Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: scaffold321
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  1029294

Tables:   1   2   3   

This is table  3  of  3  ( 319 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
815210--815249
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6
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0
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7
0
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0
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7
5.9
7
93
6
64
84
0
15
0
0.62
815269--815309
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3.2
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86
13
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175
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2
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1.20
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2
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9
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9
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2
2
28
1.18
822463--822537
29
2.5
30
85
10
91
69
2
4
24
1.19
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
822494--822566
19
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20
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78
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2
2
28
1.20
825451--825517
20
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7
0
65
1.19
825495--825571
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2.5
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2
0
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1.08
825533--825578
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2.4
19
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2
0
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103
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22
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57
1.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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2.0
64
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3
168
23
19
23
33
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
988074--988124
23
2.2
23
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0
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9
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0
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0
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1.21
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132
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30
17
23
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1.97
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129
30
18
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27
1.98
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13.0
3
84
10
53
33
2
0
64
1.08

Tables:   1   2   3

The End!