Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: VEPZ01007584.1 Hibiscus syriacus cultivar Beakdansim tig00021708_pilon, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Pmatch=0.80,Pindel=0.10
tuple sizes 0,4,5,7
tuple distances 0, 29, 159, 1000
Length: 251632
ACGTcount: A:0.32, C:0.17, G:0.18, T:0.33
File 2 of 2
Found at i:236979 original size:7 final size:7
Alignment explanation
Indices: 236969--236998 Score: 60
Period size: 7 Copynumber: 4.3 Consensus size: 7
236959 GGGTCTGGGG
236969 TCAGGGC
1 TCAGGGC
236976 TCAGGGC
1 TCAGGGC
236983 TCAGGGC
1 TCAGGGC
236990 TCAGGGC
1 TCAGGGC
236997 TC
1 TC
236999 TGAAATGTAT
Statistics
Matches: 23, Mismatches: 0, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
7 23 1.00
ACGTcount: A:0.13, C:0.30, G:0.40, T:0.17
Consensus pattern (7 bp):
TCAGGGC
Found at i:237945 original size:7 final size:7
Alignment explanation
Indices: 237542--237992 Score: 656
Period size: 7 Copynumber: 64.6 Consensus size: 7
237532 GCCTGGGTTC
*
237542 AGGGTCC
1 AGGGTCT
*
237549 AGGGTCC
1 AGGGTCT
*
237556 AGGGTCC
1 AGGGTCT
*
237563 AGGGTCC
1 AGGGTCT
*
237570 AGGGTCC
1 AGGGTCT
*
237577 AGGGTCC
1 AGGGTCT
*
237584 AGGGTCC
1 AGGGTCT
*
237591 AGGGTCC
1 AGGGTCT
*
237598 AGGGTCC
1 AGGGTCT
*
237605 AGGGTCC
1 AGGGTCT
*
237612 AGGGTCC
1 AGGGTCT
*
237619 AGGGTCC
1 AGGGTCT
*
237626 AGGGTCC
1 AGGGTCT
*
237633 AGGGTCC
1 AGGGTCT
*
237640 AGGGTCC
1 AGGGTCT
*
237647 AGGGTCC
1 AGGGTCT
*
237654 AGGGTCC
1 AGGGTCT
237661 AGGGTCT
1 AGGGTCT
* *
237668 ACGGTCC
1 AGGGTCT
237675 AGGGTCT
1 AGGGTCT
237682 AGGGTCT
1 AGGGTCT
237689 AGGGTCT
1 AGGGTCT
237696 AGGGTCT
1 AGGGTCT
*
237703 ACGGTCT
1 AGGGTCT
*
237710 ACGGTCT
1 AGGGTCT
237717 AGGGTCT
1 AGGGTCT
237724 AGGGTCT
1 AGGGTCT
237731 AGGGTCT
1 AGGGTCT
237738 AGGGTCT
1 AGGGTCT
237745 AGGGTCT
1 AGGGTCT
237752 AGGGTCT
1 AGGGTCT
237759 AGGGTCT
1 AGGGTCT
237766 AGGGTCT
1 AGGGTCT
237773 AGGGTCT
1 AGGGTCT
237780 AGGGTCT
1 AGGGTCT
237787 AGGGTCT
1 AGGGTCT
237794 AGGGTCT
1 AGGGTCT
237801 AGGGTCT
1 AGGGTCT
237808 AGGGTCT
1 AGGGTCT
237815 AGGGTCT
1 AGGGTCT
237822 AGGGTCT
1 AGGGTCT
237829 AGGGTCT
1 AGGGTCT
237836 AGGGTCT
1 AGGGTCT
237843 AGGGTCT
1 AGGGTCT
237850 AGGGTCT
1 AGGGTCT
237857 AGGGTCT
1 AGGGTCT
237864 AGGGTCT
1 AGGGTCT
237871 AGGGTCT
1 AGGGTCT
237878 AGGGTCT
1 AGGGTCT
237885 AGGGTCT
1 AGGGTCT
237892 AGGGTCT
1 AGGGTCT
237899 AGGGTCT
1 AGGGTCT
237906 AGGGTCT
1 AGGGTCT
237913 AGGGTCT
1 AGGGTCT
237920 AGGGTCT
1 AGGGTCT
237927 AGGGTCT
1 AGGGTCT
237934 AGGGT-T
1 AGGGTCT
237940 AGGGGT-T
1 A-GGGTCT
237947 AGGGTCT
1 AGGGTCT
237954 AGGGTCT
1 AGGGTCT
237961 AGGGTCT
1 AGGGTCT
*
237968 AGGGTTT
1 AGGGTCT
237975 AGGGGTCT
1 A-GGGTCT
*
237983 GGGGTC-
1 AGGGTCT
237989 AGGG
1 AGGG
237993 CTCAGGGCTC
Statistics
Matches: 430, Mismatches: 11, Indels: 7
0.96 0.02 0.02
Matches are distributed among these distances:
6 9 0.02
7 416 0.97
8 5 0.01
ACGTcount: A:0.14, C:0.18, G:0.43, T:0.24
Consensus pattern (7 bp):
AGGGTCT
Found at i:237997 original size:7 final size:7
Alignment explanation
Indices: 237987--238023 Score: 74
Period size: 7 Copynumber: 5.3 Consensus size: 7
237977 GGGTCTGGGG
237987 TCAGGGC
1 TCAGGGC
237994 TCAGGGC
1 TCAGGGC
238001 TCAGGGC
1 TCAGGGC
238008 TCAGGGC
1 TCAGGGC
238015 TCAGGGC
1 TCAGGGC
238022 TC
1 TC
238024 TGAAATGTAT
Statistics
Matches: 30, Mismatches: 0, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
7 30 1.00
ACGTcount: A:0.14, C:0.30, G:0.41, T:0.16
Consensus pattern (7 bp):
TCAGGGC
Found at i:237999 original size:21 final size:21
Alignment explanation
Indices: 237975--238025 Score: 75
Period size: 21 Copynumber: 2.4 Consensus size: 21
237965 TCTAGGGTTT
*
237975 AGGGGTCTGGGGTCAGGGCTC
1 AGGGCTCTGGGGTCAGGGCTC
* *
237996 AGGGCTCAGGGCTCAGGGCTC
1 AGGGCTCTGGGGTCAGGGCTC
238017 AGGGCTCTG
1 AGGGCTCTG
238026 AAATGTATTC
Statistics
Matches: 26, Mismatches: 4, Indels: 0
0.87 0.13 0.00
Matches are distributed among these distances:
21 26 1.00
ACGTcount: A:0.12, C:0.24, G:0.47, T:0.18
Consensus pattern (21 bp):
AGGGCTCTGGGGTCAGGGCTC
Found at i:238557 original size:7 final size:7
Alignment explanation
Indices: 238538--238607 Score: 124
Period size: 7 Copynumber: 10.1 Consensus size: 7
238528 AAAATACCCA
238538 TCGGGGT
1 TCGGGGT
238545 TC-GGGT
1 TCGGGGT
238551 TCGGGGT
1 TCGGGGT
238558 TCGGGGT
1 TCGGGGT
238565 TCGGGGT
1 TCGGGGT
238572 TCGGGGT
1 TCGGGGT
*
238579 TCGAGGT
1 TCGGGGT
238586 TCGGGGT
1 TCGGGGT
238593 TCGGGGT
1 TCGGGGT
238600 TCGGGGT
1 TCGGGGT
238607 T
1 T
238608 TAGGGTTTAG
Statistics
Matches: 60, Mismatches: 2, Indels: 2
0.94 0.03 0.03
Matches are distributed among these distances:
6 6 0.10
7 54 0.90
ACGTcount: A:0.01, C:0.14, G:0.54, T:0.30
Consensus pattern (7 bp):
TCGGGGT
Found at i:238781 original size:7 final size:7
Alignment explanation
Indices: 238603--238779 Score: 329
Period size: 7 Copynumber: 25.4 Consensus size: 7
238593 TCGGGGTTCG
238603 GGGTTTA
1 GGGTTTA
238610 GGGTTTA
1 GGGTTTA
238617 GGGTTTA
1 GGGTTTA
238624 GGGTTTA
1 GGGTTTA
238631 GGGTTTA
1 GGGTTTA
238638 GGGTTTA
1 GGGTTTA
238645 GGGTTTA
1 GGGTTTA
238652 GGGTTTA
1 GGGTTTA
238659 GGGTTTA
1 GGGTTTA
238666 GGGTTTA
1 GGGTTTA
238673 GGGTTTA
1 GGGTTTA
238680 GGGTTTA
1 GGGTTTA
238687 GGGTTTA
1 GGGTTTA
238694 GGGTTTA
1 GGGTTTA
238701 GGGTTTA
1 GGGTTTA
238708 GGGTTTA
1 GGGTTTA
238715 GGGTTTA
1 GGGTTTA
238722 GGGTTTA
1 GGGTTTA
238729 GGGTTTA
1 GGGTTTA
238736 GGGTTTA
1 GGGTTTA
238743 GGGTTTA
1 GGGTTTA
238750 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
238757 GGGGTTA
1 GGGTTTA
*
238764 GGGGTTA
1 GGGTTTA
238771 GGG-TTA
1 GGGTTTA
238777 GGG
1 GGG
238780 GTAAGGGGTA
Statistics
Matches: 169, Mismatches: 1, Indels: 1
0.99 0.01 0.01
Matches are distributed among these distances:
6 6 0.04
7 163 0.96
ACGTcount: A:0.14, C:0.00, G:0.45, T:0.41
Consensus pattern (7 bp):
GGGTTTA
Found at i:238792 original size:7 final size:7
Alignment explanation
Indices: 238547--238788 Score: 189
Period size: 7 Copynumber: 34.6 Consensus size: 7
238537 ATCGGGGTTC
*
238547 GGGTTCG
1 GGGTTAG
*
238554 GGGTTCG
1 GGGTTAG
*
238561 GGGTTCG
1 GGGTTAG
*
238568 GGGTTCG
1 GGGTTAG
*
238575 GGGTTCG
1 GGGTTAG
* *
238582 AGGTTCG
1 GGGTTAG
*
238589 GGGTTCG
1 GGGTTAG
*
238596 GGGTTCG
1 GGGTTAG
238603 GGGTTTAG
1 GGG-TTAG
*
238611 GGTTTAG
1 GGGTTAG
*
238618 GGTTTAG
1 GGGTTAG
*
238625 GGTTTAG
1 GGGTTAG
*
238632 GGTTTAG
1 GGGTTAG
*
238639 GGTTTAG
1 GGGTTAG
*
238646 GGTTTAG
1 GGGTTAG
*
238653 GGTTTAG
1 GGGTTAG
*
238660 GGTTTAG
1 GGGTTAG
*
238667 GGTTTAG
1 GGGTTAG
*
238674 GGTTTAG
1 GGGTTAG
*
238681 GGTTTAG
1 GGGTTAG
*
238688 GGTTTAG
1 GGGTTAG
*
238695 GGTTTAG
1 GGGTTAG
*
238702 GGTTTAG
1 GGGTTAG
*
238709 GGTTTAG
1 GGGTTAG
*
238716 GGTTTAG
1 GGGTTAG
*
238723 GGTTTAG
1 GGGTTAG
*
238730 GGTTTAG
1 GGGTTAG
*
238737 GGTTTAG
1 GGGTTAG
*
238744 GGTTTAG
1 GGGTTAG
*
238751 GGTTTAG
1 GGGTTAG
238758 GGGTTAG
1 GGGTTAG
238765 GGGTTA-
1 GGGTTAG
238771 GGGTTAG
1 GGGTTAG
*
238778 GGGTAAG
1 GGGTTAG
238785 GGGT
1 GGGT
238789 AAGGCTCGGG
Statistics
Matches: 227, Mismatches: 6, Indels: 4
0.96 0.03 0.02
Matches are distributed among these distances:
6 6 0.03
7 216 0.95
8 5 0.02
ACGTcount: A:0.12, C:0.03, G:0.48, T:0.37
Consensus pattern (7 bp):
GGGTTAG
Found at i:238806 original size:7 final size:7
Alignment explanation
Indices: 238791--239679 Score: 1496
Period size: 7 Copynumber: 130.0 Consensus size: 7
238781 TAAGGGGTAA
238791 GGCTC-G
1 GGCTCAG
*
238797 GGCTCGG
1 GGCTCAG
*
238804 GGCTCGG
1 GGCTCAG
*
238811 GGCTCGG
1 GGCTCAG
*
238818 GGCTCGG
1 GGCTCAG
238825 GGCTC-G
1 GGCTCAG
238831 GGCTC-G
1 GGCTCAG
*
238837 GGCTCGG
1 GGCTCAG
*
238844 GGCTCGG
1 GGCTCAG
238851 GGCTC-G
1 GGCTCAG
*
238857 GGCTCGG
1 GGCTCAG
*
238864 GGCTCGG
1 GGCTCAG
*
238871 GGCTCGG
1 GGCTCAG
238878 GGCTC-G
1 GGCTCAG
238884 GG--C-G
1 GGCTCAG
*
238888 GGCTCGG
1 GGCTCAG
238895 GGCTC-G
1 GGCTCAG
*
238901 GGCTCGG
1 GGCTCAG
*
238908 GGCTCGG
1 GGCTCAG
238915 GGCTC-G
1 GGCTCAG
238921 GGCTC-G
1 GGCTCAG
**
238927 GG--GGG
1 GGCTCAG
238932 GGCTC-G
1 GGCTCAG
*
238938 GGCTCGG
1 GGCTCAG
238945 GGCTC-G
1 GGCTCAG
238951 GGCTC-G
1 GGCTCAG
238957 GGCTC-G
1 GGCTCAG
238963 GGCTC-G
1 GGCTCAG
238969 GGCTCAG
1 GGCTCAG
238976 GGCTCAG
1 GGCTCAG
238983 GGCTCAG
1 GGCTCAG
238990 GGCTCAG
1 GGCTCAG
238997 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239004 GGCTCA-
1 GGCTCAG
239010 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239017 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239024 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239031 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239038 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239045 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239052 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239059 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239066 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239073 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239080 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239087 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239094 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239101 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239108 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239115 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239122 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239129 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239136 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239143 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239150 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239157 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239164 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239171 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239178 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239185 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239192 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239199 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239206 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239213 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239220 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239227 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239234 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239241 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239248 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239255 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239262 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239269 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239276 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239283 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239290 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239297 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239304 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239311 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239318 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239325 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239332 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239339 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239346 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239353 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239360 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239367 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239374 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239381 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239388 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239395 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239402 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239409 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239416 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239423 GGCTCA-
1 GGCTCAG
239429 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239436 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239443 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239450 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239457 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239464 GGCTCA-
1 GGCTCAG
239470 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239477 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239484 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239491 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239498 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239505 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239512 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239519 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239526 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239533 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239540 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239547 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239554 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239561 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239568 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239575 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239582 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239589 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239596 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239603 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239610 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239617 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239624 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239631 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239638 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239645 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239652 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239659 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239666 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239673 GGCTCAG
1 GGCTCAG
239680 CTTATTAAAC
Statistics
Matches: 866, Mismatches: 2, Indels: 29
0.97 0.00 0.03
Matches are distributed among these distances:
4 4 0.00
5 3 0.00
6 90 0.10
7 769 0.89
ACGTcount: A:0.11, C:0.29, G:0.45, T:0.14
Consensus pattern (7 bp):
GGCTCAG
Found at i:240993 original size:23 final size:23
Alignment explanation
Indices: 240967--241011 Score: 72
Period size: 23 Copynumber: 2.0 Consensus size: 23
240957 CACCACAGCT
*
240967 CGTATAATTGCACCGAAGTGCCG
1 CGTAGAATTGCACCGAAGTGCCG
*
240990 CGTAGAATTGCACCGTAGTGCC
1 CGTAGAATTGCACCGAAGTGCC
241012 ATATAATGAT
Statistics
Matches: 20, Mismatches: 2, Indels: 0
0.91 0.09 0.00
Matches are distributed among these distances:
23 20 1.00
ACGTcount: A:0.24, C:0.27, G:0.27, T:0.22
Consensus pattern (23 bp):
CGTAGAATTGCACCGAAGTGCCG
Found at i:241178 original size:150 final size:149
Alignment explanation
Indices: 240987--241294 Score: 544
Period size: 150 Copynumber: 2.1 Consensus size: 149
240977 CACCGAAGTG
*
240987 CCGCGTAGAATTGCACCGTAGTGCCATATAATGATGTCCATAAGGACCACATATAATTCCTTAAG
1 CCGCGTAGAATTGCACCGTAGTGCCATATAATGATGTCCATAAGGACCACATAGAATTCCTTAAG
* * *
241052 AATCATATACATATACTAGGGATCAAGTATGTGTCTTTCCAAGACTTCACACATGTTCCACAGAA
66 AATCATATACATATACTAAGGATCAAGTATGTGTCTTT-CAAGACCTCACACATGTTCCAAAGAA
*
241117 TATATATATATCCCGAAGAA
130 TATACATATATCCCGAAGAA
241137 CCGCGTAGAATTGCACCGTAGTGCCATATAATGATGTCCATAAGGACCACATAGAATTCCTTAAG
1 CCGCGTAGAATTGCACCGTAGTGCCATATAATGATGTCCATAAGGACCACATAGAATTCCTTAAG
241202 AATCATATACATATACTAAGGATCAAGTATGTGTCTTTCAAGACCTCACACATGTTCCAAAGAAT
66 AATCATATACATATACTAAGGATCAAGTATGTGTCTTTCAAGACCTCACACATGTTCCAAAGAAT
* *
241267 ATACATATGTCCCGAAGGA
131 ATACATATATCCCGAAGAA
241286 CCGCGTAGA
1 CCGCGTAGA
241295 CCCTCTACCC
Statistics
Matches: 151, Mismatches: 7, Indels: 1
0.95 0.04 0.01
Matches are distributed among these distances:
149 50 0.33
150 101 0.67
ACGTcount: A:0.35, C:0.22, G:0.17, T:0.27
Consensus pattern (149 bp):
CCGCGTAGAATTGCACCGTAGTGCCATATAATGATGTCCATAAGGACCACATAGAATTCCTTAAG
AATCATATACATATACTAAGGATCAAGTATGTGTCTTTCAAGACCTCACACATGTTCCAAAGAAT
ATACATATATCCCGAAGAA
Found at i:241807 original size:19 final size:20
Alignment explanation
Indices: 241770--241807 Score: 58
Period size: 20 Copynumber: 1.9 Consensus size: 20
241760 TTTTTTCTCA
*
241770 TGGGGGAATCGGTTCCCCCC
1 TGGGGGAATCGATTCCCCCC
*
241790 TGGGGGTATCGATTCCCC
1 TGGGGGAATCGATTCCCC
241808 TCCAGCATTC
Statistics
Matches: 16, Mismatches: 2, Indels: 0
0.89 0.11 0.00
Matches are distributed among these distances:
20 16 1.00
ACGTcount: A:0.11, C:0.32, G:0.34, T:0.24
Consensus pattern (20 bp):
TGGGGGAATCGATTCCCCCC
Found at i:243904 original size:2 final size:2
Alignment explanation
Indices: 243897--243923 Score: 54
Period size: 2 Copynumber: 13.5 Consensus size: 2
243887 ATTAATTCTA
243897 AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT A
1 AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT A
243924 AGCACTGCAC
Statistics
Matches: 25, Mismatches: 0, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
2 25 1.00
ACGTcount: A:0.52, C:0.00, G:0.00, T:0.48
Consensus pattern (2 bp):
AT
Found at i:244259 original size:7 final size:7
Alignment explanation
Indices: 244247--244342 Score: 192
Period size: 7 Copynumber: 13.7 Consensus size: 7
244237 CGCTCTTGCA
244247 GGGTTCG
1 GGGTTCG
244254 GGGTTCG
1 GGGTTCG
244261 GGGTTCG
1 GGGTTCG
244268 GGGTTCG
1 GGGTTCG
244275 GGGTTCG
1 GGGTTCG
244282 GGGTTCG
1 GGGTTCG
244289 GGGTTCG
1 GGGTTCG
244296 GGGTTCG
1 GGGTTCG
244303 GGGTTCG
1 GGGTTCG
244310 GGGTTCG
1 GGGTTCG
244317 GGGTTCG
1 GGGTTCG
244324 GGGTTCG
1 GGGTTCG
244331 GGGTTCG
1 GGGTTCG
244338 GGGTT
1 GGGTT
244343 TAGGGTTTAG
Statistics
Matches: 89, Mismatches: 0, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
7 89 1.00
ACGTcount: A:0.00, C:0.14, G:0.57, T:0.29
Consensus pattern (7 bp):
GGGTTCG
Found at i:244348 original size:7 final size:7
Alignment explanation
Indices: 244338--251632 Score: 12511
Period size: 7 Copynumber: 1065.6 Consensus size: 7
244328 TCGGGGTTCG
244338 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244345 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244352 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244359 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244366 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244373 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244380 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244387 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244394 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244401 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244408 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244415 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244422 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244429 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244436 -GGTTTA
1 GGGTTTA
244442 GGG-TTA
1 GGGTTTA
244448 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244455 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244462 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244469 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244476 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244483 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244490 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244497 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244504 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244511 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244518 -GGTTTA
1 GGGTTTA
244524 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244531 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244538 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244545 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244552 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244559 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244566 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244573 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244580 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244587 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244594 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244601 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244608 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244615 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244622 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244629 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244636 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244643 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244650 GGGTTTTA
1 GGG-TTTA
244658 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244665 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244672 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244679 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244686 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244693 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244700 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244707 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244714 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244721 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244728 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244735 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244742 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244749 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244756 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244763 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244770 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244777 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244784 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244791 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244798 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244805 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244812 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244819 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244826 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244833 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244840 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244847 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244854 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244861 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244868 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244875 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244882 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244889 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244896 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244903 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244910 GGG-TTA
1 GGGTTTA
244916 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244923 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244930 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244937 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244944 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244951 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244958 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244965 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244972 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244979 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244986 GGGTTTA
1 GGGTTTA
244993 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245000 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245007 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245014 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245021 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245028 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245035 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245042 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245049 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245056 GGG-TTA
1 GGGTTTA
245062 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245069 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245076 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245083 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245090 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245097 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245104 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245111 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245118 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245125 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245132 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245139 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245146 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245153 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245160 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245167 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245174 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245181 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245188 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245195 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245202 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245209 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245216 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245223 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245230 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245237 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245244 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245251 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245258 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245265 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245272 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245279 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245286 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245293 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245300 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245307 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245314 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245321 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245328 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245335 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245342 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245349 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245356 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245363 GGG-TTA
1 GGGTTTA
245369 GGG-TTA
1 GGGTTTA
245375 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245382 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245389 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245396 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245403 -GGTTTA
1 GGGTTTA
245409 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245416 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245423 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245430 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245437 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245444 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245451 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245458 -GGTTTA
1 GGGTTTA
245464 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245471 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245478 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245485 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245492 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245499 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245506 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245513 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245520 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245527 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245534 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245541 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245548 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245555 -GGTTTA
1 GGGTTTA
245561 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245568 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245575 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245582 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245589 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245596 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245603 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245610 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245617 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245624 -GGTTTA
1 GGGTTTA
245630 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245637 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245644 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245651 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245658 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245665 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245672 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245679 GGG-TTA
1 GGGTTTA
245685 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245692 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245699 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245706 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245713 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245720 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245727 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245734 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245741 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245748 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245755 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245762 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245769 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245776 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245783 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245790 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245797 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245804 GGGTTTTA
1 GGG-TTTA
245812 GGG-TTA
1 GGGTTTA
245818 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245825 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245832 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245839 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245846 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245853 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245860 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245867 GGGTTTTTTA
1 GGG---TTTA
245877 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245884 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245891 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245898 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245905 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245912 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245919 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245926 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245933 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245940 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245947 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245954 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245961 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245968 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245975 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245982 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245989 GGGTTTA
1 GGGTTTA
245996 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246003 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246010 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246017 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246024 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246031 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246038 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246045 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246052 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246059 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246066 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246073 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246080 GGGTTTTA
1 GGG-TTTA
246088 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246095 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246102 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246109 GGG-TTA
1 GGGTTTA
246115 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246122 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246129 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246136 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246143 -GGTTTA
1 GGGTTTA
246149 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246156 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246163 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246170 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246177 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246184 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246191 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246198 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246205 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246212 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246219 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246226 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246233 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246240 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246247 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246254 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246261 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246268 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246275 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246282 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246289 -GG-TTA
1 GGGTTTA
246294 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246301 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246308 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246315 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246322 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246329 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246336 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246343 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246350 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246357 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246364 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246371 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246378 -GGTTTA
1 GGGTTTA
246384 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246391 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246398 -GGTTTA
1 GGGTTTA
246404 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246411 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246418 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246425 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246432 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246439 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246446 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246453 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246460 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246467 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246474 -GGTTTA
1 GGGTTTA
246480 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246487 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246494 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246501 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246508 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246515 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246522 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246529 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246536 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246543 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246550 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246557 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246564 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246571 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246578 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246585 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246592 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246599 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246606 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246613 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246620 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246627 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246634 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246641 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246648 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246655 -GGTTTA
1 GGGTTTA
246661 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246668 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246675 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246682 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246689 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246696 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246703 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246710 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246717 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246724 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246731 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246738 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246745 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246752 GGG-TTA
1 GGGTTTA
246758 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246765 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246772 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246779 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246786 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246793 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246800 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246807 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246814 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246821 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246828 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246835 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246842 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246849 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246856 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246863 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246870 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246877 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246884 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246891 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246898 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246905 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246912 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246919 GGG-TTA
1 GGGTTTA
246925 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246932 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246939 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246946 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246953 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246960 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246967 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246974 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246981 GGGTTTA
1 GGGTTTA
246988 GGGTTTTA
1 GGG-TTTA
246996 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247003 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247010 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247017 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247024 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247031 GGG-TTA
1 GGGTTTA
247037 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247044 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247051 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247058 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247065 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247072 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247079 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247086 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247093 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247100 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247107 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247114 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247121 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247128 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247135 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247142 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247149 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247156 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247163 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247170 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247177 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247184 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247191 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247198 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247205 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247212 -GGTTTA
1 GGGTTTA
247218 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247225 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247232 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247239 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247246 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247253 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247260 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247267 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247274 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247281 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247288 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247295 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247302 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247309 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247316 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247323 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247330 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247337 -GGTTTA
1 GGGTTTA
247343 -GGTTTA
1 GGGTTTA
247349 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247356 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247363 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247370 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247377 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247384 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247391 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247398 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247405 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247412 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247419 -GGTTTA
1 GGGTTTA
247425 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247432 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247439 -GGTTTA
1 GGGTTTA
247445 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247452 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247459 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247466 -GGTTTA
1 GGGTTTA
247472 GGG-TTA
1 GGGTTTA
247478 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247485 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247492 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247499 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247506 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247513 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247520 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247527 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247534 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247541 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247548 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247555 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247562 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247569 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247576 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247583 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247590 -GGTTTA
1 GGGTTTA
247596 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247603 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247610 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247617 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247624 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247631 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247638 -GGTTTA
1 GGGTTTA
247644 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247651 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247658 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247665 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247672 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247679 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247686 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247693 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247700 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247707 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247714 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247721 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247728 -GGTTTA
1 GGGTTTA
247734 GGG-TTA
1 GGGTTTA
247740 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247747 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247754 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247761 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247768 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247775 GGG-TTA
1 GGGTTTA
247781 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247788 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247795 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247802 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247809 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247816 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247823 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247830 -GGTTTA
1 GGGTTTA
247836 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247843 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247850 -GGTTTA
1 GGGTTTA
247856 GGG-TTA
1 GGGTTTA
247862 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247869 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247876 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247883 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247890 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247897 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247904 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247911 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247918 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247925 GGG-TTA
1 GGGTTTA
247931 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247938 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247945 -GGTTTA
1 GGGTTTA
247951 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247958 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247965 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247972 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247979 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247986 GGG-TTA
1 GGGTTTA
247992 GGGTTTA
1 GGGTTTA
247999 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248006 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248013 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248020 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248027 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248034 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248041 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248048 -GGTTTA
1 GGGTTTA
248054 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248061 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248068 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248075 -GGTTTA
1 GGGTTTA
248081 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248088 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248095 GGGTTTTA
1 GGG-TTTA
248103 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248110 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248117 -GGTTTA
1 GGGTTTA
248123 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248130 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248137 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248144 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248151 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248158 -GGTTTA
1 GGGTTTA
248164 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248171 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248178 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248185 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248192 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248199 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248206 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248213 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248220 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248227 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248234 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248241 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248248 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248255 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248262 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248269 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248276 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248283 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248290 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248297 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248304 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248311 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248318 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248325 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248332 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248339 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248346 GGGGTTTA
1 -GGGTTTA
248354 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248361 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248368 GGG-TTA
1 GGGTTTA
248374 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
248381 GGGGTTA
1 GGGTTTA
*
248388 GGGTTTT
1 GGGTTTA
248395 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248402 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248409 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248416 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
248423 GGTTTTTA
1 GG-GTTTA
248431 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248438 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248445 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248452 -GGTTTA
1 GGGTTTA
248458 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248465 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248472 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248479 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248486 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248493 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248500 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248507 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248514 GGG-TTA
1 GGGTTTA
248520 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248527 -GGTTTA
1 GGGTTTA
248533 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248540 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248547 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248554 --G-TTA
1 GGGTTTA
248558 GGG-TT-
1 GGGTTTA
248563 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248570 -GGTTTA
1 GGGTTTA
248576 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248583 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248590 GGG-TTA
1 GGGTTTA
248596 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248603 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248610 -GGTTTA
1 GGGTTTA
248616 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248623 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248630 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248637 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248644 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248651 GGG-TTA
1 GGGTTTA
248657 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248664 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248671 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248678 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248685 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248692 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248699 -GGTTTA
1 GGGTTTA
248705 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248712 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248719 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248726 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248733 GGG-TTA
1 GGGTTTA
248739 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248746 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248753 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248760 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248767 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248774 -GGTTTA
1 GGGTTTA
248780 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248787 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
248794 GGG--GA
1 GGGTTTA
248799 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248806 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248813 -GGTTTA
1 GGGTTTA
248819 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248826 GGG-TTA
1 GGGTTTA
248832 GGG-TTA
1 GGGTTTA
248838 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248845 -GGTTTA
1 GGGTTTA
248851 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248858 -GGTTTA
1 GGGTTTA
248864 -GGTTTA
1 GGGTTTA
248870 GGG-TTA
1 GGGTTTA
248876 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248883 GGG-TTA
1 GGGTTTA
248889 -GGTTTA
1 GGGTTTA
248895 -GGTTTA
1 GGGTTTA
248901 -GGTTTA
1 GGGTTTA
248907 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248914 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248921 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248928 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248935 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248942 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248949 -GGTTTA
1 GGGTTTA
248955 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248962 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248969 -GGTTTA
1 GGGTTTA
248975 -GGTTTA
1 GGGTTTA
248981 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248988 GGGTTTA
1 GGGTTTA
248995 GGG-TTA
1 GGGTTTA
249001 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249008 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249015 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249022 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249029 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249036 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249043 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249050 -GGTTTA
1 GGGTTTA
249056 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249063 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249070 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249077 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249084 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249091 GGG-TTA
1 GGGTTTA
249097 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249104 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249111 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249118 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249125 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249132 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249139 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249146 GGGTTTTA
1 GGG-TTTA
249154 GGG-TTA
1 GGGTTTA
249160 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249167 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249174 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249181 GGG-TTA
1 GGGTTTA
249187 GGGTTTTA
1 GGG-TTTA
249195 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249202 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249209 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249216 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249223 GGGTTTTA
1 GGG-TTTA
249231 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249238 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249245 GGGTTT-
1 GGGTTTA
249251 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249258 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249265 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249272 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249279 -GGTTT-
1 GGGTTTA
249284 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249291 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249298 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249305 GGGTTTTA
1 GGG-TTTA
249313 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249320 GGGTTTTA
1 GGG-TTTA
249328 --GTTTA
1 GGGTTTA
249333 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249340 GGGTTTTA
1 GGG-TTTA
249348 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249355 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249362 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249369 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249376 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249383 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249390 GGGTTTTA
1 GGG-TTTA
249398 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249405 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249412 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249419 GGGTTTTA
1 GGG-TTTA
249427 -GG-TT-
1 GGGTTTA
249431 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249438 -GGTTTA
1 GGGTTTA
249444 -GGTTTA
1 GGGTTTA
249450 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249457 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249464 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249471 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249478 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249485 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249492 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249499 GGGTTTTA
1 GGG-TTTA
*
249507 --ATTTA
1 GGGTTTA
*
249512 GGGTTTC
1 GGGTTTA
249519 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249526 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249533 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249540 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249547 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249554 GGGTTTTA
1 GGG-TTTA
249562 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249569 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249576 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249583 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249590 GGG-TTA
1 GGGTTTA
249596 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249603 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249610 -GGTTTA
1 GGGTTTA
249616 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249623 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249630 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249637 GGG-TTA
1 GGGTTTA
249643 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249650 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249657 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249664 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249671 GGGTTT-
1 GGGTTTA
249677 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249684 -GGTTTA
1 GGGTTTA
249690 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249697 GGGTTT-
1 GGGTTTA
249703 --GTTTA
1 GGGTTTA
249708 -GGTTTA
1 GGGTTTA
249714 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249721 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249728 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249735 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249742 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249749 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249756 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249763 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249770 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249777 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249784 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
249791 GGGTTTC
1 GGGTTTA
249798 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249805 -GGTTTA
1 GGGTTTA
249811 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249818 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249825 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249832 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249839 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249846 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249853 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249860 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249867 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249874 -GGTTTA
1 GGGTTTA
249880 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249887 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249894 -GG-TTA
1 GGGTTTA
249899 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249906 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249913 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249920 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249927 GGGTTT-
1 GGGTTTA
249933 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249940 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249947 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249954 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249961 -GGTTTA
1 GGGTTTA
249967 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249974 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249981 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249988 GGGTTTA
1 GGGTTTA
249995 GGGTTTA
1 GGGTTTA
250002 GGGTTTTA
1 GGG-TTTA
250010 GGGTTT-
1 GGGTTTA
250016 GGGTTTA
1 GGGTTTA
250023 GGGTTTA
1 GGGTTTA
250030 GGG-TTA
1 GGGTTTA
250036 GGG-TTA
1 GGGTTTA
250042 GGGTTTA
1 GGGTTTA
250049 -GGTTTA
1 GGGTTTA
250055 -GGTTTA
1 GGGTTTA
250061 GGGTTTA
1 GGGTTTA
250068 GGGTTTA
1 GGGTTTA
250075 GGGTTTA
1 GGGTTTA
250082 GGGTTTA
1 GGGTTTA
250089 GGGTTTA
1 GGGTTTA
250096 GGGTTTA
1 GGGTTTA
250103 GGGTTTA
1 GGGTTTA
250110 GGGTTTAA
1 GGGTTT-A
250118 GGGTTTA
1 GGGTTTA
250125 -GGTTTA
1 GGGTTTA
250131 GGGTTTA
1 GGGTTTA
250138 GGGTTTA
1 GGGTTTA
250145 GGG-TTA
1 GGGTTTA
250151 GGGTTTA
1 GGGTTTA
250158 GGGTTTA
1 GGGTTTA
250165 GGGTTTA
1 GGGTTTA
250172 GGGTTTA
1 GGGTTTA
250179 -GGTTTA
1 GGGTTTA
250185 GGG-TTA
1 GGGTTTA
250191 GGGTTTA
1 GGGTTTA
250198 GGGTTTA
1 GGGTTTA
250205 GGGTTTA
1 GGGTTTA
250212 -GG-TTA
1 GGGTTTA
250217 GGG-TTA
1 GGGTTTA
250223 GGGTTTA
1 GGGTTTA
250230 GGGTTTA
1 GGGTTTA
250237 GGGTTTA
1 GGGTTTA
250244 -GG-TTA
1 GGGTTTA
*
250249 -GTTTTA
1 GGGTTTA
250255 GGGTTTA
1 GGGTTTA
250262 GGGTTTTTA
1 GGG--TTTA
250271 GGGTTTA
1 GGGTTTA
250278 GGGTTTA
1 GGGTTTA
250285 -GGTTT-
1 GGGTTTA
250290 -GGTTTA
1 GGGTTTA
250296 GGGTTTA
1 GGGTTTA
250303 GGG-TTA
1 GGGTTTA
250309 GGGTTTA
1 GGGTTTA
250316 -GGTTTA
1 GGGTTTA
250322 GGGTTTA
1 GGGTTTA
250329 GGGTTTA
1 GGGTTTA
250336 -GGTTTA
1 GGGTTTA
250342 GGGTTTA
1 GGGTTTA
250349 -GGTTT-
1 GGGTTTA
250354 GGGTTTA
1 GGGTTTA
250361 GGG-TTA
1 GGGTTTA
250367 GGGTTTA
1 GGGTTTA
250374 GGGTTTA
1 GGGTTTA
250381 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
250388 GGTTTTA
1 GGGTTTA
250395 GGGTTTA
1 GGGTTTA
250402 GGGTTTA
1 GGGTTTA
250409 GGG-TTA
1 GGGTTTA
250415 GGGTTTA
1 GGGTTTA
250422 GGGTTTA
1 GGGTTTA
250429 GGGTTTA
1 GGGTTTA
250436 GGGTTTA
1 GGGTTTA
250443 GGGTTTA
1 GGGTTTA
250450 GGGTTTA
1 GGGTTTA
250457 -GGTTTA
1 GGGTTTA
250463 GGGTTTA
1 GGGTTTA
250470 GGGTTTA
1 GGGTTTA
250477 GGGTTTA
1 GGGTTTA
250484 GGGTTTA
1 GGGTTTA
250491 -GGTTT-
1 GGGTTTA
250496 GGGTTTA
1 GGGTTTA
250503 GGGTTTA
1 GGGTTTA
250510 GGGTTTA
1 GGGTTTA
250517 GGGTTTA
1 GGGTTTA
250524 GGG-TTA
1 GGGTTTA
250530 -GGTTT-
1 GGGTTTA
250535 GGGTTTA
1 GGGTTTA
250542 GGGTTTA
1 GGGTTTA
250549 -GGTTTA
1 GGGTTTA
250555 GGGTTTA
1 GGGTTTA
250562 GGGTTTA
1 GGGTTTA
250569 GGGTTTA
1 GGGTTTA
250576 GGGTTTA
1 GGGTTTA
250583 GGGTTTA
1 GGGTTTA
250590 GGGTTTA
1 GGGTTTA
250597 GGGTTTA
1 GGGTTTA
250604 GGGTTTA
1 GGGTTTA
250611 GGGTTTA
1 GGGTTTA
250618 GGGTTTA
1 GGGTTTA
250625 GGG-TTA
1 GGGTTTA
*
250631 GGG-GTA
1 GGGTTTA
250637 -GGTTTA
1 GGGTTTA
*
250643 GGGTTTC
1 GGGTTTA
250650 GGG-TTA
1 GGGTTTA
250656 GGGGTTTA
1 -GGGTTTA
250664 GGGTTTA
1 GGGTTTA
250671 -GGTTTA
1 GGGTTTA
250677 GGGTTTA
1 GGGTTTA
250684 GGGTTTA
1 GGGTTTA
250691 GGGTTTA
1 GGGTTTA
250698 GGGTGTTA
1 GGGT-TTA
250706 GGGTTTA
1 GGGTTTA
250713 GGGTTTA
1 GGGTTTA
250720 GGGTTT-
1 GGGTTTA
250726 GGG-TTA
1 GGGTTTA
*
250732 GGG-GTA
1 GGGTTTA
250738 GGGTTTA
1 GGGTTTA
250745 GGGTTTA
1 GGGTTTA
250752 GGG-TTA
1 GGGTTTA
250758 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
250765 -GGTTGA
1 GGGTTTA
250771 GGGTTTTTTA
1 GGG---TTTA
250781 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
250788 GGGTGTA
1 GGGTTTA
250795 GGGTTTA
1 GGGTTTA
250802 GGGTTTA
1 GGGTTTA
250809 GGGTTTA
1 GGGTTTA
250816 GGGTTTA
1 GGGTTTA
250823 GGGTTTA
1 GGGTTTA
250830 GGGTTTA
1 GGGTTTA
250837 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
250844 GGGTTTT
1 GGGTTTA
*
250851 GGGTTTC
1 GGGTTTA
250858 GGG-TTA
1 GGGTTTA
250864 -GGTTTA
1 GGGTTTA
250870 GGGTTTA
1 GGGTTTA
250877 GGGTTTA
1 GGGTTTA
250884 GGGTTTA
1 GGGTTTA
250891 GGGTTT-
1 GGGTTTA
250897 GGGTTTA
1 GGGTTTA
250904 GGGTTTA
1 GGGTTTA
250911 GGGTTTA
1 GGGTTTA
250918 GGGTTTA
1 GGGTTTA
250925 GGG-TTA
1 GGGTTTA
*
250931 GGGTTTC
1 GGGTTTA
250938 GGGTTTA
1 GGGTTTA
250945 GGGTTT-
1 GGGTTTA
250951 GGGTTTA
1 GGGTTTA
250958 -GGTTTA
1 GGGTTTA
250964 GGGTTTA
1 GGGTTTA
250971 GGGTTTA
1 GGGTTTA
250978 -GG-TTA
1 GGGTTTA
250983 -GGTTTA
1 GGGTTTA
250989 GGG-TTA
1 GGGTTTA
250995 GGG-TTA
1 GGGTTTA
251001 GGGTTTA
1 GGGTTTA
251008 GGGTTT-
1 GGGTTTA
251014 GGGTTTA
1 GGGTTTA
251021 -GGTTTA
1 GGGTTTA
251027 GGG-TT-
1 GGGTTTA
251032 GGGTTTA
1 GGGTTTA
251039 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
251046 GGTTTTA
1 GGGTTTA
251053 GGGTTTA
1 GGGTTTA
251060 GGGTTTA
1 GGGTTTA
251067 -GGTTTA
1 GGGTTTA
251073 GGGTTTTA
1 GGG-TTTA
251081 GGGTTTTTA
1 GGG--TTTA
*
251090 GGG-TTC
1 GGGTTTA
251096 GAGGTTTA
1 G-GGTTTA
251104 GGGTTTA
1 GGGTTTA
251111 GGGTTTA
1 GGGTTTA
251118 GGGTTTA
1 GGGTTTA
251125 GGGTTTTA
1 GGG-TTTA
251133 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
251140 GGGGTT-
1 GGGTTTA
251146 GGGTTTA
1 GGGTTTA
251153 GGGTTTTA
1 GGG-TTTA
251161 -GGTTTA
1 GGGTTTA
*
251167 GGGGTTA
1 GGGTTTA
251174 GGGTTTA
1 GGGTTTA
251181 GGGTTTA
1 GGGTTTA
251188 GGGTTTA
1 GGGTTTA
251195 GGG-TTA
1 GGGTTTA
251201 GGGTTTA
1 GGGTTTA
251208 -GGTTTA
1 GGGTTTA
251214 GGG-TT-
1 GGGTTTA
251219 GGG-TTA
1 GGGTTTA
251225 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
251232 GGGGTTTC
1 -GGGTTTA
251240 GGGTTTA
1 GGGTTTA
251247 GGGTTTA
1 GGGTTTA
251254 GGG-TTA
1 GGGTTTA
251260 GGGTTTA
1 GGGTTTA
251267 GGGTTT-
1 GGGTTTA
* *
251273 --TTTTG
1 GGGTTTA
251278 GGGTTTA
1 GGGTTTA
251285 GGG-TTA
1 GGGTTTA
251291 GGGTTTA
1 GGGTTTA
251298 -GG-TTA
1 GGGTTTA
251303 GGGTTTA
1 GGGTTTA
251310 GGGTTTA
1 GGGTTTA
251317 GGGTTTA
1 GGGTTTA
251324 GGGTTTTA
1 GGG-TTTA
251332 GTTGGTTTA
1 G--GGTTTA
251341 GGGTTTA
1 GGGTTTA
251348 -GGTTTA
1 GGGTTTA
251354 GGG-TTA
1 GGGTTTA
*
251360 GGGTTGGA
1 GGGTT-TA
251368 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
251375 GGGTTTG
1 GGGTTTA
251382 GAGGTTTA
1 G-GGTTTA
251390 GGGTTTA
1 GGGTTTA
251397 GGGTTTA
1 GGGTTTA
251404 GGGTTTA
1 GGGTTTA
251411 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
251418 GGG-GTA
1 GGGTTTA
251424 -GGTTTA
1 GGGTTTA
251430 GGG-TTA
1 GGGTTTA
251436 GGGTTTA
1 GGGTTTA
251443 GGG-TTA
1 GGGTTTA
251449 GGGTTTA
1 GGGTTTA
251456 GGG-TT-
1 GGGTTTA
251461 GGG-TTA
1 GGGTTTA
251467 -GGTTTA
1 GGGTTTA
251473 GGGTTTTA
1 GGG-TTTA
251481 GGGTTTA
1 GGGTTTA
251488 GGG-TTA
1 GGGTTTA
251494 GGGTTTA
1 GGGTTTA
251501 GGG-TT-
1 GGGTTTA
251506 GGGTTTA
1 GGGTTTA
251513 GGGTTTA
1 GGGTTTA
251520 GGGGTTTA
1 -GGGTTTA
251528 GGGTTT-
1 GGGTTTA
251534 GGGTTT-
1 GGGTTTA
251540 -GG-TT-
1 GGGTTTA
251544 GGG-TTA
1 GGGTTTA
251550 -GGTTTA
1 GGGTTTA
251556 GGGTTTA
1 GGGTTTA
251563 GGGTTTA
1 GGGTTTA
251570 GGGTTTA
1 GGGTTTA
251577 GGGTTTA
1 GGGTTTA
251584 GGG-TTA
1 GGGTTTA
251590 GGGTTT-
1 GGGTTTA
251596 GGGTTTA
1 GGGTTTA
251603 GGGTTTA
1 GGGTTTA
251610 GGGTTTA
1 GGGTTTA
251617 --GTTTA
1 GGGTTTA
251622 GGGTTTA
1 GGGTTTA
251629 GGGT
1 GGGT
Statistics
Matches: 7011, Mismatches: 52, Indels: 450
0.93 0.01 0.06
Matches are distributed among these distances:
4 12 0.00
5 89 0.01
6 904 0.13
7 5781 0.82
8 190 0.03
9 20 0.00
10 15 0.00
ACGTcount: A:0.14, C:0.00, G:0.43, T:0.43
Consensus pattern (7 bp):
GGGTTTA
Done.