Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: VEPZ01007263.1 Hibiscus syriacus cultivar Beakdansim tig00019250_pilon, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Pmatch=0.80,Pindel=0.10
tuple sizes 0,4,5,7
tuple distances 0, 29, 159, 1000
Length: 22226
ACGTcount: A:0.26, C:0.12, G:0.27, T:0.35
Found at i:1193 original size:16 final size:16
Alignment explanation
Indices: 1147--1196 Score: 59
Period size: 15 Copynumber: 3.1 Consensus size: 16
1137 AATTTATCGA
*
1147 CCGAAAATTCCGGGTAT
1 CCGAAAA-TCCGGGTAC
1164 CC-AGAAAT-CGGGTAC
1 CCGA-AAATCCGGGTAC
1179 CCGAAAATCCGGGTAC
1 CCGAAAATCCGGGTAC
1195 CC
1 CC
1197 AGATTTGCAC
Statistics
Matches: 29, Mismatches: 1, Indels: 7
0.78 0.03 0.19
Matches are distributed among these distances:
15 12 0.41
16 12 0.41
17 5 0.17
ACGTcount: A:0.30, C:0.30, G:0.24, T:0.16
Consensus pattern (16 bp):
CCGAAAATCCGGGTAC
Found at i:10301 original size:40 final size:40
Alignment explanation
Indices: 10241--10334 Score: 129
Period size: 40 Copynumber: 2.4 Consensus size: 40
10231 AATATTAAGA
*
10241 AAAATATCACA-TTTTTTATTGTAAAGTG-AAATGTTATT
1 AAAATATCATATTTTTTTATTGTAAAGTGAAAATGTTATT
* * *
10279 AAAATTTTCATATTTTTTTATTGTTAATTGAAAATGTTATT
1 AAAA-TATCATATTTTTTTATTGTAAAGTGAAAATGTTATT
10320 AAAATATCATATTTT
1 AAAATATCATATTTT
10335 AAATTATGTA
Statistics
Matches: 48, Mismatches: 5, Indels: 4
0.84 0.09 0.07
Matches are distributed among these distances:
38 4 0.08
39 5 0.10
40 25 0.52
41 14 0.29
ACGTcount: A:0.38, C:0.04, G:0.07, T:0.50
Consensus pattern (40 bp):
AAAATATCATATTTTTTTATTGTAAAGTGAAAATGTTATT
Found at i:10966 original size:14 final size:14
Alignment explanation
Indices: 10947--10995 Score: 62
Period size: 14 Copynumber: 3.4 Consensus size: 14
10937 AAATAACGAA
*
10947 AAATATTAAATATT
1 AAATATTATATATT
10961 AAATATTATATATAT
1 AAATATTATATAT-T
*
10976 ATATATATATATATT
1 AAATAT-TATATATT
10991 AAATA
1 AAATA
10996 CATATTTTAA
Statistics
Matches: 30, Mismatches: 3, Indels: 3
0.83 0.08 0.08
Matches are distributed among these distances:
14 12 0.40
15 11 0.37
16 7 0.23
ACGTcount: A:0.55, C:0.00, G:0.00, T:0.45
Consensus pattern (14 bp):
AAATATTATATATT
Found at i:11242 original size:30 final size:30
Alignment explanation
Indices: 11208--11270 Score: 126
Period size: 30 Copynumber: 2.1 Consensus size: 30
11198 AAAAAAAAAA
11208 TTGGTTCAATTAAAGGTTAAAGAAAAAAGT
1 TTGGTTCAATTAAAGGTTAAAGAAAAAAGT
11238 TTGGTTCAATTAAAGGTTAAAGAAAAAAGT
1 TTGGTTCAATTAAAGGTTAAAGAAAAAAGT
11268 TTG
1 TTG
11271 ATTAATTTGG
Statistics
Matches: 33, Mismatches: 0, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
30 33 1.00
ACGTcount: A:0.44, C:0.03, G:0.21, T:0.32
Consensus pattern (30 bp):
TTGGTTCAATTAAAGGTTAAAGAAAAAAGT
Found at i:11277 original size:29 final size:30
Alignment explanation
Indices: 11212--11277 Score: 116
Period size: 30 Copynumber: 2.2 Consensus size: 30
11202 AAAAAATTGG
*
11212 TTCAATTAAAGGTTAAAGAAAAAAGTTTGG
1 TTCAATTAAAGGTTAAAGAAAAAAGTTTGA
11242 TTCAATTAAAGGTTAAAGAAAAAAGTTTGA
1 TTCAATTAAAGGTTAAAGAAAAAAGTTTGA
11272 TT-AATT
1 TTCAATT
11278 TGGTTAATGG
Statistics
Matches: 35, Mismatches: 1, Indels: 1
0.95 0.03 0.03
Matches are distributed among these distances:
29 4 0.11
30 31 0.89
ACGTcount: A:0.47, C:0.03, G:0.17, T:0.33
Consensus pattern (30 bp):
TTCAATTAAAGGTTAAAGAAAAAAGTTTGA
Found at i:13535 original size:16 final size:16
Alignment explanation
Indices: 13512--13566 Score: 67
Period size: 15 Copynumber: 3.4 Consensus size: 16
13502 GGTGTGCAAA
13512 TCCGGGTACCCGGATT
1 TCCGGGTACCCGGATT
*
13528 TTCGGGTACCC-GATT
1 TCCGGGTACCCGGATT
* *
13543 TCCGGATACCCGGAACT
1 TCCGGGTACCCGG-ATT
13560 TCCGGGT
1 TCCGGGT
13567 CGACAATTTC
Statistics
Matches: 32, Mismatches: 5, Indels: 3
0.80 0.12 0.08
Matches are distributed among these distances:
15 13 0.41
16 11 0.34
17 8 0.25
ACGTcount: A:0.15, C:0.31, G:0.29, T:0.25
Consensus pattern (16 bp):
TCCGGGTACCCGGATT
Found at i:13643 original size:17 final size:17
Alignment explanation
Indices: 13594--13645 Score: 54
Period size: 17 Copynumber: 3.2 Consensus size: 17
13584 GTGTCCCAAT
*
13594 CCGGATGTTACGGGTAC
1 CCGGATATTACGGGTAC
* *
13611 CCGG-TAAT-CAGGTAC
1 CCGGATATTACGGGTAC
*
13626 CCGGATTTTACGGGTAC
1 CCGGATATTACGGGTAC
13643 CCG
1 CCG
13646 ATACCCAGTT
Statistics
Matches: 27, Mismatches: 6, Indels: 4
0.73 0.16 0.11
Matches are distributed among these distances:
15 10 0.37
16 4 0.15
17 13 0.48
ACGTcount: A:0.19, C:0.27, G:0.31, T:0.23
Consensus pattern (17 bp):
CCGGATATTACGGGTAC
Found at i:14170 original size:7 final size:7
Alignment explanation
Indices: 14029--14170 Score: 202
Period size: 7 Copynumber: 20.9 Consensus size: 7
14019 GGGCTCGGGG
*
14029 CGGGGCC
1 CGGGGTC
*
14036 CGGGGCC
1 CGGGGTC
14043 CGGGG-C
1 CGGGGTC
*
14049 CGGGGCC
1 CGGGGTC
14056 CGGGG-C
1 CGGGGTC
14062 CGGGG-C
1 CGGGGTC
*
14068 CGGGGCC
1 CGGGGTC
*
14075 CGGGGCC
1 CGGGGTC
14082 CGGGGTC
1 CGGGGTC
14089 CGGGGTC
1 CGGGGTC
*
14096 CGGGGCC
1 CGGGGTC
14103 CGGGG-C
1 CGGGGTC
14109 CGGGGTC
1 CGGGGTC
14116 CGGGGTC
1 CGGGGTC
14123 CGGGGTC
1 CGGGGTC
14130 CGGGGTC
1 CGGGGTC
14137 CGGGGTC
1 CGGGGTC
14144 CGGGGTC
1 CGGGGTC
14151 CGGGGTC
1 CGGGGTC
14158 CGGGGTC
1 CGGGGTC
14165 CGGGGT
1 CGGGGT
14171 TTAGGGTTTG
Statistics
Matches: 130, Mismatches: 2, Indels: 6
0.94 0.01 0.04
Matches are distributed among these distances:
6 24 0.18
7 106 0.82
ACGTcount: A:0.00, C:0.33, G:0.59, T:0.08
Consensus pattern (7 bp):
CGGGGTC
Found at i:14958 original size:8 final size:7
Alignment explanation
Indices: 14167--22226 Score: 12294
Period size: 7 Copynumber: 1191.7 Consensus size: 7
14157 CCGGGGTCCG
14167 GGGTTTA
1 GGGTTTA
14174 GGGTTT-
1 GGGTTTA
14180 GGGTTTA
1 GGGTTTA
14187 GGGTTTA
1 GGGTTTA
14194 GGGTTTA
1 GGGTTTA
14201 GGGTTTA
1 GGGTTTA
14208 GGGTTTA
1 GGGTTTA
14215 GGGTTT-
1 GGGTTTA
14221 GGGTTTA
1 GGGTTTA
14228 GGGTTTA
1 GGGTTTA
14235 -GG-TTA
1 GGGTTTA
14240 GGGTTTA
1 GGGTTTA
14247 GGGTTTA
1 GGGTTTA
14254 GGGTTTA
1 GGGTTTA
14261 GGGTTTA
1 GGGTTTA
14268 GGGTTTA
1 GGGTTTA
14275 GGGTTTA
1 GGGTTTA
14282 GGGTTTA
1 GGGTTTA
14289 GGGTTTA
1 GGGTTTA
14296 GGGTTTA
1 GGGTTTA
14303 GGGTTTA
1 GGGTTTA
14310 GGGTTTA
1 GGGTTTA
14317 GGGTTTA
1 GGGTTTA
14324 GGG-TTA
1 GGGTTTA
14330 GGGTTTA
1 GGGTTTA
14337 GGGTTTA
1 GGGTTTA
14344 GGGTTTA
1 GGGTTTA
14351 GGGTTTA
1 GGGTTTA
14358 -GGTTTA
1 GGGTTTA
14364 GGGTTTA
1 GGGTTTA
14371 GGGTTTA
1 GGGTTTA
14378 GGGTTT-
1 GGGTTTA
14384 GGGTTTA
1 GGGTTTA
14391 -GGTTTA
1 GGGTTTA
14397 GGGTTTA
1 GGGTTTA
14404 GGGTTTA
1 GGGTTTA
14411 GGG-TTA
1 GGGTTTA
14417 GGGTTTA
1 GGGTTTA
14424 GGGTTTA
1 GGGTTTA
14431 GGGTTTA
1 GGGTTTA
14438 GGGTTTA
1 GGGTTTA
14445 GGGTTTA
1 GGGTTTA
14452 GGGTTTA
1 GGGTTTA
14459 GGGTTTA
1 GGGTTTA
14466 -GGTTTA
1 GGGTTTA
14472 GGGTTTA
1 GGGTTTA
14479 GGG-TTA
1 GGGTTTA
14485 GGGTTTA
1 GGGTTTA
14492 GGGTTTA
1 GGGTTTA
14499 GGGTTTA
1 GGGTTTA
14506 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
14513 GGGTTTT
1 GGGTTTA
14520 GGGTTTA
1 GGGTTTA
14527 GGGTTTA
1 GGGTTTA
14534 GGGTTTA
1 GGGTTTA
14541 GGGTTTA
1 GGGTTTA
14548 GGGTTTA
1 GGGTTTA
14555 GGGTTTA
1 GGGTTTA
14562 GGGTTTA
1 GGGTTTA
14569 GGGTTTA
1 GGGTTTA
14576 GGG-TTA
1 GGGTTTA
14582 GGGTTTA
1 GGGTTTA
14589 GGGTTTA
1 GGGTTTA
14596 GGGTTTA
1 GGGTTTA
14603 GGG-TTA
1 GGGTTTA
14609 GGGTTTA
1 GGGTTTA
14616 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
14623 GGGTTTG
1 GGGTTTA
14630 GGGTTTA
1 GGGTTTA
14637 GGGTTTA
1 GGGTTTA
14644 GGGTTTA
1 GGGTTTA
14651 GGGTTTA
1 GGGTTTA
14658 GGGTTTA
1 GGGTTTA
14665 GGG-TTA
1 GGGTTTA
14671 GGGTTT-
1 GGGTTTA
14677 GGGTTTA
1 GGGTTTA
14684 GGGTTTA
1 GGGTTTA
14691 GGGTTTA
1 GGGTTTA
14698 GGG-TTA
1 GGGTTTA
*
14704 GGGTTTC
1 GGGTTTA
14711 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
14718 GGGTTTC
1 GGGTTTA
14725 GGGTTTA
1 GGGTTTA
14732 GGGTTTA
1 GGGTTTA
* *
14739 TGTTTTA
1 GGGTTTA
14746 GGG-TTA
1 GGGTTTA
14752 GGGTTTA
1 GGGTTTA
14759 GGGTTTA
1 GGGTTTA
14766 GGGTTTA
1 GGGTTTA
14773 -GGTTTA
1 GGGTTTA
14779 GGGTTTA
1 GGGTTTA
14786 --GTTTA
1 GGGTTTA
14791 GGGTTTA
1 GGGTTTA
14798 GGGTTTA
1 GGGTTTA
14805 GGGTTTA
1 GGGTTTA
14812 GGGTTTA
1 GGGTTTA
14819 GGGTTTA
1 GGGTTTA
14826 GGGTTTA
1 GGGTTTA
14833 GGGTTTA
1 GGGTTTA
14840 GGGTTTA
1 GGGTTTA
14847 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
14854 GGGGGTTA
1 -GGGTTTA
14862 GGGTTTA
1 GGGTTTA
14869 GGGTTTA
1 GGGTTTA
14876 GGG-TTA
1 GGGTTTA
14882 GGGTTTA
1 GGGTTTA
14889 GGGTTTA
1 GGGTTTA
14896 GGGTTTA
1 GGGTTTA
14903 -GGTTT-
1 GGGTTTA
14908 GGGTTTA
1 GGGTTTA
14915 GGGTTTA
1 GGGTTTA
14922 GGGTTTA
1 GGGTTTA
14929 GGG-TTA
1 GGGTTTA
14935 GGGTTTA
1 GGGTTTA
14942 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
14949 GGTTTTTA
1 GG-GTTTA
14957 GGGTTTA
1 GGGTTTA
14964 GGGTTTA
1 GGGTTTA
14971 -GGTTTA
1 GGGTTTA
14977 GGG-TTA
1 GGGTTTA
14983 GGGTTTA
1 GGGTTTA
14990 GGGTTTA
1 GGGTTTA
14997 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15004 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15011 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15018 GGG-TTA
1 GGGTTTA
15024 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15031 -GGTTTA
1 GGGTTTA
15037 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15044 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15051 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15058 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15065 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15072 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15079 -GGTTTA
1 GGGTTTA
15085 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15092 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15099 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15106 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15113 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15120 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15127 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15134 -GGTTTA
1 GGGTTTA
15140 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15147 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15154 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15161 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15168 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15175 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15182 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15189 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15196 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15203 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15210 GGG-TTA
1 GGGTTTA
15216 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15223 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15230 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15237 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
15244 -GGTGTA
1 GGGTTTA
15250 GGG-TTA
1 GGGTTTA
15256 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15263 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15270 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15277 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15284 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15291 GGG-TTA
1 GGGTTTA
15297 GGG-TTA
1 GGGTTTA
15303 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15310 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15317 GGG-TTA
1 GGGTTTA
15323 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15330 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15337 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15344 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15351 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15358 -GGTTTA
1 GGGTTTA
15364 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15371 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15378 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15385 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15392 -GG-TTA
1 GGGTTTA
15397 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15404 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15411 GGGTTT-
1 GGGTTTA
15417 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15424 GGG-TTA
1 GGGTTTA
15430 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15437 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15444 GGG-TTA
1 GGGTTTA
15450 -GGTTTA
1 GGGTTTA
15456 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15463 GGG-TTA
1 GGGTTTA
15469 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15476 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15483 -GG-TTA
1 GGGTTTA
15488 GGG-TTA
1 GGGTTTA
*
15494 GGG-TTC
1 GGGTTTA
15500 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15507 GGG-TTA
1 GGGTTTA
15513 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15520 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15527 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15534 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15541 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15548 -GGTTTA
1 GGGTTTA
15554 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15561 -GGTTTA
1 GGGTTTA
15567 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15574 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15581 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15588 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15595 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15602 -GGTTTA
1 GGGTTTA
15608 -GGTTTA
1 GGGTTTA
15614 -GGTTTA
1 GGGTTTA
15620 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15627 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15634 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15641 GGG-TTA
1 GGGTTTA
15647 GGG-TTA
1 GGGTTTA
15653 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15660 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15667 GGG-TTA
1 GGGTTTA
15673 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15680 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15687 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15694 GGGTTT-
1 GGGTTTA
15700 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15707 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15714 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15721 -GG-TT-
1 GGGTTTA
15725 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15732 GGGTTT-
1 GGGTTTA
15738 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15745 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15752 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15759 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15766 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
15773 GGG-TTG
1 GGGTTTA
15779 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15786 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15793 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15800 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15807 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15814 -GGTTTA
1 GGGTTTA
15820 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15827 -GGTTTA
1 GGGTTTA
15833 -GGTTTA
1 GGGTTTA
15839 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15846 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15853 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15860 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15867 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15874 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15881 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15888 -GGTTTA
1 GGGTTTA
15894 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15901 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15908 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15915 --GTTTA
1 GGGTTTA
15920 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15927 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15934 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15941 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15948 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15955 -GG-TTA
1 GGGTTTA
15960 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15967 GGGTTT-
1 GGGTTTA
15973 GGG-TTA
1 GGGTTTA
15979 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15986 GGGTTTA
1 GGGTTTA
15993 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16000 -GGTTTA
1 GGGTTTA
16006 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16013 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16020 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16027 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16034 -GGTTTA
1 GGGTTTA
16040 GGGTTT-
1 GGGTTTA
16046 -GGTTTA
1 GGGTTTA
16052 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16059 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16066 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16073 GGG-TTA
1 GGGTTTA
16079 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16086 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16093 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16100 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16107 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16114 GGGTTT-
1 GGGTTTA
16120 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16127 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16134 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16141 -GGTTTA
1 GGGTTTA
16147 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16154 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16161 -GGTTTA
1 GGGTTTA
16167 -GGTTTA
1 GGGTTTA
16173 GGGTTT-
1 GGGTTTA
16179 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16186 -GGTTTA
1 GGGTTTA
16192 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16199 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16206 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16213 -GGTTTA
1 GGGTTTA
16219 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16226 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16233 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16240 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16247 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16254 --GTTTA
1 GGGTTTA
16259 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16266 -GGTTTA
1 GGGTTTA
*
16272 GGGTTTT
1 GGGTTTA
16279 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16286 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16293 GGG-TTA
1 GGGTTTA
16299 GGG-TTA
1 GGGTTTA
16305 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
16312 GGGTTTC
1 GGGTTTA
16319 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16326 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16333 -GGTTTA
1 GGGTTTA
16339 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16346 GGGGGTTTA
1 --GGGTTTA
16355 -GGTTTA
1 GGGTTTA
16361 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16368 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16375 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16382 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16389 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16396 GGGGTTTA
1 -GGGTTTA
16404 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16411 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
16418 GGGTTTC
1 GGGTTTA
16425 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16432 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16439 GGG-TTA
1 GGGTTTA
16445 -GGTTTA
1 GGGTTTA
16451 -GGTTTA
1 GGGTTTA
16457 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16464 GGG-TT-
1 GGGTTTA
16469 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16476 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16483 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16490 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16497 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16504 GGG-TTA
1 GGGTTTA
16510 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16517 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16524 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16531 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16538 GGGTTT-
1 GGGTTTA
16544 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16551 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16558 -GGTTTA
1 GGGTTTA
16564 GGGGGGTTTA
1 ---GGGTTTA
*
16574 GGGTTTC
1 GGGTTTA
16581 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16588 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16595 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16602 -GGTTTA
1 GGGTTTA
16608 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16615 GGGGTTTA
1 -GGGTTTA
*
16623 GGGGTTA
1 GGGTTTA
16630 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16637 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16644 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16651 -GGTTTA
1 GGGTTTA
16657 -GGTTTA
1 GGGTTTA
16663 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16670 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
16677 GGGTTTC
1 GGGTTTA
16684 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16691 -GGTTTA
1 GGGTTTA
16697 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16704 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16711 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16718 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16725 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16732 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16739 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16746 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16753 -GGTTTA
1 GGGTTTA
16759 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16766 GGGGTTTA
1 -GGGTTTA
16774 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16781 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16788 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16795 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16802 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16809 GGG-TTA
1 GGGTTTA
16815 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16822 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16829 -GGTTTA
1 GGGTTTA
16835 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16842 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16849 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16856 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16863 -GGTTTA
1 GGGTTTA
16869 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16876 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16883 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16890 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16897 GGG-TTA
1 GGGTTTA
*
16903 GGGTTTC
1 GGGTTTA
16910 GGG-TTA
1 GGGTTTA
16916 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16923 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16930 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16937 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16944 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16951 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16958 -GGTTTA
1 GGGTTTA
16964 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16971 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16978 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16985 GGGTTTA
1 GGGTTTA
16992 GGGTTT-
1 GGGTTTA
16998 -GG-TTA
1 GGGTTTA
17003 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17010 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17017 -GGTTTA
1 GGGTTTA
17023 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17030 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17037 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17044 TGGGTTTA
1 -GGGTTTA
17052 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17059 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17066 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17073 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17080 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17087 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17094 GGGTTT-
1 GGGTTTA
17100 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17107 GGG-TTA
1 GGGTTTA
*
17113 -GGTTTC
1 GGGTTTA
17119 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17126 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17133 GGGTTTTA
1 GGG-TTTA
17141 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17148 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
17155 GGGTTTC
1 GGGTTTA
17162 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17169 -GGTTTA
1 GGGTTTA
17175 GGG-TTA
1 GGGTTTA
17181 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17188 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17195 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17202 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17209 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17216 GGG-TTA
1 GGGTTTA
17222 -GGTTTA
1 GGGTTTA
17228 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17235 GGGTTTTA
1 GGG-TTTA
17243 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17250 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17257 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17264 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17271 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17278 GGGGTTTA
1 -GGGTTTA
*
17286 TGGTTTA
1 GGGTTTA
17293 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
17300 GGGTTTC
1 GGGTTTA
17307 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17314 -GGTTT-
1 GGGTTTA
*
17319 CGGTTTA
1 GGGTTTA
17326 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17333 GGGTTGTTTA
1 -GG--GTTTA
17343 -GGTTTA
1 GGGTTTA
17349 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17356 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17363 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17370 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17377 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17384 -GGTTTA
1 GGGTTTA
17390 GGG-TTA
1 GGGTTTA
17396 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
17403 GGGTTTC
1 GGGTTTA
17410 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17417 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17424 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17431 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17438 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17445 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17452 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17459 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17466 -GGTTTA
1 GGGTTTA
17472 -GGTTTA
1 GGGTTTA
17478 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17485 -GGTTTA
1 GGGTTTA
17491 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17498 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17505 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17512 GGG-TT-
1 GGGTTTA
*
17517 CGGTTTA
1 GGGTTTA
17524 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17531 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17538 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17545 -GGTTTA
1 GGGTTTA
17551 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17558 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17565 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17572 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17579 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17586 -GGTTTA
1 GGGTTTA
17592 -GGTTTA
1 GGGTTTA
17598 -GGTTTA
1 GGGTTTA
17604 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17611 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17618 -GGTTT-
1 GGGTTTA
*
17623 CGGTTTA
1 GGGTTTA
17630 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17637 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17644 GGG-TTA
1 GGGTTTA
17650 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17657 -GGTTT-
1 GGGTTTA
17662 GGG-TTA
1 GGGTTTA
17668 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17675 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17682 GGGTTT-
1 GGGTTTA
17688 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
17695 -GGTTTC
1 GGGTTTA
*
17701 GGGTTTC
1 GGGTTTA
17708 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17715 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17722 -GGTTTA
1 GGGTTTA
17728 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17735 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17742 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17749 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17756 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17763 -GGTTTA
1 GGGTTTA
17769 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17776 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17783 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17790 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17797 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17804 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
17811 GGG-TTC
1 GGGTTTA
17817 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17824 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17831 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17838 GGGTTT-
1 GGGTTTA
17844 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17851 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17858 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17865 -GGTTTA
1 GGGTTTA
*
17871 GGGTTTC
1 GGGTTTA
17878 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17885 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17892 -GGTTTA
1 GGGTTTA
17898 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17905 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17912 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17919 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17926 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17933 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17940 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
17947 GGGTTTC
1 GGGTTTA
17954 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17961 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17968 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17975 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17982 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17989 GGGTTTA
1 GGGTTTA
17996 GGG-TTA
1 GGGTTTA
18002 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18009 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18016 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18023 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18030 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18037 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18044 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18051 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18058 -GGTTTA
1 GGGTTTA
18064 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18071 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18078 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18085 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18092 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18099 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18106 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18113 GGGTTT-
1 GGGTTTA
18119 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18126 GGG-TTA
1 GGGTTTA
18132 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18139 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18146 -GGTTTA
1 GGGTTTA
18152 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18159 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18166 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18173 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18180 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18187 -GGTTTA
1 GGGTTTA
18193 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18200 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18207 GGGTTTTA
1 GGG-TTTA
18215 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18222 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18229 -GGTTTA
1 GGGTTTA
18235 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18242 GGG-TTA
1 GGGTTTA
18248 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18255 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18262 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18269 -GGTTTA
1 GGGTTTA
18275 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18282 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18289 -GGTTTA
1 GGGTTTA
18295 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18302 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18309 GGGGTTTA
1 -GGGTTTA
18317 GGG-TTA
1 GGGTTTA
18323 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18330 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18337 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18344 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18351 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18358 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18365 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18372 -GGTTTA
1 GGGTTTA
18378 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18385 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18392 -GGTTTA
1 GGGTTTA
18398 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18405 -GGTTTA
1 GGGTTTA
18411 GGGGTTTA
1 -GGGTTTA
18419 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18426 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18433 GGGTTT-
1 GGGTTTA
*
18439 CGGTTTA
1 GGGTTTA
18446 GGG-TTA
1 GGGTTTA
18452 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18459 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18466 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18473 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18480 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18487 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18494 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18501 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18508 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18515 GGG-TTA
1 GGGTTTA
18521 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18528 -GGTTTA
1 GGGTTTA
18534 GGG-TTA
1 GGGTTTA
18540 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18547 GGGTTT-
1 GGGTTTA
18553 GGG-TTA
1 GGGTTTA
18559 GGG-TTA
1 GGGTTTA
18565 -GGTTTA
1 GGGTTTA
18571 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18578 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18585 -GGTTTA
1 GGGTTTA
18591 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18598 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18605 -GGTTTA
1 GGGTTTA
18611 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18618 -GGTTTA
1 GGGTTTA
18624 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18631 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18638 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18645 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18652 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18659 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18666 -GG-TTA
1 GGGTTTA
18671 GGG-TTA
1 GGGTTTA
18677 GGG-TTA
1 GGGTTTA
18683 -GGTTTA
1 GGGTTTA
18689 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18696 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18703 GGG--TA
1 GGGTTTA
18708 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18715 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18722 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18729 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18736 GGG-TTA
1 GGGTTTA
18742 -GGTTTA
1 GGGTTTA
18748 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18755 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18762 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18769 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18776 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18783 GGG-TTA
1 GGGTTTA
18789 GGG-TTA
1 GGGTTTA
18795 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18802 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18809 -GGTTTA
1 GGGTTTA
18815 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18822 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18829 GGGTTTTA
1 GGG-TTTA
18837 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18844 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18851 -GG-TTA
1 GGGTTTA
18856 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18863 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18870 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18877 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18884 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
18891 GGGTTTCG
1 GGGTTT-A
18899 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18906 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18913 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18920 GGG-TTA
1 GGGTTTA
*
18926 GGGGTTA
1 GGGTTTA
18933 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18940 GGGGTTTA
1 -GGGTTTA
18948 GGGTTT-
1 GGGTTTA
18954 GGG-TTA
1 GGGTTTA
18960 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18967 GGG-TTA
1 GGGTTTA
18973 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18980 GGGTTTA
1 GGGTTTA
18987 -GGTTTA
1 GGGTTTA
18993 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19000 -GGTTTA
1 GGGTTTA
19006 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19013 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19020 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19027 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19034 GGG-TTA
1 GGGTTTA
19040 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19047 GGGTTT-
1 GGGTTTA
19053 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19060 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19067 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19074 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19081 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19088 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19095 -GGTTTA
1 GGGTTTA
19101 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19108 -GGTTTA
1 GGGTTTA
19114 GGG-TTA
1 GGGTTTA
19120 -GGTTTA
1 GGGTTTA
19126 GGGGGTTTA
1 --GGGTTTA
19135 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19142 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19149 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19156 -GGTTT-
1 GGGTTTA
**
19161 -TTTTTA
1 GGGTTTA
19167 GGGGTTTA
1 -GGGTTTA
19175 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19182 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19189 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
19196 GGGTTTC
1 GGGTTTA
19203 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19210 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19217 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19224 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19231 GGG-TTA
1 GGGTTTA
19237 GGG-TTA
1 GGGTTTA
19243 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19250 -GG--TA
1 GGGTTTA
19254 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19261 GGG-TTA
1 GGGTTTA
19267 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19274 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19281 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19288 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19295 GGG-TTA
1 GGGTTTA
19301 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19308 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19315 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19322 -GGTTTA
1 GGGTTTA
19328 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19335 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19342 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19349 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19356 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19363 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19370 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19377 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19384 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19391 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19398 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19405 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19412 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19419 -GGTTTA
1 GGGTTTA
19425 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19432 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19439 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19446 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19453 GGG-TTA
1 GGGTTTA
19459 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19466 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19473 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19480 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19487 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19494 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19501 -GGTTTA
1 GGGTTTA
19507 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19514 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19521 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19528 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19535 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19542 -GGTTTA
1 GGGTTTA
19548 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19555 -GGTTTA
1 GGGTTTA
19561 GGG-TTA
1 GGGTTTA
19567 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19574 GGG-TTA
1 GGGTTTA
19580 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19587 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19594 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19601 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19608 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19615 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19622 GGGTTT-
1 GGGTTTA
19628 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19635 GGG-TTA
1 GGGTTTA
19641 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19648 GGG--TA
1 GGGTTTA
19653 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19660 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19667 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19674 -GGTTTA
1 GGGTTTA
19680 GGG--TA
1 GGGTTTA
19685 -GGTTTA
1 GGGTTTA
19691 -GGTTTGA
1 GGGTTT-A
19698 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19705 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19712 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19719 GGGTTT-
1 GGGTTTA
19725 -GGTTTA
1 GGGTTTA
19731 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19738 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19745 GGG-TTA
1 GGGTTTA
19751 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19758 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19765 -GGTTTA
1 GGGTTTA
19771 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19778 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19785 GGG-TTA
1 GGGTTTA
*
19791 GGTTTTA
1 GGGTTTA
19798 -GGTTTA
1 GGGTTTA
19804 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19811 -GGTTTA
1 GGGTTTA
*
19817 GGGTTTC
1 GGGTTTA
*
19824 GGG-GTA
1 GGGTTTA
19830 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19837 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19844 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19851 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19858 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19865 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19872 GGGTTT-
1 GGGTTTA
19878 -GGTTTA
1 GGGTTTA
19884 GGG-TTA
1 GGGTTTA
19890 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19897 -GGTTTA
1 GGGTTTA
19903 -GGTTTA
1 GGGTTTA
19909 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19916 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19923 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19930 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19937 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19944 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19951 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19958 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19965 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19972 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19979 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19986 GGGTTTA
1 GGGTTTA
19993 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20000 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20007 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20014 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20021 GGG-TTA
1 GGGTTTA
20027 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20034 GGG-TTA
1 GGGTTTA
20040 GGG-TTA
1 GGGTTTA
20046 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20053 GGG-TTA
1 GGGTTTA
20059 GGG-TTA
1 GGGTTTA
20065 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20072 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20079 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20086 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20093 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20100 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20107 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20114 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20121 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20128 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20135 GGG-TTA
1 GGGTTTA
20141 -GGTTTA
1 GGGTTTA
20147 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20154 -GGTTTA
1 GGGTTTA
20160 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20167 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20174 GGGTTTTA
1 GGG-TTTA
20182 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20189 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20196 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20203 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20210 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20217 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20224 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20231 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20238 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20245 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20252 -GGTTTA
1 GGGTTTA
20258 -GGTTTA
1 GGGTTTA
*
20264 GGGGTTA
1 GGGTTTA
20271 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20278 -GGTTTA
1 GGGTTTA
20284 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
20291 GGG-TTC
1 GGGTTTA
20297 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20304 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20311 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20318 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20325 GGG-TTA
1 GGGTTTA
20331 GGGTTT-
1 GGGTTTA
*
20337 CGGTTT-
1 GGGTTTA
20343 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20350 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20357 GGGTTTTA
1 GGG-TTTA
20365 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20372 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20379 -GGTTTA
1 GGGTTTA
20385 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20392 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
20399 GGGTTTC
1 GGGTTTA
*
20406 GGGTTTC
1 GGGTTTA
20413 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20420 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20427 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
20434 GGTTTTTTA
1 GG--GTTTA
*
20443 GGGTTTC
1 GGGTTTA
20450 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20457 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20464 GGGGTTTA
1 -GGGTTTA
20472 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20479 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20486 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20493 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20500 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20507 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20514 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20521 -GGTTT-
1 GGGTTTA
20526 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
20533 GGG-TTC
1 GGGTTTA
20539 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20546 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20553 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20560 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20567 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20574 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20581 -GG-TTA
1 GGGTTTA
20586 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20593 GGG-TTA
1 GGGTTTA
20599 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20606 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20613 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20620 -GGTTTA
1 GGGTTTA
*
20626 GGGTTTC
1 GGGTTTA
20633 GGG-TTA
1 GGGTTTA
20639 GGG-TTA
1 GGGTTTA
20645 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20652 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20659 -GGTTTA
1 GGGTTTA
20665 GGG-TT-
1 GGGTTTA
20670 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20677 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20684 -GGTTTA
1 GGGTTTA
20690 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20697 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20704 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20711 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20718 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20725 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20732 -GGTTTA
1 GGGTTTA
20738 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20745 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20752 GGGTTT-
1 GGGTTTA
*
20758 TGGTTTA
1 GGGTTTA
*
20765 GGG-TTC
1 GGGTTTA
*
20771 GGGTTTC
1 GGGTTTA
20778 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20785 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20792 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
20799 GGGTTTC
1 GGGTTTA
20806 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20813 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20820 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20827 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20834 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20841 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20848 GGG-TT-
1 GGGTTTA
20853 -GGTTTA
1 GGGTTTA
20859 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20866 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20873 GGGGGTTTA
1 --GGGTTTA
20882 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20889 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20896 GGGTTT-
1 GGGTTTA
*
20902 CGG-TTA
1 GGGTTTA
20908 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20915 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20922 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20929 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20936 -GGTTTA
1 GGGTTTA
20942 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20949 GGGTTT-
1 GGGTTTA
*
20955 GGG-TTC
1 GGGTTTA
20961 GGGTTT-
1 GGGTTTA
20967 -GGTTTA
1 GGGTTTA
20973 GGGTTTA
1 GGGTTTA
20980 GGGTTT-
1 GGGTTTA
*
20986 CGGTTTA
1 GGGTTTA
20993 GGGTTT-
1 GGGTTTA
20999 GGGTTTA
1 GGGTTTA
21006 -GGTTTA
1 GGGTTTA
*
21012 GGG-TTC
1 GGGTTTA
21018 GGGTTTA
1 GGGTTTA
21025 -GGTTTA
1 GGGTTTA
21031 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
21038 GGGTTTC
1 GGGTTTA
21045 GGGTTTA
1 GGGTTTA
21052 -GGTTTA
1 GGGTTTA
21058 GGGTTTA
1 GGGTTTA
21065 GGGTTTA
1 GGGTTTA
21072 GGGTTTA
1 GGGTTTA
21079 GGGTTTTA
1 GGG-TTTA
21087 GGGTTT-
1 GGGTTTA
* *
21093 CGGTTTC
1 GGGTTTA
*
21100 GGGTTTT
1 GGGTTTA
*
21107 GGGTTTTC
1 GGG-TTTA
21115 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
21122 GGGTTTC
1 GGGTTTA
*
21129 GGGTTTC
1 GGGTTTA
21136 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
21143 GGGTTTC
1 GGGTTTA
21150 GGGTTTA
1 GGGTTTA
21157 GGGTTT-
1 GGGTTTA
*
21163 --CTTTA
1 GGGTTTA
21168 GGGTTTA
1 GGGTTTA
21175 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
21182 GGGTTTC
1 GGGTTTA
21189 GGGTTTA
1 GGGTTTA
21196 GGGTTTA
1 GGGTTTA
21203 -GGTTTA
1 GGGTTTA
*
21209 GGTTTTA
1 GGGTTTA
*
21216 GGGTTTC
1 GGGTTTA
21223 GGGTTTA
1 GGGTTTA
21230 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
21237 GGTGGGTTTC
1 ---GGGTTTA
21247 GGG-TTA
1 GGGTTTA
21253 GGGTTTA
1 GGGTTTA
21260 GGGTTTA
1 GGGTTTA
21267 GGGTTT-
1 GGGTTTA
*
21273 GGGTTTT
1 GGGTTTA
21280 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
21287 GGGTTTC
1 GGGTTTA
21294 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
21301 GGGTTTC
1 GGGTTTA
21308 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
21315 -GGTTTC
1 GGGTTTA
21321 GGGTTTA
1 GGGTTTA
21328 -GGTTT-
1 GGGTTTA
* *
21333 CGGTTTC
1 GGGTTTA
21340 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
21347 -GGTTTC
1 GGGTTTA
21353 GGGTTT-
1 GGGTTTA
* *
21359 CGGTTTC
1 GGGTTTA
*
21366 GGGTTTC
1 GGGTTTA
*
21373 GGGTTTC
1 GGGTTTA
21380 GGGTTTA
1 GGGTTTA
21387 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
21394 CGGTTTA
1 GGGTTTA
21401 GGGTTT-
1 GGGTTTA
21407 GGGTTTA
1 GGGTTTA
21414 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
21421 GGGTTTC
1 GGGTTTA
21428 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
21435 GGGTTTC
1 GGGTTTA
*
21442 GGGTTTC
1 GGGTTTA
*
21449 GGGTTTC
1 GGGTTTA
*
21456 GGGTTTC
1 GGGTTTA
21463 GGGTTTA
1 GGGTTTA
21470 GGGTTTA
1 GGGTTTA
21477 GGGTTTA
1 GGGTTTA
21484 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
21491 -GGTTTC
1 GGGTTTA
21497 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
21504 GGGTTTC
1 GGGTTTA
21511 GGGTTTA
1 GGGTTTA
21518 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
21525 GGGTTTC
1 GGGTTTA
21532 GGGTTTA
1 GGGTTTA
21539 GGGTTTA
1 GGGTTTA
21546 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
21553 GGGTTTC
1 GGGTTTA
21560 GGGTTTA
1 GGGTTTA
21567 GGGTTT-
1 GGGTTTA
21573 GGGTTTA
1 GGGTTTA
21580 GGGTTTA
1 GGGTTTA
21587 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
21594 GGGTTTC
1 GGGTTTA
21601 GGGTTTA
1 GGGTTTA
21608 GGGTTTA
1 GGGTTTA
21615 GGGTTTA
1 GGGTTTA
21622 GGGTTTA
1 GGGTTTA
21629 GGG-TTA
1 GGGTTTA
21635 GGGTTTA
1 GGGTTTA
21642 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
21649 GGGTTTC
1 GGGTTTA
21656 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
21663 -GGTTTC
1 GGGTTTA
*
21669 GGGTTTC
1 GGGTTTA
21676 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
21683 GGGTTTC
1 GGGTTTA
21690 GGGTTT-
1 GGGTTTA
21696 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
21703 GGGTTTC
1 GGGTTTA
21710 GGGTTTA
1 GGGTTTA
21717 GGGTTTA
1 GGGTTTA
21724 GGGTTTA
1 GGGTTTA
21731 GGGTTT-
1 GGGTTTA
21737 GGGTTTA
1 GGGTTTA
21744 GGGTTTA
1 GGGTTTA
21751 -GGTTTA
1 GGGTTTA
21757 GGGTTTA
1 GGGTTTA
21764 GGGTTTA
1 GGGTTTA
21771 GGG-TTA
1 GGGTTTA
21777 -GGTTTA
1 GGGTTTA
*
21783 GGGTTTC
1 GGGTTTA
21790 GGGTTTA
1 GGGTTTA
21797 GGGTTTA
1 GGGTTTA
21804 GGGTTTA
1 GGGTTTA
21811 GGGTTTA
1 GGGTTTA
21818 -GGTTTA
1 GGGTTTA
*
21824 GGGTTTC
1 GGGTTTA
21831 GGGTTT-
1 GGGTTTA
21837 GGGTTTA
1 GGGTTTA
21844 GGGTTTA
1 GGGTTTA
21851 -GGTTTA
1 GGGTTTA
*
21857 GGGTTTC
1 GGGTTTA
*
21864 GGGTTTC
1 GGGTTTA
21871 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
21878 GGGTTTC
1 GGGTTTA
21885 GGGTTT-
1 GGGTTTA
21891 GGGTTTA
1 GGGTTTA
21898 GGGTTT-
1 GGGTTTA
* *
21904 CGGTTTC
1 GGGTTTA
21911 GGGTTT-
1 GGGTTTA
*
21917 CGGTTTA
1 GGGTTTA
21924 GGGTTTA
1 GGGTTTA
21931 GGGTTT-
1 GGGTTTA
*
21937 CGG-TTA
1 GGGTTTA
*
21943 GGGTTTC
1 GGGTTTA
21950 GGGTTTA
1 GGGTTTA
21957 GGGTTTA
1 GGGTTTA
21964 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
21971 GGGTTTC
1 GGGTTTA
*
21978 GGGTTTC
1 GGGTTTA
*
21985 GGGTTTC
1 GGGTTTA
21992 GGGTTTA
1 GGGTTTA
21999 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
22006 GGGTTTC
1 GGGTTTA
*
22013 GGGTTTC
1 GGGTTTA
22020 GGGTTTA
1 GGGTTTA
22027 -GGTTTA
1 GGGTTTA
*
22033 GGGTTTC
1 GGGTTTA
*
22040 GGGTTTC
1 GGGTTTA
22047 GGG-TTA
1 GGGTTTA
*
22053 GGGTTTC
1 GGGTTTA
22060 GGGTTTA
1 GGGTTTA
22067 GGG-TTA
1 GGGTTTA
22073 GGGTTTA
1 GGGTTTA
22080 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
22087 GGGTTTC
1 GGGTTTA
*
22094 GGGTTTTG
1 GGG-TTTA
22102 GGGTTTA
1 GGGTTTA
22109 GGGTTTA
1 GGGTTTA
22116 GGG-TT-
1 GGGTTTA
22121 GGGTTTA
1 GGGTTTA
22128 GGGTTT-
1 GGGTTTA
*
22134 GGGTTTC
1 GGGTTTA
22141 GGGTTTA
1 GGGTTTA
22148 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
22155 GGTTTGTTTC
1 GG---GTTTA
*
22165 GGTTCGGTTA
1 GG---GTTTA
22175 -GGTTTA
1 GGGTTTA
*
22181 GGGTTTC
1 GGGTTTA
22188 GGG-TTA
1 GGGTTTA
22194 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
22201 GGGTTTC
1 GGGTTTA
*
22208 GGGTTTC
1 GGGTTTA
*
22215 GGGTTTC
1 GGGTTTA
22222 GGGTT
1 GGGTT
Statistics
Matches: 7515, Mismatches: 194, Indels: 688
0.89 0.02 0.08
Matches are distributed among these distances:
4 11 0.00
5 126 0.02
6 1508 0.20
7 5662 0.75
8 153 0.02
9 27 0.00
10 28 0.00
ACGTcount: A:0.13, C:0.01, G:0.43, T:0.43
Consensus pattern (7 bp):
GGGTTTA
Done.