Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
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*
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11457 -ATCCGGCCCACTCTAAGGCCACGTCCGACTCGAGTGATCTACTCACAGACACATAATAACGACT
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11521 ATTTTAAAAAAAAAGAAGTAAACAGAG-AGTCTACGC-GCAGACCCCGCTCCGCGGATGGACGTG
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11973 AATCCGGCCCACTCTAAGGCCACGTCCGACTCGAGTGATCTACTCACAGACACATAATAACGACT
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196 GGAGCATCTTCCGGGGGGTTTTATATTATCACGATAGAGTCTTGTAGAAGGGATTTCCAAAGTGT
12166 CGACCCCGAGAAATTGTCCGACCGATAATTACGGGGTTGGATCGGATCCCACCGCGTATACGCGT
261 CGACCCCGAGAAATTGTCCGACCGATAATTACGGGGTTGGATCGGATCCCACCGCGTATACGCGT
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391 CTCCCTCATACTTAGCCCTCCGCAAACTGAAAAAAAAATGAAAAATTCGCTTAAAAAAAATATGT
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456 TTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCTGGAAAAAAATGAAAATTCTCTTTTCCAACCCCCCGAA
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1 AACCTACTTAAACCTCTCTTGCCACCCGCTCGCTACTCAAGCGTCCGACCCGCACCCGCTACGTC
12488 -ATCCGGCCCACTCTAAGGCCACGTCCGACTCGAGTGATCTACTCACAGACACATAATAACGACT
66 AATCCGGCCCACTCTAAGGCCACGTCCGACTCGAGTGATCTACTCACAGACACATAATAACGACT
12552 ATTTTAAAAAAAAAGAAGTAAACAGAG-AGTCTACGCGGC-GACCCCGCTCCGCGGATGGACGTG
131 ATTTTAAAAAAAAAGAAGTAAACAGAGAAGTCTACGCGGCAGACCCCGCTCCGCGGATGGACGTG
12615 GGAGCATCTTCC-GGGGGTTTTATATTATCACGATAGAGTCTTGTAGAAGGGATTTCCAAAGTGT
196 GGAGCATCTTCCGGGGGGTTTTATATTATCACGATAGAGTCTTGTAGAAGGGATTTCCAAAGTGT
12679 CGACCCCGAGAAATTGTCCGACCGATAATTACGGGGTTGGATCGGATCCCACCGCGTATACGCGT
261 CGACCCCGAGAAATTGTCCGACCGATAATTACGGGGTTGGATCGGATCCCACCGCGTATACGCGT
12744 AGACAGGTATCCCTCCTCGATAACGGAGCTTACGCCATTTTTAAAATTCGCCCCTAGGGGCGAAC
326 AGACAGGTATCCCTCCTCGATAACGGAGCTTACGCCATTTTTAAAATTCGCCCCTAGGGGCGAAC
12809 CTCCCTCATACTTAGCCCTCCGCAAACTGAAAAAAAAATGAAAAATTCGCTTAAAAAAAATATGT
391 CTCCCTCATACTTAGCCCTCCGCAAACTGAAAAAAAAATGAAAAATTCGCTTAAAAAAAATATGT
12874 TTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCTGGAAAAAAATGAAAATTCTCTTTTCCAACCCCCCGAA
456 TT-AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCTGGAAAAAAATGAAAATTCTCTTTTCCAACCCCCCGAA
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66 AATCCGGCCCACTCTAAGGCCACGTCCGACTCGAGTGATCTACTCACAGACACATAATAACGACT
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13455 A
519 A
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1 AACCTACTTAAACCTCTCTTGCCACCCGCTCGCTACTCAAGCGTCCGACCCGCACCCGCTACGTC
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1 AACCTACTTAAACCTCTCTTGCCACCCGCTCGCTACTCAAGCGTCCGACCCGCACCCGCTACGTC
14040 AATCCGGCCCACTCTAAGGCCACGTCCGACTCGAGTGATCTACTCACAGACACATAATAACGACT
66 AATCCGGCCCACTCTAAGGCCACGTCCGACTCGAGTGATCTACTCACAGACACATAATAACGACT
14105 ATTTTAAAAAAAAAGAAGTAAACAGAGAAGTCTACGCGGCAGACCCCGCTCCGCGGATGGACGTG
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14493 A
519 A
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1 AACCTACTTAAACCTCTCTTGCCACCCGCTCGCTACTCAAGCGTCCGACCCGCACCCGCTACGTC
14558 AATCCGGCCCACTCTAAGGCCACGTCCGACTCGAGTGATCTACTCACAGACACATAATAACGACT
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131 ATTTTAAAAAAAAAGAAGTAAACAGAGAAGTCTACGCGGCAGACCCCGCTCCGCGGATGGACGTG
14687 GGAGCATCTTCCGGGGGGTTTTATATTATCACGATAGAGTCTTGTAGAAGGGATTTCCAAAGTGT
196 GGAGCATCTTCCGGGGGGTTTTATATTATCACGATAGAGTCTTGTAGAAGGGATTTCCAAAGTGT
14752 CGACCCCGAGAAATTGTCCGACCGATAATTACGGGGTTGGATCGGATCCCACCGCGTATACGCGT
261 CGACCCCGAGAAATTGTCCGACCGATAATTACGGGGTTGGATCGGATCCCACCGCGTATACGCGT
14817 AGACAGGTATCCCTCCTCGATAACGGAGCTTACGCCATTTTTTAAAATTCGCCCCTAGGGGCGAA
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14882 CCTCCCTCATACTTAGCCCTCCGCAAACTG-AAAAAAAATGAAAAATTCGCTTAAAAAAAATATG
390 CCTCCCTCATACTTAGCCCTCCGCAAACTGAAAAAAAAATGAAAAATTCGCTTAAAAAAAATATG
14946 TTT-AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCTGGAAAAAAATGAAAAATTCTCTTTTCCAACCCCCCGA
455 TTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCTGGAAAAAAATG-AAAATTCTCTTTTCCAACCCCCCGA
15010 A
519 A
*
15011 AACCTACTTAAACCTCTCTTGCCACCCGCTCGCTACTCGAGCGTCCGACCCGCACCCGCTACGTC
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*
15076 ACTCCGGCCCACTCTAAGGCCACGTCCGACTCGAGTGATCTACTCACAGACACATAATAACGACT
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131 ATTTTAAAAAAAAAGAAGTAAACAGAGAAGTCTACGCGGCAGACCCCGCTCCGCGGATGGACGTG
15205 GGAGCATCTTCCGGGGGGTTTTATATTATCACGATAGAGTCTTGTAGAAGGGATTTCCAAAGTGT
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15465 TTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCTGG-AAAAAATGAAAAATTCTCTTTTCCAACCCCCCG
455 TTT-AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCTGGAAAAAAATG-AAAATTCTCTTTTCCAACCCCCCG
15529 AA
518 AA
15531 AACCTACTTAAACCTCTCTTGCCACCCGCTCGCTACTCAAGCGTCCGACCCGCACCCGCTACGTC
1 AACCTACTTAAACCTCTCTTGCCACCCGCTCGCTACTCAAGCGTCCGACCCGCACCCGCTACGTC
15596 AATCCGGCCCACTCTAAGGCCACGTCCGACTCGAGTGATCTACTCACAGACACATAATAACGACT
66 AATCCGGCCCACTCTAAGGCCACGTCCGACTCGAGTGATCTACTCACAGACACATAATAACGACT
15661 A-TTTAAAAAAAAAGAAGTAAACAGAGAAGTCTACGCGGCAGACCCCGCTCCGCGGATGGACGTG
131 ATTTTAAAAAAAAAGAAGTAAACAGAGAAGTCTACGCGGCAGACCCCGCTCCGCGGATGGACGTG
15725 GGAGCATCTTCCGGGGGGTTTTATATTATCACGATAGAGTCTTGTAGAAGGGATTTCCAAAGTGT
196 GGAGCATCTTCCGGGGGGTTTTATATTATCACGATAGAGTCTTGTAGAAGGGATTTCCAAAGTGT
15790 CGACCCCGAGAAATTGTCCGACCGATAATTACGGGGTTGGATCGGATCCCACCGCGTATACGCGT
261 CGACCCCGAGAAATTGTCCGACCGATAATTACGGGGTTGGATCGGATCCCACCGCGTATACGCGT
15855 AGACAGGTATCCCTCCTCGATAACGGAGCTTACGCCATTTTTAAAATTCGCCCCTAGGGGCGAAC
326 AGACAGGTATCCCTCCTCGATAACGGAGCTTACGCCATTTTTAAAATTCGCCCCTAGGGGCGAAC
15920 CTCCCTCATACTTAGCCCTCCGCAAACTGAAAAAAAAATGAAAAATTCGCTTAAAAAAAAATATG
391 CTCCCTCATACTTAGCCCTCCGCAAACTGAAAAAAAAATGAAAAATTCGCTT-AAAAAAAATATG
15985 TTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCTGGAAAAAAATGAAAATTCTCTTTTCCAACCCCCCGAA
455 TTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCTGGAAAAAAATGAAAATTCTCTTTTCCAACCCCCCGAA
16050 AACCTACTTAAACCTCTCTTGCCACCCGCTCGCTACTCAAGCGTCCGACCCGCACCCGCTACGTC
1 AACCTACTTAAACCTCTCTTGCCACCCGCTCGCTACTCAAGCGTCCGACCCGCACCCGCTACGTC
16115 AATCCGGCCCACTCTAAGGCCACGTCCGACTCGAGTGATCTACTCACAGACACATAATAACGACT
66 AATCCGGCCCACTCTAAGGCCACGTCCGACTCGAGTGATCTACTCACAGACACATAATAACGACT
16180 ATTTT-AAAAAAAAGAAGTAAACAGAGAAGTCTACGCGGCAGACCCCGCTCCGCGGATGGACGTG
131 ATTTTAAAAAAAAAGAAGTAAACAGAGAAGTCTACGCGGCAGACCCCGCTCCGCGGATGGACGTG
16244 GGAGCATCTTCCGGGGGGTTTTATATTATCACGATAGAGTCTTGTAGAAGGGATTTCCAAAGTGT
196 GGAGCATCTTCCGGGGGGTTTTATATTATCACGATAGAGTCTTGTAGAAGGGATTTCCAAAGTGT
16309 CGACCCCGAGAAATTGTCCGACCGATAATTACGGGGTTGGATCGGATCCCACCGCGTATACGCGT
261 CGACCCCGAGAAATTGTCCGACCGATAATTACGGGGTTGGATCGGATCCCACCGCGTATACGCGT
16374 AGACAGGTATCCCTCCTCGATAACGGAGCTTACGCCATTTTTAAAATTCGCCCCTAGGGGCGAAC
326 AGACAGGTATCCCTCCTCGATAACGGAGCTTACGCCATTTTTAAAATTCGCCCCTAGGGGCGAAC
16439 CTCCCTCATACTTAGCCCTCCGCAAACTGAAAAAAAAATGAAAAATTCGCTTAAAAAAAATATGT
391 CTCCCTCATACTTAGCCCTCCGCAAACTGAAAAAAAAATGAAAAATTCGCTTAAAAAAAATATGT
16504 TTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCTGGAAAAAAATGAAAAATTCTCTTTTCCAACCCCCCG
456 TT--AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCTGGAAAAAAATG-AAAATTCTCTTTTCCAACCCCCCG
16569 AA
518 AA
16571 AACCTACTTAAACCTCTCTTGCCACCCGCTCGCTACTCAAGCGTCCGACCCGCACCCGCTACGTC
1 AACCTACTTAAACCTCTCTTGCCACCCGCTCGCTACTCAAGCGTCCGACCCGCACCCGCTACGTC
16636 AATCCGGCCCACTCTAAGGCCACGTCCGACTCGAGTGATCTACTCACAGACACATAATAACGACT
66 AATCCGGCCCACTCTAAGGCCACGTCCGACTCGAGTGATCTACTCACAGACACATAATAACGACT
16701 ATTTT-AAAAAAAAGAAGTAAACAGAGAAGTCTACGCGGC-GACCCCGCTCCGCGGATGGACGTG
131 ATTTTAAAAAAAAAGAAGTAAACAGAGAAGTCTACGCGGCAGACCCCGCTCCGCGGATGGACGTG
16764 GGAGCATCTTCCGGGGGGTTTTATATTATCACGATAGAGTCTTGTAGAAGGGATTTCCAAAGTGT
196 GGAGCATCTTCCGGGGGGTTTTATATTATCACGATAGAGTCTTGTAGAAGGGATTTCCAAAGTGT
16829 CGACCCCGAGAAATTGTCCGACCGATAATTACGGGGTTGGATCGGATCCCACCGCGTATACGCGT
261 CGACCCCGAGAAATTGTCCGACCGATAATTACGGGGTTGGATCGGATCCCACCGCGTATACGCGT
16894 AGACAGGTATCCCTCCTCGATAACGGAGCTTACGCCATTTTTTAAAATTCGCCCCTAGGGGCGAA
326 AGACAGGTATCCCTCCTCGATAACGGAGCTTACGCCA-TTTTTAAAATTCGCCCCTAGGGGCGAA
16959 CCTCCCTCATACTTAGCCCTCCGCAAACTGAAAAAAAAATGAAAAATTCGCTTAAAAAAAATATG
390 CCTCCCTCATACTTAGCCCTCCGCAAACTGAAAAAAAAATGAAAAATTCGCTTAAAAAAAATATG
17024 TTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCTGGAAAAAAATGAAAAATTCTCTTTTCCAACCCCCCGA
455 TTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCTGGAAAAAAATG-AAAATTCTCTTTTCCAACCCCCCGA
17089 A
519 A
17090 AACCTACTTAAACCTCTCTTGCCACCCGCTCGCTACTC-AGCGTCCGACCCGCACCCGCTACGTC
1 AACCTACTTAAACCTCTCTTGCCACCCGCTCGCTACTCAAGCGTCCGACCCGCACCCGCTACGTC
17154 -ATCCGGCCCACTCTAAGGCCACGTCCGACTCGAGTGATCTACTCACAGACACATAATAACGACT
66 AATCCGGCCCACTCTAAGGCCACGTCCGACTCGAGTGATCTACTCACAGACACATAATAACGACT
17218 ATTTTAAAAAAAAAGAAGTAAACAGAGAAGTCTACGTC-GCAGACCCCGCTCCGCGGATGGACGT
131 ATTTTAAAAAAAAAGAAGTAAACAGAGAAGTCTACG-CGGCAGACCCCGCTCCGCGGATGGACGT
17282 GGGAGCATCTTCCGGGGGGTTTTATATTATCACGATAGAGTCTTGTAGAAGGGATTTCCAAAGTG
195 GGGAGCATCTTCCGGGGGGTTTTATATTATCACGATAGAGTCTTGTAGAAGGGATTTCCAAAGTG
17347 TCGACCCCGAGAAATTGTCCGACCGATAATTACGGGGTTGGATCGGATCCCACCGCGTATACGCG
260 TCGACCCCGAGAAATTGTCCGACCGATAATTACGGGGTTGGATCGGATCCCACCGCGTATACGCG
17412 TAGACAGGTATCCCTCCTCGATAACGGAGCTTACGCCATTTTTAAAATTCGCCCCTAGGGGCGAA
325 TAGACAGGTATCCCTCCTCGATAACGGAGCTTACGCCATTTTTAAAATTCGCCCCTAGGGGCGAA
17477 CCTCCCTCATACTTAGCCCTCCGCAAACTGAAAAAAAAATGAAAAATTCGCTT-AAAAAAATATG
390 CCTCCCTCATACTTAGCCCTCCGCAAACTGAAAAAAAAATGAAAAATTCGCTTAAAAAAAATATG
17541 TTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCTGG-AAAAAATGAAAATTCTCTTTTCCAA-CCCCCGAA
455 TTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCTGGAAAAAAATGAAAATTCTCTTTTCCAACCCCCCGAA
17604 AACCTACTTAAACCTCTCTTGCCACCCGCTCGCTACTCAAGCGTCCGACCCGCACCCGCTACGTC
1 AACCTACTTAAACCTCTCTTGCCACCCGCTCGCTACTCAAGCGTCCGACCCGCACCCGCTACGTC
17669 AATCCGGCCCACTCTAAGGCCACGTCCGACTCGAGTGATCTACTCACAGACACATAATAACGACT
66 AATCCGGCCCACTCTAAGGCCACGTCCGACTCGAGTGATCTACTCACAGACACATAATAACGACT
17734 ATTTTAAAAAAAAAGAAGTAAACAGAGAAGTCTACGCGGCAGACCCCGCTCCGCGGATGGACGTG
131 ATTTTAAAAAAAAAGAAGTAAACAGAGAAGTCTACGCGGCAGACCCCGCTCCGCGGATGGACGTG
17799 GGAGCATCTTCCGGGGGGTTTTATATTATCACGATAGAGTCTTGTAGAAGGGATTTCCAAAGTGT
196 GGAGCATCTTCCGGGGGGTTTTATATTATCACGATAGAGTCTTGTAGAAGGGATTTCCAAAGTGT
17864 CGACCCCGAGAAATTGTCCGACCGATAATTACGGGGTTGGATCGGATCCCACCGCGTATACGCGT
261 CGACCCCGAGAAATTGTCCGACCGATAATTACGGGGTTGGATCGGATCCCACCGCGTATACGCGT
17929 AGACAGGTATCCCTCCTCGATAACGGAGCTTACGCCATTTTTAAAATTCGCCCCTAGGGGCGAAC
326 AGACAGGTATCCCTCCTCGATAACGGAGCTTACGCCATTTTTAAAATTCGCCCCTAGGGGCGAAC
17994 CTCCCTCATACTTAGCCCTCCGCAAACTGAAAAAAAAATGAAAAATTCGCTTAAAAAAAATATGT
391 CTCCCTCATACTTAGCCCTCCGCAAACTGAAAAAAAAATGAAAAATTCGCTTAAAAAAAATATGT
18059 TTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATAATCTGGAAAAAAATGAAAATTCTCTTTTCCAA-CCCCCGAA
456 TTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA-AATCTGGAAAAAAATGAAAATTCTCTTTTCCAACCCCCCGAA
18123 AACCTACTTAAACCTCTCTTGCCACCCGCTCGCTACTCAAGCGTCCGACCCGCACCCGCTACGTC
1 AACCTACTTAAACCTCTCTTGCCACCCGCTCGCTACTCAAGCGTCCGACCCGCACCCGCTACGTC
18188 AATCCGGCCCACTCTAAGGCCACGTCCGACTCGAGTGATCTACTCACAGACACATAATAACGACT
66 AATCCGGCCCACTCTAAGGCCACGTCCGACTCGAGTGATCTACTCACAGACACATAATAACGACT
18253 ATTTTAAAAAAAAAGAAGTAAACAGAGAAGTCTACGCGGCAGACCCCGCTCCGCGGATGGACGTG
131 ATTTTAAAAAAAAAGAAGTAAACAGAGAAGTCTACGCGGCAGACCCCGCTCCGCGGATGGACGTG
18318 GGAGCATCTTCCGGGGGGTTTTATA-TATCACGATAGAGTCTTGTAGAAGGGATTTCCAAAGTGT
196 GGAGCATCTTCCGGGGGGTTTTATATTATCACGATAGAGTCTTGTAGAAGGGATTTCCAAAGTGT
18382 CGACCCCGAGAAATTGTCCGACCGATAATTACGGGGTTGGATCGGATCCCACCGCGTATACGCGT
261 CGACCCCGAGAAATTGTCCGACCGATAATTACGGGGTTGGATCGGATCCCACCGCGTATACGCGT
18447 AGACAGGTATCCCTCCTCGATAACGGAGCTTACGCCATTTTTTAAAATTCGCCCCTAGGGGCGAA
326 AGACAGGTATCCCTCCTCGATAACGGAGCTTACGCCA-TTTTTAAAATTCGCCCCTAGGGGCGAA
18512 CCTCCCTCATACTTAGCCCTCCGCAAACTGAAAAAAAAATGAAAAATTCGCTT-AAAAAAATATG
390 CCTCCCTCATACTTAGCCCTCCGCAAACTGAAAAAAAAATGAAAAATTCGCTTAAAAAAAATATG
18576 TTT--AAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCTGG--AAAAATGAAAAATTCTCTTTTCCAA-CCCCCGA
455 TTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCTGGAAAAAAATG-AAAATTCTCTTTTCCAACCCCCCGA
18636 A
519 A
18637 AACCTACTTAAA-CTCTCTTGCCACCCGCTCGCTACTCAAGCGTCCGACCCGCACCCGCTACGTC
1 AACCTACTTAAACCTCTCTTGCCACCCGCTCGCTACTCAAGCGTCCGACCCGCACCCGCTACGTC
18701 AATCCGGCCCACTCTAAGGCCACGTCCGACTCGAGTGATCTACTCACAGACACATAATAACGACT
66 AATCCGGCCCACTCTAAGGCCACGTCCGACTCGAGTGATCTACTCACAGACACATAATAACGACT
18766 ATTTTAAAAAAAAAGAAGTAAACAGAG-AGTCTACGC-G--GACCCCGCTCCGCGGATGGACGTG
131 ATTTTAAAAAAAAAGAAGTAAACAGAGAAGTCTACGCGGCAGACCCCGCTCCGCGGATGGACGTG
18827 GGAGCATCTTCC-GGGGG-TTT-TATTATCACGATAGAGTCTTGTAGAAGGGATTTCCAAAGTGT
196 GGAGCATCTTCCGGGGGGTTTTATATTATCACGATAGAGTCTTGTAGAAGGGATTTCCAAAGTGT
18889 CGACCCCGAGAAATTGTCCGACCGATAATTAC-GGGTTGGATCGGATCCCACCGCGTATACGCGT
261 CGACCCCGAGAAATTGTCCGACCGATAATTACGGGGTTGGATCGGATCCCACCGCGTATACGCGT
18953 AGACAGGTATCCCTCCTCGATAACGGAGCTTACGCCATTTTTAAAATTCGCCCCTAGGGGCGAAC
326 AGACAGGTATCCCTCCTCGATAACGGAGCTTACGCCATTTTTAAAATTCGCCCCTAGGGGCGAAC
19018 CTCCCTCATACTTAGCCCTCCGCAAACTGAAAAAAAAATGAAAAATTCGCTTAAAAAAAATATGT
391 CTCCCTCATACTTAGCCCTCCGCAAACTGAAAAAAAAATGAAAAATTCGCTTAAAAAAAATATGT
19083 TTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCTGGAAAAAAATGAAAATTCTCTTTTCCAACCCCCCGA
456 TT--AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCTGGAAAAAAATGAAAATTCTCTTTTCCAACCCCCCGA
19148 A
519 A
19149 AACCTACTTAAACCTCTCTTGCCACCCGCTCGCTACTCAAGCGTCCGACCCGCACCCGCTACGTC
1 AACCTACTTAAACCTCTCTTGCCACCCGCTCGCTACTCAAGCGTCCGACCCGCACCCGCTACGTC
19214 AATCCGGCCCACTCTAAGGCCACGTCCGACTCGAGTGATCTACTCACAGACACATAATAACGACT
66 AATCCGGCCCACTCTAAGGCCACGTCCGACTCGAGTGATCTACTCACAGACACATAATAACGACT
19279 ATTTTAAAAAAAAA-AAGTAAACAGAGAAGTCTACGC-GCAGACCCCGCTCCGCGGATGGACGTG
131 ATTTTAAAAAAAAAGAAGTAAACAGAGAAGTCTACGCGGCAGACCCCGCTCCGCGGATGGACGTG
19342 GGAGCATCTTCCGGGGGGTTTTATA-TATCACGATAGAGTCTTGTAGAAGGGATTTCCAAAGTGT
196 GGAGCATCTTCCGGGGGGTTTTATATTATCACGATAGAGTCTTGTAGAAGGGATTTCCAAAGTGT
19406 CGACCCCGAGAAATTGTCCGACCGATAATTACGGGGTTGGATCGGATCCCACCGCGTATACGCGT
261 CGACCCCGAGAAATTGTCCGACCGATAATTACGGGGTTGGATCGGATCCCACCGCGTATACGCGT
19471 AGACAGGTATCCCTCCTCGATAACGGAG-TTACGCCATTTTTAAAATTCGCCCCTA-GGGCGAAC
326 AGACAGGTATCCCTCCTCGATAACGGAGCTTACGCCATTTTTAAAATTCGCCCCTAGGGGCGAAC
19534 CTCCCTCATACTTAGCCCTCCGCAAACTGAAAAAAAAATGAAAAATTCGCTTAAAAAAAATA---
391 CTCCCTCATACTTAGCCCTCCGCAAACTGAAAAAAAAATGAAAAATTCGCTTAAAAAAAATATGT
19596 --AAAAAAAAAAAAAAAAAAAATAATCTGGAAAAAAAAATGAAAAATT-TCTCTTTCCAACCCCC
456 TTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA-AATCTGG--AAAAAAATG-AAAATTCTCT-TTTCCAACCCCC
19658 CGAA
516 CGAA
19662 AACCTACTTAAACCTCTCTTGCCACCCGCTCGCTACTCAAGCGTCCGACCCGCA-CCGCTACGTC
1 AACCTACTTAAACCTCTCTTGCCACCCGCTCGCTACTCAAGCGTCCGACCCGCACCCGCTACGTC
19726 -ATCCGGCCCACTCTAAGGCCACGTCCGACTCGAGTGATCTACTCACAGACACAT-ATAACGACT
66 AATCCGGCCCACTCTAAGGCCACGTCCGACTCGAGTGATCTACTCACAGACACATAATAACGACT
19789 ATTTTAAAAAAAAAGAAGTAAAC--AG-AGTCTACGCGGCAGACCCCGCTCCGCGGATGGACGTG
131 ATTTTAAAAAAAAAGAAGTAAACAGAGAAGTCTACGCGGCAGACCCCGCTCCGCGGATGGACGTG
19851 GGAGCATCTTCCGGGGGGTTTTATATTATCACGATAGAGTCTTGTAGAAGGGATTTCCAAAGTGT
196 GGAGCATCTTCCGGGGGGTTTTATATTATCACGATAGAGTCTTGTAGAAGGGATTTCCAAAGTGT
19916 CGACCCCGAGAAATTGTCCGACCGATAATTACGGGGTTGGATCGGATCCCACCGCGTATACGCGT
261 CGACCCCGAGAAATTGTCCGACCGATAATTACGGGGTTGGATCGGATCCCACCGCGTATACGCGT
19981 AGACAGGTATCCCTCCTCGATAACGGAGCTTACG-CATTTTTAAAATTCGCCCCTAGGGGCGAAC
326 AGACAGGTATCCCTCCTCGATAACGGAGCTTACGCCATTTTTAAAATTCGCCCCTAGGGGCGAAC
20045 CTCCCTCATACTTAGCCCTCCGCAAACTG-AAAAAAAATGAAAAATTCGCTT-AAAAAAATATGT
391 CTCCCTCATACTTAGCCCTCCGCAAACTGAAAAAAAAATGAAAAATTCGCTTAAAAAAAATATGT
20108 TTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCTGGAAAAAAAATGAAAATTTCTCTTTTCCAACCCCCC
456 TT--AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCTGG-AAAAAAATGAAAA-TTCTCTTTTCCAACCCCCC
20173 GAA
517 GAA
20176 AACCTACTTAAACCTCTCTTGCCACCCGCTCGCTACTCAAGCGTCCGACCCGCACCCGCTACGTC
1 AACCTACTTAAACCTCTCTTGCCACCCGCTCGCTACTCAAGCGTCCGACCCGCACCCGCTACGTC
20241 AATCCGGCCCACTCTAAGGCCACGTCC--CTCGAGTGAT-TACTCACAGACACATAATAACGACT
66 AATCCGGCCCACTCTAAGGCCACGTCCGACTCGAGTGATCTACTCACAGACACATAATAACGACT
20303 ATTTTAAAAAAAAAGAAGTAAACAGAG-AGTCTACGTC-GCAGACCCCGCT-CGCGGATGGACGT
131 ATTTTAAAAAAAAAGAAGTAAACAGAGAAGTCTACG-CGGCAGACCCCGCTCCGCGGATGGACGT
20365 GGGAGCATCTTCCGGGGGGTTTTATATTATCACGATAGAGTCTTG-AGAAGGGATTTCCAAAGTG
195 GGGAGCATCTTCCGGGGGGTTTTATATTATCACGATAGAGTCTTGTAGAAGGGATTTCCAAAGTG
20429 TCGACCCCGAGAAATTGTCCGACCGATAATTACGGGGTTGGATCGGAT-CCACCGCGTATACGCG
260 TCGACCCCGAGAAATTGTCCGACCGATAATTACGGGGTTGGATCGGATCCCACCGCGTATACGCG
20493 TAGACAGGTAT-CCTCCTCGATAACGGAGCTTACGCCATTTTT-AAA-TCGCCCCTAGGGGCGAA
325 TAGACAGGTATCCCTCCTCGATAACGGAGCTTACGCCATTTTTAAAATTCGCCCCTAGGGGCGAA
20555 CCTCCCTCATACTTAG-CCTCCGCAAACTGAAAAAAAAATG-AAAATTCGCTTAAAAAAAATATG
390 CCTCCCTCATACTTAGCCCTCCGCAAACTGAAAAAAAAATGAAAAATTCGCTTAAAAAAAATATG
20618 TTT--------AAAAAAAAAAAAAATCTGG-AAAAAATGAAAATTTCTCTTTTCCAA-CCCCCGA
455 TTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCTGGAAAAAAATGAAAA-TTCTCTTTTCCAACCCCCCGA
20673 A
519 A
20674 AACCTACTTAAACCTCTCTTGCCACCCGCTCGCTACTCAAGCGTCCGACCCGCACCCGCTACGTC
1 AACCTACTTAAACCTCTCTTGCCACCCGCTCGCTACTCAAGCGTCCGACCCGCACCCGCTACGTC
20739 AATCCGGCCCACTCTAAGGCCACGTCCGACTCGAGTGATCTACTCACAGACACATAATAACGACT
66 AATCCGGCCCACTCTAAGGCCACGTCCGACTCGAGTGATCTACTCACAGACACATAATAACGACT
*
20804 ATTTAAAAAAAAAAGAAGTAAACAGAGAAGTCTACGTC-GCAGACCCCGCTCCGCGGATGGACGT
131 ATTTTAAAAAAAAAGAAGTAAACAGAGAAGTCTACG-CGGCAGACCCCGCTCCGCGGATGGACGT
20868 GGGAGCATCTTCC-GGGGGTTTTATATTATCAC--------C--G-AGAA---A--T------TG
195 GGGAGCATCTTCCGGGGGGTTTTATATTATCACGATAGAGTCTTGTAGAAGGGATTTCCAAAGTG
20910 T------CGAGAAATTGTCCGACCGATAATTACGGGGTTGGATCGGATCCCACCGCGTATACGCG
260 TCGACCCCGAGAAATTGTCCGACCGATAATTACGGGGTTGGATCGGATCCCACCGCGTATACGCG
20969 TAGACAGGTATCCCTCCTCGATAACGGAGCTTACGCCATTTTTTAAAATTCGCCCCTAGGGGCGA
325 TAGACAGGTATCCCTCCTCGATAACGGAGCTTACGCCA-TTTTTAAAATTCGCCCCTAGGGGCGA
21034 ACCTCCCTCATACTTAGCCCTCCGCAAACTGAAAAAAAAATGAAAAATTCGCTTAAAAAAAATAT
389 ACCTCCCTCATACTTAGCCCTCCGCAAACTGAAAAAAAAATGAAAAATTCGCTTAAAAAAAATAT
21099 GTTTAAAAAAAAAAAAATATAAAAAAAATAATCTGGAAAAAAATGAAAATTTCTCTTTTCCAACC
454 GTTT--AAAAAAAAAAA-A-AAAAAAAA-AATCTGGAAAAAAATGAAAA-TTCTCTTTTCCAACC
21164 CCCCGAA
513 CCCCGAA
21171 AACCTACTTAAACCTCTCTTGCCACCCGCTCGCTACTCAAGCGTCCGACCCGCACCCGCTACGTC
1 AACCTACTTAAACCTCTCTTGCCACCCGCTCGCTACTCAAGCGTCCGACCCGCACCCGCTACGTC
21236 AATCCGGCCCACTCTAAGGCCACGTCCGACTCGAGTGATCTACTCACAGACACATAATAACGACT
66 AATCCGGCCCACTCTAAGGCCACGTCCGACTCGAGTGATCTACTCACAGACACATAATAACGACT
*
21301 ATTTTAAAAAAAAAGAAGTAAACAGAGCAGTCTACGCGGCAGACCCCGCTCCGCGGATGGACGTG
131 ATTTTAAAAAAAAAGAAGTAAACAGAGAAGTCTACGCGGCAGACCCCGCTCCGCGGATGGACGTG
21366 GGAGCATCTTCCGGGGGGTTTTATATTATCACGATAGAGTCTTGTAGAAGGGATTTCCAAAGTGT
196 GGAGCATCTTCCGGGGGGTTTTATATTATCACGATAGAGTCTTGTAGAAGGGATTTCCAAAGTGT
21431 CGACCCCGAGAAATTGTCCGACCGATAATTACGGGGTTGGATCGGATCCCACCGCGTATACGCGT
261 CGACCCCGAGAAATTGTCCGACCGATAATTACGGGGTTGGATCGGATCCCACCGCGTATACGCGT
21496 AGACAGGTATCCCTCCTCGATAACGGAGCTTACGCCATTTTTTAAAATTCG-CCCTAGGGGCGAA
326 AGACAGGTATCCCTCCTCGATAACGGAGCTTACGCCA-TTTTTAAAATTCGCCCCTAGGGGCGAA
21560 CCTCCCTCATACTTAGCCCTCCGCAAACTGAAAAAAAAATGAAAAATTCGCTTAAAAAAAATATG
390 CCTCCCTCATACTTAGCCCTCCGCAAACTGAAAAAAAAATGAAAAATTCGCTTAAAAAAAATATG
21625 TTTAAAAAAAAAAAAATAAAAAAATAATCTGGAAAAAAATGAAAATTTCTCTTTTCCAA-CCCCC
455 TTTAAAAAAAAAAAAA-AAAAAAA-AATCTGGAAAAAAATGAAAA-TTCTCTTTTCCAACCCCCC
21689 GAA
517 GAA
21692 AACCTACTTAAACCTCTCTTGCCACCCGCTCGCTACTCAAGCGTCCGACCCGCACCCGCTACGTC
1 AACCTACTTAAACCTCTCTTGCCACCCGCTCGCTACTCAAGCGTCCGACCCGCACCCGCTACGTC
21757 AATCCGGCCCACTCTAAGGCCACGTCCGACTCGAGTGATCTACTCACAGACACATAATAACGACT
66 AATCCGGCCCACTCTAAGGCCACGTCCGACTCGAGTGATCTACTCACAGACACATAATAACGACT
21822 ATTTTAAAAAAAAAGAAGTAAAC--AG-AGTCTACGCGGCAGACCCCGCTCCGCGGATGGACGTG
131 ATTTTAAAAAAAAAGAAGTAAACAGAGAAGTCTACGCGGCAGACCCCGCTCCGCGGATGGACGTG
21884 GGAGCATCTTCCGGGGGGTTTTATATTATCACGATAGAGTCTTGTAGAAGGGATTTCCAAAGTGT
196 GGAGCATCTTCCGGGGGGTTTTATATTATCACGATAGAGTCTTGTAGAAGGGATTTCCAAAGTGT
21949 CGACCCCGAGAAATTGTCCGACCGATAATTACGGGGTTGGATCGGATCCCACCGCGTATACGCGT
261 CGACCCCGAGAAATTGTCCGACCGATAATTACGGGGTTGGATCGGATCCCACCGCGTATACGCGT
22014 AGACAGGTATCCCTCCTCGATAACGGAGCTTACGCCATTTTTTAAAATTCGCCCCTAGGGGCGAA
326 AGACAGGTATCCCTCCTCGATAACGGAGCTTACGCCA-TTTTTAAAATTCGCCCCTAGGGGCGAA
22079 CCTCCCTCATACTTAGCCCTCCGCAAACTGAAAAAAAAATGAAAAATTCGCTTAAAAAAAATATG
390 CCTCCCTCATACTTAGCCCTCCGCAAACTGAAAAAAAAATGAAAAATTCGCTTAAAAAAAATATG
22144 TTTAAAAAAAAAAAAATATAAAAAAATAATCTGGAAAAAAATGAAAATTTCTCTTTTCCAACCCC
455 TTT-AAAAAAAAAAAA-A-AAAAAAA-AATCTGGAAAAAAATGAAAA-TTCTCTTTTCCAACCCC
22209 CCGAA
515 CCGAA
22214 AACCTACTTAAACCTCTCTTGCCACCCGCTCGCTACTCAAGCGTCCGACCCGCACCCGCTACGTC
1 AACCTACTTAAACCTCTCTTGCCACCCGCTCGCTACTCAAGCGTCCGACCCGCACCCGCTACGTC
22279 AATCCGGCCCACTCTAAGGCCACGTCCGACTCGAGTGATCTACTCACAGACACATAATAACGACT
66 AATCCGGCCCACTCTAAGGCCACGTCCGACTCGAGTGATCTACTCACAGACACATAATAACGACT
*
22344 A-TTTAAAAAAAAAGAAGTAAACAGAGCAGTCTACGCGGCAGACCCCGCTCCGCGGATGGACGTG
131 ATTTTAAAAAAAAAGAAGTAAACAGAGAAGTCTACGCGGCAGACCCCGCTCCGCGGATGGACGTG
22408 GGAGCATCTTCCGGGGGGTTTTATATTATCACGATAGAGTCTTGTAGAAGGGATTTCCAAAGTGT
196 GGAGCATCTTCCGGGGGGTTTTATATTATCACGATAGAGTCTTGTAGAAGGGATTTCCAAAGTGT
22473 CGACCCCGAGAAATTGTCCGACCGATAATTACGGGGTTGGATCGGATCCCACCGCGTATACGCGT
261 CGACCCCGAGAAATTGTCCGACCGATAATTACGGGGTTGGATCGGATCCCACCGCGTATACGCGT
22538 AGACAGGTATCCCTCCTCGATAACGGAGCTTACGCCATTTTTTAAAATTCGCCCCTAGGGGCGAA
326 AGACAGGTATCCCTCCTCGATAACGGAGCTTACGCCA-TTTTTAAAATTCGCCCCTAGGGGCGAA
22603 CCTCCCTCATACTTAGCCCTCCGCAAACTG-AAAAAAAATGAAAAATTCGCTT-AAAAAAATATG
390 CCTCCCTCATACTTAGCCCTCCGCAAACTGAAAAAAAAATGAAAAATTCGCTTAAAAAAAATATG
22666 TTTAAAAAAAAAAAAAATAAAAAAAAATCTGGAAAAAAATGAAAATTTCTCTTTTCCAACCCCCC
455 TTT-AAAAAAAAAAAAA-AAAAAAAAATCTGGAAAAAAATGAAAA-TTCTCTTTTCCAACCCCCC
22731 GAA
517 GAA
22734 AACCTACTTAAACCTCTCTTGCCACCCGCTCGCTACTCAAGCGTCCGACCCGCACCCGCTACGTC
1 AACCTACTTAAACCTCTCTTGCCACCCGCTCGCTACTCAAGCGTCCGACCCGCACCCGCTACGTC
22799 AATCCGGCCCACTCTAAGGCCACGTCCGACTCGAGTGATCTACTCACAGACACATAATAACGACT
66 AATCCGGCCCACTCTAAGGCCACGTCCGACTCGAGTGATCTACTCACAGACACATAATAACGACT
*
22864 A-TTT-AAAAAAAAGAAGT-AACAGAGCAGTCTACGCGGCAGACCCCGCTCCGCGGATGGACGTG
131 ATTTTAAAAAAAAAGAAGTAAACAGAGAAGTCTACGCGGCAGACCCCGCTCCGCGGATGGACGTG
22926 GGAGCATCTTCCGGGGGGTTTTATATTATCACGATAGAGTCTTGTAGAAGGGATTTCCAAAGTGT
196 GGAGCATCTTCCGGGGGGTTTTATATTATCACGATAGAGTCTTGTAGAAGGGATTTCCAAAGTGT
22991 CGACCCCGAGAAATTGTCCGACCGATAATTACGGGGTTGGATCGGATCCCACCGCGTATACGCGT
261 CGACCCCGAGAAATTGTCCGACCGATAATTACGGGGTTGGATCGGATCCCACCGCGTATACGCGT
23056 AGACAGGTATCCCTCCTCGATAACGGAGCTTACGCCATTTTTTAAAATTCGCCCCTAGGGGCGAA
326 AGACAGGTATCCCTCCTCGATAACGGAGCTTACGCCA-TTTTTAAAATTCGCCCCTAGGGGCGAA
23121 CCTCCCTCATACTTAGCCCTCCGCAAACTG-AAAAAAAATGAAAAATTCGCTTAAAAAAAATATG
390 CCTCCCTCATACTTAGCCCTCCGCAAACTGAAAAAAAAATGAAAAATTCGCTTAAAAAAAATATG
23185 TTTAAAAAAAAAAAAAAATAAAAAAAATAATCTGGAAAAAAATGAAAATTTCTCTTTTCCAACCC
455 TTT---AAAAAAAAAAAA-AAAAAAAA-AATCTGGAAAAAAATGAAAA-TTCTCTTTTCCAACCC
23250 CCCGAA
514 CCCGAA
23256 AACCTACTTAAACCTCTCTTGCCACCCGCTCGCTACTCAAGCGTCCGACCCGCACCCGCTACGTC
1 AACCTACTTAAACCTCTCTTGCCACCCGCTCGCTACTCAAGCGTCCGACCCGCACCCGCTACGTC
23321 AATCCGGCCCACTCTAAGGCCACGTCCGACTCGAGTGATCTACTCACAGACACATAATAACGACT
66 AATCCGGCCCACTCTAAGGCCACGTCCGACTCGAGTGATCTACTCACAGACACATAATAACGACT
*
23386 A-TTTAAAAAAAAAGAAGTAAACAGAGCAGTCTACGCGGCAGACCCCGCTCCGCGGATGGACGTG
131 ATTTTAAAAAAAAAGAAGTAAACAGAGAAGTCTACGCGGCAGACCCCGCTCCGCGGATGGACGTG
23450 GGAGCATCTTCCGGGGGGTTTTATATTATCACGATAGAGTCTTGTAGAAGGGATTTCCAAAGTGT
196 GGAGCATCTTCCGGGGGGTTTTATATTATCACGATAGAGTCTTGTAGAAGGGATTTCCAAAGTGT
23515 CGACCCCGAGAAATTGTCCGACCGATAATTACGGGGTTGGATCGGATCCCACCGCGTATACGCGT
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23580 AGACAGGTATCCCTCCTCGATAACGGAGCTTACGCCATTTTTTAAAATTCGCCCCTAGGGGCGAA
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*
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*
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*
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*
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*
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* *
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*
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*
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*
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*
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*
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*
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34041 GTCAATCCGGCCCACTCTAA-GCCACGTCCGACTCGAGTGATCTA-TCACAGACACATAATAACG
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34104 ACTATTT
516 ACTATTT
*
34111 -TAAAAAAAGAAGTAAACAGAGCAGTCTA-CGCGCAGA-CCCGCTCCGCGGATGGACGTGGGAGC
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*
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*
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*
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Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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502 47 0.01
503 107 0.02
504 116 0.02
505 415 0.07
506 500 0.09
507 474 0.08
508 335 0.06
509 267 0.05
510 287 0.05
511 317 0.06
512 299 0.05
513 559 0.10
514 238 0.04
515 223 0.04
516 111 0.02
517 156 0.03
518 232 0.04
519 386 0.07
520 179 0.03
ACGTcount: A:0.33, C:0.26, G:0.19, T:0.22
Consensus pattern (522 bp):
AAAAAAAAAGAAGTAAACAGAGCAGTCTACCGGCAGACCCCGCTCCGCGGATGGACGTGGGAGCA
TCTTCCGGGGGGTTTTATATTATCACGATAGAGTCTTGTAGAAGGGATTTCCAAAGTGTCGACCC
CGAGAAATTGTCCGACCGATAATTACGGGGTTGGATCGGATCCCACCGCGTATACGCGTAGACAG
GTATCCCTCCTCGATAACGGAGCTTACGCCATTTTTAAAATTCGCCCCTAGGGGCGAACCTCCCT
CATACTTAGCCCTCCGCAAACTGAAAAAAAATGAAAAATTCGCTTAAAAAAAATATGTTTAAAAA
AAAAAAAATATAAAAAAAATAATCTGGAAAAAAATGAAAATTTCTCTTTTCCAACCCCCCGAAAA
CCTACTTAAACCTCTCTTGCCACCCGCTCGCTACTCAAGCGTCCGACCCGCACCCGCTACGTCAA
TCCGGCCCACTCTAAGGCCACGTCCGACTCGAGTGATCTACTCACAGACACATAATAACGACTAT
TT
Done.