Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: scaffold317 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 948703

Tables:   1   2   3   

This is table  1  of  3  ( 268 repeats found )
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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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19
1.97
596--911
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2
483
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22
19
1.97
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1.78
Indices
Period
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Copy
Number
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Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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125460--125717
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1.04
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
(0-2)
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22
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32
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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48
1.69
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
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Entropy
(0-2)
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73
2
101
31
24
18
25
1.97
363248--363286
16
2.4
16
86
0
51
28
28
33
10
1.90
363261--363291
16
1.9
16
93
0
53
25
25
35
12
1.92
368017--368042
6
4.3
6
100
0
52
15
38
15
30
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
370544--370570
12
2.2
12
100
0
54
7
51
22
18
1.70
370551--370669
54
2.2
54
83
5
152
16
36
22
24
1.94
371520--371550
2
15.5
2
100
0
62
51
0
0
48
1.00
374390--374429
21
1.9
21
84
0
53
37
5
20
37
1.74
375426--375559
33
4.2
33
67
18
93
14
17
25
41
1.88
377785--377824
17
2.4
17
82
0
53
42
2
2
52
1.28
379321--379362
16
2.4
18
88
11
61
7
7
16
69
1.34
381934--381977
21
2.1
21
86
0
61
43
31
2
22
1.66
383142--383286
51
2.8
51
80
0
146
37
9
25
27
1.87
383457--383535
33
2.4
33
76
0
86
43
16
25
15
1.87

Tables:   1   2   3