Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr4
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  30015117

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          81   82   83   84   85   

This is table  43  of  85  ( 10117 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14681964--14682209
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2
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27
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26
1.99
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25
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27
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26
1.99
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186
1.9
187
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537
26
27
20
25
1.99
14682482--14682727
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3.4
73
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343
26
27
20
26
1.99
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186
1.9
187
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2
537
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20
25
1.99
14682741--14682986
73
3.4
73
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2
343
26
27
20
26
1.99
14682814--14683174
186
1.9
187
88
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537
26
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1.99
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27
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26
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537
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1.99
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27
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1.9
187
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537
26
27
20
25
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.99
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186
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1.99
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27
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1.99
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1.99
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1.99
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26
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1.9
187
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537
26
27
20
25
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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1.99
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1.99
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1.99
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3.4
17
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66
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15
1
77
1.02
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14733441--14733508
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21
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18
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23
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1.97
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15
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1.74
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14
41
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14765592--14765830
50
4.7
50
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4
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27
20
29
1.99
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28
20
27
1.99
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17
25
31
1.97
14798237--14798421
101
1.8
101
85
3
264
25
17
25
31
1.97
14799104--14799161
25
2.3
25
81
0
71
27
5
10
56
1.54
14805307--14805380
24
3.0
23
64
21
60
24
14
27
33
1.94
14805307--14805497
51
3.8
50
83
3
249
24
17
27
31
1.97
14813794--14813896
16
6.3
16
74
14
77
24
17
12
45
1.83
14813803--14813894
33
2.8
32
86
1
121
26
17
13
43
1.85
14815023--14815058
17
2.0
19
89
10
58
41
13
11
33
1.80
14815128--14815218
48
1.9
47
86
2
128
38
25
15
20
1.92
14815189--14815240
21
2.4
22
84
9
63
46
26
7
19
1.77
14825198--14825421
43
5.2
43
95
1
378
30
29
19
20
1.97
14827180--14835772
86
99.9
86
99
0
16836
24
34
15
25
1.94
14837767--14837795
12
2.5
12
94
5
51
41
0
10
48
1.37
14842276--14842325
17
3.0
17
85
2
75
28
20
6
46
1.74
14848142--14848200
7
8.4
7
79
7
66
33
49
0
16
1.47
14848132--14848200
28
2.5
28
83
4
86
33
47
0
18
1.49
14848286--14848339
21
2.6
21
80
16
67
35
38
0
25
1.57
14848289--14848343
28
2.0
28
85
0
74
36
40
0
23
1.55
14848704--14848941
41
5.8
41
82
3
262
35
26
17
20
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14848704--14848930
124
1.8
124
87
3
341
35
26
17
20
1.95
14848960--14849074
41
2.9
41
81
3
128
32
28
17
21
1.96
14848824--14849073
133
1.9
135
81
5
310
33
28
17
21
1.96
14851432--14851724
163
1.8
162
83
2
390
33
15
20
30
1.93
14857667--14857752
45
1.9
45
95
0
154
32
23
16
27
1.96
14857770--14857850
38
2.2
38
90
2
128
33
20
17
28
1.95
14857807--14858021
51
4.5
51
77
15
249
33
22
17
26
1.96
14857859--14858021
89
1.8
88
92
1
272
33
23
17
25
1.96
14857910--14857990
38
2.2
38
90
2
128
33
20
17
28
1.95
14857756--14858012
140
1.8
140
100
0
514
33
23
17
25
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85