Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: Chr1 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 35726063

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  86  of  109  ( 13028 repeats found )
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Table Explanation

Indices
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Size
Copy
Number
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Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
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(0-2)
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Indices
Period
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Copy
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Indels
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Period
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Copy
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Score
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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2.9
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1
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4
1.09
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Percent
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Percent
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Score
A
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Entropy
(0-2)
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23
1.96
27841707--27841831
59
2.1
60
97
2
236
42
13
22
21
1.88
27841910--27841956
19
2.3
21
89
10
71
21
0
14
63
1.30
27841926--27841967
16
2.8
15
89
10
68
21
0
11
66
1.23
27841977--27842007
13
2.3
14
94
5
55
12
0
12
74
1.08
27841940--27842001
22
2.8
22
66
11
54
22
0
9
67
1.19
27852387--27852433
19
2.3
21
89
10
71
21
0
14
63
1.30
27852403--27852444
16
2.8
15
89
10
68
21
0
11
66
1.23
27852454--27852484
13
2.3
14
94
5
55
12
0
12
74
1.08
27852417--27852478
22
2.8
22
66
11
54
22
0
9
67
1.19
27857531--27857578
23
2.0
24
81
18
57
37
0
8
54
1.31
27857649--27857674
13
2.0
13
100
0
52
23
23
15
38
1.92
27858631--27858834
111
1.8
110
93
1
354
44
6
8
40
1.60
27858829--27858870
16
2.6
16
96
0
75
45
4
2
47
1.36
27858844--27858905
22
2.7
23
90
5
90
48
3
1
46
1.28
27861315--27861375
30
2.0
31
87
3
88
37
13
6
42
1.70
27864508--27864540
16
1.9
18
88
11
52
24
0
12
63
1.28
27867023--27867084
24
2.6
24
78
16
76
62
1
0
35
1.05
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27867083--27867125
6
7.2
6
86
7
61
46
0
0
53
1.00
27867083--27867129
23
2.0
25
91
8
80
46
0
0
53
1.00
27874341--27874439
49
2.0
50
90
2
155
37
24
16
22
1.93
27880102--27880200
28
3.6
27
84
11
112
28
28
12
31
1.92
27884788--27885173
190
2.0
190
97
1
738
32
6
10
51
1.62
27885105--27885147
20
2.2
20
83
8
52
30
0
2
67
1.03
27893342--27893410
26
2.6
27
75
6
70
23
26
36
14
1.93
27893445--27893564
10
12.1
10
72
19
83
63
1
35
0
1.05
27893445--27893533
20
4.5
20
79
9
94
65
0
34
0
0.93
27893453--27893505
15
3.5
15
78
12
63
66
0
33
0
0.92

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109