Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Scaffold63
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  2211945

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   

This is table  5  of  16  ( 1834 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
755737--755793
24
2.3
25
75
6
62
7
42
0
50
1.29
756509--756558
15
3.4
15
77
5
66
66
0
0
34
0.92
756512--756561
14
3.5
14
83
5
73
66
0
0
34
0.92
756499--756562
29
2.1
31
91
5
105
59
0
1
39
1.07
757247--757323
20
4.0
21
70
23
62
53
0
0
46
1.00
757279--757326
14
3.2
14
83
13
60
60
0
0
39
0.97
757280--757326
16
3.1
16
88
11
64
61
0
0
38
0.96
758746--758788
23
1.9
22
85
4
59
65
0
2
32
1.06
759194--759243
16
3.2
16
81
10
50
60
2
0
38
1.09
759834--759933
28
3.7
27
70
20
84
41
0
1
58
1.05
759844--759929
26
3.5
26
70
19
76
38
0
1
60
1.04
759839--759894
20
2.9
20
74
17
55
44
0
0
55
0.99
759900--759939
19
2.1
18
90
9
62
37
0
0
62
0.95
762622--762672
25
2.1
25
82
10
61
54
0
5
39
1.24
765067--765104
17
2.1
18
85
9
51
57
0
2
39
1.12
765066--765106
16
2.3
18
80
12
50
53
0
2
43
1.13
765127--765169
5
8.6
5
82
17
54
62
0
0
37
0.95
765120--765168
14
3.4
15
78
18
59
59
0
0
40
0.98
765173--765232
26
2.4
25
83
8
77
58
0
0
41
0.98
768550--768579
10
3.0
10
90
0
51
43
0
0
56
0.99
773152--773204
23
2.3
24
80
9
65
67
1
0
30
1.01
773164--773217
11
4.8
11
82
13
58
64
1
0
33
1.04
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
773232--773302
25
2.7
25
84
8
88
45
0
0
54
0.99
774025--774052
2
14.0
2
100
0
56
50
0
0
50
1.00
774215--774274
10
5.9
10
75
9
50
48
0
0
51
1.00
774801--774852
19
2.9
18
83
8
63
48
0
0
51
1.00
774810--774862
27
2.0
27
88
7
81
47
1
0
50
1.12
774806--774852
18
2.7
17
84
12
60
51
0
0
48
1.00
775188--775249
16
4.0
15
85
6
79
51
4
0
43
1.23
775189--775251
31
2.0
31
90
6
101
53
4
0
41
1.22
775755--775839
24
4.2
19
74
24
75
44
3
0
51
1.18
778164--778203
2
20.0
2
94
0
71
47
2
0
50
1.14
780148--780181
13
2.6
13
85
0
50
32
2
0
64
1.08
783009--783038
2
15.0
2
100
0
60
50
0
0
50
1.00
783354--783384
2
15.5
2
100
0
62
51
0
48
0
1.00
790554--790607
26
2.1
26
82
6
65
53
0
0
46
1.00
791414--791452
15
2.4
17
87
8
55
53
5
0
41
1.23
792086--792128
2
21.5
2
100
0
86
51
0
0
48
1.00
792551--792583
2
16.5
2
100
0
66
0
48
0
51
1.00
792583--792613
2
15.5
2
100
0
62
48
0
0
51
1.00
793880--793925
24
1.9
24
82
8
58
52
0
0
47
1.00
795822--795893
22
3.1
23
76
6
65
48
0
0
51
1.00
797078--797164
32
2.7
32
80
8
88
42
3
3
50
1.36
798806--798832
7
3.9
7
100
0
54
29
14
0
55
1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
798402--799248
428
2.0
429
98
0
1633
27
13
15
42
1.85
802109--802224
57
2.0
57
94
0
205
42
14
25
17
1.87
802490--802519
3
10.0
3
100
0
60
0
33
0
66
0.92
802962--803010
19
2.4
21
76
13
57
32
0
0
67
0.91
802965--803019
18
2.9
19
81
5
58
32
1
0
65
1.03
803046--803090
22
2.0
22
83
8
56
42
0
0
57
0.98
803086--803123
18
2.1
19
85
5
51
52
2
0
44
1.14
803712--803748
18
2.0
19
89
5
58
29
2
0
67
1.04
805259--805314
25
2.4
24
85
8
71
48
3
1
46
1.30
805679--805724
6
7.5
6
90
9
67
47
0
2
50
1.13
807923--808058
66
2.1
66
88
0
200
41
16
15
26
1.88
809380--809430
20
2.5
20
87
6
68
50
0
1
47
1.12
812422--812466
22
2.1
21
83
4
54
46
0
0
53
1.00
814576--814611
18
2.1
18
89
5
56
41
0
5
52
1.24
816518--816543
4
6.5
4
100
0
52
23
0
0
76
0.78
817830--817871
14
2.7
16
78
17
52
52
0
0
47
1.00
820066--820133
28
2.4
28
95
5
118
30
8
11
48
1.70
829089--829123
17
2.1
17
89
5
54
40
5
5
48
1.51
829145--829185
22
1.9
22
85
14
59
41
0
0
58
0.98
829756--829821
23
2.9
22
76
14
71
62
1
0
36
1.05
829772--829821
11
4.5
11
87
9
66
62
2
0
36
1.07
829825--829899
24
3.0
25
83
11
66
45
0
0
54
0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
829836--829905
24
2.7
25
84
13
88
45
0
0
54
0.99
830569--830604
2
18.0
2
100
0
72
50
0
0
50
1.00
831307--831389
19
4.5
19
73
10
66
48
1
0
50
1.08
831347--831393
18
2.7
17
84
12
60
51
0
0
48
1.00
831351--831403
27
2.0
27
88
7
81
47
1
0
50
1.12
831400--831436
3
12.7
3
88
5
58
32
0
2
64
1.07
831693--831729
15
2.5
15
87
12
51
35
0
0
64
0.94
831685--831726
12
3.6
11
90
9
66
35
0
0
64
0.94
831772--831832
15
4.0
15
82
2
77
50
0
0
49
1.00
831773--831834
30
2.0
31
93
3
108
53
0
0
46
1.00
832107--832170
26
2.6
24
79
18
69
59
0
0
40
0.97
832113--832146
11
3.2
11
87
4
52
61
0
0
38
0.96
832332--832385
20
2.9
18
79
15
65
48
0
0
51
1.00
832344--832421
24
2.9
26
74
14
70
42
3
0
53
1.19
834740--834769
2
15.0
2
92
0
51
46
3
0
50
1.18
836670--836737
13
4.6
14
73
19
50
39
2
0
57
1.14
836682--836725
19
2.3
19
84
7
54
38
2
0
59
1.10
836661--836724
33
2.0
31
87
6
92
40
3
0
56
1.15
839163--839193
4
7.8
4
100
0
62
25
0
22
51
1.48
839894--839938
2
22.5
2
100
0
90
51
0
48
0
1.00
842659--842683
2
12.5
2
100
0
50
52
48
0
0
1.00
847121--847174
26
2.1
26
82
6
65
53
0
0
46
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
847508--847572
23
2.8
24
79
11
64
44
0
0
55
0.99
847981--848019
15
2.4
17
87
8
55
53
5
0
41
1.23
848224--848832
292
2.1
293
96
2
1123
38
11
12
37
1.79
849095--849119
2
12.5
2
100
0
50
0
48
0
52
1.00
849119--849143
2
12.5
2
100
0
50
48
0
0
52
1.00
850135--850164
15
2.0
15
100
0
60
53
0
0
46
1.00
852329--852400
22
3.1
23
76
6
65
48
0
0
51
1.00
855315--855341
7
3.9
7
100
0
54
29
14
0
55
1.40
858613--858728
57
2.0
57
94
0
205
42
14
25
17
1.87
858993--859019
3
9.0
3
100
0
54
0
33
0
66
0.92
859474--859514
11
3.4
12
83
16
50
34
2
0
63
1.08
859540--859585
21
2.1
21
84
11
58
43
0
0
56
0.99
860878--860954
38
2.0
38
100
0
154
49
0
18
32
1.48
861074--861140
20
3.3
21
82
14
79
43
5
1
49
1.36
861281--861323
21
2.0
21
86
8
61
53
0
0
46
1.00
861259--861315
27
2.0
29
83
10
73
50
0
0
49
1.00
862557--862612
25
2.4
24
85
8
71
48
3
1
46
1.30
862981--863023
13
3.3
13
90
6
61
46
0
2
51
1.13
862977--863023
6
7.5
6
86
13
60
46
0
2
51
1.13
862977--863023
19
2.5
19
93
6
78
46
0
2
51
1.13
865223--865358
66
2.1
66
88
0
200
41
16
15
26
1.88
866681--866731
20
2.5
20
87
6
68
50
0
1
47
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
869718--869762
22
2.1
21
83
4
54
46
0
0
53
1.00
871872--871907
18
2.1
18
89
5
56
41
0
5
52
1.24
873815--873840
4
6.5
4
100
0
52
23
0
0
76
0.78
875125--875166
14
2.7
16
78
17
52
52
0
0
47
1.00
877361--877428
28
2.4
28
95
5
118
30
8
11
48
1.70
885007--885087
32
2.5
33
80
9
96
43
3
1
51
1.27
885068--885178
5
22.2
5
68
21
65
35
3
0
61
1.14
885072--885166
11
8.5
11
75
17
88
32
3
0
64
1.10
885077--885132
27
2.1
27
83
12
71
32
5
0
62
1.18
885605--885658
2
27.0
2
92
0
90
48
1
0
50
1.11

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16