Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: NTFQ01013451.1 Kokia drynarioides strain JFW-HI SEQ_128477, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Pmatch=0.80,Pindel=0.10
tuple sizes 0,4,5,7
tuple distances 0, 29, 159, 1000
Length: 18495
ACGTcount: A:0.30, C:0.18, G:0.18, T:0.34
Found at i:10035 original size:29 final size:29
Alignment explanation
Indices: 9983--10498 Score: 190
Period size: 29 Copynumber: 17.6 Consensus size: 29
9973 CTCGAGGGGT
* *
9983 AAATGGGAATTTTGGGAAAGTTCGGGGTTAA
1 AAAT-GGAATTTTTGGACA-TTCGGGGTTAA
* *
10014 AAATGGAATTTTTAGACATTCGGGGAT-A
1 AAATGGAATTTTTGGACATTCGGGGTTAA
* * * * **
10042 AAAGGGTAATTTTTAGAGC-TTCGAGATCGA
1 AAATGG-AATTTTTGGA-CATTCGGGGTTAA
* * * *
10072 AAATGGAGTTTTTCGACATCCGGGGGT-A
1 AAATGGAATTTTTGGACATTCGGGGTTAA
* *
10100 AAATGGTAATTTTTGGA-AGTTTCGGTGTCAA
1 AAATGG-AATTTTTGGACA--TTCGGGGTTAA
** * *
10131 AAATGGAATTTTTGGATGTTCGAGGCTAA
1 AAATGGAATTTTTGGACATTCGGGGTTAA
*
10160 AAATGGAATTTTTGGA-AGTTCGGGGTCAA
1 AAATGGAATTTTTGGACA-TTCGGGGTTAA
* * **
10189 AAATGGTATTTTTGGAAATTTAAGGG-TAA
1 AAATGGAATTTTTGGACA-TTCGGGGTTAA
* ** *
10218 GAATGGAATTTTTGGA-AGTTTTTGGGTCAA
1 AAATGGAATTTTTGGACA--TTCGGGGTTAA
* *
10248 AAATTGG-ATTTTTGTA-AGTTC-AGGTGTAA
1 AAA-TGGAATTTTTGGACA-TTCGGGGT-TAA
* *
10277 AAATGGGATTTTTGGA-AGTTCGGGG-TGA
1 AAATGGAATTTTTGGACA-TTCGGGGTTAA
* * * *
10305 AAATGGAATTTTT-AAAAGTTTCGAGGTCAA
1 AAATGGAATTTTTGGACA--TTCGGGGTTAA
* *
10335 AAATGGGATTTTTGG-CTGTTCGAGGG-TAA
1 AAATGGAATTTTTGGAC-ATTCG-GGGTTAA
* * *
10364 AAATGGGATTTTTGGA-AGTTCGGGGGTGA
1 AAATGGAATTTTTGGACA-TTCGGGGTTAA
* * * *
10393 AAACGAAATTTTTGGA-AGTTCCAGGGTCAA
1 AAATGGAATTTTTGGACA-TT-CGGGGTTAA
* * *
10423 AAATGGGATTTTTGGA-AGTTTTGGGGTCAA
1 AAATGGAATTTTTGGACA--TTCGGGGTTAA
* * *
10453 AAATGGGATTTTTGGA-AGTTTGGGGGT-A
1 AAATGGAATTTTTGGACA-TTCGGGGTTAA
*
10481 AAATAGAATTTTTGGACA
1 AAATGGAATTTTTGGACA
10499 GTTTAGGGAC
Statistics
Matches: 373, Mismatches: 83, Indels: 60
0.72 0.16 0.12
Matches are distributed among these distances:
27 1 0.00
28 55 0.15
29 189 0.51
30 112 0.30
31 16 0.04
ACGTcount: A:0.31, C:0.06, G:0.30, T:0.34
Consensus pattern (29 bp):
AAATGGAATTTTTGGACATTCGGGGTTAA
Found at i:10170 original size:117 final size:115
Alignment explanation
Indices: 9977--10501 Score: 279
Period size: 117 Copynumber: 4.5 Consensus size: 115
9967 CGGATACTCG
* * * *
9977 AGGGGT-AAATGGGAATTTTGGGAAAG-TTCGGGGTTAAAAATGGAATTTTTAGACA-TTCGGGG
1 AGGGGTAAAAT-GGAATTTTTGG-AAGTTTC-GGGTCAAAAATGGAATTTTTGGA-AGTTCGAGG
* * *
10039 AT-AAAAGGGTAATTTTTAG-AGCTTCGAGATCGAAAATGG-AGTTTTTCGACATCC
62 ATAAAAATGG-AATTTTTAGAAG-TTCGAGATCAAAAATGGTA-TTTTTCGAAATCC
* * *
10093 GGGGGTAAAATGGTAATTTTTGGAAGTTTCGGTGTCAAAAATGGAATTTTTGGATGTTCGAGGCT
1 AGGGGTAAAATGG-AATTTTTGGAAGTTTCGG-GTCAAAAATGGAATTTTTGGAAGTTCGAGGAT
* * * * **
10158 AAAAATGGAATTTTTGGAAGTTCGGGGTCAAAAATGGTATTTTTGGAAATTT
64 AAAAATGGAATTTTTAGAAGTTCGAGATCAAAAATGGTATTTTTCGAAATCC
* * *
10210 AAGGGTAAGAATGGAATTTTTGGAAGTTTTTGGGTCAAAAATTGG-ATTTTTGTAAGTTC-AGGT
1 AGGGGTAA-AATGGAATTTTTGGAAG-TTTCGGGTCAAAAA-TGGAATTTTTGGAAGTTCGAGG-
* * * * * * * * *
10273 GTAAAAATGGGATTTTTGGAAGTTCGGGGT-GAAAATGGAATTTTT-AAAAGTTTC
62 ATAAAAATGGAATTTTTAGAAGTTCGAGATCAAAAATGGTATTTTTCGAAA--TCC
* * ** * *
10327 -GAGGTCAAAAATGGGATTTTTGGCTG-TTCGAGGGT-AAAAATGGGATTTTTGGAAGTTCGGGG
1 AGGGGT--AAAATGGAATTTTTGGAAGTTTC--GGGTCAAAAATGGAATTTTTGGAAGTTCGAGG
* * * * * * * * * * **
10389 GTGAAAACGAAATTTTTGGAAGTTCCAGGGTCAAAAATGGGATTTTTGGAAGTTT
62 ATAAAAATGGAATTTTTAGAAGTTCGA-GATCAAAAATGGTATTTTTCGAAATCC
* * * *
10444 TGGGGTCAAAAATGGGATTTTTGGAAGTTTGGGGGT--AAAATAGAATTTTTGGACAGTT
1 AGGGGT--AAAATGGAATTTTTGGAAGTTT-CGGGTCAAAAATGGAATTTTTGGA-AGTT
10502 TAGGGACCTC
Statistics
Matches: 330, Mismatches: 52, Indels: 52
0.76 0.12 0.12
Matches are distributed among these distances:
115 8 0.02
116 70 0.21
117 180 0.55
118 68 0.21
119 4 0.01
ACGTcount: A:0.30, C:0.06, G:0.30, T:0.34
Consensus pattern (115 bp):
AGGGGTAAAATGGAATTTTTGGAAGTTTCGGGTCAAAAATGGAATTTTTGGAAGTTCGAGGATAA
AAATGGAATTTTTAGAAGTTCGAGATCAAAAATGGTATTTTTCGAAATCC
Found at i:10202 original size:58 final size:58
Alignment explanation
Indices: 9983--10501 Score: 391
Period size: 58 Copynumber: 8.8 Consensus size: 58
9973 CTCGAGGGGT
* * *
9983 AAATGGGAATTTTGGGAAAGTTCGGGGTTAAAAATGGAATTTTTAGACA-TTCG-GGG-ATA
1 AAAT-GGAATTTTTGG-AAGTTCGGGGTCAAAAATGGAATTTTTGGA-AGTTCGAGGGTA-A
* * * * * * * * *
10042 AAAGGGTAATTTTTAG-AGCTTCGAGATCGAAAATGGAGTTTTTCGACA-TCCGGGGGT-A
1 AAATGG-AATTTTTGGAAG-TTCGGGGTCAAAAATGGAATTTTTGGA-AGTTCGAGGGTAA
* * *
10100 AAATGGTAATTTTTGGAAGTTTCGGTGTCAAAAATGGAATTTTTGGATGTTCGAGGCTAA
1 AAATGG-AATTTTTGGAAG-TTCGGGGTCAAAAATGGAATTTTTGGAAGTTCGAGGGTAA
* * **
10160 AAATGGAATTTTTGGAAGTTCGGGGTCAAAAATGGTATTTTTGGAAATTTAAGGGTAA
1 AAATGGAATTTTTGGAAGTTCGGGGTCAAAAATGGAATTTTTGGAAGTTCGAGGGTAA
* ** *
10218 GAATGGAATTTTTGGAAGTTTTTGGGTCAAAAATTGG-ATTTTTGTAAGTTC-AGGTGTAA
1 AAATGGAATTTTTGGAAG-TTCGGGGTCAAAAA-TGGAATTTTTGGAAGTTCGAGG-GTAA
* * **
10277 AAATGGGATTTTTGGAAGTTCGGGGT-GAAAATGGAATTTTTAAAAGTTTCGA-GGTCAA
1 AAATGGAATTTTTGGAAGTTCGGGGTCAAAAATGGAATTTTTGGAAG-TTCGAGGGT-AA
* ** * * *
10335 AAATGGGATTTTTGGCTGTTCGAGGGT-AAAAATGGGATTTTTGGAAGTTCGGGGGTGA
1 AAATGGAATTTTTGGAAGTTCG-GGGTCAAAAATGGAATTTTTGGAAGTTCGAGGGTAA
* * * * *
10393 AAACGAAATTTTTGGAAGTTCCAGGGTCAAAAATGGGATTTTTGGAAGTTTTG-GGGTCAA
1 AAATGGAATTTTTGGAAGTT-CGGGGTCAAAAATGGAATTTTTGGAAG-TTCGAGGGT-AA
* * *
10453 AAATGGGATTTTTGGAAGTTTGGGGGT--AAAATAGAATTTTTGGACAGTT
1 AAATGGAATTTTTGGAAG-TTCGGGGTCAAAAATGGAATTTTTGGA-AGTT
10502 TAGGGACCTC
Statistics
Matches: 372, Mismatches: 66, Indels: 45
0.77 0.14 0.09
Matches are distributed among these distances:
56 3 0.01
57 17 0.05
58 169 0.45
59 148 0.40
60 33 0.09
61 2 0.01
ACGTcount: A:0.31, C:0.06, G:0.30, T:0.34
Consensus pattern (58 bp):
AAATGGAATTTTTGGAAGTTCGGGGTCAAAAATGGAATTTTTGGAAGTTCGAGGGTAA
Found at i:10501 original size:29 final size:29
Alignment explanation
Indices: 10094--10502 Score: 359
Period size: 29 Copynumber: 14.0 Consensus size: 29
10084 TCGACATCCG
10094 GGGGT-AAAATGGTAATTTTTGGAAGTTTC
1 GGGGTAAAAATGG-AATTTTTGGAAGTTTC
* *
10123 GGTGTCAAAAATGGAATTTTTGGATG-TTC
1 GGGGT-AAAAATGGAATTTTTGGAAGTTTC
*
10152 GAGGCTAAAAATGGAATTTTTGGAAG-TTC
1 G-GGGTAAAAATGGAATTTTTGGAAGTTTC
* * *
10181 GGGGTCAAAAATGGTATTTTTGGAAATTTA
1 GGGGT-AAAAATGGAATTTTTGGAAGTTTC
* * *
10211 AGGGTAAGAATGGAATTTTTGGAAGTTTT
1 GGGGTAAAAATGGAATTTTTGGAAGTTTC
* *
10240 TGGGTCAAAAATTGG-ATTTTTGTAAG-TTC
1 GGGGT-AAAAA-TGGAATTTTTGGAAGTTTC
* *
10269 AGGTGTAAAAATGGGATTTTTGGAAG-TTC
1 -GGGGTAAAAATGGAATTTTTGGAAGTTTC
* **
10298 GGGGTGAAAATGGAATTTTTAAAAGTTTC
1 GGGGTAAAAATGGAATTTTTGGAAGTTTC
* * **
10327 GAGGTCAAAAATGGGATTTTTGGCTG-TTC
1 GGGGT-AAAAATGGAATTTTTGGAAGTTTC
*
10356 GAGGGTAAAAATGGGATTTTTGGAAG-TTC
1 G-GGGTAAAAATGGAATTTTTGGAAGTTTC
* * * *
10385 GGGGGTGAAAACGAAATTTTTGGAAGTTCC
1 -GGGGTAAAAATGGAATTTTTGGAAGTTTC
* * *
10415 AGGGTCAAAAATGGGATTTTTGGAAGTTTT
1 GGGGT-AAAAATGGAATTTTTGGAAGTTTC
* *
10445 GGGGTCAAAAATGGGATTTTTGGAAGTTTG
1 GGGGT-AAAAATGGAATTTTTGGAAGTTTC
*
10475 GGGGT-AAAATAGAATTTTTGGACAGTTT
1 GGGGTAAAAATGGAATTTTTGGA-AGTTT
10503 AGGGACCTCT
Statistics
Matches: 312, Mismatches: 52, Indels: 32
0.79 0.13 0.08
Matches are distributed among these distances:
28 41 0.13
29 154 0.49
30 107 0.34
31 10 0.03
ACGTcount: A:0.30, C:0.05, G:0.30, T:0.35
Consensus pattern (29 bp):
GGGGTAAAAATGGAATTTTTGGAAGTTTC
Found at i:12333 original size:11 final size:11
Alignment explanation
Indices: 12308--12385 Score: 79
Period size: 11 Copynumber: 6.9 Consensus size: 11
12298 TTTAATTTTG
12308 AAATTAAATTTT
1 AAATTAAA-TTT
12320 AAATTAAATTT
1 AAATTAAATTT
12331 AAATTTAAATTT
1 AAA-TTAAATTT
*
12343 AGATT-AATTT
1 AAATTAAATTT
*
12353 AAATTTAAA-AT
1 AAA-TTAAATTT
12364 AAATCTAAATTT
1 AAAT-TAAATTT
*
12376 AAAATAAATT
1 AAATTAAATT
12386 AAAAAAAGGC
Statistics
Matches: 56, Mismatches: 5, Indels: 11
0.78 0.07 0.15
Matches are distributed among these distances:
10 8 0.14
11 24 0.43
12 24 0.43
ACGTcount: A:0.54, C:0.01, G:0.01, T:0.44
Consensus pattern (11 bp):
AAATTAAATTT
Found at i:12334 original size:6 final size:6
Alignment explanation
Indices: 12298--12378 Score: 73
Period size: 6 Copynumber: 14.0 Consensus size: 6
12288 TTTGACTTTT
* *
12298 TTTAAT TTTGAAA -TTAAA TTTTAAA -TTAAA TTTAAA TTTAAA TTTAGA
1 TTTAAA TTT-AAA TTTAAA -TTTAAA TTTAAA TTTAAA TTTAAA TTTAAA
* *
12346 -TT-AA TTTAAA TTTAAA -ATAAA TCTAAA TTTAAA
1 TTTAAA TTTAAA TTTAAA TTTAAA TTTAAA TTTAAA
12379 ATAAATTAAA
Statistics
Matches: 62, Mismatches: 6, Indels: 14
0.76 0.07 0.17
Matches are distributed among these distances:
4 1 0.02
5 16 0.26
6 38 0.61
7 7 0.11
ACGTcount: A:0.49, C:0.01, G:0.02, T:0.47
Consensus pattern (6 bp):
TTTAAA
Found at i:12337 original size:17 final size:17
Alignment explanation
Indices: 12298--12385 Score: 90
Period size: 17 Copynumber: 5.1 Consensus size: 17
12288 TTTGACTTTT
*
12298 TTTAATTTTGAAATTAAA
1 TTTAAATTT-AAATTAAA
12316 TTTTAAA-TTAAATTTAAA
1 -TTTAAATTTAAA-TTAAA
*
12334 TTTAAATTTAGATT-AA
1 TTTAAATTTAAATTAAA
*
12350 TTTAAATTTAAAATAAA
1 TTTAAATTTAAATTAAA
* *
12367 TCTAAATTTAAAATAAA
1 TTTAAATTTAAATTAAA
12384 TT
1 TT
12386 AAAAAAAGGC
Statistics
Matches: 60, Mismatches: 6, Indels: 8
0.81 0.08 0.11
Matches are distributed among these distances:
16 14 0.23
17 30 0.50
18 11 0.18
19 5 0.08
ACGTcount: A:0.50, C:0.01, G:0.02, T:0.47
Consensus pattern (17 bp):
TTTAAATTTAAATTAAA
Found at i:12523 original size:10 final size:10
Alignment explanation
Indices: 12508--12614 Score: 93
Period size: 10 Copynumber: 11.2 Consensus size: 10
12498 TTAATTAAAT
12508 TATTTAATTA
1 TATTTAATTA
12518 TATTTAATTA
1 TATTTAATTA
*
12528 -A-ATAATTA
1 TATTTAATTA
12536 TATTTAA-T-
1 TATTTAATTA
12544 TATTTAATTA
1 TATTTAATTA
*
12554 TGTTTAATTAAA
1 TATTTAATT--A
12566 TATTTAATTA
1 TATTTAATTA
**
12576 TA---AACAA
1 TATTTAATTA
*
12583 TATTTAATCA
1 TATTTAATTA
12593 TATTTAATTA
1 TATTTAATTA
*
12603 TTTTTAATTA
1 TATTTAATTA
12613 TA
1 TA
12615 AAAAACAATC
Statistics
Matches: 77, Mismatches: 11, Indels: 18
0.73 0.10 0.17
Matches are distributed among these distances:
7 5 0.06
8 13 0.17
9 4 0.05
10 46 0.60
12 9 0.12
ACGTcount: A:0.43, C:0.02, G:0.01, T:0.54
Consensus pattern (10 bp):
TATTTAATTA
Found at i:12533 original size:18 final size:18
Alignment explanation
Indices: 12512--12567 Score: 85
Period size: 18 Copynumber: 3.1 Consensus size: 18
12502 TTAAATTATT
12512 TAATTATATTTAATTAAA
1 TAATTATATTTAATTAAA
**
12530 TAATTATATTTAATTATT
1 TAATTATATTTAATTAAA
*
12548 TAATTATGTTTAATTAAA
1 TAATTATATTTAATTAAA
12566 TA
1 TA
12568 TTTAATTATA
Statistics
Matches: 33, Mismatches: 5, Indels: 0
0.87 0.13 0.00
Matches are distributed among these distances:
18 33 1.00
ACGTcount: A:0.45, C:0.00, G:0.02, T:0.54
Consensus pattern (18 bp):
TAATTATATTTAATTAAA
Found at i:12545 original size:36 final size:37
Alignment explanation
Indices: 12503--12602 Score: 123
Period size: 36 Copynumber: 2.7 Consensus size: 37
12493 ATTAGTTAAT
12503 TAAATTATTTAATTATATTTAATTAAATAATTATATT-
1 TAAATTATTTAATTATATTTAATTAAATAATTA-ATTA
* *
12540 T-AATTATTTAATTATGTTTAATTAAATATTTAATTA
1 TAAATTATTTAATTATATTTAATTAAATAATTAATTA
* *
12576 TAAACAATATTTAATCATATTTAATTA
1 T-AA-ATTATTTAATTATATTTAATTA
12603 TTTTTAATTA
Statistics
Matches: 54, Mismatches: 5, Indels: 6
0.83 0.08 0.09
Matches are distributed among these distances:
35 3 0.06
36 30 0.56
37 1 0.02
38 1 0.02
39 19 0.35
ACGTcount: A:0.45, C:0.02, G:0.01, T:0.52
Consensus pattern (37 bp):
TAAATTATTTAATTATATTTAATTAAATAATTAATTA
Found at i:14809 original size:42 final size:43
Alignment explanation
Indices: 14636--14828 Score: 271
Period size: 43 Copynumber: 4.5 Consensus size: 43
14626 TAATTTTAGC
* * *
14636 ACCATGTTCTTCAGCCGCGTTTATGGGAGAAGCACCGCTAAAG
1 ACCATGTTCTTTAGCGGCGTTTATGGGAGAAGCGCCGCTAAAG
* *
14679 ACCACGTTCTTTAGCGGCGTTTATGGGAAAAGCGCCGCTAAAG
1 ACCATGTTCTTTAGCGGCGTTTATGGGAGAAGCGCCGCTAAAG
* * * *
14722 ACCATGTTCTTTAGTGGCGTTTGTTGTAGAAGCGCCGCTAAAG
1 ACCATGTTCTTTAGCGGCGTTTATGGGAGAAGCGCCGCTAAAG
* *
14765 ACCACGTTCTTTAGCGGCGTTTGTGGG-GAAGCGCCGCTAAAG
1 ACCATGTTCTTTAGCGGCGTTTATGGGAGAAGCGCCGCTAAAG
*
14807 ACCATGCTCTTTAGCGGCGTTT
1 ACCATGTTCTTTAGCGGCGTTT
14829 TCCCTCATAA
Statistics
Matches: 133, Mismatches: 17, Indels: 1
0.88 0.11 0.01
Matches are distributed among these distances:
42 35 0.26
43 98 0.74
ACGTcount: A:0.22, C:0.23, G:0.28, T:0.27
Consensus pattern (43 bp):
ACCATGTTCTTTAGCGGCGTTTATGGGAGAAGCGCCGCTAAAG
Found at i:14844 original size:86 final size:86
Alignment explanation
Indices: 14670--14847 Score: 252
Period size: 86 Copynumber: 2.1 Consensus size: 86
14660 GGGAGAAGCA
*
14670 CCGCTAAAGACCACGTTCTTTAGCGGCGTTTATGGGAAAAGCGCCGCTAAAGACCATGTTCTTTA
1 CCGCTAAAGACCACGTTCTTTAGCGGCGTTTATGGGAAAAGCGCCGCTAAAGACCATGCTCTTTA
* ** *
14735 GTGGCGTTTGTTGTAGAAGCG
66 GCGGCGTTTGTCCTAGAAACG
* *
14756 CCGCTAAAGACCACGTTCTTTAGCGGCGTTTGTGGG-GAAGCGCCGCTAAAGACCATGCTCTTTA
1 CCGCTAAAGACCACGTTCTTTAGCGGCGTTTATGGGAAAAGCGCCGCTAAAGACCATGCTCTTTA
*
14820 GCGGCGTTT-TCCCTCATAAACG
66 GCGGCGTTTGT-CCT-AGAAACG
14842 CCGCTA
1 CCGCTA
14848 TTTTTAGCTG
Statistics
Matches: 82, Mismatches: 8, Indels: 4
0.87 0.09 0.04
Matches are distributed among these distances:
84 1 0.01
85 35 0.43
86 46 0.56
ACGTcount: A:0.22, C:0.25, G:0.26, T:0.26
Consensus pattern (86 bp):
CCGCTAAAGACCACGTTCTTTAGCGGCGTTTATGGGAAAAGCGCCGCTAAAGACCATGCTCTTTA
GCGGCGTTTGTCCTAGAAACG
Found at i:17277 original size:11 final size:10
Alignment explanation
Indices: 17263--17303 Score: 55
Period size: 11 Copynumber: 3.9 Consensus size: 10
17253 TTTTATCTTT
17263 TTTATATATTC
1 TTTATA-ATTC
*
17274 TTTAGAATTC
1 TTTATAATTC
17284 TTTATAAATTC
1 TTTAT-AATTC
17295 TTTATAATT
1 TTTATAATT
17304 TTTTTAAAAA
Statistics
Matches: 27, Mismatches: 2, Indels: 3
0.84 0.06 0.09
Matches are distributed among these distances:
10 12 0.44
11 15 0.56
ACGTcount: A:0.32, C:0.07, G:0.02, T:0.59
Consensus pattern (10 bp):
TTTATAATTC
Found at i:17289 original size:21 final size:21
Alignment explanation
Indices: 17263--17311 Score: 64
Period size: 21 Copynumber: 2.4 Consensus size: 21
17253 TTTTATCTTT
*
17263 TTTATATATTCTTTAGAATTC
1 TTTATAAATTCTTTAGAATTC
*
17284 TTTATAAATTCTTTATAATT-
1 TTTATAAATTCTTTAGAATTC
*
17304 TTTTTAAA
1 TTTATAAA
17312 AATATTAATT
Statistics
Matches: 25, Mismatches: 3, Indels: 1
0.86 0.10 0.03
Matches are distributed among these distances:
20 7 0.28
21 18 0.72
ACGTcount: A:0.33, C:0.06, G:0.02, T:0.59
Consensus pattern (21 bp):
TTTATAAATTCTTTAGAATTC
Done.