Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: VEPZ01007151.1 Hibiscus syriacus cultivar Beakdansim tig00018706_pilon, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Pmatch=0.80,Pindel=0.10
tuple sizes 0,4,5,7
tuple distances 0, 29, 159, 1000
Length: 22731
ACGTcount: A:0.35, C:0.14, G:0.19, T:0.32
Found at i:2817 original size:802 final size:813
Alignment explanation
Indices: 1--10450 Score: 17952
Period size: 802 Copynumber: 13.2 Consensus size: 813
* * *
1 TTTGTTTTATTTTTCAGAATGATGATTCGATGAAGATGAAGACTTAGAAGTCAGAGAGCAAGTAC
1 TTTGCTTTATTTTTCAGAATGATGATTCGATGAAGATGAAGAGTTAGAAGTCATAGAGCAAGTAC
66 TTGCGCCCTTTTTAATTGGGAGATATGAAGATGAAGTCATGTGC-ATGTTGCTTCCATGAATTCA
66 TTGCGCCCTTTTTAATTGGGAGATATGAAGATGAAGTCATGTGCGATGTTGCTTCCATGAATTCA
130 AGCCATCTACTTCTC-GATGTCCTTGGCACTGTGATAAACGA-CATTGCATGATGGG-TTTTAAA
131 AGCCATCTACTTCTCGGATGTCCTTGGCACTGTGATAAACGAGCATTGCATGATGGGTTTTTAAA
*
192 TCATTATTCATTCATCCATGGGAGAAGGA-TATCACGTTAGAATAATTGCCATCACACAAAGTAC
196 TCATTATTCATTCATCCATGGGAGAAGGAGAATCACGTTA-AATAATTGCCATCACACAAAGTAC
256 TTCAAGATTAACAACAACT-AA-AAAAACTTTGATGCTACGCAAAAAGAACATTGAGAGTAAAAC
260 TTCAAGATTAACAACAACTAAAGAAAAACTTTGATGCTACGCAAAAAGAACATTGAGAGTAAAA-
* * *
319 A-GCATTTGGAGTGGTTAAAAAT--GAATATTGAAGAGATTGAGTGTGAAG-AAACCATGAATGT
324 AGGCATTTGGAGTAGTTGAAAATGAGAATATTGAAGAGATTGAGTGTGAAGAAAACCATGAATTT
* *
380 GAGAGTGGAACTCAAAAAGAACAAGAGTGTAAA-GGAGCATACGATAGGAGTATGAAGAAGAGAA
389 GAGAGTGGAACTCAAAAAGAACAAGAGTGTAAAGGGAGCATACGAGAGGATTATGAAGAAGAGAA
444 ATTTC-AAAGGGACAT--GCAT--GAG-AAATAATGTGA-GA-AATGAAGTTTGA-C-CTATTAA
454 ATTTCAAAAGGGACATGAGCATGAGAGAAAATAATGTGAGGAGAATGAAGTTTGACCTCTATTAA
*
499 TCAATCTTTTCTTCATATTATTTCGTTT-TTTTGCAGGTTATTCCAAAGGCCATGCTATTGCAAA
519 TCAATCTTTTCTTCATATTATTTCGTTTGATTTGCAGGTTATTCCAAAGGCCATGCTATTGCAAA
*
563 TTGATGAATCAAATTTGTCCATTGAATTTCCAAATGATTTAACGTTTGGTATTCC-AAA-ATGTG
584 TTGATGAATCAAATTTGTCCATTGAAGTTCCAAATGATTTAACGTTTGGTATTCCAAAACATGTG
626 CTC-TTGATATTTTATGTACGTTCATTCTACATTCAAAGTTCAAACAATCTC-A-AAAGGGAAGT
649 CTCTTTGATATTTTATGTACGTTCATTCTACATTCAAAGTTCAAACAATCTCAAGAAAGGGAAGT
688 TTCAATGAACCTATCCAATGAGGACCTT-AACAAAT-AATTCATTTATTCATGAAATTGATTATT
714 TTCAATGAACCTATCCAATGAGGACCTTAAACAAATAAATTCATTTATTCATGAAATTGATTATT
751 TCATTTTCTTTGATTTTGAATTATCTA----TAAC
779 TCATTTTCTTTGATTTTGAATTATCTACTTCTAAC
782 TTTGCTTTA-TTTTCAG-A--ATGA-T-GATGAAGATG-A-AGTTAGAAGTCATAGAGCAAGTAC
1 TTTGCTTTATTTTTCAGAATGATGATTCGATGAAGATGAAGAGTTAGAAGTCATAGAGCAAGTAC
839 TTGCGCCCTTTTTAATTGGGAGATATGAA-ATGAAGTCATGTGCGATGTTGCTT-CATGAATTCA
66 TTGCGCCCTTTTTAATTGGGAGATATGAAGATGAAGTCATGTGCGATGTTGCTTCCATGAATTCA
902 AGCCATCTACTTCTCGGATGTCCTTGGCACTGTG--AAACGAGCATTGCATGATGGGTTTTTAAA
131 AGCCATCTACTTCTCGGATGTCCTTGGCACTGTGATAAACGAGCATTGCATGATGGGTTTTTAAA
* *
965 TCATTATTCATTCATCCATGGGAGAAGGAGAATCACGTT-AGTAATTGCCATCACACAAACTACT
196 TCATTATTCATTCATCCATGGGAGAAGGAGAATCACGTTAAATAATTGCCATCACACAAAGTACT
1029 TCAAGATT---AACAACTAAAGAAAAACTTTGATGCTA--CAAAAAGAACATTGAGAGTAAAAAA
261 TCAAGATTAACAACAACTAAAGAAAAACTTTGATGCTACGCAAAAAGAACATTGAGAGT-AAAAA
*
1089 GGCATTTGGAGTGGTTGAAAATGAGAATATTGAAG-GATTGAGTGTG-A-AAAACCATGAATTTG
325 GGCATTTGGAGTAGTTGAAAATGAGAATATTGAAGAGATTGAGTGTGAAGAAAACCATGAATTTG
* *
1151 AGAGTGGAACTC--AAA-AACAAGAGT-AAAAGGGAGCATAC--G-GGATTATGAATAAGAGAAA
390 AGAGTGGAACTCAAAAAGAACAAGAGTGTAAAGGGAGCATACGAGAGGATTATGAAGAAGAGAAA
1209 TTTCAAAAGGGACATGAGCATGAGAGAAAATAATGTGAGGAGAATGAAGTTTGACCTCTATTAAT
455 TTTCAAAAGGGACATGAGCATGAGAGAAAATAATGTGAGGAGAATGAAGTTTGACCTCTATTAAT
1274 CAATCTTTTCTTCATATTATTTCGTTTGATTTGCAGGTTATTCCAAAGGCCATGCTATTGCAAAT
520 CAATCTTTTCTTCATATTATTTCGTTTGATTTGCAGGTTATTCCAAAGGCCATGCTATTGCAAAT
1339 TGATGAATCAAATTTGTCCATTGAAGTTCCAAATGATTTAACGTTTGGTATTCCAAAACATGTGC
585 TGATGAATCAAATTTGTCCATTGAAGTTCCAAATGATTTAACGTTTGGTATTCCAAAACATGTGC
1404 TCTTTGATATTTTATGTACGTTCATTCTACATTCAAAGTTCAAACAATCTCAAGAAAGGGAAGTT
650 TCTTTGATATTTTATGTACGTTCATTCTACATTCAAAGTTCAAACAATCTCAAGAAAGGGAAGTT
1469 TCAATGAACCTATCCAATGAGGACCTTAAACAAATAAATTCATTTATTCATGAAATTGATTATTT
715 TCAATGAACCTATCCAATGAGGACCTTAAACAAATAAATTCATTTATTCATGAAATTGATTATTT
1534 CATTTTCTTTGA-TTTGAATTATCTACTTCTAAC
780 CATTTTCTTTGATTTTGAATTATCTACTTCTAAC
1567 TTTGCTTTATTTTTCAGAATGATGATTCGATGAAGATG-AGAGTTAGAAGTCAT--AGCAAGTAC
1 TTTGCTTTATTTTTCAGAATGATGATTCGATGAAGATGAAGAGTTAGAAGTCATAGAGCAAGTAC
1629 TTGCGCCC-TTTTAATTGGGAGATATGAAGATGAAGTCATGTGCGATGTTGCTTCCATGAATTCA
66 TTGCGCCCTTTTTAATTGGGAGATATGAAGATGAAGTCATGTGCGATGTTGCTTCCATGAATTCA
1693 AGCCATCTACTTCTCGGATGTCCTTGGCACTGTGAT-AACGAGCATTGCATGATGGG-TTTTAAA
131 AGCCATCTACTTCTCGGATGTCCTTGGCACTGTGATAAACGAGCATTGCATGATGGGTTTTTAAA
*
1756 TCATTATTCATTCATCCATGGGAGAAGGA-AATCACGTTAGAATAATTGCCATCACACAAACTAC
196 TCATTATTCATTCATCCATGGGAGAAGGAGAATCACGTTA-AATAATTGCCATCACACAAAGTAC
1820 TTCAAGATTAACCAACAACT-AAG--AAACTTTGATGCTACGCAAAAAGAACATTGAGAGTAAAA
260 TTCAAGATTAA-CAACAACTAAAGAAAAACTTTGATGCTACGCAAAAAGAACATTGAGAGTAAAA
1882 CA-GCATTTGGAGTAGTTGAAAATGAGAATATTGAAGAGATTGAGTGTGAAGAAAACCATG-ATT
324 -AGGCATTTGGAGTAGTTGAAAATGAGAATATTGAAGAGATTGAGTGTGAAGAAAACCATGAATT
1945 TGAGAGTGGAACTCAAAAAGAACAAGAGTGTAAAGGGAGCATACGAGAGGATTATGAAGAAGAGA
388 TGAGAGTGGAACTCAAAAAGAACAAGAGTGTAAAGGGAGCATACGAGAGGATTATGAAGAAGAGA
2010 AATTTC-AAAGGGACATGAGCATGAGAGAAAATAATGTGAGGAGAATGAAGTTTGACCTCTATTA
453 AATTTCAAAAGGGACATGAGCATGAGAGAAAATAATGTGAGGAGAATGAAGTTTGACCTCTATTA
2074 ATCAATCTTTTCTTCATATTATTTCGTTTGATTTGCAGGTTATTCCAAAGGCCATGCTATTGCAA
518 ATCAATCTTTTCTTCATATTATTTCGTTTGATTTGCAGGTTATTCCAAAGGCCATGCTATTGCAA
*
2139 ATTGATGAATCAAATTTGTCCATTGAAGTTCCAAATGATTTAACTTTTGGTATTCCAAAACATGT
583 ATTGATGAATCAAATTTGTCCATTGAAGTTCCAAATGATTTAACGTTTGGTATTCCAAAACATGT
2204 GCTCTTTGATATTTTATGTACGTTCATTCTACATTCAAAGTTCAAACAATCTCAAGAAAGGGAAG
648 GCTCTTTGATATTTTATGTACGTTCATTCTACATTCAAAGTTCAAACAATCTCAAGAAAGGGAAG
2269 TTTCAATGAACCTATCCAATGAGGACCTTAAACAAAT-AATTCATTTATTCATGAAATTGATTAT
713 TTTCAATGAACCTATCCAATGAGGACCTTAAACAAATAAATTCATTTATTCATGAAATTGATTAT
2333 TTCATTTTCTTTGATTTTGAATTATCTACTTCTAAC
778 TTCATTTTCTTTGATTTTGAATTATCTACTTCTAAC
* *
2369 TTTG-TTTATTTTTCAGAATGATGATTCGATGAAGATGAAGATTTAGAAGTCATAGAGAAAGTAC
1 TTTGCTTTATTTTTCAGAATGATGATTCGATGAAGATGAAGAGTTAGAAGTCATAGAGCAAGTAC
2433 TTGCGCCC-TTTTAATTGGGAGATATGAAGATGAAGTCATGTGCGATGTTGCTTCCATGAATTCA
66 TTGCGCCCTTTTTAATTGGGAGATATGAAGATGAAGTCATGTGCGATGTTGCTTCCATGAATTCA
2497 AGCCATCTACTTCTCGGATGTCCTTGGCACTGTGATAAACGAGCATTGCATGAT-GGTTTTTAAA
131 AGCCATCTACTTCTCGGATGTCCTTGGCACTGTGATAAACGAGCATTGCATGATGGGTTTTTAAA
*
2561 TCATTATTCATTCATCCATGGGAGAAGGAGTATCACGTT-AATAATTGCCATCACACAAAG-ACT
196 TCATTATTCATTCATCCATGGGAGAAGGAGAATCACGTTAAATAATTGCCATCACACAAAGTACT
* *
2624 TCAAGATTAACAACAACTAAAGAAAAACTTTGATGCTACCCAAAAAG-ACATTGAGAGTAAAAAT
261 TCAAGATTAACAACAACTAAAGAAAAACTTTGATGCTACGCAAAAAGAACATTGAGAGTAAAAAG
* * *
2688 GCATTTGGAGTGGTTAAAAATGAGAATATTGAAGAGATTGAGTGTGAAGAAAACCATGAATGTGA
326 GCATTTGGAGTAGTTGAAAATGAGAATATTGAAGAGATTGAGTGTGAAGAAAACCATGAATTTGA
* *
2753 GAGTGGAACTCAAAAAGAACAAGAGTGTAAAGGGA-CATACGATA-GAGTATGAAGAAGA-AAAT
391 GAGTGGAACTCAAAAAGAACAAGAGTGTAAAGGGAGCATACGAGAGGATTATGAAGAAGAGAAAT
2815 TTC-AAAGGGACATGAGCATGAGAG-AAATAATGT-AGGAGAATGAAGTTTGACCTCTA-T-ATC
456 TTCAAAAGGGACATGAGCATGAGAGAAAATAATGTGAGGAGAATGAAGTTTGACCTCTATTAATC
2875 AATCTTTTCTTCATATTATTTCGTTTGATTTGCAGGTTATTCCAAAGGCCATGCTATTGCAAATT
521 AATCTTTTCTTCATATTATTTCGTTTGATTTGCAGGTTATTCCAAAGGCCATGCTATTGCAAATT
2940 GATGAATCAAATTTGTCCATTGAAGTTCC-AATGATTTAA--TTTGGTATTCCAAAACATGTGCT
586 GATGAATCAAATTTGTCCATTGAAGTTCCAAATGATTTAACGTTTGGTATTCCAAAACATGTGCT
3002 C-TTGATA-TTTATGTACGTTCATTCTACATTCAAAGTTCAAACAATCTCAAGAAA-GGAAGTTT
651 CTTTGATATTTTATGTACGTTCATTCTACATTCAAAGTTCAAACAATCTCAAGAAAGGGAAGTTT
*
3064 CAATGAACCTATCCAATGA-GACCTTAAACAAATAAATTCATTTATTCATGAAATTGATTATTTA
716 CAATGAACCTATCCAATGAGGACCTTAAACAAATAAATTCATTTATTCATGAAATTGATTATTTC
3128 ATTTTC-TTGATTTTGAATTATCTACTTCTAAC
781 ATTTTCTTTGATTTTGAATTATCTACTTCTAAC
3160 TTTGCTTTATTTTTCAGAATGATGATTCGATGAAGATGAAGAGTTAGAAGTCATAGAGCAA-TAC
1 TTTGCTTTATTTTTCAGAATGATGATTCGATGAAGATGAAGAGTTAGAAGTCATAGAGCAAGTAC
3224 TTGCGCCCTTTTTAATT-GG-GATATGAAGATG-AGTCATGTGCGATGTTGCTTCCATGAATTCA
66 TTGCGCCCTTTTTAATTGGGAGATATGAAGATGAAGTCATGTGCGATGTTGCTTCCATGAATTCA
3286 AGCCATCTACTTCTC-GATGTCCTTGGCACTGTGATAAAC--GCATTGCATGATGGGTTTTT-AA
131 AGCCATCTACTTCTCGGATGTCCTTGGCACTGTGATAAACGAGCATTGCATGATGGGTTTTTAAA
*
3347 TCATTATTCATTCATCCATGGGAGAAGGAGAATCACGTTAGAATAATTGCCATCACGCAAAGTAC
196 TCATTATTCATTCATCCATGGGAGAAGGAGAATCACGTTA-AATAATTGCCATCACACAAAGTAC
3412 TTCAAGATTAACAACAACTAAAGAAAAACTTTGATGCTACGCAAAAAGAACATTGAGAGTAAAAA
260 TTCAAGATTAACAACAACTAAAGAAAAACTTTGATGCTACGCAAAAAGAACATTGAGAGTAAAAA
*
3477 GGCATTTGGAGTGGTTGAAAATGAGAATATTGAAGAGATTGAGTGTGAAGAAAACCATGAATTTG
325 GGCATTTGGAGTAGTTGAAAATGAGAATATTGAAGAGATTGAGTGTGAAGAAAACCATGAATTTG
3542 AGAGTGGAACTCAAAAAG-ACAAGAGTGTAAAGGGAGCATACGAGA-GATTATGAAGAAGAGAAA
390 AGAGTGGAACTCAAAAAGAACAAGAGTGTAAAGGGAGCATACGAGAGGATTATGAAGAAGAGAAA
3605 TTTC-AAAGGGACATGAGCATGAGAGAAAATAATGTGAGGAGAATGAAGTTTGACCTCTATTAAT
455 TTTCAAAAGGGACATGAGCATGAGAGAAAATAATGTGAGGAGAATGAAGTTTGACCTCTATTAAT
*
3669 CAATCTTTTCTTCATATTATTTCATTTGATTTGCAGGTTATTCCAAAGGCCATGCTATTGCAAAT
520 CAATCTTTTCTTCATATTATTTCGTTTGATTTGCAGGTTATTCCAAAGGCCATGCTATTGCAAAT
3734 TGATGAATCAAATTTGTCCATTGAAGTTCCAAATGATTTAACGTTTGGTATTCC--AA-ATGTG-
585 TGATGAATCAAATTTGTCCATTGAAGTTCCAAATGATTTAACGTTTGGTATTCCAAAACATGTGC
3795 -CTTTG-TATTTTATGTACGTTCATTCTACATTCAAAGTTCAAACAATCTCAAGAAAGGGAAGTT
650 TCTTTGATATTTTATGTACGTTCATTCTACATTCAAAGTTCAAACAATCTCAAGAAAGGGAAGTT
3858 TCAATGAACCTATCCAATGAGGACCTTAAACAAATAAATTCATTTATTCATGAAATTGATTATTT
715 TCAATGAACCTATCCAATGAGGACCTTAAACAAATAAATTCATTTATTCATGAAATTGATTATTT
3923 CATTTTCTTTGATTTTGAATTATCTAC-T-TAAC
780 CATTTTCTTTGATTTTGAATTATCTACTTCTAAC
3955 TTTGCTTTA-TTTTCAGAATGATG---CGATGAAGATGAAGAGTTAGAAGTCATAGAGCAAGTAC
1 TTTGCTTTATTTTTCAGAATGATGATTCGATGAAGATGAAGAGTTAGAAGTCATAGAGCAAGTAC
4016 TTGCGCCCTTTTTAATTGGGA-ATATGAAGATGAAGTCATGTGCGATGTTGCTTCCATGAATTCA
66 TTGCGCCCTTTTTAATTGGGAGATATGAAGATGAAGTCATGTGCGATGTTGCTTCCATGAATTCA
4080 AGCCA--T-CTTCTCGGATGTCCTTGGCACTGTGATAAACGA-CATTGCATGAT-GGTTTTTAAA
131 AGCCATCTACTTCTCGGATGTCCTTGGCACTGTGATAAACGAGCATTGCATGATGGGTTTTTAAA
*
4140 TCATTATTCATTCATCCATGGGAGAAGGAGAATCACGTTAGAATAATTGCCATCACACAAACTAC
196 TCATTATTCATTCATCCATGGGAGAAGGAGAATCACGTTA-AATAATTGCCATCACACAAAGTAC
4205 TTCAAGATTAACAACAACTAAAGAAAAACTTTGATGCTACGCAAAAAGAACATTGAGAGTAAAAA
260 TTCAAGATTAACAACAACTAAAGAAAAACTTTGATGCTACGCAAAAAGAACATTGAGAGT-AAAA
*
4270 AGGCATTTGGAGTGGTTGAAAATGAGAATATTGAAGAGATTGAGTGTGAAGAAAACCATGAATTT
324 AGGCATTTGGAGTAGTTGAAAATGAGAATATTGAAGAGATTGAGTGTGAAGAAAACCATGAATTT
4335 GAGAGTGGAACTCAAAAAGAACAAGAGTGTAAAGGGAGCATACGAGAGGATTATGAAGAAGAGAA
389 GAGAGTGGAACTCAAAAAGAACAAGAGTGTAAAGGGAGCATACGAGAGGATTATGAAGAAGAGAA
4400 ATTTCAAAAGGGACATGAGCATGAGAGAAAA-AA--T--GGAGAATG-AGTTTGACCTCTATTAA
454 ATTTCAAAAGGGACATGAGCATGAGAGAAAATAATGTGAGGAGAATGAAGTTTGACCTCTATTAA
4459 TCAATCTTTTCTTCATATTATTTCGTTTGATTTGCAGGTTATTCCAAAGGCCATGCTATTGCAAA
519 TCAATCTTTTCTTCATATTATTTCGTTTGATTTGCAGGTTATTCCAAAGGCCATGCTATTGCAAA
4524 TTGATGAATCAAATTTGTCCATTGAAGTTCCAAATGATTTAACG-TTGGTATT-CAAAACATGTG
584 TTGATGAATCAAATTTGTCCATTGAAGTTCCAAATGATTTAACGTTTGGTATTCCAAAACATGTG
4587 CTCTTTGATATTTTATGTACGTTCATTCTACATTCAAAGTTCAAACAATCTCAAGAAAGGGAAGT
649 CTCTTTGATATTTTATGTACGTTCATTCTACATTCAAAGTTCAAACAATCTCAAGAAAGGGAAGT
4652 TTCAATGAACCTATCCAATGAGGACCTTAAACAAATAAATTCA-TTATTCATG-AATTGATTATT
714 TTCAATGAACCTATCCAATGAGGACCTTAAACAAATAAATTCATTTATTCATGAAATTGATTATT
4715 TCATTTT-TTTGATTTTGAATTATCTACTTCTAAC
779 TCATTTTCTTTGATTTTGAATTATCTACTTCTAAC
4749 TTTGCTTTATTTTTCAGAATGATGATTCGATGAAGATGAAGAGTT--AAGTCATAGAGCAAGTAC
1 TTTGCTTTATTTTTCAGAATGATGATTCGATGAAGATGAAGAGTTAGAAGTCATAGAGCAAGTAC
4812 TTGCGCCCTTTTTAATTGGGAGATATGAAGATGAAGTCATGTGCGATGTTGCTTCCATGAATTCA
66 TTGCGCCCTTTTTAATTGGGAGATATGAAGATGAAGTCATGTGCGATGTTGCTTCCATGAATTCA
4877 AGCCATCTACTTCTCGGATGTCCTTGGCACTGTGATAAACGAGCATTGCATGATGGGTTTTTTAA
131 AGCCATCTACTTCTCGGATGTCCTTGGCACTGTGATAAACGAGCATTGCATGATGGG-TTTTTAA
*
4942 ATCATTATTCATTCATCCATGGGAGAAGGAGAATCACGTTAGAATAATTGCCATCACACAAACTA
195 ATCATTATTCATTCATCCATGGGAGAAGGAGAATCACGTTA-AATAATTGCCATCACACAAAGTA
5007 CTTCAAGATTAACAACAACTAAAG-AAAACTTTGATGCTACGCAAAAAGAACATTGAGAGTAAAA
259 CTTCAAGATTAACAACAACTAAAGAAAAACTTTGATGCTACGCAAAAAGAACATTGAGAGTAAAA
5071 CAGGCA-TTGGAGTAGTTGAAAATGAG-A-ATTGAAGAGATT--GTGTGAAG-AAACCATGAATT
324 -AGGCATTTGGAGTAGTTGAAAATGAGAATATTGAAGAGATTGAGTGTGAAGAAAACCATGAATT
5130 T--GAGTGGAACTCAAAAAGAACAAGA-TGTAAA-GGAGCATACGAGAGGATTATGAAG-A-AGA
388 TGAGAGTGGAACTCAAAAAGAACAAGAGTGTAAAGGGAGCATACGAGAGGATTATGAAGAAGAGA
5189 AATTTCAAAAGGGACATGAGCAT--GAGAAAATAATGTGAGGAGAATGAAGTTTGACCTCTATTA
453 AATTTCAAAAGGGACATGAGCATGAGAGAAAATAATGTGAGGAGAATGAAGTTTGACCTCTATTA
5252 ATCAATCTTTTCTTCATATTATTTCGTTTGATTTGCAGGTTATTCCAAAGGCCATGCTATTGCAA
518 ATCAATCTTTTCTTCATATTATTTCGTTTGATTTGCAGGTTATTCCAAAGGCCATGCTATTGCAA
5317 ATTGATGAATCAAATTTGTCCATTGAAGTTCCAAATGA-TTAACGTTTGGTATTCCAAAACATGT
583 ATTGATGAATCAAATTTGTCCATTGAAGTTCCAAATGATTTAACGTTTGGTATTCCAAAACATGT
5381 GCTCTTTGATATTTTATGTACGTTCATTCTACATTCAAAGTTCAAACAATCTC-AGAAAGGGAAG
648 GCTCTTTGATATTTTATGTACGTTCATTCTACATTCAAAGTTCAAACAATCTCAAGAAAGGGAAG
5445 TTTCAATGAACCTATCCAATGAGGACCTTAAAC-AA-AAATTCATTTATTCATG-AATTGATTAT
713 TTTCAATGAACCTATCCAATGAGGACCTTAAACAAATAAATTCATTTATTCATGAAATTGATTAT
5507 TTCATTTTCTTTGATTTTGAATTATCTACTTCTAAC
778 TTCATTTTCTTTGATTTTGAATTATCTACTTCTAAC
5543 TTTGCTTTATTTTTCAGAATGATGATTCGATGAAGATGAAGAGTTAGAAGTCATAGAGCAAGTAC
1 TTTGCTTTATTTTTCAGAATGATGATTCGATGAAGATGAAGAGTTAGAAGTCATAGAGCAAGTAC
5608 TTGCGCCCTTTTTAATTGGGAGATATGAAGATGAAGTCATGTGCGATGTTGCTTCCATGAATTCA
66 TTGCGCCCTTTTTAATTGGGAGATATGAAGATGAAGTCATGTGCGATGTTGCTTCCATGAATTCA
* *
5673 AGCCATCTACTTCTCGGATGTCCTTGGCACTGCGATAGACGAGCATTGCATGATGGGTTTTTAAA
131 AGCCATCTACTTCTCGGATGTCCTTGGCACTGTGATAAACGAGCATTGCATGATGGGTTTTTAAA
*
5738 TCATTATTCATTCATCCATGGGAGAAGGAGAATCACGTTAGAATAATTGCCATCACACAAACTAC
196 TCATTATTCATTCATCCATGGGAGAAGGAGAATCACGTTA-AATAATTGCCATCACACAAAGTAC
5803 TTCAAGATTAACAACAACTAAAGAAAAACTTTGATGCTACGC--AAA-AACATTGAGAGTAAAAC
260 TTCAAGATTAACAACAACTAAAGAAAAACTTTGATGCTACGCAAAAAGAACATTGAGAGTAAAA-
5865 AGGCATTTGGAGTAGTTGAAAATGAGAATATTG-A-AGATTGA-TGTGAAGAAAACCATGAATTT
324 AGGCATTTGGAGTAGTTGAAAATGAGAATATTGAAGAGATTGAGTGTGAAGAAAACCATGAATTT
5927 GAGAGTGGAACTCAAAAAGAACAAGAGTGTAAAGGGAGCATACGAGA-GATTATGAAGAAGAGAA
389 GAGAGTGGAACTCAAAAAGAACAAGAGTGTAAAGGGAGCATACGAGAGGATTATGAAGAAGAGAA
5991 ATTTCAAAAGGGACATGAGCATGAGAGAAAAT-ATGTGAGGAGAATGAAGTTTGACCTCTATT-A
454 ATTTCAAAAGGGACATGAGCATGAGAGAAAATAATGTGAGGAGAATGAAGTTTGACCTCTATTAA
6054 TCAATC-TTTCTTCATATTATTTCGTTTGATTTGCAGGTTATTCCAAAGGCCATGCTATTGCAAA
519 TCAATCTTTTCTTCATATTATTTCGTTTGATTTGCAGGTTATTCCAAAGGCCATGCTATTGCAAA
6118 TTGATGAATCAAATTTGTCC-TTGAAGTTCCAAATGATTTAACGTTTGGTATTCCAAAACATGTG
584 TTGATGAATCAAATTTGTCCATTGAAGTTCCAAATGATTTAACGTTTGGTATTCCAAAACATGTG
6182 CTCTTTGATATTTTATGTACGTTCATTCTACATTCAAAGTTCAAACAATCTCAAG-AAGGGAAGT
649 CTCTTTGATATTTTATGTACGTTCATTCTACATTCAAAGTTCAAACAATCTCAAGAAAGGGAAGT
6246 TTCAATG-ACCTATCCAATGAGGACCTTAAACAAATAAATTCATTTATTCATGAAATTGATTATT
714 TTCAATGAACCTATCCAATGAGGACCTTAAACAAATAAATTCATTTATTCATGAAATTGATTATT
6310 TCATTTTCTTTGATTTTGAATTATCTACTTCTAAC
779 TCATTTTCTTTGATTTTGAATTATCTACTTCTAAC
6345 TTTGCTTTA-TTTTCAG-A--ATGATTCGATGAAGATGAAGAGTTAGAAGTCATAGAGCAAGTAC
1 TTTGCTTTATTTTTCAGAATGATGATTCGATGAAGATGAAGAGTTAGAAGTCATAGAGCAAGTAC
6406 TTGCGCCCTTTTTAATTGGGAG-TATGAAGATGAAGTCATGTGCGATGTTGCTTCCATG-ATTCA
66 TTGCGCCCTTTTTAATTGGGAGATATGAAGATGAAGTCATGTGCGATGTTGCTTCCATGAATTCA
* *
6469 AGCCATCTACTTCTCGGATGTCCTTGGCACTGCGATAGACGAGCATTGCATGATGGGTTTTTAAA
131 AGCCATCTACTTCTCGGATGTCCTTGGCACTGTGATAAACGAGCATTGCATGATGGGTTTTTAAA
6534 TCATTATTCATTCATCCATGGGAGAAGGAGAATCACGTTAGAATAATTGCCATCACACAAAGTAC
196 TCATTATTCATTCATCCATGGGAGAAGGAGAATCACGTTA-AATAATTGCCATCACACAAAGTAC
6599 TTCAAGATTAACAAC-ACTAAAGAAAAACTTTGATGCTACGCAAAAAGAACATTGAGAGTAAAAA
260 TTCAAGATTAACAACAACTAAAGAAAAACTTTGATGCTACGCAAAAAGAACATTGAGAGTAAAAA
*
6663 GGCATTTGGAGTAGTTGAAAATGAGAA-ATTGAAGAGATTGTGTGTGAAGAAAACCATGAA-TTG
325 GGCATTTGGAGTAGTTGAAAATGAGAATATTGAAGAGATTGAGTGTGAAGAAAACCATGAATTTG
6726 AGAGTGGAACTCAAAAAGAACAAGA--GT-AAGGGAGCATACGAGAGGATTATGAAGAAGAGAAA
390 AGAGTGGAACTCAAAAAGAACAAGAGTGTAAAGGGAGCATACGAGAGGATTATGAAGAAGAGAAA
6788 TTTCAAAAGGGACATGAGCATGAGAGAAAATAATGTGAGGAGAATGAAGTTTGACCTCTATTAAT
455 TTTCAAAAGGGACATGAGCATGAGAGAAAATAATGTGAGGAGAATGAAGTTTGACCTCTATTAAT
6853 CAATCTTTTCTTC-TATTATTTCGTTTGATTTGCAGGTTATTCCAAAGGCCATGCTATTGCAAAT
520 CAATCTTTTCTTCATATTATTTCGTTTGATTTGCAGGTTATTCCAAAGGCCATGCTATTGCAAAT
* * *
6917 TGATGAATC-AATTTATCCATTGATGTTCCAAATGATTTAACGTTTTGTATTCCAAAACATGTGC
585 TGATGAATCAAATTTGTCCATTGAAGTTCCAAATGATTTAACGTTTGGTATTCCAAAACATGTGC
*
6981 TCTTTGATA-TTTATGTACGTTCATTCTACATTCAAAGTTCAAACAATCTCAAGAAATGGAAGTT
650 TCTTTGATATTTTATGTACGTTCATTCTACATTCAAAGTTCAAACAATCTCAAGAAAGGGAAGTT
7045 TCAATGAACCTATCCAATGAGGACCTTAAAC-AATAAATTCATTTATTCATGAAATTGATTATTT
715 TCAATGAACCTATCCAATGAGGACCTTAAACAAATAAATTCATTTATTCATGAAATTGATTATTT
7109 CATTTTCTTTGATTTTGAATTATCTACTTCTAAC
780 CATTTTCTTTGATTTTGAATTATCTACTTCTAAC
7143 TTTGCTTTATTTTTCAGAATGATGATTCGATGAAGATGAAGAGTTAGAAGTCATAGAGCAAGTAC
1 TTTGCTTTATTTTTCAGAATGATGATTCGATGAAGATGAAGAGTTAGAAGTCATAGAGCAAGTAC
7208 TTGCGCCCTTTTTAATTGGGAGATATG-AGATGAAGTCATGTGCGATGTTGCTTCCATGAATTCA
66 TTGCGCCCTTTTTAATTGGGAGATATGAAGATGAAGTCATGTGCGATGTTGCTTCCATGAATTCA
*
7272 AGCCATCTACTTCTCGTATGTCCTTGGCAC-GTGATAAAC--GCATTGCATGATGGGTTTTTTAA
131 AGCCATCTACTTCTCGGATGTCCTTGGCACTGTGATAAACGAGCATTGCATGATGGG-TTTTTAA
7334 ATCATTATTCATTCATCCATGGGAGAAGGAGAATCACGTTAGAATAATTGCCATCACACAAAGTA
195 ATCATTATTCATTCATCCATGGGAGAAGGAGAATCACGTTA-AATAATTGCCATCACACAAAGTA
7399 CTTC-AGATTAACAACAACTAAAG-AAAACTTTGATGCTACGC-AAAAGAACATTGAGAGTAAAA
259 CTTCAAGATTAACAACAACTAAAGAAAAACTTTGATGCTACGCAAAAAGAACATTGAGAGT-AAA
7461 AAGGCATTTGGAGTAGTTGAAAATGAGAATA-TGAAGAGATTGAGTGTG-AGAAAA-CATGAATT
323 AAGGCATTTGGAGTAGTTGAAAATGAGAATATTGAAGAGATTGAGTGTGAAGAAAACCATGAATT
*
7523 TGAGAGTGGATCTCAAAAAGAACAAGAGTGTAAAGGGAGCATACGAGAGGATTATGAAGAAGAGA
388 TGAGAGTGGAACTCAAAAAGAACAAGAGTGTAAAGGGAGCATACGAGAGGATTATGAAGAAGAGA
*
7588 AATTTC-AAAGGGACATGAGCAT--GAGAAAATAATGTGAGGAGAATGAAGTTTGACCTTTATTA
453 AATTTCAAAAGGGACATGAGCATGAGAGAAAATAATGTGAGGAGAATGAAGTTTGACCTCTATTA
7650 ATC-ATCTTTTCTTCATATTATTTCGTTTGATTTGCAGGTTATTCCAAAGGCCATGCTATTGCAA
518 ATCAATCTTTTCTTCATATTATTTCGTTTGATTTGCAGGTTATTCCAAAGGCCATGCTATTGCAA
7714 ATTGATGAATCAAATTTGTCCATTGAAGTTCCAAATGATTTAACG-TT--TATTCCAAAACATGT
583 ATTGATGAATCAAATTTGTCCATTGAAGTTCCAAATGATTTAACGTTTGGTATTCCAAAACATGT
7776 GCTCTTTGATATTTTATGTACGTTCATTCTACATTCAAAGTTC-AAC-ATCTCAAG-AA---AAG
648 GCTCTTTGATATTTTATGTACGTTCATTCTACATTCAAAGTTCAAACAATCTCAAGAAAGGGAAG
*
7835 -TTCCATGAACCTATCCAATGAGGACCTTAAACAAATAAATTCATTTATTCATGAAATTGATTAT
713 TTTCAATGAACCTATCCAATGAGGACCTTAAACAAATAAATTCATTTATTCATGAAATTGATTAT
*
7899 TTCATTTTATTTGATTTTGAATTATCT-CTTCTAAC
778 TTCATTTTCTTTGATTTTGAATTATCTACTTCTAAC
7934 TTTGCTTTATTTTTCAGAATGATGATTCGATGAAGATGAAGAGTTAGAAGTCATAGAGCAAGTAC
1 TTTGCTTTATTTTTCAGAATGATGATTCGATGAAGATGAAGAGTTAGAAGTCATAGAGCAAGTAC
*
7999 TTGCGCCCTTTTTAATTGGGAGATATGAAAATGAAGTCATGTGCGATGTTGCTTCCATGAATTCA
66 TTGCGCCCTTTTTAATTGGGAGATATGAAGATGAAGTCATGTGCGATGTTGCTTCCATGAATTCA
8064 AGCCATCTACTTCTCGGATGTCCTTGGCACTGTGATAAACGAGCATTGC-TGATGGGTTTTTAAA
131 AGCCATCTACTTCTCGGATGTCCTTGGCACTGTGATAAACGAGCATTGCATGATGGGTTTTTAAA
8128 TCATTATTCATTCATCCATGGGAGAAGGAGAATCACGTTAGAATAATTGCCATCACACAAAGTAC
196 TCATTATTCATTCATCCATGGGAGAAGGAGAATCACGTTA-AATAATTGCCATCACACAAAGTAC
8193 TTCAAGATTAAC-ACAACTAAAGAAAAACTTTGATGCTACGC-AAAAGAACATTGAGAGTAAAAA
260 TTCAAGATTAACAACAACTAAAGAAAAACTTTGATGCTACGCAAAAAGAACATTGAGAGT-AAAA
*
8256 AGGCATTTGGAGTAGTTGAAAATGAGAATATTGAAGAGATTGAGTGTGAAGAAAACCATGAATGT
324 AGGCATTTGGAGTAGTTGAAAATGAGAATATTGAAGAGATTGAGTGTGAAGAAAACCATGAATTT
* *
8321 GAGAGTGGAACTCAAAAAGAAC-AGAGTGTAAAGGGAGCATACGATAGGAGTATGAAGAAGAGAA
389 GAGAGTGGAACTCAAAAAGAACAAGAGTGTAAAGGGAGCATACGAGAGGATTATGAAGAAGAGAA
8385 ATTTCAAAAGGGACATGAGCATGAGAGAAAATAATGTGA-G-GAATGAA-TTTGACCTCTA-TAA
454 ATTTCAAAAGGGACATGAGCATGAGAGAAAATAATGTGAGGAGAATGAAGTTTGACCTCTATTAA
8446 TCAATCTTTTCTTCATATTATTTCGTTTGATTTGCAGGTTATTCCAAAGGCCATGCTATTGCAAA
519 TCAATCTTTTCTTCATATTATTTCGTTTGATTTGCAGGTTATTCCAAAGGCCATGCTATTGCAAA
8511 TTGATGAATCAAATTTGTCCATTGAAGTTCCAAATGATTTAACGTTTGGTATTCCAAAACATGTG
584 TTGATGAATCAAATTTGTCCATTGAAGTTCCAAATGATTTAACGTTTGGTATTCCAAAACATGTG
*
8576 CTCTTTGATATTTTATGTACGTTCATTCTACATTCAAAGTTCAAACAATCTAAAGAAAGGGAAGT
649 CTCTTTGATATTTTATGTACGTTCATTCTACATTCAAAGTTCAAACAATCTCAAGAAAGGGAAGT
8641 TTCAATGAACCTATCCAATGAGGACCTTAAACAAATAAATTCATTTATTCATGAAATTGATTATT
714 TTCAATGAACCTATCCAATGAGGACCTTAAACAAATAAATTCATTTATTCATGAAATTGATTATT
*
8706 TCATTTT-ATTGATTTTGAATTATCTCTACTTCTAAC
779 TCATTTTCTTTGATTTTGAATTA--TCTACTTCTAAC
8742 -TTGCTTTA-TTTTCAGAATGATGATTCGATGAAGATGAAGAGTTAGAAGTCATAGAGCAAGTAC
1 TTTGCTTTATTTTTCAGAATGATGATTCGATGAAGATGAAGAGTTAGAAGTCATAGAGCAAGTAC
8805 TTGCGCCCTTTTTAATTGGGAGATATG-A-A-GAAGTCATGTGCGATGTTGCTTCCATGAATTCA
66 TTGCGCCCTTTTTAATTGGGAGATATGAAGATGAAGTCATGTGCGATGTTGCTTCCATGAATTCA
8867 AGCCATCTACTTCTCGGATGTCCTTGGCACTGTGATAAAC--GCATTGCATGATGGGTTTTTAAA
131 AGCCATCTACTTCTCGGATGTCCTTGGCACTGTGATAAACGAGCATTGCATGATGGGTTTTTAAA
8930 TCATTATTCATTCATCCATGGGAGAAGGAGAATCACGTTAGAATAATTGCCATCACAC-AAGTAC
196 TCATTATTCATTCATCCATGGGAGAAGGAGAATCACGTTA-AATAATTGCCATCACACAAAGTAC
8994 TTCAAGATTAACAACAACTAAAGAAAAACTTTGATGCTACGCAAAAAGAACATTGAGAGTAAAAC
260 TTCAAGATTAACAACAACTAAAGAAAAACTTTGATGCTACGCAAAAAGAACATTGAGAGTAAAA-
9059 AGGCATTTGGAGTAGTTTGAAAATGAGAATATTGAAGAGATTGAGTGTGAAG-AAACCATGAATT
324 AGGCATTTGGAGTAG-TTGAAAATGAGAATATTGAAGAGATTGAGTGTGAAGAAAACCATGAATT
9123 TGAGAGTGGAACTC-AAAAGAACAAGAGTGTAAAGGGAGCATACGAGAGGATTATGAAGAAGAGA
388 TGAGAGTGGAACTCAAAAAGAACAAGAGTGTAAAGGGAGCATACGAGAGGATTATGAAGAAGAGA
9187 AATTTCAAAAGGGACATGAGCAT--GAGAAAATAATGTGAGGAGAATGAAGTTTGACCTCTATTA
453 AATTTCAAAAGGGACATGAGCATGAGAGAAAATAATGTGAGGAGAATGAAGTTTGACCTCTATTA
9250 ATCAATCTTTTCTTCATATTATTTCGTTTGATTTGCAGGTTATTCCAAAGGCCATGCTATTGCAA
518 ATCAATCTTTTCTTCATATTATTTCGTTTGATTTGCAGGTTATTCCAAAGGCCATGCTATTGCAA
* *
9315 ATTGATTAATCAAGTTTGTCCATTGAAGTTCCAAATGATTTAACGTTTGGTATTCCAAAACATG-
583 ATTGATGAATCAAATTTGTCCATTGAAGTTCCAAATGATTTAACGTTTGGTATTCCAAAACATGT
9379 GCTCTTTGATATTTTA--TACGTTCATTCTACATTCAAAGTTCAAACAATCTCAA-AAAGGGAAG
648 GCTCTTTGATATTTTATGTACGTTCATTCTACATTCAAAGTTCAAACAATCTCAAGAAAGGGAAG
*
9441 TTTCAATGAACCTATCCAATGAGCACCTTAAACAAATAAATTCATTTATTCATGAAA-TGATTAT
713 TTTCAATGAACCTATCCAATGAGGACCTTAAACAAATAAATTCATTTATTCATGAAATTGATTAT
9505 TTCATTTTCTTTGATTTTGAATTATCTACTTCTAAC
778 TTCATTTTCTTTGATTTTGAATTATCTACTTCTAAC
*
9541 TTTGATTTATTTTTCAGAATGATGATTCGATGAAGATGAAGAGTTAGAAGTCATAGAGCAAGTAC
1 TTTGCTTTATTTTTCAGAATGATGATTCGATGAAGATGAAGAGTTAGAAGTCATAGAGCAAGTAC
*
9606 TTACGCCCTTTTTAATTGGGAGATATGAAGATGAAGTCATGTGCGATGTTGCTTCCATGAATTCA
66 TTGCGCCCTTTTTAATTGGGAGATATGAAGATGAAGTCATGTGCGATGTTGCTTCCATGAATTCA
*
9671 AGCCATCTACTTCTTGGATGTCCTTGGCACTGTGATAAACGAGCATTGCATGATGGGTTTTTAAA
131 AGCCATCTACTTCTCGGATGTCCTTGGCACTGTGATAAACGAGCATTGCATGATGGGTTTTTAAA
9736 TCATTATTCATTCATCCATGGGAGAAGGAGAATCACGTTAGAATAATTGCCATCACAC-AAGTAC
196 TCATTATTCATTCATCCATGGGAGAAGGAGAATCACGTTA-AATAATTGCCATCACACAAAGTAC
*
9800 TTCAAGATT-ACAACAACT-AAGAAAAACTTTGATGCTATGC-AAAAGAACATTGAGAGTAAAAA
260 TTCAAGATTAACAACAACTAAAGAAAAACTTTGATGCTACGCAAAAAGAACATTGAGAGT-AAAA
9862 AGGCATTTGGAGTAGTTGAAAATGAGAATATTGAAGAGATTGA-TGTGAAGAAAACCATGAATTT
324 AGGCATTTGGAGTAGTTGAAAATGAGAATATTGAAGAGATTGAGTGTGAAGAAAACCATGAATTT
*
9926 GAGAGTGGAACTCAAAAAGAAC-A-AGTGTAAAGGGAGCATACGAGAGGAGTATGAAGAAGAGAA
389 GAGAGTGGAACTCAAAAAGAACAAGAGTGTAAAGGGAGCATACGAGAGGATTATGAAGAAGAGAA
9989 ATTTC-AAAGGGAC---A-C----------------------------A---T--CCTCTATTAA
454 ATTTCAAAAGGGACATGAGCATGAGAGAAAATAATGTGAGGAGAATGAAGTTTGACCTCTATTAA
* * * * *
10016 TCAATCTTTTCTTTATATTATTTCGTTTGATTTGCAGGTTATTCCAAAGGGCATGCAATTTCAAT
519 TCAATCTTTTCTTCATATTATTTCGTTTGATTTGCAGGTTATTCCAAAGGCCATGCTATTGCAAA
*
10081 TTGATGAATCAAATTTTTCCATTGAAGTTCCAAATGATTTAACGTTTGGTATTCCAAAACATGTG
584 TTGATGAATCAAATTTGTCCATTGAAGTTCCAAATGATTTAACGTTTGGTATTCCAAAACATGTG
*
10146 CTCTTTGATATTTTATGTACGTTCATTCTACATTCAAAGTCCAAACAATCTCAAGAAAGGGAAGT
649 CTCTTTGATATTTTATGTACGTTCATTCTACATTCAAAGTTCAAACAATCTCAAGAAAGGGAAGT
10211 TTCAATGAACCTATCCAATGAGGACCTTAAACAAATAAATTCATTTATTCAT-AAATTGATTATT
714 TTCAATGAACCTATCCAATGAGGACCTTAAACAAATAAATTCATTTATTCATGAAATTGATTATT
*
10275 TCATTTTCTTTGATTTTGAATTATCTACTTCTTAC
779 TCATTTTCTTTGATTTTGAATTATCTACTTCTAAC
* *
10310 TTTGCTTTATTTTTCAGAATGATGATTC---GAAGATGAAGAGTTAGAAGTCATATAGCTAGTAC
1 TTTGCTTTATTTTTCAGAATGATGATTCGATGAAGATGAAGAGTTAGAAGTCATAGAGCAAGTAC
*
10372 TTGCGCCCTTTTTAATTGGGAGATATGAAGATGAAGTCATGTGCGATGTTGCTTCTATGAATTCA
66 TTGCGCCCTTTTTAATTGGGAGATATGAAGATGAAGTCATGTGCGATGTTGCTTCCATGAATTCA
10437 AGCCATCTACTTCT
131 AGCCATCTACTTCT
10451 ATGAAGTCAA
Statistics
Matches: 9320, Mismatches: 103, Indels: 507
0.94 0.01 0.05
Matches are distributed among these distances:
764 21 0.00
765 140 0.02
766 128 0.01
767 23 0.00
768 42 0.00
769 160 0.02
770 64 0.01
771 35 0.00
772 107 0.01
773 115 0.01
774 44 0.00
775 99 0.01
776 4 0.00
777 12 0.00
778 48 0.01
779 2 0.00
780 45 0.00
781 28 0.00
782 41 0.00
785 13 0.00
786 59 0.01
787 8 0.00
788 51 0.01
789 139 0.01
790 214 0.02
791 476 0.05
792 439 0.05
793 421 0.05
794 640 0.07
795 581 0.06
796 717 0.08
797 353 0.04
798 528 0.06
799 374 0.04
800 417 0.04
801 536 0.06
802 845 0.09
803 434 0.05
804 370 0.04
805 271 0.03
806 257 0.03
807 11 0.00
808 8 0.00
ACGTcount: A:0.35, C:0.14, G:0.19, T:0.32
Consensus pattern (813 bp):
TTTGCTTTATTTTTCAGAATGATGATTCGATGAAGATGAAGAGTTAGAAGTCATAGAGCAAGTAC
TTGCGCCCTTTTTAATTGGGAGATATGAAGATGAAGTCATGTGCGATGTTGCTTCCATGAATTCA
AGCCATCTACTTCTCGGATGTCCTTGGCACTGTGATAAACGAGCATTGCATGATGGGTTTTTAAA
TCATTATTCATTCATCCATGGGAGAAGGAGAATCACGTTAAATAATTGCCATCACACAAAGTACT
TCAAGATTAACAACAACTAAAGAAAAACTTTGATGCTACGCAAAAAGAACATTGAGAGTAAAAAG
GCATTTGGAGTAGTTGAAAATGAGAATATTGAAGAGATTGAGTGTGAAGAAAACCATGAATTTGA
GAGTGGAACTCAAAAAGAACAAGAGTGTAAAGGGAGCATACGAGAGGATTATGAAGAAGAGAAAT
TTCAAAAGGGACATGAGCATGAGAGAAAATAATGTGAGGAGAATGAAGTTTGACCTCTATTAATC
AATCTTTTCTTCATATTATTTCGTTTGATTTGCAGGTTATTCCAAAGGCCATGCTATTGCAAATT
GATGAATCAAATTTGTCCATTGAAGTTCCAAATGATTTAACGTTTGGTATTCCAAAACATGTGCT
CTTTGATATTTTATGTACGTTCATTCTACATTCAAAGTTCAAACAATCTCAAGAAAGGGAAGTTT
CAATGAACCTATCCAATGAGGACCTTAAACAAATAAATTCATTTATTCATGAAATTGATTATTTC
ATTTTCTTTGATTTTGAATTATCTACTTCTAAC
Found at i:12301 original size:810 final size:806
Alignment explanation
Indices: 10459--12447 Score: 3524
Period size: 804 Copynumber: 2.5 Consensus size: 806
10449 CTATGAAGTC
* *
10459 AAGTACGTTCATTCTACATTCATA-TTTAAACAATCTCAAGAAAGGGAAGTTTCAATGAACCTAT
1 AAGTACGTTCATTCTACATTCAAAGTTCAAACAATCTCAAGAAAGGGAAGTTTCAATGAACCTAT
* * *
10523 CCAATGAGCACCTTAAACAAAT-AATTCATTTATTCATGAAATTGATTATTTCATTTTATTTGAT
66 CCAATGTGGACCTTAAACAAATAAATTCATTTATTCATGAAATTGATTATTTCATTTTCTTTGAT
* *
10587 TTTGAATTATCTACTTCTAACTTTGCTTTATTTTTCAGAATGATGATTCGATGAAGATGATGTGT
131 TTTGAATTATCTACTTCTAACTTTGCTTTATTTTTCAGAATGATGATTCGATGAAGATGAAGAGT
10652 TAGAAGTCATATAGCAAGTACTTGCACCCTTTTTAATTGGGAGATATGAAGATGAAGTCATGTGC
196 TAGAAGTCATATAGCAAGTACTTGCACCCTTTTTAATTGGGAGATATGAAGATGAAGTCATGTGC
*
10717 GATGTTGCTTCTATGAATTCAAGTCATCTACTTCTCGGATGTCCTTGGCACTGTGATAAACGAGC
261 GATGTTGCTTCTATGAATTCAAGCCATCTACTTCTCGGATGTCCTTGGCACTGTGATAAACGAGC
*
10782 ATTGCATGATGGTTTTTAAATCA-TTATCATTCATCCATGGGAGAAGGAGAATCACGTTAGTACA
326 ATTGCATGATGGTTTTTAAATCATTTTTCATTCATCCATGGGAGAAGGAGAATCACGTTAGTACA
*
10846 ATTGCCATCACACAAAGTACTTCAAGATTAACAACAACTAAAGAAAAACTTTGATGCAATGCAAA
391 ATTGCCATCACACAAAGTACTTCAAGATTAACAACAACTAAAGAAAAACTTGGATGCAATGCAAA
10911 AGAACATTGAGAGTAAAAAGGCATTTGGAGTAGTTGAAAATGAGAATATTGAAGAGATTGAGTGT
456 AGAACATTGAGAGTAAAAAGGCATTTGGAGTAGTTGAAAATGAGAATATTGAAGAGATTGAGTGT
* *
10976 GAAGAAAACCATGAATTTGAGAGTGGAACTCAATAAGAACAAGAGTGTAAAGGGAGCATACGAGA
521 GAAGAAAACCATGAATGTGAGAGTGGAACTCAAAAAGAACAAGAGTGTAAAGGGAGCATACGAGA
*
11041 TGAGTATGAAGAAGAAATTTCAAAAGGGACATAAGCATGAGAGAAAATAATGTGAGAGAAAAGTT
586 GGAGTATGAAGAAGAAATTTCAAAAGGGACATAAGCATGAGAGAAAATAATGTGAGAGAAAAGTT
*
11106 TGACCTCTATTAATCAATCTTTTCTTTATATATTTCGTTTGATTTGCAGGTTATTCCAAAGGGCA
651 TGACCTCTATTAATCAATCTTTTCTTCATATATTTCGTTTGATTTGCAGGTTATTCCAAAGGGCA
* **
11171 TTCAATTTCAATTTGATGAATCAAATTTGTCCATTGAAGTTCCAAATGATTTAACATTTGGTATT
716 TGCAATTAAAATTTGATGAATCAAATTTGTCCATTGAAGTTCCAAATGATTTAACATTTGGTATT
11236 CCAAAACATGTGCTATTTGATATTCT
781 CCAAAACATGTGCTATTTGATATTCT
*
11262 AAGTACGTTCATTCTACATTCAAAGTTCAAACAATCTCAAGAAAAGGAAGTTTCAATGAACCTAT
1 AAGTACGTTCATTCTACATTCAAAGTTCAAACAATCTCAAGAAAGGGAAGTTTCAATGAACCTAT
11327 CCAATGTGGACCTTAAAC-AATAAATTCATTTATTCATGAAATTGATTATTTCATTTTCTTTGAT
66 CCAATGTGGACCTTAAACAAATAAATTCATTTATTCATGAAATTGATTATTTCATTTTCTTTGAT
*
11391 TTTGAATTATCTACTTCTTACTTTGCTTTATTTTTCAGAATGATGATTCGATGAAGATGAAGAGT
131 TTTGAATTATCTACTTCTAACTTTGCTTTATTTTTCAGAATGATGATTCGATGAAGATGAAGAGT
*
11456 TAAAAGTCATATAGCAAGTACTTGCACCCTTTTTAATTGGGAGATATGAAGATGAAGTCATGTGC
196 TAGAAGTCATATAGCAAGTACTTGCACCCTTTTTAATTGGGAGATATGAAGATGAAGTCATGTGC
11521 GATGTTGCTTCTATGAATTCAAGCCATCTACTTCTCGGATGTCCTTGGCACTGTGATAAACGAGC
261 GATGTTGCTTCTATGAATTCAAGCCATCTACTTCTCGGATGTCCTTGGCACTGTGATAAACGAGC
*
11586 ATTGCATGATGGTTTTTAAATCATTTTTCATTCATCCATGGGAGAAGGATAATCACGTTAGTACA
326 ATTGCATGATGGTTTTTAAATCATTTTTCATTCATCCATGGGAGAAGGAGAATCACGTTAGTACA
* *
11651 ATTGCCATCACACAAAGTACTTCAAGATTAACAACAACT-AA-TAAAACTTGGATGCTATGCAAA
391 ATTGCCATCACACAAAGTACTTCAAGATTAACAACAACTAAAGAAAAACTTGGATGCAATGC-AA
11714 AAGAACATTGAGAGTAAAAAGGCATTTGGAGTAGTTGAAAATGAGAATATTGAAGAGATTGAGTG
455 AAGAACATTGAGAGTAAAAAGGCATTTGGAGTAGTTGAAAATGAGAATATTGAAGAGATTGAGTG
*
11779 TGAAGAAAACCATGAATGTGAGAGTGGAACTCAAAAAGAACAAGAGTGTAAAGGGAGCATACGAT
520 TGAAGAAAACCATGAATGTGAGAGTGGAACTCAAAAAGAACAAGAGTGTAAAGGGAGCATACGAG
* *
11844 AGGAGTATGAAGAAGAGAAATTTCAAAAGGGACATGAGCATGATAGAAAATAATGTGAGGAGAAT
585 AGGAGTATGAAG-A-AGAAATTTCAAAAGGGACATAAGCATGAGAGAAAATAATGTGA-GAGAA-
11909 GAAGTTTGACCTCTATTAATCAATCTTTTCTTCATATTATTTCGTTTGATTTGCAGGTTATTCCA
646 -AAGTTTGACCTCTATTAATCAATCTTTTCTTCATA-TATTTCGTTTGATTTGCAGGTTATTCCA
*
11974 AAGGGCATGCAATTAAAATTTGATGAATCAAATTTGTCCATTGAGGTTCCAAATGATTTAACATT
709 AAGGGCATGCAATTAAAATTTGATGAATCAAATTTGTCCATTGAAGTTCCAAATGATTTAACATT
12039 TGGTATTCCAAAACATGTGCTATTTGATATTCT
774 TGGTATTCCAAAACATGTGCTATTTGATATTCT
*
12072 AAGTACGTTCATTCTACATTCAAAGTTCAAACAATCTCGAGAAAGGGAAGTTTCAATGAACCTAT
1 AAGTACGTTCATTCTACATTCAAAGTTCAAACAATCTCAAGAAAGGGAAGTTTCAATGAACCTAT
12137 CCAATGTGGACCTTAAACAAATAAATTCATTTATTCATGAAATTGATTATTTCA-TTTCTTTGAT
66 CCAATGTGGACCTTAAACAAATAAATTCATTTATTCATGAAATTGATTATTTCATTTTCTTTGAT
12201 TTTGAATTATCTACTTCTAACTTTGCTTTATTTTTCAGAATGATGATTCGATGAAGATGAAGAGT
131 TTTGAATTATCTACTTCTAACTTTGCTTTATTTTTCAGAATGATGATTCGATGAAGATGAAGAGT
* * * *
12266 TAGAAGTCATAGAGCAAGTACTTGCGCCCTTTTTAATTGGGAGATATGAAGATGAAGTCACGGGC
196 TAGAAGTCATATAGCAAGTACTTGCACCCTTTTTAATTGGGAGATATGAAGATGAAGTCATGTGC
* * *
12331 GATGTTGCTTCCATGAATTCAAGCCATCTACTTCTCGGATATCCTTGGCACGGTGATAAACGAGC
261 GATGTTGCTTCTATGAATTCAAGCCATCTACTTCTCGGATGTCCTTGGCACTGTGATAAACGAGC
*
12396 ATTGCATGATGGGTTTTTAAAATCATTATTCATTCATCCATGGGAGAAGGAG
326 ATTGCATGAT-GGTTTTT-AAATCATTTTTCATTCATCCATGGGAGAAGGAG
12448 TAGAATTTGC
Statistics
Matches: 1133, Mismatches: 40, Indels: 17
0.95 0.03 0.01
Matches are distributed among these distances:
803 42 0.04
804 450 0.40
805 79 0.07
806 41 0.04
807 5 0.00
809 34 0.03
810 409 0.36
811 42 0.04
812 31 0.03
ACGTcount: A:0.35, C:0.14, G:0.19, T:0.33
Consensus pattern (806 bp):
AAGTACGTTCATTCTACATTCAAAGTTCAAACAATCTCAAGAAAGGGAAGTTTCAATGAACCTAT
CCAATGTGGACCTTAAACAAATAAATTCATTTATTCATGAAATTGATTATTTCATTTTCTTTGAT
TTTGAATTATCTACTTCTAACTTTGCTTTATTTTTCAGAATGATGATTCGATGAAGATGAAGAGT
TAGAAGTCATATAGCAAGTACTTGCACCCTTTTTAATTGGGAGATATGAAGATGAAGTCATGTGC
GATGTTGCTTCTATGAATTCAAGCCATCTACTTCTCGGATGTCCTTGGCACTGTGATAAACGAGC
ATTGCATGATGGTTTTTAAATCATTTTTCATTCATCCATGGGAGAAGGAGAATCACGTTAGTACA
ATTGCCATCACACAAAGTACTTCAAGATTAACAACAACTAAAGAAAAACTTGGATGCAATGCAAA
AGAACATTGAGAGTAAAAAGGCATTTGGAGTAGTTGAAAATGAGAATATTGAAGAGATTGAGTGT
GAAGAAAACCATGAATGTGAGAGTGGAACTCAAAAAGAACAAGAGTGTAAAGGGAGCATACGAGA
GGAGTATGAAGAAGAAATTTCAAAAGGGACATAAGCATGAGAGAAAATAATGTGAGAGAAAAGTT
TGACCTCTATTAATCAATCTTTTCTTCATATATTTCGTTTGATTTGCAGGTTATTCCAAAGGGCA
TGCAATTAAAATTTGATGAATCAAATTTGTCCATTGAAGTTCCAAATGATTTAACATTTGGTATT
CCAAAACATGTGCTATTTGATATTCT
Found at i:12629 original size:231 final size:229
Alignment explanation
Indices: 12222--12676 Score: 811
Period size: 231 Copynumber: 2.0 Consensus size: 229
12212 TACTTCTAAC
12222 TTTGCTTTATTTTTCAGAATGATGATTCGATGAAGATGAAGAGTTAGAAGTCATAGAGCAAGTAC
1 TTTGCTTTATTTTTCAGAATGATGATTCGATGAAGATGAAGAGTTAGAAGTCATAGAGCAAGTAC
12287 TTGCGCCCTTTTTAATTGGGAGATATGAAGATGAAGTCACGGGCGATGTTGCTTCCATGAATTCA
66 TTGCGCCCTTTTTAATTGGGAGATATGAAGATGAAGTCACGGGCGATGTTGCTTCCATGAATTCA
*
12352 AGCCATCTACTTCTCGGATATCCTTGGCACGGTGATAAACGAGCATTGCATGATGGGTTTTTAAA
131 AGCCATCTACTTCTCGGATATCATTGGCACGGTGATAAACGAGCATTGCATGATGGG--TTTAAA
12417 ATCATTATTCATTCATCCATGGGAGAAGGAGTAGAA
194 ATCATTATTCATTCATCCATGGGAGAAGGAGTAGAA
* *
12453 TTTGCTTTATTTTTCAGAATGATGATTCGATGAAGATGAAGAGTTAGAAGTCATATAGCTAGTAC
1 TTTGCTTTATTTTTCAGAATGATGATTCGATGAAGATGAAGAGTTAGAAGTCATAGAGCAAGTAC
* * *
12518 TTGCGCCCTTTTTAATTGGGAGATATGAAGATGAAGTCATGTGCGATGTTGGTTCCATGAATTCA
66 TTGCGCCCTTTTTAATTGGGAGATATGAAGATGAAGTCACGGGCGATGTTGCTTCCATGAATTCA
* * *
12583 AGCCATCTACTTCTCGGATGTCATTGGCACTGTGATAAATGAGCATTGCATGATGGGTTTAAAAT
131 AGCCATCTACTTCTCGGATATCATTGGCACGGTGATAAACGAGCATTGCATGATGGGTTTAAAAT
12648 CATTATTCATTCATCCATGGGAGAAGGAG
196 CATTATTCATTCATCCATGGGAGAAGGAG
12677 AATCACGTTA
Statistics
Matches: 215, Mismatches: 9, Indels: 2
0.95 0.04 0.01
Matches are distributed among these distances:
229 37 0.17
231 178 0.83
ACGTcount: A:0.29, C:0.15, G:0.24, T:0.33
Consensus pattern (229 bp):
TTTGCTTTATTTTTCAGAATGATGATTCGATGAAGATGAAGAGTTAGAAGTCATAGAGCAAGTAC
TTGCGCCCTTTTTAATTGGGAGATATGAAGATGAAGTCACGGGCGATGTTGCTTCCATGAATTCA
AGCCATCTACTTCTCGGATATCATTGGCACGGTGATAAACGAGCATTGCATGATGGGTTTAAAAT
CATTATTCATTCATCCATGGGAGAAGGAGTAGAA
Found at i:17521 original size:811 final size:815
Alignment explanation
Indices: 12453--22731 Score: 18193
Period size: 814 Copynumber: 12.7 Consensus size: 815
12443 AGGAGTAGAA
* *
12453 TTTGCTTTATTTTTCAGAATGATGATTCGATGAAGATGAAGAGTTAGAAGTCATATAGCTAGTAC
1 TTTGCTTTATTTTTCAGAATGATGATTCGATGAAGATGAAGAGTTAGAAGTCATAGAGCAAGTAC
*
12518 TTGCGCCCTTTTTAATTGGGAGATATGAAGATGAAGTCATGTGCGATGTTGGTTCCATGAATTCA
66 TTGCGCCCTTTTTAATTGGGAGATATGAAGATGAAGTCATGTGCGATGTTGCTTCCATGAATTCA
* * *
12583 AGCCATCTACTTCTCGGATGTCATTGGCACTGTGATAAATGAGCATTGCATGATGGG-TTTAAAA
131 AGCCATCTACTTCTCGGATGTCCTTGGCACTGTGATAAACGAGCATTGCATGATGGGTTTTTAAA
12647 TCATTATTCATTCATCCATGGGAGAAGGAGAATCACGTTAGTACAATTGCCATCACACAAAGTAC
196 TCATTATTCATTCATCCATGGGAGAAGGAGAATCACGTTAGTACAATTGCCATCACACAAAGTAC
*
12712 TTCAAGATTAACAACAACTAAAGAAAAACTTTGATGCAATGCAAAAAGAACATTGAGAGTAAAAA
261 TTCAAGATTAACAACAACTAAAGAAAAACTTTGATGCTATGCAAAAAGAACATTGAGAGTAAAAA
12777 AGGCATTTGGAGTAGTTGAAAATGAGAATATTGAAGAGATTGAGTGTGAAG-AAACCATGAATGT
326 AGGCATTTGGAGTAGTTGAAAATGAGAATATTGAAGAGATTGAGTGTGAAGAAAACCATGAATGT
12841 GAGAGTGGAACTCAAAAAGAACAAGAGTGTAAAGGGAGCATACGAGA-GAGTATGAAGAAGAGAA
391 GAGAGTGGAACTCAAAAAGAACAAGAGTGTAAAGGGAGCATACGAGAGGAGTATGAAGAAGAGAA
* * *
12905 ATTTCAAAAGGGACATGAGCATGATAGAAAATAATGAGAGGAGAATGAAGTTTGACATCTATTAA
456 ATTTCAAAAGGGACATGAGCATGAGAGAAAATAATGTGAGGAGAATGAAGTTTGACCTCTATTAA
*
12970 TCAATCTTTTCTTTATATTATTTCGTTTGATTTGCAGGTTATTCCAAAGGGCATGCTATTGCAAA
521 TCAATCTTTTCTTCATATTATTTCGTTTGATTTGCAGGTTATTCCAAAGGGCATGCTATTGCAAA
*
13035 TTGATGAATCAAATTTATCCATTGAAGTTCCAAATGATTTAACATTTGGTATTCCAAAACATGTG
586 TTGATGAATCAAATTTGTCCATTGAAGTTCCAAATGATTTAACATTTGGTATTCCAAAACATGTG
*
13100 CTCTTTGATATTCTAAGTACGTTCATTCTACATTCATAGTT-AAACAATCTCAAGAAAGGGAAGT
651 CTCTTTGATATTCTAAGTACGTTCATTCTACATTCAAAGTTCAAACAATCTCAAGAAAGGGAAGT
*
13164 TTCAATGAACCTATCCAATGAGCACCTTAAACAAATAAATTCATTTATTCATGAAATTGATTATT
716 TTCAATGAACCTATCCAATGAGGACCTTAAACAAATAAATTCATTTATTCATGAAATTGATTATT
*
13229 TCATTTTATTTGATTTTGAATTATCTACTTCTAAC
781 TCATTTTCTTTGATTTTGAATTATCTACTTCTAAC
* * *
13264 TTTGCTTTATTTTTCAGAATGATGATTCGATGAAGATGATGTGTTAGAAGTCATATAGCAAGTAC
1 TTTGCTTTATTTTTCAGAATGATGATTCGATGAAGATGAAGAGTTAGAAGTCATAGAGCAAGTAC
* *
13329 TTGCACCCTTTTTAATTGGGAGATATGAAGATGAAGTCATGTGCGATGTTGCTTCTATGAATTCA
66 TTGCGCCCTTTTTAATTGGGAGATATGAAGATGAAGTCATGTGCGATGTTGCTTCCATGAATTCA
13394 AGCCATCTACTTCTCGGATGT-CTTGGCACTGTGATAAACGAGCATTGCATGATGGGTTTTTAAA
131 AGCCATCTACTTCTCGGATGTCCTTGGCACTGTGATAAACGAGCATTGCATGATGGGTTTTTAAA
13458 TCATTATTCATTCATCCATGGGAGAAGGAGAATCACGTTAGTACAATTGCCATCACACAAAGTAC
196 TCATTATTCATTCATCCATGGGAGAAGGAGAATCACGTTAGTACAATTGCCATCACACAAAGTAC
*
13523 TTCAAGATTAACAACAACTAAAGAAAAACTTTGATGCAATGCAAAAAGAACATTGAGAGTAAAAA
261 TTCAAGATTAACAACAACTAAAGAAAAACTTTGATGCTATGCAAAAAGAACATTGAGAGTAAAAA
* *
13588 AGGCATTTGGAGTAGTTGAAAATGAGAATATTGAAGAGATTGAGTGTGAAGAAAATCATGAATTT
326 AGGCATTTGGAGTAGTTGAAAATGAGAATATTGAAGAGATTGAGTGTGAAGAAAACCATGAATGT
*
13653 GAGAGTGGAACTCAAAAAGAACAAGAGTGTAAAGGGAGCATACGAGATGAGTATGAAGAAGAGAA
391 GAGAGTGGAACTCAAAAAGAACAAGAGTGTAAAGGGAGCATACGAGAGGAGTATGAAGAAGAGAA
* *
13718 ATTTCAAAAGGGACATAAGCATGAGAGAAAATAATGTGAGGAGAATGAAATTTGACCTCTATTAA
456 ATTTCAAAAGGGACATGAGCATGAGAGAAAATAATGTGAGGAGAATGAAGTTTGACCTCTATTAA
* * * * **
13783 TCAATC-TTTCTTTATATTATTTCG-TT--TTTGCAGGTTATTCCAAAGGGCATTCAATTTCATT
521 TCAATCTTTTCTTCATATTATTTCGTTTGATTTGCAGGTTATTCCAAAGGGCATGCTATTGCAAA
13844 TTGATGAATCAAATTTGTCCATTGAAGTTCCAAATGATTTAACATTTGGTATTCCAAAACATGTG
586 TTGATGAATCAAATTTGTCCATTGAAGTTCCAAATGATTTAACATTTGGTATTCCAAAACATGTG
*
13909 CTATTTGATATTCTAAGTACGTTCATTCTACATTCAAAGTTCAAACAATCTCAAGAAAGGGAAGT
651 CTCTTTGATATTCTAAGTACGTTCATTCTACATTCAAAGTTCAAACAATCTCAAGAAAGGGAAGT
* *
13974 TTCAATGAACCTATCCAATGTGGACCTTAAAAAAATAAATTCATTTATTCATGAAATTGATTATT
716 TTCAATGAACCTATCCAATGAGGACCTTAAACAAATAAATTCATTTATTCATGAAATTGATTATT
*
14039 TCATTTTCTTTGATTTTGAATTATCTACTTCTTAC
781 TCATTTTCTTTGATTTTGAATTATCTACTTCTAAC
*
14074 TTTGCTTTATTTTTCAGAATGATGATTCGATGAAGATGAAGAGTTAGAAGTCATATAGCAAGTAC
1 TTTGCTTTATTTTTCAGAATGATGATTCGATGAAGATGAAGAGTTAGAAGTCATAGAGCAAGTAC
* *
14139 TTGCACCCTTTTTAATTGGGAGATATGAAGATGAAGTCATGTGCGATGTTGCTTCTATGAATTCA
66 TTGCGCCCTTTTTAATTGGGAGATATGAAGATGAAGTCATGTGCGATGTTGCTTCCATGAATTCA
14204 AGCCATCTACTTCTCGGATGTCCTTGGCACTGTGATAAACGAGCATTGCATGAT-GGTTTTTAAA
131 AGCCATCTACTTCTCGGATGTCCTTGGCACTGTGATAAACGAGCATTGCATGATGGGTTTTTAAA
* *
14268 TCATTTTTCATTCATCCATGGGAGAAGGATAATCACGTTAGTACAATTGCCATCACACAAAGTAC
196 TCATTATTCATTCATCCATGGGAGAAGGAGAATCACGTTAGTACAATTGCCATCACACAAAGTAC
* * *
14333 TTCAAGATTAACAACAACTAAATAAAAACATGGATGCTATGCAAAAAGAACATTGAGAGTAAAAA
261 TTCAAGATTAACAACAACTAAAGAAAAACTTTGATGCTATGCAAAAAGAACATTGAGAGTAAAAA
14398 AGGCATTTGGAGTAGTTGAAAATGAGAATATTGAAGAGATTGAGTGTGAAGAAAACCATGAATGT
326 AGGCATTTGGAGTAGTTGAAAATGAGAATATTGAAGAGATTGAGTGTGAAGAAAACCATGAATGT
*
14463 GAGAGTGGAACTCAAAAAGAACAAGAGTGTAAAGGGAGCATACGATAGGAGTATGAAGAAGAGAA
391 GAGAGTGGAACTCAAAAAGAACAAGAGTGTAAAGGGAGCATACGAGAGGAGTATGAAGAAGAGAA
14528 ATTTCAAAAGGGACATGAGCATGAGAGAAAATAATGTGAGGAGAATGAAGTTTGACCTCTATTAA
456 ATTTCAAAAGGGACATGAGCATGAGAGAAAATAATGTGAGGAGAATGAAGTTTGACCTCTATTAA
* *
14593 TCAATCTTTTCTTCATATTATTTCGTTTGATTTGCAGGTTATTCCAAAGGGCATGCAATT-AAAA
521 TCAATCTTTTCTTCATATTATTTCGTTTGATTTGCAGGTTATTCCAAAGGGCATGCTATTGCAAA
*
14657 TTTGATGAATCAAATTTGTCCATTGAGGTTCCAAATGATTTAACATTTGGTATTCCAAAACATGT
586 -TTGATGAATCAAATTTGTCCATTGAAGTTCCAAATGATTTAACATTTGGTATTCCAAAACATGT
* *
14722 GCTCTTTGATATTCTAAGTACGTTCATTCTACATTCAAAGTTCAAACAATCTCGAGAAAAGGAAG
650 GCTCTTTGATATTCTAAGTACGTTCATTCTACATTCAAAGTTCAAACAATCTCAAGAAAGGGAAG
*
14787 TTTCAATGAACCTATCCAATGTGGACCTTAAACAAATAAATTCATTTATTCATGAAATTGATTAT
715 TTTCAATGAACCTATCCAATGAGGACCTTAAACAAATAAATTCATTTATTCATGAAATTGATTAT
14852 TTCATTTTCTTTGATTTTGAATTATCTACTTCTAAC
780 TTCATTTTCTTTGATTTTGAATTATCTACTTCTAAC
*
14888 TTTGCTTTATTATTCAGAATGATGATTCGATGAAGATGAAGAGTTAGAAGTCATAGAGCAAGTAC
1 TTTGCTTTATTTTTCAGAATGATGATTCGATGAAGATGAAGAGTTAGAAGTCATAGAGCAAGTAC
* *
14953 TTGCGCCCTTTTTAATT-GGAGATATGAAGATGAAGTCACGGGCGATGTTGCTTCCATGAATTCA
66 TTGCGCCCTTTTTAATTGGGAGATATGAAGATGAAGTCATGTGCGATGTTGCTTCCATGAATTCA
*
15017 AGCCATCTACTTCTCGGATATCCTTGGCACTGTGATAAACGAGCATTGCATGATGGGTTTTTAAA
131 AGCCATCTACTTCTCGGATGTCCTTGGCACTGTGATAAACGAGCATTGCATGATGGGTTTTT-AA
*
15082 ATCATTATTCATTCATCCATGGGAGAAGGAGAATCACGTTAGTACAGTTGCCATCACACAAAGTA
195 ATCATTATTCATTCATCCATGGGAGAAGGAGAATCACGTTAGTACAATTGCCATCACACAAAGTA
* *
15147 CTTCAAGATTAACAACAACTAAAGAAAAACTTTGATGCAATGCAAAAAGAACAGTGAGAGTAAAA
260 CTTCAAGATTAACAACAACTAAAGAAAAACTTTGATGCTATGCAAAAAGAACATTGAGAGTAAAA
* *
15212 AAGGCATTTGGAGTAGTTGAAAATGAGAATACTG-A-AGATTGACTGTGAAGAAAACCATGAATG
325 AAGGCATTTGGAGTAGTTGAAAATGAGAATATTGAAGAGATTGAGTGTGAAGAAAACCATGAATG
* *
15275 TGAGAGTGGAACTCAAAAAGAACAAGAGTGTAAAGGGAGAATACGAGATGAGTATGAAGAAGAGA
390 TGAGAGTGGAACTCAAAAAGAACAAGAGTGTAAAGGGAGCATACGAGAGGAGTATGAAGAAGAGA
* * * *
15340 AATTTCAGAAGGGACACGAGCATGATAGAAAATAATGAGA-GAGAATGAAGTTTGACCTCTATTA
455 AATTTCAAAAGGGACATGAGCATGAGAGAAAATAATGTGAGGAGAATGAAGTTTGACCTCTATTA
15404 ATCAATCTTTTCTTCATATTATTTCGTTTGATTTGCAGGTTATTCCAAAGGGCATGCTATTGCAA
520 ATCAATCTTTTCTTCATATTATTTCGTTTGATTTGCAGGTTATTCCAAAGGGCATGCTATTGCAA
15469 ATTGATGAATCAAATTTGTCCATTGAAGTTCCAAATGATTTAACATTTGGTATTCCAAAACATGT
585 ATTGATGAATCAAATTTGTCCATTGAAGTTCCAAATGATTTAACATTTGGTATTCCAAAACATGT
* * *
15534 GCTATTTGATATTCTAAGTACGTTCATTCTACATTCAAAGTTCAAACAATCTCGAGAAAAGGAAG
650 GCTCTTTGATATTCTAAGTACGTTCATTCTACATTCAAAGTTCAAACAATCTCAAGAAAGGGAAG
*
15599 TTTCAATGAACCTATCCAATGTGGACCTTAAACACAAATAAATTCATTTATTCATGAAATTGATT
715 TTTCAATGAACCTATCCAATGAGGACCTT-AA-ACAAATAAATTCATTTATTCATGAAATTGATT
*
15664 ATTTCATTTTCTTTGATTTTGAATTATCTACTTCTTAC
778 ATTTCATTTTCTTTGATTTTGAATTATCTACTTCTAAC
* *
15702 TTTGCTTTATTTTTCAGAATGATGATTCGATGAAGATGAAGAGTTAAAAGTCATATAGCAAGTAC
1 TTTGCTTTATTTTTCAGAATGATGATTCGATGAAGATGAAGAGTTAGAAGTCATAGAGCAAGTAC
* *
15767 TTGCACCCTTTTTAATTGGGAGATATGAAGATGAAGTCATGTGCGATGTTGCTTCTATGAATTCA
66 TTGCGCCCTTTTTAATTGGGAGATATGAAGATGAAGTCATGTGCGATGTTGCTTCCATGAATTCA
15832 AGCCATCTACTTCTCGGATGTCCTTGGCACTGTGATAAACGAGCATTGCATGATGGGTTTTTAAA
131 AGCCATCTACTTCTCGGATGTCCTTGGCACTGTGATAAACGAGCATTGCATGATGGGTTTTTAAA
* *
15897 TCATTTTTCATTCATCCATGGGAGAAGGATAATCACGTTAGTACAATTGCCATCACACAAAGTAC
196 TCATTATTCATTCATCCATGGGAGAAGGAGAATCACGTTAGTACAATTGCCATCACACAAAGTAC
* *
15962 TTCAAGATTAACAACAACTAAATAAAAACTTGGATGCTATGCAAAAAGAACATTGAGAGTAAAAA
261 TTCAAGATTAACAACAACTAAAGAAAAACTTTGATGCTATGCAAAAAGAACATTGAGAGT-AAAA
16027 AAGGCATTTGGAGTAGTTGAAAATGAGAATATTGAAGAGATTGAGTGTGAAGAAAACCATGAATG
325 AAGGCATTTGGAGTAGTTGAAAATGAGAATATTGAAGAGATTGAGTGTGAAGAAAACCATGAATG
*
16092 TGAGAGTGGAACTCAAAAAGAACAAGAGTGTAAAGGGAGCATACGATAGGAGTATGAAGAAGAGA
390 TGAGAGTGGAACTCAAAAAGAACAAGAGTGTAAAGGGAGCATACGAGAGGAGTATGAAGAAGAGA
16157 AATTTCAAAAGGGACATGAGCATGAGAGAAAATAATGTGAGGAGAATGAAGTTTGACCTCTATTA
455 AATTTCAAAAGGGACATGAGCATGAGAGAAAATAATGTGAGGAGAATGAAGTTTGACCTCTATTA
*
16222 ATCAATCTTTTCTTCATATTATTTCGTTTGATTTGCAGGTTATTCCAAAGGCCATGCTATTGCAA
520 ATCAATCTTTTCTTCATATTATTTCGTTTGATTTGCAGGTTATTCCAAAGGGCATGCTATTGCAA
*
16287 ATTGATGAATCAAATTTGTCCATTGAAGTTCCAAATGATTTAACGTTTGGTATTCCAAAACATGT
585 ATTGATGAATCAAATTTGTCCATTGAAGTTCCAAATGATTTAACATTTGGTATTCCAAAACATGT
* * *
16352 GCTCTTTGATATTTTATGTACGTTCATTCTACATTCAAAGTTCAAACAATCTCAAGAAATGGAAG
650 GCTCTTTGATATTCTAAGTACGTTCATTCTACATTCAAAGTTCAAACAATCTCAAGAAAGGGAAG
16417 TTTCAATGAACCTATCCAATGAGGACCTTAAACAAATAAATTCATTTATTCATGAAATTGATTAT
715 TTTCAATGAACCTATCCAATGAGGACCTTAAACAAATAAATTCATTTATTCATGAAATTGATTAT
16482 TTCATTTTCTTTGATTTTGAATTATCTACTTCTAAC
780 TTCATTTTCTTTGATTTTGAATTATCTACTTCTAAC
16518 TTTGCTTTATTTTTCAGAATGATGATTCGATGAAGATGAAGAGTTAGAAGTCATAGAGCAAGTAC
1 TTTGCTTTATTTTTCAGAATGATGATTCGATGAAGATGAAGAGTTAGAAGTCATAGAGCAAGTAC
16583 TTGCGCCCTTTTTAATTGGGAGATATGAAGATGAAGTCATGTGCGATGTTGCTTCCATGAATTCA
66 TTGCGCCCTTTTTAATTGGGAGATATGAAGATGAAGTCATGTGCGATGTTGCTTCCATGAATTCA
16648 AGCCATCTACTTCTCGGATGTCCTTGGCACTGTGATAAACGAGCATTGCATGATGGGTTTTTAAA
131 AGCCATCTACTTCTCGGATGTCCTTGGCACTGTGATAAACGAGCATTGCATGATGGGTTTTTAAA
* *
16713 TCATTATTCATTCATCCATGGGAGAAGGAGAATCACGTTAGAATAATTGCCATCACACAAAGTAC
196 TCATTATTCATTCATCCATGGGAGAAGGAGAATCACGTTAGTACAATTGCCATCACACAAAGTAC
*
16778 TTCAAGATTAACAACAACTAAAGAAAAACTTTGATGCTACGCAAAAAGAACATTGAGAGTAAAAA
261 TTCAAGATTAACAACAACTAAAGAAAAACTTTGATGCTATGCAAAAAGAACATTGAGAGTAAAAA
*
16843 AGGCATTTGGAGTAGTTGAAAATGAGAATATTGAAGAGATTGAGTGTGAAGAAAACCATGAATTT
326 AGGCATTTGGAGTAGTTGAAAATGAGAATATTGAAGAGATTGAGTGTGAAGAAAACCATGAATGT
* *
16908 GAGAGTGGATCTC-AAAAGAACAAGAGTGTAAAGGGAGCATACGAGAGGATTATGAAG-AGAGAA
391 GAGAGTGGAACTCAAAAAGAACAAGAGTGTAAAGGGAGCATACGAGAGGAGTATGAAGAAGAGAA
16971 ATTTCAAAAGGGACATGAGCATGAGAG-AAATAATGTGAGGAGAATGAAGTTTGACCTCTATTAA
456 ATTTCAAAAGGGACATGAGCATGAGAGAAAATAATGTGAGGAGAATGAAGTTTGACCTCTATTAA
*
17035 TCAATCTTTTCTTCATATTATTTCGTTTGATTTGCAGGTTATTCCAAAGGCCATGCTATTGCAAA
521 TCAATCTTTTCTTCATATTATTTCGTTTGATTTGCAGGTTATTCCAAAGGGCATGCTATTGCAAA
*
17100 TTGATGAATCAAATTTGTCCATTGAAGTTCCAAATGATTTAACGTTTGGTATTCCAAAACATGTG
586 TTGATGAATCAAATTTGTCCATTGAAGTTCCAAATGATTTAACATTTGGTATTCCAAAACATGTG
* *
17165 CTCTTTGATATTTTATGTACGTTCATTCTACATTCAAAGTTCAAACAATCTCAAGAAAGGGAAGT
651 CTCTTTGATATTCTAAGTACGTTCATTCTACATTCAAAGTTCAAACAATCTCAAGAAAGGGAAGT
17230 TTCAATGAACCTATCCAATGAGGACCTTAAAC-AATAAATTCATTTATTCATGAAATTGATTATT
716 TTCAATGAACCTATCCAATGAGGACCTTAAACAAATAAATTCATTTATTCATGAAATTGATTATT
*
17294 TCATTTTATTTGATTTTGAATTATCTACTTCTAAC
781 TCATTTTCTTTGATTTTGAATTATCTACTTCTAAC
17329 TTTGCTTTATTTTTCAGAATGATGATTCGATGAAGATGAAGAGTTAGAAGTCATAGAGCAAGTAC
1 TTTGCTTTATTTTTCAGAATGATGATTCGATGAAGATGAAGAGTTAGAAGTCATAGAGCAAGTAC
*
17394 TTGCGCCCTTTTTAATTGGGAGATATGAAAATGAAGTCATGTGCGATGTTGCTTCCATGAATTCA
66 TTGCGCCCTTTTTAATTGGGAGATATGAAGATGAAGTCATGTGCGATGTTGCTTCCATGAATTCA
17459 AGCCATCTACTTCTCGGATGTCCTTGGCACTGTGATAAACGAGCATTGCATGATGGGTTTTTAAA
131 AGCCATCTACTTCTCGGATGTCCTTGGCACTGTGATAAACGAGCATTGCATGATGGGTTTTTAAA
* *
17524 TCATTATTCATTCATCCATGGGAGAAGGAGAATCACGTTAGAATAATTGCCATCACACAAAGTAC
196 TCATTATTCATTCATCCATGGGAGAAGGAGAATCACGTTAGTACAATTGCCATCACACAAAGTAC
*
17589 TTCAAGATTAACAACAACTAAAGAAAAACTTTGATGCTACGC-AAAAGAACATTGAGAGT-AAAA
261 TTCAAGATTAACAACAACTAAAGAAAAACTTTGATGCTATGCAAAAAGAACATTGAGAGTAAAAA
17652 AGGCATTTGGAGTAGTTGAAAATGAG-A-ATTGAAGAGATTGAGTGTGAAGAAAACCATGAATGT
326 AGGCATTTGGAGTAGTTGAAAATGAGAATATTGAAGAGATTGAGTGTGAAGAAAACCATGAATGT
*
17715 GAGAGTGGAACTC-AAAAGAACAAGAGTGTAAAGGGAGCATACGATAGGAGTATGAAGAAGAGAA
391 GAGAGTGGAACTCAAAAAGAACAAGAGTGTAAAGGGAGCATACGAGAGGAGTATGAAGAAGAGAA
17779 ATTTCAAAAGGGACATGAGCATGAGAGAAAATAATGTGAGGAGAATGAAGTTTGACCTC--TTAA
456 ATTTCAAAAGGGACATGAGCATGAGAGAAAATAATGTGAGGAGAATGAAGTTTGACCTCTATTAA
*
17842 TCAATCTTTTCTTCATATTATTTCGTTTGATTTGCAGGTTATTCCAAAGGCCATGCTATTGCAAA
521 TCAATCTTTTCTTCATATTATTTCGTTTGATTTGCAGGTTATTCCAAAGGGCATGCTATTGCAAA
*
17907 TTGATGAATCAAATTTGTCCATTGAAGTTCCAAATGATTTAACGTTTGGTATTCCAAAACATGTG
586 TTGATGAATCAAATTTGTCCATTGAAGTTCCAAATGATTTAACATTTGGTATTCCAAAACATGTG
* * *
17972 CTCTTTGATATTTTATGTACGTTCATTCTACATTCAAAGTTCAAACAATCTAAAGAAAGGGAAGT
651 CTCTTTGATATTCTAAGTACGTTCATTCTACATTCAAAGTTCAAACAATCTCAAGAAAGGGAAGT
18037 TTCAATGAACCTATCCAATGAGGACCTTAAACAAATAAATTCATTTATTCATGAAATTGATTATT
716 TTCAATGAACCTATCCAATGAGGACCTTAAACAAATAAATTCATTTATTCATGAAATTGATTATT
*
18102 TCATTTTATTTGATTTTGAATTATCTACTTCTAAC
781 TCATTTTCTTTGATTTTGAATTATCTACTTCTAAC
18137 TTTGCTTTATTTTTCAGAATGATGATTCGATGAAGATGAAGAGTTAGAAGTCATAGAGCAAGTAC
1 TTTGCTTTATTTTTCAGAATGATGATTCGATGAAGATGAAGAGTTAGAAGTCATAGAGCAAGTAC
18202 TTGCGCCCTTTTTAATTGGGAGATATGAAGATGAAGTCATGTGCGATGTTGCTTCCATGAATTCA
66 TTGCGCCCTTTTTAATTGGGAGATATGAAGATGAAGTCATGTGCGATGTTGCTTCCATGAATTCA
18267 AGCCATCTACTTCTCGGATGTCCTTGGCACTGTGATAAACGAGCATTGCATGATGGGTTTTTAAA
131 AGCCATCTACTTCTCGGATGTCCTTGGCACTGTGATAAACGAGCATTGCATGATGGGTTTTTAAA
* * *
18332 TCATTATTCATTCATCCATGGGAGAAGGAGAATCACGTTAGAATAATTTCCATCACACAAAGTAC
196 TCATTATTCATTCATCCATGGGAGAAGGAGAATCACGTTAGTACAATTGCCATCACACAAAGTAC
* *
18397 TTCAAGATTAACAACAACTAAAGAAAAACTTTGATGCTACGCAAAAAGAACATTGAGAGTAAAAC
261 TTCAAGATTAACAACAACTAAAGAAAAACTTTGATGCTATGCAAAAAGAACATTGAGAGTAAAAA
*
18462 AGGCATTTGGAGTAGTTGAAAATGAGAATATTGAAGAGATTGAGTGTGAAGAAAACCATGAATTT
326 AGGCATTTGGAGTAGTTGAAAATGAGAATATTGAAGAGATTGAGTGTGAAGAAAACCATGAATGT
*
18527 GAGAGTGGAACTCAAAAAGAACAAGAGTGTAAAGGGAGCATACGAGAGGATTATGAAGAAGAGAA
391 GAGAGTGGAACTCAAAAAGAACAAGAGTGTAAAGGGAGCATACGAGAGGAGTATGAAGAAGAGAA
18592 ATTTC-AAAGGGACATGAGCATGAGAGAAAATAATGTGAGGAGAATGAAGTTTGACCTCTATTAA
456 ATTTCAAAAGGGACATGAGCATGAGAGAAAATAATGTGAGGAGAATGAAGTTTGACCTCTATTAA
*
18656 TCAATCTTTTCTTCATATTATTTCGTTTGATTTGCAGGTTATTCCAAAGGCCATGCTATTGCAAA
521 TCAATCTTTTCTTCATATTATTTCGTTTGATTTGCAGGTTATTCCAAAGGGCATGCTATTGCAAA
* *
18721 TTGATTAATCAAATTTGTCCATTGAAGTTCCAAATGATTTAACGTTTGGTATTCCAAAACATGTG
586 TTGATGAATCAAATTTGTCCATTGAAGTTCCAAATGATTTAACATTTGGTATTCCAAAACATGTG
* *
18786 CTCTTTGATATTTTATGTACGTTCATTCTACATTCAAAGTTCAAACAATCTCAAGAAAGGGAAGT
651 CTCTTTGATATTCTAAGTACGTTCATTCTACATTCAAAGTTCAAACAATCTCAAGAAAGGGAAGT
18851 TTCAATGAACCTATCCAATGAGGACCTTAAACAAATAAATTCATTTATTCATGAAATTGATTATT
716 TTCAATGAACCTATCCAATGAGGACCTTAAACAAATAAATTCATTTATTCATGAAATTGATTATT
18916 TCATTTTCTTTGATTTTGAATTATCTACTTCTAAC
781 TCATTTTCTTTGATTTTGAATTATCTACTTCTAAC
*
18951 TTTGATTTATTTTTCAGAATGATGATTCGATGAAGATGAAGAGTTAGAAGTCATAGAGCAAGTAC
1 TTTGCTTTATTTTTCAGAATGATGATTCGATGAAGATGAAGAGTTAGAAGTCATAGAGCAAGTAC
19016 TTGCGCCCTTTTTAATTGGGAGATATGAAGATGAAGTCATGTGCGATGTTGCTTCCATGAATTCA
66 TTGCGCCCTTTTTAATTGGGAGATATGAAGATGAAGTCATGTGCGATGTTGCTTCCATGAATTCA
19081 AGCCATCTACTTCTCGGATGTCCTTGGCACTGTGATAAACGAGCATTGCATGATGGGTTTTTAAA
131 AGCCATCTACTTCTCGGATGTCCTTGGCACTGTGATAAACGAGCATTGCATGATGGGTTTTTAAA
* * *
19146 TCATTATTCATTCATCCATGGGAGAAGGAGAATCACGTTAGAATAATTGCCATCACACAAACTAC
196 TCATTATTCATTCATCCATGGGAGAAGGAGAATCACGTTAGTACAATTGCCATCACACAAAGTAC
* *
19211 TTCAAGATTAACAACAACTAAAGAAAAACTTTGATGCTACGCAAAAAGAACATTGAGAGTAAAAC
261 TTCAAGATTAACAACAACTAAAGAAAAACTTTGATGCTATGCAAAAAGAACATTGAGAGTAAAAA
*
19276 AGGCATTTGGAGTAGTTGAAAATGAGAATATTGAAGAGATTGAGTGTGAAGAAAAACCATGAATT
326 AGGCATTTGGAGTAGTTGAAAATGAGAATATTGAAGAGATTGAGTGTGAAG-AAAACCATGAATG
*
19341 TGAGAGTGGAACTCAAAAAGAACAAGAGTGTAAAGGGAGCATACGAGATGAGTATGAAGAAGAGA
390 TGAGAGTGGAACTCAAAAAGAACAAGAGTGTAAAGGGAGCATACGAGAGGAGTATGAAGAAGAGA
*
19406 AATTTCAAAAGGGACATAAGCATGAGAGAAAATAATGTGAGGAGAATGAAGTTTGACCTCTATTA
455 AATTTCAAAAGGGACATGAGCATGAGAGAAAATAATGTGAGGAGAATGAAGTTTGACCTCTATTA
*
19471 ATCAATCTTTTCTTCATATTATTTCGTTTGATTTGCAGGTTATTCCAAAGGCCATGCTATTGCAA
520 ATCAATCTTTTCTTCATATTATTTCGTTTGATTTGCAGGTTATTCCAAAGGGCATGCTATTGCAA
* *
19536 ATTGATTAATCAAATTTGTCCATTGAAGTTCCAAATGATTTAACGTTTGGTATTCCAAAACATGT
585 ATTGATGAATCAAATTTGTCCATTGAAGTTCCAAATGATTTAACATTTGGTATTCCAAAACATGT
* *
19601 GCTCTTTGATATTTTATGTACGTTCATTCTACATTCAAAGTTCAAACAATCTCAAGAAAGGGAAG
650 GCTCTTTGATATTCTAAGTACGTTCATTCTACATTCAAAGTTCAAACAATCTCAAGAAAGGGAAG
*
19666 TTTCAATGAACCTATCCAATGAGCACCTTAAACAAATAAATTCATTTATTCATGAAATTGATTAT
715 TTTCAATGAACCTATCCAATGAGGACCTTAAACAAATAAATTCATTTATTCATGAAATTGATTAT
*
19731 TTCATTTTATTTGATTTTGAATTATCTACTTCTAAC
780 TTCATTTTCTTTGATTTTGAATTATCTACTTCTAAC
19767 TTTGCTTTATTTTTCAGAATGATGATTCGATGAAGATGAAGAGTTAGAAGTCATAGAGCAAGTAC
1 TTTGCTTTATTTTTCAGAATGATGATTCGATGAAGATGAAGAGTTAGAAGTCATAGAGCAAGTAC
19832 TTGCGCCCTTTTTAATTGGGAGATATGAAGATGAAGTCATGTGCGATGTTGCTTCCATGAATTCA
66 TTGCGCCCTTTTTAATTGGGAGATATGAAGATGAAGTCATGTGCGATGTTGCTTCCATGAATTCA
19897 AGCCATCTACTTCTCGGATGTCCTTGGCACTGTGATAAACGAGCATTGCATGATGGGTTTTTAAA
131 AGCCATCTACTTCTCGGATGTCCTTGGCACTGTGATAAACGAGCATTGCATGATGGGTTTTTAAA
* * *
19962 TCATTATTCATTCATCCATGGGAGAAGGAGAATCACGTTAGAATAATTGCCATCACACAAACTAC
196 TCATTATTCATTCATCCATGGGAGAAGGAGAATCACGTTAGTACAATTGCCATCACACAAAGTAC
* *
20027 TTCAAGATTAACAACAACTAAAGAAAAACTTTGATGCTACGCAAAAAGAACATTGAGAGTAAAAC
261 TTCAAGATTAACAACAACTAAAGAAAAACTTTGATGCTATGCAAAAAGAACATTGAGAGTAAAAA
*
20092 AGGCATTTGGAGTAGTTGAAAATGAGAATATTGAAGAGATTGAGTGTGAAGAAAACCATGAATTT
326 AGGCATTTGGAGTAGTTGAAAATGAGAATATTGAAGAGATTGAGTGTGAAGAAAACCATGAATGT
* *
20157 GAGAGTGGAACTCAATAAGAACAAGAGTGTAAAGGGAGCATACGAGATGAGTATGAAGAAGAGAA
391 GAGAGTGGAACTCAAAAAGAACAAGAGTGTAAAGGGAGCATACGAGAGGAGTATGAAGAAGAGAA
*
20222 ATTTCAAAAGGGACATAAGCATGAGAGAAAATAATGTGAGGAGAATGAAGTTTGACCTCTATTAA
456 ATTTCAAAAGGGACATGAGCATGAGAGAAAATAATGTGAGGAGAATGAAGTTTGACCTCTATTAA
* * * * *
20287 TCAATCTTTTCTTTATATTATTTCGTTTGATTTGCAGGTTATTCCAAAGGGCATTCAATTTCAAT
521 TCAATCTTTTCTTCATATTATTTCGTTTGATTTGCAGGTTATTCCAAAGGGCATGCTATTGCAAA
20352 TTGATGAATCAAATTTGTCCATTGAAGTTCCAAATGATTTAACATTTGGTATTCC-AAACATGTG
586 TTGATGAATCAAATTTGTCCATTGAAGTTCCAAATGATTTAACATTTGGTATTCCAAAACATGTG
* *
20416 CTATTTGATATTCTAAGTACGTTCATTCTACATTCAAAGTTCAAAC-ATCTCAAGAAAAGGAAGT
651 CTCTTTGATATTCTAAGTACGTTCATTCTACATTCAAAGTTCAAACAATCTCAAGAAAGGGAAGT
*
20480 TTCAATGAACCTATCCAATGTGGACCTTAAACAAATAAATTCATTTATTCATGAAATTGATTATT
716 TTCAATGAACCTATCCAATGAGGACCTTAAACAAATAAATTCATTTATTCATGAAATTGATTATT
20545 TCATTTTCTTTGATTTTGAATTATCTACTTCTAAC
781 TCATTTTCTTTGATTTTGAATTATCTACTTCTAAC
*
20580 TTTGATTTATTTTTCAGAATGATGATTCGATGAAGATGAAGAGTTAGAAGTCATAGAGCAAGTAC
1 TTTGCTTTATTTTTCAGAATGATGATTCGATGAAGATGAAGAGTTAGAAGTCATAGAGCAAGTAC
* *
20645 TTACGCCCTTTTTAATTGGGAGATATGAAGATGAAGTCATGTGCGATGTTGCTTCTATGAATTCA
66 TTGCGCCCTTTTTAATTGGGAGATATGAAGATGAAGTCATGTGCGATGTTGCTTCCATGAATTCA
20710 AGCCATCTACTTCTCGGATGTCCTTGGCACTGTGATAAACGAGCATTGCATGATGGGTTTTTAAA
131 AGCCATCTACTTCTCGGATGTCCTTGGCACTGTGATAAACGAGCATTGCATGATGGGTTTTTAAA
20775 TCATTATTCATTCATCCATGGGAGAAGGAGAATCACGTTAGTACAATTGCCATCACACAAAGTAC
196 TCATTATTCATTCATCCATGGGAGAAGGAGAATCACGTTAGTACAATTGCCATCACACAAAGTAC
*
20840 TTCAAGATTAACAACAACTAAAGAAAAACTTTGATGCAATGCAAAAAGAACATTGAGAGTAAAAA
261 TTCAAGATTAACAACAACTAAAGAAAAACTTTGATGCTATGCAAAAAGAACATTGAGAGTAAAAA
20905 AGGCATTTGGAGTAGTTGAAAATGAGAATATTGAAGAGATTGAGTGTGAAGAAAACCATGAATGT
326 AGGCATTTGGAGTAGTTGAAAATGAGAATATTGAAGAGATTGAGTGTGAAGAAAACCATGAATGT
*
20970 GAGAGTGGAACTCAAAAAGAACAAGAGTGTAAAGGGAGCATACGAGATGAGTATGAAGAAGAGAA
391 GAGAGTGGAACTCAAAAAGAACAAGAGTGTAAAGGGAGCATACGAGAGGAGTATGAAGAAGAGAA
*
21035 ATTTCAAAAGGGACATAAGCATGAGAG-AAAT-ATGTGAGGAGAATGAAGTTTGACCTCTATTAA
456 ATTTCAAAAGGGACATGAGCATGAGAGAAAATAATGTGAGGAGAATGAAGTTTGACCTCTATTAA
* * * * **
21098 TCAATCTTTTCTTTATATTATTTCGTTTGATTTGCAGGTTATTCCAAAGGGCATTCAATTTCATT
521 TCAATCTTTTCTTCATATTATTTCGTTTGATTTGCAGGTTATTCCAAAGGGCATGCTATTGCAAA
21163 TTGATGAATCAAATTTGTCCATTGAAGTTCCAAATGATTTAACATTTGGTATTCCAAAACA-GTG
586 TTGATGAATCAAATTTGTCCATTGAAGTTCCAAATGATTTAACATTTGGTATTCCAAAACATGTG
*
21227 CT-ATTGATATTCTAAGTACGTTCATTCTACATTCAAAGTTCAAACAATCTCAAGAAAGGGAAGT
651 CTCTTTGATATTCTAAGTACGTTCATTCTACATTCAAAGTTCAAACAATCTCAAGAAAGGGAAGT
* *
21291 TTCAATGAACCTATCCAATGTGGACCTTAAAAAAATAAATTCATTTATTCATGAAATTGATTATT
716 TTCAATGAACCTATCCAATGAGGACCTTAAACAAATAAATTCATTTATTCATGAAATTGATTATT
*
21356 TCATTTTCTTTGATTTTGAATTATCTACTTCTTAC
781 TCATTTTCTTTGATTTTGAATTATCTACTTCTAAC
*
21391 TTTGCTTTATTTTTCAGAATGATGATTCGATGAAGATGAAGAGTTAGAAGTCATATAGCAAGTAC
1 TTTGCTTTATTTTTCAGAATGATGATTCGATGAAGATGAAGAGTTAGAAGTCATAGAGCAAGTAC
* *
21456 TTGCACCCTTTTTAATTGGGAGATATGAAGATGAAGTCATGTGCGATGTTGCTTCTATGAATTCA
66 TTGCGCCCTTTTTAATTGGGAGATATGAAGATGAAGTCATGTGCGATGTTGCTTCCATGAATTCA
21521 AGCCATCTACTTCTCGGATGTCCTTGGCACTGTGATAAACGAGCATTGCATGATGGGTTTTT-AA
131 AGCCATCTACTTCTCGGATGTCCTTGGCACTGTGATAAACGAGCATTGCATGATGGGTTTTTAAA
*
21585 TCATT-TTCATTCATCCATGGGAGAAGGATAATCACGTTAGTACAATTGCCATCACACAAAGTAC
196 TCATTATTCATTCATCCATGGGAGAAGGAGAATCACGTTAGTACAATTGCCATCACACAAAGTAC
* * *
21649 TTCAAGATTAACAACAACTAAA-TAAAACATGGATGCTATGC-AAAAGAACATTGAGAGT-AAAA
261 TTCAAGATTAACAACAACTAAAGAAAAACTTTGATGCTATGCAAAAAGAACATTGAGAGTAAAAA
21711 AGGCATTTGGAGTAGTTGAAAATGAGAATATTGAAGAGATTGAGTGTGAAG-AAACCATGAATGT
326 AGGCATTTGGAGTAGTTGAAAATGAGAATATTGAAGAGATTGAGTGTGAAGAAAACCATGAATGT
*
21775 GAGAGTGGAACTCAAAAAGAACAAGAGTGT-AAGGGAGCATACGATA-G-GTATGAAGAAGAG-A
391 GAGAGTGGAACTCAAAAAGAACAAGAGTGTAAAGGGAGCATACGAGAGGAGTATGAAGAAGAGAA
21836 A-TTCAAAAGGGACATGAGCATGAGAGAAAATAATGTGAGGAGAATGAAGTTTGACCTCTATTAA
456 ATTTCAAAAGGGACATGAGCATGAGAGAAAATAATGTGAGGAGAATGAAGTTTGACCTCTATTAA
* *
21900 TCAATCTTTTCTTCATATTATTTCGTTTGATTTGCAGGTT-TTCCAAAGGGCATGCAATT-AAAA
521 TCAATCTTTTCTTCATATTATTTCGTTTGATTTGCAGGTTATTCCAAAGGGCATGCTATTGCAAA
*
21963 TTTGATGAATCAAA-TT-TCCATTGAGGTTCCAAATGATTTAACATTTGGTATTCCAAAACATGT
586 -TTGATGAATCAAATTTGTCCATTGAAGTTCCAAATGATTTAACATTTGGTATTCCAAAACATGT
* *
22026 GCTCTTTGATATTCTAAGTACGTTCATTCTACATTCAAAGTTCAAACAATCTCGAGAAAAGGAAG
650 GCTCTTTGATATTCTAAGTACGTTCATTCTACATTCAAAGTTCAAACAATCTCAAGAAAGGGAAG
*
22091 TTTCAATGAACCTATCCAATGTGGACCTTAAACAAATAAATTCATTTATTCATGAAATTGATTA-
715 TTTCAATGAACCTATCCAATGAGGACCTTAAACAAATAAATTCATTTATTCATGAAATTGATTAT
22155 TTCATTTTCTTTGATTTTGAATTATCTACTTCT-AC
780 TTCATTTTCTTTGATTTTGAATTATCTACTTCTAAC
*
22190 TTTGCTTTA-TATTC-GAATGATGATTCGATGAAGATGAAGAAGTTAG-AGTCATAGAGCAAGTA
1 TTTGCTTTATTTTTCAGAATGATGATTCGATGAAGATGAAG-AGTTAGAAGTCATAGAGCAAGTA
* *
22252 CTTGCGCCCTTTTTAA-TGGGAGATATGAAGATGAAGTCACGGGCGATGTTGCTTCCATGAATTC
65 CTTGCGCCCTTTTTAATTGGGAGATATGAAGATGAAGTCATGTGCGATGTTGCTTCCATGAATTC
*
22316 AAGCC-TCTACTTCTCTCGGATATCCTTGGCACTGTGAT-AACGAGCATTGCATGATGGGTTTTT
130 AAGCCATCTAC-T-TCTCGGATGTCCTTGGCACTGTGATAAACGAGCATTGCATGATGGGTTTTT
22379 AAAATCATTATTCATTCATCCATGGGAGAAGGAGAATCACG-TAGTACAATTGCCATCACACAAA
193 -AAATCATTATTCATTCATCCATGGGAGAAGGAGAATCACGTTAGTACAATTGCCATCACACAAA
*
22443 GTACTTCAAGATTAACAACAACT-AAG---AAC-TTGATGC-ATGC-AAAA-AACAGTGAGAGTA
257 GTACTTCAAGATTAACAACAACTAAAGAAAAACTTTGATGCTATGCAAAAAGAACATTGAGAGTA
* *
22500 AAAAAGGCATTTGGAGTAGTTGAAAATGAGAATACTGAAGAGATTG-CTGTGAAGAAAACCATGA
322 AAAAAGGCATTTGGAGTAGTTGAAAATGAGAATATTGAAGAGATTGAGTGTGAAGAAAACCATGA
* *
22564 ATGTGAGAGTGGAACTCAAAAAGAACAAGAGTG--AA-GGAGAATAC--GATGAGTATGAAGAAG
387 ATGTGAGAGTGGAACTCAAAAAGAACAAGAGTGTAAAGGGAGCATACGAGAGGAGTATGAAGAAG
* * * *
22624 AGAAATTTCAGAAGGGACACGAGCATGATAG-AAA-AATGAGAGGAGAATGAAGTTTGACCTCTA
452 AGAAATTTCAAAAGGGACATGAGCATGAGAGAAAATAATGTGAGGAGAATGAAGTTTGACCTCTA
22687 TTAATCAATCTTTTCTTCATATTATTTCGTTTGATTTGCAGGTTA
517 TTAATCAATCTTTTCTTCATATTATTTCGTTTGATTTGCAGGTTA
Statistics
Matches: 9187, Mismatches: 228, Indels: 125
0.96 0.02 0.01
Matches are distributed among these distances:
789 1 0.00
790 1 0.00
791 93 0.01
792 25 0.00
793 117 0.01
794 6 0.00
795 8 0.00
796 76 0.01
797 81 0.01
798 63 0.01
799 84 0.01
800 65 0.01
801 158 0.02
802 84 0.01
803 1 0.00
804 15 0.00
805 43 0.00
806 55 0.01
807 336 0.04
808 416 0.05
809 291 0.03
810 724 0.08
811 1210 0.13
812 691 0.08
813 983 0.11
814 1371 0.15
815 717 0.08
816 1105 0.12
817 127 0.01
818 240 0.03
ACGTcount: A:0.36, C:0.14, G:0.19, T:0.31
Consensus pattern (815 bp):
TTTGCTTTATTTTTCAGAATGATGATTCGATGAAGATGAAGAGTTAGAAGTCATAGAGCAAGTAC
TTGCGCCCTTTTTAATTGGGAGATATGAAGATGAAGTCATGTGCGATGTTGCTTCCATGAATTCA
AGCCATCTACTTCTCGGATGTCCTTGGCACTGTGATAAACGAGCATTGCATGATGGGTTTTTAAA
TCATTATTCATTCATCCATGGGAGAAGGAGAATCACGTTAGTACAATTGCCATCACACAAAGTAC
TTCAAGATTAACAACAACTAAAGAAAAACTTTGATGCTATGCAAAAAGAACATTGAGAGTAAAAA
AGGCATTTGGAGTAGTTGAAAATGAGAATATTGAAGAGATTGAGTGTGAAGAAAACCATGAATGT
GAGAGTGGAACTCAAAAAGAACAAGAGTGTAAAGGGAGCATACGAGAGGAGTATGAAGAAGAGAA
ATTTCAAAAGGGACATGAGCATGAGAGAAAATAATGTGAGGAGAATGAAGTTTGACCTCTATTAA
TCAATCTTTTCTTCATATTATTTCGTTTGATTTGCAGGTTATTCCAAAGGGCATGCTATTGCAAA
TTGATGAATCAAATTTGTCCATTGAAGTTCCAAATGATTTAACATTTGGTATTCCAAAACATGTG
CTCTTTGATATTCTAAGTACGTTCATTCTACATTCAAAGTTCAAACAATCTCAAGAAAGGGAAGT
TTCAATGAACCTATCCAATGAGGACCTTAAACAAATAAATTCATTTATTCATGAAATTGATTATT
TCATTTTCTTTGATTTTGAATTATCTACTTCTAAC
Done.