Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: VEPZ01007659.1 Hibiscus syriacus cultivar Beakdansim tig00025513_pilon, whole genome shotgun sequence
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GGTCAACGGGTCG
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1 CGGGTCGGGTCAACGGGT
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1 CGGGTCGGGTCAACGGGT
*
21876 ----TCGGGTAAACGGGT
1 CGGGTCGGGTCAACGGGT
*
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CGGGTCGGGTCAACGGGT
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21825 AACGGTTAAC
21835 GGTCAACGGGTCGGGTCAACGGGTCGGGTCG
1 GGTCAACGGGTCGGGTCAACGGGTCGGGTCG
* * *
21866 GGTCAACGGTTCGGGTAAACGGGTCGGGTTG
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GGTCAACGGGTCGGGTCAACGGGTCGGGTCG
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21811 TCCGGTCAAC
21821 GGTCAACGGTTAAC-
1 GGTCAACGGTT--CG
*
21835 GGTCAACGGGTCG
1 GGTCAACGGTTCG
21848 GGTCAACGGGTCGGGTCG
1 GGTCAAC-GGT----TCG
21866 GGTCAACGGTTCG
1 GGTCAACGGTTCG
* *
21879 GGTAAACGGGTCG
1 GGTCAACGGTTCG
21892 GGT
1 GGT
21895 TGGGTCAACG
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GGTCAACGGTTCG
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23927 CGTCACTAAC
**
23937 AGTAAGGCCTGAGCACACAGCCGAGGAACCGGTA
1 AGTAAGGCCTGAGCACACAGCCGAGGAACCGCCA
* *
23971 AGTAAGGCCCTGAGCACACAGCCGAGGAGCCTCCA
1 AGTAAGG-CCTGAGCACACAGCCGAGGAACCGCCA
24006 AGTAA
1 AGTAA
24011 TCTTCCTCCA
Statistics
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AGTAAGGCCTGAGCACACAGCCGAGGAACCGCCA
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24040 CATAATTCAA
* * *
24050 GTCAAGTATCATATCATAATTCAG
1 GTCAA-TATCAGATCAGAATCCAG
* *
24074 GTCATGTATCAGATCAGAATCCAT
1 GTCA-ATATCAGATCAGAATCCAG
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1 GTCAATATCAGATCAGAATCCAG
* *
24121 GTCAATATCATAACAGAAT
1 GTCAATATCAGATCAGAAT
24140 TCAAATTTGA
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GTCAATATCAGATCAGAATCCAG
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26637 AACTCCGGTC
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1 AACGGTCAACGGGT
26676 CGGGTCAACG
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1.00 0.00 0.00
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15 14 1.00
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AACGGTCAACGGGTT
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26633 GGTCAACTCC
26643 GGTCAAC-
1 GGTCAACG
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1 GGTCAACG
*
26658 GGTTAAC-
1 GGTCAACG
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1 GGTCAACG
26673 GGT---CG
1 GGTCAACG
26678 GGTCAACG
1 GGTCAACG
26686 GGTC
1 GGTC
26690 GGGTCGGGTC
Statistics
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GGTCAACG
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26661 TAACGGTCAA
26671 CGGGTCGGGTCAACGGGT
1 CGGGTCGGGTCAAC-GGT
26689 CGGGTCGGGTCAACGGT
1 CGGGTCGGGTCAACGGT
*
26706 ----TCGGGTAAACGGGT
1 CGGGTCGGGTCAAC-GGT
*
26720 CGGGTTGGGTCAACGGT
1 CGGGTCGGGTCAACGGT
26737 CGGGTCGGGT
1 CGGGTCGGGT
26747 TGTGACCGGT
Statistics
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26655 ACGGGTTAAC
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* * *
26696 GGTCAACGGTTCGGGTAAACGGGTCGGGTTG
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1 GGTCAACGGGTCGGGTC
26743 GGGTTGTGAC
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GGTCAACGGGTCGGGTCAACGGGTCGGGTCG
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26655 ACGGGTTAAC
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26691 GGTC
1 GGTC
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13 17 1.00
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GGTCAACGGGTCG
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26679 GTCAACGGGT
*
26689 CGGGTCGGGTCAA
1 CGGGTCGGGTAAA
*
26702 CGGTTCGGGTAAA
1 CGGGTCGGGTAAA
26715 CGGGTCGGGT
1 CGGGTCGGGT
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13 20 1.00
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CGGGTCGGGTAAA
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27514 TGTTACAATA
* * *
27524 TGAATCCAATTATTTTTCTTAGGCATGCC-A--A-TCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCT
1 TGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCT
* * * *
27585 ATCTTAATGAGTTAGAGTTATA
66 ATCTTAAAGAGTTAAAGCTATC
* *
27607 TGAATCCAATCATTTTGCTTAGGAATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCT
1 TGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCT
27672 ATCTTAAAGAGTTAAAGCTATC
66 ATCTTAAAGAGTTAAAGCTATC
*
27694 TGAATCAAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCT
1 TGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCT
27759 ATCTTAAAGAGTTAAAGCTATC
66 ATCTTAAAGAGTTAAAGCTATC
27781 TGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCT
1 TGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCT
27846 ATCTTAAAGAGTTAAAGCTATC
66 ATCTTAAAGAGTTAAAGCTATC
* * *
27868 TGAATCCAGTCAATTTCCTTAGGCATGCCAATTATTCTAAAAAAAATACTTAAAGAGTTACACCT
1 TGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCT
*
27933 ATCTTAAAGTGTTAAAGCTATC
66 ATCTTAAAGAGTTAAAGCTATC
* *
27955 T-AATTCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAAATATTCTAACAAAAATACTTAATGAGTTACACC
1 TGAA-TCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACC
*
28019 TATCTGAAAGAGTTAAAGCTATC
65 TATCTTAAAGAGTTAAAGCTATC
* * *
28042 TGAATCCGGTCATTTTGCTTAGGCATGCCACTTATTCTAACAAAAATACTTAATGAGTTACACCT
1 TGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCT
28107 ATCTTAAAGAGTTAAAGCTATC
66 ATCTTAAAGAGTTAAAGCTATC
* *
28129 TGAATCCAGTCATTTTCCTTAGGCAAGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCT
1 TGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCT
*
28194 ATCTTAAAGTGTTAAAGCTATC
66 ATCTTAAAGAGTTAAAGCTATC
*
28216 T-ATTTCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAGA-AAAAATACTTAAAGAGTTACAC
1 TGA-ATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTA-ACAAAAATACTTAAAGAGTTACAC
*
28279 CAATCTTAAAGAGTTAAAGCTATC
64 CTATCTTAAAGAGTTAAAGCTATC
*
28303 TGAATCTAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCT
1 TGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCT
28368 ATCTTAAAGAGTTAAAGCTATC
66 ATCTTAAAGAGTTAAAGCTATC
* * * * *
28390 TGAATCCAATCATTTTCCTTAGGCAAGCCAATTATTCTAACAAAAATAC-TAAAGTGTTACACAT
1 TGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCT
*
28454 ATCTTAAAGAGTTAAAGCTAAC
66 ATCTTAAAGAGTTAAAGCTATC
* * * *
28476 TGAATCCAGACATTTTGCTTAAGCATGCCAATTTTTCTAACAAAAATACTTAAATAGTTACACCT
1 TGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCT
* * *
28541 ATCTTAATGAGATAAAGCTATA
66 ATCTTAAAGAGTTAAAGCTATC
* * *
28563 TGAATCCAATTATTTTTCTTAGGCATGCC-A--A-TCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCT
1 TGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCT
* * * *
28624 ATCTTAATGAGTTAGAGTTATA
66 ATCTTAAAGAGTTAAAGCTATC
* * * *
28646 TGAATCCAATCATTTTGCATAGGAATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTGCACCT
1 TGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCT
28711 ATCTTAAAGAGTTAAAGCTATC
66 ATCTTAAAGAGTTAAAGCTATC
* *
28733 TGAATCAAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATCCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCT
1 TGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCT
* *
28798 ATATTAAGGAGTTAAAGCTATC
66 ATCTTAAAGAGTTAAAGCTATC
* ** * *
28820 TAAATCCAACCATTTTGCTTAGGCATGCCAACTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACAT
1 TGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCT
*
28885 ATCTTAAAGAGTTAAAGCTATA
66 ATCTTAAAGAGTTAAAGCTATC
* * *
28907 TTAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCAAGCAAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCT
1 TGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCT
*
28972 ATCTTAAAGAATTAAAGCTATC
66 ATCTTAAAGAGTTAAAGCTATC
**
28994 TGAATCTTGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAAC-AAAATAACTTAAACG-GTTACAC
1 TGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAAT-ACTTAAA-GAGTTACAC
29057 CTATCTTAAAGAGTTAAAGCTATC
64 CTATCTTAAAGAGTTAAAGCTATC
29081 TGAATCCAGTCATTTT
1 TGAATCCAGTCATTTT
29097 TAACGAAAAA
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84 2 0.00
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88 5 0.00
ACGTcount: A:0.38, C:0.18, G:0.12, T:0.33
Consensus pattern (87 bp):
TGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCT
ATCTTAAAGAGTTAAAGCTATC
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27645 AACAAAAATA
*
27655 CTTAAAGAGTTACACCTAT
1 CTTAAAGAGTTAAACCTAT
*
27674 CTTAAAGAGTTAAAGCTAT
1 CTTAAAGAGTTAAACCTAT
27693 CT
1 CT
27695 GAATCAAGTC
Statistics
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0.90 0.10 0.00
Matches are distributed among these distances:
19 19 1.00
ACGTcount: A:0.38, C:0.17, G:0.12, T:0.33
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27732 AACAAAAATA
*
27742 CTTAAAGAGTTACACCTAT
1 CTTAAAGAGTTAAACCTAT
*
27761 CTTAAAGAGTTAAAGCTAT
1 CTTAAAGAGTTAAACCTAT
27780 CT
1 CT
27782 GAATCCAGTC
Statistics
Matches: 19, Mismatches: 2, Indels: 0
0.90 0.10 0.00
Matches are distributed among these distances:
19 19 1.00
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CTTAAAGAGTTAAACCTAT
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*
27829 CTTAAAGAGTTACACCTAT
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*
27848 CTTAAAGAGTTAAAGCTAT
1 CTTAAAGAGTTAAACCTAT
27867 CT
1 CT
27869 GAATCCAGTC
Statistics
Matches: 19, Mismatches: 2, Indels: 0
0.90 0.10 0.00
Matches are distributed among these distances:
19 19 1.00
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*
27916 CTTAAAGAGTTACACCTAT
1 CTTAAAGAGTTAAACCTAT
* *
27935 CTTAAAGTGTTAAAGCTAT
1 CTTAAAGAGTTAAACCTAT
27954 CT
1 CT
27956 AATTCCAGTC
Statistics
Matches: 18, Mismatches: 3, Indels: 0
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Matches are distributed among these distances:
19 18 1.00
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CTTAAAGAGTTAAACCTAT
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27514 TGTTACAATA
* * *
27524 TGAATCCAATTATTTTTCTTAGGCATGCC-A--A-TCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCT
1 TGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCT
* * * * * *
27585 ATCTTAATGAGTTAGAGTTATATGAATCCAATCATTTTGCTTAGGAATGCCAATTATTCTAACAA
66 ATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAA
*
27650 AAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCAAGTCATTTTGCTTA
131 AAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTA
27715 GGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTAT
196 GGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTAT
27780 C
261 C
27781 TGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCT
1 TGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCT
* * *
27846 ATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCAATTTCCTTAGGCATGCCAATTATTCTAAAAA
66 ATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAA
*
27911 AAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGTGTTAAAGCTATCT-AATTCCAGTCATTTTGCTT
131 AAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAA-TCCAGTCATTTTGCTT
* * *
27975 AGGCATGCCAAATATTCTAACAAAAATACTTAATGAGTTACACCTATCTGAAAGAGTTAAAGCTA
195 AGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTA
28040 TC
260 TC
* * *
28042 TGAATCCGGTCATTTTGCTTAGGCATGCCACTTATTCTAACAAAAATACTTAATGAGTTACACCT
1 TGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCT
* *
28107 ATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTCCTTAGGCAAGCCAATTATTCTAACAA
66 ATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAA
* *
28172 AAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGTGTTAAAGCTATCT-ATTTCCAGTCATTTTGCTT
131 AAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGA-ATCCAGTCATTTTGCTT
*
28236 AGGCATGCCAATTATTCTAGA-AAAAATACTTAAAGAGTTACACCAATCTTAAAGAGTTAAAGCT
195 AGGCATGCCAATTATTCTA-ACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCT
28300 ATC
259 ATC
*
28303 TGAATCTAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCT
1 TGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCT
* * *
28368 ATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAATCATTTTCCTTAGGCAAGCCAATTATTCTAACAA
66 ATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAA
* * * *
28433 AAATAC-TAAAGTGTTACACATATCTTAAAGAGTTAAAGCTAACTGAATCCAGACATTTTGCTTA
131 AAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTA
* * * * *
28497 AGCATGCCAATTTTTCTAACAAAAATACTTAAATAGTTACACCTATCTTAATGAGATAAAGCTAT
196 GGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTAT
*
28562 A
261 C
* * *
28563 TGAATCCAATTATTTTTCTTAGGCATGCC-A--A-TCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCT
1 TGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCT
* * * * * * *
28624 ATCTTAATGAGTTAGAGTTATATGAATCCAATCATTTTGCATAGGAATGCCAATTATTCTAACAA
66 ATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAA
* *
28689 AAATACTTAAAGAGTTGCACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCAAGTCATTTTGCTTA
131 AAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTA
* * *
28754 GGCATGCCAATTATCCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCTATATTAAGGAGTTAAAGCTAT
196 GGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTAT
28819 C
261 C
* ** * *
28820 TAAATCCAACCATTTTGCTTAGGCATGCCAACTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACAT
1 TGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCT
* * * *
28885 ATCTTAAAGAGTTAAAGCTATATTAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCAAGCAAATTATTCTAACAA
66 ATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAA
* **
28950 AAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAATTAAAGCTATCTGAATCTTGTCATTTTGCTTA
131 AAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTA
29015 GGCATGCCAATTATTCTAAC-AAAATAACTTAAACG-GTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCT
196 GGCATGCCAATTATTCTAACAAAAAT-ACTTAAA-GAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCT
29078 ATC
259 ATC
* **
29081 TGAATCCAGTCA--TT--TT-----T----A--A--C---GAAAAA-ACTTAACTAGTTACACCT
1 TGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCT
* * * * * *
29125 ATCTTAAAAAGTTAAAGCTATATGAATCCATTCATTTTGCTTTGGCAAGCAAATTATTCTAACAA
66 ATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAA
29190 AAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTA
131 AAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTA
* *
29255 GGCATGCCAATTATTCTAAC-AAAATAACTTAAACAGTTACACCTATATTAAAGAGTTAAAGCTA
196 GGCATGCCAATTATTCTAACAAAAAT-ACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTA
29319 TC
260 TC
** *
29321 TGAATCCAACCATTTTGCTTAGGCTTGCCAATTATTCT-------A-AC---AA-A---A-A--T
1 TGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCT
* *
29368 A-CTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGCCATTTTGCTTAGGCATGCAAATTATTCTAACAA
66 ATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAA
* * * *
29432 AAATACTTAAAGAGTTACGCCTATCTTAATGAGTTAAAGCTATATGAATCCAATCATTTTGCATT
131 AAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGC-TT
*
29497 -GGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCTACCTTAAAGAGTTAAAGCTA
195 AGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTA
29561 TC
260 TC
*
29563 TGAATCCAATCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAA-AAGAAATACTTAAAGAGTTACACC
1 TGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAA-AAATACTTAAAGAGTTACACC
29627 TATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTG-A---A-TC------C--A---AT--C-ATT-TT-TAACA
65 TATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACA
* * ** * * * *
29671 AAAAAACTTAAATAAATACACCTATATTAAAAAGTTAAAGCTATATGAATCCTGTCATTTTGCTT
130 AAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTT
* *
29736 AGGCAAGCAAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTA
195 AGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTA
29801 TC
260 TC
29803 TGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAAC-AAAATAACTTAAACG-GTTACAC
1 TGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAAT-ACTTAAA-GAGTTACAC
*
29866 CTATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCA--TT--TT-----T----A--A--C---G
64 CTATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAAC
** * *
29911 AAAAA-ACTTAACTAGTTACACCTATCTTAAAAAGTTAAAGCTATATGAATCCAGTCATTTTGCT
129 AAAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCT
* * *
29975 TTGGCAAGCAAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCT
194 TAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCT
30040 ATC
259 ATC
*
30043 TGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAAC-AAAATAACTTAAACAGTTACACC
1 TGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAAT-ACTTAAAGAGTTACACC
* ** *
30107 TATATTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAACCATTTTGCTTAGGCTTGCCAATTATTCT----
65 TATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACA
*
30168 ---A-AC---AA-A---A-A--TA-CTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGCCATTTTGCTT
130 AAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTT
* * * *
30218 AGGCATGCAAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACGCCTATCTTAAATAGTGAAAGCTA
195 AGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTA
*
30283 AC
260 TC
* * * *
30285 TGAATCCAATCATTTGGCTTAGGCATTCCAATT-TTCCTAACAAAAATACTTAAAGATTTACACC
1 TGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATT-CTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACC
* *
30349 TATCTTAATGAGTTAAAGCTATATGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCC-ATATATTCTAAC
65 TATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAAT-TATTCTAAC
* * * *
30413 AAAAATACTTAAAGAGTAACACCTACCATAAAGAGTTAAAGTTATCTGAATCCAGTCATTTTGCT
129 AAAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCT
*
30478 TAGGCATGCCAATTATTCTAAAAAAAATACTTAAAGAGTTACA-CTAATCTTAAAGAGTTAAAGC
194 TAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCT-ATCTTAAAGAGTTAAAGC
30542 TATC
258 TATC
* * *
30546 TGAATCCAGTCATATTTGCTTAGGCATGCCAATTATACTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACTCA
1 TGAATCCAGTCAT-TTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACC
* * * * **
30611 TTTCTTAAAGAGCTAAAGCCATCTAAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATAACAATTATTCTAACA
65 TATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACA
* * * * *
30676 AAAAAACTTAATGAGTTACACCTATCTTTAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAATTATTTTGCTT
130 AAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTT
* * * * *
30741 AGGCATGCCAGTTTTTCTAAAAAAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTATAGTGTTAAAGCTA
195 AGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTA
30806 TC
260 TC
* * *
30808 T-ATTTCCAGTCATTTTGCTTAGGCAAGCCAATTATTCTAGCAAAAATACTTAAAGAGTTACACC
1 TGA-ATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACC
* *
30872 AATCCTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACA
65 TATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACA
*
30937 AAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAATCATTATT-CT
130 AAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATT-TTGCT
* * * *
31001 TAGGCAAGCCAAATATTCTAACAAAAATAC-TAAAGTGTTACACGTATCTTAAAGAGTTAAAGCT
194 TAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCT
*
31065 AAC
259 ATC
* * * *
31068 TGAATCCAGTCATTTTGCTTAAGCATGCCAATTGTTCTAACAAAAATAATTAAATAGTTACACCT
1 TGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCT
* * * * *
31133 ATCTTAATGAGTTAAAGCTATATGAATCCAATTATTTTTCTTAGGCATGCC-A--A-TCTAACAA
66 ATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAA
* * * * * * *
31194 AAATAATTAAAGAGTTACACCTATTTTAATGAGTTAGAGTTATATGAATCCAATCATTTTGCTTA
131 AAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTA
* *
31259 GGAATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAATGAGTTAAAGCTAT
196 GGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTAT
31324 C
261 C
*
31325 TGAATCAAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCT
1 TGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCT
* *
31390 ATCTTAAAGAATTAAAGCTATCTGAATCTAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAAC-A
66 ATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAA
*
31454 AAATAACTTAAACG-GTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCGGAATCCAGTCA--TT--T
131 AAAT-ACTTAAA-GAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCT
* * *
31514 T-----T----A--A--C---GAAAAA-ACTTAAATAGTTACACCTATCTTAAAAAGTTAAAGCT
194 TAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCT
*
31562 ATA
259 ATC
* * * *
31565 TGAATCCATTCATTTTGCTTAGGCAAGCAAATTATTCCAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCT
1 TGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCT
31630 ATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAAC-A
66 ATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAA
* * **
31694 AAATAACTTAAACAGTTACACCTATCTTAAAGATTTAAAGCTATCTGAATCCAACCATTTTGCTT
131 AAAT-ACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTT
* * * *
31759 AGGCATGCAAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGTGTTACACTTATCTTAAATA-TTGAAAGCT
195 AGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTT-AAAGCT
*
31823 AAC
259 ATC
* * * **
31826 TGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCTTGCTAATTTTTCTATTAAAAATACTTAAAGAGTTACACCT
1 TGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCT
* * * *
31891 ATCTTAATGAGTTAAAGCTATATGAATCCAATCATTTTGCATT-GGCATGCAAATTATTCTAACA
66 ATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGC-TTAGGCATGCCAATTATTCTAACA
* * *
31955 AAAATACTTAAAGAGTTACACATACCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAATCATTTTGCTT
130 AAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTT
* *
32020 AGGCATGCCATTTATTCTAA-AAGAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGTGTTAAAGCT
195 AGGCATGCCAATTATTCTAACAA-AAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCT
32084 ATC
259 ATC
* * *
32087 T-AATTCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTGTTCTAACAAAAACACTGAAAGAGTTACACC
1 TGAA-TCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACC
* *
32151 TATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCAATTTGCTTAGGCATGCTAATTATTCTAAC-
65 TATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACA
*
32215 AAAATAACTTAAACG-GTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCGGAATCCAGTCA--TT--
130 AAAAT-ACTTAAA-GAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGC
* * *
32275 TT-----T----A--A--C---GAAAAA-ACTTAAATAGTTACACCTATCTTAAAAAGTTAAAGC
193 TTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGC
*
32323 TATA
258 TATC
* * * *
32327 TGAATCCATTCATGTTGCTTAGGCAAT-CAAATTATTCCAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACC
1 TGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGC-ATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACC
32391 TATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAAC-
65 TATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACA
* * * **
32455 AAAATAACTTAAACAGTTGCACCTATCTTAAAGATTTAAAGCTATCTGAATCCAACCATTTTGCT
130 AAAAT-ACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCT
* * * *
32520 TAGGCATGCAAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGTGTTACACTTATCTTAAATA-TTGAAAGC
194 TAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTT-AAAGC
*
32584 TAAC
258 TATC
* * * ** *
32588 TGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCTTGCTAATTTTTCTATTAAAAATACTTAAAAAGTTACACCT
1 TGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCT
* * *
32653 ATCTTAATGAGTTAAAGCTATATGAATCCAATCATTTTGCATT-GGCATGCCAATTATTCTAACA
66 ATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGC-TTAGGCATGCCAATTATTCTAACA
* * *
32717 AAAATACTTAAAGAGTTACACATACCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAATCATTTTGCTT
130 AAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTT
*
32782 AGGCATGCCAATTATTCTAA-AAAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGTGTTAAAGCTA
195 AGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTA
32846 TC
260 TC
* * *
32848 T-AATTCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTGTTCTAACAAAAACACTGAAAGAGTTACACC
1 TGAA-TCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACC
* *
32912 TATCTTAAAGAGATAAAGCTATCTGAATCCAGTCAATTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACA
65 TATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACA
* * *
32977 AAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAATCATTGTCCTT
130 AAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTT
* *
33042 AGGCAAGCCAATTATTCTAACAAAAATAC-TAAAGAGTTACACCTATCATAAAGAGTTAAAGCTA
195 AGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTA
*
33106 AC
260 TC
* * * *
33108 TGAATGCAGTCATTTTGCTTAAGCATGCCAATTTTTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACAT
1 TGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCT
*
33173 ATCTTAAAGAGTTAAAGCTATTTGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAA
66 ATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAA
* * * *
33238 AAATACTTAAAGAGTTACACATATCTTTAAGAGTTAAAGCTATATGAATCCAATCATTTTGCTTA
131 AAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTA
* *
33303 GGCATGCCCATTATTCTAACCAAAAATATTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTA
196 GGCATGCCAATTATTCTAA-CAAAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTA
33368 TAC
260 T-C
* * *
33371 -GAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCTATTATTCTAACAAAAATTCTCAAAGAGTTACACCT
1 TGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCT
* * ** * * ** *
33435 ATATTTAAGAGTTAAAGCTATCTGAATAGAGTAAATTTT-CTAAGGCAT-TTATATTTTTCTAAC
66 ATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGT-CATTTTGCTTAGGCATGCCA-ATTATTCTAAC
* * * * *
33498 AACAATACTTAAAGAGTTACAACTATCTTAAAGAGTTAAAGCAATCTGAATCCAGACATTTTTCT
129 AAAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCT
* * * * * *
33563 TAGGCCTGCAAATTGTACTAAAAAAAATACTTAAAGAGTTACATCTATCTTAAAGAGTTAAAGCT
194 TAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCT
33628 ATC
259 ATC
* * * *
33631 TGAATCTAGTCATTTTGCTTAGACAAGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGTGTTACACCT
1 TGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCT
* **
33696 ATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTAAATCCAACCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAA
66 ATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAA
* * * * *
33761 AAAAACTTAAAGAGTTACACCTACCTTAAAGAGTTAAAGCTATATCAATCCAGTCATTTTTCTTA
131 AAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTA
* *
33826 GGCATGCCAATTATTCTAAAAAAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGTGTTAAAGCTAT
196 GGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTAT
33891 C
261 C
* *
33892 T-AATTCCAGTCATTTTTCTAAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACC
1 TGAA-TCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACC
* * **
33956 TATCTGAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTCCTTAGGCAAACCAATTATTCTAACA
65 TATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACA
* * *
34021 AAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGTGTTAAAGCTATCT-ATTTCCAGTAATTTTGCT
130 AAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGA-ATCCAGTCATTTTGCT
*
34085 TAGGCATGCCAATTATTCTAGA-AAAAATACTTAAAGAGTTACACCAATCTTAAAGAGTTAAAGC
194 TAGGCATGCCAATTATTCTA-ACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGC
34149 TATC
258 TATC
34153 TGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAAC-AAAATACTTAAAGAGTTACACCT
1 TGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCT
* * *
34217 ATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAATCATTTTCCTTAGGCAAGCCAATTATTCTAACAA
66 ATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAA
* *
34282 AAATAC-TAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTAACTGAATCAAGTCATTTTGCTTA
131 AAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTA
* *
34346 GGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAATTAATGCTAT
196 GGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTAT
34411 C
261 C
*
34412 TGAATCTAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAAC-AAAATAACTTAAACG-GTTACAC
1 TGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAAT-ACTTAAA-GAGTTACAC
* *
34475 CTATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCGGAATCCAGTCA--TT--TT-----T----A--A--C---G
64 CTATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAAC
* * *
34520 AAAAA-ACGTAAATAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCTAGTCATTTTGCT
129 AAAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCT
* * * * * * *
34584 TAGGCATGCCATTTTTTCTAGCAAAAATACTTCAAGATTTACACCTATCTTAATGAGTTAATGCT
194 TAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCT
*
34649 ATA
259 ATC
* * * *
34652 TGAATCTAATCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAA-ATAAATAGTTAAAG-GTTACACCT
1 TGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCT
* * * * * *
34715 ATCTTAACGAGTTAATGTTATATGAATCTAATCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAA
66 ATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAA
* * * * ** *
34780 AAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAATATTTAATGTTATCTGAATCCAACCATTTTTCTTA
131 AAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTA
* *
34845 GGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTATATAGTTAAAGCTAT
196 GGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTAT
34910 C
261 C
* * *
34911 TTAATCCAGCCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAAAAC-TAAAGGAGTTACACC
1 TGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAA-GAGTTACACC
* * *
34975 TATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCTAGTCATTTTGCTTAGGCAAGCAAATTATTCTAACA
65 TATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACA
* *
35040 AAATATACTTAAAGTG-T-CA-C-A-C--------------CTATCTTAATCCAGTCATTTTGCT
130 AAA-ATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCT
* * * *
35086 TTGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAAATACTTAAGGAGTTACTCCTATCTTAAAGCGTTAAAGC
194 TAGGCATGCCAATTATTCTAAC-AAAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGC
35151 TATC
258 TATC
* * * *
35155 TGAATCCAATCATTTT-CTTATGCATGACAACTT-TTCTAA-AAAAA-ACATAAAGAGTTACACC
1 TGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAA-TTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACC
* * * * *
35216 TATATTTAAGAGTTAAATCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAGTTTTTCTAACA
65 TATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACA
* * * * *
35281 AAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAGATCTATCTAAATCCAATCAATTTGCTT
130 AAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTT
* **
35346 AGGCATGCCAATTATTCTTACAAAAATACTTAAAGAGTTACATTTATCTTAAAGAGTTAAAGCTA
195 AGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTA
35411 TC
260 TC
* * *
35413 TGAATCCAGTCATTTTGCTTTGGCATGCCAATTATTCTAACCAAAAAAAACTTAAAGAGTTATAC
1 TGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAA-C-AAAAATACTTAAAGAGTTACAC
* * *
35478 CTATATTTAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATG-CAATTTTTCTAAC
64 CTATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAAC
* * * * * *
35542 CAAAATAGTTAAAGAGTTACACTTATCTTAAATAGTTAAATCTAACTGAATCCAGTCATTTTGCT
129 AAAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCT
*
35607 TAGGCATGCCAATTTTTCTAACAAAAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGC
194 TAGGCATGCCAATTATTCTAAC-AAAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGC
35672 TATC
258 TATC
* * * *
35676 TAAATCCAGTCATTTTGCTTAAGCATTCCAATTTTTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCT
1 TGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCT
* * * * **
35741 ATCTTAATGAGTTAAAGCTATATGAATCCAATGATTTTGCTTAGGCATGATAATTATTCTAACAA
66 ATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAA
* * *
35806 AAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTACCCGAATCCAGTAATTTTGCTTA
131 AAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTA
*
35871 GGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACATCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTAT
196 GGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTAT
*
35936 A
261 C
** * * *
35937 TGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCAT-TTAATTATTCTAACAAAAATAATTAAAGAGTTCCTCCT
1 TGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCT
* * * * *
36001 GTCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCTAGTCATTTTTCTTAGGCCTGACAATTATTCTAACAA
66 ATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAA
* * * * * * * * *
36066 AAAAACTTAAGGAGTTACACATTTCTTAACGAGTTAATGCTATATGAATCTAATCATTTTGCTTA
131 AAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTA
*
36131 GGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTCAAGCTAT
196 GGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTAT
36196 C
261 C
** * * * ** * *
36197 TGAATCCAACCATTTTCCTTAAGCAAGTAAATTATTCTAACAAAAATACTTACAGAGTTGCACCT
1 TGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCT
* * * * * *
36262 ATCTTAAATAGTTAAAGCTATCTAAATCCAGCCATTTTGCTTAGGAATTCCAATTATTCAAACAA
66 ATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAA
* *
36327 AAAAACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCATA
131 AAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTA
** *
36392 GGCAAACAAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTAT
196 GGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTAT
36457 C
261 C
* * *
36458 TGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCTTGCCAATTATTCTAACAAAAAATACTTAAGGAGTTACTCC
1 TGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAAC-AAAAATACTTAAAGAGTTACACC
* *
36523 TATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCACTCA-TTTACTTAGGCATGCCAATTATTCTAACA
65 TATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACA
* * *
36587 AAAATGCTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTAAATCTAGTCATTTTGCTT
130 AAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTT
* **
36652 AGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAAAAACTTACGGAGTTACACCAATAT-TTAAA-AGTTAAAG
195 AGGCATGCCAATTATTCTAAC-AAAAATACTTAAAGAGTTACACC--TATCTTAAAGAGTTAAAG
*
36715 ATATC
257 CTATC
* *
36720 TGAATCCATTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTTTTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCT
1 TGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCT
* * * * *
36785 ATCTTAATGAGTTAATGCTATATGAATCCAATCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTAATCTAACAA
66 ATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAA
* * * * * *
36850 AAATAGTTAAAGAGTTACACCTATCTTAACGAGTTAATGCTATATGAATCTAATCATTTTGCTTA
131 AAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTA
* * *
36915 GGCATGCCAAGTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACA-TTATCTTAAAGACTTAAAGCTAT
196 GGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTAT
36979 C
261 C
** * * * *
36980 TGAATCCAACCATTTTTCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACATACAGAGTTACACTT
1 TGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCT
* * * *
37045 ATCTTAAATAGTTAAAGCTAACTGAATCCAGTCATTTTTCTTAGGCATGCCAATTTTTCTAACAA
66 ATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAA
* * * * *
37110 AAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAATGAGTTAAAGATATATGAATCAAATCATTTTGCTTA
131 AAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTA
* * * *
37175 GGCATGCCAATTATTCTAAAAACAAAATAGTTAAAGAGTTACACCTATCTTAACGAGTTAATGCT
196 GGCATGCCAATTATTCT-AACA-AAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCT
*
37240 ATA
259 ATC
* * * *
37243 TGAATCTAATCATCTTGCTTAGGCATGCCAAGTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCT
1 TGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCT
* * ** *
37308 ATCTTTAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCAAACCATTTTTCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAA
66 ATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAA
* *
37373 AAATACTTAAAGAGTTACACCTTTCTTAAAGAGTTAAAGCTATATGAATCCAGTCATTTTGCTTA
131 AAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTA
37438 GGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTAT
196 GGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTAT
37503 C
261 C
* *
37504 TG-----A-TCATTTTCCTTAGGCAAGCCAATTATTCTAACAAAAATAC-TAAAGAGTTACACCT
1 TGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCT
* * * * * *
37562 ATCTTAAAGAGTTAAAGCTAACTGAATCCAGTCATTTTACTTAAGTAGGCCAATT-TTTTAACAA
66 ATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAA
* * *
37626 AAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAATGAGTTAAAGCTATATGAATCCAGAT-ATTTTTCTT
131 AAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAG-TCATTTTGCTT
* * * *
37690 AGGTATGTC-A--A-TCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAATGAGTTAAAGTTA
195 AGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTA
*
37751 TA
260 TC
* * * * *
37753 TGAATCCAATCATTTTGCTTAGGCATTCAAATTATTCTAACAAAATATACTTAAAGTGTCACACC
1 TGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAA-ATACTTAAAGAGTTACACC
* *
37818 TATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTAATTTTGCTTAGGCATGCAAATTATTCTAACA
65 TATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACA
* * *
37883 AAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAATGCTATCTGAATCCATTAATTTTGCTT
130 AAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTT
* * *
37948 AGGCATGCAAATTATTCTAACAAAAATAGTTAAAGAGTTACACCTATCTTAATGAGTTAAAGCTA
195 AGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTA
38013 TC
260 TC
* * *
38015 TGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAAATCCTTAAACAGTTACTCC
1 TGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAAC-AAAAATACTTAAAGAGTTACACC
* * * * *
38080 TATCTTAAAGCGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTACTGAGGCAAGACAATTATTCT----
65 TATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACA
* *
38141 ---A-AC---AA-A---A-A---A-CTTAAAGAGTTAAAGCTATTTGAATCCAATCATTTTGCTT
130 AAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTT
* * * *
38190 GGGCTTGTCAATTTTTCT-ACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTA
195 AGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTA
38254 TC
260 TC
* * * * *
38256 TAAATCCAGTTAATTTCCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATAATTAAAGAGTTACA-CT
1 TGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCT
* * * *
38320 ATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAATCATATTGCCTAGGCATGCCAATTATTCTAA-AT
66 ATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAA
* * * * * * * *
38384 AAATAGTTTAAGAGTTACACCTATCTTAACGAGTTAATGTTATATGAATCTAATCATTTTGCTTA
131 AAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTA
*
38449 GGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGATTTAAAGCTAT
196 GGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTAT
38514 C
261 C
**
38515 TGAATCCAACCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCT
1 TGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCT
* * * * * * *
38580 ATCTTATATAGTTAAAGCTATCTAAATCCAGCCATTTTACTTAGGAATGCCAATTATTCAAACAA
66 ATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAA
* *
38645 AAA-AATATAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCAATTTG-TA
131 AAATACT-TAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCT-
* * * *
38708 TAGGCAAGCAAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACATATCTTAAAGATTTAAAGCT
194 TAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCT
38773 ATC
259 ATC
** * * * *
38776 TGAATCCAACCATTTTTCTTAGACATGCCAATTATTCTAACAAAAATAATTACAGAGTTACACCT
1 TGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCT
* * * *
38841 ATCTTAAATAGTTAAAGCTATCTAAATCCA-TCCATTTTGCTTAGGAATGCCAATTATTCAAACA
66 ATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGT-CATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACA
*
38905 AAAA-AATATAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTG-T
130 AAAATACT-TAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCT
* *
38968 ATAGGCAAGCAAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGC
194 -TAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGC
39033 TATC
258 TATC
* * *
39037 TGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCTTGCCAATTATTCTAACAAAAAATACTTAAGGAGTTACTCC
1 TGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAAC-AAAAATACTTAAAGAGTTACACC
* * * * *
39102 TATCTTAAAGCGTTAAAGCTATCTAAATCCACTCAATTTACTTAGGCATGCCAATTATTCTAACA
65 TATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACA
* * *
39167 AAAATGCTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTAAATCTAGTCATTTTGCTT
130 AAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTT
* **
39232 AGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAAAAACTTACGGAGTTACACCAATAT-TTAAA-AGTTAAAG
195 AGGCATGCCAATTATTCTAAC-AAAAATACTTAAAGAGTTACACC--TATCTTAAAGAGTTAAAG
*
39295 ATATC
257 CTATC
*
39300 TGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTTTTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCT
1 TGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCT
* * * * *
39365 ATCTTAATGAGTTAATGCTATATGAATCCAATCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTAATCTAAC-A
66 ATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAA
** * * * * *
39429 AAATTGTTAAAGAGTTACACCTATCTTAACGAGTTAATGCTATATGAATCTAATCATTTTGCTTA
131 AAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTA
* *
39494 GGCATGCCAAGTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACA-CTATCTTAAAGACTTAAAGCTAT
196 GGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTAT
39558 C
261 C
** * * *
39559 TGAATCCAACCATTTTTCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTACAGAGTTACACTT
1 TGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCT
* * * *
39624 ATCTTAAATAGTTAAAGCTAACTGAATCCAGTCATTTTTCTTAGGCATGCCAATTTTTCTAACAA
66 ATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAA
* * * * * *
39689 AAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAATGAGTTAAAGATATATGGATCAAATCATTTTGCTTA
131 AAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTA
* * *
39754 GGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATAGTTAAAGAGTTACACCTATCTTAACGAGTTAATGCTAT
196 GGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTAT
*
39819 A
261 C
* * * *
39820 TGAATCTAATCATCTTGCTTAGGCATGCCAAGTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCT
1 TGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCT
* * **
39885 ATCTTTAAGAGTTAAAGCTATCTGAA--AAACCATTTT-CTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAA
66 ATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAA
* * *
39947 AAATACGTAAAGATTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTATATGAATCCAGTCATTTTGCTTA
131 AAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTA
*
40012 GGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTTCACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTAT
196 GGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTAT
40077 C
261 C
* *
40078 TG-----A-TCATTTTCCTTAGGCAAGCCAATTATTCTAACAAAAATAC-TAAAGAGTTACACCT
1 TGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCT
* * * * * * * *
40136 ATCTTAAAGAGTTAAAGCTAACTGAATCCAGTCATTTTACTTAAGTAGGCTAATTTTTTTAACAA
66 ATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAA
* * * * *
40201 AAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAATGAGTTAAAGCTATATGAATCCAATTATTTTTCTTA
131 AAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTA
* * * *
40266 GGTATGTC-A--A-TCTAACAAAAATAC-TAAAGA-TTACACCTATCTTAATGAGTTAAAGTTAT
196 GGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTAT
*
40325 A
261 C
* * * * *
40326 TGAATCCAATCATTTTGCTTAGGCATTCAAATTATTCTAACAAAATATACTTAAAGTGTCACACC
1 TGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAA-ATACTTAAAGAGTTACACC
* * *
40391 TATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTAATTTTGCTTAGGGATGCAAATTATTCTAACA
65 TATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACA
* * * *
40456 AAAATACTTAAAGAGTTATACCTATCTTAAAGAGTTAATGCTATCTGAATCCATTAATTTTGCTT
130 AAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTT
* * *
40521 AGGCATGCAAATTATTCTAACAAAAATAGTTAAAGAGTTACACCTATCTTAATGAGTTAAAGCTA
195 AGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTA
40586 TC
260 TC
* * *
40588 TGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAAATCCTTAAACAGTTACTCC
1 TGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAAC-AAAAATACTTAAAGAGTTACACC
* * * * *
40653 TATCTTAAAGCGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTACTGAGGCAAGACAATTATTCT----
65 TATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACA
* *
40714 ---A-AC--AAA-A---A-A---A-CTTAAAGAGTTAAAGCTATTTGAATCCAATCATTTTGCTT
130 AAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTT
* * * * *
40764 GGGCTTGTCAATTTTTCTAACAAAAATACTTATAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTA
195 AGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTA
40829 TC
260 TC
* * * * *
40831 TAAATCCAGTTAATTTCCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATAATTAAAGAGTTACACCT
1 TGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCT
* * * * *
40896 ATCTTAAAGAATTAGAGCTATCTGAATCCAATCATATTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAA-AT
66 ATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAA
* * * * * * * * *
40960 AAATAGTTTAAGAGTTGCACCTATCTTAACGAGTTAATGTTATATGAATCTAATCATTTTGCTTA
131 AAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTA
*
41025 GGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGATTTAAAGCTAT
196 GGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTAT
41090 C
261 C
** * *
41091 TGAATCCAACCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAAC-AAACTAACTTAAAGAG-GACAAC
1 TGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAAT-ACTTAAAGAGTTAC-AC
* * *
41154 CTATCTT-AATAGTTAAAGCTATCTAAATCCAGCCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAAC
64 CTATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAAC
* * *
41218 AAAAAAAC-TAAAGGAGTTACACTTATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCTAGTCATTTTGC
129 AAAAATACTTAAA-GAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGC
* * *
41282 TTAGGCAAGCAAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAATC
193 TTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGC
41347 TATC
258 TATC
* * * *
41351 TGAATTCAGCCATTTTGCTTTGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAAAATACTT-AAGTAGTTACT
1 TGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAAC--AAAAATACTTAAAG-AGTTACA
* * * *
41415 CCAATCTTAAAGCGTTAAAGCTATCTGAATCCAATCATTTTGCTTAGGCATGACAATTATTCTAA
63 CCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAA
* * *
41480 -AAAAA-ACATAAAGAGTTACACCTATAATT-AAGAGTTAAATCTATCTGAATCCAGTCATTTTG
128 CAAAAATACTTAAAGAGTTACACCTAT-CTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTG
* * * * * *
41542 CTTAGGCATGCTAGTTTTTCTAACAAAAATAGTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAGAT
192 CTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAG
41607 CTATC
257 CTATC
* **
41612 TAAATCCAGTCAACTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCT
1 TGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCT
* *
41677 ATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCTAGTCATTTTGCTTTGGCATGCCAATTATTCTAACAA
66 ATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAAC--
* * * * * *
41742 AAAAAAAAACTTAAAGAGTTATACCTATATTTAAGAGTTAAACCTATCTAAATCCAGTCATTTTG
129 --AAAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTG
* * * * * *
41807 CTTAGGCATGCCAATTTTTCTAACAAAAATAGTTTAAGAGTTACACTTATCTTAAATAATTAAAG
192 CTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAG
*
41872 CTAAC
257 CTATC
* *
41877 TGAATCCAGTCATTTTGCTAAGGCATGCCAATTTTTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCT
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* * * * * * *
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* *
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ATACTTAAAGAGTTACACCTAT
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*
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*
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CTTAAAGAGTTAAACCTAT
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* * ** * * * *
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*
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* *
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66 TGCTTAGGCAAGCAAATTATTC
*
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65 TT
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TGCTTAGGCAAGCAAATTATTC
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* ** * * *
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* *
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* * **
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*
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*
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*
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1 CTTAAAGAGTTAAACCTAT
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1 CT
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CTTAAAGAGTTAAACCTAT
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29743 CAAATTATTC
* *
29753 TAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTT
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* *
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**
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*
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AGCTATCTGAATCCAGTCATTTT
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29896 CAGTCATTTT
** * *
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* * *
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65 TTGCTTAGGCATGCCAATTATTC
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* * **
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*
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* *
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30199 GAATCCAGCC
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29994 AACAAAAATA
*
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*
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1 CT
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Statistics
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* *
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66 TAC
*
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66 TAC
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TAC
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30168 AACAAAAATA
* *
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*
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66 ATACTTAAAGAGTTACACCTAT
* * * * * *
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1 CTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATT-CTAACAAA
*
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* *
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* *
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65 AATACTTAAAGAGTTACACCTAT
* * *
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*
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* * *
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* * * **
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* *
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* * * * * *
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66 ATACTTAAAGAGTTACACCTAT
* * * * *
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*
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*
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1 CTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAA
30940 ATACTTAAAGAGTTACACCTAT
66 ATACTTAAAGAGTTACACCTAT
* * *
30962 CTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAATCATTATT-CTTAGGCAAGCCAAATATTCTAACAAA
1 CTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATT-TTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAA
* *
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65 AATACTTAAAGAGTTACACCTAT
* * *
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1 CTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAA
* *
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66 ATACTTAAAGAGTTACACCTAT
* * * * *
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1 CTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAA
*
31196 ATAATTAAAGAGTTACACCTAT
66 ATACTTAAAGAGTTACACCTAT
* * * * * * *
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1 CTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAA
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66 ATACTTAAAGAGTTACACCTAT
* *
31305 CTTAATGAGTTAAAGCTATCTGAATCAAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAA
1 CTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAA
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66 ATACTTAAAGAGTTACACCTAT
* *
31392 CTTAAAGAATTAAAGCTATCTGAATCTAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAAC-AAA
1 CTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAA
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*
31479 CTTAAAGAGTTAAAGCTATCGGAATCCAGTCATTTT
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31515 TAACGAAAAA
Statistics
Matches: 1109, Mismatches: 123, Indels: 36
0.87 0.10 0.03
Matches are distributed among these distances:
83 74 0.07
84 1 0.00
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ACGTcount: A:0.38, C:0.17, G:0.12, T:0.33
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CTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAA
ATACTTAAAGAGTTACACCTAT
Found at i:30353 original size:155 final size:155
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Indices: 30023--30340 Score: 498
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30013 TTACACCTAT
* *
30023 CTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAA
1 CTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGCCATTTTGCTTAGGCATGCAAATTATTCTAACAAAA
* * *
30088 TAACTTAAACAGTTACACCTATATTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAACCATTTTGCTTAGG
66 TAACTTAAACAGTTACACCTATATTAAAGAGTGAAAGCTAACTGAATCCAACCATTTGGCTTAGG
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1 CTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGCCATTTTGCTTAGGCATGCAAATTATTCTAACAAAA
* * * * *
30243 -ATACTTAAAGAGTTACGCCTATCTTAAATAGTGAAAGCTAACTGAATCCAATCATTTGGCTTAG
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30307 GCATT-CCAATT-TTCCTAACAAAAATA
130 GC-TTGCCAATTATT-CTAACAAAAATA
30333 CTTAAAGA
1 CTTAAAGA
30341 TTTACACCTA
Statistics
Matches: 150, Mismatches: 10, Indels: 6
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Matches are distributed among these distances:
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CTTGCCAATTATTCTAACAAAAATA
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Indices: 30683--30721 Score: 53
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30673 ACAAAAAAAC
*
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*
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Statistics
Matches: 17, Mismatches: 2, Indels: 1
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Matches are distributed among these distances:
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Indices: 30943--30982 Score: 62
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30933 AACAAAAATA
*
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*
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1 CT
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Statistics
Matches: 19, Mismatches: 2, Indels: 0
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*
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* *
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1 CT
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Statistics
Matches: 18, Mismatches: 3, Indels: 0
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Matches are distributed among these distances:
19 18 1.00
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CTTAAAGAGTTAAACCTAT
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Indices: 31373--31412 Score: 53
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31363 AACAAAAATA
* *
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*
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1 CTTAAAGAATTAAACCTAT
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1 CT
31413 GAATCTAGTC
Statistics
Matches: 18, Mismatches: 3, Indels: 0
0.86 0.14 0.00
Matches are distributed among these distances:
19 18 1.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.17, G:0.10, T:0.33
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Indices: 31449--31580 Score: 194
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31439 CCAATTATTC
* * *
31449 TAACAAAATAACTTAAACGGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCGGAATCCAGTCATTT
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31514 T
66 T
* * *
31515 TAACGAAAA-AACTTAAATAGTTACACCTATCTTAAAAAGTTAAAGCTATATGAATCCATTCATT
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65 TT
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Statistics
Matches: 59, Mismatches: 6, Indels: 2
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T
Found at i:31628 original size:87 final size:87
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Indices: 31515--32276 Score: 1072
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* * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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*
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* * **
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* * *
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* *
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* *
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* *
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* *
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* * * * * *
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* * *
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* * * * *
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* *
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* * * * * *
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* * * *
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* * * * * * * *
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* *
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* * ** *
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* * * *
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*
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* * *
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* * ** *
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* * * * * * * * *
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* * *
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* * * *
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* * *
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* * * *
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* **
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* * * * *
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*
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* * * * * *
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*
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* * * *
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* * * *
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1 TAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTT
**
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* * *
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131 AGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTC
* *
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1 TAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTT
** * * * *
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66 TGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAA
* * * *
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131 AGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTC
* * * * * * * * *
36060 TAACAAAAAAACTTAAGGAGTTACACATTTCTTAACGAGTTAATGCTATATGAATCTAATCATTT
1 TAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTT
*
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66 TGCTTAGGCATGCCAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAA
** * * * **
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* * * * *
36234 TAACAAAAATACTTACAGAGTTGCACCTATCTTAAATAGTTAAAGCTATCTAAATCCAGCCATTT
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* * * *
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* ** *
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* * *
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* *
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* * *
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1 TAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTT
* **
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* * *
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* * * *
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* * *
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* * * * *
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* * **
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* * * * *
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* * *
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* * * * *
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* * *
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* * * * * *
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* * **
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* *
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*
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* *
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* * * * * *
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* *
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* * * *
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* * * * *
37745 AAGTTATATGAATCCAATCATTTTGCTTAGGCATTCAAATTATTC
130 AAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTC
* * *
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*
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* * * *
37920 ATGCTATCTGAATCCATTAATTTTGCTTAGGCATGCAAATTATTC
130 AAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTC
* *
37965 TAACAAAAATAGTTAAAGAGTTACACCTATCTTAATGAGTTAAAGCTATCTGAATCCAGTCATTT
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* * * *
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* * * *
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130 AAGCTATCTGAATCCAGTCATTTTGCTTAGGCATGCCAATTATTC
* * * ** * * ** **
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* * *** * * ** * *** * *
38199 AATTTTTCTACAAAAATACTTAAAGAGT-T-ACACCTAT-CTTAAAGAGTTAAAGCTATC-TAAA
62 -ATTTTGCT-TAGGCATGC-CAATTATTCTAACAAAAATACTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAA
* * * ** * * ** *
38260 TCCAGTT-AA--TTTCCT-TAGGCATGCCAATTATT-C-TA-ACA--AAAATAATT-
124 --GAGTTAAAGCTAT-CTGAATCCA-GTC-ATT-TTGCTTAGGCATGCCAATTATTC
* * * * * * * ** * * **
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1 TAACA---AAAATA-CTTAAAGAGTTACACCTATCTTAAAGAGTTAAAGC-TATCTG--AATCCA
* * * * ** * *
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59 -GTC-ATT-TTGCTTAGGCATGCCAATTA-TTCTAACA---A-AAATA-CTTAAAGAGTTACA-C
* * * ** * *** ** * * * ** *** * * ** *
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114 CTATCTTAA-AGAGT--TAAAGCTATCTGAAT-CCAGTCATT-TTGCTTAGGCATGC-CAATTAT
38485 T-
173 TC
*** * * * * * ** ** * *
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* ** *** * * ** * *** * * * *
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* * * ** * * ** *
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* * *
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* *
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* * * * * *
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** * *
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*
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* *
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* * * *
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***
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* * *
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*
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*
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* * *
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* * * *
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*
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65 TTTTTGTTAGAATAATTGGCAT
* * ** *
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1 GCCTAAG-CAAATGACTGGATTCATATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTA
* *
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65 TTTTTGTTAGAATAATTGGCAT
* * * *
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* * * * ***
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1 GCCTAAG-CAAATGACTGGATTCATATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTA
*
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65 TTTTTGTTAGAATAATTGGCAT
* * * **
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65 TTTTTGTTAGAATAATTGGCAT
* * *
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1 GCCTAAG-CAAATGACTGGATTCATATAGCTTTAACTC-TTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGT
*
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64 ATTTTTGTTAGAATAATTGGCAT
* * *
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1 GCCTAAGC-AAATGACTGGATTCATATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTA
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65 -TTTTTGTTAGAATAATTGGCAT
* * *
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*
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* * *
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1 GCCTAAGC-AAATGACTGGATTCA-TATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGT
*
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64 ATTTTTGTTAGAATAATTGGCAT
* ** *
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*
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64 ATTTTTGTTAGAATAATTGGCAT
* * * * * *
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* *
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65 TTTTTGTTAGAATAATTGGCAT
* * *
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1 GCCTAAGC-AAATGACTGGATTCATATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTA
*
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65 -TTTTTGTTAGAATAATTGGCAT
* *
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1 GCCTAAGC-AAATGACTGGATTCATATAGCTTTAACTCT-TTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGT
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* *
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* * * * *
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* * * *
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*
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* * * * *
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* *
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* * * * *
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* * *
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*** * *
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* * **
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* * * *
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* *
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* * *
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* * * *
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* * **
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* *
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* * * * * * *
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* *
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* * *
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*
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1 GCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCT-TTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGT
*
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** * * ** *** * * *
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* ** * ** * * * * *
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1 GCCTAAGCAAAATGA-CTGGAT-TC--AGATA-GC-TTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTT
* ** * * * ** ** * ** *
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60 TA-AGT-ATT-T-TTG--TTAG---AATAATTGGCATGCCTA-AGCAAATGACTGGATTCAGATA
*** *
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* * * *
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* * * * * *
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** *
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* * * * * * *
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1 GCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTA
* * * * * * *
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* * *
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* * * * *
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* * *
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* *
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* * * * * *
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1 GCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTA
* * * * *
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* *
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* ** * *
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1 GCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAG--
* * *
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*
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** * * * *
46447 GCCTAAGCAAGTTGACTGGATTTAGATAGATCTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAACTA
1 GCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTA
* * * *
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66 TTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGC-AAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTAA-
* * * *
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* * * *
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1 GCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACT-CTTTAAGT
* * * *
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* * * *
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*
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1 GCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACT-CTTTAAGT
* * * *
46859 TTTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGGCTGGATTTAGATAGCTTTAACTATATA
65 ATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGC-AAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCT-TA
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128 AGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAAAAAT-TGGCAT
** *
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1 GCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTA
* * * *
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* * * * *
47086 GATA-GTGCAACTC-TTAACTA-TTAT-TTAGAATAATTTGCAT
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* * * *
47126 GCCTAAGCAATATGATTGGATTCAGATAGCTCTAATTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAA
1 GCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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TTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTAAGA
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Found at i:44512 original size:261 final size:261
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Indices: 44041--47187 Score: 3815
Period size: 261 Copynumber: 12.2 Consensus size: 261
44031 TGCTTAGGCC
* * * * * * *
44041 GCCTAAGCAAAATTACTGGATTTAGAAAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTGACACTTTAAGTA
1 GCCTAAGCAAAATGACTGGATTCATATAGCTTTAACTCATTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTA
* * * * * *
44106 TATTTTGTTAGAATAATT-GAATGCCTAAGC-AAATGATTGGATTCATATAACTTTAACT-CTTA
66 T-TTTTGTTAGAAAAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTATTTA
* * * *
44168 AGATAGATGTAACTC-TTAAGTATTTTTGTTAG----ATTGGCATGCCTAAGAAAAATAATTGGA
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* * *
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260 AT
* * * *
44295 GCCTAAG-ACAAATGACAGGACTCATATAGCTTTAACTAATTAAAATAGGTGTAACTCTTTAAGT
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* * * *
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* * * *
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*** *
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195 TTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGC
44554 AT
260 AT
* * * ***
44556 GCCTAAGCAAAATGATTGGATTCAGATAGATTTAACAGTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTA
1 GCCTAAGCAAAATGACTGGATTCATATAGCTTTAACTCATTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTA
* * * * *
44621 TTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGAAAAATCATTGGATTCATATAGCTTTAACTCATTTA
66 TTTTTGTTAGAAAAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACT-ATTTA
* *
44686 AGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAAAAATTGGCATGCTTAAGCAAAATGACTGGA
130 AGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGA
*
44751 TTCAGATAGCTTCAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTTGTTAGAATAATTGG
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259 CAT
* *
44819 GCCTTAGCAAAATG-CTTGGATTCATATATCTTTAACTCATTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGT
1 GCCTAAGCAAAATGAC-TGGATTCATATAGCTTTAACTCATTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGT
*
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* * * * **
44948 AGATAAGTGTAACTCTGTAAGTATTTTTCTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGAAAAATGGTTGGA
130 AGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGA
*
45013 TTCAGATAGCTTTAACTC-TTATAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATACTTGG
195 TTCAGATAGCTTTAACTCTTTA-AGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
45077 CAT
259 CAT
* * * * * *
45080 GCCTAAGAAAAATGATTGGATTCATATAGCATTAACTCGTTAAGATAGGTGTATCTCTTTAACTA
1 GCCTAAGCAAAATGACTGGATTCATATAGCTTTAACTCATTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTA
* * *
45145 TTTTTGCTAGAAAAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTAAA
66 TTTTTGTTAGAAAAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTATTTAA
* * *
45210 TATAGGTGTAACTCTTTAAG-ATTTTTTTTTAGAATAATTGGCATGCCAAAGCAAAATGACTGGA
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45338 CAT
259 CAT
* *
45341 GCCTAAGCAAATTGACTGGA-T--T-TAG---------A-T-AGCT---T-TAACTCTTTAAGTA
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* * * *
45387 TTTTTGTTAGAAAAACTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTATCTCTTAAA
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* * * * * * *
45452 TATACGTGTAACTATTT-A-TGTTTTT-TTAGAATAATTGTCACGCCTAAGCAAAATGATTGGAT
131 GATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGAT
* * *
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* * * * * *
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* * * * * * * *
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** * *
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* * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * *
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*
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* * * *
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* * *
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* *
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* * * *
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* ** * * * *
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* * * *
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* * * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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* * * *
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*
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* * *
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**
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* * * * * * *
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*
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* * * * * *
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T
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* *
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** * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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* *
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* *
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* *
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* **
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* * * *
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*
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**
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*
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*
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* *
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* * * *
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* *
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* * *
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* **
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*
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*
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* * *
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* * * * * *
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* *
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*
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1 AG
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* * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * *
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* * * *
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* * * **
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* * * * *
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* * * * * * * *
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514 CATTA
* * * * *
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* *
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*
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* *
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* * * * *
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*
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* *
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* * * *
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* * *
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* * * *
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* * * *
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* * * *
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**
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* * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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Done.