Tandem Repeats Finder Program written by:

                 Gary Benson
      Program in Bioinformatics
          Boston University

Version 4.09

Sequence: NTFQ01014196.1 Kokia drynarioides strain JFW-HI SEQ_129229, whole genome shotgun sequence

Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000

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Found at i:882 original size:470 final size:470

Alignment explanation


    Indices: 1--5070  Score: 8623
    Period size: 470  Copynumber: 10.8  Consensus size: 470

                                                              *              
          1 CTGTCCTTGCATATATGGCATTGCATTCTATTGTGGCTGCAATCGTATCTGTGGTTGCATCTGGC
          1 CTGTCCTTGCATATATGGCATTGCATTCTATTGTGGCTGCAATCGTATCTATGGTTGCATCTGGC

                     *                                                  *    
         66 TATGTACCTACAATTGATCAGTGTGCGAATATACCTACAAATTCTGATTAAAATTCTGCTATTTA
         66 TATGTACCTGCAATTGATCAGTGTGCGAATATACCTACAAATTCTGATTAAAATTCTGCTGTTTA

                                                                             
        131 TGGTTATTGTAACTCCCTTGAGCTGAGGAATTTCCATATCTATATGTGGAAGCATTCTGATTCCC
        131 TGGTTATTGTAACTCCCTTGAGCTGAGGAATTTCCATATCTATATGTGGAAGCATTCTGATTCCC

            *                 *                   *                          
        196 CTAAGGTTGTTGAACTCTGTTGTTGTATGAGTTACCATCTGTGGAAGCATTCTGATTCCCCTAAG
        196 TTAAGGTTGTTGAACTCTATTGTTGTATGAGTTACCATATGTGGAAGCATTCTGATTCCCCTAAG

                                         *                                   
        261 CGTTGGGTTCTCAGTATCACTAGGTAGAGAACCTGGTGACCTTACACTCAGATTAGAAGCCAATT
        261 CGTTGGGTTCTCAGTATCACTAGGTAGAGCACCTGGTGACCTTACACTCAGATTAGAAGCCAATT

                          **             *                           *       
        326 ATCCTAGCTGGGCTACCAATGCTCGGATAGAAGAAGAATTACCTTGCACTATCGCTTTAGTTCTC
        326 ATCCTAGCTGGGCTTTCAATGCTCGGATAAAAGAAGAATTACCTTGCACTATCGCTTCAGTTCTC

            *      *           *             *  *                            
        391 ATGATATGCTCTCACATCAATGCTTCAAGCGCAGCCGTAGGATCTGACCTTTGTTGAGAAAATTG
        391 GTGATATTCTCTCACATCAGTGCTTCAAGCGCAACCATAGGATCTGACCTTTGTTGAGAAAATTG

                           
        456 CTACTGTTGCTGATG
        456 CTACTGTTGCTGATG

            *                     *                              *           
        471 TTGTCCTTGCATATATGGCATTACATTCTATTGTGGCTGCAATCGTATCTATGATTGCATCTGGC
          1 CTGTCCTTGCATATATGGCATTGCATTCTATTGTGGCTGCAATCGTATCTATGGTTGCATCTGGC

                               *                       *             *       
        536 TATGTACCTGCAATTGATCTGTGTGCGAATATACCTACAAATTATGATTAAAATTCTACTGTTTA
         66 TATGTACCTGCAATTGATCAGTGTGCGAATATACCTACAAATTCTGATTAAAATTCTGCTGTTTA

                            *                                                
        601 TGGTTATTGTAACTCCTTTGAGCTGAGGAATTTCCATATCTATATGTGGAAGCATTCTGATTCCC
        131 TGGTTATTGTAACTCCCTTGAGCTGAGGAATTTCCATATCTATATGTGGAAGCATTCTGATTCCC

                                                                   *         
        666 TTAAGGTTGTTGAACTCTATTGTTGTATGAGTTACCATATGTGGAAGCATTCTGAATCCCCTAAG
        196 TTAAGGTTGTTGAACTCTATTGTTGTATGAGTTACCATATGTGGAAGCATTCTGATTCCCCTAAG

                                                              *              
        731 CGTTGGGTTCTCAGTATCACTAGGTAGAGCACCTGGTGACCTTACACTCATATTAGAAGCCAATT
        261 CGTTGGGTTCTCAGTATCACTAGGTAGAGCACCTGGTGACCTTACACTCAGATTAGAAGCCAATT

                           *             *                           *       
        796 ATCCTAGCTGGGCTTCCAATGCTCGGATAGAAGAAGAATTACCTTGCACTATCGCTTTAGTTCTC
        326 ATCCTAGCTGGGCTTTCAATGCTCGGATAAAAGAAGAATTACCTTGCACTATCGCTTCAGTTCTC

            *      *           *             *                               
        861 ATGATATGCTCTCACATCAATGCTTCAAGCGCAGCCATAGGATCTGACCTTTGTTGAGAAAATTG
        391 GTGATATTCTCTCACATCAGTGCTTCAAGCGCAACCATAGGATCTGACCTTTGTTGAGAAAATTG

                  *        
        926 CTACTGCTGCTGATG
        456 CTACTGTTGCTGATG

            *                     *                                          
        941 TTGTCCTTGCATATATGGCATTACATTCTATTGTGGCTGCAATCGTATCTATGGTTGCATCTGGC
          1 CTGTCCTTGCATATATGGCATTGCATTCTATTGTGGCTGCAATCGTATCTATGGTTGCATCTGGC

                               *                     * *             *       
       1006 TATGTACCTGCAATTGATCTGTGTGCGAATATACCTACAAAATATGATTAAAATTCTACTGTTTA
         66 TATGTACCTGCAATTGATCAGTGTGCGAATATACCTACAAATTCTGATTAAAATTCTGCTGTTTA

                                                                             
       1071 TGGTTATTGTAACTCCCTTGAGCTGAGGAATTTCCATATCTATATGTGGAAGCATTCTGATTCCC
        131 TGGTTATTGTAACTCCCTTGAGCTGAGGAATTTCCATATCTATATGTGGAAGCATTCTGATTCCC

                                                                             
       1136 TTAAGGTTGTTGAACTCTATTGTTGTATGAGTTACCATATGTGGAAGCATTCTGATTCCCCTAAG
        196 TTAAGGTTGTTGAACTCTATTGTTGTATGAGTTACCATATGTGGAAGCATTCTGATTCCCCTAAG

                *                                                            
       1201 CGTTAGGTTCTCAGTATCACTAGGTAGAGCACCTGGTGACCTTACACTCAGATTAGAAGCCAATT
        261 CGTTGGGTTCTCAGTATCACTAGGTAGAGCACCTGGTGACCTTACACTCAGATTAGAAGCCAATT

                            *       *          *  *                          
       1266 ATCCTAGCTGGGCTTTTAATGCTCAGATAAAAGAAAAAATACCTTGCACTATCGCTTCAGTTCTC
        326 ATCCTAGCTGGGCTTTCAATGCTCGGATAAAAGAAGAATTACCTTGCACTATCGCTTCAGTTCTC

              *                                          *                   
       1331 GTTATATTCTCTCACATCAGTGCTTCAAGCGCAACCATAGGATCTAACCTTTGTTGAGAAAATTG
        391 GTGATATTCTCTCACATCAGTGCTTCAAGCGCAACCATAGGATCTGACCTTTGTTGAGAAAATTG

                           
       1396 CTACTGTTGCTGATG
        456 CTACTGTTGCTGATG

                                                  *      *                   
       1411 CTGTCCTTGCATATATGGCATTGCATTCTATTGTGGCTACAATCGCATCTATGGTTGCATCTGGC
          1 CTGTCCTTGCATATATGGCATTGCATTCTATTGTGGCTGCAATCGTATCTATGGTTGCATCTGGC

                   *                                     *         * **      
       1476 TATGTACTTGCAATTGATCAGTGTGCGAATATACCTACAAATTCTAATTAAAATTTTATTGTTTA
         66 TATGTACCTGCAATTGATCAGTGTGCGAATATACCTACAAATTCTGATTAAAATTCTGCTGTTTA

                                                                             
       1541 TGGTTATTGTAACTCCCTTGAGCTGAGGAATTTCCATATCTATATGTGGAAGCATTCTGATTCCC
        131 TGGTTATTGTAACTCCCTTGAGCTGAGGAATTTCCATATCTATATGTGGAAGCATTCTGATTCCC

                                                                             
       1606 TTAAGGTTGTTGAACTCTATTGTTGTATGAGTTACCATATGTGGAAGCATTCTGATTCCCCTAAG
        196 TTAAGGTTGTTGAACTCTATTGTTGTATGAGTTACCATATGTGGAAGCATTCTGATTCCCCTAAG

                *                                                            
       1671 CGTTAGGTTCTCAGTATCACTAGGTAGAGCACCTGGTGACCTTACACTCAGATTAGAAGCCAATT
        261 CGTTGGGTTCTCAGTATCACTAGGTAGAGCACCTGGTGACCTTACACTCAGATTAGAAGCCAATT

                            *       *          *                            *
       1736 ATCCTAGCTGGGCTTTTAATGCTCAGATAAAAGAAAAATTACCTTGCACTATCGCTTCAGTTCTT
        326 ATCCTAGCTGGGCTTTCAATGCTCGGATAAAAGAAGAATTACCTTGCACTATCGCTTCAGTTCTC

                                                         *                  *
       1801 GTGATATTCTCTCACATCAGTGCTTCAAGCGCAACCATAGGATCTAACCTTTGTTGAGAAAATTA
        391 GTGATATTCTCTCACATCAGTGCTTCAAGCGCAACCATAGGATCTGACCTTTGTTGAGAAAATTG

                           
       1866 CTACTGTTGCTGATG
        456 CTACTGTTGCTGATG

            *                                     *      *                   
       1881 TTGTCCTTGCATATATGGCATTGCATTCTATTGTGGCTACAATCGCATCTATGGTTGCATCTGGC
          1 CTGTCCTTGCATATATGGCATTGCATTCTATTGTGGCTGCAATCGTATCTATGGTTGCATCTGGC

                   *                                                    *    
       1946 TATGTACTTGCAATTGATCAGTGTGCGAATATACCTACAAATTCTGATTAAAATTCTGCTATTTA
         66 TATGTACCTGCAATTGATCAGTGTGCGAATATACCTACAAATTCTGATTAAAATTCTGCTGTTTA

                                                                             
       2011 TGGTTATTGTAACTCCCTTGAGCTGAGGAATTTCCATATCTATATGTGGAAGCATTCTGATTCCC
        131 TGGTTATTGTAACTCCCTTGAGCTGAGGAATTTCCATATCTATATGTGGAAGCATTCTGATTCCC

                                                                             
       2076 TTAAGGTTGTTGAACTCTATTGTTGTATGAGTTACCATATGTGGAAGCATTCTGATTCCCCTAAG
        196 TTAAGGTTGTTGAACTCTATTGTTGTATGAGTTACCATATGTGGAAGCATTCTGATTCCCCTAAG

                *                                  *                         
       2141 CGTTAGGTTCTCAGTATCACTAGGTAGAGCACCTGGTGAACTTACACTCAGATTAGAAGCCAATT
        261 CGTTGGGTTCTCAGTATCACTAGGTAGAGCACCTGGTGACCTTACACTCAGATTAGAAGCCAATT

                            *                  *                *            
       2206 ATCCTAGCTGGGCTTTTAATGCTCGGATAAAAGAAAAATTACCTTGCACTATTGCTTCAGTTCTC
        326 ATCCTAGCTGGGCTTTCAATGCTCGGATAAAAGAAGAATTACCTTGCACTATCGCTTCAGTTCTC

                                                         *                   
       2271 GTGATATTCTCTCACATCAGTGCTTCAAGCGCAACCATAGGATCTAACCTTTGTTGAGAAAATTG
        391 GTGATATTCTCTCACATCAGTGCTTCAAGCGCAACCATAGGATCTGACCTTTGTTGAGAAAATTG

                           
       2336 CTACTGTTGCTGATG
        456 CTACTGTTGCTGATG

                                                        *          *         
       2351 CTGTCCTTGCATATATGGCATTGCATTCTATTGTGGCTGCAATCATATCTATGGTCGCATCTGGC
          1 CTGTCCTTGCATATATGGCATTGCATTCTATTGTGGCTGCAATCGTATCTATGGTTGCATCTGGC

                 * *                                     *            *      
       2416 TATGTTCTTGCAATTGATCAGTGTGCGAATATACCTACAAATTCTAATTAAAATTCTGTTGTTTA
         66 TATGTACCTGCAATTGATCAGTGTGCGAATATACCTACAAATTCTGATTAAAATTCTGCTGTTTA

                *                                        *      *            
       2481 TGGTCATTGTAACTCCCTTGAGCTGAGGAATTTCCATATCTATATATGGAAGTATTCTGATTCCC
        131 TGGTTATTGTAACTCCCTTGAGCTGAGGAATTTCCATATCTATATGTGGAAGCATTCTGATTCCC

            *                 *                *      *    *                 
       2546 CTAAGGTTGTTGAACTCTGTTGTTGTATGAGTTACTATATGTAGAAGTATTCTGATTCCCCTAAG
        196 TTAAGGTTGTTGAACTCTATTGTTGTATGAGTTACCATATGTGGAAGCATTCTGATTCCCCTAAG

            *    *                                                           
       2611 TGTTGCGTTCTCAGTATCACTAGGTAGAGCACCTGGTGACCTTACACTCAGATTAGAAGCCAATT
        261 CGTTGGGTTCTCAGTATCACTAGGTAGAGCACCTGGTGACCTTACACTCAGATTAGAAGCCAATT

                                      *              *           *           
       2676 ATCCTAGCTGGGCTTTCAATGCTCGGGTAAAAGAA-AATTTTCCTTGCACTATTGCTTCAGTTCT
        326 ATCCTAGCTGGGCTTTCAATGCTCGGATAAAAGAAGAA-TTACCTTGCACTATCGCTTCAGTTCT

                        *                                                    
       2740 CGTGATATTCTCCCACATCAGTGCTTCAAGCGCAACCATAGGATCTGACCTTTGTTGAGAAAATT
        390 CGTGATATTCTCTCACATCAGTGCTTCAAGCGCAACCATAGGATCTGACCTTTGTTGAGAAAATT

            *              *
       2805 ACTACTGTTGCTGATA
        455 GCTACTGTTGCTGATG

                                                              *              
       2821 CTGTCCTTGCATATATGGCATTGCATTCTATTGTGGCTGCAATCGTATCTGTGGTTGCATCTGGC
          1 CTGTCCTTGCATATATGGCATTGCATTCTATTGTGGCTGCAATCGTATCTATGGTTGCATCTGGC

                     *                                                  *    
       2886 TATGTACCTACAATTGATCAGTGTGCGAATATACCTACAAATTCTGATTAAAATTCTGCTATTTA
         66 TATGTACCTGCAATTGATCAGTGTGCGAATATACCTACAAATTCTGATTAAAATTCTGCTGTTTA

                                                                             
       2951 TGGTTATTGTAACTCCCTTGAGCTGAGGAATTTCCATATCTATATGTGGAAGCATTCTGATTCCC
        131 TGGTTATTGTAACTCCCTTGAGCTGAGGAATTTCCATATCTATATGTGGAAGCATTCTGATTCCC

            *                 *                   *                          
       3016 CTAAGGTTGTTGAACTCTGTTGTTGTATGAGTTACCATCTGTGGAAGCATTCTGATTCCCCTAAG
        196 TTAAGGTTGTTGAACTCTATTGTTGTATGAGTTACCATATGTGGAAGCATTCTGATTCCCCTAAG

                                         *                                   
       3081 CGTTGGGTTCTCAGTATCACTAGGTAGAGAACCTGGTGACCTTACACTCAGATTAGAAGCCAATT
        261 CGTTGGGTTCTCAGTATCACTAGGTAGAGCACCTGGTGACCTTACACTCAGATTAGAAGCCAATT

                           *             *                           *       
       3146 ATCCTAGCTGGGCTTCCAATGCTCGGATAGAAGAAGAATTACCTTGCACTATCGCTTTAGTTCTC
        326 ATCCTAGCTGGGCTTTCAATGCTCGGATAAAAGAAGAATTACCTTGCACTATCGCTTCAGTTCTC

            *      *           *             *                               
       3211 ATGATATGCTCTCACATCAATGCTTCAAGCGCAGCCATAGGATCTGACCTTTGTTGAGAAAATTG
        391 GTGATATTCTCTCACATCAGTGCTTCAAGCGCAACCATAGGATCTGACCTTTGTTGAGAAAATTG

                           
       3276 CTACTGTTGCTGATG
        456 CTACTGTTGCTGATG

            *                     *                           *              
       3291 TTGTCCTTGCATATATGGCATTACATTCTATTGTGGCTGCAATCGTATCTGTGGTTGCATCTGGC
          1 CTGTCCTTGCATATATGGCATTGCATTCTATTGTGGCTGCAATCGTATCTATGGTTGCATCTGGC

                     *                                                       
       3356 TATGTACCTACAATTGATCAGTGTGCGAATATACCTACAAATTCTGATTAAAATTCTGCTGTTTA
         66 TATGTACCTGCAATTGATCAGTGTGCGAATATACCTACAAATTCTGATTAAAATTCTGCTGTTTA

                                                                             
       3421 TGGTTATTGTAACTCCCTTGAGCTGAGGAATTTCCATATCTATATGTGGAAGCATTCTGATTCCC
        131 TGGTTATTGTAACTCCCTTGAGCTGAGGAATTTCCATATCTATATGTGGAAGCATTCTGATTCCC

                                                                             
       3486 TTAAGGTTGTTGAACTCTATTGTTGTATGAGTTACCATATGTGGAAGCATTCTGATTCCCCTAAG
        196 TTAAGGTTGTTGAACTCTATTGTTGTATGAGTTACCATATGTGGAAGCATTCTGATTCCCCTAAG

                *                   *                                        
       3551 CGTTAGGTTCTCAGTATCACTAGGAAGAGCACCTGGTGACCTTACACTCAGATTAGAAGCCAATT
        261 CGTTGGGTTCTCAGTATCACTAGGTAGAGCACCTGGTGACCTTACACTCAGATTAGAAGCCAATT

                            *                  *                             
       3616 ATCCTAGCTGGGCTTTTAATGCTCGGATAAAAGAAAAATTACCTTGCACTATCGCTTCAGTTCTC
        326 ATCCTAGCTGGGCTTTCAATGCTCGGATAAAAGAAGAATTACCTTGCACTATCGCTTCAGTTCTC

                                                         *                   
       3681 GTGATATTCTCTCACATCAGTGCTTCAAGCGCAACCATAGGATCTAACCTTTGTTGAGAAAATTG
        391 GTGATATTCTCTCACATCAGTGCTTCAAGCGCAACCATAGGATCTGACCTTTGTTGAGAAAATTG

                           
       3746 CTACTGTTGCTGATG
        456 CTACTGTTGCTGATG

                                                  *                *         
       3761 CTGTCCTTGCATATATGGCATTGCATTCTATTGTGGCTACAATCGTATCTATGGTCGCATCTGGC
          1 CTGTCCTTGCATATATGGCATTGCATTCTATTGTGGCTGCAATCGTATCTATGGTTGCATCTGGC

                   *                                                  *      
       3826 TATGTACTTGCAATTGATCAGTGTGCGAATATACCTACAAATTCTGATTAAAATTCTGTTGTTTA
         66 TATGTACCTGCAATTGATCAGTGTGCGAATATACCTACAAATTCTGATTAAAATTCTGCTGTTTA

                *                              *         *      *            
       3891 TGGTCATTGTAACTCCCTTGAGCTGAGGAATTTCCGTATCTATATATGGAAGTATTCTGATTCCC
        131 TGGTTATTGTAACTCCCTTGAGCTGAGGAATTTCCATATCTATATGTGGAAGCATTCTGATTCCC

            *                 *                *      *    *   *             
       3956 CTAAGGTTGTTGAACTCTGTTGTTGTATGAGTTACTATATGTAGAAGTATTTTGATTCCCCTAAG
        196 TTAAGGTTGTTGAACTCTATTGTTGTATGAGTTACCATATGTGGAAGCATTCTGATTCCCCTAAG

            *    *                                                           
       4021 TGTTGCGTTCTCAGTATCACTAGGTAGAGCACCTGGTGACCTTACACTCAGATTAGAAGCCAATT
        261 CGTTGGGTTCTCAGTATCACTAGGTAGAGCACCTGGTGACCTTACACTCAGATTAGAAGCCAATT

                                                     *           *    *      
       4086 ATCCTAGCTGGGCTTTCAATGCTCGGATAAAAGAA-AATTTTCCTTGCACTATTGCTTTAGTTCT
        326 ATCCTAGCTGGGCTTTCAATGCTCGGATAAAAGAAGAA-TTACCTTGCACTATCGCTTCAGTTCT

                        *                                                    
       4150 CGTGATATTCTCCCACATCAGTGCTTCAAGCGCAACCATAGGATCTGACCTTTGTTGAGAAAATT
        390 CGTGATATTCTCTCACATCAGTGCTTCAAGCGCAACCATAGGATCTGACCTTTGTTGAGAAAATT

            *              *
       4215 ACTACTGTTGCTGATA
        455 GCTACTGTTGCTGATG

                                                              *              
       4231 CTGTCCTTGCATATATGGCATTGCATTCTATTGTGGCTGCAATCGTATCTGTGGTTGCATCTGGC
          1 CTGTCCTTGCATATATGGCATTGCATTCTATTGTGGCTGCAATCGTATCTATGGTTGCATCTGGC

                     *                                                  *    
       4296 TATGTACCTACAATTGATCAGTGTGCGAATATACCTACAAATTCTGATTAAAATTCTGCTATTTA
         66 TATGTACCTGCAATTGATCAGTGTGCGAATATACCTACAAATTCTGATTAAAATTCTGCTGTTTA

                                                                             
       4361 TGGTTATTGTAACTCCCTTGAGCTGAGGAATTTCCATATCTATATGTGGAAGCATTCTGATTCCC
        131 TGGTTATTGTAACTCCCTTGAGCTGAGGAATTTCCATATCTATATGTGGAAGCATTCTGATTCCC

            *                 *                   *                          
       4426 CTAAGGTTGTTGAACTCTGTTGTTGTATGAGTTACCATCTGTGGAAGCATTCTGATTCCCCTAAG
        196 TTAAGGTTGTTGAACTCTATTGTTGTATGAGTTACCATATGTGGAAGCATTCTGATTCCCCTAAG

                                         *                                   
       4491 CGTTGGGTTCTCAGTATCACTAGGTAGAGAACCTGGTGACCTTACACTCAGATTAGAAGCCAATT
        261 CGTTGGGTTCTCAGTATCACTAGGTAGAGCACCTGGTGACCTTACACTCAGATTAGAAGCCAATT

                           *             *                           *       
       4556 ATCCTAGCTGGGCTTCCAATGCTCGGATAGAAGAAGAATTACCTTGCACTATCGCTTTAGTTCTC
        326 ATCCTAGCTGGGCTTTCAATGCTCGGATAAAAGAAGAATTACCTTGCACTATCGCTTCAGTTCTC

            *      *         * *             *                               
       4621 ATGATATGCTCTCACATAAATGCTTCAAGCGCAGCCATAGGATCTGACCTTTGTTGAGAAAATTG
        391 GTGATATTCTCTCACATCAGTGCTTCAAGCGCAACCATAGGATCTGACCTTTGTTGAGAAAATTG

                 *         
       4686 CTACTATTGCTGATG
        456 CTACTGTTGCTGATG

            *                     *                     *                    
       4701 TTGTCCTTGCATATATGGCATTACATTCTATTGTGGCTGCAATCTTATCTATGGTTGCATCTGGC
          1 CTGTCCTTGCATATATGGCATTGCATTCTATTGTGGCTGCAATCGTATCTATGGTTGCATCTGGC

                               *                       *             *       
       4766 TATGTACCTGCAATTGATCTGTGTGCGAATATACCTACAAATTATGATTAAAATTCTACTGTTTA
         66 TATGTACCTGCAATTGATCAGTGTGCGAATATACCTACAAATTCTGATTAAAATTCTGCTGTTTA

                                                                    *        
       4831 TGGTTATTGTAACTCCCTTGAGCTGAGGAATTTCCATATCTATATGTGGAAGCATTTTGATTCCC
        131 TGGTTATTGTAACTCCCTTGAGCTGAGGAATTTCCATATCTATATGTGGAAGCATTCTGATTCCC

                                                                   *         
       4896 TTAAGGTTGTTGAACTCTATTGTTGTATGAGTTACCATATGTGGAAGCATTCTGAATCCCCTAAG
        196 TTAAGGTTGTTGAACTCTATTGTTGTATGAGTTACCATATGTGGAAGCATTCTGATTCCCCTAAG

                                                              *              
       4961 CGTTGGGTTCTCAGTATCACTAGGTAGAGCACCTGGTGACCTTACACTCATATTAGAAGCCAATT
        261 CGTTGGGTTCTCAGTATCACTAGGTAGAGCACCTGGTGACCTTACACTCAGATTAGAAGCCAATT

                           *             *               
       5026 ATCCTAGCTGGGCTTCCAATGCTCGGATAGAAGAAGAATTACCTT
        326 ATCCTAGCTGGGCTTTCAATGCTCGGATAAAAGAAGAATTACCTT


Statistics
Matches: 4374,  Mismatches: 222, Indels: 8
        0.95            0.05        0.00

Matches are distributed among these distances:
 469    4  0.00
 470  4366  1.00
 471    4  0.00

ACGTcount: A:0.25, C:0.20, G:0.20, T:0.35


Consensus pattern (470 bp):   
CTGTCCTTGCATATATGGCATTGCATTCTATTGTGGCTGCAATCGTATCTATGGTTGCATCTGGC
TATGTACCTGCAATTGATCAGTGTGCGAATATACCTACAAATTCTGATTAAAATTCTGCTGTTTA
TGGTTATTGTAACTCCCTTGAGCTGAGGAATTTCCATATCTATATGTGGAAGCATTCTGATTCCC
TTAAGGTTGTTGAACTCTATTGTTGTATGAGTTACCATATGTGGAAGCATTCTGATTCCCCTAAG
CGTTGGGTTCTCAGTATCACTAGGTAGAGCACCTGGTGACCTTACACTCAGATTAGAAGCCAATT
ATCCTAGCTGGGCTTTCAATGCTCGGATAAAAGAAGAATTACCTTGCACTATCGCTTCAGTTCTC
GTGATATTCTCTCACATCAGTGCTTCAAGCGCAACCATAGGATCTGACCTTTGTTGAGAAAATTG
CTACTGTTGCTGATG

Done.