Tandem Repeats Finder Program written by:

Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09


Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.


Multiple Sequence Summary

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Sequence
Index
Sequence
Description
Number of
Repeats


11
Cotton_A_34469
1
43
Cotton_A_06320
1
54
Cotton_A_10961
1
100
Cotton_A_12909
1
107
Cotton_A_10026
1
108
Cotton_A_01203
4
115
Cotton_A_35074
1
139
Cotton_A_38863
1
145
Cotton_A_04295
1
256
Cotton_A_05727
1
304
Cotton_A_41065
3
312
Cotton_A_09133
1
320
Cotton_A_23360
1
339
Cotton_A_15984
1
349
Cotton_A_09597
1
360
Cotton_A_05072
2
407
Cotton_A_37481
1
417
Cotton_A_07705
1
421
Cotton_A_15337
1
471
Cotton_A_29946
3
472
Cotton_A_04385
1
488
Cotton_A_30600
1
550
Cotton_A_31109
1
571
Cotton_A_35817
1
588
Cotton_A_03740
1
599
Cotton_A_00517
1
608
Cotton_A_30553
1
741
Cotton_A_14757
2
805
Cotton_A_38100
1
833
Cotton_A_32101
1
844
Cotton_A_22691
1
937
Cotton_A_06514
4
971
Cotton_A_09471
1
982
Cotton_A_33041
4
1063
Cotton_A_07530
1
1064
Cotton_A_17030
1
1081
Cotton_A_05121
1
1098
Cotton_A_26606
1
1116
Cotton_A_24054
1
1118
Cotton_A_06298
1
1123
Cotton_A_41225
1
1149
Cotton_A_33070
1
1158
Cotton_A_26306
1
1160
Cotton_A_19155
1
1176
Cotton_A_08619
2
1228
Cotton_A_08231
1
1235
Cotton_A_13844
1
1241
Cotton_A_35833
1
1289
Cotton_A_35063
1
1318
Cotton_A_32873
3
1345
Cotton_A_00368
1
1353
Cotton_A_19357
1
1358
Cotton_A_39289
1
1366
Cotton_A_23047
1
1389
Cotton_A_07491
4
1400
Cotton_A_06739
1
1413
Cotton_A_17240
1
1414
Cotton_A_24623
4
1449
Cotton_A_08226
1
1536
Cotton_A_14977
1
1559
Cotton_A_12414
1
1565
Cotton_A_34790
1
1570
Cotton_A_19480
1
1574
Cotton_A_02366
1
1609
Cotton_A_17575
1
1634
Cotton_A_01205
1
1710
Cotton_A_09150
1
1721
Cotton_A_35374
1
1752
Cotton_A_03990
3
1759
Cotton_A_29989
1
1773
Cotton_A_07471
1
1840
Cotton_A_01972
1
1857
Cotton_A_10758
1
1874
Cotton_A_01171
1
1884
Cotton_A_21204
1
1891
Cotton_A_05425
3
1908
Cotton_A_21381
1
1989
Cotton_A_17532
2
2002
Cotton_A_19768
4
2005
Cotton_A_18047
1
2033
Cotton_A_31770
1
2036
Cotton_A_39029
1
2039
Cotton_A_36799
1
2150
Cotton_A_28664
1
2202
Cotton_A_09220
1
2240
Cotton_A_24016
1
2330
Cotton_A_12539
1
2339
Cotton_A_03309
1
2354
Cotton_A_21865
1
2402
Cotton_A_33376
1
2412
Cotton_A_00468
1
2455
Cotton_A_37662
1
2458
Cotton_A_18522
1
2501
Cotton_A_04136
1
2510
Cotton_A_00785
1
2531
Cotton_A_17068
1
2536
Cotton_A_19971
1
2540
Cotton_A_15982
7
2555
Cotton_A_25314
2
2590
Cotton_A_18981
1
2592
Cotton_A_11686
1
2611
Cotton_A_38988
1
2617
Cotton_A_32901
1
2631
Cotton_A_09208
1
2632
Cotton_A_06355
1
2642
Cotton_A_18905
1
2678
Cotton_A_09366
1
2706
Cotton_A_12791
1
2801
Cotton_A_15174
3
2849
Cotton_A_38757
1
2868
Cotton_A_09372
1
2869
Cotton_A_14261
4
2934
Cotton_A_19569
1
2955
Cotton_A_30732
1
2961
Cotton_A_32263
3
2972
Cotton_A_36312
1
2976
Cotton_A_37777
1
2978
Cotton_A_28916
1
2979
Cotton_A_35130
1
3006
Cotton_A_05000
2
3024
Cotton_A_19604
2
3028
Cotton_A_40866
1
3062
Cotton_A_31458
2
3069
Cotton_A_18988
1
3070
Cotton_A_33252
1
3080
Cotton_A_35075
1
3109
Cotton_A_38139
2
3144
Cotton_A_02999
1
3191
Cotton_A_35587
2
3206
Cotton_A_02343
1
3225
Cotton_A_09224
1
3274
Cotton_A_03863
1
3316
Cotton_A_35338
2
3337
Cotton_A_34018
1
3343
Cotton_A_37012
1
3351
Cotton_A_08336
1
3359
Cotton_A_09807
3
3398
Cotton_A_15521
1
3402
Cotton_A_33739
5
3416
Cotton_A_01582
1
3420
Cotton_A_29613
1
3427
Cotton_A_05263
1
3444
Cotton_A_27239
2
3448
Cotton_A_19190
1
3462
Cotton_A_15523
1
3524
Cotton_A_12921
1
3526
Cotton_A_07746
1
3535
Cotton_A_06399
1
3541
Cotton_A_06539
1
3612
Cotton_A_36320
1
3643
Cotton_A_02246
3
3649
Cotton_A_12738
1
3674
Cotton_A_01861
1
3688
Cotton_A_21379
2
3802
Cotton_A_12300
2
3878
Cotton_A_29677
2
3882
Cotton_A_13890
1
3916
Cotton_A_21176
1
3922
Cotton_A_35291
1
3927
Cotton_A_10431
1
3970
Cotton_A_06625
1
3973
Cotton_A_17276
1
4000
Cotton_A_16787
2
4036
Cotton_A_00552
1
4051
Cotton_A_40334
1
4062
Cotton_A_26294
1
4081
Cotton_A_17726
2
4105
Cotton_A_10228
1
4128
Cotton_A_08297
1
4205
Cotton_A_26628
1
4241
Cotton_A_20590
2
4300
Cotton_A_24495
3
4342
Cotton_A_36851
2
4369
Cotton_A_13906
1
4443
Cotton_A_04077
1
4468
Cotton_A_26576
3
4575
Cotton_A_11323
1
4589
Cotton_A_14625
1
4604
Cotton_A_12445
1
4623
Cotton_A_15598
1
4643
Cotton_A_29173
2
4657
Cotton_A_00036
1
4672
Cotton_A_03465
1
4681
Cotton_A_10355
1
4682
Cotton_A_03070
1
4684
Cotton_A_38093
1
4695
Cotton_A_07991
1
4712
Cotton_A_03994
3
4722
Cotton_A_19471
2
4799
Cotton_A_39773
6
4802
Cotton_A_20973
6
4811
Cotton_A_09869
1
4816
Cotton_A_40142
1
4818
Cotton_A_23015
1
4828
Cotton_A_30006
2
4868
Cotton_A_38593
1
4885
Cotton_A_21730
2
4906
Cotton_A_35238
4
4909
Cotton_A_23319
1
4910
Cotton_A_19598
1
4964
Cotton_A_40967
1
4981
Cotton_A_18514
1
5034
Cotton_A_25510
1
5114
Cotton_A_04412
1
5150
Cotton_A_12626
1
5177
Cotton_A_10444
1
5228
Cotton_A_03140
1
5270
Cotton_A_35589
2
5273
Cotton_A_35841
1
5283
Cotton_A_30016
1
5287
Cotton_A_10881
1
5299
Cotton_A_08813
1
5331
Cotton_A_31163
1
5337
Cotton_A_25458
1
5349
Cotton_A_15587
1
5359
Cotton_A_13624
1
5374
Cotton_A_34919
2
5402
Cotton_A_27329
1
5452
Cotton_A_09743
1
5539
Cotton_A_32737
1
5546
Cotton_A_33596
1
5548
Cotton_A_17142
1
5557
Cotton_A_30870
1
5614
Cotton_A_17143
1
5642
Cotton_A_02059
1
5666
Cotton_A_20141
1
5696
Cotton_A_30984
1
5780
Cotton_A_17152
2
5795
Cotton_A_21509
2
5821
Cotton_A_20857
1
5824
Cotton_A_18429
1
5832
Cotton_A_17376
2
5846
Cotton_A_13817
1
5866
Cotton_A_23902
10
5867
Cotton_A_21070
1
5959
Cotton_A_39451
2
5965
Cotton_A_29628
3
5968
Cotton_A_11499
2
5976
Cotton_A_29380
1
5989
Cotton_A_10368
1
6003
Cotton_A_00180
1
6038
Cotton_A_15382
1
6057
Cotton_A_37295
1
6070
Cotton_A_06412
4
6142
Cotton_A_30896
1
6164
Cotton_A_15701
2
6228
Cotton_A_22636
1
6264
Cotton_A_06045
1
6294
Cotton_A_34632
1
6321
Cotton_A_30090
1
6324
Cotton_A_35695
3
6368
Cotton_A_21995
1
6410
Cotton_A_14613
1
6503
Cotton_A_31358
7
6514
Cotton_A_26974
1
6527
Cotton_A_14557
5
6538
Cotton_A_20257
1
6558
Cotton_A_04012
1
6640
Cotton_A_38763
1
6641
Cotton_A_08238
1
6642
Cotton_A_22351
1
6649
Cotton_A_10935
1
6680
Cotton_A_21731
1
6692
Cotton_A_05616
1
6699
Cotton_A_29372
2
6702
Cotton_A_15791
1
6751
Cotton_A_22055
1
6772
Cotton_A_01888
1
6773
Cotton_A_30924
2
6792
Cotton_A_00901
1
6851
Cotton_A_12087
1
6858
Cotton_A_30327
2
6871
Cotton_A_25823
1
6878
Cotton_A_08497
3
6886
Cotton_A_25827
4
6910
Cotton_A_38213
1
6913
Cotton_A_31100
1
6979
Cotton_A_00387
1
7004
Cotton_A_13248
1
7042
Cotton_A_00553
2
7043
Cotton_A_06567
1
7138
Cotton_A_23123
1
7162
Cotton_A_08397
1
7190
Cotton_A_38686
1
7197
Cotton_A_12984
2
7205
Cotton_A_02899
1
7220
Cotton_A_27241
1
7260
Cotton_A_24432
1
7278
Cotton_A_29909
3
7282
Cotton_A_29962
1
7331
Cotton_A_17136
1
7344
Cotton_A_34288
1
7375
Cotton_A_07365
1
7377
Cotton_A_08376
1
7408
Cotton_A_32314
8
7438
Cotton_A_32834
2
7497
Cotton_A_22693
1
7542
Cotton_A_41183
5
7556
Cotton_A_08942
2
7566
Cotton_A_40586
1
7582
Cotton_A_03372
2
7591
Cotton_A_19736
2
7600
Cotton_A_03843
1
7627
Cotton_A_40456
1
7639
Cotton_A_32050
1
7688
Cotton_A_36666
1
7804
Cotton_A_01296
1
7832
Cotton_A_26009
1
7834
Cotton_A_22873
1
7851
Cotton_A_23107
1
7860
Cotton_A_14578
1
7884
Cotton_A_18621
1
7948
Cotton_A_08278
1
8083
Cotton_A_12225
2
8143
Cotton_A_39905
1
8187
Cotton_A_27072
1
8193
Cotton_A_09473
2
8207
Cotton_A_14396
1
8213
Cotton_A_07677
1
8289
Cotton_A_00524
1
8291
Cotton_A_14788
2
8348
Cotton_A_24712
1
8389
Cotton_A_05754
1
8402
Cotton_A_28925
2
8428
Cotton_A_32491
1
8446
Cotton_A_08761
1
8466
Cotton_A_08826
1
8477
Cotton_A_37423
1
8507
Cotton_A_37082
1
8509
Cotton_A_04870
1
8538
Cotton_A_31314
1
8548
Cotton_A_02085
1
8584
Cotton_A_00776
1
8590
Cotton_A_30703
1
8595
Cotton_A_16380
1
8609
Cotton_A_05042
2
8639
Cotton_A_04737
1
8658
Cotton_A_13784
1
8660
Cotton_A_32785
1
8690
Cotton_A_40023
1
8728
Cotton_A_28668
1
8732
Cotton_A_20110
1
8777
Cotton_A_30746
1
8778
Cotton_A_28735
1
8782
Cotton_A_32497
2
8806
Cotton_A_01185
1
8821
Cotton_A_04297
1
8827
Cotton_A_18881
1
8852
Cotton_A_10332
1
8872
Cotton_A_16834
1
8891
Cotton_A_23702
4
8904
Cotton_A_38986
1
8908
Cotton_A_16506
1
8921
Cotton_A_01964
1
8946
Cotton_A_40876
1
8950
Cotton_A_38161
4
8964
Cotton_A_29823
1
8973
Cotton_A_36683
1
8979
Cotton_A_39616
1
9000
Cotton_A_33850
1
9037
Cotton_A_09096
1
9046
Cotton_A_01230
1
9059
Cotton_A_23068
1
9061
Cotton_A_10165
1
9144
Cotton_A_19380
1
9172
Cotton_A_21716
1
9193
Cotton_A_06814
1
9203
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