Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: Scaffold174 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 2085601

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   

This is table  7  of  15  ( 1687 repeats found )
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Table Explanation

Indices
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Copy
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Percent
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Percent
Indels
Score
A
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T
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(0-2)
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Number
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Period
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Copy
Number
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Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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1.09
906324--906380
2
29.0
2
80
16
66
43
5
0
50
1.24
906396--906432
17
2.2
17
90
0
56
43
24
10
21
1.84
910015--910053
13
3.2
13
85
7
55
56
2
0
41
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
911699--911814
21
5.5
21
71
22
66
50
0
0
48
1.06
911658--911779
43
2.8
44
75
15
119
51
0
0
47
1.06
911769--911796
5
5.6
5
100
0
56
57
0
0
42
0.99
913242--913278
19
2.0
20
89
10
60
43
2
0
54
1.14
913490--913577
45
1.9
46
88
6
135
52
3
1
43
1.25
913490--913601
45
2.5
45
84
8
131
52
3
0
42
1.24
914005--914037
12
2.6
13
85
9
50
87
0
12
0
0.53
919437--919486
2
25.0
2
100
0
100
50
0
0
50
1.00
921689--921731
18
2.5
17
77
7
50
46
0
0
53
1.00
921755--921788
13
2.5
13
85
4
50
35
0
0
64
0.94

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15