Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: NTFQ01012075.1 Kokia drynarioides strain JFW-HI SEQ_127073, whole genome shotgun sequence
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* * ** * *
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* *
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* * * *
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* * *
758 CTTATTTATGTGAGAATAT-TATTTCTCCTGGTTCTTGGACGAACTTTCGAACTTGTCAAACTTT
130 CTTATTTACGTGAGAAT-TGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTTCGAACTTGTCAAACTTT
* * * * * *
822 TACGAGTTCTTTTATTACTTTGGTTCCTCAAAGTATTCAAGGCAATCCATTCCTTCAAGCAATTT
194 TACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGCAATTT
* * * *
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*** * * *
951 TTTTTCCCCTTGAATTAAAAACTTATTTAAGTGAGAATTTTATCTCTCTTGGTTCTTGAACGAAC
323 TTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTAAGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAAC
* * *
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* * * * * *
1050 GTTCCTTAAAGTATTCAAGTCGATGCTTTCCTTCGAGACATTTCCCAAAAATTACATGCTCGAGA
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGACATTTCCCGAACATTCCATGCTCTA-A
* * * * *
1115 AATCGAATCTTTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGAAAATAACTTTTGGTCTTCGAATTAAAAC
65 AATCGCATCTTTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAA
* * * *
1180 CTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCTTGTTTCTTGGATGAACTTCCAAACTTGTCAAACTTTT
130 CTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTTCGAACTTGTCAAACTTTT
* * * *
1245 ACGAGTTC-CTTATAACTTCTGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTTGAGCAATTTC
195 ACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGCAATTT-
* *
1309 TCGAACATTCCATGCTCGGGAAATCACATTATTTGGTCCAAATAGTTTGTTATTT-TATATACAA
259 TCGAACATTCCATGCTCGAGAAATCACATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTTATTTGTA-A-ACAA
*
1373 CTTTTGGT-TTTCGAATTAAAAACTTATTTACA-TGAGAATTGTATCTCTCATGGTTCTT-GATC
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* *
1435 AAACTTGTCAACCTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCG
384 GAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCG
* * *
1473 GTTCCTTAAAGTATTCAACACGATCCTTTCCTTCGAGACATTTCCCAAACATTCCATGCTCAAAA
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGACATTTCCCGAACATTCCATGCTC-TAA
* *
1538 AATTGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTTTGGT-TATTGAATTAAAA
65 AATCGCATCTTTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTTTGGTCT-TTGAATTAAAA
* ** * * *
1602 ACTTATTTACATGAGAATTGTATCAATCCTGGTTTTTGGACAAACTTTCGAACTTGTCAAACTTT
129 ACTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTTCGAACTTGTCAAACTTT
* * * *
1667 TACGAGTTCTTTTATAACTTCGATTCCTTAAAGTATTCAAGACAATCAATTCCTTCGAGCTATTT
194 TACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGCAATTT
* ** * ** * *
1732 CTTGGGCATTCCATGCTTGAGAAATCGTATCGTTTGGTCCAAATAGTTT-TTCATTTGTAACCAA
259 -TCGAACATTCCATGCTCGAGAAATCACATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTT-ATTTGTAAACAA
*
1796 CTTTTGGTCTTTTAATTAAAAACTTATTTACA-TGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGA
322 CTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTA-AGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGA
*
1860 ACTTTTGAACTCGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTAT-ACTTTTG
386 AC---T----T-GTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAAC-TTCG
* * * *** *
1904 GTTCCTTAAA-TATACAAGACGATCCATTCCTTCGA-TCAATTTTAAGAACATTCCATGCTCGAT
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGAC-ATTTCCCGAACATTCCATGCTCTA-
* * * *
1967 AAATCGCAT-TATTTGGTCCAAATAGTTTGTC---TTGTAAAAAAATTTCGGTCTTTGAATAAAA
64 AAATCGCATCT-TTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAA
* *
2028 AACTTATTTACGTGAGAATTTTATCTCTCTTGGTTCTTGGACTAACTTTCGAACTTGTCAAACTT
128 AACTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTTCGAACTTGTCAAACTT
* * * * * *
2093 TTACAAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTATTTAAGATGATTCATTCCTTCAAGCTATT
193 TTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGCAATT
* * ** *
2158 TTCTAAACATTTCATGCTCGAGAAATTGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACA
258 TTC-GAACATTCCATGCTCGAGAAATCACATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTTA-TTTGTAAACA
*
2223 ACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTATGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGA
321 ACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTAAGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGA
* * *
2288 ACTTGTCAAACATTTA-GAACTTCTTTTCTAACTTCG
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* * *
2324 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCGTTCGAGACATTTCCCGAGCATTCCATGCTCTGGA
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGACATTTCCCGAACATTCCATGCTCT-AA
* * * * * *
2389 AGTCGCATATTTTGGTCCAAATTGTTTTTCATTTTTTAAACAACTTTTGGACTTTGAATTAAAAA
65 AATCGCATCTTTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAA
*
2454 CATATTT-CTGTGAGAATAT-TATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTTCGAACTTGTCAAACTT
130 CTTATTTAC-GTGAGAAT-TGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTTCGAACTTGTCAAACTT
* * * *
2517 TTACAAGTTCCTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGGCAATCCATTCCTTCGAGCAATT
193 TTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGCAATT
* * * * *
2582 TTATGAACATTCCATGCTCGGGAAATCACATTATTTGGTCCAAATAGTTT-TTACTTGGAAACAA
258 TT-CGAACATTCCATGCTCGAGAAATCACATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTTATTTGTAAACAA
* * * * * *
2646 ATTTTTGTCTTTAAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTTTATCTCTCTTGGTTCTTGGATGAA
322 CTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTAAGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAA
* * * *
2711 CTAGTCAAACTTTGACGATTTCTTTTATAACTTTG
387 CTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCG
* * * * *
2746 GTTCCTTAAAGTATTCAAGTCGATGCTTTCCTTCGAGACATTTCTCGAAAATTCCATGCTCGAGA
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* *
2811 AATCGAATCTTTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGAAAACAACTTTTGGT-TTTCGAATTAAAA
65 AATCGCATCTTTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTTTGGTCTTT-GAATTAAAA
* * * * *
2875 CCTTAGTTACATGAGAATTGCATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTTCAAACTTGTCAAACTTT
129 ACTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTTCGAACTTGTCAAACTTT
* * * * * *
2940 TACGAGTTCTTTTATAAATTCAGTTCCTTAAAGTATTCAAGATGATCCATTCATACGAGCTATTT
194 TACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGC-AATT
* ** *
3005 TTCGAACATTCCATGCTCGAGAAATCACATCATTTTGTCCAAATAGTTTGCCATTTTGCAAACAA
258 TTCGAACATTCCATGCTCGAGAAATCACATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTTA-TTTGTAAACAA
* * * * * * *
3070 CTTGTGGTTTTTGGATTAAAAACTTATTTATGTGAGAATT-TATCTCACCTGGTTCTTGGGCGAA
322 CTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTAAGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAA
* *
3134 CTTCTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCT
387 CTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCG
* * * * * * * * *
3169 GTTCATTAAAGCATTCAAAACAATCATTTCCTTCTAGACATTTCCCTATCATTCCATG-TTTAGG
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGACATTTCCCGAACATTCCATGCTCTA--
* * *
3233 AAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTGTCTAAACAACTTTTGGTCTTT-AATTCAAA
64 AAATCGCATCTTTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATT-AAA
* * * * * *
3297 AACATATTTACGTGAGAACTGTATCTCTCCTGGTTCTTGGACAAAC-TTCTGAACCTGTCGAACT
128 AACTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTTC-GAACTTGTCAAACT
* * * *
3361 TTTATGAGTTCTTCTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGATGATCCATTCCTTCGAGCTAT
192 TTTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGCAAT
* * * *
3426 TTTCGAGCATTCCATGCTCAAGAATTCACATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTGTAAACAA
257 TTTCGAACATTCCATGCTCGAGAAATCACATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTTATTTGTAAACAA
*
3491 CTTTTGGTCTTTGAATT-AAAACTTATTTACA-TGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGATGA
322 CTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTA-AGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGA
3554 ACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCG
386 ACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCG
* * *
3590 GTTCCTTAAAGTATTCAAAACGATCCATTT-CTTCTAG-CTATTTTCCGAACATTCCATGCT-TG
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCC-TTTCCTTCGAGAC-ATTTCCCGAACATTCCATGCTCT-
* * * * *
3652 AGAAATCACATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTTTGGCCATTGAATTTA
63 A-AAATCGCATCTTTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAA
* * * * * *
3717 AAACTTATTTAAGTAAGAATTGTTTCAT-TTTTTGTTCTTGGACGAACATTCGAACTTGTCAAAC
127 AAACTTATTTACGTGAGAATTGTATC-TCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTTCGAACTTGTCAAAC
* * * * * * * * * *
3781 ATTTAAGAGTTCTTTTATAATTTTGATTCCTTATAGTATTCATGATGATCCATTCCTTCAAGGAA
191 TTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGCAA
* * *
3846 CTTTTTTGAGCATTCCATGCTC-AGGAAATCGCATCATCTT-GTCCAAATA-TTT-TTCCATTTG
256 --TTTTCGAACATTCCATGCTCGA-GAAATCACATCAT-TTGGTCCAAATAGTTTGTT--ATTTG
* * * * * * * *
3907 TAAACAACTTTTGGTATTTAAATTAAAATCTTATTTAATTGGGAATTGTTTTTCTCTTGATTCTT
315 TAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTAAGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTT
* * *
3972 GGACGAACTTTCGAACCTGTCAAAGTTTTACAAGTTCTTTTATAACTTCA
380 GGACGAAC--T------TGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCG
* * * * * *
4022 GTTCCTTAAAGTATTCTAGACGATCCTTTCCTTTGAG-CAATATCACAAAAATTCCATGCT-TGG
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGAC-ATTTCCCGAACATTCCATGCTCT--
* ** * * *
4085 GAAATCGCATAATTTGGTCCAAATAGTTTGTTATTTTATAAACAAGTTTTGGTCTTTGAATTAAA
63 AAAATCGCATCTTTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAA
* * *
4150 AACTTATTTACATGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGATGAACTTTCGAACTTATCAAACTT
128 AACTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTTCGAACTTGTCAAACTT
* * * * * * * *
4215 TTATGAGATCTTTTATAACTTCAGTTCCTTAAAGTATTCCAGACGATCCTTTCCTACGAGTAGTT
193 TTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGCAATT
* * * * * *
4280 TCCCGACCATTCCATGCTCGGGAAATCAAATTATTTGGTCCAAATAGTTTGTCAATTTGTAAACA
258 T-TCGAACATTCCATGCTCGAGAAATCACATCATTTGGTCCAAATAGTTTGT-TATTTGTAAACA
* * * *
4345 ACTTTTTGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTATGAGAGTATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGA
321 ACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTAAGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGA
* * * *
4410 ACTTGTCAGACTTTTACGACTTCTTTCATAACTTCA
386 ACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCG
* * ** * * *
4446 GTTCCATAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTTGAGACATTTTACGAACATACAATGCT-TGGG
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGACATTTCCCGAACATTCCATGCTCT--A
* * ***
4510 AAATCGCATCATTTGGGT-CAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAAATTTTGGTCTTTTTGTTAAA
64 AAATCGCATC-TTTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAA
* * *
4574 AACTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCCGAACTCGTCAAAGTT
128 AACTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTTCGAACTTGTCAAACTT
* * *
4639 TTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTATGCTAGACGATCCTTTCCTTCGAGCAATT
193 TTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGCAATT
* * ** * ** * * *
4704 TCACAAACATTCCAT--TTAATATGTCCTAACCAGCATGTT--T--AATTTGTCTTAGGGATATC
258 T-TCGAACATTCCATGCTCGAGAAAT-C--A-CATCAT-TTGGTCCAAATAGT-TT---G-T-T-
* * *** **** * * ** * * *** *
4763 AATGGCTGGCCAACACAAGCTTTTAATGCACCTACAAAC--ATTTAAAGTGCTGAA-AACACCTC
310 ATTTG-TAAACAACTTTTGGTCTT--TG-AATTAAAAACTTATTT-AAGTG-AGAATTGTATCTC
** * ** * * * *** * * *
4825 TTCAAAAGG-GCATTTCATGATC-AG-CAAAGGAATT-CAATGTTCTCTTCATGCATGACTAATT
369 -TC--TTGGTTC-TTGGACGAACTTGTCAAA-CTTTTACGA-GTTCT-TT--T--ATAACT--TC
4886 G
421 G
* * * * * ** * * *** * *
4887 GTTTCATCAAAGGT-CTCAAG--G-TACTTAAATGC-TC-A-A-A--GGCTGATCATGGGA-ACA
1 G-TTCCTTAAA-GTATTCAAGACGATCCTT---TCCTTCGAGACATTTCCCGAACATTCCATGCT
* * * ** * * ** * * **
4941 CGAAAAGTGGC-TGTTCGGGTTACTCAAA-A----ATCATTAATACACCAACCACATTTATTCCA
61 CTAAAA-TCGCATCTTTTGG-T-C-CAAATAGTTTGTCATT-TTGTA--AACAACTTTTGGT-C-
** * * * * ** *** * * * * * **
5000 AGTGCA-TGAGAAC---TTCA-G-CCGAATT-TAAAGAACACTT-CTTCCTAGCCAACCAAGCAC
117 TTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGT--ATCTCTCTTGGTT-CTTG--GACGAA-CTT
* * * * * * ***** * ** ** *
5057 T-AAATTTGGCCAACTATT-CCA-TTGAAGCA-ACCACCATATTAACTTAAAGTGCA-TCGAGAA
176 TCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTC-GGTT-CCTTAAAGT--ATTC---AA
* * * * * * * ** ** * **** *
5117 TATTGAACAAATT--TATGGTGTAATTTTTTTAA-ATT--ATTTTATGACTTTTCAACTGGTCAT
234 GA-CGATC-CATTCCT-TCGAGCAA-TTTTCGAACATTCCATGCT-CGAGAAATC-AC--ATCAT
* * ** *
5177 TT-GTAAGCCTATAAATATGAGGCTTGCAATATTTTGTTAAA-AACCTTTT-G---AAGAATTTA
291 TTGGT---CC----AA-AT-A-GTTTG--TTA-TTTG-TAAACAA-CTTTTGGTCTTTGAATTAA
* * * * ****
5236 AATCTTA-TT--GTGAG-TTTGCAAACTC-CTT-GTTCTTATTTG-AC---TCAAA-TTGACTTA
341 AAACTTATTTAAGTGAGAATTG-TATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTGTCAAACTT---TTA
* * * * * *
5290 TCAAGTAACCCTTGTAGCATCAATCTG
402 -CGAGT---TCTTTTA-TAAC-TTC-G
* * * * * * * ** * ** * * **
5317 ATTCTTTCGAACT-TATCACTACATTGAAGT-GTGACGTTC-ACCCTTTTACC-AATTGGTTCCT
1 GTTCCTT-AAAGTAT-TCA--AGA-CG-A-TCCTTTCCTTCGAGACATTTCCCGAA--CATTCC-
* * ** *** * * * * * * * *
5378 AT-CTTTCT-AGATAG-AGGGTCACGGTTC--TTA-CTTG-CAATTCGTTCTAAGAATAAATATA
56 ATGC--TCTAAAATCGCA-TCTTTTGGTCCAAATAGTTTGTC-ATT--TTGT-A-AACAACTTTT
** * ** * ** * * * * ** *
5436 GG-AATCG-GGTCAGTA-TTCTTTTA--T-A-ATATTGGACCAT-TCTTGAGTCCTTAAACCAA-
113 GGTCTTTGAATTAAAAACTT-ATTTACGTGAGA-ATTGTATC-TCTCTTG-GTTCTTGGACGAAC
* * *** * * * * ** * * * * * **
5492 GTTC-AAGCTTATCCTTC-TTTATCCA-TTGC--ATAT-CCATC-CATCCAT-CATTCTACAACC
174 TTTCGAA-CTTGTCAAACTTTTA-CGAGTT-CTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGA
* ** ** *
5549 CG--CCATTATCATTTC---CAACTGTCACGAA-A-TCCAT--TACGA-ACGGT-ACGTCTTAAT
236 CGATCCA-T-TC-CTTCGAGCAA-T-TTTCGAACATTCCATGCT-CGAGA-AATCACATC---A-
* ** * * ** * * * * ** * ** * *** * *
5603 TTTGATAGGGAACTCG--TGCGACTCGTAATCATCCCTCGAG--GATGATTTCGCATC-AATTT-
290 TTTGGT--CCAAATAGTTTGTTATTTGTAAACAACTTTTG-GTCTTTGAATTAAAAACTTATTTA
* * * * * * ** ** * * * * ** * *
5662 GGTCAAAAATAGT-T-TGTGTT--TTTGTAAACAATATTTGGTCTTTGAA--TTAAAAACTTATT
352 AGT-GAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGA-ACTT-GTC---AAACTTTTACGAGTTCTT
* *
5721 TACGTAAAAATT-G
411 T---TATAACTTCG
* ** * ** * * * **** *
5734 TTTCTCTT-TTG-GTTCTTGGACGA-ACTTTCGAACTTGCCAAACTTATTAAATGAGCATTCCAT
1 GTTC-CTTAAAGTATTC-AAGACGATCCTTTC---CTT-CGAGAC--ATTTCCCGAACATTCCAT
* * *
5796 GCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCTTTTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGA
58 GCTCTA-AAATCGCATCTTTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGA
* * *
5861 ATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCCTGGTTCTTGGATGAACTTTCGAACCTGTC
122 ATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTTCGAACTTGTC
** * *
5926 AAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTATTTAAAATATTCAAGACGATCCATTCCTTTGA
187 AAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTCGA
* ** ** ** *
5991 GCTATTTTTCGGGCATTCCATGCTTTAGAAATTGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTGT
252 GC-AATTTTCGAACATTCCATGCTCGAGAAATCACATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTTATTTGT
*
6056 AAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACA-TGAGAATTGTGTCTCTCTTGGTTCTT
316 AAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTA-AGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTT
* *
6120 GGACAAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCA
380 GGACGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCG
** * * * * **
6162 ACTCCTTAAAATATTCAAGATGATCCATTCCTTTGAG-CTACTTT-CCGAACATTCCATGCTAGA
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGAC-A-TTTCCCGAACATTCCATGCTCTA
* *
6225 GAAATTGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATT-AA
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* * * * * * *
6289 AACTTATTTACGTAAAAATTGTTTCCCTTTTGGTTCTTGGACGAACATCCGAACTTGTCAAACTT
128 AACTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTTCGAACTTGTCAAACTT
* * * * * * * * *
6354 TTATGAGTTATTTTATAACTTTGATTCCTTAGAGTATTCATGATGATCCATTCCTTTGAGGAATC
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* * * * *
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257 TTTCGAACATTCCATGCTCGAGAAATCACATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTTA-TTTGTAAACA
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*
6549 ACTTCCAAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTAT-ACTTTTG
385 -------AACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAAC-TTCG
* * * ** *
6593 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACTATCCTATCCTTTGAG-CAATTTAACAAACATTCCATGCT-TGA
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGAC-ATTTCCCGAACATTCCATGCTCT-A
* ** ** *
6656 GAAATTGCAT-TATTTGGTAGAAATTCCATGCTCAGGAAATCACATTATTTGGTCCAAATAGTTT
64 -AAATCGCATCT-TTTGGTCCAAA-T--A-G-T-TTG---T--CA-T-TTT-GT--AAACA----
* *
6720 GTCATTTT-GTAAACAACTTTTGGTTTTAGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATCGTATCTCT
107 -AC-TTTTGGT------C-------TTT-GAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCT
*
6784 CATGGTTCTT-G--G-A----CGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCC
156 CTTGGTTCTTGGACGAACTTTCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCC
* * * *
6841 TTAAAGTATTCAACACGATCCTTTCCTTCGAG-ACATTTCCTGAACATTCCATGCTCGAAAAATC
221 TTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGCA-ATTTTC-GAACATTCCATGCTCGAGAAATC
* * *
6905 GCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTTTGGT-TATTGAATTAAAAACAT
284 ACATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTTA-TTTGTAAACAACTTTTGGTCT-TTGAATTAAAAACTT
* * ** * *
6969 ATTTATGTGAGATTTGTATCAATCCTGGTTTTTGGACGAACTTTCGAACTTGTCAAACTTTTACG
347 ATTTAAGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTT-G--G-A----CGAACTTGTCAAACTTTTACG
*
7034 AGTTCTTTTATAAATTCG
404 AGTTCTTTTATAACTTCG
** * * * ** *
7052 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCAATTCCTTCGA-TCTATTTTCTGGGCATTCCATGCTCGAG
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGAC-ATTTCCCGAACATTCCATGCTCTA-
* * **
7116 AAATCGTATCGTTTT-GTCAAAATAGTTTGTCA-TTTGTAGCCAACTTTTGGTCTTTGAATTAAA
64 AAATCGCATC-TTTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAA
* * * *
7179 AACTTATTTACATGAGAATTGTACCTCTCTTGGTTCTCGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTT
128 AACTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTTCGAACTTGTCAAACTT
* *
7244 TTACGAGTTCTTTTAT-ACTTTTGGTTCCTTAAA-TATTCAAGACGATCCATTCCTTCGACCAA-
193 TTACGAGTTCTTTTATAAC-TTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGCAAT
* * *
7306 TTTC-AAGA----A--C-C-----TTC-CA-C-----G--CAAATAGTTTG-T-CTTGTAAACAA
257 TTTCGAACATTCCATGCTCGAGAAATCACATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTTATTTGTAAACAA
* * * *
7347 ATTTTGGTCCTTGAATAAAAAACTTATTTACA-TGAGAATTTTATCTCTCTTGGTTCTTAGACGA
322 CTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTA-AGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTT-G--G-
* *
7411 ACTTTCTAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCA
382 A----CGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCG
* * * * * * * * *
7455 GTTCCATAAAGTATTAAAGATGATTCATTCCTTC-ACG-CTATTTTCTGAACATTTCATGCTCGA
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGA-GAC-ATTTCCCGAACATTCCATGCTCTA
* * * * *
7518 GAAATCGTATCATTTGGTCCAACTAGTTTGTCATTTTATAAATAACTTTTGGTCTTTGAATTAAA
64 -AAATCGCATCTTTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAA
* * *
7583 AACTTATTTATGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCTCAAACATT-TAAAAC
128 AACTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTT-TCGAAC-TTGTCAAAC
*
7647 TTTTACGAGTTCTTTTAT-ACTTTTGGTTCCTTAAA-TATTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGCA
191 TTTTACGAGTTCTTTTATAAC-TTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGCA
* ** * * *
7710 A-TTTCAAGAACATTCCATGCTCGATAAATCGTATTATTTGATCCAAATAGTTTG-T-CTTGTAA
255 ATTTTC--GAACATTCCATGCTCGAGAAATCACATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTTATTTGTAA
* * * *
7772 ACAAATTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTATGTGGGAATAT-TATCTCTCCTGGTTTCTAG
318 ACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTAAGTGAGAAT-TGTATCTCTCTTGG-TTCT--
* * * * *
7836 ATGAACTTTTGAACTTGTCAAACATTTACGAGTTATTTTATACCTTTG
379 -TGGAC----GAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCG
* * * * * ** **
7884 GTTCCTCAAAGTATTCAAGGCAATCCATTCCTTCGAG-CAATTTTCTTAACATTCCATGCTCGGG
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGAC-ATTTCCCGAACATTCCATGCTC-TA
* *
7948 AAATCACA-CTATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAAAATTTT-GTCTTTGAATTAA
64 AAATCGCATCT-TTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAAC-AACTTTTGGTCTTTGAATTAA
8011 AAACTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTT-G--G-A----CGAACTTGTCAAACT
127 AAACTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTTCGAACTTGTCAAACT
* * * * * * *
8068 CTGACGAGTTCTTTTATAACTTTGGTTCCTTAAAGTATTCAAGTCGATGCTTTCCATCGAG-ACA
192 TTTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGCA-A
* * * *
8132 TTTCTCGAAAATTCCATGCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGAAAA
256 TTT-TCGAACATTCCATGCTCGAGAAATCACATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTTA-TTTGTAAA
* * * *
8197 CAACTGTTGGTCTTCGAATTAAAACCTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCTT-GTATCTTGGA
319 CAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTAAGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGT-TCTTGGA
* * *
8261 TGAACTT-CCAAACTTGAAAAACATTTACGAGTTCTTTTATAACTTCT
383 CGAACTTGTCAAAC-T--------TTTACGAGTTCTTTTATAACTTCG
* * ** **
8308 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTCCCTTTGAG-CAATTTCTTGAACATTCCATGCTCGGG
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGAC-ATTTCCCGAACATTCCATGCTC-TA
* * * *
8372 AAATCACAT-TATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTCTGTTTTTTGAATTAAA
64 AAATCGCATCT-TTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAA
** * * * * *
8436 AACTTATTTACGTGAGAATTGTATCAATCCTAGTTTTTGGATGAACTTTTGAACTTGTCAAACTT
128 AACTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTTCGAACTTGTCAAACTT
* * *
8501 TTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCAATTCTTTCGAGCTATT
193 TTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGC-AAT
* * * * *
8566 TTTC-AGGCATTCCATGCTCAAGAAATC-CTATCGTTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTGTAACC
257 TTTCGA-ACATTCCATGCTCGAGAAATCAC-ATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTTATTTGTAAAC
* * *
8629 AACTTTTTGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACA-TGCGAATTGTATCTCTCTCGGTTCTTGGAC
320 AACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTA-AGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTT-G--
*
8693 GAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTATGAGTTCTTTTAT-ACTTTTC-
381 G-A----CGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAAC--TTCG
** * ** *
8739 GTTCCTTAAAGTATTCAAGGTGATCCATTCCTTCGAG-CAATTTCAAGAACATTCCATGCTCGAT
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGAC-ATTTCCCGAACATTCCATGCTCTA-
* *
8803 AAATCGCAT-TACTTGGTCCAAATAGTTTGTC---TTGTAAACAAATTTTGGTCTTTGAATTAAA
64 AAATCGCATCT-TTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAA
** * * * * ** *
8864 AACTTATTTTTGTGGGAATAT-TATCTCTCATGGTTCCTAGACGAACTTTTTAACTTGTCAAACA
128 AACTTATTTACGTGAGAAT-TGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTTCGAACTTGTCAAACT
* * * * * * * * *
8928 TTTACGAGTTATTTTATACCTTTGGTTCCTCAAAGTATTCAAGGCAATCCATTTCTTCAAGCAAA
192 TTTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGCAAT
* * * *
8993 TTTCTAAACATTCCATGCTCGGGAAATCACA-CTATTTGGTCCAAATAATTTGTCATTTTGTAAA
257 TTTC-GAACATTCCATGCTCGAGAAATCACATC-ATTTGGTCCAAATAGTTTGTTA-TTTGTAAA
* * *
9057 CAAATTTTTGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTATGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGAC
319 CAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTAAGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGAC
* * * *
9122 GAACTTGTCAAACTCTGACGAGTTCTTTTATAAATTTG
384 GAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCG
* * * * * **
9160 GTTCCTTAAAGTATTCAAGTCGATGCTTTCCATCGAGACATTTCTCGAAAATTCCATGCTCGGGA
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGACATTTCCCGAACATTCCATGCTC-TAA
* * * * * * ** *
9225 AATCGAAACTTTTGGTCCAAATAGTTTTTCATTGTGAAAACAACTGTTGGTCTTCAAATTAAAAC
65 AATCGCATCTTTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAA
* * * * * ** *
9290 CTTATTTATGTGAGAATTGTATCTCTCTT-GTATCTTGGATGAACATCCAAACTTGAAAAACATT
130 CTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGT-TCTTGGACGAACTTTCGAACTTGTCAAACTTT
*
9354 TACGAGTTCTTTTATAACTTCTGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCC-TTCCCTTCGAGCAATT
194 TACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATT-CCTTCGAGCAATT
* * **
9418 TCTCGAACATTCCATGCTCGGGAAATCACATTATTTGGTCCAAATAGTTTGCCATTTCGTAAACA
258 T-TCGAACATTCCATGCTCGAGAAATCACATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTTATTT-GTAAACA
* ** * * ** * *
9483 ACTTCTATTTTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTATCAATCCTGGTTTTTGGACGA
321 ACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTAAGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGA
*
9548 ACTTTTGAACTCGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAAGTTCG
386 AC---T----T-GTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCG
* ** * ** ** *
9592 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACAATCAATTCCTTTGAG-CTATTTTTCGGGCATTCCATGCTCGAG
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGAC-ATTTCCCGAACATTCCATGCTCTA-
* * * *
9656 AAATCGTATCGTTTGGTCCAAATAGTTTGTCA-TTTGTAACCAACTTTTGGTCTTTG-ATTTAAA
64 AAATCGCATCTTTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAA
* * *
9719 ACTTATTTACATGAGAACTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTT
129 ACTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTTCGAACTTGTCAAACTTT
** ** * * * *
9784 TGTGAGTTCTTTTATATTTTTGGTTCCTTAAAGTATTTAAGACAATTCATTCCTTCGAGCAA-TT
194 TACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGCAATTT
* * * * * *
9848 TCAAGAACATTCCATGATCGATAAATCGCATTATTTGGTCCAAATAATTTG-T-CTTGTAAACAA
259 TC--GAACATTCCATGCTCGAGAAATCACATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTTATTTGTAAACAA
* * * * * *
9911 ATTTTGGTCTTTGAATTAAAAACATATTTACGTGGGAATTATATCTCTCTTTGTTCTTGGACGAA
322 CTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTAAGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTT-G--G-A
*
9976 CTTTCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCA
383 ----CGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCG
* * * *** *
10019 GTTCCTTTAAGTATTCAAGATGA----TTCCTTCAAG-CTATTTTTTGAACATTTCATGCTCTAG
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGAC-ATTTCCCGAACATTCCATGCTCTA-
*
10079 AAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAA
64 AAATCGCATCTTTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAA
* * * *
10144 ACTTATTTATGTGAGAATTGTACCTCTCTTGGTTATT-G--G-A----CGAACTTGTCAAACATT
129 ACTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTTCGAACTTGTCAAACTTT
** * * * * *
10201 TAAAACTTCTTTTCTAACTTCAGTTCCTTAAAGTATTTAAGACGATCCTTTCCTTCGAG-ACATT
194 TACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGCA-ATT
* * * * * * *
10265 TCCCG-ACACTCC-TCGTTC-AGGAAGTCACATCTTTTGGTCCAAATTGTTT-TTCATTTTCTAA
258 T-TCGAACATTCCAT-GCTCGA-GAAATCACATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTT-A-TTTGTAA
* * * * *
10326 ACAACTTTTGGTCTTTGAATT-AAAATTTTTTTATGTGAGAATAT-TACCTCTCTTTGTTCTTGG
318 ACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTAAGTGAGAAT-TGTATCTCTCTTGGTTCTT-G
10389 ACGAACTTCTGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCG
381 --G-A---C-GAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCG
* * * * * ** **
10437 GCTCCTTAAAGTATTCAAGGCAATCCATTCCTTTGAG-CAGTTTTACGAACATTCCATGCTCGGG
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGACA-TTTCCCGAACATTCCATGCTC-TA
** * * * * * *
10501 AAATAACAT-TATTTGGTCCAAATAGTTT-TTA-CTTGGAAATAATTTTTTGTCTTTGAATTAAA
64 AAATCGCATCT-TTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAA
* * * *
10563 AACTTATTCACGTGAGAATTTTATCTCTCTTGGTT-TT--TCG-A---T-GAACTGGTCAAACTT
128 AACTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTTCGAACTTGTCAAACTT
* * * * * * * *
10620 TGACGAGTTCTTTTATAATTTTGGTTCCTTAAAATTTTCAAGTCGATGCTTTCCTTCGAG-ACAT
193 TTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGCA-AT
* * * * *
10684 TTCTCGAAAATTCCATGCTCGGGAAATCGA-ATCTTTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGAAAA
257 TT-TCGAACATTCCATGCTCGAGAAATC-ACATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTTA-TTTGTAAA
* * *
10748 CAACTTTTGGTCTTCGAATTAAAACCTTATTTACA-TGAGAATTGTATCTCTCTTGTTTCTTAGA
319 CAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTA-AGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTT-G-
* * *
10812 TGAACTTCCAAACTTGTCAAACATTTACGAGTTCTTTTATAACTTCT
381 -G-A----CGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCG
* * * * ***
10859 GTTCCTTATAGTATTCAAGACGATACTTTCCTTCGAG-CAATTTCTCGAACGTTCCATGCTAGGG
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGAC-ATTTCCCGAACATTCCATGCT-CTA
* * *
10923 AAATCACAT-TATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTTTGATTTTTGAATTAAA
64 AAATCGCATCT-TTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAA
**
10987 AACTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTAATGGTTCTT-G--G-A----CGAACTTGTCAAACTT
128 AACTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTTCGAACTTGTCAAACTT
** * *
11044 TTACGAGTTCTTTTATAACTTCAATTCCTTAAAGTATTCAACACGATCCTTTCCTTCGAG-ACAT
193 TTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGCA-AT
* * * * * * *
11108 TTCCCGAACATTTCATGCTCGAAAAATCGCGTCATTTGGTCCAAATAATTTGTCATTTTGTAAA-
257 TT-TCGAACATTCCATGCTCGAGAAATCACATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTTA-TTTGTAAAC
* * * ** * *
11172 ATTCTTTTGCT-TATTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTATCAATCCTGGTTTTTGGA
320 A-ACTTTTGGTCT-TTGAATTAAAAACTTATTTAAGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTT-G-
*
11236 CGAACTTTCGAACTTGTCAAACTTTTACAAGTTCTTTTATAACTTCG
381 -G-A----CGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCG
** ** ** *
11283 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCAATTCCTTCGAG-CTATTTTTCGGGCATTCCATGCTCGAT
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGAC-ATTTCCCGAACATTCCATGCTCTA-
* * * *
11347 AAATCGTATCGTTTGGTCCAAATAGTTTGTC-TTTTGTAACCAACTTTTGGTCTGTGAATTAAAA
64 AAATCGCATCTTTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAA
* * * * *
11411 ACTTATTTACGTGGGAATTTTAACTCTCTTGGTTGTTGGACGAACTTTCAAACTTGTCAAACTTT
129 ACTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTTCGAACTTGTCAAACTTT
* * * * * * *
11476 TACGAGTTCTTTTATAACTTCAGTTCCTAAAAGTATTCAAAATGATTCATTCCTTCAAGCTATTT
194 TACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGC-AATT
** * * * * *
11541 TTTAAACATTTCATGCTTGAGAAATCGCATCATTAGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAA
258 TTCGAACATTCCATGCTCGAGAAATCACATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTTA-TTTGTAAACAA
* *
11606 CTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTATGTGAGAATT-TATCTCTCTTGGTTCTTGGTCGAA
322 CTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTAAGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAA
* ** * * *
11670 CTTGTCAAACATTTAAAACTTCTTTTCTAACTTCA
387 CTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCG
* * * *
11705 GTTCCTT-AAGTATTCAAGACGATGCTTTCGTTCGAGACATTTCTCGAGCATTCCATGCTCTAGA
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGACATTTCCCGAACATTCCATGCTCTA-A
* * *
11769 AGTCGCATCTTTTGGTCCAAATTGTTTTTCATTTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAA
65 AATCGCATCTTTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAA
** * * *
11834 CCGATTTATGTGAGAATAT-TATCTCTCCTGGTTCCTGGACGAACTTTCGAACTTGTCAAACTTT
130 CTTATTTACGTGAGAAT-TGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTTCGAACTTGTCAAACTTT
* * * * * *
11898 TACAAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTCAATGTATTCAAGGCAATCCATTCCTTCAAGCAATTT
194 TACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGCAATTT
* * * * * * * *
11963 TACGAATATTCCATGCTCGGGAAATCACATTATTTGATCCAAATAGTTT-CTACTTGGAAA-ATT
259 T-CGAACATTCCATGCTCGAGAAATCACATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTTATTTGTAAACA-A
* * * * * *
12026 TTTTTTGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTATGTGAGAATTTTATCTCTCTTGATTTTTGGACGAA
322 CTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTAAGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAA
* * *
12091 CTCGTCAAACTTTGACGAGTTCTTTTATAACTTTG
387 CTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCG
*** * * * **
12126 GTTCCTTAAAGTATTCAAGTTAATGCTTTCCTTCGAGACATTTCTCGAAAATTCCATGCTCGGGA
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGACATTTCCCGAACATTCCATGCTC-TAA
* * * * * *
12191 AATTGAATCTTTTGGTCCAAATAGTTTTTCATTTTGAAAACAACTTTTGGTATTAGAATTAAAAA
65 AATCGCATCTTTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAA
* * * *
12256 CTTATTTATGTG-GAAATTTTATCTTTCTTGGTTCCT-G--G-A----CGAACTTGTCAAACTTT
130 CTTATTTACGTGAG-AATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTTCGAACTTGTCAAACTTT
* * * * *
12312 TACGAGTTCTTTTATAACTTCAGTTCCTTAAAGTATTCAAGATGATTCATTCCTTCAAGCTATTT
194 TACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGCAATTT
* ** *
12377 TCTGAACATTTCATGCTCGAGAAATCGTATCATTTGGTCCAAATAGTTT-TTCATTTTTTAAACA
259 TC-GAACATTCCATGCTCGAGAAATCACATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTT-A-TTTGTAAACA
* * *
12441 ACTTTTGGTCTTTTAATTAAAAACTTATTTATGTGGGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGA
321 ACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTAAGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGA
* ** * *
12506 ACTTGTCAAACATTTAAAACTTCTTTTCTAACTTCG
386 ACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCG
* * *
12542 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGACATTTCCCGAGCACTCCATGTTC-AGG
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGACATTTCCCGAACATTCCATGCTCTA--
* * * * * *
12606 AAGTCACATCTTTTGGTCCAAATTGTTTTTCATTTTCTAAACAACTTTTGGTCTATGAATTAAAA
64 AAATCGCATCTTTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAA
* * * *
12671 ACTTTTTTATGTGAGAATAT-TACCTCTCCTT-GTTCTTGGACAAAC-TTCTGAACTTGTCAAAC
129 ACTTATTTACGTGAGAAT-TGTATCTCT-CTTGGTTCTTGGACGAACTTTC-GAACTTGTCAAAC
* * * *
12733 TTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGCTCCTTAAAGTATTCAAGGCAATCCATTCCTTCGAGCAG
191 TTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGCAA
* * * ** * * *
12798 TTTTACAAACATTCCATGCTCGGGAAATGATGTTA-TTGGTCCAAATAGTTT-TTACTTGGAAAC
256 TTTT-CGAACATTCCATGCTCGAGAAATCACATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTTATTTGTAAAC
* * * * * * *
12861 AAATTTTTGCCTTTGTATTAAAAACTTATTCACGTGAGAATTTTATCTCTCTTGGTTCTTGGACG
320 AACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTAAGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACG
* * *
12926 AACTAGTCAAACTTTGACGAGTTCTTTTATAACTTTG
385 AACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCG
* * * * * *
12963 GTTCCTTAAAGTATTCAAGTCGATGCTTTCCTTCGAGACATTTCTCGAAAATTTCATGCT-TGGG
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGACATTTCCCGAACATTCCATGCTCT--A
* * * * *
13027 AAATCGAATCTCTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGAAAACAACTTTTGGTCTTCGAATTAAGA
64 AAATCGCATCTTTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAA
* * * * * * * * *
13092 CCTTACTTACGTGAGAATTGTATCTCTCTTGTTTCTTAGATGAACTTCCAAACTTGTCCAACATT
129 ACTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTTCGAACTTGTCAAACTTT
* * * *
13157 TACGAGTTCTTTTATAACTTCTGTTCCTTACAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTTGAGCAATTT
194 TACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGCAATTT
* *
13222 CTCGAACATTCCATGCTCGAGAAATTACATTATTTGGTCCAAATAGTTT-TTCATTTTGTAAACA
259 -TCGAACATTCCATGCTCGAGAAATCACATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTT-A-TTTGTAAACA
* *
13286 ACTTTTGGT-TTTAGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCATGGTTCTTGGACG
321 ACTTTTGGTCTTT-GAATTAAAAACTTATTTAAGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACG
*
13350 AACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTCCG
385 AACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCG
* * * **
13387 GTTCCTTAAAGTATTCAACACGATCCTTCCCTTCGAGACATTTCCCGAACATTTCATGCTAGAAA
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGACATTTCCCGAACATTCCATGCT-CTAA
* * *
13452 AATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAA-ATTCTTTTGCT-TATTGAATTAAA
65 AATCGCATCTTTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACA-ACTTTTGGTCT-TTGAATTAAA
** * * * *
13515 AACTTATTTACGTGAGAATTGTATCAATCCTAGTTTTTGGACAAACTTTCGAACTTGTCAAACTT
128 AACTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTTCGAACTTGTCAAACTT
** *
13580 TTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATAAATTCCTTCGAGCTATT
193 TTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGCAATT
* * ** * * * *
13645 TTCCTG-GCATTCCATGCTCGATAAATCGTATCGTTTGGTCCAAATAGTTTGTCAGTTGTAACCA
258 TT-C-GAACATTCCATGCTCGAGAAATCACATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTTATTTGTAAACA
* * *
13709 ACTTTTGGTCTTTAAATTAAAAACTTATTTACA-TG-GAATTTTATCTCTCTTGGTTGTTGGACG
321 ACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTA-AGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTT-G--G
*
13772 AACTTTCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCA
382 -A----CGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCG
* * * * * * **** * *
13817 ATTCTTTAAAGTATTCAAGATGATTCATTCCTTCAAG-CTATTTTTTAAACATTTCATGCTCGAG
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGAC-ATTTCCCGAACATTCCATGCTCTA-
* * *
13881 AAATCGCATCATTTGGTCGAAATATTTTGTCATTTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAA
64 AAATCGCATCTTTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAA
** * * *
13946 ACTTATTTTTGTGAGAATT-TATCTCTCTTAGTACTTGGACG-----T---ACTTGTCAAACATT
129 ACTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTTCGAACTTGTCAAACTTT
** * * * *
14002 TAAAACTTCTTTTCTAACTTCGATTCCTTAAAGTATTC-AGAACGATCCTTTCCTTCGAGACAAT
194 TACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAG-ACGATCCATTCCTTCGAG-CAAT
** * * * * *
14066 TCCCGAGCACTCCATGCTCTG-GAAGTCGCAT-ATTTTGGTCCAAATAATTT-TTCATTTTGTAA
257 TTTCGAACATTCCATGCTC-GAGAAATCACATCA-TTTGGTCCAAATAGTTTGTT-A-TTTGTAA
* * * * *
14128 ACAACTTTTGGTATTTTAATTAAAAACTTATTTATGTGAGAATAT-TATCTCTCCTGGTTCATGG
318 ACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTAAGTGAGAAT-TGTATCTCTCTTGGTTCTTGG
* * *
14192 ATGAACTTCCTAACTAGTAAAACTTTAACGAGTTCTTTTATAACTTCG
382 ACGAA----CT---T-GTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCG
* * * * * ***
14240 GTTCCTCAAAGTATTCAAGGCAATCCATTCCTTGGAG-CAATTTTATGAACATTCCATGCT-TAG
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGAC-ATTTCCCGAACATTCCATGCTCT--
* * * * * *
14303 AAAATCACAT-TATTTGGTCCAAATAGTTT-TTA-CTTGGAAACAAATTTTTGTCTTTGAATTAA
63 AAAATCGCATCT-TTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAA
* * *
14365 AAACTTATTCACGTGAGAATTTTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAAC--T-G-----GTCAATCT
127 AAACTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTTCGAACTTGTCAAACT
* * * * * *
14422 TTGACGAGTTCATTTATAACTTTGGTTCCTTAAAGTATTCAAGTCGATGCTTTCCTTCGAG-ACA
192 TTTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGCA-A
* * *
14486 TTTCTCGAAAATTCCATGCTCTG-GAAATCGA-ATCTTTTGGTCCAAATAGTTTGTTATTTTGAA
256 TTT-TCGAACATTCCATGCTC-GAGAAATC-ACATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTTA-TTTGTA
* * * * * *
14549 AACAACTTTTGGTCTTCGAATTAAAACCTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCCCTTGTTTCATGG
317 AACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTAAGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTC-T--
* * * *
14614 ATGAACTTCCAAACTTTTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCT
379 -TGGA----CGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCG
* * **
14662 GTTCCTTAAAGTATTTAAGACGATCCTTTCCTTCGAG-CAATTTCTCGAACATTCCATGCTCGGG
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGAC-ATTTCCCGAACATTCCATGCTC-TA
* *
14726 AAATCACAT-TATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTTTTGT-TATTGAATTAA
64 AAATCGCATCT-TTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTTTGGTCT-TTGAATTAA
* ** * * * * *
14789 AAACTTATTTACGTGAGAATCGTATCAATCCTGGTTTTTGGATGAACTTTCGAACTTATCAAACA
127 AAACTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTTCGAACTTGTCAAACT
* * * *
14854 TTTATGAGTTCTTTTATAACTTTGGTTCCTTAAAGTATTCAAGATGATCAATTCCTTC-AGGCTA
192 TTTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTCGA-GC-A
* ** ** * *
14918 TTTTTCGGGCATTCCATGCTCGAGAAATCGTATCGTTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAA
255 ATTTTCGAACATTCCATGCTCGAGAAATCACATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTTA-TTTGTAAA
* * * ** *
14983 CAACTTTTGGT-TATTGAATTGAATACTTATTTACGTGAGAATTGTATCAATGC-TGGTTTTTGG
319 CAACTTTTGGTCT-TTGAATTAAAAACTTATTTAAGTGAGAATTGTATCTCT-CTTGGTTCTTGG
*
15046 ACGAAATTTTGAACTTGTCAAACATTTACGAGTTCTTTTATAACTTCG
382 AC--------GAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCG
** ** ** *
15094 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCAATTCCTTCGAG-CTATTTTTCGGGCATTCCATGCTCGAG
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGAC-ATTTCCCGAACATTCCATGCTCTA-
** *
15158 AAATCATAT-TGTTTGGTCCAAATAGTTTGTCA-TTTGTAACCAACTTTTGGTCTTTGAATTAAA
64 AAATCGCATCT-TTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAA
* * * *
15221 AACTTATTTGCATGAGAACTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTT
128 AACTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTTCGAACTTGTCAAACTT
* ** *
15286 TTACGAGTTCTTTTAT-ACTTTTGGTTCCTTAAAGTATTCAAGATTATCCATTCCTTCGATCAA-
193 TTACGAGTTCTTTTATAAC-TTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGCAAT
* * * * *
15349 TTTCAAGAACATTCCATGCTTGATAAATCGCATTATTTGGT-CAAATAGTTTG-T-CTTGTAAAC
257 TTTC--GAACATTCCATGCTCGAGAAATCACATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTTATTTGTAAAC
* * * * * *
15411 AAATTTTGGTCTTTTAATTAAAAACTTATTTACGTGGGAATT-TATCTCTCTCGGTCCTTAGACG
320 AACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTAAGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTT-G--G
**
15475 AACTTTCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTTA
382 -A----CGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCG
* * * * * *** * *
15520 GTTCCTTTAAGTATTCAATATGAT-TTATTCCTTCAAG-CTATTTTTTGAACATTTCATGCTCGA
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCT-TTCCTTCGAGAC-ATTTCCCGAACATTCCATGCTCTA
15583 GAAATCGCAT-TATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAA
64 -AAATCGCATCT-TTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAA
* *
15647 AAACTTATTTATGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAAC--T-----TT-TCAAACA
127 AAACTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTTCGAACTTGTCAAACT
** * * * * *
15704 TTTAAAACTTCTTTTCTAACTTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCATTTGAG-ACA
192 TTTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGCA-A
* * * * * *
15768 TTTCCCGAGCATTCCATGCTCTG-GAAGTCTCATCTTTTGGTCCAAATTGTTT-TTCATTTTGTA
256 TTT-TCGAACATTCCATGCTC-GAGAAATCACATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTT-A-TTTGTA
* * * *
15831 AACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACCTATTTATGTGAGAATAT-TATCTCTCCTAGTTCTTG
317 AACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTAAGTGAGAAT-TGTATCTCTCTTGGTTCTT-
15895 GACGAACTTTCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCG
380 G--G-A----CGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCG
* * * * * ** **
15944 GTTCCTAAAAGTATTCAAGGCAATCCATTCCTTCAAG-CAATTTTACGAACATTCCATGCTCGGG
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGAC-ATTTCCCGAACATTCCATGCTC-TA
* *
16008 AAATCACAT-TATTTGG-----A-A-------A-----T--A-AA-TTTTTGTCTTTGAATTAAA
64 AAATCGCATCT-TTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAA
* *
16050 AACTTATTTACATGAGAATTTTATCTCTCTTGGTTCTT--A-G-A---T-GAACTTGTCAAACTT
128 AACTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTTCGAACTTGTCAAACTT
* * * * * * *
16107 TGACGAGTTGTTTTATAACTTTGGTTCCTTAAAGTATTCAGGTCGATGCTTTCCTTCGAG-ACAT
193 TTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGCA-AT
* * * *
16171 TTCTCGAAAATTCCATGCTCGAGAAATCGA-ATCTTTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGAAAA
257 TT-TCGAACATTCCATGCTCGAGAAATC-ACATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTTA-TTTGTAAA
* * *
16235 CAACTTTTGGTCTTCGAATTAAAACCTTATTTAAGTGAGAATTGTATCTCTCTTGTTTCTTGGAT
319 CAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTAAGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTT-G--
* **
16300 GAATTTCCAAACTTGTCAAACTTTTACGAGCTT-TTTTATAACTTTT
381 G-A----CGAACTTGTCAAACTTTTACGAG-TTCTTTTATAACTTCG
* * * *
16346 GTTCCTTAAAGTATTCAAGGCGATCCTTTCCTTCGAG-CAATTTCTCAAACATTCCATGCTCGAG
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGAC-ATTTCCCGAACATTCCATGCTCTA-
* * *
16410 AAATCACAT-TATTTGGTCCAAATAGTTTATCATTTTGTAAACAAC-TTTGGT-TATTGAATTGA
64 AAATCGCATCT-TTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTTTGGTCT-TTGAATTAA
* ** * * * *
16472 AAACTTATTTATGTGAGAATTGTATCAATCCTGGTTTTTGGATGAACTTTCGAACTTATCAAACT
127 AAACTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTTCGAACTTGTCAAACT
* *
16537 TTTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCAATTCCTTCGAGCTAT
192 TTTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGCAAT
** * ** * * *
16602 TTTCTGGGCATTCCATGCTCAAGAAATCGTATCGTTTGGTCCAAATAGTTT-TTCATTCGTAACC
257 TTTC-GAACATTCCATGCTCGAGAAATCACATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTT-ATTTGTAAAC
*
16666 AACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACA-TGTGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGAC
320 AACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTA-AGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGAC
*
16730 GAACTTTCGATATTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTAT-ACTTTTG
384 GAA----C----TTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAAC-TTCG
*
16776 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTC
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTC
16810 AAGCAATTTC
Statistics
Matches: 12977, Mismatches: 2366, Indels: 1670
0.76 0.14 0.10
Matches are distributed among these distances:
397 1 0.00
398 1 0.00
399 1 0.00
400 1 0.00
401 5 0.00
402 330 0.03
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440 16 0.00
441 16 0.00
442 32 0.00
443 5 0.00
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462 1 0.00
463 2 0.00
464 1 0.00
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466 6 0.00
467 35 0.00
ACGTcount: A:0.28, C:0.18, G:0.14, T:0.40
Consensus pattern (421 bp):
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TTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTTCGAACTTGTCAAACTTTTA
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GAACATTCCATGCTCGAGAAATCACATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTTATTTGTAAACAACTTT
TGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTAAGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTG
TCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCG
Found at i:1557 original size:208 final size:210
Alignment explanation
Indices: 206--16023 Score: 9669
Period size: 216 Copynumber: 74.4 Consensus size: 210
196 TACGTATCAA
* *
206 GTTCCTTAAAGTATTCAACACGATCCTTTCCTTCGAG-ACATTTCCCGAACATTCCATGCTCGAA
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGCA-ATTTCCCGAACATTCCATGCTCGAG
* * **
270 AAATCGAATTATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTCGTAAACAACTTTTGGTTATTGAATTAAAA
65 AAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTATAAACAACTTTTGGTT-TTGAATTAAAA
* * ** * *
335 ACTTATCTACGTGAGAATTGTATCAATCCTGGTTTTTGGACGAACATTCGAACTTGTCAAACTTT
129 ACTTATTTACATGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTT-G--G-A-ATTCGAACTTGTCAAACTTT
* *
400 TACGAGGTCTTTTATAACTTTG
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* * * * * *
422 GTTCCATAAAGTATTCAAGACGATCCATTT-ATTCGAGCTATTTTCCGAGCATTCCATGCTTGAG
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* * * * *
486 AAATCGCATTATTTGGTCCAAAGAGTTT-TACA-TTTGTAACCAACTTTTGGTCTTCGAATTAAA
65 AAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGT-CATTTTATAAACAACTTTTGGT-TTTGAATTAAA
* * * * **
549 AACTTATTT-CTTGAGAATTGAATCTCTCTTGGTTCTTGG-A--CGAACTTTTCAAACATTTAAA
128 AACTTATTTACATGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGAATTCGAACTTGTCAAACTTTTACG
* *
610 ACTTCTTTTCTAACTTCG
193 AGTTCTTTTATAACTTCG
* * *
628 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCG-GGACATTTCCCGATCATTCCATGCTCTA-
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGCA-ATTTCCCGAACATTCCATGCTCGAG
* * * * *
691 AAAGTCGCATCTTTTGGTCCAAATTGTTTTTCACTTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAA
65 AAA-TCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTATAAACAACTTTTGGT-TTTGAATTAAA
* ** * *
756 AGCTTATTTATGTGAGAATAT-TATTTCTCCTGGTTCTTGGACGAACTTTCGAACTTGTCAAACT
128 AACTTATTTACATGAGAAT-TGTATCTCTCTTGGTTCTT-G--GAA--TTCGAACTTGTCAAACT
* *
820 TTTACGAGTTCTTTTATTACTTTG
187 TTTACGAGTTCTTTTATAACTTCG
* * * * * **
844 GTTCCTCAAAGTATTCAAGGCAATCCATTCCTTCAAGCAATTTTACGAACATTCCATGCTCGAGA
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGCAATTTCCCGAACATTCCATGCTCGAGA
* * * * ** * ****
909 AATCACATTATTTGGTCCAAATAGTTT-TTA-CTTGGAAACAAATTTTTCCCCTTGAATTAAAAA
66 AATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTATAAAC-AACTTTTGGTTTTGAATTAAAAA
* * *
972 CTTATTTA-AGTGAGAATTTTATCTCTCTTGGTTCTT-GAA--CGAACTTGTAAAACTTTGACGA
130 CTTATTTACA-TGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGAATTCGAACTTGTCAAACTTTTACGA
*
1033 GTTCTTTTATAACTTTG
194 GTTCTTTTATAACTTCG
* * * * *
1050 GTTCCTTAAAGTATTCAAGTCGATGCTTTCCTTCGAG-ACATTTCCCAAAAATTACATGCTCGAG
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGCA-ATTTCCCGAACATTCCATGCTCGAG
* * * *
1114 AAATCGAATCTTTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGA-AAATAACTTTTGGTCTTCGAATTAAA
65 AAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTT-ATAAACAACTTTTGGT-TTTGAATTAAA
* * * *
1178 ACCTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCTTGTTTCTTGGATGAACTTCCAAACTTGTCAAACTT
128 AACTTATTTACATGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTT-G--GAA-TT-CGAACTTGTCAAACTT
* *
1243 TTACGAGTTC-CTTATAACTTCT
188 TTACGAGTTCTTTTATAACTTCG
* * *
1265 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTTGAGCAATTTCTCGAACATTCCATGCTCGGGA
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGCAATTTCCCGAACATTCCATGCTCGAGA
* * * *
1330 AATCACATTATTTGGTCCAAATAGTTTGTTATTTTATATACAACTTTTGGTTTTCGAATTAAAAA
66 AATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTATAAACAACTTTTGGTTTT-GAATTAAAAA
* * *
1395 CTTATTTACATGAGAATTGTATCTCTCATGGTTCTT-G-A-TCAAACTTGTCAACCTTTTACGAG
130 CTTATTTACATGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGAATTCGAACTTGTCAAACTTTTACGAG
1457 TTCTTTTATAACTTCG
195 TTCTTTTATAACTTCG
* * * *
1473 GTTCCTTAAAGTATTCAACACGATCCTTTCCTTCGAG-ACATTTCCCAAACATTCCATGCTCAAA
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGCA-ATTTCCCGAACATTCCATGCTCGAG
* *
1537 AAATTGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTTTGGTTATTGAATTAAAA
65 AAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTATAAACAACTTTTGGTT-TTGAATTAAAA
** * *
1602 ACTTATTTACATGAGAATTGTATCAATCCTGGTTTTTGGACAAACTTTCGAACTTGTCAAACTTT
129 ACTTATTTACATGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGG---AA--TTCGAACTTGTCAAACTTT
1667 TACGAGTTCTTTTATAACTTCG
189 TACGAGTTCTTTTATAACTTCG
* * ** * ** ** *
1689 ATTCCTTAAAGTATTCAAGACAATCAATTCCTTCGAGCTATTTCTTGGGCATTCCATGCTTGAGA
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGCAATTTCCCGAACATTCCATGCTCGAGA
* * * * * *
1754 AATCGTATCGTTTGGTCCAAATAGTTTTTCA-TTTGTAACCAACTTTTGGTCTTTTAATTAAAAA
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* *
1818 CTTATTTACATGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTTTGAACTCGTCAAACTTTT
130 CTTATTTACATGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTT-G--GAA--TTCGAACTTGTCAAACTTTT
*
1883 ACGAGTTCTTTTAT-ACTTTTG
190 ACGAGTTCTTTTATAAC-TTCG
* * * *** *
1904 GTTCCTTAAA-TATACAAGACGATCCATTCCTTCGATCAATTTTAAGAACATTCCATGCTCGATA
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* * * * *
1968 AATCGCATTATTTGGTCCAAATAGTTTGTC-TTGTA-AAA-AAATTTCGGTCTTTGAATAAAAAA
66 AATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTATAAACAACTTTTGGT-TTTGAATTAAAAA
* *
2030 CTTATTTACGTGAGAATTTTATCTCTCTTGGTTCTTGGACTAACTTTCGAACTTGTCAAACTTTT
130 CTTATTTACATGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGG---AA--TTCGAACTTGTCAAACTTTT
*
2095 ACAAGTTCTTTTATAACTTCG
190 ACGAGTTCTTTTATAACTTCG
* * * * * * * ** *
2116 GTTCCTTAAAGTATTTAAGATGATTCATTCCTTCAAGCTATTTTCTAAACATTTCATGCTCGAGA
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGCAATTTCCCGAACATTCCATGCTCGAGA
* *
2181 AATTGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAA
66 AATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTATAAACAACTTTTGGT-TTTGAATTAAAAA
** *
2246 CTTATTTATGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGG-A--CGAACTTGTCAAACATTTA-GAA
130 CTTATTTACATGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGAATTCGAACTTGTCAAACTTTTACG-A
* *
2307 CTTCTTTTCTAACTTCG
194 GTTCTTTTATAACTTCG
* *
2324 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCGTTCGAG-ACATTTCCCGAGCATTCCATGCTCTG-
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGCA-ATTTCCCGAACATTCCATGCTC-GA
* * * * *
2387 GAAGTCGCAT-ATTTTGGTCCAAATTGTTTTTCATTTTTTAAACAACTTTTGGACTTTGAATTAA
64 GAAATCGCATCA-TTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTATAAACAACTTTTGG-TTTTGAATTAA
* *
2451 AAACATATTT-CTGTGAGAATAT-TATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTTCGAACTTGTCAAA
127 AAACTTATTTAC-ATGAGAAT-TGTATCTCTCTTGGTTCTT-G--GAA--TTCGAACTTGTCAAA
* *
2514 CTTTTACAAGTTCCTTTATAACTTCG
185 CTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCG
* * * *** *
2540 GTTCCTTAAAGTATTCAAGGCAATCCATTCCTTCGAGCAATTTTATGAACATTCCATGCTCGGGA
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGCAATTTCCCGAACATTCCATGCTCGAGA
* * * * ** * * *
2605 AATCACATTATTTGGTCCAAATAGTTT-TTA-CTTGGAAACAAATTTTTGTCTTTAAATTAAAAA
66 AATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTATAAACAACTTTTGGT-TTTGAATTAAAAA
* * * * *
2668 CTTATTTACGTGAGAATTTTATCTCTCTTGGTTCTTGG-A-T-GAACTAGTCAAACTTTGACGAT
130 CTTATTTACATGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGAATTCGAACTTGTCAAACTTTTACGAG
*
2730 TTCTTTTATAACTTTG
195 TTCTTTTATAACTTCG
* * * *
2746 GTTCCTTAAAGTATTCAAGTCGATGCTTTCCTTCGAG-ACATTTCTCGAAAATTCCATGCTCGAG
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGCA-ATTTCCCGAACATTCCATGCTCGAG
* *
2810 AAATCGAATCTTTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGA-AAACAACTTTTGGTTTTCGAATTAAA
65 AAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTT-ATAAACAACTTTTGGTTTT-GAATTAAA
* * * *
2874 ACCTTAGTTACATGAGAATTGCATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTTCAAACTTGTCAAACTT
128 AACTTATTTACATGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTT-G--GAA--TTCGAACTTGTCAAACTT
* *
2939 TTACGAGTTCTTTTATAAATTCA
188 TTACGAGTTCTTTTATAACTTCG
* * * * * **
2962 GTTCCTTAAAGTATTCAAGATGATCCATTCATACGAGCTATTTTTCGAACATTCCATGCTCGAGA
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGCAATTTCCCGAACATTCCATGCTCGAGA
* * * ** * *
3027 AATCACATCATTTTGTCCAAATAGTTTGCCATTTTGCAAACAACTTGTGGTTTTTGGATTAAAAA
66 AATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTATAAACAACTTTTGG-TTTTGAATTAAAAA
** * * * *
3092 CTTATTTATGTGAGAATT-TATCTCACCTGGTTCTTGG---GCGAACTTCTCAAACTTTTACGAG
130 CTTATTTACATGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGAATTCGAACTTGTCAAACTTTTACGAG
*
3153 TTCTTTTATAACTTCT
195 TTCTTTTATAACTTCG
* * * * * * * * **
3169 GTTCATTAAAGCATTCAAAACAATCATTTCCTTCTAG-ACATTTCCCTATCATTCCATG-TTTAG
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGCA-ATTTCCCGAACATTCCATGCTCGA-
* *
3232 GAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTGTCTAAACAACTTTTGGTCTTT-AATTCAA
64 GAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTATAAACAACTTTTGGT-TTTGAATT-AA
* * * * * *
3296 AAACATATTTACGTGAGAACTGTATCTCTCCTGGTTCTTGGACAAACTTCTGAACCTGTCGAACT
127 AAACTTATTTACATGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGG---AA-TTC-GAACTTGTCAAACT
* *
3361 TTTATGAGTTCTTCTATAACTTCG
187 TTTACGAGTTCTTTTATAACTTCG
* * * * * *
3385 GTTCCTTAAAGTATTCAAGATGATCCATTCCTTCGAGCTATTT-TCGAGCATTCCATGCTCAAGA
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGCAATTTCCCGAACATTCCATGCTCGAGA
* * *
3449 ATTCACATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCA-TTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATT-AAAA
66 AATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTATAAACAACTTTTGGT-TTTGAATTAAAAA
3512 CTTATTTACATGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGG-A-T-GAACTTGTCAAACTTTTACGAG
130 CTTATTTACATGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGAATTCGAACTTGTCAAACTTTTACGAG
3574 TTCTTTTATAACTTCG
195 TTCTTTTATAACTTCG
* * * * *
3590 GTTCCTTAAAGTATTCAAAACGATCCATTT-CTTCTAGCTATTTTCCGAACATTCCATGCTTGAG
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCC-TTTCCTTCGAGCAATTTCCCGAACATTCCATGCTCGAG
* * ** *
3654 AAATCACATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTTTGGCCATTGAATTTAAA
65 AAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTATAAACAACTTTTGG-TTTTGAATTAAAA
* * * * *
3719 ACTTATTTA-AGTAAGAATTGTTTCAT-TTTTTGTTCTTGGACGAACATTCGAACTTGTCAAACA
129 ACTTATTTACA-TGAGAATTGTATC-TCTCTTGGTTCTT-G--G-A-ATTCGAACTTGTCAAACT
* * *
3782 TTTAAGAGTTCTTTTATAATTTTG
187 TTTACGAGTTCTTTTATAACTTCG
* * * * * * * *** *
3806 ATTCCTTATAGTATTCATGATGATCCATTCCTTCAAGGAACTTTTTTGAGCATTCCATGCTC-AG
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGCAA-TTTCCCGAACATTCCATGCTCGA-
* * *
3870 GAAATCGCATCATCTT-GTCCAAATA-TTTTTCCA-TTTGTAAACAACTTTTGGTATTTAAATTA
64 GAAATCGCATCAT-TTGGTCCAAATAGTTTGT-CATTTTATAAACAACTTTTGGT-TTTGAATTA
* * * * * *
3932 AAATCTTATTTA-ATTGGGAATTGTTTTTCTCTTGATTCTTGGACGAACTTTCGAACCTGTCAAA
126 AAAACTTATTTACA-TGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTT-G--GAA--TTCGAACTTGTCAAA
* * *
3996 GTTTTACAAGTTCTTTTATAACTTCA
185 CTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCG
* * * * * * * *
4022 GTTCCTTAAAGTATTCTAGACGATCCTTTCCTTTGAGCAATATCACAAAAATTCCATGCTTGGGA
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGCAATTTCCCGAACATTCCATGCTCGAGA
* * *
4087 AATCGCATAATTTGGTCCAAATAGTTTGTTATTTTATAAACAAGTTTTGGTCTTTGAATTAAAAA
66 AATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTATAAACAACTTTTGGT-TTTGAATTAAAAA
*
4152 CTTATTTACATGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGATGAACTTTCGAACTTATCAAACTTTT
130 CTTATTTACATGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTT-G--GAA--TTCGAACTTGTCAAACTTTT
* * *
4217 ATGAGATCTTTTATAACTTCA
190 ACGAGTTCTTTTATAACTTCG
* * * * * *
4238 GTTCCTTAAAGTATTCCAGACGATCCTTTCCTACGAGTAGTTTCCCGACCATTCCATGCTCGGGA
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGCAATTTCCCGAACATTCCATGCTCGAGA
** * * * *
4303 AATCAAATTATTTGGTCCAAATAGTTTGTCAATTTGTAAACAACTTTTTGTCTTTGAATTAAAAA
66 AATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTATAAACAACTTTTGGT-TTTGAATTAAAAA
*
4368 CTTATTT--ATGAGAGTATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGG-A--CGAACTTGTCAGACTTTTACG
130 CTTATTTACATGAGA--ATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGAATTCGAACTTGTCAAACTTTTACG
* * *
4428 ACTTCTTTCATAACTTCA
193 AGTTCTTTTATAACTTCG
* * ** * * * *
4446 GTTCCATAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTTGAG-ACATTTTACGAACATACAATGCTTGGG
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGCA-ATTTCCCGAACATTCCATGCTCGAG
* * ***
4510 AAATCGCATCATTTGGGT-CAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAAATTTTGGTCTTTTTGTTAAA
65 AAATCGCATCATTT-GGTCCAAATAGTTTGTCATTTTATAAACAACTTTTGGT-TTTGAATTAAA
* * *
4574 AACTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCCGAACTCGTCAAAGTT
128 AACTTATTTACATGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTT-G--GAA-TT-CGAACTTGTCAAACTT
4639 TTACGAGTTCTTTTATAACTTCG
188 TTACGAGTTCTTTTATAACTTCG
* * * * * **
4662 GTTCCTTAAAGTATGCTAGACGATCCTTTCCTTCGAGCAATTTCACAAACATTCCAT-TTAATAT
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGCAATTTCCCGAACATTCCATGCT-CGA-
* * * * * * * *** *
4726 GTCCTAACCAGCATGTTTAATTT-GTCTTAGGGATA-TCAATGGC-TGGCCA-ACACAAGC-TTT
64 G---AAATC-GCA----TCATTTGGTC-CA--AATAGT--TTGTCAT-TTTATAAACAA-CTTTT
** ** * * * *** ****** *
4786 --TAATGCACCTACAAAC--ATTTAAAGTGCTGAA-AACA-C-CTCTT-CAAAAGGGCATTTCAT
114 GGTTTTG-AATTAAAAACTTATTTACA-TG-AGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGG-AATTC--
* * *** * * *
4843 GATC-AG-CAAAGGAATT-CAATGTTCTCTTCATGCATGACTAATTG
173 GAACTTGTCAAA-CTTTTACGA-GTTCT-TT--T--ATAACT--TCG
* * * * *** ** *** * * *** * *
4887 GTTTCATCAAAGGT-CTCAAG--G-TAC-TTAAAT-GCTCAA-AGGCTGATCATGGGA-ACACGA
1 G-TTCCTTAAA-GTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGCAATTTCCCGAACATTCCATGCTCGA
* * * * * * * * * **
4944 -AAAGTGGC-T-GTTCGGGTTACTCAAA-A----ATCATTAATACACCAACCACATTT--ATTCC
64 GAAA-TCGCATCATT-TGG-T-C-CAAATAGTTTGTCATT-TTATA--AACAACTTTTGGTTTTG
* * *** * * * **** **
4999 AAGTGCATGAGAACTTCAGCCGAATTTA-A--AGAACACT-TCT-TCCTAG-CCAACCAAGCACT
121 AA-T---TAAAAACTT-------ATTTACATGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGAA-TTC-
* * * * * * ** *** **
5058 AAATTTGGCCAACTATTCCATTGAAGCAACCACCATATTAACTTAAA
173 GAACTTGTCAAACT-TT-TA-CG-AG--TTC-TTTTA-TAACTT-CG
* * * * ** * * * * **** * **
5105 GTGCATCGAGAA-TATT-GA-AC-A-AATTT--ATGGTGTAATTTTTTTAAATTATTTTATGACT
1 GTTCCT-TA-AAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGCAA-TTTCCCGAA-CATTCCATG-CT
**** * * * *
5163 TTTCAACT-G-GTCATTT-GTAAGCCTATAAATATGAGGCTTG-CAATATTTTGTTAAA-AACCT
61 CGAGAAATCGCATCATTTGGT---CC----AA-AT-A-GTTTGTC---ATTTT-ATAAACAA-CT
** * * * * * * *
5223 TTT-G--AAGAATTTAAATCTTA-TT--GTGAG-TTTGCAAACTC-CTT-GTTCTT---ATTTG-
111 TTTGGTTTTGAATTAAAAACTTATTTACATGAGAATTG-TATCTCTCTTGGTTCTTGGAATTCGA
* * * * * *
5275 AC---TCAAA-TTGACTTATCAAGTAACCCTTGTAGCATCAATCTG
175 ACTTGTCAAACTT---TTA-CGAGT---TCTTTTA-TAAC-TTC-G
* * * * * * * ** * * ** * **
5317 ATTCTTTCGAACT-TATCACTACATTGAAGT-GTGACGTTC-ACCCTTTTACC-AATTGGTTCCT
1 GTTCCTT-AAAGTAT-TCA--AGA-CG-A-TCCTTTCCTTCGAGCAATTTCCCGAA--CATTCC-
* * ** ** * * * * * * * * *
5378 AT-CTTTCTAGATAGAGGGTCA--CGGTTC--TTA-CTTG-CAATTCGTTCTAAGAATAAATATA
56 ATGC--TCGAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTC-ATT--TTAT-A-AACAACTTTT
** * ** * ** * * * * * **
5436 GGAATCG-GGTCAGTA-TTCTTT-TAT-A-ATATTGGACCAT-TCTTGAGTCCTTAAACCAAGTT
114 GGTTTTGAATTAAAAACTTATTTACATGAGA-ATTGTATC-TCTCTTG-GTTCTT---GGAA-TT
* *** * * * *
5495 C-AAGCTTATCCTTC-TTTATCCA-TTGC--ATAT-CCATC-
172 CGAA-CTTGTCAAACTTTTA-CGAGTT-CTTTTATAACTTCG
** * * * * * ** * * *
5530 CATCCAT-CATTCTACAACCCG--CCATTATCATTTC---CAACTGTCACGAA-A-TCCAT--TA
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCC-TT-TC-CTTCGAGCAA-TTTCCCGAACATTCCATGCT-
** * * * ** * * * ** * * ** * *
5585 CGA-ACGGTACGTCTTAATTTTGATAGGGAACTCG--TG-CGA-CTCGTAATCATCCCTCGAG-G
61 CGAGA-AAT-CG-CATCA-TTTGGT--CCAAATAGTTTGTC-ATTTTATAAACAACTTTTG-GTT
* * *** * * * * * * * * * * ***** * **
5644 ATGATTTCGCATC-AATTTGGTCA--AAAATAGTTTGTGTTTTTG-TAAACAATATTTGGTCTT-
118 TTGAATTAAAAACTTATTT--ACATGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGA-ATTCGAACTTG
* * ** * * * *
5704 T-GAA--TTAAAAACTTATTTACGTAAAAATT-G
180 TCAAACTTTTACGAGTTCTTT---TATAACTTCG
* ** * ** * * * * **** *
5734 TTTCTCTT-TTG-GTTCTTGGACGA-ACTTTCGAACTTGCCAAACTTATTAAATGAGCATTCCAT
1 GTTC-CTTAAAGTATTC-AAGACGATCCTTTC---CTT--CGAGC-AATTTCCCGAACATTCCAT
* *
5796 GCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCTTTTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGA
58 GCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTATAAACAACTTTTGGT-TTTGA
* * *
5861 ATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCCTGGTTCTTGGATGAACTTTCGAACCTGTC
122 ATTAAAAACTTATTTACATGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTT-G--GAA--TTCGAACTTGTC
5926 AAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCG
182 AAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCG
** * * * * ** ** **
5955 GTTATTTAAAATATTCAAGACGATCCATTCCTTTGAGCTATTTTTCGGGCATTCCATGCTTTAGA
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGCAATTTCCCGAACATTCCATGCTCGAGA
* *
6020 AATTGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCA-TTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAA
66 AATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTATAAACAACTTTTGGT-TTTGAATTAAAAA
* *
6084 CTTATTTACATGAGAATTGTGTCTCTCTTGGTTCTTGG-A--CAAACTTGTCAAACTTTTACGAG
130 CTTATTTACATGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGAATTCGAACTTGTCAAACTTTTACGAG
*
6146 TTCTTTTATAACTTCA
195 TTCTTTTATAACTTCG
** * * * * * *
6162 ACTCCTTAAAATATTCAAGATGATCCATTCCTTTGAGCTACTTT-CCGAACATTCCATGCTAGAG
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGC-AATTTCCCGAACATTCCATGCTCGAG
* *
6226 AAATTGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATT-AAA
65 AAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTATAAACAACTTTTGGT-TTTGAATTAAAA
* * * * * * *
6290 ACTTATTTACGTAAAAATTGTTTCCCTTTTGGTTCTTGGACGAACATCCGAACTTGTCAAACTTT
129 ACTTATTTACATGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTT-G--G-A-ATTCGAACTTGTCAAACTTT
* * *
6355 TATGAGTTATTTTATAACTTTG
189 TACGAGTTCTTTTATAACTTCG
* * * * * * * * * * *
6377 ATTCCTTAGAGTATTCATGATGATCCATTCCTTTGAGGAATCTT-TCTAGCATTCCATGCTCTAG
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGCAAT-TTCCCGAACATTCCATGCTCGAG
* * *
6441 AAATCACATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTATAAACAACTTTCGGTCTTCGAATTAAAA
65 AAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTATAAACAACTTTTGGT-TTTGAATTAAAA
* * * *
6506 ACTTAATTACGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGCTCTTGGACGAACTTCCAAACTTGTCAAACTTT
129 ACTTATTTACATGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTT-G--GAA-TT-CGAACTTGTCAAACTTT
*
6571 TACGAGTTCTTTTAT-ACTTTTG
189 TACGAGTTCTTTTATAAC-TTCG
* * * ** * *
6593 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACTATCCTATCCTTTGAGCAATTTAACAAACATTCCATGCTTGAGA
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGCAATTTCCCGAACATTCCATGCTCGAGA
* * ** **** ** * * * * * *
6658 AATTGCATTATTTGGTAGAAATTCCATGCTCA--GGA-AATC-AC-ATT--ATTTG-GTCCAAAT
66 AATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTG-TCATTTTATAAACAACTTTTGGTTTTGAAT-TAAAA
* * * * * * * ** *
6715 AGTT-TGT-CAT----TTTGTAAACAACTTTTGGTT-TTAGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGA
129 ACTTATTTACATGAGAATTGT-ATC-TCTCTTGGTTCTTGGAATT-CGAAC----TT--GTCA-A
* ** *
6773 ATCGTATCTCTCATG-GTTCTTGGACGAACTT--
184 A-C-T-T-T-T-ACGAGTTCTTTTA-TAACTTCG
* * * * ** ** * * *
6804 G-TCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATA-AC-TTCGGTTCCTTAAAG-TA-TTCAACACGATCCTT
1 GTTC---C--TTA-AAG-T-ATTCA-AGACGATCCTTTCCTTCGAGCAATTTC--C-CGA-ACAT
* * * * *
6864 TCC-T--TCGAGACATTTC-CTGAACATTCCATGCTCGAAAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAG
53 TCCATGCTCGAGA-A-ATCGC--ATCATT---TGGTC--CAAAT---A--GTTT-GT-C----A-
* ** * *
6925 TTTGTCATTTTGTAAACAACTTTTGGTTATTGAATTAAAAACATATTTATGTGAGATTTGTATCA
97 TTT-T-A-----TAAACAACTTTTGGTT-TTGAATTAAAAACTTATTTACATGAGAATTGTATCT
* * * *
6990 ATCCTGGTTTTTGGACGAACTTTCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAAATTCG
154 CTCTTGGTTCTT-G--GAA--TTCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCG
** * * * * **
7052 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCAATTCCTTCGATCTATTTTCTGGGCATTCCATGCTCGAGA
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGCAATTTCCCGAACATTCCATGCTCGAGA
* * * * * **
7117 AATCGTATCGTTTTGTCAAAATAGTTTGTCA-TTTGTAGCCAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAA
66 AATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTATAAACAACTTTTGGT-TTTGAATTAAAAA
* *
7181 CTTATTTACATGAGAATTGTACCTCTCTTGGTTCTCGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTT
130 CTTATTTACATGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCT-TG--GAA-TT-CGAACTTGTCAAACTTTT
*
7246 ACGAGTTCTTTTAT-ACTTTTG
190 ACGAGTTCTTTTATAAC-TTCG
* * ** * *
7267 GTTCCTTAAA-TATTCAAGACGATCCATTCCTTCGACCAATTTCAAGAACCTTCCA----CG-CA
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGCAATTTCCCGAACATTCCATGCTCGAGA
* * ** * * ** * * *
7326 AATAG-TTTGTCTT-GTAAACAAAT--TTTGGTCCTTGAATAAAAAAC--TT--ATTT-ACATGA
66 AATCGCATCAT-TTGGT--CCAAATAGTTT-GTCATTTTATAAACAACTTTTGGTTTTGA-ATTA
* ** * * * * * *
7382 GAATTTTATCT-C-T----CTTG---GT-TCTTAG-AC---GAACTTTCTAACTTGTCAAACTTT
126 AAAACTTATTTACATGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGAA--TTCGAACTTGTCAAACTTT
*
7433 TACGAGTTCTTTTATAACTTCA
189 TACGAGTTCTTTTATAACTTCG
* * * * * * * * *
7455 GTTCCATAAAGTATTAAAGATGATTCATTCCTTC-ACGCTATTTTCTGAACATTTCATGCTCGAG
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGA-GCAATTTCCCGAACATTCCATGCTCGAG
* * *
7519 AAATCGTATCATTTGGTCCAACTAGTTTGTCATTTTATAAATAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAA
65 AAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTATAAACAACTTTTGGT-TTTGAATTAAAA
** * *
7584 ACTTATTTATGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCTCAAACATT-TAAAACT
129 ACTTATTTACATGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTT-G--GAA--T-TCGAAC-TTGTCAAACT
*
7648 TTTACGAGTTCTTTTAT-ACTTTTG
187 TTTACGAGTTCTTTTATAAC-TTCG
* ** *
7672 GTTCCTTAAA-TATTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGCAATTTCAAGAACATTCCATGCTCGATA
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGCAATTTCCCGAACATTCCATGCTCGAGA
* * * * *
7736 AATCGTATTATTTGATCCAAATAGTTTGTC---TTGTAAACAAATTTTGGTCTTTGAATTAAAAA
66 AATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTATAAACAACTTTTGGT-TTTGAATTAAAAA
** * * * * *
7798 CTTATTTATGTGGGAATAT-TATCTCTCCTGGTTTCTAGATGAACTTTTGAACTTGTCAAACATT
130 CTTATTTACATGAGAAT-TGTATCTCTCTTGG-TTCTTG--GAA--TTCGAACTTGTCAAACTTT
* * *
7862 TACGAGTTATTTTATACCTTTG
189 TACGAGTTCTTTTATAACTTCG
* * * * * ** *
7884 GTTCCTCAAAGTATTCAAGGCAATCCATTCCTTCGAGCAATTTTCTTAACATTCCATGCTCGGGA
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGCAATTTCCCGAACATTCCATGCTCGAGA
* * *
7949 AATCACA-CTATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAAAATTTT-GTCTTTGAATTAAA
66 AATCGCATC-ATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTATAAAC-AACTTTTGGT-TTTGAATTAAA
* * *
8012 AACTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGG-A--CGAACTTGTCAAACTCTGACG
128 AACTTATTTACATGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGAATTCGAACTTGTCAAACTTTTACG
*
8074 AGTTCTTTTATAACTTTG
193 AGTTCTTTTATAACTTCG
* * * * *
8092 GTTCCTTAAAGTATTCAAGTCGATGCTTTCCATCGAG-ACATTTCTCGAAAATTCCATGCTCGAG
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGCA-ATTTCCCGAACATTCCATGCTCGAG
* *
8156 AAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGA-AAACAACTGTTGGTCTTCGAATTAAA
65 AAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTT-ATAAACAACTTTTGGT-TTTGAATTAAA
* * * ** *
8220 ACCTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCTT-GTATCTTGGATGAACTTCCAAACTTGAAAAACA
128 AACTTATTTACATGAGAATTGTATCTCTCTTGGT-TCTT-G--GAA-TT-CGAACTTGTCAAACT
*
8284 TTTACGAGTTCTTTTATAACTTCT
187 TTTACGAGTTCTTTTATAACTTCG
* * ** *
8308 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTCCCTTTGAGCAATTTCTTGAACATTCCATGCTCGGGA
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGCAATTTCCCGAACATTCCATGCTCGAGA
* * * * *
8373 AATCACATTATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTCTGTTTTTTGAATTAAAAA
66 AATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTATAAACAACTTTTG-GTTTTGAATTAAAAA
* ** * * * *
8438 CTTATTTACGTGAGAATTGTATCAATCCTAGTTTTTGGATGAACTTTTGAACTTGTCAAACTTTT
130 CTTATTTACATGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTT-G--GAA--TTCGAACTTGTCAAACTTTT
8503 ACGAGTTCTTTTATAACTTCG
190 ACGAGTTCTTTTATAACTTCG
** * * ** * *
8524 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCAATTCTTTCGAGCTATTTTTC-AGGCATTCCATGCTCAAG
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGCAATTTCCCGA-ACATTCCATGCTCGAG
* * * *
8588 AAATC-CTATCGTTTGGTCCAAATAGTTTGTCA-TTTGTAACCAACTTTTTGTCTTTGAATTAAA
65 AAATCGC-ATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTATAAACAACTTTTGGT-TTTGAATTAAA
* *
8651 AACTTATTTACATGCGAATTGTATCTCTCTCGGTTCTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTT
128 AACTTATTTACATGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTT-G--GAA-TT-CGAACTTGTCAAACTT
*
8716 TTATGAGTTCTTTTAT-ACTTTTC-
188 TTACGAGTTCTTTTATAAC--TTCG
** * ** *
8739 GTTCCTTAAAGTATTCAAGGTGATCCATTCCTTCGAGCAATTTCAAGAACATTCCATGCTCGATA
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGCAATTTCCCGAACATTCCATGCTCGAGA
* * * *
8804 AATCGCATTACTTGGTCCAAATAGTTTGTC---TTGTAAACAAATTTTGGTCTTTGAATTAAAAA
66 AATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTATAAACAACTTTTGGT-TTTGAATTAAAAA
*** * * * ** *
8866 CTTATTTTTGTGGGAATAT-TATCTCTCATGGTTCCTAGACGAACTTTTTAACTTGTCAAACATT
130 CTTATTTACATGAGAAT-TGTATCTCTCTTGGTT-CTTG--GAA--TTCGAACTTGTCAAACTTT
* * *
8930 TACGAGTTATTTTATACCTTTG
189 TACGAGTTCTTTTATAACTTCG
* * * * ** *
8952 GTTCCTCAAAGTATTCAAGGCAATCCATTT-CTTCAAGCAAATTT-CTAAACATTCCATGCTCGG
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCC-TTTCCTTCGAGC-AATTTCCCGAACATTCCATGCTCGA
* * * * *
9015 GAAATCACA-CTATTTGGTCCAAATAATTTGTCATTTTGTAAACAAATTTTTGTCTTTGAATTAA
64 GAAATCGCATC-ATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTATAAACAACTTTTGGT-TTTGAATTAA
** * *
9079 AAACTTATTTATGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGG-A--CGAACTTGTCAAACTCTGAC
127 AAACTTATTTACATGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGAATTCGAACTTGTCAAACTTTTAC
* *
9141 GAGTTCTTTTATAAATTTG
192 GAGTTCTTTTATAACTTCG
* * * * * *
9160 GTTCCTTAAAGTATTCAAGTCGATGCTTTCCATCGAG-ACATTTCTCGAAAATTCCATGCTCGGG
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGCA-ATTTCCCGAACATTCCATGCTCGAG
* * * * * * **
9224 AAATCGAAACTTTTGGTCCAAATAGTTTTTCATTGTGA-AAACAACTGTTGGTCTTCAAATTAAA
65 AAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATT-TTATAAACAACTTTTGGT-TTTGAATTAAA
* ** * * ** *
9288 ACCTTATTTATGTGAGAATTGTATCTCTCTT-GTATCTTGGATGAACATCCAAACTTGAAAAACA
128 AACTTATTTACATGAGAATTGTATCTCTCTTGGT-TCTT-G--G-A-ATTCGAACTTGTCAAACT
*
9352 TTTACGAGTTCTTTTATAACTTCT
187 TTTACGAGTTCTTTTATAACTTCG
* * *
9376 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTCCCTTCGAGCAATTTCTCGAACATTCCATGCTCGGGA
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGCAATTTCCCGAACATTCCATGCTCGAGA
* * * ** *
9441 AATCACATTATTTGGTCCAAATAGTTTGCCATTTCGTAAACAACTTCTAT-TTTTTGAATTAAAA
66 AATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTATAAACAACTT-T-TGGTTTTGAATTAAAA
* ** * * * *
9505 ACTTATTTACGTGAGAATTGTATCAATCCTGGTTTTTGGACGAACTTTTGAACTCGTCAAACTTT
129 ACTTATTTACATGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTT-G--GAA--TTCGAACTTGTCAAACTTT
*
9570 TACGAGTTCTTTTATAAGTTCG
189 TACGAGTTCTTTTATAACTTCG
* ** * * ** **
9592 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACAATCAATTCCTTTGAGCTATTTTTCGGGCATTCCATGCTCGAGA
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGCAATTTCCCGAACATTCCATGCTCGAGA
* * * * *
9657 AATCGTATCGTTTGGTCCAAATAGTTTGTCA-TTTGTAACCAACTTTTGGTCTTTG-ATTTAAAA
66 AATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTATAAACAACTTTTGGT-TTTGAATTAAAAA
*
9720 CTTATTTACATGAGAACTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTT
130 CTTATTTACATGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTT-G--GAA-TT-CGAACTTGTCAAACTTTT
** ** *
9785 GTGAGTTCTTTTATATTTTTG
190 ACGAGTTCTTTTATAACTTCG
* * * * ** * *
9806 GTTCCTTAAAGTATTTAAGACAATTCATTCCTTCGAGCAATTTCAAGAACATTCCATGATCGATA
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGCAATTTCCCGAACATTCCATGCTCGAGA
* * * *
9871 AATCGCATTATTTGGTCCAAATAATTTGTC---TTGTAAACAAATTTTGGTCTTTGAATTAAAAA
66 AATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTATAAACAACTTTTGGT-TTTGAATTAAAAA
* * * * *
9933 CATATTTACGTGGGAATTATATCTCTCTTTGTTCTTGGACGAACTTTCGAACTTGTCAAACTTTT
130 CTTATTTACATGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTT-G--GAA--TTCGAACTTGTCAAACTTTT
*
9998 ACGAGTTCTTTTATAACTTCA
190 ACGAGTTCTTTTATAACTTCG
* * * * *** * *
10019 GTTCCTTTAAGTATTCAAGATGA----TTCCTTCAAGCTATTTTTTGAACATTTCATGCTCTAGA
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGCAATTTCCCGAACATTCCATGCTCGAGA
*
10080 AATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAA
66 AATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTATAAACAACTTTTGGT-TTTGAATTAAAAA
** * * * ** *
10145 CTTATTTATGTGAGAATTGTACCTCTCTTGGTTATTGG-A--CGAACTTGTCAAACATTTAAAAC
130 CTTATTTACATGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGAATTCGAACTTGTCAAACTTTTACGAG
* *
10207 TTCTTTTCTAACTTCA
195 TTCTTTTATAACTTCG
* * *
10223 GTTCCTTAAAGTATTTAAGACGATCCTTTCCTTCGAG-ACATTTCCCG-ACACTCC-TCGTTC-A
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGCA-ATTTCCCGAACATTCCAT-GCTCGA
* * * * * *
10284 GGAAGTCACATCTTTTGGTCCAAATTGTTTTTCATTTTCTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATT-A
64 -GAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTATAAACAACTTTTGGT-TTTGAATTAA
* * ** * *
10348 AAATTTTTTTATGTGAGAATAT-TACCTCTCTTTGTTCTTGGACGAACTTCTGAACTTGTCAAAC
127 AAACTTATTTACATGAGAAT-TGTATCTCTCTTGGTTCTT-G--GAA-TTC-GAACTTGTCAAAC
10412 TTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCG
186 TTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCG
* * * * * * ** *
10437 GCTCCTTAAAGTATTCAAGGCAATCCATTCCTTTGAGCAGTTTTACGAACATTCCATGCTCGGGA
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGCAATTTCCCGAACATTCCATGCTCGAGA
** * * * ** * * *
10502 AATAACATTATTTGGTCCAAATAGTTT-TTA-CTTGGAAATAATTTTTTGTCTTTGAATTAAAAA
66 AATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTATAAACAACTTTTGGT-TTTGAATTAAAAA
* * * * * * *
10565 CTTATTCACGTGAGAATTTTATCTCTCTTGGTTTTTCG-A-T-GAACTGGTCAAACTTTGACGAG
130 CTTATTTACATGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGAATTCGAACTTGTCAAACTTTTACGAG
* *
10627 TTCTTTTATAATTTTG
195 TTCTTTTATAACTTCG
* * * * * * *
10643 GTTCCTTAAAATTTTCAAGTCGATGCTTTCCTTCGAG-ACATTTCTCGAAAATTCCATGCTCGGG
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGCA-ATTTCCCGAACATTCCATGCTCGAG
* * *
10707 AAATCGAATCTTTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGA-AAACAACTTTTGGTCTTCGAATTAAA
65 AAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTT-ATAAACAACTTTTGGT-TTTGAATTAAA
* * * *
10771 ACCTTATTTACATGAGAATTGTATCTCTCTTGTTTCTTAGATGAACTTCCAAACTTGTCAAACAT
128 AACTTATTTACATGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTT-G--GAA-TT-CGAACTTGTCAAACTT
*
10836 TTACGAGTTCTTTTATAACTTCT
188 TTACGAGTTCTTTTATAACTTCG
* * * * * *
10859 GTTCCTTATAGTATTCAAGACGATACTTTCCTTCGAGCAATTTCTCGAACGTTCCATGCTAGGGA
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGCAATTTCCCGAACATTCCATGCTCGAGA
* * * *
10924 AATCACATTATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTTTGATTTTTGAATTAAAAA
66 AATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTATAAACAACTTTTG-GTTTTGAATTAAAAA
* **
10989 CTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTAATGGTTCTTGG-A--CGAACTTGTCAAACTTTTACGAG
130 CTTATTTACATGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGAATTCGAACTTGTCAAACTTTTACGAG
*
11051 TTCTTTTATAACTTCA
195 TTCTTTTATAACTTCG
* * * *
11067 ATTCCTTAAAGTATTCAACACGATCCTTTCCTTCGAG-ACATTTCCCGAACATTTCATGCTCGAA
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGCA-ATTTCCCGAACATTCCATGCTCGAG
* * * * *
11131 AAATCGCGTCATTTGGTCCAAATAATTTGTCATTTTGTAAA-ATTCTTTTGCTTATTGAATTAAA
65 AAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTATAAACA-ACTTTTGGTT-TTGAATTAAA
* ** * *
11195 AACTTATTTACGTGAGAATTGTATCAATCCTGGTTTTTGGACGAACTTTCGAACTTGTCAAACTT
128 AACTTATTTACATGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTT-G--GAA--TTCGAACTTGTCAAACTT
*
11260 TTACAAGTTCTTTTATAACTTCG
188 TTACGAGTTCTTTTATAACTTCG
** * ** ** *
11283 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCAATTCCTTCGAGCTATTTTTCGGGCATTCCATGCTCGATA
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGCAATTTCCCGAACATTCCATGCTCGAGA
* * * * *
11348 AATCGTATCGTTTGGTCCAAATAGTTTGTC-TTTTGTAACCAACTTTTGGTCTGTGAATTAAAAA
66 AATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTATAAACAACTTTTGGT-TTTGAATTAAAAA
* * * * * *
11412 CTTATTTACGTGGGAATTTTAACTCTCTTGGTTGTTGGACGAACTTTCAAACTTGTCAAACTTTT
130 CTTATTTACATGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTT-G--GAA--TTCGAACTTGTCAAACTTTT
*
11477 ACGAGTTCTTTTATAACTTCA
190 ACGAGTTCTTTTATAACTTCG
* * * * * * * **** * *
11498 GTTCCTAAAAGTATTCAAAATGATTCATTCCTTCAAGCTATTTTTTAAACATTTCATGCTTGAGA
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGCAATTTCCCGAACATTCCATGCTCGAGA
* *
11563 AATCGCATCATTAGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAA
66 AATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTATAAACAACTTTTGGT-TTTGAATTAAAAA
** * ** *
11628 CTTATTTATGTGAGAATT-TATCTCTCTTGGTTCTTGG---TCGAACTTGTCAAACATTTAAAAC
130 CTTATTTACATGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGAATTCGAACTTGTCAAACTTTTACGAG
* *
11689 TTCTTTTCTAACTTCA
195 TTCTTTTATAACTTCG
* * * * *
11705 GTTCCTT-AAGTATTCAAGACGATGCTTTCGTTCGAG-ACATTTCTCGAGCATTCCATGCTCTAG
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGCA-ATTTCCCGAACATTCCATGCTCGAG
* * * * *
11768 AAGTCGCATCTTTTGGTCCAAATTGTTTTTCATTTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAA
65 AAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTATAAACAACTTTTGGT-TTTGAATTAAAA
** ** * *
11833 ACCGATTTATGTGAGAATAT-TATCTCTCCTGGTTCCTGGACGAACTTTCGAACTTGTCAAACTT
129 ACTTATTTACATGAGAAT-TGTATCTCTCTTGGTT-CTTG--GAA--TTCGAACTTGTCAAACTT
*
11897 TTACAAGTTCTTTTATAACTTCG
188 TTACGAGTTCTTTTATAACTTCG
* * * * * * ** * *
11920 GTTCCTCAATGTATTCAAGGCAATCCATTCCTTCAAGCAATTTTACGAATATTCCATGCTCGGGA
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGCAATTTCCCGAACATTCCATGCTCGAGA
* * * * ** *** *
11985 AATCACATTATTTGATCCAAATAGTTTCT-ACTTGGA-AAA-TTTTTTTTGTCTTTGAATTAAAA
66 AATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCA-TTTTATAAACAACTTTTGGT-TTTGAATTAAAA
** * * * * *
12047 ACTTATTTATGTGAGAATTTTATCTCTCTTGATTTTTGG-A--CGAACTCGTCAAACTTTGACGA
129 ACTTATTTACATGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGAATTCGAACTTGTCAAACTTTTACGA
*
12109 GTTCTTTTATAACTTTG
194 GTTCTTTTATAACTTCG
*** * * * *
12126 GTTCCTTAAAGTATTCAAGTTAATGCTTTCCTTCGAG-ACATTTCTCGAAAATTCCATGCTCGGG
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGCA-ATTTCCCGAACATTCCATGCTCGAG
* * * * *
12190 AAATTGAATCTTTTGGTCCAAATAGTTTTTCATTTTGA-AAACAACTTTTGGTATTAGAATTAAA
65 AAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTT-ATAAACAACTTTTGGT-TTTGAATTAAA
** * * *
12254 AACTTATTTATGTG-GAAATTTTATCTTTCTTGGTTCCTGG-A--CGAACTTGTCAAACTTTTAC
128 AACTTATTTACATGAG-AATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGAATTCGAACTTGTCAAACTTTTAC
*
12315 GAGTTCTTTTATAACTTCA
192 GAGTTCTTTTATAACTTCG
* * * * * * * *
12334 GTTCCTTAAAGTATTCAAGATGATTCATTCCTTCAAGCTATTTTCTGAACATTTCATGCTCGAGA
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGCAATTTCCCGAACATTCCATGCTCGAGA
* * * *
12399 AATCGTATCATTTGGTCCAAATAGTTTTTCATTTTTTAAACAACTTTTGGTCTTTTAATTAAAAA
66 AATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTATAAACAACTTTTGGT-TTTGAATTAAAAA
** * * ** *
12464 CTTATTTATGTGGGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGG-A--CGAACTTGTCAAACATTTAAAAC
130 CTTATTTACATGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGAATTCGAACTTGTCAAACTTTTACGAG
*
12526 TTCTTTTCTAACTTCG
195 TTCTTTTATAACTTCG
* * *
12542 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAG-ACATTTCCCGAGCACTCCATGTTC-AG
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGCA-ATTTCCCGAACATTCCATGCTCGA-
* * * * * * *
12605 GAAGTCACATCTTTTGGTCCAAATTGTTTTTCATTTTCTAAACAACTTTTGGTCTATGAATTAAA
64 GAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTATAAACAACTTTTGGT-TTTGAATTAAA
* ** *
12670 AACTTTTTTATGTGAGAATAT-TACCTCTCCTT-GTTCTTGGACAAACTTCTGAACTTGTCAAAC
128 AACTTATTTACATGAGAAT-TGTATCTCT-CTTGGTTCTTGG---AA-TTC-GAACTTGTCAAAC
12733 TTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCG
186 TTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCG
* * * * * ** * *
12758 GCTCCTTAAAGTATTCAAGGCAATCCATTCCTTCGAGCAGTTTTACAAACATTCCATGCTCGGGA
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGCAATTTCCCGAACATTCCATGCTCGAGA
** * * ** * ** *
12823 AAT-G-ATGTTATTGGTCCAAATAGTTT-TTA-CTTGGAAACAAATTTTTGCCTTTGTATTAAAA
66 AATCGCATCAT-TTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTATAAAC-AACTTTTGGTTTTGAATTAAAA
* * * * *
12884 ACTTATTCACGTGAGAATTTTATCTCTCTTGGTTCTTGG-A--CGAACTAGTCAAACTTTGACGA
129 ACTTATTTACATGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGAATTCGAACTTGTCAAACTTTTACGA
*
12946 GTTCTTTTATAACTTTG
194 GTTCTTTTATAACTTCG
* * * * * * *
12963 GTTCCTTAAAGTATTCAAGTCGATGCTTTCCTTCGAG-ACATTTCTCGAAAATTTCATGCTTGGG
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGCA-ATTTCCCGAACATTCCATGCTCGAG
* *
13027 AAATCGAATC-TCTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGA-AAACAACTTTTGGTCTTCGAATTAA
65 AAATCGCATCAT-TTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTT-ATAAACAACTTTTGGT-TTTGAATTAA
* * * * * * * *
13090 GACCTTACTTACGTGAGAATTGTATCTCTCTTGTTTCTTAGATGAACTTCCAAACTTGTCCAACA
127 AAACTTATTTACATGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTT-G--GAA-TT-CGAACTTGTCAAACT
*
13155 TTTACGAGTTCTTTTATAACTTCT
187 TTTACGAGTTCTTTTATAACTTCG
* * *
13179 GTTCCTTACAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTTGAGCAATTTCTCGAACATTCCATGCTCGAGA
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGCAATTTCCCGAACATTCCATGCTCGAGA
** * * *
13244 AATTACATTATTTGGTCCAAATAGTTTTTCATTTTGTAAACAACTTTTGGTTTTAGAATTAAAAA
66 AATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTATAAACAACTTTTGGTTTT-GAATTAAAAA
* *
13309 CTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCATGGTTCTTGG-A--CGAACTTGTCAAACTTTTACGAG
130 CTTATTTACATGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGAATTCGAACTTGTCAAACTTTTACGAG
*
13371 TTCTTTTATAACTCCG
195 TTCTTTTATAACTTCG
* * * * *
13387 GTTCCTTAAAGTATTCAACACGATCCTTCCCTTCGAG-ACATTTCCCGAACATTTCATGCTAGAA
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGCA-ATTTCCCGAACATTCCATGCTCGAG
* * *
13451 AAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAA-ATTCTTTTGCTTATTGAATTAAA
65 AAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTATAAACA-ACTTTTGGTT-TTGAATTAAA
* ** * * *
13515 AACTTATTTACGTGAGAATTGTATCAATCCTAGTTTTTGGACAAACTTTCGAACTTGTCAAACTT
128 AACTTATTTACATGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGG---AA--TTCGAACTTGTCAAACTT
13580 TTACGAGTTCTTTTATAACTTCG
188 TTACGAGTTCTTTTATAACTTCG
*** * * * *
13603 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATAAATTCCTTCGAGCTATTTTCCTG-GCATTCCATGCTCGAT
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGC-AATTTCCCGAACATTCCATGCTCGAG
* * * * * *
13667 AAATCGTATCGTTTGGTCCAAATAGTTTGTCA-GTTGTAACCAACTTTTGGTCTTTAAATTAAAA
65 AAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTATAAACAACTTTTGGT-TTTGAATTAAAA
* *
13731 ACTTATTTACATG-GAATTTTATCTCTCTTGGTTGTTGGACGAACTTTCGAACTTGTCAAACTTT
129 ACTTATTTACATGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTT-G--GAA--TTCGAACTTGTCAAACTTT
*
13795 TACGAGTTCTTTTATAACTTCA
189 TACGAGTTCTTTTATAACTTCG
* * * * * * * **** *
13817 ATTCTTTAAAGTATTCAAGATGATTCATTCCTTCAAGCTATTTTTTAAACATTTCATGCTCGAGA
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGCAATTTCCCGAACATTCCATGCTCGAGA
* * *
13882 AATCGCATCATTTGGTCGAAATATTTTGTCATTTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAA
66 AATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTATAAACAACTTTTGGT-TTTGAATTAAAAA
*** * * * * ** *
13947 CTTATTTTTGTGAGAATT-TATCTCTCTTAGTACTTGG-A--CGTACTTGTCAAACATTTAAAAC
130 CTTATTTACATGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGAATTCGAACTTGTCAAACTTTTACGAG
*
14008 TTCTTTTCTAACTTCG
195 TTCTTTTATAACTTCG
* * *
14024 ATTCCTTAAAGTATTC-AGAACGATCCTTTCCTTCGAGACAA-TTCCCGAGCACTCCATGCTCTG
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAG-ACGATCCTTTCCTTCGAG-CAATTTCCCGAACATTCCATGCTC-G
* * * * *
14087 -GAAGTCGCAT-ATTTTGGTCCAAATAATTTTTCATTTTGTAAACAACTTTTGGTATTTTAATTA
63 AGAAATCGCATCA-TTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTATAAACAACTTTTGGT-TTTGAATTA
** * * * * *
14150 AAAACTTATTTATGTGAGAATAT-TATCTCTCCTGGTTCATGGATGAACTTCCTAACTAGTAAAA
126 AAAACTTATTTACATGAGAAT-TGTATCTCTCTTGGTTC-TTG--GAA-TT-CGAACTTGTCAAA
*
14214 CTTTAACGAGTTCTTTTATAACTTCG
185 CTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCG
* * * * * *** *
14240 GTTCCTCAAAGTATTCAAGGCAATCCATTCCTTGGAGCAATTTTATGAACATTCCATGCT-TAGA
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGCAATTTCCCGAACATTCCATGCTCGAG-
* * * * ** * *
14304 AAATCACATTATTTGGTCCAAATAGTTT-TTA-CTTGGAAACAAATTTTTGTCTTTGAATTAAAA
65 AAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTATAAACAACTTTTGGT-TTTGAATTAAAA
* * * * * *
14367 ACTTATTCACGTGAGAATTTTATCTCTCTTGGTTCTTGG-A--CGAACTGGTCAATCTTTGACGA
129 ACTTATTTACATGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGAATTCGAACTTGTCAAACTTTTACGA
* *
14429 GTTCATTTATAACTTTG
194 GTTCTTTTATAACTTCG
* * * *
14446 GTTCCTTAAAGTATTCAAGTCGATGCTTTCCTTCGAG-ACATTTCTCGAAAATTCCATGCTCTG-
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGCA-ATTTCCCGAACATTCCATGCTC-GA
* * * *
14509 GAAATCGAATCTTTTGGTCCAAATAGTTTGTTATTTTGA-AAACAACTTTTGGTCTTCGAATTAA
64 GAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTT-ATAAACAACTTTTGGT-TTTGAATTAA
* * * * * * * *
14573 AACCTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCCCTTGTTTCATGGATGAACTTCCAAACTTTTCAAACT
127 AAACTTATTTACATGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTC-TTG--GAA-TT-CGAACTTGTCAAACT
*
14638 TTTACGAGTTCTTTTATAACTTCT
187 TTTACGAGTTCTTTTATAACTTCG
* * *
14662 GTTCCTTAAAGTATTTAAGACGATCCTTTCCTTCGAGCAATTTCTCGAACATTCCATGCTCGGGA
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGCAATTTCCCGAACATTCCATGCTCGAGA
* * * *
14727 AATCACATTATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTTTTGTTATTGAATTAAAAA
66 AATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTATAAACAACTTTTGGTT-TTGAATTAAAAA
* * ** * * * *
14792 CTTATTTACGTGAGAATCGTATCAATCCTGGTTTTTGGATGAACTTTCGAACTTATCAAACATTT
130 CTTATTTACATGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTT-G--GAA--TTCGAACTTGTCAAACTTTT
* *
14857 ATGAGTTCTTTTATAACTTTG
190 ACGAGTTCTTTTATAACTTCG
* ** * ** **
14878 GTTCCTTAAAGTATTCAAGATGATCAATTCCTTC-AGGCTATTTTTCGGGCATTCCATGCTCGAG
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGA-GCAATTTCCCGAACATTCCATGCTCGAG
* * * * *
14942 AAATCGTATCGTTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTTTGGTTATTGAATTGAAT
65 AAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTATAAACAACTTTTGGTT-TTGAATTAAAA
* ** * * *
15007 ACTTATTTACGTGAGAATTGTATCAATGC-TGGTTTTTGGACGAAATTTTGAACTTGTCAAACAT
129 ACTTATTTACATGAGAATTGTATCTCT-CTTGGTTCTT-G--G-AA-TTCGAACTTGTCAAACTT
15071 TTACGAGTTCTTTTATAACTTCG
188 TTACGAGTTCTTTTATAACTTCG
** * ** **
15094 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCAATTCCTTCGAGCTATTTTTCGGGCATTCCATGCTCGAGA
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGCAATTTCCCGAACATTCCATGCTCGAGA
** ** * *
15159 AATCATATTGTTTGGTCCAAATAGTTTGTCA-TTTGTAACCAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAA
66 AATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTATAAACAACTTTTGGT-TTTGAATTAAAAA
* *
15223 CTTATTTGCATGAGAACTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTT
130 CTTATTTACATGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTT-G--GAA-TT-CGAACTTGTCAAACTTTT
*
15288 ACGAGTTCTTTTAT-ACTTTTG
190 ACGAGTTCTTTTATAAC-TTCG
** * * ** * *
15309 GTTCCTTAAAGTATTCAAGATTATCCATTCCTTCGATCAATTTCAAGAACATTCCATGCTTGATA
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGCAATTTCCCGAACATTCCATGCTCGAGA
* * * *
15374 AATCGCATTATTTGGT-CAAATAGTTTGTC---TTGTAAACAAATTTTGGTCTTTTAATTAAAAA
66 AATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTATAAACAACTTTTGGT-TTTGAATTAAAAA
* * * *
15435 CTTATTTACGTGGGAATT-TATCTCTCTCGGTCCTTAGACGAACTTTCGAACTTGTCAAACTTTT
130 CTTATTTACATGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTT-G--GAA--TTCGAACTTGTCAAACTTTT
**
15499 ACGAGTTCTTTTATAACTTTA
190 ACGAGTTCTTTTATAACTTCG
* * * * * * *** *
15520 GTTCCTTTAAGTATTCAATATGAT-TTATTCCTTCAAGCTATTTTTTGAACATTTCATGCTCGAG
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCT-TTCCTTCGAGCAATTTCCCGAACATTCCATGCTCGAG
* *
15584 AAATCGCATTATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAA
65 AAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTATAAACAACTTTTGGT-TTTGAATTAAAA
** * * **
15649 ACTTATTTATGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGG-A--CGAACTTTTCAAACATTTAAAA
129 ACTTATTTACATGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGAATTCGAACTTGTCAAACTTTTACGA
* *
15711 CTTCTTTTCTAACTTCG
194 GTTCTTTTATAACTTCG
* * *
15728 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCATTTGAG-ACATTTCCCGAGCATTCCATGCTCTG-
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGCA-ATTTCCCGAACATTCCATGCTC-GA
* * * * * *
15791 GAAGTCTCATCTTTTGGTCCAAATTGTTTTTCATTTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAA
64 GAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTATAAACAACTTTTGGT-TTTGAATTAAA
* ** * *
15856 AACCTATTTATGTGAGAATAT-TATCTCTCCTAGTTCTTGGACGAACTTTCGAACTTGTCAAACT
128 AACTTATTTACATGAGAAT-TGTATCTCTCTTGGTTCTT-G--GAA--TTCGAACTTGTCAAACT
15920 TTTACGAGTTCTTTTATAACTTCG
187 TTTACGAGTTCTTTTATAACTTCG
* * * * * ** *
15944 GTTCCTAAAAGTATTCAAGGCAATCCATTCCTTCAAGCAATTTTACGAACATTCCATGCTCGGGA
1 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGCAATTTCCCGAACATTCCATGCTCGAGA
* *
16009 AATCACATTATTTGG
66 AATCGCATCATTTGG
16024 AAATAAATTT
Statistics
Matches: 12329, Mismatches: 2416, Indels: 1714
0.75 0.15 0.10
Matches are distributed among these distances:
188 46 0.00
189 37 0.00
193 6 0.00
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256 5 0.00
258 3 0.00
259 3 0.00
260 2 0.00
ACGTcount: A:0.28, C:0.18, G:0.14, T:0.40
Consensus pattern (210 bp):
GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGCAATTTCCCGAACATTCCATGCTCGAGA
AATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTATAAACAACTTTTGGTTTTGAATTAAAAAC
TTATTTACATGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGAATTCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGT
TCTTTTATAACTTCG
Found at i:6628 original size:216 final size:215
Alignment explanation
Indices: 5786--7308 Score: 1474
Period size: 215 Copynumber: 7.0 Consensus size: 215
5776 TTATTAAATG
*
5786 AGCATTCCATGCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCTTTTTGTAAACAACTTT
1 AGCATTCCATGCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTT
* * *
5851 TGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCCTGGTTCTTGGATGAACTTT
66 TGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTC
* ** *
5916 CGAACCTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTATTTAAAATATTCAAGACGATCC
131 CGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCC
* *
5981 ATTCCTTTGAGCTATTTTTCG
196 ATTCCTTTGAGC-AATTTTCT
* ** *
6002 GGCATTCCATGCTTTAGAAATTGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCA-TTTGTAAACAACTTT
1 AGCATTCCATGCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTT
* *
6066 TGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACATGAGAATTGTGTCTCTCTTGGTTCTTGGAC--A----
66 TGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTC
*** * *
6125 --AACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCAACTCCTTAAAATATTCAAGATGATCC
131 CGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCC
* * *
6188 ATTCCTTTGAGCTACTTTCCG
196 ATTCCTTTGAGC-AATTTTCT
* * *
6209 AACATTCCATGCTAGAGAAATTGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTT
1 AGCATTCCATGCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTT
* * * * * *
6274 TGGTCTTTGAATT-AAAACTTATTTACGTAAAAATTGTTTCCCTTTTGGTTCTTGGACGAACATC
66 TGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTC
* * * * * * *
6338 CGAACTTGTCAAACTTTTATGAGTTATTTTATAACTTTGATTCCTTAGAGTATTCATGATGATCC
131 CGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCC
*
6403 ATTCCTTTGAGGAATCTTTCT
196 ATTCCTTTGAGCAAT-TTTCT
* * *
6424 AGCATTCCATGCTCTAGAAATCACATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTATAAACAACTTT
1 AGCATTCCATGCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTT
* * * *
6489 CGGTCTTCGAATTAAAAACTTAATTACGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGCTCTTGGACGAACTTC
66 TGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTC
* * *
6554 CAAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTAT-ACTTTTGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACTATC
131 CGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAAC-TTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATC
* *
6618 C-TATCCTTTGAGCAATTTAACA
195 CAT-TCCTTTGAGCAATTT-TCT
* * * * ** **** * *
6640 AACATTCCATGCTTGAGAAATTGCATTATTTGGTAGAAATTCCATGCTCA----GGAAATCACAT
1 AGCATTCCATGCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTG-TCATTTTGTAAA-CA-AC
* * * * * *
6701 TATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTTTGGTTTTA-GAATTAAAAACT-TATT
63 T-TTTGGT-C------TTTG--A--AT-TAAA-AAC--TT--ATTTACG---TGAGAATTGTATC
** * * * ** *
6764 TACGTGAGAATCGTATCTCT-CATGGTTCTTGGACGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTA
107 T-C-T---CTTGGT-TCT-TGGA-CGAACTT--CCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTA
* * * *
6828 TAACTTCGGTTCCTTAAAGTATTCAACACGATCCTTTCCTTCGAG-ACATTTCCT
162 TAACTTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTTGAGCA-ATTTTCT
* *
6882 GAACATTCCATGCTCGAAAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTT
1 -AGCATTCCATGCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTT
* * * ** * *
6947 TTGGT-TATTGAATTAAAAACATATTTATGTGAGATTTGTATCAATCCTGGTTTTTGGACGAACT
65 TTGGTCT-TTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACT
* *
7011 TTCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAAATTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGAT
129 TCCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGAT
* * * *
7076 CAATTCCTTCGATCTATTTTCT
194 CCATTCCTTTGAGCAATTTTCT
* * * * * **
7098 GGGCATTCCATGCTCGAGAAATCGTATCGTTTTGTCAAAATAGTTTGTCA-TTTGTAGCCAACTT
1 -AGCATTCCATGCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTT
* * *
7162 TTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACATGAGAATTGTACCTCTCTTGGTTCTCGGACGAACTT
65 TTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTT
*
7227 CCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTAT-ACTTTTGGTTCCTTAAA-TATTCAAGACGAT
130 CCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAAC-TTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGAT
* *
7290 CCATTCCTTCGACCAATTT
194 CCATTCCTTTGAGCAATTT
7309 CAAGAACCTT
Statistics
Matches: 1074, Mismatches: 170, Indels: 128
0.78 0.12 0.09
Matches are distributed among these distances:
207 158 0.15
208 28 0.03
209 1 0.00
213 4 0.00
214 34 0.03
215 325 0.30
216 314 0.29
217 4 0.00
218 5 0.00
219 3 0.00
220 3 0.00
223 4 0.00
224 4 0.00
225 4 0.00
226 4 0.00
227 2 0.00
228 5 0.00
229 3 0.00
230 3 0.00
231 6 0.01
232 2 0.00
233 3 0.00
234 5 0.00
235 7 0.01
236 4 0.00
239 2 0.00
240 4 0.00
241 5 0.00
242 5 0.00
243 112 0.10
244 5 0.00
245 2 0.00
246 4 0.00
ACGTcount: A:0.28, C:0.18, G:0.15, T:0.40
Consensus pattern (215 bp):
AGCATTCCATGCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTT
TGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTC
CGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCC
ATTCCTTTGAGCAATTTTCT
Found at i:7119 original size:459 final size:462
Alignment explanation
Indices: 6212--7087 Score: 1169
Period size: 459 Copynumber: 1.9 Consensus size: 462
6202 CTTTCCGAAC
**
6212 ATTCCATGCTAGAGAAATTGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTTTGG
1 ATTCCATGCTAGAGAAATCACATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTTTGG
* * **
6277 TCTTTGAATTAAAACTTATTTACGTAAAAATTGTTTCCCTTTTGGTTCTTGGACGAACATCCGAA
66 TCTTTGAATTAAAACTTATTTACGTAAAAATCGTATCCCTCATGGTTCTTGGA-G-A-A-CCGAA
* * * ** *
6342 CTTGTCAAACTTTTATGAGTTATTTTATAACTTTGATTCCTTAGAGTATTCATGATGATCCATTC
127 CTTGTCAAACTTTTACGAGTTATTTTATAACTTCGATTCCTTAAAGTATTCAACACGATCCATTC
* * * * *
6407 CTTTGAGGAATCTTTCTAGCATTCCATGCTCTAGAAATCACATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTC
192 CTTCGAGGAATCTTCCTAACATTCCATGCTCGAAAAATCACATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTC
* ** *
6472 ATTTTATAAACAACTTTCGGTCTTCGAATTAAAAACTTAATTACGTGAGAATTGTATCTCTCTTG
257 ATTTTATAAACAACTTTCGGTCTTCGAATTAAAAACATAATTACGTGAGAATTGTATCAATCCTG
** *
6537 GCTCTTGGACGAACTTCCAAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATACTTTTGGTTCCTTAA
322 GCTCTTGGACGAACTTCCAAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAAATTCGGTTCCTTAA
* * * *
6602 AGTATTCAAGACTATCCTATCCTTTGAGCAATTTAACAAACATTCCATGCTTGAGAAATTGCATT
387 AGTATTCAAGACGATCATATCCTTCGAGCAATTTAACAAACATTCCATGCTCGAGAAATTGCATT
6667 ATTTGGTAGAA
452 ATTTGGTAGAA
*
6678 ATTCCATGCTCAG-GAAATCACATTATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTTTG
1 ATTCCATGCT-AGAGAAATCACATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTTTG
* * *
6742 GT-TTTAGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATCGTATCTCTCATGGTTCTT-G-G-A-CGAAC
65 GTCTTT-GAATT-AAAACTTATTTACGTAAAAATCGTATCCCTCATGGTTCTTGGAGAACCGAAC
* * *
6802 TTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTATTCAACACGATCCTTTCC
128 TTGTCAAACTTTTACGAGTTATTTTATAACTTCGATTCCTTAAAGTATTCAACACGATCCATTCC
*
6867 TTCGA-GACAT-TTCCTGAACATTCCATGCTCGAAAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGT
193 TTCGAGGA-ATCTTCCT-AACATTCCATGCTCGAAAAATCACATCATTTGGTCCAAATAGTTTGT
* * * * * *
6930 CATTTTGTAAACAACTTTTGGT-TATTGAATTAAAAACATATTTATGTGAGATTTGTATCAATCC
256 CATTTTATAAACAACTTTCGGTCT-TCGAATTAAAAACATAATTACGTGAGAATTGTATCAATCC
* * * *
6994 TGGTTTTTGGACGAACTTTCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAAATTCGGTTCCTT
320 TGGCTCTTGGACGAACTTCCAAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAAATTCGGTTCCTT
7059 AAAGTATTCAAGACGATCA-ATTCCTTCGA
385 AAAGTATTCAAGACGATCATA-TCCTTCGA
7088 TCTATTTTCT
Statistics
Matches: 358, Mismatches: 45, Indels: 21
0.84 0.11 0.05
Matches are distributed among these distances:
458 8 0.02
459 244 0.68
461 1 0.00
464 1 0.00
465 3 0.01
466 66 0.18
467 35 0.10
ACGTcount: A:0.29, C:0.18, G:0.14, T:0.39
Consensus pattern (462 bp):
ATTCCATGCTAGAGAAATCACATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTTTGG
TCTTTGAATTAAAACTTATTTACGTAAAAATCGTATCCCTCATGGTTCTTGGAGAACCGAACTTG
TCAAACTTTTACGAGTTATTTTATAACTTCGATTCCTTAAAGTATTCAACACGATCCATTCCTTC
GAGGAATCTTCCTAACATTCCATGCTCGAAAAATCACATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTT
TATAAACAACTTTCGGTCTTCGAATTAAAAACATAATTACGTGAGAATTGTATCAATCCTGGCTC
TTGGACGAACTTCCAAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAAATTCGGTTCCTTAAAGTA
TTCAAGACGATCATATCCTTCGAGCAATTTAACAAACATTCCATGCTCGAGAAATTGCATTATTT
GGTAGAA
Found at i:16186 original size:186 final size:191
Alignment explanation
Indices: 15837--16198 Score: 461
Period size: 186 Copynumber: 1.9 Consensus size: 191
15827 TGTAAACAAC
**
15837 TTTTGGTCTTTGAATTAAAAACCTATTTATGTGAGAATATTATCTCTCCTAGTTCTTGGACGAAC
1 TTTTGGTCTTTGAATTAAAAACCTATTTACATGAGAATATTATCTCTCCTAGTTCTT-GACGAA-
*
15902 TTTCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTAAAAGTATTCAAGGCAA
64 -TTCGAACTTGTCAAACTTTGACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTAAAAGTATTCAAGGCAA
* *
15967 TCCATTCCTTCAAGCAATTTTACGAACATTCCATGCTCGGGAAATCACATTATTTGGAAATAAA
128 TCCATTCCTTCAAGCAATTTTACGAAAATTCCATGCTCGAGAAATCACATTATTTGGAAATAAA
* * * * *
16031 TTTTTGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACATGAGAATTTTATCTCTCTTGGTTCTT-A-G-A-T
1 TTTTGGTCTTTGAATTAAAAACCTATTTACATGAGAATATTATCTCTCCTAGTTCTTGACGAATT
* * * * *
16092 -GAACTTGTCAAACTTTGACGAGTTGTTTTATAACTTTGGTTCCTTAAAGTATTC-AGGTCGATG
66 CGAACTTGTCAAACTTTGACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTAAAAGTATTCAAGG-CAATC
* *
16155 CTTTCCTTCGAG-ACATTTCT-CGAAAATTCCATGCTCGAGAAATC
130 CATTCCTTCAAGCA-ATTT-TACGAAAATTCCATGCTCGAGAAATC
16199 GAATCTTTTG
Statistics
Matches: 148, Mismatches: 17, Indels: 14
0.83 0.09 0.08
Matches are distributed among these distances:
185 4 0.03
186 89 0.60
187 2 0.01
190 1 0.01
191 1 0.01
192 1 0.01
194 50 0.34
ACGTcount: A:0.28, C:0.18, G:0.15, T:0.39
Consensus pattern (191 bp):
TTTTGGTCTTTGAATTAAAAACCTATTTACATGAGAATATTATCTCTCCTAGTTCTTGACGAATT
CGAACTTGTCAAACTTTGACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTAAAAGTATTCAAGGCAATCC
ATTCCTTCAAGCAATTTTACGAAAATTCCATGCTCGAGAAATCACATTATTTGGAAATAAA
Found at i:16408 original size:216 final size:217
Alignment explanation
Indices: 16031--16819 Score: 914
Period size: 215 Copynumber: 3.7 Consensus size: 217
16021 TGGAAATAAA
* * *
16031 TTTTTGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACA-TGAGAATTTTATCTCTCTTGGTTCTT--A-G-A
1 TTTTGGTCTTTGAATT-AAAACTTATTTA-AGTGAGAATTGTATCTCTCTTGTTTCTTGGATGAA
* * * * *
16091 ---T--GAACTTGTCAAACTTTGACGAGTTGTTTTATAACTTTGGTTCCTTAAAGTATTCAGGTC
64 CTTTCCAAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTTGGTTCCTTAAAGTATTCAAGAC
* *
16151 GATGCTTTCCTTCGAG-ACATTTCTCGAAA-ATTCCATGCTCGAGAAATCGAATCTTTTGGTCCA
129 GATCCATTCCTTCGAGCA-ATTTCTCGAAACATTCCATGCTCGAGAAATCGAATCTTTTGGTCCA
* *
16214 AATAGTTTGTCATTTTGAAAACAAC
193 AATAGTTTATCATTTTGTAAACAAC
*
16239 TTTTGGTCTTCGAATTAAAACCTTATTTAAGTGAGAATTGTATCTCTCTTGTTTCTTGGATGAA-
1 TTTTGGTCTTTGAATTAAAA-CTTATTTAAGTGAGAATTGTATCTCTCTTGTTTCTTGGATGAAC
* *
16303 TTTCCAAACTTGTCAAACTTTTACGAGCTT-TTTTATAACTTTTGTTCCTTAAAGTATTCAAGGC
65 TTTCCAAACTTGTCAAACTTTTACGAG-TTCTTTTATAACTTTGGTTCCTTAAAGTATTCAAGAC
*
16367 GATCCTTTCCTTCGAGCAATTTCTC-AAACATTCCATGCTCGAGAAATC-ACAT-TATTTGGTCC
129 GATCCATTCCTTCGAGCAATTTCTCGAAACATTCCATGCTCGAGAAATCGA-ATCT-TTTGGTCC
16429 AAATAGTTTATCATTTTGTAAACAAC
192 AAATAGTTTATCATTTTGTAAACAAC
* *
16455 -TTTGGT-TATTGAATTGAAAACTTATTTATGTGAGAATTGTATCAATC-CTGGTTT-TTGGATG
1 TTTTGGTCT-TTGAATT-AAAACTTATTTAAGTGAGAATTGTATC--TCTCTTGTTTCTTGGATG
* * *
16516 AACTTT-CGAACTTATCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAG
62 AACTTTCCAAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTTGGTTCCTTAAAGTATTCAAG
* * ** * * *
16580 ACGATCAATTCCTTCGAGCTATTT-TCTG-GGCATTCCATGCTCAAGAAATCGTATCGTTTGGTC
127 ACGATCCATTCCTTCGAGCAATTTCTC-GAAACATTCCATGCTCGAGAAATCGAATCTTTTGGTC
* * *
16643 CAAATAGTTTTTCA-TTCGTAACCAAC
191 CAAATAGTTTATCATTTTGTAAACAAC
* * *
16669 TTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACA-TGTGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAA
1 TTTTGGTCTTTGAATT-AAAACTTATTTA-AGTGAGAATTGTATCTCTCTTGTTTCTTGGATGAA
* *
16733 CTTTCGATA-TTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTAT-ACTTTTGGTTCCTTAAAGTATTCAAGA
64 CTTTCCAAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAAC-TTTGGTTCCTTAAAGTATTCAAGA
*
16796 CGATCCATTCCTTCAAGCAATTTC
128 CGATCCATTCCTTCGAGCAATTTC
16820 AAGAACATTT
Statistics
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211 1 0.00
212 1 0.00
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217 5 0.01
ACGTcount: A:0.27, C:0.17, G:0.15, T:0.41
Consensus pattern (217 bp):
TTTTGGTCTTTGAATTAAAACTTATTTAAGTGAGAATTGTATCTCTCTTGTTTCTTGGATGAACT
TTCCAAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTTGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGA
TCCATTCCTTCGAGCAATTTCTCGAAACATTCCATGCTCGAGAAATCGAATCTTTTGGTCCAAAT
AGTTTATCATTTTGTAAACAAC
Found at i:17836 original size:32 final size:32
Alignment explanation
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Period size: 32 Copynumber: 2.0 Consensus size: 32
17790 GCCATCCATA
* * *
17800 CATGTACTTGAAATATATTAAAT-AGCTAATTG
1 CATGTACCTGAAACACATT-AATCAGCTAATTG
17832 CATGTACCTGAAACACATTAATCAGCTAATT
1 CATGTACCTGAAACACATTAATCAGCTAATT
17863 AATTTTGGCT
Statistics
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Consensus pattern (32 bp):
CATGTACCTGAAACACATTAATCAGCTAATTG
Found at i:17995 original size:38 final size:38
Alignment explanation
Indices: 17897--18005 Score: 164
Period size: 39 Copynumber: 2.8 Consensus size: 38
17887 CAAACATGAA
* * * *
17897 ATTAATTTGTCTCAAACTTAGACACCTTAAAAACAACT
1 ATTAATATGTATCAAACTAAGACACATTAAAAACAACT
*
17935 ATTAAATATGTATCAAAATAAGACACATTAAAAACAACT
1 ATT-AATATGTATCAAACTAAGACACATTAAAAACAACT
17974 ATTAATATGTATCAAACTAAGACACATTAAAA
1 ATTAATATGTATCAAACTAAGACACATTAAAA
18006 CCCTATTTAA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (38 bp):
ATTAATATGTATCAAACTAAGACACATTAAAAACAACT
Found at i:19288 original size:421 final size:418
Alignment explanation
Indices: 18369--20030 Score: 1948
Period size: 421 Copynumber: 3.9 Consensus size: 418
18359 GCCGTATCAA
* * * * *
18369 CATTCCATGCTAGATAAATCGCAT-TATTTGGTCCAAATAGTTTGTC-TTATAAACAAATTTTGG
1 CATTCCATGCTCG-GAAATCGAATCT-TTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTAAACAACTTTTGG
* *
18432 TCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGGGAATTTTATCTCT-CTCGGTTCTTGGACGAACTTTCG
64 TCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTTTATCTCTCCT-GGTTCTTGGACGAACTTCCG
* * *
18496 AGCTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCAGTTCTTTAAAGTATTCAAGATAATTCAT
128 AACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCAGTTCCTTAAAGTATTCAAGATAATCCAT
* ** * ** *
18561 TCCTTCAAGCTACTTTTTAAACATTTCATGCTCGAGAAATTGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTG
193 TCCTTCAAGC-AATTTTCGAACATTCCATGCTCGAGAAATCACATCATTTGGTCCAAATAGTTTA
* * *
18626 TCATTTTGAAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAATTTATTTATGTGAGAATTGTATCTCTCT
257 TTATTTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTATGTGAGAATTGTATCTCTCT
* * * *
18691 TGGTTCTTGGACGAACTTGTCAAACATTTAAAAATTCTTCTCTAACTTCGGTTCCTTAAAGTATT
322 TGGTTCTTGGACGAACTCGTCAAAC-TTTAAAAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTATT
* * *
18756 CAAGACGATCCTTTCATTAGAGACATTTCCCGAG
386 CAAGACGAT-CTTTCCTTCGAGACATTTCTCGAG
* * * * * * *
18790 CATTCCATGCTCTGAAAGTCGCATCTTTTGGTGCAAGTTGTTTTTCATTTTGTAAACAACTTTCG
1 CATTCCATGCTCGGAAA-TCGAATCTTTTGGTCCAAATAGTTTGTCA-TTT-TAAACAACTTTTG
* * *
18855 GTCTTTGAATTAAAAACTTATTTATGTGAGAATATTATCTCTCCTGGTTCCTGGACGAACTTCCG
63 GTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTTTATCTCTCCTGGTTCTTGGACGAACTTCCG
* * * **
18920 AACTTGTCAAACTTTTATGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTCAAAGTATTCAAGGCAATCCAT
128 AACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCAGTTCCTTAAAGTATTCAAGATAATCCAT
*
18985 TCCTTCAAGCAATTTTACGAACATTCCATGCTCGGGAAATCACATCATTTGGTCCAAATAGTTT-
193 TCCTTCAAGCAATTTT-CGAACATTCCATGCTCGAGAAATCACATCATTTGGTCCAAATAGTTTA
* * * * *
19049 TTA-CTTGGAAACAA-ATTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTAAGTGAGAATTTTATCTCTCT
257 TTATTTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTATGTGAGAATTGTATCTCTCT
** *
19112 TGGTTCTTGGACGAACTCGTCAAACTTTGACGAGTTCTTTTATAACTTTGGTTCCTTAAAGTATT
322 TGGTTCTTGGACGAACTCGTCAAACTTT-AAAAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTATT
* * *
19177 CAAGTCGATGCTTTCCTTCGAGACATTTCTCAAA
386 CAAGACGAT-CTTTCCTTCGAGACATTTCTCGAG
* * *
19211 AATTCCATGCTCAGGAAATCAAATCTTTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTCTTAAAACAACTTTTA
1 CATTCCATGCTC-GGAAATCGAATCTTTTGGTCCAAATAGTTTGTCATT-TT-AAACAACTTTTG
* * * * * * *
19276 GTCTTCGAATTAAAACCTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCTTGTTTCTTGGATGAACTTCCA
63 GTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTTTATCTCTCCTGGTTCTTGGACGAACTTCCG
* * * * *
19341 AACTTGTCAAACATTTCCGAGCTCTTTTATAACTTCTA-TTCATTAAAGTATTCAAGATAATCCT
128 AACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTC-AGTTCCTTAAAGTATTCAAGATAATCCA
* * *
19405 TTCCTTCGAGCAATTTCTCGAACATTCCATGCTCGGGAAATCACATTATTTGGTCCAAATAGTTT
192 TTCCTTCAAGCAATTT-TCGAACATTCCATGCTCGAGAAATCACATCATTTGGTCCAAATAGTTT
* * *
19470 ATCAATTTGTAAACAACTTTTGGT-TATTGAATTGAAAACTTATTTATGTGAGAATTGTATCAAT
256 ATTATTTTGTAAACAACTTTTGGTCT-TTGAATTAAAAACTTATTTATGTGAGAATTGTATC--T
* * *
19534 C-CTT-GTTTTTGGACGAACTTTCAAACTTATCAAACTTTTACAAGTTCTTTTATAACTTCGGTT
318 CTCTTGGTTCTTGGACGAAC--T----C--GTCAAAC-TTTAAAAGTTCTTTTATAACTTCGGTT
* * * * *
19597 CCTTAAAGTATTCAAGACGGTCAATTCCTTCGAG-CTATTTTTTGGG
374 CCTTAAAGTATTCAAGACGATC-TTTCCTTCGAGAC-ATTTCTCGAG
* * * *
19643 CATTCCATGCTTGAGAAATCGTATCGTTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTGTAACCAACTTTTGG
1 CATTCCATGCTCG-GAAATCGAATCTTTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTT-TAAACAACTTTTGG
* * * *
19708 TCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTCG-GAATTTTATCTCTCTTGGTTATTAGACGAACTTTCG
64 TCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGT-GAGAATTTTATCTCTCCTGGTTCTTGGACGAACTTCCG
* * *
19772 AACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCAGTTCCTTGAAGTATTCAAGATGATTCAT
128 AACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCAGTTCCTTAAAGTATTCAAGATAATCCAT
* * * *
19837 TCCTTCAAGCTATTTTCTGAGCATTTCATGCTCGAGAAAT-AGCATCATTTGGTTCAAATAGTTT
193 TCCTTCAAGCAATTTTC-GAACATTCCATGCTCGAGAAATCA-CATCATTTGGTCCAAATAGTTT
*
19901 -TTCATTTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTATGTGAGAAATGTATCTCT
256 ATT-ATTTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTATGTGAGAATTGTATCTCT
* * * * *
19965 CTTGGTTCTTGGACGAACTTGTCAAAGATTTAAAACTTTTTTTCTAACTTCGGTTCCTTAAAGTA
320 CTTGGTTCTTGGACGAACTCGTCAAA-CTTTAAAAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTA
20030 T
384 T
20031 CGATACGAGT
Statistics
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0.82 0.11 0.06
Matches are distributed among these distances:
420 9 0.01
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426 3 0.00
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430 9 0.01
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ACGTcount: A:0.28, C:0.18, G:0.14, T:0.40
Consensus pattern (418 bp):
CATTCCATGCTCGGAAATCGAATCTTTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTAAACAACTTTTGGTC
TTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTTTATCTCTCCTGGTTCTTGGACGAACTTCCGAAC
TTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCAGTTCCTTAAAGTATTCAAGATAATCCATTCC
TTCAAGCAATTTTCGAACATTCCATGCTCGAGAAATCACATCATTTGGTCCAAATAGTTTATTAT
TTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTATGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGT
TCTTGGACGAACTCGTCAAACTTTAAAAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGA
CGATCTTTCCTTCGAGACATTTCTCGAG
Found at i:19514 original size:216 final size:215
Alignment explanation
Indices: 18367--19984 Score: 1715
Period size: 216 Copynumber: 7.6 Consensus size: 215
18357 TGGCCGTATC
* * * * * *
18367 AACATTCCATGCTAGATAAATCGCATTATTTGGTCCAAATAGTTTGTC---TTATAAACAAATTT
1 AACATTCCATGCTCGAGAAATCACATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCAATTTGTAAACAACTTT
* * * *
18429 TGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGGGAATTTTATCTCTCTCGGTTCTTGGACGAACTTT
66 TGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTATGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTT
* * * * *
18494 CGAGCTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCAGTTCTTTAAAGTATTCAAGATAATTC
131 CGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGATGATCC
* * **
18559 ATTCCTTCAAGCTACTTTTTA
196 ATTCCTTCGAGC-AATTTTCG
* ** * *
18580 AACATTTCATGCTCGAGAAATTGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGAAAACAACTTT
1 AACATTCCATGCTCGAGAAATCACATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCAATTTGTAAACAACTTT
*
18645 TGGTCTTTGAATTAAAAATTTATTTATGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTT-G--G-A----
66 TGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTATGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTT
* ** * * * *
18702 CGAACTTGTCAAACATTTAAAAATTCTTCTCTAACTTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCC
131 CGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGATGATCC
* * * *
18767 TTTCATTAGAG-ACATTTCCCG
196 ATTCCTTCGAGCA-ATTT-TCG
* * * * * * * * *
18788 AGCATTCCATGCTCTGA-AAGTCGCATCTTTTGGTGCAAGTTGTTTTTCATTTTGTAAACAACTT
1 AACATTCCATGCTC-GAGAAATCACATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCAATTTGTAAACAACTT
* * *
18852 TCGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTATGTGAGAATAT-TATCTCTCCTGGTTCCTGGACGAACT
65 TTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTATGTGAGAAT-TGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACT
* * * ***
18916 TCCGAACTTGTCAAACTTTTATGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTCAAAGTATTCAAGGCAAT
129 TTCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGATGAT
*
18981 CCATTCCTTCAAGCAATTTTACG
194 CCATTCCTTCGAGCAATTTT-CG
* * * * *
19004 AACATTCCATGCTCGGGAAATCACATCATTTGGTCCAAATAGTTT-T-TACTTGGAAACAA-ATT
1 AACATTCCATGCTCGAGAAATCACATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCAATTTGTAAACAACTTT
* *
19066 TGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTAAGTGAGAATTTTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAAC--T
66 TGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTATGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTT
* * *
19129 ----C--GTCAAACTTTGACGAGTTCTTTTATAACTTTGGTTCCTTAAAGTATTCAAG-TCGATG
131 CGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGAT-GATC
* *
19187 CTTTCCTTCGAG-ACATTTCTCA
195 CATTCCTTCGAGCA-ATTT-TCG
* * *
19209 AAAATTCCATGCTC-AGGAAATCAAATCTTTTGGTCCAAATAGTTTGTC-ATTCT-TAAAACAAC
1 AACATTCCATGCTCGA-GAAATCACATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCAATT-TGT-AAACAAC
* * * * * *
19271 TTTTAGTCTTCGAATTAAAACCTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCTTGTTTCTTGGATGAAC
63 TTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTATGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAAC
* * * * * ** * *
19336 TTCCAAACTTGTCAAACATTTCCGAGCTCTTTTATAACTTCTATTCATTAAAGTATTCAAGATAA
128 TTTCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGATGA
*
19401 TCCTTTCCTTCGAGCAATTTCTCG
193 TCCATTCCTTCGAGCAATTT-TCG
* * *
19425 AACATTCCATGCTCGGGAAATCACATTATTTGGTCCAAATAGTTTATCAATTTGTAAACAACTTT
1 AACATTCCATGCTCGAGAAATCACATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCAATTTGTAAACAACTTT
* *
19490 TGGT-TATTGAATTGAAAACTTATTTATGTGAGAATTGTATCAATC-CTT-GTTTTTGGACGAAC
66 TGGTCT-TTGAATTAAAAACTTATTTATGTGAGAATTGTATC--TCTCTTGGTTCTTGGACGAAC
* * * * *
19552 TTTCAAACTTATCAAACTTTTACAAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGG
128 TTTCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGATGA
* * *
19617 TCAATTCCTTCGAGCTATTTTTTG
193 TCCATTCCTTCGAGC-AATTTTCG
** * ** * *
19641 GGCATTCCATGCTTGAGAAATCGTATCGTTTGGTCCAAATAGTTTGTC-ATTTGTAACCAACTTT
1 AACATTCCATGCTCGAGAAATCACATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCAATTTGTAAACAACTTT
* * * *
19705 TGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTCG-GAATTTTATCTCTCTTGGTTATTAGACGAACTT
66 TGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTATGT-GAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTT
* * *
19769 TCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCAGTTCCTTGAAGTATTCAAGATGATT
130 TCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGATGATC
* *
19834 CATTCCTTCAAGCTATTTTCTG
195 CATTCCTTCGAGCAATTTTC-G
* * * * *
19856 AGCATTTCATGCTCGAGAAAT-AGCATCATTTGGTTCAAATAGTTTTTCATTTTGTAAACAACTT
1 AACATTCCATGCTCGAGAAATCA-CATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCAATTTGTAAACAACTT
*
19920 TTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTATGTGAGAAATGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTT
65 TTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTATGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTT
19985 GTCAAAGATT
Statistics
Matches: 1164, Mismatches: 188, Indels: 103
0.80 0.13 0.07
Matches are distributed among these distances:
204 1 0.00
205 104 0.09
206 5 0.00
207 11 0.01
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209 4 0.00
211 1 0.00
212 3 0.00
213 104 0.09
214 17 0.01
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217 14 0.01
218 2 0.00
ACGTcount: A:0.28, C:0.18, G:0.14, T:0.40
Consensus pattern (215 bp):
AACATTCCATGCTCGAGAAATCACATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCAATTTGTAAACAACTTT
TGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTATGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTT
CGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGATGATCC
ATTCCTTCGAGCAATTTTCG
Found at i:19582 original size:637 final size:632
Alignment explanation
Indices: 18367--19984 Score: 1927
Period size: 637 Copynumber: 2.5 Consensus size: 632
18357 TGGCCGTATC
* * * *
18367 AACATTCCATGCTAGATAAATCGCATTATTTGGTCCAAATAGTTTGT-CTTATAAACAAATTTTG
1 AACATTCCATGCTAGAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTTTACTTGTAAACAAA-TTTG
*
18431 GTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGGGAATTTTATCTCTCTCGGTTCTTGGACGAACTTTCG
65 GTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGT-GGAATTTTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAAC--T--
* *
18496 AGCTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCAGTTCTTTAAAGTATTCAAGATAATTCAT
125 --C--GTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCAGTTCCTTAAAGTATTCAAGATGATTCAT
* *
18561 TCCTTCAAGCTACTTTTTAAACATTTCATGCTCGAGAAATTGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTG
186 TCCTTCAAGCTA-TTTTCAAACATTTCATGCTCGAGAAA-TACATCATTTGGTCCAAATAGTTTG
*
18626 TCATTTTGAAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAATTTATTTATGTGAGAATTGTATCTCTCT
249 TCATTTTGAAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTATGTGAGAATTGTATCTCTCT
* * * * *
18691 TGGTTCTT-G-G-A---CGAACTTGTCAAACATTTAAAAATTCTTCTCTAACTTCGGTTCCTTAA
314 TGGTTCTTGGAGAACTTCAAACTTGTCAAACATTTAAAAACTCTTCTATAACTTCGATTCATTAA
* * * *
18750 AGTATTCAAGACGATCCTTTCATTAGAGACATTTCCCGAGCATTCCATGCTCTGAAAGTCGCATC
379 AGTATTCAAGACAATCCTTTCATTAGAGACATTTCCCGAACATTCCATGCTCGGAAAGTCACATC
* * * * *
18815 TTTTGGTGCAAGTTGTTTTTCATTTTGTAAACAACTTTCGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTAT
444 TTTTGGTCCAAATAGTTTATCAATTTGTAAACAACTTTCGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTAT
** * * **
18880 GTGAGAATATTATCTCTCCTGGTTCCTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTATGAGTTCT
509 GTGAGAATATTATCAATCCTGGTTCCTGGACGAACTTCCAAACTTATCAAACTTTTACAAGTTCT
* *
18945 TTTATAACTTCGGTTCCTCAAAGTATTCAAGGCAATCCATTCCTTCAAGCAATTTTACG
574 TTTATAACTTCGGTTCCTCAAAGTATTCAAGACAATCAATTCCTTCAAGCAATTTTACG
* * * *
19004 AACATTCCATGCTCGGGAAATCACATCATTTGGTCCAAATAGTTTTTACTTGGAAACAAATTTGG
1 AACATTCCATGCTAGAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTTTACTTGTAAACAAATTTGG
*
19069 TCTTTGAATTAAAAACTTATTTAAGTGAGAATTTTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTCGTCA
66 TCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTG-GAATTTTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTCGTCA
* ** * * *
19134 AACTTTGACGAGTTCTTTTATAACTTTGGTTCCTTAAAGTATTCAAG-TCGATGCTTTCCTTCGA
130 AACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCAGTTCCTTAAAGTATTCAAGAT-GATTCATTCCTTCAA
* * * *
19198 GAC-ATTTCTCAAAAATTCCATGCTC-AGGAAATCAAATCTTTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTC
194 G-CTATTT-TCAAACATTTCATGCTCGA-GAAAT-ACATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATT-
* * * * *
19261 TT-AAAACAACTTTTAGTCTTCGAATTAAAACCTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCTTGTTT
254 TTGAAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTATGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTT
*** * * *
19325 CTTGGATGAACTTCCAAACTTGTCAAACATTTCCGAGCTCTTTTATAACTTCTATTCATTAAAGT
319 CTTGGA-GAACTT-CAAACTTGTCAAACATTTAAAAACTCTTCTATAACTTCGATTCATTAAAGT
* * * *
19390 ATTCAAGATAATCCTTTCCTTCGAG-CAATTTCTCGAACATTCCATGCTCGGGAAA-TCACAT-T
382 ATTCAAGACAATCCTTTCATTAGAGAC-ATTTCCCGAACATTCCATGCTC-GGAAAGTCACATCT
* *
19452 ATTTGGTCCAAATAGTTTATCAATTTGTAAACAACTTTTGGT-TATTGAATTGAAAACTTATTTA
445 -TTTGGTCCAAATAGTTTATCAATTTGTAAACAACTTTCGGTCT-TTGAATTAAAAACTTATTTA
* ** *
19516 TGTGAGAAT-TGTATCAATCCTTGTTTTTGGACGAACTTTCAAACTTATCAAACTTTTACAAGTT
508 TGTGAGAATAT-TATCAATCCTGGTTCCTGGACGAACTTCCAAACTTATCAAACTTTTACAAGTT
* ** * * **
19580 CTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGGTCAATTCCTTCGAGCTATTTTTTG
572 CTTTTATAACTTCGGTTCCTCAAAGTATTCAAGACAATCAATTCCTTCAAGCAATTTTACG
** * * * * * * *
19641 GGCATTCCATGCTTGAGAAATCGTATCGTTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTGTAACCAACTTTT
1 AACATTCCATGCTAGAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTT-TTACTTGTAAACAA-ATTT
*
19706 GGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTCGGAATTTTATCTCTCTTGGTTATTAGACGAACTTTC
64 GGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGT-GGAATTTTATCTCTCTTGGTTCTT-G--G-A----C
* *
19771 GAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCAGTTCCTTGAAGTATTCAAGATGATTCA
120 GAACTCGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCAGTTCCTTAAAGTATTCAAGATGATTCA
* * *
19836 TTCCTTCAAGCTATTTTCTGAGCATTTCATGCTCGAGAAATAGCATCATTTGGTTCAAATAGTTT
185 TTCCTTCAAGCTATTTTC-AAACATTTCATGCTCGAGAAATA-CATCATTTGGTCCAAATAGTTT
* * *
19901 TTCATTTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTATGTGAGAAATGTATCTCTC
248 GTCATTTTGAAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTATGTGAGAATTGTATCTCTC
19966 TTGGTTCTTGGACGAACTT
313 TTGGTTCTTGGA-GAACTT
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Statistics
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Consensus pattern (632 bp):
AACATTCCATGCTAGAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTTTACTTGTAAACAAATTTGG
TCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGGAATTTTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTCGTCAA
ACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCAGTTCCTTAAAGTATTCAAGATGATTCATTCCTTCAAGC
TATTTTCAAACATTTCATGCTCGAGAAATACATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGAAAA
CAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTATGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGAG
AACTTCAAACTTGTCAAACATTTAAAAACTCTTCTATAACTTCGATTCATTAAAGTATTCAAGAC
AATCCTTTCATTAGAGACATTTCCCGAACATTCCATGCTCGGAAAGTCACATCTTTTGGTCCAAA
TAGTTTATCAATTTGTAAACAACTTTCGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTATGTGAGAATATTA
TCAATCCTGGTTCCTGGACGAACTTCCAAACTTATCAAACTTTTACAAGTTCTTTTATAACTTCG
GTTCCTCAAAGTATTCAAGACAATCAATTCCTTCAAGCAATTTTACG
Found at i:25388 original size:214 final size:214
Alignment explanation
Indices: 24959--25907 Score: 1020
Period size: 214 Copynumber: 4.5 Consensus size: 214
24949 ACATTTCTGG
* * * *
24959 GTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTATTCAATACGATCAATTCCTTTGAGCT-ATTTTCCG
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* * * * * * *
25023 GGCATTCCATGCTCGAGAAATCGTATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTGTAACCAACTTTT
65 AGCATTCCATGCTCGAGAAATCGCATTATTTGGTCCAAATAGTTT-TTACTTGGAAACAACTTTT
*
25088 GGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACATGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCC
129 GGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCC
25153 GAA-CTAGTCAAACTTTTACGA
194 GAACCT-GTCAAACTTTTACGA
* *
25174 GTTCTTTTAT-ACTTTTGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTCAAGTAATTTTACG
1 GTTCTTTTATAAC-TTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGTAATTTTACG
* * ** *
25238 AGCATTCCATGCTCGAAAAATCGCATTATTTAGTCTGAATAGTTTTTACTTGGAAACAAAATTTT
65 AGCATTCCATGCTCGAGAAATCGCATTATTTGGTCCAAATAGTTTTTACTTGGAAAC-AACTTTT
* * * * *
25303 -GTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTTTATCTCTCTTGATTCATGGATGAACTTTC
129 GGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCC
25367 GAACCTGTCAAACTTTTACGA
194 GAACCTGTCAAACTTTTACGA
* * * * * *
25388 GTT-TGTTTATAACTTCAGTTCCTTAAAGTATTCACGATGATTCATTCCTTCAAGTTATTTT-CT
1 GTTCT-TTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGTAATTTTAC-
* * * * * * **
25451 GAACATTTCATGCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCCATATAGTTTGTCATTTCATAAACAACTT
64 GAGCATTCCATGCTCGAGAAATCGCATTATTTGGTCCAAATAGTTT-TTACTT-GGAAACAACTT
* *
25516 TTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTT-TGAGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAAC-T
127 TTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTT
* **
25579 -------TGTCAAACGTTTAAAA
192 CCGAACCTGTCAAACTTTTACGA
* * * * * *
25595 CTTCTTTTCTAACTTCGATTCCTTAATGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAG-ACATTTCACG
1 GTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGTA-ATTTTACG
* * * * *
25659 AGCATTCCATGCTCTG-GAAGTCACA-TATTTTGGTCCAAATTGTTTTTCATTTTGTAAACAACT
65 AGCATTCCATGCTC-GAGAAATCGCATTA-TTTGGTCCAAATAGTTTTT-A-CTTGGAAACAACT
* * *
25722 TTTGGTCGTTGAATTAAAAACTTATTTATGTGAGAATAT-TATCTCTCCTGGTTCTTGGACGAAC
126 TTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAAT-TGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAAC
*
25786 TTCCGAACTTGTCAAACTTTTACGA
190 TTCCGAACCTGTCAAACTTTTACGA
* * * ** *
25811 GTTCTTTTATAACTTCGGTTTCTCAAAGTATTCAAGACAATCCATTCCCACGAGCAATTTTACGA
1 GTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGTAATTTTACGA
* *
25876 ACATTCCATGCTC-AGGAAATCACATTATTTGG
66 GCATTCCATGCTCGA-GAAATCGCATTATTTGG
25908 AAACAAATTT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.28, C:0.19, G:0.14, T:0.39
Consensus pattern (214 bp):
GTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGTAATTTTACGA
GCATTCCATGCTCGAGAAATCGCATTATTTGGTCCAAATAGTTTTTACTTGGAAACAACTTTTGG
TCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCCGA
ACCTGTCAAACTTTTACGA
Found at i:26727 original size:215 final size:217
Alignment explanation
Indices: 25903--29693 Score: 3851
Period size: 215 Copynumber: 17.9 Consensus size: 217
25893 AATCACATTA
* * * * * * *
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* * *
25968 TCTT-G--G-A----CGAACTTGTCAAACTTTGATGAGTTCTTTTATAACTTTGGTTCCTTAAAG
66 TCTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAG
* * * * * *
26025 TA-TCAAGTCGATGC-TGTCCTT-TGAG-ATATTTCTCGAAAATTCCATGCTCGGGAAATCGAAT
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*
26086 CTTTTGGTCCAAATAGTTTGTCAT
194 CATTTGGTCCAAATAGTTTGTCAT
* ** * ** *
26110 TTTGAAAACAACTTTTGGTCTTCCAATTAAAACCTTATTTGTGTGAGAATTGTATCTCTCTTGTT
1 TTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGT
* * * * * *
26175 TCATGGATGAACTTCCAAACTTGTCAAACATTTACGAGTTCTTTTATAACCTCTGTTCCTTAAAG
66 TCTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAG
* * * * *
26240 TA-TC----C--T---TTCCTTC-GAGCAATTTCTTGAACATTCCATACTCGGGAAATCACATTA
131 TATTCAAGACGATCCATTCCTTCAGAGCAATTTCTCGAACATTCCATGCTCGAGAAATCGCATCA
*
26294 TTTTGTCCAAATAGTTTGTCAT
196 TTTGGTCCAAATAGTTTGTCAT
* * * *
26316 TTTGTAAACAACTTCTGGTTTTTGAATTAAAAACTTATTTACATGAGAATTGTATCTCTCATGGT
1 TTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGT
26381 TCTT-G--G-A----CGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAG
66 TCTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAG
* * * * *
26438 TATTCAACACGATCCTTTCCTTC-GAG-ACATTTCCCGAACATTTCATGCTCGAAAAATCGCATC
131 TATTCAAGACGATCCATTCCTTCAGAGCA-ATTTCTCGAACATTCCATGCTCGAGAAATCGCATC
26501 ATTTGGTCCAAATAGTTTGTCAT
195 ATTTGGTCCAAATAGTTTGTCAT
* * ** * *
26524 TTTGTGAACAACTTTTGGT-TATTGAATTGAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTATCAATCCTAG
1 TTTGTAAACAACTTTTGGTCT-TTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCTTGG
* ** * *
26588 TTTTTGGACG-ACTTTTGAACTTGTCAAACTTTTAGGAGTTCTTTTATAACATCGGTTCCTTAAA
65 TTCTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAA
* * * * ** * **
26652 GTATTCAAGAAGATCAATTCCTTCAG-GCTATTTTTCGGGCATTCCAGGCTCGAGAAATCATATC
130 GTATTCAAGACGATCCATTCCTTCAGAGCAATTTCTCGAACATTCCATGCTCGAGAAATCGCATC
*
26716 GTTTGGTCCAAATAGTTTGTCA-
195 ATTTGGTCCAAATAGTTTGTCAT
* * * *
26738 TTTCTAACCAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACATGAGAATTGTGTCTCTCTTGGT
1 TTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGT
* * * *
26803 TTTTGGACGAACTTCCGAACTAGTCAAACTTTTATGAGTTCTTTTAT-ACTTTTGGTTCCTTAAA
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* * * ** * *
26867 GTTTTCAAGATGATCCATTCGTTC-GAGCAATTTCAAGAACATTCCATGCTCGATAAATCGCATT
130 GTATTCAAGACGATCCATTCCTTCAGAGCAATTTCTCGAACATTCCATGCTCGAGAAATCGCATC
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195 ATTTGGTCCAAATAGTTTGTCAT
* * *
26952 -TTGAAAACAAATTTTGGTCTTTGAATTAAAAACGTATTTACGTGAGAATT-T-TCTCTCTTGGT
1 TTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGT
* * * * * * *
27014 TATTGGATGAACTTTCGAATTTGTCAAACTTTTATGAGTTCTTTTATAACTTCAGTTCCTTGAAG
66 TCTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAG
* ** * *
27079 TATTCAAGATGATTAATTCCTTCA-AGCTATTT-TCTGAACATTTCATGCTCGAGAAATCGCATC
131 TATTCAAGACGATCCATTCCTTCAGAGCAATTTCTC-GAACATTCCATGCTCGAGAAATCGCATC
*
27142 ATTTGGTCAAAATAGTTTGTCAT
195 ATTTGGTCCAAATAGTTTGTCAT
* * * ** *
27165 TTTGTAAACAACTTCTGGTTTTTGAATTAAAAACTTATTTACGAGAGAATTGTATCAATCCTGGT
1 TTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGT
* * * *
27230 TTTTGGATGAACTTTCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCATAAAG
66 TCTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAG
* * * * * ** *
27295 TAATCAAGACGATCAATTTCTTC-GAGCTATTTTTC-AGGTATTCCATGCTCGAGAAATCGTATC
131 TATTCAAGACGATCCATTCCTTCAGAGCAATTTCTCGA-ACATTCCATGCTCGAGAAATCGCATC
* *
27358 GTTTGGTCCAAATAGCTTGTCA-
195 ATTTGGTCCAAATAGTTTGTCAT
* * *
27380 TTTGTAACCAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAAATTATTTACATGAGAATTGTATCTCTCTTGGT
1 TTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGT
* * * *
27445 TCTTAGACGAACTTCTGAACTTGTCAAACATTTACGAGTTCTTTTAT-ACTTTTGGTTCCTTAAA
66 TCTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAAC-TTCGGTTCCTTAAA
* * * * * * *
27509 GAATTCAAGATGATCCATTCCTT-TGAGCAATTTCAAC-AACACTCCATGCTTGATAAATCGCAT
130 GTATTCAAGACGATCCATTCCTTCAGAGCAATTTC-TCGAACATTCCATGCTCGAGAAATCGCAT
* *
27572 AATTTGGTCCAAATAATTTGTC--
194 CATTTGGTCCAAATAGTTTGTCAT
* * *
27594 -TTGTAAACAAATTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGGGAATTTTATCTCTCTTGGT
1 TTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGT
* * * * *
27658 TCTTGGACGAACTTTCGAACTTGTCAAACTTTTACGTGTCCGTTTATAACTTCAGTTCCTTAAAG
66 TCTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAG
* * * * *
27723 TATTCAAGATGATTCATTCCTTCA-AGCAATTT-TCTAAACATTTCATGCTTGAGAAATCGCATC
131 TATTCAAGACGATCCATTCCTTCAGAGCAATTTCTC-GAACATTCCATGCTCGAGAAATCGCATC
27786 ATTTGGTCCAAATAGTTTGTCAT
195 ATTTGGTCCAAATAGTTTGTCAT
* **
27809 TTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTATGTGAGAATTGTATCTCTCTTGAC
1 TTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGT
* ** * *
27874 TCTT-G--G-A--T--GAACTTGTCAAACATTTAAAACTTCTTTTCTAACTTCGGTTCCTTAAAG
66 TCTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAG
* ** * * * *
27931 TATTCAAGATGATCCATTCCTTC-GAGCAATTTCAAGAATATTCCACGCTCGATAAATCGCATTA
131 TATTCAAGACGATCCATTCCTTCAGAGCAATTTCTCGAACATTCCATGCTCGAGAAATCGCATCA
27995 TTTGGT-CAATATAGTTTGTC--
196 TTTGGTCCAA-ATAGTTTGTCAT
* * * * *
28015 -TTGTAAACAAATTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACTTGGGAATTTTATCTCTTTTGGT
1 TTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGT
* * *
28079 TCTTGGATGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCGTTTATAACTTCAGTTCCTTAAAG
66 TCTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAG
* * * *
28144 TATTCAAGATGATTCATTCCTTCA-AGCTATTT-TCTGAACATTTCATGCTCGAGAAATCGCATC
131 TATTCAAGACGATCCATTCCTTCAGAGCAATTTCTC-GAACATTCCATGCTCGAGAAATCGCATC
* *
28207 ATTTGTTCCAAATAATTTGTCAT
195 ATTTGGTCCAAATAGTTTGTCAT
*
28230 TTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTAAGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGT
1 TTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGT
* ** * * **
28295 TCTTGGACGAA----C---C-TGTCAAACATTTAAAACTTCTTTTCTAACTTTTGTTCCTTAAAG
66 TCTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAG
* * * * * * *
28352 TATTCAAGACGATCCTTTCTTTC-GAG-ACATTTCCCGAGCATTCCATGCTCTAGAAGTCTCATC
131 TATTCAAGACGATCCATTCCTTCAGAGCA-ATTTCTCGAACATTCCATGCTCGAGAAATCGCATC
* * *
28415 CTTTGGTCCAAATTGTTTTTCAT
195 ATTTGGTCCAAATAGTTTGTCAT
* * * *
28438 TTTGTAAACAACTTTTGGTCCTTGAATTAAAAACTTATTTATGTTAGAATAT-TATCTCTCCTGG
1 TTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAAT-TGTATCTCTCTTGG
* * * * * *
28502 TTCGTGGACAAACTTTCAAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAAATTCGGTTCCTCAAA
65 TTCTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAA
* * * * * *
28567 GTATTCAAGGCAATCCATTCCTTC-GAACAATTT-TAAGAACATTCCATGCTCGGGAAATCACAT
130 GTATTCAAGACGATCCATTCCTTCAGAGCAATTTCT-CGAACATTCCATGCTCGAGAAATCGCAT
* * *
28630 TATTTGGTCTAAATAGGTTT-T-AC
194 CATTTGGTCCAAATA-GTTTGTCAT
* * * * *
28653 TTAG-AAACTAA-TTTTTGTATTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGCATTTTATCTCTCTTGG
1 TTTGTAAAC-AACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCTTGG
* * * *
28716 TTCTT-G--G-A----CGAACTTGTCAAACTTTGACAAGTTTTTTTATAACTTTGGTTCCTTAAA
65 TTCTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAA
* * * * * * * *
28773 GTATTCAAGTCGATGCTTTCCTTC-GAG-ACATTTCTCAAAAATTCCATGCTCGGGAAATTGAAT
130 GTATTCAAGACGATCCATTCCTTCAGAGCA-ATTTCTCGAACATTCCATGCTCGAGAAATCGCAT
* *
28836 -ATTTTTGTCCAAATAGTTTGTCTT
194 CA-TTTGGTCCAAATAGTTTGTCAT
* * * * *
28860 TTTGAAAACAACTTTTGGTCTTCGAATTAAAACCTTATTTACGTGAGAATTGTAGCTCTCTTGTT
1 TTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGT
* * * * **
28925 TCTTGGATGAACTTCCAAACTTGTCAAACATTTACGAGTTC-TTTATAACCTCTATTCCTTAAAG
66 TCTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAG
* * * * ** *
28989 TATTAAACACGATCCTTTCCTTC-GAGCAATTTCTCGAACATTCCATGCTCGGGAAAT-AAATTA
131 TATTCAAGACGATCCATTCCTTCAGAGCAATTTCTCGAACATTCCATGCTCGAGAAATCGCATCA
29052 TTTGGTCCAAATAGTTTGTCAT
196 TTTGGTCCAAATAGTTTGTCAT
* * * * *
29074 TCTGTAAACAACTTATGGTTTTTGAATTTAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCATGGT
1 TTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGT
* * *
29139 TCTT-G--G-A----CGAACTTGTCAAACTTTTACAAGTTCTTTTATAAATTTGGTTCCTTAAAG
66 TCTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAG
* * * * * * *
29196 TATTCAACACGATCCTTTCCTTC-GAG-ACATTTCCCGAACATTCCATGCTTGAAAAATTGCATG
131 TATTCAAGACGATCCATTCCTTCAGAGCA-ATTTCTCGAACATTCCATGCTCGAGAAATCGCATC
29259 ATTTGGTCCAAATAGTTTGTCAT
195 ATTTGGTCCAAATAGTTTGTCAT
* * ** * *
29282 TTTGTAAACAACTTTTGGT-TATTGAATTGAAAACTTATTTATGTGAGAATTGTATCAATCCTGA
1 TTTGTAAACAACTTTTGGTCT-TTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCTTGG
* * * *
29346 TTTTTGGACGAACTTTCAAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCAGTTCCTTAAA
65 TTCTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAA
* * * * ** * **
29411 GTATTCAAGAAGATCAATTCGTTC-GAGCTATTT-TCTGGGCATTTCATGCTCGAGAAATCATAT
130 GTATTCAAGACGATCCATTCCTTCAGAGCAATTTCTC-GAACATTCCATGCTCGAGAAATCGCAT
*
29474 CGTTTGGTCCAAATAGTTTGTCA-
194 CATTTGGTCCAAATAGTTTGTCAT
* * * *
29497 TTTGTAACCAACTTTTGGTGTTTGAATAAAAAACTTATTTACATGAGAATTGTATCTCTCTTGGT
1 TTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGT
* * * * *
29562 TCTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACATTTACGAGTTCTTTCAT-GCTTTTGGATCCTTAAA
66 TCTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAAC-TTCGGTTCCTTAAA
* * ** * *
29626 GTATACAAGACGATCAATTCCTTCA-AGCAATTTCAAGAACATTCCATGCTCGATAAATCGCATT
130 GTATTCAAGACGATCCATTCCTTCAGAGCAATTTCTCGAACATTCCATGCTCGAGAAATCGCATC
29690 ATTT
195 ATTT
29694 CGAAAACAAC
Statistics
Matches: 2976, Mismatches: 483, Indels: 242
0.80 0.13 0.07
Matches are distributed among these distances:
198 48 0.02
199 2 0.00
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203 2 0.00
205 68 0.02
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216 495 0.17
217 7 0.00
ACGTcount: A:0.28, C:0.17, G:0.15, T:0.40
Consensus pattern (217 bp):
TTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGT
TCTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAG
TATTCAAGACGATCCATTCCTTCAGAGCAATTTCTCGAACATTCCATGCTCGAGAAATCGCATCA
TTTGGTCCAAATAGTTTGTCAT
Found at i:28871 original size:422 final size:419
Alignment explanation
Indices: 24959--29846 Score: 4192
Period size: 421 Copynumber: 11.6 Consensus size: 419
24949 ACATTTCTGG
* * *
24959 GTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTATTCAA-TACGATCAATTCCTTTGAGCTATTT-TCC
1 GTTCTTTTATAACTTTGGTTCCTTAAAGTATTCAAGT--GATCCATTCCTTCGAGC-ATTTCT-C
** * * *
25022 GGGCATTCCATGCTCGAGAAATCGTATCA-TTTGGTCCAAATAGTTTGTCA-TTTGTAACCAACT
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*
25085 TTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACATGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACT
126 TTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACT
* * *
25150 TCCGAACTAGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTAT-ACTTTTGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGA
191 TTCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAAC-TTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGA
* * * * * **
25214 TCCATTCCTTC-AAGTAATTTT-ACGAGCATTCCATGCTCGAAAAATCGCATTATTTAGTCTGAA
255 TCCATTCCTTCGAA-CAATTTTCA-GAACATTCCATGCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAA
* * * *
25277 TAGTTTTTAC-TTGGAAACAAAATTTT-GTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTTTA
318 TAGTTTGT-CTTTGTAAAC-AACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTA
* * * *
25340 TCTCTCTTGATTCATGGATGAACTTTCGAACCTGTCAAACTTTTACGA
381 TCTCTCTTGGTTC-T---TGGA----CGAACTTGTCAAAC-TTTACAA
** * * * *
25388 GTT-TGTTTATAACTTCAGTTCCTTAAAGTATTCACGATGATTCATTCCTTCAAGTTATTT-TCT
1 GTTCT-TTTATAACTTTGGTTCCTTAAAGTATTCAAG-TGATCCATTCCTTCGAG-CATTTCTC-
* * * **
25451 GAACATTTCATGCTCGAGAAATCGCATCA-TTTGGTCCATATAGTTTGTCATTTCATAAACAACT
62 GAACATTCCATGCTCGAGAAATTGCAT-ATTTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACT
* *
25515 TTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTT-TGAGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTT-G--G-A--
126 TTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACT
* ** * * * *
25573 --CGAACTTGTCAAACGTTTAAAACTTCTTTTCTAACTTCGATTCCTTAATGTATTCAAGACGAT
191 TTCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGAT
* * * *
25636 CCTTTCCTTCGAGAC-A-TTTCACGAGCATTCCATGCTCTG-GAAGTCACAT-ATTTTGGTCCAA
256 CCATTCCTTCGA-ACAATTTTCA-GAACATTCCATGCTC-GAGAAATCGCATCA-TTTGGTCCAA
* * * *
25697 ATTGTTTTTCATTTTGTAAACAACTTTTGGTCGTTGAATTAAAAACTTATTTATGTGAGAATAT-
317 ATAGTTTGTC--TTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAAT-TG
* *
25761 TATCTCTCCTGGTTCTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACGA
379 TATCTCTCTTGGTTCTT-G--G-A----CGAACTTGTCAAAC-TTTACAA
* * * ** **
25811 GTTCTTTTATAACTTCGGTTTCTCAAAGTATTCAAGACAATCCATTCCCACGAGCAATTT-TACG
1 GTTCTTTTATAACTTTGGTTCCTTAAAGTATTCAAG-TGATCCATTCCTTCGAGC-ATTTCT-CG
* *
25875 AACATTCCATGCTC-AGGAAA-T-C--A--------C----A---T-T-A-TTTGGAAACAAATT
63 AACATTCCATGCTCGA-GAAATTGCATATTTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTT
* * * * *
25917 TTTGTCTTTGAATTAAAAACATATTTGCTTGAGAATTTTATCTCTCTTGGTTCTT-G--G-A---
127 TTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTT
* * * * *
25975 -CGAACTTGTCAAACTTTGATGAGTTCTTTTATAACTTTGGTTCCTTAAAGTA-TCAAGTCGATG
192 TCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATC
* * * * * *
26038 C-TGTCCTTTGAGA-TATTTCTC-GAAAATTCCATGCTCGGGAAATCGAATCTTTTGGTCCAAAT
257 CAT-TCCTTCGA-ACAATTT-TCAGAACATTCCATGCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAAT
* ** * **
26100 AGTTTGTCATTTTGAAAACAACTTTTGGTCTTCCAATTAAAACCTTATTTGTGTGAGAATTGTAT
319 AGTTTGTC--TTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTAT
* * * *
26165 CTCTCTTGTTTCATGGATGAACTTCCAAACTTGTCAAACATTTACGA
382 CTCTCTTGGTTC-T---TGGA----CGAACTTGTCAAAC-TTTACAA
* * *
26212 GTTCTTTTATAACCTCT-GTTCC-T----TA---AAGT-ATCCTTTCCTTCGAGCAATTTCTTGA
1 GTTCTTTTATAA-CTTTGGTTCCTTAAAGTATTCAAGTGATCCATTCCTTCGAGC-ATTTCTCGA
* * ** *
26267 ACATTCCATACTCGGGAAATCACATTATTTT-GTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTC
64 ACATTCCATGCTCGAGAAATTGCA-TATTTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTT
* * *
26331 TGGTTTTTGAATTAAAAACTTATTTACATGAGAATTGTATCTCTCATGGTTCTT-G--G-A----
128 TGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTT
*
26388 CGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTATTCAACACGATCC
193 CGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCC
* * * * *
26453 TTTCCTTCGAGAC-ATTTCCCGAACATTTCATGCTCGAAAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGT
258 ATTCCTTCGA-ACAATTTTCAGAACATTCCATGCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGT
* * *
26517 TTGTCATTTTGTGAACAACTTTTGGT-TATTGAATTGAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTATCA
322 TTGTC--TTTGTAAACAACTTTTGGTCT-TTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTATCT
* * * * **
26581 ATCCTAGTTTTTGGACGACTTTTGAACTTGTCAAACTTTTAGGA
384 CTCTTGGTTCTT-G--GAC----GAACTTGTCAAAC-TTTACAA
* * * * *
26625 GTTCTTTTATAACATCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGAAGATCAATTCCTTC-AGGCTATTTTTCG
1 GTTCTTTTATAACTTTGGTTCCTTAAAGTATTCAAG-TGATCCATTCCTTCGA-GC-ATTTCTCG
** * * *
26689 GGCATTCCAGGCTCGAGAAA-T-CATATCGTTTGGTCCAAATAGTTTGTCA-TTTCTAACCAACT
63 AACATTCCATGCTCGAGAAATTGCATAT--TTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACT
* * *
26751 TTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACATGAGAATTGTGTCTCTCTTGGTTTTTGGACGAACT
126 TTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACT
* * * * * *
26816 TCCGAACTAGTCAAACTTTTATGAGTTCTTTTAT-ACTTTTGGTTCCTTAAAGTTTTCAAGATGA
191 TTCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAAC-TTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGA
* * * *
26880 TCCATTCGTTCGAGCAA-TTTCAAGAACATTCCATGCTCGATAAATCGCATTATTTGGTCCAAAT
255 TCCATTCCTTCGAACAATTTTC-AGAACATTCCATGCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAAT
* * *
26944 AGTTTGTC-TTGAAAACAAATTTTGGTCTTTGAATTAAAAACGTATTTACGTGAGAATT-T-TCT
319 AGTTTGTCTTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTATCT
* * **
27006 CTCTTGGTTATTGGATGAACTTTCGAATTTGTCAAACTTTTATGA
384 CTCTTGGTTCTT-G--G-A----CGAACTTGTCAAAC-TTTACAA
** * ** *
27051 GTTCTTTTATAACTTCAGTTCCTTGAAGTATTCAAGATGATTAATTCCTTCAAGCTATTT-TCTG
1 GTTCTTTTATAACTTTGGTTCCTTAAAGTATTCAAG-TGATCCATTCCTTCGAGC-ATTTCTC-G
* * *
27115 AACATTTCATGCTCGAGAAATCGCATCA-TTTGGTCAAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTT
63 AACATTCCATGCTCGAGAAATTGCAT-ATTTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTT
* * * ** * * *
27179 CTGGTTTTTGAATTAAAAACTTATTTACGAGAGAATTGTATCAATCCTGGTTTTTGGATGAACTT
127 TTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTT
* *
27244 TCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCATAAAGTAATCAAGACGATC
192 TCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATC
* * * * ** * *
27309 AATTTCTTCGAGCTATTTTTCAG-GTATTCCATGCTCGAGAAATCGTATCGTTTGGTCCAAATAG
257 CATTCCTTCGAAC-AATTTTCAGAACATTCCATGCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAG
* * * *
27373 CTTGTCATTTGTAACCAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAAATTATTTACATGAGAATTGTATCTC
321 TTTGTC-TTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTATCTC
*
27438 TCTTGGTTCTTAGACGAACTTCTGAACTTGTCAAACATTTACGA
385 TCTTGGTTCTT-G--G-A---C-GAACTTGTCAAAC-TTTACAA
* * *
27482 GTTCTTTTAT-ACTTTTGGTTCCTTAAAGAATTCAAGATGATCCATTCCTTTGAGCAATTTCAAC
1 GTTCTTTTATAAC-TTTGGTTCCTTAAAGTATTCAAG-TGATCCATTCCTTCGAGC-ATTTC-TC
* * * * * * *
27546 -AACACTCCATGCTTGATAAATCGCATAATTTGGTCCAAATAATTTGTC---TTGTAAACAAATT
62 GAACATTCCATGCTCGAGAAATTGCATATTTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTT
* *
27607 TTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGGGAATTTTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTT
127 TTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTT
* * * * * *
27672 TCGAACTTGTCAAACTTTTACGTGTCCGTTTATAACTTCAGTTCCTTAAAGTATTCAAGATGATT
192 TCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATC
* *
27737 CATTCCTTC-AAGCAATTTTCTA-AACATTTCATGCTTGAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATA
257 CATTCCTTCGAA-CAATTTTC-AGAACATTCCATGCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATA
*
27800 GTTTGTCATTTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTATGTGAGAATTGTATC
320 GTTTGTC--TTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTATC
** * *
27865 TCTCTTGACTCTTGGATGAACTTGTCAAACATTTAAAA
383 TCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTGTCAAAC-TTTACAA
* * * **
27903 CTTCTTTTCTAACTTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGATGATCCATTCCTTCGAGCAATTTCAAGA
1 GTTCTTTTATAACTTTGGTTCCTTAAAGTATTCAAG-TGATCCATTCCTTCGAGC-ATTTCTCGA
* * * * *
27968 ATATTCCACGCTCGATAAATCGCAT-TATTTGGT-CAATATAGTTTGTC---TTGTAAACAAATT
64 ACATTCCATGCTCGAGAAATTGCATAT-TTTGGTCCAA-ATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTT
* * * * *
28028 TTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACTTGGGAATTTTATCTCTTTTGGTTCTTGGATGAACTT
127 TTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTT
* * * * *
28093 CCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCGTTTATAACTTCAGTTCCTTAAAGTATTCAAGATGATT
192 TCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATC
* * * * *
28158 CATTCCTTC-AAGCTATTTTCTGAACATTTCATGCTCGAGAAATCGCATCATTTGTTCCAAATAA
257 CATTCCTTCGAA-CAATTTTCAGAACATTCCATGCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAG
*
28222 TTTGTCATTTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTAAGTGAGAATTGTATCT
321 TTTGTC--TTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTATCT
* *
28287 CTCTTGGTTCTTGGACGAACCTGTCAAACATTTAAAA
384 CTCTTGGTTCTTGGACGAACTTGTCAAAC-TTTACAA
* * * * * * *
28324 CTTCTTTTCTAACTTTTGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCTTTCGAGACATTTCCCGA
1 GTTCTTTTATAACTTTGGTTCCTTAAAGTATTCAAG-TGATCCATTCCTTCGAG-CATTTCTCGA
* * * ** * *
28389 GCATTCCATGCTCTAGAAGTCT-CATCCTTTGGTCCAAATTGTTTTTCATTTTGTAAACAACTTT
64 ACATTCCATGCTCGAGAAAT-TGCATATTTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTT
* * * * * *
28453 TGGTCCTTGAATTAAAAACTTATTTATGTTAGAATAT-TATCTCTCCTGGTTCGTGGACAAACTT
128 TGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAAT-TGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTT
* * * * *
28517 TCAAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAAATTCGGTTCCTCAAAGTATTCAAGGCAATC
192 TCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATC
* * * * *
28582 CATTCCTTCGAACAATTTTAAGAACATTCCATGCTCGGGAAATCACATTATTTGGTCTAAATAGG
257 CATTCCTTCGAACAATTTTCAGAACATTCCATGCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATA-G
* * * * *
28647 TTT-TACTTAG-AAACTAA-TTTTTGTATTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGCATTTTATCT
321 TTTGT-CTTTGTAAAC-AACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTATCT
28709 CTCTTGGTTCTTGGACGAACTTGTCAAACTTTGACAA
384 CTCTTGGTTCTTGGACGAACTTGTCAAACTTT-ACAA
* * * *
28746 GTTTTTTTATAACTTTGGTTCCTTAAAGTATTCAAGTCGATGCTTTCCTTCGAGACATTTCTCAA
1 GTTCTTTTATAACTTTGGTTCCTTAAAGTATTCAAGT-GATCCATTCCTTCGAG-CATTTCTCGA
* * * * * *
28811 AAATTCCATGCTCGGGAAATTGAATATTTTTGTCCAAATAGTTTGTCTTTTTGAAAACAACTTTT
64 ACATTCCATGCTCGAGAAATTGCATATTTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTTT
* * * * * *
28876 GGTCTTCGAATTAAAACCTTATTTACGTGAGAATTGTAGCTCTCTTGTTTCTTGGATGAACTTCC
129 GGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTTC
* * * ** * * *
28941 AAACTTGTCAAACATTTACGAGTTC-TTTATAACCTCTATTCCTTAAAGTATTAAACACGATCCT
194 GAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCA
* * ** *
29005 TTCCTTCGAGCAATTTCTC-GAACATTCCATGCTCGGGAAAT-AAATTATTTGGTCCAAATAGTT
259 TTCCTTCGAACAATTT-TCAGAACATTCCATGCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTT
* * *
29068 TGTCATTCTGTAAACAACTTATGGTTTTTGAATTTAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCT
323 TGTC-TT-TGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCT
*
29133 CATGGTTCTTGGACGAACTTGTCAAACTTTTACAA
386 CTTGGTTCTTGGACGAACTTGTCAAAC-TTTACAA
* ** * *
29168 GTTCTTTTATAAATTTGGTTCCTTAAAGTATTCAACACGATCCTTTCCTTCGAGACATTTCCCGA
1 GTTCTTTTATAACTTTGGTTCCTTAAAGTATTCAA-GTGATCCATTCCTTCGAG-CATTTCTCGA
* *
29233 ACATTCCATGCTTGAAAAATTGCATGA-TTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTT
64 ACATTCCATGCTCGAGAAATTGCAT-ATTTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTT
* * ** * * *
29297 TGGT-TATTGAATTGAAAACTTATTTATGTGAGAATTGTATCAATCCTGATTTTTGGACGAACTT
128 TGGTCT-TTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTT
* * *
29361 TCAAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCAGTTCCTTAAAGTATTCAAGAAGATC
192 TCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATC
* * * * * ** * ** *
29426 AATTCGTTCGAGCTATTTTCTGGGCATTTCATGCTCGAGAAATCATATCGTTTGGTCCAAATAGT
257 CATTCCTTCGAACAATTTTCAGAACATTCCATGCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGT
* * * *
29491 TTGTCATTTGTAACCAACTTTTGGTGTTTGAATAAAAAACTTATTTACATGAGAATTGTATCTCT
322 TTGTC-TTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCT
*
29556 CTTGGTTCTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACATTTACGA
386 CTTGGTTCTT-G--G-A----CGAACTTGTCAAAC-TTTACAA
* * * * * * * **
29599 GTTCTTTCAT-GCTTTTGGATCCTTAAAGTATACAAGACGATCAATTCCTTCAAGCAATTTCAAG
1 GTTCTTTTATAAC-TTTGGTTCCTTAAAGTATTCAAG-TGATCCATTCCTTCGAGC-ATTTCTCG
* * *
29663 AACATTCCATGCTCGATAAA-T-C--------G--C----A---T-T-ATTTCGAAAACAACTTT
63 AACATTCCATGCTCGAGAAATTGCATATTTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTT
* * * *
29707 TGCTCTTTGAATTAAAAACTTATTTATGTGAGAATAT-TATCTCTCCTAGTTCCTT-GACGAACT
128 TGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAAT-TGTATCTCTCTTGGTT-CTTGGACGAACT
* * * *
29770 TCCGAACTTGTCAAACTTTGACGAGTTCTTTTATAACTTTGGTTCCTTAAAGTATTCAAGTCGAT
191 TTCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGAT
* *
29835 GCTTTCCTTCGA
256 CCATTCCTTCGA
29847 GACATTTCTC
Statistics
Matches: 3743, Mismatches: 540, Indels: 371
0.80 0.12 0.08
Matches are distributed among these distances:
391 36 0.01
392 1 0.00
393 4 0.00
396 3 0.00
400 3 0.00
401 192 0.05
402 76 0.02
403 4 0.00
404 2 0.00
405 1 0.00
407 2 0.00
409 1 0.00
410 132 0.04
411 8 0.00
412 3 0.00
413 150 0.04
414 119 0.03
415 2 0.00
418 3 0.00
419 7 0.00
420 33 0.01
421 670 0.18
422 604 0.16
423 325 0.09
424 202 0.05
425 26 0.01
426 115 0.03
427 224 0.06
428 186 0.05
429 237 0.06
430 158 0.04
431 213 0.06
433 1 0.00
ACGTcount: A:0.28, C:0.18, G:0.14, T:0.40
Consensus pattern (419 bp):
GTTCTTTTATAACTTTGGTTCCTTAAAGTATTCAAGTGATCCATTCCTTCGAGCATTTCTCGAAC
ATTCCATGCTCGAGAAATTGCATATTTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTTTGG
TCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTTCGA
ACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATT
CCTTCGAACAATTTTCAGAACATTCCATGCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGT
CTTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCTTGG
TTCTTGGACGAACTTGTCAAACTTTACAA
Done.