Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: NW_019167966.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_225, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  46882

Tables:   1   2   

This is table  1  of  2  ( 183 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
158--214
25
2.3
24
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3
60
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5
21
1.41
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2.1
23
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11
64
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1.14
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2.2
21
85
11
60
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4
2
21
1.14
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24
2.3
24
78
3
58
69
5
12
12
1.34
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24
2.4
23
77
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14
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1829--1914
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1940--1986
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12
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2006--2038
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2004--2059
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2.2
18
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0
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71
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1.24
3858--3917
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10
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4168--4232
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19
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2.3
24
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12
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0
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5820--5863
19
2.3
19
84
0
52
77
6
2
13
1.07
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5817--5875
26
2.3
24
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5
3
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1.13
5885--5917
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1.9
17
88
11
50
78
0
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0.93
5883--5938
30
1.9
28
85
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1.13
6563--6647
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4.2
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29
1.22
6941--6991
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7722--7773
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2.3
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2.2
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53
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9305--9367
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2.2
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10
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11450--11488
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0
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12
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11584--11683
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0
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12
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2
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1.03
11613--11774
15
11.2
15
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19
62
78
2
4
14
1.01
12177--12219
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3.0
14
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1.04
12172--12209
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1.9
19
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2.4
35
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3
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12120--12363
8
32.4
7
63
23
54
73
4
5
16
1.19
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12321--12363
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0
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1.07
12432--12476
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3.2
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54
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4
4
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2.4
24
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7
3
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1.21
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22
1.9
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90
0
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3.0
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0
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9
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4
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1.23
14046--14131
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4.3
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5
11
1.04
14075--14157
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2.6
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3
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1.11
14633--14672
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2.2
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1.06
14770--14898
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1
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2
16
1.06
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15835--15969
8
17.7
7
70
17
67
76
1
6
15
1.07
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15867--15952
13
6.5
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1
3
16
0.94
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2.4
21
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10
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0
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1.9
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10
251
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4
10
17
1.38
17002--17041
18
2.2
18
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77
5
10
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1.11
17137--17295
8
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17208--17319
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38
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77
2
5
14
1.05
17203--17278
39
2.0
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82
12
91
77
2
5
14
1.05
17200--17312
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19
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2
5
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1.07
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4
15
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1
18
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64
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3
4
15
1.11
17669--17829
13
12.2
13
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4
3
15
1.11
18012--18067
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2.4
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19409--19471
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23
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25
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18
2.2
18
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77
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10
7
1.11
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8
20.2
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5
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3
5
15
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5
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1.12
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15
108
75
3
5
16
1.11
20360--20441
35
2.4
33
82
11
103
75
2
4
17
1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20807--20886
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3
6
13
1.12
20875--20955
38
2.1
39
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89
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4
2
16
1.06
20819--20956
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74
5
3
16
1.14
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2.5
24
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10
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75
1
3
19
1.03
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24
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17
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2.2
18
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10
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1.11
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0
4
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0.93
22784--22864
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3.1
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82
77
0
4
17
0.93
22791--22858
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5.4
12
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77
0
5
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0.95
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0
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4
14
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23227--23464
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10.5
21
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68
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4
5
15
1.15
23421--23463
15
2.7
16
85
7
52
74
0
11
13
1.07
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24
2.4
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5
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4
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5
10
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24
4.4
23
72
14
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75
1
5
16
1.07
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25897--25978
35
2.4
33
82
11
103
75
2
4
17
1.08
25809--25979
8
20.2
8
69
17
62
74
2
5
16
1.14
26345--26424
39
2.1
38
81
11
92
76
3
6
13
1.12
26413--26493
38
2.1
39
78
13
89
76
4
2
16
1.06
26357--26494
7
18.6
7
70
17
84
74
5
3
16
1.14
26004--26856
476
1.8
468
80
10
1027
67
5
10
16
1.39
26951--26979
9
3.0
10
90
10
51
82
0
0
17
0.66
26927--27030
17
5.9
17
73
22
72
76
2
2
17
1.02
26919--27034
44
2.6
44
75
15
107
76
2
4
16
1.05
26919--27074
8
18.4
8
69
12
80
75
2
5
16
1.09

Tables:   1   2