGCATTTAACTTTCATT
* *
34564 TGTGGCACCTTTTATGCTGAAATGCACCGTTATGCATTTTACTTTCATT
1 AGTGGCACCTTTTATGCTGAAATGCACCGTTATGCATTTAACTTTCATT
34613 TTAGAGCATT
Statistics
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AGTGGCACCTTTTATGCTGAAATGCACCGTTATGCATTTAACTTTCATT
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Alignment explanation
Indices: 34325--34596 Score: 382
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34315 GAATAACATG
* *
34325 AGTGGCACCTTTTATGCCGAAATACACCGTTATGTATTTAACTTTCATTAGTGGCACCTTTTATG
1 AGTGGCACCTTTTATGCCGAAATGCACCGTTATGCATTTAACTTTCATTAGTGGCACCTTTTATG
*
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66 CTGAAATGCACCGT--T--A--TAACTTCCATT
* * * *
34423 TGTGGCACCTTTTATGCCGAAACGCACCGTTATGCATTTATCTTTCATTAGTGGTACCTTTTATG
1 AGTGGCACCTTTTATGCCGAAATGCACCGTTATGCATTTAACTTTCATTAGTGGCACCTTTTATG
* *
34488 CTGAAATGCACCGTTATAATTTTCATT
66 CTGAAATGCACCGTTATAACTTCCATT
* * *
34515 AGTGACACCTTTTATGCTGAAATGCACCGTTATGCATTTAACTTTCATTTGTGGCACCTTTTATG
1 AGTGGCACCTTTTATGCCGAAATGCACCGTTATGCATTTAACTTTCATTAGTGGCACCTTTTATG
34580 CTGAAATGCACCGTTAT
66 CTGAAATGCACCGTTAT
34597 GCATTTTACT
Statistics
Matches: 158, Mismatches: 16, Indels: 6
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CTGAAATGCACCGTTATAACTTCCATT
Found at i:35035 original size:18 final size:19
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Indices: 34999--35037 Score: 62
Period size: 19 Copynumber: 2.1 Consensus size: 19
34989 TTCTATACTA
34999 TGGTAGCGATACTCATTTT
1 TGGTAGCGATACTCATTTT
*
35018 TGGTATCGATAC-CATTTT
1 TGGTAGCGATACTCATTTT
35036 TG
1 TG
35038 CATTCTAGAA
Statistics
Matches: 19, Mismatches: 1, Indels: 1
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TGGTAGCGATACTCATTTT
Done.