Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: NTFQ01004521.1 Kokia drynarioides strain JFW-HI SEQ_117965, whole genome shotgun sequence
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* * * ** *
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* * * * *
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129 TTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTATTGGTTCTTGGACGAACT
*
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* * *
237 AGTTCTTTTATAACTTCAGTTCATTAATGTATTCAAGATGATCCATTCTTTCGAGCAATTTTTCG
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* *
302 AACATTCCATGCCCGGGAAATTGCATCATTTGGTCTAAA-AATTTTGTCATTTTCG-AAACAAGT
66 AACATTCCATGCTCGGGAAATTGCATCATTTGGTCTAAATAGTTTT-TCATTTT-GTAAACAAGT
* * * * * *
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129 TTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTATTGGTTCTTGGACGAACT
* * *
430 TTCGAACTAGTCAAACTTTTACG
194 TTCCAACTTGTCAAAATTTTACG
* * *
453 AGTTCTTTTATATA-TT-AGGTTCCTTCAAGTATTCAAGACGATACATTCCTTT-GAGCAGCTTT
1 AGTTCTTTTATA-ACTTCA-GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATT-CTTTCGAGCA-ATTT
* * * * * * *
515 TGCGAACATTTCATGCTCAGG-AATCGCATCATTCGGTCCAAATAGTTTTTCATTTTGTAATCAA
62 TTCGAACATTCCATGCTCGGGAAATTGCATCATTTGGTCTAAATAGTTTTTCATTTTGTAAACAA
* * * * * * *
579 GTTTTGGTGTTTGTATTAAAAACTTATTTACGTAAGAATTATTTCTCTCTT-TTGTCTTGGTCGA
127 GTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTATTGGT-TCTTGGACGA
* *
643 ACTTTCGAACTTGTCAAAATTTTACA
191 ACTTTCCAACTTGTCAAAATTTTACG
* * * * * * *
669 AGTTCTTTTTTAACTTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGGTCCATTCCTTT-TAGTAGTTTTTT
1 AGTTCTTTTATAACTTCAGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATT-CTTTCGAGCAATTTTTC
* * *
733 GAACATTCCATTCTCGGGAAATCGCATCATTTGGTCTAAATAGTTTTTCATTTAGTAAACAAGTT
65 GAACATTCCATGCTCGGGAAATTGCATCATTTGGTCTAAATAGTTTTTCATTTTGTAAACAAGTT
* * * * *
798 TTGGTCCTTGAATTAAAAACTTATTTACATGAGAATTGTTTCTCTATTGGTTGTTGGATGAAC-A
130 TTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTATTGGTTCTTGGACGAACTT
*
862 TCCAAACATGTCAAACA-TTTACG
195 TCC-AACTTGTCAAA-ATTTTACG
* * * * * *
885 AGTTCTTTT-TAAATCCGGTTCCTTAAAGTGTTCAAGACAATCCATTGC-TTC-AACTAATTTTT
1 AGTTCTTTTATAACTTCAGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATT-CTTTCGAGC-AATTTTT
* ** ** * *
947 CAAACATTCCATGCGAGGGAAATCACATCATTTGGTCTAAATAGCTTTTCATTTTGTAAACAATT
64 CGAACATTCCATGCTCGGGAAATTGCATCATTTGGTCTAAATAGTTTTTCATTTTGTAAACAAGT
** * * *
1012 TTTTATCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTCATGGATGAACT
129 TTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTATTGGTTCTTGGACGAACT
** * * * *
1077 TTTGAAATTGACAAACTGTTACG
194 TTCCAACTTGTCAAAATTTTACG
* * * * *
1100 AGTTCTTTTATAACTTCAATTCATTAAAGTATTCAAGATGATCCAATTCCTTCTAG-AAGTTTTT
1 AGTTCTTTTATAACTTCAGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCC-ATTCTTTCGAGCAA-TTTTT
* * * * *
1164 CGAACAATCCATTCTCGGGAAATCT-TATCAATTGGTCTAAATAGTTTTTCATTTTGTAAAAAAG
64 CGAACATTCCATGCTCGGGAAAT-TGCATCATTTGGTCTAAATAGTTTTTCATTTTGTAAACAAG
* * * *
1228 TTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACATGAGAAAAAATTGTGTCTCTCTTGGTTCTTGGAT
128 TTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAG----AATTGTTTCTCTATTGGTTCTTGGAC
* * * *
1293 GAACTTTCAAACTTTTCGAACTTTTACG
189 GAACTTTCCAACTTGTCAAAATTTTACG
* * * *
1321 AGTTCTTTTATAACTTCTGTTCCTTAACGTATTCAAGATGATCCAATCCTTT-GAGCAATTTTTC
1 AGTTCTTTTATAACTTCAGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCC-ATTCTTTCGAGCAATTTTTC
** * * * *
1385 GAACATTCCATGCGAGGGAAGTTACATCATTTGGACTAAAATA-TTTGTCATTTTGTAAACAAGT
65 GAACATTCCATGCTCGGGAAATTGCATCATTTGGTCT-AAATAGTTTTTCATTTTGTAAACAAGT
* * *** * ** * **
1449 TTTGGCCTTCGAGTAATTTTTCGAACCT-TCCACGCTGGAGAA--ATCACAT-TATTTGG-TC-T
129 TTTGGTCTT--TG-AA--TTAAAAACTTATTTACG-T-GAGAATTGTTTC-TCTA-TTGGTTCTT
* * * ** ** * *
1508 --AAGTAGTTTTTATTTTGTAGAAAAGTTTT-GG
185 GGACGAACTTTCCAACTTGT-CAAAA-TTTTACG
* * * * * * *** * * *
1539 ACTT-TAAATTTAAAACTT-ATTTACGT-AAGAATT-ATTTC--TCTCTTTGTTCTTGGATG-AA
1 AGTTCT---TTTATAACTTCAGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATC-CATT-CT-TTCGA-GCAA
* * * * ** ** *** *** * * * * *
1597 -CTTTCAAACTTGTCAAAATTTTACAAGTTCTTTTTTAACTTCGGTTCCTTAA-AG-TATTCAAG
59 TTTTTCGAACAT-TC--CATGCT-CGGGAAATTGCATCA-TTTGG-T-CTAAATAGTTTTTC-AT
*** ** **** * ** *
1659 AAGGTCCATTCCTTTTAGTAGTTTTTCGAACATTCCAGGCTCGAGAAATCGCATCATT-CGGTCT
116 TTTGTAAACAAGTTTT-G--GTCTTT-G-A-ATT--A------A-AAA-CTTAT--TTAC-GT-G
* * * ** * **** *
1723 A-AATAGTTTTTC-A-T--TTCTT-AAAAAAGTTTTGGTCTTTGAACTAAAAACTTATTTACGTG
161 AGAATTGTTTCTCTATTGGTTCTTGGACGAACTTTCCAAC-TTG---TCAAAA--T-TTTAC--G
* * * * * * * * **
1782 AGAATTGTTTCTCTCA-TT--TTTGACTAAATAGTTTTTCATTTTGTAAACTTTGCCATGTTCTT
1 AG--TTCTTT-TATAACTTCAGTT-CCTTAA-AG-TATTCA------AGACGAT-CCA--TTC--
* * * * * * * * *
1844 TTATAACTTTGATTCCTTAAAGTATTCAAGACGA-TCCATTCCTTCGAGCAATTTTCCGAACATT
49 TT-T--C---GA--GC---AATTTTTCGA-AC-ATTCCA-TGC-TCG-GGAA-ATTGC-ATCA-T
**
1908 CCACGCTCGGGAAATCGCATCATTCGGTCTAAATAGTTACTCATTTTGTAAACAAGTTTTGGTCT
95 ----------------------TT-GGTCTAAATAGTTTTTCATTTTGTAAACAAGTTTTGGTCT
* * * ** * *
1973 TTCAATTAAAAACTTATTTACAT--GAATTGTTCCTCTATTATTTCATGGATGAAC-TTCCAATC
137 TTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTATTGGTTCTTGGACGAACTTTCCAA-C
2035 TTGT-AGAAATTTTACG
201 TTGTCA-AAATTTTACG
* * * * * *
2051 ATTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAGAGTATTCAAGATGATCCATTCTTTCAAGCAATTTTTTG
1 AGTTCTTTTATAACTTCAGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCTTTCGAGCAATTTTTCG
* * * * * *
2116 AACATTCCATGCCCGAGAAATCGGATCATTTGGTCTAAA-AATTTTCTCATTTTCTAAACAAGTT
66 AACATTCCATGCTCGGGAAATTGCATCATTTGGTCTAAATAGTTTT-TCATTTTGTAAACAAGTT
* * * * *
2180 TTGGCCTTTGAATTAAAACCTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTTTTGGTTCTTAGACAAACTT
130 TTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTATTGGTTCTTGGACGAACTT
* ** *
2245 TCGAACTTGTCAATCTTTTATG
195 TCCAACTTGTCAAAATTTTACG
* ** * ** * * ** *
2267 AGTTCTTTTATATCTTTGGTTCCTTCAAGTATTCAAGACGATAAATTCCTTCAAGCAGCTTTTCA
1 AGTTCTTTTATAACTTCAGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCTTTCGAGCAATTTTTCG
** * * *
2332 AACATTTTATGCTCGGGAAATCGCATCATTGGGTCTAAATCA-TTTTTCATTTTGTAATCAAGTT
66 AACATTCCATGCTCGGGAAATTGCATCATTTGGTCTAAAT-AGTTTTTCATTTTGTAAACAAGTT
* * * ** * **
2396 TTGGTGTTTGTATTAAAAACTTATTTACGTAAGAATTAATTCTCTCTTTTTTCTTGGACGAACTT
130 TTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTATTGGTTCTTGGACGAACTT
* *
2461 TCGAACTTGTCAAAATTTTACA
195 TCCAACTTGTCAAAATTTTACG
* * * * * ** * *
2483 AGTCCTTTTTTTAACTTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGGTGCATTCTTTTTAGTATTTTTTC
1 AGTTC-TTTTATAACTTCAGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCTTTCGAGCAATTTTTC
* * * * *
2548 GAACATTCCATGCTCGGGAAATCGCATCATTCGGTATCAATAGTTTTTCATTTTGTAAAAAAGTT
65 GAACATTCCATGCTCGGGAAATTGCATCATTTGGTCTAAATAGTTTTTCATTTTGTAAACAAGTT
* * ** *
2613 TTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTATCTCATTTTGG-TC-T-AAATAG
130 TTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTG-TT-TCTC-TATTGGTTCTTGGACGAA
* * ** * * *** *
2675 TTTTTCATTTTAT-AAACTTCGCCA
192 CTTTCCAACTTGTCAAAATTTTACG
2699 AGTTCTTTTATAACTTC-GATTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTT-GAGCAATTTTT
1 AGTTCTTTTATAACTTCAG-TTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATT-CTTTCGAGCAATTTTT
* * * ** * * **
2762 CTAACATTTCACGCTCAAGAAATCGTATCATTTGGTCTAAATAGTTACTCATTTTGTAAACAAGT
64 CGAACATTCCATGCTCGGGAAATTGCATCATTTGGTCTAAATAGTTTTTCATTTTGTAAACAAGT
* * * *
2827 TTTGGTTTTTCAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTCCTCTATTAG-TCTATGGACGAA-
129 TTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTATTGGTTCT-TGGACGAAC
* **
2890 TTTCCAATCTTGT-AGAAACTTTGTG
193 TTTCCAA-CTTGTCA-AAATTTTACG
* * *
2915 AGTTATTTTATAACTTC-GATTCCTTAGAGTATTCAAGATGATCCATTCTTTCGAGCAATTTTTC
1 AGTTCTTTTATAACTTCAG-TTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCTTTCGAGCAATTTTTC
* * * ** * *
2979 GAACATTCCATGCCCGAGAAATCGCATCATTTGGTCTAAA-A-AATGTCATTTTCTAAACAAGTT
65 GAACATTCCATGCTCGGGAAATTGCATCATTTGGTCTAAATAGTTTTTCATTTTGTAAACAAGTT
* * * * * * *
3042 TTGGCCTTTGAATTAAAACCTTATTTACTTGAGAATTGTTTCTCTTTTGGTTCCTAGACAAACTT
130 TTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTATTGGTTCTTGGACGAACTT
* * *
3107 TCGAACTTGTCAAACTCTTACG
195 TCCAACTTGTCAAAATTTTACG
* ** * * *
3129 AGTTCTTTTATATCTTTGGTTCCTTCAAGTGTTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGC-ATCTTTTC
1 AGTTCTTTTATAACTTCAGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCTTTCGAGCAAT-TTTTC
* * * * * *
3193 GAACATTTCATGCTTGAGAAATTGCATCATTCGGTCTATATAGTTTTTCATTTTGTAATCAAGTT
65 GAACATTCCATGCTCGGGAAATTGCATCATTTGGTCTAAATAGTTTTTCATTTTGTAAACAAGTT
* * * * ** * * *
3258 TTGGTGTTTGTATTAAAAACTTATTTACATAAGAATTAATTCTCTCTTTGTTGTTGGACGAACTT
130 TTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTATTGGTTCTTGGACGAACTT
** * ** *
3323 TAGAACCTAACAAAATTTTACA
195 TCCAACTTGTCAAAATTTTACG
* * ** ** * * *
3345 AGTCCTTCTTTTAACTTTGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGGCCCATTCATTT-TAGTAGTTTTT
1 AGTTCTT-TTATAACTTCAGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTC-TTTCGAGCAATTTTT
* ** *
3409 CGAACATTCCATGCTCGGGAAATCGCATCATTCAGTCTAAATAGTTTTTCATTTTGTAAAAAAGT
64 CGAACATTCCATGCTCGGGAAATTGCATCATTTGGTCTAAATAGTTTTTCATTTTGTAAACAAGT
* * * * **
3474 TTTGGTCTTTGAATTTAAAACTTTTTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCATT--TTGGCCT-AAATA
129 TTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCT-ATTGGTT--CTTGGACGA
** * *** * ** *
3536 GTTTTTCGTTTTGT-AAACTTTGCCA
191 ACTTTCCAACTTGTCAAAATTTTACG
* *
3561 AGTTCTTTTATAACTTC-GATTCCTTAAAGTATTCAAGATGATCCATTCCTTCGAGCAATTTTTC
1 AGTTCTTTTATAACTTCAG-TTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCTTTCGAGCAATTTTTC
* * * ** **
3625 GAACAATCCACGCTCGGGAAATCGCATCATTCAGTCTAAATAGTTACTCATTTTGTAAACAAGTT
65 GAACATTCCATGCTCGGGAAATTGCATCATTTGGTCTAAATAGTTTTTCATTTTGTAAACAAGTT
* * * * * * * * **
3690 ATGGTTTTTCAATTAAAAACTTATCTACATGAGAATTGTTCCTCTATTAGTTCATATACGAAC-T
130 TTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTATTGGTTCTTGGACGAACTT
* *
3754 TCCAATCTTGT-AGAAACTTTGCG
195 TCCAA-CTTGTCA-AAATTTTACG
* * * * *
3777 AGTTCTTTTATAATTTCGGTTCTTTAGAGTATTCAAGATGATCCATTCTTTCGAGCAATTTTTCG
1 AGTTCTTTTATAACTTCAGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCTTTCGAGCAATTTTTCG
* * * * *
3842 TACATTCCATGCCCGGGAAATCGCATCATTTGGTCTAAA-AATTTTGTCATTTTCTAAACAAGTT
66 AACATTCCATGCTCGGGAAATTGCATCATTTGGTCTAAATAGTTTT-TCATTTTGTAAACAAGTT
* * * * * * * *
3906 TTGGCCTTTGAATTAAAACCTTATTTACTTGAGAATTATTTTTCTTTTGGTTCTTTGACAAAC-T
130 TTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTATTGGTTCTTGGACGAACTT
* * *
3970 TCGAACTTGTCAAACTTTTATG
195 TCCAACTTGTCAAAATTTTACG
* ** * *
3992 AGTTCTTTTATATCTTTGGTTCCTTCAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGC-ATCTTTTC
1 AGTTCTTTTATAACTTCAGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCTTTCGAGCAAT-TTTTC
* * * * * * *
4056 GAACATTTCATGATCGGGAAATCGCAGCATTCGGTCTGAATAGTTTTTCATTTTGTAATCAAGTT
65 GAACATTCCATGCTCGGGAAATTGCATCATTTGGTCTAAATAGTTTTTCATTTTGTAAACAAGTT
* * * ** * *
4121 TTGGTGTTTGTATTAAAAACTTATTTACGTAAGAATTAATTCTCTCTTTGTTCTTGGACGAACTT
130 TTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTATTGGTTCTTGGACGAACTT
* *
4186 TCAAACTTGTCAAAATTTTACA
195 TCCAACTTGTCAAAATTTTACG
* * * * * * * *
4208 AGTCCTTTTTGTAACTTC-GATTCCTTAAAGTGTTCAAGACGGTTCATTCCTTT-TAGTAGTTTT
1 AGTTC-TTTTATAACTTCAG-TTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATT-CTTTCGAGCAATTTT
* * * * * * **
4271 TCGAACATTTCACGCTTGGGAAATCGCATCAGTCGGTCTAAATAGTTACTCATTTTGTAAACAAG
63 TCGAACATTCCATGCTCGGGAAATTGCATCATTTGGTCTAAATAGTTTTTCATTTTGTAAACAAG
* * * * **
4336 TTTTGGTCTTTCAATTAAAAACTTATTTATGTGAGAATTGTTCCTCTATTAGTTCAAGGACGAAC
128 TTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTATTGGTTCTTGGACGAAC
*
4401 -TTCCAATCTTGT-AGAAACTTTACG
193 TTTCCAA-CTTGTCA-AAATTTTACG
* * *
4425 AGTT-TTGTTATAACTTCGGTTCCTTAGAGTATTCAAGATGATCCATTCTTTCGAGCAATTTTTC
1 AGTTCTT-TTATAACTTCAGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCTTTCGAGCAATTTTTC
* * * * *
4489 GAACATTCCATGCTTGGGAAATCGTATCATTTGGTCTAAA-AATTTTGTCATTTTCTAAACAAGT
65 GAACATTCCATGCTCGGGAAATTGCATCATTTGGTCTAAATAGTTTT-TCATTTTGTAAACAAGT
* * * * * * *
4553 TTTGGCCTTTTAATTAAAACCTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTTTTGATTCTTAGACAAACT
129 TTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTATTGGTTCTTGGACGAACT
* * *
4618 TTCGAACCTGTCAAACTTTTACG
194 TTCCAACTTGTCAAAATTTTACG
* * ** * * ** *
4641 AGTTCTTTTGTATCTTTGGATCCTTCAAGTATTCAAGACGATCCATTCCCTCGAGC-ATCGTTTC
1 AGTTCTTTTATAACTTCAGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCTTTCGAGCAAT-TTTTC
* ** *
4705 GAACATTTCATGCTCGGGAAATCCCATCATTTGGTCTAAATAGTTTTTCATTTTGTAATCAAG-T
65 GAACATTCCATGCTCGGGAAATTGCATCATTTGGTCTAAATAGTTTTTCATTTTGTAAACAAGTT
* * * * ** *
4769 TTGGTCTTTGTATTAAAAACTTATTTACATAAGAATTGTTTCTCTCATTTTGG-TC-T-AAATAG
130 TTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCT-A--TTGGTTCTTGGACGAA
* * ** * *
4831 TTTTTCATTTTGT-AAACTTTGT-CA
192 CTTTCCAACTTGTCAAAATTT-TACG
** * * * *
4855 AGTTCTTTTATAACTTTGGTTCTTTACAGTATTCAAGACGATCTATTCCTTT-GAGTAA-TTTTC
1 AGTTCTTTTATAACTTCAGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATT-CTTTCGAGCAATTTTTC
* * *** * * *
4918 TAAACATTCAATGAGAGGGAAATCGCATCATTTGGTCTAAATAGTTTTTTATTTTGTGAACAAGT
65 -GAACATTCCATGCTCGGGAAATTGCATCATTTGGTCTAAATAGTTTTTCATTTTGTAAACAAGT
* * * *
4983 TTTGATCTTTAAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTCTTGGTCGAACT
129 TTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTATTGGTTCTTGGACGAACT
** * * * *
5048 TTTGAAATTGACAAACTTTTACA
194 TTCCAACTTGTCAAAATTTTACG
* * ** * * *
5071 AATTCATTTATAACTTCAGTTCAATAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTCTAGCAAATTTTCG
1 AGTTCTTTTATAACTTCAGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCTTTCGAGCAATTTTTCG
* * ** * *
5136 AACAATCCATTCTCGATAAATCGTATCATTTGGTCTAAATAGTTTTTCATTTTGTAAACAAGTTT
66 AACATTCCATGCTCGGGAAATTGCATCATTTGGTCTAAATAGTTTTTCATTTTGTAAACAAGTTT
* * * * * *
5201 TGATCTCTGAATTAAAAACTTATTTACGTAAGAATTGTGTCTCTCTTGGTCCTTGGACGAACTTT
131 TGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTATTGGTTCTTGGACGAACTTT
** * *
5266 TGAACTTGTC-GAA-CTTACG
196 CCAACTTGTCAAAATTTTACG
* * * * * *
5285 AGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAACA-TATTCAAGATGATGCAATCTTTTGAGCAATTTTTT
1 AGTTCTTTTATAACTTCAGTTCCTTAA-AGTATTCAAGACGATCCATTCTTTCGAGCAATTTTTC
* ** * * *
5349 GGACATTCCATGCGAGGGAAGTCGCATCATTTGGTCTAAAAAGTTTTTCATTTTGTAAACAAGTT
65 GAACATTCCATGCTCGGGAAATTGCATCATTTGGTCTAAATAGTTTTTCATTTTGTAAACAAGTT
* * * ** * *
5414 TTAGCCTTTGAATTAAAAACTTATTTATGTGAGAA---TTTCTC--TTGGTTGGTAGACAAACTT
130 TTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTATTGGTTCTTGGACGAACTT
* * *
5474 CCCAACTTGTCAAACTTTTATG
195 TCCAACTTGTCAAAATTTTACG
* * * * * *
5496 AGTTCTTTTTTAACTTCAGTTCCTCAAAGTGTTCAAGACAATCCATTTCTTT-GAGTAATTTTGC
1 AGTTCTTTTATAACTTCAGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCA-TTCTTTCGAGCAATTTTTC
** * * * * *
5560 GAACATTCCGCGCTAGAGAAATAGCATCATTTGGTCAAAATAGTTTTTCTTTTTGTCAAA-AAGT
65 GAACATTCCATGCTCGGGAAATTGCATCATTTGGTCTAAATAGTTTTTCATTTTGT-AAACAAGT
* * * * **
5624 TTTGGACTTTAAACTT-AAAACTTATTTACGTGACAATTGTTTCTCTCTTGGTTCTTGGATAAAC
129 TTTGGTCTTTGAA-TTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTATTGGTTCTTGGACGAAC
* * *
5688 -TTCCGAAAC-TGACAAACTTTTACA
193 TTTCC--AACTTGTCAAAATTTTACG
** * * * *
5712 AGTTCTTTTATAACTTTGGTTCATTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTCTAGCAAATTTTCG
1 AGTTCTTTTATAACTTCAGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCTTTCGAGCAATTTTTCG
* * ** **
5777 AA-ATTCCATTCTCAGGAAATCACATCATTTGGTCTAAATAGTTTTTCATTTCATAAACAAGTTT
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* * * *
5841 TGATCTTTGAATTAAGAACTTATTTACGTGAGAATTGTGTCTCTCTTGGTTCTTGGACGAAC-TT
131 TGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTATTGGTTCTTGGACGAACTTT
* *
5905 CCGAACTTGTCGAACTTTTACG
196 CC-AACTTGTCAAAATTTTACG
* * * * * * *
5927 AGTTCTTTTATAACATCAATTCTTTAAAGTATTCAAGACGATCCAATCCTTCGAGCAATTTGTCA
1 AGTTCTTTTATAACTTCAGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCTTTCGAGCAATTTTTCG
* * * * * *
5992 AACATTACATGCTCAGGAAGTTGCATCATTTAGTCTAAAAAGTTTGTCATTTTGTAAACAAGTTT
66 AACATTCCATGCTCGGGAAATTGCATCATTTGGTCTAAATAGTTTTTCATTTTGTAAACAAGTTT
* * * ** *
6057 TGGCCTTTGAATTAAAAATTTATTTACGTGAGAATTGTTTCACTATTGGTTGGTGGATGAAC-TT
131 TGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTATTGGTTCTTGGACGAACTTT
* *
6121 CCAAACTTGTCAAACTTTTAAG
196 CC-AACTTGTCAAAATTTTACG
* * * * * * *
6143 AGTTTTTTTTTAAC-TCTGATTCCTTAAAGTGTTTAAGATGATCCATTCCTTT-GAGTAATTTTT
1 AGTTCTTTTATAACTTCAG-TTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATT-CTTTCGAGCAATTTTT
* * * * * * * * *
6206 CTAACATTCCACGCTCGAGAAATCGCATCATTTGGACAAAATAGATTTTCATTTTGTAAAAAAAT
64 CGAACATTCCATGCTCGGGAAATTGCATCATTTGGTCTAAATAGTTTTTCATTTTGTAAACAAGT
* * * * * * ** *
6271 TTTGGTTTTTAAATTTAAAACTTATTTTCGTGAGAATTGTGTCTCTCTTTATTCTTGGATGAACT
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** *
6336 TTTGAACTTGTCAAAATTTTACC
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* * * * * * * *
6359 AGTTCTTTTTTAACTTCGGTTCCTTAAAGTATTGAAGATGATCCATTCATTT-TAGTAGTTTTTT
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* * * * * *
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* * ** *
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* * ** * ** *
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*
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* * * ** *
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* * * * *
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130 TTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTATTGGTTCTTGGACGAACTT
*
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* *
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6828 CAATTTTTGA
Statistics
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* *
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* *
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* * * * **
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* * *
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* ** * * * * * * *
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* *
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* * * * * *
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* * *
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* * ** * *
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* **
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** ** * ** *
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* * * * **
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* ** * * * * *
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* *
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* * * * * * *
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* *
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* * ** ** * ** *
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* * * ** * **
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* * *
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* ** * * * * *** * *
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* *
2937 CTTAGAGTATTCAAGATGATCCATT
192 CTTAAAGTATTCAAGACGATCCATT
* * ** *
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* * * *
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* * * * *
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* *
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* * * * * * *
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* * * * * **
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65 TCATTTTGTAAACAAGTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCA
* ** * * ** * * * *
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**
3366 TCCTTAAAGTATTCAAGACGGCCCATT
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* * * * **
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* * *
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* * ** *** * *
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*
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* * * ** **
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* * * * * *
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* * * * * * * * * * *
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* *
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* * *
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* * * * *
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* * * * ** * *
3950 -TTTTGGTTCTTTGACAA-AC-TTCGAACTTGTCAAACTTTTA-TGAGTTCTTTTATATCTTTGG
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*
4011 TTCCTTCAAGTATTCAAGACGATCCATT
189 TTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATT
* * * * * *
4039 CCTTCGAGC-ATCTTTTCGAACATTTCATGATCGGGAAATCGCAGCATTCGGTCTGAATAGTTTT
1 CCTTTGAGCAAT-TTTTCGAACATTCCATGCTCGGGAAATCGCATCATTTGGTCTAAATAGTTTT
* * * * **
4103 TCATTTTGTAATCAAGTTTTGGTGTTTGTATTAAAAACTTATTTACGTAAGAATTAATTCTCTC-
65 TCATTTTGTAAACAAGTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCA
** * * * * *
4167 TTTGTT--CTTGGACGAACTTTCAAACTTGTCAAAATTTTA-CAAGTCCTTTTTGTAACTTCGAT
130 TTT-TTGAC-TAAAAG-ACTTTCAAACTTGTC-AAACTTTACCAAGTTC-TTTTATAACTTCGGT
* * *
4229 TCCTTAAAGTGTTCAAGACGGTTCATT
190 TCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATT
* * * * * * * * **
4256 CCTTTTAGTAGTTTTTCGAACATTTCACGCTTGGGAAATCGCATCAGTCGGTCTAAATAGTTACT
1 CCTTTGAGCAATTTTTCGAACATTCCATGCTCGGGAAATCGCATCATTTGGTCTAAATAGTTTTT
* * *
4321 CATTTTGTAAACAAGTTTTGGTCTTTCAATTAAAAACTTATTTATGTGAGAATTGTTCCTCT-AT
66 CATTTTGTAAACAAGTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCAT
* * * * * *
4385 TAGTT--C-AAGGACGAACTTCCAATCTTGTAGAAACTTTA-CGAGTT-TTGTTATAACTTCGGT
131 T-TTTGACTAA--AAG-ACTTTCAAACTTGT-CAAACTTTACCAAGTTCTT-TTATAACTTCGGT
* *
4445 TCCTTAGAGTATTCAAGATGATCCATT
190 TCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATT
* * *
4472 -CTTTCGAGCAATTTTTCGAACATTCCATGCTTGGGAAATCGTATCATTTGGTCTAAA-AATTTT
1 CCTTT-GAGCAATTTTTCGAACATTCCATGCTCGGGAAATCGCATCATTTGGTCTAAATAGTTTT
* * * *
4535 GTCATTTTCTAAACAAGTTTTGGCCTTTTAATTAAAACCTTATTTACGTGAGAATTG-TT-TCTC
65 -TCATTTTGTAAACAAGTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTC
* * * * * *
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* *
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* * * * *
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* * * *
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65 TCATTTTGTAAACAAGTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCA
* * ** ** ** * *
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130 TTTTTGACTAAA-AGACTTTCAAACTTGTCAAACTTTACCAAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCT
* *
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* * * ***
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* * * * *
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65 TCATTTTGTAAACAAGTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCA
* ** * * * * *
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**
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* * * ** *
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* * * *
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** * ** * ** * *
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* * *
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* * * ** * *
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* * *
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** * * * ** * *
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* * *
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* * * ** * * * *
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* * * *
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* * * *
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*
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* * * *
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** * * * *
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* * * * * * **
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* *
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* * * * * * * * * *
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* * *
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* * ** * * * * *
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* * *
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* * * * * * *
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** * ** * *
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* *
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1 CCTTTGAGCAATTTTTCGAACATTCCATGCTCGGGAAATCGCATCATTTGGTCTAAATAGTTTTT
* * * *
6686 CATTTTGTAAACAGGTTTTGGTCTTTCAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTCCTAT-AT
66 CATTTTGTAAACAAGTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCAT
* * ** * * * * * ** * *
6750 TAGTTCA-TGGACGAACTTCCAATCTTGTAGAAATTTTA-TGAGTTCTTTTATAACTTTGATTCC
131 T-TTTGACTAAAAG-ACTTTCAAACTTGT-CAAACTTTACCAAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCC
*
6813 TTAGAGTATT--------T-CA--
193 TTAAAGTATTCAAGACGATCCATT
* *
6826 ------AGCAATTTTT-GAACATTCCATGTTCGGGAAATCGCATCATTTGGTCTAAA-AATTTTG
1 CCTTTGAGCAATTTTTCGAACATTCCATGCTCGGGAAATCGCATCATTTGGTCTAAATAGTTTT-
** * * ** * * *
6883 TTTTTTTCTGAACAAGCCTTGGAGGAACTTTTGAAATTGACAAAC-T-TTTAC-T-AG--TTCTT
65 TCATTTTGTAAACAAG--TT-TTGG-TC-TTTG-AATT-AAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTT
* * * * * * * ** * *
6942 T-TATAACTTCAGTTCA-TCAAAG--TATTCAAGACAAT-CCATTCCTTCTAGC-AG-T-TTTTC
123 TCTCTCA-TT--TTTGACTAAAAGACT-TTCAA-AC-TTGTCA-AACTT-TACCAAGTTCTTTTA
* * ** ** * * ***
6999 GAACAATCCATTCTCGGGAAATCGTA-TCATTTGGTCGAAATAGTTTTT
180 TAAC-TTCGGTTC-C-TTAAA--GTATTCA---AGACG--AT--CCATT
* * * * * ** * * ** * * * * *
7047 CATTTTGTAAACAAGTTTT-GATCTTTGAAT--T---AAAAACTTATTTATGTGG--GAATTTTG
1 C-CTTTG--AGCAATTTTTCGAACATTCCATGCTCGGGAAATCGCA-TCATTTGGTCTAA-ATAG
** *** * * ** * ** * * *
7104 TCTCTCTTGGTTTT-TGGTCGAGCTTTCGAACTTGTCGAACTTTACTAGTTCTTTTA--T-A-AC
61 T-T-T-TTCATTTTGTAAACAAG-TTTTGGTCTT-T-GAA-TTAAAAACTT-ATTTACGTGAGAA
* * * * * * * * **
7164 TTCAGTTCCT-TAACGTATT--C---AAGA-TTACCCAATCCTT-TGAGCAA-TTTTCTGAG--C
118 TT--GTTTCTCTCA-TTTTTGACTAAAAGACTT--TCAA-ACTTGTCA--AACTTTACCAAGTTC
** * ** * * ** * * * *
7218 ATTCCAT-GCAACGGAAGTCGCATCAAA-TGGTCTAAAAAGTTTGTCATT
175 -TTTTATAACTTCGG--TTC-C-TTAAAGTATTC-AAGACG-AT-CCATT
* ** * ** * ** ** * * * *
7266 --TTGTAAAAAAGTTTT-GTCCTTTGAAT--T--AAAAAT---A-AATTTACGT-GAGAATTGTT
1 CCTT-TGAGCAATTTTTCGAACATTCCATGCTCGGGAAATCGCATCATTT-GGTCTA-AATAGTT
* * * ** * * ** * * * *
7319 TCTCTC-TTGGTTGGTAGACGAACTTTCGAACTTGTCAAACCTTTACGAGTTATTT--TTTA-AC
63 T-T-TCATT--TT-GTAAAC-AAGTTTTGGTCTT-T-GAA--TTAAAAACTTATTTACGTGAGAA
* * *** * * * * *
7380 TTCGGTTC-CTTA-AAGTG-CTCAAGACGATCCATTCCTTTGAGTAATTTTGT-GAACATT-CCA
118 TT-GTTTCTCTCATTTTTGACT-AA-A--A--GA---CTTTCA--AA-CTTGTCAAACTTTACCA
* * **** * * * * **** ** **
7440 CGCTCGAGAAATCGCACCATTTGG-T-CTAAATAGTTTTTCATTTTG-TAAAAA
170 AGTTC-TTTTAT---AAC-TTCGGTTCCTTAA-AG-TATTCAAGACGATCCATT
** * * ** * * * ** * *
7491 AGTTTCAG-ACTTTAAACTTAAAACTTATT-TATG-T-GAG-AATTGTTTCCCTCTTGGTTTTTT
1 CCTTTGAGCAATTT----TTCGAAC--ATTCCATGCTCGGGAAATCGCAT-CAT-TTGG---TCT
*** ** ** * * * *
7551 GATGAACTTCCGAAACTGACAAATTTT-T--ACAAGTTCTTTTATAACTTCG-GTTCATTAAA-G
55 -A--AA--T---AGTTTTTC--ATTTTGTAAACAAG-T-TTTGGT--CTTTGAATT-A-AAAACT
* * * ** ** ** * * *** *
7611 TATTCAAGACGATCCATTCCTTCTAGCAAATTTTCGA--ACATTCCATTCTCGGGAAA-TCGCAT
104 TATTTACG-TGA-GAATTGTTTCT--CTCATTTTTGACTAAAAGAC-TT-TC---AAACTTG--T
*** * * * ** * * * **
7673 CATTTGGTTTA-AATAGTTTTTATTTTGAAAATAAGTTTTGATCTTTGAATTAAGAACTT-ATTT
158 CA--AACTTTACCA-AG---TTCTTTT----ATAACTTCGGTTCCTT--A--AAGTA-TTCA-AG
*
7736 ACG-TCAGAATT
207 ACGATC--CATT
* ** ** * * * * * * *** * **
7747 -GTTT-CTCTCTTGGTTCTTGGACAAACTTCCGA-ACTTGTCGAACTTTTA-CGACTT-GT-TTT
1 CCTTTGAGC-AAT--TT-TTCGA-ACA-TTCC-ATGCTCG-GGAAATCGCATC-ATTTGGTCTAA
* * ** * **** *
7806 ATAGCTTCGATTCCTTAAAGTAATCAAGTCGATCCAATCCTTTGAGCAATTTTTCGAAAA-TTAT
57 ATAG-TT--TTTCATT-TTGTAAACAAGT---TTTGGT-CTTT--G-AA---TT-AAAAACTTAT
* * * *** * **
7870 ATGC-TCGGGAA--G-TTGGATCA--TTTGATCTAAAA-AGTTTGTC-ATTTTGT-AAACAAGTT
107 TTACGT-GAGAATTGTTTCTCTCATTTTTGA-CTAAAAGA-CTT-TCAAACTTGTCAAAC----T
** **
7926 TTATCCTTTGAA-TTAAAAACTTATTTACATGAGAAAT-GTGTCTCGCTT--AG--TTCTTGGAC
164 TTA-CC----AAGTT-----C-T-TTT--AT-A-ACTTCG-GT-TC-CTTAAAGTATTC-AAGAC
**
7985 GAACTTCCAAA
209 G-A--TCCATT
* * ** * * * ***
7996 CC--TG-TCAACTTTTAC-AAGTTC-TTTTATAAGTTCGGTTCCTTAAA--GTATTCAAGAGGAT
1 CCTTTGAGCAA-TTTTTCGAA---CATTCCAT--GCTCGG-----GAAATCGCA-TCATTTGG-T
* ** ** * * * * ** * *** * *
8054 C-CAATCCTTCGAGTAATTTT-TCGAAC-A-TTACATGCTC-GGGAA-GATGCA-TCATTT-GGT
53 CTAAATAGTT--TTTCATTTTGT-AAACAAGTT--TTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGT
* * * * * * ** * **
8111 CCTAAAAGTTTGTAATTTTGTAAATAAGTTTTGGCCTTTGAATTAAAGACTTAT-TTACGTGAGA
113 --GAGAA--TTGT--TTCTCT-CAT---TTTT-GAC--T--A--AAAGACTT-TCAAACTTGTCA
* ** ** * * * ** * * * * *
8175 ATTGCTTCCCCCTTGTT-TGTTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTTT
160 A--ACTT-TACCAAGTTCT-TT-TA-TAACTTCGGTTCCT-T-AAAGTATT-CAAG-AC------
* *
8239 AAATCCGGTT
209 -GATCC-ATT
* * * * * * *
8249 CC-TT-A--AAGTGTT-GAAGACGA-TCCATTCCTTTGAGTAATTTTCCCAACATTCCAAGTGAG
1 CCTTTGAGCAATTTTTCG-A-AC-ATTCCA-TGC-TCG-GGAA--AT--C-GCA-T-C-A-T---
* * * * *
8308 GAAAATTGCATCATTTAGTCTAAATAGTTTTTCATTTTGTAAACAAGTTTTGATCTCTAAATTAA
48 -----TTG-GTC---TA----AAT-AGTTTTTCATTTTGTAAACAAGTTTTGGTCTTTGAATTAA
* * * * * *
8373 AAACTTATTTACGTGAGAATTATTTCTCTCTTGGTTCTTGGAC---GA-ACTTCCGAACTTGTCT
99 AAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCAT--TT-TT-GACTAAAAGACTTTCAAACTTGTCA
* *** * * *
8434 AGCTTTTA-TGTGTTCATTTATAGCTTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCAAT
160 AAC-TTTACCAAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATT
* ** * * * * * * * *
8491 CGTTCAAGCGATTTTTTGAACATTACATGCTCGGGAAGTCG-ACTCATTTAGCCTAAAGAGTTTG
1 CCTTTGAGCAATTTTTCGAACATTCCATGCTCGGGAAATCGCA-TCATTTGGTCTAAATAGTTTT
* * * *
8555 TCATTTAGTAATCAAGTTTTGGCCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGT-ACGAATTGCTTCTCTC
65 TCATTTTGTAAACAAGTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGA-GAATTGTTTCTCTC
* * ** * * * * * * *
8619 -TTGGTTG-TTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTA-CAATTTCTTTTTTAA-ATCTGAT
129 ATT-TTTGACTAAAAG-ACTTTCAAACTTGTCAAAC-TTTACCAAGTTCTTTTATAACTTC-GGT
* * *
8680 TCCTTAAAGTGTCCAAGACGATCCGTT
190 TCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATT
* * * * * * *
8707 CCGTCGAGTAATTCTACGAACATTCCATGC-CAAGGAATTCGCATCATTTGGTCTAAATAGTTTT
1 CCTTTGAGCAATTTTTCGAACATTCCATGCTC-GGGAAATCGCATCATTTGGTCTAAATAGTTTT
** * *
8771 TCATTTTGTAAACAAGTTTTAATCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGAGAGAATTGTGTCTCTC-
65 TCATTTTGTAAACAAGTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCA
** ** * * * * *
8835 TTGGT-ACATGGACGAACTCTCAAACTTGTCAAACTTTTA-CGAGTTCTTTTATAACTTCGATTT
130 TTTTTGAC-TAAAAG-ACTTTCAAACTTGTCAAAC-TTTACCAAGTTCTTTTATAACTTCGGTTC
* * * *
8898 CTTAAAGTAGTCAAGTCGATCTAAT
192 CTTAAAGTATTCAAGACGATCCATT
* * * * * ** * *
8923 CCTTCGAGCAATTTTTCGAACATTACATGCTTGGGAAGTCGAATCATTCAGTCTAAAAAGTTTGT
1 CCTTTGAGCAATTTTTCGAACATTCCATGCTCGGGAAATCGCATCATTTGGTCTAAATAGTTTTT
*
8988 CATTTTGTAAACAAGTTTTGGCCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTGTATCTCTT
66 CATTTTGTAAACAAGTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGT-T-TCTC-T
** * * * ** * *
9053 GGTTCTTGGA-T--GA-ACTTTCGAACTTGTCAAACTTTTA-TGAGTTCTTTCATAACTTTGGTT
128 CATT-TTTGACTAAAAGACTTTCAAACTTGTCAAAC-TTTACCAAGTTCTTTTATAACTTCGGTT
*
9113 CCTTAAAGTATTCAAGACGATCCAAT
191 CCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATT
* * * * *
9139 CCTTCGAGTAA-TTTTCTGAACATTACATGCTTGGGAAATCGCATCATTTGGTCTAAA-AGCTTG
1 CCTTTGAGCAATTTTTC-GAACATTCCATGCTCGGGAAATCGCATCATTTGGTCTAAATAG-TTT
*
9202 TT-ATTTTGTAAACAAGTTTTGGCCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTC
64 TTCATTTTGTAAACAAGTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTC
* * * * ** *
9266 TTGGTTGTTG-GT--GA-AC-TTCTGAACTTGTCAAACTTTTA-TGAGTTCTTATT-TAA-ATCT
129 AT--TT-TTGACTAAAAGACTTTC-AAACTTGTCAAAC-TTTACCAAGTTCTT-TTATAACTTC-
* *
9323 GGTTCCTTAAAGTTTTCAAGATGATCCATT
187 GGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATT
* * ** *
9353 CCTTCGAGTAA-TTTTCTGAACATTCCATGCGAGGGAAATTGCATCATTTGGTCTAAATAGTTTT
1 CCTTTGAGCAATTTTTC-GAACATTCCATGCTCGGGAAATCGCATCATTTGGTCTAAATAGTTTT
* * * * * *
9417 TCATTTTTTAAACAAGTTTTGATCTTTGAATTAAAAACTTATTTACATTCA-AATTATTTCTTTC
65 TCATTTTGTAAACAAGTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTAC-GTGAGAATTGTTTCTCTC
* * ** * *** ** ** * *
9481 -TTCGTT-ATTGGACGAACTTTTGGACTTGTTGAACTTTTA-CGTGTTGTTTTATAGCTTCGGTT
129 ATT-TTTGACTAAAAG-ACTTTCAAACTTGTCAAAC-TTTACCAAGTTCTTTTATAACTTCGGTT
* *
9543 CCATAAAGTATTCAAGACGATCCAAT
191 CCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATT
* * * * * * * *
9569 CCTTCGAGAAATTTTTCAAACATTACATGCTCGGGAAGTCGAATCATTTGGTCTAAAGAGTTTGT
1 CCTTTGAGCAATTTTTCGAACATTCCATGCTCGGGAAATCGCATCATTTGGTCTAAATAGTTTTT
*
9634 CATTTTGTAAACAAGTTTTGGCCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTC-T
66 CATTTTGTAAACAAGTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCAT
* * ** * * * * * * * * *
9698 TGGTTG-TTGGACGAAC-TTCTAAAATTGTTAATCTTTTA-CGAGTTCTTTTTTAAATCCGATTC
131 T-TTTGACTAAAAG-ACTTTC-AAACTTGTCAAAC-TTTACCAAGTTCTTTTATAACTTCGGTTC
*
9760 CTTAAAGTGTTCAAGACGATCCATT
192 CTTAAAGTATTCAAGACGATCCATT
* * *
9785 CCTTCGAGTAATTTTAT-GAACATTCCATGCGT-GGGAAATTGCATCATTTGGTCTAAATAGTTT
1 CCTTTGAGCAATTTT-TCGAACATTCCATGC-TCGGGAAATCGCATCATTTGGTCTAAATAGTTT
* * * *
9848 TTCATTTT-TAAACAAGTTTTGATCTTTGAATT-AAAATTTATTTACATGCGAATTGTTTCTCT-
64 TTCATTTTGTAAACAAGTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTC
* * * ** * * * * ** * *
9910 GTTGGTT-ATTGGATGAACTTCCGAACTTGTCGAACTTTTA-CGTGTTCTTCTATAGCTTCGGTT
129 ATT-TTTGACTAAAAG-ACTTTCAAACTTGTCAAAC-TTTACCAAGTTCTTTTATAACTTCGGTT
* *
9973 CCTTAAAGTATTCAAGATGATCCAAT
191 CCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATT
* * * * ** * *
9999 CCTTCGAGCAATTTTTCAAACATTACATGCTC-GAAAAGTCAAATCATTTGGTCTAAAGAGTTTG
1 CCTTTGAGCAATTTTTCGAACATTCCATGCTCGGGAAA-TCGCATCATTTGGTCTAAATAGTTTT
*
10063 TCATTTTGTAAACAAGTTTTGGCCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTC-
65 TCATTTTGTAAACAAGTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCA
* * ** * * * * * * * * * *
10127 TTGGTTG-TTGGACGAACTTCCGAACTTATCGAACTTTTACC-TGTTCTTTTTTAAATCCGATTC
130 TT-TTTGACTAAAAG-ACTTTCAAACTTGTCAAAC-TTTACCAAGTTCTTTTATAACTTCGGTTC
* * *
10190 CTTAAAGTGTCCAACACGATCCATT
192 CTTAAAGTATTCAAGACGATCCATT
* * * * * * * * * *
10215 TCGTAGAGTAATTCTCCGACCCTTCCATG-TGAGGGAAATCTCATCATTTGGTCTAAATAGTTTT
1 CCTTTGAGCAATTTTTCGAACATTCCATGCT-CGGGAAATCGCATCATTTGGTCTAAATAGTTTT
** * *
10279 TCATTTTGTAAACAAGTTTTAATCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTGTCTCTCT
65 TCATTTTGTAAACAAGTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCA
* ** * *
10344 TGGTTCTTGGA-T--GA-ACTTTTGAACTTGTCAAACATTTA-CGAGTTCTTTTATAACTTTGGT
130 T--TT-TT-GACTAAAAGACTTTCAAACTTGTCAAAC-TTTACCAAGTTCTTTTATAACTTCGGT
* * *
10404 TCCTTAAAGTGTTCAAGTCGATCCAAT
190 TCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATT
* * * * * * * *
10431 CCTTCGAGCAATTATTCAAACATTACATGCTCGGGAAGTTGCATCATTTGGTCTAAAAAGTTTGT
1 CCTTTGAGCAATTTTTCGAACATTCCATGCTCGGGAAATCGCATCATTTGGTCTAAATAGTTTTT
* * *
10496 CATTTTTGTCAACAAGTTTTGGCCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTAAGAATTGTTTCTCTC-
66 CA-TTTTGTAAACAAGTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCA
* * ** * * *
10560 TTGATTG-TTGGACGAAC-TTCTGAACTTGTCAAACTTTTA-CAAGTTCTTTT-TGAA--TCTAG
130 TT-TTTGACTAAAAG-ACTTTC-AAACTTGTCAAAC-TTTACCAAGTTCTTTTAT-AACTTC-GG
* * *
10619 TTCCTTAAAGTGTTCAACACAATCCATT
189 TTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATT
* * * * ** *
10647 CCTTCGAGTAATTTTCCGAACATTTCATGCGAGGGAAATCGCATCATTTGGACTAAATAGTTTTT
1 CCTTTGAGCAATTTTTCGAACATTCCATGCTCGGGAAATCGCATCATTTGGTCTAAATAGTTTTT
* *
10712 CATTTTGTAAACAAG-TTTGAATCTTTAAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTC-
66 CATTTTGTAAACAAGTTTTG-GTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCA
* * ** * * * * * *
10775 TTGGTTG-TTGGACGAACTTCCGAACCTGTCAAACTTTTA-CGAGTTCATTTT-TAAATTCGGTT
130 TT-TTTGACTAAAAG-ACTTTCAAACTTGTCAAAC-TTTACCAAGTTC-TTTTATAACTTCGGTT
* *
10837 CCTTAAAGTGTTGAAGACGATCCATT
191 CCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATT
* * * *** *
10863 CCTTCGAGTAATTTTTCGAGCATTCCATGGGAGGGAAATCGCACCATTTGGTCTAAATAGTTTTT
1 CCTTTGAGCAATTTTTCGAACATTCCATGCTCGGGAAATCGCATCATTTGGTCTAAATAGTTTTT
* * * * * * *
10928 CATTTTGTAAACATGTTTTGATCTATGAATTAAAAACTTTTTTACTTGAGAACTGTTTCTCTCTT
66 CATTTTGTAAACAAGTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCAT
* * * * *
10993 GGTTCTTGGA-T--GA-ACTTTCGAACTTGTCGAACTTTTA-CAACTTCTTTTATAGCTTCGGTT
131 --TT-TT-GACTAAAAGACTTTCAAACTTGTCAAAC-TTTACCAAGTTCTTTTATAACTTCGGTT
* * * * *
11053 CCATACAGTATTAAAGACTATCCAAT
191 CCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATT
* * * * * *
11079 CCTTCGAGCAATTTTTTGAGCATTACTTGCTC-GGAATGTCGCATCATTTGGTCTTAAA-AGTTT
1 CCTTTGAGCAATTTTTCGAACATTCCATGCTCGGGAA-ATCGCATCATTTGGTC-TAAATAGTTT
* * ** * *
11142 GTCATTTTGTAAACAAGTTTTGGCCTTTGAATTAAAATTTTATTTATGTGAGAATTTTTTCTCT-
64 TTCATTTTGTAAACAAGTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTC
* * ** * * * * *
11206 ATTGGTTG-TTGGATGAAC-TTCAGAAATTGTCAAACTGTTA-CGAGTTCTTTTTTAA-ATCTGG
129 ATT-TTTGACTAAAAG-ACTTTCA-AACTTGTCAAACT-TTACCAAGTTCTTTTATAACTTC-GG
* *
11267 TTCCTTCAAGTGTTCAAGACGATCCATT
189 TTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATT
* * * * * **
11295 CCTTCGAGTAATTTTTCGAACATTGCATGCAT-GGGAAATTGCATTATTTTTTCTAAATAGTTTT
1 CCTTTGAGCAATTTTTCGAACATTCCATGC-TCGGGAAATCGCATCATTTGGTCTAAATAGTTTT
* * *
11359 TCATTTCT-TAAACAATTTTTGATCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGCGAATTGTTTCTCTC
65 TCATTT-TGTAAACAAGTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTC
* * * * ** *
11423 TTGGTTATTGGAC---AA-ACTTCCGAACTTGTCGAACTTTTA-CGTGTTCTTTTATAGCTTCGG
129 AT--TT-TT-GACTAAAAGACTTTCAAACTTGTCAAAC-TTTACCAAGTTCTTTTATAACTTCGG
*
11483 TTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCAAT
189 TTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATT
* * * * * * * *
11511 CCTTCGAGCAATTTTTCAAACATTACATGCTCGAGAAGTCGAATCATTTGGTCTAAAGAGTTTGT
1 CCTTTGAGCAATTTTTCGAACATTCCATGCTCGGGAAATCGCATCATTTGGTCTAAATAGTTTTT
* * *
11576 CATTTTGTAAACAAGTTTTGGCCTTCGAATT-AAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTCCTCTC-T
66 CATTTTGTAAACAAGTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCAT
* * ** * * * * * *
11639 TGGTTG-TTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTA-CAAGTTCTTTTTTAAATACGGTTCC
131 T-TTTGACTAAAAG-ACTTTCAAACTTGTCAAAC-TTTACCAAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCC
* *
11702 TTAAAGTGTCCAAGACGATCCATT
193 TTAAAGTATTCAAGACGATCCATT
* * * * * * * * ** *
11726 TCGTAGAGTAA-TTCTCTAACCATCCCAAGCGAGGGAAATCGTATCATTTGGTCTAAATAGTTTT
1 CCTTTGAGCAATTTTTCGAA-CATTCCATGCTCGGGAAATCGCATCATTTGGTCTAAATAGTTTT
** * * * *
11790 TCATTTTGTAAACAAGTTTTAATTTTTGAATTAGAAACTTAATTACGTGAGAATTGTGCCTCTCT
65 TCATTTTGTAAACAAGTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGT--TTCTC-
** * * * *
11855 TGGTTCTTTGAC---GA-ACTTTCGAACTTGTCAAACTTTTA-CGAGTTCTTTTATAAC-ACTGG
127 TCATT-TTTGACTAAAAGACTTTCAAACTTGTCAAAC-TTTACCAAGTTCTTTTATAACTTC-GG
* * **
11914 TACCTTAAAGTATTCTAGTTGATCCATT
189 TTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATT
* * * * *
11942 CCTTCGAGCAATTTTTCGAACATTACATGCTC-GGAAAGTCGCATCATTTGGTCAAAAAAGTTTG
1 CCTTTGAGCAATTTTTCGAACATTCCATGCTCGGGAAA-TCGCATCATTTGGTCTAAATAGTTTT
* *
12006 TCATTTTGTAAACAAGTTTTGGCCATTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCT
65 TCATTTTGTAAACAAGTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTG-TT-TCTCT
* * * * * *
12071 CGATTTTTGGAC---AA-AC-TTCTGAACTTGTCAAACTTTTA-CGAGTTCTTTTTTAAATCCAG
128 C-ATTTTT-GACTAAAAGACTTTC-AAACTTGTCAAAC-TTTACCAAGTTCTTTTATAACTTCGG
* *
12130 TTCGTTAAAGTGTTCAAGACGATCCATT
189 TTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATT
* * * ** *
12158 -CTGTCGAGTAAGTTTTCGAACATTCCATGCGAGGGAAATCGCATCATTTGGACTAAATAGTTTT
1 CCT-TTGAGCAATTTTTCGAACATTCCATGCTCGGGAAATCGCATCATTTGGTCTAAATAGTTTT
** ** * *
12222 TCATTTTGTAAACAAGTTTTTATCTTAAAATTAAAAACTTATTTACCTGAGAATTATTTCTCTC-
65 TCATTTTGTAAACAAGTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCA
* * ** * * * * *
12286 TTGGTTG-TTGGACGAACTTCCGAAA-TTGTCAAACTTTTA-CGAGTTCTTTTTTTTAA-ATCTG
130 TT-TTTGACTAAAAG-ACTTTC-AAACTTGTCAAAC-TTTACCAAGTTC--TTTTATAACTTC-G
* * * *
12347 TTTCCTTAAACTGTTCTAGACGATCCACTT
188 GTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCA-TT
* * * * ** * * *
12377 -CTTCGAGTAATTTTCCTAACATTCCATGCGAGCGAAATCGCATTATTTGTTCTAAATAGTTTTT
1 CCTTTGAGCAATTTTTCGAACATTCCATGCTCGGGAAATCGCATCATTTGGTCTAAATAGTTTTT
* * * * * * *
12441 CATTTAGTAAGCAAGCTTTGGCCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGACAATTTTTTTTCTCAT
66 CATTTTGTAAACAAGTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTCAT
** * ** * * * * * * * **
12506 GGTT-ATTGGATGAAC-TTCTGAACTTATCAAACTTTTA-CGAGTTCTTTTTTTAAATCCGGTAG
131 TTTTGACTAAAAG-ACTTTC-AAACTTGTCAAAC-TTTACCAAGTTC-TTTTATAACTTCGGTTC
*
12568 CTTAAAGTGTTCAAGACGATCCATT
192 CTTAAAGTATTCAAGACGATCCATT
* * ** * ** * *
12593 ACTTCGAATAA-TTTTCTGAACATCCCATGCGAGGGAAATCGCA-CTATTTGGTCTAAATAATTA
1 CCTTTGAGCAATTTTTC-GAACATTCCATGCTCGGGAAATCGCATC-ATTTGGTCTAAATAGTTT
* *
12656 TTCATTTTGTAAA-AATGTTTTGATCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAACTGTTTCTCT
64 TTCATTTTGTAAACAA-GTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCT
* * * * * * **
12720 CTTGGTTTTTGGA-T--GA-AC-TTCAAAACCTATCGAACTTTTA-CGAGTTCTTCCATAACTTC
128 C---ATTTTT-GACTAAAAGACTTTC-AAACTTGTCAAAC-TTTACCAAGTTCTTTTATAACTTC
* *
12779 GGTTCCATAAAGTATTCAAGACGATCCAAT
187 GGTTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATT
* * * *
12809 CCTTCGA-CTAATTTTTTGAACATTACTTGCTC-GGAAAGTCGCATCATTTGGTCTAAA-AGTTT
1 CCTTTGAGC-AATTTTTCGAACATTCCATGCTCGGGAAA-TCGCATCATTTGGTCTAAATAGTTT
* *
12871 TTCATTTTGTAAACAAGTTTTGGCCTTTGAATTAAAAATTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTC
64 TTCATTTTGTAAACAAGTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTC
* ** * * * * * * *
12936 -TTTGTTG-TTGGACGAACTTCCGAAA-TTGTTAAACTTTTA-CGAGTTCTTTTTTAAATCCGGT
129 ATTT-TTGACTAAAAG-ACTTTC-AAACTTGTCAAAC-TTTACCAAGTTCTTTTATAACTTCGGT
*
12997 TCCTTAAAGTGTTCAAGACGATCCATT
190 TCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATT
* * *
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1 CCTTTGAGCAATTTTTC-GAACATTCCATGC-TCGGGAAATCGCATCATTTGGTCTAAATAGTTT
* * * *
13087 TTCATTTT-TAAACAAGTTTTGATCTTTGAATTAAAAATTTATTTACATGCA-AATTCTTTCTCT
64 TTCATTTTGTAAACAAGTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTG-AGAATTGTTTCTCT
* * ** * * * * *** * *
13150 C-TTGGTT-ATTGGATGAACTTCCGAACTTGTCGAACTTTTA-TGTGTTCTTTTATAGCTTCGAT
128 CATT-TTTGACTAAAAG-ACTTTCAAACTTGTCAAAC-TTTACCAAGTTCTTTTATAACTTCGGT
* * *
13212 TCCCTAAAGTATTCAAGATGATCCAAT
190 TCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATT
* * * * * * * * *
13239 CCTTCGAGCAATTTTTCAAACACTACATGCTCGGGAAGTCGAATCATTTGGTCTGAAGAGTTTGT
1 CCTTTGAGCAATTTTTCGAACATTCCATGCTCGGGAAATCGCATCATTTGGTCTAAATAGTTTTT
* * *
13304 CATTTTGTAAACAAGTTTTGGCCTTTGAATTATAAACTTATTTACGTGAGAATTATTTTTCTCTC
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* * * * * * * *
13369 GGTTGTTGGAC---GA-ACTCTCGAACTTGTCACACTTTTA-CGAGTTCCTTTTA-AAATTCGGT
129 -ATT-TTTGACTAAAAGACTTTCAAACTTGTCAAAC-TTTACCAAGTT-CTTTTATAACTTCGGT
* *
13428 TCCTTAAAGTGTTGAAGACGATCCATT
190 TCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATT
* * * *
13455 CCTTCGAGTAA-TTTTCTGAACATTCCAAG-T-GAGGTAAATCGCATCATTCGGTCTAAATAGTT
1 CCTTTGAGCAATTTTTC-GAACATTCCATGCTCG-GG-AAATCGCATCATTTGGTCTAAATAGTT
* * *
13517 TTTCATTTTGTAAACAAGTATTGATCTTTGAATTAAAAACTTATTTACTTGAGAATTGTGTGTCT
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** ** * ** * * * *
13582 CTTGGTTTTTGA--ATGA-ACTTCCAAACTAATCGAACTTTTA-CAAGTTCTTTCATAAGTTTGG
126 C-TCATTTTTGACTAAAAGACTTTCAAACTTGTCAAAC-TTTACCAAGTTCTTTTATAACTTCGG
* * * * *
13643 TCCCATAAAGTATTCAAGATGATCAAAT
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* * * * * * * **
13671 CCTTCGAGCAATTTTTTGAACATTACATGCTCGAGAAGTTGCATCATTTGGTCTAAAAAGTTAGT
1 CCTTTGAGCAATTTTTCGAACATTCCATGCTCGGGAAATCGCATCATTTGGTCTAAATAGTTTTT
*
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66 CATTTTGTAAACAAGTTTTGGT-CTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATT
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Statistics
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Found at i:3044 original size:862 final size:862
Alignment explanation
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* * * * * * * *
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* * * * *
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* * *
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* * *
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*
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* * *
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* * * *
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*
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* * * *
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* * *
2031 AATCTTGTAGAAATTTTACGATTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAGAGTATTCAAGATGATCCA
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* * *
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*
2160 TCTCATTTTCTAAACAAGTTTTGGCCTTTGAATTAAAACCTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCT
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* * *
2225 TTTGGTTCTTAGACAAACTTTCGAACTTGTCAATCTTTTATGAGTTCTTTTATATCTTTGGTTCC
774 TTTGGTTCTTAGACAAACTTTCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTTGGTTCC
**
2290 TTCAAGTATTCAAGACGATAAATT
839 TTCAAGTATTCAAGACGATCCATT
* * * ** *
2314 CCTTCAAGCAGCTTTTCAAACATTTTATGCTCGGGAAATCGCATCATTGGGTCTAAATCA-TTTT
1 CCTTCGAGCAACTTTTCGAACATTCCATGCTCGGGAAATCGCATCATTCGGTCTAAAT-AGTTTT
* *
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*
2443 TTTTTCTTGGACGAACTTTCGAACTTGTCAAAATTTTACAAGTCCTTTTTTTAACTTCGGTTCCT
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* * *
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* *
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* *
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324 TACGTGAGAATTGTTTCTCTCATTTTGGTCTAAATAGTTTTTCATTTTGTAAACTT-GCCAAGTT
* *
2703 CTTTTATAACTTCGATTCCTTAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTTGAGCAATTTTTCTAACA
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* ** *
2768 TTTCACGCTCAAGAAATCGTATCATTTGGTCTAAATAGTTACTCATTTTGTAAACAAGTTTTGGT
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** *
2897 TCTTGTAGAAACTTTGTGAGTTATTTTATAACTTCGATTCCTTAGAGTATTCAAGATGATCCATT
583 -CTTGTAGAAACTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCGATTCCTTAGAGTATTCAAGATGATCCATT
*
2962 CTTTCGAGCAATTTTTCGAACATTCCATGCCCGAGAAATCGCATCATTTGGTCTAAAA-A-ATGT
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*
3025 CATTTTCTAAACAAGTTTTGGCCTTTGAATTAAAACCTTATTTACTTGAGAATTGTTTCTCTTTT
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* * *
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*
3155 AAGTGTTCAAGACGATCCATT
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* * * * * *
3176 CCTTCGAGCATCTTTTCGAACATTTCATGCTTGAGAAATTGCATCATTCGGTCTATATAGTTTTT
1 CCTTCGAGCAACTTTTCGAACATTCCATGCTCGGGAAATCGCATCATTCGGTCTAAATAGTTTTT
* * *
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* * * ** *
3306 TGTTGTTGGACGAACTTTAGAACCTAACAAAATTTTACAAGTCCTTCTTTTAACTTTGGTTCCTT
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* *
3371 AAAGTATTCAAGACGGCCCATTCATTTTAGTAGTTTTTCGAACATTCCATGCTCGGGAAATCGCA
195 AAAGTATTCAAGACGGTCCATTCCTTTTAGTAGTTTTTCGAACATTCCATGCTCGGGAAATCGCA
* * *
3436 TCATTCAGTCTAAATAGTTTTTCATTTTGTAAAAAAGTTTTGGTCTTTGAATTTAAAACTTTTTT
260 TCATTCGGTCTAAATAGTTTTTCATTTTGTAAAAAAGTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTT
* *
3501 ACGTGAGAATTGTTTCTCTCATTTTGGCCTAAATAGTTTTTCGTTTTGTAAACTTTGCCAAGTTC
325 ACGTGAGAATTGTTTCTCTCATTTTGGTCTAAATAGTTTTTCATTTTGTAAAC-TTGCCAAGTTC
* *
3566 TTTTATAACTTCGATTCCTTAAAGTATTCAAGATGATCCATTCCTTCGAGCAATTTTTCGAACAA
389 TTTTATAACTTCGATTCCTTAAAGTATTCAAGATGATCCATTCCTTTGAGCAATTTTTCGAACAT
** *
3631 TCCACGCTCGGGAAATCGCATCATTCAGTCTAAATAGTTACTCATTTTGTAAACAAGTTATGGTT
454 TCCACGCTCGGGAAATCGCATCATTTGGTCTAAATAGTTACTCATTTTGTAAACAAGTTTTGGTT
* *
3696 TTTCAATTAAAAACTTATCTACATGAGAATTGTTCCTCTATTAGTTCATAT--ACGAAC-TTCCA
519 TTTCAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTCCTCTATTAG-TC-TATGGACGAACTTTCCA
* * * *
3758 ATCTTGTAGAAACTTTGCGAGTTCTTTTATAATTTCGGTTCTTTAGAGTATTCAAGATGATCCAT
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* *
3823 TCTTTCGAGCAATTTTTCGTACATTCCATGCCCGGGAAATCGCATCATTTGGTCTAAAA-ATTTT
646 TCTTTCGAGCAATTTTTCGAACATTCCATGCCCGAGAAATCGCATCATTTGGTCTAAAAGA-TTT
* * *
3887 GTCATTTTCTAAACAAGTTTTGGCCTTTGAATTAAAACCTTATTTACTTGAGAATTATTTTTCTT
710 GTCATTTTCTAAACAAGTTTTGGCCTTTGAATTAAAACCTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTT
* * *
3952 TTGGTTCTTTGACAAAC-TTCGAACTTGTCAAACTTTTATGAGTTCTTTTATATCTTTGGTTCCT
775 TTGGTTCTTAGACAAACTTTCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTTGGTTCCT
4016 TCAAGTATTCAAGACGATCCATT
840 TCAAGTATTCAAGACGATCCATT
* * * * *
4039 CCTTCGAGCATCTTTTCGAACATTTCATGATCGGGAAATCGCAGCATTCGGTCTGAATAGTTTTT
1 CCTTCGAGCAACTTTTCGAACATTCCATGCTCGGGAAATCGCATCATTCGGTCTAAATAGTTTTT
* *
4104 CATTTTGTAATCAAGTTTTGGTGTTTGTATTAAAAACTTATTTACGTAAGAATTAATTCTCTCTT
66 CATTTTGTAATCAAGTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTAAGAATTAATTCTCTCTT
* *
4169 TGTTCTTGGACGAACTTTCAAACTTGTCAAAATTTTACAAGTCCTTTTTGTAACTTCGATTCCTT
131 TGTTCTTGGACGAACTTTCGAACTTGTCAAAATTTTACAAGTCCTTTTT-TAACTTCGGTTCCTT
* * * * *
4234 AAAGTGTTCAAGACGGTTCATTCCTTTTAGTAGTTTTTCGAACATTTCACGCTTGGGAAATCGCA
195 AAAGTATTCAAGACGGTCCATTCCTTTTAGTAGTTTTTCGAACATTCCATGCTCGGGAAATCGCA
* ** * *
4299 TCAGTCGGTCTAAATAGTTACTCATTTTGTAAACAAGTTTTGGTCTTTCAATTAAAAACTTATTT
260 TCATTCGGTCTAAATAGTTTTTCATTTTGTAAAAAAGTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTT
* * * * ** ** * * ** *
4364 ATGTGAGAATTGTTCCTCT-A-TTAGTTC-AAGGACGAACTTCCAATCTTGTAGAAACTTTACGA
325 ACGTGAGAATTGTTTCTCTCATTTTGGTCTAAATA-G-TTTTTC-ATTTTGT--AAACTTGCCAA
* *
4426 GTT-TTGTTATAACTTCGGTTCCTTAGAGTATTCAAGATGATCCATT-CTTTCGAGCAATTTTTC
385 GTTCTT-TTATAACTTCGATTCCTTAAAGTATTCAAGATGATCCATTCCTTT-GAGCAATTTTTC
* * * * * ** *
4489 GAACATTCCATGCTTGGGAAATCGTATCATTTGGTCTAAAAATTTTGTCATTTTCTAAACAAGTT
448 GAACATTCCACGCTCGGGAAATCGCATCATTTGGTCTAAATAGTTACTCATTTTGTAAACAAGTT
* * * * * * *
4554 TTGGCCTTTT-AATTAAAACCTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTTTTGATTCT-TAGACAAAC
513 TTGG-TTTTTCAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTCCTCTATT-AGTCTATGGACGAAC
* * * * * *
4617 TTTCGAACCTGT-CAAACTTTTACGAGTTCTTTTGTATCTTTGGA-TCCTTCA-AGTATTCAAGA
576 TTTCCAACTTGTAGAAAC-TTTACGAGTTCTTTTATAAC-TTCGATTCCTT-AGAGTATTCAAGA
* ** * * * * *
4679 CGATCCATTCCCTCGAGC-ATCGTTTCGAACATTTCATGCTCGGGAAATCCCATCATTTGGTCTA
638 TGATCCATTCTTTCGAGCAAT-TTTTCGAACATTCCATGCCCGAGAAATCGCATCATTTGGTCTA
* * * * * * * *
4743 AATAG-TTTTTCATTTTGTAATCAAG-TTTGGTCTTTGTATTAAAAACTTATTTACATAAGAATT
702 AA-AGATTTGTCATTTTCTAAACAAGTTTTGGCCTTTGAATTAAAACCTTATTTACGTGAGAATT
* * *** ** *
4806 GTTTCTCTCATTTTGG-TC-TAAATAGTTTTTC-ATTTTGT-AAACTTTGT-CAAGTTCTTTTAT
766 G-TT-TCTC-TTTTGGTTCTTAGACAAACTTTCGAACTTGTCAAACTTT-TACGAGTTCTTTTAT
* *
4866 AACTTTGGTT-CTTTACAGTATTCAAGACGATCTATT
827 AACTTTGGTTCCTTCA-AGTATTCAAGACGATCCATT
* * * * *** *
4902 CCTTTGAGTAA-TTTTCTAAACATTCAATGAGAGGGAAATCGCATCATTTGGTCTAAATAGTTTT
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* * * * **
4966 TTATTTTGTGAA-CAAGTTTTGATCTTTAAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTTCTCTC
65 TCATTTTGT-AATCAAGTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTAAGAATTAATTCTCTC
* * * * * * * * * * * **
5030 TTGGTTCTTGGTCGAACTTTTGAAATTGACAAACTTTTACAAATTCATTTATAACTTCAGTTCAA
129 TTTGTTCTTGGACGAACTTTCGAACTTGTCAAAATTTTACAAGTCCTTTTTTAACTTCGGTTCCT
* * * ** * * ** *
5095 TAAAGTATTCAAGACGATCCATTCCTTCTAGCAAATTTTCGAACAATCCATTCTCGATAAATCGT
194 TAAAGTATTCAAGACGGTCCATTCCTTTTAGTAGTTTTTCGAACATTCCATGCTCGGGAAATCGC
* * * *
5160 ATCATTTGGTCTAAATAGTTTTTCATTTTGTAAACAAGTTTTGATCTCTGAATTAAAAACTTATT
259 ATCATTCGGTCTAAATAGTTTTTCATTTTGTAAAAAAGTTTTGGTCTTTGAATTAAAAACTTATT
* * * ** ** * ** * * *
5225 TACGTAAGAATTGTGTCTCTC---TTGGTCCTTGGACGAACTTTTGAACTTGTCGAACTT-ACGA
324 TACGTGAGAATTGTTTCTCTCATTTTGGT-C-T-AAATAGTTTTTCATTTTGT-AAACTTGCCAA
* * * * *
5286 GTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAACA-TATTCAAGATGATGCAATCTTTTGAGCAATTTTTTG
385 GTTCTTTTATAACTTCGATTCCTTAA-AGTATTCAAGATGATCCATTCCTTTGAGCAATTTTTCG
* * ** * * **
5350 GACATTCCATGCGAGGGAAGTCGCATCATTTGGTCTAAAAAGTTTTTCATTTTGTAAACAAGTTT
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* ** * * * * * *
5415 TAGCCTTTGAATTAAAAACTTATTTATGTGAGAA-T-TT-CTC--TTGGT-TGGTAGACAAACTT
514 TGGTTTTTCAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTCCTCTATTAGTCT-ATGGACGAACTT
* * * * * * * **
5474 CCCAACTTGT-CAAACTTTTATGAGTTCTTTTTTAACTTC-AGTTCCTCAAAGTGTTCAAGACAA
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* * ** ** *
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* * * * * * *
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* * * * * *
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* *
5727 TTGGTTCATTAAAGTATTCAAGACGATCCATT
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* * * * * *
5759 CCTTCTAGCAAATTTTCGAA-ATTCCATTCTCAGGAAATCACATCATTTGGTCTAAATAGTTTTT
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** * * * * *
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* * * * * * * * ** *
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* * ** * * * * * * * *
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** * * * * *
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* ** ** * ** ***
6082 ACGTGAGAATTGTTTCACT-ATTGGTTGG--TGGAT-GAACTTCCAAACTTGTCAAACTTTTAAG
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* * * * *
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* * * * * * *
6207 TAACATTCCACGCTCGAGAAATCGCATCATTTGGACAAAATAGATT-TTCATTTTGTAAAAAAAT
448 GAACATTCCACGCTCGGGAAATCGCATCATTTGGTCTAAATAG-TTACTCATTTTGTAAACAAGT
* * * * *
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** * * * * * *
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575 CTTTCCAACTTGT-AGAAACTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCGATTCCTTAGAGTATTCAAGAT
* * * * ** * * * *
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639 GATCCATTC-TTTCGAGCAATTTTTCGAACATTCCATGCCCGAGAAATCGCATCATTTGGTCTAA
* * * * *
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* * *** ** ** *
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* * *
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* * **
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* * * * * *
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* * ** * * * *
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*
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TGTTCTTGGACGAACTTTCGAACTTGTCAAAATTTTACAAGTCCTTTTTTAACTTCGGTTCCTTA
AAGTATTCAAGACGGTCCATTCCTTTTAGTAGTTTTTCGAACATTCCATGCTCGGGAAATCGCAT
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TCAATTAAAAACTTATTTACGTGAGAATTGTTCCTCTATTAGTCTATGGACGAACTTTCCAACTT
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CGAGCAATTTTTCGAACATTCCATGCCCGAGAAATCGCATCATTTGGTCTAAAAGATTTGTCATT
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* ** * *
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* *
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* * * * * * *
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* * * *
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* *
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* * * * * * * *
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* * * * * * ** * * *
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* * * *** *
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* * * * *
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* * * * * *
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* * *
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* * * * *
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* * * *
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* * * *
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* * ** * *
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* * *
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* *
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* * * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * *
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*
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* * * * * *
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* * * ** * *
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*
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* * **
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* * * * *
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* * * * * * * *
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** * * *
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* * *
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* * * * *
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1 TTGGACGAACTTTCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTG
* * *
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* *
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* * *
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* * ** *
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*
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* * * * * *
9463 ATTCA-AATTATTTCTTTCTTCGTTA
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* * ** * * * * *
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1 TTGGACGAACTTTCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTG
* * * * * *
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66 TTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGTAATTTTT-GAACATTCCATGCTCGGGAAATCGCATCATTT
* * *
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130 GGTCTAAATAGTTTTTCATTTTGTAAACAAGTTTTGGACTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGA
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195 GAATTGTTTCTCTCTTGGTTG
* * * * * * * *
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*
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* *
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128 TTGGTCTAAATAGTTTTTCATTTTGTAAACAAGTTTTGGA-CTTTGAATTAAAAACTTATTTACG
* * *
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192 TGAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTG
* * * * * * *
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1 TTGGACGAACTTTCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTG
* * * * * * **
9983 TTCAAGATGATCCAATCCTTCGAGCAATTTTTCAAACATTACATGCTC-GAAAAGTCAAATCATT
66 TTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGTAATTTTT-GAACATTCCATGCTCGGGAAA-TCGCATCATT
* * *
10047 TGGTCTAAAGAGTTTGTCATTTTGTAAACAAGTTTTGGCCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTG
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* * * ** * * * *
10134 TTGGACGAACTTCCGAACTTATCGAACTTTTACCTGTTCTTTTTTAAATCCGATTCCTTAAAGTG
1 TTGGACGAACTTTCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTG
* * * * * ** * * * *
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*
10263 TGGTCTAAATAGTTTTTCATTTTGTAAACAAGTTTT-AATCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGT
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* *
10327 GAGAATTGTGTCTCTCTTGGTTC
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* * * *
10350 TTGGATGAACTTTTGAACTTGTCAAACATTTACGAGTTCTTTTATAACTTTGGTTCCTTAAAGTG
1 TTGGACGAACTTTCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTG
* * * ** * * *
10415 TTCAAGTCGATCCAATCCTTCGAGCAATTATTCAAACATTACATGCTCGGGAAGTTGCATCATTT
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* * * * *
10480 GGTCTAAAAAGTTTGTCATTTTTGTCAACAAGTTTTGGCCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTA
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*
10545 AGAATTGTTTCTCTCTTGATTG
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* *
10567 TTGGACGAAC-TTCTGAACTTGTCAAACTTTTACAAGTTCTTTT-TGAA--TCTAGTTCCTTAAA
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* * * * **
10628 GTGTTCAACACAATCCATTCCTTCGAGTAATTTTCCGAACATTTCATGCGAGGGAAATCGCATCA
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* * *
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* * *
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* * *** *
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* * * *
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* *
10975 GAGAACTGTTTCTCTCTTGGTTC
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* * * * * * * *
10998 TTGGATGAACTTTCGAACTTGTCGAACTTTTACAACTTCTTTTATAGCTTCGGTTCCATACAGTA
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* * * * * * * *
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* * ** *
11127 TGGTCTTAAA-AGTTTGTCATTTTGTAAACAAGTTTTGGCCTTTGAATTAAAATTTTATTTATGT
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* *
11191 GAGAATTTTTTCTCTATTGGTTG
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* * * * * *
11214 TTGGATGAAC-TTCAGAAATTGTCAAACTGTTACGAGTTCTTTTTTAA-ATCTGGTTCCTTCAAG
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* * *
11277 TGTTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGTAATTTTTCGAACATTGCATGCAT-GGGAAATTGCATTA
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** *
11341 TTTTTTCTAAATAGTTTTTCATTTCT-TAAACAA-TTTTTGATCTTTGAATTAAAAACTTATTTA
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* *
11404 CGTGCGAATTGTTTCTCTCTTGGTTA
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* * * * * *
11430 TTGGACAAACTTCCGAACTTGTCGAACTTTTACGTGTTCTTTTATAGCTTCGGTTCCTTAAAGTA
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* * * * * * *
11495 TTCAAGACGATCCAATCCTTCGAGCAATTTTTCAAACATTACATGCTCGAGAAGTCGAATCATTT
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* * * *
11560 GGTCTAAAGAGTTTGTCATTTTGTAAACAAGTTTTGGCCTTCGAATT-AAAACTTATTTACGTGA
130 GGTCTAAATAGTTTTTCATTTTGTAAACAAGTTTTGGACTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGA
*
11624 GAATTGTTCCTCTCTTGGTTG
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* * * * *
11645 TTGGACGAACTTCCGAACTTGTCAAACTTTTACAAGTTCTTTTTTAAATACGGTTCCTTAAAGTG
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* * * * * * * ** *
11710 TCCAAGACGATCCATTTCGTAGAGTAATTCTCT-AACCATCCCAAGCGAGGGAAATCGTATCATT
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* * * *
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** *
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* * *
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* * ** * *
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* * * * *
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* * *
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* * * * * *
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1 TTGGACGAACTTTC-GAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGT
* **
12141 GTTCAAGACGATCCATT-CTGTCGAGTAAGTTTTCGAACATTCCATGCGAGGGAAATCGCATCAT
65 GTTCAAGACGATCCATTCCT-TCGAGTAA-TTTTTGAACATTCCATGCTCGGGAAATCGCATCAT
* * ** *
12205 TTGGACTAAATAGTTTTTCATTTTGTAAACAAGTTTT-TATCTTAAAATTAAAAACTTATTTACC
128 TTGGTCTAAATAGTTTTTCATTTTGTAAACAAGTTTTGGA-CTTTGAATTAAAAACTTATTTACG
*
12269 TGAGAATTATTTCTCTCTTGGTTG
192 TGAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTG
* * * * *
12293 TTGGACGAACTTCCGAAATTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTTTTTAA-ATCTGTTTCCTTAAA
1 TTGGACGAACTTTCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTC--TTTTATAACTTC-GGTTCCTTAAA
* * ** *
12357 CTGTTCTAGACGATCCACTT-CTTCGAGTAATTTTCCT-AACATTCCATGCGAGCGAAATCGCAT
63 GTGTTCAAGACGATCCA-TTCCTTCGAGTAATTTT--TGAACATTCCATGCTCGGGAAATCGCAT
* * * * * *
12420 TATTTGTTCTAAATAGTTTTTCATTTAGTAAGCAAGCTTTGGCCTTTGAATTAAAAACTTATTTA
125 CATTTGGTCTAAATAGTTTTTCATTTTGTAAACAAGTTTTGGACTTTGAATTAAAAACTTATTTA
* * * * *
12485 CGTGACAATTTTTTTTCTCATGGTTA
190 CGTGAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTG
* * * * * **
12511 TTGGATGAAC-TTCTGAACTTATCAAACTTTTACGAGTTCTTTTTTTAAATCCGGTAGCTTAAAG
1 TTGGACGAACTTTC-GAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTC-TTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAG
* * * **
12575 TGTTCAAGACGATCCATTACTTCGAATAATTTTCTGAACATCCCATGCGAGGGAAATCGCA-CTA
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* *
12639 TTTGGTCTAAATAATTATTCATTTTGTAAA-AATGTTTT-GATCTTTGAATTAAAAACTTATTTA
127 TTTGGTCTAAATAGTTTTTCATTTTGTAAACAA-GTTTTGGA-CTTTGAATTAAAAACTTATTTA
* *
12702 CGTGAGAACTGTTTCTCTCTTGGTTT
190 CGTGAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTG
* * * * * ** *
12728 TTGGATGAAC-TTCAAAACCTATCGAACTTTTACGAGTTCTTCCATAACTTCGGTTCCATAAAGT
1 TTGGACGAACTTTC-GAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGT
* * * * *
12792 ATTCAAGACGATCCAATCCTTCGACTAATTTTTTGAACATTACTTGCTC-GGAAAGTCGCATCAT
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* *
12856 TTGGTCTAAA-AGTTTTTCATTTTGTAAACAAGTTTTGGCCTTTGAATTAAAAATTTATTTACGT
128 TTGGTCTAAATAGTTTTTCATTTTGTAAACAAGTTTTGGACTTTGAATTAAAAACTTATTTACGT
*
12920 GAGAATTGTTTCTCTCTTTGTTG
193 GAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTG
* * * * * *
12943 TTGGACGAACTTCCGAAATTGTTAAACTTTTACGAGTTCTTTTTTAAATCCGGTTCCTTAAAGTG
1 TTGGACGAACTTTCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTG
*
13008 TTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGTAATTTTCTGAACATTCCATGCGT-GGGAAATTGCATCATT
66 TTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGTAATTTT-TGAACATTCCATGC-TCGGGAAATCGCATCATT
* *
13072 TGGTCTAAATAGTTTTTCATTTT-TAAACAAGTTTT-GATCTTTGAATTAAAAATTTATTTACAT
129 TGGTCTAAATAGTTTTTCATTTTGTAAACAAGTTTTGGA-CTTTGAATTAAAAACTTATTTACGT
* *
13135 GCA-AATTCTTTCTCTCTTGGTTA
193 G-AGAATTGTTTCTCTCTTGGTTG
* * * * * * * * *
13158 TTGGATGAACTTCCGAACTTGTCGAACTTTTATGTGTTCTTTTATAGCTTCGATTCCCTAAAGTA
1 TTGGACGAACTTTCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTG
* * * * * * * *
13223 TTCAAGATGATCCAATCCTTCGAGCAATTTTTCAAACACTACATGCTCGGGAAGTCGAATCATTT
66 TTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGTAATTTTT-GAACATTCCATGCTCGGGAAATCGCATCATTT
* * * * *
13288 GGTCTGAAGAGTTTGTCATTTTGTAAACAAGTTTTGGCCTTTGAATTATAAACTTATTTACGTGA
130 GGTCTAAATAGTTTTTCATTTTGTAAACAAGTTTTGGACTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGA
* * *
13353 GAATTATTTTTCTCTCGGTTG
195 GAATTGTTTCTCTCTTGGTTG
* * *
13374 TTGGACGAACTCTCGAACTTGTCACACTTTTACGAGTTCCTTTTA-AAATTCGGTTCCTTAAAGT
1 TTGGACGAACTTTCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTT-CTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGT
* *
13438 GTTGAAGACGATCCATTCCTTCGAGTAATTTTCTGAACATTCCAAG-T-GAGGTAAATCGCATCA
65 GTTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGTAATTTT-TGAACATTCCATGCTCG-GG-AAATCGCATCA
* *
13501 TTCGGTCTAAATAGTTTTTCATTTTGTAAACAAGTATT-GATCTTTGAATTAAAAACTTATTTAC
127 TTTGGTCTAAATAGTTTTTCATTTTGTAAACAAGTTTTGGA-CTTTGAATTAAAAACTTATTTAC
* * * *
13565 TTGAGAATTGTGTGTCTCTTGGTTT
191 GTGAGAATTGTTTCTCTCTTGGTTG
* * * * ** * * * * * * * *
13590 TTGAATGAACTTCCAAACTAATCGAACTTTTACAAGTTCTTTCATAAGTTTGGTCCCATAAAGTA
1 TTGGACGAACTTTCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTG
* * * * * * * *
13655 TTCAAGATGATCAAATCCTTCGAGCAATTTTTTGAACATTACATGCTCGAGAAGTTGCATCATTT
66 TTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGTAA-TTTTTGAACATTCCATGCTCGGGAAATCGCATCATTT
* ** * **
13720 GGTCTAAAAAGTTAGTCATTTTGTAAACAAGTTTCGTCCTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGA
130 GGTCTAAATAGTTTTTCATTTTGTAAACAAGTTTTGGACTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGA
13785 -AATT
195 GAATT
13789 TCGTCTAAAT
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Matches are distributed among these distances:
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214 297 0.05
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ACGTcount: A:0.28, C:0.17, G:0.16, T:0.40
Consensus pattern (215 bp):
TTGGACGAACTTTCGAACTTGTCAAACTTTTACGAGTTCTTTTATAACTTCGGTTCCTTAAAGTG
TTCAAGACGATCCATTCCTTCGAGTAATTTTTGAACATTCCATGCTCGGGAAATCGCATCATTTG
GTCTAAATAGTTTTTCATTTTGTAAACAAGTTTTGGACTTTGAATTAAAAACTTATTTACGTGAG
AATTGTTTCTCTCTTGGTTG
Found at i:7711 original size:19 final size:19
Alignment explanation
Indices: 7683--7721 Score: 53
Period size: 19 Copynumber: 2.1 Consensus size: 19
7673 CATTTGGTTT
*
7683 AAATAGTTTTTAT-TTTGA
1 AAATAGTTTTGATCTTTGA
7701 AAATAAGTTTTGATCTTTGA
1 AAAT-AGTTTTGATCTTTGA
7721 A
1 A
7722 TTAAGAACTT
Statistics
Matches: 18, Mismatches: 1, Indels: 2
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Matches are distributed among these distances:
18 4 0.22
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Consensus pattern (19 bp):
AAATAGTTTTGATCTTTGA
Found at i:12026 original size:21 final size:21
Alignment explanation
Indices: 11985--12024 Score: 55
Period size: 20 Copynumber: 2.0 Consensus size: 21
11975 GAAAGTCGCA
11985 TCATTTGGTCAAAAAAGTTTG
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* *
12006 TCATTTTGT-AAACAAGTTT
1 TCATTTGGTCAAAAAAGTTT
12025 TGGCCATTGA
Statistics
Matches: 17, Mismatches: 2, Indels: 1
0.85 0.10 0.05
Matches are distributed among these distances:
20 9 0.53
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Consensus pattern (21 bp):
TCATTTGGTCAAAAAAGTTTG
Found at i:13815 original size:70 final size:71
Alignment explanation
Indices: 13716--13859 Score: 211
Period size: 70 Copynumber: 2.0 Consensus size: 71
13706 AAGTTGCATC
*
13716 ATTTGGTCTAAAAAGTTAGTCATTTTGTAAACAAGTTTCG-TCCTTTGAATTAAAAACTTATTTA
1 ATTTCGTCTAAAAAGTTAGTCATTTTGTAAACAAGTTTCGAT-CTTTGAATTAAAAACTTATTTA
13780 CGTGA-A
65 CGTGAGA
* ** * *
13786 ATTTCGTCTAAATAGTTTTTCATTTTGTAAGCAAGTTTTGATCTTTGAATTAAAAACTTATTTAC
1 ATTTCGTCTAAAAAGTTAGTCATTTTGTAAACAAGTTTCGATCTTTGAATTAAAAACTTATTTAC
13851 GTGAGA
66 GTGAGA
13857 ATT
1 ATT
13860 GTTTGTCTCT
Statistics
Matches: 66, Mismatches: 6, Indels: 3
0.88 0.08 0.04
Matches are distributed among these distances:
70 61 0.92
71 5 0.08
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Consensus pattern (71 bp):
ATTTCGTCTAAAAAGTTAGTCATTTTGTAAACAAGTTTCGATCTTTGAATTAAAAACTTATTTAC
GTGAGA
Done.