Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: VEPZ01008730.1 Hibiscus syriacus cultivar Beakdansim tig00111799_pilon, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Pmatch=0.80,Pindel=0.10
tuple sizes 0,4,5,7
tuple distances 0, 29, 159, 1000
Length: 439989
ACGTcount: A:0.32, C:0.17, G:0.19, T:0.32
File 2 of 2
Found at i:302157 original size:29 final size:29
Alignment explanation
Indices: 302122--302201 Score: 151
Period size: 29 Copynumber: 2.8 Consensus size: 29
302112 TCCACCTTGG
*
302122 AGGTCGCCCGGATTGCATGGCGACCTCCA
1 AGGTCGCCTGGATTGCATGGCGACCTCCA
302151 AGGTCGCCTGGATTGCATGGCGACCTCCA
1 AGGTCGCCTGGATTGCATGGCGACCTCCA
302180 AGGTCGCCTGGATTGCATGGCG
1 AGGTCGCCTGGATTGCATGGCG
302202 TCCTATGGCG
Statistics
Matches: 50, Mismatches: 1, Indels: 0
0.98 0.02 0.00
Matches are distributed among these distances:
29 50 1.00
ACGTcount: A:0.16, C:0.30, G:0.34, T:0.20
Consensus pattern (29 bp):
AGGTCGCCTGGATTGCATGGCGACCTCCA
Found at i:307135 original size:10 final size:10
Alignment explanation
Indices: 307120--307156 Score: 65
Period size: 10 Copynumber: 3.7 Consensus size: 10
307110 AAAATTGGAT
307120 TTTGAATTAA
1 TTTGAATTAA
307130 TTTGAATTAA
1 TTTGAATTAA
307140 TTTGAATTAA
1 TTTGAATTAA
*
307150 ATTGAAT
1 TTTGAAT
307157 AAGAATCACC
Statistics
Matches: 26, Mismatches: 1, Indels: 0
0.96 0.04 0.00
Matches are distributed among these distances:
10 26 1.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.00, G:0.11, T:0.49
Consensus pattern (10 bp):
TTTGAATTAA
Found at i:310163 original size:17 final size:18
Alignment explanation
Indices: 310131--310165 Score: 54
Period size: 17 Copynumber: 2.0 Consensus size: 18
310121 TGACCGGTCA
310131 CGACCCGACCCGTTGACC
1 CGACCCGACCCGTTGACC
*
310149 CGACCCGA-TCGTTGACC
1 CGACCCGACCCGTTGACC
310166 GTTGACCGGT
Statistics
Matches: 16, Mismatches: 1, Indels: 1
0.89 0.06 0.06
Matches are distributed among these distances:
17 8 0.50
18 8 0.50
ACGTcount: A:0.17, C:0.46, G:0.23, T:0.14
Consensus pattern (18 bp):
CGACCCGACCCGTTGACC
Found at i:310215 original size:29 final size:29
Alignment explanation
Indices: 310173--310244 Score: 90
Period size: 29 Copynumber: 2.5 Consensus size: 29
310163 ACCGTTGACC
** *
310173 GGTGCTATTCTGGTAAATAATTCGATTTT
1 GGTGCTATTCTGGTAAATAATTCGAAATG
* *
310202 GGTGCTATTCTGGTAATTAGTTCGAAATG
1 GGTGCTATTCTGGTAAATAATTCGAAATG
*
310231 GGTGCTATTTTGGT
1 GGTGCTATTCTGGT
310245 GATTATTTTA
Statistics
Matches: 37, Mismatches: 6, Indels: 0
0.86 0.14 0.00
Matches are distributed among these distances:
29 37 1.00
ACGTcount: A:0.21, C:0.10, G:0.26, T:0.43
Consensus pattern (29 bp):
GGTGCTATTCTGGTAAATAATTCGAAATG
Found at i:310249 original size:29 final size:29
Alignment explanation
Indices: 310202--310269 Score: 82
Period size: 29 Copynumber: 2.3 Consensus size: 29
310192 ATTCGATTTT
* * *
310202 GGTGCTATTCTGGTAATTAGTTCGAAATG
1 GGTGCTATTTTGGTAATTAGTTCAAAAAG
* * *
310231 GGTGCTATTTTGGTGATTATTTTAAAAAG
1 GGTGCTATTTTGGTAATTAGTTCAAAAAG
310260 GGTGCTATTT
1 GGTGCTATTT
310270 GTGTAAAATG
Statistics
Matches: 33, Mismatches: 6, Indels: 0
0.85 0.15 0.00
Matches are distributed among these distances:
29 33 1.00
ACGTcount: A:0.24, C:0.07, G:0.26, T:0.43
Consensus pattern (29 bp):
GGTGCTATTTTGGTAATTAGTTCAAAAAG
Found at i:312626 original size:2 final size:2
Alignment explanation
Indices: 312619--312654 Score: 58
Period size: 2 Copynumber: 19.0 Consensus size: 2
312609 ACATGTTACA
312619 AT AT AT AT AT AT AT AT AT -T AT AT AT AT AT AT -T AT AT
1 AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT
312655 GAGTTGTGTA
Statistics
Matches: 32, Mismatches: 0, Indels: 4
0.89 0.00 0.11
Matches are distributed among these distances:
1 2 0.06
2 30 0.94
ACGTcount: A:0.47, C:0.00, G:0.00, T:0.53
Consensus pattern (2 bp):
AT
Found at i:312642 original size:13 final size:13
Alignment explanation
Indices: 312619--312654 Score: 65
Period size: 13 Copynumber: 2.8 Consensus size: 13
312609 ACATGTTACA
312619 ATATA-TATATAT
1 ATATATTATATAT
312631 ATATATTATATAT
1 ATATATTATATAT
312644 ATATATTATAT
1 ATATATTATAT
312655 GAGTTGTGTA
Statistics
Matches: 23, Mismatches: 0, Indels: 1
0.96 0.00 0.04
Matches are distributed among these distances:
12 5 0.22
13 18 0.78
ACGTcount: A:0.47, C:0.00, G:0.00, T:0.53
Consensus pattern (13 bp):
ATATATTATATAT
Found at i:312783 original size:16 final size:15
Alignment explanation
Indices: 312762--312791 Score: 51
Period size: 16 Copynumber: 1.9 Consensus size: 15
312752 GACATAAGAA
312762 AGAATATGAAATATAC
1 AGAATATG-AATATAC
312778 AGAATATGAATATA
1 AGAATATGAATATA
312792 AAATCATATG
Statistics
Matches: 14, Mismatches: 0, Indels: 1
0.93 0.00 0.07
Matches are distributed among these distances:
15 6 0.43
16 8 0.57
ACGTcount: A:0.57, C:0.03, G:0.13, T:0.27
Consensus pattern (15 bp):
AGAATATGAATATAC
Found at i:313047 original size:31 final size:30
Alignment explanation
Indices: 313009--313104 Score: 79
Period size: 31 Copynumber: 3.1 Consensus size: 30
312999 GTCAAAGAAC
313009 TACCTATGTCTTTCGAGACATATGGACAGT
1 TACCTATGTCTTTCGAGACATATGGACAGT
*** *
313039 ATACCTATGTTCTAAGGA-ACATATGGATAGTT
1 -TACCTATG-TCTTTCGAGACATATGGACAG-T
* * *
313071 TACCTAGGT-TCTTCGGGACCTATGGACAGT
1 TACCTATGTCT-TTCGAGACATATGGACAGT
313101 TACC
1 TACC
313105 GAGGATCTTT
Statistics
Matches: 50, Mismatches: 11, Indels: 9
0.71 0.16 0.13
Matches are distributed among these distances:
29 1 0.02
30 7 0.14
31 36 0.72
32 6 0.12
ACGTcount: A:0.27, C:0.20, G:0.21, T:0.32
Consensus pattern (30 bp):
TACCTATGTCTTTCGAGACATATGGACAGT
Found at i:313121 original size:30 final size:30
Alignment explanation
Indices: 313087--313339 Score: 470
Period size: 30 Copynumber: 8.4 Consensus size: 30
313077 GGTTCTTCGG
* *
313087 GACCTATGGACAGTTACCGAGGATCTTTAT
1 GACCTCTGGATAGTTACCGAGGATCTTTAT
313117 GACCTCTGGATAGTTACCGAGGATCTTTAT
1 GACCTCTGGATAGTTACCGAGGATCTTTAT
313147 GACCTCTGGATAGTTACCGAGGATCTTTAT
1 GACCTCTGGATAGTTACCGAGGATCTTTAT
313177 GACCTCTGGATAGTTACCGAGGATCTTTAT
1 GACCTCTGGATAGTTACCGAGGATCTTTAT
313207 GACCTCTGGATAGTTACCGAGGATCTTTAT
1 GACCTCTGGATAGTTACCGAGGATCTTTAT
313237 GACCTCTGGATAGTTACCGAGGATCTTTAT
1 GACCTCTGGATAGTTACCGAGGATCTTTAT
313267 GACCTCTGGATAGTTACCGAGGATCTTTAT
1 GACCTCTGGATAGTTACCGAGGATCTTTAT
* *
313297 GACCTCTGGACAGTTAACGAGGATCTTTAT
1 GACCTCTGGATAGTTACCGAGGATCTTTAT
313327 GACCTCTGGATAG
1 GACCTCTGGATAG
313340 GTCCTTCGGA
Statistics
Matches: 218, Mismatches: 5, Indels: 0
0.98 0.02 0.00
Matches are distributed among these distances:
30 218 1.00
ACGTcount: A:0.24, C:0.20, G:0.24, T:0.32
Consensus pattern (30 bp):
GACCTCTGGATAGTTACCGAGGATCTTTAT
Found at i:320094 original size:29 final size:29
Alignment explanation
Indices: 320033--320128 Score: 77
Period size: 29 Copynumber: 3.3 Consensus size: 29
320023 ACCGTTGACC
* * * *
320033 GGTGCTCTTCTGGTAAATAATTCAATTTT
1 GGTGCTATTCTGGTAATTAATTCAATATG
*
320062 GGTGTTATTCTGGTAATTAATTCGAA-ATG
1 GGTGCTATTCTGGTAATTAATTC-AATATG
* * * * * *
320091 GGTGCTATTTTGGTGATTATTTTAAAAAG
1 GGTGCTATTCTGGTAATTAATTCAATATG
320120 GGTGCTATT
1 GGTGCTATT
320129 TGTGTAAAAT
Statistics
Matches: 54, Mismatches: 11, Indels: 4
0.78 0.16 0.06
Matches are distributed among these distances:
28 2 0.04
29 50 0.93
30 2 0.04
ACGTcount: A:0.25, C:0.08, G:0.23, T:0.44
Consensus pattern (29 bp):
GGTGCTATTCTGGTAATTAATTCAATATG
Found at i:321694 original size:11 final size:11
Alignment explanation
Indices: 321678--321713 Score: 63
Period size: 11 Copynumber: 3.3 Consensus size: 11
321668 GTTACAATAA
*
321678 TAATAATAAGT
1 TAATAATAAAT
321689 TAATAATAAAT
1 TAATAATAAAT
321700 TAATAATAAAT
1 TAATAATAAAT
321711 TAA
1 TAA
321714 AACTTGGGTA
Statistics
Matches: 24, Mismatches: 1, Indels: 0
0.96 0.04 0.00
Matches are distributed among these distances:
11 24 1.00
ACGTcount: A:0.61, C:0.00, G:0.03, T:0.36
Consensus pattern (11 bp):
TAATAATAAAT
Found at i:324144 original size:20 final size:19
Alignment explanation
Indices: 324114--324161 Score: 55
Period size: 20 Copynumber: 2.5 Consensus size: 19
324104 AAATTATCAT
*
324114 ATAT-TTTTTTTTTA-AAA
1 ATATGTTTTTTTATAGAAA
324131 ATTATGTATTTTTTATAGAAA
1 A-TATGT-TTTTTTATAGAAA
324152 ATATGTTTTT
1 ATATGTTTTT
324162 GCGCCATAAA
Statistics
Matches: 26, Mismatches: 1, Indels: 6
0.79 0.03 0.18
Matches are distributed among these distances:
17 1 0.04
18 3 0.12
19 5 0.19
20 13 0.50
21 4 0.15
ACGTcount: A:0.33, C:0.00, G:0.06, T:0.60
Consensus pattern (19 bp):
ATATGTTTTTTTATAGAAA
Found at i:326333 original size:5 final size:5
Alignment explanation
Indices: 326323--326348 Score: 52
Period size: 5 Copynumber: 5.2 Consensus size: 5
326313 AGGTTCACTC
326323 TCATA TCATA TCATA TCATA TCATA T
1 TCATA TCATA TCATA TCATA TCATA T
326349 GTGATTTTCT
Statistics
Matches: 21, Mismatches: 0, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
5 21 1.00
ACGTcount: A:0.38, C:0.19, G:0.00, T:0.42
Consensus pattern (5 bp):
TCATA
Found at i:327264 original size:35 final size:35
Alignment explanation
Indices: 327225--327294 Score: 131
Period size: 35 Copynumber: 2.0 Consensus size: 35
327215 TGTTGAAAGT
*
327225 TCAATTTCGTAGTTTGCTAGTTGTTAATTGTTTTA
1 TCAATTTCGTAGTTTGCTAGTTATTAATTGTTTTA
327260 TCAATTTCGTAGTTTGCTAGTTATTAATTGTTTTA
1 TCAATTTCGTAGTTTGCTAGTTATTAATTGTTTTA
327295 AGTGTTAATT
Statistics
Matches: 34, Mismatches: 1, Indels: 0
0.97 0.03 0.00
Matches are distributed among these distances:
35 34 1.00
ACGTcount: A:0.21, C:0.09, G:0.16, T:0.54
Consensus pattern (35 bp):
TCAATTTCGTAGTTTGCTAGTTATTAATTGTTTTA
Found at i:329020 original size:21 final size:21
Alignment explanation
Indices: 328947--329068 Score: 69
Period size: 21 Copynumber: 6.1 Consensus size: 21
328937 CACCACTGCT
*
328947 CCTCCACCCTCAACAGCAACC-
1 CCTCCTCCCTCAACAGC-ACCA
**
328968 CCTCCTCCCTCAACTTCACCA
1 CCTCCTCCCTCAACAGCACCA
* * *
328989 CC-CC-CGC-CAACGGCAGCA
1 CCTCCTCCCTCAACAGCACCA
**
329007 CCTCCTCCCTCAACTTCACCA
1 CCTCCTCCCTCAACAGCACCA
* *
329028 CCTACT---TCAACAGCAGCA
1 CCTCCTCCCTCAACAGCACCA
* **
329046 CCTCCACCCTCAACTTCACCA
1 CCTCCTCCCTCAACAGCACCA
329067 CC
1 CC
329069 CCCTTCAACA
Statistics
Matches: 74, Mismatches: 20, Indels: 14
0.69 0.19 0.13
Matches are distributed among these distances:
18 23 0.31
19 4 0.05
20 7 0.09
21 40 0.54
ACGTcount: A:0.24, C:0.55, G:0.06, T:0.16
Consensus pattern (21 bp):
CCTCCTCCCTCAACAGCACCA
Found at i:329089 original size:39 final size:39
Alignment explanation
Indices: 328956--329089 Score: 178
Period size: 39 Copynumber: 3.4 Consensus size: 39
328946 TCCTCCACCC
* *
328956 TCAACAGCAACCCCTCCTCCCTCAACTTCACCACCCCCG
1 TCAACAGCAACACCTCCTCCCTCAACTTCACCACCCCCT
* * * **
328995 CCAACGGCAGCACCTCCTCCCTCAACTTCACCACCTACT
1 TCAACAGCAACACCTCCTCCCTCAACTTCACCACCCCCT
* *
329034 TCAACAGCAGCACCTCCACCCTCAACTTCACCACCCCCT
1 TCAACAGCAACACCTCCTCCCTCAACTTCACCACCCCCT
*
329073 TCAACAGCAACGCCTCC
1 TCAACAGCAACACCTCC
329090 GCCTACCACC
Statistics
Matches: 81, Mismatches: 14, Indels: 0
0.85 0.15 0.00
Matches are distributed among these distances:
39 81 1.00
ACGTcount: A:0.25, C:0.53, G:0.07, T:0.16
Consensus pattern (39 bp):
TCAACAGCAACACCTCCTCCCTCAACTTCACCACCCCCT
Found at i:330087 original size:20 final size:20
Alignment explanation
Indices: 330064--330118 Score: 110
Period size: 20 Copynumber: 2.8 Consensus size: 20
330054 GCAATGCGAA
330064 TTCCAATTTCGCAACCCAGT
1 TTCCAATTTCGCAACCCAGT
330084 TTCCAATTTCGCAACCCAGT
1 TTCCAATTTCGCAACCCAGT
330104 TTCCAATTTCGCAAC
1 TTCCAATTTCGCAAC
330119 GTGAATATGT
Statistics
Matches: 35, Mismatches: 0, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
20 35 1.00
ACGTcount: A:0.25, C:0.35, G:0.09, T:0.31
Consensus pattern (20 bp):
TTCCAATTTCGCAACCCAGT
Found at i:330136 original size:40 final size:40
Alignment explanation
Indices: 330111--330203 Score: 109
Period size: 40 Copynumber: 2.4 Consensus size: 40
330101 AGTTTCCAAT
*
330111 TTCGCAACGTGAATATGTAAATCGCAACACAGAAGTCAAA
1 TTCGCAACGCGAATATGTAAATCGCAACACAGAAGTCAAA
* * * *
330151 TTCGCAACGCGACTTTGTAAATCGC-A-ACTGAATTTCAAA
1 TTCGCAACGCGAATATGTAAATCGCAACACAGAA-GTCAAA
*
330190 TTTGCAACGCGAAT
1 TTCGCAACGCGAAT
330204 TTAATTTCGC
Statistics
Matches: 45, Mismatches: 7, Indels: 3
0.82 0.13 0.05
Matches are distributed among these distances:
38 5 0.11
39 18 0.40
40 22 0.49
ACGTcount: A:0.37, C:0.22, G:0.17, T:0.25
Consensus pattern (40 bp):
TTCGCAACGCGAATATGTAAATCGCAACACAGAAGTCAAA
Found at i:330983 original size:12 final size:12
Alignment explanation
Indices: 330962--330995 Score: 50
Period size: 12 Copynumber: 2.8 Consensus size: 12
330952 ACCACATTTC
*
330962 CAATACCAAACA
1 CAATATCAAACA
330974 CAATATCAAACA
1 CAATATCAAACA
*
330986 CAATCTCAAA
1 CAATATCAAA
330996 ACCCACAACC
Statistics
Matches: 20, Mismatches: 2, Indels: 0
0.91 0.09 0.00
Matches are distributed among these distances:
12 20 1.00
ACGTcount: A:0.56, C:0.29, G:0.00, T:0.15
Consensus pattern (12 bp):
CAATATCAAACA
Found at i:331174 original size:24 final size:24
Alignment explanation
Indices: 331116--331162 Score: 85
Period size: 24 Copynumber: 2.0 Consensus size: 24
331106 AGTCAGTATT
*
331116 CGAAATTTGATCTTGGTCAATACC
1 CGAACTTTGATCTTGGTCAATACC
331140 CGAACTTTGATCTTGGTCAATAC
1 CGAACTTTGATCTTGGTCAATAC
331163 TCGGATTTTG
Statistics
Matches: 22, Mismatches: 1, Indels: 0
0.96 0.04 0.00
Matches are distributed among these distances:
24 22 1.00
ACGTcount: A:0.28, C:0.21, G:0.17, T:0.34
Consensus pattern (24 bp):
CGAACTTTGATCTTGGTCAATACC
Found at i:333312 original size:18 final size:18
Alignment explanation
Indices: 333289--333324 Score: 63
Period size: 18 Copynumber: 2.0 Consensus size: 18
333279 AAGCAAAAGG
*
333289 AAATCAAAATCGCAATCA
1 AAATCAAAATCCCAATCA
333307 AAATCAAAATCCCAATCA
1 AAATCAAAATCCCAATCA
333325 CAACCGGCTT
Statistics
Matches: 17, Mismatches: 1, Indels: 0
0.94 0.06 0.00
Matches are distributed among these distances:
18 17 1.00
ACGTcount: A:0.56, C:0.25, G:0.03, T:0.17
Consensus pattern (18 bp):
AAATCAAAATCCCAATCA
Found at i:333634 original size:20 final size:20
Alignment explanation
Indices: 333609--333659 Score: 75
Period size: 20 Copynumber: 2.5 Consensus size: 20
333599 ATGTTACGAT
*
333609 CAACGCGAAAGTCAAATTTG
1 CAACGCGAAAGTCAAATTCG
*
333629 CAACGCAAAAGTCAAATTCG
1 CAACGCGAAAGTCAAATTCG
*
333649 CAACGTGAAAG
1 CAACGCGAAAG
333660 CGTTGCGAAT
Statistics
Matches: 27, Mismatches: 4, Indels: 0
0.87 0.13 0.00
Matches are distributed among these distances:
20 27 1.00
ACGTcount: A:0.43, C:0.22, G:0.20, T:0.16
Consensus pattern (20 bp):
CAACGCGAAAGTCAAATTCG
Found at i:333777 original size:14 final size:13
Alignment explanation
Indices: 333758--333807 Score: 50
Period size: 14 Copynumber: 3.8 Consensus size: 13
333748 AATCAATTAA
333758 ACATTATTGTGGGT
1 ACATTATT-TGGGT
*
333772 ACATTATTT--GA
1 ACATTATTTGGGT
*
333783 ACATTGTTATGGGT
1 ACATTATT-TGGGT
333797 ACATTATTTGG
1 ACATTATTTGG
333808 AAAAATAATG
Statistics
Matches: 29, Mismatches: 4, Indels: 7
0.73 0.10 0.17
Matches are distributed among these distances:
11 8 0.28
12 1 0.03
13 4 0.14
14 16 0.55
ACGTcount: A:0.26, C:0.08, G:0.22, T:0.44
Consensus pattern (13 bp):
ACATTATTTGGGT
Found at i:333785 original size:25 final size:25
Alignment explanation
Indices: 333757--333806 Score: 82
Period size: 25 Copynumber: 2.0 Consensus size: 25
333747 AAATCAATTA
*
333757 AACATTATTGTGGGTACATTATTTG
1 AACATTATTATGGGTACATTATTTG
*
333782 AACATTGTTATGGGTACATTATTTG
1 AACATTATTATGGGTACATTATTTG
333807 GAAAAATAAT
Statistics
Matches: 23, Mismatches: 2, Indels: 0
0.92 0.08 0.00
Matches are distributed among these distances:
25 23 1.00
ACGTcount: A:0.28, C:0.08, G:0.20, T:0.44
Consensus pattern (25 bp):
AACATTATTATGGGTACATTATTTG
Found at i:334213 original size:18 final size:18
Alignment explanation
Indices: 334192--334238 Score: 58
Period size: 18 Copynumber: 2.6 Consensus size: 18
334182 GTAATTGGAG
334192 TTTGAATTTAAATTTCAA
1 TTTGAATTTAAATTTCAA
* *
334210 TTTGAGTTTGAATTTCAA
1 TTTGAATTTAAATTTCAA
* *
334228 TATCAATTTAA
1 TTTGAATTTAA
334239 CCTTGATGTT
Statistics
Matches: 23, Mismatches: 6, Indels: 0
0.79 0.21 0.00
Matches are distributed among these distances:
18 23 1.00
ACGTcount: A:0.36, C:0.06, G:0.09, T:0.49
Consensus pattern (18 bp):
TTTGAATTTAAATTTCAA
Found at i:334236 original size:24 final size:24
Alignment explanation
Indices: 334184--334236 Score: 79
Period size: 24 Copynumber: 2.2 Consensus size: 24
334174 TTTCATATGT
* *
334184 AATTGGAGTTTGAATTTAAATTTC
1 AATTTGAGTTTGAATTTAAATATC
*
334208 AATTTGAGTTTGAATTTCAATATC
1 AATTTGAGTTTGAATTTAAATATC
334232 AATTT
1 AATTT
334237 AACCTTGATG
Statistics
Matches: 26, Mismatches: 3, Indels: 0
0.90 0.10 0.00
Matches are distributed among these distances:
24 26 1.00
ACGTcount: A:0.34, C:0.06, G:0.13, T:0.47
Consensus pattern (24 bp):
AATTTGAGTTTGAATTTAAATATC
Found at i:334244 original size:24 final size:24
Alignment explanation
Indices: 334193--334244 Score: 59
Period size: 24 Copynumber: 2.2 Consensus size: 24
334183 TAATTGGAGT
* * **
334193 TTGAATTTAAATTTCAATTTGAGT
1 TTGAATTTAAATATCAATTTAACC
*
334217 TTGAATTTCAATATCAATTTAACC
1 TTGAATTTAAATATCAATTTAACC
334241 TTGA
1 TTGA
334245 TGTTGTATGT
Statistics
Matches: 23, Mismatches: 5, Indels: 0
0.82 0.18 0.00
Matches are distributed among these distances:
24 23 1.00
ACGTcount: A:0.35, C:0.10, G:0.10, T:0.46
Consensus pattern (24 bp):
TTGAATTTAAATATCAATTTAACC
Found at i:335891 original size:21 final size:21
Alignment explanation
Indices: 335867--335962 Score: 106
Period size: 21 Copynumber: 4.6 Consensus size: 21
335857 GGCGGGACCA
* *
335867 CTTGAACGATGACAGGGGCCT
1 CTTGAATGATGAGAGGGGCCT
* *
335888 CTTGAATGGTGAGAGGGGCTT
1 CTTGAATGATGAGAGGGGCCT
335909 CTTCG-ATGATGAGAGGGGCCT
1 CTT-GAATGATGAGAGGGGCCT
* *
335930 TTTGAACGAT-AGGAGGGGCCT
1 CTTGAATGATGA-GAGGGGCCT
335951 CTTGAATGATGA
1 CTTGAATGATGA
335963 TAGGTGCATC
Statistics
Matches: 61, Mismatches: 10, Indels: 7
0.78 0.13 0.09
Matches are distributed among these distances:
20 2 0.03
21 57 0.93
22 2 0.03
ACGTcount: A:0.23, C:0.16, G:0.36, T:0.25
Consensus pattern (21 bp):
CTTGAATGATGAGAGGGGCCT
Found at i:336138 original size:4 final size:4
Alignment explanation
Indices: 336106--336155 Score: 64
Period size: 4 Copynumber: 12.5 Consensus size: 4
336096 GGGCCGCTAA
* * * *
336106 AAAT AAAT TAAT ACAT AAAT CAGT AAAT AAAT AAAT AAAT AAAT AAAT
1 AAAT AAAT AAAT AAAT AAAT AAAT AAAT AAAT AAAT AAAT AAAT AAAT
336154 AA
1 AA
336156 TGTCAAAAAA
Statistics
Matches: 38, Mismatches: 8, Indels: 0
0.83 0.17 0.00
Matches are distributed among these distances:
4 38 1.00
ACGTcount: A:0.68, C:0.04, G:0.02, T:0.26
Consensus pattern (4 bp):
AAAT
Found at i:338091 original size:20 final size:20
Alignment explanation
Indices: 338068--338118 Score: 66
Period size: 20 Copynumber: 2.5 Consensus size: 20
338058 AGAAGTTTCT
*
338068 GAAACTTAAATTCACAACGC
1 GAAACTAAAATTCACAACGC
* * *
338088 GAAAATAAAAATCGCAACGC
1 GAAACTAAAATTCACAACGC
338108 GAAACTAAAAT
1 GAAACTAAAAT
338119 CGCTTTGCGA
Statistics
Matches: 25, Mismatches: 6, Indels: 0
0.81 0.19 0.00
Matches are distributed among these distances:
20 25 1.00
ACGTcount: A:0.53, C:0.20, G:0.12, T:0.16
Consensus pattern (20 bp):
GAAACTAAAATTCACAACGC
Found at i:338198 original size:16 final size:17
Alignment explanation
Indices: 338177--338216 Score: 55
Period size: 16 Copynumber: 2.4 Consensus size: 17
338167 GGGTTTCTTC
*
338177 AACAAAAATA-AAACAA
1 AACAAAAAGACAAACAA
338193 AACAAAAAGACAAACAA
1 AACAAAAAGACAAACAA
338210 AGACAAA
1 A-ACAAA
338217 TACTAACTTC
Statistics
Matches: 21, Mismatches: 1, Indels: 2
0.88 0.04 0.08
Matches are distributed among these distances:
16 9 0.43
17 7 0.33
18 5 0.24
ACGTcount: A:0.78, C:0.15, G:0.05, T:0.03
Consensus pattern (17 bp):
AACAAAAAGACAAACAA
Found at i:338454 original size:22 final size:22
Alignment explanation
Indices: 338424--338471 Score: 78
Period size: 22 Copynumber: 2.2 Consensus size: 22
338414 GATGGAGATA
*
338424 GACGGATTTCGTCGGAAATGGG
1 GACGAATTTCGTCGGAAATGGG
*
338446 GACGAATTTCGTCGGAGATGGG
1 GACGAATTTCGTCGGAAATGGG
338468 GACG
1 GACG
338472 GATGTAGCCG
Statistics
Matches: 24, Mismatches: 2, Indels: 0
0.92 0.08 0.00
Matches are distributed among these distances:
22 24 1.00
ACGTcount: A:0.23, C:0.15, G:0.42, T:0.21
Consensus pattern (22 bp):
GACGAATTTCGTCGGAAATGGG
Found at i:338627 original size:20 final size:19
Alignment explanation
Indices: 338602--338746 Score: 109
Period size: 20 Copynumber: 7.3 Consensus size: 19
338592 GTGTAAAAAC
338602 ATTTGACTGTCGCGTTGCGA
1 ATTTGACT-TCGCGTTGCGA
* *
338622 ATTTGACTTCTGTGTTACG-
1 ATTTGACTTC-GCGTTGCGA
338641 ATTT-ACAAATTCGCGTTGCGA
1 ATTTGAC---TTCGCGTTGCGA
*
338662 ATTTGACTATCGCTTTGCGA
1 ATTTGACT-TCGCGTTGCGA
*
338682 ATTTGACTTCTGTGTTGCG-
1 ATTTGACTTC-GCGTTGCGA
*
338701 ATTT-ACAAATTCGCGTTACGA
1 ATTTGAC---TTCGCGTTGCGA
*
338722 ATTTGACTTTCGCATTGCGA
1 ATTTGAC-TTCGCGTTGCGA
338742 ATTTG
1 ATTTG
338747 GAAAAGCGCA
Statistics
Matches: 100, Mismatches: 12, Indels: 26
0.72 0.09 0.19
Matches are distributed among these distances:
18 4 0.04
19 13 0.13
20 65 0.65
21 14 0.14
22 4 0.04
ACGTcount: A:0.21, C:0.18, G:0.21, T:0.40
Consensus pattern (19 bp):
ATTTGACTTCGCGTTGCGA
Found at i:338681 original size:60 final size:60
Alignment explanation
Indices: 338602--338746 Score: 236
Period size: 60 Copynumber: 2.4 Consensus size: 60
338592 GTGTAAAAAC
* * *
338602 ATTTGACTGTCGCGTTGCGAATTTGACTTCTGTGTTACGATTTACAAATTCGCGTTGCGA
1 ATTTGACTATCGCATTGCGAATTTGACTTCTGTGTTACGATTTACAAATTCGCGTTACGA
* *
338662 ATTTGACTATCGCTTTGCGAATTTGACTTCTGTGTTGCGATTTACAAATTCGCGTTACGA
1 ATTTGACTATCGCATTGCGAATTTGACTTCTGTGTTACGATTTACAAATTCGCGTTACGA
*
338722 ATTTGACTTTCGCATTGCGAATTTG
1 ATTTGACTATCGCATTGCGAATTTG
338747 GAAAAGCGCA
Statistics
Matches: 79, Mismatches: 6, Indels: 0
0.93 0.07 0.00
Matches are distributed among these distances:
60 79 1.00
ACGTcount: A:0.21, C:0.18, G:0.21, T:0.40
Consensus pattern (60 bp):
ATTTGACTATCGCATTGCGAATTTGACTTCTGTGTTACGATTTACAAATTCGCGTTACGA
Found at i:338823 original size:20 final size:19
Alignment explanation
Indices: 338772--338842 Score: 72
Period size: 20 Copynumber: 3.6 Consensus size: 19
338762 AATTACATAT
338772 TCGCGTTGCGAAATTGGAA
1 TCGCGTTGCGAAATTGGAA
* * *
338791 ACTGGGTTACGAAATTGGAA
1 TC-GCGTTGCGAAATTGGAA
*
338811 TTCGCGTTGCG-AATTTGAGA
1 -TCGCGTTGCGAAATTGGA-A
338831 TCGCGTTGCGAA
1 TCGCGTTGCGAA
338843 TTTGTTGGTC
Statistics
Matches: 41, Mismatches: 7, Indels: 7
0.75 0.13 0.13
Matches are distributed among these distances:
19 17 0.41
20 23 0.56
21 1 0.02
ACGTcount: A:0.25, C:0.15, G:0.31, T:0.28
Consensus pattern (19 bp):
TCGCGTTGCGAAATTGGAA
Found at i:341272 original size:12 final size:12
Alignment explanation
Indices: 341243--341289 Score: 53
Period size: 11 Copynumber: 4.1 Consensus size: 12
341233 AATTATTAAC
341243 ATATTTAA-AAT
1 ATATTTAATAAT
*
341254 ATATTTATTAAT
1 ATATTTAATAAT
*
341266 ATTTTTAATAAT
1 ATATTTAATAAT
*
341278 ATA-ATAATAAT
1 ATATTTAATAAT
341289 A
1 A
341290 ATAATAATAT
Statistics
Matches: 30, Mismatches: 5, Indels: 2
0.81 0.14 0.05
Matches are distributed among these distances:
11 15 0.50
12 15 0.50
ACGTcount: A:0.51, C:0.00, G:0.00, T:0.49
Consensus pattern (12 bp):
ATATTTAATAAT
Found at i:341272 original size:23 final size:23
Alignment explanation
Indices: 341225--341282 Score: 71
Period size: 23 Copynumber: 2.4 Consensus size: 23
341215 CATTTTAATA
341225 AAAATATTAATTATTAACATATTT
1 AAAATA-TAATTATTAACATATTT
* * *
341249 AAAATATATTTATTAATATTTTT
1 AAAATATAATTATTAACATATTT
341272 AATAATATAAT
1 AA-AATATAAT
341283 AATAATAATA
Statistics
Matches: 29, Mismatches: 4, Indels: 2
0.83 0.11 0.06
Matches are distributed among these distances:
23 16 0.55
24 13 0.45
ACGTcount: A:0.50, C:0.02, G:0.00, T:0.48
Consensus pattern (23 bp):
AAAATATAATTATTAACATATTT
Found at i:341536 original size:24 final size:23
Alignment explanation
Indices: 341488--341535 Score: 62
Period size: 23 Copynumber: 2.1 Consensus size: 23
341478 TAAAAATTCC
*
341488 TTAAAATATATTTATTAATAATT
1 TTAAAATATATTTAATAATAATT
*
341511 TTAAAATTTAATTTAAT-ATAATT
1 TTAAAATAT-ATTTAATAATAATT
341534 TT
1 TT
341536 TTTTTTTTTT
Statistics
Matches: 22, Mismatches: 2, Indels: 2
0.85 0.08 0.08
Matches are distributed among these distances:
23 16 0.73
24 6 0.27
ACGTcount: A:0.46, C:0.00, G:0.00, T:0.54
Consensus pattern (23 bp):
TTAAAATATATTTAATAATAATT
Found at i:346161 original size:2 final size:2
Alignment explanation
Indices: 346154--346181 Score: 56
Period size: 2 Copynumber: 14.0 Consensus size: 2
346144 GTCATAAATC
346154 AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT
1 AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT
346182 TGTAGATTGA
Statistics
Matches: 26, Mismatches: 0, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
2 26 1.00
ACGTcount: A:0.50, C:0.00, G:0.00, T:0.50
Consensus pattern (2 bp):
AT
Found at i:349190 original size:42 final size:46
Alignment explanation
Indices: 349143--349252 Score: 147
Period size: 42 Copynumber: 2.5 Consensus size: 46
349133 GGTAAGTATG
349143 AAATAAGCTTACGAGCTTATG-AA-T-AATGGCAAGTATATTGAT-
1 AAATAAGCTTACGAGCTTATGAAATTAAATGGCAAGTATATTGATA
* * *
349185 AAATAAGCTTACGAGCTTATGAAATTTAAATGGTAAGTATTTTGGTA
1 AAATAAGCTTACGAGCTTATGAAA-TTAAATGGCAAGTATATTGATA
*
349232 AAATAAGCTTACAAGCTTATG
1 AAATAAGCTTACGAGCTTATG
349253 GGATAAATGG
Statistics
Matches: 59, Mismatches: 4, Indels: 5
0.87 0.06 0.07
Matches are distributed among these distances:
42 21 0.36
43 2 0.03
45 1 0.02
46 15 0.25
47 20 0.34
ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.18, T:0.33
Consensus pattern (46 bp):
AAATAAGCTTACGAGCTTATGAAATTAAATGGCAAGTATATTGATA
Found at i:350887 original size:2 final size:2
Alignment explanation
Indices: 350882--350908 Score: 54
Period size: 2 Copynumber: 13.5 Consensus size: 2
350872 CACACATTTA
350882 AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT A
1 AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT A
350909 ACTAATAGAA
Statistics
Matches: 25, Mismatches: 0, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
2 25 1.00
ACGTcount: A:0.52, C:0.00, G:0.00, T:0.48
Consensus pattern (2 bp):
AT
Found at i:352871 original size:33 final size:33
Alignment explanation
Indices: 352829--352894 Score: 123
Period size: 33 Copynumber: 2.0 Consensus size: 33
352819 GTTCTCACTT
*
352829 CGTGTGAAAGCGTTGTCCATCCAGTTGAACAGA
1 CGTGTGAAAGCGTTGTCCATCCAGTCGAACAGA
352862 CGTGTGAAAGCGTTGTCCATCCAGTCGAACAGA
1 CGTGTGAAAGCGTTGTCCATCCAGTCGAACAGA
352895 TTGTGAGCAT
Statistics
Matches: 32, Mismatches: 1, Indels: 0
0.97 0.03 0.00
Matches are distributed among these distances:
33 32 1.00
ACGTcount: A:0.27, C:0.23, G:0.27, T:0.23
Consensus pattern (33 bp):
CGTGTGAAAGCGTTGTCCATCCAGTCGAACAGA
Found at i:358428 original size:16 final size:16
Alignment explanation
Indices: 358395--358440 Score: 56
Period size: 16 Copynumber: 2.8 Consensus size: 16
358385 GTTGTGGTTA
*
358395 AAATAAAAAATAAGAATT
1 AAAT-AAAAA-AATAATT
358413 AAATAAAAAAATAATT
1 AAATAAAAAAATAATT
*
358429 AAATAAACAAAT
1 AAATAAAAAAAT
358441 TAAAGAGATT
Statistics
Matches: 26, Mismatches: 2, Indels: 2
0.87 0.07 0.07
Matches are distributed among these distances:
16 17 0.65
17 5 0.19
18 4 0.15
ACGTcount: A:0.74, C:0.02, G:0.02, T:0.22
Consensus pattern (16 bp):
AAATAAAAAAATAATT
Found at i:359173 original size:68 final size:69
Alignment explanation
Indices: 359028--359219 Score: 209
Period size: 68 Copynumber: 2.8 Consensus size: 69
359018 TAAAACATCT
* * * * ** *
359028 TAAATCCTAATTAAAACACTTAAAA-CTATCTAAACTAAAATACCTA-A-AAAA-AT-AATATAA
1 TAAAACCTAATTAAAATACTAAAAACCTATTTAAACTAAAATA-AAAGATAAAATATAAAAATAA
*
359088 TATTC
65 TATCC
* *
359093 TAAATCCTAATTAAAATACT-AAAACCTATTTAAACTGAAGAT-AAAGATAAAATATAAAAATAA
1 TAAAACCTAATTAAAATACTAAAAACCTATTTAAACT-AAAATAAAAGATAAAATATAAAAATAA
359156 TATCC
65 TATCC
*
359161 TAAAACTTAATTAAAATACTAAAAACCTATTTAAACTAAAATACAAAGATAAAATATAA
1 TAAAACCTAATTAAAATACTAAAAACCTATTTAAACTAAAATA-AAAGATAAAATATAA
359220 TGTTTAAAAT
Statistics
Matches: 108, Mismatches: 10, Indels: 13
0.82 0.08 0.10
Matches are distributed among these distances:
64 5 0.05
65 30 0.28
66 8 0.07
67 2 0.02
68 32 0.30
69 16 0.15
70 15 0.14
ACGTcount: A:0.57, C:0.12, G:0.02, T:0.28
Consensus pattern (69 bp):
TAAAACCTAATTAAAATACTAAAAACCTATTTAAACTAAAATAAAAGATAAAATATAAAAATAAT
ATCC
Found at i:361028 original size:29 final size:29
Alignment explanation
Indices: 360995--361065 Score: 83
Period size: 30 Copynumber: 2.4 Consensus size: 29
360985 TTGACACTTT
360995 AGTTTCTGTTATTT-TATTT-TAGTCATTTA
1 AGTTTCTGTT-TTTCTATTTAT-GTCATTTA
*
361024 AGTTTTTGTTTTTGCTATTTATGTCATTTA
1 AGTTTCTGTTTTT-CTATTTATGTCATTTA
*
361054 AATTTCTGTTTT
1 AGTTTCTGTTTT
361066 AGCTATCTTA
Statistics
Matches: 36, Mismatches: 3, Indels: 5
0.82 0.07 0.11
Matches are distributed among these distances:
28 3 0.08
29 9 0.25
30 23 0.64
31 1 0.03
ACGTcount: A:0.18, C:0.07, G:0.11, T:0.63
Consensus pattern (29 bp):
AGTTTCTGTTTTTCTATTTATGTCATTTA
Found at i:361050 original size:30 final size:29
Alignment explanation
Indices: 361012--361129 Score: 110
Period size: 30 Copynumber: 4.0 Consensus size: 29
361002 GTTATTTTAT
*
361012 TTTAGTCATTTAAGTTTTTGTTTTTGCTA
1 TTTAGTCATTTAAGTTTATGTTTTTGCTA
* * *
361041 TTTATGTCATTTAAATTTCTGTTTTAGCTA
1 TTTA-GTCATTTAAGTTTATGTTTTTGCTA
* * * * *
361071 TCTTAGCCTTTTGAGTTTATGTTTTTACCA
1 T-TTAGTCATTTAAGTTTATGTTTTTGCTA
* * *
361101 TTTAATCCTTTAAGTTCATGTTTTTGCTA
1 TTTAGTCATTTAAGTTTATGTTTTTGCTA
361130 GATCTATTAT
Statistics
Matches: 69, Mismatches: 18, Indels: 4
0.76 0.20 0.04
Matches are distributed among these distances:
29 25 0.36
30 41 0.59
31 3 0.04
ACGTcount: A:0.19, C:0.12, G:0.12, T:0.57
Consensus pattern (29 bp):
TTTAGTCATTTAAGTTTATGTTTTTGCTA
Found at i:362327 original size:17 final size:17
Alignment explanation
Indices: 362305--362347 Score: 77
Period size: 17 Copynumber: 2.5 Consensus size: 17
362295 AATACATCTT
362305 TGTGGGTAGAAAGCATG
1 TGTGGGTAGAAAGCATG
362322 TGTGGGTAGAAAGCATG
1 TGTGGGTAGAAAGCATG
*
362339 TTTGGGTAG
1 TGTGGGTAG
362348 GACTACTATC
Statistics
Matches: 25, Mismatches: 1, Indels: 0
0.96 0.04 0.00
Matches are distributed among these distances:
17 25 1.00
ACGTcount: A:0.26, C:0.05, G:0.42, T:0.28
Consensus pattern (17 bp):
TGTGGGTAGAAAGCATG
Found at i:363914 original size:10 final size:11
Alignment explanation
Indices: 363889--363915 Score: 54
Period size: 11 Copynumber: 2.5 Consensus size: 11
363879 TATCATGTTA
363889 AAAAAACAAAC
1 AAAAAACAAAC
363900 AAAAAACAAAC
1 AAAAAACAAAC
363911 AAAAA
1 AAAAA
363916 TCCATCAATT
Statistics
Matches: 16, Mismatches: 0, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
11 16 1.00
ACGTcount: A:0.85, C:0.15, G:0.00, T:0.00
Consensus pattern (11 bp):
AAAAAACAAAC
Found at i:365619 original size:32 final size:32
Alignment explanation
Indices: 365570--365658 Score: 101
Period size: 32 Copynumber: 2.8 Consensus size: 32
365560 AAAGTAATAG
* *
365570 AGGGCAT-ATTTGAAGATTCAACATCAAATGTT
1 AGGGCATCTTTTG-AGATTCAACATCAAATATT
*
365602 -GAGGCATCTTTTGAGATTCAACATCGAATATT
1 AG-GGCATCTTTTGAGATTCAACATCAAATATT
* *
365634 AGGGCATCTTTGGGGATTCAACATC
1 AGGGCATCTTTTGAGATTCAACATC
365659 CCGATGCAAA
Statistics
Matches: 49, Mismatches: 5, Indels: 6
0.82 0.08 0.10
Matches are distributed among these distances:
31 1 0.02
32 43 0.88
33 5 0.10
ACGTcount: A:0.31, C:0.16, G:0.21, T:0.31
Consensus pattern (32 bp):
AGGGCATCTTTTGAGATTCAACATCAAATATT
Found at i:370144 original size:65 final size:63
Alignment explanation
Indices: 370001--370162 Score: 182
Period size: 65 Copynumber: 2.5 Consensus size: 63
369991 TAATGAAGGT
* * * *
370001 ATGCATTGATGCACTACACCATGCATCGATGCATAAATCCTATTCGATGTTTGTATTTAATGGGG
1 ATGCATCGATGCACTCCA-TATGCATCGATGCATAAATCCTATTCGATGTTTGTATTTAAT-GGA
* * * *
370066 ATGCATCGATGCACTCCTTATGCATCGATGCATAAATCCTATTCGATGTTTTCTTTTTTAAAT-T
1 ATGCATCGATGCACTCCATATGCATCGATGCATAAATCCTATTCGATG-TTT-GTATTT-AATGG
370130 A
63 A
* *
370131 ATGCATCGATGCACTGCATGTGCATCGATGCA
1 ATGCATCGATGCACTCCATATGCATCGATGCA
370163 CCTTAAATAA
Statistics
Matches: 83, Mismatches: 11, Indels: 6
0.83 0.11 0.06
Matches are distributed among these distances:
64 29 0.35
65 47 0.57
66 4 0.05
67 3 0.04
ACGTcount: A:0.27, C:0.20, G:0.18, T:0.35
Consensus pattern (63 bp):
ATGCATCGATGCACTCCATATGCATCGATGCATAAATCCTATTCGATGTTTGTATTTAATGGA
Found at i:371160 original size:43 final size:43
Alignment explanation
Indices: 371058--371178 Score: 154
Period size: 43 Copynumber: 2.8 Consensus size: 43
371048 GCCATTCATG
*
371058 ATTTCAACTCCACGACAGAGGATATCGTACCCACAGATCCACA
1 ATTTCAACTCCACGACGGAGGATATCGTACCCACAGATCCACA
* * *
371101 ATTTCAACTCCACGACGGAGGATATCGTGCCCACATATCCACG
1 ATTTCAACTCCACGACGGAGGATATCGTACCCACAGATCCACA
* * * *
371144 GTTTCAACTTCACGACGAAGGGA-ATCGTACACACA
1 ATTTCAACTCCACGACGGA-GGATATCGTACCCACA
371179 AGCAACATTC
Statistics
Matches: 68, Mismatches: 9, Indels: 2
0.86 0.11 0.03
Matches are distributed among these distances:
43 65 0.96
44 3 0.04
ACGTcount: A:0.32, C:0.31, G:0.17, T:0.20
Consensus pattern (43 bp):
ATTTCAACTCCACGACGGAGGATATCGTACCCACAGATCCACA
Found at i:371625 original size:292 final size:292
Alignment explanation
Indices: 371101--371744 Score: 1103
Period size: 292 Copynumber: 2.2 Consensus size: 292
371091 CAGATCCACA
*
371101 ATTTCAACTCCACGACGGAGGATATCGTGCCCACATATCCACGGTTTCAACTTCACGACGAAGGG
1 ATTTCAACTCCACGACGGAGGATATCGTGCCCACACATCCACGGTTTCAACTTCACGACGAAGGG
* * *
371166 AATCGTACACACAAGCAACATTCATCTCTAGCTTTGATTTCAACTTCATAACGAAAGATATCCAA
66 AATCGTACACACAAGCAACATTCATCTCTAGATTGGATTTCAACTTCACAACGAAAGATATCCAA
371231 CTCAAAGAAGGAGTGTCTGTCAACAAACTTTCCAGTTTCAGAGTCAATTTCAACTTCAAGGCGAA
131 CTCAAAGAAGGAGTGTCTGTCAACAAACTTTCCAGTTTCAGAGTCAATTTCAACTTCAAGGCGAA
* *
371296 GGATATTGGACTCGAAACAGCACAAGCTTGGATTTCAACTTCACGACGAATGATATTCAAGTCAA
196 GGATATTGGACTCGAAACAACACAAGCTTGGATTTCAACTTCACGACGAAGGATATTCAAGTCAA
371361 GGCTCAACTTCACA-ACGAAGGAGTCATCCGCG
261 GGCTCAACTTCA-AGACGAAGGAGTCATCCGCG
371393 ATTTCAACTCCACGACGGAGGATATCGTGCCCACACATCCACGGTTT-AACCTTCACGACGAAGG
1 ATTTCAACTCCACGACGGAGGATATCGTGCCCACACATCCACGGTTTCAA-CTTCACGACGAAGG
* * *
371457 GAATCGTACACACAAGCAGCATTCATCTCTAGATTGGATTTCAACTTCACGACGAAGGATATCCA
65 GAATCGTACACACAAGCAACATTCATCTCTAGATTGGATTTCAACTTCACAACGAAAGATATCCA
* *
371522 ACTCAAAGAAGGAGTGTCTGTCAATAAACTTTCCAGTTTCAGAGTCAATTTCAACTTCACGGCGA
130 ACTCAAAGAAGGAGTGTCTGTCAACAAACTTTCCAGTTTCAGAGTCAATTTCAACTTCAAGGCGA
371587 AGGATATTGGACTCGAAACAACACAAGCTTGGATTTCAACTTCACGACGAAGGATATTCAAGTCA
195 AGGATATTGGACTCGAAACAACACAAGCTTGGATTTCAACTTCACGACGAAGGATATTCAAGTCA
371652 AGGCTCAACTTCAAGACGAAGGAGTCATCCGCG
260 AGGCTCAACTTCAAGACGAAGGAGTCATCCGCG
* *** * *
371685 ATTTCAACTCCACGACGGAGGATATCGTACCCATGGATCCACGATTTCAACTCCACGACG
1 ATTTCAACTCCACGACGGAGGATATCGTGCCCACACATCCACGGTTTCAACTTCACGACG
371745 GAGGATATTG
Statistics
Matches: 332, Mismatches: 17, Indels: 6
0.94 0.05 0.02
Matches are distributed among these distances:
291 3 0.01
292 327 0.98
293 2 0.01
ACGTcount: A:0.32, C:0.25, G:0.19, T:0.23
Consensus pattern (292 bp):
ATTTCAACTCCACGACGGAGGATATCGTGCCCACACATCCACGGTTTCAACTTCACGACGAAGGG
AATCGTACACACAAGCAACATTCATCTCTAGATTGGATTTCAACTTCACAACGAAAGATATCCAA
CTCAAAGAAGGAGTGTCTGTCAACAAACTTTCCAGTTTCAGAGTCAATTTCAACTTCAAGGCGAA
GGATATTGGACTCGAAACAACACAAGCTTGGATTTCAACTTCACGACGAAGGATATTCAAGTCAA
GGCTCAACTTCAAGACGAAGGAGTCATCCGCG
Found at i:371731 original size:43 final size:43
Alignment explanation
Indices: 371677--371785 Score: 146
Period size: 43 Copynumber: 2.5 Consensus size: 43
371667 ACGAAGGAGT
* **
371677 CATCCGCGATTTCAACTCCACGACGGAGGATATCGTACCCATG
1 CATCCACGATTTCAACTCCACGACGGAGGATATCGTACCCACA
* * *
371720 GATCCACGATTTCAACTCCACGACGGAGGATATTGTGCCCACA
1 CATCCACGATTTCAACTCCACGACGGAGGATATCGTACCCACA
* *
371763 CATCCACGGTTTCAACTTCACGA
1 CATCCACGATTTCAACTCCACGA
371786 TGAAGGGAAT
Statistics
Matches: 57, Mismatches: 9, Indels: 0
0.86 0.14 0.00
Matches are distributed among these distances:
43 57 1.00
ACGTcount: A:0.27, C:0.32, G:0.19, T:0.22
Consensus pattern (43 bp):
CATCCACGATTTCAACTCCACGACGGAGGATATCGTACCCACA
Found at i:372102 original size:43 final size:43
Alignment explanation
Indices: 372011--372121 Score: 127
Period size: 43 Copynumber: 2.6 Consensus size: 43
372001 ATGAATGAGT
* * * * *
372011 CATCCGCGATTTAAACTCCACGACGGAGGATATCGTACCCGCG
1 CATCCACGATTTCAATTCCACGACGGAGGATATCGTACCCACA
* *
372054 GATCCACGATTTCAATTCCACGACGGAGGATATCGTGCCCACA
1 CATCCACGATTTCAATTCCACGACGGAGGATATCGTACCCACA
372097 CATCCACTG-TTTCAACTT-CACGACG
1 CATCCAC-GATTTCAA-TTCCACGACG
372122 AAGGGAATCG
Statistics
Matches: 58, Mismatches: 8, Indels: 4
0.83 0.11 0.06
Matches are distributed among these distances:
43 55 0.95
44 3 0.05
ACGTcount: A:0.26, C:0.32, G:0.20, T:0.22
Consensus pattern (43 bp):
CATCCACGATTTCAATTCCACGACGGAGGATATCGTACCCACA
Found at i:372168 original size:334 final size:335
Alignment explanation
Indices: 371386--372243 Score: 1459
Period size: 335 Copynumber: 2.6 Consensus size: 335
371376 CGAAGGAGTC
*
371386 ATCCGCGATTTCAACTCCACGACGGAGGATATCGTGCCCACACATCCACGGTTT-AACCTTCACG
1 ATCCACGATTTCAACTCCACGACGGAGGATATCGTGCCCACACATCCACGGTTTCAA-CTTCACG
371450 ACGAAGGGAATCGTACACACAAGCAGCATTCATCTCTAGATTGGATTTCAACTTCACGACGAAGG
65 ACGAAGGGAATCGTACACACAAGCAGCATTCATCTCTAGATTGGATTTCAACTTCACGACGAAGG
*
371515 ATATCCAACTCAAAGAAGGAGTGTCTGTCAATAAACTTTCCAGTTTCAGAGTCAATTTCAACTTC
130 ATATCCAACTCAAAGAAGGAGTGTCTGTCAACAAACTTTCCAGTTTCAGAGTCAATTTCAACTTC
371580 ACGGCGAAGGATATTGGACTCGAAACAACACAAGCTTGGATTTCAACTTCACGACGAAGGATATT
195 ACGGCGAAGGATATTGGACTCGAAACAACACAAGCTTGGATTTCAACTTCACGACGAAGGATATT
* *
371645 CAAGTCAAGGCTCAACTTCAAGACGAAGGAGTCATCCGCGATTTCAACTCCACGACGGAGGATAT
260 CAAGTCAAGGCTCAACTCCAAGACGAAGGAGTCATCCGCGATTTAAACTCCACGACGGAGGATAT
*
371710 CGTACCCATGG
325 CGTACCCACGG
*
371721 ATCCACGATTTCAACTCCACGACGGAGGATATTGTGCCCACACATCCACGGTTTCAACTTCACGA
1 ATCCACGATTTCAACTCCACGACGGAGGATATCGTGCCCACACATCCACGGTTTCAACTTCACGA
* * * * *
371786 TGAAGGGAATCGTACAGATAAGCATCATTCATCTCTAGATTAGATTTCAACTTCACGACGAAGGA
66 CGAAGGGAATCGTACACACAAGCAGCATTCATCTCTAGATTGGATTTCAACTTCACGACGAAGGA
*
371851 TATCCAACTCAAAGAAGGAGTGTTTGTCAACAAACTTTCCAGTTTCAGAGTCAATTTCAACTTCA
131 TATCCAACTCAAAGAAGGAGTGTCTGTCAACAAACTTTCCAGTTTCAGAGTCAATTTCAACTTCA
* * *
371916 TGGCGAAGGATATTGGACTCGAAACATCACAAGCTTGGATTTCAACTTCATGACGAAGGATATTC
196 CGGCGAAGGATATTGGACTCGAAACAACACAAGCTTGGATTTCAACTTCACGACGAAGGATATTC
* * * *
371981 AAGTTAA-GCTCAACTCCACGATGAATGAGTCATCCGCGATTTAAACTCCACGACGGAGGATATC
261 AAGTCAAGGCTCAACTCCAAGACGAAGGAGTCATCCGCGATTTAAACTCCACGACGGAGGATATC
*
372045 GTACCCGCGG
326 GTACCCACGG
* *
372055 ATCCACGATTTCAATTCCACGACGGAGGATATCGTGCCCACACATCCACTGTTTCAACTTCACGA
1 ATCCACGATTTCAACTCCACGACGGAGGATATCGTGCCCACACATCCACGGTTTCAACTTCACGA
* *
372120 CGAAGGGAATCGTATACACAAGCAGCATTCATCTCTAGATTGGATTTCAACTTCACGAAGAAGGA
66 CGAAGGGAATCGTACACACAAGCAGCATTCATCTCTAGATTGGATTTCAACTTCACGACGAAGGA
* *
372185 TATCCAACTCAAAGAATGAGTGTCTGTCAACAAACTTTCCAGTTTCAGAGTCAACTTCA
131 TATCCAACTCAAAGAAGGAGTGTCTGTCAACAAACTTTCCAGTTTCAGAGTCAATTTCA
372244 CAGTAAAGGA
Statistics
Matches: 489, Mismatches: 33, Indels: 3
0.93 0.06 0.01
Matches are distributed among these distances:
334 236 0.48
335 251 0.51
336 2 0.00
ACGTcount: A:0.32, C:0.25, G:0.19, T:0.24
Consensus pattern (335 bp):
ATCCACGATTTCAACTCCACGACGGAGGATATCGTGCCCACACATCCACGGTTTCAACTTCACGA
CGAAGGGAATCGTACACACAAGCAGCATTCATCTCTAGATTGGATTTCAACTTCACGACGAAGGA
TATCCAACTCAAAGAAGGAGTGTCTGTCAACAAACTTTCCAGTTTCAGAGTCAATTTCAACTTCA
CGGCGAAGGATATTGGACTCGAAACAACACAAGCTTGGATTTCAACTTCACGACGAAGGATATTC
AAGTCAAGGCTCAACTCCAAGACGAAGGAGTCATCCGCGATTTAAACTCCACGACGGAGGATATC
GTACCCACGG
Found at i:372523 original size:121 final size:121
Alignment explanation
Indices: 372282--372625 Score: 519
Period size: 121 Copynumber: 2.9 Consensus size: 121
372272 GCAACTTATA
* * * * * * * *
372282 TTGGATTTTAACTTCACGACGAATGATATCCAATTCCAGGCTCAACTTCACAATGAAGGATCCAT
1 TTGGATTTCAACTTCACGACGAATGATATCCAATTCAAAGCTCAATTTCACGACGAATGAGCCAT
* * *
372347 CC-CGATTTCAACTTCACGAAGAATAATATCGTACCCACAAGTAGCAATGCAACCC
66 CCACGATTTCAACTTCACGAAGAATGATATCGTGCCCACAAGCAGCAATGCAACCC
* * *
372402 TTGGATTTCAACTTCACGACAAATGATATCCAATTCAAAGCTCAATTTCATGACGAATAAGCCAT
1 TTGGATTTCAACTTCACGACGAATGATATCCAATTCAAAGCTCAATTTCACGACGAATGAGCCAT
* *
372467 CCACGATTTCAACTTCACGATGAAGGATATCGTGCCCACAAGCAGCAATGCAACCC
66 CCACGATTTCAACTTCACGAAGAATGATATCGTGCCCACAAGCAGCAATGCAACCC
* *
372523 TTGGATTTCAACTTCACGACGAAGGATATCCAATTCAAAGCTCAATTTCACGACGAATGAGCCAC
1 TTGGATTTCAACTTCACGACGAATGATATCCAATTCAAAGCTCAATTTCACGACGAATGAGCCAT
372588 CCACGATTTCAACTTCACGAAGAATGATATCGTGCCCA
66 CCACGATTTCAACTTCACGAAGAATGATATCGTGCCCA
372626 ATGGATCGAC
Statistics
Matches: 200, Mismatches: 23, Indels: 1
0.89 0.10 0.00
Matches are distributed among these distances:
120 56 0.28
121 144 0.72
ACGTcount: A:0.34, C:0.26, G:0.15, T:0.24
Consensus pattern (121 bp):
TTGGATTTCAACTTCACGACGAATGATATCCAATTCAAAGCTCAATTTCACGACGAATGAGCCAT
CCACGATTTCAACTTCACGAAGAATGATATCGTGCCCACAAGCAGCAATGCAACCC
Found at i:372821 original size:40 final size:40
Alignment explanation
Indices: 372766--372872 Score: 169
Period size: 40 Copynumber: 2.7 Consensus size: 40
372756 TGGCATGCAA
* *
372766 TCCTCATCACGTAGGAACCGTGTCATCCCTTGACTAGGTC
1 TCCTCATCACGTAGGAACCGTGTCATCCCTCGAATAGGTC
* *
372806 TCCTCATCACGTAGGAACCATGTCATCCCTCGAATATGTC
1 TCCTCATCACGTAGGAACCGTGTCATCCCTCGAATAGGTC
*
372846 TCCTCATCACGTAGGAACTGTGTCATC
1 TCCTCATCACGTAGGAACCGTGTCATC
372873 ATCCTTTAGA
Statistics
Matches: 61, Mismatches: 6, Indels: 0
0.91 0.09 0.00
Matches are distributed among these distances:
40 61 1.00
ACGTcount: A:0.22, C:0.32, G:0.18, T:0.28
Consensus pattern (40 bp):
TCCTCATCACGTAGGAACCGTGTCATCCCTCGAATAGGTC
Found at i:373003 original size:3 final size:3
Alignment explanation
Indices: 372997--373022 Score: 52
Period size: 3 Copynumber: 8.7 Consensus size: 3
372987 CTTAAAAAAA
372997 TAT TAT TAT TAT TAT TAT TAT TAT TA
1 TAT TAT TAT TAT TAT TAT TAT TAT TA
373023 CAACATTTAC
Statistics
Matches: 23, Mismatches: 0, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
3 23 1.00
ACGTcount: A:0.35, C:0.00, G:0.00, T:0.65
Consensus pattern (3 bp):
TAT
Found at i:374203 original size:30 final size:29
Alignment explanation
Indices: 374148--374207 Score: 77
Period size: 29 Copynumber: 2.0 Consensus size: 29
374138 TTGACACTTT
*
374148 AGTTTCTGTTATTTTATTTTAGTCATTTA
1 AGTTTATGTTATTTTATTTTAGTCATTTA
*
374177 AGTTTATGTTTTTGTTA-TTTATGTCATTTA
1 AGTTTATGTTATT-TTATTTTA-GTCATTTA
374207 A
1 A
374208 ATTTCTATTT
Statistics
Matches: 27, Mismatches: 2, Indels: 3
0.84 0.06 0.09
Matches are distributed among these distances:
29 15 0.56
30 12 0.44
ACGTcount: A:0.22, C:0.05, G:0.12, T:0.62
Consensus pattern (29 bp):
AGTTTATGTTATTTTATTTTAGTCATTTA
Found at i:375761 original size:24 final size:24
Alignment explanation
Indices: 375717--375763 Score: 60
Period size: 24 Copynumber: 2.0 Consensus size: 24
375707 ATAAAGAACC
*
375717 AAAATAAACTTAAATATACCATTA
1 AAAATAAACTTAAACATACCATTA
*
375741 AAAATAAAGTTTAAACA-ACCATT
1 AAAATAAA-CTTAAACATACCATT
375764 CAACCAACCA
Statistics
Matches: 20, Mismatches: 2, Indels: 2
0.83 0.08 0.08
Matches are distributed among these distances:
24 14 0.70
25 6 0.30
ACGTcount: A:0.57, C:0.13, G:0.02, T:0.28
Consensus pattern (24 bp):
AAAATAAACTTAAACATACCATTA
Found at i:378958 original size:20 final size:20
Alignment explanation
Indices: 378935--378977 Score: 61
Period size: 20 Copynumber: 2.2 Consensus size: 20
378925 GAGAAAAGGT
*
378935 AAAATTTAA-AATGAAAGAG
1 AAAAATTAATAATGAAAGAG
*
378954 AAAAATTAATAATGAAAGAT
1 AAAAATTAATAATGAAAGAG
378974 AAAA
1 AAAA
378978 GAAAAAGTTA
Statistics
Matches: 21, Mismatches: 2, Indels: 1
0.88 0.08 0.04
Matches are distributed among these distances:
19 8 0.38
20 13 0.62
ACGTcount: A:0.67, C:0.00, G:0.12, T:0.21
Consensus pattern (20 bp):
AAAAATTAATAATGAAAGAG
Found at i:385875 original size:24 final size:24
Alignment explanation
Indices: 385831--385877 Score: 60
Period size: 24 Copynumber: 2.0 Consensus size: 24
385821 ATAAAGAACC
*
385831 AAAATAAACTTAAATATACCATTA
1 AAAATAAACTTAAACATACCATTA
*
385855 AAAATAAAGTTTAAACA-ACCATT
1 AAAATAAA-CTTAAACATACCATT
385878 CAACCAACCA
Statistics
Matches: 20, Mismatches: 2, Indels: 2
0.83 0.08 0.08
Matches are distributed among these distances:
24 14 0.70
25 6 0.30
ACGTcount: A:0.57, C:0.13, G:0.02, T:0.28
Consensus pattern (24 bp):
AAAATAAACTTAAACATACCATTA
Found at i:393637 original size:23 final size:24
Alignment explanation
Indices: 393611--393687 Score: 58
Period size: 23 Copynumber: 3.2 Consensus size: 24
393601 TTTGAAATTA
393611 TAAAAT-TTTAAAAAATGTAAAAT
1 TAAAATATTTAAAAAATGTAAAAT
*
393634 T-AAATCA-TTAATAAAA-ATAAAA-
1 TAAAAT-ATTTAA-AAAATGTAAAAT
393656 TAAAATATTTAAACAATATG-AAAATT
1 TAAAATATTTAAA-AA-ATGTAAAA-T
393682 TAAAAT
1 TAAAAT
393688 TTCTATGATG
Statistics
Matches: 42, Mismatches: 2, Indels: 17
0.69 0.03 0.28
Matches are distributed among these distances:
22 7 0.17
23 20 0.48
24 9 0.21
26 6 0.14
ACGTcount: A:0.62, C:0.03, G:0.03, T:0.32
Consensus pattern (24 bp):
TAAAATATTTAAAAAATGTAAAAT
Found at i:398150 original size:155 final size:157
Alignment explanation
Indices: 397865--398178 Score: 596
Period size: 155 Copynumber: 2.0 Consensus size: 157
397855 CAGTGAACGA
397865 TTGATCGAACCTATACTAGCAATCAACAACAACAAGGTGGCCGTTTTTGCCACATAACTGACATT
1 TTGATCGAACCTATACTAGCAAT--ACAACAACAAGGTGGCCGTTTTTGCCACATAACTGACATT
397930 GAACCCGTGGTCAACCACGACCTCGTCCTCCAGTTCTGCCACCAGCATTGGTTCCAGATTATCCC
64 GAACCCGTGGTCAACCACGACCTCGTCCTCCAGTTCTGCCACCAGCATTGGTTCCAGATTATCCC
397995 AAAGA-CGATCATGAAATGTGTGACTAGT
129 AAAGATCGATCATGAAATGTGTGACTAGT
398023 TTGATCGAACCTATACTAGCAAT-CAACAACAAGGTGGCCGTTTTTGCCACATAACTGACATTGA
1 TTGATCGAACCTATACTAGCAATACAACAACAAGGTGGCCGTTTTTGCCACATAACTGACATTGA
398087 ACCCGTGGTCAACCACGACCTCGTCCTCCAGTTCTGCCACCAGCATTGGTTCCAGATTATCCCAA
66 ACCCGTGGTCAACCACGACCTCGTCCTCCAGTTCTGCCACCAGCATTGGTTCCAGATTATCCCAA
398152 AGATCGATCATGAAATGTGTGACTAGT
131 AGATCGATCATGAAATGTGTGACTAGT
398179 GGTCTTCGAG
Statistics
Matches: 155, Mismatches: 0, Indels: 4
0.97 0.00 0.03
Matches are distributed among these distances:
155 109 0.70
156 23 0.15
158 23 0.15
ACGTcount: A:0.29, C:0.28, G:0.18, T:0.25
Consensus pattern (157 bp):
TTGATCGAACCTATACTAGCAATACAACAACAAGGTGGCCGTTTTTGCCACATAACTGACATTGA
ACCCGTGGTCAACCACGACCTCGTCCTCCAGTTCTGCCACCAGCATTGGTTCCAGATTATCCCAA
AGATCGATCATGAAATGTGTGACTAGT
Found at i:399724 original size:17 final size:17
Alignment explanation
Indices: 399683--399727 Score: 54
Period size: 17 Copynumber: 2.6 Consensus size: 17
399673 CCTTACTTGA
399683 TTAAATATTTAATAAAT
1 TTAAATATTTAATAAAT
** **
399700 TTTTATATTTTTTAAAT
1 TTAAATATTTAATAAAT
399717 TTAAATATTTA
1 TTAAATATTTA
399728 TTTTTACATG
Statistics
Matches: 21, Mismatches: 7, Indels: 0
0.75 0.25 0.00
Matches are distributed among these distances:
17 21 1.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.00, G:0.00, T:0.58
Consensus pattern (17 bp):
TTAAATATTTAATAAAT
Found at i:403660 original size:23 final size:23
Alignment explanation
Indices: 403630--403680 Score: 93
Period size: 23 Copynumber: 2.2 Consensus size: 23
403620 GTTAAGAGGA
403630 TGCAGGAAAGGAAAGAAATGGAG
1 TGCAGGAAAGGAAAGAAATGGAG
*
403653 TGCAGGAAAGGAAAGAAATGGGG
1 TGCAGGAAAGGAAAGAAATGGAG
403676 TGCAG
1 TGCAG
403681 TTGCCACTAG
Statistics
Matches: 27, Mismatches: 1, Indels: 0
0.96 0.04 0.00
Matches are distributed among these distances:
23 27 1.00
ACGTcount: A:0.43, C:0.06, G:0.41, T:0.10
Consensus pattern (23 bp):
TGCAGGAAAGGAAAGAAATGGAG
Found at i:405888 original size:2 final size:2
Alignment explanation
Indices: 405881--405931 Score: 102
Period size: 2 Copynumber: 25.5 Consensus size: 2
405871 TTTCAAATCC
405881 AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT
1 AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT
405923 AT AT AT AT A
1 AT AT AT AT A
405932 AATCTGCCCC
Statistics
Matches: 49, Mismatches: 0, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
2 49 1.00
ACGTcount: A:0.51, C:0.00, G:0.00, T:0.49
Consensus pattern (2 bp):
AT
Found at i:414777 original size:83 final size:83
Alignment explanation
Indices: 414674--414831 Score: 226
Period size: 83 Copynumber: 1.9 Consensus size: 83
414664 TTATTATCTA
* ** * *
414674 TTTAAGTTTAGATATTAAAAGAGTTTTGGTTGGAGTAAAACACTCAGGTTTAATATTATAAATTT
1 TTTAAATTTAGATATTAAAAGAGTTTTAATTAGAGTAAAACACTCAGATTTAATATTATAAATTT
414739 AAAAGATATTTTAATTTG
66 AAAAGATATTTTAATTTG
* * * *
414757 TTTAAATTTAGATATTAAAAGAGTTTTAATTATAGTAAAACTCTCAGATTTAATATTTTATATTT
1 TTTAAATTTAGATATTAAAAGAGTTTTAATTAGAGTAAAACACTCAGATTTAATATTATAAATTT
*
414822 AAAATATATT
66 AAAAGATATT
414832 ATTATCTATT
Statistics
Matches: 65, Mismatches: 10, Indels: 0
0.87 0.13 0.00
Matches are distributed among these distances:
83 65 1.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.04, G:0.11, T:0.44
Consensus pattern (83 bp):
TTTAAATTTAGATATTAAAAGAGTTTTAATTAGAGTAAAACACTCAGATTTAATATTATAAATTT
AAAAGATATTTTAATTTG
Found at i:416875 original size:20 final size:21
Alignment explanation
Indices: 416850--416924 Score: 75
Period size: 24 Copynumber: 3.6 Consensus size: 21
416840 TTTGAGGTAG
416850 GTATCGATACACT-CTATAGT
1 GTATCGATACACTACTATAGT
* * *
416870 GTATCGATACATTCCTTAACATGT
1 GTATCGATACACTAC-T-ATA-GT
416894 GTATCGATACACTACT-TA-T
1 GTATCGATACACTACTATAGT
416913 GTATCGATACAC
1 GTATCGATACAC
416925 AAATTGCATT
Statistics
Matches: 46, Mismatches: 5, Indels: 9
0.77 0.08 0.15
Matches are distributed among these distances:
19 13 0.28
20 12 0.26
21 2 0.04
22 1 0.02
23 3 0.07
24 15 0.33
ACGTcount: A:0.31, C:0.21, G:0.13, T:0.35
Consensus pattern (21 bp):
GTATCGATACACTACTATAGT
Found at i:417043 original size:19 final size:19
Alignment explanation
Indices: 417019--417091 Score: 146
Period size: 19 Copynumber: 3.8 Consensus size: 19
417009 ATTTTAAGGA
417019 GTGTATCGATACACTTCCT
1 GTGTATCGATACACTTCCT
417038 GTGTATCGATACACTTCCT
1 GTGTATCGATACACTTCCT
417057 GTGTATCGATACACTTCCT
1 GTGTATCGATACACTTCCT
417076 GTGTATCGATACACTT
1 GTGTATCGATACACTT
417092 TGAATATTTT
Statistics
Matches: 54, Mismatches: 0, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
19 54 1.00
ACGTcount: A:0.22, C:0.25, G:0.16, T:0.37
Consensus pattern (19 bp):
GTGTATCGATACACTTCCT
Found at i:417050 original size:63 final size:64
Alignment explanation
Indices: 416892--417051 Score: 241
Period size: 64 Copynumber: 2.5 Consensus size: 64
416882 TCCTTAACAT
* * * *
416892 GTGTATCGATACACTACTTATGTATCGATACACAAATTGCATTCGATGTTTTTATTTACAAGGA
1 GTGTATCGATACACTTCCTATGTATCGATACACAAATTGCATTCAATGTTTTCATTTACAAGGA
* * *
416956 GTGTATCGATACACTTTCTATGTATCAATACACAAATTGCATTCAATGTTTTCATTT-TAAGGA
1 GTGTATCGATACACTTCCTATGTATCGATACACAAATTGCATTCAATGTTTTCATTTACAAGGA
*
417019 GTGTATCGATACACTTCCTGTGTATCGATACAC
1 GTGTATCGATACACTTCCTATGTATCGATACAC
417052 TTCCTGTGTA
Statistics
Matches: 86, Mismatches: 10, Indels: 1
0.89 0.10 0.01
Matches are distributed among these distances:
63 35 0.41
64 51 0.59
ACGTcount: A:0.30, C:0.17, G:0.15, T:0.38
Consensus pattern (64 bp):
GTGTATCGATACACTTCCTATGTATCGATACACAAATTGCATTCAATGTTTTCATTTACAAGGA
Found at i:419880 original size:323 final size:322
Alignment explanation
Indices: 419293--419912 Score: 1159
Period size: 323 Copynumber: 1.9 Consensus size: 322
419283 TTTTGTCCAC
*
419293 CCAAATTTCCTGCACAAGCACCAGTAGCACTGTTGGTTTCGAAAAAGATAAATCAAGGAATTAAA
1 CCAAATTTCCTGCACAAGCACCAGTAGCACTGTTGGTATCGAAAAAGATAAATCAAGGAATTAAA
*
419358 CTATTTTCTCTATTTGTTATGTCAAATGTAGAACAAGATAAATATGTTATAAGAAGTCCGTTCCT
66 CCATTTTCTCTATTTGTTATGTCAAATGTAGAACAAGATAAATATGTTATAAGAAGTCCGTTCCT
*
419423 CAAATTTAAAACTGAAAAAAATACACAAATTGGTAACAAGAACATAGCGAAGAAAGTGATTTATA
131 CAAATTTAAAACTGAAAAAAATACACAAATTAGTAACAAGAACATAGCGAAGAAAGTGATTTATA
419488 AAAGAAAAGGCAACACTTTTTCAATAGAAAAGAAGCTGCAAATAAACAGGACATCATTTTGACAT
196 AAAGAAAAGGCAACACTTTTTCAATAGAAAAGAAGCTGCAAATAAACAGGACATCATTTTGACAT
419553 GGGTTAGGCATCAACAAGCTTAAAATAACAGATAACTGGTCCTCTGGTTACCTATCATTAAG
261 GGGTTAGGCATCAACAAGCTTAAAATAACAGATAACTGGTCCTCTGGTTACCTATCATTAAG
*
419615 CCAAATTTCCTGCACAAGCACCAGTAGCACTGTTGGTATCGAAAAAGATAAATCAATGAATTAAA
1 CCAAATTTCCTGCACAAGCACCAGTAGCACTGTTGGTATCGAAAAAGATAAATCAAGGAATTAAA
* *
419680 CCATTTTCTCTATTTGTTCTGTCAAATGTAGAACAAGATAAAATATGTTATAAGAAGTTCGTTCC
66 CCATTTTCTCTATTTGTTATGTCAAATGTAGAACAAGAT-AAATATGTTATAAGAAGTCCGTTCC
* *
419745 TCAAATTTAAAACTGAAAAAAATACACAAATTAGTAACAAGAACATAGTGAATAAAGTGATTTAT
130 TCAAATTTAAAACTGAAAAAAATACACAAATTAGTAACAAGAACATAGCGAAGAAAGTGATTTAT
419810 AAAAGAAAAGGCAACACTTTTTCAATAGAAAAGAAGCTGCAAATAAACAGGACATCATTTTGACA
195 AAAAGAAAAGGCAACACTTTTTCAATAGAAAAGAAGCTGCAAATAAACAGGACATCATTTTGACA
419875 TGGGTTAGGCATCAACAAGCTTAAAATAACAGATAACT
260 TGGGTTAGGCATCAACAAGCTTAAAATAACAGATAACT
419913 AATAACAAAA
Statistics
Matches: 289, Mismatches: 8, Indels: 1
0.97 0.03 0.00
Matches are distributed among these distances:
322 100 0.35
323 189 0.65
ACGTcount: A:0.43, C:0.15, G:0.15, T:0.27
Consensus pattern (322 bp):
CCAAATTTCCTGCACAAGCACCAGTAGCACTGTTGGTATCGAAAAAGATAAATCAAGGAATTAAA
CCATTTTCTCTATTTGTTATGTCAAATGTAGAACAAGATAAATATGTTATAAGAAGTCCGTTCCT
CAAATTTAAAACTGAAAAAAATACACAAATTAGTAACAAGAACATAGCGAAGAAAGTGATTTATA
AAAGAAAAGGCAACACTTTTTCAATAGAAAAGAAGCTGCAAATAAACAGGACATCATTTTGACAT
GGGTTAGGCATCAACAAGCTTAAAATAACAGATAACTGGTCCTCTGGTTACCTATCATTAAG
Found at i:420268 original size:17 final size:17
Alignment explanation
Indices: 420246--420280 Score: 70
Period size: 17 Copynumber: 2.1 Consensus size: 17
420236 AAATCCATTC
420246 GATAAGAGATTTGAACT
1 GATAAGAGATTTGAACT
420263 GATAAGAGATTTGAACT
1 GATAAGAGATTTGAACT
420280 G
1 G
420281 CTGAACATGC
Statistics
Matches: 18, Mismatches: 0, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
17 18 1.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.06, G:0.26, T:0.29
Consensus pattern (17 bp):
GATAAGAGATTTGAACT
Found at i:426816 original size:7 final size:7
Alignment explanation
Indices: 426804--439983 Score: 22589
Period size: 7 Copynumber: 1924.7 Consensus size: 7
426794 TGCACAATCT
426804 GGGTTTA
1 GGGTTTA
426811 GGGTTTA
1 GGGTTTA
426818 GGGTTTA
1 GGGTTTA
426825 GGGTTTA
1 GGGTTTA
426832 GGGTTTA
1 GGGTTTA
426839 GGGTTTA
1 GGGTTTA
426846 GGGTTTA
1 GGGTTTA
426853 GGGTTTA
1 GGGTTTA
426860 GGGTTTA
1 GGGTTTA
426867 GGGTTTA
1 GGGTTTA
426874 -GGTTTA
1 GGGTTTA
426880 GGGTTTA
1 GGGTTTA
426887 GGGTTTA
1 GGGTTTA
426894 GGG-TTA
1 GGGTTTA
426900 GGGTTTA
1 GGGTTTA
426907 GGGTTTA
1 GGGTTTA
426914 GGGTTTA
1 GGGTTTA
426921 GGGTTTA
1 GGGTTTA
426928 GGGTTTA
1 GGGTTTA
426935 GGGTTTA
1 GGGTTTA
426942 GGGTTTA
1 GGGTTTA
426949 GGGTTTA
1 GGGTTTA
426956 GGGTTTA
1 GGGTTTA
426963 GGGTTTA
1 GGGTTTA
426970 GGGTTTA
1 GGGTTTA
426977 GGGTTTA
1 GGGTTTA
426984 GGGTTTA
1 GGGTTTA
426991 GGGTTTA
1 GGGTTTA
426998 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427005 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427012 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427019 -GG-TTA
1 GGGTTTA
427024 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427031 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427038 -GGTTTA
1 GGGTTTA
427044 -GGTTTA
1 GGGTTTA
427050 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427057 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427064 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427071 -GGTTTA
1 GGGTTTA
427077 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427084 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427091 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427098 -GGTTTA
1 GGGTTTA
427104 GGGTTTTTA
1 GGG--TTTA
427113 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427120 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
427127 GGGTTGA
1 GGGTTTA
427134 -GGTTTA
1 GGGTTTA
427140 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427147 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427154 -GGTTTA
1 GGGTTTA
427160 GGG-TTA
1 GGGTTTA
427166 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427173 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427180 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427187 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427194 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427201 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427208 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427215 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427222 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427229 GGG--TA
1 GGGTTTA
427234 GGG-TTA
1 GGGTTTA
427240 -GGTTTA
1 GGGTTTA
427246 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427253 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427260 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427267 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427274 GGG-TTA
1 GGGTTTA
427280 GGG-TTA
1 GGGTTTA
427286 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427293 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427300 GGG-TTA
1 GGGTTTA
427306 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427313 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427320 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427327 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427334 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427341 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427348 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427355 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427362 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427369 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427376 GGG-TT-
1 GGGTTTA
427381 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427388 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427395 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427402 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427409 -GGTTTA
1 GGGTTTA
427415 GGG-TTA
1 GGGTTTA
427421 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427428 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427435 GGG-TTA
1 GGGTTTA
427441 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427448 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427455 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427462 -GGTTTA
1 GGGTTTA
427468 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427475 -GGTTTA
1 GGGTTTA
427481 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427488 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427495 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427502 GGG-TTA
1 GGGTTTA
427508 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427515 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427522 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427529 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427536 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427543 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427550 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427557 -GGTTTA
1 GGGTTTA
427563 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427570 -GGTTTA
1 GGGTTTA
427576 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427583 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427590 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427597 GGG-TTA
1 GGGTTTA
427603 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427610 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427617 -GGTTTA
1 GGGTTTA
427623 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427630 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427637 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427644 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427651 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427658 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427665 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427672 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427679 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427686 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427693 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427700 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427707 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427714 GGG-TTA
1 GGGTTTA
427720 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427727 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427734 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427741 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427748 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427755 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427762 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427769 -GGTTTA
1 GGGTTTA
427775 GGG-TTA
1 GGGTTTA
427781 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427788 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427795 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427802 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427809 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427816 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427823 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427830 -GGTTTA
1 GGGTTTA
427836 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427843 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427850 -GGTTT-
1 GGGTTTA
427855 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427862 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427869 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427876 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427883 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427890 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427897 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427904 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427911 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427918 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427925 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427932 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427939 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
427946 GGGTTTT
1 GGGTTTA
427953 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427960 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427967 GGGTTTA
1 GGGTTTA
427974 GGG-TTA
1 GGGTTTA
427980 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
427987 GGG-TGA
1 GGGTTTA
427993 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428000 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428007 -GGTTTA
1 GGGTTTA
428013 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428020 GGG-TTA
1 GGGTTTA
428026 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428033 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428040 GGGTTTA
1 GGGTTTA
**
428047 GGGTTGG
1 GGGTTTA
428054 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428061 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428068 GGG-TTA
1 GGGTTTA
428074 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428081 GGG-TTA
1 GGGTTTA
428087 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428094 -GGTTTA
1 GGGTTTA
428100 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428107 -GGTTTA
1 GGGTTTA
428113 GGG-TTA
1 GGGTTTA
428119 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428126 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428133 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428140 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428147 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428154 GGGTTTTA
1 GGG-TTTA
428162 GGGTTTTA
1 GGG-TTTA
428170 GGG-TTA
1 GGGTTTA
428176 GGGTTT-
1 GGGTTTA
428182 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428189 GGG--TA
1 GGGTTTA
428194 GGG-TTA
1 GGGTTTA
428200 -GGTTTA
1 GGGTTTA
428206 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428213 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428220 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428227 -GGTTTA
1 GGGTTTA
428233 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428240 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428247 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428254 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428261 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428268 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428275 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428282 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428289 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428296 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428303 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428310 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428317 -GGTTTA
1 GGGTTTA
428323 GGGTTTTTTA
1 GGG---TTTA
428333 GGG-TTA
1 GGGTTTA
428339 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428346 GGG-TTA
1 GGGTTTA
428352 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428359 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428366 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428373 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428380 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428387 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428394 GGG-TTA
1 GGGTTTA
428400 GGG-TTA
1 GGGTTTA
428406 GGG-TT-
1 GGGTTTA
428411 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428418 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428425 -GGTTTA
1 GGGTTTA
428431 GGG-TTA
1 GGGTTTA
428437 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428444 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428451 GGG-TTA
1 GGGTTTA
428457 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428464 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428471 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428478 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428485 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428492 GGG-TTA
1 GGGTTTA
428498 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428505 -GGTTTA
1 GGGTTTA
428511 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428518 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428525 GGG-TTA
1 GGGTTTA
428531 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428538 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428545 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428552 -GGTTTA
1 GGGTTTA
428558 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428565 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428572 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428579 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428586 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428593 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428600 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428607 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428614 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428621 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428628 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428635 GGG-TTA
1 GGGTTTA
428641 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428648 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428655 -GG-TTA
1 GGGTTTA
428660 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428667 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428674 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428681 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428688 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428695 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428702 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428709 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428716 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428723 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428730 GGG-TT-
1 GGGTTTA
*
428735 GGGGTTA
1 GGGTTTA
428742 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428749 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428756 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428763 GGG-TTA
1 GGGTTTA
428769 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428776 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428783 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428790 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428797 GGGTTT-
1 GGGTTTA
428803 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428810 GGG-TTA
1 GGGTTTA
428816 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428823 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428830 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428837 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
428844 GGTTTTA
1 GGGTTTA
428851 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428858 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428865 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428872 GGG-TTA
1 GGGTTTA
428878 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428885 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428892 -GG-TTA
1 GGGTTTA
428897 GGGTTT-
1 GGGTTTA
428903 GGGTTTTA
1 GGG-TTTA
428911 GGG-TTA
1 GGGTTTA
428917 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428924 GGG-TTA
1 GGGTTTA
428930 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428937 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428944 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428951 -GGTTTA
1 GGGTTTA
428957 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428964 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428971 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428978 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428985 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428992 GGGTTTA
1 GGGTTTA
428999 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429006 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429013 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429020 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429027 -GGTTTA
1 GGGTTTA
429033 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429040 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429047 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429054 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429061 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429068 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429075 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429082 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429089 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429096 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429103 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429110 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429117 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429124 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429131 -GGTTTA
1 GGGTTTA
429137 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429144 -GGTTTA
1 GGGTTTA
429150 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429157 GGG-TTA
1 GGGTTTA
429163 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429170 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429177 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429184 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429191 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429198 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429205 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429212 -GGTTTA
1 GGGTTTA
429218 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429225 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429232 -GGTTTA
1 GGGTTTA
429238 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429245 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429252 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429259 -GGTTTA
1 GGGTTTA
429265 -GGTTTA
1 GGGTTTA
429271 GGG-TTA
1 GGGTTTA
429277 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429284 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429291 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429298 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429305 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429312 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429319 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429326 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429333 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429340 -GGTTTA
1 GGGTTTA
429346 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429353 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429360 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429367 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429374 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429381 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429388 -GGTTTA
1 GGGTTTA
429394 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429401 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429408 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429415 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429422 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429429 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429436 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429443 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429450 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429457 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429464 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429471 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429478 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429485 -GGTTTA
1 GGGTTTA
429491 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429498 GGG-TTA
1 GGGTTTA
429504 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429511 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429518 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429525 GGGTTTTTTA
1 GGG---TTTA
429535 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429542 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429549 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429556 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429563 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429570 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429577 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429584 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429591 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429598 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429605 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429612 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429619 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429626 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429633 GGGTTTTA
1 GGG-TTTA
429641 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429648 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429655 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429662 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429669 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429676 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429683 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429690 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429697 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429704 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429711 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429718 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429725 GGGTTTTTTA
1 GGG---TTTA
429735 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429742 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429749 GGG-TTA
1 GGGTTTA
429755 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429762 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429769 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429776 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429783 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429790 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429797 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429804 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429811 GGG-TTA
1 GGGTTTA
429817 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429824 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429831 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429838 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429845 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429852 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429859 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429866 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429873 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429880 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429887 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429894 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429901 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429908 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429915 GGG-TT-
1 GGGTTTA
429920 GGG-TTA
1 GGGTTTA
429926 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429933 GGG-TTA
1 GGGTTTA
429939 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429946 GGG-TT-
1 GGGTTTA
429951 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429958 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429965 GGG-TTA
1 GGGTTTA
429971 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429978 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429985 GGGTTTA
1 GGGTTTA
429992 GGG-TTA
1 GGGTTTA
429998 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430005 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430012 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430019 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430026 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430033 -GGTTTA
1 GGGTTTA
430039 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430046 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430053 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430060 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430067 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430074 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430081 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430088 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430095 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430102 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430109 -GGTTTA
1 GGGTTTA
430115 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430122 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430129 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430136 GGG-TTA
1 GGGTTTA
430142 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430149 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430156 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430163 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430170 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430177 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430184 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430191 GGG-TTA
1 GGGTTTA
430197 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430204 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430211 GGGTTTTTTA
1 GGG---TTTA
430221 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430228 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430235 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430242 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430249 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430256 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430263 GGG-TTA
1 GGGTTTA
430269 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430276 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430283 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430290 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430297 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430304 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430311 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430318 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430325 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430332 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430339 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430346 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430353 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430360 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430367 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430374 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430381 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430388 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430395 GGGTTT-
1 GGGTTTA
430401 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430408 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430415 GGGTTT-
1 GGGTTTA
430421 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430428 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430435 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430442 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430449 -GGTTTA
1 GGGTTTA
430455 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430462 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430469 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430476 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430483 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430490 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430497 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430504 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430511 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430518 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430525 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430532 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430539 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430546 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430553 GGG-TTA
1 GGGTTTA
430559 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430566 -GGTTTA
1 GGGTTTA
430572 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430579 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430586 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430593 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430600 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430607 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430614 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430621 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430628 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430635 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430642 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430649 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430656 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430663 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430670 GGG-TTA
1 GGGTTTA
430676 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430683 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430690 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430697 GGG-TTA
1 GGGTTTA
430703 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430710 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430717 -GGTTTA
1 GGGTTTA
430723 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430730 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430737 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430744 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430751 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430758 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430765 GGG-TTA
1 GGGTTTA
430771 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430778 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430785 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430792 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430799 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430806 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430813 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430820 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430827 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430834 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430841 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430848 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430855 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430862 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430869 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430876 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430883 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430890 GGG-TTA
1 GGGTTTA
430896 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430903 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430910 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430917 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430924 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430931 -GGTTTA
1 GGGTTTA
430937 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430944 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430951 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430958 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430965 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430972 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430979 GGG-TTA
1 GGGTTTA
430985 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430992 GGGTTTA
1 GGGTTTA
430999 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431006 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431013 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431020 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431027 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431034 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431041 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431048 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431055 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431062 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431069 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431076 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431083 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431090 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431097 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431104 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431111 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431118 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431125 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431132 GGG-TTA
1 GGGTTTA
431138 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431145 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431152 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431159 -GGTTTA
1 GGGTTTA
431165 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431172 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431179 GGG-TTA
1 GGGTTTA
431185 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431192 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431199 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431206 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431213 GGGTTTTTA
1 GGG--TTTA
431222 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431229 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431236 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431243 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431250 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431257 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431264 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431271 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431278 GGG-TTA
1 GGGTTTA
431284 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431291 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431298 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431305 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431312 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431319 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431326 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431333 GGG-TTA
1 GGGTTTA
431339 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431346 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431353 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431360 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431367 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431374 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431381 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431388 GGG-TTA
1 GGGTTTA
431394 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431401 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431408 GGG-TTA
1 GGGTTTA
431414 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431421 GGGGGGTTTA
1 ---GGGTTTA
431431 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431438 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431445 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431452 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431459 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431466 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431473 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431480 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431487 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431494 GGG-TTA
1 GGGTTTA
431500 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431507 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431514 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431521 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431528 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431535 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431542 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431549 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431556 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431563 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431570 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431577 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431584 GGG-TTA
1 GGGTTTA
431590 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431597 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431604 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431611 GGG-TTA
1 GGGTTTA
431617 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431624 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431631 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431638 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431645 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431652 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431659 GGG-TTA
1 GGGTTTA
431665 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431672 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431679 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431686 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431693 -GGTTTA
1 GGGTTTA
431699 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431706 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431713 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431720 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431727 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431734 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431741 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431748 GGG-TTA
1 GGGTTTA
431754 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431761 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431768 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431775 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431782 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431789 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431796 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431803 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431810 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431817 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431824 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431831 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431838 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431845 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431852 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431859 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431866 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431873 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431880 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431887 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431894 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431901 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431908 -GGTTTA
1 GGGTTTA
431914 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431921 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431928 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431935 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431942 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431949 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431956 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431963 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431970 GGG-TTA
1 GGGTTTA
431976 -GGTTTA
1 GGGTTTA
431982 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431989 GGGTTTA
1 GGGTTTA
431996 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432003 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432010 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432017 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432024 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432031 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432038 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432045 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432052 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432059 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432066 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432073 -GGTTTA
1 GGGTTTA
432079 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432086 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432093 -GGTTTA
1 GGGTTTA
432099 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432106 GGG-TTA
1 GGGTTTA
432112 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432119 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432126 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432133 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432140 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432147 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432154 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432161 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432168 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432175 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432182 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432189 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432196 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432203 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432210 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432217 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432224 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432231 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432238 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432245 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432252 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432259 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432266 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432273 -GGTTTA
1 GGGTTTA
432279 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432286 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432293 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432300 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432307 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432314 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432321 -GGTTTA
1 GGGTTTA
432327 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432334 -GGTTTA
1 GGGTTTA
432340 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432347 -GGTTTA
1 GGGTTTA
432353 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432360 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432367 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432374 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432381 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432388 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432395 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432402 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432409 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432416 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432423 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432430 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432437 -GGTTTA
1 GGGTTTA
432443 GGG-TTA
1 GGGTTTA
432449 GGG-TTA
1 GGGTTTA
432455 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432462 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432469 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432476 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432483 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432490 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432497 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432504 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432511 -GGTTTA
1 GGGTTTA
432517 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432524 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432531 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432538 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432545 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432552 GGG-TTA
1 GGGTTTA
432558 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432565 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432572 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432579 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432586 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432593 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432600 -GGTTTA
1 GGGTTTA
432606 GGG-TTA
1 GGGTTTA
432612 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432619 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432626 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432633 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432640 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432647 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432654 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432661 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432668 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432675 GGG-TTA
1 GGGTTTA
*
432681 GGGTTTC
1 GGGTTTA
432688 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432695 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432702 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432709 -GGTTTA
1 GGGTTTA
432715 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432722 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432729 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432736 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432743 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432750 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432757 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432764 -GGTTTA
1 GGGTTTA
432770 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432777 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432784 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432791 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432798 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432805 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432812 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432819 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432826 GGG-TTA
1 GGGTTTA
432832 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432839 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432846 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432853 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432860 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432867 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432874 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432881 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432888 -GGTTTA
1 GGGTTTA
432894 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432901 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432908 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432915 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432922 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432929 -GGTTTA
1 GGGTTTA
432935 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432942 GGG-TTA
1 GGGTTTA
432948 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432955 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432962 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432969 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432976 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432983 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432990 GGGTTTA
1 GGGTTTA
432997 -GGTTTA
1 GGGTTTA
433003 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433010 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433017 GGG-TTA
1 GGGTTTA
433023 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433030 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433037 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433044 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433051 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433058 GGGTTT-
1 GGGTTTA
433064 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433071 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433078 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433085 GGGTTT-
1 GGGTTTA
433091 -GG-TTA
1 GGGTTTA
433096 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433103 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433110 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433117 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433124 GGG-TTA
1 GGGTTTA
433130 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433137 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433144 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433151 -GGTTTA
1 GGGTTTA
433157 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433164 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433171 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433178 GGG-TTA
1 GGGTTTA
433184 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433191 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433198 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433205 GGG-TTA
1 GGGTTTA
433211 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433218 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433225 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433232 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433239 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433246 GGG-TTA
1 GGGTTTA
433252 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433259 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433266 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433273 -GGTTTA
1 GGGTTTA
433279 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433286 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433293 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433300 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433307 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433314 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433321 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433328 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433335 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433342 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433349 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433356 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433363 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433370 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433377 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433384 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433391 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433398 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433405 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433412 GGG-TTA
1 GGGTTTA
433418 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433425 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433432 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433439 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433446 GGG-TT-
1 GGGTTTA
433451 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433458 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433465 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433472 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433479 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433486 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433493 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433500 -GGTTTA
1 GGGTTTA
433506 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433513 -GGTTTA
1 GGGTTTA
433519 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433526 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433533 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433540 GGGTTT-
1 GGGTTTA
433546 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
433553 GGGTTTT
1 GGGTTTA
433560 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433567 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433574 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433581 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433588 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433595 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433602 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433609 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433616 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433623 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433630 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433637 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433644 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433651 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433658 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433665 -GGTTTA
1 GGGTTTA
433671 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433678 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433685 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433692 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433699 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433706 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433713 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433720 GGGGTTTTA
1 -GGG-TTTA
433729 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433736 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433743 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433750 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433757 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433764 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433771 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433778 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433785 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433792 -GGTTTA
1 GGGTTTA
433798 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433805 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433812 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433819 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433826 -GGTTTA
1 GGGTTTA
433832 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433839 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433846 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433853 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433860 -GGTTTA
1 GGGTTTA
433866 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433873 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433880 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433887 -GGTTTA
1 GGGTTTA
433893 GGG-TTA
1 GGGTTTA
433899 GGG-TTA
1 GGGTTTA
433905 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433912 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433919 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433926 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433933 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433940 GGG-TTA
1 GGGTTTA
433946 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433953 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433960 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433967 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433974 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433981 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433988 GGGTTTA
1 GGGTTTA
433995 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434002 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434009 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434016 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434023 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434030 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434037 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434044 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434051 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434058 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434065 GGG-TTA
1 GGGTTTA
434071 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434078 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434085 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434092 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434099 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434106 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434113 GGGTTT-
1 GGGTTTA
434119 -GGTTTA
1 GGGTTTA
434125 GGG-TTA
1 GGGTTTA
434131 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434138 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434145 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434152 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434159 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434166 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434173 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434180 GGGTTTTA
1 GGG-TTTA
434188 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434195 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434202 GGG-TTA
1 GGGTTTA
434208 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434215 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434222 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434229 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434236 GGGTTT-
1 GGGTTTA
434242 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434249 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434256 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434263 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434270 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434277 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434284 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434291 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434298 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434305 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434312 -GGTTTA
1 GGGTTTA
434318 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434325 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434332 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434339 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434346 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434353 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434360 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434367 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434374 GGG-TTA
1 GGGTTTA
434380 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434387 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434394 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434401 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434408 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434415 -GGTTTA
1 GGGTTTA
434421 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434428 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434435 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434442 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434449 GGG-TTA
1 GGGTTTA
434455 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434462 -GGTTTA
1 GGGTTTA
434468 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434475 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434482 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434489 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434496 -GGTTTA
1 GGGTTTA
434502 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434509 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434516 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434523 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434530 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434537 GGG-TTA
1 GGGTTTA
434543 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434550 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
434557 GGGTTTC
1 GGGTTTA
434564 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434571 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434578 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434585 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434592 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434599 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434606 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434613 -GGTTTA
1 GGGTTTA
434619 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434626 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434633 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434640 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434647 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434654 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434661 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434668 GGGTTT-
1 GGGTTTA
434674 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434681 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434688 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434695 GGG-TTA
1 GGGTTTA
434701 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434708 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434715 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434722 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434729 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434736 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434743 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434750 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434757 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434764 GGG-TTA
1 GGGTTTA
434770 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434777 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434784 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434791 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434798 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434805 GGG-TTA
1 GGGTTTA
434811 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434818 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434825 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434832 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434839 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434846 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434853 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434860 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434867 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434874 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434881 GGG-TTA
1 GGGTTTA
434887 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434894 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434901 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434908 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434915 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434922 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434929 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434936 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434943 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
434950 GGGTTTT
1 GGGTTTA
434957 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434964 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434971 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434978 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434985 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434992 GGGTTTA
1 GGGTTTA
434999 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435006 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435013 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435020 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435027 GGG-TTA
1 GGGTTTA
435033 GGG-TTA
1 GGGTTTA
435039 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435046 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435053 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435060 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435067 GGG-TTA
1 GGGTTTA
435073 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
435080 GGGTTTC
1 GGGTTTA
435087 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435094 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435101 GGGGTTTA
1 -GGGTTTA
435109 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435116 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435123 GGGTTT-
1 GGGTTTA
435129 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435136 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435143 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435150 GGGTTT-
1 GGGTTTA
435156 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435163 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435170 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435177 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435184 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435191 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435198 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435205 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435212 GGG-TTA
1 GGGTTTA
435218 -GGTTTA
1 GGGTTTA
435224 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435231 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435238 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435245 -GG-TTA
1 GGGTTTA
435250 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435257 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435264 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435271 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435278 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435285 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435292 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435299 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435306 GGGTTT-
1 GGGTTTA
435312 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435319 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435326 GGG-TTA
1 GGGTTTA
435332 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435339 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435346 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435353 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435360 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435367 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435374 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435381 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435388 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435395 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435402 -GGTTTA
1 GGGTTTA
435408 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435415 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435422 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435429 GGG-TTA
1 GGGTTTA
435435 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435442 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435449 GGG-TTA
1 GGGTTTA
435455 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435462 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435469 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435476 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435483 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435490 GGGTTT-
1 GGGTTTA
435496 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435503 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435510 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435517 GGGGTTTA
1 -GGGTTTA
435525 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435532 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435539 GGG-TTA
1 GGGTTTA
435545 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435552 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435559 GGG-TTA
1 GGGTTTA
435565 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435572 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435579 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435586 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435593 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435600 GGG-TTA
1 GGGTTTA
435606 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435613 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435620 GGGTTTTA
1 GGG-TTTA
435628 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435635 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435642 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435649 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435656 -GGTTTA
1 GGGTTTA
435662 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435669 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435676 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435683 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435690 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435697 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435704 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435711 -GGTTTA
1 GGGTTTA
435717 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435724 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435731 GGG-TTA
1 GGGTTTA
435737 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435744 -GGTTTA
1 GGGTTTA
435750 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435757 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435764 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435771 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435778 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435785 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435792 GGG-TTA
1 GGGTTTA
435798 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435805 -GGTTTA
1 GGGTTTA
435811 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435818 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435825 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435832 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435839 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435846 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435853 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435860 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435867 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435874 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435881 GGGGGTTTA
1 --GGGTTTA
435890 GGG-TTA
1 GGGTTTA
435896 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435903 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435910 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435917 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435924 -GGTTTA
1 GGGTTTA
435930 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435937 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435944 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435951 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435958 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435965 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435972 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435979 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435986 GGG-TTA
1 GGGTTTA
435992 GGGTTTA
1 GGGTTTA
435999 -GGTTTA
1 GGGTTTA
436005 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436012 GGG-TTA
1 GGGTTTA
436018 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436025 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436032 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436039 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436046 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436053 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436060 GGGTTTTA
1 GGG-TTTA
436068 GGG-TTA
1 GGGTTTA
436074 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436081 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436088 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436095 GGG-TTA
1 GGGTTTA
436101 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436108 GGG-TTA
1 GGGTTTA
436114 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436121 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436128 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436135 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436142 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436149 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436156 -GGTTTA
1 GGGTTTA
436162 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436169 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436176 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436183 -GGTTTA
1 GGGTTTA
436189 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436196 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436203 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436210 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436217 GGG-TTA
1 GGGTTTA
436223 -GGTTTA
1 GGGTTTA
436229 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436236 GGGGGGTTTA
1 ---GGGTTTA
436246 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436253 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436260 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436267 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436274 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436281 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436288 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436295 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436302 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436309 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436316 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436323 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436330 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436337 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436344 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436351 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436358 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436365 GGG-TTA
1 GGGTTTA
436371 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436378 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436385 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436392 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436399 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436406 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436413 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436420 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436427 GGG-TTA
1 GGGTTTA
436433 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436440 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436447 GGG-TTA
1 GGGTTTA
436453 GGGTTTTA
1 GGG-TTTA
436461 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436468 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436475 GGG-TTA
1 GGGTTTA
436481 -GGTTTA
1 GGGTTTA
436487 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436494 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436501 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436508 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436515 -GGTTT-
1 GGGTTTA
436520 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436527 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436534 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436541 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436548 GGG-TTA
1 GGGTTTA
436554 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436561 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436568 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436575 -GGTTTA
1 GGGTTTA
436581 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436588 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
436595 GGGTTTC
1 GGGTTTA
436602 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436609 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436616 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436623 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436630 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436637 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436644 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436651 GGGTTT-
1 GGGTTTA
436657 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436664 -GGTTTA
1 GGGTTTA
436670 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436677 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436684 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436691 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436698 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436705 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436712 GGG-TTA
1 GGGTTTA
436718 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436725 -GGTTTA
1 GGGTTTA
436731 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436738 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436745 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436752 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436759 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
436766 GGGTTTC
1 GGGTTTA
436773 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436780 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436787 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436794 -GGTTTA
1 GGGTTTA
436800 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436807 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436814 GGG-TTA
1 GGGTTTA
436820 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436827 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436834 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436841 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436848 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436855 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436862 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436869 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436876 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436883 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436890 GGG-TTA
1 GGGTTTA
436896 GGGTTTTA
1 GGG-TTTA
436904 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436911 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436918 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436925 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436932 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436939 GGG-TTA
1 GGGTTTA
436945 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436952 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436959 GGG-TTA
1 GGGTTTA
436965 GGGTTTTA
1 GGG-TTTA
436973 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436980 GGGTTTA
1 GGGTTTA
436987 -GGTTTA
1 GGGTTTA
436993 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437000 -GGTTTA
1 GGGTTTA
437006 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437013 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437020 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437027 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437034 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437041 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437048 GGG-TTA
1 GGGTTTA
437054 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437061 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437068 GGG--TA
1 GGGTTTA
437073 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437080 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437087 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437094 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437101 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437108 GGG-TT-
1 GGGTTTA
*
437113 GGG-TGA
1 GGGTTTA
437119 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437126 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437133 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437140 GGG-TTA
1 GGGTTTA
437146 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437153 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
437160 GGGTTTG
1 GGGTTTA
437167 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437174 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437181 GGG-TT-
1 GGGTTTA
437186 -GGTTTA
1 GGGTTTA
437192 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437199 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437206 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437213 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437220 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437227 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437234 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437241 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437248 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437255 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437262 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437269 GGGGTTTA
1 -GGGTTTA
437277 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437284 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437291 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437298 GGGTTT-
1 GGGTTTA
437304 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437311 -GGTTTA
1 GGGTTTA
437317 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437324 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437331 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437338 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437345 GGG-TTA
1 GGGTTTA
437351 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437358 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437365 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437372 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437379 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437386 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437393 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437400 -GGTTTA
1 GGGTTTA
437406 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437413 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437420 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437427 -GGTTTA
1 GGGTTTA
437433 GGG-TTA
1 GGGTTTA
437439 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437446 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437453 GGG-TTA
1 GGGTTTA
437459 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437466 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437473 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437480 -GGTTT-
1 GGGTTTA
437485 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437492 GGG-TTA
1 GGGTTTA
437498 GGG-TTA
1 GGGTTTA
437504 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437511 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437518 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437525 -GGTTTA
1 GGGTTTA
437531 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437538 GGGTTTTA
1 GGG-TTTA
437546 -GGTTTA
1 GGGTTTA
437552 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437559 -GGTTTA
1 GGGTTTA
437565 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437572 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437579 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437586 GGG-TTA
1 GGGTTTA
437592 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437599 GGG-TTA
1 GGGTTTA
437605 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437612 -GGTTTA
1 GGGTTTA
437618 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437625 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437632 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437639 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437646 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437653 -GGTTTA
1 GGGTTTA
437659 GGGTTT-
1 GGGTTTA
437665 GTTAGGTTTA
1 G---GGTTTA
437675 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437682 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437689 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437696 GGGTTTTA
1 GGG-TTTA
*
437704 GGTTTTA
1 GGGTTTA
437711 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437718 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437725 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
437732 GGGTTTC
1 GGGTTTA
*
437739 GGGTTTC
1 GGGTTTA
437746 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437753 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437760 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437767 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437774 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437781 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437788 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437795 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
437802 GGGTTTC
1 GGGTTTA
437809 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437816 GGGTTTTA
1 GGG-TTTA
*
437824 GGGTTTC
1 GGGTTTA
437831 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437838 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437845 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437852 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437859 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437866 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437873 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437880 -GGTTTA
1 GGGTTTA
437886 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437893 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437900 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437907 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437914 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437921 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437928 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437935 GGG-TTA
1 GGGTTTA
437941 GGGGGTTTA
1 --GGGTTTA
437950 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437957 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437964 -GGTTTA
1 GGGTTTA
437970 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437977 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437984 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437991 GGGTTTA
1 GGGTTTA
437998 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438005 GGGTTTTA
1 GGG-TTTA
438013 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438020 GGGTTTTTA
1 GGG--TTTA
438029 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438036 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438043 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
438050 GGGTTTT
1 GGGTTTA
438057 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438064 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438071 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438078 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438085 -GG-TTA
1 GGGTTTA
438090 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438097 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438104 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438111 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438118 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438125 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
438132 GGGTTTC
1 GGGTTTA
438139 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438146 GGG-TTA
1 GGGTTTA
438152 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438159 GGG-TTA
1 GGGTTTA
438165 GGG-TTA
1 GGGTTTA
438171 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438178 GGGGTTTA
1 -GGGTTTA
*
438186 GGGTGTA
1 GGGTTTA
438193 -GG-TTA
1 GGGTTTA
438198 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438205 GGG-TTA
1 GGGTTTA
438211 GGGTTTTA
1 GGG-TTTA
438219 GGG-TT-
1 GGGTTTA
*
438224 GGGGTTA
1 GGGTTTA
438231 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438238 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438245 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438252 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438259 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438266 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438273 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438280 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438287 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438294 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438301 -GGTTTA
1 GGGTTTA
438307 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438314 GGG-TTA
1 GGGTTTA
438320 -GGTTTA
1 GGGTTTA
438326 GGGTTT-
1 GGGTTTA
438332 GGG-TTA
1 GGGTTTA
438338 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438345 GGG-TTA
1 GGGTTTA
438351 GGGTTTTA
1 GGG-TTTA
*
438359 GGGTTTTC
1 GGG-TTTA
438367 GGG-TTA
1 GGGTTTA
438373 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438380 -GGTTTA
1 GGGTTTA
438386 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438393 -GGTTTA
1 GGGTTTA
438399 -GGTTTA
1 GGGTTTA
438405 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438412 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438419 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438426 GGG-TTA
1 GGGTTTA
438432 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438439 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438446 GGG-TTA
1 GGGTTTA
438452 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438459 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438466 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438473 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438480 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438487 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438494 -GGTTTA
1 GGGTTTA
438500 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438507 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438514 GGGTTT-
1 GGGTTTA
438520 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438527 GGGTTTTA
1 GGG-TTTA
438535 GGGTTT-
1 GGGTTTA
438541 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438548 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438555 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438562 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438569 -GG-TTA
1 GGGTTTA
438574 GGG-TTA
1 GGGTTTA
438580 -GGTTTA
1 GGGTTTA
438586 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
438593 GGGTTTC
1 GGGTTTA
438600 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438607 GGG-TTA
1 GGGTTTA
438613 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438620 GGGTTT-
1 GGGTTTA
438626 GGG-TTA
1 GGGTTTA
*
438632 GGGTTTC
1 GGGTTTA
438639 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438646 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438653 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438660 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438667 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438674 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438681 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438688 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438695 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438702 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438709 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438716 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438723 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438730 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438737 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438744 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438751 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
438758 GGGTTTC
1 GGGTTTA
438765 GGG-TTA
1 GGGTTTA
438771 GGTGGGTTTA
1 ---GGGTTTA
438781 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438788 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438795 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438802 GGG-TTA
1 GGGTTTA
438808 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438815 -GG-TT-
1 GGGTTTA
438819 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438826 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438833 -GGTTTA
1 GGGTTTA
438839 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438846 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438853 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438860 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438867 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438874 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438881 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438888 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438895 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438902 GGG--TA
1 GGGTTTA
438907 GGG-TTA
1 GGGTTTA
438913 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438920 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438927 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438934 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438941 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438948 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438955 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438962 GGG-TTA
1 GGGTTTA
438968 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438975 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438982 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438989 GGGTTTA
1 GGGTTTA
438996 GGG-TTA
1 GGGTTTA
439002 -GGTTTA
1 GGGTTTA
439008 GGGTTTA
1 GGGTTTA
439015 -GGTTT-
1 GGGTTTA
*
439020 GGGTTTT
1 GGGTTTA
*
439027 GGTTTTA
1 GGGTTTA
439034 GGG-TTA
1 GGGTTTA
*
439040 GGGTTTTT
1 GGG-TTTA
*
439048 TGGTTTA
1 GGGTTTA
439055 GGG-TTA
1 GGGTTTA
439061 GGGTTTA
1 GGGTTTA
439068 GGG--TA
1 GGGTTTA
439073 GGG-TTA
1 GGGTTTA
439079 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
439086 GGGTTTC
1 GGGTTTA
439093 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
439100 GGGGGTTA
1 -GGGTTTA
439108 GGGTTTA
1 GGGTTTA
439115 GGGTTTTTA
1 GGG--TTTA
439124 GGGTTTA
1 GGGTTTA
439131 GGGTTTA
1 GGGTTTA
439138 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
439145 GGGTTTT
1 GGGTTTA
439152 GGG-TTA
1 GGGTTTA
439158 GGGTTTA
1 GGGTTTA
439165 GGGTTTA
1 GGGTTTA
439172 GGG-TTA
1 GGGTTTA
439178 GGGTTTA
1 GGGTTTA
439185 GGGTTTA
1 GGGTTTA
439192 GGGTTTA
1 GGGTTTA
439199 -GG-TTA
1 GGGTTTA
439204 GGGTTTA
1 GGGTTTA
439211 GGGTTTA
1 GGGTTTA
439218 GGGTTTA
1 GGGTTTA
439225 GGGTTTA
1 GGGTTTA
439232 GGGTTTA
1 GGGTTTA
439239 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
439246 GGGTTTT
1 GGGTTTA
439253 GGGTTTA
1 GGGTTTA
439260 GGGTTTA
1 GGGTTTA
439267 GGGTTTA
1 GGGTTTA
439274 GGGTTTA
1 GGGTTTA
439281 GGGTTTA
1 GGGTTTA
439288 GGGTTTA
1 GGGTTTA
439295 GGGTTTA
1 GGGTTTA
439302 GGGTTTA
1 GGGTTTA
439309 -GGTTTA
1 GGGTTTA
439315 GGGTTT-
1 GGGTTTA
439321 -GGTTTA
1 GGGTTTA
439327 GGGTTTA
1 GGGTTTA
439334 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
439341 -GGTTTC
1 GGGTTTA
439347 GGG-TTA
1 GGGTTTA
439353 GGGTTTA
1 GGGTTTA
439360 GGGTTTA
1 GGGTTTA
439367 GGGTTTA
1 GGGTTTA
439374 GGGTTTA
1 GGGTTTA
439381 -GGTTTA
1 GGGTTTA
439387 GGGTTTA
1 GGGTTTA
439394 -GGTTTA
1 GGGTTTA
439400 GGGTTTA
1 GGGTTTA
439407 GGGTTTTTA
1 GGG--TTTA
439416 GGGTTTA
1 GGGTTTA
439423 -GGTTTA
1 GGGTTTA
439429 GGGTTTA
1 GGGTTTA
439436 GGGTTT-
1 GGGTTTA
*
439442 CGGTTTA
1 GGGTTTA
*
439449 GGGTTTC
1 GGGTTTA
439456 GGGTTTA
1 GGGTTTA
439463 GGGTTTA
1 GGGTTTA
439470 GGGTTTA
1 GGGTTTA
439477 GGGTTT-
1 GGGTTTA
*
439483 CGGTTTA
1 GGGTTTA
439490 GGGTTTA
1 GGGTTTA
439497 GGGTTTA
1 GGGTTTA
439504 GGGTTTA
1 GGGTTTA
439511 GGGTTTA
1 GGGTTTA
439518 GGGTTTA
1 GGGTTTA
439525 GGGTTTA
1 GGGTTTA
439532 GGGTTTA
1 GGGTTTA
439539 -GGTTTA
1 GGGTTTA
439545 -GGTTTA
1 GGGTTTA
*
439551 GGGTTTC
1 GGGTTTA
439558 GGGTTTA
1 GGGTTTA
439565 GGGTTTA
1 GGGTTTA
439572 GGG-TTA
1 GGGTTTA
439578 GGGTTTA
1 GGGTTTA
439585 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
439592 GGGTTTC
1 GGGTTTA
439599 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
439606 GGGTTTC
1 GGGTTTA
439613 GGGTTTA
1 GGGTTTA
439620 GGGTTTA
1 GGGTTTA
439627 GGGTTTA
1 GGGTTTA
439634 GGGTTT-
1 GGGTTTA
*
439640 CGGTTT-
1 GGGTTTA
*
439646 CGGTTTA
1 GGGTTTA
439653 -GGTTTA
1 GGGTTTA
439659 GGGTTTA
1 GGGTTTA
439666 GGGTTTA
1 GGGTTTA
439673 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
439680 GGGTTTC
1 GGGTTTA
439687 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
439694 GGG-TTC
1 GGGTTTA
439700 GGGTTTA
1 GGGTTTA
439707 GGGTTTA
1 GGGTTTA
439714 GGGTTTA
1 GGGTTTA
439721 GGGTTTTTA
1 GGG--TTTA
439730 GGGTTTA
1 GGGTTTA
439737 GGGTTT-
1 GGGTTTA
439743 GGGTTTTA
1 GGG-TTTA
*
439751 GGGTTTTTC
1 GGG--TTTA
439760 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
439767 GGGTTTC
1 GGGTTTA
439774 GGGTTTA
1 GGGTTTA
439781 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
439788 GGGTTTCGG
1 GGGTTT--A
*
439797 GGGTTTC
1 GGGTTTA
439804 GGGTTTA
1 GGGTTTA
439811 GGGTTTA
1 GGGTTTA
439818 GGGTTTA
1 GGGTTTA
439825 GGGTTTA
1 GGGTTTA
439832 -GGTTTA
1 GGGTTTA
439838 GGGTTTA
1 GGGTTTA
439845 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
439852 GGGTTTTC
1 GGG-TTTA
439860 GGGTTT-
1 GGGTTTA
439866 GGGTTTTA
1 GGG-TTTA
439874 GGGTTTA
1 GGGTTTA
439881 -GGTTTA
1 GGGTTTA
439887 GGGTTTA
1 GGGTTTA
439894 GGGTTTA
1 GGGTTTA
439901 GGG-TTA
1 GGGTTTA
*
439907 TGGTTTA
1 GGGTTTA
439914 GGGTTTA
1 GGGTTTA
439921 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
439928 -GGTTTCG
1 GGGTTT-A
439935 GGGTTTA
1 GGGTTTA
439942 GGGTTTA
1 GGGTTTA
439949 GGGTTTA
1 GGGTTTA
439956 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
439963 GGGTTTGG
1 GGGTTT-A
439971 GGGTTTTA
1 GGG-TTTA
439979 GGGTT
1 GGGTT
439984 AGGTTT
Statistics
Matches: 12649, Mismatches: 102, Indels: 844
0.93 0.01 0.06
Matches are distributed among these distances:
4 4 0.00
5 115 0.01
6 1833 0.14
7 10387 0.82
8 184 0.01
9 80 0.01
10 46 0.00
ACGTcount: A:0.14, C:0.00, G:0.43, T:0.43
Consensus pattern (7 bp):
GGGTTTA
Done.