Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: NTFQ01011481.1 Kokia drynarioides strain JFW-HI SEQ_126465, whole genome shotgun sequence
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1 C
* * * *
2 GTAAACATGTTTTGATCTTTGAATTAAAAACTTA-TTAAGTGAGGATTGTTCCTCTCTTGGTTCT
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* * ** *
66 TGGACGAACTTTCGAACTTCTCAAACTTTTACGAGTTC-TTTTATAGCTTCGGTTCCTTAAAGTA
66 TGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTTA-AAATTCGGTTCCTTAAAGTG
* * * * * * * * *
130 TGCAAGG-CGATCCAATCC-T--AGCAATTTTCCGAACATTACATGCTCA-GGAAGTCGTATAAT
130 TTC-AGGACGATCCATTCCTTCGAGTAATTTTCTGAACATTCCATGC-GAGGGAAATCGCATCAT
*
190 TTGGTCTAAA-AGGTTTGTCATTTT
193 TTGGTCTAAATA-GTTTTTCATTTT
* * *
214 GTAAACAAGTTTTG-GCGTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAACTGTTTCTCTCTTGGTTG
1 GTAAACAAGTTTTGATC-TTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTC
* * * * * *
278 TTGGACAAACATCCGAAATTGTCAAACTTTTACTAGTTCTTTTTAAAATCCAGTTCCTTAAAGTG
65 TTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTTAAAATTCGGTTCCTTAAAGTG
* *
343 TTCGGGACGATCTATTCCTTCGAGTAATTTTCTGAACATTCCATGCGAGGGAAATCGCATCATTT
130 TTCAGGACGATCCATTCCTTCGAGTAATTTTCTGAACATTCCATGCGAGGGAAATCGCATCATTT
* * *
408 GGTCTAAATGGTTTTTCAATTC
195 GGTCTAAATAGTTTTTCATTTT
* *
430 GAAAACAAGTTTTGATCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTGTCTCT-TCTGGTTC
1 GTAAACAAGTTTTGATCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCT-TGGTTC
* * * **
494 TTGGACGAAATTTCGAGCTTGT-AGAACTTTTACGAGTTC-TTTTATAGCTTCGGTTCCTTAAAG
65 TTGGACGAACTTCCGAACTTGTCA-AACTTTTACGAGTTCTTTTTA-AAATTCGGTTCCTTAAAG
* * * * * *
557 TATTCTA-GACGATCCAATCCTTCTATTAAATCTTTC-GAACATTCCATGCGATGGAAATCTCAT
128 TGTTC-AGGACGATCCATTCCTTCGAGT-AAT-TTTCTGAACATTCCATGCGAGGGAAATCGCAT
620 CATTTGGTCTAAATAGTTTTTCAATTTT
190 CATTTGGTCTAAATAGTTTTTC-ATTTT
* * **
648 GTAAACAAGTTTAGATCTTTGAATTATAAACTTATTTACGTGAGAATTACTTCTCTCTTGGTTCT
1 GTAAACAAGTTTTGATCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTCT
* * * * * *
713 TGGATGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACTAGTTCTTTTTTAAGTCCAGTTCCTTAAAGTGT
66 TGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTTAAAATTCGGTTCCTTAAAGTGT
* * * *
778 TCAGGATGATCTATTCTTTCGAGTAATTTT-TCGAACATTCCATGCGAGGGAAATCACATCATTT
131 TCAGGACGATCCATTCCTTCGAGTAATTTTCT-GAACATTCCATGCGAGGGAAATCGCATCATTT
842 GGTCTAAATAGTTTTTC-TTTT
195 GGTCTAAATAGTTTTTCATTTT
* * * * *
863 CGTAAACATGTTTTCATATTTGAATTAAAAACTTA-TTAAGTGAGAATTGTTCCTCTCTTGGTTC
1 -GTAAACAAGTTTTGATCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTC
* ** **
927 TTGGACGAACTTTCGAACTTGTTTAACTTTTACGAGTTC-TTTTATAGCTTCGGTTCCTTAAAGT
65 TTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTTA-AAATTCGGTTCCTTAAAGT
*** * * * * * * * * *
991 ACGCAACG-CGATCCAATCCTTCGAGCAATTTTCCGAACATTACATGCTCA-GGAAGTCGTATAA
129 GTTC-AGGACGATCCATTCCTTCGAGTAATTTTCTGAACATTCCATGC-GAGGGAAATCGCATCA
*
1054 TTTGGTCTAAA-AGGTTTGTCATTTT
192 TTTGGTCTAAATA-GTTTTTCATTTT
* * *
1079 GTAAACAAGTTTTG-GCGTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAACTGTTTCTCTCTTGGTTG
1 GTAAACAAGTTTTGATC-TTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTC
* * * * *
1143 TTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACTAGTTATTTTTTAAA-TCAAGTTGCTTAAAGT
65 TTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTTAAAATTC-GGTTCCTTAAAGT
* * * * *
1207 GTTCAAGACTATCCATTCCTTCGAGTAATTTTCCGAACATTCCATGCGAGGTAATTCGCATCATT
129 GTTCAGGACGATCCATTCCTTCGAGTAATTTTCTGAACATTCCATGCGAGGGAAATCGCATCATT
* *
1272 CGGTATAAATAGTTTTTCATTTT
194 TGGTCTAAATAGTTTTTCATTTT
*
1295 GTAAACAAGTTTTTG-TCTTTGAATTAAAAACTTATTTAAGTGAGAA-----T-TCTCTTGGTTC
1 GTAAACAAG-TTTTGATCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTC
* * * * ** *
1353 TTGGATGAACTTCTGAACTTGTCGAACTTTTACGACTTC-TTTTATAGCTTCGCTTCCTTAAAGT
65 TTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTTA-AAATTCGGTTCCTTAAAGT
* * * * * ** * * ** *
1417 ATTCAAGACAATCCAATCCTTCGAGAAATTTGATGAACATTACAAGCTCGGGAAGTCGCATCATT
129 GTTCAGGACGATCCATTCCTTCGAGTAATTTTCTGAACATTCCATGCGAGGGAAATCGCATCATT
* * * *
1482 TGGCCTAAAAAGTTTGTCATTTA
194 TGGTCTAAATAGTTTTTCATTTT
** * * *
1505 GTAAACAAGTTTTGGCCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTAAGAATTGTTTCTCTCTGGGTTGT
1 GTAAACAAGTTTTGATCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTCT
* *
1570 TGGACGAACTTCTGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTCTT-AAATTCGATTCCTTAAAGTG
66 TGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTT-TTAAAATTCGGTTCCTTAAAGTG
* * * *
1634 CTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGTAATTTTCTGAACATTCCATGCGAGGGAAATCGTAACATTT
130 TTCAGGACGATCCATTCCTTCGAGTAATTTTCTGAACATTCCATGCGAGGGAAATCGCATCATTT
* * *
1699 GGACAAAATAGTTTTTCTTTTT
195 GGTCTAAATAGTTTTTCATTTT
* * * *
1721 GTAAACATGTTTTGAACTTTGAATTAAAAACTTA-TTAAGTGAGAATTGTTCCTCTCTTGGTTCT
1 GTAAACAAGTTTTGATCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTCT
* * ** *
1785 TGGACGAACTTTCGAACTTGTTAAACTTTTACGAGTTC-TTTTATAGCTTCGGTTCCTTAAAGTA
66 TGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTTA-AAATTCGGTTCCTTAAAGTG
* * * * * * *
1849 TGCAAGG-CGATCCAATCCTTCGAGTAATATTCTGAACATTACATGCTCA-GGAAGTCGCATAAT
130 TTC-AGGACGATCCATTCCTTCGAGTAATTTTCTGAACATTCCATGC-GAGGGAAATCGCATCAT
*
1912 TTGGTCTAAA-AGGTTTGTCATTTT
193 TTGGTCTAAATA-GTTTTTCATTTT
* *
1936 GTAAACAAGTTTTG-GCATTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTG
1 GTAAACAAGTTTTGATC-TTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTC
* * * * **
2000 TTGGACGAACTTCCAAACTTGACAAACTTTTACGTGTTCTTTTTTAAATTCGAATCCTTAAAGTG
65 TTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTTAAAATTCGGTTCCTTAAAGTG
* ** ** * * *
2065 TTCAAGACGATCTGTTCCTTCTTGT-ATTTTTTCGAACATTTCATGCGAGGGAAATCTCATCATT
130 TTCAGGACGATCCATTCCTTCGAGTAATTTTCT-GAACATTCCATGCGAGGGAAATCGCATCATT
*
2129 TGGTCTAAATAG-TGTTCAATTTT
194 TGGTCTAAATAGTTTTTC-ATTTT
* * **
2152 GTAAACAAGTATTGATCATTGAATTATAAAA-TTATTTACGTGAGAATTACTTCTCTCTTGGTTC
1 GTAAACAAGTTTTGATCTTTGAATTA-AAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTC
* * *
2216 TTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTAC-AGTTCTTTTTTAAATCCAGTTCCTTAAAGTG
65 TTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTTAAAATTCGGTTCCTTAAAGTG
* **********************
2280 TTCAGGACGATCTATTCCTTCGAGTAATTTT-TCGAACATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTT
130 TTCAGGACGATCCATTCCTTCGAGTAATTTTCT-GAACATTCCATGCGAGGGAAATCGCATCATT
2344 TGGTCTAAATAGTTTTTC-TTTT
194 TGGTCTAAATAGTTTTTCATTTT
* * *
2366 CGTAAACATGTTTTGATCTTTGAATTAAAAACTTATTCA-GTGAGAATTGTTCCTCTCTTGGTTC
1 -GTAAACAAGTTTTGATCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTC
* * ** **
2430 TTTGACGAACTTTCGAACTTGTTGAACTTTTACGAGTTC-TTTTATAGCTTCGGTTCCTTAAAGT
65 TTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTTA-AAATTCGGTTCCTTAAAGT
* * * * * * * *
2494 ATGCAAGG-CGATCCAATCCTTCGAGTAATATTCTGAACATTACATGCTCA-GGAAGTCGCATAA
129 GTTC-AGGACGATCCATTCCTTCGAGTAATTTTCTGAACATTCCATGC-GAGGGAAATCGCATCA
*
2557 TTTGGTCTAAA-AGGTTTGTCATTTT
192 TTTGGTCTAAATA-GTTTTTCATTTT
* * *
2582 GTAAACAAGTTTTG-GCATTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCATGGTTG
1 GTAAACAAGTTTTGATC-TTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTC
* *
2646 TTGGACGAACTTCTGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTACTT-AAATTCGGTTCCTTAAAGT
65 TTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTT-TTTAAAATTCGGTTCCTTAAAGT
* * * *
2710 GTTCAAGACGATCCATTCATTCGAGTAATTTTCTGAACATTCCATGCGAGGGAAATCGTAACATT
129 GTTCAGGACGATCCATTCCTTCGAGTAATTTTCTGAACATTCCATGCGAGGGAAATCGCATCATT
* * *
2775 TGGACAAAATAGTTTTTCTTTTT
194 TGGTCTAAATAGTTTTTCATTTT
* * * * *
2798 GTAAACATGTTTTGAACTTTGAATTAAAAACTTA-TTAAGTGAGAATTGTTTCCCTCTTGGTTCC
1 GTAAACAAGTTTTGATCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTCT
* * * * ** * * *
2862 TGGATGAACTTTCGAACTTGTCGAACTTTTATGAGTTC-TTTTATAGCTTTGGTTCCTTACAGTA
66 TGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTTA-AAATTCGGTTCCTTAAAGTG
* * * * * * ** * * *
2926 TGCAAGACGATCCAATCCTTCAAGCAATTTTCCGAACATTACCA-GCTCGAGAAGTCGCATCTTT
130 TTCAGGACGATCCATTCCTTCGAGTAATTTTCTGAACATT-CCATGCGAGGGAAATCGCATCATT
* *
2990 TGTTCTAAA-AGTTTTGTCATTTC
194 TGGTCTAAATAGTTTT-TCATTTT
** * * *
3013 GTAAACAAGTTTTGGCCTCTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCACTCTTGGTTGT
1 GTAAACAAGTTTTGATCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTCT
* * * * * *
3078 TGGACAAACTTCCAAAATTGTCAAACTTTTACTAGTTCTTTTTAAAATCCAGTTCCTTAAAGTGT
66 TGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTTAAAATTCGGTTCCTTAAAGTGT
* * * * * *
3143 TCAAGATGATCTATTCCTACGAGTAATTTT-TCAAACATTCCATGCGAGGGAAATCACATCATTT
131 TCAGGACGATCCATTCCTTCGAGTAATTTTCT-GAACATTCCATGCGAGGGAAATCGCATCATTT
3207 GGTCTAAATAGTTTTTC-TTTT
195 GGTCTAAATAGTTTTTCATTTT
* * * *
3228 CGTAAACATGTTTTGATCTTTGAATTAAAAACTTA-TTAAGTGAGGATTGTTCCTCTCTTGGTTC
1 -GTAAACAAGTTTTGATCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTC
* ** ** *
3292 TTGGACGAACTTTCGAACTTGTTGAACTTTTACGAGTTC-TTTTATAGCTTCGGTTCCTTAAACT
65 TTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTTA-AAATTCGGTTCCTTAAAGT
* * * ** * * * * *
3356 ATGCAAGG-CGATCCAATCCTTCGAACAATTTT-TCGAACATTACATGCTCA-GGAAGTCGTATA
129 GTTC-AGGACGATCCATTCCTTCGAGTAATTTTCT-GAACATTCCATGC-GAGGGAAATCGCATC
3418 ATTTGGTCTAAA-AGGTTTTTCATTTT
191 ATTTGGTCTAAATA-GTTTTTCATTTT
* *
3444 GTAAACAAGTTTTG-GCGTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTG
1 GTAAACAAGTTTTGATC-TTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTC
* * * * * *
3508 TTGGACGAACTTCCAAACTTGACAAACTTTTACGAGTTCTTTTTTAAATTCGGATGCTTAAACTG
65 TTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTTAAAATTCGGTTCCTTAAAGTG
* * ** * * *
3573 TTCAAGACGATCCATTCCATCTTGTAATTTTTTGAACATTCCATGCGAGGGAAATCTCATCGTTT
130 TTCAGGACGATCCATTCCTTCGAGTAATTTTCTGAACATTCCATGCGAGGGAAATCGCATCATTT
3638 GGTCTAAATAG-TTTTCAATTTT
195 GGTCTAAATAGTTTTTC-ATTTT
* **
3660 GTAAACATGTTTTGATCTTTGAATTATAAAA-TTATTTACGTGAGAATTACTTCTCTCTTGGTTC
1 GTAAACAAGTTTTGATCTTTGAATTA-AAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTC
* * * * * *
3724 TTGGACGGACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACTAGTT-TTTTTTAAATCCAGTTCCTTAAAGTC
65 TTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTTAAAATTCGGTTCCTTAAAGTG
* ** * * * *
3788 TTTACTACGATCCATTCCTTCGAGTAATTTTCCGAACATTCCATGCAAGGAAAATCACATCATTT
130 TTCAGGACGATCCATTCCTTCGAGTAATTTTCTGAACATTCCATGCGAGGGAAATCGCATCATTT
3853 GGTCTAAATAGTTTTTC-TTTT
195 GGTCTAAATAGTTTTTCATTTT
** * * *
3874 CGTACTCATGTTTTGATCTTTGAATTAAAAACTTA-TTAAGTGAGAATTGTTCCTCTCTTGGTTC
1 -GTAAACAAGTTTTGATCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTC
* ** **
3938 TTGGACGAACTTTCGAACTTGTTGAACTTTTACGAGTTC-TTTTATAGCTTCGGTTCCTTAAAGT
65 TTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTTA-AAATTCGGTTCCTTAAAGT
* * * ** * * * *
4002 ATGCAAGG-CGATCCAATCCTTCGAGTAATTTTCCAAACATTACATGCTCA-GGAAGTCGCATAA
129 GTTC-AGGACGATCCATTCCTTCGAGTAATTTTCTGAACATTCCATGC-GAGGGAAATCGCATCA
* *
4065 TTTGGTCTTAAA-GGTTTGTCATTTT
192 TTTGGTC-TAAATAGTTTTTCATTTT
*
4090 GTAAACAAGTTTTGA-CATTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTG
1 GTAAACAAGTTTTGATC-TTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTC
* * * ** *
4154 TTGGACGAACTTCCAAACTTGACAAACTTTTACGAGTTCTTTTTTAAATTCGAATCATTAAAGTG
65 TTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTTAAAATTCGGTTCCTTAAAGTG
** ** * * *
4219 TTC-GAGACGATCTGTTCCTTCTTGTATTTTTTTGAACATTCCATGCGAGGGAAATCTCATCATT
130 TTCAG-GACGATCCATTCCTTCGAGTAATTTTCTGAACATTCCATGCGAGGGAAATCGCATCATT
4283 TGGTCTAAATAG-TTTTCAATTTT
194 TGGTCTAAATAGTTTTTC-ATTTT
* * * * ** * *
4306 TTAAACAAATATTGATCTTTGAATTATAAACTTATTTACGTGAGAATTACTTCTCTCATGGTTGT
1 GTAAACAAGTTTTGATCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTCT
* *
4371 TGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACTAGTTCTTTTTTAAA-TCGAGTTCCTTAAAGTG
66 TGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTTAAAATTCG-GTTCCTTAAAGTG
* * ** *
4435 TTCAAGACTATCCATTCCTTCGAGTAATTTTCCAAACATTCCATGCGAGGGAATTCGCATCATTT
130 TTCAGGACGATCCATTCCTTCGAGTAATTTTCTGAACATTCCATGCGAGGGAAATCGCATCATTT
*
4500 GGTATAAATAGTTTTTCATTTT
195 GGTCTAAATAGTTTTTCATTTT
*
4522 GTAAACAAGTTTTTG-TCTTTGAATTAAAAACTTATTTAGGTGAGAA----TTCTCT-TT-GTTC
1 GTAAACAAG-TTTTGATCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTC
* * * * ** *
4580 TTGGACGAACTTCTGAACTTGTCGAACTATTACGACTTC-TTTTATAGCTTCGCTTCCTTAAAGT
65 TTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTTA-AAATTCGGTTCCTTAAAGT
* * * * * * * * ** *
4644 ATTCAAGACAATCCAATCCTTCGAGCAATTTGAC-GAACATTACAAGCTCGGGAAGTCGCATCAT
129 GTTCAGGACGATCCATTCCTTCGAGTAATTT-TCTGAACATTCCATGCGAGGGAAATCGCATCAT
* * *
4708 TTGGTCTAAAAAGTTTGTCATTTA
193 TTGGTCTAAATAGTTTTTCATTTT
* ** * *
4732 ATAAACAAGTTTTGGCCTTTGAGTTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTGT
1 GTAAACAAGTTTTGATCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTCT
* * * * ** *
4797 TGGACGAACTTCTGACCTTGTCAAACTTTTAC-ATGTTCTTTTTTAAATCCAATTCCTTAAAATG
66 TGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACGA-GTTCTTTTTAAAATTCGGTTCCTTAAAGTG
* * * ** * * * *
4861 TTCAAGATGATCTATTCCTTCGAGTAATTTTCCAAACATTCCATGTGAGAGAATTCGCATCATTC
130 TTCAGGACGATCCATTCCTTCGAGTAATTTTCTGAACATTCCATGCGAGGGAAATCGCATCATTT
4926 GGTCTAAATAGTTTTTCATTTT
195 GGTCTAAATAGTTTTTCATTTT
* * *
4948 GCAAACAAGTTTTCATCTTTGAATTAAAAACTTATTTAAGTGAGAA-----T-TCTCTTGGTTCT
1 GTAAACAAGTTTTGATCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTCT
* * * * ** * *
5007 TGGACGAACTTCTGAACTTGTCGAACTTTTAAGACTTC-TTTTATAGCTTCGTTTCCTTAAAGTA
66 TGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTTA-AAATTCGGTTCCTTAAAGTG
* * * * ** * **
5071 TTCAAGG-CGATCCAATCCTTCGAGCAATTTTAC-GAACATTACAAGCTCGGGAAGTTACATCAT
130 TTC-AGGACGATCCATTCCTTCGAGTAATTTT-CTGAACATTCCATGCGAGGGAAATCGCATCAT
* *
5134 TTGGTCTAAA-AATTTTGTCATTTA
193 TTGGTCTAAATAGTTTT-TCATTTT
** * *
5158 GTAAACAAGTTTTGGCCTTTGAATTAAAAAGTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTGT
1 GTAAACAAGTTTTGATCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTCT
* *
5223 TGGACGAACTTCTGAACTTGTCAAACTTTTACAAGTTCTTTCTT-AAATTCGGTTCCTTAAAGTG
66 TGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTT-TTAAAATTCGGTTCCTTAAAGTG
* *
5287 TTCAGGACGATCCATTCGTTCGAGTAATTTTCTGAACATTCCATGCGAGGGAAATCGCAACATTT
130 TTCAGGACGATCCATTCCTTCGAGTAATTTTCTGAACATTCCATGCGAGGGAAATCGCATCATTT
* *
5352 GGACTAAATAGTTTTTCTTTTT
195 GGTCTAAATAGTTTTTCATTTT
* ** * *
5374 GTAGACATTTTTTGAACTTTGAATTAAAAACTTA-TTAAGTGAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTCT
1 GTAAACAAGTTTTGATCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTCT
* * * ** * * *
5438 TGGACGAACTTTCGAACTTGTCGAACTTTTATGAGTTC-TTTTATAGCTTTGGTTCCTTACAGTA
66 TGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTTA-AAATTCGGTTCCTTAAAGTG
* * * * ** * * * *
5502 TGCAAGG-CGATCCAATCCTTCGAGCAATTTTCCGAACATTACC-TGCTCGAGAAGTTGCATCTT
130 TTC-AGGACGATCCATTCCTTCGAGTAATTTTCTGAACATT-CCATGCGAGGGAAATCGCATCAT
*
5565 TTGGTCTAAA-ATTTTTGTCATTTT
193 TTGGTCTAAATAGTTTT-TCATTTT
** * * *
5589 GTAAACAAGTTTTGGCCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGGGAATTGTTTCACTCTTGGTTGT
1 GTAAACAAGTTTTGATCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTCT
* ** * * *
5654 TGGACAAACTTCCGAAAATGTCAAACTTTTACTAGTTCTTTTTAAAATCCAGTTCCTTAAAGTGT
66 TGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTTAAAATTCGGTTCCTTAAAGTGT
* * *
5719 TCAGGATGATCTATTCCTTCGAGTAATTTTCCT-AACATTCCATGCGAGGGAAATCACATCATTT
131 TCAGGACGATCCATTCCTTCGAGTAATTTT-CTGAACATTCCATGCGAGGGAAATCGCATCATTT
5783 GGTCTAAATAGTTTTTC-TTTT
195 GGTCTAAATAGTTTTTCATTTT
* * * *
5804 CGTAAACATGTTTTGATCTTTGAATTAAAAACTTA-TTAAGTGAGGATTGTTCCTCTCTTGGTTC
1 -GTAAACAAGTTTTGATCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTC
* ** ** *
5868 TTGGACGAACTTTCGAACTTGTTGAACTTTTACGAGTTC-TTTTATAGCTTTGGTTCCTTAAAGT
65 TTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTTA-AAATTCGGTTCCTTAAAGT
* * * * * * * * * * *
5932 ATGCAAGG-CAATCCAATCCTTCGAGCAATTTTCCGAACATTACATGCTTA-GGAAGTCGTATAA
129 GTTC-AGGACGATCCATTCCTTCGAGTAATTTTCTGAACATTCCATGC-GAGGGAAATCGCATCA
* *
5995 TTTTGTCTAAA-AGGTTTGTCATTTT
192 TTTGGTCTAAATA-GTTTTTCATTTT
* * * *
6020 GTAAACAAGTTTTG-GCGCTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAACTGTTTCTCTCTTGGTTG
1 GTAAACAAGTTTTGATC-TTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTC
** * * * *
6084 TTGGAAAAACATCCGAAATTGTCAAACTTTTACTAGTTCTTTTTAAAA-TCAAGTTCCTTAAAGT
65 TTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTTAAAATTC-GGTTCCTTAAAGT
* * *
6148 GTTTAGGACGATCTATTCCTTCGAGTAATTTT-TCGAACATTCCATGCGAGGGAAATTGCATCAT
129 GTTCAGGACGATCCATTCCTTCGAGTAATTTTCT-GAACATTCCATGCGAGGGAAATCGCATCAT
* *
6212 TTGGTCTAAATAGTTTTTCAATTC
193 TTGGTCTAAATAGTTTTTCATTTT
* * *
6236 GTAAACAAATTTTGATCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTGTCTCTCTTGGATCT
1 GTAAACAAGTTTTGATCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTCT
* * **
6301 TGGACGAAATTCTGAACTTGT-AGAACTTTTACGAGTTC-TTTTATAGCTTCGGTTCCTTAAAGT
66 TGGACGAACTTCCGAACTTGTCA-AACTTTTACGAGTTCTTTTTA-AAATTCGGTTCCTTAAAGT
* * *** * *
6364 ATTCAAGACGATCCAATTCCTTATTGTAATTTTTTGAACATTCCATGCGAGGGAAATCTCATCAT
129 GTTCAGGACGATCC-ATTCCTTCGAGTAATTTTCTGAACATTCCATGCGAGGGAAATCGCATCAT
6429 TTGGTCTAAATAG-TTTTCAATTTT
193 TTGGTCTAAATAGTTTTTC-ATTTT
* * **
6453 GTAAACAAGTTTTGATCTTTGAATCACAAACTTATTTACGTGAGAATTACTTCTCTCTTGGTTCT
1 GTAAACAAGTTTTGATCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTCT
* * * * *
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* * * * * *
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196 GTCTAAATAGTTTTTCATTTT
* * * *
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* * * ** * ** *
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* * * * * * * * * * *
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*
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* *
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1 GTAAACAAGTTTTGATC-TTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTC
* * * * *
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* * * ** * * *
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* **
7100 GTAAACATGTTTTGATCTTTGAATTATAAAA-TTATTTACGTGAGAATTACTTCTCTCTTGGTTC
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* * * *
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* * * * *
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193 TTGGTCTAAATAGTTTTTCATTTT
* * *
7314 CGTAAACAAGTTTTGATCTTTGAATTAAAAACTTA-TTAAGTGAGAATTGTTCCTCTCTTGGTTA
1 -GTAAACAAGTTTTGATCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTC
* * ** ** **
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* * *
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1 C
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66 TGGACGAACTTTCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAAATTCGGTTCCTTAAAGTGT
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* *
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* * * *
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* * *
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* *
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* * **
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* *
621 ATTTGGTCTAAATAGTTTTTCAATTTTGTAAACAAGTTTAGATCTTTGAATTATAAACTTATTTA
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** * *
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*
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* * * * *
863 CGTAAACATGTTTTCATATTTGAATTAAAAACTTA-TTAAGTGAGAATTGTTCCTCTCTTGGTTC
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** ** *
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** * * * * * * * *
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* *
1055 TTGGTCTAAA-AGGTTTGTCATTTTGTAAACAAGTTTTG-GCGTTTGAATTAAAAACTTATTTAC
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* * * *
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* * * * *
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* * * *
1248 CCATGCGAGGTAATTCGCATCATTCGGTATAAATAGTTTTTCATTTT
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*
1295 GTAAACAAGTTTTTG-TCTTTGAATTAAAAACTTATTTAAGTGAGAA-----T-TCTCTTGGTTC
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* * * * *** * * ** *
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* * * * **
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* * * *
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* ** *
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* * * * *
1674 CCATGCGAGGGAAATCGTAACATTTGGACAAAATAGTTTTTCTTTTT
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* * * *
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* ** *
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* * * * * * * *
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* *
1913 TGGTCTAAA-AGGTTTGTCATTTTGTAAACAAGTTTTG-GCATTTGAATTAAAAACTTATTTACG
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* * * *
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* * * ** ** *
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* * *
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* * **
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1 GTAAACAAGTTTTGATCTTTGAATTA-AAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTC
* * * *
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* *
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195 TGGTCTAAATAGTTTTTCATTTT-GTAAACAAGTTTTGATCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGT
* * * **
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259 GAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTT
* ** * * * *
2472 TATAGCTTCGGTTCCTTAAAGTATGCAAGG-CGATCCAATCCTTCGAGTAA-TATTCTGAACATT
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* * * * *
2535 ACATGCTCA-GGAAGTCGCATAATTTGGTCTAAA-AGGTTTGTCATTTT
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* * *
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*
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* * * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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258 TGAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTT
* ** ** * * * * * * *
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** * * * * *
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386 CCATGCGAGGGAAATCGCATCATTTGGTCTAAATAGTTTT-TCATTTT
** * * *
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1 GTAAACAAGTTTTGATCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTCT
* * * * * * *
3078 TGGACAAACTTCCAAAATTGTCAAACTTTTACTAGTTCTTTT-TAAAATCCAGTTCCTTAAAGTG
66 TGGACGAACTTTCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTAT-AAATTCGGTTCCTTAAAGTG
* * * * * *
3142 TTCAA-GATGATCTATTCCTACGAGTAATTTTTCAAACATTCCATGCGAGGGAAATCACATCATT
130 TTCAAGGACGATCCATTCCTTCGAGTAATTTTCCGAACATTCCATGCGAGGGAAATCGCATCATT
* *
3206 TGGTCTAAATAGTTTTTC-TTTTCGTAAACATGTTTTGATCTTTGAATTAAAAACTTA-TTAAGT
195 TGGTCTAAATAGTTTTTCATTTT-GTAAACAAGTTTTGATCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGT
* * * **
3269 GAGGATTGTTCCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTTCGAACTTGTTGAACTTTTACGAGTTCTTT
259 GAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTT
* ** * * * * ** *
3334 TATAGCTTCGGTTCCTTAAACTATGCAAGG-CGATCCAATCCTTCGAACAATTTTTCGAACATTA
324 TTTA-AATCAGTTCCTTAAAGTATTC-AGGACGATCCATTCCTTCGAGTAATTTTTCGAACATTC
* * * *
3398 CATGCTCA-GGAAGTCGTATAATTTGGTCTAAA-AGGTTTTTCATTTT
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* *
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* * * * * * *
3508 TTGGACGAACTTCCAAACTTGACAAACTTTTACGAGTTCTTTTTTAAATTCGGATGCTTAAACTG
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* ** ** * *
3573 TTCAA-GACGATCCATTCCATCTTGTAATTTTTTGAACATTCCATGCGAGGGAAATCTCATCGTT
130 TTCAAGGACGATCCATTCCTTCGAGTAATTTTCCGAACATTCCATGCGAGGGAAATCGCATCATT
*
3637 TGGTCTAAATAG-TTTTCAATTTTGTAAACATGTTTTGATCTTTGAATTATAAAA-TTATTTACG
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** * *
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* * ** *
3764 TTTTAAATCCAGTTCCTTAAAGTCTTTACTACGATCCATTCCTTCGAGTAATTTTCCGAACATTC
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* * *
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** * * *
3874 CGTACTCATGTTTTGATCTTTGAATTAAAAACTTA-TTAAGTGAGAATTGTTCCTCTCTTGGTTC
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** ** *
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* * * * * * *
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* *
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** * *
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* ** ** * * * * *
5479 TATAGCTTTGGTTCCTTACAGTATGCAAGG-CGATCCAATCCTTCGAGCAATTTTCCGAACATTA
324 TTTA-AATCAGTTCCTTAAAGTATTC-AGGACGATCCATTCCTTCGAGTAATTTTTCGAACATT-
** * * * * *
5543 CC-TGCTCGAGAAGTTGCATCTTTTGGTCTAAA-ATTTTTGTCATTTT
386 CCATGCGAGGGAAATCGCATCATTTGGTCTAAATAGTTTT-TCATTTT
** * * *
5589 GTAAACAAGTTTTGGCCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGGGAATTGTTTCACTCTTGGTTGT
1 GTAAACAAGTTTTGATCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTCT
* * ** * * *
5654 TGGACAAACTTCCGAAAATGTCAAACTTTTACTAGTTCTTTT-TAAAATCCAGTTCCTTAAAGTG
66 TGGACGAACTTTCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTAT-AAATTCGGTTCCTTAAAGTG
* * * *
5718 TTC-AGGATGATCTATTCCTTCGAGTAATTTTCCTAACATTCCATGCGAGGGAAATCACATCATT
130 TTCAAGGACGATCCATTCCTTCGAGTAATTTTCCGAACATTCCATGCGAGGGAAATCGCATCATT
* *
5782 TGGTCTAAATAGTTTTTC-TTTTCGTAAACATGTTTTGATCTTTGAATTAAAAACTTA-TTAAGT
195 TGGTCTAAATAGTTTTTCATTTT-GTAAACAAGTTTTGATCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGT
* * * **
5845 GAGGATTGTTCCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTTCGAACTTGTTGAACTTTTACGAGTTCTTT
259 GAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTT
* ** ** * * * * * *
5910 TATAGCTTTGGTTCCTTAAAGTATGCAAGG-CAATCCAATCCTTCGAGCAATTTTCCGAACATTA
324 TTTA-AATCAGTTCCTTAAAGTATTC-AGGACGATCCATTCCTTCGAGTAATTTTTCGAACATTC
* * * * * *
5974 CATGCTTA-GGAAGTCGTATAATTTTGTCTAAA-AGGTTTGTCATTTT
387 CATGC-GAGGGAAATCGCATCATTTGGTCTAAATA-GTTTTTCATTTT
* * * *
6020 GTAAACAAGTTTTG-GCGCTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAACTGTTTCTCTCTTGGTTG
1 GTAAACAAGTTTTGATC-TTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTC
** * * * * * *
6084 TTGGAAAAACATCCGAAATTGTCAAACTTTTACTAGTTCTTTT-TAAAATCAAGTTCCTTAAAGT
65 TTGGACGAACTTTCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAAATTC-GGTTCCTTAAAGT
* * * *
6148 GTT-TAGGACGATCTATTCCTTCGAGTAATTTTTCGAACATTCCATGCGAGGGAAATTGCATCAT
129 GTTCAAGGACGATCCATTCCTTCGAGTAATTTTCCGAACATTCCATGCGAGGGAAATCGCATCAT
* * *
6212 TTGGTCTAAATAGTTTTTCAATTCGTAAACAAATTTTGATCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGT
194 TTGGTCTAAATAGTTTTTCATTTTGTAAACAAGTTTTGATCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGT
* * * *
6277 GAGAATTGTGTCTCTCTTGGATCTTGGACGAAATTCTGAACTTGT-AGAACTTTTACGAGTTCTT
259 GAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCA-AACTTTTACGAGTTCTT
* ** * * *** *
6341 TTATAGCTTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCAATTCCTTATTGTAATTTTTTGAACATT
323 TTTTA-AATCAGTTCCTTAAAGTATTCAGGACGATCC-ATTCCTTCGAGTAATTTTTCGAACATT
*
6406 CCATGCGAGGGAAATCTCATCATTTGGTCTAAATAG-TTTTCAATTTT
386 CCATGCGAGGGAAATCGCATCATTTGGTCTAAATAGTTTTTC-ATTTT
* * **
6453 GTAAACAAGTTTTGATCTTTGAATCACAAACTTATTTACGTGAGAATTACTTCTCTCTTGGTTCT
1 GTAAACAAGTTTTGATCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTCT
* * * *
6518 TGGACGAACTTTCGAACTTGTCAAACTTTTACTAGTTCTTTTTTAAATCCAGTTCCTTAAAGTGT
66 TGGACGAACTTTCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAAATTCGGTTCCTTAAAGTGT
* * * * *
6583 TC-AGGACGATCTATTCCTTTGAGTAACTTTCCGAACATTCCATGCAAGGGAAATCACATCATTT
131 TCAAGGACGATCCATTCCTTCGAGTAATTTTCCGAACATTCCATGCGAGGGAAATCGCATCATTT
* * *
6647 GGTCTAAATAGTTTTTC-TTTTCGTCAACATGTTTT-ATTCTTTGAATTAAAAACTTATTCA-GT
196 GGTCTAAATAGTTTTTCATTTT-GTAAACAAGTTTTGA-TCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGT
* * * * ** *
6709 GAGAATTGTTCCTCTCTTGGTTCTTGGTCGAACTTTCGAACCTGTTGAAGTTTTACGAGTTCTTT
259 GAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTT
* ** * * * * *
6774 TATAGCTTC-GATTCCTTAAAGTATGCAAGG-TGATCCAATCCTTCGAGCAATTTTCCGAACATT
324 TTTA-AATCAG-TTCCTTAAAGTATTC-AGGACGATCCATTCCTTCGAGTAATTTTTCGAACATT
* * * * * *
6837 ACATGCTCA-GGAAGTCGTATAATTTGGTCTAAA-AGGTTTGTCATTTT
386 CCATGC-GAGGGAAATCGCATCATTTGGTCTAAATA-GTTTTTCATTTT
* *
6884 GTAAACAAGTTTTG-GCGTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTG
1 GTAAACAAGTTTTGATC-TTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTC
* * * * * *
6948 TTGGACGAACTTCCAAACTTGACAAACCTTTACGAGTTCGTTTT-TAAATTCGGATGCTTAAAGT
65 TTGGACGAACTTTCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTC-TTTTATAAATTCGGTTCCTTAAAGT
* * ** * * * *
7012 GTTCAA-GACGATACATTACTTCTTGTAAGTTTT-TGAACATTGCATGCAAGGGAAATCTCATCA
129 GTTCAAGGACGATCCATTCCTTCGAGTAA-TTTTCCGAACATTCCATGCGAGGGAAATCGCATCA
*
7075 TTTGGTCTAAATAG-TTTTCAATTTTGTAAACATGTTTTGATCTTTGAATTATAAAA-TTATTTA
193 TTTGGTCTAAATAGTTTTTC-ATTTTGTAAACAAGTTTTGATCTTTGAATTA-AAAACTTATTTA
** * *
7138 CGTGAGAATTACTTCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTTCGAACTTGTCAAAC-TTTACTAGTTC
256 CGTGAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTC
* * * *
7202 TGTTTTAAATCCAGTTCCTTAAAGTTTTCACTG-CGATCCATTCCTTCGAGTAATTTTCCGAACA
321 TTTTTTAAAT-CAGTTCCTTAAAGTATTCA-GGACGATCCATTCCTTCGAGTAATTTTTCGAACA
* *
7266 TTCCATGCGAGGGAAATCACATCGTTTGGTCTAAATAGTTTTTC-TTTT
384 TTCCATGCGAGGGAAATCGCATCATTTGGTCTAAATAGTTTTTCATTTT
* * *
7314 CGTAAACAAGTTTTGATCTTTGAATTAAAAACTTA-TTAAGTGAGAATTGTTCCTCTCTTGGTTA
1 -GTAAACAAGTTTTGATCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTC
* ** ** ** *
7378 TTTGACGAACTTTCGAACTTGTTGAACTTTTACGAGTTCTTTTATACCTTTTGTTCCTTAAAGTA
65 TTGGACGAACTTTCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAAATTCGGTTCCTTAAAGTG
* *
7443 TGCAAGG-CGATCCAATCCTTCGAGTAATTT
130 TTCAAGGACGATCCATTCCTTCGAGTAATTT
7473 GGTCTAAAAG
Statistics
Matches: 6028, Mismatches: 833, Indels: 363
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Matches are distributed among these distances:
424 3 0.00
425 51 0.01
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427 15 0.00
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Consensus pattern (432 bp):
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TGGACGAACTTTCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAAATTCGGTTCCTTAAAGTGT
TCAAGGACGATCCATTCCTTCGAGTAATTTTCCGAACATTCCATGCGAGGGAAATCGCATCATTT
GGTCTAAATAGTTTTTCATTTTGTAAACAAGTTTTGATCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGA
GAATTGTTTCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTT
TAAATCAGTTCCTTAAAGTATTCAGGACGATCCATTCCTTCGAGTAATTTTTCGAACATTCCATG
CGAGGGAAATCGCATCATTTGGTCTAAATAGTTTTTCATTTT
Found at i:2439 original size:646 final size:644
Alignment explanation
Indices: 2--9747 Score: 10352
Period size: 646 Copynumber: 15.1 Consensus size: 644
1 C
* * * *
2 GTAAACATGTTTTGATCTTTGAATTAAAAACTTA-TTAAGTGAGGATTGTTCCTCTCTTGGTTCT
1 GTAAACAAGTTTTGATCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTCT
* *
66 TGGACGAACTTTCGAACTTCTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAGCTTCGGTTCCTTAAAGTAT
66 TGGACGAACTTTCGAACTTGTCGAACTTTTACGAGTTCTTTTATAGCTTCGGTTCCTTAAAGTAT
* * * * *
131 GCAAGGCGATCCAATCC-T--AGCAATTTTCCGAACATTACATGCTCA-GGAAGTCGT-ATAATT
131 TCAAGACGATCCAATCCTTCGAGCAATTTTTCGAACATTACATGC-GAGGGAAGTC-TCATCATT
*
191 TGGTCTAAAAGGTTTGTCATTTTGTAAACAAGTTTTG-GCGTTTGAATTAAAAACTTATTTACGT
194 TGGTCTAAAA-GTTTTTCATTTTGTAAACAAGTTTTGAGC-TTTGAATTAAAAACTTATTTACGT
* * * * *
255 GAGAACTGTTTCTCTCTTGGTTGTTGGACAAACATCCGAAATTGTCAAACTTTTACTAGTTCTTT
257 GAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTGTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTT
* * * ** *
320 TTAAAATCCAGTTCCTTAAAGTGTTCGGGACGATCTATTCCTTCGAGTAA-TTTTCTGAACATTC
322 TTTAAATTCGGTTCCTTAAAGTGTTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGTAATTTTTC-GAACATTC
* * * *
384 CATGCGAGGGAAATCGCATCATTTGGTCTAAATGGTTTTTCAATTCGAAAACAAGTTTTGATCTT
386 CATGCGAGGGAAATCGCATCATTTGGTCTAAATAGTTTTTCATTTTGTAAACAAGTTTTGATCTT
* * *
449 TGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTGTCTCT-TCTGGTTCTTGGACGAAATTTCGAGCT
451 TGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGT-TCTCTCT-TGGTTCTTGGACGAACTTCCGAACT
* ** * * * * *
513 TGT-AGAACTTTTACGAGTTCTTTTATAGCTTCGGTTCCTTAAAGTATTCTAGACGATCCAATCC
514 TGTCA-AACTTTTACTAGTTCTTTT-TAAATTCAGTTCCTTAAAGTGTTCAAGGCGATCCATTCC
* * * * *
577 TTCTATTAAATCTTTCGAACATTCCATGCGATGGAAATCTCATCATTTGGTCTAAATAGTTTTTC
577 TTCGAGT-AAT-TTTTGAACATTCCATGCGAGGGAAATCACATCATTTGGTCTAAATAGTTTTTC
642 AATTTT
640 -ATTTT
* * **
648 GTAAACAAGTTTAGATCTTTGAATTATAAACTTATTTACGTGAGAATTACTTCTCTCTTGGTTCT
1 GTAAACAAGTTTTGATCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTCT
* * * * * * * *
713 TGGATGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACTAGTTCTTTTTTAAG-TCCAGTTCCTTAAAGTG
66 TGGACGAACTTTCGAACTTGTCGAACTTTTACGAGTTCTTTTAT-AGCTTCGGTTCCTTAAAGTA
* * * * * * * * *
777 TTCAGGATGATCTATTCTTTCGAGTAATTTTTCGAACATTCCATGCGAGGGAAATCACATCATTT
130 TTCAAGACGATCCAATCCTTCGAGCAATTTTTCGAACATTACATGCGAGGGAAGTCTCATCATTT
* * ** *
842 GGTCTAAATAGTTTTTC-TTTTCGTAAACATGTTTTCATATTTGAATTAAAAACTTA-TTAAGTG
195 GGTCTAAA-AGTTTTTCATTTT-GTAAACAAGTTTTGAGCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTG
* * * **
905 AGAATTGTTCCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTTCGAACTTGTTTAACTTTTACGAGTTCTTTT
258 AGAATTGTTTCTCTCTTGGTTGTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTT
* ** *** * * * *
970 ATAGCTTCGGTTCCTTAAAGTACGCAACG-CGATCCAATCCTTCGAGCAATTTTCCGAACATTAC
323 TTAAATTCGGTTCCTTAAAGTGTTCAA-GACGATCCATTCCTTCGAGTAATTTTTCGAACATTCC
* * * * * *
1034 ATGCTCA-GGAAGTCGTATAATTTGGTCTAAA-AGGTTTGTCATTTTGTAAACAAGTTTTG-GCG
387 ATGC-GAGGGAAATCGCATCATTTGGTCTAAATA-GTTTTTCATTTTGTAAACAAGTTTTGATC-
* *
1096 TTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAACTGTTTCTCTCTTGGTTGTTGGACGAACTTCCGAAC
449 TTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTG-TTCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCCGAAC
* * * *
1161 TTGTCAAACTTTTACTAGTTATTTTTTAAA-TCAAGTTGCTTAAAGTGTTCAAGACTATCCATTC
513 TTGTCAAACTTTTACTAGTT-CTTTTTAAATTC-AGTTCCTTAAAGTGTTCAAGGCGATCCATTC
* * * * * *
1225 CTTCGAGTAATTTTCCGAACATTCCATGCGAGGTAATTCGCATCATTCGGTATAAATAGTTTTTC
576 CTTCGAGTAATTTT-TGAACATTCCATGCGAGGGAAATCACATCATTTGGTCTAAATAGTTTTTC
1290 ATTTT
640 ATTTT
*
1295 GTAAACAAGTTTTTG-TCTTTGAATTAAAAACTTATTTAAGTGAGAA-----T-TCTCTTGGTTC
1 GTAAACAAG-TTTTGATCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTC
* * *
1353 TTGGATGAAC-TTCTGAACTTGTCGAACTTTTACGACTTCTTTTATAGCTTCGCTTCCTTAAAGT
65 TTGGACGAACTTTC-GAACTTGTCGAACTTTTACGAGTTCTTTTATAGCTTCGGTTCCTTAAAGT
* * * * ** *
1417 ATTCAAGACAATCCAATCCTTCGAGAAATTTGAT-GAACATTACAAGCTCGGGAAGTCGCATCAT
129 ATTCAAGACGATCCAATCCTTCGAGCAATTT-TTCGAACATTACATGCGAGGGAAGTCTCATCAT
* * *
1481 TTGGCCTAAAAAGTTTGTCATTTAGTAAACAAGTTTTG-GCCTTTGAATTAAAAACTTATTTACG
193 TTGGTCT-AAAAGTTTTTCATTTTGTAAACAAGTTTTGAG-CTTTGAATTAAAAACTTATTTACG
* * *
1545 TAAGAATTGTTTCTCTCTGGGTTGTTGGACGAACTTCTGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTT
256 TGAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTGTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTT
* * *
1610 TCTTAAATTCGATTCCTTAAAGTGCTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGTAA-TTTTCTGAACATT
321 TTTTAAATTCGGTTCCTTAAAGTGTTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGTAATTTTTC-GAACATT
* * * * * * *
1674 CCATGCGAGGGAAATCGTAACATTTGGACAAAATAGTTTTTCTTTTTGTAAACATGTTTTGAACT
385 CCATGCGAGGGAAATCGCATCATTTGGTCTAAATAGTTTTTCATTTTGTAAACAAGTTTTGATCT
* *
1739 TTGAATTAAAAACTTA-TTAAGTGAGAATTGTTCCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTTCGAACT
450 TTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTT-CTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCCGAACT
* * ** * * * *
1803 TGTTAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAGCTTCGGTTCCTTAAAGTATGCAAGGCGATCCAATCCT
514 TGTCAAACTTTTACTAGTTCTTTT-TAAATTCAGTTCCTTAAAGTGTTCAAGGCGATCCATTCCT
* * * * * * *
1868 TCGAGTAATATTCTGAACATTACATGCTCA-GGAAGTCGCATAATTTGGTCTAAA-AGGTTTGTC
578 TCGAGTAAT-TTTTGAACATTCCATGC-GAGGGAAATCACATCATTTGGTCTAAATA-GTTTTTC
1931 ATTTT
640 ATTTT
* *
1936 GTAAACAAGTTTTG-GCATTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTG
1 GTAAACAAGTTTTGATC-TTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTC
* * * * * * ** ** *
2000 TTGGACGAACTTCCAAACTTGACAAACTTTTACGTGTTCTTTTTTAAATTCGAATCCTTAAAGTG
65 TTGGACGAACTTTCGAACTTGTCGAACTTTTACGAGTTCTTTTATAGCTTCGGTTCCTTAAAGTA
*** ** * * * *
2065 TTCAAGACGATCTGTTCCTTCTTGTATTTTTTCGAACATTTCATGCGAGGGAAATCTCATCATTT
130 TTCAAGACGATCCAATCCTTCGAGCAATTTTTCGAACATTACATGCGAGGGAAGTCTCATCATTT
* * * *
2130 GGTCTAAATAG-TGTTCAATTTTGTAAACAAGTATTGATCATTGAATTATAAAA-TTATTTACGT
195 GGTCTAAA-AGTTTTTC-ATTTTGTAAACAAGTTTTGAGCTTTGAATTA-AAAACTTATTTACGT
** *
2193 GAGAATTACTTCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTAC-AGTTCTTT
257 GAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTGTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTT
* * * * **
2257 TTTAAATCCAGTTCCTTAAAGTGTTCAGGACGATCTATTCCTTCGAGTAATTTTTCGAACATTNN
322 TTTAAATTCGGTTCCTTAAAGTGTTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGTAATTTTTCGAACATTCC
******************** *
2322 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTGGTCTAAATAGTTTTTC-TTTTCGTAAACATGTTTTGATCTT
387 ATGCGAGGGAAATCGCATCATTTGGTCTAAATAGTTTTTCATTTT-GTAAACAAGTTTTGATCTT
* * *
2386 TGAATTAAAAACTTATTCA-GTGAGAATTGTTCCTCTCTTGGTTCTTTGACGAACTTTCGAACTT
451 TGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTT-CTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCCGAACTT
** * ** * * * *
2450 GTTGAACTTTTACGAGTTCTTTTATAGCTTCGGTTCCTTAAAGTATGCAAGGCGATCCAATCCTT
515 GTCAAACTTTTACTAGTTCTTTT-TAAATTCAGTTCCTTAAAGTGTTCAAGGCGATCCATTCCTT
* * * * * * *
2515 CGAGTAATATTCTGAACATTACATGCTCA-GGAAGTCGCATAATTTGGTCTAAA-AGGTTTGTCA
579 CGAGTAAT-TTTTGAACATTCCATGC-GAGGGAAATCACATCATTTGGTCTAAATA-GTTTTTCA
2578 TTTT
641 TTTT
* * *
2582 GTAAACAAGTTTTG-GCATTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCATGGTTG
1 GTAAACAAGTTTTGATC-TTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTC
* *
2646 TTGGACGAAC-TTCTGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTACTTA-A-ATTCGGTTCCTTAAA
65 TTGGACGAACTTTC-GAACTTGTCGAACTTTTACGAGTTCTT--TTATAGCTTCGGTTCCTTAAA
* * * * * * *
2708 GTGTTCAAGACGATCCATTCATTCGAGTAA-TTTTCTGAACATTCCATGCGAGGGAAATCGT-AA
127 GTATTCAAGACGATCCAATCCTTCGAGCAATTTTTC-GAACATTACATGCGAGGGAAGTC-TCAT
* * * * *
2771 CATTTGGACAAAATAGTTTTTCTTTTTGTAAACATGTTTTGAACTTTGAATTAAAAACTTA-TTA
190 CATTTGGTCTAAA-AGTTTTTCATTTTGTAAACAAGTTTTGAGCTTTGAATTAAAAACTTATTTA
* * ** * * * *
2835 AGTGAGAATTGTTTCCCTCTTGGTTCCTGGATGAACTTTCGAACTTGTCGAACTTTTATGAGTTC
254 CGTGAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTGTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTC
* ** * * * * * * * *
2900 TTTTATAGCTTTGGTTCCTTACAGTATGCAAGACGATCCAATCCTTCAAGCAATTTTCCGAACAT
319 TTTTTTAAATTCGGTTCCTTAAAGTGTTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGTAATTTTTCGAACAT
** * * * * * *
2965 TACCA-GCTCGAGAAGTCGCATCTTTTGTTCTAAA-AGTTTTGTCATTTCGTAAACAAGTTTTGG
384 T-CCATGCGAGGGAAATCGCATCATTTGGTCTAAATAGTTTT-TCATTTTGTAAACAAGTTTTGA
* * * * * *
3028 CCTCTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCACTCTTGGTTGTTGGACAAACTTCCAA
447 TCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTG-TTCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCCGA
* * ** *
3093 AATTGTCAAACTTTTACTAGTTCTTTTTAAAATCCAGTTCCTTAAAGTGTTCAAGATGATCTATT
511 ACTTGTCAAACTTTTACTAGTTCTTTTT-AAATTCAGTTCCTTAAAGTGTTCAAGGCGATCCATT
* *
3158 CCTACGAGTAATTTTTCAAACATTCCATGCGAGGGAAATCACATCATTTGGTCTAAATAGTTTTT
575 CCTTCGAGTAATTTTT-GAACATTCCATGCGAGGGAAATCACATCATTTGGTCTAAATAGTTTTT
3223 C-TTTT
639 CATTTT
* * * *
3228 CGTAAACATGTTTTGATCTTTGAATTAAAAACTTA-TTAAGTGAGGATTGTTCCTCTCTTGGTTC
1 -GTAAACAAGTTTTGATCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTC
* *
3292 TTGGACGAACTTTCGAACTTGTTGAACTTTTACGAGTTCTTTTATAGCTTCGGTTCCTTAAACTA
65 TTGGACGAACTTTCGAACTTGTCGAACTTTTACGAGTTCTTTTATAGCTTCGGTTCCTTAAAGTA
* * * * *
3357 TGCAAGGCGATCCAATCCTTCGAACAATTTTTCGAACATTACATGCTCA-GGAAGTCGT-ATAAT
130 TTCAAGACGATCCAATCCTTCGAGCAATTTTTCGAACATTACATGC-GAGGGAAGTC-TCATCAT
3420 TTGGTCTAAAAGGTTTTTCATTTTGTAAACAAGTTTTG-GCGTTTGAATTAAAAACTTATTTACG
193 TTGGTCTAAAA-GTTTTTCATTTTGTAAACAAGTTTTGAGC-TTTGAATTAAAAACTTATTTACG
* *
3484 TGAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTGTTGGACGAACTTCCAAACTTGACAAACTTTTACGAGTTCTT
256 TGAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTGTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTT
* * * * ** *
3549 TTTTAAATTCGGATGCTTAAACTGTTCAAGACGATCCATTCCATCTTGTAATTTTTTGAACATTC
321 TTTTAAATTCGGTTCCTTAAAGTGTTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGTAATTTTTCGAACATTC
* * *
3614 CATGCGAGGGAAATCTCATCGTTTGGTCTAAATAG-TTTTCAATTTTGTAAACATGTTTTGATCT
386 CATGCGAGGGAAATCGCATCATTTGGTCTAAATAGTTTTTC-ATTTTGTAAACAAGTTTTGATCT
* *
3678 TTGAATTATAAAA-TTATTTACGTGAGAATTACTTCTCTCTTGGTTCTTGGACGGACTTCCGAAC
450 TTGAATTA-AAAACTTATTTACGTGAGAATT-GTTCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCCGAAC
* * * * ***
3742 TTGTCAAACTTTTACTAGTTTTTTTTAAATCCAGTTCCTTAAAGTCTTTACTACGATCCATTCCT
513 TTGTCAAACTTTTACTAGTTCTTTTTAAATTCAGTTCCTTAAAGTGTTCAAGGCGATCCATTCCT
* * *
3807 TCGAGTAATTTTCCGAACATTCCATGCAAGGAAAATCACATCATTTGGTCTAAATAGTTTTTC-T
578 TCGAGTAATTTT-TGAACATTCCATGCGAGGGAAATCACATCATTTGGTCTAAATAGTTTTTCAT
3871 TTT
642 TTT
** * * *
3874 CGTACTCATGTTTTGATCTTTGAATTAAAAACTTA-TTAAGTGAGAATTGTTCCTCTCTTGGTTC
1 -GTAAACAAGTTTTGATCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTC
*
3938 TTGGACGAACTTTCGAACTTGTTGAACTTTTACGAGTTCTTTTATAGCTTCGGTTCCTTAAAGTA
65 TTGGACGAACTTTCGAACTTGTCGAACTTTTACGAGTTCTTTTATAGCTTCGGTTCCTTAAAGTA
* * * * * * * *
4003 TGCAAGGCGATCCAATCCTTCGAGTAATTTTCCAAACATTACATGCTCA-GGAAGTCGCATAATT
130 TTCAAGACGATCCAATCCTTCGAGCAATTTTTCGAACATTACATGC-GAGGGAAGTCTCATCATT
* *
4067 TGGTCTTAAAGGTTTGTCATTTTGTAAACAAGTTTTGA-CATTTGAATTAAAAACTTATTTACGT
194 TGGTC-TAAAAGTTTTTCATTTTGTAAACAAGTTTTGAGC-TTTGAATTAAAAACTTATTTACGT
* *
4131 GAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTGTTGGACGAACTTCCAAACTTGACAAACTTTTACGAGTTCTTT
257 GAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTGTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTT
** * * ** ** * *
4196 TTTAAATTCGAATCATTAAAGTGTTCGAGACGATCTGTTCCTTCTTGTATTTTTTTGAACATTCC
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* * * *
4261 ATGCGAGGGAAATCTCATCATTTGGTCTAAATAG-TTTTCAATTTTTTAAACAAATATTGATCTT
387 ATGCGAGGGAAATCGCATCATTTGGTCTAAATAGTTTTTC-ATTTTGTAAACAAGTTTTGATCTT
* * * *
4325 TGAATTATAAACTTATTTACGTGAGAATTACTTCTCTCATGGTTGTTGGACGAACTTCCGAACTT
451 TGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATT-GTTCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCCGAACTT
* *
4390 GTCAAACTTTTACTAGTTCTTTTTTAAA-TCGAGTTCCTTAAAGTGTTCAAGACTATCCATTCCT
515 GTCAAACTTTTACTAGTTC-TTTTTAAATTC-AGTTCCTTAAAGTGTTCAAGGCGATCCATTCCT
** * * *
4454 TCGAGTAATTTTCCAAACATTCCATGCGAGGGAATTCGCATCATTTGGTATAAATAGTTTTTCAT
578 TCGAGTAATTTT-TGAACATTCCATGCGAGGGAAATCACATCATTTGGTCTAAATAGTTTTTCAT
4519 TTT
642 TTT
*
4522 GTAAACAAGTTTTTG-TCTTTGAATTAAAAACTTATTTAGGTGAGAA----TTCTCT-TT-GTTC
1 GTAAACAAG-TTTTGATCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTC
* * *
4580 TTGGACGAAC-TTCTGAACTTGTCGAACTATTACGACTTCTTTTATAGCTTCGCTTCCTTAAAGT
65 TTGGACGAACTTTC-GAACTTGTCGAACTTTTACGAGTTCTTTTATAGCTTCGGTTCCTTAAAGT
* ** * ** *
4644 ATTCAAGACAATCCAATCCTTCGAGCAATTTGACGAACATTACAAGCTCGGGAAGTCGCATCATT
129 ATTCAAGACGATCCAATCCTTCGAGCAATTTTTCGAACATTACATGCGAGGGAAGTCTCATCATT
* ** *
4709 TGGTCTAAAAAGTTTGTCATTTAATAAACAAGTTTTG-GCCTTTGAGTTAAAAACTTATTTACGT
194 TGGTCT-AAAAGTTTTTCATTTTGTAAACAAGTTTTGAG-CTTTGAATTAAAAACTTATTTACGT
* *
4773 GAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTGTTGGACGAACTTCTGACCTTGTCAAACTTTTAC-ATGTTCTT
257 GAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTGTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACGA-GTTCTT
* ** * * * * *
4837 TTTTAAATCCAATTCCTTAAAATGTTCAAGATGATCTATTCCTTCGAGTAATTTTCCAAACATTC
321 TTTTAAATTCGGTTCCTTAAAGTGTTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGTAATTTTTCGAACATTC
* * * * * *
4902 CATGTGAGAGAATTCGCATCATTCGGTCTAAATAGTTTTTCATTTTGCAAACAAGTTTTCATCTT
386 CATGCGAGGGAAATCGCATCATTTGGTCTAAATAGTTTTTCATTTTGTAAACAAGTTTTGATCTT
* *
4967 TGAATTAAAAACTTATTTAAGTGAGAA----T-TCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCTGAACTTG
451 TGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCCGAACTTG
* ** * ** * *
5027 TCGAACTTTTAAGACTTCTTTTATAGCTTC-GTTTCCTTAAAGTATTCAAGGCGATCCAATCCTT
516 TCAAACTTTTACTAGTTCTTTT-TAAATTCAG-TTCCTTAAAGTGTTCAAGGCGATCCATTCCTT
* * * * ** * * *
5091 CGAGCAATTTTACGAACATTACAAGCTCGGGAAGTTACATCATTTGGTCTAAA-AATTTTGTCAT
579 CGAGTAATTTT-TGAACATTCCATGCGAGGGAAATCACATCATTTGGTCTAAATAGTTTT-TCAT
*
5155 TTA
642 TTT
** * *
5158 GTAAACAAGTTTTGGCCTTTGAATTAAAAAGTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTGT
1 GTAAACAAGTTTTGATCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTCT
* * **
5223 TGGACGAAC-TTCTGAACTTGTCAAACTTTTACAAGTTCTTTCT-TAAATTCGGTTCCTTAAAGT
66 TGGACGAACTTTC-GAACTTGTCGAACTTTTACGAGTTCTTT-TATAGCTTCGGTTCCTTAAAGT
* * * * * * * * *
5286 GTTCAGGACGATCCATTCGTTCGAGTAA-TTTTCTGAACATTCCATGCGAGGGAAATCGCAACAT
129 ATTCAAGACGATCCAATCCTTCGAGCAATTTTTC-GAACATTACATGCGAGGGAAGTCTCATCAT
* * * ** * *
5350 TTGGACTAAATAGTTTTTCTTTTTGTAGACATTTTTTGAACTTTGAATTAAAAACTTA-TTAAGT
193 TTGGTCTAAA-AGTTTTTCATTTTGTAAACAAGTTTTGAGCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGT
* * * *
5414 GAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTTCGAACTTGTCGAACTTTTATGAGTTCTTT
257 GAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTGTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTT
* ** * * * * * * * *
5479 TATAGCTTTGGTTCCTTACAGTATGCAAGGCGATCCAATCCTTCGAGCAATTTTCCGAACATTAC
322 TTTAAATTCGGTTCCTTAAAGTGTTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGTAATTTTTCGAACATT-C
** * * * * * **
5544 C-TGCTCGAGAAGTTGCATCTTTTGGTCTAAA-ATTTTTGTCATTTTGTAAACAAGTTTTGGCCT
386 CATGCGAGGGAAATCGCATCATTTGGTCTAAATAGTTTT-TCATTTTGTAAACAAGTTTTGATCT
* * * * **
5607 TTGAATTAAAAACTTATTTACGTGGGAATTGTTTCACTCTTGGTTGTTGGACAAACTTCCGAAAA
450 TTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTG-TTCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCCGAACT
* * *
5672 TGTCAAACTTTTACTAGTTCTTTTTAAAATCCAGTTCCTTAAAGTGTTC-AGGATGATCTATTCC
514 TGTCAAACTTTTACTAGTTCTTTTT-AAATTCAGTTCCTTAAAGTGTTCAAGG-CGATCCATTCC
5736 TTCGAGTAATTTTCCT-AACATTCCATGCGAGGGAAATCACATCATTTGGTCTAAATAGTTTTTC
577 TTCGAGTAATTTT--TGAACATTCCATGCGAGGGAAATCACATCATTTGGTCTAAATAGTTTTTC
5800 -TTTT
640 ATTTT
* * * *
5804 CGTAAACATGTTTTGATCTTTGAATTAAAAACTTA-TTAAGTGAGGATTGTTCCTCTCTTGGTTC
1 -GTAAACAAGTTTTGATCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTC
* *
5868 TTGGACGAACTTTCGAACTTGTTGAACTTTTACGAGTTCTTTTATAGCTTTGGTTCCTTAAAGTA
65 TTGGACGAACTTTCGAACTTGTCGAACTTTTACGAGTTCTTTTATAGCTTCGGTTCCTTAAAGTA
* * * * * *
5933 TGCAAGGCAATCCAATCCTTCGAGCAATTTTCCGAACATTACATGCTTA-GGAAGTCGT-ATAAT
130 TTCAAGACGATCCAATCCTTCGAGCAATTTTTCGAACATTACATGC-GAGGGAAGTC-TCATCAT
* * *
5996 TTTGTCTAAAAGGTTTGTCATTTTGTAAACAAGTTTTG-GCGCTTGAATTAAAAACTTATTTACG
193 TTGGTCTAAAA-GTTTTTCATTTTGTAAACAAGTTTTGAGC-TTTGAATTAAAAACTTATTTACG
* ** * * *
6060 TGAGAACTGTTTCTCTCTTGGTTGTTGGAAAAACATCCGAAATTGTCAAACTTTTACTAGTTC-T
256 TGAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTGTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTT
* * * * *
6124 TTTTAAAATCAAGTTCCTTAAAGTGTTTAGGACGATCTATTCCTTCGAGTAATTTTTCGAACATT
321 TTTTAAATTC-GGTTCCTTAAAGTGTTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGTAATTTTTCGAACATT
* * * *
6189 CCATGCGAGGGAAATTGCATCATTTGGTCTAAATAGTTTTTCAATTCGTAAACAAATTTTGATCT
385 CCATGCGAGGGAAATCGCATCATTTGGTCTAAATAGTTTTTCATTTTGTAAACAAGTTTTGATCT
* * *
6254 TTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTGTCTCTCTTGGATCTTGGACGAAATTCTGAACT
450 TTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGT-TCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCCGAACT
* ** * * *
6319 TGT-AGAACTTTTACGAGTTCTTTTATAGCTTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCAATTC
514 TGTCA-AACTTTTACTAGTTCTTTT-TAAATTCAGTTCCTTAAAGTGTTCAAGGCGATCC-ATTC
*** *
6383 CTTATTGTAATTTTTTGAACATTCCATGCGAGGGAAATCTCATCATTTGGTCTAAATAG-TTTTC
576 CTTCGAGTAA-TTTTTGAACATTCCATGCGAGGGAAATCACATCATTTGGTCTAAATAGTTTTTC
6447 AATTTT
640 -ATTTT
* * **
6453 GTAAACAAGTTTTGATCTTTGAATCACAAACTTATTTACGTGAGAATTACTTCTCTCTTGGTTCT
1 GTAAACAAGTTTTGATCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTCT
* * * ** * * *
6518 TGGACGAACTTTCGAACTTGTCAAACTTTTACTAGTTCTTTTTTAAATCCAGTTCCTTAAAGTGT
66 TGGACGAACTTTCGAACTTGTCGAACTTTTACGAGTTCTTTTATAGCTTCGGTTCCTTAAAGTAT
* * * * * * * * * * *
6583 TCAGGACGATCTATTCCTTTGAGTAACTTTCCGAACATTCCATGCAAGGGAAATCACATCATTTG
131 TCAAGACGATCCAATCCTTCGAGCAATTTTTCGAACATTACATGCGAGGGAAGTCTCATCATTTG
* * * *
6648 GTCTAAATAGTTTTTC-TTTTCGTCAACATGTTTT-ATTCTTTGAATTAAAAACTTATTCA-GTG
196 GTCTAAA-AGTTTTTCATTTT-GTAAACAAGTTTTGA-GCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTG
* * * * * ** *
6710 AGAATTGTTCCTCTCTTGGTTCTTGGTCGAACTTTCGAACCTGTTGAAGTTTTACGAGTTCTTTT
258 AGAATTGTTTCTCTCTTGGTTGTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTT
* ** * * * ** * * * *
6775 ATAGCTTCGATTCCTTAAAGTATGCAAGGTGATCCAATCCTTCGAGCAATTTTCCGAACATTACA
323 TTAAATTCGGTTCCTTAAAGTGTTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGTAATTTTTCGAACATTCCA
* * * * * *
6840 TGCTCA-GGAAGTCGTATAATTTGGTCTAAA-AGGTTTGTCATTTTGTAAACAAGTTTTG-GCGT
388 TGC-GAGGGAAATCGCATCATTTGGTCTAAATA-GTTTTTCATTTTGTAAACAAGTTTTGATC-T
* *
6902 TTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTGTTGGACGAACTTCCAAACT
450 TTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTG-TTCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCCGAACT
* * * * * * * * *
6967 TGACAAACCTTTACGAGTTCGTTTTTAAATTCGGATGCTTAAAGTGTTCAAGACGATACATTACT
514 TGTCAAACTTTTACTAGTTC-TTTTTAAATTCAGTTCCTTAAAGTGTTCAAGGCGATCCATTCCT
** * * *
7032 TCTTGTAAGTTTTTGAACATTGCATGCAAGGGAAATCTCATCATTTGGTCTAAATAG-TTTTCAA
578 TCGAGTAA-TTTTTGAACATTCCATGCGAGGGAAATCACATCATTTGGTCTAAATAGTTTTTC-A
7096 TTTT
641 TTTT
* **
7100 GTAAACATGTTTTGATCTTTGAATTATAAAA-TTATTTACGTGAGAATTACTTCTCTCTTGGTTC
1 GTAAACAAGTTTTGATCTTTGAATTA-AAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTC
* * ** * *
7164 TTGGACGAACTTTCGAACTTGTCAAAC-TTTACTAGTTCTGTTT-TAAATCCAGTTCCTTAAAGT
65 TTGGACGAACTTTCGAACTTGTCGAACTTTTACGAGTTCT-TTTATAGCTTCGGTTCCTTAAAGT
* * * * * * * * *
7227 TTTCACTG-CGATCCATTCCTTCGAGTAATTTTCCGAACATTCCATGCGAGGGAAATCACATCGT
129 ATTCA-AGACGATCCAATCCTTCGAGCAATTTTTCGAACATTACATGCGAGGGAAGTCTCATCAT
* *
7291 TTGGTCTAAATAGTTTTTC-TTTTCGTAAACAAGTTTTGATCTTTGAATTAAAAACTTA-TTAAG
193 TTGGTCTAAA-AGTTTTTCATTTT-GTAAACAAGTTTTGAGCTTTGAATTAAAAACTTATTTACG
* * * * **
7354 TGAGAATTGTTCCTCTCTTGGTTATTTGACGAACTTTCGAACTTGTTGAACTTTTACGAGTTCTT
256 TGAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTGTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTT
* ** ** * * * * *
7419 TTATACCTTTTGTTCCTTAAAGTATGCAAGGCGATCCAATCCTTCGAGTAA--TTT-G----GT-
321 TTTTAAATTCGGTTCCTTAAAGTGTTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGTAATTTTTCGAACATTC
*
7476 C-T--------AA----A--A---GGT-T---T-G----TCATTTTGTAAACAAGTTTTG-GCGT
386 CATGCGAGGGAAATCGCATCATTTGGTCTAAATAGTTTTTCATTTTGTAAACAAGTTTTGATC-T
* * *
7513 TTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTGTTGGACAAACTTCCGAAAT
450 TTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTG-TTCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCCGAACT
* *
7578 TGTCAAACTTTTACTAGTTCTTTTTAAAATCAAGTTCCTTAAAGTGTTC-AGGACGATCTATTCC
514 TGTCAAACTTTTACTAGTTCTTTTTAAATTC-AGTTCCTTAAAGTGTTCAAGG-CGATCCATTCC
*
7642 TTCGAGTAATTTTTCGAACATTCCATGCGAGGGAAATCACATCATTTGGTCTAAATAGATTTTCA
577 TTCGAGTAATTTTT-GAACATTCCATGCGAGGGAAATCACATCATTTGGTCTAAATAGTTTTTCA
*
7707 TTTC
641 TTTT
* * *
7711 GTAAACAAGTTTTGATCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTATGTGTCTCTTGGTTCT
1 GTAAACAAGTTTTGATCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTCT
* * *
7776 TGGACGAAATTTCAAACTTGTAGAACTTTTACGAGTTCTTTTATAGCTTCGGTTCCTTAAAGTAT
66 TGGACGAACTTTCGAACTTGTCGAACTTTTACGAGTTCTTTTATAGCTTCGGTTCCTTAAAGTAT
* * * * * *
7841 TCAGGACGATCCAATCCTTTGAACAGTTTTTCGAAC-TGTACATG-GTCGGGAAGTCACATCATT
131 TCAAGACGATCCAATCCTTCGAGCAATTTTTCGAACAT-TACATGCG-AGGGAAGTCTCATCATT
**** * * *
7904 TGGTCTAAAA-ACCGTCATTTTGTAAAAAAATTTTG-GCCATTGAATTAAAAACTTATTTACGTG
194 TGGTCTAAAAGTTTTTCATTTTGTAAACAAGTTTTGAG-CTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTG
* *
7967 AGAATTGTTTCTCTCTTGGTTGTTGGACGAACTTCCAAACTTGACAAACTTTTACGAGTTCTTTT
258 AGAATTGTTTCTCTCTTGGTTGTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTT
* * **
8032 TTAAATTCGGATCCTTAAAGTGTTCAAGACGATCCATTCCTACTTGTAATTTTTCGAACATTCCA
323 TTAAATTCGGTTCCTTAAAGTGTTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGTAATTTTTCGAACATTCCA
* * * *
8097 TGCGAGGGAAATCTCATCATTTAGTCTAAATAG-TATTCAATTTTGTAAACATGTTTTGATCTTT
388 TGCGAGGGAAATCGCATCATTTGGTCTAAATAGTTTTTC-ATTTTGTAAACAAGTTTTGATCTTT
* * *
8161 GAATTATAAACTTATTTACGTGAGAATTACTTCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCCGAAATTG
452 GAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATT-GTTCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCCGAACTTG
* * * *
8226 TCAAACTTTTACTAGTTCTTTTTAAAATCCAGTTCCGTAAAGTGTTC-AGGACGATCTATTCCTC
516 TCAAACTTTTACTAGTTCTTTTT-AAATTCAGTTCCTTAAAGTGTTCAAGG-CGATCCATTCCTT
* *
8290 CGAGTAATTTTTCGAACATTCCATGCGAGGGAAATCGCATCATTTGGTCTAAGTAGTTTTTCATT
579 CGAGTAATTTTT-GAACATTCCATGCGAGGGAAATCACATCATTTGGTCTAAATAGTTTTTCATT
*
8355 TC
643 TT
*
8357 GTAAACAAGTTTTGATCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTGTCTCTCTTGGTTCT
1 GTAAACAAGTTTTGATCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTCT
* * *
8422 TGGACAAACTTTCGAACTTGTTGAACTTTTACGAGTTCTTTTATAGCTTCGGTTGCTTAAAGTAT
66 TGGACGAACTTTCGAACTTGTCGAACTTTTACGAGTTCTTTTATAGCTTCGGTTCCTTAAAGTAT
* * * * *
8487 GCAAGGA-GATCCAATCCTTCGAACAATTTTTCGAACATTAGATGCTCA-GGAAGTCGT-ATAAT
131 TCAA-GACGATCCAATCCTTCGAGCAATTTTTCGAACATTACATGC-GAGGGAAGTC-TCATCAT
* *
8549 TTGGTCTAAAAGTTTTTTCAGTTTGTAAACAAGTTTAG-GCGTTTGAATTAAAAACTTATTTACG
193 TTGGTCTAAAAG-TTTTTCATTTTGTAAACAAGTTTTGAGC-TTTGAATTAAAAACTTATTTACG
* * ** *
8613 TGAAAATTGTTTCTCTTTTGGTTGTTGGACGAACTTCAAAACTTGACAAACTTTTACGAGTTCTT
256 TGAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTGTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTT
* * **
8678 TTTTAAATTCGGATCCTTAAAGTGTTCAAGACGATCCATTCCTACTTGTAATTTTTCGAACATTC
321 TTTTAAATTCGGTTCCTTAAAGTGTTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGTAATTTTTCGAACATTC
* * * * *
8743 CATGCGAGGGAAATCTCATCGTTTAGTTTAAATAG-TTTTCAATTTTGTAAACATGTTTTGATCT
386 CATGCGAGGGAAATCGCATCATTTGGTCTAAATAGTTTTTC-ATTTTGTAAACAAGTTTTGATCT
* *
8807 TTGAATTATAAACTTATTTACGTGAGAATTACTTCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCCGAACT
450 TTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATT-GTTCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCCGAACT
* **
8872 TGTCAAACTTTTACTAGTTCTTTTTTAAATCCAGTTCCTTAAAGTGTTCACTGCGATCCATTCCT
514 TGTCAAACTTTTACTAGTTC-TTTTTAAATTCAGTTCCTTAAAGTGTTCAAGGCGATCCATTCCT
**
8937 TCGAGTAATTTTTCGAACATTCCATGCGAGGGAAATCACATTGTTTGGTCTAAATAGTTTTTC-T
578 TCGAGTAATTTTT-GAACATTCCATGCGAGGGAAATCACATCATTTGGTCTAAATAGTTTTTCAT
9001 TTT
642 TTT
* * * *
9004 CGTAAACATGTTTTGAACTTTGAATTAAAAACTTA-TTAAGTGAGAATTGTTCCTCTCTTGGTTC
1 -GTAAACAAGTTTTGATCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTC
* * * *
9068 TTGGATGAACTTTCTAACTTGTTGAACTTTTATGAGTTCTTTTATAGCTTCGGTTCCTTAAAGTA
65 TTGGACGAACTTTCGAACTTGTCGAACTTTTACGAGTTCTTTTATAGCTTCGGTTCCTTAAAGTA
* * * * * * *
9133 TGCAAGACGATCCAAACCTTCGAGCAATTTTTCGAACATTAGATACTCA-AGAAGTCGT-ATAAT
130 TTCAAGACGATCCAATCCTTCGAGCAATTTTTCGAACATTACATGC-GAGGGAAGTC-TCATCAT
9196 TTGGTCTAAAAGGTTTTTCATTTTGTAAACAAGTTTTG-GCGTTTGAATTAAAAACTTATTTACG
193 TTGGTCTAAAA-GTTTTTCATTTTGTAAACAAGTTTTGAGC-TTTGAATTAAAAACTTATTTACG
* * * * *
9260 TGAGAAATGTTTCTCTCTTGGTTGTTGGACGAAGTTCCAAACTTGACAAACTTTTATGAGTTCTT
256 TGAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTGTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTT
* ** **
9325 TTTTAAATTTGAATCCTTAAAGTGTTCAAGACGATCCATTCCTTCTTGTAATTTTTCGAACATTC
321 TTTTAAATTCGGTTCCTTAAAGTGTTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGTAATTTTTCGAACATTC
* * * *
9390 CATGCGAGGGAAATCTCATCATTTAGTCTAAATTG-TTTTCAATTTTGTAAACATGTTTTGATCT
386 CATGCGAGGGAAATCGCATCATTTGGTCTAAATAGTTTTTC-ATTTTGTAAACAAGTTTTGATCT
* *
9454 TTGAATTACAAACTTATTTACGTGAGAATTACTTCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCCGAACT
450 TTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATT-GTTCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCCGAACT
* *
9519 TGTCAAACTTTTACTAGTTCTTTTTTAAATCCAGTTCCTTAAAGTGTTC-AGGACGATCTATTCC
514 TGTCAAACTTTTACTAGTTC-TTTTTAAATTCAGTTCCTTAAAGTGTTCAAGG-CGATCCATTCC
* * *
9583 TTCGAGTAATTTTTCGAACATTCCATGCTAGGGACATCACATCATTTGGTGTAAATAGTTTTTC-
577 TTCGAGTAATTTTT-GAACATTCCATGCGAGGGAAATCACATCATTTGGTCTAAATAGTTTTTCA
9647 TTTT
641 TTTT
* * * *
9651 CGTAAACATGTTCTGATCTTTGAATTAAAAACTTATTTAAGTGAGAATTGTTCCTCTCTTGGTTC
1 -GTAAACAAGTTTTGATCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTC
* * *
9716 TTAGACAAACTTTCGAACTTGTTGAACTTTTA
65 TTGGACGAACTTTCGAACTTGTCGAACTTTTA
Statistics
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Consensus pattern (644 bp):
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TGGACGAACTTTCGAACTTGTCGAACTTTTACGAGTTCTTTTATAGCTTCGGTTCCTTAAAGTAT
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GTCTAAAAGTTTTTCATTTTGTAAACAAGTTTTGAGCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGA
ATTGTTTCTCTCTTGGTTGTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTTTA
AATTCGGTTCCTTAAAGTGTTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGTAATTTTTCGAACATTCCATGC
GAGGGAAATCGCATCATTTGGTCTAAATAGTTTTTCATTTTGTAAACAAGTTTTGATCTTTGAAT
TAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAA
CTTTTACTAGTTCTTTTTAAATTCAGTTCCTTAAAGTGTTCAAGGCGATCCATTCCTTCGAGTAA
TTTTTGAACATTCCATGCGAGGGAAATCACATCATTTGGTCTAAATAGTTTTTCATTTT
Found at i:7617 original size:181 final size:180
Alignment explanation
Indices: 7290--7653 Score: 450
Period size: 181 Copynumber: 2.0 Consensus size: 180
7280 AATCACATCG
* *
7290 TTTGGTCTAAATAGTTTTTCTTTTCGTAAACAAGTTTTGATCTTTGAATTAAAAACTTATTAAGT
1 TTTGGTCTAAATAGTTTGTCTTTTCGTAAACAAGTTTTGAGCTTTGAATTAAAAACTTATTAAGT
* * * * **
7355 GAGAATTGTTCCTCTCTTGGTTATTTGACGAACTTTCGAACTTGTTGAACTTTTACGAGTTCTTT
66 GAGAATTGTTCCTCTCTTGGTTATTGGACAAACTTCCGAAATTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTT
** ***
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* * * *
7532 ACGTGAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTGTTGGACAAACTTCCGAAATTGTCAAACTTTTACTAGTT
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* * * *
7597 CTTTT-TAAAATCAAGTTCCTTAAAGTGTTCAGGACGATCTATTCCTTCGAGTAA
127 CTTTTAT-AAATCAAGTTCCTTAAAGTATGCAGGACGATCCAATCCTTCGAGTAA
7651 TTT
1 TTT
7654 TTCGAACATT
Statistics
Matches: 157, Mismatches: 21, Indels: 11
0.83 0.11 0.06
Matches are distributed among these distances:
179 2 0.01
180 52 0.33
181 103 0.66
ACGTcount: A:0.27, C:0.15, G:0.16, T:0.42
Consensus pattern (180 bp):
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GAGAATTGTTCCTCTCTTGGTTATTGGACAAACTTCCGAAATTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTT
TATAAATCAAGTTCCTTAAAGTATGCAGGACGATCCAATCCTTCGAGTAA
Found at i:9430 original size:647 final size:647
Alignment explanation
Indices: 7469--9747 Score: 3646
Period size: 647 Copynumber: 3.5 Consensus size: 647
7459 CCTTCGAGTA
* * * *
7469 ATTTGGTCTAAA-AGGTTTGTC-ATTTTGTAAACAAGTTTTG-GCGTTTGAATTAAAAACTTATT
1 ATTTAGTCTAAATA-GTTT-TCAATTTTGTAAACATGTTTTGATC-TTTGAATTATAAACTTATT
** * *
7531 TACGTGAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTGTTGGACAAACTTCCGAAATTGTCAAACTTTTACTAGT
63 TACGTGAGAATTACTTCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCCGAAATTGTCAAACTTTTACTAGT
*
7596 TCTTTTTAAAATCAAGTTCCTTAAAGTGTTCAGGACGATCTATTCCTTCGAGTAATTTTTCGAAC
128 TCTTTTTAAAATCCAGTTCCTTAAAGTGTTCAGGACGATCTATTCCTTCGAGTAATTTTTCGAAC
*
7661 ATTCCATGCGAGGGAAATCACATCATTTGGTCTAAATAGATTTTCATTTCGTAAACAAGTTTTGA
193 ATTCCATGCGAGGGAAATCACATCATTTGGTCTAAATAGTTTTTCATTTCGTAAACAAGTTTTGA
* * * *
7726 TCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTATGTGTCTCTTGGTTCTTGGACGAAA-TTTCA
258 TCTTTGAATTAAAAACTTATTTAAGTGAGAATTGTGTCTCTCTTGGTTCTTGGAC-AAACTTTCG
* * *
7790 AACTTGTAGAACTTTTACGAGTTCTTTTATAGCTTCGGTTCCTTAAAGTATTCAGGACGATCCAA
322 AACTTGTTGAACTTTTACGAGTTCTTTTATAGCTTCGGTTCCTTAAAGTATGCAAGACGATCCAA
* * * * * ** * ****
7855 TCCTTTGAACAGTTTTTCGAAC-TGTACATGGTCGGGAAGTCACATCATTTGGTCTAAAA-ACCG
387 TCCTTCGAACAATTTTTCGAACAT-TAGATGCTCAGGAAGTCGTATAATTTGGTCTAAAAGTTTT
* * ** *
7918 TCATTTTGTAAAAAAATTTTGGCCATTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCT
451 TCATTTTGTAAACAAGTTTTGGCGTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAAATGTTTCTCTCT
7983 TGGTTGTTGGACGAACTTCCAAACTTGACAAACTTTTACGAGTTCTTTTTTAAATTCGGATCCTT
516 TGGTTGTTGGACGAACTTCCAAACTTGACAAACTTTTACGAGTTCTTTTTTAAATTCGGATCCTT
8048 AAAGTGTTCAAGACGATCCATTCCTACTTGTAATTTTTCGAACATTCCATGCGAGGGAAATCTCA
581 AAAGTGTTCAAGACGATCCATTCCTACTTGTAATTTTTCGAACATTCCATGCGAGGGAAATCTCA
8113 TC
646 TC
*
8115 ATTTAGTCTAAATAGTATTCAATTTTGTAAACATGTTTTGATCTTTGAATTATAAACTTATTTAC
1 ATTTAGTCTAAATAGTTTTCAATTTTGTAAACATGTTTTGATCTTTGAATTATAAACTTATTTAC
8180 GTGAGAATTACTTCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCCGAAATTGTCAAACTTTTACTAGTTCT
66 GTGAGAATTACTTCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCCGAAATTGTCAAACTTTTACTAGTTCT
* *
8245 TTTTAAAATCCAGTTCCGTAAAGTGTTCAGGACGATCTATTCCTCCGAGTAATTTTTCGAACATT
131 TTTTAAAATCCAGTTCCTTAAAGTGTTCAGGACGATCTATTCCTTCGAGTAATTTTTCGAACATT
* *
8310 CCATGCGAGGGAAATCGCATCATTTGGTCTAAGTAGTTTTTCATTTCGTAAACAAGTTTTGATCT
196 CCATGCGAGGGAAATCACATCATTTGGTCTAAATAGTTTTTCATTTCGTAAACAAGTTTTGATCT
*
8375 TTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTGTCTCTCTTGGTTCTTGGACAAACTTTCGAACT
261 TTGAATTAAAAACTTATTTAAGTGAGAATTGTGTCTCTCTTGGTTCTTGGACAAACTTTCGAACT
*
8440 TGTTGAACTTTTACGAGTTCTTTTATAGCTTCGGTTGCTTAAAGTATGCAAGGA-GATCCAATCC
326 TGTTGAACTTTTACGAGTTCTTTTATAGCTTCGGTTCCTTAAAGTATGCAA-GACGATCCAATCC
8504 TTCGAACAATTTTTCGAACATTAGATGCTCAGGAAGTCGTATAATTTGGTCTAAAAGTTTTTTCA
390 TTCGAACAATTTTTCGAACATTAGATGCTCAGGAAGTCGTATAATTTGGTCTAAAAG-TTTTTCA
* * *
8569 GTTTGTAAACAAGTTTAGGCGTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGA-AAATTGTTTCTCTTTTG
454 TTTTGTAAACAAGTTTTGGCGTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAAA-TGTTTCTCTCTTG
*
8633 GTTGTTGGACGAACTTCAAAACTTGACAAACTTTTACGAGTTCTTTTTTAAATTCGGATCCTTAA
518 GTTGTTGGACGAACTTCCAAACTTGACAAACTTTTACGAGTTCTTTTTTAAATTCGGATCCTTAA
8698 AGTGTTCAAGACGATCCATTCCTACTTGTAATTTTTCGAACATTCCATGCGAGGGAAATCTCATC
583 AGTGTTCAAGACGATCCATTCCTACTTGTAATTTTTCGAACATTCCATGCGAGGGAAATCTCATC
* *
8763 GTTTAGTTTAAATAGTTTTCAATTTTGTAAACATGTTTTGATCTTTGAATTATAAACTTATTTAC
1 ATTTAGTCTAAATAGTTTTCAATTTTGTAAACATGTTTTGATCTTTGAATTATAAACTTATTTAC
*
8828 GTGAGAATTACTTCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACTAGTTCT
66 GTGAGAATTACTTCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCCGAAATTGTCAAACTTTTACTAGTTCT
* * *
8893 TTTTTAAATCCAGTTCCTTAAAGTGTTCACTG-CGATCCATTCCTTCGAGTAATTTTTCGAACAT
131 TTTTAAAATCCAGTTCCTTAAAGTGTTCA-GGACGATCTATTCCTTCGAGTAATTTTTCGAACAT
** * * *
8957 TCCATGCGAGGGAAATCACATTGTTTGGTCTAAATAGTTTTTCTTTTCGTAAACATGTTTTGAAC
195 TCCATGCGAGGGAAATCACATCATTTGGTCTAAATAGTTTTTCATTTCGTAAACAAGTTTTGATC
** *
9022 TTTGAATTAAAAACTTA-TTAAGTGAGAATTGT-TCCTCTCTTGGTTCTTGGATGAACTTTCTAA
260 TTTGAATTAAAAACTTATTTAAGTGAGAATTGTGT-CTCTCTTGGTTCTTGGACAAACTTTCGAA
* *
9085 CTTGTTGAACTTTTATGAGTTCTTTTATAGCTTCGGTTCCTTAAAGTATGCAAGACGATCCAAAC
324 CTTGTTGAACTTTTACGAGTTCTTTTATAGCTTCGGTTCCTTAAAGTATGCAAGACGATCCAATC
* * *
9150 CTTCGAGCAATTTTTCGAACATTAGATACTCAAGAAGTCGTATAATTTGGTCTAAAAGGTTTTTC
389 CTTCGAACAATTTTTCGAACATTAGATGCTCAGGAAGTCGTATAATTTGGTCTAAAA-GTTTTTC
9215 ATTTTGTAAACAAGTTTTGGCGTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAAATGTTTCTCTCTTG
453 ATTTTGTAAACAAGTTTTGGCGTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAAATGTTTCTCTCTTG
* * * *
9280 GTTGTTGGACGAAGTTCCAAACTTGACAAACTTTTATGAGTTCTTTTTTAAATTTGAATCCTTAA
518 GTTGTTGGACGAACTTCCAAACTTGACAAACTTTTACGAGTTCTTTTTTAAATTCGGATCCTTAA
*
9345 AGTGTTCAAGACGATCCATTCCTTCTTGTAATTTTTCGAACATTCCATGCGAGGGAAATCTCATC
583 AGTGTTCAAGACGATCCATTCCTACTTGTAATTTTTCGAACATTCCATGCGAGGGAAATCTCATC
* *
9410 ATTTAGTCTAAATTGTTTTCAATTTTGTAAACATGTTTTGATCTTTGAATTACAAACTTATTTAC
1 ATTTAGTCTAAATAGTTTTCAATTTTGTAAACATGTTTTGATCTTTGAATTATAAACTTATTTAC
*
9475 GTGAGAATTACTTCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACTAGTTCT
66 GTGAGAATTACTTCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCCGAAATTGTCAAACTTTTACTAGTTCT
*
9540 TTTTTAAATCCAGTTCCTTAAAGTGTTCAGGACGATCTATTCCTTCGAGTAATTTTTCGAACATT
131 TTTTAAAATCCAGTTCCTTAAAGTGTTCAGGACGATCTATTCCTTCGAGTAATTTTTCGAACATT
* * * * * *
9605 CCATGCTAGGGACATCACATCATTTGGTGTAAATAGTTTTTCTTTTCGTAAACATGTTCTGATCT
196 CCATGCGAGGGAAATCACATCATTTGGTCTAAATAGTTTTTCATTTCGTAAACAAGTTTTGATCT
*
9670 TTGAATTAAAAACTTATTTAAGTGAGAATTGT-TCCTCTCTTGGTTCTTAGACAAACTTTCGAAC
261 TTGAATTAAAAACTTATTTAAGTGAGAATTGTGT-CTCTCTTGGTTCTTGGACAAACTTTCGAAC
9734 TTGTTGAACTTTTA
325 TTGTTGAACTTTTA
Statistics
Matches: 1522, Mismatches: 95, Indels: 30
0.92 0.06 0.02
Matches are distributed among these distances:
645 5 0.00
646 403 0.26
647 609 0.40
648 504 0.33
649 1 0.00
ACGTcount: A:0.28, C:0.16, G:0.16, T:0.40
Consensus pattern (647 bp):
ATTTAGTCTAAATAGTTTTCAATTTTGTAAACATGTTTTGATCTTTGAATTATAAACTTATTTAC
GTGAGAATTACTTCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCCGAAATTGTCAAACTTTTACTAGTTCT
TTTTAAAATCCAGTTCCTTAAAGTGTTCAGGACGATCTATTCCTTCGAGTAATTTTTCGAACATT
CCATGCGAGGGAAATCACATCATTTGGTCTAAATAGTTTTTCATTTCGTAAACAAGTTTTGATCT
TTGAATTAAAAACTTATTTAAGTGAGAATTGTGTCTCTCTTGGTTCTTGGACAAACTTTCGAACT
TGTTGAACTTTTACGAGTTCTTTTATAGCTTCGGTTCCTTAAAGTATGCAAGACGATCCAATCCT
TCGAACAATTTTTCGAACATTAGATGCTCAGGAAGTCGTATAATTTGGTCTAAAAGTTTTTCATT
TTGTAAACAAGTTTTGGCGTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAAATGTTTCTCTCTTGGTT
GTTGGACGAACTTCCAAACTTGACAAACTTTTACGAGTTCTTTTTTAAATTCGGATCCTTAAAGT
GTTCAAGACGATCCATTCCTACTTGTAATTTTTCGAACATTCCATGCGAGGGAAATCTCATC
Found at i:9735 original size:216 final size:215
Alignment explanation
Indices: 7469--9747 Score: 2590
Period size: 216 Copynumber: 10.6 Consensus size: 215
7459 CCTTCGAGTA
* *
7469 ATTTGGTCTAAA-AGGTTTGTCATTTTGTAAACAAGTTTTG-GCGTTTGAATTAAAAACTTATTT
1 ATTTGGTCTAAATA-GTTTTTCATTTTGTAAACAAGTTTTGATC-TTTGAATTAAAAACTTATTT
* * *
7532 ACGTGAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTGTTGGACAAACTTCCGAAATTGTCAAACTTTTACTAGTT
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* * *
7597 C-TTTTTAAAATCAAGTTCCTTAAAGTGTTCAGGACGATCTATTCCTTCGAGTAATTTTTCGAAC
128 CTTTTTTAAATTC-GGTTCCTTAAAGTGTTCAGGACGATCCATTCCTTCGAGTAATTTTTCGAAC
7661 ATTCCATGCGAGGGAAATCACATC
192 ATTCCATGCGAGGGAAATCACATC
* *
7685 ATTTGGTCTAAATAGATTTTCATTTCGTAAACAAGTTTTGATCTTTGAATTAAAAACTTATTTAC
1 ATTTGGTCTAAATAGTTTTTCATTTTGTAAACAAGTTTTGATCTTTGAATTAAAAACTTATTTAC
* * * * * *
7750 GTGAGAATTATGTGTCTCTTGGTTCTTGGACGAAATTTCAAACTTGT-AGAACTTTTACGAGTTC
66 GTGAGAATTGT-TCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCA-AACTTTTACTAGTTC
* ** * * * ** *
7814 TTTTATAGCTTCGGTTCCTTAAAGTATTCAGGACGATCCAATCCTTTGAACAGTTTTTCGAAC-T
129 TTTTTTAAATTCGGTTCCTTAAAGTGTTCAGGACGATCCATTCCTTCGAGTAATTTTTCGAACAT
* * *
7878 GTACATG-GTCGGGAAGTCACATC
194 -TCCATGCG-AGGGAAATCACATC
**** * * ** *
7901 ATTTGGTCTAAA-A-ACCGTCATTTTGTAAAAAAATTTTGGCCATTGAATTAAAAACTTATTTAC
1 ATTTGGTCTAAATAGTTTTTCATTTTGTAAACAAGTTTTGATCTTTGAATTAAAAACTTATTTAC
* * * *
7964 GTGAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTGTTGGACGAACTTCCAAACTTGACAAACTTTTACGAGTTCT
66 GTGAGAATTG-TTCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACTAGTTCT
* * * **
8029 TTTTTAAATTCGGATCCTTAAAGTGTTCAAGACGATCCATTCCTACTTGTAATTTTTCGAACATT
130 TTTTTAAATTCGGTTCCTTAAAGTGTTCAGGACGATCCATTCCTTCGAGTAATTTTTCGAACATT
*
8094 CCATGCGAGGGAAATCTCATC
195 CCATGCGAGGGAAATCACATC
* * * *
8115 ATTTAGTCTAAATAG-TATTCAATTTTGTAAACATGTTTTGATCTTTGAATTATAAACTTATTTA
1 ATTTGGTCTAAATAGTTTTTC-ATTTTGTAAACAAGTTTTGATCTTTGAATTAAAAACTTATTTA
* *
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65 CGTGAGAATT-GTTCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACTAGTTC
* * * * * *
8244 TTTTTAAAATCCAGTTCCGTAAAGTGTTCAGGACGATCTATTCCTCCGAGTAATTTTTCGAACAT
129 TTTTTTAAATTCGGTTCCTTAAAGTGTTCAGGACGATCCATTCCTTCGAGTAATTTTTCGAACAT
*
8309 TCCATGCGAGGGAAATCGCATC
194 TCCATGCGAGGGAAATCACATC
* *
8331 ATTTGGTCTAAGTAGTTTTTCATTTCGTAAACAAGTTTTGATCTTTGAATTAAAAACTTATTTAC
1 ATTTGGTCTAAATAGTTTTTCATTTTGTAAACAAGTTTTGATCTTTGAATTAAAAACTTATTTAC
* * ** *
8396 GTGAGAATTGTGTCTCTCTTGGTTCTTGGACAAACTTTCGAACTTGTTGAACTTTTACGAGTTCT
66 GTGAGAATTGT-TCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACTAGTTCT
* ** * * * * **
8461 TTTATAGCTTCGGTTGCTTAAAGTATGCAAGGA-GATCCAATCCTTCGAACAATTTTTCGAACAT
130 TTTTTAAATTCGGTTCCTTAAAGTGTTC-AGGACGATCCATTCCTTCGAGTAATTTTTCGAACAT
** * * ** *
8525 TAGATGCTCA-GGAAGTCGTATA
194 TCCATGC-GAGGGAAATCACATC
* * *
8547 ATTTGGTCTAAA-AGTTTTTTCAGTTTGTAAACAAGTTTAG-GCGTTTGAATTAAAAACTTATTT
1 ATTTGGTCTAAATAG-TTTTTCATTTTGTAAACAAGTTTTGATC-TTTGAATTAAAAACTTATTT
* * * ** * *
8610 ACGTGAAAATTGTTTCTCTTTTGGTTGTTGGACGAACTTCAAAACTTGACAAACTTTTACGAGTT
64 ACGTGAGAATTG-TTCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACTAGTT
* * * **
8675 CTTTTTTAAATTCGGATCCTTAAAGTGTTCAAGACGATCCATTCCTACTTGTAATTTTTCGAACA
128 CTTTTTTAAATTCGGTTCCTTAAAGTGTTCAGGACGATCCATTCCTTCGAGTAATTTTTCGAACA
*
8740 TTCCATGCGAGGGAAATCTCATC
193 TTCCATGCGAGGGAAATCACATC
* * * * *
8763 GTTTAGTTTAAATAG-TTTTCAATTTTGTAAACATGTTTTGATCTTTGAATTATAAACTTATTTA
1 ATTTGGTCTAAATAGTTTTTC-ATTTTGTAAACAAGTTTTGATCTTTGAATTAAAAACTTATTTA
*
8827 CGTGAGAATTACTTCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACTAGTTC
65 CGTGAGAATT-GTTCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACTAGTTC
* * *
8892 TTTTTTAAATCCAGTTCCTTAAAGTGTTCACTG-CGATCCATTCCTTCGAGTAATTTTTCGAACA
129 TTTTTTAAATTCGGTTCCTTAAAGTGTTCA-GGACGATCCATTCCTTCGAGTAATTTTTCGAACA
*
8956 TTCCATGCGAGGGAAATCACATT
193 TTCCATGCGAGGGAAATCACATC
* * *
8979 GTTTGGTCTAAATAGTTTTTC-TTTTCGTAAACATGTTTTGAACTTTGAATTAAAAACTTA-TTA
1 ATTTGGTCTAAATAGTTTTTCATTTT-GTAAACAAGTTTTGATCTTTGAATTAAAAACTTATTTA
* * * * **
9042 AGTGAGAATTGTTCCTCTCTTGGTTCTTGGATGAACTTTCTAACTTGTTGAACTTTTA-TGAGTT
65 CGTGAGAATTGTT-CTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACT-AGTT
* ** * * * ** *
9106 CTTTTATAGCTTCGGTTCCTTAAAGTATGCAAGACGATCCAAACCTTCGAGCAATTTTTCGAACA
128 CTTTTTTAAATTCGGTTCCTTAAAGTGTTCAGGACGATCCATTCCTTCGAGTAATTTTTCGAACA
** * * * * ** *
9171 TTAGATACTCA-AGAAGTCGTATA
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*
9194 ATTTGGTCTAAA-AGGTTTTTCATTTTGTAAACAAGTTTTG-GCGTTTGAATTAAAAACTTATTT
1 ATTTGGTCTAAATA-GTTTTTCATTTTGTAAACAAGTTTTGATC-TTTGAATTAAAAACTTATTT
* * * * *
9257 ACGTGAGAAATGTTTCTCTCTTGGTTGTTGGACGAAGTTCCAAACTTGACAAACTTTTA-TGAGT
64 ACGTGAGAATTG-TTCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACT-AGT
* ** * **
9321 TCTTTTTTAAATTTGAATCCTTAAAGTGTTCAAGACGATCCATTCCTTCTTGTAATTTTTCGAAC
127 TCTTTTTTAAATTCGGTTCCTTAAAGTGTTCAGGACGATCCATTCCTTCGAGTAATTTTTCGAAC
*
9386 ATTCCATGCGAGGGAAATCTCATC
192 ATTCCATGCGAGGGAAATCACATC
* * * *
9410 ATTTAGTCTAAATTG-TTTTCAATTTTGTAAACATGTTTTGATCTTTGAATTACAAACTTATTTA
1 ATTTGGTCTAAATAGTTTTTC-ATTTTGTAAACAAGTTTTGATCTTTGAATTAAAAACTTATTTA
*
9474 CGTGAGAATTACTTCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACTAGTTC
65 CGTGAGAATT-GTTCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACTAGTTC
* * *
9539 TTTTTTAAATCCAGTTCCTTAAAGTGTTCAGGACGATCTATTCCTTCGAGTAATTTTTCGAACAT
129 TTTTTTAAATTCGGTTCCTTAAAGTGTTCAGGACGATCCATTCCTTCGAGTAATTTTTCGAACAT
* *
9604 TCCATGCTAGGGACATCACATC
194 TCCATGCGAGGGAAATCACATC
* * *
9626 ATTTGGTGTAAATAGTTTTTC-TTTTCGTAAACATGTTCTGATCTTTGAATTAAAAACTTATTTA
1 ATTTGGTCTAAATAGTTTTTCATTTT-GTAAACAAGTTTTGATCTTTGAATTAAAAACTTATTTA
* * * * **
9690 AGTGAGAATTGTTCCTCTCTTGGTTCTTAGACAAACTTTCGAACTTGTTGAACTTTTA
65 CGTGAGAATTGTT-CTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTA
Statistics
Matches: 1729, Mismatches: 285, Indels: 98
0.82 0.13 0.05
Matches are distributed among these distances:
214 177 0.10
215 208 0.12
216 1307 0.76
217 37 0.02
ACGTcount: A:0.28, C:0.16, G:0.16, T:0.40
Consensus pattern (215 bp):
ATTTGGTCTAAATAGTTTTTCATTTTGTAAACAAGTTTTGATCTTTGAATTAAAAACTTATTTAC
GTGAGAATTGTTCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACTAGTTCTT
TTTTAAATTCGGTTCCTTAAAGTGTTCAGGACGATCCATTCCTTCGAGTAATTTTTCGAACATTC
CATGCGAGGGAAATCACATC
Done.