Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 ID=Chr13-JGI_221_v2.0
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
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Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  75  of  199  ( 23770 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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151
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30
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22
26
25
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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154
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26
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21
22
25
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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128
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0
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16
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0
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1.9
82
87
2
229
26
0
27
44
1.59
22974021--22974054
7
4.9
7
88
0
50
11
0
55
32
1.36
22973936--22974148
96
2.2
95
89
4
313
23
0
34
42
1.58
22973898--22974062
82
2.0
82
82
6
201
25
0
30
43
1.59
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22974110--22974149
7
5.6
7
84
3
53
7
0
50
42
1.30
22974110--22974171
14
4.4
14
75
8
54
12
0
45
41
1.42
22975568--22975614
19
2.5
19
92
0
85
42
10
8
38
1.70
22976032--22976056
8
3.1
8
100
0
50
36
0
24
40
1.55
22978651--22978747
43
2.3
43
83
3
115
26
18
28
25
1.98
22978832--22978878
13
4.0
13
71
25
50
38
27
25
8
1.85
22978839--22978882
21
2.1
21
95
0
79
38
29
20
11
1.87
22979179--22979320
71
2.0
71
87
0
203
30
14
17
38
1.89
22980515--22980561
24
2.0
24
91
8
78
29
2
0
68
1.02
22980516--22980567
24
2.2
24
86
6
70
30
1
0
67
1.02
22981894--22981933
16
2.5
16
83
0
53
67
2
2
27
1.16
22985047--22985135
30
3.0
29
88
4
142
32
15
5
46
1.70
22990185--22990231
25
1.9
24
82
4
58
53
8
4
34
1.51
22993333--22993370
10
3.8
10
85
0
58
60
0
0
39
0.97
22993333--22993381
20
2.4
20
83
10
64
61
0
0
38
0.96
22993784--22993849
32
2.1
31
83
8
80
33
1
4
60
1.26
22994368--22994413
9
5.0
9
94
2
74
54
2
0
43
1.12
22994420--22994465
17
2.6
18
78
18
51
60
4
0
34
1.16
22994373--22994472
9
10.4
10
78
17
81
60
3
1
36
1.19
22994429--22994473
20
2.2
20
80
0
54
64
4
2
28
1.25
22995810--22995885
23
3.3
23
88
0
125
23
21
25
30
1.99
22999326--22999369
16
2.8
16
96
0
79
27
0
18
54
1.44
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23000823--23000874
18
2.9
18
97
0
95
44
17
17
21
1.87
23003848--23003872
7
3.6
7
100
0
50
16
24
0
60
1.36
23005050--23005100
22
2.3
22
82
0
57
72
0
7
19
1.08
23012902--23013171
42
6.4
42
79
9
264
33
21
19
25
1.97
23012902--23013108
85
2.4
85
86
7
287
33
21
19
25
1.97
23012902--23013152
85
3.0
85
81
7
280
32
21
20
25
1.98
23012902--23013149
127
2.0
127
83
6
315
32
21
20
25
1.98
23013556--23013623
21
3.2
21
85
0
73
2
39
20
36
1.68
23016447--23017597
9
129.2
9
67
18
479
33
2
18
45
1.63
23016469--23016570
41
2.5
41
95
0
177
30
4
21
43
1.74

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199