Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: NW_019168337.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_56, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  149304

Tables:   1   2   3   4   

This is table  1  of  4  ( 405 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1424--1452
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0
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27
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1.94
2052--2380
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21
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0
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0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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19
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0
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17716--17789
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2.2
32
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1.21
18081--18167
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41
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21507--21555
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2.8
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19
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2
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1.09
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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19
2.6
18
77
6
51
12
4
4
79
1.02
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25133--25174
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4
2
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65
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4
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2.1
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1
13
1.01
28760--28836
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5
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1
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20
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0
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80
0
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16
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0
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43
1.70
31063--31566
115
4.3
115
83
6
579
36
12
7
43
1.70
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
33808--33849
13
3.5
13
81
15
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0
7
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14
12
40
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9
100
0
50
8
0
0
92
0.40
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5.1
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18
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79
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286
36
17
18
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1.93
34367--34611
126
2.0
124
84
8
327
36
17
17
27
1.93
34368--34640
84
3.3
80
79
9
273
36
17
16
28
1.92
34368--34640
125
2.2
124
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8
313
36
17
16
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2.0
42
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103
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104
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10
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100
0
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0
11
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27
3.1
27
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23
72
39
17
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39
1.66
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57
5.7
57
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2.0
18
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2.5
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9
52
79
0
8
11
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11
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0
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0
5
22
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1.9
28
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0
81
75
5
5
12
1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
45468--45507
21
1.9
21
94
0
71
87
2
2
7
0.71
45435--45499
28
2.3
28
78
0
76
78
4
4
12
1.06
45433--45506
28
2.4
31
74
22
75
78
4
5
12
1.06
45468--45519
16
3.1
16
81
10
59
84
1
3
9
0.82
45768--45807
22
1.9
20
85
10
53
67
0
10
22
1.20
46168--46222
26
2.2
25
83
9
67
78
1
9
10
1.05
46643--46710
21
3.2
21
80
17
70
80
1
8
8
0.96
47484--47519
18
2.0
18
94
0
63
72
0
13
13
1.13
47556--47612
24
2.4
25
75
19
59
73
7
5
14
1.21
47718--47776
31
1.9
31
83
13
77
74
5
10
10
1.20

Tables:   1   2   3   4