Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: VEPZ01007891.1 Hibiscus syriacus cultivar Beakdansim tig00110273_pilon, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  893409

Tables:   1   2   3   4   

This is table  4  of  4  ( 423 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
706208--706274
32
2.1
33
81
18
79
58
1
25
14
1.46
710126--710174
16
2.9
16
84
6
53
61
0
22
16
1.34
715874--715924
19
2.6
20
90
3
77
43
5
15
35
1.71
721785--721835
19
2.6
20
90
3
77
43
5
15
35
1.71
729706--729748
23
1.9
22
90
4
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13
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4
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1.33
730089--730131
10
4.3
10
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0
59
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4
0
0.90
730089--730131
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20
95
0
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0
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22
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1.33
736741--736818
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2.4
33
95
0
138
30
17
23
28
1.97
736738--736791
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1.96
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18
3.2
18
65
15
53
23
21
21
32
1.98
739325--739372
16
2.9
16
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60
66
0
18
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0
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0
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0
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1.34
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13
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3
55
0
14
4
80
0.87
743638--743686
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81
2.0
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0
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16
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53
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0
22
14
1.30
756349--756383
17
2.1
17
88
0
52
14
14
8
62
1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
756439--756479
13
3.1
13
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3
55
0
14
4
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0.87
756431--756479
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1.9
24
88
12
71
0
16
4
79
0.88
757322--757409
13
7.3
12
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23
62
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3
36
30
1.74
757304--757407
36
2.9
36
95
1
183
28
3
36
30
1.75
761699--761802
33
3.1
33
82
9
95
31
36
1
29
1.69
768557--768638
36
2.3
36
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2
121
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3
34
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1.75
773261--773322
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2.1
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0
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20
43
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779066--779123
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2.5
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8
82
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2.0
23
83
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1.60
788968--789013
23
2.0
23
83
8
58
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6
8
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1.60
797795--797824
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2.0
15
100
0
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20
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2.0
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9
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1.84
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2.0
162
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43
81
11
140
28
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8
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1.83
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40
4.1
40
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1
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16
23
1.95
817756--817916
79
2.0
80
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1
297
33
26
16
23
1.95
831606--831731
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2.8
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164
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7
39
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4.1
40
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16
22
1.96
831836--831996
79
2.0
80
97
1
306
32
27
16
22
1.96
840032--840080
16
2.9
16
84
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53
61
0
22
16
1.34
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0
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0
72
0
17
0
82
0.68
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
844681--844721
16
2.6
16
88
0
55
14
12
4
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1.36
845070--845106
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4.9
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3
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0
0
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0
0
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100
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0
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0
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2.5
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18
20
22
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855008--855060
22
2.6
19
88
8
70
35
15
5
43
1.70
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2.2
21
85
14
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22
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14
11
1.52
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2.0
26
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24
22
20
1.97
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6
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0
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0
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20
25
23
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28
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5
11
54
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58
84
0
148
31
15
27
25
1.96

Tables:   1   2   3   4

The End!