Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 ID=Chr01-JGI_221_v2.0
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  55868233

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  5  of  187  ( 22383 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
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(0-2)
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1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Indels
Score
A
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1.42
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Indels
Score
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Score
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Size
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A
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(0-2)
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184
26
33
15
23
1.95
2020253--2020331
37
2.1
38
88
6
117
29
32
10
27
1.89
2031317--2031348
12
2.8
11
90
9
55
90
0
9
0
0.45
2034406--2034435
14
2.1
14
93
0
51
46
10
6
36
1.64
2034404--2034448
13
3.4
13
84
6
54
40
6
6
46
1.56
2034415--2034454
13
2.9
14
81
7
55
40
2
7
50
1.44
2041419--2041474
22
2.4
23
79
8
60
66
5
0
28
1.14
2047012--2047134
42
2.9
42
83
4
151
30
6
17
45
1.74
2047282--2047364
42
2.0
42
92
0
139
26
6
21
45
1.75
2047421--2047607
97
1.9
98
87
3
279
21
13
11
52
1.72
2054941--2054975
18
2.0
17
88
5
52
28
0
5
65
1.15
2057434--2057468
16
2.2
16
90
5
54
25
0
2
71
1.00
2060871--2060913
22
2.0
22
85
0
59
76
0
4
18
0.95
2067678--2067724
23
2.0
23
83
0
58
46
6
8
38
1.60
2075915--2075969
24
2.2
25
84
9
69
18
40
3
38
1.68
2089775--2089805
9
3.4
9
90
0
53
25
12
22
38
1.90
2089859--2089895
9
4.1
9
85
0
56
48
13
8
29
1.71
2099651--2099696
11
4.5
11
76
15
53
34
0
6
58
1.24
2099653--2099694
10
4.2
10
78
9
50
33
0
7
59
1.25
2102467--2102549
27
2.9
27
77
20
73
27
2
2
67
1.16
2102477--2102670
9
21.4
9
64
22
61
30
3
3
62
1.27
2102476--2102549
15
5.2
13
70
29
53
27
1
2
68
1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2102496--2102550
15
3.5
15
78
16
58
29
1
1
67
1.11
2102567--2102609
11
4.0
11
79
14
54
34
2
0
62
1.08
2102637--2102700
30
2.2
30
83
5
78
29
7
6
56
1.52
2117590--2117630
20
2.1
19
86
13
57
41
7
4
46
1.53
2118233--2118276
21
2.0
22
82
4
54
43
2
2
52
1.26
2120362--2120496
42
3.2
42
78
0
135
43
17
22
15
1.87
2126037--2126082
25
1.9
24
91
8
76
58
2
0
39
1.10
2128818--2128879
31
2.0
31
100
0
124
19
9
19
51
1.74
2135441--2135481
16
2.6
16
80
3
57
41
0
0
58
0.98
2140711--2140735
11
2.3
11
100
0
50
32
36
0
32
1.58

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187