Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: VEPZ01006401.1 Hibiscus syriacus cultivar Beakdansim tig00015434_pilon, whole genome shotgun sequence
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1 AATGATAAT
*
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1 AAT
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AATGATAAT
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TAT
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17 12 0.50
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AAGTCAAACTCTAACT
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31448 ATAGGTAAAA
* * *
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1 ATATAATGTAATAGGTAGCGCTT
*
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1 ATATAATGTAATAGGTAGCGCTT
*
31504 ATATAATGTAATAGGTAGTGCTT
1 ATATAATGTAATAGGTAGCGCTT
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1 ATAT
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31936 ATAGGTAAAA
*
31946 ATATGATGTAATAGGTAGCGCTT
1 ATATAATGTAATAGGTAGCGCTT
*
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1 ATATAATGTAATAGGTAGCGCTT
*
31992 ATATAATGTAATAGGTAGTGCTT
1 ATATAATGTAATAGGTAGCGCTT
32015 ATAT
1 ATAT
32019 TATAAAGTAT
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32425 ATAGGTAAAA
*
32435 ATATGATGTAATAGGTAGCGCTT
1 ATATAATGTAATAGGTAGCGCTT
** *
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1 ATATAATGTAATAGGTAGCGCTT
*
32481 ATATAATGTAATAGGTAGTGCTT
1 ATATAATGTAATAGGTAGCGCTT
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1 ATAT
32508 TGTAAAGTAT
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32915 ATAGGTAAAA
* *
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*
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*
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1 ATAT
32998 TGTAAAGTAT
Statistics
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ATATAATGTAATAGGTAGCGCTT
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31026 TTTTTACATG
* * * *
31036 TTATATTGTAAAGTATATTTCCTTTTTATAAAAGTG-CTCATAATTTTTACACTGTGGAAAACAT
1 TTATATTGTAAAGTATCTATCATTTTTATAAAAGTGTC-CATAATTTTTTCACTGTGGAAAACAT
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65 TAATTTAAGGTTATCTTTTGAGTGAGTTTTAAGATATTAATTTAGTAATTATAGGT-GTCTAATG
* *
31164 ATTTATTTTTTACGTTACGATATATATTATTATTAAATTCAAAACAATAAATATATATATTACAT
129 ATTTATTTTTTACGTTACGATATATATTATTATTAAATTAAAAACAATAAACATATATATTACAT
* *
31229 ATTTATTATTATCTTTGGTTAATATTATTAAATTTAAATTCTAAATATTATTTTACAAAATATCA
194 ATTTATTATTATCTTTGGTTAATATTGTTAAATTTAAATTCTAAATATTATTTTATAAAATATCA
31294 AAACAATCAAATAATTTTTTGTGCAAATGAAATTATTAAATTAATATTGTAGGTAGAAAACATGA
259 AAACAATCAAATAATTTTTTGTGCAAATGAAATTATTAAATTAATATTGTAGGTAGAAAACATGA
*
31359 AACACTATTAAAAAAA-TGAAACATAAATTACATAACTTTAAAAAAAAATATCGATCCTTTTTAT
324 AACACTATTAAAAAAATTGAAACATAAATTACATAACTTT-AAAAAAAGTATCGATCCTTTTTAT
* * * *
31423 AAAAGGTATGGGCACTTTCAATATAATAGGTAAAAATATGATGTAATATGTAGCACTTATATAAT
388 AAAAAGTATGGACACTTTCAATATAATAGGTAAAAATATGATGTAATAGGTAGCGCTTATATAAT
*
31488 GTAATAGGTAGCGTTTATATAATGTAATAGGTAGTGCTTATATTATAAAGTATCTATCCTTTTTA
453 GTAATAGATAGCGTTTATATAATGTAATAGGTAGTGCTTATATTATAAAGTATCTATCCTTTTTA
*
31553 TAAAAGTGTCCATACTTTTTTCACTGTAGAAAACATTAATTTAAGGTTATCTTTTGAGTGAGTTT
518 TAAAAGTGTCCATACTTTTTTCACTGTAGAAAACATTAATTTAAGGTTATATTTTGAGTGAGTTT
* * *
31618 TAAGATATTAATTTAGTAATTATAGGTGTCTAATGATTTATTTTTTACGTTATGGTATATATTAT
583 TAAGATATTAATTTAGTAATTATAGGCGTCTAATGATTTATTTTTTACGTTACGATATATATTAT
*
31683 TATTAAATTAAAAACAATAAACATATATATTACATATTTATTATTATCTTTGGTTAATATTGTTA
648 TATTAAATTAAAAACAATAAACATATATATTACATATTTATTATTATCTTTGATTAATATTGTTA
*
31748 AATTTAAATTCTAAATATTATTTTATAAAATATCAAAACAATCAAATAATTTTTTGTGCAAATGA
713 AATTTAAATTCTAAATATTATTTTATAAAATATCAAAACAATCAAATAATATTTTGTGCAAATGA
*
31813 AATTATTAAATTAATATTGTAGGTGGAAAACATAAAATACTATTAAAAAATTGAAACATAAATTA
778 AATTATTAAATTAATATTGTAGGTGGAAAACATAAAACACTATTAAAAAATTGAAACATAAATTA
*
31878 CATAACTTTAAAAAAAGTATCGATCATTTTTATAAAAAGTATGGACACTTTCAATATAATAGGTA
843 CATAACTTTAAAAAAAGTATCGATCATTTTTATAAAAAGTATGAACACTTTCAATATAATAGGTA
*
31943 AAAATATGATGTAATAGGTAGCGCTTATATAATGTAATAGGTAGCGTTTATATAATGTAATAGGT
908 AAAATATGATGTAATAGGTAGCACTTATATAATGTAATAGGTAGCGTTTATATAATGTAATAGGT
32008 AGTGC
973 AGTGC
* *
32013 TTATATTATAAAGTATCTATCATTTTTATAAAAGTGTCCATATTTTTTTCACTGTGGAAAACATT
1 TTATATTGTAAAGTATCTATCATTTTTATAAAAGTGTCCATAATTTTTTCACTGTGGAAAACATT
*
32078 AATTTAAGGTTATCTTTTGAGTGAGTTTTAAGATATTAATTTAGTAATTATAGGCGTCTAATGAT
66 AATTTAAGGTTATCTTTTGAGTGAGTTTTAAGATATTAATTTAGTAATTATAGGTGTCTAATGAT
32143 TTATTTTTTACGTTACGATATATATTATTATTAAATTAAAAACAATAAACATATATATTACATAT
131 TTATTTTTTACGTTACGATATATATTATTATTAAATTAAAAACAATAAACATATATATTACATAT
* *
32208 TTATTATTATCTTTAGTTAATGTTGTTAAATTTAAATTCTAAATATTATTTTATAAAATATCAAA
196 TTATTATTATCTTTGGTTAATATTGTTAAATTTAAATTCTAAATATTATTTTATAAAATATCAAA
* * *
32273 ACAATCAAATAATATTTTGTGCAAATGAAATTATTAAATTAATATTGTAGGTGGAAAACATGGAA
261 ACAATCAAATAATTTTTTGTGCAAATGAAATTATTAAATTAATATTGTAGGTAGAAAACATGAAA
32338 CACTATTAAAAAAATTGAAACATAAATTACATAACTTTAAAAAAAGTATCGATCCTTTTTATAAA
326 CACTATTAAAAAAATTGAAACATAAATTACATAACTTTAAAAAAAGTATCGATCCTTTTTATAAA
32403 AAGTATGGACACTTTCAATATAATAGGTAAAAATATGATGTAATAGGTAGCGCTTATATAATGTA
391 AAGTATGGACACTTTCAATATAATAGGTAAAAATATGATGTAATAGGTAGCGCTTATATAATGTA
* * * *
32468 ATATATAGCGTTTATATAATGTAATAGGTAGTGCTTATATTGTAAAGTATTTATCATTTTTTATA
456 ATAGATAGCGTTTATATAATGTAATAGGTAGTGCTTATATTATAAAGTATCTATC-CTTTTTATA
* *
32533 AAAGTGTCTATACTTTTTTCACTGTGGAAAACATTAATTTAAGGTTATATTTTGAGTGAGTTTTA
520 AAAGTGTCCATACTTTTTTCACTGTAGAAAACATTAATTTAAGGTTATATTTTGAGTGAGTTTTA
*
32598 AGATATTAATTTAGTAATTATAGGCGTCTAATGATTTATTTTTTATGTTACGATATATATTATTA
585 AGATATTAATTTAGTAATTATAGGCGTCTAATGATTTATTTTTTACGTTACGATATATATTATTA
32663 TTAAATTAAAAACAATAAACATATATATTACATATTTATTATTATCTTTGATTAATATTGTTAAA
650 TTAAATTAAAAACAATAAACATATATATTACATATTTATTATTATCTTTGATTAATATTGTTAAA
32728 TTTAAATTCTAAATATTATTTTATAAAATATCAAAACAATCAAATAATATTTTGTGCAAATGAAA
715 TTTAAATTCTAAATATTATTTTATAAAATATCAAAACAATCAAATAATATTTTGTGCAAATGAAA
* *
32793 TTATTAAATTAATATTGTAGGTGGTAAACATGAAACACTATTAAAAAAATTGAAACATAAATTAC
780 TTATTAAATTAATATTGTAGGTGGAAAACATAAAACACTATT-AAAAAATTGAAACATAAATTAC
32858 ATAACTTTAAAAAAAGTATCGATCATTTTTATAAAAAGTATGAACACTTTCAATATAATAGGTAA
844 ATAACTTTAAAAAAAGTATCGATCATTTTTATAAAAAGTATGAACACTTTCAATATAATAGGTAA
32923 AAATATGATGTAATAGGTAGCACTTATATAATGTAATAGGTAGCGTTTATATAATGTAATAGGTA
909 AAATATGATGTAATAGGTAGCACTTATATAATGTAATAGGTAGCGTTTATATAATGTAATAGGTA
32988 GTGC
974 GTGC
* * *
32992 TTATATTGTAAAGTATCTATCATTTTTATAAAAGTGTCCATACTTTTTTCACGGTAGAAAACATT
1 TTATATTGTAAAGTATCTATCATTTTTATAAAAGTGTCCATAATTTTTTCACTGTGGAAAACATT
33057 AATTTAAGGTTATCTTTTGAGTGAGTTTTAAGATATTAATTTAGTAATTATAGGTGTCTAATGAT
66 AATTTAAGGTTATCTTTTGAGTGAGTTTTAAGATATTAATTTAGTAATTATAGGTGTCTAATGAT
* *
33122 TTATGTTTTACGTTACGGTATATATTATTATTAAATTAAAAACAATAAACATATATATTACATAT
131 TTATTTTTTACGTTACGATATATATTATTATTAAATTAAAAACAATAAACATATATATTACATAT
*
33187 TTATTATTATCTTTGGTTAATATTGTTAAATTTAAATTCTAAATATTATTTTATAAAATATTAAA
196 TTATTATTATCTTTGGTTAATATTGTTAAATTTAAATTCTAAATATTATTTTATAAAATATCAAA
* *
33252 ACAATCAAATAATTTTTTGTGTAAATGAAATTATTAAATTAATATTGTATGTAGAAAACATGAAA
261 ACAATCAAATAATTTTTTGTGCAAATGAAATTATTAAATTAATATTGTAGGTAGAAAACATGAAA
*
33317 TACTATTAAAAAAATTGAAACATAAATTACATAACTTTAAAAAAAGTATCGATCCTTTTTATAAA
326 CACTATTAAAAAAATTGAAACATAAATTACATAACTTTAAAAAAAGTATCGATCCTTTTTAT-AA
* *
33382 AAAGTACT-AATACTTTACAATAT-ATCAGGTAAAAATATGATGTAATAGGTAGCGCTTATAT
390 AAAGTA-TGGACACTTT-CAATATAAT-AGGTAAAAATATGATGTAATAGGTAGCGCTTATAT
33443 TATAAAGTAT
Statistics
Matches: 1363, Mismatches: 58, Indels: 14
0.95 0.04 0.01
Matches are distributed among these distances:
977 457 0.34
978 323 0.24
979 525 0.39
980 16 0.01
981 42 0.03
ACGTcount: A:0.41, C:0.07, G:0.11, T:0.41
Consensus pattern (977 bp):
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TTATTATTATCTTTGGTTAATATTGTTAAATTTAAATTCTAAATATTATTTTATAAAATATCAAA
ACAATCAAATAATTTTTTGTGCAAATGAAATTATTAAATTAATATTGTAGGTAGAAAACATGAAA
CACTATTAAAAAAATTGAAACATAAATTACATAACTTTAAAAAAAGTATCGATCCTTTTTATAAA
AAGTATGGACACTTTCAATATAATAGGTAAAAATATGATGTAATAGGTAGCGCTTATATAATGTA
ATAGATAGCGTTTATATAATGTAATAGGTAGTGCTTATATTATAAAGTATCTATCCTTTTTATAA
AAGTGTCCATACTTTTTTCACTGTAGAAAACATTAATTTAAGGTTATATTTTGAGTGAGTTTTAA
GATATTAATTTAGTAATTATAGGCGTCTAATGATTTATTTTTTACGTTACGATATATATTATTAT
TAAATTAAAAACAATAAACATATATATTACATATTTATTATTATCTTTGATTAATATTGTTAAAT
TTAAATTCTAAATATTATTTTATAAAATATCAAAACAATCAAATAATATTTTGTGCAAATGAAAT
TATTAAATTAATATTGTAGGTGGAAAACATAAAACACTATTAAAAAATTGAAACATAAATTACAT
AACTTTAAAAAAAGTATCGATCATTTTTATAAAAAGTATGAACACTTTCAATATAATAGGTAAAA
ATATGATGTAATAGGTAGCACTTATATAATGTAATAGGTAGCGTTTATATAATGTAATAGGTAGT
GC
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31026 TTTTTACATG
* * * * *
31036 TTATATTGTAAAGTATATTTCCTTTTTATAAAAGTG-CTCATAATTTTTACACTGTGGAAAACAT
1 TTATATTGTAAAGTATCTATCATTTTTATAAAAGTGTC-CATACTTTTTTCACTGTGGAAAACAT
31100 TAATTTAAGGTTATCTTTTGAGTGAGTTTTAAGATATTAATTTAGTAATTATA-GTAGTCTAATG
65 TAATTTAAGGTTATCTTTTGAGTGAGTTTTAAGATATTAATTTAGTAATTATAGGT-GTCTAATG
* *
31164 ATTTATTTTTTACGTTACGATATATATTATTATTAAATTCAAAACAATAAATATATATATTACAT
129 ATTTATTTTTTACGTTACGATATATATTATTATTAAATTAAAAACAATAAACATATATATTACAT
* *
31229 ATTTATTATTATCTTTGGTTAATATTATTAAATTTAAATTCTAAATATTATTTTACAAAATATCA
194 ATTTATTATTATCTTTGGTTAATATTGTTAAATTTAAATTCTAAATATTATTTTATAAAATATCA
*
31294 AAACAATCAAATAATTTTTTGTGCAAATGAAATTATTAAATTAATATTGTAGGTAGAAAACATGA
259 AAACAATCAAATAATTTTTTGTGCAAATGAAATTATTAAATTAATATTGTAGGTGGAAAACATGA
*
31359 AACACTATTAAAAAAA-TGAAACATAAATTACATAACTTTAAAAAAAAATATCGATCCTTTTTAT
324 AACACTATTAAAAAAATTGAAACATAAATTACATAACTTT-AAAAAAAGTATCGATCCTTTTTAT
* * * *
31423 AAAAGGTATGGGCACTTTCAATATAATAGGTAAAAATATGATGTAATATGTAGCACTTATATAAT
388 AAAAAGTATGGACACTTTCAATATAATAGGTAAAAATATGATGTAATAGGTAGCGCTTATATAAT
31488 GTAATAGGTAGCGTTTATATAATGTAATAGGTAGTGC
453 GTAATAGGTAGCGTTTATATAATGTAATAGGTAGTGC
* * *
31525 TTATATTATAAAGTATCTATCCTTTTTATAAAAGTGTCCATACTTTTTTCACTGTAGAAAACATT
1 TTATATTGTAAAGTATCTATCATTTTTATAAAAGTGTCCATACTTTTTTCACTGTGGAAAACATT
31590 AATTTAAGGTTATCTTTTGAGTGAGTTTTAAGATATTAATTTAGTAATTATAGGTGTCTAATGAT
66 AATTTAAGGTTATCTTTTGAGTGAGTTTTAAGATATTAATTTAGTAATTATAGGTGTCTAATGAT
* *
31655 TTATTTTTTACGTTATGGTATATATTATTATTAAATTAAAAACAATAAACATATATATTACATAT
131 TTATTTTTTACGTTACGATATATATTATTATTAAATTAAAAACAATAAACATATATATTACATAT
31720 TTATTATTATCTTTGGTTAATATTGTTAAATTTAAATTCTAAATATTATTTTATAAAATATCAAA
196 TTATTATTATCTTTGGTTAATATTGTTAAATTTAAATTCTAAATATTATTTTATAAAATATCAAA
*
31785 ACAATCAAATAATTTTTTGTGCAAATGAAATTATTAAATTAATATTGTAGGTGGAAAACATAAAA
261 ACAATCAAATAATTTTTTGTGCAAATGAAATTATTAAATTAATATTGTAGGTGGAAAACATGAAA
* *
31850 TACTATT-AAAAAATTGAAACATAAATTACATAACTTTAAAAAAAGTATCGATCATTTTTATAAA
326 CACTATTAAAAAAATTGAAACATAAATTACATAACTTTAAAAAAAGTATCGATCCTTTTTATAAA
31914 AAGTATGGACACTTTCAATATAATAGGTAAAAATATGATGTAATAGGTAGCGCTTATATAATGTA
391 AAGTATGGACACTTTCAATATAATAGGTAAAAATATGATGTAATAGGTAGCGCTTATATAATGTA
31979 ATAGGTAGCGTTTATATAATGTAATAGGTAGTGC
456 ATAGGTAGCGTTTATATAATGTAATAGGTAGTGC
* *
32013 TTATATTATAAAGTATCTATCATTTTTATAAAAGTGTCCATATTTTTTTCACTGTGGAAAACATT
1 TTATATTGTAAAGTATCTATCATTTTTATAAAAGTGTCCATACTTTTTTCACTGTGGAAAACATT
*
32078 AATTTAAGGTTATCTTTTGAGTGAGTTTTAAGATATTAATTTAGTAATTATAGGCGTCTAATGAT
66 AATTTAAGGTTATCTTTTGAGTGAGTTTTAAGATATTAATTTAGTAATTATAGGTGTCTAATGAT
32143 TTATTTTTTACGTTACGATATATATTATTATTAAATTAAAAACAATAAACATATATATTACATAT
131 TTATTTTTTACGTTACGATATATATTATTATTAAATTAAAAACAATAAACATATATATTACATAT
* *
32208 TTATTATTATCTTTAGTTAATGTTGTTAAATTTAAATTCTAAATATTATTTTATAAAATATCAAA
196 TTATTATTATCTTTGGTTAATATTGTTAAATTTAAATTCTAAATATTATTTTATAAAATATCAAA
* *
32273 ACAATCAAATAATATTTTGTGCAAATGAAATTATTAAATTAATATTGTAGGTGGAAAACATGGAA
261 ACAATCAAATAATTTTTTGTGCAAATGAAATTATTAAATTAATATTGTAGGTGGAAAACATGAAA
32338 CACTATTAAAAAAATTGAAACATAAATTACATAACTTTAAAAAAAGTATCGATCCTTTTTATAAA
326 CACTATTAAAAAAATTGAAACATAAATTACATAACTTTAAAAAAAGTATCGATCCTTTTTATAAA
32403 AAGTATGGACACTTTCAATATAATAGGTAAAAATATGATGTAATAGGTAGCGCTTATATAATGTA
391 AAGTATGGACACTTTCAATATAATAGGTAAAAATATGATGTAATAGGTAGCGCTTATATAATGTA
**
32468 ATATATAGCGTTTATATAATGTAATAGGTAGTGC
456 ATAGGTAGCGTTTATATAATGTAATAGGTAGTGC
* *
32502 TTATATTGTAAAGTATTTATCATTTTTTATAAAAGTGTCTATACTTTTTTCACTGTGGAAAACAT
1 TTATATTGTAAAGTATCTATCA-TTTTTATAAAAGTGTCCATACTTTTTTCACTGTGGAAAACAT
* *
32567 TAATTTAAGGTTATATTTTGAGTGAGTTTTAAGATATTAATTTAGTAATTATAGGCGTCTAATGA
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*
32632 TTTATTTTTTATGTTACGATATATATTATTATTAAATTAAAAACAATAAACATATATATTACATA
130 TTTATTTTTTACGTTACGATATATATTATTATTAAATTAAAAACAATAAACATATATATTACATA
*
32697 TTTATTATTATCTTTGATTAATATTGTTAAATTTAAATTCTAAATATTATTTTATAAAATATCAA
195 TTTATTATTATCTTTGGTTAATATTGTTAAATTTAAATTCTAAATATTATTTTATAAAATATCAA
* *
32762 AACAATCAAATAATATTTTGTGCAAATGAAATTATTAAATTAATATTGTAGGTGGTAAACATGAA
260 AACAATCAAATAATTTTTTGTGCAAATGAAATTATTAAATTAATATTGTAGGTGGAAAACATGAA
*
32827 ACACTATTAAAAAAATTGAAACATAAATTACATAACTTTAAAAAAAGTATCGATCATTTTTATAA
325 ACACTATTAAAAAAATTGAAACATAAATTACATAACTTTAAAAAAAGTATCGATCCTTTTTATAA
* *
32892 AAAGTATGAACACTTTCAATATAATAGGTAAAAATATGATGTAATAGGTAGCACTTATATAATGT
390 AAAGTATGGACACTTTCAATATAATAGGTAAAAATATGATGTAATAGGTAGCGCTTATATAATGT
32957 AATAGGTAGCGTTTATATAATGTAATAGGTAGTGC
455 AATAGGTAGCGTTTATATAATGTAATAGGTAGTGC
* *
32992 TTATATTGTAAAGTATCTATCATTTTTATAAAAGTGTCCATACTTTTTTCACGGTAGAAAACATT
1 TTATATTGTAAAGTATCTATCATTTTTATAAAAGTGTCCATACTTTTTTCACTGTGGAAAACATT
33057 AATTTAAGGTTATCTTTTGAGTGAGTTTTAAGATATTAATTTAGTAATTATAGGTGTCTAATGAT
66 AATTTAAGGTTATCTTTTGAGTGAGTTTTAAGATATTAATTTAGTAATTATAGGTGTCTAATGAT
* *
33122 TTATGTTTTACGTTACGGTATATATTATTATTAAATTAAAAACAATAAACATATATATTACATAT
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*
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* * *
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*
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* *
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* *
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* **
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* *
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*
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* * *
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* * *
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ATAAACATATATATTACATATTTATTATTATCTTTGGTTAATATTGTTAAATTTAAATTCTAAAT
ATTATTTTATAAAATATCAAAACAATCAAATAATTTTTTGTACAAATGAAATTATTAAATTAATA
TTGTAGGTAGAAAACATAAAATACTATTAAAAAATTGAAACATAAATTACATAACTTTAAAAAAA
GTATCGATCATTTTTATAAAAAAGTACTAATACTTTACAATATATCAGGTAAAA
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**
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*
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* *
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1 CT
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*
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* * *
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*
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*
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1 GTTCAGGTTCAA
*
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1 GTTCAGGTTCA
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* * *
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*
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* *
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*
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*
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** * *
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*
55622 ATGACAAAATCGGTAAAGAGCTACCGAATATGTTGAAAGTGTCGATACTTTATTATAAGTATCGA
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* *
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* *
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* *
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*
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* * *
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*
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GATCCATAACAATATAACAGATAAAAATATGACAAAACCGATCTCGAA
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* *
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* *
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1 AT
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57207 CTTACACCAA
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1 TAGGTGAATTTTCCAACTTGTTTCTAATGGAGTTTAGGTTTCCTTTTTGTTGCAGAATTGGCTTA
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57530 TTTTACATAGTTTATCATAGTTGTTGGGGTTTTCTTGGAAATTCTCACCTATTTCAAGCAGTTTT
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*
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57714 T
1 T
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Statistics
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CAAAGCCATCACCATTGAGTTACCTGCCAAATGAGCATATCTGCGGCCGACCT
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60691 GATAATTTTT
60701 ATAATTTAAG
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Found at i:60733 original size:21 final size:20
Alignment explanation
Indices: 60701--60739 Score: 69
Period size: 21 Copynumber: 1.9 Consensus size: 20
60691 GATAATTTTT
60701 ATAATTTAAGATAATTTAAG
1 ATAATTTAAGATAATTTAAG
60721 ATAATTATAAGATAATTTA
1 ATAATT-TAAGATAATTTA
60740 TGTTTAAAAA
Statistics
Matches: 18, Mismatches: 0, Indels: 1
0.95 0.00 0.05
Matches are distributed among these distances:
20 6 0.33
21 12 0.67
ACGTcount: A:0.51, C:0.00, G:0.08, T:0.41
Consensus pattern (20 bp):
ATAATTTAAGATAATTTAAG
Done.