Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: VEPZ01007999.1 Hibiscus syriacus cultivar Beakdansim tig00110450_pilon, whole genome shotgun sequence
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* * *
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*
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*
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*
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*
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*
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1 TATATA
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TATATATAAT
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Indices: 699185--699812 Score: 162
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699175 AAAGTGTATA
* * *
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1 TATATATATACTATATAATT
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* *
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*
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* *
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* *
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1 TATATATATACTATATAATT
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1 TATA-TATATACTATAT-AA-TT
* *
699343 TAGTCTTTATATTACT-TATATATA
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*
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* *
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1 -TATATATATACTATATAATT
*
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*
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* *
699448 TAGTATTTATAATTACTTTAT-ATA
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*
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* *
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* * *
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*
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*
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* *
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*
699589 TATA-ATTATACTATA-AATA
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** * *
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* *
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* *
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*
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* * *
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* *
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*
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* * **
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* *
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* * *
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1 TATATATA
699813 GTTTATATTA
Statistics
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TATATATATACTATATAATT
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699691 CATATTAAAT
* *
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1 ATAATATAAATATAAAGTATATG
*
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699746 AGTTTATATA
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ATAATATAAATATAAAGTATATG
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1 TATATAGTTTA
699807 TATATAGTTTA
1 TATATAGTTTA
699818 TAT
1 TAT
699821 TAATAAATTA
Statistics
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TATATAGTTTA
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706476 GGGAAATCTA
* * * * * * *
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*
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* * * *
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*
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*
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1 CTCCACTATTCATTCAGGGGAGATCAGACTTGA
706684 GATTGATTTA
Statistics
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TTTTGGAAGATAGGTTTG
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*
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GAGATTGATTTACTTCACTACTCTTTCATG
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* *
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*
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1 TTAAA-ATTTTCTAATTCAAATAA
715973 CAGTTATAAT
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TTAAAATTTTCTAATTCAAATAAAA
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715942 TATAAAATTA
*
715952 AATATTTTTTAATTCAAATAACAGTTATAATTAATTTAAATAATATAATTATAAAATAAAAATTT
1 AATATTTTTTAATTCAAATAACAGTTACAATTAATTTAAATAATATAATTATAAAATAAAAATTT
* *
716017 TATATAATTTAATTAATTAATATTGATTTAGGTTTAAAGTTATTGGATCTTAAATTATTAATTAG
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*
716082 GTTTTAAATGGTTGGGCTGAGCCCATATG-TATAATATA-TT
131 GTTTTAAATAGTTGGGCTGAGCCCATATGTTATAATATATTT
* * *
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1 AATATTTTTTAATTCAAATAACAGTTACAATTAATTTAAAT-AATATAATTATAAAA-TAAAAAT
*
716184 TTAATATAAAATTTTTAATTATTTAATAATGATTTAGGTTTAAAAGTTATTGGATCTTAAATTAT
64 TT--TATAAAA--TTTAATTAATTAATAATGATTTAGGTTT-AAAGTTATTGGATCTTAAATTAT
* * *
716249 TAATTGGGTTTTAAATATTTGGGTTGAGCCCATATGTTATATAATATATTT
124 TAATTAGGTTTTAAATAGTTGGGCTGAGCCCATATG-T-TATAATATATTT
716300 AATATTT
1 AATATTT
716307 AAAATTTAAT
Statistics
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TATAAAATTTAATTAATTAATAATGATTTAGGTTTAAAGTTATTGGATCTTAAATTATTAATTAG
GTTTTAAATAGTTGGGCTGAGCCCATATGTTATAATATATTT
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717935 ATTTTAGTGA
*
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1 CCAAATTGTAAAATTACAAACTACAGGGGTTGCGGGGATGATTTACCCACACGCAAAATACACAG
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66 ATAACCCCTCCTTGAAACGACGT
* *
718033 CCAAATTGTAAAATTACAAACTACAGGGGTTGCGGGGATGATTTACCCACGCGCAAAATACATAG
1 CCAAATTGTAAAATTACAAACTACAGGGGTTGCGGGGATGATTTACCCACACGCAAAATACACAG
718098 ATAACCCCTCCTTGAAACGACGT
66 ATAACCCCTCCTTGAAACGACGT
718121 C
1 C
718122 GTTTCAAGGA
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ATAACCCCTCCTTGAAACGACGT
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*
722861 TA TA TA TT TA -A TA TA TA TA TA TA TA TA TA TA TA TA
1 TA TA TA TA TA TA TA TA TA TA TA TA TA TA TA TA TA TA
722896 AAATAAAGAA
Statistics
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1 TCTTTGCTCAT
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1 TCT
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Statistics
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TCTTTGCTCAT
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**
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*
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1 TTTTTCTTTTCATTTT
* *
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1 TT-TTTCTTTTCATTTT
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*
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* * *
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*
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1 TTTTTTTTGATTTTCATTTTTCTTCTCA
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1 TTT-TTTTT
726695 TCTCTCTTTT
Statistics
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*
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* *
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*
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Statistics
Matches: 30, Mismatches: 6, Indels: 1
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Found at i:745467 original size:28 final size:30
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**
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745497 CTATATACTT
Statistics
Matches: 23, Mismatches: 2, Indels: 2
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* *
756137 TTAGGATGAAAACCCGAAGGGGCGTCCT-AAGT-AAAAAAA-TGAAAAACGT
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* *
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TTAGGATGAAAACCCGAAAGGGCGCCCTAAAGTGAAAAAAATTGAAAAACGT
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* * **
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* *
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* * * *
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* *
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* * * * **
757187 CGAGACAACACAAGTTCAACTTCACAATGAAGGGACGGTTGGTTGTCAACAACAATTTCCCAGTT
1 CAAGACAACACAAGCTCAACTTCACAACGAAGGGACGGCTGACTGTCAACAACAATTTCCCAGTT
* *
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66 CCAGGGCCAATCTCAACTTCACAGCGAAGGATATTGGACC
* * * * * *
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**
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CAAGACAACACAAGCTCAACTTCACAACGAAGGGACGGCTGACTGTCAACAACAATTTCCCAGTT
CCAGGGCCAATCTCAACTTCACAGCGAAGGATATTGGACC
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*
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*
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* * * * * *
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** * * **
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*
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* *
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TTTCAGAGCCAATTTCAACTTCACAGCGAAGGATATTGGACCCAAGACAGCACAAGCTCAACTTC
ACAGCGAAGGGGCGGCTGACTGTCAACAAACAA
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756971 ATATCGTGCC
*
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*
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196 GATATTGG
* * *
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*
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66 GTTCCAGGGCCAATTTCAACTTCACAGCGAAGGATATTGGACCCAAGACAGCACAAGCTCAACTT
* * *
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757352 CCGGTTCCAG
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CACAGCGAAGGGGCGACTGACTGTCAACAAACAATTTCAGAGCCAATCTCAACTTCACAACGAAG
GATATTGG
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*
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* *
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*
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1 ATTTATTTTT
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Statistics
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ATTTATTTTTATT
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* *
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* * * *
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*
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GATAAATCCTTCGGGCCATCAGTAAGCCTTTCGAGCAAGAT
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764841 TTCTAAAATC
*
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* * * * *
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*
765056 -AAAAATAGAATAAT
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*
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*
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1 AAAAAATAAA
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AAAAAATAAAAAAT
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Indices: 768101--768132 Score: 64
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1 ATTACCATGTTTTTTT
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Indices: 768635--768662 Score: 56
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768625 TGAAGCAAAC
768635 TA TA TA TA TA TA TA TA TA TA TA TA TA TA
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TA
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* *
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*
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*
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1 TTTATTAATTTACAGAG
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1 TTT
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1 TTT
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Statistics
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TTTTTTCTTTT
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Indices: 774015--774101 Score: 97
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*
774015 TAAATACAACAAACTTACAATAAGAATTAAATGG
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* *
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1 TAAATACAACAAAATTA
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Statistics
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* * * * * * * *
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* * * *
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* * *
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* * * * * *
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1 ATACTACTATGCAACATACAAACTGAGGTAGGCATCATGGTGCGGCTGAGGGGCTACATCTCAG-
* * * *
784135 AGCTCGCACACCTCTCTAACCTACTT
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* *
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*
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1 AATATAT-ATAGATATATTA
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*
790862 AAAATATATTATTTAATA
1 AAAATATATAATTTAATA
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1 AAA
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* *
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* * *
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795301 ATGGTGTCTT
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TGGAACACGATTTAGA
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* *
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* * *
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*
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CATATAATTGCACCGAAGTGCCA
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797274 TAATGTCCAT
* *
797284 AAGGACCACATATCATTCCTTAAGAATCATATACACATACTAGGAATCAAGTATGTGTCTCCCCA
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* * *
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AAGGACCACATATCATTCCTTAAGAATCATATACACATACAAGGAATCAAGTATGTGTCTCACCA
GACTTCACACATGTTCCAAAGAATACATATATGTCCCG
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798300 CTCTTTATAA
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*
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1 A
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ACATCTATTTATATTTCCCT
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802262 TCACACATCT
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* *
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* *
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*
802341 TATAATAAT
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CATATAATTGCACCGAAGTGCCA
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802345 ATAATGTCAT
* * *
802355 AAGGACCACATATCATTCCTTAAGAATCATATACTTATACTAAGGATCAAGTATGTGTCTCCCCA
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*
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1 AAGGACC
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AAGGACCACATATCATTCCTTAAGAATCATATACATATACCAAGGATCAAGTATGTGTCTCACCA
GACTTCACACATGTTCCAAAGAATACATATATGTCCCG
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806489 ACACACCCTT
* *
806499 TTATAGCCAAGTTACCCTAATCATATT-AGGGTTTTATTATTTCAAATTAATTAAATCTATATTT
1 TTATAGCCAAGTTACCCTAATCATATTAAGGATTTTATTATTTCAAATTAATTAAATATATATTT
* *
806563 AATTAATTGAAATTTAATAATCCTC
66 AATTAATTAAAATTAAATAATCCTC
*
806588 TTATATCCAAGTTACCCTAATCATATTAAGGATTTTATTATTTCAAATTAATTAAATATATATTT
1 TTATAGCCAAGTTACCCTAATCATATTAAGGATTTTATTATTTCAAATTAATTAAATATATATTT
806653 AATTAATTAAAATTAAATA
66 AATTAATTAAAATTAAATA
806672 TTCATGATTA
Statistics
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89 26 0.33
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TTATAGCCAAGTTACCCTAATCATATTAAGGATTTTATTATTTCAAATTAATTAAATATATATTT
AATTAATTAAAATTAAATAATCCTC
Found at i:806658 original size:20 final size:21
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806623 TATTATTTCA
806633 AATTAATT-AAATATATATTT
1 AATTAATTAAAATATATATTT
*
806653 AATTAATTAAAATTAAATATTCAT
1 AATTAATTAAAA-TATATATT--T
* *
806677 GATT-ATTAAAACATATATTT
1 AATTAATTAAAATATATATTT
* *
806697 AATTAACTATAGATATATATTT
1 AATTAATTA-AAATATATATTT
806719 TAGTAACGTA
Statistics
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21 6 0.12
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AATTAATTAAAATATATATTT
Found at i:815066 original size:22 final size:20
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815024 TATATATATA
*
815034 TTAT-TTATTTATTTATATGT
1 TTATATTATTTATAT-TATGT
815054 TTCATATTATTTATATTATGT
1 TT-ATATTATTTATATTATGT
**
815075 TTATA-TACATATATATAT-T
1 TTATATTATTTATAT-TATGT
815094 TTATATTAT
1 TTATATTAT
815103 ACAAAATCTT
Statistics
Matches: 41, Mismatches: 4, Indels: 8
0.77 0.08 0.15
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19 13 0.32
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22 9 0.22
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Consensus pattern (20 bp):
TTATATTATTTATATTATGT
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Period size: 9 Copynumber: 4.9 Consensus size: 9
815020 TTCTTATATA
815030 TATATTATT
1 TATATTATT
815039 TAT-TTATT
1 TATATTATT
815047 TATATGT-TT
1 TATAT-TATT
*
815056 CATATTATT
1 TATATTATT
815065 TATATTAT
1 TATATTAT
815073 GTTTATATAC
Statistics
Matches: 29, Mismatches: 2, Indels: 6
0.78 0.05 0.16
Matches are distributed among these distances:
8 9 0.31
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ACGTcount: A:0.30, C:0.02, G:0.02, T:0.65
Consensus pattern (9 bp):
TATATTATT
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Period size: 208 Copynumber: 2.0 Consensus size: 206
816763 GGTAGATTTC
*
816773 TCCTTACACACAACACTGCATTTACATAACAAGCTCTATACTGAGCTTCGTCCATTTTAAGTTGG
1 TCCTTACACACAACACTGCATTTACATAACAAGCTCTATACTGAGCTTCGTCCATTTTAAGTGGG
816838 GGTGAAAGTGACACCTTCTTGAGAAATGTTTCTCCGTGCCAGGACTAGCAAGTAAACTTCGAGGT
66 GGTGAAAGTGACACCTTCTTGAGAAATGTTTCTCCGTGCCAGGACTAGCAAGTAAACTTCGAGGT
816903 CCACACTTTATGTCTTTGTGAGACATGTTTCCCCGTTTCAGGCATAGGGAAGTGCATCCCCTCAA
131 CCACACTTTATGTCTTTGTGAGACATGTTTCCCCGTTTCAGGCATAGGGAAGTGCATCCCCTCAA
816968 ATTTAACTTGG
196 ATTTAACTTGG
*
816979 TCCTTACACACAACACTGTATTTACATAACATAAGCTCTATACTGAGCTTCGTCCATTTTAAGTG
1 TCCTTACACACAACACTGCATTTACATAAC--AAGCTCTATACTGAGCTTCGTCCATTTTAAGTG
* *
817044 GGGGTGAAAGTGACGCCTTCTTGAGAAATGTTTCTCCGTGCCAGGACTAGCAAGTAAACTTCGGG
64 GGGGTGAAAGTGACACCTTCTTGAGAAATGTTTCTCCGTGCCAGGACTAGCAAGTAAACTTCGAG
817109 GTCCACACTTTATGTCTTTGTGAGACATGTTTCCCCGTTTCAGGCATAGGGAAGTGCATCCCCTC
129 GTCCACACTTTATGTCTTTGTGAGACATGTTTCCCCGTTTCAGGCATAGGGAAGTGCATCCCCTC
817174 AAATTTAACTTGG
194 AAATTTAACTTGG
817187 TCCTT
1 TCCTT
817192 GTAAGCCTGT
Statistics
Matches: 207, Mismatches: 4, Indels: 2
0.97 0.02 0.01
Matches are distributed among these distances:
206 29 0.14
208 178 0.86
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Consensus pattern (206 bp):
TCCTTACACACAACACTGCATTTACATAACAAGCTCTATACTGAGCTTCGTCCATTTTAAGTGGG
GGTGAAAGTGACACCTTCTTGAGAAATGTTTCTCCGTGCCAGGACTAGCAAGTAAACTTCGAGGT
CCACACTTTATGTCTTTGTGAGACATGTTTCCCCGTTTCAGGCATAGGGAAGTGCATCCCCTCAA
ATTTAACTTGG
Found at i:817531 original size:22 final size:21
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Indices: 817497--817537 Score: 64
Period size: 22 Copynumber: 1.9 Consensus size: 21
817487 ATAATTATTT
817497 AAAAAATTAAATAAAAATACC
1 AAAAAATTAAATAAAAATACC
*
817518 AAAAACATTTAATAAAAATA
1 AAAAA-ATTAAATAAAAATA
817538 ATTTTTTATA
Statistics
Matches: 18, Mismatches: 1, Indels: 1
0.90 0.05 0.05
Matches are distributed among these distances:
21 5 0.28
22 13 0.72
ACGTcount: A:0.71, C:0.07, G:0.00, T:0.22
Consensus pattern (21 bp):
AAAAAATTAAATAAAAATACC
Found at i:821148 original size:259 final size:257
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Indices: 820680--821427 Score: 865
Period size: 259 Copynumber: 2.9 Consensus size: 257
820670 TTTTATTGGG
*
820680 TTCACAATGAAGGATATTGGGTT-TAAAAGCAATTTTAAAATCGACTTAACTCACAATGGAGGAG
1 TTCACAATGAAGGATATT-GGTTCT-AAAGTAATTTTAAAATCGACTTAACTCACAATGGAGGAG
* **
820744 T-TGTATGTAATTTAGCTTAACTCAACAATGAGGAGCTATTTTTCAGTTAAGATTTTCGAGTCAA
64 TCT-TATGCAATTTAGCTTAACTCAACAGCGAGGAGCTATTTTTCAGTTAAGATTTTCGAGTCAA
* ** * * *
820808 ATTCCAACTTCACGACAAAATATATTTGGGTACGAAAGCAAATTCAAAATCAAAAGATTCATTTG
128 ATTTCAACTTCACGATGAAAGATATTTGGGTTCGAAAGCAAATTCAAAATCAAAAGAGTCATTTG
* * * *** * *
820873 CAATTCAACCTAACTCAATAGCGATTTGCTATTTTTCAGTCAAAATTTTTGAAGACCAATTGCAA
193 CAATT-AGCTTAACTCAACAGCGAGGAGCTATTTTCCAATCAAAATTTTTGAAGACCAATTGCAA
*
820938 T
257 C
* * * * * *
820939 TTCACAATTAATGATATTAGGTTCTAAAGTAATTTCACAATCGACTTAACTCGCAATTGAGGAGT
1 TTCACAATGAAGGATATT-GGTTCTAAAGTAATTTTAAAATCGACTTAACTCACAATGGAGGAGT
* * *
821004 CTTTTGCAATTTAGCTTAACTCAACAGCGAGGAGCTATTTTCCAGTTAAGATTTTCAAGTCAAAT
65 CTTATGCAATTTAGCTTAACTCAACAGCGAGGAGCTATTTTTCAGTTAAGATTTTCGAGTCAAAT
* * * *
821069 TTCAATTTTACGATGAAGGATATTTGGGTTCGAAAGCAAATTCAAAATCAAAAGAGTCATCTGCA
130 TTCAACTTCACGATGAAAGATATTTGGGTTCGAAAGCAAATTCAAAATCAAAAGAGTCATTTGCA
* * * * *
821134 ATATAGCTTAACTCAACAGTGAGGAGTTATTTTCCAATCAAATTTTTTGAAGATCAATTTCAAC
195 AT-TAGCTTAACTCAACAGCGAGGAGCTATTTTCCAATCAAAATTTTTGAAGACCAATTGCAAC
* * * * *
821198 TTCATAGTGAAGGATATTGTATTCGAAAGTAATTTTAAAATCGACTTAACTCACAATGGAAGAGT
1 TTCACAATGAAGGATATTG-GTTCTAAAGTAATTTTAAAATCGACTTAACTCACAATGGAGGAGT
* * * * * *
821263 CATCTACAATCTAGCTTAACTCAACAGCGAGGAGCTATTTTTCAGTCAAGATTTTCGAGTAAAAT
65 CTTATGCAATTTAGCTTAACTCAACAGCGAGGAGCTATTTTTCAGTTAAGATTTTCGAGTCAAAT
* * * * ** *
821328 TTCAACTTCACGATGAATGACATTTGAGTTCTAAAGCAAATTCAAAATGGAAA-AGTCATTTGTA
130 TTCAACTTCACGATGAAAGATATTTGGGTTCGAAAGCAAATTCAAAATCAAAAGAGTCATTTGCA
* * *
821392 GTCTAGCTTAACTCAACA-CTGAGAAACTATTTTCCA
195 AT-TAGCTTAACTCAACAGC-GAGGAGCTATTTTCCA
821428 GCTAAAGTTA
Statistics
Matches: 411, Mismatches: 73, Indels: 11
0.83 0.15 0.02
Matches are distributed among these distances:
258 39 0.09
259 369 0.90
260 3 0.01
ACGTcount: A:0.36, C:0.16, G:0.15, T:0.32
Consensus pattern (257 bp):
TTCACAATGAAGGATATTGGTTCTAAAGTAATTTTAAAATCGACTTAACTCACAATGGAGGAGTC
TTATGCAATTTAGCTTAACTCAACAGCGAGGAGCTATTTTTCAGTTAAGATTTTCGAGTCAAATT
TCAACTTCACGATGAAAGATATTTGGGTTCGAAAGCAAATTCAAAATCAAAAGAGTCATTTGCAA
TTAGCTTAACTCAACAGCGAGGAGCTATTTTCCAATCAAAATTTTTGAAGACCAATTGCAAC
Found at i:821238 original size:122 final size:122
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Indices: 821008--821453 Score: 300
Period size: 137 Copynumber: 3.5 Consensus size: 122
820998 AGGAGTCTTT
* * *
821008 TGCAATTTAGCTTAACTCAACAGCGAGGAGCTATTTTCCAGTTAAGATTTTCAAGTCAAATTTCA
1 TGCAATATAGCTTAACTCAACAGCGAGGAGCTATTTTCCAATCAAGATTTTCAAGTCAAATTTCA
* *
821073 ATTTTACGATGAAGGATATTTGGGTTCGAAAGCAAATTCAAAATCAAAAGAGTCATC
66 ATTATACGATGAAGGATATTTGGATTCGAAAGCAAATTCAAAATCAAAAGAGTCATC
* * *
821130 TGCAATATAGCTTAACTCAACAGTGAGGAGTTATTTTCCAATCAA-ATTTTTTGAAGATC-AATT
1 TGCAATATAGCTTAACTCAACAGCGAGGAGCTATTTTCCAATCAAGA--TTTTCAAG-TCAAATT
* * * *
821193 TCAACTTCATA-G-TGAAGGATA-TTGTATTCGAAAGTAATTTTAAAATCGACTTAACTCACAAT
63 TCAA-TT-ATACGATGAAGGATATTTGGATTCGAAAG------CAAATTC-A---AAAT--CAA-
821255 GGAAGAGTCATC
113 --AAGAGTCATC
* * * * * *
821267 TACAATCTAGCTTAACTCAACAGCGAGGAGCTATTTTTCAGTCAAGATTTTCGAGTAAAATTTCA
1 TGCAATATAGCTTAACTCAACAGCGAGGAGCTATTTTCCAATCAAGATTTTCAAGTCAAATTTCA
* * * * ** *
821332 ACTT-CACGATGAATGACATTT-GAGTTCTAAAGCAAATTCAAAATGGAAA-AGTCATT
66 A-TTATACGATGAAGGATATTTGGA-TTCGAAAGCAAATTCAAAATCAAAAGAGTCATC
* * * * * * * * *
821388 TGTAGTCTAGCTTAACTCAACA-CTGAGAAACTATTTTCCAGCTAAAG-TTATCGAGTCAAATTT
1 TGCAATATAGCTTAACTCAACAGC-GAGGAGCTATTTTCCA-ATCAAGATTTTCAAGTCAAATTT
821451 CAA
64 CAA
821454 CTTCACAAAG
Statistics
Matches: 254, Mismatches: 42, Indels: 57
0.72 0.12 0.16
Matches are distributed among these distances:
120 1 0.00
121 56 0.22
122 57 0.22
123 24 0.09
124 5 0.02
125 3 0.01
127 3 0.01
128 5 0.02
129 1 0.00
130 1 0.00
131 5 0.02
132 3 0.01
134 4 0.02
135 2 0.01
136 25 0.10
137 58 0.23
138 1 0.00
ACGTcount: A:0.36, C:0.16, G:0.16, T:0.32
Consensus pattern (122 bp):
TGCAATATAGCTTAACTCAACAGCGAGGAGCTATTTTCCAATCAAGATTTTCAAGTCAAATTTCA
ATTATACGATGAAGGATATTTGGATTCGAAAGCAAATTCAAAATCAAAAGAGTCATC
Found at i:821561 original size:32 final size:33
Alignment explanation
Indices: 821498--821567 Score: 90
Period size: 32 Copynumber: 2.1 Consensus size: 33
821488 CCAAGAGTCG
*
821498 ACTTAACTCGCTAAAAGGAGTCATCCACAACTTT
1 ACTTAACTCGC-AAAAGGAGTCATCCACAACTTC
*
821532 ACTTAACTCGC-AAAGGAGTCAAT-CTCAACTTC
1 ACTTAACTCGCAAAAGGAGTC-ATCCACAACTTC
821564 ACTT
1 ACTT
821568 CTTTGGACAA
Statistics
Matches: 33, Mismatches: 2, Indels: 4
0.85 0.05 0.10
Matches are distributed among these distances:
32 20 0.61
33 2 0.06
34 11 0.33
ACGTcount: A:0.34, C:0.27, G:0.11, T:0.27
Consensus pattern (33 bp):
ACTTAACTCGCAAAAGGAGTCATCCACAACTTC
Found at i:824221 original size:13 final size:13
Alignment explanation
Indices: 824205--824231 Score: 54
Period size: 13 Copynumber: 2.1 Consensus size: 13
824195 GTTCATTAAC
824205 ATCTAATTATACT
1 ATCTAATTATACT
824218 ATCTAATTATACT
1 ATCTAATTATACT
824231 A
1 A
824232 AGGCATGCAA
Statistics
Matches: 14, Mismatches: 0, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
13 14 1.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.15, G:0.00, T:0.44
Consensus pattern (13 bp):
ATCTAATTATACT
Found at i:830512 original size:22 final size:24
Alignment explanation
Indices: 830487--830539 Score: 74
Period size: 24 Copynumber: 2.3 Consensus size: 24
830477 CATGAGCTAA
830487 TAAATGAATG-AAT-AAGCATGCT
1 TAAATGAATGTAATGAAGCATGCT
* *
830509 TAAATGAATGTGATGAATCATGCT
1 TAAATGAATGTAATGAAGCATGCT
830533 TAAATGA
1 TAAATGA
830540 TTGCAAGACT
Statistics
Matches: 27, Mismatches: 2, Indels: 2
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Consensus pattern (24 bp):
TAAATGAATGTAATGAAGCATGCT
Found at i:838360 original size:17 final size:16
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Period size: 17 Copynumber: 2.8 Consensus size: 16
838328 TTATTTTACC
838338 TTTTTATATTATATATA
1 TTTTTATATTATA-ATA
*
838355 TTTTTATACTTTTAATA
1 TTTTTATA-TTATAATA
*
838372 TTATTATATTAT
1 TTTTTATATTAT
838384 GTTTATATAC
Statistics
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17 18 0.72
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TTTTTATATTATAATA
Found at i:845485 original size:39 final size:39
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845432 GTTTACAATC
845442 CAAACGCCACAAAATGATACTTTAGCGGCGTTTTTTCAA
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1 CAAACGCCACAAAATGATACTTTAGCGGCGTTTTTTCAA
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1 CAAACGCCA
845529 TAATAGAGTG
Statistics
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CAAACGCCACAAAATGATACTTTAGCGGCGTTTTTTCAA
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845502 TTAGCGGCGT
* * *
845512 TTTTTCAACAAACGCCATAATAGAGTGGCAATGTAGCGGTGTTTATAGCT-CAAATGCTGGAACA
1 TTTTTCAACAAACGCCATAATAGAGTAGCAATGTAGCGGCGTTTATA--TACAAACGCTGGAACA
845576 GGGTTGTTTATAATGGCA
64 GGGTTGTTTATAATGGCA
* * * * *
845594 TTTTTCAACAAATGCCATAATAGAGTAGTAATTTAGCGGCGTTTTTATACAAACGCTGTAACAGG
1 TTTTTCAACAAACGCCATAATAGAGTAGCAATGTAGCGGCGTTTATATACAAACGCTGGAACAGG
845659 GTTGTTTATA
66 GTTGTTTATA
845669 GTGACGTTTA
Statistics
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TTTTTCAACAAACGCCATAATAGAGTAGCAATGTAGCGGCGTTTATATACAAACGCTGGAACAGG
GTTGTTTATAATGGCA
Found at i:845685 original size:82 final size:81
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845502 TTAGCGGCGT
* * * * * * *
845512 TTTTTCAACAAACGCCATAATAGAGTGGCAATGTAGCGGTGTTTATAGCTCAAATGCTGGAACAG
1 TTTTCCAACAAATGCCATAATAGAGTAGTAATTTAGCGGCGTTTATA-CTCAAACGCTGGAACAG
*
845577 GGTTGTTTATAATGGCA
65 GGTTGTTTATAATGACA
* * *
845594 TTTTTCAACAAATGCCATAATAGAGTAGTAATTTAGCGGCGTTTTTA-TACAAACGCTGTAACAG
1 TTTTCCAACAAATGCCATAATAGAGTAGTAATTTAGCGGCGTTTATACT-CAAACGCTGGAACAG
* *
845658 GGTTGTTTATAGTGACG
65 GGTTGTTTATAATGACA
* * *
845675 TTTATCCAACAAATG-AATCTATAGAGAAGTAATTTAGCGG
1 TTT-TCCAACAAATGCCAT-AATAGAGTAGTAATTTAGCGG
845715 TATTTATCAA
Statistics
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80 1 0.01
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ACGTcount: A:0.33, C:0.14, G:0.22, T:0.32
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TTTTCCAACAAATGCCATAATAGAGTAGTAATTTAGCGGCGTTTATACTCAAACGCTGGAACAGG
GTTGTTTATAATGACA
Found at i:846293 original size:22 final size:22
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846258 TCTGCTTTCA
*
846268 AATA-GAAGAATAATATCTTTTG
1 AATAGGAA-AATAATAGCTTTTG
846290 AATAGGAAAATAATAGCTTTTG
1 AATAGGAAAATAATAGCTTTTG
846312 AA
1 AA
846314 AACGTGAACA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
22 19 0.86
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Consensus pattern (22 bp):
AATAGGAAAATAATAGCTTTTG
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856412 GCCTAAAATA
856422 AAGCAAGGGAAGCAGAGAGAG
1 AAGCAAGGGAAGCAGAGAGAG
* * * * *
856443 CAGCAATGAAAGTAGCGAGAG
1 AAGCAAGGGAAGCAGAGAGAG
*
856464 TAGC-AGCGGAAGCAGAGAGAG
1 AAGCAAG-GGAAGCAGAGAGAG
856485 AAGCAA
1 AAGCAA
856491 CAATAGCATA
Statistics
Matches: 35, Mismatches: 11, Indels: 3
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Consensus pattern (21 bp):
AAGCAAGGGAAGCAGAGAGAG
Found at i:857148 original size:43 final size:44
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Indices: 857021--857303 Score: 260
Period size: 43 Copynumber: 6.6 Consensus size: 44
857011 ACGCATTTTA
* * * *
857021 CGGCGTTTGTGGGAAAAATGCCGTTAAATGTCACA-ACCTATTG
1 CGGCGTTTGTGAGAAAAACGCCGCTAAATCTCACACACCTATTG
* * * * *
857064 CGACGTTTCTGAGAAAAACG-TGTTAAATGTCACA-ACCTATTG
1 CGGCGTTTGTGAGAAAAACGCCGCTAAATCTCACACACCTATTG
*
857106 CGGCGTTTGTCAGAAAAACGCCGCTAAATCTCACA-ACCTATTG
1 CGGCGTTTGTGAGAAAAACGCCGCTAAATCTCACACACCTATTG
* * *
857149 CGTCGTTTGTTAGAAAAACGCAGCTAAATCTCA-ACACCTATTG
1 CGGCGTTTGTGAGAAAAACGCCGCTAAATCTCACACACCTATTG
* * * *
857192 CGGCGTTTGTGGGAAAAACGCCACTAAACCTC-CATACCTATTG
1 CGGCGTTTGTGAGAAAAACGCCGCTAAATCTCACACACCTATTG
* * * ** * *
857235 CAGCATTTGT-AGGACAAACGTTGCTAAATAT-AAACACCTATTG
1 CGGCGTTTGTGA-GAAAAACGCCGCTAAATCTCACACACCTATTG
*
857278 CGACGTTTGTTGA-AAAAACGCCGCTA
1 CGGCGTTTG-TGAGAAAAACGCCGCTA
857304 TATATCGTTA
Statistics
Matches: 195, Mismatches: 38, Indels: 14
0.79 0.15 0.06
Matches are distributed among these distances:
42 39 0.20
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45 1 0.01
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Consensus pattern (44 bp):
CGGCGTTTGTGAGAAAAACGCCGCTAAATCTCACACACCTATTG
Found at i:857219 original size:86 final size:84
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Indices: 857021--857303 Score: 302
Period size: 86 Copynumber: 3.3 Consensus size: 84
857011 ACGCATTTTA
* * * * *
857021 CGGCGTTTGTGGGAAAAATGCCGTTAAATGTCACAACCTATTGCGACGTTTCTGAGAAAAACGTG
1 CGGCGTTTGTGGGAAAAACGCCGCTAAATCTCACAACCTATTGCG-CGTTTGTTAGAAAAACGTG
* *
857086 TTAAATGTC-ACAACCTATTG
65 CTAAATATCAAC-ACCTATTG
** *
857106 CGGCGTTTGTCAGAAAAACGCCGCTAAATCTCACAACCTATTGCGTCGTTTGTTAGAAAAACGCA
1 CGGCGTTTGTGGGAAAAACGCCGCTAAATCTCACAACCTATTGCG-CGTTTGTTAGAAAAACG-T
*
857171 GCTAAATCTCAACACCTATTG
64 GCTAAATATCAACACCTATTG
* * * *
857192 CGGCGTTTGTGGGAAAAACGCCACTAAACCTC-CATACCTATTGCAGCATTTG-TAGGACAAACG
1 CGGCGTTTGTGGGAAAAACGCCGCTAAATCTCACA-ACCTATTGC-GCGTTTGTTA-GAAAAACG
*
857255 TTGCTAAATATAAACACCTATTG
63 -TGCTAAATATCAACACCTATTG
* * *
857278 CGACGTTTGTTGAAAAAACGCCGCTA
1 CGGCGTTTGTGGGAAAAACGCCGCTA
857304 TATATCGTTA
Statistics
Matches: 168, Mismatches: 25, Indels: 9
0.83 0.12 0.04
Matches are distributed among these distances:
85 59 0.35
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87 3 0.02
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CGGCGTTTGTGGGAAAAACGCCGCTAAATCTCACAACCTATTGCGCGTTTGTTAGAAAAACGTGC
TAAATATCAACACCTATTG
Found at i:866199 original size:2 final size:2
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Period size: 2 Copynumber: 66.0 Consensus size: 2
866184 ACACACACAC
*
866194 AT AT AT AT AT A- AT AT AT AT AT GT AT AT AT AT AT AT AT AT AT
1 AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT
* * *
866235 AT AT -T GAT -T A- AT GT -T GT TT AT AT -T AT AT -T AT AT -T AT
1 AT AT AT -AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT
*
866271 AT -T AT AT TT AT -T AT -T AT AT -T AT AT -T AT AT -T AT AT -T
1 AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT
866306 AT AT AT
1 AT AT AT
866312 TATTTATTAC
Statistics
Matches: 93, Mismatches: 7, Indels: 32
0.70 0.05 0.24
Matches are distributed among these distances:
1 15 0.16
2 77 0.83
3 1 0.01
ACGTcount: A:0.41, C:0.00, G:0.03, T:0.56
Consensus pattern (2 bp):
AT
Found at i:866235 original size:10 final size:10
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Indices: 866194--866311 Score: 77
Period size: 9 Copynumber: 13.2 Consensus size: 10
866184 ACACACACAC
866194 ATATATATAT
1 ATATATATAT
866204 A-ATATATAT
1 ATATATATAT
*
866213 ATGTATATAT
1 ATATATATAT
866223 ATATATATAT
1 ATATATATAT
866233 ATATAT-TGAT
1 ATATATAT-AT
*
866243 -TA-ATGT-T
1 ATATATATAT
* *
866250 GTTTATAT-T
1 ATATATATAT
866259 ATAT-TATAT
1 ATATATATAT
866268 -TATAT-TAT
1 ATATATATAT
*
866276 ATTTAT-TAT
1 ATATATATAT
866285 -TATAT-TAT
1 ATATATATAT
866293 AT-TATAT-T
1 ATATATATAT
866301 ATAT-TATAT
1 ATATATATAT
866310 AT
1 AT
866312 TATTTATTAC
Statistics
Matches: 88, Mismatches: 8, Indels: 25
0.73 0.07 0.21
Matches are distributed among these distances:
7 1 0.01
8 28 0.32
9 34 0.39
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ACGTcount: A:0.41, C:0.00, G:0.03, T:0.56
Consensus pattern (10 bp):
ATATATATAT
Found at i:866262 original size:5 final size:5
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Indices: 866252--866868 Score: 495
Period size: 5 Copynumber: 124.2 Consensus size: 5
866242 TTAATGTTGT
866252 TTATA TTATA TTATA TTATA TTATA TTTATTA TTATA TTATA TTATA TTATA
1 TTATA TTATA TTATA TTATA TTATA -TTA-TA TTATA TTATA TTATA TTATA
* * * * * * *
866304 TTATA -TATTA TT-TA TTACA TTACA TTACA TTACA TTACA TTACA TTACA
1 TTATA TTA-TA TTATA TTATA TTATA TTATA TTATA TTATA TTATA TTATA
* * * * * *
866353 TTACA TTACA TTACA TTACA TTACA TTACA TTATA TTATA TTATA TTATA
1 TTATA TTATA TTATA TTATA TTATA TTATA TTATA TTATA TTATA TTATA
* * * * *
866403 TTATA TTATA TTATA TTATA TTATA TTACA TTACA TTACA TTACA TTACA
1 TTATA TTATA TTATA TTATA TTATA TTATA TTATA TTATA TTATA TTATA
* * * * * * * * * *
866453 TTACA TTACA TTACA TTACA TTACA TTACA TTACA TTACA TTACA TTACA
1 TTATA TTATA TTATA TTATA TTATA TTATA TTATA TTATA TTATA TTATA
* * *
866503 TTACA TTA-C TTACA -T-TA TTATA TT-TA TTATA TTATA TTATA TTATA
1 TTATA TTATA TTATA TTATA TTATA TTATA TTATA TTATA TTATA TTATA
866549 TTATA TTATA TTATA TTATA TTATA -T-TA TTATA TTATA -TATA TTATA
1 TTATA TTATA TTATA TTATA TTATA TTATA TTATA TTATA TTATA TTATA
866596 TTATA TTATA TTATA TTATA -TATA TTATA TTATA TTATA TTAT- TATATTA
1 TTATA TTATA TTATA TTATA TTATA TTATA TTATA TTATA TTATA T-TA-TA
* * * * * * * * *
866646 TTACA TTACA TTATA -TA-C TTACA TTACA TTACA TTACA TTACA TTACA
1 TTATA TTATA TTATA TTATA TTATA TTATA TTATA TTATA TTATA TTATA
* * * * * * * * * *
866694 TTACA TTACA TTACA TTACA TTACA TTACA TTACA TTACA TTACA TTACA
1 TTATA TTATA TTATA TTATA TTATA TTATA TTATA TTATA TTATA TTATA
* * * * * * * *
866744 TTACA TTACA TTACA TTACA TTACA TTACA TTACA TTACTTA TTACA TTATA
1 TTATA TTATA TTATA TTATA TTATA TTATA TTATA TTA--TA TTATA TTATA
* * *
866796 TTATA TTATATA TTATA TTATA TTATA TTATA TTATA TTGTA TTGTA TTGTA
1 TTATA -T-TATA TTATA TTATA TTATA TTATA TTATA TTATA TTATA TTATA
* *
866848 TTGTA TTGTA TTATA TTATA T
1 TTATA TTATA TTATA TTATA T
866869 ACCTATTTAA
Statistics
Matches: 575, Mismatches: 15, Indels: 44
0.91 0.02 0.07
Matches are distributed among these distances:
3 3 0.01
4 30 0.05
5 519 0.90
6 12 0.02
7 11 0.02
ACGTcount: A:0.39, C:0.10, G:0.01, T:0.51
Consensus pattern (5 bp):
TTATA
Found at i:866807 original size:12 final size:12
Alignment explanation
Indices: 866792--866828 Score: 60
Period size: 12 Copynumber: 3.2 Consensus size: 12
866782 CTTATTACAT
866792 TATATTATATTA
1 TATATTATATTA
866804 TATATTATA-T-
1 TATATTATATTA
866814 TATATTATATTA
1 TATATTATATTA
866826 TAT
1 TAT
866829 TATATTGTAT
Statistics
Matches: 23, Mismatches: 0, Indels: 4
0.85 0.00 0.15
Matches are distributed among these distances:
10 9 0.39
11 2 0.09
12 12 0.52
ACGTcount: A:0.41, C:0.00, G:0.00, T:0.59
Consensus pattern (12 bp):
TATATTATATTA
Found at i:868066 original size:22 final size:22
Alignment explanation
Indices: 868018--868068 Score: 66
Period size: 22 Copynumber: 2.3 Consensus size: 22
868008 AAACCAAAAC
* *
868018 ACCCAAACAAAACTCGACCTGG
1 ACCCAAACAAAACTCGACCCGA
* *
868040 GCCCAAACCAAACTCGACCCGA
1 ACCCAAACAAAACTCGACCCGA
868062 ACCCAAA
1 ACCCAAA
868069 TTGGATCCTA
Statistics
Matches: 24, Mismatches: 5, Indels: 0
0.83 0.17 0.00
Matches are distributed among these distances:
22 24 1.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.41, G:0.12, T:0.06
Consensus pattern (22 bp):
ACCCAAACAAAACTCGACCCGA
Found at i:877757 original size:58 final size:56
Alignment explanation
Indices: 877681--878047 Score: 289
Period size: 58 Copynumber: 6.4 Consensus size: 56
877671 ATCAGGTCCC
* * * * *
877681 ATTTTTAGAGGTTCCTTGATATGATATTTTCAAATGA-TTTTGAAAGAAACTAAGACTA
1 ATTTTTAGGGGTTTCTTG--ATGAT-TTTTCAAATGATTTTTAAAAGAAGCTAAGTCTA
* * * *
877739 ATTTTTAGGGGTTTCTTGATG--TTTTCAAATCAGTTTTT--TAGAAACTAAGTCTG
1 ATTTTTAGGGGTTTCTTGATGATTTTTCAAATGA-TTTTTAAAAGAAGCTAAGTCTA
* * * * *
877792 ATTTTGAGGGGTTTCTTGATGATGATTTCCAAAAGATTTTAAAAAATAGAAGCTAAGCCTA
1 ATTTTTAGGGGTTTCTTGATGAT--TTTTCAAATGATTTT--TAAA-AGAAGCTAAGTCTA
* * * * *
877853 ATTTTTAGGGGTATGTTGATGATGATTTCCAATGAATTTTTAAAAGAAGCTAAGTCTG
1 ATTTTTAGGGGTTTCTTGATGAT-TTTTCAAATG-ATTTTTAAAAGAAGCTAAGTCTA
* * * * * *
877911 ATTTTCAGGGTTTTCTTGATGATTATTTCCAATGAATTTTTTAGAGAAGC-AAGT-TG
1 ATTTTTAGGGGTTTCTTGATGATT-TTTCAAATG-ATTTTTAAAAGAAGCTAAGTCTA
* * * *
877967 ATTTTCAGGGGTTTCTTGATAATTATTTCCAATGAATTTTTAAAAGAAGCTAAGACTA
1 ATTTTTAGGGGTTTCTTGATGATT-TTTCAAATG-ATTTTTAAAAGAAGCTAAGTCTA
878025 ATTTTTAGGGGTTTCTTGATGAT
1 ATTTTTAGGGGTTTCTTGATGAT
878048 AACTGTAAAC
Statistics
Matches: 253, Mismatches: 41, Indels: 30
0.78 0.13 0.09
Matches are distributed among these distances:
53 42 0.17
55 4 0.02
56 55 0.22
57 15 0.06
58 92 0.36
59 3 0.01
60 6 0.02
61 36 0.14
ACGTcount: A:0.31, C:0.09, G:0.19, T:0.41
Consensus pattern (56 bp):
ATTTTTAGGGGTTTCTTGATGATTTTTCAAATGATTTTTAAAAGAAGCTAAGTCTA
Found at i:877857 original size:61 final size:58
Alignment explanation
Indices: 877718--878047 Score: 325
Period size: 58 Copynumber: 5.8 Consensus size: 58
877708 TTTCAAATGA
* * * * * * * *
877718 TTTTGAAAGAAACTAAGACTAATTTTTAGGGGTTTCTTGATG-T--TTTCAAATCAGT
1 TTTTAAAAGAAGCTAAGTCTGATTTTCAGGGGTTTCTTGATGATGATTTCCAATGAAT
* * * *
877773 TTTT--TAGAAACTAAGTCTGATTTTGAGGGGTTTCTTGATGATGATTTCCAA-AAGAT
1 TTTTAAAAGAAGCTAAGTCTGATTTTCAGGGGTTTCTTGATGATGATTTCCAATGA-AT
* * * * * *
877829 TTTAAAAAATAGAAGCTAAGCCTAATTTTTAGGGGTATGTTGATGATGATTTCCAATGAAT
1 TTT--TAAA-AGAAGCTAAGTCTGATTTTCAGGGGTTTCTTGATGATGATTTCCAATGAAT
* *
877890 TTTTAAAAGAAGCTAAGTCTGATTTTCAGGGTTTTCTTGATGATTATTTCCAATGAAT
1 TTTTAAAAGAAGCTAAGTCTGATTTTCAGGGGTTTCTTGATGATGATTTCCAATGAAT
* * * *
877948 TTTTTAGAGAAGC-AAGT-TGATTTTCAGGGGTTTCTTGATAATTATTTCCAATGAAT
1 TTTTAAAAGAAGCTAAGTCTGATTTTCAGGGGTTTCTTGATGATGATTTCCAATGAAT
* * *
878004 TTTTAAAAGAAGCTAAGACTAATTTTTAGGGGTTTCTTGATGAT
1 TTTTAAAAGAAGCTAAGTCTGATTTTCAGGGGTTTCTTGATGAT
878048 AACTGTAAAC
Statistics
Matches: 229, Mismatches: 34, Indels: 21
0.81 0.12 0.07
Matches are distributed among these distances:
53 32 0.14
54 1 0.00
55 5 0.02
56 58 0.25
57 7 0.03
58 77 0.34
59 3 0.01
61 45 0.20
62 1 0.00
ACGTcount: A:0.31, C:0.09, G:0.19, T:0.41
Consensus pattern (58 bp):
TTTTAAAAGAAGCTAAGTCTGATTTTCAGGGGTTTCTTGATGATGATTTCCAATGAAT
Found at i:878031 original size:172 final size:171
Alignment explanation
Indices: 877718--878047 Score: 409
Period size: 172 Copynumber: 1.9 Consensus size: 171
877708 TTTCAAATGA
* * *
877718 TTTTGAAAGAAACTAAGACTAATTTTTAGGGGTTTCTTGATGTTTTCAAATCAGTTTTTTAGAAA
1 TTTTAAAAGAAACTAAGACTAATTTTCAGGGGTTTCTTGATGTTTTCAAATCAATTTTTTAGAAA
* *
877783 CTAAGTCTGATTTTGAGGGGTTTCTTGATGATGATTTCCAAAAGATTTTAAAAAATAGAAGCTAA
66 CTAAGTCTGATTTTCAGGGGTTTCTTGATAATGATTTCCAAAAGATTTT-AAAAATAGAAGCTAA
* *
877848 GCCTAATTTTTAGGGGTATGTTGATGATGATTTCCAATGAAT
130 GACTAATTTTTAGGGGTATCTTGATGATGATTTCCAATGAAT
* * * * * *
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* * *
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* * *
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* * * * *
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* * * *
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* * * * ** * *
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* * * *
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* **
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* * *
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* * *
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* * *
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* * * * * * *
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*
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66 GTACGGATCAGGTGTTGGTTCATCAACTGGAGGATCGTCTTCAGCTTGTTCGGGCTCTGGAGATG
* * *
886206 CCTCGACATTGAATGCCGGCAGAATTTCATCTGGGAAGATAGGGAAATTCCATTGACCGTGGGGA
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*
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* *
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* * *
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* * * * *
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196 AAAACCAAATAGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTC
* *
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261 TTATAATTCGACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATAACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAA
* * * *
893317 ATTTTTTTTGAGTGCATTTTATTTTTAA-AACC-AAGGCAATGTTCACTTATTAGGTAA-T--TG
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* *
893377 GTATATCCCCTGCAAGTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCCTGAAATAGGTCGACATCCT
390 GTATATCCCCTGCAAGTATGCTCAAGGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCT
* *
893442 TTTCAAATTCGTATCATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAAT
455 TTTCAAATTCGCATCAATGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAAT
* * * * * *
893507 ATCTCACATTTATGCTA-GGGATGAATGCTATTAGAATTAATAAATGAATACCCTTTTTCACTTT
520 ATCTCAAATTTATGCTAGGGGA--AACGCTATTAGCATTAATAAACGAATACCCTCTTTAACTTT
* *
893571 A-ATTTCGTAATGATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTAATTTTAAATATAGG
583 ACATCT-GTAATGATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGG
* *
893635 GTAATAAATTA
647 GTAATTAACTA
* * * *
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1 GGTACCAATTTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCCATGCGTAACCAACTCCCGAATT
* *
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* * *
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131 AATCACCCGA-TTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTC
* * **
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195 AAAAACCAAATAGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCT-TTAAT
* *
893905 TCTTATAATTTGACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATAACCCTTGGTTAATTAGGACAAATG
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* *
894035 AGTATATCCCCTGCAAGTATGCTGAAGGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCC
389 GGTATATCCCCTGCAAGTATGCTCAAGGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCC
* *
894100 TTTTCAAATTCGCATCAATGTTTCTAAAATTGAGGCAATATTTGGTTATTAGGAACAATAGCTAA
454 TTTTCAAATTCGCATCAATGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAA
* *
894165 TATCTCAAATTTATGCTAGGGGCAAACACTATTAGTATTAATAAACGAATACCCTCTTTAACTTT
519 TATCTCAAATTTATGCTAGGGG-AAACGCTATTAGCATTAATAAACGAATACCCTCTTTAACTTT
* *
894230 ACATCTGTAATGATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTATGATTTTAAATAGAGGG
583 ACATCTGTAATGATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGGG
*
894295 TAATCAACTA
648 TAATTAACTA
894305 GGTACCAATTTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCCATGCGTAACCAACTCCCGAATT
1 GGTACCAATTTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCCATGCGTAACCAACTCCCGAATT
** *
894370 TGATTTCTAGATTTTCGCATACCTT-AAACTT-GTA-TTTGAT-AAAAGGAAAT-ATTTTATTAA
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*
894430 AATCACCTGATTTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTC
131 AATCACCCGA-TTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTC
* **
894495 AAAAACCAAATAGGGTTAATATTAGAACCTATATTTCTAGGTTCATGCCTTTAGGTTCTCTT-AT
195 AAAAACCAAATAGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCT-TTAAT
894559 TCTTATAATTCGACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATAACCCTTGGTTAATTAGGACGAATG
259 TCTTATAATTCGACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATAACCCTTGGTTAATTAGGACGAATG
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324 AAAATTTGTTTGAGTGCATTTAATTTTAAGAACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAAT
*
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389 GGTATATCCCCTGCAAGTATGCTCAAGGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCC
*
894754 TTTTCAAATTCGCATCAATGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGAACAATAGCTAA
454 TTTTCAAATTCGCATCAATGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAA
894819 TATCTCGAAA-TTATGCTAGGGGCAAACGCTATTAGCATTAATAAACGAATACCCT-TTTAACTT
519 TATCTC-AAATTTATGCTAGGGG-AAACGCTATTAGCATTAATAAACGAATACCCTCTTTAACTT
*
894882 TACATCCGTAATGATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGG
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647 GTAATTAACTA
* *
894958 GGTACCAATTTTTGGGTGCTTAT--GGGTTATAATCCTTTCCCATGCGT-ACTAACTCCCGAATT
1 GGTACCAATTTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCCATGCGTAACCAACTCCCGAATT
895020 TGA-TTCTAGATTTT--C--ACCTTAAAACTTGGTATTTTGATAAAAATAATAAAATGTTTTTAT
66 TGATTTCTAGATTTTCGCATACCTTAAAACTTGGTATTTTGAT--AAA-AATAAAATGTTTTTAT
* * * * ** *
895080 TAAAATAATCCTATTTTTATGG-GTCCCAATCGTACCTTAAATGATTCATGGAGACTCCTCA-AT
128 TAAAATCACCCGA-TTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATAT
* *
895143 TTCAAAAACCAAATAGGGTT-ATATTAGAACTTACATTTCTAGGATTGTGCCTTTAGGTTCTTTA
192 TTCAAAAACCAAATAGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTA
* * *
895207 ATTC-TATAATTCGACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATCACCCTTGGTAAATTCGGACGAA
257 ATTCTTATAATTCGACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATAACCCTTGGTTAATTAGGACGAA
*
895271 TGAAAATTTGTTTGAGTGCATTTTATTTTTAA-AACCTAAGGC-ATG-T---TTATTAGGGAATT
322 TGAAAATTTGTTTGAGTGCA-TTTAATTTTAAGAACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATT
* * * *
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* * *
895394 T--TTTTCAAATTCGCATCATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATA-TT--TT-GTAGG--CATTAGC
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** ** * * *
895451 TAATATCTCGCATTTATGCTAGGGGTGATGCTATTAGCATTAATAAAC-AATACCAT-ATTAACT
516 TAATATCTCAAATTTATGCTAGGGGAAACGCTATTAGCATTAATAAACGAATACCCTCTTTAACT
* *
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* *
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* *** ** *
895588 GGTACCAATTTTTGGGTGTTTATGGGGG-T-TAATCCTTCCCCACATGTAACTGACTCCTGAATT
1 GGTACCAATTTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCCATGCGTAACCAACTCCCGAATT
* *
895651 TGATTTCTAGATTTTCGCATACCTT-AAACTTTGTA-TTTGATAAAAAT-AAATATTTTTATT-A
66 TGATTTCTAGATTTTCGCATACCTTAAAACTTGGTATTTTGATAAAAATAAAATGTTTTTATTAA
* * * * *
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* * **
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* **
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* * * * *
895902 AATTTGTTTGAGTGTATTTTATTTTAAGAACCTAAGGTAATGTTTACTTATTAGGGAATGAATGG
326 AATTTGTTTGAGTGCATTTAATTTTAAGAACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGG
*
895967 TATATCCCCTGCAAGTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTT
391 TATATCCCCTGCAAGTATGCTCAAGGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTT
*
896032 TTCAAATTCGCATCAATGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAACTAATA
456 TTCAAATTCGCATCAATGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATA
* * * * *
896097 TCTCAAATTTATGTTAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAATGAATAACCTCTTTAACTTTAC
521 TCTCAAATTTATGCTAGGGG-AAACGCTATTAGCATTAATAAACGAATACCCTCTTTAACTTTAC
* * * *
896162 AT-TCATAATGATTTTCAAATTAAATAAGGATCGAACTCAAAATTTTTGATTTTAAATACAGGGT
585 ATCT-GTAATGATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGGGT
896226 AATTAACTA
649 AATTAACTA
* * * *
896235 GGTACCAATTTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCCGTGCATAATCAACTCCTGAATT
1 GGTACCAATTTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCCATGCGTAACCAACTCCCGAATT
* * *
896300 TGATTTTTAGATTTTCGTATACCTTAAAACATGGTATTTTGA-AAAAATAAAATGTTTTTATTAA
66 TGATTTCTAGATTTTCGCATACCTTAAAACTTGGTATTTTGATAAAAATAAAATGTTTTTATTAA
** * * *
896364 AATCACTTGATTTTATGGTTTCCCAATCGTACTTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCA
131 AATCACCCGATTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCA
* *
896429 AAATCC-AATAGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTTTTTAATTC
196 AAAACCAAATAGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTC
*
896493 TTATAATTTGACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATAACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAA
261 TTATAATTCGACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATAACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAA
*
896558 AATTTGTTTGAGTGCATTTTATTTTAAGAACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGG
326 AATTTGTTTGAGTGCATTTAATTTTAAGAACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGG
* * *
896623 TATATCTCCTGCAAGTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCCCAAAATAGGTCGACATCCTT
391 TATATCCCCTGCAAGTATGCTCAAGGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTT
* * *
896688 TTC-AATTCACATCAATGTTTCT--AATCGATGCTATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATA
456 TTCAAATTCGCATCAATGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATA
*
896750 TCTCAAATTCATGCTAGGGTG-AACGCTATTAGCATTAAT-AAC-AATACCCTCTTTAA
521 TCTCAAATTTATGCTAGGG-GAAACGCTATTAGCATTAATAAACGAATACCCTCTTTAA
896806 ATAGGGTAAT
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Consensus pattern (657 bp):
GGTACCAATTTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCCATGCGTAACCAACTCCCGAATT
TGATTTCTAGATTTTCGCATACCTTAAAACTTGGTATTTTGATAAAAATAAAATGTTTTTATTAA
AATCACCCGATTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCA
AAAACCAAATAGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTC
TTATAATTCGACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATAACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAA
AATTTGTTTGAGTGCATTTAATTTTAAGAACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGG
TATATCCCCTGCAAGTATGCTCAAGGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTT
TTCAAATTCGCATCAATGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATA
TCTCAAATTTATGCTAGGGGAAACGCTATTAGCATTAATAAACGAATACCCTCTTTAACTTTACA
TCTGTAATGATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGGGTAA
TTAACTA
Found at i:897929 original size:638 final size:639
Alignment explanation
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Period size: 638 Copynumber: 2.4 Consensus size: 639
896796 CCCTCTTTAA
* * * *
896806 ATAGGGTAATCAACTAGGTACAAGTTTTAGGTGCTTATAGGGG-TATAATCCTTCCCTACGCGTA
1 ATAGGGTAAT--A-TAGGTACAATTTTTAGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCC-ACACATA
* * * *
896870 A-CCTCCCGAATTTGATTTCTAGATTTTTGCATACCTTAAACTTTGCATTTTGATAAAA-ATAAA
62 AGACTCCTGAATTTGATTTCTAGATTTTTTCATACCTTAAAC-TTGAATTTTGATAAAATA-AAA
*
896933 TGTTTTTATTAAAATCACCGATTTTTGTGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACT
125 TG-TTTTATTAAAATCACCGATTTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACT
* * *
896998 CCTCACATTTCAAAAACCAAATA-GGTTAATATTAGAACTTACA-TTCTAGGTTTGTGCCTTTAG
189 TCTCACATTTCAAAAACCAAATAGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTAGCTTTGTGCCTTTAG
* * *
897061 GTTCTTTAATTCTCATAATCAACCCTTTAGGATATAGAGAGCCTTAAATCACCTTGGTTAATTAG
254 GTTCTTTAATTCTCATAATCAACACTTTAGGATAGAGAGAGACTTAAATCACCTTGGTTAATTAG
* *
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*
897191 TAATGGTATATCTCCTGCAAGTATTCTCAGGGGATGACTACCAGTGATTCATGAAATAGGTTGAC
383 TAATGGTATATCTCCTGCAAGTATGCTCAGGGGATGACTACCAGTGATTCATGAAATAGGTTGAC
*
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448 ATACTTTTCAAATTCACATCAATTTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTTGTTATTAGGCACAATAG
* *
897321 CTAATATCTCGCATTCATGATAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAATGAATAACTTTTTAAC
513 CTAATATCTCGCATTCATGATAGGGATGAATGCTATTAGCATTAATAAATGAATAACCTTTTAAC
*
897386 TTTACTT-CAT-ATGATTTTCAAATTAAAT-AAGATCGAACTCAAAATTTCT-GATTTTAAAT
578 TTTAATTCCATAATGATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTT-TGGATTTTAAAT
* ***
897445 ATAGGGTAAT-TAGGTCCAATTTTT-GG-GC-TA-GGGGGTTATAATCCTTCCCGTGCATAACCG
1 ATAGGGTAATATAGGTACAATTTTTAGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCACACATAA--G
*
897505 ACTCCTGAATTTGATTTCTAGATTTTTTCACACCTTTAAACTTGATATTTTGATAAAATAAAATG
64 ACTCCTGAATTTGATTTCTAGATTTTTTCATACC-TTAAACTTGA-ATTTTGATAAAATAAAATG
* *
897570 TTTTATTAAAATCACCTGATTTTTATGGTGTCCCAATCACACCTTAAATGATTGGTTGAGACTTC
127 TTTTATTAAAATCACC-GATTTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTC
*
897635 TCACATTTCAAAAACCAAATAGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTATCTTTGTGCCTTTAGGT
191 TCACATTTCAAAAACCAAATAGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTAGCTTTGTGCCTTTAGGT
* * *
897700 TCTTTAATTCTTATAATTCGACACTTTAGGATAGAGAGAGACTTAAATCACCCTTGGTTATTTAG
256 TCTTTAATTCTCATAA-TCAACACTTTAGGATAGAGAGAGACTTAAATCA-CCTTGGTTAATTAG
897765 GACGAATGAAAA-TTGTTTGAGTGCATTTTATTTTCAAACC-AAGGCAA-TTCACTTATTAGGGA
319 GACGAATGAAAATTTG-TTGAG-GCATTTTATTTTCAAACCTAAGGCAATTTCACTTATTA-GGA
* ** *
897827 ATTAATGGTATATCTCCTGCATGTATGCTCA-GGGAGTGACTACTGGTGATTCCTGAAATAGGTT
381 ATTAATGGTATATCTCCTGCAAGTATGCTCAGGGGA-TGACTACCAGTGATTCATGAAATAGGTT
* *
897891 GACATCCTTTTCAAATTCACATC-ATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTTTTTATTAGGCACA
445 GACATACTTTTCAAATTCACATCAATT-TTTCTAAAATCGAGGCAATATTTTGTTATTAGGCACA
* * *
897955 ATAGCTAATATCTCGCATTTATGCTAGGGATGAATGCTATTAGCATTAATAAATGAATACCCTTT
509 ATAGCTAATATCTCGCATTCATGATAGGGATGAATGCTATTAGCATTAATAAATGAATAACCTTT
* *
898020 TCACTTTAATTCCATAATGATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTTGGGTTTTAAA
574 TAACTTTAATTCCATAATGATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTTGGATTTTAAA
898085 T
639 T
* *
898086 ATAGGGTAATCAACTAGGTATAATTTTTAGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCACACGTAA
1 ATAGGGTAAT--A-TAGGTACAATTTTTAGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCACACATAA
*
898151 GACT-CTCGAATTTGATTTCTAGA-TTTCTCATACC-TAAACTTGGAATTTTGATAAAATAAAAT
63 GACTCCT-GAATTTGATTTCTAGATTTTTTCATACCTTAAACTT-GAATTTTGATAAAATAAAAT
* * * * *
898213 G-TTT-TTATAAATCACCCAACTATTATGGTGTCCCAATCGCACGTTAAATGATTGGTGGCGACT
126 GTTTTATTA-AAATCA-CCGATTTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACT
* *
898276 TCTCATATTTCAAAAACTAAATAGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTAG
189 TCTCACATTTCAAAAACCAAATAGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTAG
898327 GTTTCTGCAT
Statistics
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0.87 0.07 0.07
Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.32, C:0.16, G:0.16, T:0.37
Consensus pattern (639 bp):
ATAGGGTAATATAGGTACAATTTTTAGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCACACATAAGAC
TCCTGAATTTGATTTCTAGATTTTTTCATACCTTAAACTTGAATTTTGATAAAATAAAATGTTTT
ATTAAAATCACCGATTTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCACA
TTTCAAAAACCAAATAGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTAGCTTTGTGCCTTTAGGTTCTTT
AATTCTCATAATCAACACTTTAGGATAGAGAGAGACTTAAATCACCTTGGTTAATTAGGACGAAT
GAAAATTTGTTGAGGCATTTTATTTTCAAACCTAAGGCAATTTCACTTATTAGGAATTAATGGTA
TATCTCCTGCAAGTATGCTCAGGGGATGACTACCAGTGATTCATGAAATAGGTTGACATACTTTT
CAAATTCACATCAATTTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTTGTTATTAGGCACAATAGCTAATATC
TCGCATTCATGATAGGGATGAATGCTATTAGCATTAATAAATGAATAACCTTTTAACTTTAATTC
CATAATGATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTTGGATTTTAAAT
Found at i:902499 original size:658 final size:658
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Period size: 658 Copynumber: 64.3 Consensus size: 658
899737 CAAACTTGAC
* * * *
899747 TTTTATGGTGTCCTAATCGCTCCTAAAATGATTGGTGGAGAC-CCTTCATATTTCAAAAACCAAA
1 TTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTC-TCATATTTCAAAAACCAAA
* * *
899811 TAGGGTTAATATTAGAACTTACATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTCATAATTT
65 TAGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTATAATTC
* * * *
899876 GACCCTTTAGGATAGAGAGAGCTTTAAATCACTCTTGTTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTT
130 GACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATCACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTT
* * *
899941 GAGTGCATTTTATTTTTAAAACCTAAGGCAATGTTAACTTATTAGGGAATTAATGGGATATCTCT
195 GAGTGCATTTTA-TTTTAAAACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCTCC
* * * ** * *
900006 TGAAAGTATGCTGAGGGGATGACTACCAGTGATTCCCGAAATAGGTTGACATACTTTTCAAATTC
259 TGCAAGTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATTC
* * * *
900071 GCATCATTGTTTCTAAAATTGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCAAAATAGCTAATATATCGCATT
324 GCATCATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGAATT
* * * * *
900136 TATGATAGGGGTGAATGCTATTATCA-TAATAAATGAACAACCTCTTTAACTTTACATTCGTAAT
389 TATGCTAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAATGAATACCCTCTTTAACTTTACATCCGTAAT
* *
900200 GATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAAGGTAATTAACTAG
454 GATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGGGTAATCAACTAG
* *
900265 GTACCAATTTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCCATGCGTAACCGACTCCTGAATTT
519 GTACCAATTTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCCACGCGTAACCGACTCCCGAATTT
** * * *
900330 GATTTCTAGATTTTTTCACACCTTAAACCTTGGTATTTTGATAAAAATAAAATGTTTTTATTAAA
584 GATTTCTAGATTTTCGCATACCTTAAAACTTGGTATTTTGATAAAAATAAAATATTTTTATTAAA
900395 ATCACCCGAT
649 ATCACCCGAT
* * * * * *
900405 TTTTATAGTGTCCTAATCGAACCTTAAATGATTGGTGGAGACTCCTAACATTTCAAAAACCAAAT
1 TTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAAAT
* *
900470 AGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTATGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTATAGTTCG
66 AGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTATAATTCG
* * * *
900535 ACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAAGCACCTTTGGTTAGTTAGGATGAATGAAAATTTGTTTG
131 ACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATCACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTTG
* ** *
900600 AATGCATTTTATTTTTAAAACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATTATATATCTCGT
196 AGTGCATTTTA-TTTTAAAACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCTCCT
*
900665 GCAAGTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCCCAAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATTCG
260 GCAAGTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATTCG
* * *
900730 CATCAATGTTTCTAAAATCAAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCAAATTT
325 CATCATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGAATTT
* * * *
900795 ATGCTAGGGGTTAATGCTATTAGCATTAATAAATGAACAACCTCTTTAACTTTACATTCGTAATG
390 ATGCTAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAATGAATACCCTCTTTAACTTTACATCCGTAATG
*
900860 ATTTTCAAATTAAATAAAGTTCGAACTCAAAAGTTT-TGATTTTAAATATAGGGTAATCAACTAG
455 ATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAA-TTTCTGATTTTAAATATAGGGTAATCAACTAG
* * *
900924 GTACCAATTTTTGGGTGATTATAGGGGTTATAATCCTTCTCCACGCGTAACCGACTCCCGAATTT
519 GTACCAATTTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCCACGCGTAACCGACTCCCGAATTT
* *
900989 GATTTCTAGATTTTCGCATTCCTTAAAACTTGGTATTTTGATAAAAATAAAATGTTTTTATTAAA
584 GATTTCTAGATTTTCGCATACCTTAAAACTTGGTATTTTGATAAAAATAAAATATTTTTATTAAA
*
901054 ATCACCTGAT
649 ATCACCCGAT
*** *
901064 TTTTATGGTGTCCCAAAATCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTCCTCATATTTCAAAAACCAAAT
1 TTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAAAT
* * * *
901129 AGGGTTAATATTAGAACCTATATTTCTATGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTGTAATTCA
66 AGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTATAATTCG
* * * *
901194 ACACTTTAAGATAGAGAGAGCCTTAAATAACCCCTGGTTATTTAGGACGAATGAAAATTTGTTTG
131 ACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATCACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTTG
* *
901259 AATGCATTTTATTTTTAAAACCTAAGGTAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCTCCT
196 AGTGCATTTTA-TTTTAAAACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCTCCT
*
901324 GCAAGTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCCC-AAAGTAGGTCGACATGCTTTTCAAATTC
260 GCAAGTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAAA-TAGGTCGACATCCTTTTCAAATTC
* * * *
901388 GCATCATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATCTTTGGTTATTAGCCACAATAGCTAATATCTGGCATT
324 GCATCATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGAATT
* * *
901453 TATGCTAGGGATGAATGCTATTAGCATTAATAAATGAATACCGT-TTTCACTTTA-ATTCCGTAA
389 TATGCTAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAATGAATACCCTCTTTAACTTTACA-TCCGTAA
* *
901516 TGATTTTCAGATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGAATTTAAATATAGGGTAATCAACTA
453 TGATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGGGTAATCAACTA
* *
901581 GGTACCAATTTTTGGGTGATTATGGGGGTTATAATCCTTCCCCACGCATAACCGACTCCCGAATT
518 GGTACCAATTTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCCACGCGTAACCGACTCCCGAATT
* * *
901646 TGATTTCTAGAATTTCGCATACCTTAAAACTTGGTATTTTGATAAAAATAAAAT-GTTTTATAAA
583 TGATTTCTAGATTTTCGCATACCTTAAAACTTGGTATTTTGATAAAAATAAAATATTTTTATTAA
*
901710 AATCACCTGAT
648 AATCACCCGAT
* * *
901721 TTTTATGGTGTCCCAATCGCACTTTAAATGATTGGTGGAGACTTTTCATATTTAAAAAACCAAAT
1 TTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAAAT
*
901786 AGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTATAATTTG
66 AGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTATAATTCG
* * *
901851 ACACTTTAGGATAGAGAAAGCCTTAAATAACCCTTGGTCAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTTG
131 ACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATCACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTTG
*
901916 AGTGCATTTTATTTTAAGAACCTAAGACAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCTCCT
196 AGTGCATTTTATTTTAA-AACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCTCCT
* **
901981 GCAAGTATGCTCAGGGGGAGACTACTGAAGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATTCG
260 GCAAGTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATTCG
*
902046 CATCAATGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGAATTT
325 CATCATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGAATTT
* * * * *
902111 ATGCTAGGGGTGAACGCTATTAGCATTAATAAACGAATTCCCTCTTTAACTTTACATCCGAAATT
390 ATGCTAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAATGAATACCCTCTTTAACTTTACATCCGTAATG
*
902176 ATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAGCTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGGGTAATCAACTAGG
455 ATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGGGTAATCAACTAGG
*
902241 TACCAATTTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATAAGCCTTCCCCACGCGTAACCGACTCCCGAATTTG
520 TACCAATTTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCCACGCGTAACCGACTCCCGAATTTG
**
902306 ATTTCTAGATTTTCGCACGCCTTAAAACTTGGTATTTTGATAAAAATAAAATATTTTTATTAAAA
585 ATTTCTAGATTTTCGCATACCTTAAAACTTGGTATTTTGATAAAAATAAAATATTTTTATTAAAA
902371 TCACCCG-T
650 TCACCCGAT
*
902379 TTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTCCTCATATTTCAAAAACCAAAT
1 TTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAAAT
* * * * * * *
902444 AAGGTTACTATAAGAACTTATATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTCATAATTCA
66 AGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTATAATTCG
* * * *
902509 ACCCTTTAGGATAGAGAGAGCTTTAAATCACTCTTGGTTAATTAGGAAGAATGAAAATTTGTTTG
131 ACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATCACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTTG
* * *
902574 AGTGCATTTTATTTTTAAAACCTAAGGTAATGTTCAGTTATTAGGAAATTAATGGTATATCTCCT
196 AGTGCATTTTA-TTTTAAAACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCTCCT
* * ** ** * * * *
902639 GCAAGTATGCTCAGGGGATAACTACCAGCAATTGCCGAAATAGGTTGACATACTTTTCAAATTCA
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* * *
902704 CATCATTGTTTCTAAAATCGAGGCAGTATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGTATAT
325 CATCATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGAATTT
* * * * * * * *
902769 ATGATAGGGGTGAATGCTATTAGAATTAAAAAATGAACAACCTCTTTAAATTAACATTCGTAATG
390 ATGCTAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAATGAATACCCTCTTTAACTTTACATCCGTAATG
* *
902834 ATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTTTGATTTTAAATATAGGGTAATTAACTAGG
455 ATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGGGTAATCAACTAGG
* *
902899 TACCAATTTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCCATGCGTAACCGACTCCTGAATTTG
520 TACCAATTTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCCACGCGTAACCGACTCCCGAATTTG
* * * *
902964 ATTTCTATATTTTTGCACACCTTAAAACATGGTATTTTGATAAAAATAAAATATTTTTATTAAAA
585 ATTTCTAGATTTTCGCATACCTTAAAACTTGGTATTTTGATAAAAATAAAATATTTTTATTAAAA
*
903029 TTACCCGAT
650 TCACCCGAT
* * *
903038 TTTTAT-GTGTCCCAATCGCACATTAAATGATTGGTGGAGACTTTTCACATTTCAAAAACCAAAT
1 TTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAAAT
** *
903102 AGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTATTTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTATAATTTG
66 AGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTATAATTCG
* * * *
903167 ACACTTTAGGATAGAGAAAGCCTTAAATAACCCTTGGTCAATTAGGACAAATGAAAATTTGTTTG
131 ACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATCACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTTG
** * *** ** ** *
903232 AGTGCATTTTATTTTAAGAACCTAAGATAATATTTGGTTGACAAATGAA--AAT--T-TGA-C-A
196 AGTGCATTTTATTTTAA-AACCTAAGGCAATGTTCACTT-ATTAGGGAATTAATGGTAT-ATCTC
** ** * ** * *
903290 CT-TTAGTATGCTTTGGGGGTGACTATTGGTGATAACCGAAATAGGTTGACATCTTTTTCAAATT
258 CTGCAAGTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATT
* * *
903354 TGCATCATTGTTTCTAAAATTGAGGCAATATTTGGTTATTAGG-ACAATAGCTAATATC-CTGCA
323 CGCATCATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTC-GAA
* * * *
903417 TTTATTCTAGGGATGAATGCTATTAGCATTAATAAATGAATACCCTTTTTCACTTTA-ATTCCGT
387 TTTATGCTAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAATGAATACCCTCTTTAACTTTACA-TCCGT
* *
903481 AATGATTTTTAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGGGTAATCAAT
451 AATGATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGGGTAATCAAC
* * * **
903546 TAGGTACAAATTTTTGGGTTCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCTCACGCGTAACCGACTCTTGAA
516 TAGGTACCAATTTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCCACGCGTAACCGACTCCCGAA
* * * *
903611 TTTGATTTCTAGATTTTCGCATACCCTAAAAATTTGTATTTTGATAAAAATAAAATGTTTTTATT
581 TTTGATTTCTAGATTTTCGCATACCTTAAAACTTGGTATTTTGATAAAAATAAAATATTTTTATT
903676 AAAATCACCCGAT
646 AAAATCACCCGAT
* *
903689 TTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGGGGAGACTTCTCATATTTTAAAAACCAAAT
1 TTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAAAT
*
903754 AGGGTTAATATTAGAACCTATATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTATAATTCG
66 AGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTATAATTCG
* * **
903819 ACACTTTAGGATAGAGAGAGACTTAAATAACCCTTCATTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTTG
131 ACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATCACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTTG
* *
903884 AGTGCATTTTATTTTAAGAACCTAAGGAAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCCCCT
196 AGTGCATTTTATTTTAA-AACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCTCCT
* *
903949 GCAAGTATGCTCAGAGGGTGACTACTGGTAATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATTCG
260 GCAAGTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATTCG
*
904014 CATCAATGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGAATTT
325 CATCATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGAATTT
* * * *
904079 ATGCCAGGGTTGAACGCTATTAGCATTAATAAACGAATACCCTCTTTAACTTTACATCCGTAATG
390 ATGCTAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAATGAATACCCTCTTTAACTTTACATCCGTAATG
** * * * * * * ** *
904144 ATAGAGAGAGCCTTAAATCACCCTTGGTTAATTAGGA-CGAA-TGAAAATTTATTTGA-GTGCAT
455 AT----------TT---TCA--AAT--TAAATAAAGATCGAACTCAAAA-TT-TCTGATTTTAAA
* *** * * * **
904206 TTTATTTTTAA--AACCTAAGGCAATATTCACTTATTAGGG-AATTAAT---GG-TAT-AT-C-T
501 TATA-GGGTAATCAA-CT-AGG---TA-CCAATT-TTTGGGTGCTT-ATGGGGGTTATAATCCTT
* * * ** * * * * * * *
904261 CCTGCA--AGT-A-TG-CTCAGGGGAGACTACTAGATTCCCGAAATAGGTT-GACATACTTTCAA
557 CC-CCACGCGTAACCGACTC--CCGA-A-T--TTGATT-TCTAGAT--TTTCG-CATACCTTAAA
* ** **
904320 A-TTCGCATCATTGTTTCT-AAAATCAAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAACTAATATTT
611 ACTT-G-GT-ATT-TTGATAAAAAT-AA---AATATTT--TTATTA---A-AAT--C----A-CC
904383 CGCAT
655 CG-AT
* * * * * * * * ** *
904388 TTATGATAGGGGTGAATGCTATTAGCA-TTAATAAATGAACAACCT-CTTTA-ACTT-T-ACA-T
1 TT-T--TA-TGGTG--TCCCAATCGCACCT--TAAATG----A-TTGGTGGAGACTTCTCATATT
** ** * * * * * * *** *
904447 TCGTAATGACTTTCAAATTA-AATAAAGA-TCGAACTCAAAATTTCT-GATTT-TAAATATAGG-
53 TC--AAAAAC---CAAA-TAGGGTTAATATTAGAAC-CTACATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGT
* * * * * * * * ** * ** * *
904507 ---GTAATT-ATATAGGTACCA-ATTTTTGGGT-GCTTATGGGTGTTATAATCCTTCCCCATGCG
111 TCTTTAATTCTTATA-ATTCGACACTTTAGGATAG-AGA-GAGCCTTA-AAT-C--ACCCTTG-G
** *** * ** * *
904566 -TAA--CCGACTCCTG--AATTTGATTT--CTAG-ATTTTTGCACACCTTAAAA-CT-TGG-TAT
168 TTAATTAGGACGAATGAAAATTTG-TTTGAGT-GCA-TTTT----ATTTTAAAACCTAAGGCAAT
* * * * ** * ** * * * * *
904620 TTTGA-TAAAAATA-AAATATTTTAAT--TAAAAT-TACC--C--G-ATTTTTATGGTGT-CCCA
226 GTTCACT--TATTAGGGA-A--TTAATGGT-ATATCT-CCTGCAAGTATGCTCAGGGGGTGACTA
* * * ** * * ** *
904674 ATCG-CA--CCTTAAATGATTGGTGGATACTCCTCACATTTCAAAAAC-CAAAT-AGGGTTAATA
284 CTGGTGATTCCCGAAAT-A--GGTCGACA-TCCT----TTTCAAATTCGC--ATCA---TT-GT-
* ** ** * * ** ** **
904734 TTATAACCTAC-ATTTCAATGTTTGTGCCT-TTAGGTTCCTTAATTATTATAAT-TCGACACTTT
334 TTCTAAAAT-CGA-GGCAATATTTG-G-TTATTAGGCACAATAGCTA--AT-ATCTCGA-A-TTT
* * * * ** *** * * * ** * * ** *** ** * * ** *
904796 AGGATAGAGAGAGCCTTAAAGTACCCTTGGTTAAT-TAGGCCGAATGAAAATTT--GTTTG-AGT
390 ATGCTAG-GGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAATGAATACCCTCTTTAACTTTACATCCGTAAT
** * * ** ** * * *** * *
904857 GCATTTT---ATT-TTTAAA-ACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAAT-TAAAGGTATATCC
454 G-ATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATT-TCTGATT-TTAAATAT-AGGGTA-ATCA
* * * ** * * ** * * * **
904916 CCTGAAGTATGCTCAGGGGGTGACTACT-GGTGATTCCTGAAATAGG-TAGACATCTATTTCAAA
514 ACT-AGGTA--C-CA-------ATTTTTGGGTGCTT-ATG---GGGGTTATA-ATC-CTTCCCCA
* * ** ** *** ** * * * *
904979 TTCGCATCATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATT-T-GGTTATTAAGCACAATAGC-TAATA-TC
562 --CGCGTAACCGACTCCCGAAT--TTG--AT-TTCTAGATT-TT---CGC-ATACCTTAAAACT-
* * * **** ** *** * *
905040 TCGCATTTATGCTAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAACGAATACC-AT
614 TGGTATTT-TGATAAAAAT-AA-AATATTTTTATTAA-AATC--A-CCCGAT
* * * * * * ** ** ** * ***
905091 CTTTAACT-TTACATCCGTAAT--TA-TTTACAA--ATTAAATAAAGA-TT-AAATTTTTGTTTT
1 -TTTTA-TGGT--GTCC-CAATCGCACCTTA-AATGATT-GGTGGAGACTTCTCA-TATT-TCAA
* * * * * * * ** * *
905148 TAA--ATATATGG-TAATCAACTAGCTACC-A-ATTT-TTGG---GTGCTCATGGGGGT-TATAA
57 AAACCAAATAGGGTTAAT--ATTAG-AACCTACATTTCTAGGTTTGTGC-CTTTAGGTTCTTTAA
* * * *
905203 TTCTTCCCCACGCGTAA-CCGACACCCGATTATTTTAGGGAATTTTGATAAAAAGAAAATATTTT
118 TTCTT----A----TAATTCGACA--C------TTTA--G------GAT----AG-AGAGA---G
** * ** * * ** *
905267 TATTAAAATCACCCGATTTG-T-ATGCT-GTCCCAATCACACCTTAGATGATTG-GTGAACACTC
151 CCTT-AAATCACCC--TTGGTTAAT--TAGGACGAATGA-AAATT---TGTTTGAGTG--CA-T-
* * ** * * * ** * * **
905328 CTCATATTTCAAAAACC-AA-ATAAGGTTGA--TATTA-GCACCTACAT-TTCTAGGT-TTGTGC
203 -T-TTATTT-TAAAACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTA-ATGGTATA--TCTCCTGC
*** * * ** * * ** * * * * *
905386 CTTTAGGTTC----TTTAATTA-TTATAATT--CGATACTTTAGGATAGAGAGGGCC--TT-AAA
262 AAGTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCCCGA-A--ATAGG-TCGACA--TCCTTTTCAAA
* * * * * * ** *** *
905441 -T--CACCCTTG-GT-TAATAATGACGAATG-AAAATTT-GTT-TGAGTGCATTTTATTTTTAAA
321 TTCGCATCATTGTTTCTAA-AAT--CG-AGGCAATATTTGGTTATTAG-GCA--CAATAGCTAAT
* * ** * * * * ** **
905498 ACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTA-TATC-TCTGCAAGTATGCAGGGGGTG
379 ATCT--CG-AAT-TT-A--TGCTAGGG-GTGAATGCTATTAGCAT-T--AA-TA---AATGAAT-
* ** * * *** * ** *** ** * * *
905561 ACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACAT-ACTTTTCAAATCCGCATCATTGTTTCTAAAATC
428 AC-CCTCTTTA-ACTTTACATCCGT--A-ATGA-TTTTCAAAT-TAAAT-AAAG-ATC-GAACTC
* * * * * * *** * *
905625 AAGGCAGTATT-TGGTTATTAGGCACA-ATA-GCTAAT-ATCT-CGCATTTATGATATGGATGAA
483 AA---AAT-TTCTGATT-TTA---A-ATATAGGGTAATCAACTAGGTACCAAT-TTTTGG--G--
** ** *** * **** * ** * ** *
905685 TGC-TATTAGCATTAATAAATGAATACCC-TTTTTCACTTTAATTTCGTAA--TGATTT-TCAAA
534 TGCTTATGGGGGTT-AT-AATCCTTCCCCACGCGTAAC-CGACTCCCG-AATTTGATTTCT-AGA
** * ** * * *
905745 TTAAATAAAG-ATCGAACTTAAAA-TTTTTGATTTTAAATATAGGGTAATCAACTAGGTACCAAT
594 TT---T-TCGCAT--ACCTTAAAACTTGGT-ATTTT-GATA-A---AAAT-AA--A---A--TAT
* * ** ** *
905808 TTTTGGGTGATTAT-A-GGGGT
639 TTTT--ATTAAAATCACCCGAT
* * ** ** * ** * * *
905828 TATAATCCT-TCTCCACGCGTAACCGACTCCTAAATTTGATT--TCTAGATTTTTGCATACCTT-
1 TTTTATGGTGTC-CCAATCG----C-AC-CTTAAA--TGATTGGTGGAGACTTCT-CATA-TTTC
*** *** * * * * *** * *** **
905889 -AAAACTTGGTATTTTGATAAAAATA-AA-ATGTTTTTATTAAAATT-ACCCAATTTTTATGGTG
55 AAAAAC--CAAATAGGGTTAATATTAGAACCTACATTT-CTAGGTTTGTGCC----TTTA-GGT-
** * * *
905950 TC-CCAATCACACCTTA-AATTCGACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATAACCCCTGGTTAA
111 TCTTTAAT----TCTTATAATTCGACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATCACCCTTGGTTAA
* *
906013 TTAGGATGAATGAAAATTTGTTTGAGTGCATTTTATTTTAAGAACCTTAGGCAATGTTCACTTAT
172 TTAGGACGAATGAAAATTTGTTTGAGTGCATTTTATTTTAA-AACCTAAGGCAATGTTCACTTAT
* *
906078 TTGGGAATTAATGGTATATC-CC--C-----TG--CA---AGT-AC--C-GGTGATTCCCGAAAT
236 TAGGGAATTAATGGTATATCTCCTGCAAGTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAAAT
* * *
906126 AGGTCGACATCTTTTTCAAATTCGCATCAATGTTTCTAAAATCGAGGAAATATTTGGTTATTAGG
301 AGGTCGACATCCTTTTCAAATTCGCATCATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGG
* * * **
906191 CACAATAGCTAATATCTCGAATTTATGCCAGGGTTGAACGCTATTAGCATTAATAAACAAATACC
366 CACAATAGCTAATATCTCGAATTTATGCTAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAATGAATACC
906256 CTCTTTAACTTTACATCCGTAATGATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATT
431 CTCTTTAACTTTACATCCGTAATGATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATT
* * *
906321 TTAAATATAAGGTAATCAACTAGGTACCAATATTTGGGTTCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCC
496 TTAAATATAGGGTAATCAACTAGGTACCAATTTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCC
* * *
906386 ACGCATAACCGACTCCCTAATTTGATTTCTAGATTTTCGCATACCTTAAAACATGGTATTTTGAT
561 ACGCGTAACCGACTCCCGAATTTGATTTCTAGATTTTCGCATACCTTAAAACTTGGTATTTTGAT
* * * * *
906451 AAACATAAAATGTTTTAATTAAAAGCGCCCGAT
626 AAAAATAAAATATTTTTATTAAAATCACCCGAT
* * * *
906484 TTTTATGTTGTCCCAATCTCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTCCTCACATTTCAAAAACCAAAT
1 TTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAAAT
* * * *
906549 AGGGTTAATATTAGAACTTACATTTCTAGCTTTGTGCCTTTAGCTTCTTTAATTCTCATAATTCG
66 AGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTATAATTCG
*
906614 ACCCTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATCACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTTG
131 ACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATCACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTTG
* *
906679 AGTGCATTTTATTTTTAAAACCTATGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGATATATCTCCT
196 AGTGCATTTTA-TTTTAAAACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCTCCT
* * * ** * *
906744 GTAAGTATGCTCAGGGGATGACCACCAGTGATTCCCGAAATAGGTTGACATACTTTTCAAATTCG
260 GCAAGTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATTCG
* * *
906809 CATCATTGTTTCTAAAATCAAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAACTAATATCTCGCATTT
325 CATCATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGAATTT
* * *
906874 ATGATAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAATGAACAACCTCTTTAACTTTACAGT-CGTAAT
390 ATGCTAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAATGAATACCCTCTTTAACTTTACA-TCCGTAAT
*
906938 GATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGGGTAATTATA-TA
454 GATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGGGTAATCA-ACTA
* *
907002 GGTACCAATTTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCCATGCGTAACCGACTCCTGAA-T
518 GGTACCAATTTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCCACGCGTAACCGACTCCCGAATT
* * *
907066 TGATTTCTAGATTTTTGCACACCTTAAAAACTTGGTA-TTTGATAAAAATAAAATATTTTAATTA
583 TGATTTCTAGATTTTCGCATACCTT-AAAACTTGGTATTTTGATAAAAATAAAATATTTTTATTA
*
907130 AAATTACCCGAT
647 AAATCACCCGAT
* * *
907142 TTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTCGAGACTCCTCACATTTCAAAAACCAAAT
1 TTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAAAT
* * *
907207 AGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTATGTTTGTGCCTTTAGGTTGTTTAATTATTATAATTCG
66 AGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTATAATTCG
* *
907272 AAACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAAGCACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTTG
131 ACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATCACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTTG
* *
907337 AGTGCATTTTATTTTTAAAACCTAAGGCAATGTTCACTTAATAGGGAATTAATGGTATATCCCCT
196 AGTGCATTTTA-TTTTAAAACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCTCCT
* * *
907402 GCATGTATGCTCAGGGGGTGACTACTTGTGATT-CCGAAATAGGTCGACATCTTTTTCAAATTCG
260 GCAAGTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATTCG
* * * *
907466 CATCATTGTTTCTAAAATCGAGGCTATATTTCGTTATTAAGCACAATAGCTAATATCTCG-CTTT
325 CATCATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGAATTT
* * * *
907530 AT--TAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAACGAATACCATCTTTAAATTTACATCCGTAATT
390 ATGCTAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAATGAATACCCTCTTTAACTTTACATCCGTAATG
* * * * *
907593 ATTTACAAATTAAATGAAGATCGAACTCAAAATTTTTGTTTTTAAATATAGGGTAATCAACTAGC
455 ATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGGGTAATCAACTAGG
* * * *
907658 TACAAATTTTTGGGTGCTCATGGGGGTTATAATTCTTCCCCACGCGTAACCGACACCCGAATTTG
520 TACCAATTTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCCACGCGTAACCGACTCCCGAATTTG
* *
907723 TTTTCTAGATTTTCGCATACCTTAAAACTTGGTATTTTGATAAAAAGAAAATATTTTTATTAAAA
585 ATTTCTAGATTTTCGCATACCTTAAAACTTGGTATTTTGATAAAAATAAAATATTTTTATTAAAA
907788 TCACCCGAT
650 TCACCCGAT
* * * * * *
907797 TTTTATGGTGTCGCAATCGCACCTTAGATGATTGGCGAACACTCCTCATATTTCAAAAACCAAAT
1 TTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAAAT
* * *
907862 AAGGTTGATATTAGCACCTACATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTATAATTCG
66 AGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTATAATTCG
* * * * * *
907927 ATACTTTAGTATATAGAGGGCCTTAAATCACCCTTGGTTAATAATGACGAATGAAAATTTGTTTG
131 ACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATCACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTTG
*
907992 AGTGCATTTTATTTTTAAAACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGAGAATTAATGGTATATCTCCT
196 AGTGCATTTTA-TTTTAAAACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCTCCT
* * *
908057 GCAAGTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCCCAAAATATGTCGACATCTTTTTCAAATTCG
260 GCAAGTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATTCG
* * * *
908122 CATCATTGTTTCTAAACTCGAGGCAAGATTTGGTTATGAGGCACAATAGCTAATATCTCGCATTT
325 CATCATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGAATTT
* * * ** *
908187 ATGCTAGGGGTAAATTCTATTTGCATTAATAAACAAATACCCTCTTTAACTTTACGTCCGTAATG
390 ATGCTAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAATGAATACCCTCTTTAACTTTACATCCGTAATG
* * *
908252 ATTTTTAAGTTAAATAAAGATCGAACTCAAAA-TTCTTGATTTTAAATATAGTGTAATCAACTAG
455 ATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTC-TGATTTTAAATATAGGGTAATCAACTAG
* * * * * *
908316 GTACCAATTTTTGGGTGCTTATGGGGGTAATAATACTTCCCCATGTGTAACCGACTCCTGAATAT
519 GTACCAATTTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCCACGCGTAACCGACTCCCGAATTT
* *
908381 GATTTCTAGATTTTCGCATACCTTAAAACTTTGTATTTTGAT-AAAA-AAAATGTTTTTATTAAA
584 GATTTCTAGATTTTCGCATACCTTAAAACTTGGTATTTTGATAAAAATAAAATATTTTTATTAAA
*
908444 ATAACCCGAT
649 ATCACCCGAT
* ** * *
908454 TTTTATGGCG-CCCAATCATACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCACATTTCAAAAGCCAAAT
1 TTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAAAT
* * *
908518 ATGGTTAATATCAGAACCTACATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTATAATTAG
66 AGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTATAATTCG
*
908583 ACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAA-AACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTTG
131 ACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATCACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTTG
*
908647 AGTGCATTTTAATTTTAAAACCTAAGGCAATGATCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATAC-CC
196 AGTGCATTTT-ATTTTAAAACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATAT-CTCC
** ** *
908711 TGCAAGTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCCTTAAATAGGTCGACATATTTTTCAAATTT
259 TGCAAGTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATTC
* * *
908776 GCATCAAT-TTTCTAAAATCAAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCTAATT
324 GCATCATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGAATT
* * * * * *
908840 TATGCTAAGGGTGAACGCTATTAGCATTAATAAACGAATATCCTATTTAACTTTACATCCGTAGT
389 TATGCTAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAATGAATACCCTCTTTAACTTTACATCCGTAAT
908905 GATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGGGTAATCAACTAG
454 GATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGGGTAATCAACTAG
* *
908970 GTACCAATTTTTGGGTGCTTATGGAGGTTAAAATCCTTCCCCACGCGTAACCGACTCCCGAATTT
519 GTACCAATTTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCCACGCGTAACCGACTCCCGAATTT
*
909035 GATTTCTAGATTTTCGCATACCTTAAAACTTGGTATTTTGATAAAAATAAAATGTTTTTATTAAA
584 GATTTCTAGATTTTCGCATACCTTAAAACTTGGTATTTTGATAAAAATAAAATATTTTTATTAAA
909100 ATCACCCGAT
649 ATCACCCGAT
* *
909110 TTTTATGGTGTCCCAATCACACCTGAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAAAT
1 TTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAAAT
*
909175 AGGGTTAATATTAGAACCTATATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTATAATTCG
66 AGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTATAATTCG
* *
909240 ACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATAACCCTTCGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTTG
131 ACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATCACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTTG
* * * *
909305 AGTGCATTTTATTTTCAGAACTTAAAGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCCCCT
196 AGTGCATTTTATTTT-AAAACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCTCCT
*
909370 GCAAGTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATTCA
260 GCAAGTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATTCG
*
909435 CATCATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGCATTT
325 CATCATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGAATTT
* * * * *
909500 ATGCTAGGGATGAATGCTATTAGCATTAATAAAAGAATACCCTTTTTCACTTTA-ATTTCGTAAT
390 ATGCTAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAATGAATACCCTCTTTAACTTTACA-TCCGTAAT
*
909564 GATTTTCAAATTAAATAAAGATCAAACTCAAAA-TTCATGATTTTAAATATAGGGTAATCAACTA
454 GATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTC-TGATTTTAAATATAGGGTAATCAACTA
* * * *
909628 GGTACCAATTTTTGGGTTCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCCACGTGTAACCGACTCCTGAACT
518 GGTACCAATTTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCCACGCGTAACCGACTCCCGAATT
* * *
909693 TGATTTCTAGATTTTCGCATACCTTAAAACTTTGTATTTTGATAAAAATAATATGTTTTTATTAA
583 TGATTTCTAGATTTTCGCATACCTTAAAACTTGGTATTTTGATAAAAATAAAATATTTTTATTAA
*
909758 AATCACCCTAT
648 AATCACCCGAT
* * * * *
909769 TTTTATAGTGTCCCAATCGTACCTTAAATGATTGGTGGAGGCTTCTCACATTTCAAAAACAAAAT
1 TTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAAAT
* * *
909834 AGGGTTAATATTAGAACCTAAATTTCTAAGTTTGTGCATTTAGGTTCTTTAATTCTTATAATTCG
66 AGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTATAATTCG
* * * * * *
909899 ACACTTTATGATAGATAAAGCCTTAAATCACCCTTGGTCAATTAGGACAAAAGAAAATTTGTTTG
131 ACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATCACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTTG
* * *
909964 AGTGCATTTTATTTTTAAGACCTAAGGCAATGTTCACTTATTCGGGAATTAATGGTATATCTCTT
196 AGTGCATTTTA-TTTTAAAACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCTCCT
* *
910029 GCAAGTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGAGATTCCCGAAATAGGTCGACATTCTTTTCAAATTCG
260 GCAAGTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATTCG
* * * * *
910094 TATCATTGTTTCTAAAATTGAGACAATAATTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATA-CATCGCATT
325 CATCATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATC-TCGAATT
* * *
910158 TATGCTAGGGTTGAATACTATTAGCATTAATAAATGATTACCCTCTTTAAC-TTACATCCGTAAT
389 TATGCTAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAATGAATACCCTCTTTAACTTTACATCCGTAAT
* *
910222 GATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTTTTATTTTAAATATAGGGTAATCAACTAG
454 GATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGGGTAATCAACTAG
* * * *
910287 GTACCAATTTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCACAAGCGTAACCGAGTCCCAAATTT
519 GTACCAATTTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCCACGCGTAACCGACTCCCGAATTT
* * * * * *
910352 GATTTCTAGATTTTTGCATACCTTAAAACATGGTAGTTTGAGAAAAAGAAAATGTTTTTATTAAA
584 GATTTCTAGATTTTCGCATACCTTAAAACTTGGTATTTTGATAAAAATAAAATATTTTTATTAAA
*
910417 ATCACCCTAT
649 ATCACCCGAT
* * * * **
910427 TTTTTTGGTGTCCTAATGGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCACATTTCAAAAATAAAAT
1 TTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAAAT
** *
910492 AGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTATATTTCTGCCTTTAGGTTCTTT-ATCTCTTATAATTC
66 AGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAAT-TCTTATAATTC
* * *
910556 GACACTTTAGGATAGAGAGATCCTTAAATAACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAGAATTTGTTT
130 GACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATCACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTT
* *
910621 GAGTGCATTTTATTTTAAGAACCTAAGG-AATTGTTCACTTATTAGGTAATTAATGGTATATCCC
195 GAGTGCATTTTATTTTAA-AACCTAAGGCAA-TGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCTC
910685 CTGCAAGTATGCTCA-GGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATT
258 CTGCAAGTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATT
* * * * *
910749 CCCATCAATGTTTCTAAAATCGAGGAAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTACTATCTCGACT
323 CGCATCATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGAAT
* * *
910814 TTATGCTAGGGGTGAACGCTATTAGCATTAATAAACGAATACCCTCTTTAACTTTACATCCGTTA
388 TTATGCTAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAATGAATACCCTCTTTAACTTTACATCCGTAA
* * * *
910879 TGATTTTCAAATTAAATAAAGATCAAACTCAAAATTTCTAATTTTAAGTATAAGGTAATCAACTA
453 TGATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGGGTAATCAACTA
* * * * *
910944 GGTACCAATTTTTGGGTGCTCACGGGGGTTATAATTCTTCCCCATGCGTAACCGACTCCTGAATT
518 GGTACCAATTTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCCACGCGTAACCGACTCCCGAATT
** * *
911009 TGATTTCTAGATTTTTACACAACTTAAAAC-TGGTATTTTGAT--AAA-AAAATATTTTTATT-A
583 TGATTTCTAGATTTTCGCATACCTTAAAACTTGGTATTTTGATAAAAATAAAATATTTTTATTAA
*
911069 AATTACCCGA-
648 AATCACCCGAT
* *
911079 TTTT-TGGTATCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGAC--CTCACATTTCAAAAACCAAAT
1 TTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAAAT
* *
911141 AGGGTT-ATATTAGAACCTACATTTC-ATG-TTGTGCCTTTAGGTTCTTTAACTCTTATAATTCG
66 AGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTATAATTCG
* ** * * *
911203 ACACATTAATATAGAGAGAGCCTTAAATAACCCTTGGTTAATTAGGAAGAATGAAAATTTGTTTA
131 ACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATCACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTTG
*
911268 AGTGCA-TTTATTTTAAGAACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCCCCT
196 AGTGCATTTTATTTTAA-AACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCTCCT
* * * *
911332 GCAAGTATGCTCAGGGGATGACTACTGGAGATTCCCGAAAAAGGTCGACATCCTTTTCAAATTCA
260 GCAAGTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATTCG
* * *
911397 CATCAATGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTTTTAGGCACAATAGCCAATATCTC-ACATT
325 CATCATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGA-ATT
* * * * *
911461 TATGATAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAA-AAATGAACAACCTCTTTAACTTAACATTCGTAAT
389 TATGCTAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAATGAATACCCTCTTTAACTTTACATCCGTAAT
* *
911525 GATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGGTTAATTAACTAG
454 GATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGGGTAATCAACTAG
* *
911590 GTACTAATTTTTGGGTGCTTATGGGGGGTTATAATCCTTCCCCATGCGTAACCGACTCCCGAATT
519 GTACCAATTTTTGGGTGCTTAT-GGGGGTTATAATCCTTCCCCACGCGTAACCGACTCCCGAATT
* * *
911655 TGATTTCTAGATTTTTGCATACCTTAAAACTTGGTATTTTGATAAAAGT-AAATGTTTTTATTAA
583 TGATTTCTAGATTTTCGCATACCTTAAAACTTGGTATTTTGATAAAAATAAAATATTTTTATTAA
*
911719 AATCACCCAAT
648 AATCACCCGAT
* *
911730 TTTTGATGGTGTCCCAATCGCACGTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTAATATTTCAAAAACCAAA
1 TTTT-ATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAAA
* *
911795 TAGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTAGGTTTGTTCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTATAATTT
65 TAGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTATAATTC
*
911860 GACACTTTAGGATAGAGAAAGCCTTAAATCA-CCTTAGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTT
130 GACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATCACCCTT-GGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTT
* * *
911924 TGAGTGCATTTTACTTTTAAAACCTAAGGCAATGATCACTTATTAGGAAATTACTGGTATATCTC
194 TGAGTGCATTTTA-TTTTAAAACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCTC
** *
911989 CTGCAAGTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCCTAAAATAGGTCGACATCTTTTTC-AATT
258 CTGCAAGTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATT
* *
912053 CGCGTCA-TG-TTCTTAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTC-ACA
323 CGCATCATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGA-A
* * *
912115 TTTATGCTAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAACGAATATCATACTTT-ACTTTACATCCGT
387 TTTATGCTAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAATGAATACCCT-CTTTAACTTTACATCCGT
* * * *
912179 AATTATTTACAAATTAAATGAAGATCGAACTCAAAATTTTTG-TTTTGAAATATAGGGTAATCAA
451 AATGATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTT-AAATATAGGGTAATCAA
* *
912243 CTAGGTACCAATGTTTGGGTTCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCCACGCGTAACCGACTCCCGA
515 CTAGGTACCAATTTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCCACGCGTAACCGACTCCCGA
*
912308 ATTTGATTTCTAGATTTTCGCACACCTTAAAACTTGGTATTTTGATAAAAATAAAATATTTTTAT
580 ATTTGATTTCTAGATTTTCGCATACCTTAAAACTTGGTATTTTGATAAAAATAAAATATTTTTAT
* *
912373 TAAAATTACCCAAT
645 TAAAATCACCCGAT
* * *
912387 TTTTATGGTGTCCCAATCACACCTTAAATGATTGGCGGAGACTCCTCATATTTCAAAAACCAAAT
1 TTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAAAT
* **
912452 AGTGTTAATATTAGAACCTACATTTCTATTTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTATAATTCG
66 AGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTATAATTCG
* * *
912517 ACACATTAGAATAGAGAGAGCCTT-AATGCA-CCTTAGTTAATT-GGACGAATG-AAATTTGTTT
131 ACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAAT-CACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTT
*
912578 GAGTGCA-TTTATTTTTAATACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCTCC
195 GAGTGCATTTTA-TTTTAAAACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCTCC
* *
912642 TGCAAGTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTTATTCCCGAAATAGGTCGACATCTTTTTCAAATTC
259 TGCAAGTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATTC
* * * * *
912707 GCATCATTGTTCCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTACTAGGCAAAATAGCTAATATCTTGCATT
324 GCATCATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGAATT
* * * * * *
912772 TATTCTTA-GGATGAATGTTATTAGCATTAATAAATGAATACCCTTTTTCACTTTA-AGTTCGTA
389 TATGC-TAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAATGAATACCCTCTTTAACTTTACA-TCCGTA
* *
912835 ATGATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTTTGATTTTAAATATAGGGTAATCAATT
452 ATGATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGGGTAATCAACT
* *
912900 AGGTACCAATTTTTGGGTGCATATGGGGGTTATAATCCTTCCCCACGCGTAACCGACTCCCAAAT
517 AGGTACCAATTTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCCACGCGTAACCGACTCCCGAAT
* *
912965 TTGATTTCTAGA-TTTCG-ATACCTTAAAAATTGGTA-TTTGATAAAAAT--AATTTTTTTATTA
582 TTGATTTCTAGATTTTCGCATACCTTAAAACTTGGTATTTTGATAAAAATAAAATATTTTTATTA
913025 AAATCA-CCGAT
647 AAATCACCCGAT
913036 TTTTATGGTGT-CCAATCGCACCTTAAATGA-TGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAAAT
1 TTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAAAT
*
913099 AGGGTTAATATTAGAA-CTATATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTATAATTCG
66 AGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTATAATTCG
* * *
913163 ACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATAACCCTTCGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTTTTTG
131 ACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATCACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTTG
* * *
913228 AGTGCATTTTATTTTAAGAACCTGAGGAAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCCCCT
196 AGTGCATTTTATTTTAA-AACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCTCCT
* * * *
913293 GCATGTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCTCGAAATAGGTTGACATCCTTTTCAAATTTG
260 GCAAGTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATTCG
* * * * * *
913358 CATCAATGTTTCTAAAATCGTGGCAGTATTTGGTTATTAGGCACCATAACTAATATCTCAAATTT
325 CATCATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGAATTT
** *
913423 ATGAC-AGGGGTGAATG-TAATTAGCATTAATAAACAAATACCGTCTTTAACTTTACATCCGTAA
390 ATG-CTAGGGGTGAATGCT-ATTAGCATTAATAAATGAATACCCTCTTTAACTTTACATCCGTAA
* *
913486 TGATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAAGGTAATGAACTA
453 TGATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGGGTAATCAACTA
* *
913551 GGTACCAATATTTGGGTTCTTATGGGGGTTATAATCCTTCACCC-CGCGTAACCGACTCCCGAAT
518 GGTACCAATTTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTC-CCCACGCGTAACCGACTCCCGAAT
*
913615 TTGATTTCTAGATTTTCGCATACATTAAAACTTGGTATTTTGATAAAAATAAAATATTTGTT-TT
582 TTGATTTCTAGATTTTCGCATACCTTAAAACTTGGTATTTTGATAAAAATAAAATATTT-TTATT
*
913679 AAAATTACCCGAT
646 AAAATCACCCGAT
* * * *
913692 TTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGTCTCCTCACATTT-TAAAACCAAAT
1 TTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAAAT
* * * *
913756 AGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTATGTTTGTACCTTTAGGTTTTTTAATTATTATAATTCG
66 AGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTATAATTCG
* *
913821 ACACTTTAGGATAGAGAGACCCTTAAAGCACCCTTGGTTAATTAGGACGAATG-AAATTTGTTTG
131 ACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATCACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTTG
** * ** *
913885 AGTGCATTTTATTTTTAAAACCTAAGATAATGTTCACTTATTTGGTTATTAATGGTATATCTCTT
196 AGTGCATTTTA-TTTTAAAACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCTCCT
* *
913950 GCAAGTATGCTCAGGGAGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGATATCCTTTTCAAATTCG
260 GCAAGTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATTCG
* * * *
914015 CATCATTGTTTCCAAAATCGAGGAAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATGTCGCATTT
325 CATCATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGAATTT
* * *
914080 ATGCTAGGGATGAATGCTATTAGCATTAATAAATGAATACCCTTTTTTCACTTTA-ATTCCGTAA
390 ATGCTAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAATGAATACCC-TCTTTAACTTTACA-TCCGTAA
* * *
914144 TGATTTTTAAATTCAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGGTTTTAAATATAGGGT-ATCAACTA
453 TGATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGGGTAATCAACTA
* *
914208 GGTACCAATTTATGGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCCATGCGTAACCGACTCCCGAATT
518 GGTACCAATTTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCCACGCGTAACCGACTCCCGAATT
* * *
914273 TGATTTCTAGATTTTTGCATACCTTAAAACTTGGTATTTTGATAAAAGTAAAATGTTTTTATTAA
583 TGATTTCTAGATTTTCGCATACCTTAAAACTTGGTATTTTGATAAAAATAAAATATTTTTATTAA
914338 AATCACCC-ATTT
648 AATCACCCGA--T
* *
914350 TTTTGATGGTGTCCCAATCGCACGTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTAATATTTCAAAAACCAAA
1 TTTT-ATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAAA
*
914415 TAGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTAGGTTTGTTCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTATAATTC
65 TAGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTATAATTC
* * *
914480 GACACTTTAGGATAAAGAAAGCCTTAAATCACCTTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTT
130 GACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATCACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTT
* * *
914545 GAGTGCATTTTACTTTTAAAACCTAAGGCAATGATCACTTATTAGGAAATTACTGGTATATCTCC
195 GAGTGCATTTTA-TTTTAAAACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCTCC
** *
914610 TGCAAGTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCCTAAAATAGGTCGACATCTTTTTCAAATTC
259 TGCAAGTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATTC
* *
914675 GCGTCATTGTTTCTTAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTC-ACAT
324 GCATCATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGA-AT
* * *
914739 TTATGCTAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAACGAATATCATACTTT-ACTTTACATCCGTA
388 TTATGCTAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAATGAATACCCT-CTTTAACTTTACATCCGTA
* * * *
914803 ATTATTTACAAATTAAATGAAGATCGAACTCAAAATTTTTG-TTTTGAAAATATAGGGTAATCAA
452 ATGATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTT--AAATATAGGGTAATCAA
*
914867 CTAGGTACCAATGTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCCACGCGTAACCGACTCCCGA
515 CTAGGTACCAATTTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCCACGCGTAACCGACTCCCGA
* **
914932 ATTTGATTTCTAGATTTTCGCATACCTTAAAACTTGGTATTTTGATAAAAATAGAATGCTTTTAT
580 ATTTGATTTCTAGATTTTCGCATACCTTAAAACTTGGTATTTTGATAAAAATAAAATATTTTTAT
*
914997 TAAAATCAGCCGAT
645 TAAAATCACCCGAT
* * *
915011 TTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTCCTCACATTTCACAAACCAAAT
1 TTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAAAT
* *
915076 ACGG-------T------TA-A----TA------T---TTTAGGTTCTTTAATTCTCATAATTCG
66 AGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTATAATTCG
* * * *
915114 ACCCTTTAGGATAGAGAGAGCTTTAAATCACTCTTGGTTAATTAGGACGAACGAAAATTTGTTTG
131 ACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATCACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTTG
* *
915179 AGTGTATTTTATTTTTAAAACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCCCCT
196 AGTGCATTTTA-TTTTAAAACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCTCCT
* * * * *
915244 GCAAGTATGCTCAGGGGGTGATTATTGGAGATTCCCGAAAAAGGTCGACATCGTTTTCAAATTCG
260 GCAAGTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATTCG
* * *
915309 CATCAATGTTTCTAAAATCGAGGCAATAATTGGTTATTAGGAACAATAGCTAATATCTCGAATTT
325 CATCATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGAATTT
* * *
915374 ATGCTAGGCGTGAACGCTATTAGCATTAATAAACGAATACCCTCTTTAACTTTACATCCGTAATG
390 ATGCTAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAATGAATACCCTCTTTAACTTTACATCCGTAATG
* *
915439 ATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTTTTATTTTAAATATAGGGTAATCAACTAGG
455 ATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGGGTAATCAACTAGG
* * * *
915504 TACCAA-TTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCACAAGCGTAACCGAGTCCCAAATTTG
520 TACCAATTTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCCACGCGTAACCGACTCCCGAATTTG
* * * * * *
915568 ATTTCTAGATTTTTGCATACCTTAAAACATGGTAGTTTGAGAAAAAGAAAATGTTTTTATTAAAA
585 ATTTCTAGATTTTCGCATACCTTAAAACTTGGTATTTTGATAAAAATAAAATATTTTTATTAAAA
*
915633 TCACCCTAT
650 TCACCCGAT
* * * * **
915642 TTTTTTGGTGTCCTAATGGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCACATTTCAAAAATAAAAT
1 TTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAAAT
** *
915707 AGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTATATTTCTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTATAATTCG
66 AGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTATAATTCG
* * *
915772 ACACTTTAGGATAGAGAGATCCTTAAATAACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAGAATTTGTTTG
131 ACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATCACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTTG
* *
915837 AGTGCATTTTATTTTAAGAACCTAAGG-AATTGTTCACTTATTAGGTAATTAATGGTATATCCCC
196 AGTGCATTTTATTTTAA-AACCTAAGGCAA-TGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCTCC
*
915901 TGCAAGTATGCTCAGGGGGTGACTATTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATTC
259 TGCAAGTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATTC
* * * * *
915966 CCATCAATGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCATAATAGCTACTATCTCGACTT
324 GCATCATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGAATT
* * *
916031 TATGCTAGGGGTGAACGCTATTAGCATTAATAAACGAATACCCTCTTTAACTTTACATCCGTTAT
389 TATGCTAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAATGAATACCCTCTTTAACTTTACATCCGTAAT
* * *
916096 GATTTTCAAATTAAATAAAGATCAAACTCAAAATTTCTAATTTTAAGTATAGGGTAATCAACTAG
454 GATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGGGTAATCAACTAG
* ** * * *
916161 GTACCAATTTTTGGGTGCTCACAGGGGTTATAATTCTTCCCCATGCGTAACCGACTCCTGAATTT
519 GTACCAATTTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCCACGCGTAACCGACTCCCGAATTT
** * *
916226 GATTTCTAGATTTTTACACAACTTAAAACTTGGTATTTTGAT--AAA-AAAATATTTTTATTAAA
584 GATTTCTAGATTTTCGCATACCTTAAAACTTGGTATTTTGATAAAAATAAAATATTTTTATTAAA
*
916288 ATTACCCGAT
649 ATCACCCGAT
*
916298 TTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGAC--CTCACATTTCAAAAACCAAAT
1 TTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAAAT
* *
916361 AGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTATGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAACTCTTATAATTCG
66 AGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTATAATTCG
* ** * * *
916426 ACACATTAATATAGAGAGAGCCTTAAATAACCCTTGGTTAATTAGGAAGAATGAAAATTTGTTTA
131 ACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATCACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTTG
916491 AGTGCATTTTATTTTAAGAACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATT-ATGGTATATC-CCT
196 AGTGCATTTTATTTTAA-AACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCTCCT
* * *
916554 GCAAGTATGCTCAGGGGATGACTACTGGAGATTCCCGAAAAAGGTCGACATCCTTTTCAAATTCG
260 GCAAGTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATTCG
* *
916619 CATCAATGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTTTTAGGCACAATAGCTAATATCTC-ACATT
325 CATCATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGA-ATT
* * * * * * *
916683 TATGATAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAAAAAATGAACAACCTCTTTAACTTAACATTCATAAT
389 TATGCTAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAATGAATACCCTCTTTAACTTTACATCCGTAAT
* *
916748 GATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGGTTAATTAACTAG
454 GATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGGGTAATCAACTAG
* *
916813 GTACTAATTTTTGGGTGCTTATGGGGGGTTATAATCCTTCCCCACGCGTAACCGACTCCTGAATT
519 GTACCAATTTTTGGGTGCTTAT-GGGGGTTATAATCCTTCCCCACGCGTAACCGACTCCCGAATT
** * *
916878 TGATTTCTAGATTTTTACACACCTTAAAACTTTGTATTTTGATAAAAATAAAATATTTTTATTAA
583 TGATTTCTAGATTTTCGCATACCTTAAAACTTGGTATTTTGATAAAAATAAAATATTTTTATTAA
916943 AAGT-ACCCGAT
648 AA-TCACCCGAT
*
916954 TTTTATGGTGTCCCAATCGCA-CTTCAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAATACCAAA
1 TTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTT-AAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAAA
* *
917018 TAGGGTTAATATTAGAACCTATATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTACAATTC
65 TAGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTATAATTC
*
917083 GACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATAACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTT
130 GACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATCACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTT
*
917148 GAGTGCATTTTATTTTAAGAACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATTGTATATCTCC
195 GAGTGCATTTTATTTTAA-AACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCTCC
* * ** * * *
917213 TGCAACTATGCTCAGGGGATGACTACAAGTGATTCCCGAAATAAGTTGACATACTTTTCAAATTC
259 TGCAAGTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATTC
* *
917278 GCATCATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCTCAATAGCTAATATCTCGTATT
324 GCATCATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGAATT
* * * * * * *
917343 TATGATAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAAAAAATGAACAACATCTTTAACTTAACATTCGTAAT
389 TATGCTAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAATGAATACCCTCTTTAACTTTACATCCGTAAT
* * *
917408 GATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTTTTATTTTAAATATAGGGTAATTAACTAG
454 GATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGGGTAATCAACTAG
* * * *
917473 GTACCAATTTTTGGGTGCTCATGGGGGTTATAATCCTTCCCCATGAGTAACCGACTCCTGAATTT
519 GTACCAATTTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCCACGCGTAACCGACTCCCGAATTT
* *
917538 GATTTCTAGATTTTTGCACACCTTAAAACTTGGTATTTTGATAAAAAT-AAA-ATTTTTATTAAA
584 GATTTCTAGATTTTCGCATACCTTAAAACTTGGTATTTTGATAAAAATAAAATATTTTTATTAAA
* *
917601 ATTACCC-AA
649 ATCACCCGAT
*
917610 TTTTATGGTGTCCCAATCACACCTTAAATGATTGGTGGAGAC-TCTCATATTTC-AAAACCAAAT
1 TTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAAAT
**
917673 AGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTATTTTTGTGCCTTTAGGTTC-TTAATTCTTATAATTCG
66 AGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTATAATTCG
* * * *
917737 ACACATTAGAATAGAGAGAGCCTT-AATGCACCCTTAGTTAATTGGGACGAATGAAAATTTGTTT
131 ACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAAT-CACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTT
* *
917801 GAGTGCATTTTATTTTTAATACCTAAGGCAATGTTCACTTATTCGGGAATTAATGGTATATCTCC
195 GAGTGCATTTTA-TTTTAAAACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCTCC
* * *
917866 TGCAAGTATGCTCAGGGGGTGACTACTAGTTATTCCCGAAATAGGTCGACATCTTTTTCAAATTC
259 TGCAAGTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATTC
* * *
917931 GCATCATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTACTAGGCACAATAGCTAATATCTTGCATT
324 GCATCATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGAATT
* * * * * *
917996 TATTCTTA-GGATGAATGTTATTAGCATTAATAAATGAATACCCTTTTTCACTTTA-AGTTCGTA
389 TATGC-TAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAATGAATACCCTCTTTAACTTTACA-TCCGTA
* *
918059 ATGATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTTTGATTTTAAATATAGGGTAATCAATT
452 ATGATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGGGTAATCAACT
* *
918124 AGGTACCAATTTTTGGGTGCTTATGGGGGTTAAAATCCTTCCCCACGCGTAACCGACTCCCAAAT
517 AGGTACCAATTTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCCACGCGTAACCGACTCCCGAAT
* * **
918189 TTGATTTCTAGATTTTCGTATACCTTAAAAATTGGTATTTTGATAAAAATAATTTA-TTTTATTA
582 TTGATTTCTAGATTTTCGCATACCTTAAAACTTGGTATTTTGATAAAAATAAAATATTTTTATTA
918253 AAATCACCCGAT
647 AAATCACCCGAT
*
918265 TTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCCAAAACCAAAT
1 TTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAAAT
* *
918330 AGGGTTAACATTAGAACCTATATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTATAATTCG
66 AGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTATAATTCG
* * ** *
918395 ACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATAACCCTTCGTTAATTAGGACGAATGAATTTTTTTTTG
131 ACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATCACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTTG
* * *
918460 AGTGCATTTTATTTTAAGAACCTGAGGAAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCCCCT
196 AGTGCATTTTATTTTAA-AACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCTCCT
* * *
918525 GCATGTATGCTCAGGGGGTG---AC-------T------ATAGGTTGACATCCTTTTCAAATTTG
260 GCAAGTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATTCG
* * * * * *
918574 CATCAATGTTTCTAAAATCGTGGCAGTATTTGGTTATTAGGCACCATAACTAATATCTCAAATTT
325 CATCATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGAATTT
** *
918639 ATGAC-AGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAACAAATACCGTCTTTAACTTTACATCCGTAAT
390 ATG-CTAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAATGAATACCCTCTTTAACTTTACATCCGTAAT
* * *
918703 GATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAAGGAAATGAACTAG
454 GATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGGGTAATCAACTAG
* * *
918768 GTACCAATATTTGGGTTCTTATGGGGGTTATAATCCTTCACCC-CGCGTAACCGATTCCCGAATT
519 GTACCAATTTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTC-CCCACGCGTAACCGACTCCCGAATT
* *
918832 TGATTTCTAGATTTTTGCATACATTAAAACTTGGTATTTTGATAAAAATAAAATATTTGTT-TTA
583 TGATTTCTAGATTTTCGCATACCTTAAAACTTGGTATTTTGATAAAAATAAAATATTT-TTATTA
*
918896 AAATTACCCGAT
647 AAATCACCCGAT
* * * *
918908 TTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGTCTCCTCACATTTTAAAAACCAAAT
1 TTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAAAT
* * ** ** ** *
918973 AGGGTTAATATTAGAACCTACATTT-TAAAAATTGGTATTTTG-ATAAAAATAAT-TTTTTTTAT
66 AGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCT----A--GGT-TTGTGCCTTTAGGT--TCTTTAATTCT
* * * * ** * * *
919035 TAAAATCACCCGA-ATTTTATGGTGTCCCA-ATCGCA-CCTTAAATGA---TTGGTGGAGACTTC
122 TATAAT---TCGACACTTTA-GG-AT---AGAGAG-AGCCTTAAATCACCCTTGGT-TA-A-TTA
** * * * ****** * * * * ** * * ** *
919094 TCA-TATTTCAAAAACCAAAT-AG-G--GTTAATATTAGAACCTATATTTCTAGGTTTGTGCCT-
175 GGACGA-ATGAAAATTTGTTTGAGTGCATTTTATTTTAAAACCTA-A-GGCAATG-TT-CACTTA
*** ** ** * * * * * * * *****
919153 TTAGGTTCTTTAATTCTTATAAT-T-C-GACACTTTAGGAT-AGAGAGAGCCTTAAATAACCCTT
235 TTAGG-GAATTAA-TGGTAT-ATCTCCTG-CA-AGTATGCTCAGGGGGTGAC-T-ACTGGTGATT
*** * * ** *** * * * * *
919214 CGTTAATTAGGACGA-ATGAAAATTTTTTTGAGT-GCAT-TTTATTT-TAAGAACCTGAGGAAAT
293 CCCGAAATAGGTCGACAT----CCTTTTCAAATTCGCATCATTGTTTCTAA-AATC-GAGGCAAT
* *** * * * * * * *
919275 GTTCACTTATTAGGGA-ATTAATGGT-ATATCCCCTGCATGTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGT
352 ATTTGGTTATTAGGCACAAT-A-GCTAATAT-CTC-GAATTTATGCT-A-GGGGTGA--A-TGCT
** ** * * *
919338 GATTCTCGA--AATAGGTTGACAT--CCT-TTTCAAATTTGCAT-C--AATG-TTTCTAAAATCG
408 -ATTAGC-ATTAATA-AATGA-ATACCCTCTTT-AACTTTACATCCGTAATGATTT-TCAAAT--
* * ** * * * * * * * *
919394 TGGCAGTATTGGTTATTAGGCAC-CATAACTATCTCAATTT--ATGACAGGGTGAATGTAA-T--
465 T--AAATA-AAG--A-T-CGAACTCA-AAATTTCTGATTTTAAAT-ATAGGGT-AAT-CAACTAG
* ** *** ** *** * ** * * ** *
919453 -TAGC-ATTAAT--AAACAAAT-ACCGTCTTTAA--CTT-TACATC-CGTAA-TGATTTTC-AAA
519 GTACCAATTTTTGGGTGCTTATGGGGGT-TATAATCCTTCCCCA-CGCGTAACCGACTCCCGAAT
** ** * ** * ** ***
919507 TT-AAATAAAGA---TCG-A-A-CTCAAAA-TTTCTGA-TTT--TAAATATAAGGTAATGAACTA
582 TTGATTTCTAGATTTTCGCATACCTTAAAACTTGGT-ATTTTGATAAAAATAAAAT-AT-TTTTA
* * *** *
919561 GGTACCAAT-ATTTGGGT
644 -TTA-AAATCA-CCCGAT
* * *** * * ** * *** * * *
919578 TCTTATGGGGGTTATAATCCTTCACCCCGCGTAACCGACTCCCGAATTTGATTTCT-AGATTTTC
1 TTTTAT-GGTGTCCCAAT-C-GCA---C-CTTAAATGATTGGTGGA---GACTTCTCATA-TTTC
** * * * * * ** * ****
919642 GCATA-CATTAAAACTTGG-T-ATTTTGATAAAAATAAAATATT-T--GTTT-TAAAATTACCCG
55 AAAAACCA--AATA--GGGTTAATATT-A-GAACCT-ACAT-TTCTAGGTTTGTGCCTTTA---G
* ** * * * * * *
919700 ATT-TTT-A-TGGTATCCCAA-TCG-CACCTTAAATGATTGGTGGAGACCTCACATTTCAAA-AA
109 GTTCTTTAATTCTTAT---AATTCGACA-CTT-TAGGA-TAG-AGAGA--GC-C--TT-AAATCA
* * ** *** * * ** * *
919759 CCAAATAGGGTTAA-TATTA-GAACCTACATTTCTATGTTTGTGC-CTTTAGGTTCTT-TAACTC
161 CC--CT-TGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGT-T-TGAGTGCATTTTA--TT-TTAAAAC-C
* * ** * * *** * * * *** * *
919820 TTA--TAA--TTCGACACATT----AA-T-ATAG-AGAGAGCCT-TAAATA-AC-CCTTGGTTAA
217 TAAGGCAATGTTC-ACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCTCCTGCAAGTATGCTCAGGGGGTGA
* * * * * * ** * *
919871 TTA--GGAAGAAT---GAAA-A--T-----T--TGTTT--AAGT-GCAT-TTTATTTTAAGAACC
281 CTACTGG-TGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCT-TTTCAAATTCGCATCATTGTTTCTAAAATC
* * *** * * * * *
919917 TAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGA-ATTAATGGT-ATATCCCCTGCAA-GTATGCTCAGGGGAT
344 -GAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAAT-A-GCTAATAT-CTC-G-AATTTATGCT-AGGGG-T
* * ** * **
919979 GACTACT-GGAG-ATTCCCGAA-AAAGGTCGACAT--CCT-TTTCAAATTCGCAT-C--AATG-T
401 GAATGCTATTAGCATT----AATAAA--T-GA-ATACCCTCTTT-AACTTTACATCCGTAATGAT
* * ** * ** * * * * *
920034 TTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTTTTAGGCACAATAGCCAATATCTCACATTT--ATGATAG
457 TT-TCAAAT-TA---AATA--AAG-ATCGA-ACTC-A-A---AATTTCTGA-TTTTAAAT-ATA-
* * * ** ******* ***** * ** * *
920097 GGGTGAATGCTATTAGCATTAAAAATGAACAACCT-CTTTAACTTAACATTCGTAATGATTTTCA
505 GGGT-AAT-CAACTAG--GTACCAAT-TTTTGGGTGC-TT-A-TGGGGGTT-ATAAT-CCTTCCC
* **** * *** *** ** *
920161 AATTAAATAA-AGA-T--CGAACTCAAAATTTCT-GATTTTAAATATAGGTTAATTAACTAGGTA
560 CA-CGCGTAACCGACTCCCGAA-T-TTGATTTCTAGATTTT-CGCATACCTTAA--AACTTGG--
* **** ****** * ***
920221 CTAATTTTTGGGTGCTTAT-GGGGGGTTTTAAT-CCTTC-CCC-AT
617 -T-A-TTTT-GATAAAAATAAAATATTTTTATTAAAATCACCCGAT
** * ** ** * * ** ** * * ** *
920263 GCGTAACCGACTCCCGAATTTG-A-TTTCTA-GATTTTTGCATACCTTAAAACTTGGTATTTTGA
1 -TTTTATGGTGTCCC-AA-TCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGA-CTT----C-TCATA-TTTCA
** * ** * * * **
920325 TAAAAGTAAA-A-TGTTTTTATTAAAATCAC-CCAATTTTTTGATGGTGTCCCAATCGCACGTTA
56 -AAAACCAAATAGGGTTAATATTAGAA-C-CTAC-A-TTTCT-A-GGT-T---TGT-GC-C-TT-
* * * ** * * * * ** * * * * *
920387 AATGATTGGTGGAGACTTCTAATATTTCAAAAACCAAATAGGGTTAATATTAGAACC-TACATTT
106 TA-GGTT-CTTTA-A-TTCTTATAATTC-GACA-C-TTTA-GGAT-AGA-GAGAGCCTTA-A-AT
** * ** * * * * *** *
920451 CTA-GGTTTGTTCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTATAATTTGACACTTT-AG-G-ATAGAGAAAGC
159 C-ACCCTTGGTT-AATTAGG-AC--GAA---TGAAAATTTG----TTTGAGTGCAT---TTTA-T
* *** * * * * * ** * *
920512 CTTAAATCACCTTAGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTTGAGTGCATTTTACTTTTAAAAC
208 TTTAAA--ACC------T-A--AGG-C-AATGTTCACTT-ATT-AG-GGA-ATTAATGGT-ATAT
*** * * *** ** * * * ***
920577 CTAAGGCAA-TGATCACTTATTAGGAAATTACTGGT-ATATCTCCTGCAAGTATGCTCAGGGGGT
255 CTCCTGCAAGT-AT-GCTCAGGGGGTGACTACTGGTGAT-TC-CC-G-AAATA-GGTC--GACAT
* * **** * * * * * * *
920640 GACTACTGGTGATTC-CTAAAATAGGTCGACATCTTTTTC-AAATTCGCGTCATTGTTT-CTTAA
311 -CCT-TTTCAAATTCGC------A--T---CAT-TGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTT--
* * * * *
920702 ATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCACATTTATGCTAGGGGTGAATG
360 AT-TAGGC-ACA-------A-TA-GC-TAATATCT-----C-GA-ATTTATGCTAGGGGTGAATG
* * * * *
920767 CTATTAGCATTAATAAACGAATATCATACTTT-ACTTTACATCCGTAATTATTTACAAATTAAAT
406 CTATTAGCATTAATAAATGAATACCCT-CTTTAACTTTACATCCGTAATGATTTTCAAATTAAAT
* * *
920831 GAAGATCGAACTCAAAATTTTTG-TTTTGAAATATAGGGTAATCAACTAGGTACCAATGTTTGGG
470 AAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTT-AAATATAGGGTAATCAACTAGGTACCAATTTTTGGG
*
920895 TTCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCCACGCGTAACCGACTCCCGAATTTGATTTCTAGATTTTC
534 TGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCCACGCGTAACCGACTCCCGAATTTGATTTCTAGATTTTC
* * *
920960 GCACACCTTAAAACTTGGTATTTTGATAAAAATAAAATATTTTTATTAAAATTACCCAAT
599 GCATACCTTAAAACTTGGTATTTTGATAAAAATAAAATATTTTTATTAAAATCACCCGAT
* *
921020 TTTTATGGTGTCCCAATCACACCTTAAATGATTGGTGGAGACTCCTCATATTTCAAAAACCAAAT
1 TTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAAAT
* **
921085 AGTGTTAATATTAGAACCTACATTTCTATTTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTATAATTCG
66 AGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTATAATTCG
* * * *
921150 ACACATTAGAATAGAGAGAGCCTT-AATGCACCCTTAGTTAATTGGGACGAATGAAAATTTGTTT
131 ACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAAT-CACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTT
* *
921214 GAGTGCATTTTATTTTTAATACCTAAGGCAATGTTCA-TTATTAGGGAATTAATGGTATATATCC
195 GAGTGCATTTTA-TTTTAAAACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCTCC
* *
921278 TGCAAGTATGCTCA-GGGGTGACTACT-GTTATTCCCGAAATAGGTCGACATCTTTTTCAAATTC
259 TGCAAGTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATTC
* * * *
921341 GCATCATTGTTCCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTACTAGGCACAATAGCTAATATCTTGCATT
324 GCATCATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGAATT
* * * * * *
921406 TATTCTTA-GGATGAATGTTATTAGCATTAATAAATGAATACCCTTTTTCACTTTA-AGTTCGTA
389 TATGC-TAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAATGAATACCCTCTTTAACTTTACA-TCCGTA
* *
921469 ATGATTTTC-AATTAAATAAAGATCGAA-TCAAAATTTTTGATTTTAAATATAGGGTAATCAATT
452 ATGATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGGGTAATCAACT
* *
921532 AGGTACCAATTTTTGGGTGCATATGGGGGTTATAAT-CTT-CCCACGCGTAACCGACTCCCAAAT
517 AGGTACCAATTTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCCACGCGTAACCGACTCCCGAAT
* * *
921595 TTGATTTCTAGATTTTCGTATACCTTAAAAATTGGTATTTTGATAAAAAT--AATTTTTTTATTA
582 TTGATTTCTAGATTTTCGCATACCTTAAAACTTGGTATTTTGATAAAAATAAAATATTTTTATTA
921658 AAATCACCCGAT
647 AAATCACCCGAT
921670 TTTTATGGTGTCCCAATCGCA-CTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAAAT
1 TTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAAAT
*
921734 AGGGTTAATATTAGAACCTATATTTCTAGGTTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTATAATTC
66 AGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTAGG-TTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTATAATTC
* * *
921799 GACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATAACCCTTCGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTTTTT
130 GACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATCACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAA-TTTGTT
* * *
921864 TGAGTGCATTTTATTTTAAGAACCTGAGGAAATGTTCACTTATTAGGGAATTAAT-GTATATCCC
194 TGAGTGCATTTTATTTTAA-AACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCTC
* * *
921928 CTGCATG-ATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCTCGAAATAGGTTGACATCCTTTTCAAATT
258 CTGCAAGTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATT
* * * * * * *
921992 TGCATCAATGTTTCTAAAATCGTGGCAGTA-TTGGTTATTAGGCACCATAACTAATATCTC-AAA
323 CGCATCATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGAAT
** *
922055 TTATGAC-AGGGGTGAATG-TAATTAGCATTAA-AAACAAATACCGTCTTTAACTTTACATCCGT
388 TTATG-CTAGGGGTGAATGCT-ATTAGCATTAATAAATGAATACCCTCTTTAACTTTACATCCGT
* *
922117 AATGATTTTCAAATTAAAT-AAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAAGGTAATGAAC
451 AATGATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGGGTAATCAAC
* *
922181 TAGGTACCAATATTTGGGTTCTTATGGGGGTTATAATCCTTCACCC-CGCGTAACCGACTCCCGA
516 TAGGTACCAATTTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTC-CCCACGCGTAACCGACTCCCGA
*
922245 ATTTGATTTCTAGATTTTCGCATACATTAAAACTTGGTATTTTGATAAAAATAAAATATTTGTT-
580 ATTTGATTTCTAGATTTTCGCATACCTTAAAACTTGGTATTTTGATAAAAATAAAATATTT-TTA
*
922309 TTAAAATTACCCGAT
644 TTAAAATCACCCGAT
* * * *
922324 TTTTATGGTGTCCC-ATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGTCTCCTCACATTT-TAAAACCAAAT
1 TTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAAAT
922387 AGGGTTAATATTAGAACCT--A---C-A---TT-T--C---A-----TTT-A---TTATAATTCG
66 AGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTATAATTCG
* *
922428 ACACTTTAGGATAGAGAGACCCTTAAAGCACCCTTGGTTAATTAGGACGAATG-AAATTTGTTTG
131 ACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATCACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTTG
* * ** *
922492 AGTGCATTTTATTTTTAAAACCTAAGACAATGTTCACTTATTTGGTTATTAATGGTATATCTCTT
196 AGTGCATTTTA-TTTTAAAACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCTCCT
* *
922557 GCAAGTATGCTCAGGGAGTGACTACTGGTGA-TCCCGAAATAGGTCGATATCCTTTT-AAATT--
260 GCAAGTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATTCG
* * * *
922618 CATCATTTTTTCCAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATGTCGCATTT
325 CATCATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGAATTT
* * *
922683 ATGCTAGGGATGAATGCTATTAGCATTAATAAATGAATA-CCTTTTTCACTTTA-ATTCCGTAAT
390 ATGCTAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAATGAATACCCTCTTTAACTTTACA-TCCGTAAT
* * *
922746 GATTTTTAAATT-CAT-AAGATCGAACTC-AAATTTCTGGTTTTAAATATAGGGT-ATCAACTAG
454 GATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGGGTAATCAACTAG
* * *
922807 GTACCAATTTATGGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCCATGCGTAATCGACTCCCGAATTT
519 GTACCAATTTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCCACGCGTAACCGACTCCCGAATTT
* * *
922872 GATTTCTAGATTTTTGCATACCTTAAAACTTGGTATTTTGATAAAAGTAAAATGTTTTTATTAAA
584 GATTTCTAGATTTTCGCATACCTTAAAACTTGGTATTTTGATAAAAATAAAATATTTTTATTAAA
922937 ATCACCC-ATTT
649 ATCACCCGA--T
* *
922948 TTTTGATGGTGTCCCAATCGCACGTTAAATGA-TGGTGGAGACTTCTAATATTTCAAAAACCAAA
1 TTTT-ATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAAA
*
923012 TAGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTAGGTTTGTTCCTTTAGGTTCTTTAATTC-TATAATTC
65 TAGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTATAATTC
* * *
923076 GACACTTTAGGATA-AAAAAGCCTTAAATCACCTTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTT
130 GACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATCACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTT
* * *
923140 GAGTGCATTTTACTTTAAAACCTAAGGCAATGATCACTTATTAGGAAATT-ATGGTATATCTCCT
195 GAGTGCATTTTATTTTAAAACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCTCCT
*
923204 GCAAGTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATT-CCTAAATAGGTCGACAT-CTTTTCAAATTCG
260 GCAAGTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATTCG
* *
923267 CGTCATTG-TT-T-AAATCGAGGCAATATTTGGTTTTTAGGCACAATAGCTAATATCTC-ACATT
325 CATCATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGA-ATT
* * *
923328 TATGCTA-GGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAACGAATATCATACTTT-AC-TTACATCCGTAA
389 TATGCTAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAATGAATACCCT-CTTTAACTTTACATCCGTAA
* * * *
923390 T-A-TTACAAATTAAATGAAGATCGAACTC-AAATTTTTG-TTTGAAATATAGGGTAATCAACTA
453 TGATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGGGTAATCAACTA
*
923451 GGTACCAATGTTTGGGTGCTTAT-GGGGTTATAATCCTTCCCC-C-CGT-ACCGACTCCCG-ATT
518 GGTACCAATTTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCCACGCGTAACCGACTCCCGAATT
* **
923511 TGATTTCTAGATTTTCGCATACCTTAAAACTTGGTATTTTGATAAAAATAGAATGCTTTTATTAA
583 TGATTTCTAGATTTTCGCATACCTTAAAACTTGGTATTTTGATAAAAATAAAATATTTTTATTAA
*
923576 AATCAGCCGAT
648 AATCACCCGAT
* *
923587 TTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTCCTCACATTTCAAAAACCAAAT
1 TTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAAAT
* *
923652 ACGG-------T------TA-A----TA------T---TTTAGGTTCTTTAATTCTCATAATTCG
66 AGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTATAATTCG
* * * *
923690 ACCCTTTAGGATAGAGAGAGCTTTAAATCACTCTTGGTTAATTAGGACGAACGAAAATTTGTTTG
131 ACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATCACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTTG
* *
923755 AGTGTATTTTATTTTTAAAACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCCCCT
196 AGTGCATTTTA-TTTTAAAACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCTCCT
* * * * *
923820 GCAAGTATGCTCAGGGGGTGATTATTGGAGATTCCCGAAAAAGGTCGACATCGTTTTCAAATTCG
260 GCAAGTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATTCG
* * *
923885 CATCAATGTTTCTAAAATCGAGGCAATAATTGGTTATTAGGAACAATAGCTAATATCTCGAATTT
325 CATCATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGAATTT
* * *
923950 ATGCTAGGCGTGAACGCTATTAGCATTAATAAACGAATACCCTCTTTAACTTTACATCCGTAATG
390 ATGCTAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAATGAATACCCTCTTTAACTTTACATCCGTAATG
* *
924015 ATTTTTC-AATTAAATAAAGATCG-ACTCAAAATTTTTTA-TTT-AATATAGGGTAATCAACTAG
455 A-TTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGGGTAATCAACTAG
* * * * *
924076 GTACCAAATTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCACAAGCGTAACCGAGTCCCAAATTT
519 GTACCAATTTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCCACGCGTAACCGACTCCCGAATTT
* * * * *
924141 GA-TTCTAGATTTTTGCATACCTTAAAACAT-GT-TGTTTGAGAAAAAGAAAAT-GTTTTA-TAA
584 GATTTCTAGATTTTCGCATACCTTAAAACTTGGTAT-TTTGATAAAAATAAAATATTTTTATTAA
*
924201 AATCACCCTAT
648 AATCACCCGAT
* * * **
924212 TTTT-TGGTGTCCTAATGGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCACATTTCAAAAATAAAAT
1 TTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAAAT
** *
924276 AGGGTTAATATTAGAACCTACA-TTCTATATTTCTGCCTTTAGGTTCTTT-ATCTCTTATAATTC
66 AGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAAT-TCTTATAATTC
* * *
924339 GACACTTTAGGATAGAGAGATCCTTAAATAACCCTTGGTT-ATTAGGACGAATGAGAATTTGTTT
130 GACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATCACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTT
* *
924403 GAGTGCATTTTATTTTAAGAACCTAAGG-AATTGTTCAC---TTAGGTAATTAATGGTATATCCC
195 GAGTGCATTTTATTTTAA-AACCTAAGGCAA-TGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCTC
924464 CTGCAAGTATGCTCA-GGGGTGACTACTGGTGATTCCCG-AATAGGTCGACATCCTTTTCAAATT
258 CTGCAAGTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATT
* * *
924527 CCCATCA-TGTTTCTAAAATCGAGGCAATA-TTGGTTATTAGGCACAATAGCTACTATCTCGACT
323 CGCATCATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGAAT
* * *
924590 TTATGCTA-GGGTGAACGCTATTAGCATTAATAAACGAATACCCTCTTTAACTTTACATCCGTTA
388 TTATGCTAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAATGAATACCCTCTTTAACTTTACATCCGTAA
* * * *
924654 TGA-TTTCAAATTAAAT-AA-ATCAAACTCAAAATTTCTAATTTTAAGTATAAGGTAATCAACTA
453 TGATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGGGTAATCAACTA
* * * * *
924716 GGTACCAATTTTTGGGTGCTCACGGGGGTTATAATTCTTCCCCATGCGTAACCGACTCCTGAATT
518 GGTACCAATTTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCCACGCGTAACCGACTCCCGAATT
** * *
924781 TGATTTCTAGATTTTTACACAACTTAAAACTTGGTATTTTGAT---AA-AAAATATTTTTATT-A
583 TGATTTCTAGATTTTCGCATACCTTAAAACTTGGTATTTTGATAAAAATAAAATATTTTTATTAA
*
924841 AATTACCCGAT
648 AATCACCCGAT
* *
924852 TTTTATGGTATCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGAC--CTCACATTTC-AAAACCAAAT
1 TTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAAAT
* *
924914 AGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTATG-TTGTTGCCTTTAGGTTCTTTAACTCTTAT-ATTC
66 AGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTAGGTTTG-TGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTATAATTC
* ** * *
924977 GACACATTAATATAGAGAGAGCCTTAAATAACCCTTGGTT-ATTAGGAAGAATGAAAA--TGTTT
130 GACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATCACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTT
* *
925039 AAGTGCATTTTATTTTAAGAA-CTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCCCC
195 GAGTGCATTTTATTTTAA-AACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCTCC
* * *
925103 TGCAAGTATGCTCAGGGGATGACTA-TGGAGATTCCCGAAAAAGGTCGACATCCTTTTCAAATTC
259 TGCAAGTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATTC
* *
925167 GCATCAATGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTTTTAGGCACAATAGCTAATATCTC-ACAT
324 GCATCATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGA-AT
* * * * * * *
925231 TTATGATAGGGGTGAATG--ATTAGCATTAAAAAATGAACAACCTCTTTAACTTAACATTCATAA
388 TTATGCTAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAATGAATACCCTCTTTAACTTTACATCCGTAA
* * *
925294 TGA-TTTCAAATT---GAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGGTTAATTAACTA
453 TGATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGGGTAATCAACTA
* *
925355 GGTACTAATTTTTGGGTGCTTATGGGGGGTTATAATCCTTCCCCACGCGTAACCGACTCCTGAAT
518 GGTACCAATTTTTGGGTGCTTAT-GGGGGTTATAATCCTTCCCCACGCGTAACCGACTCCCGAAT
* *
925420 TTGATTTCTAGATTTT-ACACACCTTAAAACTTTGGTATTTTGAT-AAAATAAAATATTTTTATT
582 TTGATTTCTAGATTTTCGCATACCTTAAAAC-TTGGTATTTTGATAAAAATAAAATATTTTTATT
925483 AAAAGT-ACCCGAT
646 AAAA-TCACCCGAT
*
925496 TTTTATGGTGTCCCAATCGCA-CTTCAAATGATTGGT-GAGACTTCTCATA-TTCAAATACCAAA
1 TTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTT-AAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAAA
*
925558 TAGGGTTAATATTAGAACCT--A-TTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTACAATTC
65 TAGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTATAATTC
*
925620 GACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATAACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTT
130 GACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATCACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTT
*
925685 GAGTGCATTTTA-TTTAAGAACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATTGTATATCTCC
195 GAGTGCATTTTATTTTAA-AACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCTCC
* * ** * *
925749 TGCAACTATGCTCAGGGGATGACTACAAGTGATTCCCGAAATAAGT-GACATACTTTTCAAATTC
259 TGCAAGTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATTC
*
925813 GCATCATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGTATT
324 GCATCATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGAATT
* * * * * * *
925878 TATGATA-GGGTGAATGCTATTAGCATTAAAAAATGAACAACATCTTTAA-TTAACATTCGTAAT
389 TATGCTAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAATGAATACCCTCTTTAACTTTACATCCGTAAT
* *
925941 GATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTT-TTA-TTTAAATATAGGGTAATTAACTAG
454 GATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGGGTAATCAACTAG
* * * *
926004 GTACC-ATTTTTGGGGTGCTCATGGGGGTTATAATCCTT-CCCATGAGTAACCGACTCCTGAATT
519 GTACCAATTTTT-GGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCCACGCGTAACCGACTCCCGAATT
*
926067 TGATTTCTAGATTTT-GCACACCTTAAAACTTGGTATTTTGAT-AAAATAAAATATTTTTATTAA
583 TGATTTCTAGATTTTCGCATACCTTAAAACTTGGTATTTTGATAAAAATAAAATATTTTTATTAA
* *
926130 AATTACCCAAT
648 AATCACCCGAT
* *
926141 TTTTATGGTGTCCCAATCACACCTTAAATGATTGGTGGAGACTCCTCATA-TTCAAAAACCAAAT
1 TTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAAAT
**
926205 AGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTATTTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTATAATTCG
66 AGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTATAATTCG
* * * *
926270 ACACATTAGAATAGAGAGAGCCTT-AATGCACCCTTAGTTAATTGGGACGAATGAAAATTTGTTT
131 ACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAAT-CACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTT
*
926334 GAGTGCATTTTATTTTTAATACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGG--TAT-T-C
195 GAGTGCATTTTA-TTTTAAAACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCTCC
* *
926395 TGCAAGTATGCTCAGGGGGTGACTACTAGT-ATTCCCGAAATAGGTCGACATCTTTTTCAAATTC
259 TGCAAGTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATTC
* * *
926459 GCATCATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTACTAGGCACAATAGCTAATATCTTGCATT
324 GCATCATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGAATT
* * * * * *
926524 TATTCTTA-GGATGAATGTTATTAGCATTAATAAATGAATACCCTTTTTCACTTTA-AGTTCGTA
389 TATGC-TAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAATGAATACCCTCTTTAACTTTACA-TCCGTA
* *
926587 ATGATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTC-AAATTTTTGATTTTAAATATAGGGTAATCAATT
452 ATGATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGGGTAATCAACT
* *
926651 AGGTACCAATTTTTGGGTGCTTATGGGGGTTAAAATCCTTCCCCCCACGCGTAACCGACT-CCAA
517 AGGTACCAATTTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTT--CCCCACGCGTAACCGACTCCCGA
* *
926715 ATTTGATTTCTAGATTTTCGTATACCTTAAAA-TTGGTATTTTG--AAAAAT--AATTTTTTTAT
580 ATTTGATTTCTAGATTTTCGCATACCTTAAAACTTGGTATTTTGATAAAAATAAAATATTTTTAT
926775 T-AAATCACCCGAT
645 TAAAATCACCCGAT
926788 TTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAAAT
1 TTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAAAT
*
926853 AGGGTTAATATTAGAACCTATATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTATAATTCG
66 AGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTATAATTCG
* * ** *
926918 ACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATAACCCTTCGTTAATTAGGACGAATGAATTTTTTTTTG
131 ACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATCACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTTG
* * *
926983 AGTGCATTTTATTTTAAGAACCTGAGGAAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCCCCT
196 AGTGCATTTTATTTTAA-AACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCTCCT
* * *
927048 GCATGTATGCTCAGGGGGTG---AC-------T------ATAGGTTGACATCCTTTTCAAATTTG
260 GCAAGTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATTCG
* * * * * *
927097 CATCAATGTTTCTAAAATCGTGGCAGTATTTGGTTATTAGGCACCATAACTAATATCTCAAATTT
325 CATCATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGAATTT
** * *
927162 ATGAC-AGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAACAAATATCGTCTTTAACTTTACATCCGTAAT
390 ATG-CTAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAATGAATACCCTCTTTAACTTTACATCCGTAAT
* * *
927226 GATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAAGGAAATGAACTAG
454 GATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGGGTAATCAACTAG
* * *
927291 GTACCAATATTTGGGTTCTTATGGGGGTTATAATCCTTCACCC-CGCGTAACCGATTCCCGAATT
519 GTACCAATTTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTC-CCCACGCGTAACCGACTCCCGAATT
*
927355 TGATTTCTAGATTTTCGCATACATTAAAACTTGGTATTTTGATAAAAATAAAATATTTGTT-TTA
583 TGATTTCTAGATTTTCGCATACCTTAAAACTTGGTATTTTGATAAAAATAAAATATTT-TTATTA
*
927419 AAATTACCCGAT
647 AAATCACCCGAT
* * * *
927431 TTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGTCTCCTCACATTTTAAAAACCAAAT
1 TTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAAAT
* * * *
927496 AGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTATGTTTGTACCTTTAGGTTTTTTAATTATTATAATTCG
66 AGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTATAATTCG
*
927561 ACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAAGCACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTTG
131 ACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATCACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTTG
* *
927626 AGTGCATTTTATTTTTAAAACCTAAGACAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCTCTT
196 AGTGCATTTTA-TTTTAAAACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCTCCT
* *
927691 GCAAGTATGCTCAGGGAGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGATATCCTTTTCAAATTCG
260 GCAAGTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATTCG
* *
927756 CATCATTGTTTCCAAAATCGAGGCAA-ATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATA--TCGCA-TT
325 CATCATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGAATTT
* * * *
927817 ATGCTAGGGATGAATGCTATTAGCGTTAAT-AATGAATACCCTTTTTCACTTTA-ATTCCGTAAT
390 ATGCTAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAATGAATACCCTCTTTAACTTTACA-TCCGTAAT
* * * *
927880 GATTTTTAAATTCAATAAAAATCGAACTCAAAATTTCTGGTTTTAAATATAGGGT-ATCAACTAG
454 GATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGGGTAATCAACTAG
* *
927944 GTACCAATTTATGGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCCATGCGTAACCGACT-CCGAATTT
519 GTACCAATTTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCCACGCGTAACCGACTCCCGAATTT
* * *
928008 GATTTCTAGATTTTTGCATTCCTTAAAACTTGGTA-TTTGATAAAAGT-AAA-ATTTTTATTAAA
584 GATTTCTAGATTTTCGCATACCTTAAAACTTGGTATTTTGATAAAAATAAAATATTTTTATTAAA
*
928070 ATCACCCAATT
649 ATCACCCGA-T
*
928081 TTTTGATGGTGTCCCAATCGCACCGTTAAATGATTTGGTGGAGACTTCTAATATTTCAAAAACCA
1 TTTT-ATGGTGTCCCAATCGCACC-TTAAATGA-TTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAAAACCA
* *
928146 AATAGGGTTAATATTAGAACCTACTTTTCTAGGTTTGTTCCTTTAGGTTCTTTAATTC-TATAAT
63 AATAGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTATAAT
* *
928210 TCGACACTTTAGGATAGAGAAAGCCTTAAATCACCTTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGT
128 TCGACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATCACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGT
* * *
928275 TTGAGTGCATTTTACTTTTAAAACCTAAGGCAATGATCACTTATTAGGAAATTACTGGTATATCT
193 TTGAGTGCATTTTA-TTTTAAAACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCT
** *
928340 CCTGCAAGTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCCTAAAATAGGTCGACATCTTTTTCAAAT
257 CCTGCAAGTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAAT
* *
928405 TCGCGTCATTGTTTCTTAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTC-AC
322 TCGCATCATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGA-
* *
928469 ATTTATGCTA-GGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAACGAATA-TCTAC-TT-ACTTTACATCCG
386 ATTTATGCTAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAATGAATACCCT-CTTTAACTTTACATCCG
* * *
928530 TAATTATTTACAAATTAAATGAAGATCGAACTCAAAATTT-TG-TTTTGAAATATAGGGTAATCA
450 TAATGATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTT-AAATATAGGGTAATCA
* *
928593 ACTAGGTACCAATGTTTGGTTGC-TATGGGGGTTATAATCCTTCCCCACGCGTAACCGACT-CCG
514 ACTAGGTACCAATTTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCCACGCGTAACCGACTCCCG
* **
928656 AATTTGATTTCTAGATTTTCGCATACCTTAAAACTTGGTATTTTGATAAAAATAGAATGCTTTTA
579 AATTTGATTTCTAGATTTTCGCATACCTTAAAACTTGGTATTTTGATAAAAATAAAATATTTTTA
*
928721 TTAAAATCAGCCGAT
644 TTAAAATCACCCGAT
* * * *
928736 TTTTATGGCGTCCCAATTGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTCCTCACATTTCAAAAACCAAAT
1 TTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAAAT
* *
928801 ACGG-------T------TA-A----TA------T---TTTAGGTTCTTTAATTCTCATAATTCG
66 AGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTATAATTCG
* *
928839 ACCCTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATCACTCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTTG
131 ACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATCACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTTG
*
928904 AGT--ATTTTATTTTTAAAA-CTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCCCCT
196 AGTGCATTTTA-TTTTAAAACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCTCCT
* * * * *
928966 GCAAGTATGCTCAGGGGGTGATTATTGGAGATTCCCGAAAAAGGTCGACATCGTTTTCAAATTCG
260 GCAAGTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATTCG
* * *
929031 CATCAATGTTTCTAAAATCGAGGCAATAATTGGTTATTAGGAACAATAGCTAATATCTCGAATTT
325 CATCATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGAATTT
* * *
929096 ATGCTAGGCGTGAACGCTATTAGCATTAATAAACGAATACCCTCTTTAACTTTACATCCGTAATG
390 ATGCTAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAATGAATACCCTCTTTAACTTTACATCCGTAATG
* *
929161 ATTTTCAAATTAGATAAAGATCGAACTCAAAATTTATGATTTTAAATATAGGGTAATCAACTAGG
455 ATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGGGTAATCAACTAGG
* * * *
929226 TACCAGTTTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCCCCCGCGTAATCGACTCCTGAATTT
520 TACCAATTTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTT-CCCCACGCGTAACCGACTCCCGAATTT
* * * *
929291 GATTTCTAGATTTTCTCATACTTTAAAATTTGGTATTTTGATAAAAATAAAATGTTTTTATTAAA
584 GATTTCTAGATTTTCGCATACCTTAAAACTTGGTATTTTGATAAAAATAAAATATTTTTATTAAA
*
929356 ATCACCTGAT
649 ATCACCCGAT
929366 TTTTATGGTGTCCCAATCGCA-CTTCAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAAA
1 TTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTT-AAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAAA
* *
929430 TAGGGTTAATATTAGAA---ATATTTCTAGG-TT-TGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTACAATTC
65 TAGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTATAATTC
*
929490 GACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATAACCC-TGGTTAATTAGGACGAATG-AAA-TTGTTT
130 GACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATCACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTT
929552 GAGTGCATTTTATTTTAAGAACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCT-C
195 GAGTGCATTTTATTTTAA-AACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCTCC
* * ** * *
929616 TGCAACTATGCTCAGGGGATGACTACAAGTG-TTCCCGAAATAAGT-GACATACTTTTC-AATTC
259 TGCAAGTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATTC
*
929678 GCATCATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGG-TATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGTATT
324 GCATCATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGAATT
* * * * * *
929742 TATGATAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAAAAAATGAACAACCTCTTTAACTTAACATTCGTAAT
389 TATGCTAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAATGAATACCCTCTTTAACTTTACATCCGTAAT
* * *
929807 GATTTTC-AATT-AATAAAGATCGAACTCAAAATTT-TTATTTT--TTATAGGGTAATTAACTAG
454 GATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGGGTAATCAACTAG
* * * * * **
929867 GTACCAATTTTTGGGTGCTCATGGGGGTTATAATCCAT-CCCATGAGTAACTGACTCCTAAATTT
519 GTACCAATTTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCCACGCGTAACCGACTCCCGAATTT
* *
929931 GATTTCTAGA-TTT-GCACACCTTAAAACTTGGAATTTTGATAAAAAT-AAA-A-TTTTATTAAA
584 GATTTCTAGATTTTCGCATACCTTAAAACTTGGTATTTTGATAAAAATAAAATATTTTTATTAAA
* *
929991 ATTACCC-AA
649 ATCACCCGAT
* * *
930000 TTTTATGGTGTCCCAATCACACCTTAAATGATTGGTGGAGACTCCTCACATTTCAAAAACCAAAT
1 TTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAAAT
* *
930065 AGGGTTCATATTAGAACCTACA-TTCTA-TTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTATAATTCG
66 AGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTATAATTCG
*
930128 A-A--TTA-GATAGAGAGAGCCTT-AATGCACCCTTAGTTAATTAGGACGAATG-AAATTTG-TT
131 ACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAAT-CACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTT
* *
930186 GAGTGCATTTTATTTT-ATACCTACGGCAATGTTCACTTA-TAGGGAATTAATGGTATATCTCCT
195 GAGTGCATTTTATTTTAAAACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCTCCT
* *
930249 GCAAGTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGT-ATTCCTGAAATAGGTCGACATCTTTTTCAAATTCG
260 GCAAGTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATTCG
* *
930313 CATCATTGTTTCTAAAATCGAGGC-ATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTTGCATTT
325 CATCATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGAATTT
* * * * * *
930377 ATTCTTGGGATGAATG-TATTAGCATTAATAAATGAATA-CCTTTTTCACTTT--ATTCGTAATG
390 ATGCTAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAATGAATACCCTCTTTAACTTTACATCCGTAATG
* * *
930438 ATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTTTTA-TTT-AATATAGGGTAATTAACTAGG
455 ATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGGGTAATCAACTAGG
* * * *
930501 TACCAATTTTTTGGTGCTCATGGGGGTTATAATCCTTCCCCA-GAGTAACTGACT---GAATTTG
520 TACCAATTTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCCACGCGTAACCGACTCCCGAATTTG
*
930562 ATTTCTAGATTTT-GC--ACCTTAAAACTTGG-AATTTGATAAAAATAAAATA-TTTTA-TAAAA
585 ATTTCTAGATTTTCGCATACCTTAAAACTTGGTATTTTGATAAAAATAAAATATTTTTATTAAAA
*
930621 T-ACCCAAT
650 TCACCCGAT
* *
930629 TTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTCCTCACATTTCAAAAACCAAAT
1 TTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAAAT
**
930694 AGGGTTAATATTAGAA-CTACA-TTCTATTTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTATAATTCG
66 AGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTATAATTCG
* *
930757 ACA--TTAGAATAGAGAGAGCCTT-AATGCACCCTTAGTTAATTAGGACGAATGAAAA-TTGTTT
131 ACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAAT-CACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTT
* *
930818 GAGTACATTTTATTTTAATACCTAAGGC-ATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTAT-TCTCCT
195 GAGTGCATTTTATTTTAAAACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCTCCT
*
930881 GCAAGTATGCTCA-GGGGTGACTACTGGTTATT-CCGAAATAGGTCGACAT-CTTTTCAAATTCG
260 GCAAGTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATTCG
* *
930943 CATCATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTTGTATTT
325 CATCATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGAATTT
* * * * ***
931008 ATTCT-GGGATGAAT--TATTAGCATTAATAAATGAATACCCTTTTTCACTTTA-ATTTTATAAT
390 ATGCTAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAATGAATACCCTCTTTAACTTTACA-TCCGTAAT
*
931069 GATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTT-TGATTTT-AA-ATAGGGTAATCAATTA-
454 GATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGGGTAATCAACTAG
* * *
931130 GTACCAA-TTTTGGGTGCTTATGGTGG-T-T-ATCCTTCCCCACGCGTAACAGACTCCCAAATTT
519 GTACCAATTTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCCACGCGTAACCGACTCCCGAATTT
* *
931191 GA-TTCTAGATTTTCGTATACCTTAAAAATTGGTATTTTGATAAAAAT--AAT-TTTTTATTAAA
584 GATTTCTAGATTTTCGCATACCTTAAAACTTGGTATTTTGATAAAAATAAAATATTTTTATTAAA
931252 ATCACCCGA-
649 ATCACCCGAT
*
931261 TTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAAAACTAAAT
1 TTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAAAT
* *
931326 AGGGTTAATATTAGAACCTACATTTTTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTACAATTCG
66 AGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTATAATTCG
* *
931391 ACACTTTAGGATAGAGAGAG-CTTAAAT-AACCTTGGTTAATTAGGACAAATGAAAATTTGTTTG
131 ACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATCACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTTG
*
931454 AGGGCATTTTATTTTAAGAACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCTCCT
196 AGTGCATTTTATTTTAA-AACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCTCCT
* * *
931519 GCAAGTATGCTCAGGGGATGACTACTAGTGATT-CCGAAATAGGTTGACA--CTTTTCAAATTCG
260 GCAAGTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATTCG
* ** * * *
931581 CATCATTGTTTCTAAAATCGACGC-A-ATTTGGTTATTAGAAAAAATAGCTAATATATCGCATTT
325 CATCATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGAATTT
* * * * **
931644 ATGATAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAATAAACAACCTCTTTAACTTTACATTAGTAATG
390 ATGCTAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAATGAATACCCTCTTTAACTTTACATCCGTAATG
* *
931709 ATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGCTTTTGAATATAGGGTAAT-AACTAGG
455 ATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGGGTAATCAACTAGG
* *
931773 TACCAA-TTTT--GTGCTTAT-GGGGTTATAATCCTTTCCCATGCGTAACCGACT-CCGAATTTG
520 TACCAATTTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCCACGCGTAACCGACTCCCGAATTTG
* *
931833 ATTTC-AGATTTT--TACACCTTAAAAACTTGGTATTTTGATAAAAATAAAATA--TTT-TTAAA
585 ATTTCTAGATTTTCGCATACCTT-AAAACTTGGTATTTTGATAAAAATAAAATATTTTTATTAAA
* *
931892 ATTACCTGA-
649 ATCACCCGAT
*
931901 TTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCT-AT-TTT-AAAAA-AAAAT
1 TTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAAAT
* * * *
931962 AGGGTTAATATTAGAACCTACATTTAT-TGTTTGTACCTTTAGGTT-TTTAA-TC-TATAATTCA
66 AGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTATAATTCG
*
932023 ACACTTTAGGATAGAGAG-GCCTTAAA-AACCC-TGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTTG
131 ACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATCACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTTG
932085 AGTGCA-TTTATTTT-AAACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCT--TG
196 AGTGCATTTTATTTTAAAACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCTCCTG
*
932146 CAAGTATGCTCAGGGAGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCG--ATCCTTTTCAAATTCGC
261 CAAGTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATTCGC
932209 ATCATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGG--CAATAGCTAATATCTC-ACATTT
326 ATCATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGA-ATTT
* *
932271 ATGCTAGGGATGAATGCTATTAGCATTAATAAATGAATA-CCT-TTTCACTTTA-ATTCCGTAAT
390 ATGCTAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAATGAATACCCTCTTTAACTTTACA-TCCGTAAT
* *
932333 GATTTT-AAATTCAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTG--GTTAAATATAGGGT-ATCAACT--
454 GATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGGGTAATCAACTAG
*
932392 GTACCAA-TTTTGGGTGCTTATGGGGGGTTATAATCCTTCCCCATGCGTAA-CGACTCCCGAATT
519 GTACCAATTTTTGGGTGCTTAT-GGGGGTTATAATCCTTCCCCACGCGTAACCGACTCCCGAATT
* * *
932455 TGATTTCTAGATTTTCGCATACCTTAAAACTTGGAATTTTGATAAAAGTAAAAT-GTTTTATTAA
583 TGATTTCTAGATTTTCGCATACCTTAAAACTTGGTATTTTGATAAAAATAAAATATTTTTATTAA
*
932519 AATCACCCAAT
648 AATCACCCGAT
*
932530 TTTTAT-GTGTCCCAATCGCACGTTAAATGATTGGTGGAGACTTCT-ATATTT-AAAAACCAAAT
1 TTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAAAT
932592 AGGGTTAATATTAGAA-CTACATTTCTAGGTTTGT-CCTTTAGG----TTAATTCTTAT-A-TCG
66 AGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTATAATTCG
*
932649 ACACTTTAGGAT--AGAGAGCCTTAAATCA-CCGTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTTG
131 ACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATCACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTTG
* * * *
932711 AGTG-A-TCTATTTTAAAACCTAAGGCAATGATC-CTTATTAGGAAATT-ACGGTATATCTCCTG
196 AGTGCATTTTATTTTAAAACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCTCCTG
* * *
932772 CAAGTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGCGATTCCCAAAATAGGTCGACATCTTTTTCAAATTCGC
261 CAAGTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATTCGC
* *
932837 ATCATTGTTTCTTAAAATCTAGGCAATA-TTGGTTATTAGGCAC-ATATCTAATATCTC--ATAT
326 ATCATTGTTTC-TAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGAAT-T
* *
932898 TATGCTA-GGGTGAATGCTATTAGCATTAAT-AACGAATA-TCTC-TTAACTTTACATCCGTAAT
389 TATGCTAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAATGAATACCCTCTTTAACTTTACATCCGTAAT
* * * *
932959 TA-TTT-AAATTAAATGAAGATCAAACTCAAAATTTTTG-TTTTAAATATAGGGTAATCAACTAG
454 GATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGGGTAATCAACTAG
* * *
933021 GTACCAA-TTTTGGGTGCTCATGGGGGTTATAATTCTTCCCCACGCGTAACCGACACCCGAATTT
519 GTACCAATTTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCCACGCGTAACCGACTCCCGAATTT
* *
933085 -ATTT-TAAGATTTTCGCATGCCTTAAAACTTGG-ATTTTGATAAAAA-AGAAA-AATTTTATTA
584 GATTTCT-AGATTTTCGCATACCTTAAAACTTGGTATTTTGATAAAAATA-AAATATTTTTATTA
*
933145 AAATCACCCAAT
647 AAATCACCCGAT
* * *
933157 TTTTATAGTGTCCCAATCGCA-CTTAAATGATTGGTGGACACTCCTCATATTTCAAAAACCAAAT
1 TTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAAAT
*
933221 AGGGTTGATATTAGAACCTACATTTCTAGGTTTGTG-CTTTAGGTTCTTTAATTC-TATAATTCG
66 AGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTATAATTCG
* * * * * *
933284 ATAC-TTAGGATAGAGAGGGCCTTAAATCACCCGT-G-TAATAATGA-GAATGAAAATTGGTTTG
131 ACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATCACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTTG
*
933345 AGTGAATTTTATTTT-AAACCTAAGGCAA--TTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCTCCTG
196 AGTGCATTTTATTTTAAAACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCTCCTG
* * * *
933407 CAAGTATGCTC--GGGTTCACTACTGGAGATT-CC-AAATAGGTCGACATCC-TTTCAAATTCGT
261 CAAGTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATTCGC
* *
933467 ATCATTGTTTCTAAAATC-AGGCAATA-TTGGTTATTAGG--CAATAGCTAATACCTCGCA-TTA
326 ATCATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGAATTTA
* *
933527 TGATA-GGGTGAATGCTATTAGCAATTAATAAACG-ATACCCTCTTTAACTTTACATCCGTAATG
391 TGCTAGGGGTGAATGCTATTAGC-ATTAATAAATGAATACCCTCTTTAACTTTACATCCGTAATG
*
933590 ATTTTC-AATTAAAT-AAGATC-AACTCAAAA-TTCTGATTTTAAATA-AAGGT-ATCAACTAGG
455 ATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGGGTAATCAACTAGG
* * * * * *
933649 TACCAATATTTGGGTGCTTATGGGGG-TA-ATTACTTCCCCACGTGTAACCGACTCCTGAATATG
520 TACCAATTTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCCACGCGTAACCGACTCCCGAATTTG
* *
933712 ATTTATAGATTTT--CATACCTTAAAACTT-GTATTTTGATAAAAA-AAAATGTTTTTATTAAAA
585 ATTTCTAGATTTTCGCATACCTTAAAACTTGGTATTTTGATAAAAATAAAATATTTTTATTAAAA
933773 TCA-CCGAT
650 TCACCCGAT
* * *
933781 TTTTATGGTGTCCCAATTGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCACATTTCAAAAGCCAAAT
1 TTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAAAT
* * * * * *
933846 -TGGTTACT-TCAGAACCTACATTTCTAGGTTTGTGAC-TTAGTTTC-TTAATTCTTATAATTAG
66 AGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTATAATTCG
* *
933907 CCACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATAACCCTT-GTTAATTAGGACGAATGAAAAATTTGTTT
131 ACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATCACCCTTGGTTAATTAGGACGAATG-AAAATTTGTTT
* *
933971 GAGTGCATTTT-TTTTAAAACCGAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCCCCT
195 GAGTGCATTTTATTTTAAAACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCTCCT
* *
934035 GCAAGTATGCTCCGGGGGTGGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTGAAATTC
260 GCAAGTATGCTCAGGGGGT-GACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATTC
*
934100 GCAT-A-AGTTTCTAAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGAAT
324 GCATCATTGTTTCT-AAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGAAT
*
934163 TTATGCTAGGGG-GAATGCTATTAGCATTAATAAACGAAT-CCCTCTTTAACTTTACATCCGTAA
388 TTATGCTAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAATGAATACCCTCTTTAACTTTACATCCGTAA
* *
934226 TGATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTACTGATTTT-AATATAAGGTAATCAACTA
453 TGATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGGGTAATCAACTA
* *
934290 GGTACCAA-TGTTGGGTGCTTAT-GGGGTTATAATCCTTCCCCACGCGTAACCGACTCCCAAATT
518 GGTACCAATTTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCCACGCGTAACCGACTCCCGAATT
* * *
934353 TGATTTCTAGATTTTCGCATACCTTAAAACTTGTTATTTTGATAAAAATAGAATACTTTTATTAA
583 TGATTTCTAGATTTTCGCATACCTTAAAACTTGGTATTTTGATAAAAATAAAATATTTTTATTAA
*
934418 AATCAGCCGAT
648 AATCACCCGAT
* * *
934429 TTTTATGGTGTCCCAA-CGCACCTTAAATGATTGGTGGAGGACTCCTCACATTTCAAAAACAAAA
1 TTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGA-GACTTCTCATATTTCAAAAACCAAA
* * *
934493 TAGGGTTAATATTAGAACTTACATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAAGTTCTTTAA-TCTCATAATTC
65 TAGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTATAATTC
* *
934557 GACCCTTTAGGATAGAGAGAG-CTTAAATCACTCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTT
130 GACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATCACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTT
**
934621 GAGTGCATTTTATTTTTAAAACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGAAAATTAATGGTATATCTCC
195 GAGTGCATTTTA-TTTTAAAACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCTCC
* **
934686 TGCAAGTATGCTCA-GGGATGACTACCAGTGATTCCC-AAATAGGT-GACAT-CTTTTCAAATTC
259 TGCAAGTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATTC
*
934747 GCATCATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCA-AATAGCTAATATCTCGCATT
324 GCATCATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGAATT
* * * *
934811 TATGATTGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAATGAACAACCTCTTTAACTTTACAT-CGTAAT
389 TATGCTAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAATGAATACCCTCTTTAACTTTACATCCGTAAT
*
934875 GATTTTCAAATT-AA-AAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGGGTAATTAACTAG
454 GATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGGGTAATCAACTAG
* * *
934938 GTACCAA-CTTTGGGTG-TTATGGGGGTTATAATCCTT--CCA-TCGTAACCGACTCCTGAA-TT
519 GTACCAATTTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCCACGCGTAACCGACTCCCGAATTT
* ** * * * *
934997 GATTTCTATATTTTTTTCACACCTTTAAAC-TGATATTTTGATAAAAAT-AAA-ATGTTTATTAA
584 GATTTCTAGA-TTTTCGCATACCTTAAAACTTGGTATTTTGATAAAAATAAAATATTTTTATTAA
935059 AATCACCCGATT
648 AATCACCCGA-T
* **
935071 TTTTATGGTG-CCCGAATCG---CTTTAATGATTGGTGGAGACTTCTCAT-TTTTTAAAACCAAA
1 TTTTATGGTGTCCC-AATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAAA
* *
935131 TTGGGTTAATATTA-AAACTACATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTATAATTC
65 TAGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTATAATTC
* *
935195 GAC-CTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATAACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTTTTT
130 GACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATCACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTT
*
935259 GAGTGCA-TTTATTTTAAGAACCTAAGGCAATGTTCACTTATTA-GGAATTAATGGTATATCCCC
195 GAGTGCATTTTATTTTAA-AACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCTCC
*
935322 TGCAAGTATGCTCA-GGGGTGACTACTGGTGATT-CCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATTT
259 TGCAAGTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATTC
* * *
935385 GCATAAATGTTTCTAAAATCGAGGCAA-ATTTGGTTATTA-ACACAATAGCTAATATCTCGAATT
324 GCATCATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGAATT
* * *
935448 TATGCTAGGGGTGAACGCTATTAGCATTAATAAACGAATACCCTCTTTAAAATTTA-ATCCGTAA
389 TATGCTAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAATGAATACCCTCTTT-AACTTTACATCCGTAA
* *
935512 TGA-TTTCAAA-TAAATAAAAATCAAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGGGTAATCAAACT
453 TGATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGGGTAATC-AACT
*
935575 AGGTACCAATTTTTGGGTGCTTATAGGGGTTATAATCCTT-CCCACGCGTAACCGACT-CCGAAT
517 AGGTACCAATTTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCCACGCGTAACCGACTCCCGAAT
* *
935638 TTGATTTCTAGATTTTCG-ATACATTAAAAC-TGGTTATTTTGATAAAAA-AAAAT-GTTTTATT
582 TTGATTTCTAGATTTTCGCATACCTTAAAACTTGG-TATTTTGATAAAAATAAAATATTTTTATT
935699 AAAATCA-CCGAT
646 AAAATCACCCGAT
935711 TTTTATGGTGTCCCAAATCGCACCTTAAATG-TTGGTGGAGAC-TCTC--ATTTCAAAAACCAAA
1 TTTTATGGTGTCCC-AATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAAA
* *
935772 TAGGGTTAATATTAGAA-CTATATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGG-TCTTTAATTCTCATAA-TC
65 TAGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTATAATTC
* * * *
935834 GGCCCTTTAGGATAGAGAGAGCTTTAAATCACTCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTT
130 GACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATCACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTT
* * **
935899 GAGAGCATTTTATTTTTTAAAACCTAAGGAAATGTTCACTTATTAGAAAATTAATGGTATATCTC
195 GAGTGCATTTTA--TTTTAAAACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCTC
* * ** * *
935964 CTGCAAGTATGCTCAGGGGATGACTTCCAGTGATTCCCGAAATAGGTTGACATACTTTTCAAATT
258 CTGCAAGTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATT
* * *
936029 CACATCATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGTAAAATAGCTAATATCTCGCAA
323 CGCATCATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCG-AA
* * * *
936094 -TTATGATAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAATGAACAACCTCTTTAACTTTACATTCGTA
387 TTTATGCTAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAATGAATACCCTCTTTAACTTTACATCCGTA
*
936158 ATGATTTTCAAATTAAAT-AAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGGGTAATTAA-T
452 ATGATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGGGTAATCAACT
* * *
936221 AGGTACC-ATTTTTGGGAGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCCATGCGTAACCGACTCCTGAAT
517 AGGTACCAATTTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCCACGCGTAACCGACTCCCGAAT
** * * * *
936285 TTGATTTCTAGATTTTTTTCACACCTTAAAACTTGATA-TTTGCTAAAAAT-AAA-AGTTTTATT
582 TTGATTTCTAGA-TTTTCGCATACCTTAAAACTTGGTATTTTGATAAAAATAAAATATTTTTATT
936347 AAAATCA-CCGA-
646 AAAATCACCCGAT
*
936358 TTTTATGGTGTCTCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAAAT
1 TTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAAAT
936423 AGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTATAATTCG
66 AGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTATAATTCG
* * * *
936488 ACATTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATAACCCTTTGTTAATTAGGACGAATG-AAATTTTTTTG
131 ACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATCACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTTG
* * *
936552 AGTGCATTTTATTTTAAGAACATAAGGCGATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCCCCT
196 AGTGCATTTTATTTTAA-AACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCTCCT
* * *
936617 GCAAGTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACGTCCTGTTCAAATTAG
260 GCAAGTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATTCG
* * * *
936682 CATAAATGTTTCTAAAATCGAGGTAATATTTGGTTATTAGGTACAATAGCTAATATCTCGAATTT
325 CATCATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGAATTT
* * * * * *
936747 ATGCTAGGGGTGAACGTTATTAGCTTTAATAAACGAATACCTTCTTTAAATTTACATCCGTAATG
390 ATGCTAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAATGAATACCCTCTTTAACTTTACATCCGTAATG
*
936812 ATTTTAAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGGGTAATCAACTAGG
455 ATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGGGTAATCAACTAGG
*
936877 TACCAATTGTTT-GGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCTCCACGCGTAACCGACTCCCGAATTT
520 TACCAATT-TTTGGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCCACGCGTAACCGACTCCCGAATTT
* * * * *
936941 GGTTTCTAGATTTTCGCATACCTTAAAACTTGGTAATTAGATAAAAAAAAAATGTTTTTATTAAA
584 GATTTCTAGATTTTCGCATACCTTAAAACTTGGTATTTTGATAAAAATAAAATATTTTTATTAAA
*
937006 ATCAGCCGA-
649 ATCACCCGAT
* * *
937015 TTTTATGGTGTCCC-ATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTCCTCACATTTCAAAAACAAAAT
1 TTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAAAT
* * *
937079 AGGG-TAATATTAGAA-CTATATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAAGTTCTTTAATTCTCATAATTCG
66 AGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTATAATTCG
* * *
937142 ACCCTTTAGGATAGAGAGAGCTTTAAATCACTCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTTG
131 ACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATCACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTTG
**
937207 AGTGCATTTTATTTTTAAAACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGAAAATTAATGGTATATCTCCT
196 AGTGCATTTTA-TTTTAAAACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCTCCT
* ** * *
937272 GCAAGTATGCTCAGGGGATGACTACCAGTGATTCCCGAAATAGGTTGACATACTTTTCAAATTCG
260 GCAAGTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATTCG
* *
937337 CATCATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCAAAATAGCTAATATCTCGCATTT
325 CATCATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGAATTT
* * * * *
937402 ATGATTGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAATGAACAACCTCTTTAACTTTACATTCGTAATG
390 ATGCTAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAATGAATACCCTCTTTAACTTTACATCCGTAATG
* *
937467 ATTTTCAAATTAAAAAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGGGTAATTAACTAGG
455 ATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGGGTAATCAACTAGG
* * * *
937532 TACCAACTTTTGGGTGTTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCCATGCGTAACCGACTCCTGAATTTG
520 TACCAATTTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCCACGCGTAACCGACTCCCGAATTTG
* ** * * *
937597 ATTTCTATATTTTTTTCACACCTTAAAACTTGATATTTTGATAAAAATAAAATGTTTTTATTAAA
585 ATTTCTAGA-TTTTCGCATACCTTAAAACTTGGTATTTTGATAAAAATAAAATATTTTTATTAAA
937662 ATCACCCGAT
649 ATCACCCGAT
* * *
937672 TTTTATGGTG-CCCGAATCGCACCTTTAATGATTGGTGGAGACTTCTCATTTTTTAAAAACCAAA
1 TTTTATGGTGTCCC-AATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAAA
* *
937736 TTGGGTTAATATTAAAACCTACATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTATAATTC
65 TAGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTATAATTC
* * *
937801 GACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATAACCCTTTGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTTTTT
130 GACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATCACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTT
* * *
937866 AAGTGCATTTTATTTTAAGAACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGAGAATTAATGGTATATCCCC
195 GAGTGCATTTTATTTTAA-AACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCTCC
* *
937931 TGCAAGTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTTCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATTT
259 TGCAAGTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATTC
* * *
937996 GCATAAATGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAAGCACAATAGCTAATATCTCGAATT
324 GCATCATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGAATT
* * *
938061 TATGCTAGGGGTGAACGCTATTAGCATTAATAAACG-ATACCCTC-TTAAATTTA-ATCCGTAAT
389 TATGCTAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAATGAATACCCTCTTTAACTTTACATCCGTAAT
* *
938123 GATTTTCAAATTAAATAAAAATCAAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGGGTAATCAACTAG
454 GATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGGGTAATCAACTAG
*
938188 GTACCAATTTTTGGGTGCTTATAGGGGTTATAATCCTTCCCCACGCGTAACCGACTCCCGAATTT
519 GTACCAATTTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCCACGCGTAACCGACTCCCGAATTT
* *
938253 GATTTCTAGATTTTCGCATACATTAAAACTTGTTATTTTGATAAAAATAAAAT-TTTTTATTAAA
584 GATTTCTAGATTTTCGCATACCTTAAAACTTGGTATTTTGATAAAAATAAAATATTTTTATTAAA
938317 ATCACCCGAT
649 ATCACCCGAT
*
938327 TTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATG-TTGGTGGAGAC-CCTC--ATTTC-AAAACCAAAT
1 TTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAAAT
* * * * *
938387 AGGGTTATTA-GAGAACTTATATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTCATAATTCG
66 AGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTATAATTCG
* * *
938451 ACCCTTTAGGATAGAGAGAGCTTTAAATCACTCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTTG
131 ACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATCACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTTG
* * **
938516 AGAGCATTTTATTTTTAAAACCTAAGGAAATGTTCACTTATTAGAAAATTAATGGTATATCT-C-
196 AGTGCATTTTA-TTTTAAAACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCTCCT
* * ** * * *
938579 -C-AGTATGCTCAGGGGATGACTTCCAGTGATTCCCGAAATAGGTTGACATACTTTTCAAA-TCA
260 GCAAGTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATTCG
* *
938641 CATCATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGTAAAATAGCTAATATCTCGCAA--
325 CATCATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCG-AATT
* * * **
938704 T-TGATAGGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAATGAACA-ACTCTTTAACTTTACATTTGTAA
389 TATGCTA-GGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAATGAATACCCTCTTTAACTTTACATCCGTAA
938767 TGATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGGGTAAT-AACTA
453 TGATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGGGTAATCAACTA
* *
938831 GGTACCAA-TTTTGGGAGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCCATGCGTAACCGACT-CCGAATT
518 GGTACCAATTTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCCACGCGTAACCGACTCCCGAATT
* ** * * * *
938894 TGATTTCCAGATTTTTTTC-CACCTTAAAACTTGATATTTTGCTAAAAATAAAATGTTTTTATTA
583 TGATTTCTAGA-TTTTCGCATACCTTAAAACTTGGTATTTTGATAAAAATAAAATATTTTTATTA
938958 AAATCACCCGAT
647 AAATCACCCGAT
* *
938970 TTTTATGGTGTCTCAATCGTACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAAAT
1 TTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAAAT
939035 AGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTATAATTCG
66 AGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTATAATTCG
* * *
939100 ACATTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATAACCCTTTGTTAATTA-G--GAATG-AAATTT-TTTG
131 ACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATCACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTTG
* *
939160 AGTGCATTTTATTTTAAGAACATAAGGCGATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATC-CCT
196 AGTGCATTTTATTTTAA-AACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCTCCT
* * *
939224 GCAAGTATGCTCA-GGGTTGACTACT-G-GATTCCCGAAATAGGTCG--A-CCTGTTCAAATTAG
260 GCAAGTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATTCG
* * * *
939283 CATAAATGTTTCTAAAATCGAGGTAATATTTGGTTATTAGGTACAATAGCTAATATCTCGAATTT
325 CATCATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGAATTT
* * * *
939348 ATGCTAGGGGTGAACGCTATTAGCTTTAATAAACGAATACCTTCTTTAACTTTACATCCGTAATG
390 ATGCTAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAATGAATACCCTCTTTAACTTTACATCCGTAATG
*
939413 ATTTTAAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGGGTAATCAACTAGG
455 ATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGGGTAATCAACTAGG
*
939478 TACCAATTGTTT-GGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCTCCACGCGTAACCGACTCCCGAATTT
520 TACCAATT-TTTGGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCCACGCGTAACCGACTCCCGAATTT
* * * * *
939542 GGTTTCTAGATTTTCGCATACCTTAAAACTTGGTAATTAGATAAAAAAAAAGAATGTTTTTATTA
584 GATTTCTAGATTTTCGCATACCTTAAAACTTGGTATTTTGAT-AAAAATAA-AATATTTTTATTA
*
939607 AAATCAGCCGAT
647 AAATCACCCGAT
* *
939619 TTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTCCTCACATTTCAAAAACCAAAT
1 TTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAAAT
* * *
939684 AGGGTTAATATTAGAACTTACATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTCATAATTTG
66 AGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTATAATTCG
* * * *
939749 ACCCTTTAGGATAGAGAGAGCTTTAAATCACTCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTGTG
131 ACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATCACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTTG
* *
939814 AGTGCATTTTATTTTTAAAAACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATGTCT
196 AGTGCATTTTA-TTTT-AAAACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCTCC
* * * * *
939879 TGCAAGTATTCTCAGGTGGTGACTACTTGTGATTCCCGAAATAGGTCGGCATCTTTTTCAAATTC
259 TGCAAGTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATTC
* * *
939944 GCATCATTGTTTCAAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAACTAATATCTTGCAA-
324 GCATCATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCG-AAT
* * * * *
940008 -TATTCTAGGGATGAATGCTATTAGCATTAAT-AATGAATACCCTTTTTCACTCTA-ATTCCGTA
388 TTATGCTAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAATGAATACCCTCTTTAACTTTACA-TCCGTA
*
940070 ATGATTTTCAAATT-AATTAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGGGTAATCAACT
452 ATGATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGGGTAATCAACT
* * ** *
940134 AGGTACTAATTTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATAGTCCGCCCCCACTG-ATAACCGACTCCCGAA
517 AGGTACCAATTTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCCAC-GCGTAACCGACTCCCGAA
* * *
940198 TTTGATTTCTAGATTTTCGCATACCTTGAAAGTTGGTATTTTGATAAAAATAAAATGTTTTTATT
581 TTTGATTTCTAGATTTTCGCATACCTTAAAACTTGGTATTTTGATAAAAATAAAATATTTTTATT
940263 AAAATCACCCGAT
646 AAAATCACCCGAT
* * * **
940276 TTTTATGGTGTCCCAATCACACCTTAAATGATTAGAGGAGACTTCTCATATTTCAAAAATAAAAT
1 TTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAAAT
*
940341 AGGGTTAATATTAGAACCTATATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTATAATTCG
66 AGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTATAATTCG
*
940406 ACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATCACCCTTCGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTTG
131 ACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATCACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTTG
* *
940471 TGAGCA-TTTATTTTAAGAACCTAA-G----G--CA---A-T---G--TTAA---T-TA--T--T
196 AGTGCATTTTATTTTAA-AACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCTCCT
* *
940511 ---AG---G----GGGGGTGAAT-CTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATTCA
260 GCAAGTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATTCG
* * *
940565 CATCA-TGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTT-TTAGGCA-AATGGCTAAGATCTCGCATTT
325 CATCATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGAATTT
*
940627 ATGCTAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAAT-AATGAATACCCT-TTTCAA-TTTA-ATCCATAAT
390 ATGCTAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAATGAATACCCTCTTT-AACTTTACATCCGTAAT
*
940688 GA-TTT-AAATTAAAT-AAGATCGAACTCAAAAGTTCTGATTTT---TATAGGGTAATCAACTAG
454 GATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGGGTAATCAACTAG
* * * * * *
940747 GTACCATTTTTTTGGTGCTTATGGGGGTTAGAATCCTTCCCCACGCGTATCCGACTCTCAAATTT
519 GTACCAATTTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCCACGCGTAACCGACTCCCGAATTT
* * * *
940812 GATTTCTAGATTTTCGCAAACCTTAAAACTTGGCATTTTGA-AAGAAATAATATGTTTTTATTAA
584 GATTTCTAGATTTTCGCATACCTTAAAACTTGGTATTTTGATAA-AAATAAAATATTTTTATTAA
*
940876 AATCACCC-AA
648 AATCACCCGAT
* * * *
940886 TTTTATGGTGTCTCAATCGTACCTTAAATGATTGGTGGAGGCTTCTCACATTTCAAAAACCAAAC
1 TTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAAA-
* *
940951 T-GGGTT-ATATTAGAACCTACATTTTTTTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTAAAAT
65 TAGGGTTAATATTAGAACCTACA--TTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTATAAT
* * *
941014 TCGACACTTTATGATAGAGAAAGCCTT-AATCACCCTTGG-TAATTAGGACAAATGAAAATTTG-
128 TCGACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATCACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGT
* * *
941076 TTGAGTGCATTTTATTTTTAAAA-CTAAGGTAATGTTCCCTTATTA-GGAATTAACGGTATA--T
193 TTGAGTGCATTTTA-TTTTAAAACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCT
* *
941137 -CTGCAAGTATGCTCA--GGGTGACTACTGGAGATTCCCTAAATAGGTCGACAT-CTTTTCAAAT
257 CCTGCAAGTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAAT
* * * *
941198 TCGTATCATTGTTTCTAAAATCGAGCCAATAATTGG-TATTAGGCACAATAGCTAATA-CTCGCA
322 TCGCATCATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGAA
*
941261 TTT-TGCTAGGGGTGAATACTATTAGCATTAATAAATGAATACCCTCTTTAACTTTACATCCGTA
387 TTTATGCTAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAATGAATACCCTCTTTAACTTTACATCCGTA
* *
941325 ATGATTTTCAAATT-AATAAAGATCGAACTCAAAATAT-T--TTTTAAATATAGAGTAATC-ACT
452 ATGATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGGGTAATCAACT
**
941385 AGGTA-CAATTTTTGGGTGCTTAT-GGGGTTATAATCCTTCCCCAATCGTAACCGACTCCCGAAT
517 AGGTACCAATTTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCCACGCGTAACCGACTCCCGAAT
* * * * *
941448 TTGATTTCTAGATTTTCGCATACCTTAAAA-ATAGTAGTTTGATAAAAAGAAAATGTTTTTA-TA
582 TTGATTTCTAGATTTTCGCATACCTTAAAACTTGGTATTTTGATAAAAATAAAATATTTTTATTA
941511 AAATCACCC-A-
647 AAATCACCCGAT
* * *
941521 ---T-TGGTGT--CAATGGCACCTTAAATGATTGGTGGAGGCTTCTCACATTTCAAAAA-CAAAT
1 TTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAAAT
* *
941579 AGGGTTAATATTAGAA---ACATTTCTATGTTTGTGCCTTTAGGTTC-TTAACTCTTATAATTCG
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* * *
941640 ACACTTTAGGATAGATAGAGCCTTAAATAACCCTT-GTTAATTTGGACGAATGAAAATTTGTTTG
131 ACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATCACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTTG
941704 AGTGCATTTTA-TTTAAGAACCTAAGGCA
196 AGTGCATTTTATTTTAA-AACCTAAGGCA
941732 GGTCGACATC
Statistics
Matches: 35237, Mismatches: 4286, Indels: 3641
0.82 0.10 0.08
Matches are distributed among these distances:
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785 9 0.00
ACGTcount: A:0.32, C:0.16, G:0.16, T:0.36
Consensus pattern (658 bp):
TTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAAAT
AGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTATAATTCG
ACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATCACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTTG
AGTGCATTTTATTTTAAAACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCTCCTG
CAAGTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATTCGC
ATCATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGAATTTA
TGCTAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAATGAATACCCTCTTTAACTTTACATCCGTAATGA
TTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGGGTAATCAACTAGGT
ACCAATTTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCCACGCGTAACCGACTCCCGAATTTGA
TTTCTAGATTTTCGCATACCTTAAAACTTGGTATTTTGATAAAAATAAAATATTTTTATTAAAAT
CACCCGAT
Found at i:919110 original size:141 final size:141
Alignment explanation
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Period size: 141 Copynumber: 2.0 Consensus size: 141
918845 TTTGCATACA
* * *
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* *
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* *
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1 TTAAAAATTGGTATTTTGATAAAAATAAATATTTGTT-TTAAAATCACCCGAATTTTATGGTGTC
* *
919061 CCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAAATAGGGTTAATATT
65 CCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTCCTCACATTTCAAAAACCAAATAGGGTTAATATT
*
919126 AGAACCTATATT
130 AGAACCTACATT
919138 T
1 T
919139 CTAGGTTTGT
Statistics
Matches: 131, Mismatches: 10, Indels: 3
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141 98 0.75
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ACGTcount: A:0.36, C:0.14, G:0.13, T:0.37
Consensus pattern (141 bp):
TTAAAAATTGGTATTTTGATAAAAATAAATATTTGTTTTAAAATCACCCGAATTTTATGGTGTCC
CAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTCCTCACATTTCAAAAACCAAATAGGGTTAATATTA
GAACCTACATT
Found at i:945525 original size:649 final size:644
Alignment explanation
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Period size: 649 Copynumber: 7.9 Consensus size: 644
941721 AACCTAAGGC
* * *
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* * **
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130 TCTTTAACTTTACATCCGTAATGATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTT
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* * * * * * * *
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257 GCGT-ACCGAGTCCCGAATTTGATTTCTAG-ATTTTCGCATACCTTAAAACATGGTAGTTTGATA
* *
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320 AAAAAA-ATGTTTTATTAAAATCACCCGAATTTTTTGGTGTCCTAATCGCACCTTAAATGATTGG
* *
942099 TGGAGACTTCTCACATTT--AGAA--AAATAGGGTTAATATTAGAA-CTACATTTCTATGTTTGT
384 TGGAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAAATAGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTATGTTTGT
* * * * *
942159 GGCTTTAGGTAC-TTAA-TTATATAATT---TAC-TTAGGATAGAGAGAGCCTTAAA-GA-CCTT
449 GCCTTTAGGTTCTTTAATTTTTATAATTCGACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATCACCCTT
* *
942216 GG-TAATTAGGACAAATGAAAATTTGTTT--GTGCATTTATTTTTAAAACCTAAGGCAATGTTCA
514 GGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTTGAGTGCATTTATTTTTAAAACCTAAGGCAATATTCA
* *
942278 CTTATTAGGGAATTAAT-GTATATCTCTTGCAGGTATG--C--GGG-GACTACT-GTGATTCCCG
579 C-T-TTA-GGAATTAATGGTATATCTCCTGCAAGTATGCTCAGGGGTGACTACTGGTGATTCCCG
942336 AAAT
641 AAAT
* * * *
942340 AGGTCGATATCCTTTTCAAATTTG--TAATTGTTTCTAAATAGAGGC-ATA-TTGGTTATTAGGC
1 AGGTCGACATCCTTTTCAAATTCGCATCATTGTTTCTAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGC
* * * *
942401 ACAATAGCT-ATATCTCGCATTTATGCTAGGGATGAATGCCATTAGCATT-ATAAATGATACCCT
66 ACAATAGCTAATATCTCGCATTTATGCCAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAACGATACCCT
* *
942464 -TTT---TTTA-ATTCTGTAATGATTTTCAAA-T-AATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGGTTT
131 CTTTAACTTTACA-TCCGTAATGATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTT
* * *
942522 TAAATATAGGGTAATAAACTAGGAACCAATTTTTAGGTGCTTATGGGGTTATAATCCTTCCC-A-
195 TAAATATAGGGTAATCAACTAGGTACCAATTTTTGGGTGCTTATGGGG-T-TAATCCTTCCCAAG
* * * * *
942585 CGTAAC-AGACTCCGAATTTGATTTCTAGATTTTAGCATACC-TAAAAC-TTGTAATTTTGATAA
258 CGTACCGAGTC-CCGAATTTGATTTCTAGATTTTCGCATACCTTAAAACATGGT-AGTTTGATAA
* * *
942647 AAAAAATGTTTTATTAAAATCACCC-AATTTTATGGTATCCTAATCGCACGTTAAATGATTGGTG
321 AAAAAATGTTTTATTAAAATCACCCGAATTTTTTGGTGTCCTAATCGCACCTTAAATGATTGGTG
*
942711 GAGACTTCTCATATTTCAAAAACC-AATAGGGTT-ATATTAGAACCTATATTTCTATG-TTGTGC
386 GAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAAATAGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTATGTTTGTGC
942773 C-TTAGGTTCTTTAATTTTTATAATTCGACACTTTAGGAT--AGAGAGCCTTAAATCACCCTTGG
451 CTTTAGGTTCTTTAATTTTTATAATTCGACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATCACCCTTGG
* * *
942835 TTAATTAGGATGAAAG-AAATTTG--T--GTGCATTTTATTTTTAAAACCTAAGGCAATGTTCAC
516 TTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTTGAGTGCA-TTTATTTTTAAAACCTAAGGCAATATTCAC
* ** * *
942895 TTATTAGGGAATTAATGATATA-CTCCAACAAGTATGC-CCGGGGT-A-AACTGGTGATTCCCGA
580 -T-TTA-GGAATTAATGGTATATCTCCTGCAAGTATGCTCAGGGGTGACTACTGGTGATTCCCGA
942956 AAT
642 AAT
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1 AGGTCGACATCCTTTTCAAATTCGCATCATTGTTTCT-AAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGG
* *
943021 TAC-ATAGCTAATATCTCGCATTTATGCCAGGGGTG-ATGCTATTATCATT-ATAAACGA-ACCC
65 CACAATAGCTAATATCTCGCATTTATGCCAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAACGATACCC
*
943082 TCTTTAACTTTACATCCGTAATGATTTTTAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGA-TT
130 TCTTTAACTTTACATCCGTAATGATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTT
*
943146 T-AA-ATAGGGT-ATCAACTAGGT----ATGTTTGGGTGCTTATGGGGGTT-ATCCTTCCCAAGC
195 TAAATATAGGGTAATCAACTAGGTACCAATTTTTGGGTGCTTAT-GGGGTTAATCCTTCCCAAGC
943203 GTATCCGAGT-CCGAA-TTGATTTCTAGA-TTTCGCATACCTTAAAACATGGTAGTTTGAT--AA
259 GTA-CCGAGTCCCGAATTTGATTTCTAGATTTTCGCATACCTTAAAACATGGTAGTTTGATAAAA
* *
943263 AAAATG-TTTATTAAAATGA-CCG-ATTTTTTGGTGTCCTAATGGCACCTTAAATGATTGGTGGA
323 AAAATGTTTTATTAAAATCACCCGAATTTTTTGGTGTCCTAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGA
* * * * *
943325 G-GTTCTCACATTTC-AAAACCAAACA-GG-TAATATTAG-ACCAACATTTCTATATTTGTGCCT
388 GACTTCTCATATTTCAAAAACCAAATAGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTATGTTTGTGCCT
* * *
943385 TTAGGTT-TTTAA-CTTTATAATTCGACACTTTAGGATAGAGAGAGCC-TAAATAAACCTTGGTT
453 TTAGGTTCTTTAATTTTTATAATTCGACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATCACCCTTGGTT
* *
943447 AATTAGGACGAATGAAAATTTGATTGAGTGCATTTA-TTTTAAGAACCTAAGGCAA-GTTCACTT
518 AATTAGGACGAATGAAAATTTGTTTGAGTGCATTTATTTTTAA-AACCTAAGGCAATATTCAC-T
*
943510 ATTAGGGAATTAATGGTATATC-CC-CCAAGTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAA
581 -TTA-GGAATTAATGGTATATCTCCTGCAAGTATGCTCA-GGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAA
943573 AT
643 AT
* * * *
943575 AGGTCGACATCCTTTT-AAATTCGCATCAATATTTCTAAATCGAGGCTATA-TTAGTTATTAGGC
1 AGGTCGACATCCTTTTCAAATTCGCATCATTGTTTCTAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGC
* * * *
943638 ACAATAGCTAATATCTCG-AATTATGCTAGGGGAGAACGCTATTAGCA-TAATAAACGA-A-CCT
66 ACAATAGCTAATATCTCGCATTTATGCCAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAACGATACCCT
*
943699 C-TTAACTTTACATCCGTAATGATTTTCAAATTAAATAAAGATCAAACTC-AAATTT-TGATTTT
131 CTTTAACTTTACATCCGTAATGATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTT
* * *
943761 AAATATAGAGTAATCAACTAGGTACCAATTTTTGGGTGCTCATGGGGGTTAAT--TTCCCCATGC
196 AAATATAGGGTAATCAACTAGGTACCAATTTTTGGGTGCTTAT-GGGGTTAATCCTT-CCCAAGC
* * ** * * *
943824 GTAACGACTCTTGAATTTGATTTCTAGAATTTT-ACACACCTTAAAACTTGGTA---TGATAAAA
259 GTACCGAGTCCCGAATTTGATTTCTAG-ATTTTCGCATACCTTAAAACATGGTAGTTTGATAAAA
* * * * *
943885 TAAAATATTTTTATTAAAATTACCCG-ATTTTTATGGTGTCCCAATCGCACATTAAGTGATTGGT
323 -AAAAT-GTTTTATTAAAATCACCCGAATTTTT-TGGTGTCCTAATCGCACCTTAAATGATTGGT
* * * * * *
943949 GGAGACTCCTCAGATTTCGAAAACCAAATTGGGTT-A-A-TAGAACTTACATTTCTATGCTTGTG
385 GGAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAAATAGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTATGTTTGTG
* ** *
944011 CCTTTAGGTTCTTTAATTATTAT-ATTTTACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAAGCACCCTTG
450 CCTTTAGGTTCTTTAATTTTTATAATTCGACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATCACCCTTG
*
944075 GTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTTGAGTGCATTTTATTTTTAAAA-CTAAGGCAATGTTCA
515 GTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTTGAGTGCA-TTTATTTTTAAAACCTAAGGCAATATTCA
* * * **
944139 CTTATTAGGGAATTAATGGTATATCTCTTGCAAGTATGCCCAAGAATGACTACTGGTGATTCCCG
579 C-T-TTA-GGAATTAATGGTATATCTCCTGCAAGTATGCTCAGGGGTGACTACTGGTGATTCCCG
944204 AAAT
641 AAAT
*
944208 AGGTCGATATCCTTTTC-AATTCGCATCATTGTTTCTAAATCGAGGCAAT-TTTGGTTATTAGGC
1 AGGTCGACATCCTTTTCAAATTCGCATCATTGTTTCTAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGC
* * * * *
944271 ACAATAGCTAATATCTCGCATTTATGCTAGGGATAAATGCCATTAGCATTAAT-AATGATACCCT
66 ACAATAGCTAATATCTCGCATTTATGCCAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAACGATACCCT
* * * *
944335 TTTTCACTTTA-ATTCCGTAATG-TTTTCAAATTCAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGGTTT
131 CTTTAACTTTACA-TCCGTAATGATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTT
* * * **
944398 TAAATATAGGGTAATAAACTTGGAACCAA-TTTTGGGTGCTTATGGGGTTAATCCTTCCCCACTC
195 TAAATATAGGGTAATCAACTAGGTACCAATTTTTGGGTGCTTATGGGGTTAATCCTT-CCCAAGC
* * * *
944462 GTAACCGACTCCAGAATTTGATTTCTAGATTTTCGCATACCTTAAAAC-TTGTAATTTGATAAAA
259 GT-ACCGAGTCCCGAATTTGATTTCTAGATTTTCGCATACCTTAAAACATGGTAGTTTGAT-AAA
* * * *
944526 ATAAAATGTTTTTATTAAAATTACCC-AATTATTATGGTGTCCCAATCGCACGTT-AA--ATTGG
322 A-AAAATG-TTTTATTAAAATCACCCGAATT-TTTTGGTGTCCTAATCGCACCTTAAATGATTGG
*
944587 TGGAGACTTCTCATATTTC-AAAACCAAATA-GG-T--TATTAGAACCTATATTTCTATGTTTGT
384 TGGAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAAATAGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTATGTTTGT
*
944647 GCCTTTAGGTTCTTTAA-TTTTATAATTCGATACTTTAGGATAGAGAGAGCCTT-AA--ACCCTT
449 GCCTTTAGGTTCTTTAATTTTTATAATTCGACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATCACCCTT
* * *
944708 GGTTAATTAGGATGAAAGAAAATTTGTTTGTGTGCATTTA-TTTTAAAACCTAAGGCAATATTCA
514 GGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTTGAGTGCATTTATTTTTAAAACCTAAGGCAATATTCA
* *
944772 CTTATTAGGGAATTAATGATATATCTCCTGCAAGTATGCTCAGGGGTAACTACTGGTGATTCCCG
579 C-T-TTA-GGAATTAATGGTATATCTCCTGCAAGTATGCTCAGGGGTGACTACTGGTGATTCCCG
944837 AAAT
641 AAAT
*
944841 AGGTCGACATCCTTTTCAAATTCACATCA-TGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGG
1 AGGTCGACATCCTTTTCAAATTCGCATCATTGTTTCT-AAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGG
* * *
944905 CACAATAGCTAATATCTCACATTTATGCCATGGGTGAATGCTATTATCATTAATAAACGAATACC
65 CACAATAGCTAATATCTCGCATTTATGCCAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAACG-ATACC
* *
944970 CACTTTAACTTTACATCCGTAATTATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTT-TGATT
129 CTCTTTAACTTTACATCCGTAATGATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATT
* * * *
945034 TTAAATATAGGGTAATCAACTAGGTATCGATTTTTAGGTGCTTATGGGGGTTATAATCTTTCCCC
194 TTAAATATAGGGTAATCAACTAGGTACCAATTTTTGGGTGCTTAT-GGGG-T-TAATCCTT-CCC
*
945099 AAGCGTACCGAGTCCCGAATTTGATTTCTAGATTTTCGCATACCTTAAAAGATGGTAGTTTGATA
255 AAGCGTACCGAGTCCCGAATTTGATTTCTAGATTTTCGCATACCTTAAAACATGGTAGTTTGAT-
* *
945164 AAAAGAAAATGTTTTTACTAAAATCACCCGAATTTTTTGGTGTCCTAATAGCACCTTAAATGATT
319 AAAA-AAAATG-TTTTATTAAAATCACCCGAATTTTTTGGTGTCCTAATCGCACCTTAAATGATT
* *
945229 GGTGGAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAAATAGGGTTAATATTAGAACCTATACTTCTATGTTT
382 GGTGGAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAAATAGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTATGTTT
* * * *
945294 GTGCCATTAGGTTCTTTAGTTTTTATAATTTG-CACTTTAGGATAGAGAGGGCCTTAAATCACCC
447 GTGCCTTTAGGTTCTTTAATTTTTATAATTCGACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATCACCC
* * * *
945358 TTGGTTAATTAGAACGAATG-AAATTTGTTTGAGTGCATTTATTTTTAAAACTTCAGGCAGTATT
512 TTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTTGAGTGCATTTATTTTTAAAACCTAAGGCAATATT
*
945422 CAC-TTA-GAATTAATGGTATATCTCCTGTAAGTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCCCG
577 CACTTTAGGAATTAATGGTATATCTCCTGCAAGTATGCTCA-GGGGTGACTACTGGTGATTCCCG
945485 AAAT
641 AAAT
945489 AGGTCGACATCCTTTTCAAATTCGCATCATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGG
1 AGGTCGACATCCTTTTCAAATTCGCATCATTGTTTCT-AAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGG
945554 CACAATAGCTAATATCTCGCATTTATGCCAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAACGAATACC
65 CACAATAGCTAATATCTCGCATTTATGCCAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAACG-ATACC
*
945619 CTCTTTAACTTTACATCCGTAATGATTTTCAAATTAAATTAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATT
129 CTCTTTAACTTTACATCCGTAATGATTTTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATT
* * * *
945684 TTAAATATAGGGTAATCAACTAGGTATCAATTTTTAGGAGCTTATGGGGTTAATCTTTCCCAAGC
194 TTAAATATAGGGTAATCAACTAGGTACCAATTTTTGGGTGCTTATGGGGTTAATCCTTCCCAAGC
945749 GTAACCGAGTCCCGAATTTGATTTCTAGA-TTT-GCATACCTT-AAACATGGTAG-TTGATAAAA
259 GT-ACCGAGTCCCGAATTTGATTTCTAGATTTTCGCATACCTTAAAACATGGTAGTTTGAT-AAA
* * *
945810 AGAAAATGTTTTACTAAAATCACCCAAATTTTTTGGTGTCCTAATCGAACCTTAAATGATTGGTG
322 A-AAAATGTTTTATTAAAATCACCCGAATTTTTTGGTGTCCTAATCGCACCTTAAATGATTGGTG
945875 GAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAAATAGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTATGTTTGTGC
386 GAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAAATAGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTATGTTTGTGC
* *
945940 CGTTAGGTTCTTTAATTTTTATAATTCGACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATCACCTTTGG
451 CTTTAGGTTCTTTAATTTTTATAATTCGACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATCACCCTTGG
* * * *
946005 TTAATTAGGATGAAAGAAAATTTGTTTGAGTGCATTTTTTTTTAAAACCTAAGGCAATGTTCACT
516 TTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTTGAGTGCATTTATTTTTAAAACCTAAGGCAATATTCAC-
* *
946070 TATTAGGGAATTAATGATATATCTCCTGCAAGTATGCTCAGGGGGTAACTACTGGTGATTCCCGA
580 T-TTA-GGAATTAATGGTATATCTCCTGCAAGTATGCTCA-GGGGTGACTACTGGTGATTCCCGA
946135 AAT
642 AAT
* *
946138 AGGTCGACATCCTTTTCAAATTTGCATCATTGTTTCTAAAATCGAAGCAATATTTGGTTATTAGG
1 AGGTCGACATCCTTTTCAAATTCGCATCATTGTTTCT-AAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGG
*
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* *
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*
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* *
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*
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* *
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* *
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* * * *
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* *
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* *
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*
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* * * * * *
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* * * * *
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* *
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*
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* * * *
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* *
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* *
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* *
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*
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* *
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** * ** * *
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* * * * * * *
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* * * * * *
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* *
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* * * * * *
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* * *
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* *
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* * * * *
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*
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*
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* *
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* * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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*
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* * *
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* *
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**
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*
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* * * *
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*
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*
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* **
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* * * *
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* *
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* * *
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*
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* * * * *
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* *
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* * *
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** * * *
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*
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* * *
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*
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* *
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**
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* * * * *
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* ** *
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** * * * * * * * * ** *
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* * ** * ** * * * *
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* ** * * *
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* *
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* ** *
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* *
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* * * * * * *
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66 ATCATTCCCCAAGCGTAACCGACTCCCGAATTTGATTTCTAGATTTTCGCATACCTTAAAACATG
* *
952106 GAATTTTGATAAAAA-ATAAATTTTTTTTATTAAAATCACCCAATTTTTATGGTGTCCCAATCGC
131 GTATTTTGATAAAAAGA-AAA-TGTTTTTATTAAAATCACCCAATTTTTATGGTGTCCCAATCGC
* *
952170 ACGTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAAATAGGGTTATTATTAGAACCTA
194 ACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAAATAGGGTTAATATTAGAACCTA
* * *
952235 CATTTCTATGTTTGTGCCATTAGGTTCTTCAATTTTTATAATTCGACACTTTAGGATAGAGAGAT
259 CATTTCTATGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTTTTATAATTCGACACTTTAGGATAGAGAGAG
* * * * *
952300 CCTTAAATGACCCTTGGTTAATTAGGATGAAAGAAAATTTGTTTGTGTGAATTTTATTTTTAAAA
324 CCTTAAATCACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTTGAGTGCATTTTATTTTTAAAA
* * * *
952365 CCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGATATATCTCCTGCAAGTATGCTCAGGGGGTA
389 CTTAAGGCAATATTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCTCCTGCAAGTATGCTCAGGGGGTG
*
952430 ACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGCCGACATCCTTTTCAAATTCGCATCATTGTTTCTAAAATCG
454 ACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATTCGCATCATTGTTTCTAAAATCG
*
952495 AGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGCATTTATGCCAGGGGTGAATGCTAT
519 AGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGCATTTATGCTAGGGGTGAATGCTAT
*
952560 TAGCATTAATAAACGAATACCCTCTTTAACTTTACATCCGTAATGATTTTCAAATTAAATTAAGA
584 TAGCATTAATAAACGAATACCCTCTTTAACTTTACATCCGTAATGATTTTCAAATTAAATAAAGA
952625 TCGAACTCAAA
649 TCGAACTCAAA
* * *
952636 ATTTCTAATTTTAAATATAGGGTAATCAACTAGGTACCAATTATTGGGTGCTTATAGGGGTTATA
1 ATTTCTGATTTTAAATATAGGGTAATCAACTAGGTACCAATTTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATA
* * * *
952701 ATCCTTCCCCAAGCATTACCGAGTCCCGAATTTGATTTCTAGATTTTCGCATACCTTAAAACATG
66 ATCATTCCCCAAGCGTAACCGACTCCCGAATTTGATTTCTAGATTTTCGCATACCTTAAAACATG
* *
952766 GTAGTTTGATAAAAAGAAAATGTTTTTATTAAAATCACCCGAA-TTTT-TGGTGTCCTAATCGCA
131 GTATTTTGATAAAAAGAAAATGTTTTTATTAAAATCACCC-AATTTTTATGGTGTCCCAATCGCA
*
952829 CCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAATTAGGGTTAATATTAGAACCTAC
195 CCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAAATAGGGTTAATATTAGAACCTAC
* *
952894 ATTTCTATGTTTGTGCCGTTAGGTTCTTTAATTTTTATAATTCGACACTTTAGGATAGAGAGAGT
260 ATTTCTATGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTTTTATAATTCGACACTTTAGGATAGAGAGAGC
* * * * * *
952959 TTTAAATCACCCTTGGTTAATTACGATGAAAGAAAATTTGTTTGTGCGCATTTTATTTTTAAAAC
325 CTTAAATCACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTTGAGTGCATTTTATTTTTAAAAC
* * * * * * *
953024 CTAAGGCAATGTTCACTTATCAGGGAATTAATGATATATCTCATGCAAGTATGCCCAGGGGGTAA
390 TTAAGGCAATATTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCTCCTGCAAGTATGCTCAGGGGGTGA
* *
953089 CTACTGGTGATTTCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATTCGCATCATTGTTTCTAAAATAGA
455 CTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATTCGCATCATTGTTTCTAAAATCGA
* *
953154 GGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGCATTTATGCCACGGGTGAATGCTATT
520 GGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGCATTTATGCTAGGGGTGAATGCTATT
953219 AGCATTAATAAACGAATACCCTCTTTAACTTTACATCCGTAATGATTTTCAAATTAAATAAAGAT
585 AGCATTAATAAACGAATACCCTCTTTAACTTTACATCCGTAATGATTTTCAAATTAAATAAAGAT
953284 CGAACTCAAA
650 CGAACTCAAA
* *
953294 ATTTCTGATTTTAAATATAGGGTAATCAACTAGGTATCAATTTTTGGGTGCTTTTGGGGGTTATA
1 ATTTCTGATTTTAAATATAGGGTAATCAACTAGGTACCAATTTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATA
* *
953359 ATCCTTCCCCAAGCGTAACCGAGTCCCGAATTTGATTTCTAGATTTTCGCATACCTTAAAACATG
66 ATCATTCCCCAAGCGTAACCGACTCCCGAATTTGATTTCTAGATTTTCGCATACCTTAAAACATG
* * * *
953424 GTAGTTTGATAAAAAGATAATATTTTTATT-AAA-CACCCAAATTTTT-TGGTGTCCTAATCGCA
131 GTATTTTGATAAAAAGAAAATGTTTTTATTAAAATCACCC-AATTTTTATGGTGTCCCAATCGCA
** *
953486 CCTTAAATGATTGGTTAAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAAATAGGGTTAATATTAGAACTTAC
195 CCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAAATAGGGTTAATATTAGAACCTAC
**
953551 ATTTAAATGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTTTTATAATTCGACACTTTAGGATAGAGAGAGC
260 ATTTCTATGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTTTTATAATTCGACACTTTAGGATAGAGAGAGC
953616 CTTAAATCACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTTGAGTGCATTTTATTTTTAAAAC
325 CTTAAATCACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTTGAGTGCATTTTATTTTTAAAAC
*
953681 TTAAGGCAATATTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCTCCTGTAAGTATGCTCAGGGGGTGA
390 TTAAGGCAATATTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCTCCTGCAAGTATGCTCAGGGGGTGA
* *
953746 CTACTTGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATTCGTATCATTGTTTCTAAAATCGA
455 CTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATTCGCATCATTGTTTCTAAAATCGA
* *
953811 GGCAATATTTAGTTATTAGGCACAATAGCTAATA-CTTCGCATTTATGCTAGGGGTGAATACTAT
520 GGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATC-TCGCATTTATGCTAGGGGTGAATGCTAT
* * *
953875 TAGCATTAATAAATGAATACCCTCTTTAAATATACATCCGTAATGATTTTCAAATTAAATAAAGA
584 TAGCATTAATAAACGAATACCCTCTTTAACTTTACATCCGTAATGATTTTCAAATTAAATAAAGA
**
953940 TTAAACTCAAA
649 TCGAACTCAAA
* * * *
953951 ATTTATGATTTTAAGTATAGGGTAATCAACTAGGTA-CAATATTTTGGGTGCTTA-CGGGGTTAA
1 ATTTCTGATTTTAAATATAGGGTAATCAACTAGGTACCAAT-TTTTGGGTGCTTATGGGGGTTAT
*
954014 AATCATTCCCCAAGCTTAACCGACTCCCGAATTTGATTTCTAGATTTTCGCATACCTTAAAACAT
65 AATCATTCCCCAAGCGTAACCGACTCCCGAATTTGATTTCTAGATTTTCGCATACCTTAAAACAT
* * * *
954079 GGTATTTTGATAAAAATAAAATGTTTTTATTAAAATCA-CTAGATTTGTATGGTGTCCCATTCGC
130 GGTATTTTGATAAAAAGAAAATGTTTTTATTAAAATCACCCA-ATTTTTATGGTGTCCCAATCGC
* * * * *
954143 ACCTTAAATGATTGGCGGAGACTTCTCACATTTCAACAATCGAATAGGGTTAATATTAGAACCTA
194 ACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAAATAGGGTTAATATTAGAACCTA
* ** * *
954208 TATTTCTCGGGTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTATAATTCGACACTTTAGGATAGAGAGAG
259 CATTTCTATGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTTTTATAATTCGACACTTTAGGATAGAGAGAG
954273 CCTTAAATCACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTTGAGTGCATTTTATTTTTAAAA
324 CCTTAAATCACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTTGAGTGCATTTTATTTTTAAAA
**
954338 CTTAAGGCAATATTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCTCCTTTAAGTATGCTCAGGGGGTG
389 CTTAAGGCAATATTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCTCCTGCAAGTATGCTCAGGGGGTG
* *
954403 ACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATCCACATCATTGTTTCTAAAATCG
454 ACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATTCGCATCATTGTTTCTAAAATCG
*
954468 AGGCAATATTTGGTTTTTAGGCACAATAGCTAATATCTCGCATTTATGCTAGGGGTGAATGCTAT
519 AGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGCATTTATGCTAGGGGTGAATGCTAT
* *
954533 TAGCATTAATAAACGAATACCCTCTTTAACTTTACATTCGTAATGATTTTAAAATTAAATAAAGA
584 TAGCATTAATAAACGAATACCCTCTTTAACTTTACATCCGTAATGATTTTCAAATTAAATAAAGA
954598 TCGAACTCAAA
649 TCGAACTCAAA
* *
954609 ATTTCTCATTTTATATATAGGGTAATCAACTAGGTACCAATTTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATA
1 ATTTCTGATTTTAAATATAGGGTAATCAACTAGGTACCAATTTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATA
* *
954674 AT-ACTTCCCCTAGCGTAACCGAGTCCCGAATTTGATTTCTAGATTTTCGCATACCTT---A-A-
66 ATCA-TTCCCCAAGCGTAACCGACTCCCGAATTTGATTTCTAGATTTTCGCATACCTTAAAACAT
* * * *
954733 GGTAGTTTGAT-AAAATAAAATATTTTTATTAAAATCACCCGAA-TTTT-TGGTGTCCTAATCGC
130 GGTATTTTGATAAAAAGAAAATGTTTTTATTAAAATCACCC-AATTTTTATGGTGTCCCAATCGC
* * *
954795 ACCTTAAATGATTGGTGGACACTTCTCATATTTCAAAAACCAAATAGGGTTAATTTTAGAACATA
194 ACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAAATAGGGTTAATATTAGAACCTA
954860 CATTT
259 CATTT
954865 TATTTTTAAA
Statistics
Matches: 6707, Mismatches: 652, Indels: 239
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Matches are distributed among these distances:
629 1 0.00
630 9 0.00
631 4 0.00
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CTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAAATAGGGTTAATATTAGAACCTACA
TTTCTATGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTTTTATAATTCGACACTTTAGGATAGAGAGAGCC
TTAAATCACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTTGAGTGCATTTTATTTTTAAAACT
TAAGGCAATATTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCTCCTGCAAGTATGCTCAGGGGGTGAC
TACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATTCGCATCATTGTTTCTAAAATCGAG
GCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGCATTTATGCTAGGGGTGAATGCTATTA
GCATTAATAAACGAATACCCTCTTTAACTTTACATCCGTAATGATTTTCAAATTAAATAAAGATC
GAACTCAAA
Found at i:953411 original size:658 final size:659
Alignment explanation
Indices: 951094--954864 Score: 5724
Period size: 658 Copynumber: 5.7 Consensus size: 659
951084 GGGTGCTTAT
*
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* *
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* * * *
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131 AATGCTATTAGC------A-----TTAATAAACGAATACCCTCTTTAACTTTACATCCGTAATGA
* ** * *
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* * *
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250 ACCAATTTTTGGGTGCTTATAGGGGTTATAATCCTTCCCCAAGCGTAACCGACTCCCGAATTTGA
* * *
951418 TTTCTAGATTTTTGCATACCTAAAAACATGGTATTTTGAT-AAAATAAAATGTTTTTATTAAAAT
315 TTTCTAGATTTTCGCATACCTTAAAACATGGTAGTTTGATAAAAATAAAATGTTTTTATTAAAAT
** * *
951482 CACTAG-ATTTGTATGGTGTCCCATTCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCACATTTCAA
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* * * ** ** * * *
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* *
951611 TATAATTCGACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATCACCCTTGGTTAGTTAGGACGAATGTAA
509 TATAATTCGACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATCACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAA
* *
951676 ATTTGTTTGAGTGCATTTTATTTTTAAAACTTAAGGCAATATTCACTTATTTGGAAATTAATGGT
574 ATTTGTTTGAGTGCATTTTATTTTTAAAACTTAAGGCAATATTCACTTATTAGGGAATTAATGGT
*
951741 ACATCTCCTGCAAGTATGCTC
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* * ** *
951762 AGGGTGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCAACATCCTTTTCAAATTCATATCATCGTTTC
1 AGGGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATTCGCATCATTGTTTC
* * *
951827 TAAAATCGAGGTAATATTTCGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGCATTTATGCTAGTGGTG
66 TAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGCATTTATGCTAGGGGTG
* *
951892 AATGCTATTAACATTAATAAACGAATACCCTCTGTAACTTTACATCCGTAATGATTTTCAAATTA
131 AATGCTATTAGCATTAATAAACGAATACCCTCTTTAACTTTACATCCGTAATGATTTTCAAATTA
* * * * *
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196 AATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGGGTAATCAACTAGGTACCAATTTTTG
* * * * * * *
952022 GGTTCTTATAGGTGTTATAATCCTTCCCTACGCGCAACCGACTCCTGAATTTGATTTCTAGAATT
261 GGTGCTTATAGGGGTTATAATCCTTCCCCAAGCGTAACCGACTCCCGAATTTGATTTCTAGATTT
* * * * *
952087 TCGCATACCTTAAAACTTGGAATTTTGATAAAAAATAAATTTTTTTTATTAAAATCACCC-AATT
326 TCGCATACCTTAAAACATGGTAGTTTGAT-AAAAATAAAATGTTTTTATTAAAATCACCCGAA-T
*
952151 TTTATGGTGTCCCAATCGCACGTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAAATA
389 TTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAAATA
* * *
952216 GGGTTATTATTAGAACCTACATTTCTATGTTTGTGCCATTAGGTTCTTCAATTTTTATAATTCGA
454 GGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTATGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTTTTATAATTCGA
* * * * *
952281 CACTTTAGGATAGAGAGATCCTTAAATGACCCTTGGTTAATTAGGATGAAAGAAAATTTGTTTGT
519 CACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATCACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTTGTTTGA
* * * *
952346 GTGAATTTTATTTTTAAAACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGATATATCTCCTG
584 GTGCATTTTATTTTTAAAACTTAAGGCAATATTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCTCCTG
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* *
952422 AGGGGGTAACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGCCGACATCCTTTTCAAATTCGCATCATTGTTTC
1 AGGGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATTCGCATCATTGTTTC
*
952487 TAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGCATTTATGCCAGGGGTG
66 TAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGCATTTATGCTAGGGGTG
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131 AATGCTATTAGCATTAATAAACGAATACCCTCTTTAACTTTACATCCGTAATGATTTTCAAATTA
* * *
952617 AATTAAGATCGAACTCAAAATTTCTAATTTTAAATATAGGGTAATCAACTAGGTACCAATTATTG
196 AATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGGGTAATCAACTAGGTACCAATTTTTG
* * *
952682 GGTGCTTATAGGGGTTATAATCCTTCCCCAAGCATTACCGAGTCCCGAATTTGATTTCTAGATTT
261 GGTGCTTATAGGGGTTATAATCCTTCCCCAAGCGTAACCGACTCCCGAATTTGATTTCTAGATTT
*
952747 TCGCATACCTTAAAACATGGTAGTTTGATAAAAAGAAAATGTTTTTATTAAAATCACCCGAATTT
326 TCGCATACCTTAAAACATGGTAGTTTGATAAAAATAAAATGTTTTTATTAAAATCACCCGAATTT
* *
952812 T-TGGTGTCCTAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAATTAGG
391 TATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAAATAGG
*
952876 GTTAATATTAGAACCTACATTTCTATGTTTGTGCCGTTAGGTTCTTTAATTTTTATAATTCGACA
456 GTTAATATTAGAACCTACATTTCTATGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTTTTATAATTCGACA
** * * * * *
952941 CTTTAGGATAGAGAGAGTTTTAAATCACCCTTGGTTAATTACGATGAAAGAAAATTTGTTTGTGC
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* * * * *
953006 GCATTTTATTTTTAAAACCTAAGGCAATGTTCACTTATCAGGGAATTAATGATATATCTCATGCA
586 GCATTTTATTTTTAAAACTTAAGGCAATATTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCTCCTGCA
*
953071 AGTATGCCC
651 AGTATGCTC
* *
953080 AGGGGGTAACTACTGGTGATTTCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATTCGCATCATTGTTTC
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* * *
953145 TAAAATAGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGCATTTATGCCACGGGTG
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953210 AATGCTATTAGCATTAATAAACGAATACCCTCTTTAACTTTACATCCGTAATGATTTTCAAATTA
131 AATGCTATTAGCATTAATAAACGAATACCCTCTTTAACTTTACATCCGTAATGATTTTCAAATTA
*
953275 AATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGGGTAATCAACTAGGTATCAATTTTTG
196 AATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGGGTAATCAACTAGGTACCAATTTTTG
* * *
953340 GGTGCTTTTGGGGGTTATAATCCTTCCCCAAGCGTAACCGAGTCCCGAATTTGATTTCTAGATTT
261 GGTGCTTATAGGGGTTATAATCCTTCCCCAAGCGTAACCGACTCCCGAATTTGATTTCTAGATTT
* * * *
953405 TCGCATACCTTAAAACATGGTAGTTTGATAAAAAGATAATATTTTTATT-AAA-CACCCAAATTT
326 TCGCATACCTTAAAACATGGTAGTTTGATAAAAATAAAATGTTTTTATTAAAATCACCCGAATTT
* * **
953468 TTTGGTGTCCTAATCGCACCTTAAATGATTGGTTAAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAAATAGG
391 TATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAAATAGG
* **
953533 GTTAATATTAGAACTTACATTTAAATGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTTTTATAATTCGACA
456 GTTAATATTAGAACCTACATTTCTATGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTTTTATAATTCGACA
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*
953663 GCATTTTATTTTTAAAACTTAAGGCAATATTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCTCCTGTA
586 GCATTTTATTTTTAAAACTTAAGGCAATATTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCTCCTGCA
953728 AGTATGCTC
651 AGTATGCTC
* *
953737 AGGGGGTGACTACTTGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATTCGTATCATTGTTTC
1 AGGGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATTCGCATCATTGTTTC
*
953802 TAAAATCGAGGCAATATTTAGTTATTAGGCACAATAGCTAATA-CTTCGCATTTATGCTAGGGGT
66 TAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATC-TCGCATTTATGCTAGGGGT
* * * *
953866 GAATACTATTAGCATTAATAAATGAATACCCTCTTTAAATATACATCCGTAATGATTTTCAAATT
130 GAATGCTATTAGCATTAATAAACGAATACCCTCTTTAACTTTACATCCGTAATGATTTTCAAATT
** * *
953931 AAATAAAGATTAAACTCAAAATTTATGATTTTAAGTATAGGGTAATCAACTAGGTA-CAATATTT
195 AAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGGGTAATCAACTAGGTACCAAT-TTT
* * * *
953995 TGGGTGCTTA-CGGGGTTAAAATCATTCCCCAAGCTTAACCGACTCCCGAATTTGATTTCTAGAT
259 TGGGTGCTTATAGGGGTTATAATCCTTCCCCAAGCGTAACCGACTCCCGAATTTGATTTCTAGAT
* **
954059 TTTCGCATACCTTAAAACATGGTATTTTGATAAAAATAAAATGTTTTTATTAAAATCACTAG-AT
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* * * * * *
954123 TTGTATGGTGTCCCATTCGCACCTTAAATGATTGGCGGAGACTTCTCACATTTCAACAATCGAAT
389 TT-TATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAAAACCAAAT
* ** * *
954188 AGGGTTAATATTAGAACCTATATTTCTCGGGTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTATAATTCG
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**
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* *
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*
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* *
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* *
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* * * *
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*
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* *
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* **
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* * *
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** *
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*
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* *
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*
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*
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* *
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* *
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* * * * * *
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* * *
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* * * *
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* *
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* *
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* * *
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* * *
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* * *
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* * * * * *
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* * * * *
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*
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* * * * * *
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* **
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* *
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* *
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* *
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**
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* * *
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650 TGTTTGAGTG
* * *
960764 CATTTTATTTTTAAAACTTAAGGCAATATTCACTTATTAGGGAATTAATGGTACATCTCCTGCAA
1 CATTTTATTTTTAAAACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCTCCTGCAA
* * **
960829 GTATGCTCAGGGTGTGACTACTAGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATTCATATC
66 GTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATTCGCATC
*
960894 ATTGTTTCTAAAATCGAGGTAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGCATTTATGC
131 ATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGCATTTATGC
*
960959 TAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAACGAATACCCTCTGTAACTTTACATCCGTAATGATTT
196 TAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAACGAATACCCTCTTTAACTTTACATCCGTAATGATTT
* * * * * * *
961024 TGAAATTAAATAAAGATCAAAGTCAAAATTTCTAATTTTAAATATAGGGAAATGAACTATGTACC
261 TCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGGGTAATCAACTAGGTACC
* * * *
961089 AATTTTTGGGTGCTTAT-GGGGTTAGAATCCTTCCCCAAGCGTAACCGATTCCCAAATTTGATTT
326 AATTTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCCACGCGTAACCGACTCCCGAATTTGATTT
* * *
961153 CTAGATTTTTGCATACCTTAAAACTTGGTATTTGGAAAAAAATAAAATGTTTTTATTAAAATCAC
391 CTAGATTTTCGCATACCTTAAAACTTGGTATTTTGATAAAAATAAAATGTTTTTATTAAAATCAC
* * * *
961218 TCATTTTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGTTGGAGACTCCTCATAATTT-AAAAA
456 CCAATTTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCAT-ATTTCAAAAA
* *
961282 CC-AATAGGGTTAATATTATAACCTACATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTCAT
520 CCAAATAGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTAT
* * *
961346 AATTCGACATTTTAGGATAGAGAGGGCTTTAAATCACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATT
585 AATTCGACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATCACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATT
*
961411 TGTTTGACTG
650 TGTTTGAGTG
* * *
961421 CATTTTATTTTTATAACCTAAGGCAATTTTCACTTATTAGGGAATTAATGGCATATCTCCTGCAA
1 CATTTTATTTTTAAAACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCTCCTGCAA
961486 GTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATTCGCATC
66 GTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATTCGCATC
961551 ATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGCATTTATGC
131 ATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGCATTTATGC
*
961616 TAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATATACGAATACCCTCTTTAACTTTACATCCGTAATGATTT
196 TAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAACGAATACCCTCTTTAACTTTACATCCGTAATGATTT
* *
961681 TCAAATTAAATAAGGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGGGTAATCAATTAGGTACC
261 TCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGGGTAATCAACTAGGTACC
* * *
961746 AATTTTTGGGTGCTTTTGGGGGTTATAATCCTTCCCCACGCATAACCGAGTCCCGAATTTGATTT
326 AATTTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCCACGCGTAACCGACTCCCGAATTTGATTT
* * *
961811 CTAGATTTTCGCATTCCTTAAAACTTGGTATTTTGAT--AAA-AAAATGTTTTTATGAAAATTA-
391 CTAGATTTTCGCATACCTTAAAACTTGGTATTTTGATAAAAATAAAATGTTTTTATTAAAATCAC
* * * * *
961872 CCAGATTTGTATGGTTTCCCATTCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCACATTTCAACAA
456 CCA-ATTTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAAAA
* * * *
961937 TCGAATAGGGTTAA-ATTAGAACCTACGTTTCTCGG-TTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTAT
520 CCAAATAGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTAT
*
962000 AATTCGACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATCACCCTTGGTT-ATTAGGACGAATGTAAATT
585 AATTCGACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATCACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATT
962064 TGTTTGAGTG
650 TGTTTGAGTG
* * *
962074 CATTTTATTTTTAAAACTTAAGGCAATATTCACTTATTAGGGAATTAATGGTACATCTCCTGCAA
1 CATTTTATTTTTAAAACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCTCCTGCAA
* * **
962139 GTATGCTCAGGGTGTGACTACTAGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATTCATATC
66 GTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATTCGCATC
*
962204 A-TGTTTCTAAAATCGAGGTAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGCATTTATGC
131 ATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGCATTTATGC
*
962268 TAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAACGAATACCCTCTGTAACTTTACATCCGTAATGATTT
196 TAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAACGAATACCCTCTTTAACTTTACATCCGTAATGATTT
* * * * ** *
962333 TGAAATTAAATAAAGATCAAAGTCAAAATTTCTAATTTT-AATATAGGG-AAAGAACTATGTACC
261 TCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGGGTAATCAACTAGGTACC
* * * *
962396 AATTTTTGGGTGCTTAT-GGGGTTAGAATCCTTCCCCAAGCGTAACCGATTCCCAAATTTGATTT
326 AATTTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCCACGCGTAACCGACTCCCGAATTTGATTT
* * *
962460 CTAGATTTTTGCATACCTTAAAACTTGGTATTTGGAAAAAAATAAAATGTTTTTATTAAAATCAC
391 CTAGATTTTCGCATACCTTAAAACTTGGTATTTTGATAAAAATAAAATGTTTTTATTAAAATCAC
* * * *
962525 TCATTTTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGTTGGAGACTCCTCATAATTT-AAAAA
456 CCAATTTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCAT-ATTTCAAAAA
* *
962589 CCAAATAGGGTTAATATTATAACCTACATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTCAT
520 CCAAATAGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTAT
* * *
962654 AATTCGACATTTTAGGATAGAGAGGGCTTTAAATCACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATT
585 AATTCGACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATCACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATT
*
962719 TGTTTGACTG
650 TGTTTGAGTG
* * *
962729 CATTTTATTTTTATAACCTAAGGCAATTTTCACTTATTAGGGAATTAATGGCATATCTCCTGCAA
1 CATTTTATTTTTAAAACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCTCCTGCAA
962794 GTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATTCGCATC
66 GTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATTCGCATC
962859 ATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGCATTTATGC
131 ATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGCATTTATGC
*
962924 TAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATATACGAATACCCTCTTTAACTTTACATCCGTAATGATTT
196 TAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAACGAATACCCTCTTTAACTTTACATCCGTAATGATTT
* *
962989 TCAAATTAAATAAGGATCGAACTCAAAATTTCTGA-TTTAAATATAGGGTAATCAATTAGGTACC
261 TCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGGGTAATCAACTAGGTACC
* * *
963053 AATTTTTGGGTGCTTTTGGGGGTTATAATCCTTCCCCACGCATAACCGAGTCCCGAATTTGATTT
326 AATTTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCCACGCGTAACCGACTCCCGAATTTGATTT
* * *
963118 CTAGATTTTCGCATTCCTTAAAACTTGGTATTTTGAT--AAA-AAAATGTTTTTATGAAAATTA-
391 CTAGATTTTCGCATACCTTAAAACTTGGTATTTTGATAAAAATAAAATGTTTTTATTAAAATCAC
* * * * * *
963179 CC-A-TTGTATGGTTTCCCATTCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCACATTTCAACAAT
456 CCAATTTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAAAAC
* * *
963242 CGAATAGGGTTAA-ATTAGAACCTACGTTTCTCGG-TTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTATA
521 CAAATAGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTATA
* *
963305 ATTCGACACTTTAGGAT--AGAGAGCCTTAAATCACCCTTGGTTAGTTAGGACGAATGTAAATTT
586 ATTCGACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATCACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTT
963368 GTTTGAGTG
651 GTTTGAGTG
* *
963377 CA-TTTA-TTTTAAAA-CTAAGGCAATATTCACTTATTAGGGAATTAATGGTACATCTCCTGCAA
1 CATTTTATTTTTAAAACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCTCCTGCAA
* * **
963439 GTATGCTCAGGGTGTGACTACTAGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATTCATATC
66 GTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATTCGCATC
*
963504 ATTGTTTCTAAAATCGAGGTAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGCATTTATGC
131 ATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGCATTTATGC
*
963569 TAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAACGAATACCCTCTGTAACTTTACATCCGTAATGATTT
196 TAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAACGAATACCCTCTTTAACTTTACATCCGTAATGATTT
* * * * * * *
963634 TGAAATTAAATAAAGATCAAAGTCAAAATTTCTAATTTTAAATATAGGGAAATGAACTATGTACC
261 TCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGGGTAATCAACTAGGTACC
* * *
963699 AATTTTTGGGTGCTTATGGGGGTTAGAATCCTTCCCCAAGCGTAACCGACTCCCAAATTTGATTT
326 AATTTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCCACGCGTAACCGACTCCCGAATTTGATTT
* * *
963764 CTAGATTTTTGCATACCTTAAAACTTGGTATTTGGAAAAAAATAAAATGTTTTTATTAAAATCAC
391 CTAGATTTTCGCATACCTTAAAACTTGGTATTTTGATAAAAATAAAATGTTTTTATTAAAATCAC
* * *
963829 TCAATTTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGTTGGAGACTCCTCATAATTT-AAAAA
456 CCAATTTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCAT-ATTTCAAAAA
* *
963893 CCAAATAGGGTTAATATTATAACCTACATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTCAT
520 CCAAATAGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTAT
* *
963958 AATTCGACATTTTAGGATAGAGAGGGCCTTAAATCACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATT
585 AATTCGACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATCACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATT
*
964023 TGTTTGACTG
650 TGTTTGAGTG
* * *
964033 CATTTTATTTTTATAACCTAAGGCAATTTTCACTTATTAGGGAATTAATGGCATATCTCCTGCAA
1 CATTTTATTTTTAAAACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCTCCTGCAA
964098 GTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATTCGCATC
66 GTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATTCGCATC
*
964163 ATTGTTTCTAAAATCGAGGAAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGCATTTATGC
131 ATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGCATTTATGC
*
964228 TAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAACGAATACCCTCTGTAACTTTACATCCGTAATGATTT
196 TAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAACGAATACCCTCTTTAACTTTACATCCGTAATGATTT
* * * * * *
964293 TGAAATTAAATAAAGATCAAAGTCAAAATTTCTAATTTTAAATATAGGGGTAATGAACTATGTAC
261 TCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATA-GGGTAATCAACTAGGTAC
* * * *
964358 CAA-TTTTGGGTGCTTAT-GGGGTTAGAATCCTTCCACAAGCGTAACCGACTCCCAAATTTGATT
325 CAATTTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCCACGCGTAACCGACTCCCGAATTTGATT
* *
964421 TCTAGATTTTTGCATACCTT-AAACTTGGTA-TTTGAAAAAAAAATAAAATGTTTTTATTAAAAT
390 TCTAGATTTTCGCATACCTTAAAACTTGGTATTTTG--ATAAAAATAAAATGTTTTTATTAAAAT
* * * * * * *
964484 CACTCGATTTTCATGGAGTCCCAATCGCACCTTAAACGATTGGTGGACACTTCTCATATTTCGAA
453 CACCCAATTTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAA
* *
964549 AACAAAATAGGGTTAATATTAGAGCCTACATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTT
518 AACCAAATAGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTT
* * *
964614 ATAATTCGATACTTTAGGATAGAGAAAGCCTTAAATCACCCTTGGTTAATTAGGATGAATGAAAA
583 ATAATTCGACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATCACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAA
964679 TTTGTTTGAGTG
648 TTTGTTTGAGTG
*
964691 CATTTTATTTTT-AAACCTAAGGCAATGATCACTTATTA-GGAATTTAA---T-TATCTCCTGCA
1 CATTTTATTTTTAAAACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAA-TTAATGGTATATCTCCTGCA
*
964750 AGTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCTTTTTCAAATTCGCAT
65 AGTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATTCGCAT
* * * *
964815 TATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGATTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCTCATTTATT
130 CATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGCATTTATG
* * * * * *
964880 CTAGGGGTGAAAGTTATTAGCAATAATAAACTAATACCATCTTTAACTTTATATCCGTAATGATT
195 CTAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAACGAATACCCTCTTTAACTTTACATCCGTAATGATT
* * *
964945 TACAAATTAAATGAAGATCGAACTCAAAATTTCT-ATTTTTAAATATAGGGTAATTAACTAGGTA
260 TTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGA-TTTTAAATATAGGGTAATCAACTAGGTA
* *
965009 CCAATTTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCCACGCGTAACCAACTCCTGAATTTGAT
324 CCAATTTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCCACGCGTAACCGACTCCCGAATTTGAT
* * * * *
965074 ATCTAGATTTCCGCATACCTTAAAACTTGGTATTTTGAAAAAAAAGAAAATATTTTTATTAAAAT
389 TTCTAGATTTTCGCATACCTTAAAACTTGGTATTTTG-ATAAAAATAAAATGTTTTTATTAAAAT
* * * ** * *
965139 TACCCGATTTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAAAGATTGGTAAACATTTCTCATATTTCAAA
453 CACCCAATTTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAA
* *
965204 AACCAAATAGGGTTGATATTAGAACCTATATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTT
518 AACCAAATAGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTT
* * * * *
965269 ATAATTCGATACTTTAGGATAGAAAGGGCCTTAAATAACCCTTGGTTAATTATGACGAATGAAAA
583 ATAATTCGACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATCACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAA
965334 TTTGTTTGAGTG
648 TTTGTTTGAGTG
* * *
965346 CATTTTATTTCTAAAACCTAAGGGAATGTTCAGTTATTAGGGAATTAATGGTATATCTCCTGCAA
1 CATTTTATTTTTAAAACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCTCCTGCAA
* * *
965411 GTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTTTCCGAAATAGGTCTACATCTTTTTCAAATTCGCAT
66 GTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGA-TTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATTCGCAT
* *
965476 CATTGTTTCTAAAATTGACGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGCATTTATG
130 CATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGCATTTATG
* * *
965541 CTAGGGGTAAATGCTATTAGCATTAATAAACGAATACCTTCTTTAACTTTACATTCGTAATGATT
195 CTAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAACGAATACCCTCTTTAACTTTACATCCGTAATGATT
* *
965606 TTCAAATTAAATAAAGATCAAACTCAAAATTCCTGATTTTAAATATAGGGTAATCAACTAGGTAC
260 TTCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGGGTAATCAACTAGGTAC
* * *
965671 CAATTTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCCACGTGTAACCGTCTCCAGAATTTGATT
325 CAATTTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCCACGCGTAACCGACTCCCGAATTTGATT
* * *
965736 TCTAGATTTTCGCATACCTTAAAACTTTGTATTTTGATAAAAAGAATATGTTTTTATTAAAATCA
390 TCTAGATTTTCGCATACCTTAAAACTTGGTATTTTGATAAAAATAAAATGTTTTTATTAAAATCA
* * *
965801 CCCAATTTTTATGGTGTCCCAATCGTACCTTAAATGATTCGTGGAGGCTTCTCATATTTCAAAAA
455 CCCAATTTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAAAA
*
965866 CCAAATAGGGTTAATATTAGAACCTAAATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTAT
520 CCAAATAGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTAT
* *
965931 AATTCGACAC-TT--GATAGAGAAAGCCTTAAAT-ACCCTTGGTTAATTAGGACAAATGAAAATT
585 AATTCGACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATCACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATT
965992 TGTTTGAGTG
650 TGTTTGAGTG
*
966002 CATTTTATTTTTAAAACCTAAGGCAATCTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCTCCTGCAA
1 CATTTTATTTTTAAAACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCTCCTGCAA
*
966067 GTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGAGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATTCG--T-
66 GTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATTCGCATC
* * * *
966129 ATTGTTTATAAAATCGAGGCAATAATTGGTTATCAGGCACAATAGCTAATACCTCGCATTTATGC
131 ATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGCATTTATGC
* *
966194 TA-GGGTGAATACTATTAGCATTAATAAATGAATACCCTCTTTAACTTTACATCCGTAATGATTT
196 TAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAACGAATACCCTCTTTAACTTTACATCCGTAATGATTT
*
966258 TCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTTTGATTTTAAATATAGGGTAATCAACTAGGTACC
261 TCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGGGTAATCAACTAGGTACC
* * *
966323 AAGTTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCCAAGCGTAACCGAGTCCCGAATTTGATTT
326 AATTTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCCACGCGTAACCGACTCCCGAATTTGATTT
* * * * *
966388 CTAAATTTTTGCATACCTTAAAACATGGTAGTTTCAT-AAAA-AAAATGTTTTTATTAAAATCAC
391 CTAGATTTTCGCATACCTTAAAACTTGGTATTTTGATAAAAATAAAATGTTTTTATTAAAATCAC
** * * * *
966451 CGGATTTTTTTGGTGTCCTAATGGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCACATTTCAAAAAC
456 CCAATTTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAAAAAC
* * *
966516 AAAATAGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTATGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTATC
521 CAAATAGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTATA
*
966581 ATTCGACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATCACCCTTGGTTAATTAGGACGAAAGAAAATTT
586 ATTCGACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATCACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAATTT
* *
966646 TTTTGTGTG
651 GTTTGAGTG
**
966655 CATTTTATTTTTAAAACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATTATATATCTCCTGCAA
1 CATTTTATTTTTAAAACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCTCCTGCAA
* * *
966720 GTATCCTCAGTGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGAC-TACTTTTCAAATTCGCATC
66 GTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATTCGCATC
966784 ATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCT-ATATCTCGCATTTATGC
131 ATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGCATTTATGC
* *
966848 TAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATATACGAATACCCTCTTTAACTTTACATCCGTAATTATTT
196 TAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAACGAATACCCTCTTTAACTTTACATCCGTAATGATTT
*
966913 TC-AATTAAATAAGGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGGGTAATCAACTAGGTACC
261 TCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGGGTAATCAACTAGGTACC
* * * *
966977 AA-TTTTGGGTACTTTTGGGGGTTATAATCCTTCCCCACGCATAACCGAGTCCCGAATTTGATTT
326 AATTTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCCACGCGTAACCGACTCCCGAATTTGATTT
*
967041 CTAGATTTTCGCATTCCTTAAAACTTGGTATTTTGAT--AAA-AAAATG-TTTTATTAAAATCA-
391 CTAGATTTTCGCATACCTTAAAACTTGGTATTTTGATAAAAATAAAATGTTTTTATTAAAATCAC
* * *
967101 CCAGATTTGTATGGTGTCCCATTCGCACCTTAAATGA-TGGTGGAGACTTCTCAT-TAT-AACAA
456 CCA-ATTTTTATGGTGTCCCAATCGCACCTTAAATGATTGGTGGAGACTTCTCATATTTCAA-AA
* * * *
967163 ACCGAATAGGGTTAATATTAGAA-CTACTTTTCTCGGGTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTA
519 ACCAAATAGGGTTAATATTAGAACCTACATTTCTAGGTTTGTGCCTTTAGGTTCTTTAATTCTTA
967227 TAATTCGACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATCACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAAT
584 TAATTCGACACTTTAGGATAGAGAGAGCCTTAAATCACCCTTGGTTAATTAGGACGAATGAAAAT
967292 TTGTTTGAGTG
649 TTGTTTGAGTG
* * * *
967303 TATTTTATTTTTAAAACCCAAGGTAATATTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCTCCTGCAA
1 CATTTTATTTTTAAAACCTAAGGCAATGTTCACTTATTAGGGAATTAATGGTATATCTCCTGCAA
* * * *
967368 GTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGAGATTCCCGAAATAGTTCGACATCCTTATCAAATTCGTATC
66 GTATGCTCAGGGGGTGACTACTGGTGATTCCCGAAATAGGTCGACATCCTTTTCAAATTCGCATC
* * * *
967433 ATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATAATTGGTTATCAGACACAATAGCTAATACCTCGCATTTATGC
131 ATTGTTTCTAAAATCGAGGCAATATTTGGTTATTAGGCACAATAGCTAATATCTCGCATTTATGC
**
967498 TAGGGGTGAA---TATTAGCATTAATAAATAAATACCCTCTTTAACTTTACATCCGTAATGA-TT
196 TAGGGGTGAATGCTATTAGCATTAATAAACGAATACCCTCTTTAACTTTACATCCGTAATGATTT
* *
967559 TCAAATTAAATAAAGATCTAACTCAAAATTTTTGATTTTAAATATAGGGTAATCAACTAGGTACC
261 TCAAATTAAATAAAGATCGAACTCAAAATTTCTGATTTTAAATATAGGGTAATCAACTAGGTACC
* * *
967624 AA-TTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCCAAGCGTAATCGAGTCCCGAATTTGATTT
326 AATTTTTGGGTGCTTATGGGGGTTATAATCCTTCCCCACGCGTAACCGACTCCCGAATTTGATTT
* * * * *
967688 CTAAATTTTTGCATACCTTAAAACATGGTAGTTTGATAAAAAGAAAATGTTTTTA-TAAAATCAC
391 CTAGATTTTCGCATACCTTAAAACTTGGTATTTTGATAAAAATAAAATGTTTTTATTAAAATCAC
* * * *
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*
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* * * **
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*
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* *
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* * *
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*
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*
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* * * *
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*
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* * *
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* * ** * * *
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*
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* * * * *
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* *
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* *
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*
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* * * *
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* ** * *
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* * *
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* ** * * * *
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* *
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* * * *
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* *
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* * *
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** * * *
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*
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* * *
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* * *
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* *
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*
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*
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* *
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*
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*** * *
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* *
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*
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* *
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* *
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* *
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* * *
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*
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*
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* *
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*
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*
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* ** *
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* * *
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*
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* * *
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*
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*
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66 CACACATTTGTGCGTCATAA
* *
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* * *
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* * * * *
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992278 TA TA TA TA TA TA TA TA TA TA TA TA TA TA TA TA TA T
1 TA TA TA TA TA TA TA TA TA TA TA TA TA TA TA TA TA T
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TA
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*
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* * * *
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* * *
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*
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*
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* *
1004602 TAAACTAAAATTAAATAAAAGCGATAGTTAAGGTAAATATATAATAGTA
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* * *
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*
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**
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** *
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* **
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1 AATTCCCAAAATAGCACCAAAATCGAATT
*
1009084 AATTCCCAGAATAGCACC
1 AATTCCCAAAATAGCACC
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1 TCAACGGGTCGGGTCGGG
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*
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1 CGGG
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1016310 GTCAACGGGT
*
1016320 CGGGTCGGGTCAA
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*
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*
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1 ACCGGTCAAA
*
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Indices: 1017362--1017432 Score: 76
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* * *
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*
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1 AGGACATTGACGAAGGA
1017433 ACACAATGGA
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Indices: 1018776--1018881 Score: 88
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1018766 ATAAATTGCA
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* *
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* *
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*
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* *
1018865 CCGAATGACCGCATAGA
1 CCGAAGGACCACATAGA
1018882 ACCCTTGACT
Statistics
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Indices: 1018787--1018882 Score: 124
Period size: 46 Copynumber: 2.2 Consensus size: 44
1018777 CGAAGTGCCA
1018787 CATAG-AATGTCTCGAAAGACCACATAGATGTCCCGAAGGACCG
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* * *
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1 CATAGAA
1018883 CCCTTGACTC
Statistics
Matches: 45, Mismatches: 4, Indels: 5
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Matches are distributed among these distances:
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Found at i:1018975 original size:18 final size:19
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Indices: 1018940--1018976 Score: 58
Period size: 20 Copynumber: 1.9 Consensus size: 19
1018930 CACGGAATGT
1018940 AAGATTACCAGTGGGAATAA
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Indices: 1019595--1019766 Score: 186
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1019585 TTTACACATT
* *
1019595 TCACATTTTCA-ATTATTCACATAGCTCAGTATCACATAGATTATA
1 TCACATGTTCATA-TATTCACATAGATCAGTATCACATAGATTATA
* * * ** *
1019640 TCATATGTTCACATAGTCACATAGA-CCTTATCACATAGCTTATA
1 TCACATGTTCATATATTCACATAGATCAGTATCACATAGATTATA
* * * *
1019684 TCACATGTTCATATATTCACGTAGATCAGTATCAAATGGTTTATA
1 TCACATGTTCATATATTCACATAGATCAGTATCACATAGATTATA
* * *
1019729 TCACATTTTCATATATTCACGTAGATCAATATCACATA
1 TCACATGTTCATATATTCACATAGATCAGTATCACATA
1019767 TATCATCATA
Statistics
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Found at i:1024007 original size:21 final size:22
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* * *
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*
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ACAAAAAGAAAAGAAAAG
Found at i:1048327 original size:29 final size:30
Alignment explanation
Indices: 1048259--1048316 Score: 82
Period size: 30 Copynumber: 1.9 Consensus size: 30
1048249 AATTTAAGGA
1048259 AAATGGTTTTTGGACTTGAATTAAATTTAAT
1 AAAT-GTTTTTGGACTTGAATTAAATTTAAT
* *
1048290 AAATTTTTTTGGACTT-AATTGAATTTA
1 AAATGTTTTTGGACTTGAATTAAATTTA
1048317 TTCAAAGTTT
Statistics
Matches: 25, Mismatches: 2, Indels: 2
0.86 0.07 0.07
Matches are distributed among these distances:
29 10 0.40
30 11 0.44
31 4 0.16
ACGTcount: A:0.34, C:0.03, G:0.14, T:0.48
Consensus pattern (30 bp):
AAATGTTTTTGGACTTGAATTAAATTTAAT
Found at i:1048493 original size:21 final size:20
Alignment explanation
Indices: 1048389--1048494 Score: 97
Period size: 21 Copynumber: 5.0 Consensus size: 20
1048379 AGGGTGTCAA
*
1048389 AGTGCATCCATGCACCCCTTC
1 AGTGCATCCATGCA-CCCTGC
* *
1048410 AGTGCATCCATGTATCCCTGT
1 AGTGCATCCATGCA-CCCTGC
*
1048431 AGTGCATCCATGC-GCCTGCAC
1 AGTGCATCCATGCACCCTG--C
* *
1048452 TAGTGCATCTATGCACCATGC
1 -AGTGCATCCATGCACCCTGC
1048473 AGTGCATCCATGCACCCATGC
1 AGTGCATCCATGCACCC-TGC
1048494 A
1 A
1048495 CTCAAACACC
Statistics
Matches: 68, Mismatches: 12, Indels: 10
0.76 0.13 0.11
Matches are distributed among these distances:
19 4 0.06
20 15 0.22
21 34 0.50
22 12 0.18
23 3 0.04
ACGTcount: A:0.22, C:0.35, G:0.19, T:0.25
Consensus pattern (20 bp):
AGTGCATCCATGCACCCTGC
Found at i:1048561 original size:21 final size:20
Alignment explanation
Indices: 1048516--1048589 Score: 89
Period size: 20 Copynumber: 3.6 Consensus size: 20
1048506 AATGCAATTA
1048516 GTGCATCGATGCATCCGTCT
1 GTGCATCGATGCATCCGTCT
*
1048536 GTGCATCGATGCATCAAGGT-T
1 GTGCATCGATGCATC--CGTCT
1048557 GTGCATCGATGCATCC-TGCT
1 GTGCATCGATGCATCCGT-CT
*
1048577 GTGCATCCATGCA
1 GTGCATCGATGCA
1048590 CGAAGGCTAC
Statistics
Matches: 47, Mismatches: 3, Indels: 8
0.81 0.05 0.14
Matches are distributed among these distances:
18 1 0.02
20 28 0.60
21 16 0.34
22 2 0.04
ACGTcount: A:0.19, C:0.27, G:0.26, T:0.28
Consensus pattern (20 bp):
GTGCATCGATGCATCCGTCT
Found at i:1048995 original size:34 final size:32
Alignment explanation
Indices: 1048955--1049024 Score: 95
Period size: 34 Copynumber: 2.1 Consensus size: 32
1048945 TTTTATAAAG
* *
1048955 GGGAAAGGTTCTAGCTTATCCCGTGTAAAAGCTA
1 GGGAAAGGTTCTAGCTTAGCCCG-GGAAAA-CTA
*
1048989 GGGAAAGGTTCTAGTTTAGCCCGGGAAAACTA
1 GGGAAAGGTTCTAGCTTAGCCCGGGAAAACTA
1049021 GGGA
1 GGGA
1049025 GTTGTAAGGT
Statistics
Matches: 33, Mismatches: 3, Indels: 2
0.87 0.08 0.05
Matches are distributed among these distances:
32 7 0.21
33 5 0.15
34 21 0.64
ACGTcount: A:0.30, C:0.16, G:0.31, T:0.23
Consensus pattern (32 bp):
GGGAAAGGTTCTAGCTTAGCCCGGGAAAACTA
Found at i:1049907 original size:19 final size:20
Alignment explanation
Indices: 1049883--1049930 Score: 62
Period size: 19 Copynumber: 2.5 Consensus size: 20
1049873 AACGATTTTC
*
1049883 TTTTGAAAACAAAAAT-AGA
1 TTTTGAAAACAAAAATGAAA
* *
1049902 TTTTGAAAGCCAAAATGAAA
1 TTTTGAAAACAAAAATGAAA
1049922 TTTTGAAAA
1 TTTTGAAAA
1049931 AGGATTTAGA
Statistics
Matches: 24, Mismatches: 4, Indels: 1
0.83 0.14 0.03
Matches are distributed among these distances:
19 14 0.58
20 10 0.42
ACGTcount: A:0.52, C:0.06, G:0.12, T:0.29
Consensus pattern (20 bp):
TTTTGAAAACAAAAATGAAA
Found at i:1051259 original size:29 final size:30
Alignment explanation
Indices: 1051191--1051248 Score: 82
Period size: 30 Copynumber: 1.9 Consensus size: 30
1051181 ATTTAAGGCA
*
1051191 AAATGGTTTTTGGATTTGAATTAAATTTAAT
1 AAAT-GTTTTTGGAATTGAATTAAATTTAAT
*
1051222 AAATGTTTTTGGAATT-AATTGAATTTA
1 AAATGTTTTTGGAATTGAATTAAATTTA
1051249 TTCAAAGTTT
Statistics
Matches: 25, Mismatches: 2, Indels: 2
0.86 0.07 0.07
Matches are distributed among these distances:
29 10 0.40
30 11 0.44
31 4 0.16
ACGTcount: A:0.36, C:0.00, G:0.16, T:0.48
Consensus pattern (30 bp):
AAATGTTTTTGGAATTGAATTAAATTTAAT
Done.