Tandem Repeats Finder Program written by:

                 Gary Benson
      Program in Bioinformatics
          Boston University

Version 4.09

Sequence: Ga10g00690.F1

Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000

Pmatch=0.80,Pindel=0.10
tuple sizes 0,4,5,7
tuple distances 0, 29, 159, 784

Length: 1308
ACGTcount: A:0.29, C:0.17, G:0.22, T:0.32


Found at i:1120 original size:3 final size:3

Alignment explanation


    Indices: 1114--1154  Score: 82
    Period size: 3  Copynumber: 13.7  Consensus size: 3

       1104 TAAATGATGA

                                                                  
       1114 ATT ATT ATT ATT ATT ATT ATT ATT ATT ATT ATT ATT ATT AT
          1 ATT ATT ATT ATT ATT ATT ATT ATT ATT ATT ATT ATT ATT AT

       1155 GGTTTAGGTT


Statistics
Matches: 38,  Mismatches: 0, Indels: 0
        1.00            0.00        0.00

Matches are distributed among these distances:
   3   38  1.00

ACGTcount: A:0.34, C:0.00, G:0.00, T:0.66


Consensus pattern (3 bp):   
ATT

Done.