Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: scaffold355 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 482196

Tables:   1   2   3   

This is table  1  of  3  ( 253 repeats found )
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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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0
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0.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
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(0-2)
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1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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0
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62
1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
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Entropy
(0-2)
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2.7
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3
158
42
20
24
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
187542--187576
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18
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19
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0
22
52
1.48
236429--236489
18
3.5
17
93
2
86
27
1
21
49
1.59
236326--236551
64
3.5
63
75
16
230
26
0
27
45
1.60
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
236620--236816
29
6.4
29
82
13
250
24
0
29
44
1.58
236620--236816
64
3.2
62
83
12
246
24
0
29
44
1.58
236620--236816
93
2.1
93
95
0
349
24
0
29
44
1.58
236782--236846
18
3.7
18
67
8
53
24
1
27
46
1.62
236800--236824
11
2.3
11
100
0
50
16
0
44
40
1.47
236896--237006
25
4.6
25
69
20
83
45
14
1
37
1.55
236845--237008
71
2.3
71
95
0
292
46
14
1
37
1.55
237115--237172
21
2.8
21
97
0
107
3
20
29
46
1.67
239073--239188
51
2.3
51
95
0
205
43
0
27
27
1.61
239163--239210
22
2.2
21
85
14
62
43
0
33
22
1.54

Tables:   1   2   3