Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: chr9
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Pmatch=0.80,Pindel=0.10
tuple sizes 0,4,5,7
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ACGTcount: A:0.31, C:0.16, G:0.16, T:0.31
Warning! 2298367 characters in sequence are not A, C, G, or T
File 46 of 97
Found at i:18798743 original size:2 final size:2
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Indices: 18798738--18798777 Score: 71
Period size: 2 Copynumber: 20.0 Consensus size: 2
18798728 ACAACAAGGG
*
18798738 GA GA GA GA GA GA GA GA GA GC GA GA GA GA GA GA GA GA GA GA
1 GA GA GA GA GA GA GA GA GA GA GA GA GA GA GA GA GA GA GA GA
18798778 ACATAGAAGA
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2 36 1.00
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Consensus pattern (2 bp):
GA
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18799082 AGTCTCATCT
18799092 TTTGTCACATTTTCATTAAACTAAAATCC
1 TTTGTCACATTTTCATTAAACTAAAATCC
*
18799121 TTTGTCACATTTTCATTATACTAAAAT
1 TTTGTCACATTTTCATTAAACTAAAAT
18799148 GGTTGCTTAA
Statistics
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29 26 1.00
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Consensus pattern (29 bp):
TTTGTCACATTTTCATTAAACTAAAATCC
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18802427 TTGGAATTAG
*
18802437 AAATAAAAAAATGGA
1 AAATAAAAAAATGCA
*
18802452 AAATAAAAAAATTCA
1 AAATAAAAAAATGCA
18802467 AAA-AACAAAAAT
1 AAATAA-AAAAAT
18802479 AAATCCTAAA
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14 2 0.08
15 22 0.92
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Consensus pattern (15 bp):
AAATAAAAAAATGCA
Found at i:18808397 original size:28 final size:29
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18808336 GAAATGCATA
* *
18808346 TTATATCTTTTTTTTTAAAAAAAAGCTATG
1 TTATATC-TATTTTTTAAAAAAAAGCTAAG
**
18808376 TTATATCTATTTTTT-AAAAAAATTTAAG
1 TTATATCTATTTTTTAAAAAAAAGCTAAG
18808404 TTATATCTAT
1 TTATATCTAT
18808414 CTTCAATCGT
Statistics
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0.85 0.10 0.05
Matches are distributed among these distances:
28 20 0.59
29 7 0.21
30 7 0.21
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Consensus pattern (29 bp):
TTATATCTATTTTTTAAAAAAAAGCTAAG
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18808702 CTTATCCCTC
*
18808712 CTCATCTTATATTTTCAT
1 CTCATCTTATATGTTCAT
18808730 CTCAT-TTATATGTTCA
1 CTCATCTTATATGTTCA
18808746 CACCCTACCT
Statistics
Matches: 15, Mismatches: 1, Indels: 1
0.88 0.06 0.06
Matches are distributed among these distances:
17 10 0.67
18 5 0.33
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Consensus pattern (18 bp):
CTCATCTTATATGTTCAT
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Indices: 18814580--18814618 Score: 51
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18814570 CCTCACCAAA
18814580 CATCAAATAT
1 CATCAAATAT
*
18814590 CACCAAAATAT
1 CATC-AAATAT
*
18814601 CATGAAATAT
1 CATCAAATAT
18814611 CATCAAAT
1 CATCAAAT
18814619 TCAGCCACAA
Statistics
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0.80 0.13 0.07
Matches are distributed among these distances:
10 16 0.67
11 8 0.33
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Consensus pattern (10 bp):
CATCAAATAT
Found at i:18817643 original size:27 final size:28
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18817579 GACAAGTGCT
* *
18817589 GGGGTGACAAATTTACCGATTTACCCCC
1 GGGGTGAAAAAATTACCGATTTACCCCC
18817617 GGGGTGAAAAAATTA-CGATTTTACCCC
1 GGGGTGAAAAAATTACCGA-TTTACCCC
18817644 TATACTCCGA
Statistics
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0.86 0.07 0.07
Matches are distributed among these distances:
27 3 0.12
28 21 0.88
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Consensus pattern (28 bp):
GGGGTGAAAAAATTACCGATTTACCCCC
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18820249 TTTTGGCCCC
*
18820259 ATTTCACTTATTGGAGTATA
1 ATTTGACTTATTGGAGTATA
*
18820279 ATTTGACTTATTGGAGTATG
1 ATTTGACTTATTGGAGTATA
18820299 ATTTGA
1 ATTTGA
18820305 GGTTTAGAAG
Statistics
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0.92 0.08 0.00
Matches are distributed among these distances:
20 24 1.00
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Consensus pattern (20 bp):
ATTTGACTTATTGGAGTATA
Found at i:18820912 original size:171 final size:171
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Period size: 171 Copynumber: 1.9 Consensus size: 171
18820601 NNNNNNNNNN
* *
18820611 AAAGCCATCGATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTCATTATAT
1 AAAGCCATCGATTAACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTCATTATAT
* *
18820676 GCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATTATTAATTTTATGTTGAATTTTCTTACATTTGTGGTTAAA
66 GCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATTATTAATTTTAAGTAGAATTTTCTTACATTTGTGGTTAAA
18820741 ACAGAATATAATTGAATGCTTGTCTCGGGAAGCACGAAGCA
131 ACAGAATATAATTGAATGCTTGTCTCGGGAAGCACGAAGCA
* *
18820782 AAAGCCATCGATTAACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTTATGCCTTCGAAAGCCTTATTACT-
1 AAAGCCATCGATTAACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTCATTA-TA
* * * * *
18820846 TGCTTTAAATGGTTTTATAATCTGATTATTGATTTTAAGTAGAATATTT-TTATATTTTTTGTTA
65 TGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATTATTAATTTTAAGTAGAAT-TTTCTTACATTTGTGGTTA
**
18820910 AAACAGGTTATAATTGAATG
129 AAACAGAATATAATTGAATG
18820930 TTTACCTCAA
Statistics
Matches: 133, Mismatches: 13, Indels: 4
0.89 0.09 0.03
Matches are distributed among these distances:
171 129 0.97
172 4 0.03
ACGTcount: A:0.33, C:0.13, G:0.15, T:0.39
Consensus pattern (171 bp):
AAAGCCATCGATTAACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTCATTATAT
GCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATTATTAATTTTAAGTAGAATTTTCTTACATTTGTGGTTAAA
ACAGAATATAATTGAATGCTTGTCTCGGGAAGCACGAAGCA
Found at i:18824329 original size:171 final size:171
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Period size: 171 Copynumber: 6.7 Consensus size: 171
18823966 AGTCTGTTTG
* * *
18823976 TAGTCACGCATGCCTTC-AGAAGCCTTATTACTCACTTAAAATGGTTTTATAATCTCA-TAGTTG
1 TAGTCACTCATGCCTTCGA-AAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATTA-TTG
* * *
18824039 ATTTTAAGTTGAATTTCTTTTACATTTGCTT--TTAAGAA-AGGTTATAATTAAATGTTTGCCTT
64 ATTTTAAGTTGAATTT-TTTTACATTT--TTGGTTAA-AACAGATTATAATTGAATGTTTGCCTC
* * * *
18824101 GAGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAGAAGTCCATTTA
125 AAGAAACATGAAGCAAAAGCCATCGATTGACAAGAAAAGTCCATTTA
* * *
18824148 TAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCTTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCATTATTGAT
1 TAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATTATTGAT
* * *
18824213 TTTAAGTTAAATTTTCTTACATTTTTGGTTACAACAGATTATAATTGAATGTTTGCCTCAAGAAA
66 TTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTTTGCCTCAAGAAA
* * *
18824278 CATGAAGCGAAAGCCATTGATTGATAAGAAAAGTCCATTTA
131 CATGAAGCAAAAGCCATCGATTGACAAGAAAAGTCCATTTA
* * * * * ** * * * *
18824319 CATTCACTCATTCTTTCAAAAATCTTATTACTCTCTTTAAAAGGTTTTATAGTCTCATAATTTG-
1 TAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATTA-TTGA
* * * * * *
18824383 TTTTAGGTTGAATTTTTTTGCATTTTTTGTTAAAACAGATTATAATTGATTGTTTACCTTGAA-A
65 TTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTTTGCC-TCAAGA
* *
18824447 AACATGAAGCAAAAGCTAT-GCATTGACAAGAAAAGTTCATTTA
129 AACATGAAGCAAAAGCCATCG-ATTGACAAGAAAAGTCCATTTA
** * * * * *
18824490 TACCCACTCACGCCTTCAAAAGCCTTATTATTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGAT
1 TAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATTATTGAT
* * * * * * *
18824555 TTTAAGTTGAGTTTTTTTCCATTTTCGATTAAGAA-AGGTTATAATTAAATGTTTGCCTCTAGAA
66 TTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAA-AACAGATTATAATTGAATGTTTGCCTCAAGAA
* * * *
18824619 ACATGAAACAAAAGCCACCGATTGATATGAAAAGTCCATTTA
130 ACATGAAGCAAAAGCCATCGATTGACAAGAAAAGTCCATTTA
* * * * * *
18824661 TAGCCACTCATGCCTCCGAAAGCCTTATTACTCGTTTTAAATGATTTTATAATCTCATAATTTAT
1 TAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATTATTGAT
* * * * * * **
18824726 TTTAAGTTGAA-TTTTTTCCCTTTTTGGTTAAAACGGATTCTAATTGAATATTTACCT-TGGAAA
66 TTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTTTGCCTCAAG-AA
* * * *
18824789 ACGTAAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTA
130 ACATGAAGCAAAAGCCATCGATTGACAAGAAAAGTCCATTTA
* * * *
18824831 TAGTCACTTATGCCTTTGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATTATTAAT
1 TAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATTATTGAT
* * * * * * * * *
18824896 TTTATGTTAAATTCTCTTACATTTGTGGTTAAAACAGAATATAATTGAATGCTTGCCTCAGGAAG
66 TTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTTTGCCTCAAGAAA
** *
18824961 CATGAAGTGAAAGGCATCGATTGACAAGAAAAGTCCATTTA
131 CATGAAGCAAAAGCCATCGATTGACAAGAAAAGTCCATTTA
* * * *
18825002 TAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTGATTATTGAC
1 TAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATTATTGAT
* * * *
18825067 TTTAAGTAGAATGTTTTTACATTTTT-GTTAAAATAGGTTATAATTGAATGTTT
66 TTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTTT
18825120 AAACGTAAGG
Statistics
Matches: 808, Mismatches: 148, Indels: 34
0.82 0.15 0.03
Matches are distributed among these distances:
169 6 0.01
170 166 0.21
171 553 0.68
172 80 0.10
173 3 0.00
ACGTcount: A:0.33, C:0.15, G:0.14, T:0.39
Consensus pattern (171 bp):
TAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATTATTGAT
TTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTTTGCCTCAAGAAA
CATGAAGCAAAAGCCATCGATTGACAAGAAAAGTCCATTTA
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18823966 AGTCTGTTTG
* * *
18823976 TAGTCACGCATGCCTTC-AGAAGCCTTATTACTCACTTAAAATGGTTTTATAATCTCA-TAGTTG
1 TAGTCACTCATGCCTTCGA-AAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATTA-TTG
* *
18824039 ATTTTAAGTTGAATTTCTTTTACATTTGCTT--TTAAGAA-AGGTTATAATTAAATGTTTGCCTT
64 ATTTTAAGTTGAATTT-TTTTACATTT--TTGGTTAA-AACAGATTATAATTGAATGTTTGCCTT
*
18824101 -GAGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAGAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTT
125 GGA-AAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTT
* *
18824165 GAAAGCTTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCATTATTGATTTTAAGTTAAATTTTCT
189 GAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCATTATTGATTTTAAGTTAAATTTTTT
* *
18824230 TACATTTTTGGTTACAACAGATTATAATTGAATGTTTGCCTCAAGAAACATGAAGCGAAAGCCAT
254 TACATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTTTGCCT-TAGAAACATGAAGCGAAAGCCAT
* *
18824295 TGATTGATAAGAAAAGTCCATTTA
318 CGATTGAGAAGAAAAGTCCATTTA
* * * * * ** * * * *
18824319 CATTCACTCATTCTTTCAAAAATCTTATTACTCTCTTTAAAAGGTTTTATAGTCTCATAATTTG-
1 TAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATTA-TTGA
* * * * * *
18824383 TTTTAGGTTGAATTTTTTTGCATTTTTTGTTAAAACAGATTATAATTGATTGTTTACCTTGAAAA
65 TTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTTTGCCTTGGAAA
* * * * ** * **
18824448 ACATGAAGCAAAAGCTATGCATTGACAAGAAAAGTTCATTTATACCCACTCACGCCTTCAAAAGC
130 ACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGC
* ** * * * *
18824513 CTTATTATTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAGTTTTTTTCCATT
195 CTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCATTATTGATTTTAAGTTAAATTTTTTTACATT
* * * * * * *
18824578 TTCGATTAAGAA-AGGTTATAATTAAATGTTTGCCTCTAGAAACATGAAACAAAAGCCACCGATT
260 TTTGGTTAA-AACAGATTATAATTGAATGTTTGCCT-TAGAAACATGAAGCGAAAGCCATCGATT
* *
18824642 GATATGAAAAGTCCATTTA
323 GAGAAGAAAAGTCCATTTA
* * * * * *
18824661 TAGCCACTCATGCCTCCGAAAGCCTTATTACTCGTTTTAAATGATTTTATAATCTCATAATTTAT
1 TAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATTATTGAT
* * * * * *
18824726 TTTAAGTTGAA-TTTTTTCCCTTTTTGGTTAAAACGGATTCTAATTGAATATTTACCTTGGAAAA
66 TTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTTTGCCTTGGAAAA
* * *
18824790 CGTAAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTTATGCCTTTGAAAGCC
131 CGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCC
** * * * *
18824855 TTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATTATTAATTTTATGTTAAATTCTCTTACATTT
196 TTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCATTATTGATTTTAAGTTAAATTTTTTTACATTT
* * * * * * *
18824920 GTGGTTAAAACAGAATATAATTGAATGCTTGCCTCAGGAAGCATGAAGTGAAAGGCATCGATTGA
261 TTGGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTTTGCCTTA-GAAACATGAAGCGAAAGCCATCGATTGA
*
18824985 CAAGAAAAGTCCATTTA
325 GAAGAAAAGTCCATTTA
* * * *
18825002 TAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTGATTATTGAC
1 TAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATTATTGAT
* * * *
18825067 TTTAAGTAGAATGTTTTTACATTTTT-GTTAAAATAGGTTATAATTGAATG--T---TT---AAA
66 TTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTTTGCCTTGGAAAA
* ** *
18825123 CGT-AAGGCTAAAA-CCCTCTGTTGACAGGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCC-TT-----
131 CGTGAA-GC-AAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAG
*******************************************************
18825180 -C----TA--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
194 CCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCATTATTGATTTTAAGTTAAATTTTTTTACAT
*****************************************************************
18825238 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
259 TTTTGGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTTTGCCTTAGAAACATGAAGCGAAAGCCATCGATTG
**
18825303 NNAAGAAAAGTCCATTTA
324 AGAAGAAAAGTCCATTTA
* *
18825321 TAGTCACTCATGCCTTCGGAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGCTTTTATAATCTCATTATTGAT
1 TAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATTATTGAT
* * * *
18825386 TTTAACTTGAATTTTCTTACATTTTTGGTTAAAATAGATTATAATTGAATGTTTGTCTTAGG-AA
66 TTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTTTGCCTT-GGAAA
* * *
18825450 ATGAGAAGCAAAAGCCATCGATTGAC-AGTAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCT-AAA
130 ACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAG-AAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTT-TGAAA
* * *
18825513 GCCTTATTACTCACTTTAAAT--TATTTATAATCTTATAATTTG-TTTTAAGTTTAA-TTTTTTA
193 GCCTTATTACTCACTTTAAATGGT-TTTATAATCTCATTA-TTGATTTTAAGTTAAATTTTTTTA
* * * * * *
18825574 CATTTTTGGTTAAAATAGATGATAGTTG-ATTTTTGCCTGAAGAAACATGAAGCAAAAGCCATCG
256 CATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTTTGCCT-TAGAAACATGAAGCGAAAGCCATCG
18825638 ATTGAGAAGAAAAGTCCATTTA
320 ATTGAGAAGAAAAGTCCATTTA
* *
18825660 TAGTCACTCATACCTTCGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGTTTTTATAATCTCATTATTGAT
1 TAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATTATTGAT
* * * * * *
18825725 TTTAAGTTGAATTTTCTTATA-TTTTAGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTTTGCATAGGGAAA
66 TTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTTTGCCTTGGAAAA
* ** * *
18825789 CGTGAAGCGAAAGCCATTGATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGTC
131 CGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCC
* * *
18825854 TTATTACTCACTTTAAATGATTTTATAATCTCATTATTGATTTTATGTTGAATTTTTTTACATTT
196 TTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCATTATTGATTTTAAGTTAAATTTTTTTACATTT
* * * * *
18825919 TTGGTTAAAACAGATTATAATTGAATGCTTGCCTTGAGAAGCATGTAGAGAAAGTCATCGATTGA
261 TTGGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTTTGCCTT-AGAAACATGAAGCGAAAGCCATCGATTGA
18825984 GAAGAAAAGTCCATTTA
325 GAAGAAAAGTCCATTTA
* * * *
18826001 TAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATGCTTTTATAATTTGATTATTGAT
1 TAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATTATTGAT
* * * *
18826066 TTTAAGTAGAATTTTTTTACATTTTTTGTTAAAACATATTATAATTGAATG-TTGACCTTGGGAA
66 TTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTTTG-CCTTGGAAA
* * ** * * * * * *
18826130 ATGTGAAGCTAAAA-CCCTCTGTTAATAGGAAAAGTCCATTTATAGTCGCCCATGCC-TTAAGAA
130 ACGTGAAGC-AAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGA-AA
* * * * *
18826193 GCCATATTACTCAC-TTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTAACTTTAAG-TAGAA-TTTTTTAT
193 GCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCATTATTGATTTTAAGTTA-AATTTTTTTAC
** * * * * * *
18826255 ATTTTTTATTAAGAA-AGGTTATAATTAAAAGTTTACCTTGAGAAACGTGAAGCGAAAGCTATTC
257 ATTTTTGGTTAA-AACAGATTATAATTGAATGTTTGCCTT-AGAAACATGAAGCGAAAGCCA-TC
* *
18826319 -ATTGACAACAAAAGTCCATTTA
319 GATTGAGAAGAAAAGTCCATTTA
*
18826341 TAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATTATTGAT
1 TAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATTATTGAT
* * * * * *
18826406 TTTAAGTTAAATTTTTTTGCTTTTTTGATTAAAACAGATTATAATTGAATGTTTGCCTCGG-GAA
66 TTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTTTGCCTTGGAAAA
* ** *
18826470 CGTGAAGCAAAAGCCATCGATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCA-TGCATGTGTTCGAAAGC
131 CGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACT-CATGCCTTTGAAAGC
* * * * *
18826534 CTTATTACT-AGCTTTAAATGGTTTTATAAACTGATTA-TGTATTTTCAGTTGAATTTTTTAACA
195 CTTATTACTCA-CTTTAAATGGTTTTATAATCTCATTATTG-ATTTTAAGTTAAATTTTTTTACA
* * * * * * * * * **
18826597 TATTTT-G-TAAAACATATTATAACTGAATATTTACCTTGGGAAACCTGAGGCTAAAACTGTCCG
258 T-TTTTGGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTTTGCCTT-AGAAACATGAAGCGAAAGCCAT-CG
*
18826660 -TTGA-TAGAAAAAGTCCATTTA
320 ATTGAGAAG-AAAAGTCCATTTA
18826681 TAGTCACTCATGCCTT-GAGAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATTATTGA
1 TAGTCACTCATGCCTTCGA-AAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATTATTGA
** * * *
18826745 TTTTAAGTTGAA-TTTTTTACATTTTCAGTTAAGAA-AGGTTATAATTCAATGTTTGCC-TCGAG
65 TTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAA-AACAGATTATAATTGAATGTTTGCCTTGGA-
* * * *
18826807 AAACATGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTTCATTTATAGTCACTTATGCCTTTGAAA
128 AAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAA
* * * *
18826872 GCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCATTATAGATCTTAAGTTAAATTTTCTTGCA
193 GCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCATTATTGATTTTAAGTTAAATTTTTTTACA
* * * * *
18826937 TTTTTGGTTAAAAAAGATTAAAATTGAAGGTTTGCCTTAGAAAACGTGAAGCGAAAGCCATCAAT
258 TTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTTTGCCTTAG-AAACATGAAGCGAAAGCCATCGAT
* * *
18827002 TGGGAAAAAAAGTTCATTTA
322 TGAGAAGAAAAGTCCATTTA
* * * ** * *
18827022 TAGTCACTCATACCTTCAAAAGCCTTATTACTCGATTTAAATAATTTTATAATCTGATAATTGAT
1 TAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATTATTGAT
* ** * * * *
18827087 TTTAAG-TGAAATTTTTTTATATTTTTTTATTAAAACGGATTATAATTGAATGTTTACCATGGGA
66 TTTAAGTTG-AATTTTTTTACA-TTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTTTGCCTTGGAA
** * * * ** * *
18827151 AACGTGAAGTTAAAGCCTTCCGTTGGCAAGAAAAGTTTATTTATAGTCACTCATACCTTCGAAAG
129 AACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAG
* * * *
18827216 TCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCATTATTGATTTTAAATTGAATGTTTTTTTGC
194 CCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCATTATTGATTTTAAGTT-AA-ATTTTTTTAC
* * *
18827281 CTTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTTTG-CTTCAGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCG
257 ATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTTTGCCTT-A-GAAACATGAAGCGAAAGCCATCG
18827345 AT
320 AT
18827347 CATAAGAAAG
Statistics
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0.75 0.20 0.06
Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.32, C:0.14, G:0.14, T:0.37
Consensus pattern (341 bp):
TAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATTATTGAT
TTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTTTGCCTTGGAAAA
CGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCC
TTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCATTATTGATTTTAAGTTAAATTTTTTTACATTT
TTGGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTTTGCCTTAGAAACATGAAGCGAAAGCCATCGATTGAG
AAGAAAAGTCCATTTA
Found at i:18825838 original size:170 final size:170
Alignment explanation
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Period size: 170 Copynumber: 12.0 Consensus size: 170
18825295 NNNNNNNNNN
* *
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1 AAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTA
* * *
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66 TAATCTCATTATTGATTTTAAGTTGAATTTT-TTATATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTGAA
* * * *
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130 TGTTTG-CCTAGGGAAACGTGAAGCGAAAGCCATCGATTGAC
* *
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1 AAG-AAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGT-TT
* * * * * * *
18825538 TATAATCTTATAATTTG-TTTTAAGTTTAATTTTTTACATTTTTGGTTAAAATAGATGATAGTTG
64 TATAATCTCATTA-TTGATTTTAAGTTGAATTTTTTATATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTG
* * * * *
18825602 -ATTTTTGCCT-GAAGAAACATGAAGCAAAAGCCATCGATTGAG
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* *
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1 AAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTA
*
18825709 TAATCTCATTATTGATTTTAAGTTGAATTTTCTTATA-TTTTAGTTAAAACAGATTATAATTGAA
66 TAATCTCATTATTGATTTTAAGTTGAATTTT-TTATATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTGAA
* *
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130 TGTTTGCCTAGGGAAACGTGAAGCGAAAGCCATCGATTGAC
* * *
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1 AAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTA
* *
18825879 TAATCTCATTATTGATTTTATGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTGAA
66 TAATCTCATTATTGATTTTAAGTTGAA-TTTTTTATATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTGAA
* * * * * * * * *
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130 TGTTTGCCTAGGGAAACGTGAAGCGAAAGCCATCGATTGAC
* *
18825985 AAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATGCTTTTA
1 AAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTA
* * * * * *
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66 TAATCTCATTATTGATTTTAAGTTGAA-TTTTTTATATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTGAA
* * * * * * *
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130 TGTTTG-CCTAGGGAAACGTGAAGCGAAAGCCATC-GATTGAC
* * * * * *
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1 AAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGA-AAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTT
* * * * ** * *
18826219 ATAATCTCATAATTAACTTTAAGTAGAATTTTTTATATTTTTTATTAAGAA-AGGTTATAATTAA
65 ATAATCTCATTATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTATATTTTTGGTTAA-AACAGATTATAATTGA
* * * * *
18826283 AAGTTTACCTTGAGAAACGTGAAGCGAAAGCTATTC-ATTGAC
129 ATGTTTGCCTAGGGAAACGTGAAGCGAAAGCCA-TCGATTGAC
* *
18826325 AACAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTA
1 AAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTA
* * *
18826390 TAATCTCATTATTGATTTTAAGTTAAATTTTTT-TGCTTTTTTGATTAAAACAGATTATAATTGA
66 TAATCTCATTATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTAT--ATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTGA
* *
18826454 ATGTTTGCCTCGGG-AACGTGAAGCAAAAGCCATCGATTGAC
129 ATGTTTGCCTAGGGAAACGTGAAGCGAAAGCCATCGATTGAC
** *
18826495 AAGAAAAGTCCATTTATAGTCA-TGCATGTGTTCGAAAGCCTTATTACTAGCTTTAAATGGTTTT
1 AAGAAAAGTCCATTTATAGTCACT-CATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTT
* * * * * *
18826559 ATAAACTGATTA-TGTATTTTCAGTTGAATTTTTTAACATATTTT-G-TAAAACATATTATAACT
65 ATAATCTCATTATTG-ATTTTAAGTTGAATTTTTT-ATAT-TTTTGGTTAAAACAGATTATAATT
* * * * * * * **
18826621 GAATATTTACCTTGGGAAACCTGAGGCTAAAACTGTCCG-TTGA-
127 GAATGTTTGCCTAGGGAAACGTGAAGCGAAAGCCAT-CGATTGAC
*
18826664 TAGAAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTT-GAGAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTT
1 AAG-AAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGA-AAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTT
* ** * *
18826728 TATAATCTCATTATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTACATTTTCAGTTAAGAA-AGGTTATAATTC
64 TATAATCTCATTATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTATATTTTTGGTTAA-AACAGATTATAATTG
* * * *
18826792 AATGTTTGCCTCGAGAAACATGAAGCGAAAGCCATCCATTGAC
128 AATGTTTGCCTAGGGAAACGTGAAGCGAAAGCCATCGATTGAC
* * * *
18826835 AAGAAAAGTTCATTTATAGTCACTTATGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTA
1 AAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTA
* * * ** * *
18826900 TAATCTCATTATAGATCTTAAGTTAAATTTTCTTGCATTTTTGGTTAAAAAAGATTAAAATTGAA
66 TAATCTCATTATTGATTTTAAGTTGAATTTT-TTATATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTGAA
* * * **
18826965 GGTTTGCCTTA-GAAAACGTGAAGCGAAAGCCATCAATTGGG
130 TGTTTGCC-TAGGGAAACGTGAAGCGAAAGCCATCGATTGAC
* * * * * **
18827006 AAAAAAAGTTCATTTATAGTCACTCATACCTTCAAAAGCCTTATTACTCGATTTAAATAATTTTA
1 AAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTA
* * ** *
18827071 TAATCTGATAATTGATTTTAAG-TGAAATTTTTTTATATTTTTTTATTAAAACGGATTATAATTG
66 TAATCTCATTATTGATTTTAAGTTG-AA-TTTTTTATA-TTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTG
* ** * *
18827135 AATGTTTACC-ATGGGAAACGTGAAGTTAAAGCCTTCCG-TTGGC
128 AATGTTTGCCTA-GGGAAACGTGAAGCGAAAGCCAT-CGATTGAC
** * * *
18827178 AAGAAAAGTTTATTTATAGTCACTCATACCTTCGAAAGTCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTA
1 AAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTA
* * *
18827243 TAATCTCATTATTGATTTTAAATTGAATGTTTTTTTGCCTTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTG
66 TAATCTCATTATTGATTTTAAGTTGAAT-TTTTTAT--ATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTG
* *
18827308 AATGTTTGCTTCA-GGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCGAT
128 AATGTTTGCCT-AGGGAAACGTGAAGCGAAAGCCATCGAT
18827347 CATAAGAAAG
Statistics
Matches: 1570, Mismatches: 241, Indels: 118
0.81 0.12 0.06
Matches are distributed among these distances:
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168 89 0.06
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173 54 0.03
175 1 0.00
ACGTcount: A:0.33, C:0.14, G:0.14, T:0.39
Consensus pattern (170 bp):
AAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTA
TAATCTCATTATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTATATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTGAAT
GTTTGCCTAGGGAAACGTGAAGCGAAAGCCATCGATTGAC
Found at i:18827753 original size:172 final size:170
Alignment explanation
Indices: 18827367--18827938 Score: 668
Period size: 172 Copynumber: 3.3 Consensus size: 170
18827357 GCTATTATTA
* * * * *
18827367 AATGTTTGTCTCGAGAAATGTGAAGCAAAAGTCATCCATTCACAAGAGAAGTCTATTTATAGTCA
1 AATGTTTGCCTCGAGAAATGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCA
* * * * *
18827432 CTT-ATGCCTTCAAAAGGCTTATTAC-GAACTTTAAATGGTTTTATAAACTAATAATTGATTTTG
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*
18827495 AGTTGAATTTTTTTACATTTTTTGTTAAAACAGATTATAATTG
128 AGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTG
* * * * * *
18827538 AATGTTTACTTTGGGAAATGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAATCT
1 AATGTTTGCCTCGAGAAATGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCA
* * *
18827603 TTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCAATCTAAATGATTTTATAATCTCAATACTGATTTTAAG
66 TTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCAATTTAAATGGTTTTATAATCT-AATATTGATTTTAAG
* *
18827668 TTG-ATTTTTTTAAAAATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATAG
130 TTGAATTTTTTT--ACATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTG
* * *
18827710 AATGTTTGCCTCAAGAAACGTGAAGCAAAAGCCAAT-GATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTC
1 AATGTTTGCCTCGAGAAATGTGAAGCAAAAGCC-ATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTC
* * * * * *
18827774 ACTCATGCCTTCGAAACCCTTATTGCTCACTTTCAATGGTTTTATAATCTGATTATTGATTTTAA
65 ATTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCAATTTAAATGGTTTTATAATCT-AATATTGATTTTAA
** *
18827839 ACTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAATAGATTATAATTG
129 GTTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTG
* **
18827881 AATGTTTGCCTTCGGGAAACATGAAGACGAAAA-CCATCCATTGACAAAGAAAAGTCCA
1 AATGTTTGCC-TCGAGAAATGTGAAG-C-AAAAGCCATCCATTGAC-AAGAAAAGTCCA
18827939 NNNNNNNNNN
Statistics
Matches: 339, Mismatches: 50, Indels: 21
0.83 0.12 0.05
Matches are distributed among these distances:
170 10 0.03
171 140 0.41
172 154 0.45
173 19 0.06
174 16 0.05
ACGTcount: A:0.35, C:0.14, G:0.14, T:0.36
Consensus pattern (170 bp):
AATGTTTGCCTCGAGAAATGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCA
TTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCAATTTAAATGGTTTTATAATCTAATATTGATTTTAAGT
TGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTG
Found at i:18828733 original size:171 final size:172
Alignment explanation
Indices: 18828268--18829844 Score: 1687
Period size: 171 Copynumber: 9.2 Consensus size: 172
18828258 NNNNNNAAAG
* * * * * *
18828268 ATGATGCGAAAGCCATCCATTTACAA-AACATGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCT
1 ATGAAGCGAAAGCCATCGATTGATAAGAA-AAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCC
* * * *
18828332 TTATTACTTGCTTTAAATGGTTTCATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTGACATTT
65 TTATTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTT
* * * *
18828397 TTGGTTAAAATAAATTATAATTGAA-TGTTTGCCTCGAAAAAC
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* *
18828439 ATGAAGCGAAAGCCATCGATTGATAAAAAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAT-CCTTCGAAAGG
1 ATGAAGCGAAAGCCATCGATTGAT-AAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTC-ATGCCTTCGAAAGC
* * *
18828503 CTTATTACTTGCTTTAAA-AGGTTTTATAGTCTCATAATTTG-TTTTAAGTTGACTTTTTTTACA
64 CTTATTACTCGCTTTAAATA-GTTTTATAATCTCATAA-TTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACA
* *
18828566 TTTTTGGTTAAAACATATTATAATT-AATTGTTTACCTTGATAAAC
127 TTTTTGGTTAAAACAAATTATAATTGAATTGTTTACCTTGAGAAAC
* *
18828611 ATGAAGCGAAAGCCATCGATTGATAAGAAAACTCCATTTATAGTCACTCATGCC-TCTGAAAGAC
1 ATGAAGCGAAAGCCATCGATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTC-GAAAGCC
*
18828675 TTATTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACCTTT
65 TTATTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTT
** * *
18828740 TTGGTTAAAACGGATTGTAATTGAATT-TTTACC-TCAGCAAAC
130 TTGGTTAAAACAAATTATAATTGAATTGTTTACCTTGAG-AAAC
* * * ** **
18828782 ATGAAGCGAAACACCATCCATTGAGAAGAAAAGTTTATTTATAGTCACTCATATCTTCGAAAGCC
1 ATGAAGCGAAA-GCCATCGATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCC
* * * * * * * * *
18828847 TTATTGCTCACTTTGAATGGTTTTATAATTTGATAATTGATTTTACGTGGAATTTTTTTAGATTT
65 TTATTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTT
* * *
18828912 TTGGTTAAAACAGATTATAATT-AAATGTTTACCTCGAGAAAC
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* ** * * * *
18828954 GTGAAGTTAAAGCCCTCCG-TTGGTAAGAAAAGTCCATTTATAGTCTCTCATACCTTCGAAAGCC
1 ATGAAGCGAAAGCCAT-CGATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCC
* * * *
18829018 TTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCATTATTGATTTTAAGCTGAA-TTTTTTACA-TT
65 TTATTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTT
*
18829081 TTGGTTAAAACAAATTATAATTGAA-TGTTTGCCTTG-GTAAAC
130 TTGGTTAAAACAAATTATAATTGAATTGTTTACCTTGAG-AAAC
* * * * *
18829123 GTGAAGCGAAAGTCATCCATTGACAAGCAAAG-CCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCC
1 ATGAAGCGAAAGCCATCGATTGATAAGAAAAGTCC-ATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCC
* * * * * * * *
18829187 TTATTACTTGCTTTAAATGGTTCTATAATCTCATTATTTATTTTAAGTTAAATTTTCTTAGATTT
65 TTATTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTT
* * *
18829252 TTGGTTAAAACATATTATAATTGAA-TGTTTGCCTCGAGAAAC
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* * * * *
18829294 GTGAAGCAAAAGCCATTGATTGATAAGCAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCT
1 ATGAAGCGAAAGCCATCGATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCT
* * * *
18829359 TATTACTTGCTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTTATTTTAAGTTGAATTTTTTAACTTTTT
66 TATTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTT
* * **
18829424 TGGTTAAAACAAATGATAGTT-AGATT-TTTGTCTTGAGAAAC
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* * * * * * *
18829465 ATGAAGCAAAAGCCATCCATTGAGAAGAAAAGTCCATTTGTAGTCACTAATTCCTTCAAAAAG-C
1 ATGAAGCGAAAGCCATCGATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTC-GAAAGCC
* * * *
18829529 TTATTACTCGCATTAAA-AGGTTTTATAGTCTCATAATTTATTTTAAGTTGATTTTTTTTACATT
65 TTATTACTCGCTTTAAATA-GTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATT
*
18829593 TTTGGTTAAAACAGATTATAATTG-ATTG-TTACCTTGAGAAAC
129 TTTGGTTAAAACAAATTATAATTGAATTGTTTACCTTGAGAAAC
* ** * ** *
18829635 ATGAAGCGAAAGCTATAC-ATTGGCAAGAAAAGTTCATTTATACCCACTCATGCCTTTGAAAGCC
1 ATGAAGCGAAAGCCAT-CGATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCC
* * **
18829699 TTATTACTAGCTTTAAAT-GTTTTTATAATCTTATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTGTATT
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*** ** * ** *
18829763 TTCATTTAAGAA-AGGTTATAATT-AAATGTTTGTCTCGAGAAAC
129 TTTGGTTAA-AACAAATTATAATTGAATTGTTTACCTTGAGAAAC
* * * * *
18829806 ATGAAGTGAAAGCCATCCATTAATAATAAAAGTCTATTT
1 ATGAAGCGAAAGCCATCGATTGATAAGAAAAGTCCATTT
18829845 GCCTTAGCAA
Statistics
Matches: 1194, Mismatches: 173, Indels: 78
0.83 0.12 0.05
Matches are distributed among these distances:
168 4 0.00
169 136 0.11
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171 590 0.49
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173 11 0.01
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Consensus pattern (172 bp):
ATGAAGCGAAAGCCATCGATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCT
TATTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTT
TGGTTAAAACAAATTATAATTGAATTGTTTACCTTGAGAAAC
Found at i:18828905 original size:343 final size:342
Alignment explanation
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18828263 NAAAGATGAT
* * * * *
18828273 GCGAAAGCCATCCATTTACAA-AACATGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCTTTATT
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* * *
18828337 ACTTGCTTTAAATGGTTTCATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTGACATTTTTGGT
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* * * * * * *
18828402 TAAAATAAATTATAATTGAATGTTTGCCTC-GAAAAACATGAAGCGAAAGCCATCGATTGATAAA
130 TAAAACAGATTATAATTGAATTTTTACCTCAG-GAAACATGAAGCGAAAGCCATCCATTGA-GAA
* * ** *
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193 GAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATA-CCTTCGAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTAT
* * * *
18828530 AGTCTCATAATTTG-TTTTAAGTTGACTTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTAAT
257 AATCTCATAA-TTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTAAA
* * *
18828594 TGTTTACCTTGATAAACATGAA
321 TGTTTACCTCGAGAAACGTGAA
* *
18828616 GCGAAAGCCATCGATTGATAAGAAAACTCCATTTATAGTCACTCATGCC-TCTGAAAGACTTATT
1 GCGAAAGCCATCGATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTC-GAAAGCCTTATT
* * * *
18828680 ACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACCTTTTTGGT
65 ACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATTATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGT
* * * *
18828745 TAAAACGGATTGTAATTGAATTTTTACCTCAGCAAACATGAAGCGAAACACCATCCATTGAGAAG
130 TAAAACAGATTATAATTGAATTTTTACCTCAGGAAACATGAAGCGAAA-GCCATCCATTGAGAAG
** * * *
18828810 AAAAGTTTATTTATAGTCACTCATATCTTCGAAAGCCTTATTGCTCACTTTGAATGGTTTTATAA
194 AAAAGTCCATTTATAGTCACTCATACCTTCGAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAA
* * * * *
18828875 TTTGATAATTGATTTTACGTGGAATTTTTTTAGATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTAAATGT
259 TCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTAAATGT
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324 TTACCTCGAGAAACGTGAA
** * * * *
18828959 GTTAAAGCCCTCCG-TTGGTAAGAAAAGTCCATTTATAGTCTCTCATACCTTCGAAAGCCTTATT
1 GCGAAAGCCAT-CGATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATT
** *
18829023 ACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCATTATTGATTTTAAGCTGAA-TTTTTTACA-TTTTGGT
65 ACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATTATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGT
* * * * * * *
18829086 TAAAACAAATTATAATTGAATGTTTGCCT-TGGTAAACGTGAAGCGAAAGTCATCCATTGACAAG
130 TAAAACAGATTATAATTGAATTTTTACCTCAGG-AAACATGAAGCGAAAGCCATCCATTGAGAAG
* * ** *
18829150 CAAAG-CCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTCTATA
194 AAAAGTCC-ATTTATAGTCACTCATACCTTCGAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATA
* * * * * * *
18829214 ATCTCATTATTTATTTTAAGTTAAATTTTCTTAGATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATG
258 ATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTAAATG
*
18829279 TTTGCCTCGAGAAACGTGAA
323 TTTACCTCGAGAAACGTGAA
* * * *
18829299 GCAAAAGCCATTGATTGATAAGCAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTATTA
1 GCGAAAGCCATCGATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTA
* * * * *
18829364 CTTGCTTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTTATTTTAAGTTGAATTTTTTAACTTTTTTGGTT
66 CTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATTATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGTT
* * * ** * *
18829429 AAAACAAATGATAGTT-AGATTTTTGTCT-TGAGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGAGAAG
131 AAAACAGATTATAATTGA-ATTTTTACCTCAG-GAAACATGAAGCGAAAGCCATCCATTGAGAAG
* * * * * * *
18829492 AAAAGTCCATTTGTAGTCACTAATTCCTTCAAAAAG-CTTATTACTCGCATTAAAAGGTTTTATA
194 AAAAGTCCATTTATAGTCACTCATACCTTC-GAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATA
* * * * *
18829556 GTCTCATAATTTATTTTAAGTTGATTTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTGATTG
258 ATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTAAATG
* *
18829621 -TTACCTTGAGAAACATGAA
323 TTTACCTCGAGAAACGTGAA
* ** * ** *
18829640 GCGAAAGCTATAC-ATTGGCAAGAAAAGTTCATTTATACCCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTATT
1 GCGAAAGCCAT-CGATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATT
* * * * ** ***
18829704 ACTAGCTTTAAATGTTTTTATAATCTTATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTGTATTTTCATT
65 ACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATTATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGT
* * * ** * * *
18829769 TAAGAA-AGGTTATAATTAAATGTTTGTCTC-GAGAAACATGAAGTGAAAGCCATCCATTAATAA
130 TAA-AACAGATTATAATTGAATTTTTACCTCAG-GAAACATGAAGCGAAAGCCATCCATTGAGAA
* * *** * * * ** ** *
18829832 TAAAAGTCTATTT-GCCTTA-GCAAACGCGAAGCGAAAGCCATTGATTGA-T-A--AGAAA-AGT
193 GAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATAC-C--TTCGAAAGCC-TT-ATT-ACTCACTTTAAATGGT
* * * * ** * * **
18829890 TCATT-TATTGTCACTCA-TGCCTTCAAAAGCGTT--ATTACTGGCTTTAAATAGATTTATAATC
252 T--TTATAATCTCA-TAATTG-ATT-TTAA--GTTGAATT--T---TTT---TACATTTTTGGT-
** * * ** ** ***** *
18829951 TAATAATTGATTTTAAGTTGAAT-TTT-TTTATATTTTTTGTTAAA
301 TAA-AACAGATTATAA-TTAAATGTTTACCTCGA-GAAACG-TGAA
* * ** * * ** ** ** * * * *
18829995 ACAAAATGTAATTGAATGTTTACCTCGGGAAACA-TGAAGCTAAAG-CTCTC-CG-TTTACAAGA
1 GCGAAA-GCCATCG-A--TTGA--T-AAGAAA-AGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTT-C--G-
*
18830056 AAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCCAAA-GCGTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAA
54 AAAG-CC--TTAT--T-ACT--TG-CTT-TAAATG-GTT-TTA-------T-AA------T----
* * *
18830120 TCTCATTATTGATTTTAAGCTGATTTTTTTTACATTTTTTGTTAAAACAGATTATAATTGAATTT
89 -CTCATTATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTGAATTT
* * * * *
18830185 TTACCTC-GTGAAACATGGAGCGAAATACTATCCATTGAGAAGAAATGTTCATTTATAGTCACTC
153 TTACCTCAG-GAAACATGAAGCGAAA-GCCATCCATTGAGAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTC
* * * * * *
18830249 ATGCCTTCGAAAGGCTTATTACTCATTTTAAATGATTTTATAATATGATAATTGATTTTAAGTTG
216 ATACCTTCGAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
** * ** * * *
18830314 AATTTTTTTGTATTTTTAGTTAAAACAGATTGCAATTGAATGTTTACCT-TAGGAAACGTGAT
281 AATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTAAATGTTTACCTCGA-GAAACGTGAA
* * * * * *
18830376 GCTAAAGCCCTCCGTTTGCA-AA-AAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCTTTCCAAAGCCTTAT
1 GCGAAAGCCAT-CGATTG-ATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTAT
* *
18830439 TACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCT-AGTTATTGATTTTAAGTTGAATTGTTTTACATTTTTG
64 TACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCA-TTATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTG
* * * * *
18830503 ATTAAAACACATTATAATTGAATATTTGA-CTCAAGAAACATGAAGCGAAAGCCATCCATTAAG-
128 GTTAAAACAGATTATAATTGAAT-TTTTACCTCAGGAAACATGAAGCGAAAGCCATCCATTGAGA
* *
18830566 AGAAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTG
192 AG-AAAAGTCCATTTATAGTCACTCATACCTTCGAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTA
* * * * * *
18830631 TAATCTCATTACTGATTTTAGGTTGAGTTTTTTTACATTTTCGG-TAAAGAAAGATTATAATTAA
256 TAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAA-ACAGATTATAATTAA
** * * *
18830695 ATGTTTGTCTCAAAAAATGTGAA
320 ATGTTTACCTCGAGAAACGTGAA
* * * * * * *
18830718 GCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGCCCTTTTATAGGCACTGATGCCTTCCAAAGCCTTATTA
1 GCGAAAGCCATCGATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTA
* * *
18830783 CTTGCTTTAAATTGTTTTATAATCTCATTATTGATTTTAAGTTGAATTCTTTTACATTTTTGATT
66 CTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATTATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGTT
* * * *
18830848 AAAACAGATTATTATTGAATTTTTACCAT-GGGAAACGTGAAGTGAAATGCCATCCATTGAGAAG
131 AAAACAGATTATAATTGAATTTTTACC-TCAGGAAACATGAAGCGAAA-GCCATCCATTGAGAAG
* * * *
18830912 AAAAGTTCTTTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAA
194 AAAAGTCCATTTATAGTCACTCATACCTTCGAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAA
* * * * * *
18830977 TCTCATTACTGATTTTAGGTTGAATTCTTTTACATTTTCGG-TAAAGAAAGATTATAATTAAATG
259 TCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAA-ACAGATTATAATTAAATG
* *
18831041 TTTACCTCAAAAAACGTGAA
323 TTTACCTCGAGAAACGTGAA
* * * * * *
18831061 GCGAAAGCCATCCG-TTGACAA-TAAAG-CCTTTTTATAGGCACTAATGCTTTCGAAAGCCTTAT
1 GCGAAAGCCAT-CGATTGATAAGAAAAGTCC-ATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTAT
* * *
18831123 TACTTGCTTTAAATGCTTTTATAATCTCATTATTGATTTTAAG-TGAATTCTTTTACTTTTTTGG
64 TACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATTATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTT-G
* * *
18831187 GTTAAAACAGATTATTATTGAATTTTTACCAT-GGGAAACGTGAAGTC-AAATGCCATCCATTGA
128 GTTAAAACAGATTATAATTGAATTTTTACC-TCAGGAAACATGAAG-CGAAA-GCCATCCATTGA
* * * ** *
18831250 GAAAAAAAGTTCTTTTATAGTCACTCATTTCTTCGGAAGCCTTATTACTCGA-TTTAAATGGTTT
190 GAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATACCTTCGAAAGCCTTATTACTC-ACTTTAAATGGTTT
* * *
18831314 TATAATCTGATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACA-TTTCGGCTAAGAA-AGATTATAATT
254 TATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAA-AACAGATTATAATT
* *
18831377 AAATGTTTGCCTCGAGAAAAGTGAA
318 AAATGTTTACCTCGAGAAACGTGAA
* * * * * * *
18831402 GCAAAATCCATCCATTGATAACAAATG-GCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTATTA
1 GCGAAAGCCATCGATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTA
* * * * * *
18831466 CATGCTTTAAATTGTTTCATGATCTCATTATTGATTTTAAGTTAAATTATTTTT-CATTTTTTGT
66 CTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATTATTGATTTTAAGTTGAATT-TTTTTACATTTTTGGT
* * * * * * * * *
18831530 TAAAACATATTATAATTGAATGTTTGCC-CTGGGAAACGTGAAGCAAAAGCCAAT-GATTGACAG
130 TAAAACAGATTATAATTGAATTTTTACCTC-AGGAAACATGAAGCGAAAGCC-ATCCATTGAGAA
* * * *
18831593 GAAAAGTCCATTTACAATCACTCATACCTTCGAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATTGTTCTATA
193 GAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATACCTTCGAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATA
* * * *** *
18831658 ATCTGATAATT--TATT---TTGACTTTTTTTCACATTTTCAATTATGAA-AGATTATAATTAAA
258 ATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTT-ACATTTTTGGTTA-AAACAGATTATAATTAAA
* * *
18831717 TGTTCACC-CAAGGAAATGTGAA
321 TGTTTACCTCGA-GAAACGTGAA
* * * * * * *
18831739 GCGAAAGCCAACCATTGACAACAAAAGTGCATTTGTAGTCACTTATGCCTTCGAAAGCCTTATTA
1 GCGAAAGCCATCGATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTA
* * * * * **
18831804 CTCGCTTCAAATGGTTTTGTAATCTCAATATTGATTTTAA-TTGAATATTTTTACACTTTTTCAT
66 CTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATTATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACA-TTTTTGGT
* *
18831868 TAAAATAGATTGTAATT
130 TAAAACAGATTATAATT
18831885 NNNNNNNNNN
Statistics
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ACGTcount: A:0.33, C:0.14, G:0.14, T:0.39
Consensus pattern (342 bp):
GCGAAAGCCATCGATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTA
CTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATTATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGTT
AAAACAGATTATAATTGAATTTTTACCTCAGGAAACATGAAGCGAAAGCCATCCATTGAGAAGAA
AAGTCCATTTATAGTCACTCATACCTTCGAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATC
TCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTAAATGTTT
ACCTCGAGAAACGTGAA
Found at i:18830061 original size:222 final size:222
Alignment explanation
Indices: 18829659--18830066 Score: 520
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18829649 ATACATTGGC
** *
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* * ***
18829724 TAATCTTATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTGTATTTTCATTTAAGAAAGGTTATAATTAAA
66 TAATCTAATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTATATTTTCATTTAAGAAAAAATATAATTAAA
** * * *
18829789 TGTTTGTCTCGAGAAACATGAAGTGAAAGCCATCCATTAATAATAAAAGTCTATTTGCCTTAGCA
131 TGTTTACCTCGAGAAACATGAAGTGAAAGCCATCCATTAACAAGAAAAGTCCATTTGCCTTAGCA
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196 AACGCGAAGCGAAAGCCATTGATTGAT
*** * *
18829881 AAGAAAAGTTCATTTATTGTCACTCATGCCTTCAAAAGCGTTATTACTGGCTTTAAATAG-ATTT
1 AAGAAAAGTTCATTTATACCCACTCATGCCTTCAAAAGCCTTATTACTAGCTTTAAAT-GTATTT
* *
18829945 ATAATCTAATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTATATTTT-TTGTTAA-AACAAAATGTAATT
65 ATAATCTAATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTATATTTTCAT-TTAAGAA-AAAATATAATT
* * * *
18830008 GAATGTTTACCTCGGGAAACATGAAGCT-AAAGCTC-TCCGTTTACAAGAAAAGTCCATTT
128 AAATGTTTACCTCGAGAAACATGAAG-TGAAAGC-CATCCATTAACAAGAAAAGTCCATTT
18830067 ATAGTCACTC
Statistics
Matches: 157, Mismatches: 24, Indels: 10
0.82 0.13 0.05
Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.35, C:0.13, G:0.14, T:0.38
Consensus pattern (222 bp):
AAGAAAAGTTCATTTATACCCACTCATGCCTTCAAAAGCCTTATTACTAGCTTTAAATGTATTTA
TAATCTAATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTATATTTTCATTTAAGAAAAAATATAATTAAA
TGTTTACCTCGAGAAACATGAAGTGAAAGCCATCCATTAACAAGAAAAGTCCATTTGCCTTAGCA
AACGCGAAGCGAAAGCCATTGATTGAT
Found at i:18830166 original size:171 final size:171
Alignment explanation
Indices: 18829853--18831884 Score: 1995
Period size: 171 Copynumber: 11.9 Consensus size: 171
18829843 TTGCCTTAGC
* ** * * * *
18829853 AAACGCGAAGCGAAAGCCATTGATTGATAAGAAAAGTTCATTTATTGTCACTCATGCCTTCAAAA
1 AAACGTGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAA
* * * * * * *
18829918 GCGTTATTACTGGCTTTAAATAGATTTATAATCTAATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTATA
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* * *
18829983 TTTTTTGTTAAAACAAAATGTAATTGAATGTTTACCTCGGG
131 TTTTTTGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTTTACCTCGGG
* * * * *
18830024 AAACATGAAGCTAAAGCTC-TCCGTTTACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCCAA
1 AAACGTGAAGCGAAAGC-CATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAA
* * * *
18830088 AGCGTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATTATTGATTTTAAGCTGATTTTTTTTAC
65 AGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATTATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTAC
* *
18830153 ATTTTTTGTTAAAACAGATTATAATTGAATTTTTACCTCGTG
130 ATTTTTTGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTTTACCTCGGG
* * * * * * *
18830195 AAACATGGAGCGAAATACTATCCATTGAGAAGAAATGTTCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAA
1 AAACGTGAAGCGAAA-GCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAA
* ** * * * * **
18830260 AGGCTTATTACTCATTTTAAATGATTTTATAATATGATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTGT
65 AGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATTATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTAC
* ** **
18830325 ATTTTTAGTTAAAACAGATTGCAATTGAATGTTTACCTTAGG
130 ATTTTTTGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTTTACCTCGGG
* * * * * * * *
18830367 AAACGTGATGCTAAAGCCCTCCGTTTG-CAAAAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCTTTCCAA
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*
18830431 AGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCT-AGTTATTGATTTTAAGTTGAATTGTTTTA
65 AGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCA-TTATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTA
* * **
18830495 CA-TTTTTGATTAAAACACATTATAATTGAATATTTGA-CTCAAG
129 CATTTTTTG-TTAAAACAGATTATAATTGAATGTTT-ACCTCGGG
*
18830538 AAACATGAAGCGAAAGCCATCCATT-A-AGAGAAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGA
1 AAACGTGAAGCGAAAGCCATCCATTGACA-AG-AAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGA
* * * * *
18830601 AAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTGTAATCTCATTACTGATTTTAGGTTGAGTTTTTTTA
64 AAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATTATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTA
* * * * ** ***
18830666 CA-TTTTCGGTAAAGAAAGATTATAATTAAATGTTTGTCTCAAA
129 CATTTTTTGTTAAA-ACAGATTATAATTGAATGTTTACCTCGGG
* * * * * *
18830709 AAATGTGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGCCCTTTTATAGGCACTGATGCCTTCCAAA
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* * *
18830774 GCCTTATTACTTGCTTTAAATTGTTTTATAATCTCATTATTGATTTTAAGTTGAATTCTTTTACA
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* *
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131 TTTTTTG-TTAAAACAGATTATAATTGAATGTTTACC-TCGGG
* * * *
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*
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129 TCCATTGA-CAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATG
18841228 GCTTGGAAGG
Statistics
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ACGTcount: A:0.33, C:0.13, G:0.15, T:0.39
Consensus pattern (171 bp):
AAAGCCTTATTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTTTAAATGATTTTAAATTAAATTTTTTT
ACATTTTTGGTTAAAATAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGGAAAACGTGAAGCGAAAGCCATC
CATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCA
Found at i:18841256 original size:42 final size:42
Alignment explanation
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Period size: 42 Copynumber: 2.0 Consensus size: 42
18841187 GCCAACCATT
18841197 AGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGGCTTGGAAGGC
1 AGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGGCTTGGAAGGC
18841239 AGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGGCTTGGAAGGC
1 AGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGGCTTGGAAGGC
18841281 TTTTTTACTC
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (42 bp):
AGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGGCTTGGAAGGC
Found at i:18841471 original size:170 final size:170
Alignment explanation
Indices: 18841241--18841821 Score: 493
Period size: 171 Copynumber: 3.4 Consensus size: 170
18841231 TGGAAGGCAG
* * * * * *
18841241 CAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGGCTTGGAAGGCTTTTTTACTCACTTTAAGTGGTTTT
1 CAAG-AAAGTTCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCACTTTAAGTGGTTTT
* * *
18841306 AGAACTTTTTAGATG-TATTTGATTTGAATTTTTTTTGCATTTGTGGTTAAAAAAGATCATAATT
65 AGAACTTTTTAAATGAT-TTTAATTTGAATTTTTTTTGAATTTGTGGTTAAAAAAGATCATAATT
* * *
18841370 T-ATGTTTTCATCGAGAAACGTAAAGCAAAAACCTTCTGTTGA
129 TGATGTTTGCAT-GAGAAACGTAAAGCAAAAACATTCTATTGA
* * * * * *
18841412 GAAGCAAAGTTTAGTTATAGTCACTCATGCCTT-TAAAGCCTTATTACTCACTTTAAGTGGATAT
1 CAAG-AAAGTTCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCACTTTAAGTGGTTTT
* * * * * * * **
18841476 ATAACTTTTTAAATGATTTTAAATTT-AATTGTTTTTAAATTTTTAGTTCAAACAGATTGTAATT
65 AGAACTTTTTAAATGATTTT-AATTTGAATTTTTTTTGAATTTGTGGTTAAAAAAGATCATAATT
* * * * * *
18841540 TGATGTTTGCATTAGAAAACATGAAGCAAAAGCAATCTCTTGA
129 TGATGTTTGCATGAG-AAACGTAAAGCAAAAACATTCTATTGA
* * * **
18841583 CAAGAAAAGTCCATTTATCA-TCACTCATGCCTTC-ATATGCCTTGTTACTTGCTTTAAGT-GTA
1 CAAG-AAAGTTCATTTAT-AGTCACTCATGCCTTCGA-AAGCCTTATTACTCACTTTAAGTGGT-
* * * * * *
18841645 TTTAAAACTTTTTAAATGATTTTAAATAGAA-ATTTTTTGTA-TTGTTGGTTAAAATAGATCATA
62 TTTAGAACTTTTTAAATGATTTTAATTTGAATTTTTTTTGAATTTG-TGGTTAAAAAAGATCATA
*
18841708 ATTTGAATGTTTGCATTGAGAAACGTGAAA-CAAAAACAATTC-ATTAA
126 ATTTG-ATGTTTGCA-TGAGAAACGT-AAAGCAAAAAC-ATTCTATTGA
* * *
18841755 CAAGAAAGGTTCATTTACAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTGC-CTACTTTAAATGGTTT
1 CAAGAAA-GTTCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTC-ACTTTAAGTGGTTT
18841819 TAG
64 TAG
18841822 GATCTCACTA
Statistics
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0.75 0.17 0.09
Matches are distributed among these distances:
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173 11 0.03
ACGTcount: A:0.33, C:0.13, G:0.15, T:0.39
Consensus pattern (170 bp):
CAAGAAAGTTCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCACTTTAAGTGGTTTTA
GAACTTTTTAAATGATTTTAATTTGAATTTTTTTTGAATTTGTGGTTAAAAAAGATCATAATTTG
ATGTTTGCATGAGAAACGTAAAGCAAAAACATTCTATTGA
Found at i:18841666 original size:172 final size:171
Alignment explanation
Indices: 18841241--18841800 Score: 447
Period size: 172 Copynumber: 3.3 Consensus size: 171
18841231 TGGAAGGCAG
* * * * * * * *
18841241 CAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGGCTTGGAAGGCTTTTTTACTCACTTTAAGTGGTTTT
1 CAAGAAAAGTCCATTTACAGTCACTCATGCCTT-CAAAGCCTTATTACTCACTTTAAGTGGATAT
* * * * * * ** * *
18841306 AGAACTTTTTAGATG-TATTTGATTTGAATTTTTTTTGCATT-TGTGGTTAAAAAAGATCATAAT
65 AAAACTTTTTAAATGAT-TTTAAATAGAA-ATTTTTTAAATTGT-TAGTTAAAACAGATCATAAT
* * * * * *
18841369 TT--ATGTTTTCATCGAGAAACGT-AAAGCAAAAAC-CTTCTGTTGA
127 TTGAATGTTTGCATTGAGAAACATGAAA-CAAAAACAATTC-ATTAA
* * ** * * *
18841412 GAAGCAAAGTTTAGTTATAGTCACTCATGCCTTTAAAGCCTTATTACTCACTTTAAGTGGATATA
1 CAAGAAAAGTCCATTTACAGTCACTCATGCCTTCAAAGCCTTATTACTCACTTTAAGTGGATATA
* ** * * * **
18841477 TAACTTTTTAAATGATTTTAAATTTAATTGTTTTTAAATTTTTAGTTCAAACAGATTGTAATTTG
66 AAACTTTTTAAATGATTTTAAATAGAAAT-TTTTTAAATTGTTAGTTAAAACAGATCATAATTTG
* * *
18841542 -ATGTTTGCATT-AGAAAACATGAAGCAAAAGCAATCTC-TTGA
130 AATGTTTGCATTGAG-AAACATGAAACAAAAACAAT-TCATTAA
* * ** * *
18841583 CAAGAAAAGTCCATTTATCA-TCACTCATGCCTTCATATGCCTTGTTACTTGCTTTAAGTGTATT
1 CAAGAAAAGTCCATTTA-CAGTCACTCATGCCTTCA-AAGCCTTATTACTCACTTTAAGTGGATA
** * *
18841647 TAAAACTTTTTAAATGATTTTAAATAGAAATTTTTTGTATTGTTGGTTAAAATAGATCATAATTT
64 TAAAACTTTTTAAATGATTTTAAATAGAAATTTTTTAAATTGTTAGTTAAAACAGATCATAATTT
*
18841712 GAATGTTTGCATTGAGAAACGTGAAACAAAAACAATTCATTAA
129 GAATGTTTGCATTGAGAAACATGAAACAAAAACAATTCATTAA
* *
18841755 CAAGAAAGGTTCATTTACAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATT
1 CAAGAAAAGTCCATTTACAGTCACTCATGCCTTC-AAAGCCTTATT
18841801 GCCTACTTTA
Statistics
Matches: 311, Mismatches: 63, Indels: 29
0.77 0.16 0.07
Matches are distributed among these distances:
169 2 0.01
170 73 0.23
171 110 0.35
172 121 0.39
173 5 0.02
ACGTcount: A:0.34, C:0.13, G:0.14, T:0.39
Consensus pattern (171 bp):
CAAGAAAAGTCCATTTACAGTCACTCATGCCTTCAAAGCCTTATTACTCACTTTAAGTGGATATA
AAACTTTTTAAATGATTTTAAATAGAAATTTTTTAAATTGTTAGTTAAAACAGATCATAATTTGA
ATGTTTGCATTGAGAAACATGAAACAAAAACAATTCATTAA
Found at i:18841761 original size:556 final size:556
Alignment explanation
Indices: 18840686--18841783 Score: 1289
Period size: 556 Copynumber: 2.0 Consensus size: 556
18840676 TCCGTTGATG
* * ** *
18840686 AGAAAAGTCTAGTTATAGTCACTCATGCCTTCGTAAGCCTTATTACTTGCTTTAAGTGGATTTAT
1 AGAAAAGTCCAGTTATAGTCACTCATGCCTTCGGAAGCCTTATTACTCACTTTAAGTGGATTTAG
* * *
18840751 AATTTTTTAAATGATTTTAGATTCAATTGTTTTTAAATTTTTGGTTAAAAAAGATCGTAATTTGA
66 AACTTTTTAAATGATTTTAGATTCAATTGTTTTTAAATTTGTGGTTAAAAAAGATCATAATTTGA
* * *
18840816 TGTTTGCATCAAAAAATATAAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCAGTTATCGTAACT
131 TGTTTGCATCAAAAAACATAAAGCAAAAACCATCCATTGACAAGAAAAGTCCAGTTATAGTAACT
* * ** * *
18840881 CATGCCTTCATATGCCTTGTTACTTGCTTTAAGTGGATTTATTACTTTTTAAATGATTTTAAAAT
196 CATGCCTTCATAAGCCTTATTACTCACTTTAAGTGGATATATAACTTTTTAAATGATTTTAAAAT
* * * * *
18840946 GATTTTTTTTACATTTTTGGTTAAAATAGATCATAATTTGATGTTTCCATTTAGAAACATGAAGT
261 AATTGTTTTTAAATTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTCCATTTAGAAACATGAAGT
* ** * * * * *
18841011 GAAAACCTTCTTTTGATAAGAAAGGTCTATTTATAGTCCCTCATACATTCAAAAGCCTTATTACT
326 CAAAACAATCTCTTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATACATTCAAAAGCCTTATTACT
* * * * *
18841076 CGCTTTAAGTGGGTTTATAACTTTTGAAATGATTTCAAATTGAATTTTTTTTACATTTTTGGTTA
391 CGCTTTAAGTGGATTTAAAACTTTTGAAATGATTTCAAATAGAATTTTTTGTA-ATTGTTGGTTA
* ** *
18841141 AAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCGAGAAACGTGAAGCGAAAGCCAACCATTAGCAAGAAA
455 AAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCGAGAAACGTGAAACGAAAAACAACCATTAACAAGAAA
*
18841206 AGTCCATTTATAGTCACTCATGGCTTGGAAGGCAGCA
520 AGTCCATTTACAGTCACTCATGGCTTGGAAGGCAGCA
* * * * *
18841243 AGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGGCTT-GGAAGGCTTTTTTACTCACTTTAAGTGGTTTTA
1 AGAAAAGTCCAGTTATAGTCACTCATGCCTTCGGAA-GCCTTATTACTCACTTTAAGTGGATTTA
* * * **
18841307 GAACTTTTTAGATG-TATTT-GATTTGAATTTTTTTTGCATTTGTGGTTAAAAAAGATCATAATT
65 GAACTTTTTAAATGAT-TTTAGA-TTCAATTGTTTTTAAATTTGTGGTTAAAAAAGATCATAATT
* * * * * ** * * ** *
18841370 T-ATGTTTTCATCGAGAAACGTAAAGCAAAAACCTTCTGTTGAGAAGCAAAGTTTAGTTATAGTC
128 TGATGTTTGCATCAAAAAACATAAAGCAAAAACCATCCATTGACAAGAAAAGTCCAGTTATAGTA
*
18841434 ACTCATGCCTTTA-AAGCCTTATTACTCACTTTAAGTGGATATATAACTTTTTAAATGATTTTAA
193 ACTCATGCCTTCATAAGCCTTATTACTCACTTTAAGTGGATATATAACTTTTTAAATGATTTTAA
* * ** *
18841498 ATTTAATTGTTTTTAAATTTTTAGTTCAAACAGATTGTAATTTGATGTTTGCA-TTAGAAAACAT
258 A-ATAATTGTTTTTAAATTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTCCATTTAG-AAACAT
* * * *
18841562 GAAG-CAAAAGCAATCTCTTGACAAGAAAAGTCCATTTATCA-TCACTCATGCCTTCATATGCCT
321 GAAGTCAAAA-CAATCTCTTGACAAGAAAAGTCCATTTAT-AGTCACTCATACATTCAAAAGCCT
* * * * *
18841625 TGTTACTTGCTTTAAGTGTATTTAAAACTTTTTAAATGATTTTAAATAGAAATTTTTTGT-ATTG
384 TATTACTCGCTTTAAGTGGATTTAAAACTTTTGAAATGATTTCAAATAG-AATTTTTTGTAATTG
* * *
18841689 TTGGTTAAAATAGATCATAATTTGAATGTTTGCATTGAGAAACGTGAAAC-AAAAACAATTCATT
448 TTGGTTAAAACAGATCATAATTTG-ATGTTTGCATCGAGAAACGTGAAACGAAAAACAA-CCATT
* *
18841753 AACAAGAAAGGTTCATTTACAGTCACTCATG
511 AACAAGAAAAGTCCATTTACAGTCACTCATG
18841784 CCTTCGAAAG
Statistics
Matches: 449, Mismatches: 82, Indels: 21
0.81 0.15 0.04
Matches are distributed among these distances:
555 86 0.19
556 252 0.56
557 111 0.25
ACGTcount: A:0.33, C:0.13, G:0.15, T:0.39
Consensus pattern (556 bp):
AGAAAAGTCCAGTTATAGTCACTCATGCCTTCGGAAGCCTTATTACTCACTTTAAGTGGATTTAG
AACTTTTTAAATGATTTTAGATTCAATTGTTTTTAAATTTGTGGTTAAAAAAGATCATAATTTGA
TGTTTGCATCAAAAAACATAAAGCAAAAACCATCCATTGACAAGAAAAGTCCAGTTATAGTAACT
CATGCCTTCATAAGCCTTATTACTCACTTTAAGTGGATATATAACTTTTTAAATGATTTTAAAAT
AATTGTTTTTAAATTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTCCATTTAGAAACATGAAGT
CAAAACAATCTCTTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATACATTCAAAAGCCTTATTACT
CGCTTTAAGTGGATTTAAAACTTTTGAAATGATTTCAAATAGAATTTTTTGTAATTGTTGGTTAA
AACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCGAGAAACGTGAAACGAAAAACAACCATTAACAAGAAAA
GTCCATTTACAGTCACTCATGGCTTGGAAGGCAGCA
Found at i:18841933 original size:727 final size:726
Alignment explanation
Indices: 18840513--18841954 Score: 1780
Period size: 727 Copynumber: 2.0 Consensus size: 726
18840503 CAACCATTAA
18840513 CAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCAATGGCTTGGAAAGCCTTTTTTACTCACTTTAAGTGGTTT
1 CAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCAATGGCTTGGAAAGCCTTTTTTACTCACTTTAAGTGGTTT
* *
18840578 GAAAACTTTTTAAATGATTTTGAATTGATATTTTTAACATTTTTGGTTAAGAAAGATCATAATTT
66 GAAAACTTTTTAAATGATTTTGAATTGATATTTTTAACATTTGTGGTTAAAAAAGATCATAATTT
* * * *
18840643 ATGTTTGCATTAGGAAATGTGAAGCAAAAATCTTCCGTTGATGAGAAAAGTCTAGTTATAGTCAC
131 ATGTTTGCATGAGGAAACGTAAAGCAAAAACCTTCCGTTGATGAGAAAAGTCTAGTTATAGTCAC
** * * *
18840708 TCATGCCTTCGTAAGCCTTATTACTTGCTTTAAGTGGATTTATAATTTTTTAAATGATTTTAGAT
196 TCATGCCTTC-TAAGCCTTATTACTCACTTTAAGTGGATATATAACTTTTTAAATGATTTTAAAT
* *
18840773 TCAATTGTTTTTAAATTTTTGGTTAAAAAAGATCGTAATTTGATGTTTGCATCAAAAAATATAAA
260 TCAATTGTTTTTAAATTTTTAGTTAAAAAAGATCGTAATTTGATGTTTGCATCAAAAAACATAAA
* *
18840838 GCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCAGTTATCGTAACTCATGCCTTCATATGCCTTGTTA
325 GCAAAAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCAGTTATCATAACTCATGCCTTCATATGCCTTGTTA
** ** *
18840903 CTTGCTTTAAGTGGATTTATTACTTTTTAAATGATTTTAAAATGATTTTTTTTACATTTTTGGTT
390 CTTGCTTTAAGTGGATTTAAAACTTTTTAAATGATTTTAAAATGAAATTTTTTACATTGTTGGTT
* *** * * * *
18840968 AAAATAGATCATAATTTGATGTTTCCATTTAGAAACATGAAGTGAAAACCTTCTTTTGATAAGAA
455 AAAATAGATCATAATTTGATGTTTCCATTGAGAAACATGAAACAAAAACATTCTATTAACAAGAA
* * * * *
18841033 AGGTCTATTTATAGTCCCTCATACATTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAGTGGGTTTATAACT
520 AGGTCTATTTACAGTCACTCATACATTCAAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGGTTTAGAACT
** * * * ***
18841098 TTTGAAATGATTTCAAATTGAATTTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTT
585 ACT-AAATAATTTCAAATTGAATTGTTTTTACATTTTTGATTAAAACAGATCATAATCAAATGTT
* * * * *
18841163 TGCATCGAGAAACGTGAAGCGAAAGCCAACCATTAGCAAGAAAAGTCCATT-TATAGTCACTCAT
649 TGCATAGAGAAACGTAAAGCAAAAGCCAACCATTAGAAAGAAAAGT-CATTCTATAATCACTCAT
18841227 GGCTTGGAAGGCAG
713 GGCTTGGAAGGCAG
*
18841241 CAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTC-ATGGCTTGG-AAGGCTTTTTTACTCACTTTAAGTGGTT
1 CAAGAAAAGTCCATTTATAGTCAC-CAATGGCTTGGAAAGCCTTTTTTACTCACTTTAAGTGGTT
* * * * * **
18841304 TTAGAACTTTTTAGATG-TATTTGATTTGAATTTTTTTTGCATTTGTGGTTAAAAAAGATCATAA
65 TGAAAACTTTTTAAATGAT-TTTGAATTG-ATATTTTTAACATTTGTGGTTAAAAAAGATCATAA
* * * *
18841368 TTTATGTTTTCATCGA-GAAACGTAAAGCAAAAACCTTCTGTTGA-GAAGCAAAGTTTAGTTATA
128 TTTATGTTTGCAT-GAGGAAACGTAAAGCAAAAACCTTCCGTTGATG-AGAAAAGTCTAGTTATA
18841431 GTCACTCATGCCTT-TAAAGCCTTATTACTCACTTTAAGTGGATATATAACTTTTTAAATGATTT
191 GTCACTCATGCCTTCT-AAGCCTTATTACTCACTTTAAGTGGATATATAACTTTTTAAATGATTT
* * * * * *
18841495 TAAATTTAATTGTTTTTAAATTTTTAGTTCAAACAGATTGTAATTTGATGTTTGCATTAGAAAAC
255 TAAATTCAATTGTTTTTAAATTTTTAGTTAAAAAAGATCGTAATTTGATGTTTGCATCAAAAAAC
* * *
18841560 ATGAAGCAAAAGCAATCTC-TTGACAAGAAAAGTCCATTTATCATCACTCATGCCTTCATATGCC
320 ATAAAGCAAAAGCAATC-CATTGACAAGAAAAGTCCAGTTATCATAACTCATGCCTTCATATGCC
* **
18841624 TTGTTACTTGCTTTAAGTGTATTTAAAACTTTTTAAATGATTTT-AAATAGAAATTTTTTGTATT
384 TTGTTACTTGCTTTAAGTGGATTTAAAACTTTTTAAATGATTTTAAAAT-GAAATTTTTTACATT
* *
18841688 GTTGGTTAAAATAGATCATAATTTGAATGTTTGCATTGAGAAACGTGAAACAAAAACAATTC-AT
448 GTTGGTTAAAATAGATCATAATTTG-ATGTTTCCATTGAGAAACATGAAACAAAAAC-ATTCTAT
* * * *
18841752 TAACAAGAAAGGT-TCATTTACAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTGC-CTACTTTAAATG
511 TAACAAGAAAGGTCT-ATTTACAGTCACTCATACATTCAAAAGCCTTATTACTC-ACTTTAAATG
* * * * * * * * *
18841815 GTTTTAGGATCTCACT-ATTAATTTTAAGTTGAA-TGTTTTTACGTTTTTTATTAAAACAGGTTA
574 GGTTTA-GAACT-ACTAAATAATTTCAAATTGAATTGTTTTTACATTTTTGATTAAAACAGATCA
* * ** * * * *
18841878 TAATCAAATGTTTGCCTTAG-GAAATGTAAAGCAAAAGTGATCGATTGGAAAGAAAAGTCTTTCT
637 TAATCAAATGTTTG-CATAGAGAAACGTAAAGCAAAAGCCAACCATTAGAAAGAAAAGTCATTCT
18841942 ATAATCACTCATG
701 ATAATCACTCATG
18841955 CCTTTGAAAG
Statistics
Matches: 605, Mismatches: 93, Indels: 33
0.83 0.13 0.05
Matches are distributed among these distances:
726 9 0.01
727 362 0.60
728 225 0.37
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730 1 0.00
ACGTcount: A:0.33, C:0.13, G:0.15, T:0.39
Consensus pattern (726 bp):
CAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACCAATGGCTTGGAAAGCCTTTTTTACTCACTTTAAGTGGTTT
GAAAACTTTTTAAATGATTTTGAATTGATATTTTTAACATTTGTGGTTAAAAAAGATCATAATTT
ATGTTTGCATGAGGAAACGTAAAGCAAAAACCTTCCGTTGATGAGAAAAGTCTAGTTATAGTCAC
TCATGCCTTCTAAGCCTTATTACTCACTTTAAGTGGATATATAACTTTTTAAATGATTTTAAATT
CAATTGTTTTTAAATTTTTAGTTAAAAAAGATCGTAATTTGATGTTTGCATCAAAAAACATAAAG
CAAAAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCAGTTATCATAACTCATGCCTTCATATGCCTTGTTAC
TTGCTTTAAGTGGATTTAAAACTTTTTAAATGATTTTAAAATGAAATTTTTTACATTGTTGGTTA
AAATAGATCATAATTTGATGTTTCCATTGAGAAACATGAAACAAAAACATTCTATTAACAAGAAA
GGTCTATTTACAGTCACTCATACATTCAAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGGTTTAGAACTA
CTAAATAATTTCAAATTGAATTGTTTTTACATTTTTGATTAAAACAGATCATAATCAAATGTTTG
CATAGAGAAACGTAAAGCAAAAGCCAACCATTAGAAAGAAAAGTCATTCTATAATCACTCATGGC
TTGGAAGGCAG
Found at i:18842012 original size:171 final size:171
Alignment explanation
Indices: 18841766--18842213 Score: 445
Period size: 171 Copynumber: 2.6 Consensus size: 171
18841756 AAGAAAGGTT
* * * * * ** *
18841766 CATTTACAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTGCCTACTTTAAATGGTTTTAGGATCTCACT
1 CATTTATAATCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATT
* * * * * *
18841831 ATTAATTTTAAGTTGAATGTTTTTACGTTTTTTATTAAAACAGGTTATAATCAAATGTTTGCCTT
66 ATTAATTTTAAGTTCAAT-TTTTTACGTTTTTTATTAAAACAGATTATAATAAAACGATTACCTT
** **
18841896 AGGAAATGTAAAGCAAAAGTGATCGATTGGA-AAG-AAAAGT-
130 AGGAAACATAAAGCAAAAGCCATCGATT-GACAAGAAAAAGTC
* * * *
18841936 CTTTCTATAATCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTCTTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTTAT
1 CATT-TATAATCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCAT
* * * * *
18842001 TATTCATTTTAAGTTCAATTTTTT-TGTATTTTTCATGAAAACAGATTATAGTAAAACGATTATC
65 TATTAATTTTAAGTTCAATTTTTTACGT-TTTTT-ATTAAAACAGATTATAATAAAACGATTACC
* * *
18842065 TTGGGAAACATGAAGCGAAAGCCATCGATTGACAAGAAAAAGTC
128 TTAGGAAACATAAAGCAAAAGCCATCGATTGACAAGAAAAAGTC
* * * * * *
18842109 CATTTATAGTAACTCATGGCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTGTAATCTCATT
1 CATTTATAATCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATT
* * * * *
18842174 ATTGATTTTAACTTCATTTTTTTTACATTTTTCATTAAAA
66 ATTAATTTTAAGTTCA-ATTTTTTACGTTTTTTATTAAAA
18842214 NAAACGTGAA
Statistics
Matches: 223, Mismatches: 47, Indels: 14
0.79 0.17 0.05
Matches are distributed among these distances:
169 2 0.01
170 15 0.07
171 114 0.51
172 78 0.35
173 13 0.06
174 1 0.00
ACGTcount: A:0.32, C:0.15, G:0.13, T:0.40
Consensus pattern (171 bp):
CATTTATAATCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATT
ATTAATTTTAAGTTCAATTTTTTACGTTTTTTATTAAAACAGATTATAATAAAACGATTACCTTA
GGAAACATAAAGCAAAAGCCATCGATTGACAAGAAAAAGTC
Found at i:18842351 original size:144 final size:144
Alignment explanation
Indices: 18842070--18842360 Score: 306
Period size: 144 Copynumber: 2.0 Consensus size: 144
18842060 TTATCTTGGG
*
18842070 AAACATGAAGCGAAAGCCATCGATTGACAAGAAAAAGTCCATTTATAGTAACTCATGGCTTCAAA
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* * * * **
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* * ** **
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* ** * *
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* *
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** * * * ** *
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* * * * * *
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* * * * ** * * *
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* * * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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** * * * * *
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* * * *
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* * * *
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* * * *
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* *** ** *
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* ** *
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** ** * * *
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* * * *
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* * * *
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** * * ** * * * * *
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* * * * **
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* * *
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* **
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* * * * *
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* * * ** ** * *
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* *
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** *
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** * * *
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* * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * *
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* * * *
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** * * * *
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* * * * ** * * *
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* * * * * *
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* *
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* * * *
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* * * * *
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*** * * *
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* ***
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** * * *
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* * *
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* * * * * * * * * * * *
18850637 ATAGTTTGCTGTTTACATCGAGAAACGCGGAGTGAAA-ACAGTTCATTGAGAAGAAAAGTCCATC
128 ATAATTTGATGTTTGCATTGGGAAACGTGAAGCGAAAGCCA-TCCATTGACAAGAAAAGTCCATT
* * * *** ** * * * *
18850701 TATAATCACTTATGCCCCCGAAAGCCTAATTAGTCGCTTTAAATGGTTTTATAA-TCATATAAAT
192 TATAGTCACTCATGGCTTTGAAAGCCTTGTTATTCGCTTTAAGTGG-TTTATAACT-TTTTAAAT
* * * *
18850765 GATTTTAAAATTG-AGTTTTTCT-C-TTTTTGGGTTAAAACAGATCATAATTTGACGTTTACATT
255 GATTTT-AAATTGAAATTTTTTTACATTTTT-GGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATT
* * ** *
18850827 GATAAACGTGAAGCGAAAGCCATAC-
318 -AGAAACATGAAGC-AAAAAC-TTCT
* * * *
18850852 ATTGA-TAGAAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCATACGCTTTATTAC-CTGCTTTAAG
1 ATTGACAAG-AAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTTATTACTC-GCTTTAAG
** * * *
18850915 TGGATTTATAACTTTTTAAATGATTTTAAATTGAATTTATTTTTTATTTTTGATTAAAGCAGATC
64 TGGATTTATAACTTTTTAAATGATTTTAAATTGAATTT-TTTTACATTTTTGGTTAAAACATATC
* * * *
18850980 ATAACTTGTTG-TTGCCATTGGAAAACGTGAAG-AAAAGCCATCCATTGAC-AGAAAAAGGTCCA
128 ATAATTTGATGTTTG-CATTGGGAAACGTGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAG-AAAA-GTCCA
* * * * ** * * * **
18851042 GTTATAGTAATTCATGCCTTCAAAAGCCTTTTTAATCGCTTTAAGTGGATTTCTAACCCTTT-AA
190 TTTATAGTCACTCATGGCTTTGAAAGCCTTGTTATTCGCTTTAAGTGG-TTTATAACTTTTTAAA
* * * *
18851106 TGATTTTAAAGTG-AATGTATTTTACATTTTTGGTTAAAATAGATCATAATTTGATGTTTGGATT
254 TGATTTTAAATTGAAAT-TTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATT
* * * * *
18851170 GGAAA-ATGTGAAACAAAATCCATCC
318 AGAAACA--TGAAGCAAAA-ACTTCT
*** * * * *
18851195 ATTGATGGGAAAAGTCTATTTATAGTCTCTAATGCCTTCAAAAGCC-TATTTACTCGC-ATAAGA
1 ATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTTA-TTACTCGCTTTAAG-
* * * * *
18851258 TGG-TTTATAA-TCTTATAAATGATTTCAATTTGAATTTGTTTT-CATTTTTGGTTAAAAAAAAA
64 TGGATTTATAACT-TTTTAAATGATTTTAAATTGAATTT-TTTTACATTTTTGGTT-AAAACATA
* * * * * *** * * *
18851320 TCATAGTTTGTTGTTTGCATTGGGAAATGTGAAGCAAAAACCATCTGCTGATAAAAAAAGTTCAT
126 TCATAATTTGATGTTTGCATTGGGAAACGTGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCAT
* * * * * * * * * * *
18851385 TTATAGTCACTTATGCCCTCGAAAGCCTAGTAAGTT-GC-TTAAATAGCTTT-TAA-TCATATCA
191 TTATAGTCACTCATGGCTTTGAAAGCCTTGTTA-TTCGCTTTAAGT-GGTTTATAACT-TTTTAA
* * * *
18851446 ATGATTTTAAAATTG-AATTTTTCT-CTTTTTTGGTTAAACCAGATCATAATTTGATGTTTACAT
253 ATGATTTT-AAATTGAAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCAT
* * ** *
18851509 CGAGAAACGTGAAG-AAAAAGCCACAC
317 -TAGAAACATGAAGCAAAAA-CTTC-T
* * * * * *
18851535 ATGGATAAGAAAAGTCTATTTATAGTGACTCATGCCCTCAAAAGCCTTATTACTCACTTTAAGTG
1 ATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAGTG
** **
18851600 GATTTATAACTTTTTAAATGATTTTAAATTGAATTTTATTTTGTATTTTTGGTTAAAACATATTG
66 GATTTATAACTTTTTAAATGATTTTAAATTGAA-TTT-TTTTACATTTTTGGTTAAAACATATCA
* * ** * * * *
18851665 TAATTTAATGTTTGGATCAGGAAACATAAAGTGAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCACTTA
129 TAATTTGATGTTTGCATTGGGAAACGTGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCA-TT-
* * * * *
18851730 TAGTCACAGAGTTACTCATGGCTTGGAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGTATTAGAACTTAT
192 TA-T-----AGTCACTCATGGCTTTGAAAGCCTTGTTATTCGCTTTAAGTGGT-TTATAACTTTT
* * * * * *
18851795 TAAATGATTTTGAATTGAATTTTTTTTACATTTTTAGTTAAAACAAACCATAATTTGATGTTTGG
250 TAAATGATTTTAAATTGAAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGC
** *
18851860 ACTGGGAAACATGAAGCAAAAACCTTTT
315 A-TTAGAAACATGAAGCAAAAA-CTTCT
* * ** * * * *
18851888 GTTGATAAGAAAAG-CCTAGCTATAGTCACTCATACCTTTAAAAGCCTTGTTACTCACTTTAAGT
1 ATTGACAAGAAAAGTCC-ATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAGT
* ** * *
18851952 GGATTTATAATTTTTTTGATGATTTTAAATTGAATTTTTTTATATTTTTTGTTAAAACATATCAT
65 GGATTTATAACTTTTTAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATCAT
* * * * * *** *
18852017 AATTTGATGTTTGGATTGAGAAATGTGAAGCGACAATCCA-CTCA-TGGCTTTAAAAG-CCTTGT
130 AATTTGATGTTTGCATTGGGAAACGTGAAGCGA-AAGCCATC-CATTGACAAGAAAAGTCCAT-T
* ** * * * * * * * * **
18852079 TAT-TTGCTTTAAGTGG-TTTCAGAA--CTTTTTAAAT-GATAATGAATTGATTT-T-TTTTTTT
192 TATAGT-CACTCA-TGGCTTTGA-AAGCCTTGTT-ATTCGCT--TTAAGTGGTTTATAACTTTTT
* * * ** * * * * * * *
18852137 ACAT-TTTGGATTAAA--AAAGATCATAATTT-GATGTTTGCATTAGAAACGTGAAGCAAAAACC
251 AAATGATT---TTAAATTGAA-AT--TTTTTTACATTTTTG-GTTA-AAAC-AG-ATC-ATAA-T
* * ** * ** ** *
18852198 TT-CTG-CTGCA--AGAAA-AGTCCAGCTATAGTCACCC
304 TTGATGTTTGCATTAGAAACA-TGAAGC-AAAAACTTCT
*** * ** * ** * * * *****
18852232 A-T-ACCTTTAAAAG-CCTTATTACTA-TCTTTAAGTGGATTTATAA--CTTTTTAAAAAATTTT
1 ATTGA-CAAGAAAAGTCCAT-TTA-TAGTCACTCA-TGCCTTCAAAAGCCTTATT-ACTCGCTTT
* * * * ** * * ** *******
18852291 AATTGAATTTTTTTGCACTTTTGGTTAAAACATATTGTAATTTG-ATGTTTGGATCGGGAAACG-
61 AAGTGGA--TTTAT-AAC-TTT--TTAAATGAT-TT-TAAATTGAATTTTTTTA-CATTTTTGGT
* * ** * * * * ** * * *
18852354 TAAAGCCATCCATTGATGAA--AAAAG-TT-CATT--TATA-G-CAATTG--AGTCCCT-CGTGG
117 TAAA-ACAT--A-TCAT-AATTTGATGTTTGCATTGGGAAACGTGAAGCGAAAG-CCATCCATTG
** * * * * * * ** **
18852408 A-TTGAAAA-ACC-TTGT-TACTCACTTTAAAT-GATTTTAGAA--CTTTTTAAACAATTTTAAA
176 ACAAGAAAAGTCCATT-TATAGTCAC--T-CATGGCTTTGA-AAGCCTTGTTATTC-GCTTT-AA
* ** * * * ** * * * *
18852466 TTGAATT-T---TTTTTACATTTTAGGTTTAAA---AAATCATAATTT-GATGTTTGCATCAGGA
234 GTGGTTTATAACTTTTTA-A-ATGA-TTTTAAATTGAAAT--TTTTTTACATTTTTG-GTTA--A
* * * * ** ** * **
18852523 AACACGAAGCGAAAACCTT-AT-ATTGACA--AGAAATGTCTAGTTATAGTCAC-TC-
291 AACA-G-ATC-ATAA-TTTGATGTTTG-CATTAGAAACATGAAG-CA-A-AAACTTCT
* ** * * * ** * * * * *
18852575 A-TGCCTTTG-AAAG---ACTTATTACTCACTTTAAGTGGATT-TATAG-CTTTTTAAAT-GATT
1 ATTGAC-AAGAAAAGTCCATTTA-TAGTCAC--TCA-TGCCTTCAAAAGCCTTATT-ACTCG-CT
* * ** *** * ** ** * *
18852632 TTAAATTGAATTT-T---TTTTTGCAT--TTTTGGCTAGAATAAATCGTA-ATTTGAT-GTT--T
59 TT-AAGTGGATTTATAACTTTTTAAATGATTTTAAATTGAAT-TTTTTTACATTT-TTGGTTAAA
* * ** * ** * ** *** * * *
18852687 GCAT-TGGGA-AACGTGAAG--CACA-TGGACAAGAAAAGTTCATTTATAGTCA-CTCA-TGCCC
121 ACATAT--CATAATTTGATGTTTGCATTGG----GAAACGTGAAGCGAAAGCCATC-CATTG-AC
** * * * * * * * *
18852745 TCGAAAA--CC-----TAGTTAGT-A--GCTTT-AAATG-GTTTTATATTC-ATATAAATGATTT
178 AAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGGCTTTGAAA-GCCTTGT-TATTCGCTTTAAGTG-GTT
** * * * * * * * *
18852797 TAAAATTGAACTTTTCT-CTTTATTGGTTAAAAT-AGATTATAATTT-GATATTTGCATCGAGAA
240 T---A-T-AACTTTT-TAAATGATT--TTAAATTGAAATT-T-TTTTACATTTTTG-GT-TA-AA
* ** * **** ** * *** *
18852859 ACGTGAAGAAAAAGCCATACATTGACA--AGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCA-TGCCT
292 AC-AGATCATAATTTGAT-GTTTG-CATTAG-AAA--C-A-TGA-AG-CAAAAACT-TCT
* *** * * * * * * ** * ****
18852916 -TCGA-AAGCCTTATTACTCACTTTA-AGTGGATTTATAACTTTTTAAA---TAATT--TTAAAT
1 ATTGACAAG-AAAAGT-C-CA-TTTATAGT-CACTCAT-GCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTT
* *** ** * ** * *** ****** *
18852973 TAAATTTTTTTATATTTTTAGTTAAAACAGATCGTAATTTG-ATGTTGCCT-CAAGAAACGTGAA
60 TAAGTGGATTTATAACTTT--TT-AAA-TGATTTTAAATTGAAT-TTTTTTACATTTTTGGTTAA
** * * *** * * * * * ** * * * * *****
18853036 GTGCAT-TGACAA-AAAAAG--TCCATT--CATA-GT-CA-CTCATGCC-TTCATACGCCCTCTT
120 -AACATATCATAATTTGATGTTTGCATTGGGAAACGTGAAGCGAAAGCCATCCAT-TGACAAGAA
** * * * * ** * * * * **
18853091 ACTTAC-TTTA-AGTGGATTTATAACTTTTTAAA----TGATT-TT-GAATTGAATTTCTTT-T-
183 AAGTCCATTTATAGT-CACTCATGGC-TTTGAAAGCCTTG-TTATTCG-CTTTAAGTGGTTTATA
* * ** * * * * ** * *
18853146 ACATTTT---TGGTTAAAACATATCATAA----TTT-GATGTTTGGATCAGGAAATGTGAAGCAA
244 ACTTTTTAAATGATTTTAA-AT-TGA-AATTTTTTTACATTTTTGG-TTA--AAA-CAG-ATCAT
**** * * ** ** * * * *
18853203 AAGCCAACCG--TGAACGAGAAA-A-G-TCCATTTATAGTCACT
301 AATTTGA-TGTTTGCATTAGAAACATGAAGCA--AAAACT-TCT
* *** * * * ** * * * *
18853242 CA-TGGCTTTAAAAG-CC-TTGT-TACTCGCCTTAAGTGGTTTCAGAA--CTTCTTAAAT-GATT
1 -ATTGACAAGAAAAGTCCATT-TATAGTC-AC-TCA-TGCCTTCAAAAGCCTTATT-ACTCGCTT
* ** * *** ** * *
18853300 GTGAA-TTGATTT-T----TTTT-AA-GATTTTTGATTAAAAAAGATCATA-ATTTGATGTTTAC
60 -T-AAGTGGATTTATAACTTTTTAAATGATTTTAAATT--GAATTTTTTTACATTT-TTGGTTA-
* * **** *** ** * ** ** *
18853356 ATCAAGA-AACATGAAGCAAAAACCTT-CAGTTGACAAAAAAGTCTAGTTATAA-TCA-CTCA-T
119 A--AACATATCAT-AA-TTTGATGTTTGCA-TTG--GGAAACGTGAAGCGA-AAGCCATC-CATT
** * * * * * * * * * *
18853416 -ACCTTTG-AAAG-CC-TTTTTATTCTCTTTAAGTGGATTT-ATAA-CTTTATAAAT-GATTTTA
175 GA-C-AAGAAAAGTCCATTTATAGTCAC--TCA-TGGCTTTGA-AAGCCTTGTTATTCG-CTTT-
* ** * * * ** ** * * * *
18853474 AATTGAATT-T---TTTTT-CA-G-TTTT-GATTAAAGCAGATCATAACTTGTTGTTTGCATTAG
232 AAGTGGTTTATAACTTTTTAAATGATTTTAAATTGAA--ATTTTTTTAC--ATT-TTTG-GTTAA
**** * ** *
18853531 AA-A-A-CATGAAGAAAAAGCCATCCATT---AAC---AAG-AAAAA--TCT
291 AACAGATCAT-AATTTGATG-TTTGCATTAGAAACATGAAGCAAAAACTTCT
* * ** * * * * * * * * ** * *
18853571 ATTTA-TAGTCACTCA-TGCGTTCTAAAGCCTAATTAAT-CACTTTAAATGGTTTA-TAATC-AT
1 ATTGACAAG--A-AAAGTCCATT-TATAG--TCACTCATGC-CTTCAAAAGCCTTATTACTCGCT
* * *
18853631 ATAAAT-GATTT-T-------------A----AAATTGAA---TTTT---TTTTTGGTTCAAACA
59 TTAAGTGGATTTATAACTTTTTAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACA
* * * * *
18853671 GACCATAATTTGATGTTTGCATTAGGAAACGTGAAG-AACAAGCCATGCATTGACAAGAAAAGTC
124 TATCATAATTTGATGTTTGCATTGGGAAACGTGAAGCGA-AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTC
* * * * * * * *
18853735 TATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCTTTATTACTCGCTTTAAGTGAATTTATAACTCTTTA
188 CATTTATAGTCACTCATGGCTTTGAAAGCCTTGTTATTCGCTTTAAGTG-GTTTATAACTTTTTA
* ** * ** * *
18853800 AATAATTTTAAATTGAGTTTTTTTTTATATTTTTTATTAAAACAGATCATAATTTAATGTTTTCA
252 AATGATTTTAAATTGA-AATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCA
*
18853865 TTGAGAAACGTGAAGC----A---C-
316 TT-AGAAACATGAAGCAAAAACTTCT
* * * * * * * * *
18853883 ATTGACAAAAAAAGTGCAATCATAGTCACTCATGCCTTCATACGCCTTCTTACTTGCTTTTTAGT
1 ATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGC-TTTAAGT
* * ** * ***
18853948 GGATTTATAACATTTTAAATGATTTTAGATTGAATTTTTTTTACATTTTCAGTTAAAAAAGGCCA
65 GGATTTATAACTTTTTAAATGATTTTAAATTGAA-TTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATCA
* * * * * ** * *
18854013 TAATTTGATGTTTGCATTGGAAAACATGAAGCAAAAACCTTCTGTTGATAAGAAAAGTCCAGTTA
129 TAATTTGATGTTTGCATTGGGAAACGTGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTA
** ** * * *
18854078 TAGTCACTCATACCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTTTTAATGAT
194 TAGTCACTCATGGCTTTGAAAGCCTTGTTATTCGCTTTAAGTGG-TTTATAACTTTTTAAATGAT
* * **
18854143 TTTAAATTG-AATTCTTTTACATTTTTTGTTCAAAA-A-AT-ATAATTTGATGTTTGCATCGGGA
258 TTTAAATTGAAATTTTTTTACATTTTTGGTT-AAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCAT-TAGA
* ** * *
18854204 AACGTGAAGCGAAATCCATCC
321 AACATGAAGC-AAAAACTTCT
* * * *
18854225 ATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCATACGCCTTGTTACTTGCTTTAAGTG
1 ATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAGTG
* * * * *
18854290 GATTTATAGCTTTTTAAATGATATTCAATTGAATTGTTTTCACATTTTTGGTTAAAACAAATCAT
66 GATTTATAACTTTTTAAATGATTTTAAATTGAATT-TTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATCAT
* ** * * * *
18854355 AATTTGATGTTAGCATCAGGAAACGTGAAGCGAAAGCCAACCATTAATAAGAAAACTCCATTTAT
130 AATTTGATGTTTGCATTGGGAAACGTGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTAT
* * * *
18854420 AGTCACTCATGGCTTGGAAAGCCTTGTTACTCGC-TTCAGATGGTTTTATAA-TCTTATAAATGA
195 AGTCACTCATGGCTTTGAAAGCCTTGTTATTCGCTTTAAG-TGG-TTTATAACT-TTTTAAATGA
* * *
18854483 -TTTAAATTTG-AATTTGTTTT-TATTTTTGGTTAAAACATATCATAGTTT-ATTGTTTGCATTG
257 TTTTAAA-TTGAAATTT-TTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGA-TGTTTGCATT-
* ** * * *
18854544 GGAAATGTGAAGCGAAAACCATCC
318 AGAAACATGAAGC-AAAAACTTCT
* * * * * ** *
18854568 ATTGATAACAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATATCCTT-GAGAGCC-TAGTTTGTCGCTTTAAA
1 ATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAT-GCCTTCAAAAGCCTTA-TTACTCGCTTTAAG
* * * * * * **
18854631 TGGTTTTATAA-TCATATAAATGATTTTAAAATGAAAATTTTCT-C-TTTATTGGTTAAAACCGA
64 TGGATTTATAACT-TTTTAAATGATTTTAAATTG-AATTTTTTTACATTT-TTGGTTAAAACATA
** ** * * *
18854693 TCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACGTGAAGAAAAAGCCATACATTGACATGAAAAGTCTAT
126 TCATAATTTGATGTTTGCATTGGGAAACGTGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCAT
* ** ** * * * *
18854758 TTATAGTGGA---AAAGCCAT-ACA-CCATCTTACTT-ACTTTAAGTGGATTTATAACTTTTTAA
191 TTATAGT-CACTCATGGCTTTGAAAGCCTTGTTA-TTCGCTTTAAGTGG-TTTATAACTTTTTAA
* * *
18854817 ATGATTTTGAATT-AAATTTGTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATCATAATTTGATGTTTGG
253 ATGATTTTAAATTGAAA--T-TTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGC
* * * * ** ** *
18854881 GTTGGGAAACGTGAAGTGAAAGCCAACC
315 ATT-AGAAACATGAAG-CAAAAACTTCT
* * * * *
18854909 A-TGAACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGGCTTTAAAAGCCTTGTTACTTGCTATAAGT
1 ATTG-ACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAGT
* * * * * * * *
18854973 GG-TTTCAAAACTTTTTAATTGATTGTGAATTGATTTTTTTTATATTTTTGATTAAAA-AGGATC
65 GGATTT-ATAACTTTTTAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACA-TATC
* * * * ** * *
18855036 ATAATTTGATGTTTGCATTGGAAAACGTGAAGCAAAAACCTTCTGTTGACAAAAAAAAAGTCCAG
128 ATAATTTGATGTTTGCATTGGGAAACGTGAAGCGAAAGCCATCCATTGAC--AAGAAAAGTCCAT
* ** * * *
18855101 TTATAGTCACTCATAGCTTCAAAAGCCTTGTTATTCTCTTTAAGTAGATTTATAACTTTATAAAT
191 TTATAGTCACTCATGGCTTTGAAAGCCTTGTTATTCGCTTTAAGT-GGTTTATAACTTTTTAAAT
* * * * * * *
18855166 GATTTTAAATTGAATTTTTTTTTCAATTTTAGTTAAAACAGATCACAACTTGTTGTTTGCATTGA
255 GATTTTAAATTGAAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATT-A
* * * ** * *
18855231 AAAACGTGAAACAAAGTCATCC
319 GAAACATGAAGCAAAAACTTCT
* * * * *
18855253 ATTGACAAG-AAAGTCCATTTATAGTTACTCATGTCC-TCAAAAGCCTAATTAGTCACTTTAAAA
1 ATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATG-CCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTT-AAG
* * * * * * *
18855316 T-GTTTTATAA-TCATATAAATGATTTAAAATTGAATTTTTCT-CTTTTTTGGTTAAAACAGATC
64 TGGATTTATAACT-TTTTAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATC
* * ** * *
18855378 ATAGTTTGATGTTTGCATTGGGAAATGTGAAGAAAAAGCCATACATTGACAAG-AAAGTCTATTT
128 ATAATTTGATGTTTGCATTGGGAAACGTGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTT
** * * *
18855442 ATAGTCACTCATTCCTTCGAAAGCTTTGTTATTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTTTAAATAA
193 ATAGTCACTCATGGCTTTGAAAGCCTTGTTATTCGCTTTAAGTGG-TTTATAACTTTTTAAATGA
* * * *
18855507 TTTCAAATTG-AATTTTTTTACAATTTTGGTTAAAA-AGATCATAGTTTGATGTTTGCATTGGGA
257 TTTTAAATTGAAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATT-AGA
*
18855570 AACATGAAG-------TGC-
321 AACATGAAGCAAAAACTTCT
* * * * * * * * * * *
18855582 ATCGACAAAAAAAGTCCAATCATA-CCACTCATGCCTTCATACGCCTTGTTACTTGCATTAAGTA
1 ATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAGTG
** * * *
18855646 GATTTATAGGTTTTTAAATGATTTTAAATTAAACTTTTTTTACATTTTTAGTTAAAA-AGGATCA
66 GATTTATAACTTTTTAAATGATTTTAAATTGAA-TTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACA-TATCA
* * * * * * * * *
18855710 TAATGTGATGTTTGCATTAGGAAACATGAAGCAAAAACCTTCTATTGACAAGAAAAGTCTAGTTA
129 TAATTTGATGTTTGCATTGGGAAACGTGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTA
* * * * * *
18855775 TAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAGTAGATTTATAACTTTTTAAATAAT
194 TAGTCACTCATGGCTTTGAAAGCCTTGTTATTCGCTTTAAGT-GGTTTATAACTTTTTAAATGAT
* * * * *
18855840 TTTGAATTG-AAGTTTTTTACAATTTTGGTTAAAACAAATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAA
258 TTTAAATTGAAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTA-GAA
** * *
18855904 ACATGAAGCGAAAGCCATCC
322 ACATGAAGC-AAAAACTTCT
* * * * *
18855924 ATTGACAAGAAAAGTCCATTTATGGTAACTCATGCCTTCAAATGCCTTGTTACTTGCTTTAAGTG
1 ATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAGTG
* * * * *
18855989 GATTTATAACTTTTTAAATAATTTTAAATT-AACTTTTTTAATATTTTTGGTTAAAACAGATCGT
66 GATTTATAACTTTTTAAATGATTTTAAATTGAA-TTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATCAT
* * *
18856053 AATTTGATATTTGCATTGGGAAAGGTGATGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTAT
130 AATTTGATGTTTGCATTGGGAAACGTGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTAT
* * * * **
18856118 AGTCACTCATGGCTTGGAAAGCCTTGTTACTCAC-TTCAGATGGTTTATAA-TCTTGCAAATGAT
195 AGTCACTCATGGCTTTGAAAGCCTTGTTATTCGCTTTAAG-TGGTTTATAACT-TTTTAAATGAT
* * * * * * * * *
18856181 TTCAATTTG-AATGTGTTTT-CACTTTTGGTTAAAACAGATCATAGTTTGTTATTTACATCAAGA
258 TTTAAATTGAAAT-TTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCAT-TAGA
* * * *
18856244 AACACGGAGTGAAAACAGTTC-
321 AACATGAAG-CAAAA-ACTTCT
* * * * ** * * * *
18856265 ATTGAGAAGAAAAGTCCATCTATAATCACTTATGCCCCCGAAAG-CTTAGTTAGTCGTTTTAAAT
1 ATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTTA-TTACTCGCTTTAAGT
* * * * * *
18856329 GGTTTTATAA-TCATATAAATGATTTTAAAATTGAGTTTTTCT-CTTTTTTGGTTAAAACA-ATT
65 GGATTTATAACT-TTTTAAATGATTTT-AAATTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATA-T
* * * *
18856391 CATAATTTGACGTTTACATTGAGAAACGTGAAGCGAAAGCCATCTATTGACAAGAAAAGTCCATT
127 CATAATTTGATGTTTGCATTGGGAAACGTGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATT
* * * * *
18856456 TATGGTAACTCAT-GCCTTCAAATGCCTTGTTACTT-GCTTTAAGTGGATTTAAAACTTTTTAAA
192 TATAGTCACTCATGGCTTTGAAA-GCCTTGTTA-TTCGCTTTAAGTGG-TTTATAACTTTTTAAA
* * * * * * *
18856519 TAATTTTCAACTG-AATTGTTTTACATTTTTAGTTAAAGCAGATCATAATTTGATGTTTGCATCA
254 TGATTTTAAATTGAAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTA
* * * *
18856583 GAAAACGTGAAG-AGAAAGCTAACC
319 G-AAACATGAAGCA-AAAACT-TCT
* * * * * * *
18856607 ATTAACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATAG-CTTGAAAAGTCTTGTTACTCACTTCAAAT
1 ATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAT-GCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAGT
* * * * * * *
18856671 GGTTTTATAA-TCTTGTAAATGATTTCAATTTGAATGTGTTTT-CACTTTTGGTTAAAACAGATC
65 GGATTTATAACT-TTTTAAATGATTTTAAATTGAAT-TTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATC
* * * * * * * * * * * *
18856734 ATAGTTTGCTGTTTACATCGAGAAACGCGGAGTGAAA-ACAGTTCATTGAGAAGAAAAGTCCATC
128 ATAATTTGATGTTTGCATTGGGAAACGTGAAGCGAAAGCCA-TCCATTGACAAGAAAAGTCCATT
* * * *** ** * * * *
18856798 TATAATCACTTATGCCCCCGAAAGCCTAATTAGTCGCTTTAAATGGTTTTATAA-TCATATAAAT
192 TATAGTCACTCATGGCTTTGAAAGCCTTGTTATTCGCTTTAAGTGG-TTTATAACT-TTTTAAAT
* * * *
18856862 GATTTTAAAATTG-AGTTTTTCT-C-TTTTTGGGTTAAAACAGATCATAATTTGACGTTTACATT
255 GATTTT-AAATTGAAATTTTTTTACATTTTT-GGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATT
* * ** *
18856924 GATAAACGTGAAGCGAAAGCCATAC-
318 -AGAAACATGAAGC-AAAAAC-TTCT
* * * *
18856949 ATTGA-TAGAAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCATACGCTTTATTAC-CTGCTTTAAG
1 ATTGACAAG-AAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTTATTACTC-GCTTTAAG
** * * *
18857012 TGGATTTATAACTTTTTAAATGATTTTAAATTGAATTTATTTTTTATTTTTGATTAAAGCAGATC
64 TGGATTTATAACTTTTTAAATGATTTTAAATTGAATTT-TTTTACATTTTTGGTTAAAACATATC
* * * *
18857077 ATAACTTGTTG-TTGCCATTGGAAAACGTGAAG-AAAAGCCATCCATTGAC-AGAAAAAGGTCCA
128 ATAATTTGATGTTTG-CATTGGGAAACGTGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAG-AAAA-GTCCA
* * * * ** * * * **
18857139 GTTATAGTAATTCATGCCTTCAAAAGCCTTTTTAATCGCTTTAAGTGGATTTCTAACCCTTT-AA
190 TTTATAGTCACTCATGGCTTTGAAAGCCTTGTTATTCGCTTTAAGTGG-TTTATAACTTTTTAAA
* * * *
18857203 TGATTTTAAAGTG-AATGTATTTTACATTTTTGGTTAAAATAGATCATAATTTGATGTTTGGATT
254 TGATTTTAAATTGAAAT-TTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATT
* * * * *
18857267 GGAAA-ATGTGAAACAAAATCCATCC
318 AGAAACA--TGAAGCAAAA-ACTTCT
*** * * * *
18857292 ATTGATGGGAAAAGTCTATTTATAGTCTCTAATGCCTTCAAAAGCC-TATTTACTCGC-ATAAGA
1 ATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTTA-TTACTCGCTTTAAG-
* * * * *
18857355 TGG-TTTATAA-TCTTATAAATGATTTCAATTTGAATTTGTTTT-CATTTTTGGTTAAAAAAAAA
64 TGGATTTATAACT-TTTTAAATGATTTTAAATTGAATTT-TTTTACATTTTTGGTT-AAAACATA
* * * * * *** * * *
18857417 TCATAGTTTGTTGTTTGCATTGGGAAATGTGAAGCAAAAACCATCTGCTGATAAAAAAAGTTCAT
126 TCATAATTTGATGTTTGCATTGGGAAACGTGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCAT
* * * * * * * * * * *
18857482 TTATAGTCACTTATGCCCTCGAAAGCCTAGTAAGTT-GC-TTAAATAGCTTT-TAA-TCATATCA
191 TTATAGTCACTCATGGCTTTGAAAGCCTTGTTA-TTCGCTTTAAGT-GGTTTATAACT-TTTTAA
* * * *
18857543 ATGATTTTAAAATTG-AATTTTTCT-CTTTTTTGGTTAAACCAGATCATAATTTGATGTTTACAT
253 ATGATTTT-AAATTGAAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCAT
* * ** *
18857606 CGAGAAACGTGAAG-AAAAAGCCACAC
317 -TAGAAACATGAAGCAAAAA-CTTC-T
* * * * * *
18857632 ATGGATAAGAAAAGTCTATTTATAGTGACTCATGCCCTCAAAAGCCTTATTACTCACTTTAAGTG
1 ATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAGTG
** **
18857697 GATTTATAACTTTTTAAATGATTTTAAATTGAATTTTATTTTGTATTTTTGGTTAAAACATATTG
66 GATTTATAACTTTTTAAATGATTTTAAATTGAA-TTT-TTTTACATTTTTGGTTAAAACATATCA
* * ** * * * *
18857762 TAATTTAATGTTTGGATCAGGAAACATAAAGTGAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCACTTA
129 TAATTTGATGTTTGCATTGGGAAACGTGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCA-TT-
* * * * *
18857827 TAGTCACAGAGTTACTCATGGCTTGGAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGTATTAGAACTTAT
192 TA-T-----AGTCACTCATGGCTTTGAAAGCCTTGTTATTCGCTTTAAGTGGT-TTATAACTTTT
* * *** * *
18857892 TAAATGATTTTGAATTGAATTTTTTTTACATTTTCAATTAAAAGAGATCATAATTTGAT-TCTTA
250 TAAATGATTTTAAATTGAAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGT-TTG
* * * *
18857956 CTTTGGGAAACATGAAGCGAAAACCTTCC
314 CATT-AGAAACATGAAGC-AAAAACTTCT
* * *
18857985 GTTGACAAGAAAAGTTCAATTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAGTG
1 ATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAGTG
* * * *
18858050 GATTTATAACTTTTTAAATGAGTTTAAATTAAATTCTTTTACATTTTTGGTTAAAACAAATCATA
66 GATTTATAACTTTTTAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATCATA
* * * * *
18858115 ATTTGATGTTTGCATTAGGAAACGTGAAGTGAAAGCCAACCATTAATAAGAAAAGTCCATTTATA
131 ATTTGATGTTTGCATTGGGAAACGTGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATA
* * * * *
18858180 GTCACTCATGGCTTTAAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGATTTCAGAACTTTTTAAATGATTG
196 GTCACTCATGGCTTTGAAAGCCTTGTTATTCGCTTTAAGTGGTTT-ATAACTTTTTAAATGATTT
* ** * * * *
18858245 TGAATTGATTGTTTTTTTACATTTTCGATTAAAAAAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGGGAAA
260 TAAATTGA-AATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATT-AGAAA
*
18858310 CATGAAGCAAAAACTTTTT
323 CATGAAGCAAAAAC-TTCT
* * * * *
18858329 ATTGACAAGAAAAGTCTAATTATAGTCACTCATACCTTTAAAAGCCTAATTACTCGCTTTAAGTG
1 ATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAGTG
* ** * **
18858394 GATTTATAACTTTTTAAATGATTTTATATTGAATATTTTTTGTATTCTTT-GTTAAAACAGATTG
66 GATTTATAACTTTTTAAATGATTTTAAATTGAAT-TTTTTTACATT-TTTGGTTAAAACATATCA
* * * * * * * *
18858458 TAATTTGATATTTGCATTAGGAAACATGAAGTGAAAGCTAGCCATTAAAAAGAAAAGTCCATTTA
129 TAATTTGATGTTTGCATTGGGAAACGTGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTA
* * * * *
18858523 TAGTCACTAAT-GCTTTCATA-CACTGTGTTACTT-ACTTTAAGTGGATTTATAACTTTTGAAAT
194 TAGTCACTCATGGCTTTGAAAGC-CT-TGTTA-TTCGCTTTAAGTGG-TTTATAACTTTTTAAAT
* *
18858585 GATTTTAAATTG-AATTTTTTTATATTGTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAG
255 GATTTTAAATTGAAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTA-
** * *
18858649 GAAATGTGAAGCAAAAGCCAATC-
319 GAAACATGAAGCAAAA-AC-TTCT
* * * * ** * *
18858672 ATTAACAAGAAAAGTCTATTTATAATCACTCATGGCTTGGAAAGCCTTATAACTCGCTTTCAGTG
1 ATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAGTG
* * * * * * * *
18858737 GTTTTAGAACTTTTTAAATGATTTTGAATTGATTTTGTTTTCACATTTTTTGTCAAAAAAGATCA
66 GATTTATAACTTTTTAAATGATTTTAAATTGAATTT-TTTT-ACATTTTTGGTTAAAACATATCA
* *** * * * * *
18858802 TAATTTGATGTTTTCATCAAGAAACATGTAG-AAAATGGCATACATTGACAAGAAAAGTCCATTT
129 TAATTTGATGTTTGCATTGGGAAACGTGAAGCGAAA-GCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTT
* * * * * * * * *
18858866 ATAGTCACTCATGCCCTCGAAAGCCTAGTTAGTCACTTTAAATGGTTTTATAA-TCGTATAAATG
193 ATAGTCACTCATGGCTTTGAAAGCCTTGTTATTCGCTTTAAGTGG-TTTATAACT-TTTTAAATG
* * * * *
18858930 ATTTTAAATTTG-AATTTTTCT-CTTTTTTGGTT-AAACGAGATCATAATTTGAAGCTTGCATCA
256 ATTTTAAA-TTGAAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAAC-AGATCATAATTTGATGTTTGCATTA
*
18858992 GGAAACATGAAG-AAAAAGCCATAC-
319 -GAAACATGAAGCAAAAA--C-TTCT
* * * *
18859016 ATTGACAAGAAAAGTCTATTGATAGTCACTCACGCCTTCCAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAGTG
1 ATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAGTG
* * * * *
18859081 GATTTATAACATTTTACATAATTTTAAATTAAATTTTTTCTTA-ATTTTTGATTAAAACATA-CT
66 GATTTATAACTTTTTAAATGATTTTAAATTGAA-TTTTT-TTACATTTTTGGTTAAAACATATC-
* * * * * *
18859144 GTAATTTGATGTTTGCATCGGGAAAGGTGATGCGAAAGCTATCTATTGACAAGAAAAGTCCATTT
128 ATAATTTGATGTTTGCATTGGGAAACGTGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTT
* ** *
18859209 ATAGTTACTCATAAC-TTCATAAGCCTTGTTACTT-GCTTTAAGTGGGTTTATAACTTTTTAAAT
193 ATAGTCACTCATGGCTTTGA-AAGCCTTGTTA-TTCGCTTTAAGT-GGTTTATAACTTTTTAAAT
** * * * * * * *
18859272 GATTTGGAATTG-AATTCTTTTACATTTTTGGCTAAAAAAGACCATAATTTGTTGTTTGGATTGG
255 GATTTTAAATTGAAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATT-A
** * * *
18859336 GAAATGTGTAGTGAAAACCTTCT
319 GAAACATGAAG-CAAAAACTTCT
* * ** * * *
18859359 GTTGATAAGAAAAGTCCAACTATAGTTACTCATACCTTCAAAAGCCATATTACTCGCTTTAAGTG
1 ATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAGTG
* * * * * *
18859424 GACTTATAACTTTTTAGATGATTTTAAATTGAATTATTTTATATTTTAT--TTGAAACATGTCAT
66 GATTTATAACTTTTTAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTACATTTT-TGGTTAAAACATATCAT
* **** * * * *
18859487 AATTTGATGTTTGGATCACAAAATGTGAAGCGAAAGCCAGCCATTAACAAGAAAAGTCCATTTAG
130 AATTTGATGTTTGCATTGGGAAACGTGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTAT
* * * **
18859552 AGTCACTCATGGCTTTGAAAGCCTTATTATTCGTTTTAAGTGGTTTCAGAACTTTTTAAATGAGA
195 AGTCACTCATGGCTTTGAAAGCCTTGTTATTCGCTTTAAGTGGTTT-ATAACTTTTTAAATGATT
* ** * * * *
18859617 GTGCATTGAATTTTTTTTATATTTTTGATTAAAA-AGATCATAATTTGATGTTTGCA-TCGAAAA
259 TTAAATTGAAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAG-AAA
* *
18859680 CGTGAAGCCAAAACCTTCT
323 CATGAAG-CAAAAACTTCT
** * * *
18859699 ATTGACAAGAAAAGTCCAACTATAGTCACTCATTCCTTCAAAAGCTTTATTACTCGCTTTAAGCG
1 ATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAGTG
* * * * *
18859764 GATTTATAACTTTTTAAATGATTTGAAATTGAATTTTTTTGCATTTTTGGTTAAAATAGATCGTA
66 GATTTATAACTTTTTAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATCATA
* * * * *
18859829 ATTTGATGTTTGGATCGAGAAACGTGAAGCAAAAGCCATTCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATA
131 ATTTGATGTTTGCATTGGGAAACGTGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATA
** * * *
18859894 GTCACTAAGTCACTAATGGCTGGGAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGATTTTAGAACTTTTTA
196 GTCAC----T--C--ATGGCTTTGAAAGCCTTGTTATTCGCTTTAAGTG-GTTTATAACTTTTTA
* * * * * * * *
18859959 AAGGATTTTGAATTGAATTTTTTTTTTCATTTTAAGTTTAAAA-A-TTCATAATTTGATGCTTGC
252 AATGATTTTAAATTGAA-ATTTTTTTACATTTT-TGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGC
** * *
18860022 ATCGGGAAACATGAAGCGAAAACCTTCC
315 AT-TAGAAACATGAAGC-AAAAACTTCT
* * * * * **
18860050 ATTGACAAGAAAAGTTCAGTTATAGTCACTCATGTCTTCGAAGGCCTTATTACTTACTTTAAGT
1 ATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAGT
18860114 TGAATTTTTT
Statistics
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ACGTcount: A:0.34, C:0.13, G:0.15, T:0.38
Consensus pattern (340 bp):
ATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAGTG
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ATTTGATGTTTGCATTGGGAAACGTGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATA
GTCACTCATGGCTTTGAAAGCCTTGTTATTCGCTTTAAGTGGTTTATAACTTTTTAAATGATTTT
AAATTGAAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGAAACAT
GAAGCAAAAACTTCT
Found at i:18852073 original size:141 final size:143
Alignment explanation
Indices: 18851914--18852190 Score: 328
Period size: 141 Copynumber: 2.0 Consensus size: 143
18851904 TAGCTATAGT
* * ** **
18851914 CACTCATACCTTTAAAAGCCTTGTTACTCACTTTAAGTGGATTT-ATAATTTTTTTGATGATTTT
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* * * * *
18851978 AAATTGA-ATTTTTTTATA-TTTTTTG-TTAAAACATATCATAATTTGATGTTTGGATTGAGAAA
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*
18852040 TGTGAAGCGACAATC
129 CGTGAAGCGACAATC
** * ** *
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* *
18852120 AATTGATTTTTTTTTTTACATTTTGGATTAAAAAAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGAAACG
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18852185 TGAAGC
131 TGAAGC
18852191 AAAAACCTTC
Statistics
Matches: 112, Mismatches: 20, Indels: 6
0.81 0.14 0.04
Matches are distributed among these distances:
140 3 0.03
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ACGTcount: A:0.31, C:0.10, G:0.15, T:0.44
Consensus pattern (143 bp):
CACTCATACCTTTAAAAGCCTTGTTACTCACTTTAAGTGGTTTCAGAACTTTTTAAATGATAATA
AATTGATATTTTTTTATACATTTTGGATTAAAAAAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGAAACG
TGAAGCGACAATC
Found at i:18852555 original size:343 final size:333
Alignment explanation
Indices: 18852129--18860113 Score: 2392
Period size: 343 Copynumber: 23.4 Consensus size: 333
18852119 GAATTGATTT
* *
18852129 TTTTTTTTACATTTTGGATTAAAAAAGATCATAATTTGATGTTTGCATTA-GAAACGTGAAGCAA
1 TTTTTTTTACATTTTGG-TTTAAAAAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACGTGAAGCAA
* ** * * * * *
18852193 AAACCTTCTGCTG-CAAGAAAAGTCCAGCTATAGTCACCCATACCTTTAAAAGCCTTATTACT-A
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* *
18852256 TCTTTAAGTGGATTTATAACTTTTTAAAAAATTTT-AATTGAATTTTTTTGCACTTTTGGTTAAA
130 -CTTTAAGTGGATTTATAACTTTTTAAATAATTTTAAATTGAATTTTTTTGCATTTTTGGTTAAA
* * * * *
18852320 ACATATTGTAATTTGATGTTTGGATCGGGAAACGTAAAGCCATCCATTGATGAA-AAAAGTTCAT
194 ACAAATCGTAATTTGATGTTTGCATCGGGAAACGTAAAG-CA--CATGGA-CAAGAAAAGTTCAT
* * *
18852384 TTATAG-CAATTGA-GTCCCTCGTGGATTGAAAAACCTTGTTACTCA-CTTTAAATGATTTTAGA
255 TTATAGTC-ACTCATG-CCCTC-------G-AAAACCTAGTTACT-AGCTTTAAATGATTTTA-A
*
18852446 ACTT-TTTAAACAATTTT-AAATTGAA
308 A-TTATATAAACAATTTTAAAATTGAA
** *
18852471 TTTTTTTTACATTTTAGGTTTAAAAA-ATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACACGAAGCGA
1 TTTTTTTTACATTTT-GGTTTAAAAAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACGTGAAGCAA
* *
18852535 AAACCTTATATTGACAAGAAATGTCTAGTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGACTTATTACTCA
65 AAACCTTATATTGACAAGAAAAGTCTAGTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCA
* * * *
18852600 CTTTAAGTGGATTTATAGCTTTTTAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTTGCATTTTTGGCTAG
130 CTTTAAGTGGATTTATAACTTTTTAAATAATTTTAAATTGAA--TTTTTTTGCATTTTTGGTTAA
* * *
18852665 AATAAATCGTAATTTGATGTTTGCATTGGGAAACGTGAAGCACATGGACAAGAAAAGTTCATTTA
193 AACAAATCGTAATTTGATGTTTGCATCGGGAAACGTAAAGCACATGGACAAGAAAAGTTCATTTA
* * * **
18852730 TAGTCACTCATGCCCTCGAAAACCTAGTTAGTAGCTTTAAATGGTTTTATATTCATATAAATGAT
258 TAGTCACTCATGCCCTCGAAAACCTAGTTACTAGCTTTAAATGATTTTAAATT-ATATAAACAAT
18852795 TTTAAAATTGAA
322 TTTAAAATTGAA
* * * * *
18852807 -CTTTTCT-CTTTATTGG-TTAAAATAGATTATAATTTGATATTTGCATC-GAGAAACGTGAAG-
1 TTTTTTTTACATT-TTGGTTTAAAA-AGATCATAATTTGATGTTTGCATCAG-GAAACGTGAAGC
* * * *
18852867 AAAAAGCCATACATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTAC
63 AAAAA-CCTTATATTGACAAGAAAAGTCTAGTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTATTAC
* ** *
18852932 TCACTTTAAGTGGATTTATAACTTTTTAAATAATTTTAAATTAAATTTTTTTATATTTTTAGTTA
127 TCACTTTAAGTGGATTTATAACTTTTTAAATAATTTTAAATTGAATTTTTTTGCATTTTTGGTTA
* * ** * ** * * * *
18852997 AAACAGATCGTAATTTGATG-TTGCCTCAAGAAACGTGAAGTGCATTGACAAAAAAAGTCCATTC
192 AAACAAATCGTAATTTGATGTTTGCATCGGGAAACGTAAAGCACATGGACAAGAAAAGTTCATTT
* ** * * * *
18853061 ATAGTCACTCATGCCTTC-ATACGCCCT-CTTACTTA-CTTTAAGTGGATTTATAACTT-TTTAA
257 ATAGTCACTCATGCCCTCGA-A-AACCTAGTTAC-TAGCTTTAAAT-GATTT-TAAATTATATAA
** *
18853122 ATGATTTT-GAATTGAA
317 ACAATTTTAAAATTGAA
* * * *
18853138 TTTCTTTTACATTTTTGG-TTAAAACATATCATAATTTGATGTTTGGATCAGGAAATGTGAAGCA
1 TTTTTTTTACA-TTTTGGTTTAAAA-AGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACGTGAAGCA
* * *** * * * * * *
18853202 AAAGCC-AACCGTGAACGAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGGCTTTAAAAGCCTTGTTACT
64 AAAACCTTATATTG-ACAAGAAAAGTCTAGTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTATTACT
* * * * * * * * *
18853266 CGCCTTAAGTGG-TTTCAGAACTTCTTAAATGATTGTGAATTGATTTTTTTTAAG-ATTTTTGAT
128 CACTTTAAGTGGATTT-ATAACTTTTTAAATAATTTTAAATTGAATTTTTTT--GCATTTTTGGT
* * ** * * *
18853329 TAAAA-AAGATCATAATTTGATGTTTACATCAAGAAACATGAAGCAAAAACCTTCAGTTGACAA-
190 TAAAACAA-ATCGTAATTTGATGTTTGCATCGGGAAACGTAAAGC----A----CA-TGGACAAG
* * * * * * ** * ** *
18853392 AAAAG-TCTAGTTATAATCACTCATACCTTTGAAAGCCTTTTTATTCTCTTTAAGTGGATTTATA
245 AAAAGTTC-ATTTATAGTCACTCATGCCCTCGAAAACCTAGTTACTAGCTTTAAAT-GATTT-TA
* **
18853456 ACTT-TATAAATGATTTT-AAATTGAA
307 AATTATATAAACAATTTTAAAATTGAA
* * * * * * *
18853481 TTTTTTTT-CAGTTTT-GATTAAAGCAGATCATAACTTGTTGTTTGCATTAGAAAACATGAAG-A
1 TTTTTTTTACA-TTTTGGTTTAAA-AAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACGTGAAGCA
* ** * * * * * *
18853543 AAAAGCCATCCATTAACAAGAAAAATCTATTTATAGTCACTCATGCGTTCT-AAAGCCTAATTAA
64 AAAA-CCTTATATTGACAAGAAAAGTCTAGTTATAGTCACTCATGCCTT-TGAAAGCCTTATTAC
* * * *
18853607 TCACTTTAAATGG-TTTATAA-TCATATAAATGATTTTAAAATTGAA---TTTT---TTTTTGGT
127 TCACTTTAAGTGGATTTATAACT-TTTTAAATAATTTT-AAATTGAATTTTTTTGCATTTTTGGT
* * * * ** *
18853664 TCAAACAGACCATAATTTGATGTTTGCATTAGGAAACGTGAAGAACAAGCCATGCATTGACAAGA
190 TAAAACAAATCGTAATTTGATGTTTGCATCGGGAAACGT-----A-AAG-CA--CATGGACAAGA
* * * * * *
18853729 AAAG-TCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCTTTA-TTACTCGCTTTAAGTGAATTTATA
246 AAAGTTC-ATTTATAGTCACTCATGCCCTCGAAAAC-CTAGTTACTAGCTTTAAATGATTTTA-A
* * * * *
18853792 ACTCTTTAAATAATTTT-AAATTGAGT
308 ATTATATAAACAATTTTAAAATTGA-A
* * * * *
18853818 TTTTTTTTATATTTT-TTATTAAAACAGATCATAATTTAATGTTTTCAT-TGAGAAACGTGAAGC
1 TTTTTTTTACATTTTGGT-TTAAAA-AGATCATAATTTGATGTTTGCATCAG-GAAACGTGAAGC
* * * * * *
18853881 ----A-C----ATTGACAAAAAAAGTGC-AATCATAGTCACTCATGCC-TTCATACGCCTTCTTA
63 AAAAACCTTATATTGACAAGAAAAGT-CTAGTTATAGTCACTCATGCCTTTGA-AAGCCTTATTA
** * * * * * **
18853935 CTTGCTTTTTAGTGGATTTATAACATTTTAAATGATTTTAGATTGAATTTTTTTTACATTTTCAG
126 CTCAC-TTTAAGTGGATTTATAACTTTTTAAATAATTTTAAATTGAA-TTTTTTTGCATTTTTGG
** * * * * * * *
18854000 TTAAAA-AAGGCCATAATTTGATGTTTGCATTGGAAAACATGAAGCAAAAACCTTCTGTTGATAA
189 TTAAAACAA-ATCGTAATTTGATGTTTGCATCGGGAAACGTAAAGC----A-C--ATG--GACAA
* * * * * *
18854064 GAAAAGTCCAGTTATAGTCACTCATACCTTC-AAAAGCCTTA-TTACTCGCTTTAAGTGGATTTA
244 GAAAAGTTCATTTATAGTCACTCATGCCCTCGAAAA-CC-TAGTTACTAGCTTTAAAT-GATTT-
* * * **
18854127 TAACTT-TTTTAATGATTTT-AAATTGAA
305 TAAATTATATAAACAATTTTAAAATTGAA
* * * * *
18854154 -TTCTTTTACATTTTTTGTTCAAAAA-AT-ATAATTTGATGTTTGCATCGGGAAACGTGAAGCGA
1 TTTTTTTTACA-TTTTGGTTTAAAAAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACGTGAAGCAA
* * ** * * * * * *
18854216 AATCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCC-TTCATACGCCTTGTTACTT
65 AAACCTTATATTGACAAGAAAAGTCTAGTTATAGTCACTCATGCCTTTGA-AAGCCTTATTACTC
* * * * * **
18854280 GCTTTAAGTGGATTTATAGCTTTTTAAATGATATTCAATTGAATTGTTTTCACATTTTTGGTTAA
129 ACTTTAAGTGGATTTATAACTTTTTAAATAATTTTAAATTGAATT-TTTTTGCATTTTTGGTTAA
* * * ** *
18854345 AACAAATCATAATTTGATGTTAGCATCAGGAAACGTGAAGCGAAAGCCAACCATTAATAAGAAAA
193 AACAAATCGTAATTTGATGTTTGCATCGGGAAACGT------AAAG-C-A-CATGGACAAGAAAA
* * * * * * * * * * *
18854410 CTCCATTTATAGTCACTCATGGCTTGGAAAGCCTTGTTACTCGCTTCAGATGGTTTTATAATCT-
249 GTTCATTTATAGTCACTCATGCCCTCGAAAACCTAGTTACTAGCTTTAAATGATTTTA-AAT-TA
** *
18854474 TATAAATGA-TTTAAATTTGAA
312 TATAAACAATTTTAAAATTGAA
* * * ** *
18854495 TTTGTTTTTA-TTTTTGG-TTAAAACATATCATAGTTT-ATTGTTTGCATTGGGAAATGTGAAGC
1 TTT-TTTTTACATTTTGGTTTAAAA-AGATCATAATTTGA-TGTTTGCATCAGGAAACGTGAAGC
* * ** * * * * * * *
18854557 GAAAACCATCCATTGATAACAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATATCC-TTGAGAGCC-TAGTTT
63 AAAAACCTTATATTGACAAGAAAAGTCTAGTTATAGTCACTCAT-GCCTTTGAAAGCCTTA-TTA
* * * * * * * * * *
18854620 GTCGCTTTAAATGGTTTTATAA-TCATATAAATGATTTTAAAATGAAAATTTTCT-C-TTTATTG
126 CTCACTTTAAGTGGATTTATAACT-TTTTAAATAATTTTAAATTG-AATTTTTTTGCATTT-TTG
** * * * *
18854682 GTTAAAACCGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACGTGAAGAAAAAGCCATACATTGACAT
188 GTTAAAACAAATCGTAATTTGATGTTTGCATCGGGAAACGT------AAAG-C--ACATGGACAA
* * * * * * *
18854747 GAAAAG-TCTATTTATAGTGGA--AAAGCCAT---ACACC-ATCTTACTTA-CTTTAAGTGGATT
244 GAAAAGTTC-ATTTATAGT-CACTCATGCCCTCGAAAACCTA-GTTAC-TAGCTTTAAAT-GATT
* * ** * *
18854804 TATAACTT-TTTAAATGATTTT-GAATTAAA
304 T-TAAATTATATAAACAATTTTAAAATTGAA
* ** **
18854833 TTTGTTTTTTACATTTTTGG-TTAAAACATATCATAATTTGATGTTTGGGTTGGGAAACGTGAAG
1 -TT-TTTTTTACA-TTTTGGTTTAAAA-AGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACGTGAAG
** * * * * * * * *
18854897 TGAAAGCC-AACCA-TGAACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGGCTTTAAAAGCCTTGTT
62 CAAAAACCTTA-TATTG-ACAAGAAAAGTCTAGTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTATT
** * * * * * * * ** *
18854960 ACTTGCTATAAGTGG-TTTCAAAACTTTTTAATTGATTGTGAATTGATTTTTTTTATATTTTTGA
125 ACTCACTTTAAGTGGATTT-ATAACTTTTTAAATAATTTTAAATTGAATTTTTTTGCATTTTTGG
* * * * * *
18855024 TTAAAA-AGGATCATAATTTGATGTTTGCATTGGAAAACGTGAAGCAAAAACCTTCTGTTGACAA
189 TTAAAACA-AATCGTAATTTGATGTTTGCATCGGGAAACGTAAAGC----A-C--ATG--GAC--
* * * * * * ** *
18855088 AAAAAAAGTCCAGTTATAGTCACTCATAG-CTTC-AAAAGCCTTGTTATTCTCTTTAAGTAGATT
242 AAGAAAAGTTCATTTATAGTCACTCAT-GCCCTCGAAAA-CCTAGTTACTAGCTTTAAAT-GATT
* **
18855151 TATAACTT-TATAAATGATTTT-AAATTGAA
304 T-TAAATTATATAAACAATTTTAAAATTGAA
* * * * * * * *
18855180 TTTTTTTTTCAATTTTAG-TTAAAACAGATCACAACTTGTTGTTTGCAT-TGAAAAACGTGAAAC
1 TTTTTTTTAC-ATTTTGGTTTAAAA-AGATCATAATTTGATGTTTGCATCAG-GAAACGTGAAGC
** * ** * * * ** * *
18855243 -AAAGTCATCCATTGACAAG-AAAGTCCATTTATAGTTACTCATGTCC-TCAAAAGCCTAATTAG
63 AAAAACCTTATATTGACAAGAAAAGTCTAGTTATAGTCACTCATG-CCTTTGAAAGCCTTATTAC
* * * * * * * *
18855305 TCACTTTAAAAT-GTTTTATAA-TCATATAAATGATTTAAAATTGAATTTTTCT-CTTTTTTGGT
127 TCACTTT-AAGTGGATTTATAACT-TTTTAAATAATTTTAAATTGAATTTTTTTGCATTTTTGGT
* * * * * *
18855367 TAAAACAGATCATAGTTTGATGTTTGCATTGGGAAATGTGAAGAAAAAGCCATACATTGACAAG-
190 TAAAACAAATCGTAATTTGATGTTTGCATCGGGAAACGT------AAAG-C--ACATGGACAAGA
* * * * * * * *
18855431 AAAG-TCTATTTATAGTCACTCATTCCTTCGAAAGCTTTGTTATTCGCTTTAAGTGGATTTATAA
246 AAAGTTC-ATTTATAGTCACTCATGCCCTCGAAAACCTAGTTACTAGCTTTAAAT-GATTT-TAA
* * * *
18855495 CTT-TTTAAATAA-TTTCAAATTGAA
308 ATTATATAAACAATTTTAAAATTGAA
* ** *
18855519 -TTTTTTTACAATTTTGG-TTAAAAAGATCATAGTTTGATGTTTGCATTGGGAAACATGAAG---
1 TTTTTTTTAC-ATTTTGGTTTAAAAAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACGTGAAGCAA
** * * * * * * * * * *
18855579 ------TGCATCGACAAAAAAAGTCCAATCATA-CCACTCATGCC-TTCATACGCCTTGTTACTT
65 AAACCTTATATTGACAAGAAAAGTCTAGTTATAGTCACTCATGCCTTTGA-AAGCCTTATTACTC
* * * ** * * * *
18855636 GCATTAAGTAGATTTATAGGTTTTTAAATGATTTTAAATTAAACTTTTTTTACATTTTTAGTTAA
129 ACTTTAAGTGGATTTATAACTTTTTAAATAATTTTAAATTGAA-TTTTTTTGCATTTTTGGTTAA
* * * ** * * *
18855701 AA-AGGATCATAATGTGATGTTTGCATTAGGAAACATGAAGCAAAAACCTTCTATTGACAAGAAA
193 AACA-AATCGTAATTTGATGTTTGCATCGGGAAACGTAAAGC----A----C-ATGGACAAGAAA
* * * * * *
18855765 AG-TCTAGTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTA-TTACTCGCTTTAAGTAGATTTATAAC
248 AGTTC-ATTTATAGTCACTCATGCCCTCGAAAACC-TAGTTACTAGCTTTAAAT-GATTT-TAAA
* * *
18855828 TT-TTTAAATAATTTT-GAATTGAA
309 TTATATAAACAATTTTAAAATTGAA
* * * *
18855851 -GTTTTTTACAATTTTGG-TTAAAACAAATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACATGAAGCG
1 TTTTTTTTAC-ATTTTGGTTTAAAA-AGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACGTGAAGCA
* * ** * * * * * *
18855914 AAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATGGTAACTCATGCC-TTCAAATGCCTTGTTACT
64 AAAACCTTATATTGACAAGAAAAGTCTAGTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAA-GCCTTATTACT
** ***
18855978 TGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTTTAAATAATTTTAAATT-AACTTTTTTAATATTTTTGGTTA
128 CACTTTAAGTGGATTTATAACTTTTTAAATAATTTTAAATTGAA-TTTTTTTGCATTTTTGGTTA
* * * * *
18856042 AAACAGATCGTAATTTGATATTTGCATTGGGAAAGGTGATGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAA
192 AAACAAATCGTAATTTGATGTTTGCATCGGGAAA--CG-T---AAAG-CA--CATGGACAAGAAA
* * * * * * * * *
18856107 AGTCCATTTATAGTCACTCATGGCTTGGAAAGCCTTGTTACTCA-CTTCAGATG-GTTTATAATC
248 AGTTCATTTATAGTCACTCATGCCCTCGAAAACCTAGTTACT-AGCTTTAAATGATTTTA-AAT-
** ** * *
18856170 T-TGCAAATGA-TTTCAATTTGAA
310 TATATAAACAATTTTAAAATTGAA
* * * * * * * ** * **
18856192 TGTGTTTT-CACTTTTGG-TTAAAACAGATCATAGTTTGTTATTTACATCAAGAAACACGGAGTG
1 TTTTTTTTACA-TTTTGGTTTAAAA-AGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACGTGAAGCA
* * * * * * ***
18856255 AAAACAGTT-CATTGAGAAGAAAAGTCCA-TCTATAATCACTTATGCCCCCGAAAG-CTTAGTTA
64 AAAAC-CTTATATTGACAAGAAAAGTCTAGT-TATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTA-TTA
* ** * * * * * * * *
18856317 GTCGTTTTAAATGGTTTTATAA-TCATATAAATGATTTTAAAATTGAGTTTTTCT-CTTTTTTGG
126 CTCACTTTAAGTGGATTTATAACT-TTTTAAATAATTTT-AAATTGAATTTTTTTGCATTTTTGG
* * * * * * *
18856380 TTAAAACAATTCATAATTTGACGTTTACATTGAGAAACGTGAAGCGAAAGCCATCTATTGACAAG
189 TTAAAACAAATCGTAATTTGATGTTTGCATCGGGAAACGT------AAAG-CA-C-ATGGACAAG
* * * * * * * * *
18856445 AAAAGTCCATTTATGGTAACTCATGCCTTC-AAATGCCTTGTTACTTGCTTTAAGTGGATTTAAA
245 AAAAGTTCATTTATAGTCACTCATGCCCTCGAAA-ACCTAGTTACTAGCTTTAAAT-GATTTTAA
* * * *
18856509 ACTT-TTTAAATAATTTT-CAACTGAA
308 A-TTATATAAACAATTTTAAAATTGAA
* * * *
18856534 -TTGTTTTACATTTTTAG-TTAAAGCAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGAAAACGTGAAG-A
1 TTTTTTTTACA-TTTTGGTTTAAA-AAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACGTGAAGCA
* * * * * * * * *
18856596 GAAAGCTAACCATTAACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATAG-C-TTGAAAAGTCTTGTTA
64 AAAACCTTA-TATTGACAAGAAAAGTCTAGTTATAGTCACTCAT-GCCTTTG-AAAGCCTTATTA
* * * * * * * * *
18856659 CTCACTTCAAATGGTTTTATAA-TCTTGTAAATGATTTCAATTTGAATGTGTTTT-CACTTTTGG
126 CTCACTTTAAGTGGATTTATAACT-TTTTAAATAATTTTAAATTGAAT-TTTTTTGCATTTTTGG
* * * * * * * * *
18856722 TTAAAACAGATCATAGTTTGCTGTTTACATCGAGAAACGCGGAGTGAAAACAGTTCATTGAGAAG
189 TTAAAACAAATCGTAATTTGATGTTTGCATCGGGAAA--C---GT-AAAGCA---CATGGACAAG
* * * * * * * * * *
18856787 AAAAGTCCATCTATAATCACTTATGCCCCCGAAAGCCTAATTAGTCGCTTTAAATGGTTTTATAA
245 AAAAGTTCATTTATAGTCACTCATGCCCTCGAAAACCTAGTTACTAGCTTTAAATGATTTTA-AA
* **
18856852 TCATATAAATGATTTTAAAATTG-A
309 TTATATAAACAATTTTAAAATTGAA
* * * * * * * * *
18856876 GTTTTTCT-CTTTTTGGGTTAAAACAGATCATAATTTGACGTTTACAT-TGATAAACGTGAAGCG
1 TTTTTTTTACATTTTGGTTTAAAA-AGATCATAATTTGATGTTTGCATCAG-GAAACGTGAAGCA
* * * * * * * * *
18856939 AAAGCCATACATTGA-TAGAAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCC-TTCATACGCTTTATTAC
64 AAAACCTTATATTGACAAG-AAAAGTCTAGTTATAGTCACTCATGCCTTTGA-AAGCCTTATTAC
* * ** *
18857002 -CTGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTTTAAATGATTTTAAATTGAATTTATTTTTTATTTTTGAT
127 TC-ACTTTAAGTGGATTTATAACTTTTTAAATAATTTTAAATTGAATTT-TTTTGCATTTTTGGT
* * * * * * * *
18857066 TAAAGCAGATCATAACTTGTTG-TTGCCATTGGAAAACGTGAAGAAAAGCCATCCATTGAC-AGA
190 TAAAACAAATCGTAATTTGATGTTTG-CATCGGGAAACGT-----AAAG-CA--CATGGACAAG-
* * * * * ** * * *
18857129 AAAAGGTCCAGTTATAGTAATTCATGCCTTC-AAAAGCCTTTTTAATCGCTTTAAGTGGATTTCT
245 AAAA-GTTCATTTATAGTCACTCATGCCCTCGAAAA-CCTAGTTACTAGCTTTAAAT-GATTT-T
** ** *
18857193 AACCCT-T-T-AATGATTTT-AAAGTGAA
306 AA-ATTATATAAACAATTTTAAAATTGAA
* * * * * *
18857218 TGTATTTTACATTTTTGG-TTAAAATAGATCATAATTTGATGTTTGGAT-TGGAAAATGTGAAAC
1 TTTTTTTTACA-TTTTGGTTTAAAA-AGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGG-AAACGTGAAGC
* * ** *** * * * **
18857281 AAAATCCATCCATTGATGGGAAAAGTCTATTTATAGTCTCTAATGCCTTCAAAAGCC-TATTTAC
63 AAAAACCTTATATTGACAAGAAAAGTCTAGTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTA-TTAC
* * * * * *
18857345 TCGC-ATAAGATGG-TTTATAA-TCTTATAAATGATTTCAATTTGAATTTGTTTT-CATTTTTGG
127 TCACTTTAAG-TGGATTTATAACT-TTTTAAATAATTTTAAATTGAATTT-TTTTGCATTTTTGG
* * * * * * * *
18857406 TTAAAAAAAAATCATAGTTTGTTGTTTGCATTGGGAAATGTGAAGCAAAAACCATCTGCTGATAA
189 TT-AAAACAAATCGTAATTTGATGTTTGCATCGGGAAACGTAAAGC----A-CA--TG--GACAA
* * * * * * *
18857471 AAAAAGTTCATTTATAGTCACTTATGCCCTCGAAAGCCTAGTAAGTTGC-TTAAATAGCTTTT-A
244 GAAAAGTTCATTTATAGTCACTCATGCCCTCGAAAACCTAGTTACTAGCTTTAAAT-GATTTTAA
* * **
18857534 ATCATATCAATGATTTTAAAATTGAA
308 ATTATATAAACAATTTTAAAATTGAA
* *
18857560 TTTTTCTCTT---TTTTGG-TTAAACCAGATCATAATTTGATGTTTACATC-GAGAAACGTGAAG
1 TTTTT-T-TTACATTTTGGTTTAAA-AAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAG-GAAACGTGAAG
** * * * * * * **
18857620 -AAAAAGCCACACATGGATAAGAAAAGTCTATTTATAGTGACTCATGCCCTCAAAAGCCTTATTA
62 CAAAAA-CCTTATATTGACAAGAAAAGTCTAGTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTATTA
* *
18857684 CTCACTTTAAGTGGATTTATAACTTTTTAAATGATTTTAAATTGAATTTTATTTTGTATTTTTGG
126 CTCACTTTAAGTGGATTTATAACTTTTTAAATAATTTTAAATTGAA-TTT-TTTTGCATTTTTGG
* * * * * * *
18857749 TTAAAACATATTGTAATTTAATGTTTGGATCAGGAAACATAAAGTGAAAGCCATCCATTGATAAG
189 TTAAAACAAATCGTAATTTGATGTTTGCATCGGGAAAC-----GT-AAAG-CA--CATGGACAAG
* * * * * * * * * *
18857814 AAAAGTCCACTTATAGTCACAGAGTTACTCATGGCTTGGAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGG
245 AAAAGTTCA-TT-TA-T-----AGTCACTCATGCCCTCGAAAACCTAGTTACTAGCTTTAAATGA
* ** *
18857879 TATTAGAACTTAT-TAAATGATTTT-GAATTGAA
302 TTTTA-AA-TTATATAAACAATTTTAAAATTGAA
*** * * ** * *
18857911 TTTTTTTTACATTTTCAATTAAAAGAGATCATAATTTGAT-TCTTACTTTGGGAAACATGAAGCG
1 TTTTTTTTACATTTTGGTTTAAAA-AGATCATAATTTGATGT-TTGCATCAGGAAACGTGAAGCA
*** * **
18857975 AAAACCTTCCGTTGACAAGAAAAGT-TCAATTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTTATTACT
64 AAAACCTTATATTGACAAGAAAAGTCT-AGTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTATTACT
* * * * * *
18858039 CGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTTTAAATGAGTTTAAATTAAATTCTTTTACATTTTTGGTTAA
128 CACTTTAAGTGGATTTATAACTTTTTAAATAATTTTAAATTGAATTTTTTTGCATTTTTGGTTAA
* ** ** *
18858104 AACAAATCATAATTTGATGTTTGCATTAGGAAACGTGAAGTGAAAGCCAACCATTAATAAGAAAA
193 AACAAATCGTAATTTGATGTTTGCATCGGGAAAC-----GT-AAAG-C-A-CATGGACAAGAAAA
* * ** * * * *
18858169 GTCCATTTATAGTCACTCATG-GCTTTAAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGATTTCAGAACTT
249 GTTCATTTATAGTCACTCATGCCCTCGAAAA-CCTAGTTACTAGCTTTAAATGATTTTA-AA-TT
* ** * * *
18858233 -TTTAAATGATTGT-GAATTGAT
311 ATATAAACAATTTTAAAATTGAA
* * ** *
18858254 TGTTTTTTTACATTTTCGATTAAAAAAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGGGAAACATGAAGCA
1 T-TTTTTTTACATTTT-GGTTTAAAAAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACGTGAAGCA
* * * * * *
18858319 AAAACTTTTTATTGACAAGAAAAGTCTAATTATAGTCACTCATACCTTTAAAAGCCTAATTACTC
64 AAAACCTTATATTGACAAGAAAAGTCTAGTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTATTACTC
* * * *
18858384 GCTTTAAGTGGATTTATAACTTTTTAAATGATTTTATATTGAATATTTTTTGTATTCTTT-GTTA
129 ACTTTAAGTGGATTTATAACTTTTTAAATAATTTTAAATTGAAT-TTTTTTGCATT-TTTGGTTA
* * * ** ** *
18858448 AAACAGATTGTAATTTGATATTTGCATTAGGAAACATGAAGTGAAAGCTAGCCATTAAAAAGAAA
192 AAACAAATCGTAATTTGATGTTTGCATCGGGAAAC-----GT-AAAGC-A--CATGGACAAGAAA
* * ** * * *
18858513 AGTCCATTTATAGTCACTAATGCTTTC--ATACACTGTGTTACTTA-CTTTAAGTGGATTTATAA
248 AGTTCATTTATAGTCACTCATGCCCTCGAAAAC-CT-AGTTAC-TAGCTTTAAAT-GATTT-TAA
* **
18858575 CTT-T-TGAAATGATTTT-AAATTGAA
308 ATTATAT-AAACAATTTTAAAATTGAA
* * *
18858599 -TTTTTTTATATTGTTGG-TTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGGAAATGTGAAGCA
1 TTTTTTTTACATT-TTGGTTTAAAA-AGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACGTGAAGCA
* * * * * * * *
18858662 AAAGCC-AATCATTAACAAGAAAAGTCTATTTATAATCACTCATGGCTTGGAAAGCCTTATAACT
64 AAAACCTTAT-ATTGACAAGAAAAGTCTAGTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTATTACT
* * * * * * * * * *
18858726 CGCTTTCAGTGGTTTTAGAACTTTTTAAATGATTTTGAATTGATTTTGTTTTCACATTTTTTGTC
128 CACTTTAAGTGGATTTATAACTTTTTAAATAATTTTAAATTGAATTT-TTTT-GCATTTTTGGTT
* * ** *
18858791 AAAA-AAGATCATAATTTGATGTTTTCATCAAGAAACATGTAGAAAATGGCATACATTGACAAGA
191 AAAACAA-ATCGTAATTTGATGTTTGCATCGGGAAAC--GT---AAA--GC--ACATGGACAAGA
* * * *
18858855 AAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCCTCGAAAGCCTAGTTAGTCA-CTTTAAATGGTTTTATAA
246 AAAGTTCATTTATAGTCACTCATGCCCTCGAAAACCTAGTTACT-AGCTTTAAATGATTTTA-AA
** ** *
18858919 TCGTATAAATGATTTTAAATTTGAA
309 TTATATAAACAATTTTAAAATTGAA
* * * *
18858944 TTTTTCTCTT---TTTTGG-TTAAACGAGATCATAATTTGAAGCTTGCATCAGGAAACATGAAG-
1 TTTTT-T-TTACATTTTGGTTTAAA-AAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACGTGAAGC
* * * **
18859004 AAAAAGCCATACATTGACAAGAAAAGTCTA-TTGATAGTCACTCACGCCTTCCAAAGCCTTATTA
63 AAAAA-CCTTATATTGACAAGAAAAGTCTAGTT-ATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTATTA
* * * * ** *
18859068 CTCGCTTTAAGTGGATTTATAACATTTTACATAATTTTAAATTAAATTTTTTCTTAATTTTTGAT
126 CTCACTTTAAGTGGATTTATAACTTTTTAAATAATTTTAAATTGAATTTTTT-TGCATTTTTGGT
* * *
18859133 TAAAACATA-CTGTAATTTGATGTTTGCATCGGGAAAGGTGATGCGAAAGCTATCTATTGACAAG
190 TAAAACAAATC-GTAATTTGATGTTTGCATCGGGAAA--CG-T---AAAGC-A-C-ATGGACAAG
* * ** * * * * * *
18859197 AAAAGTCCATTTATAGTTACTCATAACTTC-ATAAGCCTTGTTACTTGCTTTAAGTGGGTTTATA
245 AAAAGTTCATTTATAGTCACTCATGCCCTCGA-AAACCTAGTTACTAGCTTTAAAT-GATTT-TA
* * ** **
18859261 ACTT-TTTAAATGA-TTTGGAATTGAA
307 AATTATATAAACAATTTTAAAATTGAA
* * * * * * ** * * **
18859286 -TTCTTTTACATTTTTGGCTAAAAAAGACCATAATTTGTTGTTTGGATTGGGAAATGTGTAGTGA
1 TTTTTTTTACA-TTTTGGTTTAAAAAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACGTGAAGCAA
* * * * ** * * ** * *
18859350 AAACCTTCTGTTGATAAGAAAAGTCCAACTATAGTTACTCATACCTTCAAAAGCCATATTACTCG
65 AAACCTTATATTGACAAGAAAAGTCTAGTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCA
* * * * ** *
18859415 CTTTAAGTGGACTTATAACTTTTTAGATGATTTTAAATTGAATTATTTT--ATATTTTATTTGAA
130 CTTTAAGTGGATTTATAACTTTTTAAATAATTTTAAATTGAATTTTTTTGCAT-TTTTGGTTAAA
** * * * * **
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125 AACGTGAAGCGAAAA-CCATCCATTGACAAG-AAAA-GTCCATTTATAGT
* * ** * * * **
18857147 AATTCATGCCTTCAAAAGCCTTTTTAATCGCTTTAAGTGGATTTCTAACCCTTT-AATGATTTTA
1 CACTCATGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTTTAAATGATTTTA
* * * * * *
18857211 AAGTGAATGTATTTTACATTTTTGGTTAAAATAGATCATAATTTGATGTTTGGAT-TGGAAAATG
66 AATTGAATTTTTTTTACATTTTTGGTTAAAA-AGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGG-AAACG
* *** *
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129 TGAAGCGAAAA-CCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGT
* * ** * *
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* * * * * * **
18857379 TCAATTTGAATTTGTTTT-CATTTTTGGTTAAAAAAAAATCATAGTTTGTTGTTTGCATTGGGAA
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* * *** * * *
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126 ACGTGAAGCGAAAACCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGT
* * * * * * * * * * * *
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1 CACTCATGCCTTTGAAAGCCTTA-TTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACT-TTTTAAATGATTT
* * * *
18857550 TAAAATTGAA-TTTTTCT-CTTTTTTGGTTAAACCAGATCATAATTTGATGTTTACATC-GAGAA
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* * * *
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126 ACGTGAAGCGAAAA-CCATC-CATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGT
* * ** *
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1 CACTCATGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTTTAAATGATTTTA
** * ** * * *
18857723 AATTGAATTTTATTTTGTATTTTTGGTTAAAACATATTGTAATTTAATGTTTGGATCAGGAAACA
66 AATTGAATTTT-TTTTACATTTTTGGTTAAAA-AGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACG
* * * *
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129 TGAAGCGAAAACCATCCATTGACAAGAAAAGTCCA-TT-TA-T-----AGT
* * * * * *
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1 CACTCATGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAGTGGAT-TTATAACTTTTTAAATGATTTT
* *** * * **
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* * * * *
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128 GTGAAGCGAAAACCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGT
** *
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1 CACTCATGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTTTAAATGATTTTA
* * * *
18858076 AATT-AAATTCTTTTACATTTTTGGTTAAAACAAATCATAATTTGATGTTTGCATTAGGAAACGT
66 AATTGAATTTTTTTTACATTTTTGGTTAAAA-AGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACGT
* * * * *
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* * * * *
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* * * * **
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* * ** ** * *
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128 GTGAAGCGAAAACCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGT
* * *
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1 CACTCATGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTTTAAATGATTTTA
* * ** ** * * *
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* * * * * *
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* * * * ** *
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* * * *
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* * *
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* * * * * * *
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1 CACTCATGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTTTAAATGATTTTA
* * * *
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* * * *
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* * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * ** *
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* * * ** * **
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* * ** * * *
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* * * * ** *
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* * * *
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* * * * ***
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** * * *
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* * * **
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* ** * * *
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1 CACTCATGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTTTAAATGATTTTA
* * *
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*
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* * *
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* * * * * * *
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* * * * *
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* * * * *
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*
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* * *
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* * *
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* * * * * * *
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*
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* * * * * * *
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* * * *
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* * * * *
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* * ** *
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* * *
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* * * * *
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*
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* * *
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* * *
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*
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* * * *
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* * * *
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* * *
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* * *
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* * ** * *
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* * * * * * *
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* * * *
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* * * * *
18865302 CATTTATAGTCACTCATGTCTTTGAAAGCTTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTGTAATCTCATA
1 CATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATA
* * * ** *
18865367 ATTTATTTTAAGTTGAATTGTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTGATTACTTATCTC
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* * * *
18865432 GAGAAACTTGATGCGAAAGCCATCCATTGAAAAGAAAAGTT
130 GAGAAACGTGAAGCGAAAGCCAT-CATTGACAAGAAAAGTC
* * * * * * * * *
18865473 TAGTTATAGTCACTAATGGCTTCAAAAGCCTTATTACTTGCTTCAAATGGTTTTATAATATGATA
1 CATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATA
** * *
18865538 ATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTCAGTTAAGGA-AGATTATAATTAAATGTTTACCT
66 ATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAA-AACAGATTATAATTGAATGTTTACCT
* *
18865602 CGAGAAACGTGAAGCGAAAGCTATTCATTGACATGAAAAGTC
130 -GAGAAACGTGAAGCGAAAGCCA-TCATTGACAAGAAAAGTC
* * *
18865644 CATTTATAGTCACTCATGCCTTCGGAAGCCTTATTACTCACTTAAAATGGTTTTATAATCTCATA
1 CATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATA
** * * *
18865709 ATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTCAGTTAAGAA-AGATTATATTTAAATGTTTGCCT
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18865773 CGAGAAACGTGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAA
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Statistics
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Matches are distributed among these distances:
169 32 0.02
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ACGTcount: A:0.33, C:0.14, G:0.14, T:0.38
Consensus pattern (169 bp):
CATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATA
ATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTTTACCTG
AGAAACGTGAAGCGAAAGCCATCATTGACAAGAAAAGTC
Found at i:18865220 original size:513 final size:513
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18863581 TCGGGTTTTA
* *
18863591 CATTTATAGTCACTCATACCTTCGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCTGATA
1 CATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTGATA
** * *
18863656 ATTGATTTTAACCTGAATTTGTTTACATTTTTTGTTAAAACAGATTATAATTGATTGTTTACCAT
66 ATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTTTACC-T
* * * ** * * *
18863721 GGGAAACATGAAGCTAAAGCCCTCTGTTGGCAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTAATGGCTTCG
130 AGGAAACATGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCG
* * * *
18863786 AAAGCCTTATTACTCATTTTAAATGGTTTTATAATTTCATCATTGATTTTAAGTTG-AGTTTTTT
195 AAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCATTATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTT
* * * * *
18863850 TACCTTTTTGATTAAAACAGATTATAATTGAATGTTTGCCTCAGGAAACGTGAGGCGAAAGCCAT
260 TACATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTTTACCTCAAGAAACGTGAAGCGAAAGCCAT
18863915 CGATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTAAAA
325 CGATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTAAAA
* * * * *
18863980 TGATTTTATAATCTCATAATTGATTTTGAGTTGAATTGTTTTTACATTTTTGGTTAAAAAAGGCT
390 TGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATT-TTTTTACATTTTCGGTTAAGAAAGACT
* * *
18864045 ATAATTAAATGTTTGCC-CTGTGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCA-TGACAAGAAAAGTT
454 ATAATTAAATGTTTACCTC-GAGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTC
* * * * * *
18864104 CATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCTTTATTACACACTTTTAATGGTTTAATAAACTGATA
1 CATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTGATA
18864169 ATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTTTACC-A
66 ATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTTTACCTA
** * * * * * * *
18864233 TGAGAAATGTGAAGCTAAACCCCTTCGTTGGA-ATGAAAAGTTCATTTATAGTCACTCATGCCTT
131 -G-GAAACATGAAGCGAAAGCCATCCATT-GACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTT
* * * *
18864297 CGAAAGCCTTGTTTCTCACTTTAAATGGTTTTCTAATCTCATTATTGATTTT-AGTTTGAGTTTT
193 CGAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCATTATTGATTTTAAG-TTGAATTTT
* * * * * *
18864361 TTTTGCCTTTTTGGTTAAAACATATCATAATTGAATGTTTGCCTCATGAAACGTGAAGCGAAAGC
257 TTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTTTACCTCAAGAAACGTGAAGCGAAAGC
* * * * *** *
18864426 CGTCGATTGACAAGAAACGTTCATATATAGTCACTCATGCCTTTGGAAGCCTTATTACTCACTTA
322 CATCGATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTA
*
18864491 AAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTTACATTTTCGATTAAGAAAG
387 AAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAA-TTTTTTTACATTTTCGGTTAAGAAAG
* * * *
18864556 GCTATAATTAAATGTTTACCTCGAGAAACGTGAAGCAAAAGTCATCTATTGTCAAGAAAAGTC
451 ACTATAATTAAATGTTTACCTCGAGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTC
* * * *
18864619 CATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTATTACACGCTTTAAATAGTTTTATAAACTGATA
1 CATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTGATA
18864684 ATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTGTTAACAA-AGATTATAATTGAATGTTTACCT
66 ATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTGTTAA-AACAGATTATAATTGAATGTTTACC-
*
18864748 TAGGAAACATGGAA-CAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTT
129 TAGGAAACAT-GAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTT
* * *
18864812 CAAAAGCCTTATTACTCGCTCTAAATGG-TTT-TAATCTCATTATTGATTTTAAGTTGAATTTTT
193 CGAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCATTATTGATTTTAAGTTGAATTTTT
* *
18864875 TTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTTTACCTCAAGAAACGTGAAACGAAAGCC
258 TTTACATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTTTACCTCAAGAAACGTGAAGCGAAAGCC
* * * * *
18864940 AACGATTGAGAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATACCTTCGAAAA-CCTTATTACTTGCTTT
323 ATCGATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTC-AAAAGCCTTATTACTCGCTTA
* * *
18865004 AACTGGTTTTATAATCTCATAATTGAATTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAGAAAGA
387 AAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTCGGTTAAGAAAGA
* * * * *
18865069 TTATAATTAAATGTTTGCCTTGAGAAACATGAAGCAAAATCCATCCATTGACAAGAAAAGTC
452 CTATAATTAAATGTTTACCTCGAGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTC
* * **
18865131 CATTTATAGTCATTCATGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTACGATCTCG-T
1 CATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCT-GAT
* * * * * * *
18865195 TATTCATTTTAAGTTGATTTTTTTTTACA-GTTTTGATTAAAACAAATTATAATTAAATGTTTGC
65 AATTGATTTTAAGTTGA-ATTTTTTTACATTTTTTG-TTAAAACAGATTATAATTGAATGTTTAC
* * * *
18865259 CTTAGGAAACATAAAGCGAAAGCCATCAATTGA-ATGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGTCT
128 C-TAGGAAACATGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCT
* * * * * *
18865323 TTGAAAGCTTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTGTAATCTCATAATTTATTTTAAGTTGAA-TTG
192 TCGAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCATTATTGATTTTAAGTTGAATTTT
* ** * * * *
18865387 TTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTGATTACTTATCTCGAGAAACTTGATGCGAAAGC
257 TTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTTTACCTCAAGAAACGTGAAGCGAAAGC
* * ** * * * * *
18865452 CATCCATTGAAAAGAAAAGTTTAGTTATAGTCACTAATGGCTTCAAAAGCCTTATTACTTGCTTC
322 CATCGATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTA
* * * *
18865517 AAATGGTTTTATAATATGATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTCAGTTAAGGAAGA
387 AAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTCGGTTAAGAAAGA
* * * * *
18865582 TTATAATTAAATGTTTACCTCGAGAAACGTGAAGCGAAAGCTATTCATTGACATGAAAAGTC
452 CTATAATTAAATGTTTACCTCGAGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTC
* * * *
18865644 CATTTATAGTCACTCATGCCTTCGGAAGCCTTATTACTCACTTAAAATGGTTTTATAATCTCATA
1 CATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTGATA
** * * *
18865709 ATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTCAGTTAAGAA-AGATTATATTTAAATGTTTGCCT
66 ATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTGTTAA-AACAGATTATAATTGAATGTTTACCT
* *
18865773 CGAGAAACGTGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAA
130 AG-GAAACATGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAA
18865811 GTTGTCACGA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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517 1 0.00
ACGTcount: A:0.33, C:0.14, G:0.14, T:0.38
Consensus pattern (513 bp):
CATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTGATA
ATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTTGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTTTACCTA
GGAAACATGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGA
AAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCATTATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTT
ACATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTTTACCTCAAGAAACGTGAAGCGAAAGCCATC
GATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTAAAAT
GGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTCGGTTAAGAAAGACTAT
AATTAAATGTTTACCTCGAGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTC
Found at i:18868932 original size:171 final size:170
Alignment explanation
Indices: 18868710--18871803 Score: 2290
Period size: 171 Copynumber: 18.1 Consensus size: 170
18868700 CGGGCTTTAC
* * * * *
18868710 AAAAGTCCATTTATAGCCACTCAT-AC-TCGAAAACCTTATTACTCCCTTTAAATGGATTTATAA
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* *
18868773 TCTGATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTCACATTTTTGGTTAAAACAAATTATAATTGAATGT
66 TCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTT-ACATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTGAATGT
* * * * ** *
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* *
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* * * * * * *
18868944 TCTCATAATTTATTTTAGGTTGAATTTTTTTACATTTTTGATTAAAACAAATGATAGTT-AGATT
66 TCTCATAATTGATTTTAAGTTGAA-TTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTGA-ATG
* * * **
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* * * *
18869050 AAAAGTCCTTTTATAGTCACTCATTCCTTCGAAAGGCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAG
1 AAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAA
* * * *
18869115 TCTCATAATTTATTTTAGGTTGAATATTTTTACAATTTTGGTTAAAACAGATTATAATTGACTGT
66 TCTCATAATTGATTTTAAGTTGAAT-TTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTGAATGT
* **
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*
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* * * *
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* * * * **
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* * * * * *
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1 AAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAA
* * * * *
18869455 TTTCATTATTGATTTTAAGTTGAGTTTTTTTACCTTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTGAATTT
66 TCTCATAATTGATTTTAAGTTGA-ATTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTGAATGT
* * * * * * *
18869520 TTACCTCCA-AAAATGT-AAGCAAAATACCATCTATTGAGAAG
130 TTGCCT-CAGGAAACGTGAAGCGAAA-GCCATCGATTGACAAG
* * ** * * * * * *
18869561 AAAAGTTCATTTATAATCACTCATGTTTTCAAAAGCCTTAATACTTGCTTTAGATGATTTCATAA
1 AAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAA
* * * *
18869626 TCTCATAATTGATTTTAAGTTGAACTTTTTTATATTTTTTGTTAAAACAGATTCTTATTGAATGT
66 TCTCATAATTGATTTTAAGTTGAA-TTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTGAATGT
* * * * * *
18869691 TTACCTTAGGAAACGTGGAGCTAAAGTTC-TCCG-TTGGCAAG
130 TTGCCTCAGGAAACGTGAAGCGAAAG-CCAT-CGATTGACAAG
* * *
18869732 AAAAGTTCATTTATAGTCACTCATG-CTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTAAAATGGTTTTATAA
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* * *
18869796 TCTCATTATTGATTTTAAGTTGAATTTCTTTACATTATTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGT
66 TCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTT-TTTACATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTGAATGT
* * *
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* * **
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1 AAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAA
* * *
18869967 TCTCATAATTGAATTTAAGTTGAATTCTTTTGCATTTTTGGTTAAGAA-AGATTATAATTAAATG
66 TCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATT-TTTTACATTTTTGGTTAA-AACAGATTATAATTGAATG
* * * * *
18870031 TTTGCCTTAGGAAACGTGTAGCAAAAGTCATCAATTGACAAG
129 TTTGCCTCAGGAAACGTGAAGCGAAAGCCATCGATTGACAAG
* * *
18870073 AAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAAATAGTTTTATAA
1 AAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAA
* * *
18870138 TCTCATTATTGATTTTAAGTTTAA-TTTTAACATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTT
66 TCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTT
* ** * * *
18870202 TACCTTGGGAAACGTGAAGCAAAAACCA-CTGATTGACATG
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* ** *
18870242 AAAAG-CCAACTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTACTTTAAATGGTTTTGTA
1 AAAAGTCC-ATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATA
* * * *
18870306 ATCTCATAA-TGTATTTTAGGTTGAATTGTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATCATCATTTG-A
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* ** * * ** * *
18870369 TGTTTGCATTGGGAAATGTGAAGCAAAAATCAACCA-TGAACAAG
127 TGTTTGCCTCAGGAAACGTGAAGCGAAAGCCATCGATTG-ACAAG
* ** * * *
18870413 TAAAGTCCATTTATAAACAC-CAATAG-C-TCGCAAAGCCTTTTTACTCGCTTTAAGTGATTTTA
1 AAAAGTCCATTTATAGTCACTC-AT-GCCTTCG-AAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTA
* ** * * ** * *
18870475 -AAACTTTTTAAATGATTTTTAGTTGTTTTTTTTTTACATTTGTGGTTAAAA-ACGATCATAATT
63 TAATC-TCATAATTGATTTTAAGTTG--AATTTTTTACATTTTTGGTTAAAACA-GATTATAATT
** * * *
18870538 -TTTGTTTG-C-AATGGTAAACATGAAGCGAAAGCCTTCCG-TTGACAAG
124 GAATGTTTGCCTCA-GG-AAACGTGAAGCGAAAGCCAT-CGATTGACAAG
* * * * * *
18870584 AAAAGTCTAGTTATAGTCACTCATACCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAA
1 AAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAA
** * * * * * * *
18870649 -CTTTTTAAATGATTTTAAATTCAATTGTTTTTAAATTTTTGATTAAAAAAGATTGTAATTG-AT
66 TC-TCATAATTGATTTTAAGTTGAA-T-TTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTGAAT
* * * * * *
18870712 GTTTGCATCAGAAAATGTGAAGCAAAAACCATCCATTGACAAG
128 GTTTGCCTCAGGAAACGTGAAGCGAAAGCCATCGATTGACAAG
* * * * * ** * * *
18870755 AAAAGTCCAGTTATAGTAACTTATGCCTTC-ATACGCGTTGCTACTTGCTTCAAATGGATTTATA
1 AAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGA-AAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATA
** * * * * * *
18870819 A-CTTTTTAAATT-ATTTTAAATTAAATTTTTTGGCATTTTTGGTTAACATAGATCATAATTTG-
65 ATC-TCAT-AATTGATTTTAAGTTGAATTTTTT-ACATTTTTGGTTAAAACAGATTATAA-TTGA
* * * * ** * *
18870881 GTGTTTGCATCAAGAAACGTGAAGCGAAAGCCAACCTTTAATAAG
126 ATGTTTGCCTCAGGAAACGTGAAGCGAAAGCCATCGATTGACAAG
* * * *
18870926 AAAAATCCATTTATAGTCACTCATGCCTT-GCAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGTTTTAGA
1 AAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCG-AAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATA
** * * *
18870990 A-CTTTTTCAA-TGATTTTGAA-TTGAAAATTTTTTAAATTTTTGATT-AAACAAGATCATAATT
65 ATC-TCAT-AATTGATTTT-AAGTTG--AATTTTTTACATTTTTGGTTAAAAC-AGATTATAATT
* * * * * * * *
18871051 -TATGTTTGCATCGGGAAACATAAAGTGAAAACCTTTCG-TTGACAAG
124 GAATGTTTGCCTCAGGAAACGTGAAGCGAAAGCC-ATCGATTGACAAG
* * * * * * * *
18871097 AAATGTCAAGTTATAGCCACTCATGCCTTCAAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAA
1 AAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAA
** * * * *
18871162 -CTTTTTCAA-TGATTTTAAATTGAATTTTCTTTTACATTTTTGGTTAACACATATCATAATTTG
66 TC-TCAT-AATTGATTTTAAGTTGAA--TT-TTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATTATAA-TTG
* * * * * *
18871225 AA-GTTTGCATCAAGAAACGTGAAGCAAAAGCCAACCATTAACAAG
125 AATGTTTGCCTCAGGAAACGTGAAGCGAAAGCCATCGATTGACAAG
* * * * * * *
18871270 AAAAATCCATTTATAGTCACTCATGGCTTAGAAAGCCTTTTTACTCGCTTTAAGTGGTTTCAGAA
1 AAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAA
* ** * * ** * * *
18871335 CCTTTTAAATGATTTTGAA-TTTAATTTTTTTTACATTTTCAGTTAAAAAAGATAATAATT-TAT
66 TCTCATAATTGATTTT-AAGTTGAA--TTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTGAAT
* * ** * *
18871398 GTTTGCACT-AGGAAATGTCAAGTAAAAACCTTCCG-TTGACAAG
128 GTTTGC-CTCAGGAAACGTGAAGCGAAAGCCAT-CGATTGACAAG
* * * * * * **
18871441 -AAAG-CCTAGTCATAATCAGTCATGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAGTGAATTTATA
1 AAAAGTCC-ATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATA
** * * ** * * *
18871504 A-CTTTTTAAATGATTTTAAATTCAGTTTTTTTTTTA-ATTTTTAGTTAAAACATATCATAATTT
65 ATC-TCATAATTGATTTTAAGTT--G--AATTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATTATAA-TT
* ** ** * * *
18871567 G-ATATTTGGATTGGGAAAGGTGAAGCGAAAGTCATCCATTGACAAG
124 GAATGTTTGCCTCAGGAAACGTGAAGCGAAAGCCATCGATTGACAAG
* * * * * *
18871613 AAAAGTCCATTTATAGTTACTCATGCCTT-TATATA-CCTTGTTACTTGCTTTAAGTGGATTTAT
1 AAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGA-A-AGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTAT
* ** * * * * * * * *
18871676 -AGCTTTTTAAATGATTTTAAATGGAATTTGTTTTACATTTTTGATTCAAATAGATCATTATTTG
64 AATC-TCATAATTGATTTTAAGTTGAA-TT-TTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATTA-TAATTG
** * * * * * *
18871740 -ATGTTTGTATCGGGAAACATGAAGCAAAAGCCAACTATTAACAAG
125 AATGTTTGCCTCAGGAAACGTGAAGCGAAAGCCATCGATTGACAAG
18871785 AAAAGTCCATTTATAGTCA
1 AAAAGTCCATTTATAGTCA
18871804 TTAATGGCTC
Statistics
Matches: 2383, Mismatches: 431, Indels: 219
0.79 0.14 0.07
Matches are distributed among these distances:
168 6 0.00
169 296 0.12
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ACGTcount: A:0.33, C:0.14, G:0.14, T:0.39
Consensus pattern (170 bp):
AAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAA
TCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTT
TGCCTCAGGAAACGTGAAGCGAAAGCCATCGATTGACAAG
Found at i:18869672 original size:511 final size:507
Alignment explanation
Indices: 18868710--18871492 Score: 2092
Period size: 511 Copynumber: 5.4 Consensus size: 507
18868700 CGGGCTTTAC
* * * * *
18868710 AAAAGTCCATTTATAGCCACTCAT-AC-TCGAAAACCTTATTACTCCCTTTAAATGGATTTATAA
1 AAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTCC-TTAAATGGTTTTATAA
* * *
18868773 TCTGATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTCACATTTTTGGTTAAAACAAATTATAATTGAATGT
65 TCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGT
* * * * **
18868838 TTGCCTCAGAAAACGTGAAGCGATAGCTATTGATCAATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAT
130 TTGCCTCAGGAAACGTGAAGCGAAAGCCATCGATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAT
* * * * *
18868903 GCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGATTTTATAATCTCATAATTTATTTTAGGTTGAA
195 GCCTTCGAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAA
* * * * * * *
18868968 TTTTTTTACATTTTTGATTAAAACAAATGATAGTTAGATTTTTGCCTAAGGGAACGTGAAGCGAA
260 TTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTA-ATTTTTGCCTAA--AAATGT-AAGCAAA
* * * * * * *
18869033 AGCCATCCATTGTGAAGAAAAGTCCTTTTATAGTCACTCAT-TCCTTCGAAAGGCTTATTACTCG
321 ATCCATCAATTGAGAAGAAAAGTTCATTTATAGTCACTCATGT-CTTCGAAAGCCTTATTACTTG
* * * * *
18869097 CTTTAAATGGTTTTATAGTCTCATAATTTATTTTAGGTTGAATATTTTTACAATTTTGGTTAAAA
385 CTTTAAATGATTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAAT-TTTTTACATTTTTGGTTAAAA
* *
18869162 CAGATTATAATTGACTGTTTACCTTGGGAAACGTGAAGCGAAAGCCATGCATTGACAAG
449 CAGATTATAATTGAATGTTTACCTTGGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATGCATTGACAAG
*
18869221 AAAAGTCCA-TTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTCCTTAAATGGTTTTATTAT
1 AAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTCCTTAAATGGTTTTATAAT
* * *
18869285 CTCATAATTTATTTTAAGTTGAATTTTTTTACCTTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATATT
66 CTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTT
* * * * ** * * * *
18869350 TACCTCAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGGGAAGCAAAGTCCATTTATAGTCACCCTTA
131 TGCCTCAGGAAACGTGAAGCGAAAGCCATCGATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATG
* * * *
18869415 CCTTCAAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATTTCATTATTGATTTTAAGTTGAGT
196 CCTTCGAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAAT
* *
18869480 TTTTTTACCTTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTGAATTTTTACCTCCAAAAATGTAAGCAAAAT
261 TTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATT-AATTTTTGCCT--AAAAATGTAAGCAAAAT
* * * * *
18869545 ACCATCTATTGAGAAGAAAAGTTCATTTATAATCACTCATGTTTTCAAAAGCCTTAATACTTGCT
323 -CCATCAATTGAGAAGAAAAGTTCATTTATAGTCACTCATGTCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCT
* * * *
18869610 TTAGATGATTTCATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAACTTTTTTATATTTTTTGTTAAAACA
387 TTAAATGATTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAA-TTTTTTACATTTTTGGTTAAAACA
* * * * * * * * *
18869675 GATTCTTATTGAATGTTTACCTTAGGAAACGTGGAGCTAAAGTTC-TCCGTTGGCAAG
451 GATTATAATTGAATGTTTACCTTGGGAAACGTGAAGCAAAAG-CCATGCATTGACAAG
* *
18869732 AAAAGTTCATTTATAGTCACTCATG-CTTCAAAAGCCTTATTAC-TCGCTTAAAATGGTTTTATA
1 AAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTC-CTT-AAATGGTTTTATA
* * *
18869795 ATCTCATTATTGATTTTAAGTTGAATTTCTTTACATTATTGGTTAAAACATATTATAATTGAATG
64 ATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATG
* * *
18869860 TTTGCCTC-GAGAAACGTGAAGCGAAAGCCAACGATTGATAAAAAAAGTCTATTTATAGTCACTC
129 TTTGCCTCAG-GAAACGTGAAGCGAAAGCCATCGATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTC
* ** *
18869924 ATGCCTTCGGAAGCCTTATTACTTTCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGAATTTAAGTTG
193 ATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTG
* * * *
18869989 AATTCTTTTGCATTTTTGGTTAAGAA-AGATTATAATTAAATGTTTGCCTTAGGAAACGTGT-AG
258 AATTTTTTTACATTTTTGGTTAA-AACAGATTATAATT-AATTTTTGCC-TA--AAA-ATGTAAG
* *
18870052 CAAAAGT-CATCAATTGACAAGAAAAG-TCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATT
317 CAAAA-TCCATCAATTGAGAAGAAAAGTTC-ATTTATAGTCACTCATGTCTTCGAAAGCCTTATT
* * *
18870115 ACTTGCTTTAAAT-AGTTTTATAATCTCATTATTGATTTTAAGTTTAA-TTTTAACATTTTTGGT
380 ACTTGCTTTAAATGA-TTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTACATTTTTGGT
* *
18870178 TAAAACAGATTATAATTGAATGTTTACCTTGGGAAACGTGAAGCAAAAACCACTG-ATTGACATG
444 TAAAACAGATTATAATTGAATGTTTACCTTGGGAAACGTGAAGCAAAAGCCA-TGCATTGACAAG
* * *
18870242 AAAAG-CCAACTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTACTTTAAATGGTTTTGTA
1 AAAAGTCC-ATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTT-CCTTAAATGGTTTTATA
* * * *
18870306 ATCTCATAA-TGTATTTTAGGTTGAATTGTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATCATCATTTG-A
64 ATCTCATAATTG-ATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTAT-AATTGAA
* ** * * ** * * * * **
18870369 TGTTTGCATTGGGAAATGTGAAGCAAAAATCAACCA-TGAACAAGTAAAGTCCATTTATAAACAC
127 TGTTTGCCTCAGGAAACGTGAAGCGAAAGCCATCGATTG-ATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCAC
* * * * * ** *
18870433 -CAATAG-C-TCGCAAAGCCTTTTTACTCGCTTTAAGTGATTTTA-AAACTTTTTAAATGATTTT
191 TC-AT-GCCTTCG-AAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATC-TCATAATTGATTTT
* ** * * * * *
18870494 TAGTTGTTTTTTTTTTACATTTGTGGTTAAAA-ACGATCATAATT-TTTGTTTGCAATGGTAAAC
252 AAGTTG-AATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACA-GATTATAATTAATT-TTTGC----CTAAAA
* * * ** * * ** *
18870557 ATG-AAGCGAAAGCCTTCCGTTGACAAGAAAAG-TCTAGTTATAGTCACTCATACCTTTGAAAGC
310 ATGTAAGCAAAATCCATCAATTGAGAAGAAAAGTTC-ATTTATAGTCACTCATGTCTTCGAAAGC
* * ** * * * *
18870620 CTTATTACTCGCTTTAAGTGGA-TTTATAA-CTTTTTAAATGATTTTAAATTCAATTGTTTTTAA
374 CTTATTACTTGCTTTAAAT-GATTTTATAATC-TCATAATTGATTTTAAGTTGAA-T-TTTTTAC
* * * * * ** * * * *
18870683 ATTTTTGATTAAAAAAGATTGTAATTG-ATGTTTGCATCAGAAAATGTGAAGCAAAAACCATCCA
435 ATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTGAATGTTTACCTTGGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATGCA
18870747 TTGACAAG
500 TTGACAAG
* * * * * ** * *
18870755 AAAAGTCCAGTTATAGTAACTTATGCCTTC-ATACGCGTTGCTACTTGCTTCAAATGGATTTATA
1 AAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGA-AAGCCTTATTACTTCCTT-AAATGGTTTTATA
** * * ** * * * *
18870819 A-CTTTTTAAATT-ATTTTAAATTAAATTTTTTGGCATTTTTGGTTAACATAGATCATAATTTG-
64 ATC-TCAT-AATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAA-TTGA
* * * * ** * *
18870881 GTGTTTGCATCAAGAAACGTGAAGCGAAAGCCAACCTTTAATAAGAAAAATCCATTTATAGTCAC
126 ATGTTTGCCTCAGGAAACGTGAAGCGAAAGCCATCGATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCAC
* * * * **
18870946 TCATGCCTT-GCAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGTTTTAGAA-CTTTTTCAA-TGATTTTG
191 TCATGCCTTCG-AAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATC-TCAT-AATTGATTTT-
* * * * * * * *
18871008 AA-TTGAAAATTTTTTAAATTTTTGATT-AAACAAGATCATAATTTATGTTTGCATCGGGAAACA
252 AAGTTG-AATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAAC-AGATTATAATTAATTTTTGC--C--TAAAAA
* * * * * * * * * *
18871071 T-AAAGTGAAAA-CCTTTC-GTTGACAAGAAATG-TCAAGTTATAGCCACTCATGCCTTCAAAAG
311 TGTAAG-CAAAATCC-ATCAATTGAGAAGAAAAGTTC-ATTTATAGTCACTCATGTCTTCGAAAG
* * * ** *
18871132 CCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGA-TTTATAA-CTTTTTCAA-TGATTTTAAATTGAATTTTCTTT
373 CCTTATTACTTGCTTTAAAT-GATTTTATAATC-TCAT-AATTGATTTTAAGTTGAA--TT-TTT
* * * * * ***
18871194 TACATTTTTGGTTAACACATATCATAATTTGAA-GTTTGCATCAAGAAACGTGAAGCAAAAGCCA
432 TACATTTTTGGTTAAAACAGATTATAA-TTGAATGTTTACCTTGGGAAACGTGAAGCAAAAGCCA
** *
18871258 ACCATTAACAAG
496 TGCATTGACAAG
* * * * * * *
18871270 AAAAATCCATTTATAGTCACTCATGGCTTAGAAAGCCTTTTTAC-TCGCTTTAAGTGGTTTCAGA
1 AAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTC-C-TTAAATGGTTTTATA
* ** * * ** * * * *
18871334 ACCTTTTAAATGATTTTGAA-TTTAATTTTTTTTACATTTTCAGTTAAAAAAGATAATAATT-TA
64 ATCTCATAATTGATTTT-AAGTTGAA-TTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAA
* * ** * * * * * *
18871397 TGTTTGCACT-AGGAAATGTCAAGTAAAAACCTTCCG-TTGACAAG-AAAG-CCTAGTCATAATC
127 TGTTTGC-CTCAGGAAACGTGAAGCGAAAGCCAT-CGATTGATAAGAAAAGTCC-ATTTATAGTC
* * *
18871458 AGTCATGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAA
189 ACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCACTTTAA
18871493 GTGAATTTAT
Statistics
Matches: 1847, Mismatches: 335, Indels: 177
0.78 0.14 0.08
Matches are distributed among these distances:
509 2 0.00
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ACGTcount: A:0.33, C:0.15, G:0.14, T:0.38
Consensus pattern (507 bp):
AAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTCCTTAAATGGTTTTATAAT
CTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACATATTATAATTGAATGTT
TGCCTCAGGAAACGTGAAGCGAAAGCCATCGATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATG
CCTTCGAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAAT
TTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTAATTTTTGCCTAAAAATGTAAGCAAAATCCA
TCAATTGAGAAGAAAAGTTCATTTATAGTCACTCATGTCTTCGAAAGCCTTATTACTTGCTTTAA
ATGATTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATTA
TAATTGAATGTTTACCTTGGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATGCATTGACAAG
Found at i:18870280 original size:852 final size:852
Alignment explanation
Indices: 18868755--18870355 Score: 2134
Period size: 852 Copynumber: 1.9 Consensus size: 852
18868745 TTATTACTCC
*
18868755 CTTTAAATGGATTTATAATCTGATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTCACATTTTTGGTTAAAA
1 CTTTAAATGGATTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTCACATTTTTGGTTAAAA
* * * *
18868820 CAAATTATAATTGAATGTTTGCCTCAGAAAACGTGAAGCGATAGCTATTGATCAATAAGAAAAGT
66 CAAATTATAATTGAATGTTTACCTCAGAAAACGTGAAGCGAAAGCTATCGATCAACAAGAAAAGT
** *
18868885 CCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGATTTTATAATCTCAT
131 CCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTAAAATGATTTTATAATCTCAT
* * * * * *
18868950 AATTTATTTTAGGTTGAATTTTTTTACATTTTTGATTAAAACAAATGATAGTTAGATTTTTGCCT
196 AATTGATTTTAAGTTGAATTTCTTTACATTATTGATTAAAACAAATGATAATTAGATGTTTGCCT
* * * *
18869015 AAGGGAACGTGAAGCGAAAGCCATCCATTGTGAAGAAAAGTCCTTTTATAGTCACTCATTCCTTC
261 AAGGAAACGTGAAGCGAAAGCCAACCATTGTGAAAAAAAGTCCTTTTATAGTCACTCATGCCTTC
* * * * *
18869080 GAAAGGCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAGTCTCATAATTTATTTTAGGTTGAATATTTT
326 GAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGAATTTAAGTTGAATATTTT
* * * *
18869145 TACAATTTTGGTTAAAACAGATTATAATTGACTGTTTACCTTGGGAAACGTGAAGCGAAAGCCAT
391 TACAATTTTGGTTAAAACAGATTATAATTAAATGTTTACCTTAGGAAACGTGAAGCAAAAGCCAT
*
18869210 GCATTGACAAGAAAAGTCCATTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTCCTTAAATG
456 GCATTGACAAGAAAAGTCCATTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTCCTTAAATA
* * * * *
18869275 GTTTTATTATCTCATAATTTATTTTAAGTTGAATTTTTTTACCTTTTTGGTTAAAACATATTATA
521 GTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAA-TTTTTAACATTTTTGGTTAAAACAGATTATA
* ** * *
18869340 ATTGAATATTTACCTCAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGGGAAGCAAAGTCCATTTATA
585 ATTGAATATTTACCTCAGGAAACATGAAGCAAAAACCATCCATTGACAAGAAAAGTCCACTTATA
* * *
18869405 GTCACCCTTACCTTCAAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATTTCATTAT-TGATT
650 GTCACCCATACCTTCAAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATGT-ATT
* * *
18869469 TTAAGTTGAGTTTTTTTACCTTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTGAATTTTTACCTCCAAAAAT
714 TTAAGTTGAATTGTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTGAATTTTTACCTCCAAAAAT
18869534 GTAAGCAAAATACCATCTATTGAGAAGAAAAGTTCATTTATAATCACTCATGTTTTCAAAAGCCT
779 GTAAGCAAAATACCATCTATTGAGAAGAAAAGTTCATTTATAATCACTCATGTTTTCAAAAGCCT
18869599 TAATACTTG
844 TAATACTTG
* * *
18869608 CTTTAGAT-GATTTCATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAACTTTTTT-ATATTTTTTGTTAA
1 CTTTAAATGGATTT-ATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAA-TTTTTTCACATTTTTGGTTAA
* * * * * * * * * ***
18869671 AACAGATTCTTATTGAATGTTTACCTTAGGAAACGTGGAGCTAAAGTTCTCCG-TTGGCAAGAAA
64 AACAAATTATAATTGAATGTTTACCTCAGAAAACGTGAAGCGAAAGCTAT-CGATCAACAAGAAA
* *
18869735 AGTTCATTTATAGTCACTCATG-CTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTAAAATGGTTTTATAATCT
128 AGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTAAAATGATTTTATAATCT
* * * *
18869799 CATTATTGATTTTAAGTTGAATTTCTTTACATTATTGGTTAAAACATATTATAATT-GAATGTTT
193 CATAATTGATTTTAAGTTGAATTTCTTTACATTATTGATTAAAACAAATGATAATTAG-ATGTTT
* *
18869863 GCCT-CGAGAAACGTGAAGCGAAAGCCAACGATTGAT-AAAAAAAGT-CTATTTATAGTCACTCA
257 GCCTAAG-GAAACGTGAAGCGAAAGCCAACCATTG-TGAAAAAAAGTCCT-TTTATAGTCACTCA
* **
18869925 TGCCTTCGGAAGCCTTATTACTTTCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGAATTTAAGTTGA
319 TGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGAATTTAAGTTGA
* * * *
18869990 AT-TCTTTTGCATTTTTGGTTAAGAA-AGATTATAATTAAATGTTTGCCTTAGGAAACGTGTAGC
384 ATAT-TTTTACAATTTTGGTTAA-AACAGATTATAATTAAATGTTTACCTTAGGAAACGTGAAGC
* *
18870053 AAAAGTCAT-CAATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTAC
447 AAAAGCCATGC-ATTGACAAGAAAAGTCCA-TTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTAC
* * *
18870117 TTGCTTTAAATAGTTTTATAATCTCATTATTGATTTTAAGTTTAA-TTTTAACATTTTTGGTTAA
510 TT-CCTTAAATAGTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTAACATTTTTGGTTAA
* ** * * *
18870181 AACAGATTATAATTGAATGTTTACCTTGGGAAACGTGAAGCAAAAACCA-CTGATTGACATGAAA
574 AACAGATTATAATTGAATATTTACCTCAGGAAACATGAAGCAAAAACCATC-CATTGACAAGAAA
* * * * *
18870245 AG-CCAACTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTACTTTAAATGGTTTTGTAATC
638 AGTCC-ACTTATAGTCACCCATACCTTCAAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATC
*
18870309 TCATAATGTATTTTAGGTTGAATTGTTTTACATTTTTGGTTAAAACA
702 TCATAATGTATTTTAAGTTGAATTGTTTTACATTTTTGGTTAAAACA
18870356 TATCATCATT
Statistics
Matches: 642, Mismatches: 91, Indels: 31
0.84 0.12 0.04
Matches are distributed among these distances:
851 9 0.01
852 437 0.68
853 153 0.24
854 43 0.07
ACGTcount: A:0.33, C:0.14, G:0.14, T:0.39
Consensus pattern (852 bp):
CTTTAAATGGATTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTTCACATTTTTGGTTAAAA
CAAATTATAATTGAATGTTTACCTCAGAAAACGTGAAGCGAAAGCTATCGATCAACAAGAAAAGT
CCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCGCTTAAAATGATTTTATAATCTCAT
AATTGATTTTAAGTTGAATTTCTTTACATTATTGATTAAAACAAATGATAATTAGATGTTTGCCT
AAGGAAACGTGAAGCGAAAGCCAACCATTGTGAAAAAAAGTCCTTTTATAGTCACTCATGCCTTC
GAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATTGAATTTAAGTTGAATATTTT
TACAATTTTGGTTAAAACAGATTATAATTAAATGTTTACCTTAGGAAACGTGAAGCAAAAGCCAT
GCATTGACAAGAAAAGTCCATTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTTCCTTAAATA
GTTTTATAATCTCATAATTGATTTTAAGTTGAATTTTTAACATTTTTGGTTAAAACAGATTATAA
TTGAATATTTACCTCAGGAAACATGAAGCAAAAACCATCCATTGACAAGAAAAGTCCACTTATAG
TCACCCATACCTTCAAAAGCCTTATTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAATGTATTTT
AAGTTGAATTGTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATTATAATTGAATTTTTACCTCCAAAAATGT
AAGCAAAATACCATCTATTGAGAAGAAAAGTTCATTTATAATCACTCATGTTTTCAAAAGCCTTA
ATACTTG
Found at i:18877241 original size:20 final size:20
Alignment explanation
Indices: 18877216--18877253 Score: 58
Period size: 20 Copynumber: 1.9 Consensus size: 20
18877206 TTAGTGGCTT
* *
18877216 TAAATAGTTTTATAATCATA
1 TAAATAATTTTAAAATCATA
18877236 TAAATAATTTTAAAATCA
1 TAAATAATTTTAAAATCA
18877254 AAATTTTCTC
Statistics
Matches: 16, Mismatches: 2, Indels: 0
0.89 0.11 0.00
Matches are distributed among these distances:
20 16 1.00
ACGTcount: A:0.50, C:0.05, G:0.03, T:0.42
Consensus pattern (20 bp):
TAAATAATTTTAAAATCATA
Found at i:18879540 original size:172 final size:169
Alignment explanation
Indices: 18875725--18880950 Score: 3923
Period size: 171 Copynumber: 30.7 Consensus size: 169
18875715 GTGACAGAAT
* * **** * *
18875725 TTTTTTTACATTTTTGGTTAACACAAATCATAATTTGATGTTTGCATCAAAAAACATGAAATAAA
1 TTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGGGAAACGTGAAA-CAA
* * * * * *
18875790 AGCCAACCATTAACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCATTAATGGC-TCGAAAAGCCTTTTTACTCG
65 AGCCATCCATTGACAA-AAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTC-AAAAGCCTTGTTACTCG
* * *
18875854 CTTTAAGTGGTTTTAGAACTTTTTAAATGATTTTGAATTGAA
128 CTTTAAGTGGATTTATAACTTTTTAAATGATTTTAAATTGAA
**** * * * * *
18875896 TTTTTTTTACATTTGCAATTAAAAAAGATCATAATTT-TTGTTTGCAATGGGAAACATGAAGCGA
1 -TTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGGGAAACGTGAAAC-A
* * * * * ** * *
18875960 AATCCTTCCGTTGACAAAAAAAGTCCAGTTATAGTCACTCATACCTTTGAAAGCCTTGTTATTCT
64 AAGCCATCCATTGAC-AAAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTTGTTACTCG
* *
18876025 CTTTAAGTGAATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAA
128 CTTTAAGTGGATTTATAACTTTTTAAATGATTTTAAATTGAA
* * * * * ** * *
18876067 TTTTTTTTCAGTTTTGGTTAAAGCAGATCATAACTT-ATTATTTGCATCAGAAAACGTGAAGAAA
1 TTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGA-TGTTTGCATTGGGAAACGTGAA-ACA
* * * * ** *
18876131 AAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCTATTTATAGTCACTCATGTGC-TCTAAAGCCTAATTAGTC
64 AAGCCATCCATTGACAA-AAAAGTCCATTTATAGTCACTCATG-CCTTCAAAAGCCTTGTTACTC
* * * * * * *
18876195 ACTTTAAATGGTTTTATAA-TCATATAAATAATTTTAGAGTTGAAA
127 GCTTTAAGTGGATTTATAACT-TTTTAAATGATTTTA-AATTG-AA
** * *
18876240 TTTTTCTT-TTTTTTTGGTTAAAACATG-TCATAATTTGATGTTTGCATTAGGAAACGTGAAGAA
1 TTTTT-TTACATTTTTGGTTAAAACA-GATCATAATTTGATGTTTGCATTGGGAAACGTGAA-AC
* * * *
18876303 AAAGCCATGCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCTTTGTTACTC
63 AAAGCCATCCATTGACAA-AAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTTGTTACTC
* * *
18876368 GCTTTAAGTGGATTTATAACTTTTTAAATAATTTCAAATTGAG
127 GCTTTAAGTGGATTTATAACTTTTTAAATGATTTTAAATTGAA
* * * *
18876411 TTTTTTTACATTTTT-GTTAAAACAGATCATAATTTAATGTTTTCATCGAGAAACGTG-----AA
1 TTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGGGAAACGTGAAACAAA
* * * * * *
18876470 G-CA--CATTGACAAAAAAAGTGCAATCATAGTCACTCATGCCTTCATATA-CCTTCTTACTTGC
66 GCCATCCATTGAC-AAAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCA-AAAGCCTTGTTACTCGC
* * *
18876531 TTTTTAGTGGATTTATAAATTTTTAAATGATTTTAGATTGAA
129 -TTTAAGTGGATTTATAACTTTTTAAATGATTTTAAATTGAA
* * * * * *
18876573 TTTTTTTTACA--TATAGTTAAAAAAGACCATAATTTGATGTTTGCATTGGGAAACATGAAGCGA
1 -TTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGGGAAACGTGAAAC-A
* * * * * * * *
18876636 AAACCTTCCGTTGACAAGAAAAATCCAGTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAACCCTTATTACTCG
64 AAGCCATCCATTGACAA-AAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTTGTTACTCG
* *
18876701 CTTTAAGTGGATTTACAACTTTCTT-AATGATTTAAAATTGAA
128 CTTTAAGTGGATTTATAACTTT-TTAAATGATTTTAAATTGAA
* * ** * *
18876743 TTCTTTTACATTTTTGGTTAAAA-AAATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACATGAAGCGAA
1 TTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGGGAAACGTGAAAC-AA
* * * *
18876807 ATCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCATACGCCTTGTTACTTGC
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* * *
18876872 TTTAAGTGGATTTATAGCTTTTTAAATGATATTCAATTGAA
129 TTTAAGTGGATTTATAACTTTTTAAATGATTTTAAATTGAA
* * * * * *
18876913 TTTCTTTACATATTTGGTTAAAACAAATCATAATTTGATGTTTGCATCGGGAAACATGAAGCGAA
1 TTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGGGAAACGTGAAAC-AA
* * * * * ** * *
18876978 AGCCAACCATTAACAAGAAAAATCTATTTATAGTCACTCATGGCTTGGAAAGGCTTATTACTCGC
65 AGCCATCCATTGACAA-AAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTTGTTACTCGC
* * * *
18877043 -TTCAGATGGTTTTATAA-TCTTATAAATTA-TTTAAATTTGAA
129 TTTAAG-TGGATTTATAACT-TTTTAAATGATTTTAAA-TTGAA
* * * * * * * *
18877084 TTTATTTT-TATTTTTGGTTAAAACAGATCATAGTTTGTTTTTTTCATTAGGAAATGTGAAGCGA
1 TTT-TTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGGGAAACGTGAAAC-A
* * * * * * * *
18877148 AAACCATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCATTCATATCCTT-GAAAGCCTAGTTAGTG
64 AAGCCATCCATTGACAA-AAAAGTCCATTTATAGTCACTCAT-GCCTTCAAAAGCCTTGTTACTC
* * * * * * **
18877212 GCTTTAAATAGTTTTATAA-TCATATAAATAATTTTAAAATCAAA
127 GCTTTAAGTGGATTTATAACT-TTTTAAATGATTTT-AAATTGAA
* * * * ** * * * *
18877256 ATTTTCT-C-TTTATTGGTTAAAACCGATCATAATTTGATGTTTACATAAGAAAATGTAAAGAAA
1 TTTTTTTACATTT-TTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGGGAAACGTGAA-ACA
* * * *
18877319 AAGCCATACATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACAT-ATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTC
64 AAGCCATCCATTGACAA-AAAAGTCCATTTATAGTCAC-TCATGCCTTCAAAAGCCTTGTTACTC
* *
18877383 GCTTTAAGTGGATTTATAACTTTCTAAATAATTTTAAATTGAA
127 GCTTTAAGTGGATTTATAACTTTTTAAATGATTTTAAATTGAA
* * * * *
18877426 CTTTTTTTATATTTTTGATTTAAACAGATCATAATTTGATATTTGCAGTGGGAAACGTG-----A
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* * * * * * *
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* ** *
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* * * *
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* * * * * *
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** * *
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* * *** * * * * *
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* * * * * * * *
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* * *
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* * * *
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* *
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* *
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** * *
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* ** * **
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Statistics
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* * * * * * *
18903203 AAAAGCCATCCATTGAGAAAAAAAGTCCAATTACACTCACTCATGTCTTCAAAAGC
116 AAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGC
* * * * *
18903259 CTTGTTCCTCACTTTAAGTGGATTTATAACTTTTTAAATGACTTTAAATTGAA-TTTTTTACATT
1 CTTGTTACTCACTTTAAGTGGTTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATT
* * * *
18903323 TTTGGTTAAAAAAGACCATAATTTGATGTTTGCATC-GAGAAATGTGAAGCAAAAGCTATCCATT
66 TTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAG-GAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATT
* * * * *
18903387 GAAAATAAAAGTCTAGTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGC
130 GACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGC
* * * * * *
18903429 CTTATTATTCTCTTTAAGT-CTACTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTG-ATTTTTTTT-AA
1 CTTGTTACTCACTTTAAGTGGT-TTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCAT
* * * *
18903491 TTTT-GTCAAAACATATCATAATTTGATGTTTGCATCA-GAAGACGTGAAGGAAAACCCATCCAT
65 TTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAA-ACGTGAAGCAAAAGCCATCCAT
* * *
18903554 TGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCATTCATGTCTTCAAAAGC
129 TGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGC
* * * *
18903597 CTTGTTAGTCACTTTAAGTGGATTTATAACTTTTTAAATGATTTTCAATT-AATTGTTTTTAT-A
1 CTTGTTACTCACTTTAAGTGGTTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATT-TTTTT-TCA
* * *
18903660 ATTTTGGTTAAACCATATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCAT
64 TTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCAT
* * * * * *
18903725 TGATC-AGAGAAGCCCAGTTATAATCATTGATGCCTTCGAAAGC
129 TGA-CAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGC
* * * * * * * * *
18903768 ATAGTTACT-ATCTTTAAGTAGATTTATAACTTTACAAATGATTTGAAGTTCAATTTGTTTTCAT
1 CTTGTTACTCA-CTTTAAGTGGTTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCA-
* * * * * * * **
18903832 TTTTTGATTAAAATAGATCATAATTTGTTGTTTGAATCGGGAAACATAAAGCGTAAGCCATCCAT
64 TTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCAT
* * * * *
18903897 TGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCAGTGATACCTTGGAAAGC
129 TGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGC
* * * * * ** * *
18903940 CTAGTTAGTCGCTTTAAATGATTTTATAATCTTT-CCAATGATTTTAAACTTGAATTTGTCTT-A
1 CTTGTTACTCACTTTAAGTGGTTTTATAA-CTTTATAAATGATTTTAAA-TTGAATTTTTTTTCA
* * *
18904003 TTTTTGGTTAAAATAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAATGTGAAGC--AAGCCAT-CGT
64 TTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCAT
* * ** * *
18904065 TGAGAAGAAAAGTCTAGGTATACTCACTCATGCCTTCAAAAGC
129 TGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGC
* * * * * *
18904108 CTTGTTACTCACTTTAAGTGGATTTATAAATTTTTAAATGATTTCAAACTGAA-TTTTTATCATT
1 CTTGTTACTCACTTTAAGTGGTTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATT
* * * * * *
18904172 TTTTGTTAAAATAGATAATAATTTGATGTTTACAT-TGAGAGACGTGAAGCAAAA-CCATCCATT
66 TTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAG-GAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATT
*
18904235 GACAAGAAAAGTCCAATTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGC
130 GACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGC
* * * * *
18904277 CTTGTTTCTCTCTTTAAATGGATTTATAACTTTTTAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTTACA
1 CTTGTTACTCACTTTAAGTGGTTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAA-TTTTTTTT-CA
* * ** * * *
18904342 TTTTTGGTTAAACCAAGATCAT-TTTTGATGTTTGCATTGGGAAACCTAAAGCAAAAGCCATTCA
64 TTTTTGGTTAAAAC-AGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCA
* * * *
18904406 TTGACAAGAGAAG-CCTAGTTATAATCAC-CGATGCCTTCGAAATC
128 TTGACAAGAAAAGTCC-ATTTATAGTCACTC-ATGCCTTCGAAAGC
* * * * *
18904450 CTTGTTACTCTCTTTAAGTGGATTTATTACTTTATAAATGATTTTAAATTGAGTTTGTTTTCATT
1 CTTGTTACTCACTTTAAGTGGTTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATT
* * * * *
18904515 TTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGTTTTTTGAATCAGGAAACATGAAGCAAACGCCATCCATTG
66 TTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTG
* * * * * *
18904580 ACAAGAAAAATCCATTCATATTCACTCATCCCTTCTAAAGT
131 ACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGC
* ** * * * * * ** * * * *
18904621 GTTGTTACTTGCATTAAATAGCTTAATAA-TCTTATAAATGATTTTAAAACGAAATTCTATACAT
1 CTTGTTACTCACTTTAAGTGGTTTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCAT
* * * * * * * *
18904685 ATATGGTTAAAACATATCATAA-TTGATGTTTGCAT-TGAGAAACATGAGGCGAAAGCC-GCCTA
65 TTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAG-GAAACGTGAAGCAAAAGCCATCC-A
* * * * *
18904747 TTGGCAAGAAAGGTCCATTTATTGTCACTCATTCCTTC-AAGAGA
128 TTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAA-AGC
* ** ** * * * *** * * * *
18904791 CGTGAAACAAAAGCCATCT-ATTGATGAGAAAAGTCCATTTATAGTCAATCATGCCTTCAAA-AG
1 CTTGTTAC-TCA--C-TTTAAGTGGTTTTATAA---C-TTTATA---AATGAT---TTTAAATTG
** ** * ** * ** * * *
18904854 CCTTTTTACTCGCTTAAAGTGGATTTATAACTTTTTAAATGATTTTAAATTGAGTCTTTTCTAT-
52 AATTTTTTTTC-ATT--TTTGG--TTA-AA------ACA-GATCATAATTTGA-TGTTTGC-ATC
****** * * * **** ** ** ** ** ** **
18904918 ATTTTTTGTTAA--AATATA-TCAT-AATTTGGTGTTTGCATCGAGAAACATGAAGCGAAAAACA
102 AGGAAACGTGAAGCAA-A-AGCCATCCA-TT-G-ACAAG-A-AAAG-TCCATTTATAGTCACTCA
*
18904979 T-CCATT-GATAAGA
159 TGCC-TTCGA-AAGC
*** *** * ** * *** * *
18904992 AACGTT--T--CTTTATAGT-CACTCATGCCTTT-GAAA-GCCTATTTACTCGCTTTAAATGGTT
1 CTTGTTACTCACTTTA-AGTGGTTTTATAACTTTATAAATG---ATTT--T-AAATTGAAT-TTT
* * * * ** ** ** * * * * * *
18905050 TTATAATCTTATAAATGATTTCAAATTGAATGTTTTTTTCATTTTTG-GTTA--AAACAT--ATC
58 TTTTCAT-TT-T---TG-GTTAAAACAG-ATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACGTGAAGC
* *** *** * ** * * *
18905110 ATAA-TTTTTTGTTCG-CATTAGGAAACGTGAAGTGA-A-T-AC-CAT-CCATT-GACAAGA
116 AAAAGCCATCCATT-GACA--A-GAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCC-TTCGA-AAGC
*** * * * ** * * * * **
18905164 AAAG-T-C-CA-TTTATAGTCAG--TGAT-ACCTTCGAAA-GCTTAGTTAGTCACTTTAAATGGT
1 CTTGTTACTCACTTTA-AGT-GGTTTTATAACTTTATAAATGATT--TTA---AATTGAATTTTT
** * * * * * * *
18905221 TTT-A-TAAT-CTTACAAA-TGA-CTTTAAAATTGAAT-TTGTCTCATTTCTAGTTAAAAC-AG-
59 TTTCATTTTTGGTTA-AAACAGATC-AT-AATTTG-ATGTT-T-GCA--TC-AG--GAAACGTGA
* **** ** * * ** *** * * * ****
18905278 ATCATAATTTTAT-GTTTGCATCAGGAAACGTGAAGCAAAAGTCAATCCGTTG-AGAAGAAAAGT
113 AGCA-AAAGCCATCCATTG-A-CAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACT-C-ATGCCTTCG-AAAG-
18905341 C
171 C
* ** * * * * * * * * * * **
18905342 CAGTT-ATACTCAC-TT-A-TGCCTTTAAAAGCCTTGTTACTCACTTT-AAGTGGA-TTTATAAC
1 C--TTGTTACTCACTTTAAGTGGTTTTATAA-CTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTC
* * * * ** * * * * *
18905401 TTTTTAAATGACTTTAAACTGA--ATTTTTTACATTTTTG-GTTA--AAA----AAGACTATAAT
63 ATTTT---TG-GTTAAAACAGATCATAATTT-GATGTTTGCATCAGGAAACGTGAAG-C-A-AAA
*** ** * ** *** * * * **
18905457 TTGAT-GTTTGCATCGAGAAAAGTGAAGCAAAAGCCA-TCCATTGAC-AAGAAAAGTC
120 GCCATCCATTG-A-CAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACT-CA-TGCCTTCG-AAAG-C
* ** ** * *
18905512 CAGTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAG-CCTTATTATTCTCTTTAAGTCGACTTATAATTTTAT
1 C---T-T-GTTACTCA---CTTT--AAGTGGTT-TTA-TAACTTT-A-T--A--AATGA-TTT-T
* * * * * * *
18905576 AAATGATTTTAAATTGATTTTTTTAATTTT-GTCAAAACATATCATAATTTGATGTTTGCGTAAG
46 -AA--A--TTGAATT--TTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAG
* * * ** *
18905640 GAGACGTGAAGGAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCCATTTATAGTCACTCATATCTTCAAA
104 GAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAA
18905705 AGC
169 AGC
* * * *
18905708 CTTGTTACTCACTTTAAGTGGATTTATAACTTTTTAAATGATTTTAAATTAAATTTTTTTTACAA
1 CTTGTTACTCACTTTAAGTGGTTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTT-CAT
* * *
18905773 TTTTGGTTAAACCATATCATAATTTGATGTTTGCATTAGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATT
65 TTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATT
* * * * * *
18905838 GACGAGAGAAG-CCTAGTTATAATCACTGATGCCTTTGAAAGC
130 GACAAGAAAAGTCC-ATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGC
* * * *
18905880 CTTATTACTCTCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTGTTTTCATT
1 CTTGTTACTCACTTTAAGTGGTTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATT
* * * ** *
18905945 TTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGTTGTTTGAATAAGGAAATATGAAGCGAAAGCCATCCATTG
66 TTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTG
* * * * *
18906010 ATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCAGTGATACCTTGGAAAGC
131 ACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGC
* * * * * * * *
18906051 CTAGTTAGTCACTTTAAATGGTTTTATAA-TCTTACAAATGATTTAAAATTGAA-CTTGTCTCAT
1 CTTGTTACTCACTTTAAGTGGTTTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCAT
* * * * * * *
18906114 TTATGGTTTAAACGGATCATAATTTTATGTTTGCATTAGGAAATGTGAAGCAAAAGCCAT-CGTT
65 TTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATT
* *** * * *
18906178 GAGAAGAAAAGTCTGGTTATACTCACTCATACCTTCAAAAGC
130 GACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGC
* * * * * * *
18906220 CTTGTTACTCACTCTAAGTGGATTTATAATTTTTTAAATGATTTTAAACTGCATTTTTTATCATT
1 CTTGTTACTCACTTTAAGTGGTTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCA-T
* ** * * * * * * **
18906285 TTTTTGTTAAAATTGTTAATAATTTGATGTTTACATC-GAAAGACGTAAAGGAAAAATCATCCAT
65 TTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAA-ACGTGAAGCAAAAGCCATCCAT
* * * * *
18906349 TGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCAGTGATACTTTTGAAAGC
129 TGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGC
* * * * * * *
18906392 CTAGTTAGTCACTTTAAATGGTTTTATAA-TCTTACAAAT-AGTTTTAAAATAGAA-TTTGTGTC
1 CTTGTTACTCACTTTAAGTGGTTTTATAACT-TTATAAATGA-TTTT-AAATTGAATTTTTTTTC
* * * * * * * *
18906454 ATTTCTGGTTAAAGA-AAATTATAATTTTAGGTTTGCATTAGGAAACGTGGAGCAAAAGCCATCT
63 ATTTTTGGTTAAA-ACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCC
* * * *
18906518 GTTGAGAAGAAAAGTCCAATTATACTCACTCATGCCTT-GAAAAGC
127 ATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCG-AAAGC
* * *
18906563 CTTGTTACTCACTTTAAGT-GTATTTATAACTTTTTAAATGATTTTAAACTGAA-TTTTTTACAT
1 CTTGTTACTCACTTTAAGTGGT-TTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCAT
** * * * * *
18906626 TTTTTCTCAAAAAAGACCATAATTTGATGTTTGCAT-TGAGAAATGTGAAGCAAAAGCCATCCAT
65 TTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAG-GAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCAT
* * * *
18906690 TGATAAGAAAAGTCCAATTATAGTCATTCATGCCTTTGAAAGC
129 TGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGC
* * * **** *
18906733 CTTATTATTCTCTTTAAGTCAACTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTGTTTTTAAT
1 CTTGTTACTCACTTTAAGTGGTTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTT-TTTTTCAT
* * * * * *
18906798 TGTT-GTTAAAACAGGTCATAATTTGATGTTTGCATCAAGATACGTGAAGGAAAAGCCATCCGTT
65 TTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATT
* *
18906862 GACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTTATACCTTCGAAAGC
130 GACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGC
* * ** ** * * * *
18906904 TTTTTTACTTGCTTTAAGTGCATTTATAAGTTTTTAAATGATTTTAAATTGAA-TTTATTTCAGT
1 CTTGTTACTCACTTTAAGTGGTTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATT
* * ** *
18906968 TTTGG-TAAAAAAGATCATAA-TT-ATTGTTTGCATCAGGAAACGTGAAGTAAAAATCATTCATT
66 TTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGA-TGTTTGCATCAGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATT
* *
18907030 GAAAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTAATG-CTTACGAAAGC
130 GACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTT-CGAAAGC
* ** * * ** * * * *
18907072 CTAGTTTGTCACTCTAAATGGTTTTATAACCATATAAATAATTTTAAAATTGACTTCTTCTT-AT
1 CTTGTTACTCACTTTAAGTGGTTTTATAACTTTATAAATGATTTT-AAATTGAATTTTTTTTCAT
* * *
18907136 TTTTGGTTAAAATAGATCATAATTTGATGTTTGCATC-GAGAAACGTGAAGCAAAAACCATCCGT
65 TTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAG-GAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCAT
* * *
18907200 TGACAAAAAAAGTCAATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAG-
129 TGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGC
* * * * * * * * *
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1 CTT-GTTACTCACTTTAAGTGGTTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCAT
* * * * *
18907307 ATTTGGTTGAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAAGAAACATGAAGGAAAAGCCATCCATT
65 TTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATT
* * *
18907372 GATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCGTGCCTAT-GAATGC
130 GACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCT-TCGAAAGC
* * * *
18907414 CTTGTTACTCTCTTTAAGTAGATTTATAACTTTATAAATGACTTTAAATTGAATTGTTTTTTCAT
1 CTTGTTACTCACTTTAAGTGGTTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATT-TTTTTTCAT
* * * *
18907479 TTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGTTGTTTGCAT-AGGGAAACGTGAAGCGAAAGCCATCAAA
65 TTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCA-GGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCAT
* * **
18907543 TGACAAGAAAAGTCTATTTATACTCACTCATGCCTTTTAAAGC
129 TGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGC
* * ** * *** *
18907586 CTTGTTACCTGCA--TTAAATGGTTTCATAACCTTT-TAAATGATTTTAAATCAAAATTCAATAC
1 CTTGTTA-CT-CACTTTAAGTGGTTTTATAA-CTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTC
* * * * * ** *
18907648 ATGTATGGTTAAAACATATCATAATTTGTTGTTTTCATGGGGAAATGTGAAGCAAAAGCCATCCA
63 ATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCA
* * * * *
18907713 TTGATAAGAAAAGTCTAGTTATAGTCATTCACT-CCTTTGAAAGC
128 TTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCA-TGCCTTCGAAAGC
** * * *
18907757 CTTGTTACTTTCTTTAAGTGGATTTATAAGGTTT-TAAATGCTTTTAAATTGAATTTTTTTTACA
1 CTTGTTACTCACTTTAAGTGGTTTTATAA-CTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTT-CA
* * *
18907821 CTTTTGGTT-AAACTAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAAGAAATGTGAAGCAAAAGCCATCCA
64 TTTTTGGTTAAAAC-AGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCA
** * * * * * *
18907885 TTGATGAGAGAAGTCTAGTTATAATCACTAACGCCTTCGAAAGC
128 TTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGC
* * * * *
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1 CTTGTTACT-CACTTTAAGTGGTTTTATAA-CTTTATAAATGATTTTAAATTGAA-TTTTTTTTC
* * * * * ** * * * ** *
18907992 ATTTTTGGTTAAAATAGATCATATTTTGCTATTTGCTTTTGTAAACATGGAGTGAATGCCATCCA
63 ATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCA
* * * *
18908057 TTGACAAGAAAAGTCCATTTATACTCACTCATACCTTCTAAGGC
128 TTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGC
** * * * * * * * *
18908101 CTTGTTACTTGCATTAAATGGTTTCATAA-TCTTATAAATGATTTTAAATTAAAATTCTATACAT
1 CTTGTTACTCACTTTAAGTGGTTTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCAT
* * * * * * *
18908165 ATATGGTTAAAACATATCATAATTTGATGTTTACATCAAGAAACGTGATGCAAAAGCCATTCATT
65 TTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATT
* * *
18908230 GACTAA-AAAAGTCCAATTATAGTCACTCATGACTTTGAAAGC
130 GAC-AAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGC
* * *
18908272 CTTGTTACTCTCTTTAAGTGGATTTATAACTTTTTAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTAT-AT
1 CTTGTTACTCACTTTAAGTGGTTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTT-TCAT
* * *
18908336 TTTTGGTTAAACCAGATCATAATTTGATGTTTGCAT-TGGTAAAAGTGAAGCAAAAGCCATCCAT
65 TTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGG-AAACGTGAAGCAAAAGCCATCCAT
* * *
18908400 TGAAAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTTATGCCTTCAAAAGC
129 TGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGC
* * * * * * *
18908443 C--GATATACTCGCTTCAAATGGTTTTATAATTTTATAAATCATTTCAAATTG-ATTTTTTTTTA
1 CTTG-T-TACTCACTTTAAGTGGTTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCA
* * *
18908505 TTTTTGGTTAAAATAGATCATAATTTGTTGTTTGCATC-GAGAAACGTGAAGTGAAAA-CCATCC
64 TTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAG-GAAACGTGAAG-CAAAAGCCATCC
* * * * **
18908568 ATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCAGTGATTCCTTTAAAAGC
127 ATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGC
* * * * * * * *
18908613 CTAGTTAGTCGCTTTAAATAGTTTTATAA-TCTTACAAATGATTTTAAAATTGAA-TTTGTCTCA
1 CTTGTTACTCACTTTAAGTGGTTTTATAACT-TTATAAATGATTTT-AAATTGAATTTTTTTTCA
* * * * * *
18908676 TTTTCGGTTAAAACAGATCA-AATTTGATATTTGCATTAGGAAACGTGAAACAAACGCCATCCGT
64 TTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCAT
* * * * *
18908740 TGAGAAGAAAAGTCCAGTTATACTCACTCATGCCTACAAAAGC
129 TGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGC
** * * * * * * * *
18908783 CTTGTTACTTGCTCTAAGTGGATTTATAACTTTTTAAAAGATTATAAACTGAA-TATTTTACATT
1 CTTGTTACTCACTTTAAGTGGTTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATT
* ** * *
18908847 TTTGGTTCAAAA-AGACCATAATTTGATGTTTGCATTGGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATA
66 TTTGGTT-AAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATT
*
18908911 GACAAGAAAAGTCCA-TTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGC
130 GACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGC
* ** * ** * * *
18908952 CTTATTGTTCTCTTTAAGTGCATTTATAACTTTTTCAATGATTTTAAATTGAATTTATTTTCATT
1 CTTGTTACTCACTTTAAGTGGTTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATT
* * * * * *** *
18909017 TTTGGTTAAAACATATTATAATTTGTTTTTTGCATTAGGAAATACGAAGCAAAA-CC-TTCATTG
66 TTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTG
* * *
18909080 AAAAGAAATGTCCATTTATAGTCACTAATG-CTTACGAAAGC
131 ACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTT-CGAAAGC
* ** * * * **
18909121 CTAGTTTGTCTCTCTAAATGGTTTTATAACCATATAAATGATTTTAAAATTGAA-TTTTTTTCAT
1 CTTGTTACTCACTTTAAGTGGTTTTATAACTTTATAAATGATTTT-AAATTGAATTTTTTTTCAT
* * * * ** *
18909185 TTTTAGTTAAAACATATCATAATTTAATGTTTGCATC-GAGAAACGTGAAGTAAAAATCATCTAT
65 TTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAG-GAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCAT
* *
18909249 TGACAAAAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGC
129 TGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGC
* * * * * * * *
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** * * *
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* * *
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* * *
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*
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* * * * * *
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* * * * ** *
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*** * * * * * *** *
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* * * *
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* * * *
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* * * *
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* *
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* * ** *
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* * * * * * *
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* * * * * *
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* *
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** * * ** * * * *
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312 TTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCAT
* * * * *
18909868 CAAGAAATGTGAAAG-AAAAGCCATCCGTTGACAAGAAAAGTTCATTTATAGTCACTCATACATT
1 -AAGAAACGTG-AAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTT
* * * * * * * *
18909932 TGAAAGACTTTTTACTCACTGTAAG-TGCATTTATAACTTTTTAAATGAATTTAAATAGAATTTA
64 TGAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTTG-ATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTG
* * * * *
18909996 TTT-CATTTTTGGTCAAAA-AAATCATAATTTGTTGTTTACATCAGGAAACGTGAAGCCAAAA-C
128 TTTACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAAGAAACGTGAAG-CAAAAGC
* * * ** * **
18910058 CATCCATTGAAAAGAAAAGTTCATTTATAGTCACTAATG-CTTACAAAAAGCCTAGTTTGT-TGC
192 CATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTT--TGAAAGCCTTGTTACTCT-C
** * * * *
18910121 TCGAAATGGTTTTATAA-TCATATGAATGATTTTAAAATTGAA---TTTCTCATTTTTGGTTAAA
254 TTTAAATGGATTTATAACT-TTATAAATGATTTT-AAATTGAATTTTTTTTCATTTTTGGTTAAA
* *
18910182 ACAAATCATAATTTGATGTTTACAT
317 ACAGATCATAATTTGATGTTTGCAT
* * * * * * * * *
18910207 CAGGAAACATGAAGCAAAAACCATTCGTTGATAAAAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGGCTTC
1 -AAGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTT
* * * * * * ** *
18910272 GAAAGCCTCGTTACTCACTTTAAGTGGATTTATAATTTTATAAAAGATTTTTAATCAAATTTTTT
65 GAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTTGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTGTT
* * * ** * *
18910337 TACTTTTTTAGTT-AAATAGATCATAATTT-ATGTTTGCAT-TGGTGAATGTG-AG-ATGAAAGC
130 TACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAAG-AAACGTGAAGCA--AAAGC
* * * * * * * * *
18910397 CATCCATTGACAAGAATAGTCTACTTATTGTCACTCGTGCCTTTGAAAGCATTGTTAGTCACTTT
192 CATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTGTTACTCTCTTT
* * * * * *
18910462 AAGTGGTTTTATAACTTTATAAATGATTTTGAATCATG-TTTTTTTTTACAGTTTTGGTTAAAAG
257 AAATGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAAT--TGAATTTTTTTT-CATTTTTGGTTAAAAC
* *
18910526 GGATCATAATTTGATGTTTGTATT
319 AGATCATAATTTGATGTTTGCA-T
** * * * * **
18910550 GGGAAACATGAAGCAAAATCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTGATGCCATCA
1 AAGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTG
* * * * * **
18910615 AAAACCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTACAAGTAATTTTAAA-CAAAGCTTT-T
66 AAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTTGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAA--TTTGT
* * ** * *** *
18910678 TTAAATTTTTGGTTAAAACAAATCATAATTCAATGTTTTCATTGGGAAACTTGAAGCAAAAGCCA
129 TTACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAAGAAACGTGAAGCAAAAGCCA
* * *
18910743 TCCATTGACAAGAAAAGT-CATTTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTAT-TTACTCGCTTT
194 TCCATTGATAAGAAAAGTCCA-TTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCT-TGTTACTCTCTTT
** * * * *
18910806 AAGCGAATTTATAACTTTTTAAATGACTTTAAATCT--ATTATTTTTACATTTTTGGTTAAAA-A
257 AAATGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAAT-TGAATT-TTTTTTCATTTTTGGTTAAAACA
18910868 GGATCATAA-TTGATGTTTGCAT
320 -GATCATAATTTGATGTTTGCAT
* * * * * *
18910890 AGGGAAACATGAAG-AGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTACATTTATAGTCAATCATGTCGT
1 A-AGAAACGTGAAGCA-AAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTT
** * * * ** ***
18910954 TGAAAGCCTCATTGCTCGCTTTAAGTGGATTTGTAACTTTATAAGCGATTTTAAACAAAATTT-T
64 TGAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTTGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTGT
* * * ** *
18911018 TTAAATTTTTGGTTAACACATATCATAATTTGATGTTTGCATTGAGAAACGTAAAGCAAAAGCCA
129 TTACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAAGAAACGTGAAGCAAAAGCCA
* * *
18911083 TCCATTGATAAGAAAAGTGCTTTTATAGTCACTCATGCCTTAGAAAGCCTAT-TTACT-TGCTTT
194 TCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCT-TGTTACTCT-CTTT
* * * * * * *
18911146 AAGTGGATTTATAACTTTTTAAATGACTTTGAATT-TATTTGTTTTTACATTTTCT-ATTAAAAG
257 AAATGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTT-TTTTT-CATTTT-TGGTTAAAAC
* * *
18911209 GGATCATAATTTGATGTTTGGACG
319 AGATCATAATTTGATGTTTGCA-T
** * * * *
18911233 GGGAAACATGATGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCTTTTATAGTGA-TCTATGCCTTT
1 AAGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTC-ATGCCTTT
* * * * *
18911297 GAAAGCCTAT-TTACTCGCTTCAAATGGTTTTTTAA-TCTTATAAATGATTTTAAA-T-ACATTT
65 GAAAGCCT-TGTTACTCGCTTTAAGTTGATTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAATTGA-ATTT
* * * * * *
18911358 -TTTCTCA-TTTTGGTTAAAAAATACCATAATTTGATGTTTGCATCACGAAACATGAAGCAAAAG
127 GTTT-ACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAAGAAACGTGAAGCAAAAG
* * * * * * *
18911421 CCATCCATTGACAAGAAAAGTTCATTTATACTCATTCAGGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCGCTT
191 CCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTGTTACTCTCTT
* * * * * * *
18911486 TAAGTGGATTTATAACTTTTTTAATGATTTTAAATTCAATTTGTTTTACATTTTTAGTCAAAACA
256 TAAATGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTT-TTTTTCATTTTTGGTTAAAACA
*
18911551 GATCATAATTTGATGTTTTCATT
320 GATCATAATTTGATGTTTGCA-T
** * * * *
18911574 GGGAAAC-AGAAGCCAAAGCCATCCATTGACATA-AAAAGTCCAGTTATAGTCACTCATGACTTT
1 AAGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACA-AGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTT
* * * * * *
18911637 GAAAGCCTTGTTATTCTCTTTAA-TTGGATTTATAACTTTATAAATGATTATGAATTGATTTTTT
65 GAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTT-GATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTGT
* * * ** * * * * *
18911701 TTTCATTTTTGGTTAAAACAAATCATAGTTTTTTATTTTCAT-TAGAAAACATGAAGCAAAAGCA
129 TTACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAAG-AAACGTGAAGCAAAAGCC
* ** * * *
18911765 ATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGTGTTTGAAAACCTTATTACTCGCTTTA
193 ATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTGTTACTCTCTTTA
* * * *
18911830 AGTGG-TTTAATAACATAATAAATGATTTTGAATTGAATTTTTTTATCATTTTTGGTTAAAACAG
258 AATGGATTT-ATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTT-TCATTTTTGGTTAAAACAG
18911894 ATCATAATTTGATGTTTGCAT
321 ATCATAATTTGATGTTTGCAT
* * * ** *
18911915 CGAGAGACGTGAAGTAAAAATCATCCATTGAGAAGAAAAGTCCATTTATCA-TCACTCATGCCTT
1 -AAGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTAT-AGTCACTCATGCCTT
* * * * *
18911979 TAAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTTTAAATGATCTTAAATTGAATTTTT
64 TGAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTTGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAA-TTTG
* * * * * * * * * *
18912044 TTTAAATATCTAGTTAAAATAGATTACAATTCGATGTTTGCATCAACAAATGTGAAGCAAAAGCC
128 TTTACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAAGAAACGTGAAGCAAAAGCC
* * * * * * *
18912109 ATTCATTGACAAGAAAAGTCTAATTAT-GCTCACTCATGCCTTCGAAAAGCTTTGTTACTCACTT
193 ATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAG-TCACTCATGCCTTTG-AAAGCCTTGTTACTCTCTT
* * * * * * *
18912173 TAAGTGGGTTTATAACTTTTTAAATGATTTTACATGGAATGTTTTTTGACATTTTTAGTTAAAAC
256 TAAATGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAAT-TTTTTT-TCATTTTTGGTTAAAAC
*
18912238 AGATCATAATTTGATGCTTGCAT
319 AGATCATAATTTGATGTTTGCAT
* * * * * * * ******
18912261 TAGAAAACATGAAGCAAAAGCCATCTATTCACAAAAAAAGTCTAGTTATAGTCANNNNNNNNNNN
1 AAG-AAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCA-----CTCATG
*****************************************************************
18912326 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
60 CCTTTGAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTTGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAAT
*****************************************************************
18912391 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
125 TTGTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAAGAAACGTGAAGCAAAA
*****************************************************************
18912456 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
190 GCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTGTTACTCTCT
************************************************* *
18912521 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATTATTTTAGTTAAAA
255 TTAAATGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCA-T-TTTTGGTTAAAA
18912586 CAGATCATAATTTGATGTTT-CAT
318 CAGATCATAATTTGATGTTTGCAT
* * * *
18912609 AGGGGAAACATGAAGTC-AAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTTCATTTATAATCACTCATGCCA
1 A--AGAAACGTGAAG-CAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCC-
* ** *
18912673 TTTG-AAGCCTTGTTACTCGC-TCAAAATGAATTTATAACTTTTTAAATGATTTTAAATTGAAGT
62 TTTGAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTTG-ATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAA-T
* * * * *
18912736 TT-TTTAAAATTTTTGGCTAAAATAGATCATAATTTGTTGTTTGCATAAAGAAACGTGAAGCAAA
125 TTGTTT-ACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAAGAAACGTGAAGCAAA
* * * * *
18912800 ATCCATCTATTGACACA-AAAAATCCATTTATAGTCACTC-TCGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTC
189 AGCCATCCATTGATA-AGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAT-GCCTTTGAAAGCCTTGTTACTC
* * * * *
18912863 GCTTGAAGTGGATTTAT-AGTTTCATAAATGATTTTAAATTGAATTTCTTTTACATTTTTGGTTA
252 TCTTTAAATGGATTTATAACTTT-ATAAATGATTTTAAATTGAATTT-TTTTTCATTTTTGGTTA
* * *
18912927 AAA-AAATCATAATTTGTTGTTTACATT
315 AAACAGATCATAATTTGATGTTTGCA-T
** * * * * * * *
18912954 TGGAAATGTGAAGTGAAAA-CCATCCATTGATAAGAAAAGTCTATTTACAGTCACTGATGCTTTT
1 AAGAAACGTGAAG-CAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTT
* * * * * *
18913018 GAAAGCCTAGTTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAA-TCTTACAAATGATTTTAAAATTAAATTT-
65 GAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTTGATTTATAACT-TTATAAATGATTTT-AAATTGAATTTG
* * * ** * * *
18913081 TTCT-CATTTTTAGTTAAAACAGATCGTAATTTCATGTTTGCAT-TGGAAAATGTCAAGAAAAAG
128 TT-TACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAAG-AAACGTGAAGCAAAAG
* * * * * ** * ** *
18913144 CCATCCATTGACAAGAAAAGTGCATTTATACTCACTTATACCTTCAAAAGCATTACTACTCACTT
191 CCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTGTTACTCTCTT
* * * * * *
18913209 TAAGTGAATTTATAGCTCTATAAATGATTTTAAATTAAAGTTTTTTTTTCATTTTTTGTTAAAAC
256 TAAATGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAA--TTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAAC
* * **
18913274 AGTTAATAATTTTCTGTTTGCAT
319 AGATCATAATTTGATGTTTGCAT
* * * * * * * *
18913297 TAGAGGACATGTAGC-AAAGCCATTCATTGACAAGAAAAGTCTAGTTATAGTCACTCATGCCTTC
1 AAGA-AACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTT
* * * * * *
18913361 GAAAGCCTTGTTACTAGCTTTAAGTGGATTTTTAACTTTTTAAACGATTTCAAATTGAATTTGTT
65 GAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTTGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTG--
* * * *
18913426 TTTACA-TTTTGGTTAAAAAAGACCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACGTGAAGCAAAAGCT
128 TTTACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAAGAAACGTGAAGCAAAAGCC
* * * * * * *
18913490 ATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATACTCACTCAAGTCTTCGAAAGCCTTGCTAGTCGCTTTA
193 ATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTGTTACTCTCTTTA
* * * * *
18913555 AGTGGATTTATAACTTTTTTAATGATTTTAAATTGAATTTATTTTACATTTTTGGTCAAAACAGA
258 AATGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTT-TTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGA
18913620 TCATAATTTGATGTTTGCATT
322 TCATAATTTGATGTTTGCA-T
** * * * * * * *
18913641 GGGAAGCATGAAGCCAAAGCCATCCATTGGCATA-AAAAGTCCAGTTATAGTCACTTATACCTTT
1 AAGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACA-AGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTT
* * *
18913705 GAAAGCCTTGTTACTCTCTTTAAATGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTT-TT
65 GAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTTGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTGTT
* * * * *** *
18913769 ATTCATTTTTGATTAAAACAGATCATAATTTGTTGTGTGCATTGGGAAACGTAAAGCAAAAGCCA
130 -TACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAAGAAACGTGAAGCAAAAGCCA
* ** * * * * * * *
18913834 TCTATTGGCAAGAAATGTCCATTTATACTCACTTATTCCTTTTAAAGCCTT-TCTACTCTCATCA
194 TCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTGT-TACTCTCTTTA
* * * * ** * * * * * *
18913898 AATGGTTTTATAA-TCTTATAAATGAGTATGAATCCAAATTCTATAT-ATATATGGTTAAAACAT
258 AATGGATTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAAT-TGAATTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAG
* *
18913961 ATCATACTTTGATATTTGCAT
321 ATCATAATTTGATGTTTGCAT
* * *
18913982 CAAGAAACATGAAGCAAAAGCCATCTATTGACAAGAAAAGTCCAATTATAGTCACTCATGCCTTT
1 -AAGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTT
* * * *
18914047 GAAAGTCTTGTTACTCTCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTT
65 GAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTTGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTGTT
* * * *** *
18914112 TA-ATTTTTGGTTAAAACATATCATAATTT-ATTTTTTGTATTGGGAAACGTGAAGCAAAAGCTA
130 TACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGA-TGTTTGCATCAAGAAACGTGAAGCAAAAGCCA
* * * * ** * * *
18914175 TCCGTTGACAAG-AAAGTCCACTTATAGTCACTCATACCTTCAAAAGCCTAGTTACTCACTTTAG
194 TCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTGTTACTCTCTTTAA
* * * * *
18914239 GTGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGTATTATTTTGT-AATTTTGGTTAAAACATAT
259 ATGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATT-TTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGAT
* * *
18914303 CATAATTTGTTTTTTGAAT
323 CATAATTTGATGTTTGCAT
** * * * * * *
18914322 GGGGAAACATGAATCGAAAGCCATCCATTGGCTAGAAATA-TCCATTTATAGTCACTCAAGCCTT
1 -AAGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAA-AGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTT
** * * * * ** *
18914386 CAAAAGCCTTATTACTCACTTTAAGTAGTTTTATAACTTTATAAATGATTTTTGATT-TATTTGT
64 TGAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTTGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTG-
* * * * * * * **
18914450 TTTACTTTTTTAGTTGAAACAAATCATAATTTG-TATTTGCAT-ATGGAAACGTGATGTTAAAGC
128 TTTACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCA-AGAAACGTGAAGCAAAAGC
* * * * * * * *
18914513 AATCCATTGACT-AGAAATGTCCATTTATAGTCAGTCAAGTCTTCGAAAGCCTTATTACT-TGGT
192 CATCCATTGA-TAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTGTTACTCT-CT
* * ** * * * * *
18914576 TTAAGTGGTTTTATAACTTTATAAATGATTTTTGATTTATTTATTTTTTTACTTTTCTAGTTGAA
255 TTAAATGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATT-TTTTTTCA-TTTT-TGGTTAAA
* * **
18914641 ATAGATGATAATTT-ATAATTGCAT
317 ACAGATCATAATTTGATGTTTGCAT
** * ** * * *
18914665 TTGAAAACGTGATGTGAAAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTTATGTCTTT
1 AAG-AAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTT
* * * *
18914730 GAAAGCCTAGTTACTCACATTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTAT-T
65 GAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTTGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATT-TGT
** * * * * * **
18914794 TTACA-TTTCAGTTAAAATAGATCATAATTTGATGTTTGAAT-ATGGAAACATGAGGCAAAAGTT
129 TTACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCA-AGAAACGTGAAGCAAAAGCC
* * * * *
18914857 ATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATTGTCACTCAT-TCTATTGAGAGCCTTGTAACTCGCTTT
193 ATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCT-TTGAAAGCCTTGTTACTCTCTTT
* * * ** * * * *
18914921 AAATGGTTTTATAAATTTATAAATGATTTTGAATTGAGCTTTTTATCATTTTTGGCTAAAAAAAA
257 AAATGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGA
*
18914986 TCATAATTTGATGTTTCCAT
322 TCATAATTTGATGTTTGCAT
** * ** * * * *
18915006 CTGGAGACGTGAAGCAAAAGCCATTTATTGATAAGAAAAGTCCATTGATAGTTACTCATGCCTTC
1 -AAGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTT
* * * *
18915071 GAAAGCCTTTTTACTAGCTTTAAGTGGATTTATAACTTT-TAAATGATTTTAAATTGAATCGTTT
65 GAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTTGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAAT--TTG
* * * ** * *
18915135 TTTACATTTTTAGTTTAAACAGATCATAATTTGATGTTTGTAT-TGGAAAACATGAGGCAAAAGC
128 TTTACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAAG-AAACGTGAAGCAAAAGC
* * *
18915199 CATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATTGTCACTCATGCC-TTCAAGAGCTTTGTTACT-TGCT
192 CATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAA-AGCCTTGTTACTCT-CT
* * * * * *
18915262 TTAAGTGGTTTTATAAATTTATAAATGATTTTGAATTTAATTTTTTTTATCATTTTTAGTTAAAA
255 TTAAATGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAA-TTTTTTT-TCATTTTTGGTTAAAA
* *
18915327 CAGATCATAATATGATGTTTCCATT
318 CAGATCATAATTTGATGTTTGCA-T
** * * * * *
18915352 GGGAGACGTGAAGCAAAAGCCATCTATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTTACTCATGCCTTCG
1 AAGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTG
* * * * * *
18915417 AAAGACTTGTTACTCTCTTTAAGTGGATTTATAACTTTTTAAATGATTTTAAATTGATTTTTTTT
66 AAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTTGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGA-ATTTGTT
* * *** * *
18915482 TACATTTTTGGTTAAAATAGATCATAATTCGATGTTTGCATTGGGAAACGTCAAGTAAAAGCCAT
130 TACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAAGAAACGTGAAGCAAAAGCCAT
* * * * * ** * *
18915547 TCATTGACATGAAAAGTCCAATTATAGTCAGTCATGCCTTCAAAAGCCTTATTACTCTCTTTAAG
195 CCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTGTTACTCTCTTTAAA
* * * *
18915612 TGGATGTATAACTTTATAAATGATTTTAAATAGAATTGTTTTTCATTTTTGGTTAAAACATATCA
260 TGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCA
*
18915677 TAATTTGTTGTTTGCAT
325 TAATTTGATGTTTGCAT
* * * *
18915694 TAGAAAACGTGAAG-AGAAAGCCATCCGTTAACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTGATGCCTT
1 AAG-AAACGTGAAGCA-AAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTT
** * * * * *
18915758 CAAAAGCCTAGTTACTCGCTTTAAGTGGATTCATAACTTTGTAAATGATTTTAAACTGAATTAT-
64 TGAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTTGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATT-TG
* * * * * *** * * * *
18915822 TTGACAATTTTGGTTAAAACAAATCATAATTTGTTGTTTGAATTGGGAAACATTAACCGAAAGCC
128 TTTACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAAGAAACGTGAAGCAAAAGCC
* * * * * * * *
18915887 ATCTATTGACAAAAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGGCTTCT-AAAGCCTTATCACTCACTTT
193 ATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTT-TGAAAGCCTTGTTACTCTCTTT
* * * * * * * * * *
18915951 AAGTAGTTTTATAGCTTCATAAATGATTTGT-GATTTAATTGTGTTTACATTTTTAGTTAAAACA
257 AAATGGATTTATAACTTTATAAATGATTT-TAAATTGAATT-TTTTTTCATTTTTGGTTAAAACA
*
18916015 GATCATAAATT-ATGTTTGCAT
320 GATCATAATTTGATGTTTGCAT
* * * * * * * * * * *
18916036 CAGGAAACATGATGCAAAAGCAATCAATTGACAAGAAAAGTGCATTTATAGTTACTTATACCGTC
1 -AAGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTT
* *
18916101 GAAAGCCTAGTTACTCGCTTTAAG-TGCATTTATAAGTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTAT-
65 GAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTTG-ATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATT-TG
** * * * *** *
18916164 TTTACATTTTTGAAT-AAAGAGATCATGATTTGATGTTTGAATTGGGAAACATG-AGCTAAAAGC
128 TTTACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAAGAAACGTGAAGC-AAAAGC
* * ** * * * * * * *
18916227 TATCCATTGACAAGAAAAGTTGATTTATTGTCACTAATTCCTTCGATAGCCTTGTAACTCACTTT
192 CATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTGTTACTCTCTTT
* * * ** * *
18916292 AAATAGTTTTATAACTTTATAAATGATTTTCAATTTTATTTTTTGTCATTTTTGGCTAAAACAGA
257 AAATGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGA
18916357 TCATAATTTGATGTTCT-CATT
322 TCATAATTTGATGTT-TGCA-T
** * * * * * * * *
18916378 GGGAGACATGAAGCAAAAGCTATCTATTTACAAGAAAAGTCCCTTTATAGTCACTCATACCTTCG
1 AAGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTG
* * * * * *
18916443 AAAGCCTTGTTGCTTGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTTTAAATGATTTTAAATTAAATTTTTTT
66 AAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTTGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTGTTT
* * * * * * ** *
18916508 ACATTTTTAGTTGAAACATATTATAATTTGATGTTTGTATCAGGAAACGTGAAGCAAAAGATAAC
131 ACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAAGAAACGTGAAGCAAAAGCCATC
* * * ** * *
18916573 CATTGACATGAAAAGTCCAATTATAGTCACTCATAACTTCGAAAGCCTTGTTACTCTCTTTAAGT
196 CATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTGTTACTCTCTTTAAAT
* * * * *
18916638 GGATGTATAACTTTACAAATGATTTCAAATTGAATTGTTTTTCATTTTTGGTTAAAACATATCAT
261 GGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCAT
* *
18916703 AATTTGTTGTTTTCATT
326 AATTTGATGTTTGCA-T
* ** ** *
18916720 GAA-AAACATGAAGTGAAAGTAATCCATTAACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTT
1 -AAGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTT
* * * ** *
18916784 GAAAGCCTAGTTACTCGCTTTAAGTGGATTCATAACTTGGTAAATGATTTTAAACTAT-AATCT-
65 GAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTTGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAA-T-TGAATTTG
** * * ** * * **
18916847 TACAAATTATT--TTAAAATTGACTTTTTC-TCATTT-TTAGTTAAAACATATCATAATTTGATG
128 TTTACATTTTTGGTTAAAACAGA-----TCATAATTTGAT-GTT--TGC--ATC--AA---GA--
* *
18916908 TTCACATCAG-GAAAG-ATGAAGCAAAAGTCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACT
176 ---A-A-C-GTG-AAGCA-AAAGC------CATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACT
* * * * * *
18916971 TATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCACTTTAAGTGGATTTATAACTTTTTAAATGATTTTAGATT
227 CATGCCTTTGAAAGCCTTGTTACTCTCTTTAAATGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATT
* * *
18917036 --ATTTTTTTTCAATGTTGGTTAAAACATATCATAATTTGATGTTTGCATT
292 GAATTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCA-T
** * * * * * *
18917085 GGGAAATGTGAAGCAAAAGCCATCCATTAACATGGAAAGTCCAATTATAGTCACTCATGCCTTCG
1 AAGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTG
* * * * *
18917150 AAAGACTTGTTACTCTCTTTAAGTGGATCTA-AACTTTATAAATGATTTTAGATTGAATTT-TTT
66 AAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTTGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTGTTT
* * **
18917213 TCATTTTTGGTTAAAACATATCATAATTTTTTGTTTGCATC-AGAAAACGTGAAG-AGAAAGCCA
131 ACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAAG-AAACGTGAAGCA-AAAGCCA
* ** * * *
18917276 TCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAACCTAGTTACTCGCTTTAA
194 TCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTGTTACTCTCTTTAA
* * * * ** * * * ** * *
18917341 GTGGACTCATAGCTTGGTAAATGATTTCAAACTGAATTATTTGACAATTTTGGTTAAAACATATC
259 ATGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATC
* *
18917406 ATAATTTGTTGTTTGAATT
324 ATAATTTGATGTTTGCA-T
** * * * *
18917425 GGGAAACGTGAATCGAAA-CCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTGATAGTCACTCAAGCCTTCT
1 AAGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTT-T
* * * * * ** ** * *
18917489 -AAAGCCTTATCACACGCTTTAAGTGGTTTTATAACTTCCTAAATGATTTTTTATT-TATTTTTT
65 GAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTTGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTGTT
* * * * *
18917552 TACATTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTT-ATGTTTGCATCAGGAAACGAGATGCAAAAGCAAT
130 TACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAAGAAACGTGAAGCAAAAGCCAT
* * * * ** *
18917616 CCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCAATTATGCCTTCGAAAGCCTAATTACT-TGCATTAA
195 CCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTGTTACTCT-CTTTAA
* * * * * * * * *
18917680 GTGCATTTATAAGTTTATAAATGATTTTAAGTTGAATTATTTTACATTTTTAGTTCAAGCAGATC
259 ATGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATC
*
18917745 ATAATTTGATGTTTGGATT
324 ATAATTTGATGTTTGCA-T
** * * * * * *
18917764 GGGAAACATGAGGCAAAAGCTATCCATTGACAAGAAAAGTCGATTTATTGTCACTCATTCCTTTG
1 AAGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTG
** * * ** * *
18917829 GGAGCCTTGTAACTTGCTTTAAG-TGATTTTATAGTTTTATAAATGATTTTGAATTGAATTTTTT
66 AAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTTGA-TTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTGTT
* * * *** * *
18917893 TATCATTTTTGGCTAAAATAGATCATAATTTGATGTATGCATTGGGAGACATGAAGCAAAAGCCA
130 TA-CATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAAGAAACGTGAAGCAAAAGCCA
* * * * * * * *
18917958 TCTATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTTATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCGCTCTAA
194 TCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTGTTACTCTCTTTAA
* * * *
18918023 GTGGATTTATAACTTTTTAAATGATTTTAAATTGAATATTTTTTACA-TTTTGGCTAAAACAGAT
259 ATGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAAT-TTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGAT
*
18918087 CATAATTTGATGTTTGTAT
323 CATAATTTGATGTTTGCAT
** * * * *
18918106 TGGAAACGTGAAGCAAAAGCAATCCATTGACATA-AAAAGTGCAGTGATAGTCACTCATGCCTTC
1 AAGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACA-AGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTT-
* * * * * * *
18918170 T-AAAGCCTTGTTACTTGCATCAAATGGTTTTATAAAC-TTATAAATGATTTAAAATTGAATTT-
64 TGAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTTGATTTAT-AACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTG
** * * * * * * *
18918232 TTT-CTAGTTTTCAGCTAAAACATATAAGAATTTGTTGTTTCCATCAAGAAACGTGAAGCAAAAT
128 TTTAC-A-TTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAAGAAACGTGAAGCAAAAG
* * * * * * *
18918296 CCATCCATTGACACGAAAATTCCATTTATAGTCACTCTTGTCTTTGAAAGACTTGTTACTCACTT
191 CCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTGTTACTCTCTT
* * * * *
18918361 GAAGTGGATTTATAACTTTA-CAATAGATTTTAAATTGAATTTCTTTTACATTTTTGGTTAAAAT
256 TAAATGGATTTATAACTTTATAAAT-GATTTTAAATTGAATTT-TTTTTCATTTTTGGTTAAAAC
* * *
18918425 AAATCATAATTTGTTGTTCGCAT
319 AGATCATAATTTGATGTTTGCAT
* * * ** ** * * * *
18918448 AGGGAAAAGT-AAGTCGAAAA-CCATCCATTGAGAAGAAATTTTTATTTGTAATCCCTGATGCCT
1 A-AGAAACGTGAAG-C-AAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCT
** * * * * *** * ** * * ** * *
18918511 TCAAAAGCCTAGTTAGTCACTTCACACG-TGAAGCAAAAGC---ACCCATTGACATAAAAAGTCA
63 TTGAAAGCCTTGTTACTCGCTTTA-A-GTTGATTTATAA-CTTTA-TAAATGA-TTTTAAATTGA
* ** * ** * * * * * * * ** *
18918572 AATCATAGT-CATTCATGCCTTCGAAAGACTTTGTACTCTCTTTAAGTGGATGTAT-AACTTTAT
123 ATTTGT-TTACATTTTTG-GTT--AAA-AC--AG-A---TC-ATAATTTGATGTTTGCA-TCAAG
*** *** * * * *
18918635 AAA--TGATTTTAAATTACATTTTTTTCATTTTTGGTTAA-AACATA-TCACAATTTGTTGTTCA
175 AAACGTGA-AGCAAAAGCCA-----TCCA---TT-GATAAGAA-A-AGTC-C-ATTTATAG-TCA
* ** * ** * ** *** **
18918696 CATCA-GAAAACGTGAAGAGAAAGCCAT-CCATTGACAAAAAAAGTTCATTTATAGTCACTCATG
225 C-TCATG----CCT---TTGAAAGCCTTGTTACTCTC-TTTAAA-TGGATTTATA---ACT--T-
* * * * * * *** * * **
18918759 CCTTTGAAA-GCCTAGTTACTCACTTTAA-GTGGATTCATAACTTT-G-T-AAA-TGATTTTAAA
274 --TAT-AAATG---A-TT-TTAAATTGAATTTTTTTTCAT--TTTTGGTTAAAACAGATCAT-AA
* ** * *
18918818 CTAAATTATTTG-AC
328 TTTGA-TGTTTGCAT
***** * * * *** * * ** ** ** **
18918832 AATTTTGGTTAAAACAAATCA-CAATTTGTTGTTCAA-ATAGAGAAACATGAACCGAAAACT-AT
1 AAGAAACG-TGAAGCAAA--AGCCATCCATTG-ACAAGA-AAAG-TCCATTTATAG-TCACTCAT
* * * * * * * * * * * * *
18918894 -CCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCAC-TCAAGCCT--TCTA-AAGCCTTATCACTCACT
59 GCC-TT----TG-AAAGCCT-TGT-TACTCGCTTTAAG-TTGATTTATAA-CTTTATAAATGATT
* ** * *** * *** * * * **
18918954 TT-AAGTGGTTTTATAACTT-CATAAATGATT---TTTGAT-TTAATTT--TTTTTACATTTTTA
114 TTAAATTGAATTTGT---TTACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCA--TCAA
* * * *** ** ** * * * *
18919011 GTTAAA-AT-AGATCATAATTTAT-GTTTGCATTGGGAAACA-T-GATGTGAAAG-CAATCCATT
174 G--AAACGTGA-AGCAAAAGCCATCCATTG-A-TAAGAAA-AGTCCAT-TTATAGTCACT-CA-T
* ** * * ** * * * * * **
18919070 GAC-AAGAAAAGTCCATT-TATAATCAC-TT--AT-GCCTTAGAAAGC-CTAGTTACTCACATT-
230 GCCTTTG-AAAG-CC-TTGT-TACTCTCTTTAAATGGATTTA-TAA-CTTTA-TAAATGATTTTA
* * * ** * * ** * * * *
18919127 AAGTGCATTTATAAGTTT-ATAGTTGATTTTAAATTGA--ATTATTTTACATTTTTG-GT
288 AATTGAATTT-T--TTTTCATTTTTG-GTTAAAACAGATCA-TAATTT-GATGTTTGCAT
* * * **** ** * * * * * *
18919183 --TAAA-GTAAATCATAATTTGAT-GTTTGA-ATTGGGAAACA-T-GAGGTGAAAGTTA-TCCAT
1 AAGAAACGTGAAGCA-AAAGCCATCCATTGACA---AGAAA-AGTCCA-TTTATAGTCACT-CA-
* ** * * * * ** * * * * * * * *
18919240 TGAC-AAGAAAAGTTCATTTATTA-TCAC--TCA-TTCCTTCGAGAGCCTTGTAACTCACTTT-A
58 TGCCTTTG-AAAG--C-CTTGTTACTCGCTTTAAGTTGATT-TATAACTTTATAAATGATTTTAA
* * * * *** * **** * * **** *
18919299 AGTG-GTTT-TATA-ACTTTATAAATGATTTTGAATTA-AATTTGTTATTATTTTTGGCTA-AAA
118 ATTGAATTTGTTTACA-TTTTTGGTTAAAACAG-ATCATAATTTG--A-TGTTTGCATCAAGAAA
* * **** *** * ** ** *** * * * **
18919359 C-AG-ATCATAATTTGATGTTTTCATTGGAAAACGTGAAGCAAAAAGCCA-TCTATTGAC-AAGA
178 CGTGAAGCA-AAAGCCATCCATTGATAAGAAAA-GTCCA-TTTATAGTCACTC-A-TGCCTTTG-
* * ** * * * * * * * * * *
18919420 AAAGTCCATT-TATAGTCAC-TT--ATGCCTTCAAAAGCCTTGTTACTCG-CTCT-AAGTGGA-T
237 AAAG-CC-TTGT-TACTCTCTTTAAATGGATTTATAA-CTTTATAAAT-GATTTTAAATTGAATT
* ** * * * ** ** * *
18919478 TTATAGCTTTTTAAATGAATTTAAATTGAATTTTTTTTACATTTTG-GGTTAAAACAGATCAT
297 TTTTTTCATTTT---TG-GTTAAAACAG-A----TCATA-A-TTTGATGTT-----TG--CAT
**** * * ** ** * * * *
18919540 AATTTGATGTTTGCATTAGGAAACTTGAAGCGAAAGCCATCCATTGAGATGAAAAGTCCAATTGT
1 AA---GAAACGTG-A--A-GCAA----AAGC-CATCCATT-----GACAAGAAAAGTCCATTTAT
* * * * * * * *
18919605 AGTCACTCATGCCTTCGAAAGCGTTATTACTCTCTTTAAGTGGATGTGT-AGTGTTATAAATGAT
49 AGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTTGATTTATAACT-TTATAAATGAT
* * * *
18919669 TGTAAATTGAATTT-TTTTCATATTTGGTTAAAACATATCATAATTT-ATTGTTTGCATC-AGAA
113 TTTAAATTGAATTTGTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGA-TGTTTGCATCAAG-A
* * * * **
18919731 AACGTAAAG-AGAAAGTCATCCATTGACAAGAAAAGTTCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAA
176 AACGTGAAGCA-AAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAA
* * * * * * * **
18919795 GCCTAGTTACT-TGCTTTAAGTGGACTCATAACTTTGTAAATAATTTTAAACTGAATTATTTGAT
240 GCCTTGTTACTCT-CTTTAAATGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATT-TTTTTT
* *
18919859 -AATTTTGGTTAAAACAGATCATAA-TTGCTTGTTT-CAAT
303 CATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTG-ATGTTTGC-AT
* * * * * *
18919897 CAGGAAACGTGAACCGAAAGACATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCAAGCCTTC
1 -AAGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTT-
* * * * * ** *
18919962 T-AAAGCCTTATCACTCGCTTTAAGTGGTTTTATAACTTCATAAATGATTTTTGATTTAATTTGT
64 TGAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTTGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTG-
* * * *** ** * *
18920026 TTTGCATTTTTAGTTAAAACAGAAT-ATAATTT-TTGTTTGCATTGGGAAACGTGCTGCGAAAGT
128 TTTACATTTTTGGTTAAAACAG-ATCATAATTTGATGTTTGCATCAAGAAACGTGAAGCAAAAGC
* * * * * * ** * ** * ** *
18920089 AATCTATTGACAAGGAAAGTCTATTCATAGTCACTTTTTCCTTCAAAAGCCTAGTTACTAGC-AT
192 CATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTGTTACTCTCTTT
* * * * * * * *
18920153 AAAGTGCATTTATAAGTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTATTTTACATTTTCGATTAAAGCAT
257 AAA-TGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAG
*
18920218 ATCATAATTTGATGTTTGGATT
321 ATCATAATTTGATGTTTGCA-T
* * * * * * *
18920240 GAGAAACATGAGGCAAAAGCTATCCATTGACAAGAAAAGTCAATTTATTGTCACTCAT-TCTTTC
1 AAGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTT-
* * * * * * *
18920304 GAGAGCCTTGTAACTCACTTTAAGTGGTTTTATAACTTTATAAATAATTTTGAATTGAATTT-TT
65 GAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTTGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTGTT
* * * * ** * * *** * *
18920368 TGTCATATTTGGCTGAATTAGATCATAGTTTGATGTTTCCATTGGGAGACATGAAGCAAAAGCCA
130 T-ACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAAGAAACGTGAAGCAAAAGCCA
* * * * * * * *
18920433 TCTATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAATCACTTATGCCTTCGAAAGCCTTGTTTCTCACTCTAA
194 TCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTGTTACTCTCTTTAA
* * *
18920498 ATGGATTTATAACTTTTTAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTTACATTTTTAGTTAAAACATA
259 ATGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAA-TTTTTTTT-CATTTTTGGTTAAAACAGA
*
18920563 TCATAATTTGATGTTTGAAT
322 TCATAATTTGATGTTTGCAT
* * * * * * *
18920583 CGAGAAACGTGAAACAAAAACCATCTATTGACATA-AAAAGTACAATGATAGTCACTCATGCCTT
1 -AAGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACA-AGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTT
* * * ** **
18920647 CT-AAAGCCTTGTTACTTGCATCAA--ACATTTTATAA-TCTTATAAATGATTCAAAATTGAATT
64 -TGAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTTGA-TTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAATTGAATT
* * * * * * *
18920708 T-TTTCTCATTTTTGGTTAAAACAAATTAGAATTTGTTGTTTCCATCAGGAAACGTGAAGCAAAA
126 TGTTT-ACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAAGAAACGTGAAGCAAAA
* * * * * * * * *
18920772 TCCATCCATTGACATGAAAATTCCATTTATAGTCATTCTTGCCTTAGAAAGCCTTGTTAGTCGCT
190 GCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTGTTACTCTCT
* * * * *
18920837 TGAATTGGATTTATAACTTTATAAAAGATTTTAAATTGAATTTTTTTTAGATTTTTTGTTAAAAC
255 TTAAATGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTT-CATTTTTGGTTAAAAC
* *
18920902 AAATCATAATTTGTTGTTTGCATT
319 AGATCATAATTTGATGTTTGCA-T
** * * * *
18920926 GGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACATA-AAAAGTCTAGTGATAGTCACTCAAT--CTT
1 AAGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACA-AGAAAAGTCCATTTATAGTCACTC-ATGCCTT
* * * * * * *
18920988 TCGATAGCCTTGTTGCTCTCTTTAAG-TGATTTTATAACTTTATAAGTAAGTTTGAATTGAA-TT
64 T-GAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTTGA-TTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTT
* * *** * * *
18921051 GTTTTATCATTTTTTGTTAAAACAGATCATAATTAGATGTTTGCATTGGGAGATGTGAAGAAAAA
127 G-TTTA-CATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAAGAAACGTGAAGCAAAA
* * * * *
18921116 GCCATCTATTTACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATACCTTTGAAAGCCTTGTTACT-TGC
190 GCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTGTTACTCT-C
* * * * * * * * *
18921180 TTTAAGTGGATTTATAAATTTTTAAACGATTTTAAATTAAATTCTTTTTACA--CTTAGTTGAAA
254 TTTAAATGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATT-TTTTTTCATTTTTGGTTAAAA
*
18921243 TAGATCATAATTTGATGTTTGCATT
318 CAGATCATAATTTGATGTTTGCA-T
* * * * * *
18921268 GAGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACATGAAAAGTCCAATTATGGTCACTCATGCCTTCG
1 AAGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTG
** * * * * *
18921333 AAAGCCTCATTACTCTCTTTAAGTGGATGTATAACATTATAAATGATTTTAAATTG-ATTTTTTT
66 AAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTTGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTGTTT
* * * ** * *
18921397 TCATTTTTGGTTAAAACATATGAT-ATTTTTTGCTTGCATCGAA-AAATGTGAA--AAGACAGCC
131 ACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATC-AAGAAACGTGAAGCAA-A-AGCC
* * * *
18921458 ATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATTGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTAGTTACTCGT-ATT
193 ATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTGTTACTC-TCTTT
* ** *
18921522 AAGTGGATTTATAACTTTATAAACAATTTTAAATTGAATGTTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAAAA
257 AAATGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAA--TTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACA
* * *
18921587 GATCATAATTTGTTATTTACAT
320 GATCATAATTTGATGTTTGCAT
* * * * * * * * * *
18921609 CAGGAAATGTGAAACAAAAGACATTCATTG----G-CAAGTCCAGTTATACTCACTCAAGCCTTC
1 -AAGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTT
* * * * *
18921669 AAAAGCCTTGTTGCTCTCTTTAAGTTGATTTATAACTTTAGAAATGATTTTAAATTGAATTTTTT
65 GAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTTGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAA-TTTGT
* * *
18921734 TTTCATTTTTGATTAAAACAGATCATAATTTGTTGTTTGCATC-AGAAAACGTGAAGCAAAAGCC
129 TTACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAAG-AAACGTGAAGCAAAAGCC
* ** * * * *
18921798 ATCCATTGACATTAAAAGTCCAATTATAGTCACTCATGCCTTCGTAAA-TCTTGGTACTCTC-TT
193 ATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTG-AAAGCCTTGTTACTCTCTTT
* * * *
18921861 AAGTGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATT-AAATTTTTTT-ATTTTTGGTTAAAATAAA
257 AAATGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGA
*
18921924 TCATAATTTGTTGTTTGCATT
322 TCATAATTTGATGTTTGCA-T
** * * * * * * *
18921945 GGGAAATGTGAAACAAAAGCCATCCATTGACAAAAAAAATCCATTTACACTCATTCATGCCTTCT
1 AAGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTT-T
* * * * * * *
18922010 -AAAGCCTTGTTACTTGCATCAAATGGTTTTATAA-TCTTATAAATGATTTTAAATCGAAATTCT
65 GAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTTGATTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAATTG-AATT-T
* * * ** *
18922073 ATATATATATATATATGGTTAAAACTTATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACGTGAAGCAA
127 GT-T-TACAT-T-TTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAAGAAACGTGAAGCAA
* ** ** **
18922138 AAGCCATCCATTGACATTAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATATCTTCAAAAGCCTTGTTACTCT
188 AAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTGTTACTCT
* *
18922203 CTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTGTCATTGTTGGTTAAA
253 CTTTAAATGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTT-TCATTTTTGGTTAAA
* *
18922268 ATAGATCATCATTT-ATTGTTTGCAT
317 ACAGATCATAATTTGA-TGTTTGCAT
* * * * * * *
18922293 CAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATTCATTG---AG--AAGTCCAGTTATACTCACTCAAGCCTTC
1 -AAGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTT
* * ** * * *
18922353 AAAAGCCTTGCTACTTTCTTTAAGTTGGTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGATTTTTTT
65 GAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTTGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTGTT
* * * * * *
18922418 TTCATTTTTGGTTAAAACATATCATAATTT-ATTGTTTGCATTAGGCAAATGTGAAGAAAAAGCC
130 TACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGA-TGTTTGCATCAAG-AAACGTGAAGCAAAAGCC
* * ** * * * * * * *
18922482 ATCTATTGACATTAAAAGTTCAGTTATAGTCGCTCATGACTTCAT-ATA-CCTTGGTACTCTCTG
193 ATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTT--TGAAAGCCTTGTTACTCTCTT
* * *
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256 TAAATGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAG
* *
18922609 GTCATAATTTGTTGTTTGCAT
321 ATCATAATTTGATGTTTGCAT
** * * * * *
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1 -AAGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTT
* * * * * * * * ** * *
18922695 TAAAGCCTTGTTAGTTGCATCAAATGGTTTTATAA-TCTTATAAATGATTTTAAATCAAAATTCT
65 GAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTTGATTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAATTGAATTTGT
* * * * *** * * *
18922759 ATACATGTATGTTTAAAACTTCTCATAATTTGATGTTTTCATTAGGAAACGTGAAGCAAAAGCCA
129 TTACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAAGAAACGTGAAGCAAAAGCCA
* * * *
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194 TCCATTGATA-AGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTGTTACTCTCTTTA
** * * *
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**
18922953 CATAATTTCTTGTTTGCAT
323 CATAATTTGATGTTTGCAT
* * * * *
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1 -AAGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTT
* * * *
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65 GAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTTGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAA-TTTGT
* * * * ***
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129 TTACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAAGAAACGTGAAGCAAAAGCCA
* ** * ** * * *
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194 TCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTG-AAAGCCTTGTTACTCTCTTTA
* * * * * *
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258 AATGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGAT
* *
18923288 CATAATTTGTTATTTGCAT
323 CATAATTTGATGTTTGCAT
** * * * * * * * *
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1 -AAGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTT-
* * * * * ** *
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* * * * ** * * *
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** * * * * *
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* * *
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* *
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** * * *
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* * * *
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* * * * * *** * *
18923776 TTTCATTTTAGGTTAAAATAGATCATAATTTGTTATTTGCATTGGGAAACATGAAGCCAAAGCCA
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* * * * * * *
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* * * * * * *
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* *
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324 ATAATTTGATGTTTGCAT
* * * * * * * *
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* * * * ** *
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** * * * * *
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* * * * *
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* *
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** * * * * * *
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1 -AAGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTT
* * * * * * * * * * ** * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * * * *
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192 CATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTC-ACTCATGCCTTTGAAAGCCTTGTTACTCTCTT
* ** *
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256 TAAATGGATTTATAACTTT-ATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACA
* * *
18924646 TATCATAATTCGTTGTTTGCAT
320 GATCATAATTTGATGTTTGCAT
18924668 TGGGAAACGT
Statistics
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CATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTGTTACTCTCTTTAAAT
GGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCAT
AATTTGATGTTTGCAT
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Indices: 18909702--18924667 Score: 7189
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*
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** * * * *
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* * * * * * * *
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* * * *
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* * * * *
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* * ** * ** * * * * *
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* * *
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* * * * * * *
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* * * * *
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* * * *
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** * * * * * *
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* * * * * **
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* ** * **
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126 TTTACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAG
* * * **
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* * * * * *
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* * ** * **
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* *
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* * * * **
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* * * *
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** * * ** * *
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* * * *
18911021 AATTTTTGGTTAACACATATCATAATTTGATGTTTGCAT-TG
130 CATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAG
* * * * * *
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* * * * ** *
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* ** * *
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* * *
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* * * * *
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* * * *
18911361 CT-CA-TTTTGGTTAAAAAATACCATAATTTGATGTTTGCATCAC
128 -TACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAG
* * * * *
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* * * **
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* * *
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* * * * * * * *
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65 AAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATAGAATTTTTTTA
* * ** * * *
18911704 CATTTTTGGTTAAAACAAATCATAGTTTTTTATTTTCATTAG
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* * **
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* * * * * *
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* * * ** * *
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* * *
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64 AAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATAGAAT-TTTTT
* * *
18912219 TGACATTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTTGATGCTTGCATTAG
128 T-ACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAG
* * * * * * *********
18912264 AAAACATGAAGCAAAAGCCATCTATTCACAAAAAAAGTCTAGTTATAGTCANNNNNNNNNNNNNN
1 GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCA-----CTCATGCCT
*****************************************************************
18912329 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
61 TTGAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATAGAATTTT
**********************************************
18912394 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
126 TTTACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAG
*****************************************************************
18912440 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
1 GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAA
*****************************************************************
18912505 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
66 AGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATAGAATTTTTTTAC
*
18912570 ATTATTTTAGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTT-CAT-AGGG
131 A-T-TTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCA--G
* *
18912613 GAAACATGAAGTC-AAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTTCATTTATAATCACTCATGCCATTTG
1 GAAACATGAAG-CAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCC-TTTG
** * * * *
18912677 -AAGCCTTGTTACTCGCTCAAAATGAATTTATAACTTTTTAAATGATTTTAAATTGAAGTTTTTT
64 AAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATAGAA-TTTTTT
* * * * * * *
18912741 AAAATTTTTGGCTAAAATAGATCATAATTTGTTGTTTGCATAAA
128 TACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAG
* * * * *
18912785 GAAACGTGAAGCAAAATCCATCTATTGACACA-AAAAATCCATTTATAGTCACTC-TCGCCTTCG
1 GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACA-AGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAT-GCCTTTG
* * *
18912848 AAAGCCTTGTTACTCGCTTGAAGTGGATTTAT-AGTTTCATAAATGATTTTAAATTGAATTTCTT
64 AAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTT-ATAAATGATTTTAAATAGAATTT-TT
* * * **
18912912 TTACATTTTTGGTTAAAA-AAATCATAATTTGTTGTTTACATTTG
127 TTACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAG
** * * * * * *
18912956 GAAATGTGAAGTGAAAA-CCATCCATTGATAAGAAAAGTCTATTTACAGTCACTGATGCTTTTGA
1 GAAACATGAAG-CAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGA
* * * * *
18913020 AAGCCTAGTTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAA-TCTTACAAATGATTTTAAAATTA-AATTTTT
65 AAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACT-TTATAAATGATTTT-AAA-TAGAATTTTT
* * * * *
18913083 CT-CATTTTTAGTTAAAACAGATCGTAATTTCATGTTTGCAT-TG
127 TTACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAG
* * * * * **
18913126 GAAA-ATGTCAAGAAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTGCATTTATACTCACTTATACCTTCA
1 GAAACATG--AAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTG
* ** * * * *
18913190 AAAGCATTACTACTCACTTTAAGTGAATTTATAGCTCTATAAATGATTTTAAATTA-AAGTTTTT
64 AAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAA-TAGAA--TTTT
* * * * ** *
18913254 TTTTCATTTTTTGTTAAAACAGTTAATAATTTTCTGTTTGCATTA-
126 TTTACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAG
* * * * * *
18913299 GAGGACATGTAGC-AAAGCCATTCATTGACAAGAAAAGTCTAGTTATAGTCACTCATGCCTTCGA
1 GA-AACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGA
* * * * * *
18913363 AAGCCTTGTTACTAGCTTTAAGTGGATTTTTAACTTTTTAAACGATTTCAAATTGAATTTGTTTT
65 AAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATAGAA-TT-TTTT
* *
18913428 TACA-TTTTGGTTAAAAAAGACCATAATTTGATGTTTGCATCAG
128 TACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAG
* * * * * * *
18913471 GAAACGTGAAGCAAAAGCTATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATACTCACTCAAGTCTTCGAA
1 GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAA
* * * * *
18913536 AGCCTTGCTAGTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTTTTAATGATTTTAAATTGAATTTATTTTA
66 AGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATAGAATTT-TTTTA
* **
18913601 CATTTTTGGTCAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGG
130 CATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAG
* * * * * *
18913643 GAAGCATGAAGCCAAAGCCATCCATTGGCATA-AAAAGTCCAGTTATAGTCACTTATACCTTTGA
1 GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACA-AGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGA
* * *
18913707 AAGCCTTGTTACTCTCTTTAAATGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTATT
65 AAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATAGAATTTTT-TT
* * * **
18913772 -CATTTTTGATTAAAACAGATCATAATTTGTTGTGTGCATTGG
129 ACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAG
* * * * * * * * *
18913814 GAAACGTAAAGCAAAAGCCATCTATTGGCAAGAAATGTCCATTTATACTCACTTATTCCTTTTAA
1 GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAA
* * * * * * * * ** * * *
18913879 AGCCTT-TCTACTCTCATCAAATGGTTTTATAA-TCTTATAAATGAGTATGAATCCAAATTCTAT
66 AGCCTTGT-TACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAATAGAATTTTTTT
* * * * * * *
18913942 ATATATATGGTTAAAACATATCATACTTTGATATTTGCATCAA
129 ACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAG
* *
18913985 GAAACATGAAGCAAAAGCCATCTATTGACAAGAAAAGTCCAATTATAGTCACTCATGCCTTTGAA
1 GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAA
* * *
18914050 AGTCTTGTTACTCTCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTA-
66 AGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATAGAATTTTTTTAC
* * * **
18914114 ATTTTTGGTTAAAACATATCATAATTT-ATTTTTTGTATTGG
131 ATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGA-TGTTTGCATCAG
* * * * * **
18914155 GAAACGTGAAGCAAAAGCTATCCGTTGACAAG-AAAGTCCACTTATAGTCACTCATACCTTCAAA
1 GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAA
* * * * *
18914219 AGCCTAGTTACTCACTTTAGGTGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGTATTATTTTGT
66 AGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATAGAATT-TTTT-T
* * * * **
18914284 A-A-TTTTGGTTAAAACATATCATAATTTGTTTTTTGAATGGG
129 ACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAG
* * * * * **
18914325 GAAACATGAATCGAAAGCCATCCATTGGCTAGAAATA-TCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTCAA
1 GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAA-AGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGA
* * * * ** **
18914389 AAGCCTTATTACTCACTTTAAGTAGTTTTATAACTTTATAAATGATTTTTGAT-TTATTTGTTTT
65 AAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATAGAATTT-TTTT
* * * * *
18914453 ACTTTTTTAGTTGAAACAAATCATAATTTG-TATTTGCAT-ATG
129 ACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCA-G
* * ** * * * * * * *
18914495 GAAACGTGATGTTAAAGCAATCCATTGACTAGAAATGTCCATTTATAGTCAGTCAAGTCTTCGAA
1 GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAA
* * * * ** **
18914560 AGCCTTATTACTTGGTTTAAGTGGTTTTATAACTTTATAAATGATTTTTGATTTATTTATTTTTT
66 AGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATGA-TTTT-AAATA-GAATTTTTT
* * * * ** **
18914625 TAC-TTTTCTAGTTGAAATAGATGATAATTT-ATAATTGCATTTG
128 TACATTTT-TGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAG
* * * ** * * *
18914668 AAAACGTGATGTGAAAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTTATGTCTTTGAA
1 GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAA
* * * * *
18914733 AGCCTAGTTACTCACATTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTATTTTAC
66 AGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATAGAATTTTTTTAC
** * *
18914798 A-TTTCAGTTAAAATAGATCATAATTTGATGTTTGAAT-ATG
131 ATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCA-G
* ** * * *
18914838 GAAACATGAGGCAAAAGTTATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATTGTCACTCAT-TCTATTGA
1 GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCT-TTGA
* * * * * * * **
18914902 GAGCCTTGTAACTCGCTTTAAATGGTTTTATAAATTTATAAATGATTTTGAATTG-AGCTTTTTA
65 AAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATAGAATTTTTTTA
* * * * *
18914966 TCATTTTTGGCTAAAAAAAATCATAATTTGATGTTTCCATCTG
130 -CATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAG
* * ** * * * *
18915009 GAGACGTGAAGCAAAAGCCATTTATTGATAAGAAAAGTCCATTGATAGTTACTCATGCCTTCGAA
1 GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAA
* * *
18915074 AGCCTTTTTACTAGCTTTAAGTGGATTTATAACTTT-TAAATGATTTTAAATTGAATCGTTTTTT
66 AGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATAGAAT--TTTTTT
* * * *
18915138 ACATTTTTAGTTTAAACAGATCATAATTTGATGTTTGTAT-TG
129 ACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAG
* * * *
18915180 GAAAACATGAGGCAAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATTGTCACTCATGCC-TTCA
1 G-AAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGA
* * * * * **
18915244 AGAGCTTTGTTACTTGCTTTAAGTGGTTTTATAAATTTATAAATGATTTTGAATTTAATTTTTTT
65 A-AGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATAGAA-TTTTTT
* * * **
18915309 TATCATTTTTAGTTAAAACAGATCATAATATGATGTTTCCATTGG
128 TA-CATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAG
* * * * * *
18915354 GAGACGTGAAGCAAAAGCCATCTATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTTACTCATGCCTTCGAA
1 GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAA
* * * * *
18915419 AGACTTGTTACTCTCTTTAAGTGGATTTATAACTTTTTAAATGATTTTAAATTGATTTTTTTTTA
66 AGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATAGA-ATTTTTTTA
* * **
18915484 CATTTTTGGTTAAAATAGATCATAATTCGATGTTTGCATTGG
130 CATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAG
* * * * * * * **
18915526 GAAACGTCAAGTAAAAGCCATTCATTGACATGAAAAGTCCAATTATAGTCAGTCATGCCTTCAAA
1 GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAA
* * *
18915591 AGCCTTATTACTCTCTTTAAGTGGATGTATAACTTTATAAATGATTTTAAATAGAATTGTTTTT-
66 AGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATAGAATT-TTTTTA
* * *
18915655 CATTTTTGGTTAAAACATATCATAATTTGTTGTTTGCATTAG
130 CATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAG
* * * * * **
18915697 AAAACGTGAAG-AGAAAGCCATCCGTTAACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTGATGCCTTCAA
1 GAAACATGAAGCA-AAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGA
* * * * *
18915761 AAGCCTAGTTACTCGCTTTAAGTGGATTCATAACTTTGTAAATGATTTTAAACT-GAATTATTTG
65 AAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAA-TAGAATTTTTTT
* * * * **
18915825 ACAATTTTGGTTAAAACAAATCATAATTTGTTGTTTGAATTGG
129 ACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAG
* * * * * * *
18915868 GAAACATTAACCGAAAGCCATCTATTGACAAAAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGGCTTCT-A
1 GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTT-TGA
* * * * * * * * ** *
18915932 AAGCCTTATCACTCACTTTAAGTAGTTTTATAGCTTCATAAATGATTTGT-GATTTAATTGTGTT
65 AAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATGATTT-TAAATAGAATT-TTTT
* *
18915996 TACATTTTTAGTTAAAACAGATCATAAATT-ATGTTTGCATCAG
128 TACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAG
* * * * * * * * *
18916039 GAAACATGATGCAAAAGCAATCAATTGACAAGAAAAGTGCATTTATAGTTACTTATACCGTCGAA
1 GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAA
* * * * *
18916104 AGCCTAGTTACTCGCTTTAAGTGCATTTATAAGTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTATTTTAC
66 AGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATAGAATTTTTTTAC
** * * * **
18916169 ATTTTTGAAT-AAAGAGATCATGATTTGATGTTTGAATTGG
131 ATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAG
* ** * * * *
18916209 GAAACATG-AGCTAAAAGCTATCCATTGACAAGAAAAGTTGATTTATTGTCACTAATTCCTTCGA
1 GAAACATGAAGC-AAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGA
* * * * * * * ***
18916273 TAGCCTTGTAACTCACTTTAAATAGTTTTATAACTTTATAAATGATTTTCAATTTTATTTTTTGT
65 AAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATAGAATTTTTT-T
* **
18916338 -CATTTTTGGCTAAAACAGATCATAATTTGATGTTCT-CATTGG
129 ACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTT-TGCATCAG
* * * * * * *
18916380 GAGACATGAAGCAAAAGCTATCTATTTACAAGAAAAGTCCCTTTATAGTCACTCATACCTTCGAA
1 GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAA
* * *
18916445 AGCCTTGTTGCTTGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTTTAAATGATTTTAAATTA-AATTTTTTTA
66 AGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAA-TAGAATTTTTTTA
* * * * *
18916509 CATTTTTAGTTGAAACATATTATAATTTGATGTTTGTATCAG
130 CATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAG
* ** * * * ** *
18916551 GAAACGTGAAGCAAAAGATAACCATTGACATGAAAAGTCCAATTATAGTCACTCATAACTTCGAA
1 GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAA
* * * * *
18916616 AGCCTTGTTACTCTCTTTAAGTGGATGTATAACTTTACAAATGATTTCAAATTGAATTGTTTTT-
66 AGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATAGAATT-TTTTTA
* * * *
18916680 CATTTTTGGTTAAAACATATCATAATTTGTTGTTTTCAT-TG
130 CATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAG
* ** ** *
18916721 AAAAACATGAAGTGAAAGTAATCCATTAACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGA
1 -GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGA
* * ** * * **
18916786 AAGCCTAGTTACTCGCTTTAAGTGGATTCATAACTTGGTAAATGATTTTAAACTATAA-TCTTAC
65 AAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAA-TAGAATTTTTTT
* * ** ** * * *
18916850 AAATTATT--TTAAAATTGA-C-TTTTTCTCAT-TTT-TAGTTA-
129 ACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATT-TGATGTTTGCA-TCAG
* **** * * * ** *** * *
18916888 -AAACAT--ATCATAATTTGAT--GTTCACATCAGGAAAGATGAAGCAAAAGTCA-TCCATTGAC
1 GAAACATGAAGCA-AAAGCCATCCATTGACA--AGAAAAG-TCCATTTATAGTCACT-CA-TGCC
** * * ** * * * * * * * *
18916947 -AAGAAAAGTCCATT-TATAGTCAC-TT-A-TGCCTTCGA-AAGCCTTGTTACTCACTTTAAGT-
60 TTTG-AAAG-CC-TTGT-TACTCGCTTTAAGTGGATT-TATAA-CTTTATAAATGATTTTAAATA
* * * ** * **** * ** * * *
18917005 GGA-TTTATAAC-TTTTTAAATGATTTTAGATTATTTTTTTTCAATG-TTG-GTTA-
119 GAATTTTTTTACATTTTT-GGTTAAAACAGATCA--TAATTT-GATGTTTGCATCAG
* **** ** * * ** *** * * **
18917057 -AAACAT--ATCATAATTTGAT-GTTTG-CATTGGGAAATGTGAAGCAAAAGCCA-TCCATTAAC
1 GAAACATGAAGCA-AAAGCCATCCATTGACA---AGAAAAGTCCATTTATAGTCACT-CA-TGCC
* * * * * * * * *
18917116 ATGGAAAGTCCAATTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGACTTGTTACTCTCTTTAAGTGGATCTA
60 TTTGAAAG-CC---T-T-GTTACTC--G-CTT--TAAG---TG-GA-T-T-TATAACT--TTATA
* ** * * **
18917181 AACTTTATAAATGATTTTAGATTGAATTTTTTT-CATTTTTGGTTAAAACATATCATAATTTTTT
105 AA--TGAT---T--TTAA--ATAGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGAT
18917245 GTTTGCATCAG
161 GTTTGCATCAG
* * **
18917256 AAAACGTGAAG-AGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAA
1 GAAACATGAAGCA-AAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGA
* * * * * ** * * *
18917320 AAACCTAGTTACTCGCTTTAAGTGGACTCATAGCTTGGTAAATGATTTCAAACT-GAATTATTTG
65 AAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAA-TAGAATTTTTTT
* * * * **
18917384 ACAATTTTGGTTAAAACATATCATAATTTGTTGTTTGAATTGG
129 ACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAG
* * * * *
18917427 GAAACGTGAATCGAAA-CCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTGATAGTCACTCAAGCCTTCT-A
1 GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTT-TGA
* * * * ** ** **
18917490 AAGCCTTATCACACGCTTTAAGTGGTTTTATAACTTCCTAAATGATTTTTTAT-TTATTTTTTTA
65 AAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATAGAATTTTTTTA
*
18917554 CATTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTT-ATGTTTGCATCAG
130 CATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAG
* * * * *
18917595 GAAACGA-GATGCAAAAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCAATTATGCCTTCGA
1 GAAAC-ATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGA
** * * * * * * *
18917659 AAGCCTAATTACTTGCATTAAGTGCATTTATAAGTTTATAAATGATTTTAAGTTGAATTATTTTA
65 AAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATAGAATTTTTTTA
* * * * **
18917724 CATTTTTAGTTCAAGCAGATCATAATTTGATGTTTGGATTGG
130 CATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAG
* * * * * **
18917766 GAAACATGAGGCAAAAGCTATCCATTGACAAGAAAAGTCGATTTATTGTCACTCATTCCTTTGGG
1 GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAA
* * ** * *
18917831 AGCCTTGTAACTTGCTTTAAGT-GATTTTATAGTTTTATAAATGATTTTGAATTGAATTTTTTTA
66 AGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGA-TTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATAGAATTTTTTTA
* * * **
18917895 TCATTTTTGGCTAAAATAGATCATAATTTGATGTATGCATTGG
130 -CATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAG
* * * * *
18917938 GAGACATGAAGCAAAAGCCATCTATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTTATGCCTTCGAA
1 GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAA
* * * *
18918003 AGCCTTATTACTCGCTCTAAGTGGATTTATAACTTTTTAAATGATTTTAAATTGAATATTTTTTA
66 AGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATAGAAT-TTTTTTA
* * *
18918068 CA-TTTTGGCTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGTAT-TG
130 CATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAG
* * * * *
18918108 GAAACGTGAAGCAAAAGCAATCCATTGACATA-AAAAGTGCAGTGATAGTCACTCATGCCTTCT-
1 GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACA-AGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTT-TG
* * * * * * *
18918171 AAAGCCTTGTTACTTGCATCAAATGGTTTTATAAAC-TTATAAATGATTTAAAATTGAATTTTTT
64 AAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTAT-AACTTTATAAATGATTTTAAATAGAATTTTTT
* ** * * * * * * *
18918235 CTA-GTTTTCAGCTAAAACATATAAGAATTTGTTGTTTCCATCAA
128 -TACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAG
* * * * * *
18918279 GAAACGTGAAGCAAAATCCATCCATTGACACGAAAATTCCATTTATAGTCACTCTTGTCTTTGAA
1 GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAA
* * * * *
18918344 AGACTTGTTACTCACTTGAAGTGGATTTATAACTTTA-CAATAGATTTTAAATTGAATTTCTTTT
66 AGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAAT-GATTTTAAATAGAATTT-TTTT
* * * *
18918408 ACATTTTTGGTTAAAATAAATCATAATTTGTTGTTCGCAT-AGG
129 ACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCA-G
* ** ** * * * * *
18918451 GAAA-A-GTAAGTCGAAAA-CCATCCATTGAGAAGAAATTTTTATTTGTAATCCCTGATGCCTTC
1 GAAACATG-AAG-C-AAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTT
* * * * * *** * ** * ** *
18918513 AAAAGCCTAGTTAGTCACTTCACACGT-GAAGCAAAAGC---ACCCATTGA-CATAAAAAGTCAA
63 GAAAGCCTTGTTACTCGCTTTA-A-GTGGATTTATAA-CTTTA-TAAATGATTTTAAATAG---A
** ** ** * * * * * ** * *
18918573 ATCATAGT-CATTCATGCCTTCGAAAGACTTTGTACTCTCTTTAAGTGGATGTATAACTTTA-
121 ATTTTTTTACATTTTTG-GTT--AAA-AC--AG-A---TC-ATAATTTGATGT-TTGCATCAG
* *** *** * ** * *
18918634 -TAA-ATGATTTTAAATTACATTTTTTTCATTTTTGGTTAA-AACATA-TCACAATTTGTTGTTC
1 GAAACATGA-AGCAAAAGCCA-----TCCA---TT-GACAAGAA-A-AGTC-C-ATTTATAG-TC
* ** ** ***** ** * *
18918695 ACATCA-GAAAACGTGAAGAGAAAGCCATCCATTGA--CAAAAAAAGTTCATTTAT-A-GTCACT
51 AC-TCATG----CCT---TTGAAAGCC-T-TGTT-ACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTA-T
* ** * ** * ** * * * ** *
18918755 -CATGCCTTTGAA-AGCCTAGTTACT-CACTTTAAGTGGATTCATAAC--TTTGTAA-ATGAT-T
104 AAATGATTTTAAATAGAAT-TTTTTTACA-TTT--TTGG-TT-AAAACAGATCATAATTTGATGT
* * *
18918813 TTAAACTAAATTATTT
163 TT--GC---ATCA--G
** * * *** * * ** ** ** **
18918829 GACAATTTTGGTTAAAACAAATCA-CAATTTGTTGTTCAA-ATAGAGAAACATGAACCGAAAACT
1 GA-AA-CAT-G---AAGCAAA--AGCCATCCATTG-ACAAGA-AAAG-TCCATTTATAG-TCACT
* **** * * * * * * * * * *
18918892 -AT-CCATTGACAAGAAAAG-T-CT--ATTTATAGT-CACTCA-AGCCTTCTAAA-GCCTTATCA
54 CATGCCTTTGA-AAGCCTTGTTACTCGCTTTA-AGTGGATTTATAACTTTATAAATG-ATTTTAA
* * * *** ** ** * ** * * * * *
18918948 CT-CACTTTAAGT-GGTTTTATAACTTCATAAA-TGATTTTTGATTTAATTTTTTTTACATTTTT
116 ATAGAATTTTTTTACATTTT-T-GGTT-A-AAACAGA-TCATAATTTGA---TGTTTGCA---TC
18919010 AG
170 AG
* * * *** ** * * * * *
18919012 TTAAA-AT-AGATCATAATTTAT-GTTTG-CATTGGGAAACA-T-GATGTGAAAG-CAATCCATT
1 -GAAACATGA-AGCAAAAGCCATCCATTGACA---AGAAA-AGTCCAT-TTATAGTCACT-CA-T
* ** * * ** * * * * * **
18919070 GAC-AAGAAAAGTCCATT-TATAATCAC-TT-A-T-GCCTTAGAAAGC-CTAGTTACTCACATTA
57 GCCTTTG-AAAG-CC-TTGT-TACTCGCTTTAAGTGGATTTA-TAA-CTTTA-TAAATGATTTTA
* * * * ** * * * ** *
18919128 AGT-GCATTTATAAGTTTATAGTTGATT--TT-AAATTGA--ATTATTTTACATTTTTGGTTAAA
115 AATAGAATTT-T---TTTACA-TT-TTTGGTTAAAACAGATCA-TAATTT-GATGTTTGCAT-CA
18919187 G
171 G
* **** * ** ** *
18919188 TAAATCAT-AATTTGATG-TTTGAATTGGGAAACATGAGGTGAAAGTTATCCATTGACAAGAAAA
1 GAAA-CATGAAGCAAAAGCCATCCATT--G--ACA--A-G-AAAAG---TCCA-T----------
* * * * * * *
18919251 GTTCATTTATTATCACTCATTCCTTCGAGAGCCTTGTAACTCACTTTAAGTGGTTTTATAACTTT
43 -TT-A--TA--GTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTT
* *
18919316 ATAAATGATTTTGAATTA-AATTTGTTATT--ATTTTTGGCTAAAACAGATCATAATTTGATGTT
102 ATAAATGATTTT-AAATAGAATTT-TT-TTACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTT
* *
18919378 TTCAT-TG
164 TGCATCAG
* * * **
18919385 GAAAACGTGAAGCAAAAAGCCATCTATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTTATGCCTTCA
1 G-AAACATGAAGC-AAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTG
* * * * *
18919450 AAAGCCTTGTTACTCGCTCTAAGTGGATTTATAGCTTTTTAAATGAATTTAAATTGAATTTTTTT
64 AAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATAGAA-TTTTTT
* *
18919515 TACATTTTGGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAG
128 TACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAG
* * * * * * *
18919559 GAAACTTGAAGCGAAAGCCATCCATTGAGATGAAAAGTCCAATTGTAGTCACTCATGCCTTCGAA
1 GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAA
* * * * * * * *
18919624 AGCGTTATTACTCTCTTTAAGTGGATGTGT-AGTGTTATAAATGATTGTAAATTGAATTTTTTT-
66 AGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAATAGAATTTTTTTA
* *
18919687 CATATTTGGTTAAAACATATCATAATTT-ATTGTTTGCATCAG
130 CATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGA-TGTTTGCATCAG
* * * * * **
18919729 AAAACGTAAAG-AGAAAGTCATCCATTGACAAGAAAAGTTCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAA
1 GAAACATGAAGCA-AAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGA
* * * * * * * *
18919793 AAGCCTAGTTACTTGCTTTAAGTGGACTCATAACTTTGTAAATAATTTTAAACT-GAATTATTTG
65 AAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAA-TAGAATTTTTTT
* * *
18919857 ATAATTTTGGTTAAAACAGATCATAA-TTGCTTGTTT-CAATCAG
129 ACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTG-ATGTTTGC-ATCAG
* * * * * *
18919900 GAAACGTGAACCGAAAGACATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCAAGCCTTCT-A
1 GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTT-TGA
* * * * ** **
18919964 AAGCCTTATCACTCGCTTTAAGTGGTTTTATAACTTCATAAATGATTTTTGATTTAATTTGTTTT
65 AAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATAGAATTT-TTTT
* * * **
18920029 GCATTTTTAGTTAAAACAGAAT-ATAATTT-TTGTTTGCATTGG
129 ACATTTTTGGTTAAAACAG-ATCATAATTTGATGTTTGCATCAG
* ** * ** * * * * ** * **
18920071 GAAACGTGCTGCGAAAGTAATCTATTGACAAGGAAAGTCTATTCATAGTCACTTTTTCCTTCAAA
1 GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAA
* * * * * * * *
18920136 AGCCTAGTTACTAGCATAAAGTGCATTTATAAGTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTATTTTAC
66 AGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATAGAATTTTTTTAC
* * * * * *
18920201 ATTTTCGATTAAAGCATATCATAATTTGATGTTTGGAT-TG
131 ATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAG
* * * * *
18920241 AGAAACATGAGGCAAAAGCTATCCATTGACAAGAAAAGTCAATTTATTGTCACTCAT-TCTTTCG
1 -GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTT-G
* * * * * * *
18920305 AGAGCCTTGTAACTCACTTTAAGTGGTTTTATAACTTTATAAATAATTTTGAATTGAATTTTTTG
64 AAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATAGAATTTTTT-
* * * ** * * **
18920370 T-CATATTTGGCTGAATTAGATCATAGTTTGATGTTTCCATTGG
128 TACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAG
* * * * *
18920413 GAGACATGAAGCAAAAGCCATCTATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAATCACTTATGCCTTCGAA
1 GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAA
* * * * * *
18920478 AGCCTTGTTTCTCACTCTAAATGGATTTATAACTTTTTAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTT
66 AGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATAGAA--TTTTTTT
* * *
18920543 ACATTTTTAGTTAAAACATATCATAATTTGATGTTTGAATC-G
129 ACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAG
* * * * * * *
18920585 AGAAACGTGAAACAAAAACCATCTATTGACATA-AAAAGTACAATGATAGTCACTCATGCCTTCT
1 -GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACA-AGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTT-T
* * * ** ** *
18920649 -AAAGCCTTGTTACTTGCATCAA--ACATTTTATAA-TCTTATAAATGATTCAAAATTGAATTTT
63 GAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGA-TTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAATAGAATTTT
* * * * *
18920710 TTCT-CATTTTTGGTTAAAACAAATTAGAATTTGTTGTTTCCATCAG
126 TT-TACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAG
* * * * * * *
18920756 GAAACGTGAAGCAAAATCCATCCATTGACATGAAAATTCCATTTATAGTCATTCTTGCCTTAGAA
1 GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAA
* * * * *
18920821 AGCCTTGTTAGTCGCTTGAATTGGATTTATAACTTTATAAAAGATTTTAAATTGAATTTTTTTTA
66 AGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATAGAA-TTTTTTTA
* * * * **
18920886 GATTTTTTGTTAAAACAAATCATAATTTGTTGTTTGCATTGG
130 CATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAG
* * *
18920928 GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACATA-AAAAGTCTAGTGATAGTCACTCAAT--CTTTC
1 GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACA-AGAAAAGTCCATTTATAGTCACTC-ATGCCTTT-
* * * * * * * * *
18920990 GATAGCCTTGTTGCTCTCTTTAAGT-GATTTTATAACTTTATAAGTAAGTTTGAATTGAATTGTT
63 GAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGA-TTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATAGAATTTTT
* * **
18921054 TTATCATTTTTTGTTAAAACAGATCATAATTAGATGTTTGCATTGG
127 TTA-CATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAG
* ** * * * * *
18921100 GAGATGTGAAGAAAAAGCCATCTATTTACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATACCTTTGAA
1 GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAA
* * * *
18921165 AGCCTTGTTACTTGCTTTAAGTGGATTTATAAATTTTTAAACGATTTTAAATTA-AATTCTTTTT
66 AGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAA-TAGAATT-TTTTT
* * * * *
18921229 ACA--CTTAGTTGAAATAGATCATAATTTGATGTTTGCAT-TG
129 ACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAG
* * * *
18921269 AGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACATGAAAAGTCCAATTATGGTCACTCATGCCTTCGA
1 -GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGA
** * * * * *
18921334 AAGCCTCATTACTCTCTTTAAGTGGATGTATAACATTATAAATGATTTTAAATTG-ATTTTTTTT
65 AAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATAGAATTTTTTTA
* * ** *
18921398 CATTTTTGGTTAAAACATATGAT-ATTTTTTGCTTGCATC--
130 CATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAG
* *
18921437 GAAAAATGTGAA--AAGACAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATTGTCACTCATGCCTT
1 GAAACA--TGAAGCAA-A-AGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTT
* ** *
18921500 TGAAAGCCTAGTTACTCG-TATTAAGTGGATTTATAACTTTATAAACAATTTTAAATTGAATGTT
62 TGAAAGCCTTGTTACTCGCT-TTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATAGAA--TT
* * * * *
18921564 TTTTTTCATTTTTGGTTAAAAAAGATCATAATTTGTTATTTACATCAG
124 TTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAG
** * * * * * * * **
18921612 GAAATGTGAAACAAAAGACATTCATTG----G-CAAGTCCAGTTATACTCACTCAAGCCTTCAAA
1 GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAA
* * * * * *
18921672 AGCCTTGTTGCTCTCTTTAAGTTGATTTATAACTTTAGAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTT
66 AGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATAGAA-TTTTTTTA
* *
18921737 CATTTTTGATTAAAACAGATCATAATTTGTTGTTTGCATCAG
130 CATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAG
* * ** * *
18921779 AAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACATTAAAAGTCCAATTATAGTCACTCATGCCTTCGTA
1 GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTG-A
* * *
18921844 AA-TCTTGGTACTCTC-TTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTA-AATTTTTTT
65 AAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAA-TAGAATTTTTTT
* * * **
18921906 --ATTTTTGGTTAAAATAAATCATAATTTGTTGTTTGCATTGG
129 ACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAG
** * * * * * *
18921947 GAAATGTGAAACAAAAGCCATCCATTGACAAAAAAAATCCATTTACACTCATTCATGCCTTCT-A
1 GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTT-TGA
* * * * * *
18922011 AAGCCTTGTTACTTGCATCAAATGGTTTTATAA-TCTTATAAATGATTTTAAATCGAAATTCTAT
65 AAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAATAG-AATT-T-T
* * * **
18922075 ATATATATATATATGGTTAAAACTTATCATAATTTGATGTTTGCATCAG
126 -T-T-TACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAG
* ** ** **
18922124 GAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACATTAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATATCTTCAAA
1 GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAA
* * *
18922189 AGCCTTGTTACTCTCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTGT
66 AGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATAGAATTTTTTT-A
* * *
18922254 CATTGTTGGTTAAAATAGATCATCATTT-ATTGTTTGCATCAG
130 CATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGA-TGTTTGCATCAG
* * * * **
18922296 GAAACATGAAGCAAAAGCCATTCATTG---AG--AAGTCCAGTTATACTCACTCAAGCCTTCAAA
1 GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAA
* ** * * *
18922356 AGCCTTGCTACTTTCTTTAAGTTGG-TTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGATTTTTTTTT
66 AGCCTTGTTACTCGCTTTAAG-TGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATAGAATTTTTTTA
* *
18922420 CATTTTTGGTTAAAACATATCATAATTT-ATTGTTTGCATTAG
130 CATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGA-TGTTTGCATCAG
** * * ** * * * *
18922462 GCAAATGTGAAGAAAAAGCCATCTATTGACATTAAAAGTTCAGTTATAGTCGCTCATGACTTCAT
1 G-AAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTT--T
* * * * *
18922527 -ATA-CCTTGGTACTCTCTGTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTT
63 GAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATAGAATTTTTT
* * * * * *
18922590 T-TATTTCTGGTTAAAATAGGTCATAATTTGTTGTTTGCATCAA
128 TACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAG
* ** * * * * * *
18922633 GAAACGTGAAATAAAAGCCATCCATTGGCAAAAAAAATCCATTTACACTCACTCATGCCTTTTAA
1 GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAA
* * * * * * * * *
18922698 AGCCTTGTTAGTTGCATCAAATGGTTTTATAA-TCTTATAAATGATTTTAAATCA-AAATTCTAT
66 AGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAAT-AGAATTTTTTT
* * * *** * *
18922761 ACATGTATGTTTAAAACTTCTCATAATTTGATGTTTTCATTAG
129 ACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAG
* * * *
18922804 GAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACATA-AAAAGTCCAATTATAGTCACTTATGCCTTCGA
1 GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACA-AGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGA
* * *
18922868 AAGCCTTGTTACTCTCTTTAAGCGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATGTTTTTT
65 AAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATAGAAT-TTTTTT
* * **
18922933 -CTTTTTTGGTTAAAAAAGATCATAATTTCTTGTTTGCATCAAG
129 ACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATC-AG
* * * * * *
18922976 G-AACGTGAAGCAAAAGCCATTCATTGAC-----AAGTCCAGTTATACTCACTCAAGCCTTTAAA
1 GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAA
* * * * *
18923035 AGCCTTGTTACTCTCTTTAACTTGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTT
66 AGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATAGAA-TTTTTTTA
* * * **
18923100 CATTTTTGGTTAAAGCAGATCGTAATTTGTTGTTTGCATTGG
130 CATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAG
* ** * ** * *
18923142 GAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACATTAAAAGTCCAATTATAGTTGCTTATGCCTTCGTA
1 GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTG-A
* * * * * *
18923207 AA-CCTTGGTACTCTC-TTAAGTGGATTTGTAACTTTATAAATGATTATAGATTGAATTTTTTT-
65 AAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATAGAATTTTTTTA
* * * * *
18923269 -ATTTCTGGTTAAAATAGATCATAATTTGTTATTTGCATCGG
130 CATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAG
* * * * * * *
18923310 GAAACATGAAACGAAAGCCATCCATTGGCAA-AAAAGCCCCTTTACACTCACTCATGCCTTCT-A
1 GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTT-TGA
* * * * * *
18923373 ACGCCTTGTTACT--TTTATCAAATGGTTTTATAA-TATTATAAATGATTTTAAATCA-AAATTC
65 AAGCCTTGTTACTCGCTT-T-AAGTGGATTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAAT-AGAATTTT
* * * ** * *
18923434 TATACATATATGGTTAAAACTTATCATAATTTGATCTTTGCATTAG
126 TTTACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAG
* ** * * * * *
18923480 GAAACGTGAAGCAAAAGCTGTCCATTGATATA-AAAAGTCCAATTACAGTCGCTCATACCTTTGA
1 GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACA-AGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGA
** * *
18923544 AAGCCTTGTTACTTTCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATTATTTTAAATTGAATTTTTTT-
65 AAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATAGAATTTTTTTA
* * * **
18923608 CATTTTAGGTTAAAACAGATCATAATTTGTTGTTTACATTGG
130 CATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAG
* * * *
18923650 GAAACGTGAAGCGAAAGCCATCCATTAACAAGAAAAGTACATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAA
1 GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAA
*
18923715 AG-CTTAGTAACTCGCTTTAAGTGGATTTA-AACTTTATAAATGATTTTAAACT-GAATTATTTT
66 AGCCTT-GTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAA-TAGAATT-TTTT
* * * * * **
18923777 TTCATTTTAGGTTAAAATAGATCATAATTTGTTATTTGCATTGG
128 TACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAG
* * * *
18923821 GAAACATGAAGCCAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTTATGCCGTTAAA
1 GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAA
* * * * * *
18923886 AGCCTAGTAACTCGCTTTAAGTGGATTTAGAACCTTATAAATGATTTTAAACT-GAATTATTTTG
66 AGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAA-TAGAATTTTTTTA
* * * *
18923950 CAATTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGTTGTTTGAATTAG
130 CATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAG
* ** * * * * * *
18923992 AAAAGTTGAACCGAAAGCCATCCATTGAGAAGAAATGTCCATTTATAGTCACTCAAGCCTTCGAA
1 GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAA
* * * ** ** *
18924057 AGTCTTGTTACTCACTTTAAGTGGTTTTATAACTTTATAAATGATTTTTGATTTAA-TTTTTTAT
66 AGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATAGAATTTTTTTAC
* * * * **
18924121 ATTTTTAGTTAAAACATATTATAATTT-ATATTTGCATTTGG
131 ATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCA-TCAG
* * * * * * * * *
18924162 GAAACGTGATGCGAAAGCTATCCATTGGCAAGAAAAGTCTATTTATAGTCAGTTATGCCTTCGAA
1 GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAA
* ** * * *
18924227 AGCCTAGTTACTTACATTT-AGTGGATTTATAACTTTATAAATAATTTTTAATTG-ATTTTTTT-
66 AGCCTTGTTACTCGC-TTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATAGAATTTTTTTA
* * * * * **
18924289 TATTTTTGGATAAAACAAATCATAATTTGTTGTTTGAATGGG
130 CATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAG
** * * * * * * *
18924331 GAAACGCGAACCGAAAGCCATCCATTAACAAGAAAAGTCCATTTATAGTAACTCAAGCCTTTTAG
1 GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAA
* * * * * * * ** ** * *
18924396 AGCTTTATCACTTGCTTTAAGTGGTTTTGTAACTTCATAAATGATTTTTGATTTACCTATTTTTA
66 AGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATAGA-ATTTTTTTA
* * * * *
18924461 TATATTTT--TAAAAAAAGATCATAATTT-CTATTTGCATC-G
130 CAT-TTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAG
* * * * * * * * *
18924500 ACAAACGTGATGCGAAAGCAATCCATTTACAAGAAAAGTCTATGTATA-TCTACTTATGCCTTTG
1 -GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTC-ACTCATGCCTTTG
* ** * *
18924564 AAAGCCTAGTTACTCGCTTTAAGTGGATGCATAACTTTGA-AAATAATTTTAAATTG-ATTTTTT
64 AAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTT-ATAAATGATTTTAAATAGAATTTTTT
* * * *
18924627 TTCATTTTTGGTTAAAACATATCATAATTCGTTGTTTGCAT
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Statistics
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* * * * *
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* * ** * ** * *
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* * * * * * *
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* * * * * *
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* * *
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* * * *
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* * * * * * *
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* * * * *
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63 CTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTGAAT-ATGTT
** * * *
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* * *
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* * *
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256 TTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATAATTTTAAATAAA--TTTTTTAAATTTTTGGTTAAAA-
* * **
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318 AAATCATAATTCGATGTTTGCATCAGGAAACTTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTT
* *
18910761 CATTTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTAT-TTACTCGCTTTAAGCGAATTTATAACTTTT
383 CA-TTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTATGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTT
* * *
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447 TAAATGATTTTAAATCAATT-TTTTTACATTTTTAGTTAAAACA-GATCATAATTTGATGTTTGC
* * * * *
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510 ATA-GGAAACATGAAGCA-AAAGCCATCCATTGACAAAAAAAGTCCAGTTATAGTCACTCATGAC
* * * * ** *
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* *
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* * * *
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1 CATTG-GAAACGTGAAG-AAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCC
* * * * * *
18911122 TTAGAAAGCC-TATTTACTTGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTTTAAATGACTTTGAATTTATTT
64 TTTGAAAGCCTTA-TTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTGAATATGTTT
* ** ** * * *
18911186 GTTTTTACATTTTCTATTAAAAGGGATCATAATTTGATGTTTGGA-CGGGGAAACATGATGCAAA
128 TTTTTTACATTTT-GGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATC-GAGAAACATGAAGCAAA
* * * * *
18911250 AGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCTTTTATAGTGA-TCTATGCCTTTGAAAGCCTAT-TTACTC
191 AGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTC-ATGCCATTAAAAACCT-TGTTACTC
* * * * * * **
18911313 GCTTCAAATGGTTTTTTAA-TCTTATAAATGATTTTAAATACATTTTTTCTCA-TTTTGGTTAAA
254 GCTTTAAGTGGATTTATAACT-TTATAAATAATTTTAAATAAATTTTTT-AAATTTTTGGTTAAA
* * * *
18911376 AAATACCATAATTTGATGTTTGCATCACGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAG
317 AAA-ATCATAATTCGATGTTTGCATCAGGAAACTTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAG
* * *
18911441 TTCATTTATACTCATTCAGGCCTTCGAAAGCCT-TGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTT
381 TTCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTATGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTT
* * *
18911505 TTTAATGATTTTAAATTCAATTTGTTTTACATTTTTAGTCAAAACAGATCATAATTTGATGTTTT
446 TTAAATGATTTTAAA-TCAATTT-TTTTACATTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTG
* * *
18911570 CATTGGGAAACA-GAAGCCAAAGCCATCCATTGACATAAAAAGTCCAGTTATAGTCACTCATGAC
509 CA-TAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAAAAAAGTCCAGTTATAGTCACTCATGAC
* * * * * * *** *
18911634 TTTGAAAGCCTTGTTATTCTCTTTAATTGGATTTATAACTTTATAAATGATTATGAATTGATTTT
573 -TTGAAAGCCTCGTTACTCACTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAAAGATT-TTAAACAAATTT
* * * * *
18911699 TTTTTCATTTTTGGTTAAAACAAATCATAGTTTTTTATTTT
636 TTTTACATTTTTGGTT-AAACAAATCATA-ATTTATGTTTG
* * * **
18911740 CATTAGAAAACATGAAGCAAAAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGTG
1 CATT-GGAAACGTGAAG-AAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCC
* * * **
18911805 TTTGAAAACCTTATTACTCGCTTTAAGTGG-TTTAATAACATAATAAATGATTTTGAAT-TGAAT
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* * *
18911868 TTTTTTATCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCGAGAGACGTGAAGTAAA
128 TTTTTTA-CA-TTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCGAGAAACATGAAGCAAA
** * * *
18911933 AATCATCCATTGAGAAGAAAAGTCCATTTATCA-TCACTCATGCCTTTAAAAGCCTTGTTACTCG
191 AGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTAT-AGTCACTCATGCCATTAAAAACCTTGTTACTCG
* * * * * * *
18911997 CTTTAAGTGGATTTATAACTTTTTAAATGATCTTAAATTGAATTTTTTTTAAATATCTAGTTAAA
255 CTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATAATTTTAAA-T-AA-ATTTTTTAAATTTTTGGTTAAA
* * * ** *
18912062 ATAGATTACAATTCGATGTTTGCATCAACAAA-TGTGAAGCAAAAGCCATTCATTGACAAGAAAA
317 A-AAATCATAATTCGATGTTTGCATCAGGAAACT-TGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAA
* * * *
18912126 G-TCTAATTAT-GCTCACTCATGCCTTCGAAAAG-CTTTGTTACTCACTTTAAGTGGGTTTATAA
380 GTTC-ATTTATAG-TCACTCATGCCTTCG-AAAGCCTATGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAA
* *
18912188 CTTTTTAAATGATTTTACATGGAATGTTTTTTGACATTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTTGAT
442 CTTTTTAAATGATTTTAAAT-CAAT-TTTTTT-ACATTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTTGAT
* * * * *
18912253 GCTTGCATTAGAAAACATGAAGCAAAAGCCATCTATTCACAAAAAAAGTCTAGTTATAGTCANNN
504 GTTTGCA-TAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAAAAAAGTCCAGTTATAGTCA---
********************************************************
18912318 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
565 ---------CTCATGACTTGAAAGCCTCGTTACTCACTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAAAG
******************************************************
18912383 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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*****************************************************************
18912437 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
1 CATTGGAAACGTGAAGAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTT
*****************************************************************
18912502 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
66 TGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTGAATATGTTTTTT
*** * * * *
18912567 NNNATTATTTTAGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTT-CATAGGGGAAACATGAAGTC-AAAG
131 TTTA-CATTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCAT-CGAGAAACATGAAG-CAAAAG
* * ** * *
18912630 CCATCCATTGACAAGAAAAGTTCATTTATAATCACTCATGCCATTTGAAGCCTTGTTACTCGCTC
193 CCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCATTAAAAACCTTGTTACTCGCTT
* * * * * * *
18912695 AAAATGAATTTATAACTTTTTAAATGATTTTAAATTGAAGTTTTTTAAAATTTTTGGCTAAAATA
258 TAAGTGGATTTATAACTTTATAAATAATTTTAAA-T-AAATTTTTT-AAATTTTTGGTTAAAA-A
* * * * * * * * * *
18912760 GATCATAATTTGTTGTTTGCATAAAGAAACGTGAAGCAAAATCCATCTATTGACACA-AAAAATC
319 AATCATAATTCGATGTTTGCATCAGGAAACTTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACA-AGAAAAGTT
* *
18912824 CATTTATAGTCACTC-TCGCCTTCGAAAGCCT-TGTTACTCGCTTGAAGTGGATTTAT-AGTTTC
383 CATTTATAGTCACTCAT-GCCTTCGAAAGCCTATGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTT-
* * * * * *
18912886 ATAAATGATTTTAAATTGAATTTCTTTTACATTTTTGGTTAAAA-AAATCATAATTTGTTGTTTA
446 TTAAATGATTTTAAA-TCAATTT-TTTTACATTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTG
* ** * * * * * * *
18912950 CATTTGGAAATGTGAAGTGAAAA-CCATCCATTGATAAGAAAAGTCTATTTACAGTCACTGATG-
509 CA-TAGGAAACATGAAG-CAAAAGCCATCCATTGACAAAAAAAGTCCAGTTATAGTCACTCATGA
* * * * * * * *
18913013 CTTTTGAAAGCCTAGTTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAA-TCTTACAAATGATTTTAAAATTAA
572 C--TTGAAAGCCTCGTTACTCACTTTAAGTGGATTTATAACT-TTATAAAAGATTTT-AAA-CAA
* * * *
18913077 ATTTTTCT-CATTTTTAGTTAAAACAGATCGTAATTTCATGTTTG
632 ATTTTTTTACATTTTTGGTT-AAACAAATCATAATTT-ATGTTTG
* * * * * *
18913121 CATTGGAAAATGTCAAGAAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTGCATTTATACTCACTTATACC
1 CATTGG-AAACGTGAAG-AAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCC
** * * * * * * * *
18913186 TTCAAAAGCATTACTACTCACTTTAAGTGAATTTATAGCTCTATAAATGATTTTAAATTAAAGTT
64 TTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTGAA-T-ATGTT
* * * ** * * *
18913251 TTTTTTT-CATTTTTTGTTAAAACAGTTAATAATTTTCTGTTTGCAT-TAGAGGACATGTAGC-A
127 TTTTTTTACA-TTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCGAGA-AACATGAAGCAA
* * * * * *
18913313 AAGCCATTCATTGACAAGAAAAGTCTAGTTATAGTCACTCATGCC-TTCGAAAGCCTTGTTACTA
190 AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCATT-AAAAACCTTGTTACTC
* * ** * * *
18913377 GCTTTAAGTGGATTTTTAACTTTTTAAACGATTTCAAATTGAATTTGTTTTTACA-TTTTGGTTA
254 GCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATAATTTTAAA-T-AA-AT-TTTTTAAATTTTTGGTTA
* * * * *
18913441 AAAAAGACCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACGTGAAGCAAAAGCTATCCATTGATAAGAAA
315 AAAAA-ATCATAATTCGATGTTTGCATCAGGAAACTTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAA
* * * * * *
18913506 AGTCCATTTATACTCACTCAAGTCTTCGAAAGCCT-TGCTAGTCGCTTTAAGTGGATTTATAACT
379 AGTTCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTATGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACT
* * * *
18913570 TTTTTAATGATTTTAAATTGAATTTATTTTACATTTTTGGTCAAAACAGATCATAATTTGATGTT
444 TTTTAAATGATTTTAAA-TCAATTT-TTTTACATTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTT
* * * * * *
18913635 TGCATTGGGAAGCATGAAGCCAAAGCCATCCATTGGCATAAAAAGTCCAGTTATAGTCACTTAT-
507 TGCA-TAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAAAAAAGTCCAGTTATAGTCACTCATG
* * * * **
18913699 ACCTTTGAAAGCCTTGTTACTCTCTTTAAATGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAA
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* * * *
18913764 TTTTTATT-CATTTTTGATTAAAACAGATCATAATTTGTTGTGTG
633 TTTTT-TTACATTTTTGGTT-AAACAAATCATAATTT-ATGTTTG
* * * * * * *
18913808 CATTGGGAAACGTAAAGCAAAAGCCATCTATTGGCAAGAAATGTCCATTTATACTCACTTATTCC
1 CATT-GGAAACGTGAAG-AAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCC
* * * * * * * * *
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* * * * * * * * * *
18913935 ATTCTATATATA-TATGGTTAAAACATATCATACTTTGATATTTGCATCAAGAAACATGAAGCAA
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* * * * ** *
18913999 AAGCCATCTATTGACAAGAAAAGTCCAATTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGTCTTGTTACTCT
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* * *
18914064 CTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTAATTTTTGGTTAAAAC
255 CTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATAATTTTAAA-TAAATTTTTTAAATTTTTGGTTAAAA-
* * * * ** * * *
18914129 ATATCATAATT-TATTTTTTGTATTGGGAAACGTGAAGCAAAAGCTATCCGTTGACAAG-AAAGT
318 AAATCATAATTCGA-TGTTTGCATCAGGAAACTTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGT
* * * * * * *
18914192 CCACTTATAGTCACTCATACCTTCAAAAGCCTA-GTTACTCACTTTAGGTGGATTTATAACTTTA
382 TCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTATGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTT
** * * * *
18914256 TAAATGATTTTAAATTGTATTATTTTGTA-A-TTTTGGTTAAAACATATCATAATTTGTTTTTTG
447 TAAATGATTTTAAA-TCAATT-TTTT-TACATTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTG
* * * * * * * * * *
18914319 AATGGGGAAACATGAATCGAAAGCCATCCATTGGCTAGAAATA-TCCATTTATAGTCACTCAAGC
509 CAT-AGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGAC-AAAAAAAGTCCAGTTATAGTCACTCATGA
* ** * * * ** ***
18914383 CTTCAAAAGCCTTATTACTCACTTTAAGTAGTTTTATAACTTTATAAATGATTTTTGATTTATTT
572 CTT-GAAAGCCTCGTTACTCACTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAAAGATTTTAAACAAATTT
* * * *
18914448 GTTTTACTTTTTTAGTTGAAACAAATCATAATTTGTATTTG
636 -TTTTACATTTTTGGTT-AAACAAATCATAATTTATGTTTG
* * * * * * * *
18914489 CATATGGAAACGTGATGTTAAAGCAATCCATTGACTAGAAATGTCCATTTATAGTCAGTCAAGTC
1 CAT-TGGAAACGTGAAG-AAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCC
* * * * *
18914554 TTCGAAAGCCTTATTACTTGGTTTAAGTGGTTTTATAACTTTATAAATGATTTTTGATTTAT-TT
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* * * * * ** * * * **
18914618 ATTTTTTTACTTTTCTAGTTGAAATAGATGATAATTT-ATAATTGCATTTGA-AAACGTGATGTG
127 -TTTTTTTACATTT-TGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCA-TCGAGAAACATGAAGCA
* * * * * * *
18914681 AAAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTTATGTCTTTGAAAGCCTAGTTACTC
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* * * * * **
18914746 ACATTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTATTTTACA-TTTCAGTTAAA
254 GCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATAATTTTAAA-TAAATT-TTTTAAATTTTTGGTTAAA
* * * * * ** *
18914810 ATAGATCATAATTTGATGTTTGAAT-ATGGAAACATGAGGCAAAAGTTATCCATTGATAAGAAAA
317 A-AAATCATAATTCGATGTTTGCATCA-GGAAACTTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAA
* * * * * * * * *
18914874 GTCCATTTATTGTCACTCAT-TCTATTGAGAGCCT-TGTAACTCGCTTTAAATGGTTTTATAAAT
380 GTTCATTTATAGTCACTCATGCCT-TCGAAAGCCTATGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACT
* * ** ** * * * *
18914937 TTATAAATGATTTTGAATTGAGCTTTTTATCATTTTTGGCTAAAAAAAATCATAATTTGATGTTT
444 TTTTAAATGATTTTAAATCAATTTTTTTA-CATTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTT
* * * * ** * * *
18915002 CCATCTGGAGACGTGAAGCAAAAGCCATTTATTGATAAGAAAAGTCCA-TTGATAGTTACTCATG
508 GCAT-AGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAAAAAAGTCCAGTT-ATAGTCACTCATG
* ** * **
18915066 CCTTCGAAAGCCTTTTTACT-AGCTTTAAGTGGATTTATAACTTT-TAAATGATTTTAAATTGAA
571 ACTT-GAAAGCCTCGTTACTCA-CTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAAAGATTTTAAA-CAAA
* *
18915129 TCGTTTTTTACATTTTTAGTTTAAACAGATCATAATTTGATGTTTG
633 T--TTTTTTACATTTTT-GGTTAAACAAATCATAATTT-ATGTTTG
* * * * *
18915175 TATTGGAAAACATGAGGCAAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATTGTCACTCATGCC
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* * * * * * * **
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18915304 TTTTTTATCATTTTTAGTTAAAACAGATCATAATATGATGTTTCCATTGGGAGACGTGAAGCAAA
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* * * *
18915369 AGCCATCTATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTTACTCATGCC-TTCGAAAGA-CTTGTTACTC
191 AGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCATT--AAAAACCTTGTTACTC
* * * ** *
18915432 TCTTTAAGTGGATTTATAACTTTTTAAATGATTTTAAATTGATTTTTTTTTACATTTTTGGTTAA
254 GCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATAATTTTAAA-T-A-AATTTTTTAAATTTTTGGTTAA
* ** * * * * *
18915497 AATAGATCATAATTCGATGTTTGCATTGGGAAACGTCAAGTAAAAGCCATTCATTGACATGAAAA
316 AA-AAATCATAATTCGATGTTTGCATCAGGAAACTTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAA
* * * * * * *
18915562 GTCCAATTATAGTCAGTCATGCCTTCAAAAGCCT-TATTACTCTCTTTAAGTGGATGTATAACTT
380 GTTCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTATGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTT
* * * * *
18915626 TATAAATGATTTTAAATAGAATTGTTTTT-CATTTTTGGTTAAAACATATCATAATTTGTTGTTT
445 TTTAAATGATTTTAAAT-CAATT-TTTTTACATTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTT
* * * * * * *
18915690 GCATTAGAAAACGTGAAG-AGAAAGCCATCCGTTAACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTGATG
508 GCA-TAGGAAACATGAAGCA-AAAGCCATCCATTGACAAAAAAAGTCCAGTTATAGTCACTCATG
* * * * * * * *
18915754 CCTTCAAAAGCCTAGTTACTCGCTTTAAGTGGATTCATAACTTTGTAAATGATTTTAAACTGAAT
571 ACTT-GAAAGCCTCGTTACTCACTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAAAGATTTTAAAC-AAAT
* * * *
18915819 TATTTGACAATTTTGGTTAAAACAAATCATAATTTGTTGTTTG
634 TTTTTTACATTTTTGGTT-AAACAAATCATAATTT-ATGTTTG
* * * * * * *
18915862 AATTGGGAAACATTAACCG-AAAGCCATCTATTGACAAAAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGG
1 CATT-GGAAACGTGAA--GAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGC
* * * * * * * **
18915926 CTTCT-AAAGCCTTATCACTCACTTTAAGTAGTTTTATAGCTTCATAAATGATTTGTG-ATTTAA
63 CTT-TGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATGATTT-TGAATATGT
* * * * *
18915989 TTGTGTTTACATTTTTAGTTAAAACAGATCATAAATT-ATGTTTGCATC-AGGAAACATGATGCA
126 TTTTTTTTACA-TTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCGA-GAAACATGAAGCA
* * * * * * * ** * *
18916052 AAAGCAATCAATTGACAAGAAAAGTGCATTTATAGTTACTTATACCGTCGAAAGCCTAGTTACTC
189 AAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCATTAAAAACCTTGTTACTC
* * * * * **
18916117 GCTTTAAGTGCATTTATAAGTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTATTTTACATTTTTGAATAAA
254 GCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATAATTTTAAA-TAAATT-TTTTAAATTTTTGGTTAAA
* * * * * ** * *
18916182 GAGATCATGATTTGATGTTTGAATTGGGAAACATG-AGCTAAAAGCTATCCATTGACAAGAAAAG
317 AAAATCATAATTCGATGTTTGCATCAGGAAACTTGAAGC-AAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAG
* * * * * * * * * *
18916246 TTGATTTATTGTCACTAATTCCTTCGATAGCCT-TGTAACTCACTTTAAATAGTTTTATAACTTT
381 TTCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTATGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTT
* * ** * *
18916310 ATAAATGATTTTCAATTTTATTTTTTGT-CATTTTTGGCTAAAACAGATCATAATTTGATGTTCT
446 TTAAATGATTTT-AAATCAATTTTTT-TACATTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTT-T
* * * * * * **
18916374 -CATTGGGAGACATGAAGCAAAAGCTATCTATTTACAAGAAAAGTCCCTTTATAGTCACTCAT-A
508 GCA-TAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAAAAAAGTCCAGTTATAGTCACTCATGA
* * ** * * *
18916437 CCTTCGAAAGCCTTGTTGCTTGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTTTAAATGATTTTAAATTAAAT
572 -CTT-GAAAGCCTCGTTACTCACTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAAAGATTTTAAA-CAAAT
* * *
18916502 TTTTTTACATTTTTAGTTGAAACATATTATAATTTGATGTTTG
634 TTTTTTACATTTTTGGTT-AAACAAATCATAATTT-ATGTTTG
* * ** * * * **
18916545 TATCAGGAAACGTGAAGCAAAAGATAACCATTGACATGAAAAGTCCAATTATAGTCACTCATAAC
1 CAT-TGGAAACGTGAAG-AAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCC
* * * * * ** *
18916610 TTCGAAAGCCTTGTTACTCTCTTTAAGTGGATGTATAACTTTACAAATGATTTCAAAT-TGAATT
64 TTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTGAATATG-TTT
* * * * * * **
18916674 GTTTTT-CATTTTTGGTTAAAACATATCATAATTTGTTGTTTTCATTGAAAAACATGAAGTGAAA
128 TTTTTTACA-TTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCGAGAAACATGAAGCAAAA
** * * * * *
18916738 GTAATCCATTAACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTAGTTACTCGCT
192 GCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCATTAAAAACCTTGTTACTCGCT
* *
18916803 TTAAGTGGATTCATAACTTGGTAAATGATTTTAAACTATAATCTTACAAATTATTTTAAAATTGA
257 TTAAGTGGATTTATAAC-T--T---T-A---T-AA--ATAAT-TT--TAA--A---T-AAA-T--
** * * * ** **
18916868 CTTTTTCTCATTTTTAGTTAAAACATATCATAATTTGATGTTCACATCAGGAAAGATGAAGCAAA
297 -TTTTT-AAATTTTTGGTTAAAA-AAATCATAATTCGATGTTTGCATCAGGAAACTTGAAGCAAA
* * * *
18916933 AGTCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTTATGCCTTCGAAAGCCT-TGTTACTCA
359 AGCCATCCATTGACAAGAAAAGTTCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTATGTTACTCG
* * * * * *
18916997 CTTTAAGTGGATTTATAACTTTTTAAATGATTTTAGAT-TATTTTTTTTCAATGTTGGTTAAAAC
424 CTTTAAGTGGATTTATAACTTTTTAAATGATTTTAAATCAATTTTTTTACATTTTTAGTTAAAAC
* * ** * ***
18917061 ATATCATAATTTGATGTTTGCATTGGGAAATGTGAAGCAAAAGCCATCCATTAACATGGAAAGTC
489 AGATCATAATTTGATGTTTGCA-TAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAAAAAAGTC
* * * * * *
18917126 CAATTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGACTTGTTACTCTCTTTAAGTGGATCTA-AACTTTATA
553 CAGTTATAGTCACTCATGACTT-GAAAGCCTCGTTACTCACTTTAAGTGGATTTATAACTTTATA
* *** * *
18917190 AATGATTTTAGATTGAATTTTTTT-CATTTTTGGTTAAAACATATCATAATTTTTTGTTTG
617 AAAGATTTTA-AACAAATTTTTTTACATTTTTGGTT-AAACAAATCATAA-TTTATGTTTG
* *
18917250 CATCAGAAAACGTGAAGAGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCC
1 CAT-TGGAAACGTGAAGA-AAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCC
** * * * * ** * **
18917315 TTCAAAAACC-TAGTTACTCGCTTTAAGTGGACTCATAGCTTGGTAAATGA-TTTCAA-ACTGAA
64 TTTGAAAGCCTTA-TTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTGAATA-TGTT
* * * * * * * * * *
18917377 TTATTTGACAATTTTGGTTAAAACATATCATAATTTGTTGTTTGAATTGGGAAACGTGAATCGAA
127 TTTTTTTAC-ATTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCGAGAAACATGAAGCAAA
* * * * * * *
18917442 A-CCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTGATAGTCACTCAAGCC-TTCTAAAGCCTTATCACACG
191 AGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCATT-AAAAACCTTGTTACTCG
* ** * * * * * * *
18917505 CTTTAAGTGGTTTTATAACTTCCTAAATGATTTTTTATTTATTTTTTTACATTTTTAGTTAAAAC
255 CTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAAT-AATTTTAAATAAATTTTTTAAATTTTTGGTTAAAA-
* * ** * * *
18917570 AGATCATAATT-TATGTTTGCATCAGGAAACGAGATGCAAAAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTC
318 AAATCATAATTCGATGTTTGCATCAGGAAACTTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTT
* * * * * * * *
18917634 CATTTATAGTCAATTATGCCTTCGAAAGCCTA-ATTACTTGCATTAAGTGCATTTATAAGTTTAT
383 CATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTATGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTTT
* * * * * *
18917698 AAATGATTTTAAGTTGAATTATTTTACATTTTTAGTTCAAGCAGATCATAATTTGATGTTTGGAT
448 AAATGATTTTAA-ATCAATTTTTTTACATTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCA-
* * * * * * * **
18917763 TGGGAAACATGAGGCAAAAGCTATCCATTGACAAGAAAAGTCGATTTATTGTCACTCATTCCTTT
511 TAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAAAAAAGTCCAGTTATAGTCACTCATGAC-TT
** * * ** ** * ***
18917828 GGGAGCCTTGTAACTTGCTTTAAGT-GATTTTATAGTTTTATAAATGATTTTGAATTGAATTTTT
575 GAAAGCCTCGTTACTCACTTTAAGTGGA-TTTATAACTTTATAAAAGATTTT-AAACAAATTTTT
* *
18917892 TTATCATTTTTGGCTAAA-ATAGATCATAATTTGATGTATG
638 TTA-CATTTTTGGTTAAACA-A-ATCATAATTT-ATGTTTG
* * * * *
18917932 CATTGGGAGACATGAAGCAAAAGCCATCTATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTTATGCC
1 CATT-GGAAACGTGAAG-AAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCC
* * * * * *
18917997 TTCGAAAGCCTTATTACTCGCTCTAAGTGGATTTATAACTTTTTAAATGATTTTAAAT-TGAATA
64 TTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTGAATATG-TTT
* * * *
18918061 TTTTTTACATTTTGGCTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGTATTG-GAAACGTGAAGCAAAAG
128 TTTTTTACATTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCGAGAAACATGAAGCAAAAG
* * * * * * *
18918125 CAATCCATTGACATA-AAAAGTGCAGTGATAGTCACTCATGCC-TTCTAAAGCCTTGTTACTTGC
193 CCATCCATTGACA-AGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCATT-AAAAACCTTGTTACTCGC
* * * * * * * * * ** *
18918188 ATCAAATGGTTTTATAAAC-TTATAAATGATTTAAAATTGAATTTTTTCTAGTTTTCAGCTAAAA
256 TTTAAGTGGATTTAT-AACTTTATAAATAATTTTAAA-TAAATTTTTT-AAATTTTTGGTTAAAA
* * * * * * * * * *
18918252 CATATAAGAATTTGTTGTTTCCATCAAGAAACGTGAAGCAAAATCCATCCATTGACACGAAAA-T
318 -AAATCATAATTCGATGTTTGCATCAGGAAACTTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGT
* * * * * *
18918316 TCCATTTATAGTCACTCTTGTCTTTGAAAGACT-TGTTACTCACTTGAAGTGGATTTATAAC--T
382 T-CATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTATGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTT
* * * * *
18918378 TTACAATAGATTTTAAATTGAATTTCTTTTACATTTTTGGTTAAAATAAATCATAATTTGTTGTT
446 TTA-AAT-GATTTTAAA-TCAATTT-TTTTACATTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTT
* * * ** ** * * * * *
18918443 CGCATAGGGAAA-A-GTAAGTCGAAAA-CCATCCATTGAGAAGAAATTTTTATTTGTAATCCCTG
507 TGCATA-GGAAACATG-AAG-C-AAAAGCCATCCATTGACAAAAAAAGTCCAGTTATAGTCACTC
* * * * * * *** * *
18918505 ATGCCTTCAAAAGCCTAGTTAGTCACTTCACACGTGAAGCAAAAGCACCCATTGACATAAAAAGT
568 ATGACTT-GAAAGCCTCGTTACTCACTTTA-A-GTGGATTTATA--A--C-TT--TAT-AAAAG-
** ** * *
18918570 CAAATCATAGTCATTCATGCCTTCGAAAGACTTTGTACTCTCTTTAAGTGGATGTATAACTTTAT
621 ------AT--T--TT-A----AAC-AAA-TTTTTTTAC-AT-TTT---TGG-T-TA-AAC-----
* * * *
18918635 AAATGATTTTAAATTACATTTTTTT
656 AAATCA---T-AATT-TA-TGTTTG
**** * * *** ** *** * *
18918660 CATT--TTTGGTTAA-AACATATCACAATTTGTTGTTCACATCAGAAAACGTGAAGAGAAAGCCA
1 CATTGGAAACGTGAAGAA-A-AGC-C-ATCCATTG---ACA--AGAAAA-GTCCATTTATAGTCA
* **** * *** * *
18918722 -TCCATTGACAAAAAAAGTTCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTAGTTACTCACTTTA
56 CT-CA-TGCCTTTGAAAG--C-CTTAT--T-ACTC--G-CTTT--AAGTGGATTTA-TAACTTT-
* * * *
18918786 AGTGGATTCATAACTTTGTAA-ATGATTTTAAACTAAATTATTTGACAATTTTGGTTAAAACAAA
106 A-T--A--AATGATTTTG-AATATG--TTT----T---TT-TTT-AC-ATTTTGGTTAAAACAGA
* * *** * * * *
18918850 TCACAATTTGTTGTTCAAATAGAGAAACATGAACCGAAAA-CTATCCATTGACAAGAAAAGTCTA
153 TCATAATTTGATGTTTGCATCGAGAAACATGAAGC-AAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCA
* * * * * * * *
18918914 TTTATAGTCACTCAAGCC-TTCTAAAGCCTTATCACTCACTTTAAGTGGTTTTATAACTTCATAA
217 TTTATAGTCACTCATGCCATT-AAAAACCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAA
* ** * * * * * *
18918978 ATGATTTTTGATTTAATTTTTTTTACATTTTTAGTTAAAATAGATCATAATT-TATGTTTGCATT
281 AT-AATTTT-AAATAA-ATTTTTTAAATTTTTGGTTAAAA-AAATCATAATTCGATGTTTGCATC
* * * ** * * * * *
18919042 GGGAAACATGATGTGAAAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAATCACTTATGCCTTAG
342 AGGAAACTTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTTCATTTATAGTCACTCATGCCTTCG
* * * * * ** * *
18919107 AAAGCCTA-GTTACTCACATTAAGTGCATTTATAAGTTTATAGTTGATTTTAAATTGAATTATTT
407 AAAGCCTATGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTTTAAATGATTTTAAA-TCAATTTTTT
* ** * * * * ** **
18919171 TACATTTTTGGTTAAAGTAAATCATAATTTGATGTTTGAATTGGGAAACATGAGGTGAAAGTTAT
471 TACATTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCA-TAGGAAACATGAAGCAAAAGCCAT
* * * ** * * *
18919236 CCATTGACAAGAAAAGTTCATTTATTA-TCACTCATTCCTTCGAGAGCCTTGTAACTCACTTTAA
535 CCATTGACAAAAAAAGTCCAGTTA-TAGTCACTCATGACTT-GAAAGCCTCGTTACTCACTTTAA
* * ** * *
18919300 GTGGTTTTATAACTTTATAAATGATTTTGAATTAAATTTGTTATT--ATTTTTGGCTAAAACAGA
598 GTGGATTTATAACTTTATAAAAGATTTT-AAACAAATTT-TT-TTACATTTTTGG-TTAAACAAA
*
18919363 TCATAATTTGATGTTTT
659 TCATAATTT-ATGTTTG
* *
18919380 CATTGGAAAACGTGAAGCAAAAAGCCATCTATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTTATGC
1 CATTGG-AAACGTGAAG--AAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGC
** * * * * * * *
18919445 CTTCAAAAGCCTTGTTACTCGCTCTAAGTGGATTTATAGCTTTTTAAATGAATTTAAAT-TGAAT
63 CTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTGAATATG-TT
* * *
18919509 TTTTTTTACATTTTGGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCAT-TAGGAAACTTGAAGCGA
127 TTTTTTTACATTTT-GGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCGA-GAAACATGAAGCAA
* * * * * * * *
18919573 AAGCCATCCATTGAGATGAAAAGTCCAATTGTAGTCACTCATGCC-TTCGAAAGCGTTATTACTC
190 AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCATT-AAAAACCTTGTTACTC
* * * * * * * ** *
18919637 TCTTTAAGTGGATGTGT-AGTGTTATAAATGATTGTAAATTGAATTTTTTTCATATTTGGTTAAA
254 GCTTTAAGTGGATTTATAACT-TTATAAATAATTTTAAA-TAAATTTTTTAAATTTTTGGTTAAA
* * * * * *
18919701 ACATATCATAATT-TATTGTTTGCATCAGAAAACGTAAAG-AGAAAGTCATCCATTGACAAGAAA
317 A-AAATCATAATTCGA-TGTTTGCATCAGGAAACTTGAAGCA-AAAGCCATCCATTGACAAGAAA
* * * *
18919764 AGTTCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTA-GTTACTTGCTTTAAGTGGACTCATAACT
379 AGTTCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTATGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACT
* * * * * * * * *
18919828 TTGTAAATAATTTTAAACTGAATTATTTGATAATTTTGGTTAAAACAGATCATAA-TTGCTTGTT
444 TTTTAAATGATTTTAAA-TCAATTTTTTTACATTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTTG-ATGTT
* * * * * * * *
18919892 T-CAATCAGGAAACGTGAACCGAAAGACATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCAA
507 TGC-AT-AGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAAAAAAGTCCAGTTATAGTCACTCAT
* * ** * * * * * * ***
18919956 GCCTTCTAAAGCCTTATCACTCGCTTTAAGTGGTTTTATAACTTCATAAATGATTTTTGATTTAA
570 GACTT-GAAAGCCTCGTTACTCACTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAAAGA-TTTTAAACAAA
* * *
18920021 TTTGTTTTGCATTTTTAGTTAAAACAGAAT-ATAATTTTTGTTTG
633 TTT-TTTTACATTTTTGGTT-AAACA-AATCATAATTTATGTTTG
** * ** * * * * ** *
18920065 CATTGGGAAACGTGCTGCGAAAGTAATCTATTGACAAGGAAAGTCTATTCATAGTCACTTTTTCC
1 CATT-GGAAACGTGAAG-AAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCC
** * * * * * * **
18920130 TTCAAAAGCC-TAGTTACTAGCATAAAGTGCATTTATAAGTTTATAAATGATTTTAAAT-TGAAT
64 TTTGAAAGCCTTA-TTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTGAATATGTTT
* * * * * * *
18920193 TATTTTACATTTTCGATTAAAGCATATCATAATTTGATGTTTGGATTGAGAAACATGAGGCAAAA
128 TTTTTTACATTTT-GGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCGAGAAACATGAAGCAAAA
* * * * * * * * * *
18920258 GCTATCCATTGACAAGAAAAGTCAATTTATTGTCACTCAT-TCTTTCGAGAGCCTTGTAACTCAC
192 GCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCATT-AAAAACCTTGTTACTCGC
* * * ** * * **
18920322 TTTAAGTGGTTTTATAACTTTATAAATAATTTTGAATTGAATTTTTTGTCATATTTGGCTGAATT
256 TTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATAATTTT-AAATAAATTTTTT-AAATTTTTGG-TTAAAA
* * * * ** * * * *
18920387 AGATCATAGTTTGATGTTTCCATTGGGAGACATGAAGCAAAAGCCATCTATTGACAAGAAAAGTC
318 AAATCATAATTCGATGTTTGCATCAGGAAACTTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTT
* * * * * *
18920452 CATTTATAATCACTTATGCCTTCGAAAGCCT-TGTTTCTCACTCTAAATGGATTTATAACTTTTT
383 CATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTATGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTTT
* * *
18920516 AAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTTACATTTTTAGTTAAAACATATCATAATTTGATGTTTGA
448 AAATGATTTTAAA-TCAA--TTTTTTTACATTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGC
* * * * * * * * * *
18920581 ATCGAGAAACGTGAAACAAAAACCATCTATTGACATAAAAAGTACAATGATAGTCACTCATGCCT
510 ATAG-GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAAAAAAGTCCAGTTATAGTCACTCATGACT
* * ** * * ** * ** **
18920646 TCTAAAGCCTTGTTACTTGCATCAA--ACATTTTATAA-TCTTATAAATGATTCAAAATTGAATT
574 T-GAAAGCCTCGTTACTCACTTTAAGTGGA-TTTATAACT-TTATAAAAGATTTTAAA-CAAATT
* * * *
18920708 TTTTCT-CATTTTTGGTTAAAACAAATTAGAATTTGTTGTTTC
635 TTTT-TACATTTTTGGTT-AAACAAATCATAATTT-ATGTTTG
* * * * * *
18920750 CATCAGGAAACGTGAAGCAAAATCCATCCATTGACATGAAAATTCCATTTATAGTCATTCTTGCC
1 CAT-TGGAAACGTGAAG-AAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCC
* * * * * * * *
18920815 TTAGAAAGCCTTGTTAGTCGCTTGAATTGGATTTATAACTTTATAAAAGATTTTAAAT-TGAATT
64 TTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTGAATATG-TTT
* * * * * *
18920879 TTTTTTAGATTTTTTGTTAAAACAAATCATAATTTGTTGTTTGCATTGGGAAACATGAAGCAAAA
128 TTTTTTACA-TTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCGAGAAACATGAAGCAAAA
* * * * * * * *
18920944 GCCATCCATTGACATA-AAAAGTCTAGTGATAGTCACTCAAT--CTTTCGATAGCCTTGTTGCTC
192 GCCATCCATTGACA-AGAAAAGTCCATTTATAGTCACTC-ATGCCATT-AAAAACCTTGTTACTC
* * * * * * *
18921006 TCTTTAAGT-GATTTTATAACTTTATAAGTAAGTTTGAATTGAATTGTTTTATCATTTTTTGTTA
254 GCTTTAAGTGGA-TTTATAACTTTATAAATAA-TTTTAAATAAATT-TTTTA-AATTTTTGGTTA
* * ** * * * *
18921070 AAACAGATCATAATTAGATGTTTGCATTGGGAGA-TGTGAAGAAAAAGCCATCTATTTACAAGAA
315 AAA-AAATCATAATTCGATGTTTGCATCAGGAAACT-TGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAA
* * *
18921134 AAG-TCTATTTATAGTCACTCATACCTTTGAAAGCCT-TGTTACTTGCTTTAAGTGGATTTATAA
378 AAGTTC-ATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTATGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAA
* * * * * *
18921197 ATTTTTAAACGATTTTAAATTAAATTCTTTTTACA--CTTAGTTGAAATAGATCATAATTTGATG
442 CTTTTTAAATGATTTTAAA-TCAATT-TTTTTACATTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTTGATG
* ** * *
18921260 TTTGCATTGAGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACATGAAAAGTCCAATTATGGTCACTCA
505 TTTGCATAG-GAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAAAAAAGTCCAGTTATAGTCACTCA
* * * * * * ***
18921325 TGCCTTCGAAAGCCTCATTACTCTCTTTAAGTGGATGTATAACATTATAAATGATTTTAAATTGA
569 TGACTT-GAAAGCCTCGTTACTCACTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAAAGATTTTAAACAAA
* * * * * *
18921390 TTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACATATGATATTTTTTGCTTG
633 TTTTTTTACATTTTTGGTT-AAACAAATCATAATTTATGTTTG
* * * *
18921433 CATCGAAAAATGTGAA-AAGACAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATTGTCACTCATGC
1 CATTG-GAAACGTGAAGAA-A-AGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGC
** *
18921497 CTTTGAAAGCC-TAGTTACTCG-TATTAAGTGGATTTATAACTTTATAAACAATTTTAAAT-TGA
63 CTTTGAAAGCCTTA-TTACTCGCT-TTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTGAATATG-
* * * * **
18921559 ATGTTTTTTTT-CATTTTTGGTTAAAAAAGATCATAATTTGTTATTTACATC-AGGAAATGTGAA
125 -T-TTTTTTTTACA-TTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCGA-GAAACATGAA
* * * * * * * *
18921622 ACAAAAGACATTCATTG----G-CAAGTCCAGTTATACTCACTCAAGCC-TTCAAAAGCCTTGTT
186 GCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCATT-AAAAACCTTGTT
* * * * * * ** *
18921681 GCTCTCTTTAAGTTGATTTATAACTTTAGAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTTCATTTTTGA
250 ACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATAATTTTAAA-T-AA-ATTTTTTAAATTTTTGG
* * * * * **
18921746 TTAAAACAGATCATAATTTGTTGTTTGCATCAGAAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACATT
312 TTAAAA-AAATCATAATTCGATGTTTGCATCAGGAAACTTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAG
* * * * *
18921811 AAAAGTCCAATTATAGTCACTCATGCCTTCGTAAA-TCT-TGGTACTCTC-TTAAGTGGATTTAT
376 AAAAGTTCATTTATAGTCACTCATGCCTTCG-AAAGCCTATGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTAT
* * * * * *
18921873 AACTTTATAAATGATTTTAAATTAAATTTTTTT--ATTTTTGGTTAAAATAAATCATAATTTGTT
440 AACTTTTTAAATGATTTTAAA-TCAATTTTTTTACATTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTTGAT
* ** * * * * * *
18921936 GTTTGCATTGGGAAATGTGAAACAAAAGCCATCCATTGACAAAAAAAATCCATTTACACTCATTC
504 GTTTGCA-TAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAAAAAAGTCCAGTTATAGTCACTC
* * * ** * * * * *
18922001 ATGCCTTCTAAAGCCTTGTTACTTGCATCAAATGGTTTTATAA-TCTTATAAATGATTTTAAATC
568 ATGACTT-GAAAGCCTCGTTACTCACTTTAAGTGGATTTATAACT-TTATAAAAGATTTTAAA-C
* * * **
18922065 GAAATTCTATATATATATATATATGGTTAAAACTTATCATAATTTGATGTTTG
630 -AAATT-T-T-T-T-TACATTTTTGGTT-AAACAAATCATAATTT-ATGTTTG
* ** **
18922118 CATCAGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACATTAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATATC
1 CAT-TGGAAACGTGAAG-AAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCC
** * * *
18922183 TTCAAAAGCCTTGTTACTCTCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAAT-TGAATT
64 TTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTGAATATG--TT
* * *
18922247 TTTTTGT-CATTGTTGGTTAAAATAGATCATCATTT-ATTGTTTGCATC-AGGAAACATGAAGCA
127 TTTTTTTACATT-TTGGTTAAAACAGATCATAATTTGA-TGTTTGCATCGA-GAAACATGAAGCA
* * * * * *
18922309 AAAGCCATTCATTG---AG--AAGTCCAGTTATACTCACTCAAGCC-TTCAAAAGCCTTGCTACT
189 AAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCATT-AAAAACCTTGTTACT
** * ** **
18922368 TTCTTTAAGTTGG-TTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGATTTTTTTTTCATTTTTGGTTA
253 CGCTTTAAG-TGGATTTATAACTTTATAAATAATTTTAAA-T-AAATTTTTTAAATTTTTGGTTA
* * * * * **
18922432 AAACATATCATAATT-TATTGTTTGCATTAGGCAAA-TGTGAAGAAAAAGCCATCTATTGACATT
315 AAA-AAATCATAATTCGA-TGTTTGCATCAGG-AAACT-TGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAG
* * * * * *
18922495 AAAAGTTCAGTTATAGTCGCTCATGACTTC-ATATA-CCT-TGGTACTCTCTGTAAGTGGATTTA
376 AAAAGTTCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGA-A-AGCCTATGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTA
* * * * * * * *
18922557 TAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTT-TATTTCTGGTTAAAATAGGTCATAATTTGT
439 TAACTTTTTAAATGATTTTAAA-TCAATTTTTTTACATTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTTGA
* * ** * * * * *
18922621 TGTTTGCATCAAGAAACGTGAAATAAAAGCCATCCATTGGCAAAAAAAATCCATTTACACTCACT
503 TGTTTGCAT-AGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAAAAAAGTCCAGTTATAGTCACT
* * * * ** * * * * *
18922686 CATGCCTTTTAAAGCCTTGTTAGTTGCATCAAATGGTTTTATAA-TCTTATAAATGATTTTAAAT
567 CATGAC-TTGAAAGCCTCGTTACTCACTTTAAGTGGATTTATAACT-TTATAAAAGATTTTAAA-
* * * * * * *** *
18922750 CAAAATTCTATACATGTATGTTTAAAACTTCTCATAATTTGATGTTTT
629 CAAATTTTTTTACATTTTTGGTT-AAACAAATCATAATTT-ATGTTTG
* *
18922798 CATTAGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACATA-AAAAGTCCAATTATAGTCACTTATGC
1 CATT-GGAAACGTGAAG-AAAAGCCATCCATTGACA-AGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGC
* * * * *
18922862 CTTCGAAAGCCTTGTTACTCTCTTTAAGCGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATG
63 CTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTGAA-T--ATG
* * ** * * *
18922927 TTTTTTCTT---TTTTGGTTAAAAAAGATCATAATTTCTTGTTTGCATCAAGGAACGTGAAGCAA
125 TTTTTTTTTACATTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCGAGAAACATGAAGCAA
* * * * * * *
18922989 AAGCCATTCATTGAC-----AAGTCCAGTTATACTCACTCAAGCCTTTAAAAGCCTTGTTACTCT
190 AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCATTAAAAACCTTGTTACTCG
* * * * **
18923049 CTTTAACTTGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTTCATTTTTGGTTAAA
255 CTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATAATTTTAAA-T-AA-ATTTTTTAAATTTTTGGTTAAA
* * * * * ** * **
18923114 GCAGATCGTAATTTGTTGTTTGCATTGGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACATTAAAAG
317 -AAAATCATAATTCGATGTTTGCATCAGGAAACTTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAG
* * ** * * * *
18923179 TCCAATTATAGTTGCTTATGCCTTCGTAAA-CCT-TGGTACTCTC-TTAAGTGGATTTGTAACTT
381 TTCATTTATAGTCACTCATGCCTTCG-AAAGCCTATGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTT
* * * * * * * * *
18923241 TATAAATGATTATAGATTGAATTTTTTT--ATTTCTGGTTAAAATAGATCATAATTTGTTATTTG
445 TTTAAATGATTTTA-AATCAATTTTTTTACATTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTG
* * * * * ** * * *
18923304 CATCGGGAAACATGAAACGAAAGCCATCCATTGGC-AAAAAAGCCCCTTTACACTCACTCATGCC
509 CAT-AGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAAAAAAGTCCAGTTATAGTCACTCATGAC
* * * * * * *
18923368 TTCTAACGCCTTGTTACT--TTTATCAAATGGTTTTATAA-TATTATAAATGATTTTAAATCAAA
573 TT-GAAAGCCTCGTTACTCACTT-T-AAGTGGATTTATAACT-TTATAAAAGATTTTAAA-CAAA
* * * * * ** *
18923430 ATTCTATACATATATGGTTAAAACTTATCATAATTTGATCTTTG
633 TTTTTTTACATTTTTGGTT-AAACAAATCATAATTT-ATGTTTG
** * * * * *
18923474 CATTAGGAAACGTGAAGCAAAAGCTGTCCATTGATATA-AAAAGTCCAATTACAGTCGCTCATAC
1 CATT-GGAAACGTGAAG-AAAAGCCATCCATTGACA-AGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGC
* ** * * **
18923538 CTTTGAAAGCCTTGTTACTTTCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATTATTTTAAAT-TGAAT
63 CTTTGAAAGCCTTATTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTGAATATGTTT
* * * * * *
18923602 TTTTTT-CATTTTAGGTTAAAACAGATCATAATTTGTTGTTTACATTGGGAAACGTGAAGCGAAA
128 TTTTTTACATTTT-GGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCGAGAAACATGAAGCAAAA
* * ** * *
18923666 GCCATCCATTAACAAGAAAAGTACATTTATAGTCACTCATGCC-TTTGAAAGCTTAGTAACTCGC
192 GCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCATTAAAAACCTT-GTTACTCGC
* * *
18923730 TTTAAGTGGATTTA-AACTTTATAAATGATTTTAAACTGAATTATTTTTT-CATTTTAGGTTAAA
256 TTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATAATTTTAAA-T-AA--ATTTTTTAAATTTTTGGTTAAA
* * * * ** * *
18923793 ATAGATCATAATTTGTTATTTGCATTGGGAAACATGAAGCCAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAG
317 A-AAATCATAATTCGATGTTTGCATCAGGAAACTTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAG
* * * * * *
18923858 TCCATTTATAGTCACTTATGCCGTT-AAAAGCCTA-GTAACTCGCTTTAAGTGGATTTAGAACCT
381 TTCATTTATAGTCACTCATGCC-TTCGAAAGCCTATGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTT
* * * * * * *
18923921 TATAAATGATTTTAAACTGAATTATTTTGCAATTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGTTGTTTG
445 TTTAAATGATTTTAAA-TCAATTTTTTTACATTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTG
* * ** * * * * * * * *
18923986 AATTAGAAAAGTTGAACCGAAAGCCATCCATTGAGAAGAAATGTCCATTTATAGTCACTCAAGCC
509 CA-TAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAAAAAAGTCCAGTTATAGTCACTCATGAC
* * * * * ***
18924051 TTCGAAAGTCTTGTTACTCACTTTAAGTGGTTTTATAACTTTATAAATGATTTTTGATTTAA-TT
573 TT-GAAAGCCTCGTTACTCACTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAAAGA-TTTTAAACAAATTT
* * * * *
18924115 TTTTATATTTTTAGTTAAAACATATTATAATTTATATTTG
636 TTTTACATTTTTGGTT-AAACAAATCATAATTTATGTTTG
* * * * * * *
18924155 CATTTGGGAAACGTGATGCGAAAGCTATCCATTGGCAAGAAAAGTCTATTTATAGTCAGTTATGC
1 CA-TT-GGAAACGTGAAG-AAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGC
* ** * * *
18924220 CTTCGAAAGCC-TAGTTACTTACATTT-AGTGGATTTATAACTTTATAAATAATTTTTAAT-TGA
63 CTTTGAAAGCCTTA-TTACTCGC-TTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTGAATATGT
* * * * * * * ** * *
18924282 TTTTTTTTA-TTTTTGGATAAAACAAATCATAATTTGTTGTTTGAATGGGGAAACGCGAACCGAA
126 TTTTTTTTACATTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCGAGAAACATGAAGCAAA
* * * * * * * * * * *
18924346 AGCCATCCATTAACAAGAAAAGTCCATTTATAGTAACTCAAGCCTTTTAGAGCTTTATCACTTGC
191 AGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCATTAAAAACCTTGTTACTCGC
* * * * ** ** * *
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256 TTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAAT-AATTTT-AAATAAAT-TTTTTAAAT-TTTTGGTTAAA
* * * * * * *
18924474 AAAGATCATAATTTC--TATTTGCATC-GACAAACGTGATGCGAAAGCAATCCATTTACAAGAAA
317 AAA-ATCATAA-TTCGATGTTTGCATCAG-GAAACTTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAA
* * * **
18924536 AG-TCTATGTATA-TCTACTTATGCCTTTGAAAGCCTA-GTTACTCGCTTTAAGTGGATGCATAA
379 AGTTC-ATTTATAGTC-ACTCATGCCTTCGAAAGCCTATGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAA
** * ** * * * * *
18924598 CTTTGAAAATAATTTTAAATTGATTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACATATCATAATTCGTTGTT
442 CTTTTTAAATGATTTTAAATCAATTTTTTTACATTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTT
18924663 TGCAT
507 TGCAT
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Statistics
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TTAAATCAATTTTTTTACATTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATAGGAAACAT
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TAAACAAATCATAATTTATGTTTG
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* * * ** *
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* * * *
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* * * *** * *
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* *
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*
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* * * * * *
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* * * * * * * * * *
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* * *
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* * * * * * *
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* * * * * * ** * *
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* * * *
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* * * ** * * *
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* * *
18913323 TTGACAAGAAAAGTCTAGTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTAGCTTTAAGTGG
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* * * *
18913388 ATTTTTAACTTTTTAAACGATTTCAAATTGAATTTGTTTTTACA-
129 ATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAA-TT-TTTTTACAT
* * ** *
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1 TTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATT
* * * * * *
18913497 GATAAGAAAAGTCCATTTATACTCACTCAAGTCTTCGAAAGCCTTGCTAGTCGCTTTAAGTGGAT
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* *
18913562 TTATAACTTTTTTAATGATTTTAAATTGAATTTATTTTACAT
131 TTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTT-TTTTACAT
* * * *
18913604 TTTTGGTCAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGGGAAGCATGAAGCCAAAGCCATCCATT
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* * * * * * *
18913669 GGCATA-AAAAGTCCAGTTATAGTCACTTATACCTTTGAAAGCCTTGTTACTCTCTTTAAATGGA
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130 TTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTT-TTACAT
* * * * *
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* * * ** * * * *
18913904 TTTATAA-TCTTATAAATGAGTATGAATCCAAATTCTATATAT
130 TTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTACAT
* * * * * *** * *
18913946 ATATGGTTAAAACATATCATACTTTGATATTTGCATCAAGAAACATGAAGCAAAAGCCATCTATT
1 TTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATT
* * * *
18914011 GACAAGAAAAGTCCAATTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGTCTTGTTACTCTCTTTAAGTGGAT
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18914076 TTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTA-AT
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* * * * *
18914116 TTTTGGTTAAAACATATCATAATTT-ATTTTTTGTATTGGGAAACGTGAAGCAAAAGCTATCCGT
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* * * * * *
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*
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* * * * * * * *
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* * * * * * * *
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** * *
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* * * * * ** *
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* * * * * * * * *
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** *
18914585 TTTATAACTTTATAAATGATTTTTGATTTATTTATTTTTTTAC-T
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* * * * ** * * * ** *
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1 TTT-TGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCAT
* * * * * *
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65 TGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGA
*
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130 TTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTACAT
** * * * * **
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1 TTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCAT-TGGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCAT
* * * * * * *
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65 TGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCT-TCGAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGG
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* * * * * **
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1 TTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCAT-TGGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCAT
* * * * *
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65 TGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGA
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130 TTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAAT--TTTTTTACAT
* * * * * *
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1 TTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATT
* * * * *
18915207 GATAAGAAAAGTCCATTTATTGTCACTCATGCCTTC-AAGAGCTTTGTTACTTGCTTTAAGTGGT
66 GACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAA-AGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGA
* * *
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* * * * *
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1 TTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATT
* * * *
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66 GACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGAT
* *
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131 TTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGA-ATTTTTTTACAT
* * * * *
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1 TTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATT
* * * * * *
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66 GACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGAT
* *
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* * * * *
18915658 TTTTGGTTAAAACATATCATAATTTGTTGTTTGCATTAGAAAACGTGAAG-AGAAAGCCATCCGT
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* * * *
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* * * * * *
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* * * * * * * *
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1 TTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATT
* * * * * * * * *
18915894 GACAAAAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAAGGCTTCTAAAGCCTTATCACTCACTTTAAGTAGTT
66 GACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGAT
* * * * *
18915959 TTATAGCTTCATAAATGATTTGT-GATTTAATTGTGTTTACAT
131 TTATAACTTTATAAATGATTT-TAAATTGAATT-TTTTTACAT
* * ** * * * *
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1 TTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATT
* * * * * * *
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66 GACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGAT
* *
18916130 TTATAAGTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTATTTTACAT
131 TTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTACAT
** * * * * *
18916171 TTTTGAAT-AAAGAGATCATGATTTGATGTTTGAATTGGGAAACATG-AGCTAAAAGCTATCCAT
1 TTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGGGAAACGTGAAGC-AAAAGCCATCCAT
** * * * * * * * * *
18916234 TGACAAGAAAAGTTGATTTATTGTCACTAATTCCTTCGATAGCCTTGTAACTCACTTTAAATAGT
65 TGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGA
* **
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130 TTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTT-TACAT
* * * * *
18916341 TTTTGGCTAAAACAGATCATAATTTGATGTTCT-CATTGGGAGACATGAAGCAAAAGCTATCTAT
1 TTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTT-TGCATTGGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCAT
* * * * *
18916405 TTACAAGAAAAGTCCCTTTATAGTCACTCATACCTTCGAAAGCCTTGTTGCTTGCTTTAAGTGGA
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* *
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130 TTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTACAT
* * * * * ** ** *
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1 TTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATT
* * ** *
18916577 GACATGAAAAGTCCAATTATAGTCACTCATAACTTCGAAAGCCTTGTTACTCTCTTTAAGTGGAT
66 GACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGAT
* * *
18916642 GTATAACTTTACAAATGATTTCAAATTGAATTGTTTTT-CAT
131 TTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATT-TTTTTACAT
* * * ** * ** **
18916683 TTTTGGTTAAAACATATCATAATTTGTTGTTTTCATTGAAAAACATGAAGTGAAAGTAATCCATT
1 TTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATT
* * *
18916748 AACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTAGTTACTCGCTTTAAGTGGAT
66 GACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGAT
* ** * ** *
18916813 TCATAACTTGGTAAATGATTTTAAACTAT-AA-TCTTACAAAT
131 TTATAACTTTATAAATGATTTTAAA-T-TGAATTTTTTTACAT
* ** ** * * * * *
18916854 TATT--TTAAAATTGA-C-TTTTTCTCAT-TTT-TAGTT--AAAACAT--ATCATAATTTGATGT
1 TTTTGGTTAAAACAGATCATAATT-TGATGTTTGCA-TTGGGAAACGTGAAGCA-AA----A-G-
* ** * ** * * *** * * *
18916909 TCACATCAGGAAAGATGAAGCAAAAGT-CATCCATTGACAAGAAAAGTCCATT-TATAGTCACTT
57 -C-CATC--CATTGA-CAAG-AAAAGTCCATTTATAGTC-ACTCATG-CC-TTCGAAAG-C-CTT
* ** * * * * *
18916972 ATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACT-CACTTTAAGTGGA-TTTATAACT--TTTTAAATGATTTTAG
111 GTTAC-TC----G-CTT-TAAGTGGA-TTT-A-T-AACTTTATAAATGATTTT-AA--A--TT-G
* *
18917033 ATTATTTTTTTTCAA
159 A--ATTTTTTTACAT
* * *
18917048 TGTTGGTTAAAACATATCATAATTTGATGTTTGCATTGGGAAATGTGAAGCAAAAGCCATCCATT
1 TTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATT
* * * * * *
18917113 AACATGGAAAGTCCAATTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGACTTGTTACTCTCTTTAAGTGGAT
66 GACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGAT
* *
18917178 CTA-AACTTTATAAATGATTTTAGATTGAATTTTTTT-CAT
131 TTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTACAT
* ** ** *
18917217 TTTTGGTTAAAACATATCATAATTTTTTGTTTGCATCAGAAAACGTGAAG-AGAAAGCCATCCAT
1 TTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGGGAAACGTGAAGCA-AAAGCCATCCAT
* * *
18917281 TGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAACCTAGTTACTCGCTTTAAGTGGA
65 TGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGA
* * * ** * * * * *
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130 TTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTACAT
* * * * *
18917388 TTTTGGTTAAAACATATCATAATTTGTTGTTTGAATTGGGAAACGTGAATCGAAA-CCATCCATT
1 TTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATT
* * * * * * *
18917452 GACAAGAAAAGTCCATTGATAGTCACTCAAGCCTTCTAAAGCCTTATCACACGCTTTAAGTGGTT
66 GACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGAT
** ** *
18917517 TTATAACTTCCTAAATGATTTTTTATT-TATTTTTTTACAT
131 TTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTACAT
* ** * * *
18917557 TTTTAGTTAAAACAGATCATAATTT-ATGTTTGCATCAGGAAACGAGATGCAAAAGCAATCCATT
1 TTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATT
* * ** * * *
18917621 GACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCAATTATGCCTTCGAAAGCCTAATTACTTGCATTAAGTGCAT
66 GACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGAT
* * *
18917686 TTATAAGTTTATAAATGATTTTAAGTTGAATTATTTTACAT
131 TTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTACAT
* * * * * * *
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1 TTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATT
* * * * ** * *
18917792 GACAAGAAAAGTCGATTTATTGTCACTCATTCCTTTGGGAGCCTTGTAACTTGCTTTAAGT-GAT
66 GACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGA-
** *
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130 TTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTA-CAT
* * * * * *
18917899 TTTTGGCTAAAATAGATCATAATTTGATGTATGCATTGGGAGACATGAAGCAAAAGCCATCTATT
1 TTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATT
* * * *
18917964 GACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTTATGCCTTCGAAAGCCTTATTACTCGCTCTAAGTGGAT
66 GACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGAT
*
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131 TTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAAT-TTTTTTACAT
* * *
18918070 TTTTGGCTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGTATT-GGAAACGTGAAGCAAAAGCAATCCATT
1 TTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATT
* * * * * * * * *
18918134 GACATA-AAAAGTGCAGTGATAGTCACTCATGCCTTCTAAAGCCTTGTTACTTGCATCAAATGGT
66 GACA-AGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGA
* *
18918198 TTTATAAAC-TTATAAATGATTTAAAATTGAATTTTTTCTA-GT
130 TTTAT-AACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTT-TACAT
** * * * * * * *** *
18918240 TTTCAGCTAAAACATATAAGAATTTGTTGTTTCCATCAAGAAACGTGAAGCAAAATCCATCCATT
1 TTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATT
* * * * * * * *
18918305 GACACGAAAATTCCATTTATAGTCACTCTTGTCTTTGAAAGACTTGTTACTCACTTGAAGTGGAT
66 GACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGAT
*
18918370 TTATAACTTTA-CAATAGATTTTAAATTGAATTTCTTTTACAT
131 TTATAACTTTATAAAT-GATTTTAAATTGAATTT-TTTTACAT
* * * * * *
18918412 TTTTGGTTAAAATAAATCATAATTTGTTGTTCGCATAGGGAAAAGT-AAGTCGAAAA-CCATCCA
1 TTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGGGAAACGTGAAG-C-AAAAGCCATCCA
* ** ** * * * * * * * * *
18918475 TTGAGAAGAAATTTTTATTTGTAATCCCTGATGCCTTCAAAAGCCTAGTTAGTCACTTCACACGT
64 TTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCGCTTTA-A-GT
*** * ** * * ** ** ** **
18918540 -GAAGCAAAAGC---ACCCATTGACATAAAAAGTCAAATCATAGT-CAT
127 GGATTTATAA-CTTTA-TAAATGA-TTTTAAA-TTGAATTTTTTTACAT
** * * * * * * * *** ***
18918584 TCATGCCTTCGAAAGACTTTGTACTCTCTTTAAGTGGATGTAT-AACTTTATAAA--TGATTTTA
1 TTTTG-GTT--AAA-AC--AG-A---TC-ATAATTTGATGTTTGCA-TTGGGAAACGTGA-AGCA
*** * ** * * *
18918646 AATTACATTTTTTTCATTTTTGGTTAA-AACATA-TCACAATTTGTTGTTCACATCA-GAAAACG
53 AAAGCCA-----TCCA---TT-GACAAGAA-A-AGTC-C-ATTTATAG-TCAC-TCATG----CC
** ** ** * * * ** *
18918708 TGAAGAGAAAGCCATCCATTGACAAAAAAAGTTCATTTATAGT-CACTCATGCCTTT-GAAA-GC
99 T---TCGAAAGCC-T-TGTT-AC-----TCG--C-TTTA-AGTGGATTTATAACTTTATAAATG-
* * * * * ***
18918770 CTAGTTACTCACTTTAAGTGGATT-CAT
148 --A-TT-TTAAATTGAATTTTTTTACAT
* * ** * ** * **
18918797 AACTTT-G-T-AAA-TGATTTTAAACTAAATTATTTGACAATTTTGGTTAA----AA-CAAATCA
1 --TTTTGGTTAAAACAGATCAT-AATTTGA-TGTTTG-C-A--TTGGGAAACGTGAAGCAAA--A
* *** * * ** ** ** ** ****
18918853 -CAATTTGTTGTTCAA-ATAGAGAAACATGAACCGAAAACT-AT-CCATT-GACAAGAAAAG-T-
56 GCCATCCATTG-ACAAGA-AAAG-TCCATTTATAG-TCACTCATGCC-TTCGA-AAGCCTTGTTA
* * * * * * * * * * * ** *
18918911 CT--ATTTATAGT-CACTCA-AGCCTTCTAAA-GCCTTATCACTCACTTTAAGTGGTTTTATA-
115 CTCGCTTTA-AGTGGATTTATAACTTTATAAATG-ATT-T---TAAATTGAA-TTTTTTTACAT
** ** ** * * * ** * *
18918969 ACTT-CATAAATGATTTTTGAT-TTAATTT--TTTTTACATTTTTAGTTAAA-AT-AGATCATAA
1 TTTTGGTTAAA--A---CAGATCATAATTTGATGTTTGCA---TT-GGGAAACGTGA-AGCA-AA
** * * *
18919028 TTTATG-TTTGCATTGGGAAACATGATGTGAAAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAA
55 ---A-GCCATCCATT--G--ACA--A---GAAA--AGTCCATT-----------------TATAG
* * * * * * * **
18919092 TCACTTATGCCTTAGAAAGCCTAGTTACTCACATTAAGTGCATTTATAAGTTTATAGTTGATTTT
88 TCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATGATTTT
*
18919157 AAATTGAATTATTTTACAT
153 AAATTGAATTTTTTTACAT
** * * * * ** **
18919176 TTTTGGTTAAAGTAAATCATAATTTGATGTTTGAATTGGGAAACATGAGGTGAAAGTTATCCATT
1 TTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATT
* * * * * *
18919241 GACAAGAAAAGTTCATTTATTA-TCACTCATTCCTTCGAGAGCCTTGTAACTCACTTTAAGTGGT
66 GACAAGAAAAGTCCATTTA-TAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGA
* *
18919305 TTTATAACTTTATAAATGATTTTGAATTAAATTTGTTATT--AT
130 TTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTT-TT-TTACAT
* * * *
18919347 TTTTGGCTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTTCATTGGAAAACGTGAAGCAAAAAGCCATCTAT
1 TTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGGGAAACGTGAAGC-AAAAGCCATCCAT
* * *
18919412 TGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTTATGCCTTCAAAAGCCTTGTTACTCGCTCTAAGTGGA
65 TGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGA
* * *
18919477 TTTATAGCTTTTTAAATGAATTTAAATTGAATTTTTTTTACAT
130 TTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAA-TTTTTTTACAT
* * * *
18919520 TTTGGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGGAAACTTGAAGCGAAAGCCATCCATT
1 TTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATT
* * * * * * *
18919585 GAGATGAAAAGTCCAATTGTAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCGTTATTACTCTCTTTAAGTGGAT
66 GACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGAT
* * * *
18919650 GTGT-AGTGTTATAAATGATTGTAAATTGAATTTTTTT-CAT
131 TTATAACT-TTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTACAT
* * ** * * *
18919690 ATTTGGTTAAAACATATCATAATTT-ATTGTTTGCATCAGAAAACGTAAAG-AGAAAGTCATCCA
1 TTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGA-TGTTTGCATTGGGAAACGTGAAGCA-AAAGCCATCCA
* * * *
18919753 TTGACAAGAAAAGTTCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTACTTGCTTTAAGTGG
64 TTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGG
* * * * * * * * *
18919818 ACTCATAACTTTGTAAATAATTTTAAACTGAATTATTTGATAA
129 ATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTACAT
* ** * * *
18919861 TTTTGGTTAAAACAGATCATAA-TTGCTTGTTT-CAATCAGGAAACGTGAACCGAAAGACATCCA
1 TTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTG-ATGTTTGC-ATTGGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCA
* * * * *
18919924 TTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCAAGCCTTCTAAAGCCTTATCACTCGCTTTAAGTGG
64 TTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGG
* * ** * *
18919989 TTTTATAACTTCATAAATGATTTTTGATTTAATTTGTTTTGCAT
129 ATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTT-TTTTACAT
* * ** * ** *
18920033 TTTTAGTTAAAACAGAAT-ATAATTT-TTGTTTGCATTGGGAAACGTGCTGCGAAAGTAATCTAT
1 TTTTGGTTAAAACAG-ATCATAATTTGATGTTTGCATTGGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCAT
* * * ** * * * * * * *
18920096 TGACAAGGAAAGTCTATTCATAGTCACTTTTTCCTTCAAAAGCCTAGTTACTAGCATAAAGTGCA
65 TGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGA
* *
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130 TTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTACAT
* * * * * * * * *
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1 TTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATT
* * * * * * * *
18920268 GACAAGAAAAGTCAATTTATTGTCACTCATTCTTTCGAGAGCCTTGTAACTCACTTTAAGTGGTT
66 GACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGAT
* *
18920333 TTATAACTTTATAAATAATTTTGAATTGAATTTTTTGT-CAT
131 TTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTT-TACAT
* * * ** * * * * *
18920374 ATTTGGCTGAATTAGATCATAGTTTGATGTTTCCATTGGGAGACATGAAGCAAAAGCCATCTATT
1 TTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATT
* * * * * *
18920439 GACAAGAAAAGTCCATTTATAATCACTTATGCCTTCGAAAGCCTTGTTTCTCACTCTAAATGGAT
66 GACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGAT
*
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131 TTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAA--TTTTTTTACAT
* * * * * * * *
18920547 TTTTAGTTAAAACATATCATAATTTGATGTTTGAATCGAGAAACGTGAAACAAAAACCATCTATT
1 TTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATT
* * * * * * * **
18920612 GACATA-AAAAGTACAATGATAGTCACTCATGCCTTCTAAAGCCTTGTTACTTGCATCAA--ACA
66 GACA-AGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGA
**
18920674 TTTTATAA-TCTTATAAATGATTCAAAATTGAATTTTTTCT-CAT
130 -TTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTT-TACAT
* * * * * ** *
18920717 TTTTGGTTAAAACAAATTAGAATTTGTTGTTTCCATCAGGAAACGTGAAGCAAAATCCATCCATT
1 TTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATT
* * * * * * * *
18920782 GACATGAAAATTCCATTTATAGTCATTCTTGCCTTAGAAAGCCTTGTTAGTCGCTTGAATTGGAT
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* *
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* *
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* *
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*
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* *
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* *
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*
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* * * *
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* *
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* *
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1 AAATAATATTTTTAGGAATA
*
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* *
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* * * *
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*
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* * * * * *
18953630 AAAAGACCAATTATAGTCACTCATGCCTTCCAAAGCCTTGTTACCCT-CTTTAAGTAGATGTATA
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* * * * *
18953694 AGTTTATAAATGATTTTATATTGATTTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACATATGATAATTT-ATT
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* * * * * * *
18953758 ATTTGCAT-TGAGAAACATGAAACAAAAGCCATCTATTGCCAGG
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* * * ** * * * * *
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* * * * * * *
18953866 -TCTTATAAATAATTTTAAACTGTAATTCTATAT-ATATATAGTTAAAACAGATCATAATTTGAT
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* * * * *
18953929 GTTTACATCAGAAAACATGAAGCAAAAGCCATCTATTGATAAG
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* * *
18953972 AAAAGTCTAGTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTTCTCT-CTTTAAGTGGATTTATA
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* *
18954036 ACTTTATAAATGACTTTAAATTGAATTTTTTTTTCA-TTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTAAT
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* * * *
18954100 GTTTACATCAGCAAACATGAAGCAAAAGCTATCCATTGACAAG
128 GTTTGCATCAGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAG
* * * * * * **
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1 AAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTTGCTTTAAGTGGATTTATAA
* * * * *
18954208 CTTTTTAAATGATTTTAAATTAAATTTTTTTTACATTTTTGGTTAAAAAAGATCAGAATTTGAAG
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* * *
18954273 TTTTCAT-TGAGAAACGTGTAGCAAAAGCCATCCATTGAC--G
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* * ** * * *
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1 -AAAA-GTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACT-TGCTTTAAGTGGATTTA
* * * *
18954377 TAACTTTATAAATGATTTCAAACTGAATTTTTTTTC-TTTTTGGTTGAAACAGATCATAATTTGT
63 TAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAA-TTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGA
** * * * * * *
18954441 TGTTTAAATTAAGAAACGTGAA-CTGAAAGCCAACCATTGATAAT
127 TGTTTGCATCAGGAAACGTGAAGC-AAAAGCCATCCATTGACAAG
* * * * * *
18954485 AAAAGTTCATTTATAGTCACTCAAGCCTTCTAAAACCTTGTTACTCGCATTAAGTGGATTTATAA
1 AAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTTGCTTTAAGTGGATTTATAA
* ** *
18954550 CTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTATTTTACATTTTCAGTTAAAATAGATCATAATTTGATGT
66 CTTTATAAATGATTTTAAATTGAATT-TTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGT
* ** * *
18954615 TTGAATTGGGAAACATG-AGACAAAAGCTATCCATTGACAAG
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* * *
18954656 -AAAGATTCATTT-T-GT--GTCA---C-TC--AA----T-TTACTCGCTTTAAGT-GATTTTAT
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* * ** *
18954704 AACTTTATAAATAATTTTGAATTGAAAATTTTTCATTTTTTGTTAAAACAGA-CTATAATTTGAT
64 AACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATC-ATAATTTGAT
* *
18954768 GTTTGCATCAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCTATTGACAAG
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* * * * * *
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* *
18954876 CTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAACTTGTTGTT
66 CTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTT
* * *
18954941 TGCATC-GAAAAACGTGAAGAAAAAGCCATTCATTGACAAG
131 TGCATCAG-GAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAG
* * * * ** *
18954981 AAAAGTTCAATTATGGTAACTCACACCTTCGAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAA
1 AAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTTGCTTTAAGTGGATTTATAA
* * * * *
18955046 CTTTATAAATGATTTTGAATTGAATTTTTTTTCAGTTTTGGTTTAAAACATATTATAATTTGTTG
66 CTTTATAAATGATTTTAAATTGAA-TTTTTTTCATTTTTGG-TTAAAACAGATCATAATTTGATG
* * *
18955111 TTTGCAT-TGAGAAATGTGAAACAAAAGCCATCCATT-AGCAAG
129 TTTGCATCAG-GAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGA-CAAG
* * * * * * *
18955153 AAAAG-CACATTTATATTCACTCATGTGC-TCTAAAGCCTTGTTACTTGCATCAAATGGTTTTAT
1 AAAAGTC-CATTTATAGTCACTCATG-CCTTCGAAAGCCTTGTTACTTGCTTTAAGTGGATTTAT
* * * * * * *
18955216 AA-TCTTATAAATGATTTGAAATTAAATATTTTCTCATTTTTGGCTAAAACATATTATAATTTGT
64 AACT-TTATAAATGATTTTAAATTGAAT-TTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGA
* * *
18955280 TGTTTGCATCATGAAACGTGAAGCAAGATCCATCCATTGACACA-
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* * * * * ** * *
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1 AAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTTGCTTTAAGTGGATTTATAA
* * *
18955389 CTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTCTTTTGTATTTTTGGTTAAAACAAATCATAATTTGTTG
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* * ** * *
18955454 TTTGCATTAGAAAATATGAAGCGAAAA-TCGTCCATTGACAAG
129 TTTGCATCAGGAAACGTGAAGC-AAAAGCCATCCATTGACAAG
* * * * * * * * *
18955496 AAAAGTCTATTTACAGTCACTGATGCCTT-GAAAAGCCTAGTTAGTCGCTTTAAATAGTTTTATA
1 AAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCG-AAAGCCTTGTTACTTGCTTTAAGTGGATTTATA
* * * * ** *
18955560 A-TCTTACAAATGATTTCAAAATTGAATTTTTCTCATTTTTTGTTAAATTATATCATAATTTGAT
65 ACT-TTATAAATGATTT-TAAATTGAATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGAT
*
18955624 GTTTGCATCAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAG
128 GTTTGCATCAGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAG
* * * *
18955667 AAAAGTCCATTTATACTCACTCATGCATTCGAAAACCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAA
1 AAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTTGCTTTAAGTGGATTTATAA
* * * **
18955732 ATTTTTTAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAATGGATCATAATTTGATGT
66 CTTTATAAATGATTTTAAATTGAA-TTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGT
* * *
18955797 TTGTAGCAGGAAACGTGAAGTAAAAGCCATCCATTGACATA-
130 TTGCATCAGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACA-AG
* * * * ** *
18955838 AAAAGTCCAATGATAGTCACTCATGCCTTTGTAAA-CATTGAAAATCT-CTTTAAGTGGATTTAT
1 AAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCG-AAAGCCTTGTTACT-TGCTTTAAGTGGATTTAT
* * *
18955901 AACTTTATAAATGATTTTTAATTGAATTTTTTTTTTCATTTCTGGTTAAAATAGATCATAATTTG
64 AACTTTATAAATGATTTTAAATTGAA---TTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTG
* * ** * *
18955966 TTGTTTTCATTGGGAAACGTGAAACAAAAG-CATCCATTTG-CAAA
126 ATGTTTGCATCAGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCA-TTGACAAG
* ** * * * * * *
18956010 AAAACTATATTTATACTCACTCATGCCTTCTAAAGCCTTGTTACTTGCATCAAATGGTTTTATAA
1 AAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTTGCTTTAAGTGGATTTATAA
* ** * *
18956075 -TCCTATAAATGATTTTAAATCAAAATTCTATATATAT-ATATATATGGTTAAAACATATCATAA
66 CT-TTATAAATGATTTTAAAT-TGAATT-T-T-T-T-TCAT-T-TTTGGTTAAAACAGATCATAA
* * *
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122 TTTGATGTTTGCATCAGGAAACGTGAAGC-AAAAGCCATCCATTGACAAG
** * * * *
18956187 AATGGTCCAGTTATAGTCACTCATGCTTTCGAAAGCATTATTACTCT-CTTTAAGTGGATTTATA
1 AAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACT-TGCTTTAAGTGGATTTATA
* * * * *
18956251 ACCTTATAAATGGTTTTAAATTGAATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACATATCATAATTTGTTGC
65 ACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGT
* * *
18956316 TTGCATTC-GGAAACTTGAAACAAAAGCCATCCATTGGCAAG
130 TTGCA-TCAGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAG
* * * * * * *
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1 AAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTTGCTTTAAGTGGATTTATAA
** * * * * * *
18956422 -TCTTATAAATGATTTTAAATCAAAATTCTATACATATATGGTTAAAACATATCATAATTTGATG
66 CT-TTATAAATGATTTTAAAT-TGAATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATG
*
18956486 TTTGCATAAGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACATA-
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* * ** *
18956528 AAAAGTCTAGTTATAGTCACTCATGCCTTTAAAAGCCTTGTTACTCT-CTTTAAGTGGGTTTATA
1 AAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACT-TGCTTTAAGTGGATTTATA
* * * *
18956592 ACTTTATAAATGATTTTGAATTGAATTTTTTTTCTAGTTTTGGTTAAAACATATCATAATTTGTT
65 ACTTTATAAATGATTTTAAATTGAA-TTTTTTTC-ATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGAT
* * * *
18956657 ATTAGCATCGGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTAACATA-
128 GTTTGCATCAGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACA-AG
* * * * ** *
18956700 AAAAGTCTAGTTATAGTCACTCATACCTTCGAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAAT-GATTTTATA
1 AAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTTGCTTTAAGTGGA-TTTATA
* * ** * * *
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* * * * * *
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* * *
18956871 AAAAGTCCA-TTATAGTCACTCAAGCCTTCTAAAGCCTTGTTACTCT-CATTAAGTGGATTTATA
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* * *
18956934 ACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTATTTTATAATTTTT-ATTAAAACATATCATAATTTGAT
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* * * ** * * *
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128 G-TTTGCATCAGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAG
* * * * * * *
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* * * * *
18957105 ACTTTATAAATCATTTTGAATTGAGTTTTTTTATAATTTTTGGCTAAAACAGATCATAATTTGAT
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* * * *
18957170 GTTT-CTATC-GAGAGACGAGAAGCAAAAGCCATCTATTGACAAAA
128 GTTTGC-ATCAG-GAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGAC-AAG
* * *
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* * *
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* *
18957342 GTTTGCATCAGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGGCATAA
128 GTTTGCATCAGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACA-AG
* * * *
18957386 AAAAGTCCAGTTATAGTTACTCATACCTTCGAAAGCCTTGTTACTCT-CTTTAGGTGGATTTATA
1 AAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACT-TGCTTTAAGTGGATTTATA
* * * * * **
18957450 ACTTTATAAATGATTTTAAATTG-ATTTTTTTTATTTTTTGTCAAAATAGATCATAATTTGCTAC
65 ACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGT
* * * *
18957514 TTGCATCGGGAAACGTGAAGCGAAAGCCATCTATTAACAAG
130 TTGCATCAGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAG
* * * *
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1 AAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTTGCTTTAAGTGGATTTATAA
* * * * * *
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* * * *
18957682 GTTT-CAATCAGGAAACGTGAACCGAAAGCCATCAATTGGCAAG
128 GTTTGC-ATCAGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAG
* * * * * * *
18957725 AAAAGTCCATTTATCGTCAGTTA-ACCTTCGAAAACCTTGTTACTTACTTTAAGTGGTTTTATAA
1 AAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTTGCTTTAAGTGGATTTATAA
* * * ** * * * *
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* * * *
18957853 TTTGCATC-GAGAAACGTGATGCGAAAGCAAACCATTGACAAG
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* * * * * **
18957895 AAATGTCCATTTATAGTCACTTATCCCTTCAAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAGTGGATTTATAA
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* *** *
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* * * * * *
18958024 TTTGAATTACGAAACATGAGGCAAAA-CCTATCCATTGACAAA
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** * * * * * ** *
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* * * * *
18958131 CTTTATAAATGATTTTGAATTGAATTTTTTTTATTATTTCTTGCTAAAACAAATCATAATTTGAT
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* * *
18958196 GTTTCCATCA-GAAGATGTGAAGCAAAAGCCATCTATTGACAAG
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* * * ** *
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***
18958304 CTTT-TCAAATGATTTTAAATTGAATTTTTAAAAATTTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGAT
66 CTTTAT-AAATGATTTTAAATTGAATTTTT-TTCA-TTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGAT
* * * *
18958368 GTTTGCATCAGGAAATGTGAAGCAAGAGCCATCCATGGACATG
128 GTTTGCATCAGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAG
* * * * * * *
18958411 AAAAGTCTAGTTATAGTCACTCACGCCTTTGATAGGCTTGTTACTCT-CTTTAAGTGGATGTATA
1 AAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACT-TGCTTTAAGTGGATTTATA
* * * *
18958475 ACTTTATAAATGATTTTAAATGGATTTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATGTGTTG
65 ACTTTATAAATGATTTTAAATTGA-ATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATG
* * * *
18958540 TTTGCAT-AGAGAAACGTGAAACAAACGCCATCCATCGATAAG
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* * * * * * *
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* * * * * * * *
18958647 -TCTTATAAATGATTTTAAATCGAAACTCTATACATATATGGTTAAAACATATCATAATTTGATG
66 CT-TTATAAATGATTTTAAATTG-AATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATG
** * *
18958711 TTTGCATCAAAAAATGTGATGCAAAAGCCATCCATTGACATA-
129 TTTGCATCAGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACA-AG
*
18958753 AAAAGTCCAGTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTT
1 AAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTT
18958795 TGTCACGACC
Statistics
Matches: 4063, Mismatches: 758, Indels: 346
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (170 bp):
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CTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTT
TGCATCAGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAG
Found at i:18954381 original size:343 final size:342
Alignment explanation
Indices: 18953620--18958794 Score: 4643
Period size: 343 Copynumber: 15.2 Consensus size: 342
18953610 TAATCTTATA
* * * * * *
18953620 CATTAACATTAAAAGACCAATTATAGTCACTCATGCCTTCCAAAGCCTTGTTACCCTCTTTAAGT
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* * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * * * *
18953877 ATTTTAAACTGTAA-TTCTATATATATATAGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTACA-TCAG
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*
18953940 AAAACATGAAGCAAAAGCCATC
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* * * * *
18953962 TATTGATA-AGAAAAGTCTAGTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTTCTCTCTTTAAG
1 CATTGACATA-AAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCTCTTTAAG
*
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* * * * *
18954090 ATAATTTAATGTTTACATCAGCAAACATGAAGCAAAAGCTATCCATTGACAAGAAAAGTCGATTT
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* * * ** *
18954155 ATACTCACTCATGCTTTCAAAAACCTTGTTACTCGCTTTAAGTCAATTTATAACTTTTTAAATGA
194 ATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATGA
* * * * *
18954220 TTTTAAATTAAATTTTTTTTACATTTTTGGTTAAAAAAGATCAGAATTTGAAGTTTTCATTGAGA
259 TTTTAAATTGAA-TTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGAGA
*
18954285 AACGTGTAGCAAAAGCCATC
323 AACGTGAAGCAAAAGCCATC
* * * * ** * *
18954305 CATTGACGTAAAAGGTCTAGTTATAGTCACTCATATCTTCGAAAGCCTTATTAGTCTCTTTAAGT
1 CATTGACATAAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCTCTTTAAGT
* * * *
18954370 GGATATATAACTTTATAAATGATTTCAAACTGAA-TTTTTTTTC-TTTTTGGTTGAAACAGATCA
66 GGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCA
* ** * * * * * *
18954433 TAATTTGTTGTTTAAATTAAGAAACGTGAA-CTGAAAGCCAACCATTGATAATAAAAGTTCATTT
131 TAATTTGATGTTTGCA-TCAGAAACGTGAAGC-AAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTT
* *
18954497 ATAGTCACTCAAGCCTTCTAAAA-CCTTGTTACTCGCATTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATG
194 ATAGTCACTCATGCCTTC-AAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATG
* ** * * *
18954561 ATTTTAAATTGAATTATTTTACATTTTCAGTTAAAATAGATCATAATTTGATGTTTGAATTGGGA
258 ATTTTAAATTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGAGA
* *
18954626 AACATG-AGACAAAAGCTATC
323 AACGTGAAG-CAAAAGCCATC
* * * *
18954646 CATTGACA-AGAAAGATTCATTT-T-GT--GTCA---C-TC--AA----T-TTACTCGCTTTAAG
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* * ** *
18954695 T-GATTTTATAACTTTATAAATAATTTTGAATTGAA--AATTTTTCATTTTTTGTTAAAACAGA-
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* *
18954756 CTATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCTATTGACAAGAAAAGTCCAT
129 C-ATAATTTGATGTTTGCATCA-GAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCAT
* * ** * * * *
18954821 TTATAGCCATTCATGCCTTTGAAATCCTTGTTACTTGCTTTTAGTGAATTTATAACTTTATAAAT
192 TTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAAT
* * * *
18954886 GATTTTAAATTGAATTTTTTT-CATTTTTGGTTAAAACAGATCATAACTTGTTGTTTGCATCGAA
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* *
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322 AAACGTGAAGCAAAAGCCATC
* * * * ** *
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* * *
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* * * * *
18955099 TATAATTTGTTGTTTGCATTGAGAAATGTGAAACAAAAGCCATCCATT-AGCAAGAAAAG-CACA
129 CATAATTTGATGTTTGCA-TCAGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGA-CAAGAAAAGTC-CA
* * * * * * * *
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* * * * * * *
18955225 AATGATTTGAAATTAAATATTTTCT-CATTTTTGGCTAAAACATATTATAATTTGTTGTTTGCA-
254 AATGATTTTAAATTGAAT-TTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCAT
* * *
18955288 TCATGAAACGTGAAGCAAGATCCATC
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* * * * * * * *
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* * *
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* * ** * * *
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* * * * * * * * *
18955507 TACAGTCACTGATGCCTTGAAAAGCCTAGTTAGTCGCTTTAAATAGTTTTATAA-TCTTACAAAT
193 TATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACT-TTATAAAT
* * * ** * *
18955571 GATTTCAAAATTGAATTTTTCT-CATTTTTTGTTAAATTATATCATAATTTGATGTTTGCA-TCA
257 GATTT-TAAATTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGA
*
18955634 GGAAACATGAAGCAAAAGCCATC
321 -GAAACGTGAAGCAAAAGCCATC
* * * *
18955657 CATTGACA-AGAAAAGTCCATTTATACTCACTCATGCATTCGAAAACCTTGTTACTCGCTTTAAG
1 CATTGACATA-AAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCTCTTTAAG
* * * **
18955721 TGGATTTATAAATTTTTTAATGATTTTAAATTGAA-TTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAATGGATC
65 TGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATC
* * * *
18955785 ATAATTTGATGTTTGTAGCAGGAAACGTGAAGTAAAAGCCATCCATTGACATA-AAAAGTCCAAT
130 ATAATTTGATGTTTGCATCA-GAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACA-AGAAAAGTCCATT
* ** * ** * *
18955849 GATAGTCACTCATGCCTTTGTAAA-CATTGAAAATCTCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAAT
193 TATAGTCACTCATGCC-TTCAAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAAT
* * * * * *
18955913 GATTTTTAATTGAATTTTTTTTTTCATTTCTGGTTAAAATAGATCATAATTTGTTGTTTTCATTG
257 GATTTTAAATTGAA--TTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTG
* *
18955978 GGAAACGTGAAACAAAAG-CATC
320 AGAAACGTGAAGCAAAAGCCATC
* * ** * * * *
18956000 CATTTG-CAAAAAAACTATATTTATACTCACTCATGCCTTCTAAAGCCTTGTTACT-TGCATCAA
1 CA-TTGACATAAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCT-CTTTAA
* * * ** * * *
18956063 ATGGTTTTATAA-TCCTATAAATGATTTTAAATCAAAATTCTATATATATAT-ATATATGGTTAA
64 GTGGATTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAAT-TGAATT-T-T-T-T-TTTCATTTTTGGTTAA
* * * * *
18956126 AACATATCATAATTTGATGTTTGCATTAGGAAATGTGAA-CTGAAAGCCATCCATTGACAAGAAT
122 AACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCA-GAAACGTGAAGC-AAAAGCCATCCATTGACAAGAAA
* * * * * * * *
18956190 GGTCCAGTTATAGTCACTCATGCTTTCGAAAGCATTATTACTCTCTTTAAGTGGATTTATAACCT
185 AGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTT
* * * *
18956255 TATAAATGGTTTTAAATTGAATTTTTTT-CATTTTTGGTTAAAACATATCATAATTTGTTGCTTG
250 TATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTG
* *
18956319 CATTCG-GAAACTTGAAACAAAAGCCATC
315 CATT-GAGAAACGTGAAGCAAAAGCCATC
* * * * * *
18956347 CATTGGCA-AGAAAAGTCCATTTATACTCACTTATGCCTTCTAAAGCCTTGTTACT-TGCATCAA
1 CATTGACATA-AAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCT-CTTTAA
* * * ** * * * * * *
18956410 ATGGTTTTATAA-TCTTATAAATGATTTTAAA-TCAAAATTCTATACATATATGGTTAAAACATA
64 GTGGATTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGA
* *
18956473 TCATAATTTGATGTTTGCATAAGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACATA-AAAAGTCTA
128 TCATAATTTGATGTTTGCATCA-GAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACA-AGAAAAGTCCA
* * * *
18956537 GTTATAGTCACTCATGCCTTTAAAAGCCTTGTTACTCTCTTTAAGTGGGTTTATAACTTTATAAA
191 TTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAA
* * * * * * * *
18956602 TGATTTTGAATTGAATTTTTTTTCTAGTTTTGGTTAAAACATATCATAATTTGTTATTAGCATCG
256 TGATTTTAAATTGAATTTTTTTAC-ATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTG
*
18956667 GGAAACGTGAAGCAAAAGCCATC
320 AGAAACGTGAAGCAAAAGCCATC
* * * * * * *
18956690 CATTAACATAAAAAGTCTAGTTATAGTCACTCATACCTTCGAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAAT
1 CATTGACATAAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCTCTTTAAGT
* * * ** * *
18956755 -GATTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAACT-AAATTATTTCACAATTTTGGTTAAAACAGAAC
66 GGA-TTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATC
* * * * * * *
18956818 ATAATTTGTTGTTTGAATTGAGAAACGTGAACCGAAAGCCAACCATTGACAATAAAAGTCCA-TT
130 ATAATTTGATGTTTGCA-TCAGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTT
* * * *
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194 ATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATGA
* * *
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259 TTTTAAATTGAATT-TTTT-TACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATG-TTTGCATTGA
* ** * *
18957009 GAAACGTGAGGTGAATGCTATC
321 GAAACGTGAAGCAAAAGCCATC
* * * * * * * *
18957031 CATTGACAAAAAAAGTCCATTTATTGTCACTCATTCTTTCGAGAGCCTTATAACT-TGCTTTAAA
1 CATTGACATAAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCT-CTTTAAG
* * * * * *
18957095 T-GATTTTATAACTTTATAAATCATTTTGAATTGAGTTTTTTTATAATTTTTGGCTAAAACAGAT
65 TGGA-TTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGAT
* * * * *
18957159 CATAATTTGATGTTT-CTATCGAGAGACGAGAAGCAAAAGCCATCTATTGACAAAAAAAACTCCA
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* * *
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* * * * *
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255 ATGATTTTAAATTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTG
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320 A-GAAACGTGAAGCAAAAGCCATC
* * * * *
18957375 CATTGGCATAAAAAAGTCCAGTTATAGTTACTCATACCTTCGAAAGCCTTGTTACTCTCTTTAGG
1 CATTGACAT-AAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCTCTTTAAG
* * *
18957440 TGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTG-A-TTTTTTTT-ATTTTTTGTCAAAATAGATC
65 TGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATC
* ** * * * * *
18957502 ATAATTTGCTACTTGCATCGGGAAACGTGAAGCGAAAGCCATCTATTAACAAGAAAAGTCCACTT
130 ATAATTTGATGTTTGCATC-AGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTT
* * * * * *
18957567 ATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTGGTTAGTTGTTTTAAGTGGATTTATAACTTTTTAAATGA
194 ATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATGA
* * * * * * *
18957632 TTTTAAACTAAATTATTTTACAATTTTT-GTTGAAACAGATTAT-ATTT-ATTGTTT-CAATCAG
259 TTTTAAATTGAATTTTTTTAC-ATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGA-TGTTTGCATTGA-
* *
18957693 GAAACGTGAACCGAAAGCCATC
321 GAAACGTGAAGCAAAAGCCATC
* * * * * * *
18957715 AATTGGCA-AGAAAAGTCCATTTATCGTCAGTTA-ACCTTCGAAAACCTTGTTACT-TACTTTAA
1 CATTGACATA-AAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCT-CTTTAA
* * * * ** * * * *
18957777 GTGGTTTTATAACTTCATATATAATTTTTTATTTAATTTTTTTTACATTTTTAGTTAAAACATAT
64 GTGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGAT
* * * * * *
18957842 CATAATTT-ATATTTGCATCGAGAAACGTGATGCGAAAGCAAACCATTGACAAGAAATGTCCATT
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* * * *
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* *** * *
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258 ATTTTAAATTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAA-ACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGA-
* *
18958034 GAAACATGAGGCAAAA-CCTATC
321 GAAACGTGAAGCAAAAGCC-ATC
* ** * * * * * *
18958056 CATTGACAAAAAAAGTCCATTTATTTTCACTCATTCTTTCGAGAGCCTTATAACTCACTTTAAGT
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* * * * *
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* * *
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129 CATAATTTGATGTTTGCATCAGAA-ACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATT
* * * *
18958250 TATAGTCACTTATTCCTTCAAAAGCCTTGTTACTCACTTTAAATGGATTTATAACTTT-TCAAAT
193 TATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTAT-AAAT
** * *
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257 GATTTTAAATTGAATTTTTTTACA-TTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGA
* *
18958378 GGAAATGTGAAGCAAGAGCCATC
321 -GAAACGTGAAGCAAAAGCCATC
* * * * * * * *
18958401 CATGGACATGAAAAGTCTAGTTATAGTCACTCACGCCTTTGATAGGCTTGTTACTCTCTTTAAGT
1 CATTGACATAAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCTCTTTAAGT
* *
18958466 GGATGTATAACTTTATAAATGATTTTAAA-TGGATTTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCA
66 GGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCA
* * * * * * *
18958530 TAATGTGTTGTTTGCATAGAGAAACGTGAAACAAACGCCATCCATCGATAAGAAAAGTCCATTTA
131 TAATTTGATGTTTGCAT-CAGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTA
* * * * * *
18958595 TACTCACTCATGCCTTCTAAAA-CCTTGTTACTTGCATCAAATGGTTTTATAA-TCTTATAAATG
195 TAGTCACTCATGCCTTC-AAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACT-TTATAAATG
* ** * * * * * ** *
18958658 ATTTTAAATCGAAACTCTATACATATATGGTTAAAACATATCATAATTTGATGTTTGCATCAAAA
258 ATTTTAAATTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGAGA
* *
18958723 AATGTGATGCAAAAGCCATC
323 AACGTGAAGCAAAAGCCATC
*
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1 CATTGACATAAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTT
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Statistics
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GGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCA
TAATTTGATGTTTGCATCAGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTAT
AGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATGATT
TTAAATTGAATTTTTTTACATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGAGAAAC
GTGAAGCAAAAGCCATC
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Alignment explanation
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18954515 TAAAACCTTG
* *
18954525 TTACTCGCATTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTATTTTACATTTTCA
1 TTACTCGCATTAAGTGGATTTATAACTTTATAAATAATTTTAAATTGAATAATTTTACATTTTCA
* ** *
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131 GAAAGATTCATTTTGTGTCACTCAAT
* * * *
18954681 TTACTCGCTTTAAGT-GATTTTATAACTTTATAAATAATTTTGAATTGAA-AATTTTTCATTTTT
1 TTACTCGCATTAAGTGGA-TTTATAACTTTATAAATAATTTTAAATTGAATAATTTTACATTTTC
* * *
18954744 TGTTAAAACAGA-CTATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAACATGA-AGCAAAAGCCATCTATTGA
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18954807 CAAGAAA
128 CAAGAAA
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GTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGAATCAGGAAACATGAGACAAAAGCCATCCATTGACAA
GAAAGATTCATTTTGTGTCACTCAAT
Found at i:18956769 original size:18 final size:18
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Indices: 18956746--18956785 Score: 55
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18956736 CTAGTTACTC
18956746 ACTT-TAAATGATTTTATA
1 ACTTATAAATGATTTTA-A
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1 ACT
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Statistics
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ACTTATAAATGATTTTAA
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Alignment explanation
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18962966 GGGCTTGACA
* * * *
18962976 TTGTTACACTCTTTAAGTGGATTTATAA-CTTTATAAATGATTTTGAATTGAATTTGTTTTTCA-
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* * * * *
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* * * * ** *
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* * * * * * *
18963167 GATTTATAACTTTATTAACT--CTTT-AACTGAATTATTTTACATTTTTGGTTAAAACATATCAG
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* * * * * * ** *
18963229 AATTTGATGTTTGAAT-TAGGAAAGGTGAGGCGAAAGCTATTAATTGACAAGAAAAGTTCATTTA
253 AATTTGATGTTTGCATCGA-GAAAGATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTA
* * ** *
18963293 TTGTCAGTCATTTCTTTGAAAGCC
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* * * * * * *
18963317 TTATAACT-TGCTTTAAGTGGTTTTATAA-CTTTGTAAATGGTTTTGAATTGAATTTTTTTATTA
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** * * * * ** **
18963380 TTTTTGCCTAAAACAAGTCATAATTTGATGTTTCCATTGGGAGATGTGAAGCAAAATACATTTAT
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* * * *
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* * *
18963510 TTTATAACTTTTTAAATGATTTTAAATTGATTTTTTTACATTTTTGGTGAAAACATATCATAATT
193 TTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGATTTTTTT-CATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATT
* * * *
18963575 TGGTGTTTGCATCGAGAAAGATGAAGCAAAAGCCATCTATTGACATA-AAATGTCCAGTTATAGT
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* * *
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321 CACTCATGCCTTCGAAAGCC
* * * * *
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1 TTGTTACTCTCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATTGAATT-TTTTTTCATT
* * * *
18963724 TTTGGTTAAAACATA-TCATAATTTGTTGTTTGCATCGAGAAACATGAAGCGAAAGCCATCCATT
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* ** * * * * * *
18963788 GATAAGAATTGTCCATTTATAGTCACTAAGGCCTTAGAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAATGATT
129 GACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCACTTTAAGTGGTT
* * * * *
18963853 TTATAACTTTATAAATGATTTTTGATTTAATTTTTTTTACATTTTTAGTTAAAATAGATCATAAT
194 TTATAACTTTATAAATGA-TTTTAAATTGA-TTTTTTT-CATTTTTGGTTAAAACAGATCATAAT
* * * * * *
18963918 TT-TTATTTGTATC-AGGAAATG-TGATGCGAAAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATA
256 TTGATGTTTGCATCGA-GAAA-GATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATA
* *
18963980 GTCACTTATGCCTTTGAAAGCC
319 GTCACTCATGCCTTCGAAAGCC
* * * * * * * * *
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* * * * ** *
18964066 TTTGGTTAAAACATA-TCATAATTTGATATTTGAATTGGGAAACGTGAGGTGAAAGCTATCCATT
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* *
18964130 GACAAGAAAAGTCCATTTATCGTCACTCAAT-CCTTTGAGAA-CCTTGTTACTCACTTTAAGTGG
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** ** * * *
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192 TTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTG-ATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAAT
* * * * * *
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256 TTGATGTTTGCATCGAGAAAGATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGT
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* ** *
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** * * * * * *
18964405 TTTTGGTGCAAA-ATG-GAAAATTTGTTGTTTGCA-TGAAGAAACATGCAGCAAAAGCCATCC-T
64 TTTTGGTTAAAACAAGTCATAATTTGATGTTTGCATTG-AGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCAT
* * ** * * *
18964466 GTAACAAGAAAAGTCTA-TTATAGTCACTCATGTGTTCGAAAGCCTTATTACTCGCTTGAAGTGG
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* * * * *
18964530 TTTTATAACTTTATAAATGGTTATAAATTGATTTTTTTATCCTTTTTGATTAAAACAAATCATAA
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** * * ** *
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*
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318 AGTCACTCATGCCT-TCGAAAGCC
* * * * * **
18964681 TTGTTACTCGCTTTAAGTAGATTTATAA-CTTTTTAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTAAATT
1 TTGTTACTCTCTTTAAATGGTTTTATAATC-TTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATT
* * * * ** *
18964745 TCTGATTAAAACAAATCATAATTTGATGTTTAG-ATTG-GAAAACGTGATGTGAAAGCCATCCAC
65 TTTGGTTAAAACAAGTCATAATTTGATGTTT-GCATTGAG-AAACGTGAAGCAAAAGCCATCCAT
* ** * * ** * * *
18964808 TAACTAA-AAAAGTTAATTTATTA-TCTCTCATGCTTTCGGGAGGCTTATTACTCTCTTTAAGTG
128 TGAC-AAGAAAAGTCCATTTA-TAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCACTTTAAGTG
*
18964871 GTTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTATCATTTTTGGTTAAAAACCATATC
191 GTTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTG-A-TTTTTT-TCATTTTTGGTT-AAAA-CAGATC
* * * * * *
18964936 ATAATTTGACGTTTGCATCAAGAGATATGAAGCAAAAGCCATCCATTCACAAGAAAAGTCTATTT
251 ATAATTTGATGTTTGCATCGAGAAAGATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTT
* *
18965001 ATTGTCACTCATGCCTTCGAGAGCC
316 ATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCC
* * * *
18965026 TTGTTACTCTCTTTAAGTGGTTTTATAATTTTATAAATGATTTTAAATT-AAATTTTTATCA-TT
1 TTGTTACTCTCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATTT
* * * * *
18965089 TTAGTTAAAAC-AGATCATAATTTGATGTTTGCA-TCAG-GATGTGAAGCGAAAGCCATCCATAT
66 TTGGTTAAAACAAG-TCATAATTTGATGTTTGCATTGAGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCAT-T
* * * * * ** *
18965151 G-CAAGAAAAGTCCATTTATAATCACTCATACCTTTGAAAGCCTAGTTATTTGCTTTAAGTGGAT
129 GACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCACTTTAAGTGGTT
* * * ** *
18965215 TTAAAACTTTATAAATGATTTTTAATTGAATTTTTTTACATCTTTCATTAAAACAGTTCATAATT
194 TTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTG-ATTTTTTT-CATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATT
** **
18965280 TGATGTTTGCATCG-GAAACG-TGAAGTGAAAGCCATATATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGT
257 TGATGTTTGCATCGAGAAA-GATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGT
* * **
18965343 CACTTATGACTTCGAAAGTG
321 CACTCATGCCTTCGAAAGCC
* * * * * *
18965363 TAGTTACTCACTTTAAATTGTTTTATAATCTTACAATTGATTTTAAATTGAATTTTTTTTTATTT
1 TTGTTACTCTCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATTT
* * ** * * ** *
18965428 CTT-ATTAAAAC-AGATCATAATTGGATGTTTGCATCAAGAAACATCAAGCGCAAGCAATCCATT
66 -TTGGTTAAAACAAG-TCATAATTTGATGTTTGCATTGAGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATT
* * * *
18965491 GACAAG-AAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCTTTGTTACT-AGCTTTAAATTGT
129 GACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCA-CTTTAAGTGGT
** * * * *
18965554 TTTATAA-TCTTATAAATGATTTTAAATCAAAATTGTTTTCATATTTAGTTAAAAATAGATCATA
193 TTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAAT--TGATTTTTTTCATTTTTGGTT-AAAACAGATCATA
* * * * *
18965618 ATTT-ATTGTTTGCATTGGGAAACATGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATCTAT
254 ATTTGA-TGTTTGCATCGAGAAAGATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTAT
**
18965682 AGAT-ACTCATGCC-TCTGAAAGTG
318 AG-TCACTCATGCCTTC-GAAAGCC
* * * * * * * *
18965705 ATGTTACTCGCTTTAGATGGTTTAAAAATCTCATAAATGGTTTTGAATTGATATTTTTTTTCATT
1 TTGTTACTCTCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATTGA-ATTTTTTTTCATT
* * * * * * * * * ** *
18965770 TTAGTTTCAAACAAATTATAATTTGCTGTTTGCATAGGGAAACATGAAGTGAAAGCCATCCGTTG
65 TTTGGTTAAAACAAGTCATAATTTGATGTTTGCATTGAGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTG
* * * * *
18965835 ACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGATAGGCTTGTTACTCTCTTGAAGTAGTTT
130 ACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCACTTTAAGTGGTTT
* * * *
18965900 TATAACATTATAAATGATTGTAAATTGAATTTGTTTTCATTTTTAGTTAAAATAGATCATAATTT
195 TATAACTTTATAAATGATTTTAAATTG-ATTT-TTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTT
* * * * ** * *
18965965 GTTGTTTGGAT-TAGGAAACATGAAGTGAAAGCTAT-CATTGACAAGAAAAGTCCATCTATAGTC
258 GATGTTTGCATCGA-GAAAGATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTC
* *
18966028 ACTCATTCC-TCTGAAAGCA
322 ACTCATGCCTTC-GAAAGCC
* * * *
18966047 TTGTTACTCACTTTAAAGGGTTTTAAAAT-TTCATAAATGATTTCAAATTGAATTTTTTTTCATT
1 TTGTTACTCTCTTTAAATGGTTTTATAATCTT-ATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATT
* * * * * * * * * *
18966111 TTAGGTTCAAACAGGTCATAATTTGTTGTTTGCCTTGGGAAACATGAAGCGAAACCCATCCATTT
65 TTTGGTTAAAACAAGTCATAATTTGATGTTTGCATTGAGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTG
* * * ***
18966176 AGAATG-AAAGTCCATTTATAGTCACTCATACCTTCGACAAG-CTTGTCACTCGA-TTTAACCAG
130 ACAA-GAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGA-AAGCCTTGTTACTC-ACTTTAAGTGG
* * ** * *
18966238 TTTTATAAC-TTATAAATGATTTTAAATTATATTATTTTTTATTTTTTATCAAAATAGATCATAA
192 TTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATT-GATT-TTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAA
* * * * *
18966302 TTTAATGTGTT-CAT-TAGAAA-ACGTGAAGCAAAAACTATCCATTGACAAG-AAACTCCATTTA
255 TTTGATGT-TTGCATCGAGAAAGA--TGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTA
* *
18966363 TAGTCACTCATACCTTCGAAAGCG
317 TAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCC
* * * * * *
18966387 TAGTTACT-TGCTTTAAATGATTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAGTTGAA-TTGTTTTCGTA
1 TTGTTACTCT-CTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATT
* ** * * * * * *
18966450 TTTGGCT-AAATTAGATAAGAATTTGTTCTTTGCATT-AAAAAGCATGAAATGC--AAGCCATCC
65 TTTGGTTAAAACAAG-TCATAATTTGATGTTTGCATTGAGAAA-CGTG-AA-GCAAAAGCCATCC
* * * * * * * * **
18966511 ATTAACAATACAAGTCCATCTATAGT-ATCTAATGGCTTCAAAAGCGTTGTTACTTGCTTTAAGT
126 ATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCA-CTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCACTTTAAGT
* * * *
18966575 AGTTTTATAACTTTGTAAATTATTTTAAATTGAATTTGTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATAAT
190 GGTTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTG-ATTT-TTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCAT
* * * * * * * * *
18966640 AATTTGTTTTTTGCATTGAAAAACATGAAGCAAAAACCATCAATTGACAAAAAAAGTGCATTTAT
253 AATTTGATGTTTGCATCGAGAAAGATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTAT
* * *
18966705 AGTGACTTATGCCTTCAAAAGCC
318 AGTCACTCATGCCTTCGAAAGCC
* * * *
18966728 TAGTTA-TTTGCTTTAAATGGTTTTAAAATCTTATAAATGATTTTAATATTGAA--TTTTCTCAT
1 TTGTTACTCT-CTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAA-ATTGAATTTTTTTTCAT
* * * * ** *
18966790 TTTTGGTTAAAACAAATCTTAATTAGAT-TTGTCACATCAAGAAAAGTGAAGCAAAAGCCATCCA
64 TTTTGGTTAAAACAAGTCATAATTTGATGTT-T-GCATTGAGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCA
* * * * * * * *
18966854 ATGACAAGGAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAAACCTAGCTACTCATTTTAAATG
127 TTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCG-AAAGCCTTGTTACTCACTTTAAGTG
* * * * *
18966919 ATTTTATTA-TCTTATAAATGAGTTTAAATTGAATTTTTTTGCATTTCTGGTTAAAACAAATCAT
191 GTTTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAATTG-ATTTTTTT-CATTTTTGGTTAAAACAGATCAT
* * * *
18966983 GATTTGTTGTTTGCATC-AGAAACATGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTAT
253 AATTTGATGTTTGCATCGAGAAAGATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTAT
* * *
18967047 AGTCACTTATGACTTCAAAAGCC
318 AGTCACTCATGCCTTCGAAAGCC
* ** ** * * * *
18967070 TAGTTACTCAGTTTAAATTATTTTATAATCTAATAATTGATTTTAAATTGAAATTGTTTTCATTT
1 TTGTTACTCTCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATTT
* * * * * * *
18967135 CTAGTTAAAACAGGTCAAAATTGGATGTTTGCATTGGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGA
66 TTGGTTAAAACAAGTCATAATTTGATGTTTGCATTGAGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGA
* * * *
18967200 TAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTC-AGTAGGCTTGTTACTCACTTTAAGTGATTT
131 CAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGA-AAGCCTTGTTACTCACTTTAAGTGGTTT
* * * * *
18967264 TATAAATTTATAAATGATTGTAAATTGATTTTTTTATGTATTTTTAGTTAAAATAGATCATAATT
195 TATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGA-TTTTTT-T-CATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATT
* * * * * ** * *
18967329 TGTTGTTTG-TTTGGGAGACG-TGAAGTGAAAGCCATTCATTGACAAGAAAAGTCCATCTATA-T
257 TGATGTTTGCATCGAGA-AAGATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGT
* * *
18967391 ACACTCATGCCTCCAAAAGCA
321 -CACTCATGCCTTCGAAAGCC
* * * * *
18967412 TTATTA-TACTCTTTAGATGGTTTTAAAATCTCATAAATGGTTTTAAATTGAATTTTTTTTCATT
1 TTGTTACT-CTCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATT
* * * * * *
18967476 TTAGGTTCAAACATA-TCATAATTTG-TCATTTGCCTTG-GAAAAAGTGAAGCTAAAGCCATCCA
65 TTTGGTTAAAACA-AGTCATAATTTGAT-GTTTGCATTGAG-AAACGTGAAGCAAAAGCCATCCA
* * * * * * * *
18967538 TTAAGAAGAATAGTCCAGTTATAGTCACTCATACCTTCGATAGGCTTGTTACTTGA-TTTAAGTG
127 TTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTAC-TCACTTTAAGTG
* * *
18967602 GTTTTATAACTTTATAAATGATTTTTAATTAAACTTTTTTCCATTTTTGGTT--AA-A-A-C---
191 GTTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATT-GA-TTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATA
* ** ** * * *
18967659 A--TGATGTTTCCATTAAGAAACG-TGAAGGGAAATCTATCCATTGACAAG-AAAGTTCATTTAT
254 ATTTGATGTTTGCATCGAGAAA-GATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTAT
* * **
18967720 AGTCGCTCATGCCTTCAAAAGTG
318 AGTCACTCATGCCTTCGAAAGCC
* * * * * * * *
18967743 TAGGTACTCGCTTTAAATAGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTCAGTTGCA-TTGTTTTCATTT
1 TTGTTACTCTCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATTT
* * * * * * * * *
18967807 ATGGCTAAATCATA-TCAGAATTTGGTGTTTGCATCGAGAAACATGAAGCACAAGCCATCCATTC
66 TTGGTTAAAACA-AGTCATAATTTGATGTTTGCATTGAGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTG
* * * * * * * *
18967871 ACAAAAAAAGTCCATCTATAATCTCTAATGCCTTCGAAAGCATTGCTACTTACTTTAAGTGGTTT
130 ACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCACTTTAAGTGGTTT
* * * ** *
18967936 TATAACTTTAGAAATGATTTTAAATTAAATTAGTTTTTCATTTTTTGTTAAAACTTATAATAATT
195 TATAACTTTATAAATGATTTTAAATT-GATT--TTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATT
* * * * * * * * *
18968001 AGTTATTTGCCTC-AGTAAACATGAAGCAAAAGCCATTCATTGACATGTAATGTCCATTTATAGT
257 TGATGTTTGCATCGAG-AAAGATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGT
* *
18968065 GACTTATGCCTTCGAAAGCC
321 CACTCATGCCTTCGAAAGCC
* * * * * * * *
18968085 TAGTCACT-TGCTTCAAATGGTTTTAAAATCTTATAAATGATTTTTATACTGAATTTTTCTT-GT
1 TTGTTACTCT-CTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGA-TTTTAAATTGAATTTTTTTTCAT
* * * * * **
18968148 TTTTGCTTAAAAC-AGATCGTAATTT--TATTTGTCACATCAGGAAACGTGAAGTGAAAGCCATC
64 TTTTGGTTAAAACAAG-TCATAATTTGATGTTTG-CA-TTGA-GAAACGTGAAGCAAAAGCCATC
* * * * * * *
18968210 CAATGACAAGGAAAGCCCATTTATAGTCACTTATGCCTTTGAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAAT
125 CATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCACTTTAAGT
* ** *
18968275 GGTTTTATAACCTTATAAATGAGCTTAAATTGAATTTTTTTTCTTCATTTCTT-GTTAAAACAAA
190 GGTTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTG-A---TTTTT-TTCATTT-TTGGTTAAAACAGA
* * * *
18968339 TCATGATTTGATGTTTGCA-CCATAAACG-TGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCTA
249 TCATAATTTGATGTTTGCATCGAGAAA-GATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCA
* * *
18968402 TTTATAGTCACTTATGACTTCGAGAGCC
313 TTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCC
* * * * ** * *
18968430 TAG-T--T-TCTTTAAGTTGTTTTATAATCTTATAATTGATTTTAAATCAAAATTGTTTTCATTT
1 TTGTTACTCTCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATTT
* * * *
18968491 TTGGTTAAAATAGGTTATAATTTGATGTTTGCATTGAGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGA
66 TTGGTTAAAACAAGTCATAATTTGATGTTTGCATTGAGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGA
* * *
18968556 CAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGACAGGCTTGTTACTCGCTTTAAGTGGTTTT
131 CAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCACTTTAAGTGGTTTT
* * * *
18968621 ATAACTTTATAAATGATTGTAAATTGATTTTTTTTATTTTTAGTTAAAATAGATCATAATTT-AT
196 ATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGA-
* * * * *
18968685 TGTTTGCATTGAGAAACATGAAGCAAAAGCTATCCATTGACAA-ATAAAGTCCATCTATAATCAC
260 TGTTTGCATCGAGAAAGATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGA-AAAGTCCATTTATAGTCAC
* * *
18968749 TCATTCCTCCGAAAGCA
324 TCATGCCTTCGAAAGCC
* * * * * *
18968766 TTGTTACTCACGTTAAATTGTTTTAAAATCTCATAAATGATTTGAAATTG-ATTTTTTTTCATTT
1 TTGTTACTCTCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATTT
** * * * * *
18968830 TAAGTTCAAACATA-TCATAATTTGTTGTTTGCCTTG-GAAAACATGAAGCGAAAGCCATCCATT
66 TTGGTTAAAACA-AGTCATAATTTGATGTTTGCATTGAG-AAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATT
** * * * *
18968893 GGTAATAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCG--A--C-AG--A---A----AAGTCG--
129 GACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCACTTTAAGTGGTT
* * *
18968942 ---T---TTTATAAATGATTTTAAA-T--TTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACAGATAATAATTTC
194 TTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTG
* * * * *
18968998 ATATTTCCATTG-GCAAACG-TGAAGCAAAAGCTATCCATTGACAAG-AAAGTCCATTTACAGTC
259 ATGTTTGCATCGAG-AAA-GATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTC
** * *
18969060 ACTCATGCCTTTAAAAACG
322 ACTCATGCCTTCGAAAGCC
* * * *
18969079 TTGTTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAGTTGAA-CTATTTTCATTT
1 TTGTTACTCTCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATTT
* * * * * *
18969143 TTGGGTAAAAC-AGATTAGAATTT-CTCATTTGCATTGAGAAACGTGAAGCGTAAAA--CATCAA
66 TTGGTTAAAACAAG-TCATAATTTGAT-GTTTGCATTGAGAAACGTGAAGC--AAAAGCCATCCA
* * * * ** *
18969204 TTAACAAGAAAAGTCCATCTATAGTCATTAATGCCTTCGAAAGCGATGTTACTCACTTTAAATGG
127 TTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCACTTTAAGTGG
** *
18969269 TTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTCATTCATGGTTAAAACATATCATAAT
192 TTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTG-ATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAAT
* * * *
18969334 TTGTTGTTTGTAT-TAGAAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAG
256 TTGATGTTTGCATCGAG-AAAGATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAG
* * * *
18969398 TGACTTATGCCTTTGAAAGCG
320 TCACTCATGCCTTCGAAAGCC
* * * * * * *
18969419 TAGTTACACACTTTAAATGGTTTTAAAATCTTATAAATGATTTTTAAGTTGAATTTTTCTT-GTT
1 TTGTTACTCTCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGA-TTTTAAATTGAATTTTTTTTCATT
* * * * * * * * * *
18969483 TTTGGTTAAAA-TAGATCGTAATTTGATTTTTCGCATCGGGAAACATGAAGCAGAAGACATCAAA
65 TTTGGTTAAAACAAG-TCATAATTTGATGTTT-GCATTGAGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCAT
* * **
18969547 TGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCATACTTACTCACTTTAAAG-GG
128 TGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCACTTT-AAGTGG
* ** * * * * *
18969611 TTTTATAA-TCTGATAAATGATTTTAAATCAAAACTATCTTCATTTTTTGTTAGAAC-GAATCAT
192 TTTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAAT--TGATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAG-ATCAT
* * * * * **
18969674 AATTGGATATTTGCATCAAGAAACATGAAGCCAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTTTATTTAT
253 AATTTGATGTTTGCATCGAGAAAGATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTAT
*
18969739 AGTCACTCATACCTTCGAAAGCC
318 AGTCACTCATGCCTTCGAAAGCC
* * * *
18969762 TAGTTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTTTTAAATGAGTTTAAATTGAA-TTTTTTTCATTT
1 TTGTTACTCTCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATTT
* * * * * * *
18969826 CTAGTTAAAAC-TGATCATAGTTTGATGTTTGCA-TCAGAAACGTGAAGCGAAAGCCATTCATTG
66 TTGGTTAAAACAAG-TCATAATTTGATGTTTGCATTGAGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTG
* * * * * * ** * * *
18969889 AGAAGAAATGGCCA-TT-T-CTCACTTATGACTTTAAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATTGTTT
130 ACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCACTTTAAGTGGTTT
* * ** * * * * * *
18969951 TA-AAATCTTATAATTGATTTTAAATCAAAATTGTTTTCATGTCTAGTTAAAATAGATTATAATT
195 TATAACT-TTATAAATGATTTTAAAT--TGATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATT
* * * * *
18970015 GGATGTTTGCATCGAGAAACG-TGAAACAAAAGCCATTCATTGACAAGAAAAATGCATTTATAGT
257 TGATGTTTGCATCGAGAAA-GATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGT
* * *
18970079 TACTTATGCCTTTGAAAGCC
321 CACTCATGCCTTCGAAAGCC
* * *
18970099 TAGTTACTCTCTTTAAATGGTTTTATAATTTTATAAATGATTTTAAATTGATTTTGTTTTTCATT
1 TTGTTACTCTCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATTGAATTT-TTTTTCATT
* * * * * *
18970164 CTTGGTTAAAAC-AGATCCTAATTTGATGTTTGCATTGAGAAATGTGAAGCGAAAGTCTTCCATT
65 TTTGGTTAAAACAAG-TCATAATTTGATGTTTGCATTGAGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATT
* * * * * * *
18970228 GAGAAGAAAAGTCCATTTATATTCACTGATGCCTTCGAAAGCCTAGTTACT-AGCTTAAAATGAT
129 GACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCA-CTTTAAGTGGT
** * * * *
18970292 TTTGCAA-TCTTATAAATGAGTTCAATAGAATT-TTTTTTTTCATTTTTGCTTAAAACATATCAT
193 TTTATAACT-TTATAAATGA-TT--TTA-AATTGATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCAT
* * ** * *
18970355 AATTTGATTTTTGCATC-AGGAAACATGAAGCAAAAGATATCCATTGACAGGAGAAGTCCATTTA
253 AATTTGATGTTTGCATCGA-GAAAGATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTA
* *
18970419 TAGTCACTTATACCTTCGAAAGCC
317 TAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCC
* ** * * * *
18970443 TAGTTACTAGCTTAAAATGATTTTATAATCTTATAAATGATTTTAGATTGAATGTTTTTTTCATC
1 TTGTTACTCTCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATTGAAT-TTTTTTTCATT
* * * * * *
18970508 TTAGGTTCAAA-TAGATCATAATTTGATGTTTACATTGGGAAACGCGAAGCAAAAGCCATCCATT
65 TTTGGTTAAAACAAG-TCATAATTTGATGTTTGCATTGAGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATT
* * **
18970572 GACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTTCTTACTTGCTTTAAGTGGTT
129 GACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCACTTTAAGTGGTT
* * * * * * * * *
18970637 TTCTAGCTTTATAAATTATTTCAAATTGAATTTTTTTCATTTGTAGCTAAAATAGATTATAATTT
194 TTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTG-ATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTT
* * * * * * *
18970702 -ACTGTTTGCGTTGGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATCTCTAGCC
258 GA-TGTTTGCATCGAGAAAGATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTC
* **
18970766 ACTCATTCCTTCGAAAGTG
322 ACTCATGCCTTCGAAAGCC
18970785 TTGTTACTCTCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATTGAATTCTTTTTTCATT
1 TTGTTACTCTCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATTGAATT-TTTTTTCATT
* * * * * * * * * ** *
18970850 TTAGGTTCAGA-TAGATTATAATTTGCTCTTTGCATCGAGAAACATGAAGTGAAAGGCATCCATT
65 TTTGGTTAAAACAAG-TCATAATTTGATGTTTGCATTGAGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATT
* * * * * * ** **
18970914 GATAAGAAAAGTCCATCTATAGTCACTCATGTCTTTGACAGGCTTGTTACTTGCTTTAAGTATTT
129 GACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCACTTTAAGTGGTT
* *
18970979 TTATGAC-TTATAAATGATTTTAAATTGAATTATTTTTCATTTTTGGTTAAAACAAATCATAATT
194 TTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTG-ATT-TTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATT
* * * * * * * * *
18971043 TGATGTTTGTATCAAGAAATATGAAGCGAAAGCTATCCGTTAACAAG-AAACTCCATTTACAGTC
257 TGATGTTTGCATCGAGAAAGATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTC
* ** *
18971107 ACTCAAGTATTTGAAAG-C
322 ACTCATGCCTTCGAAAGCC
* * *
18971125 TTAGTTACTCGCTTTAAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAGTTAAATTTTTTTGTCA
1 TT-GTTACTCTCTTT-AAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTT-TCA
* * * * *
18971190 TTTTTGGTTAACACATAGT-AGAATTT-ATTGTTTACATTAAGAAACATGAAGCAAAAGCCATCC
63 TTTTTGGTTAAAACA-AGTCATAATTTGA-TGTTTGCATTGAGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCC
* * * * * *
18971253 ATTAACAAGAAAAGTCCATCTATAGTCACTAATACCTTCAAAAGCGTTGTTACTCACTTTAAGTG
126 ATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCACTTTAAGTG
* * * * *
18971318 GTTTTGTAACTTTATAAATGATTTTGAATTGAATTTGTTTTTAGTTTTGGCTAAAACAGATCATA
191 GTTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTG-ATTT-TTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATA
* * * * *
18971383 A-TT-AT-TTACTGCAT-TAGGAAATG-TGAAGGAAAAGTCATCCGTTGACAAGAAAAGTCTATT
254 ATTTGATGTT--TGCATCGA-GAAA-GATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATT
* * * * * *
18971443 TATAATGACTTATTCCTTTGCAAGCC
315 TATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCC
* * * * * *
18971469 TAGTTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGAGTTTAAATCGATTTTTTTTTCATGT
1 TTGTTACTCTCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATTT
* * * * *
18971534 TTGGCTAAAA-TAGATCCTAATTTGATGTTTGCATCGAGAAATGTGAAGCAAAAGCCATCCATTG
66 TTGGTTAAAACAAG-TCATAATTTGATGTTTGCATTGAGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTG
* * * *
18971598 AAAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCA-ACCTTTGAAAGCCTTGTTACTCACTTTAAATGGTTT
130 ACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCACTTTAAGTGGTTT
* * ** * * *
18971662 TATAA-TCTGACAAATGATTTTAAATCAAAATTTTTTCCATTTTTGGTTAGAACAGATTATAATT
195 TATAACT-TTATAAATGATTTTAAAT--TGATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATT
* * * ** * *
18971726 GGATGTTTGCATTGAGAGACG-TGAAGTGAAAGTCATCCATTGACAAGAAAAGAT-CA-TTGTAG
257 TGATGTTTGCATCGAGA-AAGATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAG-TCCATTTATAG
* *
18971788 TTACTCATGCCTTCAAAAGCC
320 TCACTCATGCCTTCGAAAGCC
* * * *
18971809 TAT-TTACTCGCTTAAAATGGTTTTATGATCTTATAAATGATTTTAAAATTGAA-TTTTTTTGAT
1 T-TGTTACTCTCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTT-AAATTGAATTTTTTTTCAT
* * *
18971872 TTTTGGTTAAAA-TAGATCATAAATTGATGTTTGCATTG-GTAAA-GATGAAGCGAAAGCCATCC
64 TTTTGGTTAAAACAAG-TCATAATTTGATGTTTGCATTGAG-AAACG-TGAAGCAAAAGCCATCC
* * * * * * *
18971934 ATTGACAAGAAAAATCCAATTATATTGACTCATGCCTTCAAAAGCCCTATTACTCACTTTAAGTG
126 ATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCACTTTAAGTG
* * *
18971999 GTTTTATAACTTTATAAATTATTTTAAATTGAATTTTTTTCATTTTTGGTTAGAATAGATCATAA
191 GTTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTG-ATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAA
* * * * *
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255 TTTGATGTTTGCATCGAGAAAGA-TGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATA
* * **
18972128 GTCACTTATACCTTTAAAAGCC
319 GTCACTCATGCCTTCGAAAGCC
* *** * * *
18972150 TAGTCGTTCACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAAATT-AAATTTTTCTCATT
1 TTGTTACTCTCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTT-AAATTGAATTTTTTTTCATT
* * * * * **
18972214 TTTGATTAAAACATA-TCATAATTTAATGTTTGCATCGAGAAACATGAAGCGAAAGCCATCTGTT
65 TTTGGTTAAAACA-AGTCATAATTTGATGTTTGCATTGAGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATT
* * * * * * *
18972278 GACAAGAAAAGTTCATTTGTGGTCACTCATGCCTTCGAAAG-CTTAGTTACACGCTTCAAATGGT
129 GACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTT-GTTACTCACTTTAAGTGGT
* * ** ** * * * * *
18972342 TTTA-CAGTCTTATAAATGATTTTAAATCAAAAAGTTTTTCATTTCTAGATAAAATATATCATAA
193 TTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAAT--TGATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAA
* * * ** * * * *
18972406 TTGGATTTTTGCATCGTGAAACG-TGAAG-TGAAGCCTTTCTATTGACAAGAAAAGCCCATTTGT
255 TTTGATGTTTGCATCGAGAAA-GATGAAGCAAAAGCC-ATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTAT
* * *
18972469 AGTTACTCATACCTTTGAAAGCC
318 AGTCACTCATGCCTTCGAAAGCC
* * * *
18972492 TTGTTACT-TGCTTTAAGTGGTTTTATAA-CTTTATAAATAACTTTAAATTG-ATTTTTTTTCTT
1 TTGTTACTCT-CTTTAAATGGTTTTATAATC-TTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCAT
* * * * *
18972554 TTTTGGTT-AAACTAGATCATAATTTGATGTTTGCA-TCAGTAAACGTAAAGCGAAAGCCATCAA
64 TTTTGGTTAAAACAAG-TCATAATTTGATGTTTGCATTGAG-AAACGTGAAGCAAAAGCCATCCA
* * ** * * * ** *
18972617 TTGACCAGAAAAATCCATTTATAGTTGCTCAT-CTATTCAAAAGCCTAGTTACTTGCTTTAAATG
127 TTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGC-CTTCGAAAGCCTTGTTACTCACTTTAAGTG
* * * * * **
18972681 TTTTTACAA-TCTCATAAATGATTTTTATATTGAATTTTTTCTCATTTTTGGTTAAAACATATTG
191 GTTTTATAACT-TTATAAATGA-TTTTAAATTG-ATTTTTT-TCATTTTTGGTTAAAACAGATCA
* * * * * * * *
18972745 CAATTTGATGTTTGCATTGGGACACG-TGAAACCAAAGCCATTCATTTACAAGAAAAGAT-CATT
252 TAATTTGATGTTTGCATCGAGA-AAGATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAG-TCCATT
* *
18972808 TATAGTCAGTCATCCCTTCGAAA
315 TATAGTCACTCATGCCTTCGAAA
18972831 ATGTAGTCAT
Statistics
Matches: 7615, Mismatches: 1548, Indels: 701
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Matches are distributed among these distances:
311 1 0.00
312 1 0.00
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ATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGAT
GTTTGCATCGAGAAAGATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTC
ATGCCTTCGAAAGCC
Found at i:18964129 original size:171 final size:171
Alignment explanation
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* * * *
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* * ** * *
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* * * *
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** * * * * * * *
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* * * * ** * * **
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* * * ** *
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129 GACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCC
* * ** * * * *
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** * * ** * ** **
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* * *
18963446 GACAAGAAAAGTCCATTTATTGTTACTCATGCCTTTGAAAGCC
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* * *
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1 TTGTTACTCACTTTAAGTGGTTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATTT
* * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * *
18963659 TTGTTACTCTCTTTAAGTTGATTTATAATTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTATGTTTTCATT
1 TTGTTACTCACTTTAAGTGGTTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATT-TTTTTTCATT
* * * *
18963724 TTTGGTTAAAACATATCATAATTTGTTGTTTGCATCGAGAAACATGAAGCGAAAGCCATCCATTG
65 TTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGGGAAACATGAAGCGAAAGCCATCCATTG
* ** * * *
18963789 ATAAGAATTGTCCATTTATAGTCACTAAGGCCTTAGAAAGCC
130 ACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCC
* * * ** *
18963831 TTGTTACTCGCTTTAAATGATTTTATAACTTTATAAATGATTTTTGATTTAATTTTTTTTACATT
1 TTGTTACTCACTTTAAGTGGTTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTT-CATT
* * * * * ** ** * *
18963896 TTTAGTTAAAATAGATCATAATTT-TTATTTGTATCAGGAAATGTGATGCGAAAGCAATCCATTG
65 TTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGGGAAACATGAAGCGAAAGCCATCCATTG
* *
18963960 ACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTTATGCCTTTGAAAGCC
130 ACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCC
* * * * * * *
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* * * * * * *
18964067 TTGGTTAAAACATATCATAATTTGATATTTGAATTGGGAAACGTGAGGTGAAAGCTATCCATTGA
66 TTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGGGAAACATGAAGCGAAAGCCATCCATTGA
* *
18964132 CAAGAAAAGTCCATTTATCGTCACTCAAT-CCTTTGAGAA-CC
131 CAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTC-ATGCCTTCGA-AAGCC
** ** * *
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1 TTGTTACTCACTTTAAGTGGTTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATTT
* * *
18964237 TTGGTTAAAACATATCATAATTTGATGTTTGCATTGGGAAACATGAAGCAAAAGTCATCCATTGA
66 TTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGGGAAACATGAAGCGAAAGCCATCCATTGA
* *
18964302 CAATAAAAGTCCAATTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCC
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* * * *
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1 TTGTTACTCACTTTAAGTGGTTTTATAACTTTATAAATGA-TTTTAAATTGAATTTTTTTTCATT
* ** * * * *
18964406 TTTGGTGCAAAATGGA--A-AATTTGTTGTTTGCA-TGAAGAAACATGCAGCAAAAGCCATCC-T
65 TTTGGT-TAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTG-GGAAACATGAAGCGAAAGCCATCCAT
* * **
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* * * * * *
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1 TTGTTACTCACTTTAAGTGGTTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTT-TCATT
* * * * * * ** **
18964574 TTTGATTAAAACAAATCATAATTTGATGTTTGCTTTAGGAGACGTGAAGTAAAATTCATCCATTG
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* *
18964639 ACAAGAAAACTCCATTTATAGTCACTCATGCCTAT-AAAAGCC
130 ACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCT-TCGAAAGCC
* * * * **
18964681 TTGTTACTCGCTTTAAGTAGATTTATAACTTTTTAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTAAATTT
1 TTGTTACTCACTTTAAGTGGTTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATTT
* * * * * * * * *
18964746 CTGATTAAAACAAATCATAATTTGATGTTTAG-ATTGGAAAACGTGATGTGAAAGCCATCCACTA
66 TTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTT-GCATTGGGAAACATGAAGCGAAAGCCATCCATTG
** * * ** *
18964810 ACTAA-AAAAGTTAATTTATTA-TCTCTCATGCTTTCGGGAGGC
130 AC-AAGAAAAGTCCATTTA-TAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCC
* *
18964852 TTATTACTCTCTTTAAGTGGTTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTATCATT
1 TTGTTACTCACTTTAAGTGGTTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTT-TCATT
* * *** * * *
18964917 TTTGGTTAAAAACCATATCATAATTTGACGTTTGCATCAAGAGATATGAAGCAAAAGCCATCCAT
65 TTTGGTT-AAAA-CAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGGGAAACATGAAGCGAAAGCCATCCAT
* * * *
18964982 TCACAAGAAAAGTCTATTTATTGTCACTCATGCCTTCGAGAGCC
128 TGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCC
* * * *
18965026 TTGTTACTCTCTTTAAGTGGTTTTATAATTTTATAAATGATTTTAAATT-AAATTTTTATCA-TT
1 TTGTTACTCACTTTAAGTGGTTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATTT
* ** **
18965089 TTAGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCAGG--ATGTGAAGCGAAAGCCATCCATATG
66 TTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGGGAAACATGAAGCGAAAGCCATCCAT-TG
* * *
18965152 -CAAGAAAAGTCCATTTATAATCACTCATACCTTTGAAAGCC
130 ACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCC
* * ** * * * * *
18965193 TAGTTATTTGCTTTAAGTGGATTTAAAACTTTATAAATGATTTTTAATTGAATTTTTTTACATCT
1 TTGTTACTCACTTTAAGTGGTTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATTT
** * * * * **
18965258 TTCATTAAAACAGTTCATAATTTGATGTTTGCA-TCGGAAACGTGAAGTGAAAGCCATATATTGA
66 TTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGGGAAACATGAAGCGAAAGCCATCCATTGA
* * **
18965322 CAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTTATGACTTCGAAAGTG
131 CAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCC
* * * * * *
18965363 TAGTTACTCACTTTAAATTGTTTTATAA-TCTTACAATTGATTTTAAATTGAATTTTTTTTTATT
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* * *** * * *
18965427 TCTT-ATTAAAACAGATCATAATTGGATGTTTGCATCAAGAAACATCAAGCGCAAGCAATCCATT
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* *
18965491 GACAAG-AAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCT
129 GACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCC
* * ** * *
18965533 TTGTTACT-AGCTTTAAATTGTTTTATAA-TCTTATAAATGATTTTAAATCAAAATTGTTTTCAT
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* * *
18965596 ATTTAGTTAAAAATAGATCATAATTT-ATTGTTTGCATTGGGAAACATGAAGCGAAAGCCATCCA
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* **
18965660 TTGACAAGAAAAGTCCATCTATAGAT-ACTCATGCC-TCTGAAAGTG
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* * * * * * *
18965705 ATGTTACTCGCTTT-AGATGG-TTTAAAAATCTCATAAATGGTTTTGAATTGATATTTTTTTTCA
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* * * * * * * * *
18965768 TTTTAGTTTCAAACAAATTATAATTTGCTGTTTGCATAGGGAAACATGAAGTGAAAGCCATCCGT
63 TTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGGGAAACATGAAGCGAAAGCCATCCAT
* *
18965833 TGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGATAGGC
128 TGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCC
* * * * * *
18965877 TTGTTACTCTCTTGAAGTAGTTTTATAACATTATAAATGATTGTAAATTGAATTTGTTTTCATTT
1 TTGTTACTCACTTTAAGTGGTTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATTT
* * * * * * *
18965942 TTAGTTAAAATAGATCATAATTTGTTGTTTGGATTAGGAAACATGAAGTGAAAGCTAT-CATTGA
66 TTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGGGAAACATGAAGCGAAAGCCATCCATTGA
* * *
18966006 CAAGAAAAGTCCATCTATAGTCACTCATTCC-TCTGAAAGCA
131 CAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTC-GAAAGCC
* *
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1 TTGTTACTCACTTT-AAGTGGTTTTATAACTTT-ATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCAT
* * * * * *
18966110 TTTAGGTTCAAACAGGTCATAATTTGTTGTTTGCCTTGGGAAACATGAAGCGAAACCCATCCATT
64 TTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGGGAAACATGAAGCGAAAGCCATCCATT
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18966175 TAGAATG-AAAGTCCATTTATAGTCACTCATACCTTCGACAAG-C
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* ***
18966218 TTGTCACTCGA-TTTAACCAGTTTTATAAC-TTATAAATGATTTTAAATT-ATATTATTTTTT-A
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** * * * * * * * * *
18966279 TTTTTTATCAAAATAGATCATAATTTAATGTGTT-CATTAGAAAACGTGAAGCAAAAACTATCCA
63 TTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGT-TTGCATTGGGAAACATGAAGCGAAAGCCATCCA
* * *
18966343 TTGACAAG-AAACTCCATTTATAGTCACTCATACCTTCGAAAGCG
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* ** * * * * * *
18966387 TAGTTACTTGCTTTAAATGATTTTATAA-TCTTATAAATGATTTTAAGTTGAA-TTGTTTTCGTA
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* ** * * * * ** ** *
18966450 TTTGGCTAAATTAGATAAGAATTTGTTCTTTGCATT-AAAAAGCATGAAATGCAAGCCATCCATT
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18966514 AACAATACAAGTCCATCTATAGT-ATCTAATGGCTTCAAAAGCG
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* * * ** * * *
18966622 TTGGTTAAAACAGATAATAATTTGTTTTTTGCATTGAAAAACATGAAGCAAAAACCATCAATTGA
66 TTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGGGAAACATGAAGCGAAAGCCATCCATTGA
* * * * *
18966687 CAAAAAAAGTGCATTTATAGTGACTTATGCCTTCAAAAGCC
131 CAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCC
* * ** * * *
18966728 TAGTTATTTGCTTTAAATGGTTTTA-AAATCTTATAAATGATTTTAATATTGAA--TTTTCTCAT
1 TTGTTACTCACTTTAAGTGGTTTTATAACT-TTATAAATGATTTTAA-ATTGAATTTTTTTTCAT
* * * * *** *
18966790 TTTTGGTTAAAACAAATCTTAATTAGAT-TTGTCACATCAAGAAA-AGTGAAGCAAAAGCCATCC
64 TTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTT-T-GCATTGGGAAACA-TGAAGCGAAAGCCATCC
* * * *
18966853 AATGACAAGGAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAAACC
126 ATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCG-AAAGCC
* * * * * * * *
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1 TTGTTACTCACTTTAAGTGGTTTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATT
* * * * **
18966964 TCTGGTTAAAACAAATCATGATTTGTTGTTTGCA-TCAGAAACATGAAGCGAAAGCCATCCATTG
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* * *
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130 ACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCC
* * * ** * * * *
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1 TTGTTACTCACTTTAAGTGGTTTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATT
* * * * * *
18967134 TCTAGTTAAAACAGGTCAAAATTGGATGTTTGCATTGGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTG
65 TTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGGGAAACATGAAGCGAAAGCCATCCATTG
* * *
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* * * *
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1 TTGTTACTCACTTTAAGTGGTTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTT-T-CAT
* * * * * * * *
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64 TTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGGGAAACATGAAGCGAAAGCCATCCATT
* * * *
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* * * * *
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1 TTGTTACTCACT-TTAAG-TGGTTTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCA
* * * * * * *
18967474 TTTTAGGTTCAAACATATCATAATTTG-TCATTTGCCTT-GGAAAAAGTGAAGCTAAAGCCATCC
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* * * * * * *
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* * * * *
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1 TTGTTAC-TCACTTTAAGTGGTTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATT
* ** * * * *
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* * * **
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* * * * * * * * *
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1 TTGTTACTCACTTTAAGTGGTTTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATT
* * * * * * * *
18967806 TATGGCTAAATCATATCAGAATTTGGTGTTTGCATCGAGAAACATGAAGC-ACAAGCCATCCATT
65 TTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGGGAAACATGAAGCGA-AAGCCATCCATT
* * * * * * *
18967870 CACAAAAAAAGTCCATCTATAATCTCTAATGCCTTCGAAAGCA
129 GACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCC
* * * * *
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1 TTGTTACTCACTTTAAGTGGTTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATT-TTTTTTCATT
* ** * * * * * ** * * *
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65 TTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGGGAAACATGAAGCGAAAGCCATCCATTG
* * * * *
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130 ACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCC
* * ** * * * * * * *
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1 TTGTTACTCACTTTAAGTGGTTTTATAACT-TTATAAATGA-TTTTAAATTGAATTTTTTTTCAT
* * * * ** * *
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* * * * *
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127 TTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCC
* * * **
18968257 TTGTTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAACCTTATAAATGAGCTTAAATTGAATTTTTTTTCTTCA
1 TTGTTACTCACTTTAAGTGGTTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAA--TTTTTT-TTCA
* * **** * *
18968322 TTTCTT-GTTAAAACAAATCATGATTTGATGTTTGCA-CCATAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCA
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* * * *
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127 TTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCC
* * * ** * *
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1 TTGTTACTCACTTTAAGTGGTTTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATT
* * * * *
18968490 TTTGGTTAAAATAGGTTATAATTTGATGTTTGCATTGAGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTG
65 TTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGGGAAACATGAAGCGAAAGCCATCCATTG
* *
18968555 ACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGACAGGC
130 ACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCC
* *
18968597 TTGTTACTCGCTTTAAGTGGTTTTATAACTTTATAAATGATTGTAAATTG-ATTTTTTTT-ATTT
1 TTGTTACTCACTTTAAGTGGTTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATTT
* * * * *
18968660 TTAGTTAAAATAGATCATAATTT-ATTGTTTGCATTGAGAAACATGAAGCAAAAGCTATCCATTG
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* * * * *
18968724 ACAA-ATAAAGTCCATCTATAATCACTCATTCCTCCGAAAGCA
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* * * * * *
18968766 TTGTTACTCACGTTAAATTGTTTTA-AAATCTCATAAATGATTTGAAATTG-ATTTTTTTTCATT
1 TTGTTACTCACTTTAAGTGGTTTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATT
** * * * * *
18968829 TTAAGTTCAAACATATCATAATTTGTTGTTTGCCTTGGAAAACATGAAGCGAAAGCCATCCATTG
65 TTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGGGAAACATGAAGCGAAAGCCATCCATTG
** * *
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130 ACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGA
18968931 CAGAAAAGTC
Statistics
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Consensus pattern (171 bp):
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TTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGGGAAACATGAAGCGAAAGCCATCCATTGA
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Found at i:18969273 original size:170 final size:168
Alignment explanation
Indices: 18968944--18972830 Score: 3198
Period size: 170 Copynumber: 22.8 Consensus size: 168
18968934 AAAAGTCGTT
* * * * *
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*
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** * * *
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* * * * * * * *
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* * * * *
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*
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** * *
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* * * *
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* * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * *
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* ** * * * * * * *
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1 TTATAAATGATTTTAAAT-TGAATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAG-ATCATAATTTGATGTT
** * * ** *
18969685 TGCATCAAGAAACATGAAGCCAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTTTATTTATAGTCACTCATA
64 TGCATTGAGAAACGTGAAG-CAAA-ACATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATG
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127 CCTTCGAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATC
* * * * * *
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* * * * * * * * *
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66 CATTGAGAAACGTGAAGC-AAA-ACATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCC
** * *
18969918 TTTAAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATTGTTTTAAAATC
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* ** * * * * * * *
18969958 TTATAATTGATTTTAAATCAAAATTGTTTTCATGTCTAGTTAAAATAGATTATAATTGGATGTTT
1 TTATAAATGATTTTAAAT-TGAATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTT
* * * * * * *
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* * *
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128 CTTCGAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATC
* * *
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1 TTATAAATGATTTTAAATTGA-ATT-TTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTT
* * * * * *
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* * **
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* * * * * *
18970301 TTATAAATGA-GTTCAATAGAATTTTTTTTTTCATTTTTGCTTAAAACATATCATAATTTGATTT
1 TTATAAATGATTTTAAATTGAA---TTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGT
* * * * * *
18970365 TTGCA-TCAGGAAACATGAAGCAAAAGATATCCATTGACAGGAGAAGTCCATTTATAGTCACTTA
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* * *
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* * * * *
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1 TTATAAATGATTTTAAATTGAA--TTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTT
* * *
18970538 TACATTGGGAAACGCGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATG
64 TGCATTGAGAAACGTGAAGCAAAA--CATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATG
* ** ** * * *
18970603 CCTTCAAAAGCCTTCTTACTTGCTTTAAGTGGTTTTCT-AGC
127 CCTTCGAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATC
* * * * * * *
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1 -TTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGA-TGTT
* * * * * * *
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** * *
18970773 CCTTCGAAAGTGTTGTTACTCTCTTTAAATGGTTTTATAATC
127 CCTTCGAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATC
* * * * * * *
18970815 TTATAAATGATTTTAAATTGAATTCTTTTTTCATTTTAGGTTCAGATAGATTATAATTTGCTCTT
1 TTATAAATGATTTTAAATTGAA-T-TTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTT
* * * * * *
18970880 TGCATCGAGAAACATGAAGTGAAAGGCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATCTATAGTCACTCATG
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* * * * * ** * ** *
18970945 TCTTTGACAGGCTTGTTACTTGCTTTAAGTATTTTTATGA-C
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*
18970986 TTATAAATGATTTTAAATTGAATTATTTTTCATTTTTGGTTAAAACAAATCATAATTTGATGTTT
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* ** ** * * * * * * *
18971051 GTATCAAGAAATATGAAGCGAAAGCTATCCGTTAACAAG-AAACTCCATTTACAGTCACTCAAGT
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* * * *
18971115 ATTTGAAAGCTTAGTTACTCGCTTTAAAATGGTTTTATAATC
128 CTTCGAAAGCCTAGTTACTCACTTT-AAATGGTTTTATAATC
* * * * *
18971157 TTATAAATGATTTTAAGTTAAATTTTTTTGTCATTTTTGGTTAACACATAGT-AGAATTT-ATTG
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* * * * * *
18971220 TTTACATTAAGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTAACAAGAAAAGTCCATCTATAGTCACTAA
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* * * * * *
18971285 TACCTTCAAAAGCGTTGTTACTCACTTTAAGTGGTTTTGTAA-C
125 TGCCTTCGAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATC
* * * *
18971328 TTTATAAATGATTTTGAATTGAATTTGTTTTTAGTTTTGGCTAAAACAGATCATAA-TT-AT-TT
1 -TTATAAATGATTTTAAATTGAATTT-TTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTT
* * * * * * *
18971390 ACTGCATT-AGGAAATGTGAAGGAAAAGTCATCCGTTGACAAGAAAAGTCTATTTATAATGACTT
64 --TGCATTGA-GAAACGTGAAGCAAAA--CATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTC
* * *
18971454 ATTCCTTTGCAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATC
124 ATGCCTTCGAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATC
* * * * * * *
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* * * *
18971564 GCATCGAGAAATGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGAAAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCA-AC
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* *
18971628 CTTTGAAAGCCTTGTTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATC
128 CTTCGAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATC
* * ** * * * *
18971669 TGACAAATGATTTTAAATCAAAATTTTTTCCATTTTTGGTTAGAACAGATTATAATTGGATGTTT
1 TTATAAATGATTTTAAAT-TGAATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTT
* * * * *
18971734 GCATTGAGAGACGTGAAGTGAAAGTCATCCATTGACAAGAAAAGAT-CA-TTGTAGTTACTCATG
65 GCATTGAGAAACGTGAAG-CAAA-ACATCCATTGACAAGAAAAG-TCCATTTATAGTCACTCATG
* * * * *
18971797 CCTTCAAAAGCCTATTTACTCGCTTAAAATGGTTTTATGATC
127 CCTTCGAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATC
* * *
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* * * * *
18971904 GCATTG-GTAAA-GATGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAATCCAATTATATTGACTCAT
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* *
18971967 GCCTTCAAAAGCCCTA-TTACTCACTTTAAGTGGTTTTATAA-C
126 GCCTTCGAAAG-CCTAGTTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATC
* * *
18972009 TTTATAAATTATTTTAAATTGAATTTTTTTCATTTTTGGTTAGAATAGATCATAATTTGATGTTT
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** * * * * * *
18972074 GCATCAAAAAAAGTGGAGCAAAAGTCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTTATAC
65 GCATTGAGAAACGTGAAGCAAAA--CATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGC
** ***
18972139 CTTTAAAAGCCTAGTCGTTCACTTTAAATGGTTTTATAATC
128 CTTCGAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATC
* * * * *
18972180 TTATAAATGATTTTAAAATTAAATTTTTCTCATTTTTGATTAAAACATATCATAATTTAATGTTT
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* * * ** * * *
18972245 GCATCGAGAAACATGAAGCGAAAGCCATCTGTTGACAAGAAAAGTTCATTTGTGGTCACTCATGC
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* * * * * *
18972310 CTTCGAAAGCTTAGTTACACGCTTCAAATGGTTTTACAGTC
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** ** * * * * * * *
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* * ** *
18972481 CTTTGAAAGCCTTGTTACTTGCTTTAAGTGGTTTTATAA-C
128 CTTCGAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATC
* * * *
18972521 TTTATAAATAACTTTAAATTGATTTTTTTTCTTTTTTGGTT-AAACTAGATCATAATTTGATGTT
1 -TTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAAC-AGATCATAATTTGATGTT
* * * * * * **
18972585 TGCA-TCAGTAAACGTAAAGCGAAAGCCATCAATTGACCAGAAAAATCCATTTATAGTTGCTCAT
64 TGCATTGAG-AAACGTGAAGC-AAA-ACATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAT
* * ** * *
18972649 -CTATTCAAAAGCCTAGTTACTTGCTTTAAATGTTTTTACAATC
126 GC-CTTCGAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATC
* * * ***
18972692 TCATAAATGATTTTTATATTGAATTTTTTCTCATTTTTGGTTAAAACATATTGCAATTTGATGTT
1 TTATAAATGA-TTTTAAATTGAATTTTTT-TCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTT
* * * * * * *
18972757 TGCATTGGGACACGTGAAACCAAAGCCATTCATTTACAAGAAAAGAT-CATTTATAGTCAGTCAT
64 TGCATTGAGAAACGTG-AAGCAAA-ACATCCATTGACAAGAAAAG-TCCATTTATAGTCACTCAT
*
18972821 CCCTTCGAAA
126 GCCTTCGAAA
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TTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTG
CATTGAGAAACGTGAAGCAAAACATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTT
CGAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGGTTTTATAATC
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18975708 AATAAGCAAG
* * * *
18975718 ACAGAAAATTTCTCACTGTAGCGAAATTCACGCCATAAA
1 ACAGAAAGTTTCTCGCTGCAGCGAAATTCATGCCATAAA
18975757 ACAGAAAGTTTCTCGCTGCAGCGAAATTCATGCCATAAA
1 ACAGAAAGTTTCTCGCTGCAGCGAAATTCATGCCATAAA
*
18975796 ACAGAAAGTTTCTCGCTGCAGCGAGATTCAT
1 ACAGAAAGTTTCTCGCTGCAGCGAAATTCAT
18975827 TCTCACTGTA
Statistics
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ACAGAAAGTTTCTCGCTGCAGCGAAATTCATGCCATAAA
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18976143 CACCCTCCCA
* * *
18976153 TCATCATCAGCTCATATGCACTCCCCACTAGCACATGGCTAGG
1 TCATCATCAGCTCATACGCACT-CCCACTAGCACATAGCCAGG
* * * *
18976196 TCATCATCGGCTTATGCGCACTCCCACTCGCACATAGCCAGG
1 TCATCATCAGCTCATACGCACTCCCACTAGCACATAGCCAGG
18976238 TCA
1 TCA
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Statistics
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TCATCATCAGCTCATACGCACTCCCACTAGCACATAGCCAGG
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* *
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1 AAAATGGGTGCAGGAATCTAG
* *
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1 AAAATGGGTGCAGGAAT
18983875 TAAAAAAAAA
Statistics
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AAAATGGGTGCAGGAATCTAG
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18986171 GGTTTATAAC
* ** *
18986181 TTTATAAATGATTTTGAAT-TGAAT-TTGTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATG
1 TTTATAAATGATTTTAAATCAAAATGTT-TTTTCATTTTTGGTTAAAACATATCATAATTTGATG
* * * *
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* * * *
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* * * * *
18986351 TGTTATAAATGATTGTAAATCAAAATGTTTTTTCATTTCTGATTAAAACATATCATAATTGGATT
1 T-TTATAAATGATTTTAAATCAAAATGTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACATATCATAATTTGATG
* * * * * * * *
18986416 TTTGCATCATGAAACGTGAAGC-AAACCCTTCCATCGATAAGAAAAGTCTATTTGTAATCACTCA
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* * * * *
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* ** *
18986523 TTCATAAATGATTTTAAAT--TGAT-TTTTTT-ATTTTTGGTTAAAACATATCATAATTTAATGT
1 TTTATAAATGATTTTAAATCAAAATGTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACATATCATAATTTGATGT
* *** ** * * *
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* * * * *
18986648 TGCCTTTGAAAGCCTAGTTGCTTACTTTAAATCG-TTTATAG
130 TGCCTTTGAAAGCCTTGTTACTCACTTCAAATGGTTTTATAG
* * * *
18986689 TCTTGTAAATTG-TTTTAAATCGAAATGCTTTTT-ATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTG-T
1 T-TTATAAA-TGATTTTAAATCAAAATGTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACATATCATAATTTGAT
* * * * * * *
18986751 GATTGCCAT-TGAGAATCGTGAAGCAAAAGCTATCCATTGACAAAAAAAAGTCTATCTATAGTCA
64 GTTTG-CATCAG-GAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGAC-AAGAAAAGTCCATTTATAGTCA
* * * ** * * *
18986815 CTCATGCCTTTAAAAGGCTTGTTACTCACTTTAAGCGATTTTGTAAC
126 CTCATGCCTTTGAAAGCCTTGTTACTCACTTCAAATGGTTTTAT-AG
* ** * * * * * *
18986862 TTTATAAATGATGTTAAATTGAATTGTTTTTTCATTTTTTGTTAAAATAGACCTTAATTTGATGT
1 TTTATAAATGATTTTAAATCAAAATGTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACATATCATAATTTGATGT
*
18986927 TTGCATCAGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGCCCATTTATAGTCACTCAT
66 TTGCATCAGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAT
* ** *
18986992 GCCTTCGAAAG-CTTAGTTACTTGCTTCAAATGATTTTATAG
131 GCCTTTGAAAGCCTT-GTTACTCACTTCAAATGGTTTTATAG
* * * *
18987033 TCTTATAAATGATTTTAAATCAGAAATG--TTTTCATTTCTGGTTAGAATATATCATAATTGGAT
1 T-TTATAAATGATTTTAAATCA-AAATGTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACATATCATAATTTGAT
** * * * *
18987096 GAATACATCTAGGAAACGTGAAGCAAAAACCATCTAATGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACT
64 GTTTGCATC-AGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACT
* * *
18987161 CATACCTTTGAAAGCCTTGGTACTCACTTCAAAATGGTTTTATAAT
128 CATGCCTTTGAAAGCCTTGTTACTCACTTC-AAATGGTTTTAT-AG
** * * * **
18987207 TTTATAAATGATTTTAAAT-TGAA-CTTTTCTCATTTTTGGTTAAAACATATCATTATTACATGT
1 TTTATAAATGATTTTAAATCAAAATGTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACATATCATAATTTGATGT
* * *
18987270 TTGCATCAGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATCTATAGTCACTTAT
66 TTGCATCAGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAT
*
18987335 GCCTTCGAAAG
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18987346 GTTAATAGCT
Statistics
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166 2 0.00
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TTTATAAATGATTTTAAATCAAAATGTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACATATCATAATTTGATGT
TTGCATCAGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCAT
GCCTTTGAAAGCCTTGTTACTCACTTCAAATGGTTTTATAG
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18986047 TTTTATGATA
* * * ** * * *
18986057 TTTGATTAAAACAAATCATTATTTGATGTTTGCATCAAGAAACGTAAAGCGAAAGCCATCCATTT
1 TTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGAGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTG
* * * * *
18986122 ACAAAAAAATTCCATTTATAGTCACTCGTGCCTTTGAAA--------A-T--CTTTAAGTGG-TT
66 ACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTGTTACTCGCTTCAAATGGTTT
* *
18986175 TATAACTTTATAAATGATTTTGAATTGAATTTGTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTT
131 TATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTT-TTTT-ATTTTTGGTTAAAACATATCATAATTT
* * * * *
18986240 GATGTTTGCATCG-GCAAACATGAAGCGAAAGTCATCCATTCACAAGAAAAGTCCATTTATAGTC
194 GATGTTTGCATCGAGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTC
* ** * * *
18986304 ACTCATGCCTTC-AGAAGCCTAGTCACACACTTCAAATGGTTTTATAGTGTTATAAATGATTGTA
259 ACTCATGCCTTCGA-AAGCCTAGTTACTTACTTTAAATGG-TTTATAGTCTTATAAATGATTTTA
*
18986368 AATCAAAATGTTTTTTCATT
322 AATCGAAATG-TTTTTCATT
* * * * * * * * *
18986388 TCTGATTAAAACATATCATAATTGGATTTTTGCA-TCATGAAACGTGAAGC-AAACCCTTCCATC
1 TTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGA-GAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATT
* * * * * * *
18986451 GATAAGAAAAGTCTATTTGTAATCACTCATGTCTTTGAAAGCCTTGTTACTCGCTTCAAGTGTTT
65 GACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTGTTACTCGCTTCAAATGGTT
* *
18986516 TTATAACTTCATAAATGATTTTAAATTG-ATTTTTTTATTTTTGGTTAAAACATATCATAATTTA
130 TTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTATTTTTGGTTAAAACATATCATAATTTG
* *** ** * * *
18986580 ATGTTTGCATCGA-GAACCACAAAGCAAAAGCCATCCATTGATGAGCAACGTCCATTTATAGTTA
195 ATGTTTGCATCGAGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCA
* * * *
18986644 CTCATGCCTTTGAAAGCCTAGTTGCTTACTTTAAATCGTTTATAGTCTTGTAAATTG-TTTTAAA
260 CTCATGCCTTCGAAAGCCTAGTTACTTACTTTAAATGGTTTATAGTCTTATAAA-TGATTTTAAA
18986708 TCGAAATGCTTTTT-ATT
324 TCGAAATG-TTTTTCATT
* * *
18986725 TTTGGTTAAAACAGATCATAATTTG-TGATTGCCATTGAGAATCGTGAAGCAAAAGCTATCCATT
1 TTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTG-CATTGAGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATT
* * * * * * * ** *
18986789 GACAAAAAAAAGTCTATCTATAGTCACTCATGCCTTTAAAAGGCTTGTTACTCACTTTAAGCGAT
65 GAC-AAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTGTTACTCGCTTCAAATGGT
* * * * * * *
18986854 TTTGTAACTTTATAAATGATGTTAAATTGAATTGTTTTTTCATTTTTTGTTAAAATAGACCTTAA
129 TTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAA-T-TTTTTT-ATTTTTGGTTAAAACATATCATAA
*
18986919 TTTGATGTTTGCATC-AGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGCCCATTTATA
191 TTTGATGTTTGCATCGAGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATA
* * * *
18986983 GTCACTCATGCCTTCGAAAGCTTAGTTACTTGCTTCAAATGATTTTATAGTCTTATAAATGATTT
256 GTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTAGTTACTTACTTTAAATG-GTTTATAGTCTTATAAATGATTT
18987048 TAAATCAGAAATG-TTTTCATT
320 TAAATC-GAAATGTTTTTCATT
* * * * * ** * * * *
18987069 TCTGGTTAGAATATATCATAATTGGATGAATACATCT-AGGAAACGTGAAGCAAAAACCATCTAA
1 TTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCAT-TGA-GAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCAT
* * *
18987133 TGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATACCTTTGAAAGCCTTGGTACTCACTTCAAAATGG
64 TGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTGTTACTCGCTTC-AAATGG
* * * *
18987198 TTTTATAATTTTATAAATGATTTTAAATTGAACTTTTCTCATTTTTGGTTAAAACATATCATTAT
128 TTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAA-TTTTTTTATTTTTGGTTAAAACATATCATAAT
** * *
18987263 TACATGTTTGCATC-AGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATCTATAG
192 TTGATGTTTGCATCGAGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAG
* * ** *
18987327 TCACTTATGCCTTCGAAAG----GTTA---A---T--A--GCTTA-CCTTTTATAAATGATTTTA
257 TCACTCATGCCTTCGAAAGCCTAGTTACTTACTTTAAATGGTTTATAGTCTTATAAATGATTTTA
* * *
18987377 TATCAAAATTTTTTTCATT
322 AATCGAAATGTTTTTCATT
* * * * * ** * * * * *
18987396 TCTAGTTAAAACAGATAAAAAAATAAATGTTTGCATT-AGGAAACATGATGTCGAAA-TCATTCA
1 TTTGGTTAAAACAGAT-CATAATTTGATGTTTGCATTGA-GAAACGTGAAG-CAAAAGCCATCCA
** * * * * ** *
18987459 TTTTCAAGAAAAGTCCATTTATAGTTACTTAAGCCTTCGAAAATCTTGTTACTCGCTTTAAATGG
63 TTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTGTTACTCGCTTCAAATGG
* * * * * *
18987524 TTTTATAACTTTATAAATGATCTTAGATTTAATTTTGTTCAAATTTT-GTTAAAACATATCATTA
128 TTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTT-TT-TATTTTTGGTTAAAACATATCATAA
* * * * * * * *
18987588 TTTGATGTTTTCAT-TAGGAAATGTGAAGCGAAAGCGATCTATTGACAAGAAAAGTCCATTAATT
191 TTTGATGTTTGCATCGAGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATA
* * * * *
18987652 GTAACTCATACCTTCGAAAACCTAGTTACTCACTTTGAAATGGTTT-TATGATCTTATAATTGAT
256 GTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTAGTTACTTACTTT-AAATGGTTTATA-G-TCTTATAAATGAT
*
18987716 TTTAAAATTG-AAT-TTTTCTCATT
318 TTT-AAATCGAAATGTTTT-TCATT
* * *
18987739 TTTGGTTCAAACAAATCATAATTTGATGTTTGCATTG-GCAAACGTGAAGCCAAAGCCATCCATT
1 TTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGAG-AAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATT
* * * * * *
18987803 GACAAGAAAAATCCATTAATAGTCACTTATGCCTTTGAAAGCCTTGTTACTCACTTCAAGTGATT
65 GACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTGTTACTCGCTTCAAATGGTT
* * * *
18987868 TTATAACTTTATAAATGATTTTAATTTGAATTTTTTTCATTTTT-TTTTAAACAAATCATAATTT
130 TTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTT-ATTTTTGGTTAAAACATATCATAATTT
* * * * * **
18987932 GATGTTTGCAT-TAGGAAATGTGAAGCAAAAGCGATCCGTTGACAAGAAAAGTCCACTTATTTTC
194 GATGTTTGCATCGAGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTC
* * * * * * *
18987996 AGTCATGCTTTTGAAAGCCTAGTTA-TTCCCTTTAAATGATTTTATAATCTTATAAAGGATTTTT
259 ACTCATGCCTTCGAAAGCCTAGTTACTT-ACTTTAAATG-GTTTATAGTCTTATAAATGA-TTTT
* *
18988060 ATATTG-AAT-TTTTCTCATT
321 AAATCGAAATGTTTT-TCATT
* * * * * * * * * *
18988079 TTTTGTTAAAATAGATCACAATTTGATGCTTGCATCGGGAACCATAAAGCGAAAGCCATCCATTG
1 TTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGAGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTG
** * * * * * *
18988144 ATGAGAAACGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAG-CTTAGTTGCTTGATTTAAATGGTT
66 ACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTT-GTTACTCGCTTCAAATGGTT
* * **
18988208 TTAT-AGTCTTATAAATTATTTTAAATCAAATTTTTTTATTTTTGGGTT-AAACATATCATAATT
130 TTATAACT-TTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTATTTTT-GGTTAAAACATATCATAATT
* * * * * *
18988271 T-ATGGTTTCCATCGAGG-AACATGAAGAAAAAGCTATCCATTGATAA-AAAAGTCTATTTATAG
193 TGAT-GTTTGCATCGAGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAG
* * * * * * * *
18988333 TCACTTATACCTTCGAAAGGCTTGTTA-TCACTTTAAGTGGTTT-T-GCAACTTTATAAATGATG
257 TCACTCATGCCTTCGAAAGCCTAGTTACTTACTTTAAATGGTTTATAG--TC-TTATAAATGATT
* *
18988395 TTAAATTGAATTGTCTTTTCATT
319 TTAAATCGAAATGT-TTTTCATT
* * * *
18988418 TTTGGTTAAAACAGACCTTAATTTGATGTTTACA-TCAGAAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATT
1 TTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGAG-AAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATT
*
18988482 GACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAG-CTTAGTTACTCGCTTCAAATGGT
65 GACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTT-GTTACTCGCTTCAAATGGT
*
18988546 TTTAT-AGTCTTATAAATGATTTTA
129 TTTATAACT-TTATAAATGATTTTA
18988570 TGTCACGACC
Statistics
Matches: 1748, Mismatches: 353, Indels: 154
0.78 0.16 0.07
Matches are distributed among these distances:
325 4 0.00
326 124 0.07
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328 18 0.01
330 46 0.03
331 41 0.02
333 1 0.00
336 6 0.00
337 49 0.03
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340 215 0.12
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345 68 0.04
ACGTcount: A:0.34, C:0.15, G:0.14, T:0.38
Consensus pattern (340 bp):
TTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGAGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTG
ACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTGTTACTCGCTTCAAATGGTTT
TATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTATTTTTGGTTAAAACATATCATAATTTGA
TGTTTGCATCGAGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCAC
TCATGCCTTCGAAAGCCTAGTTACTTACTTTAAATGGTTTATAGTCTTATAAATGATTTTAAATC
GAAATGTTTTTCATT
Found at i:18987976 original size:169 final size:171
Alignment explanation
Indices: 18987422--18988569 Score: 1065
Period size: 171 Copynumber: 6.7 Consensus size: 171
18987412 AAAAAAATAA
* * * * * ** *
18987422 ATGTTTGCATTAGGAAACATGATGTCGAAA-TCATTCATTTTCAAGAAAAGTCCATTTATAGTTA
1 ATGTTTGCATTAGGAAACGTGAAG-CAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCA
* * ** * * *
18987486 CTTAAGCCTTCGAAAATCTTGTTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAACT-TTATAAATGATCTTAG
65 CTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCACTTTAAATGGTTTTATAACTCTTATAAATGATTTTAA
* * * * * *
18987550 ATTTAATTTTGTTCAAATTTT-GTTAAAACATATCATTATTTG
130 ATTGAATTTTTTTC-ATTTTTGGTTTAAACAAATCATAATTTG
* * * * * * * *
18987592 ATGTTTTCATTAGGAAATGTGAAGCGAAAGCGATCTATTGACAAGAAAAGTCCATTAATTGTAAC
1 ATGTTTGCATTAGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCAC
* * * * *
18987657 TCATACCTTCGAAAACCTAGTTACTCACTTTGAAATGGTTTTATGA-TCTTATAATTGATTTTAA
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* *
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* * *
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1 ATGTTTGCATTAGG-AAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCA
* * * * *
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* *
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* * * * ** *
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* * * * * * * *
18987998 TCATGCTTTTGAAAGCCTAGTTATTCCCTTTAAATGATTTTATAA-TCTTATAAAGGATTTTTAT
66 TCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCACTTTAAATGGTTTTATAACTCTTATAAATGA-TTTTAA
* * * * * *
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130 ATTGAATTTTTTTCATTTTTGGTTTAAACAAATCATAATTTG
* ** * * * * ** *
18988104 ATGCTTGCATCGGGAACCATAAAGCGAAAGCCATCCATTGATGAGAAACGTCCATTTATAGTCAC
1 ATGTTTGCATTAGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCAC
* * * *
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** * *
18988231 AATCAAATTTTTTT-ATTTTTGGGTTAAACATATCATAATTT-
129 AATTGAATTTTTTTCATTTTTGGTTTAAACAAATCATAATTTG
* * * * * * *
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1 AT-GTTTGCAT-TAGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTC
* * * * ** *
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* * * *
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129 AATTGAATT-T-TTTTCATTTTTGGTTTAAACAAATCATAATTTG
* * *
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1 ATGTTTGCATTAGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCAC
* * *
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* * * * * *
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* * * * *
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* * * *
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* * * *
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* * * *
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*
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* * * * * *
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* *
18987869 TATAACT-TTATAAATGATTTTAATTTGAATTTTTTTCATTTTTTTTTAAACAAATCATAATTTG
65 TAT-ACTCTTATAAATGATTTTAATTT-AATTTTTTTCATTTTTGTTTAAACATATCATAATTTG
* * * *
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* * * * * * *
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192 TCATACCTTCGAAAGCCTAGTTA-TCACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTTAAA
* * * * * * * *
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*
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** * * * *
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* * ** *
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65 TATACTCTTATAAATGATTTT-AATTTAATTTTTTTCATTTTT-GTTTAAACATATCATAATTTG
* * * * * *
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128 AT-GTTTCCAT-TAGGAA-ATGTGAAGCAAAAGCGATCCATTGACAAGAAAAGTCCA-TTATTGT
* * * * ** *
18988334 CACTTATACCTTCGAAAGGCTTGTTATCACTTTAAGTGGTTTTGCAA-CTTTATAAATGA-TGTT
189 CACTCATACCTTCGAAAGCCTAGTTATCACTTTAAATGGTTTTATAATC-TTATAAATGATTTTT
* * * * *
18988397 AAATTGAATTGTCTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGACCTTAATTTGATGTTTACATCAGAAAACG
253 AAATTGAATT-T-TTCTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCGGAAAACG
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316 TGAAGCAAAAGCCATCCATTGA
*
18988484 CAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCTTAGTTACTCGCTTCAAATGGTTTT
1 CAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCTTAGTTACTCACTTCAAATGGTTTT
*
18988549 ATAGTCTTATAAATGATTTTA
66 ATACTCTTATAAATGATTTTA
18988570 TGTCACGACC
Statistics
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CAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCTTAGTTACTCACTTCAAATGGTTTT
ATACTCTTATAAATGATTTTAATTTAATTTTTTTCATTTTTGTTTAAACATATCATAATTTGATG
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ACCTTCGAAAGCCTAGTTATCACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTTAAATTGAA
TTTTTCTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATCGGAAAACGTGAAGCAAAA
GCCATCCATTGA
Found at i:18993023 original size:15 final size:15
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*
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*
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AACTTTAAAATCCAA
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18992993 TTCTTAAAAC
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*
18993033 AGCTTTAAAATCAA
1 AACTTTAAAATCAA
*
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AACTTTAAAATCAA
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1 ACTTCAAATCATACTCCAAT
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1 A
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Statistics
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ACTTCAAATCATACTCCAAT
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* * * * * * *
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* *
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* * * ** * * * * *
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* * * * * * *
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* * ** **
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* * * * * * ** *
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* * * * *
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* * *
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* * * * * ** *
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* * * * * *
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* *
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* * * * * *
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* * * * * * *
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* * *
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* * * **
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* * * * * * * * *
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*
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* * * ** ** *
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* * * * *
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* ** *
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* * *
18996998 TTTTTCATTTTTGGTTAGAACAAATCATAATTTGAT-TGTTGCATTAGGAAATGC--GAAGCAAA
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* ** *
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* * * *
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* * * * * * ** * *
18997167 TTTTTTATTTTTGGTTGAAACAAATCAAAATTGGATATTCACAGTGAAAAACATGAAGCAAAAGC
1 TTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGGAAAACATGAAGCAAAAGC
* * * **
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*
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* * * * * * **
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* * ** ** ***
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* * * ** *
18997466 TTTAAATGGTTTTAT-AGTCTTACAAATGGTTTTAAATCAAAAAT
128 TTTAAATGGTTTTATAACTCTTATAAATGATTTTAAAT-TGAATT
* * * * * * *
18997510 TTTTTGATTTCTAGTTAAAATAGATCATAATTGGCTGTTTGCATTATG-AAACATGAAGCAAAAG
1 TTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATT-GGAAAACATGAAGCAAAAG
* * * * * * *
18997574 CCATCCATTGACAAGAAAAGTTCATTTCTAGTCACTCAAG-CTTTCGAAAGCTTTGTTACTCGCT
65 CCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTT-GAAAACCTAGTTACTCACT
* * *
18997638 TCAAGTGGTTTTATAACT-TTATAAATAATTTTAAATTGAATGT
129 TTAAATGGTTTTATAACTCTTATAAATGATTTTAAATTGAAT-T
* ** * * * * * * **
18997681 CTTTTCCGTTTTGGTTAAAAAATATCATAATTTGATATTTGCATTGGGGAATC-TAAAGTGAAAG
1 TTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATT-GGAAAACATGAAGCAAAAG
* * *
18997745 CCATCCACTT-ACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATTCC-TTCAAAAGCCTAGTTACTCGC
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*
18997808 TTTAAATGGTTTTATAA-TCTTATAAATGATTTTTCAATTGAATT
128 TTTAAATGGTTTTATAACTCTTATAAATGA-TTTTAAATTGAATT
* * * ** * * *
18997852 TTTCTCATTTTTGGTTAAAAAATATTGTAATTTCATGCTTGCATT-GATAAACATGAAGCGAGAA
1 TTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGGA-AAACATGAAGC-AAAA
**
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AAATGGTTTTATAACTCTTATAAATGATTTTAAATTGAATT
Found at i:18996642 original size:341 final size:338
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* * * * * ** * *
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* * * * * *
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64 GCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCACT
* * * *
18995933 TTAAATAGTTTTATAA-TCTTATAAATGATTTTAAATTAAATTTTTTTTATTTTTGGTTAAAACA
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* ** * * * *
18995997 TATCATTATTACATGTTGGCATCAGGAAACGTAAAGCGAAAGCCATCCATTGAGAAGAAAAGTCC
193 TATCATAATTTGATGTTTGCATCAGGAAATGTGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCC
* * * * * *
18996062 ATCTACAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCTTAGTAACTCACTTCAAATGGTTTTATACTCTTATAA
258 ATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTAGTTACTCA-TTTAAATGGTTTTATAGTCTTATAA
* *
18996127 ATGATTTATATCAA--AAAA
322 ATGATTT-TA--AATTGAAT
* * * * * * * ** *
18996145 ATTT-TCATTTTTGGTCAAAACAGATAAAAAAATTGATGTTTGCCTTGGAAAACATGATTTCGAA
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* * * * **
18996209 A-CCATCCATTGACAAGAAAAGTCAATTTATAGTCACTCAAGTCTTTGAAAATCTTGTTACTCAC
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* * *
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* * * *
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* * *
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* ** *
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* * * * **
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* * * *
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* * * *
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* *
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* * **
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* * * *
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* * * * * * *
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* * * ** *
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* **
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* * * * * * *
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* * * * * *
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* * * ** *
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* * * *
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*
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* ** * * *
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**
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Statistics
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** * * *
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* * * * * * *
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* ** * *
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128 AAACAGATCATAATTTGATGT-TTGCATTGGGAAACGTGAAGC
* * *
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1 GAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTAGTTACT
* * ** *
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66 CGCTTTAAATGGTTTTATATCTTATAAATGATTTTAAATTGAA-T-TTTTTTCATTTTTGGTTAA
* * * * * *
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** * * * * * * **
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1 GAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTAGTTACT
* ** * * *
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66 CGCTTTAAATGGTTTTATA-TCTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTCA--TTTTTGGTTA
* * *
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128 AAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGGGAAACGTGAAGC
* * * * * ** *
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** * * * * * **
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* * * * **
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129 AACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGGGAAACGTGAAGC
* * * * *
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1 GAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTAGTTACT
* ** *
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66 CGCTTTAAATGGTTTTAT-ATCTTATAAATGATTTTAAATTGAA---TTTTTTTCATTTTTGGTT
* * * ** *
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*** * * * * * *
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* * * * *
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* * * *
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* * * * * *
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* *
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* * * * **** *
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* * * * *
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* * * * *
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65 TCGCTTTAAATGGTTTTATATC-TTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTCATTTTTGGTTAA
* * ** ** * *
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129 AACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGGGAAACGTGAAGC
* * * * * *
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**
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66 CGCTTTAAATGGTTTTAT-ATCTTATAAATGATTTTAAATTGAATTT-TTTTCATTTTTGGT-TA
* ** * *
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128 AAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGGGAAACGTGAAGC
* *
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* * * * *
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* * * * * **
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127 AAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGGGAAACGTGAAGC
*
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CAGATCATAATTTGATGTTTGCATTGGGAAACGTGAAGC
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* * *
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** * * ** * *
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* *
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* * ** *
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*
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CTTTAAAAGCCTAATTGCTCT
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* * * * ****
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* *
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* * * * *
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129 TTTAAATGGTTTTA
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Statistics
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CAATCCAATAACAAGAAAAGTCCATTTATAGACGCTCATCCTATCGAAAGCCTAGTTACTAGATT
TAAATGGTTTTACATTGAATTT
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* * *
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* * * *
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*
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* * *
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* * * * *
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* ** * *
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* * * *
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*
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127 CTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATT--AA
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Statistics
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Consensus pattern (167 bp):
TTTTTTTCATTTTAGTTAAAAAGATCATAATTTAATGTTGTATATCAGAAACGTGAAGTGAAAGC
AATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTAGTTACTTACTTT
AAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATTAA
Found at i:19010380 original size:171 final size:170
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19010078 ACAGTTGGGC
* * * * *
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* * * * *
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* *
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* * * * * * *
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* * * *
19010324 TTTTATAACATTATAGATGATATTAAGTTGAATTATTTTTTC-TTTTTCGATTAAAAAGATAATA
66 TTTTATAACTTTATAGATGATTTTAAGTTGAATT-TTTTTTCATTTTT-GGTTAAAAAGATCATA
* * *
19010388 ATTT-AT-TGTTGCATTAGGAAACTTGAAGTAAAAGCCATCCA
129 ATTTGATGT-TTGTATTAGGAAACTTGAAGCAAAAGCAATCCA
* * *
19010429 TTGACAAGAAAAGTCCACTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGTCTTGTTACTCGCTTTAAGTGA
1 TTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGG
* * * * *
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* *
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130 TTTGATGTTTGTATTAGGAAACTTGAAGCAAAAGCAATCCA
* * * * ** * * *
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* * *
19010665 TTTTACAA-TCTTATAAATGATTTTAAATTG-ATTTTTTTT-ATTTTTGGT
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19010713 CGAAACAAAT
Statistics
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172 2 0.01
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TTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCGCTTTAAGTGG
TTTTATAACTTTATAGATGATTTTAAGTTGAATTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAAAGATCATAAT
TTGATGTTTGTATTAGGAAACTTGAAGCAAAAGCAATCCA
Found at i:19011216 original size:169 final size:165
Alignment explanation
Indices: 19010751--19011224 Score: 501
Period size: 169 Copynumber: 2.8 Consensus size: 165
19010741 ATTTTAAGTG
* * * * *
19010751 GTTTTATG-ATCTTATAAATGATTTTAAAATTGAATTTTTCTCATTTTTATTTAAAATATCATAA
1 GTTTTATGAATCTTATAAATGATTTT-AAATTGATTTTTTTTTATTTTTGTTAAAAATATCATAA
* * * *
19010815 TTGATGTTTGCATTGGGAAATGTGAAGCAAAAGCAATCCATTGATAAGAAAAATCCATTTATAGT
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*
19010880 CA-TGCATCCCTTCGAAAGCCTAGTTGCTTGCTTTAAAAA
127 CACT-CATCCCTTCGAAAGCCTAGTTGCTCGCTTTAAAAA
* * * * *
19010919 GTTTTAT-AATCCTATAAATGATTTCACATTGAATTTTTTTTTCATTCTTTGTTCAAAAGATCAT
1 GTTTTATGAATCTTATAAATGATTTTAAATTG-ATTTTTTTTT-ATT-TTTGTTAAAAATATCAT
* * * * *
19010983 AATTTGATGTTTGCATTGAGAAACGTGAAGCGAAAGCCATCCATTAATAA-AAAACCCGTTTATA
63 AATTT-AT-TTTGCATGGA-AAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAACCATTTATA
* * *
19011047 GTCACTCATGCCTTCTAAAGCCTAGTTGCTCGCTTTAAATA
125 GTCACTCATCCCTTCGAAAGCCTAGTTGCTCGCTTTAAAAA
*
19011088 GTTTT-TGAATCTTATAAATGATTTTAAACT-ATTTTTTTTTATTTTTGGTTAAAACATATCATA
1 GTTTTATGAATCTTATAAATGATTTTAAATTGATTTTTTTTTATTTTT-GTTAAAA-ATATCATA
* * * *
19011151 ATTTCTTATTCGCATAGGAAAACGTGAAGTAAAAGCCATCCATGGACAAGAAAAGACCATTTATA
64 ATTTATT-TT-GCAT-GGAAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGATAAGAAAA-ACCATTTATA
19011216 GTCACTCAT
125 GTCACTCAT
19011225 ACTTTAAGTT
Statistics
Matches: 254, Mismatches: 37, Indels: 29
0.79 0.12 0.09
Matches are distributed among these distances:
165 4 0.02
166 12 0.05
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ACGTcount: A:0.34, C:0.14, G:0.13, T:0.38
Consensus pattern (165 bp):
GTTTTATGAATCTTATAAATGATTTTAAATTGATTTTTTTTTATTTTTGTTAAAAATATCATAAT
TTATTTTGCATGGAAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAACCATTTATAGTCACT
CATCCCTTCGAAAGCCTAGTTGCTCGCTTTAAAAA
Found at i:19011502 original size:289 final size:285
Alignment explanation
Indices: 19010976--19011513 Score: 676
Period size: 289 Copynumber: 1.9 Consensus size: 285
19010966 TTTGTTCAAA
* * * * * *
19010976 AGATCATAATTTGATGTTTGCATTGAGAAACGTGAAGCGAAAGCCATCCATTAATAAAAAACCCG
1 AGATCATAATTTCATGTTTGCATCGAAAAACATGAAGCGAAAGCCATCCATTAACAAAAAACCCA
* * *
19011041 TTTATAGTCACTCATGCCTTCTAAAGCCTAGTTGCTCGCTTTAAATAGTTTTTGAATCTTATAAA
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* * * *
19011106 TGATTTTAAACTATTTTTTTTTATTTTTGGTTAAAACATATCATAATTTCTTATTCGCATAGGAA
131 TGATTTTAAACTATTTATTTTCATTTTTGGTTAAAACAAATCATAATTTATTATTCGCATAGGAA
* * *
19011171 AACGTGAAGTAAAAGCCATCCATGGACAAGAAAAGACCATTTAT-AGTCACTCATACTTTAAGTT
196 AACATGAAGCAAAAGCCATCAATGGACAAGAAAAGACCATTTATGA-TCACTCATACTTTAAGTT
19011235 AAATTTTTTAAATTTTTTCTTAAAAT
260 AAATTTTTTAAATTTTTTCTTAAAAT
**
19011261 AGATCATAA-TTCATTGTTTGCATCGAAAAACATGAAGCGAAAGCCATCCATTAACAATAATAGT
1 AGATCATAATTTCA-TGTTTGCATCGAAAAACATGAAGCGAAAGCCATCCATTAACAA-AA-AAC
*
19011325 CCATCTATAGTCACTCATGCCTTCTAAAGCCTTA-TTACAT-GCTTTAAAT-GATTTTAT-AGTC
63 CCATCTATAGTCACTCATGCCTTCTAAAGCC-TAGTTAC-TCGCTTTAAATAG-TTTT-TGAATC
* * * * *
19011386 TAATAAATTATTTTAAATTGAATTTATTTTCATTTTTGGTTCAAACAAATCATAATTTATTGTTT
124 TAATAAATGATTTTAAACT--ATTTATTTTCATTTTTGGTTAAAACAAATCATAATTTATTATTC
** * *
19011451 GCATCA-TTAAACATGAAGCAAAAGCCATCAATTGACAAGAAAAGTCCATTTATGATCACTCAT
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19011514 GCCTTTGAAA
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AATTTTTTAAATTTTTTCTTAAAAT
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* * * * *
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* *
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* * **
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* * *
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* * *
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65 AGCCTAGTTACT-CGTTTAAAT-GTTTTAT-ATCTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTT-TTTC
* * * * ** *
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* * * *
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1 AAACGTGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTT-GAA
* * * * * *
19011694 AGCCTAGTTTCTCACTTTAAATG-GTT-T-TC---TAAATGATTTTCAA-TCAATTTTTTTTTAT
65 AGCCTAGTTACTC-GTTTAAATGTTTTATATCTTATAAATGATTTTAAATTGAA-TTTTTTTCAT
* * *
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* * * * * * * **
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* ** * *
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* * ** *** * * * *
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* * * * ** * * ** * * * * **
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* * * * * *
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* * * * * *
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120 TTTTTCATTTTTGGTTAAAACAAATCATAATTTAT-GTTTGCATTAG-G
* * * * * *
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** * * * ** *
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* * *
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* * * * * * * *
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* *
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* * * * * *
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* * * * * * *
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* * *
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* * * * *
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126 ATTTTTGGTTAAAACAAATCATAATT-TATGTTTGCATTAGG
* * * * * * * *
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* * * * * * * * *
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66 GCCTAGTTACTCG-TTTAAATGTTTTATATC-TTATAAATGATTTTAAATTGAAT-TTTTTTCAT
* * ** * **
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* * * * * *
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* *
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* * * *
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126 ATTTTTGGTTAAAACAAATCATAATTT-ATGTTTGCATTAGG
** ** * * *
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* ** * * *
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* * * * *
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126 ATTTTTGGTTAAAACAA-ATCATAATT-TATGTTTGCATTAGG
* * * * * * **
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* * * * * *
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66 GCCTAGTTACTC-GTTTAAAT-GTTTTAT-ATCTTATAAATGATTTTAAAT
19013288 GGTTTTATTA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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TGGTTAAAACAAATCATAATTTATGTTTGCATTAGG
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*
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Statistics
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19011897 TTGCATAACT
* * *
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* * * * * *
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* * * *
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* * * * * *
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* * * * * * * *
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* ** * *
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** * * *
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** * * * * *
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* *
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* * * * * *
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* * * * * * * * *
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* *
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* * * * * * **
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* * * * * * * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * ** *
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1 -TTATAAATGATTTTAAATTGAATGTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACA-GATCATAATTTGATGT
* * * * * * *
19012821 TTTTATTAGGAAACGTGAAGCGAAAGCAATCCAATGATAGGAAAAGTCCATTTATAGTCA-TTAC
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* *
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* * *
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1 TTATAAATGATTTTAAATTGAA-TGTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTT
* * * * * * * *
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65 TGTATTAGAAAACGTG-AAGCGAAAGCAATCCATTGACAAGAAAATTCCATTTATAGTCACTCAT
*
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* ** * * * * * *
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* * * * * * * * * * *
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** * * * * *
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130 -TTTGAAAGCCTAGTTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATC
*
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1 TTATAAATGATTTTAAAT
19013288 GGTTTTATTA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.34, C:0.13, G:0.14, T:0.39
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TTATAAATGATTTTAAATTGAATGTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTT
GTATTAGAAAACGTGAAGCGAAAGCAATCCATTGACAAGAAAATTCCATTTATAGTCACTCATGT
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Found at i:19012642 original size:341 final size:337
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Indices: 19011907--19013287 Score: 1217
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19011897 TTGCATAACT
* * * * **
19011907 TTATAAATGACTTTAATTTGAATTGCTTTTTCATTTTTGGTTAAAACGATCATAATTTGATGTTT
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* * * * * * *
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* * * *
19012037 CTTTGAAAGCCTTGTTACTCGCCTTAAATGATTTTATAACTTTATCAGTG-ATTTGAATTGAAT-
127 CTTTGAAAGCCTAGTTACTCGCCTTAAATGATTTTATAACTTTATAAATGAATTTAAATTGAATA
* * ** * * * * *
19012100 TTTTTTCATATTTGGTTAAAACAGATCATAATT-TCTCTTTTGCAAT-GAAAAACGTCAACCGAA
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* * * * **
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* *
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** * * * *
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* ** * * *
19012311 TGTATTAGGGAACATAAAGCGAAAGCAATCCATTCACAAGAAAATTCAATTTATAGGT-AGTCAT
63 TGCATTAGAAAACATGAAGCGAAAGCAATCCATTGACAAGAAAATTC-ATTTATA-GTCACTCAT
* *
19012375 G-TTGTCGAAAGCCTAGTTGCTCGCTTTAAATGATTTTATAA-TCTTATAAAT-AATTTAAATTG
126 GCTT-T-GAAAGCCTAGTTACTCGCCTTAAATGATTTTATAACT-TTATAAATGAATTTAAATTG
* * * * * *
19012437 AATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAACACATTATAATTGGATGTTTTCATTGGGATATGTGAAGTG
188 AATATTTTTTCATTTTT-GTTAAAACACATCATAATTGGATGTTTTCATTAGGAAACGTGAAGCG
* * * * *
19012502 AAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTGCACTTATAGTCACTCATGTCTTCGAAAGCCTAGTTACTT
252 AAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTAGTTACTC
*
19012567 GCTTTAAATGGTTTTATAGTC
317 GCTTTAAATGGTTTTATAATC
* ** **
19012588 TTACAAATGATTTTAAATTGAAAAGTTTTTTATTTCTGATTAAAAGAAATCATAATTACATGTTT
1 TTATAAATGATTTTAAATTGAATTGTTTTTTATTT-TGATTAAAA-AAATCATAATTTGATGTTT
* * * * * * * * *
19012653 GCATTAGCAAACATGAGGTGAAAGCCATCCATTTATAATAAAAGTCTACTTATAGTCACTCATGC
64 GCATTAGAAAACATGAAGCGAAAGCAATCCATTGACAAGAAAATTC-ATTTATAGTCACTCATG-
* * * * * * * *
19012718 CTTTGAAAGCCTTGCTATTAGCCTGAAGTG-GTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATA
127 CTTTGAAAGCCTAGTTACTCGCCTTAAATGATTTTATAACTTTATAAATGAATTTAAATTGAATA
* * * * *
19012782 TTTTTTCATTTTTTGCTAAAA-ACTTTCATAATTTGAAGTTTTTATTAGGAAACGTGAAGCGAAA
192 TTTTTTCA-TTTTTGTTAAAACAC-ATCATAATTGGATGTTTTCATTAGGAAACGTGAAGCGAAA
* * * * *
19012846 GCAATCCAATGATAGGAAAAGTCCATTTATAGTCA-TTACTGCCTTCGAAAGCCTAGTTGCTCGC
255 GCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCA-TGCCTTCGAAAGCCTAGTTACTCGC
19012910 TTTAAATGGTTTTATAATC
319 TTTAAATGGTTTTATAATC
* * * *
19012929 TTATAAATGATTTTAAATTGAATTGTTTTTTATTTTTGGTTAAAACACATCCTAATTTGTTGTTT
1 TTATAAATGATTTTAAATTGAATTGTTTTTTA-TTTTGATTAAAA-AAATCATAATTTGATGTTT
* * * * * * *
19012994 GCATTAGAAAACGTGCAA-CAAAAACAGTCCATTGACAAGAAACTTTCATTTATGGTCACTTATG
64 GCATTAGAAAACATG-AAGCGAAAGCAATCCATTGACAAGAAA-ATTCATTTATAGTCACTCATG
* * * * *
19013058 CCTTTGAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATGGTTTTATAA-TCTTATAAATGATTTTAAA-TCAA
127 -CTTTGAAAGCCTAGTTACTCGCCTTAAATGATTTTATAACT-TTATAAATGAATTTAAATTGAA
* * * * * * ** * * *
19013121 AATATTTCCATTTCTGATTAAAAAAGATCATAATTGGATGTTTGGATAAGGAAATGTGAAGCAAA
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* * * * * * * *
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* *
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*
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GGTTTTATAATC
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* * *
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*
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*
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*
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*** * * * * *
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* * * * *
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* * *
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ATTTATAGTCACTCATGCCATTCAAAGCCTAATTACTAGC
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* ** * * *
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*
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* * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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* * * ** * *
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**** * * *
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* * ** * *** * *
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* *
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* ** *
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* ** * ** * * * *
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* * **
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* * * * ** * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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* * * * ** *
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* ** * * *
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* * * * *
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* * * * ** * * *
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* * * * **
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* * * *
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** * ** * ** * *
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* * * ** * *
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* *
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* * ** * *
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** ** *
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* * *
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* * * * * *
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* * * *
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* *
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* ** *
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* *
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**
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* * *
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** * * *
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* * * * * * * *
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*
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* ** * * *
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* * * * *
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* * * ***
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* * * * * ** *
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* *** * *
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* * * * * *
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*
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** * * * * **
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* * * * * *
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* * ** * *
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* * * *
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* * * * *
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* * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * ** * * **
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* * ** *
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* * * *
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* ** * * * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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* * * ** *
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* * * ** * *
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* * * *
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* * * * * * *
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*
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129 TAAATGGTTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATATT
* ** * * * * * *
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* * * * * * *
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*
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** * * * *
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* * *
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* * *
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* * * * *
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* * * *
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* * * *
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* *
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* *
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* * ** * * ** * *
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* * *
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* *
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* * * *
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* *
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* *
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* * * * * * *
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* *
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* * * * * * * * **
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* * * * * ** * * *
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* * * * * * * *
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* * * * *
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* ** *
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* ** * * *
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* * * *
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* * * * * * *
19024478 GTTTTCATTTCTGGTTAAAACAAATCATAATTTGTTGTTTGCATT-GAAAAACGTGAAGCGAAAG
1 -TTTTCATTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAG-GAAACATGAAGTGAAAG
* * * * *
19024542 CCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATCTATAGAT-ACTCATGCCTCCAAAAGCGTTGTTACTCACT
64 CCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAG-TCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCGCT
* * * *
19024606 TTAAATGGTTTGA-AAATCTCATAAATGGTTTTAAATTGAAT-TT
128 TTAAATGGTTTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAATTGAATATT
* * * * * **
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1 -TTTTCATTTTTA-GTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTA-GGAAACATGAAGTGAAA
* * * * * * * **
19024712 GCTATCCGTTAACAAGAAAAGTCCATTTTTAGTCACTCATGCCTT-TAATAGGCTTGTTATTATC
63 GCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAA-AGCCTTGTTACTCGC
* * * * *
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* * * * **
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1 -TTTTCATTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGGAAACATGAAGTGAAAGC
* * * * * *
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* *
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* * * * * * *
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1 TTTTCAT-TTTTA-GTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGG-AAACATGAAGTGAAA
** * * * * * *
19025053 ATCATCTATTTAGAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTTATGCCTTCGACAAG-CTTGTTACTTGA
63 GCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGA-AAGCCTTGTTACTCGC
***
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127 TTTAAATGGTTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATA-T-T
* * * * ** *
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1 TTTTCATTTTTAG-TTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGC-ATTAGGAAACATGAAGTGAAAG
* * * * * ** *
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64 CCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCGCTT
* * * *
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129 TAAATGGTTTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAATTGAATATT
* * * ** * * * * * * * * *
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1 TTTTCATTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGGAAACATGAAG-TGAAAGC
* * * ** * * ** * *
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* * * *
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* * * * * * *
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1 TTTTCATTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTT-TGC--ATTAGGAAACATGAAGTGAAA
* * * * * * **
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63 GCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCG-AAAGCCTTGTTACTCGC
* * *
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127 TTTAAATGGTTTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAATTGAATATT
* * * * * *
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1 TTTTCATTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGGAAACATGAAGTGAAAGCC
* * * * *
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* * *
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* * * * * * **
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1 -TTTTCATTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGGAAACATGAAGTGAAAGC
* * * * * * *
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65 CATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAA-AGCCTTGTTACTCGCTT
** * * *
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* ** * * ** *
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1 TT-TTCATTTTTAGTTAAAACAG-ATCATAATTTGATGTTTGCATTAGGAAACATGAAGTGAAAG
* * * * * * * * *
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64 CCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCGCTT
* * * *
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129 TAAATGGTTTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAATTGAATATT
* * * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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* * * * *
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** * ** * * *
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* * * * * *
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* * * * ** * *
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* * * * * * * * **
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* * *
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** ** * * * * * **
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1 TTTTCATTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGGAAACATGAAGTGAAAGCC
* * * * * * * * **
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* **
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** * ** * * * *
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* * * * * *
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* * ** *
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* * * * * * **
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* * * * * *
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65 CATCCATTGACAAG-AAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCGCTT
* * * * *
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* * * * *
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* * * * *
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64 CCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTA-TAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCGCT
* * ** *
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128 TTAAATGGTTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATATT
* * * * * **
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1 T-TTT-CATTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAG-GAAACATGAAGTGAAA
* * * * * * ** *
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63 GCCATCCATTGACAAGA-AAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCGC
* ** * * * *
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127 TTTAAATGGTTTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAATTGAATATT
* * * * *
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1 TTTTCATTTTTA-GTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGG-AAACATGAAGTGAAAG
* * * * * * *
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64 CCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCT-TGTTACTCGCT
* * * ** ** ** * *
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128 T-TAAATGGTTTTATAACTTTATAAATGATT--TT-AAATTGAATATT
* * * * * * * ** **
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1 TTTTCAT-TTT-TAGTT--AAAAC--AGATCATAATTTGAT-GTTTG-CATTAGGAAA---CA-T
* * * * * *
19027769 TATAGT--TA-CTCATGCC-TTTA-AA-AACATAGTTACTCACTTTAAATGGTTTTA-TAAT--C
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* * * * * * * * * ** *
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19027878 -A-T
168 TATT
* ** * * * ** *** ** * * * *
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1 TTTTCATTTTTAGT-TA-AAAC-AG-ATCATAATTTGAT-GTTTGCATTAGGAAA---CAT-GA-
* **** *** * * * **
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* ** * * ** * * * ** * *
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* * * ** * * ** * *
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1 -TTTTCATTTTTAGTTAAAACA-G-ATCATAATTTGAT--GTTTGCATTAGGAAA---CA-TGA-
* * * * *
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56 AGTGAAAGC-CAT-CCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTG
**** * * * *** * *** * * **
19028158 TTAAAATCTTATAAATGATTTT-TAAGTTGAATTTTTCTAGTTTTTGGTTAAAACAAA
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* * * *** ** ** * * *
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1 TTTTCATTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAG-G-AA-ACATGAAGTGA-A
** * * * * * *
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62 AGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCGC
* * * *
19028319 TTTAAATTGTTTTATAA-TCTTATCAATGATTTTAAA-TCAAAATT
127 TTTAAATGGTTTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAATTGAATATT
* * * * *
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1 -TTTTCATTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGGAAACATGAAGTGAAAGC
* * * * * *
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* *
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* * * *
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* * * *
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* * * * * * * * * * *
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* * *
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* * * ** ***
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* * * ** * * *
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* * *
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129 TAAATGGTTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATATT
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1 TTTTCATTTTTAGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAG-GAAACATGAAGTGAAAGC
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* * *
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* ** * ** * **
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* * * * * ** *
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* * * * *
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** * * * * * ** *
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* * * *
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* * * * *
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* * * * * **
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*
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* * * * * * ** ** **
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* * ** * * * * * *
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* * * ** * *
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* * * *
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* * * * * * * **
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* * * * * *
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* *
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* * * * * ** **
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*
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*
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* * * *
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* * * * * * * * *
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*
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* * *
19021706 TAAGTGGTTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAGTTGAATATTTTTTTCATTTAC-AGTTAAAAT
129 TAAATGGTTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAAT-TTTTTTTCATTT-CTAGTTAAAAC
* *** * **
19021770 AGA-CTATAATTTGTTGTTTGCATCAAGAAACGTGAAATGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGT
192 AGATC-ATAA-TTGATGTTTGCATTGGGAAACATGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGT
* * * * * ** * * * *
19021834 CTAGTTACAGTCACTCATACCTTCGAAAGCCTACATACACGCTTTAAACGATTTTATAA-CTT-T
255 CCATTTATAGTCACTCATGCTTTCGAAAGCCTAGTTACTCTCTTTAAATGGTTTTATAATCTTAT
19021897 ATAAATGATTTTAAATTGAATT
320 A-AAATGATTTTAAATTGAATT
** * * * * * *
19021919 GTTGTTCATTTTTGGTCCAAACAAATCATAATTTGATGTTTGC-CTCGGGAAACGTGAAGCGAAA
1 -TT-TTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGAGAAACATGAAGTGAAA
* * * * *
19021983 GCCATCTATTAACAAGAAAAGTTCATTTATAGTCACTCATGCATTCGAGAGCCTTA-TTACTTGC
64 GCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCC-TAGTTAC-TGC
* * * * *
19022047 TTTAAATGGTTTTAT-AGTCTTAGAAATGATTTTAAGTAGAAATATTTTTT-ATTTCTAGTTAAA
127 TTTAAATGGTTTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAATTG-AATTTTTTTTCATTTCTAGTTAAA
* * * * * *
19022110 ACAGATCATGATTGGATGTTTGCATTAGAAAACTTGAAAC-AAACGCCATCCATTAACAAGAAAA
190 ACAGATCATAATT-GATGTTTGCATTGGGAAACATGAAGCGAAA-GCCATCCATTGACAAGAAAA
** * * ** *
19022174 GTCCATTTATAG-CACTCATGCCTTT-GAAAGTATAGTTACACGCTTTAAATGGTTTTATAGCCA
253 GTCCATTTATAGTCACTCATG-CTTTCGAAAGCCTAGTTACTCTCTTTAAATGGTTTTATAATCT
* *
19022237 CAT-AAATGATTTTAAATTAAAATT
317 TATAAAATGATTTTAAATT-GAATT
* * * * *
19022261 TTTTCATTTTTAGTTTAAACAGATCGTAA-TTGAATCTTTGCA-TAGGGAAACATGAAGTGAAAG
1 TTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTG-ATGTTTGCATTAGAGAAACATGAAGTGAAAG
* * * * * * *
19022324 CCATCTATTTACAAGAAAAGTCCATTTATACTTACTTATGCCTTCGAAAGTCTAGTTATTCT-CC
65 CCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTAGTTA--CTGCT
* * * * ** * * *
19022388 CTAAATAGTTTTATAA-TCTTATAAAATTA-TTTAAGTTGAA-TTTTTTAAATTTTTGGTTAACA
128 TTAAATGGTTTTATAACT-TTAT-AAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATTTCTAGTTAAAA
* * * * * *
19022450 CATATTC-TAATTTGTTGTTTGCATCT-AGAAACATGAAGTGATAGCCATCCATTGATAAGAAAA
191 CAGA-TCATAA-TTGATGTTTGCAT-TGGGAAACATGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAA
* * * * * *
19022513 GTCCATTTAAAGTTACTCATGCCTTT-GAAAGCCTTGCTACTCTCTTTAAGTGGTTTTATAGTCT
253 GTCCATTTATAGTCACTCATG-CTTTCGAAAGCCTAGTTACTCTCTTTAAATGGTTTTATAATCT
* * *
19022577 TA-GAAATGATTTTAAGTAGAAATGT
317 TATAAAATGATTTTAAATTG-AAT-T
* ** * * * *
19022602 TTTTCCTTTTTGGTT-AAACAGATCATAATCGGATGTTTGCGTCA-CGAAACATGAAGCGAAAGC
1 TTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGAGAAACATGAAGTGAAAGC
* * * * * * * *
19022665 CATCCATTGATAATAAATGTCCATTTATACTCACTTATGCTTTCGAAAGCCTTGTTAGTTGCTTT
66 CATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTAGTTA-CTGCTTT
* *
19022730 AAATGGTTTCATAACTTTGTAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTT-AGTTT-TCA-TTAAAA-A
130 AAATGGTTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCA-TTTCT-AGTTAAAACA
* * * * *
19022791 GATCATAATTTGATGTTTGCATCGAGAAACGTGAAGTGAAAGCCATCCATTGATAA-AAGAAGTC
193 GATCATAA-TTGATGTTTGCATTGGGAAACATGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAA-AAGTC
* * * * * ** *
19022855 CATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTTGTTACTCGCTGTAAATGGTTTTATAGCCATAT-
256 CATTTATAGTCACTCATGCTTTCGAAAGCCTAGTTACTCTCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATA
* * * **
19022919 CAATAATTTTGAATCAAAAGTT
321 AAATGATTTTAAAT-TGAA-TT
* * * * *
19022941 TTTTCATTTGTAGTTAAAACAGATCATAATTGGATGTTTGCA-TGGAGAAACACGAAGTGAAAGC
1 TTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGAGAAACATGAAGTGAAAGC
* * ** *
19023005 CATTCATT-AGCAAG-AAAGTTTCATTTATAGTCACTCATATCTTCGAAAGCCTTA-TTACTCGT
66 CATCCATTGA-CAAGAAAAG-TCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCC-TAGTTACT-GC
* ** * * * * *
19023067 TTTAAGTCCTTTTACAACTTTATAAATGATTTTAAACT-ATTTTTTTTTTCATTTTTCA-TTTAA
127 TTTAAATGGTTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGA-ATTTTTTTTCATTTCT-AGTTAAA
* ** * * *
19023130 ACAGGTCATAATTTGATGTTTGCATCAAGG-AACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAGGAAAA
190 ACAGATCATAA-TTGATGTTTGCAT-TGGGAAACATGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAA
* * * * * *
19023194 GTCCATTTATAGTTACTTATGCCTTCAAAAGCATAATTTA-T-TACTTTAAATGGTTTTATAA-C
253 GTCCATTTATAGTCACTCATGCTTTCGAAAGCCT-AGTTACTCT-CTTTAAATGGTTTTATAATC
* *
19023256 TT-TATAAATAATTTCAAAATTGAATT
316 TTATA-AAATGATTT-TAAATTGAATT
* ** * * *
19023282 TTTCTCATTTTTGGTTAAAACATATTGTTATTTGAGGTTTG-AGTT-GAGAAACGTGAAGTGAAA
1 TTT-TCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCA-TTAGAGAAACATGAAGTGAAA
* * * * * *
19023345 ACCATCCATGGACAAGCAAAGTCCATTTATAATTC-CTCATACCTTTGAAAGCCTAGTTACTTGC
64 GCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTAT-AGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTAGTTAC-TGC
* * * * * *
19023409 TTTCAATGGTTTTAT-AGTCTTATAAATGATTTTAAGTAGAAATTTTTTTACATTTCTGGTTAAA
127 TTTAAATGGTTTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAATTG-AATTTTTTTTCATTTCTAGTTAAA
* * * ** * * *
19023473 AAATATCATAATTGGATGTTTGC-TTAGAGAAATGTGAAGTGAAGGCCATCCATTGACAAAAAAA
190 ACAGATCATAATT-GATGTTTGCATT-GGGAAACATGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAA
** * * *
19023537 GTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTT-GAAAGTATAGTTACAT-GCTTGAAATGGTTTTAT-AGC
253 GTCCATTTATAGTCACTCATG-CTTTCGAAAGCCTAGTTAC-TCTCTTTAAATGGTTTTATAATC
*
19023599 -CATACAAATGATTTTAAATT-AATTTT
316 TTATA-AAATGATTTTAAATTGAA--TT
* * * * * * * **
19023625 TTTTCATTTCTAGTTTAAACAGATCGTAA-TTGAATCTTTGCA-TGGGGAAACATGAAACGAAAG
1 TTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTG-ATGTTTGCATTAGAGAAACATGAAGTGAAAG
* * *
19023688 CCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATACTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTAGTTGCTCTCTT
65 CCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTAGTTACT-GCTT
* * * * * *
19023753 TAAATGGTTTTATAA-TCTTATAAAATGATTTTAAGTTGAA-TTATTTTAATTTTTGGTTAACAC
129 TAAATGGTTTTATAACT-TTAT-AAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATTTCTAGTTAAAAC
* * * * * ** * *
19023816 AGATCCTAATATGTTCTTTGCATCT-GAAAACATGAAGTGAAAATCGTCCATTGATAAGAAAAGT
192 AGATCATAAT-TGATGTTTGCAT-TGGGAAACATGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGT
* * * * * * *
19023880 TCATTTAAAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTTA-CTACTCGT-TTTAATTGGTTTTATAGTCTT
255 CCATTTATAGTCACTCATGCTTTCGAAAGCC-TAGTTACTC-TCTTTAAATGGTTTTATAATCTT
* * **
19023943 A-GAAATGATTTTAAGTAAAATAAT
318 ATAAAATGATTTTAAATTGAAT--T
* * * * * * *
19023967 TTTTCATTTCTGGTTAAAATAGATCATAA-TTGAATGTCTGCATCA-AAAAACGTGAAGCGAAAA
1 TTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTG-ATGTTTGCATTAGAGAAACATGAAGTG-AAA
* * * * * * * * * *
19024030 ACCATGCATTGATAATAAATGTCCATTTATAGTCACTCATGTCTTCAAAAACTTTGTTACTCGCT
64 GCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTAGTTACT-GCT
* * * * *
19024095 TTAAGTGGTTTCATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTCTTTTTTCAGTAT-TGGTTAACA
128 TTAAATGGTTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATT-TTTTTTCA-TTTCTAGTTAAAA
* * * *
19024159 -AGATTATAATTTGATGTTTGCATTAGGAAACATGAAGTGAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGT
191 CAGATCATAA-TTGATGTTTGCATTGGGAAACATGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGT
* * * * ** *
19024223 CCA-TTATAGTCACTCATGCCTTT-AAAAACCTTGTTACTCGCTTTAAATGG-TTTATAGCCATA
255 CCATTTATAGTCACTCATG-CTTTCGAAAGCCTAGTTACTCTCTTTAAATGGTTTTATAATCTTA
* **
19024285 T-AAATAATTTTAAATCAAAAGTT
319 TAAAATGATTTTAAAT-TGAA-TT
* * * * *
19024308 TTTTCATTTTTAGTTAAAACATATCATAA-TTGAATATTTGCATT-GGGAAAAATGAAGTGAAAG
1 TTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTG-ATGTTTGCATTAGAGAAACATGAAGTGAAAG
* * * * * *
19024371 CCATTCATT-AGCAAG-AAAGTTCTATTTACAATCACTCATGCCTTTGAAAGCCTTGTTACT-CG
65 CCATCCATTGA-CAAGAAAAG-TCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTAGTTACTGC-
* * * * * *
19024433 TTTCAAGTAGTTTTATAACTTTATAAATGGTTTTAAATTGAAATTGTTTTCATTTCTGGTTAAAA
127 TTT-AAATGGTTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATTTCTAGTTAAAA
* * ** *
19024498 CAAATCATAATTTGTTGTTTGCATTGAAAAACGTGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGT
191 CAGATCATAA-TTGATGTTTGCATTGGGAAACATGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGT
* * * * * * * * * *
19024563 CCATCTATAGAT-ACTCATGCCTCCAAAAGCGTTGTTACTCACTTTAAATGGTTTGAAAATCTCA
255 CCATTTATAG-TCACTCATGCTTTCGAAAGCCTAGTTACTCTCTTTAAATGGTTTTATAATCTTA
*
19024627 T-AAATGGTTTTAAATTGAATTT
319 TAAAATGATTTTAAATTGAA-TT
* * * * * * * **
19024649 CTTTTCATTTTAGGTTCAAACATATCATAATTTGTTGTTTAC-GTAGGGAAACATGAAGCAAAAG
1 -TTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGAGAAACATGAAGTGAAAG
* * * * * * * * *
19024713 CTATCCGTTAACAAGAAAAGTCCATTTTTAGTCACTCATGCCTT-TAATAGGCTTGTTATTATCT
65 CCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAA-AGCCTAGTTACT-GCT
* * * * * * * *
19024777 TCAAGTGGTTTTGTAACTTTATAAATTATTATAAATTGAATTTGTTTTCATTTTTAGTTAAAATA
128 TTAAATGGTTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATTTCTAGTTAAAACA
* * * * *
19024842 GATCATAATTTGTTGTTTGCATTGGGAAACATAAAGCAAAAGCTATCCATTAACAAG-AAAGTCC
193 GATCATAA-TTGATGTTTGCATTGGGAAACATGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCC
* * * * * * * *
19024906 ATCTATAGTCACTTATTC-CTCTGAAAGCATTGTTACTCGCTTTAAATGGTTTTACAAT-TTCAT
257 ATTTATAGTCACTCATGCTTTC-GAAAGCCTAGTTACTCTCTTTAAATGGTTTTATAATCTT-AT
*
19024969 -AAATGATTTGAAATTGAATT
320 AAAATGATTTTAAATTGAATT
* * * * * * * * *
19024989 TTTTTATATTTTAGGTTCAAACAGATCATAATTTGTTATTTACCTTGGA-AAACGTGAAGCGAAA
1 TTTTCAT-TTTT-GGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGAGAAACATGAAGTGAAA
** * * * * * *
19025053 ATCATCTATTTAGAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTTATGCCTTCGACAAG-CTTGTTACTTGA
64 GCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGA-AAGCCTAGTTAC-TGC
*** * *
19025117 TTTAAGCAGTTTTATAAC-TTATAAATGATTTTAAATT-ATATTATTTTTCA-TTCTTGATTAAA
127 TTTAAATGGTTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGA-ATTTTTTTTCATTTCTAG-TTAAA
* * * * ** * * *
19025179 ATAGATCATAATTTGATGTGT-CTATTAGAAAATGTGAAGTGAAAACTATCCATTGACAAG-AAA
190 ACAGATCATAA-TTGATGTTTGC-ATTGGGAAACATGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAA
* * * * *
19025242 TTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTT-GAAAGCATAATTACT-TGCTTTAAATGATTTTATAATC
253 GTCCATTTATAGTCACTCATG-CTTTCGAAAGCCTAGTTACTCT-CTTTAAATGGTTTTATAATC
* *
19025305 TTAT-AAATGATTTTAAGTTCAATT
316 TTATAAAATGATTTTAAATTGAATT
* * ** * * * * * * * *
19025329 GTTTTCATATTTGGCTAAATTAGATCAGAATTTGTTCTTTACATCA-AGAAGCGTGAAGCT-CAA
1 -TTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGAGAAACATGAAG-TGAAA
* * * ** * * **
19025392 GCCATCAATTAACAA-AACAAGTCCATTCATAGTCTTTTACGCCTTTAAAAGCCTAGTTACTTGC
64 GCCATCCATTGACAAGAA-AAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTAGTTAC-TGC
* * * * * * * *
19025456 TTTAAGTAGTTTTA-AAATCTTATAAATGATTTTAATATTCAA-TTTTTCTCATTTTTGGTTGAA
127 TTTAAATGGTTTTATAACT-TTATAAATGATTTTAA-ATTGAATTTTTTTTCATTTCTAGTTAAA
* * * * *
19025519 ACAAATCTTAATTAGAT-TTAT-CATATTAGGAAACATGAAGCGAAAGCCATCCAATGACAAGGA
190 ACAGATCATAATT-GATGTT-TGC--ATTGGGAAACATGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAA
* * *
19025582 AAGTCTATTTATAGTTACTCATGCCTTT-GAAAAGCCTAGTTACTCAT-TTTAAATGATTTTATA
251 AAGTCCATTTATAGTCACTCATG-CTTTCG-AAAGCCTAGTTACTC-TCTTTAAATGGTTTTATA
*
19025645 ATCTTAT-AAATGAGTTTAAATTGAATTTT
313 ATCTTATAAAATGATTTTAAATTGAA--TT
* * * * * * *
19025674 TTTTCATTTCTAGTTAAAACAGATCCTGATTTGATGTTTGCA-T-CAGAAACATGAAGCGAAAGG
1 TTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGAGAAACATGAAGTGAAAGC
* * * *
19025737 CATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTTATGACTTCGAAAGCCTAGTTATTCGCTTT
66 CATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTAGTTACT-GCTTT
* * * * * *
19025802 AAATTGTTTTATAA-TCTAATAATTGATTTTAAATTGAAATTGTTTTCATTTCTGGTTAAAACAG
130 AAATGGTTTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATTTCTAGTTAAAACAG
* * * * * *
19025866 GTCATAAATGGATGTTTGCATTGGGAAACATGAAGCAAAAGCTATCCATTGACAAAAAAAATCCA
194 ATCAT-AATTGATGTTTGCATTGGGAAACATGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCA
* * ** *
19025931 TTTATAGTCACTCATGCTTTC-AACAGGCTTA-TTACTCACTTTATGTGATTTTATAA-CTT-TA
258 TTTATAGTCACTCATGCTTTCGAA-A-GCCTAGTTACTCTCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATA
*
19025992 TAAATGATTGTAAATT-AATTTTTT
321 -AAATGATTTTAAATTGAA----TT
* * ** * * **
19026016 TTATTCATTTTTAGTTGAAATGGAAT-ATAATTTGTTGTTTGCATTAG-GAGACGCGAAGTGAAA
1 TT-TTCATTTTTGGTTAAAACAG-ATCATAATTTGATGTTTGCATTAGAGAAACATGAAGTGAAA
* * * * * * * * *
19026079 CCCATTCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGACACTTAGGCCTCCTAAAGCATTA-TTACTCTC
64 GCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGC-CTAGTTACT-GC
* * * * *
19026143 TTTAAATGGTTTTA-AAATCTTATAAATGGTTTTGAATTGAATTTTGTTTTCATTT-TAGGCTCA
127 TTTAAATGGTTTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAATTGAATTTT-TTTTCATTTCTA-GTTAA
* * ** * *
19026206 AACAGATCATAATTTGTTGTTTGCCTTGAAAAACATGAAGCTAAAGCCATCCATTGAGAAGAAAA
189 AACAGATCATAA-TTGATGTTTGCATTGGGAAACATGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAA
* * * * * * *
19026271 GTCCACTTATAATCACTCATGCTTTCAACAAG-CTTGTTACT-TGATTTAAGTGGTTTTATTA-C
253 GTCCATTTATAGTCACTCATGCTTTCGA-AAGCCTAGTTACTCT-CTTTAAATGGTTTTATAATC
* *
19026333 TT-TATAAATGATTTTTAATTAAACTTT
316 TTATA-AAATGATTTTAAATTGAA--TT
* * * *
19026360 TTTTCATTTTT-GTT--AA-A-A-C---A--TGATGTTTCCATCA-AGAAACGTG-AG-GCAAAA
1 TTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGAGAAACATGAAGTG-AAAG
** * ** *
19026411 CCTATCCATTGACAAG-AAAGTTTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGTGTAGGTACTTGCT
65 CC-ATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTAGTTAC-TGCT
* * * * * * * * * *
19026475 TTAAATGGTTTTATAA-TCTTACAAATGACTTTCAGTTGCA-TTGTTTTCATTTTTGGCTAAATC
128 TTAAATGGTTTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATTTCTAGTTAAAAC
* ** * * * *
19026538 ATATCCGAATTTGGTGTTTGCATTGAGAAACATGAAGC-ACAAGCCATCCATTCACAAGAAAATT
192 AGATCATAA-TTGATGTTTGCATTGGGAAACATGAAGCGA-AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGT
* * * * * * *
19026602 CCATCTATAATCTCTAATGCCTTT-GAAAGCATTGTTACT-TACTTTAAGTGGTTTTATAA-CTT
255 CCATTTATAGTCACTCATG-CTTTCGAAAGCCTAGTTACTCT-CTTTAAATGGTTTTATAATCTT
*
19026664 -TAGAAATGATTTTAAATTAAATTT
318 ATA-AAATGATTTTAAATTGAA-TT
** ** * * * * * **
19026688 TTTTCATTTTTTCTTAAAACTTATAATAATTAGTTGTTTGCATTAG-TAAGCATGAAGCAAAAGC
1 TTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGAGAAACATGAAGTGAAAGC
* * * * * * * *
19026752 CATCCATTGACAGGCAATGTCAATTTATAGTGACTTATGCCGTCGAAAGCCTAGTTACTTACTTT
66 CATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTAGTTAC-TGCTTT
* ** ** *
19026817 AAATGGTTTTAAAACTTTATAAATGATTTTTGTATTGAA-TTTTACTCATTT-TTGCTTAAAACA
130 AAATGGTTTTATAACTTTATAAATGA-TTTTAAATTGAATTTTTTTTCATTTCTAG-TTAAAACA
* ** * * ** * * * *
19026880 AATTGTAATTTTAT-TTGTCTCATCAGGAAACGTGAAGTGAAAG-CA---A-TGACAAGGAAAGC
193 GATCATAA-TTGATGTT-T-GCATTGGGAAACATGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGT
* * * * * *
19026939 CCATTTATAGTCACTCATACCTTT-GAAAGCCTTGCTACTCACTTGAAATAGTTTTATAATCTTA
255 CCATTTATAGTCACTCAT-GCTTTCGAAAGCCTAGTTACTCTCTTTAAATGGTTTTATAATCTTA
**
19027003 T-AAATGAGCTTAAATT-AATTTTTTT
319 TAAAATGATTTTAAATTGAA-----TT
* * * * * **
19027028 TTCTTCATTTCTGGTTAAAACAAATCATGATTTGATGTTTGCA-T-CATAAACATGAAGCAAAAG
1 TT-TTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGAGAAACATGAAGTGAAAG
* * * * *
19027091 CCATCCATTGACAAGAAAAAGTCAATTTATAGTCACTTATGACTTCGAAAACCTA-AT-CT-CTT
65 CCATCCATTGACAAG-AAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTAGTTACTGCTT
* * * ** * *
19027153 TAAATTGTTCTATAA-TCTTATAATTGATTTTAAATCAAAATTGTTTTCATTTCT-GATTAAAAC
129 TAAATGGTTTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATTTCTAG-TTAAAAC
* * *
19027216 AGGTCATAATTTGATGCTTGCATTGGGAAACATGAAGCGAAAGCCATTCATTGACAAGAAAAGTC
192 AGATCATAA-TTGATGTTTGCATTGGGAAACATGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTC
* * * * * * *
19027281 CATTTATTA-TCACTCATGCCTTCGACAGGCTTA-TGACTCGCTTTAAGTGGTTTTTTAA-CTTT
256 CATTTA-TAGTCACTCATGCTTTCGA-AAGCCTAGTTACTCTCTTTAAATGGTTTTATAATC-TT
* *
19027343 ATAAACA--ATTGTAAATTGATTT
318 ATAAA-ATGATTTTAAATTGAATT
* * * * * * **
19027365 TGTTTATATTTTTAGTCAAAATAGATCATAATTTGCTGTTTGCA-TCGAGAAACATGAAGCAAAA
1 T-TTT-CATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGAGAAACATGAAGTGAAA
* * * * * * ** *
19027429 ACCATCCATTGACAA-ATAAAGTCTATCTATAATCACTCATTCCATCGAAAGTGTTGTTACTTGC
64 GCCATCCATTGACAAGA-AAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTAGTTAC-TGC
* ** * * * *
19027493 ATTAAATTATTTTA-AAATCTCATAAATGATTTGAAATTGAATTTTTTTTCATTT-TAGGTTCAA
127 TTTAAATGGTTTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATTTCTA-GTTAAA
* * * * *
19027556 ACATATCATAATTTGTTGTTTGCCTTGGAAAACATGAAGCGAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAG
190 ACAGATCATAA-TTGATGTTTGCATTGGGAAACATGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAG
* * *
19027621 TCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCG--A--C-AG--A-------T-AA--G--TCAT--T-TTA
254 TCCATTTATAGTCACTCATGCTTTCGAAAGCCTAGTTACTCTCTTTAAATGGTTTTATAATCTTA
19027664 T-AAATGATTTTAAATT---TT
319 TAAAATGATTTTAAATTGAATT
** * * * **
19027682 TTTT-ATTTTTGGTTAAAACAGAAAATAATTTGATGTTTCCATT-G-GCAAACGTAAAGCAAAAG
1 TTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGAG-AAACATGAAGTGAAAG
* * ** * * *
19027744 CTATCCATTGACAAG-AAAGTCCATTTATAGTTACTCATGCCTTTAAAAACATAGTTACTCACTT
65 CCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTAGTTACT-GCTT
* * * ** * * *
19027808 TAAATGGTTTTATAA-TCTTAGAAATGACTTTAAGTTGAA-TTGCTTTCATTTTTGGCTAAAACA
129 TAAATGGTTTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATTTCTAGTTAAAACA
* * * ** * *** * * * * *
19027871 TATTAGAATTTCTCATTTGCATCAAGAAACGTGAAGCGCAAGCCATACATTAATAAGAAAAGTCC
193 GATCATAATTGAT-GTTTGCATTGGGAAACATGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCC
* * * * * *
19027936 ATCTATAGTCATTAATGCCTTT-GAAAGCGTTGTTACT-TGCTTTAAGTGGTTTTATAA-CTT-T
257 ATTTATAGTCACTCATG-CTTTCGAAAGCCTAGTTACTCT-CTTTAAATGGTTTTATAATCTTAT
19027997 ATAAATGATTTTAAATTGAATTT
320 A-AAATGATTTTAAATTGAA-TT
** * * * * **
19028020 CTTTTCATTCATGATGAAAACATATCATAATTT-ATTGTTTGCATCAGA-AAACATGAAGCAAAA
1 -TTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGA-TGTTTGCATTAGAGAAACATGAAGTGAAA
* * * * * *
19028083 GTCATCCATTAACAAGAAAAGTTCATTTATAGTGACTTATGCCTTCAAAAGCCTAGTTACTTGCT
64 GCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTAGTTAC-TGCT
* * * * * *
19028148 TTCAATGGTTTTA-AAATCTTATAAATGATTTTTAAGTTGAA-TTTTTCT-AGTTTTTGGTTAAA
128 TTAAATGGTTTTATAACT-TTATAAATGA-TTTTAAATTGAATTTTTTTTCA-TTTCTAGTTAAA
* ** ** * * *
19028210 ACAAATTGTAATTTGAT-TTGTCGCATTGGGAAATGTGAAGCGAAAGACATCAAATGACAAGAAA
190 ACAGATCATAA-TTGATGTT-T-GCATTGGGAAACATGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAA
* * * * * *
19028274 AGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCATTGTTACTCACTTTAAATTGTTTTATAATCT
252 AGTCCATTTATAGTCACTCATGCTTTCGAAAGCCTAGTTACTCTCTTTAAATGGTTTTATAATCT
* **
19028339 TAT-CAATGATTTTAAATCAAAATT
317 TATAAAATGATTTTAAAT-TGAATT
** * * * *
19028363 GTTTTCATTTTCAGTTAAAATAGATCATAATTTGTTGTTTGCATT-GGGAAGCATGAAGTGAAAG
1 -TTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGAGAAACATGAAGTGAAAG
* * * * * * *
19028427 CCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATCTATAGGCACTCATGCCTCCGGAAGCGTTGTTACTCACTT
65 CCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTAGTTACT-GCTT
* * * *
19028492 TAAATGGTTTTA-AACTGTCATAAATGATTTTAAATTG-ATTTTTTTTTATTT-TAGGTTCAAAT
129 TAAATGGTTTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATTTCTA-GTTAAAAC
* * * * *
19028554 AGATCATAATATGTTGTTGGTATTGTGAAACGTGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTC
192 AGATCATAAT-TGATGTTTGCATTGGGAAACATGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTC
* * * * * * * * *
19028619 CATTCATAGTCACTTATGCCTTCGAAAGACTTGTTACTCACTTTAAGTGATTTTTCTAA-CTT-T
256 CATTTATAGTCACTCATGCTTTCGAAAGCCTAGTTACTCTCTTTAAATG-GTTTTATAATCTTAT
*
19028682 ATAAATGATTTTAAATTAAATTT
320 A-AAATGATTTTAAATTGAA-TT
* * * * * * * *
19028705 TTTTAATTTTTGGTGAAAACAGATAATAATTTAAAGTTTGCATCA-AGAAACGTGAAGAGAAAGC
1 TTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGAGAAACATGAAGTGAAAGC
* * * * * * *
19028769 TATCCACTAACAAG-AAAGTCCATTTATAGTTGTCCCTTATGCCTTCAAAAGCGTAGTTACTTGC
66 CATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATA---GTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTAGTTAC-TGC
* * * *
19028833 TTTAAATGGTTTTATAA-TCCTATAAATGATTTTAAGTTGAATGTTTTTTCATTT-TTGATTAAA
127 TTTAAATGGTTTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATTTCTAG-TTAAA
* * ** ** * * * *
19028896 ACATATTATAATTTGATGTTTGCA-TAAGAAATGTGAAACAAAAGCCATTCATTGACAAGAAAAA
190 ACAGATCATAA-TTGATGTTTGCATTGGGAAACATGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAG
* ** * * * * *
19028960 TGCATTTATAGTTGCTTATGCCTTCGAAAGCTTAGTTAATCTCTTTAAATGGTTTTATAATTTTA
254 TCCATTTATAGTCACTCATGCTTTCGAAAGCCTAGTTACTCTCTTTAAATGGTTTTATAATCTTA
* *
19029025 T-AAATGAGTTTAAATTGATTTT
319 TAAAATGATTTTAAATTGA-ATT
* * * * * * * * ** ** *
19029047 TTTTTAATCTTGGTTAACACAAATCCTAATTTGATATTTGCAAT-GAGAAATGTGAAGCAAAAGT
1 TTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGAGAAACATGAAGTGAAAGC
* * * * *
19029111 CTTCCATTGAGAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATACCTTTGAAAGCCTAGTTACACT-CTT
66 CATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTAGTT--ACTGCTT
* * * * * **
19029175 TAAATGGTTTTATAA-TTTGATAAATGGTTTTAAATCAGAATTTTTTTTAATTTCCAGTTAGAGT
129 TAAATGGTTTTATAACTTT-ATAAATGATTTTAAAT-TGAATTTTTTTTCATTTCTAGTTAAAAC
* * *
19029239 AGATCATAATTGGATGTTTGCATTGAGAAA-ATTGAAGCAAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGT
192 AGATCATAATT-GATGTTTGCATTGGGAAACA-TGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGT
* * * * * * ** * *
19029303 CTATTTATATTCACTGATGCCTTCAAAAGCCTAATTACTAGCTTGAAATGGTTTTACAATCTTAT
255 CCATTTATAGTCACTCATGCTTTCGAAAGCCTAGTTACTCTCTTTAAATGGTTTTATAATCTTAT
* * *
19029368 -AAATGAGTTT-AATAGATTTTT
320 AAAATGATTTTAAATTGA--ATT
* * * * * *
19029389 TTTTCATTTTTGCTTAAAATATATCATAATTTGAT-TTTCGCA-TCGAGAAACGTAAAGT-AGAA
1 TTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTT-GCATTAGAGAAACATGAAGTGA-AA
** * * * * * *
19029451 GATATCCATTGACAAAAAAAGTCTATTTATAGTCACTTATACCTTTGAAAGCCTAATTACTAGCT
64 GCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTAGTTACT-GCT
* * * * * * * *
19029516 TAAAATGATTTTATAA-TCATATAAATGAGTTTAAATTGAAGTTTTTTTCATCT-TAGGTTCAGA
128 TTAAATGGTTTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATTTCTA-GTTAAAA
* * **
19029579 TAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGGAAACACAAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGT
191 CAGATCATAA-TTGATGTTTGCATTGGGAAACATGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGT
* ** * * *
19029644 CTATTTATAGTCACTCATGCCTTT-GAAAGCCTTCTTACT-TGCTTTAAGTGGTTTTGT-AGCTT
255 CCATTTATAGTCACTCATG-CTTTCGAAAGCCTAGTTACTCT-CTTTAAATGGTTTTATAATCTT
* *
19029706 -TATAAATTATTTCAAATTGAATTT
318 ATA-AAATGATTTTAAATTGAA-TT
* * * * * * **
19029730 TTTTCATTTGTAGCTAAAATAGATCATAATTT-ATTGTTTGCATT-GGGAAACGTGAAGCAAAAG
1 TTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGA-TGTTTGCATTAGAGAAACATGAAGTGAAAG
* * * * * * ** * *
19029793 CCAACCATTGGA-AAGAAAAGTCTATCTCTA-TCACTCATTCCTCCGAAAGTGTTGTTACTCTCT
65 CCATCCATT-GACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTAGTTACT-GCT
* * *
19029856 TTAAATGGTTTTATAA-TCTTATAAGTGATTTTAAATTGAATTATTTTTTCATTT-TAGGTTCAG
128 TTAAATGGTTTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAATTGAATT-TTTTTTCATTTCTA-GTTAAA
* * * **** ** * * * *
19029919 ATAAATCATAATTTGTTGTTTGCATCAACAAATGTGAAGCAAAAGCTATCCATTAATAAGAAAAG
190 ACAGATCATAA-TTGATGTTTGCATTGGGAAACATGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAG
* * * * ** *
19029984 TCTATCTATAGTCACTCATGCCTTT-GAAAAGCTTA-TTACT-TGCTTTAAGTATTTTTATGA-C
254 TCCATTTATAGTCACTCATG-CTTTCG-AAAGCCTAGTTACTCT-CTTTAAATGGTTTTATAATC
19030045 TT-TATAAATGATTTTAAATTGAATTTT
316 TTATA-AAATGATTTTAAATTGAA--TT
* * ** * * * *
19030072 TTTTTATTTTTTGTTAAAGTAGATCATAATTTGATGTTTGTATCA-AGAAACATAAAGCGAAAGC
1 TTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGAGAAACATGAAGTGAAAGC
* * * * ** * * *
19030136 TATCCA-TGAACAAG-AAACTGCATTTATAGTCACTCAAGTATTTGAAAGCTTAGTTACTCACTT
66 CATCCATTG-ACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTAGTTACT-GCTT
* * * * * *
19030199 TAAAATGGTTTTATAA-TCTTATAACTGATTTTAAGTTGATTTTTTTTGTCATTTTTGGTTAACA
129 T-AAATGGTTTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTT-TCATTTCTAGTTAAAA
* * * * ** ** *
19030263 CATATCAAAATTTGTTGTTTACCATTGAAAAATGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAG
191 CAGATCATAA-TTGATGTTT-GCATTGGGAAACATGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAG
* * * * * * * * *
19030328 TCCATCTAGAGTCATTAATGCCTT-GAAAAGCATTGTTACT-TGCTTTAAGTGGTTTTGTAA-CT
254 TCCATTTATAGTCACTCATGCTTTCG-AAAGCCTAGTTACTCT-CTTTAAATGGTTTTATAATCT
19030390 T-TATAAATGATTTTAAATTGAATTT
317 TATA-AAATGATTTTAAATTGAA-TT
* * * * ** **
19030415 TTTTCAGTTTTGGCTAAAACAAATCATAATTT-AT-TTACTACATTAG-GAAATGTGAAGCAAAA
1 TTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTT--TGCATTAGAGAAACATGAAGTGAAA
* * * * * * * * *
19030477 GCCATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAATGACTTATGCCTTTGCAAGCATTGTTACTCACT
64 GCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTAGTTACT-GCT
* ** * * * *
19030542 TTAAATGGTTTTATAA-TCTTATAAATGAGTTTAAATCAAATTTTTTTTCATTTTTGGCTAAAAT
128 TTAAATGGTTTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATTTCTAGTTAAAAC
* * * * *** ** * *
19030606 AGATCCTAGTTTAATATTTGCATCAAGAAATGTGAAGCAAAATCCATCCATTGA-AGAGAAAAGT
192 AGATCATA-ATTGATGTTTGCATTGGGAAACATGAAGCGAAAGCCATCCATTGACA-AGAAAAGT
* * * * *
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255 CCATTTATAGTCACTCATGCT-TTCGAAAGCCTAGTTACTCTCTTTAAATGGTTTTATAATCTTA
* **
19030734 -CAAATGATTTTAAATCAAAATT
319 TAAAATGATTTTAAAT-TGAATT
* * * * * * * *
19030756 TTTGCCCATTTTTGGTTAGAACATATCATAATTGGATGTTTGCATCA-ACAGACGTGAAGTGAAA
1 TTT--TCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGAGAAACATGAAGTGAAA
* * * * * *
19030820 GTCATCCACTGACAAGAAAAGACCATTTGTAGTTACTCATGCCTTCGAAAGCCTATTTACTCGCT
64 GCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTAGTTACT-GCT
* * * * *
19030885 TTAAATGGTTTTATGA-TCTTATAAATGATTTTAAAATTGAA-TTTTTCTCATTTTTGGTTAAAG
128 TTAAATGGTTTTATAACT-TTATAAATGATTTT-AAATTGAATTTTTTTTCATTTCTAGTTAAAA
* * * * * *
19030948 TAGATCATAAGTTGATGTTTGCATCGGTAAAGATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAAT
191 CAGATCATAA-TTGATGTTTGCATTGGGAAACATGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGT
* * * * *
19031013 CCATTTATACTGACTCATGCCTTT-AAAAGCCCTA-TTACTCACTTTAAGTGGTTTTATAA-CTT
255 CCATTTATAGTCACTCATG-CTTTCGAAAG-CCTAGTTACTCTCTTTAAATGGTTTTATAATCTT
* *
19031075 -TATAAATTATTTTAAATTGATTTT
318 ATA-AAATGATTTTAAATTGA-ATT
* * **
19031099 TTTTCATTTTTGG-TAAGAATAGATCGTAATTTGATGTTTGCATT-GAGAAA-AGTGAAGCAAAA
1 TTTTCATTTTTGGTTAA-AACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGAGAAACA-TGAAGTGAAA
* * * * * * *
19031161 GTCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAATCATTTATACCTTCAAAACCCTAG-T--TGC--
64 GCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTAGTTACTGCTT
* * * * *
19031221 ------------TCAC--TATAAATGATTTTAAAATT-AAATTTTTCTCATTTTTGGTTAAAACA
129 TAAATGGTTTTATAACTTTATAAATGATTTT-AAATTGAATTTTTTTTCATTTCTAGTTAAAACA
* * * ** * * * *
19031271 AATCGTAATTTGATGTTTGCATTGAGAAATGTTAAGCAAAAGCCATCTATTGACAAGAAAAGTTC
193 GATCATAA-TTGATGTTTGCATTGGGAAACATGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCC
* * * * * * * *
19031336 ATTTGTAGTCATTCATACCTTT-GAAAGCCTAGTTACACACTTTAGATAGTTTTATAGTCTTAT-
257 ATTTATAGTCACTCAT-GCTTTCGAAAGCCTAGTTACTCTCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATA
** *
19031399 AAATGATTTTAAATAAAAAAGT
321 AAATGATTTTAAAT--TGAATT
* * * * * * * ** *
19031421 TTTTCATTTCTAGATAAAACATATCATAATTGGATTTTTGCATCAG-GAAATGTGAAGCGAAA-C
1 TTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGAGAAACATGAAGTGAAAGC
* * * * * * * * * *
19031484 CTTTCCATTGATAAGAAAAGCCCATTTGTAGTTACTTATACTTTTGAAAGCCTTGTTACTCGCTT
66 C-ATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTAGTTACT-GCTT
* * * * * * * *
19031549 GAAGTGGTTTTATAACTTTATAAATAACTTTAAATTG-ATTTTTTTTCTTTTTTGGTT-AAGCTA
129 TAAATGGTTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATTTCTAGTTAAAAC-A
** * * *
19031612 GATCATAATTTGATGTTTGCATTAAGAAACGTAAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCC
193 GATCATAA-TTGATGTTTGCATTGGGAAACATGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCC
* ** * * * *
19031677 ATTTATAGTCGCTC-TTTTATTCGAAAGCCTAATTGCTCACTTTAAAT-GTTTTACAATCTTAT-
257 ATTTATAGTCACTCATGCT-TTCGAAAGCCTAGTTACTCTCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATA
* *
19031739 AAATAATTTTATATTGAATTT
321 AAATGATTTTAAATTGAA-TT
* *** * * **
19031760 TTTCTCATTTTTGGTTAAAACATATTGCAATTTGATGTTTGCATT-GGGACACATGAAACGAAAG
1 TTT-TCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGAGAAACATGAAGTGAAAG
* * * *
19031824 CCAT-C--T---------A-T---TTT-TAGTCA-TC---CCTCCGAAAACCTAGTCACTTGTTT
65 CCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTAGTTAC-TGCTT
* * * *
19031868 TAAATGGTTTTATAA-TCTTATAAATGATTTTAAATTGAA-CTTTTTCCATTTTTGGTTAAAACA
129 TAAATGGTTTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATTTCTAGTTAAAACA
* * * * * * * * *
19031931 GATCATTATTAGATGTTTTGCA-TCGAAAAGCATGAAGTGAAAACTATCCATCGACAAAAAAAGC
193 GATCATAATT-GATG-TTTGCATTGGGAAA-CATGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGT
* * * * *** * * * *
19031995 CCATTTATAGTTATTCTTGCCTTCGAAAGACC-AGTTACAAGCTTCAAATAGTTTTGTACTCTTA
255 CCATTTATAGTCACTCATGCTTTCGAAAG-CCTAGTTACTCTCTTTAAATGGTTTTATAATCTTA
19032059 T-AAATGATTTTAAATTGAAATGT
319 TAAAATGATTTTAAATTG-AAT-T
* * * * ** * **
19032082 TTTTCATTTCTAGTTAAAACAGATCA-AAATTGAATGTTCGCATCGGA-AAACCTGAAGCCAAAG
1 TTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTG-ATGTTTGCATTAGAGAAACATGAAGTGAAAG
** * * * * * * * *
19032145 CTGTCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGCCACTCATACATGCGAAAACTTTGTTACTCACTT
65 CCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTAGTTACT-GCTT
*
19032210 TAAGTGGTTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAA-TTTTTTTCATATT-T-GATTAAAAC
129 TAAATGGTTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCAT-TTCTAG-TTAAAAC
* * * * * * * * * *
19032272 ATATCATTATTTCATGTTTGTATCGAGAAA-AGTGAAGCAAAAACCATCCATTTACAAGAAAAAT
192 AGATCA-TAATTGATGTTTGCATTGGGAAACA-TGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGT
* *
19032336 CCATTTATAGT-AGCTTATGCCTTT-AAAAGCGATCTA-TTGACAAGAAAGT-TCATTTATAGTC
255 CCATTTATAGTCA-CTCATG-CTTTCGAAAGC---CTAGTT-AC-------TCTC--TT-TA---
** * * * * *
19032397 ACTCATGCCTTTAAAAGCCTTGT-TACT-ATCTTTAAATT--ATT
301 A---ATGGTTTTATAA-TCTTATAAAATGAT-TTTAAATTGAATT
* * * *** **** * **
19032438 TTATAATCTTATAAATAATTTTGAATCA-AAATT-AT-TTT-CATTTTTAGTTAAA-ATAGATCA
1 TTTTCAT-TTTTGGTTAAAACAG-ATCATAATTTGATGTTTGCA---TTAGAGAAACAT-GA--A
* ** * * * * *
19032498 -T-AATTTGTTATTTGCATTGAGAAACATGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCAGT
58 GTGAA--AGCCA--TCCATT--G--AC---AAG-AAAAG---TCCATT------TATAGT-CACT
* * * ** * ** * * * * * * *
19032561 TATAG-ATGCTCATGCCTCCA-AAAGTG-TTGTTACTCGCTTTAAATGGTTTGAAAATCTCATAA
101 CAT-GCCTTCGAAAGCCT--AGTTACTGCTT-TAAAT-G-GTT---T--TAT--AACT-TTATAA
* * ** * * * * * *
19032623 ATGGTTTTGAATTGAATTTCGTTTCATTT-TAGGTTCAAACATATCATAATTTGTTGTTTACGTA
152 ATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCATTTCTA-GTTAAAACAGATCATAA-TTGATGTTTGCATT
* * * * *
19032687 GGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCGTTAATAAGAAAAATCCATTTATAGTCACTCATGCCTTT-
215 GGGAAACATGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATG-CTTTC
* * * * * * *
19032751 GACAGGCTTGTTATTCTCTTCAAGTGG-TTTATAA-CTT-TATAAATGATTGTAAATTGAATTT
279 GAAAGCCTAGTTACTCTCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATA-AAATGATTTTAAATTGAA-TT
* * * * * *
19032812 GTTTTCATTTTTAGTTAAAATATATCATAATTT-ATTGTTTGCATT-GGGAAACATAAAGCGAAA
1 -TTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGA-TGTTTGCATTAGAGAAACATGAAGTGAAA
* * * * * * * * * *
19032875 GCTATCCATTGACAAGAAAAGTCTATATATAGTTACTTATTCC-TCTAAAAGCATTGTTACTCAC
64 GCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTC-GAAAGCCTAGTTACT-GC
* * *
19032939 TTTAAATGGTTTTA-AAATTTCATAAATGATTTGAAATTGAATTTTTTTAT-ATTT-TAGGTTTA
127 TTTAAATGGTTTTATAACTTT-ATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTT-TCATTTCTA-GTTAA
* * * * * *
19033001 AACAAATCATAATTTGTTATTTGCCTTGGGAAACATGAAGCGAAAGCCATCCATTTAGAAGAAAA
189 AACAGATCATAA-TTGATGTTTGCATTGGGAAACATGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAA
* * * * * ** *
19033066 GTTCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGACAGACTTGTTACT-TGATTAAA-GCAATTTTATAA-C
253 GTCCATTTATAGTCACTCATGCTTTCGAAAGCCTAGTTACTCTCTTTAAATG--GTTTTATAATC
*
19033128 TTAT-AAATGATTTTAAGTT-ATATTGT
316 TTATAAAATGATTTTAAATTGA-A-T-T
* * * * * * ** * *
19033154 TTTTCATTCTTGATTAAAATAGATCACAATTTGATGTGTCCATTAGA-AAATGTGAAGCGAAAAC
1 TTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGAGAAACATGAAGTGAAAGC
* * * * *
19033218 TATCCATTGATAAG-AAATTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCATAGTTACTTGCTTT
66 CATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTAGTTAC-TGCTTT
* * * * * * * **
19033282 AAATGATTTTATAA-TCTTATAAATAATTTTAAGTT-CAGTTTTTTTCATATT-TGGCTAAATTA
130 AAATGGTTTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTCAT-TTCTAGTTAAAACA
** * * * * * * * *
19033344 GATCGA-AATTTTTTCTTTGCATCGAGAAGCGTGAAGCGCAAGCCATCCATTAACAAGACAAGTC
193 GATC-ATAA-TTGATGTTTGCATTGGGAAACATGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTC
* * * * * * *
19033408 CATCTATAGTCTCTAATGCCTTCGAAAGCGTTA-TTACT-TGCTTTAAGTAGTTTTATAA-CTT-
256 CATTTATAGTCACTCATGCTTTCGAAAGC-CTAGTTACTCT-CTTTAAATGGTTTTATAATCTTA
*
19033469 TATAAATGATTTTAAATTAAAAATTAT
319 TA-AAATGATTTTAAATT--GAA-T-T
* * * ** **
19033496 TTTTCATTTTTGGTTAAAATAGATAATAATTTGTTGTTTGCATT-GA-AAGACGGGAAGCAAAAG
1 TTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGCATTAGAGAA-ACATGAAGTGAAAG
* * * * * *
19033559 CCATCCATTGATAAGAAAAGTGCATTTATAGTGACTTATGCCTTCAAAAGCATAGTTACTTGCTT
65 CCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTAGTTAC-TGCTT
* * * * * * *
19033624 TAAATAGTTTTA-AAATCGTATAAATGATTTTAATATTCAA-TTTTTCTCATTTTTGGTTAAAAC
129 TAAATGGTTTTATAACT-TTATAAATGATTTTAA-ATTGAATTTTTTTTCATTTCTAGTTAAAAC
* * * * * * *
19033687 AAATCTTAATT-A-GATTAGTCATATTAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCAATGACAAGGAAA
192 AGATCATAATTGATG-TTTG-C--ATTGGGAAACATGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAA
* * * * ** **
19033750 GTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTC-AACATGCTTA-TTACTCACTTTATGTAATTTTATAA-C
253 GTCCATTTATAGTCACTCATGCTTTCGAA-A-GCCTAGTTACTCTCTTTAAATGGTTTTATAATC
* *
19033812 TT-TATAAATGATTGTAAATTAAATTTTT
316 TTATA-AAATGATTTTAAATTGAA---TT
* ** * * * ** **
19033840 TTATTCATTTTTAGTTAAAATGGAAT-ATAATTTGTTGTTTGCATT-GGGAGACGCGAAGCAAAA
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* * * * * * * * * *
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* * * *
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* * ** * * * *
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* *
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* * * * * * * * * * * * *
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*
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* * *
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* * * * * ** * *
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* * *
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* * * * * *
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* * * * **
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*
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* * ** *
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* * * ** * ** * *
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* * * * *
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257 AAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGACTTGTTACTCACTTTAAGTGGTTTTATAAC
* *
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194 AAACAGATCATAATTTGTTG-TTTGCATTGAGAAA-CGTGAAG-CAAAAGCCATCCATTGACAAG
* * * * ** * * * * *
19031989 AAAAGCCCATTTATAGTTATTCTTGCCTTCGAAAGACCAGTTAC-AAGCTTCAAATAGTTTTGT-
256 AAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGACTTGTTACTCA-CTTTAAGTGGTTTTATA
19032052 ACTCTTATAAATGATTTTAAA
320 ACT-TTATAAATGATTTTAAA
* * * * * * * * *
19032073 TTGAAATGTTTTTCATTTCTAGTTAAAACAGATCA-AAATTGAATGTTCGCATCGGAAAACCTGA
1 TT-AAATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTG-TTGTTTGCATTGGGAAACGTGA
* ** * * * * * * *
19032137 AGCCAAAGCTGTCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGCCACTCATACATGCGAAAACTTTGTT
64 AGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTAGTT
* * * * *
19032202 ACTCACTTTAAGTGGTTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTCATATTTGATT
129 ACTCGCTTTAAATGGTTTTATAAC-TTATAAATGATTTTAAATTGATTTTTTTTCATTTTTGGTT
* * ** * * * * *
19032267 AAAACATATCATTATTTCATGTTTGTATCGAGAAAAGTGAAGCAAAAACCATCCATTTACAAGAA
193 AAAACAGATCATAATTTGTTGTTTGCATTGAGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAA
* * ** *
19032332 AAATCCATTTATAGT-AGCTTATGCCTTTAAAAGCGATCTAT-TGACAAGAAAGTTCA-TTTATA
258 AAGTCCATTTATAGTCA-CTCATGCCTTCGAAA--GA-CT-TGTTAC--------TCACTTTA-A
** * * * * *
19032394 GTCACTCATGCCTTTAAAAGCCTTGTTACT-ATCTTTAAA
309 G-------TGGTTTTATAA-CTTTATAAATGAT-TTTAAA
** * * * ** ** *
19032433 TTATTTTATAATCTTATAAATAATTTTGAATCAAAA-TTATTTTCATTT-TTAGTTAAAATAGAT
1 TTAAATT-T--T-TT-T-CAT--TTTTG-GTTAAAACAGATCATAATTTGTT-GTT----T-G--
** ** * * * * * *
19032496 CATAATTTGTTATTTGCATTGAGAAACATGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCAGT
49 C---A-TTGGGA--AAC-GTGA--AGCA-AAAGC--CATCC----ATTGACAAGAAAAGTCCATT
* * * ** * * * *
19032561 TATAGAT-GCTCATGCCTCCAAAAGTGTTGTTACTCGCTTTAAATGGTTTGAAAATCTCATAAAT
98 TATAG-TCACTCATGCCTTCGAAAGCCTAGTTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAA-CTTATAAAT
* * ** * * * * * * *
19032625 GGTTTTGAATTGAATTTCGTTTCATTTTAGGTTCAAACATATCATAATTTGTTGTTTACGTAGGG
161 GATTTTAAATTG-ATTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGTTGTTTGCATTGAG
* * * * * * *
19032690 AAACATGAAGCAAAAGCCATCCGTTAATAAGAAAAATCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGACA
225 AAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAA
* * * * *
19032755 GGCTTGTTATTCTCTTCAAGTGG-TTTATAACTTTATAAATGATTGTAAA
290 GACTTGTTACTCACTTTAAGTGGTTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAA
* * * * * * *
19032804 TTGAATTTGTTTTCATTTTTAGTTAAAATATATCATAATTTATTGTTTGCATTGGGAAACATAAA
1 TTAAATTT-TTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGTTGTTTGCATTGGGAAACGTGAA
* * * * * * * * * *
19032869 GCGAAAGCTATCCATTGACAAGAAAAGTCTATATATAGTTACTTATTCC-TCTAAAAGCATTGTT
65 GCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTC-GAAAGCCTAGTT
* * * * *
19032933 ACTCACTTTAAATGGTTTTAAAATTTCATAAATGATTTGAAATTGAATTTTTTTAT-ATTTTAGG
129 ACTCGCTTTAAATGGTTTTATAACTT-ATAAATGATTTTAAATTG-ATTTTTTT-TCATTTTTGG
* * * * * * * * *
19032997 TTTAAACAAATCATAATTTGTTATTTGCCTTGGGAAACATGAAGCGAAAGCCATCCATTTAGAAG
191 TTAAAACAGATCATAATTTGTTGTTTGCATTGAGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAG
* * * * ***
19033062 AAAAGTTCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGACAGACTTGTTACTTGA-TTAAAGCAATTTTATA
256 AAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGACTTGTTAC-TCACTTTAAGTGGTTTTATA
*
19033126 AC-TTATAAATGATTTTAAG
320 ACTTTATAAATGATTTTAAA
* * * * * * * * * * *
19033145 TTATATTGTTTTTCATTCTTGATTAAAATAGATCACAATTTGATGTGTCCATTAGAAAATGTGAA
1 TTAAATT-TTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGTTGTTTGCATTGGGAAACGTGAA
* * * * *
19033210 GCGAAAA-CTATCCATTGATAAG-AAATTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCATAGTT
65 GC-AAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTAGTT
* * * * * * * *
19033273 ACTTGCTTTAAATGATTTTATAATCTTATAAATAATTTTAAGTTCAGTTTTTTTCATATTTGGCT
129 ACTCGCTTTAAATGGTTTTATAA-CTTATAAATGATTTTAAATTGATTTTTTTTCATTTTTGGTT
** * * * * ** *
19033338 AAATTAGATCGA-AATTTTTTCTTTGCATCGAGAAGCGTGAAGCGCAAGCCATCCATTAACAAGA
193 AAAACAGATC-ATAATTTGTTGTTTGCATTGAGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGA
* * * * * ** *
19033402 CAAGTCCATCTATAGTCTCTAATGCCTTCGAAAG-CGTTATTACTTGCTTTAAGTAGTTTTATAA
257 AAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGAC-TTGTTACTCACTTTAAGTGGTTTTATAA
19033466 CTTTATAAATGATTTTAAA
321 CTTTATAAATGATTTTAAA
* * * *
19033485 TTAAAAATTATTTTTCATTTTTGGTTAAAATAGATAATAATTTGTTGTTTGCATT-GAAAGACGG
1 TT--AAATT-TTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGTTGTTTGCATTGGGAA-ACGT
* * * * * *
19033549 GAAGCAAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTGCATTTATAGTGACTTATGCCTTCAAAAGCATAG
62 GAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTAG
* * * * * * *
19033614 TTACTTGCTTTAAATAGTTTTAAAATCGTATAAATGATTTTAATATTCAATTTTTCTCATTTTTG
127 TTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAA-CTTATAAATGATTTTAA-ATTGATTTTTTTTCATTTTTG
* * * * * *
19033679 GTTAAAACAAATCTTAATTAGATTAG--T-CATATTAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCAATG
190 GTTAAAACAGATCATAATTTG-TT-GTTTGCAT-TGA-GAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTG
* * * * **
19033741 ACAAGGAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTC-AACATG-CTTATTACTCACTTTATGTAAT
251 ACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAA-A-GACTTGTTACTCACTTTAAGTGGT
*
19033804 TTTATAACTTTATAAATGATTGTAAA
314 TTTATAACTTTATAAATGATTTTAAA
* ** * *
19033830 TTAAATTTTTTTATTCATTTTTAGTTAAAATGGAAT-ATAATTTGTTGTTTGCATTGGGAGACGC
1 TTAAA--TTTTT-TTCATTTTTGGTTAAAACAG-ATCATAATTTGTTGTTTGCATTGGGAAACGT
* * * * * * * * *
19033894 GAAGCAAAAGCCATTCATTGACAAGAAAAGTTCATCTATAGACACTTATGCCTCCAAAAGCATTG
62 GAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTAG
* * * * *
19033959 TTACTCTCTTTAAATGGTTTTAAAATCTCACAAAT-AGTTTTGAATTGATTTTTTTTTTCATTTT
127 TTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAA-CTTATAAATGA-TTTTAAATTGA--TTTTTTTTCATTTT
* * * * * * *
19034023 AGGCTCAAACATATCATAATTTGTTGTTTGCCTTG-G--A----AAGCTAAAGCCATCCATTGAG
188 TGGTTAAAACAGATCATAATTTGTTGTTTGCATTGAGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGAC
* ** * *
19034081 AAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGACATTCTTGTTACTTGA-TTTAAATGGTTTT
253 AAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGACTTGTTAC-TCACTTTAAGTGGTTTT
*
19034145 ATAACTTTATAAATGATTTTTAA
317 ATAACTTTATAAATGATTTTAAA
* * * ***
19034168 TTAAACTATTTTTCATTTTTGGTT--AA-A-A-CATGA----TT-TTTCCATCAAGAAACGTGAA
1 TTAAA-TTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGTTGTTTGCATTGGGAAACGTGAA
** * ** *
19034223 GCAAAA-CCTATCCATTGACAAG-AAAGTTTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGTGTAGGT
65 GCAAAAGCC-ATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTAGTT
* * * * * * *
19034286 ACTTGCTTTAAATGGATTTATAATCTTACAAATGATTTTCAGTTGCA-TTGTTTTCATTTTTGGC
129 ACTCGCTTTAAATGGTTTTATAA-CTTATAAATGATTTTAAATTG-ATTTTTTTTCATTTTTGGT
* * * * * * * * *
19034350 TAAATCATATCAGAATTTGGTGTTTGCATTGAGAAACATGAAACACAAGCCATCCATTCACTAGA
192 TAAAACAGATCATAATTTGTTGTTTGCATTGAGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGA
* * * * * *
19034415 AAAGTCCATCTATAATCTCTAATGCCTTCGAAAGTA-TTTTTACTTACTTTAAGTGGTTTTATAA
257 AAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAG-ACTTGTTACTCACTTTAAGTGGTTTTATAA
19034479 CTTTATAAATGATTTTAAA
321 CTTTATAAATGATTTTAAA
* ** ** * * * * * *
19034498 CTAAATTTTTTTCATTTTTTCTTAAAACTTATAATAATTAGTTGTTTGCATTAGTAAGCATGAAG
1 TTAAATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGTTGTTTGCATTGGGAAACGTGAAG
* * * * * * * * * *
19034563 CAAAAGCTATCCATTAACAGGCAATGTCAACTTATAGTAACTTATACCTTCGAAAGCCTAGTTAC
66 CAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTAGTTAC
** * * * * ** *
19034628 TTACTTTAAATGGTTTTAAAACCATATAAATGATTTTTATATTGAATTTTACTCATTTTTGCTTA
131 TCGCTTTAAATGGTTTTATAA-CTTATAAATGA-TTTTAAATTGATTTTTTTTCATTTTTGGTTA
19034693 AAACA
194 AAACA
19034698 TATTGTAATT
Statistics
Matches: 5194, Mismatches: 1216, Indels: 550
0.75 0.17 0.08
Matches are distributed among these distances:
319 82 0.02
320 79 0.02
321 205 0.04
322 109 0.02
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384 4 0.00
386 2 0.00
387 1 0.00
388 4 0.00
389 1 0.00
390 76 0.01
391 92 0.02
392 1 0.00
ACGTcount: A:0.34, C:0.14, G:0.14, T:0.38
Consensus pattern (339 bp):
TTAAATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGTTGTTTGCATTGGGAAACGTGAAG
CAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTAGTTAC
TCGCTTTAAATGGTTTTATAACTTATAAATGATTTTAAATTGATTTTTTTTCATTTTTGGTTAAA
ACAGATCATAATTTGTTGTTTGCATTGAGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAG
TCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGACTTGTTACTCACTTTAAGTGGTTTTATAACTTTA
TAAATGATTTTAAA
Found at i:19031369 original size:151 final size:150
Alignment explanation
Indices: 19031075--19031356 Score: 413
Period size: 151 Copynumber: 1.9 Consensus size: 150
19031065 TTTATAACTT
* * * * * *
19031075 TATAAATTATTTTAAATTGATTTTTTTTCATTTTTGGTAAGAATAGATCGTAATTTGATGTTTGC
1 TATAAATGATTTTAAATTAAATTTTTCTCATTTTTGGTAAGAACAAATCGTAATTTGATGTTTGC
* *
19031140 ATTGAGAAAAGTGAAGCAAAAGTCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAATCATTTATACCT
66 ATTGAGAAAAGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAATCATTCATACCT
19031205 TCAAAACCCTAGTTGCTCAC
131 TCAAAACCCTAGTTGCTCAC
19031225 TATAAATGATTTTAAAATTAAATTTTTCTCATTTTTGGTTAA-AACAAATCGTAATTTGATGTTT
1 TATAAATGATTTT-AAATTAAATTTTTCTCATTTTTGG-TAAGAACAAATCGTAATTTGATGTTT
* * * * * *
19031289 GCATTGAGAAATGTTAAGCAAAAGCCATCTATTGACAAGAAAAGTTCATTTGTAGTCATTCATAC
64 GCATTGAGAAAAGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAATCATTCATAC
19031354 CTT
129 CTT
19031357 TGAAAGCCTA
Statistics
Matches: 116, Mismatches: 14, Indels: 3
0.87 0.11 0.02
Matches are distributed among these distances:
150 12 0.10
151 101 0.87
152 3 0.03
ACGTcount: A:0.36, C:0.12, G:0.13, T:0.39
Consensus pattern (150 bp):
TATAAATGATTTTAAATTAAATTTTTCTCATTTTTGGTAAGAACAAATCGTAATTTGATGTTTGC
ATTGAGAAAAGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAATCATTCATACCT
TCAAAACCCTAGTTGCTCAC
Found at i:19031794 original size:170 final size:169
Alignment explanation
Indices: 19031225--19031804 Score: 530
Period size: 171 Copynumber: 3.4 Consensus size: 169
19031215 AGTTGCTCAC
* * *
19031225 TATAAATGATTTTAAAATT-AAATTTTTCTCATTTTTGGTTAAAACAAATCGTAATTTGATGTTT
1 TATAAATAATTTT-AAATTGAAATTTTTCTCATTTTTGGTTAAAACATATCATAATTTGATGTTT
* * * * *
19031289 GCATTGAGAAATGTTAAGCAAAAGCCATCTATTGACAAGAAAAGTTCATTTGTAGTCAT-TCATA
65 GCATTAAGAAATGTAAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTGTAGTC-TCTTATA
* * *
19031353 CCTTTGAAAGCCTAGTTACACACTTTAGATAGTTTTATAGTCT
129 --TTTGAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATAGTTTTATAATCT
* ** * * * * * *
19031396 TATAAATGATTTTAAATAAAAAAGTTTT-TCATTTCTAGATAAAACATATCATAATTGGATTTTT
1 TATAAATAATTTTAAAT-TGAAATTTTTCTCATTTTTGGTTAAAACATATCATAATTTGATGTTT
* * * * * * *
19031460 GCATCAGGAAATGTGAAGCGAAA-CCTTTCCATTGATAAGAAAAGCCCATTTGTAGT-TACTTAT
65 GCATTAAGAAATGTAAAGCAAAAGCC-ATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTGTAGTCT-CTTAT
* * * * *
19031523 ACTTTTGAAAGCCTTGTTACTCGCTTGAAGTGGTTTTATAA-CTT
128 A--TTTGAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATAGTTTTATAATC-T
* * * * * *
19031567 TATAAATAACTTTAAATTG-ATTTTTTTTCTTTTTTGGTT-AAGCTAGATCATAATTTGATGTTT
1 TATAAATAATTTTAAATTGAAATTTTTCTCATTTTTGGTTAAAAC-ATATCATAATTTGATGTTT
* * *
19031630 GCATTAAGAAACGTAAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCGCTCTTTT
65 GCATTAAGAAATGTAAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTGTAGT--CTCTTAT
* * * *
19031695 ATTCGAAAGCCTAATTGCTCACTTTAAAT-GTTTTACAATCT
128 ATTTGAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATAGTTTTATAATCT
* * ***
19031736 TATAAATAATTTTATATTGAATTTTTTCTCATTTTTGGTTAAAACATATTGCAATTTGATGTTTG
1 TATAAATAATTTTAAATTGAAATTTTTCTCATTTTTGGTTAAAACATATCATAATTTGATGTTTG
19031801 CATT
66 CATT
19031805 GGGACACATG
Statistics
Matches: 324, Mismatches: 70, Indels: 31
0.76 0.16 0.07
Matches are distributed among these distances:
169 35 0.11
170 135 0.42
171 141 0.44
172 12 0.04
173 1 0.00
ACGTcount: A:0.34, C:0.13, G:0.13, T:0.41
Consensus pattern (169 bp):
TATAAATAATTTTAAATTGAAATTTTTCTCATTTTTGGTTAAAACATATCATAATTTGATGTTTG
CATTAAGAAATGTAAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTGTAGTCTCTTATATT
TGAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAATAGTTTTATAATCT
Found at i:19033276 original size:169 final size:168
Alignment explanation
Indices: 19032371--19034515 Score: 1056
Period size: 170 Copynumber: 12.7 Consensus size: 168
19032361 AAAGCGATCT
* * ** * *
19032371 ATTGACAAG-AAAGTTCATTTATAGTCACTCATGCCTTTAAAAGCCTTGTTACTAT-CTTTAAA-
1 ATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCATAGTTACT-TGCTTTAAAG
* * * * *
19032433 TTATTTTATAATCTTATAAATAATTTTGAA-TCAAAATTATTTTCATTTTTAGTTAAAATAGATC
65 TAATTTTATAATCTTATAAATGATTTT-AAGT-TAAATTTTTTTCA-TTTTGGTTAAAATAGATC
* * *
19032497 ATAATTTGTTATTTGCATTGAGAAACATGAAGCGAAAGCCATCC
127 A-AATTTGTTGTTTGCATTGA-AAACGTGAAGCGAAAACCATCC
* * * * * ** * *
19032541 ATTGACAAGAAAAGTCCAGTTATAGAT-GCTCATGCCTCCAAAAGTGTTGTTACTCGCTTTAAA-
1 ATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAG-TCACTCATGCCTTCGAAAGCATAGTTACTTGCTTTAAAG
** * * * * * * * * *
19032604 TGGTTTGAAAATCTCATAAATGGTTTTGAA-TTGAATTTCGTTTCATTTTAGGTTCAAACATATC
65 TAATTTTATAATCTTATAAATGATTTT-AAGTTAAATTT-TTTTCATTTT-GGTTAAAATAGATC
* * * * *
19032668 ATAATTTGTTGTTTACGTAGGGAAACATGAAGC-AAAAGCCATCC
127 A-AATTTGTTGTTTGCAT-TGAAAACGTGAAGCGAAAA-CCATCC
* * * * * * *
19032712 GTTAATAAGAAAAATCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGACAGGC-TTGTTA-TT-CTCTTCAA
1 ATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGA-AAGCATAGTTACTTGCT-TTAAA
** * * * * *
19032774 GT-GGTTTATAA-CTTTATAAATGATTGTAAATTGAATTTGTTTTCATTTTTAGTTAAAATATAT
64 GTAATTTTATAATC-TTATAAATGATTTTAAGTTAAATTT-TTTTCA-TTTTGGTTAAAATAGAT
* * * * * *
19032837 CATAATTTATTGTTTGCATTGGGAAACATAAAGCGAAAGCTATCC
126 CA-AATTTGTTGTTTGCATT-GAAAACGTGAAGCGAAAACCATCC
* * * * * * * * **
19032882 ATTGACAAGAAAAGTCTATATATAGTTACTTATTCC-TCTAAAAGCATTGTTACTCACTTTAAA-
1 ATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTC-GAAAGCATAGTTACTTGCTTTAAAG
** * * * * * * * *
19032945 TGGTTTTAAAAT-TTCATAAATGATTTGAAATTGAATTTTTTTATATTTTAGGTTTAAACAAATC
65 TAATTTTATAATCTT-ATAAATGATTTTAAGTTAAATTTTTTT-CATTTT-GGTTAAAATAGATC
* * * * *
19033009 ATAATTTGTTATTTGCCTTGGGAAACATGAAGCGAAAGCCATCC
127 A-AATTTGTTGTTTGCATT-GAAAACGTGAAGCGAAAACCATCC
* * * * * *
19033053 ATTTAGAAGAAAAGTTCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGACAG-ACTTGTTACTTG-ATTAAAG
1 ATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCA-TAGTTACTTGCTTTAAAG
* * *
19033116 CAATTTTATAA-CTTATAAATGATTTTAAGTTATATTGTTTTTCATTCTTGATTAAAATAGATCA
65 TAATTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAGTTAAATT-TTTTTCATT-TTGGTTAAAATAGATCA
* * * * *
19033180 CAATTTGATGTGTCCATTAGAAAATGTGAAGCGAAAACTATCC
128 -AATTTGTTGTTTGCATT-GAAAACGTGAAGCGAAAACCATCC
* *
19033223 ATTGATAAG-AAATTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCATAGTTACTTGCTTTAAA-T
1 ATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCATAGTTACTTGCTTTAAAGT
* * * * * *
19033286 GATTTTATAATCTTATAAATAATTTTAAGTTCAGTTTTTTTCATATTTGGCTAAATTAGATCGAA
66 AATTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAGTTAAATTTTTTTCAT-TTTGGTTAAAATAGATC-AA
* * * * * *
19033351 ATTTTTTCTTTGCATCGAGAAGCGTGAAGCGCAAGCCATCC
129 ATTTGTTGTTTGCATTGA-AAACGTGAAGCGAAAACCATCC
* * * * * * *
19033392 ATTAACAAGACAAGTCCATCTATAGTCTCTAATGCCTTCGAAAGCGTTA-TTACTTGCTTT-AAG
1 ATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGC-ATAGTTACTTGCTTTAAAG
* *
19033455 TAGTTTTATAA-CTTTATAAATGATTTTAAATTAAAAATTATTTTTCATTTTTGGTTAAAATAGA
65 TAATTTTATAATC-TTATAAATGATTTTAAGTT--AAATT-TTTTTCA-TTTTGGTTAAAATAGA
* *
19033519 TAATAATTTGTTGTTTGCATTGAAAGACGGGAAGC-AAAAGCCATCC
125 TCA-AATTTGTTGTTTGCATTGAAA-ACGTGAAGCGAAAA-CCATCC
* * * *
19033565 ATTGATAAGAAAAGTGCATTTATAGTGACTTATGCCTTCAAAAGCATAGTTACTTGCTTTAAA-T
1 ATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCATAGTTACTTGCTTTAAAGT
* * * * * * * * *
19033629 AGTTTTAAAATCGTATAAATGATTTTAATATTCAATTTTTCTCATTTTTGGTTAAAACAAATCTT
66 AATTTTATAATCTTATAAATGATTTTAA-GTTAAATTTTTTTCA-TTTTGGTTAAAATAGATC-A
* * * *
19033694 AATTAGATTAGTCAT--ATTAGGAAACATGAAGC-AAAAGCCATCC
128 AATTTG-TT-GT-TTGCATT-GAAAACGTGAAGCGAAAA-CCATCC
* * * * * ** *
19033737 AATGACAAGGAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTC-AACATGCTTA-TTACTCACTTT-AT
1 ATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAA-A-GCATAGTTACTTGCTTTAAA
* * * *
19033799 GTAATTTTATAA-CTTTATAAATGATTGTAAATTAAATTTTTTTATTCATTTTTAGTTAAAATGG
64 GTAATTTTATAATC-TTATAAATGATTTTAAGTTAAA--TTTTT-TTCA-TTTTGGTTAAAATAG
* * * *
19033863 AAT-ATAATTTGTTGTTTGCATTGGGAGACGCGAAGC-AAAAGCCATTC
124 -ATCA-AATTTGTTGTTTGCATT-GAAAACGTGAAGCGAAAA-CCATCC
* * * * * * * *
19033910 ATTGACAAGAAAAGTTCATCTATAGACACTTATGCCTCCAAAAGCATTGTTACTCT-CTTTAAA-
1 ATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCATAGTTACT-TGCTTTAAAG
** * * * ** * * * *
19033973 TGGTTTTAAAATCTCACAAAT-AGTTTTGAA-TTGATTTTTTTTTTCATTTTAGGCTCAAACATA
65 TAATTTTATAATCTTATAAATGA-TTTT-AAGTT-A-AATTTTTTTCATTTT-GGTTAAAATAGA
* * * *
19034036 TCATAATTTGTTGTTTGCCTTG-----G-AAAGCTAAAGCCATCC
125 TCA-AATTTGTTGTTTGCATTGAAAACGTGAAGCGAAAACCATCC
* ** * *
19034075 ATTGAGAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGACATTC-TTGTTACTTGATTTAAA-
1 ATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGA-AAGCATAGTTACTTGCTTTAAAG
** * *
19034138 TGGTTTTATAA-CTTTATAAATGATTTTTAA-TTAAACTATTTTTCATTTTTGGTT-AAA-ACAT
65 TAATTTTATAATC-TTATAAATGA-TTTTAAGTTAAA-TTTTTTTCA-TTTTGGTTAAAATAGAT
* *** *
19034199 --GATTT-TTCCAT-CA-AG-AAACGTGAAGC-AAAACCTATCC
126 CAAATTTGTTGTTTGCATTGAAAACGTGAAGCGAAAACC-ATCC
* ** * ** *
19034236 ATTGACAAG-AAAGTTTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGTGTAGGTACTTGCTTTAAA-T
1 ATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCATAGTTACTTGCTTTAAAGT
* * * ** * * *
19034299 GGA-TTTATAATCTTACAAATGATTTTCAGTTGCATTGTTTTCATTTTTGGCT-AAATCATATCA
66 -AATTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAGTTAAATTTTTTTCA-TTTTGGTTAAAAT-AGATCA
* * * *
19034362 GAATTTGGTGTTTGCATTGAGAAACATGAAAC-ACAAGCCATCC
128 -AATTTGTTGTTTGCATTGA-AAACGTGAAGCGA-AAACCATCC
* * * * * * ** *
19034405 ATTCACT-AGAAAAGTCCATCTATAATCTCTAATGCCTTCGAAAGTATTTTTACTTACTTT-AAG
1 ATTGA-TAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCATAGTTACTTGCTTTAAAG
** **
19034468 TGGTTTTATAA-CTTTATAAATGATTTTAAACTAAATTTTTTTCATTTT
65 TAATTTTATAATC-TTATAAATGATTTTAAGTTAAATTTTTTTCATTTT
19034516 TTCTTAAAAC
Statistics
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0.73 0.16 0.11
Matches are distributed among these distances:
156 1 0.00
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Consensus pattern (168 bp):
ATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCATAGTTACTTGCTTTAAAGT
AATTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAGTTAAATTTTTTTCATTTTGGTTAAAATAGATCAAAT
TTGTTGTTTGCATTGAAAACGTGAAGCGAAAACCATCC
Found at i:19034130 original size:683 final size:674
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19032363 AGCGATCTAT
* * * * *
19032373 TGACAA-GAAAGTTCATTTATAGTCACTCATGCCTTTAAAAGCCTTGTTACTATCTTTAAATTAT
1 TGACAAGGAAAGTTCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAACAGACTTGTTACTA-CTTTAAGTAAT
* * * * *
19032437 TTTATAA-TCTTATAAATAATTTTGAATCAAAATTATTTTCATTTTTAGTTAAAATAGATCATAA
65 TTTATAACT-TTATAAATGATTTTAAATTAAATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAATAGATCATAA
* * * * *
19032501 TTTGTTATTTGCATTGAGAAACATGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCAGTTATAG
129 TTTGTTGTTTGCATTGGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTTCA-TTATAG
** ** * * *
19032566 ATGCTCATGCCTCCAAAAGTGTTGTTACTCGCTTTAAATGGTTTGAAAATCTCATAAATGGTTTT
193 ACACTCATGCCTCCAAAAGCATTGTTACTCTCTTTAAATGGTTTTAAAATCTCATAAATAGTTTT
** * * * *
19032631 GAATTGAATTTCGTTTCATTTTAGGTTCAAACATATCATAATTTGTTGTTTACGTAGGGAAACAT
258 GAATTG-ATTTTTTTTCATTTTAGGCTCAAACATATCATAATTTGTTGTTTGCCT-TGG----A-
* * * * * *
19032696 GAAGCAAAAGCCATCCGTTAATAAGAAAAATCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGACAGGCTTG
316 GAAGCTAAAGCCATCCATTAACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGACAAGCTTG
* * *
19032761 TTA-TT-CTCTTCAAGTGGTTTATAACTTTATAAATGATTGTAAATTGAATT-TGTTTTCATTTT
381 TTACTTGCT-TT-AAGTGTTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTAAATTAT-TTTTCATTTT
* * * * * * *
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443 TGGTTAAAATAGATAATAATTTATTGTTTGCATTGGAAAACAGAAAGCAAAAGCCATCCATTGAC
* * * *
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508 AAGAAAAGTCTATATATAGTGACTTATGCCTCTAAAAGCATAGTTACTCACTTTAAATAGTTTTA
* * * * *
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* ** * * * *
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* * * * * *
19033055 TTAGAAGAAAAGTTCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGACAGACTTGTTACTTGA-TTAAAGCAA
1 TGACAAGGAAAGTTCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAACAGACTTGTTAC-T-ACTTTAAGTAA
* * * * *
19033119 TTTTATAAC-TTATAAATGATTTTAAGTTATATTGTTTTTCATTCTT-GATTAAAATAGATCACA
64 TTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTAAATTTTTTTTCATTTTTAG-TTAAAATAGATCATA
* * * * * * * *
19033182 ATTTGATGTGTCCATTAGAAAATGTGAAGCGAAAA-CTATCCATTGATAAG-AAA-TTCCATTTA
128 ATTTGTTGTTTGCATTGGGAAACGTGAAGC-AAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTT-CA-TTA
* *** * * * * *
19033244 TAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCATAGTTACT-TGCTTTAAATGATTTTATAATCTTATAAATAA
190 TAGACACTCATGCCTCCAAAAGCATTGTTACTCT-CTTTAAATGGTTTTAAAATCTCATAAATAG
* * * * * * * *
19033308 TTTT-AAGTTCAGTTTTTTTCATATTT-GGCT-AAATTAGATCGA-AATTTTTTCTTTG-CATCG
254 TTTTGAA-TTGATTTTTTTTCAT-TTTAGGCTCAAA-CATATC-ATAATTTGTTGTTTGCCTTGG
* * * *
19033368 AGAAGCGTGAAGCGCAAGCCATCCATTAACAAGACAAGTCCATCTATAGTCTCTAATGCCTTCGA
315 AGAAGC-T--A----AAGCCATCCATTAACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGA
*
19033433 -AAGCGTTATTACTTGCTTTAAGTAGTTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTAAAAATTATT
373 CAAGC-TTGTTACTTGCTTTAAGT-GTTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATT--AAATTATT
* * *
19033497 TTTCATTTTTGGTTAAAATAGATAATAATTTGTTGTTTGCATT-GAAAGACGGGAAGCAAAAGCC
434 TTTCATTTTTGGTTAAAATAGATAATAATTTATTGTTTGCATTGGAAA-ACAGAAAGCAAAAGCC
* * **
19033561 ATCCATTGATAAGAAAAGTGC-ATTTATAGTGACTTATGCCT-TCAAAAGCATAGTTACTTGCTT
498 ATCCATTGACAAGAAAAGT-CTATATATAGTGACTTATGCCTCT-AAAAGCATAGTTACTCACTT
*
19033624 TAAATAGTTTTAAAATCGT-ATAAATGATTTTAATATTCAATTTTTCTCAT-TTTT-GGTTAAAA
561 TAAATAGTTTTAAAAT-GTCATAAATGATTTGAA-ATTCAATTTTT-TCATATTTTAGGTTAAAA
* *
19033686 CAAATCTTAATTAGATTAGTCATATTAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCAA
623 CAAATCATAATTAG-TTAGTCACATTAGGAAACATGAAGCAAAAGCCATCCAA
* *
19033739 TGACAAGGAAAG-TCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAACATG-CTTATTACTCACTTTATGTA
1 TGACAAGGAAAGTTC-ATTTATAGTCACTCATGCCTTCAACA-GACTTGTTACT-ACTTTAAGTA
* *
19033802 ATTTTATAACTTTATAAATGATTGTAAATTAAATTTTTTTATTCATTTTTAGTTAAAATGGAAT-
63 ATTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTAAA-TTTTTT-TTCATTTTTAGTTAAAATAG-ATC
* * *
19033866 ATAATTTGTTGTTTGCATTGGGAGACGCGAAGCAAAAGCCATTCATTGACAAGAAAAGTTCATCT
125 ATAATTTGTTGTTTGCATTGGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTTCAT-T
* *
19033931 ATAGACACTTATGCCTCCAAAAGCATTGTTACTCTCTTTAAATGGTTTTAAAATCTCACAAATAG
189 ATAGACACTCATGCCTCCAAAAGCATTGTTACTCTCTTTAAATGGTTTTAAAATCTCATAAATAG
19033996 TTTTGAATTGATTTTTTTTTTCATTTTAGGCTCAAACATATCATAATTTGTTGTTTGCCTTGGA-
254 TTTTGAATTGA--TTTTTTTTCATTTTAGGCTCAAACATATCATAATTTGTTGTTTGCCTTGGAG
* * **
19034060 AAGCTAAAGCCATCCATTGAGAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGACATTCTTGT
317 AAGCTAAAGCCATCCATTAACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGACAAGCTTGT
* * * *
19034125 TACTTGATTTAAATGGTTTTATAACTTTATAAATGATTTTTAATTAAACTATTTTTCATTTTTGG
382 TACTTGCTTTAAGT-GTTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTAAATTATTTTTCATTTTTGG
19034190 TTAAAA
446 TTAAAA
19034196 CATGATTTTT
Statistics
Matches: 915, Mismatches: 172, Indels: 109
0.77 0.14 0.09
Matches are distributed among these distances:
673 5 0.01
674 1 0.00
676 1 0.00
678 1 0.00
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ACGTcount: A:0.34, C:0.13, G:0.13, T:0.39
Consensus pattern (674 bp):
TGACAAGGAAAGTTCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAACAGACTTGTTACTACTTTAAGTAATT
TTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTAAATTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAATAGATCATAATT
TGTTGTTTGCATTGGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTTCATTATAGACA
CTCATGCCTCCAAAAGCATTGTTACTCTCTTTAAATGGTTTTAAAATCTCATAAATAGTTTTGAA
TTGATTTTTTTTCATTTTAGGCTCAAACATATCATAATTTGTTGTTTGCCTTGGAGAAGCTAAAG
CCATCCATTAACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCGACAAGCTTGTTACTTGCTT
TAAGTGTTTTATAACTTTATAAATGATTTTAAATTAAATTATTTTTCATTTTTGGTTAAAATAGA
TAATAATTTATTGTTTGCATTGGAAAACAGAAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCTAT
ATATAGTGACTTATGCCTCTAAAAGCATAGTTACTCACTTTAAATAGTTTTAAAATGTCATAAAT
GATTTGAAATTCAATTTTTTCATATTTTAGGTTAAAACAAATCATAATTAGTTAGTCACATTAGG
AAACATGAAGCAAAAGCCATCCAA
Found at i:19038916 original size:171 final size:166
Alignment explanation
Indices: 19038442--19038929 Score: 520
Period size: 170 Copynumber: 2.9 Consensus size: 166
19038432 AATGATTTTA
* * * * *
19038442 AATTTTTTT-ATTTTTAGTTAAAACAGATAATAATTTGATGTTTCCATTGGCAAACGTAAAGCAA
1 AATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGAT-ATAATTTGATATTTGCATTGGCAAAC-TGAAGCGA
* * * * *
19038506 AAGCTATCCATTGACAAG-AAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAACATAGTTACTCA
64 AAGC-ATCCATTAACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCC-TCTAAAGCATAGTTACTCG
*
19038570 CTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGACTCTAAGTTG
127 CTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGACTCTAAATTG
* * * * *
19038610 AATTGTTTTCATTTTTGGCTAAAACATAATAGAATTT-CTCATTTGCATTGAG-AAACGTGAAGC
1 AATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACA-GATATAATTTGAT-ATTTGCATTG-GCAAAC-TGAAGC
* * * * * *
19038673 GCAAGCCATCCATTAACAAGAAAAGTCCATCTATAGTCATTAATGCCTTCGAAAGCATTGTTACT
62 GAAAG-CATCCATTAACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCC-TCTAAAGCATAGTTACT
* * *
19038738 CGCTTTAAGTGGTTTTATAA-CATTATAAATGATTTTAAATTG
125 CGCTTTAAATGGTTTTATAATC-TTATAAATGACTCTAAATTG
19038780 AATTTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATATTTGCATTGGCATAA-TGAAGC
1 AA--TTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGAT-ATAATTTGATATTTGCATTGGCA-AACTGAAGC
* * *
19038844 GAAAGTCATCCATTCACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTCTATAAGCCTAGTTGCT
62 GAAAG-CATCCATTAACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTCTA-AAGCATAGTTACT
*
19038909 TGCTTTAAATGGTTTTATAAT
125 CGCTTTAAATGGTTTTATAAT
19038930 GTCAAGACCC
Statistics
Matches: 264, Mismatches: 41, Indels: 26
0.80 0.12 0.08
Matches are distributed among these distances:
168 9 0.03
169 54 0.20
170 81 0.31
171 78 0.30
172 39 0.15
173 3 0.01
ACGTcount: A:0.34, C:0.15, G:0.14, T:0.38
Consensus pattern (166 bp):
AATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATATAATTTGATATTTGCATTGGCAAACTGAAGCGAAA
GCATCCATTAACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTCTAAAGCATAGTTACTCGCTTT
AAATGGTTTTATAATCTTATAAATGACTCTAAATTG
Found at i:19041038 original size:3 final size:3
Alignment explanation
Indices: 19041024--19041053 Score: 51
Period size: 3 Copynumber: 9.7 Consensus size: 3
19041014 AACGTGAAAG
19041024 AGA AGA AGGA AGA AGA AGA AGA AGA AGA AG
1 AGA AGA A-GA AGA AGA AGA AGA AGA AGA AG
19041054 CTGTTGGAAA
Statistics
Matches: 26, Mismatches: 0, Indels: 2
0.93 0.00 0.07
Matches are distributed among these distances:
3 23 0.88
4 3 0.12
ACGTcount: A:0.63, C:0.00, G:0.37, T:0.00
Consensus pattern (3 bp):
AGA
Found at i:19044549 original size:171 final size:171
Alignment explanation
Indices: 19044194--19047152 Score: 2135
Period size: 171 Copynumber: 17.4 Consensus size: 171
19044184 AGGTCTCACA
* * ** * *
19044194 TATAATCTTATAAATGATTTTAAAATTG-AATTTTTCCCATTTTT-GTTAAAAACATATCGTAAT
1 TATACTCTTATAAATGATTTT-AAATCGAAATTTTTTTCATTTTTGGTT-AAAACAGATCATAAT
* * ** * * * ** * *
19044257 TTGATATTTTCATCAAAAAATGTGAACCGAAAGCTATCCATTGGCAATAAAAGTCCAGTTATAGT
64 TTGATGTTTGCATCAGGAAACGTGAAGC-AAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGT
* * * ** *
19044322 CACTCATGCCTTCGAGAGCC-TAATCAGACACTTCAAATAGTTT
128 CACTCATGCCTTCGAAAGCCTTAGTTACTCACTTCAAATGGTTT
* * ** * * *
19044365 TATAGTCTTATAAATGATTGTAAATCGAGTTTTTTTTTCATTTCTGGTTAAGACATATCATAATT
1 TATACTCTTATAAATGATTTTAAATCGA-AATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATT
* * * * ** * *
19044430 GGATTTTTGCATCATGG-AACGTGAAGCAAACCCTTCCATCAATAAGAAAAGTCCATTTGTAATC
65 TGATGTTTGCATCA-GGAAACGTGAAGCAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTC
** *
19044494 ACTCATGCCTTCGAAAGCCTT-GTTACTTGCTTCAAGTGGTTT
129 ACTCATGCCTTCGAAAGCCTTAGTTACTCACTTCAAATGGTTT
* * * *
19044536 TTTAACT-TTATAAATGATTTTAAATTG--ATTTTTTT-ATTTTTAGTTAAAACAGATCCTAATT
1 TAT-ACTCTTATAAATGATTTTAAATCGAAATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATT
* ** * * * * **
19044597 TAATGTTTATATCAAGAACCGTAAAACGAAAGCCATCCATTGACGAGAAACA-TCCATTTATAGT
65 TGATGTTTGCATCAGGAAACGTGAAGC-AAAGCCATCCATTGATAAGAAA-AGTCCATTTATAGT
* * ** *
19044661 CACTCATGCCTTTGAAAG-CTTAGTTGCTTGCTTTAAATGGTTT
128 CACTCATGCCTTCGAAAGCCTTAGTTACTCACTTCAAATGGTTT
* * * * *
19044704 TATAGTCTTATAAATTATTTTAAATCAAAACGTTTTTT-ATTTTTGGTTAAAACAGATCACAATT
1 TATACTCTTATAAATGATTTTAAATCGAAA-TTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATT
* ** * * *
19044768 TG-TGGTTT-CTATCAAGAAACGTGAAGCAAAAGTTATCCATTGATAAAAAAAGTCTATCTATAG
65 TGAT-GTTTGC-ATCAGGAAACGTGAAGC-AAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAG
* * * *
19044831 TCACTCATGCCTTTGAAAGGCTT-GTTACTCACTTTAAGTGGTTT
127 TCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTAGTTACTCACTTCAAATGGTTT
* * * * * *
19044875 TGTAACT-TTATAAATGATGTTAAATTG-AATTGTCTTTCATTTTTGGTTAAAACAGACCTTAAT
1 TAT-ACTCTTATAAATGATTTTAAATCGAAATT-TTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAAT
* *
19044938 TTGATGTTTGCATTAGGAAACGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTTCATTTATAGT
64 TTGATGTTTGCATCAGGAAACGTGAAGC-AAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGT
* *
19045003 CACTCATGCCTTCGAAAG-TTTAGTTACTTACTTCAAATGGTTT
128 CACTCATGCCTTCGAAAGCCTTAGTTACTCACTTCAAATGGTTT
* ** * *
19045046 TATAGTCTTATAAATGATTTTAAATCAGAAA-CATTTTCATTTCTGGTTAAAATAGATCATAATT
1 TATACTCTTATAAATGATTTTAAATC-GAAATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATT
* ** * * * * * *
19045110 GGATGAATGCATCTAGGAAACATCAAGCAAATGCCATCTAATGACAAGAAAAGTCTATTTATAGT
65 TGATGTTTGCATC-AGGAAACGTGAAGCAAA-GCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGT
* *
19045175 CACTCATGCCTTCGAAAGCCTT-GGTACTCACTTTAAATGGTTT
128 CACTCATGCCTTCGAAAGCCTTAGTTACTCACTTCAAATGGTTT
* * * * * *
19045218 TATAATCTAATAAATGATTTTAAATTG-AATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACATATCATTATTA
1 TATACTCTTATAAATGATTTTAAATCGAAATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTT
* * * *
19045282 CATGTTTGCATCAGGAAACGTGAAGTGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATCTATAGTCA
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** * *
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130 CTCATGCCTTCGAAAGCCTTAGTTACTCACTTCAAATGGTTT
* * * * * * * * * *
19045388 TATACTCTTATAAATGATGTTATATC-AAAATGTTTTCATTTCTGGTTAAAATAGATAAAAAATA
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** * * * * *
19045452 GATGTTTGCATTGGGAAACATGACGCAGAAACCATCCATTGACAGGAAAAGTCCATTTATAGTCA
66 GATGTTTGCATCAGGAAACGTGAAGCA-AAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCA
* ** * * *
19045517 CT-TTAGCCTTCGAAAATCTT-GTTACTCATTTTAAGTGGTTT
130 CTCAT-GCCTTCGAAAGCCTTAGTTACTCACTTCAAATGGTTT
** * *
19045558 TATAACT-TTATAAATGATTTTAAAT-TTAGTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATTATT
1 TAT-ACTCTTATAAATGATTTTAAATCGAAATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATT
* ** * * * * *
19045621 TGATGTTTACATCACAAAATGTGAAGCGAAAGCGATCTATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTA
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* ** * *
19045686 ACTCATACCTTTAAAAGCC-TAGTTACTCGCTTTAAAATGGTTT
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* * * * *
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*
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* * * * * *
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127 TCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTAGTTACTCACTTCAAATGGTTT
* * * *
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* * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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1 TATACTCTTATAAATGA-TTTTAAATCGAAATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATT
** * * ** * * * *
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* * ** * *
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* * * *
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1 TAT-ACTCTTATAAATGATTTTAAATCGAAATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATT
* * *
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* * * * * * *
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* * * * * * *
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1 TATACTCTTATAAATGATTTTAAATCGAA-ATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATT
* * ** * ** * *
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65 TGATGTTTGCATCAGGAAACGTGAAGC-AAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTC
* * ** *
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129 ACTCATGCCTTCGAAAGCCTTAGTTACTCACTTCAAATGGTTT
* * * ** * * *
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1 TATACTCTTATAAATGATTTT-AAATCGAAATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATT
** ** * * * ** **
19046629 TGATGTTTAAATTTGGAAATGGGAAGTGAAAGCCATTGATTGATAAGAAAAGTCTTTTTATAGTC
65 TGATGTTTGCATCAGGAAACGTGAAG-CAAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTC
* * *** *
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* * * * * * *
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1 TATACTCTTATAAATGATTTTAAATCGAAATTTTTTTCATTTTTGGTT-AAAACAGATCATAATT
* * * * * * * *
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65 TGATGTTTGCATCAGGAAACGTGAAGC-AAAGCCATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTC
* * * * *
19046865 ACTCAAGCTTTCAAAAACCTT-GTTACTCACTTCAAGTGGTTT
129 ACTCATGCCTTCGAAAGCCTTAGTTACTCACTTCAAATGGTTT
* * * * *
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1 TAT-ACTCTTATAAATGATTTTAAATCGAAAT-TTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAAT
* ** * * * *
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** * * *
19047034 TTGCTCATGCTTTCGAAAGCC-TAGTTACTCGCTTTAAATGGTTT
127 TCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTAGTTACTCACTTCAAATGGTTT
* * * * * **
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1 TATACTCTTATAAATGATTTTAAATC-GAAATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATT
*
19047141 TCATGTTTGCAT
65 TGATGTTTGCAT
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Statistics
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* * * *
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* * ** * * *
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* * * *
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* * * *
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*
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* * * *
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* * * * *
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** * *
19045012 CTTCGAAAGTTTAGTTACTTACTTCAAATGGTTTTATAGTCTTATAAATGATTTTAAATCAGAAA
130 CTTCGAAAGCCTAGTTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAGTCTTATAAATGATTTTAAATCA-AAA
* * * ** * * * *
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* * *
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*
19045207 TTAAATGGTTTTATAA-T
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* * * **
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* * * **
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* * * * * *
19045354 CTTCGAAA-CCTTAGTAACTCGCTTCAAATGGTTTTATACTCTTATAAATGATGTTATATCAAAA
130 CTTCGAAAGCC-TAGTTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAGTCTTATAAATGATTTTAAATCAAAA
* * * * * *** *
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* * * **
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*
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* * * *
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** * * * *
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** * **
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* * * *
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* * *
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*
19045868 CACTTTAAGTGATTTTATAACT
319 CACTTTAAGTGGTTTTATAACT
* * *
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* * * * * * * *
19045954 GCATCAGGAAATGTGAAGCAAAAACGATCCATTAACAAGAAAAGTTCACTTATTGTCAATCATGC
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* * * * **
19046019 CTTTGAAAGCCTAGTTA-TTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATAATTTTTATAT-TGA
130 CTTCGAAAGCCTAGTTACTT-GCTTTAAATGGTTTTATAGTCTTATAAATGA-TTTTAAATCAAA
* *
19046082 ACTTTTCTCATTTTTGGTTAAAACATATCATAATTTGAT-G-TTCA-CATAGGAAA-ATGTGAAG
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* * * * * * * ** **
19046143 CAAAAGCCATCTATTGGCAAAAAAAATGC-ATTTACAGTCACTAATGCATTAAAAAGCCTTACTA
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* *
19046207 CTCACTATAAGTGGTTTTTATAACA
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* *
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* * *
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* * * * * * * * ***
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* * * * * * * *
19046427 TTTTTCATTTGTGGTTAAAATAGATCAAAATTGGAT-ATTCACATTAAAAAACATGAAGCAAAAG
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* * * * **
19046491 CCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCATTCATACCTTCGAAAGCCTAGTTACTTGCTT
259 CCATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCACTT
*
19046556 TAAATGGTTTTATAA-T
324 TAAGTGGTTTTATAACT
* * * * * *
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1 -TTATAAATGATTTT-AAATTGAATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTT
** ** * * ** * **
19046636 TAAATTTGGAAATGGGAAGTGAAAGCCATTGATTGATAAGAAAAGTCTTTTTATAGTCACTCATG
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* * * *
19046701 CCTTCAAAAATCCTAGTTACTTGTTTTAAATGGTTTTATAGTCTTACAAATGATTTTAAATC-AA
129 CCTTC-GAAAGCCTAGTTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAGTCTTATAAATGATTTTAAATCAAA
** * * * * * * *
19046765 TTTTTTTTATTTCTAGTTAAAAAAATATCATAA-TTGGTTGTTTGCATCATGAAACATGAAGCAA
193 ACTTTTTCATTTCTGGTT-AAAACAGATCATAATTTGATGGTTT-CATCAAGAAACATGAAGCAA
* * * * * * *
19046829 AAGCCATCCCTTGAGAAGAAAAGT-TCATTTCTAGTCACTCAAGCTTTCAAAAACCTTGTTACTC
256 AAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCT-ATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTC
*
19046893 ACTTCAAGTGGTTTTATAACT
320 ACTTTAAGTGGTTTTATAACT
* * * * *
19046914 TTATAAATAATTTTAAATTGAATGTCTTTTCCTTTTTGGTTAAAACAGATCGTAATTTGATATTT
1 TTATAAATGATTTTAAATTGAAT-TTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTT
** * * **
19046979 GCATTGGGGAATGTGAAGTGAAAGCCATCCACTT-ACAAGAAAAGTCCATTTATAGTTGCTCATG
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* * * * * **
19047043 CTTTCGAAAGCCTAGTTACTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTTAAGCTGAA
129 CCTTCGAAAGCCTAGTTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAGTCTTATAAATGATTTTAAATCAAAA
* * * ** * ** * ** *
19047108 TTTTTCTCATTTTTGGTTAAAA-ATATTGTAATTTCAT-GTTTGCATTGATAAACATGAAGTGAG
194 CTTTT-TCATTTCTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGGTTT-CATCAAGAAACATGAAGCAAA
* ** * * *
19047171 AGCCATTCATTGACAAGAAAAGTC-A--CCTAG-CTGCTC--G-CTT-TAAA---TGGTT--T--
257 AGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTC-ACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCA
*
19047221 -TATAA-T-G--TTATAA--
321 CTTTAAGTGGTTTTATAACT
* * * * *
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1 TTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTG
* * * * * *
19047293 CATCATGAAATGTGAAGTGAAAGCCATCCATAGACAAGAAAAGTCCATTGATAGTTACTTATGCC
66 CATCAGGAAATGTGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCC
* * * ** * * * **
19047358 TTCAAAAGCCTAG-TAGCTCGCTTTAAATTGTTTTATAACCTTGTAAATGATTTTAATTTGAATT
131 TTCGAAAGCCTAGTTA-CTTGCTTTAAATGGTTTTATAGTCTTATAAATGATTTTAA-ATCAAAA
* * * * * * ** ** ***
19047422 TTTTTTTATTTTTTGTTAAAACAAATCATAATTTG-TTGTTTGCATTGAGAAATGTGAAATGAAA
194 CTTTTTCATTTCTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGGTTT-CATCAAGAAACATGAAGCAAAA
* * * * *
19047486 GCGATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTTGAAAGCCTAGTTACTCACT
258 GCCATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCACT
* * *
19047551 TGAAATGGTTTTAT-AGT
323 TTAAGTGGTTTTATAACT
* * * * *
19047568 CTTATGAATGATTTTGAATTGAAACTTTTTTTCATTTCTGGTTAAAACAGATAATGA-TTGAATG
1 -TTATAAATGATTTTAAATTG-AA-TTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTG-ATG
** * * * * * *
19047632 TTTGCATTGGGAAATATGAAGTGAAAGCCATCCATTGACAGGAAAAGTCCATTTAAAATCACTTA
62 TTTGCATCAGGAAATGTGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCA
* * * * * * *
19047697 CG-CTTCCAAAAGACTAGTTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAAATAATTTTAAATTG
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** * * * * * **
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** ** * * ** *
19047824 TGAAAGTGATCCATTGACAAGAAAAGT-TCATTTATAGTCACCCATGCCTTCAAAAGCCTAATTG
253 CAAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCT-ATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTA
* *
19047888 CTTACTTTAAATGGTTTTATAA-T
317 CTCACTTTAAGTGGTTTTATAACT
* * * *
19047911 CTTATAAATGTTTTTAAATTGAATTTTTTTCATCTTTGATTAAAACAGATCATAATTTGTTGTTT
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* * * ** * *
19047976 GTATTAGG-AATCGTGAAGCCAAAGCCATCTGTTAACAAGAAAAGTCCATTGATAGTCACTCATG
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** * * * * * * ** *
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***
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19048441 A-TTTCCTTCATTTCTGGTTAAAA-ATATCATAATTTGAT-GTTTGTATTGGGAAATGTGAAGCA
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19048503 AAAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCATTCATACCTTCAAAAGCCTAGTTGCTC
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* *
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320 ACTTTAAGTGGTTTTATAACT
* *
19048588 CTTATAAATGATTTTAAA-T-AATTTTGTTTTC-TTTCTTGGTTAAAATAGAT-ATAATTTGTTG
1 -TTATAAATGATTTTAAATTGAA-TTT-TTTTCATTT-TTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATG
* * * *
19048649 TTTGCA-CTGGGAAATATGAAGCGAAAGCCATCCATTGGCAACAAAAGTCCATTTATAGTCACTC
62 TTTGCATC-AGGAAATGTGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTC
* * * * * *
19048713 ATGCATTTGAAAGCCGAGTTTCTTGATTTAAATGGTTTTATAGTCTTATAAATGATTGTAAAT-A
126 ATGCCTTCGAAAGCCTAGTTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAGTCTTATAAATGATTTTAAATCA
**** * * *
19048777 TTTTTTTTTCATTTCTAGTTAAAATAGATCATAATTGGATG
191 AAACTTTTTCATTTCTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATG
19048818 TTTGCATTGG
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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345 1 0.00
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TTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTG
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TTTTCATTTCTGGTTAAAACAGATCATAATTTGATGGTTTCATCAAGAAACATGAAGCAAAAGCC
ATCCATTGACAAGAAAAGTCTATTTATAGTCACTCATGCCTTCGAAAGCCTTGTTACTCACTTTA
AGTGGTTTTATAACT
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Alignment explanation
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Period size: 153 Copynumber: 3.0 Consensus size: 155
19045663 ACAAGAAAAG
* * *
19045673 TCCATTTATAGTAACTCATACCTTTAAAAGCCTAGTTACTCGCTTTAAAATGGTTTTATGATCTT
1 TCCATTTATAGTAACTCATACCTTTAAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAAATGATTTTATAATCTT
* * *
19045738 ATAAATGATTTTAAAATTGAACTTTTCTCATTTTTGGTTCAAACAGATCATCATTTGATGTTTGC
66 ATAAATGATTTTAAAATTGAACTTTTCTCATTTTTGGCTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGC
* *
19045803 ATCGAAAAACGTGAAGCCAAAACTA
131 ATCGAAAAACGTGAAGCAAAAACGA
* * * * *
19045828 TCCATTTATAGTCACTTAT-GCTTTCAAAAGCCTTGTTACTCACTTT-AAGTGATTTTATAA-CT
1 TCCATTTATAGTAACTCATACCTTT-AAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAAATGATTTTATAATC-
* * * *
19045890 TTATAAATGATTTT-AAATTGAATTTTTTTCATTTCTT-GCTAAAATATATCATAATTTGATGTT
64 TTATAAATGATTTTAAAATTGAACTTTTCTCATTT-TTGGCTAAAACAGATCATAATTTGATGTT
* *
19045953 TGCATC-AGGAAATGTGAAGCAAAAACGA
128 TGCATCGA-AAAACGTGAAGCAAAAACGA
* * * *
19045981 TCCATTAACAAGAAAAGTTCACTTATTGTCAA-TCATGCCTTTGAAAGCCTAGTTATTCGCTTT-
1 TCCA-T-----------TT-A--TA--GT-AACTCATACCTTTAAAAGCCTAGTTACTCACTTTA
* * * * * *
19046044 AAATGGTTTTATAATCTTATAAATAATTTTTATATTGAACTTTTCTCATTTTTGGTTAAAACATA
48 AAATGATTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAAATTGAACTTTTCTCATTTTTGGCTAAAACAGA
** * * *
19046109 TCATAATTTGATGTTCACATAGGAAAATGTGAAGCAAAA
113 TCATAATTTGATGTTTGCATCGAAAAACGTGAAGCAAAA
19046148 GCCATCTATT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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168 2 0.01
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ACGTcount: A:0.34, C:0.14, G:0.12, T:0.40
Consensus pattern (155 bp):
TCCATTTATAGTAACTCATACCTTTAAAAGCCTAGTTACTCACTTTAAAATGATTTTATAATCTT
ATAAATGATTTTAAAATTGAACTTTTCTCATTTTTGGCTAAAACAGATCATAATTTGATGTTTGC
ATCGAAAAACGTGAAGCAAAAACGA
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Alignment explanation
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Period size: 143 Copynumber: 1.9 Consensus size: 143
19047051 AGCCTAGTTA
**
19047061 CTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTTAAGCTGAATTTTTCTCATTTTTGGTT
1 CTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTTAAAATGAATTTTTCTCATTTTTGGTT
** * * * *
19047126 AAAAATATTGTAATTTCATGTTTGCATTGATAAACATGAAGTGAGAGCCATTCATTGACAAGAAA
66 AAAAATATCATAATTTCATGTTTGCATTCATAAACATGAAGTGAAAGCCATCCATAGACAAGAAA
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131 AGTCACCTAGCTG
*
19047204 CTCGCTTTAAATGGTTTTATAATGTTATAAATGA-TTTTAAAATGAAATTTTT-TCATTTTTGGT
1 CTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTTAAAATG-AATTTTTCTCATTTTTGGT
* ** **
19047267 TAAAACTGATCATAATTTGTTGTTTGCA-TCATGAAATGTGAAGTGAAAGCCATCCATAGACAAG
65 TAAAAAT-ATCATAATTTCATGTTTGCATTCAT-AAACATGAAGTGAAAGCCATCCATAGACAAG
19047331 AAAAGTC
128 AAAAGTC
19047338 CATTGATAGT
Statistics
Matches: 117, Mismatches: 14, Indels: 6
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Matches are distributed among these distances:
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CTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTTAAAATGAATTTTTCTCATTTTTGGTT
AAAAATATCATAATTTCATGTTTGCATTCATAAACATGAAGTGAAAGCCATCCATAGACAAGAAA
AGTCACCTAGCTG
Found at i:19047487 original size:171 final size:171
Alignment explanation
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Period size: 171 Copynumber: 9.6 Consensus size: 171
19047197 CTAGCTGCTC
* * *
19047207 GCTTTAAATGGTTTTATAATGTTATAAATGATTTTAAAATGAAATTTTTTCATTTTTGGTTAAAA
1 GCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAA
* * * *
19047272 CTGATCATAATTTGTTGTTTGCA-TCATGAAATGTGAAGTGAAAGCCATCCATAGACAAGAAAAG
66 CAGATCATAATTTGTTGTTTGCATTGA-GAAATGTGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAG
* * * *
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* * * * * *
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1 GCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATTGAA-TTTTTTTCATTTTTGGTTAAA
* ** * *
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65 ACAGATCATAATTTGTTGTTTGCATTGAGAAATGTGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAG
** *
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130 TCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTAGCTT
* * * * * *
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1 GCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATTG-AA-TTTTTTTCATTTTTGGTTAA
* * * * * * *
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* * * * *
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128 AGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTT-CAAAAGCCTAGTTAGCTT
* * * *
19047720 GCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAAATAATTTTAAATTGAAATGTTTTTCATTTTTGATTAAA
1 GCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATTG-AATTTTTTTCATTTTTGGTTAAA
* * * * ** * **
19047785 TCAAATCATAATTTGATGTTTGTATTG-GAAAACATGAAGTGAAAGTGATCCATTGACAAGAAAA
65 ACAGATCATAATTTGTTGTTTGCATTGAG-AAATGTGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAA
* * *
19047849 GTTCATTTATAGTCACCCATGCCTTCAAAAGCCTAATT-GCTT
129 GTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTAGCTT
* * * *
19047891 ACTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGTTTTTAAATTGAATTTTTTTCATCTTTGATTAAAA
1 GCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAA
* * * ** *
19047956 CAGATCATAATTTGTTGTTTGTATT-AGGAATCGTGAAGCCAAAGCCATCTGTTAACAAGAAAAG
66 CAGATCATAATTTGTTGTTTGCATTGAGAAAT-GTGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAG
*
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* * *
19048061 GTTTTAAATGGTTTTACAATCTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTCTTT-AATTTT--TTAAA
1 GCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTT-TTTCATTTTTGGTTAAA
* * *
19048123 ACAAATCATAATTTGTTGTATGCATT-AGGAAATGTGAAGCGAAAGCTATCCATTGACAAGAAAA
65 ACAGATCATAATTTGTTGTTTGCATTGA-GAAATGTGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAA
* * **
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129 GTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTAGCTT
** * * * ** * ***
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1 GCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAAT-TGAATTTTTTTCATTTTTGGTTAAA
* * * * * * * * *
19048293 ATAGATCACAAATGGGTGTTTGCATTGGGAAATGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGA-AAAAAAAA
65 ACAGATCATAATTTGTTGTTTGCATTGAGAAATGTGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAG
* ** *
19048357 TCCCATTTATAGTCATTCATGCCTTTGAAAGCCTTGTTA-CTT
130 T-CCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTAGCTT
** * ** *
19048399 ATTTTAAGTGGTTTTATAA-CTTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTCCTTCATTTCTGGTTAAA
1 GCTTTAAATGGTTTTATAATC-TTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTCATTTTTGGTTAAA
* * * * * *
19048463 A-ATATCATAATTTGATGTTTGTATTGGGAAATGTGAAGCAAAAGCAATCCATTGACAAGAAAAG
65 ACAGATCATAATTTGTTGTTTGCATTGAGAAATGTGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAG
* * *
19048527 TCCATTTATAGTCATTCATACCTTCAAAAGCCTAGTT-GCTC
130 TCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTAGCTT
* *
19048568 ACTTTAAATGGTTTTATGATCTTATAAATGATTTTAAA-T-AATTTTGTTTTC-TTTCTTGGTTA
1 GCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATTGAA-TTT-TTTTCATTT-TTGGTTA
* * * * * *
19048630 AAATAGAT-ATAATTTGTTGTTTGCACTGGGAAATATGAAGCGAAAGCCATCCATTGGCAACAAA
63 AAACAGATCATAATTTGTTGTTTGCATTGAGAAATGTGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAA
* ** * *
19048694 AGTCCATTTATAGTCACTCATGCATTTGAAAGCCGAGTT-TCTT
128 AGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTAGCTT
* * * * * *
19048737 GATTTAAATGGTTTTATAGTCTTATAAATGATTGTAAA-T-ATTTTTTTTTCATTTCTAGTTAAA
1 GCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATTGA-ATTTTTTTCATTTTTGGTTAAA
* * * **
19048800 ATAGATCATAATTGGATGTTTGCATTG-GAAAACATGAAGCGAAAG
65 ACAGATCATAATTTGTTGTTTGCATTGAG-AAATGTGAAGCGAAAG
19048845 TGTCACGACT
Statistics
Matches: 1217, Mismatches: 215, Indels: 73
0.81 0.14 0.05
Matches are distributed among these distances:
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170 289 0.24
171 323 0.27
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ACGTcount: A:0.34, C:0.12, G:0.15, T:0.39
Consensus pattern (171 bp):
GCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTCATTTTTGGTTAAAA
CAGATCATAATTTGTTGTTTGCATTGAGAAATGTGAAGCGAAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGT
CCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTAGCTT
Found at i:19048332 original size:338 final size:337
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Period size: 338 Copynumber: 4.8 Consensus size: 337
19047198 TAGCTGCTCG
* * *
19047208 CTTTAAATGGTTTTATAATGTTATAAATGATTTTAAAATGAAA-TTTTTTCATTTTTGGTTAAAA
1 CTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTT-AAATAAAATTTTTTTCATTTCTGGTTAAAA
*** *
19047272 CT-GATCATAATTTGTTGTTTGCATCATGAAATGTGAAGTGAAAGCCATCCA-TAGACAAGAAAA
65 -TAGATCATAATTTGTTGTTTGCATTGGGAAATGTGAAGCGAAAGCCATCCATTA-ACAAGAAAA
* * * * * *
19047335 GTCCATTGATAGTTACTTATGCCTTCAAAAGCCTAG-TAGCTCGCTTTAAATTGTTTTATAACCT
128 GTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTA--TTGCTTTAAATGGTTTTATAATCT
* * * * *
19047399 TGTAAATGATTTTAATTTGAATTTTTTTTTATTTTTTGTTAAAACAAATCATAATTTGTTGTTTG
191 TATAAATGATTTTAAATTGAA-TTTTCTTTA-ATTTTGTTAAAACAAATCATAATTTGATGTTTG
** * *
19047464 CATTGAGAAATGTGAAATGAAAGCGATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCC
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**
19047529 TTTGAAAGCCTAGTTACTCA
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* * * * *
19047549 CTTGAAATGGTTTTATAGTCTTATGAATGATTTTGAATTGAAACTTTTTTTCATTTCTGGTTAAA
1 CTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTT-AAAT-AAAATTTTTTTCATTTCTGGTTAAA
* * * * * * * *
19047614 ACAGATAATGA-TTGAATGTTTGCATTGGGAAATATGAAGTGAAAGCCATCCATTGACAGGAAAA
64 ATAGATCATAATTTG-TTGTTTGCATTGGGAAATGTGAAGCGAAAGCCATCCATTAACAAGAAAA
* * * * *
19047678 GTCCATTTAAAATCACTTACG-CTTCCAAAAGACTAGTTACTTGCTTTAAATGGTTTTATAATCT
128 GTCCATTTATAGTCACTCATGCCTT-CAAAAGCCTAGTTA-TTGCTTTAAATGGTTTTATAATCT
* * * * *
19047742 CATAAATAATTTTAAATTGAAATGTTT-TTCATTTTTGATTAAATCAAATCATAATTTGATGTTT
191 TATAAATGATTTTAAATTG-AAT-TTTCTTTAATTTTG-TTAAAACAAATCATAATTTGATGTTT
* ** * * *
19047806 GTATTGGAAAACATGAAGTGAAAG-TGATCCATTGACAAGAAAAGTTCATTTATAGTCACCCATG
253 GCATTGG-AAATGTGAAGCGAAAGCT-ATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATG
* * *
19047870 CCTTCAAAAGCCTAATTGCTTA
316 CCTTCAAAAGCCTAGTTACTCA
* ** *
19047892 CTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGTTTTTAAATTGAATTTTTTTCATCTT-TGATTAAAA
1 CTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATAAAATTTTTTTCAT-TTCTGGTTAAAA
* * * * **
19047956 CAGATCATAATTTGTTGTTTGTATTAGG-AATCGTGAAGCCAAAGCCATCTGTTAACAAGAAAAG
65 TAGATCATAATTTGTTGTTTGCATTGGGAAAT-GTGAAGCGAAAGCCATCCATTAACAAGAAAAG
* * *
19048020 TCCATTGATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTATGTGTTTTAAATGGTTTTACAATCTTA
129 TCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTAT-TGCTTTAAATGGTTTTATAATCTTA
* *
19048085 TAAATGATTTTAAATTGAATTTTCTTTAATTTT-TTAAAACAAATCATAATTTGTTGTATGCATT
193 TAAATGATTTTAAATTGAATTTTCTTTAATTTTGTTAAAACAAATCATAATTTGATGTTTGCATT
* * *
19048149 AGGAAATGTGAAGCGAAAGCTATCCATTGACAAGAAAAATCCATTTATATTCACTCATGCCTT-T
258 -GGAAATGTGAAGCGAAAGCTATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCA
* **
19048213 GAAGCCTAGTTACTTG
322 AAAGCCTAGTTACTCA
** * * * * **
19048229 CTTTAAACAGTTTTATACTTTTATAAATGATTTTATATCAAAATGTTTTTCATTTCCAGTTAAAA
1 CTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAAT-AAAATTTTTTTCATTTCTGGTTAAAA
* * * * * *
19048294 TAGATCACAAATGGGTGTTTGCATTGGGAAATGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGAA-AA-AAAAA
65 TAGATCATAATTTGTTGTTTGCATTGGGAAATGTGAAGCGAAAGCCATCCATT-AACAAGAAAAG
* ** * ** *
19048357 TCCCATTTATAGTCATTCATGCCTTTGAAAGCCTTGTTACTTATTTTAAGTGGTTTTATAA-CTT
129 T-CCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTA-TTGCTTTAAATGGTTTTATAATC-T
* * *
19048421 TATAAATGATTTTAAATTGAA-TTTCCTTCATTTCTGGTTAAAA-ATATCATAATTTGATGTTTG
191 TATAAATGATTTTAAATTGAATTTTCTTTAATTT-T-GTTAAAACAAATCATAATTTGATGTTTG
* * * * *
19048484 TATTGGGAAATGTGAAGCAAAAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCATTCATACC
254 CATT-GGAAATGTGAAGCGAAAGCTATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCC
*
19048549 TTCAAAAGCCTAGTTGCTCA
318 TTCAAAAGCCTAGTTACTCA
* *
19048569 CTTTAAATGGTTTTATGATCTTATAAATGATTTTAAAT-AATTTTGTTTTC-TTTCTTGGTTAAA
1 CTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATAAAATTT-TTTTCATTTC-TGGTTAAA
* * ** *
19048632 ATAGAT-ATAATTTGTTGTTTGCACTGGGAAATATGAAGCGAAAGCCATCCATTGGCAACAAAAG
64 ATAGATCATAATTTGTTGTTTGCATTGGGAAATGTGAAGCGAAAGCCATCCATTAACAAGAAAAG
* ** * * * *
19048696 TCCATTTATAGTCACTCATGCATTTGAAAGCCGAGTTTCTTGATTTAAATGGTTTTATAGTCTTA
129 TCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAG-TTATTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTTA
* * * * * * *
19048761 TAAATGATTGTAAA-T-ATTTTTTTTTCATTTCTAGTTAAAATAGATCATAATTGGATGTTTGCA
193 TAAATGATTTTAAATTGAATTTTCTTTAATTT-T-GTTAAAACAAATCATAATTTGATGTTTGCA
**
19048824 TTGGAAAACATGAAGCGAAAG
256 TTGG-AAATGTGAAGCGAAAG
19048845 TGTCACGACT
Statistics
Matches: 1070, Mismatches: 186, Indels: 83
0.80 0.14 0.06
Matches are distributed among these distances:
336 1 0.00
337 84 0.08
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339 113 0.11
340 64 0.06
341 162 0.15
342 26 0.02
343 257 0.24
344 8 0.01
ACGTcount: A:0.34, C:0.12, G:0.15, T:0.39
Consensus pattern (337 bp):
CTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATAAAATTTTTTTCATTTCTGGTTAAAAT
AGATCATAATTTGTTGTTTGCATTGGGAAATGTGAAGCGAAAGCCATCCATTAACAAGAAAAGTC
CATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAGCCTAGTTATTGCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAA
ATGATTTTAAATTGAATTTTCTTTAATTTTGTTAAAACAAATCATAATTTGATGTTTGCATTGGA
AATGTGAAGCGAAAGCTATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAAAG
CCTAGTTACTCA
Found at i:19048671 original size:508 final size:506
Alignment explanation
Indices: 19047207--19048844 Score: 1680
Period size: 508 Copynumber: 3.2 Consensus size: 506
19047197 CTAGCTGCTC
* * *
19047207 GCTTTAAATGGTTTTATAATGTTATAAATGATTTTAAAATGAAAT-TTTTTCATTTTTGGTTAAA
1 GCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTT-AAAT-AAATGTTTTTCATTTCTAGTTAAA
* * ** ** * *
19047271 ACT-GATCATAATTTGTTGTTTGCATCAT-G-AAATGTGAAGTGAAAGCCATCCATAGACAAGAA
64 A-TAGATCATAATTGGATGTTTGCAT--TGGAAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAAAA
* * * ** * ** *
19047333 AAGTCCATTGATAGTTACTTATGCCTTCAAAAGCCT-AGTAGCTCGCTTTAAATTGTTTTATAAC
126 AAATCCATTTATAGTCACCCATGCCTTCAAAAGCCTAATTA-CTTACTTTAAATGGTTTTATAAC
* * * * *
19047397 CTTGTAAATGATTTTAATTTGAATTTTTTTTTATTTTTTGTTAAAACAAATCATAATTTGTTGTT
190 TTTATAAATGATTTTAAATTGAA-TTTTTTTCA-TTTTGGTTAAAACAAATCATAATTTGTTGTT
* * *** * *
19047462 TGCATTGAGAAATGTGAAATGAAAGCGATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATG
253 TGTATTGGGAAATGTGAAGCAAAAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATG
** * * * *
19047527 CCTTTGAAAGCCTAGTTACTCACTTGAAATGGTTTTATAGTCTTATGAATGATTTTGAATTGAAA
318 CCTTCAAAAGCCTAGTTGCTCACTTTAAATGGTTTTATA-TCTTATAAATGATTTT-AAATG-AA
* * * *
19047592 CTTTTTTTCATTTC-TGGTTAAAACAGATAATGA-TTGAATGTTTGCATTGGGAAATATGAAGTG
380 TTTTTTTTC-TTTCTTGGTTAAAACAGATAATAATTTG-TTGTTTGCATTGGGAAATATGAAGCG
* * * * ** *
19047655 AAAGCCATCCATTGACAGGAAAAGTCCATTTAAAATCACTTACG-CTTCCAAAAGACTAGTTACT
443 AAAGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAATCACTCATGCCTT--TGAAGCCTAGTTACT
19047719 T
506 T
* * *
19047720 GCTTTAAATGGTTTTATAATCTCATAAATAATTTTAAATTGAAATGTTTTTCATTT-TTGATT-A
1 GCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAA-T-AAATGTTTTTCATTTCTAG-TTAA
* * * ** ** *
19047783 AATCAAATCATAATTTGATGTTTGTATTGGAAAACATGAAGTGAAAGTGATCCATTGACAAGAAA
63 AAT-AGATCATAATTGGATGTTTGCATTGGAAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAAAAA
* * *
19047848 AGTTCATTTATAGTCACCCATGCCTTCAAAAGCCTAATTGCTTACTTTAAATGGTTTTATAA-TC
127 AATCCATTTATAGTCACCCATGCCTTCAAAAGCCTAATTACTTACTTTAAATGGTTTTATAACT-
* * *
19047912 TTATAAATGTTTTTAAATTGAATTTTTTTCATCTTTGATTAAAACAGATCATAATTTGTTGTTTG
191 TTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTCAT-TTTGGTTAAAACAAATCATAATTTGTTGTTTG
* * * ** * *
19047977 TATTAGG-AATCGTGAAGCCAAAGCCATCTGTTAACAAGAAAAGTCCATTGATAGTCACTCATGC
255 TATTGGGAAAT-GTGAAGCAAAAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGC
** *
19048041 CTTCAAAAGCCTAGTTATG-T-GTTTTAAATGGTTTTACAATCTTATAAATGATTTTAAATTGAA
319 CTTCAAAAGCCTAG-T-TGCTCACTTTAAATGGTTTTA-TATCTTATAAATGATTTTAAA-TGAA
* ** * * * * *
19048104 TTTTCTTTAATT-TT--TTAAAACAAATCATAATTTGTTGTATGCATTAGGAAATGTGAAGCGAA
380 TTTTTTTTCTTTCTTGGTTAAAACAGATAATAATTTGTTGTTTGCATTGGGAAATATGAAGCGAA
* * *
19048166 AGCTATCCATTGACAAGAAAAATCCATTTATATTCACTCATGCCTTTGAAGCCTAGTTACTT
445 AGCCATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAATCACTCATGCCTTTGAAGCCTAGTTACTT
** * * * *
19048228 GCTTTAAACAGTTTTATACTTTTATAAATGATTTTATATCAAAATGTTTTTCATTTCCAGTTAAA
1 GCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAAT--AAATGTTTTTCATTTCTAGTTAAA
* * * * **
19048293 ATAGATCACAAATGGGTGTTTGCATTGGGAAATGTGAAGCAAAAGCCATCCATTGA-AAAAAAAA
64 ATAGATCATAATTGGATGTTTGCATTGGAAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAAAAAAA
** ** ** * *
19048357 TCCCATTTATAGTCATTCATGCCTTTGAAAGCCTTGTTACTTATTTTAAGTGGTTTTATAACTTT
129 T-CCATTTATAGTCACCCATGCCTTCAAAAGCCTAATTACTTACTTTAAATGGTTTTATAACTTT
** * *
19048422 ATAAATGATTTTAAATTGAATTTCCTTCATTTCTGGTTAAAA-ATATCATAATTTGATGTTTGTA
193 ATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTCATTT-TGGTTAAAACAAATCATAATTTGTTGTTTGTA
* *
19048486 TTGGGAAATGTGAAGCAAAAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCATTCATACCTT
257 TTGGGAAATGTGAAGCAAAAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTT
19048551 CAAAAGCCTAGTTGCTCACTTTAAATGGTTTTATGATCTTATAAATGATTTTAAAT-AATTTTGT
322 CAAAAGCCTAGTTGCTCACTTTAAATGGTTTTAT-ATCTTATAAATGATTTTAAATGAATTTT-T
* *
19048615 TTTCTTTCTTGGTTAAAATAGAT-ATAATTTGTTGTTTGCACTGGGAAATATGAAGCGAAAGCCA
385 TTTCTTTCTTGGTTAAAACAGATAATAATTTGTTGTTTGCATTGGGAAATATGAAGCGAAAGCCA
* * * * * *
19048679 TCCATTGGCAACAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCATTTGAAAGCCGAGTTTCTT
450 TCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAATCACTCATGCCTTTG-AAGCCTAGTTACTT
* * * ** *
19048737 GATTTAAATGGTTTTATAGTCTTATAAATGATTGTAAATATTTTTTTTTCATTTCTAGTTAAAAT
1 GCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATAAATGTTTTTCATTTCTAGTTAAAAT
*
19048802 AGATCATAATTGGATGTTTGCATTGGAAAACATGAAGCGAAAG
66 AGATCATAATTGGATGTTTGCATTGGAAAACATGAAGCAAAAG
19048845 TGTCACGACT
Statistics
Matches: 931, Mismatches: 161, Indels: 72
0.80 0.14 0.06
Matches are distributed among these distances:
505 8 0.01
506 8 0.01
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514 131 0.14
515 3 0.00
ACGTcount: A:0.34, C:0.12, G:0.15, T:0.39
Consensus pattern (506 bp):
GCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATAAATGTTTTTCATTTCTAGTTAAAAT
AGATCATAATTGGATGTTTGCATTGGAAAACATGAAGCAAAAGCCATCCATTGACAAAAAAAATC
CATTTATAGTCACCCATGCCTTCAAAAGCCTAATTACTTACTTTAAATGGTTTTATAACTTTATA
AATGATTTTAAATTGAATTTTTTTCATTTTGGTTAAAACAAATCATAATTTGTTGTTTGTATTGG
GAAATGTGAAGCAAAAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTCATGCCTTCAAA
AGCCTAGTTGCTCACTTTAAATGGTTTTATATCTTATAAATGATTTTAAATGAATTTTTTTTCTT
TCTTGGTTAAAACAGATAATAATTTGTTGTTTGCATTGGGAAATATGAAGCGAAAGCCATCCATT
GACAAGAAAAGTCCATTTATAATCACTCATGCCTTTGAAGCCTAGTTACTT
Found at i:19058945 original size:170 final size:171
Alignment explanation
Indices: 19058242--19059223 Score: 919
Period size: 170 Copynumber: 5.8 Consensus size: 171
19058232 CATTCGTTGT
* * ** * ** *
19058242 CAAGAAAAGTCAATCTATAGTCA-TTCATGCCTTTGAAAGCCCAATTGCTTGCTTTAAATGATTT
1 CAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTT-ATG-CTTCAAAAGCCTAGCTGCTCGCTTTAAATGATTT
* * *
19058306 TATAATCTTATAAATAATTTTAAGTTGAATTTTATTTTTCATTTTTGATTACAAAG--ATCATAA
64 TATAATCTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTT-TTTTTCATTTTTGGTTA-AAAGATATCATAA
* * ** *
19058369 ATTGATATTTG-AATTAAGAAACATGAAGCGAAAGCAAAT-CATTGA
127 TTTGATGTTTGCAA-TGGGAAACGTGAAGCGAAAGC-AATCCATTGA
* * * * * *
19058414 CAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTTATACATTCGAAAGCCTAGTTGCTTGCTTTAAACGGTTTT
1 CAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTTATGC-TTCAAAAGCCTAGCTGCTCGCTTTAAATGATTTT
* * * * *
19058479 ATAATCTTATAAATGATTTTAAAGTGAA-TTTATTTTCATTTTTGGCTAAAACATACCATAA-TT
65 ATAATCTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAAGATATCATAATTT
* * * * ** *
19058542 GGTGTTTGCATTGGGAAACATGAACCGAAAGTTATCAATTGA
130 GATGTTTGCAATGGGAAACGTGAAGCGAAAGCAATCCATTGA
* * * * * * * * * * *
19058584 CAAGAAAGGTCTATTTATAGTTA-TTCATGTCTTCAAAATCCTTGGTACTTG-TTTTAGTGGTTT
1 CAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTT-ATG-CTTCAAAAGCCTAGCTGCTCGCTTTAAATGATTT
* * * *
19058647 TATGAAT-TTATAAATGATTTTGAATTGAA-TTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAA-AGATCACAAT
64 TAT-AATCTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAAGATATCATAAT
* * * * *
19058709 TTGATGTTTGTATTGAGAAATGTGAAGTGAAAGCAATCCATTGA
128 TTGATGTTTGCAATGGGAAACGTGAAGCGAAAGCAATCCATTGA
* * *
19058753 TAAGAAAAGTCCATTTATCA-TCACTTACGGTTCAAAAGCCTAGCTGCTCGCTTTAAATGATTTT
1 CAAGAAAAGTCCATTTAT-AGTCACTTATGCTTCAAAAGCCTAGCTGCTCGCTTTAAATGATTTT
* *
19058817 GTAATCTTATAAATGATTTTAAATTGAA-TTTCTTTTCATTTTTGGTTAAAAGATATCATAATTT
65 ATAATCTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAAGATATCATAATTT
* * *
19058881 GTTGTTTGCAATGGGAAATGTGAAGCGAAAGCCATCCATTGA
130 GATGTTTGCAATGGGAAACGTGAAGCGAAAGCAATCCATTGA
* *
19058923 CAAGAAAAGTCCATTTATCA-TCACTTATGGTTCAAAAGCCTAGTTGCTCGCTTTAAAT-AGTTT
1 CAAGAAAAGTCCATTTAT-AGTCACTTATGCTTCAAAAGCCTAGCTGCTCGCTTTAAATGA-TTT
* *
19058986 TATAATCTTATAAATGATCTTAAATTGAATTTTTTTTTCATTTTAGGTTAAAAGATATCATAATT
64 TATAATCTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAAGATATCATAATT
* * * ** *
19059051 TGTTGTTTGCAATAGGAAACGTAAAGTAAAAGCCATCCATT-A
129 TGATGTTTGCAATGGGAAACGTGAAGCGAAAGCAATCCATTGA
* ** * * *
19059093 CAAGAAAAGTCCATTTATAGTCATTTATGCCTTTGAAA-CC-AACT--TC-ATTGTAAATGGTTT
1 CAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTTATG-CTTCAAAAGCCTAGCTGCTCGCTT-TAAATGATTT
* * * * *
19059153 TTTAATCTCATAAATGATTTTAAATCGAATTTTTTTTTCAATTTTGGTTAAAACATATCATAATT
64 TATAATCTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAAGATATCATAATT
*
19059218 GGATGT
129 TGATGT
19059224 CTAATTTAGA
Statistics
Matches: 679, Mismatches: 110, Indels: 47
0.81 0.13 0.06
Matches are distributed among these distances:
166 2 0.00
167 72 0.11
168 24 0.04
169 169 0.25
170 247 0.36
171 86 0.13
172 77 0.11
173 2 0.00
ACGTcount: A:0.34, C:0.12, G:0.14, T:0.40
Consensus pattern (171 bp):
CAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTTATGCTTCAAAAGCCTAGCTGCTCGCTTTAAATGATTTTA
TAATCTTATAAATGATTTTAAATTGAATTTTTTTTTCATTTTTGGTTAAAAGATATCATAATTTG
ATGTTTGCAATGGGAAACGTGAAGCGAAAGCAATCCATTGA
Found at i:19058988 original size:339 final size:338
Alignment explanation
Indices: 19058242--19059217 Score: 1018
Period size: 339 Copynumber: 2.9 Consensus size: 338
19058232 CATTCGTTGT
* * * ** * *
19058242 CAAGAAAAGTCAATCTATAGTCATTCATGCCTTTGAAAGCCCAATTGCTTGCTTTAAATGATTTT
1 CAAGAAAAGTCCATTTATAGTCATTCATGTCTTCAAAAGCCTAGTTGCTTGCTTTAAATG-TTTT
* * *
19058307 ATAATCTTATAAATAATTTTAAGTTGAATTTTATTTTTCATTTTT-GATTACAAAGATCATAAAT
65 ATAATCTTATAAATGATTTTAA-TTGAATTTT-TTTTTCATTTTTAG-TTAAAAAGATCATAATT
* * *
19058371 TGATATTTGAATTAAGAAACATGAAGCGAAAGCAAAT-CATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGT
127 TGATGTTTGAATT-AGAAACGTGAAGTGAAAGC-AATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGT
* * *
19058435 CACTTATAC-ATTCGAAAGCCTAGTTGCTTGCTTTAAACGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTT
190 CAC-T-TACGATTCGAAAGCCTAGCTGCTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTT
* * * *
19058499 AAAGTGAATTTATTTTCATTTTTGGCTAAAACATACCATAA-TTGGTGTTTGCATTGGGAAACAT
253 AAATTGAATTTATTTTCATTTTTGGTTAAAACATATCATAATTTGGTGTTTGCAATGGGAAACAT
**
19058563 GAACCGAAAGTTATCAATTGA
318 GAACCGAAAGCCATCAATTGA
* * * * * * * * *
19058584 CAAGAAAGGTCTATTTATAGTTATTCATGTCTTCAAAATCCTTGGTACTTG-TTTTAGTGGTTTT
1 CAAGAAAAGTCCATTTATAGTCATTCATGTCTTCAAAAGCCTAGTTGCTTGCTTTAAAT-GTTTT
*
19058648 ATGAAT-TTATAAATGATTTTGAATTGAA-TTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAAAGATCACAATTT
65 AT-AATCTTATAAATGATTTT-AATTGAATTTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAAAGATCATAATTT
* * *
19058711 GATGTTTGTATTGAGAAATGTGAAGTGAAAGCAATCCATTGATAAGAAAAGTCCATTTATCA-TC
128 GATGTTTGAATT-AGAAACGTGAAGTGAAAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTAT-AGTC
* * * *
19058775 ACTTACGGTTCAAAAGCCTAGCTGCTCGCTTTAAATGATTTTGTAATCTTATAAATGATTTTAAA
191 ACTTACGATTCGAAAGCCTAGCTGCTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAA
* * * **
19058840 TTGAATTTCTTTTCATTTTTGGTTAAAAGATATCATAATTTGTTGTTTGCAATGGGAAATGTGAA
256 TTGAATTTATTTTCATTTTTGGTTAAAACATATCATAATTTGGTGTTTGCAATGGGAAACATGAA
* *
19058905 GCGAAAGCCATCCATTGA
321 CCGAAAGCCATCAATTGA
* *
19058923 CAAGAAAAGTCCATTTATCA-TCACTT-ATG-GTTCAAAAGCCTAGTTGCTCGCTTTAAATAGTT
1 CAAGAAAAGTCCATTTAT-AGTCA-TTCATGTCTTCAAAAGCCTAGTTGCTTGCTTTAAAT-GTT
* *
19058985 TTATAATCTTATAAATGATCTTAAATTGAATTTTTTTTTCA-TTTTAGGTTAAAAGATATCATAA
63 TTATAATCTTATAAATGAT-TTTAATTGAATTTTTTTTTCATTTTTA-GTTAAAA-AGATCATAA
* * * *
19059049 TTTGTTGTTTGCAA-TAGGAAACGTAAAGTAAAAGCCATCCATT-ACAAGAAAAGTCCATTTATA
125 TTTGATGTTTG-AATTA-GAAACGTGAAGTGAAAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATA
* * * * * * * *
19059112 GTCATTTATGCCTTTGAAA-CC-AACT--TC-ATTGTAAATGGTTTTTTAATCTCATAAATGATT
188 GTCACTTACG-ATTCGAAAGCCTAGCTGCTCGCTT-TAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATT
* * *
19059172 TTAAATCGAATTTTTTTTTCAATTTTGGTTAAAACATATCATAATT
251 TTAAATTGAA-TTTATTTTCATTTTTGGTTAAAACATATCATAATT
19059218 GGATGTCTAA
Statistics
Matches: 530, Mismatches: 82, Indels: 48
0.80 0.12 0.07
Matches are distributed among these distances:
336 2 0.00
337 40 0.08
338 138 0.26
339 176 0.33
340 55 0.10
341 74 0.14
342 45 0.08
ACGTcount: A:0.34, C:0.12, G:0.14, T:0.40
Consensus pattern (338 bp):
CAAGAAAAGTCCATTTATAGTCATTCATGTCTTCAAAAGCCTAGTTGCTTGCTTTAAATGTTTTA
TAATCTTATAAATGATTTTAATTGAATTTTTTTTTCATTTTTAGTTAAAAAGATCATAATTTGAT
GTTTGAATTAGAAACGTGAAGTGAAAGCAATCCATTGACAAGAAAAGTCCATTTATAGTCACTTA
CGATTCGAAAGCCTAGCTGCTCGCTTTAAATGGTTTTATAATCTTATAAATGATTTTAAATTGAA
TTTATTTTCATTTTTGGTTAAAACATATCATAATTTGGTGTTTGCAATGGGAAACATGAACCGAA
AGCCATCAATTGA
Done.