Tandem Repeats Finder Program written by:

                 Gary Benson
      Program in Bioinformatics
          Boston University

Version 4.09

Sequence: Ga07g01356.C1

Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000

Pmatch=0.80,Pindel=0.10
tuple sizes 0,4,5,7
tuple distances 0, 29, 159, 689

Length: 1149
ACGTcount: A:0.28, C:0.21, G:0.17, T:0.34


Found at i:1042 original size:3 final size:3

Alignment explanation


    Indices: 1034--1072  Score: 78
    Period size: 3  Copynumber: 13.0  Consensus size: 3

       1024 ATTTTATCAC

                                                               
       1034 ATT ATT ATT ATT ATT ATT ATT ATT ATT ATT ATT ATT ATT
          1 ATT ATT ATT ATT ATT ATT ATT ATT ATT ATT ATT ATT ATT

       1073 TTTGCATAAG


Statistics
Matches: 36,  Mismatches: 0, Indels: 0
        1.00            0.00        0.00

Matches are distributed among these distances:
   3   36  1.00

ACGTcount: A:0.33, C:0.00, G:0.00, T:0.67


Consensus pattern (3 bp):   
ATT

Done.