Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Scaffold174
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
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Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   

This is table  2  of  15  ( 1687 repeats found )

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Table Explanation

Indices
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Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.27
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Size
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Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Size
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Matches
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Indels
Score
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Indices
Period
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Copy
Number
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Score
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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65
1.16
248425--248464
20
2.0
20
90
0
62
55
0
0
45
0.99
248499--248534
18
2.1
17
89
5
54
27
0
0
72
0.85
248476--248533
25
2.3
24
80
11
64
31
1
1
65
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
255564--255628
20
3.2
21
77
16
57
55
4
0
40
1.21
258038--258073
2
18.0
2
100
0
72
0
50
0
50
1.00
260591--260629
17
2.3
17
81
0
51
76
0
2
20
0.90
261559--261610
22
2.2
24
86
10
81
48
1
0
50
1.12
263568--263610
17
2.4
18
80
11
52
46
0
0
53
1.00
264122--264155
2
18.0
2
88
11
54
47
0
0
52
1.00
264110--264155
11
4.5
11
86
7
62
45
2
0
52
1.13
270059--270143
28
3.0
28
65
11
75
37
4
3
54
1.39
270059--270174
54
2.1
55
93
3
198
40
5
5
49
1.47
270659--271318
117
5.8
113
81
11
723
31
5
14
48
1.67

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15