Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: VEPZ01009133.1 Hibiscus syriacus cultivar Beakdansim tig00112632_pilon, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Pmatch=0.80,Pindel=0.10
tuple sizes 0,4,5,7
tuple distances 0, 29, 159, 1000
Length: 771734
ACGTcount: A:0.32, C:0.17, G:0.18, T:0.33
File 2 of 2
Found at i:411710 original size:21 final size:21
Alignment explanation
Indices: 411680--411727 Score: 87
Period size: 21 Copynumber: 2.3 Consensus size: 21
411670 TAATTTTCAA
*
411680 ACATTATTGCACCTAATTTTG
1 ACATTGTTGCACCTAATTTTG
411701 ACATTGTTGCACCTAATTTTG
1 ACATTGTTGCACCTAATTTTG
411722 ACATTG
1 ACATTG
411728 CAATATTAGG
Statistics
Matches: 26, Mismatches: 1, Indels: 0
0.96 0.04 0.00
Matches are distributed among these distances:
21 26 1.00
ACGTcount: A:0.27, C:0.19, G:0.12, T:0.42
Consensus pattern (21 bp):
ACATTGTTGCACCTAATTTTG
Found at i:416369 original size:21 final size:21
Alignment explanation
Indices: 416339--416386 Score: 87
Period size: 21 Copynumber: 2.3 Consensus size: 21
416329 TAATTTTCAA
*
416339 ACATTATTGCACCTAATTTTG
1 ACATTGTTGCACCTAATTTTG
416360 ACATTGTTGCACCTAATTTTG
1 ACATTGTTGCACCTAATTTTG
416381 ACATTG
1 ACATTG
416387 CAATATTAGG
Statistics
Matches: 26, Mismatches: 1, Indels: 0
0.96 0.04 0.00
Matches are distributed among these distances:
21 26 1.00
ACGTcount: A:0.27, C:0.19, G:0.12, T:0.42
Consensus pattern (21 bp):
ACATTGTTGCACCTAATTTTG
Found at i:420311 original size:18 final size:18
Alignment explanation
Indices: 420277--420310 Score: 52
Period size: 18 Copynumber: 1.9 Consensus size: 18
420267 TGCCATGTGA
*
420277 TTTTGTGCAATGATTTTG
1 TTTTATGCAATGATTTTG
420295 TTTTATGCAA-GATTTT
1 TTTTATGCAATGATTTT
420311 TTTGATGTAT
Statistics
Matches: 15, Mismatches: 1, Indels: 1
0.88 0.06 0.06
Matches are distributed among these distances:
17 6 0.40
18 9 0.60
ACGTcount: A:0.21, C:0.06, G:0.18, T:0.56
Consensus pattern (18 bp):
TTTTATGCAATGATTTTG
Found at i:428181 original size:13 final size:13
Alignment explanation
Indices: 428160--428190 Score: 53
Period size: 13 Copynumber: 2.4 Consensus size: 13
428150 TTATATAGTA
428160 TTAAATAAAATTT
1 TTAAATAAAATTT
*
428173 TTAATTAAAATTT
1 TTAAATAAAATTT
428186 TTAAA
1 TTAAA
428191 AGAATATTAT
Statistics
Matches: 16, Mismatches: 2, Indels: 0
0.89 0.11 0.00
Matches are distributed among these distances:
13 16 1.00
ACGTcount: A:0.52, C:0.00, G:0.00, T:0.48
Consensus pattern (13 bp):
TTAAATAAAATTT
Found at i:428218 original size:15 final size:16
Alignment explanation
Indices: 428194--428237 Score: 54
Period size: 17 Copynumber: 2.7 Consensus size: 16
428184 TTTTAAAAGA
*
428194 ATATTATTTATA-TGAT
1 ATATT-TTTATACTAAT
428210 ATATTTTTATAACTAAT
1 ATATTTTTAT-ACTAAT
428227 ATATTTTTATA
1 ATATTTTTATA
428238 ATATAAATAT
Statistics
Matches: 25, Mismatches: 1, Indels: 4
0.83 0.03 0.13
Matches are distributed among these distances:
15 5 0.20
16 7 0.28
17 13 0.52
ACGTcount: A:0.39, C:0.02, G:0.02, T:0.57
Consensus pattern (16 bp):
ATATTTTTATACTAAT
Found at i:428248 original size:19 final size:17
Alignment explanation
Indices: 428208--428247 Score: 55
Period size: 17 Copynumber: 2.4 Consensus size: 17
428198 TATTTATATG
*
428208 ATATATTTTTATAACTA
1 ATATATTTTTATAAATA
428225 ATATATTTTTATAATATA
1 ATATATTTTTATAA-ATA
428243 A-ATAT
1 ATATAT
428248 AATTGGTCTA
Statistics
Matches: 21, Mismatches: 1, Indels: 2
0.88 0.04 0.08
Matches are distributed among these distances:
17 18 0.86
18 3 0.14
ACGTcount: A:0.45, C:0.03, G:0.00, T:0.53
Consensus pattern (17 bp):
ATATATTTTTATAAATA
Found at i:439797 original size:21 final size:20
Alignment explanation
Indices: 439770--439867 Score: 88
Period size: 20 Copynumber: 4.8 Consensus size: 20
439760 AATCAGTGTC
439770 CAAAATCGCAACGCGATTCTT
1 CAAAATCGCAACGCGATT-TT
* * **
439791 GAAAATCGCAATGCGATAGT
1 CAAAATCGCAACGCGATTTT
* **
439811 CAAATTCGCATTGCGATTTT
1 CAAAATCGCAACGCGATTTT
* *
439831 CCAAAATCGCAACGCGAATAT
1 -CAAAATCGCAACGCGATTTT
*
439852 GAAAATCGCAACGCGA
1 CAAAATCGCAACGCGA
439868 ACACATAAAT
Statistics
Matches: 61, Mismatches: 15, Indels: 3
0.77 0.19 0.04
Matches are distributed among these distances:
20 31 0.51
21 30 0.49
ACGTcount: A:0.37, C:0.23, G:0.18, T:0.21
Consensus pattern (20 bp):
CAAAATCGCAACGCGATTTT
Found at i:439820 original size:41 final size:41
Alignment explanation
Indices: 439711--439867 Score: 126
Period size: 41 Copynumber: 3.9 Consensus size: 41
439701 AAATGACCAA
* **
439711 CAAAATCGCAACGCGAA-ATAAAAATCGCAACGCGA-TCCC
1 CAAAATCGCAACGCGAATATCAAAATCGCAACGCGATTTTC
* ** * *
439750 CAGAATCGCAAATC-AGTGTCCAAAATCGCAACGCGATTCTT-
1 CAAAATCGCAACGCGAATAT-CAAAATCGCAACGCGATT-TTC
* * * **
439791 GAAAATCGCAATGCG-ATAGTCAAATTCGCATTGCGATTTTC
1 CAAAATCGCAACGCGAATA-TCAAAATCGCAACGCGATTTTC
*
439832 CAAAATCGCAACGCGAATATGAAAATCGCAACGCGA
1 CAAAATCGCAACGCGAATATCAAAATCGCAACGCGA
439868 ACACATAAAT
Statistics
Matches: 87, Mismatches: 23, Indels: 14
0.70 0.19 0.11
Matches are distributed among these distances:
38 1 0.01
39 12 0.14
40 17 0.20
41 53 0.61
42 4 0.05
ACGTcount: A:0.38, C:0.25, G:0.18, T:0.18
Consensus pattern (41 bp):
CAAAATCGCAACGCGAATATCAAAATCGCAACGCGATTTTC
Found at i:439877 original size:20 final size:20
Alignment explanation
Indices: 439854--440024 Score: 107
Period size: 20 Copynumber: 8.6 Consensus size: 20
439844 GCGAATATGA
439854 AAATCGCAACGCG-AACACAT
1 AAATCGCAACGCGTAAC-CAT
* * *
439874 AAATCGCAATGCGTATCCGT
1 AAATCGCAACGCGTAACCAT
* * *
439894 AAATCGCAACGTGTATCCGT
1 AAATCGCAACGCGTAACCAT
** *
439914 AAATCGCAACGCGTTTCCGT
1 AAATCGCAACGCGTAACCAT
* * *
439934 ATATCGCAACGCGTATCCGT
1 AAATCGCAACGCGTAACCAT
* *
439954 AAATCGCAACG-ATAATCCGT
1 AAATCGCAACGCGTAA-CCAT
* **
439974 AAATCGCAACGAG-AATCTGT
1 AAATCGCAACGCGTAA-CCAT
* *
439994 AAATCGCAACG-ATAATCCGT
1 AAATCGCAACGCGTAA-CCAT
440014 AAATCGCAACG
1 AAATCGCAACG
440025 AGAATCTGTA
Statistics
Matches: 131, Mismatches: 16, Indels: 8
0.85 0.10 0.05
Matches are distributed among these distances:
19 2 0.02
20 127 0.97
21 2 0.02
ACGTcount: A:0.35, C:0.26, G:0.18, T:0.20
Consensus pattern (20 bp):
AAATCGCAACGCGTAACCAT
Found at i:439919 original size:60 final size:58
Alignment explanation
Indices: 439834--440043 Score: 208
Period size: 60 Copynumber: 3.5 Consensus size: 58
439824 CGATTTTCCA
* ** * *
439834 AAATCGCAACGCGAATATGAAAATCGCAACGCGAACACATAAATCGCAATGCGTATCCGT
1 AAATCGCAACGTGAATCCGTAAATCGCAACGCGAAC-CGTAAATCGCAA-GCGTATCCGT
* ** *
439894 AAATCGCAACGTGTATCCGTAAATCGCAACGCGTTTCCGTATATCGCAACGCGTATCCGT
1 AAATCGCAACGTGAATCCGTAAATCGCAACGCG-AACCGTAAATCGCAA-GCGTATCCGT
* *
439954 AAATCGCAACGAT-AATCCGTAAATCGCAACGAGAATCTGTAAATCGCAA-CGATAATCCGT
1 AAATCGCAACG-TGAATCCGTAAATCGCAACGCGAA-CCGTAAATCGCAAGCG-T-ATCCGT
* * *
440014 AAATCGCAACGAGAATCTGTAAATCACAAC
1 AAATCGCAACGTGAATCCGTAAATCGCAAC
440044 ACTGAAATTT
Statistics
Matches: 125, Mismatches: 19, Indels: 12
0.80 0.12 0.08
Matches are distributed among these distances:
58 2 0.02
59 1 0.01
60 120 0.96
61 2 0.02
ACGTcount: A:0.37, C:0.25, G:0.18, T:0.20
Consensus pattern (58 bp):
AAATCGCAACGTGAATCCGTAAATCGCAACGCGAACCGTAAATCGCAAGCGTATCCGT
Found at i:440025 original size:20 final size:20
Alignment explanation
Indices: 439888--440043 Score: 174
Period size: 20 Copynumber: 7.8 Consensus size: 20
439878 CGCAATGCGT
*
439888 ATCCGTAAATCGCAACG-TGT
1 ATCCGTAAATCGCAACGAT-A
*
439908 ATCCGTAAATCGCAACGCGT-
1 ATCCGTAAATCGCAACG-ATA
* * *
439928 TTCCGTATATCGCAACGCGT-
1 ATCCGTAAATCGCAACG-ATA
439948 ATCCGTAAATCGCAACGATA
1 ATCCGTAAATCGCAACGATA
*
439968 ATCCGTAAATCGCAACGAGA
1 ATCCGTAAATCGCAACGATA
*
439988 ATCTGTAAATCGCAACGATA
1 ATCCGTAAATCGCAACGATA
*
440008 ATCCGTAAATCGCAACGAGA
1 ATCCGTAAATCGCAACGATA
* *
440028 ATCTGTAAATCACAAC
1 ATCCGTAAATCGCAAC
440044 ACTGAAATTT
Statistics
Matches: 121, Mismatches: 12, Indels: 6
0.87 0.09 0.04
Matches are distributed among these distances:
19 1 0.01
20 119 0.98
22 1 0.01
ACGTcount: A:0.35, C:0.26, G:0.17, T:0.22
Consensus pattern (20 bp):
ATCCGTAAATCGCAACGATA
Found at i:440025 original size:40 final size:40
Alignment explanation
Indices: 439854--440043 Score: 208
Period size: 40 Copynumber: 4.8 Consensus size: 40
439844 GCGAATATGA
* *
439854 AAATCGCAACGCGAA-CACATAAATCGCAATGCG-T-ATCCGT
1 AAATCGCAACGAGAATC-CGTAAATCGCAA--CGATAATCCGT
* * * *
439894 AAATCGCAACGTGTATCCGTAAATCGCAACGCGT-TTCCGT
1 AAATCGCAACGAGAATCCGTAAATCGCAACG-ATAATCCGT
* * *
439934 ATATCGCAACGCGTATCCGTAAATCGCAACGATAATCCGT
1 AAATCGCAACGAGAATCCGTAAATCGCAACGATAATCCGT
*
439974 AAATCGCAACGAGAATCTGTAAATCGCAACGATAATCCGT
1 AAATCGCAACGAGAATCCGTAAATCGCAACGATAATCCGT
* *
440014 AAATCGCAACGAGAATCTGTAAATCACAAC
1 AAATCGCAACGAGAATCCGTAAATCGCAAC
440044 ACTGAAATTT
Statistics
Matches: 133, Mismatches: 13, Indels: 8
0.86 0.08 0.05
Matches are distributed among these distances:
38 2 0.02
39 1 0.01
40 129 0.97
41 1 0.01
ACGTcount: A:0.36, C:0.26, G:0.17, T:0.21
Consensus pattern (40 bp):
AAATCGCAACGAGAATCCGTAAATCGCAACGATAATCCGT
Found at i:440964 original size:12 final size:12
Alignment explanation
Indices: 440947--440971 Score: 50
Period size: 12 Copynumber: 2.1 Consensus size: 12
440937 ATATAATCCT
440947 GAAGAAGAAAAA
1 GAAGAAGAAAAA
440959 GAAGAAGAAAAA
1 GAAGAAGAAAAA
440971 G
1 G
440972 TCCCCGAAGA
Statistics
Matches: 13, Mismatches: 0, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
12 13 1.00
ACGTcount: A:0.72, C:0.00, G:0.28, T:0.00
Consensus pattern (12 bp):
GAAGAAGAAAAA
Found at i:443276 original size:19 final size:19
Alignment explanation
Indices: 443254--443631 Score: 474
Period size: 19 Copynumber: 21.4 Consensus size: 19
443244 CGGAAATTAC
*
443254 AATCGCAACGCGAAATGAA
1 AATCGCAATGCGAAATGAA
*
443273 AATCCCAA--C---ATGAA
1 AATCGCAATGCGAAATGAA
443287 AATCGCAATGCGGAAATGAA
1 AATCGCAATGC-GAAATGAA
*
443307 AATCGCAA--CG--A-GAG
1 AATCGCAATGCGAAATGAA
443321 AATCGCAATGCGAAATGAA
1 AATCGCAATGCGAAATGAA
443340 AATCGCAATGCGAAATGAA
1 AATCGCAATGCGAAATGAA
*
443359 AATCGCAA--CG--A-GAG
1 AATCGCAATGCGAAATGAA
*
443373 AATCACAATGCGAAATGAA
1 AATCGCAATGCGAAATGAA
443392 AATCGCAATGCGAAATGAA
1 AATCGCAATGCGAAATGAA
*
443411 AATCGCAA--CGACA-G--
1 AATCGCAATGCGAAATGAA
443425 AATCGCAATGCGAAATGAA
1 AATCGCAATGCGAAATGAA
443444 AATCGCAATGCGAAATGAA
1 AATCGCAATGCGAAATGAA
443463 AATCGCAATGCGAAATGAA
1 AATCGCAATGCGAAATGAA
*
443482 AATCGCAA--CGACA-G--
1 AATCGCAATGCGAAATGAA
443496 AATCGCAATGCGAAATGAA
1 AATCGCAATGCGAAATGAA
443515 AATCGCAATGCGAAATGAA
1 AATCGCAATGCGAAATGAA
443534 AATCGCAATGCGAAATGAA
1 AATCGCAATGCGAAATGAA
443553 AATCGCAATGCGAAATGAA
1 AATCGCAATGCGAAATGAA
443572 AATCGCAA--CGAAA-G--
1 AATCGCAATGCGAAATGAA
443586 AATCGCAATGCGAAATGAA
1 AATCGCAATGCGAAATGAA
443605 AATCGCAATGCGAAATGAA
1 AATCGCAATGCGAAATGAA
443624 AATCGCAA
1 AATCGCAA
443632 CGAGAGAATC
Statistics
Matches: 316, Mismatches: 12, Indels: 62
0.81 0.03 0.16
Matches are distributed among these distances:
14 55 0.17
15 2 0.01
16 21 0.07
17 20 0.06
18 3 0.01
19 202 0.64
20 13 0.04
ACGTcount: A:0.47, C:0.18, G:0.21, T:0.14
Consensus pattern (19 bp):
AATCGCAATGCGAAATGAA
Found at i:443669 original size:52 final size:52
Alignment explanation
Indices: 443282--443653 Score: 561
Period size: 52 Copynumber: 7.0 Consensus size: 52
443272 AAATCCCAAC
443282 ATGAAAATCGCAATGCGGAAATGAAAATCGCAACGAGAGAATCGCAATGCGAA
1 ATGAAAATCGCAATGC-GAAATGAAAATCGCAACGAGAGAATCGCAATGCGAA
*
443335 ATGAAAATCGCAATGCGAAATGAAAATCGCAACGAGAGAATCACAATGCGAA
1 ATGAAAATCGCAATGCGAAATGAAAATCGCAACGAGAGAATCGCAATGCGAA
*
443387 ATGAAAATCGCAATGCGAAATGAAAATCGCAACGACAGAATCGCAATGCGAA
1 ATGAAAATCGCAATGCGAAATGAAAATCGCAACGAGAGAATCGCAATGCGAA
* * * *
443439 ATGAAAATCGCAATGCGAAATGAAAATCGCAATGCGA-AAT-GAAAAT-CGCA
1 ATGAAAATCGCAATGCGAAATGAAAATCGCAACGAGAGAATCG-CAATGCGAA
* *
443489 ACGACAGAATCGCAATGCGAAATGAAAATCGCAATGCGAAATGAAAATCGCAATGCGAA
1 ATGA-A-AATCGCAATGCGAAATGAAAATCGCAA--CG--A-GAGAATCGCAATGCGAA
*
443548 ATGAAAATCGCAATGCGAAATGAAAATCGCAACGAAAGAATCGCAATGCGAA
1 ATGAAAATCGCAATGCGAAATGAAAATCGCAACGAGAGAATCGCAATGCGAA
443600 ATGAAAATCGCAATGCGAAATGAAAATCGCAACGAGAGAATCGCAATGCGAA
1 ATGAAAATCGCAATGCGAAATGAAAATCGCAACGAGAGAATCGCAATGCGAA
443652 AT
1 AT
443654 TATAAACGCA
Statistics
Matches: 291, Mismatches: 17, Indels: 23
0.88 0.05 0.07
Matches are distributed among these distances:
50 7 0.02
51 7 0.02
52 214 0.74
53 17 0.06
54 1 0.00
55 2 0.01
57 29 0.10
58 7 0.02
59 7 0.02
ACGTcount: A:0.47, C:0.17, G:0.22, T:0.14
Consensus pattern (52 bp):
ATGAAAATCGCAATGCGAAATGAAAATCGCAACGAGAGAATCGCAATGCGAA
Found at i:443669 original size:71 final size:71
Alignment explanation
Indices: 443254--443653 Score: 492
Period size: 71 Copynumber: 5.7 Consensus size: 71
443244 CGGAAATTAC
* *
443254 AATCGCAACGCGAAATGAAAATCCCAACATGA-A-AATCGCAATGCGGAAATGAAAATCGCAA--
1 AATCGCAATGCGAAATGAAAATCGCAAC--GACAGAATCGCAATGC-GAAATGAAAATCGCAATG
*
443315 CG--A-GAG
63 CGAAATGAA
* * *
443321 AATCGCAATGCGAAATGAAAATCGCAATGCGAAATGAAAATCGCAA--CG--A-GAGAATCACAA
1 AATCGCAATGCGAAATGAAAATCGCAA--CGACA-G--AATCGCAATGCGAAATGAAAATCGCAA
443381 TGCGAAATGAA
61 TGCGAAATGAA
443392 AATCGCAATGCGAAATGAAAATCGCAACGACAGAATCGCAATGCGAAATGAAAATCGCAATGCGA
1 AATCGCAATGCGAAATGAAAATCGCAACGACAGAATCGCAATGCGAAATGAAAATCGCAATGCGA
443457 AATGAA
66 AATGAA
443463 AATCGCAATGCGAAATGAAAATCGCAACGACAGAATCGCAATGCGAAATGAAAATCGCAATGCGA
1 AATCGCAATGCGAAATGAAAATCGCAACGACAGAATCGCAATGCGAAATGAAAATCGCAATGCGA
443528 AATGAA
66 AATGAA
*
443534 AATCGCAATGCGAAATGAAAATCGCAATGCGAAATGAAAATCGCAA--CGAAA-G--AATCGCAA
1 AATCGCAATGCGAAATGAAAATCGCAA--CGACA-G--AATCGCAATGCGAAATGAAAATCGCAA
443594 TGCGAAATGAA
61 TGCGAAATGAA
*
443605 AATCGCAATGCGAAATGAAAATCGCAACGAGAGAATCGCAATGCGAAAT
1 AATCGCAATGCGAAATGAAAATCGCAACGACAGAATCGCAATGCGAAAT
443654 TATAAACGCA
Statistics
Matches: 298, Mismatches: 10, Indels: 48
0.84 0.03 0.13
Matches are distributed among these distances:
66 25 0.08
67 28 0.09
68 12 0.04
69 10 0.03
70 3 0.01
71 193 0.65
72 8 0.03
73 5 0.02
74 6 0.02
76 8 0.03
ACGTcount: A:0.47, C:0.18, G:0.21, T:0.14
Consensus pattern (71 bp):
AATCGCAATGCGAAATGAAAATCGCAACGACAGAATCGCAATGCGAAATGAAAATCGCAATGCGA
AATGAA
Found at i:443769 original size:19 final size:19
Alignment explanation
Indices: 443660--443761 Score: 151
Period size: 19 Copynumber: 5.6 Consensus size: 19
443650 AAATTATAAA
443660 CGCATTGCGATTTTCATTT
1 CGCATTGCGATTTTCATTT
443679 CCGCATTGCGATTTTCATTT
1 -CGCATTGCGATTTTCATTT
*
443699 CGCATTGCGA--TTC-TCT
1 CGCATTGCGATTTTCATTT
443715 CG--TTGCGATTTTCATTT
1 CGCATTGCGATTTTCATTT
443732 CGCATTGCGATTTTCATTT
1 CGCATTGCGATTTTCATTT
443751 CGCATTGCGAT
1 CGCATTGCGAT
443762 AGTCATTTTT
Statistics
Matches: 75, Mismatches: 2, Indels: 11
0.85 0.02 0.12
Matches are distributed among these distances:
14 6 0.08
16 7 0.09
17 7 0.09
19 36 0.48
20 19 0.25
ACGTcount: A:0.15, C:0.24, G:0.18, T:0.44
Consensus pattern (19 bp):
CGCATTGCGATTTTCATTT
Found at i:443887 original size:14 final size:14
Alignment explanation
Indices: 443868--443904 Score: 65
Period size: 14 Copynumber: 2.6 Consensus size: 14
443858 CATCAATTAC
443868 ACAAATCAACTTTT
1 ACAAATCAACTTTT
*
443882 ACAAATCATCTTTT
1 ACAAATCAACTTTT
443896 ACAAATCAA
1 ACAAATCAA
443905 TTAAACAATC
Statistics
Matches: 21, Mismatches: 2, Indels: 0
0.91 0.09 0.00
Matches are distributed among these distances:
14 21 1.00
ACGTcount: A:0.46, C:0.22, G:0.00, T:0.32
Consensus pattern (14 bp):
ACAAATCAACTTTT
Found at i:445903 original size:14 final size:14
Alignment explanation
Indices: 445884--445940 Score: 60
Period size: 14 Copynumber: 3.7 Consensus size: 14
445874 GCGAAATGAA
*
445884 AATCGCAACGACAG
1 AATCGCAACGAAAG
445898 AATCGCAATGCGAAATG
1 AATCGCAA--CGAAA-G
445915 AAAATCGCAACGAAAG
1 --AATCGCAACGAAAG
445931 AATCGCAACG
1 AATCGCAACG
445941 CGAAATGAAA
Statistics
Matches: 37, Mismatches: 1, Indels: 10
0.77 0.02 0.21
Matches are distributed among these distances:
14 18 0.49
16 5 0.14
17 6 0.16
19 8 0.22
ACGTcount: A:0.46, C:0.23, G:0.21, T:0.11
Consensus pattern (14 bp):
AATCGCAACGAAAG
Found at i:445911 original size:33 final size:33
Alignment explanation
Indices: 445865--445957 Score: 168
Period size: 33 Copynumber: 2.8 Consensus size: 33
445855 GCGAAACCAA
*
445865 AATCGCAACGCGAAATGAAAATCGCAACGACAG
1 AATCGCAACGCGAAATGAAAATCGCAACGAAAG
*
445898 AATCGCAATGCGAAATGAAAATCGCAACGAAAG
1 AATCGCAACGCGAAATGAAAATCGCAACGAAAG
445931 AATCGCAACGCGAAATGAAAATCGCAA
1 AATCGCAACGCGAAATGAAAATCGCAA
445958 TGCGATTTTG
Statistics
Matches: 57, Mismatches: 3, Indels: 0
0.95 0.05 0.00
Matches are distributed among these distances:
33 57 1.00
ACGTcount: A:0.47, C:0.22, G:0.20, T:0.11
Consensus pattern (33 bp):
AATCGCAACGCGAAATGAAAATCGCAACGAAAG
Found at i:445922 original size:19 final size:19
Alignment explanation
Indices: 445828--445962 Score: 128
Period size: 19 Copynumber: 7.6 Consensus size: 19
445818 TAGTTTACTT
* *
445828 TCGCAACACGAAACTTAAAA
1 TCGCAACGCGAAA-TGAAAA
**
445848 TCGCAACGCGAAACCAAAA
1 TCGCAACGCGAAATGAAAA
445867 TCGCAACGCGAAATGAAAA
1 TCGCAACGCGAAATGAAAA
*
445886 TCGCAA--CGACA-G--AA
1 TCGCAACGCGAAATGAAAA
*
445900 TCGCAATGCGAAATGAAAA
1 TCGCAACGCGAAATGAAAA
445919 TCGCAA--CGAAA-G--AA
1 TCGCAACGCGAAATGAAAA
445933 TCGCAACGCGAAATGAAAA
1 TCGCAACGCGAAATGAAAA
*
445952 TCGCAATGCGA
1 TCGCAACGCGA
445963 TTTTGGTTTC
Statistics
Matches: 97, Mismatches: 8, Indels: 21
0.77 0.06 0.17
Matches are distributed among these distances:
14 16 0.16
16 11 0.11
17 11 0.11
19 47 0.48
20 12 0.12
ACGTcount: A:0.46, C:0.24, G:0.19, T:0.11
Consensus pattern (19 bp):
TCGCAACGCGAAATGAAAA
Found at i:445974 original size:19 final size:19
Alignment explanation
Indices: 445958--446105 Score: 154
Period size: 19 Copynumber: 8.3 Consensus size: 19
445948 AAAATCGCAA
445958 TGCGATTTTGGTTTCGCGT
1 TGCGATTTTGGTTTCGCGT
*
445977 TGCGATCTT-G--T--CGT
1 TGCGATTTTGGTTTCGCGT
445991 TGCGATTTTGGTTTCGCGT
1 TGCGATTTTGGTTTCGCGT
446010 TGCGATTTTGGTTTCGCGT
1 TGCGATTTTGGTTTCGCGT
*
446029 TGCGATTAT-G--T--CGT
1 TGCGATTTTGGTTTCGCGT
**
446043 TGCGATTTTCATTTCGCGT
1 TGCGATTTTGGTTTCGCGT
446062 TGCGATTTTGGTTTCGCGT
1 TGCGATTTTGGTTTCGCGT
* **
446081 TGAGATTTTAACTTTCGCGT
1 TGCGATTTT-GGTTTCGCGT
446101 TGCGA
1 TGCGA
446106 AAGTAAACTA
Statistics
Matches: 107, Mismatches: 11, Indels: 21
0.77 0.08 0.15
Matches are distributed among these distances:
14 22 0.21
15 1 0.01
16 2 0.02
17 2 0.02
18 2 0.02
19 66 0.62
20 12 0.11
ACGTcount: A:0.09, C:0.17, G:0.28, T:0.45
Consensus pattern (19 bp):
TGCGATTTTGGTTTCGCGT
Found at i:446041 original size:52 final size:51
Alignment explanation
Indices: 445958--446088 Score: 217
Period size: 52 Copynumber: 2.5 Consensus size: 51
445948 AAAATCGCAA
**
445958 TGCGATTTTGGTTTCGCGTTGCGATCTTGTCGTTGCGATTTTGGTTTCGCGT
1 TGCGATTTTGGTTTCGCGTTGCGAT-TTGTCGTTGCGATTTTCATTTCGCGT
446010 TGCGATTTTGGTTTCGCGTTGCGATTATGTCGTTGCGATTTTCATTTCGCGT
1 TGCGATTTTGGTTTCGCGTTGCGATT-TGTCGTTGCGATTTTCATTTCGCGT
*
446062 TGCGATTTTGGTTTCGCGTTGAGATTT
1 TGCGATTTTGGTTTCGCGTTGCGATTT
446089 TAACTTTCGC
Statistics
Matches: 75, Mismatches: 3, Indels: 3
0.93 0.04 0.04
Matches are distributed among these distances:
51 2 0.03
52 73 0.97
ACGTcount: A:0.08, C:0.16, G:0.29, T:0.47
Consensus pattern (51 bp):
TGCGATTTTGGTTTCGCGTTGCGATTTGTCGTTGCGATTTTCATTTCGCGT
Found at i:446289 original size:93 final size:93
Alignment explanation
Indices: 446153--446621 Score: 904
Period size: 93 Copynumber: 5.1 Consensus size: 93
446143 ATGGATTGCA
*
446153 TTAC-TTCAACCAAAAGACAAAACAAAGACAAATACTATTTCACAGTGTTAAAGAATACAAAGTT
1 TTACTTTCAACCAAAAGACAAAACAAAGACAAATACTATTTCACAGTGTTAAAGAATACACAGTT
446217 TAGCAGAATTGGCAGCAACCGAACAAAT
66 TAGCAGAATTGGCAGCAACCGAACAAAT
446245 TTACTTTCAACCAAAAGACAAAACAAAGACAAATACTATTTCACAGTGTTAAAGAATACACAGTT
1 TTACTTTCAACCAAAAGACAAAACAAAGACAAATACTATTTCACAGTGTTAAAGAATACACAGTT
446310 TAGCAGAATTGGCAGCAACCGAACAAAT
66 TAGCAGAATTGGCAGCAACCGAACAAAT
446338 TTACTTTCAACCAAAAGACAAAACAAAGACAAATACTATTTCACAGTGTTAAAGAATACACAGTT
1 TTACTTTCAACCAAAAGACAAAACAAAGACAAATACTATTTCACAGTGTTAAAGAATACACAGTT
446403 TAGCAGAATTGGCAGCAACCGAACAAAT
66 TAGCAGAATTGGCAGCAACCGAACAAAT
*
446431 TTACTTTCAACCAGAAGACAAAACAAAGACAAATACTATTTCACAGTGTTAAAGAATACACAGTT
1 TTACTTTCAACCAAAAGACAAAACAAAGACAAATACTATTTCACAGTGTTAAAGAATACACAGTT
446496 TAGCAGAATTGGCAGCAACCGAACAAAT
66 TAGCAGAATTGGCAGCAACCGAACAAAT
446524 TTACTTTCAACCAAAAGACAAAACAAAGACAAATACTATTTCACAGTGTTAAAGAATACACAGTT
1 TTACTTTCAACCAAAAGACAAAACAAAGACAAATACTATTTCACAGTGTTAAAGAATACACAGTT
*
446589 TAGCAGAATTGGCAGCAACCGAATAAAT
66 TAGCAGAATTGGCAGCAACCGAACAAAT
446617 TTACT
1 TTACT
446622 AAGCAATCTA
Statistics
Matches: 372, Mismatches: 4, Indels: 1
0.99 0.01 0.00
Matches are distributed among these distances:
92 4 0.01
93 368 0.99
ACGTcount: A:0.46, C:0.19, G:0.13, T:0.22
Consensus pattern (93 bp):
TTACTTTCAACCAAAAGACAAAACAAAGACAAATACTATTTCACAGTGTTAAAGAATACACAGTT
TAGCAGAATTGGCAGCAACCGAACAAAT
Found at i:448362 original size:19 final size:20
Alignment explanation
Indices: 448318--448379 Score: 81
Period size: 20 Copynumber: 3.1 Consensus size: 20
448308 TTTTGGTTGA
*
448318 AATGAAAATCGCAACGAGAG
1 AATGACAATCGCAACGAGAG
** *
448338 AATGACTGTCGCAACGCGA-
1 AATGACAATCGCAACGAGAG
448357 AATGACAATCGCAACGAGAG
1 AATGACAATCGCAACGAGAG
448377 AAT
1 AAT
448380 CGCAACGCGA
Statistics
Matches: 34, Mismatches: 7, Indels: 2
0.79 0.16 0.05
Matches are distributed among these distances:
19 16 0.47
20 18 0.53
ACGTcount: A:0.44, C:0.19, G:0.24, T:0.13
Consensus pattern (20 bp):
AATGACAATCGCAACGAGAG
Found at i:448439 original size:14 final size:14
Alignment explanation
Indices: 448420--448476 Score: 60
Period size: 14 Copynumber: 3.7 Consensus size: 14
448410 TTTGGTTTCG
448420 CGTTGCGATTCTCT
1 CGTTGCGATTCTCT
*
448434 CGTTGCGATTTTCATTTCG
1 CGTTGCGA--TTC---TCT
448453 CGTTGCGATTCTCT
1 CGTTGCGATTCTCT
448467 CGTTGCGATT
1 CGTTGCGATT
448477 GTCATTTCGC
Statistics
Matches: 36, Mismatches: 2, Indels: 10
0.75 0.04 0.21
Matches are distributed among these distances:
14 20 0.56
16 3 0.08
17 3 0.08
19 10 0.28
ACGTcount: A:0.09, C:0.25, G:0.23, T:0.44
Consensus pattern (14 bp):
CGTTGCGATTCTCT
Found at i:448458 original size:19 final size:19
Alignment explanation
Indices: 448434--448522 Score: 80
Period size: 19 Copynumber: 4.9 Consensus size: 19
448424 GCGATTCTCT
448434 CGTTGCGATTTTCATTTCG
1 CGTTGCGATTTTCATTTCG
*
448453 CGTTGCGA--TTC---TCT
1 CGTTGCGATTTTCATTTCG
*
448467 CGTTGCGATTGTCATTTCG
1 CGTTGCGATTTTCATTTCG
*** *
448486 CGTTGCGACAGTCATTCTCT
1 CGTTGCGATTTTCATT-TCG
448506 CGTTGCGATTTTCATTT
1 CGTTGCGATTTTCATTT
448523 ATCTCGTTGC
Statistics
Matches: 55, Mismatches: 9, Indels: 12
0.72 0.12 0.16
Matches are distributed among these distances:
14 10 0.18
16 2 0.04
17 3 0.05
19 25 0.45
20 15 0.27
ACGTcount: A:0.11, C:0.24, G:0.21, T:0.44
Consensus pattern (19 bp):
CGTTGCGATTTTCATTTCG
Found at i:448514 original size:39 final size:33
Alignment explanation
Indices: 448404--448522 Score: 157
Period size: 33 Copynumber: 3.4 Consensus size: 33
448394 AAAATCGCAA
**
448404 TGCGATTTTGGTTTCGCGTTGCGATTCTCTCGT
1 TGCGATTTTCATTTCGCGTTGCGATTCTCTCGT
448437 TGCGATTTTCATTTCGCGTTGCGATTCTCTCGT
1 TGCGATTTTCATTTCGCGTTGCGATTCTCTCGT
*
448470 TGCGATTGTCATTTCGCGTTGCGACAGTCATTCTCTCGT
1 TGCGATTTTCATTTCGCGTT--G-C-G--ATTCTCTCGT
448509 TGCGATTTTCATTT
1 TGCGATTTTCATTT
448523 ATCTCGTTGC
Statistics
Matches: 76, Mismatches: 4, Indels: 6
0.88 0.05 0.07
Matches are distributed among these distances:
33 50 0.66
35 1 0.01
36 1 0.01
37 1 0.01
39 23 0.30
ACGTcount: A:0.10, C:0.23, G:0.23, T:0.45
Consensus pattern (33 bp):
TGCGATTTTCATTTCGCGTTGCGATTCTCTCGT
Found at i:448656 original size:33 final size:33
Alignment explanation
Indices: 448614--448684 Score: 115
Period size: 33 Copynumber: 2.2 Consensus size: 33
448604 AATACTAACT
448614 TGAAAATCGCAACGAGAGAATAGCAACACGAAA
1 TGAAAATCGCAACGAGAGAATAGCAACACGAAA
* * *
448647 TGAAAATCGCAACGAGAGAATCGTAACGCGAAA
1 TGAAAATCGCAACGAGAGAATAGCAACACGAAA
448680 TGAAA
1 TGAAA
448685 TCTAAGTGAA
Statistics
Matches: 35, Mismatches: 3, Indels: 0
0.92 0.08 0.00
Matches are distributed among these distances:
33 35 1.00
ACGTcount: A:0.49, C:0.17, G:0.23, T:0.11
Consensus pattern (33 bp):
TGAAAATCGCAACGAGAGAATAGCAACACGAAA
Found at i:448918 original size:22 final size:22
Alignment explanation
Indices: 448866--448920 Score: 74
Period size: 22 Copynumber: 2.5 Consensus size: 22
448856 TGGTTGTGAG
**
448866 GGATTTCGCCGGAGATGGGGAC
1 GGATTTCTTCGGAGATGGGGAC
**
448888 GGAAATCTTCGGAGATGGGGAC
1 GGATTTCTTCGGAGATGGGGAC
448910 GGATTTCTTCG
1 GGATTTCTTCG
448921 CCGTAGAGAG
Statistics
Matches: 27, Mismatches: 6, Indels: 0
0.82 0.18 0.00
Matches are distributed among these distances:
22 27 1.00
ACGTcount: A:0.20, C:0.16, G:0.40, T:0.24
Consensus pattern (22 bp):
GGATTTCTTCGGAGATGGGGAC
Found at i:449092 original size:20 final size:20
Alignment explanation
Indices: 449067--449260 Score: 203
Period size: 20 Copynumber: 9.7 Consensus size: 20
449057 CTTTAAATAT
449067 CGCGTTGCGATTTACGGATA
1 CGCGTTGCGATTTACGGATA
* *
449087 CGCGTTGCGATTTTATGTATTA
1 CGCGTTGCGA-TTTACGGA-TA
* *
449109 -TCGTTGCGATTTACCGATA
1 CGCGTTGCGATTTACGGATA
*
449128 CGCGTTGCGATATACGGATA
1 CGCGTTGCGATTTACGGATA
* **
449148 CGCATTGCGATTTACCCATA
1 CGCGTTGCGATTTACGGATA
449168 CGCGTTGCGATTTACGGATA
1 CGCGTTGCGATTTACGGATA
*
449188 CACGTTGCGATTTACGGATA
1 CGCGTTGCGATTTACGGATA
* * *
449208 CGCATTGCGATTTATGTG-TT
1 CGCGTTGCGATTTACG-GATA
* ** *
449228 CGCGTTGCGATTTTCATATT
1 CGCGTTGCGATTTACGGATA
449248 CGCGTTGCGATTT
1 CGCGTTGCGATTT
449261 TGGAAAATCG
Statistics
Matches: 143, Mismatches: 26, Indels: 10
0.80 0.15 0.06
Matches are distributed among these distances:
19 2 0.01
20 124 0.87
21 15 0.10
22 2 0.01
ACGTcount: A:0.20, C:0.20, G:0.25, T:0.36
Consensus pattern (20 bp):
CGCGTTGCGATTTACGGATA
Found at i:449232 original size:60 final size:60
Alignment explanation
Indices: 449069--449240 Score: 236
Period size: 60 Copynumber: 2.9 Consensus size: 60
449059 TTAAATATCG
* ** *
449069 CGTTGCGATTTACGGATACGCGTTGCGATTTTATGTATTATCGTTGCGATTTACCGATACG
1 CGTTGCGATTTACGGATACGCATTGCGA-TTTATGTATTCGCGTTGCGATTTACCGATACA
* *** * *
449130 CGTTGCGATATACGGATACGCATTGCGATTTACCCATACGCGTTGCGATTTACGGATACA
1 CGTTGCGATTTACGGATACGCATTGCGATTTATGTATTCGCGTTGCGATTTACCGATACA
*
449190 CGTTGCGATTTACGGATACGCATTGCGATTTATGTGTTCGCGTTGCGATTT
1 CGTTGCGATTTACGGATACGCATTGCGATTTATGTATTCGCGTTGCGATTT
449241 TCATATTCGC
Statistics
Matches: 95, Mismatches: 16, Indels: 1
0.85 0.14 0.01
Matches are distributed among these distances:
60 69 0.73
61 26 0.27
ACGTcount: A:0.20, C:0.20, G:0.25, T:0.35
Consensus pattern (60 bp):
CGTTGCGATTTACGGATACGCATTGCGATTTATGTATTCGCGTTGCGATTTACCGATACA
Found at i:449254 original size:60 final size:60
Alignment explanation
Indices: 449066--449381 Score: 232
Period size: 60 Copynumber: 5.2 Consensus size: 60
449056 GCTTTAAATA
* ** * *
449066 TCGCGTTGCGATTTACGGATACGCGTTGCGATTTTATGTATTATCGTTGCGATTTACCGAT
1 TCGCGTTGCGATTTACGGATACGCATTGCGA-TTTATGTATTCGCGTTGCGATTTTCAGAT
* * *** * * *
449127 ACGCGTTGCGATATACGGATACGCATTGCGATTTACCCATACGCGTTGCGATTTACGGAT
1 TCGCGTTGCGATTTACGGATACGCATTGCGATTTATGTATTCGCGTTGCGATTTTCAGAT
* * * *
449187 ACACGTTGCGATTTACGGATACGCATTGCGATTTATGTGTTCGCGTTGCGATTTTCATAT
1 TCGCGTTGCGATTTACGGATACGCATTGCGATTTATGTATTCGCGTTGCGATTTTCAGAT
* * * * * *
449247 TCGCGTTGCGATTT-TGGAAAATCGCAATGCGAATT-TG-ACTATCGCATTGCGATTTTCAAGAA
1 TCGCGTTGCGATTTACGG-ATA-CGCATTGCGATTTATGTA-T-TCGCGTTGCGATTTTC-AGAT
* * ** * * *
449309 TCGCGTTGCGATTT-TGGAAACTG-ATTTGCGATTCTGGGGA-TCGCGTTGCGATTTTTA-TT
1 TCGCGTTGCGATTTACGGATAC-GCA-TTGCGATT-TATGTATTCGCGTTGCGATTTTCAGAT
449368 TCGCGTTGCGATTT
1 TCGCGTTGCGATTT
449382 TGTTGGTCAT
Statistics
Matches: 208, Mismatches: 37, Indels: 22
0.78 0.14 0.08
Matches are distributed among these distances:
59 16 0.08
60 92 0.44
61 78 0.38
62 20 0.10
63 1 0.00
64 1 0.00
ACGTcount: A:0.20, C:0.19, G:0.25, T:0.36
Consensus pattern (60 bp):
TCGCGTTGCGATTTACGGATACGCATTGCGATTTATGTATTCGCGTTGCGATTTTCAGAT
Found at i:449277 original size:21 final size:20
Alignment explanation
Indices: 449227--449324 Score: 79
Period size: 20 Copynumber: 4.8 Consensus size: 20
449217 ATTTATGTGT
* * * *
449227 TCGCGTTGCGATTTTCATAT
1 TCGCATTGCGATTTTGAAAA
*
449247 TCGCGTTGCGATTTTGGAAAA
1 TCGCATTGCGATTTT-GAAAA
* * **
449268 TCGCAATGCGAATTTGACTA
1 TCGCATTGCGATTTTGAAAA
*
449288 TCGCATTGCGATTTTCAAGAA
1 TCGCATTGCGATTTTGAA-AA
*
449309 TCGCGTTGCGATTTTG
1 TCGCATTGCGATTTTG
449325 GAAACTGATT
Statistics
Matches: 61, Mismatches: 15, Indels: 3
0.77 0.19 0.04
Matches are distributed among these distances:
20 32 0.52
21 29 0.48
ACGTcount: A:0.21, C:0.18, G:0.23, T:0.37
Consensus pattern (20 bp):
TCGCATTGCGATTTTGAAAA
Found at i:449300 original size:61 final size:60
Alignment explanation
Indices: 449227--449383 Score: 176
Period size: 61 Copynumber: 2.6 Consensus size: 60
449217 ATTTATGTGT
*
449227 TCGCGTTGCGATTTTCATATTCGCGTTGCGATTTTGGAAAATCGCA-ATGCGAATT-TGACTA
1 TCGCGTTGCGATTTTCATATTCGCGTTGCGATTTTGGAAAAT-G-ATATGCG-ATTCTGACGA
* * * * * **
449288 TCGCATTGCGATTTTCAAGAATCGCGTTGCGATTTTGGAAACTGATTTGCGATTCTGGGGA
1 TCGCGTTGCGATTTTC-ATATTCGCGTTGCGATTTTGGAAAATGATATGCGATTCTGACGA
*
449349 TCGCGTTGCGATTTTTAT-TTCGCGTTGCGATTTTG
1 TCGCGTTGCGATTTTCATATTCGCGTTGCGATTTTG
449384 TTGGTCATTT
Statistics
Matches: 81, Mismatches: 12, Indels: 8
0.80 0.12 0.08
Matches are distributed among these distances:
59 16 0.20
60 5 0.06
61 37 0.46
62 23 0.28
ACGTcount: A:0.19, C:0.17, G:0.25, T:0.38
Consensus pattern (60 bp):
TCGCGTTGCGATTTTCATATTCGCGTTGCGATTTTGGAAAATGATATGCGATTCTGACGA
Found at i:449319 original size:41 final size:41
Alignment explanation
Indices: 449227--449383 Score: 110
Period size: 41 Copynumber: 3.9 Consensus size: 41
449217 ATTTATGTGT
* * *
449227 TCGCGTTGCGATTTTCATATTCGCGTTGCGATTTTGGAAAA
1 TCGCGTTGCGATTTTGATATTCGCATTGCGATTTTGCAAAA
** *
449268 TCGCAATGCGAATTTGACTA-TCGCATTGCGATTTT-CAAGAA
1 TCGCGTTGCGATTTTGA-TATTCGCATTGCGATTTTGCAA-AA
* * * ***
449309 TCGCGTTGCGATTTTGGAAACT-G-ATTTGCGATTCTG-GGGA
1 TCGCGTTGCGATTTT-GATATTCGCA-TTGCGATTTTGCAAAA
* *
449349 TCGCGTTGCGATTTTTAT-TTCGCGTTGCGATTTTG
1 TCGCGTTGCGATTTTGATATTCGCATTGCGATTTTG
449384 TTGGTCATTT
Statistics
Matches: 89, Mismatches: 19, Indels: 18
0.71 0.15 0.14
Matches are distributed among these distances:
38 1 0.01
39 12 0.13
40 19 0.21
41 52 0.58
42 5 0.06
ACGTcount: A:0.19, C:0.17, G:0.25, T:0.38
Consensus pattern (41 bp):
TCGCGTTGCGATTTTGATATTCGCATTGCGATTTTGCAAAA
Found at i:450373 original size:29 final size:29
Alignment explanation
Indices: 450331--450389 Score: 118
Period size: 29 Copynumber: 2.0 Consensus size: 29
450321 ATTTTCACCT
450331 AACTAAATTGATGTAAGCAATGACATCAA
1 AACTAAATTGATGTAAGCAATGACATCAA
450360 AACTAAATTGATGTAAGCAATGACATCAA
1 AACTAAATTGATGTAAGCAATGACATCAA
450389 A
1 A
450390 TTAATTTAGG
Statistics
Matches: 30, Mismatches: 0, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
29 30 1.00
ACGTcount: A:0.49, C:0.14, G:0.14, T:0.24
Consensus pattern (29 bp):
AACTAAATTGATGTAAGCAATGACATCAA
Found at i:455055 original size:29 final size:28
Alignment explanation
Indices: 455009--455068 Score: 93
Period size: 29 Copynumber: 2.1 Consensus size: 28
454999 TTCACCTAAC
* *
455009 TAAATTGATGTAAGCAATGACATCAAAAT
1 TAAATTGATGCAAACAATGACATC-AAAT
455038 TAAATTGATGCAAACAATGACATCAAAT
1 TAAATTGATGCAAACAATGACATCAAAT
455066 TAA
1 TAA
455069 TTTAGGTGTG
Statistics
Matches: 29, Mismatches: 2, Indels: 1
0.91 0.06 0.03
Matches are distributed among these distances:
28 7 0.24
29 22 0.76
ACGTcount: A:0.50, C:0.12, G:0.12, T:0.27
Consensus pattern (28 bp):
TAAATTGATGCAAACAATGACATCAAAT
Found at i:462085 original size:34 final size:34
Alignment explanation
Indices: 462042--462151 Score: 93
Period size: 35 Copynumber: 3.2 Consensus size: 34
462032 GGTAAGAAAT
* * *
462042 TTATTTTTATGTTAGTAT-TTT-TTTAAATAGTTA
1 TTATTTTTATATTAATATATTTATGTAAATA-TTA
462075 TTATATTTTATATTAATATATTTATGTAAATATTA
1 TTAT-TTTTATATTAATATATTTATGTAAATATTA
* *
462110 TT-TTTTT-TATTGAAATAATATTTATATAATTATTA
1 TTATTTTTATATT--AAT-ATATTTATGTAAATATTA
462145 TTTATTT
1 -TTATTT
462152 AGAATTATTA
Statistics
Matches: 64, Mismatches: 5, Indels: 12
0.79 0.06 0.15
Matches are distributed among these distances:
32 4 0.06
33 8 0.12
34 16 0.25
35 24 0.38
36 9 0.14
37 3 0.05
ACGTcount: A:0.34, C:0.00, G:0.05, T:0.62
Consensus pattern (34 bp):
TTATTTTTATATTAATATATTTATGTAAATATTA
Found at i:462111 original size:35 final size:35
Alignment explanation
Indices: 462065--462151 Score: 99
Period size: 35 Copynumber: 2.5 Consensus size: 35
462055 AGTATTTTTT
*
462065 TAAATAGTTATTATATTTTATATT-AAT-ATATTTATG
1 TAAATA-TTATT-TATTTT-TATTAAATAATATTTATA
462101 TAAATATTATTT-TTTTTATTGAAATAATATTTATA
1 TAAATATTATTTATTTTTATT-AAATAATATTTATA
*
462136 TAATTATTATTTATTT
1 TAAATATTATTTATTT
462152 AGAATTATTA
Statistics
Matches: 45, Mismatches: 2, Indels: 8
0.82 0.04 0.15
Matches are distributed among these distances:
32 4 0.09
33 4 0.09
34 4 0.09
35 24 0.53
36 9 0.20
ACGTcount: A:0.38, C:0.00, G:0.03, T:0.59
Consensus pattern (35 bp):
TAAATATTATTTATTTTTATTAAATAATATTTATA
Found at i:463958 original size:21 final size:21
Alignment explanation
Indices: 463932--464000 Score: 104
Period size: 21 Copynumber: 3.3 Consensus size: 21
463922 CCATCTCCGT
*
463932 AGGGTTACATTCCGAGCCCGC
1 AGGGTTACATTCCTAGCCCGC
463953 AGGGTTACATTCCTAGCCCGCC
1 AGGGTTACATTCCTAGCCCG-C
*
463975 A-GGTTACATGCCTAGCCCGC
1 AGGGTTACATTCCTAGCCCGC
463995 AGGGTT
1 AGGGTT
464001 TTATACCATA
Statistics
Matches: 44, Mismatches: 2, Indels: 4
0.88 0.04 0.08
Matches are distributed among these distances:
20 2 0.05
21 40 0.91
22 2 0.05
ACGTcount: A:0.19, C:0.32, G:0.28, T:0.22
Consensus pattern (21 bp):
AGGGTTACATTCCTAGCCCGC
Found at i:464615 original size:34 final size:34
Alignment explanation
Indices: 464519--464619 Score: 121
Period size: 34 Copynumber: 3.0 Consensus size: 34
464509 GATAAATGTT
* *
464519 TTTAAAATACAAATTATATTATTCAAAATTTAAA
1 TTTAAAATAAAAATTATATTATTCGAAATTTAAA
* * *
464553 ATAAAAATAAAAATAATATTATTCGAAATTTAAA
1 TTTAAAATAAAAATTATATTATTCGAAATTTAAA
* * * *
464587 TTTAAAATATAAATTTTAGTATTTGAAATTTAA
1 TTTAAAATAAAAATTATATTATTCGAAATTTAA
464620 CATTAAATTT
Statistics
Matches: 55, Mismatches: 12, Indels: 0
0.82 0.18 0.00
Matches are distributed among these distances:
34 55 1.00
ACGTcount: A:0.53, C:0.03, G:0.03, T:0.41
Consensus pattern (34 bp):
TTTAAAATAAAAATTATATTATTCGAAATTTAAA
Found at i:465571 original size:8 final size:8
Alignment explanation
Indices: 465558--465598 Score: 66
Period size: 8 Copynumber: 5.2 Consensus size: 8
465548 TCACAAGCTT
465558 TCAAATTC
1 TCAAATTC
465566 TCAAATTC
1 TCAAATTC
*
465574 TCAAACTC
1 TCAAATTC
465582 T-AAATTC
1 TCAAATTC
465589 TCAAATTC
1 TCAAATTC
465597 TC
1 TC
465599 TGAAAATGAG
Statistics
Matches: 30, Mismatches: 2, Indels: 2
0.88 0.06 0.06
Matches are distributed among these distances:
7 6 0.20
8 24 0.80
ACGTcount: A:0.37, C:0.27, G:0.00, T:0.37
Consensus pattern (8 bp):
TCAAATTC
Found at i:465588 original size:15 final size:16
Alignment explanation
Indices: 465558--465598 Score: 57
Period size: 15 Copynumber: 2.6 Consensus size: 16
465548 TCACAAGCTT
*
465558 TCAAATTCTCAAATTC
1 TCAAACTCTCAAATTC
465574 TCAAACTCT-AAATTC
1 TCAAACTCTCAAATTC
*
465589 TCAAATTCTC
1 TCAAACTCTC
465599 TGAAAATGAG
Statistics
Matches: 22, Mismatches: 2, Indels: 2
0.85 0.08 0.08
Matches are distributed among these distances:
15 14 0.64
16 8 0.36
ACGTcount: A:0.37, C:0.27, G:0.00, T:0.37
Consensus pattern (16 bp):
TCAAACTCTCAAATTC
Found at i:486567 original size:13 final size:13
Alignment explanation
Indices: 486549--486582 Score: 68
Period size: 13 Copynumber: 2.6 Consensus size: 13
486539 AGACTGCAAA
486549 AGAAAATGGAATG
1 AGAAAATGGAATG
486562 AGAAAATGGAATG
1 AGAAAATGGAATG
486575 AGAAAATG
1 AGAAAATG
486583 AATAAAGAGA
Statistics
Matches: 21, Mismatches: 0, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
13 21 1.00
ACGTcount: A:0.56, C:0.00, G:0.29, T:0.15
Consensus pattern (13 bp):
AGAAAATGGAATG
Found at i:508620 original size:103 final size:103
Alignment explanation
Indices: 508297--508612 Score: 560
Period size: 103 Copynumber: 3.1 Consensus size: 103
508287 GGGTCTACGC
508297 GGTCCTTCGGGACATATATGTATTCTTTGGAACATGTGTGAAGTCTGGTGAGACACATACTTGAT
1 GGTCCTTCGGGACATATATGTATTCTTTGGAACATGTGTGAAGTCTGGTGAGACACATACTTGAT
508362 CCTTGGCATATGTATATGATTCTTAAGGAATGATATAT
66 CCTTGGCATATGTATATGATTCTTAAGGAATGATATAT
508400 GGTCCTTCGGGACATATATGTATTCTTTGGAACATGTGTGAAGTCTGGTGAGACACATACTTGAT
1 GGTCCTTCGGGACATATATGTATTCTTTGGAACATGTGTGAAGTCTGGTGAGACACATACTTGAT
508465 CCTTGGCATATGTATATGATTCTTAAGGAATGATATAT
66 CCTTGGCATATGTATATGATTCTTAAGGAATGATATAT
** *
508503 GGTTATTCGGGACATATATGTATTCTTTGGAACATGTGTGAAGTATGGTGAGACACATACTTGAT
1 GGTCCTTCGGGACATATATGTATTCTTTGGAACATGTGTGAAGTCTGGTGAGACACATACTTGAT
* * * *
508568 CCCTAGTATATGTATATGATTCTTAAGGAATGATATGT
66 CCTTGGCATATGTATATGATTCTTAAGGAATGATATAT
*
508606 AGTCCTT
1 GGTCCTT
508613 ATGGACATTA
Statistics
Matches: 203, Mismatches: 10, Indels: 0
0.95 0.05 0.00
Matches are distributed among these distances:
103 203 1.00
ACGTcount: A:0.28, C:0.13, G:0.23, T:0.36
Consensus pattern (103 bp):
GGTCCTTCGGGACATATATGTATTCTTTGGAACATGTGTGAAGTCTGGTGAGACACATACTTGAT
CCTTGGCATATGTATATGATTCTTAAGGAATGATATAT
Found at i:508655 original size:23 final size:23
Alignment explanation
Indices: 508629--508696 Score: 73
Period size: 23 Copynumber: 3.0 Consensus size: 23
508619 ATTATTATAT
* *
508629 GGCACTACGGTGTAATTCTATGC
1 GGCACTACGGTGCAATTCTACGC
* *
508652 GGCACTCCGGTGCAATTCTACGT
1 GGCACTACGGTGCAATTCTACGC
* * *
508675 GGCACTTCGGTACAATTATACG
1 GGCACTACGGTGCAATTCTACG
508697 AGCTGTGGTG
Statistics
Matches: 38, Mismatches: 7, Indels: 0
0.84 0.16 0.00
Matches are distributed among these distances:
23 38 1.00
ACGTcount: A:0.22, C:0.25, G:0.25, T:0.28
Consensus pattern (23 bp):
GGCACTACGGTGCAATTCTACGC
Found at i:513876 original size:103 final size:103
Alignment explanation
Indices: 513692--513895 Score: 345
Period size: 103 Copynumber: 2.0 Consensus size: 103
513682 GGGTCTACGC
* * *
513692 GGTCCTTCGGGACATATATGTATTCTTTGGAACATGTGTGAAGTCTGGTGAGACATATACTTGAT
1 GGTCATTCGGGACATATATGTATTCTTTGGAACATATGTGAAGTCTGGTGAGACACATACTTGAT
* *
513757 CCTTGGCATATGTATATGATTCTTAAGGAATGATATAT
66 CCCTAGCATATGTATATGATTCTTAAGGAATGATATAT
513795 GGTCATTCGGGACATATATGTATTCTTTGGAACATATGTGAAGTCTGGTGAGACACATACTTGAT
1 GGTCATTCGGGACATATATGTATTCTTTGGAACATATGTGAAGTCTGGTGAGACACATACTTGAT
* *
513860 CCCTAGTATATGTATATGATTCTTACGGAATGATAT
66 CCCTAGCATATGTATATGATTCTTAAGGAATGATAT
513896 GTAGTCCTTA
Statistics
Matches: 94, Mismatches: 7, Indels: 0
0.93 0.07 0.00
Matches are distributed among these distances:
103 94 1.00
ACGTcount: A:0.28, C:0.13, G:0.23, T:0.36
Consensus pattern (103 bp):
GGTCATTCGGGACATATATGTATTCTTTGGAACATATGTGAAGTCTGGTGAGACACATACTTGAT
CCCTAGCATATGTATATGATTCTTAAGGAATGATATAT
Found at i:513954 original size:23 final size:23
Alignment explanation
Indices: 513921--513988 Score: 91
Period size: 23 Copynumber: 3.0 Consensus size: 23
513911 ATTATTATAT
*
513921 GGCACTACGGTGCAATTCTACGC
1 GGCACTACGGTGTAATTCTACGC
* *
513944 GGCACTCCGGTGTAATTCTACGT
1 GGCACTACGGTGTAATTCTACGC
* *
513967 GGCACTTCGGTGTAATTATACG
1 GGCACTACGGTGTAATTCTACG
513989 AGCTGTGGTG
Statistics
Matches: 40, Mismatches: 5, Indels: 0
0.89 0.11 0.00
Matches are distributed among these distances:
23 40 1.00
ACGTcount: A:0.21, C:0.25, G:0.26, T:0.28
Consensus pattern (23 bp):
GGCACTACGGTGTAATTCTACGC
Found at i:522391 original size:62 final size:63
Alignment explanation
Indices: 522282--522402 Score: 190
Period size: 62 Copynumber: 1.9 Consensus size: 63
522272 GGCAAAGATC
* *
522282 TAATCACTCTCATTGATCTAAATATCATTGACACATAGGATGGTTGAGTTCGTACCAAACATG
1 TAATCACTCTCATTGATCTAAAGATCATTGACACATAGGATGGTTGAGGTCGTACCAAACATG
* * *
522345 TAATCACTCTCGTTGATCT-AAGATCATTGGCACGTAGGATGGTTGAGGTCGTACCAAA
1 TAATCACTCTCATTGATCTAAAGATCATTGACACATAGGATGGTTGAGGTCGTACCAAA
522403 TATTGGACCA
Statistics
Matches: 53, Mismatches: 5, Indels: 1
0.90 0.08 0.02
Matches are distributed among these distances:
62 35 0.66
63 18 0.34
ACGTcount: A:0.31, C:0.19, G:0.20, T:0.31
Consensus pattern (63 bp):
TAATCACTCTCATTGATCTAAAGATCATTGACACATAGGATGGTTGAGGTCGTACCAAACATG
Found at i:537286 original size:54 final size:54
Alignment explanation
Indices: 537228--537347 Score: 159
Period size: 54 Copynumber: 2.2 Consensus size: 54
537218 GTGGGATTGA
* *
537228 AGGTGGCGGTGGTGATGGTGATGGATAAGTAGGCGGCAGAGGTGAGGGCGGGGG
1 AGGTGACGGTGGTGAGGGTGATGGATAAGTAGGCGGCAGAGGTGAGGGCGGGGG
* * * ** *
537282 AGGTGATGGTGGTGGGGGTGATGGATAAGTAGGTGGTGGTGGTGAGGGCGGGGG
1 AGGTGACGGTGGTGAGGGTGATGGATAAGTAGGCGGCAGAGGTGAGGGCGGGGG
*
537336 AGGTGATGGTGG
1 AGGTGACGGTGG
537348 AGGCGGTGGA
Statistics
Matches: 58, Mismatches: 8, Indels: 0
0.88 0.12 0.00
Matches are distributed among these distances:
54 58 1.00
ACGTcount: A:0.17, C:0.04, G:0.59, T:0.20
Consensus pattern (54 bp):
AGGTGACGGTGGTGAGGGTGATGGATAAGTAGGCGGCAGAGGTGAGGGCGGGGG
Found at i:537295 original size:24 final size:24
Alignment explanation
Indices: 537268--537347 Score: 70
Period size: 24 Copynumber: 3.1 Consensus size: 24
537258 AGGCGGCAGA
537268 GGTGAGGGCGGGGGAGGTGATGGT
1 GGTGAGGGCGGGGGAGGTGATGGT
* * * *
537292 GGTGGGGGTGATGGATAAGTAGGTGGTGGT
1 GGTGAGGGCG--GG----GGAGGTGATGGT
537322 GGTGAGGGCGGGGGAGGTGATGGT
1 GGTGAGGGCGGGGGAGGTGATGGT
537346 GG
1 GG
537348 AGGCGGTGGA
Statistics
Matches: 42, Mismatches: 8, Indels: 12
0.68 0.13 0.19
Matches are distributed among these distances:
24 20 0.48
26 2 0.05
28 2 0.05
30 18 0.43
ACGTcount: A:0.14, C:0.03, G:0.64, T:0.20
Consensus pattern (24 bp):
GGTGAGGGCGGGGGAGGTGATGGT
Found at i:537370 original size:54 final size:54
Alignment explanation
Indices: 537268--537379 Score: 147
Period size: 54 Copynumber: 2.1 Consensus size: 54
537258 AGGCGGCAGA
* * * * *
537268 GGTGAGGGCGGGGGAGGTGATGGTGGTGGGGGTGATGGATAAGTAGGTGGTGGT
1 GGTGAGGGCGGGGGAGGTGATGGTGGAGGCGGTGATAGATAAGCAGGTGGAGGT
537322 GGTGAGGGCGGGGGAGGTGATGGTGGAGGCGGTGGATAG-TGAA-CAGGTGGAGGT
1 GGTGAGGGCGGGGGAGGTGATGGTGGAGGCGGT-GATAGAT-AAGCAGGTGGAGGT
537376 GGTG
1 GGTG
537380 GAGGAGGTGA
Statistics
Matches: 51, Mismatches: 5, Indels: 4
0.85 0.08 0.07
Matches are distributed among these distances:
54 45 0.88
55 6 0.12
ACGTcount: A:0.16, C:0.04, G:0.61, T:0.20
Consensus pattern (54 bp):
GGTGAGGGCGGGGGAGGTGATGGTGGAGGCGGTGATAGATAAGCAGGTGGAGGT
Found at i:537431 original size:42 final size:42
Alignment explanation
Indices: 537385--537470 Score: 118
Period size: 42 Copynumber: 2.0 Consensus size: 42
537375 TGGTGGAGGA
* *
537385 GGTGAGAGCGGTGGTGGTGGAGGCGAGTATACTGGAGGTGGT
1 GGTGAGAGCGGTGGTGGGGGAGGCGAGTAAACTGGAGGTGGT
* * * *
537427 GGTGAGGGTGGTGGTGGGGGAGGTGAGTAAACTGGTGGTGGT
1 GGTGAGAGCGGTGGTGGGGGAGGCGAGTAAACTGGAGGTGGT
537469 GG
1 GG
537471 GGGAGGTGGA
Statistics
Matches: 38, Mismatches: 6, Indels: 0
0.86 0.14 0.00
Matches are distributed among these distances:
42 38 1.00
ACGTcount: A:0.15, C:0.05, G:0.58, T:0.22
Consensus pattern (42 bp):
GGTGAGAGCGGTGGTGGGGGAGGCGAGTAAACTGGAGGTGGT
Found at i:537452 original size:21 final size:21
Alignment explanation
Indices: 537373--537453 Score: 65
Period size: 21 Copynumber: 3.9 Consensus size: 21
537363 AACAGGTGGA
* *
537373 GGTGGTGGAGGAGGTGAGAGC
1 GGTGGTGGTGGAGGTGAGAGT
*
537394 GGTGGTGGTGGAGGCGAGTA-T
1 GGTGGTGGTGGAGGTGAG-AGT
** * * *
537415 ACTGGAGGTGGTGGTGAGGGT
1 GGTGGTGGTGGAGGTGAGAGT
*
537436 GGTGGTGGGGGAGGTGAG
1 GGTGGTGGTGGAGGTGAG
537454 TAAACTGGTG
Statistics
Matches: 44, Mismatches: 14, Indels: 4
0.71 0.23 0.06
Matches are distributed among these distances:
21 43 0.98
22 1 0.02
ACGTcount: A:0.15, C:0.04, G:0.62, T:0.20
Consensus pattern (21 bp):
GGTGGTGGTGGAGGTGAGAGT
Found at i:537463 original size:27 final size:28
Alignment explanation
Indices: 537433--537497 Score: 96
Period size: 27 Copynumber: 2.3 Consensus size: 28
537423 TGGTGGTGAG
*
537433 GGTGGTGGTGGGGGAGGT-GAGTAAACT
1 GGTGGTGGTGGGGGAGGTGGAGTAAACC
537460 GGTGGTGGTGGGGGAGGTGGAGAGTAAACC
1 GGTGGTGGTGGGGGAGGT-G-GAGTAAACC
537490 GGTGGTGG
1 GGTGGTGG
537498 GGGAGAGTAT
Statistics
Matches: 34, Mismatches: 1, Indels: 3
0.89 0.03 0.08
Matches are distributed among these distances:
27 18 0.53
30 16 0.47
ACGTcount: A:0.17, C:0.05, G:0.58, T:0.20
Consensus pattern (28 bp):
GGTGGTGGTGGGGGAGGTGGAGTAAACC
Found at i:537469 original size:30 final size:30
Alignment explanation
Indices: 537433--537497 Score: 87
Period size: 30 Copynumber: 2.2 Consensus size: 30
537423 TGGTGGTGAG
* *
537433 GGTGGTGGTGGG-GGAGGTGAGTAAACTGGT
1 GGTGGTGG-GGGAGGAGGAGAGTAAACCGGT
*
537463 GGTGGTGGGGGAGGTGGAGAGTAAACCGGT
1 GGTGGTGGGGGAGGAGGAGAGTAAACCGGT
537493 GGTGG
1 GGTGG
537498 GGGAGAGTAT
Statistics
Matches: 31, Mismatches: 3, Indels: 2
0.86 0.08 0.06
Matches are distributed among these distances:
29 3 0.10
30 28 0.90
ACGTcount: A:0.17, C:0.05, G:0.58, T:0.20
Consensus pattern (30 bp):
GGTGGTGGGGGAGGAGGAGAGTAAACCGGT
Found at i:539187 original size:6 final size:6
Alignment explanation
Indices: 539176--539201 Score: 52
Period size: 6 Copynumber: 4.3 Consensus size: 6
539166 CCACACAAAC
539176 AAGCTA AAGCTA AAGCTA AAGCTA AA
1 AAGCTA AAGCTA AAGCTA AAGCTA AA
539202 AGAACAAATC
Statistics
Matches: 20, Mismatches: 0, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
6 20 1.00
ACGTcount: A:0.54, C:0.15, G:0.15, T:0.15
Consensus pattern (6 bp):
AAGCTA
Found at i:540803 original size:14 final size:14
Alignment explanation
Indices: 540784--540833 Score: 50
Period size: 14 Copynumber: 3.7 Consensus size: 14
540774 TTTTATATTA
540784 ATTATAATTTTTAT
1 ATTATAATTTTTAT
* *
540798 ATTATAAATCTTA-
1 ATTATAATTTTTAT
**
540811 ATTATAATCATTAT
1 ATTATAATTTTTAT
540825 ATTA-AATTT
1 ATTATAATTT
540834 ATTAAATATT
Statistics
Matches: 28, Mismatches: 7, Indels: 3
0.74 0.18 0.08
Matches are distributed among these distances:
13 13 0.46
14 15 0.54
ACGTcount: A:0.42, C:0.04, G:0.00, T:0.54
Consensus pattern (14 bp):
ATTATAATTTTTAT
Found at i:540871 original size:24 final size:24
Alignment explanation
Indices: 540824--540871 Score: 62
Period size: 24 Copynumber: 2.0 Consensus size: 24
540814 ATAATCATTA
* *
540824 TATTAAATTTATTAAATATTATTT
1 TATTAAATTTATTAAAAATAATTT
540848 TATTAAA-TTATATAAAAATAATTT
1 TATTAAATTTAT-TAAAAATAATTT
540872 AAATATTTAT
Statistics
Matches: 21, Mismatches: 2, Indels: 2
0.84 0.08 0.08
Matches are distributed among these distances:
23 4 0.19
24 17 0.81
ACGTcount: A:0.48, C:0.00, G:0.00, T:0.52
Consensus pattern (24 bp):
TATTAAATTTATTAAAAATAATTT
Found at i:540911 original size:29 final size:29
Alignment explanation
Indices: 540879--540949 Score: 142
Period size: 29 Copynumber: 2.4 Consensus size: 29
540869 TTTAAATATT
540879 TATAAGTATATATATATTAAACTTATGCA
1 TATAAGTATATATATATTAAACTTATGCA
540908 TATAAGTATATATATATTAAACTTATGCA
1 TATAAGTATATATATATTAAACTTATGCA
540937 TATAAGTATATAT
1 TATAAGTATATAT
540950 GTTTTTAACG
Statistics
Matches: 42, Mismatches: 0, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
29 42 1.00
ACGTcount: A:0.45, C:0.06, G:0.07, T:0.42
Consensus pattern (29 bp):
TATAAGTATATATATATTAAACTTATGCA
Found at i:547506 original size:15 final size:15
Alignment explanation
Indices: 547458--547507 Score: 57
Period size: 15 Copynumber: 3.3 Consensus size: 15
547448 CTTGTCGGGG
* *
547458 TCTTCCTCTTCCTCC
1 TCTTCCTCTTCTTCA
*
547473 TCTTCCTCTTTCTT-T
1 TCTTCCTC-TTCTTCA
547488 TCTTCCTCTTCTTCA
1 TCTTCCTCTTCTTCA
547503 TCTTC
1 TCTTC
547508 TTCAGGAGGG
Statistics
Matches: 30, Mismatches: 3, Indels: 4
0.81 0.08 0.11
Matches are distributed among these distances:
14 5 0.17
15 21 0.70
16 4 0.13
ACGTcount: A:0.02, C:0.42, G:0.00, T:0.56
Consensus pattern (15 bp):
TCTTCCTCTTCTTCA
Found at i:548884 original size:33 final size:33
Alignment explanation
Indices: 548838--548907 Score: 106
Period size: 33 Copynumber: 2.1 Consensus size: 33
548828 TATTTTGTTT
*
548838 GGGTCGAGGTTTTTTAAGTGTGATATTCAGGTC
1 GGGTCGAGGTTTTTTAAGTGTCATATTCAGGTC
*
548871 GGGTCG-GGTTTTTTTAAGTGTCATATTCGGGTC
1 GGGTCGAGG-TTTTTTAAGTGTCATATTCAGGTC
548904 GGGT
1 GGGT
548908 TTAGAGTGAA
Statistics
Matches: 34, Mismatches: 2, Indels: 2
0.89 0.05 0.05
Matches are distributed among these distances:
32 2 0.06
33 32 0.94
ACGTcount: A:0.14, C:0.10, G:0.36, T:0.40
Consensus pattern (33 bp):
GGGTCGAGGTTTTTTAAGTGTCATATTCAGGTC
Found at i:550904 original size:37 final size:38
Alignment explanation
Indices: 550820--550908 Score: 146
Period size: 38 Copynumber: 2.4 Consensus size: 38
550810 CCTAAACTCG
*
550820 AACCCGACCCGACCTGACCCGAATATCACACTTAAAAA
1 AACCCGACCCGACCTGACCAGAATATCACACTTAAAAA
550858 AACCCGACCCGA-CTCGACCAGAATATCACACTT-AAAA
1 AACCCGACCCGACCT-GACCAGAATATCACACTTAAAAA
550895 AACCCGACCCGACC
1 AACCCGACCCGACC
550909 CGAACAAATA
Statistics
Matches: 48, Mismatches: 1, Indels: 4
0.91 0.02 0.08
Matches are distributed among these distances:
37 18 0.38
38 30 0.62
ACGTcount: A:0.38, C:0.39, G:0.11, T:0.11
Consensus pattern (38 bp):
AACCCGACCCGACCTGACCAGAATATCACACTTAAAAA
Found at i:551265 original size:263 final size:258
Alignment explanation
Indices: 550771--551337 Score: 893
Period size: 263 Copynumber: 2.2 Consensus size: 258
550761 TATAATGTAA
* * * **
550771 AATTATATATTTTTTTCGGTTCAGTCCGTTTTTTTTCACCCTAAACTCGAACCCGACCCGACCTG
1 AATTATATA-TATTTTCGGGTCGGTCCGGGTTTTTTCACCCTAAACTCGAACCCGACCCGACCTG
* *
550836 ACCCGAATATCACACTTAAAAAAACCCGACCCGACTCGACCAGAATATCACACTTAAAAAACCCG
65 ACCCGAATATCACACTTAAAAAAACCCGACCCGACTCAACCAGAATATCACACTTAAAAAAACCG
* *
550901 ACCCGACCCGAACAAATAAAGTTTCATTCGAACCGACCCGAATATATGAATTAGAAATCCGACCC
130 ACCCGACCCGAACAAATAAAGTTTCATCCGAACCGACCCGAATATATGAATTAGAAATCCAACCC
550966 GACCCGAAATAATAAAAAATTATTTTTATTTAATAAAAACAGTGACTTAA-CCGACCCGACCCG
195 GACCCGAAATAATAAAAAATTATTTTTATTTAATAAAAACAGTGACTTAATCCGACCCGACCCG
*
551029 AATTATATATATTTTCGGGTCGGTCCGGGTTTTTTCACCCTAAACTCGAACCCGATCCGACCCGA
1 AATTATATATATTTTCGGGTCGGTCCGGGTTTTTTCACCCTAAACTCGAACCCGACCCGA-CC--
* *
551094 TCCGATCCGAATATCACACTTAAAAAAACCCGACCCGACTCAACCCGAATATCACACTTAAAAAA
63 T--GACCCGAATATCACACTTAAAAAAACCCGACCCGACTCAACCAGAATATCACACTTAAAAAA
* * * *
551159 ACTGACCCGACCCGAACAAAATAAAGTTTCATCCGACCCGACCTGAATATATGAATTAGAAATTC
126 ACCGACCCGACCCGAAC-AAATAAAGTTTCATCCGAACCGACCCGAATATATGAATTAGAAATCC
* *
551224 AACCCGACCCTAAATAATAAAAAATTATTTTTATTTAATAAAAACAGTGACTTAATCTGACCCGA
190 AACCCGACCCGAAATAATAAAAAATTATTTTTATTTAATAAAAACAGTGACTTAATCCGACCCGA
*
551289 CCTG
255 CCCG
551293 AATTATATATATTTTCGGGTCGGTCCGGGTTTTTTCACCCTAAAC
1 AATTATATATATTTTCGGGTCGGTCCGGGTTTTTTCACCCTAAAC
551338 CCGATCCGAC
Statistics
Matches: 283, Mismatches: 19, Indels: 8
0.91 0.06 0.03
Matches are distributed among these distances:
257 45 0.16
258 11 0.04
260 1 0.00
262 74 0.26
263 96 0.34
264 56 0.20
ACGTcount: A:0.35, C:0.27, G:0.12, T:0.26
Consensus pattern (258 bp):
AATTATATATATTTTCGGGTCGGTCCGGGTTTTTTCACCCTAAACTCGAACCCGACCCGACCTGA
CCCGAATATCACACTTAAAAAAACCCGACCCGACTCAACCAGAATATCACACTTAAAAAAACCGA
CCCGACCCGAACAAATAAAGTTTCATCCGAACCGACCCGAATATATGAATTAGAAATCCAACCCG
ACCCGAAATAATAAAAAATTATTTTTATTTAATAAAAACAGTGACTTAATCCGACCCGACCCG
Found at i:554274 original size:2 final size:2
Alignment explanation
Indices: 554267--554319 Score: 106
Period size: 2 Copynumber: 26.5 Consensus size: 2
554257 TACCTTAATA
554267 AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT
1 AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT AT
554309 AT AT AT AT AT A
1 AT AT AT AT AT A
554320 AGCAACGTAA
Statistics
Matches: 51, Mismatches: 0, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
2 51 1.00
ACGTcount: A:0.51, C:0.00, G:0.00, T:0.49
Consensus pattern (2 bp):
AT
Found at i:559459 original size:13 final size:13
Alignment explanation
Indices: 559441--559467 Score: 54
Period size: 13 Copynumber: 2.1 Consensus size: 13
559431 GATGGGCATT
559441 CTCTTTTTTCCTA
1 CTCTTTTTTCCTA
559454 CTCTTTTTTCCTA
1 CTCTTTTTTCCTA
559467 C
1 C
559468 AGTTATTGTT
Statistics
Matches: 14, Mismatches: 0, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
13 14 1.00
ACGTcount: A:0.07, C:0.33, G:0.00, T:0.59
Consensus pattern (13 bp):
CTCTTTTTTCCTA
Found at i:562879 original size:30 final size:27
Alignment explanation
Indices: 562828--562882 Score: 74
Period size: 30 Copynumber: 1.9 Consensus size: 27
562818 CAAATAATAG
*
562828 TAAAATTATATTTATCTTTTTAAAAGA
1 TAAAATTATATTAATCTTTTTAAAAGA
562855 TAAAATTATGATATAATCCTTTTTAAAA
1 TAAAATTAT-AT-TAAT-CTTTTTAAAA
562883 TTAATACTGA
Statistics
Matches: 24, Mismatches: 1, Indels: 3
0.86 0.04 0.11
Matches are distributed among these distances:
27 9 0.38
28 2 0.08
29 3 0.12
30 10 0.42
ACGTcount: A:0.45, C:0.05, G:0.04, T:0.45
Consensus pattern (27 bp):
TAAAATTATATTAATCTTTTTAAAAGA
Found at i:565141 original size:14 final size:14
Alignment explanation
Indices: 565119--565152 Score: 50
Period size: 14 Copynumber: 2.4 Consensus size: 14
565109 TAAGTCAAGC
*
565119 TTTAAGATTTAGAG
1 TTTAGGATTTAGAG
*
565133 TTTAGGATTTAGGG
1 TTTAGGATTTAGAG
565147 TTTAGG
1 TTTAGG
565153 GTTTTAAGTT
Statistics
Matches: 18, Mismatches: 2, Indels: 0
0.90 0.10 0.00
Matches are distributed among these distances:
14 18 1.00
ACGTcount: A:0.26, C:0.00, G:0.29, T:0.44
Consensus pattern (14 bp):
TTTAGGATTTAGAG
Found at i:565790 original size:12 final size:13
Alignment explanation
Indices: 565773--565801 Score: 51
Period size: 13 Copynumber: 2.3 Consensus size: 13
565763 TAGTATATGT
565773 AATATAA-TTTTA
1 AATATAATTTTTA
565785 AATATAATTTTTA
1 AATATAATTTTTA
565798 AATA
1 AATA
565802 AAAAATCTAA
Statistics
Matches: 16, Mismatches: 0, Indels: 1
0.94 0.00 0.06
Matches are distributed among these distances:
12 7 0.44
13 9 0.56
ACGTcount: A:0.52, C:0.00, G:0.00, T:0.48
Consensus pattern (13 bp):
AATATAATTTTTA
Found at i:576551 original size:11 final size:11
Alignment explanation
Indices: 576511--576551 Score: 52
Period size: 11 Copynumber: 4.0 Consensus size: 11
576501 TCTAATAGTT
576511 TAAGTACTAAA
1 TAAGTACTAAA
*
576522 TAAATACTAAA
1 TAAGTACTAAA
576533 TAAG---TAAA
1 TAAGTACTAAA
576541 TAAGTACTAAA
1 TAAGTACTAAA
576552 ACTTTAACAT
Statistics
Matches: 25, Mismatches: 2, Indels: 6
0.76 0.06 0.18
Matches are distributed among these distances:
8 8 0.32
11 17 0.68
ACGTcount: A:0.59, C:0.07, G:0.07, T:0.27
Consensus pattern (11 bp):
TAAGTACTAAA
Found at i:593586 original size:60 final size:60
Alignment explanation
Indices: 593522--593636 Score: 142
Period size: 60 Copynumber: 1.9 Consensus size: 60
593512 GTCAAGTGAC
* * *
593522 CATTTTATAATTTTTAATAGTCGA-GAAATTCAACAAAACAACATCCTATAATCAAAACAT
1 CATTTTATAACTTTTAATAATCAATGAAATT-AACAAAACAACATCCTATAATCAAAACAT
* * * * *
593582 CATTTTGTAACTTTTAATAATCAATGGACTTAACAAAACAATATCTTATAATCAA
1 CATTTTATAACTTTTAATAATCAATGAAATTAACAAAACAACATCCTATAATCAA
593637 TGGACTTAAC
Statistics
Matches: 46, Mismatches: 8, Indels: 2
0.82 0.14 0.04
Matches are distributed among these distances:
60 42 0.91
61 4 0.09
ACGTcount: A:0.45, C:0.16, G:0.05, T:0.34
Consensus pattern (60 bp):
CATTTTATAACTTTTAATAATCAATGAAATTAACAAAACAACATCCTATAATCAAAACAT
Found at i:593636 original size:31 final size:31
Alignment explanation
Indices: 593598--593668 Score: 142
Period size: 31 Copynumber: 2.3 Consensus size: 31
593588 GTAACTTTTA
593598 ATAATCAATGGACTTAACAAAACAATATCTT
1 ATAATCAATGGACTTAACAAAACAATATCTT
593629 ATAATCAATGGACTTAACAAAACAATATCTT
1 ATAATCAATGGACTTAACAAAACAATATCTT
593660 ATAATCAAT
1 ATAATCAAT
593669 AGGCCATTTG
Statistics
Matches: 40, Mismatches: 0, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
31 40 1.00
ACGTcount: A:0.49, C:0.15, G:0.06, T:0.30
Consensus pattern (31 bp):
ATAATCAATGGACTTAACAAAACAATATCTT
Found at i:610052 original size:5 final size:5
Alignment explanation
Indices: 610042--610066 Score: 50
Period size: 5 Copynumber: 5.0 Consensus size: 5
610032 CACATAAAAG
610042 TTAAA TTAAA TTAAA TTAAA TTAAA
1 TTAAA TTAAA TTAAA TTAAA TTAAA
610067 CAACTAAAAG
Statistics
Matches: 20, Mismatches: 0, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
5 20 1.00
ACGTcount: A:0.60, C:0.00, G:0.00, T:0.40
Consensus pattern (5 bp):
TTAAA
Found at i:613694 original size:3 final size:3
Alignment explanation
Indices: 613686--613710 Score: 50
Period size: 3 Copynumber: 8.3 Consensus size: 3
613676 ATGAATCGAA
613686 GAG GAG GAG GAG GAG GAG GAG GAG G
1 GAG GAG GAG GAG GAG GAG GAG GAG G
613711 GCGTGTGAGG
Statistics
Matches: 22, Mismatches: 0, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
3 22 1.00
ACGTcount: A:0.32, C:0.00, G:0.68, T:0.00
Consensus pattern (3 bp):
GAG
Found at i:616778 original size:23 final size:23
Alignment explanation
Indices: 616745--616790 Score: 83
Period size: 23 Copynumber: 2.0 Consensus size: 23
616735 TTAATTAAAC
616745 TTTTGTAACACATTTATCTCTGT
1 TTTTGTAACACATTTATCTCTGT
*
616768 TTTTGTGACACATTTATCTCTGT
1 TTTTGTAACACATTTATCTCTGT
616791 CTTCTGATAG
Statistics
Matches: 22, Mismatches: 1, Indels: 0
0.96 0.04 0.00
Matches are distributed among these distances:
23 22 1.00
ACGTcount: A:0.20, C:0.17, G:0.11, T:0.52
Consensus pattern (23 bp):
TTTTGTAACACATTTATCTCTGT
Found at i:617803 original size:31 final size:31
Alignment explanation
Indices: 617765--617918 Score: 242
Period size: 31 Copynumber: 5.0 Consensus size: 31
617755 CCCGAAGGAC
* * *
617765 CAGTCCATA-GATTCCGAAGAACCTAGGTAAT
1 CAGTCCATATG-TCCCGAAGAACATAGGTAAA
*
617796 CAGTCCATATGTCCCGAATAACATAGGTAAA
1 CAGTCCATATGTCCCGAAGAACATAGGTAAA
617827 CAGTCCATATGTCCCGAAGAACATAGGTAAA
1 CAGTCCATATGTCCCGAAGAACATAGGTAAA
617858 CAGTCCATATGTCCCGAAGAACATAGGTAAA
1 CAGTCCATATGTCCCGAAGAACATAGGTAAA
617889 CAGTCCATA--TCCCGAAGAACATAGGTAAA
1 CAGTCCATATGTCCCGAAGAACATAGGTAAA
617918 C
1 C
617919 CCTCGACCCT
Statistics
Matches: 117, Mismatches: 5, Indels: 4
0.93 0.04 0.03
Matches are distributed among these distances:
29 21 0.18
31 95 0.81
32 1 0.01
ACGTcount: A:0.38, C:0.23, G:0.18, T:0.20
Consensus pattern (31 bp):
CAGTCCATATGTCCCGAAGAACATAGGTAAA
Found at i:618922 original size:18 final size:18
Alignment explanation
Indices: 618878--618933 Score: 57
Period size: 18 Copynumber: 3.3 Consensus size: 18
618868 ATCGATACCC
618878 CCCCCAGGGGAATCTGT-
1 CCCCCAGGGGAATCTGTA
* *
618895 -TCTC-GGGGAATC-GATA
1 CCCCCAGGGGAATCTG-TA
618911 CCCCCAGGGGAATCTGTA
1 CCCCCAGGGGAATCTGTA
618929 CCCCC
1 CCCCC
618934 TGGACATTCT
Statistics
Matches: 30, Mismatches: 4, Indels: 9
0.70 0.09 0.21
Matches are distributed among these distances:
14 1 0.03
15 9 0.30
16 2 0.07
17 2 0.07
18 15 0.50
19 1 0.03
ACGTcount: A:0.20, C:0.36, G:0.27, T:0.18
Consensus pattern (18 bp):
CCCCCAGGGGAATCTGTA
Found at i:619866 original size:21 final size:21
Alignment explanation
Indices: 619824--619867 Score: 54
Period size: 21 Copynumber: 2.1 Consensus size: 21
619814 ATAAAAAAAT
* *
619824 ATTATAAACTATAATCTCTAA
1 ATTATAAAATATAATCTATAA
619845 ATTATAAAATATATAT-TATAA
1 ATTATAAAATATA-ATCTATAA
619866 AT
1 AT
619868 CTTAAACTTT
Statistics
Matches: 20, Mismatches: 2, Indels: 2
0.83 0.08 0.08
Matches are distributed among these distances:
21 18 0.90
22 2 0.10
ACGTcount: A:0.52, C:0.07, G:0.00, T:0.41
Consensus pattern (21 bp):
ATTATAAAATATAATCTATAA
Found at i:623237 original size:3 final size:3
Alignment explanation
Indices: 623231--623257 Score: 54
Period size: 3 Copynumber: 9.0 Consensus size: 3
623221 CAACAACAAC
623231 AAT AAT AAT AAT AAT AAT AAT AAT AAT
1 AAT AAT AAT AAT AAT AAT AAT AAT AAT
623258 TTCATTAAAT
Statistics
Matches: 24, Mismatches: 0, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
3 24 1.00
ACGTcount: A:0.67, C:0.00, G:0.00, T:0.33
Consensus pattern (3 bp):
AAT
Found at i:625595 original size:162 final size:162
Alignment explanation
Indices: 625324--625638 Score: 605
Period size: 162 Copynumber: 1.9 Consensus size: 162
625314 CGTCTTGTTT
625324 CCCCAAAGAATGTCCTTTTGAAGAAGATCTAAACCTAATTTTCCCTTCGAAGCTTGTTTTCTTGA
1 CCCCAAAGAATGTCCTTTTGAAGAAGATCTAAACCTAATTTTCCCTTCGAAGCTTGTTTTCTTGA
625389 TGCATTCGCTTATAGTTAATGTTTCCCATCAGTTGGAACATTACTCGAAACTCTGCAC-ACAAAA
66 TGCATTCGCTTATAGTTAATGTTTCCCATCAGTTGGAACATTACTCGAAACTCTGCACAACAAAA
625453 CCTGACCAGACAATTTCTTAACCCCCCCCCCC
131 CCTGACCAGACAATTTCTTAACCCCCCCCCCC
*
625485 CCCCGAAGAATGTCCTTTTGAAGAAGATCTAAACCTAAATTTTCCCTTCGAAGCTTGTTTTCTTG
1 CCCCAAAGAATGTCCTTTTGAAGAAGATCTAAACCT-AATTTTCCCTTCGAAGCTTGTTTTCTTG
625550 ATGCATTCGCTTATAGTTAATGTTTCCCATCAGTTGGAACATTACTCGAAACTCTGCACAACAAA
65 ATGCATTCGCTTATAGTTAATGTTTCCCATCAGTTGGAACATTACTCGAAACTCTGCACAACAAA
625615 ACCTGACCAGACAATTTCTTAACC
130 ACCTGACCAGACAATTTCTTAACC
625639 TACATCATGC
Statistics
Matches: 151, Mismatches: 1, Indels: 2
0.98 0.01 0.01
Matches are distributed among these distances:
161 35 0.23
162 87 0.58
163 29 0.19
ACGTcount: A:0.29, C:0.27, G:0.13, T:0.31
Consensus pattern (162 bp):
CCCCAAAGAATGTCCTTTTGAAGAAGATCTAAACCTAATTTTCCCTTCGAAGCTTGTTTTCTTGA
TGCATTCGCTTATAGTTAATGTTTCCCATCAGTTGGAACATTACTCGAAACTCTGCACAACAAAA
CCTGACCAGACAATTTCTTAACCCCCCCCCCC
Found at i:628388 original size:81 final size:80
Alignment explanation
Indices: 628253--628414 Score: 315
Period size: 81 Copynumber: 2.0 Consensus size: 80
628243 GACAAACCGA
628253 TCTCCAACAAGAAGTGTATGGGGAAAGACACCGCAAGAAGCATGGAGTGAAAGAAAGCCTGGCAT
1 TCTCCAACAAGAAGTGTATGGGGAAAGACACCGCAAGAAGCATGGAGTGAAAGAAAGCCTGGCAT
628318 ATCCCATTTGAGAACC
66 AT-CCATTTGAGAACC
628334 TCTCCAACAAGAAGTGTATGGGGAAAGACACCGCAAGAAGCATGGAGTGAAAGAAAGCCTGGCAT
1 TCTCCAACAAGAAGTGTATGGGGAAAGACACCGCAAGAAGCATGGAGTGAAAGAAAGCCTGGCAT
628399 ATCCATTTGAGAACC
66 ATCCATTTGAGAACC
628414 T
1 T
628415 TGGTATAGCC
Statistics
Matches: 81, Mismatches: 0, Indels: 1
0.99 0.00 0.01
Matches are distributed among these distances:
80 14 0.17
81 67 0.83
ACGTcount: A:0.37, C:0.20, G:0.26, T:0.17
Consensus pattern (80 bp):
TCTCCAACAAGAAGTGTATGGGGAAAGACACCGCAAGAAGCATGGAGTGAAAGAAAGCCTGGCAT
ATCCATTTGAGAACC
Found at i:632012 original size:30 final size:30
Alignment explanation
Indices: 631969--632062 Score: 127
Period size: 30 Copynumber: 3.2 Consensus size: 30
631959 TTGTTTAATT
*
631969 TTAAT-TTGAATTTTAGATAAAATATTAAA
1 TTAATCTTAAATTTTAGATAAAATATTAAA
*
631998 TTAATCTTAAATTTTAGATAAAATTTTAAA
1 TTAATCTTAAATTTTAGATAAAATATTAAA
* * * *
632028 TTAATCTTAAAATTTGGATAAGATATTAAT
1 TTAATCTTAAATTTTAGATAAAATATTAAA
632058 TTAAT
1 TTAAT
632063 ATATGAATTT
Statistics
Matches: 57, Mismatches: 7, Indels: 1
0.88 0.11 0.02
Matches are distributed among these distances:
29 5 0.09
30 52 0.91
ACGTcount: A:0.46, C:0.02, G:0.06, T:0.46
Consensus pattern (30 bp):
TTAATCTTAAATTTTAGATAAAATATTAAA
Found at i:637760 original size:26 final size:27
Alignment explanation
Indices: 637708--637762 Score: 78
Period size: 26 Copynumber: 2.1 Consensus size: 27
637698 TTAAACGTCA
*
637708 ATAATTTTTAAAAATTATATGAAATTT
1 ATAATTTTTAAAAATTATATAAAATTT
637735 ATAATTTTT-AAAATTATA-AAATATTT
1 ATAATTTTTAAAAATTATATAAA-ATTT
637761 AT
1 AT
637763 TATTATAAAA
Statistics
Matches: 26, Mismatches: 1, Indels: 3
0.87 0.03 0.10
Matches are distributed among these distances:
25 2 0.08
26 15 0.58
27 9 0.35
ACGTcount: A:0.49, C:0.00, G:0.02, T:0.49
Consensus pattern (27 bp):
ATAATTTTTAAAAATTATATAAAATTT
Found at i:637773 original size:26 final size:26
Alignment explanation
Indices: 637716--637773 Score: 64
Period size: 26 Copynumber: 2.2 Consensus size: 26
637706 CAATAATTTT
* *
637716 TAAAAATTATATGAAATTTATAATTT
1 TAAAAATTATATAAAATTTATAATTA
* *
637742 TTAAAATTATA-AAATATTTATTATTA
1 TAAAAATTATATAAA-ATTTATAATTA
637768 TAAAAA
1 TAAAAA
637774 ATAAACTTGT
Statistics
Matches: 26, Mismatches: 5, Indels: 2
0.79 0.15 0.06
Matches are distributed among these distances:
25 2 0.08
26 24 0.92
ACGTcount: A:0.53, C:0.00, G:0.02, T:0.45
Consensus pattern (26 bp):
TAAAAATTATATAAAATTTATAATTA
Found at i:647075 original size:29 final size:29
Alignment explanation
Indices: 647031--647090 Score: 93
Period size: 29 Copynumber: 2.1 Consensus size: 29
647021 AGATTTTATG
**
647031 TAAGGGATAAAATTAAACTTATAAAATTT
1 TAAGGGATAAAATTAAAAATATAAAATTT
*
647060 TAAGGGATAAATTTAAAAATATAAAATTT
1 TAAGGGATAAAATTAAAAATATAAAATTT
647089 TA
1 TA
647091 GGAGAAAAAA
Statistics
Matches: 28, Mismatches: 3, Indels: 0
0.90 0.10 0.00
Matches are distributed among these distances:
29 28 1.00
ACGTcount: A:0.53, C:0.02, G:0.10, T:0.35
Consensus pattern (29 bp):
TAAGGGATAAAATTAAAAATATAAAATTT
Found at i:650186 original size:28 final size:28
Alignment explanation
Indices: 650142--650198 Score: 78
Period size: 28 Copynumber: 2.0 Consensus size: 28
650132 CTGTCGTTGC
* * *
650142 TTTCAAGCACTGGCTCGATGCCATAATG
1 TTTCAAGCACTGACTCGACGACATAATG
*
650170 TTTCAAGCATTGACTCGACGACATAATG
1 TTTCAAGCACTGACTCGACGACATAATG
650198 T
1 T
650199 AAACATAGAC
Statistics
Matches: 25, Mismatches: 4, Indels: 0
0.86 0.14 0.00
Matches are distributed among these distances:
28 25 1.00
ACGTcount: A:0.28, C:0.23, G:0.19, T:0.30
Consensus pattern (28 bp):
TTTCAAGCACTGACTCGACGACATAATG
Found at i:659151 original size:3 final size:3
Alignment explanation
Indices: 659143--659175 Score: 66
Period size: 3 Copynumber: 11.0 Consensus size: 3
659133 CAAATTACCC
659143 AAT AAT AAT AAT AAT AAT AAT AAT AAT AAT AAT
1 AAT AAT AAT AAT AAT AAT AAT AAT AAT AAT AAT
659176 GTTATGAGAT
Statistics
Matches: 30, Mismatches: 0, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
3 30 1.00
ACGTcount: A:0.67, C:0.00, G:0.00, T:0.33
Consensus pattern (3 bp):
AAT
Found at i:661006 original size:20 final size:21
Alignment explanation
Indices: 660981--661019 Score: 62
Period size: 20 Copynumber: 1.9 Consensus size: 21
660971 GGACTAATTT
660981 TATTTTATT-TTAATTTAATA
1 TATTTTATTATTAATTTAATA
*
661001 TATTTTATTATTATTTTAA
1 TATTTTATTATTAATTTAA
661020 CTTTTCCAAA
Statistics
Matches: 17, Mismatches: 1, Indels: 1
0.89 0.05 0.05
Matches are distributed among these distances:
20 9 0.53
21 8 0.47
ACGTcount: A:0.33, C:0.00, G:0.00, T:0.67
Consensus pattern (21 bp):
TATTTTATTATTAATTTAATA
Found at i:663580 original size:26 final size:28
Alignment explanation
Indices: 663519--663580 Score: 65
Period size: 31 Copynumber: 2.2 Consensus size: 28
663509 GAGTATTGCT
* *
663519 GAGCTCGACTCGACTCGAAAACTTTGAAAT
1 GAGCTCGACTCGACTCGAAAACTTCG--AC
663549 GAAGCTCGACTCGACTCGAAAAC-TCG-C
1 G-AGCTCGACTCGACTCGAAAACTTCGAC
663576 GAGCT
1 GAGCT
663581 TAAAATTTTC
Statistics
Matches: 29, Mismatches: 2, Indels: 6
0.78 0.05 0.16
Matches are distributed among these distances:
26 4 0.14
27 1 0.03
30 3 0.10
31 21 0.72
ACGTcount: A:0.31, C:0.27, G:0.23, T:0.19
Consensus pattern (28 bp):
GAGCTCGACTCGACTCGAAAACTTCGAC
Found at i:666424 original size:22 final size:23
Alignment explanation
Indices: 666391--666434 Score: 63
Period size: 22 Copynumber: 2.0 Consensus size: 23
666381 TAATAATGTA
* *
666391 TCAATAATTTATATGGTTTAAAT
1 TCAATAATTTATAAGGCTTAAAT
666414 TCAAT-ATTTATAAGGCTTAAA
1 TCAATAATTTATAAGGCTTAAA
666435 CTAAAAATAT
Statistics
Matches: 19, Mismatches: 2, Indels: 1
0.86 0.09 0.05
Matches are distributed among these distances:
22 14 0.74
23 5 0.26
ACGTcount: A:0.41, C:0.07, G:0.09, T:0.43
Consensus pattern (23 bp):
TCAATAATTTATAAGGCTTAAAT
Found at i:671738 original size:155 final size:158
Alignment explanation
Indices: 671449--671797 Score: 449
Period size: 155 Copynumber: 2.2 Consensus size: 158
671439 AGTCAAACAT
* * ** * * *
671449 TGGATTCCAGTCGATTTTTAATCAGATACAACTGCGTTGATTTCTATGCCACGTTGAGATAGAAG
1 TGGATTCCAGTCG-TTTTTAATCAGATACAATTGTGTTGATTTCTATGAAACATTGAAATACAAG
* * * *
671514 TACTCAAAACAGTTTCTGGTTATGAGGAAGTGGGAAATTGATGCTATTTAAGGGGGATTGAAATG
65 TACTCAAAACAGTTTCAGGTTATAAGGAAG-GGGAAATTGATGCTATTCAAGGAGGATTGAAATG
*
671579 AAGTAATACATGGTCAGCGCATTCAAACGC
129 AAGTAATACATGGTCAGCACATTCAAACGC
*
671609 TGGATTCCAGTCGTTTTTAATCAGATACAATTGTGTTGGA-TTCTATGAAACATTGAAATACATG
1 TGGATTCCAGTCGTTTTTAATCAGATACAATTGTGTT-GATTTCTATGAAACATTGAAATACAAG
*
671673 TA-TCAAAGCAGTTTCAGGTTATAAGGAA-GGG-AATTGATG-TGATTCAAGGAGGATTGAAATG
65 TACTCAAAACAGTTTCAGGTTATAAGGAAGGGGAAATTGATGCT-ATTCAAGGAGGATTGAAATG
* * *
671734 AAGTAATGCGTGGTCAGCACATTCAAACGT
129 AAGTAATACATGGTCAGCACATTCAAACGC
*
671764 TGGATTCCAGTC-TTGTTTAATCAGATGCAATTGT
1 TGGATTCCAGTCGTT-TTTAATCAGATACAATTGT
671798 ATTGTGTTCA
Statistics
Matches: 168, Mismatches: 18, Indels: 11
0.85 0.09 0.06
Matches are distributed among these distances:
154 3 0.02
155 82 0.49
156 3 0.02
158 23 0.14
159 42 0.25
160 15 0.09
ACGTcount: A:0.32, C:0.13, G:0.24, T:0.32
Consensus pattern (158 bp):
TGGATTCCAGTCGTTTTTAATCAGATACAATTGTGTTGATTTCTATGAAACATTGAAATACAAGT
ACTCAAAACAGTTTCAGGTTATAAGGAAGGGGAAATTGATGCTATTCAAGGAGGATTGAAATGAA
GTAATACATGGTCAGCACATTCAAACGC
Found at i:689298 original size:4 final size:4
Alignment explanation
Indices: 689289--689314 Score: 52
Period size: 4 Copynumber: 6.5 Consensus size: 4
689279 CTACTCTTAA
689289 TATG TATG TATG TATG TATG TATG TA
1 TATG TATG TATG TATG TATG TATG TA
689315 GGGAGAGGGT
Statistics
Matches: 22, Mismatches: 0, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
4 22 1.00
ACGTcount: A:0.27, C:0.00, G:0.23, T:0.50
Consensus pattern (4 bp):
TATG
Found at i:692766 original size:30 final size:30
Alignment explanation
Indices: 692732--692800 Score: 122
Period size: 30 Copynumber: 2.3 Consensus size: 30
692722 TGGCGCAGAT
692732 GAATCTTCAAGACCATTAGACAAGT-ACACA
1 GAATCTTCAAGACCATTAGACAAGTCA-ACA
692762 GAATCTTCAAGACCATTAGACAAGTCAACA
1 GAATCTTCAAGACCATTAGACAAGTCAACA
692792 GAATCTTCA
1 GAATCTTCA
692801 TGATCACACA
Statistics
Matches: 38, Mismatches: 0, Indels: 2
0.95 0.00 0.05
Matches are distributed among these distances:
30 37 0.97
31 1 0.03
ACGTcount: A:0.42, C:0.23, G:0.13, T:0.22
Consensus pattern (30 bp):
GAATCTTCAAGACCATTAGACAAGTCAACA
Found at i:696524 original size:3 final size:3
Alignment explanation
Indices: 696516--696543 Score: 56
Period size: 3 Copynumber: 9.3 Consensus size: 3
696506 ACTGGATTTA
696516 AAG AAG AAG AAG AAG AAG AAG AAG AAG A
1 AAG AAG AAG AAG AAG AAG AAG AAG AAG A
696544 GTCAGTCAAA
Statistics
Matches: 25, Mismatches: 0, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
3 25 1.00
ACGTcount: A:0.68, C:0.00, G:0.32, T:0.00
Consensus pattern (3 bp):
AAG
Found at i:704568 original size:133 final size:133
Alignment explanation
Indices: 704325--704581 Score: 435
Period size: 133 Copynumber: 1.9 Consensus size: 133
704315 CTCACTGATT
* *
704325 TTGTCCTTATACGTCGCAGTAAAATGGGAGCGTCCAACGCAAACATCGACATGTTGTCATTAAAA
1 TTGTCCTTATACATCGCAGTAAAATGGGAGCGTCCAACGCAAACATCAACATGTTGTCATTAAAA
*
704390 TAGGCAATTATAAAAATATTTTGATGTAATAAGTAGAAGTGTTTTTGTTCCCATGATTCAACATT
66 CAGGCAATTATAAAAATATTTTGATGTAATAAGTAGAAGTGTTTTTGTTCCCATGATTCAACATT
704455 TAC
131 TAC
* * *
704458 TTGTCCTTATACATCGCAGTAAAATGAGG-TCGTCGAATGCAAACATCAACATGTTGTCATTAAA
1 TTGTCCTTATACATCGCAGTAAAATG-GGAGCGTCCAACGCAAACATCAACATGTTGTCATTAAA
*
704522 ACAGGCAATTATAAAAATATTTTGATGTAATAAGTAGAAGTTTTTTTGTTCCCATGATTC
65 ACAGGCAATTATAAAAATATTTTGATGTAATAAGTAGAAGTGTTTTTGTTCCCATGATTC
704582 TCATCATAAA
Statistics
Matches: 116, Mismatches: 7, Indels: 2
0.93 0.06 0.02
Matches are distributed among these distances:
133 114 0.98
134 2 0.02
ACGTcount: A:0.34, C:0.15, G:0.17, T:0.34
Consensus pattern (133 bp):
TTGTCCTTATACATCGCAGTAAAATGGGAGCGTCCAACGCAAACATCAACATGTTGTCATTAAAA
CAGGCAATTATAAAAATATTTTGATGTAATAAGTAGAAGTGTTTTTGTTCCCATGATTCAACATT
TAC
Found at i:705535 original size:18 final size:18
Alignment explanation
Indices: 705489--705536 Score: 69
Period size: 18 Copynumber: 2.7 Consensus size: 18
705479 ATGCTAAATG
705489 GGTACCGATACCATGACA
1 GGTACCGATACCATGACA
* *
705507 AGCACCGATACCATGACA
1 GGTACCGATACCATGACA
*
705525 GGTACCCATACC
1 GGTACCGATACC
705537 TATTTACATA
Statistics
Matches: 25, Mismatches: 5, Indels: 0
0.83 0.17 0.00
Matches are distributed among these distances:
18 25 1.00
ACGTcount: A:0.33, C:0.33, G:0.19, T:0.15
Consensus pattern (18 bp):
GGTACCGATACCATGACA
Found at i:708494 original size:16 final size:17
Alignment explanation
Indices: 708473--708505 Score: 50
Period size: 16 Copynumber: 2.0 Consensus size: 17
708463 AGTTTTTTTA
*
708473 ATTTTAACTT-ATTATT
1 ATTTTAAATTCATTATT
708489 ATTTTAAATTCATTATT
1 ATTTTAAATTCATTATT
708506 GATAAAAATA
Statistics
Matches: 15, Mismatches: 1, Indels: 1
0.88 0.06 0.06
Matches are distributed among these distances:
16 9 0.60
17 6 0.40
ACGTcount: A:0.33, C:0.06, G:0.00, T:0.61
Consensus pattern (17 bp):
ATTTTAAATTCATTATT
Found at i:711403 original size:83 final size:83
Alignment explanation
Indices: 711295--711456 Score: 254
Period size: 83 Copynumber: 2.0 Consensus size: 83
711285 ATATATACAT
* * * *
711295 ACACATACTATAAATTAAGGTTAATTGTGCCAGACCTACTCAAGCTATGAGGATATATTCTAACT
1 ACACATACTATAAATTAAGATTAATTGTACCAAACCTACTCAAACTATGAGGATATATTCTAAC-
711360 TTGCCCCA-AAATTTTTAC
65 TTGCCCCAGAAATTTTTAC
*
711378 ACACATACTATAAATTAAGATTAATTGTACCAAACCTACTCAAACTATGAGGTTATATTCTAACT
1 ACACATACTATAAATTAAGATTAATTGTACCAAACCTACTCAAACTATGAGGATATATTCTAACT
*
711443 TGGCCCAGAAATTT
66 TGCCCCAGAAATTT
711457 CACGATGTTC
Statistics
Matches: 72, Mismatches: 6, Indels: 2
0.90 0.08 0.03
Matches are distributed among these distances:
82 7 0.10
83 65 0.90
ACGTcount: A:0.37, C:0.20, G:0.11, T:0.32
Consensus pattern (83 bp):
ACACATACTATAAATTAAGATTAATTGTACCAAACCTACTCAAACTATGAGGATATATTCTAACT
TGCCCCAGAAATTTTTAC
Found at i:712300 original size:6 final size:6
Alignment explanation
Indices: 712289--712343 Score: 51
Period size: 6 Copynumber: 9.0 Consensus size: 6
712279 TCAAGAGCTT
* *
712289 AGAGAA AGAG-A AGAGGATA ACAGAA AGAGAA A-ATGAA AGGGAA AGAGAA
1 AGAGAA AGAGAA AGA-GA-A AGAGAA AGAGAA AGA-GAA AGAGAA AGAGAA
712338 AGAGAA
1 AGAGAA
712344 GGGTGCGTAA
Statistics
Matches: 40, Mismatches: 4, Indels: 10
0.74 0.07 0.19
Matches are distributed among these distances:
5 5 0.12
6 30 0.75
7 2 0.05
8 3 0.08
ACGTcount: A:0.62, C:0.02, G:0.33, T:0.04
Consensus pattern (6 bp):
AGAGAA
Found at i:722897 original size:23 final size:23
Alignment explanation
Indices: 722867--722912 Score: 92
Period size: 23 Copynumber: 2.0 Consensus size: 23
722857 ATTGTTCTCA
722867 TCATGCTACCGAGAATGATACTT
1 TCATGCTACCGAGAATGATACTT
722890 TCATGCTACCGAGAATGATACTT
1 TCATGCTACCGAGAATGATACTT
722913 GTAACACCCT
Statistics
Matches: 23, Mismatches: 0, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
23 23 1.00
ACGTcount: A:0.30, C:0.22, G:0.17, T:0.30
Consensus pattern (23 bp):
TCATGCTACCGAGAATGATACTT
Found at i:738815 original size:21 final size:21
Alignment explanation
Indices: 738789--738833 Score: 63
Period size: 21 Copynumber: 2.1 Consensus size: 21
738779 GATTTCTGGG
* *
738789 CAAGGGGAATCGGTACCCATT
1 CAAGGGGAACCGATACCCATT
*
738810 CAAGGGGAACCGATACCCCTT
1 CAAGGGGAACCGATACCCATT
738831 CAA
1 CAA
738834 ACGACAGAAT
Statistics
Matches: 21, Mismatches: 3, Indels: 0
0.88 0.12 0.00
Matches are distributed among these distances:
21 21 1.00
ACGTcount: A:0.31, C:0.29, G:0.24, T:0.16
Consensus pattern (21 bp):
CAAGGGGAACCGATACCCATT
Found at i:739724 original size:62 final size:62
Alignment explanation
Indices: 739658--739811 Score: 247
Period size: 62 Copynumber: 2.5 Consensus size: 62
739648 GGTCGAGGGT
*
739658 TTACCTATGTTCTTCTGG-ATATATGGACTGTTTACCTATGTTCTTCGGGACATATGGACTGA
1 TTACCTATGTTCTTC-GGAATATATGGACTGTTTACCTATGTCCTTCGGGACATATGGACTGA
* *
739720 TTACCTATGTTCTTCGGAACATACGGACTGTTTACCTATGTCCTTCGGGACATATGGACTGA
1 TTACCTATGTTCTTCGGAATATATGGACTGTTTACCTATGTCCTTCGGGACATATGGACTGA
* *
739782 TTACCTAGGTTCTTCGGAATCTATGGACTG
1 TTACCTATGTTCTTCGGAATATATGGACTG
739812 GTCCTTCGGG
Statistics
Matches: 84, Mismatches: 7, Indels: 2
0.90 0.08 0.02
Matches are distributed among these distances:
61 2 0.02
62 82 0.98
ACGTcount: A:0.21, C:0.20, G:0.21, T:0.37
Consensus pattern (62 bp):
TTACCTATGTTCTTCGGAATATATGGACTGTTTACCTATGTCCTTCGGGACATATGGACTGA
Found at i:739807 original size:31 final size:31
Alignment explanation
Indices: 739658--739811 Score: 204
Period size: 31 Copynumber: 5.0 Consensus size: 31
739648 GGTCGAGGGT
* *
739658 TTACCTATGTTCTTCTGG-ATATATGGACTGT
1 TTACCTATGTTCTTC-GGAACATATGGACTGA
*
739689 TTACCTATGTTCTTCGGGACATATGGACTGA
1 TTACCTATGTTCTTCGGAACATATGGACTGA
* *
739720 TTACCTATGTTCTTCGGAACATACGGACTGT
1 TTACCTATGTTCTTCGGAACATATGGACTGA
* *
739751 TTACCTATGTCCTTCGGGACATATGGACTGA
1 TTACCTATGTTCTTCGGAACATATGGACTGA
*
739782 TTACCTAGGTTCTTCGGAATC-TATGGACTG
1 TTACCTATGTTCTTCGGAA-CATATGGACTG
739812 GTCCTTCGGG
Statistics
Matches: 109, Mismatches: 12, Indels: 4
0.87 0.10 0.03
Matches are distributed among these distances:
30 2 0.02
31 106 0.97
32 1 0.01
ACGTcount: A:0.21, C:0.20, G:0.21, T:0.37
Consensus pattern (31 bp):
TTACCTATGTTCTTCGGAACATATGGACTGA
Found at i:742964 original size:21 final size:21
Alignment explanation
Indices: 742938--742982 Score: 63
Period size: 21 Copynumber: 2.1 Consensus size: 21
742928 GATTTCTGGG
* *
742938 CAAGGGGAATCGGTACCCATT
1 CAAGGGGAACCGATACCCATT
*
742959 CAAGGGGAACCGATACCCCTT
1 CAAGGGGAACCGATACCCATT
742980 CAA
1 CAA
742983 ACGACAGAAT
Statistics
Matches: 21, Mismatches: 3, Indels: 0
0.88 0.12 0.00
Matches are distributed among these distances:
21 21 1.00
ACGTcount: A:0.31, C:0.29, G:0.24, T:0.16
Consensus pattern (21 bp):
CAAGGGGAACCGATACCCATT
Found at i:743871 original size:62 final size:62
Alignment explanation
Indices: 743805--743958 Score: 247
Period size: 62 Copynumber: 2.5 Consensus size: 62
743795 GGTCGAGGGT
*
743805 TTACCTATGTTCTTCTGG-ATATATGGACTGTTTACCTATGTTCTTCGGGACATATGGACTGA
1 TTACCTATGTTCTTC-GGAATATATGGACTGTTTACCTATGTCCTTCGGGACATATGGACTGA
* *
743867 TTACCTATGTTCTTCGGAACATACGGACTGTTTACCTATGTCCTTCGGGACATATGGACTGA
1 TTACCTATGTTCTTCGGAATATATGGACTGTTTACCTATGTCCTTCGGGACATATGGACTGA
* *
743929 TTACCTAGGTTCTTCGGAATCTATGGACTG
1 TTACCTATGTTCTTCGGAATATATGGACTG
743959 GTCCTTCGGG
Statistics
Matches: 84, Mismatches: 7, Indels: 2
0.90 0.08 0.02
Matches are distributed among these distances:
61 2 0.02
62 82 0.98
ACGTcount: A:0.21, C:0.20, G:0.21, T:0.37
Consensus pattern (62 bp):
TTACCTATGTTCTTCGGAATATATGGACTGTTTACCTATGTCCTTCGGGACATATGGACTGA
Found at i:743954 original size:31 final size:31
Alignment explanation
Indices: 743805--743958 Score: 204
Period size: 31 Copynumber: 5.0 Consensus size: 31
743795 GGTCGAGGGT
* *
743805 TTACCTATGTTCTTCTGG-ATATATGGACTGT
1 TTACCTATGTTCTTC-GGAACATATGGACTGA
*
743836 TTACCTATGTTCTTCGGGACATATGGACTGA
1 TTACCTATGTTCTTCGGAACATATGGACTGA
* *
743867 TTACCTATGTTCTTCGGAACATACGGACTGT
1 TTACCTATGTTCTTCGGAACATATGGACTGA
* *
743898 TTACCTATGTCCTTCGGGACATATGGACTGA
1 TTACCTATGTTCTTCGGAACATATGGACTGA
*
743929 TTACCTAGGTTCTTCGGAATC-TATGGACTG
1 TTACCTATGTTCTTCGGAA-CATATGGACTG
743959 GTCCTTCGGG
Statistics
Matches: 109, Mismatches: 12, Indels: 4
0.87 0.10 0.03
Matches are distributed among these distances:
30 2 0.02
31 106 0.97
32 1 0.01
ACGTcount: A:0.21, C:0.20, G:0.21, T:0.37
Consensus pattern (31 bp):
TTACCTATGTTCTTCGGAACATATGGACTGA
Found at i:745131 original size:17 final size:17
Alignment explanation
Indices: 745105--745139 Score: 61
Period size: 17 Copynumber: 2.1 Consensus size: 17
745095 ATCTGTAAAA
745105 AAATAATTAAATAAATT
1 AAATAATTAAATAAATT
*
745122 AAATACTTAAATAAATT
1 AAATAATTAAATAAATT
745139 A
1 A
745140 TAAACAAAAT
Statistics
Matches: 17, Mismatches: 1, Indels: 0
0.94 0.06 0.00
Matches are distributed among these distances:
17 17 1.00
ACGTcount: A:0.63, C:0.03, G:0.00, T:0.34
Consensus pattern (17 bp):
AAATAATTAAATAAATT
Found at i:752893 original size:16 final size:16
Alignment explanation
Indices: 752869--752922 Score: 56
Period size: 16 Copynumber: 3.2 Consensus size: 16
752859 TATATCTGTA
*
752869 AAAAAATTAATTAAA-T
1 AAAATATTAA-TAAATT
*
752885 AAAATATTAAAAAATT
1 AAAATATTAATAAATT
752901 AAAATACTTAAATAAATT
1 AAAATA-TT-AATAAATT
752919 AAAA
1 AAAA
752923 ATAAAATATT
Statistics
Matches: 32, Mismatches: 3, Indels: 4
0.82 0.08 0.10
Matches are distributed among these distances:
15 3 0.09
16 16 0.50
17 2 0.06
18 11 0.34
ACGTcount: A:0.69, C:0.02, G:0.00, T:0.30
Consensus pattern (16 bp):
AAAATATTAATAAATT
Found at i:752901 original size:8 final size:8
Alignment explanation
Indices: 752869--752935 Score: 50
Period size: 8 Copynumber: 8.4 Consensus size: 8
752859 TATATCTGTA
752869 AAAAAATT
1 AAAAAATT
*
752877 AATTAAA-T
1 AA-AAAATT
*
752885 AAAATATT
1 AAAAAATT
752893 AAAAAATT
1 AAAAAATT
*
752901 AAAATACTT
1 AAAA-AATT
752910 AAATAAATT
1 AAA-AAATT
752919 -AAAAA-T
1 AAAAAATT
*
752925 AAAATATT
1 AAAAAATT
752933 AAA
1 AAA
752936 CATAATAAAA
Statistics
Matches: 46, Mismatches: 7, Indels: 12
0.71 0.11 0.18
Matches are distributed among these distances:
6 1 0.02
7 9 0.20
8 23 0.50
9 12 0.26
10 1 0.02
ACGTcount: A:0.69, C:0.01, G:0.00, T:0.30
Consensus pattern (8 bp):
AAAAAATT
Found at i:754067 original size:7 final size:7
Alignment explanation
Indices: 754057--754144 Score: 176
Period size: 7 Copynumber: 12.6 Consensus size: 7
754047 CCTGGGGCCT
754057 GGGTTTA
1 GGGTTTA
754064 GGGTTTA
1 GGGTTTA
754071 GGGTTTA
1 GGGTTTA
754078 GGGTTTA
1 GGGTTTA
754085 GGGTTTA
1 GGGTTTA
754092 GGGTTTA
1 GGGTTTA
754099 GGGTTTA
1 GGGTTTA
754106 GGGTTTA
1 GGGTTTA
754113 GGGTTTA
1 GGGTTTA
754120 GGGTTTA
1 GGGTTTA
754127 GGGTTTA
1 GGGTTTA
754134 GGGTTTA
1 GGGTTTA
754141 GGGT
1 GGGT
754145 CCGGGGTCCG
Statistics
Matches: 81, Mismatches: 0, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
7 81 1.00
ACGTcount: A:0.14, C:0.00, G:0.44, T:0.42
Consensus pattern (7 bp):
GGGTTTA
Found at i:754171 original size:6 final size:6
Alignment explanation
Indices: 754141--754274 Score: 159
Period size: 6 Copynumber: 21.7 Consensus size: 6
754131 TTAGGGTTTA
*
754141 GGGTCCG GGGTCCGG GGGTCGG GGGTCG GGGTTCG GGGTGG GGGT-G GGGTCG
1 GGGT-CG GGGT-C-G GGGTC-G GGGTCG GGG-TCG GGGTCG GGGTCG GGGTCG
754193 GGGTC- GGGTCG GGGT-- GGGTCG GGGTCGG GGGTCG GGGTCG GGGTCG
1 GGGTCG GGGTCG GGGTCG GGGTCG GGGTC-G GGGTCG GGGTCG GGGTCG
754239 GGGTCG GGGTCGG GGGTCGG GGGTCG GGGTCG GGGT
1 GGGTCG GGGTC-G GGGTC-G GGGTCG GGGTCG GGGT
754275 TTAGGGTTTA
Statistics
Matches: 118, Mismatches: 1, Indels: 17
0.87 0.01 0.12
Matches are distributed among these distances:
4 4 0.03
5 10 0.08
6 60 0.51
7 39 0.33
8 5 0.04
ACGTcount: A:0.00, C:0.15, G:0.68, T:0.17
Consensus pattern (6 bp):
GGGTCG
Found at i:754215 original size:38 final size:40
Alignment explanation
Indices: 754141--754274 Score: 165
Period size: 38 Copynumber: 3.4 Consensus size: 40
754131 TTAGGGTTTA
754141 GGGTCCGGGGTCCGGGGGTCGGGGGTCGGGGT--TCGGGGT-GG
1 GGGT-CGGGGT-C-GGGGTC-GGGGTCGGGGTCGTCGGGGTCGG
*
754182 GGGT-GGGGTCGGGGTC-GGGTCGGGGTGGGTCGGGGTCGG
1 GGGTCGGGGTCGGGGTCGGGGTCGGGGT-CGTCGGGGTCGG
754221 GGGTCGGGGTCGGGGTCGGGGTCGGGGTCG--GGGGTCGG
1 GGGTCGGGGTCGGGGTCGGGGTCGGGGTCGTCGGGGTCGG
754259 GGGTCGGGGTCGGGGT
1 GGGTCGGGGTCGGGGT
754275 TTAGGGTTTA
Statistics
Matches: 86, Mismatches: 1, Indels: 15
0.84 0.01 0.15
Matches are distributed among these distances:
35 10 0.12
37 6 0.07
38 32 0.37
39 11 0.13
40 13 0.15
41 14 0.16
ACGTcount: A:0.00, C:0.15, G:0.68, T:0.17
Consensus pattern (40 bp):
GGGTCGGGGTCGGGGTCGGGGTCGGGGTCGTCGGGGTCGG
Found at i:754281 original size:7 final size:7
Alignment explanation
Indices: 754271--771734 Score: 23228
Period size: 7 Copynumber: 2576.9 Consensus size: 7
754261 GTCGGGGTCG
754271 GGGTTTA
1 GGGTTTA
754278 GGGTTTA
1 GGGTTTA
754285 GGGTTTA
1 GGGTTTA
754292 GGGTTTA
1 GGGTTTA
754299 GGGTTTA
1 GGGTTTA
754306 GGGTTTA
1 GGGTTTA
754313 GGGTTTA
1 GGGTTTA
754320 GGGTTTA
1 GGGTTTA
754327 GGGTTTA
1 GGGTTTA
754334 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
754341 GGGTGTA
1 GGGTTTA
754348 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
754355 GGGTGTA
1 GGGTTTA
754362 GGGTTTA
1 GGGTTTA
754369 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
754376 GGGTGTA
1 GGGTTTA
*
754383 GGGTGTA
1 GGGTTTA
*
754390 GGGTGTA
1 GGGTTTA
*
754397 GGGTGTA
1 GGGTTTA
754404 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
754411 GGGTGTA
1 GGGTTTA
*
754418 GGGCTTA
1 GGGTTTA
754425 GGGTTTA
1 GGGTTTA
754432 GGGTTTA
1 GGGTTTA
754439 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
754446 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
754453 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
754460 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
754467 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
754474 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
754481 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
754488 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
754495 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
754502 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
754509 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
754516 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
754523 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
754530 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
754537 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
754544 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
754551 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
754558 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
754565 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
754572 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
754579 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
754586 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
754593 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
754600 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
754607 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
754614 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
754621 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
754628 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
754635 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
754642 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
754649 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
754656 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
754663 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
754670 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
754677 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
754684 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
754691 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
754698 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
754705 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
754712 -GGCTTA
1 GGGTTTA
*
754718 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
754725 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
754732 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
754739 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
754746 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
754753 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
754760 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
754767 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
754774 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
754781 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
754788 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
754795 GGGCTTA
1 GGGTTTA
* *
754802 GGGCTTC
1 GGGTTTA
** *
754809 GGGCCTC
1 GGGTTTA
** *
754816 GGGCCTC
1 GGGTTTA
** *
754823 GGGCCTC
1 GGGTTTA
** *
754830 GGGCCTC
1 GGGTTTA
* ** *
754837 TGGCCTC
1 GGGTTTA
** *
754844 GGGCCTC
1 GGGTTTA
** *
754851 GGGCCTC
1 GGGTTTA
**
754858 GGGCCT-
1 GGGTTTA
* * *
754864 CGG-CTC
1 GGGTTTA
* *
754870 GGGCTCGGCTC
1 GGG-T---TTA
** *
754881 GGGCCTC
1 GGGTTTA
** *
754888 GGGCCTC
1 GGGTTTA
**
754895 GGGCCT-
1 GGGTTTA
* *
754901 CGGCTTA
1 GGGTTTA
*
754908 GGGGGCTTA
1 --GGGTTTA
*
754917 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
754924 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
754931 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
754938 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
754945 -GGCTTA
1 GGGTTTA
*
754951 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
754958 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
754965 -GGCTTA
1 GGGTTTA
*
754971 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
754978 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
754985 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
754992 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
754999 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755006 -GGCTTA
1 GGGTTTA
*
755012 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755019 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755026 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755033 -GGCTT-
1 GGGTTTA
*
755038 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755045 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755052 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755059 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755066 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755073 -GGCTTA
1 GGGTTTA
*
755079 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755086 -GGCTTA
1 GGGTTTA
*
755092 GGGCTTA
1 GGGTTTA
755099 -GG-TTA
1 GGGTTTA
*
755104 -GGCTTA
1 GGGTTTA
*
755110 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755117 -GGCTTA
1 GGGTTTA
*
755123 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755130 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755137 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755144 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755151 --GCTTA
1 GGGTTTA
*
755156 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755163 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755170 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755177 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755184 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755191 -GGCTTA
1 GGGTTTA
*
755197 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755204 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755211 -GGCTTA
1 GGGTTTA
*
755217 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755224 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755231 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755238 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755245 -GGCTTA
1 GGGTTTA
*
755251 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755258 -GGCTTA
1 GGGTTTA
*
755264 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755271 -GGCTTA
1 GGGTTTA
*
755277 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755284 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755291 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755298 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755305 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755312 -GGCTTA
1 GGGTTTA
*
755318 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755325 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755332 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755339 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755346 -GGCTTA
1 GGGTTTA
*
755352 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755359 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755366 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755373 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755380 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755387 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755394 -GGCTTA
1 GGGTTTA
*
755400 -GGCTTA
1 GGGTTTA
*
755406 GGGCTTA
1 GGGTTTA
755413 GGG-TTA
1 GGGTTTA
*
755419 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755426 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755433 GGGCTTA
1 GGGTTTA
755440 GGG--TA
1 GGGTTTA
*
755445 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755452 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755459 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755466 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755473 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755480 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755487 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755494 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755501 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755508 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755515 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755522 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755529 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755536 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755543 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755550 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755557 -GGCTTA
1 GGGTTTA
*
755563 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755570 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755577 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755584 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755591 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755598 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755605 -GGCTTA
1 GGGTTTA
*
755611 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755618 -GGCTTA
1 GGGTTTA
*
755624 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755631 -GG-CTA
1 GGGTTTA
*
755636 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755643 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755650 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755657 GGG-CTA
1 GGGTTTA
*
755663 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755670 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755677 -GGCTT-
1 GGGTTTA
*
755682 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755689 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755696 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755703 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755710 -GGCTTA
1 GGGTTTA
*
755716 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755723 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755730 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755737 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755744 -GGCTTA
1 GGGTTTA
*
755750 -GGCTTA
1 GGGTTTA
*
755756 -GGCTTA
1 GGGTTTA
*
755762 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755769 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755776 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755783 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755790 -GGCTTA
1 GGGTTTA
*
755796 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755803 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755810 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755817 -GGCTTA
1 GGGTTTA
*
755823 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755830 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755837 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755844 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755851 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755858 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755865 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755872 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755879 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755886 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755893 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755900 -GGCTTA
1 GGGTTTA
*
755906 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755913 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755920 GGGCTT-
1 GGGTTTA
*
755926 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755933 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755940 -GGCTTA
1 GGGTTTA
*
755946 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755953 -GGATTA
1 GGGTTTA
*
755959 GGGCTTA
1 GGGTTTA
755966 GGG-TTA
1 GGGTTTA
*
755972 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755979 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755986 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
755993 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
756000 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
756007 -GGCTTA
1 GGGTTTA
*
756013 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
756020 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
756027 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
756034 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
756041 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
756048 GGGTGTA
1 GGGTTTA
756055 GGGTTTA
1 GGGTTTA
756062 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
756069 GGGTGTA
1 GGGTTTA
*
756076 GGGTATA
1 GGGTTTA
*
756083 GGGTGTA
1 GGGTTTA
756090 GGGTTTA
1 GGGTTTA
756097 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
756104 GGGTGTA
1 GGGTTTA
*
756111 GGGTGTA
1 GGGTTTA
*
756118 GGGTGTA
1 GGGTTTA
*
756125 GGGTGTA
1 GGGTTTA
756132 GGGTTTA
1 GGGTTTA
756139 GGGTTTA
1 GGGTTTA
* *
756146 GGATATA
1 GGGTTTA
* *
756153 AGGTGTA
1 GGGTTTA
756160 GGGTTTA
1 GGGTTTA
756167 GGGTTTA
1 GGGTTTA
756174 GGGTTTA
1 GGGTTTA
756181 GGG-TTA
1 GGGTTTA
756187 -GGTTTA
1 GGGTTTA
756193 GGG-TTA
1 GGGTTTA
756199 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
756206 GGGTGTA
1 GGGTTTA
756213 GGG-TTA
1 GGGTTTA
756219 GGGTAGGTTA
1 GGGT---TTA
756229 GGG-TTA
1 GGGTTTA
756235 GGG-TTA
1 GGGTTTA
756241 GGG--TA
1 GGGTTTA
756246 -GGTTTA
1 GGGTTTA
756252 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
756259 GGGTGTA
1 GGGTTTA
756266 GGGTTTA
1 GGGTTTA
756273 GGGTTTA
1 GGGTTTA
756280 GGGTTTA
1 GGGTTTA
756287 GGGTTTA
1 GGGTTTA
756294 GGG-TTA
1 GGGTTTA
756300 GGG-TTA
1 GGGTTTA
756306 GGGTTTA
1 GGGTTTA
756313 GGGTTTA
1 GGGTTTA
756320 -GGTTTA
1 GGGTTTA
756326 GGG-TTA
1 GGGTTTA
*
756332 -GGTGTA
1 GGGTTTA
*
756338 -GGTGTA
1 GGGTTTA
756344 GGGTTTA
1 GGGTTTA
756351 GGGTTTA
1 GGGTTTA
756358 -GG-TTA
1 GGGTTTA
756363 GGGTTTA
1 GGGTTTA
756370 GGGTTTA
1 GGGTTTA
756377 -GGTTTA
1 GGGTTTA
756383 GGGTTTA
1 GGGTTTA
756390 GGGTTTA
1 GGGTTTA
756397 GGGTTTA
1 GGGTTTA
756404 GGG-TTA
1 GGGTTTA
756410 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
756417 GGGTGTA
1 GGGTTTA
756424 GGG-TTA
1 GGGTTTA
*
756430 -GGTGTA
1 GGGTTTA
*
756436 -GGTGTA
1 GGGTTTA
*
756442 GGGTGTA
1 GGGTTTA
756449 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
756456 GGGTGTA
1 GGGTTTA
756463 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
756470 GGGCTTA
1 GGGTTTA
756477 GGG-TTA
1 GGGTTTA
*
756483 GGGCTTA
1 GGGTTTA
756490 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
756497 GGGCTTA
1 GGGTTTA
756504 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
756511 -GGCTTA
1 GGGTTTA
756517 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
756524 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
756531 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
756538 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
756545 -GGCTTA
1 GGGTTTA
*
756551 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
756558 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
756565 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
756572 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
756579 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
756586 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
756593 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
756600 -GGCTTA
1 GGGTTTA
*
756606 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
756613 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
756620 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
756627 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
756634 GGGCTT-
1 GGGTTTA
*
756640 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
756647 -GGCTTA
1 GGGTTTA
*
756653 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
756660 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
756667 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
756674 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
756681 -GGCTTA
1 GGGTTTA
*
756687 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
756694 -GGCTTA
1 GGGTTTA
*
756700 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
756707 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
756714 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
756721 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
756728 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
756735 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
756742 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
756749 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
756756 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
756763 -GGCTTA
1 GGGTTTA
*
756769 GGGCTTA
1 GGGTTTA
756776 -GGTCTTA
1 GGGT-TTA
*
756783 -GGCTTA
1 GGGTTTA
*
756789 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
756796 -GGCTTA
1 GGGTTTA
*
756802 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
756809 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
756816 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
756823 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
756830 GGG-CTA
1 GGGTTTA
*
756836 -GGCTTA
1 GGGTTTA
*
756842 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
756849 -GGCTTA
1 GGGTTTA
*
756855 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
756862 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
756869 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
756876 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
756883 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
756890 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
756897 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
756904 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
756911 -GGCTTA
1 GGGTTTA
*
756917 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
756924 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
756931 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
756938 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
756945 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
756952 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
756959 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
756966 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
756973 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
756980 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
756987 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
756994 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757001 -GGCTTA
1 GGGTTTA
* **
757007 GGGCTGG
1 GGGTTTA
*
757014 GGGCTTTC
1 GGG-TTTA
* *
757022 GGGCTTC
1 GGGTTTA
* *
757029 GGG-CTC
1 GGGTTTA
* *
757035 GGGCCTTC
1 GGG-TTTA
* *
757043 GGG-CTC
1 GGGTTTA
* *
757049 GGG-CTC
1 GGGTTTA
** *
757055 GGGCCTC
1 GGGTTTA
** *
757062 GGGCCTC
1 GGGTTTA
** *
757069 GGGCCTC
1 GGGTTTA
* *
757076 GGGCTTC
1 GGGTTTA
*
757083 GGG-CT-
1 GGGTTTA
* *
757088 CGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757095 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757102 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757109 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757116 -GGCTTA
1 GGGTTTA
*
757122 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757129 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757136 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757143 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757150 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757157 GGGCTT-
1 GGGTTTA
*
757163 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757170 -GGCTTA
1 GGGTTTA
*
757176 GGG-CTA
1 GGGTTTA
*
757182 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757189 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757196 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757203 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757210 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757217 -GGCTTA
1 GGGTTTA
*
757223 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757230 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757237 GGGCTT-
1 GGGTTTA
*
757243 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757250 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757257 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757264 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757271 -GGCTTA
1 GGGTTTA
*
757277 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757284 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757291 -GGCTTA
1 GGGTTTA
*
757297 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757304 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757311 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757318 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757325 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757332 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757339 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757346 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757353 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757360 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757367 -GGCTTA
1 GGGTTTA
*
757373 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757380 -GGCTTA
1 GGGTTTA
*
757386 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757393 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757400 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757407 -GGCTTA
1 GGGTTTA
*
757413 --GCTTA
1 GGGTTTA
*
757418 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757425 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757432 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757439 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757446 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757453 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757460 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757467 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757474 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757481 GGG-CTA
1 GGGTTTA
*
757487 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757494 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757501 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757508 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757515 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757522 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757529 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757536 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757543 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757550 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757557 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757564 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757571 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757578 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757585 -GGCTTA
1 GGGTTTA
*
757591 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757598 -GGCTTA
1 GGGTTTA
*
757604 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757611 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757618 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757625 -GGCTTA
1 GGGTTTA
*
757631 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757638 -GGCTTA
1 GGGTTTA
*
757644 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757651 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757658 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757665 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757672 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757679 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757686 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757693 --GCTTA
1 GGGTTTA
*
757698 -GGCTTA
1 GGGTTTA
*
757704 -GGCTTA
1 GGGTTTA
*
757710 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757717 GGG-CTA
1 GGGTTTA
*
757723 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757730 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757737 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757744 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757751 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757758 -GGCTTA
1 GGGTTTA
*
757764 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757771 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757778 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757785 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757792 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757799 -GGCTTA
1 GGGTTTA
*
757805 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757812 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757819 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757826 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757833 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757840 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757847 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757854 -GGCTTA
1 GGGTTTA
*
757860 -GGCTTA
1 GGGTTTA
*
757866 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757873 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757880 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757887 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757894 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757901 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757908 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757915 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757922 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757929 -GGCTTA
1 GGGTTTA
*
757935 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757942 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757949 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757956 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757963 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757970 -GGCTTA
1 GGGTTTA
*
757976 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757983 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757990 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
757997 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
758004 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
758011 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
758018 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
758025 -GGCTTA
1 GGGTTTA
*
758031 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
758038 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
758045 -GGCTTA
1 GGGTTTA
*
758051 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
758058 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
758065 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
758072 GGGCTTA
1 GGGTTTA
758079 GGG--TA
1 GGGTTTA
758084 GGGTTTA
1 GGGTTTA
758091 -GGTTTA
1 GGGTTTA
*
758097 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
758104 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
758111 GGGCTTA
1 GGGTTTA
758118 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
758125 GGGCTTA
1 GGGTTTA
758132 GGG-TTA
1 GGGTTTA
758138 GGGTTTA
1 GGGTTTA
758145 GGG-TTA
1 GGGTTTA
*
758151 GGGCTTA
1 GGGTTTA
758158 -GG-TTA
1 GGGTTTA
758163 GGGTTTTA
1 GGG-TTTA
*
758171 GGCTTAGGTA
1 GGGTT---TA
758181 GGG-TTA
1 GGGTTTA
758187 GGG-TTA
1 GGGTTTA
758193 GGGTTTA
1 GGGTTTA
758200 GGGTTTA
1 GGGTTTA
758207 GGG-TTA
1 GGGTTTA
758213 -GGTTTA
1 GGGTTTA
758219 -GGTTTA
1 GGGTTTA
758225 GGGTTTA
1 GGGTTTA
758232 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
758239 GGGTGTA
1 GGGTTTA
758246 -GGTTTA
1 GGGTTTA
758252 GGG-TTA
1 GGGTTTA
758258 GGGGTTTA
1 -GGGTTTA
758266 GGGTTTA
1 GGGTTTA
758273 -GGTTTA
1 GGGTTTA
758279 GGGTTTA
1 GGGTTTA
758286 GGGTTTA
1 GGGTTTA
758293 GGGTTTA
1 GGGTTTA
758300 GGGGTTTA
1 -GGGTTTA
758308 GGG-TTA
1 GGGTTTA
758314 GGG-TTA
1 GGGTTTA
758320 GGG-TTA
1 GGGTTTA
758326 GGGTTTA
1 GGGTTTA
758333 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
758340 GGG-GTA
1 GGGTTTA
758346 GGGTTTA
1 GGGTTTA
758353 GGG--TA
1 GGGTTTA
758358 GGGTTTA
1 GGGTTTA
758365 GGGTTTA
1 GGGTTTA
758372 -GGTTTA
1 GGGTTTA
758378 GGGTTTA
1 GGGTTTA
758385 -GGTTTA
1 GGGTTTA
758391 GGGTTTA
1 GGGTTTA
758398 GGGTTTA
1 GGGTTTA
758405 GGGTTTA
1 GGGTTTA
758412 GGG-TTA
1 GGGTTTA
758418 GGG-TTA
1 GGGTTTA
758424 GGGTTTA
1 GGGTTTA
758431 GGG-TTA
1 GGGTTTA
758437 GGG-TTA
1 GGGTTTA
758443 GGG-TTA
1 GGGTTTA
758449 -GG-TTA
1 GGGTTTA
758454 GGGTTTA
1 GGGTTTA
758461 GGG-TTA
1 GGGTTTA
758467 GGGTTT-
1 GGGTTTA
758473 GGGTTTA
1 GGGTTTA
758480 GGGTTTA
1 GGGTTTA
758487 GGG-TTA
1 GGGTTTA
758493 GGGTTTA
1 GGGTTTA
758500 GGG-TTA
1 GGGTTTA
758506 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
758513 GGGCTTA
1 GGGTTTA
758520 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
758527 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
758534 GGTTTTA
1 GGGTTTA
758541 -GG-TTA
1 GGGTTTA
758546 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
758553 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
758560 GGGCTTA
1 GGGTTTA
758567 -GG-TTA
1 GGGTTTA
*
758572 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
758579 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
758586 GGGCTTA
1 GGGTTTA
758593 -GG-TTA
1 GGGTTTA
*
758598 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
758605 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
758612 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
758619 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
758626 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
758633 GGGCTTA
1 GGGTTTA
758640 GGG-TTA
1 GGGTTTA
*
758646 GGGCTTA
1 GGGTTTA
758653 GGGCTTT-
1 GGG-TTTA
*
758660 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
758667 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
758674 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
758681 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
758688 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
758695 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
758702 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
758709 -GGCTTA
1 GGGTTTA
*
758715 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
758722 -GGCTTA
1 GGGTTTA
*
758728 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
758735 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
758742 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
758749 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
758756 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
758763 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
758770 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
758777 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
758784 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
758791 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
758798 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
758805 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
758812 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
758819 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
758826 GGGCTTA
1 GGGTTTA
758833 --GTTTA
1 GGGTTTA
*
758838 -GGCTTA
1 GGGTTTA
*
758844 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
758851 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
758858 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
758865 -GGCTTA
1 GGGTTTA
*
758871 GGG-CTA
1 GGGTTTA
*
758877 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
758884 GGGCTTA
1 GGGTTTA
758891 GGG--TA
1 GGGTTTA
758896 GGGTTTA
1 GGGTTTA
758903 GGGTTTA
1 GGGTTTA
758910 GGGTTTA
1 GGGTTTA
758917 -GGTTTA
1 GGGTTTA
758923 GGGTTTA
1 GGGTTTA
758930 GGG-TTA
1 GGGTTTA
758936 -GGTTTA
1 GGGTTTA
758942 GGGTTTA
1 GGGTTTA
758949 GGGTTTA
1 GGGTTTA
758956 -GG-TTA
1 GGGTTTA
758961 GGG-TTA
1 GGGTTTA
758967 GGG-TTA
1 GGGTTTA
758973 -GGTTTA
1 GGGTTTA
758979 -GG-TTA
1 GGGTTTA
758984 GGG-TTA
1 GGGTTTA
758990 GGGTTTA
1 GGGTTTA
758997 GGGTTTA
1 GGGTTTA
759004 -GGTTTA
1 GGGTTTA
759010 --GTTTA
1 GGGTTTA
759015 GGGTTTA
1 GGGTTTA
759022 -GG-TTA
1 GGGTTTA
759027 GGG-TTA
1 GGGTTTA
*
759033 TGG-TTA
1 GGGTTTA
759039 GGGTTTA
1 GGGTTTA
759046 GGG-TTA
1 GGGTTTA
759052 GGG-TTA
1 GGGTTTA
*
759058 GGGCTTA
1 GGGTTTA
759065 -GG-TTA
1 GGGTTTA
*
759070 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
759077 -GGCTTA
1 GGGTTTA
759083 GGG-TTA
1 GGGTTTA
*
759089 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
759096 -GGCTTA
1 GGGTTTA
*
759102 GGGCTTA
1 GGGTTTA
759109 GGG-TTA
1 GGGTTTA
*
759115 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
759122 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
759129 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
759136 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
759143 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
759150 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
759157 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
759164 -GGCTTA
1 GGGTTTA
*
759170 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
759177 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
759184 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
759191 -GGCTTA
1 GGGTTTA
*
759197 GGGCTTA
1 GGGTTTA
759204 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
759211 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
759218 --GCTTA
1 GGGTTTA
*
759223 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
759230 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
759237 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
759244 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
759251 GGGCTTA
1 GGGTTTA
759258 GGG-TTA
1 GGGTTTA
*
759264 -GGCTTA
1 GGGTTTA
*
759270 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
759277 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
759284 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
759291 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
759298 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
759305 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
759312 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
759319 GGGCTTA
1 GGGTTTA
759326 -GG-TTA
1 GGGTTTA
759331 GGGCTTTA
1 GGG-TTTA
*
759339 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
759346 -GGCTTA
1 GGGTTTA
*
759352 GGGCTTA
1 GGGTTTA
759359 -GGTTTA
1 GGGTTTA
759365 GGG-TTA
1 GGGTTTA
759371 GGGTTTA
1 GGGTTTA
759378 GGGTTTA
1 GGGTTTA
759385 GGG-TTA
1 GGGTTTA
759391 GGGTTTGTA
1 GGG-TT-TA
759400 GGG-TTA
1 GGGTTTA
759406 GGG-TT-
1 GGGTTTA
759411 GGG-TTA
1 GGGTTTA
759417 --GTTTA
1 GGGTTTA
759422 GGGTAGGTTA
1 GGGT---TTA
759432 GGGTTTA
1 GGGTTTA
759439 GGGTTTA
1 GGGTTTA
759446 GGG-TTA
1 GGGTTTA
759452 -GG-TTA
1 GGGTTTA
759457 GGGTTTA
1 GGGTTTA
759464 GGGTTTA
1 GGGTTTA
759471 GGGTTTA
1 GGGTTTA
759478 GGGTTTA
1 GGGTTTA
759485 GGGTTTA
1 GGGTTTA
759492 -GGTTTA
1 GGGTTTA
759498 GGGTTTA
1 GGGTTTA
759505 GGGTTTA
1 GGGTTTA
759512 GGG-TTA
1 GGGTTTA
759518 -GGTTTA
1 GGGTTTA
759524 GGG-TTA
1 GGGTTTA
759530 GGG-TTA
1 GGGTTTA
759536 -GGTTTA
1 GGGTTTA
759542 GGGTTTA
1 GGGTTTA
759549 GGGTTTA
1 GGGTTTA
759556 GGGTTTA
1 GGGTTTA
759563 -GGTTTA
1 GGGTTTA
759569 GGG-TTA
1 GGGTTTA
759575 GGGTTTA
1 GGGTTTA
759582 GGGTTTA
1 GGGTTTA
759589 GGG-TTA
1 GGGTTTA
759595 -GGTTTA
1 GGGTTTA
759601 GGGTTTA
1 GGGTTTA
759608 GGGTTTA
1 GGGTTTA
759615 GGG-TTA
1 GGGTTTA
759621 GGGTTTA
1 GGGTTTA
759628 GGG-TT-
1 GGGTTTA
759633 GGGTTTA
1 GGGTTTA
759640 GGG-TTA
1 GGGTTTA
759646 GGG--TA
1 GGGTTTA
759651 GGGTTTA
1 GGGTTTA
759658 -GG-TTA
1 GGGTTTA
759663 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
759670 GGG-TTC
1 GGGTTTA
*
759676 GGGTGTA
1 GGGTTTA
759683 GGGTGTTA
1 GGGT-TTA
759691 GGG--T-
1 GGGTTTA
759695 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
759702 -GGTGTA
1 GGGTTTA
759708 GGG-TTA
1 GGGTTTA
759714 -GGTTTA
1 GGGTTTA
759720 -GGTTTA
1 GGGTTTA
759726 GGG-TTA
1 GGGTTTA
759732 GGG-TTA
1 GGGTTTA
759738 GGGTTTA
1 GGGTTTA
759745 GGGTTTA
1 GGGTTTA
759752 GGG-TTA
1 GGGTTTA
759758 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
759765 GGGCTTA
1 GGGTTTA
*
759772 GGGGGTTA
1 -GGGTTTA
*
759780 -GGCTTA
1 GGGTTTA
759786 GGGTTTA
1 GGGTTTA
759793 GGG-TTA
1 GGGTTTA
759799 -GG-TTA
1 GGGTTTA
759804 GGG-TTA
1 GGGTTTA
759810 GGG-TTA
1 GGGTTTA
759816 GGG-TTA
1 GGGTTTA
759822 GGG-TTA
1 GGGTTTA
759828 GGG-TTA
1 GGGTTTA
759834 GGG-TTA
1 GGGTTTA
759840 GGGTTTA
1 GGGTTTA
759847 -GGTTTA
1 GGGTTTA
759853 -GGTTTA
1 GGGTTTA
759859 GGG-TT-
1 GGGTTTA
759864 GGG-TTA
1 GGGTTTA
759870 GGGTTTA
1 GGGTTTA
759877 GGGTTTA
1 GGGTTTA
759884 GGG-TTA
1 GGGTTTA
759890 -GGTTTA
1 GGGTTTA
759896 GGGTTTA
1 GGGTTTA
759903 GGG-TTA
1 GGGTTTA
759909 --GTTTA
1 GGGTTTA
759914 -GGTTTA
1 GGGTTTA
759920 GGGTTTA
1 GGGTTTA
759927 GGGTTTA
1 GGGTTTA
759934 -GGTTTA
1 GGGTTTA
759940 -GG-TTA
1 GGGTTTA
759945 GGG-TTA
1 GGGTTTA
759951 GGGTTTA
1 GGGTTTA
759958 GGGTTTA
1 GGGTTTA
759965 -GG-TTA
1 GGGTTTA
759970 GGG-TTA
1 GGGTTTA
759976 GGGTTTA
1 GGGTTTA
759983 GGGGTTTA
1 -GGGTTTA
759991 GGGTTTA
1 GGGTTTA
759998 -GGTTTA
1 GGGTTTA
760004 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760011 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760018 GGGGTTTA
1 -GGGTTTA
760026 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760033 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760040 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760047 GGG-TTA
1 GGGTTTA
760053 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760060 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760067 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760074 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760081 GGG-TTA
1 GGGTTTA
760087 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760094 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
760101 GGGGTTA
1 GGGTTTA
760108 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760115 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760122 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760129 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760136 GGG-TTA
1 GGGTTTA
760142 GGG--TA
1 GGGTTTA
760147 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760154 GGG-TTA
1 GGGTTTA
760160 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760167 -GGTTTA
1 GGGTTTA
760173 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760180 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760187 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760194 -GGTTTA
1 GGGTTTA
760200 GGG-TTA
1 GGGTTTA
760206 GGGTTTA
1 GGGTTTA
**
760213 GGGGGGTA
1 -GGGTTTA
760221 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760228 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760235 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760242 -GGTTTA
1 GGGTTTA
760248 -GGTTTA
1 GGGTTTA
760254 -GGTTTA
1 GGGTTTA
760260 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760267 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760274 -GGTTTA
1 GGGTTTA
760280 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760287 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760294 GGG-TT-
1 GGGTTTA
760299 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760306 -GGTTTA
1 GGGTTTA
760312 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760319 GGGTTTTA
1 GGG-TTTA
760327 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760334 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760341 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760348 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760355 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760362 GGG-TTA
1 GGGTTTA
760368 GGG-TTA
1 GGGTTTA
760374 -GGTTTA
1 GGGTTTA
760380 -GGTTTA
1 GGGTTTA
760386 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760393 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760400 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760407 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760414 GGG-TTA
1 GGGTTTA
760420 -GGTTTA
1 GGGTTTA
760426 GGG-TTA
1 GGGTTTA
760432 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760439 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760446 GGG-TTA
1 GGGTTTA
760452 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760459 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760466 GGG-TTA
1 GGGTTTA
760472 GGG-TTA
1 GGGTTTA
760478 GGG-TTA
1 GGGTTTA
760484 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760491 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760498 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760505 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
760512 GGTTTTA
1 GGGTTTA
760519 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760526 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760533 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760540 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760547 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760554 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760561 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760568 GGG-TTA
1 GGGTTTA
760574 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760581 GGG-TTA
1 GGGTTTA
760587 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760594 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760601 -GG-TTA
1 GGGTTTA
760606 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760613 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760620 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760627 -GGTTTA
1 GGGTTTA
760633 GGG--TA
1 GGGTTTA
760638 -GGTTTA
1 GGGTTTA
760644 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760651 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
760658 GGGTTGA
1 GGGTTTA
760665 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760672 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760679 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760686 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760693 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760700 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760707 GGG-TTA
1 GGGTTTA
760713 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760720 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760727 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760734 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760741 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760748 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760755 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760762 -GGTTTA
1 GGGTTTA
760768 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760775 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760782 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760789 GGG--TA
1 GGGTTTA
760794 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760801 GGG--TA
1 GGGTTTA
760806 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760813 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760820 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760827 GGG-TTA
1 GGGTTTA
760833 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760840 GGGTTTTA
1 GGG-TTTA
760848 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760855 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760862 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760869 GGG-TTA
1 GGGTTTA
760875 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760882 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760889 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760896 GGG-TT-
1 GGGTTTA
*
760901 GGG-GTA
1 GGGTTTA
760907 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760914 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760921 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760928 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760935 GGG-TTA
1 GGGTTTA
760941 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760948 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
760955 GGGTTAGA
1 GGGTT-TA
760963 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760970 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760977 GGGTTT-
1 GGGTTTA
760983 GGG-TTA
1 GGGTTTA
760989 GGGTTTA
1 GGGTTTA
760996 GGG-TTA
1 GGGTTTA
761002 -GGTTTA
1 GGGTTTA
761008 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761015 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761022 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761029 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761036 GGG-TTA
1 GGGTTTA
761042 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761049 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761056 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761063 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761070 -GGTTTA
1 GGGTTTA
761076 GGG-TTA
1 GGGTTTA
761082 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761089 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761096 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761103 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761110 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761117 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761124 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761131 -GGTTTA
1 GGGTTTA
761137 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761144 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761151 -GGTTT-
1 GGGTTTA
761156 GGG-TTA
1 GGGTTTA
761162 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761169 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761176 GGG-TTA
1 GGGTTTA
761182 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761189 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761196 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761203 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761210 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761217 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
761224 GGG--GA
1 GGGTTTA
*
761229 GGG---G
1 GGGTTTA
761233 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761240 GGG-TTA
1 GGGTTTA
761246 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761253 GGG-TTA
1 GGGTTTA
761259 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761266 GGG-TTA
1 GGGTTTA
761272 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761279 GGG--TA
1 GGGTTTA
761284 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761291 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761298 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761305 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761312 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761319 -GGTTTA
1 GGGTTTA
761325 GGG-TTA
1 GGGTTTA
761331 GGGGGTTTA
1 --GGGTTTA
761340 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761347 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761354 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761361 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
761368 GGGGTTA
1 GGGTTTA
761375 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761382 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761389 -GGTTTA
1 GGGTTTA
761395 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761402 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761409 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761416 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761423 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761430 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761437 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761444 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761451 -GGTTTA
1 GGGTTTA
761457 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761464 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761471 GGGTTT-
1 GGGTTTA
761477 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761484 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761491 -GGTTTA
1 GGGTTTA
761497 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761504 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761511 GGGTTT-
1 GGGTTTA
761517 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761524 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761531 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761538 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761545 -GGTTTA
1 GGGTTTA
761551 GGG-TTA
1 GGGTTTA
761557 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761564 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761571 GGG-TTA
1 GGGTTTA
761577 -GGTTTA
1 GGGTTTA
761583 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761590 GGG-TTA
1 GGGTTTA
761596 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761603 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761610 GGG-TTA
1 GGGTTTA
761616 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761623 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761630 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761637 GGG-TTA
1 GGGTTTA
761643 -GGTTTA
1 GGGTTTA
761649 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761656 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761663 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761670 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761677 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
761684 GGG-TGA
1 GGGTTTA
761690 GGGTTTTA
1 GGG-TTTA
761698 -GGTTTA
1 GGGTTTA
761704 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761711 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761718 GGG-TTA
1 GGGTTTA
761724 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761731 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761738 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761745 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761752 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761759 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761766 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761773 GGG-TTA
1 GGGTTTA
761779 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761786 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761793 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761800 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761807 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761814 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761821 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
761828 GGGTTGA
1 GGGTTTA
761835 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761842 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761849 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761856 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761863 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761870 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761877 -GGTTTA
1 GGGTTTA
761883 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761890 GGGGTTTA
1 -GGGTTTA
761898 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761905 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761912 GGG-TTA
1 GGGTTTA
761918 GGG-TTA
1 GGGTTTA
761924 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761931 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761938 GGG-TTA
1 GGGTTTA
761944 -GGTTTA
1 GGGTTTA
761950 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761957 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761964 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761971 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761978 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761985 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761992 GGGTTTA
1 GGGTTTA
761999 GGGTTTTA
1 GGG-TTTA
762007 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762014 GGG--TA
1 GGGTTTA
762019 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762026 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762033 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762040 GGGTTTTTA
1 GGG--TTTA
762049 -GGTTTA
1 GGGTTTA
762055 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762062 GGGTTTTA
1 GGG-TTTA
762070 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762077 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762084 -GGTTTA
1 GGGTTTA
762090 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762097 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762104 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762111 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762118 GGG-TTA
1 GGGTTTA
762124 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762131 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762138 GGG-TTA
1 GGGTTTA
762144 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762151 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762158 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
762165 GGGTTTT
1 GGGTTTA
762172 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762179 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762186 -GGTGTTA
1 GGGT-TTA
762193 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762200 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762207 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762214 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762221 -GGTTTA
1 GGGTTTA
762227 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762234 GGG-TTA
1 GGGTTTA
762240 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762247 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762254 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762261 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762268 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762275 -GGTTTA
1 GGGTTTA
762281 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762288 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762295 -GGTTTA
1 GGGTTTA
762301 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762308 GGG-TTA
1 GGGTTTA
762314 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762321 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762328 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762335 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762342 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762349 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762356 GGG-TTA
1 GGGTTTA
762362 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762369 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762376 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762383 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762390 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762397 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762404 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762411 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762418 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762425 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762432 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762439 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762446 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762453 -GGTTTA
1 GGGTTTA
762459 GGGTTT-
1 GGGTTTA
762465 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762472 GGGTTT-
1 GGGTTTA
762478 GGG--TA
1 GGGTTTA
762483 GGGTTTTA
1 GGG-TTTA
762491 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762498 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762505 GGG-TTA
1 GGGTTTA
762511 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762518 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762525 -GGTTTA
1 GGGTTTA
762531 -GGTTTA
1 GGGTTTA
762537 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762544 -GGTTTA
1 GGGTTTA
762550 -GGTTTA
1 GGGTTTA
762556 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762563 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762570 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762577 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762584 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762591 -GG-TTA
1 GGGTTTA
762596 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762603 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762610 GGGTTT-
1 GGGTTTA
762616 GGG-TTA
1 GGGTTTA
762622 -GGTTTA
1 GGGTTTA
762628 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762635 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762642 -GGTTTA
1 GGGTTTA
762648 GGG-TTA
1 GGGTTTA
762654 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762661 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762668 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762675 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762682 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762689 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762696 --GTTTA
1 GGGTTTA
762701 GGGTTTTA
1 GGG-TTTA
762709 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762716 -GG-TTA
1 GGGTTTA
762721 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762728 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762735 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762742 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762749 -GGTTTA
1 GGGTTTA
762755 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762762 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762769 GGGTTTTTA
1 GGG--TTTA
762778 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762785 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762792 -GGTTTA
1 GGGTTTA
762798 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762805 GGG-TTA
1 GGGTTTA
762811 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762818 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762825 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762832 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762839 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762846 GGG-TTA
1 GGGTTTA
762852 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762859 -GGTTTA
1 GGGTTTA
762865 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762872 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762879 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762886 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762893 GGG-TTA
1 GGGTTTA
762899 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762906 -GGTTTA
1 GGGTTTA
762912 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762919 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762926 -GGTTTA
1 GGGTTTA
762932 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762939 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762946 -GGTTTA
1 GGGTTTA
762952 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762959 GGGTTTTA
1 GGG-TTTA
762967 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762974 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762981 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762988 GGGTTTA
1 GGGTTTA
762995 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763002 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763009 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763016 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763023 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763030 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
763037 GGGTTTC
1 GGGTTTA
763044 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763051 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763058 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763065 GGG-TTA
1 GGGTTTA
763071 -GG-TTA
1 GGGTTTA
763076 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763083 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763090 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763097 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763104 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763111 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763118 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763125 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763132 -GG-TTA
1 GGGTTTA
763137 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763144 GGG-TTA
1 GGGTTTA
763150 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763157 -GGTTTA
1 GGGTTTA
763163 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763170 GGG-TTA
1 GGGTTTA
763176 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763183 -GGTTTA
1 GGGTTTA
763189 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763196 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763203 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763210 -GGTTTA
1 GGGTTTA
763216 -GG-TTA
1 GGGTTTA
763221 GGGTTT-
1 GGGTTTA
763227 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763234 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763241 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
763248 GGGTTTT
1 GGGTTTA
763255 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763262 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763269 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763276 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763283 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763290 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
763297 GGG-TTG
1 GGGTTTA
763303 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763310 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763317 GGG-TTA
1 GGGTTTA
763323 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763330 GGG-TTA
1 GGGTTTA
763336 GGG--TA
1 GGGTTTA
763341 -GGTTTA
1 GGGTTTA
763347 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763354 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763361 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763368 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763375 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763382 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763389 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763396 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763403 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763410 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763417 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763424 GGGTTTTTA
1 GGG--TTTA
763433 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763440 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763447 -GG-TTA
1 GGGTTTA
763452 -GGTTTA
1 GGGTTTA
763458 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763465 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763472 -GGTTTA
1 GGGTTTA
763478 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763485 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763492 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763499 -GGTTTA
1 GGGTTTA
763505 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763512 GGG-TT-
1 GGGTTTA
763517 -GGTTTA
1 GGGTTTA
763523 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763530 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763537 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763544 GGGTTTTA
1 GGG-TTTA
763552 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763559 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763566 GGGGGTTTA
1 --GGGTTTA
763575 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763582 -GGTTTA
1 GGGTTTA
763588 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763595 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763602 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763609 -GGTTTA
1 GGGTTTA
763615 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763622 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763629 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763636 -GGTTTA
1 GGGTTTA
763642 -GGTTTA
1 GGGTTTA
763648 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763655 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763662 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763669 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763676 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763683 GGGTTT-
1 GGGTTTA
763689 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763696 -GGTTTA
1 GGGTTTA
763702 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763709 GGGTTT-
1 GGGTTTA
763715 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763722 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763729 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763736 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763743 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763750 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763757 GGGTTTTA
1 GGG-TTTA
763765 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763772 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763779 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763786 -GGTTTA
1 GGGTTTA
763792 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763799 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763806 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763813 GGG-TTA
1 GGGTTTA
763819 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763826 GGG-TTA
1 GGGTTTA
*
763832 GGGTTTC
1 GGGTTTA
763839 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
763846 GGTTTTA
1 GGGTTTA
763853 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763860 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763867 GGGTTT-
1 GGGTTTA
763873 -GGTTTA
1 GGGTTTA
763879 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763886 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763893 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763900 GGGGTTTA
1 -GGGTTTA
763908 GGGTTTAA
1 GGGTTT-A
763916 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
763923 GGGTGGGGTA
1 GGGT---TTA
763933 -GGTTT-
1 GGGTTTA
763938 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763945 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763952 GGG-TTA
1 GGGTTTA
763958 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763965 GGGTTTTA
1 GGG-TTTA
763973 GGG--TA
1 GGGTTTA
763978 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763985 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763992 GGGTTTA
1 GGGTTTA
763999 -GGTTTA
1 GGGTTTA
764005 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764012 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764019 GGGTTT-
1 GGGTTTA
764025 GGGTTTTA
1 GGG-TTTA
764033 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764040 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764047 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764054 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764061 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764068 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764075 GGG--TA
1 GGGTTTA
764080 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764087 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764094 -GGTTTA
1 GGGTTTA
764100 GGG-TTA
1 GGGTTTA
764106 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764113 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764120 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764127 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764134 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764141 -GGTTTA
1 GGGTTTA
764147 GGG-TTA
1 GGGTTTA
764153 GGG--TA
1 GGGTTTA
764158 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764165 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764172 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764179 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764186 GGGGTTTA
1 -GGGTTTA
764194 -GGTTTA
1 GGGTTTA
764200 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
764207 GGTTTTA
1 GGGTTTA
764214 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764221 GGGTTTTA
1 GGG-TTTA
764229 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764236 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764243 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764250 GGG-TTA
1 GGGTTTA
764256 GGGTTT-
1 GGGTTTA
764262 -GGTTTA
1 GGGTTTA
764268 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764275 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764282 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764289 -GGTTTA
1 GGGTTTA
764295 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764302 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764309 GGG--TA
1 GGGTTTA
764314 GGGTTT-
1 GGGTTTA
764320 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764327 -GGTTTA
1 GGGTTTA
764333 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764340 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764347 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764354 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
764361 GGGTTTTC
1 GGG-TTTA
764369 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
764376 GGG---G
1 GGGTTTA
764380 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764387 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764394 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764401 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764408 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764415 GGG-TTA
1 GGGTTTA
764421 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764428 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764435 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764442 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764449 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764456 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764463 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764470 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764477 GGG-TTA
1 GGGTTTA
764483 GGG-TTA
1 GGGTTTA
764489 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764496 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764503 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764510 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764517 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764524 GGG-TTA
1 GGGTTTA
764530 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764537 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764544 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764551 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764558 -GGTTTA
1 GGGTTTA
764564 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764571 GGG-TTA
1 GGGTTTA
764577 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764584 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764591 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764598 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764605 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764612 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764619 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764626 GGG-TTA
1 GGGTTTA
764632 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764639 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764646 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764653 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764660 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764667 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764674 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764681 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764688 -GGTTTA
1 GGGTTTA
764694 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764701 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764708 GGG-TTA
1 GGGTTTA
764714 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764721 -GGTTTA
1 GGGTTTA
764727 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764734 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764741 GGG-TTA
1 GGGTTTA
764747 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764754 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764761 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764768 GGGTTT-
1 GGGTTTA
764774 -GG-TTA
1 GGGTTTA
764779 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764786 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764793 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764800 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764807 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764814 GGG-TTA
1 GGGTTTA
764820 -GGTTTA
1 GGGTTTA
764826 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764833 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764840 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764847 GGGTTTTA
1 GGG-TTTA
764855 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764862 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764869 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764876 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764883 GGGTTTTTA
1 GGG--TTTA
764892 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764899 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764906 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764913 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764920 GGG-TTA
1 GGGTTTA
764926 -GGTTTA
1 GGGTTTA
764932 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764939 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764946 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764953 GGG-TTA
1 GGGTTTA
764959 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764966 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764973 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764980 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764987 GGGTTTA
1 GGGTTTA
764994 GGG--TA
1 GGGTTTA
764999 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765006 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765013 GGG-TTA
1 GGGTTTA
765019 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765026 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765033 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765040 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765047 GGG-TTA
1 GGGTTTA
765053 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765060 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765067 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
765074 GGGGTTA
1 GGGTTTA
765081 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765088 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765095 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765102 -GGTTTA
1 GGGTTTA
765108 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765115 GGG-TTA
1 GGGTTTA
765121 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765128 -GGTTTA
1 GGGTTTA
765134 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765141 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765148 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765155 -GGTTTA
1 GGGTTTA
765161 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765168 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765175 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765182 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765189 GGG-TTA
1 GGGTTTA
765195 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765202 GGGTTTTA
1 GGG-TTTA
765210 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765217 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
765224 GGGGTTA
1 GGGTTTA
765231 GGG-TTA
1 GGGTTTA
765237 -GGTTTA
1 GGGTTTA
765243 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765250 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765257 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765264 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765271 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765278 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765285 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765292 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765299 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765306 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765313 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765320 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765327 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765334 GGG-TTA
1 GGGTTTA
765340 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765347 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765354 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765361 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765368 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765375 GGG-TTA
1 GGGTTTA
765381 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765388 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765395 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765402 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765409 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765416 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765423 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765430 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765437 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765444 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765451 GGG-TTA
1 GGGTTTA
765457 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765464 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765471 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765478 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765485 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765492 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765499 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765506 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765513 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765520 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765527 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765534 GGGTTTTA
1 GGG-TTTA
765542 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765549 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765556 GGG-TTA
1 GGGTTTA
765562 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765569 -GGTTTA
1 GGGTTTA
765575 GGG-TTA
1 GGGTTTA
765581 -GGTTTA
1 GGGTTTA
765587 GGG-TTA
1 GGGTTTA
765593 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765600 GGGTTTTA
1 GGG-TTTA
765608 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765615 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765622 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765629 -GGTTTA
1 GGGTTTA
765635 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765642 GGGGTTTA
1 -GGGTTTA
765650 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765657 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765664 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765671 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765678 GGG-TTA
1 GGGTTTA
765684 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765691 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765698 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765705 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765712 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765719 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765726 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765733 GGGTTTTA
1 GGG-TTTA
765741 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765748 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765755 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765762 GGGTTT-
1 GGGTTTA
765768 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765775 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765782 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765789 GGGTTT-
1 GGGTTTA
765795 GGG-TTA
1 GGGTTTA
765801 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765808 GGG-TT-
1 GGGTTTA
765813 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765820 GGG-TTA
1 GGGTTTA
765826 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765833 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765840 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765847 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765854 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765861 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765868 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765875 GGG-TTA
1 GGGTTTA
765881 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765888 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765895 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765902 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765909 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765916 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765923 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765930 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765937 GGG-TTA
1 GGGTTTA
765943 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
765950 GGGGTTA
1 GGGTTTA
765957 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765964 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765971 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765978 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765985 -GGTTTA
1 GGGTTTA
765991 GGGTTTA
1 GGGTTTA
765998 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766005 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766012 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766019 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766026 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766033 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766040 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766047 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766054 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766061 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766068 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766075 GGG-TTA
1 GGGTTTA
766081 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766088 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766095 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766102 GGG-TTA
1 GGGTTTA
766108 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766115 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766122 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766129 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766136 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766143 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766150 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766157 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766164 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766171 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766178 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766185 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766192 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766199 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766206 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766213 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766220 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766227 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766234 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766241 -GGTTTA
1 GGGTTTA
766247 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766254 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766261 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766268 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766275 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766282 GGG-TTA
1 GGGTTTA
766288 GGGTTT-
1 GGGTTTA
766294 -GGTTTA
1 GGGTTTA
766300 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766307 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766314 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766321 GGG--TA
1 GGGTTTA
766326 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766333 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766340 GGGGTTTA
1 -GGGTTTA
766348 -GG-TTA
1 GGGTTTA
766353 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766360 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766367 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766374 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766381 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766388 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766395 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766402 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766409 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766416 GGG-TTA
1 GGGTTTA
766422 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766429 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766436 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766443 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766450 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766457 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766464 GGGTTT-
1 GGGTTTA
766470 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766477 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766484 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766491 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766498 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766505 GGGTTT-
1 GGGTTTA
766511 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766518 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766525 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766532 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766539 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766546 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766553 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766560 GGGTTTTA
1 GGG-TTTA
766568 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766575 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766582 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766589 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766596 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766603 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766610 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766617 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766624 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766631 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766638 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766645 GGG-TTA
1 GGGTTTA
766651 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766658 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766665 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766672 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
766679 GGG-TTG
1 GGGTTTA
766685 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766692 GGG-TTA
1 GGGTTTA
766698 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766705 GGGTTTTA
1 GGG-TTTA
766713 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766720 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766727 GGGGTTTA
1 -GGGTTTA
766735 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766742 GGG-TT-
1 GGGTTTA
766747 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
766754 GGGGTTA
1 GGGTTTA
766761 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766768 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766775 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766782 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766789 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766796 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766803 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766810 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766817 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766824 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766831 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766838 GGGGGTTTA
1 --GGGTTTA
766847 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766854 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766861 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766868 GGGTTT-
1 GGGTTTA
766874 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766881 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766888 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
766895 GGG-TTG
1 GGGTTTA
766901 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766908 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766915 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766922 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766929 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766936 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766943 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766950 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766957 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766964 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766971 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766978 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766985 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766992 GGGTTTA
1 GGGTTTA
766999 -GGTTTA
1 GGGTTTA
767005 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767012 GGGTTT-
1 GGGTTTA
767018 -GGTTTA
1 GGGTTTA
*
767024 GGGTTTG
1 GGGTTTA
767031 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767038 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767045 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767052 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767059 GGGGTTTA
1 -GGGTTTA
767067 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767074 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767081 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767088 GGGTTT-
1 GGGTTTA
767094 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767101 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767108 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767115 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767122 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767129 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767136 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767143 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767150 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767157 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767164 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767171 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767178 -GGTTTA
1 GGGTTTA
767184 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767191 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767198 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767205 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767212 GGG-TTA
1 GGGTTTA
767218 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767225 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767232 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767239 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
767246 GGGTTTC
1 GGGTTTA
767253 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767260 GGG-TTA
1 GGGTTTA
767266 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767273 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767280 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767287 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767294 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767301 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767308 GGGTTT-
1 GGGTTTA
767314 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767321 GGGGTTT-
1 -GGGTTTA
767328 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767335 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767342 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767349 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767356 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767363 GGGTTT-
1 GGGTTTA
767369 GGG--TA
1 GGGTTTA
767374 GGGGTTT-
1 -GGGTTTA
767381 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767388 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767395 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767402 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767409 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767416 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767423 -GGTTTA
1 GGGTTTA
767429 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767436 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
767443 GGGTTTT
1 GGGTTTA
767450 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767457 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767464 GGGTTTTA
1 GGG-TTTA
767472 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767479 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767486 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767493 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767500 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767507 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767514 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767521 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767528 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767535 GGGTTTTA
1 GGG-TTTA
767543 GGG-TTA
1 GGGTTTA
767549 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767556 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767563 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767570 GGG-TTA
1 GGGTTTA
767576 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767583 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767590 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767597 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767604 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767611 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767618 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767625 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767632 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767639 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767646 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767653 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767660 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767667 GGG-TTA
1 GGGTTTA
767673 GGG-TTA
1 GGGTTTA
767679 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767686 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767693 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767700 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767707 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767714 GGG-TTA
1 GGGTTTA
767720 GGG-TTA
1 GGGTTTA
767726 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767733 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767740 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767747 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767754 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767761 -GG-TTA
1 GGGTTTA
767766 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767773 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767780 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767787 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767794 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767801 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767808 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767815 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767822 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767829 GGG-TTA
1 GGGTTTA
767835 GGGGTTTA
1 -GGGTTTA
767843 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767850 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767857 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767864 GGG-TTA
1 GGGTTTA
767870 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767877 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767884 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767891 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767898 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767905 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767912 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767919 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767926 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767933 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767940 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767947 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767954 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767961 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767968 GGG-TT-
1 GGGTTTA
767973 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767980 -GGTTTA
1 GGGTTTA
767986 GGGTTTA
1 GGGTTTA
767993 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768000 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768007 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768014 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768021 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768028 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768035 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768042 GGG-TT-
1 GGGTTTA
768047 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768054 GGG-TTA
1 GGGTTTA
768060 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768067 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768074 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768081 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768088 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768095 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768102 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768109 GGG-TTA
1 GGGTTTA
768115 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768122 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768129 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768136 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768143 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768150 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768157 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768164 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768171 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768178 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768185 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768192 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768199 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768206 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768213 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768220 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768227 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768234 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768241 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768248 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768255 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768262 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768269 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768276 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768283 GGG-TTA
1 GGGTTTA
768289 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768296 GGGTTT-
1 GGGTTTA
768302 GGG-TTA
1 GGGTTTA
768308 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768315 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768322 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768329 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768336 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768343 GGG-TTA
1 GGGTTTA
768349 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768356 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768363 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768370 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768377 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768384 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768391 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768398 -GGTTT-
1 GGGTTTA
768403 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768410 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768417 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768424 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768431 GGG-TTA
1 GGGTTTA
768437 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768444 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768451 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768458 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768465 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768472 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768479 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768486 GGGTTTTA
1 GGG-TTTA
768494 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768501 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768508 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768515 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768522 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768529 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768536 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768543 GGGGTTTA
1 -GGGTTTA
768551 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768558 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768565 GGG-TTA
1 GGGTTTA
768571 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768578 GGG-TTA
1 GGGTTTA
768584 GGG-TTA
1 GGGTTTA
768590 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768597 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768604 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768611 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
768618 GGGTTTC
1 GGGTTTA
768625 GGG-TTA
1 GGGTTTA
768631 GGG-TTA
1 GGGTTTA
768637 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768644 GGG-TTA
1 GGGTTTA
768650 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768657 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768664 -GGTTTA
1 GGGTTTA
768670 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
768677 GGGTTTC
1 GGGTTTA
768684 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768691 GGG-TT-
1 GGGTTTA
768696 GGG-TTA
1 GGGTTTA
768702 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768709 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768716 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768723 --GTTTA
1 GGGTTTA
768728 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768735 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768742 GGG-TTA
1 GGGTTTA
768748 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768755 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768762 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768769 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768776 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768783 GGG-TT-
1 GGGTTTA
768788 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768795 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768802 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768809 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768816 GGG-TTA
1 GGGTTTA
768822 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768829 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768836 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768843 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768850 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768857 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768864 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768871 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768878 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768885 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768892 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768899 -GGTTTA
1 GGGTTTA
768905 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768912 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768919 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768926 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768933 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768940 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768947 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768954 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768961 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768968 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768975 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768982 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768989 GGGTTTA
1 GGGTTTA
768996 GGG-TTA
1 GGGTTTA
769002 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769009 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769016 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769023 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769030 GGGTTTTTTA
1 GGG---TTTA
769040 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769047 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769054 GGG-TTA
1 GGGTTTA
769060 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769067 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769074 -GGTTTA
1 GGGTTTA
769080 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769087 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769094 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769101 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769108 GGGTTT-
1 GGGTTTA
769114 GGG-TTA
1 GGGTTTA
769120 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769127 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769134 GGG-TTA
1 GGGTTTA
769140 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769147 -GGTTTA
1 GGGTTTA
769153 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769160 GGG-TTA
1 GGGTTTA
769166 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769173 GGG-TTA
1 GGGTTTA
769179 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769186 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769193 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769200 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769207 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769214 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769221 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769228 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769235 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769242 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769249 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769256 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769263 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769270 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769277 GGG-TTA
1 GGGTTTA
769283 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769290 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769297 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769304 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769311 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769318 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769325 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769332 GGG--TA
1 GGGTTTA
769337 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769344 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769351 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769358 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769365 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769372 GGG-TTA
1 GGGTTTA
769378 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769385 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769392 -GGTTTA
1 GGGTTTA
769398 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769405 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769412 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769419 GGG-TTA
1 GGGTTTA
769425 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769432 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769439 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769446 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769453 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769460 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769467 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769474 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769481 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769488 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769495 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769502 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769509 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769516 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769523 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769530 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769537 GGGGTTTA
1 -GGGTTTA
769545 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769552 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769559 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769566 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769573 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769580 -GGTTTA
1 GGGTTTA
769586 -GGTTTA
1 GGGTTTA
769592 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769599 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769606 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769613 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769620 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769627 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769634 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769641 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769648 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769655 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769662 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
769669 GGGTTTT
1 GGGTTTA
769676 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
769683 GGGTTTC
1 GGGTTTA
769690 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769697 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769704 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769711 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769718 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769725 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
769732 GGGTTTC
1 GGGTTTA
769739 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769746 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769753 GGG-TTA
1 GGGTTTA
769759 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769766 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769773 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769780 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769787 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769794 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769801 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769808 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769815 -GGTTTA
1 GGGTTTA
769821 -GGTTTA
1 GGGTTTA
769827 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769834 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769841 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769848 GGG-TTA
1 GGGTTTA
769854 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769861 GGG-TTA
1 GGGTTTA
769867 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769874 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769881 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769888 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769895 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769902 GGG-TTA
1 GGGTTTA
769908 GGG-TTA
1 GGGTTTA
769914 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769921 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769928 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769935 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769942 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769949 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769956 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769963 -GG-TTA
1 GGGTTTA
769968 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769975 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769982 GGGTTTA
1 GGGTTTA
769989 -GGTTTA
1 GGGTTTA
769995 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770002 GGG-TTA
1 GGGTTTA
770008 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770015 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770022 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770029 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770036 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770043 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770050 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770057 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770064 GGGTTTTA
1 GGG-TTTA
770072 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770079 GGGTTT-
1 GGGTTTA
770085 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770092 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770099 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770106 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770113 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770120 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770127 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770134 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770141 GGG-TTA
1 GGGTTTA
770147 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770154 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770161 GGGGGTTTA
1 --GGGTTTA
770170 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770177 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770184 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770191 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770198 -GGTTTA
1 GGGTTTA
770204 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770211 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770218 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770225 GGG-TTA
1 GGGTTTA
770231 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
770238 GGGTTTC
1 GGGTTTA
770245 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770252 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770259 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770266 -GGTTTA
1 GGGTTTA
770272 GGG-TTA
1 GGGTTTA
770278 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770285 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770292 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770299 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
770306 -GGTTTC
1 GGGTTTA
770312 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770319 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770326 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770333 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770340 GGG-TTA
1 GGGTTTA
770346 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770353 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770360 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770367 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770374 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770381 -GGTTTA
1 GGGTTTA
770387 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770394 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770401 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770408 GGGTTTTA
1 GGG-TTTA
770416 -GGTTTA
1 GGGTTTA
770422 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770429 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770436 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770443 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770450 -GGTTTA
1 GGGTTTA
770456 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770463 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770470 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770477 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770484 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770491 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770498 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770505 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770512 GGG-TTA
1 GGGTTTA
770518 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770525 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770532 GGGTTTTTA
1 GGG--TTTA
770541 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770548 GGGTTTTA
1 GGG-TTTA
770556 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770563 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770570 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770577 -GGTTTA
1 GGGTTTA
770583 -GGTTTA
1 GGGTTTA
770589 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770596 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770603 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770610 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770617 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770624 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770631 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770638 GGG-TTA
1 GGGTTTA
770644 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770651 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770658 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770665 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770672 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770679 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770686 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770693 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770700 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770707 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770714 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770721 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770728 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770735 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770742 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770749 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770756 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770763 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770770 -GGTTTA
1 GGGTTTA
770776 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770783 -GGTTTA
1 GGGTTTA
770789 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770796 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770803 -GGTTTA
1 GGGTTTA
770809 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770816 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770823 -GGTTTA
1 GGGTTTA
770829 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770836 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770843 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770850 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770857 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770864 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770871 GGG-TTA
1 GGGTTTA
770877 GGGTTT-
1 GGGTTTA
770883 GGG-TTA
1 GGGTTTA
770889 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770896 GGG-TTA
1 GGGTTTA
770902 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770909 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770916 GGG-TTA
1 GGGTTTA
770922 -GGTTTA
1 GGGTTTA
770928 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770935 -GGTTTA
1 GGGTTTA
770941 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770948 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770955 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770962 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770969 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770976 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
770983 GGTTTTA
1 GGGTTTA
770990 GGGTTTA
1 GGGTTTA
770997 GGGTTTTA
1 GGG-TTTA
771005 GGGTTTA
1 GGGTTTA
771012 -GGTTTA
1 GGGTTTA
771018 GGGTTTA
1 GGGTTTA
771025 GGGTTTA
1 GGGTTTA
771032 GGGTTTA
1 GGGTTTA
771039 GGGTTTA
1 GGGTTTA
771046 GGGTTTA
1 GGGTTTA
771053 -GGTTTA
1 GGGTTTA
771059 GGGTTTA
1 GGGTTTA
771066 GGGTTTA
1 GGGTTTA
771073 GGGTTTA
1 GGGTTTA
771080 GGGTTTA
1 GGGTTTA
771087 GGGTTTA
1 GGGTTTA
771094 GGGTTTA
1 GGGTTTA
771101 GGGTTTA
1 GGGTTTA
771108 GGGTTTA
1 GGGTTTA
771115 GGG-TTA
1 GGGTTTA
771121 GGGTTTA
1 GGGTTTA
771128 GGGTTTTTTA
1 GGG---TTTA
771138 GGGTTTA
1 GGGTTTA
771145 GGGTTTA
1 GGGTTTA
771152 GGGTTTA
1 GGGTTTA
771159 GGGTTTA
1 GGGTTTA
771166 GGGTTTA
1 GGGTTTA
771173 GGGTTTA
1 GGGTTTA
771180 GGGTTTA
1 GGGTTTA
771187 GGGTTTA
1 GGGTTTA
771194 GGGTTTA
1 GGGTTTA
771201 -GGTTTA
1 GGGTTTA
771207 GGGTTTA
1 GGGTTTA
771214 GGGTTTA
1 GGGTTTA
771221 GGGTTTA
1 GGGTTTA
771228 GGGTTTA
1 GGGTTTA
771235 GGGTTTA
1 GGGTTTA
771242 GGGTTTA
1 GGGTTTA
771249 GGGTTTA
1 GGGTTTA
771256 GGGTTTA
1 GGGTTTA
771263 GGGTTTA
1 GGGTTTA
771270 GGGTTTA
1 GGGTTTA
771277 GGGTTTA
1 GGGTTTA
771284 GGGTTTA
1 GGGTTTA
771291 GGGTTTA
1 GGGTTTA
771298 GGG-TTA
1 GGGTTTA
771304 GGGTTTA
1 GGGTTTA
771311 GGG-TTA
1 GGGTTTA
771317 GGGTTTA
1 GGGTTTA
771324 GGGTTTA
1 GGGTTTA
771331 GGGTTTA
1 GGGTTTA
771338 GGGGTTTA
1 -GGGTTTA
771346 GGGTTTA
1 GGGTTTA
771353 GGGTTTA
1 GGGTTTA
771360 GGGTTTA
1 GGGTTTA
771367 GGGTTTA
1 GGGTTTA
771374 GGGTTTA
1 GGGTTTA
771381 GGGTTTA
1 GGGTTTA
771388 GGG-TTA
1 GGGTTTA
771394 GGGTTTA
1 GGGTTTA
771401 GGGTTTA
1 GGGTTTA
771408 GGGTTTA
1 GGGTTTA
771415 GGGTTTA
1 GGGTTTA
771422 GGGTTTA
1 GGGTTTA
771429 GGGTTTA
1 GGGTTTA
771436 GGGTTTA
1 GGGTTTA
771443 GGGTTTA
1 GGGTTTA
771450 GGGTTT-
1 GGGTTTA
771456 GGGTTTA
1 GGGTTTA
771463 GGGTTTA
1 GGGTTTA
771470 GGG-TTA
1 GGGTTTA
771476 GGGTTTA
1 GGGTTTA
771483 GGG-TT-
1 GGGTTTA
771488 GGGTTTA
1 GGGTTTA
771495 GGGTTTA
1 GGGTTTA
771502 GGGTTTA
1 GGGTTTA
771509 GGG-TTA
1 GGGTTTA
771515 GGGTTTA
1 GGGTTTA
771522 -GGTTTA
1 GGGTTTA
771528 GGGTTTA
1 GGGTTTA
771535 GGGTTTA
1 GGGTTTA
771542 GGGTTTA
1 GGGTTTA
771549 GGGTTTA
1 GGGTTTA
771556 GGGTTTA
1 GGGTTTA
771563 GGG-TTA
1 GGGTTTA
771569 GGG-TTA
1 GGGTTTA
771575 GGGTTTA
1 GGGTTTA
771582 GGGTTTA
1 GGGTTTA
771589 GGGTTTA
1 GGGTTTA
771596 GGGTTTA
1 GGGTTTA
771603 GGGTTTA
1 GGGTTTA
771610 GGGTTTA
1 GGGTTTA
771617 GGGTTTA
1 GGGTTTA
771624 GGGTTTA
1 GGGTTTA
771631 GGGTTTA
1 GGGTTTA
771638 GGGTTTA
1 GGGTTTA
771645 GGGTTTA
1 GGGTTTA
771652 GGGTTTA
1 GGGTTTA
771659 GGGTTTA
1 GGGTTTA
*
771666 GGGTTTC
1 GGGTTTA
771673 GGGTTTA
1 GGGTTTA
771680 GGGTTTA
1 GGGTTTA
771687 GGGTTTA
1 GGGTTTA
771694 GGGTTTA
1 GGGTTTA
771701 GGGTTTA
1 GGGTTTA
771708 GGGTTTA
1 GGGTTTA
771715 GGGTTTA
1 GGGTTTA
771722 GGGTTTA
1 GGGTTTA
771729 GGGTTT
1 GGGTTT
Statistics
Matches: 16561, Mismatches: 202, Indels: 1388
0.91 0.01 0.08
Matches are distributed among these distances:
4 23 0.00
5 374 0.02
6 2835 0.17
7 12874 0.78
8 345 0.02
9 71 0.00
10 33 0.00
11 6 0.00
ACGTcount: A:0.14, C:0.04, G:0.43, T:0.39
Consensus pattern (7 bp):
GGGTTTA
Done.