Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: VEPZ01008271.1 Hibiscus syriacus cultivar Beakdansim tig00110928_pilon, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Pmatch=0.80,Pindel=0.10
tuple sizes 0,4,5,7
tuple distances 0, 29, 159, 1000
Length: 134579
ACGTcount: A:0.33, C:0.16, G:0.17, T:0.34
File 1 of 2
Found at i:148 original size:64 final size:64
Alignment explanation
Indices: 54--181 Score: 204
Period size: 64 Copynumber: 2.0 Consensus size: 64
44 AGCGTTTGTT
* *
54 AACAAACAACTTTTCAATTTCATTCAGAGTCAATTTCAACTTCACAGCGAATGATATTGTACTC
1 AACAAACAACTTTTCAATTTCATTCAGAGTCAATTTCAACTTCACAGCGAAGGATATTGAACTC
* *
118 AACAAACAA-TTTTCTAGTTTCATTCAGAGTCAATTTCAACTTGACAGCGAAGGATATTGAACTC
1 AACAAACAACTTTTC-AATTTCATTCAGAGTCAATTTCAACTTCACAGCGAAGGATATTGAACTC
182 GAAATAACAC
Statistics
Matches: 59, Mismatches: 4, Indels: 2
0.91 0.06 0.03
Matches are distributed among these distances:
63 5 0.08
64 54 0.92
ACGTcount: A:0.36, C:0.20, G:0.12, T:0.32
Consensus pattern (64 bp):
AACAAACAACTTTTCAATTTCATTCAGAGTCAATTTCAACTTCACAGCGAAGGATATTGAACTC
Found at i:369 original size:22 final size:21
Alignment explanation
Indices: 326--370 Score: 63
Period size: 22 Copynumber: 2.1 Consensus size: 21
316 TACAATGCTT
*
326 GGATTTCAACTTCACGACGAA
1 GGATTTCAACTTCACAACGAA
*
347 GGATATTCAACTTCACAATGAA
1 GGAT-TTCAACTTCACAACGAA
369 GG
1 GG
371 GGTCATCCAC
Statistics
Matches: 21, Mismatches: 2, Indels: 1
0.88 0.08 0.04
Matches are distributed among these distances:
21 4 0.19
22 17 0.81
ACGTcount: A:0.36, C:0.20, G:0.20, T:0.24
Consensus pattern (21 bp):
GGATTTCAACTTCACAACGAA
Found at i:464 original size:43 final size:42
Alignment explanation
Indices: 374--475 Score: 132
Period size: 43 Copynumber: 2.4 Consensus size: 42
364 ATGAAGGGGT
*
374 CATCCACATTTCAACTCCACGACGGAGGATATCGTACCAACG
1 CATCCACATTTCAACTCCACGACGGAGGATATCGTACCAACA
* * * *
416 GATCCACAATTTCAACTCCACGATGGAGGATATCGTTCCCACA
1 CATCCAC-ATTTCAACTCCACGACGGAGGATATCGTACCAACA
*
459 CATCCACGGTTTCAACT
1 CATCCAC-ATTTCAACT
476 TCACAACGAA
Statistics
Matches: 51, Mismatches: 8, Indels: 1
0.85 0.13 0.02
Matches are distributed among these distances:
42 6 0.12
43 45 0.88
ACGTcount: A:0.29, C:0.32, G:0.16, T:0.23
Consensus pattern (42 bp):
CATCCACATTTCAACTCCACGACGGAGGATATCGTACCAACA
Found at i:1230 original size:168 final size:166
Alignment explanation
Indices: 911--1553 Score: 781
Period size: 168 Copynumber: 3.9 Consensus size: 166
901 GATATCGTGC
* * * * * *
911 TCATTTGCATCTTAACTCAAGGCAAGAAGGGTTATATGCTAACAAAGACCTTCGAGTTCAATTAC
1 TCATTTGCAGCATAACTCAAGGCGAGAAGGGTTATCTGCCAACAAAGACCTTCGAGTTCGATTAC
* * * * * *
976 ACTTAGCTCAAAGACACATCATTTACA-CATAACTTAAGGCTATAATGGTTA--TGCCACCAAAG
66 ACTCAGCTCAAAGGCACATCATTTACAGCATAACTCAAGGCGAGAAGGGTTATCTGCCACCAAAG
* *
1038 ACCTTTGAGTTCGACTACGCTCAGCTCCAAGACACA
131 ACCTTCGAGTTCGACTACGCTCAGCTCAAAGACACA
*
1074 TCATTTGCAGCATAACTCAAGGCGAGAAGGGTTATCTGCCACCAAAAGACCTTCGAGTTCGATTA
1 TCATTTGCAGCATAACTCAAGGCGAGAAGGGTTATCTGCCAAC-AAAGACCTTCGAGTTCGATTA
* * * * * ** * * * *
1139 AACTCATCACAAAGGTACATCATTTGCATAATAACTTAAGTCGAGAATGGCTATCTGCCAACCAA
65 CACTCAGCTCAAAGGCACATCATTTACAGCATAACTCAAGGCGAGAAGGGTTATCTGCC-ACCAA
*
1204 AGACCTTCGAGTTCGACTACGCTCAGCTCTAAGACACA
129 AGACCTTCGAGTTCGACTACGCTCAGCTCAAAGACACA
* * * *
1242 TCATTTGCAGCATATCTC-AGGCTAGAAGGGTTATCTACCAACAAAAGACCTTCGAGTTCGACTA
1 TCATTTGCAGCATAACTCAAGGCGAGAAGGGTTATCTGCCAAC-AAAGACCTTCGAGTTCGATTA
** * *
1306 TGCTCAGCTCTAAGGCACATCATTTGCAGCATAACTCAAGGCGAGAAGGGTTATCTGCCACCAAA
65 CACTCAGCTCAAAGGCACATCATTTACAGCATAACTCAAGGCGAGAAGGGTTATCTGCCACCAAA
* ** * *
1371 GACCTTCGAGTTCGATTATACTCAGCTCAAAGGCATA
130 GACCTTCGAGTTCGACTACGCTCAGCTCAAAGACACA
* * *
1408 TCATTTGCAGCATAACTCAAGGCGAGAATGGTTATCTGTCAACAAAGACCTTTGAGTTCGATTAC
1 TCATTTGCAGCATAACTCAAGGCGAGAAGGGTTATCTGCCAACAAAGACCTTCGAGTTCGATTAC
* * * * *
1473 ACTCACCTCAAAGGTATATCAAATTTACAGCATAACTCAAGGCGAGAAGGGTTATCTGTCATCAA
66 ACTCAGCTCAAAGGCACATC--ATTTACAGCATAACTCAAGGCGAGAAGGGTTATCTGCCACCAA
1538 AGACCTTCGAGTTCGA
129 AGACCTTCGAGTTCGA
1554 TTTCATTCAG
Statistics
Matches: 412, Mismatches: 60, Indels: 11
0.85 0.12 0.02
Matches are distributed among these distances:
163 37 0.09
164 41 0.10
165 19 0.05
166 88 0.21
167 113 0.27
168 114 0.28
ACGTcount: A:0.33, C:0.24, G:0.18, T:0.25
Consensus pattern (166 bp):
TCATTTGCAGCATAACTCAAGGCGAGAAGGGTTATCTGCCAACAAAGACCTTCGAGTTCGATTAC
ACTCAGCTCAAAGGCACATCATTTACAGCATAACTCAAGGCGAGAAGGGTTATCTGCCACCAAAG
ACCTTCGAGTTCGACTACGCTCAGCTCAAAGACACA
Found at i:1303 original size:83 final size:83
Alignment explanation
Indices: 911--1578 Score: 750
Period size: 83 Copynumber: 8.0 Consensus size: 83
901 GATATCGTGC
* * * * * *
911 TCATTTGCATCTTAACTCAAGGCAAGAAGGGTTATATGCTAACAAAGACCTTCGAGTTCAATTAC
1 TCATTTGCAGCATAACTCAAGGCGAGAAGGGTTATCTGCCAACAAAGACCTTCGAGTTCGATTAC
* *
976 ACTTAGCTCAAAGACACA
66 ACTCAGCTCAAAGGCACA
* * * * * * * *
994 TCATTTACA-CATAACTTAAGGCTATAATGGTTA--TGCCACCAAAGACCTTTGAGTTCGACTAC
1 TCATTTGCAGCATAACTCAAGGCGAGAAGGGTTATCTGCCAACAAAGACCTTCGAGTTCGATTAC
* * *
1056 GCTCAGCTCCAAGACACA
66 ACTCAGCTCAAAGGCACA
*
1074 TCATTTGCAGCATAACTCAAGGCGAGAAGGGTTATCTGCCACCAAAAGACCTTCGAGTTCGATTA
1 TCATTTGCAGCATAACTCAAGGCGAGAAGGGTTATCTGCCAAC-AAAGACCTTCGAGTTCGATTA
* * * *
1139 AACTCATCACAAAGGTACA
65 CACTCAGCTCAAAGGCACA
** * * * * *
1158 TCATTTGCATAATAACTTAAGTCGAGAATGGCTATCTGCCAACCAAAGACCTTCGAGTTCGACTA
1 TCATTTGCAGCATAACTCAAGGCGAGAAGGGTTATCTGCCAA-CAAAGACCTTCGAGTTCGATTA
* * *
1223 CGCTCAGCTCTAAGACACA
65 CACTCAGCTCAAAGGCACA
* * * *
1242 TCATTTGCAGCATATCTC-AGGCTAGAAGGGTTATCTACCAACAAAAGACCTTCGAGTTCGACTA
1 TCATTTGCAGCATAACTCAAGGCGAGAAGGGTTATCTGCCAAC-AAAGACCTTCGAGTTCGATTA
** *
1306 TGCTCAGCTCTAAGGCACA
65 CACTCAGCTCAAAGGCACA
* *
1325 TCATTTGCAGCATAACTCAAGGCGAGAAGGGTTATCTGCCACCAAAGACCTTCGAGTTCGATTAT
1 TCATTTGCAGCATAACTCAAGGCGAGAAGGGTTATCTGCCAACAAAGACCTTCGAGTTCGATTAC
*
1390 ACTCAGCTCAAAGGCATA
66 ACTCAGCTCAAAGGCACA
* * *
1408 TCATTTGCAGCATAACTCAAGGCGAGAATGGTTATCTGTCAACAAAGACCTTTGAGTTCGATTAC
1 TCATTTGCAGCATAACTCAAGGCGAGAAGGGTTATCTGCCAACAAAGACCTTCGAGTTCGATTAC
* * *
1473 ACTCACCTCAAAGGTATA
66 ACTCAGCTCAAAGGCACA
* * *
1491 TCAAATTTACAGCATAACTCAAGGCGAGAAGGGTTATCTGTCATCAAAGACCTTCGAGTTCGATT
1 TC--ATTTGCAGCATAACTCAAGGCGAGAAGGGTTATCTGCCAACAAAGACCTTCGAGTTCGATT
* * * *
1556 TCATTCAGCTCATAGGCATA
64 ACACTCAGCTCAAAGGCACA
1576 TCA
1 TCA
1579 ACCGTATGGT
Statistics
Matches: 498, Mismatches: 78, Indels: 18
0.84 0.13 0.03
Matches are distributed among these distances:
80 47 0.09
81 20 0.04
82 20 0.04
83 203 0.41
84 133 0.27
85 75 0.15
ACGTcount: A:0.33, C:0.24, G:0.18, T:0.26
Consensus pattern (83 bp):
TCATTTGCAGCATAACTCAAGGCGAGAAGGGTTATCTGCCAACAAAGACCTTCGAGTTCGATTAC
ACTCAGCTCAAAGGCACA
Found at i:1506 original size:251 final size:248
Alignment explanation
Indices: 911--1553 Score: 835
Period size: 251 Copynumber: 2.6 Consensus size: 248
901 GATATCGTGC
* * * * *
911 TCATTTGCATCTTAACTCAAGGCAAGAAGGGTTATATGCTAACAAAGACCTTCGAGTTCAATTAC
1 TCATTTGCATCATAACTCAAGGCGAGAATGGTTATCTGC-AACAAAGACCTTCGAGTTCGATTAC
* * * * *
976 ACTTAGCTCAAAGACACATCATTTACA-CATAACTTAAGGCTATAATGGTTA--TGCCACCAAAG
65 ACTCAGCTCAAAGACACATCATTTACAGCATAAC-TCAGGCTAGAAGGGTTATCTGCCAACAAAG
*
1038 ACCTTTGAGTTCGACTACGCTCAGCTCCAAGACACATCATTTGCAGCATAACTCAAGGCGAGAAG
129 ACCTTCGAGTTCGACTACGCTCAGCTCCAAGACACATCATTTGCAGCATAACTCAAGGCGAGAAG
* *
1103 GGTTATCTGCCACCAAAAGACCTTCGAGTTCGATTAAACTCATCACAAAGGTACA
194 GGTTATCTGCCACCAAAAGACCTTCGAGTTCGATTAAACTCAGCACAAAGGCACA
* * * * *
1158 TCATTTGCATAATAACTTAAGTCGAGAATGGCTATCTGCCAACCAAAGACCTTCGAGTTCGACTA
1 TCATTTGCATCATAACTCAAGGCGAGAATGGTTATCTG-CAA-CAAAGACCTTCGAGTTCGATTA
* * * * *
1223 CGCTCAGCTCTAAGACACATCATTTGCAGCATATCTCAGGCTAGAAGGGTTATCTACCAACAAAA
64 CACTCAGCTCAAAGACACATCATTTACAGCATAACTCAGGCTAGAAGGGTTATCTGCCAAC-AAA
* * *
1288 GACCTTCGAGTTCGACTATGCTCAGCTCTAAGGCACATCATTTGCAGCATAACTCAAGGCGAGAA
128 GACCTTCGAGTTCGACTACGCTCAGCTCCAAGACACATCATTTGCAGCATAACTCAAGGCGAGAA
* * *
1353 GGGTTATCTGCCACC-AAAGACCTTCGAGTTCGATTATACTCAGCTCAAAGGCATA
193 GGGTTATCTGCCACCAAAAGACCTTCGAGTTCGATTAAACTCAGCACAAAGGCACA
* *
1408 TCATTTGCAGCATAACTCAAGGCGAGAATGGTTATCTGTCAACAAAGACCTTTGAGTTCGATTAC
1 TCATTTGCATCATAACTCAAGGCGAGAATGGTTATCTG-CAACAAAGACCTTCGAGTTCGATTAC
* ** * * * *
1473 ACTCACCTCAAAGGTATATCAAATTTACAGCATAACTCAAGGCGAGAAGGGTTATCTGTCATCAA
65 ACTCAGCTCAAAGACACATC--ATTTACAGCATAACTC-AGGCTAGAAGGGTTATCTGCCAACAA
1538 AGACCTTCGAGTTCGA
127 AGACCTTCGAGTTCGA
1554 TTTCATTCAG
Statistics
Matches: 338, Mismatches: 49, Indels: 14
0.84 0.12 0.03
Matches are distributed among these distances:
247 32 0.09
248 59 0.17
249 40 0.12
250 76 0.22
251 111 0.33
252 20 0.06
ACGTcount: A:0.33, C:0.24, G:0.18, T:0.25
Consensus pattern (248 bp):
TCATTTGCATCATAACTCAAGGCGAGAATGGTTATCTGCAACAAAGACCTTCGAGTTCGATTACA
CTCAGCTCAAAGACACATCATTTACAGCATAACTCAGGCTAGAAGGGTTATCTGCCAACAAAGAC
CTTCGAGTTCGACTACGCTCAGCTCCAAGACACATCATTTGCAGCATAACTCAAGGCGAGAAGGG
TTATCTGCCACCAAAAGACCTTCGAGTTCGATTAAACTCAGCACAAAGGCACA
Found at i:2588 original size:13 final size:13
Alignment explanation
Indices: 2570--2602 Score: 66
Period size: 13 Copynumber: 2.5 Consensus size: 13
2560 TTTCTTTGTT
2570 TTGCAGGGTTTCG
1 TTGCAGGGTTTCG
2583 TTGCAGGGTTTCG
1 TTGCAGGGTTTCG
2596 TTGCAGG
1 TTGCAGG
2603 CTACTGGAAA
Statistics
Matches: 20, Mismatches: 0, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
13 20 1.00
ACGTcount: A:0.09, C:0.15, G:0.39, T:0.36
Consensus pattern (13 bp):
TTGCAGGGTTTCG
Found at i:3046 original size:28 final size:27
Alignment explanation
Indices: 2998--3051 Score: 72
Period size: 28 Copynumber: 2.0 Consensus size: 27
2988 TTTAATTATT
2998 TTTAATTATTTTTTAAATTCGAATTTTC
1 TTTAATTATTTTTTAAATTCG-ATTTTC
* * *
3026 TTTATTTATTTTTTTATTTCGATTTT
1 TTTAATTATTTTTTAAATTCGATTTT
3052 AATACTAACT
Statistics
Matches: 23, Mismatches: 3, Indels: 1
0.85 0.11 0.04
Matches are distributed among these distances:
27 5 0.22
28 18 0.78
ACGTcount: A:0.22, C:0.06, G:0.04, T:0.69
Consensus pattern (27 bp):
TTTAATTATTTTTTAAATTCGATTTTC
Found at i:9475 original size:64 final size:65
Alignment explanation
Indices: 9402--9533 Score: 239
Period size: 64 Copynumber: 2.0 Consensus size: 65
9392 TTGAGGGATC
9402 AAATGAATTATTATTCATTAATAATTATTTTTAAAAACAATTAATAATGTTTATTCA-TTTTAAT
1 AAATGAATTATTATTCATTAATAATTATTTTTAAAAACAATTAATAATGTTTATTCATTTTTAAT
* *
9466 AAATGAATTATTATTCATTAATTATTATTTTTTAAAACAATTAATAATGTTTATTCATTTTTAAT
1 AAATGAATTATTATTCATTAATAATTATTTTTAAAAACAATTAATAATGTTTATTCATTTTTAAT
9531 AAA
1 AAA
9534 ATTATTTTGA
Statistics
Matches: 65, Mismatches: 2, Indels: 1
0.96 0.03 0.01
Matches are distributed among these distances:
64 55 0.85
65 10 0.15
ACGTcount: A:0.43, C:0.05, G:0.03, T:0.49
Consensus pattern (65 bp):
AAATGAATTATTATTCATTAATAATTATTTTTAAAAACAATTAATAATGTTTATTCATTTTTAAT
Found at i:9747 original size:18 final size:19
Alignment explanation
Indices: 9706--9747 Score: 52
Period size: 19 Copynumber: 2.3 Consensus size: 19
9696 TAAAAATTAT
*
9706 AAATTTTATATATTTTTGA
1 AAATTTTATATACTTTTGA
9725 AAATTTTAT-TAACTTTT-A
1 AAATTTTATAT-ACTTTTGA
9743 AAATT
1 AAATT
9748 AATTGTTTAA
Statistics
Matches: 21, Mismatches: 1, Indels: 3
0.84 0.04 0.12
Matches are distributed among these distances:
18 7 0.33
19 14 0.67
ACGTcount: A:0.40, C:0.02, G:0.02, T:0.55
Consensus pattern (19 bp):
AAATTTTATATACTTTTGA
Found at i:10022 original size:11 final size:10
Alignment explanation
Indices: 9966--10020 Score: 58
Period size: 10 Copynumber: 5.5 Consensus size: 10
9956 TTACATTATT
*
9966 TTTTTATTAA
1 TTTTTATTGA
* *
9976 ATTTTATTCA
1 TTTTTATTGA
*
9986 CTTTTAATT-A
1 -TTTTTATTGA
9996 TTTTTATTGA
1 TTTTTATTGA
10006 TTTTTATTGA
1 TTTTTATTGA
10016 TTTTT
1 TTTTT
10021 TAAAAAGTGA
Statistics
Matches: 38, Mismatches: 5, Indels: 4
0.81 0.11 0.09
Matches are distributed among these distances:
9 7 0.18
10 25 0.66
11 6 0.16
ACGTcount: A:0.24, C:0.04, G:0.04, T:0.69
Consensus pattern (10 bp):
TTTTTATTGA
Found at i:21081 original size:13 final size:13
Alignment explanation
Indices: 21059--21114 Score: 60
Period size: 13 Copynumber: 4.2 Consensus size: 13
21049 TCAAGTTCGA
*
21059 TAATTCAAATACT
1 TAATTGAAATACT
21072 TAATTGAAATACT
1 TAATTGAAATACT
* *
21085 TAATT-AACTCAACA
1 TAATTGAAAT--ACT
21099 TAATTGAAATACT
1 TAATTGAAATACT
21112 TAA
1 TAA
21115 ATACTTCCAA
Statistics
Matches: 35, Mismatches: 5, Indels: 6
0.76 0.11 0.13
Matches are distributed among these distances:
12 3 0.09
13 22 0.63
14 7 0.20
15 3 0.09
ACGTcount: A:0.48, C:0.12, G:0.04, T:0.36
Consensus pattern (13 bp):
TAATTGAAATACT
Found at i:21196 original size:32 final size:33
Alignment explanation
Indices: 21100--21198 Score: 164
Period size: 33 Copynumber: 3.0 Consensus size: 33
21090 AACTCAACAT
* * *
21100 AATTGAAATACTTAAATACTTCCAAGTTTGATA
1 AATTCAAATACTTAAAAACTTCCAAGTTCGATA
21133 AATTCAAATACTTAAAAACTTCCAAGTTCGATA
1 AATTCAAATACTTAAAAACTTCCAAGTTCGATA
21166 AATTCAAATACTTAAAAACTT-CAAGTTCGATA
1 AATTCAAATACTTAAAAACTTCCAAGTTCGATA
21198 A
1 A
21199 TTGAAACAAA
Statistics
Matches: 63, Mismatches: 3, Indels: 1
0.94 0.04 0.01
Matches are distributed among these distances:
32 12 0.19
33 51 0.81
ACGTcount: A:0.45, C:0.15, G:0.07, T:0.32
Consensus pattern (33 bp):
AATTCAAATACTTAAAAACTTCCAAGTTCGATA
Found at i:21217 original size:21 final size:21
Alignment explanation
Indices: 21193--21232 Score: 71
Period size: 21 Copynumber: 1.9 Consensus size: 21
21183 ACTTCAAGTT
21193 CGATAATTGAAACAAAGTTTA
1 CGATAATTGAAACAAAGTTTA
*
21214 CGATAATTGAAATAAAGTT
1 CGATAATTGAAACAAAGTT
21233 ATAAAATAAA
Statistics
Matches: 18, Mismatches: 1, Indels: 0
0.95 0.05 0.00
Matches are distributed among these distances:
21 18 1.00
ACGTcount: A:0.47, C:0.07, G:0.15, T:0.30
Consensus pattern (21 bp):
CGATAATTGAAACAAAGTTTA
Found at i:23535 original size:11 final size:12
Alignment explanation
Indices: 23514--23559 Score: 56
Period size: 12 Copynumber: 3.6 Consensus size: 12
23504 TCCGGATAAA
23514 AACCGGTTTTTT
1 AACCGGTTTTTT
23526 AACCGGTTTTTTT
1 AACCGG-TTTTTT
23539 CAAACCGGTTTTTT
1 --AACCGGTTTTTT
*
23553 ATCCGGT
1 AACCGGT
23560 AAAAAAACCG
Statistics
Matches: 30, Mismatches: 1, Indels: 6
0.81 0.03 0.16
Matches are distributed among these distances:
12 12 0.40
13 6 0.20
14 6 0.20
15 6 0.20
ACGTcount: A:0.17, C:0.20, G:0.17, T:0.46
Consensus pattern (12 bp):
AACCGGTTTTTT
Found at i:23544 original size:15 final size:14
Alignment explanation
Indices: 23513--23552 Score: 57
Period size: 15 Copynumber: 2.9 Consensus size: 14
23503 TTCCGGATAA
23513 AAACCGG-TTTTTT
1 AAACCGGTTTTTTT
23526 -AACCGGTTTTTTT
1 AAACCGGTTTTTTT
23539 CAAACCGGTTTTTT
1 -AAACCGGTTTTTT
23553 ATCCGGTAAA
Statistics
Matches: 24, Mismatches: 0, Indels: 4
0.86 0.00 0.14
Matches are distributed among these distances:
12 6 0.25
13 6 0.25
15 12 0.50
ACGTcount: A:0.20, C:0.17, G:0.15, T:0.47
Consensus pattern (14 bp):
AAACCGGTTTTTTT
Found at i:26260 original size:2 final size:2
Alignment explanation
Indices: 26249--26278 Score: 53
Period size: 2 Copynumber: 15.5 Consensus size: 2
26239 AAGTAAATAA
26249 AT AT -T AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT A
1 AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT A
26279 AATTAATAGA
Statistics
Matches: 27, Mismatches: 0, Indels: 2
0.93 0.00 0.07
Matches are distributed among these distances:
1 1 0.04
2 26 0.96
ACGTcount: A:0.50, C:0.00, G:0.00, T:0.50
Consensus pattern (2 bp):
AT
Found at i:28395 original size:20 final size:20
Alignment explanation
Indices: 28361--28407 Score: 67
Period size: 20 Copynumber: 2.4 Consensus size: 20
28351 TGTTACGTTC
*
28361 ACATATTTACATTTGTATTT
1 ACATTTTTACATTTGTATTT
* *
28381 GCATTTTTACGTTTGTATTT
1 ACATTTTTACATTTGTATTT
28401 ACATTTT
1 ACATTTT
28408 CATTTTTTCA
Statistics
Matches: 23, Mismatches: 4, Indels: 0
0.85 0.15 0.00
Matches are distributed among these distances:
20 23 1.00
ACGTcount: A:0.23, C:0.11, G:0.09, T:0.57
Consensus pattern (20 bp):
ACATTTTTACATTTGTATTT
Found at i:36238 original size:112 final size:117
Alignment explanation
Indices: 36053--36495 Score: 508
Period size: 121 Copynumber: 3.8 Consensus size: 117
36043 TCACTCAATG
* * *
36053 GATCAACATTTCC-G-GAAGAGTTCATAATGAGAAGAACTCATCTGAAGAAGAAAGAAGAAGTTC
1 GATCAACTTTTCCAGAGAA-AGTTCATAATGAGAAGAACTTATCTGAAG-AGGAAGAAGAAGTTC
** * * *
36116 ATAATGAGAAGAACTTGTTCAACCTTT-TG-CT-TA-A-ATTCATCATTCGAT-A
64 ATAATGAGAAGAACTTGTTCAACCTTTATGACTCTACACA-GAAACAATAGATCA
*
36165 GATCAACTTTTCCAGAGAAAGTTCATAATGAGAAGAATTTATCTGAAGAGGAAGAAGAAGTTCAT
1 GATCAACTTTTCCAGAGAAAGTTCATAATGAGAAGAACTTATCTGAAGAGGAAGAAGAAGTTCAT
* *
36230 AATGAGAAGAACTTGTTCAACCTTTGCATGACTCTATCACAGAAAGAATAGATCT
66 AATGAGAAGAACTTGTTCAACCTTT--ATGACTCTA-CACAGAAACAATAGATCA
36285 GCATCAACTTTTCCAGAGAAAGTTCATAATGAGAAGAACTTATCTGAAGAGGAAGAAGAAGTTCA
1 G-ATCAACTTTTCCAGAGAAAGTTCATAATGAGAAGAACTTATCTGAAGAGGAAGAAGAAGTTCA
* * *
36350 TAATGAGAAGAACTTGTCCAACCTTTGCATGACTCTATCATAGAAAGAGATAGATCAA
65 TAATGAGAAGAACTTGTTCAACCTTT--ATGACTCTA-CACAGAAACA-ATAGATC-A
* * * ** * * *
36408 CATCAACATTTCTAGA-AGTGTTCATAATGAGAAGAGCTCATCTGAAGAAGAAGAAGAAGTTCAT
1 GATCAACTTTTCCAGAGAAAGTTCATAATGAGAAGAACTTATCTGAAGAGGAAGAAGAAGTTCAT
*
36472 AATGAGAATAACTTGTTCAACCTT
66 AATGAGAAGAACTTGTTCAACCTT
36496 GCCTTAATTC
Statistics
Matches: 292, Mismatches: 25, Indels: 19
0.87 0.07 0.06
Matches are distributed among these distances:
112 53 0.18
113 28 0.10
114 3 0.01
115 2 0.01
116 2 0.01
117 2 0.01
119 7 0.02
120 2 0.01
121 173 0.59
122 20 0.07
ACGTcount: A:0.40, C:0.15, G:0.19, T:0.26
Consensus pattern (117 bp):
GATCAACTTTTCCAGAGAAAGTTCATAATGAGAAGAACTTATCTGAAGAGGAAGAAGAAGTTCAT
AATGAGAAGAACTTGTTCAACCTTTATGACTCTACACAGAAACAATAGATCA
Found at i:36313 original size:121 final size:122
Alignment explanation
Indices: 36166--36495 Score: 529
Period size: 121 Copynumber: 2.7 Consensus size: 122
36156 CATTCGATAG
*
36166 ATCAACTTTTCCAGAGAAAGTTCATAATGAGAAGAATTTATCTGAAGAGGAAGAAGAAGTTCATA
1 ATCAACTTTTCCAGAGAAAGTTCATAATGAGAAGAACTTATCTGAAGAGGAAGAAGAAGTTCATA
**
36231 ATGAGAAGAACTTGTTCAACCTTTGCATGACTCTATCACAGAAAGA-ATAGATCTGC
66 ATGAGAAGAACTTGTTCAACCTTTGCATGACTCTATCACAGAAAGAGATAGATCAAC
36287 ATCAACTTTTCCAGAGAAAGTTCATAATGAGAAGAACTTATCTGAAGAGGAAGAAGAAGTTCATA
1 ATCAACTTTTCCAGAGAAAGTTCATAATGAGAAGAACTTATCTGAAGAGGAAGAAGAAGTTCATA
* *
36352 ATGAGAAGAACTTGTCCAACCTTTGCATGACTCTATCATAGAAAGAGATAGATCAAC
66 ATGAGAAGAACTTGTTCAACCTTTGCATGACTCTATCACAGAAAGAGATAGATCAAC
* * ** * * *
36409 ATCAACATTTCTAGA-AGTGTTCATAATGAGAAGAGCTCATCTGAAGAAGAAGAAGAAGTTCATA
1 ATCAACTTTTCCAGAGAAAGTTCATAATGAGAAGAACTTATCTGAAGAGGAAGAAGAAGTTCATA
*
36473 ATGAGAATAACTTGTTCAACCTT
66 ATGAGAAGAACTTGTTCAACCTT
36496 GCCTTAATTC
Statistics
Matches: 194, Mismatches: 14, Indels: 2
0.92 0.07 0.01
Matches are distributed among these distances:
121 173 0.89
122 21 0.11
ACGTcount: A:0.40, C:0.15, G:0.19, T:0.26
Consensus pattern (122 bp):
ATCAACTTTTCCAGAGAAAGTTCATAATGAGAAGAACTTATCTGAAGAGGAAGAAGAAGTTCATA
ATGAGAAGAACTTGTTCAACCTTTGCATGACTCTATCACAGAAAGAGATAGATCAAC
Found at i:36488 original size:242 final size:233
Alignment explanation
Indices: 36054--36495 Score: 570
Period size: 242 Copynumber: 1.9 Consensus size: 233
36044 CACTCAATGG
36054 ATCAACATTTCCGGAAGAGTTCATAATGAGAAGAACTCATCTGAAGAAGAAAGAAGAAGTTCATA
1 ATCAACATTTCCGGAAGAGTTCATAATGAGAAGAACTCATCTGAAGAAGAAAGAAGAAGTTCATA
* * **
36119 ATGAGAAGAACTTGTTCAACCTTTTGCTTAAATTCATCATTCGATAGATCAACTTTTCCAGAGAA
66 ATGAGAAGAACTTGTCCAACCTTTTGCATAAATTCATCATGAGATAGATCAACTTTTCCAGAGAA
* * *
36184 AGTTCATAATGAGAAGAATTTATCTGAAGAGGAAGAAGAAGTTCATAATGAGAAGAACTTGTTCA
131 AGTTCATAATGAGAAGAACTCATCTGAAGAAGAAGAAGAAGTTCATAATGAGAAGAACTTGTTCA
36249 ACCTTTGCATGACTCTATCACAGAAAGAATAGATCTGC
196 ACCTTTGCATGACTCTATCACAGAAAGAATAGATCTGC
* * *
36287 ATCAACTTTTCCAGAGAA-AGTTCATAATGAGAAGAACTTATCTGAAG-AGGAAGAAGAAGTTCA
1 ATCAACATTTCC-G-GAAGAGTTCATAATGAGAAGAACTCATCTGAAGAAGAAAGAAGAAGTTCA
* *
36350 TAATGAGAAGAACTTGTCCAACC-TTTGCAT-GACTCTATCATAGAAAGAGATAGATCAACATCA
64 TAATGAGAAGAACTTGTCCAACCTTTTGCATAAATTC-ATCAT-----GAGATAGATCAAC-T--
* ** *
36413 ACATTTCTAGA-AGTGTTCATAATGAGAAGAGCTCATCTGAAGAAGAAGAAGAAGTTCATAATGA
120 ---TTTCCAGAGAAAGTTCATAATGAGAAGAACTCATCTGAAGAAGAAGAAGAAGTTCATAATGA
*
36477 GAATAACTTGTTCAACCTT
182 GAAGAACTTGTTCAACCTT
36496 GCCTTAATTC
Statistics
Matches: 178, Mismatches: 17, Indels: 19
0.83 0.08 0.09
Matches are distributed among these distances:
231 3 0.02
232 11 0.06
233 48 0.27
234 29 0.16
235 3 0.02
237 11 0.06
238 1 0.01
242 65 0.37
243 7 0.04
ACGTcount: A:0.40, C:0.15, G:0.19, T:0.26
Consensus pattern (233 bp):
ATCAACATTTCCGGAAGAGTTCATAATGAGAAGAACTCATCTGAAGAAGAAAGAAGAAGTTCATA
ATGAGAAGAACTTGTCCAACCTTTTGCATAAATTCATCATGAGATAGATCAACTTTTCCAGAGAA
AGTTCATAATGAGAAGAACTCATCTGAAGAAGAAGAAGAAGTTCATAATGAGAAGAACTTGTTCA
ACCTTTGCATGACTCTATCACAGAAAGAATAGATCTGC
Found at i:36865 original size:3 final size:3
Alignment explanation
Indices: 36857--36920 Score: 78
Period size: 3 Copynumber: 22.0 Consensus size: 3
36847 TTTATTTTGT
* * *
36857 TTA TTA TTA TTA TTA TTA TTA TTA TTT TTT TTA ATA TTA TTA TTA -TA
1 TTA TTA TTA TTA TTA TTA TTA TTA TTA TTA TTA TTA TTA TTA TTA TTA
*
36904 TTA TT- TTA TTA CTA TTA
1 TTA TTA TTA TTA TTA TTA
36921 CATAATAATT
Statistics
Matches: 53, Mismatches: 6, Indels: 4
0.84 0.10 0.06
Matches are distributed among these distances:
2 4 0.08
3 49 0.92
ACGTcount: A:0.31, C:0.02, G:0.00, T:0.67
Consensus pattern (3 bp):
TTA
Found at i:39265 original size:17 final size:17
Alignment explanation
Indices: 39243--39277 Score: 52
Period size: 17 Copynumber: 2.1 Consensus size: 17
39233 ATTAACTTTG
*
39243 ACAAAATGTCAAATTTT
1 ACAAAAAGTCAAATTTT
*
39260 ACAAAAAGTCATATTTT
1 ACAAAAAGTCAAATTTT
39277 A
1 A
39278 TATTTTTCGA
Statistics
Matches: 16, Mismatches: 2, Indels: 0
0.89 0.11 0.00
Matches are distributed among these distances:
17 16 1.00
ACGTcount: A:0.49, C:0.11, G:0.06, T:0.34
Consensus pattern (17 bp):
ACAAAAAGTCAAATTTT
Found at i:39831 original size:27 final size:27
Alignment explanation
Indices: 39793--39860 Score: 127
Period size: 27 Copynumber: 2.5 Consensus size: 27
39783 CTTGGTTATG
39793 AAATTACAAAAATGTCTCTAAGAAGTA
1 AAATTACAAAAATGTCTCTAAGAAGTA
*
39820 AAATTACAAAAATGTCTCTATGAAGTA
1 AAATTACAAAAATGTCTCTAAGAAGTA
39847 AAATTACAAAAATG
1 AAATTACAAAAATG
39861 CCCTTGTATG
Statistics
Matches: 40, Mismatches: 1, Indels: 0
0.98 0.02 0.00
Matches are distributed among these distances:
27 40 1.00
ACGTcount: A:0.53, C:0.10, G:0.10, T:0.26
Consensus pattern (27 bp):
AAATTACAAAAATGTCTCTAAGAAGTA
Found at i:44615 original size:17 final size:17
Alignment explanation
Indices: 44590--44694 Score: 138
Period size: 17 Copynumber: 6.2 Consensus size: 17
44580 AACCTCGAAG
*
44590 TTTTTGATTGAAAACAA
1 TTTTCGATTGAAAACAA
44607 TTTTCGATTGAAAACAA
1 TTTTCGATTGAAAACAA
* * *
44624 TTTTCGATTAAAAATAG
1 TTTTCGATTGAAAACAA
* *
44641 TTTTCTATTGAAAACAG
1 TTTTCGATTGAAAACAA
*
44658 TTTTCGATTGAAAATAA
1 TTTTCGATTGAAAACAA
*
44675 TTTTCGATTGAAAATAA
1 TTTTCGATTGAAAACAA
44692 TTT
1 TTT
44695 ATTTATTTTA
Statistics
Matches: 78, Mismatches: 10, Indels: 0
0.89 0.11 0.00
Matches are distributed among these distances:
17 78 1.00
ACGTcount: A:0.39, C:0.08, G:0.11, T:0.42
Consensus pattern (17 bp):
TTTTCGATTGAAAACAA
Found at i:44651 original size:51 final size:51
Alignment explanation
Indices: 44588--44690 Score: 163
Period size: 51 Copynumber: 2.0 Consensus size: 51
44578 CCAACCTCGA
44588 AGTTTTTGATTGAAAACAATTTTCGATTGAAAACAATTTTCGATTAAAAAT
1 AGTTTTTGATTGAAAACAATTTTCGATTGAAAACAATTTTCGATTAAAAAT
* * *
44639 AGTTTTCT-ATTGAAAACAGTTTTCGATTGAAAATAATTTTCGATTGAAAAT
1 AGTTTT-TGATTGAAAACAATTTTCGATTGAAAACAATTTTCGATTAAAAAT
44690 A
1 A
44691 ATTTATTTAT
Statistics
Matches: 48, Mismatches: 3, Indels: 2
0.91 0.06 0.04
Matches are distributed among these distances:
51 47 0.98
52 1 0.02
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.13, T:0.40
Consensus pattern (51 bp):
AGTTTTTGATTGAAAACAATTTTCGATTGAAAACAATTTTCGATTAAAAAT
Found at i:45046 original size:24 final size:24
Alignment explanation
Indices: 44976--45070 Score: 140
Period size: 23 Copynumber: 4.0 Consensus size: 24
44966 GGTTCTTCGC
*
44976 GGTCCTTCGGGACAAA-TCTATGT
1 GGTCCTTCGGGACAAATTCTACGT
*
44999 GGTCCTTCGGGAC-ATTTCTACGT
1 GGTCCTTCGGGACAAATTCTACGT
45022 GGTCCTTCGGGACAAATTCTACGT
1 GGTCCTTCGGGACAAATTCTACGT
* *
45046 GGTCCTTTGGGAAAAATTCTACGT
1 GGTCCTTCGGGACAAATTCTACGT
45070 G
1 G
45071 ACACTTCGGT
Statistics
Matches: 65, Mismatches: 5, Indels: 3
0.89 0.07 0.04
Matches are distributed among these distances:
22 1 0.02
23 32 0.49
24 32 0.49
ACGTcount: A:0.20, C:0.22, G:0.26, T:0.32
Consensus pattern (24 bp):
GGTCCTTCGGGACAAATTCTACGT
Found at i:45086 original size:48 final size:47
Alignment explanation
Indices: 44979--45087 Score: 125
Period size: 48 Copynumber: 2.3 Consensus size: 47
44969 TCTTCGCGGT
* * * *
44979 CCTTCGGGACAAA-TCTATGTGGTCCTTCGGGACATTTCTACGTGGT
1 CCTTCGGGACAAATTCTACGTGGTCCTTCGGGAAAATTCTACGTGGA
*
45025 CCTTCGGGACAAATTCTACGTGGTCCTTTGGGAAAAATTCTACGT-GA
1 CCTTCGGGACAAATTCTACGTGGTCCTTCGGG-AAAATTCTACGTGGA
45072 CACTTCGGTG-CAAATT
1 C-CTTCGG-GACAAATT
45088 ATATGAGCAG
Statistics
Matches: 54, Mismatches: 5, Indels: 6
0.83 0.08 0.09
Matches are distributed among these distances:
46 13 0.24
47 18 0.33
48 22 0.41
49 1 0.02
ACGTcount: A:0.22, C:0.23, G:0.24, T:0.31
Consensus pattern (47 bp):
CCTTCGGGACAAATTCTACGTGGTCCTTCGGGAAAATTCTACGTGGA
Found at i:45531 original size:2 final size:2
Alignment explanation
Indices: 45524--45567 Score: 88
Period size: 2 Copynumber: 22.0 Consensus size: 2
45514 GAGTTTATGA
45524 AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT
1 AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT
45566 AT
1 AT
45568 TTATTTTATT
Statistics
Matches: 42, Mismatches: 0, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
2 42 1.00
ACGTcount: A:0.50, C:0.00, G:0.00, T:0.50
Consensus pattern (2 bp):
AT
Found at i:58069 original size:7 final size:7
Alignment explanation
Indices: 58049--58087 Score: 51
Period size: 7 Copynumber: 5.3 Consensus size: 7
58039 ATGATGTTCG
*
58049 AAAAAGG
1 AAAAAGA
58056 AAAAAGA
1 AAAAAGA
58063 AAAAAGA
1 AAAAAGA
58070 AAGAAAGA
1 AA-AAAGA
58078 AGAAAAGA
1 A-AAAAGA
58086 AA
1 AA
58088 GACGTGAAAA
Statistics
Matches: 29, Mismatches: 1, Indels: 4
0.85 0.03 0.12
Matches are distributed among these distances:
7 16 0.55
8 12 0.41
9 1 0.03
ACGTcount: A:0.79, C:0.00, G:0.21, T:0.00
Consensus pattern (7 bp):
AAAAAGA
Found at i:58084 original size:12 final size:12
Alignment explanation
Indices: 58057--58089 Score: 50
Period size: 11 Copynumber: 2.8 Consensus size: 12
58047 CGAAAAAGGA
*
58057 AAAAGAAAAAAG
1 AAAAGAAAGAAG
58069 -AAAGAAAGAAG
1 AAAAGAAAGAAG
58080 AAAAGAAAGA
1 AAAAGAAAGA
58090 CGTGAAAAAG
Statistics
Matches: 19, Mismatches: 1, Indels: 2
0.86 0.05 0.09
Matches are distributed among these distances:
11 10 0.53
12 9 0.47
ACGTcount: A:0.79, C:0.00, G:0.21, T:0.00
Consensus pattern (12 bp):
AAAAGAAAGAAG
Found at i:58085 original size:16 final size:15
Alignment explanation
Indices: 58049--58089 Score: 57
Period size: 16 Copynumber: 2.7 Consensus size: 15
58039 ATGATGTTCG
*
58049 AAAAAGGAA-AAAGA
1 AAAAAGAAAGAAAGA
58063 AAAAAGAAAGAAAGA
1 AAAAAGAAAGAAAGA
58078 AGAAAAGAAAGA
1 A-AAAAGAAAGA
58090 CGTGAAAAAG
Statistics
Matches: 24, Mismatches: 1, Indels: 2
0.89 0.04 0.07
Matches are distributed among these distances:
14 8 0.33
15 6 0.25
16 10 0.42
ACGTcount: A:0.78, C:0.00, G:0.22, T:0.00
Consensus pattern (15 bp):
AAAAAGAAAGAAAGA
Found at i:60883 original size:24 final size:23
Alignment explanation
Indices: 60818--60908 Score: 69
Period size: 24 Copynumber: 3.9 Consensus size: 23
60808 GGTTCTATGC
**
60818 GGTCCTTCGGGACAAA-TCTAGGT
1 GGTCCTTCGGGA-AAATTCTACAT
* *
60841 -GTCATTCGGGACAATTCTACAT
1 GGTCCTTCGGGAAAATTCTACAT
* **
60863 GGTCTTTCGGGATAAATTCTATGT
1 GGTCCTTCGGGA-AAATTCTACAT
*
60887 TGTCCTTCGGGAAAAATTCTAC
1 GGTCCTTCGGG-AAAATTCTAC
60909 GTGGCACTTC
Statistics
Matches: 53, Mismatches: 11, Indels: 7
0.75 0.15 0.10
Matches are distributed among these distances:
21 2 0.04
22 15 0.28
23 10 0.19
24 25 0.47
25 1 0.02
ACGTcount: A:0.24, C:0.20, G:0.23, T:0.33
Consensus pattern (23 bp):
GGTCCTTCGGGAAAATTCTACAT
Found at i:60918 original size:24 final size:23
Alignment explanation
Indices: 60821--60918 Score: 65
Period size: 24 Copynumber: 4.2 Consensus size: 23
60811 TCTATGCGGT
* * *
60821 CCTTCGGGACAAA-TCTAGGTGT
1 CCTTCGGGAAAAATTCTACGTGG
* * *
60843 CATTCGGG-ACAATTCTACATGG
1 CCTTCGGGAAAAATTCTACGTGG
* * * *
60865 TCTTTCGGGATAAATTCTATGTTGT
1 -CCTTCGGGAAAAATTCTACG-TGG
60890 CCTTCGGGAAAAATTCTACGTGG
1 CCTTCGGGAAAAATTCTACGTGG
60913 CACTTC
1 C-CTTC
60919 AATGCAAATT
Statistics
Matches: 55, Mismatches: 16, Indels: 8
0.70 0.20 0.10
Matches are distributed among these distances:
21 2 0.04
22 13 0.24
23 10 0.18
24 28 0.51
25 2 0.04
ACGTcount: A:0.23, C:0.21, G:0.22, T:0.33
Consensus pattern (23 bp):
CCTTCGGGAAAAATTCTACGTGG
Found at i:65347 original size:22 final size:24
Alignment explanation
Indices: 65316--65365 Score: 59
Period size: 22 Copynumber: 2.2 Consensus size: 24
65306 TGTATATCAT
* * *
65316 ATAACACATATATCATTTCATA-A
1 ATAACACATACATAATATCATATA
65339 ATAA-ACATACATAATATCATATA
1 ATAACACATACATAATATCATATA
65362 ATAA
1 ATAA
65366 TACAAAGACT
Statistics
Matches: 23, Mismatches: 3, Indels: 2
0.82 0.11 0.07
Matches are distributed among these distances:
22 14 0.61
23 9 0.39
ACGTcount: A:0.54, C:0.14, G:0.00, T:0.32
Consensus pattern (24 bp):
ATAACACATACATAATATCATATA
Found at i:65547 original size:21 final size:21
Alignment explanation
Indices: 65498--65561 Score: 92
Period size: 22 Copynumber: 3.0 Consensus size: 21
65488 ATATGAAATT
65498 TTGTCCCGAAGGACCTATGAA
1 TTGTCCCGAAGGACCTATGAA
* *
65519 TATGTCCCAAAGGACCTATGAG
1 T-TGTCCCGAAGGACCTATGAA
*
65541 TTGTCCCGAATGACCTATGAA
1 TTGTCCCGAAGGACCTATGAA
65562 ACCCTCAACT
Statistics
Matches: 37, Mismatches: 5, Indels: 2
0.84 0.11 0.05
Matches are distributed among these distances:
21 18 0.49
22 19 0.51
ACGTcount: A:0.30, C:0.23, G:0.22, T:0.25
Consensus pattern (21 bp):
TTGTCCCGAAGGACCTATGAA
Found at i:67995 original size:22 final size:21
Alignment explanation
Indices: 67967--68010 Score: 61
Period size: 21 Copynumber: 2.0 Consensus size: 21
67957 TTTCCTAAAA
*
67967 TGCTACAGGGGTATCGATACCC
1 TGCTACA-GGGTACCGATACCC
*
67989 TGCTACAGTGTACCGATACCC
1 TGCTACAGGGTACCGATACCC
68010 T
1 T
68011 TACTACAGTA
Statistics
Matches: 20, Mismatches: 2, Indels: 1
0.87 0.09 0.04
Matches are distributed among these distances:
21 13 0.65
22 7 0.35
ACGTcount: A:0.23, C:0.30, G:0.23, T:0.25
Consensus pattern (21 bp):
TGCTACAGGGTACCGATACCC
Found at i:68007 original size:21 final size:22
Alignment explanation
Indices: 67967--68019 Score: 63
Period size: 22 Copynumber: 2.4 Consensus size: 22
67957 TTTCCTAAAA
* *
67967 TGCTACAGGGGTATCGATACCC-
1 TGCTACA-GTGTACCGATACCCT
67989 TGCTACAGTGTACCGATACCCT
1 TGCTACAGTGTACCGATACCCT
*
68011 TACTACAGT
1 TGCTACAGT
68020 AAATTTTGGT
Statistics
Matches: 27, Mismatches: 3, Indels: 2
0.84 0.09 0.06
Matches are distributed among these distances:
21 12 0.44
22 15 0.56
ACGTcount: A:0.25, C:0.28, G:0.21, T:0.26
Consensus pattern (22 bp):
TGCTACAGTGTACCGATACCCT
Found at i:68687 original size:22 final size:21
Alignment explanation
Indices: 68661--68724 Score: 76
Period size: 22 Copynumber: 3.0 Consensus size: 21
68651 ATATGAAATT
*
68661 TTGTCCCGAAGAACCTGTGAA
1 TTGTCCCGAAGAACCTATGAA
* *
68682 TATGTCCCAAAGAACCTATGAG
1 T-TGTCCCGAAGAACCTATGAA
68704 TTGTCCCGAATG-ACCTATGAA
1 TTGTCCCGAA-GAACCTATGAA
68725 ACCCTCGACT
Statistics
Matches: 36, Mismatches: 5, Indels: 4
0.80 0.11 0.09
Matches are distributed among these distances:
21 17 0.47
22 19 0.53
ACGTcount: A:0.31, C:0.23, G:0.20, T:0.25
Consensus pattern (21 bp):
TTGTCCCGAAGAACCTATGAA
Found at i:74923 original size:21 final size:23
Alignment explanation
Indices: 74890--74941 Score: 63
Period size: 22 Copynumber: 2.3 Consensus size: 23
74880 TTCAAAAGAT
*
74890 AAAAAAGAGAGGGGGATTCG-AAC
1 AAAAAA-AGAGGGGGAATCGAAAC
*
74913 AAAAAAA-AGGGTGAATCGAAAC
1 AAAAAAAGAGGGGGAATCGAAAC
74935 AAAAAAA
1 AAAAAAA
74942 TGAAAAAAAG
Statistics
Matches: 26, Mismatches: 2, Indels: 3
0.84 0.06 0.10
Matches are distributed among these distances:
21 9 0.35
22 11 0.42
23 6 0.23
ACGTcount: A:0.60, C:0.08, G:0.25, T:0.08
Consensus pattern (23 bp):
AAAAAAAGAGGGGGAATCGAAAC
Found at i:75531 original size:10 final size:11
Alignment explanation
Indices: 75509--75541 Score: 50
Period size: 11 Copynumber: 3.0 Consensus size: 11
75499 TTGAAATATA
75509 AATTTTAAATTT
1 AATTTT-AATTT
75521 AA-TTTAATTT
1 AATTTTAATTT
75531 AATTTTAATTT
1 AATTTTAATTT
75542 CAGTCATTTA
Statistics
Matches: 20, Mismatches: 0, Indels: 3
0.87 0.00 0.13
Matches are distributed among these distances:
10 7 0.35
11 11 0.55
12 2 0.10
ACGTcount: A:0.39, C:0.00, G:0.00, T:0.61
Consensus pattern (11 bp):
AATTTTAATTT
Found at i:78357 original size:32 final size:30
Alignment explanation
Indices: 78289--78357 Score: 86
Period size: 32 Copynumber: 2.2 Consensus size: 30
78279 ATTAAAATAT
*
78289 CTAAAG-TATTTTTTTTATCAAAATAGGTA
1 CTAAAGTTATTTTTTTTATCAAAATAGATA
*
78318 CTCAAAGTTATATTTTTTTGTCAAAATAGATA
1 CT-AAAGTTAT-TTTTTTTATCAAAATAGATA
78350 CATAAAGT
1 C-TAAAGT
78358 ACTCAATTAT
Statistics
Matches: 34, Mismatches: 2, Indels: 5
0.83 0.05 0.12
Matches are distributed among these distances:
29 2 0.06
30 4 0.12
31 3 0.09
32 24 0.71
33 1 0.03
ACGTcount: A:0.39, C:0.09, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (30 bp):
CTAAAGTTATTTTTTTTATCAAAATAGATA
Found at i:80795 original size:26 final size:27
Alignment explanation
Indices: 80742--80795 Score: 67
Period size: 27 Copynumber: 2.0 Consensus size: 27
80732 ATAAAAGGTA
* *
80742 TTTAATTATGATTTTTATTTTTATATT
1 TTTAATTATGATTTTGATATTTATATT
80769 TTTAA-TATGATTATTGATATTTA-ATT
1 TTTAATTATGATT-TTGATATTTATATT
80795 T
1 T
80796 ATTAGTTTAT
Statistics
Matches: 24, Mismatches: 2, Indels: 3
0.83 0.07 0.10
Matches are distributed among these distances:
26 11 0.46
27 13 0.54
ACGTcount: A:0.30, C:0.00, G:0.06, T:0.65
Consensus pattern (27 bp):
TTTAATTATGATTTTGATATTTATATT
Found at i:81423 original size:71 final size:72
Alignment explanation
Indices: 81293--81442 Score: 248
Period size: 71 Copynumber: 2.1 Consensus size: 72
81283 ATTTTGTAAC
* * *
81293 AATTTTTAGTTTATCTGCTACTTCGTTAAAAAATCTCTTTAATTAATAATAAGTTGGCATATCGT
1 AATTTATAGTTTATATGCTACTTCGTTAAAAAACCTCTTTAATTAATAATAAGTTGGCATATCGT
81358 CTAAATT
66 CTAAATT
* *
81365 AATTTATAGTTTATATGTTACTTCGTT-AAAACCCTCTTTAATTAATAATAAGTTGGCATATCGT
1 AATTTATAGTTTATATGCTACTTCGTTAAAAAACCTCTTTAATTAATAATAAGTTGGCATATCGT
81429 CTAAATT
66 CTAAATT
81436 AATTTAT
1 AATTTAT
81443 TTTTTAATAA
Statistics
Matches: 73, Mismatches: 5, Indels: 1
0.92 0.06 0.01
Matches are distributed among these distances:
71 49 0.67
72 24 0.33
ACGTcount: A:0.34, C:0.12, G:0.09, T:0.45
Consensus pattern (72 bp):
AATTTATAGTTTATATGCTACTTCGTTAAAAAACCTCTTTAATTAATAATAAGTTGGCATATCGT
CTAAATT
Found at i:94909 original size:21 final size:21
Alignment explanation
Indices: 94883--94922 Score: 71
Period size: 21 Copynumber: 1.9 Consensus size: 21
94873 TTCTACGTGG
*
94883 TCCTTTGGGACATATATGTAA
1 TCCTTTGGAACATATATGTAA
94904 TCCTTTGGAACATATATGT
1 TCCTTTGGAACATATATGT
94923 GGTACTTCGG
Statistics
Matches: 18, Mismatches: 1, Indels: 0
0.95 0.05 0.00
Matches are distributed among these distances:
21 18 1.00
ACGTcount: A:0.28, C:0.15, G:0.17, T:0.40
Consensus pattern (21 bp):
TCCTTTGGAACATATATGTAA
Found at i:95031 original size:18 final size:19
Alignment explanation
Indices: 94999--95036 Score: 60
Period size: 18 Copynumber: 2.1 Consensus size: 19
94989 GACATATATG
*
94999 ATATGTGGTCCTTCGGGAC
1 ATATGTGGTCATTCGGGAC
95018 ATAT-TGGTCATTCGGGAC
1 ATATGTGGTCATTCGGGAC
95036 A
1 A
95037 AATTTTAAGT
Statistics
Matches: 18, Mismatches: 1, Indels: 1
0.90 0.05 0.05
Matches are distributed among these distances:
18 14 0.78
19 4 0.22
ACGTcount: A:0.21, C:0.18, G:0.29, T:0.32
Consensus pattern (19 bp):
ATATGTGGTCATTCGGGAC
Found at i:100964 original size:2 final size:2
Alignment explanation
Indices: 100959--101031 Score: 132
Period size: 2 Copynumber: 37.5 Consensus size: 2
100949 TGTGTGTGTG
100959 TA TA TA TA TA TA TA TA TA TA TA TA TA TA TA TA TA TA TA TA TA
1 TA TA TA TA TA TA TA TA TA TA TA TA TA TA TA TA TA TA TA TA TA
101001 TA -A TA TA TA TA TA TA TA TA TA TA T- TA TA TA T
1 TA TA TA TA TA TA TA TA TA TA TA TA TA TA TA TA T
101032 TCTACTCGTG
Statistics
Matches: 69, Mismatches: 0, Indels: 4
0.95 0.00 0.05
Matches are distributed among these distances:
1 2 0.03
2 67 0.97
ACGTcount: A:0.49, C:0.00, G:0.00, T:0.51
Consensus pattern (2 bp):
TA
Found at i:101717 original size:20 final size:20
Alignment explanation
Indices: 101680--101719 Score: 53
Period size: 20 Copynumber: 2.0 Consensus size: 20
101670 TTCTCAATAC
* *
101680 AACATACAATGGGCTTTTAT
1 AACATACAATGAGATTTTAT
*
101700 AACATACAATGATATTTTAT
1 AACATACAATGAGATTTTAT
101720 TTCGATTCAT
Statistics
Matches: 17, Mismatches: 3, Indels: 0
0.85 0.15 0.00
Matches are distributed among these distances:
20 17 1.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.12, G:0.10, T:0.38
Consensus pattern (20 bp):
AACATACAATGAGATTTTAT
Found at i:111449 original size:21 final size:21
Alignment explanation
Indices: 111384--111449 Score: 57
Period size: 21 Copynumber: 3.2 Consensus size: 21
111374 ATATTTTATT
* *
111384 TTAATAATTTAGTATTAATATCC
1 TTAATAATTTA-TTTTAAT-TAC
* *
111407 TTAA-AA-ATATTTT-ATTAA
1 TTAATAATTTATTTTAATTAC
111425 TTAATAATTTATTTTAATTAC
1 TTAATAATTTATTTTAATTAC
111446 TTAA
1 TTAA
111450 AAATAAATAA
Statistics
Matches: 34, Mismatches: 6, Indels: 8
0.71 0.12 0.17
Matches are distributed among these distances:
18 5 0.15
19 4 0.12
20 9 0.26
21 10 0.29
22 2 0.06
23 4 0.12
ACGTcount: A:0.42, C:0.05, G:0.02, T:0.52
Consensus pattern (21 bp):
TTAATAATTTATTTTAATTAC
Found at i:111449 original size:39 final size:39
Alignment explanation
Indices: 111374--111454 Score: 112
Period size: 39 Copynumber: 2.1 Consensus size: 39
111364 TTATATATTT
*
111374 ATATTTTATTTTAATAATTTAGTATTAATATCCTTAAAA
1 ATATTTTATTTTAATAATTTAGTATTAATATACTTAAAA
*
111413 ATATTTTATTAATTAATAATTTA-TTTTAAT-TACTTAAAA
1 ATATTTTATT--TTAATAATTTAGTATTAATATACTTAAAA
111452 ATA
1 ATA
111455 AATAAAATTC
Statistics
Matches: 38, Mismatches: 2, Indels: 4
0.86 0.05 0.09
Matches are distributed among these distances:
39 21 0.55
40 6 0.16
41 11 0.29
ACGTcount: A:0.43, C:0.04, G:0.01, T:0.52
Consensus pattern (39 bp):
ATATTTTATTTTAATAATTTAGTATTAATATACTTAAAA
Found at i:111571 original size:3 final size:3
Alignment explanation
Indices: 111565--111590 Score: 52
Period size: 3 Copynumber: 8.7 Consensus size: 3
111555 TATTTATTAT
111565 ATA ATA ATA ATA ATA ATA ATA ATA AT
1 ATA ATA ATA ATA ATA ATA ATA ATA AT
111591 TTCATTTGAA
Statistics
Matches: 23, Mismatches: 0, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
3 23 1.00
ACGTcount: A:0.65, C:0.00, G:0.00, T:0.35
Consensus pattern (3 bp):
ATA
Found at i:112865 original size:87 final size:87
Alignment explanation
Indices: 112716--113846 Score: 1669
Period size: 87 Copynumber: 13.0 Consensus size: 87
112706 CTGTTAGAAC
*
112716 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTTTTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
*
112781 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTA
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
* * **
112803 AATATAGGTGTAACTCTTTAAGTTTTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTAT
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
* *
112868 ATTCATATAACTTTAACTCTTT
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
* * *
112890 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGTACGCCTAAGCAAAATGACTAG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
* *
112955 ATTTAGATAGGTTTAACTCTTT
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
** * *
112977 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTCATTAGAAAAACTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
*
113042 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTA
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
* * * * *
113064 AAGATAGGTGTAACTCCTTAAGTTTTTTTTGTTAGAATAATTGTCAGGCCTAAGAAAAATGACTG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAG-TATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTG
113129 GATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
65 GATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
*
113152 AAGATAGGAGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
*
113217 ATTCATATAGCTTTAACTCTTT
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
*
113239 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATTACT-G
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
*
113303 ATTCGGATAGCTTTAACTCTTT
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
*
113325 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTT-TTAGAATAATTGACATGCCTAAG-ACAAATGACTG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCA-AAATGACTG
* *
113388 GATTCATATAGCTTTAACTATTT
65 GATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
* * *
113411 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAAAAATTGGCATG-CTAAGAAAAATGACTGA
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
* * *
113475 ATTCAGTTAGTTTTAACTATTT
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
* * * * *
113497 AAGATAGGTGTACCTCTGTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGAAAAATAACTAG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
** *
113562 ATTCAGAGGGCTTTAGCTCTTT
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
*** * *
113584 AAGATAGGCACAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGTATGCCTAAGCAAAATGATTGG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
*
113649 ATTCAGATAGATTTAACTCTTT
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
* *
113671 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATCATTGG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
* * *
113736 ATTCATATAGCTGTAACTCATT
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
* * * * *
113758 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTT-TTAGAAAAATTGGCATGCTTATGAAAAATGAATGG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
113822 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
113844 AAG
1 AAG
113847 TATTTTTTAG
Statistics
Matches: 937, Mismatches: 101, Indels: 13
0.89 0.10 0.01
Matches are distributed among these distances:
84 1 0.00
85 29 0.03
86 227 0.24
87 604 0.64
88 76 0.08
ACGTcount: A:0.34, C:0.12, G:0.17, T:0.37
Consensus pattern (87 bp):
AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
ATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
Found at i:112983 original size:19 final size:19
Alignment explanation
Indices: 112959--112998 Score: 71
Period size: 19 Copynumber: 2.1 Consensus size: 19
112949 GACTAGATTT
*
112959 AGATAGGTTTAACTCTTTA
1 AGATAGGTGTAACTCTTTA
112978 AGATAGGTGTAACTCTTTA
1 AGATAGGTGTAACTCTTTA
112997 AG
1 AG
112999 TATTTTCATT
Statistics
Matches: 20, Mismatches: 1, Indels: 0
0.95 0.05 0.00
Matches are distributed among these distances:
19 20 1.00
ACGTcount: A:0.33, C:0.10, G:0.20, T:0.38
Consensus pattern (19 bp):
AGATAGGTGTAACTCTTTA
Found at i:113023 original size:174 final size:174
Alignment explanation
Indices: 112716--134553 Score: 25899
Period size: 174 Copynumber: 130.6 Consensus size: 174
112706 CTGTTAGAAC
*
112716 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTTTTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
* * *
112781 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTAAATATAGGTGTAACTCTTTAAGTTTTTTTGTTAGAATAATTGG
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
** * *
112846 CATGCCTAAGCAAAATGACTATATTCATATAACTTTAACTCTTT
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
* * *
112890 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGTACGCCTAAGCAAAATGACTAG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
* * ** * *
112955 ATTTAGATAGGTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTCATTAGAAAAACTGG
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
*
113020 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTA
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
* * * * *
113064 AAGATAGGTGTAACTCCTTAAGTTTTTTTTGTTAGAATAATTGTCAGGCCTAAGAAAAATGACTG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAG-TATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTG
*
113129 GATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGAGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTG
65 GATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTG
*
113194 GCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCATATAGCTTTAACTCTTT
130 GCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
*
113239 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATTACT-G
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
* *
113303 ATTCGGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTT-TTAGAATAATTGA
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
* *
113367 CATGCCTAAG-ACAAATGACTGGATTCATATAGCTTTAACTATTT
131 CATGCCTAAGCA-AAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
* * *
113411 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAAAAATTGGCATG-CTAAGAAAAATGACTGA
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
* * * * *
113475 ATTCAGTTAGTTTTAACTATTTAAGATAGGTGTACCTCTGTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
* * * ** *
113540 CATGCCTAAGAAAAATAACTAGATTCAGAGGGCTTTAGCTCTTT
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
*** * *
113584 AAGATAGGCACAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGTATGCCTAAGCAAAATGATTGG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
*
113649 ATTCAGATAGATTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
* * * * *
113714 CATGCCTAAGCAAAATCATTGGATTCATATAGCTGTAACTCATT
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
* * * * *
113758 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTT-TTAGAAAAATTGGCATGCTTATGAAAAATGAATGG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
* ** *
113822 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAG-TA--T-T---T-TTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAA
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTA-AGT-ATT--TTTG--TTAG-AA
* * * ** * * * * *
113879 -AATGACTGG-ATTCAGTTAGC--TTTAACT--ATTTAAGATAAG-TGTAACACTGT
124 TAAT---TGGCATGC-CTAAGCAAAATGACTGGA-TTCAGAT-AGCTTTAACTCTTT
*** * ** * * *** * * * * ** *
113929 AAGTATTTTTGTTAGAATAATT-GGCA--TGCCTAAGAA-AAATGG--T-TCGATTC-AGAT-AG
1 AAG-ATAGGTG-TA-ACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGA-
** * *** * * *** * * * * ** *
113985 CTTTAACTCTTTTAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAC-TT-GGCATGCCTAAG-C
62 C-TGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAG-ATAGGTG-TA-ACT-CTTTAAGTAT--TTTTGTT
* * * * * * * * * * *
114047 AAAATGATTAG-ATTCATATAGC--ATTAACTCG-TTAAGATAGGTGTAACTCTTT
120 AGAATAATTGGCATGCCTA-AGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
* *** * ** * ** * * * * * *
114099 AACTATTTTTGTTAGAATAATT--GTCATGCCTAAG-CAAAATGATTGG-ATTCATATAGC--AT
1 AA-GATAGGTG-TA-ACTCTTTAAGT-AT--TTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTA-AGCAAAA
* * * * * * * * *** **
114158 TAACT-CATTAAGATAGGTGTAACTCTTTAA-CTA--T-T---T-TTGTTAGAAAAATTGGCATG
59 TGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTT-TAAGTATTTTTGTTA-G
** ***** * * ** * * * * *
114214 CCTAAGCAAAATGACT--GGATTCA-GA-TAGCTT----TAACTCTTAA--ATAT
122 AATAATTGGCATGCCTAAGCA-AAATGACTGGATTCAGATAGCT-TTAACTCTTT
* * * * ** *
114259 -AGGT--GT-AACTC-CTTAAGTTTTTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAG-AAAATGA-TG
1 AAGATAGGTGTA-ACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTG
114317 GATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTG
65 GATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTG
* * *
114382 GCATGCCTAAGCAAATTGACTGAATTTAGATAGCTTTAACTCTTT
130 GCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
* *
114427 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAAAAACTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
* * * * *
114492 ATTCAGGTATCTTTAACTC-TTATATATAGGTGTAACTCTTTATGTTTTTTTGTTAGAATAATTG
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTA-AGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTG
* * * * *
114556 TCATCCCTAAGCAAAATGAATGAATTCAGATAGCTTT-ACGCTTT
130 GCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
* *
114600 AAGATAGGAGTAACTCTTAAAGTATTTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTA-TTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTG
*
114665 GATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTT
65 GATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTG
*
114730 GCTTGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
130 GCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
* * *
114775 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTTTTTTTGTTTGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAATTGACTGG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
* * *
114840 ATTTAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAAAAACTGG
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
* *
114905 CATGCCTAAGCAAAATGATTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTA
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
* * * *
114949 AATATAGGTG----TCTTTATGT-TTTTT-TTAGAATAATTGTCATGCCTAAGCAAAATGATTGG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
* *
115008 ATTCAGATAGCTTTAACGCTTTAAGATAGGAGTAACT-TTGTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTG
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTT-TAAGTATTTTTGTTAGAATAATTG
** *
115072 GCATGCCTAAGCAAAATGGTTGGATTCAGATAGCTTTAAATCTTT
130 GCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
* *
115117 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGATTAG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
* * * * * * *
115182 ATTCATATAGCATTAACTCGTTAAGATATGTGTAACTCCTTAAGTTTTTTTGTTAGAATAATTGT
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
* * *
115247 CAGGCCTAAGAAAAATGACTAGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
* * *
115291 AAGATAGGAGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAATCAAAATGACTAG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
* *
115356 ATTCATATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGATGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
* *
115421 CATGCCTAAGCAAAATTACTGGATTCGGATAGCTTTAACTCTTT
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
* *
115465 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGACATGCCTAAG-ACAAATGACAG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCA-AAATGACTG
* * * * *
115529 GACTCATATAGCTTTAACTCATTAAAATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAAAAATTG
65 GATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTG
* * * * *
115594 GCAAGCCTAAGTAAAATGACTGAATTCAGTTAGCTTTAACTATTT
130 GCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
* * * *
115639 AGGATAGGTGTAACT-TTGTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGAAAAATAACTA
1 AAGATAGGTGTAACTCTT-TAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTG
***
115703 GATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGCACAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTG
65 GATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTG
* * * * * **
115768 GTATGCCTATGCAAAATGATTGGATTTAGATAGATTTAACAGTTT
130 GCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
* *
115813 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATCATTGG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
* *
115878 ATTCATATAGCTTTAACTCTTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAAAAATTG
66 ATTCAGATAGCTTTAACTC-TTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTG
* *
115943 GCATTCTTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
130 GCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
* *
115988 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTTAGCAAAATGATTG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTA-TTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTG
* * * *
116053 GATTCATATATCTTTAACTCATTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAAAAATTG
65 GATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTG
* *
116118 GCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGTTAGCTTTAACTATTT
130 GCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
* * * **
116163 AAGATAAGTGTAACTCTGTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGAAAAATGGTTGG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
* *
116228 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTCAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATACTTGG
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
* * * ** *
116293 CATGCCTAAGAAAAATGATTGGATTCATATAGCAATAACTCGTT
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
* *
116337 AAGATAGGTGTAACTCTTTAACTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGATTGG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
* * * * *
116402 ATTCATATAGCATTAACTCATTAAGATAGGTGTAACTCTTTAATTATTTTTGTTAGAAAAATTGG
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
*
116467 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTA
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
* * * *
116511 AATATAGGTGTAACTCTTTCAGT-TTTTTTTTAGAATAATTGGCATGCCAAAGCAAAATGACTGG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
*
116575 ATTCAGATAGCTTTAACACTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
* * *
116640 CATGCCTAAGCAAATTGATTGGATTTAGATAGCTTTAACTCTTT
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
* *
116684 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTA-TTTTGTTAGAAAAACTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
* * * *
116748 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTAAATATAGGTGTAACTCTTT-A-TGTTTTT-TTAGAATAATTGT
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
* * *
116810 CATGCCTAAGCAAAATGATTGGATTCATATAGCTTTAACGCTTT
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
* * * *
116854 AAGATATGAGTAACTCCTTAAGTATTTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCAAAGCAAAATGACTG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTA-TTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTG
* *
116919 GATTCAGATAGATTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTT
65 GATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTG
* * *
116984 GCTTGCCTAAGAAAAATGACTAGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
130 GCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
*
117029 AAGATAGGTGTAACTCCTTT-AG--TTTTT-TTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGGCTG
1 AAGATAGGTGTAACT-CTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTG
* * * *
117090 GATTTAGATAGCTTTAACTATATAAGATAGGTGTAACTCTCTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTG
65 GATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTG
** *
117155 GCATGCCTAAGCAAAATGGTTGGATTCAGATAGCTTTAAATCTTT
130 GCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
** * *
117200 AAGATAGGTGTAACAATTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGATTAG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
* * * * * *
117265 ATTCATATAACATTAACTCGTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAACTATTTAT-TTAGAA-AATTGG
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
* * * * *
117328 CATGCCTAAGCAAAATGATTAGATTCATATAGCATTAACTCATT
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
* * * * *
117372 AAGATAAGTGTAAATCTTGAAGTATTTTTGTTAGAAAAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTAG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
* * *
117437 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTAAATATAGGTGTAACTCTTTAAGTTTTTTTTGTTAGAATAATTG
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAG-TATTTTTGTTAGAATAATTG
* * *
117502 GCATGCCTAAGCAATATGATTGGATTCAGATAGCTTTAACTATTT
130 GCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
* * * *
117547 AAGATAGATGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAATTAACAGG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
* * * *
117612 ATTTAGACAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAAAAATTGA
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
* * * *
117677 CATGCCCAAGCAATATGATTGGATTCAAATAGCTTTAACTCTTT
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
* * * ** * ** * * *** * **
117721 AAG-T---T-T---TTTTGTTAGAATAATTGTCATGCCTCAGTAAAATGACT-AG-ATTCA-GA-
1 AAGATAGGTGTAACTCTT-TAAGTATTTTTGTTA-GAATAATTGGCATGCCTAAGCA-AAATGAC
* * * * ** * * * * *
117774 TAGCTTTA-ACA-CTTTAA---GAT-AG-GA-GT-AACTCT-TTAAGGAT-TTTTTGTTAGAATA
63 TGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTA-ACTCTTTAAG-TATTTTTGTTAGAATA
* * *
117828 ATTTGCATGCCTAAGCAAATTGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCATT
126 ATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
* * * *
117877 AAGATAGGTGTAACTCTTTAACTATTTTTGTTAGAATAATTTGCATGCCTAAGCAAAATTAATGG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
* *
117942 ATTCAGATAGCATTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTTG
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
*
118007 CATGCCTAAGCAAAATTACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
* * * * *
118051 AAGATAGGTGTGACACTTTAAGTATATTTTGTTAGAATAATTTGAATGCCTAAGCAAAATGATTG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTAT-TTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTG
* * *
118116 GATTCATATAACTTTAACTCATTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAG----ATTG
65 GATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTG
* * * * * *
118177 GCATGCCTAAGAAAAATAATTGGATTTATATAGATTTAACTCTTT
130 GCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
* * * ** *
118222 AAAATAGGTGTAACACTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGACATGTGTAAG-ACAAATGACAG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCA-AAATGACTG
* * * * *
118286 GACTCATATAGCTTTAACTCATTAAAATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAAAAATTG
65 GATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTG
* * * * *
118351 GCAAGCCTAAGTAAAATGACTGAATTCAGTTAGCTTTAACTATTT
130 GCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
* * * *
118396 AAGATAGGTGTAACTCTGTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGAAAAATAACTAG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
***
118461 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGCACAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
* * * **
118526 TATGCCTAAGCAAAATGATTGGATTCAGATAGATTTAACAGTTT
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
* *
118570 AAGATAAGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATCA-TAG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACT-G
*
118634 GATTCATATAGCTTTAACTCATTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTTGTTAGAATAAT
65 GATTCAGATAGCTTTAACTC-TTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTA-TTTTTGTTAGAATAAT
* * * * *
118699 TGGCATGCCTTAGCAAAATGATTGGATTCATATATCTTTAACTCATT
128 TGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
118746 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAA-AATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
* * * *
118810 ATTCAGTTAGCTTTAACTATTTAAGATAAGTGTAACTCTGTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
* ** *
118875 CATGCCTAAGGAAAATGGTTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTC
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
* *
118919 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATACTTGGCATGCCTAA--AAAATGA-TTG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
* *
118981 ATTC--ATAGCATTAACTC-TTAAGATAGGTGTAACTCTTTAACTATTTTTGTTAGAATAATTGG
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
* * *
119043 CATG-CTAAGCAAAATGATTGGATTCATATAGC-TTAACTCATT
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
* *
119085 AAGATA-G-GTAACTCTTTAATTATTTTTGTTAGAAAAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
* * * *
119148 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTAAATACAGGTGTAACTCTTTAAGT-TTTTTTTTAGAATAATTGG
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
*
119212 CATGCCAAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
*
119256 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAATTGACTGG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
* * *
119321 ATTTAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAAAAACTGG
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
* * *
119386 CATGCCTAATCAAAATGATTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTA
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
* * *
119430 AATATAGGTGTAACTC-TT---TATTTTT-TTAGAATAATTGTCATGCCTAAGCAAAATGATTGG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
* * * *
119490 ATTCAGATAGCTTTAACGCTTTAAGATAGGAGTATCTCCTTAAGTATTTTTTGTTAGAATAATTG
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTA-TTTTTGTTAGAATAATTG
* *
119555 GCATGCCAAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGATTTAACTCTTT
130 GCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
* * * * *
119600 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTTGCTTGCCTAAGAAAAATGGCTAG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
* *
119665 ATTCAGATAACTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCATTT-AG-ATTTTTTATTAGAATAATT
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTC-TTTAAGTA-TTTTTGTTAGAATAATT
* * * *
119728 GGCATGCCTAAGCAAAATGGCTGGATTTAGATAGCTTTAACTATAT
129 GGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
** * * **
119774 AAGATAAATGTAACTCTGTAAGTATTTTTGTTAGAGTAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGGTTGG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
* **
119839 ATTCAGATAGCTTTAAATCTTTAAGATAGGTGTAACAATTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
* * *
119904 CATGCCTAAGCAAAATGATTAGATTCATATA---TTAACTC---
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
* * * * *
119942 -AGATAGGTTTAACTCTTTAACTATTTAT-TTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGATTAG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
* * * * * * *
120005 ATTCATATAGCATTAACTCATTAAGATAGGTGTAAATCTTGAAGTATTTTTGTTAGAAAAAATGG
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
** *
120070 CATGCCTAAGCAAAATGACTATATTCAGATAGCTTTAACTCTTA
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
* * * *
120114 AATATAGGTGTAACTCTTTAAGTTTTTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAATATGATTG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAG-TATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTG
**
120179 GATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAAATGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATT-
65 GATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTG
* * * * *
120243 GCATGCCTAAGCAAATTAACAGGATTTAGACAGCTTTAACTCTTT
130 GCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
* * * *
120288 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAAAAATTGACATGCCCAAGCAAAATGATTGG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
* *
120353 ATTCAAATAGCTTTAACTCTTT---A-A---G-------TT---T-TTTTTGTTAGAATAATTGT
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
* * *
120400 CATGCCTCAGTAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACGCTTT
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
* * *
120444 AAGATAGGAGTAACTCTTTAAGGATTTTTTGTTAGAATAATTTGCATGCCTAAGCAAAATGACTG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTA-TTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTG
* * *
120509 GATTCAGATAGCTTTAACTCATTAAGATAGGTGTAACTCTTTAACTATTTTTGTTAGAATAATTT
65 GATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTG
* * * *
120574 GCATGCCTAAACAAAATTAATGGATTCAGATAGCATTAACTCTTT
130 GCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
* *
120619 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTTGCATGCCTAAGCAAAATTACTGG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
120684 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
* *
120749 CATGCCTAAGCAAAATGATTGGATTCATATAGCTTTAACTC-TT
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
120792 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAG---AATTGGCATGCCTAA-CAAAATGA-TGG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
*
120852 ATTCATATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATT-G
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
120916 CATGCCTAAG-ACAAATG---GGATTC--ATAGCTTTAA--CTTT
131 CATGCCTAAGCA-AAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
*
120953 AA-ATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCAAGCCTAAG-AAAATGA---G
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
*
121013 ATTCA-TTAGCTTTAA--CTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAG-AT--TTGG
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
121072 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTC-TT
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
121115 -AGATA-G-GTAACTCTTTAAGTA-TTTTGTTAGAATAATTGG--TGCCTAAGCAAAATGA-TGG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
121173 ATTCAGATAGCTTTAA--CTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
*
121236 CATGCCT-A--AAAAT---TGGATTCATATAGCTTTAACTCTTT
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
121274 AAGATA-GTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAA-AATTGGCATG-CTAAGCAAAATGACTGG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
121336 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
*
121401 CATGCCTAAGC-AAATGA-TGGATTCATATAGCTTTAACTC-TT
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
*
121442 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAAAAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
* * *
121507 ATTCA-TTAGCTTTAACTATTTAAGATAGGTGTAACTCTGTAAGTA-TTTT-TTAGAATAATTGG
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
*
121569 CATGCCTAAG-AAAATG-GTGGATTCAGATAGCTTTAACTC-TT
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
*
121610 AAGATA-GTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGATTGG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
*
121674 ATTCATATAGC-TTAACTC-TTAAGATA-G-GT-ACTCTTTAAGT-TTTTTG-TAGAA-AATTGG
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
*
121731 CATGCCTAA-AAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
121774 AA-ATAGGTGTAACTCTTTAAG-A-TTTT-TTAGAATAATTGGCATGCC-AAGCAAAATGACTGG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
121834 ATTCAGATAGCTTTAACTC-TTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
*
121898 CATGCCTAAGC-AAAT---T--ATT--TATAGCTTTAACTCTTT
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
* ** *** * * * **
121934 AAG-TA--T-T---TTTGTTAGAAAATGGCATGCCTAAGCAA-AATGACTGG-ATTCAT-AGCTT
1 AAGATAGGTGTAACTCT-TTA-AGTAT-TTTTG--TTAG-AATAAT---TGGCATGCCTAAGCAA
* * * * * *** * * ** * * * **
121989 TAT--CT---TT-AAATAGGTGTAACTATTT---ATTTTTTTAGAATAATT-GGCATGCCTAAG-
57 AATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTA-ACTCTTTAAGTAT--TTTTGT
* * * * ** ** * ** * * *
122043 CAAAATGATTGG-ATTCAGATAGC--TTTAACT-CTTTAAGATAGGTGTAACTC-TT
119 TAGAATAATTGGCATGCCTA-AGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
* * ** ** ** ** * ** *
122095 AAG-TA--T-T---T-TTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAA---GCAAATGATTCAG--ATTTAA
1 AAGATAGGTGTAACTCTT-TAAGTATTTTTGTTA-GAATAATTGGC--ATGCCTAAGCAAAATGA
* * * * * ** * * ** **** *
122147 CT--CTTTAAATAGGTGTAACTCTTTAAG-TA--T-T-TTTGTTAGAAAAATTGGCCTAAGCAA-
62 CTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTT-TAAGTATTTTTGTTAG-AAT
* * ** * ** * * *
122204 AATGACTGG-ATTCAT-AGC--TTTAACT-CTTTAAGATAGGTGTAACTCTTT
125 AAT---TGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
*** * ** * * *** * ** * *
122252 AAGTATTTTTGTTAGAATAATT-GGCA--TGCCTAAGCAA-AA-T-G-ATGATTCATAGCTTAAC
1 AAG-ATAGGTG-TA-ACTCTTTAAGTATTTTTGTTAG-AATAATTGGCATGCCT-A-AGC-AAAA
* * * ** * * ** * * * ** *
122310 T--CT---TTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAG-TATTTTTAGAATAATT-GGCATGCCTAAG-CA
59 TGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTA-ACTCTTTAAGTAT--TTTTGTTA
* * * * ** * * * *
122367 AAATGATTGG-ATTCATATAGC--TTTAACT--CTTAAGATAG--GTAA--C-TT
121 GAATAATTGGCATGCCTA-AGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
* ** ** * * ** * *
122412 AAG-TA--T-T---TTTGTTAGAAAATTGGCATGCCTAAGCAA-AA-TGAC-TGATTCAG--ATA
1 AAGATAGGTGTAACTCT-TTA-AGTATT--TTTG--TTAG-AATAATTGGCATGCCTAAGCAAAA
** * * * * * * **
122465 -G-CTTTAACTCTTAAATAGGTGTAACTCTTTAAG-T---T-T---TTTTTAGAATAATTGGCAT
59 TGAC-TGGA-T-TCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTA-AGT-ATT--TTT
* * * ** ** * ** * * *
122520 GCCTAAGCA-AATGATGG-ATTCAGATAGC--TTTAACT-CTTTAAGATAGGTGTAACTCTTT
117 G--TTAGAATAAT--TGGCATGCCTA-AGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
* ** * ** * * *** * * * * ** *
122578 -ATAT-TTTGTTAGAATAATT-GGCA--TGCCTAAGCAAATGACTGG-AT-TC-AGAGC--TTTA
1 AAGATAGGTG-TA-ACTCTTTAAGTATTTTTGTTAG--AATAATTGGCATGCCTA-AGCAAAATG
** * * * * ** ** *
122633 ACT-CTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAG-TA--T-T---TTTGTTAGAAAATTGCATGCCTAA
61 ACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCT-TTA-AGTATT-TTTG--TTA
* * * ** *** * * **
122690 GCAAAATGATTGGATTCAATAGCTTTAACTCTTTAAGTTTTTTTG-TT-AGAATA--ATTGGCAT
121 G---AATAATTGG---C-AT-GC-CTAA-GC---AAAATGACTGGATTCAG-ATAGCTTTAAC-T
**
122751 GCCTAGCAA
171 --CT---TT
* * ** * * * * *
122760 AATGATTGGAT-TCAGA-TAGCTTTAA--CTTTAAGATAGGAGTAACT--C-T--TTAAG-ATTT
1 AA-GATAGG-TGT-A-ACT--CTTTAAGTATTTTTGTTA-GAATAATTGGCATGCCTAAGCA--A
** * * * * * ** *
122815 TTTGTTAAAT-AATT-GGCAT-GC-CTAA-GC-AAAATGACT-GGAT-TCAGA-TAGCTTTAACT
57 AATG---ACTGGATTCAG-ATAGCTTTAACTCTTTAA-GA-TAGG-TGT-A-ACT--CTTTAAGT
* * * ** *** *** * * * * ** **
122871 CATAATATG-TA-ACTCTTTAATATTTTTGTTAG-AATAAT--TTGCATGCCTA-AGCAAAATAA
111 -AT-TTTTGTTAGAATAATTGGCA--TGCCTAAGCAA-AATGACTGGATTCAGATAGC--TTTAA
**
122930 -TGGATT
169 CT-CTTT
* * *
122936 CAGATAGCT-TAACTCTTAAGATAGGTGTAACTCTTTATTTTTTGTTAGAATAATT-G-ATGCCT
1 AAGATAGGTGTAACTC------T---T-TAA----GTA-TTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCT
122998 AAGC-AAA--A-TGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAAC-CTTTAAGTA-TTT
51 AAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTT
*
123057 TGTTAGAATAATTGGC-TGCCTAAGC-AAATGA-TGGATTCATATAGCTTTAACTCTTT
116 TGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
*
123113 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAG---AATT-GCATGCCTAAGCAAAATGATTGG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
* *
123174 ATTTATATAGCTTTAACTC-TTAAGATA-G-GTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAA-AATTGG
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
123235 C---CCTAAGCAAAATGACTGGATTCAG-TAGCTTTAACTCTTT
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
123275 -A-ATAGGTGTAACTCTTTAAGTA-TTTT-TTAGAATAATTGGC-TGCCTAAGC-AAATGA-T-G
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
123332 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
123397 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATT-AGATAGCTTTAACTCTTT
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
* *
123440 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTA-TTTTGTTAGAA-AATTGGCATGCCTAAGCAAAATG-GTTG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
*
123502 ATTCAGATAGCTTTAACACTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
123567 CATGCCTAAGCAAAATGA-TGGATTC--ATAGC-TTAACTC-TT
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
123606 AAGATAGGTGTAACTCTTTAA-TATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGA-TGG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
* *
123669 ATTCATATAGCTTTAACTCATTAAGATA-GTGTAACTC-TTAAGTA-TTTTGTTAGAA-AATTGG
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
123730 CATGCCTAAGCAAAATGA-TGGATTCAGATAGCTTTAACT-TTT
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
**
123772 AAGATA-GTGTAACTCTTTAAGTATTTTT-TTAGAATAATT-GCATGCCT-AG-AAAATGGTTGG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
123832 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATA-GTGTAACTCTTT-AGTATTTTTGTT-GAATAATTGG
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
* * *
123894 CATGCCTAAGCAAAATGA-T-TAATCATATAGCTTTAACTC-TT
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
* *
123935 AAGATAGGTGTAACTCTTT-ACTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGATTGG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
*
123999 ATTCATATAGC-TTAACTC-TTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTA-TTTTGTTAGAATAATTGG
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
124061 CATGCCTAAGCAAAATGA-TGG-TTCAGATAGCTTTAACTC-TT
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
*
124102 AAGATAGGTGTAACTC-TTAAGTTTTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCT-AGCAAAATGA-TGG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
*
124164 ATTC--ATAGATTTAACTC-TTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAG--TTTTTGTTAG---AATTGG
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
*
124221 CATGCCTAAGC-AAATGACTGGATTTAGATAGCTTTAACTCTTT
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
124264 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTT-TTAGAA-AA--GGCA----TAAGCAAAATGACTTG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGAC-TG
124321 GATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATA-GTGTAACTCTTTAAGT-TTTTTGTTAG-A-AATTG
65 GATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTG
*
124382 GCATGCCTAAGCAAAATGATTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
130 GCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
124427 AAGATA---GTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAA-CAAAA-GACTGG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
124487 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATT--
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
*
124550 CTTGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACT-TTT
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
124593 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGT-TTTTTG-T-GAATAATTGGCATGCCTAAGC-AAATGACTGG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
124654 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAG--AGGTGTAA--CTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
**
124715 CATGCCTAAGCAAAATGGTTGGATTCAGATAGCTTTAA-TCTTT
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
124758 -A-ATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGA-TGG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
124820 ATTCAGATAGCTTTAACTC-TTAAGATA-G-GTAACTC-TTAAGT-TTTTTGTTAGAATAA-T--
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
*
124877 --TGCCTAAGCAAAATGACTAGA-TCAGATAGCTTTAACTCTTT
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
124918 AAG--AGG-GTAACTCTTTAAGTA-TTTTGTTAG---AATTGGCA-GCCTAAGCAAAATGACTGG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
124975 ATTC--ATAGCTTTAACT-TTT-A-A-A---GTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
125031 CATGCCTAAG--AAA--A-T--ATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
*
125068 AAGATA-GTGTAACTCTTTAAGTA-TTTTGTTTGAATAATTGGCATGCC-AAGCAAAATGA-T-G
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
*
125128 ATTCATATAGCTTTAACTC-TTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
* *
125192 CATGCCTAAGCAAAATGA-TTGATTCATATAGC-TTAACTC-TT
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
125233 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAG-AAAATGACTGG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
125297 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATA-G-G----TC-TTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
125355 CATGCCTAAGCAAAATGACT-GATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
* *
125398 AAGATA-GTGTAACTC-TT--GTATTTTTTTTAAAAT-ATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
125458 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATA-G-GTAACTC-TTAAGTATTTTTGTTAGAATAATT-G
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
125519 CATGCCTAAGCAAAATGA-TGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
125562 AAGATA-GTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGC-TGCCTAAGCAAAATGACTGG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
125625 ATTCAGATAGCTTTAACTC-TTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
125689 CATG-CTAAGCAAAATGACTGGA-T-AGATAGCTTTAACTC-TT
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
125729 AAGATAGGTGTAACTC-TTAAGTA-TTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATG--TGG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
125790 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTT-AG--TTTTT-TTAGAATAATTGG
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
125851 CATGCCTAAGCAAAATGA-TGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
125894 AAGATA-G-GTAACTC-TTAAGTATTTTTGTTAGAATAATT-GCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
*
125955 ATTCAGATAGCTTTAA-TCTTTAAGATAGATGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATT-G
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
126018 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGC-TTAACTCTTT
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
*
126061 AAGATA---G-AACTCTTTAAGT-TTTTTGTTAG-ATAATTGGCATGGCTAAGCAAAATG-CTGG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
*
126119 ATT-AGATAGCTTTAACT-ATTAAGATAGGTGTAACTC-TTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
*
126181 CATGCCTAAGCAAAATG-GTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
*
126224 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAAT-ATTGGCATGCCTAAGCAAAATGA-T-T
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
* *
126286 ATTCATATAGCTTTAACTCTTTAAGA-A-G-GTAACTC-TTAAGTTTTTTTGTTAGAATAATT-G
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
126346 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTC--ATAGCTTTAACTCTTT
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
126388 AAGATA-G-GTAACTCTTTAAGTA-TTTTGTTAGAAT-ATTGGCATGCCTAAGC-AAA--A-TGG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
126445 ATTCAG-TAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTT-AG--TTTTTGTTAGAATAATT-G
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
*
126505 CTTGCCTAAGCAAAATGA-TGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
*
126548 AAGATA-GTGTAACT-TTTAAGTATTTTTGTTAGAAAAATTGG-ATGCCTAAGCAAAATGACTGG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
126610 ATTCAGATAGCTTTAACTC-TTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
*
126674 CATGCCTAAGCAAAATGA-TGGATTCAGATATCTTTAACTCTTT
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
126717 AAGATA-GTGTAACTCTTTAAGTA-TTTT-TTAGAA-AATTGGCATGCCTAAGC-AAATGACTGG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
126777 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATA-GTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAA-AATTGG
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
126840 -ATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAA--CTTT
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
*
126881 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGT-TTTTT-TTAGAAAAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
126944 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
*
127009 CATGCCTAAGC-AAATGACTGGATTTAGATAGCTTTAACTCTTT
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
127052 AAGATA-GTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAA-AA-TGGCATGCCTAAGCAAAA-GACTGG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
127113 ATTCAGATAGCTTTAACTC-TTAA-ATAGGTGTAACTC-TT---TA-TTTT-TTAGAATAATTGG
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
127170 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
127214 AAGATA-G-GTAACTC-TTAAGTA--TTT-TTAGAATAATTGGCATGCC-AAGCAAAATGACTGG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
127272 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTA-TTTTGTTAGAATAATT--
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
* *
127334 -TTGCCTAAGCAAAATGACTAGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
127377 AAG-TAGGTGTAACTC-TT---TATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGC-AAATGACTGG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
*
127436 ATTTAGATAGCTTTAACTC-TT-AGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTT-TTAGAATAATTGG
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
127498 CATGCCTAAGCAAAAT---TGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
*
127539 AAG-TAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGA-TTG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
** *
127602 ATTC-TTTA--ATTAACTC-TTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTTGTTAGAATAATTG
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTA-TTTTTGTTAGAATAATTG
127663 GCATGCCTAAGCAAAATGA-T-GATTCAGATAGCTTTAACTC-TT
130 GCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
127705 AAGATAGGTGTAACT-TTTAAGTATTTTTGTTAGAA-AATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
127768 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTA-TTTTGTTAGAATAATTGG
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
*
127832 CATGCCTAAGC-AAATGAATGGATTCAGATAGC-TTAA-TC-TT
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
127872 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAA--GGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
*
127935 ATTCAGATAGCTTTAA-TC-TTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATT-T
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
127997 C-TGCCTAA--AAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTC-TT
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
* *
128037 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTTTTTTTGTTTGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
* * *
128102 ATTTAGATAGCTTTAACTATTTAAGATAGGTGTAACTCTGTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
**
128167 CATGCCTAAGCAAAATGGTTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
128211 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGC-AAA--A-T-G
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
*
128271 ATTCAGATAGC-TTAACTC-TTAAGA-A-GTGTAACTCTTTAAGTTTTTTTGTTAGAATAATT-G
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
128331 CAT--CTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
128373 AAGATAGGTGTAACTC-TTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
128437 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTT-TTAGAATAATTGG
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
* *
128501 CATGCCTAAGCAAAATGATTGGATTCATATAGCTTTAACTCTTT
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
*
128545 AAGATAGGTGTAACTC-TTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGC-AAATGATTGG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
128608 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTC-TTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
128672 CATGCCTAAGCAAAAT---TGGATTC--ATAGC-TTAACTCTTT
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
128710 AAGATA-G-GTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAA-AATTGG-ATGCCTAAGCAAAATGACTGG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
128771 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
*
128836 CATGCCTAAG-AAAAT---TGGATTCATATAGCTTTAACTCTTT
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
128876 AAGATA---GTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAA-AATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
128937 ATTC--ATAGCTTTAACTC-TTAAGATA-GTGTAACTCTTTAA-TA-TTTTGTTAGAA-AATTGG
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
128995 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
129039 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGT-TTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCC-AAGCAAAATGA-TGG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
129101 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
129166 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
129210 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAA-AATT-GCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
*
129273 ATTCAGATAGCTTTAACTC-TTAATATAGGTGTAACTCTTTAAGT-TTTTT-TTAGAATAATT-G
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
129334 CATGCCTAAGC-AAATGA-TGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
129376 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCC-AAGC-AAATGACT-
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTA-TTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTG
129438 GATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATA-G-GTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATT-
65 GATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTG
129500 GC-TGCCTAAGCAAAATGACT--ATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
130 GCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
* * *
129542 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTTTTTTTGTTTGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGGCTGG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
* * *
129607 ATTTAGATAGCTTTAACTATTTAAGATAGGTGTAACTCTGTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
*
129672 CATGCCTAAGC-AAATGACTTGGATTCAGATAGCTTTAAATCTTT
131 CATGCCTAAGCAAAATGAC-TGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
129716 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGA-T--
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
* *
129778 ATTCATATAGC-TTAACTCTTTAAGATA-GTGTAACTC-TTAAGTA-TTTT-TTAGAAAAATTGG
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
129838 CATGCCTAAGC-AAATGA-TGGATTCAGATAGC-TTAACTC-TT
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
129878 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGC-AAATGACTGG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
*
129942 ATTCAGATAGCTTTAAC-CTTT-A-A-A-GAGTAACTC-TTAAGTA--TTT-TTAGAATAATTGG
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
129998 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTC-TT
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
130041 AAGATAGGTGTAACTC-TTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAAT-A-TGG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
130103 ATTC--ATAGC-TTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTC-TTAAGTATTTTTGTTAGAATAATT-G
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
130163 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
130207 AAGATAGGTGTAACTC--TAAGTA-TTTTGTTAGAATAATT-G-ATGCCTAAGCAAAATGA-TGG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
* *
130266 ATTCATATAGCTTTAACTC-TTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAG----ATTGA
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
** *
130326 CATGCCTAA--AAAATTTCTGGATTCATATAGCTTTAACTCTTT
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
130368 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTA-TTTTGTTAGAATAATT-G---GCCTAAAGCAAAATGA-TG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCT-AAGCAAAATGACTG
130427 GATTC--ATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTT-AGTATTTTTGTTAGAATAATTG
65 GATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTG
*
130489 GC-TGCCTAAGC-AAA--A-T-GA-TCATATAGCTTTAACTCTTT
130 GCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
130527 AAGATA-G-GTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
*
130590 ATTCATATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
130655 CATGCCTAAG-AAAA--A-TGGTATTCAGATAGCTTTAACTC-TT
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGG-ATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
130695 AAGATA-G-GTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAAT-ATTGGCATGCCTAAGC--AATGA-T-G
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
130753 ATTC--ATAGC-TTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTC-TTAAGTATTTTTGTTAGAATAATT-G
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
* *
130813 CATGCCTAAGCAAAATGA-T-GATTCATATATCTTTAACTC-TT
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
130854 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAG-AAAATGACTGG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
130918 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATA-GTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
**
130982 CATGCCTAAGC-AAATGGTTGGATTC--ATAGCTTTAACTCTTT
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
*
131023 AAGATAGGTATAACTC-TTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGA-TGG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
*
131086 ATTCATATAGC-TTAACTC-TTAAGATA-GTGTAACTC-TTAAG--TTTTTGTTAGAAT-ATT-G
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
131143 CATGCCTAAGC-AAATGA-TGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
131185 AAGATA-G-GTAACTC-TTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACT-G
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
131246 ATTC--ATAGCTTTAACTCTTTAAGATA---GTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAAT-ATT-G
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
131304 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTC--ATAGCTTTAACTCTTT
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
*
131346 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATT-GCATGCCTAAGCAAAATGACAGG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
*
131410 A-T---ATAGCTTTAACTCTTTAA-ATA-G-GTAACTCTTTAAGTA-TTTTGTTAGAAAAATTGG
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
131467 CA-GCCTAAGCAAAATGA-T-GATTCAG-TAGCTTTAACTCTTT
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
131507 AAGATAGGTGTAA--CTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAG--AAA--A-T-G
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
131564 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTA-TTTTGTTAGAAT-ATTGG
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
131627 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
*
131671 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGA-TTG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
*
131735 ATTCATATAGC-TTAACTC-TTAAGATA-G-GTAACTC-TTAAGTA-TTTT-TTAGAATAATTGG
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
*
131793 CATGCCTAAGC-AAATGATTGGATTCAGATAGC--TAACTC-TT
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
131833 AAGATAGGTGTAACTCTTTAA-TATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGC-AAATGACT-G
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
131895 ATTCAGATTAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGT-TTTTTGTTAGAATAATTG
66 ATTCAGA-TAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTG
131959 GCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTC-TT
130 GCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
132003 AAGATA-GTGTAACTCTTTAAGTA-TTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGC-AAA--A-TGG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
132062 ATTCAGATAGC-TTAACTCTTTAAGATA-GTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
132125 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTC-TT
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
*
132168 AAGATAGGTGTAACTC-TTAAGTATTTTTGTTAGAATAATT-G-ATGCCTAAGCAAAATGATTGG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
132230 ATTC--ATA----TAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAG---AATT-G
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
*
132285 CATG-CTAAGC-AAA--ACTGGATTCATATAGCTTTAACTCTTT
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
132325 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAA-AATT-G---GCCTAAAGC-AAATGACTG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCT-AAGCAAAATGACTG
*
132384 GATTCAG-TAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTT-AGTATTTTTTTTAGAATAATTG
65 GATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTG
132447 GCATGCCTAAGC-AAA--A-T-GA-TCAGATAGCTTTAACTCTTT
130 GCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
132486 AAGATA-G-GTAACTCTTT-AGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
132548 ATTCAGATAGCTTTAA--CTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
132611 CATGCCTAAGC-AAA--A-TGGATTCAGATAGCTTTAACTC-TT
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
*
132650 AAGATA-G-GTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGC-AAATGA-TAG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
*
132711 ATTCATATAGCTTTAACTC-TTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTA-TTTTGTTAGAATAATTGG
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
*
132774 CATGCCTAAGC-AAATGA-T-GATTC--ATAGC-TTAACTCATT
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
132812 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAA-AATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
132876 ATTCAG-TAGCTTTAA-T-TTTAAGATA-G-GTAACTCTTT-AGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
* *
132935 CATGCCTAAGC-AAATGACT-GATTCATATAGCTTTAAATCTTT
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
132977 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGA-TGG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
*
133041 ATTCATATAGCTTTAACTC-TTAAGATA-G-GTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATT--
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
133101 --TGCCTAA--AAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
133141 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATT-GCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
133205 ATTC--ATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTA-TTTTGTTAGAATAATT-G
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
133266 CATGCCTAAGCAAAATGACT-GATTC--ATAGCTTTAACTCTTT
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
133307 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGC-AAA--A-TGG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
*
133368 ATTCATATAGCTTTAACTC-TTAAGATAGGTGTAACTC-TTAAG--TTTTTGTTAGAA-AATTGG
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
133428 CATGCCTAAGCAAAATGACT-GATTC--ATAGCTTTAACTCTTT
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
*
133469 AAGATAGGTGTAA--CTTTAAGTA-TTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAAT-ACTAG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
133530 ATTC--ATAGC-TTAACTCTTTAAGATA---GTAACTCTTTAAGTATTTTT-TTAGAATAA-TGG
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
133587 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTC-GATAGCTTTAACTC-TT
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
133629 AAGATA-G-GTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATG-CTAAGCAAAATGA-TGG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
* *
133690 ATTCATATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTA-TTTTGTTAGAAAAATTGG
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
* *
133754 CATGCCTAAGC-AAATGATTGGATTCATATAGCTTTAACTCTTT
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
*
133797 -A-ATA-GTGTAACTCTTTAAGTA-TTTTGTTAGAATAATTGGCATG-CTAAGCAAAATGATTGG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
*
133857 ATTCAGATA-TTTTAACTC-TTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAA-AATTGG
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
133919 CATG-CTAAGCAAAATGACTGGATTC--ATAGCTTTAACTC-TT
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
133959 AAGATA--TGTAACTC-TTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAG--AAA--A-TGG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
*
134016 ATTCAGATAGCTTTAACTC-TTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAG-A-ACTTGG
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
*
134078 CATG-CTAAG-AAAATGA-TGGATTCATATAGCTTTAACTC-TT
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
134118 AAGATAGGTGTAACTC-TTAAGTATTTTTGTTAGAATAATT-GCATG-CTAAGCAAAATGA-TGG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
*
134179 AATTCATATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAA-AATTG
66 -ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTG
134243 GCATGCCTAAGCAAAATGACT-GATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
130 GCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
134287 AAGATAGGTGT-ACTCTTTAAG--TTTTT-TTAGAATAATTGGCATGCCTAAGC-AAA-GACTGG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
134346 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATA-GT-TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
134409 CATGCCTAAGCAAAATGA-TGGATTC--ATAGCTTTAACTCTTT
131 CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
*
134450 AAGATAGGT-TAACTC-TTAAGTATTTTTGTTAGAAT-ATTGGCATGCCTAAGCAAAATGATTGG
1 AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
*
134512 ATTCATATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTA
66 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTA
134554 TGTTTTTAGA
Statistics
Matches: 19155, Mismatches: 1418, Indels: 2188
0.84 0.06 0.10
Matches are distributed among these distances:
149 8 0.00
150 31 0.00
151 21 0.00
152 29 0.00
153 38 0.00
154 60 0.00
155 101 0.01
156 248 0.01
157 177 0.01
158 299 0.02
159 481 0.03
160 715 0.04
161 1043 0.05
162 925 0.05
163 1255 0.07
164 1169 0.06
165 1341 0.07
166 1430 0.07
167 1214 0.06
168 970 0.05
169 670 0.03
170 729 0.04
171 562 0.03
172 582 0.03
173 848 0.04
174 2859 0.15
175 993 0.05
176 163 0.01
177 21 0.00
178 31 0.00
179 14 0.00
180 5 0.00
181 8 0.00
182 10 0.00
183 9 0.00
184 13 0.00
185 11 0.00
186 20 0.00
187 13 0.00
188 15 0.00
189 6 0.00
190 6 0.00
192 1 0.00
194 2 0.00
195 8 0.00
196 1 0.00
ACGTcount: A:0.33, C:0.12, G:0.17, T:0.37
Consensus pattern (174 bp):
AAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGG
CATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTT
Found at i:113070 original size:19 final size:20
Alignment explanation
Indices: 113046--113084 Score: 53
Period size: 19 Copynumber: 2.0 Consensus size: 20
113036 GACTGGATTC
*
113046 AGATAGCTTTAACT-CTTAA
1 AGATAGCTGTAACTCCTTAA
*
113065 AGATAGGTGTAACTCCTTAA
1 AGATAGCTGTAACTCCTTAA
113085 GTTTTTTTTG
Statistics
Matches: 17, Mismatches: 2, Indels: 1
0.85 0.10 0.05
Matches are distributed among these distances:
19 12 0.71
20 5 0.29
ACGTcount: A:0.36, C:0.15, G:0.15, T:0.33
Consensus pattern (20 bp):
AGATAGCTGTAACTCCTTAA
Found at i:113677 original size:19 final size:19
Alignment explanation
Indices: 113653--113692 Score: 62
Period size: 19 Copynumber: 2.1 Consensus size: 19
113643 GATTGGATTC
*
113653 AGATAGATTTAACTCTTTA
1 AGATAGATGTAACTCTTTA
*
113672 AGATAGGTGTAACTCTTTA
1 AGATAGATGTAACTCTTTA
113691 AG
1 AG
113693 TATTTTTGTT
Statistics
Matches: 19, Mismatches: 2, Indels: 0
0.90 0.10 0.00
Matches are distributed among these distances:
19 19 1.00
ACGTcount: A:0.35, C:0.10, G:0.17, T:0.38
Consensus pattern (19 bp):
AGATAGATGTAACTCTTTA
Found at i:113769 original size:19 final size:19
Alignment explanation
Indices: 113742--113779 Score: 58
Period size: 19 Copynumber: 2.0 Consensus size: 19
113732 TTGGATTCAT
113742 ATAGCTGTAACTCATTAAG
1 ATAGCTGTAACTCATTAAG
* *
113761 ATAGGTGTAACTCTTTAAG
1 ATAGCTGTAACTCATTAAG
113780 TATTTTTTTA
Statistics
Matches: 17, Mismatches: 2, Indels: 0
0.89 0.11 0.00
Matches are distributed among these distances:
19 17 1.00
ACGTcount: A:0.34, C:0.13, G:0.18, T:0.34
Consensus pattern (19 bp):
ATAGCTGTAACTCATTAAG
Found at i:113881 original size:66 final size:67
Alignment explanation
Indices: 113759--113912 Score: 220
Period size: 66 Copynumber: 2.3 Consensus size: 67
113749 TAACTCATTA
* * * *
113759 AGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTTTAGAAAAATTGGCATGCTTATGAAAAATGAATGGAT
1 AGATAGCTTTAACTCTTTAAGTATTTTTTTAGAAAAATTGGCATGCCTAAGAAAAATGAATGGAT
113824 TC
66 TC
* * *
113826 AGATAGCTTTAACTCTTTAAGTA-TTTTTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGAT
1 AGATAGCTTTAACTCTTTAAGTATTTTTTTAGAAAAATTGGCATGCCTAAGAAAAATGAATGGAT
113890 TC
66 TC
* *
113892 AGTTAGCTTTAACTATTTAAG
1 AGATAGCTTTAACTCTTTAAG
113913 ATAAGTGTAA
Statistics
Matches: 78, Mismatches: 9, Indels: 1
0.89 0.10 0.01
Matches are distributed among these distances:
66 57 0.73
67 21 0.27
ACGTcount: A:0.34, C:0.10, G:0.18, T:0.38
Consensus pattern (67 bp):
AGATAGCTTTAACTCTTTAAGTATTTTTTTAGAAAAATTGGCATGCCTAAGAAAAATGAATGGAT
TC
Found at i:113889 original size:152 final size:155
Alignment explanation
Indices: 113672--114169 Score: 488
Period size: 170 Copynumber: 3.1 Consensus size: 155
113662 TAACTCTTTA
* * *
113672 AGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATCATTGGA
1 AGATAGCTTTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATCACTGGA
* * *
113737 TTCA-TATAGCTGTAACTCA-TTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTT-TTAGAAAAATTG
66 TTCAGT-TAGCTGTAACT-ATTTAAGATAAGTGTAACACTGTAAGTATTTTTGTTAGAAAAATTG
* * *
113799 GCATGCTTATGAAAAATGAATGGATTC
129 GCATGCCTAAGAAAAATGAATCGATTC
*
113826 AGATAGCTTTAACTCTTTAAGTA-TTTT-TTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGA
1 AGATAGCTTTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATCACTGGA
* *
113889 TTCAGTTAGCTTTAACTATTTAAGATAAGTGTAACACTGTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGC
66 TTCAGTTAGCTGTAACTATTTAAGATAAGTGTAACACTGTAAGTATTTTTGTTAGAAAAATTGGC
**
113954 ATGCCTAAGAAAAATGGTTCGATTC
131 ATGCCTAAGAAAAATGAATCGATTC
*
113979 AGATAGCTTTAACTCTTTTAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATACTTGGCATGCCTA
1 AGATAG--------C---T---T-TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTA
* * * ** * * * *
114044 AGCAAAATGATTAGATTCA-TATAGCAT-TAACTCGTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAACTATTT
51 AGCAAAATCACTGGATTCAGT-TAGC-TGTAACTATTTAAGATAAGTGTAACACTGTAAGTATTT
* * * * *
114107 TTGTTAGAATAATTGTCATGCCTAAGCAAAATGATTGGATTC
114 TTGTTAGAAAAATTGGCATGCCTAAGAAAAATGAATCGATTC
* * *
114149 ATATAGCATTAACTCATTAAG
1 AGATAGCTTTAACTCTTTAAG
114170 ATAGGTGTAA
Statistics
Matches: 292, Mismatches: 30, Indels: 43
0.80 0.08 0.12
Matches are distributed among these distances:
151 1 0.00
152 76 0.26
153 44 0.15
154 21 0.07
155 11 0.04
156 1 0.00
161 1 0.00
162 1 0.00
164 1 0.00
167 1 0.00
168 14 0.05
169 5 0.02
170 114 0.39
171 1 0.00
ACGTcount: A:0.34, C:0.12, G:0.17, T:0.37
Consensus pattern (155 bp):
AGATAGCTTTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATCACTGGA
TTCAGTTAGCTGTAACTATTTAAGATAAGTGTAACACTGTAAGTATTTTTGTTAGAAAAATTGGC
ATGCCTAAGAAAAATGAATCGATTC
Found at i:113960 original size:87 final size:87
Alignment explanation
Indices: 113826--117723 Score: 5534
Period size: 87 Copynumber: 45.0 Consensus size: 87
113816 GAATGGATTC
* *
113826 AGATAGCTTTAACTCTTTAAGTA-TTTT-TTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGA
1 AGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGA
* *
113889 TTCAGTTAGCTTTAACTATTTA
66 TTCAGATAGCTTTAACTCTTTA
* * * * ** *
113911 AGATAAGTGTAACACTGTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGAAAAATGGTTCGA
1 AGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGA
113976 TTCAGATAGCTTTAACTCTTT-
66 TTCAGATAGCTTTAACTCTTTA
* * *
113997 ---TAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATACTTGGCATGCCTAAGCAAAATGATTAGA
1 AGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGA
* * *
114059 TTCATATAGCATTAACTCGTTA
66 TTCAGATAGCTTTAACTCTTTA
* * *
114081 AGATAGGTGTAACTCTTTAACTATTTTTGTTAGAATAATTGTCATGCCTAAGCAAAATGATTGGA
1 AGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGA
* * *
114146 TTCATATAGCATTAACTCATTA
66 TTCAGATAGCTTTAACTCTTTA
* *
114168 AGATAGGTGTAACTCTTTAACTATTTTTGTTAGAAAAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGA
1 AGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGA
*
114233 TTCAGATAGCTTTAACTCTTAA
66 TTCAGATAGCTTTAACTCTTTA
* * *
114255 ATATAGGTGTAACTCCTTAAGTTTTTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAG-AAAATGA-TGG
1 AGATAGGTGTAACTCTTTAAG-TATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
114318 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTA
65 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTA
* *
114341 AGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAATTGACTGAA
1 AGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGA
*
114406 TTTAGATAGCTTTAACTCTTTA
66 TTCAGATAGCTTTAACTCTTTA
* *
114428 AGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAAAAACTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGA
1 AGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGA
* *
114493 TTCAGGTATCTTTAACTC-TTA
66 TTCAGATAGCTTTAACTCTTTA
* * * * * * *
114514 TATATAGGTGTAACTCTTTATGTTTTTTTGTTAGAATAATTGTCATCCCTAAGCAAAATGAATGA
1 -AGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
*
114579 ATTCAGATAGCTTT-ACGCTTTA
65 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTA
* *
114601 AGATAGGAGTAACTCTTAAAGTATTTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
1 AGATAGGTGTAACTCTTTAAGTA-TTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
114666 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTA
65 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTA
* *
114689 AGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTTGCTTGCCTAAGCAAAATGACTGGA
1 AGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGA
114754 TTCAGATAGCTTTAACTCTTTA
66 TTCAGATAGCTTTAACTCTTTA
* * *
114776 AGATAGGTGTAACTCTTTAAGTTTTTTTGTTTGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAATTGACTGGA
1 AGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGA
*
114841 TTTAGATAGCTTTAACTCTTTA
66 TTCAGATAGCTTTAACTCTTTA
* * *
114863 AGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAAAAACTGGCATGCCTAAGCAAAATGATTGGA
1 AGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGA
*
114928 TTCAGATAGCTTTAACTCTTAA
66 TTCAGATAGCTTTAACTCTTTA
* * * *
114950 ATATAGGTG----TCTTTATGT-TTTTT-TTAGAATAATTGTCATGCCTAAGCAAAATGATTGGA
1 AGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGA
*
115009 TTCAGATAGCTTTAACGCTTTA
66 TTCAGATAGCTTTAACTCTTTA
* **
115031 AGATAGGAGTAACT-TTGTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGGTTGG
1 AGATAGGTGTAACTCTT-TAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
*
115095 ATTCAGATAGCTTTAAATCTTTA
65 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTA
* *
115118 AGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGATTAGA
1 AGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGA
* * *
115183 TTCATATAGCATTAACTCGTTA
66 TTCAGATAGCTTTAACTCTTTA
* * * * * * *
115205 AGATATGTGTAACTCCTTAAGTTTTTTTGTTAGAATAATTGTCAGGCCTAAGAAAAATGACTAGA
1 AGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGA
115270 TTCAGATAGCTTTAACTCTTTA
66 TTCAGATAGCTTTAACTCTTTA
* * *
115292 AGATAGGAGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAATCAAAATGACTAGA
1 AGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGA
*
115357 TTCATATAGCTTTAACTCTTTA
66 TTCAGATAGCTTTAACTCTTTA
* *
115379 AGATAGATGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATTACTGGA
1 AGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGA
*
115444 TTCGGATAGCTTTAACTCTTTA
66 TTCAGATAGCTTTAACTCTTTA
* *
115466 AGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGACATGCCTAAG-ACAAATGACAGG
1 AGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCA-AAATGACTGG
* * *
115530 ACTCATATAGCTTTAACTCATTA
65 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTA
* * * * *
115553 AAATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAAAAATTGGCAAGCCTAAGTAAAATGACTGAA
1 AGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGA
* *
115618 TTCAGTTAGCTTTAACTATTTA
66 TTCAGATAGCTTTAACTCTTTA
* * * *
115640 GGATAGGTGTAACT-TTGTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGAAAAATAACTAG
1 AGATAGGTGTAACTCTT-TAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
115704 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTA
65 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTA
*** * * *
115727 AGATAGGCACAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGTATGCCTATGCAAAATGATTGGA
1 AGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGA
* * **
115792 TTTAGATAGATTTAACAGTTTA
66 TTCAGATAGCTTTAACTCTTTA
* *
115814 AGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATCATTGGA
1 AGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGA
*
115879 TTCATATAGCTTTAACTCTTTTA
66 TTCAGATAGCTTTAACTC-TTTA
* * *
115902 AGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAAAAATTGGCATTCTTAAGCAAAATGACTGGA
1 AGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGA
115967 TTCAGATAGCTTTAACTCTTTA
66 TTCAGATAGCTTTAACTCTTTA
* *
115989 AGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTTAGCAAAATGATTGG
1 AGATAGGTGTAACTCTTTAAGTA-TTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
* * *
116054 ATTCATATATCTTTAACTCATTA
65 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTA
*
116077 AGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAAAAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGA
1 AGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGA
* *
116142 TTCAGTTAGCTTTAACTATTTA
66 TTCAGATAGCTTTAACTCTTTA
* * * **
116164 AGATAAGTGTAACTCTGTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGAAAAATGGTTGGA
1 AGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGA
*
116229 TTCAGATAGCTTTAACTCTTCA
66 TTCAGATAGCTTTAACTCTTTA
* * *
116251 AGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATACTTGGCATGCCTAAGAAAAATGATTGGA
1 AGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGA
* ** *
116316 TTCATATAGCAATAACTCGTTA
66 TTCAGATAGCTTTAACTCTTTA
* *
116338 AGATAGGTGTAACTCTTTAACTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGATTGGA
1 AGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGA
* * *
116403 TTCATATAGCATTAACTCATTA
66 TTCAGATAGCTTTAACTCTTTA
* *
116425 AGATAGGTGTAACTCTTTAATTATTTTTGTTAGAAAAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGA
1 AGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGA
*
116490 TTCAGATAGCTTTAACTCTTAA
66 TTCAGATAGCTTTAACTCTTTA
* * * *
116512 ATATAGGTGTAACTCTTTCAGT-TTTTTTTTAGAATAATTGGCATGCCAAAGCAAAATGACTGGA
1 AGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGA
*
116576 TTCAGATAGCTTTAACACTTTA
66 TTCAGATAGCTTTAACTCTTTA
* *
116598 AGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAATTGATTGGA
1 AGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGA
*
116663 TTTAGATAGCTTTAACTCTTTA
66 TTCAGATAGCTTTAACTCTTTA
* *
116685 AGATAGGTGTAACTCTTTAAGTA-TTTTGTTAGAAAAACTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGA
1 AGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGA
*
116749 TTCAGATAGCTTTAACTCTTAA
66 TTCAGATAGCTTTAACTCTTTA
* * * *
116771 ATATAGGTGTAACTCTTT-A-TGTTTTT-TTAGAATAATTGTCATGCCTAAGCAAAATGATTGGA
1 AGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGA
* *
116833 TTCATATAGCTTTAACGCTTTA
66 TTCAGATAGCTTTAACTCTTTA
* * * *
116855 AGATATGAGTAACTCCTTAAGTATTTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCAAAGCAAAATGACTGG
1 AGATAGGTGTAACTCTTTAAGTA-TTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
*
116920 ATTCAGATAGATTTAACTCTTTA
65 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTA
* * * *
116943 AGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTTGCTTGCCTAAGAAAAATGACTAGA
1 AGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGA
117008 TTCAGATAGCTTTAACTCTTTA
66 TTCAGATAGCTTTAACTCTTTA
*
117030 AGATAGGTGTAACTCCTTT-AG--TTTTT-TTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGGCTGG
1 AGATAGGTGTAACT-CTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
* * *
117091 ATTTAGATAGCTTTAACTATATA
65 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTA
* **
117114 AGATAGGTGTAACTCTCTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGGTTGGA
1 AGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGA
*
117179 TTCAGATAGCTTTAAATCTTTA
66 TTCAGATAGCTTTAACTCTTTA
** * *
117201 AGATAGGTGTAACAATTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGATTAGA
1 AGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGA
* * * *
117266 TTCATATAACATTAACTCGTTA
66 TTCAGATAGCTTTAACTCTTTA
* * * *
117288 AGATAGGTGTAACTCTTTAACTATTTAT-TTAGAA-AATTGGCATGCCTAAGCAAAATGATTAGA
1 AGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGA
* * *
117351 TTCATATAGCATTAACTCATTA
66 TTCAGATAGCTTTAACTCTTTA
* * * * *
117373 AGATAAGTGTAAATCTTGAAGTATTTTTGTTAGAAAAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTAGA
1 AGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGA
*
117438 TTCAGATAGCTTTAACTCTTAA
66 TTCAGATAGCTTTAACTCTTTA
* * * *
117460 ATATAGGTGTAACTCTTTAAGTTTTTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAATATGATTGG
1 AGATAGGTGTAACTCTTTAAG-TATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG
*
117525 ATTCAGATAGCTTTAACTATTTA
65 ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTA
* * * *
117548 AGATAGATGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAATTAACAGGA
1 AGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGA
* *
117613 TTTAGACAGCTTTAACTCTTTA
66 TTCAGATAGCTTTAACTCTTTA
* * * * *
117635 AGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAAAAATTGACATGCCCAAGCAATATGATTGGA
1 AGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGA
*
117700 TTCAAATAGCTTTAACTCTTTA
66 TTCAGATAGCTTTAACTCTTTA
117722 AG
1 AG
117724 TTTTTTTGTT
Statistics
Matches: 3402, Mismatches: 370, Indels: 80
0.88 0.10 0.02
Matches are distributed among these distances:
81 60 0.02
82 5 0.00
83 84 0.02
84 134 0.04
85 136 0.04
86 257 0.08
87 2350 0.69
88 376 0.11
ACGTcount: A:0.33, C:0.12, G:0.17, T:0.37
Consensus pattern (87 bp):
AGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGA
TTCAGATAGCTTTAACTCTTTA
Found at i:114346 original size:19 final size:19
Alignment explanation
Indices: 114322--114361 Score: 62
Period size: 19 Copynumber: 2.1 Consensus size: 19
114312 TGATGGATTC
*
114322 AGATAGCTTTAACTCTTTA
1 AGATAGCTGTAACTCTTTA
*
114341 AGATAGGTGTAACTCTTTA
1 AGATAGCTGTAACTCTTTA
114360 AG
1 AG
114362 TATTTTTGTT
Statistics
Matches: 19, Mismatches: 2, Indels: 0
0.90 0.10 0.00
Matches are distributed among these distances:
19 19 1.00
ACGTcount: A:0.33, C:0.12, G:0.17, T:0.38
Consensus pattern (19 bp):
AGATAGCTGTAACTCTTTA
Found at i:114433 original size:19 final size:19
Alignment explanation
Indices: 114409--114448 Score: 62
Period size: 19 Copynumber: 2.1 Consensus size: 19
114399 GACTGAATTT
*
114409 AGATAGCTTTAACTCTTTA
1 AGATAGCTGTAACTCTTTA
*
114428 AGATAGGTGTAACTCTTTA
1 AGATAGCTGTAACTCTTTA
114447 AG
1 AG
114449 TATTTTTGTT
Statistics
Matches: 19, Mismatches: 2, Indels: 0
0.90 0.10 0.00
Matches are distributed among these distances:
19 19 1.00
ACGTcount: A:0.33, C:0.12, G:0.17, T:0.38
Consensus pattern (19 bp):
AGATAGCTGTAACTCTTTA
Found at i:114694 original size:19 final size:19
Alignment explanation
Indices: 114670--114709 Score: 62
Period size: 19 Copynumber: 2.1 Consensus size: 19
114660 GACTGGATTC
*
114670 AGATAGCTTTAACTCTTTA
1 AGATAGCTGTAACTCTTTA
*
114689 AGATAGGTGTAACTCTTTA
1 AGATAGCTGTAACTCTTTA
114708 AG
1 AG
114710 TATTTTTGTT
Statistics
Matches: 19, Mismatches: 2, Indels: 0
0.90 0.10 0.00
Matches are distributed among these distances:
19 19 1.00
ACGTcount: A:0.33, C:0.12, G:0.17, T:0.38
Consensus pattern (19 bp):
AGATAGCTGTAACTCTTTA
Found at i:114781 original size:19 final size:19
Alignment explanation
Indices: 114757--114796 Score: 62
Period size: 19 Copynumber: 2.1 Consensus size: 19
114747 GACTGGATTC
*
114757 AGATAGCTTTAACTCTTTA
1 AGATAGCTGTAACTCTTTA
*
114776 AGATAGGTGTAACTCTTTA
1 AGATAGCTGTAACTCTTTA
114795 AG
1 AG
114797 TTTTTTTGTT
Statistics
Matches: 19, Mismatches: 2, Indels: 0
0.90 0.10 0.00
Matches are distributed among these distances:
19 19 1.00
ACGTcount: A:0.33, C:0.12, G:0.17, T:0.38
Consensus pattern (19 bp):
AGATAGCTGTAACTCTTTA
Found at i:114868 original size:19 final size:19
Alignment explanation
Indices: 114844--114883 Score: 62
Period size: 19 Copynumber: 2.1 Consensus size: 19
114834 GACTGGATTT
*
114844 AGATAGCTTTAACTCTTTA
1 AGATAGCTGTAACTCTTTA
*
114863 AGATAGGTGTAACTCTTTA
1 AGATAGCTGTAACTCTTTA
114882 AG
1 AG
114884 TATTTTTGTT
Statistics
Matches: 19, Mismatches: 2, Indels: 0
0.90 0.10 0.00
Matches are distributed among these distances:
19 19 1.00
ACGTcount: A:0.33, C:0.12, G:0.17, T:0.38
Consensus pattern (19 bp):
AGATAGCTGTAACTCTTTA
Found at i:115123 original size:19 final size:19
Alignment explanation
Indices: 115099--115138 Score: 53
Period size: 19 Copynumber: 2.1 Consensus size: 19
115089 GGTTGGATTC
*
115099 AGATAGCTTTAAATCTTTA
1 AGATAGCTGTAAATCTTTA
* *
115118 AGATAGGTGTAACTCTTTA
1 AGATAGCTGTAAATCTTTA
115137 AG
1 AG
115139 TATTTTTGTT
Statistics
Matches: 18, Mismatches: 3, Indels: 0
0.86 0.14 0.00
Matches are distributed among these distances:
19 18 1.00
ACGTcount: A:0.35, C:0.10, G:0.17, T:0.38
Consensus pattern (19 bp):
AGATAGCTGTAAATCTTTA
Found at i:115994 original size:19 final size:19
Alignment explanation
Indices: 115970--116009 Score: 62
Period size: 19 Copynumber: 2.1 Consensus size: 19
115960 GACTGGATTC
*
115970 AGATAGCTTTAACTCTTTA
1 AGATAGCTGTAACTCTTTA
*
115989 AGATAGGTGTAACTCTTTA
1 AGATAGCTGTAACTCTTTA
116008 AG
1 AG
116010 TATTTTTTGT
Statistics
Matches: 19, Mismatches: 2, Indels: 0
0.90 0.10 0.00
Matches are distributed among these distances:
19 19 1.00
ACGTcount: A:0.33, C:0.12, G:0.17, T:0.38
Consensus pattern (19 bp):
AGATAGCTGTAACTCTTTA
Found at i:116603 original size:19 final size:19
Alignment explanation
Indices: 116579--116618 Score: 53
Period size: 19 Copynumber: 2.1 Consensus size: 19
116569 GACTGGATTC
*
116579 AGATAGCTTTAACACTTTA
1 AGATAGCTGTAACACTTTA
* *
116598 AGATAGGTGTAACTCTTTA
1 AGATAGCTGTAACACTTTA
116617 AG
1 AG
116619 TATTTTTGTT
Statistics
Matches: 18, Mismatches: 3, Indels: 0
0.86 0.14 0.00
Matches are distributed among these distances:
19 18 1.00
ACGTcount: A:0.35, C:0.12, G:0.17, T:0.35
Consensus pattern (19 bp):
AGATAGCTGTAACACTTTA
Found at i:116690 original size:19 final size:19
Alignment explanation
Indices: 116666--116705 Score: 62
Period size: 19 Copynumber: 2.1 Consensus size: 19
116656 GATTGGATTT
*
116666 AGATAGCTTTAACTCTTTA
1 AGATAGCTGTAACTCTTTA
*
116685 AGATAGGTGTAACTCTTTA
1 AGATAGCTGTAACTCTTTA
116704 AG
1 AG
116706 TATTTTGTTA
Statistics
Matches: 19, Mismatches: 2, Indels: 0
0.90 0.10 0.00
Matches are distributed among these distances:
19 19 1.00
ACGTcount: A:0.33, C:0.12, G:0.17, T:0.38
Consensus pattern (19 bp):
AGATAGCTGTAACTCTTTA
Found at i:116948 original size:19 final size:19
Alignment explanation
Indices: 116924--116963 Score: 62
Period size: 19 Copynumber: 2.1 Consensus size: 19
116914 GACTGGATTC
*
116924 AGATAGATTTAACTCTTTA
1 AGATAGATGTAACTCTTTA
*
116943 AGATAGGTGTAACTCTTTA
1 AGATAGATGTAACTCTTTA
116962 AG
1 AG
116964 TATTTTTGTT
Statistics
Matches: 19, Mismatches: 2, Indels: 0
0.90 0.10 0.00
Matches are distributed among these distances:
19 19 1.00
ACGTcount: A:0.35, C:0.10, G:0.17, T:0.38
Consensus pattern (19 bp):
AGATAGATGTAACTCTTTA
Found at i:117035 original size:19 final size:20
Alignment explanation
Indices: 117011--117049 Score: 53
Period size: 19 Copynumber: 2.0 Consensus size: 20
117001 GACTAGATTC
*
117011 AGATAGCTTTAACT-CTTTA
1 AGATAGCTGTAACTCCTTTA
*
117030 AGATAGGTGTAACTCCTTTA
1 AGATAGCTGTAACTCCTTTA
117050 GTTTTTTTAG
Statistics
Matches: 17, Mismatches: 2, Indels: 1
0.85 0.10 0.05
Matches are distributed among these distances:
19 12 0.71
20 5 0.29
ACGTcount: A:0.31, C:0.15, G:0.15, T:0.38
Consensus pattern (20 bp):
AGATAGCTGTAACTCCTTTA
Found at i:117740 original size:155 final size:156
Alignment explanation
Indices: 117557--117879 Score: 447
Period size: 155 Copynumber: 2.1 Consensus size: 156
117547 AAGATAGATG
* *
117557 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAATTAAC-AGGATTTAGACA
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATAACTA-GATTCAGACA
* * *
117621 GCTTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTA-TTTTTGTTAGAA-AAATTGACATGCCC
65 GCTTTAACACTTTAAGATAGGAGTAACTCTTTAAGGATTTTTTGTTAGAATAAATTG-CATGCCC
*
117684 AAGC-AATATGATTGGATTCAAATAGCTT
129 AAGCAAAT-TGACTGGATTCAAATAGCTT
* * * * * *
117712 TAACTCTTTAAGTTTTTTTGTTAGAATAATTGTCATGCCTCAGTAAAATGACTAGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATAACTAGATTCAGACAG
* *
117777 CTTTAACACTTTAAGATAGGAGTAACTCTTTAAGGATTTTTTGTTAGAATAATTTGCATGCCTAA
66 CTTTAACACTTTAAGATAGGAGTAACTCTTTAAGGATTTTTTGTTAGAATAAATTGCATGCCCAA
*
117842 GCAAATTGACTGGATTCAGATAGCTT
131 GCAAATTGACTGGATTCAAATAGCTT
*
117868 TAACTCATTAAG
1 TAACTCTTTAAG
117880 ATAGGTGTAA
Statistics
Matches: 148, Mismatches: 16, Indels: 7
0.87 0.09 0.04
Matches are distributed among these distances:
155 88 0.59
156 52 0.35
157 8 0.05
ACGTcount: A:0.33, C:0.13, G:0.16, T:0.37
Consensus pattern (156 bp):
TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATAACTAGATTCAGACAG
CTTTAACACTTTAAGATAGGAGTAACTCTTTAAGGATTTTTTGTTAGAATAAATTGCATGCCCAA
GCAAATTGACTGGATTCAAATAGCTT
Found at i:117770 original size:68 final size:68
Alignment explanation
Indices: 117644--117791 Score: 199
Period size: 68 Copynumber: 2.2 Consensus size: 68
117634 AAGATAGGTG
* * *
117644 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAAAAATTGACATGCCCAAGCAATATGATTGGATTCAAATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAAAAATTGACATGCCCAAGCAAAATGACTAGATTCAAATAG
117709 CTT
66 CTT
* * * * *
117712 TAACTCTTTAAGTTTTTTTGTTAGAATAATTGTCATGCCTC-AGTAAAATGACTAGATTCAGATA
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAAAAATTGACATGCC-CAAGCAAAATGACTAGATTCAAATA
117776 GCTT
65 GCTT
*
117780 TAACACTTTAAG
1 TAACTCTTTAAG
117792 ATAGGAGTAA
Statistics
Matches: 70, Mismatches: 9, Indels: 2
0.86 0.11 0.02
Matches are distributed among these distances:
68 69 0.99
69 1 0.01
ACGTcount: A:0.34, C:0.14, G:0.14, T:0.39
Consensus pattern (68 bp):
TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAAAAATTGACATGCCCAAGCAAAATGACTAGATTCAAATAG
CTT
Found at i:117808 original size:87 final size:87
Alignment explanation
Indices: 117712--120377 Score: 3564
Period size: 87 Copynumber: 30.9 Consensus size: 87
117702 CAAATAGCTT
* * * * *
117712 TAACTCTTTAAGTTTTTTTGTTAGAATAATTGTCATGCCTCAGTAAAATGACTAGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
* *
117777 CTTTAACACTTTAAGATAGGAG
66 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
* * *
117799 TAACTCTTTAAGGATTTTTTGTTAGAATAATTTGCATGCCTAAGCAAATTGACTGGATTCAGATA
1 TAACTCTTTAAGTA-TTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATA
*
117864 GCTTTAACTCATTAAGATAGGTG
65 GCTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
* * * *
117887 TAACTCTTTAACTATTTTTGTTAGAATAATTTGCATGCCTAAGCAAAATTAATGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
*
117952 CATTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
* *
117974 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTTGCATGCCTAAGCAAAATTACTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
118039 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
* * * * * *
118061 TGACACTTTAAGTATATTTTGTTAGAATAATTTGAATGCCTAAGCAAAATGATTGGATTCATATA
1 TAACTCTTTAAGTAT-TTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATA
* *
118126 ACTTTAACTCATTAAGATAGGTG
65 GCTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
* * * * *
118149 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAG----ATTGGCATGCCTAAGAAAAATAATTGGATTTATATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
* *
118210 ATTTAACTCTTTAAAATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
* * ** * * *
118232 TAACACTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGACATGTGTAAG-ACAAATGACAGGACTCATATA
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCA-AAATGACTGGATTCAGATA
* *
118296 GCTTTAACTCATTAAAATAGGTG
65 GCTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
* * * * *
118319 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAAAAATTGGCAAGCCTAAGTAAAATGACTGAATTCAGTTAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
*
118384 CTTTAACTATTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
* * * *
118406 TAACTCTGTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGAAAAATAACTAGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
**
118471 CTTTAACTCTTTAAGATAGGCA
66 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
* * *
118493 CAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGTATGCCTAAGCAAAATGATTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
* ** *
118558 ATTTAACAGTTTAAGATAAGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
* *
118580 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATCA-TAGGATTCATATA
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACT-GGATTCAGATA
118644 GCTTTAACTCATTTAAGATAGGTG
65 GCTTTAACTC-TTTAAGATAGGTG
* * *
118668 TAACTCTTTAAGTATTTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTTAGCAAAATGATTGGATTCATATA
1 TAACTCTTTAAGTA-TTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATA
* *
118733 TCTTTAACTCATTAAGATAGGTG
65 GCTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
*
118756 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAA-AATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGTTAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
* *
118820 CTTTAACTATTTAAGATAAGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
* * **
118842 TAACTCTGTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGGAAAATGGTTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
*
118907 CTTTAACTCTTCAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
* *
118929 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATACTTGGCATGCCTAA--AAAATGA-TTGATTC--ATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
*
118989 CATTAACTC-TTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
* * *
119010 TAACTCTTTAACTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATG-CTAAGCAAAATGATTGGATTCATATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
*
119074 C-TTAACTCATTAAGATA-G-G
66 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
* *
119093 TAACTCTTTAATTATTTTTGTTAGAAAAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
* * *
119158 CTTTAACTCTTAAATACAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
* *
119180 TAACTCTTTAAGT-TTTTTTTTAGAATAATTGGCATGCCAAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
119244 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
* *
119266 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAATTGACTGGATTTAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
119331 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
* * * *
119353 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAAAAACTGGCATGCCTAATCAAAATGATTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
* *
119418 CTTTAACTCTTAAATATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
* *
119440 TAACTC-TT---TATTTTT-TTAGAATAATTGTCATGCCTAAGCAAAATGATTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
* *
119500 CTTTAACGCTTTAAGATAGGAG
66 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
* * *
119522 TATCTCCTTAAGTATTTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCAAAGCAAAATGACTGGATTCAGATA
1 TAACTCTTTAAGTA-TTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATA
*
119587 GATTTAACTCTTTAAGATAGGTG
65 GCTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
* * * * * *
119610 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTTGCTTGCCTAAGAAAAATGGCTAGATTCAGATAA
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
119675 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
* * *
119697 TAACTCATTT-AG-ATTTTTTATTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGGCTGGATTTAGAT
1 TAACTC-TTTAAGTA-TTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGAT
* * **
119760 AGCTTTAACTATATAAGATAAATG
64 AGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
* * **
119784 TAACTCTGTAAGTATTTTTGTTAGAGTAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGGTTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
*
119849 CTTTAAATCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
** * * *
119871 TAACAATTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGATTAGATTCATATA-
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
*
119935 --TTAACTC----AGATAGGTT
66 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
* * * * *
119951 TAACTCTTTAACTATTTAT-TTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGATTAGATTCATATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
* *
120015 CATTAACTCATTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
* * * * **
120037 TAAATCTTGAAGTATTTTTGTTAGAAAAAATGGCATGCCTAAGCAAAATGACTATATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
* *
120102 CTTTAACTCTTAAATATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
* * *
120124 TAACTCTTTAAGTTTTTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAATATGATTGGATTCAGATA
1 TAACTCTTTAAG-TATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATA
**
120189 GCTTTAACTCTTTAAGATAAATG
65 GCTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
* * * * *
120212 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATT-GCATGCCTAAGCAAATTAACAGGATTTAGACAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
120276 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
* * * * *
120298 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAAAAATTGACATGCCCAAGCAAAATGATTGGATTCAAATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
120363 CTTTAACTCTTTAAG
66 CTTTAACTCTTTAAG
120378 TTTTTTTTGT
Statistics
Matches: 2276, Mismatches: 259, Indels: 88
0.87 0.10 0.03
Matches are distributed among these distances:
79 44 0.02
80 27 0.01
81 46 0.02
82 90 0.04
83 124 0.05
84 46 0.02
85 31 0.01
86 266 0.12
87 1185 0.52
88 361 0.16
89 55 0.02
90 1 0.00
ACGTcount: A:0.34, C:0.12, G:0.17, T:0.37
Consensus pattern (87 bp):
TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
Found at i:117883 original size:19 final size:19
Alignment explanation
Indices: 117859--117897 Score: 51
Period size: 19 Copynumber: 2.1 Consensus size: 19
117849 GACTGGATTC
*
117859 AGATAGCTTTAACTCATTA
1 AGATAGCTGTAACTCATTA
* *
117878 AGATAGGTGTAACTCTTTA
1 AGATAGCTGTAACTCATTA
117897 A
1 A
117898 CTATTTTTGT
Statistics
Matches: 17, Mismatches: 3, Indels: 0
0.85 0.15 0.00
Matches are distributed among these distances:
19 17 1.00
ACGTcount: A:0.36, C:0.13, G:0.15, T:0.36
Consensus pattern (19 bp):
AGATAGCTGTAACTCATTA
Found at i:117968 original size:19 final size:19
Alignment explanation
Indices: 117946--117985 Score: 55
Period size: 19 Copynumber: 2.1 Consensus size: 19
117936 TAATGGATTC
117946 AGATAGCAT-TAACTCTTTA
1 AGATAG-ATGTAACTCTTTA
*
117965 AGATAGGTGTAACTCTTTA
1 AGATAGATGTAACTCTTTA
117984 AG
1 AG
117986 TATTTTTGTT
Statistics
Matches: 19, Mismatches: 1, Indels: 2
0.86 0.05 0.09
Matches are distributed among these distances:
18 1 0.05
19 18 0.95
ACGTcount: A:0.35, C:0.12, G:0.17, T:0.35
Consensus pattern (19 bp):
AGATAGATGTAACTCTTTA
Found at i:119262 original size:19 final size:19
Alignment explanation
Indices: 119238--119277 Score: 62
Period size: 19 Copynumber: 2.1 Consensus size: 19
119228 GACTGGATTC
*
119238 AGATAGCTTTAACTCTTTA
1 AGATAGCTGTAACTCTTTA
*
119257 AGATAGGTGTAACTCTTTA
1 AGATAGCTGTAACTCTTTA
119276 AG
1 AG
119278 TATTTTTGTT
Statistics
Matches: 19, Mismatches: 2, Indels: 0
0.90 0.10 0.00
Matches are distributed among these distances:
19 19 1.00
ACGTcount: A:0.33, C:0.12, G:0.17, T:0.38
Consensus pattern (19 bp):
AGATAGCTGTAACTCTTTA
Found at i:119349 original size:19 final size:19
Alignment explanation
Indices: 119325--119364 Score: 62
Period size: 19 Copynumber: 2.1 Consensus size: 19
119315 GACTGGATTT
*
119325 AGATAGCTTTAACTCTTTA
1 AGATAGCTGTAACTCTTTA
*
119344 AGATAGGTGTAACTCTTTA
1 AGATAGCTGTAACTCTTTA
119363 AG
1 AG
119365 TATTTTTGTT
Statistics
Matches: 19, Mismatches: 2, Indels: 0
0.90 0.10 0.00
Matches are distributed among these distances:
19 19 1.00
ACGTcount: A:0.33, C:0.12, G:0.17, T:0.38
Consensus pattern (19 bp):
AGATAGCTGTAACTCTTTA
Found at i:119606 original size:19 final size:19
Alignment explanation
Indices: 119582--119621 Score: 62
Period size: 19 Copynumber: 2.1 Consensus size: 19
119572 GACTGGATTC
*
119582 AGATAGATTTAACTCTTTA
1 AGATAGATGTAACTCTTTA
*
119601 AGATAGGTGTAACTCTTTA
1 AGATAGATGTAACTCTTTA
119620 AG
1 AG
119622 TATTTTTGTT
Statistics
Matches: 19, Mismatches: 2, Indels: 0
0.90 0.10 0.00
Matches are distributed among these distances:
19 19 1.00
ACGTcount: A:0.35, C:0.10, G:0.17, T:0.38
Consensus pattern (19 bp):
AGATAGATGTAACTCTTTA
Found at i:120415 original size:69 final size:68
Alignment explanation
Indices: 120298--120446 Score: 210
Period size: 69 Copynumber: 2.2 Consensus size: 68
120288 AAGATAGGTG
*
120298 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAAAAATTGACATGCCCAAGCAAAATGATTGGATTCAAATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAAAAATTGACATGCCCAAGCAAAATGACTGGATTCAAATAG
120363 CTT
66 CTT
* * * * *
120366 TAACTCTTTAAGTTTTTTTTGTTAGAATAATTGTCATGCCTC-AGTAAAATGACTGGATTCAGAT
1 TAACTCTTTAAG-TATTTTTGTTAGAAAAATTGACATGCC-CAAGCAAAATGACTGGATTCAAAT
120430 AGCTT
64 AGCTT
*
120435 TAACGCTTTAAG
1 TAACTCTTTAAG
120447 ATAGGAGTAA
Statistics
Matches: 72, Mismatches: 7, Indels: 3
0.88 0.09 0.04
Matches are distributed among these distances:
68 12 0.17
69 59 0.82
70 1 0.01
ACGTcount: A:0.33, C:0.13, G:0.15, T:0.38
Consensus pattern (68 bp):
TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAAAAATTGACATGCCCAAGCAAAATGACTGGATTCAAATAG
CTT
Found at i:120538 original size:19 final size:19
Alignment explanation
Indices: 120514--120552 Score: 51
Period size: 19 Copynumber: 2.1 Consensus size: 19
120504 GACTGGATTC
*
120514 AGATAGCTTTAACTCATTA
1 AGATAGCTGTAACTCATTA
* *
120533 AGATAGGTGTAACTCTTTA
1 AGATAGCTGTAACTCATTA
120552 A
1 A
120553 CTATTTTTGT
Statistics
Matches: 17, Mismatches: 3, Indels: 0
0.85 0.15 0.00
Matches are distributed among these distances:
19 17 1.00
ACGTcount: A:0.36, C:0.13, G:0.15, T:0.36
Consensus pattern (19 bp):
AGATAGCTGTAACTCATTA
Found at i:120614 original size:87 final size:86
Alignment explanation
Indices: 120366--134553 Score: 16433
Period size: 82 Copynumber: 171.1 Consensus size: 86
120356 CAAATAGCTT
* * * *
120366 TAACTCTTTAAGTTTTTTTTGTTAGAATAATTGTCATGCCTCAGTAAAATGACTGGATTCAGATA
1 TAACTCTTTAAG-TATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATA
* *
120431 GCTTTAACGCTTTAAGATAGGAG
65 GCTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
* *
120454 TAACTCTTTAAGGATTTTTTGTTAGAATAATTTGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATA
1 TAACTCTTTAAGTA-TTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATA
120519 GCTTTAACTCATTAAGATAGGTG
65 GCTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
* * * * *
120542 TAACTCTTTAACTATTTTTGTTAGAATAATTTGCATGCCTAAACAAAATTAATGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
*
120607 CATTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
* *
120629 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTTGCATGCCTAAGCAAAATTACTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
120694 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
* *
120716 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGATTGGATTCATATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
120781 CTTTAACTCTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTAAGATAGGTG
*
120802 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAG---AATTGGCATGCCTAA-CAAAATGA-TGGATTCATATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
120862 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
120884 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATT-GCATGCCTAAG-ACAAATG---GGATTC--ATA
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCA-AAATGACTGGATTCAGATA
120942 GCTTTAACT-TTAA-ATAGGTG
65 GCTTTAACTCTTAAGATAGGTG
* *
120962 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCAAGCCTAAG-AAAATGA---GATTCA-TTAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
121022 CTTTAACT-TTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTAAGATAGGTG
121042 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAG-AT--TTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
121104 CTTTAACTCTT-AGATA-G-G
66 CTTTAACTCTTAAGATAGGTG
121122 TAACTCTTTAAGTA-TTTTGTTAGAATAATTGG--TGCCTAAGCAAAATGA-TGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
121183 CTTTAACT-TTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTAAGATAGGTG
*
121203 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCT-A--AAAAT---TGGATTCATATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
121262 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
66 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
121283 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAA-AATTGGCATG-CTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
121346 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
*
121368 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGC-AAATGA-TGGATTCATATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
121431 CTTTAACTCTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTAAGATAGGTG
* *
121452 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAAAAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCA-TTAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
*
121516 CTTTAACTATTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACT-CTTAAGATAGGTG
* *
121538 TAACTCTGTAAGTA-TTTT-TTAGAATAATTGGCATGCCTAAG-AAAATG-GTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
121599 CTTTAACTCTTAAGATA-GTG
66 CTTTAACTCTTAAGATAGGTG
* *
121619 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGATTGGATTCATATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
121684 C-TTAACTCTTAAGATA-G-G
66 CTTTAACTCTTAAGATAGGTG
*
121702 T-ACTCTTTAAGT-TTTTTG-TAGAA-AATTGGCATGCCTAA-AAAAATGACTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
121762 CTTTAACTCTTTAA-ATAGGTG
66 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
121783 TAACTCTTTAAG-A-TTTT-TTAGAATAATTGGCATGCC-AAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
121844 CTTTAACTCTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTAAGATAGGTG
*
121865 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGC-AAAT---T--ATT--TATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
121922 CTTTAACTCTTTAAG-TA--T-
66 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
* ** *** * * * * *
121940 T---TTTGTTAGAAAATGGCATGCCTAAGCAA-AATGACTGGATTCATAGCTTTATCTTTAAAT-
1 TAACTCT-TTA-AGTAT-TTTTG--TTAG-AATAAT---TGG---CAT-GCCTAAGC--AAAATG
** * * **
122000 A--GG-TGT-A-ACTA--TTTATTTTTTTAGAATAATTG
51 ACTGGAT-TCAGA-TAGCTTTAACTCTTAAG-ATAGGTG
** * * * * * ** * **
122032 GCA-TGC-CTAAGCAAAATGATTGGATTCAG-ATAGCTT-TAACT-CTTTAAG-ATAGGTGTAAC
1 TAACT-CTTTAAG---TAT-TTTTG-TT-AGAATA-ATTGGCA-TGC-CTAAGCA-AAATG--AC
* * *** * * * *
122091 T--CTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATT-GGCAT-GCCTAAG
53 TGGATTCAG-ATAGCT-TTA-ACT-CTTAAG-ATAG-GT--G
* * ** * ** ** * * *** *
122129 CAAATGATTCAG-ATTTAACTCT-TTA-AATAGGTGTAACT-CTTTAAGTATTTTTG-TTAGAAA
1 TAACTCTTTAAGTATTT---T-TGTTAGAATAATTGGCA-TGC-CTAAGCA-AAATGACT-G---
* * * * * * ** * *
122189 AATT-GGCCTAAGC--AAAATGACTGGATTCATAGCTT
55 GATTCAG-AT-AGCTTTAACT--CT-TA-AGATAGGTG
*** * ** * * * ** * * * * * **
122224 TAACTCTTTAAG-ATAGGTG-TA-ACTCTTTAAGTAT--TTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTA
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATT-GGCATGCCTAAG-CAAAATGACTGG-ATTCAGA
* * * * ** *
122284 -AGC--AAAATGATGATTCATAGCT-
63 TAGCTTTAACT-CTTA-AGATAGGTG
*** * ** * * ** * * **
122306 TAACTCTTTAAG-ATAGGTG-TA-ACTCTTTAAGTAT-TTTTAG-AATAAT---TGGCATGCCTA
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATT-GGCATGCCTAAGCAA-AATGACTGG-ATTCAGA
** * * * * * * *
122363 -AGCAAAATGATTGGATTCATATAGCTT
63 TAGC--TTTAACT--CTTAAGATAGGTG
* * *
122390 TAACTC-TTAAGATAGGTAACTTAAGTATTTTTGTTAGAAAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGAC
1 TAACTCTTTAAG-TA--T---TT---T-TGTTAG--A-ATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGAC
122454 T-GATTCAGATAGCTTTAACTCTTAA-ATAGGTG
53 TGGATTCAGATAGCTTTAACTCTTAAGATAGGTG
122486 TAACTCTTTAAGT-TTTTT-TTAGAATAATTGGCATGCCTAAGC-AAATGA-TGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
122547 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
122569 TAACTCTTT-A-TA-TTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGC-AAATGACTGGATTCAG--AG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
122628 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
*
122650 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAA-AATT-GCATGCCTAAGCAAAATGATTGGATTCA-ATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
* ***
122712 CTTTAACTCTTTAAGTTTTTTTG
66 CTTTAACTC-TTAAG-ATAGGTG
* ** * * ** * * * * * ** ** * *
122735 TTAGAATAATT-GGCATGCCTAG-CAAAATGATTGG-ATTCAGATAGC--TTTAACT---TTAAG
1 -TA-ACTCTTTAAGTAT-TTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTA-AGCAAAATGACTGGATTCAG
*** ***
122792 ATAGGAGTAACTCTTTAAGATTTTTTG
62 ATAGCTTTAACTC-TTAAGA-TAGGTG
* ** * * * ** * * * * * ** ** * *
122819 TTAAATAATT-GGCATGCCTAAG-CAAAATGACTGG-ATTCAGATAGC--TTTAACT-CA-T-A-
1 -TAACTCTTTAAGTAT--TTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTA-AGCAAAATGACTGGATTCAG
* * ***
122875 ATA--TGTAACTCTTTAATATTTTTG
62 ATAGCTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
* * * * ** * * * ** * * * *
122899 TTAGAATAATTT--GCATGCCTAAG-CAAAATAA-TGG-ATTCAGATAGC---TTAACT--CTTA
1 -TA-ACT-CTTTAAGTAT--TTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTA-AGCAAAATGACTGGATTC
* *
122954 AGATAGGTGTAACTCTT----TA--T-
60 AGATAGCTTTAACTCTTAAGATAGGTG
* * * ** * * ** * * *** *
122974 T--TTTTGTTAGAATAATTGATGCCTAAGCAA-AA-TGG-ATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAG
1 TAACTCT-TTA-AGT-ATTTTTG--TTAG-AATAATTGGCATGCCTA-AGC--AAAATGACT-GG
*** * * * ** * **
123034 ATAGGTG-TAACCTTTAAGTATTTTGTTA-GAA
56 AT-TCAGAT-AGCTTTAACTCTTAAGATAGGTG
* * * ** * * * * * * * **
123065 TAATTGGCTGCCTAAGCA--AATGATGGATTCATATAGCTTTAACTCTTTAAG-ATAGGTGTAAC
1 TAACT--CT--TTAAGTATTTTTGTTAGAATAAT-TGGC-AT-GC-C--TAAGCA-AAATG--AC
** * *** * **
123127 T-CTTTAAGTATTTTTGTTAGAATTGCATGCCTAAGCA-AAATG
53 TGGATTCAG-ATAGCT-TT--AA---C-T-CTTAAG-ATAGGTG
* ** * ** ** * * *** *
123169 ATTGGA-T-TTATATAGCT-TTAACTCTTA-AGATAGGTAAC-T-CTTTAAGTATTTTTG-TTAG
1 --T-AACTCTT-TA-AG-TATT-TTTGTTAGA-ATAATTGGCATGC-CTAAGCA-AAATGACT-G
* ** ** * * * * *
123227 AAAATTGGC-CCTAAGCAAAATGACTGGATTCAG-TAGCTT
55 --GATT--CAGAT-AGC--TTTAACT--CTTAAGATAGGTG
* * ** ** * **
123266 TAACTCTTTAA-TAGGTGTAACTCTT-TAAGTATTTTTTAGAATAATTGGCT--GCCTAA-GCAA
1 TAACTCTTTAAGTA--T-T---T-TTGTTAG-AATAATT-G--GCA-TGCCTAAGCAAAATG--A
*
123326 ATGATGATTCAGATAGCTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
52 CTG--GATTCAGATAGCTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
123364 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATT-AGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
123428 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
* *
123450 TAACTCTTTAAGTA-TTTTGTTAGAA-AATTGGCATGCCTAAGCAAAATG-GTTGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
*
123512 CTTTAACACTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
123534 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGA-TGGATTC--ATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
123596 C-TTAACTCTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTAAGATAGGTG
*
123616 TAACTCTTTAA-TATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGA-TGGATTCATATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
123679 CTTTAACTCATTAAGATA-GTG
66 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
123700 TAACTC-TTAAGTA-TTTTGTTAGAA-AATTGGCATGCCTAAGCAAAATGA-TGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
*
123761 CTTTAACTTTTAAGATA-GTG
66 CTTTAACTCTTAAGATAGGTG
**
123781 TAACTCTTTAAGTATTTTT-TTAGAATAATT-GCATGCCT-AG-AAAATGGTTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
123842 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
66 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
* * *
123863 TAACTCTTT-AGTATTTTTGTT-GAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGA-T-TAATCATATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
123924 CTTTAACTCTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTAAGATAGGTG
* * *
123945 TAACTCTTT-ACTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGATTGGATTCATATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
124009 C-TTAACTCTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTAAGATAGGTG
124029 TAACTCTTTAAGTA-TTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGA-TGG-TTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
124091 CTTTAACTCTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTAAGATAGGTG
*
124112 TAACTC-TTAAGTTTTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCT-AGCAAAATGA-TGGATTC--ATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
*
124172 ATTTAACTCTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTAAGATAGGTG
*
124193 TAACTCTTTAAG--TTTTTGTTAG---AATTGGCATGCCTAAGC-AAATGACTGGATTTAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
124252 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
124274 TAACTCTTTAAGTATTTTT-TTAGAA-AA--GGCA----TAAGCAAAATGACTTGGATTCAGATA
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGAC-TGGATTCAGATA
124331 GCTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
65 GCTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
*
124353 TAACTCTTTAAGT-TTTTTGTTAG-A-AATTGGCATGCCTAAGCAAAATGATTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
124415 CTTTAACTCTTTAAGATA---G
66 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
124434 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAA-CAAAA-GACTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
124497 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
*
124519 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATT--CTTGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
*
124582 CTTTAACTTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTAAGATAGGTG
124603 TAACTCTTTAAGT-TTTTTG-T-GAATAATTGGCATGCCTAAGC-AAATGACTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
124664 CTTTAACTCTTTAAG--AGGTG
66 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
**
124684 TAA--CTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGGTTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
*
124747 CTTTAA-TCTTTA-ATAGGTG
66 CTTTAACTCTTAAGATAGGTG
124766 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGA-TGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
124830 CTTTAACTCTTAAGATA-G-G
66 CTTTAACTCTTAAGATAGGTG
*
124849 TAACTC-TTAAGT-TTTTTGTTAGAATAA-T----TGCCTAAGCAAAATGACTAGA-TCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
124906 CTTTAACTCTTTAAG--AGG-G
66 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
124925 TAACTCTTTAAGTA-TTTTGTTAG---AATTGGCA-GCCTAAGCAAAATGACTGGATTC--ATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
*
124983 CTTTAACT-TTTA-A-A---G
66 CTTTAACTCTTAAGATAGGTG
124998 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAG--AAA--A-T--ATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
125056 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
66 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
* *
125077 TAACTCTTTAAGTA-TTTTGTTTGAATAATTGGCATGCC-AAGCAAAATGA-T-GATTCATATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
125138 CTTTAACTCTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTAAGATAGGTG
* *
125159 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGA-TTGATTCATATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
125223 C-TTAACTCTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTAAGATAGGTG
125243 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAG-AAAATGACTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
125307 CTTTAACTCTTTAAGATA-G-G
66 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
125327 ----TC-TTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACT-GATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
125386 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
66 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
* *
125407 TAACTC-TT--GTATTTTTTTTAAAAT-ATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
125468 CTTTAACTCTTTAAGATA-G-G
66 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
125488 TAACTC-TTAAGTATTTTTGTTAGAATAATT-GCATGCCTAAGCAAAATGA-TGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
125550 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
66 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
125571 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGC-TGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
125635 CTTTAACTCTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTAAGATAGGTG
125656 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATG-CTAAGCAAAATGACTGGA-T-AGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
125718 CTTTAACTCTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTAAGATAGGTG
125739 TAACTC-TTAAGTA-TTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATG--TGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
125800 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
125822 TAACTCTTT-AG--TTTTT-TTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGA-TGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
125882 CTTTAACTCTTTAAGATA-G-G
66 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
125902 TAACTC-TTAAGTATTTTTGTTAGAATAATT-GCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
*
125965 CTTTAA-TCTTTAAGATAGATG
66 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
125986 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATT-GCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
126050 C-TTAACTCTTTAAGATA---G
66 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
*
126068 -AACTCTTTAAGT-TTTTTGTTAG-ATAATTGGCATGGCTAAGCAAAATG-CTGGATT-AGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
*
126128 CTTTAACTATTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTAAGATAGGTG
*
126149 TAACTC-TTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATG-GTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
126212 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
* *
126234 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAAT-ATTGGCATGCCTAAGCAAAATGA-T-TATTCATATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
126296 CTTTAACTCTTTAAGA-A-G-G
66 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
*
126315 TAACTC-TTAAGTTTTTTTGTTAGAATAATT-GCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTC--ATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
126376 CTTTAACTCTTTAAGATA-G-G
66 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
126396 TAACTCTTTAAGTA-TTTTGTTAGAAT-ATTGGCATGCCTAAGC-AAA--A-TGGATTCAG-TAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
126454 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
*
126476 TAACTCTTT-AG--TTTTTGTTAGAATAATT-GCTTGCCTAAGCAAAATGA-TGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
126536 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
66 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
*
126557 TAACT-TTTAAGTATTTTTGTTAGAAAAATTGG-ATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
126620 CTTTAACTCTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTAAGATAGGTG
*
126641 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGA-TGGATTCAGATAT
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
126705 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
66 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
126726 TAACTCTTTAAGTA-TTTT-TTAGAA-AATTGGCATGCCTAAGC-AAATGACTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
126787 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
66 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
126808 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAA-AATTGG-ATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
126871 CTTTAACT-TTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTAAGATAGGTG
*
126891 TAACTCTTTAAGT-TTTTT-TTAGAAAAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
126954 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
*
126976 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGC-AAATGACTGGATTTAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
127040 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
66 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
127061 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAA-AA-TGGCATGCCTAAGCAAAA-GACTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
127123 CTTTAACTCTTAA-ATAGGTG
66 CTTTAACTCTTAAGATAGGTG
127143 TAACTC-TT---TA-TTTT-TTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
127202 CTTTAACTCTTTAAGATA-G-G
66 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
127222 TAACTC-TTAAGTA--TTT-TTAGAATAATTGGCATGCC-AAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
127282 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
* *
127304 TAACTCTTTAAGTA-TTTTGTTAGAATAATT---TTGCCTAAGCAAAATGACTAGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
127365 CTTTAACTCTTTAAG-TAGGTG
66 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
*
127386 TAACTC-TT---TATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGC-AAATGACTGGATTTAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
127446 CTTTAACTCTT-AGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTAAGATAGGTG
127466 TAACTCTTTAAGTATTTTT-TTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAAT---TGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
127527 CTTTAACTCTTTAAG-TAGGTG
66 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
* **
127548 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGA-TTGATTC-TTTA-
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
*
127610 -ATTAACTCTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTAAGATAGGTG
127630 TAACTCTTTAAGTATTTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGA-T-GATTCAGATA
1 TAACTCTTTAAGTA-TTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATA
127693 GCTTTAACTCTTAAGATAGGTG
65 GCTTTAACTCTTAAGATAGGTG
127715 TAACT-TTTAAGTATTTTTGTTAGAA-AATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
127778 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
*
127800 TAACTCTTTAAGTA-TTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGC-AAATGAATGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
127863 C-TTAA-TCTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTAAGATAGGTG
127882 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAA--GGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
127945 CTTTAA-TCTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTAAGATAGGTG
*
127965 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATT-TC-TGCCTAA--AAAATGACTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
128026 CTTTAACTCTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTAAGATAGGTG
* * *
128047 TAACTCTTTAAGTTTTTTTGTTTGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTTAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
*
128112 CTTTAACTATTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACT-CTTAAGATAGGTG
* **
128134 TAACTCTGTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGGTTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
128199 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
128221 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGC-AAA--A-T-GATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
128281 C-TTAACTCTTAAGA-A-GTG
66 CTTTAACTCTTAAGATAGGTG
*
128299 TAACTCTTTAAGTTTTTTTGTTAGAATAATT-GCAT--CTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
128361 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
128383 TAACTC-TTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
128447 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
* *
128469 TAACTCTTTAAGTATTTTT-TTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGATTGGATTCATATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
128533 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
*
128555 TAACTC-TTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGC-AAATGATTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
128618 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
128640 TAACTC-TTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAAT---TGGATTC--ATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
128699 C-TTAACTCTTTAAGATA-G-G
66 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
128718 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAA-AATTGG-ATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
128781 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
*
128803 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAG-AAAAT---TGGATTCATATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
128864 CTTTAACTCTTTAAGATA---G
66 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
128883 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAA-AATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTC--ATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
128945 CTTTAACTCTTAAGATA-GTG
66 CTTTAACTCTTAAGATAGGTG
128965 TAACTCTTTAA-TA-TTTTGTTAGAA-AATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
129027 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
129049 TAACTCTTTAAGT-TTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCC-AAGCAAAATGA-TGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
129111 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
129133 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
129198 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
129220 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAA-AATT-GCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
*
129283 CTTTAACTCTTAATATAGGTG
66 CTTTAACTCTTAAGATAGGTG
129304 TAACTCTTTAAGT-TTTTT-TTAGAATAATT-GCATGCCTAAGC-AAATGA-TGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
129364 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
129386 TAACTCTTTAAGTATTTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCC-AAGC-AAATGACT-GATTCAGATA
1 TAACTCTTTAAGTA-TTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATA
129448 GCTTTAACTCTTTAAGATA-G-G
65 GCTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
129469 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATT-GC-TGCCTAAGCAAAATGACT--ATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
129530 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
* * * *
129552 TAACTCTTTAAGTTTTTTTGTTTGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGGCTGGATTTAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
*
129617 CTTTAACTATTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACT-CTTAAGATAGGTG
*
129639 TAACTCTGTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGC-AAATGACTTGGATTCAGATA
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGAC-TGGATTCAGATA
*
129703 GCTTTAAATCTTTAAGATAGGTG
65 GCTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
*
129726 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGA-T--ATTCATATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
129788 C-TTAACTCTTTAAGATA-GTG
66 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
*
129808 TAACTC-TTAAGTA-TTTT-TTAGAAAAATTGGCATGCCTAAGC-AAATGA-TGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
129868 C-TTAACTCTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTAAGATAGGTG
129888 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGC-AAATGACTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
* *
129952 CTTTAAC-CTTTA-A-A-GAG
66 CTTTAACTCTTAAGATAGGTG
129969 TAACTC-TTAAGTA--TTT-TTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
130030 CTTTAACTCTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTAAGATAGGTG
130051 TAACTC-TTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAAT-A-TGGATTC--ATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
130111 C-TTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
130132 TAACTC-TTAAGTATTTTTGTTAGAATAATT-GCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
130195 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
*
130217 TAACTC--TAAGTA-TTTTGTTAGAATAATT-G-ATGCCTAAGCAAAATGA-TGGATTCATATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
130276 CTTTAACTCTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTAAGATAGGTG
* ** *
130297 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAG----ATTGACATGCCTAA--AAAATTTCTGGATTCATATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
130356 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
130378 TAACTCTTTAAGTA-TTTTGTTAGAATAATT-G---GCCTAAAGCAAAATGA-TGGATTC--ATA
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCT-AAGCAAAATGACTGGATTCAGATA
130435 GCTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
65 GCTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
*
130458 TAACTCTTT-AGTATTTTTGTTAGAATAATTGGC-TGCCTAAGC-AAA--A-T-GA-TCATATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
130515 CTTTAACTCTTTAAGATA-G-G
66 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
*
130535 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCATATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
130600 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
130622 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAG-AAAA--A-TGGTATTCAGATA
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG-ATTCAGATA
130683 GCTTTAACTCTTAAGATA-G-G
65 GCTTTAACTCTTAAGATAGGTG
130703 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAAT-ATTGGCATGCCTAAGC--AATGA-T-GATTC--ATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
130761 C-TTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
* *
130782 TAACTC-TTAAGTATTTTTGTTAGAATAATT-GCATGCCTAAGCAAAATGA-T-GATTCATATAT
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
130843 CTTTAACTCTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTAAGATAGGTG
130864 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAG-AAAATGACTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
130928 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
66 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
**
130949 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGC-AAATGGTTGGATTC--ATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
*
131011 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTA
66 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
*
131033 TAACTC-TTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGA-TGGATTCATATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
131096 C-TTAACTCTTAAGATA-GTG
66 CTTTAACTCTTAAGATAGGTG
131115 TAACTC-TTAAG--TTTTTGTTAGAAT-ATT-GCATGCCTAAGC-AAATGA-TGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
131173 CTTTAACTCTTTAAGATA-G-G
66 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
131193 TAACTC-TTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACT-GATTC--ATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
131254 CTTTAACTCTTTAAGATA---G
66 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
131273 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAAT-ATT-GCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTC--ATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
131334 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
*
131356 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATT-GCATGCCTAAGCAAAATGACAGGA-T---ATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
131416 CTTTAACTCTTTAA-ATA-G-G
66 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
*
131435 TAACTCTTTAAGTA-TTTTGTTAGAAAAATTGGCA-GCCTAAGCAAAATGA-T-GATTCAG-TAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
131495 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
131517 TAA--CTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAG--AAA--A-T-GATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
131574 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
131596 TAACTCTTTAAGTA-TTTTGTTAGAAT-ATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
131659 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
* *
131681 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGA-TTGATTCATATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
131745 C-TTAACTCTTAAGATA-G-G
66 CTTTAACTCTTAAGATAGGTG
*
131763 TAACTC-TTAAGTA-TTTT-TTAGAATAATTGGCATGCCTAAGC-AAATGATTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
131824 C--TAACTCTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTAAGATAGGTG
131843 TAACTCTTTAA-TATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGC-AAATGACT-GATTCAGATTA
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGA-TA
131905 GCTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
65 GCTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
131928 TAACTCTTTAAGT-TTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
131992 CTTTAACTCTTAAGATA-GTG
66 CTTTAACTCTTAAGATAGGTG
132012 TAACTCTTTAAGTA-TTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGC-AAA--A-TGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
132072 C-TTAACTCTTTAAGATA-GTG
66 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
132092 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
132157 CTTTAACTCTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTAAGATAGGTG
*
132178 TAACTC-TTAAGTATTTTTGTTAGAATAATT-G-ATGCCTAAGCAAAATGATTGGATTC--ATA-
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
132237 ---TAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
*
132256 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAG---AATT-GCATG-CTAAGC-AAA--ACTGGATTCATATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
132313 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
132335 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAA-AATT-G---GCCTAAAGC-AAATGACTGGATTCAG-TA
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCT-AAGCAAAATGACTGGATTCAGATA
132393 GCTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
65 GCTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
*
132416 TAACTCTTT-AGTATTTTTTTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGC-AAA--A-T-GA-TCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
132474 CTTTAACTCTTTAAGATA-G-G
66 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
132494 TAACTCTTT-AGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
132558 CTTTAACT-TTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTAAGATAGGTG
132578 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGC-AAA--A-TGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
132639 CTTTAACTCTTAAGATA-G-G
66 CTTTAACTCTTAAGATAGGTG
* *
132658 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGC-AAATGA-TAGATTCATATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
132721 CTTTAACTCTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTAAGATAGGTG
132742 TAACTCTTTAAGTA-TTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGC-AAATGA-T-GATTC--ATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
132801 C-TTAACTCATTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
132822 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAA-AATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAG-TAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
*
132885 CTTTAA-TTTTAAGATA-G-G
66 CTTTAACTCTTAAGATAGGTG
*
132903 TAACTCTTT-AGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGC-AAATGACT-GATTCATATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
*
132965 CTTTAAATCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
*
132987 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGA-TGGATTCATATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
133051 CTTTAACTCTTAAGATA-G-G
66 CTTTAACTCTTAAGATAGGTG
133070 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATT----TGCCTAA--AAAATGACTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
133129 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
133151 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATT-GCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTC--ATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
133213 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
133235 TAACTCTTTAAGTA-TTTTGTTAGAATAATT-GCATGCCTAAGCAAAATGACT-GATTC--ATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
133295 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
*
133317 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGC-AAA--A-TGGATTCATATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
133378 CTTTAACTCTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTAAGATAGGTG
133399 TAACTC-TTAAG--TTTTTGTTAGAA-AATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACT-GATTC--ATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
133457 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
*
133479 TAA--CTTTAAGTA-TTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAAT-ACTAGATTC--ATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
133538 C-TTAACTCTTTAAGATA---G
66 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
133556 TAACTCTTTAAGTATTTTT-TTAGAATAA-TGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTC-GATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
133618 CTTTAACTCTTAAGATA-G-G
66 CTTTAACTCTTAAGATAGGTG
*
133637 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATG-CTAAGCAAAATGA-TGGATTCATATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
133700 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
* * *
133722 TAACTCTTTAAGTA-TTTTGTTAGAAAAATTGGCATGCCTAAGC-AAATGATTGGATTCATATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
*
133785 CTTTAACTCTTTA-ATA-GTG
66 CTTTAACTCTTAAGATAGGTG
*
133804 TAACTCTTTAAGTA-TTTTGTTAGAATAATTGGCATG-CTAAGCAAAATGATTGGATTCAGATA-
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
*
133866 TTTTAACTCTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTAAGATAGGTG
133887 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAA-AATTGGCATG-CTAAGCAAAATGACTGGATTC--ATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
133948 CTTTAACTCTTAAGATA--TG
66 CTTTAACTCTTAAGATAGGTG
133967 TAACTC-TTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAG--AAA--A-TGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
134026 CTTTAACTCTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTAAGATAGGTG
* *
134047 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAG-A-ACTTGGCATG-CTAAG-AAAATGA-TGGATTCATATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
134107 CTTTAACTCTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTAAGATAGGTG
*
134128 TAACTC-TTAAGTATTTTTGTTAGAATAATT-GCATG-CTAAGCAAAATGA-TGGAATTCATATA
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG-ATTCAGATA
134189 GCTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
65 GCTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
134212 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAA-AATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACT-GATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
134275 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
134297 T-ACTCTTTAAG--TTTTT-TTAGAATAATTGGCATGCCTAAGC-AAA-GACTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
134356 CTTTAACTCTTTAAGATA-GT-
66 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
134376 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGA-TGGATTC--ATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
134438 CTTTAACTCTTTAAGATAGGT-
66 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
* *
134459 TAACTC-TTAAGTATTTTTGTTAGAAT-ATTGGCATGCCTAAGCAAAATGATTGGATTCATATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
134522 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
134544 TAACTCTTTA
1 TAACTCTTTA
134554 TGTTTTTAGA
Statistics
Matches: 12703, Mismatches: 530, Indels: 1736
0.85 0.04 0.12
Matches are distributed among these distances:
70 1 0.00
71 7 0.00
72 2 0.00
73 41 0.00
74 16 0.00
75 26 0.00
76 100 0.01
77 209 0.02
78 630 0.05
79 833 0.07
80 1160 0.09
81 1521 0.12
82 1806 0.14
83 1689 0.13
84 1382 0.11
85 1459 0.11
86 665 0.05
87 716 0.06
88 114 0.01
89 19 0.00
90 16 0.00
91 12 0.00
92 17 0.00
93 13 0.00
94 33 0.00
95 44 0.00
96 24 0.00
97 28 0.00
98 40 0.00
99 20 0.00
100 16 0.00
101 12 0.00
102 10 0.00
103 9 0.00
104 2 0.00
105 4 0.00
106 6 0.00
107 1 0.00
ACGTcount: A:0.33, C:0.12, G:0.17, T:0.38
Consensus pattern (86 bp):
TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
CTTTAACTCTTAAGATAGGTG
Found at i:120623 original size:19 final size:19
Alignment explanation
Indices: 120601--120640 Score: 55
Period size: 19 Copynumber: 2.1 Consensus size: 19
120591 TAATGGATTC
120601 AGATAGCAT-TAACTCTTTA
1 AGATAG-ATGTAACTCTTTA
*
120620 AGATAGGTGTAACTCTTTA
1 AGATAGATGTAACTCTTTA
120639 AG
1 AG
120641 TATTTTTGTT
Statistics
Matches: 19, Mismatches: 1, Indels: 2
0.86 0.05 0.09
Matches are distributed among these distances:
18 1 0.05
19 18 0.95
ACGTcount: A:0.35, C:0.12, G:0.17, T:0.35
Consensus pattern (19 bp):
AGATAGATGTAACTCTTTA
Found at i:120712 original size:19 final size:19
Alignment explanation
Indices: 120688--120727 Score: 62
Period size: 19 Copynumber: 2.1 Consensus size: 19
120678 TACTGGATTC
*
120688 AGATAGCTTTAACTCTTTA
1 AGATAGCTGTAACTCTTTA
*
120707 AGATAGGTGTAACTCTTTA
1 AGATAGCTGTAACTCTTTA
120726 AG
1 AG
120728 TATTTTTGTT
Statistics
Matches: 19, Mismatches: 2, Indels: 0
0.90 0.10 0.00
Matches are distributed among these distances:
19 19 1.00
ACGTcount: A:0.33, C:0.12, G:0.17, T:0.38
Consensus pattern (19 bp):
AGATAGCTGTAACTCTTTA
Found at i:120896 original size:82 final size:85
Alignment explanation
Indices: 120366--121911 Score: 2041
Period size: 87 Copynumber: 18.5 Consensus size: 85
120356 CAAATAGCTT
* * * *
120366 TAACTCTTTAAGTTTTTTTTGTTAGAATAATTGTCATGCCTCAGTAAAATGACTGGATTCAGATA
1 TAACTCTTTAAG-TATTTTTGTTAG-A-AATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATA
* *
120431 GCTTTAACGCTTTAAGATAGGAG
63 GCTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
* *
120454 TAACTCTTTAAGGATTTTTTGTTAGAATAATTTGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATA
1 TAACTCTTTAAGTA-TTTTTGTTAG-A-AATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATA
*
120519 GCTTTAACTCATTAAGATAGGTG
63 GCTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
* * * * *
120542 TAACTCTTTAACTATTTTTGTTAGAATAATTTGCATGCCTAAACAAAATTAATGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAG-A-AATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
*
120607 CATTAACTCTTTAAGATAGGTG
64 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
* *
120629 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTTGCATGCCTAAGCAAAATTACTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAG-A-AATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
120694 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
64 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
* *
120716 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGATTGGATTCATATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAG-A-AATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
120781 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
64 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
*
120802 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAG-AATTGGCATGCCTAA-CAAAATGA-TGGATTCATATAGCT
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCT
120864 TTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 TTAACTCTTTAAGATAGGTG
120884 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATT-GCATGCCTAAG-ACAAATG---GGATTC--ATA
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAG-A-AATTGGCATGCCTAAGCA-AAATGACTGGATTCAGATA
120942 GCTTTAA--CTTTAA-ATAGGTG
63 GCTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
* *
120962 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCAAGCCTAAG-AAAATGA---GATTCA-TTAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAG-A-AATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
121022 CTTTAA--CTTTAAGATAGGTG
64 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
*
121042 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAG-ATTTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCT
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCT
121106 TTAACTC-TT-AGATA-G-G
66 TTAACTCTTTAAGATAGGTG
121122 TAACTCTTTAAGTA-TTTTGTTAGAATAATTGG--TGCCTAAGCAAAATGA-TGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAG-A-AATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
121183 CTTTAA--CTTTAAGATAGGTG
64 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
*
121203 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCT-A--AAAAT---TGGATTCATATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAG-A-AATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
121262 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
64 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
121283 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAAAATTGGCATG-CTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGC
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAG-AAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGC
121347 TTTAACTCTTTAAGATAGGTG
65 TTTAACTCTTTAAGATAGGTG
*
121368 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGC-AAATGA-TGGATTCATATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAG-A-AATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
121431 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
64 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
*
121452 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAAAAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCA-TTAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAG--AAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
*
121516 CTTTAACTATTTAAGATAGGTG
64 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
* *
121538 TAACTCTGTAAGTA-TTTT-TTAGAATAATTGGCATGCCTAAG-AAAATG-GTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAG-A-AATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
121599 CTTTAACTC-TTAAGATA-GTG
64 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
* *
121619 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGATTGGATTCATATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAG-A-AATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
121684 C-TTAACTC-TTAAGATA-G-G
64 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
*
121702 T-ACTCTTTAAGT-TTTTTG-TAGAAAATTGGCATGCCTAA-AAAAATGACTGGATTCAGATAGC
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAG-AAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGC
121763 TTTAACTCTTTAA-ATAGGTG
65 TTTAACTCTTTAAGATAGGTG
121783 TAACTCTTTAAG-A-TTTT-TTAGAATAATTGGCATGCC-AAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAG-A-AATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
121844 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
64 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
121865 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAA
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAG-A-AATTGGCATGCCTAAGCAAA
121912 TTATTTATAG
Statistics
Matches: 1349, Mismatches: 46, Indels: 128
0.89 0.03 0.08
Matches are distributed among these distances:
77 15 0.01
78 79 0.06
79 119 0.09
80 102 0.08
81 113 0.08
82 183 0.14
83 69 0.05
84 146 0.11
85 114 0.08
86 92 0.07
87 227 0.17
88 90 0.07
ACGTcount: A:0.33, C:0.12, G:0.17, T:0.38
Consensus pattern (85 bp):
TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCT
TTAACTCTTTAAGATAGGTG
Found at i:121364 original size:19 final size:19
Alignment explanation
Indices: 121340--121379 Score: 62
Period size: 19 Copynumber: 2.1 Consensus size: 19
121330 GACTGGATTC
*
121340 AGATAGCTTTAACTCTTTA
1 AGATAGCTGTAACTCTTTA
*
121359 AGATAGGTGTAACTCTTTA
1 AGATAGCTGTAACTCTTTA
121378 AG
1 AG
121380 TATTTTTGTT
Statistics
Matches: 19, Mismatches: 2, Indels: 0
0.90 0.10 0.00
Matches are distributed among these distances:
19 19 1.00
ACGTcount: A:0.33, C:0.12, G:0.17, T:0.38
Consensus pattern (19 bp):
AGATAGCTGTAACTCTTTA
Found at i:121861 original size:18 final size:18
Alignment explanation
Indices: 121838--121872 Score: 52
Period size: 18 Copynumber: 1.9 Consensus size: 18
121828 GACTGGATTC
*
121838 AGATAGCTTTAACTCTTA
1 AGATAGCTGTAACTCTTA
*
121856 AGATAGGTGTAACTCTT
1 AGATAGCTGTAACTCTT
121873 TAAGTATTTT
Statistics
Matches: 15, Mismatches: 2, Indels: 0
0.88 0.12 0.00
Matches are distributed among these distances:
18 15 1.00
ACGTcount: A:0.31, C:0.14, G:0.17, T:0.37
Consensus pattern (18 bp):
AGATAGCTGTAACTCTTA
Found at i:122045 original size:135 final size:139
Alignment explanation
Indices: 121783--122046 Score: 391
Period size: 135 Copynumber: 1.9 Consensus size: 139
121773 TAAATAGGTG
121783 TAACTCTTTAAGATTTTTTAGAATAATTGGCATGCCAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTT
1 TAACTCTTTAAGATTTTTTAGAATAATTGGCATGCCAAGCAAAATGACTGGATTCA-ATAGCTTT
*
121848 AACTCTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAT
65 AACTCTTAAGATAGGTGTAACTCATT-A-TATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAT
121913 TATTTATAGCTT
128 TATTTATAGCTT
121925 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAA-AA-TGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTC-ATAGC
1 TAACTCTTTAAG-A-TTTT-TTAGAATAATTGGCATGCC-AAGCAAAATGACTGGATTCAATAGC
*
121987 TTTATCT-TTAA-ATAGGTGTAACT-ATT-TATTTTT-TTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAA
62 TTTAACTCTTAAGATAGGTGTAACTCATTATATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAA
122047 ATGATTGGAT
Statistics
Matches: 116, Mismatches: 2, Indels: 15
0.87 0.02 0.11
Matches are distributed among these distances:
135 27 0.23
136 7 0.06
139 2 0.02
140 12 0.10
141 4 0.03
142 23 0.20
143 10 0.09
144 25 0.22
145 6 0.05
ACGTcount: A:0.33, C:0.12, G:0.16, T:0.38
Consensus pattern (139 bp):
TAACTCTTTAAGATTTTTTAGAATAATTGGCATGCCAAGCAAAATGACTGGATTCAATAGCTTTA
ACTCTTAAGATAGGTGTAACTCATTATATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAATTAT
TTATAGCTT
Found at i:122070 original size:135 final size:138
Alignment explanation
Indices: 121783--122053 Score: 342
Period size: 144 Copynumber: 2.0 Consensus size: 138
121773 TAAATAGGTG
*
121783 TAACTCTTTAAGATTTTTTAGAATAATTGGCATGCCAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAGCTTT
1 TAACGCTTTAAGATTTTTTAGAATAATTGGCATGCCAAGCAAAATGACTGGATTCA-ATAGCTTT
*
121848 AACTCTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAT
65 AACTCTTAAGATAGGTGTAACTCATT-A-TATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAT
* * *
121913 TATTTATAGCTT
128 GATTGATAGC-A
*
121925 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAA-AA-TGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTC-ATAGC
1 TAACGCTTTAAG-A-TTTT-TTAGAATAATTGGCATGCC-AAGCAAAATGACTGGATTCAATAGC
*
121987 TTTATCT-TTAA-ATAGGTGTAACT-ATT-TATTTTT-TTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAA
62 TTTAACTCTTAAGATAGGTGTAACTCATTATATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGC-AA
122047 ATGATTG
126 ATGATTG
122054 GATTCAGATA
Statistics
Matches: 120, Mismatches: 4, Indels: 16
0.86 0.03 0.11
Matches are distributed among these distances:
135 24 0.20
136 14 0.12
139 2 0.02
140 12 0.10
141 4 0.03
142 23 0.19
143 10 0.08
144 25 0.21
145 6 0.05
ACGTcount: A:0.33, C:0.12, G:0.16, T:0.38
Consensus pattern (138 bp):
TAACGCTTTAAGATTTTTTAGAATAATTGGCATGCCAAGCAAAATGACTGGATTCAATAGCTTTA
ACTCTTAAGATAGGTGTAACTCATTATATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAATGAT
TGATAGCA
Found at i:122516 original size:82 final size:87
Alignment explanation
Indices: 122142--122726 Score: 868
Period size: 81 Copynumber: 7.2 Consensus size: 87
122132 ATGATTCAGA
*
122142 TTTAACTCTTTAA-ATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAAAAATT-G---GCCTAAGC
1 TTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGC
122202 AAAATGACTGGATTC--ATAGC
66 AAAATGACTGGATTCAGATAGC
122222 TTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGC
1 TTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGC
122287 AAAATGA-T-GATTC--ATAGC
66 AAAATGACTGGATTCAGATAGC
122305 -TTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTA--TTT-TTAGAATAATTGGCATGCCTAAGC
1 TTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGC
* *
122366 AAAATGATTGGATTCATATAGC
66 AAAATGACTGGATTCAGATAGC
122388 TTTAACTC-TTAAGATA-G-GTAA--C-TTAAGTATTTTTGTTAGAA-AATTGGCATGCCTAAGC
1 TTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGC
122446 AAAATGACT-GATTCAGATAGC
66 AAAATGACTGGATTCAGATAGC
122467 TTTAACTC-TTAA-ATAGGTGTAACTCTTTAAGT-TTTTT-TTAGAATAATTGGCATGCCTAAGC
1 TTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGC
122528 -AAATGA-TGGATTCAGATAGC
66 AAAATGACTGGATTCAGATAGC
122548 TTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTT-A-TA-TTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGC
1 TTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGC
122610 -AAATGACTGGATTCAG--AGC
66 AAAATGACTGGATTCAGATAGC
122629 TTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAA-AATT-GCATGCCTAAGC
1 TTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGC
*
122692 AAAATGATTGGATTCA-ATAGC
66 AAAATGACTGGATTCAGATAGC
122713 TTTAACTCTTTAAG
1 TTTAACTCTTTAAG
122727 TTTTTTTGTT
Statistics
Matches: 470, Mismatches: 4, Indels: 58
0.88 0.01 0.11
Matches are distributed among these distances:
78 10 0.02
79 56 0.12
80 50 0.11
81 122 0.26
82 107 0.23
83 74 0.16
84 36 0.08
85 15 0.03
ACGTcount: A:0.33, C:0.12, G:0.17, T:0.38
Consensus pattern (87 bp):
TTTAACTCTTTAAGATAGGTGTAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGC
AAAATGACTGGATTCAGATAGC
Found at i:122565 original size:19 final size:19
Alignment explanation
Indices: 122541--122578 Score: 58
Period size: 19 Copynumber: 2.0 Consensus size: 19
122531 TGATGGATTC
*
122541 AGATAGCTTTAACTCTTTA
1 AGATAGCTGTAACTCTTTA
*
122560 AGATAGGTGTAACTCTTTA
1 AGATAGCTGTAACTCTTTA
122579 TATTTTGTTA
Statistics
Matches: 17, Mismatches: 2, Indels: 0
0.89 0.11 0.00
Matches are distributed among these distances:
19 17 1.00
ACGTcount: A:0.32, C:0.13, G:0.16, T:0.39
Consensus pattern (19 bp):
AGATAGCTGTAACTCTTTA
Found at i:122789 original size:65 final size:64
Alignment explanation
Indices: 122650--122791 Score: 216
Period size: 65 Copynumber: 2.2 Consensus size: 64
122640 AAGATAGGTG
122650 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAAAATTGCATGCCTAAGCAAAATGATTGGATTCAATAGCTT
1 TAAC-CTTTAAGTATTTTTGTTAGAAAATTGCATGCCTAAGCAAAATGATTGGATTCAATAGCTT
*
122715 TAACTCTTTAAGTTTTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCT-AGCAAAATGATTGGATTCAGATAG
1 TAAC-CTTTAAGTATTTTTGTTAGAA-AATT-GCATGCCTAAGCAAAATGATTGGATTCA-ATAG
122779 CTT
62 CTT
122782 TAA-CTTTAAG
1 TAACCTTTAAG
122792 ATAGGAGTAA
Statistics
Matches: 73, Mismatches: 1, Indels: 6
0.91 0.01 0.08
Matches are distributed among these distances:
65 32 0.44
66 23 0.32
67 18 0.25
ACGTcount: A:0.32, C:0.12, G:0.16, T:0.39
Consensus pattern (64 bp):
TAACCTTTAAGTATTTTTGTTAGAAAATTGCATGCCTAAGCAAAATGATTGGATTCAATAGCTT
Found at i:122916 original size:81 final size:86
Alignment explanation
Indices: 122715--134553 Score: 17047
Period size: 83 Copynumber: 144.1 Consensus size: 86
122705 TCAATAGCTT
* *
122715 TAACTCTTTAAGTTTTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCT-AGCAAAATGATTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
*
122779 CTTTAA--CTTTAAGATAGGAG
66 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
122799 TAACTCTTTAAG-ATTTTTTGTTA-AATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATA
1 TAACTCTTTAAGTA-TTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATA
*
122862 GCTTTAACTC-AT-A-ATA-TG
65 GCTTTAACTCTTTAAGATAGTG
* *
122880 TAACTCTTTAA-TATTTTTGTTAGAATAATTTGCATGCCTAAGCAAAAT-AATGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
122943 C-TTAACTC-TTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
122963 TAACTCTTT-A-T-TTTTTGTTAGAATAATT-G-ATGCCTAAGC-AAA--A-TGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
123019 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
*
123041 TAAC-CTTTAAGTA-TTTTGTTAGAATAATTGGC-TGCCTAAGC-AAATGA-TGGATTCATATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
123101 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
* * *
123123 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAG---AATT-GCATGCCTAAGCAAAATGATTGGATTTATATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
123184 CTTTAACTC-TTAAGATAG-G
66 CTTTAACTCTTTAAGATAGTG
123203 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAA-AATTGGC---CCTAAGCAAAATGACTGGATTCAG-TAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
123263 CTTTAACTCTTT-A-ATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
123283 TAACTCTTTAAGTA-TTTT-TTAGAATAATTGGC-TGCCTAAGC-AAATGA-T-GATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
123342 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
123364 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATT-AGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
123428 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
* *
123450 TAACTCTTTAAGTA-TTTTGTTAGAA-AATTGGCATGCCTAAGCAAAATG-GTTGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
*
123512 CTTTAACACTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
123534 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGA-TGGATTC--ATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
123596 C-TTAACTC-TTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
*
123616 TAACTCTTTAA-TATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGA-TGGATTCATATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
*
123679 CTTTAACTCATTAAGATAGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATAGTG
123700 TAACTC-TTAAGTA-TTTTGTTAGAA-AATTGGCATGCCTAAGCAAAATGA-TGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
123761 CTTTAACT-TTTAAGATAGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATAGTG
**
123781 TAACTCTTTAAGTATTTTT-TTAGAATAATT-GCATGCCT-AG-AAAATGGTTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
123842 CTTTAACTCTTTAAGATAGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATAGTG
* * *
123863 TAACTCTTT-AGTATTTTTGTT-GAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGA-T-TAATCATATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
123924 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
* * *
123945 TAACTCTTT-ACTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGATTGGATTCATATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
124009 C-TTAACTC-TTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
124029 TAACTCTTTAAGTA-TTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGA-TGG-TTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
124091 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
*
124112 TAACTC-TTAAGTTTTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCT-AGCAAAATGA-TGGATTC--ATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
*
124172 ATTTAACTC-TTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
*
124193 TAACTCTTTAAG--TTTTTGTTAG---AATTGGCATGCCTAAGC-AAATGACTGGATTTAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
124252 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
124274 TAACTCTTTAAGTATTTTT-TTAGAA-AA--GGCA----TAAGCAAAATGACTTGGATTCAGATA
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGAC-TGGATTCAGATA
124331 GCTTTAACTCTTTAAGATAGTG
65 GCTTTAACTCTTTAAGATAGTG
*
124353 TAACTCTTTAAGT-TTTTTGTTAG-A-AATTGGCATGCCTAAGCAAAATGATTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
124415 CTTTAACTCTTTAAGATA--G
66 CTTTAACTCTTTAAGATAGTG
124434 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAA-CAAAA-GACTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
124497 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
*
124519 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATT--CTTGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
124582 CTTTAACT-TTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
124603 TAACTCTTTAAGT-TTTTTG-T-GAATAATTGGCATGCCTAAGC-AAATGACTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
*
124664 CTTTAACTCTTTAAGA-GGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATAGTG
**
124684 TAA--CTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGGTTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
124747 CTTTAA-TCTTT-A-ATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
124766 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGA-TGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
124830 CTTTAACTC-TTAAGATAG-G
66 CTTTAACTCTTTAAGATAGTG
*
124849 TAACTC-TTAAGT-TTTTTGTTAGAATAA-T----TGCCTAAGCAAAATGACTAGA-TCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
*
124906 CTTTAACTCTTTAAG--AGGG
66 CTTTAACTCTTTAAGATAGTG
124925 TAACTCTTTAAGTA-TTTTGTTAG---AATTGGCA-GCCTAAGCAAAATGACTGGATTC--ATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
124983 CTTTAACT-TTT-A-A-A--G
66 CTTTAACTCTTTAAGATAGTG
124998 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAG--AAA--A-T--ATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
125056 CTTTAACTCTTTAAGATAGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATAGTG
* *
125077 TAACTCTTTAAGTA-TTTTGTTTGAATAATTGGCATGCC-AAGCAAAATGA-T-GATTCATATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
125138 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
* *
125159 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGA-TTGATTCATATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
125223 C-TTAACTC-TTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
125243 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAG-AAAATGACTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
125307 CTTTAACTCTTTAAGATAG-G
66 CTTTAACTCTTTAAGATAGTG
125327 ----TC-TTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACT-GATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
125386 CTTTAACTCTTTAAGATAGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATAGTG
* *
125407 TAACTC-TT--GTATTTTTTTTAAAAT-ATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
125468 CTTTAACTCTTTAAGATAG-G
66 CTTTAACTCTTTAAGATAGTG
125488 TAACTC-TTAAGTATTTTTGTTAGAATAATT-GCATGCCTAAGCAAAATGA-TGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
125550 CTTTAACTCTTTAAGATAGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATAGTG
125571 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGC-TGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
125635 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
125656 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATG-CTAAGCAAAATGACTGGA-T-AGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
125718 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
125739 TAACTC-TTAAGTA-TTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATG--TGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
125800 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
125822 TAACTCTTT-AG--TTTTT-TTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGA-TGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
125882 CTTTAACTCTTTAAGATAG-G
66 CTTTAACTCTTTAAGATAGTG
125902 TAACTC-TTAAGTATTTTTGTTAGAATAATT-GCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
125965 CTTTAA-TCTTTAAGATAGATG
66 CTTTAACTCTTTAAGATAG-TG
125986 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATT-GCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
126050 C-TTAACTCTTTAAGATA--G
66 CTTTAACTCTTTAAGATAGTG
*
126068 -AACTCTTTAAGT-TTTTTGTTAG-ATAATTGGCATGGCTAAGCAAAATG-CTGGATT-AGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
*
126128 CTTTAACT-ATTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
*
126149 TAACTC-TTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATG-GTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
126212 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
* *
126234 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAAT-ATTGGCATGCCTAAGCAAAATGA-T-TATTCATATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
126296 CTTTAACTCTTTAAGA-AG-G
66 CTTTAACTCTTTAAGATAGTG
*
126315 TAACTC-TTAAGTTTTTTTGTTAGAATAATT-GCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTC--ATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
126376 CTTTAACTCTTTAAGATAG-G
66 CTTTAACTCTTTAAGATAGTG
126396 TAACTCTTTAAGTA-TTTTGTTAGAAT-ATTGGCATGCCTAAGC-AAA--A-TGGATTCAG-TAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
126454 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
*
126476 TAACTCTTT-AG--TTTTTGTTAGAATAATT-GCTTGCCTAAGCAAAATGA-TGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
126536 CTTTAACTCTTTAAGATAGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATAGTG
*
126557 TAACT-TTTAAGTATTTTTGTTAGAAAAATTGG-ATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
126620 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
*
126641 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGA-TGGATTCAGATAT
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
126705 CTTTAACTCTTTAAGATAGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATAGTG
126726 TAACTCTTTAAGTA-TTTT-TTAGAA-AATTGGCATGCCTAAGC-AAATGACTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
126787 CTTTAACTCTTTAAGATAGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATAGTG
126808 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAA-AATTGG-ATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
126871 CTTTAA--CTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
*
126891 TAACTCTTTAAGT-TTTTT-TTAGAAAAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
126954 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
*
126976 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGC-AAATGACTGGATTTAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
127040 CTTTAACTCTTTAAGATAGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATAGTG
127061 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAA-AA-TGGCATGCCTAAGCAAAA-GACTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
127123 CTTTAACTC-TTAA-ATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
127143 TAACTC-TT---TA-TTTT-TTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
127202 CTTTAACTCTTTAAGATAG-G
66 CTTTAACTCTTTAAGATAGTG
127222 TAACTC-TTAAGTA--TTT-TTAGAATAATTGGCATGCC-AAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
127282 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
* *
127304 TAACTCTTTAAGTA-TTTTGTTAGAATAATT---TTGCCTAAGCAAAATGACTAGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
127365 CTTTAACTCTTTAAG-TAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
*
127386 TAACTC-TT---TATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGC-AAATGACTGGATTTAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
127446 CTTTAACTC-TT-AGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
127466 TAACTCTTTAAGTATTTTT-TTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAAT---TGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
127527 CTTTAACTCTTTAAG-TAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
* **
127548 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGA-TTGATTC-TTTA-
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
*
127610 -ATTAACTC-TTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
127630 TAACTCTTTAAGTATTTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGA-T-GATTCAGATA
1 TAACTCTTTAAGTA-TTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATA
127693 GCTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
65 GCTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
127715 TAACT-TTTAAGTATTTTTGTTAGAA-AATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
127778 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
*
127800 TAACTCTTTAAGTA-TTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGC-AAATGAATGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
127863 C-TTAA-TC-TTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
127882 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAA--GGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
127945 CTTTAA-TC-TTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
*
127965 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATT-TC-TGCCTAA--AAAATGACTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
128026 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
* * *
128047 TAACTCTTTAAGTTTTTTTGTTTGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTTAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
*
128112 CTTTAACTATTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
* **
128134 TAACTCTGTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGGTTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
128199 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
128221 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGC-AAA--A-T-GATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
128281 C-TTAACTC-TTAAGA-AGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATAGTG
*
128299 TAACTCTTTAAGTTTTTTTGTTAGAATAATT-GCAT--CTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
128361 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
128383 TAACTC-TTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
128447 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
* *
128469 TAACTCTTTAAGTATTTTT-TTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGATTGGATTCATATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
128533 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
*
128555 TAACTC-TTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGC-AAATGATTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
128618 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
128640 TAACTC-TTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAAT---TGGATTC--ATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
128699 C-TTAACTCTTTAAGATAG-G
66 CTTTAACTCTTTAAGATAGTG
128718 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAA-AATTGG-ATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
128781 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
*
128803 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAG-AAAAT---TGGATTCATATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
128864 CTTTAACTCTTTAAGATA--G
66 CTTTAACTCTTTAAGATAGTG
128883 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAA-AATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTC--ATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
128945 CTTTAACTC-TTAAGATAGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATAGTG
128965 TAACTCTTTAA-TA-TTTTGTTAGAA-AATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
129027 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
129049 TAACTCTTTAAGT-TTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCC-AAGCAAAATGA-TGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
129111 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
129133 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
129198 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
129220 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAA-AATT-GCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
*
129283 CTTTAACTC-TTAATATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
129304 TAACTCTTTAAGT-TTTTT-TTAGAATAATT-GCATGCCTAAGC-AAATGA-TGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
129364 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
129386 TAACTCTTTAAGTATTTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCC-AAGC-AAATGACT-GATTCAGATA
1 TAACTCTTTAAGTA-TTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATA
129448 GCTTTAACTCTTTAAGATAG-G
65 GCTTTAACTCTTTAAGATAGTG
129469 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATT-GC-TGCCTAAGCAAAATGACT--ATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
129530 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
* * * *
129552 TAACTCTTTAAGTTTTTTTGTTTGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGGCTGGATTTAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
*
129617 CTTTAACTATTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
*
129639 TAACTCTGTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGC-AAATGACTTGGATTCAGATA
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGAC-TGGATTCAGATA
*
129703 GCTTTAAATCTTTAAGATAGGTG
65 GCTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
*
129726 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGA-T--ATTCATATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
129788 C-TTAACTCTTTAAGATAGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATAGTG
*
129808 TAACTC-TTAAGTA-TTTT-TTAGAAAAATTGGCATGCCTAAGC-AAATGA-TGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
129868 C-TTAACTC-TTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
129888 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGC-AAATGACTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
*
129952 CTTTAAC-CTTT-A-A-AGAG
66 CTTTAACTCTTTAAGATAGTG
129969 TAACTC-TTAAGTA--TTT-TTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
130030 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
130051 TAACTC-TTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAAT-A-TGGATTC--ATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
130111 C-TTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
130132 TAACTC-TTAAGTATTTTTGTTAGAATAATT-GCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
130195 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
*
130217 TAACTC--TAAGTA-TTTTGTTAGAATAATT-G-ATGCCTAAGCAAAATGA-TGGATTCATATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
130276 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
* ** *
130297 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAG----ATTGACATGCCTAA--AAAATTTCTGGATTCATATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
130356 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
130378 TAACTCTTTAAGTA-TTTTGTTAGAATAATT-G---GCCTAAAGCAAAATGA-TGGATTC--ATA
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCT-AAGCAAAATGACTGGATTCAGATA
130435 GCTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
65 GCTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
*
130458 TAACTCTTT-AGTATTTTTGTTAGAATAATTGGC-TGCCTAAGC-AAA--A-T-GA-TCATATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
130515 CTTTAACTCTTTAAGATAG-G
66 CTTTAACTCTTTAAGATAGTG
*
130535 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCATATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
130600 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
130622 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAG-AAAA--A-TGGTATTCAGATA
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG-ATTCAGATA
130683 GCTTTAACTC-TTAAGATAG-G
65 GCTTTAACTCTTTAAGATAGTG
130703 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAAT-ATTGGCATGCCTAAGC--AATGA-T-GATTC--ATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
130761 C-TTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
* *
130782 TAACTC-TTAAGTATTTTTGTTAGAATAATT-GCATGCCTAAGCAAAATGA-T-GATTCATATAT
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
130843 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
130864 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAG-AAAATGACTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
130928 CTTTAACTCTTTAAGATAGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATAGTG
**
130949 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGC-AAATGGTTGGATTC--ATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
*
131011 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTA
66 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
*
131033 TAACTC-TTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGA-TGGATTCATATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
131096 C-TTAACTC-TTAAGATAGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATAGTG
131115 TAACTC-TTAAG--TTTTTGTTAGAAT-ATT-GCATGCCTAAGC-AAATGA-TGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
131173 CTTTAACTCTTTAAGATAG-G
66 CTTTAACTCTTTAAGATAGTG
131193 TAACTC-TTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACT-GATTC--ATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
131254 CTTTAACTCTTTAAGATA--G
66 CTTTAACTCTTTAAGATAGTG
131273 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAAT-ATT-GCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTC--ATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
131334 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
*
131356 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATT-GCATGCCTAAGCAAAATGACAGGA-T---ATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
131416 CTTTAACTCTTTAA-ATAG-G
66 CTTTAACTCTTTAAGATAGTG
*
131435 TAACTCTTTAAGTA-TTTTGTTAGAAAAATTGGCA-GCCTAAGCAAAATGA-T-GATTCAG-TAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
131495 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
131517 TAA--CTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAG--AAA--A-T-GATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
131574 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
131596 TAACTCTTTAAGTA-TTTTGTTAGAAT-ATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
131659 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
* *
131681 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGA-TTGATTCATATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
131745 C-TTAACTC-TTAAGATAG-G
66 CTTTAACTCTTTAAGATAGTG
*
131763 TAACTC-TTAAGTA-TTTT-TTAGAATAATTGGCATGCCTAAGC-AAATGATTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
131824 C--TAACTC-TTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
131843 TAACTCTTTAA-TATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGC-AAATGACT-GATTCAGATTA
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGA-TA
131905 GCTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
65 GCTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
131928 TAACTCTTTAAGT-TTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
131992 CTTTAACTC-TTAAGATAGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATAGTG
132012 TAACTCTTTAAGTA-TTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGC-AAA--A-TGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
132072 C-TTAACTCTTTAAGATAGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATAGTG
132092 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
132157 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
*
132178 TAACTC-TTAAGTATTTTTGTTAGAATAATT-G-ATGCCTAAGCAAAATGATTGGATTC--ATA-
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
132237 ---TAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
*
132256 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAG---AATT-GCATG-CTAAGC-AAA--ACTGGATTCATATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
132313 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
132335 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAA-AATT-G---GCCTAAAGC-AAATGACTGGATTCAG-TA
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCT-AAGCAAAATGACTGGATTCAGATA
132393 GCTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
65 GCTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
*
132416 TAACTCTTT-AGTATTTTTTTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGC-AAA--A-T-GA-TCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
132474 CTTTAACTCTTTAAGATAG-G
66 CTTTAACTCTTTAAGATAGTG
132494 TAACTCTTT-AGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
132558 CTTTAA--CTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
132578 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGC-AAA--A-TGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
132639 CTTTAACTC-TTAAGATAG-G
66 CTTTAACTCTTTAAGATAGTG
* *
132658 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGC-AAATGA-TAGATTCATATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
132721 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
132742 TAACTCTTTAAGTA-TTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGC-AAATGA-T-GATTC--ATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
*
132801 C-TTAACTCATTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
132822 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAA-AATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAG-TAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
132885 CTTTAA-T-TTTAAGATAG-G
66 CTTTAACTCTTTAAGATAGTG
*
132903 TAACTCTTT-AGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGC-AAATGACT-GATTCATATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
*
132965 CTTTAAATCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
*
132987 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGA-TGGATTCATATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
133051 CTTTAACTC-TTAAGATAG-G
66 CTTTAACTCTTTAAGATAGTG
133070 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATT----TGCCTAA--AAAATGACTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
133129 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
133151 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATT-GCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTC--ATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
133213 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
133235 TAACTCTTTAAGTA-TTTTGTTAGAATAATT-GCATGCCTAAGCAAAATGACT-GATTC--ATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
133295 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
*
133317 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGC-AAA--A-TGGATTCATATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
133378 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
133399 TAACTC-TTAAG--TTTTTGTTAGAA-AATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACT-GATTC--ATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
133457 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
*
133479 TAA--CTTTAAGTA-TTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAAT-ACTAGATTC--ATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
133538 C-TTAACTCTTTAAGATA--G
66 CTTTAACTCTTTAAGATAGTG
133556 TAACTCTTTAAGTATTTTT-TTAGAATAA-TGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTC-GATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
133618 CTTTAACTC-TTAAGATAG-G
66 CTTTAACTCTTTAAGATAGTG
*
133637 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATG-CTAAGCAAAATGA-TGGATTCATATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
133700 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
* * *
133722 TAACTCTTTAAGTA-TTTTGTTAGAAAAATTGGCATGCCTAAGC-AAATGATTGGATTCATATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
133785 CTTTAACTCTTT-A-ATAGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATAGTG
*
133804 TAACTCTTTAAGTA-TTTTGTTAGAATAATTGGCATG-CTAAGCAAAATGATTGGATTCAGATA-
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
*
133866 TTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
133887 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAA-AATTGGCATG-CTAAGCAAAATGACTGGATTC--ATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
133948 CTTTAACTC-TTAAGATA-TG
66 CTTTAACTCTTTAAGATAGTG
133967 TAACTC-TTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAG--AAA--A-TGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
134026 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
* *
134047 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAG-A-ACTTGGCATG-CTAAG-AAAATGA-TGGATTCATATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
134107 CTTTAACTC-TTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
*
134128 TAACTC-TTAAGTATTTTTGTTAGAATAATT-GCATG-CTAAGCAAAATGA-TGGAATTCATATA
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGG-ATTCAGATA
134189 GCTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
65 GCTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
134212 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAA-AATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACT-GATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
134275 CTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
66 CTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
134297 T-ACTCTTTAAG--TTTTT-TTAGAATAATTGGCATGCCTAAGC-AAA-GACTGGATTCAGATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
134356 CTTTAACTCTTTAAGATAGT-
66 CTTTAACTCTTTAAGATAGTG
134376 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGA-TGGATTC--ATAG
1 TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
134438 CTTTAACTCTTTAAGATAG-G
66 CTTTAACTCTTTAAGATAGTG
* *
134458 TTAACTC-TTAAGTATTTTTGTTAGAAT-ATTGGCATGCCTAAGCAAAATGATTGGATTCATATA
1 -TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATA
134521 GCTTTAACTCTTTAAGATAGGTG
65 GCTTTAACTCTTTAAGATA-GTG
134544 TAACTCTTTA
1 TAACTCTTTA
134554 TGTTTTTAGA
Statistics
Matches: 10971, Mismatches: 180, Indels: 1206
0.89 0.01 0.10
Matches are distributed among these distances:
71 4 0.00
73 36 0.00
74 15 0.00
75 18 0.00
76 97 0.01
77 200 0.02
78 571 0.05
79 758 0.07
80 1139 0.10
81 1395 0.13
82 1585 0.14
83 1596 0.15
84 1187 0.11
85 1333 0.12
86 565 0.05
87 466 0.04
88 6 0.00
ACGTcount: A:0.33, C:0.12, G:0.17, T:0.38
Consensus pattern (86 bp):
TAACTCTTTAAGTATTTTTGTTAGAATAATTGGCATGCCTAAGCAAAATGACTGGATTCAGATAG
CTTTAACTCTTTAAGATAGTG
Found at i:122959 original size:17 final size:18
Alignment explanation
Indices: 122937--122970 Score: 52
Period size: 18 Copynumber: 1.9 Consensus size: 18
122927 TAATGGATTC
122937 AGATAGCT-TAACTCTTA
1 AGATAGCTGTAACTCTTA
*
122954 AGATAGGTGTAACTCTT
1 AGATAGCTGTAACTCTT
122971 TATTTTTTGT
Statistics
Matches: 15, Mismatches: 1, Indels: 1
0.88 0.06 0.06
Matches are distributed among these distances:
17 7 0.47
18 8 0.53
ACGTcount: A:0.32, C:0.15, G:0.18, T:0.35
Consensus pattern (18 bp):
AGATAGCTGTAACTCTTA
Found at i:123037 original size:19 final size:18
Alignment explanation
Indices: 123013--123051 Score: 51
Period size: 19 Copynumber: 2.1 Consensus size: 18
123003 AAATGGATTC
*
123013 AGATAGCTTTAACTCTTTA
1 AGATAGCTGTAAC-CTTTA
*
123032 AGATAGGTGTAACCTTTA
1 AGATAGCTGTAACCTTTA
123050 AG
1 AG
123052 TATTTTGTTA
Statistics
Matches: 18, Mismatches: 2, Indels: 1
0.86 0.10 0.05
Matches are distributed among these distances:
18 7 0.39
19 11 0.61
ACGTcount: A:0.33, C:0.13, G:0.18, T:0.36
Consensus pattern (18 bp):
AGATAGCTGTAACCTTTA
Found at i:123360 original size:19 final size:19
Alignment explanation
Indices: 123336--123375 Score: 62
Period size: 19 Copynumber: 2.1 Consensus size: 19
123326 ATGATGATTC
*
123336 AGATAGCTTTAACTCTTTA
1 AGATAGCTGTAACTCTTTA
*
123355 AGATAGGTGTAACTCTTTA
1 AGATAGCTGTAACTCTTTA
123374 AG
1 AG
123376 TATTTTTGTT
Statistics
Matches: 19, Mismatches: 2, Indels: 0
0.90 0.10 0.00
Matches are distributed among these distances:
19 19 1.00
ACGTcount: A:0.33, C:0.12, G:0.17, T:0.38
Consensus pattern (19 bp):
AGATAGCTGTAACTCTTTA
Found at i:123446 original size:19 final size:19
Alignment explanation
Indices: 123422--123461 Score: 62
Period size: 19 Copynumber: 2.1 Consensus size: 19
123412 TGACTGGATT
*
123422 AGATAGCTTTAACTCTTTA
1 AGATAGCTGTAACTCTTTA
*
123441 AGATAGGTGTAACTCTTTA
1 AGATAGCTGTAACTCTTTA
123460 AG
1 AG
123462 TATTTTGTTA
Statistics
Matches: 19, Mismatches: 2, Indels: 0
0.90 0.10 0.00
Matches are distributed among these distances:
19 19 1.00
ACGTcount: A:0.33, C:0.12, G:0.17, T:0.38
Consensus pattern (19 bp):
AGATAGCTGTAACTCTTTA
Found at i:123530 original size:19 final size:19
Alignment explanation
Indices: 123506--123545 Score: 53
Period size: 19 Copynumber: 2.1 Consensus size: 19
123496 TGGTTGATTC
*
123506 AGATAGCTTTAACACTTTA
1 AGATAGCTGTAACACTTTA
* *
123525 AGATAGGTGTAACTCTTTA
1 AGATAGCTGTAACACTTTA
123544 AG
1 AG
123546 TATTTTTGTT
Statistics
Matches: 18, Mismatches: 3, Indels: 0
0.86 0.14 0.00
Matches are distributed among these distances:
19 18 1.00
ACGTcount: A:0.35, C:0.12, G:0.17, T:0.35
Consensus pattern (19 bp):
AGATAGCTGTAACACTTTA
Found at i:124108 original size:18 final size:18
Alignment explanation
Indices: 124085--124122 Score: 58
Period size: 18 Copynumber: 2.1 Consensus size: 18
124075 ATGATGGTTC
*
124085 AGATAGCTTTAACTCTTA
1 AGATAGCTGTAACTCTTA
*
124103 AGATAGGTGTAACTCTTA
1 AGATAGCTGTAACTCTTA
124121 AG
1 AG
124123 TTTTTTTGTT
Statistics
Matches: 18, Mismatches: 2, Indels: 0
0.90 0.10 0.00
Matches are distributed among these distances:
18 18 1.00
ACGTcount: A:0.34, C:0.13, G:0.18, T:0.34
Consensus pattern (18 bp):
AGATAGCTGTAACTCTTA
Found at i:124270 original size:19 final size:19
Alignment explanation
Indices: 124246--124285 Score: 62
Period size: 19 Copynumber: 2.1 Consensus size: 19
124236 GACTGGATTT
*
124246 AGATAGCTTTAACTCTTTA
1 AGATAGCTGTAACTCTTTA
*
124265 AGATAGGTGTAACTCTTTA
1 AGATAGCTGTAACTCTTTA
124284 AG
1 AG
124286 TATTTTTTTA
Statistics
Matches: 19, Mismatches: 2, Indels: 0
0.90 0.10 0.00
Matches are distributed among these distances:
19 19 1.00
ACGTcount: A:0.33, C:0.12, G:0.17, T:0.38
Consensus pattern (19 bp):
AGATAGCTGTAACTCTTTA
Found at i:124515 original size:19 final size:19
Alignment explanation
Indices: 124491--124530 Score: 62
Period size: 19 Copynumber: 2.1 Consensus size: 19
124481 GACTGGATTC
*
124491 AGATAGCTTTAACTCTTTA
1 AGATAGCTGTAACTCTTTA
*
124510 AGATAGGTGTAACTCTTTA
1 AGATAGCTGTAACTCTTTA
124529 AG
1 AG
124531 TATTTTTGTT
Statistics
Matches: 19, Mismatches: 2, Indels: 0
0.90 0.10 0.00
Matches are distributed among these distances:
19 19 1.00
ACGTcount: A:0.33, C:0.12, G:0.17, T:0.38
Consensus pattern (19 bp):
AGATAGCTGTAACTCTTTA
Found at i:124599 original size:18 final size:19
Alignment explanation
Indices: 124576--124614 Score: 53
Period size: 18 Copynumber: 2.1 Consensus size: 19
124566 GACTGGATTC
*
124576 AGATAGCTTTAACT-TTTA
1 AGATAGCTGTAACTCTTTA
*
124594 AGATAGGTGTAACTCTTTA
1 AGATAGCTGTAACTCTTTA
124613 AG
1 AG
124615 TTTTTTGTGA
Statistics
Matches: 18, Mismatches: 2, Indels: 1
0.86 0.10 0.05
Matches are distributed among these distances:
18 12 0.67
19 6 0.33
ACGTcount: A:0.33, C:0.10, G:0.18, T:0.38
Consensus pattern (19 bp):
AGATAGCTGTAACTCTTTA
Found at i:125652 original size:18 final size:18
Alignment explanation
Indices: 125629--125663 Score: 52
Period size: 18 Copynumber: 1.9 Consensus size: 18
125619 GACTGGATTC
*
125629 AGATAGCTTTAACTCTTA
1 AGATAGCTGTAACTCTTA
*
125647 AGATAGGTGTAACTCTT
1 AGATAGCTGTAACTCTT
125664 TAAGTATTTT
Statistics
Matches: 15, Mismatches: 2, Indels: 0
0.88 0.12 0.00
Matches are distributed among these distances:
18 15 1.00
ACGTcount: A:0.31, C:0.14, G:0.17, T:0.37
Consensus pattern (18 bp):
AGATAGCTGTAACTCTTA
Found at i:125735 original size:18 final size:18
Alignment explanation
Indices: 125712--125749 Score: 58
Period size: 18 Copynumber: 2.1 Consensus size: 18
125702 ATGACTGGAT
*
125712 AGATAGCTTTAACTCTTA
1 AGATAGCTGTAACTCTTA
*
125730 AGATAGGTGTAACTCTTA
1 AGATAGCTGTAACTCTTA
125748 AG
1 AG
125750 TATTTTGTTA
Statistics
Matches: 18, Mismatches: 2, Indels: 0
0.90 0.10 0.00
Matches are distributed among these distances:
18 18 1.00
ACGTcount: A:0.34, C:0.13, G:0.18, T:0.34
Consensus pattern (18 bp):
AGATAGCTGTAACTCTTA
Found at i:125818 original size:19 final size:19
Alignment explanation
Indices: 125794--125831 Score: 58
Period size: 19 Copynumber: 2.0 Consensus size: 19
125784 ATGTGGATTC
*
125794 AGATAGCTTTAACTCTTTA
1 AGATAGCTGTAACTCTTTA
*
125813 AGATAGGTGTAACTCTTTA
1 AGATAGCTGTAACTCTTTA
125832 GTTTTTTTAG
Statistics
Matches: 17, Mismatches: 2, Indels: 0
0.89 0.11 0.00
Matches are distributed among these distances:
19 17 1.00
ACGTcount: A:0.32, C:0.13, G:0.16, T:0.39
Consensus pattern (19 bp):
AGATAGCTGTAACTCTTTA
Found at i:126230 original size:19 final size:19
Alignment explanation
Indices: 126206--126245 Score: 62
Period size: 19 Copynumber: 2.1 Consensus size: 19
126196 TGGTGGATTC
*
126206 AGATAGCTTTAACTCTTTA
1 AGATAGCTGTAACTCTTTA
*
126225 AGATAGGTGTAACTCTTTA
1 AGATAGCTGTAACTCTTTA
126244 AG
1 AG
126246 TATTTTTGTT
Statistics
Matches: 19, Mismatches: 2, Indels: 0
0.90 0.10 0.00
Matches are distributed among these distances:
19 19 1.00
ACGTcount: A:0.33, C:0.12, G:0.17, T:0.38
Consensus pattern (19 bp):
AGATAGCTGTAACTCTTTA
Found at i:126637 original size:18 final size:18
Alignment explanation
Indices: 126614--126648 Score: 52
Period size: 18 Copynumber: 1.9 Consensus size: 18
126604 GACTGGATTC
*
126614 AGATAGCTTTAACTCTTA
1 AGATAGCTGTAACTCTTA
*
126632 AGATAGGTGTAACTCTT
1 AGATAGCTGTAACTCTT
126649 TAAGTATTTT
Statistics
Matches: 15, Mismatches: 2, Indels: 0
0.88 0.12 0.00
Matches are distributed among these distances:
18 15 1.00
ACGTcount: A:0.31, C:0.14, G:0.17, T:0.37
Consensus pattern (18 bp):
AGATAGCTGTAACTCTTA
Found at i:126972 original size:19 final size:19
Alignment explanation
Indices: 126948--126987 Score: 62
Period size: 19 Copynumber: 2.1 Consensus size: 19
126938 GACTGGATTC
*
126948 AGATAGCTTTAACTCTTTA
1 AGATAGCTGTAACTCTTTA
*
126967 AGATAGGTGTAACTCTTTA
1 AGATAGCTGTAACTCTTTA
126986 AG
1 AG
126988 TATTTTTGTT
Statistics
Matches: 19, Mismatches: 2, Indels: 0
0.90 0.10 0.00
Matches are distributed among these distances:
19 19 1.00
ACGTcount: A:0.33, C:0.12, G:0.17, T:0.38
Consensus pattern (19 bp):
AGATAGCTGTAACTCTTTA
Found at i:127300 original size:19 final size:19
Alignment explanation
Indices: 127276--127315 Score: 62
Period size: 19 Copynumber: 2.1 Consensus size: 19
127266 GACTGGATTC
*
127276 AGATAGCTTTAACTCTTTA
1 AGATAGCTGTAACTCTTTA
*
127295 AGATAGGTGTAACTCTTTA
1 AGATAGCTGTAACTCTTTA
127314 AG
1 AG
127316 TATTTTGTTA
Statistics
Matches: 19, Mismatches: 2, Indels: 0
0.90 0.10 0.00
Matches are distributed among these distances:
19 19 1.00
ACGTcount: A:0.33, C:0.12, G:0.17, T:0.38
Consensus pattern (19 bp):
AGATAGCTGTAACTCTTTA
Found at i:127460 original size:17 final size:17
Alignment explanation
Indices: 127438--127473 Score: 54
Period size: 17 Copynumber: 2.1 Consensus size: 17
127428 ATGACTGGAT
*
127438 TTAGATAGCTTTAACTC
1 TTAGATAGCTGTAACTC
*
127455 TTAGATAGGTGTAACTC
1 TTAGATAGCTGTAACTC
127472 TT
1 TT
127474 TAAGTATTTT
Statistics
Matches: 17, Mismatches: 2, Indels: 0
0.89 0.11 0.00
Matches are distributed among these distances:
17 17 1.00
ACGTcount: A:0.28, C:0.14, G:0.17, T:0.42
Consensus pattern (17 bp):
TTAGATAGCTGTAACTC
Found at i:127796 original size:19 final size:19
Alignment explanation
Indices: 127772--127811 Score: 62
Period size: 19 Copynumber: 2.1 Consensus size: 19
127762 GACTGGATTC
*
127772 AGATAGCTTTAACTCTTTA
1 AGATAGCTGTAACTCTTTA
*
127791 AGATAGGTGTAACTCTTTA
1 AGATAGCTGTAACTCTTTA
127810 AG
1 AG
127812 TATTTTGTTA
Statistics
Matches: 19, Mismatches: 2, Indels: 0
0.90 0.10 0.00
Matches are distributed among these distances:
19 19 1.00
ACGTcount: A:0.33, C:0.12, G:0.17, T:0.38
Consensus pattern (19 bp):
AGATAGCTGTAACTCTTTA
Found at i:128043 original size:18 final size:18
Alignment explanation
Indices: 128020--128054 Score: 52
Period size: 18 Copynumber: 1.9 Consensus size: 18
128010 GACTGGATTC
*
128020 AGATAGCTTTAACTCTTA
1 AGATAGCTGTAACTCTTA
*
128038 AGATAGGTGTAACTCTT
1 AGATAGCTGTAACTCTT
128055 TAAGTTTTTT
Statistics
Matches: 15, Mismatches: 2, Indels: 0
0.88 0.12 0.00
Matches are distributed among these distances:
18 15 1.00
ACGTcount: A:0.31, C:0.14, G:0.17, T:0.37
Consensus pattern (18 bp):
AGATAGCTGTAACTCTTA
Found at i:128217 original size:19 final size:19
Alignment explanation
Indices: 128193--128232 Score: 62
Period size: 19 Copynumber: 2.1 Consensus size: 19
128183 GGTTGGATTC
*
128193 AGATAGCTTTAACTCTTTA
1 AGATAGCTGTAACTCTTTA
*
128212 AGATAGGTGTAACTCTTTA
1 AGATAGCTGTAACTCTTTA
128231 AG
1 AG
128233 TATTTTTGTT
Statistics
Matches: 19, Mismatches: 2, Indels: 0
0.90 0.10 0.00
Matches are distributed among these distances:
19 19 1.00
ACGTcount: A:0.33, C:0.12, G:0.17, T:0.38
Consensus pattern (19 bp):
AGATAGCTGTAACTCTTTA
Found at i:128465 original size:19 final size:19
Alignment explanation
Indices: 128441--128480 Score: 62
Period size: 19 Copynumber: 2.1 Consensus size: 19
128431 GACTGGATTC
*
128441 AGATAGCTTTAACTCTTTA
1 AGATAGCTGTAACTCTTTA
*
128460 AGATAGGTGTAACTCTTTA
1 AGATAGCTGTAACTCTTTA
128479 AG
1 AG
128481 TATTTTTTTA
Statistics
Matches: 19, Mismatches: 2, Indels: 0
0.90 0.10 0.00
Matches are distributed among these distances:
19 19 1.00
ACGTcount: A:0.33, C:0.12, G:0.17, T:0.38
Consensus pattern (19 bp):
AGATAGCTGTAACTCTTTA
Found at i:128799 original size:19 final size:19
Alignment explanation
Indices: 128775--128814 Score: 62
Period size: 19 Copynumber: 2.1 Consensus size: 19
128765 GACTGGATTC
*
128775 AGATAGCTTTAACTCTTTA
1 AGATAGCTGTAACTCTTTA
*
128794 AGATAGGTGTAACTCTTTA
1 AGATAGCTGTAACTCTTTA
128813 AG
1 AG
128815 TATTTTTGTT
Statistics
Matches: 19, Mismatches: 2, Indels: 0
0.90 0.10 0.00
Matches are distributed among these distances:
19 19 1.00
ACGTcount: A:0.33, C:0.12, G:0.17, T:0.38
Consensus pattern (19 bp):
AGATAGCTGTAACTCTTTA
Found at i:129045 original size:19 final size:19
Alignment explanation
Indices: 129021--129060 Score: 62
Period size: 19 Copynumber: 2.1 Consensus size: 19
129011 GACTGGATTC
*
129021 AGATAGCTTTAACTCTTTA
1 AGATAGCTGTAACTCTTTA
*
129040 AGATAGGTGTAACTCTTTA
1 AGATAGCTGTAACTCTTTA
129059 AG
1 AG
129061 TTTTTTGTTA
Statistics
Matches: 19, Mismatches: 2, Indels: 0
0.90 0.10 0.00
Matches are distributed among these distances:
19 19 1.00
ACGTcount: A:0.33, C:0.12, G:0.17, T:0.38
Consensus pattern (19 bp):
AGATAGCTGTAACTCTTTA
Found at i:129129 original size:19 final size:19
Alignment explanation
Indices: 129105--129144 Score: 62
Period size: 19 Copynumber: 2.1 Consensus size: 19
129095 TGATGGATTC
*
129105 AGATAGCTTTAACTCTTTA
1 AGATAGCTGTAACTCTTTA
*
129124 AGATAGGTGTAACTCTTTA
1 AGATAGCTGTAACTCTTTA
129143 AG
1 AG
129145 TATTTTTGTT
Statistics
Matches: 19, Mismatches: 2, Indels: 0
0.90 0.10 0.00
Matches are distributed among these distances:
19 19 1.00
ACGTcount: A:0.33, C:0.12, G:0.17, T:0.38
Consensus pattern (19 bp):
AGATAGCTGTAACTCTTTA
Found at i:129216 original size:19 final size:19
Alignment explanation
Indices: 129192--129231 Score: 62
Period size: 19 Copynumber: 2.1 Consensus size: 19
129182 GACTGGATTC
*
129192 AGATAGCTTTAACTCTTTA
1 AGATAGCTGTAACTCTTTA
*
129211 AGATAGGTGTAACTCTTTA
1 AGATAGCTGTAACTCTTTA
129230 AG
1 AG
129232 TATTTTTGTT
Statistics
Matches: 19, Mismatches: 2, Indels: 0
0.90 0.10 0.00
Matches are distributed among these distances:
19 19 1.00
ACGTcount: A:0.33, C:0.12, G:0.17, T:0.38
Consensus pattern (19 bp):
AGATAGCTGTAACTCTTTA
Found at i:129382 original size:19 final size:19
Alignment explanation
Indices: 129358--129397 Score: 62
Period size: 19 Copynumber: 2.1 Consensus size: 19
129348 TGATGGATTC
*
129358 AGATAGCTTTAACTCTTTA
1 AGATAGCTGTAACTCTTTA
*
129377 AGATAGGTGTAACTCTTTA
1 AGATAGCTGTAACTCTTTA
129396 AG
1 AG
129398 TATTTTTTGT
Statistics
Matches: 19, Mismatches: 2, Indels: 0
0.90 0.10 0.00
Matches are distributed among these distances:
19 19 1.00
ACGTcount: A:0.33, C:0.12, G:0.17, T:0.38
Consensus pattern (19 bp):
AGATAGCTGTAACTCTTTA
Found at i:129548 original size:19 final size:19
Alignment explanation
Indices: 129524--129563 Score: 62
Period size: 19 Copynumber: 2.1 Consensus size: 19
129514 ATGACTATTC
*
129524 AGATAGCTTTAACTCTTTA
1 AGATAGCTGTAACTCTTTA
*
129543 AGATAGGTGTAACTCTTTA
1 AGATAGCTGTAACTCTTTA
129562 AG
1 AG
129564 TTTTTTTGTT
Statistics
Matches: 19, Mismatches: 2, Indels: 0
0.90 0.10 0.00
Matches are distributed among these distances:
19 19 1.00
ACGTcount: A:0.33, C:0.12, G:0.17, T:0.38
Consensus pattern (19 bp):
AGATAGCTGTAACTCTTTA
Done.