Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: NW_019167979.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_237, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  44953

Tables:   1   2   

This is table  1  of  2  ( 173 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
118--175
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1.07
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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9
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2.1
38
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
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Entropy
(0-2)
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25
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0
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0
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0
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1
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2.6
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2.0
25
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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0
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1.9
27
84
0
68
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5
1
76
1.05
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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11
0
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1.07
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11
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2.1
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Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
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Score
A
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(0-2)
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24
2.5
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3
8
71
1.24
26748--26785
15
2.4
16
86
4
51
15
10
0
73
1.09
26748--26790
15
2.7
15
85
7
50
13
11
0
74
1.07
27197--27254
23
2.6
23
81
10
59
15
5
6
72
1.24
27335--27437
7
13.4
7
70
18
64
16
3
3
75
1.10
27289--27345
20
2.9
20
76
7
55
17
12
5
64
1.44
27383--27455
24
3.0
24
70
21
62
16
4
4
75
1.11
27570--27620
19
2.7
19
81
3
59
5
11
3
78
1.06
27578--27622
19
2.3
20
84
7
65
8
8
4
77
1.10
27587--27629
19
2.3
19
83
0
50
11
6
4
76
1.13

Tables:   1   2