Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: VEPZ01002853.1 Hibiscus syriacus cultivar Beakdansim tig00005872_pilon, whole genome shotgun sequence
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* *
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* *
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* *
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* *
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* *
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*
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*
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* **
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7590 CCGTTGACCG
* ** *
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*
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*
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*
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*
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*
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14957 TGTTGTATAT
* *
14967 ATGAGATTATATCTCCATCCTATTTCTGC
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* * ** *
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16798 TCTTTGAAAA
* * * *
16808 GGTTTTTGAAATGTGAGGAGTTTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTAGGACACCATAAAAATCG
1 GGTTTTTGAAATATGAGAAGTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCG
* * * *
16873 GGTGATTTTAATAAAAATATTTTATTTTCATCAAAATACCAAGTTTTAAGGTATACGAAAATCTA
66 GGTGATTTTAATAAAAACATTTTATTTTTATCAAAATACCATGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTA
* *
16938 GAAATCAAATTCGGGAATTGGTTACGCTTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCC-AAAAT
131 GAAATCAAATTCGGGAGTCGGTTACGCTTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAAT
*
17002 TGGTACCTAGTTGATTACCCTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTTGATCTTTATTTAATTTG
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* * * **
17067 AAAATCATTACGGATGAAAAGTTAGAGAGGGTATTCATTTATTAATGCTAATA-CTATTCACCAG
261 AAAATCATTACGGATGTAAAGTTAAAGAGGGTATTCGTTTATTAATGCTAATAGC-ATTCACCCC
* * * *
17131 TAGCATATATGCGAGGTATTAGCTATTGTGCCTAATAACAAAAAATTGCCTCGATTTTAGAAACA
325 TAGCATAAATGCGAGATATTAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACA
* * * * *
17196 ATGATGTGAATTTGAAAAAGATTTCAACCTATTTTGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCAT
390 ATGATGCGAATTTGAAAAGGATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCAT
* * * *
17261 ACTTGCAGGAGATATACCATTAATTCCCTAATAAGTGAACAATGCCTTAGGTTATAAAAATAAAA
455 ACTTGCAGGAGATATACCATTAATTCCCTAATAAGTGAATATTGCCTTAAGTTTTAAAAATAAAA
* * * * *
17326 TGCAGTTAAACAAATTTTCATTCGTCCAAATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCCCCCTCTATCCTA
520 TGCACTCAAACAAATTTTCATTCGTCCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTA
* * *
17391 AAGTGTCGAATTATAAGAATTAAAGAACCTAAAGGCAAAAACCTAGAAATATAGGTTCTAATATT
585 AAGTGTCGAATTATAAGAATTAAAGAACCTAAAGGCACAAACATAGAAATGTAGGTTCTAATATT
17456 AACCCTATTT
650 AACCCTATTT
* * * ** *
17466 GGTTTTTAAAATATGAGGAGTGTTTACCAATCATTTAAGGTGTGATTGGGACACCATAAAAATCG
1 GGTTTTTGAAATATGAGAAGTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCG
* * * * * *
17531 GGTGATTTTAATAAAAATATTTTCTTTTTTTCAAAATACCAAGTTTTAAGGTATGCGGAAATGTA
66 GGTGATTTTAATAAAAACATTTTATTTTTATCAAAATACCATGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTA
*
17596 GAAATCAAATTCGGGAGTCGGTTACGCGTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAAT
131 GAAATCAAATTCGGGAGTCGGTTACGCTTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAAT
* *
17661 TGGTACCTAGTTAATTACCCTATATTTAAAATTAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTT-ATTTG
196 TGGTACCTAGTTGATTACCCTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTG
*
17725 AAAATCATTACGGATGTAAAGTTATAGAGGGTATTCGTTTATTAATGCTAATAG-ACTTCACCCC
261 AAAATCATTACGGATGTAAAGTTAAAGAGGGTATTCGTTTATTAATGCTAATAGCA-TTCACCCC
* * *
17789 TAGCATAAATGCGAGATATTAGCTATTGTGCTTAATAACCAAATATTACCTTGATTTTAGAAACA
325 TAGCATAAATGCGAGATATTAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACA
* *
17854 ATGATACAAATTTGAAAAGGATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCAT
390 ATGATGCGAATTTGAAAAGGATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCAT
*
17919 ACTTGCAGGAGATATACCATTAATTCTCTAATAAGTGAATATTGCCTTAAGTTTTAAAAATAAAA
455 ACTTGCAGGAGATATACCATTAATTCCCTAATAAGTGAATATTGCCTTAAGTTTTAAAAATAAAA
* *
17984 TACACTCAAACAAATTTTCATTCGTCCAAATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTA
520 TGCACTCAAACAAATTTTCATTCGTCCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTA
* * ** * *
18049 AAGTGTCGAATTATAAGAATTAAAGAAACTAAAGGCACAACCCGAGAAAACGTAAGTTCTAATAT
585 AAGTGTCGAATTATAAGAATTAAAGAACCTAAAGGCACAAACATAG-AAATGTAGGTTCTAATAT
*
18114 TAACCCTATTC
649 TAACCCTATTT
* * * *
18125 GGTTGTTGAAATATGAGAAGTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGAATGGGACACCATACAAATCT
1 GGTTTTTGAAATATGAGAAGTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCG
* *
18190 GGTGATTTTAATAAAAACATTTTATTTTTATCAAAATACCAAGTTTTAAGGAATGCGAAAATCTA
66 GGTGATTTTAATAAAAACATTTTATTTTTATCAAAATACCATGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTA
* * * * *
18255 GAAATCAAATTTGGGACTCGGTTATGCGTGGGGAAGGATTATAACCACCA-AGAGCACCCAAAAA
131 GAAATCAAATTCGGGAGTCGGTTACGCTTGGGGAAGGATTATAACCCCCATA-AGCACCCAAAAA
*
18319 TTGGTACCTAAG-TGATTACCCTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTCGATCTTAATTTAATT
195 TTGGTACCT-AGTTGATTACCCTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATT
*
18383 TGAAAATCATTACGGATGTAAAGTTAAAGAGGTTATTCGTTTATTAATGCTAATAGCATTCACCC
259 TGAAAATCATTACGGATGTAAAGTTAAAGAGGGTATTCGTTTATTAATGCTAATAGCATTCACCC
*
18448 CTAGCATAAATGCGAGATATTAGCTATTGTACCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAAC
324 CTAGCATAAATGCGAGATATTAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAAC
* * *
18513 AATGATGCGAATTTGAAAAGGATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCGGTAGTCACCCACTGAGGA
389 AATGATGCGAATTTGAAAAGGATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCA
* * *
18578 TACTTGCAGGAGATATATCATTAATTCCCTAATAAGTGAACATTGCCTTAGGTTTTAAAAATAAA
454 TACTTGCAGGAGATATACCATTAATTCCCTAATAAGTGAATATTGCCTTAAGTTTTAAAAATAAA
* * ***** * *
18643 CTGCACACAATTTTTTTTTCTTTCGTCCTAATTAACCAAGGGTGTTTTAAGGCTCTCTCTATCCT
519 ATGCACTCAAACAAATTTTCATTCGTCCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCT
*
18708 AAAGTGTCGAATGATAAGAATTAAAGAACCTAAAGGCACAAACATAGAAATGTAGGTTCTAATAT
584 AAAGTGTCGAATTATAAGAATTAAAGAACCTAAAGGCACAAACATAGAAATGTAGGTTCTAATAT
18773 TAACCCTATTT
649 TAACCCTATTT
* * * * *
18784 TGTTTTTGAAATATGAGAAGTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCCATTCGGACACAAAAAAAATCG
1 GGTTTTTGAAATATGAGAAGTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCG
* * * *
18849 GGTGATTTTAATAAAAACATTTTCTTTTTATCAAACTACCATGTTTTAAGGTATGCAAAAATTTA
66 GGTGATTTTAATAAAAACATTTTATTTTTATCAAAATACCATGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTA
* *
18914 GAAATCAAATTCGGGACTCGATTACGCTTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAAT
131 GAAATCAAATTCGGGAGTCGGTTACGCTTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAAT
* * *
18979 TGGTACCTAGTTGATTACCTTATATTTAAAATCAAAAATTTTGAGTTAGATCTTTATTTAATTTG
196 TGGTACCTAGTTGATTACCCTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTG
** *
19044 AAAATCATTACGGATGTAAAGTTAAAGAGGGTATTTATTTATTAATGCTAATAGTATTCACCCCT
261 AAAATCATTACGGATGTAAAGTTAAAGAGGGTATTCGTTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCCT
* * * *
19109 AGCATAAATGCGAGGTATTAGCTATTGTGTCTGATAACCAATTATTGCCTCGATTTTAGAAACAA
326 AGCATAAATGCGAGATATTAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACAA
* * *
19174 TGATACGAATTTGAAAAGGATGTCTACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACACCCTGAGCATA
391 TGATGCGAATTTGAAAAGGATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATA
*
19239 CTTGCAGGAGATGTACCATTAATTCCCTAATAAGTGAATATTGCCTTAAGTTTTAAAAATAAAAT
456 CTTGCAGGAGATATACCATTAATTCCCTAATAAGTGAATATTGCCTTAAGTTTTAAAAATAAAAT
* **
19304 GCACTCAAACAAATTTACATTCGTCCTAACAAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAA
521 GCACTCAAACAAATTTTCATTCGTCCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAA
* ** * *
19369 AGTGTCGAATTATAAGAATTAAAGAACCTAAAGGCACAACCCGAGAAAAGTAAGTTCTAATATTA
586 AGTGTCGAATTATAAGAATTAAAGAACCTAAAGGCACAAACATAGAAATGTAGGTTCTAATATTA
*
19434 ACCCTATTC
651 ACCCTATTT
* * * * * *
19443 GGTTGTT-ATAATGTGAGAAGTCTCAACCAATCATTTAAGGTGCGAATGGGACACCATACAAATA
1 GGTTTTTGA-AATATGAGAAGTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATC
* *
19507 TGGTGATTTTAATAAAAACA--TT-TTTTTATCAAAATACCATGTTTTAAGGAATGCGAAAATCT
65 GGGTGATTTTAATAAAAACATTTTATTTTTATCAAAATACCATGTTTTAAGGTATGCGAAAATCT
* * * * * *
19569 GGAAATCAAATTCGGGACTCGGTTATGCGTGGGGAAGGATTATAACCCCCAAAAGTACCCAAAAA
130 AGAAATCAAATTCGGGAGTCGGTTACGCTTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAA
*
19634 TTGGTACCTAGTTGATTACCCTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTCGATCCTTATTTAATTT
195 TTGGTACCTAGTTGATTACCCTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTT
*
19699 GAAAATCATTACGGATGTAAAGTTAAAGAGGGTATTCGTATATTAATGCTAATAGCATTCACCCC
260 GAAAATCATTACGGATGTAAAGTTAAAGAGGGTATTCGTTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCC
19764 TAGCATAAATGCGAGATATTAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACA
325 TAGCATAAATGCGAGATATTAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACA
* * *
19829 ATGATGCGAATTTGAAAAGTATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCACTGAGGAT
390 ATGATGCGAATTTGAAAAGGATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCAT
** * *
19894 ACTTGCAGGAGATATATAATTAATTCCCTAATAAGTGAACATTGCCTTAGGTTTTAAAAATAAAA
455 ACTTGCAGGAGATATACCATTAATTCCCTAATAAGTGAATATTGCCTTAAGTTTTAAAAATAAAA
* * *
19959 TGCACACAAAAAAATTTTCTTTCGTCCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTA
520 TGCACTCAAACAAATTTTCATTCGTCCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTA
* * *
20024 AAGTATCGAATGAAAAGAATTAAAGAACCTAAAGGCACAAACATAGAAATGTAGGTTCTAATATT
585 AAGTGTCGAATTATAAGAATTAAAGAACCTAAAGGCACAAACATAGAAATGTAGGTTCTAATATT
20089 AACCCTATTT
650 AACCCTATTT
* * * * * * *
20099 TGTTTTTGAAATGTGAGAAGTCTCCACCAATAATTTAAGGTGCCATTAGGACACCAAAAAAATCT
1 GGTTTTTGAAATATGAGAAGTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCG
* * *
20164 GGTGATTTTAATAAAAACATTTT-TTTTTATCAAACTACCATGTTTTAAGGTATGCAAAAATTTA
66 GGTGATTTTAATAAAAACATTTTATTTTTATCAAAATACCATGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTA
* *
20228 GAAATCAAATTCGGGACTCGGTTACGCTTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAACT
131 GAAATCAAATTCGGGAGTCGGTTACGCTTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAAT
*
20293 TGGTACCTAGTTGATTACCCTATATTTAAAATCAAAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTG
196 TGGTACCTAGTTGATTACCCTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTG
* *
20358 AAAATCATTACGGATGTAAAGTTAAAGAGGGTATTCATTTATTAATGCTAATAGTATTCACCCCT
261 AAAATCATTACGGATGTAAAGTTAAAGAGGGTATTCGTTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCCT
* * * * *
20423 AGCATAAATGCGAGGTATTAGCTATTGTGCCTGATAACCAATTATTGCCTTGATTTTATAAACAA
326 AGCATAAATGCGAGATATTAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACAA
* *
20488 TGATACGAATTTGAAAAGGATGTCGACCTATTTCGGGAATCTCCAGTAGTCACCCCCTGAGCATA
391 TGATGCGAATTTGAAAAGGATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATA
* *
20553 CTTGCAGGAGATATACCATTAATTCCCTAATAAGTGAAGATTGCCTTAGGTTTTAAAAATAAAAT
456 CTTGCAGGAGATATACCATTAATTCCCTAATAAGTGAATATTGCCTTAAGTTTTAAAAATAAAAT
* * * *
20618 GCACTCAAACAAATTTTCATTTGTCCTAATTAACCAAGGGTAATTTAAGGCTTTCTCTATCATAA
521 GCACTCAAACAAATTTTCATTCGTCCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAA
** * *
20683 AAAGTCGAATTATAAGAATTAAAGAACCTAAAGGCACAAACCTAGAAATTTAGGTTCTAATATTA
586 AGTGTCGAATTATAAGAATTAAAGAACCTAAAGGCACAAACATAGAAATGTAGGTTCTAATATTA
20748 ACCCTATTT
651 ACCCTATTT
* * * *
20757 GGTTTTTGAAATATGAGAAGCCTCCACGAATCATTTAAGGTACGATTGGGACACCATAAAAATTG
1 GGTTTTTGAAATATGAGAAGTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCG
* * * *
20822 GGTGATTTTAATAAAAACATATTATTTTTATCAAAATACAAAGTTTTAAGGTATGCAAAAATCTA
66 GGTGATTTTAATAAAAACATTTTATTTTTATCAAAATACCATGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTA
* * * * *
20887 GAAATCAAATTCTGGAGACCGTTACACGTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAAT
131 GAAATCAAATTCGGGAGTCGGTTACGCTTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAAT
* *
20952 TGGTACCTAGTTGATTACCCTATATTTAAAATCAGGAATTTTGAGTTTGATCTTTATTTAATTTG
196 TGGTACCTAGTTGATTACCCTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTG
* *
21017 AAAATCATTACGAATGTAAAGTTAAAGAAGGTATTCGTTTATTAATGCTAATAGCACTT-ACCCC
261 AAAATCATTACGGATGTAAAGTTAAAGAGGGTATTCGTTTATTAATGCTAATAGCA-TTCACCCC
* * *
21081 TAGCATAAATGTGAGATATTAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCGTCAATTTTAGAAACA
325 TAGCATAAATGCGAGATATTAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACA
* *
21146 ATGATGCGAATTTGAAAAAGATGTAGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCAT
390 ATGATGCGAATTTGAAAAGGATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCAT
* * * * *
21211 ACTTGCAGGAGATATACCATTAATTCCCTAATAACTGAACAATGCCTTAGGTTTTAGAAATAAAA
455 ACTTGCAGGAGATATACCATTAATTCCCTAATAAGTGAATATTGCCTTAAGTTTTAAAAATAAAA
* * * *
21276 TGCACTCAAACAAATTTTCATTCGTCATAATTAACCAAGGGTTATTTAAGGCCCTTTCTATCCTA
520 TGCACTCAAACAAATTTTCATTCGTCCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTA
* * * *
21341 AAGTATCGAATTATAAGAATTAAAGAACCTAAAGGCACAAACCTAGAAATATAGGTTCTAATATC
585 AAGTGTCGAATTATAAGAATTAAAGAACCTAAAGGCACAAACATAGAAATGTAGGTTCTAATATT
21406 AACCCTATTT
650 AACCCTATTT
* * ** *
21416 GGTTTTTGAAATATGAGGAGTGTTTACCAATCATTTAAGGTGTGATTGGGACACCATAAAAATCG
1 GGTTTTTGAAATATGAGAAGTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCG
* * * * *
21481 GGTGATTTTAATAAAAATATTTTATTTTTTTCAAAATACCAAGTTTTAAGGTATGCGGAAATGTA
66 GGTGATTTTAATAAAAACATTTTATTTTTATCAAAATACCATGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTA
*
21546 GAAATCAAATTCGGGAGTCGGTTACGCGTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAAT
131 GAAATCAAATTCGGGAGTCGGTTACGCTTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAAT
* *
21611 TGGTACCTAGTTAATTACCCTATATTTAAAAAT-AGAAATTTTGAGTTCGATCTTCATTTAATTT
196 TGGTACCTAGTTGATTACCCTATATTT-AAAATCAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTT
* * * * * * *
21675 GTAAATCATTACGGATATAAAGTTAAAGATGGTATTAGTTTATTATTGCTAATAACTTTCACCCC
260 GAAAATCATTACGGATGTAAAGTTAAAGAGGGTATTCGTTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCC
* *
21740 TAGAATAAATGAGAGATATTAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACA
325 TAGCATAAATGCGAGATATTAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACA
* *
21805 ATAATGCGAATTTGAAAAAGATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCAT
390 ATGATGCGAATTTGAAAAGGATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCAT
* * * *
21870 ACTTGAAGGAGATATACAATTAATTTCCTAATAAGTG-ATCATTGCCTT-AGGTTTAAAAATAAA
455 ACTTGCAGGAGATATACCATTAATTCCCTAATAAGTGAAT-ATTGCCTTAAGTTTTAAAAATAAA
*
21933 ATGCACTCAAACAAATTTTCATTCGTCCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTTTCTCTATCCT
519 ATGCACTCAAACAAATTTTCATTCGTCCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCT
* * *
21998 AAAGTATCGAATTATAAGAATTAAAGAACCTAAAGGCACAAACCTAGAAATGTAGGCTCTAATAT
584 AAAGTGTCGAATTATAAGAATTAAAGAACCTAAAGGCACAAACATAGAAATGTAGGTTCTAATAT
22063 TAACCCTATTT
649 TAACCCTATTT
* * *
22074 TGTTTTCGAAATATGAGAAGTCTCCACCAATCGTTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCG
1 GGTTTTTGAAATATGAGAAGTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCG
* * * *
22139 AGTGATTTTAATAAAAACATTTTATTTTTTTCAAAATACCAAGTTTTAAGGTATGCAAAAATCTA
66 GGTGATTTTAATAAAAACATTTTATTTTTATCAAAATACCATGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTA
** * *
22204 GAAATCAAATTTTGGAGTCGGTTACGCTTGGGGAAGGATTCTAACCCCCATAAGCACCCAAAAGT
131 GAAATCAAATTCGGGAGTCGGTTACGCTTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAAT
* * * * * * *
22269 TGGTACATAG--CATTACCCTATATTTAAAATTAGAAATTTTGACTTTGATATTTATTTAATTTC
196 TGGTACCTAGTTGATTACCCTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTG
* * *
22332 AAAATCATTGCGGATGTAAAGTTACAGAGGGTATTTGTTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCCT
261 AAAATCATTACGGATGTAAAGTTAAAGAGGGTATTCGTTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCCT
*
22397 AGCATAAATGCGAGATATTAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTACCTCGATTTTAGAAACAA
326 AGCATAAATGCGAGATATTAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACAA
** * *
22462 TGATATGAATTTGAAAAGAATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACACCCTGAGCATA
391 TGATGCGAATTTGAAAAGGATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATA
*
22527 CTTGCAGGAGATGTACCATTAATTCCCTAATAAGTGAATATTGCCTTAAGTTTTAAAAATAAAAT
456 CTTGCAGGAGATATACCATTAATTCCCTAATAAGTGAATATTGCCTTAAGTTTTAAAAATAAAAT
* * *
22592 GCACACAAACAAATTTTCTTTCATCCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAA
521 GCACTCAAACAAATTTTCATTCGTCCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAA
* * *
22657 AGTGACGAATTATAAAAATTAAAGAACCTAAAGGCATAAACATAGAAATGTAGGTTCTAATATTA
586 AGTGTCGAATTATAAGAATTAAAGAACCTAAAGGCACAAACATAGAAATGTAGGTTCTAATATTA
22722 ACCCTATTT
651 ACCCTATTT
* ** *
22731 GGTTTTTGAAATATGAGAAGTCTCCACCAATCATTTAAGGTACGATCAGGACACCA-AAAAATTA
1 GGTTTTTGAAATATGAGAAGTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAA-TC
* * * *
22795 GGGTGATTTTAGTAAAAACATTTTCTTTTTTATCAAACTACCATGTTTTAAGGAATGCGAAAATC
65 GGGTGATTTTAATAAAAACATTTT-ATTTTTATCAAAATACCATGTTTTAAGGTATGCGAAAATC
* * * *
22860 TAGAAATCAAATTCGGGACTCGGTTATGCGTGGGGAAGGATTATAACCCCCAAAAGCACCCAAAA
129 TAGAAATCAAATTCGGGAGTCGGTTACGCTTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAA
* *
22925 ATTGGTACCT-GATTGATTACCCTATACTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTCGATCCTTATTTAAT
194 ATTGGTACCTAG-TTGATTACCCTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAAT
*
22989 TTGAAAATCATTACGGATGTAAAGTTAAAGAGGGTATTCGTATATTAATGCTAATAGCATTCA-C
258 TTGAAAATCATTACGGATGTAAAGTTAAAGAGGGTATTCGTTTATTAATGCTAATAGCATTCACC
23053 CCTAGCATAAATGCGAGATATTAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAA
323 CCTAGCATAAATGCGAGATATTAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAA
* * *
23118 CAATGATGCGAATTTGAAAAGTATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCACTGAGG
388 CAATGATGCGAATTTGAAAAGGATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGC
** * * *
23183 ATACTTGCAGGAGATATATAATTAATTACCTAATAAGTGAACATTGCCTTAGGTTTTAAAAATAA
453 ATACTTGCAGGAGATATACCATTAATTCCCTAATAAGTGAATATTGCCTTAAGTTTTAAAAATAA
* *
23248 AATGCACACAAA-AAATTTTTCTTTCGTCCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATC
518 AATGCACTCAAACAAA-TTTTCATTCGTCCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATC
*
23312 CTAAAGTGTCGAATGATAAGAATTAAAGAACCTAAAGGCACAAACATAGAAATGTAGGTTCTAAT
582 CTAAAGTGTCGAATTATAAGAATTAAAGAACCTAAAGGCACAAACATAGAAATGTAGGTTCTAAT
23377 ATTAACCCTATTT
647 ATTAACCCTATTT
* * * * *
23390 TGTTTTTGAAATGTGAGAAGTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCCATTAGGACACCAAAAAAATCG
1 GGTTTTTGAAATATGAGAAGTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCG
** * *
23455 GGTGATTTTAATAAAAACATTTT-TTTTTATCAATCTACCATGTTTTAAGGTATGCAAAAATTTA
66 GGTGATTTTAATAAAAACATTTTATTTTTATCAAAATACCATGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTA
* * * *
23519 GAAATCAAATTCGGGACTCGGTTTCGCTTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCGAAAACT
131 GAAATCAAATTCGGGAGTCGGTTACGCTTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAAT
*
23584 TGGTACCTAGTTGATTACCCTATATTTAAAATCAAAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTG
196 TGGTACCTAGTTGATTACCCTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTG
* *
23649 AAAATCATTACGGATGTAAAGTTAAAGAGGGTATTCATTTATTAATGCTAATAGTATTCACCCCT
261 AAAATCATTACGGATGTAAAGTTAAAGAGGGTATTCGTTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCCT
* * * * *
23714 AGCATAAATGCGAGGTATTATCTATTGTGCCTGATAACCAATTATTGCCTCGATTTTATAAACAA
326 AGCATAAATGCGAGATATTAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACAA
* * * *
23779 TGATACGAATTTGAAAAGGACGTCGACCTATTTCGGGAATCTCCAGTAGTCACCCCCTGAGCCTA
391 TGATGCGAATTTGAAAAGGATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATA
* * *
23844 CTTGCAGGATATATACCATTAATTCCCTAATAAGTGAAGATTGCCTTAGGTTTTAAAAATAAAAT
456 CTTGCAGGAGATATACCATTAATTCCCTAATAAGTGAATATTGCCTTAAGTTTTAAAAATAAAAT
* * * *
23909 GCACTCAAACAAATTTTCATTTGTCCTAATTAACCAAGGGTAATTTAAGGCTTTCTCTATCATAA
521 GCACTCAAACAAATTTTCATTCGTCCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAA
* *
23974 AGTGTTGAATTATAAGAATTAAAGAACCTAAAGGCACAAACCTAGAAAT-TAGGTTCTAATATTA
586 AGTGTCGAATTATAAGAATTAAAGAACCTAAAGGCACAAACATAGAAATGTAGGTTCTAATATTA
24038 ACCCTATTT
651 ACCCTATTT
* * * *
24047 GGTTTTTGAAATATGAGAAGCCTCCACGAATCATTTAAGGTACGATTGGGACACCATAAAAATTG
1 GGTTTTTGAAATATGAGAAGTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCG
* * *
24112 GGTGATTTTAATAAAAAACATATTATTTTTATCAAAATACAAAGTTTTAAGGTATGCGAAAATCT
66 GGTGATTTTAAT-AAAAACATTTTATTTTTATCAAAATACCATGTTTTAAGGTATGCGAAAATCT
* * * *
24177 AGAAATCAAATTCTGGAGTCGGTTACACGTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCTCCCAAAAA
130 AGAAATCAAATTCGGGAGTCGGTTACGCTTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAA
* *
24242 TTGGTACCTAGTTGATTACCCTATATTTAAAATCAGGAATTTTGAGTTTGATCTTTATTTAATTT
195 TTGGTACCTAGTTGATTACCCTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTT
* * *
24307 GAAAATCATTACGAATGTAAAGTTAAAGAGGGTATTCATTTATTAATGCTAATAGCATTTACCCC
260 GAAAATCATTACGGATGTAAAGTTAAAGAGGGTATTCGTTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCC
* *
24372 TAGCATAAATGCGAGATATTAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCGTCAATTTTAGAAACA
325 TAGCATAAATGCGAGATATTAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACA
* **
24437 ATGATGCGAATTTCAAAAATATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCAT
390 ATGATGCGAATTTGAAAAGGATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCAT
* * * *
24502 ACTTGCAGGAGATATACCATTAATTCCCTAATAACTGAACATTGCCTTAGGTTTTAGAAATAAAA
455 ACTTGCAGGAGATATACCATTAATTCCCTAATAAGTGAATATTGCCTTAAGTTTTAAAAATAAAA
* * * *
24567 TGCACTCAAACAAATTTTCATTCGTCATAATTAACCAAGGGTTATTTAAGGCCCTTTCTATCCTA
520 TGCACTCAAACAAATTTTCATTCGTCCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTA
* * * *
24632 AAGTATCGAATTATAAGAATTAAAGAACCTAAAGGCACAAACCTAGAAATATAGGTTCTAATATC
585 AAGTGTCGAATTATAAGAATTAAAGAACCTAAAGGCACAAACATAGAAATGTAGGTTCTAATATT
24697 AACCCTATTT
650 AACCCTATTT
* * * **
24707 GGTTTTTGAAATGTGAGGAGTGTTTACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCG
1 GGTTTTTGAAATATGAGAAGTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCG
* * * * * *
24772 GGTGATTTTAATAAACATATTTTCTTTTTTTCAAAATACCAAGTTTTAAGGTATGCGGAAATCTA
66 GGTGATTTTAATAAAAACATTTTATTTTTATCAAAATACCATGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTA
* * *
24837 GAAATCAAATTCGGGAGTCGGTTACGCGTGGGGAAGGATTATAACCCCAATAAGCACCCAAATAT
131 GAAATCAAATTCGGGAGTCGGTTACGCTTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAAT
* *
24902 TGGTACCTAGTTAATTACCCTATATTTAAAAAT-AGAAATTTTGAGTTCGATCTTCATTTAATTT
196 TGGTACCTAGTTGATTACCCTATATTT-AAAATCAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTT
* * * * * * *
24966 GTAAATCATTACGGATATAAAGTTAAAGATGGTATTAGTTTATTATTGCTAATAACTTTCACCCC
260 GAAAATCATTACGGATGTAAAGTTAAAGAGGGTATTCGTTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCC
* * *
25031 TAGAATAAATGAGAGATATTAGCTATTGTTCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACA
325 TAGCATAAATGCGAGATATTAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACA
* * *
25096 ATAATGCGAATTTGAAAAAGATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTGGTCACCCCCTGAGCAT
390 ATGATGCGAATTTGAAAAGGATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCAT
* * * *
25161 ACTTGCAAGAGATATACAATTAATTTCCTAATAAGTG-ATCATTGCCTT-AGGTTTAAAAATAAA
455 ACTTGCAGGAGATATACCATTAATTCCCTAATAAGTGAAT-ATTGCCTTAAGTTTTAAAAATAAA
* *
25224 ATGCACTCAAACAAATTTTCATTCGTCCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGTCTTTCTCTATCCT
519 ATGCACTCAAACAAATTTTCATTCGTCCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCT
* *
25289 AAAGTATCGAATTATAAGAATTAAAGAACCTAAAGGCACAAACCTAGAAATGTAGGTTCTAATAT
584 AAAGTGTCGAATTATAAGAATTAAAGAACCTAAAGGCACAAACATAGAAATGTAGGTTCTAATAT
25354 TAACCCTATTT
649 TAACCCTATTT
* * *
25365 TGTTTTCGAAATATGAGAAGTCTCCACCAATCGTTTAAGGTG-GAATTGGGACACCATAAAAATC
1 GGTTTTTGAAATATGAGAAGTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCG-ATTGGGACACCATAAAAATC
** * * *
25429 GAATGATTTTAATAAAAACATTTTATTTTTTTCAAAATACCAAGTTTTAAGGTATGCAAAAATCT
65 GGGTGATTTTAATAAAAACATTTTATTTTTATCAAAATACCATGTTTTAAGGTATGCGAAAATCT
*
25494 AGAAATCAAATAT-GGGAGTCGGTTACGCTTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCTAAAA
130 AGAAATCAAAT-TCGGGAGTCGGTTACGCTTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAA
* * * * *
25558 ATTGGTACATAGTTCATTACCCTATATTTAAAATTAGAAATTTTGACTTTGATCTTTATTTAATT
194 ATTGGTACCTAGTTGATTACCCTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATT
* *
25623 TCAAAATCATTACGGATGTAAAGTTACAGAGGGTATTCGTTTATTAATGCTAATAGCATTCACCC
259 TGAAAATCATTACGGATGTAAAGTTAAAGAGGGTATTCGTTTATTAATGCTAATAGCATTCACCC
*
25688 CTAGCATAAATGCGAGATATTAGATATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAAC
324 CTAGCATAAATGCGAGATATTAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAAC
25753 AATGATGCGAATTTGAAAAGGATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCA
389 AATGATGCGAATTTGAAAAGGATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCA
* * *
25818 TACTTGCAGGAGATATACCATTAATTCCCTAATAAGTGAAAATTGCCTTAGGTTATAAAAATAAA
454 TACTTGCAGGAGATATACCATTAATTCCCTAATAAGTGAATATTGCCTTAAGTTTTAAAAATAAA
* *
25883 ATGCAGTCAAACAAATTTTCATTCGTCCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCCCTCTCTATCCT
519 ATGCACTCAAACAAATTTTCATTCGTCCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCT
* *
25948 AAAGTGTCGAATTATGAGAATTAAAGAACCTAAAGGCACAAACCTAGAAATGTAGGTTCTAATAT
584 AAAGTGTCGAATTATAAGAATTAAAGAACCTAAAGGCACAAACATAGAAATGTAGGTTCTAATAT
*
26013 TAACCCTATTC
649 TAACCCTATTT
* * * * * *
26024 GATTGTTGAAATGTGAGAAGTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGAATGGGACACCATACAAATCT
1 GGTTTTTGAAATATGAGAAGTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCG
26089 GGTGATTTTAATAAAAACATTTTATTTTTATCAAAATACCATGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTA
66 GGTGATTTTAATAAAAACATTTTATTTTTATCAAAATACCATGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTA
* * * * *
26154 GAAATCAAATTCGGGAGTCGATTAAGCTTGGGGAATGATTACAA-CCCCGTAAGCACCCAAAAAT
131 GAAATCAAATTCGGGAGTCGGTTACGCTTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAAT
* * * *
26218 TTGTACCTAGTTGATTACCCTATACTTAAAATCATAAATTTTGAGTTTGATCTTTATTTAATTTG
196 TGGTACCTAGTTGATTACCCTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTG
* * * *
26283 AAAATCATTACGGATGTATATTTAAAGAGGGTATTCATTTATTAATGCTAATAGTATTCACCCCT
261 AAAATCATTACGGATGTAAAGTTAAAGAGGGTATTCGTTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCCT
* *
26348 AGCATAAATGCGA-AGTATTAACTATTGTGCCTAATAACTAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACA
326 AGCATAAATGCGAGA-TATTAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACA
* * *
26412 ATGATACGAATTTGAATAGGATGTCGAACTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCAT
390 ATGATGCGAATTTGAAAAGGATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCAT
* * *
26477 ACTTACAGGAGATATACCATTAATTCCATAATAAGTGAATATTGCCATAAGTTTTAAAAATAAAA
455 ACTTGCAGGAGATATACCATTAATTCCCTAATAAGTGAATATTGCCTTAAGTTTTAAAAATAAAA
*
26542 TGCACTCAAACAAATTTTCATTCGTCCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGACTCTCTCTATCCTA
520 TGCACTCAAACAAATTTTCATTCGTCCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTA
*
26607 AAGTGTCGAATTATAAAAATTAAAGAACCTAAAGGCACAAACATAGAAATGTAGGTTCTAATATT
585 AAGTGTCGAATTATAAGAATTAAAGAACCTAAAGGCACAAACATAGAAATGTAGGTTCTAATATT
26672 AACCCTATTT
650 AACCCTATTT
*
26682 GGTTTTTGAAATATGAGAAGTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTAGGACACCA-AAAAATTC
1 GGTTTTTGAAATATGAGAAGTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAA-TC
* * *
26746 GGGTGATTCTAATAAAAACATTTTCTTTTTATCAAACTACCATGTTTTAAGGTATGCGAAAATCT
65 GGGTGATTTTAATAAAAACATTTTATTTTTATCAAAATACCATGTTTTAAGGTATGCGAAAATCT
* * * *
26811 AGAAATCAAATTCGGGACTCGGCTACGCTTGGGGAAGTATTATAACGCCCATAAGCACCCAAAAA
130 AGAAATCAAATTCGGGAGTCGGTTACGCTTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAA
*
26876 TTGGTACCTTGTTGATTACCCTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTT
195 TTGGTACCTAGTTGATTACCCTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTT
* * * *
26941 TAAAATTATTACGGATATAAAGTTAAAGAGGGTATTCGTTTATTAATGCTAATAACATTCACCCC
260 GAAAATCATTACGGATGTAAAGTTAAAGAGGGTATTCGTTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCC
*
27006 TAACATAAATGCGAGATATTAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACA
325 TAGCATAAATGCGAGATATTAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACA
* * * *
27071 ATGATGCGAATTTGAAAAGGATGTCGACCTATTTCAGGAATCACCAGTAGTTACCCCCTGGGTAT
390 ATGATGCGAATTTGAAAAGGATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCAT
* * *
27136 ACTTGCAGGAGATATATCATTAATTCCCTAATAAGTGAACATTGCCTTAGGTTTTAAAAATAAAA
455 ACTTGCAGGAGATATACCATTAATTCCCTAATAAGTGAATATTGCCTTAAGTTTTAAAAATAAAA
* * * * * *
27201 TTCACACAAACAAATTTTCTTTCATCCTAATTAACCAAGGGTCATTTAAGGATCTCTCTATCCTA
520 TGCACTCAAACAAATTTTCATTCGTCCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTA
* * *
27266 AAGTGTCGAATTATAAAAATTAAATAACCTAAAGGCACAAACATAGAAATGTAGGTTTTAATATT
585 AAGTGTCGAATTATAAGAATTAAAGAACCTAAAGGCACAAACATAGAAATGTAGGTTCTAATATT
27331 AACCCTATTT
650 AACCCTATTT
* *
27341 GGTTTTTGAAATATGAGAAGTCTCCACCAATCATTTAACGTGCGATTGGGACACCATAAAAATTG
1 GGTTTTTGAAATATGAGAAGTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCG
* * *
27406 GGTGATTTTAATAAAAACATTTTCTTTTTTTATCAAAATTCCAAGTTTTAAGGTATGCGAAAATC
66 GGTGATTTTAATAAAAACA-TTT-TATTTTTATCAAAATACCATGTTTTAAGGTATGCGAAAATC
** * * *
27471 TAGAAATCAAATTCGACAGTCGGTTATGCGTGGGGAAGGATTACAACCCCCATAAGCACCCAAAA
129 TAGAAATCAAATTCGGGAGTCGGTTACGCTTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAA
* * * *
27536 ATTGGTACCTAGTTGATTACCCTATATTTAAAACCAGAAATTTTGAGCTCGATCTATATTAAATT
194 ATTGGTACCTAGTTGATTACCCTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATT
* * * *
27601 TGAAAATCATTACGGAAT-TAAAGTGAAAAAGGGTATTCATTTATTAATGCTAATAGCATTCATC
259 TGAAAATCATTACGG-ATGTAAAGTTAAAGAGGGTATTCGTTTATTAATGCTAATAGCATTCACC
* * *
27665 CCTAGCATAAATGCGAGATATTAGCTATTGTGCCTAGTAACCAAATATTGCCTCAATTTTATAAA
323 CCTAGCATAAATGCGAGATATTAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAA
* *
27730 CAATGATGCGAATTTGAAAAGGATATCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACTCCCTGAGC
388 CAATGATGCGAATTTGAAAAGGATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGC
* * * * *
27795 ATACTTGCAAGAGATATACCATTAATTCTCTAATAAGTGAACATTTCCTTAGGTTTTAAAAATAA
453 ATACTTGCAGGAGATATACCATTAATTCCCTAATAAGTGAATATTGCCTTAAGTTTTAAAAATAA
* * *
27860 ACTGCACTCAAACAAATTTTCATTCGTCCTAATTAACCAAGGGTGCTTTAAGGCTATCTCTATCC
518 AATGCACTCAAACAAATTTTCATTCGTCCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCC
* * *
27925 TAAAGTGTCGAATTATAATAATTAAAGAACCTAAAGGCACAAACATAAAAATATAGGTTCTAATA
583 TAAAGTGTCGAATTATAAGAATTAAAGAACCTAAAGGCACAAACATAGAAATGTAGGTTCTAATA
*
27990 TTAACCCTATCT
648 TTAACCCTATTT
* * * * *
28002 GGTTTTCGAAATGTGAGGAGTCCCCACCAATCTTTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCG
1 GGTTTTTGAAATATGAGAAGTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCG
* ** * * * *
28067 GGTAATTTTAATAAAAATGTTATATTTTTATCAAAATACCAAGTTTTAAGGTGTG-TAAAATTCT
66 GGTGATTTTAATAAAAACATTTTATTTTTATCAAAATACCATGTTTTAAGGTATGCGAAAA-TCT
* * * *
28131 AGAAATCAAATTCAGGAGTCGGTTACGCATGGGGAAGAATTATAACCCCCATGAGCACCCAAAAA
130 AGAAATCAAATTCGGGAGTCGGTTACGCTTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAA
*
28196 TTGGTACCTAGTTGATTACCCTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTTGATCTTTATTTAATTT
195 TTGGTACCTAGTTGATTACCCTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTT
* *
28261 GAAAATCATTACGGATGTAAAGTTAAAGTGGGTATTCGTTTATTAATGCTAATAGCGTTCACCCC
260 GAAAATCATTACGGATGTAAAGTTAAAGAGGGTATTCGTTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCC
*
28326 TAGCATAAATTCGAGATATTAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACA
325 TAGCATAAATGCGAGATATTAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACA
* *
28391 ATGATACGAATTTGAAAAGGATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAATAGTCACCCCCTGAGCAT
390 ATGATGCGAATTTGAAAAGGATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCAT
* * *
28456 ACTTACATGAGATATACCATTAATTCCCTAATAAGTGAATATTGCCTAAAGTTTTAAAAATAAAA
455 ACTTGCAGGAGATATACCATTAATTCCCTAATAAGTGAATATTGCCTTAAGTTTTAAAAATAAAA
*
28521 TGCACTCAAACAAATTTTCATTCGTCCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAAGCTCTCTCTATCCTA
520 TGCACTCAAACAAATTTTCATTCGTCCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTA
* *
28586 AAGTGTCGAATTATAAAAATTAAAGAACCTAAAGGCATAAACATAGAAATGTAGGTTCTAATATT
585 AAGTGTCGAATTATAAGAATTAAAGAACCTAAAGGCACAAACATAGAAATGTAGGTTCTAATATT
28651 AACCCTATTT
650 AACCCTATTT
* * *
28661 GGTTTTTGAAATATGATAAGTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTAGGACACCA-AACAATTC
1 GGTTTTTGAAATATGAGAAGTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAA-AAATC
* * * * * * * *
28725 AGGTGATTTTAATAAAAATATTTTCTTTTTATCAAACTACCATGTCTTAAGATATGCAAAAATAT
65 GGGTGATTTTAATAAAAACATTTTATTTTTATCAAAATACCATGTTTTAAGGTATGCGAAAATCT
*
28790 AGAAATCAAATTCGGGACTCGGTTACGCTTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAA
130 AGAAATCAAATTCGGGAGTCGGTTACGCTTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAA
* *
28855 TTGGTACCTAGTTGATTACCCTATATTTAAAATTAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTATTTT
195 TTGGTACCTAGTTGATTACCCTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTT
*
28920 GAAAATCATT-CAGATGTAAAGTTAAAGAGGGTATTCGTTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCC
260 GAAAATCATTACGGATGTAAAGTTAAAGAGGGTATTCGTTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCC
* *
28984 TAGCATAATTGCGAGATATTAGCTATTGTGCCTAAAAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACA
325 TAGCATAAATGCGAGATATTAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACA
* * *
29049 ATGATGTGGATTTGAAAAGGATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAG-ATGTCACCCCCTTAGCA
390 ATGATGCGAATTTGAAAAGGATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTA-GTCACCCCCTGAGCA
29113 TACTTGCAGGAGATATACCATTAATTCCCTAATAAGTGAATATTGCCTTAAGTTTTAAAAATAAA
454 TACTTGCAGGAGATATACCATTAATTCCCTAATAAGTGAATATTGCCTTAAGTTTTAAAAATAAA
* * *
29178 ATGCACTCAGACAAATTTTCATTTGTCCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTTTATCCT
519 ATGCACTCAAACAAATTTTCATTCGTCCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCT
* * *
29243 AATGTGTTGAATTATAAGAATTAAAGAACCTAAAGGCAC-AACCTGAGAAATGTAGGTTCTAATA
584 AAAGTGTCGAATTATAAGAATTAAAGAACCTAAAGGCACAAACAT-AGAAATGTAGGTTCTAATA
*
29307 TTAACCCTATTC
648 TTAACCCTATTT
* * * * *
29319 GGTTGTTGAAATGTGAGAAGTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGAATGGGACACCATACAAATCT
1 GGTTTTTGAAATATGAGAAGTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCG
29384 GGTGATTTTAATAAAAACATTTTATTTTTATCAAAATACCATGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTA
66 GGTGATTTTAATAAAAACATTTTATTTTTATCAAAATACCATGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTA
* * * *
29449 GAAATCAAATTCGGGAGTCGGTTAAGCTTGGGGAATGATTATAA-CCCCGTAAGCACCCAAAACT
131 GAAATCAAATTCGGGAGTCGGTTACGCTTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAAT
* * * *
29513 TTGTACCTAGTTGATTACCCTATACTTAAAATCATAAATTTTGAGTTTGATCTTTATTTAATTTG
196 TGGTACCTAGTTGATTACCCTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTG
* * * *
29578 AAAATCATTACGGATGTATATTTAAAGAGGGTATTCATTTATTAATGCTAATAGTATTCACCCCT
261 AAAATCATTACGGATGTAAAGTTAAAGAGGGTATTCGTTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCCT
*
29643 AGCATAAATGCGA-AGTATTAGCTATTGTGCCTAATAACTAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACA
326 AGCATAAATGCGAGA-TATTAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACA
* *
29707 ATGATACGAATTTGAAAAGGATGTCGACCTATTTCGGGAATCACAAGTAGTCACCCCCTGAGCAT
390 ATGATGCGAATTTGAAAAGGATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCAT
* *
29772 ACTTACAGGAGATGTACCATTAATTCCCTAATAAGTGAATATTGCCTTAAGTTTTAAAAATAAAA
455 ACTTGCAGGAGATATACCATTAATTCCCTAATAAGTGAATATTGCCTTAAGTTTTAAAAATAAAA
29837 TGCACTCAAACAAATTTTCATTCGTCCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTA
520 TGCACTCAAACAAATTTTCATTCGTCCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTA
* * *
29902 AAGTGACGAATTATAAAAATTAAAGAACCTAAAGGCATAAACATAGAAATGTAGGTTCTAATATT
585 AAGTGTCGAATTATAAGAATTAAAGAACCTAAAGGCACAAACATAGAAATGTAGGTTCTAATATT
29967 AACCCTATTT
650 AACCCTATTT
* ** *
29977 GGTTTTTGAAATATGAGAAGTCTCCACCAATCATTTAAGGTACGATCAGGACACCA-AAAAATTA
1 GGTTTTTGAAATATGAGAAGTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAA-TC
* * *
30041 GGGTGATTTTAGTAAAAACATTTTCTTTTTTATCAAACTACCATGTTTTAAGGTATGCGAAAATC
65 GGGTGATTTTAATAAAAACATTTT-ATTTTTATCAAAATACCATGTTTTAAGGTATGCGAAAATC
* * *
30106 TAGAAATCAAATTCGGGACTCGGTTACGCTTGGGGAATGATTATAACCCCCATAAGCACCTAAAA
129 TAGAAATCAAATTCGGGAGTCGGTTACGCTTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAA
*
30171 ATTGATACCTAGTTGATTACCCTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATT
194 ATTGGTACCTAGTTGATTACCCTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATT
**
30236 TGAAAATCATTACGGATGTAAAGTTAAAGAGGGTATTCGTTTATTAATGAAAATAGCATTCACCC
259 TGAAAATCATTACGGATGTAAAGTTAAAGAGGGTATTCGTTTATTAATGCTAATAGCATTCACCC
*
30301 CTAGCATAAATGCGAGATATTTAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTTGATTTTAGAAA
324 CTAGCATAAATGCGAGATA-TTAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAA
* *
30366 CAATGATGCGAATTTGAAAAGGATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGAAGTCACCCCCTTAGC
388 CAATGATGCGAATTTGAAAAGGATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGC
*
30431 ATACTTGCACGAGATATACCATTAATTCCCTAATAAGTGAATATTGCCTTAAGTTTTAAAAATAA
453 ATACTTGCAGGAGATATACCATTAATTCCCTAATAAGTGAATATTGCCTTAAGTTTTAAAAATAA
*
30496 AATGCACTCAAACAAATTTTCATTTGTCCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCC
518 AATGCACTCAAACAAATTTTCATTCGTCCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCC
* **
30561 TAAAGTGTCGAATTATAATAATTAAAGAACCTAAAGGCA-AAACCCGAGAAATGTAGGTTCTAAT
583 TAAAGTGTCGAATTATAAGAATTAAAGAACCTAAAGGCACAAA-CATAGAAATGTAGGTTCTAAT
30625 ATTAACCCTATTCT
647 ATTAACCCTATT-T
* * * * * *
30639 -GTTGTTGAAATGTGAGAAGTCTTCACCAATCATTTAAGGTGCGAATGGGACACCATACAAATCT
1 GGTTTTTGAAATATGAGAAGTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCG
**
30703 GGTGATTTTAAGGAAAACATTTTATTTTTATCAAAATACCATGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTA
66 GGTGATTTTAATAAAAACATTTTATTTTTATCAAAATACCATGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTA
* * *
30768 GAAATCAATTTCGGGAGTTGGTTACGCTTGGGGAATGATTATAA-CCCCATAAGCACCCAAAAAT
131 GAAATCAAATTCGGGAGTCGGTTACGCTTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAAT
* * * * *
30832 TTGTACCTAGTTGATTACCCTATACTTAAAATCATAAATTTTGAGTTTGTTCTTTATTTAATTTG
196 TGGTACCTAGTTGATTACCCTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTG
* * *
30897 AAAATCATTACGGATGTATAGTTAAAGAGGGTATTCATTTATTAATGCTAATAGTATTCACCCCT
261 AAAATCATTACGGATGTAAAGTTAAAGAGGGTATTCGTTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCCT
* * **
30962 AGCATAAATGCGAGGTATTAGCTATTGTGCCTAATAACTAAATATTGAATCGATTTTAGAAACAA
326 AGCATAAATGCGAGATATTAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACAA
* * *
31027 TGATACGAATTTGAAAAGGATGTCGACCTATTACGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTAAGCATA
391 TGATGCGAATTTGAAAAGGATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATA
* *
31092 CTTACAGGAGATATACCATTAATTCCCTAATAAGTGAATACTGCCTTAAGTTTTAAAAATAAAAT
456 CTTGCAGGAGATATACCATTAATTCCCTAATAAGTGAATATTGCCTTAAGTTTTAAAAATAAAAT
*
31157 GCACTCAAACAAATTTTCATTCGTTCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAA
521 GCACTCAAACAAATTTTCATTCGTCCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAA
* * * * *
31222 AGTGTCGAATTATAAAAACTAAAGAACCTAATGGTACAAACATAGAAATATAGGTTCTAATATTA
586 AGTGTCGAATTATAAGAATTAAAGAACCTAAAGGCACAAACATAGAAATGTAGGTTCTAATATTA
31287 ACCCTATTT
651 ACCCTATTT
* *
31296 GGTTTTTGAAATATGAGAAGTCTCCACCAATCATTTAAGGTGTGATTAGGACACCA-AAAAATTC
1 GGTTTTTGAAATATGAGAAGTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAA-TC
* * *
31360 GGGTGATTTTAGTAAAAACATTTTCTTTTTATCAAACTACCATGTTTTAAGGTATGCGAAAATCT
65 GGGTGATTTTAATAAAAACATTTTATTTTTATCAAAATACCATGTTTTAAGGTATGCGAAAATCT
* * *
31425 AGAAATCAAATTCGGGACTCGGTTACGCTTGGGGAAAGATTATAACCCCCATAAGCACCTAAAAA
130 AGAAATCAAATTCGGGAGTCGGTTACGCTTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAA
*
31490 TTGATACCTAGTTGATTACCCTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTT
195 TTGGTACCTAGTTGATTACCCTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTT
* * *
31555 GAAAATAATTACGGATGTAAAGTTAAAGAGGGTATTCGTTTATTAATGATAATAGCATTCACCCG
260 GAAAATCATTACGGATGTAAAGTTAAAGAGGGTATTCGTTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCC
*
31620 TGGCATAAATGCGAGATATTAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACA
325 TAGCATAAATGCGAGATATTAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACA
* * * *
31685 TTGATGTGAATTTGAAAAGGATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTTACCCCCTGAGGAT
390 ATGATGCGAATTTGAAAAGGATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCAT
* *
31750 ACTTGCAGGAGATATATCATTAATTCCCTAATAAGTGAATATTGCCTTAGGTTTTAAAAATAAAA
455 ACTTGCAGGAGATATACCATTAATTCCCTAATAAGTGAATATTGCCTTAAGTTTTAAAAATAAAA
* * *
31815 TGCACACAAACAAATTTTCTTTCATCCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTA
520 TGCACTCAAACAAATTTTCATTCGTCCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTA
*
31880 AAGTGTCGAATTATAAAAATTAAAGAACCTAAAGGCACAAACATAGAAATGTAGGTTCTAATATT
585 AAGTGTCGAATTATAAGAATTAAAGAACCTAAAGGCACAAACATAGAAATGTAGGTTCTAATATT
31945 AACCCTATTT
650 AACCCTATTT
* *
31955 GGTTTTTGAAATATGAGAAGTCTCCACCAATCATTTAACGTGCGATTGGGACACCATAAAAATTG
1 GGTTTTTGAAATATGAGAAGTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCG
* * *
32020 GGTGATTTTAATAAAAAAAAAATTATT-TTTTTATCAAAATTCCAAGTTTTAAGGTATGCGAAAA
66 GGTGATTTTAAT---AAAAACATT-TTATTTTTATCAAAATACCATGTTTTAAGGTATGCGAAAA
* * * * *
32084 TCTAGAAATCAAATTCGGGAGTCGGTTGCGCGTAGGGAAGGATTATAACACCTATAAGCACCCAA
127 TCTAGAAATCAAATTCGGGAGTCGGTTACGCTTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAA
* * *
32149 AAATTGGTACATAGTTGATTACCCTGA-ATTTAAAATTAGAAATTTAGAGTTCGATCTTTATTTA
192 AAATTGGTACCTAGTTGATTACCCT-ATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTA
* * *
32213 ATTTGAAAATCATTACGGATGTAAAGTTACAGAGGGTATTCCTTTATTAATGTTAATAGCATTCA
256 ATTTGAAAATCATTACGGATGTAAAGTTAAAGAGGGTATTCGTTTATTAATGCTAATAGCATTCA
* *
32278 CCACTAGCATAAATGCGAGATATTAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTACCTCGATTTTAGA
321 CCCCTAGCATAAATGCGAGATATTAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGA
** *
32343 AACAATGATATGAATTTGAAAAGGATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACACCCTGA
386 AACAATGATGCGAATTTGAAAAGGATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGA
* * *
32408 GCATACTTGCAGGAGATGTACCATTAATTTCCAAATAAGTGAATATTGCCTTAAGTTTTAAAAAT
451 GCATACTTGCAGGAGATATACCATTAATTCCCTAATAAGTGAATATTGCCTTAAGTTTTAAAAAT
* *
32473 AAAATGCACTCAAACAAATTTACATTCGTCCTAACTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTAT
516 AAAATGCACTCAAACAAATTTTCATTCGTCCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTAT
* ** **
32538 CCTAAAGTGTCGAATTATAAGAATTAAAGAACCTAAAGGCACAACCCGAGAAACATAGGTTCTAA
581 CCTAAAGTGTCGAATTATAAGAATTAAAGAACCTAAAGGCACAAACATAGAAATGTAGGTTCTAA
* *
32603 TTTTAACCCTATTC
646 TATTAACCCTATTT
* * * * *
32617 GGTTGTTGAAATGTGAGAAGTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGAATGGGACACCATACAAATCT
1 GGTTTTTGAAATATGAGAAGTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCG
*
32682 GGTGATTTTAATAAAAACATTTTATTTTTATCAAAATACCATGTTTTAAGGAATGCGAAAATCTA
66 GGTGATTTTAATAAAAACATTTTATTTTTATCAAAATACCATGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTA
* * *
32747 GAAAACAAATTCGGGAGTCGGTTACGCTTGGGGAATGATTATAA-CCCCATAAGCACCCAAAATT
131 GAAATCAAATTCGGGAGTCGGTTACGCTTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAAT
* * ** * *
32811 TTGTACCTAGTTGATTACCCTATATTTAAAATCATAAATTTTGAGTTTAATCTTTATTTAATCTA
196 TGGTACCTAGTTGATTACCCTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTG
* * * * * *
32876 AAAATCATTACAGATGTATAGTTAAAGAGGGTATTCATTTACTAAAGCTAATAGTATTCACCCCT
261 AAAATCATTACGGATGTAAAGTTAAAGAGGGTATTCGTTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCCT
*
32941 AGCATAAATGCGAGGTATTAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACAA
326 AGCATAAATGCGAGATATTAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACAA
*
33006 TGATACGAATTTGAAAAGGATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCA-CCCC----C-TA
391 TGATGCGAATTTGAAAAGGATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATA
33065 --T--A--AG------C----A--CCC-----A---AATATTGCCTTAAGTTTTAAAAATAAAAT
456 CTTGCAGGAGATATACCATTAATTCCCTAATAAGTGAATATTGCCTTAAGTTTTAAAAATAAAAT
*
33104 GCACTCAAACAAATTTTCAATCGTCCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAA
521 GCACTCAAACAAATTTTCATTCGTCCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAA
*
33169 AGTGTCGAATTATAAAAATTAAAGAACCTAAAGGCACAAACATAGAAATGTAGGTTCTAATATTA
586 AGTGTCGAATTATAAGAATTAAAGAACCTAAAGGCACAAACATAGAAATGTAGGTTCTAATATTA
33234 ACCCTATTT
651 ACCCTATTT
* * **
33243 GGTTTTTGAAATATGAGAAGTCTCCACCAAACATTTAAGGTGCGATTAGGACACCA-AAACCTTC
1 GGTTTTTGAAATATGAGAAGTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAA-AATC
* * *
33307 GGGTGATTTTAATAAAAACATTTTCTTTTTATCAAACTACCATGTCTTAAGGTATGCGAAAATCT
65 GGGTGATTTTAATAAAAACATTTTATTTTTATCAAAATACCATGTTTTAAGGTATGCGAAAATCT
* * * *
33372 AGAAATCAAAATT-GGGACTCGGTTAAGCTTGGGGAAGTATTATAACCCCCATAAGAACCCAAAA
130 AGAAATC-AAATTCGGGAGTCGGTTACGCTTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAA
33436 ATTGGTACCTAGTTGATTACCCTATATTTAAAATCA-AAACTTTTGAGTTCGATCTTTATTTAAT
194 ATTGGTACCTAGTTGATTACCCTATATTTAAAATCAGAAA-TTTTGAGTTCGATCTTTATTTAAT
* * * *
33500 TTTAAAATCATTACGGATATAAAGTTAAAGTGGGTATTCATTTATTAATGCTAATAGCATTCACC
258 TTGAAAATCATTACGGATGTAAAGTTAAAGAGGGTATTCGTTTATTAATGCTAATAGCATTCACC
*
33565 CCTAGCATAAATGCGAGATATTAGCTATTGTGCCTAAAAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAA
323 CCTAGCATAAATGCGAGATATTAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAA
* *
33630 CAATGATGTGGATTTGAAAAGGATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGC
388 CAATGATGCGAATTTGAAAAGGATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGC
*
33695 ATACTTACAGGAGATATACCATTAATTCCCTAATAAGTGAATATTGCCTTAAGTTTTAAAAATAA
453 ATACTTGCAGGAGATATACCATTAATTCCCTAATAAGTGAATATTGCCTTAAGTTTTAAAAATAA
33760 AATGCACTCAAACAAATTTTCATTCGTCCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCC
518 AATGCACTCAAACAAATTTTCATTCGTCCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCC
* *
33825 TAAAGTGTCGAATTATAAGAATTAAAGAACCTAAAGGCAC-AACCTGTGAAATGTAGGTTCTAAT
583 TAAAGTGTCGAATTATAAGAATTAAAGAACCTAAAGGCACAAACAT-AGAAATGTAGGTTCTAAT
*
33889 ATTAACCCTATTC
647 ATTAACCCTATTT
* * * * * * *
33902 GGTTGTTGAAATGTGAGAAGTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGAATGAGACATCATACAAATCT
1 GGTTTTTGAAATATGAGAAGTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCG
*
33967 GGTGATTTTAATAAAAACATTTTATTTTTATCAAAATACCATGTTTTAAGGTATGCAAAAATCTA
66 GGTGATTTTAATAAAAACATTTTATTTTTATCAAAATACCATGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTA
* * ** * *
34032 GAAATCAAATTCGGGAGTCGATTAAGCTTGGGGAATAATTACAA-CCCCGTAAGCACCCAAAAAT
131 GAAATCAAATTCGGGAGTCGGTTACGCTTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAAT
* * * * *
34096 TTGTACCTAGTTGATTACCCTATACTTAAAATCATAAATTTTCAGTTTGATCTTTATTTAATTTG
196 TGGTACCTAGTTGATTACCCTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTG
* * * * * *
34161 AAAATCATTATGGATGTATATTTAAAGAGGGTATTCATTTATTAATGCTAATAGTATTCACCCTT
261 AAAATCATTACGGATGTAAAGTTAAAGAGGGTATTCGTTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCCT
*
34226 AGCATAAATGCGA-AGTATTAGCTATTGTGCCTAATAACTAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACA
326 AGCATAAATGCGAGA-TATTAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACA
* * *
34290 ATGATACGAATTTGAATAGGATGTCGAACTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCAT
390 ATGATGCGAATTTGAAAAGGATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCAT
*
34355 ACTTACAGGAGATATACCATTAATTCCCTAATAAGTGAATATTGCCTTAAGTTTTAAAAATAAAA
455 ACTTGCAGGAGATATACCATTAATTCCCTAATAAGTGAATATTGCCTTAAGTTTTAAAAATAAAA
*
34420 TGCACTCAAACAAATTTTCATTCGTCCTAATTAACCAATGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTA
520 TGCACTCAAACAAATTTTCATTCGTCCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTA
*
34485 AAGTGTCGAATTATAAAAATTAAAGAACCTAAAGGCACAAACATAGAAATGTAGGTTCTAATATT
585 AAGTGTCGAATTATAAGAATTAAAGAACCTAAAGGCACAAACATAGAAATGTAGGTTCTAATATT
34550 AACCCTATTT
650 AACCCTATTT
*
34560 GGTTTTTGAAATATGAGAAGTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTAGGACACCA-AAAAATTC
1 GGTTTTTGAAATATGAGAAGTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAA-TC
* * *
34624 GGGTGATTCTAATAAAAACATTTTCTTTTTATCAAACTACCATGTTTTAAGGTATGCGAAAATCT
65 GGGTGATTTTAATAAAAACATTTTATTTTTATCAAAATACCATGTTTTAAGGTATGCGAAAATCT
* * *
34689 AGAAATCAAATTCGGGACTCGGTAACGCTTGGGGAAGGATTATAACGCCCATAAGCACCCAAAAA
130 AGAAATCAAATTCGGGAGTCGGTTACGCTTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAA
* *
34754 TTGGTACCTAGTTGATTACCCTATATTTAAAATCAGATATTTTGAGTTCGATCTTAATTTAATTT
195 TTGGTACCTAGTTGATTACCCTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTT
*
34819 GAAAATCATTTCGGATGTAAAGTTAAAGAGGGTATTCGTTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCC
260 GAAAATCATTACGGATGTAAAGTTAAAGAGGGTATTCGTTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCC
*
34884 TGGCATAAATGCGAGATATTAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACA
325 TAGCATAAATGCGAGATATTAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACA
*
34949 ATGATGCGAATTTGAAAAGGATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTTACCCCCTGAGCAT
390 ATGATGCGAATTTGAAAAGGATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCAT
* * *
35014 ACTTGCAGGAGATATATCATTAATTCCCTAATAAGTGAACATTGCCTTAGGTTTTAAAAATAAAA
455 ACTTGCAGGAGATATACCATTAATTCCCTAATAAGTGAATATTGCCTTAAGTTTTAAAAATAAAA
* * * * *
35079 TTCACACAAACAAATTTTCTTTCATCCTAATTAACCAAGGGTCATTTAAGGCTCTCTCTATCCTA
520 TGCACTCAAACAAATTTTCATTCGTCCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTA
*
35144 AAGTGTCGAATTATAAAAATTAAAGAACCTAAAGGCACAAACATAGAAATGTAGGTTCTAATATT
585 AAGTGTCGAATTATAAGAATTAAAGAACCTAAAGGCACAAACATAGAAATGTAGGTTCTAATATT
35209 AACCCTATTT
650 AACCCTATTT
* *
35219 GGTTTTTGAAATATGAGAAGTCTCCACCAATCATTTAACGTGCGATTGGGACACCATAAAAATTG
1 GGTTTTTGAAATATGAGAAGTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCG
* * * *
35284 GGTGATTTTAATAAAAACATTTTCTTTTTTATCAAAATTCTAAGTTTTAAGGTATGCGAAAATCT
66 GGTGATTTTAATAAAAACATTTT-ATTTTTATCAAAATACCATGTTTTAAGGTATGCGAAAATCT
**
35349 AGAAATCAAATTCGGGAGTCGGTTACGAGTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAA
130 AGAAATCAAATTCGGGAGTCGGTTACGCTTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAA
* *
35414 TTGGTACCTAGTTGATTACCCTATATTTAAAACCA-AAACTTTTGAGTTCGATCTTTATTAAATT
195 TTGGTACCTAGTTGATTACCCTATATTTAAAATCAGAAA-TTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATT
* * * * *
35478 TAAAAATCATTACGGAAT-TAAAGTGAAAAAGGGTATTCATTTATTAATGCTAATAGCATTCATC
259 TGAAAATCATTACGG-ATGTAAAGTTAAAGAGGGTATTCGTTTATTAATGCTAATAGCATTCACC
*
35542 CCTAGCATAAATAG-GAGATATTAGCTATTGTGCCTAATAACAAAATATTGCCTCGATTTTAGAA
323 CCTAGCATAAAT-GCGAGATATTAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAA
* * *
35606 ACAATGATGCAAATTTGAAAAGGATATCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACTCCCTGAG
387 ACAATGATGCGAATTTGAAAAGGATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAG
* * **
35671 CATACTTGCAAGAGATATACCATTAATTCCCTAATAAGTGAACATTGCCTTTGGTTTTAAAAATA
452 CATACTTGCAGGAGATATACCATTAATTCCCTAATAAGTGAATATTGCCTTAAGTTTTAAAAATA
* *
35736 AAATGCACTAAAACAAATTTTCATTCGTCCTAATTAACCAAGGGTGCTTTAAGGCTCTCTCTATC
517 AAATGCACTCAAACAAATTTTCATTCGTCCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATC
* *
35801 CTAAAGTGTCGAATTATAATAATTAAAGAACCTAAAGGCACAAACATAGAAATATAGGTTCTAAT
582 CTAAAGTGTCGAATTATAAGAATTAAAGAACCTAAAGGCACAAACATAGAAATGTAGGTTCTAAT
*
35866 ATTAACCCTATCT
647 ATTAACCCTATTT
* * * * * *
35879 GGTTTTCGAAATGTGAGGAGTCCCCACCAATCTTTTAAGGTGCGAATGGGACACCATAAAAATCG
1 GGTTTTTGAAATATGAGAAGTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCG
* * * * * * **
35944 GGTAATTTTAATAAAAATATTATATTTTTATTAAAATACCAAGTTTTAAGGTGTGTAAAAATCTA
66 GGTGATTTTAATAAAAACATTTTATTTTTATCAAAATACCATGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTA
* * * * *
36009 GAAATCAAATTCAGGAGTCGGGTACGCATGGGGAAGAATTATAACCCCCATGAGCACCCAAAAAT
131 GAAATCAAATTCGGGAGTCGGTTACGCTTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAAT
*
36074 TGGTACCTAGTTGATTACCCTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTTGATCTTTATTTAATTTG
196 TGGTACCTAGTTGATTACCCTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTG
* *
36139 AAAATCATTACGAATGTAAAGTTAAAGAGGGTATTCGTTTATTAATGCTAATAGCGTTCACCCCT
261 AAAATCATTACGGATGTAAAGTTAAAGAGGGTATTCGTTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCCT
* *
36204 AGCATAAATTCTAGATATTAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACAA
326 AGCATAAATGCGAGATATTAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACAA
*
36269 TGATACGAATTTGAAAAGGATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATA
391 TGATGCGAATTTGAAAAGGATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATA
* *
36334 CTTACAAGAGATATACCATTAATTCCCTAATAAGTGAATATTGCCTTAAGTTTTAAAAATAAAAT
456 CTTGCAGGAGATATACCATTAATTCCCTAATAAGTGAATATTGCCTTAAGTTTTAAAAATAAAAT
36399 GCACTCAAACAAATTTTCATTCGTCCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAA
521 GCACTCAAACAAATTTTCATTCGTCCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAA
* *
36464 AGTGTCGAATTATAAAAATTAAAGAACCTAAAGGCATAAACATAGAAATGTAGGTTCTAATATTA
586 AGTGTCGAATTATAAGAATTAAAGAACCTAAAGGCACAAACATAGAAATGTAGGTTCTAATATTA
36529 ACCCTATTT
651 ACCCTATTT
* *
36538 GGTTTTTGAAATATGATAAGTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTAGGACACCA-AAAAATTC
1 GGTTTTTGAAATATGAGAAGTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAA-TC
* * * * *
36602 GGGTGATTTTAATAAAAACATTTTGTTTTTATCAAACTACCATGTCTTAAGGTATGCCAAAATAT
65 GGGTGATTTTAATAAAAACATTTTATTTTTATCAAAATACCATGTTTTAAGGTATGCGAAAATCT
* * *
36667 AGAAATCAAATTCGGGACTCGGTTACGTTTGGGGAAGGATTATAACCCCCATGAGCACCCAAAAA
130 AGAAATCAAATTCGGGAGTCGGTTACGCTTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAA
*
36732 TTGGTACCTAGTTGATTACCCTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTTGATCTTTATTTAATTT
195 TTGGTACCTAGTTGATTACCCTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTT
*
36797 GAAAATCATTACGGGTGTAAAGTTAAAGAGGGTATTCGTTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCC
260 GAAAATCATTACGGATGTAAAGTTAAAGAGGGTATTCGTTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCC
* *
36862 TAGCATAAATGCGAGATATTTAGCTATTGTGCCTAATAACTAAATATTGCATCGATTTTAGAAAC
325 TAGCATAAATGCGAGATA-TTAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAAC
* * *
36927 AATGATACAAATTTGAAAAGGATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGAAGTCACCCCCTGAGCA
389 AATGATGCGAATTTGAAAAGGATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCA
* * * *
36992 TACTTACAAGAGATAAACCATTAAATCCCTAATAAGTGAATATTGCCTTAAGTTTTAAAAATAAA
454 TACTTGCAGGAGATATACCATTAATTCCCTAATAAGTGAATATTGCCTTAAGTTTTAAAAATAAA
* * *
37057 ATGCACTCAAAAAAATTTTCATTCGCCCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGACTCTCTCTATCCT
519 ATGCACTCAAACAAATTTTCATTCGTCCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCT
* *
37122 AAAGTGTCGAATTATAAAAATTAAAGAACCTAAAGGCATAAACATAGAAATGTAGGTTCTAATAT
584 AAAGTGTCGAATTATAAGAATTAAAGAACCTAAAGGCACAAACATAGAAATGTAGGTTCTAATAT
37187 TAACCCTATTT
649 TAACCCTATTT
* * *
37198 GGTTTTTGAAATATGAGAAGTCTCCACCAATCATTTAAGGTACGATTAGGACACCA-AAAAATTA
1 GGTTTTTGAAATATGAGAAGTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAA-TC
* ** *
37262 GGGTGATTTTAGTAAAAACATTCTCT-TTTTTATCAACCTACCATGTTTTAAGGTATGCGAAAAC
65 GGGTGATTTTAATAAAAACATT-T-TATTTTTATCAAAATACCATGTTTTAAGGTATGCGAAAAT
* * * * *
37326 CTAGAAATCAAAGTCGGGACTCGGTTACGCTTGGGGAATGATTATAATCCCCATAAGCACCTAAA
128 CTAGAAATCAAATTCGGGAGTCGGTTACGCTTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAA
* * *
37391 AATTGATACCTAGTTGATTACCCTATATTTAAAATTAGAAATTTTGAGTTTGATCTTTATTTAAT
193 AATTGGTACCTAGTTGATTACCCTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAAT
*
37456 TTGAAAATCATTACGGATGTAAAGTTAAAGAGGGTATTCGTTTATTAATGATAATAGCATTCACC
258 TTGAAAATCATTACGGATGTAAAGTTAAAGAGGGTATTCGTTTATTAATGCTAATAGCATTCACC
*
37521 CCTAGCATAAATGCGAGATATTTAGCTATTGTGCATAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAA
323 CCTAGCATAAATGCGAGATA-TTAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAA
* *
37586 ACAATGATGCGAATTTGAAAAGGATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGAAGTCACCCCCTTAG
387 ACAATGATGCGAATTTGAAAAGGATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAG
37651 CATACTTGCAGGAGATATACCATTAATTCCCTAATAAGTGAATATTGCCTTAAGTTTTAAAAATA
452 CATACTTGCAGGAGATATACCATTAATTCCCTAATAAGTGAATATTGCCTTAAGTTTTAAAAATA
* *
37716 AAATGCACTCAAACAAATTTTCGTTTGTCCTAATTAACCAAGGGTGAT
517 AAATGCACTCAAACAAATTTTCATTCGTCCTAATTAACCAAGGGTGAT
37764 AAAATGCACC
Statistics
Matches: 18539, Mismatches: 1619, Indels: 277
0.91 0.08 0.01
Matches are distributed among these distances:
625 2 0.00
626 307 0.02
627 249 0.01
628 4 0.00
629 1 0.00
632 1 0.00
633 2 0.00
634 2 0.00
635 1 0.00
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637 1 0.00
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640 1 0.00
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648 1 0.00
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650 1 0.00
651 3 0.00
652 2 0.00
653 1 0.00
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663 3 0.00
ACGTcount: A:0.36, C:0.16, G:0.16, T:0.32
Consensus pattern (659 bp):
GGTTTTTGAAATATGAGAAGTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCG
GGTGATTTTAATAAAAACATTTTATTTTTATCAAAATACCATGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTA
GAAATCAAATTCGGGAGTCGGTTACGCTTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAAT
TGGTACCTAGTTGATTACCCTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTG
AAAATCATTACGGATGTAAAGTTAAAGAGGGTATTCGTTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCCT
AGCATAAATGCGAGATATTAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACAA
TGATGCGAATTTGAAAAGGATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATA
CTTGCAGGAGATATACCATTAATTCCCTAATAAGTGAATATTGCCTTAAGTTTTAAAAATAAAAT
GCACTCAAACAAATTTTCATTCGTCCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAA
AGTGTCGAATTATAAGAATTAAAGAACCTAAAGGCACAAACATAGAAATGTAGGTTCTAATATTA
ACCCTATTT
Found at i:42854 original size:657 final size:659
Alignment explanation
Indices: 37776--46125 Score: 12592
Period size: 658 Copynumber: 12.7 Consensus size: 659
37766 AATGCACCCG
* *
37776 AGAAATGTAGGTTCTAATATTAACCCTATTCT-GTTGTTGAAATGTGAGAAGTCTTCACCAATCA
1 AGAAATGTAGGTTCTAATATTAACCCTATT-TGGTTTTTGAAATGTGAGAAGTCTCCACCAATCA
* * **
37840 TTTAAGGTGCGAATGGGACACCATACAAATCTGGTGATTTTAAGGAAAACATTTTATTTTTATCA
65 TTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCTGGTGATTTTAATAAAAACATTTTATTTTTATCA
*
37905 AAATACCATGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTAGAAATCAATTTCGGGAGTCGGTTACGCTTGGGG
130 AAATACCATGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTAGAAATCAAATTCGGGAGTCGGTTACGCTTGGGG
* * *
37970 AATGATTATAA-CCCCATAAGCACCCAAAAATTTGTACCTAGTTGATTACCCTATACTTAAAATC
195 AAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAATTGGTACCTAGTTGATTACCCTATATTTAAAATC
* * *
38034 ATAAATTTTGAGTTTGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTACGGATGTATAGTTAAAGAGGGTA
260 AGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTACGGATGTAAAGTTAAAGAGGGTA
*
38099 TTCATTTATTAATGCTAATAGTATTCACCCCTAGCATAAATGCGAGGTATTAGCTATTGTGCCTA
325 TTCATTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCCTAGCATAAATGCGAGGTATTAGCTATTGTGCCTA
* ** *
38164 ATAACTAAATATTGAATCGATTTTAGAAACAATGATACGAATTTGAAAAGGATGTCGACCTATTA
390 ATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACAATGATACGAATTTGAAAAGGATGTCGACCTATTT
*
38229 CGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATACTTACAGGAGATATACCATTAATTCCCTAATAA
455 CGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATACTTGCAGGAGATATACCATTAATTCCCTAATAA
* * * *
38294 GTGAATACTGCCTTAAGTTTTAAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTTCATTCGTTCTAATTAA
520 GTGAACATTGCCTTAGGTTTTAAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTTCATTCGTCCTAATTAA
* * *
38359 CCAACGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGTGTCGAATTATAAAAACTAAAGAACCTAATG
585 CCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGTGTCGAATTATAAAAATTAAAGAACCTAAAG
38424 GCACAAACAT
650 GCACAAACAT
* *
38434 AGAAATATAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTGAAATATGAGAAGTCTCCACCAATCAT
1 AGAAATGTAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTGAAATGTGAGAAGTCTCCACCAATCAT
* * * *
38499 TTAAGGTGCGATTAGGACACCA-AAAAATTCGGGTGATTTTAGTAAAAACATTTTCTTTTTATCA
66 TTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAA-TCTGGTGATTTTAATAAAAACATTTTATTTTTATCA
* *
38563 AACTACCATGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTAGAAATCAAATTCGGGACTCGGTTACGCTTGGGG
130 AAATACCATGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTAGAAATCAAATTCGGGAGTCGGTTACGCTTGGGG
* * * *
38628 AAAGATTATAACCCCCATAAGCACCTAAAATTTGATACCTAGTTGATTACCCTATATTTAAAATC
195 AAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAATTGGTACCTAGTTGATTACCCTATATTTAAAATC
* *
38693 AAAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATAATTACGGATGTAAAGTTAAAGAGGGTA
260 AGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTACGGATGTAAAGTTAAAGAGGGTA
* * * * * *
38758 TTCGTTTATTAATGATAATAGCATTCACCCGTGGCATAAATGCGAGATATTATCTATTGTGCCTA
325 TTCATTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCCTAGCATAAATGCGAGGTATTAGCTATTGTGCCTA
* **
38823 ATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACATTGATGTGAATTTGAAAAGGATGTCGACCTATTT
390 ATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACAATGATACGAATTTGAAAAGGATGTCGACCTATTT
* * *
38888 CGGGAATCACCAGTAGTTACCCCCTGAGCATACTTGCAGGAGATATATCATTAATTCCGTAATAA
455 CGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATACTTGCAGGAGATATACCATTAATTCCCTAATAA
* * *
38953 GTGAATATTGCCTTAGGTTTTAAAAATAAAATGCACACAAAC-AATTTTC-TTCATCCTAATTAA
520 GTGAACATTGCCTTAGGTTTTAAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTTCATTCGTCCTAATTAA
* *
39016 GCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGTGTCGAATTATAAAAATTAAAGAACCTAAAC
585 CCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGTGTCGAATTATAAAAATTAAAGAACCTAAAG
39081 GCACAAACAT
650 GCACAAACAT
* *
39091 AGAAATATAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTGAAATATGAGAAGTCTCCACCAATCAT
1 AGAAATGTAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTGAAATGTGAGAAGTCTCCACCAATCAT
* *
39156 TTAACGTGCGATTGGGACACCAT---AAT-TGGGTAATTTTAATAAAAAC-TTTTATTTTTATCA
66 TTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCT-GGTGATTTTAATAAAAACATTTTATTTTTATCA
* * **
39216 AAATTA-CAAGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTAGAAATCAAATTCTGGAGTCGGTTACGAGTGGG
130 AAA-TACCATGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTAGAAATCAAATTCGGGAGTCGGTTACGCTTGGG
* * *
39280 GAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAATTGGTTCCTAGTTTATTACCCTATATTTAAAAC
194 GAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAATTGGTACCTAGTTGATTACCCTATATTTAAAAT
* * * *
39345 CAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTGAATTTGAAAAACATTACGGAAT-TAAAGTGAAAAAGGG
259 CAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTACGG-ATGTAAAGTTAAAGAGGG
* * *
39409 TATTCATTTATTAATGCTAAT-GCATTTATCCCTAGCATAAATGCGAGATATTAGCTATTGTGCC
323 TATTCATTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCCTAGCATAAATGCGAGGTATTAGCTATTGTGCC
* * *
39473 TAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACAATGATGCGAATTTGAAATGGATATCGACCTAT
388 TAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACAATGATACGAATTTGAAAAGGATGTCGACCTAT
** * *
39538 TTCGGGAATCACCAGTAGTCACTTCTTGAGCATACTTGCAAGAGATATACCATTAATTCCCTAAT
453 TTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATACTTGCAGGAGATATACCATTAATTCCCTAAT
*
39603 AAGTGAACATTGCCTTAGGTTTTAAAAATAAAATGCACTCAAACCAATTTTCATTCGTCCTAATT
518 AAGTGAACATTGCCTTAGGTTTTAAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTTCATTCGTCCTAATT
* * ** *
39668 AACCAAGGGTGCTTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAACTGTAAAATTATAATAATTAAAGAACCTAA
583 AACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGTGTCGAATTATAAAAATTAAAGAACCTAA
39733 AGGCACAAACAT
648 AGGCACAAACAT
* * * * * * * *
39745 AGAAATGTAAGTTCTAATATTAACCCAATTTGTTTTTTGAAATCTGAGGAGTATCTACCAATCAC
1 AGAAATGTAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTGAAATGTGAGAAGTCTCCACCAATCAT
* * * * *
39810 TTAATGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCGGGTAATTTTAATAAAAATATTTTATTTTTATCAT
66 TTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCTGGTGATTTTAATAAAAACATTTTATTTTTATCAA
* * * * *
39875 AATACCAAGTTTTAAGGTGTG-TAAAATTCTAGAAATCAAATTC-AGAGTCGGTTACGCATGGGG
131 AATACCATGTTTTAAGGTATGCGAAAA-TCTAGAAATCAAATTCGGGAGTCGGTTACGCTTGGGG
* *
39938 -A--ATTATAACCCCCATGAGCACCCAAAAATTGGTACCTAGTTGATTACTCTATATTTAAAATC
195 AAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAATTGGTACCTAGTTGATTACCCTATATTTAAAATC
* * *
40000 AGAAATTTTGAGTTTGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTACAGATGTAAAGTTAAAGTGGGTA
260 AGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTACGGATGTAAAGTTAAAGAGGGTA
* * *
40065 TTCGTTTATTAATGCTAATAGCGTTCTCCCCTAGCATAAATGCGAGGTATTAGCTATTGTGCCTA
325 TTCATTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCCTAGCATAAATGCGAGGTATTAGCTATTGTGCCTA
* * * * *
40130 ATAACTAAATATTGCCTCGATTTTAGAAATATTGATGCGAATTTTAAAAGGATGTCGACCTATTT
390 ATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACAATGATACGAATTTGAAAAGGATGTCGACCTATTT
*
40195 CGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATACTTGCAGGGGATATACCATTAATTCCCTAATAA
455 CGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATACTTGCAGGAGATATACCATTAATTCCCTAAT-A
*
40260 AATGAACATTGCCTTAGGTTCTT-AAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTTCATTCGTCCTAATT
519 AGTGAACATTGCCTTAGGTT-TTAAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTTCATTCGTCCTAATT
** * * * * * *
40324 CCCCAAGGTTTATTTAAGGCTCTCTTTATCCTAAAGTGTCGAATTATAAGAGTTAAAGAACCTAT
583 AACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGTGTCGAATTATAAAAATTAAAGAACCTAA
*
40389 AGGCACAAATAT
648 AGGCACAAACAT
* **
40401 AGAAATGTAGGTTCTAATATTAACCCTGTTTGGTTTTTGAAATGTGAGAAACCTCCACCAATCAT
1 AGAAATGTAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTGAAATGTGAGAAGTCTCCACCAATCAT
* * * * * *
40466 TTAAGGTGCCATTAGGACACCAAAAAAATCGGGTAATTTTAATAAAAACATTTTCTTTTTATCAA
66 TTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCTGGTGATTTTAATAAAAACATTTTATTTTTATCAA
* * *
40531 ACTACCATGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTAGAAATCAAATTCGGGACTCGGATACGCTTGGGGA
131 AATACCATGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTAGAAATCAAATTCGGGAGTCGGTTACGCTTGGGGA
*
40596 AGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAACATTGGTACCTAGTTGATTACCCTATATTTAAAATCA
196 AGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAATTGGTACCTAGTTGATTACCCTATATTTAAAATCA
*
40661 GAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTTAAAATCATTACGGATGTAAAGTTAAAGAGGGTAT
261 GAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTACGGATGTAAAGTTAAAGAGGGTAT
* *
40726 TCATTTATTAATGCTAATAGTATTCACCCCTAGCATAAATGCGAGGTATTAGCTATAGTGCCTAA
326 TCATTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCCTAGCATAAATGCGAGGTATTAGCTATTGTGCCTAA
* *
40791 TAACCAATTATTGCCTCGATTTTAGAAACAATGATACGAATTTGAAAAGGATGTCGACCTATTTA
391 TAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACAATGATACGAATTTGAAAAGGATGTCGACCTATTTC
* **
40856 GGGAATCTCCAGTAGT-AAACCCTGAGCATACTTGCAGGAGATATACCATTAATTCCCTAATAAG
456 GGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATACTTGCAGGAGATATACCATTAATTCCCTAATAAG
* *
40920 TGAACATTGCCTTAGGTTTTAAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTTCATTTGTCGTAATTAAC
521 TGAACATTGCCTTAGGTTTTAAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTTCATTCGTCCTAATTAAC
*
40985 CAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGTGTCGAATTATAAGAATTAAAGAACCTAAAGG
586 CAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGTGTCGAATTATAAAAATTAAAGAACCTAAAGG
* **
41050 CACAACCCG
651 CACAAACAT
* * * * * *
41059 AGAAATATAGGTTCTAATATTAACCATATTCGATTGTTGAACTGTGAGAAGTCTCCACCAATCAT
1 AGAAATGTAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTGAAATGTGAGAAGTCTCCACCAATCAT
* * *
41124 TTAAGGTGCGAATGGGACACCATACAAATCTGGTGATTTTAATGAAAACATTTTATTTTTATCAA
66 TTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCTGGTGATTTTAATAAAAACATTTTATTTTTATCAA
* * *
41189 AATACCATTTTTTAAGGTATTCGAAAATCTAGAAATCAAATTCGGGAGTTGGTTACGCTTGGGGA
131 AATACCATGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTAGAAATCAAATTCGGGAGTCGGTTACGCTTGGGGA
* * *
41254 ATGATTATAA-CCCCATAAGCACCCAAAAATTGGTACCTAGTTGATCACCTTATATTTAAAATCA
196 AGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAATTGGTACCTAGTTGATTACCCTATATTTAAAATCA
*
41318 GAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTACGGATGTATAGTTAAAGAGGGTAT
261 GAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTACGGATGTAAAGTTAAAGAGGGTAT
*
41383 TCATTTATTAATGCTAATAGTATTCACCCCTAGCATAAATGCGAGGTATTAGCTATTGTGCCTAA
326 TCATTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCCTAGCATAAATGCGAGGTATTAGCTATTGTGCCTAA
* * *
41448 TAACTAAATATTGCATCGATTTTAGAAACAATGATACGAATTTGAAAAGGATGTTGACCTATTTC
391 TAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACAATGATACGAATTTGAAAAGGATGTCGACCTATTTC
*
41513 GGGAATCACCAGTGGTCACCCCCTGAGCATACTTGCAGGAGATATACCATTAATTCCCTAATAAG
456 GGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATACTTGCAGGAGATATACCATTAATTCCCTAATAAG
* * * *
41578 TGAATACTGCCTTAAGTTTTAAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTTCATTCGTTCTAATTAAC
521 TGAACATTGCCTTAGGTTTTAAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTTCATTCGTCCTAATTAAC
* * *
41643 CAAGGGTGAATTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGTGTCGAATTATAAAAACTAAAGAACCTAATGG
586 CAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGTGTCGAATTATAAAAATTAAAGAACCTAAAGG
41708 CACAAACAT
651 CACAAACAT
*
41717 AGAAATGTAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTGAAATATGAGAAGTCTCCACCAATCAT
1 AGAAATGTAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTGAAATGTGAGAAGTCTCCACCAATCAT
* * * *
41782 TTTAGGTGCGATTAGGACACCA-AAAAATTCAGGTGATTTTAATAAAAACATTTTCTTTTTATCA
66 TTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAA-TCTGGTGATTTTAATAAAAACATTTTATTTTTATCA
* * * *
41846 AACTACCATGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTAGAAATCAAATTCGGGACTCGGATACGCTTGGAG
130 AAATACCATGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTAGAAATCAAATTCGGGAGTCGGTTACGCTTGGGG
*
41911 AAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAACATTGGTACCTAGTTGATTACCCTATATTTAAAATC
195 AAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAATTGGTACCTAGTTGATTACCCTATATTTAAAATC
*
41976 AGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTTAAAATCATTACGGATGTAAAGTTAAAGAGGGTA
260 AGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTACGGATGTAAAGTTAAAGAGGGTA
* *
42041 TTCATTTATTAATGCTAATAGTATTCACCCCTAGCATAAATGCGAGGTATTAGCTATAGTGCCTA
325 TTCATTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCCTAGCATAAATGCGAGGTATTAGCTATTGTGCCTA
* ** *
42106 ATAACCAATTATTGAGTCGATTTTAGAAACAATGATACAAATTTGAAAAGGATGTCGACCTATTT
390 ATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACAATGATACGAATTTGAAAAGGATGTCGACCTATTT
* * *
42171 AGGGAATCTCCAGTAGTCA-ACCCTGAGCATACTTGCAGGAGATATACCATTAATTCCCTAATAA
455 CGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATACTTGCAGGAGATATACCATTAATTCCCTAATAA
* **
42235 GTGAACATTGCCTTAGGTTTTAAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTT-ATTTGTTGTAATTAA
520 GTGAACATTGCCTTAGGTTTTAAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTTCATTCGTCCTAATTAA
*
42299 CCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGTGTCGAATTATAAGAATTAAAGAACCTAAAG
585 CCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGTGTCGAATTATAAAAATTAAAGAACCTAAAG
* **
42364 GCACAACCCG
650 GCACAAACAT
* * * *
42374 AGAAATATAGGTTCTAATATTAACCCTATTCGATTGTTGAAATGTGAGAAGTCTCCACCAATCAT
1 AGAAATGTAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTGAAATGTGAGAAGTCTCCACCAATCAT
* * *
42439 TTAAGGTGCGAATGGGACACCATACAAATCTGGTGATTTTAATGAAAACATTTTATTTTTATCAA
66 TTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCTGGTGATTTTAATAAAAACATTTTATTTTTATCAA
* * *
42504 AATACCATTTTTTAAGGTATTCGAAAATCTAGAAATCAAATTCGGGAGTTGGTTACGCTTGGGGA
131 AATACCATGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTAGAAATCAAATTCGGGAGTCGGTTACGCTTGGGGA
* * *
42569 ATGATTATAA-CCCCATAAGCACCCAAAAATTGGTACCTAGTTGATCACCTTATATTTAAAATCA
196 AGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAATTGGTACCTAGTTGATTACCCTATATTTAAAATCA
*
42633 GAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTACGGATGTATAGTTAAAGAGGGTAT
261 GAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTACGGATGTAAAGTTAAAGAGGGTAT
*
42698 TCATTTATTAATGCTAATAGTATTCACCCCTAGCATAAATGCGAGGTATTAGCTATTGTGCCTAA
326 TCATTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCCTAGCATAAATGCGAGGTATTAGCTATTGTGCCTAA
* ** *
42763 TAACTAAATATTGAATCGATTTTAGAAACAATGATACGAATTTGAAAAGGATGTTGACCTATTTC
391 TAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACAATGATACGAATTTGAAAAGGATGTCGACCTATTTC
*
42828 GGGAATCACCAGTGGTCACCCCCTGAGCATACTTGCAGGAGATATACCATTAATTCCCTAATAAG
456 GGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATACTTGCAGGAGATATACCATTAATTCCCTAATAAG
* * * *
42893 TGAATACTGCCTTAAGTTTTAAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTTCATTCGTTCTAATTAAC
521 TGAACATTGCCTTAGGTTTTAAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTTCATTCGTCCTAATTAAC
* * *
42958 CAAGGGTGAATTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGTGTCGAATTATAAAAACTAAAGAACCTAACGG
586 CAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGTGTCGAATTATAAAAATTAAAGAACCTAAAGG
43023 CACAAACAT
651 CACAAACAT
* *
43032 AGAAATGTAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTGAAATATGAGAAGTCTCTACCAATCAT
1 AGAAATGTAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTGAAATGTGAGAAGTCTCCACCAATCAT
* * * *
43097 TTTAGGTGCGATTAGGACACCA-AAAAATTCAGGTGATTTTAATAAAAACATTTTCTTTTTATCA
66 TTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAA-TCTGGTGATTTTAATAAAAACATTTTATTTTTATCA
* * * * *
43161 AACTACCATGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTAGAAATCAAATTCAGGACTTGGTTACGATTGGGG
130 AAATACCATGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTAGAAATCAAATTCGGGAGTCGGTTACGCTTGGGG
* *
43226 AAGGATTATAACACCCATAAGCACCCAAAAATTGATACCTAGTTGATTACCCTATATTTAAAATC
195 AAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAATTGGTACCTAGTTGATTACCCTATATTTAAAATC
*
43291 AGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTACGGATGTAAAGTTAAAGAGGGTG
260 AGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTACGGATGTAAAGTTAAAGAGGGTA
* * * *
43356 TTCGTTTATTAATGATAATAGCATTCACCCCT-GACATAAATGCGAGATATTAGCTATTGTACCT
325 TTCATTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCCTAG-CATAAATGCGAGGTATTAGCTATTGTGCCT
*
43420 AATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACAATGATGA-GAGTTTGAAAAGGATGTCGACCTAT
389 AATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACAATGAT-ACGAATTTGAAAAGGATGTCGACCTAT
* * * *
43484 TTCGGGAATCACCAGTAGTTACCCCCTGGGCATACTTGTAGGAGATATATCATTAATTCCCTAAT
453 TTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATACTTGCAGGAGATATACCATTAATTCCCTAAT
* * *
43549 AAGTGAACATTGCCTTAGGTTTTAAAAATAAAATGCACACAAACAAATTTTCTTTCATCCTAATT
518 AAGTGAACATTGCCTTAGGTTTTAAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTTCATTCGTCCTAATT
43614 AACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGTGTCGAATTATAAAAATTAAAGAACCTAA
583 AACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGTGTCGAATTATAAAAATTAAAGAACCTAA
43679 AGGCACAAACAT
648 AGGCACAAACAT
* *
43691 AGAAATATAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTGAAATATGAGAAGTCTCCACCAATCAT
1 AGAAATGTAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTGAAATGTGAGAAGTCTCCACCAATCAT
* *
43756 TTAACGTGCGATTAGGACACCATAAAAAT-TGGGTGATTTTAATAAAAACATTTTATTTTTATCA
66 TTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCT-GGTGATTTTAATAAAAACATTTTATTTTTATCA
* * * * *
43820 AAATTA-CAAGTTTTAGGGTATGCTAAAATATAGAAATCAAATTCGGGAGTCGGTTACGCGTGGG
130 AAA-TACCATGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTAGAAATCAAATTCGGGAGTCGGTTACGCTTGGG
* * * *
43884 GAAGGATTATAA-CCCCATAAGCACCTAAAAATTGGTTCCTAGTTTATTACCCTATATTTAAAAC
194 GAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAATTGGTACCTAGTTGATTACCCTATATTTAAAAT
* * * *
43948 CAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTGAATTTGAAAATCATTACAGAAT-TAAAGTGAAAAAGGG
259 CAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTAC-GGATGTAAAGTTAAAGAGGG
* * * *
44012 TATTCATTTATAAATGCTAATGGCATTCATCCCTAGCATAAATGCGAGATATTAGCTATTGTGCC
323 TATTCATTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCCTAGCATAAATGCGAGGTATTAGCTATTGTGCC
* * * *
44077 TAATAACCAAATATTGCCTCTATTTTAGAAACAATGATGCAAATTTGAAAAGGATATCGACCTAT
388 TAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACAATGATACGAATTTGAAAAGGATGTCGACCTAT
** *
44142 TTCGGGAATCACCAGTAGTCACTTCCTGAGCATACTTGCAAGAGATATACCATTAATTCCCTAAT
453 TTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATACTTGCAGGAGATATACCATTAATTCCCTAAT
* *
44207 AAGTGAACATTGGCTTAGGTTTTAAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTTCATT-TTCCTAATT
518 AAGTGAACATTGCCTTAGGTTTTAAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTTCATTCGTCCTAATT
* ** * * *
44271 AACCAAGGGTGCTTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGTGTAAAATTATAATAATTATAGTACCTAA
583 AACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGTGTCGAATTATAAAAATTAAAGAACCTAA
44336 AGGCACAAACAT
648 AGGCACAAACAT
*
44348 AGAAATGTAAGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTCT-AAATGTGAGAAGTCTCCACCAATCA
1 AGAAATGTAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTT-TGAAATGTGAGAAGTCTCCACCAATCA
* * * *
44412 CTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCGGGTAATTTTAATAAAAATATTTTATTTTTATCA
65 TTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCTGGTGATTTTAATAAAAACATTTTATTTTTATCA
** * * * * *
44477 AAATACCAAATTTCAAGGTGTG-TAAAATTCTAGAAATCAAATTCAGGAGTCGGTTACGCATGGG
130 AAATACCATGTTTTAAGGTATGCGAAAA-TCTAGAAATCAAATTCGGGAGTCGGTTACGCTTGGG
* *
44541 GAAGAATTATAACCCCCATGAGCACCCAAAAATTGGTACCTAGTTGATTACCCTATATTTAAAAT
194 GAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAATTGGTACCTAGTTGATTACCCTATATTTAAAAT
*
44606 CAGAAATTTTGAGTTTGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTACGGATGTAAAGTTAAAGAGGGT
259 CAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTACGGATGTAAAGTTAAAGAGGGT
* * * * * *
44671 ATTCGTTTATTAATGCTAATAGCGTTCACCCCTAGCATAATTTCGAGATATTAGGTATTGTGCCT
324 ATTCATTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCCTAGCATAAATGCGAGGTATTAGCTATTGTGCCT
* * * * *
44736 AATAACTAAATATTGCCTCAATTTTAGAAATATTGATGCGAATTTGAAAAGGATGTCGACCTATT
389 AATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACAATGATACGAATTTGAAAAGGATGTCGACCTATT
* *
44801 TCGGGAATCACTAGTAGTCACCCCCTGAGCATACTTGCAGGGGATATACCATTAATTCCCTAATA
454 TCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATACTTGCAGGAGATATACCATTAATTCCCTAATA
*
44866 AGTGAACATTGCCTTAGGTTCTT-AAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTTCATTCGTCCAAATT
519 AGTGAACATTGCCTTAGGTT-TTAAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTTCATTCGTCCTAATT
* * * *
44930 AACCAAGGGTTATTTAAGGCTCTATCTATCCTAAAGTGTCGAATTATAAGAGTTAAAGAACCTAA
583 AACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGTGTCGAATTATAAAAATTAAAGAACCTAA
44995 AGGCACAAACAT
648 AGGCACAAACAT
* *
45007 AGAAATGTAGGTTCTAATATTAACCCTAGTTGGTTTTTGAAATGTGAGAAGCCTCCACCAATCAT
1 AGAAATGTAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTGAAATGTGAGAAGTCTCCACCAATCAT
* * * *
45072 TTAAGGTGCCATTAGGACACCA-AAAAA-CTTGGGTGATTTTTATAAAAACATTTTCTTTTTATC
66 TTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATC-T-GGTGATTTTAATAAAAACATTTTATTTTTATC
* * * *
45135 AAACTACTATGTTTTAAGGTATGC-AAAATCTAGAAATCAAATTCGGGACTCGGTTACGATTGGG
129 AAAATACCATGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTAGAAATCAAATTCGGGAGTCGGTTACGCTTGGG
*
45199 GAAGGATTATAA-CCCCATAAGCACCCAAAAATTGGTACCTAGTTGATTACTCTATATTTAAAAT
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* *
45263 -AAAATATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTTAAAATCATTACGGATGTAAAGTTAAAGAGGG
259 CAGAA-ATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTACGGATGTAAAGTTAAAGAGGG
* * *
45327 TATTCATTTATTAATGCTAATAGTATTCACCCATAGCACAAATGCGAGGTATTAGCTATTGTGCC
323 TATTCATTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCCTAGCATAAATGCGAGGTATTAGCTATTGTGCC
* * *
45392 GAATAACCAATTATTGGCTCGATTTTAGAAACAATGATACGAATTTGAAAAGGATGTCGACCTAT
388 TAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACAATGATACGAATTTGAAAAGGATGTCGACCTAT
* * * *
45457 TTAGGGAATCTCCAGTAGTCA-ACCCTGAGCATACTTGCAGGAGATATACCGTTAATTCCCTAAT
453 TTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATACTTGCAGGAGATATACCATTAATTCCCTAAT
* *
45521 AAGTGAACATTACCTTAGGTTTTAAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTTCATTTGTCCTAATT
518 AAGTGAACATTGCCTTAGGTTTTAAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTTCATTCGTCCTAATT
* * * *
45586 AACCAAGGGTGATTTAAGGCTTTCTCTATCATAAAGTGTCGAATTTTAAGAATTAAAGAACCTAA
583 AACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGTGTCGAATTATAAAAATTAAAGAACCTAA
45651 A-G---------
648 AGGCACAAACAT
*
45653 -G--A---AGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTGAAATGTGAGAAGCCTCCACCAATCAT
1 AGAAATGTAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTGAAATGTGAGAAGTCTCCACCAATCAT
* * *
45712 TTAAGGTACGATTGAGACACCATAAAAAT-TGGGTGATTTTAATAAAAACATATTATTTCTT-TC
66 TTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCT-GGTGATTTTAATAAAAACATTTTATTT-TTATC
* * * * *
45775 AAAATGCCAAGTTTTAAGGTTTGCGAAAATCTAGAAATCAAATTCGAGAGTCGGTTACGCGTGGG
129 AAAATACCATGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTAGAAATCAAATTCGGGAGTCGGTTACGCTTGGG
* *
45840 GAAGGATTCTAACCCCCATAAGCACCCAAAAAATGGTACCTAGTTGATTACCCTATATTTAAAAT
194 GAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAATTGGTACCTAGTTGATTACCCTATATTTAAAAT
* * * *
45905 TAGAACTTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTACGGAAT-TAAAGTGAAAAAGGG
259 CAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTACGG-ATGTAAAGTTAAAGAGGG
* * * *
45969 TATTCATTTATTAATGCTAATAGCATTCATCCCTAGCATAAATGCGAGATCTTAGCCATTGTGCC
323 TATTCATTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCCTAGCATAAATGCGAGGTATTAGCTATTGTGCC
**
46034 TAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACAATGATGTGAATTTGAAAAGGATGTCGACCTAT
388 TAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACAATGATACGAATTTGAAAAGGATGTCGACCTAT
*
46099 TTCGGGAATCACCAGTGGTCACCCCCT
453 TTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCT
46126 AATAAGTTAA
Statistics
Matches: 6983, Mismatches: 645, Indels: 143
0.90 0.08 0.02
Matches are distributed among these distances:
640 121 0.02
641 54 0.01
642 238 0.03
643 10 0.00
645 1 0.00
652 199 0.03
653 209 0.03
654 309 0.04
655 162 0.02
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657 1347 0.19
658 1954 0.28
659 1425 0.20
660 261 0.04
ACGTcount: A:0.36, C:0.16, G:0.16, T:0.32
Consensus pattern (659 bp):
AGAAATGTAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTGAAATGTGAGAAGTCTCCACCAATCAT
TTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCTGGTGATTTTAATAAAAACATTTTATTTTTATCAA
AATACCATGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTAGAAATCAAATTCGGGAGTCGGTTACGCTTGGGGA
AGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAATTGGTACCTAGTTGATTACCCTATATTTAAAATCA
GAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTACGGATGTAAAGTTAAAGAGGGTAT
TCATTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCCTAGCATAAATGCGAGGTATTAGCTATTGTGCCTAA
TAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACAATGATACGAATTTGAAAAGGATGTCGACCTATTTC
GGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATACTTGCAGGAGATATACCATTAATTCCCTAATAAG
TGAACATTGCCTTAGGTTTTAAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTTCATTCGTCCTAATTAAC
CAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGTGTCGAATTATAAAAATTAAAGAACCTAAAGG
CACAAACAT
Found at i:48513 original size:658 final size:659
Alignment explanation
Indices: 46122--50938 Score: 7397
Period size: 659 Copynumber: 7.3 Consensus size: 659
46112 AGTGGTCACC
* * *
46122 CCCTAATAAGTTAACATTGCCTTAGGTTCTT-AAAATTAAATGCTCTCAAACAAATTTTCATTCG
1 CCCTAATAAGTGAACATTGCCTTAGGTT-TTAAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTTCATTCG
* * * *
46186 TGCTAATTAACGAAGGGTTATTTAAGGCTATCTCTATCCTAAAGTGTCGAATTATAAGAATTAAA
65 TCCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGTGTCGAATTATAAGAATTAAA
* **
46251 GAACCTAAAGGCACAAACCTAGAAATATAGGTTCTAATATTAACCCTATTTTATTTTTGAAATAT
130 GAACCTAAAGGCACAAACCTAGAAATGTAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTGAAATAT
* * *
46316 GAGAAGTCT-CAGCCAATCATTTAAGGTGTGATTGGGACACCATAAAAATCAGGTGATTTTAATA
195 GAGGAGTCTCCA-CCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCGGGTGATTTTAATA
* *
46380 AAAACATTTTATTTTTATCAAAATACCAAGTTTCAAGGTATGTGAAAATCTAGAAATCAAATTCG
259 AAAACATTTTATTTTTATCAAAATACCAAGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTAGAAATCAAATTCG
* * * *
46445 GGAGTCGGTTATGAGTGGGGACGGACTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAATTGGTACCTAGTTG
324 GGAGTCGGTTACGCGTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAATTGGTACCTAGTTG
* *
46510 ATTACCCTATATTTAAAATCAAAAATTTTGAGTTCGATCTTTAATTAATTTGAAAATCATTACGG
389 ATTACCCTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTACGG
* * * * *
46575 AAT-TAGAGTGAAAAAGGGTATTCATTTATTAATGCTAATAGCATTCATCCCTAGAAT-AATTGC
454 -ATGTAAAGTTAAAGAGGGTATTCATTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCCTAGCATAAATT-C
* *
46638 AAGATATTAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTTGAAACAATGATGCGAATT
517 GAGATATTAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACAATGATGCGAATT
* * * * *
46703 TGAAAAAGATGCCGACCTATTTC-GGAATCACAAGTAGTCACCCCCTGAGAATACTTGCAGGACA
582 TGAAAAGGATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATACTTGCAGGAGA
46767 TATACCATTAATT
647 TATACCATTAATT
46780 CCCTAATAAGTGAACATTGCCTTAGGTTTTAAAAATAAAATG----C-AACAAATTTTCATTCGT
1 CCCTAATAAGTGAACATTGCCTTAGGTTTTAAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTTCATTCGT
* *
46840 CCTAATTAACCAAGGGTGCTTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGTGTCGAATTATAAGAATTGAAG
66 CCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGTGTCGAATTATAAGAATTAAAG
* * * *
46905 AACCTAAAGGCACAAACATAGAAATGTGGGTTCTAATATTAACCCTTTTTGGTTTTTGAAATGTG
131 AACCTAAAGGCACAAACCTAGAAATGTAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTGAAATATG
*
46970 AGGAGTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTAGGACACCATAAAAATCGGGT-ACTTTTAATAA
196 AGGAGTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCGGGTGA-TTTTAATAA
* * * ** *
47034 AAATATTTTATTTTTATCAAAATACAAAGTTTTAAGGTGTGTAAAAATCTAGAAATCAAATTCAG
260 AAACATTTTATTTTTATCAAAATACCAAGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTAGAAATCAAATTCGG
* *
47099 GAGTCGGTTACGCGTGGGGAAGGATTATAACCCCCCATAAGCACCCAAAAATTAGTACCTAGTTA
325 GAGTCGGTTACGCGTGGGGAAGGATTATAA-CCCCCATAAGCACCCAAAAATTGGTACCTAGTTG
* *
47164 ATTAACCTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTACGA
389 ATTACCCTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTACGG
* * *
47229 ATGTTAAGTTAAAGA-GGTAGTTCATTTTTTAATGCTAATAGCATTCACCCCTATCATAAATGT-
454 ATGTAAAGTTAAAGAGGGTA-TTCATTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCCTAGCATAAAT-TC
* * **
47292 TAGATATTAGCTATTGTGCCTAAAAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACAATGATGTTAATT
517 GAGATATTAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACAATGATGCGAATT
* * ** * * *
47357 TGAAAAGTATGTCAACCTATTTCGGGAATCACTGGTAGTCATCCCCTGAGCATAGTTGCCGGAGA
582 TGAAAAGGATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATACTTGCAGGAGA
47422 TATACCATTAATT
647 TATACCATTAATT
*
47435 CCCTAATAAGTGAACATTGCCTTAGGTTTTAAAAATAAAATGCACTCACACAAATTTTCATTCGT
1 CCCTAATAAGTGAACATTGCCTTAGGTTTTAAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTTCATTCGT
* * * * *
47500 CCTAATTAACCAAGAGTGATTTAAAGCTCTCTCTATCCTAAAGGGTCAAATTATGAGAATTAAAG
66 CCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGTGTCGAATTATAAGAATTAAAG
* *
47565 AACCTAAAGGCACAAACCTAGAAATGTAAGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTGAAATGTG
131 AACCTAAAGGCACAAACCTAGAAATGTAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTGAAATATG
* *
47630 AGGAGTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGAGACACCATAAAAATCGGCTGATTTTAATAAA
196 AGGAGTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCGGGTGATTTTAATAAA
* *
47695 AACATTCTT-TTTTTATCTAATTACCAAGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTAGAAATCAAATTCGG
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*
47823 ATTACCCTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTAAAAATCATTACGG
389 ATTACCCTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTACGG
* * *
47888 ATGTAAAGTTAAAGAGGGTATTCGTTTATTAAAGCTAATAGCGTTCACCCCTAGCATAAATTCGA
454 ATGTAAAGTTAAAGAGGGTATTCATTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCCTAGCATAAATTCGA
* * * * * *
47953 GATATTAGCTACTGTACCAAATAACCAAATATTACCTCGATTTTAGAAACATTTATGCGAATTTG
519 GATATTAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACAATGATGCGAATTTG
*
48018 AAAAGGACGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATACTTGCA-GAGGAT
584 AAAAGGATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATACTTGCAGGA-GAT
48082 ATACCATTAATT
648 ATACCATTAATT
* * * * *
48094 CCCTAATAACTGAACATCGCCTTATGTTCTT-AAAATAAAATGAACTCAAA-AAAATTTCATTCG
1 CCCTAATAAGTGAACATTGCCTTAGGTT-TTAAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTTCATTCG
* * * *
48157 TCCTAATTAACAAAGGGTTATTTAAGGCTCTTTCTATCCTAAAATGTCGAATTATAAGAATTAAA
65 TCCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGTGTCGAATTATAAGAATTAAA
* *
48222 GAACCTAAAGGCACAAACCTACAAATGTAGGTTCTAATATTAACCCTATTTTGTTTTTGAAATAT
130 GAACCTAAAGGCACAAACCTAGAAATGTAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTGAAATAT
*
48287 GAGAAGTCTCCACCAATCA-TTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCGGGTGATTTTAATAA
195 GAGGAGTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCGGGTGATTTTAATAA
* * * * ** *
48351 AAACATTTTACTTTTAGCAAAATATCAAGTTTTAAGGTGTGAAAAAAATCTAGAAATCAAATTCA
260 AAACATTTTATTTTTATCAAAATACCAAGTTTTAAGGTATG-CGAAAATCTAGAAATCAAATTCG
* * *
48416 GGAGTCGGTTACGCATGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCTCCCAAAAATTGGTACCTAGTTA
324 GGAGTCGGTTACGCGTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAATTGGTACCTAGTTG
*
48481 ATTACCCTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTACGA
389 ATTACCCTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTACGG
* * * *
48546 ATGTAAAGTTAAAGAGGTTGTTCATTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCCTATCATAAATGCGA
454 ATGTAAAGTTAAAGAGGGTATTCATTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCCTAGCATAAATTCGA
* * *
48611 GATATTAGCTATTTTACCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACAATGATGTGAATTTG
519 GATATTAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACAATGATGCGAATTTG
* * ** * * *
48676 AAAAGTATGTCAACCTATTTCGGGAATCACTGGAAGACATCCCCTGAGCATACTTGCAGGAGATA
584 AAAAGGATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATACTTGCAGGAGATA
48741 TACCATTAATT
649 TACCATTAATT
** *
48752 TTCTAATAAGTGAACATTTCCTTAGGTTTTAAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTTCATTCGT
1 CCCTAATAAGTGAACATTGCCTTAGGTTTTAAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTTCATTCGT
* * * *
48817 CCTAATTAACCAAGAGTGATTTAAAGCTCTCTCTATCCTAAAGGGTCGAATTATGAGAATTAAAG
66 CCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGTGTCGAATTATAAGAATTAAAG
* * *
48882 AACCTAAAGGCACAAACCTAGAAATATATGTTATAATATTAACCCTATTTGGTTTTTGAAATATG
131 AACCTAAAGGCACAAACCTAGAAATGTAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTGAAATATG
*
48947 AGGAGTCTCCACCAAACATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCGGGTGATTTTAAT-AA
196 AGGAGTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCGGGTGATTTTAATAAA
*
49011 AACATTTTATTTTTATCAAAATACCAAGTTTTAATGTATGCGAAAATCTAGAAATCAAATTCGGG
261 AACATTTTATTTTTATCAAAATACCAAGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTAGAAATCAAATTCGGG
*
49076 AGTCGGTTACGCGTGGGGAAGGATTATAACCCCTATAAGCACCCAAAAATTGGTACCTAGTTGAT
326 AGTCGGTTACGCGTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAATTGGTACCTAGTTGAT
*
49141 TACCCTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTCGATTTTTATTTAATTTGAAAATCATTACGGAT
391 TACCCTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTACGGAT
* * *
49206 GTAAATTTAAAGAGGGTATTCGTTTATTAATGCTAATAGCGTTCACCCCTAGCATAAATTCGAGA
456 GTAAAGTTAAAGAGGGTATTCATTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCCTAGCATAAATTCGAGA
* * * *
49271 TATTAGCTATTGTGCTTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACATTTATACGAATTTGAA
521 TATTAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACAATGATGCGAATTTGAA
* *
49336 AAGGATGTCGACCTATTTCAGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATACTTGCAGGGGATATA
586 AAGGATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATACTTGCAGGAGATATA
49401 CCATTAATT
651 CCATTAATT
*
49410 CCCTAATAAGTGAACATTGCCTTCGGTTTTAAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTTCATTCGT
1 CCCTAATAAGTGAACATTGCCTTAGGTTTTAAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTTCATTCGT
* * * *
49475 CCTAATTAACCAAGAGTGATTTAAAGCTCTCTCTATCCTAAAGGGTCGAATTATGAGAATTAAAG
66 CCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGTGTCGAATTATAAGAATTAAAG
* * * *
49540 AACCTAAAGGCACAAACCTAGAAATATAAGTTCTAATATTAACCCTATTTTGTTTTTGAAATGTG
131 AACCTAAAGGCACAAACCTAGAAATGTAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTGAAATATG
*
49605 AGGAGTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCGGATGATTTTAATAAA
196 AGGAGTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCGGGTGATTTTAATAAA
* * * *
49670 AGCATTCTATTTTTATCAAAATAACAAGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTAGAAATCAAATTTGGG
261 AACATTTTATTTTTATCAAAATACCAAGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTAGAAATCAAATTCGGG
* *
49735 AGTCGGTTACGCGTGGGGAAGGATTATAACTCCCATAAGCACCCAAACATTGGTACCTAGTTGAT
326 AGTCGGTTACGCGTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAATTGGTACCTAGTTGAT
* * *
49800 TACCTTATATTTAAAATCAGTAATATTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTACGGAT
391 TACCCTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTACGGAT
* *
49865 GTAAAGTTAAAGAGGGTATTCGTTTATTAATGCTAATAGCGTTCACCCCTAGCATAAATTCGAGA
456 GTAAAGTTAAAGAGGGTATTCATTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCCTAGCATAAATTCGAGA
* * * * *
49930 TATTAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAATATTTATGCGATTTTCAA
521 TATTAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACAATGATGCGAATTTGAA
* *
49995 AAGGATGTCGACCTATTTCAGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATACTTGCAGGGGATATA
586 AAGGATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATACTTGCAGGAGATATA
50060 CCATTAATT
651 CCATTAATT
*
50069 CCCTAATAAGTGAACATTGCCTTCGGTTTTAAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTTCATTCGT
1 CCCTAATAAGTGAACATTGCCTTAGGTTTTAAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTTCATTCGT
* * * *
50134 CCTAATTAACAAAGGGTTATTTAAGTCTCTCTCTATCCTAAAGTGTCTAATTATAAGAATTAAAG
66 CCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGTGTCGAATTATAAGAATTAAAG
* * * * * *
50199 AAACTAAAGGCACAAACCTAGAAATGTAGGTTCTGATAGTAACCATATTTGGCTTTTGAAATGTG
131 AACCTAAAGGCACAAACCTAGAAATGTAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTGAAATATG
* * *
50264 AGAAGTCTCCACCAATCAGTTAAGGTGCAATTGGGACACCATAAAAATCGGGTGATTTTAATAAA
196 AGGAGTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCGGGTGATTTTAATAAA
* * ** * *
50329 AACATTTTATTTTTATCAAAATATCAAGTTTTAAGGTGTGAAAAAAATATAGAAATCAAATTCAG
261 AACATTTTATTTTTATCAAAATACCAAGTTTTAAGGTATG-CGAAAATCTAGAAATCAAATTCGG
* * * *
50394 GAGTCGGTTACGCATGGGGAAGTATTATAACCCCCATAAACACCCAAAAATTGGTACCTAGTTAA
325 GAGTCGGTTACGCGTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAATTGGTACCTAGTTGA
* *
50459 TTACCCTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTTGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTACGAA
390 TTACCCTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTACGGA
* * * * *
50524 TGTAAAGTTAAAGAGGTTGTTCATTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCCAATCATAAATGCGAG
455 TGTAAAGTTAAAGAGGGTATTCATTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCCTAGCATAAATTCGAG
*
50589 ATATTAGCTATTTTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACAATGATGCGAATTTGA
520 ATATTAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACAATGATGCGAATTTGA
* * *
50654 AAAGGATATCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACTCCCTGAGCATACTTGCAAGAGATAT
585 AAAGGATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATACTTGCAGGAGATAT
50719 ACCATTAATT
650 ACCATTAATT
*
50729 CCCTAATAAGTGAACATTGCCTTAGGTTTTAAAAATAAAAAGCACTCAAACAAATTTTCATTCGT
1 CCCTAATAAGTGAACATTGCCTTAGGTTTTAAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTTCATTCGT
* * * * *
50794 CATTATTAATCAAGGGTGATTTAAGGCCCTCTCTATCCTAAAGTATCGAATTATAAGAATTAAAG
66 CCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGTGTCGAATTATAAGAATTAAAG
*
50859 AACCTAAAGGCACAAACCTAGAAATGTAGGTTCTAATATCAACCCTATTTGGTTTTTGAAATATG
131 AACCTAAAGGCACAAACCTAGAAATGTAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTGAAATATG
* *
50924 AGGAGTGTTCACCAA
196 AGGAGTCTCCACCAA
50939 GTTTTAAGGC
Statistics
Matches: 3793, Mismatches: 336, Indels: 58
0.91 0.08 0.01
Matches are distributed among these distances:
652 1 0.00
653 280 0.07
654 216 0.06
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ACGTcount: A:0.36, C:0.16, G:0.16, T:0.32
Consensus pattern (659 bp):
CCCTAATAAGTGAACATTGCCTTAGGTTTTAAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTTCATTCGT
CCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGTGTCGAATTATAAGAATTAAAG
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TACCCTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTACGGAT
GTAAAGTTAAAGAGGGTATTCATTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCCTAGCATAAATTCGAGA
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AAGGATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATACTTGCAGGAGATATA
CCATTAATT
Found at i:57185 original size:658 final size:658
Alignment explanation
Indices: 52728--57267 Score: 7336
Period size: 659 Copynumber: 6.9 Consensus size: 658
52718 CTCTCTCTAT
** * *
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* * * **
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* * * * * * **
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* * * * *
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*
52986 CCCTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATAATTACAAAATT
261 CCCTATATTTAAAAT-AGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTACAAAATT
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*
53311 CATTCGTCCTAATTAACTAAGGGTGCATTAAGACTCTCTCTATTCTAATGTGTCGAATTATAA-A
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53375 ATTAAAGAA
650 ATTAAAGAA
53384 CCTAAAGGCAC-AAAA-AGAAATGTAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTGAAATGA-GA
1 CCTAAAGGCACAAAAATAGAAATGTAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTGAAAT-ATGA
*
53446 GGAGTCTCCACCAATCATTTAAGGTGTGATTGGGACACCAAAAAAATTGGGTAATTTTAATAAAA
65 GGAGTCTCCACCAATCATTTAAGGTGTGATTGGGACACCATAAAAATTGGGTAATTTTAATAAAA
53511 ATATTTTATTTTTATCAAAATTCCAAGTTTTAAGGTGTGCAAAAATCTAGAAATCAAATTCAGGA
130 ATATTTTATTTTTATCAAAATTCCAAGTTTTAAGGTGTGCAAAAATCTAGAAATCAAATTCAGGA
*
53576 GTCAGTTACTCATGGGGAAGGATTATAACCCCCATGAGCACCCAAAAATTGGTACCTATTTAATT
195 GTCAGTTACTCATGGGGAAGGATTATAACCCCCATGAGCACCCAAAAATTGGTACCTAATTAATT
* * * **
53641 ACCCTATATTTGAAATAAAAAATTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTATGAAATT
260 ACCCTATATTTAAAATAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTACAAAATT
* *
53706 AAAGTGAAAAAGGGTATTCATTTATTAATGCTAATAACATTCATCCCAAGAATAAATGCAAGATA
325 AAAGTTAAAAAGGGTATTCATTTATTAATGCTAATAACATTCATCCCAAGAATAAATACAAGATA
53771 TTAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACAATGATGCGAATTTGAAAA
390 TTAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACAATGATGCGAATTTGAAAA
* *
53836 AGATGTTGACCTATTTCGGGAATAACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATACTTGCATGAGATATACC
455 AGATGTCGACCTATTTCGGGAATAACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATACTTGCAGGAGATATACC
53901 ATTAATTCCCTAATAAGTGAACATTGCCTTAGGTATTAAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTT
520 ATTAATTCCCTAATAAGTGAACATTGCCTTAGGTATTAAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTT
53966 CATTCGTCCTAATTAACTAAGGGTGCATTAAGGCTCTCTCTATTCTAATGTGTCGAATTATAAGA
585 CATTCGTCCTAATTAACTAAGGGTGCATTAAGGCTCTCTCTATTCTAATGTGTCGAATTATAAGA
54031 ATTAAAGAA
650 ATTAAAGAA
*
54040 CCTAAAGGCACAAAAATAGAAATGTAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTGAAATGTGAG
1 CCTAAAGGCACAAAAATAGAAATGTAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTGAAATATGAG
*
54105 GAGTCTCCACCAATCATTTAAGGTGTGATTTGGACACCATAAAAATTGGGTAATTTTAATAAAAA
66 GAGTCTCCACCAATCATTTAAGGTGTGATTGGGACACCATAAAAATTGGGTAATTTTAATAAAAA
54170 TATTTTATTTTTATCAAAATTCCAAGTTTTAAGGTGTGCAAAAATCTAGAAATCAAATTCAGGAG
131 TATTTTATTTTTATCAAAATTCCAAGTTTTAAGGTGTGCAAAAATCTAGAAATCAAATTCAGGAG
* *
54235 TCAGTTACTCATGGGGATGGATTATAACCCCCATGAGCACCCAAAAATTGGTACCTAGTTAATTA
196 TCAGTTACTCATGGGGAAGGATTATAACCCCCATGAGCACCCAAAAATTGGTACCTAATTAATTA
* * *
54300 CCCTATATTTAAAATA-AAACTTTTTGAGTTTGATCTTTATTTAATTTGGAAATCATTAC-GAAT
261 CCCTATATTTAAAATAGAAA--TTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTACAAAAT
* * * * * * * * ** *
54363 GTTAAGTTAAAGAGGTTGTTCATTTTTTAATGCTAATAGCATTCACCCCTATCATAAATACGAGA
324 -TAAAGTTAAAAAGGGTATTCATTTATTAATGCTAATAACATTCATCCCAAGAATAAATACAAGA
*
54428 TATTAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACAATGGTGCGAATTTG-A
388 TATTAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACAATGATGCGAATTTGAA
* * * ** * *
54492 AAAGTATGTCAACTTATTTCGGGAATCACTTGTAGTCATCCCCTGAGCATAGTTGCAGGAGATAT
453 AAAG-ATGTCGACCTATTTCGGGAATAACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATACTTGCAGGAGATAT
*
54557 ACCATTAATTCCCTAATAAGTGAACATTGCCTTAGGT-TCTTAAAATAAAATGCACTCAAACAAA
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* * * *
54621 TTTTCATTCGTCCTAATTAACCAAGGGT-TATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGTGTCGAATTA
581 TTTTCATTCGTCCTAATTAACTAAGGGTGCA-TTAAGGCTCTCTCTATTCTAATGTGTCGAATTA
54685 TAAGAATTAAAGAA
645 TAAGAATTAAAGAA
** *
54699 CCTAAAGGCACAAACCTAGAAATGTAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTGAAATATGAT
1 CCTAAAGGCACAAAAATAGAAATGTAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTGAAATATGAG
* * * **
54764 AAGTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCGGGCGATTTTAATAAAAA
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* * * * * * **
54829 AAATTTT-TTTTTATCAAAATACCAATTTTTAAGGTATACGAAAATCTAGAAATCAAATTTGGGA
130 ATATTTTATTTTTATCAAAATTCCAAGTTTTAAGGTGTGCAAAAATCTAGAAATCAAATTCAGGA
* * * * *
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195 GTCAGTTACTCATGGGGAAGGATTATAACCCCCATGAGCACCCAAAAATTGGTACCTAATTAATT
*
54958 ACCCTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATAATTACAAAAT
260 ACCCTATATTTAAAAT-AGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTACAAAAT
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324 TAAAGTTAAAAAGGGTATTCATTTATTAATGCTAATAACATTCATCCCAAGAATAAATACAAGAT
55088 ATTAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACAATGATGCGAATTTGAAA
389 ATTAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACAATGATGCGAATTTGAAA
55153 AAGATGTCGACCTATTTCGGGAATAACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATACTTGCAGGAGATATAC
454 AAGATGTCGACCTATTTCGGGAATAACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATACTTGCAGGAGATATAC
55218 CATTAATTCCCTAATAAGTGAACATTGCCTTAGGTATTAAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTT
519 CATTAATTCCCTAATAAGTGAACATTGCCTTAGGTATTAAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTT
*
55283 TCATTCGTCCTAATTAACTAAGGGTGCATTAAGACTCTCTCTATTCTAATGTGTCGAATTATAAG
584 TCATTCGTCCTAATTAACTAAGGGTGCATTAAGGCTCTCTCTATTCTAATGTGTCGAATTATAAG
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649 AATTAAAGAA
55358 CCTAAAGGCACAAAAATAGAAATGTAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTGAAATGA-GA
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*
55422 GGAGTCTCCACCAATCATTTAAGGTGTGATTGGGACACCAAAAAAATTGGGTAATTTTAATAAAA
65 GGAGTCTCCACCAATCATTTAAGGTGTGATTGGGACACCATAAAAATTGGGTAATTTTAATAAAA
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130 ATATTTTATTTTTATCAAAATTCCAAGTTTTAAGGTGTGCAAAAATCTAGAAATCAAATTCAGGA
*
55552 GTCAGTTACTCATGGGGAAGGATTATAACCCCCATGAGCACCCAAAAATTGGTACCTATTTAATT
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* * * **
55617 ACCCTATATTTGAAATAAAAAAATTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTATGAAAT
260 ACCCTATATTTAAAAT-AGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTACAAAAT
* *
55682 TAAAGTGAAAAAGGGTATTCATTTATTAATGCTAATAACATTCATCCCAAGAATAAATGCAAGAT
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*
55747 ATTAGCTATTGTGCCTAATAACAAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACAATGATGCGAATTTGAAA
389 ATTAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACAATGATGCGAATTTGAAA
*
55812 AAGATGTTGACCTATTTCGGGAATAACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATACTTGCAGGAGATATAC
454 AAGATGTCGACCTATTTCGGGAATAACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATACTTGCAGGAGATATAC
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519 CATTAATTCCCTAATAAGTGAACATTGCCTTAGGTATTAAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTT
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584 TCATTCGTCCTAATTAACTAAGGGTGCATTAAGGCTCTCTCTATTCTAATGTGTCGAATTATAAG
56007 AATTAAAGAA
649 AATTAAAGAA
*
56017 CCTAAAGGCACAAAAATAGAAATGTAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTGAAATGTGAG
1 CCTAAAGGCACAAAAATAGAAATGTAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTGAAATATGAG
*
56082 GAGTCTCCACCAATCATTTAAGGTGTGATTTGGACACCATAAAAATTGGGTAATTTTAATAAAAA
66 GAGTCTCCACCAATCATTTAAGGTGTGATTGGGACACCATAAAAATTGGGTAATTTTAATAAAAA
56147 TATTTTATTTTTATCAAAATTCCAAGTTTTAAGGTGTGCAAAAATCTAGAAATCAAATTCAGGAG
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* *
56212 TCAGTTACTCATGGGGATGGATTATAACCCCCATGAGCACCCAAAAATTGGTACCTAGTTAATTA
196 TCAGTTACTCATGGGGAAGGATTATAACCCCCATGAGCACCCAAAAATTGGTACCTAATTAATTA
* * *
56277 CCCTATATTTAAAATA-AAACTTTTTGAGTTTGATCTTTATTTAATTTGGAAATCATTAC-GAAT
261 CCCTATATTTAAAATAGAAA--TTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTACAAAAT
* * * * * * * * ** *
56340 GTTAAGTTAAAGAGGTTGTTCATTTTTTAATGCTAATAGCATTCACCCCTATCATAAATACGAGA
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*
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* * * ** * *
56469 AAAGTATGTCAACTTATTTCGGGAATCACTTGTAGTCATCCCCTGAGCATAGTTGCAGGAGATAT
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*
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* * * *
56598 TTTTCATTCGTCCTAATTAACCAAGGGT-TATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGTGTCGAATTA
581 TTTTCATTCGTCCTAATTAACTAAGGGTGCA-TTAAGGCTCTCTCTATTCTAATGTGTCGAATTA
56662 TAAGAATTAAAGAA
645 TAAGAATTAAAGAA
** *
56676 CCTAAAGGCACAAACCTAGAAATGTAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTGAAATATGAT
1 CCTAAAGGCACAAAAATAGAAATGTAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTGAAATATGAG
* * * * **
56741 AAGTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCGAGCGATTTTAATAAAAA
66 GAGTCTCCACCAATCATTTAAGGTGTGATTGGGACACCATAAAAATTGGGTAATTTTAATAAAAA
* * * * * * **
56806 AATTTT-TTTTTATCAAAATACCAATTTTTAAGGTATACGAAAATCTAGAAATCAAATTTGGGAG
131 TATTTTATTTTTATCAAAATTCCAAGTTTTAAGGTGTGCAAAAATCTAGAAATCAAATTCAGGAG
* * * * *
56870 TCTGTTACGCGTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAATTGGTACCTAATTGATTA
196 TCAGTTACTCATGGGGAAGGATTATAACCCCCATGAGCACCCAAAAATTGGTACCTAATTAATTA
*
56935 CCCTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATAATTACAAAATT
261 CCCTATATTTAAAAT-AGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTACAAAATT
*
57000 AAAGTAAAAAAGGGTATTCATTTATTAATGCTAATAACATTCATCCCAAGAATAAATACAAGATA
325 AAAGTTAAAAAGGGTATTCATTTATTAATGCTAATAACATTCATCCCAAGAATAAATACAAGATA
57065 TTAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACAATGATGCGAATTTGAAAA
390 TTAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACAATGATGCGAATTTGAAAA
* *
57130 AGATGTCGACCTATTTCGGGAATAACCAGTAATCACCCCCTGAGCATACTTGCAGGGGATATACC
455 AGATGTCGACCTATTTCGGGAATAACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATACTTGCAGGAGATATACC
* * *
57195 ATTAATTCCCTAATAAGTAAACATTGCCTTAGGTTTTAAAAATAAAATGCACTCAAATAAATTTT
520 ATTAATTCCCTAATAAGTGAACATTGCCTTAGGTATTAAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTT
57260 CATTCGTC
585 CATTCGTC
57268 TCCACCAAAC
Statistics
Matches: 3593, Mismatches: 257, Indels: 66
0.92 0.07 0.02
Matches are distributed among these distances:
654 103 0.03
655 366 0.10
656 159 0.04
657 10 0.00
658 678 0.19
659 2249 0.63
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661 3 0.00
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Consensus pattern (658 bp):
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TATTTTATTTTTATCAAAATTCCAAGTTTTAAGGTGTGCAAAAATCTAGAAATCAAATTCAGGAG
TCAGTTACTCATGGGGAAGGATTATAACCCCCATGAGCACCCAAAAATTGGTACCTAATTAATTA
CCCTATATTTAAAATAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTACAAAATTA
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TAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACAATGATGCGAATTTGAAAAA
GATGTCGACCTATTTCGGGAATAACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATACTTGCAGGAGATATACCA
TTAATTCCCTAATAAGTGAACATTGCCTTAGGTATTAAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTTC
ATTCGTCCTAATTAACTAAGGGTGCATTAAGGCTCTCTCTATTCTAATGTGTCGAATTATAAGAA
TTAAAGAA
Found at i:62350 original size:659 final size:659
Alignment explanation
Indices: 57265--78468 Score: 31825
Period size: 659 Copynumber: 32.3 Consensus size: 659
57255 ATTTTCATTC
* * *
57265 GTCTCCACCAAACATTTGAA-GTGCGATTGGGACACCATAAAAATCAGGTGATTTTAATAAAAAT
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* * *
57329 ATTTTATTTTTATCAAAATACCAAGTTTTAAAGTATGGGAAAATCTAGAAATCAAATTCAGGAGT
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* *
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130 CGGTTACGCGTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAATTGGTACCTAGTTGATTAC
* * * *
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195 CCTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTACGAATGTA
* * *
57524 AAGTTAAAGAGGGTATTCGTTTATTAATGCTAATAGCGTTCACCCCTAGCATAAATTCGAGATAT
260 AAGTTAAAGAGGGTATTCATTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCCTAGCATAAATGCGAGATAT
* * * *
57589 TAGCTATTGTTCCTAATAACCAATTATTGCCTCGATTTTAGAAACATTGATACGAATTTGAAAAG
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* * * *
57654 GATGTCGACCTTTTTCGGGAATCTCCAGTAATCACCCCCTGAGCATACTTGCAGGGGATATACCA
390 GATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATACTTGCAGGAGATATACCA
*
57719 TTAATTCCCTAATAAGTAAACATTGCCTTAGGTTTTAAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTTC
455 TTAATTCCCTAATAAGTGAACATTGCCTTAGGTTTTAAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTTC
* * * *
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* *
57849 TTAAAGAACCTAAAGGCACAAACCTAGAAATGTAAGTTCTAATATTAACCGTATTTGGTTTTTGA
585 TTAAAGAACCTAAAGGCACAAACCTAGAAATGTAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTGA
* *
57914 AATGTGAGGA
650 AATATGAGAA
*
57924 GTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCGGCTGATTTTAATAAAAACA
1 GTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCGGGTGATTTTAATAAAAACA
*
57989 TTCTATTTTTATCAAAATACCAAGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTAGAAATCAAATTCGGGAGTC
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* *
58054 GGTTACGCGTGGGGAAGGACTATAACCCCCATAAGCACCCAAACATTGGTACCTAGTTGATTACC
131 GGTTACGCGTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAATTGGTACCTAGTTGATTACC
* * * * *
58119 CTATATTTAAAATCAGTAATATCGAGTTTGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTACGGATGTAA
196 CTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTACGAATGTAA
* * *
58184 AGTTAAAGAGGGTATTCGTTTATTAATGCTAATAGCGTTCACCCCTAGCATAAATTCGAGATATT
261 AGTTAAAGAGGGTATTCATTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCCTAGCATAAATGCGAGATATT
* *
58249 AGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACATTTATGCGAATTTGAAAAGG
326 AGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACAATGATGCGAATTTGAAAAGG
*
58314 ATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATACTTGCAGGGGATATACCAT
391 ATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATACTTGCAGGAGATATACCAT
* * *
58379 TAATTCCATAATAAGTGAACATTACCTT-CGTATTT-AAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTTC
456 TAATTCCCTAATAAGTGAACATTGCCTTAGGT-TTTAAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTTC
* * * *
58442 ATTTGTCCTAATTAACAAAGGGTTATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGTGTCTAATTATAAGAA
520 ATTCGTCCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGTGTCGAATTATAAGAA
* * * *
58507 TTAAAGAACCTAAAGGCACAAACCTAGAAATGTAGGTTCTGATAGTAACCATATTTGGCTTTTGA
585 TTAAAGAACCTAAAGGCACAAACCTAGAAATGTAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTGA
*
58572 AATGTGAGAA
650 AATATGAGAA
* * * * * * *
58582 GTCTTCATCAATCATTTAAGGTGCAATTTGAACACCATAAAAATTGGGTTATTTTAATAAAAACA
1 GTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCGGGTGATTTTAATAAAAACA
* * *
58647 TTTTATTTTTATCAAAATACAAAGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTAGAAATCATATTCAGGAGTC
66 TTTTATTTTTATCAAAATACCAAGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTAGAAATCAAATTCGGGAGTC
* * * *
58712 GGTTACACGTGGGGAAGTATTATTACCCCCATAAGCACCAAAAAATTGGTACCTAGTTGATTACC
131 GGTTACGCGTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAATTGGTACCTAGTTGATTACC
* * * *
58777 CTATATTTAAAATCAGGACTTTTGAGTTCGATCTTTATTTAACTTGAAAATCATTACGGATGTAA
196 CTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTACGAATGTAA
* * * *
58842 AGTTAAAGAGGGTATTCGTTTATTAATGCTAATAGCATTTACCTCTAGCATAAATGCAAGATATT
261 AGTTAAAGAGGGTATTCATTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCCTAGCATAAATGCGAGATATT
* * *
58907 AGCTATTGTGCCTAATAACAAAATAATGCCTCGAGTTTAGAAACAATGATGCGAATTTGAAAAGG
326 AGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACAATGATGCGAATTTGAAAAGG
*
58972 ATGTCTACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATACTTGCAGGAGATATACCAT
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*
59037 TAATTCCCTAATAAGTGAACATTGCCTTAGGTTTTAAAAATAAAATGCAGTCAAACAAATTTTCA
456 TAATTCCCTAATAAGTGAACATTGCCTTAGGTTTTAAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTTCA
* * * * * *
59102 TTCATCATTATTAATCAAGGGTGATTTAAGGCCCTCTCTATCCTAAAGTATCGAATTATAAGAAT
521 TTCGTCCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGTGTCGAATTATAAGAAT
* *
59167 TAAAGAACCTAAAGGCAGAAACCTAGAAATGTAGGTTCTAATATCAACCCTATTTGGTTTTTGAA
586 TAAAGAACCTAAAGGCACAAACCTAGAAATGTAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTGAA
*
59232 ATATGAGGA
651 ATATGAGAA
* * * *
59241 GTGTTCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGG--ACCATAAAAATTGGGTGATTTTAATAAAAATA
1 GTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCGGGTGATTTTAATAAAAACA
* * * * * * *
59304 TTTTCTTTTTATCAAAATGCCAAGTTTTAAGGTATACGAAAATCTTGAAATAAAATTCGAGTGTC
66 TTTTATTTTTATCAAAATACCAAGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTAGAAATCAAATTCGGGAGTC
** *
59369 GGTTACGCGTGGGGAAAAATTATAACCCCCATGAGCACCC-AAAATTGGTACCTAGTTGATTACC
131 GGTTACGCGTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAATTGGTACCTAGTTGATTACC
* * * *
59433 CTATATTTCAAAA-CAAAAATTTTGAGTTCGATCTTCATTTAATTTGTAAAT-AGTTACGGATGT
196 CTATATTT-AAAATCAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATCA-TTACGAATGT
* * * * * *
59496 AAAGTAAAATATGATATTCGTTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCCTAGCATAAATGTGAGATA
259 AAAGTTAAAGAGGGTATTCATTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCCTAGCATAAATGCGAGATA
*
59561 TTAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTAAGAAACAATGATGCGAATTTGAAAA
324 TTAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACAATGATGCGAATTTGAAAA
* ** *
59626 AGATGTCGACCTATTTTAGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATACTTGCAAGAGATATACC
389 GGATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATACTTGCAGGAGATATACC
* * * * *
59691 AGTAATTTCCTAATAAGTGATCATTGCCTTACGTTTTAAAAGTAAAATGCACTCAAACAAATTTT
454 ATTAATTCCCTAATAAGTGAACATTGCCTTAGGTTTTAAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTT
* *
59756 CATTCGTCCTAATTAACCAAAGGTGATTTAAGGCTTTCTCTATCCTAAAGTGTCGAATTATAAGA
519 CATTCGTCCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGTGTCGAATTATAAGA
* *
59821 ATTAAAGAACCTAAAGGAACAAACCTAGAAACGTAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTG
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*
59886 AAATATTAGAA
649 AAATATGAGAA
* *
59897 GTCTCCACCAATCATTTAACGTGCGATTGGGACACCATCAAAAAATTGGGTGATTTTAATAAAAA
1 GTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCAT--AAAAATCGGGTGATTTTAATAAAAA
*
59962 CATTTTACTTTTATCAAAATACCAAGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTAGAAATCAAATTCGGGAG
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* *
60027 TCGGTTACGCATGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCATAAATTGGTACCTAGTTGA-TA
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* * *
60091 CCCTATATTTAAAACCAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTGAATTTAAAAATCATTACGGAAT-
194 CCCTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTAC-GAATG
* * *
60155 TAAAGTGAAAAAGGGTATTCATTTATTAATGCTAATAGCATTCATCCCTAGCATAAATGCGAGAT
258 TAAAGTTAAAGAGGGTATTCATTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCCTAGCATAAATGCGAGAT
* *
60220 ATTAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTGGAAATAATGATGCGAATTTGAAA
323 ATTAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACAATGATGCGAATTTGAAA
* *
60285 AGGATATCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACTCCCTGAGCATACTTGCAGGAGATATAC
388 AGGATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATACTTGCAGGAGATATAC
*
60350 CATTAATTCCCTAATAAGTGAACATTGTCTTAGGTTTTAAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTT
453 CATTAATTCCCTAATAAGTGAACATTGCCTTAGGTTTTAAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTT
* * *
60415 TCATTCGTCCTAATTAACCAAGGGTGCTTTAAGGCTCTCTCTATCATAAAGTGTCGAATTATAAT
518 TCATTCGTCCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGTGTCGAATTATAAG
* * * *
60480 AATTAAAAAAACCTAAAGGTACAAACATAGAAATGTAGGTTCTAATATTAACCCTTTTTGGTTTT
583 AATT-AAAGAACCTAAAGGCACAAACCTAGAAATGTAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTT
* * *
60545 TAAAATGTGAGGA
647 TGAAATATGAGAA
* * *
60558 GACTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCGGGTAATTTTAA-AACAAAT
1 GTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCGGGTGATTTTAATAA-AAAC
*
60622 ATTTTATTTTTATCAAAATACCAAGTTTTAATGTATGCGAAAATCTAGAAATCAAATTCGGGAGT
65 ATTTTATTTTTATCAAAATACCAAGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTAGAAATCAAATTCGGGAGT
* * * *
60687 CGGTTACGCGTGGTGAAGGATTATAACCCCCATAAGAACCCAAATATTGGTACCTAGTTCATTAC
130 CGGTTACGCGTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAATTGGTACCTAGTTGATTAC
* * *
60752 CTTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTTGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTACGGATGTA
195 CCTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTACGAATGTA
* ** **
60817 AAGTTAAAGACGGTATTTGTTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCCT-GTCATAAATTTGAGATA
260 AAGTTAAAGAGGGTATTCATTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCCTAG-CATAAATGCGAGATA
* * * * * *
60881 TTAGTTATGGTGCCTAATAACCAAATACTT-CCTCAAATTTAGAAACATTGATGCAAATTTGAAA
324 TTAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATA-TTGCCTCGATTTTAGAAACAATGATGCGAATTTGAAA
* * * *
60945 AGGATGTCAACCTATTTCGAGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATACATGCAGGGGATATAC
388 AGGATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATACTTGCAGGAGATATAC
* *
61010 CATTAATTCCCTAATAAGTGAACATTTCCTCAGGTTCTT-AAAATAAAATGCACTCAAACAAATT
453 CATTAATTCCCTAATAAGTGAACATTGCCTTAGGTT-TTAAAAATAAAATGCACTCAAACAAATT
* *
61074 TTCATTCGTCCTAATTAACGAAGGGTTATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGTGTCGAATTATAA
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* *
61139 GAATTAAAGAACCTAAAGGAACAAACCTAGAAATATAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTT
582 GAATTAAAGAACCTAAAGGCACAAACCTAGAAATGTAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTT
61204 TGAAATATGAGAA
647 TGAAATATGAGAA
61217 GTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCGGGTGATTTTAATAAAAA-A
1 GTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCGGGTGATTTTAATAAAAACA
** * * *
61281 AATTATTTTTATCAAAATACCAATTTTTAAGGTATACGAAAATCTAGAAATCAAATTTGGGAGTC
66 TTTTATTTTTATCAAAATACCAAGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTAGAAATCAAATTCGGGAGTC
*
61346 GGTTACGCGTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAATTGGTACCTAATTGATTACC
131 GGTTACGCGTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAATTGGTACCTAGTTGATTACC
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196 CTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTACG-AATGTA
* * * * * *
61474 AAGTGAAAAAGGGTATTCATTTATTAATGCTAATAACATTCA-TCCTAAGAATAAATGCAAGATA
260 AAGTTAAAGAGGGTATTCATTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCCT-AGCATAAATGCGAGATA
* *
61538 TTAGCTATTGTGCCTAGTAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGGAACAATGATGCGAATTTGAAAA
324 TTAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACAATGATGCGAATTTGAAAA
* *
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*
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* *
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* * *
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* * * ** *
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*
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* * * * * * **
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258 TAAAGTTAAAGAGGGTATTCATTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCCTAGCATAAATGCGAGAT
* *
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* * * * * *
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*
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* * * ** *
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* *
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* *
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*
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1 GTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCGGGTGATTTTAATAAAAACA
* * * ** *
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* * * *
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* * * *
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196 CTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTACGAATGTAA
* * *
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261 AGTTAAAGAGGGTATTCATTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCCTAGCATAAATG-CGAGATAT
* * *
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*
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390 GATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATACTTGCAGGAGATATACCA
* *
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455 TTAATTCCCTAATAAGTGAACATTGCCTTAGGTT-TTAAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTT
*
63048 CATTCGTCCTAATTAACCAAGGGTTATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGTGTCGAATTATAAGA
519 CATTCGTCCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGTGTCGAATTATAAGA
* ** **
63113 GA-TAAAGAACCTAAAGGCAGAAATATAGAAATGTAGGTTCTAATATTAACCCTATTTTATTTTT
584 -ATTAAAGAACCTAAAGGCACAAACCTAGAAATGTAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTT
63177 GAAATATGAGAA
648 GAAATATGAGAA
* * *
63189 GTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCCATTAGGACACCA-AAAATATAGGGTGATTTTAATAAAAAC
1 GTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAA-ATCGGGTGATTTTAATAAAAAC
* * * * * * *
63253 ATTTTCTTTTTCTCAAACTACCATGTTTTAAGGTATGCAAAAATCTAGAAATCAAATTTGGGACT
65 ATTTTATTTTTATCAAAATACCAAGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTAGAAATCAAATTCGGGAGT
* *
63318 CGGTTACGCTTGTGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAATTGGTACCTAGTTGATTAC
130 CGGTTACGCGTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAATTGGTACCTAGTTGATTAC
* * *
63383 CCTATATTTAAAATAAAAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTACGAATGTT
195 CCTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTACGAATGTA
* * * * * **
63448 AAGTTAAAGAGGTTGTTCATTTTTTAATGCTAATAACATTCACCCCTATCATAAATATGAGATAT
260 AAGTTAAAGAGGGTATTCATTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCCTAGCATAAATGCGAGATAT
* *
63513 TAGCTATTGTGCCTAAAAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACATTGATGCGAATTTGAAAAG
325 TAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACAATGATGCGAATTTGAAAAG
* * * * * *
63578 GATGTCAACCTTTTTCGGGAATCTCCAATAGTCATCCCCTGAGCATACTTGCAGGGGATATACCA
390 GATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATACTTGCAGGAGATATACCA
63643 TTAATTCCCTAATAAGTGAACATTGCCTTAGGTTCTT-AAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTT
455 TTAATTCCCTAATAAGTGAACATTGCCTTAGGTT-TTAAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTT
*
63707 CATTCGTCCTAATTAACCAAGGGTTATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGTGTCGAATTATAAGA
519 CATTCGTCCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGTGTCGAATTATAAGA
* ** **
63772 GA-TAAAGAACCTAAAGGCAGAAATATAGAAATGTAGGTTCTAATATTAACCCTATTTTATTTTT
584 -ATTAAAGAACCTAAAGGCACAAACCTAGAAATGTAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTT
* *
63836 GAAGTGTGAGAA
648 GAAATATGAGAA
* * * *
63848 GTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCCATTTGGACACCAAAAAAATAGGGTGATTTTAATAAAAACA
1 GTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCGGGTGATTTTAATAAAAACA
* * * * * * *
63913 TTTTCTTTTTCTCAAACTACCATGTTTTAAGGTATGCAAAAATCTAGAAATCAAATTTGGGACTC
66 TTTTATTTTTATCAAAATACCAAGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTAGAAATCAAATTCGGGAGTC
* *
63978 GGTTACGCTTGTGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAATTGGTACCTAGTTGATTACC
131 GGTTACGCGTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAATTGGTACCTAGTTGATTACC
* * *
64043 CTATATTTAAAATAAAAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTACGGATGTAA
196 CTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTACGAATGTAA
* * *
64108 AGTTAAAGAGGGTATTCATTTATTAATGCTAATAGTATTCAACCCTAGCATAAATGCGAGGTATT
261 AGTTAAAGAGGGTATTCATTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCCTAGCATAAATGCGAGATATT
* * * * **
64173 AGCTATTGTGCCTAATAACCAATTATTGTCTCAATTTTAGAAACAATGATACGAATTTGAAAAAA
326 AGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACAATGATGCGAATTTGAAAAGG
** * *
64238 ATGTCGACCTATTTCGGGAATCTGCAGTAGTTACCCCCTGAGCATACTTGCAAGAGATATACCAT
391 ATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATACTTGCAGGAGATATACCAT
* *
64303 TAATTCCCAAATAAGTGAACATTGCCTTAGGTCTTAAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTTCA
456 TAATTCCCTAATAAGTGAACATTGCCTTAGGTTTTAAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTTCA
* * * * *
64368 TTTGTCCTAATTGACCAAGGGTGATTTAAGGCTTTATCTATCATAAAGTGTCGAATTATAAGAAT
521 TTCGTCCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGTGTCGAATTATAAGAAT
* * *
64433 TAAATAACCTAAAGGCACAAACTTAGAAATTTAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTGAA
586 TAAAGAACCTAAAGGCACAAACCTAGAAATGTAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTGAA
*
64498 ATGTGAGAA
651 ATATGAGAA
* * * *
64507 GCCTCCACCAATCATTTAAGGTACGATTGGGACACTATAAAAATAGGGTGATTTTAATAAAAACA
1 GTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCGGGTGATTTTAATAAAAACA
* * * *
64572 TATTATTTTTATCAAAATACAAAGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTAGAAATCAAGTTCAGGAGTC
66 TTTTATTTTTATCAAAATACCAAGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTAGAAATCAAATTCGGGAGTC
* *
64637 GGTTACACGTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGAACCCAAAAAATTGGTACCTAGTTGATTAC
131 GGTTACGCGTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCC-AAAAATTGGTACCTAGTTGATTAC
*
64702 CCTATATTTAAAATCAGGAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTACGAATGTA
195 CCTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTACGAATGTA
* * * * **
64767 AAGTTAAAGAGGTTGTTCATTTTTTAATGCTAATAGCATTCACCCCTATCATAAATATGAGATAT
260 AAGTTAAAGAGGGTATTCATTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCCTAGCATAAATGCGAGATAT
* *
64832 TAGCTATTGTGCCTAAAAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACATTGATGCGAATTTGAAAAG
325 TAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACAATGATGCGAATTTGAAAAG
* * * * *
64897 GATGTCAACCTTTTTCGGGAATCTCCA-TAGTCATCCCCTGAGCATACTTGCAGGGGATATACCA
390 GATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATACTTGCAGGAGATATACCA
*
64961 TTAATTCCCTAATAAGTGAACATTGCCTTAGGTTCTT-AAAATAAAATGCACTTAAACAAATTTT
455 TTAATTCCCTAATAAGTGAACATTGCCTTAGGTT-TTAAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTT
* * ** *
65025 CATTCTTCCTAATTAACCAAGGGTTATTTAAGGCTCTCTCTATATTAATGTGTCGAATTATAAGA
519 CATTCGTCCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGTGTCGAATTATAAGA
* *
65090 GTTAAAGAACCTAAAGGCACAAACATAGAAATGTAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTG
584 ATTAAAGAACCTAAAGGCACAAACCTAGAAATGTAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTG
* *
65155 AAATGTGAGGA
649 AAATATGAGAA
* *
65166 GTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCGGGTAATTTTAATAAAAATA
1 GTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCGGGTGATTTTAATAAAAACA
* * ** * *
65231 -TTT-TTTTTATCAAAATACCAAGTTTTAAGTTGTGTAAAAAACTAGAAATCAAATTCAGGAGTC
66 TTTTATTTTTATCAAAATACCAAGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTAGAAATCAAATTCGGGAGTC
* * * *
65294 GGTTACGCATGGGGAAGAATTATAACCCCCGTGAGCACCCAAAAATTGGTACCTAGTTGATTACC
131 GGTTACGCGTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAATTGGTACCTAGTTGATTACC
* * * *
65359 CTATACTTAAAATTAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATAACGGATGTAA
196 CTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTACGAATGTAA
* * *
65424 AGTTAAAGAGGGTATTCGTATATTAATGCTAATAGCGTTCACCCCTAGCATAAA-GTCGAGATAT
261 AGTTAAAGAGGGTATTCATTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCCTAGCATAAATG-CGAGATAT
* *
65488 TAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACATTGATGGGAATTTGAAAAG
325 TAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACAATGATGCGAATTTGAAAAG
* *
65553 GAAGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATACTTGCAGGGGATATACCA
390 GATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATACTTGCAGGAGATATACCA
* *
65618 TTAATTACCTAATAAGTGAACATTGCCTTAGGTTCTT-AAAATAAAATGCACTCAAACAAATTCT
455 TTAATTCCCTAATAAGTGAACATTGCCTTAGGTT-TTAAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTT
*
65682 CATTCGTCCTAATTAACCAAGGGTTATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGTGTCGAATTATAAGA
519 CATTCGTCCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGTGTCGAATTATAAGA
* ** **
65747 GA-TAAAGAACCTAAAGGCAGAAATATAGAAATGTAGGTTCTAATATTAACCCTATTTTATTTTT
584 -ATTAAAGAACCTAAAGGCACAAACCTAGAAATGTAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTT
65811 GAAATATGAGAA
648 GAAATATGAGAA
* * *
65823 GTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCCATTAGGACACCA-AAAATATAGGGTGATTTTAATAAAAAC
1 GTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAA-ATCGGGTGATTTTAATAAAAAC
* * * * * * *
65887 ATTTTCTTTTTCTCAAACTACCATGTTTTAAGGTATGCAAAAATCTAGAAATCAAATTTGGGACT
65 ATTTTATTTTTATCAAAATACCAAGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTAGAAATCAAATTCGGGAGT
* *
65952 CGGTTACGCTTGTGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAATTGGTACCTAGTTGATTAC
130 CGGTTACGCGTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAATTGGTACCTAGTTGATTAC
* * *
66017 CCTATATTTAAAATAAAAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTACGGATGTA
195 CCTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTACGAATGTA
* * *
66082 AAGTTAAAGAGGGTATTCATTTATTAATGCTAATAGTATTCAACCCTAGCATAAATGCGAGGTAT
260 AAGTTAAAGAGGGTATTCATTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCCTAGCATAAATGCGAGATAT
* * * * *
66147 TAGCTATTGTGCCTAATAACCAATTATTGTCTCAATTTTAGAAACAATGATACGAATTTGAAAAA
325 TAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACAATGATGCGAATTTGAAAAG
* ** * *
66212 AATGTCGACCTATTTCGGGAATCTGCAGTAGTTACCCCCTGAGCATACTTGCAAGAGATATACCA
390 GATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATACTTGCAGGAGATATACCA
* *
66277 TTAATTCCCAAATAAGTGAACATTGCCTTAGGTCTTAAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTTC
455 TTAATTCCCTAATAAGTGAACATTGCCTTAGGTTTTAAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTTC
* * * * *
66342 ATTTGTCCTAATTGACCAAGGGTGATTTAAGGCTTTATCTATCATAAAGTGTCGAATTATAAGAA
520 ATTCGTCCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGTGTCGAATTATAAGAA
* * *
66407 TTAAATAACCTAAAGGCACAAACTTAGAAATTTAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTGA
585 TTAAAGAACCTAAAGGCACAAACCTAGAAATGTAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTGA
*
66472 AATGTGAGAA
650 AATATGAGAA
* * * *
66482 GCCTCCACCAATCATTTAAGGTACGATTGGGACACTATAAAAATAGGGTGATTTTAATAAAAACA
1 GTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCGGGTGATTTTAATAAAAACA
* * * *
66547 TATTATTTTTATCAAAATACAAAGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTAGAAATCAAGTTCAGGAGTC
66 TTTTATTTTTATCAAAATACCAAGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTAGAAATCAAATTCGGGAGTC
* *
66612 GGTTACACGTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGAACCCAAAAATTGGTACCTAGTTGATTACC
131 GGTTACGCGTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAATTGGTACCTAGTTGATTACC
*
66677 CTATATTTAAAATCATG-AATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTACAAATGTA
196 CTATATTTAAAATCA-GAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTACGAATGTA
* * * *
66741 AAGTTAAAGAGGTTGTTCATTTTTTAATGCTAATAGCATTCACCCCTATCATAAATGCGAGATAT
260 AAGTTAAAGAGGGTATTCATTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCCTAGCATAAATGCGAGATAT
* * *
66806 TAGCTTTTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACTATGATGCGAATTTGAAAAA
325 TAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACAATGATGCGAATTTGAAAAG
*
66871 GATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCCTGGGCATACTTGCAGGAGATATACC
390 GATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCA-CCCCCTGAGCATACTTGCAGGAGATATACC
* * * *
66936 ATTAATTTCATAATAAGTGATA-ATTGCCTTAGGTTCTAAAAGTAAAATGCACTCAAACAAATTT
454 ATTAATTCCCTAATAAGTGA-ACATTGCCTTAGGTTTTAAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTT
* * * * *
67000 TCATTTGTCCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTTTCACTATCCCAAAGTATCGAATTATAAG
518 TCATTCGTCCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGTGTCGAATTATAAG
* * *
67065 AATTTAAGAACCTAAAGGCACAAACCTAGAAATGTAGGTTCTAATATTAACCCTATTTTGTTTTC
583 AATTAAAGAACCTAAAGGCACAAACCTAGAAATGTAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTT
67130 GAAATATGAGAA
648 GAAATATGAGAA
* *
67142 GTCTCCACCAATCATATAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCGAGTGATTTTAATAAAAACA
1 GTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCGGGTGATTTTAATAAAAACA
*
67207 TTTTATTTTTTTCAAAATACCAAGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTAGAAATCAAATTCGGGAGTC
66 TTTTATTTTTATCAAAATACCAAGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTAGAAATCAAATTCGGGAGTC
** * *
67272 GGTTACGTTTGGGGAAGGATTCTAACCCCCATAAGCACCCAAAAATTGGTACCTAGTTGATCACC
131 GGTTACGCGTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAATTGGTACCTAGTTGATTACC
*
67337 TTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTACGAAAT-TA
196 CTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTACG-AATGTA
* * * *
67401 AAGTGAAAAAGGGTATTC-TTTAATTAATGCTAATAGCATTCATCCCTAGCATAAATACGAGATA
260 AAGTTAAAGAGGGTATTCATTT-ATTAATGCTAATAGCATTCACCCCTAGCATAAATGCGAGATA
* *
67465 TTAGCTATTGTTCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACAATGATGTGAATTTGAAAA
324 TTAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACAATGATGCGAATTTGAAAA
* *
67530 GGATGTCGACCTGTTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATACTTGCAGGGGATATACC
389 GGATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATACTTGCAGGAGATATACC
* * *
67595 ATTAATTCCCTAATAAGTGAACATTGCCTTAAGTTCTGAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTT
454 ATTAATTCCCTAATAAGTGAACATTGCCTTAGGTTTTAAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTT
* *
67660 CATTCGTCCTAATTAACGAAGGGTTATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGTGTCGAATTATAAGA
519 CATTCGTCCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGTGTCGAATTATAAGA
* *
67725 ATTAAAGAACCTAAAGGCACAAACCTAGAAATATAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTA
584 ATTAAAGAACCTAAAGGCACAAACCTAGAAATGTAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTG
67790 AAATATGAGAA
649 AAATATGAGAA
* *
67801 GTCTCCACCAATCATTTAAGGTGTGATTGAGACACCATAAAAATCGGGTGATTTTAATAAAAACA
1 GTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCGGGTGATTTTAATAAAAACA
67866 TTTTATTTTTATCAAAATACCAAGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTAGAAATCAAATTCGGGAGTC
66 TTTTATTTTTATCAAAATACCAAGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTAGAAATCAAATTCGGGAGTC
* *
67931 GGTTACGCGTGGGGAAGGATTTTAACCTCCATAAGCACCCAAAAATTGGTACCTAGTTGATTACC
131 GGTTACGCGTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAATTGGTACCTAGTTGATTACC
*
67996 CTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTACGGATGTAA
196 CTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTACGAATGTAA
* * * * **
68061 AGTTAAAGAGGATATTCGTTTATTAATGCTAATAGCGTTCACCCTTAGCATAAATTAGAGATATT
261 AGTTAAAGAGGGTATTCATTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCCTAGCATAAATGCGAGATATT
* ** * *
68126 AGCTATTGTGCCTAATAACCAAATA-TGTCCTTGATTTTAGAAA-TTTGATGCAAATTTGAAAAA
326 AGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTG-CCTCGATTTTAGAAACAATGATGCGAATTTGAAAAG
* * * *
68189 TATGTCGACCTATTTCAGAAATCACCAGAAGTCACCCCCTGAGCATACTTGCAGG-GTATATACC
390 GATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATACTTGCAGGAG-ATATACC
* * *
68253 ATTAATTCCCTAATAAGTGATCATTTCCTTAGGTTTTAAAATTAAAATGCACTCAAACAAATTTT
454 ATTAATTCCCTAATAAGTGAACATTGCCTTAGGTTTTAAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTT
* *
68318 CATTCGTCCTAATTAACCAAGGGTTATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGTGTCTAATTATAAGA
519 CATTCGTCCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGTGTCGAATTATAAGA
* *
68383 ATTAAAGAACCTAAAGGCACAAACCTAGAAATGTAGGTTCTAATATTAACCATATTTGGCTTTTG
584 ATTAAAGAACCTAAAGGCACAAACCTAGAAATGTAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTG
*
68448 AAATGTGAGAA
649 AAATATGAGAA
** *
68459 GTCTCCACCAATCATTTAAGGTATGATTGGGACACCATAAAAATCGGGTTATTTTAATAAAAACA
1 GTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCGGGTGATTTTAATAAAAACA
* * *
68524 TTTTATTTTTATCAAAATACAAAGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTAGAAATCATATTCAGGAGTC
66 TTTTATTTTTATCAAAATACCAAGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTAGAAATCAAATTCGGGAGTC
* * * * * * *
68589 GGTTACACATGGGGAAGTATTATTACCCCTATAAGCACCCAAAAATTGGTATCTAGTTGATTACA
131 GGTTACGCGTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAATTGGTACCTAGTTGATTACC
* * *
68654 CTATATTTAAAATCA-AGAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAACTTAAAAATCATTACGGATGTA
196 CTATATTTAAAATCAGA-AATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTACGAATGTA
** * * *
68718 AAGTTAAAGAGGGTATTTGTTTATTAATGCAAATAGAATTTACCCCTAGCATAAATGCGAGATAT
260 AAGTTAAAGAGGGTATTCATTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCCTAGCATAAATGCGAGATAT
* * * *
68783 TAGCTATTGTGCCTCATAACCAAATCTTGCCTCGAGTTTAGAAACAATGATGCGAATTTGAAAAA
325 TAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACAATGATGCGAATTTGAAAAG
* *
68848 GATGTCGACATATTTTGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATACTTGCAGGAGATATACCA
390 GATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATACTTGCAGGAGATATACCA
*
68913 TTAATTCTCTAATAAGTGAACATTGCCTTAGGTTTTAAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTTC
455 TTAATTCCCTAATAAGTGAACATTGCCTTAGGTTTTAAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTTC
* ** * *
68978 ATTCGTCATTTTTAACCAAGGGTGATTTAAGGCCCTCTCTATCCTAAAGTATCGAATTATAAGAA
520 ATTCGTCCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGTGTCGAATTATAAGAA
* * *
69043 TTAAAGAACCTAAAGGCACAAACCTAGAAATGTAGGTGCTAATATCAACCTTATTTGGTTTTTGA
585 TTAAAGAACCTAAAGGCACAAACCTAGAAATGTAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTGA
*
69108 AATATGAGGA
650 AATATGAGAA
* * * * * ** *
69118 GTGTTCGCCAATCATCTAAGGAGCGATTGGGACACCATAAAAATCAAGTGATTTTAATAAAAATA
1 GTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCGGGTGATTTTAATAAAAACA
* * * *
69183 TTTTCTTTTTACCAAAATACCAAGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTAGAAAACAAATTCGGGTGTC
66 TTTTATTTTTATCAAAATACCAAGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTAGAAATCAAATTCGGGAGTC
* * * *
69248 GGTTACGCGTGGGGAAGAATTATAACCCCCATGAGCACCCAAAAATTTGTAGCTAGTTGATTACC
131 GGTTACGCGTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAATTGGTACCTAGTTGATTACC
* * * * * *
69313 CTATATTTAAAAACAAAAATTTTGAGTTCGATCTTCATTTAATTTGTAAATAATTACGGATGTAA
196 CTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTACGAATGTAA
* * *
69378 AGTTAAAGATGGTATCCGTTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCCTAGCATAAATGCGAGATATT
261 AGTTAAAGAGGGTATTCATTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCCTAGCATAAATGCGAGATATT
* * * * *
69443 AGCTATTTTGCTTAATAACGAAATATAGCCTCGATTTTAGAAACAATGATGCGAATTTGAAAAAG
326 AGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACAATGATGCGAATTTGAAAAGG
*
69508 ATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATACTTGCAGGGGATATACCAT
391 ATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATACTTGCAGGAGATATACCAT
69573 TAATTCCCTAATAAGTGAACATTGCCTTAGGTTTTAAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTTCA
456 TAATTCCCTAATAAGTGAACATTGCCTTAGGTTTTAAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTTCA
* * * *
69638 TTCATCCTAATTAACCAAGGGTGCTTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGTTTCGAATTATAATAAT
521 TTCGTCCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGTGTCGAATTATAAGAAT
* *
69703 TAAACAACCTAAAGGCACAAACATAGAAATGTAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTGAA
586 TAAAGAACCTAAAGGCACAAACCTAGAAATGTAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTGAA
* *
69768 ATGTGAGGA
651 ATATGAGAA
* * * * * *
69777 GTCTCGACGAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCGAGTAATTTTAATTAAAATA
1 GTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCGGGTGATTTTAATAAAAACA
* * *
69842 TTTTATTTTTATCAAAATACCAAGTTTTAAGGTGTGCAAAAATCTAGAAATCAAATTCAGGAGTC
66 TTTTATTTTTATCAAAATACCAAGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTAGAAATCAAATTCGGGAGTC
* *
69907 GGTTACGCATGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAATTGGTACCTA-TATAATTAC
131 GGTTACGCGTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAATTGGTACCTAGT-TGATTAC
*
69971 CCTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTACGACTGTA
195 CCTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTACGAATGTA
* * *
70036 AAGTTAAAGAGGTTGTTCATTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCCTATCATAAATGCGAGATAT
260 AAGTTAAAGAGGGTATTCATTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCCTAGCATAAATGCGAGATAT
* * *
70101 TAGTTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTTGATTTTAGAAACAATGAGGCGAATTTGAAAAG
325 TAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACAATGATGCGAATTTGAAAAG
* * ** * * *
70166 TATGTCAACCTATTTCGGGAATCACTGGTAGTCATCCCCTGAGCATACTTACAGGATATATACCA
390 GATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATACTTGCAGGAGATATACCA
* *
70231 TTAATTCCCTAATAAGTGAACATTTCCATAGGTTTTAAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTTC
455 TTAATTCCCTAATAAGTGAACATTGCCTTAGGTTTTAAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTTC
* *
70296 ATTCGTCCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGGGTCGAATTATGAGAA
520 ATTCGTCCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGTGTCGAATTATAAGAA
* * *
70361 TTAAAGAAGCTAAAGGCACAAAGCTAGAAATGTAGGTTCTAATATCAACCCTATTTGGTTTTTGA
585 TTAAAGAACCTAAAGGCACAAACCTAGAAATGTAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTGA
*
70426 AATATGAGGA
650 AATATGAGAA
* * * *
70436 GTGTTCACCAATCATTTAAGGTGAGATTGGGACACCATAAAAATCGGGTGCTTTTAATAAAAACA
1 GTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCGGGTGATTTTAATAAAAACA
* * * *
70501 TTTTATGTTTATCAAAATACCATGTTTTAAGGTATGCAAAAATCTAGAAATCAAATTAGGGAGTC
66 TTTTATTTTTATCAAAATACCAAGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTAGAAATCAAATTCGGGAGTC
* * * *
70566 GGTTACGTGTGGGGAAGGATTATAACCCGCATAAGAACCCAAATATTGGTACCTAGTTGATTACC
131 GGTTACGCGTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAATTGGTACCTAGTTGATTACC
* ** *
70631 TTATATTTAAAATCAGAAATTTTTTGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTACGGATGTAA
196 CTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTACGAATGTAA
* * * * *
70696 AGTTAAAGAGGGTATTCGTTTATTAATGCTAATAGCGTTCAACCCTGGCATAAATTCGAGATATT
261 AGTTAAAGAGGGTATTCATTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCCTAGCATAAATGCGAGATATT
* *
70761 AGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTTCCTCGATTTTAGAAACATTGATGCGAATTTGAAAAGG
326 AGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACAATGATGCGAATTTGAAAAGG
*
70826 ATGTCGACCTATTTCGGG-------A--A-TCA---CC--AG--TACTTGCAGGGGATATACCAT
391 ATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATACTTGCAGGAGATATACCAT
70874 TAATTCCCTAATAAGTGAACATTGCCTTAGGTTCTT-AAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTTC
456 TAATTCCCTAATAAGTGAACATTGCCTTAGGTT-TTAAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTTC
* *
70938 ATTCGTCCTAATTAACCAGGGGTTATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGTGTCGAATTATAAGAA
520 ATTCGTCCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGTGTCGAATTATAAGAA
* *
71003 TTAAAGAACCTAAAGGCACAAACCTAAAAAAGTAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTGA
585 TTAAAGAACCTAAAGGCACAAACCTAGAAATGTAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTGA
71068 AATATGAGAA
650 AATATGAGAA
* ** **
71078 GTCTCCACCAATCATTTAAAGTGCGATTGGGATGCCATAAAAATCAAGTGATTTTAATAAAAACA
1 GTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCGGGTGATTTTAATAAAAACA
**
71143 TTTTATTTTTATCAAAATACCAAGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTAGAAATCAAATTTAGGAGTC
66 TTTTATTTTTATCAAAATACCAAGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTAGAAATCAAATTCGGGAGTC
* * *
71208 GGTTACGCGTGGAGAAGGATTATAACCCCTATAATCACCCAAAAATTGGTACCTAGTTGATTACC
131 GGTTACGCGTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAATTGGTACCTAGTTGATTACC
* * *
71273 CTATATTTAAAATCAAAAATTTTAAGTTTGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTACGAAAT-TA
196 CTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTACG-AATGTA
* * * *
71337 AAGTGAAAAAGGGTATTCATTTATTAATGCTAATAGCATTCATCCCTATCATAAATGCGAGATAT
260 AAGTTAAAGAGGGTATTCATTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCCTAGCATAAATGCGAGATAT
* * *
71402 TAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATACTGCCTTGATTTTAGAAACAATGATGCGGATTTGAAAAG
325 TAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACAATGATGCGAATTTGAAAAG
*
71467 TATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATACTTGCAGGAGATATACCA
390 GATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATACTTGCAGGAGATATACCA
71532 TTAATTCCCTAATAAGTGAACATTGCCTTAGGTTTTAAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTTC
455 TTAATTCCCTAATAAGTGAACATTGCCTTAGGTTTTAAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTTC
* * * *
71597 ATTCGTCATTATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCCCTCTCTATCCTAAAGTATCGAATTATAAGAA
520 ATTCGTCCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGTGTCGAATTATAAGAA
* * *
71662 TTAAAGAACCTAAAGGCACAAACCTAGAAATGTAGGTGCTAATATCAACCTTATTTGGTTTTTGA
585 TTAAAGAACCTAAAGGCACAAACCTAGAAATGTAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTGA
*
71727 AATATGAGGA
650 AATATGAGAA
* * * * * * * *
71737 GTGTTCACCAATCATCTATGGTGTGATTGGGACAGCATACAAATCGGGTGATTTTAATAAAAATA
1 GTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCGGGTGATTTTAATAAAAACA
* * *
71802 TTTT-CTTTT-T----AT--CAA-----AA--T-T-C-----CCTA-AAAT---ATTCGGGTGTC
66 TTTTATTTTTATCAAAATACCAAGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTAGAAATCAAATTCGGGAGTC
* * * *
71841 GGTTACGCGTGGGGAAGAATTATAACCCCCATGAGTACCCAAAAATTGGTAGCTAGTTGATTACC
131 GGTTACGCGTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAATTGGTACCTAGTTGATTACC
* * * * * *
71906 CTATATTTAAAAACAAAAATTTTGAGTTCGATCTTCATTTAATTTGTAAATAATTACGGATGTAA
196 CTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTACGAATGTAA
* *
71971 AGTTAAAGATGGTATTCGTTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCCTAGCATAAATGCGAGATATT
261 AGTTAAAGAGGGTATTCATTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCCTAGCATAAATGCGAGATATT
* *
72036 AGCTATTGTGCTTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACAATGTTGCGAATTTGAAATA-
326 AGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACAATGATGCGAATTTGAAA-AG
* * *
72100 GATGTCTACCTATTTCAGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATACTTGCAGGGGATATACCA
390 GATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATACTTGCAGGAGATATACCA
72165 TT-ATTCCCTAATAAGTGAACATTGCCTTAGGTTTTAAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTTC
455 TTAATTCCCTAATAAGTGAACATTGCCTTAGGTTTTAAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTTC
* * *
72229 ATTCGGCCTAATTAACCAAGGGTGCTTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGTGTCGAATTATAATAA
520 ATTCGTCCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGTGTCGAATTATAAGAA
* * *
72294 TTAAGGAACCTAAAGGCACAAACATTGAAATGTAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTGA
585 TTAAAGAACCTAAAGGCACAAACCTAGAAATGTAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTGA
* *
72359 AATGTGAGGA
650 AATATGAGAA
* * * *
72369 GTATCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCGGGTAATTTTAATTAAAATA
1 GTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCGGGTGATTTTAATAAAAACA
* **
72434 TTTTATTTTTATCAAAATACCAAGTTTTAAGGTGTGTAAAAATCTAGAAATCAAATTCGGGAGTC
66 TTTTATTTTTATCAAAATACCAAGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTAGAAATCAAATTCGGGAGTC
* *
72499 GGTTACGCATGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAATTGGTACCTA-TATAATTAC
131 GGTTACGCGTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAATTGGTACCTAGT-TGATTAC
*
72563 CCTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAGTCATTACGAATGTA
195 CCTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTACGAATGTA
* * * *
72628 AAGTTAAAGAGGTTGTTCATTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCCTATCATAAATGCGAAATAT
260 AAGTTAAAGAGGGTATTCATTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCCTAGCATAAATGCGAGATAT
* *
72693 TAGTTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTTGATTTTAGAAACAATGATGCGAATTTGAAAAG
325 TAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACAATGATGCGAATTTGAAAAG
* * ** *
72758 TATGTCAACCTATTTCGGGAATCACTGGTAGTCATCCCCTGAGCATACTTGCAGGAGATATACCA
390 GATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATACTTGCAGGAGATATACCA
*
72823 TTAATTCCCTAATAAGTGAATATTGCCTTAGGTTTTAAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTTC
455 TTAATTCCCTAATAAGTGAACATTGCCTTAGGTTTTAAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTTC
* * *
72888 ATTCGTCCTAAATAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGGGTCGAATTATGAGAA
520 ATTCGTCCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGTGTCGAATTATAAGAA
* * *
72953 TTAAAGAAGCTAAAGGCACAAAGCTAGAAATGTAAGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTGA
585 TTAAAGAACCTAAAGGCACAAACCTAGAAATGTAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTGA
* *
73018 AATGTGAGGA
650 AATATGAGAA
* *
73028 GTCTCCACCAATCATTTAAGGTGAGATTGGGACACCATAAAAATCGGGTGCTTTTAATAAAAACA
1 GTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCGGGTGATTTTAATAAAAACA
* * * *
73093 TTTTATTTTTATCAAAATACCAGGTTTTATGATATGCGAAAATCTAGAAATCAAATTCAGGAGTC
66 TTTTATTTTTATCAAAATACCAAGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTAGAAATCAAATTCGGGAGTC
* *
73158 GGTTACGCGTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGAACCCAAATATTGGTACCTAGTTGATTACC
131 GGTTACGCGTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAATTGGTACCTAGTTGATTACC
* * *
73223 TTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTTAAAATCATTACGGATGTAA
196 CTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTACGAATGTAA
* * *
73288 AGTTAAAGAGGGTATTCATTTATTAATGCTAATAGCGTTCAACCCTGGCATAAAAT-CGAGATAT
261 AGTTAAAGAGGGTATTCATTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCCTAGCAT-AAATGCGAGATAT
*
73352 TAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACATTGATGCGAATTTGAAAAG
325 TAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACAATGATGCGAATTTGAAAAG
* *
73417 GATGTCGACCTATTTCGGGAATTACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATACTTGCAGGGGATATACCA
390 GATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATACTTGCAGGAGATATACCA
*
73482 TTAATTCCCTAATAAGTGAACATTTCCTTAGGTTCTT-AAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTT
455 TTAATTCCCTAATAAGTGAACATTGCCTTAGGTT-TTAAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTT
* * *
73546 CATTCGTCCTAATTAACGAAGGGTTATTTAAGTCTCTCTCTATCCTAAAGTGTCGAATTATAAGA
519 CATTCGTCCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGTGTCGAATTATAAGA
* * * *
73611 ATTAAAGAACCTAAAGGCACAAACCTAGAATTATAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGGTTTTA
584 ATTAAAGAACCTAAAGGCACAAACCTAGAAATGTAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTG
73676 AAATATGAGAA
649 AAATATGAGAA
*
73687 GTCTCCCCCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCGGGTGATTTTAATAAAAACA
1 GTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCGGGTGATTTTAATAAAAACA
* * * **
73752 TTTTATTTTTATCAAAATACTAATTTTTAGGGTATGCGAAAATCTAGAAATCAAATTCAAGAGTC
66 TTTTATTTTTATCAAAATACCAAGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTAGAAATCAAATTCGGGAGTC
* *
73817 GGTTACGCGTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGAACCCAAAAATTGGTACCTAATTGATTACC
131 GGTTACGCGTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAATTGGTACCTAGTTGATTACC
*
73882 CTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTAAAAATCATTACGGAAT-TA
196 CTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTAC-GAATGTA
* * * *
73946 AAGTGAAAAAGGGTATTCATTTATTAATGCTAATAGCATTCATCCCTAGAATAAATGC-AGGATA
260 AAGTTAAAGAGGGTATTCATTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCCTAGCATAAATGCGA-GATA
* * *
74010 TTAGCTATTGT-CCTAATAACCAAATATTGCCTCAATTTTACAAACAATGATGCAAATTTGAAAA
324 TTAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACAATGATGCGAATTTGAAAA
* * * * * *
74074 AGATGTCAACCTATTTCGGTTAA-CACCAATAGTCACCCCCTAAGCATACTTGCAGTAGATATAC
389 GGATGTCGACCTATTTCGG-GAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATACTTGCAGGAGATATAC
* * * **
74138 CATTAATTCCATAATAAATGAATATTATCTTAGGTTCTT-AAAATAAAATGCACTCAAACAAATT
453 CATTAATTCCCTAATAAGTGAACATTGCCTTAGGTT-TTAAAAATAAAATGCACTCAAACAAATT
* * * * **
74202 TTCATTTGTCCTAATTGACCAAGGGTTATTTAAGGCTTTCTCTATCCTAAAGTGTTAAATTATAA
517 TTCATTCGTCCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGTGTCGAATTATAA
**
74267 GAATTAAAGAACCTAAAGGCACAAAAATAGAAATGTAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTT
582 GAATTAAAGAACCTAAAGGCACAAACCTAGAAATGTAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTT
* *
74332 TGAAATGTGAAAA
647 TGAAATATGAGAA
* * * *
74345 GTCTCCACCAATCATTTAATGTGCGATTGGGACA-CATAAAAAGCGGGTAATTTTAATAAAAATA
1 GTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCGGGTGATTTTAATAAAAACA
* * * * *
74409 TTTTATTTTTATCAAAATACTAAGTTTTAAGGTGTGCAAAAATATAGAAATCAAATTCAGGAGTC
66 TTTTATTTTTATCAAAATACCAAGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTAGAAATCAAATTCGGGAGTC
* *
74474 GGTTACGCATGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAATTGGTACCTAGTTAATTACC
131 GGTTACGCGTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAATTGGTACCTAGTTGATTACC
* * *
74539 CTATATTTAAAATCAAAAATTTTGCGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTACGAATGTTA
196 CTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTACGAATGTAA
* * * * * * *
74604 ATTTAAAGAGGTTGTTCATTTTTTAATTCTAATAGCATTCACCCCTATCATAAATACGAGATATT
261 AGTTAAAGAGGGTATTCATTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCCTAGCATAAATGCGAGATATT
* * * *
74669 AGCTATTGTGCCTAATAACAAAATACTGCCTCGATTTTAGAAACAATGATGTGAATTTGAAAAGT
326 AGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACAATGATGCGAATTTGAAAAGG
* * * ** * *
74734 ATGTCAACCTATTTCGGCAATCGCTGGTAGTTATCCCCTGAGCATACTTGCAGGAGATATACCAT
391 ATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATACTTGCAGGAGATATACCAT
* * * *
74799 TAATTTCCTAATAACTGAACATTACCTTAGGTTTTAAAAATAAAATGCACTC-AATAAATTTTCA
456 TAATTCCCTAATAAGTGAACATTGCCTTAGGTTTTAAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTTCA
* * * * *
74863 TTCGTCCTAATTAACCAAGAGTGATTTAAAGCTCTCTCTATCCTAAAGGGTCAAATTATGAGAAT
521 TTCGTCCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGTGTCGAATTATAAGAAT
* * *
74928 TAAAGAACCTAAAGGCACAAACCTAGAAATGTAAGTTCTAATAGTAACCTTATTTGGTTTTTGAA
586 TAAAGAACCTAAAGGCACAAACCTAGAAATGTAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTGAA
*
74993 ATATGAGGA
651 ATATGAGAA
*
75002 GTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAAAT-GGGTGATTTTAATAAAAAG
1 GTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCAT-AAAAATCGGGTGATTTTAATAAAAAC
* *
75066 ATTTTATTTTTATCAAAATACCAAGTTTTAAAGTGTGCGAAAATCTAGAAATCAAATTCGGGAGT
65 ATTTTATTTTTATCAAAATACCAAGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTAGAAATCAAATTCGGGAGT
* * * *
75131 CGGTTACGCGTGGGGAAGGCTTCTAACCCCCATAAGCACCCAAATATTGGTACCTAGTTGAATAC
130 CGGTTACGCGTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAATTGGTACCTAGTTGATTAC
* * *
75196 CCTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATAATTTCGGATGTA
195 CCTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTACGAATGTA
* * * *
75261 AAGTTAAAGAGGGAATTCGTTTATTAATGCTAATAGCGTTCACCCCTAGCATAAATTCGAGATAT
260 AAGTTAAAGAGGGTATTCATTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCCTAGCATAAATGCGAGATAT
*
75326 TAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACATTGATGCGAATTTGAAAAG
325 TAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACAATGATGCGAATTTGAAAAG
*
75391 GATGTCGACCTATTTCGGGAATCTCCAGTAGTCACCCCCTGAGCATACTTGCAGGAGATATACCA
390 GATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATACTTGCAGGAGATATACCA
* *
75456 TTAATTCCCTAATAAGTGAACATTGTCATAGGTTCTT-AAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTT
455 TTAATTCCCTAATAAGTGAACATTGCCTTAGGTT-TTAAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTT
* * * *
75520 CATTCGTCCTAATTGACCAAGGGTTATTTAAGGCTTTCTCTATCCTAAAGTGTCAAATTATAAGA
519 CATTCGTCCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGTGTCGAATTATAAGA
75585 ATTAAAGAACCTAAAGGCACAAACCTAGAAATGTAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTG
584 ATTAAAGAACCTAAAGGCACAAACCTAGAAATGTAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTG
75650 AAATATGAGAA
649 AAATATGAGAA
* * *
75661 GTCTCCACCAATCATTTAAAGTGCGATTGGGATACCATAAAAATCAGGTGATTTTAAT-AAAACA
1 GTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCGGGTGATTTTAATAAAAACA
*
75725 TTTTATTTTTATCAAAATACCAAGTTTTAAGGTATGCGAAATTCTAGAAATCAAATTCGGGAGTC
66 TTTTATTTTTATCAAAATACCAAGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTAGAAATCAAATTCGGGAGTC
*
75790 GGTTACGCGTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAATCACCCAAAAATTGGTACCTAGTTGATTACC
131 GGTTACGCGTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAATTGGTACCTAGTTGATTACC
75855 CTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTACGGAAT-TA
196 CTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTAC-GAATGTA
* * *
75919 AAGTGAAA-AGGGTATTCATTTATTAATGCTAATAGCATTCATCCCTAGCATAAATGCCAGATAT
260 AAGTTAAAGAGGGTATTCATTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCCTAGCATAAATGCGAGATAT
*
75983 TAGCTATTGTGGCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACAATGATGCGAATTTGAAAAG
325 TAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACAATGATGCGAATTTGAAAAG
*
76048 CATGTCGACCTACTTT-GGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATACTTGCAGGAGATATACC
390 GATGTCGACCTA-TTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATACTTGCAGGAGATATACC
* *
76112 ATTAATTCCCTAATAAGTGAACATTGCCTTAGGTTTTAAAAATAAAATGTATTCAAACAAATTTT
454 ATTAATTCCCTAATAAGTGAACATTGCCTTAGGTTTTAAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTT
* * * * *
76177 CATTCGTCCTAATTAACCAGGGGTTATTTAAGGCTCTCTCTATCTTAAAGTGTTGAATTACAAGA
519 CATTCGTCCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGTGTCGAATTATAAGA
* *
76242 ATTAAAGAACCTAAAGGCACAAACATAGAAATATAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTG
584 ATTAAAGAACCTAAAGGCACAAACCTAGAAATGTAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTG
76307 AAATATGAGAA
649 AAATATGAGAA
76318 GTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCGGGTGATTTTAATAAAAACA
1 GTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCGGGTGATTTTAATAAAAACA
*
76383 TTTTATTTTTATCAAAATACCAAGTTTTAAGGAATGCGAAAATCTAGAAATCAAATTCGGGAGTC
66 TTTTATTTTTATCAAAATACCAAGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTAGAAATCAAATTCGGGAGTC
* * *
76448 GGTTACGCGTGGAGAAGGATTATAACCCCTATAATCACCCAAAAATTGGTACCTAGTTGATTACC
131 GGTTACGCGTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAATTGGTACCTAGTTGATTACC
76513 CTATATTTAAAATCA-AAACTTTTGAGTTCGGA-CTTTATTTAATTTGAAAATCATTACGAATGT
196 CTATATTTAAAATCAGAAA-TTTTGAGTTC-GATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTACGAATGT
* * * **
76576 AAAGTTAAAGAGGTTGTTCATTTATTAATGCTAATAGCATTAACCCCTAGCATAAATTTGAGATA
259 AAAGTTAAAGAGGGTATTCATTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCCTAGCATAAATGCGAGATA
*
76641 TTAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTTGATTTTAGAAA-AATTGATGCGAATTTGAAA
324 TTAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACAA-TGATGCGAATTTGAAA
* * *
76705 AGGATGTCGACCTATTTCGGTAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATACTTGCAGGGGATATAT
388 AGGATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATACTTGCAGGAGATATAC
76770 CATTAATTCCCTAATAAGTGAACATTGCCTTAGGTTCTT-AAAATAAAATGCACTCAAACAAATT
453 CATTAATTCCCTAATAAGTGAACATTGCCTTAGGTT-TTAAAAATAAAATGCACTCAAACAAATT
* *
76834 TTCATTCATCCTAATTAACCAAGGGTTATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGTGTCGAATTATAA
517 TTCATTCGTCCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGTGTCGAATTATAA
* *
76899 GAATTAAAGAACCTAAAGACACAAACCTAGAAATGTAGATTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTT
582 GAATTAAAGAACCTAAAGGCACAAACCTAGAAATGTAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTT
76964 TGAAATATGAGAA
647 TGAAATATGAGAA
* ** **
76977 GTCTCCACCAATCATTTAAAGTGCGATTGGGATGCCATAAAAATCAAGTGATTTTAATAAAAACA
1 GTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCGGGTGATTTTAATAAAAACA
* * * *
77042 TTTTATTTTTATTAAAATACCAAGTTTTAAGGAATGCGAAAATGTAGAAATAAAATTCGGGAGTC
66 TTTTATTTTTATCAAAATACCAAGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTAGAAATCAAATTCGGGAGTC
* * * *
77107 GGTTACGCGTGGAGAAGGATTATAACCCCTATAATCACCCAAAAATTGGTACCTAGTTGATTACA
131 GGTTACGCGTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAATTGGTACCTAGTTGATTACC
77172 CTATATTTAAAATCA-AAACTTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTACGAAAT-T
196 CTATATTTAAAATCAGAAA-TTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTACG-AATGT
* * *
77235 AAAGTGAAAAAGGGTATTCATTTATTAATGCTAATAGCATTCATCCCTAGCATAAATGCGAGATA
259 AAAGTTAAAGAGGGTATTCATTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCCTAGCATAAATGCGAGATA
* *
77300 TTAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTTGATTTTAGAAACAATGATGCGGATTTGAAAA
324 TTAGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACAATGATGCGAATTTGAAAA
* *
77365 GGATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATACTTGCACGAGATATACA
389 GGATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATACTTGCAGGAGATATACC
* *
77430 ATTATTTCCCTAATAAGTGAACATTGCCTTAGGTTTTAAAAATAAAATGCATTCAAACAAATTTT
454 ATTAATTCCCTAATAAGTGAACATTGCCTTAGGTTTTAAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTT
* * * *
77495 CATTCGTCCTAATTAACCAAAGGTGCTTTAAGGCTCTCTCTATTCTAAAGTGTCGAACTATAAGA
519 CATTCGTCCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGTGTCGAATTATAAGA
* *
77560 ATTAAAGAACTTAAAGGCACAAACATAGAAATGTAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTG
584 ATTAAAGAACCTAAAGGCACAAACCTAGAAATGTAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTG
* * *
77625 AAATGTTAGGA
649 AAATATGAGAA
* * * *
77636 GTCTCCACCAATCATTTAAGGTTCGATTAGGACACTATAAAAATCGGGTGATTTTAATAAAAATA
1 GTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCGGGTGATTTTAATAAAAACA
* * ** *
77701 TTTTATTTTTATCAAAATACCAAGGTTTAAGGTGTGAAAAAATCTAGAAATCAAATTCAGGAGTC
66 TTTTATTTTTATCAAAATACCAAGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTAGAAATCAAATTCGGGAGTC
* * *
77766 TGTTACGCATGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAATTGGTACCTAGTTAATTACC
131 GGTTACGCGTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAATTGGTACCTAGTTGATTACC
*
77831 TTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTACGAATGTAA
196 CTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTACGAATGTAA
* * * *
77896 AGTTAAAGAGGTTGTTCATTTATT-ATGATAATAGCATTCACCCCTATCATAAATGCGAGATATT
261 AGTTAAAGAGGGTATTCATTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCCTAGCATAAATGCGAGATATT
* * * *
77960 AGCTATTTTGCCTAATGACCAAATATTGCCTCAATTTTAGAAACAATGATGCGAATTTGAAAAGT
326 AGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACAATGATGCGAATTTGAAAAGG
* ** * * * *
78025 ATGTCAACCTATTTCGGGAATCACTGGTAGTCATCCCCTGAGCATACTTTCAAGAGATATCCCAT
391 ATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATACTTGCAGGAGATATACCAT
* *
78090 TAATTCCCTAATAAGTTAACATTGCCTTACGTTTTAAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTTCA
456 TAATTCCCTAATAAGTGAACATTGCCTTAGGTTTTAAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTTCA
* * * * * *
78155 TTCGTCCTAATTAAACAAGAGTGATTTAAAGCTCTCTCTATCCTAAAGGGTCAAATTATGAGAAT
521 TTCGTCCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGTGTCGAATTATAAGAAT
*
78220 TAAAGAACCTAAAGGCACAAACCTAGAAATGTAAGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTGAA
586 TAAAGAACCTAAAGGCACAAACCTAGAAATGTAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTGAA
*
78285 ATGTGA-AGA
651 ATATGAGA-A
* * **
78294 GTCTCCACCAATCATTTTAGGTGCGATTAGGACACCATAAAAATCAAGTGATTTTAAT-AAAACA
1 GTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCGGGTGATTTTAATAAAAACA
* * *
78358 TTTTATTTTTATCAAAATACCATA-TTTTAAGGTATGCAAAAATATAGAAATCAAATTTGGGAGT
66 TTTTATTTTTATCAAAATACCA-AGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTAGAAATCAAATTCGGGAGT
* *
78422 CGGTTACGTGTGGGGAAGGATTATAA-CCGCATAAGCACCCAAAAATT
130 CGGTTACGCGTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAATT
78469 AGTTTATTAA
Statistics
Matches: 18672, Mismatches: 1708, Indels: 333
0.90 0.08 0.02
Matches are distributed among these distances:
632 250 0.01
633 304 0.02
634 2 0.00
636 4 0.00
637 3 0.00
638 2 0.00
640 3 0.00
642 572 0.03
643 5 0.00
644 3 0.00
645 2 0.00
646 4 0.00
647 1 0.00
648 1 0.00
649 4 0.00
650 1 0.00
651 4 0.00
652 3 0.00
653 2 0.00
654 3 0.00
655 12 0.00
656 1341 0.07
657 1969 0.11
658 3393 0.18
659 8881 0.48
660 1772 0.09
661 131 0.01
ACGTcount: A:0.36, C:0.16, G:0.16, T:0.32
Consensus pattern (659 bp):
GTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCGGGTGATTTTAATAAAAACA
TTTTATTTTTATCAAAATACCAAGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTAGAAATCAAATTCGGGAGTC
GGTTACGCGTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAATTGGTACCTAGTTGATTACC
CTATATTTAAAATCAGAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTACGAATGTAA
AGTTAAAGAGGGTATTCATTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCCTAGCATAAATGCGAGATATT
AGCTATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACAATGATGCGAATTTGAAAAGG
ATGTCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATACTTGCAGGAGATATACCAT
TAATTCCCTAATAAGTGAACATTGCCTTAGGTTTTAAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTTCA
TTCGTCCTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGTGTCGAATTATAAGAAT
TAAAGAACCTAAAGGCACAAACCTAGAAATGTAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTGAA
ATATGAGAA
Found at i:80683 original size:565 final size:563
Alignment explanation
Indices: 79610--81334 Score: 2574
Period size: 565 Copynumber: 3.0 Consensus size: 563
79600 AAAGTGAAAA
* * *
79610 AGGGTATTCATTTATTAATGCTAATAGCATTCATCCCTAGCAT-AATTGCGAGATATTAGCTATT
1 AGGGTATTCATTTATTAATGCTAATAGCGTTCACCCCTAGCATGAATT-TGAGATATTAGCTATT
** * * * *
79674 GTGCCTAATAAAAAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACAATGATGTGAATTTGAAAAGGATGTCAA
65 GTGCCTAATAACCAAATATAGCATCGATTTTAGAAACATTGATGTGAATTTGAAAAGGATGTCGA
* * *
79739 CCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACTCCCTGAGCTTACATGCAGGAGATATACCATTAATTCC
130 CCTATTTTGGGAATCACCAGTAGTCAC-CCCTGAGCATACTTGCAGGAGATATACCATTAATTCC
79804 CTAATAAGTGAACATTGCCTTAGGTT-TTGAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTTCATTCGTC
194 CTAATAAGTGAACATTGCCTTAGGTTCTT-AAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTTCATTCGTC
* *
79868 CTAAATAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGTGTCAAATTATAAGAATTAAAGA
258 CTAATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGTGTCGAATTATAAGAATTAAAGA
**
79933 ACCTAAAGGCACAAAGATAGAAATGTAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTGAAATGTGA
323 ACCTAAAGGCACAAACCTAGAAATGTAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTGAAATGTGA
* *
79998 GAAGTCTCAACCAATCATTTAAGGTGTGATTGGGACACCATAAAAATCAGGTGATTTTAATAAAA
388 GAAGTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATC-GGTGATTTTAATAAAA
* * *
80063 ACATTTTATTTTTATCAAAATACCAAGTTTAAAGGTGTGAAAAAATCTAGAAATCAAATTCAGGA
452 ACATTTTATTTTTATCAAAATACCAAGTTTTAAGGTATGCAAAAATCTAGAAATCAAATTCAGGA
80128 GTCGGTTATGCACGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAG
517 GTCGGTTATGCACGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAG
** *
80175 AGTTTATTCATTTATTAATGCTAATAGCGTTCACCCCTAGCATGAATTTGAGATATTAGTTATTG
1 AGGGTATTCATTTATTAATGCTAATAGCGTTCACCCCTAGCATGAATTTGAGATATTAGCTATTG
80240 TGCCTAATAACCAAATATAGCATCGATTTTAGAAACATTGATGTGAATTTGAAAAGGATGTCGAC
66 TGCCTAATAACCAAATATAGCATCGATTTTAGAAACATTGATGTGAATTTGAAAAGGATGTCGAC
80305 CTATTTTGGGAATCACCAGTAGTCATCCCCTGAGCATACTTGCAGGAGATATACCATTAATTCCC
131 CTATTTTGGGAATCACCAGTAGTCA-CCCCTGAGCATACTTGCAGGAGATATACCATTAATTCCC
* * *
80370 TAATAAATTAACATTGCCTTAGGTTCTTAAAATAAAATGCACTCAAACAAAGTTTCATTCGTCCT
195 TAATAAGTGAACATTGCCTTAGGTTCTTAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTTCATTCGTCCT
* * * *
80435 AATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTATATCCTAAAGGGTTGAATTATGAGAATTAAAGAAC
260 AATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGTGTCGAATTATAAGAATTAAAGAAC
* * *
80500 CTAAAGGCACAAACCTAGAAATGTAAGTTCTAATATTAAACCTATTTGGTTTTTGAAATGTGAGG
325 CTAAAGGCACAAACCTAGAAATGTAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTGAAATGTGAGA
*
80565 AGTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCACAAAAATCGTGTGATTTTAATAAAAAC
390 AGTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCG-GTGATTTTAATAAAAAC
* * *
80630 ATTTTATTTTTATCAAAATGCAAAGTTTTAAGGTATGCAAAAATCTAGAAATCAAATTCGGGAGT
454 ATTTTATTTTTATCAAAATACCAAGTTTTAAGGTATGCAAAAATCTAGAAATCAAATTCAGGAGT
* ***
80695 CGGTTACGCGTAGGGAAGGATTATAACCCCATAAGCACCTAAAACTTGGTACCTAGTTGATTACC
519 CGGTTATGCACGGGGAAGGATTATAACCCC-----CA--T--AA----G---C---------ACC
80760 CTATATATAAAG
559 C-------AAAG
*
80772 AGGGTATTCGTTTATTAATGCTAATAGCGTTCACCCCTAGCATGAATTTGAGATATTAGCTATTG
1 AGGGTATTCATTTATTAATGCTAATAGCGTTCACCCCTAGCATGAATTTGAGATATTAGCTATTG
* *
80837 TGCCTAATAACCAAATGTAGCATCGATTCTAGAAACATTGATGTGAATTTGAAAAGGATGTCGAC
66 TGCCTAATAACCAAATATAGCATCGATTTTAGAAACATTGATGTGAATTTGAAAAGGATGTCGAC
80902 CTATTTTGGGAATCACCAGTAGTCACCCTCTGAGCATACTTGCAGGAGATATACCATTAATTCCC
131 CTATTTTGGGAATCACCAGTAGTCACCC-CTGAGCATACTTGCAGGAGATATACCATTAATTCCC
80967 TAATAAGTGAACATTGCCTTAGGTTCTTAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTTCATTCGTCCT
195 TAATAAGTGAACATTGCCTTAGGTTCTTAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTTCATTCGTCCT
* *
81032 AATTAACCAAGGGTTATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGTGTCGAATTATAAGAATTAAAAAAC
260 AATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGTGTCGAATTATAAGAATTAAAGAAC
* *
81097 CTAAAGGCACAAACCTAGAAATGTAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGATTTTGAAATATGAGA
325 CTAAAGGCACAAACCTAGAAATGTAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTGAAATGTGAGA
* * * *
81162 AGTCTCCACCAATCATTTAAAGTACGATTGGGAAACCATAAAAATCAAGTGATTTTAATAAAAAC
390 AGTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATC-GGTGATTTTAATAAAAAC
* *
81227 ATTTTATTTTT-TCAAAATACCATGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTAGAAATCAAATTCAGGAGT
454 ATTTTATTTTTATCAAAATACCAAGTTTTAAGGTATGCAAAAATCTAGAAATCAAATTCAGGAGT
81291 CGGTTATGCACGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAA
519 CGGTTATGCACGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAA
81335 AATTGGTACC
Statistics
Matches: 1046, Mismatches: 76, Indels: 77
0.87 0.06 0.06
Matches are distributed among these distances:
564 4 0.00
565 496 0.47
566 7 0.01
570 2 0.00
571 4 0.00
572 1 0.00
574 2 0.00
578 1 0.00
580 1 0.00
581 1 0.00
583 1 0.00
587 2 0.00
589 1 0.00
590 4 0.00
591 2 0.00
596 77 0.07
597 440 0.42
ACGTcount: A:0.36, C:0.17, G:0.17, T:0.31
Consensus pattern (563 bp):
AGGGTATTCATTTATTAATGCTAATAGCGTTCACCCCTAGCATGAATTTGAGATATTAGCTATTG
TGCCTAATAACCAAATATAGCATCGATTTTAGAAACATTGATGTGAATTTGAAAAGGATGTCGAC
CTATTTTGGGAATCACCAGTAGTCACCCCTGAGCATACTTGCAGGAGATATACCATTAATTCCCT
AATAAGTGAACATTGCCTTAGGTTCTTAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTTCATTCGTCCTA
ATTAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGTGTCGAATTATAAGAATTAAAGAACC
TAAAGGCACAAACCTAGAAATGTAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTGAAATGTGAGAA
GTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCGGTGATTTTAATAAAAACAT
TTTATTTTTATCAAAATACCAAGTTTTAAGGTATGCAAAAATCTAGAAATCAAATTCAGGAGTCG
GTTATGCACGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAG
Found at i:81324 original size:597 final size:596
Alignment explanation
Indices: 80179--82027 Score: 2294
Period size: 597 Copynumber: 3.0 Consensus size: 596
80169 CCAAAGAGTT
* *
80179 TATTCATTTATTAATGCTAATAGCGTTCACCCCTAGCATGAATTTGAGATATTAGTTATTGTGCC
1 TATTCGTTTATTAATGCTAATAGCGTTCACCCCTAGCATGAATTTGAGATATTAGCTATTGTGCC
*
80244 TAATAACCAAATATAGCATCGATTTTAGAAACATTGATGTGAATTTGAAAAGGATGTCGACCTAT
66 TAATAACCAAAT-TAGCATCGATTCTAGAAACATTGATGTGAATTTGAAAAGGATGTCGACCTAT
80309 TTTGGGAATCACCAGTAGTCATCCCCTGAGCATACTTGCAGGAGATATACCATTAATTCCCTAAT
130 TTTGGGAATCACCAGTAGTCATCCCCTGAGCATACTTGCAGGAGATATACCATTAATTCCCTAAT
* * *
80374 AAATTAACATTGCCTTAGGTTCTTAAAATAAAATGCACTCAAACAAAGTTTCATTCGTCCTAATT
195 AAGTGAACATTGCCTTAGGTTCTTAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTTCATTCGTCCTAATT
* *
80439 AACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTATATCCTAAAGGGTTGAATTATGAGAATTAAAGAACCTAA
260 AACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAA-GGTCGAATTATGAGAATTAAAGAACCTAA
*
80504 AGGCACAAACCTAGAAATGTAAGTTCTAATATTAAACCTATTTGGTTTTTGAAATGTGAGGAGTC
324 AGGCACAAACCTAGAAATGTAAGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTGAAATGTGAGGAGTC
* *
80569 TCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCACAAAAATCGTGTGATTTTAATAAAAACATTT
389 TCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCGAGTGATTTTAATAAAAACATTT
*
80634 TATTTTTATCAAAATGCAAAGTTTTAAGGTATGCAAAAATCTAGAAATCAAATTCGGGAGTCGGT
454 TATTTTTATCAAAATACAAAGTTTTAAGGTATGCAAAAATCTAGAAATCAAATTCGGGAGTCGGT
* * *
80699 TACGCGTAGGGAAGGATTATAA-CCCCATAAGCACCTAAAACTTGGTACCTAGTTGATTACCCTA
519 TACGCGTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAATTGGTACCTAGTTGATTACCCTA
*
80763 TATATAAAGAGGG
584 TATATAAAAAGGG
80776 TATTCGTTTATTAATGCTAATAGCGTTCACCCCTAGCATGAATTTGAGATATTAGCTATTGTGCC
1 TATTCGTTTATTAATGCTAATAGCGTTCACCCCTAGCATGAATTTGAGATATTAGCTATTGTGCC
80841 TAATAACCAAATGTAGCATCGATTCTAGAAACATTGATGTGAATTTGAAAAGGATGTCGACCTAT
66 TAATAACCAAAT-TAGCATCGATTCTAGAAACATTGATGTGAATTTGAAAAGGATGTCGACCTAT
80906 TTTGGGAATCACCAGTAGTCA-CCCTCTGAGCATACTTGCAGGAGATATACCATTAATTCCCTAA
130 TTTGGGAATCACCAGTAGTCATCCC-CTGAGCATACTTGCAGGAGATATACCATTAATTCCCTAA
80970 TAAGTGAACATTGCCTTAGGTTCTTAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTTCATTCGTCCTAAT
194 TAAGTGAACATTGCCTTAGGTTCTTAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTTCATTCGTCCTAAT
* * *
81035 TAACCAAGGGTTATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGTGTCGAATTATAAGAATTAAAAAACCTA
259 TAACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAG-GTCGAATTATGAGAATTAAAGAACCTA
* * * *
81100 AAGGCACAAACCTAGAAATGTAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGATTTTGAAATATGAGAAGT
323 AAGGCACAAACCTAGAAATGTAAGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTGAAATGTGAGGAGT
* * * *
81165 CTCCACCAATCATTTAAAGTACGATTGGGAAACCATAAAAATCAAGTGATTTTAATAAAAACATT
388 CTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCGAGTGATTTTAATAAAAACATT
* * * *
81230 TTATTTTT-TCAAAATACCATGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTAGAAATCAAATTCAGGAGTCGG
453 TTATTTTTATCAAAATACAAAGTTTTAAGGTATGCAAAAATCTAGAAATCAAATTCGGGAGTCGG
* ** *
81294 TTATGCACGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAATTGGTACCTAGTTAATTACCCT
518 TTACGCGTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAATTGGTACCTAGTTGATTACCCT
***
81359 ATATTTAAAATCAAAAATTT
583 ATA--T---AT-AAAAAGGG
** * **** * **
81379 TGAGTTCGATCCTTATTTAATTTGAAAATCATTATGAATATAAAGTTAAAGAGGTTATTCATTTA
1 T-A-TTCG-T--TTA-TTAA--TG-----C----T--A-ATAGCGTT-CA-CCCCTA-GCATGAA
* * * *** * * *
81444 -TTAATGCTAATAGC-ATTCACCCATATCATAAATGCGAGATATTAGCTATTG-TGCCTA-ATAA
43 TTTGA-GATATTAGCTATTGTGCC-TA--AT-AA--CCA-A-ATTAGC-ATCGAT-TCTAGA-AA
* * * * **
81505 TCAAAT-ATTGCCTCGATTTTAGAAACAATGATGCGAATTTGAAAAGTATGTCAACCTATTTCGG
96 -C-ATTGA-TG--T-GAATTT-G-AA-AAGGAT--G---TCG--ACCTA--T-------TTT-GG
** *
81569 GAATCACTGGTTGTCATCCCCTGAGCATACTTGCAGGAGATATACCATTAATTCCCTAATAAGTG
135 GAATCACCAGTAGTCATCCCCTGAGCATACTTGCAGGAGATATACCATTAATTCCCTAATAAGTG
*
81634 AACATTGCCTTAGGTT-TTAAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTTCATTCATCCTAATTAACC
200 AACATTGCCTTAGGTTCTT-AAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTTCATTCGTCCTAATTAACC
81698 AAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGGATCGAATTATGAGAATTAAAGAACCTAAAGGC
264 AAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGG-TCGAATTATGAGAATTAAAGAACCTAAAGGC
*
81763 ACAAACCTAGAAATATAAGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTGAAATGTGAGGAGTCTCCA
328 ACAAACCTAGAAATGTAAGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTGAAATGTGAGGAGTCTCCA
*
81828 CCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCGAGTGATTTTAATAATAACATTTTATT
393 CCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCGAGTGATTTTAATAAAAACATTTTATT
* * *
81893 TTTATCAAATTACAAAGCTTTAAGGTATGCAAAAATCTAGAAATCAAATTCGGGTGTCGGTTACG
458 TTTATCAAAATACAAAGTTTTAAGGTATGCAAAAATCTAGAAATCAAATTCGGGAGTCGGTTACG
* * *
81958 CGTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAACCACCCAAAAATTGGAACCTAGTTGATTACCCTATATT
523 CGTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAATTGGTACCTAGTTGATTACCCTATATA
82023 TAAAA
588 TAAAA
82028 TCAAAAAGTT
Statistics
Matches: 1083, Mismatches: 95, Indels: 92
0.85 0.07 0.07
Matches are distributed among these distances:
596 74 0.07
597 474 0.44
599 1 0.00
602 2 0.00
603 5 0.00
604 1 0.00
605 4 0.00
606 1 0.00
608 3 0.00
609 4 0.00
611 2 0.00
616 1 0.00
620 1 0.00
622 1 0.00
623 6 0.01
624 1 0.00
625 10 0.01
626 13 0.01
628 2 0.00
629 2 0.00
631 2 0.00
632 7 0.01
633 10 0.01
634 2 0.00
635 4 0.00
637 1 0.00
638 5 0.00
639 1 0.00
640 2 0.00
641 5 0.00
643 1 0.00
646 2 0.00
648 3 0.00
650 1 0.00
653 4 0.00
654 1 0.00
657 7 0.01
658 303 0.28
659 114 0.11
ACGTcount: A:0.36, C:0.17, G:0.16, T:0.31
Consensus pattern (596 bp):
TATTCGTTTATTAATGCTAATAGCGTTCACCCCTAGCATGAATTTGAGATATTAGCTATTGTGCC
TAATAACCAAATTAGCATCGATTCTAGAAACATTGATGTGAATTTGAAAAGGATGTCGACCTATT
TTGGGAATCACCAGTAGTCATCCCCTGAGCATACTTGCAGGAGATATACCATTAATTCCCTAATA
AGTGAACATTGCCTTAGGTTCTTAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTTCATTCGTCCTAATTA
ACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGGTCGAATTATGAGAATTAAAGAACCTAAAG
GCACAAACCTAGAAATGTAAGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTGAAATGTGAGGAGTCTC
CACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGACACCATAAAAATCGAGTGATTTTAATAAAAACATTTTA
TTTTTATCAAAATACAAAGTTTTAAGGTATGCAAAAATCTAGAAATCAAATTCGGGAGTCGGTTA
CGCGTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAATTGGTACCTAGTTGATTACCCTATA
TATAAAAAGGG
Found at i:82253 original size:659 final size:659
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Indices: 80767--84642 Score: 5913
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80757 ACCCTATATA
* * **
80767 TAAAGAGGGTATTCGTTTATTAATGCTAATAGCGTTCACCCCTAGCATGAATTTGAGATATTAGC
1 TAAAGAGGGTATTCGTTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCCTAGCATAAATGCGAGATATTAGC
* * * * * *
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66 TATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACAATGATGCGAATTTGAAAAGGATG
* *
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131 TCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATACTTGCAGGAGATATACCATTAA
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* * * *
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* * *
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* *
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* *
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* *
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*
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* * * *
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* *
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* ** * *
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131 TCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATACTTGCAGGAGATATACCATTAA
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* * *
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*
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* *
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* * * * *
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* * * *
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* * * *
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* ** ** *
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*
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* *
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* *
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** * *
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261 GTCCTAATTAACCAAGGGTTATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGTGTCGAATTATAAGAATTAA
* * *** * *
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326 AGAACCTAAAGGCACAAACCTAGAAATATAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTGAAATG
*
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* * * * *
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* *** * * *
82604 GGAGTCAGTTACATGTGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAACACCCAAAAATTGGTACCTAATTG
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** *
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*
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* * * *
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* * * *
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* * *
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*
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* * * *
83002 CGTCCGAATTTACCAAGGGTGATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGTGTCGAATTATGAGAATTA
260 CGTCCTAATTAACCAAGGGTTATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGTGTCGAATTATAAGAATTA
* * * *
83067 AAGAACCTAAAGGCATAATCCTAGAAATGTAAGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTGAAAA
325 AAGAACCTAAAGGCACAAACCTAGAAATATAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTG-AAA
* * *
83132 T-TGAGGAGTCTCCACCAATCATTTAAGGTATGATTGGGACACCATAAAAATAG-GATGATTTTA
389 TGTGAGAAGTCTCCACCAATCATTTAAGGTACGATTGGGACACCATAAAAATCGAG-TGATTTTA
*
83195 ATAAAAACATTTTATTTTTTTTATCAAAATACCAAGTTTTAAGGTATGTGAAAATCTAGAAATCA
453 ATAAAAACATTTTA---TTTTTATCAAAATACCAAGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTAGAAATCA
** *
83260 AATTCGGGAGTTAGTTACGCATGGGAAAGGATTATAA-CCCCATAAGCACCCAAAAATTGGTACC
515 AATTCGGGAGTCGGTTACGCATGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAATTGGTACC
*
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* *
83389 TGACGGATGTAAAGT
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* ** *
83404 TAAAGAGGGTATTCGTTTATTAATGCTAATAGCGTTTGCCCCTAGCATAAATTCGAGATATTAGC
1 TAAAGAGGGTATTCGTTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCCTAGCATAAATGCGAGATATTAGC
*
83469 TATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACATTGATGCGAATTTGAAAAGGATG
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83534 TCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCTTGAGCATACTTGCAGGGGATATACTATTAA
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* *
83599 TTCCCTAATAAGTGAACATTGCCTTAGGTTCTTAAAATTAAATGCACTCAAACAAATTTTCATTT
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83664 GTCCTAATTAACCAAGGGTTATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGTGTCGAATTATAAGAA-TAA
261 GTCCTAATTAACCAAGGGTTATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGTGTCGAATTATAAGAATTAA
* **
83728 GATAACCTAAAGGCATGAACCTAGAAATATAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTGAAAT
326 -AGAACCTAAAGGCACAAACCTAGAAATATAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTGAAAT
* ** * * *
83793 ATGAGAAGTCTCCACCAATCATTTAAGGTGTGATTGGGACACCATAAAAATTGGGTTATTTTAAT
390 GTGAGAAGTCTCCACCAATCATTTAAGGTACGATTGGGACACCATAAAAATCGAGTGATTTTAAT
* *
83858 AGAAACATTTTATTTTTATCAAAATACCAAGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTAGAAATTAAATTC
455 AAAAACATTTTATTTTTATCAAAATACCAAGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTAGAAATCAAATTC
* * * *
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520 GGGAGTCGGTTACGCATGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAATTGGTACCTAGTT
* * *
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649 GAATGTAAAGT
* * * * *
84063 GAAAAAGGGTATTCATTTATTAATGCTAATAGCATTCATCCCTAGCATAAATGTGAGATATTAGC
1 TAAAGAGGGTATTCGTTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCCTAGCATAAATGCGAGATATTAGC
*
84128 TATTGTGCCTAATAACCAAATATTTCCTCGATTTTAGAAACAATGATGCGAATTTGAAAAGGATG
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*
84193 TCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATACTTGCAGGGGATATACCATTAA
131 TCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATACTTGCAGGAGATATACCATTAA
* *
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* *
84322 CGTCCTAATTAACCATGGGTTATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGTGTCCAATTATAAGAATTA
260 CGTCCTAATTAACCAAGGGTTATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGTGTCGAATTATAAGAATTA
* * *
84387 AAGAACCTAAAGGCACAAACCTAGAAATGTAGGTTCTGATATTAACCCTATTTAGTTTTTGAAAT
325 AAGAACCTAAAGGCACAAACCTAGAAATATAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTGAAAT
* * * * * * * *
84452 GTGAGGAGTCTCCACCAATCATTTAAGGTGCGATTGGGAAACCATTAAAATTGGGTGATCTTAAC
390 GTGAGAAGTCTCCACCAATCATTTAAGGTACGATTGGGACACCATAAAAATCGAGTGATTTTAAT
* * * *
84517 ACAAATATTTTCTTTTTATCAAAATACCAAGTTTTAAGGTATGCAAAAATCTAGAAATCAAATTC
455 AAAAACATTTTATTTTTATCAAAATACCAAGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTAGAAATCAAATTC
* * * *
84582 GGGAGTTGGTTACGCAT-GGGAAGGATTATAACCCCTATAACCACCCAAACATTGGTACCTA
520 GGGAGTCGGTTACGCATGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAATTGGTACCTA
84643 TAGAACCTGA
Statistics
Matches: 2923, Mismatches: 274, Indels: 42
0.90 0.08 0.01
Matches are distributed among these distances:
657 3 0.00
658 553 0.19
659 1754 0.60
660 20 0.01
661 513 0.18
662 80 0.03
ACGTcount: A:0.36, C:0.16, G:0.16, T:0.32
Consensus pattern (659 bp):
TAAAGAGGGTATTCGTTTATTAATGCTAATAGCATTCACCCCTAGCATAAATGCGAGATATTAGC
TATTGTGCCTAATAACCAAATATTGCCTCGATTTTAGAAACAATGATGCGAATTTGAAAAGGATG
TCGACCTATTTCGGGAATCACCAGTAGTCACCCCCTGAGCATACTTGCAGGAGATATACCATTAA
TTCCCTAATAAGTGAACATTGCCTTAGGTTCTTAAAATAAAATGCACTCAAACAAATTTTCATTC
GTCCTAATTAACCAAGGGTTATTTAAGGCTCTCTCTATCCTAAAGTGTCGAATTATAAGAATTAA
AGAACCTAAAGGCACAAACCTAGAAATATAGGTTCTAATATTAACCCTATTTGGTTTTTGAAATG
TGAGAAGTCTCCACCAATCATTTAAGGTACGATTGGGACACCATAAAAATCGAGTGATTTTAATA
AAAACATTTTATTTTTATCAAAATACCAAGTTTTAAGGTATGCGAAAATCTAGAAATCAAATTCG
GGAGTCGGTTACGCATGGGGAAGGATTATAACCCCCATAAGCACCCAAAAATTGGTACCTAGTTA
ATTACCCTATATTTAAAATCAAAAATTTTGAGTTCGATCTTTATTTAATTTGAAAATCATTACGA
ATGTAAAGT
Done.