Tandem Repeats Finder Program written by:

                 Gary Benson
      Program in Bioinformatics
          Boston University

Version 4.09

Sequence: VEPZ01009552.1 Hibiscus syriacus cultivar Beakdansim tig00116472_pilon, whole genome shotgun sequence

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GCACACGTACGTATTCCGCCTGCCTGGAGTGGGGTACTTGGGGAG 7352 AAAGGTTC-GGGCGTAGAATCCGAATTTTGCGACTCCCTT-AGT--GGGCCGGAAGAAAACGAAC 1 AAAGGTTCGGGGCGTAGAATCCGAATTTTGCGACTCCCTTAAGTGCGGGCCGGAAGAAAACGAAC 7413 GCCTTAATAAATTAAGGGCGCAAGGCATGACGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATC 66 GCCTTAATAAATTAAGGGCGCAAGGCATGACGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATC 7478 CCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCT-GG 131 CCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGG * 7542 --G-----GTGTTGCACCCCTATTTTTCGGATTATTTTC-TTTTATTCTATCTCGAACACACGCA 196 AAGTCCTCGTGTTGCACCCCTCTTTTTCGGATTATTTTCTTTTTATTCTATCTCGAACACACGCA * 7599 CACGTACGTATTCCGCCTGCCTGGAGTGGGGTACTTTGGGAG 261 CACGTACGTATTCCGCCTGCCTGGAGTGGGGTACTTGGGGAG 7641 AAAGGTTC-GGGCGTAGAATCCGAATTTTGCGACTCCCTTAAGTGCGGGCCGGAAGAAAACGAAC 1 AAAGGTTCGGGGCGTAGAATCCGAATTTTGCGACTCCCTTAAGTGCGGGCCGGAAGAAAACGAAC 7705 GCCTTAAATAAATTAAGGGCGCAAGGCATGAC-GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGAT 66 GCCTT-AATAAATTAAGGGCGCAAGGCATGACGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGAT 7769 CCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGG 130 CCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGG 7834 GAAGTCCTCGTGTTGCA-CCCTCTTTTTCGGATTATTTTCTTTTTATTCTATCTCGAACACACGC 195 GAAGTCCTCGTGTTGCACCCCTCTTTTTCGGATTATTTTCTTTTTATTCTATCTCGAACACACGC 7898 ACACGTACGTATTCCGCCTGCCT-G-GTGGGGTACTT-GGG-G 260 ACACGTACGTATTCCGCCTGCCTGGAGTGGGGTACTTGGGGAG 7937 AAAGGTTC-GGGCGTAGAATCCGAATTTTGCGACTCCCTTAAGTGCGGGCCGGAAGAAAACGAAC 1 AAAGGTTCGGGGCGTAGAATCCGAATTTTGCGACTCCCTTAAGTGCGGGCCGGAAGAAAACGAAC 8001 GCCTTAAATAAATTAAGGGCGCAAGGCATGACGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGAT 66 GCCTT-AATAAATTAAGGGCGCAAGGCATGACGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGAT 8066 CCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGG 130 CCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGG * 8131 GAAGTCCTCGTGTTGCACCCCTATTTTTC-GATTATTTTC-TTTTATTCTATCTCGAACACACGC 195 GAAGTCCTCGTGTTGCACCCCTCTTTTTCGGATTATTTTCTTTTTATTCTATCTCGAACACACGC 8194 ACACGTACGTATTCCGCCTGCCTGGAGTGGGGTACTTGGGGAG 260 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CACGTACGTATTCCGCCTGCCTGGAGTGGGGTACTTGGGGAG 9108 AAAGGTTCGGGGCGTAGAATCCGAATTTTGCGACTCCCTTAAGTGC-GGCCGGAAGAAAACGAAC 1 AAAGGTTCGGGGCGTAGAATCCGAATTTTGCGACTCCCTTAAGTGCGGGCCGGAAGAAAACGAAC 9172 GCCTTAATAAATTAAGGGCGCAAGGCATGACGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATC 66 GCCTTAATAAATTAAGGGCGCAAGGCATGACGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATC 9237 CCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGA----TG-CCTCCTGGG 131 CCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGG * 9297 AAGTCCTCGTGTTGCACCCCTATTTTTTCGGATTATTTTCTTTTTATTCTA--TCGAACACA--C 196 AAGTCCTCGTGTTGCACCCCT-CTTTTTCGGATTATTTTCTTTTTATTCTATCTCGAACACACGC 9358 ACACGTACGTATTCCGCCTGCCTGGAGTGGGGTACTTGGGGAG 260 ACACGTACGTATTCCGCCTGCCTGGAGTGGGGTACTTGGGGAG 9401 AAAGGTTC-GGGCGTAGAATCCGAA-TTTGCGACTCCCTTAAGTGC-GGCCGGAAGAAAACGAAC 1 AAAGGTTCGGGGCGTAGAATCCGAATTTTGCGACTCCCTTAAGTGCGGGCCGGAAGAAAACGAAC 9463 GCCTTAATAAATTAAGGGCGCAAGGCATGACGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATC 66 GCCTTAATAAATTAAGGGCGCAAGGCATGACGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATC 9528 CCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC--GAGTAGTA--AGGATGGGTGACCTCCTGGG 131 CCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGG 9589 AAGTCCTCGTGTTGCACCCCTC-TTTTCGGATTATTTTCTTTTTATTCTATCTCG-ACACACGCA 196 AAGTCCTCGTGTTGCACCCCTCTTTTTCGGATTATTTTCTTTTTATTCTATCTCGAACACACGCA 9652 CACGTACGTATTCCGCCTGCCTGGAGTGGGGTACTTGGGGAG 261 CACGTACGTATTCCGCCTGCCTGGAGTGGGGTACTTGGGGAG 9694 AAAGGTTC-GGGCGTAGAATCCGAATTTTGCGACTCCCTTAAGTGCGGGCCGGAAGAAAACGAAC 1 AAAGGTTCGGGGCGTAGAATCCGAATTTTGCGACTCCCTTAAGTGCGGGCCGGAAGAAAACGAAC 9758 GCCTT-A-AAATTAAGGGCGCAAGGCATGAC-GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATC 66 GCCTTAATAAATTAAGGGCGCAAGGCATGACGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATC 9820 CCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGAT-GGTGACCTCCTGGG 131 CCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGG * * 9884 AAGTCCTCGTGTTGCACCCCTATTTTTCGGATTATTTTCTTTTTATTCTATCTCGAACACACACA 196 AAGTCCTCGTGTTGCACCCCTCTTTTTCGGATTATTTTCTTTTTATTCTATCTCGAACACACGCA 9949 CACGTACGTATTCCGCCTGCCTGGAGT-GGGTACTTGGGGAG 261 CACGTACGTATTCCGCCTGCCTGGAGTGGGGTACTTGGGGAG 9990 AAAGGTTCGGGGCGTAGAATCCGAATTTTGCGACTCCCTTAAGTGCGGGCCGGAAGAAAACGAAC 1 AAAGGTTCGGGGCGTAGAATCCGAATTTTGCGACTCCCTTAAGTGCGGGCCGGAAGAAAACGAAC 10055 GCCTTAA-ATAATTAAGGGCGCAAGGCATGACGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGAT 66 GCCTTAATA-AATTAAGGGCGCAAGGCATGACGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGAT 10119 CCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTA-TACTAGGATGGGTGACCTCCTGG 130 CCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGG 10183 GAAGTCCTCGTGTTGCACCCCTCTTTTTCGGATTATTTTCTTTTTATTCTATCTCGAACACACGC 195 GAAGTCCTCGTGTTGCACCCCTCTTTTTCGGATTATTTTCTTTTTATTCTATCTCGAACACACGC 10248 ACACGTACGTATTCCGCCTGCCTGGAGT-GGGTACTTGGGGAG 260 ACACGTACGTATTCCGCCTGCCTGGAGTGGGGTACTTGGGGAG 10290 AAAGGTTCGGGGCGTAGAATCCGAATTTTGCGACTCCCTTAAGT---GGCC-GAAGAAAACGAAC 1 AAAGGTTCGGGGCGTAGAATCCGAATTTTGCGACTCCCTTAAGTGCGGGCCGGAAGAAAACGAAC 10351 GCCTTAAATAAATTAAGGGCGCAAGGCATGACGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGAT 66 GCCTT-AATAAATTAAGGGCGCAAGGCATGACGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGAT 10416 CCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC--GAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGG 130 CCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGG * 10479 GAAGTCCTCGTGTTGCACCCCTTTTTTTTCGGATTATTTTCTTTTTATTCTATCTCG-A-ACACG 195 GAAGTCCTCGTGTTGCACCCC-TCTTTTTCGGATTATTTTCTTTTTATTCTATCTCGAACACACG 10542 CACACGTACGTATTCCGCCTGCCTGGA--GGGGTACTT-GGG-G 259 CACACGTACGTATTCCGCCTGCCTGGAGTGGGGTACTTGGGGAG ** * 10582 AAAGGTTCGGGGCGTAGAAT-ATAATTTTGCGA--CCCTTAAGTGCGGGCC-GAAGAAAACAAAC 1 AAAGGTTCGGGGCGTAGAATCCGAATTTTGCGACTCCCTTAAGTGCGGGCCGGAAGAAAACGAAC 10643 GCCTTAATAAATTAAGGGCGCAAGGCATGAC-GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATC 66 GCCTTAATAAATTAAGGGCGCAAGGCATGACGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATC 10707 CCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGG 131 CCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGG 10772 AAGTCCTCGTGTTGCACCCCTCTTTTTTCGGATTATTTTCTTTTTATTCTATCTCGAACACACGC 196 AAGTCCTCGTGTTGCACCCCTC-TTTTTCGGATTATTTTCTTTTTATTCTATCTCGAACACACGC 10837 ACACGTACGTATTCCGCCTGCCTGGAGT-GGGTACTTGGGGAG 260 ACACGTACGTATTCCGCCTGCCTGGAGTGGGGTACTTGGGGAG 10879 AAAGGTTC-GGGCGTAGAATCCGAATTTTGCGACTCCCTTAAGTGCGGGCCGGAAGAAAACGAAC 1 AAAGGTTCGGGGCGTAGAATCCGAATTTTGCGACTCCCTTAAGTGCGGGCCGGAAGAAAACGAAC 10943 GCCTTAAATAAATTAAGGGCGCAAGGCATGAC-GGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGAT 66 GCCTT-AATAAATTAAGGGCGCAAGGCATGACGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGAT 11007 CCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGG 130 CCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGG 11072 GAAGTCCTCGTGTTGCACCCCCTCTTTTTCGGATTA-TTTCTTTTTATTCTATCTCG-ACACACG 195 GAAGTCCTCGTGTTGCA-CCCCTCTTTTTCGGATTATTTTCTTTTTATTCTATCTCGAACACACG 11135 ----C--ACGTATTCCGCCTGCCTGGAGTGGGGTACTTGGGG-G 259 CACACGTACGTATTCCGCCTGCCTGGAGTGGGGTACTTGGGGAG * 11172 AAAGGTTCGGGGCGTAGAATCCGAATTTTGCGACTCCCTTAAGT--GTGCC-GAAGAAAACGAAC 1 AAAGGTTCGGGGCGTAGAATCCGAATTTTGCGACTCCCTTAAGTGCGGGCCGGAAGAAAACGAAC 11234 GCCTTAATAAATTAAGGGCGCAAGGCATGACGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATC 66 GCCTTAATAAATTAAGGGCGCAAGGCATGACGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATC 11299 CCATC--AACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGG 131 CCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGG * 11362 AAGTCCTCGTGTTGCA-CCC-CTATTTCGGATTATTTTCTTTTTATTCTA--TCGAACACA--CA 196 AAGTCCTCGTGTTGCACCCCTCTTTTTCGGATTATTTTCTTTTTATTCTATCTCGAACACACGCA 11421 CACGTACGTATTCCGCCTGCCTGGAGTGGGGTACTTTGGGGAG 261 CACGTACGTATTCCGCCTGCCTGGAGTGGGGTAC-TTGGGGAG * ** * 11464 AAAGGTTCGGGTCGTAGAATATGAATTTT--GACTCCCTTAAGT--GGGCCGTAAGAAAACGAAC 1 AAAGGTTCGGGGCGTAGAATCCGAATTTTGCGACTCCCTTAAGTGCGGGCCGGAAGAAAACGAAC 11525 GCCTTAAATAAATTAA-GGCGCAAGGCATGAC-GG-GCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGAT 66 GCCTT-AATAAATTAAGGGCGCAAGGCATGACGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGAT 11587 CCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGC--GAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGG 130 CCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGG 11650 GAAGTCCTCGTGTTGCACCCCTCTTTTTCGGATTATTTTCTTTTTATTCTATCTCGAACACACGC 195 GAAGTCCTCGTGTTGCACCCCTCTTTTTCGGATTATTTTCTTTTTATTCTATCTCGAACACACGC 11715 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CCCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGG * 14311 GAAGTCCTCGTGTTGCACCCCTATTTTTCGGATTATTTTC-TTTTATTCTATCTCGAACACA--C 195 GAAGTCCTCGTGTTGCACCCCTCTTTTTCGGATTATTTTCTTTTTATTCTATCTCGAACACACGC 14373 ACACGTACGTATTCCGCCTGCCTGGAGT-GGGTACTT-GGGAG 260 ACACGTACGTATTCCGCCTGCCTGGAGTGGGGTACTTGGGGAG * 14414 AAAGGTTC-GGGCGTAGAATCCGAATTTTGCGACTCCCTTAAGTGTGGGCC-GAAGAAAACGAAC 1 AAAGGTTCGGGGCGTAGAATCCGAATTTTGCGACTCCCTTAAGTGCGGGCCGGAAGAAAACGAAC 14477 GCCTTAAT-AATTAAGGGCGCAAGGCATGACGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATC 66 GCCTTAATAAATTAAGGGCGCAAGGCATGACGGGTGCGATCATACCAGCACTAATGCACCGGATC 14541 CCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAG---TAGGATGGGTGACCTCCTGGG 131 CCATCAGAACTCCGCAGTTAAGCGTGCTTGGGCGAGAGTAGTACTAGGATGGGTGACCTCCTGGG 14603 AAGTCCTCGTGTTGCACCCCTCTTTTTTTCGGATTATTTTCTTTTTATTCTATCTCGAACACACG 196 AAGTCCTCGTGTTGCACCCCTC--TTTTTCGGATTATTTTCTTTTTATTCTATCTCGAACACACG 14668 CACACGTACGTATTCCGCCTGCCTGGAGTGGGGTACTTGGGGAG 259 CACACGTACGTATTCCGCCTGCCTGGAGTGGGGTACTTGGGGAG 14712 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