Tandem Repeats Finder Program written by:

                 Gary Benson
      Program in Bioinformatics
          Boston University

Version 4.09

Sequence: Ga05g03487.C1

Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000

Pmatch=0.80,Pindel=0.10
tuple sizes 0,4,5,7
tuple distances 0, 29, 159, 524

Length: 874
ACGTcount: A:0.33, C:0.16, G:0.19, T:0.32


Found at i:707 original size:3 final size:3

Alignment explanation


    Indices: 699--735  Score: 74
    Period size: 3  Copynumber: 12.3  Consensus size: 3

        689 AACTCATCTC

                                                             
        699 ATT ATT ATT ATT ATT ATT ATT ATT ATT ATT ATT ATT A
          1 ATT ATT ATT ATT ATT ATT ATT ATT ATT ATT ATT ATT A

        736 GGGGAAAGGG


Statistics
Matches: 34,  Mismatches: 0, Indels: 0
        1.00            0.00        0.00

Matches are distributed among these distances:
   3   34  1.00

ACGTcount: A:0.35, C:0.00, G:0.00, T:0.65


Consensus pattern (3 bp):   
ATT

Done.