Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: NTFQ01004040.1 Kokia drynarioides strain JFW-HI SEQ_117181, whole genome shotgun sequence
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194 TCTGGTTTTTGAATTAAAAACT
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216 TATTTACGTGAGAATTTTATCTCTCATGGTTCTT-G--G-A---CGAACTTGTCAAACTTTTACG
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* * * *
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66 AGTTCTTTTATAACTTCG-TTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTCGAG-CTATTTC-C
*
338 GAACATTCCATGCTCGAAAAATCGCAGT-ATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACT
128 GAACATTCCATGCTCGAGAAATCGCA-TCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACT
*
402 TTTGGT-TATTGAATTGAAAACT
192 TTTGGTCT-TTGAATTAAAAACT
* ** * * * * *
424 TATTTACGTGAG-ATTTGTATCAATCCTGGTTTTTGGACGAGCTTTTGAACTTGTCAAACTTGTA
1 TATTTATGTGAGAATTT-TATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAAC-TTCGAACTTGTCAAACTTTTA
* * *
488 CGAGTTCTTTTATAACTTCGTTTCCTTGAAGTATTCAAGACGATCAATTCCTTCGAGCTCTATTC
64 CGAGTTCTTTTATAACTTCG-TTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGCTAT-TTC
** * **
553 CGAGTATTCCATGCTCGAGAAATCGTATTGTTTGGTCCAAATAGTTTGTCA-TTTGT-AACTAAC
127 CGAACATTCCATGCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAAC-AAC
*
616 TTTTGGTCTTTGAATTAACAACT
191 TTTTGGTCTTTGAATTAAAAACT
* * * *
639 TATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGAAGAACTTTCGAACTTTTCAAACTTTTAC
1 TATTTATGTGAGAATTTTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAAC-TTCGAACTTGTCAAACTTTTAC
* * * *
704 GAGTTCTTTTAT-ACTTTTCGTTCCTTAAAGTATTCAGGACAATCAATAT-CTTCGAGCAATTTC
65 GAGTTCTTTTATAAC--TTCGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCAT-TCCTTCGAGCTATTTC
* * * * *
767 AAGAACATTCCATGCTCAATAAATCGCATTATTTGGTCCAAATAGTTTGTC---TTGTAAACAAA
127 -CGAACATTCCATGCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAAC
* *
829 TTATGGTCTCTGAATTAAAAACT
191 TTTTGGTCTTTGAATTAAAAACT
* * * *
852 TATTTACGTGGGAATTTTATCTCTCTTGGTTCTTGGACAAACTTTCGAACTTGTCAAAATTTTAC
1 TATTTATGTGAGAATTTTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAAC-TTCGAACTTGTCAAACTTTTAC
* * * * * *
917 CAGTTCGTTTATAACTTCAGTTCCTTAAAGTATTCAAGATGATTCATTCCTTCAAGCTATTTTCT
65 GAGTTCTTTTATAACTTC-GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGCTA-TTTCC
* *
982 GAACATTTCATGCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCAGTTTGTAAACAACTT
128 GAACATTCCATGCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTT
1047 TTGGTCTTTGAATTAAAAACT
193 TTGGTCTTTGAATTAAAAACT
* * * **
1068 TATTTATGTGATAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAA---C--A--TGTCAAACATTTAAA
1 TATTTATGTGAGAATTTTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCGAACTTGTCAAACTTTTACG
* * * **
1126 ACTTCTTTTCTAACTTCGGTTGCTTAAAGTATTCAAGACGATCTTTTCCTTCGAGAC-ATTTCCC
66 AGTTCTTTTATAACTTC-GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTCGAG-CTATTT-CC
* * * * * * *
1190 GAACATTCCATACTTTG-GAAGTCGCATCTTTTGGTCCAAATTGTTTTTCATTTTGTAAGCAACT
128 GAACATTCCATGC-TCGAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACT
** *
1254 TTTTCTCTTTGAATTAATAACT
192 TTTGGTCTTTGAATTAAAAACT
* * * * * *
1276 TATTCATGTGAGAATATTATCTCTCCTAGTTCCTGGACGAACTTCCGAACTTGTTAAACTTTTAC
1 TATTTATGTGAGAATTTTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTT-CGAACTTGTCAAACTTTTAC
* * * * * * *
1341 GAGTTCGTTTATAACTTTAGTTCCTTAAAGTATTCATGATGATTCATTCCTTCAAGCTATTTTCT
65 GAGTTCTTTTATAAC-TTCGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGCTA-TTTCC
* * *
1406 GAACATTTCATGCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCTAAAAAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTT
128 GAACATTCCATGCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTT
*
1471 TTGGTCTTTAAATTAAAAACT
193 TTGGTCTTTGAATTAAAAACT
* * * **
1492 TATTTATTTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTT-G--G-A---CGAACTTGTCAAACCTTTAAA
1 TATTTATGTGAGAATTTTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCGAACTTGTCAAACTTTTACG
* * * *
1550 ACTTCTTTTCTAACTTCGATTCCTTAAAGTATTCAAGACAATCCTTTCCTTCGAGAC-ATTTCTC
66 AGTTCTTTTATAACTTCG-TTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTCGAG-CTATTTC-C
* *** * * * *
1614 GAGCATTCCAT-CTTTTGAAAGTTGCATCTTTTGGTCCAAATTGTTTTTCATTTTGTAAACAACT
128 GAACATTCCATGCTCGAGAAA-TCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACT
1678 TTTGGTCTTTGAATTAAAAACT
192 TTTGGTCTTTGAATTAAAAACT
* * *
1700 TATTTATGTGAGAATATTATCTCTCCTGGTTCCTGGACGAACTTTCGAACTTGTCAAACTTTTAC
1 TATTTATGTGAGAATTTTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAAC-TTCGAACTTGTCAAACTTTTAC
* * ** * *
1765 GAGTTCTTTTAT-ACTTTTGGTTCCTTAAAGTATTCTAGACGATCCATAACTTCAAGCAATTTCA
65 GAGTTCTTTTATAAC--TTCGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGCTATTTC-
* * * * * **
1829 AGAACATTCCATGCTCGATAATTCGCATTATTAGGTCCAAATAGTTTGTC---TTGTAAACAAAA
127 CGAACATTCCATGCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACT
1891 TTTGGTCTTTGAATTAAAAACT
192 TTTGGTCTTTGAATTAAAAACT
* * * *
1913 TATTTACGTGGGAATTTTATCTCTCTTGGTTCTTGGACAAACTTTCGAACTTGTCAAACTTTCAC
1 TATTTATGTGAGAATTTTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAAC-TTCGAACTTGTCAAACTTTTAC
* * * * * * ** *
1978 CAGTTCGTTTATAAATTCAGTTCCTTAAAGTATTCAAGATGATTCATTCCTTCAATATATTTTCT
65 GAGTTCTTTTATAACTTC-GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGCTA-TTTCC
* *
2043 GAACATTTCATGCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCAGTTTGTAAACAACTT
128 GAACATTCCATGCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTT
*
2108 TTGGTCTTTGAATTAAAAAAT
193 TTGGTCTTTGAATTAAAAACT
* * * **
2129 TATTTGTGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAA---C--A--TGTCAAACATTTAAA
1 TATTTATGTGAGAATTTTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCGAACTTGTCAAACTTTTACG
* * * ** *
2187 ACTTCTTTTCTAGCTTCAGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCTTTTCCTTCGATAC-ATTTCCC
66 AGTTCTTTTATAACTTC-GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTCGA-GCTATTT-CC
* * * * * * * *
2251 GACCATTCCATGCTCTG-GAAGTCGCATCTTTTGGTACAAATTGTTTTTTATTTTGTAAGCAACT
128 GAACATTCCATGCTC-GAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACT
** *
2315 TTTTCTCTTTGAATTAATAACT
192 TTTGGTCTTTGAATTAAAAACT
* * * * *
2337 TATTCATGTGAGAATATTATCTCTCCTAGTTCTTGGACAAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTAC
1 TATTTATGTGAGAATTTTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTT-CGAACTTGTCAAACTTTTAC
* * * * *
2402 GAGTTCGTTTATAACTTTAGTTCCTTAAAGTATTCATGATGATTCATTCCTTC-ACGCTATTTTC
65 GAGTTCTTTTATAAC-TTCGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTCGA-GCTA-TTTC
* * * *
2466 TGAACATTTCATGCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCTAAAAAGTTTGTCATTTTGTAAACAACT
127 CGAACATTCCATGCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACT
* *
2531 TTTGGTATTTAAATTAAAAACT
192 TTTGGTCTTTGAATTAAAAACT
* * **
2553 TATTTATGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAA---C---C-TGTCAAACATTTAAA
1 TATTTATGTGAGAATTTTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCGAACTTGTCAAACTTTTACG
* * * * * *
2611 ACTTCTTTTCTAACTTTGGTTCCATAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGGGAC-ATTTCCC
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* * * * * *
2675 GAGCATTCCATACTCTG-GAAGTCGCATC-TTTCGGTCCAAATTGTTTTTCATTTTGTAAGCAAC
128 GAACATTCCATGCTC-GAGAAATCGCATCATTT-GGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAAC
** *
2738 TTTTGCACTTTGAATTAATAACT
191 TTTTGGTCTTTGAATTAAAAACT
* * * * * *
2761 TATTTATGTGAGAATATTATCTCTCCTCGTTCCTAGACGAACTTTCGAACTTGTTAAACTTTTAC
1 TATTTATGTGAGAATTTTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAAC-TTCGAACTTGTCAAACTTTTAC
* * * * *
2826 GAGTTCGTTTATAACTTCAGTTCCTTAAAGTATTCAAGATGATTCATTCCTTCAAGCTATTTTCT
65 GAGTTCTTTTATAACTTC-GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGCTA-TTTCC
*
2891 GAACATTTCATGCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTT
128 GAACATTCCATGCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTT
2956 TTGGTCTTTGAATTAAAAACT
193 TTGGTCTTTGAATTAAAAACT
* ** **
2977 TATTTATGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAA---C---C-TGTCAAAGATTTAAA
1 TATTTATGTGAGAATTTTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCGAACTTGTCAAACTTTTACG
* * * * *
3035 ACTTCATTTCTAACTTCAATTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGAC-ATTTCCC
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* * * * * *
3099 GAGCATTCCATGCTCTG-GAAGTCGCATCTTTTGGTCCAAATTGTTTTTCATTTCGTAAACAACT
128 GAACATTCCATGCTC-GAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACT
* * *
3163 TTTGCTCTTTGAAATAAAAATT
192 TTTGGTCTTTGAATTAAAAACT
* * * * * *
3185 TACTTATGTGAGAATATTATCTCTCCTGGTTCCTT-GACAAACTTCCAAACTTTTCAAACTTTTA
1 TATTTATGTGAGAATTTTATCTCTCTTGGTT-CTTGGACGAACTT-CGAACTTGTCAAACTTTTA
* * ** * * *
3249 CGAGTTCTTTTATAACCTCGGTTCCTCAAAGTATTCAAGAAAATCCTTTCCTTCGAGCAATTTTA
64 CGAGTTCTTTTATAACTTC-GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGCTA-TTTC
* * * ** * * * *
3314 CGAACATTCCATGCTCGAAAAATCGCATTAGTTGGTCTGAATA-TTT-TTA-CTTGGAAACAAAT
127 CGAACATTCCATGCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACT
* *
3376 TTTTGTCTTTGAATTAAAAATT
192 TTTGGTCTTTGAATTAAAAACT
* *
3398 TATTTACGTGAGAATTTTATCTCTCTTGGTTCTTGGACG------G-ACTTGTCAAACTTTGACG
1 TATTTATGTGAGAATTTTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCGAACTTGTCAAACTTTTACG
* * *** * * *
3456 AGTTCTTTTATAACTTTGGTTACTTAAAGTATTCAACTTGATGCTTTCCTTTGAGAC-ATTTCTC
66 AGTTCTTTTATAAC-TTCGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTCGAG-CTATTTC-C
* * * * * *
3520 GAAAATTCCATGCACGGGAAATCGAATCTTTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGAAAACAACTT
128 GAACATTCCATGCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTT
* *
3585 TTGGTCTTCGAATTAAAACCT
193 TTGGTCTTTGAATTAAAAACT
* * * * * *
3606 TATTTACGTGAGAATTGTT-TCTCTCTTGTTTCTTGAATGAACTTCCAAACTTGTCAAACATTTA
1 TATTTATGTGAGAATT-TTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTT-CGAACTTGTCAAACTTTTA
* * * * * *
3670 CGAGTTCTTTTATAACCTCTGTTCCTTAAAGAATTCAACACAATCCTTTCCTTCGAGCAATTTCT
64 CGAGTTCTTTTATAACTTC-GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGCTATTTC-
* * ** *
3735 CGAGCATTCAATGCTCGAGAAATCATATTATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACT
127 CGAACATTCCATGCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACT
* * *
3800 TCTGGTTTTTGAATTAAAAACG
192 TTTGGTCTTTGAATTAAAAACT
* * *
3822 TATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCATGGTTCTT-G--G-A---CGAACTTGTCAAACTTTTACG
1 TATTTATGTGAGAATTTTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCGAACTTGTCAAACTTTTACG
* * * * * * *
3880 AGTTTTTTTATAATTTTGGTTCCTCAAAGTATTCAACACGATCCTTTCCTCCGAGAC-ATTTCCC
66 AGTTCTTTTATAA-CTTCGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTCGAG-CTATTT-CC
*
3944 GAACATTCCATGCTCGA-AAATCGCATCATTTGGTTCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTT
128 GAACATTCCATGCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTT
*
4008 TTGGT-TATTGAATTGAAAACT
193 TTGGTCT-TTGAATTAAAAACT
* * * * * * *
4029 TATTTACGTGTGAATTGTATC-CATCCTGGTTTTTGGACGAACTTTCAAACTTTTCAAACTTTTA
1 TATTTATGTGAGAATTTTATCTC-TCTTGGTTCTTGGACGAAC-TTCGAACTTGTCAAACTTTTA
* * * * *
4093 CGAGTTCTTTTAGAACATCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGGCGATCAATTCCTTCGAGCTATTTTT
64 CGAGTTCTTTTATAACTTC-GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGCTA-TTTC
*** ** * *
4158 CGGGTATTTTATGCTCGAGAAATCGTATCATTTGGTCCAAAGAGTTTGTCA-TTTGT-AACAAAC
127 CGAACATTCCATGCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAAC-AAC
4221 TTTTGGTCTTTGAATTAAAAACT
191 TTTTGGTCTTTGAATTAAAAACT
** * *
4244 TATTTAAATGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTAT
1 TATTTATGTGAGAATTTTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTT-CGAACTTGTCAAACTTTTAC
* * * * *
4309 GAGTTCTTTTAT-ACTTTTGGTTACTTATAGTATTCAAGAAGATCCATTCCTTCGAGCAATTTCA
65 GAGTTCTTTTATAAC--TTCGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGCTATTTC-
* * * * *
4373 AGAACATTCCATGCTCGATAAATCTCATTATTTGGTCCAAATAGTTTGTCA---TGTAAACAAAT
127 CGAACATTCCATGCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACT
4435 TTTGGTCTTTGAATTAAAAACT
192 TTTGGTCTTTGAATTAAAAACT
* * *
4457 TATTTACGTGGGAATTTTATCTCTCTTGGTTCTTGGACAAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTAC
1 TATTTATGTGAGAATTTTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTT-CGAACTTGTCAAACTTTTAC
* * * * *
4522 GAGTTCATTTATAACTTCAGTTCCTTAAAGTATTCAAGATGATTCATTCCTTCAAGCTATTTTCT
65 GAGTTCTTTTATAACTTC-GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGCTA-TTTCC
* ** * *
4587 GAACATTTCATGCTCGAGAAATCGCATCATTAAGTCCAAATATTTTGTCATTTTCTAAACAACTT
128 GAACATTCCATGCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTT
4652 TTGGTCTTTGAATTAAAAACT
193 TTGGTCTTTGAATTAAAAACT
* * **
4673 TATTTATGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAA---C---C-TGTCAAACATTTAAA
1 TATTTATGTGAGAATTTTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCGAACTTGTCAAACTTTTACG
* * * * * * *
4731 ACTACTTTTCTAACTTCAGTTCCTTAATGTATTCAATACGATCCTTTCCTTCGATAC-ATTTCCC
66 AGTTCTTTTATAACTTC-GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTCGA-GCTATTT-CC
* * * * * * *
4795 GAGCATTCCATGCTCTG-GAAGTCGCATCTTTTGGTCAAAATTGTTTTTCATTTTGTAAGCAACT
128 GAACATTCCATGCTC-GAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACT
** *
4859 TTTGCACTTTGAATTAATAACT
192 TTTGGTCTTTGAATTAAAAACT
* * ** * * * *
4881 TATTTATGTGAGAATATTATCTCTCCTCATTCCTGGATGAACTTCCAAACTTGTCAAACTTTTAT
1 TATTTATGTGAGAATTTTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTT-CGAACTTGTCAAACTTTTAC
* * * * *
4946 GAGTTCATTTATAACTTCAGTTCCTTAAAGTATTCAAGATGATTCATTCCTTCAAGCTATTTTCT
65 GAGTTCTTTTATAACTTC-GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGCTA-TTTCC
*
5011 GAACATTTCATGCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTT
128 GAACATTCCATGCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTT
5076 TTGGTCTTTGAATTAAAAACT
193 TTGGTCTTTGAATTAAAAACT
* * **
5097 TATTTATGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAA---C---C-TGTCAAACATTTAAA
1 TATTTATGTGAGAATTTTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCGAACTTGTCAAACTTTTACG
* * * * * * * *
5155 ACTACTTTTCTAACTACGGTTCCTTAATGTATTCAATACGATCCTTTCCTTCGATAC-ATTTCCC
66 AGTTCTTTTATAACTTC-GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTCGA-GCTATTT-CC
* * * * * *
5219 GAGCATTCCATGCTCTG-GAAGTCGCATCTTTTGGTCCAAATTGTTTTTCATTTTGTAAGCAACT
128 GAACATTCCATGCTC-GAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACT
* *
5283 TTTGCTCTTTGAATTAATAACT
192 TTTGGTCTTTGAATTAAAAACT
* * * * *
5305 TATTTATGTGAGAATATTATCTTTCCTGGTTCCTGGACGAACTTTGGAACTTGTCAAACTTTTAC
1 TATTTATGTGAGAATTTTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAAC-TTCGAACTTGTCAAACTTTTAC
* * * *
5370 GAGTTCATTTATAACTTCAGTTCCTTAAAGTATTCAAGAAGATCCATTCCTTCGAGCAATTTCAA
65 GAGTTCTTTTATAACTTC-GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGCTATTTC-C
* * *
5435 GAACATTCCATGCTCGATAAATCGCATTATTTGGTCCAAATAGTTTGTCA---TGTAAACAAATT
128 GAACATTCCATGCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTT
*
5497 TTGGTCTTTCAATTAAAAACT
193 TTGGTCTTTGAATTAAAAACT
* * *
5518 TATTTACGTGGGAATTTTATCTCTCTTGGTTCTTGGACAAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTAC
1 TATTTATGTGAGAATTTTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTT-CGAACTTGTCAAACTTTTAC
* * * * * *
5583 GAGTTCATTTATAACTTCAGTTCCTTAAAGTATACAAGATGATTCATTCCTTCAAGCTATTTTCT
65 GAGTTCTTTTATAACTTC-GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGCTA-TTTCC
** * *
5648 GAACATTTTATGCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATATTTTGTCATTTTCTAAACAACTT
128 GAACATTCCATGCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTT
*
5713 TTGGTCTGTGAATTAAAAACT
193 TTGGTCTTTGAATTAAAAACT
* * * * **
5734 TATTTATGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGAC--A-----AACCTGTCAAACATGTAAA
1 TATTTATGTGAGAATTTTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCGAACTTGTCAAACTTTTACG
* * * * * * * *
5792 ACTACTTTTCTAACTTCAATTCCTTAATGTATTCAATACGATCCTTTCCTTCGATAC-ATTTCCC
66 AGTTCTTTTATAACTTC-GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTCGA-GCTATTT-CC
* * * * * * *
5856 GAGCATTCCATGCACTG-GAAGTCGCATCTTTTGGTCCAAATTGTTTTTCATTTTGTAAGCAACT
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* *
5920 TTTGCTCTTTGAATTAATAACT
192 TTTGGTCTTTGAATTAAAAACT
* * * * *
5942 TATTTATGTGAGAATATTATCTCTCCTGGTTCCTAGCCGAACTTTCGAACTTGTCAAACTTTTAC
1 TATTTATGTGAGAATTTTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAAC-TTCGAACTTGTCAAACTTTTAC
* * * * *
6007 GAGTTCATTTATAACTTCAGTTCCTTAAAGTATTCAAGATGATTCATTCCTT-GAAGATATTTTT
65 GAGTTCTTTTATAACTTC-GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTCG-AGCTA-TTTC
* * * *
6071 TGAACATTTCATGCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTTTAAAAAACT
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* * * * **
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* * *
6216 ACTTCTTTTCTAACTTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGAC-ATTTCCC
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* * * * * *
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6366 TATTTATGTGAGAATATTATCACTCCTGGTTCCTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTAC
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* ** *
6431 GAGTTCTTTTAT-ACTTTTGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGAT-CATAACTTCGAGCAATTTCA
65 GAGTTCTTTTATAAC--TTCGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGCTATTTC-
* * ** *
6494 AGAACATTCCATGCTCGATAAATCGCATTTTTTGGTCCAAATAGTTTGTCA---TGTAAACAAAT
127 CGAACATTCCATGCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACT
6556 TTTGGTCTTTGAATTAAAAACT
192 TTTGGTCTTTGAATTAAAAACT
* *
6578 TATTTACGTGGGAATTTTATCTCTCTTGGT
1 TATTTATGTGAGAATTTTATCTCTCTTGGT
Statistics
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CATTCCATGCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTTTG
GTCTTTGAATTAAAAACT
Found at i:1371 original size:424 final size:422
Alignment explanation
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* * * * *
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* * * *
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* * * * *
192 CTTCTGGTTTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTTTATCTCTCATGGTTCTTGGACGAA
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** * * * *
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* * *
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320 CCTTCGAG-CTATTTCCCGAACATTCCATGCTCGAGAAATCGCA-TCTTTTGGTCCAAATAGTTT
*
384 GTCATTTTGTAAACAACTTTTGGT-TATTGAATTGAAAACT
383 GTCATTTTGTAAACAACTTTTGGTCT-TTGAATTAAAAACT
* * ** * * * * *
424 TATTTACGTGAGATTTGTATCAATCCTGGTTTTTGGACGAGCTTTTGAACTTGTCAAACTTGTAC
1 TATTTATGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAAC-TTCGAACTTGTCAAACTTTTAC
* * * *
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** * **
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127 CCGAACATTCCATGCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAAC-AA
* * *
615 CTTTTGGTCTTTGAATTAACAACTTATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGAAGAA
191 CTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTATGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAA
* *
680 CTT-TCGAACTTTTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTAT-ACTTTTC-GTTCCTTAAAGTATTCAGG
256 CTTGTCAAACTTTT-AAA-----AC---TTCTTTTATAAC--TTCAGTTCCTTAAAGTATTCAAG
* * * * ** * *
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* * *
805 CAAATAGTTTGTC---TTGTAAACAAATTATGGTCTCTGAATTAAAAACT
373 CAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACT
* * * * *
852 TATTTACGTGGGAATTTTATCTCTCTTGGTTCTTGGACAAACTTTCGAACTTGTCAAAATTTTAC
1 TATTTATGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAAC-TTCGAACTTGTCAAACTTTTAC
* * * * * *
917 CAGTTCGTTTATAACTTCAGTTCCTTAAAGTATTCAAGATGATTCATTCCTTCAAGCTATTTTCT
65 GAGTTCTTTTATAACTTTAGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTCAAGC-ATTTTCC
* *
982 GAACATTTCATGCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCAGTTTGTAAACAACTT
129 GAACATTCCATGCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTT
* *
1047 TTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTATGTGATAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACAT
194 TTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTATGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTT
* * * * *
1112 GTCAAACATTTAAAACTTCTTTTCTAACTTCGGTTGCTTAAAGTATTCAAGACGATCTTTTCCTT
259 GTCAAACTTTTAAAACTTCTTTTATAACTTCAGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTT
* * * * *
1177 CGAGAC-ATTTCCCGAACATTCCATACTTTG-GAAGTCGCATCTTTTGGTCCAAATTGTTTTTCA
324 CGAG-CTATTTCCCGAACATTCCATGC-TCGAGAAATCGCATCTTTTGGTCCAAATAGTTTGTCA
* ** *
1240 TTTTGTAAGCAACTTTTTCTCTTTGAATTAATAACT
387 TTTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACT
* * * * *
1276 TATTCATGTGAGAATAT-TATCTCTCCTAGTTCCTGGACGAACTTCCGAACTTGTTAAACTTTTA
1 TATTTATGTGAGAAT-TGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTT-CGAACTTGTCAAACTTTTA
* * * *
1340 CGAGTTCGTTTATAACTTTAGTTCCTTAAAGTATTCATGATGATTCATTCCTTCAAGCTATTTTC
64 CGAGTTCTTTTATAACTTTAGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTCAAGC-ATTTTC
* * * *
1405 TGAACATTTCATGCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCTAAAAAGTTTGTCATTTTGTAAACAACT
128 CGAACATTCCATGCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACT
* *
1470 TTTGGTCTTTAAATTAAAAACTTATTTATTTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACT
193 TTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTATGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACT
* * *
1535 TGTCAAACCTTTAAAACTTCTTTTCTAACTTC-GATTCCTTAAAGTATTCAAGACAATCCTTTCC
258 TGTCAAACTTTTAAAACTTCTTTTATAACTTCAG-TTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCC
* * *** * * *
1599 TTCGAGAC-ATTTCTCGAGCATTCCAT-CTTTTGAAAGTTGCATCTTTTGGTCCAAATTGTTTTT
322 TTCGAG-CTATTTCCCGAACATTCCATGCTCGAGAAA-TCGCATCTTTTGGTCCAAATAGTTTGT
1662 CATTTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACT
385 CATTTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACT
* *
1700 TATTTATGTGAGAATAT-TATCTCTCCTGGTTCCTGGACGAACTTTCGAACTTGTCAAACTTTTA
1 TATTTATGTGAGAAT-TGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAAC-TTCGAACTTGTCAAACTTTTA
* * ** *
1764 CGAGTTCTTTTAT-ACTTTTGGTTCCTTAAAGTATTCTAGACGATCCATAACTTCAAGCAATTTC
64 CGAGTTCTTTTATAAC-TTTAGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTCAAGCATTTTC
* * * * * *
1828 AAGAACATTCCATGCTCGATAATTCGCATTATTAGGTCCAAATAGTTTGTC---TTGTAAACAAA
128 -CGAACATTCCATGCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAAC
* * * *
1890 ATTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGGGAATTTTATCTCTCTTGGTTCTTGGACAAAC
192 TTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTATGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGG----A-
* ** * * * *
1955 TTTCGAACTTGTCAAACTTTCACCAGTTCGTTTATAAATTCAGTTCCTTAAAGTATTCAAGATGA
252 ---CGAACTTGTCAAACTTTTAAAACTTCTTTTATAACTTCAGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGA
* * * ** * * * *
2020 TTCATTCCTTCAATATATTTTCTGAACATTTCATGCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATA
314 TCCTTTCCTTCGAGCTATTTCCCGAACATTCCATGCTCGAGAAATCGCATCTTTTGGTCCAAATA
* *
2085 GTTTGTCAGTTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAAAT
379 GTTTGTCATTTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACT
* * **
2129 TATTTGTGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAA---C--A--TGTCAAACATTTAAA
1 TATTTATGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCGAACTTGTCAAACTTTTACG
* * * * ** *
2187 ACTTCTTTTCTAGCTTCAGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCTTTTCCTTCGATA-CATTTCCC
66 AGTTCTTTTATAACTTTAGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTC-A-AGCATTTTCC
* * * * * * * *
2251 GACCATTCCATGCTCTG-GAAGTCGCATCTTTTGGTACAAATTGTTTTTTATTTTGTAAGCAACT
129 GAACATTCCATGCTC-GAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACT
** * * * *
2315 TTTTCTCTTTGAATTAATAACTTATTCATGTGAGAATAT-TATCTCTCCTAGTTCTTGGACAAAC
193 TTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTATGTGAGAAT-TGTATCTCTCTTGGTTCTTGG----A-
** * * * * *
2379 TTCCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCGTTTATAACTTTAGTTCCTTAAAGTATTCATGATGA
252 ---CGAACTTGTCAAACTTTTAAAACTTCTTTTATAACTTCAGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGA
* * * * * * * *
2444 TTCATTCCTTC-ACGCTATTTTCTGAACATTTCATGCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCTAAAA
314 TCCTTTCCTTCGA-GCTATTTCCCGAACATTCCATGCTCGAGAAATCGCATCTTTTGGTCCAAAT
* *
2508 AGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTTTGGTATTTAAATTAAAAACT
378 AGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACT
* **
2553 TATTTATGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAA---C---C-TGTCAAACATTTAAA
1 TATTTATGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCGAACTTGTCAAACTTTTACG
* * * * * ** *
2611 ACTTCTTTTCTAACTTTGGTTCCATAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGGGACATTTCCCG
66 AGTTCTTTTATAACTTTAGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTCAAG-CATTTTCCG
* * * * * *
2676 AGCATTCCATACTCTG-GAAGTCGCATC-TTTCGGTCCAAATTGTTTTTCATTTTGTAAGCAACT
130 AACATTCCATGCTC-GAGAAATCGCATCATTT-GGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACT
** * * * * *
2739 TTTGCACTTTGAATTAATAACTTATTTATGTGAGAATAT-TATCTCTCCTCGTTCCTAGACGAAC
193 TTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTATGTGAGAAT-TGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAAC
* * *
2803 TT-TCGAACTTGTTAAACTTTTACGAGTTCGTTTATAACTTCAGTTCCTTAAAGTATTCAAGATG
257 TTGTCAAACTT-TTAAA-----AC---TTCTTTTATAACTTCAGTTCCTTAAAGTATTCAAGACG
* * * * * * *
2867 ATTCATTCCTTCAAGCTATTTTCTGAACATTTCATGCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAAT
313 ATCCTTTCCTTCGAGCTATTTCCCGAACATTCCATGCTCGAGAAATCGCATCTTTTGGTCCAAAT
2932 AGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACT
378 AGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACT
** **
2977 TATTTATGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAA---C---C-TGTCAAAGATTTAAA
1 TATTTATGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCGAACTTGTCAAACTTTTACG
* * * * * * * *
3035 ACTTCATTTCTAACTTCAATTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGACATTTCCCG
66 AGTTCTTTTATAACTTTAGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTCAAG-CATTTTCCG
* * * * * *
3100 AGCATTCCATGCTCTG-GAAGTCGCATCTTTTGGTCCAAATTGTTTTTCATTTCGTAAACAACTT
130 AACATTCCATGCTC-GAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTT
* * * * * *
3164 TTGCTCTTTGAAATAAAAATTTACTTATGTGAGAATAT-TATCTCTCCTGGTTCCTT-GACAAAC
194 TTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTATGTGAGAAT-TGTATCTCTCTTGGTT-CTTGGACGAAC
* * * * **
3227 TT-CCAAACTTTTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACCTCGGTTCCTCAAAGTATTCAAGAAA
257 TTGTCAAACTTTT-AAA-----AC---TTCTTTTATAACTTCAGTTCCTTAAAGTATTCAAGACG
* ** * * **
3291 ATCCTTTCCTTCGAGCAATTTTACGAACATTCCATGCTCGAAAAATCGCAT-TAGTTGGTCTGAA
313 ATCCTTTCCTTCGAGCTATTTCCCGAACATTCCATGCTCGAGAAATCGCATCT-TTTGGTCCAAA
* * * * * *
3355 TA-TTT-TTA-CTTGGAAACAAATTTTTGTCTTTGAATTAAAAATT
377 TAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACT
* * *
3398 TATTTACGTGAGAATTTTATCTCTCTTGGTTCTTGGACG------G-ACTTGTCAAACTTTGACG
1 TATTTATGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCGAACTTGTCAAACTTTTACG
* * *** * * **
3456 AGTTCTTTTATAACTTTGGTTACTTAAAGTATTCAACTTGATGCTTTCCTTTGAGACA-TTTCTC
66 AGTTCTTTTATAACTTTAGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTCAAG-CATTTTC-C
* * * * * *
3520 GAAAATTCCATGCACGGGAAATCGAATCTTTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGAAAACAACTT
129 GAACATTCCATGCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTT
* * * * *
3585 TTGGTCTTCGAATTAAAACCTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCTTGTTTCTTGAATGAACTT
194 TTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTATGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTG---G-A---
* * ** * * * * * *
3650 CCAAACTTGTCAAACATTTACGAGTTCTTTTATAACCTCTGTTCCTTAAAGAATTCAACACAATC
252 -CGAACTTGTCAAACTTTTAAAACTTCTTTTATAACTTCAGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATC
* * * * **
3715 CTTTCCTTCGAGCAATTTCTCGAGCATTCAATGCTCGAGAAATCATAT-TATTTGGTCCAAATAG
316 CTTTCCTTCGAGCTATTTCCCGAACATTCCATGCTCGAGAAATCGCATCT-TTTGGTCCAAATAG
* * *
3779 TTTGTCATTTTGTAAACAACTTCTGGTTTTTGAATTAAAAACG
380 TTTGTCATTTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACT
* *
3822 TATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCATGGTTCTT-G--G-A---CGAACTTGTCAAACTTTTACG
1 TATTTATGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCGAACTTGTCAAACTTTTACG
* * * * * * * * *
3880 AGTTTTTTTATAATTTTGGTTCCTCAAAGTATTCAACACGATCCTTTCCTCCGAGACATTTCCCG
66 AGTTCTTTTATAACTTTAGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTCAAG-CATTTTCCG
*
3945 AACATTCCATGCTCGA-AAATCGCATCATTTGGTTCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTT
130 AACATTCCATGCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTT
* * * * *
4009 TGGT-TATTGAATTGAAAACTTATTTACGTGTGAATTGTATC-CATCCTGGTTTTTGGACGAACT
195 TGGTCT-TTGAATTAAAAACTTATTTATGTGAGAATTGTATCTC-TCTTGGTTCTTGGACGAACT
* * * *
4072 T-TCAAACTTTTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTAGAACATCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGGCGA
258 TGTCAAACTTTT-AAA-----AC---TTCTTTTATAACTTCAGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGA
** ** *** ** * * *
4136 TCAATTCCTTCGAGCTATTTTTCGGGTATTTTATGCTCGAGAAATCGTATCATTTGGTCCAAAGA
314 TCCTTTCCTTCGAGCTATTTCCCGAACATTCCATGCTCGAGAAATCGCATCTTTTGGTCCAAATA
4201 GTTTGTCA-TTTGT-AACAAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACT
379 GTTTGTCATTTTGTAAAC-AACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACT
** *
4244 TATTTAAATGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTAT
1 TATTTATGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTT-CGAACTTGTCAAACTTTTAC
* * * * * *
4309 GAGTTCTTTTAT-ACTTTTGGTTACTTATAGTATTCAAGAAGATCCATTCCTTCGAGCAATTTCA
65 GAGTTCTTTTATAAC-TTTAGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTCAAGCATTTTC-
* * * * *
4373 AGAACATTCCATGCTCGATAAATCTCATTATTTGGTCCAAATAGTTTGTCA---TGTAAACAAAT
128 CGAACATTCCATGCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACT
* * *
4435 TTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGGGAATTTTATCTCTCTTGGTTCTTGGACAAACT
193 TTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTATGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGG----A--
** * * *
4500 TCCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCATTTATAACTTCAGTTCCTTAAAGTATTCAAGATGAT
252 --CGAACTTGTCAAACTTTTAAAACTTCTTTTATAACTTCAGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGAT
* * * * * * * ** *
4565 TCATTCCTTCAAGCTATTTTCTGAACATTTCATGCTCGAGAAATCGCATCATTAAGTCCAAATAT
315 CCTTTCCTTCGAGCTATTTCCCGAACATTCCATGCTCGAGAAATCGCATCTTTTGGTCCAAATAG
*
4630 TTTGTCATTTTCTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACT
380 TTTGTCATTTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACT
* **
4673 TATTTATGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAA---C---C-TGTCAAACATTTAAA
1 TATTTATGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCGAACTTGTCAAACTTTTACG
* * * * * * * *
4731 ACTACTTTTCTAACTTCAGTTCCTTAATGTATTCAATACGATCCTTTCCTTCGATA-CATTTCCC
66 AGTTCTTTTATAACTTTAGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTC-A-AGCATTTTCC
* * * * * * *
4795 GAGCATTCCATGCTCTG-GAAGTCGCATCTTTTGGTCAAAATTGTTTTTCATTTTGTAAGCAACT
129 GAACATTCCATGCTC-GAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACT
** * * ** *
4859 TTTGCACTTTGAATTAATAACTTATTTATGTGAGAATAT-TATCTCTCCTCATTCCTGGATGAAC
193 TTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTATGTGAGAAT-TGTATCTCTCTTGGTT-CT---TGGA-
* ** * * *
4923 TTCCAAACTTGTCAAACTTTTATGAGTTCATTTATAACTTCAGTTCCTTAAAGTATTCAAGATGA
252 ---CGAACTTGTCAAACTTTTAAAACTTCTTTTATAACTTCAGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGA
* * * * * * *
4988 TTCATTCCTTCAAGCTATTTTCTGAACATTTCATGCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATA
314 TCCTTTCCTTCGAGCTATTTCCCGAACATTCCATGCTCGAGAAATCGCATCTTTTGGTCCAAATA
5053 GTTTGTCATTTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACT
379 GTTTGTCATTTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACT
* **
5097 TATTTATGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAA---C---C-TGTCAAACATTTAAA
1 TATTTATGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCGAACTTGTCAAACTTTTACG
* * * *** * * * *
5155 ACTACTTTTCTAACTACGGTTCCTTAATGTATTCAATACGATCCTTTCCTTCGATA-CATTTCCC
66 AGTTCTTTTATAACTTTAGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTC-A-AGCATTTTCC
* * * * * *
5219 GAGCATTCCATGCTCTG-GAAGTCGCATCTTTTGGTCCAAATTGTTTTTCATTTTGTAAGCAACT
129 GAACATTCCATGCTC-GAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACT
* * * * *
5283 TTTGCTCTTTGAATTAATAACTTATTTATGTGAGAATAT-TATCTTTCCTGGTTCCTGGACGAAC
193 TTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTATGTGAGAAT-TGTATCTCTCTTGGTT-CTTG--G-AC
** * * *
5347 TTTGGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCATTTATAACTTCAGTTCCTTAAAGTATTCAAGAAGA
253 ----GAACTTGTCAAACTTTTAAAACTTCTTTTATAACTTCAGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGA
* * ** *
5412 TCCATTCCTTCGAGCAATTTCAAGAACATTCCATGCTCGATAAATCGCAT-TATTTGGTCCAAAT
314 TCCTTTCCTTCGAGCTATTTCCCGAACATTCCATGCTCGAGAAATCGCATCT-TTTGGTCCAAAT
* *
5476 AGTTTGTCA---TGTAAACAAATTTTGGTCTTTCAATTAAAAACT
378 AGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACT
* * * *
5518 TATTTACGTGGGAATTTTATCTCTCTTGGTTCTTGGACAAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTAC
1 TATTTATGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTT-CGAACTTGTCAAACTTTTAC
* * * * * *
5583 GAGTTCATTTATAACTTCAGTTCCTTAAAGTATACAAGATGATTCATTCCTTCAAGCTATTTTCT
65 GAGTTCTTTTATAACTTTAGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTCAAGC-ATTTTCC
** * *
5648 GAACATTTTATGCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATATTTTGTCATTTTCTAAACAACTT
129 GAACATTCCATGCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTT
* * *
5713 TTGGTCTGTGAATTAAAAACTTATTTATGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACAAACCT
194 TTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTATGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTT
* * * * * * *
5778 GTCAAACATGTAAAACTACTTTTCTAACTTCAATTCCTTAATGTATTCAATACGATCCTTTCCTT
259 GTCAAACTTTTAAAACTTCTTTTATAACTTCAGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTT
* * * * * *
5843 CGATAC-ATTTCCCGAGCATTCCATGCACTG-GAAGTCGCATCTTTTGGTCCAAATTGTTTTTCA
324 CGA-GCTATTTCCCGAACATTCCATGCTC-GAGAAATCGCATCTTTTGGTCCAAATAGTTTGTCA
* * *
5906 TTTTGTAAGCAACTTTTGCTCTTTGAATTAATAACT
387 TTTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACT
* * * *
5942 TATTTATGTGAGAATAT-TATCTCTCCTGGTTCCTAGCCGAACTTTCGAACTTGTCAAACTTTTA
1 TATTTATGTGAGAAT-TGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAAC-TTCGAACTTGTCAAACTTTTA
* * * * * * *
6006 CGAGTTCATTTATAACTTCAGTTCCTTAAAGTATTCAAGATGATTCATTCCTTGAAGATATTTTT
64 CGAGTTCTTTTATAACTTTAGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTCAAG-CATTTTC
* * * *
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128 CGAACATTCCATGCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACT
* * *
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193 TTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTATGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACT
* * *
6201 TGTCAAACATTTAAAACTTCTTTTCTAACTTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCT
258 TGTCAAACTTTTAAAACTTCTTTTATAACTTCAGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCT
* * * * *
6266 TCGAGAC-ATTTCCCGAGCATTCCATGCTCTG-GAAGTCGTATCTTTTGGTCCAAATTGTTTTTC
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**
6329 ATTTTGTAAACAACTTTTTCTCTTTGAATTAAAAACT
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* * *
6366 TATTTATGTGAGAATAT-TATCACTCCTGGTTCCTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTA
1 TATTTATGTGAGAAT-TGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTT-CGAACTTGTCAAACTTTTA
* ** * *
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64 CGAGTTCTTTTATAAC-TTTAGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTCAAGCATTTTC
* * ** *
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128 -CGAACATTCCATGCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAAC
* * *
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Statistics
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* *
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* * * *
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* * * * *
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** * * * * *
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*
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385 TCATTTTGTAAACAACTTTTGGTCT-TTGAATTAAAAACTTATTTATGTGAGAATTGTATCTCTC
* * * ** * *
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* * ** ** *
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* *
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578 ATTATTTGGTCCAAATAGTTTGTC-TTTGTAAAC-AACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACT
* * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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129 -CGAACATTCCATGCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAAC
* * * * *
829 TTATGGTCTCTGAATTAAAAACTTATTTACGTGGGAATTTTATCTCTCTTGGTTCTTGGACAAAC
193 TTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTATGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGG----A-
* ** * * *
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253 ---CGAACTTGTCAAACTTTTAAAACTTCTTTTATAACTTCAGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGA
* * *
959 TTCATTCCTTCAAG-CTATTT-TCTGAACATTTCATGCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAA
315 TCCATTCCTTCGAGAC-ATTTCTC-GAACATTCCATGCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAA
* *
1022 TAGTTTGTCAGTTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTATGTGATAATTGTA
378 TAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTATGTGAGAATTGTA
* ** * *
1087 TCTCTCTTGGTTCTTGGACGAA----C--A--TGTCAAACATTTAAAACTTCTTTTCTAACTTCG
443 TCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCG
* ** * *
1144 GTTGCTTAAAGTATTCAAGACGATCTTTTCCTTCGAG-ACATTTCCCGAACATTCCATACTTTG-
508 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGCA-ATTT-CCGAACATTCCATGC-TCGA
* * * * **
1207 GAAGTCGCATCT-TTTGGTCCAAATTGTTTTTCATTTTGTAAGCAACTTTTTCTCTTTGAATTAA
570 GAAATCGCAT-TATTTGGTCCAAATAGTTTGTC--TTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAA
*
1271 TAACT
632 AAACT
* * * * *
1276 TATTCATGTGAGAATAT-TATCTCTCCTAGTTCCTGGACGAACTTCCGAACTTGTTAAACTTTTA
1 TATTTATGTGAGAAT-TGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTA
* * * * * * *
1340 CGAGTTCGTTTATAACTTTAGTTCCTTAAAGTATTCATGATGATTCATTCCTTCAAGCTATTTTC
65 CGAGTTCTTTTATAACTTTGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGC-ATTTTC
* * * *
1405 TGAACATTTCATGCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCTAAAAAGTTTGTCATTTTGTAAACAACT
129 CGAACATTCCATGCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACT
* *
1470 TTTGGTCTTTAAATTAAAAACTTATTTATTTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACT
194 TTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTATGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACT
* * * *
1535 TGTCAAACCTTTAAAACTTCTTTTCTAACTTC-GATTCCTTAAAGTATTCAAGACAATCCTTTCC
259 TGTCAAACTTTTAAAACTTCTTTTATAACTTCAG-TTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCC
* *** * * * *
1599 TTCGAGACATTTCTCGAGCATTCCAT-CTTTTGAAAGTTGCATCTTTTGGTCCAAATTGTTTTTC
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*
1663 ATTTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTATGTGAGAATAT-TATCTCTCCT
387 ATTTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTATGTGAGAAT-TGTATCTCTCTT
* * *
1727 GGTTCCTGGACGAACTTTCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTAT-ACTTTTGGTTCCTT
451 GGTTCTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAAC-TTCGGTTCCTT
* ** * * * *
1791 AAAGTATTCTAGACGATCCATAACTTCAAGCAATTTCAAGAACATTCCATGCTCGATAATTCGCA
515 AAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGCAATTTC-CGAACATTCCATGCTCGAGAAATCGCA
* **
1856 TTATTAGGTCCAAATAGTTTGTC-TTGTAAACAAAATTTGGTCTTTGAATTAAAAACT
579 TTATTTGGTCCAAATAGTTTGTCTTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACT
* * * * * *
1913 TATTTACGTGGGAATTTTATCTCTCTTGGTTCTTGGACAAACTTTCGAACTTGTCAAACTTTCAC
1 TATTTATGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTAC
* * * ** * * * * ** *
1978 CAGTTCGTTTATAAATTCAGTTCCTTAAAGTATTCAAGATGATTCATTCCTTCAATATATTTTCT
66 GAGTTCTTTTATAACTTTGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGA-GCATTTTCC
* *
2043 GAACATTTCATGCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCAGTTTGTAAACAACTT
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* * *
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195 TTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTATGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTT
* * * **
2173 GTCAAACATTTAAAACTTCTTTTCTAGCTTCAGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCTTTTCCTT
260 GTCAAACTTTTAAAACTTCTTTTATAACTTCAGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTT
* * * * * * * * *
2238 CGATACATTTCCCGACCATTCCATGCTCTG-GAAGTCGCATCTTTTGGTACAAATTGTTTTTTAT
325 CGAGACATTTCTCGAACATTCCATGCTC-GAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCAT
* ** * * * *
2302 TTTGTAAGCAACTTTTTCTCTTTGAATTAATAACTTATTCATGTGAGAATAT-TATCTCTCCTAG
389 TTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTATGTGAGAAT-TGTATCTCTCTTGG
* * **
2366 TTCTTGGACAAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCGTTTATAACTTTAGTTCCTTAAA
453 TTCTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAA
* * * * * * *
2431 GTATTCATGATGATTCATTCCTTC-ACGCTATTTTCTGAACATTTCATGCTCGAGAAATCGCATC
518 GTATTCAAGACGATCCATTCCTTCGA-GC-AATTTCCGAACATTCCATGCTCGAGAAATCGCATT
* * * *
2495 ATTTGGTCTAAAAAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTTTGGTATTTAAATTAAAAACT
581 ATTTGGTCCAAATAGTTTGTC--TTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACT
* *
2553 TATTTATGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAA----C---C-TGTCAAACATTTAA
1 TATTTATGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTAC
* * * * * *
2610 AACTTCTTTTCTAACTTTGGTTCCATAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGGGACATTTCCC
66 GAGTTCTTTTATAACTTTGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAG-CATTTTCC
* * * * * *
2675 GAGCATTCCATACTCTG-GAAGTCGCATC-TTTCGGTCCAAATTGTTTTTCATTTTGTAAGCAAC
130 GAACATTCCATGCTC-GAGAAATCGCATCATTT-GGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAAC
** * * * * *
2738 TTTTGCACTTTGAATTAATAACTTATTTATGTGAGAATAT-TATCTCTCCTCGTTCCTAGACGAA
193 TTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTATGTGAGAAT-TGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAA
* * *
2802 CTT-TCGAACTTGTTAAACTTTTACGAGTTCGTTTATAACTTCAGTTCCTTAAAGTATTCAAGAT
257 CTTGTCAAACTT-TTAAA-----AC---TTCTTTTATAACTTCAGTTCCTTAAAGTATTCAAGAC
* * *
2866 GATTCATTCCTTCAAG-CTATTT-TCTGAACATTTCATGCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCCA
313 GATCCATTCCTTCGAGAC-ATTTCTC-GAACATTCCATGCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCCA
2929 AATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTATGTGAGAATTG
376 AATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTATGTGAGAATTG
** ** * * *
2994 TATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAA----C---C-TGTCAAAGATTTAAAACTTCATTTCTAACTT
441 TATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTT
** * *
3051 CAATTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAG-ACATTTCCCGAGCATTCCATGCTCT
506 CGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGCA-ATTT-CCGAACATTCCATGCTC-
* * * * *
3115 G-GAAGTCGCATCT-TTTGGTCCAAATTGTTTTTCATTTCGTAAACAACTTTTGCTCTTTGAAAT
568 GAGAAATCGCAT-TATTTGGTCCAAATAGTTTGTC-TTT-GTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATT
*
3178 AAAAATT
630 AAAAACT
* * * * *
3185 TACTTATGTGAGAATAT-TATCTCTCCTGGTTCCTT-GACAAACTTCCAAACTTTTCAAACTTTT
1 TATTTATGTGAGAAT-TGTATCTCTCTTGGTT-CTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTT
* * * **
3248 ACGAGTTCTTTTATAACCTCGGTTCCTCAAAGTATTCAAGAAAATCCTTTCCTTCGAGCAATTTT
64 ACGAGTTCTTTTATAACTTTGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGC-ATTTT
* * * * ** * * * *
3313 ACGAACATTCCATGCTCGAAAAATCGCATTAGTTGGTCTGAATA-TTT-TTA-CTTGGAAACAAA
128 CCGAACATTCCATGCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAAC
* * * * *
3375 TTTTTGTCTTTGAATTAAAAATTTATTTACGTGAGAATTTTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGGAC
193 TTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTATGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAAC
* ** * ** * *** * *
3440 TTGTCAAACTTTGACGAGTTCTTTTATAACTTTGGTTACTTAAAGTATTCAACTTGATGCTTTCC
258 TTGTCAAACTTTTAAAACTTCTTTTATAACTTCAGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCC
* * * * * *
3505 TTTGAGACATTTCTCGAAAATTCCATGCACGGGAAATCGAATCTTTTGGTCCAAATAGTTTGTCA
323 TTCGAGACATTTCTCGAACATTCCATGCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCA
* * * * * *
3570 TTTTGAAAACAACTTTTGGTCTTCGAATTAAAACCTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCTTGT
388 TTTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTATGTGAGAATTGTATCTCTCTTGG
* * * * * *
3635 TTCTTGAATGAACTTCCAAACTTGTCAAACATTTACGAGTTCTTTTATAACCTCTGTTCCTTAAA
453 TTCTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAA
* * * * * * **
3700 GAATTCAACACAATCCTTTCCTTCGAGCAATTTCTCGAGCATTCAATGCTCGAGAAATCATATTA
518 GTATTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGCAATTTC-CGAACATTCCATGCTCGAGAAATCGCATTA
* * *
3765 TTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTCTGGTTTTTGAATTAAAAACG
582 TTTGGTCCAAATAGTTTGTC--TTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACT
* *
3822 TATTTACGTGAGAATTGTATCTCTCATGGTTCTT-G--G-A----CGAACTTGTCAAACTTTTAC
1 TATTTATGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTAC
* * * * * *
3879 GAGTTTTTTTATAATTTTGGTTCCTCAAAGTATTCAACACGATCCTTTCCTCCGAGACATTTCCC
66 GAGTTCTTTTATAACTTTGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAG-CATTTTCC
*
3944 GAACATTCCATGCTCGA-AAATCGCATCATTTGGTTCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTT
130 GAACATTCCATGCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTT
* * * * *
4008 TTGGT-TATTGAATTGAAAACTTATTTACGTGTGAATTGTATC-CATCCTGGTTTTTGGACGAAC
195 TTGGTCT-TTGAATTAAAAACTTATTTATGTGAGAATTGTATCTC-TCTTGGTTCTTGGACGAAC
* * * *
4071 TT-TCAAACTTTTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTAGAACATCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGGCG
258 TTGTCAAACTTTT-AAA-----AC---TTCTTTTATAACTTCAGTTCCTTAAAGTATTCAAGACG
* * *** ** *
4135 ATCAATTCCTTCGAG-CTATTTTTCGGGTATTTTATGCTCGAGAAATCGTATCATTTGGTCCAAA
314 ATCCATTCCTTCGAGAC-ATTTCTCGAACATTCCATGCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAA
* **
4199 GAGTTTGTCA-TTTGT-AACAAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTAAATGAGAATTGT
378 TAGTTTGTCATTTTGTAAAC-AACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTATGTGAGAATTGT
*
4262 ATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTATGAGTTCTTTTAT-ACTTT
442 ATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAAC-TT
* * * * *
4326 TGGTTACTTATAGTATTCAAGAAGATCCATTCCTTCGAGCAATTTCAAGAACATTCCATGCTCGA
506 CGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGCAATTTC-CGAACATTCCATGCTCGA
* * * *
4391 TAAATCTCATTATTTGGTCCAAATAGTTTGTC-ATGTAAACAAATTTTGGTCTTTGAATTAAAAA
570 GAAATCGCATTATTTGGTCCAAATAGTTTGTCTTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAA
4455 CT
635 CT
* * * *
4457 TATTTACGTGGGAATTTTATCTCTCTTGGTTCTTGGACAAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTAC
1 TATTTATGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTAC
* ** * * * * *
4522 GAGTTCATTTATAACTTCAGTTCCTTAAAGTATTCAAGATGATTCATTCCTTCAAGCTATTTTCT
66 GAGTTCTTTTATAACTTTGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGC-ATTTTCC
* ** * *
4587 GAACATTTCATGCTCGAGAAATCGCATCATTAAGTCCAAATATTTTGTCATTTTCTAAACAACTT
130 GAACATTCCATGCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTT
*
4652 TTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTATGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACCT
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* * * * * *
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260 GTCAAACTTTTAAAACTTCTTTTATAACTTCAGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTT
* * * * * * * *
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325 CGAGACATTTCTCGAACATTCCATGCTC-GAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCAT
* ** * * **
4846 TTTGTAAGCAACTTTTGCACTTTGAATTAATAACTTATTTATGTGAGAATAT-TATCTCTCCTCA
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* * * * * *
4910 TTCCTGGATGAACTTCCAAACTTGTCAAACTTTTATGAGTTCATTTATAACTTCAGTTCCTTAAA
453 TTCTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAA
* * * * * * *
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518 GTATTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGC-AATTTCCGAACATTCCATGCTCGAGAAATCGCATTA
5040 TTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACT
582 TTTGGTCCAAATAGTTTGTC--TTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACT
* *
5097 TATTTATGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAA----C---C-TGTCAAACATTTAA
1 TATTTATGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTAC
* * * * ** * * * *
5154 AACTACTTTTCTAACTACGGTTCCTTAATGTATTCAATACGATCCTTTCCTTCGATACATTTCCC
66 GAGTTCTTTTATAACTTTGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGA-GCATTTTCC
* * * * * *
5219 GAGCATTCCATGCTCTG-GAAGTCGCATCTTTTGGTCCAAATTGTTTTTCATTTTGTAAGCAACT
130 GAACATTCCATGCTC-GAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACT
* * * * *
5283 TTTGCTCTTTGAATTAATAACTTATTTATGTGAGAATAT-TATCTTTCCTGGTTCCTGGACGAAC
194 TTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTATGTGAGAAT-TGTATCTCTCTTGGTT-CTTG--G-AC
** * * *
5347 TTTGGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCATTTATAACTTCAGTTCCTTAAAGTATTCAAGAAGA
254 ----GAACTTGTCAAACTTTTAAAACTTCTTTTATAACTTCAGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGA
** * *
5412 TCCATTCCTTCGAG-CAATTTCAAGAACATTCCATGCTCGATAAATCGCATTATTTGGTCCAAAT
315 TCCATTCCTTCGAGAC-ATTTCTCGAACATTCCATGCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAAT
* * * * *
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379 AGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTATGTGAGAATTGTAT
* * *
5538 CTCTCTTGGTTCTTGGACAAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCATTTATAACTTCAG
444 CTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCGG
* * * * * * **
5603 TTCCTTAAAGTATACAAGATGATTCATTCCTTCAAGCTATTTTCTGAACATTTTATGCTCGAGAA
509 TTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGC-AATTTCCGAACATTCCATGCTCGAGAA
* * * *
5668 ATCGCATCATTTGGTCCAAATATTTTGTCATTTTCTAAACAACTTTTGGTCTGTGAATTAAAAAC
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5733 T
636 T
* * * *
5734 TATTTATGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGAC--A------AACCTGTCAAACATGTAA
1 TATTTATGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTAC
* * * * *** * * * *
5791 AACTACTTTTCTAACTTCAATTCCTTAATGTATTCAATACGATCCTTTCCTTCGATACATTTCCC
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* * * * * * *
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* * * *
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** * * *
5984 TTTCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCATTTATAACTTCAGTTCCTTAAAGTATTCAAGATGA
253 ---CGAACTTGTCAAACTTTTAAAACTTCTTTTATAACTTCAGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGA
* * * * *
6049 TTCATTCCTT-GAAGATATTTTTTGAACATTTCATGCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAAT
315 TCCATTCCTTCG-AGACATTTCTCGAACATTCCATGCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAAT
* * *
6113 AGTTTGTCATTTTTTAAAAAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTAGTTATGTGAGAATTGTAT
379 AGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTATGTGAGAATTGTAT
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6178 CTCTCTTGGTTC-TGG--G-A----CGAACCTGTCAAACATTTAAAACTTCTTTTCTAACTTCGG
444 CTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCGG
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6235 TTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAG-ACATTTCCCGAGCATTCCATGCTCTG-G
509 TTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGCA-ATTT-CCGAACATTCCATGCTC-GAG
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6298 AAGTCGTATCT-TTTGGTCCAAATTGTTTTTCATTTTGTAAACAACTTTTTCTCTTTGAATTAAA
571 AAATCGCAT-TATTTGGTCCAAATAGTTTGTC--TTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAA
6362 AACT
633 AACT
* * *
6366 TATTTATGTGAGAATAT-TATCACTCCTGGTTCCTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTA
1 TATTTATGTGAGAAT-TGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTA
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6430 CGAGTTCTTTTAT-ACTTTTGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGAT-CATAACTTCGAGCAATTTC
65 CGAGTTCTTTTATAAC-TTTGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGCATTTTC
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6493 AAGAACATTCCATGCTCGATAAATCGCATTTTTTGGTCCAAATAGTTTGTCA---TGTAAACAAA
129 -CGAACATTCCATGCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAAC
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6555 TTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGGGAATTTTATCTCTCTTGGT
193 TTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTATGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGT
Statistics
Matches: 4998, Mismatches: 772, Indels: 400
0.81 0.13 0.06
Matches are distributed among these distances:
628 19 0.00
629 251 0.05
630 19 0.00
631 90 0.02
632 816 0.16
633 25 0.01
634 1 0.00
635 65 0.01
636 328 0.07
637 1702 0.34
638 357 0.07
639 191 0.04
640 748 0.15
641 4 0.00
642 1 0.00
643 89 0.02
644 279 0.06
645 13 0.00
ACGTcount: A:0.28, C:0.18, G:0.14, T:0.40
Consensus pattern (636 bp):
TATTTATGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTAC
GAGTTCTTTTATAACTTTGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCTTTCCTTCGAGCATTTTCCG
AACATTCCATGCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTTTGTAAACAACTTT
TGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTATGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTCTTGGACGAACTTG
TCAAACTTTTAAAACTTCTTTTATAACTTCAGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTC
GAGACATTTCTCGAACATTCCATGCTCGAGAAATCGCATCATTTGGTCCAAATAGTTTGTCATTT
TGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTATGTGAGAATTGTATCTCTCTTGGTTC
TTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTA
TTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGCAATTTCCGAACATTCCATGCTCGAGAAATCGCATTATTTG
GTCCAAATAGTTTGTCTTTGTAAACAACTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACT
Done.